View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11065_high_4 (Length: 316)

Name: NF11065_high_4
Description: NF11065
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11065_high_4
NF11065_high_4
[»] chr3 (80 HSPs)
chr3 (1-305)||(39203502-39203806)
chr3 (1-170)||(1217076-1217245)
chr3 (1-169)||(22122918-22123086)
chr3 (1-170)||(40272812-40272983)
chr3 (1-169)||(7696893-7697056)
chr3 (1-170)||(13730602-13730775)
chr3 (16-170)||(13628790-13628948)
chr3 (1-170)||(46421034-46421208)
chr3 (4-170)||(26869696-26869863)
chr3 (1-170)||(29366720-29366893)
chr3 (44-170)||(31592878-31593004)
chr3 (13-169)||(22609764-22609921)
chr3 (1-170)||(52926219-52926381)
chr3 (1-168)||(8247688-8247860)
chr3 (1-170)||(16735427-16735597)
chr3 (1-170)||(12914035-12914206)
chr3 (64-170)||(15797271-15797377)
chr3 (13-168)||(26573125-26573282)
chr3 (1-159)||(6411833-6411992)
chr3 (14-170)||(34420643-34420802)
chr3 (23-170)||(516417-516569)
chr3 (73-170)||(34771364-34771461)
chr3 (16-170)||(5173719-5173876)
chr3 (55-170)||(54484730-54484848)
chr3 (5-170)||(4495676-4495831)
chr3 (1-153)||(9607189-9607345)
chr3 (43-171)||(10795422-10795554)
chr3 (47-170)||(14986989-14987116)
chr3 (13-170)||(53996565-53996725)
chr3 (17-148)||(30928169-30928302)
chr3 (26-154)||(33926094-33926224)
chr3 (18-166)||(7942993-7943143)
chr3 (17-160)||(45948848-45948996)
chr3 (61-170)||(49013473-49013586)
chr3 (1-97)||(10870025-10870122)
chr3 (1-170)||(25517170-25517344)
chr3 (60-171)||(45786213-45786328)
chr3 (14-170)||(25944468-25944627)
chr3 (30-158)||(54374357-54374488)
chr3 (77-168)||(353351-353444)
chr3 (65-170)||(26292382-26292487)
chr3 (13-117)||(45620881-45620988)
chr3 (60-134)||(47624087-47624162)
chr3 (13-166)||(44403559-44403715)
chr3 (26-169)||(45139479-45139624)
chr3 (13-166)||(19731000-19731155)
chr3 (26-170)||(54032571-54032705)
chr3 (64-173)||(9276313-9276422)
chr3 (110-170)||(30452892-30452952)
chr3 (61-171)||(31831245-31831344)
chr3 (11-169)||(33235526-33235687)
chr3 (21-148)||(8410889-8411016)
chr3 (104-170)||(24851301-24851367)
chr3 (34-171)||(55401195-55401335)
chr3 (13-171)||(28904941-28905101)
chr3 (13-166)||(19751576-19751731)
chr3 (95-170)||(24577917-24577992)
chr3 (95-170)||(24578007-24578082)
chr3 (48-156)||(43114882-43114994)
chr3 (1-170)||(12525396-12525564)
chr3 (37-161)||(52428479-52428613)
chr3 (13-87)||(53062036-53062112)
chr3 (61-170)||(50624953-50625064)
chr3 (13-160)||(829452-829601)
chr3 (21-123)||(29106555-29106659)
chr3 (115-175)||(10484611-10484671)
chr3 (54-169)||(31904857-31904975)
chr3 (13-167)||(35417914-35418058)
chr3 (124-170)||(6242285-6242331)
chr3 (17-104)||(39211992-39212081)
chr3 (122-170)||(47624208-47624256)
chr3 (99-148)||(46169989-46170038)
chr3 (1-110)||(21875006-21875111)
chr3 (12-111)||(26782363-26782464)
chr3 (129-170)||(40390357-40390398)
chr3 (110-170)||(14266372-14266431)
chr3 (107-170)||(40968612-40968675)
chr3 (77-143)||(21330273-21330339)
chr3 (15-109)||(1121286-1121382)
chr3 (13-41)||(55400996-55401024)
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (1-170)||(12670250-12670419)
chr8 (1-170)||(30454097-30454266)
chr8 (4-175)||(13160669-13160841)
chr8 (1-170)||(28817626-28817797)
chr8 (1-170)||(36720760-36720931)
chr8 (1-175)||(44530113-44530289)
chr8 (1-170)||(35261643-35261814)
chr8 (1-170)||(6760786-6760959)
chr8 (1-170)||(39460994-39461167)
chr8 (1-171)||(17823540-17823712)
chr8 (1-169)||(45071229-45071398)
chr8 (1-170)||(7136527-7136700)
chr8 (1-147)||(20869523-20869667)
chr8 (1-170)||(29521685-29521856)
chr8 (1-170)||(2626483-2626657)
chr8 (1-166)||(18164764-18164930)
chr8 (12-170)||(26954107-26954270)
chr8 (10-170)||(8897764-8897926)
chr8 (10-170)||(12625862-12626025)
chr8 (13-164)||(20284075-20284232)
chr8 (13-164)||(21070703-21070861)
chr8 (14-148)||(24365081-24365218)
chr8 (1-170)||(25250486-25250659)
chr8 (19-170)||(31457155-31457307)
chr8 (1-170)||(28407380-28407538)
chr8 (61-170)||(19729366-19729475)
chr8 (43-170)||(5135290-5135418)
chr8 (13-157)||(44781517-44781665)
chr8 (55-170)||(20869941-20870060)
chr8 (54-168)||(29877111-29877227)
chr8 (13-161)||(8483947-8484097)
chr8 (13-158)||(22598133-22598279)
chr8 (37-160)||(389643-389770)
chr8 (46-165)||(5689640-5689761)
chr8 (23-171)||(23000227-23000365)
chr8 (96-170)||(26102578-26102652)
chr8 (1-148)||(24245415-24245562)
chr8 (13-169)||(42083699-42083858)
chr8 (61-170)||(10857852-10857964)
chr8 (63-171)||(16225045-16225157)
chr8 (16-133)||(35105902-35106022)
chr8 (13-148)||(11000971-11001109)
chr8 (13-148)||(14017990-14018128)
chr8 (63-171)||(23286336-23286432)
chr8 (13-167)||(44742521-44742678)
chr8 (10-141)||(11748272-11748407)
chr8 (48-167)||(17250879-17251001)
chr8 (82-163)||(26457776-26457855)
chr8 (92-170)||(16013511-16013591)
chr8 (16-80)||(30962865-30962929)
chr8 (60-126)||(43942347-43942417)
chr8 (110-169)||(27507985-27508044)
chr8 (107-170)||(35107311-35107374)
chr8 (2-170)||(40604906-40605075)
chr8 (121-170)||(27468092-27468141)
chr8 (45-171)||(33866957-33867088)
chr8 (109-169)||(36486567-36486627)
chr8 (81-156)||(30231344-30231420)
chr8 (115-166)||(18595918-18595969)
chr8 (15-110)||(36918102-36918199)
chr8 (126-171)||(30962770-30962815)
chr8 (109-141)||(12483584-12483616)
chr8 (1-65)||(31454152-31454216)
chr8 (114-170)||(40444845-40444901)
[»] chr7 (84 HSPs)
chr7 (1-170)||(21172009-21172178)
chr7 (1-170)||(32758225-32758394)
chr7 (1-172)||(10693071-10693242)
chr7 (1-171)||(48735121-48735292)
chr7 (19-170)||(42391100-42391251)
chr7 (1-172)||(2541017-2541191)
chr7 (1-170)||(42798633-42798804)
chr7 (10-169)||(42476846-42477005)
chr7 (1-170)||(42805488-42805661)
chr7 (16-169)||(11741774-11741927)
chr7 (1-170)||(27629598-27629769)
chr7 (1-166)||(47077859-47078024)
chr7 (4-169)||(11617589-11617756)
chr7 (1-171)||(47716423-47716597)
chr7 (2-170)||(19426890-19427059)
chr7 (37-170)||(31591109-31591242)
chr7 (11-171)||(33871909-33872070)
chr7 (1-170)||(43557436-43557610)
chr7 (1-168)||(35334818-35334985)
chr7 (5-170)||(34626208-34626374)
chr7 (1-170)||(40463841-40464011)
chr7 (13-170)||(19265791-19265948)
chr7 (38-170)||(7879639-7879773)
chr7 (1-141)||(46354158-46354302)
chr7 (12-148)||(13805077-13805214)
chr7 (13-171)||(23419673-23419833)
chr7 (13-148)||(19266426-19266563)
chr7 (1-171)||(22698966-22699141)
chr7 (1-160)||(2662946-2663102)
chr7 (37-168)||(18512455-18512587)
chr7 (13-169)||(29907393-29907552)
chr7 (23-169)||(18747472-18747621)
chr7 (13-161)||(28362155-28362304)
chr7 (13-146)||(48123508-48123643)
chr7 (13-146)||(14099030-14099165)
chr7 (13-146)||(14409047-14409182)
chr7 (1-170)||(14732821-14732993)
chr7 (20-170)||(32233135-32233286)
chr7 (28-170)||(38262196-38262340)
chr7 (13-169)||(16341254-16341413)
chr7 (56-162)||(38604546-38604654)
chr7 (1-126)||(8148989-8149117)
chr7 (3-148)||(28078154-28078300)
chr7 (62-170)||(35787269-35787378)
chr7 (12-158)||(39123865-39124018)
chr7 (87-170)||(27889316-27889399)
chr7 (12-145)||(7644931-7645066)
chr7 (1-93)||(18326998-18327091)
chr7 (41-161)||(21566439-21566562)
chr7 (1-109)||(12473268-12473378)
chr7 (13-169)||(3469176-3469338)
chr7 (14-115)||(6736867-6736969)
chr7 (1-90)||(42495916-42496006)
chr7 (49-166)||(1408469-1408588)
chr7 (1-109)||(5180218-5180328)
chr7 (53-171)||(23231573-23231693)
chr7 (13-148)||(44123644-44123780)
chr7 (5-80)||(7794598-7794673)
chr7 (1-79)||(7193049-7193127)
chr7 (13-155)||(42101899-42102044)
chr7 (87-170)||(45018923-45019010)
chr7 (2-108)||(1423972-1424080)
chr7 (37-148)||(35203439-35203554)
chr7 (78-170)||(39093439-39093532)
chr7 (1-80)||(21447554-21447633)
chr7 (1-170)||(25198686-25198861)
chr7 (41-126)||(15108441-15108527)
chr7 (76-170)||(23618977-23619071)
chr7 (78-145)||(33500556-33500625)
chr7 (12-168)||(22065563-22065720)
chr7 (77-170)||(23065925-23066018)
chr7 (88-160)||(36267827-36267900)
chr7 (68-157)||(21139761-21139851)
chr7 (15-167)||(11458267-11458421)
chr7 (84-170)||(13792150-13792237)
chr7 (123-170)||(36602535-36602582)
chr7 (77-154)||(17048831-17048909)
chr7 (1-45)||(29140487-29140531)
chr7 (119-167)||(42495865-42495913)
chr7 (13-104)||(43852026-43852111)
chr7 (107-170)||(45811919-45811981)
chr7 (112-173)||(11888414-11888475)
chr7 (52-168)||(27697452-27697572)
chr7 (13-77)||(1524281-1524345)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (1-170)||(1346928-1347097)
chr6 (1-170)||(1354757-1354926)
chr6 (1-170)||(12221914-12222088)
chr6 (20-170)||(29355855-29356009)
chr6 (55-170)||(26097178-26097293)
chr6 (13-170)||(9161099-9161259)
chr6 (5-170)||(2166410-2166579)
chr6 (5-170)||(2178043-2178212)
chr6 (55-170)||(25557743-25557858)
chr6 (15-170)||(28007604-28007760)
chr6 (1-163)||(3815084-3815248)
chr6 (1-168)||(15866041-15866208)
chr6 (23-168)||(23240826-23240971)
chr6 (22-170)||(18277193-18277343)
chr6 (13-135)||(13905015-13905138)
chr6 (1-170)||(1941819-1941990)
chr6 (13-171)||(7947370-7947531)
chr6 (13-171)||(12889402-12889563)
chr6 (1-103)||(8409207-8409311)
chr6 (1-166)||(14975094-14975251)
chr6 (1-170)||(24097545-24097712)
chr6 (1-170)||(23930127-23930297)
chr6 (10-148)||(14553485-14553626)
chr6 (47-153)||(32579436-32579543)
chr6 (10-138)||(6024206-6024338)
chr6 (42-159)||(33138838-33138957)
chr6 (92-170)||(12892064-12892144)
chr6 (98-170)||(13267788-13267860)
chr6 (14-170)||(32728157-32728314)
chr6 (37-168)||(15865859-15865991)
chr6 (1-159)||(20400631-20400791)
chr6 (93-173)||(383757-383837)
chr6 (108-170)||(6808468-6808530)
chr6 (91-170)||(12885967-12886048)
chr6 (13-169)||(2755422-2755583)
chr6 (29-172)||(17432332-17432485)
chr6 (2-143)||(24734598-24734752)
chr6 (3-170)||(3116129-3116299)
chr6 (15-146)||(22967149-22967287)
chr6 (15-146)||(23821106-23821244)
chr6 (102-172)||(10734903-10734974)
chr6 (60-170)||(9671084-9671197)
chr6 (10-107)||(27855500-27855600)
chr6 (19-97)||(4136590-4136670)
chr6 (1-80)||(12063431-12063510)
chr6 (64-161)||(19340855-19340954)
chr6 (102-160)||(11395827-11395886)
chr6 (1-84)||(19649255-19649338)
chr6 (135-170)||(25997749-25997784)
chr6 (37-100)||(17448324-17448389)
chr6 (15-123)||(32068074-32068182)
chr6 (47-140)||(11849063-11849159)
chr6 (117-166)||(30786378-30786427)
chr6 (1-58)||(33922942-33922999)
chr6 (10-66)||(8417445-8417501)
chr6 (111-170)||(33922857-33922916)
chr6 (107-171)||(16895695-16895761)
chr6 (77-106)||(14341134-14341163)
[»] chr1 (104 HSPs)
chr1 (1-170)||(34725098-34725267)
chr1 (1-170)||(38478282-38478451)
chr1 (1-166)||(45812541-45812706)
chr1 (2-158)||(47214499-47214655)
chr1 (12-170)||(19414437-19414595)
chr1 (1-170)||(30395726-30395899)
chr1 (1-170)||(32632557-32632727)
chr1 (28-170)||(35253187-35253329)
chr1 (1-170)||(14617025-14617196)
chr1 (1-170)||(46247953-46248124)
chr1 (1-170)||(12126837-12127006)
chr1 (1-170)||(18944630-18944804)
chr1 (1-167)||(46991791-46991959)
chr1 (1-170)||(20004090-20004263)
chr1 (10-170)||(27474277-27474438)
chr1 (1-170)||(10668207-10668385)
chr1 (12-170)||(27201645-27201807)
chr1 (10-166)||(6925096-6925254)
chr1 (10-170)||(41319806-41319968)
chr1 (13-148)||(18724567-18724704)
chr1 (10-165)||(23768325-23768482)
chr1 (1-167)||(45402082-45402251)
chr1 (30-170)||(35005139-35005283)
chr1 (12-170)||(6983811-6983969)
chr1 (1-170)||(8197030-8197201)
chr1 (13-148)||(11596512-11596648)
chr1 (13-170)||(35117765-35117927)
chr1 (1-135)||(22930104-22930238)
chr1 (77-171)||(4349703-4349797)
chr1 (1-170)||(18741957-18742132)
chr1 (14-149)||(25468284-25468421)
chr1 (55-170)||(31382214-31382330)
chr1 (13-160)||(2435796-2435946)
chr1 (16-170)||(9939463-9939622)
chr1 (13-167)||(10378738-10378884)
chr1 (14-158)||(19701570-19701717)
chr1 (12-146)||(20036218-20036355)
chr1 (1-168)||(19932755-19932923)
chr1 (14-161)||(44485119-44485267)
chr1 (1-173)||(33222971-33223152)
chr1 (13-170)||(50811938-50812098)
chr1 (1-116)||(4430080-4430197)
chr1 (56-170)||(23796507-23796623)
chr1 (13-166)||(35019229-35019383)
chr1 (12-168)||(15511150-15511311)
chr1 (13-108)||(50760288-50760385)
chr1 (13-125)||(17470390-17470505)
chr1 (77-170)||(1517311-1517404)
chr1 (14-167)||(39214961-39215117)
chr1 (37-158)||(45264411-45264535)
chr1 (77-170)||(42304207-42304302)
chr1 (78-170)||(43768205-43768297)
chr1 (107-170)||(50606498-50606561)
chr1 (46-168)||(22324925-22325049)
chr1 (16-166)||(22327101-22327250)
chr1 (80-148)||(15505632-15505700)
chr1 (14-161)||(23371124-23371271)
chr1 (24-170)||(31272381-31272522)
chr1 (56-161)||(34148969-34149076)
chr1 (25-170)||(19974074-19974221)
chr1 (13-160)||(27136661-27136811)
chr1 (77-170)||(20999850-20999943)
chr1 (1-140)||(25290150-25290300)
chr1 (45-148)||(30682845-30682948)
chr1 (15-170)||(19656105-19656263)
chr1 (77-163)||(31442396-31442483)
chr1 (103-165)||(4587568-4587630)
chr1 (54-148)||(20169111-20169207)
chr1 (13-80)||(2435985-2436052)
chr1 (13-167)||(52910216-52910379)
chr1 (10-100)||(14987989-14988081)
chr1 (1-66)||(34714610-34714675)
chr1 (1-58)||(40424729-40424786)
chr1 (77-133)||(21910686-21910742)
chr1 (1-170)||(24564331-24564492)
chr1 (1-125)||(18335333-18335459)
chr1 (12-93)||(25554800-25554882)
chr1 (13-168)||(34679217-34679378)
chr1 (61-140)||(21723731-21723811)
chr1 (107-170)||(30555210-30555273)
chr1 (89-155)||(4430014-4430080)
chr1 (81-154)||(6358190-6358264)
chr1 (120-170)||(19386576-19386626)
chr1 (77-147)||(20982773-20982843)
chr1 (93-158)||(4249455-4249520)
chr1 (93-158)||(4249779-4249844)
chr1 (93-158)||(4250103-4250168)
chr1 (86-167)||(28894561-28894642)
chr1 (105-170)||(33594131-33594196)
chr1 (1-102)||(18335914-18336017)
chr1 (84-158)||(7074588-7074663)
chr1 (115-170)||(16120819-16120874)
chr1 (2-80)||(10163747-10163825)
chr1 (42-156)||(43207523-43207640)
chr1 (55-101)||(44745854-44745900)
chr1 (5-78)||(22151495-22151568)
chr1 (10-78)||(21723660-21723727)
chr1 (129-168)||(42432228-42432267)
chr1 (96-156)||(43921804-43921866)
chr1 (77-170)||(5549582-5549677)
chr1 (116-170)||(25554742-25554796)
chr1 (77-118)||(46859131-46859173)
chr1 (18-102)||(49722641-49722726)
chr1 (79-123)||(10158266-10158310)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (1-170)||(30543-30712)
[»] chr4 (101 HSPs)
chr4 (1-170)||(20224948-20225117)
chr4 (1-170)||(48598825-48598994)
chr4 (2-170)||(11054148-11054316)
chr4 (1-170)||(47528530-47528699)
chr4 (15-170)||(9832313-9832468)
chr4 (1-170)||(5648223-5648393)
chr4 (1-169)||(6430627-6430796)
chr4 (1-170)||(30639344-30639514)
chr4 (29-168)||(29207900-29208039)
chr4 (10-169)||(40915802-40915962)
chr4 (1-170)||(16408601-16408774)
chr4 (1-170)||(5306660-5306834)
chr4 (1-170)||(23501757-23501924)
chr4 (18-166)||(39077800-39077948)
chr4 (1-170)||(16911526-16911699)
chr4 (10-171)||(44363129-44363294)
chr4 (1-167)||(21646928-21647098)
chr4 (2-169)||(8473621-8473790)
chr4 (17-170)||(54175043-54175200)
chr4 (37-170)||(47443957-47444092)
chr4 (17-148)||(17043416-17043549)
chr4 (13-170)||(35567146-35567305)
chr4 (15-171)||(30690175-30690340)
chr4 (54-170)||(20639658-20639777)
chr4 (23-148)||(25463108-25463235)
chr4 (12-160)||(19027823-19027973)
chr4 (1-170)||(13256399-13256568)
chr4 (13-159)||(54730225-54730376)
chr4 (1-170)||(30352580-30352762)
chr4 (10-170)||(14983807-14983969)
chr4 (1-159)||(30496333-30496491)
chr4 (1-156)||(37494815-37494972)
chr4 (41-170)||(10277757-10277886)
chr4 (61-170)||(25629073-25629184)
chr4 (13-148)||(39029082-39029220)
chr4 (15-171)||(32478791-32478942)
chr4 (13-167)||(54966997-54967151)
chr4 (1-119)||(14590801-14590922)
chr4 (1-170)||(55766466-55766637)
chr4 (20-147)||(7385499-7385628)
chr4 (80-171)||(20225119-20225212)
chr4 (20-157)||(41018807-41018945)
chr4 (15-154)||(30581481-30581624)
chr4 (55-169)||(7909281-7909397)
chr4 (13-134)||(47441566-47441689)
chr4 (16-148)||(49938615-49938746)
chr4 (61-170)||(51865038-51865149)
chr4 (1-170)||(20405057-20405224)
chr4 (99-170)||(38786673-38786744)
chr4 (49-166)||(9987838-9987957)
chr4 (61-148)||(49796822-49796910)
chr4 (1-170)||(55830721-55830892)
chr4 (13-170)||(20908636-20908797)
chr4 (1-167)||(10660368-10660538)
chr4 (1-167)||(10874513-10874683)
chr4 (13-161)||(487135-487294)
chr4 (14-148)||(3580862-3580994)
chr4 (25-170)||(7038041-7038187)
chr4 (49-165)||(21489099-21489218)
chr4 (12-167)||(25343162-25343321)
chr4 (109-170)||(32484307-32484368)
chr4 (108-172)||(38755906-38755970)
chr4 (13-95)||(42164224-42164307)
chr4 (106-172)||(11394923-11394989)
chr4 (106-172)||(11404650-11404716)
chr4 (1-94)||(17315375-17315469)
chr4 (22-146)||(32629293-32629418)
chr4 (96-170)||(33836487-33836563)
chr4 (109-173)||(40553934-40553998)
chr4 (15-170)||(23580208-23580365)
chr4 (77-170)||(36816384-36816478)
chr4 (106-166)||(28494222-28494282)
chr4 (13-94)||(43035224-43035307)
chr4 (108-171)||(25388249-25388312)
chr4 (1-67)||(5313099-5313165)
chr4 (13-167)||(36589720-36589876)
chr4 (77-171)||(48327762-48327858)
chr4 (13-80)||(54640431-54640498)
chr4 (120-170)||(35532077-35532127)
chr4 (109-171)||(44718641-44718703)
chr4 (77-169)||(12711450-12711542)
chr4 (76-161)||(16494258-16494345)
chr4 (16-118)||(49938490-49938594)
chr4 (79-170)||(2813169-2813263)
chr4 (107-170)||(47482850-47482913)
chr4 (119-170)||(56322984-56323035)
chr4 (108-170)||(50555656-50555718)
chr4 (17-107)||(51420553-51420646)
chr4 (13-77)||(12257688-12257752)
chr4 (110-170)||(19027986-19028046)
chr4 (46-130)||(17079691-17079777)
chr4 (13-83)||(41549358-41549428)
chr4 (28-116)||(10379997-10380086)
chr4 (77-129)||(35894502-35894555)
chr4 (12-133)||(44357195-44357319)
chr4 (77-147)||(46082785-46082856)
chr4 (85-127)||(4222071-4222113)
chr4 (1-34)||(18969705-18969738)
chr4 (13-58)||(50856350-50856395)
chr4 (108-156)||(8820581-8820629)
chr4 (113-169)||(12666858-12666914)
[»] chr2 (80 HSPs)
chr2 (1-170)||(21779261-21779430)
chr2 (1-171)||(23397730-23397900)
chr2 (1-170)||(8455316-8455487)
chr2 (1-170)||(9671144-9671314)
chr2 (1-171)||(14530282-14530456)
chr2 (1-170)||(10543662-10543835)
chr2 (1-170)||(25249738-25249908)
chr2 (1-160)||(12023929-12024089)
chr2 (1-170)||(11514400-11514570)
chr2 (28-170)||(10546153-10546298)
chr2 (10-170)||(24200623-24200787)
chr2 (28-170)||(14444720-14444863)
chr2 (10-170)||(17667975-17668137)
chr2 (1-170)||(25079717-25079889)
chr2 (10-170)||(17623537-17623699)
chr2 (1-170)||(17896223-17896395)
chr2 (15-170)||(5841006-5841165)
chr2 (1-134)||(22371021-22371153)
chr2 (1-170)||(27573585-27573755)
chr2 (53-170)||(36871509-36871626)
chr2 (11-170)||(39914306-39914467)
chr2 (12-171)||(40416870-40417031)
chr2 (14-154)||(99281-99421)
chr2 (1-166)||(24859992-24860157)
chr2 (22-170)||(25641487-25641636)
chr2 (1-158)||(19977726-19977885)
chr2 (13-170)||(21377074-21377232)
chr2 (15-133)||(5450263-5450384)
chr2 (5-170)||(26684620-26684789)
chr2 (10-166)||(7214507-7214667)
chr2 (13-167)||(4516354-4516510)
chr2 (17-171)||(17380237-17380391)
chr2 (12-170)||(44643497-44643658)
chr2 (1-171)||(14544027-14544202)
chr2 (13-132)||(23145736-23145857)
chr2 (13-132)||(23557526-23557647)
chr2 (61-170)||(40762234-40762345)
chr2 (12-148)||(32781310-32781448)
chr2 (1-107)||(17705459-17705567)
chr2 (15-158)||(31158451-31158598)
chr2 (13-148)||(33795261-33795398)
chr2 (38-174)||(13245091-13245220)
chr2 (77-170)||(25632551-25632644)
chr2 (52-158)||(30826052-30826158)
chr2 (26-158)||(19614981-19615116)
chr2 (77-157)||(24890453-24890533)
chr2 (13-148)||(44521395-44521532)
chr2 (14-167)||(45235820-45235976)
chr2 (26-135)||(44449418-44449529)
chr2 (110-170)||(34080176-34080236)
chr2 (109-168)||(41409936-41409995)
chr2 (13-109)||(29419946-29420048)
chr2 (46-170)||(15296406-15296533)
chr2 (22-158)||(31821355-31821491)
chr2 (109-169)||(40579750-40579810)
chr2 (10-89)||(44604827-44604907)
chr2 (107-170)||(23488555-23488618)
chr2 (104-157)||(4794871-4794924)
chr2 (61-160)||(17471572-17471675)
chr2 (31-114)||(2003592-2003678)
chr2 (115-175)||(8575975-8576035)
chr2 (110-170)||(34766330-34766390)
chr2 (119-166)||(39189508-39189555)
chr2 (116-170)||(3633708-3633762)
chr2 (14-170)||(4795730-4795890)
chr2 (77-158)||(39499242-39499323)
chr2 (122-170)||(22371199-22371247)
chr2 (13-68)||(35017793-35017849)
chr2 (108-170)||(1289095-1289158)
chr2 (100-167)||(31525771-31525838)
chr2 (100-162)||(31523296-31523358)
chr2 (52-148)||(30864439-30864536)
chr2 (122-166)||(124918-124962)
chr2 (99-154)||(24059012-24059067)
chr2 (37-125)||(12315697-12315786)
chr2 (107-171)||(19185742-19185806)
chr2 (22-80)||(4852306-4852364)
chr2 (2-40)||(27466262-27466300)
chr2 (1-35)||(39189558-39189592)
chr2 (101-129)||(4252656-4252684)
[»] chr5 (79 HSPs)
chr5 (24-170)||(32703411-32703557)
chr5 (1-170)||(8169984-8170153)
chr5 (1-170)||(35710277-35710446)
chr5 (1-170)||(41014283-41014453)
chr5 (1-170)||(38879545-38879718)
chr5 (1-170)||(24448854-24449025)
chr5 (1-170)||(4619104-4619277)
chr5 (1-170)||(43334166-43334339)
chr5 (1-171)||(1565395-1565567)
chr5 (52-167)||(7368413-7368528)
chr5 (12-166)||(27328727-27328885)
chr5 (12-170)||(19142943-19143102)
chr5 (1-170)||(22861669-22861837)
chr5 (46-171)||(13801766-13801895)
chr5 (76-171)||(34154813-34154908)
chr5 (20-170)||(1405170-1405322)
chr5 (1-100)||(37024626-37024725)
chr5 (13-161)||(208936-209086)
chr5 (1-147)||(2838742-2838890)
chr5 (40-161)||(43574609-43574732)
chr5 (2-169)||(12006329-12006500)
chr5 (10-148)||(22600427-22600567)
chr5 (62-171)||(16880646-16880757)
chr5 (2-171)||(30006290-30006461)
chr5 (59-171)||(7097759-7097872)
chr5 (13-170)||(28516433-28516593)
chr5 (21-160)||(1850624-1850764)
chr5 (56-169)||(20135623-20135740)
chr5 (13-161)||(39301099-39301249)
chr5 (95-170)||(16957374-16957449)
chr5 (2-171)||(22187250-22187423)
chr5 (61-170)||(29334419-29334531)
chr5 (14-170)||(3771318-3771474)
chr5 (13-170)||(24903696-24903855)
chr5 (111-170)||(16028624-16028683)
chr5 (29-170)||(42924830-42924977)
chr5 (22-122)||(22907913-22908014)
chr5 (111-172)||(30877562-30877623)
chr5 (52-171)||(5873321-5873441)
chr5 (15-148)||(24323727-24323862)
chr5 (15-148)||(24360351-24360486)
chr5 (55-171)||(12575659-12575779)
chr5 (13-95)||(23974756-23974840)
chr5 (17-161)||(34074573-34074717)
chr5 (35-135)||(41425946-41426048)
chr5 (108-170)||(25622533-25622595)
chr5 (1-109)||(31299596-31299705)
chr5 (85-170)||(11657699-11657785)
chr5 (14-172)||(31694106-31694266)
chr5 (77-160)||(9794388-9794471)
chr5 (100-170)||(10943845-10943914)
chr5 (91-161)||(13774921-13774991)
chr5 (12-133)||(18698586-18698707)
chr5 (86-158)||(12477132-12477205)
chr5 (97-148)||(10306496-10306548)
chr5 (107-167)||(21784335-21784395)
chr5 (32-93)||(22025538-22025601)
chr5 (110-166)||(39801591-39801647)
chr5 (126-169)||(19438757-19438800)
chr5 (119-170)||(32354211-32354262)
chr5 (20-66)||(9794465-9794511)
chr5 (123-168)||(11462913-11462958)
chr5 (15-170)||(24313572-24313732)
chr5 (15-170)||(24355909-24356069)
chr5 (107-158)||(4654427-4654478)
chr5 (17-105)||(10634211-10634301)
chr5 (105-148)||(21542489-21542532)
chr5 (13-56)||(39079882-39079925)
chr5 (1-47)||(19438713-19438759)
chr5 (10-67)||(17419887-17419944)
chr5 (15-156)||(18426017-18426160)
chr5 (95-166)||(39079755-39079827)
chr5 (107-170)||(19093885-19093948)
chr5 (85-157)||(3176770-3176839)
chr5 (14-120)||(4809986-4810094)
chr5 (84-153)||(15141929-15141998)
chr5 (128-169)||(29184062-29184103)
chr5 (12-53)||(31362454-31362495)
chr5 (95-170)||(37225961-37226037)
[»] scaffold0187 (4 HSPs)
scaffold0187 (1-168)||(10052-10219)
scaffold0187 (1-168)||(20380-20547)
scaffold0187 (1-56)||(8909-8964)
scaffold0187 (1-56)||(19237-19292)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (1-171)||(11096-11265)
[»] scaffold0057 (5 HSPs)
scaffold0057 (1-170)||(46795-46966)
scaffold0057 (1-170)||(24772-24938)
scaffold0057 (50-170)||(43672-43793)
scaffold0057 (82-148)||(46729-46796)
scaffold0057 (14-59)||(46996-47041)
[»] scaffold1176 (1 HSPs)
scaffold1176 (12-171)||(1586-1745)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (1-170)||(13024-13194)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (46-170)||(48634-48758)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (1-170)||(10774-10945)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-171)||(58941-59115)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (83-170)||(24133-24220)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (10-125)||(35062-35181)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-170)||(72867-73032)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-119)||(226456-226577)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (5-133)||(4125-4258)
[»] scaffold0954 (1 HSPs)
scaffold0954 (53-171)||(3560-3680)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (28-148)||(23590-23712)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (1-65)||(83839-83903)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (5-80)||(43097-43172)
[»] scaffold0867 (1 HSPs)
scaffold0867 (41-154)||(3685-3798)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (11-80)||(8865-8934)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (15-170)||(24642-24783)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (100-171)||(58629-58699)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (13-120)||(32906-33016)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 80)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 39203502 - 39203806
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39203502 cttggcacaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccttgaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggttgcgtacaa 39203601  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaatgtatagtttctctctagagttccgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39203602 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttaatgtatagtttctctctagagttccgaaa 39203701  T
Q  201 cagttaattttggttgaaattctcaatgaattagtttatcttcatgaaaacttatagaaacaaacagcttatgcaaaagttatttatgtttaccctcctt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39203702 cagttaattttggttgaaattctcaatgaattagtttatcttcatgaaaacttatagaaacaaacagcttatacaaaagttatttatgtttaccctcctt 39203801  T
Q  301 ttcat 305  Q
    |||||    
T  39203802 ttcat 39203806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 1217076 - 1217245
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1217076 cttggcgcaactggtaaagttgtagtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 1217175  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1217176 tacaccaaatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 1217245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22123086 - 22122918
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123086 cttggcgccactggtaaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 22122987  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22122986 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgagagctctagtgcaccgggttgccctt 22122918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 40272983 - 40272812
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40272983 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 40272884  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40272883 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 40272812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7697056 - 7696893
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7697056 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 7696957  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    ||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  7696956 tacaccaaatgg-----ccccttcccggacactgcatatgtgggagctctagtgcaccgggtttccctt 7696893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13730775 - 13730602
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  13730775 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtac 13730676  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13730675 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 13730602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13628948 - 13628790
Alignment:
Q  16 aaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atg 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  13628948 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatg 13628849  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13628848 gtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 13628790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 46421208 - 46421034
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46421208 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 46421109  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct-agtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  46421108 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggtttgcccttt 46421034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Original strand, 26869696 - 26869863
Alignment:
Q  4 ggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaata 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26869696 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctctggtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaata 26869795  T
Q  103 caccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26869796 caccaaatggtgggaccccttgccggaccatgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcccttt 26869863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 29366893 - 29366720
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  29366893 cttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcgtac 29366794  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29366793 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcactgggttgcccttt 29366720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 170
Target Start/End: Original strand, 31592878 - 31593004
Alignment:
Q  44 acgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgg 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31592878 acgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggactccttcccggaccctgcatatgcgg 31592977  T
Q  144 gagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  31592978 gagctctagtgcaccgggttgcccttt 31593004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 22609764 - 22609921
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22609764 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtaacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 22609863  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22609864 gtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 22609921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 52926381 - 52926219
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||    
T  52926381 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-------gtaaggctgcgtacaa 52926289  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  52926288 tacaccaaatggtgggacaccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgcccttt 52926219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8247860 - 8247688
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  8247860 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtac 8247761  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct-agtgcaccgggttgccct 168  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  8247760 aatacaccaataatggtgggactccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcactgggttgccct 8247688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 16735427 - 16735597
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16735427 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaaggctgcgtaca 16735526  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||    
T  16735527 atacaccaaatggtgggaccccttcccggacactgcgtatgcggtagcttcagtgcactgggttgcccttt 16735597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12914206 - 12914035
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  12914206 cttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgaccgaaaggtcacaagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggcggcgtac 12914107  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  12914106 aatacaccaaatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcaatgcaccgggttgcccttt 12914035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 170
Target Start/End: Original strand, 15797271 - 15797377
Alignment:
Q  64 cagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggtt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15797271 cagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggtt 15797370  T
Q  164 gcccttt 170  Q
    |||||||    
T  15797371 gcccttt 15797377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 26573125 - 26573282
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26573125 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaatt 26573224  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||    
T  26573225 ggtgggaccccatcccggaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccaggctgccct 26573282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6411992 - 6411833
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6411992 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgataggtcatgggttcaagtcttgtaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtaca 6411893  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccg 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6411892 atacaccaaatgatgggaccccttcccagaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 6411833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34420802 - 34420643
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34420802 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaccatacaccaaaat 34420703  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  34420702 ggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcacatggctgcccttt 34420643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 170
Target Start/End: Original strand, 516417 - 516569
Alignment:
Q  23 ttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc---aaatggtggga 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||| ||||    
T  516417 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgcacaataaaccaaaaaatggcggga 516516  T
Q  118 ccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  516517 ccccttccccgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 516569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34771461 - 34771364
Alignment:
Q  73 gtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34771461 gtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcccttt 34771364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5173876 - 5173719
Alignment:
Q  16 aaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| | |||||||||  ||||||    
T  5173876 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacaaagtaaggttgcatgcaatacaccaaaaatgg 5173777  T
Q  113 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5173776 tggggccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 5173719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Original strand, 54484730 - 54484848
Alignment:
Q  55 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctcta 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  54484730 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttta 54484829  T
Q  152 gtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||    
T  54484830 gtgcaccgggttgcccttt 54484848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4495831 - 4495676
Alignment:
Q  5 gcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaata 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4495831 gcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctgaaaatagcctattgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaata 4495732  T
Q  103 caccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||            ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4495731 caccaaatggtg------------ggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 4495676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 9607189 - 9607345
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||     
T  9607189 cttggcgcaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatcggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtag 9607288  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagt 153  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9607289 aatacaccaataatgttgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 9607345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10795554 - 10795422
Alignment:
Q  43 cacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcata 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10795554 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgta 10795455  T
Q  139 tgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  10795454 tgcgggagcttcagtgcaccaggttgcccttta 10795422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 170
Target Start/End: Original strand, 14986989 - 14987116
Alignment:
Q  47 ggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcg 142  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14986989 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccattcccggaccttgcatatgcg 14987088  T
Q  143 ggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14987089 ggagctttagtgcaccgggtttcccttt 14987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 53996725 - 53996565
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa- 109  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  53996725 ggtaaatttgttgtcatttgactgaaaggtcacgtgttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcttacaatacaccaaaa 53996626  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  53996625 tggtgggaccccttccctgacactgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 53996565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 30928302 - 30928169
Alignment:
Q  17 aagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 114  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||| |||||||||| ||| |    
T  30928302 aagttcttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgtgtaaaatacaccaattggcg 30928203  T
Q  115 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30928202 ggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagct 30928169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 33926094 - 33926224
Alignment:
Q  26 tcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca-aatggtgggacccctt 123  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33926094 tcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccataatggtgggacccctt 33926193  T
Q  124 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 154  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33926194 cctggaccctgcatatgcgagagctttagtg 33926224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 7942993 - 7943143
Alignment:
Q  18 agttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7942993 agttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcatcttgtctaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacatcaaatggtgg 7943092  T
Q  116 gaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    || ||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7943093 gatccctttccagaccatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgcc 7943143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 45948996 - 45948848
Alignment:
Q  17 aagttgttgtcatgtgactaaa---aggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 111  Q
    |||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  45948996 aagttgttttcatgtgactgaaggaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcatacaatacaccaattg 45948897  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  45948896 gtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 45948848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 49013586 - 49013473
Alignment:
Q  61 aaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 156  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  49013586 aaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatacgcgggagctttagtgca 49013487  T
Q  157 ccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||    
T  49013486 ccgggttgcccttt 49013473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 10870122 - 10870025
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgta 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10870122 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgta 10870025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 25517344 - 25517170
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagt--cctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcg 95  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || | | |   |||| ||||| ||||||||||||||   || | || |||||||    
T  25517344 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggatgatgggacctggaaacatcctcttgtgtaaaaaaacaagatatggctgcg 25517245  T
Q  96 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25517244 tacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgctggagctttagtgcaccgggttgcccttt 25517170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 45786328 - 45786213
Alignment:
Q  60 aaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgc 155  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  45786328 aaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgaatgctggagctttagtgc 45786229  T
Q  156 accgggttgcccttta 171  Q
    ||||||||||||||||    
T  45786228 accgggttgcccttta 45786213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 25944468 - 25944627
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  25944468 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaaccgcctctcgtgtaaaaaactgggcaaggctgagtacaatacaccaaaat 25944567  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  25944568 ggtgggaccccttccctgaccctgcgtatgtgggagctttagcgcaccaggctgcccttt 25944627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 54374488 - 54374357
Alignment:
Q  30 gtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttccc 126  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  54374488 gtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatccaccaaaatggtgggaccccttccc 54374389  T
Q  127 ggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  54374388 ggaccctgcatatgcgggagctttagttcacc 54374357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 353444 - 353351
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  353444 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 170
Target Start/End: Original strand, 26292382 - 26292487
Alignment:
Q  65 agcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26292382 agcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacgatacaccaaatgatgggatcccttcccgaaccctgcatatgcgggaactctagtgcaccgggttg 26292481  T
Q  165 cccttt 170  Q
     |||||    
T  26292482 tccttt 26292487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 45620988 - 45620881
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45620988 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat 45620889  T
Q  110 tggtggga 117  Q
    ||||||||    
T  45620888 tggtggga 45620881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 47624087 - 47624162
Alignment:
Q  60 aaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctg 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47624087 aaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctg 47624162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44403715 - 44403559
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatac-accaaa 109  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||| || |||    
T  44403715 ggtaaagttattgtcacgtggctaaaaggtcacaggttaaagtcctgggaatagcctcttgtgtaaaagacaaggtaaggctgcggagaataccacaaaa 44403616  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||| ||||    
T  44403615 tggtgggaccccttcccggaccctacgtatgctgaagctttagtgcaccgggctgcc 44403559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 45139624 - 45139479
Alignment:
Q  26 tcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggacccc 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  45139624 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggacccc 45139525  T
Q  122 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||    
T  45139524 ttcccaga-cctgcgtatgcgggaact-ttgtgcaccgggctgccctt 45139479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Original strand, 19731000 - 19731155
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| | |    
T  19731000 ggtaaatttgttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgcgtacaatacacctatt 19731099  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  19731100 ggtgggaccctttcccagactctgtgtatgcaggagctttagtgcaccgggctgcc 19731155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 54032705 - 54032571
Alignment:
Q  26 tcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctt 123  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||             
T  54032705 tcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccgaatggtg--------- 54032615  T
Q  124 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
       ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54032614 ---ggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 54032571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 173
Target Start/End: Original strand, 9276313 - 9276422
Alignment:
Q  64 cagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 161  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||| | |||    
T  9276313 cagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt-ggaccctttcccggaccctgcgtatgcgggaacttta-tgcgcaggg 9276410  T
Q  162 ttgccctttaat 173  Q
    ||||||||||||    
T  9276411 ttgccctttaat 9276422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 170
Target Start/End: Original strand, 30452892 - 30452952
Alignment:
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30452892 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30452952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 171
Target Start/End: Original strand, 31831245 - 31831344
Alignment:
Q  61 aaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31831245 aaacagcctcttgtgtaaaatagggtaaggctgcatacaatacaccaaatggt-----------ccggaccctgcatatgcgggtgctctagtgcaccgg 31831333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Original strand, 33235526 - 33235687
Alignment:
Q  11 ctggtaaagttgttgtcatgtgac-taaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacacc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||| || || ||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||     
T  33235526 ctggtaaagttgttgtcatgtgacatgaaaggtcacaagttcaaatcgtgtaaagagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgtgtacaatacact 33235625  T
Q  107 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    ||||||||||||||| || | |||| | | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  33235626 aaatggtgggacccc-tcgcagaccttacgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgccctt 33235687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8411016 - 8410889
Alignment:
Q  21 tgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc 120  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||     
T  8411016 tgttgtcatgggactgaaaggtcaccggttcaggtcctggaaactgcctcgtgtaaaaaacagggtaaggctgctcacaatacaccaactggtgggacct 8410917  T
Q  121 cttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  8410916 cttctcagaccctgcataggcggaagct 8410889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24851367 - 24851301
Alignment:
Q  104 accaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24851367 accaaatggtgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 24851301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 171
Target Start/End: Original strand, 55401195 - 55401335
Alignment:
Q  34 ctaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggtgggaccccttcccggac 130  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  55401195 ctaaaaggccatcggttcaagtcctgtaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtataatacaccaaaatggtgggaccccttctcggac 55401294  T
Q  131 cctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    | | | |||||||||||| |  ||||||||| |||| ||||    
T  55401295 cttccgtatgcgggagcttttttgcaccgggctgcctttta 55401335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Original strand, 28904941 - 28905101
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa---aacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |  ||||| |||||||||||   |||| |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  28904941 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaagtcacatgtttaagtccagggaacagtctcttgtgtaaaataacaaggtaagactgtgtacattacaccaaa 28905040  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |  |||||||| |||||||||||||| || |||||| || ||||| | |||| |||||||||    
T  28905041 t-atgggaccctttcccggaccctgcgtaagcgggaactttagtgtaacgggctgcccttta 28905101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Original strand, 19751576 - 19751731
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    |||||| || |||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| | |    
T  19751576 ggtaaattttttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaatcaaggtaaggttgcgtacaatacacctatt 19751675  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||  |||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  19751676 ggtgggaccctttcccagactttgtgtatgcatgagctttagtgcaccgggctgcc 19751731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Original strand, 24577917 - 24577992
Alignment:
Q  95 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24577917 gtacaatacactaaatggtgggatcctttcccagaccctgcatatacgggagctctagtgcaccggattgcccttt 24577992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Original strand, 24578007 - 24578082
Alignment:
Q  95 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24578007 gtacaatacactaaatggtgggactctttcccagaccctacatatgcgggaactctagtgcaccgggttgcccttt 24578082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43114994 - 43114882
Alignment:
Q  48 gttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaa-ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgga-ccctgcatatgcg 142  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  43114994 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggctacctacaatacaccaaatggtggga-cccttcctggacccctgcgtatgcg 43114896  T
Q  143 ggagctctagtgca 156  Q
    |||||| |||||||    
T  43114895 ggagctttagtgca 43114882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 12525396 - 12525564
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |     
T  12525396 cttggcgcaactggtaaagttgt---catatgactgaaaggtcacaggttcgagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgaag 12525492  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
     | ||   |||||||||||| ||||||  |||||||  ||| ||||||||  | |||||| |||||| ||||    
T  12525493 tacaccaaaaatggtgggacaccttcctagaccctgtgtatacgggagcttcactgcaccaggttgctcttt 12525564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 52428613 - 52428479
Alignment:
Q  37 aaaggtcacgggttcaagtc-ctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgg-------gaccccttccc 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||| |    
T  52428613 aaaggtcacgggtttaagtctctggaagcagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatagtggaaccccaaaccccttctc 52428514  T
Q  127 ggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 161  Q
    ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||    
T  52428513 ggaccctacgtatgtgggagctttagtgcaccggg 52428479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 87
Target Start/End: Original strand, 53062036 - 53062112
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 87  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||    
T  53062036 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtcaaaaacagggta 53062112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 50625064 - 50624953
Alignment:
Q  61 aaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||| || | ||||||| |||||||||    
T  50625064 aaacagcctcttgtgtataaaaaagggtaaggtagcgtacaatacaccatttggtgggacgccttcctgggccctgcgtaagtgggagctttagtgcacc 50624965  T
Q  159 gggttgcccttt 170  Q
    ||| ||||||||    
T  50624964 gggctgcccttt 50624953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 829601 - 829452
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa- 109  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||  | || |||||||| ||  ||||| |||||||| ||||  |||  |||| | ||||||||||||||||||     
T  829601 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaagacc-cgagttcaagttctagaaacaacctcttgtctaaagaacatagtaaagttgcgtacaatacaccaaaa 829503  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  829502 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgg 829452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 29106555 - 29106659
Alignment:
Q  21 tgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggac 118  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||     
T  29106555 tgttgtcatgtggctcaaagatcacgggtacaagtcttgaaaacaacctcttgtgtaaaaaataggataaggttacgtacaatacaccaaattgtgggat 29106654  T
Q  119 ccctt 123  Q
    |||||    
T  29106655 ccctt 29106659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10484671 - 10484611
Alignment:
Q  115 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaatgt 175  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10484671 ggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttatgt 10484611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31904975 - 31904857
Alignment:
Q  54 gtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggga-ccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 150  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | | | | |||||||||| |    
T  31904975 gtcctggaaacagcctattatgtaaaaaacagggtatgactgcgtacaatacaccaaatggtgggacccccttcccagatcttacgtgtgcgggagcttt 31904876  T
Q  151 agtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||||||| || |||||||    
T  31904875 agtgcaccaggctgccctt 31904857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 35417914 - 35418058
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||           |||||    
T  35417914 ggtaaagttgttatcatgtgactgagaggtcacgagttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggg-aagaccgc-----------caaat 35418001  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||| |||||    
T  35418002 ggtgggaccccttcccggaccccgcaaatgcgagagctttagtgcatcgggctgccc 35418058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6242331 - 6242285
Alignment:
Q  124 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6242331 cccggaccctgcatatgcaggagctctagtgcaccgggttgcccttt 6242285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Original strand, 39211992 - 39212081
Alignment:
Q  17 aagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaaggctgcgtacaataca 104  Q
    ||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||    
T  39211992 aagttgtcgttatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaataacctcttgtgtaaataacaaggtaagactgcgtacaataca 39212081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 170
Target Start/End: Original strand, 47624208 - 47624256
Alignment:
Q  122 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47624208 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 47624256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 46170038 - 46169989
Alignment:
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46170038 aataaaccaaatggtaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagct 46169989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 21875006 - 21875111
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgta 97  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  21875006 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactga-------cgggttcaaattctggaaacaacctcttgtgttaaaaaagagggtaaggctgcgta 21875098  T
Q  98 caatacaccaaat 110  Q
    |||||||| ||||    
T  21875099 caatacactaaat 21875111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Original strand, 26782363 - 26782464
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||  |||| ||||||| ||||  || |||||||||||    
T  26782363 tggtaaagttattgtcatgcgattgaaaggtcacggattcaagtccttgaaacaatctcttgtgtaaaaaatagggtaatgctgtataaaatacaccaaa 26782462  T
Q  110 tg 111  Q
    ||    
T  26782463 tg 26782464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 170
Target Start/End: Original strand, 40390357 - 40390398
Alignment:
Q  129 accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40390357 accctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 40390398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14266431 - 14266372
Alignment:
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14266431 tggtgggaccc-ttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 14266372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 40968612 - 40968675
Alignment:
Q  107 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||| || | ||||||||    
T  40968612 aaatggtgagaccccttcctagaccctacatatgcgggagctttagtgcatcgagctgcccttt 40968675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21330339 - 21330273
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgg 143  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  21330339 aaaatagggtaaggccgcatacaatacaccaaattgcgggaccctttcctagaccatgcatatgcgg 21330273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1121382 - 1121286
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 109  Q
    |||| ||||||||  ||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||  || | ||| || |||||||||||||||||||    
T  1121382 taaatttgttgtccggtggctgaaaggtcacgtgtttaagtcctggaaacaacttcttgtgtaagaaataaggtgagactgcgtacaatacaccaaa 1121286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 41
Target Start/End: Original strand, 55400996 - 55401024
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagg 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55400996 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagg 55401024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12670419 - 12670250
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12670419 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 12670320  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12670319 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttacccttt 12670250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30454266 - 30454097
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  30454266 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaggtaaggctgcgtacga 30454167  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454166 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30454097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Original strand, 13160669 - 13160841
Alignment:
Q  4 ggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaata 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13160669 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaata 13160768  T
Q  103 caccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaatgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  13160769 caccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcgccgggttgccctttaatgt 13160841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28817797 - 28817626
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28817797 cttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 28817698  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28817697 aatacacccaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 28817626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 36720760 - 36720931
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36720760 cttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 36720859  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  36720860 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcacccggttgcccttt 36720931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 44530113 - 44530289
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44530113 cttggcgcaactggtaaagttgctgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 44530212  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaatgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44530213 aatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgaccttttatgt 44530289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 35261643 - 35261814
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  35261643 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagccctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtac 35261742  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35261743 aatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 35261814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 6760786 - 6760959
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  6760786 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggcttcgtac 6760885  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6760886 aatacaccaataatggtgggaccccttctcggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 6760959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39461167 - 39460994
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  39461167 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaaggctgcgtac 39461068  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39461067 aatacaccaataatggtgagaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 39460994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 17823540 - 17823712
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||     
T  17823540 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaccaggataagactgcgtaa 17823639  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17823640 aatacaccaaatggtggaaccccttcccgaaccctgcatatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttta 17823712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 45071229 - 45071398
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45071229 cttggcgatactggtaaagttgttgtcatgtgattgtaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtaca 45071328  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45071329 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 45071398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7136700 - 7136527
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7136700 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaccagggtaaggctgcgtac 7136601  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7136600 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttt 7136527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20869667 - 20869523
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20869667 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgtgtacaa 20869568  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 147  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20869567 tacaccaa--ggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 20869523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 29521856 - 29521685
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  29521856 cttggcgcaactgataaagttgttgtcgtgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtttaaaaaacagggtaaggctgcgtac 29521757  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29521756 aatacaccaaatggtgggaacccatcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgctcttt 29521685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 2626483 - 2626657
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-----cagggtaaggctgcg 95  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||    
T  2626483 cttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaacagggtaagactgcg 2626582  T
Q  96 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||    
T  2626583 tacaatacaccaaatgatgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccagattgcccttt 2626657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18164930 - 18164764
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18164930 cttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggttgcgtaca 18164831  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    |||||||||| | || ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18164830 atacaccaaaggatgtgaccatttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 18164764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Original strand, 26954107 - 26954270
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca- 107  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26954107 tggtaaagttgttgtcatgtgattagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 26954206  T
Q  108 -aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
     ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26954207 taatggtgggaccccttcccagacctcgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 26954270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8897926 - 8897764
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacacca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  8897926 actggtaaagttgttgtcatgtgacagcaaggtcacgggttgaagtcctggaaacaaccgcttgtgtaaaaaatagggtaaggctacgtacaatacacca 8897827  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  8897826 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttactgcacccggttgcccttt 8897764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 12625862 - 12626025
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacacc 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||    
T  12625862 actggtaaagttgttgtcgtgtgacttgtaggtcacgggctcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgcatacaatacacc 12625961  T
Q  107 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12625962 aaatggtgggaccccctcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 12626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20284232 - 20284075
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt----aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca- 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    |||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  20284232 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 20284133  T
Q  108 -aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttg 164  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  20284132 taatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 20284075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21070861 - 21070703
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca-----gggtaaggctgcgtacaatacacca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |     |||||||||||||||||||||||||    
T  21070861 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaaagggtaaggctgcgtacaatacacca 21070762  T
Q  108 a--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttg 164  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  21070761 ataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 21070703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24365218 - 24365081
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24365218 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaatgtcacgggttcaagccctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatcagggtaaggctgcgaacaatacaccaaat 24365119  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24365118 ggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagct 24365081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 25250486 - 25250659
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  25250486 cttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacatgttcaagtcctggaaacagcctattgtgtaaaaaatagggtatggctgcgtac 25250585  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25250586 aatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagatttagtgcaccgggttgcccttt 25250659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Original strand, 31457155 - 31457307
Alignment:
Q  19 gttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggga 117  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31457155 gttgttgtcatgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctgtaaacaacctcttgtgtaaaaataggaaaaggctgcgtacaatacatcaaatggtagga 31457254  T
Q  118 ccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31457255 ccccttcccaaaccctgcgtatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttt 31457307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 28407380 - 28407538
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||             
T  28407380 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaagg--------- 28407470  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28407471 ---caccaaatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgcccttt 28407538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 170
Target Start/End: Original strand, 19729366 - 19729475
Alignment:
Q  61 aaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19729366 aaacagtctcttatgtaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatacgggagctctagtgcactgg 19729465  T
Q  161 gttgcccttt 170  Q
     |||||||||    
T  19729466 attgcccttt 19729475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5135418 - 5135290
Alignment:
Q  43 cacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatg 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5135418 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaagagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatg 5135319  T
Q  141 cgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    | |||||| | |||||||||| ||||||||    
T  5135318 caggagct-ttgtgcaccgggctgcccttt 5135290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44781665 - 44781517
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaatacacc--aa 108  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  44781665 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaagttcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 44781566  T
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 157  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  44781565 atgttgggaccccgtcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 44781517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Original strand, 20869941 - 20870060
Alignment:
Q  55 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 150  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  20869941 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccaggaccccgcatatgcgggagcttt 20870040  T
Q  151 agtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20870041 agtgcaccgggttgcccttt 20870060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Original strand, 29877111 - 29877227
Alignment:
Q  54 gtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctcta 151  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  29877111 gtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcgtta 29877210  T
Q  152 gtgcaccgggttgccct 168  Q
    ||||||| || ||||||    
T  29877211 gtgcaccaggctgccct 29877227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8484097 - 8483947
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    |||||||  |||| || |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  8484097 ggtaaagcggttgccacgtgacttaaatgtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggcaaggctgcgtacaatacaccaatt 8483998  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 161  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  8483997 ggtgggaccccatcccagaccctgcgtatgcgggagctttagggcaccggg 8483947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 158
Target Start/End: Original strand, 22598133 - 22598279
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  22598133 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgggttcaaatcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaatacaccaatt 22598232  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||    
T  22598233 ggtgagaccctttcccggaccttgcgtatgcggga-ctttagtgcacc 22598279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 160
Target Start/End: Original strand, 389643 - 389770
Alignment:
Q  37 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt----aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  389643 aaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaccctcttgtgtcaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatgatgggatccctttcctgaccc 389742  T
Q  133 tgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  389743 tgcgtatgcgagagctttagtgcaccgg 389770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 165
Target Start/End: Original strand, 5689640 - 5689761
Alignment:
Q  46 gggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgg 143  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  5689640 gggttcaagtcttgtaaatagcctcttgtgtaaaaagcagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggaaccccttcccgaaccatgcgtatgtgg 5689739  T
Q  144 gagctctagtgcaccgggttgc 165  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  5689740 gagctttagtgcaccggtttgc 5689761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23000365 - 23000227
Alignment:
Q  23 ttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccc 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23000365 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggt--aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacacggtaaggttccatacaatacaccaaatggtgggacccc 23000268  T
Q  122 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |||||||         ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23000267 ttcccgg---------atgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 23000227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Original strand, 26102578 - 26102652
Alignment:
Q  96 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26102578 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcttatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 26102652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 24245415 - 24245562
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||  ||||||||||| || |||||||    
T  24245415 cttggggcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaac-gtctcttatgt--aacagggtaagactacgtacaa 24245511  T
Q  101 tacacc---aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    | ||||   |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24245512 tgcaccaaaaaattgtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagct 24245562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 42083858 - 42083699
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacacc-aaa 109  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| || ||| |||    
T  42083858 ggtaaaattgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatggggcaaggctgcgtacagtataccaaaa 42083759  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || | ||||||| |||||||  ||| |||||||    
T  42083758 tggtgggaccccttcccgaaccctgtgtacgtgggagctttagtgcattgggctgccctt 42083699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 170
Target Start/End: Original strand, 10857852 - 10857964
Alignment:
Q  61 aaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 157  Q
    |||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  10857852 aaaccgcctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgcacaatacaccaattggtgggaccacttcctggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcac 10857951  T
Q  158 cgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||    
T  10857952 cgggttgcccttt 10857964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 171
Target Start/End: Original strand, 16225045 - 16225157
Alignment:
Q  63 acagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16225045 acagcctcttatgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaataatggtgggatcccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 16225144  T
Q  159 gggttgcccttta 171  Q
    |||||| ||||||    
T  16225145 gggttgtccttta 16225157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Original strand, 35105902 - 35106022
Alignment:
Q  16 aaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaatacacca-aatgg 112  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35105902 aaagttgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagagagtgtaaggctgcgtacaatacaccagaatgg 35106001  T
Q  113 tgggaccccttcccggaccct 133  Q
    ||||||| ||||| |||||||    
T  35106002 tgggacctcttcctggaccct 35106022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11001109 - 11000971
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||  |||||||||   || | |||||||| |||||||||||||||    
T  11001109 ggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcgcgggttcaaattctgaaaacaacctactgtgtaaaaaaacaagataaggctgtgtacaatacaccaaa 11001010  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||    
T  11001009 tggtgggacccctacccgaaccctgtttatgcaggagct 11000971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14018128 - 14017990
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa- 109  Q
    ||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||| |||     
T  14018128 ggtaatgttgttgtcacgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtgagactgcgtacaatacactaaat 14018029  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  14018028 tggtgggaccacttcctggaccctgcagatgcggtagct 14017990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23286432 - 23286336
Alignment:
Q  63 acagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23286432 acagcctcttgtgtaaaacagggtaaagctgcgtacaatacaccaaatggtggg------------accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggc 23286345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44742678 - 44742521
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaa 109  Q
    |||||||||||||||  |||| |  ||||||| | |||||||| ||| |||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44742678 ggtaaagttgttgtcgcgtgattgtaaggtcatgagttcaagttctggaaacaatctcctgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaa 44742579  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  44742578 tggtgggaccccttcttggaccctacggatgcgggagcattagtgcaccggggtgccc 44742521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 11748272 - 11748407
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtaca--atacac 105  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||  |||||     
T  11748272 actggtgaaattgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttttgtaaaaagcagggtaagacagcgtacaatatacaa 11748371  T
Q  106 caaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgc 141  Q
     ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  11748372 aaaatggtaggaccccttcccgaatcctgcatatgc 11748407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17251001 - 17250879
Alignment:
Q  48 gttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgg 143  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||||  |    
T  17251001 gttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacaggttaaggcagcgtacaatacaccaataatggtgggaccctttcccgaaccctgcgtatgaag 17250902  T
Q  144 gagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||    
T  17250901 gagctttagtgca-cgggttgccc 17250879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 163
Target Start/End: Original strand, 26457776 - 26457855
Alignment:
Q  82 agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggtt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26457776 agggtaaggctgcgtacaatacaccaattggtgggacccct--cctgaccttgcgtatgagggagctttagtgcaccgggtt 26457855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 170
Target Start/End: Original strand, 16013511 - 16013591
Alignment:
Q  92 tgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16013511 tgcgtacaatacactaaaaatggtgcgaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgggttgtccttt 16013591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30962929 - 30962865
Alignment:
Q  16 aaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 80  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30962929 aaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgacttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 30962865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 126
Target Start/End: Original strand, 43942347 - 43942417
Alignment:
Q  60 aaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttccc 126  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43942347 aaaacagcctcttatgtcaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttccc 43942417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 169
Target Start/End: Original strand, 27507985 - 27508044
Alignment:
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27507985 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgtcctt 27508044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35107374 - 35107311
Alignment:
Q  107 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  35107374 aaatggtgggaccccttcccggacgctgtgtatgcggaagctttagtgcaccgggttgcccttt 35107311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 40605075 - 40604906
Alignment:
Q  2 ttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtaca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | | | | ||||||||||| || |||||  || |||||||||| |  || ||||| ||||||||    
T  40605075 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggatgattatgggttcaagtcatggaaacaatcttttgtgtaaaaaattggataaggttgcgtaca 40604976  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||| ||||| ||| | |||||||   ||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  40604975 atacactaaatgatgg-atcccttccgaaaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgaattgcccttt 40604906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 27468141 - 27468092
Alignment:
Q  121 cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27468141 cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 27468092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 171
Target Start/End: Original strand, 33866957 - 33867088
Alignment:
Q  45 cgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatat 139  Q
    |||||||||||||| |||||| | | ||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||  |||  |||||  ||  ||||||| ||||||| |||    
T  33866957 cgggttcaagtcctaaaaacaactttttgtgtaaaaaagcagggtaagactgcatacaatacataaaaaatggtgacacttcttcccgaaccctgcgtat 33867056  T
Q  140 gcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  33867057 gcagaagctttagtgcaccgggttgcccttta 33867088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 36486627 - 36486567
Alignment:
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  36486627 atggtgggacctcttcccggaccttgcgtatgcaggagctttagtgccccgggttgccctt 36486567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 30231420 - 30231344
Alignment:
Q  81 cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 156  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||| ||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  30231420 caggataaggctgcgtacaatataccaaaatggtgggacccttacccgaaccctccatacgtgggagctttagtgca 30231344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Original strand, 18595918 - 18595969
Alignment:
Q  115 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  18595918 ggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagttttagtgcatcgggttgcc 18595969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 110
Target Start/End: Original strand, 36918102 - 36918199
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    |||| ||||||| |||  ||| |||||||||  |||||||| ||| |||||   |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36918102 taaaattgttgttatggaactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaacaatttcttatgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaat 36918199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 30962815 - 30962770
Alignment:
Q  126 cggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  30962815 cggaccctgcgtatgcgggagatttagtgaaccgggttgcccttta 30962770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 141
Target Start/End: Original strand, 12483584 - 12483616
Alignment:
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12483584 atggtgggaccccttcccggaccctacatatgc 12483616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 31454152 - 31454216
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaaca 65  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  31454152 cttggcgcaaccggtatagttgttgtcatgtggttgaaaggtcacatgttcatgtcctgaaaaca 31454216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 170
Target Start/End: Original strand, 40444845 - 40444901
Alignment:
Q  114 gggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  40444845 gggaccccttgccggaccctgcgtatgttggagctttagtgcaccgagctgcccttt 40444901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 84)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21172178 - 21172009
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172178 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 21172079  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172078 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 21172009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 32758225 - 32758394
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32758225 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgtgtacaa 32758324  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32758325 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 32758394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10693242 - 10693071
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10693242 cttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagagggtaaggctgcgtacaa 10693143  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10693142 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcactgggttgccctttaa 10693071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 48735292 - 48735121
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcct-gaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48735292 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttggaaacaacctcttgtgtaaaacacggtaaggctgcgtaca 48735193  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48735192 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 48735121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42391251 - 42391100
Alignment:
Q  19 gttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggac 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42391251 gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcttcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggac 42391152  T
Q  119 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42391151 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 42391100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 2541191 - 2541017
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgacta-aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2541191 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 2541092  T
Q  98 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 172  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2541091 ctatacaccaaatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtttccctttaa 2541017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 42798633 - 42798804
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  42798633 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtac 42798732  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42798733 aatacaccaaatggtgggaccctttcccggaccctgcatatgcgggagctatagtgcatcgggttgcccttt 42798804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 42476846 - 42477005
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42476846 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggattcaagttctggaaacagtctcttgtgtaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 42476945  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42476946 tggtgggaccccttcctaggctctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 42477005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 42805488 - 42805661
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  42805488 cttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtac 42805587  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42805588 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 42805661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Original strand, 11741774 - 11741927
Alignment:
Q  16 aaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11741774 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacagcttctagtgtaaaatagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgg 11741873  T
Q  116 gaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11741874 gatcccttcccggattctgcacatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 11741927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 27629598 - 27629769
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||     
T  27629598 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatttgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtaa 27629697  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  27629698 aatacaccaaatggtgggaccccttcccgggccctgcatatgcggtagcttcagtgcaccgggttgcccttt 27629769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 47078024 - 47077859
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||| | |||||||||    
T  47078024 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaatagagtaaagttgcgtacaa 47077925  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47077924 tacacaaaatggtgggaccccttcccaaaccctacatatgcgggagctctagtgcaccggattgcc 47077859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11617756 - 11617589
Alignment:
Q  4 ggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaat 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  11617756 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaat 11617657  T
Q  102 acaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  11617656 acaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggacctttagtgcaccgggttgccctt 11617589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 47716423 - 47716597
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47716423 cttggcacaactggaaaagttgttgccatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 47716522  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47716523 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttggtgcaccgggttgcccttta 47716597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19427059 - 19426890
Alignment:
Q  2 ttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||    
T  19427059 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtaca 19426960  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  19426959 atacaccaaatggtggga-cccttctcggaccctgcatatgcgagagcttcagtgcaccgggttgcccttt 19426890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31591242 - 31591109
Alignment:
Q  37 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgca 136  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31591242 aaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaacagagtaaggctgcgtacaatacaataaatggtgggaccccttcccggaccttgca 31591143  T
Q  137 tatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31591142 tatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 31591109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 33872070 - 33871909
Alignment:
Q  11 ctggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33872070 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaa 33871971  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  33871970 tggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgagagctttagtgcaccaggttgcctttta 33871909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 43557436 - 43557610
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  43557436 cttgccgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaaggctgcgtac 43557535  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc-tctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43557536 aatacaccaataatggtgggaccccctcccggactctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttt 43557610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35334985 - 35334818
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  35334985 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagtctcgtgtaaaaaacagggtaagactgtgtacaa 35334886  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  35334885 tacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggtttccct 35334818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34626374 - 34626208
Alignment:
Q  5 gcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatac 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34626374 gcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggccacagattcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaacagggtaaggctgcgttcaatac 34626275  T
Q  104 accaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  34626274 accaaatggtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagttcatcgggttgcccttt 34626208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 40463841 - 40464011
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  40463841 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatagaaacagtctcttgtgtaaaaactgggtaaggctgcgtata 40463940  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  40463941 atacaccaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgagttgcccttt 40464011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 19265791 - 19265948
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 111  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19265791 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggatacagccgcttgtgtaaaaagagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 19265890  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19265891 gtgggaccccttcccgga-cctacatatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 19265948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 170
Target Start/End: Original strand, 7879639 - 7879773
Alignment:
Q  38 aaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgc 135  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7879639 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgc 7879738  T
Q  136 atatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7879739 gtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttt 7879773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 46354158 - 46354302
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46354158 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 46354257  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgc 141  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46354258 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 46354302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 148
Target Start/End: Original strand, 13805077 - 13805214
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca-gggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13805077 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtaacgggttcaagtcctggaaatagcctctggtgtaaaacaggggtaaggctgtgtacaatacaccaaat 13805176  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13805177 ggtgggaccacttcctggaccctgcgtatgcgggagct 13805214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23419833 - 23419673
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23419833 ggtaaagttgctgtcatgtgactaaaaggtcacaggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 23419734  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| | |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  23419733 ggtgggaccccttcctagaccttgcgtgtgcgggggctttagtgcatcgggctgcccttta 23419673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Original strand, 19266426 - 19266563
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19266426 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtgggttcaagtcctgaaaatagccacttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 19266525  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19266526 tgtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagct 19266563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 22699141 - 22698966
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22699141 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttatgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 22699042  T
Q  99 aatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22699041 aatacaccaaaaatggtgggacccttttcccggaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 22698966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2663102 - 2662946
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2663102 cttggcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgga--gtcataggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatagggtaaggctgcgtacaa 2663005  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2663004 tacaccaaatggtggga-cccttttcagaccctgcatatgcgggagctctagcgcaccgg 2662946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18512587 - 18512455
Alignment:
Q  37 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgc 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18512587 aaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaatagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgc 18512488  T
Q  136 atatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
     |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  18512487 gtatgcgggagctttggtgcactgggttgccct 18512455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 29907393 - 29907552
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgt--catgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-a 107  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||| |    
T  29907393 ggtaaagttgttgtatcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatagtgtaaggctgcgttcaatacaccaa 29907492  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29907493 aatggtgggaccccatcccggaccctg--tatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 29907552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 169
Target Start/End: Original strand, 18747472 - 18747621
Alignment:
Q  23 ttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacc 119  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18747472 ttgtcacgtgactgaaaggtcacgggatcaagtcttggaaacagccttttgtgtaaaaaagcagggtaaggctgcgtataatacaccaattggtgggacc 18747571  T
Q  120 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18747572 ccttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggctgccctt 18747621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28362304 - 28362155
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  28362304 ggtaaagttgttgtcatgtggctgaaaggtcacaggttcaagtcctagaaactgcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 28362205  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 161  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  28362204 ggtgggaccccttcccagaccttgcatatgtgggagct-ttgtgcaccggg 28362155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 48123643 - 48123508
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  48123643 ggtaaagttgttatcatgtgtctgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacagggtaaaactgcatacaatacaccaaat 48123544  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 146  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  48123543 ggtgggacccctttctggaccatgcatatgcgggag 48123508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14099165 - 14099030
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14099165 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacaccaaat 14099066  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  14099065 ggtgggaccccttcccgaaccctacgtatgcaggag 14099030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14409182 - 14409047
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14409182 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacaccaaat 14409083  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  14409082 ggtgggaccccttcccgaaccctacgtatgcaggag 14409047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14732993 - 14732821
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcct--cttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||  | |||  |||||||||||||||||||| |    
T  14732993 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcccatgtaaaaaacagggtaaggctgcgt-c 14732895  T
Q  99 aatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||  ||||||||  || |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  14732894 aatacaccaaaaatggtgaaactccttcccgaaccctgtttatgcgggagctttagtgcaccggattgtccttt 14732821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32233286 - 32233135
Alignment:
Q  20 ttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggac 118  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||     
T  32233286 ttgttgtcacctgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggcagcgtatattacaccaaatggtgggat 32233187  T
Q  119 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
     |||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  32233186 tccttcccaaaccctgcatatgagggagcttcagtgcaccgggctgcccttt 32233135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38262340 - 38262196
Alignment:
Q  28 atgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcc 125  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |   ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38262340 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatatggtaatgttgcatacaatacaccaaatgatgggaccccttcc 38262241  T
Q  126 cggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38262240 cgaacactgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 38262196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 16341254 - 16341413
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  16341254 ggtaaagttgttatcatgtatttgaaaggtcacgggttcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctacgtacaatacaccaaaa 16341353  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    ||||||| || |||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  16341354 tggtgggccctcttcccggacctatcatatgcgggagctttggtgcaccgggctgccctt 16341413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 162
Target Start/End: Original strand, 38604546 - 38604654
Alignment:
Q  56 cctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct-agt 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  38604546 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgagacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttaagt 38604645  T
Q  154 gcaccgggt 162  Q
    |||||||||    
T  38604646 gcaccgggt 38604654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 8149117 - 8148989
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgta 97  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||   |||| ||||||||| ||||||    
T  8149117 cttggcacaactggtaatgttgttgtcatgtgactgcaaagtcacgagttcaagtcctgaaaactacctcttgtgttaaaaaatagggtaaggttgcgta 8149018  T
Q  98 caatacaccaaatggtgggaccccttccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8149017 caatacaccaaatggtgggaccccttccc 8148989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 28078300 - 28078154
Alignment:
Q  3 tggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaat 101  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||||||||| ||| | ||||    
T  28078300 tggcgcaactcgtgaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagtctcgtgtaaaaaaacagggtaaggttgcatgcaat 28078201  T
Q  102 acaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  28078200 acaccaaatggtgggaccccttcccgaatcctgcatatgcgagagct 28078154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35787378 - 35787269
Alignment:
Q  62 aacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||    
T  35787378 aacagcctcttgtgtaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcaatgcaccgg 35787279  T
Q  161 gttgcccttt 170  Q
    ||||||||||    
T  35787278 gttgcccttt 35787269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 158
Target Start/End: Original strand, 39123865 - 39124018
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggt----aaggctgcgtacaatacacc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||||||    ||||||||||| ||||||||    
T  39123865 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaacgacacgggttcaagtcctagaaacggtctcttgtgtaaaaacagggtagggaaggctgcgtaaaatacacc 39123964  T
Q  107 --aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||    
T  39123965 aaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgagggagctttggtgcacc 39124018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 27889399 - 27889316
Alignment:
Q  87 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  27889399 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtacaccgggttgcccttt 27889316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 145
Target Start/End: Original strand, 7644931 - 7645066
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aa 108  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  7644931 tggtaaatttgttgtaacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagatagcgtacaatacaccaaa 7645030  T
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggga 145  Q
    || |||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  7645031 attgtgggacccctt-cctgaccctgcgtatgcggga 7645066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 18326998 - 18327091
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctg 93  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18326998 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaggtcacgggttcaagtcccggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctg 18327091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 161
Target Start/End: Original strand, 21566439 - 21566562
Alignment:
Q  41 gtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcat 137  Q
    ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21566439 gtcacaggttcaagtcttggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagaggaagactgcgtacaatacaccaaaatggtaggaccccttcccgaaccctgcat 21566538  T
Q  138 atgcgggagctctagtgcaccggg 161  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  21566539 atgcgggagctttagtgcaccggg 21566562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 12473268 - 12473378
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  12473268 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtatctgaaaggtcatgggttcaagtcctgcaaacaacctcttgtgtcaaaaacagggtaaggatgcgtac 12473367  T
Q  99 aatacaccaaa 109  Q
    |||||||||||    
T  12473368 aatacaccaaa 12473378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3469338 - 3469176
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt----aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-- 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||  |||||  |||||||||    ||||||||||| || |||||||||||||||      
T  3469338 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagactcaagtcctagaaacattctcttgtgtaaaaaaaacagggtacggttgcgtacaatacaccaa 3469239  T
Q  107 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  3469238 aaatggcgggaccccttcctagaccctgtgtatgcgggagctttagtgcgctgggttgccctt 3469176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Original strand, 6736867 - 6736969
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 112  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6736867 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcaaaacaacctcttgtataaaaacaaggtaagactgcatacaatacaccaaatgg 6736966  T
Q  113 tgg 115  Q
    |||    
T  6736967 tgg 6736969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 42496006 - 42495916
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagg 90  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  42496006 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaacagggtaagg 42495916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 166
Target Start/End: Original strand, 1408469 - 1408588
Alignment:
Q  49 ttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 146  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |     
T  1408469 ttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacagcaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcagaat 1408568  T
Q  147 ctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    || |||| |||||| |||||    
T  1408569 ctttagttcaccggattgcc 1408588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5180328 - 5180218
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||    
T  5180328 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaacttctggaaacagcctcttgtgtcaaaaacagggtaagactgtgtac 5180229  T
Q  99 aatacaccaaa 109  Q
    || ||||||||    
T  5180228 aacacaccaaa 5180218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 171
Target Start/End: Original strand, 23231573 - 23231693
Alignment:
Q  53 agtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 150  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |    
T  23231573 agtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaatgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagcttt 23231672  T
Q  151 agtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    ||||||||| ||| |||||||    
T  23231673 agtgcaccgagtttcccttta 23231693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 44123780 - 44123644
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 111  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |  ||||||||| ||     
T  44123780 ggtaaagttggtgtcatgtgactgaaagattacgggttcaagtactggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggttgcatgaaatacaccatata 44123681  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
     |||||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||    
T  44123680 atgggacccgttctcggacactgcgtatgcaggagct 44123644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 7794673 - 7794598
Alignment:
Q  5 gcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 80  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7794673 gcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttatgtaaaa 7794598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 7193049 - 7193127
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa 79  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  7193049 cttggcgtaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaa 7193127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42102044 - 42101899
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctctt--gtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa- 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||  ||||||||| ||| | |||     
T  42102044 ggtaaagttgttgtcacgtgactggaaggtcaaaagttcaagtcctggaaacagcctcttccgtaaaaaacagggtaacactgcgtacagtactctaaag 42101945  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgc 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  42101944 tggtgggaccctttcccggaccctgcgtatccggcagctttagtgc 42101899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45019010 - 45018923
Alignment:
Q  87 aaggctgcgtacaatacaccaaa----tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  45019010 aaggctgcgtacaatataccaaaaaactggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 45018923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1424080 - 1423972
Alignment:
Q  2 ttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  1424080 ttggcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacggattcaaatcctggaaacagtctgttgtgtaaaaaacagggtaatgctgcataca 1423981  T
Q  100 atacaccaa 108  Q
     ||||||||    
T  1423980 ctacaccaa 1423972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 148
Target Start/End: Original strand, 35203439 - 35203554
Alignment:
Q  37 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| | || |    
T  35203439 aaaggtcacgggttcaagtcctggaaacattctcttgtgtaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaaatggtgggatcccttcctgaactc 35203538  T
Q  133 tgcatatgcgggagct 148  Q
    | | ||||||||||||    
T  35203539 tacgtatgcgggagct 35203554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39093532 - 39093439
Alignment:
Q  78 aaacagggtaaggctgcgtacaatacacca-aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  39093532 aaacagggtaagactgtgtacaatacaccataatagtgggaacccttcccggaacttgcatatgcagaagctttagtgcaccgggctgcccttt 39093439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 21447554 - 21447633
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 80  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21447554 cttggcgcaactgataaatttgttgtcatgtaattggaaggtcacggattcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaa 21447633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 25198686 - 25198861
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaa---gtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgc 94  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||   ||| || |||||| || ||||||||||   || |||||| | ||    
T  25198686 cttggcgtaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaagatcatgggatcaaaaagtcttggaaacagtcttttgtgtaaaaaaacaaggtaagaccgc 25198785  T
Q  95 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25198786 gtataatgcactaaatggtaggatcccttcccagacccttcgtatgtgagagctttagtgcaccgggttgcacttt 25198861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15108527 - 15108441
Alignment:
Q  41 gtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttccc 126  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  15108527 gtcacgagttcaagtcctggaaacagtttcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacatcaaatagtgggatcccttccc 15108441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23619071 - 23618977
Alignment:
Q  76 taaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23619071 taaaacagagtaagcttgtgtacaatacatcaaatggtgggaccccttcgcagaccttgcgtttgcaggagctttagtgcagcgggttgcccttt 23618977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 145
Target Start/End: Original strand, 33500556 - 33500625
Alignment:
Q  78 aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggga 145  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33500556 aaacagggtaagactgcgtactatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggga 33500625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 22065563 - 22065720
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||| |||| | ||||||||  || ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| | |||||    
T  22065563 tggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaagtcatgagttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaaatagggtaaagctgcatacaataaagcaaat 22065662  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
     ||| |||||||||||| ||  ||  ||||| |||| | ||||| |||||| ||||||    
T  22065663 agtgagaccccttcccgaactatgtgtatgcaggagttttagtgtaccgggctgccct 22065720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23066018 - 23065925
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| | |||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  23066018 aaaacaggataaagttgcgtacaatacaccatatgatgggatccctttccgaatcctgcatatgtgggagctttggtgcaccggattgcccttt 23065925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36267900 - 36267827
Alignment:
Q  88 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  36267900 aggctgcgtacaatacaccaaatggttggacccatttcccgaaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgg 36267827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21139851 - 21139761
Alignment:
Q  68 ctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 157  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||| ||||||||    
T  21139851 ctcttgtgtaaaaacagagtaaggttggatacagtacaccaaatggtgggaccccttcccgaactctgtgtatgcggaagctttagtgcac 21139761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11458421 - 11458267
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatg 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||  | |||  ||||||  |||||||| |||| || ||||| |||||    
T  11458421 taaagttattgtcatgtgactaaaaggtcacgagttcaagt-ctagaaatagcctactatgttgaaaacaaagtaaggcttcgtaaaacacaccaaaatg 11458323  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    ||||| || |||  | |||||||| |||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  11458322 gtggggcctctttgcagaccctgcgtatgcaagagctttagtgcaccgggctgccc 11458267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13792237 - 13792150
Alignment:
Q  84 ggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| | ||||||||    
T  13792237 ggtaagactgcatacaatacacccaaatggcgggaccccttctcgaaccctgcgtatgctggagcttttgtgcaccgagctgcccttt 13792150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 170
Target Start/End: Original strand, 36602535 - 36602582
Alignment:
Q  123 tcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36602535 tcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 36602582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17048909 - 17048831
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 154  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||  |||||| |||||    
T  17048909 aaaacagggtaaggttacgtacaatacaccaaaatggtggaaccccttcccggaacttgcttatgtaggagctttagtg 17048831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 29140531 - 29140487
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcac 45  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29140531 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcac 29140487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42495913 - 42495865
Alignment:
Q  119 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  42495913 cccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccccgttgccc 42495865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 43852026 - 43852111
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaataca 104  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43852026 ggtaaagttgttgtcatgtga-------gtcacgggttcaagtcctgaaaa-aacctcttctgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaataca 43852111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 45811919 - 45811981
Alignment:
Q  107 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45811919 aaatggtgggatccctttccagaccctgcttatgcaggagctttagtgca-cgggttgcccttt 45811981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 173
Target Start/End: Original strand, 11888414 - 11888475
Alignment:
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaat 173  Q
    |||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  11888414 gtgggacccctttctggaccctgtgtatgcaggagcttcagtgcactgggttgccctttaat 11888475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 168
Target Start/End: Original strand, 27697452 - 27697572
Alignment:
Q  52 aagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggt--gggacccctt-cccggaccctgcatatgcggga 145  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  27697452 aagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggcaaggctgtgt--aatacaccaaaatggtgggggaccctttccccagaccctgcgtatgcggga 27697549  T
Q  146 gctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    |||  | ||||||||| ||||||    
T  27697550 gcttaaatgcaccgggatgccct 27697572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 1524345 - 1524281
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta 77  Q
    |||||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  1524345 ggtaaagtggttgtcacgagactgaaaggtcacaagttcaagtcttataaacagcctcttgtgta 1524281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 1346928 - 1347097
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1346928 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccacttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 1347027  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1347028 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 1347097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1354926 - 1354757
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1354926 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 1354827  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1354826 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 1354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12222088 - 12221914
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12222088 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 12221989  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc-tctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12221988 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttt 12221914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 29356009 - 29355855
Alignment:
Q  20 ttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgg 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29356009 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgg 29355910  T
Q  116 gaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29355909 gaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 29355855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Original strand, 26097178 - 26097293
Alignment:
Q  55 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097178 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgaagggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 26097277  T
Q  155 caccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||    
T  26097278 caccgggttgcccttt 26097293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 9161099 - 9161259
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||    
T  9161099 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagagtaaggctgcgtacaatacatcaataa 9161198  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  9161199 tggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgcccttt 9161259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2166579 - 2166410
Alignment:
Q  5 gcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaata 102  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  2166579 gcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaata 2166480  T
Q  103 cacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2166479 caccaataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 2166410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2178212 - 2178043
Alignment:
Q  5 gcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaata 102  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  2178212 gcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaata 2178113  T
Q  103 cacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2178112 caccaataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 2178043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Original strand, 25557743 - 25557858
Alignment:
Q  55 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25557743 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgaaggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 25557842  T
Q  155 caccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||    
T  25557843 caccgggttgcccttt 25557858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Original strand, 28007604 - 28007760
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgact--aaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  28007604 taaagttgttgtcatgtgacatgaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaagagcctcttgtgtaaaacagggtcaggctgcgtacaatacaccaaatgc 28007703  T
Q  113 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  28007704 tgggaccccttccc-taacctccatatgcggaagctctagtgcaccggattacccttt 28007760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3815248 - 3815084
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  |||| | |||| | ||||||||    
T  3815248 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacagactattgtgtaaaaaatatggtacgactgcgtac 3815149  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggtt 163  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3815148 aatacaccaaatggtgggaccctttcccgaaccctacgtatgcggaagctttagtgcaccgggtt 3815084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15866208 - 15866041
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||||||     
T  15866208 cttggcccaactggtaaagttgttggcatgtgattgaaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttaagtaaaaaacagggtaaagctgcgta- 15866110  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| | ||||||||    
T  15866109 -atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtttgcgggatctatagtgcactgagttgccct 15866041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23240971 - 23240826
Alignment:
Q  23 ttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccct 122  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23240971 ttgtcacgtgactgaaaggtcacaggtgcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagtttgcgtacaatataccaattggtgggacccct 23240872  T
Q  123 tcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    ||  ||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  23240871 tctaggacaatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggctgccct 23240826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18277343 - 18277193
Alignment:
Q  22 gttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacc 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  18277343 gttgtcctgtgactaaaaggtcacgggttcaaatcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgagtacagaacaccaaatggtgggacc 18277244  T
Q  120 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||  ||| || | |||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  18277243 ccttcctagactctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgtccttt 18277193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 13905138 - 13905015
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13905138 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggctcaagtcctgaaaacgacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaattcaccaaat 13905039  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgc 135  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||    
T  13905038 ggt-ggaccctttcccgaaccctgc 13905015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 1941819 - 1941990
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1941819 cttggtgcaactggtaaagttgttgtcatctgactggaaggtcgcggattgaagtcatgtaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 1941918  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||| | ||  |||||||||| | | |||||||| ||||||||||    
T  1941919 aatacaccgaatggtgggaccccatcctggatcttgtgtatgcgggagtttttgtgcaccgtgttgcccttt 1941990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7947531 - 7947370
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa- 109  Q
    |||||||||| |||   |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7947531 ggtaaagttggtgttgcgtgactgaaaggtcaccggttcaactcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaccagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaa 7947432  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  7947431 tggtgggcccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcacttggctgcccttta 7947370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Original strand, 12889402 - 12889563
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaa 109  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  12889402 ggtaaagttgttgtcacgtgagtgaaaggtcacaggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgttaaaaacagggcaaggctgcatacaatacacctaaa 12889501  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
     | ||||||||||| |||||||||   | || ||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  12889502 cgatgggacccctttccggaccctctgtgtgtgggagctttagtgcatcgggctgcccttta 12889563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 8409207 - 8409311
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8409207 cttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctggaaactgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 8409306  T
Q  99 aatac 103  Q
    |||||    
T  8409307 aatac 8409311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14975251 - 14975094
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    ||||       |||    
T  14975251 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaa---caagg-------caa 14975162  T
Q  101 tacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14975161 tacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagttttagtgcaccgggttgcc 14975094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 24097545 - 24097712
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||  || ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||    
T  24097545 cttggcacaactggtaaaattgatgtcatgttactgaaaggtcacgagtttaagtcctcgaaccagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcttac 24097644  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  || |||||||||||    
T  24097645 aa----ccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgtcccaggttgcccttt 24097712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23930297 - 23930127
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttc-aagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| |||  ||||| |||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||||||||| |    |  | ||||||||    
T  23930297 cttggcgcaactcataaagatgttgtcatgtgtctcaaaggtcacgagttccaagtcatggaaacagtctcatgtgtaaaaaacaagatagttgcgtaca 23930198  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23930197 atacaccagatggtgggaccccttcacggaccctgcttatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 23930127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Original strand, 14553485 - 14553626
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  14553485 actggtaaagttgttgtcatgtgact-aaaggtcacaggttcaagtcctggaaatagcttcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtataatacacca 14553583  T
Q  108 aa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    ||  |||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||    
T  14553584 aaactggtgggaccccttcgtagaccctgtgtatgcgggagct 14553626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 153
Target Start/End: Original strand, 32579436 - 32579543
Alignment:
Q  47 ggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggga 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32579436 ggttcaagtcctggaaacagcctctggtataaaaatacggtaagcctgcgtacaataccccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcggga 32579535  T
Q  146 gctctagt 153  Q
    ||| ||||    
T  32579536 gctttagt 32579543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 138
Target Start/End: Original strand, 6024206 - 6024338
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  6024206 actggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacggtttcaaatcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaagactgcgtacaatacacca 6024305  T
Q  108 --aatggtgggaccccttcccggaccctgcata 138  Q
      |||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  6024306 ataatgatgggacctcttcccggaccccgcata 6024338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 159
Target Start/End: Original strand, 33138838 - 33138957
Alignment:
Q  42 tcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatat 139  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  33138838 tcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtataaaaaacagagtaaggccgcgtacaatacaccaaatggtgggacccttttccggaccctgtgtat 33138937  T
Q  140 gcgggagctctagtgcaccg 159  Q
    || | |||| ||||||||||    
T  33138938 gcagtagctttagtgcaccg 33138957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 170
Target Start/End: Original strand, 12892064 - 12892144
Alignment:
Q  92 tgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12892064 tgcgtataatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 12892144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 170
Target Start/End: Original strand, 13267788 - 13267860
Alignment:
Q  98 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13267788 caatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttt 13267860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32728314 - 32728157
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  || ||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  32728314 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagattcaagttttggaaacaacctcttatgtaaaaaacagggtaagactgtgtacaatataccaaata 32728215  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    || || ||| ||||| |||||| | ||||||||| || |||||||||  ||||||||||    
T  32728214 gt-ggtccctttcccagaccctacgtatgcgggaactttagtgcaccatgttgcccttt 32728157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15865991 - 15865859
Alignment:
Q  37 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccct 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||   |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15865991 aaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttacgtaaaaaaacagggtaaagctgcgta--atacaccaaatggtgggaccccttcctggaccct 15865894  T
Q  134 gcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    || | |||| || || |||||||| | ||||||||    
T  15865893 gcgtttgcgtgatctatagtgcactgagttgccct 15865859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 20400631 - 20400791
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  || |||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  20400631 cttggcgcaattggtatagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagttatggaaacaatctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 20400730  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccg 159  Q
    | ||||| |||| | ||||||| || ||| ||||| | ||||| | | || ||||||||||    
T  20400731 agtacactaaatagcgggacccttttccgaaccctacgtatgcagaaactttagtgcaccg 20400791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 383837 - 383757
Alignment:
Q  93 gcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaat 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  383837 gcgtacaatacaccaaattgtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcgggagcttcagtccaccgggttgccctttaat 383757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 6808468 - 6808530
Alignment:
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6808468 aatggtgggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 6808530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 170
Target Start/End: Original strand, 12885967 - 12886048
Alignment:
Q  91 ctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12885967 ctgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 12886048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2755583 - 2755422
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| || ||||| |||||| |    |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  2755583 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtaggttcaagtcttgcaaacatcctcttataccaaaaataggctaaggctgcgtacaatacaccaaaa 2755484  T
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcatat--gcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||||||||  |||||||  | |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2755483 atggtgggagtccttcccaaatcctgcatatgcgcgggagctttagtgcacc-ggttgccctt 2755422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 172
Target Start/End: Original strand, 17432332 - 17432485
Alignment:
Q  29 tgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--------gggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggac 118  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |        ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||    
T  17432332 tgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaagggtaaggctgtgtacaatacactaaaaatggtgagac 17432431  T
Q  119 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 172  Q
    |  |||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17432432 cttttcccggatcctgtgcatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttaa 17432485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 24734598 - 24734752
Alignment:
Q  2 ttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-----------aaaacagggtaagg 90  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||  ||||| ||||||||||           ||||||||||||||    
T  24734598 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaaaagttcaaatccttgaaacaacctcttgtgtaaaaaaaaaaaaaaacagggtaagg 24734697  T
Q  91 ctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgg 143  Q
     ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24734698 ttgcgtacaatacaacaaaaaaggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgcgg 24734752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3116299 - 3116129
Alignment:
Q  3 tggcgccactggtaaagttgttgtcatgtga-------ctaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcg 95  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||       || |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||      | | |||||    
T  3116299 tggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgagttgcgactgaaaggtcatgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaa------atgactgcg 3116206  T
Q  96 tacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  3116205 cacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccttgcgtatgcgggagctttagtacaccggattgcccttt 3116129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 146
Target Start/End: Original strand, 22967149 - 22967287
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtaca------atacacca 107  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||| || ||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||      ||||||||    
T  22967149 taaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaaataggataaggctgcatacaaatacaatacacca 22967248  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  22967249 aatggtgggaccccttcttggaccctgcctatgcgggag 22967287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23821244 - 23821106
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaa------tacacca 107  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||| || ||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||      |||||||    
T  23821244 taaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaaataggataaggctgcatacaaatacaatacacca 23821145  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  23821144 aatggtgggaccccttcttggaccctgcctatgcgggag 23821106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10734974 - 10734903
Alignment:
Q  102 acaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 172  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  10734974 acaccaaagtggtgggcccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtccaccgggctgccctttaa 10734903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9671197 - 9671084
Alignment:
Q  60 aaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaataca-ccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 156  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||| ||||||||| ||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  9671197 aaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcctactttacatcaaaatggtaggacccctttccgaaccctgcaaatacgggagctttaatgca 9671098  T
Q  157 ccgggttgcccttt 170  Q
     |||| ||||||||    
T  9671097 tcgggctgcccttt 9671084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27855600 - 27855500
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||| ||||||||| || |||||   |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27855600 actggtaaagtttttgtcatgtgactgaaatgtcgcgagtttaagtcccgaaaacagcttcctgtgtaaaaaaatagggtaaggctgcgtataatacacc 27855501  T
Q  107 a 107  Q
    |    
T  27855500 a 27855500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 4136670 - 4136590
Alignment:
Q  19 gttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgta 97  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  4136670 gttgttgccacgtgactaaaatgtcacgggttcaagtcctaaaaacaacatcttgtgtaaaatacagggtaaggttgcgta 4136590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 12063431 - 12063510
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 80  Q
    ||||| || |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  12063431 cttggtgcaactgataaagttgttatcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaatagcctcttgtataaaa 12063510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 161
Target Start/End: Original strand, 19340855 - 19340954
Alignment:
Q  64 cagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||| |||    
T  19340855 cagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgca-acaatacaccaaaatgatgggaccccttcctggacccggcgtatgcggaagctttagtgcaacgg 19340953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 160
Target Start/End: Original strand, 11395827 - 11395886
Alignment:
Q  102 acaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  11395827 acaccaaagtggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgcgggagctttagtccaccgg 11395886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 19649338 - 19649255
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagg 84  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || | ||||||| |||| ||| | |||||||||    
T  19649338 cttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaagatcacggatttaaattctgaaaatagccccttatctaaaacagg 19649255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 170
Target Start/End: Original strand, 25997749 - 25997784
Alignment:
Q  135 catatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25997749 catatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 25997784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Original strand, 17448324 - 17448389
Alignment:
Q  37 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17448324 aaaggtcacgggttcaagttttgaaaacaacattttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaa 17448389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 32068074 - 32068182
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatg 111  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||| || |||   ||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  32068074 taaagttgttgtcacgtgaccgaaaggtcacatgttcaagtcttggaaa---cctcttgtgtaaaaaacaggataatgctgtttacaatacaccaaaatg 32068170  T
Q  112 gtgggacccctt 123  Q
    ||||||||||||    
T  32068171 gtgggacccctt 32068182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Original strand, 11849063 - 11849159
Alignment:
Q  47 ggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatg 140  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||| ||| | |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  11849063 ggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgttaaaaacaggataaagttgcccacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccgaactctgcgtatg 11849159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30786427 - 30786378
Alignment:
Q  117 accccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30786427 accccttcctggaccgtgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 30786378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 33922999 - 33922942
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcct 58  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  33922999 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatttgactgaaaagtcacaggttcaagtcct 33922942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 66
Target Start/End: Original strand, 8417445 - 8417501
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacag 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| || ||||||    
T  8417445 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgagttcaggtcatggaaacag 8417501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33922916 - 33922857
Alignment:
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  33922916 ggtggcaccccttcccggaccctgcttatgttggagctttagtgcacatggttgcccttt 33922857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16895761 - 16895695
Alignment:
Q  107 aaatggtgggacccc-ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg-ttgcccttta 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || || | |||||||||||| ||||||||||    
T  16895761 aaatggtgggacccccttcccggaccctacatatgtggaagttttagtgcaccgggtttgcccttta 16895695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14341163 - 14341134
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14341163 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 14341134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 104)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34725267 - 34725098
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34725267 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 34725168  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34725167 tacactaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 34725098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38478451 - 38478282
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38478451 cttggcgcaactagtaaacttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 38478352  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38478351 tacaccaaatggtggaaccccttctcggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 38478282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 45812706 - 45812541
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  45812706 cttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtaaaagagggtaaggctgcatacaa 45812607  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45812606 tacaccaaatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 45812541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Original strand, 47214499 - 47214655
Alignment:
Q  2 ttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaat 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  47214499 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaacagggtaaggttgcgtacaat 47214598  T
Q  102 acaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47214599 acaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 47214655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Original strand, 19414437 - 19414595
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19414437 tggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaagagcctcttatgtaaaacaggttaaggctgcgtacaatacaccaaatg 19414536  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19414537 gtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 19414595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30395899 - 30395726
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30395899 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactttaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 30395800  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30395799 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 30395726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32632727 - 32632557
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32632727 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtaca 32632628  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  32632627 atacaccaaatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagcttgagtgcaccaggtttcccttt 32632557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35253329 - 35253187
Alignment:
Q  28 atgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccg 127  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35253329 atgtgactgaaagatcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccg 35253230  T
Q  128 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35253229 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttt 35253187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 14617025 - 14617196
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  14617025 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacaaggtaaggttgcgtac 14617124  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14617125 aatacaccaaatggtgggatcccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttt 14617196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 46248124 - 46247953
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  46248124 cttggctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 46248025  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46248024 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgcccttt 46247953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12127006 - 12126837
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12127006 cttggcgcaactcgtaaagttgttgtcatgtaattgaaaggtcacgggtttaagttctggaaacagcttcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 12126907  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  12126906 tacaccaaattgtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctgtagtgcactgcgttgcccttt 12126837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 18944630 - 18944804
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18944630 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaaggcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 18944729  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc-tctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18944730 aatacaccaacaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttt 18944804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 46991791 - 46991959
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  46991791 cttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtac 46991890  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  46991891 aatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgccc 46991959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20004263 - 20004090
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  20004263 cttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctctcgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtac 20004164  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20004163 aatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 20004090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 27474277 - 27474438
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||  |    
T  27474277 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaacagggcaaagctgcgtacaatacactga 27474376  T
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27474377 atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 27474438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 10668207 - 10668385
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtga-----ctaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctg 93  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||    
T  10668207 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttg 10668306  T
Q  94 cgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10668307 cgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10668385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Original strand, 27201645 - 27201807
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--a 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  27201645 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtcagaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 27201744  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  27201745 aatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttt 27201807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 6925096 - 6925254
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacacca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||     
T  6925096 actggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcggacaatacaccg 6925195  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6925196 aatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgagttgcc 6925254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 41319968 - 41319806
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41319968 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca 41319869  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  41319868 aatgatgggaccccttcccgaacccttcatatgcgggagtttcagtgcactgggttgcccttt 41319806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18724704 - 18724567
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18724704 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaat 18724605  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18724604 cttgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagct 18724567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23768482 - 23768325
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23768482 actggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca 23768383  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgc 165  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  23768382 aatggtgggacaccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagcggattgc 23768325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 45402082 - 45402251
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggt--aagg-ctgcgt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||    
T  45402082 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-tggaaggtaacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggttcaagttctgcgt 45402180  T
Q  97 acaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45402181 acaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 45402251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 170
Target Start/End: Original strand, 35005139 - 35005283
Alignment:
Q  30 gtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcc 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35005139 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcc 35005238  T
Q  126 cggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35005239 cggaccctgcgtatgcgggcgctttagtgcaccgggttgcccttt 35005283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6983969 - 6983811
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6983969 tggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcgtataaaaaacagggtaagtatgcgtacaatacaccaaatg 6983870  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || |||||| | |||||||||| ||||||||    
T  6983869 gtgggacccctttccggaccctgcgtaggcaggagctttggtgcaccgggctgcccttt 6983811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 8197030 - 8197201
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||  || ||||||||| |||||    
T  8197030 cttggtgcaactggtcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggtaattgcctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctacgtac 8197129  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8197130 agtacaccaaatggtaggaccccttctcggaccctgcgtatgttggagctttagtgtaccgggttgcccttt 8197201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Original strand, 11596512 - 11596648
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 111  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11596512 ggtaaagtggctgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtataatacaccaaatg 11596611  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11596612 gtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagct 11596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35117927 - 35117765
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaatacacc--aa 108  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  35117927 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 35117828  T
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcat-atgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  35117827 atgatgggaccccttcccggaccctgcgtaatgcaggagctttagtgcaccgggcttcccttt 35117765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22930238 - 22930104
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || | |||    
T  22930238 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaacagggtaaggttgtg-aca 22930140  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgc 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22930139 atacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgc 22930104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 171
Target Start/End: Original strand, 4349703 - 4349797
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4349703 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 4349797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18742132 - 18741957
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcct-gaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | | |||||| || |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  18742132 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaaatcttgggaaacagtcttttgtataaaaaaacagggtaaggctgcgt 18742033  T
Q  97 acaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18742032 acaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggtttcccttt 18741957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25468421 - 25468284
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 111  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25468421 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatg 25468322  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctc 149  Q
    || ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25468321 gttggacctcttcccagaccctgcgtatgcgggagctc 25468284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31382330 - 31382214
Alignment:
Q  55 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagt 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  31382330 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcatatgcgggagctttact 31382231  T
Q  154 gcaccgggttgcccttt 170  Q
    | |||||||||||||||    
T  31382230 gtaccgggttgcccttt 31382214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2435946 - 2435796
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaa 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  2435946 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtgaaaaatagggtaagcctgcgtacaatacaccaaaa 2435847  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||    
T  2435846 tggtgggacccctttccgtaccctccgcatgcgggagctttagtgcaccgg 2435796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Original strand, 9939463 - 9939622
Alignment:
Q  16 aaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatg 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||  |||||    
T  9939463 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtttaagaaacatggtaaggttgcgtgcaatacaccaaaaatg 9939562  T
Q  112 gtggga-ccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9939563 gtgggacccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttt 9939622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10378884 - 10378738
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||        || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10378884 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggttacgggttcaagtcctggaaag-------tgag-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 10378793  T
Q  113 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10378792 tgggaccccttcttggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgccc 10378738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Original strand, 19701570 - 19701717
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaat 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  19701570 gtaaagttgttgtcgtgtgactgaaatgtcacgggtttaagtcatgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggatgggtacaatacaccaaaat 19701669  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19701670 ggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 19701717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 20036218 - 20036355
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa---acagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||   | ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  20036218 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaaactcttgtgtaaagagaaagggtaagattgcgttcaatacaccaa 20036317  T
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20036318 atggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggag 20036355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19932923 - 19932755
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || | ||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19932923 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagt--tggatacaacct-ttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 19932827  T
Q  99 aatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||||| |||||||||    
T  19932826 aatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagatcattagtgcaccaggttgccct 19932755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44485267 - 44485119
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 111  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44485267 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttatagtcctggaaacaaccacttgtgtaaaagacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 44485168  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 161  Q
    || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||    
T  44485167 gttggaccccttcccggatcctacgtatgcgggagct-ttgtgcaccggg 44485119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 33222971 - 33223152
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  33222971 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggatttaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggaaaggttgcgtaca 33223070  T
Q  100 atacacc-aaatggtg-------ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaat 173  Q
    ||||||| ||||||||       |||||||||||||||| |||| ||||  | |||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  33223071 atacaccaaaatggtgggaccccggaccccttcccggactctgcctatgtagaagctctagtgcaccagattgtcctttaat 33223152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 50811938 - 50812098
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacacc-aa 108  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  50811938 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacggaatcatgtcctggaaacagcttcttgtgtaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaa 50812037  T
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  50812038 atggt-ggaccccttcccgcgccctgcgtatgcgggagctttaatgcactgggctgcccttt 50812098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 4430197 - 4430080
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  4430197 cttggcgcagctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggtttaagtcttgaaaacagtatcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 4430098  T
Q  99 aatacaccaaatggtggg 116  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4430097 aatacaccaaatggtggg 4430080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Original strand, 23796507 - 23796623
Alignment:
Q  56 cctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagt 153  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  23796507 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcaatgtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgctggagctttagt 23796606  T
Q  154 gcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||| ||||||||    
T  23796607 gcaccgggctgcccttt 23796623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Original strand, 35019229 - 35019383
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| |    
T  35019229 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacagattcaagtcctgtaaacaacctcttgtataaaaatcagtataaggctgcatacaatacaccaatt 35019328  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  35019329 ggtgggacccc-tcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggctgcc 35019383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15511311 - 15511150
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcg--tacaatacacca 107  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||   || |||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15511311 tggtaaagttgttgtaatgtggctgaaaggtcacatattgaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcggatacaatacacca 15511212  T
Q  108 aa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  15511211 aaatggtggtaccccttcctggaccctgcgtatgtgtgagctttagtgcaccgggctgccct 15511150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 50760385 - 50760288
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtg--taaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50760385 ggtaaagtagttgtcatgtgactgagaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtataaaactgggtaaggctgcgtataatacaccaa 50760288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 17470505 - 17470390
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaa 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17470505 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggtcatgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaa 17470406  T
Q  110 tggtgggaccccttcc 125  Q
    | ||||||||| ||||    
T  17470405 tagtgggacccgttcc 17470390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1517404 - 1517311
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1517404 aaaacatgataaggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttt 1517311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39215117 - 39214961
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaat 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  39215117 gtaaagttattgtcacgtgactaaaaggtcccaagttcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctgcgtacaatattccaaaat 39215018  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  39215017 ggtgggtccccttcccaaaccctgcgtatgtggaagctttagtgcaccgggctgccc 39214961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 45264535 - 45264411
Alignment:
Q  37 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccct 133  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  45264535 aaaggtcacatgttcaagtcctggaaacaacctcttgtgcaaaaaacagagtaaggctgtgtgcaatacaccaaaatggtgggaccccttctcagaccct 45264436  T
Q  134 gcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  45264435 gcatatgcgggagctttagtgcacc 45264411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42304302 - 42304207
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42304302 aaaacagggtaaggttgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccggattgcccttt 42304207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 170
Target Start/End: Original strand, 43768205 - 43768297
Alignment:
Q  78 aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  43768205 aaacagggtaaggctgcctacaatacaccaattggtgggaccccttcccagaccctgcgtatacgggagctttaatgcaccgggctgcccttt 43768297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 50606498 - 50606561
Alignment:
Q  107 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50606498 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 50606561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 168
Target Start/End: Original strand, 22324925 - 22325049
Alignment:
Q  46 gggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcg 142  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||    
T  22324925 gggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtggagccccgtccc-gaccctgcgtatgcg 22325023  T
Q  143 ggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||    
T  22325024 ggagctttagtgcaccaggctgccct 22325049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Original strand, 22327101 - 22327250
Alignment:
Q  16 aaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||    
T  22327101 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacgatgcaccaaaatgg 22327200  T
Q  113 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    ||||     |||||| || |||  |||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  22327201 tggg----gttcccgaactctgtgtatgcgggagctttggtgcaccgggctgcc 22327250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 148
Target Start/End: Original strand, 15505632 - 15505700
Alignment:
Q  80 acagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15505632 acagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 15505700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 23371124 - 23371271
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca-gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 112  Q
    ||||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||     
T  23371124 gtaaagttgttttcgcatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccacttgggtaaaaaacgggcaaggttgtgtacaatacaccaaatgc 23371223  T
Q  113 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 161  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  23371224 tgggacccctt-ccagaccctgcgtatgtggtagctttagtgcaccggg 23371271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31272522 - 31272381
Alignment:
Q  24 tgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccct 122  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||          
T  31272522 tgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacatggtaaggctgcgtacagcacatcaaatggtggg------ 31272429  T
Q  123 tcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  31272428 ttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtggactgggctgcccttt 31272381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 34149076 - 34148969
Alignment:
Q  56 cctgaaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagt 153  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34149076 cctggaaacagcctcttgtgtagaaaatagggtaaggttgcgtacaaaagaccaaatggtgagaccccttcctggaccctgcatatgcaggagcgctagt 34148977  T
Q  154 gcaccggg 161  Q
    ||| ||||    
T  34148976 gcaacggg 34148969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19974221 - 19974074
Alignment:
Q  25 gtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggacccct 122  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  19974221 gtcacgtgactgaaagatcacgggttcaagtcttggaaacagcctcaagtgtaaaaatagggcaaggttgcgtacaatacaccaaaatgatgggacccat 19974122  T
Q  123 tcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||| ||   |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  19974121 tcccggactctatgtatgcgggagctttagtgcacggggctgcccttt 19974074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27136811 - 27136661
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaa 109  Q
    |||||||||||||||| |||| |  |||| |||| |||||||| |||  |||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  27136811 ggtaaagttgttgtcacgtgattggaaggacacgagttcaagttctgggaacaacctcttgtgtaaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacaccaaaa 27136712  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
    ||||||||||||||||  || | ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  27136711 tggtgggaccccttcctagatcatgtgtatgcgggagctccagtgcaccgg 27136661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20999943 - 20999850
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20999943 aaaacaaggcaaggctgcgtacaatacaccaaatgatggggccccttccggcaccctgcgtacgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 20999850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 25290150 - 25290300
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaaca--gcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggc----- 91  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||  |||||||||||         
T  25290150 cttggcgcaacaggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcttggaaacacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggcaaggt 25290249  T
Q  92 tgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatg 140  Q
    || |||||||||||||||  || | |||||||||||| ||| |||||||||    
T  25290250 tgtgtacaatacaccaaaaatgataggaccccttcccagactctgcatatg 25290300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 148
Target Start/End: Original strand, 30682845 - 30682948
Alignment:
Q  45 cgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgg 143  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30682845 cgggttcaaatcctgaaaatagcctcttgtgtaaaaacaaggtaagattgtgtaca-tacaacaaatggtgggaccccttcccggaccgtgcgtatgcgg 30682943  T
Q  144 gagct 148  Q
    |||||    
T  30682944 gagct 30682948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19656263 - 19656105
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatg 111  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||  | ||||| | || ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||  |||||||||||| |||||    
T  19656263 taaagttgttgtcgcgtgactcaaaggtcactagctcaaggcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaacgctatgtacaatacaccaaaatg 19656164  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  19656163 gtaggaccctttcttggaccctgcatatgcaagagctttaatgcaccgggctgcccttt 19656105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 31442483 - 31442396
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggtt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  31442483 aaaacagggtaaggatgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggacactgtgtatgtgggagctttggtgcaccgggtt 31442396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4587630 - 4587568
Alignment:
Q  103 caccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgc 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4587630 caccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcctatgcgggagcttcagtgcaccgggttgc 4587568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20169207 - 20169111
Alignment:
Q  54 gtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |   |||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20169207 gtcctgaaaacaccctcttgtgtaaaaaaaaaggtaagactgtgtacaataccccaatcggtgggactccttcccggaccctgcatatgcgggagct 20169111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 2436052 - 2435985
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 80  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  2436052 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcctgtgtaaaa 2435985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 52910216 - 52910379
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa- 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||  ||   ||||||||||| | ||| |||||||||||| |     
T  52910216 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaactcttggaaacagcctcttaggtaaaaaaacagggtaggactgtgtacaatacacctaa 52910315  T
Q  109 -----atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
         ||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||| || ||||||||| || |||||    
T  52910316 tggttatggtgggaccccttcctggaacctccgtatgtgggaactttagtgcaccaggctgccc 52910379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 14988081 - 14987989
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  14988081 actggtaaagttgttgtcatatgactagaaagtcacaagttcaagtcctgaaaacagtatcttatgtaaaatacaggataaggctgcgtacaa 14987989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 34714610 - 34714675
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacag 66  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  34714610 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacag 34714675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 40424729 - 40424786
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcct 58  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40424729 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggccacgggttcaagtcct 40424786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21910742 - 21910686
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccct 133  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21910742 aaaatagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccct 21910686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 24564331 - 24564492
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||| | | |||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  24564331 cttggcgcaaccagtaaagttgatgtcttgtgattgaaaggtcgcagattcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagggtgcgtac 24564430  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||| |||||||||||       |||   ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  24564431 aattcaccaaatggt-------ctt---ggaccctgcctatgcaggagcgttagtgcaccgggttgcccttt 24564492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18335459 - 18335333
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac--agggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| | || ||||||| |||||||||| || |||||||||  ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||   ||||||| | |||||||    
T  18335459 cttggcgcaagtgataaagtttttgtcatgtgtctgaaaggtcacaagttaaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaaattagggtaaagttgcgtac 18335360  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcc 125  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||    
T  18335359 aatacatcaaatgatgggaccctttcc 18335333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 25554882 - 25554800
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaaggctg 93  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  25554882 tggtaaagttgttgtcacgtgactaaaaggccacgtgtttaagtcctggaaacaacctcttgtgtagaaacacggtagggctg 25554800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34679378 - 34679217
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||  |||| | ||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  34679378 ggtaaagttattgtcatgtgactgaaatatcacatgttccattcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtactatacatcaaat 34679279  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggac----cctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    |||||  |||| | || |||    ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  34679278 ggtggagccccgttccagacccggcctgcgtatgcgggagctttagtacaccgggctgccct 34679217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 140
Target Start/End: Original strand, 21723731 - 21723811
Alignment:
Q  61 aaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatg 140  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||    
T  21723731 aaacagcctcttgtataaaaatagggtaaggctgagtacaatacaccaaatggtagaaccttttcccggaccctgcgtatg 21723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 30555210 - 30555273
Alignment:
Q  107 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || |||||    
T  30555210 aaatggtgggaccccttcacggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggctgaccttt 30555273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4430080 - 4430014
Alignment:
Q  89 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||  |||||||||||| ||||||    
T  4430080 ggctgcgtacaatacaccaaatggtggaacccctttctggatcctgtgtatgcgggagctttagtgc 4430014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 6358190 - 6358264
Alignment:
Q  81 cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 154  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| || |||||    
T  6358190 cagggtaaagctgcgtacaaaacaccaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcaggatctttagtg 6358264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19386626 - 19386576
Alignment:
Q  120 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  19386626 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgaaccaggttgctcttt 19386576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20982843 - 20982773
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 147  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  20982843 aaaatagggtaaggctgccaacaatacacctaatggtgggatctcttctcggaccctgcgtatgcgggagc 20982773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4249520 - 4249455
Alignment:
Q  93 gcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||| || ||||||    
T  4249520 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcacc 4249455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4249844 - 4249779
Alignment:
Q  93 gcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||| || ||||||    
T  4249844 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcacc 4249779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4250168 - 4250103
Alignment:
Q  93 gcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||| || ||||||    
T  4250168 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcacc 4250103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28894642 - 28894561
Alignment:
Q  86 taaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||    
T  28894642 taaggttgcgtacaatacatcaaatggtaaaaccccttcctagaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccaggctgccc 28894561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33594196 - 33594131
Alignment:
Q  105 ccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  33594196 ccaattggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggctacccttt 33594131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 18336017 - 18335914
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| | || ||||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||| ||||||| |  || |||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  18336017 cttggcgcaagtgataaagttgttgccatgtgtctgaaaggtcacatgttcaagttctgaaaataatctattgtttaaagaacagggtaaggctgcgtac 18335918  T
Q  99 aata 102  Q
    ||||    
T  18335917 aata 18335914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 158
Target Start/End: Original strand, 7074588 - 7074663
Alignment:
Q  84 ggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7074588 ggtatggctgcgtacaatacaccaaaattgtgggacctctttctagaccctgcatatccgggagctttagtgcacc 7074663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Original strand, 16120819 - 16120874
Alignment:
Q  115 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  16120819 ggaccccttcccggcccctgcatatgcgggagctttaatgcaccaggctgcccttt 16120874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 80
Target Start/End: Original strand, 10163747 - 10163825
Alignment:
Q  2 ttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 80  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || ||  ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  10163747 ttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtggctaaaatgttacaagtttaagttctgaaaacaacctcttatgtaaaa 10163825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 156
Target Start/End: Original strand, 43207523 - 43207640
Alignment:
Q  42 tcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcata 138  Q
    |||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||   ||    
T  43207523 tcacaggtttaagtcttggaaacaacctcttatgtgaaaaacagggtaagacggcatacaatacaccaaattggtgggacctcttcccagaccctatgta 43207622  T
Q  139 tgcgggagctctagtgca 156  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  43207623 tgcgagagctttagtgca 43207640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 44745900 - 44745854
Alignment:
Q  55 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaat 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  44745900 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaggtaaagctgcgtacaat 44745854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 78
Target Start/End: Original strand, 22151495 - 22151568
Alignment:
Q  5 gcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa 78  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22151495 gcgcaactgataaagttgttgtcatctgactgtaaggtcataggttcaagttctggaaacagcctcttatgtaa 22151568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 21723660 - 21723727
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21723660 actggtaaagttgttgtcatgtgactggatggttacaagttc-agtcctggaaacagcctcttgtgtaa 21723727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 168
Target Start/End: Original strand, 42432228 - 42432267
Alignment:
Q  129 accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  42432228 accctgcatatgctggagctctagtgcaccggattgccct 42432267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43921866 - 43921804
Alignment:
Q  96 tacaatacaccaaatggtgggacccc--ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 156  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  43921866 tacaatacaccaaatggtaggacccctattctcggaccctgcacatgcgagagctttagtgca 43921804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Original strand, 5549582 - 5549677
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc---aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||| |||||| |||| || | |||||||||||    
T  5549582 aaaacagggtaaagctgcgcacaatacaccaaaaaatgatgggacccctttctggactctgcctatgcaggagctttagtaca-caggttgcccttt 5549677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 25554796 - 25554742
Alignment:
Q  116 gaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  25554796 gaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcattagtgcaccggactgcccttt 25554742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 118
Target Start/End: Original strand, 46859131 - 46859173
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggtgggac 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46859131 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaatggtgggac 46859173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 49722726 - 49722641
Alignment:
Q  18 agttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa-aacagggtaaggctgcgtacaata 102  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  || || ||||||||  |||||||||||    
T  49722726 agttgttgtcacgtgaatgaaaggtcacgggtttaagtcatgtaaacaacctcttgtaaaataatagggtaagattgcgtacaata 49722641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 123
Target Start/End: Original strand, 10158266 - 10158310
Alignment:
Q  79 aacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctt 123  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10158266 aacagagtaatgctacgtacaatacaccaaatggtggcacccctt 10158310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 30543 - 30712
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30543 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtagggctgcgtacaa 30642  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 101)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 20224948 - 20225117
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20224948 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 20225047  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20225048 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 20225117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 48598994 - 48598825
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48598994 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 48598895  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48598894 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccatgcatatgccggagctctagtgcaccgggttgcccttt 48598825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11054316 - 11054148
Alignment:
Q  2 ttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaat 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11054316 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaat 11054217  T
Q  102 acaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11054216 acaccaaatggcggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 11054148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47528699 - 47528530
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47528699 cttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 47528600  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47528599 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgaatatgtgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 47528530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9832468 - 9832313
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 114  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9832468 taaaattgttgtgatctgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 9832369  T
Q  115 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9832368 ggaccccttcccggaccctgcatatgcaggaactctagtgcaccgggttgcccttt 9832313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 5648223 - 5648393
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5648223 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtaca 5648322  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  5648323 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcactgggttgcccttt 5648393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6430796 - 6430627
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6430796 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtaca 6430697  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6430696 atacaccaaatggtgggaccacttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgccctt 6430627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 30639344 - 30639514
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30639344 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcttgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagactcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtaca 30639443  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30639444 atacaccaaatggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 30639514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29208039 - 29207900
Alignment:
Q  29 tgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgg 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29208039 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaattgcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgg 29207940  T
Q  129 accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29207939 accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 29207900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 40915802 - 40915962
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  40915802 actggtaaagttgttgtcatgtgactataaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa 40915901  T
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  40915902 atggtgggagcccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccggattgccctt 40915962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16408774 - 16408601
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  16408774 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 16408675  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16408674 aatacaccaataatggtggaaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 16408601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5306834 - 5306660
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5306834 cttggcgcaactggtaaagttgatgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatcagggtaaggttgcgtaca 5306735  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatg----cgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5306734 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggacgggagctttaatgcaccgggttgcccttt 5306660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 23501757 - 23501924
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  23501757 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc------acagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtac 23501850  T
Q  99 aatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23501851 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 23501924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 39077948 - 39077800
Alignment:
Q  18 agttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggga 117  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  39077948 agttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggttgcgtacaatataccaaatggtgaga 39077849  T
Q  118 ccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39077848 catctttccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 39077800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 16911526 - 16911699
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  16911526 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtacaaatcagggtaaggctgcgtac 16911625  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  16911626 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtacgcgggagctttagtttaccgggttgcccttt 16911699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 44363294 - 44363129
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc- 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||||     
T  44363294 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacagcctcgtgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtacaacgcacca 44363195  T
Q  107 -aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44363194 aaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 44363129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 21646928 - 21647098
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  21646928 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtac 21647027  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21647028 aatataccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 21647098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8473790 - 8473621
Alignment:
Q  2 ttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaat 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  8473790 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgaccggaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtttaacagggtaaggctgcatacaat 8473691  T
Q  102 acaccaaatggtgggacccctt-cccgga-ccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8473690 acaccaaatggtgggaccccttccccggacccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 8473621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Original strand, 54175043 - 54175200
Alignment:
Q  17 aagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctg-aaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54175043 aagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacggattcaagtcctggaaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaatggt 54175142  T
Q  114 gggaccccttccc-ggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54175143 gggaccccttccccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 54175200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 170
Target Start/End: Original strand, 47443957 - 47444092
Alignment:
Q  37 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47443957 aaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctg 47444056  T
Q  135 catatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  47444057 catatgcaggagcttcagtgcactgggttgcccttt 47444092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17043549 - 17043416
Alignment:
Q  17 aagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 114  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17043549 aagttgttgtcaagtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 17043450  T
Q  115 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17043449 ggaccccttcccagaccctgcatatgctggagct 17043416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 35567146 - 35567305
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  35567146 ggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagccacttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaacacaccaaat 35567245  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35567246 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtctgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 35567305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 30690340 - 30690175
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---------cagggtaaggctgcgtacaatacac 105  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||         |||||||||||||| ||||||||||    
T  30690340 taaagtggttgtcaagtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaaagcctcttgtgtaaaaaataaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 30690241  T
Q  106 caaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  30690240 caattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctgcccttta 30690175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20639777 - 20639658
Alignment:
Q  54 gtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 150  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  20639777 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 20639678  T
Q  151 agtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20639677 agtgcaccgggttgcccttt 20639658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 148
Target Start/End: Original strand, 25463108 - 25463235
Alignment:
Q  23 ttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25463108 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggaaaggttgcgtacaacacaccaaatggtgggaccc 25463207  T
Q  121 cttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25463208 cttcccggaccctgcatatgcgggagct 25463235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Original strand, 19027823 - 19027973
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 109  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19027823 tggtagagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat 19027922  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  19027923 tggtgggacccctttccagactctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgg 19027973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13256568 - 13256399
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||     ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13256568 cttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcataggttcaagtcctg----gagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 13256473  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13256472 aatacaccaataatagtgggaccccttcccgaaccccgcatctgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 13256399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 159
Target Start/End: Original strand, 54730225 - 54730376
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca-- 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||| |||||||||      
T  54730225 ggtaaagttgttgtcatgtgaccaaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaataggataaggctgcgtataatacaccaat 54730324  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccg 159  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  54730325 aatgatggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 54730376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30352762 - 30352580
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-------cagggtaag---- 89  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||        
T  30352762 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcaagtgaccgaaaggtcacgggttagagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaaaacagggtaagtaaa 30352663  T
Q  90 gctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30352662 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgtgttgcccttt 30352580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 14983807 - 14983969
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacacca 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||| |    
T  14983807 actggtaaagttgttgtcatatgattggaaggtcacggattcaagtctttgaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcctacaatacacta 14983906  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  14983907 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccatgttgcccttt 14983969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30496491 - 30496333
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  30496491 cttggcgcaactgtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaacacgggtaaggctgcatacaa 30496392  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccg 159  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  30496391 tacaccaaatggggggactccttcccggaccgtgcttatgatggagctttagtgcaccg 30496333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 37494815 - 37494972
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| |||    
T  37494815 cttggtgcaactggtaaagttgttgccatgcgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcatac 37494914  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 156  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  37494915 aatataccaaatggtgggacccctttcgggaccctgcgtatgcaggagctttagtgca 37494972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10277886 - 10277757
Alignment:
Q  41 gtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatg 140  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  10277886 gtcacgggttcaaatccttgaaacagcctcttgtataaaataggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgaaaccccttcccagaccctgcatatg 10277787  T
Q  141 cgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  10277786 cgggagttctagtgaaccggattgcccttt 10277757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 170
Target Start/End: Original strand, 25629073 - 25629184
Alignment:
Q  61 aaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25629073 aaacagtctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagctttagtgcacc 25629172  T
Q  159 gggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||    
T  25629173 gggttgcccttt 25629184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 39029220 - 39029082
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacac-caaa 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  39029220 ggtaaagttgttgtcgtgtgactaaaaggtcataggttcaagccttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacgaaaa 39029121  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39029120 tggtgggaccactttccggaccctgcatatgcgggagct 39029082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 32478942 - 32478791
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||    
T  32478942 taaagttgttgtcatgtgaccgagaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctctagtgtaaaaacagggtaaggctg-----aatacaccaaatggt 32478848  T
Q  114 gggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  32478847 gggaccccttcccggacccagcgtatgcgggagct-ttgtgcaccgggtggcccttta 32478791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 54966997 - 54967151
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  54966997 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 54967095  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  54967096 ggtgggaccccttcccgtaccctacatatgcgggagct-ttgtgcaccgggctgccc 54967151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 14590801 - 14590922
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgta 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||    
T  14590801 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggtaaggctgcata 14590900  T
Q  98 caatacaccaaatggtgggacc 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  14590901 caatacatcaaatggtgggacc 14590922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 55766637 - 55766466
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggg-ttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  || ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  55766637 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccggaaggtcacggggttcaagttttggaaacagtttcttgtgtgtaaacagggtaaggctgcgtac 55766538  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  55766537 aatacactgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggatgcccttt 55766466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7385628 - 7385499
Alignment:
Q  20 ttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggga 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  |||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  7385628 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagccctggaaacagcctcatgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtgcaatacaccaaatggtggga 7385529  T
Q  118 ccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 147  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  7385528 ccctttcccggaccctgtgtatgcgggagc 7385499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 171
Target Start/End: Original strand, 20225119 - 20225212
Alignment:
Q  80 acagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20225119 acagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 20225212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 41018945 - 41018807
Alignment:
Q  20 ttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggac 118  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  41018945 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaattagggtaaggctacgtacaatacaccaaatagtgggac 41018846  T
Q  119 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 157  Q
    |||||||| |||| ||| ||||  || ||| ||||||||    
T  41018845 cccttcccagaccttgcgtatggaggggctttagtgcac 41018807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 30581624 - 30581481
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaat 110  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||   |||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  30581624 taaagttgttgtcacatcactaaaaggtcaagggttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggtgtgtacaatacaccaaaat 30581525  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  30581524 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtaggagctttagtg 30581481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7909397 - 7909281
Alignment:
Q  55 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgc-gggagctctag 152  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||    
T  7909397 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggggagctttag 7909298  T
Q  153 tgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||| ||||||||||||    
T  7909297 tgcatcgggttgccctt 7909281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 47441689 - 47441566
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||   |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47441689 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccaagaaacagtctcttttgtaaaaatcagggtaaggctgtgtacaatacaccaaat 47441590  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctg 134  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  47441589 ggttggaccccttcccggaccctg 47441566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 49938746 - 49938615
Alignment:
Q  16 aaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggt 113  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||   | |||||||||||| |||||||    
T  49938746 aaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacggggtaag---gtgtacaatacaccaaaatggt 49938650  T
Q  114 gggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  49938649 gggaccccttcccataccctgcatatgcgggagct 49938615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 51865149 - 51865038
Alignment:
Q  61 aaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  51865149 aaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttattgcacc 51865050  T
Q  159 gggttgcccttt 170  Q
    ||  ||||||||    
T  51865049 ggactgcccttt 51865038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 20405057 - 20405224
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgta 97  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||       |||  ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||    
T  20405057 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggg-------cctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagattgcgta 20405149  T
Q  98 caatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  20405150 caatacactaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttt 20405224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Original strand, 38786673 - 38786744
Alignment:
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38786673 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 38786744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9987957 - 9987838
Alignment:
Q  49 ttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 146  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  9987957 ttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaacaatagggtaaggctgcatacaatacaccaaatggtgggaccccttccttgaccttgcatatgcgggag 9987858  T
Q  147 ctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    || || ||||||||| ||||    
T  9987857 ctttaatgcaccgggctgcc 9987838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 148
Target Start/End: Original strand, 49796822 - 49796910
Alignment:
Q  61 aaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  49796822 aaacagcctcttgtgttaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 49796910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 55830892 - 55830721
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgg-gttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||  || |||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  55830892 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatcggaaggtcacggagttcaagttttggaaacagtctcttgtgtgtaaacagggtaatgctgcgtac 55830793  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  55830792 aatacactgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccaggatgcccttt 55830721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20908797 - 20908636
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgact-aaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||| || ||||| | |||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20908797 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaatgttacatgttcaagtcatggaaacatcgtcttttctaaaaaagaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 20908698  T
Q  110 -tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  20908697 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacaaggctgcccttt 20908636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 10660368 - 10660538
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||| |||||| |||  |||| |||||| |||||| |||    
T  10660368 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtatggctgcatac 10660467  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct-agtgcaccgggttgccc 167  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  10660468 aatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgccc 10660538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 10874513 - 10874683
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||| |||||| |||  |||| |||||| |||||| |||    
T  10874513 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtatggctgcatac 10874612  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct-agtgcaccgggttgccc 167  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  10874613 aatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgccc 10874683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 487294 - 487135
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtg--taaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-- 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||      
T  487294 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaaacaaggtaaagctgcgtacaatacactaaaa 487195  T
Q  109 -------atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 161  Q
           |||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  487194 tggtgggatggcgggaccccttcccggattctgcgaatgcgggagctttagtgcaccggg 487135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3580994 - 3580862
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  ||||    ||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||    
T  3580994 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgagttcaagtctggaaa----cctcttgtgtaaaaaccatggtaaggctgtgtgcaatacaccaaatg 3580899  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3580898 ctaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagct 3580862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 170
Target Start/End: Original strand, 7038041 - 7038187
Alignment:
Q  25 gtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggtgggacccc 121  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  7038041 gtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctg-aaacagcttcttgtgtaaaaaatagggtaagacttcgtacaatacaccaaaatggtggggcacc 7038139  T
Q  122 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    | |||||||||||| ||| | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7038140 tacccggaccctgcgtatac-ggagctttagtgcactgggttgcccttt 7038187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 165
Target Start/End: Original strand, 21489099 - 21489218
Alignment:
Q  49 ttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggga 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21489099 ttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagagtaagactgcgtacaatgcaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggga 21489198  T
Q  146 gctctagtgcaccgggttgc 165  Q
    ||| | |||||| |||||||    
T  21489199 gctttcgtgcactgggttgc 21489218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 25343162 - 25343321
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--a 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25343162 tggtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcacaggttcaagttctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 25343261  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    || ||| |||||||||||  || ||||| |||| | ||||| ||| ||||| || |||||    
T  25343262 aagggttggaccccttcctagatcctgcgtatgtgagagctttagagcacccggctgccc 25343321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 170
Target Start/End: Original strand, 32484307 - 32484368
Alignment:
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32484307 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 32484368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 38755970 - 38755906
Alignment:
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38755970 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttaa 38755906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 42164307 - 42164224
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcg 95  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42164307 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcg 42164224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Original strand, 11394923 - 11394989
Alignment:
Q  106 caaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11394923 caaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttaa 11394989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Original strand, 11404650 - 11404716
Alignment:
Q  106 caaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11404650 caaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttaa 11404716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17315469 - 17315375
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgc 94  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  17315469 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgc 17315375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 32629418 - 32629293
Alignment:
Q  22 gttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggacc 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  32629418 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaaatcctcgaaacagcctcttgtaaaaaaacagggtaaggccgcctac-atacaccaaattggcgggacc 32629320  T
Q  120 ccttcccggaccctgcatatgcgggag 146  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||    
T  32629319 ccttcccggaccttgcgtatgtgggag 32629293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33836563 - 33836487
Alignment:
Q  96 tacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33836563 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggttgcccttt 33836487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40553998 - 40553934
Alignment:
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaat 173  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40553998 atggtgtgaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttaat 40553934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23580365 - 23580208
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatg 111  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  23580365 taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctagaaagagcctcttgtgtaaaaaacaggggaagactgcgtaggatacaccaaaatg 23580266  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    | | |||||||||  ||| ||||  |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  23580265 gcgagaccccttcttgga-cctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgagctgcccttt 23580208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 36816478 - 36816384
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat-ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36816478 aaaacagggcagggctgcgtacaatacaccaaaaaggtgggactccttcctggaccctgtgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgcccttt 36816384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 166
Target Start/End: Original strand, 28494222 - 28494282
Alignment:
Q  106 caaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28494222 caaatggtgggaccccttcccagatcctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcc 28494282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Original strand, 43035224 - 43035307
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctgc 94  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  43035224 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgtaagaaacacggtaaggctgc 43035307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 171
Target Start/End: Original strand, 25388249 - 25388312
Alignment:
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25388249 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcatgagctttagtgcaccgggttgcccttta 25388312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 5313165 - 5313099
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagc 67  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5313165 cttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaattcctgaaaacagc 5313099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 36589720 - 36589876
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaa 109  Q
    |||||||||| |||||  ||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||   ||| |||||| |||    
T  36589720 ggtaaagttgatgtcacatgactgaaacgtc-caggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaatgctgttgacagtacaccaaaa 36589818  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    |||||||||||||||| | |||||   |||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  36589819 tggtgggaccccttcctgaaccctatgtatgcgggagctttggtgcaccgggctgccc 36589876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 48327858 - 48327762
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  48327858 aaaacagggtaagactgcatacaatacaccaataatggtgggacctcttcccgaaccccacatatgcggaagttttagtgcaccgggttacccttta 48327762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 54640498 - 54640431
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 80  Q
    |||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  54640498 ggtaaaattgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaa 54640431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Original strand, 35532077 - 35532127
Alignment:
Q  120 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35532077 ccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 35532127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Original strand, 44718641 - 44718703
Alignment:
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  44718641 atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagcacaccgggttgcccttta 44718703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12711542 - 12711450
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  || ||||||| | || |||||||||  |||||||||    
T  12711542 aaaatagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttctcagacctagcgtatgcggaaactttagtgcacccagttgccctt 12711450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 161
Target Start/End: Original strand, 16494258 - 16494345
Alignment:
Q  76 taaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 161  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  16494258 taaaacagggtaaagctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccctttcccagaccctgtgtatgcggaagctttagtgtaccggg 16494345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 49938594 - 49938490
Alignment:
Q  16 aaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaataca-ccaaatggt 113  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||| || || |||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  49938594 aaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacagattcaagtcttggaagcagcgtattgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtccaattcatcaaaatggt 49938495  T
Q  114 gggac 118  Q
    |||||    
T  49938494 gggac 49938490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 170
Target Start/End: Original strand, 2813169 - 2813263
Alignment:
Q  79 aacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct-agtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  2813169 aacagggtaagactgcgtacaatacatcaataatggtgggaccctttcccgaacgatgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggattgcccttt 2813263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47482913 - 47482850
Alignment:
Q  107 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || | ||||||||    
T  47482913 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaacgagctgcccttt 47482850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 170
Target Start/End: Original strand, 56322984 - 56323035
Alignment:
Q  119 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  56322984 cccttcccggaccccggatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 56323035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 50555718 - 50555656
Alignment:
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||||||    
T  50555718 aatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagttttagtgcaccgggctgcccttt 50555656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 107
Target Start/End: Original strand, 51420553 - 51420646
Alignment:
Q  17 aagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggg-ttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacacca 107  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||   | |||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51420553 aagttgttgtcacgtgactgaaaggtcagttgattcaagtcatggaaacaacctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgggtacaatacacca 51420646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 12257752 - 12257688
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta 77  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  12257752 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaaatcctagaaacagcgtcttgtgta 12257688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 170
Target Start/End: Original strand, 19027986 - 19028046
Alignment:
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19027986 tggtgggactccttcccggaccccacttatgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 19028046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 17079777 - 17079691
Alignment:
Q  46 gggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggac 130  Q
    ||||||||||| || |||||   |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  17079777 gggttcaagtcttggaaacaatatcttgtgtataaaacagggtaaggctgcatacaatacgctaaatggtgggaccctttcctggac 17079691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 83
Target Start/End: Original strand, 41549358 - 41549428
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag 83  Q
    ||||||||||||| ||  ||| | ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41549358 ggtaaagttgttgacacatgattgaaatgtcacgggttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaacag 41549428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10380086 - 10379997
Alignment:
Q  28 atgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggg 116  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||| |||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  10380086 atgtgactgaaaggtcacttgttcaagtcctacaaacaacctcttgtgtaaaaataggataaaattgcgtacaatacaccaaatagtggg 10379997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 35894555 - 35894502
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccgga 129  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35894555 aaaacacggtaagtgtgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccgga 35894502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 44357195 - 44357319
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aa 108  Q
    |||||||||| |||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||  ||||| ||| |||||||  ||| || ||||| |  ||||||||||||| ||    
T  44357195 tggtaaagttattgttatgtaactgaaaggtcatgagttcaagtcctagaaacaaccttttgtgtaataaatagagtaagacgacgtacaatacaccaaa 44357294  T
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccct 133  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||    
T  44357295 atggcgggacctcttcccagaccct 44357319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Original strand, 46082785 - 46082856
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca-aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 147  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46082785 aaaataggttaaggctgcgtattatacacaataatggtgagactccttctcggaccctgcatatgcgggagc 46082856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4222113 - 4222071
Alignment:
Q  85 gtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccg 127  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4222113 gtaaggctgcgtagaatacacaaattggtgggaccccttcccg 4222071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 18969705 - 18969738
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgac 34  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18969705 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 18969738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 50856395 - 50856350
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcct 58  Q
    ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  50856395 ggtaaagttgttgtcacatgattgaaaggtcacgggttcaagtcct 50856350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 156
Target Start/End: Original strand, 8820581 - 8820629
Alignment:
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||    
T  8820581 aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagttttagtgca 8820629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12666914 - 12666858
Alignment:
Q  113 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  12666914 tgggaccccttgtcggaccatgcgtatgcaggagctttagtacaccgggttgccctt 12666858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 80)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21779430 - 21779261
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21779430 cttggcgcaactggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggagacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggttgcgtacaa 21779331  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21779330 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 21779261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 23397730 - 23397900
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23397730 cttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatagggtaaggctacgtacaa 23397829  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23397830 tacaccaaatggtgggaccccttctcggaccctacatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 23397900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8455487 - 8455316
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8455487 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcgtac 8455388  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8455387 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgccggagctttagtgcaccgggttgcccttt 8455316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 9671144 - 9671314
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgacta-aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9671144 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaatgtcacgggttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtaca 9671243  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9671244 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 9671314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 14530282 - 14530456
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  14530282 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctacgtac 14530381  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14530382 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 14530456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 10543662 - 10543835
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10543662 cttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacggcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 10543761  T
Q  99 aatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10543762 aatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10543835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 25249908 - 25249738
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25249908 cttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtctcttgtgtacaaacagggtaaggctgcgtaca 25249809  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25249808 atacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccgggttgcccttt 25249738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12024089 - 12023929
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12024089 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtaca 12023990  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||| || ||||||||    
T  12023989 atacaccaaatggtgggaccccctcccggaccctgcgtatttggaagctttaatgcaccgg 12023929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 11514400 - 11514570
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  11514400 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaactcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaagtaaggctgcgtac 11514499  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11514500 aatacaccaaatggtggga-cccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 11514570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Original strand, 10546153 - 10546298
Alignment:
Q  28 atgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttc 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10546153 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacatcctcttgtataaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttc 10546252  T
Q  125 ccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10546253 ccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24200787 - 24200623
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc- 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24200787 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca 24200688  T
Q  107 -aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24200687 aaaatggtgggaacccttcccggaccctgagtatgtgagagctttagtgcaccgggttgcccttt 24200623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Original strand, 14444720 - 14444863
Alignment:
Q  28 atgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttccc 126  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14444720 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgtgtacgatacaccaaatggtgggaccccttccc 14444819  T
Q  127 ggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14444820 ggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 14444863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 17667975 - 17668137
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17667975 actggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacacca 17668074  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17668075 aatggtggaaccccttctcgaaccctgcgtatatgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 17668137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 25079889 - 25079717
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgta 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||   || ||||||| ||||||    
T  25079889 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttagaaacaacctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggatgcgta 25079790  T
Q  98 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25079789 caatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagagctttagtgcaccgggttgcccttt 25079717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 17623537 - 17623699
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacca 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17623537 actggtaaagttgttgtcatgcgactggaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacacca 17623636  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| |||| || |||| |||||||| ||||||||||||    
T  17623637 aatggtggaaccccttcccgaatcctgcgtatgtggaagctttagtgcactgggttgcccttt 17623699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 17896223 - 17896395
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca---gggtaaggctgcgta 97  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  17896223 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaaatagggtaaggctgcgta 17896322  T
Q  98 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  17896323 caatataccaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcatcgagttgcccttt 17896395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Original strand, 5841006 - 5841165
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaa--at 110  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  5841006 taaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaaggatgcgtacaatacatcaataat 5841105  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5841106 ggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 5841165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 22371021 - 22371153
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22371021 cttggcccaactggtaaagttgttgtcatgtgactgggaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcgtgta-aaaacagggtaaggctgcgtacaa 22371119  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22371120 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctg 22371153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 27573585 - 27573755
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27573585 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcattggttcaagtccgggcaacagcctcttgtgtataaacatggtaaggctgcgtaca 27573684  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27573685 atacaccaaatggtggaaccatttcccaaaccctgtgtatgtgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 27573755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 170
Target Start/End: Original strand, 36871509 - 36871626
Alignment:
Q  53 agtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctcta 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  36871509 agtcctggaaacagcctcttgtgtgaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgga-cctgcgtatgcgggagcttta 36871607  T
Q  152 gtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36871608 gtgcaccgggttgcccttt 36871626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39914467 - 39914306
Alignment:
Q  11 ctggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||     
T  39914467 ctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggatcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggatgtgtacaatacaccg 39914368  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  39914367 aatggtgggacccctt-cctgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 39914306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 40417031 - 40416870
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  40417031 tggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaaacagggaaaggctgtgtacaatacaccaat 40416932  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    || |||||||| ||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40416931 tgatgggacccttttttggaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgcccttta 40416870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 99421 - 99281
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  99421 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtaaaaaacatggcaaggctgcgtacaatacaccaaatggt 99322  T
Q  114 gggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 154  Q
    || |||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||    
T  99321 ggaaccccttctcagaccctgtgtatgcgggagctttagtg 99281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24860157 - 24859992
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||||    
T  24860157 cttggcgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactggaaggttacgggtttaagccctggaaacaacctctggtgtaaaaacatggta-ggctgcgtaca 24860059  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24860058 atacaccaaatggtagaaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcc 24859992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 170
Target Start/End: Original strand, 25641487 - 25641636
Alignment:
Q  22 gttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25641487 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcattttgtgtgaaaacagggtaaagttgcgtacaatacaccaaattgtgggaccc 25641586  T
Q  121 cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||| | ||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  25641587 cttcccgaatcctgcgtatgcgagagctttagtgaaccggattgtccttt 25641636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19977885 - 19977726
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  |||| ||| ||||| |||||||    
T  19977885 cttggcggaactggtgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttttgtaaaaaataggataaggttgcgtac 19977786  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  19977785 aatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttagtgcacc 19977726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21377232 - 21377074
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21377232 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcatagaaacatcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgggtacaatgcaccaaat 21377133  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  21377132 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgtgggagct-ttgtgcaccgagctgcccttt 21377074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 5450263 - 5450384
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5450263 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaagg 5450362  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccct 133  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  5450363 gtgggaccccttcctggaccct 5450384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26684789 - 26684620
Alignment:
Q  5 gcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacag-cctcttgtgtaaaacag---ggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  26684789 gcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcaaaggtttaagtcctgaaaacagacctcttgtgtaaaaaaatatggtaaggctgcgtacaa 26684690  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    || || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  26684689 tatactaaatggtgggacctcttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcaccggattgtccttt 26684620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 7214507 - 7214667
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaatacac-- 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  7214507 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacacaa 7214606  T
Q  106 caaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
     |||||||| || |||||| ||||| |||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  7214607 aaaatggtgagatcccttctcggacactgcgtatgcgagagttttagtgcaccaggttgcc 7214667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4516510 - 4516354
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  4516510 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacatattcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggcaacgctgcgtacaatacaccaatt 4516411  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||| |||||    
T  4516410 ggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggaagctttagtgtaccgggctgccc 4516354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17380391 - 17380237
Alignment:
Q  17 aagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||    
T  17380391 aagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaacagggtaaggttgtgtgcaatacaccaaatgatgg 17380292  T
Q  116 gaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
     ||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||||||| | |||||||    
T  17380291 aaccccttcctggaccctgcggatgcgggagct-ttgtgcaccgggcttcccttta 17380237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Original strand, 44643497 - 44643658
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||| ||||||||  ||||||   ||| |||||||||||||||||  |||||    
T  44643497 tggtaaagttgtcatcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagttctagaaagagcctcttccgtaaaaaaacagagtaaggctgcgtacaatgtaccaa 44643596  T
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  44643597 atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagccttagtgcaccgggctgcccttt 44643658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 14544027 - 14544202
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgta 97  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||     
T  14544027 cttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacaggtccaggtactggaaacagcctcttgtgtagaaaaacagggtaagactgcgtg 14544126  T
Q  98 caata--caccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |||||  ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  14544127 caataaccaaaaaatggtcggaccccttccgggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaagttgcccttta 14544202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23145857 - 23145736
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  23145857 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaatt 23145758  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccc 132  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  23145757 ggtgggaccctttcccggaccc 23145736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23557647 - 23557526
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  23557647 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaatt 23557548  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccc 132  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  23557547 ggtgggaccctttcccggaccc 23557526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 40762345 - 40762234
Alignment:
Q  61 aaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  40762345 aaacagcctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctacgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcctggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcacc 40762246  T
Q  159 gggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||    
T  40762245 gggttgcccttt 40762234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 32781448 - 32781310
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 109  Q
    ||||||||||||||  ||||  || |||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32781448 tggtaaagttgttgcaatgttgctgaaaggtcacgagttcaagtctcggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 32781349  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  32781348 tggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagct 32781310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 17705459 - 17705567
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  17705459 cttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaacaacagagtaaggctgtgtac 17705558  T
Q  99 aatacacca 107  Q
    |||||||||    
T  17705559 aatacacca 17705567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 31158598 - 31158451
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||| ||||||| |||  ||||    
T  31158598 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttaaagtcttcaaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaagattgcatacaataaaccaaaaat 31158499  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  31158498 ggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtacacc 31158451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Original strand, 33795261 - 33795398
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac-aatacaccaaa 109  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  33795261 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaacaacctcttgggtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaaatacacc-ta 33795359  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  33795360 tggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagct 33795398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13245220 - 13245091
Alignment:
Q  38 aaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcat 137  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13245220 aaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-------ggtaaggctgcgtacattacactaaatggtgggaccccttcccggaccatgcat 13245128  T
Q  138 atgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaatg 174  Q
    || |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  13245127 atacgggagctttagtgtatcgggttgcccttgaatg 13245091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Original strand, 25632551 - 25632644
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25632551 aaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggattccttcccgaaccttacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 25632644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 158
Target Start/End: Original strand, 30826052 - 30826158
Alignment:
Q  52 aagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 150  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  30826052 aagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggt-ggaacccttcccagaccctacatatgcgggagcttt 30826150  T
Q  151 agtgcacc 158  Q
    ||||||||    
T  30826151 agtgcacc 30826158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 158
Target Start/End: Original strand, 19614981 - 19615116
Alignment:
Q  26 tcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggacccc 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| || |||||||    
T  19614981 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttgaaacatcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgtacaatataccaataatagt-ggacccc 19615079  T
Q  122 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  19615080 ttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcacc 19615116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 157
Target Start/End: Original strand, 24890453 - 24890533
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 157  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  24890453 aaaacaaggtaaggctgcatacaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcac 24890533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 44521532 - 44521395
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||| || || |||||  |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  44521532 ggtaaagttgttatcacgtgactgaaaggtcacgcgttcaaatcttggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcatataatacaccaaat 44521433  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    || |||| |||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  44521432 ggcgggagcccttcccagacattgcatatacgggagct 44521395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45235976 - 45235820
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa---aacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||| ||||| |||||   || ||||||||||| |||  ||||||| ||||    
T  45235976 gtaaagttgttctcatgtgactgaaagatcacgagttcaagtcctagaaacagtctcttctgtaaaataatagggtaaggctacgtgtaatacacaaaat 45235877  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    ||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||| ||||| |||  |||||||    
T  45235876 ggtgggaccccttaccagaccctacgtatgcaggagctttagtgtaccaagttgccc 45235820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 44449529 - 44449418
Alignment:
Q  26 tcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttg--tgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggtgggacccct 122  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  44449529 tcatgtaactgaaaggtcacgagttcaa-tcctaaaaacaacctcttgaatgaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaaatagtgggacccct 44449431  T
Q  123 tcccggaccctgc 135  Q
    |||||||||||||    
T  44449430 tcccggaccctgc 44449418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 170
Target Start/End: Original strand, 34080176 - 34080236
Alignment:
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34080176 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagttttagtgcaccgggttgcccttt 34080236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Original strand, 41409936 - 41409995
Alignment:
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41409936 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccct 41409995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 29420048 - 29419946
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagg----gtaaggctgcgtacaatacacc 106  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  29420048 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagtaaggctgcgtacaatacacc 29419949  T
Q  107 aaa 109  Q
    |||    
T  29419948 aaa 29419946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15296533 - 15296406
Alignment:
Q  46 gggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcg 142  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||| |||||||||| |||| |    
T  15296533 gggttcaagtcccggaaacagcctgttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatataccaaaatagtgggatcccttctcggaccctgcgtatgtg 15296434  T
Q  143 ggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    | |||| | |||| || || ||||||||    
T  15296433 gaagctttggtgcgccaggctgcccttt 15296406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 31821491 - 31821355
Alignment:
Q  22 gttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccc 121  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||   |||  |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31821491 gttgttatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcgtagaaacagccgtgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtacaatacaccaaatgatgggacccc 31821392  T
Q  122 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    || ||| | ||||  |||||||||||| || ||||||    
T  31821391 tttccgaaacctgtgtatgcgggagctttaatgcacc 31821355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 40579810 - 40579750
Alignment:
Q  109 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40579810 atggtgggaccccttcccggaccctgagtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 40579750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 44604827 - 44604907
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 89  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44604827 actgctaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaag 44604907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 23488555 - 23488618
Alignment:
Q  107 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23488555 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggttgctcttt 23488618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 157
Target Start/End: Original strand, 4794871 - 4794924
Alignment:
Q  104 accaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4794871 accaaatgatgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctctagtgcac 4794924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 160
Target Start/End: Original strand, 17471572 - 17471675
Alignment:
Q  61 aaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 156  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17471572 aaacagcctcttgtgtaaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaatgatgagaccccttccctgaccctgcctatgcgggagttttagtgca 17471671  T
Q  157 ccgg 160  Q
    ||||    
T  17471672 ccgg 17471675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 2003678 - 2003592
Alignment:
Q  31 tgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 114  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2003678 tgactgaaaggtcacgggtacaagtcctggaaacagccccttgcgtaaaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaacaaatggtg 2003592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 175
Target Start/End: Original strand, 8575975 - 8576035
Alignment:
Q  115 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaatgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8575975 ggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccaggttgccctttaatgt 8576035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 170
Target Start/End: Original strand, 34766330 - 34766390
Alignment:
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  34766330 tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggtttcccttt 34766390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 39189555 - 39189508
Alignment:
Q  119 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39189555 cccttcccggaccccgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 39189508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3633762 - 3633708
Alignment:
Q  116 gaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3633762 gaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 3633708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 4795730 - 4795890
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa- 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||   || | | || |||||| ||||||||||||     
T  4795730 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaagtcacttgttgaagtcttgaaaacagcctcatgcgtaaaaaaacaagattagactgcgtgcaatacaccaaaa 4795829  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||  ||||||||||||    
T  4795830 tggtgggaccttttcccggaccttgtgtatgccgaagctttagtgcagtgggttgcccttt 4795890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 39499323 - 39499242
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || | ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39499323 aaaatagggtaaagctgcgtacaatacatcaaatggtgggatcccttttcgaatcctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 39499242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 170
Target Start/End: Original strand, 22371199 - 22371247
Alignment:
Q  122 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22371199 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 22371247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Original strand, 35017793 - 35017849
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgacta-aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcc 68  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35017793 ggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaaggtcacgggtttaagtcctgaaaacagcc 35017849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 1289095 - 1289158
Alignment:
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc-tctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  1289095 aatggtgggaccccttcccggatcatgcatatgcgggagcttttagtgcaccggattgcccttt 1289158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 167
Target Start/End: Original strand, 31525771 - 31525838
Alignment:
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  31525771 atacaccaaatgatgggaccctttgccagaccctgcatatgcgggagctttagtgtaccggattgccc 31525838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 162
Target Start/End: Original strand, 31523296 - 31523358
Alignment:
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggt 162  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31523296 atacaccaaatggtggaaccctttcccaaaccctgcatatgcgggagctttagtgcactgggt 31523358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 30864536 - 30864439
Alignment:
Q  52 aagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || || |||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  30864536 aagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaagggtgcgtacaatataccaaatggtaagatcctttcccaaaccctgcgtatgcggaagct 30864439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 124962 - 124918
Alignment:
Q  122 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  124962 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 124918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24059067 - 24059012
Alignment:
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 154  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  24059067 aatacaccatatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgtgggagctttagtg 24059012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12315786 - 12315697
Alignment:
Q  37 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcc 125  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||| |  |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  12315786 aaaggtcacgagttcaagtcatggaaacagcttcttattaaaaaacagggtaagactgtgtacaatacaccaaatagtgagactccttcc 12315697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19185806 - 19185742
Alignment:
Q  107 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || || ||| |||||||    
T  19185806 aaatggtggaaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtacatcgagttacccttta 19185742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 4852364 - 4852306
Alignment:
Q  22 gttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 80  Q
    |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  4852364 gttgtcatgtgaccgaaaagtcaggggttcaagtcctgcaaacagtctcttgtgaaaaa 4852306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 27466300 - 27466262
Alignment:
Q  2 ttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaag 40  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27466300 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 27466262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 39189592 - 39189558
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgact 35  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39189592 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgact 39189558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 129
Target Start/End: Original strand, 4252656 - 4252684
Alignment:
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccgga 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4252656 tacaccaaatggtgggaccccttcccgga 4252684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 79)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Original strand, 32703411 - 32703557
Alignment:
Q  24 tgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctt 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32703411 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctt 32703510  T
Q  124 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32703511 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 32703557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8170153 - 8169984
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8170153 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 8170054  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  8170053 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagtttcagtgcaccgggttgcccttt 8169984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 35710277 - 35710446
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  35710277 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatagggtaaggctgcgttcaa 35710376  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35710377 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaacatgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 35710446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 41014283 - 41014453
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41014283 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtaca 41014382  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41014383 atacaccaaatggtgggaccccttcctggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 41014453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 38879545 - 38879718
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  38879545 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcgtac 38879644  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38879645 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 38879718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 24448854 - 24449025
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  24448854 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtac 24448953  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24448954 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttt 24449025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4619277 - 4619104
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4619277 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 4619178  T
Q  99 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4619177 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgcccttt 4619104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 43334166 - 43334339
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgta 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||    
T  43334166 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgta 43334265  T
Q  98 caatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43334266 caatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgc-gatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 43334339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 1565395 - 1565567
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgta 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||   ||||||||||||    
T  1565395 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgagtaaaaaaacatattaaggctgcgta 1565494  T
Q  98 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1565495 caatgcaccaaatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagct-tagtgcaccgggttgcccttta 1565567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Original strand, 7368413 - 7368528
Alignment:
Q  52 aagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctcta 151  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7368413 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctcta 7368512  T
Q  152 gtgcaccgggttgccc 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  7368513 gtgcaccgggttgccc 7368528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Original strand, 27328727 - 27328885
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca-- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  27328727 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat 27328826  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||| ||| |||||    
T  27328827 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcatcggattgcc 27328885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19143102 - 19142943
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19143102 tggtaaaattgttgtcacgtgactaaaatgccacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacagtacaccaaat 19143003  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||| ||  ||||||||    
T  19143002 ggtgggaccccttcccggaccatgcgtatgcgggagatttagtgcactggcctgcccttt 19142943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22861837 - 22861669
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||||| | |||| ||||  ||||    
T  22861837 cttggcacaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaagcagtctcttgtgtaaaacaag-taagactgctcacaa 22861739  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22861738 tacatcaaatggtgggaccccttctcgaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgaattgcccttt 22861669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 13801895 - 13801766
Alignment:
Q  46 gggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgc 141  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13801895 gggttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 13801796  T
Q  142 gggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13801795 gagagctttagtgcaccgggttgcccttta 13801766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 34154908 - 34154813
Alignment:
Q  76 taaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34154908 taaatcagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggtagctctagtgcaccgggttgcccttta 34154813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 170
Target Start/End: Original strand, 1405170 - 1405322
Alignment:
Q  20 ttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggga 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1405170 ttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttatataaaaaatagagtaagtttgcgtacaatacaccaaatggtggga 1405269  T
Q  118 ccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1405270 ccctttcctgaaccctgcatatgcgggagctctagtacaccggattgcccttt 1405322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 37024725 - 37024626
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37024725 cttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 37024626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 209086 - 208936
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  209086 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacaagttcaagtcctggcaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcattcaatacaccaaaat 208987  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||    
T  208986 ggtgggaccccttcctggaccctgggtatgcaagagctttagtgcaccggg 208936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 2838742 - 2838890
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgacta-aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2838742 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaaggtcacgaggtcaagtctcagaaacagcatcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtac 2838841  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 147  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2838842 aatacaccaaatggtgggatcccttctcggaccctgcgtatgcgggagc 2838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 161
Target Start/End: Original strand, 43574609 - 43574732
Alignment:
Q  40 ggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcat 137  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43574609 ggtcacgtgttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgcgtacaatataccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgt 43574708  T
Q  138 atgcgggagctctagtgcaccggg 161  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||    
T  43574709 atgcgggagctttagagcaccggg 43574732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12006500 - 12006329
Alignment:
Q  2 ttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggg-ttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtac 98  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||| |  |||||||||| | |||    
T  12006500 ttggcgcaactgctcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggggttcaagtc-tggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtaaggctccatac 12006402  T
Q  99 aatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12006401 aatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgtgttgccctt 12006329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Original strand, 22600427 - 22600567
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacacca 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  22600427 actggtaaagttgttatcatgtgactggaaggttacgggttcaagtcctggaaacaatattttgtgtaaaacacagggtaaggctgtgtacaatacacca 22600526  T
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22600527 aatggtgggatcccttcccggatcctgcgtatgcgggagct 22600567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16880757 - 16880646
Alignment:
Q  62 aacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccg 159  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16880757 aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgtgaccacttcccggaccatgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 16880658  T
Q  160 ggttgcccttta 171  Q
    |||| |||||||    
T  16880657 ggtttcccttta 16880646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 171
Target Start/End: Original strand, 30006290 - 30006461
Alignment:
Q  2 ttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||||||||| |||||    
T  30006290 ttggcgcaactgataaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcatagattcaagtccggaaaacaacctcttatataaacaacagggtaaggctgtgtaca 30006389  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30006390 ttacactaaatggtgggaccccttcccggggcctatgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcctttta 30006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7097872 - 7097759
Alignment:
Q  59 gaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 157  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7097872 gaaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 7097773  T
Q  158 cgggttgcccttta 171  Q
    |  | |||||||||    
T  7097772 catgctgcccttta 7097759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28516593 - 28516433
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaataca-ccaaa 109  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| | |||    
T  28516593 ggtaaagttgttgtcaggtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacatcctcttgtgtaaaaaacaggctagggctgcgtacaatacatcaaaa 28516494  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  28516493 tggtgggacccattcccagaccctgcgcatgcaggagctttagtggaccaggttgcccttt 28516433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 160
Target Start/End: Original strand, 1850624 - 1850764
Alignment:
Q  21 tgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacc 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1850624 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaataacctcttgtgtaaaaacagaataagggtgcgtacaatacatcaaatggtgggacc 1850723  T
Q  120 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
     ||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  1850724 acttcctggaccctgcggatgcggaagctttagtgcaccgg 1850764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Original strand, 20135623 - 20135740
Alignment:
Q  56 cctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctcta 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |    
T  20135623 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcaggagcttca 20135722  T
Q  152 gtgcaccgggttgccctt 169  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20135723 gtgcaccgggttgccctt 20135740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Original strand, 39301099 - 39301249
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtg--taaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaa 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||    
T  39301099 ggtaaagttgttgtcatgttactgaaaggtcacgggttcaagtcttgggaacaacctcttgtgtataaaacagggtaaggatgcgtataatgcaccaaaa 39301198  T
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 161  Q
     ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||    
T  39301199 aggtgggaccccttcccggaccctccgtatgtgggag-tttagtgcaccggg 39301249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Original strand, 16957374 - 16957449
Alignment:
Q  95 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16957374 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 16957449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 171
Target Start/End: Original strand, 22187250 - 22187423
Alignment:
Q  2 ttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||    
T  22187250 ttggcgcaactagtaaagttgttgtcatttgactgaaaggtcaccggtttaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatgataagactgcgtaca 22187349  T
Q  100 atacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |||||||  |||   || |||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  22187350 atacaccaaaaacaatgagaccccttcccaaaccctacatatgcaggagctttagtgcatcaggttgcccttta 22187423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 170
Target Start/End: Original strand, 29334419 - 29334531
Alignment:
Q  61 aaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacca-aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 157  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| || || |||||    
T  29334419 aaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccagaatggtgggacccattcccggaccctgcgtatgtgggatctttaatgcac 29334518  T
Q  158 cgggttgcccttt 170  Q
    |||| ||||||||    
T  29334519 cgggctgcccttt 29334531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 3771318 - 3771474
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt 113  Q
    |||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||| || |     ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  3771318 gtaatgttgttctcacgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcatgtaaacagtctgtgtaaaaaaacagggtaaggctgtgaacaatacaccaattggt 3771417  T
Q  114 gggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3771418 gggaccccttcccggactctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 3771474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24903855 - 24903696
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 110  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||  || ||||||| |||||| |    
T  24903855 ggtaaatttgttgtcacgtgactgaaaagtcatgggcacaagtcctgaaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaagattgtgtacaatccaccaatt 24903756  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||||||| || |||||    
T  24903755 ggtgagaccccttcccggacactgcatacgcgggaactttggtgcaccgggctgtccttt 24903696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16028683 - 16028624
Alignment:
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16028683 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 16028624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42924977 - 42924830
Alignment:
Q  29 tgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttc 124  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||    
T  42924977 tgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaaaatgatggaatcccttc 42924878  T
Q  125 ccgg--accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    || |  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  42924877 ccagacaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccggattgtccttt 42924830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22908014 - 22907913
Alignment:
Q  22 gttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc 120  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22908014 gttgttatgtgactgaaaggtcaagggttcaagtccaagaaacagcctcttgtgtaaaaacagagtaaggttgcatacaatacaccaaatggtgggaccc 22907915  T
Q  121 ct 122  Q
    ||    
T  22907914 ct 22907913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 30877623 - 30877562
Alignment:
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30877623 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 30877562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5873441 - 5873321
Alignment:
Q  52 aagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 150  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| |    
T  5873441 aagtcgtggaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaaggctaagtacactacaccaattggtgggactcctccccggacactgcgtatgcgggagcttt 5873342  T
Q  151 agtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  5873341 agtgcatcgggatgcccttta 5873321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24323862 - 24323727
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 112  Q
    |||||||||| || ||||||| ||| ||||   |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||| |||||| |    
T  24323862 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaaatag 24323763  T
Q  113 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24323762 tgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagct 24323727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24360486 - 24360351
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 112  Q
    |||||||||| || ||||||| ||| ||||   |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||| |||||| |    
T  24360486 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaaatag 24360387  T
Q  113 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24360386 tgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagct 24360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12575779 - 12575659
Alignment:
Q  55 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaa---acagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 150  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||   ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |    
T  12575779 tcctggaaacagcctcttgcgtaaataaacaggctaaagttgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggagcttt 12575680  T
Q  151 agtgcaccgggttgcccttta 171  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  12575679 ggtgcaccgggctgcccttta 12575659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Original strand, 23974756 - 23974840
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  23974756 ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaagagggtaaggctgcg 23974840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 34074717 - 34074573
Alignment:
Q  17 aagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 114  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||      
T  34074717 aagttgttgtcacatgactgaaaggtcacaagttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacacagtaaggttgcgttcaatacaccaaatggca 34074618  T
Q  115 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 161  Q
    || |||||||||  ||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  34074617 gggccccttcccaaaccctgcgtatgggggag--ctagtgcaccggg 34074573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 135
Target Start/End: Original strand, 41425946 - 41426048
Alignment:
Q  35 taaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccc 132  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  41425946 taaaatgtcacgggttcaagttctggaaacaacttattgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaattggtgggaccccttcccagactc 41426045  T
Q  133 tgc 135  Q
    |||    
T  41426046 tgc 41426048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 25622533 - 25622595
Alignment:
Q  108 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25622533 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 25622595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 31299596 - 31299705
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||||||    
T  31299596 cttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttacaggtcactagttcaagtcctagaaacagcctcttgtattaaaacagtgtaaaactgcgtaca 31299695  T
Q  100 atacaccaaa 109  Q
    ||||| ||||    
T  31299696 atacatcaaa 31299705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11657785 - 11657699
Alignment:
Q  85 gtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || |||| ||||||| ||||||||    
T  11657785 gtaaggctgcatacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcacacgcgggaactttagttcaccgggctgcccttt 11657699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31694266 - 31694106
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 111  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||||||| |||||| || | || |||||||| |  || ||| ||||| ||||||||||| | ||    
T  31694266 gtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcataggttcaagtcttgaaaaaagtcactcgtgtaaaaaataggctaaagctgcatacaatacacctattg 31694167  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 172  Q
     |||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||    
T  31694166 atgggactccttcccagaccttgcgtatgcgggagatttagtgcaccagactgccctttaa 31694106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9794471 - 9794388
Alignment:
Q  77 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 160  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||| |||||||| | |||| |||||||||||    
T  9794471 aaaacagggtaagactgcatacaatacaccaaatagtgggatcccttcacagacccagcatatgcagaagctttagtgcaccgg 9794388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10943914 - 10943845
Alignment:
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  10943914 atacaccaaataacgggaccccttcccggaccctgca-atgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 10943845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 161
Target Start/End: Original strand, 13774921 - 13774991
Alignment:
Q  91 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 161  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13774921 ctgcgcacaatacaccaaatggcaggatccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 13774991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 18698586 - 18698707
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaata-caccaaat 110  Q
    ||||||| | ||||||| |||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||   | ||||    
T  18698586 tggtaaaatggttgtcacgtgattgaacggtcacgggttcaagtactgaaaacagcctcttgt-aaaaacaaggtacggctgcatacaatatgtcaaaat 18698684  T
Q  111 ggtgggaccccttcccggaccct 133  Q
    || ||||| ||||||||||||||    
T  18698685 ggcgggactccttcccggaccct 18698707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12477205 - 12477132
Alignment:
Q  86 taaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||| |||||||||    
T  12477205 taaggctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggattctgcgtatgcaagagctttagtgcacc 12477132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 10306548 - 10306496
Alignment:
Q  97 acaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10306548 acaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagct 10306496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21784395 - 21784335
Alignment:
Q  107 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  21784395 aaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggaggtttagtgcaccgagttgccc 21784335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 93
Target Start/End: Original strand, 22025538 - 22025601
Alignment:
Q  32 gactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctg 93  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22025538 gactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctg 22025601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 166
Target Start/End: Original strand, 39801591 - 39801647
Alignment:
Q  110 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39801591 tggtgggaccccttcccagaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 39801647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 169
Target Start/End: Original strand, 19438757 - 19438800
Alignment:
Q  126 cggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19438757 cggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 19438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 170
Target Start/End: Original strand, 32354211 - 32354262
Alignment:
Q  119 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32354211 cccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 32354262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 9794511 - 9794465
Alignment:
Q  20 ttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacag 66  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9794511 ttgttgtcatgtgatcaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacag 9794465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 168
Target Start/End: Original strand, 11462913 - 11462958
Alignment:
Q  123 tcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11462913 tcccgaactctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 11462958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24313732 - 24313572
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctc-ttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-t 110  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| || | || ||||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| |    
T  24313732 taaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaatacaccaaaat 24313633  T
Q  111 ggtgggaccccttcccgg-accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||  || ||  ||||| | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24313632 ggtgggaccccttcccggcgccatgtgtatgctgtagctttagtgcaccgggctgcccttt 24313572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24356069 - 24355909
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctc-ttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-t 110  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| || | || ||||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| |    
T  24356069 taaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaatacaccaaaat 24355970  T
Q  111 ggtgggaccccttcccgg-accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||  || ||  ||||| | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24355969 ggtgggaccccttcccggcgccatgtgtatgctgtagctttagtgcaccgggctgcccttt 24355909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4654478 - 4654427
Alignment:
Q  107 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 158  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4654478 aaatggtgggatcccttctcgaaccctgcatatgcgggagctttagtgcacc 4654427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 10634301 - 10634211
Alignment:
Q  17 aagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacac 105  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||  ||| |||||||    
T  10634301 aagttgttgtcaagtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctagaaacaacctcgtgtgcaaaaatcagggtaaggctcggtaaaatacac 10634211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21542532 - 21542489
Alignment:
Q  105 ccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21542532 ccaaatggtgggaccccttcccggactctgcgtatgcgggagct 21542489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 39079925 - 39079882
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtc 56  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39079925 ggtaaagttgttgtcatgtgacagaaaggtcacgggttcaagtc 39079882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 19438713 - 19438759
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgg 47  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19438713 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactaaaagatcacgg 19438759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 17419887 - 17419944
Alignment:
Q  10 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagc 67  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  17419887 actggtaaaattgttgtaatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcctggaaacagc 17419944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Original strand, 18426017 - 18426160
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 112  Q
    |||||||||| | | |||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||||  |||||||||  |||| || | |||| || |||||||||| | |||||    
T  18426017 taaagttgttattacgtgactgaaatgtcacaggtttaagtcttgaaaacaatctcttgtgtaaaaaatagagaaaggttgtgtacaatacatcgaatgg 18426116  T
Q  113 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 156  Q
    || ||||||||  || || |||| |||||| ||||| |||||||    
T  18426117 tgagaccccttttcgaactctgcgtatgcgagagctttagtgca 18426160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 39079827 - 39079755
Alignment:
Q  95 gtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| | |||||||| ||| ||||    
T  39079827 gtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccatgtgtatacgggagttttagtgcacagggctgcc 39079755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 19093885 - 19093948
Alignment:
Q  107 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19093885 aaatggtatgacccctacccggaccctgcgtatgttggagctttagtgcaccgggctgcccttt 19093948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3176839 - 3176770
Alignment:
Q  85 gtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 157  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||  ||||| |||||| ||||||||    
T  3176839 gtaaggttgcgtacaatacaccaactggtgggaccc---cccggactctgtgtatgccggagctttagtgcac 3176770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Original strand, 4809986 - 4810094
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 111  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| ||| || ||||||||||  |||||  |||||||||  |||| ||| |||| |||| ||||||| | ||||||    
T  4809986 gtaaagttgttgtcacatgagtaaaagatcatggattcaagtccttgaaacaatctcttgtgtcaaaaataggttaagactgcatacaatagatcaaatg 4810085  T
Q  112 gtgggaccc 120  Q
     ||||||||    
T  4810086 atgggaccc 4810094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 153
Target Start/End: Original strand, 15141929 - 15141998
Alignment:
Q  84 ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagt 153  Q
    |||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  15141929 ggtagggctgtgtgcaatacatcaaatggtgggaccccttcttgaaccctgcttatacgggagctttagt 15141998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 29184103 - 29184062
Alignment:
Q  128 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 169  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29184103 gaccatgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 29184062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 31362495 - 31362454
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  31362495 tggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaa 31362454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 37226037 - 37225961
Alignment:
Q  95 gtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| | |||||||| || |||||||||    
T  37226037 gtacaatacaacaaaatggtgggaccccttcccgaaccatgcgtatgccagaggtttagtgcactggattgcccttt 37225961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10219 - 10052
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10219 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagagtaagactgcgtacaa 10120  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10119 tacaccaaatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 10052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20547 - 20380
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20547 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagagtaagactgcgtacaa 20448  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20447 tacaccaaatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 20380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 8909 - 8964
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtc 56  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  8909 cttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 8964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 19237 - 19292
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtc 56  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  19237 cttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 19292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 11096 - 11265
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  11096 cttggcgcaactggtaaagttgttct-atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaagtaaggctgcttacaa 11194  T
Q  101 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11195 tacaccaaatggtgggacaccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttta 11265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 5)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 46795 - 46966
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||||    
T  46795 cttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtgctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcgtac 46894  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46895 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 46966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24938 - 24772
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24938 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtc-----aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 24844  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  24843 aacacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagccggttgcccttt 24772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 170
Target Start/End: Original strand, 43672 - 43793
Alignment:
Q  50 tcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccc-ttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43672 tcaagttctggaaacagcgtcttgtgtaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctttctcggaccctgcatatgcgggagct 43771  T
Q  149 ctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||| | ||||||||||    
T  43772 ctagtgcactgagttgcccttt 43793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 46796 - 46729
Alignment:
Q  82 agggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  46796 agggtaaggatgcatacaatataccaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagct 46729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 47041 - 46996
Alignment:
Q  14 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctg 59  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  47041 gtaaagttgttgtcaggtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctg 46996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1176 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1176
Description:

Target: scaffold1176; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1745 - 1586
Alignment:
Q  12 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1745 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacaacctcttgtgtaaaacaggataaggctgcatacaatacaccaaatg 1646  T
Q  112 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  1645 atgggaccccttcccggacccggcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcctttta 1586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13194 - 13024
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtaca 99  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  13194 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaacaaggtaaggctgcgtaca 13095  T
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13094 atacaccgaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggggctttagtgcaccgggttgcccttt 13024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 48758 - 48634
Alignment:
Q  46 gggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggga 145  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48758 gggttcaagtggtggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggga 48659  T
Q  146 gctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  48658 gctctagtgcaccgggttgcccttt 48634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 10774 - 10945
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 98  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |    
T  10774 cttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaaggtctgaaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtcc 10873  T
Q  99 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  10874 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgctcttt 10945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 58941 - 59115
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 98  Q
    ||||| || ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  58941 cttggagcaactggtaaacttattgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgtac 59040  T
Q  99 aatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  59041 aatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagactctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttta 59115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24220 - 24133
Alignment:
Q  83 gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24220 gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttt 24133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 35181 - 35062
Alignment:
Q  10 actggtaaagttg-ttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgtacaatacac 105  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35181 actggtaaagtttattgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtgtgaaaacagggtaaggctgcgtacaatacac 35082  T
Q  106 caaatggtgggaccccttcc 125  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  35081 caaatggtgggaccctttcc 35062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 73032 - 72867
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaaca-gcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||  || ||||||||||| ||    
T  73032 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgt-------gtcacgggttcaagtcctagaaacaagtctcttgtgtaaaaaacacggtaaggctgccta 72940  T
Q  98 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  72939 caatacaccaaatggtagtaccccttcccggaacctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 72867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 226577 - 226456
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgta 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||    
T  226577 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggtaaggctgcata 226478  T
Q  98 caatacaccaaatggtgggacc 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  226477 caatacatcaaatggtgggacc 226456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Original strand, 4125 - 4258
Alignment:
Q  5 gcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaata 102  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  4125 gcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaata 4224  T
Q  103 cacc---aaatggtgggaccccttcccggaccct 133  Q
    ||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  4225 caccaataattggtgggaccccttcccggaccct 4258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0954 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0954
Description:

Target: scaffold0954; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 171
Target Start/End: Original strand, 3560 - 3680
Alignment:
Q  53 agtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 150  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |    
T  3560 agtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaatgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagcttt 3659  T
Q  151 agtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    ||||||||| ||| |||||||    
T  3660 agtgcaccgagtttcccttta 3680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 148
Target Start/End: Original strand, 23590 - 23712
Alignment:
Q  28 atgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcc 125  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  23590 atgtgactgaaagggtacgggttcaagtcttgcaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtgaggctgcgtacaatgtagcaaatggtgggaccccttcc 23689  T
Q  126 cggaccctgcatatgcgggagct 148  Q
    | |||| ||  |||| |||||||    
T  23690 cagaccttgagtatgtgggagct 23712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 83839 - 83903
Alignment:
Q  1 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaaca 65  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  83839 cttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaaca 83903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Original strand, 43097 - 43172
Alignment:
Q  5 gcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 80  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  43097 gcgcaactggtaaagttattgtcatgtgattgaaaggtcacgagttcaggtcctagaaacagcctcttgtgtaaaa 43172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0867 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0867
Description:

Target: scaffold0867; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3798 - 3685
Alignment:
Q  41 gtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatat 139  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |  || | || ||||    
T  3798 gtcatgggttcaagttctgaaaacaacc-cttgtgtaaatacaaggtaacgttgcgtacaatacaccaaatggtgggacccttttctcgatcttgtatat 3700  T
Q  140 gcgggagctctagtg 154  Q
    ||||||||| |||||    
T  3699 gcgggagctttagtg 3685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 8865 - 8934
Alignment:
Q  11 ctggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  8865 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaattcctggaaacaacttcttgtgtaaaa 8934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Original strand, 24642 - 24783
Alignment:
Q  15 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 114  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||              ||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  24642 taaagttgttgtcaagtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcc--------------gggtaagactgcgtataatacaccaaatagtg 24727  T
Q  115 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 170  Q
    |  |||||| || |||||||| ||| ||||||||  |||||||| | |||||||||    
T  24728 gaccccctttccagaccctgcgtatacgggagcttcagtgcacctgattgcccttt 24783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 58699 - 58629
Alignment:
Q  100 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 171  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  58699 atacaccgaatggtgagaccccttctcggaccctgtgtatgcgggagctct-gtgcaccaggctgcccttta 58629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Original strand, 32906 - 33016
Alignment:
Q  13 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa- 109  Q
    |||| |||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||   ||| | |||||| |||  ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||     
T  32906 ggtatagttgttgccacgtgacttaaaggtcatgggttcaagtccgcgaaaaaacctcttctgtaaaaaacagagtaagactgtatacaatacaccaaat 33005  T
Q  110 tggtgggaccc 120  Q
    |||||||||||    
T  33006 tggtgggaccc 33016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University