View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11065_low_1 (Length: 819)

Name: NF11065_low_1
Description: NF11065
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11065_low_1
NF11065_low_1
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (360-752)||(13152430-13152831)
chr8 (32-248)||(9254928-9255143)
chr8 (435-752)||(27190593-27190910)
chr8 (435-721)||(28846435-28846726)
chr8 (435-752)||(14446647-14446971)
chr8 (583-752)||(9256359-9256528)
chr8 (360-556)||(9256161-9256356)
chr8 (493-746)||(24333586-24333850)
chr8 (631-752)||(30791494-30791615)
chr8 (619-752)||(16532667-16532800)
chr8 (619-752)||(21958518-21958651)
chr8 (635-721)||(10467786-10467872)
chr8 (652-752)||(10014471-10014571)
chr8 (630-710)||(42446935-42447015)
chr8 (677-752)||(32372022-32372097)
chr8 (435-524)||(23449066-23449148)
chr8 (677-752)||(32342880-32342955)
chr8 (677-752)||(32355367-32355442)
chr8 (677-752)||(32359486-32359561)
chr8 (682-752)||(40146046-40146116)
chr8 (679-748)||(34228269-34228338)
chr8 (247-297)||(9256044-9256098)
chr8 (684-742)||(2826349-2826407)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (360-752)||(14498635-14499036)
chr1 (435-752)||(9636936-9637260)
chr1 (435-752)||(30559041-30559366)
chr1 (437-752)||(48606648-48606971)
chr1 (583-752)||(52753856-52754025)
chr1 (360-551)||(52754029-52754222)
chr1 (619-752)||(25017392-25017525)
chr1 (620-752)||(26272965-26273097)
chr1 (638-752)||(35949014-35949128)
chr1 (619-752)||(40864755-40864888)
chr1 (631-752)||(21973824-21973945)
chr1 (619-713)||(17127445-17127539)
chr1 (619-752)||(32379892-32380021)
chr1 (464-585)||(30054708-30054829)
chr1 (639-752)||(30054847-30054960)
chr1 (435-478)||(30054660-30054703)
chr1 (680-752)||(17874845-17874917)
chr1 (715-752)||(28463197-28463234)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (435-752)||(31944432-31944755)
chr4 (617-752)||(53693070-53693205)
chr4 (619-743)||(27364889-27365013)
chr4 (619-752)||(12211262-12211395)
chr4 (619-752)||(4325418-4325550)
chr4 (435-550)||(24104677-24104793)
chr4 (658-752)||(3074414-3074508)
chr4 (619-713)||(55464735-55464829)
chr4 (619-752)||(42843713-42843849)
chr4 (494-567)||(51379514-51379587)
chr4 (435-487)||(17359270-17359322)
chr4 (677-752)||(8897962-8898037)
chr4 (705-752)||(1147591-1147638)
chr4 (624-682)||(1147523-1147581)
chr4 (677-752)||(10632680-10632757)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (435-752)||(9230215-9230540)
chr7 (413-720)||(43727788-43728103)
chr7 (435-752)||(23179922-23180251)
chr7 (627-752)||(26493750-26493875)
chr7 (619-752)||(27387342-27387475)
chr7 (619-752)||(19399984-19400117)
chr7 (619-752)||(45197650-45197782)
chr7 (623-755)||(18375416-18375546)
chr7 (620-752)||(38575325-38575457)
chr7 (619-752)||(8638620-8638754)
chr7 (493-585)||(25024455-25024547)
chr7 (680-752)||(14088815-14088887)
chr7 (680-752)||(14398833-14398905)
chr7 (443-499)||(5287719-5287775)
chr7 (493-608)||(5287940-5288060)
chr7 (503-585)||(24276438-24276521)
chr7 (435-499)||(25024226-25024290)
chr7 (686-752)||(25024596-25024662)
chr7 (619-659)||(23804627-23804667)
chr7 (680-748)||(25491674-25491742)
chr7 (709-752)||(9557784-9557827)
chr7 (360-395)||(26782377-26782412)
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (440-752)||(3055300-3055621)
chr5 (435-752)||(8785597-8785921)
chr5 (436-752)||(27168839-27169155)
chr5 (614-752)||(1280379-1280517)
chr5 (493-752)||(11852587-11852854)
chr5 (638-752)||(203875-203989)
chr5 (535-752)||(23244606-23244831)
chr5 (631-752)||(26540691-26540812)
chr5 (632-752)||(22541905-22542025)
chr5 (631-752)||(22712935-22713048)
chr5 (662-752)||(2228964-2229054)
chr5 (677-752)||(19518978-19519053)
chr5 (435-499)||(11849702-11849766)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (435-752)||(17554-17879)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (440-752)||(12539393-12539712)
chr2 (466-752)||(34317509-34317797)
chr2 (623-752)||(19951867-19951996)
chr2 (619-752)||(35649696-35649829)
chr2 (632-752)||(22483568-22483688)
chr2 (619-752)||(33453224-33453357)
chr2 (631-752)||(34526370-34526491)
chr2 (631-752)||(22464688-22464809)
chr2 (642-737)||(13308745-13308840)
chr2 (652-751)||(34907624-34907723)
chr2 (677-752)||(18425997-18426072)
chr2 (436-470)||(34318088-34318122)
chr2 (715-752)||(45121334-45121371)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (435-752)||(12180561-12180886)
chr6 (408-752)||(11970747-11971098)
chr6 (620-752)||(25599159-25599294)
chr6 (617-752)||(32442010-32442142)
chr6 (619-752)||(24074418-24074551)
chr6 (652-752)||(3050902-3051002)
chr6 (619-752)||(25340451-25340584)
chr6 (666-752)||(30621226-30621311)
chr6 (436-550)||(25340298-25340408)
chr6 (435-501)||(8035704-8035770)
chr6 (493-565)||(8035479-8035551)
chr6 (661-748)||(1296557-1296644)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (435-752)||(3856912-3857237)
chr3 (459-752)||(51261817-51262118)
chr3 (516-751)||(15667868-15668111)
chr3 (619-752)||(31989035-31989168)
chr3 (619-752)||(43137133-43137265)
chr3 (619-752)||(53710404-53710537)
chr3 (619-752)||(24908429-24908562)
chr3 (435-519)||(55194863-55194947)
chr3 (619-752)||(37381905-37382038)
chr3 (677-752)||(22934835-22934910)
chr3 (684-752)||(24988849-24988917)
chr3 (440-515)||(9741407-9741480)
chr3 (632-699)||(43585836-43585903)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (627-752)||(134890-135015)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (619-752)||(259924-260057)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (647-752)||(1430-1535)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (631-752)||(15832-15953)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (619-752)||(214197-214330)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (631-752)||(197123-197244)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (535-752)||(435384-435616)
[»] scaffold0726 (1 HSPs)
scaffold0726 (684-752)||(954-1022)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 360 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 13152831 - 13152430
Alignment:
Q  360 cattgctcatttaatttatgataacaatcacttcatacatnnnnnnnncttacaatcactttatacatnnnnnnn-cttacaatcacttctacaacatgg 458  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||  ||    
T  13152831 cattgctcatttaatttatggtaacaatcacttcatacataaaaaaaacttacaatcactttatacataaaaaaaacttacaatcacttctacaacgggg 13152732  T
Q  459 cataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaagt 558  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13152731 tataataaattagattttaacttctaatttgtggatcttcaataatagagggtgcaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtacaccagt 13152632  T
Q  559 tatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatga 650  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| | |   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13152631 tatcaagccatgtcaaaaagctagtaaaataatcttataagcccgtgagaaagaattgttaccaacatgatcaacgctgtgtggttcaatgacttgatga 13152532  T
Q  651 tatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaa 750  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13152531 tatgttacatcgagcgggagatattcaagtcatttgatgatgttggtattattccaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaa 13152432  T
Q  751 tt 752  Q
    ||    
T  13152431 tt 13152430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 248
Target Start/End: Original strand, 9254928 - 9255143
Alignment:
Q  32 ctcatgtacttgtacttagcacccctacccatgtattacaatttcaatcttataccaaatatgaatgacttcaaaataattgagggtattagagatgaga 131  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9254928 ctcatgtacttgtagttagcaccc-tacccatgtattacaatttcaatcttataccaaatatgaatgacttcaaaataattgagggtattagagatgaga 9255026  T
Q  132 aaatgggatattcatcgttactatgaattagttaaattagttttacattcacgtctaataaaaatcaaattatgttgcaattatttttaaaatatcatta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9255027 aaatgggatattcatcgttactatgaattagttaaattagttttacattcacgtctaataaaaatcaaattatgttgcaattatttttaaaatatcatta 9255126  T
Q  232 caaagtgaacttatatg 248  Q
    |||||||||||||||||    
T  9255127 caaagtgaacttatatg 9255143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 435 - 752
Target Start/End: Original strand, 27190593 - 27190910
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||        |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27190593 cttacaatcacttctacaactggacataataaatctgattttaacttctaatttgtagatct--------agcgagtgcaccaaagctattaccaacatc 27190684  T
Q  535 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacg 626  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||| | |   | | ||||||||    
T  27190685 aacaaaagttggaagtccaccagttgtcaagccatgtcaacaagctagtaaaataatcttataagcccgcgagaaagaattgttacaaacaagatcaacg 27190784  T
Q  627 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtc 726  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||||| |||    
T  27190785 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttgcacctagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattactcgaatattcaccgcaaagatgtc 27190884  T
Q  727 tcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    || |||||| ||||||||||||||||    
T  27190885 tcagaaaggacatttacctcctaatt 27190910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 435 - 721
Target Start/End: Original strand, 28846435 - 28846726
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatg 534  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  28846435 cttacaatcatttctacaacatgacataataaatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatatcgggtgcaccaaagctataaccaacatc 28846534  T
Q  535 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacg 626  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||  ||| || ||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||   |||  || | ||||||||    
T  28846535 aacaaaagttgtaagtctaccagttgccaaaccctgtcaataagctagtaaaataatcttataagtccgtgagaaagaattgttaccaacaagatcaacg 28846634  T
Q  627 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaag 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  28846635 atgtgtggttcaatgacttgatgat---gtacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaag 28846726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 435 - 752
Target Start/End: Original strand, 14446647 - 14446971
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||     
T  14446647 cttacaatcacttctacaacataacataataaattagattttaacttctaatttgtggaatttcaacaatattgggtacaccaaagctattaccaacatc 14446746  T
Q  535 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaattatga--atatgatcaacga 627  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  ||||| | |||||||||||||||||     ||||||||| | | ||||||||||| | |  | | |||||||||    
T  14446747 aacaaaagttggaagtccaccagtagtcaagtcctgtcaataagctagtaaaataatcttataagtctgcgagaaagaattgttaccacaagatcaacga 14446846  T
Q  628 tgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtct 727  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||    
T  14446847 tttgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccaagagagagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattctaacattcactgcaaagaggtct 14446946  T
Q  728 cggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||| |||| |||||||||||    
T  14446947 cggaaaggacattcacctcctaatt 14446971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 583 - 752
Target Start/End: Original strand, 9256359 - 9256528
Alignment:
Q  583 taatcttataagcccgtgagaaagaattatgaatatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtca 682  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9256359 taatcttataagcacgtgagaaagaattaccaatatgatcaatgatgtgtggtttaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtca 9256458  T
Q  683 cttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  9256459 cttgatgatgttgatataattcgaacattcatcgcaaagaggtctcgcaaatgacatttacctcctaatt 9256528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 360 - 556
Target Start/End: Original strand, 9256161 - 9256356
Alignment:
Q  360 cattgctcatttaatttatgataacaatcacttcatacatnnnnnnnncttacaatcactttatacatnnnnnnncttacaatcacttctacaacatggc 459  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||    
T  9256161 cattgctcatttaatttatg-taacaatcacttcatacataaaaataacttacaatcactttatacataaaaaaacttacaatcacttcttcaacatggc 9256259  T
Q  460 ataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaa 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9256260 ataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaaatacacaa 9256356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 493 - 746
Target Start/End: Original strand, 24333586 - 24333850
Alignment:
Q  493 atcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tc 587  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| ||||| | |||||||||||||||||     ||    
T  24333586 atcttcgacaatagcaggtgcaccaaaactattaccaacatcaataaaagttggaagtccaccggttgtcaagtcttgtcaataagctagtaaaataatc 24333685  T
Q  588 ttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcact 684  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |   | | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24333686 ttataagcccgtgagaaagaattgttaccaacaagatcaacgatgtatgattcaatgactttatgatatgttacactgagcgggagatattcaagtcact 24333785  T
Q  685 tgatgatgttgatataatttgaac---attcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctc 746  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||   ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24333786 tgatgatgttaatattattcgaacattattcaccacaaagaggtctcggaaagagaatttacctc 24333850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 631 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 30791615 - 30791494
Alignment:
Q  631 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcgg 730  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  30791615 gtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgacattgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtctcgg 30791516  T
Q  731 aaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  30791515 aaagggcatttaccacctaatt 30791494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 16532800 - 16532667
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||    
T  16532800 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttataccaagtgagagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcaaacattcaccgca 16532701  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16532700 aagagatatcggaaagggcatttacctcctaatt 16532667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Original strand, 21958518 - 21958651
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    |    
T  21958518 gatcaacaatatgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcaggagatattcgagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattaactcaa 21958617  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21958618 aagaggtcgcggaaagggaatttacctcctaatt 21958651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 635 - 721
Target Start/End: Original strand, 10467786 - 10467872
Alignment:
Q  635 ttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaag 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||    
T  10467786 ttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagataatcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacatgcatcggaaag 10467872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 652 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 10014571 - 10014471
Alignment:
Q  652 atgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaat 751  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| || |||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  10014571 atgttacaccgagcggaagatattcatgtcacttgatgatgttgatattattcaaacattcaccggaaagagattttggaaagggcatttacctcctaat 10014472  T
Q  752 t 752  Q
    |    
T  10014471 t 10014471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 630 - 710
Target Start/End: Original strand, 42446935 - 42447015
Alignment:
Q  630 tgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacat 710  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  42446935 tgtggttgaatgacgtgattatatgttacatcgagcggaagatattcaagtcacttgatgacgtttatattatttgaacat 42447015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 677 - 752
Target Start/End: Original strand, 32372022 - 32372097
Alignment:
Q  677 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  32372022 aagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtctcaaaaaggtcatttacctcctaatt 32372097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 435 - 524
Target Start/End: Original strand, 23449066 - 23449148
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctat 524  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23449066 cttacaatcacttttacaacagggcataataaatcagatttt-------aatttgtggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagctat 23449148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 752
Target Start/End: Original strand, 32342880 - 32342955
Alignment:
Q  677 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  32342880 aagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactgcaaaaaggtctcaaaaaggtcatttacctcctaatt 32342955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 752
Target Start/End: Original strand, 32355367 - 32355442
Alignment:
Q  677 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  32355367 aagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactgcaaaaaggtctcaaaaaggtcatttacctcctaatt 32355442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 752
Target Start/End: Original strand, 32359486 - 32359561
Alignment:
Q  677 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  32359486 aagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactgcaaagaggtctcaaaaatgtcatttacctcctaatt 32359561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 682 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 40146116 - 40146046
Alignment:
Q  682 acttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40146116 acttgatgatgttgatattattcgaacattcacaacaaagaggtctcggaaatggcatctacctcctaatt 40146046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 679 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 34228338 - 34228269
Alignment:
Q  679 gtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcct 748  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  34228338 gtcacttgatgatgttgatattattcgaacatttaccacaaagaggtcttggaaattgcatttacctcct 34228269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 297
Target Start/End: Original strand, 9256044 - 9256098
Alignment:
Q  247 tgacttaactagaatattatccctat----gaactattataccattcacccaaac 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  9256044 tgacttaactagaatattctccctatctatgaactattataccattcacccaaac 9256098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 684 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 2826407 - 2826349
Alignment:
Q  684 ttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcattta 742  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||    
T  2826407 ttgataatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtatcggcatgggcattta 2826349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 360 - 752
Target Start/End: Original strand, 14498635 - 14499036
Alignment:
Q  360 cattgctcatttaatttatgataacaatcacttcatacatnnnnnnnncttacaatcactttatacatnnnnnnn--cttacaatcacttctacaacatg 457  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| |    
T  14498635 cattgctcatttaatttatggtaacaatcacttcatacataaaaaaaacttacaatcactttatacataaaaaaaaacttacaatcacttctacaacagg 14498734  T
Q  458 gcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaag 557  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  14498735 gcataattaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgtaccaaagctattatcaacatcaacaaaagttggaagtacaccag 14498834  T
Q  558 ttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaaga---attatgaatatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatg 649  Q
    | |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||||||    |||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14498835 tcatcaagccatgtcaataagctagtaaaataatcttataagctcgtgagaaagatttgttaccaacatgatcaacgatttgtgg-tcaatgacttgatg 14498933  T
Q  650 atatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctccta 749  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14498934 atatcttacatcgagcgggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcatcgcaaagaggtctcagaaaggacatttacctccta 14499033  T
Q  750 att 752  Q
    |||    
T  14499034 att 14499036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 435 - 752
Target Start/End: Original strand, 9636936 - 9637260
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  9636936 cttacaatcacttctacaacaaggcatagtaaatcagattttaacttctaatttttggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagccattactaacatc 9637035  T
Q  535 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacga 627  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||| ||||| || ||||||||||||||    |||||||||  ||||||||| |||| | |   | | |||||| ||    
T  9637036 aacaaaagttgaaagtccaccggttataaagccctgccaataagctagtaaataatcttataagttcgtgagaaataattgttaccaacaagatcaatga 9637135  T
Q  628 tgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtct 727  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9637136 tgcgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggtgatattcaagtcacttgatgatgttgatattatttgaacattcaccgcaaagaggtct 9637235  T
Q  728 cggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  9637236 cggaaagggcatttacatcctaatt 9637260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 435 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 30559366 - 30559041
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30559366 cttacaatcacttctacaacagggcataataaatcagattttaacttataatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatc 30559267  T
Q  535 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacg 626  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||| ||||||  |||||||||||||||||     |||||||||| || |||||||||   |||| || | ||||||||    
T  30559266 aacaaaagttgaaagtccaccggttgtcaagctttgtcaataagctagtaaaatattcttataagctcgcgagaaagaattgttatcaacaagatcaacg 30559167  T
Q  627 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtc 726  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || ||| || ||    
T  30559166 atgtgtggttctatgacttgatgatatgttacaccgagcgagagatattcaagtcacttgatgatgctgatattattcgaacattcaccgtaaatagatc 30559067  T
Q  727 tcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||  ||| |  |||||||||||||||    
T  30559066 tcataaatgatatttacctcctaatt 30559041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 437 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 48606971 - 48606648
Alignment:
Q  437 tacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaa 536  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || ||    
T  48606971 tacaatcccttctacaacatggcataataaatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcaagtgcaccaaagctattaccaaaatcaa 48606872  T
Q  537 caaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaat---tatgaatatgatcaacgat 628  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||  ||||     |||||||||| |  |||| ||||||||   ||  || | ||||||||||    
T  48606871 caaaagttggaagtccactagttatcaaaccctgtcaatattctagtaaaataatcttatatgttcgtgggaaagaattgctaccaacaagatcaacgat 48606772  T
Q  629 gtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||     
T  48606771 gtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtaacttgataatgttgatattattcaaacactcaccgcaaagaggtctt 48606672  T
Q  729 ggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
     ||||||||||||||||| |||||    
T  48606671 cgaaagggcatttacctcataatt 48606648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 583 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 52754025 - 52753856
Alignment:
Q  583 taatcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaag 679  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52754025 taatcttataagcctgtgagaaagaattattaccaacatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgaacgggagatattcaag 52753926  T
Q  680 tcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52753925 tcatttgatgatgttgatattattcgaacat---tcgcaaagaggtctcggaaagggtatttacctcctaatt 52753856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 360 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 52754222 - 52754029
Alignment:
Q  360 cattgctcatttaatttatgataacaatcacttcatacatnnnnnnnncttacaatcactttatacatnnnnnnn---cttacaatcacttctacaacat 456  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||    
T  52754222 cattgctcatttaatttatggtaacaatcacttcatac-tgaaagaaacttacaatcactttatacataaaaaaaaaacttacaatcacttctacaacat 52754124  T
Q  457 ggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagta 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  52754123 ggcataattaatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagctattatcaacattaacaaaagttgaaagta 52754029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Original strand, 25017392 - 25017525
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  25017392 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatcttacaccgagcgagagatattcaaatcacttgatgatgttgatattattcgaacgttcaccgca 25017491  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25017492 aagaggtctcagaaagggcatatacctcctaatt 25017525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 620 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 26273097 - 26272965
Alignment:
Q  620 atcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaa 719  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  26273097 atcaacgatgtgttgttcaatgatttgatgatatgttacatcgagcaggagatattcaagtcacgtgatgatgttaatattattcgaacattcatcgcaa 26272998  T
Q  720 agaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26272997 acaggtctcggaaagggcaattacctactaatt 26272965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 638 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 35949128 - 35949014
Alignment:
Q  638 aatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggc 737  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  35949128 aatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatgttattcgaacattcaccgaaaagaggtctcggaaaggac 35949029  T
Q  738 atttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||||||||    
T  35949028 atttacctcctaatt 35949014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 40864888 - 40864755
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  40864888 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatcttacaccgaacgagggatattcaagtcacttgataatgttgatattattcgaacattcaccgca 40864789  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  40864788 aagaggttttagaaagggcatttacctcctaatt 40864755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 631 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 21973945 - 21973824
Alignment:
Q  631 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcgg 730  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||||    
T  21973945 gtggttaaatgatttgatgatatgttacactgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcgaacattcaccgcaaagaaatctcgg 21973846  T
Q  731 aaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21973845 aaagggcatttacctcctaatt 21973824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 619 - 713
Target Start/End: Original strand, 17127445 - 17127539
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca 713  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17127445 gatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcgcttgatgatgttgatattattcgaacattca 17127539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 32380021 - 32379892
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||    
T  32380021 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgat---atgttacaccaaacgggagatattcaattcacttgatgatgttgatattattcgaacattta-cgca 32379926  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  32379925 aagaggtatcgaaaatgacatttacctcctaatt 32379892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 585
Target Start/End: Original strand, 30054708 - 30054829
Alignment:
Q  464 taaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatca 563  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||| |||    
T  30054708 taaatcagattttaatttctaatttatggatcttcaacaatagcgggtgcattaaaaccattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccggttgtca 30054807  T
Q  564 agccatgtcaataagctagtaa 585  Q
    |||| |  ||||||||||||||    
T  30054808 agccctaccaataagctagtaa 30054829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 639 - 752
Target Start/End: Original strand, 30054847 - 30054960
Alignment:
Q  639 atgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggca 738  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||| |||  ||||||||||| ||  ||| | ||    
T  30054847 atgacttaatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatcatattgacattattcgaaccttctccgcaaagaggtatcataaatgaca 30054946  T
Q  739 tttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||    
T  30054947 tttacctcctaatt 30054960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 478
Target Start/End: Original strand, 30054660 - 30054703
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaa 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30054660 cttacaattacttctacaacatggcataataaatcagattttaa 30054703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 752
Target Start/End: Original strand, 17874845 - 17874917
Alignment:
Q  680 tcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  17874845 tcactggatgatgttgatattattcaaacattcaccgcaaagaggtctcgaaaagatcatttaccttctaatt 17874917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 715 - 752
Target Start/End: Original strand, 28463197 - 28463234
Alignment:
Q  715 cgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28463197 cgcaaagaggtcttggaaagggcattcacctcctaatt 28463234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 435 - 752
Target Start/End: Original strand, 31944432 - 31944755
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatg 534  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  31944432 cttacaatcacttctacaa--tggcataataaatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcatgaaagctattaccaacatt 31944529  T
Q  535 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacg 626  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||   |||  || | ||||||||    
T  31944530 aacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccctgccaataagctagtaaaataatcttataagctcgtgagaaagaattgttaccaacaagatcaacg 31944629  T
Q  627 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtc 726  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31944630 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagtgtgagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtc 31944729  T
Q  727 tcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31944730 tcggaaagggcatttacctcctaatt 31944755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 617 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 53693205 - 53693070
Alignment:
Q  617 atgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcg 716  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  53693205 atgatcaacggtgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagataatcaaggcacttgatgatgttgatattattcgaacattcatcg 53693106  T
Q  717 caaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  53693105 caaagaggtctcggaaagggcattcacctcttaatt 53693070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 619 - 743
Target Start/End: Original strand, 27364889 - 27365013
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |    
T  27364889 gatcaacagtgtgtggttaaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgaa 27364988  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttac 743  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  27364989 aagaggtctcgaaaagggcatttac 27365013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 12211395 - 12211262
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||    
T  12211395 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgaacaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcatttca 12211296  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    | ||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  12211295 atgaggtctcgaaaatgacatttacctcctaatt 12211262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Original strand, 4325418 - 4325550
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  4325418 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagtgggagataatcaacccacttgatgatgttgatattatttgaacattcacagca 4325517  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
     | | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4325518 ga-atgtctcagaaagggcaattacctcctaatt 4325550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 435 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 24104793 - 24104677
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagc-gggtgcaccaaagctattaccaacat 533  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24104793 cttacaattatttctacaacatggcataataaatcagattttaacttctaatttgtggatatgcaacgatagcagggtgcaccaaagctatcaccaacat 24104694  T
Q  534 gaacaaaagttggaagt 550  Q
     ||||||||||| ||||    
T  24104693 caacaaaagttgaaagt 24104677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 658 - 752
Target Start/End: Original strand, 3074414 - 3074508
Alignment:
Q  658 catcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  3074414 catcgagcgggagataatcaagtcacttgatgatgttgatattatttgaacattcatcgcaaagaggtctcaggaagggcatttatctcctaatt 3074508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 619 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 55464829 - 55464735
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca 713  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  55464829 gatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagaaaatcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattca 55464735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Original strand, 42843713 - 42843849
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| | ||    
T  42843713 gatcaacaatgtgtggtttaatgagttgatgatatgttatattgagtgagagatattcaagtcacttgatgatgttgatattaatcgaacattcaccaca 42843812  T
Q  719 aa---gaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||   ||||||||||  |||||||| || ||||||||    
T  42843813 aagaggaggtctcggggagggcattgacatcctaatt 42843849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 494 - 567
Target Start/End: Original strand, 51379514 - 51379587
Alignment:
Q  494 tcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagcc 567  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  51379514 tcttcaacaatagcaggtgcaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccggttgtcaagcc 51379587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 435 - 487
Target Start/End: Original strand, 17359270 - 17359322
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17359270 cttacaatcacttctacaacagggcataataaatcagattttaacttctaatt 17359322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 8898037 - 8897962
Alignment:
Q  677 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  8898037 aagtcactggatgatgttgatattattcgagcattcaccgcaaagaggtctcagaaagactatttacctcctaatt 8897962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 705 - 752
Target Start/End: Original strand, 1147591 - 1147638
Alignment:
Q  705 gaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1147591 gaacattcattgcaaagaggtctcggaaagagtatttacctcctaatt 1147638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 624 - 682
Target Start/End: Original strand, 1147523 - 1147581
Alignment:
Q  624 acgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtca 682  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1147523 acgatgtttggtttaatgatttgatgataggttacatcgagtggaagatattcaagtca 1147581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 10632757 - 10632680
Alignment:
Q  677 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacatt--catcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| |||||||  || |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  10632757 aagtcacttgatgatgttaatgttattcgaacattttcaccgcaaagaagtctcggaaatatcatttacctcctaatt 10632680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 435 - 752
Target Start/End: Original strand, 9230215 - 9230540
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  9230215 cttacaatcacttctacaacatgacataattaatcagattttaacatcttatttgtcgatattcaacaatagcgggtgcaccaaagctattatcaacatc 9230314  T
Q  535 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacg 626  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||| |||| | |   | ||| ||||||    
T  9230315 aacaaaagttggaaatacatcagttatcaagccatgtcaataagctagtaaaataatcttataagcccgttagaaaaaattgttaccaacatggtcaacg 9230414  T
Q  627 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtc 726  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  9230415 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatagagcgggagatactcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcatcgcaaagaggta 9230514  T
Q  727 tcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9230515 tcgaaaagggcatttacctcctaatt 9230540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 413 - 720
Target Start/End: Original strand, 43727788 - 43728103
Alignment:
Q  413 aatcactttatacatnnnnnnncttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtg 512  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  43727788 aatcactttatacatagaaaaacttacaatcacttctacaacaaggcataataaatcagactttaacttctaattcgtggatcttcaacaatagcgggtg 43727887  T
Q  513 caccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaaga 607  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||     |||||||||||  |||||||||    
T  43727888 caccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtacaccagttatcaactcatgtcaataagctagtaaaataatcttataagcctatgagaaaga 43727987  T
Q  608 attatga---atatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataattt 704  Q
    ||| | |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  43727988 attgttaccaacatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttatatcgaacgggagatattcaagtcagttgatgatgttgatattattc 43728087  T
Q  705 gaacattcatcgcaaa 720  Q
     |||||||||||||||    
T  43728088 aaacattcatcgcaaa 43728103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 435 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 23180251 - 23179922
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcacc--aaagctattaccaaca 532  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||  | |    | | | |  ||||||||||||||||    
T  23180251 cttacaatcacttctacaacagagcataataaattagaatttaatttttaatttgtggatctacaataacaaaatgggtatcttaaagctattaccaaca 23180152  T
Q  533 tgaacaaaagttggaagtacacaa---gttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgat 621  Q
    | |||||||||||||||||| | |   ||||||||||  || ||||||||||||||     |||||||||| ||||||||| |||| | |   | | |||    
T  23180151 tcaacaaaagttggaagtactccacgggttatcaagctttgccaataagctagtaaaataatcttataagctcgtgagaaataattgttaccaacaagat 23180052  T
Q  622 caacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaag 721  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  23180051 caacgatgtgtgtttcaataacttgatgatatgttacaccgagcgagagatattcaaggcacttgataatgttgatattattcgaacattcaccgcaaag 23179952  T
Q  722 aggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23179951 aggtcttggaaagggcattta-ctcctaatt 23179922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 627 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 26493875 - 26493750
Alignment:
Q  627 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtc 726  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||    
T  26493875 atgtgtggttaaatgacttgatgatacgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgtaaagaggtc 26493776  T
Q  727 tcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26493775 tcggaaagggcatttacctcctaatt 26493750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 27387475 - 27387342
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgc 717  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  27387475 gatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactcg- 27387377  T
Q  718 aaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  27387376 aaagaggtcgcggaaagagcatttacctcctaatt 27387342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Original strand, 19399984 - 19400117
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgc 717  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  19399984 gatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcgcttgatgatgttgatattattcgaacattcactcg- 19400082  T
Q  718 aaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19400083 aaagaggtcgcggaaagggtatttacctcctaatt 19400117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Original strand, 45197650 - 45197782
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| | ||    
T  45197650 gatcaacaatgtgtggttcaatgacttgatgatatatt-catcgagcaggagatattcaagtcacttgacgatgttgatattgttcgaacattcaccaca 45197748  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  45197749 aagaggtctcggggagggcatttacatcctaatt 45197782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 623 - 755
Target Start/End: Original strand, 18375416 - 18375546
Alignment:
Q  623 aacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaaga 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| || || |    
T  18375416 aacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatattacatggagcgggagatattcaaatcactagataatgttgatattattcgaacattcat-gcgaa-a 18375513  T
Q  723 ggtctcggaaagggcatttacctcctaattcga 755  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18375514 ggtctcgaaaagggcatttacttcctaattcga 18375546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 620 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 38575457 - 38575325
Alignment:
Q  620 atcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgca 718  Q
    |||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  38575457 atcaacaatgggtggttgaacgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattaaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactcg-a 38575359  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  38575358 aagaggtcgcggaaagaacatttacctcctaatt 38575325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Original strand, 8638620 - 8638754
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||||    
T  8638620 gatcaacgacgtgtggtttaattacttgatgatatgttataccgaacaagagatattcaagtcatttgatgatatcgatattattcgaacattcaacgca 8638719  T
Q  719 aaga-ggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8638720 aagagggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 8638754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 493 - 585
Target Start/End: Original strand, 25024455 - 25024547
Alignment:
Q  493 atcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa 585  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | || |||| |||||| |||||||||||||    
T  25024455 atcttcaacaatagcggatgcaccaaagctattaccagcatcaacaaaagttggaagtccaccaattgtcaatccatgttaataagctagtaa 25024547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 680 - 752
Target Start/End: Original strand, 14088815 - 14088887
Alignment:
Q  680 tcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14088815 tcacttgatgatgctgatattattcaaacatccatcgcaaagaggtctcggaaaaggcatttacctcctaatt 14088887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 680 - 752
Target Start/End: Original strand, 14398833 - 14398905
Alignment:
Q  680 tcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14398833 tcacttgatgatgctgatattattcaaacatccatcgcaaagaggtctcggaaaaggcatttacctcctaatt 14398905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 443 - 499
Target Start/End: Original strand, 5287719 - 5287775
Alignment:
Q  443 cacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttca 499  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5287719 cacttctacaacaagacataataaatcagattttaacttctaatttgtggatcttca 5287775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 493 - 608
Target Start/End: Original strand, 5287940 - 5288060
Alignment:
Q  493 atcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tc 587  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  ||| ||||  | |||||||||||||||||     ||    
T  5287940 atcttcaaaaatagcgggtgtaccaaagctattaccatcatcaacaaaagttggaagtccaccggttgtcaaatcctgtcaataagctagtaaaataatc 5288039  T
Q  588 ttataagcccgtgagaaagaa 608  Q
    ||| |||| ||||||||||||    
T  5288040 ttacaagctcgtgagaaagaa 5288060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 503 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 24276521 - 24276438
Alignment:
Q  503 atagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaag-ccatgtcaataagctagtaa 585  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |  | |||||||||||||||    
T  24276521 atagcgggtgcaccaaagctataaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttgtcaagactctatcaataagctagtaa 24276438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 435 - 499
Target Start/End: Original strand, 25024226 - 25024290
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttca 499  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  25024226 cttacaatcacttctacaacaaggcatgataaatcaaattttaaattctaatttgtagatcttca 25024290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 752
Target Start/End: Original strand, 25024596 - 25024662
Alignment:
Q  686 gatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||||||   || | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25024596 gatgatgttgataagtttcggacattcaccacaaagaggtctcagaaagggcatttacctcctaatt 25024662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 619 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 23804667 - 23804627
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttaca 659  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23804667 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgttgatatattaca 23804627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 680 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 25491742 - 25491674
Alignment:
Q  680 tcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcct 748  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  25491742 tcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactgtaaagaggtctcaaaaaaggcatttacttcct 25491674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 752
Target Start/End: Original strand, 9557784 - 9557827
Alignment:
Q  709 attcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9557784 attcaccgcaaagaggtctctgaaaggggatttacctcctaatt 9557827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26782412 - 26782377
Alignment:
Q  360 cattgctcatttaatttatgataacaatcacttcat 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26782412 cattgctcatttaatttatggtaacaatcacttcat 26782377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 440 - 752
Target Start/End: Original strand, 3055300 - 3055621
Alignment:
Q  440 aatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaa 539  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3055300 aatcacttctacaatatgacataattaatgagattttaacttctaatttatggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagctattatcaacatcaacaa 3055399  T
Q  540 aa-gttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacgatgt 630  Q
    |  | | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| | |   | ||||||||||||||    
T  3055400 attggtagaagtaaaccagttatcaagccatgtcaataagctagtaaaataatcttataagcccgtgagaaagaattgttaccaacatgatcaacgatgt 3055499  T
Q  631 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcgg 730  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||      
T  3055500 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattccgcgcaatgaggtctcat 3055599  T
Q  731 aaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  3055600 aaatggcatttacctcctaatt 3055621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 435 - 752
Target Start/End: Original strand, 8785597 - 8785921
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatg 534  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8785597 cttacaatcacttctacagcatgtcataataaatcagatttaaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatc 8785696  T
Q  535 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacg 626  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  || ||||||||||     |||||||||||| |  ||||||||||   |||  || | ||||||||    
T  8785697 aacaaaagttggaagtccactagttatcaaaccccgttaataagctagtaaaataatcttataag-caatgagaaagaattgttaccaacaagatcaacg 8785795  T
Q  627 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtc 726  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||    
T  8785796 atgtgtggttcaatgacttgataatatattacatcaagcgggagatattcaattcagttgatgatattgatattattcgaacattcaccgcaaataggtc 8785895  T
Q  727 tcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||| ||||||   |||||||||||||    
T  8785896 tcgaaaagggttcttacctcctaatt 8785921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 436 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 27169155 - 27168839
Alignment:
Q  436 ttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatga 535  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27169155 ttacaatcacttctacaacagggcataataaatcagattttaacttctaatttgtgaatcttcaataatagcgggtgtaccaaagctattaccaacatca 27169056  T
Q  536 acaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacga 627  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||| ||   |||  || | |||||||||    
T  27169055 acaaaagatggaagtccaccagttatcaagtcttgtcaataagctagtaaaataatcttataagcccatgagaaataattgttacaaacaagatcaacga 27168956  T
Q  628 tgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtct 727  Q
    |||||||||||        || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || || |||||||    
T  27168955 tgtgtggttca--------ataatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgataatgttgatattattcgaacattcaccgaaatgaggtct 27168864  T
Q  728 cggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  27168863 cataaagggcatttacctcctaatt 27168839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 614 - 752
Target Start/End: Original strand, 1280379 - 1280517
Alignment:
Q  614 aatatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca 713  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1280379 aataagatcaacaatgtgtggttcaatgatttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattca 1280478  T
Q  714 tcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1280479 ccgcaaagaggtctcggaaaaggcatttacctcctaatt 1280517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 493 - 752
Target Start/End: Original strand, 11852587 - 11852854
Alignment:
Q  493 atcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tc 587  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||   || | ||  |||| ||||| | |||||||||||||||||     ||    
T  11852587 atcttcaacaatagtgggtgcaccaaaactattactaacatcaacaaaagtgaaaaatccatcagttgtcaagtcctgtcaataagctagtaaaataatc 11852686  T
Q  588 ttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcact 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |   | | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  11852687 ttataagtccgtgagaaagaattattaccaacaagatgaaagatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgaacgggagatatttaactcact 11852786  T
Q  685 tgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| | | |||||||||||  ||||| | |||||||| ||||||    
T  11852787 tgatgatgttgatattattcgaacatttaacacaaagaggtctaagaaagagtatttaccttctaatt 11852854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 638 - 752
Target Start/End: Original strand, 203875 - 203989
Alignment:
Q  638 aatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggc 737  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  203875 aatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccggaaagaggtctcggaaaggac 203974  T
Q  738 atttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||||||||    
T  203975 atttacctcctaatt 203989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 535 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 23244831 - 23244606
Alignment:
Q  535 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacg 626  Q
    |||||||||||||| | ||   ||| ||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||  |||||||||||| | |   | | ||||||||    
T  23244831 aacaaaagttggaattccattcgttgtcaagccctgtcaataagctagtaaaataatcttataagccaatgagaaagaattgttaccaacaagatcaacg 23244732  T
Q  627 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtc 726  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  23244731 atgtgtcgttcaatgacttgatgatatgttatgtcgagcggaagttattctagtcacttgatgatgttgatattatttgaacattaaccgcaacgaggtc 23244632  T
Q  727 tcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||    
T  23244631 tcagaaagggcatgtacctgctaatt 23244606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 631 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 26540812 - 26540691
Alignment:
Q  631 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcgg 730  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||| |    
T  26540812 gtggttaaatgatttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcgaacattcaccgcaaagaaatctcag 26540713  T
Q  731 aaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26540712 aaagggcatttacctcctaatt 26540691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 632 - 752
Target Start/End: Original strand, 22541905 - 22542025
Alignment:
Q  632 tggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacatt-catcgcaaagaggtctcgg 730  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| | ||| ||||||||| |||    
T  22541905 tggttgaatgacttgatgatatgttacatcgaacggaagatattcaagtcactcgatgatgttaatattattcgaacattccctcg-aaagaggtcgcgg 22542003  T
Q  731 aaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  22542004 aaagggcatttacctcataatt 22542025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 631 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 22713048 - 22712935
Alignment:
Q  631 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcgg 730  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| |    
T  22713048 gtggttcaatgacttgatgatatg--------agcgggggatattcatgtcacttgatgatgttgatattattcaaacattcaccgcaaagaggtctcag 22712957  T
Q  731 aaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  22712956 aaagagcatttacctcctaatt 22712935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 662 - 752
Target Start/End: Original strand, 2228964 - 2229054
Alignment:
Q  662 gagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagagg-tctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  2228964 gagcggaagatatttaagtcatttgatgatgttgatattatttgaacattcatcgcaaagaggttctagg-aagggcatttacctcctaatt 2229054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 677 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 19519053 - 19518978
Alignment:
Q  677 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||    
T  19519053 aagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtattggaaaggtcatttaccacctaatt 19518978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 435 - 499
Target Start/End: Original strand, 11849702 - 11849766
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttca 499  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11849702 cttacaatcacttctacaacagggcataataactcaaattttaacttctaatttgtgggtcttca 11849766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 172; Significance: 5e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 435 - 752
Target Start/End: Original strand, 17554 - 17879
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||     
T  17554 cttacaatcacttctacaacatggcgtaataaatccgattttagcttctaatttgtggatcttcaacaaaagtgggtgcaccaaaactattaccaacatc 17653  T
Q  535 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaatt---atgaatatgatcaacg 626  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||||     |||||||||| | | ||||| ||||   || || | ||||||||    
T  17654 aacaaaagttggaagtccaccagttatcaatctctgtcaataagctagtaaaataatcttataagctcattagaaataattgttatcaacaagatcaacg 17753  T
Q  627 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtc 726  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17754 atgtgtggttcaatgacttgatgatacgttacatcgagcgggagatatttaagtcacttgctgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtc 17853  T
Q  727 tcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    || |||||| |||||| |||||||||    
T  17854 tccgaaaggacatttaactcctaatt 17879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 440 - 752
Target Start/End: Original strand, 12539393 - 12539712
Alignment:
Q  440 aatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaa 539  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12539393 aatcacttatacaacacggcataataaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatcaacaa 12539492  T
Q  540 aagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagt-----aatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacgatgtg 631  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||   |||  || | ||||||| ||| |    
T  12539493 aagttggaagtccaccagttatcaagccttgccaataagctagtaaaagaatcttataagcccgtgagaaagaattgttaccaacaagatcaacaatgcg 12539592  T
Q  632 tggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcgga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  12539593 tggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcataagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtcttgga 12539691  T
Q  732 aagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  12539692 aagaacatttacctcctaatt 12539712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 466 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 34317797 - 34317509
Alignment:
Q  466 aatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaag 565  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34317797 aatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgaaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaag 34317698  T
Q  566 ccatgtcaataagctagt-----aatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta 657  Q
    |  |||||||||||||||     ||||||||||  || ||||||||||   |||  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34317697 ctttgtcaataagctagtaaaagaatcttataaatccatgagaaagaattgttaccaacaagatcaatgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta 34317598  T
Q  658 catcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    || ||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||       ||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  34317597 caccgagtaagagatattcaagtcacttcatgatgttgatattgtt------ctcaccgcaaagaggtctcaaaaagagcatttacctcctaatt 34317509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 623 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 19951996 - 19951867
Alignment:
Q  623 aacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaaga 722  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  19951996 aacgatgtatggttcaatgacttgacgatatgtcacactgagcgagagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaaga 19951897  T
Q  723 ggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19951896 ggtctcgaaaagggcatttaccttctaatt 19951867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 35649829 - 35649696
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||  |||    
T  35649829 gatcaacgatgtgttgttcaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattgaaacattcactgca 35649730  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  35649729 aagagatctcgaaaaggacatttacttcctaatt 35649696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 632 - 752
Target Start/End: Original strand, 22483568 - 22483688
Alignment:
Q  632 tggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcgga 731  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||    
T  22483568 tggttaaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcgaacattcaccgcaaagaaatctcgga 22483667  T
Q  732 aagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22483668 aagggcatttacctcctaatt 22483688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 33453357 - 33453224
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtt-acatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc 717  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  33453357 gatcaacgatgtgtggt-caatgacttcatcatatgtttacaccgagcgggagatatttaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc 33453259  T
Q  718 aaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  33453258 aaagaggtatcagaaagagcatttacctcctaatt 33453224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 631 - 752
Target Start/End: Original strand, 34526370 - 34526491
Alignment:
Q  631 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcgg 730  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||||    
T  34526370 gtggttaaatgatttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcgaacattcaccgcaaagaaatctcgg 34526469  T
Q  731 aaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34526470 aaagggcatttacctcctaatt 34526491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 631 - 752
Target Start/End: Original strand, 22464688 - 22464809
Alignment:
Q  631 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcgg 730  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||     
T  22464688 gtggttaaatgatttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcaaacattcaccgcaaagaaatctcga 22464787  T
Q  731 aaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22464788 aaagggcatttacctcctaatt 22464809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 642 - 737
Target Start/End: Original strand, 13308745 - 13308840
Alignment:
Q  642 acttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggc 737  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  13308745 acttgatgatatgttacaccgagcgagagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccataaagaggtctcggaaagggc 13308840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 652 - 751
Target Start/End: Original strand, 34907624 - 34907723
Alignment:
Q  652 atgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaat 751  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  34907624 atgttacaccgaacgagagatactcaggtcacttgatggtgttgatataattcaaacattcatcggagagaagtttcgaaaagggcatttacctcctaat 34907723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 677 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 18426072 - 18425997
Alignment:
Q  677 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||  ||| |  |||||||||||||||    
T  18426072 aagtcacttgataatgttgatattattcgaacattcaccgtaaagaggtctcaaaaatgttatttacctcctaatt 18425997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 436 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 34318122 - 34318088
Alignment:
Q  436 ttacaatcacttctacaacatggcataataaatca 470  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34318122 ttacaatcacttctacaacagggcataataaatca 34318088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 715 - 752
Target Start/End: Original strand, 45121334 - 45121371
Alignment:
Q  715 cgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45121334 cgcaaagaggtctcggaaaagacatttacctcctaatt 45121371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 8e-85; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 435 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 12180886 - 12180561
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatg 534  Q
    |||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||     
T  12180886 cttacaatcatttctacatcaaagcataatgaatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcgccaaagttattacaaacatc 12180787  T
Q  535 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacg 626  Q
    ||||||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||| |||| | |   | | |||||||     
T  12180786 aacaaaagttgaaagtccatcagttatcaagccctgtcaataagctggtaaaataatcttataagcccgtgagaaaaaattgttaccaacaagatcaaca 12180687  T
Q  627 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtc 726  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12180686 ttgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagtgggagaaattcaagtcacttgatgttgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtc 12180587  T
Q  727 tcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||    
T  12180586 tcgggaagggcatttaccttctaatt 12180561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 408 - 752
Target Start/End: Original strand, 11970747 - 11971098
Alignment:
Q  408 cttacaatcactttatacatnnnnnnncttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagc 507  Q
    ||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| | |||||||||  |||||    
T  11970747 cttacaatcacttcatacataaaaaaacttacaatcacttctacaacagggcataataaatcaaattttaatttctaatttctagatcttcaaaaatagc 11970846  T
Q  508 gggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgag 602  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||| |||| |||| ||   || |||| |||||||     | |||||||   |||||    
T  11970847 gggtgcagcaaagctattaccaacatcagcaaaagtatgaagtccactagttgtcaaaccccatctataatctagtaaaataattttataagtatgtgag 11970946  T
Q  603 aaagaattatga---atatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatat 699  Q
    |||||||| | |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11970947 aaagaattgttaccaataagatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatcatatgttacaccgagcggaagatattcaagtcacttgatgatgttgatat 11971046  T
Q  700 aatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
      |  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11971047 tttgcgaacattcaccg-aaagaggtctcagaaagggcatttacctcctaatt 11971098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 620 - 752
Target Start/End: Original strand, 25599159 - 25599294
Alignment:
Q  620 atcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacat---tcatcg 716  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||    
T  25599159 atcaacgacgtgcggttcaatgacttgatggtatgttacatcgagtgggagataatcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcatcatcg 25599258  T
Q  717 caaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25599259 caaagaggtctcggaaagggcatttacgtcctaatt 25599294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 617 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 32442142 - 32442010
Alignment:
Q  617 atgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcg 716  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  32442142 atgattaacgatgtgtggttcaatgactt-atgatatgttacatcgagcggaagataataa--tcacttgatgatgttgatattattcgaacattcatcc 32442046  T
Q  717 caaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32442045 caaagaggtatcggaaagggcatttacctcttaatt 32442010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Original strand, 24074418 - 24074551
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattc-atcgc 717  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||     
T  24074418 gatcaacaatgtgtggtaaaatgacttgatgatatgttacaccgagggggagatattcaagttacttgatgatgttgatattattcgaacattcaaccgg 24074517  T
Q  718 aaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  24074518 aaagaggtctcgg-aatgacatttacctcctaatt 24074551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 652 - 752
Target Start/End: Original strand, 3050902 - 3051002
Alignment:
Q  652 atgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaat 751  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3050902 atgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcaaacattcaccggaaagaggtctcggaaagagcatttaccacctaat 3051001  T
Q  752 t 752  Q
    |    
T  3051002 t 3051002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Original strand, 25340451 - 25340584
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    |||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  |    
T  25340451 gatcaatgatgtgtgattaagtgatttgatgatatgttacacccagtggaagatatttaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccata 25340550  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25340551 aagaggtctcagaaagtgcatttacctcctaatt 25340584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 666 - 752
Target Start/End: Original strand, 30621226 - 30621311
Alignment:
Q  666 gggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30621226 gggagataatcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcatcg-aaagaggtctcggaaaggacatttacctcctaatt 30621311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 436 - 550
Target Start/End: Original strand, 25340298 - 25340408
Alignment:
Q  436 ttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatga 535  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    |||| |||||||| |||||||||||| |    
T  25340298 ttacaatcacttctacaacaacgcataataaatcagattttaacttctaattcgtggatcttcaacaa----gggttcaccaaagttattaccaacatca 25340393  T
Q  536 acaaaagttggaagt 550  Q
    |||||||||| ||||    
T  25340394 acaaaagttgaaagt 25340408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 435 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 8035770 - 8035704
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaac 501  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8035770 cttacaatcacttctacaacagggcataataaatcatattttaacttctaatttgtggatcttcaac 8035704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 493 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 8035551 - 8035479
Alignment:
Q  493 atcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaag 565  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  8035551 atcttcaacagtagcaggtgcaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccacgagttgtcaag 8035479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 661 - 748
Target Start/End: Original strand, 1296557 - 1296644
Alignment:
Q  661 cgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcct 748  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  || |||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1296557 cgagcgggagatattcaagtcacttgatgatattaatattattcaaatattcacaataaagaggtctcggaaaggccatttacctcct 1296644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 160; Significance: 8e-85; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 435 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 3857237 - 3856912
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatg 534  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  3857237 cttacaatcacttctacaataagacataataaatcaaattttaacttctaatttttggatcttcaacaatagcaggtgcaccaaagctattacgaacatc 3857138  T
Q  535 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaattatgaatat---gatcaacg 626  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||   ||||||||    
T  3857137 aacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccctgtcaataagctagtaaaataatcttataagcccgtgagaaataattgttaccatcaagatcaacg 3857038  T
Q  627 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtc 726  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  3857037 atgtgtggttaaatgacttgatgacatgttactcagagtgggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcaaacattcaccgcaaagaggtc 3856938  T
Q  727 tcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    || |||||   |||||||||||||||    
T  3856937 tcagaaagaaaatttacctcctaatt 3856912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 459 - 752
Target Start/End: Original strand, 51261817 - 51262118
Alignment:
Q  459 cataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaagt 558  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  51261817 cataataaatcagatcttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcaggtgcatcaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagt 51261916  T
Q  559 tatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatga 650  Q
    | |||| || ||||||||||||||     |||| | |||||| ||||| ||||||   |||  || | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  51261917 tgtcaaaccctgtcaataagctagtaaaataatataataagctcgtgaaaaagaattgttaccaacaagatcaacgaagtgtggtacaatgaattgatga 51262016  T
Q  651 tatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaa 750  Q
    |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||    
T  51262017 tatgttacactaagcggaagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcatcgtaaagaggtcttgaaaagaacatttacctcctaa 51262116  T
Q  751 tt 752  Q
    ||    
T  51262117 tt 51262118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 516 - 751
Target Start/End: Original strand, 15667868 - 15668111
Alignment:
Q  516 caaagctattaccaacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaatt 610  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| |||||     |||||||| ||| ||||||||||||    
T  15667868 caaacctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccactagttatcaagccctatcaataagcaagtaaaataatcttataaacccatgagaaagaatt 15667967  T
Q  611 atga---atatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaa 707  Q
     | |   | | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15667968 gttaccaacaagatcaaggatgtgtggttcaataacttgatgatatgttataccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaa 15668067  T
Q  708 cattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaat 751  Q
    ||| ||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15668068 catgcacaacaaagaggtatcggaaaaggcatttacctcctaat 15668111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Original strand, 31989035 - 31989168
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgc 717  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  31989035 gatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactcg- 31989133  T
Q  718 aaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31989134 aaagaggtcgcggaaagggcatttacctcctaatt 31989168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Original strand, 43137133 - 43137265
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||     
T  43137133 gatcaacgatgtatggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcgccgc- 43137231  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  43137232 aagaggtctcagaaaaggtatttacctcctaatt 43137265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Original strand, 53710404 - 53710537
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgc 717  Q
    ||||||| |||  ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  53710404 gatcaacaatggatggttgaatgacttgatgatctgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactcg- 53710502  T
Q  718 aaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53710503 aaagaggtcacggaaagggcatttacctcctaatt 53710537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 24908562 - 24908429
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgc 717  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  24908562 gatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccaagcaggagatattcaagtcgcttgaagatgttgatattattcgaacattcactcg- 24908464  T
Q  718 aaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24908463 aaagaggtcgcggaaagggtatttacctcctaatt 24908429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 435 - 519
Target Start/End: Original strand, 55194863 - 55194947
Alignment:
Q  435 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55194863 cttacaatcacttctacaacagggcataataaatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaa 55194947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 37382038 - 37381905
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||    
T  37382038 gatcaacgatgtgtggttaaatgactcgatgatatattacactgagcatgagatattcaagtcatttgatgatgtttatattattcgaacattcactgca 37381939  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  37381938 aagaggtctcggaaatgacatttgcctcctaatt 37381905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 677 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 22934910 - 22934835
Alignment:
Q  677 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22934910 aagtcacttgatgatgttgatattattagaacattcaccgcaaagaggtctcggaaaggtcatttacctcttaatt 22934835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 684 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 24988917 - 24988849
Alignment:
Q  684 ttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24988917 ttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtctcggaaagggcatgtatctcctaatt 24988849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 440 - 515
Target Start/End: Original strand, 9741407 - 9741480
Alignment:
Q  440 aatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcac 515  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9741407 aatcacttctacaccagggc-taataaatcagattttaacttt-aatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcac 9741480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 632 - 699
Target Start/End: Original strand, 43585836 - 43585903
Alignment:
Q  632 tggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatat 699  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  43585836 tggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatatccaagttacttgacgatgttaatat 43585903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 627 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 135015 - 134890
Alignment:
Q  627 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtc 726  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||    
T  135015 atgtgtggttaaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccggaaagaggtc 134916  T
Q  727 tcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  134915 tcggaaagggcatttacctcctaatt 134890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Original strand, 259924 - 260057
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  259924 gatcaacaatgagtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggatatattcaagtcacttgatgacattgatattattcgaacattcaccgca 260023  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  260024 aagaggtctcggaaatggcatttaccacctaatt 260057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 78; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 647 - 752
Target Start/End: Original strand, 1430 - 1535
Alignment:
Q  647 atgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctc 746  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1430 atgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgatgttgatattattcgaacattcattgcaaagaggtctcggaaatggcatttgcctc 1529  T
Q  747 ctaatt 752  Q
    ||||||    
T  1530 ctaatt 1535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 78; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 631 - 752
Target Start/End: Original strand, 15832 - 15953
Alignment:
Q  631 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcgg 730  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||||    
T  15832 gtggttaaatgatttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcgaacattcaccgcaaagaaatctcgg 15931  T
Q  731 aaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15932 aaagggcatttacctcctaatt 15953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 619 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 214330 - 214197
Alignment:
Q  619 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 718  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    |    
T  214330 gatcaacaatatgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcaggagatattcgagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattaactcaa 214231  T
Q  719 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  214230 aagaggtcgcggaaagggaatttacctcctaatt 214197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 631 - 752
Target Start/End: Original strand, 197123 - 197244
Alignment:
Q  631 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcgg 730  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||     
T  197123 gtggttaaatgaattgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcaaacattcaccgcaaagaaatctcga 197222  T
Q  731 aaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  197223 aaagggcatttacctcctaatt 197244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 535 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 435616 - 435384
Alignment:
Q  535 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacg 626  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||     |||||||||| ||||||||| |||| | |   | | ||||||      
T  435616 aacaaaagttcgaagtccaccagttgtcaacccatgtcaataagttagtaaaataatcttataagctcgtgagaaaaaattgttaccaacaagatcaata 435517  T
Q  627 atgtgtggttcaatgacttgatgatatg-----ttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaac--attcatcgcaa 719  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||     ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||| | ||| |    
T  435516 atgtgtggctcaatgacttgatgatatgatatgttacaccgagcggaagatattcaagtcacttgattatgttgatattattagaacatattaaccgcga 435417  T
Q  720 agaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  435416 agaggtctcgaaaaggacatttacctcctaatt 435384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0726 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0726
Description:

Target: scaffold0726; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 684 - 752
Target Start/End: Original strand, 954 - 1022
Alignment:
Q  684 ttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 752  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  954 ttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtctccgaaagggcatttatctcctaatt 1022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University