View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11069A_low_181 (Length: 246)

Name: NF11069A_low_181
Description: NF11069A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11069A_low_181
NF11069A_low_181
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (48-231)||(11357181-11357362)
chr3 (48-231)||(46297562-46297743)
chr3 (52-218)||(44186321-44186485)
chr3 (48-231)||(7327282-7327463)
chr3 (48-231)||(33698348-33698529)
chr3 (48-231)||(44891692-44891873)
chr3 (48-231)||(2008127-2008315)
chr3 (48-231)||(40936168-40936349)
chr3 (48-230)||(22622518-22622698)
chr3 (48-231)||(21009601-21009783)
chr3 (48-231)||(1089889-1090069)
chr3 (48-231)||(26941060-26941241)
chr3 (48-231)||(40552059-40552240)
chr3 (48-231)||(48355136-48355317)
chr3 (48-231)||(52040722-52040903)
chr3 (49-231)||(42505876-42506056)
chr3 (48-227)||(4015659-4015835)
chr3 (48-231)||(24707915-24708096)
chr3 (48-231)||(25579934-25580115)
chr3 (48-231)||(53228952-53229133)
chr3 (48-214)||(29099558-29099722)
chr3 (48-231)||(33378585-33378766)
chr3 (48-231)||(39282847-39283028)
chr3 (48-231)||(47481717-47481899)
chr3 (48-231)||(3362450-3362631)
chr3 (48-227)||(32373669-32373845)
chr3 (48-221)||(21193812-21193983)
chr3 (48-229)||(22445865-22446044)
chr3 (71-231)||(34133130-34133288)
chr3 (48-231)||(54506002-54506184)
chr3 (48-207)||(14586480-14586636)
chr3 (48-231)||(22451163-22451344)
chr3 (55-232)||(36012332-36012508)
chr3 (48-214)||(29164021-29164178)
chr3 (48-231)||(24488762-24488943)
chr3 (103-217)||(51212624-51212738)
chr3 (48-231)||(37157902-37158084)
chr3 (77-232)||(46994490-46994643)
chr3 (48-229)||(4761448-4761627)
chr3 (101-231)||(54828552-54828682)
chr3 (48-231)||(37203262-37203444)
chr3 (71-227)||(38591897-38592051)
chr3 (48-231)||(11467019-11467186)
chr3 (48-216)||(50475021-50475194)
chr3 (111-231)||(45174701-45174821)
chr3 (52-232)||(3655003-3655184)
chr3 (63-218)||(43975707-43975863)
chr3 (48-231)||(11356958-11357131)
chr3 (127-227)||(43348456-43348556)
chr3 (54-231)||(27480164-27480347)
chr3 (48-231)||(20373063-20373225)
chr3 (113-221)||(53811597-53811701)
chr3 (111-231)||(11835494-11835608)
chr3 (194-231)||(53176249-53176286)
chr3 (48-88)||(35844583-35844623)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (48-231)||(15612560-15612741)
chr7 (48-231)||(18797506-18797687)
chr7 (48-231)||(8861464-8861645)
chr7 (48-231)||(37110053-37110234)
chr7 (48-231)||(17842385-17842566)
chr7 (48-231)||(23111371-23111552)
chr7 (48-227)||(29173706-29173882)
chr7 (48-231)||(32820854-32821035)
chr7 (48-229)||(6546700-6546879)
chr7 (48-231)||(5657281-5657463)
chr7 (48-231)||(9355627-9355808)
chr7 (48-231)||(26980485-26980666)
chr7 (48-231)||(31520542-31520723)
chr7 (49-231)||(30055706-30055886)
chr7 (48-231)||(24211920-24212102)
chr7 (48-231)||(31578865-31579046)
chr7 (48-231)||(37703299-37703480)
chr7 (48-231)||(46480930-46481111)
chr7 (48-232)||(32432630-32432812)
chr7 (65-231)||(27283923-27284088)
chr7 (48-231)||(37347200-37347381)
chr7 (77-214)||(12165939-12166074)
chr7 (48-232)||(35353286-35353468)
chr7 (48-231)||(7334973-7335153)
chr7 (48-231)||(10359015-10359196)
chr7 (48-227)||(25691345-25691522)
chr7 (52-231)||(41764883-41765060)
chr7 (63-218)||(44411356-44411509)
chr7 (65-231)||(11071385-11071546)
chr7 (48-231)||(15672560-15672744)
chr7 (48-215)||(43925296-43925455)
chr7 (48-231)||(10481784-10481965)
chr7 (52-231)||(21991815-21991983)
chr7 (48-231)||(26587893-26588066)
chr7 (48-186)||(22687455-22687591)
chr7 (48-231)||(12390450-12390629)
chr7 (65-205)||(37704387-37704525)
chr7 (48-231)||(44598845-44599026)
chr7 (48-231)||(4583098-4583279)
chr7 (48-231)||(32593008-32593188)
chr7 (48-221)||(48928098-48928269)
chr7 (104-231)||(33688117-33688244)
chr7 (65-207)||(34361996-34362138)
chr7 (139-231)||(38258724-38258816)
chr7 (130-231)||(38053640-38053741)
chr7 (128-231)||(43686219-43686322)
chr7 (48-122)||(38258867-38258939)
chr7 (158-221)||(48928473-48928536)
chr7 (180-231)||(37704336-37704387)
chr7 (182-231)||(27421313-27421362)
chr7 (48-82)||(12166215-12166249)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (48-231)||(3879738-3879919)
chr6 (48-221)||(6090981-6091152)
chr6 (48-231)||(1946038-1946220)
chr6 (48-231)||(29182368-29182546)
chr6 (48-231)||(5627595-5627777)
chr6 (48-231)||(7234831-7235015)
chr6 (53-231)||(4318626-4318802)
chr6 (48-214)||(33892811-33892975)
chr6 (48-231)||(21016917-21017092)
chr6 (48-231)||(20768286-20768467)
chr6 (48-231)||(8513432-8513606)
chr6 (48-229)||(6089109-6089281)
chr6 (48-227)||(33619033-33619218)
chr6 (48-182)||(7054571-7054704)
chr6 (146-231)||(30353253-30353338)
chr6 (177-231)||(7055141-7055195)
chr6 (166-232)||(15491818-15491884)
chr6 (52-88)||(33724062-33724098)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (48-231)||(1815505-1815686)
chr4 (48-227)||(7703717-7703894)
chr4 (48-231)||(47253944-47254125)
chr4 (48-231)||(33341602-33341783)
chr4 (48-214)||(37775879-37776043)
chr4 (48-231)||(55240931-55241112)
chr4 (48-231)||(55477717-55477898)
chr4 (48-221)||(23761285-23761456)
chr4 (48-216)||(50764939-50765105)
chr4 (48-214)||(30002467-30002631)
chr4 (48-220)||(46887984-46888154)
chr4 (48-231)||(17167917-17168098)
chr4 (48-231)||(17173494-17173675)
chr4 (48-231)||(25184317-25184498)
chr4 (48-227)||(29584026-29584203)
chr4 (50-221)||(34947923-34948092)
chr4 (48-231)||(36493515-36493696)
chr4 (49-231)||(37663568-37663748)
chr4 (48-232)||(37287931-37288114)
chr4 (48-228)||(50697448-50697627)
chr4 (48-212)||(19440474-19440636)
chr4 (48-231)||(34361317-34361499)
chr4 (48-231)||(879374-879555)
chr4 (48-227)||(17272172-17272349)
chr4 (65-231)||(32912422-32912587)
chr4 (49-231)||(19089280-19089460)
chr4 (48-231)||(35020857-35021042)
chr4 (48-231)||(3042823-3043004)
chr4 (48-231)||(33816342-33816523)
chr4 (48-207)||(39400236-39400393)
chr4 (52-214)||(4598203-4598363)
chr4 (48-229)||(7152030-7152209)
chr4 (48-231)||(6864239-6864420)
chr4 (48-231)||(28002812-28002993)
chr4 (48-231)||(49376171-49376352)
chr4 (48-227)||(27396824-27396999)
chr4 (48-231)||(25700882-25701063)
chr4 (48-231)||(32579650-32579831)
chr4 (48-200)||(4205219-4205369)
chr4 (48-204)||(32592315-32592469)
chr4 (68-231)||(42199933-42200096)
chr4 (48-232)||(5047792-5047974)
chr4 (48-199)||(9139465-9139612)
chr4 (48-232)||(46883940-46884117)
chr4 (48-231)||(26896291-26896473)
chr4 (48-173)||(35025393-35025515)
chr4 (48-164)||(23431826-23431940)
chr4 (50-231)||(4934040-4934209)
chr4 (124-231)||(38012058-38012165)
chr4 (158-231)||(35025530-35025603)
chr4 (131-194)||(56050171-56050234)
chr4 (48-129)||(38012568-38012647)
chr4 (151-221)||(54499165-54499234)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (48-227)||(12117-12293)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (48-231)||(19120063-19120244)
chr5 (48-231)||(24886291-24886472)
chr5 (48-231)||(31786436-31786617)
chr5 (48-227)||(15992330-15992507)
chr5 (48-221)||(25889584-25889755)
chr5 (48-231)||(5830096-5830278)
chr5 (48-232)||(22973872-22974054)
chr5 (48-232)||(22980996-22981178)
chr5 (48-232)||(31705402-31705584)
chr5 (48-231)||(699354-699535)
chr5 (48-231)||(2888235-2888416)
chr5 (48-231)||(38528027-38528208)
chr5 (48-231)||(22255386-22255567)
chr5 (48-227)||(27330512-27330689)
chr5 (48-214)||(22019844-22020008)
chr5 (48-214)||(25669797-25669961)
chr5 (48-214)||(42342942-42343106)
chr5 (48-231)||(8741675-8741857)
chr5 (48-231)||(7208654-7208835)
chr5 (48-231)||(33908437-33908617)
chr5 (48-211)||(35826276-35826437)
chr5 (48-214)||(7693442-7693606)
chr5 (48-214)||(9200445-9200609)
chr5 (48-214)||(32563361-32563525)
chr5 (48-218)||(35511272-35511440)
chr5 (52-231)||(5837759-5837936)
chr5 (48-231)||(8437169-8437350)
chr5 (48-231)||(35504569-35504750)
chr5 (48-231)||(35934100-35934281)
chr5 (48-231)||(27318278-27318458)
chr5 (48-231)||(25500716-25500897)
chr5 (65-231)||(17157838-17158002)
chr5 (101-231)||(1429003-1429133)
chr5 (48-231)||(12910559-12910740)
chr5 (48-231)||(40133589-40133770)
chr5 (48-231)||(23116020-23116193)
chr5 (48-186)||(39573060-39573196)
chr5 (101-230)||(13956203-13956332)
chr5 (48-231)||(30969114-30969295)
chr5 (48-231)||(36860628-36860809)
chr5 (48-231)||(36866966-36867147)
chr5 (48-221)||(14409131-14409302)
chr5 (48-231)||(21088559-21088737)
chr5 (48-232)||(8466930-8467111)
chr5 (48-207)||(43308450-43308607)
chr5 (48-221)||(15724702-15724873)
chr5 (48-175)||(26269069-26269194)
chr5 (48-175)||(28416341-28416466)
chr5 (48-136)||(43254154-43254240)
chr5 (48-231)||(14919329-14919499)
chr5 (108-231)||(6824329-6824450)
chr5 (101-232)||(23954636-23954761)
chr5 (177-231)||(26268278-26268332)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (48-231)||(7006756-7006937)
chr2 (48-231)||(11366198-11366380)
chr2 (48-231)||(2325196-2325377)
chr2 (48-227)||(18494099-18494276)
chr2 (48-227)||(33709050-33709227)
chr2 (48-232)||(31570552-31570734)
chr2 (48-231)||(44913868-44914052)
chr2 (48-231)||(4763835-4764016)
chr2 (48-231)||(41961044-41961225)
chr2 (48-213)||(33660195-33660358)
chr2 (48-221)||(13711673-13711844)
chr2 (48-231)||(19289141-19289322)
chr2 (48-231)||(26357781-26357962)
chr2 (48-214)||(5881750-5881914)
chr2 (48-231)||(35959100-35959277)
chr2 (48-229)||(43648063-43648242)
chr2 (71-214)||(27349789-27349930)
chr2 (48-231)||(41465705-41465886)
chr2 (54-232)||(19500739-19500915)
chr2 (48-214)||(43770666-43770830)
chr2 (48-231)||(4167126-4167307)
chr2 (48-231)||(31862056-31862237)
chr2 (48-218)||(39167187-39167355)
chr2 (48-231)||(19424460-19424627)
chr2 (48-231)||(3177143-3177324)
chr2 (48-231)||(33550801-33550985)
chr2 (101-231)||(44286153-44286283)
chr2 (81-231)||(4478569-4478717)
chr2 (48-231)||(37905914-37906096)
chr2 (101-218)||(19314061-19314181)
chr2 (80-231)||(4263926-4264076)
chr2 (48-231)||(29241963-29242137)
chr2 (141-231)||(17071646-17071736)
chr2 (130-231)||(36642192-36642293)
chr2 (143-231)||(18258198-18258286)
chr2 (141-231)||(17054005-17054095)
chr2 (48-162)||(41463408-41463520)
chr2 (48-193)||(41051118-41051260)
chr2 (130-231)||(45327924-45328025)
chr2 (161-232)||(41463779-41463850)
chr2 (48-151)||(18257356-18257457)
chr2 (48-132)||(33902317-33902399)
chr2 (48-88)||(45328035-45328075)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (48-231)||(37451485-37451666)
chr1 (48-231)||(38823414-38823595)
chr1 (48-231)||(2959948-2960129)
chr1 (48-231)||(11742163-11742344)
chr1 (48-231)||(16415846-16416027)
chr1 (48-231)||(27532777-27532957)
chr1 (48-231)||(48353743-48353923)
chr1 (48-231)||(19899563-19899745)
chr1 (48-231)||(23999547-23999729)
chr1 (48-228)||(27266995-27267173)
chr1 (48-231)||(32216255-32216436)
chr1 (50-231)||(47682291-47682470)
chr1 (48-231)||(3309353-3309535)
chr1 (48-231)||(46931609-46931791)
chr1 (48-231)||(10922927-10923108)
chr1 (48-231)||(39393584-39393765)
chr1 (48-231)||(47279389-47279570)
chr1 (48-221)||(7078858-7079029)
chr1 (48-212)||(3535142-3535304)
chr1 (48-231)||(8222328-8222509)
chr1 (48-231)||(15383133-15383315)
chr1 (48-228)||(27227280-27227458)
chr1 (48-231)||(27763105-27763287)
chr1 (48-231)||(238308-238489)
chr1 (48-231)||(28769853-28770034)
chr1 (48-231)||(30254623-30254804)
chr1 (48-231)||(32267234-32267415)
chr1 (48-221)||(14758242-14758413)
chr1 (48-232)||(4330480-4330662)
chr1 (48-232)||(9902849-9903031)
chr1 (48-231)||(22170911-22171092)
chr1 (72-231)||(51129059-51129216)
chr1 (52-229)||(25160834-25161010)
chr1 (48-218)||(28564578-28564746)
chr1 (48-218)||(34012177-34012345)
chr1 (63-231)||(1359745-1359911)
chr1 (48-231)||(15168296-15168477)
chr1 (48-228)||(27563700-27563878)
chr1 (48-186)||(1547516-1547652)
chr1 (76-231)||(30326775-30326928)
chr1 (48-231)||(10181802-10181984)
chr1 (48-231)||(15752229-15752410)
chr1 (101-231)||(18422851-18422981)
chr1 (48-217)||(21289817-21289981)
chr1 (103-231)||(40885013-40885141)
chr1 (48-229)||(42721241-42721417)
chr1 (65-210)||(41926378-41926520)
chr1 (101-210)||(37618747-37618856)
chr1 (48-194)||(31962853-31962998)
chr1 (48-227)||(31621343-31621526)
chr1 (118-231)||(38759733-38759846)
chr1 (127-231)||(33725472-33725576)
chr1 (153-214)||(48620845-48620906)
chr1 (48-97)||(48620921-48620970)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (48-231)||(7890763-7890944)
chr8 (48-231)||(38644181-38644362)
chr8 (48-230)||(16446681-16446861)
chr8 (50-207)||(466059-466214)
chr8 (48-232)||(11727226-11727408)
chr8 (48-231)||(1149438-1149619)
chr8 (48-231)||(23854237-23854418)
chr8 (48-231)||(37970325-37970506)
chr8 (48-231)||(4132492-4132673)
chr8 (48-231)||(5299752-5299933)
chr8 (48-231)||(16223066-16223247)
chr8 (48-231)||(36694772-36694953)
chr8 (48-231)||(43643401-43643582)
chr8 (48-231)||(1205130-1205311)
chr8 (48-231)||(1953794-1953975)
chr8 (48-207)||(34951863-34952020)
chr8 (48-231)||(8803622-8803804)
chr8 (48-231)||(27082644-27082825)
chr8 (48-231)||(44869700-44869881)
chr8 (48-218)||(34895178-34895346)
chr8 (63-231)||(6098334-6098505)
chr8 (48-231)||(33906415-33906594)
chr8 (78-213)||(1149756-1149889)
chr8 (48-231)||(31933692-31933873)
chr8 (48-229)||(35459517-35459696)
chr8 (48-200)||(12587816-12587966)
chr8 (48-208)||(35859160-35859318)
chr8 (48-231)||(40862622-40862804)
chr8 (48-227)||(39098925-39099102)
chr8 (48-186)||(24823200-24823336)
chr8 (71-231)||(9864351-9864509)
chr8 (48-219)||(10555011-10555179)
chr8 (48-221)||(12876323-12876494)
chr8 (48-231)||(30654389-30654570)
chr8 (48-175)||(33198061-33198186)
chr8 (52-192)||(18259321-18259459)
chr8 (124-231)||(13307826-13307932)
chr8 (152-231)||(41910897-41910975)
chr8 (48-134)||(43025974-43026058)
chr8 (157-231)||(7998481-7998555)
chr8 (164-232)||(43025904-43025972)
chr8 (48-133)||(41362723-41362806)
chr8 (113-200)||(34463708-34463792)
chr8 (48-80)||(13307931-13307963)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (48-228)||(408229-408407)
scaffold0002 (48-231)||(338-513)
scaffold0002 (48-194)||(93901-94044)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (49-231)||(8091-8271)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (48-231)||(145815-145997)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (48-231)||(44161-44341)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (48-231)||(154446-154626)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (118-221)||(267499-267602)
scaffold0008 (48-100)||(267609-267661)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (168-214)||(100948-100994)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 11357181 - 11357362
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11357181 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 11357278  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11357279 ggacttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 11357362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 46297562 - 46297743
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46297562 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacta--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 46297659  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46297660 ggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 46297743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 218
Target Start/End: Original strand, 44186321 - 44186485
Alignment:
Q  52 gttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagat 151  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44186321 gttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagac 44186418  T
Q  152 ttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagt 218  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  44186419 ttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagt 44186485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 7327282 - 7327463
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7327282 aaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 7327379  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7327380 agacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 7327463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33698529 - 33698348
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33698529 aaaagttaattttaatcttaatgactgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaatatctt 33698432  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  33698431 agacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttaca 33698348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44891873 - 44891692
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44891873 aaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 44891776  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  44891775 agacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 44891692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2008315 - 2008127
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactg-----tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaac 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||     |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  2008315 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaac 2008216  T
Q  143 atcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2008215 atcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 2008127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40936349 - 40936168
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40936349 aaaagttaatttcaatcttaatgattgatttatttttaaattgttgattaccg--attaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 40936252  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  40936251 agacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 40936168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 22622518 - 22622698
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22622518 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaatagttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 22622615  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttac 230  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22622616 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 22622698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 21009601 - 21009783
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21009601 aaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatct 21009698  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21009699 tagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 21009783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1090069 - 1089889
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1090069 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatctt 1089972  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1089971 ggattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttaca 1089889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 26941060 - 26941241
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26941060 aaaagttaattttgattttaacgcttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 26941157  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  26941158 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagttttaagtgttaca 26941241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 40552059 - 40552240
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  40552059 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcat 40552156  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | |||||||||    
T  40552157 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttaca 40552240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48355317 - 48355136
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  48355317 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatctt 48355220  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48355219 ggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 48355136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 52040722 - 52040903
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  52040722 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactc--attaatgatcaataatcattcatctagtaatgtttgcaacatctt 52040819  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52040820 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 52040903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Original strand, 42505876 - 42506056
Alignment:
Q  49 aaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctta 148  Q
    ||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  42505876 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 42505973  T
Q  149 gatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42505974 gacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 42506056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4015835 - 4015659
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4015835 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 4015738  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||| |||||    
T  4015737 ggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaaca-agttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgt 4015659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 24707915 - 24708096
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24707915 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgattaatagtaatttatctaataatgcttgcaacttctt 24708012  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || || |||||||||    
T  24708013 ggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtgttaca 24708096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25580115 - 25579934
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25580115 aaaagttaatcttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattgcgg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatctt 25580018  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  25580017 agatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttaca 25579934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 53228952 - 53229133
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53228952 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 53229049  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
      | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  53229050 gaacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttaca 53229133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29099722 - 29099558
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29099722 aaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 29099625  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
     || ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29099624 ggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 29099558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 33378585 - 33378766
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33378585 aaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 33378682  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
      | ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||| |||||    
T  33378683 gaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatagtcttaagtattaca 33378766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39283028 - 39282847
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  39283028 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 39282931  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39282930 ggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 39282847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47481899 - 47481717
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47481899 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatct 47481802  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47481801 tgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 47481717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3362631 - 3362450
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  3362631 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatatt 3362534  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||  | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3362533 ggacttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttaca 3362450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32373845 - 32373669
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||| || |  ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32373845 aaaagttaattttaatcttattgatgaattcatttt-aaattgttgattactg--attaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 32373749  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  32373748 agacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgt 32373669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21193983 - 21193812
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  21193983 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaataatcaatagtaattcatttagtaatggttgcaacatctt 21193886  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 221  Q
      | |||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21193885 gaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctt 21193812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 22445865 - 22446044
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||    
T  22445865 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatatttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatccagtaatacttgcaacatttt 22445962  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtta 229  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22445963 ggacttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgtta 22446044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34133288 - 34133130
Alignment:
Q  71 tttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatc 170  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |  ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  34133288 tttgattcatttttaaattgttgattaccg--attcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 34133191  T
Q  171 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34133190 gttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 34133130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54506184 - 54506002
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  54506184 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacattt 54506087  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54506086 tggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 54506002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 207
Target Start/End: Original strand, 14586480 - 14586636
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14586480 aaaaattaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactg--attaatgatcagtagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 14586577  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 207  Q
     || ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14586578 ggacttac-cgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatat 14586636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22451344 - 22451163
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22451344 aaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaatttttgattgctg--attaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 22451247  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| || | |||||||    
T  22451246 ggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttaca 22451163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36012508 - 36012332
Alignment:
Q  55 aattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagattta 154  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || || |||    
T  36012508 aattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcagcattttggactta 36012411  T
Q  155 caggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaac-agagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  36012410 tcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacat 36012332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29164178 - 29164021
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  29164178 aaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgatta---------atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatctt 29164088  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29164087 agacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 29164021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 24488762 - 24488943
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24488762 aaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattattgattattg--attcatgattaatagtaatgcatctagtaatgcttgcaacatctt 24488859  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
      | |||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24488860 gaacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttaca 24488943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 217
Target Start/End: Original strand, 51212624 - 51212738
Alignment:
Q  103 attaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgct 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |    
T  51212624 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 51212723  T
Q  203 gatattatgtgatag 217  Q
    |||||||||||||||    
T  51212724 gatattatgtgatag 51212738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37158084 - 37157902
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  37158084 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactc--attaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgacatatt 37157987  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaac-agagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37157986 ggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 37157902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 232
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994643
Alignment:
Q  77 tcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggt 176  Q
    ||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||     
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcgga 46994587  T
Q  177 atctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46994588 atctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacat 46994643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 4761448 - 4761627
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||    
T  4761448 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcattttcaaattgttgatttctg--attaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgcaacatttt 4761545  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtta 229  Q
     || ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4761546 ggacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 4761627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 231
Target Start/End: Original strand, 54828552 - 54828682
Alignment:
Q  101 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||    
T  54828552 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaacatagttg 54828651  T
Q  201 ctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  54828652 atgatattatttgatagttttaagtgttaca 54828682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37203444 - 37203262
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || ||    
T  37203444 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactc--attaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgatatatt 37203347  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaac-agagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37203346 ggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 37203262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38592051 - 38591897
Alignment:
Q  71 tttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatc 170  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  38592051 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatc 38591954  T
Q  171 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
    ||||  |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38591953 gttgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 38591897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11467186 - 11467019
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||         |||||||||||||||| |||||       ||||||||||||    
T  11467186 aaaagttaattttattcttaatgattgattcatttttaaattgttgatta---------atgatcaatagtaattcatcta-------ttgcaacatctt 11467103  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11467102 agacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 11467019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50475194 - 50475021
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactg-----tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaac 142  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50475194 aaaatttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaac 50475095  T
Q  143 atcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgata 216  Q
    ||||| || ||||| ||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  50475094 atcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174701
Alignment:
Q  111 tcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattat 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcat 45174722  T
Q  211 gtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     | |||||||| |||||||||    
T  45174721 attatagtcttaagtgttaca 45174701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Original strand, 3655003 - 3655184
Alignment:
Q  52 gttaattttagtcttaatgtttgattc-atttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatt--tatctagtaatgcttgcaacatctta 148  Q
    |||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  3655003 gttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattgttgattactg--attaataatcaatagtaattcatatctagtaatgcttgcaacatcttg 3655100  T
Q  149 gatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
    || ||| | ||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  3655101 gacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgttacat 3655184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 218
Target Start/End: Original strand, 43975707 - 43975863
Alignment:
Q  63 tcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtact 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  43975707 tcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtact 43975804  T
Q  163 attttatcgttggtatctttaacatgca---aacagagttgctgatattatgtgatagt 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |   |||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  43975805 attttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgatagt 43975863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 11356958 - 11357131
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||   ||||||||| ||||||||||        |||||||||||||||||    
T  11356958 aaaagttaattttgatcttaatgttggattcatttttaaattgttgattacta--attaatgatgaatagtaatt--------aatgcttgcaacatctt 11357047  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||  |||||||||||| |||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11357048 ggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttaca 11357131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43348556 - 43348456
Alignment:
Q  127 tagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  43348556 tagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtg 43348457  T
Q  227 t 227  Q
    |    
T  43348456 t 43348456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Original strand, 27480164 - 27480347
Alignment:
Q  54 taattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaa----catcttag 149  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    ||| || |    
T  27480164 taattttgttcttaatgttcgattcatttttaaattgttgatcgctg--attaataatcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaattaacattttgg 27480261  T
Q  150 atttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaac----agagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    | ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27480262 acttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttaca 27480347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 20373063 - 20373225
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||                   ||||||    
T  20373063 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaatt-------------------catctt 20373141  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20373142 ggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 20373225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 221
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811701
Alignment:
Q  113 aatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgt 212  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaa----agttgatgatattatgt 53811692  T
Q  213 gatagtctt 221  Q
    |||||||||    
T  53811693 gatagtctt 53811701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835608
Alignment:
Q  111 tcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattat 210  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||  |||||||||||||||   ||      |||||||| ||||||| |||||| ||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacat------catgcaaatagagttgatgatatcat 11835587  T
Q  211 gtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  11835588 gtgatagtcttaattgttaca 11835608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53176286 - 53176249
Alignment:
Q  194 agagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  53176286 agagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 53176249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 35844623 - 35844583
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaat 88  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  35844623 aaaagttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaat 35844583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 15612560 - 15612741
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15612560 aaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 15612657  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15612658 agacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 15612741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18797687 - 18797506
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18797687 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 18797590  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18797589 ggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 18797506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8861645 - 8861464
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  8861645 aaaagttaattttaatcttagtgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatttcatctagtaatgcatgcaacatctt 8861548  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  8861547 agacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttaca 8861464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37110234 - 37110053
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37110234 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 37110137  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37110136 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttaca 37110053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 17842385 - 17842566
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17842385 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatctt 17842482  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17842483 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttaca 17842566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23111552 - 23111371
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  23111552 aaaagttaactttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--atttatgatcaatagtaattcttctagtaatgctttcaacatctt 23111455  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23111454 tgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 23111371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29173882 - 29173706
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29173882 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 29173785  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
     || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  29173784 ggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 29173706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 32820854 - 32821035
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32820854 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--atgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 32820951  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  32820952 agacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttaca 32821035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6546879 - 6546700
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  6546879 aaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcctcatctt 6546782  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtta 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||    
T  6546781 agacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgtta 6546700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 5657281 - 5657463
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtctt-aatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5657281 aaaagttaattttaatctttaatgatttattcatttttaaatttttgattactc--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatct 5657378  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  5657379 tagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtattaca 5657463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 9355627 - 9355808
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9355627 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 9355724  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9355725 ggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 9355808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26980666 - 26980485
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |  |||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26980666 aaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattaccg--attaatgatcaacaataattcatctagtaatacttgcaacatctt 26980569  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26980568 agacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 26980485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 31520542 - 31520723
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31520542 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacgg--attaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaacatctt 31520639  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31520640 ggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 31520723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30055886 - 30055706
Alignment:
Q  49 aaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctta 148  Q
    ||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  30055886 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 30055789  T
Q  149 gatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30055788 gacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 30055706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24212102 - 24211920
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24212102 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatct 24212005  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24212004 tggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttaca 24211920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 31578865 - 31579046
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31578865 aaaagttaattttgattttattgtttgattcatttttaaattattgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 31578962  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31578963 ggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 31579046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 37703299 - 37703480
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  37703299 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 37703396  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  37703397 ggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtaca 37703480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 46480930 - 46481111
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  46480930 aaaagttaattatgatcttaatgttttatttatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 46481027  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46481028 agacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 46481111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32432812 - 32432630
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32432812 aaaagttacttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--attcatgattaataataattcatctagtaatgcttgcaacacctt 32432715  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32432714 ggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacat 32432630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27284088 - 27283923
Alignment:
Q  65 ttaatgtttgattc-atttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtacta 163  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27284088 ttaatgtttgattttatttttaaattattgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtacta 27283991  T
Q  164 ttttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||    
T  27283990 ttttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttaca 27283923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37347381 - 37347200
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  37347381 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacgg--attaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatctt 37347284  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37347283 ggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttaca 37347200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 77 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165939
Alignment:
Q  77 tcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggt 176  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||      
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtc 12165977  T
Q  177 atctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12165976 atctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 12165939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35353468 - 35353286
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35353468 aaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaacatctt 35353371  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
     || ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35353370 ggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtcttaagtgttacat 35353286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7335153 - 7334973
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7335153 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattattgatttctg--attaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 7335056  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  7335055 ggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaac-tagttgatgatattatctgataatcttaagtgttaca 7334973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 10359015 - 10359196
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||    
T  10359015 aaaagttaattttgatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgcaaaatctt 10359112  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  10359113 ggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttaca 10359196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Original strand, 25691345 - 25691522
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  25691345 aaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatttt 25691442  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
      | ||||| ||  ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  25691443 gaacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgt 25691522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 41764883 - 41765060
Alignment:
Q  52 gttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagat 151  Q
    |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  41764883 gttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaataataattcatccagtaatgcttgcaaaatcttggac 41764980  T
Q  152 ttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41764981 ttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 41765060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 218
Target Start/End: Original strand, 44411356 - 44411509
Alignment:
Q  63 tcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtact 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| || |    
T  44411356 tcttaatgtttcattcatttttaaattgttgattactg--attaatggtcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataat 44411453  T
Q  163 attttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagt 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44411454 attttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11071546 - 11071385
Alignment:
Q  65 ttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||    
T  11071546 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtattat 11071449  T
Q  165 tttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||||||||   |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11071448 tttatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttaca 11071385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 15672560 - 15672744
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15672560 aaaaattaattttaaccttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattg--atgcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 15672657  T
Q  148 agatttacaggtactatt---ttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15672658 ggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 15672744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43925455 - 43925296
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43925455 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta--gtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 43925358  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgat 215  Q
     |      | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43925357 gg------acgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 43925296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10481965 - 10481784
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||  || |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10481965 aaaagttaattttgatcttaatatttaatttatttttaaattgttaattactg--attaacgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatctt 10481868  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10481867 ggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 10481784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21991983 - 21991815
Alignment:
Q  52 gttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagat 151  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||      |||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||| ||     
T  21991983 gttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatg------atgatcaatagtaattcatct-----tgcttgcaacatcttggac 21991895  T
Q  152 ttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21991894 ttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 21991815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 26587893 - 26588066
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26587893 aaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcctgcaacatctt 26587990  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| ||| |||||||||||||| ||||||        |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26587991 ggacttacatgtattattttatcgttggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttaca 26588066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22687591 - 22687455
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22687591 aaaagttaattttaatcttaatgtatgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaacatctt 22687494  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaaca 186  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22687493 ggacttacatgtactattttatcgttggcatccttaaca 22687455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 12390450 - 12390629
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||  |  |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12390450 aaaagttaattttgatcttaatgtttatttcatttttaaattgtcaattactg--attaatgataaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatctt 12390547  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  12390548 ggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgatattatgtg--agtcttaagtgttaca 12390629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37704525 - 37704387
Alignment:
Q  65 ttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactat 164  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||   |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  37704525 ttaatgtttgattcatttgtaaattgttgattacta--attaatgatcaatagtaattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactat 37704428  T
Q  165 tttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgat 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37704427 tttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44599026 - 44598845
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgt-gattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||  ||||||| | | |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  44599026 aaaaattaattttaatcttaacgattgattcatttt-aaattgttgattattattgattaatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttgtaacatct 44598930  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  44598929 tagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttaca 44598845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4583279 - 4583098
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4583279 aaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatgactg--attcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatctt 4583182  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
      | |||||  || ||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4583181 gaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 4583098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 32593008 - 32593188
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  32593008 aaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttt-aaattgttgattgctg--attaatgatccatagtaatttatctagtaatatttgtaacatctt 32593104  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  32593105 ggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttaca 32593188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Original strand, 48928098 - 48928269
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48928098 aaaaattaattttgatctaaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 48928195  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 221  Q
     || ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  48928196 ggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctt 48928269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688244
Alignment:
Q  104 ttaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctg 203  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  204 atattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||| || |||||||||| | |||||||    
T  33688217 atatcatatgatagtcttgaatgttaca 33688244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 207
Target Start/End: Original strand, 34361996 - 34362138
Alignment:
Q  65 ttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || ||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  34361996 ttaatgtttgattcatttttaaattgttaatgactg--attaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactat 34362093  T
Q  165 tttatcgttggtatctttaacatgcaaac--agagttgctgatat 207  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34362094 tttatcgttgatatttttaacatgcaaacagagagttgctgatat 34362138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258724
Alignment:
Q  139 caacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 38258724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38053741 - 38053640
Alignment:
Q  130 taatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtta 229  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  38053741 taatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 38053642  T
Q  230 ca 231  Q
    ||    
T  38053641 ca 38053640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43686322 - 43686219
Alignment:
Q  128 agtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  || |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  43686322 agtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgt 43686223  T
Q  228 taca 231  Q
    ||||    
T  43686222 taca 43686219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 38258939 - 38258867
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatt 122  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38258939 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac--tgattaatgatcaatagtaatt 38258867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 221
Target Start/End: Original strand, 48928473 - 48928536
Alignment:
Q  158 gtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 221  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  48928473 gtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctt 48928536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704336
Alignment:
Q  180 tttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttaca 37704336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 231
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421362
Alignment:
Q  182 taacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttaca 27421362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12166249 - 12166215
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcattt 82  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12166249 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattt 12166215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 3879738 - 3879919
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3879738 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 3879835  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3879836 ggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 3879919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Original strand, 6090981 - 6091152
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6090981 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 6091078  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 221  Q
     || |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6091079 ggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt 6091152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1946220 - 1946038
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  1946220 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctaataatgcttgtaacatct 1946123  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1946122 tggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 1946038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29182546 - 29182368
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  ||  |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29182546 aaaagttaattttagtcttaatgattgattcatttttaaattgttgattgttg--attaatgatca---gtaattcatctagtaatacttgcaacatctt 29182452  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29182451 agacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 29182368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5627777 - 5627595
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  5627777 aaaaattaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaacatct 5627680  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5627679 tggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattaca 5627595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 7234831 - 7235015
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgt-gattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7234831 aaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatct 7234930  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  7234931 tggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcgttaca 7235015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 53 - 231
Target Start/End: Original strand, 4318626 - 4318802
Alignment:
Q  53 ttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatt 152  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  4318626 ttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattaatg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggact 4318723  T
Q  153 tacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | |  ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4318724 ttcccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 4318802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Original strand, 33892811 - 33892975
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  33892811 aaaagttaattttaaccttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatctt 33892908  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
     || ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33892909 ggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtga 33892975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 21016917 - 21017092
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21016917 aaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttataaattgttgattactg--attcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 21017014  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||      | |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21017015 ag------acgtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 21017092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20768467 - 20768286
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20768467 aaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacacctt 20768370  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||  |||| |||||||||    
T  20768369 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatgatcttaagtgttaca 20768286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8513606 - 8513432
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  8513606 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta---------atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaagatttt 8513516  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8513515 ggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 8513432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6089281 - 6089109
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||         |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  6089281 aaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta---------atgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatttt 6089191  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtta 229  Q
     || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6089190 ggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtta 6089109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33619218 - 33619033
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactg-tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  33619218 aaaagttaattttaatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatat 33619119  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatct-----ttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||     |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  33619118 tggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatactcttaagtgt 33619033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 182
Target Start/End: Original strand, 7054571 - 7054704
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||    
T  7054571 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatctttaaattgttgattaatg--attaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtttgcaacatct 7054668  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatcttt 182  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7054669 tggacttacagttactattttatcgttggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 231
Target Start/End: Original strand, 30353253 - 30353338
Alignment:
Q  146 ttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30353253 ttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 30353338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 7055141 - 7055195
Alignment:
Q  177 atctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7055141 atctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 7055195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15491884 - 15491818
Alignment:
Q  166 ttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | || ||||||||||    
T  15491884 ttatcgttagcatctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacat 15491818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 88
Target Start/End: Original strand, 33724062 - 33724098
Alignment:
Q  52 gttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaat 88  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33724062 gttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaat 33724098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1815686 - 1815505
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1815686 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaattgtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 1815589  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1815588 ggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 1815505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7703894 - 7703717
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7703894 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 7703797  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
     || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7703796 cgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgt 7703717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47254125 - 47253944
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47254125 aaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 47254028  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  47254027 agacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 47253944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33341783 - 33341602
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33341783 aaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatctt 33341686  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33341685 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 33341602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37776043 - 37775879
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37776043 aaaagttaatttcaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 37775946  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37775945 agacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtga 37775879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 55240931 - 55241112
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55240931 aaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgattaatagtaatttatctagtaatgtttgcaacatctt 55241028  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  55241029 ggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttaca 55241112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 55477717 - 55477898
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55477717 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactg--attaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 55477814  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55477815 ggacttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 55477898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23761456 - 23761285
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23761456 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 23761359  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 221  Q
     || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23761358 ggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtctt 23761285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50765105 - 50764939
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50765105 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 50765008  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgata 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  50765007 agacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgata 50764939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Original strand, 30002467 - 30002631
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30002467 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 30002564  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30002565 agacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 30002631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 220
Target Start/End: Original strand, 46887984 - 46888154
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  46887984 aaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgatta--gtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatctt 46888081  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtct 220  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  46888082 ggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtct 46888154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17168098 - 17167917
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17168098 aaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacta--attaatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatctt 17168001  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17168000 agacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 17167917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17173675 - 17173494
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17173675 aaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactt--attcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatctt 17173578  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17173577 agacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 17173494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25184498 - 25184317
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25184498 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 25184401  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25184400 ggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttaca 25184317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Original strand, 29584026 - 29584203
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29584026 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 29584123  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
     || ||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  29584124 ggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgt 29584203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Original strand, 34947923 - 34948092
Alignment:
Q  50 aagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttag 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |    
T  34947923 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 34948020  T
Q  150 atttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 221  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34948021 acttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtctt 34948092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 36493515 - 36493696
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  36493515 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacgg--attaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatctt 36493612  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36493613 agacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttaca 36493696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Original strand, 37663568 - 37663748
Alignment:
Q  49 aaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctta 148  Q
    ||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  37663568 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 37663665  T
Q  149 gatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37663666 gacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 37663748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37288114 - 37287931
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttag-tcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37288114 aaaagttaattttaaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactg--attaatgctcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatct 37288017  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  37288016 tggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacat 37287931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 50697627 - 50697448
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  50697627 aaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacta--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatctt 50697530  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaaca-tgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtt 228  Q
     || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  50697529 ggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 50697448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 212
Target Start/End: Original strand, 19440474 - 19440636
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19440474 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattaatttttaaattattgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 19440571  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgt 212  Q
     || ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19440572 ggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgt 19440636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 34361317 - 34361499
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  34361317 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatct 34361414  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||    
T  34361415 tggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaagtgttaca 34361499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 879374 - 879555
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  879374 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactt--attaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 879471  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  879472 ggacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaaatgttaca 879555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17272349 - 17272172
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17272349 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattaccg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 17272252  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
     || ||||| |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  17272251 ggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgt 17272172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Original strand, 32912422 - 32912587
Alignment:
Q  65 ttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtacta 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  32912422 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtacta 32912519  T
Q  164 ttttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32912520 ttttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 32912587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Original strand, 19089280 - 19089460
Alignment:
Q  49 aaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctta 148  Q
    ||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  19089280 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 19089377  T
Q  149 gatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19089378 gacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 19089460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 35020857 - 35021042
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaata----gtaatttatctagtaatgcttgcaaca 143  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||    |||||| ||||||||||| |||||| |    
T  35020857 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccg--attaatgatcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgcaata 35020954  T
Q  144 tcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35020955 tcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 35021042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3043004 - 3042823
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  3043004 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaataatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatgtt 3042907  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3042906 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 3042823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 33816342 - 33816523
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33816342 aaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 33816439  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33816440 ggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttaca 33816523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39400393 - 39400236
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39400393 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtcattcatctagtaatgcttgcaacatctt 39400296  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 207  Q
      | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39400295 gaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4598363 - 4598203
Alignment:
Q  52 gttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagat 151  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  4598363 gttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaattaatctaataatgcttgcaacatcttggat 4598266  T
Q  152 ttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
    ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4598265 ttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtga 4598203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 7152030 - 7152209
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  7152030 aaaagttatttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 7152127  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtta 229  Q
     || |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||    
T  7152128 ggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgtta 7152209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6864420 - 6864239
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6864420 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 6864323  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
      | |||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6864322 gaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattaca 6864239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 28002812 - 28002993
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  28002812 aaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatctt 28002909  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  28002910 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 28002993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 49376352 - 49376171
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  49376352 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattcttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacttctt 49376255  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  49376254 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttaca 49376171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27396999 - 27396824
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27396999 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac----attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 27396904  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
     || ||| |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  27396903 ggacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgt 27396824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 25700882 - 25701063
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||    
T  25700882 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtacattattg--attaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaaaatctt 25700979  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  25700980 agatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttaca 25701063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32579831 - 32579650
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32579831 aaaaattaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 32579734  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||    
T  32579733 ggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaagagttaca 32579650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4205369 - 4205219
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4205369 aaaagttacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactt--attcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatctt 4205272  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 200  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4205271 ggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttg 4205219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32592469 - 32592315
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  32592469 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--attaacgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacatctt 32592372  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctga 204  Q
      | ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  32592371 gaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttgctga 32592315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42200096 - 42199933
Alignment:
Q  68 atgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttaca-ggtactatt 165  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||    
T  42200096 atgtttgattaatttttaaattattgattactg--attaatgaacagtagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaggtattatt 42199999  T
Q  166 ttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42199998 ttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 42199933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 5047792 - 5047974
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgt-gattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||| ||||||||  | |||||||| |||||||||||||||   || ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5047792 aaaaattaattttgattttaatgttcgattcatttttaaat---tgtttattgttgattactgatcaataataatttatctagtaaaacttgcaacatct 5047888  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
    | || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5047889 tggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgttacat 5047974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9139612 - 9139465
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9139612 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaat--tagattattg--attaatgatcaatagtaattcgtctagtaatgcttgcaacatctt 9139517  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagtt 199  Q
     || ||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9139516 ggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 9139465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 46883940 - 46884117
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  46883940 aaaaattaatttttattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc-- 46884035  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
     || |||||  |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  46884036 ggacttaca--tactattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatagt-ttaagtgttacat 46884117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26896473 - 26896291
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  26896473 aaaagttaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattac--tgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgtttgcaacattt 26896376  T
Q  147 t-agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |  || ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26896375 tcggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagtcttaagtgttaca 26896291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 173
Target Start/End: Original strand, 35025393 - 35025515
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35025393 aaaagttaattttgat-ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 35025489  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgtt 173  Q
     || ||||| ||||||||||||||||    
T  35025490 ggacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23431940 - 23431826
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23431940 aaaagttaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattgttgattacta--attaatgatcaatagtaattcatctactaatgcttgcaacatctt 23431843  T
Q  148 agatttacaggtactat 164  Q
     || |||||||||||||    
T  23431842 ggacttacaggtactat 23431826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 4934040 - 4934209
Alignment:
Q  50 aagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaa-tctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctta 148  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||        
T  4934040 aagttaattttgatcttaatgtttaatttatttttaaaatttttgattactg--attaatgattaatagaaattcatctattaatgcgtgcaacat---- 4934133  T
Q  149 gatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
           |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4934134 -------aggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttaca 4934209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38012165 - 38012058
Alignment:
Q  124 atctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttca 223  Q
    ||||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  38012165 atctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa 38012066  T
Q  224 gtgttaca 231  Q
    | ||||||    
T  38012065 gcgttaca 38012058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Original strand, 35025530 - 35025603
Alignment:
Q  158 gtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35025530 gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttaca 35025603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050171
Alignment:
Q  131 aatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaaca 194  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaaca 56050171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 38012647 - 38012568
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctag 129  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38012647 aaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaattcatctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 221
Target Start/End: Original strand, 54499165 - 54499234
Alignment:
Q  151 tttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 221  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  54499165 tttaccggtaccattttatcgttggcat-tttaacatggaaacagagttactaatatcatgtgatagtctt 54499234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12293 - 12117
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12293 aaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-atttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 12197  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  12196 agacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgt 12117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19120244 - 19120063
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19120244 aaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgatcactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 19120147  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19120146 agactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 19120063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24886472 - 24886291
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24886472 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 24886375  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24886374 ggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 24886291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 31786436 - 31786617
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31786436 aaaagttaattttgatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 31786533  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31786534 ggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 31786617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Original strand, 15992330 - 15992507
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15992330 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 15992427  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
     || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  15992428 ggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgt 15992507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25889755 - 25889584
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25889755 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctttcaacatctt 25889658  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 221  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  25889657 ggatttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtcataatctt 25889584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5830278 - 5830096
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgatt-catttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5830278 aaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatct 5830181  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5830180 tggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 5830096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 22973872 - 22974054
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22973872 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 22973969  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
     || ||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22973970 ggacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtcttaagtgttacat 22974054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22981178 - 22980996
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22981178 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatgattgcaacatctt 22981081  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
     || |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22981080 ggacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacat 22980996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 31705402 - 31705584
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31705402 aaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 31705499  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
     || ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31705500 ggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaagtgttacat 31705584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 699535 - 699354
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  699535 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactg--attaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 699438  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  699437 ggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattaca 699354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 2888235 - 2888416
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2888235 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatctt 2888332  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2888333 ggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtcttaagtgttaca 2888416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 38528027 - 38528208
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38528027 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 38528124  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38528125 ggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 38528208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22255567 - 22255386
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22255567 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaaggcttgcaacatctt 22255470  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  22255469 ggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttaca 22255386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27330689 - 27330512
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27330689 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 27330592  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
     || ||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  27330591 ggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgt 27330512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22020008 - 22019844
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22020008 aaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatctt 22019911  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22019910 agacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtga 22019844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25669961 - 25669797
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25669961 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 25669864  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25669863 agacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtga 25669797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42343106 - 42342942
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42343106 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 42343009  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  42343008 agacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtga 42342942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 8741675 - 8741857
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||    
T  8741675 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatttcatctagtgatgcttgcaacatttt 8741772  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgat-attatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||    
T  8741773 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtcttaagtgttaca 8741857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 7208654 - 7208835
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  7208654 aaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatctt 7208751  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
      | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7208752 gaacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttaca 7208835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33908617 - 33908437
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33908617 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaatt-atctagtaatgcttgcaacatctt 33908521  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33908520 ggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtgttaca 33908437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 211
Target Start/End: Original strand, 35826276 - 35826437
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35826276 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 35826373  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35826374 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatg 35826437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7693606 - 7693442
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7693606 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 7693509  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7693508 agacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtga 7693442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9200609 - 9200445
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9200609 aaaaattaattttaattttaaattttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 9200512  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9200511 agacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 9200445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32563525 - 32563361
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32563525 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttaattgctg--attaatgatcaataataatttatctagtaattcttgcaacatctt 32563428  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32563427 agacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 32563361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 218
Target Start/End: Original strand, 35511272 - 35511440
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  35511272 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatctt 35511369  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagt 218  Q
      | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35511370 gaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt 35511440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5837936 - 5837759
Alignment:
Q  52 gttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagat 151  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  5837936 gttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 5837839  T
Q  152 ttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    || ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5837838 ttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 5837759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8437350 - 8437169
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  8437350 aaaagttaattttgattttaatatttaattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacatctt 8437253  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8437252 ggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttaca 8437169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35504750 - 35504569
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  35504750 aaaagtcaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaataatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatctt 35504653  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35504652 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttaca 35504569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35934281 - 35934100
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35934281 aaaagttaattttaattttaatgtttgaatcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaacatctt 35934184  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35934183 ggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 35934100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 27318278 - 27318458
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatct-ttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  27318278 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaaattgttgatt--tttgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatct 27318375  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    || | |||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27318376 taaacttat--gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 27318458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 25500716 - 25500897
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  || |||||||  |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25500716 aaaagttaattttaatcttagtatttgattcatttttaaattgttaattactg--attaatgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaacatctt 25500813  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  25500814 agacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttaca 25500897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Original strand, 17157838 - 17158002
Alignment:
Q  65 ttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  17157838 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactat 17157935  T
Q  165 tttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17157936 tttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtgttaca 17158002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 101 - 231
Target Start/End: Original strand, 1429003 - 1429133
Alignment:
Q  101 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||     
T  1429003 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaataaagttt 1429102  T
Q  201 ctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1429103 atgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 1429133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12910740 - 12910559
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12910740 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 12910643  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12910642 ggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttaca 12910559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40133770 - 40133589
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40133770 aaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactg--attcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatctt 40133673  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||  || |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40133672 ggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 40133589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 23116020 - 23116193
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||    
T  23116020 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtca--------gtaatgcttgcaacatctt 23116109  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23116110 ggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 23116193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 39573196 - 39573060
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39573196 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 39573099  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaaca 186  Q
     || ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39573098 ggacttacatgtactattttatcattggcatctttaaca 39573060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 230
Target Start/End: Original strand, 13956203 - 13956332
Alignment:
Q  101 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  13956203 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttg 13956302  T
Q  201 ctgatattatgtgatagtcttcagtgttac 230  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13956303 atgatattatatgatagtcttaagtgttac 13956332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 30969114 - 30969295
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||    
T  30969114 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactg--attaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcagcatctt 30969211  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
      | ||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30969212 gaacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 30969295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36860809 - 36860628
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||   ||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  36860809 aaaagttaattttaatcttaatgcttgattcatttttaaattgttgattacta--attcatgattaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatctt 36860712  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||  || |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  36860711 ggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 36860628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36867147 - 36866966
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  36867147 aaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactg--attcatgattaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatctt 36867050  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||  || |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  36867049 ggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 36866966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Original strand, 14409131 - 14409302
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||  |||||| |||  | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  14409131 aaaatttaattttaattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctg--aataatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatctt 14409228  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 221  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  14409229 ggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctt 14409302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 21088559 - 21088737
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| |   ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21088559 aaaaattaactttaatcttaatgtttgattcatttttaaat---tgattattt--attcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatctt 21088653  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21088654 ggatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttaca 21088737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8467111 - 8466930
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  8467111 aaaagttaattttatttttaatgtttgattcatttttaaactgttgattacta--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 8467014  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
     || |||||  || ||||||||||||   | |||||| ||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  8467013 ggacttacaaataatattttatcgtt-acacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatagtcttaagtgttacat 8466930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 207
Target Start/End: Original strand, 43308450 - 43308607
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||| | |||||||| |||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43308450 aaaagttaattttgattttagtatttgattcgtttttaaattgttgatttctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 43308547  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 207  Q
     || |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  43308548 cgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgatat 43308607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15724873 - 15724702
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| || ||    
T  15724873 aaaagttaattttaactttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaatatttt 15724776  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 221  Q
     || ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||||    
T  15724775 ggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtctt 15724702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26269194 - 26269069
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26269194 aaaagttaattttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcagtagtaatttatctagtattgcttacaacatctt 26269097  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttgg 175  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||    
T  26269096 aaacttacaggtactattttatccttgg 26269069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 175
Target Start/End: Original strand, 28416341 - 28416466
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  28416341 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattgttg--attaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgcttgcaacatctt 28416438  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttgg 175  Q
     || ||| | ||||||||||||||||||    
T  28416439 ggacttaaaagtactattttatcgttgg 28416466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 43254240 - 43254154
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgct 136  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43254240 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac--tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 14919329 - 14919499
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||      | |||||| |||||    
T  14919329 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattttagatttctg--attaatgatcaat-gtaattcatct------gattgcaatatctt 14919419  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||    ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14919420 ggactta----tacaattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattaca 14919499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 231
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824450
Alignment:
Q  108 tgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 207  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atat 6824426  T
Q  208 tatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
      |||||||||||| |||||||||    
T  6824427 cttgtgatagtcttaagtgttaca 6824450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 232
Target Start/End: Original strand, 23954636 - 23954761
Alignment:
Q  101 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |     ||||||  | |||||  || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23954636 tgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgtt-----catcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttg 23954729  T
Q  201 ctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23954730 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacat 23954761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26268332 - 26268278
Alignment:
Q  177 atctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26268332 atctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 26268278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 7006756 - 7006937
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7006756 aaaagttaattttaatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 7006853  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  7006854 ggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaagtgttaca 7006937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 11366198 - 11366380
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11366198 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatct 11366295  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11366296 tggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 11366380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 2325196 - 2325377
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2325196 aaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactg--attaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 2325293  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2325294 ggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 2325377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Original strand, 18494099 - 18494276
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18494099 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttacaacatctt 18494196  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  18494197 ggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtcttaagtgt 18494276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Original strand, 33709050 - 33709227
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33709050 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 33709147  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
     |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  33709148 ggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgt 33709227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 31570552 - 31570734
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31570552 aaaagttaattttcattttaatgattgattcatttttaaatatttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatctt 31570649  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  31570650 aaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacagtcttaagtgttacat 31570734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44914052 - 44913868
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttat---ctagtaatgcttgcaacat 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||   ||| |||||||||||||||    
T  44914052 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttgcaacat 44913955  T
Q  145 cttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44913954 cttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 44913868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4764016 - 4763835
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  4764016 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactg--attaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatctt 4763919  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4763918 ggacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 4763835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41961225 - 41961044
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41961225 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 41961128  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41961127 ggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataatcttaagtgttaca 41961044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 213
Target Start/End: Original strand, 33660195 - 33660358
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  33660195 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctc 33660292  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtg 213  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  33660293 agacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtg 33660358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13711844 - 13711673
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  13711844 aaaaattaattttaatttaaatgattgattcatttttaaatcgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtattgtttgcaacatctt 13711747  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 221  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13711746 agacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtctt 13711673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 19289141 - 19289322
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  || ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19289141 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttaatttctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatctt 19289238  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19289239 ggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 19289322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26357962 - 26357781
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26357962 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 26357865  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| || |||||||||    
T  26357864 ggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatagttttaagtgttaca 26357781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5881914 - 5881750
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5881914 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--aataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 5881817  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||    
T  5881816 agacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtga 5881750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35959277 - 35959100
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35959277 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 35959180  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     ||    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  35959179 gga----catgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttaca 35959100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 43648063 - 43648242
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  43648063 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcgacatctt 43648160  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtta 229  Q
     || ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  43648161 ggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 43648242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 71 - 214
Target Start/End: Original strand, 27349789 - 27349930
Alignment:
Q  71 tttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatc 170  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27349789 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatc 27349886  T
Q  171 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27349887 gttggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtga 27349930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41465886 - 41465705
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  41465886 aaaagttaattttgatcttaatgttcgattcaattttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatctt 41465789  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  41465788 ggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtgttaca 41465705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 19500739 - 19500915
Alignment:
Q  54 taattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagattt 153  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  19500739 taattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaatt 19500836  T
Q  154 acaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
    ||| ||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19500837 acatgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacat 19500915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Original strand, 43770666 - 43770830
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43770666 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttcta--attaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 43770763  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
      | ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43770764 gaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 43770830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4167307 - 4167126
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4167307 aaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactg--attcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatctt 4167210  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||  || |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4167209 ggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 4167126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31862237 - 31862056
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||    
T  31862237 aaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtctacaatatctt 31862140  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | || |||||||||    
T  31862139 ggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttaca 31862056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 218
Target Start/End: Original strand, 39167187 - 39167355
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||| || || |||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||    
T  39167187 aaaagttaattttaatcttaatgttttattcatttttaaattgttgattactg--attcataattaatagtaattcatctagtaatgctagcaacaattt 39167284  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagt 218  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39167285 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagt 39167355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 19424460 - 19424627
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19424460 aaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 19424557  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| || |||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19424558 agacttgcaggtac--------------tatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttaca 19424627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3177324 - 3177143
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||   ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  3177324 aaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaattgttgattactt--attcatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgtaatatctt 3177227  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3177226 ggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 3177143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 33550801 - 33550985
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactg--tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatc 145  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | || ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  33550801 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactggttaataaataatcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacata 33550900  T
Q  146 ttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    || || || || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  33550901 ttggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtcttaagtgttaca 33550985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44286283 - 44286153
Alignment:
Q  101 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||    
T  44286283 tgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttg 44286184  T
Q  201 ctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  44286183 ttgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 44286153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478569
Alignment:
Q  81 ttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatct 180  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||| |||| ||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatct 4478620  T
Q  181 ttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  4478619 ttaacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttaca 4478569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37906096 - 37905914
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgatt-catttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  37906096 aaaaattaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttaattactg--attaatgatcaatagtaattcatccagtaattcttgcaacatct 37905999  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || ||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||||||    
T  37905998 tggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttaca 37905914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 101 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19314181 - 19314061
Alignment:
Q  101 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagattt---acaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagag 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||    
T  19314181 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaacatag 19314082  T
Q  198 ttgctgatattatgtgatagt 218  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  19314081 ttgctgatatcatgtgatagt 19314061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264076
Alignment:
Q  80 tttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatc 179  Q
    |||||||||  ||||||||||  || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactg--atcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatc 4264023  T
Q  180 tttaacatgcaaacagagttgctgatattatg-tgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  4264024 tttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttaca 4264076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 29241963 - 29242137
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |       |||||    
T  29241963 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgttcaatagtaattcatctagtaattc-------atctt 29242053  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  29242054 ggacttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttaca 29242137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 231
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071736
Alignment:
Q  141 acatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 17071736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36642192
Alignment:
Q  130 taatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtta 229  Q
    ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  230 ca 231  Q
    ||    
T  36642193 ca 36642192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 231
Target Start/End: Original strand, 18258198 - 18258286
Alignment:
Q  143 atcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18258198 atcttagacttgcagttactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 18258286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 231
Target Start/End: Original strand, 17054005 - 17054095
Alignment:
Q  141 acatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17054005 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttaca 17054095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Original strand, 41463408 - 41463520
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  || |||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  41463408 aaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattattaattattg--attaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaacatctt 41463505  T
Q  148 agatttacaggtact 162  Q
    ||| ||| |||||||    
T  41463506 agacttagaggtact 41463520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 193
Target Start/End: Original strand, 41051118 - 41051260
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||  ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  41051118 aaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttgaattgttgattattg--attaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaacatctt 41051215  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaac 193  Q
      | ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  41051216 gaacttacaggtactattttatccttggcat-tttaacatgcaaac 41051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327924
Alignment:
Q  130 taatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtta 229  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||  ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  230 ca 231  Q
    ||    
T  45327925 ca 45327924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 232
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41463850
Alignment:
Q  161 ctattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacat 41463850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 151
Target Start/End: Original strand, 18257356 - 18257457
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | |||||  || ||||||||| ||||  | ||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18257356 aaaagttaattttaatattaataatttattcattttaaaattgtcgattactg--attaatgataaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 18257453  T
Q  148 agat 151  Q
    ||||    
T  18257454 agat 18257457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 33902399 - 33902317
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaa 132  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  33902399 aaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattac--agattaataatcaataataattcatctagtaa 33902317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 45328075 - 45328035
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaat 88  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45328075 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaat 45328035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37451666 - 37451485
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  37451666 aaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 37451569  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37451568 ggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 37451485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38823595 - 38823414
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  38823595 aaaagttaattttaatcttaatatttgtttcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 38823498  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38823497 agacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 38823414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2960129 - 2959948
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2960129 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 2960032  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2960031 ggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 2959948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 11742163 - 11742344
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11742163 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 11742260  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  11742261 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaattgttaca 11742344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16416027 - 16415846
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16416027 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatctt 16415930  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16415929 ggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattaca 16415846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 27532777 - 27532957
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27532777 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaattgtt-gattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 27532873  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27532874 ggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatagtcttgagtgttaca 27532957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48353923 - 48353743
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  48353923 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaatatctt 48353826  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  48353825 ggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-agtgttaca 48353743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 19899563 - 19899745
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19899563 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatct 19899660  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19899661 tggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 19899745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23999729 - 23999547
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23999729 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatct 23999632  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23999631 tggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 23999547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Original strand, 27266995 - 27267173
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27266995 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattattgattattg--attaattatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 27267092  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtt 228  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27267093 agacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 27267173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32216436 - 32216255
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32216436 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatctt 32216339  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32216338 ggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 32216255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 47682291 - 47682470
Alignment:
Q  50 aagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttag 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  47682291 aagttaattttaatcttaatgtttaattcttttttaaattgttaattactg--attaatgatcaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttgg 47682388  T
Q  150 atttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  47682389 atttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttaca 47682470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3309535 - 3309353
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttag-tcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3309535 aaaagttaattttaaatctaaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatct 3309438  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  3309437 tggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttaca 3309353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46931791 - 46931609
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  46931791 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatct 46931694  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46931693 tggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 46931609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10923108 - 10922927
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  10923108 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 10923011  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10923010 ggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttaca 10922927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39393765 - 39393584
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  39393765 aaaagttaattttaattttaatgttttattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 39393668  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||    
T  39393667 ggatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttaca 39393584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47279570 - 47279389
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  47279570 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacta--attaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaacatctt 47279473  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  47279472 ggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 47279389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Original strand, 7078858 - 7079029
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  7078858 aaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatctt 7078955  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 221  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7078956 agacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtctt 7079029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3535304 - 3535142
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3535304 aaaagttagttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 3535207  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgt 212  Q
     || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3535206 ggacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgt 3535142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8222509 - 8222328
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgatt-catttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8222509 aaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaata-taattcatctagtaatgcttgcaacatct 8222413  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8222412 tggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 8222328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15383315 - 15383133
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgatt-catttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15383315 aaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattgctg--attaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatct 15383218  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15383217 tggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 15383133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Original strand, 27227280 - 27227458
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27227280 aaaagttaattttgatattaatgtttaattcatttttaaatggttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 27227377  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtt 228  Q
     || |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27227378 ggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgtt 27227458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 27763105 - 27763287
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27763105 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatatttatctagtaatgcttgcaacatct 27763202  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27763203 tgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaagtattaca 27763287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 238308 - 238489
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  238308 aaaagttgattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactg--attcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 238405  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  238406 ggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 238489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28770034 - 28769853
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  28770034 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattatta--attaatgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaacatctt 28769937  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28769936 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttaca 28769853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30254804 - 30254623
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30254804 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--attaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 30254707  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||    
T  30254706 ggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttaca 30254623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32267415 - 32267234
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32267415 aaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 32267318  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     ||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32267317 ggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttaca 32267234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14758413 - 14758242
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14758413 aaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 14758316  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 221  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  14758315 ggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctt 14758242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4330662 - 4330480
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4330662 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttatattgttgattactg--attaatgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaacatatt 4330565  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
     || ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4330564 ggacttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacat 4330480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 9902849 - 9903031
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  9902849 aaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtagtgcttgcagcatctt 9902946  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
     || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9902947 ggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacat 9903031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22171092 - 22170911
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22171092 aaaagttaattttgattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattacta--attaatgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatctt 22170995  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| ||||| | | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22170994 agacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 22170911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51129216 - 51129059
Alignment:
Q  72 ttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcg 171  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  51129216 ttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcg 51129119  T
Q  172 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||    
T  51129118 ttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaattgttaca 51129059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25161010 - 25160834
Alignment:
Q  52 gttaattttagtcttaatgtttgatt-catttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttaga 150  Q
    |||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  25161010 gttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgga 25160913  T
Q  151 tttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtta 229  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  25160912 cttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgtta 25160834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 218
Target Start/End: Original strand, 28564578 - 28564746
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28564578 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 28564675  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagt 218  Q
     || ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28564676 ggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt 28564746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 218
Target Start/End: Original strand, 34012177 - 34012345
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34012177 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatctt 34012274  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagt 218  Q
      | |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34012275 gaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt 34012345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 1359745 - 1359911
Alignment:
Q  63 tcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtact 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  1359745 tcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtact 1359842  T
Q  163 attttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  1359843 attttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataatcttaagtgttaca 1359911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15168477 - 15168296
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15168477 aaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatctt 15168380  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
      | ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  15168379 gtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtgttaca 15168296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Original strand, 27563700 - 27563878
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27563700 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaacatctt 27563797  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtt 228  Q
     || |||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27563798 ggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtcttaagtgtt 27563878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1547652 - 1547516
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1547652 aaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 1547555  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaaca 186  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1547554 ggacttacatgtactattttatcgttggtatctttaaca 1547516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 231
Target Start/End: Original strand, 30326775 - 30326928
Alignment:
Q  76 ttcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttgg 175  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||||||||||    
T  30326775 ttcatttttaaattgttgattactg--attgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtattattttatcgttgg 30326872  T
Q  176 tatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  30326873 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 30326928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 10181802 - 10181984
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  10181802 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttg--attaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 10181899  T
Q  148 agatttaca-ggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10181900 ggacttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 10181984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15752410 - 15752229
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||    
T  15752410 aaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttctt 15752313  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15752312 ggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatactcttaagtgttaca 15752229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18422981 - 18422851
Alignment:
Q  101 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  18422981 tgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtg 18422882  T
Q  201 ctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18422881 atgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 18422851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21289981 - 21289817
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21289981 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatgtttgcaacatctt 21289884  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatag 217  Q
     || ||| | ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  21289883 ggacttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagagt---tgatattatgtgatag 21289817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 103 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40885141 - 40885013
Alignment:
Q  103 attaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgct 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |    
T  40885141 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgat 40885042  T
Q  203 gatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  40885041 gatattatgcgatagtcttaagtgttaca 40885013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42721417 - 42721241
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  42721417 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactc--attaatgatcaatagtaattaatctagtaataattgcaacatctt 42721320  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtta 229  Q
     || ||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||    
T  42721319 ggacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgtta 42721241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41926520 - 41926378
Alignment:
Q  65 ttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactat 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||    
T  41926520 ttaatgtttgattcaattttaaatcattgattatta--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttggacttacaagtactat 41926424  T
Q  165 tttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattat 210  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41926423 tttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 41926378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 101 - 210
Target Start/End: Original strand, 37618747 - 37618856
Alignment:
Q  101 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 200  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37618747 tgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttg 37618846  T
Q  201 ctgatattat 210  Q
     |||||||||    
T  37618847 atgatattat 37618856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31962998 - 31962853
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatct-ttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  31962998 aaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaaattgttgattaccg--attaatgatcaatagtagttcatctaataatgcttgcaacatct 31962901  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaaca 194  Q
    || | |||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31962900 taaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaaca 31962853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Original strand, 31621343 - 31621526
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcattttt-aaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  ||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |    
T  31621343 aaaagttaattttgatcttaatgttcgattcattttttaaattgttgattgatg--attaatgatcaatagtagttcatctactaatgcttgcaacatat 31621440  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatct-----ttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| ||||     |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  31621441 tgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgt 31621526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759733
Alignment:
Q  118 taatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatag 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  || |||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatag 38759747  T
Q  218 tcttcagtgttaca 231  Q
    |||  |||||||||    
T  38759746 tctcaagtgttaca 38759733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 231
Target Start/End: Original strand, 33725472 - 33725576
Alignment:
Q  127 tagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtg 226  Q
    |||||||| ||||||||| || |  ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||    
T  33725472 tagtaatgtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatg 33725571  T
Q  227 ttaca 231  Q
    |||||    
T  33725572 ttaca 33725576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48620906 - 48620845
Alignment:
Q  153 tacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48620906 tacaggtactatttattcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 48620845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 48620970 - 48620921
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgatta 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  48620970 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgatta 48620921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 7890763 - 7890944
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  7890763 aaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 7890860  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7890861 agacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttaca 7890944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38644362 - 38644181
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38644362 aaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaatttttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 38644265  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  38644264 ggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttaca 38644181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 16446681 - 16446861
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16446681 aaaagttaattttgattttaatgttagattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 16446778  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttac 230  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16446779 ggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 16446861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 466214 - 466059
Alignment:
Q  50 aagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttag 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  466214 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttag 466117  T
Q  150 atttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 207  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  466116 acttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 466059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11727408 - 11727226
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11727408 aaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 11727311  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11727310 agacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacat 11727226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 1149438 - 1149619
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1149438 aaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 1149535  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1149536 ggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttaca 1149619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 23854237 - 23854418
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23854237 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 23854334  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23854335 ggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttaca 23854418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 37970325 - 37970506
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37970325 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctg--attaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 37970422  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37970423 ggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 37970506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 4132492 - 4132673
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4132492 aaaagttaattttgatcttaatgtgtaattcatttttaaattgttgattacaa--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 4132589  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4132590 ggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttaca 4132673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 5299752 - 5299933
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5299752 aaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactg--attaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 5299849  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  5299850 ggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatcttaagtgttaca 5299933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16223247 - 16223066
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16223247 aaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 16223150  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16223149 agacttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttaca 16223066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 36694772 - 36694953
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||   ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  36694772 aaaagttacttttaattttaatgtttgatttatttttaaattattgattactt--attcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatctt 36694869  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36694870 ggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 36694953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 43643401 - 43643582
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43643401 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 43643498  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43643499 ggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttaca 43643582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1205311 - 1205130
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1205311 aaaagttaattttgatcttgttgtttgattcatttttaaattgctgatta--gtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatctt 1205214  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1205213 ggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttaca 1205130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 1953794 - 1953975
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  1953794 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 1953891  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1953892 ggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttaca 1953975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 207
Target Start/End: Original strand, 34951863 - 34952020
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  34951863 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatgtagtaagacttgcaacatctt 34951960  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 207  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34951961 agacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 34952020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 8803622 - 8803804
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8803622 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttcattactg--attaatgatcaatagtatattcatctggtaatgcttgcaacatct 8803719  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8803720 tggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgttaca 8803804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 27082644 - 27082825
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27082644 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattg--attaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 27082741  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27082742 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 27082825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44869881 - 44869700
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  44869881 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttggttactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatctt 44869784  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  44869783 ggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttaca 44869700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34895346 - 34895178
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34895346 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatctt 34895249  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagt 218  Q
      | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34895248 gaacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt 34895178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 6098334 - 6098505
Alignment:
Q  63 tcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtact 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  6098334 tcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacta--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtact 6098431  T
Q  163 attttat-----cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| |||     |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6098432 attgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 6098505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33906594 - 33906415
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||| | || |||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33906594 aaaagttaattttgatcttactattcgattcatttttaaat--ttgattgctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 33906499  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33906498 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttaca 33906415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 213
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149889
Alignment:
Q  78 catttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggta 177  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  1149756 catttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaa 1149853  T
Q  178 tctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtg 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1149854 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtg 1149889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 31933692 - 31933873
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||||    
T  31933692 aaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatgtctgcaatatctt 31933789  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | || |||||||||    
T  31933790 agacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttaca 31933873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 35459517 - 35459696
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  35459517 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatttt 35459614  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtta 229  Q
     || |||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  35459615 ggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaagtgtta 35459696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12587966 - 12587816
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12587966 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatctt 12587869  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  12587868 tgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttg 12587816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35859318 - 35859160
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  35859318 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatctc 35859221  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatatt 208  Q
      | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  35859220 gaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40862804 - 40862622
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcattttt-aaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||  ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40862804 aaaagttacttttaatcttaatgtttgattcattttttaaattgtcgattactg--atttatgacaaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatct 40862707  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  40862706 tggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttaca 40862622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Original strand, 39098925 - 39099102
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  39098925 aaaaattaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattattgattatta--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 39099022  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgt 227  Q
     || |||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  39099023 ggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgt 39099102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 186
Target Start/End: Original strand, 24823200 - 24823336
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24823200 aaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactg--attaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 24823297  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaaca 186  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24823298 ggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 24823336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9864509 - 9864351
Alignment:
Q  71 tttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatc 170  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |  ||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  9864509 tttgattcatttttaaattgttgattaccg--attcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatc 9864412  T
Q  171 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9864411 gttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 9864351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 219
Target Start/End: Original strand, 10555011 - 10555179
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagt--aatttatctagtaatgcttgcaacatc 145  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||     ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||    
T  10555011 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattact-----taatgatcaatagtgtaattcatctagtaatgcttgcaatatc 10555105  T
Q  146 ttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtc 219  Q
    || || |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10555106 ttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 10555179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12876494 - 12876323
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| |||   |||||||||   ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  12876494 aaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaactgttgattactt--attcatgataaatagtaattcatctagtaatgcctgtaacatctt 12876397  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 221  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12876396 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt 12876323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 30654389 - 30654570
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  30654389 aaaagttaattttgattttaatatttgattcatttt-aaattgttaattactg--attaatgatcaataatatattcatttagtaatgcttgcaacatct 30654485  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30654486 tggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 30654570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 33198186 - 33198061
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  33198186 aaaagttaatcttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatttt 33198089  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttgg 175  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33198088 agacttacatgtactattttatcgttgg 33198061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18259459 - 18259321
Alignment:
Q  52 gttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagat 151  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||||||||   |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18259459 gttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattactc--attactgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagac 18259362  T
Q  152 ttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaa 192  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  18259361 ttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaa 18259321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13307932 - 13307826
Alignment:
Q  124 atctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttca 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  13307932 atcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaa 13307834  T
Q  224 gtgttaca 231  Q
    ||||||||    
T  13307833 gtgttaca 13307826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Original strand, 41910897 - 41910975
Alignment:
Q  152 ttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  41910897 ttacaggtaatattttatcgttgc-atctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttaca 41910975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 43026058 - 43025974
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatg 134  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43026058 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatcac--tgattcatgatcaatagtaatttatctaataatg 43025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7998555 - 7998481
Alignment:
Q  157 ggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7998555 ggtactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttaca 7998481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43025972 - 43025904
Alignment:
Q  164 ttttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttacat 232  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  43025972 ttttatcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacat 43025904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 41362806 - 41362723
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaat 133  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41362806 aaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattac--tggttaatgatcaatagtaattcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34463792 - 34463708
Alignment:
Q  113 aatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 200  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||    || ||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  34463792 aatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatg---gacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttg 34463708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 13307963 - 13307931
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcat 80  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13307963 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcat 13307931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Original strand, 408229 - 408407
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  408229 aaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 408326  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgtt 228  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  408327 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgtt 408407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 513 - 338
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  513 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac--tgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 416  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     |      | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  415 gg------acgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 194
Target Start/End: Original strand, 93901 - 94044
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  93901 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttt-aaattgttgatta--gtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 93997  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaaca 194  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  93998 ggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaaca 94044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8271 - 8091
Alignment:
Q  49 aaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctta 148  Q
    ||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8271 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 8174  T
Q  149 gatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8173 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 8091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 145815 - 145997
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatct 146  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  145815 aaaagttaattttgattttaatgtttaattcatttttaaattttttattactg--attaatgatcaattgtatattcatttagtaatgcttgcaacatct 145912  T
Q  147 tagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
    | || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  145913 tggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 145997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44341 - 44161
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||    
T  44341 aaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaactt 44244  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44243 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttaca 44161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 154446 - 154626
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 147  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||    
T  154446 aaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaactt 154543  T
Q  148 agatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagtgttaca 231  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  154544 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttaca 154626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 267602 - 267499
Alignment:
Q  118 taatttatctagtaatgcttgcaacatcttagatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatag 217  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  267602 taattcatctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 267503  T
Q  218 tctt 221  Q
    ||||    
T  267502 tctt 267499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 267661 - 267609
Alignment:
Q  48 aaaagttaattttagtcttaatgtttgattcatttttaaatctttgattactg 100  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  267661 aaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactg 267609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 100994 - 100948
Alignment:
Q  168 atcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  100994 atcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtga 100948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University