View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11076_low_3 (Length: 276)

Name: NF11076_low_3
Description: NF11076
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11076_low_3
NF11076_low_3
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (2-261)||(19275-19535)
scaffold0195 (66-261)||(21359-21553)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (2-261)||(16404911-16405166)
chr8 (2-260)||(43373403-43373661)
chr8 (2-261)||(16193653-16193910)
chr8 (78-261)||(30120791-30120974)
chr8 (97-261)||(21844591-21844755)
chr8 (97-261)||(21851984-21852148)
chr8 (78-261)||(16674392-16674575)
chr8 (2-214)||(24928727-24928939)
chr8 (78-261)||(6774258-6774440)
chr8 (143-261)||(222756-222874)
chr8 (143-261)||(736379-736497)
chr8 (143-261)||(860274-860392)
chr8 (78-261)||(24549051-24549233)
chr8 (66-259)||(17345641-17345832)
chr8 (66-261)||(22907214-22907407)
chr8 (66-213)||(5238203-5238350)
chr8 (66-213)||(24661248-24661395)
chr8 (66-213)||(43685662-43685809)
chr8 (143-202)||(691911-691970)
chr8 (147-261)||(16195299-16195414)
chr8 (221-261)||(5854682-5854722)
chr8 (221-261)||(22497348-22497388)
chr8 (221-261)||(38533717-38533757)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (2-261)||(36982375-36982635)
chr2 (2-261)||(19794640-19794898)
chr2 (2-261)||(8891311-8891570)
chr2 (1-260)||(43642891-43643150)
chr2 (2-261)||(462807-463064)
chr2 (13-261)||(24341337-24341583)
chr2 (66-261)||(17396653-17396847)
chr2 (2-259)||(20627249-20627505)
chr2 (78-261)||(19886661-19886844)
chr2 (66-261)||(25265390-25265584)
chr2 (66-213)||(19689401-19689548)
chr2 (66-213)||(23820187-23820334)
chr2 (66-213)||(14906440-14906587)
chr2 (66-213)||(20015127-20015274)
chr2 (70-251)||(7507848-7508027)
chr2 (2-88)||(22863169-22863256)
chr2 (221-261)||(16292940-16292980)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (97-261)||(10644288-10644452)
chr4 (13-261)||(15675037-15675283)
chr4 (2-261)||(54118179-54118438)
chr4 (2-261)||(13246499-13246758)
chr4 (67-261)||(10104251-10104444)
chr4 (4-229)||(121990-122213)
chr4 (66-261)||(13048221-13048416)
chr4 (78-261)||(47357723-47357906)
chr4 (93-261)||(31115698-31115865)
chr4 (66-261)||(26680270-26680463)
chr4 (66-213)||(10488678-10488825)
chr4 (66-213)||(16327926-16328073)
chr4 (82-261)||(40885570-40885748)
chr4 (13-129)||(33240900-33241015)
chr4 (51-239)||(7850090-7850278)
chr4 (147-261)||(8374577-8374691)
chr4 (147-261)||(17145730-17145844)
chr4 (149-261)||(18248287-18248399)
chr4 (19-100)||(31132543-31132623)
chr4 (221-261)||(13590213-13590253)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (2-259)||(23153518-23153775)
chr6 (78-261)||(25175632-25175815)
chr6 (78-261)||(27653983-27654166)
chr6 (66-261)||(35009439-35009633)
chr6 (66-261)||(14626118-14626312)
chr6 (78-261)||(16825752-16825937)
chr6 (66-261)||(1657748-1657941)
chr6 (78-261)||(1650105-1650287)
chr6 (66-205)||(15862595-15862734)
chr6 (64-261)||(29665942-29666139)
chr6 (2-78)||(23148247-23148324)
chr6 (147-261)||(27740907-27741021)
chr6 (66-151)||(27751603-27751688)
chr6 (221-261)||(18399006-18399046)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (29-261)||(15858988-15859218)
chr3 (97-261)||(16821208-16821372)
chr3 (2-261)||(14842498-14842755)
chr3 (66-261)||(51158018-51158212)
chr3 (2-261)||(13838963-13839221)
chr3 (13-260)||(12030095-12030340)
chr3 (2-260)||(2049880-2050136)
chr3 (78-261)||(55316288-55316471)
chr3 (72-261)||(15936633-15936821)
chr3 (66-261)||(13975722-13975916)
chr3 (78-261)||(41270144-41270327)
chr3 (66-261)||(45860874-45861068)
chr3 (66-261)||(13954890-13955084)
chr3 (72-261)||(15938475-15938663)
chr3 (66-261)||(17912483-17912675)
chr3 (1-213)||(16744051-16744262)
chr3 (96-261)||(15614903-15615067)
chr3 (66-213)||(2449238-2449385)
chr3 (2-129)||(19231981-19232110)
chr3 (2-112)||(19260760-19260869)
chr3 (147-261)||(12264865-12264980)
chr3 (64-258)||(54651529-54651723)
chr3 (69-261)||(11986169-11986361)
chr3 (217-261)||(47984719-47984763)
chr3 (217-261)||(47994006-47994050)
chr3 (217-261)||(48003293-48003337)
chr3 (217-261)||(48012579-48012623)
chr3 (82-123)||(14080715-14080756)
chr3 (221-261)||(11638425-11638465)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (13-261)||(22053781-22054027)
chr5 (2-261)||(27182482-27182741)
chr5 (67-261)||(18531068-18531261)
chr5 (41-261)||(23507034-23507251)
chr5 (64-261)||(4199971-4200168)
chr5 (97-261)||(43443414-43443578)
chr5 (97-261)||(18778011-18778175)
chr5 (78-261)||(19499968-19500151)
chr5 (78-261)||(21073595-21073778)
chr5 (78-261)||(22366481-22366664)
chr5 (78-261)||(25426697-25426880)
chr5 (97-261)||(27009910-27010074)
chr5 (78-261)||(12443-12626)
chr5 (78-261)||(29188284-29188466)
chr5 (66-205)||(34939401-34939540)
chr5 (66-213)||(20623085-20623232)
chr5 (66-213)||(21233528-21233675)
chr5 (68-212)||(25900408-25900552)
chr5 (66-213)||(16536313-16536460)
chr5 (66-213)||(37052860-37053007)
chr5 (69-261)||(32950762-32950955)
chr5 (148-261)||(35791172-35791286)
chr5 (221-261)||(11212212-11212252)
chr5 (221-261)||(21617084-21617124)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (41-261)||(148790-149009)
scaffold0025 (67-261)||(8918-9111)
scaffold0025 (2-87)||(146843-146927)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (2-261)||(1193-1451)
scaffold0266 (29-261)||(3547-3776)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (2-261)||(123098-123358)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (2-258)||(36848-37104)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (2-261)||(13036949-13037208)
chr7 (4-261)||(11580674-11580933)
chr7 (2-261)||(16211835-16212092)
chr7 (98-261)||(13911044-13911208)
chr7 (2-261)||(36052736-36052992)
chr7 (72-261)||(18253841-18254029)
chr7 (66-261)||(47481031-47481225)
chr7 (78-261)||(10989479-10989661)
chr7 (97-261)||(13572745-13572909)
chr7 (66-261)||(25292338-25292532)
chr7 (67-261)||(13321083-13321278)
chr7 (72-261)||(2437526-2437715)
chr7 (13-261)||(3060035-3060281)
chr7 (96-261)||(16478980-16479144)
chr7 (66-261)||(7293086-7293279)
chr7 (66-213)||(11516343-11516490)
chr7 (66-213)||(15441564-15441711)
chr7 (66-213)||(30262129-30262276)
chr7 (51-187)||(295951-296087)
chr7 (66-108)||(14113989-14114031)
chr7 (66-108)||(14423639-14423681)
chr7 (221-261)||(9723946-9723986)
chr7 (221-261)||(46474069-46474109)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (2-261)||(20931414-20931671)
chr1 (2-261)||(20893562-20893820)
chr1 (3-261)||(20445748-20446007)
chr1 (4-261)||(20531513-20531770)
chr1 (2-261)||(41394291-41394548)
chr1 (97-261)||(18601137-18601301)
chr1 (78-261)||(5072388-5072571)
chr1 (2-261)||(37844385-37844645)
chr1 (68-236)||(20913124-20913291)
chr1 (96-261)||(45051492-45051656)
chr1 (96-261)||(2116323-2116488)
chr1 (72-261)||(22227878-22228066)
chr1 (72-261)||(22232575-22232763)
chr1 (66-213)||(51452608-51452755)
chr1 (221-261)||(25093927-25093967)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (70-261)||(5597-5788)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (2-261)||(48667-48924)
scaffold0023 (99-261)||(36162-36324)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (2-261)||(247377-247636)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (101-261)||(43066-43226)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (69-261)||(48256-48447)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (2-212)||(89389-89600)
scaffold0028 (2-118)||(107719-107836)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (2-261)||(171974-172231)
scaffold0001 (2-261)||(177677-177934)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (2-261)||(4997-5255)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (13-260)||(41799-42044)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (66-261)||(6064-6257)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (2-261)||(12184-12439)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (4-212)||(51121-51328)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (2-261)||(8947-9204)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (2-261)||(26351-26609)
scaffold0162 (66-213)||(8180-8327)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (66-261)||(956-1149)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (99-261)||(31696-31859)
scaffold0008 (2-261)||(128106-128362)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (97-261)||(104-268)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (72-261)||(107816-108004)
scaffold0026 (135-261)||(64585-64711)
scaffold0026 (81-123)||(89863-89905)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (51-213)||(519-681)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (66-261)||(13575-13769)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (66-261)||(41717-41911)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (78-224)||(1304-1450)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (66-251)||(34460-34644)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (2-257)||(272098-272351)
scaffold0009 (221-261)||(69525-69565)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (72-251)||(3042-3220)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (72-261)||(21110-21298)
scaffold0139 (97-261)||(14080-14243)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (97-261)||(9368-9531)
scaffold0215 (97-261)||(16266-16429)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (135-261)||(5273-5398)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (66-213)||(26911-27058)
scaffold0141 (70-213)||(22656-22799)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (66-213)||(1582-1729)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (66-213)||(37066-37213)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (98-234)||(13345-13480)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (135-261)||(3791-3917)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (66-261)||(3258-3453)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (69-261)||(56102-56294)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (135-261)||(45099-45225)
scaffold0066 (135-261)||(54485-54611)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (215-261)||(197386-197432)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (143-261)||(22484-22601)


Alignment Details
Target: scaffold0195 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19535 - 19275
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt--gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19535 ggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactg 19436  T
Q  100 tgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||    
T  19435 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 19336  T
Q  200 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  19335 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgt 19275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21359
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgt 21359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 16404911 - 16405166
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattatttgtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtg 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16404911 ggttagtcttcatcataatcatcattatttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtg 16405010  T
Q  102 atgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaa 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||  |||||||| |    
T  16405011 atgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctca 16405110  T
Q  202 attggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||||||||| | ||||   |||||| | |||| || |||||| ||||||||||||||    
T  16405111 attggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgt 16405166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 43373403 - 43373661
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| || || || ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  43373403 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgtgctccaactgt 43373502  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||     
T  43373503 gatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 43373602  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatg 260  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43373603 aattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatg 43373661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 16193653 - 16193910
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattatttg-taaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16193653 ggttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaatttt-gctt-atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactat 16193750  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||     
T  16193751 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 16193850  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16193851 aattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgt 16193910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120791
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 30120791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Original strand, 21844591 - 21844755
Alignment:
Q  97 ctgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 196  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| |   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21844591 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 21844690  T
Q  197 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  21844691 gctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgt 21844755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Original strand, 21851984 - 21852148
Alignment:
Q  97 ctgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 196  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| |   ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21851984 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 21852083  T
Q  197 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21852084 gctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgt 21852148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674575
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 16674575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 24928727 - 24928939
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gt-aaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactg 99  Q
    |||||| ||| |||||||||||| | |||| || |||||| ||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24928727 ggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggataattgttgctaaattcgtgctccaactg 24928824  T
Q  100 tgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 199  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  24928825 tgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 24928924  T
Q  200 aaattggtgaatttc 214  Q
     ||||||||||||||    
T  24928925 caattggtgaatttc 24928939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774440
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgt 6774440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 261
Target Start/End: Original strand, 222756 - 222874
Alignment:
Q  143 tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtg 242  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  222756 tgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtg 222855  T
Q  243 attcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  222856 attcttgttcaaatgatgt 222874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 261
Target Start/End: Original strand, 736379 - 736497
Alignment:
Q  143 tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtg 242  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  736379 tgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtg 736478  T
Q  243 attcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  736479 attcttgttcaaatgatgt 736497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 261
Target Start/End: Original strand, 860274 - 860392
Alignment:
Q  143 tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtg 242  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  860274 tgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtg 860373  T
Q  243 attcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  860374 attcttgttcaaatgatgt 860392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24549051
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | |||||| |||  || ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgt 24549051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345641
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgat 259  Q
     ||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| || |||| | ||||||| ||| ||| ||||| | |||||| |||||| |||||    
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgat 17345641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907407
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||    
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgt 22907407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238203
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661395
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685662
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Original strand, 691911 - 691970
Alignment:
Q  143 tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  691911 tgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16195414 - 16195299
Alignment:
Q  147 ggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgat 244  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||  |||| || |  || |||||||||||  |||||||||||    
T  16195414 ggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgag-attatacttaatttatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgat 16195316  T
Q  245 tcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||||| ||||||||    
T  16195315 tcatgttccattgatgt 16195299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5854722 - 5854682
Alignment:
Q  221 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5854722 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgt 5854682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Original strand, 22497348 - 22497388
Alignment:
Q  221 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  22497348 gttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgt 22497388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 38533757 - 38533717
Alignment:
Q  221 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  38533757 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgt 38533717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 36982375 - 36982635
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt--gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactg 99  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982375 ggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactg 36982474  T
Q  100 tgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 199  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| ||  |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||    
T  36982475 tgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 36982574  T
Q  200 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
     ||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  36982575 caattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgt 36982635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 19794640 - 19794898
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcatta-tttgtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  19794640 ggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgt 19794738  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  ||||||||     
T  19794739 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 19794838  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  19794839 aattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgt 19794898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8891570 - 8891311
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8891570 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgt 8891471  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  ||||||||     
T  8891470 gataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 8891371  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  8891370 aattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgt 8891311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 43642891 - 43643150
Alignment:
Q  1 aggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactg 99  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  43642891 aggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattg 43642990  T
Q  100 tgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||  ||||||||    
T  43642991 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgct 43643090  T
Q  200 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatg 260  Q
     ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43643091 caattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatg 43643150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 463064 - 462807
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  463064 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt-gctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgt 462967  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |     
T  462966 gatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttc 462867  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  462866 aattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgt 462807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 24341337 - 24341583
Alignment:
Q  13 atcataatcatcattatttgtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgat-ggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtt 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||| | |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  24341337 atcatcatcatcatt-tttgcaatttttcaaatgtggtatgaattttt-cataattggataattgttgctaaattcatgcttcaactgtgatgatatgtt 24341434  T
Q  112 tgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaat 211  Q
    |||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  24341435 tgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 24341534  T
Q  212 ttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24341535 tt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 24341583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396847
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | || |   ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 17396847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Original strand, 20627249 - 20627505
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaa-tttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactg 99  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |   || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20627249 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaatattgtatgaattatg--attatggataattgttgttaaattcgtgctccaactg 20627346  T
Q  100 tgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 199  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||    
T  20627347 tgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgct 20627446  T
Q  200 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgat 259  Q
     ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  20627447 caattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgat 20627505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886844
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgt 19886844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265584
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
     ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||  |||| ||  ||||||||||||||||    
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgt 25265584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689548
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820187
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906587
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015127
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||  ||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 251
Target Start/End: Original strand, 7507848 - 7508027
Alignment:
Q  70 ataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatat 169  Q
    |||||| |||||||||||| ||||    ||||||| ||| ||  | || |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7507848 ataattattgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatat 7507947  T
Q  170 gtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgtt 251  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||||| | |||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  7507948 gtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-ggctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgtt 7508027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22863256 - 22863169
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcg 88  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22863256 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Original strand, 16292940 - 16292980
Alignment:
Q  221 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  16292940 gttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgt 16292980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10644452 - 10644288
Alignment:
Q  97 ctgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 196  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644452 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 10644353  T
Q  197 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644352 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 10644288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 15675037 - 15675283
Alignment:
Q  13 atcataatcatcattatttgtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgat-ggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtt 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||| | |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15675037 atcatcatcatcatt-tttgcaatttttcaaatgtggtatgaattttt-cataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtt 15675134  T
Q  112 tgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaat 211  Q
    |||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  15675135 tgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 15675234  T
Q  212 ttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15675235 tt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 15675283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 54118179 - 54118438
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  54118179 ggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgt 54118278  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | || || |||||| |||  ||||||||     
T  54118279 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctc 54118378  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgtt-gatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  54118379 aattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattt-agttatgattcttgttcaattgatgt 54118438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13246758 - 13246499
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  13246758 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgtgctacaactgt 13246659  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  ||||||||     
T  13246658 gatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 13246559  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  13246558 aattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgt 13246499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 261
Target Start/End: Original strand, 10104251 - 10104444
Alignment:
Q  67 tggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaa 166  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  10104251 tggataattgttgctaaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 10104350  T
Q  167 tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10104351 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 10104444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 122213 - 121990
Alignment:
Q  4 ttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtga 102  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  122213 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt-gctt-atggataattgttgctaaatttgtgctccaactgtga 122116  T
Q  103 tgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaa 202  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||    
T  122115 tgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 122016  T
Q  203 ttggtgaatttctcctaagttgttgtt 229  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||    
T  122015 ttggtgaattt-tgctaagttgttgtt 121990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048416
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |   ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 13048416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357723
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||| ||| || |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgt 47357723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115698
Alignment:
Q  93 ccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||  |    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  193 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 31115698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680270
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgt 26680270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488678
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328073
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 261
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885748
Alignment:
Q  82 aaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgtt 180  Q
    |||||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||| | || ||  || |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  181 aagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40885670 aagttatgaa-attatgctcaattggtgaactt-tgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 40885748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 33241015 - 33240900
Alignment:
Q  13 atcataatcatcattatttgtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgat-ggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtt 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||| | |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33241015 atcatcatcatcatt-tttgcaatttttcaaatgtggtatgaattttt-cataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtt 33240918  T
Q  112 tgtatgaatgaatggatg 129  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  33240917 tgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7850278 - 7850090
Alignment:
Q  51 atgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtg 150  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| |||||||  | |||| |||||||| ||||||| || ||||  |  ||| ||| ||||||||    
T  7850278 atgaatttttgtataatgcataattgctgttaaattcgtgctccaatggagatgttatgtttgaatgaatgtattgatgaaaactgtgtgattgttggtg 7850179  T
Q  151 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagat 239  Q
     ||||  |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||| || || |||| || | ||||||  ||||||| |||||||    
T  7850178 gaattgtatgtccaattatgtgaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaagtgatgaaattttgctaagtgattgttgaattgagat 7850090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8374691 - 8374577
Alignment:
Q  147 ggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgat 244  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| | || |||| |||||||| |  || |||||||||||  |||||||||||    
T  8374691 ggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatactcaattagtgaattt-taatatgttgttgttgaaatgagatgtgat 8374594  T
Q  245 tcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||||| ||||||||    
T  8374593 tcatgttccattgatgt 8374577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 261
Target Start/End: Original strand, 17145730 - 17145844
Alignment:
Q  147 ggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgat 244  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||  ||| | || |||| |||||||| |  || |||||||||||  |||||||||||    
T  17145730 ggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaa-attatactcaattagtgaattt-tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgat 17145827  T
Q  245 tcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||||| ||||||||    
T  17145828 tcatgttccattgatgt 17145844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18248399 - 18248287
Alignment:
Q  149 tgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattc 246  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||  ||| | || |||| |||||||| |  || |||||||||||  |||||||||||||    
T  18248399 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagatatgaa-attatactcaattagtgaattt-taatatgttgttgttgaaatgagatgtgattc 18248302  T
Q  247 atgttcaattgatgt 261  Q
    |||||| ||||||||    
T  18248301 atgttccattgatgt 18248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 31132623 - 31132543
Alignment:
Q  19 atcatcattatttgtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgat-ggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    ||||||||| |||| || ||| ||||||| | |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31132623 atcatcatt-tttgcaatttttcaaatgtggtatgaattttt-cataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgt 31132543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Original strand, 13590213 - 13590253
Alignment:
Q  221 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  13590213 gttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgt 13590253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23153775 - 23153518
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23153775 ggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgtgctccaactgt 23153676  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  ||||||||     
T  23153675 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 23153576  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgat 259  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  23153575 aattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgat 23153518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175632
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgt 25175632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654166
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgt 27654166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009633
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
     ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||  |||| ||  ||||||||||||||||    
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgt 35009633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 14626118 - 14626312
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14626118 atggataattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 14626217  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||   |||||||||| || | ||||||||||||| | ||||||| |||||| || |||||||||||    
T  14626218 atatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgt 14626312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16825937
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgta--tgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaa 175  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  176 atgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgt 16825937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657941
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
     ||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| || |||| | ||||||| ||| ||| ||||| | |||||| |||||| |||||||    
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgt 1657941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Original strand, 1650105 - 1650287
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||| || ||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1650105 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaat 1650204  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  1650205 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgt 1650287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862595
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattg 205  Q
     |||||| |||||| |||||||||  |||||||| |||||    
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 15862595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29666139 - 29665942
Alignment:
Q  64 tgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatg-tt 162  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||  |||| |||||| |||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  29666139 tgatggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgttt 29666040  T
Q  163 caaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||| |||| | |||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29666039 caaagtatgcataaatgtcaagttatga-aattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgt 29665942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23148324 - 23148247
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgtt 78  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23148324 ggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtt 23148247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740907
Alignment:
Q  147 ggtgaaattacatgttc--aaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgat 244  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagtcgttgttgaattgagatatgat 27740924  T
Q  245 tcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||||||||||||||    
T  27740923 tcatgttcaattgatgt 27740907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751603
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtga 151  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |  ||||||| |||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18399046 - 18399006
Alignment:
Q  221 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18399046 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgt 18399006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Original strand, 15858988 - 15859218
Alignment:
Q  29 tttgtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggat 128  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15858988 tttgtaaattt-caattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 15859086  T
Q  129 gttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 228  Q
    | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15859087 gataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 15859185  T
Q  229 tgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  15859186 tgaattgagttatgattcttgttcaattgatgt 15859218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16821372 - 16821208
Alignment:
Q  97 ctgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 196  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16821372 ctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgt 16821273  T
Q  197 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821272 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 16821208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 14842498 - 14842755
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcatta-tttgtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||| | | |||| |||||  ||||||||| ||||||| |   || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14842498 ggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtg--attatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgt 14842595  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||     
T  14842596 gatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctc 14842695  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14842696 aattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgt 14842755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 51158018 - 51158212
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51158018 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 51158117  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  51158118 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgt 51158212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13839221 - 13838963
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gt-aaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||||   || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13839221 ggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatgaataattgttgctaaattcgtgctccaactg 13839124  T
Q  100 tgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  13839123 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 13839024  T
Q  200 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
     ||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  13839023 caattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgt 13838963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 12030095 - 12030340
Alignment:
Q  13 atcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtt 111  Q
    |||||||||||||| |||| || || || ||||||||| |||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12030095 atcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgactttt-gctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtt 12030192  T
Q  112 tgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaat 211  Q
    |||||| |||||| |||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||   ||||||| |||||||||||    
T  12030193 tgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaagttgtgctcaattggtgaat 12030292  T
Q  212 ttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatg 260  Q
    || | ||||||| ||||| |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  12030293 tt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatg 12030340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2050136 - 2049880
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| || || || ||||||||| || |||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2050136 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaatttt-gctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgt 2050039  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    || ||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||  ||||||||     
T  2050038 gacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaaattgtgctc 2049939  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatg 260  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  2049938 aattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatg 2049880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316288
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 55316288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 261
Target Start/End: Original strand, 15936633 - 15936821
Alignment:
Q  72 aattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 171  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15936633 aattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgt 15936732  T
Q  172 aaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15936733 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgt 15936821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975916
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | || |   ||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 13975916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270144
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 41270144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860874
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | || |   ||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 45860874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955084
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | || |   ||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 13955084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 261
Target Start/End: Original strand, 15938475 - 15938663
Alignment:
Q  72 aattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 171  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15938475 aattgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgt 15938574  T
Q  172 aaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15938575 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgt 15938663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912675
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||||||    || ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttga--tatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgt 17912675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 16744051 - 16744262
Alignment:
Q  1 aggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactg 99  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||   || |||||| ||||||| |||||||| |||||||||     
T  16744051 aggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactt 16744148  T
Q  100 tgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 199  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||  |||||||     
T  16744149 tgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 16744248  T
Q  200 aaattggtgaattt 213  Q
    |||| | |||||||    
T  16744249 aaatggatgaattt 16744262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15615067 - 15614903
Alignment:
Q  96 actgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattg 195  Q
    |||||| || ||| |||||||| |||||| |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |    
T  15615067 actgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatgg 15614968  T
Q  196 tgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  15614967 tgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgt 15614903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449385
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 19232110 - 19231981
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gt-aaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactg 99  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19232110 ggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactg 19232011  T
Q  100 tgatgatatgtttgtatgaatgaatggatg 129  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| ||||    
T  19232010 tgatgatatgtttatattcatgaattgatg 19231981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 112
Target Start/End: Original strand, 19260760 - 19260869
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||| || | |    
T  19260760 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaatttttt--ttatggataattgttgctaaattcgtgctctaattat 19260857  T
Q  101 gatgatatgttt 112  Q
    ||||||||||||    
T  19260858 gatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 261
Target Start/End: Original strand, 12264865 - 12264980
Alignment:
Q  147 ggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgat 244  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| || |  || |||||||||||  |||||||||||    
T  12264865 ggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgag-attatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgat 12264963  T
Q  245 tcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||||| ||||||||    
T  12264964 tcatgttccattgatgt 12264980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 54651723 - 54651529
Alignment:
Q  64 tgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgtt- 162  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||| ||  | || |||||| |||| ||  ||||||| |||  |||||||| ||||||     
T  54651723 tgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttg 54651624  T
Q  163 caaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattga 258  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||  ||| | || ||||||||||||| |  || |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    
T  54651623 caaagtatgtataaatgttaagttatga-aattatactcaattggtgaattt-tgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 54651529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 261
Target Start/End: Original strand, 11986169 - 11986361
Alignment:
Q  69 gataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaa-- 166  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| || || || |||| |  ||| ||  ||||||| ||| | ||||||||||||||  ||      
T  11986169 gataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaag 11986268  T
Q  167 tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||  ||||| |||||||||  |||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||    
T  11986269 tatgtattaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaaatagtgaattt-tgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgt 11986361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984719
Alignment:
Q  217 ctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgt 47984719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47994006
Alignment:
Q  217 ctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgt 47994006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003293
Alignment:
Q  217 ctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgt 48003293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012579
Alignment:
Q  217 ctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgt 48012579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  82 aaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaa 123  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11638465 - 11638425
Alignment:
Q  221 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  11638465 gttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgt 11638425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 22053781 - 22054027
Alignment:
Q  13 atcataatcatcattatttgtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgat-ggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtt 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||| | |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22053781 atcatcatcatcatt-tttgaaatttttcaaatgtggtatgaattttt-cataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtt 22053878  T
Q  112 tgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaat 211  Q
    |||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  22053879 tgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 22053978  T
Q  212 ttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22053979 tt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 22054027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 27182482 - 27182741
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27182482 ggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcatgctccaactgt 27182581  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  ||||||||     
T  27182582 gatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 27182681  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  27182682 aattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgt 27182741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 261
Target Start/End: Original strand, 18531068 - 18531261
Alignment:
Q  67 tggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaa 166  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18531068 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 18531167  T
Q  167 tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18531168 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 18531261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23507251 - 23507034
Alignment:
Q  41 caaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatg 140  Q
    ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||    
T  23507251 caaatgttgtatgaatttt-gctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatg 23507154  T
Q  141 actgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatg 240  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||     
T  23507153 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatt 23507055  T
Q  241 tgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  23507054 tgattcttgttcaattgatgt 23507034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 64 - 261
Target Start/End: Original strand, 4199971 - 4200168
Alignment:
Q  64 tgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttc 163  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| ||||    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4199971 tgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttc 4200070  T
Q  164 aaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200071 atatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 4200168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Original strand, 43443414 - 43443578
Alignment:
Q  97 ctgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 196  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  43443414 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgt 43443513  T
Q  197 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  43443514 gctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgt 43443578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Original strand, 18778011 - 18778175
Alignment:
Q  97 ctgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 196  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||    
T  18778011 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 18778110  T
Q  197 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  18778111 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgt 18778175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499968
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgt 19499968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073778
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgt 21073778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366664
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgt 22366664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426697
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgt 25426697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27010074 - 27009910
Alignment:
Q  97 ctgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 196  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| |   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27010074 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 27009975  T
Q  197 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  27009974 actcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 27009910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12443
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgt 12443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188466
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | |||||| |||  || ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgt 29188466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939401
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattg 205  Q
     ||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||    
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 34939401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623085
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233675
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 212
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900552
Alignment:
Q  68 ggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||| |||||| |||||  |||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  168 atgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatt 212  Q
    |||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | ||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt 25900552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536313
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||  ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052860
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    ||||||  |||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 32950955 - 32950762
Alignment:
Q  69 gataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgtt-caaa- 166  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| || || || |||| | |||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||||| ||||     
T  32950955 gataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaag 32950856  T
Q  167 tatgtaaaaatgttaa-gttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||| ||| || || |||||||  |||||||| || |||||||||| | ||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  32950855 tatgtataaaggtcaaagttatgaa-attgtgctcaaatggtgaattt-tactatgttgttgttgaaaagagatgtgattcatgttccattgatgt 32950762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 261
Target Start/End: Original strand, 35791172 - 35791286
Alignment:
Q  148 gtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgatt 245  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| || |  || |||||||||||  ||||||||||||    
T  35791172 gtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgag-attatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgatt 35791270  T
Q  246 catgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||| ||||||||    
T  35791271 catgttccattgatgt 35791286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Original strand, 11212212 - 11212252
Alignment:
Q  221 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11212212 gttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgt 11212252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21617124 - 21617084
Alignment:
Q  221 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21617124 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgt 21617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 149009 - 148790
Alignment:
Q  41 caaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatg 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||| |    
T  149009 caaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaag 148910  T
Q  141 actgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatg 240  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||     
T  148909 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatt 148811  T
Q  241 tgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  148810 tgattcttgttcaattgatgt 148790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9111 - 8918
Alignment:
Q  67 tggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaa 166  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  9111 tggataattgttgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 9012  T
Q  167 tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9011 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgt 8918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 146927 - 146843
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattc 87  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  146927 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgc-ttatggataattgttcctaaattc 146843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1451 - 1193
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gt-aaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactg 99  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  1451 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttc--ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactt 1354  T
Q  100 tgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 199  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||    
T  1353 tgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 1254  T
Q  200 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1253 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgt 1193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Original strand, 3547 - 3776
Alignment:
Q  29 tttgtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggat 128  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||   || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  3547 tttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttg--attatagataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 3644  T
Q  129 gttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 228  Q
    | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  3645 gataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgt 3743  T
Q  229 tgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3744 taatttgagatttgattcttgttcaattgatgt 3776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 123098 - 123358
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt--gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactg 99  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  123098 ggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattg 123197  T
Q  100 tgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  123198 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 123297  T
Q  200 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||   || || | |||||| ||||||||||||||    
T  123298 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgt 123358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Original strand, 36848 - 37104
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| || || || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36848 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgt 36947  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||    
T  36948 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgcta 37047  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattga 258  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||| | ||| || |||||||||||    
T  37048 aattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattga 37104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 13036949 - 13037208
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13036949 ggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgt 13037048  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | | ||||| |||||| |||  ||||||||     
T  13037049 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 13037148  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  13037149 aattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgt 13037208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 261
Target Start/End: Original strand, 11580674 - 11580933
Alignment:
Q  4 ttagacttcatcataatcatcattattt--gtaaatttacaaatgttggatgaattttt-gcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11580674 ttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattcgtgctccaactgt 11580773  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  ||||||||     
T  11580774 gataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 11580873  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  11580874 aattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgt 11580933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16212092 - 16211835
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| || || || ||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16212092 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttt-gctt-atggacaattgttgctaaattcgtgctccaactgt 16211995  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||     
T  16211994 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 16211895  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  16211894 aattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgt 16211835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 98 - 261
Target Start/End: Original strand, 13911044 - 13911208
Alignment:
Q  98 tgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtg 197  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||    
T  13911044 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 13911143  T
Q  198 ctaaattggtgaatttctcct-aagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911144 ctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 13911208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 36052992 - 36052736
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| || || || ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  36052992 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttatactccaactgt 36052893  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||     
T  36052892 gatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 36052793  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | ||||   |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  36052792 aattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgt 36052736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 261
Target Start/End: Original strand, 18253841 - 18254029
Alignment:
Q  72 aattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 171  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18253841 aattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgt 18253940  T
Q  172 aaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18253941 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgt 18254029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481225
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgt 47481225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989479
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgt 10989479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13572909 - 13572745
Alignment:
Q  97 ctgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 196  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| |   ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13572909 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 13572810  T
Q  197 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  13572809 gctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 13572745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292532
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |   ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaa-ttctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 25292532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321083
Alignment:
Q  67 tggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatg-ttcaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  166 a-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttg-ttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | |||||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatga-aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 13321083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2437715 - 2437526
Alignment:
Q  72 aattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 171  Q
    |||| |||||||||||| ||||    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  2437715 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgc 2437616  T
Q  172 aaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  2437615 aaaaatgataagttatgaagattgtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgt 2437526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3060281 - 3060035
Alignment:
Q  13 atcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtt 111  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  3060281 atcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttatatgaatttt-gctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatt 3060184  T
Q  112 tgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaat 211  Q
    |||||| || ||| |||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||| |||| || ||||||||    
T  3060183 tgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaat 3060084  T
Q  212 ttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    || |  ||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  3060083 tt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgt 3060035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 261
Target Start/End: Original strand, 16478980 - 16479144
Alignment:
Q  96 actgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattg 195  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||    
T  16478980 actgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattg 16479079  T
Q  196 tgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||| || || ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  16479080 tgctcaattggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgt 16479144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293086
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||    
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgt 7293086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516343
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441711
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262276
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 187
Target Start/End: Original strand, 295951 - 296087
Alignment:
Q  51 atgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatg-tatgactgttggt 149  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || || || | || ||||||||| || |||||| |||| || ||| ||||| |||||||    
T  295951 atgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgata-atgttatgattgttggt 296049  T
Q  150 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttat 187  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||    
T  296050 gaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 108
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114031
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 108
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423681
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Original strand, 9723946 - 9723986
Alignment:
Q  221 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  9723946 gttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgt 9723986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 46474109 - 46474069
Alignment:
Q  221 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  46474109 gttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgt 46474069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20931671 - 20931414
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||| | |||| | |||||| ||| ||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20931671 ggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagttt-gctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgt 20931574  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  20931573 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgcta 20931474  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20931473 aattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgt 20931414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 20893562 - 20893820
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattatttgtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtg 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20893562 ggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcttgctccaactgtg 20893661  T
Q  102 atgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaa 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||| |    
T  20893662 atgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctca 20893761  T
Q  202 attggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||   ||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  20893762 attggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgt 20893820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20446007 - 20445748
Alignment:
Q  3 gttagacttcatcataatcatcattattt-gt-aaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  20446007 gttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgt 20445908  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | | ||||| |||||  |||  ||||||||     
T  20445907 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctc 20445808  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | | |||||| || |||||||||||    
T  20445807 aattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgt 20445748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20531770 - 20531513
Alignment:
Q  4 ttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtga 102  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20531770 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtga 20531671  T
Q  103 tgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaa 202  Q
    | ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | | ||||| |||||  |||  |||||||| ||    
T  20531670 taatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaa 20531571  T
Q  203 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | | |||||| || |||||||||||    
T  20531570 ttggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgt 20531513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 41394548 - 41394291
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||   || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41394548 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactat 41394451  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||     
T  41394450 gatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 41394351  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||   ||||||| |||||| || |||||||||||    
T  41394350 aattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgt 41394291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Original strand, 18601137 - 18601301
Alignment:
Q  97 ctgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 196  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  18601137 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgt 18601236  T
Q  197 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  18601237 gctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 18601301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072571
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 5072571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 37844385 - 37844645
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  37844385 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcatgctccaactat 37844484  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagtta-tgagtattgtgct 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | | ||||| |||  || |||  ||||||||    
T  37844485 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtgaaaattgtgct 37844584  T
Q  200 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
     ||||  ||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  37844585 caattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgt 37844645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20913291 - 20913124
Alignment:
Q  68 ggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  20913291 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatat 20913192  T
Q  168 atgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttga 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||    
T  20913191 atgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaatttga 20913124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 45051656 - 45051492
Alignment:
Q  96 actgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattg 195  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||    
T  45051656 actgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattg 45051557  T
Q  196 tgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  45051556 tgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgt 45051492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2116488 - 2116323
Alignment:
Q  96 actgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattg 195  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |    
T  2116488 actgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatgg 2116389  T
Q  196 tgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgaga-tgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  2116388 tgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgt 2116323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22228066 - 22227878
Alignment:
Q  72 aattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 171  Q
    |||| |||||||||||| ||||   |||||||| ||| ||  | || |||||| |||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22228066 aattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgt 22227967  T
Q  172 aaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||   ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22227966 aaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgt 22227878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22232763 - 22232575
Alignment:
Q  72 aattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 171  Q
    |||| |||||||||||| ||||   |||||||| ||| ||  | || |||||| |||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22232763 aattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgt 22232664  T
Q  172 aaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||   ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22232663 aaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgt 22232575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452608
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25093967 - 25093927
Alignment:
Q  221 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  25093967 gttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgt 25093927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5788 - 5597
Alignment:
Q  70 ataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatat 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| |   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5788 ataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatat 5689  T
Q  170 gtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  5688 gtaaaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 5597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 48924 - 48667
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48924 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt-gctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgt 48827  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||  ||||||||     
T  48826 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 48727  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||| |   ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  48726 agttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgt 48667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 36324 - 36162
Alignment:
Q  99 gtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 198  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||    
T  36324 gtgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 36225  T
Q  199 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36224 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgt 36162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 247377 - 247636
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  247377 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgt 247476  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| | | ||||| |||||| |||  ||||||||     
T  247477 aatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 247576  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  247577 aattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgt 247636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 101 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 43066
Alignment:
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    |||| ||||||| |||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43126 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgt 43066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 48447 - 48256
Alignment:
Q  69 gataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaata 168  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  48447 gataattgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatg 48348  T
Q  169 tgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  48347 tgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgt 48256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 89389 - 89600
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  89389 ggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgt 89488  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||| |||  ||||||||     
T  89489 gatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtgaaaattgtgctc 89588  T
Q  201 aattggtgaatt 212  Q
    ||||||||||||    
T  89589 aattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Original strand, 107719 - 107836
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  107719 ggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgtgctccaactgt 107818  T
Q  101 gatgatatgtttgtatga 118  Q
    |||||||| |||||||||    
T  107819 gatgatatatttgtatga 107836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 172231 - 171974
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||||   || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  172231 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttg--attatggataactgttgctaaatacgtgctccaactgt 172134  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||||    
T  172133 gatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgcta 172034  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  172033 aattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgt 171974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 177934 - 177677
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||||   || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  177934 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttg--attatggataactgttgctaaatacgtgctccaactgt 177837  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||||    
T  177836 gatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgcta 177737  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  177736 aattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgt 177677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 4997 - 5255
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4997 ggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttt-cataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    || ||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||     
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||    |||| | |||||| ||||||||||||||    
T  5196 aattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgt 5255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 42044 - 41799
Alignment:
Q  13 atcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtt 111  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42044 atcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt-gctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtt 41947  T
Q  112 tgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaat 211  Q
    |||||| |||||| |||| ||  |||   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||| |||||||||||    
T  41946 tgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaaattgtgctcaattggtgaat 41847  T
Q  212 ttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatg 260  Q
    || | |||||||||||||   ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  41846 tt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatg 41799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 6064 - 6257
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6064 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 6163  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||  |||||| | |  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  6164 atatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgt 6257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12439 - 12184
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||| | |||| |||| ||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12439 ggttagtctttatcataatcatcttaattttgtaacttt-caaatgctgtatgaaattttg-attatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgt 12342  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||  |||||||||    
T  12341 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgcta 12242  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12241 aattggtgaattt-tgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgt 12184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Original strand, 51121 - 51328
Alignment:
Q  4 ttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtga 102  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51121 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt-gctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtga 51218  T
Q  103 tgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaa 202  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||  |||||||| ||    
T  51219 tgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 51318  T
Q  203 ttggtgaatt 212  Q
    ||||||||||    
T  51319 ttggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9204 - 8947
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||| | |||| | |||||| |||| |||| | ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  9204 ggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaatttt-gctt-atggaaaattgttgctaaattcgtgctccatttgt 9107  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||     
T  9106 gatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaattgtgctc 9007  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9006 aattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgt 8947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 26351 - 26609
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26351 ggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttt-cataatgtataattgttgctaaattcgtgctccaacttt 26449  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||| ||     
T  26450 gatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgttctc 26549  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||    |||| | |||||| ||||||||||||||    
T  26550 aattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgt 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8327
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | || ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
     ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 956 - 1149
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  956 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 1055  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||||  |||||| |||  |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  1056 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgt 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 261
Target Start/End: Original strand, 31696 - 31859
Alignment:
Q  99 gtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 198  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| |||    
T  31696 gtgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 31795  T
Q  199 taaattggtgaatttctcct-aagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31796 tcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 31859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 128106 - 128362
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||| | |||| | |||||| |||| |||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  128106 ggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaatttt-gctt-atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactgt 128203  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||  ||||||||     
T  128204 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgtgctc 128303  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||| |||||| |  || ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  128304 aattggcgaattt-tgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgt 128362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 104
Alignment:
Q  97 ctgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 196  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| |   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  268 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgt 169  T
Q  197 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  168 gctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 108004 - 107816
Alignment:
Q  72 aattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 171  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  108004 aattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgc 107905  T
Q  172 aaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||| |||||| | |  |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  107904 aaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgt 107816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 135 - 261
Target Start/End: Original strand, 64585 - 64711
Alignment:
Q  135 tgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgattt 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  64585 tgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaattt 64684  T
Q  235 gagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||    
T  64685 gagatgtgatgcttgttcaaatgatgt 64711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 123
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  81 taaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaa 123  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 51 - 213
Target Start/End: Original strand, 519 - 681
Alignment:
Q  51 atgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||    
T  519 atgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtg 618  T
Q  151 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||  ||||| || |||||||||||||    
T  619 aaattacatgttcaaataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt 681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13575
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
     ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||  |||| ||  ||||||||||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgt 13575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41717
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
     ||||||||||||| ||||| |||  |||||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||  |||| ||  ||||||||||||||||    
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgt 41717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 224
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1450
Alignment:
Q  78 tgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 177  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  178 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttg 224  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 251
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34644
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgtt 251  Q
     | ||||||||| | ||||| |||  ||||| || ||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgtt 34644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 272351 - 272098
Alignment:
Q  2 ggttagacttcatcataatcatcattattt-gtaaatttacaaatgttggatgaatttttgcatgatggataattgttgctaaattcgagctccaactgt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| || ||||||   || |||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||    
T  272351 ggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttg--attatggataaatattgctaaatacgtactccaactgt 272254  T
Q  101 gatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||||    
T  272253 aatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgcta 272154  T
Q  201 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattg 257  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||| | |||||| ||||||||||    
T  272153 aattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattg 272098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 69565 - 69525
Alignment:
Q  221 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  69565 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgt 69525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3220 - 3042
Alignment:
Q  72 aattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 171  Q
    |||| |||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3220 aattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgt 3121  T
Q  172 aaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgtt 251  Q
    |||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3120 aaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgtt 3042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 261
Target Start/End: Original strand, 21110 - 21298
Alignment:
Q  72 aattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 171  Q
    |||| |||||||||||| ||||    ||||||| |||||||||||  || ||| |||| ||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21110 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgt 21209  T
Q  172 aaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21210 aaaaatgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgt 21298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Original strand, 14080 - 14243
Alignment:
Q  97 ctgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 196  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||  | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  14080 ctgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgt 14179  T
Q  197 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  14180 gctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgt 14243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Original strand, 9368 - 9531
Alignment:
Q  97 ctgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 196  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || ||    
T  9368 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggt 9467  T
Q  197 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  9468 gctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgt 9531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Original strand, 16266 - 16429
Alignment:
Q  97 ctgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 196  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || ||    
T  16266 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggt 16365  T
Q  197 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  16366 gctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgt 16429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 261
Target Start/End: Original strand, 5273 - 5398
Alignment:
Q  135 tgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgattt 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||| | || |||||||||| ||||    
T  5273 tgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctgagttgttgttaattt 5371  T
Q  235 gagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5372 gagatttgattcttgttcaattgatgt 5398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26911
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22799 - 22656
Alignment:
Q  70 ataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatat 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||    
T  22799 ataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatat 22700  T
Q  170 gtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    || ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  22699 gtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1729
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37213
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  166 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 213  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 234
Target Start/End: Original strand, 13345 - 13480
Alignment:
Q  98 tgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtg 197  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||    
T  13345 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtg 13444  T
Q  198 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgattt 234  Q
    || ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||    
T  13445 ctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaattt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3917 - 3791
Alignment:
Q  135 tgtatgactgttggtgaaattacatgttcaaatatgta-aaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatt 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  3917 tgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatt 3819  T
Q  234 tgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3818 tgagatttgattcttgttcaattgatgt 3791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3258
Alignment:
Q  66 atggataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacat-gttca 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| || ||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttca 3354  T
Q  165 aa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    || |||||| |||| | |||||||||  ||||| || || |||||||||| | |||||||||||||||   || ||||||||  ||||||||||||||    
T  3353 aagtatgtataaatatcaagttatga-aattgtactcaaatggtgaattt-tgctaagttgttgttgagaggatatgtgattattgttcaattgatgt 3258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 261
Target Start/End: Original strand, 56102 - 56294
Alignment:
Q  69 gataattgttgctaaattcgagctccaactgtgatgatatgtttgtatgaatgaatggatgttatatgtatgactgttggtgaaattacatg--ttcaaa 166  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| || || || |||| | |||| ||  ||||||| ||| | ||||||||||||  || ||     
T  56102 gataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaag 56201  T
Q  167 tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||    
T  56202 tatgtataaatgtcaagttatga-aattgtgctcaaatggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgt 56294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 45225 - 45099
Alignment:
Q  135 tgtatgactgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgat 232  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||  ||||| || ||||||||||||| |  || |||||||||||     
T  45225 tgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttgaa-attgtactcaattggtgaattt-tgatatgttgttgttgaa 45128  T
Q  233 ttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45127 atgagatgtgattcatgttccattgatgt 45099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 54611 - 54485
Alignment:
Q  135 tgtatgactgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgat 232  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||| |  || |||||||||||     
T  54611 tgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaa-attgtactcaattggtgaattt-tgatatgttgttgttgaa 54514  T
Q  233 ttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54513 atgagatgtgattcatgttccattgatgt 54485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 261
Target Start/End: Original strand, 197386 - 197432
Alignment:
Q  215 tcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  197386 tcctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgt 197432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 261
Target Start/End: Original strand, 22484 - 22601
Alignment:
Q  143 tgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct-aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatg 240  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||  ||| |||| |||||  ||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||    
T  22484 tgttggtgaatttgcatgttcaaaatatgtataaatgctaacttatga--attatgctcaaattattgaattg-tgctatgttgttgttgaattgagatg 22580  T
Q  241 tgattcatgttcaattgatgt 261  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  22581 tgaatcatgtttaattgatgt 22601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University