View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11080_low_16 (Length: 242)

Name: NF11080_low_16
Description: NF11080
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11080_low_16
NF11080_low_16
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (10-242)||(42033760-42033992)
chr1 (10-242)||(21885882-21886114)
chr1 (10-242)||(8539819-8540052)
chr1 (10-242)||(8605058-8605291)
chr1 (13-242)||(13964464-13964693)
chr1 (10-242)||(30549865-30550097)
chr1 (10-242)||(2115569-2115801)
chr1 (10-242)||(25019036-25019269)
chr1 (10-242)||(1968906-1969138)
chr1 (10-234)||(21458205-21458429)
chr1 (10-242)||(16154451-16154684)
chr1 (10-242)||(2370667-2370899)
chr1 (10-242)||(18382931-18383162)
chr1 (10-242)||(41544400-41544633)
chr1 (18-242)||(18062488-18062711)
chr1 (10-242)||(22956126-22956356)
chr1 (10-230)||(1186680-1186898)
chr1 (10-234)||(34822603-34822826)
chr1 (129-242)||(22406646-22406760)
chr1 (33-152)||(21782349-21782468)
chr1 (11-152)||(26193724-26193864)
chr1 (33-182)||(21821739-21821889)
chr1 (11-152)||(20308505-20308645)
chr1 (11-152)||(25867917-25868057)
chr1 (10-152)||(18097216-18097356)
chr1 (33-152)||(20328673-20328792)
chr1 (11-152)||(20314189-20314329)
chr1 (11-97)||(20318328-20318412)
chr1 (11-152)||(27065724-27065864)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (10-242)||(4478-4710)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (10-242)||(29540026-29540258)
chr6 (10-242)||(14791171-14791404)
chr6 (10-238)||(24922260-24922489)
chr6 (10-234)||(12454630-12454854)
chr6 (10-234)||(16897523-16897747)
chr6 (10-234)||(16908176-16908400)
chr6 (10-238)||(24931296-24931525)
chr6 (10-234)||(18159638-18159862)
chr6 (10-234)||(18169450-18169674)
chr6 (10-234)||(31357137-31357361)
chr6 (10-234)||(31366865-31367089)
chr6 (10-237)||(3285418-3285646)
chr6 (10-242)||(20911850-20912083)
chr6 (10-152)||(18200876-18201018)
chr6 (10-182)||(27787828-27788000)
chr6 (10-170)||(14044956-14045115)
chr6 (11-152)||(16320945-16321085)
chr6 (11-152)||(26021389-26021529)
chr6 (11-90)||(16333155-16333233)
chr6 (11-89)||(791505-791582)
chr6 (11-152)||(1596091-1596231)
chr6 (33-152)||(18712578-18712697)
chr6 (12-152)||(24505686-24505825)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (10-242)||(15668756-15668988)
chr4 (10-242)||(16252981-16253213)
chr4 (10-234)||(3487890-3488114)
chr4 (10-234)||(16249023-16249247)
chr4 (10-242)||(26330794-26331026)
chr4 (10-234)||(3497213-3497437)
chr4 (10-240)||(17160809-17161039)
chr4 (10-234)||(18105683-18105908)
chr4 (10-234)||(21845680-21845904)
chr4 (10-234)||(21855272-21855496)
chr4 (10-234)||(21901543-21901767)
chr4 (10-234)||(21911135-21911359)
chr4 (10-234)||(40921420-40921644)
chr4 (10-234)||(5293356-5293580)
chr4 (10-234)||(5303015-5303239)
chr4 (10-234)||(6691795-6692019)
chr4 (10-234)||(6702201-6702425)
chr4 (10-234)||(27681019-27681243)
chr4 (10-234)||(27690674-27690898)
chr4 (10-240)||(13403304-13403533)
chr4 (10-239)||(17985132-17985362)
chr4 (15-242)||(52498699-52498927)
chr4 (10-177)||(16241695-16241862)
chr4 (10-239)||(9836327-9836556)
chr4 (10-242)||(6406091-6406321)
chr4 (10-239)||(14600971-14601199)
chr4 (33-234)||(1292934-1293134)
chr4 (11-152)||(17838171-17838311)
chr4 (10-77)||(13793327-13793394)
chr4 (11-152)||(17828780-17828920)
chr4 (33-152)||(7847058-7847176)
chr4 (10-79)||(11476653-11476722)
chr4 (33-152)||(16629168-16629287)
chr4 (33-168)||(53946589-53946724)
chr4 (10-89)||(16211452-16211530)
chr4 (33-149)||(16472311-16472427)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (10-242)||(25432428-25432660)
chr3 (10-242)||(20491623-20491855)
chr3 (10-242)||(55478310-55478542)
chr3 (10-234)||(4370954-4371178)
chr3 (10-234)||(4380673-4380897)
chr3 (13-242)||(4024662-4024891)
chr3 (10-238)||(6432314-6432543)
chr3 (10-238)||(6421874-6422103)
chr3 (10-242)||(12254-12486)
chr3 (10-234)||(8972423-8972647)
chr3 (10-234)||(8982978-8983202)
chr3 (10-234)||(9536712-9536936)
chr3 (10-234)||(9547038-9547262)
chr3 (10-234)||(1685518-1685742)
chr3 (10-230)||(5655893-5656113)
chr3 (10-242)||(10012494-10012726)
chr3 (14-238)||(16335712-16335937)
chr3 (53-242)||(10508468-10508655)
chr3 (11-152)||(4783255-4783395)
chr3 (11-152)||(19828518-19828658)
chr3 (11-152)||(2489846-2489986)
chr3 (11-152)||(13120245-13120385)
chr3 (11-152)||(20745350-20745490)
chr3 (36-152)||(13113140-13113256)
chr3 (10-170)||(12376170-12376328)
chr3 (33-78)||(20292867-20292912)
chr3 (33-152)||(18560623-18560742)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (10-242)||(7939-8171)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (10-242)||(15417-15649)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (10-242)||(93120-93352)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (12-239)||(7757335-7757562)
chr8 (10-242)||(791305-791537)
chr8 (10-234)||(9325294-9325518)
chr8 (10-242)||(17268410-17268642)
chr8 (10-234)||(21203072-21203296)
chr8 (10-234)||(21213488-21213712)
chr8 (10-234)||(21333875-21334099)
chr8 (10-234)||(21988198-21988422)
chr8 (10-234)||(21997732-21997956)
chr8 (12-242)||(2690552-2690780)
chr8 (65-242)||(20098383-20098559)
chr8 (11-152)||(13673889-13674029)
chr8 (11-152)||(14881971-14882111)
chr8 (11-152)||(14894321-14894461)
chr8 (33-182)||(5867672-5867821)
chr8 (11-152)||(31999524-31999664)
chr8 (11-152)||(33774415-33774555)
chr8 (33-155)||(31991744-31991866)
chr8 (35-152)||(20531626-20531742)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (10-239)||(24696763-24696992)
chr2 (10-234)||(2998875-2999099)
chr2 (10-234)||(5337313-5337537)
chr2 (10-234)||(5347166-5347390)
chr2 (10-234)||(18650795-18651019)
chr2 (10-234)||(18662913-18663137)
chr2 (10-234)||(4457772-4457996)
chr2 (10-234)||(4467397-4467621)
chr2 (10-234)||(9502939-9503163)
chr2 (10-234)||(9514305-9514529)
chr2 (10-241)||(45014301-45014533)
chr2 (10-238)||(38957996-38958225)
chr2 (10-241)||(45024378-45024610)
chr2 (10-238)||(38930660-38930890)
chr2 (10-242)||(17488258-17488491)
chr2 (111-242)||(44639277-44639408)
chr2 (10-242)||(72394-72625)
chr2 (10-77)||(44639203-44639270)
chr2 (10-242)||(24239419-24239638)
chr2 (10-152)||(12570221-12570362)
chr2 (11-152)||(22687952-22688092)
chr2 (11-152)||(45190472-45190612)
chr2 (11-152)||(573895-574035)
chr2 (11-152)||(16934571-16934711)
chr2 (11-152)||(17005231-17005371)
chr2 (33-96)||(15940399-15940462)
chr2 (33-136)||(24942578-24942681)
chr2 (19-55)||(29423126-29423162)
chr2 (53-81)||(22901807-22901835)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (10-242)||(74985-75217)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (10-242)||(14943876-14944108)
chr7 (10-242)||(15371469-15371701)
chr7 (10-242)||(9535501-9535734)
chr7 (10-242)||(9545784-9546017)
chr7 (10-234)||(5382076-5382300)
chr7 (10-234)||(5391714-5391938)
chr7 (10-234)||(5926712-5926936)
chr7 (10-234)||(6544382-6544606)
chr7 (10-234)||(8500626-8500850)
chr7 (10-234)||(8511096-8511320)
chr7 (10-242)||(42620748-42620980)
chr7 (10-234)||(43983054-43983278)
chr7 (10-234)||(46496691-46496915)
chr7 (10-234)||(46507303-46507527)
chr7 (10-232)||(26348410-26348632)
chr7 (10-232)||(26363445-26363667)
chr7 (10-234)||(6534083-6534307)
chr7 (10-234)||(11626625-11626848)
chr7 (10-234)||(44896894-44897118)
chr7 (10-234)||(44907297-44907521)
chr7 (10-242)||(32097948-32098181)
chr7 (10-242)||(32108385-32108618)
chr7 (10-234)||(16132175-16132399)
chr7 (10-234)||(16142724-16142948)
chr7 (10-242)||(14248802-14249033)
chr7 (10-242)||(2992176-2992408)
chr7 (10-242)||(9006475-9006706)
chr7 (148-242)||(22964652-22964746)
chr7 (11-152)||(24541107-24541247)
chr7 (33-152)||(45552832-45552951)
chr7 (35-152)||(19585411-19585528)
chr7 (11-152)||(27988150-27988290)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (10-240)||(22244285-22244515)
chr5 (10-234)||(18360854-18361078)
chr5 (10-234)||(18389811-18390035)
chr5 (10-234)||(21753020-21753244)
chr5 (10-234)||(21762307-21762531)
chr5 (10-234)||(33938894-33939118)
chr5 (10-234)||(33949294-33949518)
chr5 (10-242)||(27411716-27411949)
chr5 (10-234)||(26192261-26192485)
chr5 (10-234)||(26202865-26203089)
chr5 (10-234)||(8765625-8765849)
chr5 (10-242)||(32070008-32070241)
chr5 (10-234)||(11411369-11411592)
chr5 (10-242)||(31104982-31105213)
chr5 (10-239)||(23378843-23379071)
chr5 (10-235)||(21484295-21484518)
chr5 (11-152)||(30944266-30944406)
chr5 (11-152)||(30953688-30953828)
chr5 (11-152)||(37299295-37299435)
chr5 (11-152)||(37549085-37549225)
chr5 (33-152)||(20896588-20896707)
chr5 (35-152)||(13572183-13572300)
chr5 (11-152)||(27274661-27274801)
chr5 (11-152)||(31916447-31916587)
chr5 (11-152)||(37651883-37652023)
chr5 (11-146)||(4038460-4038594)
chr5 (11-146)||(22173730-22173864)
chr5 (33-146)||(18210313-18210426)
chr5 (33-146)||(18219651-18219764)
chr5 (11-152)||(19888834-19888974)
chr5 (33-146)||(21681284-21681397)
chr5 (33-152)||(20763995-20764113)
chr5 (33-134)||(20905033-20905134)
chr5 (11-152)||(34130971-34131111)
chr5 (11-152)||(37817233-37817375)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (10-238)||(310286-310515)
scaffold0005 (10-239)||(216179-216407)
[»] scaffold0014 (4 HSPs)
scaffold0014 (10-234)||(234256-234480)
scaffold0014 (11-152)||(146328-146468)
scaffold0014 (11-152)||(153795-153934)
scaffold0014 (11-152)||(114793-114932)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (10-197)||(21423-21610)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (10-234)||(8110-8334)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (10-238)||(19643-19872)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (10-181)||(56091-56262)
[»] scaffold1705 (1 HSPs)
scaffold1705 (53-242)||(418-607)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (10-242)||(198960-199190)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (10-239)||(29028-29254)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (10-114)||(17554-17658)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (10-239)||(13394-13622)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (58-242)||(1143-1326)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (10-242)||(65256-65487)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (33-146)||(15046-15159)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (33-182)||(10920-11070)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (11-152)||(112061-112201)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (33-152)||(23010-23129)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (11-152)||(1136-1276)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (33-141)||(4430-4538)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (36-152)||(24108-24224)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (11-90)||(13720-13798)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (33-146)||(18402-18515)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42033992 - 42033760
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033992 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 42033893  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  42033892 gcctttattgcttgattgatctatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcaaagttcttgagattctt 42033793  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42033792 ggcttgcataagaacaaccttctgatctctgct 42033760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21886114 - 21885882
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  21886114 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataccttctttgacataatccttgtatat 21886015  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  21886014 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactctt 21885915  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21885914 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 21885882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8540052 - 8539819
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttg-acataatccttgtata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  8540052 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatggtcttaaattaacattgaatatcctttttttacataatccttatata 8539953  T
Q  109 tgcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8539952 tgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatatgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgagattat 8539853  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8539852 tggcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 8539819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8605291 - 8605058
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttg-acataatccttgtata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  8605291 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatggtcttaaattaacattgaatatcctttttttacataatccttatata 8605192  T
Q  109 tgcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8605191 tgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatatgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgagattat 8605092  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8605091 tggcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 8605058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13964693 - 13964464
Alignment:
Q  13 tctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13964693 tctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgcatatgcc 13964594  T
Q  113 tttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattcttgac 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||      
T  13964593 tttattgcttgattgatccatgcaaatctactttcctaaacatatatcaatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttgtt 13964494  T
Q  213 ttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964493 ttgtataagaacaaccttctgatctctgct 13964464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 30549865 - 30550097
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  30549865 acatctagcatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataccttctttgacataatccttgtatat 30549964  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  30549965 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacacatgtcacatgtgacttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactctt 30550064  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30550065 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 30550097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2115801 - 2115569
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||| |||||    
T  2115801 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttgatagtcttaaatgaacattgaataccttctttaacataatccttttatat 2115702  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  2115701 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattcccatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactctt 2115602  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2115601 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 2115569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25019269 - 25019036
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  25019269 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 25019170  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  25019169 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 25019070  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  25019069 tggcttgtttaagaacaaccttctaatctctgct 25019036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1969138 - 1968906
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1969138 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgtccataatcttaaatgaacattaagtatcttttttgacataatccttgtatat 1969039  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  1969038 tcctttattgcttgattgatccatgaatttgtactttcctagacatatatccatatcacatgtgccttgcatgaccttaatcaatgttcttgagattctt 1968939  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1968938 ggcttgtataagaataaccttctgatctctgct 1968906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21458429 - 21458205
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21458429 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21458330  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21458329 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21458230  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21458229 ggcttgtataagaacaaccttctga 21458205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16154684 - 16154451
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||    
T  16154684 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 16154585  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  16154584 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatatactcttctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 16154485  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16154484 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgct 16154451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 2370667 - 2370899
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2370667 acatctaggatgatattcccttttggaatatttctagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 2370766  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| |     
T  2370767 gccattattgcttgattgatccatgcaaatgtactttccttgacatttattcatgtcacatgtgcattccatgaccttgatcaatgttcttgagattttg 2370866  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2370867 ggcttgtataagaacaaccttttgatctatgct 2370899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18383162 - 18382931
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18383162 acatctaggatgatattcccttttggaatatttctagtacttcaatgttcattgtcttaaatgaacattgaatatcttttttgacataatccttgtatat 18383063  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18383062 gccattattgcttgattgatctatgc-aatgtattttcctggacatttaaccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 18382964  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18382963 ggcttgtgtaagaacaactttctgatctctgct 18382931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 41544400 - 41544633
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  41544400 acatctaggataatattcccttgtggaatattcctagtacatcaacgttcatagtcttaaatgaacattgagcatcctttttgacatagtccttgtatat 41544499  T
Q  110 gcctttattgc-ttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41544500 gcctttgttgctttgatagatccatgcaaatgtactttcgtggacatatatccatgtcacatgtgtcttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattct 41544599  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    ||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  41544600 tggtttgtgtaagaacaaccttctaatctttgct 41544633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 18062488 - 18062711
Alignment:
Q  18 gatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgcctttat 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||    
T  18062488 gatgatattcccttttggaatatttatagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacattaaccttataaatgtctttat 18062587  T
Q  118 tgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattcttgacttgta 217  Q
    ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||| || | | |||||||| | |  ||||||||  |||||| || ||| |||||||||| | ||||||    
T  18062588 tgcttcattgatccatggagatgtactttcctggacatttgttcatgtcacgtatagcttgcatgttcttgat-aatgttcttgagattctaggcttgta 18062686  T
Q  218 taagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  18062687 taagaacaaccttttgaactctgct 18062711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22956356 - 22956126
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  22956356 acatctaggatgatattcttat-tggaatattcttagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaaccttaaatatcctttttgacattaaccttgtaaat 22956258  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    |||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||| || || ||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||    
T  22956257 gcctctattgtttgattgattcatgaaaatgtactttcctagacatttattcatgtcacgtgtgacttgcatgatcttgat-aatgttcttgagattctt 22956159  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||  | |||||||| |||||||    
T  22956158 ggcttgtataagagaacccttctgaactctgct 22956126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 1186680 - 1186898
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  1186680 acatctaggatgatattctctt-tggaatatttctagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacattattcttgtaaat 1186778  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    | |||||||| |||||| || ||||  |||||||||| ||| | || ||| ||||| |||||||||||| |||  |||||| || ||| ||||| ||||     
T  1186779 gtctttattgtttgattgatacatgataatgtactttactgaacatttattcatgttacatgtgccttgtatgttcttgat-aatgttcttgagtttctg 1186877  T
Q  210 gacttgtataagaacaacctt 230  Q
    | |||| ||||||||||||||    
T  1186878 ggcttgcataagaacaacctt 1186898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34822826 - 34822603
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaa-tgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtata 108  Q
    |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  |||||| |    
T  34822826 acatctagtatgatattctctt-tagaatattcctagtacttcaaatgttcatagtcttaaatgaacaatgaagatcttttttgacattaatcttgtaaa 34822728  T
Q  109 tgcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||   ||| ||||    
T  34822727 ttcctttattgcttgattgatccaagacaatgtactttactgaacctttattcatgtcacatgtgccttgcatgttcttgat-aatattcacgagcttct 34822629  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
     | |||||||||||||||||||||||    
T  34822628 gggcttgtataagaacaaccttctga 34822603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 242
Target Start/End: Original strand, 22406646 - 22406760
Alignment:
Q  129 tccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattcttgacttgtataagaacaac 227  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  22406646 tccatgcaaatgtactcttctggacgtatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttggtcaaagttcttgagactcttggcttgtttaagaacaac 22406745  T
Q  228 cttctgatctctgct 242  Q
    |||||||||||||||    
T  22406746 cttctgatctctgct 22406760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 21782468 - 21782349
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaa-tgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21782468 tggaatattcctagtacttcaagtgtttatagtcttgaatgaaccttgaaga-cctttttgacattattcttgtaaatgcctttattgcttgattgatcc 21782370  T
Q  132 atgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||| | ||||||||| |||||    
T  21782369 atgtagatgtactttactgga 21782349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 26193724 - 26193864
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  26193724 catctaggataatattctcat-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 26193821  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  26193822 gcctttatttgttgatagatccatgcaaatgtactttactgga 26193864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 182
Target Start/End: Original strand, 21821739 - 21821889
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaa-tgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||||| ||||| | | |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  21821739 tggaatattcctagtacttcaagtcttcatagtcttgaatgaactttgaaga-cttttttgacattattcttgtaaatgcctttattgcttgattgattc 21821837  T
Q  132 atgcaaatgtactttcctggata-tatatccatgtcacatgtgccttgcatg 182  Q
    | | | ||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||| | |||||||    
T  21821838 aagtagatgtactttactggacattttattcatgtcacatgtacgttgcatg 21821889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20308645 - 20308505
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  20308645 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 20308548  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  20308547 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 20308505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25868057 - 25867917
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  25868057 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtaccttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 25867960  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  25867959 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 25867917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Original strand, 18097216 - 18097356
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| || || | ||| |||||  | |||||  ||    
T  18097216 acatctaggataatattctcat-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttagatgaacattaaagat-catttagacattgttcttgtgaat 18097313  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||||  | | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18097314 gcctcaagttcttgattgatccatgcaactgtactttcctgga 18097356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 152
Target Start/End: Original strand, 20328673 - 20328792
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||||||||  ||||| |  |||||||||||  |||||  || |    
T  20328673 tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttagataaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttttccatgcctttatttgttgatagattc 20328771  T
Q  132 atgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  20328772 atgcatatgtacttttctgga 20328792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20314329 - 20314189
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  || |||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  20314329 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggataaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 20314232  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||| | ||||| ||| |||||    
T  20314231 gcctttatttgttgatagatccatgtatatgtaattttctgga 20314189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 20318328 - 20318412
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata 97  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || || ||||||||||||    
T  20318328 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagat-ctttttgacata 20318412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27065864 - 27065724
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataat-ccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| |||||||||| |||| | | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||  ||    
T  27065864 catctaggacaatattctctt-tggaatattcttagtgctttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttgtccat 27065767  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||| | ||||||||| |||||    
T  27065766 gcctttatttgttgatagatccatgtagatgtacttttctgga 27065724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 4478 - 4710
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4478 acatctaggatgatattcccttatggaatattcctagtacatcaatgttcatagtctcaaatgcacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 4577  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4578 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgtgattctt 4677  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29540258 - 29540026
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29540258 acatctaggatgatattcccttgtgggatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataattcttgtatat 29540159  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29540158 gtctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgctttgcatgaccttgatcaaagttcttgagattctt 29540059  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29540058 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 29540026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14791404 - 14791171
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  14791404 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 14791305  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  14791304 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 14791205  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14791204 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgct 14791171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Original strand, 24922260 - 24922489
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  24922260 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 24922359  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||    
T  24922360 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatctatgtcacatgtgccttgcatgtcctttgatcaaagttcttgagactct 24922459  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctc 238  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24922460 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctc 24922489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12454854 - 12454630
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  12454854 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 12454755  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12454754 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 12454655  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  12454654 ggcttgtataagaacaaccttctga 12454630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16897747 - 16897523
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  16897747 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 16897648  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16897647 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 16897548  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  16897547 ggcttgtataagaacaaccttctga 16897523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16908400 - 16908176
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  16908400 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 16908301  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16908300 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 16908201  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  16908200 ggcttgtataagaacaaccttctga 16908176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Original strand, 24931296 - 24931525
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  24931296 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 24931395  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| | |    
T  24931396 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatctatgtcacatgtgccttgcatgtcctttgatcaaagttcttgagactat 24931495  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctc 238  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24931496 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctc 24931525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18159862 - 18159638
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  18159862 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtattaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 18159763  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18159762 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 18159663  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  18159662 ggcttgtataagaataaccttctga 18159638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18169674 - 18169450
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  18169674 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtattaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 18169575  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18169574 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 18169475  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  18169474 ggcttgtataagaataaccttctga 18169450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31357361 - 31357137
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  31357361 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 31357262  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31357261 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 31357162  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | ||||||||||||| |||||||||    
T  31357161 ggcttgtataagaactaccttctga 31357137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31367089 - 31366865
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  31367089 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 31366990  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31366989 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 31366890  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | ||||||||||||| |||||||||    
T  31366889 ggcttgtataagaactaccttctga 31366865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3285646 - 3285418
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctt-tttgacataatccttgtata 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3285646 acatctaggatgatatttccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaat-tccttctttgacataatccttgtata 3285548  T
Q  109 tgcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgac-cttgatcaaagtttttgagattc 207  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||    
T  3285547 tgcctttatttcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacttttgatcaaagttcttgagactc 3285448  T
Q  208 ttgacttgtataagaacaaccttctgatct 237  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  3285447 ttggcttttttaagaacaaccttctgatct 3285418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20912083 - 20911850
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||    
T  20912083 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 20911984  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  20911983 gcctttattgcttgattgattcatgcaaatgtactcttctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 20911884  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20911883 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgct 20911850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18201018 - 18200876
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18201018 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatcttcatagtcttaaatgaacattggatatcctttttgacataatccttgtatat 18200919  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18200918 gcctttattgctttattgatccatgcaaatgtactttcctgga 18200876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 27787828 - 27788000
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  27787828 acatctaggatgatattcccttttggaatattcctagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacattaaccttgtaaat 27787927  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatg 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  27787928 gcctttattgcttgattgatccatacaagtgtactttcctgaacatttattcatgtcatgtgtgccttgcatg 27788000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14045115 - 14044956
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14045115 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataattcttatatat 14045016  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacat 170  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||| || |  ||||||||||||||    
T  14045015 gtctttattgcttgattgatcgatgcaaatat-ctttcctagacaagtatccatgtcacat 14044956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16321085 - 16320945
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  16321085 catctaggatgatattctcat-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttagatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgttcat 16320988  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  16320987 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 16320945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 26021389 - 26021529
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  26021389 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccat 26021486  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  26021487 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 26021529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16333233 - 16333155
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttt 90  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  16333233 catctaggatgatattctcat-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttagatgaacattaaagatcctttt 16333155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 791505 - 791582
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatccttt 89  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||| || |||||||    
T  791505 catctaggatgatattctcat-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttgaatgaacattaaagatccttt 791582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1596231 - 1596091
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||| |||||| | | || |||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  1596231 catctaggataatattctcat-tgaaatattcctagtactttaatgttcatagtcttgtatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgttcat 1596134  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  1596133 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 1596091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 152
Target Start/End: Original strand, 18712578 - 18712697
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataat-ccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||  |||||  ||||    
T  18712578 tggaatattcatagtagtttaatgttcatagtcttagatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatcc 18712676  T
Q  132 atgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  18712677 atgcagatgtacttttctgga 18712697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 152
Target Start/End: Original strand, 24505686 - 24505825
Alignment:
Q  12 atctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatg 110  Q
    ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || ||||||||| |||||  |||||||  |||    
T  24505686 atctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatccttttt-acatagttccttgtccatg 24505783  T
Q  111 cctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    | ||||||  |||||  ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  24505784 cttttatttgttgatagatctatgcagatgtacttttctgga 24505825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15668988 - 15668756
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15668988 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 15668889  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15668888 gcctttattacttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgccttacataaccttgatcaaagttcttgagattctt 15668789  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15668788 ggcttgtataagaacaaccttctgatatctgct 15668756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16253213 - 16252981
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16253213 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatagcctctttgacataatccttgtatat 16253114  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16253113 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgagactctt 16253014  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16253013 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 16252981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 3487890 - 3488114
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3487890 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattggatatcctttttgacataatccttgtatat 3487989  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3487990 gcctttattgcttgattgatccatgcaagtgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 3488089  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  3488090 ggcttgtataagaacaaccttctga 3488114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16249247 - 16249023
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16249247 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 16249148  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16249147 gcctttattgcttaatttatccatgcaagtgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 16249048  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  16249047 ggcttgtataagaacaaccttctga 16249023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26331026 - 26330794
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26331026 acatctaggatgatattcccttgtagaatattcctagtacatcaatgttcatggtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 26330927  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26330926 gtctttattgcttaattgatccatgcagatgtactttcctgtacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgagattctt 26330827  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26330826 ggcttgtataagaacatccttctgatctctgct 26330794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 3497213 - 3497437
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3497213 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattggatatcctttttgacataatccttgtatat 3497312  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3497313 gcctttattgcttgattgatccatgcaagtgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 3497412  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | ||||||||||||||| |||||||    
T  3497413 ggcttgtataagaacaatcttctga 3497437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17161039 - 17160809
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17161039 acatctaagatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacatcgaatatcctttttgacataattattgtatat 17160940  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  17160939 gcctttattgattgattgatccatgcaaatgtactttcctagatatatatccgtgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttctttacattctt 17160840  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17160839 gacttgtataagaacaaccttctaatctctg 17160809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 18105683 - 18105908
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataa-tccttgtata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||| || |||||||    
T  18105683 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactctttgtata 18105782  T
Q  109 tgcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18105783 tgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattct 18105882  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  18105883 tggcttgtataagaacaaccttctga 18105908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21845904 - 21845680
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21845904 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21845805  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21845804 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21845705  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21845704 ggcttgtataagaacaaccttctga 21845680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21855496 - 21855272
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21855496 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21855397  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21855396 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21855297  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21855296 ggcttgtataagaacaaccttctga 21855272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21901767 - 21901543
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21901767 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21901668  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21901667 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21901568  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21901567 ggcttgtataagaacaaccttctga 21901543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21911359 - 21911135
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21911359 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21911260  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21911259 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21911160  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21911159 ggcttgtataagaacaaccttctga 21911135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40921644 - 40921420
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  40921644 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 40921545  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40921544 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 40921445  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  40921444 ggcttgtataagaacaaccttctga 40921420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 5293356 - 5293580
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5293356 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5293455  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  5293456 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgaccacagttcttgagattctt 5293555  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  5293556 ggcttgtataagaacaaccttctga 5293580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 5303015 - 5303239
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5303015 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5303114  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  5303115 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgaccacagttcttgagattctt 5303214  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  5303215 ggcttgtataagaacaaccttctga 5303239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6692019 - 6691795
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  6692019 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 6691920  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6691919 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 6691820  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  6691819 ggcttgtataagaataaccttctga 6691795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6702425 - 6702201
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  6702425 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 6702326  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6702325 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 6702226  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  6702225 ggcttgtataagaataaccttctga 6702201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 27681019 - 27681243
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  27681019 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 27681118  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27681119 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 27681218  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  27681219 ggcttgtataagaacaaccttctga 27681243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 27690674 - 27690898
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  27690674 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 27690773  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27690774 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 27690873  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  27690874 ggcttgtataagaacaaccttctga 27690898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 13403304 - 13403533
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13403304 acatctaggatgatattcccttttggaatattcctagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgccataatccttatatat 13403403  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13403404 gtctttattgcttgattgatccatgc-aatgtactttccaggacatttaatcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 13403502  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctg 240  Q
    | |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  13403503 ggcttgtgcaagaacaacctcctgatctctg 13403533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 17985132 - 17985362
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||    
T  17985132 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgtttatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 17985231  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  17985232 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactcttctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 17985331  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctct 239  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17985332 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctct 17985362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 52498927 - 52498699
Alignment:
Q  15 taggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgcctt 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||    
T  52498927 taggatgatattcccttatggaatattcatagtacattaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatatgcctt 52498828  T
Q  115 tattgcttgatttatccatgcaaatgtacttt-cctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattcttgact 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||| |||||||| ||| ||    
T  52498827 tattgcttgattgatccatgcaaatgtactttccctggacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacttcgaccaatgttcttgagattattggct 52498728  T
Q  214 tgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  52498727 tgcataagaacaaccttctgatctctgct 52498699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16241862 - 16241695
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16241862 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtatatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataacctctttgacataatccttgtatat 16241763  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgcctt 177  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16241762 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgcctt 16241695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 9836327 - 9836556
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9836327 acatctaggatgatattcccttttggaatattcctagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 9836426  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || ||| |||| ||  |||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||| |     
T  9836427 gtctttattgcttgattgatccatgcaaatgtattttcctgaacatttattcatgacatgtgtgtcttgcatgactttgatcaatgttcttaagattatg 9836526  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctct 239  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9836527 tgcttgtataagaacaaccttctgatctct 9836556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 6406091 - 6406321
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||    
T  6406091 acatctaggaagatattctctt-tggaatattcctagtacttcaatgttcatagtctttaatgaacattgaatatcatttttgacattaaccttgtaaat 6406189  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    | ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||||  |||||||||||||  |||||| |  ||| || || ||||     
T  6406190 gtcttaattgcttaattgatccatgaaaatgtattttcctggacatttattcatgtcaagtgtgccttgcatgttcttgat-attgttctttagtttctg 6406288  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6406289 ggcttgtataagaacaaccttctgaactctgct 6406321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 14600971 - 14601199
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtata 108  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | | || || |    
T  14600971 acatctaggatgatattcacat-tggaatattcttagtacttcaatgtttatagtcttaa-tgaacattgaatatcctttttgacatttaactttataaa 14601068  T
Q  109 tgcctttattgctt-gatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattc 207  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| || | | ||| |||||  || ||||||||  |||||| || ||| |||||||||    
T  14601069 tgtctttattgctttgattgatccatgcaaacgtacttttctggacatttgttcatatcacaaatgacttgcatgttcttgat-aatgttcttgagattc 14601167  T
Q  208 ttgacttgtataagaacaaccttctgatctct 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14601168 ttgacttgtataagaacaaccttctgacctct 14601199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1293134 - 1292934
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||  | | ||||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  1293134 tggaatattcctagtacttcaatgttcatagtcttga-tgatcattgaatatcccttttgtcatttaactttgtaaatgtctttattgtttgattgatcc 1293036  T
Q  132 atgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattcttgacttgtataagaacaaccttc 231  Q
    |||||||||||||||  |||| || | | ||||||| | ||| ||||||||  |||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  1293035 atgcaaatgtacttttatggacatttgttcatgtcataagtgacttgcatgttcttgat-aatgttcttgagattattgacttgcataagaacaactttc 1292937  T
Q  232 tga 234  Q
    |||    
T  1292936 tga 1292934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 17838171 - 17838311
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  17838171 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccat 17838268  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  17838269 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 17838311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 77
Target Start/End: Original strand, 13793327 - 13793394
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacat 77  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13793327 acatctaggatgatattcccttttaaaataatcctagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacat 13793394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 17828780 - 17828920
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||  |||  ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  17828780 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagccttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccat 17828877  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  17828878 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 17828920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 152
Target Start/End: Original strand, 7847058 - 7847176
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || ||||  |||| |||| ||||||||  |||||||||||  |||||  ||||    
T  7847058 tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc--tttggcatagatccttgttcatgcctttatttgttgatagatcc 7847155  T
Q  132 atgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  7847156 atgcaaatgtacttttctgga 7847176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 11476722 - 11476653
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattg 79  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |  |||||||||||||    
T  11476722 acatctaggatgatattcccttttggaatattcctagcacttcaatgttcgtagttataaatgaacattg 11476653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16629287 - 16629168
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||||  ||||    
T  16629287 tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatcc 16629189  T
Q  132 atgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  16629188 atgcagatgtacttttctgga 16629168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 168
Target Start/End: Original strand, 53946589 - 53946724
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaa-tgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgaca-taatccttgtatatgcctttattgcttgatttatc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |  | |||||  | |||||||||||| |||  |||    
T  53946589 tggaatattcctagaacttcaagtgttcatagtcttgaatgaaccttgaaca-cctttttgacacttttgcttgtccaagcctttattgct-gatacatc 53946686  T
Q  131 catgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcac 168  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  53946687 catgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcac 53946724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 16211452 - 16211530
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatccttt 89  Q
    ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  |||||||| || |||||||    
T  16211452 acatctaggataatattctcat-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttaggtgaacattaaagatccttt 16211530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16472427 - 16472311
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaa-tgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgaca-taatccttgtatatgcctttattgcttgatttatc 130  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |  | ||||| || |||||||||||| |||  |||    
T  16472427 tggaatattcctagaacttcaagtgttcatagtcttgaatgaaccttgaaga-cctttttgacacttttgcttgtctaagcctttattgct-gatccatc 16472330  T
Q  131 catgcaaatgtactttcct 149  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  16472329 catgcaattgtactttcct 16472311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25432660 - 25432428
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25432660 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattggatatcatttttgacataatccttgtatat 25432561  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25432560 gcctttattgcttgattaatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgcattgcatgaccttgatcaaagttcttgagattctt 25432461  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25432460 ggcttgtataagaacaaccttctgatctatgct 25432428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20491855 - 20491623
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20491855 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 20491756  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20491755 gcttttattgctagattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgagattctt 20491656  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20491655 ggcttatataagaacaaccttctaatctatgct 20491623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 55478310 - 55478542
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55478310 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtatatcaatattcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatctttgtatat 55478409  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55478410 gtctttattgcttgattgatccatgcaaaagtactttcctggacatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgagattctt 55478509  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55478510 ggcttgtataagaacaaccttctgatctatgct 55478542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4371178 - 4370954
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4371178 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattggatatcctttttgacataatccttgtatat 4371079  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4371078 gcctttattgcttgattgatccatgcaagtgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 4370979  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  4370978 ggcttgtataagaacaaccttctga 4370954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4380897 - 4380673
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4380897 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattggatatcctttttgacataatccttgtatat 4380798  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4380797 gcctttattgcttgattgatccatgcaagtgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 4380698  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  4380697 ggcttgtataagaacaaccttctga 4380673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Original strand, 4024662 - 4024891
Alignment:
Q  13 tctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4024662 tctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgcatatgcc 4024761  T
Q  113 tttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattcttgac 212  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||      
T  4024762 tttattgcttgattgatccatgtaaatctactttcctgaacatatatcaatgtcacatgtgccttgcatgaacttgatcaatgttcttgagattcttgtt 4024861  T
Q  213 ttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4024862 ttgtataagaacaaccttctgatctctgct 4024891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6432543 - 6432314
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  6432543 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 6432444  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  6432443 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 6432344  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctc 238  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6432343 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctc 6432314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6422103 - 6421874
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  6422103 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 6422004  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  6422003 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgtcttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 6421904  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctc 238  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6421903 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctc 6421874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 12254 - 12486
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  12254 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataccttctttgacataatccttgtatat 12353  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    || ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||     
T  12354 gcttttatttgttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgtcttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactctc 12453  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12454 ggcttgtataagaacaacattctgatctctgct 12486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8972647 - 8972423
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  8972647 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 8972548  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8972547 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 8972448  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  8972447 ggcttgtataagaacaaccttctga 8972423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8983202 - 8982978
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  8983202 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 8983103  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8983102 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 8983003  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  8983002 ggcttgtataagaacaaccttctga 8982978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9536936 - 9536712
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  9536936 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 9536837  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9536836 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 9536737  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  9536736 ggcttgtataagaacaaccttctga 9536712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9547262 - 9547038
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  9547262 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 9547163  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9547162 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 9547063  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  9547062 ggcttgtataagaacaaccttctga 9547038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 1685518 - 1685742
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  1685518 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 1685617  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  1685618 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgcgattctt 1685717  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  1685718 ggcttgtataagaacaaccttctga 1685742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 5655893 - 5656113
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5655893 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5655992  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5655993 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 5656092  T
Q  210 gacttgtataagaacaacctt 230  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  5656093 ggcttgtataagaacaacctt 5656113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 10012494 - 10012726
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||||||||    
T  10012494 acatctaggatgatattctcttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgatataatccttgtatat 10012593  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10012594 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattcacatgtcacatgtgtcgtgcatgaccttgatcaaagttcttgagactctt 10012693  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10012694 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgct 10012726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 16335712 - 16335937
Alignment:
Q  14 ctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgcct 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  16335712 ctaggatgatatccccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatatgcct 16335811  T
Q  114 ttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattcttgac 212  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |    
T  16335812 ttattgcttgattgattcatgcaaatgtactttccaggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactcttggc 16335911  T
Q  213 ttgtataagaacaaccttctgatctc 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  16335912 ttgtttaagaacaaccttctgatctc 16335937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 242
Target Start/End: Original strand, 10508468 - 10508655
Alignment:
Q  53 aatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  10508468 aatgttcatagtcttaa-tgaacattgaatatcctttttgacattaaccttgtaaatgtcttcattgcttgattgatccatgaaaatgtacttttctgga 10508566  T
Q  153 tatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattcttgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
     || ||| |||||||| |||| |||| |||  |||||| || ||| |||| | ||||| ||||| |||  |||||||||||| |||||||    
T  10508567 catttattcatgtcacgtgtgacttgaatgctcttgat-aatgttcttgaaactcttggcttgtgtaaagacaaccttctgaactctgct 10508655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 4783255 - 4783395
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||  ||    
T  4783255 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatcatcttggatgaacattaaagatccttttt-acatagatccttgtccat 4783352  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  4783353 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 4783395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 19828518 - 19828658
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  19828518 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccat 19828615  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  19828616 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 19828658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 2489846 - 2489986
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  2489846 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgttcat 2489943  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  2489944 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 2489986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 13120245 - 13120385
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||| |||||| | | || |||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  13120245 catctaggataatattctcat-tgaaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgttcat 13120342  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  13120343 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 13120385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 20745350 - 20745490
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  20745350 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 20745447  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||| ||||| |||||    
T  20745448 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgaacttttctgga 20745490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 152
Target Start/End: Original strand, 13113140 - 13113256
Alignment:
Q  36 aatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatccatg 134  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||||  |||||||    
T  13113140 aatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgttcatgcctttatttgttgatagatccatg 13113238  T
Q  135 caaatgtactttcctgga 152  Q
    || ||||||||| |||||    
T  13113239 cagatgtacttttctgga 13113256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12376328 - 12376170
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| || || | ||| |||||    |||||| ||    
T  12376328 acatctaggataatattctcat-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttagatgaacattaaagat-catttagacatttctcttgtaaat 12376231  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacat 170  Q
    ||||| | | ||||||| |||||| |||| || |||||||||| ||| ||  |||||||||    
T  12376230 gccttaacttcttgattgatccattcaaaggtgctttcctggacatacatttatgtcacat 12376170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20292912 - 20292867
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacatt 78  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||    
T  20292912 tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttgaatgaacatt 20292867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18560742 - 18560623
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || || |||||| |||||  || ||||  |||||||||||  |||||  |||     
T  18560742 tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagat-cttttttacatagttctttgtccatgcctttatttgttgatagatct 18560644  T
Q  132 atgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  18560643 atgcagatgtacttttctgga 18560623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8171 - 7939
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  8171 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataacctctttgacataatccttgtttat 8072  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8071 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgtcttgcatgaccttgatcaaagttcttgagactctt 7972  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7971 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 7939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15649 - 15417
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  15649 acatctaggatgatgttcccttgtggaatattcctagttcatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataacctctttgacatattccttgtatat 15550  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15549 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatatgccgtgcatgaccttgatcaaagttcttgagactctt 15450  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15449 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 15417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 93120 - 93352
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  93120 acatctaggatgatattcccttttggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataacctctttgacataatccctgtatat 93219  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  93220 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctagacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttctttagactctt 93319  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  93320 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 93352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7757562 - 7757335
Alignment:
Q  12 atctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7757562 atctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaaagttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataattcttgtatatgt 7757463  T
Q  112 ctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattcttga 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  7757462 ctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctagacatatatccatgtctcatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattcttgg 7757363  T
Q  212 cttgtataagaacaaccttctgatctct 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7757362 cttgtataagaacaaccttctgatctct 7757335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 791537 - 791305
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  791537 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataccttctttgacataatccttgtatat 791438  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  791437 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattcccgtatcacatgtgccttgcatgattttgatcaaagttcttgagactctt 791338  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  791337 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 791305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 9325294 - 9325518
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  9325294 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 9325393  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9325394 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 9325493  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  9325494 ggcttgtataagaacaaccttctga 9325518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17268642 - 17268410
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17268642 acatctaggatgatattcccttttggaatattcccagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatctttgtatat 17268543  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  17268542 gcctttgttgcttgattgatccatgcaaatgtaccttcctggaaatttatccatatcacatgtgccttgcatgatcttgatcaatgttcttgagattctt 17268443  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17268442 gacttgtataagaacaattttctgatctctgct 17268410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 21203072 - 21203296
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21203072 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21203171  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21203172 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21203271  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21203272 ggcttgtataagaacaaccttctga 21203296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 21213488 - 21213712
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21213488 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21213587  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21213588 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21213687  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21213688 ggcttgtataagaacaaccttctga 21213712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21334099 - 21333875
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21334099 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21334000  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21333999 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21333900  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21333899 ggcttgtataagaacaaccttctga 21333875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 21988198 - 21988422
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21988198 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21988297  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  21988298 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcacagttcttgagattctt 21988397  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21988398 ggcttgtataagaacaaccttctga 21988422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 21997732 - 21997956
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21997732 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21997831  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  21997832 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcacagttcttgagattctt 21997931  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21997932 ggcttgtataagaacaaccttctga 21997956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Original strand, 2690552 - 2690780
Alignment:
Q  12 atctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgc 111  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||| || |    
T  2690552 atctaggatgatattctcat-tggaatattcctagtacttcaatgttcatagtctaaaatgaacattgaatatcctctttgacattaactttgtaaatac 2690650  T
Q  112 ctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattcttga 211  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||   || || || ||| ||||| ||||||     
T  2690651 ctctattgcttgattgatccatgcaattgtacttttctggatacttattcatgtcacgtgtgacttgcatgttttttat-aatgttcttgagtttcttgg 2690749  T
Q  212 cttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2690750 cttgtataagaccaaccttctgaactctgct 2690780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20098559 - 20098383
Alignment:
Q  65 cttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatg 164  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||    
T  20098559 cttaaatgaacattgaatatcttttttgacattaatcttgtaaatgcttttattgcttgattgatccatgcaagtgtactttcctggacatttattcatg 20098460  T
Q  165 tcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattcttgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    |||  |||||||||||||  ||||||  | ||| ||||  || | | ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20098459 tcatgtgtgccttgcatgctcttgat-gatgttcttgattttatgggcttgtataagaacaaccttcttaactctgct 20098383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 13674029 - 13673889
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  13674029 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccat 13673932  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  13673931 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 13673889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 14881971 - 14882111
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  14881971 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccat 14882068  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  14882069 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 14882111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 14894321 - 14894461
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  14894321 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccat 14894418  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  14894419 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 14894461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 182
Target Start/End: Original strand, 5867672 - 5867821
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaa-tgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgac-ataatccttgtatatgcctttattgcttgatttatc 130  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |  | ||||||||||| ||||||| |||    
T  5867672 tggaatattcctagtacttcaaatgttcatagtcttaaatgaacattgaagatcctttttgactttaatcc-taaaaatgcctttattccttgattgatc 5867770  T
Q  131 catgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatg 182  Q
    | |   |||||||||| ||||  || ||| ||||| || |||||||||||||    
T  5867771 cttctcaatgtactttactgg-catttattcatgttacgtgtgccttgcatg 5867821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 31999524 - 31999664
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataat-ccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||  ||    
T  31999524 catctaggacaatattctctt-tggaatattcttagtactttaatgttcatagtcttgaatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttgtccat 31999621  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||| ||||| |||||    
T  31999622 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgaacttttctgga 31999664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 33774415 - 33774555
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  33774415 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 33774512  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||||||| |  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  33774513 gcctttacttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 33774555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Original strand, 31991744 - 31991866
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||||||||  ||||| |  |||| ||||||  |||||  ||||    
T  31991744 tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttgaatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttttccatgcatttatttgttgatagatcc 31991842  T
Q  132 atgcaaatgtactttcctggatat 155  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  31991843 atgcagatgaacttttctggatat 31991866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 152
Target Start/End: Original strand, 20531626 - 20531742
Alignment:
Q  35 gaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataa-tccttgtatatgcctttattgcttgatttatccat 133  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||||| || |||   |||||||||| || ||||  |||||||||||  |||||  ||||||    
T  20531626 gaatattcctaatactttaatgttcataatcttgattgaacattaaagatc--atttgacataattctttgttcatgcctttatttgttgatagatccat 20531723  T
Q  134 gcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  20531724 gcagatgtacttttctgga 20531742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 24696763 - 24696992
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  24696763 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataccttctttgacataatccttgtatat 24696862  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  24696863 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattcccatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactctt 24696962  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctct 239  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24696963 ggcttgtttaagaacaaccttctgatctct 24696992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 2998875 - 2999099
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  2998875 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 2998974  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  2998975 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 2999074  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  2999075 ggcttgtataagaacaaccttctga 2999099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 5337313 - 5337537
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5337313 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5337412  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5337413 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 5337512  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  5337513 ggcttgtataagaacaaccttctga 5337537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 5347166 - 5347390
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5347166 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5347265  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5347266 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 5347365  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  5347366 ggcttgtataagaacaaccttctga 5347390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18651019 - 18650795
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  18651019 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 18650920  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18650919 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 18650820  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  18650819 ggcttgtataagaacaaccttctga 18650795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18663137 - 18662913
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  18663137 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 18663038  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18663037 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 18662938  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  18662937 ggcttgtataagaacaaccttctga 18662913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4457996 - 4457772
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  4457996 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 4457897  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4457896 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 4457797  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  4457796 ggcttgtataagaacaaccttctga 4457772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4467621 - 4467397
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  4467621 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 4467522  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4467521 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 4467422  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  4467421 ggcttgtataagaacaaccttctga 4467397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 9502939 - 9503163
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  9502939 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaatattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 9503038  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9503039 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 9503138  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  9503139 ggcttgtataagaacaaccttctga 9503163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 9514305 - 9514529
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  9514305 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaatattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 9514404  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9514405 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 9514504  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  9514505 ggcttgtataagaacaaccttctga 9514529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45014533 - 45014301
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  45014533 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 45014434  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  45014433 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactctactggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 45014334  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgc 241  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45014333 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgc 45014301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Original strand, 38957996 - 38958225
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||    
T  38957996 acatctagaatgatattcccttgtggaatatttctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgtcttctttgacataatcctcgtacat 38958095  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  38958096 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttacatgacctttgatcaaagttcttgagactct 38958195  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctc 238  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38958196 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctc 38958225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45024610 - 45024378
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  45024610 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 45024511  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||    
T  45024510 gtctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactctactggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaatttcttgagactct 45024411  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgc 241  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45024410 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgc 45024378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Original strand, 38930660 - 38930890
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||| ||    
T  38930660 acatctaggatgatattctcttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacaaaatccttgtacat 38930759  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattc- 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||     
T  38930760 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 38930859  T
Q  208 ttgacttgtataagaacaaccttctgatctc 238  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38930860 ttggcttgtttaagaacaaccttctgatctc 38930890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17488491 - 17488258
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||    
T  17488491 acatctaggatgatatttctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 17488392  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||    
T  17488391 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactcttctggacgtatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaaattcttgagactct 17488292  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17488291 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgct 17488258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 111 - 242
Target Start/End: Original strand, 44639277 - 44639408
Alignment:
Q  111 cctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattcttg 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  44639277 cctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatccatatcacatgtgccttggatgaccttgatcaatgttcttgagaatcttg 44639376  T
Q  211 acttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44639377 gcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 44639408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 72394 - 72625
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaa-tgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgaca-taatccttgtat 107  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||     
T  72394 acatctaagatgatattctctt-tgaaatatccctagtacttcaagtgttcataatcttaaatgaacattgaatattttctttgacattaatcc-tgtaa 72491  T
Q  108 atgcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattc 207  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||| |||||||  ||| |||||||||  |||||| |  ||| |||||||||    
T  72492 atgtctttattgcttgattgatccatgccaatgtactttactggacatttattcatgtcatgtgtaccttgcatgttcttgat-attgttcttgagattc 72590  T
Q  208 ttgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  72591 tgggcttgtataagaacaaccttttgaactctgct 72625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 77
Target Start/End: Original strand, 44639203 - 44639270
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacat 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44639203 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctattaaatcaatgttcatagtcttaaatgaacat 44639270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 24239419 - 24239638
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtata 108  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||| || || ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||  | | || || |    
T  24239419 acatctaggatgatattctcat-tggaatattcccagcacttcaattttcatagtcttga-tgaacattgaatatccttttttacatttaactttataaa 24239516  T
Q  109 tgcctttattgctt-gatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattc 207  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| || | | |||||||||  || |||||||             ||| |||||||||    
T  24239517 tgcctttattgctttgattgatccatgcaaatgttcttttctggacattttttcatgtcacaaatgacttgcat-------------gttcttgagattc 24239603  T
Q  208 ttgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24239604 ttggcttgtataagaacaaccttctgacctctgct 24239638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12570362 - 12570221
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtata 108  Q
    ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  |    
T  12570362 acatctaggataatattctcat-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttatatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtcca 12570265  T
Q  109 tgcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    || |||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  12570264 tgtctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 12570221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 22687952 - 22688092
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  22687952 catctaggataatattctcat-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttttatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 22688049  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  22688050 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 22688092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 45190612 - 45190472
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  45190612 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 45190515  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  45190514 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 45190472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 574035 - 573895
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  574035 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 573938  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    || ||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  573937 gcttttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 573895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 16934571 - 16934711
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||| |||||| | | || |||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  16934571 catctaggataatattctcat-tgaaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgttcat 16934668  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  16934669 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 16934711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 17005231 - 17005371
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||| |||||| | | || |||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  17005231 catctaggataatattctcat-tgaaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgttcat 17005328  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  17005329 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 17005371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15940462 - 15940399
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatat-cctttttgacat 96  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15940462 tggaatattcctagcacttcaatgttcatagtctt-gatgaacattgaatatccctttttgacat 15940399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24942681 - 24942578
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||||  ||||    
T  24942681 tggaattttcctagtactttaatgttcataatcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatcc 24942583  T
Q  132 atgca 136  Q
    |||||    
T  24942582 atgca 24942578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 29423162 - 29423126
Alignment:
Q  19 atgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaat 55  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29423162 atgatatttccttgtggaatattcctagtacatcaat 29423126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22901835 - 22901807
Alignment:
Q  53 aatgttcataatcttaaatgaacattgaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22901835 aatgttcataatcttaaatgaacattgaa 22901807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 74985 - 75217
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  74985 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataccttctttgacataatccttgtatat 75084  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  75085 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattcccatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactctt 75184  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  75185 ggcttgtataagaacaagcttatgatctgtgct 75217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14944108 - 14943876
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14944108 acatataggatgatattcccttgtggaatgttcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 14944009  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14944008 gcctttattgcttaattgatccatgcaaatgtactttcctggacagatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 14943909  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | | |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  14943908 ggcctgtataggaaaaaccttccgatctctgct 14943876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15371701 - 15371469
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371701 acatataggatgatattcccttgtggaatgttcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 15371602  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15371601 gcctttattgcttaattgatccatgcaaatgtactttcctggacaaatatacatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaatgttcttgagattctt 15371502  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | | |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  15371501 ggcctgtataggaaaaaccttccgatctctgct 15371469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 9535501 - 9535734
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  9535501 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacaatgaatgccttctttgacataatccttgtatat 9535600  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |    
T  9535601 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactat 9535700  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9535701 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgct 9535734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 9545784 - 9546017
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  9545784 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacaatgaatgccttctttgacataatccttgtatat 9545883  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  9545884 gcctttatttcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 9545983  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9545984 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgct 9546017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 5382076 - 5382300
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5382076 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5382175  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5382176 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 5382275  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  5382276 ggcttgtataagaacaaccttctga 5382300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 5391714 - 5391938
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5391714 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5391813  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5391814 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 5391913  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  5391914 ggcttgtataagaacaaccttctga 5391938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5926936 - 5926712
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  5926936 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 5926837  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5926836 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 5926737  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  5926736 ggcttgtataagaacaaccttctga 5926712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6544606 - 6544382
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  6544606 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 6544507  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6544506 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 6544407  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  6544406 ggcttgtataagaacaaccttctga 6544382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8500850 - 8500626
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  8500850 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 8500751  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8500750 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 8500651  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  8500650 ggcttgtataagaacaaccttctga 8500626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8511320 - 8511096
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  8511320 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 8511221  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8511220 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 8511121  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  8511120 ggcttgtataagaacaaccttctga 8511096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42620980 - 42620748
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  42620980 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacattaatgtttatattcttatatgaacattgaatttctttttttacataatccttttatat 42620881  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  42620880 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatattctcatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactctt 42620781  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42620780 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 42620748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43983278 - 43983054
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  43983278 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 43983179  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43983178 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 43983079  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  43983078 ggcttgtataagaacaaccttctga 43983054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46496915 - 46496691
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  46496915 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 46496816  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  46496815 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 46496716  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  46496715 ggcttgtataagaacaaccttctga 46496691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46507527 - 46507303
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  46507527 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 46507428  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  46507427 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 46507328  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  46507327 ggcttgtataagaacaaccttctga 46507303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 26348410 - 26348632
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  26348410 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 26348509  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26348510 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 26348609  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttct 232  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  26348610 ggcttgtataagaacaaccttct 26348632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 26363445 - 26363667
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  26363445 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 26363544  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26363545 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 26363644  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttct 232  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  26363645 ggcttgtataagaacaaccttct 26363667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6534307 - 6534083
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  6534307 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgtttatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 6534208  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6534207 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 6534108  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  6534107 ggcttgtataagaacaaccttctga 6534083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 11626625 - 11626848
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  11626625 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 11626724  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11626725 gcctttattgcttgattgatc-atgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 11626823  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  11626824 ggcttgtataagaacaaccttctga 11626848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44897118 - 44896894
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  44897118 acatctaggatgatattcctttgtgaagtattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 44897019  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  44897018 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgaccacagttcttgagattctt 44896919  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  44896918 ggcttgtataagaacaaccttctga 44896894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44907521 - 44907297
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  44907521 acatctaggatgatattcctttgtgaagtattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 44907422  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  44907421 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgaccacagttcttgagattctt 44907322  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  44907321 ggcttgtataagaacaaccttctga 44907297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32098181 - 32097948
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||    
T  32098181 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 32098082  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  32098081 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactcttctggacgtatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 32097982  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32097981 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgct 32097948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32108618 - 32108385
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||    
T  32108618 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 32108519  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  32108518 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactcttctggacgtatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 32108419  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32108418 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgct 32108385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 16132175 - 16132399
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  16132175 acatctaggatgatattcctttgaaaaatattcctagtacgtcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 16132274  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16132275 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 16132374  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  16132375 ggcttgtataagaacaaccttctga 16132399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 16142724 - 16142948
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  16142724 acatctaggatgatattcctttgaaaaatattcctagtacgtcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 16142823  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16142824 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatatttatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 16142923  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  16142924 ggcttgtataagaacaaccttctga 16142948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 14248802 - 14249033
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  14248802 acatctaggatgatattctcct-tggaatatttatagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgagtatcatttttgacataaatcttgtatat 14248900  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||  || |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||     
T  14248901 gcctttatttcttgattgatccatgcaaatgtactttcttggacatttattaatttcacgtgtgccttgcatgatcttgatcaatgttcttgagtttctg 14249000  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | ||| |||||||| | |||||||| |||||||    
T  14249001 ggcttatataagaatagccttctgaactctgct 14249033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 2992176 - 2992408
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttg--acataatccttgtat 107  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||     
T  2992176 acatctaggatgatattcccttttgaaatattcctagtacttcaatgtctatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgcaatttaat-cttgtaa 2992274  T
Q  108 atgcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattc 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||   || ||| |||||||| ||||||||||||   |||||| || ||| ||||| |||    
T  2992275 atgcctttattgcttgattgatccatgcaagtttactttcctgcgcatttattcatgtcacgtgtgccttgcatactcttgat-aatgttcttgagtttc 2992373  T
Q  208 ttgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2992374 tggacttgtataagaacaacattctgaactctgct 2992408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9006706 - 9006475
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaa-tgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtata 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |    
T  9006706 acatctaggatgatattctctt-tggaatatttctagtatttcaagtgttcatagtcttgaatgaacattgaatatcctttttgacattaatcttgtaaa 9006608  T
Q  109 tgcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| || ||| |||||||  ||| |||||||||  |||||| || ||| ||||||||||    
T  9006607 tacctttattgcttgattgatccatgccaatgtactttaatggacatttattcatgtcatgtgtaccttgcatgttcttgat-aatgttcttgagattct 9006509  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
     | ||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  9006508 gggcttttataagaacaatcttctgaactctgct 9006475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 242
Target Start/End: Original strand, 22964652 - 22964746
Alignment:
Q  148 ctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattcttgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22964652 ctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgatcttgatcaaagttcttgagactcttggcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 22964746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 24541107 - 24541247
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  24541107 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccat 24541204  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  24541205 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 24541247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 45552951 - 45552832
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||  ||||    
T  45552951 tggaatattcctagtactttaatgttcatagtctttgatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagatcc 45552853  T
Q  132 atgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  45552852 atgcagatgtacttttctgga 45552832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19585528 - 19585411
Alignment:
Q  35 gaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatccat 133  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || || ||||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||||  ||||||    
T  19585528 gaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagat-ctttttgacatagttccttgttcatgcctttatttgttgatagatccat 19585430  T
Q  134 gcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  19585429 gcagatgtacttttctgga 19585411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27988290 - 27988150
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||||||  |||  ||||||||| || |||| ||||||||||  ||||| |  ||    
T  27988290 catctaggataatattctcat-tggaatattcctagtactttaatgttcataggcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttatccat 27988193  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  27988192 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtactttcctgga 27988150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22244515 - 22244285
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22244515 acatttaggatgatatttccttgtggaatattcctagtacatcaatgtccatagtcttaaatgaacattgagtatcctttttgacataatccttgtatat 22244416  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  22244415 gcctttattgattgattgatccatgcaaatgtaatttcctggacatatattcatatcacatgtgccttgcatgaccttgatcagtgttcttgagattctt 22244316  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctg 240  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22244315 ggcttgtataagaacaaccttctgatctctg 22244285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18361078 - 18360854
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  18361078 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 18360979  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18360978 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 18360879  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  18360878 ggcttgtataagaacaaccttctga 18360854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18390035 - 18389811
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  18390035 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 18389936  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18389935 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 18389836  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  18389835 ggcttgtataagaacaaccttctga 18389811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21753244 - 21753020
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21753244 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21753145  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21753144 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21753045  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21753044 ggcttgtataagaacaaccttctga 21753020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21762531 - 21762307
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  21762531 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 21762432  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21762431 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 21762332  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21762331 ggcttgtataagaacaaccttctga 21762307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33939118 - 33938894
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  33939118 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 33939019  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33939018 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 33938919  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  33938918 ggcttgtataagaacaaccttctga 33938894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33949518 - 33949294
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  33949518 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 33949419  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33949418 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 33949319  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  33949318 ggcttgtataagaacaaccttctga 33949294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27411949 - 27411716
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||    
T  27411949 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 27411850  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  27411849 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactcttctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 27411750  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27411749 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgct 27411716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 26192261 - 26192485
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  26192261 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 26192360  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  26192361 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatggccttgatcacagttcttgagtttctt 26192460  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  26192461 ggcttgtataagaacaaccttctga 26192485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 26202865 - 26203089
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  26202865 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 26202964  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  26202965 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatggccttgatcacagttcttgagtttctt 26203064  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  26203065 ggcttgtataagaacaaccttctga 26203089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 8765625 - 8765849
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  8765625 acatctaggatgatattcctttgtgaaatgttcctagtacatcaatgttcatagtctgaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 8765724  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8765725 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 8765824  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  8765825 ggcttgtataagagcaaccttctga 8765849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32070241 - 32070008
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||    
T  32070241 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataacccttgtatat 32070142  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  32070141 gcctttattgtttgattgttccatgcaaatgtactcttctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 32070042  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32070041 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctctgct 32070008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 11411369 - 11411592
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  11411369 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattactag-acatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 11411467  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11411468 gcctttattgcttgattgatccatgtaaatgtacttttctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 11411567  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  11411568 ggcttgtataagaacaaccttctga 11411592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31105213 - 31104982
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| ||    
T  31105213 acatctaggatgatattcctttttggaataatcctagcacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttggcattaatcttgtaaat 31105114  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    | ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||  ||| || || ||| || |||||||     
T  31105113 gactttattgcttgattgatccataccaatgtactttactggacatttattcatgtcacgtgtaccttgcatgttctttat-aatgttcttcagattcta 31105015  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  31105014 ggcttgcataagaacaaccttatgaactctgct 31104982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 23378843 - 23379071
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  |    
T  23378843 acatctaggatgatattccctttttgaatattcctagtactttaatgttcatagtcttaaatgaacatcgaatatcctttttgacattaaccttgtaatt 23378942  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  || || ||| || ||||  |||| ||||||||  |||||| || ||| ||||| ||||     
T  23378943 gtctttattgcttgattgatcgatgcaaatgtactttacctgaaatttattcaagtcatgtgtgtcttgcatgttcttgat-aatgttcttgagtttcta 23379041  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctct 239  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23379042 ggcttgtataaggacaaccttctgagctct 23379071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 21484295 - 21484518
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  21484295 acatctaagatgatattctcat-tggaatattcccagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgcatatccttttttacattaaccttgtaaat 21484393  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || || ||| ||||||||| |||  ||| |||  ||| || || ||| |||||||||||    
T  21484394 gcctttattgcttgattgatccatgcaaacgtacttttctagacatttattcatgtcacaagtgagttgtatgttctttat-aatgttcttgagattctt 21484492  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgat 235  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||    
T  21484493 ggcttatttaagaacaaccttctgat 21484518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 30944266 - 30944406
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  30944266 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccat 30944363  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  30944364 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 30944406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 30953688 - 30953828
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  30953688 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccat 30953785  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  30953786 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 30953828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 37299295 - 37299435
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  37299295 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccat 37299392  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  37299393 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 37299435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 37549085 - 37549225
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  37549085 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccat 37549182  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  37549183 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 37549225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20896707 - 20896588
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaa-tgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||| ||||| | | |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  20896707 tggaattttcctagtacttcaagtgttcatagtcttgaatgaaccttgaaga-cttttttgacattattcttgtaaatgtctttattgcttgattgatcc 20896609  T
Q  132 atgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||| | ||||||||| |||||    
T  20896608 atgtagatgtactttactgga 20896588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 152
Target Start/End: Original strand, 13572183 - 13572300
Alignment:
Q  35 gaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatccat 133  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||  ||||||    
T  13572183 gaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccatgcctttatttgttgatagatccat 13572281  T
Q  134 gcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  13572282 gcagatgtacttttctgga 13572300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 27274661 - 27274801
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  27274661 catctaggatagtattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 27274758  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  27274759 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 27274801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31916587 - 31916447
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  31916587 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 31916490  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  31916489 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 31916447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 37651883 - 37652023
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  37651883 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtccat 37651980  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    || ||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  37651981 gcatttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 37652023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 4038460 - 4038594
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  4038460 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 4038557  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtacttt 146  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||    
T  4038558 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttt 4038594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 22173730 - 22173864
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  22173730 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 22173827  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtacttt 146  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||    
T  22173828 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttt 22173864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 146
Target Start/End: Original strand, 18210313 - 18210426
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||||  ||||    
T  18210313 tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatcc 18210411  T
Q  132 atgcaaatgtacttt 146  Q
    ||||| |||||||||    
T  18210412 atgcagatgtacttt 18210426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 146
Target Start/End: Original strand, 18219651 - 18219764
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||||  ||||    
T  18219651 tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatcc 18219749  T
Q  132 atgcaaatgtacttt 146  Q
    ||||| |||||||||    
T  18219750 atgcagatgtacttt 18219764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 19888834 - 19888974
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||| |||||| | | || |||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  19888834 catctaggataatattctcat-tgaaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgttcat 19888931  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  19888932 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 19888974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21681397 - 21681284
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||||  ||||    
T  21681397 tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatcc 21681299  T
Q  132 atgcaaatgtacttt 146  Q
    ||||| |||||||||    
T  21681298 atgcagatgtacttt 21681284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20764113 - 20763995
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataat-ccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||  |||||  ||||    
T  20764113 tggaatattcctagtactttaatgttcatg-tcttagatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatcc 20764016  T
Q  132 atgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  20764015 atgcatatgtacttttctgga 20763995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 134
Target Start/End: Original strand, 20905033 - 20905134
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaa-tgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    |||||||||| |||||| |||| | |||||| |||| ||||||| ||||| | | |||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  20905033 tggaatattcttagtacttcaagttttcatagtcttgaatgaaccttgaaga-cttttttgacattattcttgtaaatgcctttattgctttattgatcc 20905131  T
Q  132 atg 134  Q
    |||    
T  20905132 atg 20905134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 34130971 - 34131111
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||  ||||| ||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  34130971 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagttttggatgaatattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 34131068  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  34131069 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 34131111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 37817375 - 37817233
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatg-aacattgaatatcctttttgacata-atccttgtata 108  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||| |||||| || |||| |||||||||| ||||||||  |    
T  37817375 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaaacattaaagatcc-ttttgacatagatccttgtcca 37817278  T
Q  109 tgcc-tttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||| ||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  37817277 tgccttttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 37817233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Original strand, 310286 - 310515
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  310286 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgctcatagtcttacatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatat 310385  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  310386 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 310485  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctc 238  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  310486 tggcttgtttaagaacaaccttctgatctc 310515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 216407 - 216179
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtata 108  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | | || || |    
T  216407 acatctaggatgatattcacat-tggaatattcttagtacttcaatgtttatagtcttaa-tgaacattgaatatcctttttgacatttaactttataaa 216310  T
Q  109 tgcctttattgctt-gatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattc 207  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| || | | ||| |||||  || ||||||||  |||||| || ||| |||||||||    
T  216309 tgtctttattgctttgattgatccatgcaaacgtacttttctggacatttgttcatatcacaaatgacttgcatgttcttgat-aatgttcttgagattc 216211  T
Q  208 ttgacttgtataagaacaaccttctgatctct 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  216210 ttgacttgtataagaacaaccttctgacctct 216179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 234256 - 234480
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  234256 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 234355  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  234356 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 234455  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  234456 ggcttgtataagaacaaccttctga 234480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 146468 - 146328
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||  ||||| |  ||    
T  146468 catctaggataatattctcat-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttagatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttttccat 146371  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  146370 gcctttatttgttgatagatccattcaaatgtacttttctgga 146328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 153795 - 153934
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtat-at 109  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||| || |||| | |||||||| || |||||||  |||||||| |||  |  ||    
T  153795 catctaggatgatattctcat-tggaatattcctagtactttaatgttcgtagtcttgattgaacattaaagatccttt--gacataattctttgaccat 153891  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  153892 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 153934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 114793 - 114932
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtat-at 109  Q
    |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||| || |||| | |||||||| || |||||||  |||||||| |||  |  ||    
T  114793 catctaagatgatattctcat-tggaatattcctagtactttaatgttcttagtcttgattgaacattaaagatccttt--gacataattctttgaccat 114889  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  114890 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 114932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Original strand, 21423 - 21610
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21423 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacaacaatgttcatattcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 21522  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtt 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21523 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctagacatatatccatgtcacatgtgccttgcacgaccttgatcaaagtt 21610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 8110 - 8334
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||||    
T  8110 acatctaggatgatattcctttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataactcttgtatat 8209  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8210 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatattcatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcacagttcttgagattctt 8309  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctga 234  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  8310 ggcttgtataagaataaccttctga 8334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Original strand, 19643 - 19872
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| |    
T  19643 acatctaggatgatattcccttgtgaaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatgccttctttgacataatccttgtatgt 19742  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgacc-ttgatcaaagtttttgagattct 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  19743 gcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtacttttctggacatatacccatgtcatatgtgccttgcatgacctttgatcaaagttcttgagactct 19842  T
Q  209 tgacttgtataagaacaaccttctgatctc 238  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19843 tggcttgtttaaaaacaaccttctgatctc 19872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 56091 - 56262
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  56091 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaataacctctttgacataatccttgtatat 56190  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcat 181  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  56191 gcctttattgcttaattgatccatgcaaatgtactttcctggacatatacccatgtcacatgtgccttgcat 56262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1705 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1705
Description:

Target: scaffold1705; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 53 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 607 - 418
Alignment:
Q  53 aatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataat-ccttgtatatgcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgg 151  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| || |||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  607 aatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcctttt-gacatagttccttatatatgcctttattgcttgattgatccatgcaaatgtactttcctgg 509  T
Q  152 atatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattcttgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  508 acatatatccatgttacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagttcttgagattcttggcttgtataagaacaaccttctgatctctgct 418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 198960 - 199190
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  198960 acatctaggatgatattcttat-tggaatattcatagtacttcaatgttcatagtcttaaatgaaccttaaatatcctttttgacattaaccttgtaaat 199058  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||    
T  199059 gcctctattgtttgattgattcatgcaaatgtactttcctggatacttattcatgtcacgtgtgacttgcatgatcttgat-aatgttcttgagattctt 199157  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | ||| |||||||  |||||||||| |||||||    
T  199158 ggcttatataagagaaaccttctgaactctgct 199190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 29028 - 29254
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  29028 acatctaggatgatattctcat-tggaatattgctagtatttcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcctttttgacattaaccttgtaaat 29126  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||| || |||  |||||||| ||| ||||||||  |||||| || ||| |||||||||||    
T  29127 gcatttattgcttgattga-ccatgcaaatgtacttttatggaaatttatttatgtcacaagtgacttgcatgttcttgat-aatgttattgagattctt 29224  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctct 239  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29225 tgcttgtttaagaacaaccttctgatctct 29254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 114
Target Start/End: Original strand, 17554 - 17658
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17554 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcatagtcttaaatgaacattgaatatcatttttgacataatccttgtatat 17653  T
Q  110 gcctt 114  Q
    |||||    
T  17654 gcctt 17658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13622 - 13394
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  |    
T  13622 acatctaggatgatattccctttttgaatattcctagtactttaatgttcatagtcttaaatgaacatcgaatatcctttttgacattaaccttgtaatt 13523  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattctt 209  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  || || ||| || ||||  |||| ||||||||  |||||| || ||| ||||| ||||     
T  13522 gtctttattgcttgattgatcgatgcaaatgtactttacctgaaatttattcaagtcatgtgtgtcttgcatgttcttgat-aatgttcttgagtttcta 13424  T
Q  210 gacttgtataagaacaaccttctgatctct 239  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13423 ggcttgtataaggacaaccttctgagctct 13394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 242
Target Start/End: Original strand, 1143 - 1326
Alignment:
Q  58 tcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatat 157  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| || |    
T  1143 tcatagtcttgaatgaaaattgaatatccttttttatattaatcttgtaaatgcctttattgcttgattgatccattccaatgtactttgctggacattt 1242  T
Q  158 atccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattcttgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    || |||||||||||| |||||||||  |||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1243 attcatgtcacatgtaccttgcatgttcttgat-aatgttcttgagattatgggcttctataagaacaaccttctgaactctgct 1326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 65487 - 65256
Alignment:
Q  10 acatctaggatgatattcccttgtg-gaatattcctagtacatcaa-tgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtat 107  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||     
T  65487 acatctaggatgatattc--ttgttcgaatattcctagtacttcaaatgttcatagtcttgaatgaacactgaagatcttttttgacattaatcttgtaa 65390  T
Q  108 atgcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctggatatatatccatgtcacatgtgccttgcatgaccttgatcaaagtttttgagattc 207  Q
    |||  ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||  |||| || ||  ||||| || |||||||  ||||  |||||| || |||  |||| |||    
T  65389 atgtatttattgcttgattgttccatgtcaatgtactttattggacatttactcatgttacgtgtgcctctcatgttcttgat-aatgttcatgagcttc 65291  T
Q  208 ttgacttgtataagaacaaccttctgatctctgct 242  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  65290 tgggcttgtataagaacaaccttctgaactctgct 65256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15159 - 15046
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaa-tgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| |  |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||    
T  15159 tggaatattcctagtacttcaagtgttcatagtcttgaatgaaccttgaagatc-tttttgacattagtcttgtaaatgtctttatttcttgattgatcc 15061  T
Q  132 atgcaaatgtacttt 146  Q
    ||||| |||||||||    
T  15060 atgcagatgtacttt 15046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11070 - 10920
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaa-tgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacataatccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||||| ||||| | | |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  11070 tggaatattcctagtacttcaagtcttcatagtcttgaatgaactttgaaga-cttttttgacattattcttgtaaatgcctttattgcttgattgattc 10972  T
Q  132 atgcaaatgtactttcctggata-tatatccatgtcacatgtgccttgcatg 182  Q
    | | | ||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||| | |||||||    
T  10971 aagtagatgtactttactggacattttattcatgtcacatgtacgttgcatg 10920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 112061 - 112201
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  112061 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 112158  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  112159 gcctttatttgttgatagatccatgcagatgtacttttctgga 112201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23129 - 23010
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||||  |||     
T  23129 tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatct 23031  T
Q  132 atgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  23030 atgcagatgtacttttctgga 23010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 1136 - 1276
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatat 109  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  ||    
T  1136 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccat 1233  T
Q  110 gcctttattgcttgatttatccatgcaaatgtactttcctgga 152  Q
    |||||||||  |||||  ||| ||||| ||| ||||| |||||    
T  1234 gcctttatttgttgatagatctatgcagatgaacttttctgga 1276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 141
Target Start/End: Original strand, 4430 - 4538
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||||  ||||    
T  4430 tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatcc 4528  T
Q  132 atgcaaatgt 141  Q
    ||||| ||||    
T  4529 atgcagatgt 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 152
Target Start/End: Original strand, 24108 - 24224
Alignment:
Q  36 aatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatccatg 134  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||||  |||||||    
T  24108 aatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatccatg 24206  T
Q  135 caaatgtactttcctgga 152  Q
    || |||| |||| |||||    
T  24207 cagatgtgcttttctgga 24224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 13720 - 13798
Alignment:
Q  11 catctaggatgatattcccttgtggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttt 90  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||| || ||||||||    
T  13720 catctaggacaatattctctt-tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacattaaagatcctttt 13798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18515 - 18402
Alignment:
Q  33 tggaatattcctagtacatcaatgttcataatcttaaatgaacattgaatatcctttttgacata-atccttgtatatgcctttattgcttgatttatcc 131  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||  || |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||||  ||||    
T  18515 tggaatattcctagtactttaatgttcatagtcttggatgaacatcaaagatcc-ttttgacatagttccttgtccatgcctttatttgttgatagatcc 18417  T
Q  132 atgcaaatgtacttt 146  Q
    ||||| ||| |||||    
T  18416 atgcagatgaacttt 18402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University