View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11086_high_3 (Length: 497)

Name: NF11086_high_3
Description: NF11086
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11086_high_3
NF11086_high_3
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (1-484)||(11710454-11710937)
chr6 (58-484)||(11662656-11663082)
chr6 (93-465)||(11632001-11632373)
chr6 (1-484)||(11673930-11674413)
chr6 (93-463)||(11617861-11618231)
chr6 (94-443)||(12094065-12094414)
chr6 (94-443)||(11755521-11755870)
chr6 (87-443)||(11739830-11740186)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (95-484)||(12192-12581)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (93-465)||(8950-9322)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (108-465)||(44811260-44811617)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 484
Target Start/End: Original strand, 11710454 - 11710937
Alignment:
Q  1 cggtgagctccaaaagaggaagagaaggtatgccctacttaattgaaccgatgatatcaatttgagttctgcatttctcaactttcctatagcattttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11710454 cggtgagctccaaaagaggaagagaaggtatgccctacttaattgaaccgatgatatcaatttgagttctgcatttctcaacttttctatagcattttta 11710553  T
Q  101 aaatgcttttcccatgcatataacttgagcactttcatattcacaagagcctcggaactagccttcaatctctcgtcttgtgccaccataagttcgctct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11710554 aaatggttttcccatgcatataacttgagcactttcatattcacaagagcctcggaactagccttcaatctctcgtcttgtgccaccataagttcgctct 11710653  T
Q  201 gaaacttgttttgtaactttgctattggagagttgcaaagcacagtgagaactatcaccaccattgaagctattgttgctagtccaattgctcggtaaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11710654 gaaacttgttttgtaactttgctattggagtgttgcaaagcacagtcagaactatcaccaccattgaagctattgttgctagtccaattgctcggtaaag 11710753  T
Q  301 aattactaatgcaatacacaattgaaggattgtcgtccatgtctggtgaaaccagaatggaaattctccaattctataagcatccacagtcatgtaattc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11710754 aattactaatgcaatacacaattgaaggattgtcgtccatgtctggtgaaaccagaatggaaattctccaattctataagcatccacagttatgtaattc 11710853  T
Q  401 attatctcaccactagagtgaatcaatctagcagaattggatagccttagtatctttttataaatttttgcggtaagtagtgat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11710854 attatctcaccactagagtgaatcaatctagcagaattggatagccttagtatctttttataaatgtttgcggtaagtagtgat 11710937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 58 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 11663082 - 11662656
Alignment:
Q  58 caatttgagttctgcatttctcaactttcctatagcatttttaaaatgcttttcccatgcatataacttgagcactttcatattcacaagagcctcggaa 157  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||| |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  11663082 caatttgagttccacatttcttaatttttctatagaacttttaaaatgtgtttcccatgcatatagctttagcactttcatactcacaagagcctcagaa 11662983  T
Q  158 ctagccttcaatctctcgtcttgtgccaccataagttcgctctgaaacttgttttgtaactttgctattggagagttgcaaagcacagtgagaactatca 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  11662982 ctagccttcaatctctcgtcttgtgccaccataagttcactctgaaacttgtgttgcaactttgctagtggagtgttgcaaagcatcgtgagaactatca 11662883  T
Q  258 ccaccattgaagctattgttgctagtccaattgctcggtaaagaattactaatgcaatacacaattgaaggattgtcgtccatgtctggtgaaaccagaa 357  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11662882 ctgccattgaagctattgttgctggtccaattgcaccaaaaagaattactaatgcaatacacatttggaggattgtggtccaagtctggtgaaaccagaa 11662783  T
Q  358 tggaaattctccaattctataagcatccacagtcatgtaattcattatctcaccactagagtgaatcaatctagcagaattggatagccttagtatcttt 457  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||    
T  11662782 tggaaattctccaattctataagtgtccacagtcatataattcattatctcgccactcgagtgaatcaatctagcagaattggatagtcttaatgttttt 11662683  T
Q  458 ttataaatttttgcggtaagtagtgat 484  Q
    |||||||    ||||||||||||||||    
T  11662682 ttataaacgactgcggtaagtagtgat 11662656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 93 - 465
Target Start/End: Original strand, 11632001 - 11632373
Alignment:
Q  93 catttttaaaatgcttttcccatgcatataacttgagcactttcatattcacaagagcctcggaactagccttcaatctctcgtcttgtgccaccataag 192  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11632001 catttttaaaatgattttcccacgcatacaacttcaacactttcatattcacaagagcctccgaactagcctttaatctctcatcttgtgccaccataag 11632100  T
Q  193 ttcgctctgaaacttgttttgtaactttgctattggagagttgcaaagcacagtgagaactatcaccaccattgaagctattgttgctagtccaattgct 292  Q
    || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| || |  ||||||||||||||||      
T  11632101 tttgctctgatacttgtgttgtaactttgctagtggataattgcaaatcacagtgagaactatcaccgccaatgatgcaagcgttgctagtccaattgtg 11632200  T
Q  293 cggtaaagaattactaatgcaatacacaattgaaggattgtcgtccatgtctggtgaaaccagaatggaaattctccaattctataagcatccacagtca 392  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||    
T  11632201 cggaaaagaattactaatgcaatacacaattggagaattgttgtccatgtctggtgaaaccagaatggaaattctccgattctataagcatctacgatca 11632300  T
Q  393 tgtaattcattatctcaccactagagtgaatcaatctagcagaattggatagccttagtatctttttataaat 465  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  11632301 tgtaattcattatctcaccaccagagtgaatcaacctagcagaattcgatagccgtaatattttcttataaat 11632373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 484
Target Start/End: Original strand, 11673930 - 11674413
Alignment:
Q  1 cggtgagctccaaaagaggaagagaaggtatgccctacttaattgaaccgatgatatcaatttgagttctgcatttctcaactttcctatagcattttta 100  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||  || |||||||| || |  |||| ||| ||||||||  ||||||| |  |    ||| | |||||||    
T  11673930 cggtgagctccaaaaaagaaagacaaggtatgttcttcttaattgcactgcagataacaacttgagttccacatttcttaggtaatatatggaattttta 11674029  T
Q  101 aaatgcttttcccatgcatataacttgagcactttcatattcacaagagcctcggaactagccttcaatctctcgtcttgtgccaccataagttcgctct 200  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  11674030 aaatgggtttcccatgcatatagcttcaacactttcatattcacaagagcctcagaactcgcttttaatctctcatcttgcgccaccattagtttgctct 11674129  T
Q  201 gaaacttgttttgtaactttgctattggagagttgcaaagcacagtgagaactatcaccaccattgaagctattgttgctagtccaattgctcggtaaag 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||| ||||| ||||| ||  ||||    
T  11674130 gaaacttgtgttgtagctttgctagcggagtgttgcaaagcacggtgagaattatcactaccagtgaagctacggttgcaagtccgattgcacgaaaaag 11674229  T
Q  301 aattactaatgcaatacacaattgaaggattgtcgtccatgtctggtgaaaccagaatggaaattctccaattctataagcatccacagtcatgtaattc 400  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11674230 aatcactaatgcaatacacagttgaagaattgttgtccaagtcttgtgaaaccaaaatggaaattctccaattctataagcatccacagtcatataattc 11674329  T
Q  401 attatctcaccactagagtgaatcaatctagcagaattggatagccttagtatctttttataaatttttgcggtaagtagtgat 484  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||   ||| ||||||||||||    
T  11674330 attatctcgccactagagtgaactaatctagcagagttggatagccttaatatttttttatgaatggctgcagtaagtagtgat 11674413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 93 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 11618231 - 11617861
Alignment:
Q  93 catttttaaaatgcttttcccatgcatataacttgagcactttcatattcacaagagcctcggaactagccttcaatctctcgtcttgtgccaccataag 192  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  11618231 catttttaaaatgtgtttcccatgcatatagcttcaacactttcatattcacaagagcctccgaactcgcctttaatctctcatcttgcgccaccataag 11618132  T
Q  193 ttcgctctgaaacttgttttgtaactttgctattggagagttgcaaagcacagtgagaactatcaccaccattgaagctattgttgctagtccaattgct 292  Q
    || | | |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||      
T  11618131 ttgggtttgaaacttgtgttgtaagtttgctagtggagcgttgcaaagcacagtgagaactatcaccaccaatgatgcgagtgttgctagtccaattgtg 11618032  T
Q  293 cggtaaagaattactaatgcaatacacaattgaaggattgtcgtccatgtctggtgaaaccagaatggaaattctccaattctataagcatccacagtca 392  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  11618031 cggaaaagaattatcaatgcaatacacaattggaggcttgttgtccaagtctggtgaaaccaaaatggaaattctccaattctataagcatcgacagtaa 11617932  T
Q  393 tgtaattcattatctcaccactagagtgaatcaatctagcagaattggatagccttagtatctttttataa 463  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||||    
T  11617931 cataattcattatctcaccaccagagtgattcaatctagccgaatttgatagacttaacatttttttataa 11617861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 94 - 443
Target Start/End: Original strand, 12094065 - 12094414
Alignment:
Q  94 atttttaaaatgcttttcccatgcatataacttgagcactttcatattcacaagagcctcggaactagccttcaatctctcgtcttgtgccaccataagt 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||| ||||    
T  12094065 atttttaaaatgcatttcccatgcatataactttagcactttcatattcaccagagcctcagaactagccttcaacctttcatcttgggccaccagaagt 12094164  T
Q  194 tcgctctgaaacttgttttgtaactttgctattggagagttgcaaagcacagtgagaactatcaccaccattgaagctattgttgctagtccaattgctc 293  Q
    |  ||  || |||| | |||||||||||||| |||||  ||  ||| ||| || | |||||||||||||| ||| || |||||||| | |||||| || |    
T  12094165 ttactaagatacttatgttgtaactttgctagtggagcattcaaaaacacggtcaaaactatcaccaccaatgacgcaattgttgccaatccaatagcac 12094264  T
Q  294 ggtaaagaattactaatgcaatacacaattgaaggattgtcgtccatgtctggtgaaaccagaatggaaattctccaattctataagcatccacagtcat 393  Q
    |  |||||||||||||||||||  | | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||     
T  12094265 gaaaaagaattactaatgcaattgatagttggaggactgttgtccatgtctggtgaaaccagaacggaaattctccgattctatacgcatccacattcac 12094364  T
Q  394 gtaattcattatctcaccactagagtgaatcaatctagcagaattggata 443  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12094365 atagttcattatctcaccgctagagtgaatcaatctagcagcattggata 12094414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 11755870 - 11755521
Alignment:
Q  94 atttttaaaatgcttttcccatgcatataacttgagcactttcatattcacaagagcctcggaactagccttcaatctctcgtcttgtgccaccataagt 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||| ||||    
T  11755870 atttttaaaatgcatttcccatgcatataactttagcactttcatgttcaccagagcctcagaactagctttcaacctttcatcttgggccaccagaagt 11755771  T
Q  194 tcgctctgaaacttgttttgtaactttgctattggagagttgcaaagcacagtgagaactatcaccaccattgaagctattgttgctagtccaattgctc 293  Q
    |  ||  || |||| | |||||||||||||| |||||  ||  ||||||| || | || |||||||||||  || || |||||||| | |||||| || |    
T  11755770 ttacttagatacttatgttgtaactttgctagtggagcattcaaaagcacggtcaaaaatatcaccaccaacgatgcaattgttgccaatccaatagcgc 11755671  T
Q  294 ggtaaagaattactaatgcaatacacaattgaaggattgtcgtccatgtctggtgaaaccagaatggaaattctccaattctataagcatccacagtcat 393  Q
    |  |||||||||||||||||||  | | ||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||     
T  11755670 gaaaaagaattactaatgcaattgatagttggaggactgttgtccatgtctggtgaaaccaaaacggaaattctccgattctataggcatccacgttcac 11755571  T
Q  394 gtaattcattatctcaccactagagtgaatcaatctagcagaattggata 443  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11755570 atagttcattatctcaccgctagagtgaatcaatctagcagcattggata 11755521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 87 - 443
Target Start/End: Original strand, 11739830 - 11740186
Alignment:
Q  87 ctatagcatttttaaaatgcttttcccatgcatataacttgagcactttcatattcacaagagcctcggaactagccttcaatctctcgtcttgtgccac 186  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  11739830 ctatagcatttttaaaatgggtttcccatgcatataacttcaacactttcacattcactagagcctcggaactagcctttaacctttcatcttgtgccac 11739929  T
Q  187 cataagttcgctctgaaacttgttttgtaactttgctattggagagttgcaaagcacagtgagaactatcaccaccattgaagctattgttgctagtcca 286  Q
     | ||||| |||  || |||| | |||||||||||||| |||||  ||  | ||| | || | ||||||||||||||  || || ||||| || || |||    
T  11739930 gagaagtttgcttagatacttatgttgtaactttgctagtggagtatttaatagcgccgtcaaaactatcaccaccaacgatgcaattgtcgcaagccca 11740029  T
Q  287 attgctcggtaaagaattactaatgcaatacacaattgaaggattgtcgtccatgtctggtgaaaccagaatggaaattctccaattctataagcatcca 386  Q
    |  || ||  ||| ||| || |||| |||||| | ||| || | ||| |||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  11740030 accgcacgaaaaataatgaccaatgaaatacatagttggagaaatgttgtccatgaatggtgaaaccaaaacggtaattctccaattctataagcatcca 11740129  T
Q  387 cagtcatgtaattcattatctcaccactagagtgaatcaatctagcagaattggata 443  Q
    || |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11740130 cattcacataattcattatctcgccaccagagtgaatcaatttagcagcattggata 11740186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 95 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 12581 - 12192
Alignment:
Q  95 tttttaaaatgcttttcccatgcatataacttgagcactttcatattcacaagagcctcggaactagccttcaatctctcgtcttgtgccaccataagtt 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||||||   ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12581 tttttaaaatggttttcccatgcatatagtttcaacactttcatattcgtgagagcttcagaactaacctttaatctctcgtcttgtgccaacataagtt 12482  T
Q  195 cgctctgaaacttgttttgtaactttgctattggagagttgcaaagcacagtgagaactatcaccaccattgaagctattgttgctagtccaattgctcg 294  Q
      |||||||| |||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12481 tactctgaaatttgtattgtaactttgatagtggagcattgcaaagcacggtgagaactatcaccgccattgatgctagtgttgctagtccaattgtgcg 12382  T
Q  295 gtaaagaattactaatgcaatacacaattgaaggattgtcgtccatgtctggtgaaaccagaatggaaattctccaattctataagcatccacagtcatg 394  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12381 gaaaaggattactaatgcaatacacaattggaggattgttgtccaagtttggtgaaaccaaaatggaaattctccaattctataagcatccaccgtcata 12282  T
Q  395 taattcattatctcaccactagagtgaatcaatctagcagaattggatagccttagtatctttttataaatttttgcggtaagtagtgat 484  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| || | |||||||| ||||| ||| |||||| ||||  |||| |||||| |||||    
T  12281 taattcattatttcaccacctgagtgaaccaatctcgctgtattggataaccttaatatttttttagaaatggttgcagtaagttgtgat 12192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 93 - 465
Target Start/End: Original strand, 8950 - 9322
Alignment:
Q  93 catttttaaaatgcttttcccatgcatataacttgagcactttcatattcacaagagcctcggaactagccttcaatctctcgtcttgtgccaccataag 192  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| || |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8950 catttttaaaatgtgtttcccatgcatataacttcaacactttcatagtaacaaaagactcaaaactagcctttaatctctcatcttgtgccaccataag 9049  T
Q  193 ttcgctctgaaacttgttttgtaactttgctattggagagttgcaaagcacagtgagaactatcaccaccattgaagctattgttgctagtccaattgct 292  Q
    ||  || ||||||||||  | |||||| ||||   |||  |||||||||| |||||||| |||||   ||| ||| ||||   |||||||||||||||      
T  9050 ttgcctttgaaacttgtgctctaacttggctaggcgagcattgcaaagcatagtgagaattatcattgccaatgatgctagaattgctagtccaattgtg 9149  T
Q  293 cggtaaagaattactaatgcaatacacaattgaaggattgtcgtccatgtctggtgaaaccagaatggaaattctccaattctataagcatccacagtca 392  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||  | |    
T  9150 cggaaaagaattactaatgcaatacacagttggaggcttgttgtccaagtctggtgaaaccaaaccggaaattctccaattctataagcatctacgatta 9249  T
Q  393 tgtaattcattatctcaccactagagtgaatcaatctagcagaattggatagccttagtatctttttataaat 465  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  9250 tataattgattatctcaccactagagtgaatcaatctagcagaattggacaaccttaatatttttttataaat 9322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 44811617 - 44811260
Alignment:
Q  108 tttcccatgcatataacttgagcactttcatattcacaagagcctcggaactagccttcaatctctcgtcttgtgccaccataagttcgctctgaaactt 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  44811617 tttcccatgcatataacttcagcaccttcatattcacaagagcctcagaagtagccttcaatctctcatcttgtgctaccataagtttgctttgaaactt 44811518  T
Q  208 gttttgtaactttgctattggagagttgcaaagcacagtgagaactatcaccaccattgaagctattgttgctagtccaattgctcggtaaagaattact 307  Q
    || |||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||||| |||||| || ||||  || || ||||| ||||  ||||| || ||| |||| |||||     
T  44811517 gtgttgtaactttgcaattggtgcattacaaagtacagtgataactatgactaccagggaggcaattgtagctatcccaatagcgcggaaaagtattacc 44811418  T
Q  308 aatgcaatacacaattgaaggattgtcgtccatgtctggtgaaaccagaatggaaattctccaattctataagcatccacagtcatgtaattcattatct 407  Q
    || |  ||||| |  || | | | || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  44811417 aacgagatacatagctggaagctagtagtccatgtttggtgaaaccagtaaggaaattctccgattctataagcatccacagtcacataattcattattt 44811318  T
Q  408 caccactagagtgaatcaatctagcagaattggatagccttagtatctttttataaat 465  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  44811317 caccgctagagtgcgtcaatctagcagaattggataacctcagttgctttttataaat 44811260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University