View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11090_low_20 (Length: 397)

Name: NF11090_low_20
Description: NF11090
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11090_low_20
NF11090_low_20
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (14-382)||(41287264-41287633)
chr5 (15-220)||(41317099-41317304)
chr5 (15-219)||(41329140-41329344)
chr5 (14-222)||(41305410-41305618)
chr5 (15-223)||(41333073-41333281)
chr5 (21-235)||(31187580-31187794)
chr5 (15-222)||(41311304-41311511)
chr5 (21-235)||(31225984-31226198)
chr5 (24-220)||(31177532-31177728)
chr5 (14-223)||(41325162-41325371)
chr5 (14-218)||(41367251-41367455)
chr5 (14-222)||(41369936-41370144)
chr5 (14-235)||(41337879-41338100)
chr5 (93-208)||(41311682-41311799)
chr5 (93-184)||(41333404-41333497)
chr5 (95-156)||(41329533-41329594)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (18-205)||(17248427-17248614)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (111-154)||(62045-62088)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (111-145)||(12609806-12609840)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 382
Target Start/End: Original strand, 41287264 - 41287633
Alignment:
Q  14 agacttcgaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtggccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgcggaattactttat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41287264 agacttcgaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtgcccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgctgaattactttat 41287363  T
Q  114 cactttgattggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacctatgattaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41287364 cactttgattggaagcttctcaatggaatgaagtgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacctatgattaa 41287463  T
Q  214 ttcctattacacgttgtccttactatttgt-ttgccaaagcaaacctgtttagtgtttaatttccatatactactttcagtaataatgtgtatgatgttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41287464 ttcctattacacgttgtccttactatttgtattgccaaagcaaacctgtttagtgtttaatttccatatactactttcagtaataatgtgtatgatgttc 41287563  T
Q  313 cgaataatgactgtggttggtaataatttgttgtaaataattttactagatgtcgtttacacttgaatat 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41287564 cgaataatgactgtggttggtaataatttgttgtaaataattttactagatgtcgtttacacttgcatat 41287633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 220
Target Start/End: Original strand, 41317099 - 41317304
Alignment:
Q  15 gacttcgaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtggccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgcggaattactttatc 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | | | ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  41317099 gacttcgaattcataccatttggtgctggaaggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttgcccaatgttgagctgcctcttgctaagttactttatc 41317198  T
Q  115 actttgattggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacctatgattaat 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |||||    
T  41317199 actttgattggaagcttcccaatggaatgaagaatgaagaattggatatgactgagtcatttgggattactgcaggtagaaaacacgatctatgcttaat 41317298  T
Q  215 tcctat 220  Q
    ||||||    
T  41317299 tcctat 41317304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 41329140 - 41329344
Alignment:
Q  15 gacttcgaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtggccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgcggaattactttatc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | || | ||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  41329140 gacttcgaattcataccatttggtgctggaagaaggatgtgtccaggtatttcatttgccatacccaatgttgagctgcctcttgctaagttactttatc 41329239  T
Q  115 actttgattggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacctatgattaat 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  41329240 actttgattggaagcttcccaatggaatgagccatcaagaacttgatatgactgagttttttgggattactgtaggtagaaaacacgacctatgtttaat 41329339  T
Q  215 tccta 219  Q
    |||||    
T  41329340 tccta 41329344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 41305410 - 41305618
Alignment:
Q  14 agacttcgaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtggccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgcggaattactttat 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | | || | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41305410 agactttgaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtgtccgggcattgcatttgccttatcaaatgttgaacttcctcttgctgaattactttat 41305509  T
Q  114 cactttgattggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacctatgattaa 213  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||    | |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || |    
T  41305510 aactttgattggaagcttcccaacggaatgagccatcaagaacttgatatgaccgagtcatttgggcttagtgtaggaagaaaacacgacctatgtttga 41305609  T
Q  214 ttcctatta 222  Q
    |||||||||    
T  41305610 ttcctatta 41305618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 41333073 - 41333281
Alignment:
Q  15 gacttcgaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtggccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgcggaattactttatc 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | | |||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||  |    
T  41333073 gacttcgaattcataccatttggtgctggaaggaggatgtgtcccggaattgcatttgccctaccaaacattgagctacctcttgctcaattactttgcc 41333172  T
Q  115 actttgattggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacctatgattaat 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||    
T  41333173 actttgattggaagcttcccaataaaatgaagaatgaagaactagatatgaccgagtcatttgggattactgtaggaagaaagcacgatctatgtttaat 41333272  T
Q  215 tcctattac 223  Q
    |||||||||    
T  41333273 tcctattac 41333281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31187794 - 31187580
Alignment:
Q  21 gaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtggccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgcggaattactttatcactttg 120  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || ||||| ||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||    
T  31187794 gaatacataccgttcggtgctggaagaagaatgtgtccaggcatggcatttggcttatccaacattgagctgcctcttgctcagttactttaccactttg 31187695  T
Q  121 attggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacctatgattaattcctat 220  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31187694 attggaagcttcctaatggaatgaagaatgaagaactagatatgactgagtcatttgggatggctataggaagaaaacatgacctatgcttgattcctat 31187595  T
Q  221 tacacgttgtcctta 235  Q
    ||| ||| |||||||    
T  31187594 tactcgtcgtcctta 31187580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 41311304 - 41311511
Alignment:
Q  15 gacttcgaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtggccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgcggaattactttatc 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | | |||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||| |    
T  41311304 gactttgaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtgtcccggaattgcatttgccctaccaaacattgagctacctcttgctcaattactttacc 41311403  T
Q  115 actttgattggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacctatgattaat 214  Q
      |||||||||||||||| ||||  ||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||    
T  41311404 ggtttgattggaagcttcccaataaaatgaagaatgaagaactagatatggctgagtcatttgggattactgtaggtagaaaacacgacctatatttaat 41311503  T
Q  215 tcctatta 222  Q
    | ||||||    
T  41311504 tgctatta 41311511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 31225984 - 31226198
Alignment:
Q  21 gaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtggccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgcggaattactttatcactttg 120  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || ||||| ||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||    
T  31225984 gaatacataccgttcggtgctggaagaagaatgtgtccaggcatggcatttggcttatccaacattgagctgcctcttgctcagttactttaccactttg 31226083  T
Q  121 attggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacctatgattaattcctat 220  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  31226084 attggaagcttcctaatggaatgaagaatgaagaactagatatgactgagtcatttgggctttctgtaggaagaaaaaatgacctgtgcttgattcctat 31226183  T
Q  221 tacacgttgtcctta 235  Q
     || ||| |||||||    
T  31226184 cactcgtcgtcctta 31226198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31177728 - 31177532
Alignment:
Q  24 tacataccatttggtgctggaaggaggatgtggccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgcggaattactttatcactttgatt 123  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || ||||| ||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  31177728 tacataccgttcggtgctggaagaagaatgtgtccaggcatggcatttggcttatccaacattgagctgcctcttgctcagttactttaccactttgatt 31177629  T
Q  124 ggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacctatgattaattcctat 220  Q
    |||||||||  |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31177628 ggaagcttcctaatggaatgaagaatgaagaactagatatgactgagtcatttgggcttgctgtagtaagaaaacatgacctatgcttgattcctat 31177532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 41325162 - 41325371
Alignment:
Q  14 agacttcgaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtggccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgcggaattactttat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || | | |||||||||||||  | ||||||||    ||||||||     
T  41325162 agactttgaatacataccatttggtgctggaagaaggatgtgtcccggaattgcatttgccttacccaacgttgaattgcctcttgctagtttactttac 41325261  T
Q  114 cactttgattggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacctatgattaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  | ||||| ||||    
T  41325262 cactttgattggaagcttcccaataaaatgaagaatgaagaactagatatgaccgagtcatttgggattactgcaggtagaaagcacaatctatgcttaa 41325361  T
Q  214 ttcctattac 223  Q
    ||||||||||    
T  41325362 ttcctattac 41325371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Original strand, 41367251 - 41367455
Alignment:
Q  14 agacttcgaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtggccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgcggaattactttat 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| || | | |||||||| | ||||| ||| | ||  | ||||||||     
T  41367251 agactttgaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtgtctgggtattgcatttgccttacccaacatagagctacctttagctcagttactttac 41367350  T
Q  114 cactttgattggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacctatgattaa 213  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||| | |||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| || |    
T  41367351 cattttgattggaagcttccaaatggaatgaagaatgaagaattagatatgacggagtcatttgggcttgcagtaggaagaaaacatgacttatgcttga 41367450  T
Q  214 ttcct 218  Q
    |||||    
T  41367451 ttcct 41367455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 41369936 - 41370144
Alignment:
Q  14 agacttcgaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtggccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgcggaattactttat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||   || ||| |||| ||||||||| | ||||||||    ||||||||     
T  41369936 agactttgaatacataccatttgatgcagggaggaggatgtgtccaggcattatgtttggcttacctaacgttgagttgcctcttgctagtttactttac 41370035  T
Q  114 cactttgattggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacctatgattaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||| ||||  |||| || |    
T  41370036 cactttgattggaagcttcccaatgaaatgaagaatgaagaattggatatgactgaatcatttgggattacagcagtaagaaaatatgatttatgcttga 41370135  T
Q  214 ttcctatta 222  Q
    |||||||||    
T  41370136 ttcctatta 41370144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 41337879 - 41338100
Alignment:
Q  14 agacttcgaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtggccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgcggaattactttat 113  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || | | | ||||| |||||||| ||||||||  | || ||||||    
T  41337879 agactttgaattaataccatttggtgctggaagaaggatgtgtccaggtattgcatttgccttgcccaatgttgagctgcctcttgctaagttgctttat 41337978  T
Q  114 cactttgattggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacctatgattaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||    | ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||||  |||| || |    
T  41337979 cactttgattggaaacttccaaatggaatgagccatcaagaacttgatatgactgaatcatttggacttactgttggaaaaaagcatgatgtatgtttga 41338078  T
Q  214 ttcctattacacgttgtcctta 235  Q
    | |||||||| ||| |||||||    
T  41338079 tccctattactcgtcgtcctta 41338100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 208
Target Start/End: Original strand, 41311682 - 41311799
Alignment:
Q  93 cctcttgcggaattactttatcactttgattggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgact--gagtcatttgggattactgtagg 190  Q
    |||||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| || ||    
T  41311682 cctcttgctgaattattttatgaatttgattgaaagcttcccaatggaatgaataatgaagaacttgatatgactgagagtcatttgggcatacagtcgg 41311781  T
Q  191 aagaaaacatgacctatg 208  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41311782 aagaaaacatgacctatg 41311799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 184
Target Start/End: Original strand, 41333404 - 41333497
Alignment:
Q  93 cctcttgcggaattactttatcactttgattggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgact--gagtcatttgggattac 184  Q
    |||||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  41333404 cctcttgctgaattattttatgaatttgattgaaagcttcccaatggaatgaataatgaagaacttgatatgattgagagtcatttgggcttac 41333497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 156
Target Start/End: Original strand, 41329533 - 41329594
Alignment:
Q  95 tcttgcggaattactttatcactttgattggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaac 156  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  41329533 tcttgctgaattactttatgactttgattgaaagctttccaatggaatgaataatgaagaac 41329594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17248614 - 17248427
Alignment:
Q  18 ttcgaatacataccatttggtgctggaaggaggatgtggccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgcggaattactttatcact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||| || |    
T  17248614 ttcgaatacataccatttggtgctggaaggaggatttgtccgggcattgcatttggcatacccaacattgagttgcctcttgctcaattactttaccatt 17248515  T
Q  118 ttgattggaagcttctcaatggaatgaattgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacct 205  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||| || |||||||| |||||||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  17248514 ttgattggaagcttcccaatgaaatgaagaatgaagatctagatatgaccgagtcatttgggattacaataagaagaaaaaatgacct 17248427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 62088 - 62045
Alignment:
Q  111 tatcactttgattggaagcttctcaatggaatgaattgtgaaga 154  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  62088 tatcactttgattggaagcttcccaatggaatgaaatgtgaaga 62045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12609840 - 12609806
Alignment:
Q  111 tatcactttgattggaagcttctcaatggaatgaa 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12609840 tatcactttgattggaagcttcccaatggaatgaa 12609806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University