View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1109_low_10 (Length: 327)

Name: NF1109_low_10
Description: NF1109
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1109_low_10
NF1109_low_10
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (42-298)||(18467436-18467692)
chr3 (42-298)||(757995-758250)
chr3 (42-298)||(18472218-18472474)
chr3 (42-298)||(39775355-39775610)
chr3 (59-298)||(7570862-7571100)
chr3 (56-298)||(23661105-23661346)
chr3 (56-298)||(23665764-23666005)
chr3 (56-298)||(24038012-24038253)
chr3 (42-290)||(55325995-55326243)
chr3 (56-295)||(14438339-14438578)
chr3 (42-298)||(55431526-55431782)
chr3 (56-295)||(27709146-27709385)
chr3 (41-298)||(2207374-2207631)
chr3 (42-298)||(29350451-29350707)
chr3 (75-257)||(32473579-32473760)
chr3 (42-298)||(46964226-46964476)
chr3 (177-298)||(10708438-10708559)
chr3 (61-298)||(3656875-3657122)
chr3 (177-298)||(20520265-20520386)
chr3 (55-298)||(3419205-3419458)
chr3 (179-286)||(25726553-25726661)
chr3 (61-251)||(12112313-12112517)
chr3 (179-295)||(6596125-6596241)
chr3 (248-298)||(32474511-32474561)
chr3 (42-168)||(17025732-17025858)
chr3 (179-295)||(8069888-8070003)
chr3 (178-292)||(19276682-19276797)
chr3 (179-295)||(8883379-8883495)
chr3 (227-298)||(10586000-10586071)
chr3 (227-286)||(45904355-45904414)
chr3 (227-286)||(45904811-45904870)
chr3 (179-295)||(3033853-3033968)
chr3 (242-298)||(12971459-12971515)
chr3 (212-295)||(17025902-17025986)
chr3 (179-295)||(3672795-3672911)
chr3 (179-295)||(3692827-3692943)
chr3 (179-295)||(8888139-8888255)
chr3 (231-298)||(31002903-31002970)
chr3 (242-297)||(12965699-12965754)
chr3 (179-224)||(27104268-27104314)
chr3 (242-295)||(28125351-28125404)
chr3 (238-274)||(13156223-13156259)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (42-298)||(26927348-26927604)
chr1 (42-298)||(39587996-39588249)
chr1 (42-287)||(16649263-16649508)
chr1 (56-295)||(10140308-10140549)
chr1 (56-298)||(25843969-25844207)
chr1 (42-298)||(47450855-47451108)
chr1 (56-220)||(10135617-10135781)
chr1 (61-298)||(16035820-16036069)
chr1 (42-185)||(51041138-51041281)
chr1 (42-298)||(19798630-19798895)
chr1 (42-207)||(33300875-33301038)
chr1 (42-295)||(38620908-38621172)
chr1 (183-298)||(40166193-40166308)
chr1 (235-298)||(51041282-51041345)
chr1 (181-251)||(11806597-11806667)
chr1 (177-251)||(39200527-39200601)
chr1 (179-295)||(33055248-33055365)
chr1 (179-293)||(8267606-8267713)
chr1 (179-294)||(18784325-18784440)
chr1 (241-298)||(28434399-28434456)
chr1 (254-298)||(33301018-33301062)
chr1 (179-295)||(3094299-3094414)
chr1 (177-227)||(32626384-32626434)
chr1 (254-295)||(12260205-12260246)
chr1 (259-297)||(8138153-8138191)
chr1 (42-181)||(40166322-40166454)
chr1 (61-110)||(39200410-39200458)
chr1 (242-298)||(16833697-16833753)
chr1 (242-298)||(23192644-23192700)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (42-298)||(36423850-36424106)
chr5 (42-297)||(37248431-37248685)
chr5 (42-298)||(26667485-26667741)
chr5 (42-298)||(26939082-26939338)
chr5 (42-298)||(29167600-29167855)
chr5 (42-277)||(37549779-37550014)
chr5 (42-298)||(36428922-36429178)
chr5 (42-277)||(37652577-37652812)
chr5 (56-298)||(12103238-12103480)
chr5 (56-295)||(7451970-7452209)
chr5 (61-298)||(35679521-35679758)
chr5 (42-298)||(40148108-40148364)
chr5 (124-298)||(10759529-10759703)
chr5 (42-207)||(9726382-9726546)
chr5 (178-296)||(20180825-20180943)
chr5 (179-295)||(16116011-16116127)
chr5 (182-295)||(15414647-15414761)
chr5 (177-290)||(34707299-34707412)
chr5 (179-298)||(6155181-6155301)
chr5 (42-251)||(6513544-6513761)
chr5 (179-285)||(3666131-3666237)
chr5 (179-294)||(12044907-12045022)
chr5 (176-274)||(7086595-7086693)
chr5 (224-298)||(12102637-12102712)
chr5 (179-295)||(32461316-32461433)
chr5 (42-143)||(15414496-15414597)
chr5 (56-135)||(16115875-16115955)
chr5 (179-295)||(556906-557021)
chr5 (179-295)||(561678-561793)
chr5 (253-298)||(12501736-12501781)
chr5 (227-296)||(13301299-13301368)
chr5 (179-295)||(41996871-41996986)
chr5 (179-295)||(42001640-42001755)
chr5 (242-298)||(4872135-4872191)
chr5 (227-298)||(31731750-31731821)
chr5 (260-298)||(6514444-6514482)
chr5 (257-298)||(9726529-9726570)
chr5 (179-295)||(36937280-36937395)
chr5 (179-295)||(36942034-36942149)
chr5 (242-286)||(1429827-1429871)
chr5 (242-298)||(39518623-39518678)
chr5 (242-298)||(39523262-39523317)
chr5 (179-246)||(23977359-23977425)
chr5 (254-298)||(11981118-11981162)
chr5 (254-298)||(21323810-21323854)
chr5 (256-298)||(12041772-12041814)
chr5 (226-285)||(9911370-9911430)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (42-298)||(18344635-18344891)
chr2 (56-298)||(1934634-1934875)
chr2 (42-298)||(19892100-19892348)
chr2 (42-297)||(25496952-25497207)
chr2 (42-298)||(25477924-25478180)
chr2 (56-295)||(9180368-9180607)
chr2 (47-298)||(28603516-28603764)
chr2 (42-273)||(31326987-31327218)
chr2 (42-295)||(12797141-12797393)
chr2 (42-204)||(17968590-17968751)
chr2 (56-187)||(9185059-9185190)
chr2 (177-298)||(40847360-40847481)
chr2 (115-298)||(17544986-17545181)
chr2 (182-295)||(9189573-9189686)
chr2 (179-295)||(19538595-19538711)
chr2 (179-285)||(28855224-28855330)
chr2 (242-298)||(29677980-29678036)
chr2 (181-295)||(10160495-10160609)
chr2 (190-295)||(35602133-35602238)
chr2 (181-251)||(19578180-19578251)
chr2 (179-295)||(17453348-17453466)
chr2 (180-287)||(30629074-30629181)
chr2 (242-298)||(30651142-30651197)
chr2 (227-298)||(6297703-6297774)
chr2 (59-134)||(40847236-40847310)
chr2 (261-298)||(42926361-42926398)
chr2 (179-276)||(19094256-19094353)
chr2 (179-221)||(30658459-30658501)
chr2 (254-295)||(7737689-7737730)
chr2 (180-229)||(30619143-30619192)
chr2 (241-286)||(30643408-30643453)
chr2 (241-273)||(35602222-35602254)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (42-298)||(17964186-17964441)
chr6 (56-298)||(6407502-6407743)
chr6 (42-298)||(25314083-25314339)
chr6 (42-298)||(26201577-26201833)
chr6 (42-295)||(11559847-11560100)
chr6 (42-295)||(11534337-11534590)
chr6 (41-298)||(12689184-12689441)
chr6 (56-295)||(16835799-16836039)
chr6 (82-298)||(11428222-11428436)
chr6 (42-295)||(11570375-11570628)
chr6 (61-298)||(12405987-12406235)
chr6 (41-298)||(4156983-4157251)
chr6 (42-206)||(33687277-33687430)
chr6 (177-298)||(5856220-5856341)
chr6 (177-298)||(19995164-19995285)
chr6 (187-298)||(29892032-29892143)
chr6 (60-278)||(22694956-22695185)
chr6 (60-298)||(2699742-2699989)
chr6 (177-297)||(11613527-11613646)
chr6 (191-298)||(17913810-17913910)
chr6 (180-295)||(8747993-8748108)
chr6 (179-298)||(6112724-6112842)
chr6 (239-286)||(22609794-22609841)
chr6 (243-295)||(33687430-33687482)
chr6 (179-295)||(2863229-2863345)
chr6 (254-298)||(14509197-14509241)
chr6 (42-134)||(19995025-19995115)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (42-298)||(15951181-15951437)
chr8 (46-298)||(36683792-36684044)
chr8 (42-298)||(44925550-44925806)
chr8 (57-290)||(33416767-33417001)
chr8 (56-273)||(1807685-1807901)
chr8 (42-285)||(18876018-18876258)
chr8 (42-298)||(23548245-23548512)
chr8 (42-298)||(38181873-38182138)
chr8 (177-298)||(28559427-28559547)
chr8 (61-298)||(1910604-1910851)
chr8 (177-298)||(28564582-28564702)
chr8 (177-298)||(28572205-28572325)
chr8 (42-298)||(19166847-19167112)
chr8 (177-298)||(2965843-2965964)
chr8 (177-286)||(17020563-17020672)
chr8 (177-286)||(17551000-17551109)
chr8 (179-283)||(24673097-24673202)
chr8 (61-293)||(26779317-26779564)
chr8 (186-293)||(22714777-22714885)
chr8 (56-143)||(17020715-17020802)
chr8 (242-297)||(17026149-17026204)
chr8 (56-143)||(17551152-17551239)
chr8 (242-297)||(17556641-17556696)
chr8 (227-298)||(25367797-25367868)
chr8 (179-295)||(43302456-43302575)
chr8 (257-298)||(24090835-24090876)
chr8 (191-298)||(34818487-34818587)
chr8 (178-277)||(17793697-17793797)
chr8 (178-295)||(31449633-31449750)
chr8 (227-298)||(8331174-8331245)
chr8 (179-295)||(4238110-4238225)
chr8 (179-295)||(4242849-4242964)
chr8 (179-274)||(14035669-14035764)
chr8 (242-298)||(40125712-40125767)
chr8 (62-133)||(22714641-22714712)
chr8 (227-298)||(37771918-37771989)
chr8 (68-134)||(28564461-28564527)
chr8 (179-295)||(15875447-15875563)
chr8 (176-224)||(27415788-27415836)
chr8 (56-135)||(2966022-2966101)
chr8 (59-132)||(17793852-17793926)
chr8 (177-207)||(24090859-24090889)
chr8 (176-221)||(5884256-5884301)
chr8 (48-146)||(18260199-18260299)
chr8 (42-134)||(24672953-24673042)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (42-298)||(8693924-8694181)
chr4 (56-298)||(37264205-37264446)
chr4 (42-298)||(5927845-5928101)
chr4 (42-298)||(19106821-19107077)
chr4 (56-298)||(31269247-31269480)
chr4 (56-295)||(5271063-5271302)
chr4 (42-298)||(19102190-19102446)
chr4 (56-295)||(31729031-31729270)
chr4 (61-298)||(13059622-13059857)
chr4 (56-295)||(31273737-31273969)
chr4 (56-298)||(37259505-37259759)
chr4 (56-295)||(51698132-51698371)
chr4 (42-230)||(31766153-31766339)
chr4 (115-298)||(47244461-47244644)
chr4 (169-298)||(31766023-31766152)
chr4 (60-298)||(16421242-16421488)
chr4 (42-298)||(19540809-19541043)
chr4 (42-292)||(6942987-6943248)
chr4 (42-298)||(12823519-12823783)
chr4 (177-298)||(32081893-32082014)
chr4 (178-292)||(15134371-15134486)
chr4 (177-290)||(13065578-13065690)
chr4 (179-295)||(47574868-47574984)
chr4 (179-295)||(31298157-31298273)
chr4 (179-295)||(13521756-13521873)
chr4 (178-298)||(40408414-40408535)
chr4 (42-143)||(55252029-55252130)
chr4 (190-277)||(39217184-39217272)
chr4 (178-249)||(4551233-4551305)
chr4 (254-298)||(55251932-55251976)
chr4 (227-298)||(7902923-7902994)
chr4 (227-298)||(34560633-34560704)
chr4 (179-277)||(52690891-52690990)
chr4 (179-295)||(39319784-39319893)
chr4 (179-297)||(41816992-41817109)
chr4 (179-295)||(23093317-23093434)
chr4 (42-123)||(32081755-32081835)
chr4 (242-298)||(8030302-8030358)
chr4 (227-286)||(3997874-3997933)
chr4 (179-295)||(42758514-42758630)
chr4 (242-298)||(48276475-48276531)
chr4 (242-297)||(33463182-33463237)
chr4 (179-251)||(2820045-2820120)
chr4 (242-298)||(19906463-19906519)
chr4 (179-218)||(16954593-16954632)
chr4 (254-295)||(12878454-12878495)
chr4 (241-274)||(39319865-39319898)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (41-298)||(42626216-42626473)
chr7 (42-298)||(26341412-26341675)
chr7 (47-298)||(44422766-44423019)
chr7 (42-298)||(8268507-8268760)
chr7 (60-298)||(13313879-13314119)
chr7 (56-298)||(4930446-4930676)
chr7 (89-298)||(12799623-12799840)
chr7 (177-298)||(27238455-27238576)
chr7 (178-298)||(3045768-3045888)
chr7 (56-298)||(10387997-10388249)
chr7 (177-298)||(30258313-30258434)
chr7 (177-277)||(3356857-3356957)
chr7 (178-285)||(21671421-21671528)
chr7 (194-295)||(15642393-15642495)
chr7 (198-298)||(13142683-13142783)
chr7 (179-298)||(44510440-44510559)
chr7 (179-293)||(19640510-19640624)
chr7 (179-295)||(9650731-9650848)
chr7 (242-298)||(3880208-3880264)
chr7 (205-272)||(3025666-3025733)
chr7 (180-295)||(23866279-23866394)
chr7 (227-297)||(27256450-27256520)
chr7 (193-295)||(8076255-8076358)
chr7 (42-143)||(30258466-30258567)
chr7 (255-298)||(3357470-3357513)
chr7 (60-134)||(21671573-21671646)
chr7 (189-241)||(15642506-15642558)
chr7 (184-238)||(23319115-23319169)
chr7 (178-240)||(23319181-23319243)
chr7 (176-224)||(15973037-15973085)
chr7 (242-298)||(40865185-40865241)
chr7 (75-181)||(27238586-27238690)
chr7 (245-298)||(26286975-26287027)
chr7 (179-223)||(2628926-2628970)
chr7 (261-297)||(3284942-3284978)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (42-295)||(443572-443825)
scaffold0002 (242-298)||(4287-4342)
scaffold0002 (238-274)||(150729-150765)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (42-298)||(7317-7573)
[»] scaffold0054 (3 HSPs)
scaffold0054 (42-297)||(25657-25921)
scaffold0054 (177-298)||(29372-29497)
scaffold0054 (42-164)||(29521-29640)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (40-288)||(5508-5766)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (56-298)||(148034-148288)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (179-298)||(9650-9769)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (178-295)||(146192-146309)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (212-295)||(83274-83357)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (227-298)||(45991-46062)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (200-278)||(42183-42262)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (227-298)||(152725-152796)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (226-298)||(4186-4259)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (200-277)||(3002-3080)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (66-135)||(13601-13670)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (245-286)||(47692-47733)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18467692 - 18467436
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18467692 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 18467593  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18467592 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 18467493  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18467492 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 18467436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 757995 - 758250
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  757995 ataatatatgtcccttcagattaaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtata 758094  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  758095 tataaaaagtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 758193  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  758194 ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 758250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18472474 - 18472218
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  18472474 ataatatatgtccctttagaataaagagtacttttaagatgatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtata 18472375  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18472374 tataaaaagtattttaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 18472275  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18472274 ttagaatgatattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacaaagtggtaac 18472218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 39775355 - 39775610
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39775355 ataatatatgtcccttcagaataaatagtacttttaagatcatagtctctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 39775454  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39775455 tataaaaagtagttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 39775553  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39775554 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcatcataacagagtagtaac 39775610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 59 - 298
Target Start/End: Original strand, 7570862 - 7571100
Alignment:
Q  59 agaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaa 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7570862 agaataaagagtacttttaagatcatagtccatatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatataaaaagtatttcaa 7570961  T
Q  159 tatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaaca 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7570962 tattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttataatggtattaaca 7571060  T
Q  259 ccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7571061 ccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 7571100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Original strand, 23661105 - 23661346
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23661105 ttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 23661204  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23661205 caatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatga 23661303  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23661304 acaccatatttgagtggtctcagcaccttaacagagtggtaac 23661346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Original strand, 23665764 - 23666005
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23665764 ttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatctaaacggtatatataaaaagtattt 23665863  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23665864 caatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatga 23665962  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23665963 acaccatatttgagtggtctcagcaccttaacagagtggtaac 23666005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Original strand, 24038012 - 24038253
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24038012 ttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatctaaacggtatatataaaaagtattt 24038111  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24038112 caatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatga 24038210  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24038211 acaccatatttgagtggtctcagcaccttaacagagtggtaac 24038253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 55326243 - 55325995
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||    
T  55326243 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtata 55326144  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||    
T  55326143 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggaaaaattaaag 55326044  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacaga 290  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55326043 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacaga 55325995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Original strand, 14438339 - 14438578
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14438339 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatataaaaagtattt 14438438  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  14438439 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaaagttagaatggtagca 14438538  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14438539 aaaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggt 14438578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 55431782 - 55431526
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||    
T  55431782 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcataatccatatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtata 55431683  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  55431682 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaattgtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatgttttggagaaattaaag 55431583  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55431582 ttagaatggtgacaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtgataac 55431526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27709385 - 27709146
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27709385 ttcagaataaagagtatttttaagatcatagtctctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 27709286  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  27709285 taatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggta 27709186  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  27709185 acaccatatttgagtggtcgcaacaccataatagagtggt 27709146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 298
Target Start/End: Original strand, 2207374 - 2207631
Alignment:
Q  41 aataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtat 140  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||    
T  2207374 aataatatatgtctcttcggaataaagagtacttttaagatcatggtccctgtttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtat 2207473  T
Q  141 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa 240  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||    
T  2207474 atataaaaagtatttcaacatttttctatttgaggagaaatggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttgaagaaattaaa 2207573  T
Q  241 gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2207574 gttagaacggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtaac 2207631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29350707 - 29350451
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  29350707 ataatatatgtcccttcagaataaagaatatttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgttccattagaattatgaatgatcttaacgatata 29350608  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||     
T  29350607 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaaa 29350508  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29350507 ttagaatggtggcaacaccatatttgagtgctctcaacactataacagagtggtaac 29350451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 257
Target Start/End: Original strand, 32473579 - 32473760
Alignment:
Q  75 ttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgag 174  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32473579 ttaagaccatggtccctgtttggaaaaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttta-tatttgag 32473677  T
Q  175 gagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaac 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32473678 gagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaac 32473760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 46964476 - 46964226
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| |  ||    
T  46964476 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcataatttatatttggaatagcaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacag--ta 46964379  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagt-ttggagaacttaaa 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||     || ||||| || |||||    
T  46964378 tataaaaattatttcaatatttttctatttgaagagaaattgtggtatcaccatacttgagttgtcgtagtgccatat-----gtcttggataaattaaa 46964284  T
Q  241 gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46964283 gttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 46964226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Original strand, 10708438 - 10708559
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10708438 gaaatggtggtatcaccatatttgagtgctcgtagtaccatattgatagttcggagaacttaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 10708537  T
Q  277 agcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  10708538 agcaccataacagagtgttaac 10708559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 298
Target Start/End: Original strand, 3656875 - 3657122
Alignment:
Q  61 aataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaata 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||  || | ||||| ||||    
T  3656875 aataaagagtactgttaagatcataatccctttttggaataataatgtcccgtcggaattaagaacgatcttaaaggtatata--aatattatttgaata 3656972  T
Q  161 tttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttaga 246  Q
    |||||||| ||||||||||||              |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3656973 tttttctaattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatc--catatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaaattaaagttaga 3657070  T
Q  247 atggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3657071 atggtggtaacatcatatttgattggtctcagcaccgtaacagagtggtaac 3657122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20520386 - 20520265
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||    
T  20520386 gaaatggcgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgcaatattgatactttggagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatattttagtggtttc 20520287  T
Q  277 agcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20520286 agcaccataacagagtggtaac 20520265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3419458 - 3419205
Alignment:
Q  55 tttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatt 154  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||  || | | ||    
T  3419458 tttcggaataaagagtattattaagatcatagtccctttttagaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatata--aatattctt 3419361  T
Q  155 tcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagta--ccatattgatagtttggagaactta 238  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||              |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||    
T  3419360 tcaatatttt---aattgaggagaaattaaaaagtgaaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtgtgccatattgatattttggagaaatta 3419264  T
Q  239 aagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  3419263 aagttagaatggtggcaacaccata-ttgagtggtcacagcgccataacagagcggtaac 3419205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 286
Target Start/End: Original strand, 25726553 - 25726661
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |    
T  25726553 aatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtaccatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacaccatatttgagtggtctta 25726652  T
Q  278 gcaccataa 286  Q
     ||||||||    
T  25726653 acaccataa 25726661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 251
Target Start/End: Original strand, 12112313 - 12112517
Alignment:
Q  61 aataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaata 160  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||    
T  12112313 aataaataatacttttaagatcatactccctatttgaaataataatgtcatgtggaaattaagaatgatcttaacgg--tatataaatattattttaata 12112410  T
Q  161 tttttctattt--gagga-------------gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gtta 244  Q
    |||||||| ||  |||||             |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  12112411 tttttctacttgagaggaaaaataaaaaatcgaaatggtagaatcaccatatttgaggggtcgtagtgccatattgatatattggagaacttaaaggtta 12112510  T
Q  245 gaatggt 251  Q
    |||||||    
T  12112511 gaatggt 12112517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 6596125 - 6596241
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||| ||||||| | ||||||||| ||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  6596125 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatactatattgaca-tttggagaagttagatgttagaatggtggtaacacaatatttgagtggtctca 6596223  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  6596224 gcaccataatagagtggt 6596241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 298
Target Start/End: Original strand, 32474511 - 32474561
Alignment:
Q  248 tggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32474511 tggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaac 32474561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 168
Target Start/End: Original strand, 17025732 - 17025858
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||| || || ||||| ||||||||| || |||||    
T  17025732 ataatatatgtcccttcagaataaaaagtatttttaagaccatagtccctttttgtaatgataatgtcccgtcgggattaagaatgatctttacagtata 17025831  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttcta 168  Q
    || ||| | | |||| |||| ||||||    
T  17025832 taaaaatattctttcgatatctttcta 17025858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8070003 - 8069888
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8070003 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 8069906  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
     ||||||||  |||||||    
T  8069905 acaccataattgagtggt 8069888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 292
Target Start/End: Original strand, 19276682 - 19276797
Alignment:
Q  178 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgata-gtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtct 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| || | ||||| ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |    
T  19276682 aaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtggtaccatattgatatttttgaaggatttaaaggttagaacgatgataacaccaaatttgagtggt-t 19276780  T
Q  276 cagcaccataacagagt 292  Q
     |||||||||| |||||    
T  19276781 tagcaccataatagagt 19276797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8883495 - 8883379
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8883495 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 8883398  T
Q  277 agcaccataacagagtggt 295  Q
    | ||||||||  |||||||    
T  8883397 aacaccataattgagtggt 8883379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Original strand, 10586000 - 10586071
Alignment:
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  10586000 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccaaaatagaatggtaac 10586071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 286
Target Start/End: Original strand, 45904355 - 45904414
Alignment:
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataa 286  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45904355 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataa 45904414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 286
Target Start/End: Original strand, 45904811 - 45904870
Alignment:
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataa 286  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45904811 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataa 45904870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3033968 - 3033853
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3033968 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 3033871  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
     || |||||  |||||||    
T  3033870 acatcataattgagtggt 3033853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Original strand, 12971459 - 12971515
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12971459 ttagaatagtagtaagacaatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaac 12971515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Original strand, 17025902 - 17025986
Alignment:
Q  212 taccatattgatagtttggagaacttaaagt-tagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||    
T  17025902 taccatattgatactttagagaacttaaaggctggaatggtgataacaccatatttaagtggtcttagcaccatactagagtggt 17025986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3672911 - 3672795
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3672911 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 3672814  T
Q  277 agcaccataacagagtggt 295  Q
    | || |||||  |||||||    
T  3672813 aacatcataattgagtggt 3672795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3692943 - 3692827
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3692943 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 3692846  T
Q  277 agcaccataacagagtggt 295  Q
    | || |||||  |||||||    
T  3692845 aacatcataattgagtggt 3692827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8888255 - 8888139
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || | | | || |||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8888255 aatggtcgtagcaccatatttgagttgttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 8888158  T
Q  277 agcaccataacagagtggt 295  Q
    | ||||||||  |||||||    
T  8888157 aacaccataattgagtggt 8888139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31002970 - 31002903
Alignment:
Q  231 agaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  31002970 agaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaataccataatagaatggtaac 31002903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 297
Target Start/End: Original strand, 12965699 - 12965754
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaa 297  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||    
T  12965699 ttagaatggtggtaacaccatatttgagttgtctcagttccataatagagtggtaa 12965754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Original strand, 27104268 - 27104314
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccata-tttgagtggtcgtagtaccatattgata 224  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104268 aatggtggtaaaaccataatttgagtggtcgtagtaccatattgata 27104314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28125404 - 28125351
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||    
T  28125404 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtttcaacactataatagagtggt 28125351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 274
Target Start/End: Original strand, 13156223 - 13156259
Alignment:
Q  238 aaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtc 274  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13156223 aaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtc 13156259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 26927348 - 26927604
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26927348 ataatatatgtcccttcagaataaagagtatttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgttccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 26927447  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26927448 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 26927547  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26927548 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcgccataacagagtggtaac 26927604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 39587996 - 39588249
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||    
T  39587996 ataatatatgtcccatcggaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaatgacaatgtcccgtcgaaattaagaatggtcttaacggtata 39588095  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||  || | ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39588096 ta--aatattatttta-tatttttctaattgaggagaaatggtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 39588192  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39588193 ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 39588249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 287
Target Start/End: Original strand, 16649263 - 16649508
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||    
T  16649263 ataatatatgtcccttcagaataaagagtatttttaagatcatagtccttatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgattttaacggtata 16649362  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  16649363 tataaaaagtatttcaatatttttccatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtctcatattgatgttttggagaaattaaag 16649462  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataac 287  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16649463 ttagaatcgtggtaacaccatatttgagtggtttcaacaccataac 16649508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10140549 - 10140308
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatata--aaaagtat 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  10140549 ttcataataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatatataaaaagtat 10140450  T
Q  154 ttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtat 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||      
T  10140449 ttcaatatttttctatgtgaggagaaatggtggtatcacaatatttgaatggtcgtagtggcatattgaagttttggagaaattaaagttagaatggtgg 10140350  T
Q  254 taacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10140349 caacaccatatttgagtggtctcaacaccataacaaagtggt 10140308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25844207 - 25843969
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25844207 ttcaggataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaatagcaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 25844108  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    ||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  25844107 caa-atattt---tttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtgaca 25844012  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25844011 gcatcatatttgagtggtctcaacaccataagagagtggtaac 25843969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 47450855 - 47451108
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  47450855 ataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaatggtata 47450954  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||  || | ||||| | || ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  47450955 ta--aatattatttta-tagttttctaattgaggagaaatgatggtatcgccatatttgagtggttgtaatatcatattgatagtttggagaacttaaag 47451051  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  47451052 ttagaatggagttaatatcatatttgagtggtctcagcgtcataacagagtggtaac 47451108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10135781 - 10135617
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10135781 ttcataataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatataaaaagtattt 10135682  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10135681 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcgccatatttgagtggtcgtagtgccatatt 10135617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16036069 - 16035820
Alignment:
Q  61 aataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaata 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || |||||||  |  ||||||| |||||||||||  |||||||  || | | ||||||||    
T  16036069 aataaagagtacttttaagatcatagtctcttttcggaacaataatgtcccttccgaattaagaatgatcttaatagtatata--aatattctttcaata 16035972  T
Q  161 tttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttaga 246  Q
    |||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16035971 tttttctatttgaggagaaataaaaaatttgaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttaga 16035872  T
Q  247 atggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16035871 atggtgataacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaac 16035820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 185
Target Start/End: Original strand, 51041138 - 51041281
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  51041138 ataatatatgttcctttagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccatcggaattaagaatgatcttaacgatata 51041237  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51041238 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtg 51041281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 19798630 - 19798895
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19798630 ataatataagtcccttcggaataaagagtactatgaagatcatagtccctttttggaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 19798729  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaa--------------tggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtt 227  Q
    ||  || | | |||||||| |||   | |||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19798730 ta--aatattctttcaatacttt---aattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactt 19798824  T
Q  228 tggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19798825 tggagaaattaaagttagaatgggggtaacaccatatttgagttgtctcagcaccataacagagtggtaac 19798895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 207
Target Start/End: Original strand, 33300875 - 33301038
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||| ||    
T  33300875 ataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttgaaataacaatgtcccgtcgaaattaaaaataatcttaa-ggt-ta 33300972  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtc 207  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33300973 tataaaaattatttcaatatatttctatttgaggagaaatggtggtaacaccatatttgagtggtc 33301038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 38621172 - 38620908
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  38621172 ataatataagtcccttcggaataaagattactattaagatcatagtccct-tttgaaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 38621074  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatattttt-ctatttgagga--------------gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagt 226  Q
    ||   ||  | ||||||||||||| |||||||||||              |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  38621073 ta---aatttctttcaatattttttctatttgaggataaattaaaaagtcgaaatgttgttattaccatatttgagtgatcgtagtgccatattgatatt 38620977  T
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  38620976 ttggagaaattaaagttagaatggtgaaaacaccatatttgagtggtcttaacatcataacagagtggt 38620908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 183 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 40166308 - 40166193
Alignment:
Q  183 gtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcacc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  40166308 gtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaatacc 40166209  T
Q  283 ataacagagtggtaac 298  Q
    |||| |||||||||||    
T  40166208 ataagagagtggtaac 40166193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 235 - 298
Target Start/End: Original strand, 51041282 - 51041345
Alignment:
Q  235 cttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51041282 cttaaagttagaatgatattaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaac 51041345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11806667 - 11806597
Alignment:
Q  181 tggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggt 251  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11806667 tggtggtatcactgtatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaacttaaagttataatggt 11806597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 251
Target Start/End: Original strand, 39200527 - 39200601
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggt 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39200527 gaaacggtggtatcaccatatttgagtgatcgtaatgccatattgatactttggagaaattaaagttagaatggt 39200601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33055365 - 33055248
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgta-gtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33055365 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaagtacgatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtgataacaccatatttgagtggtctc 33055267  T
Q  277 agcaccataacagagtggt 295  Q
    | |||||||  ||||||||    
T  33055266 aacaccatagtagagtggt 33055248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 293
Target Start/End: Original strand, 8267606 - 8267713
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcag 278  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |       ||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||     
T  8267606 aatggtcgtagcaccatatttgagtggtcatagtaccatagt-------tggagaagttaaaattagaatggtgataacaacatatttgagtggtctcaa 8267698  T
Q  279 caccataacagagtg 293  Q
    |||||||| ||||||    
T  8267699 caccataatagagtg 8267713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 294
Target Start/End: Original strand, 18784325 - 18784440
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||| |||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  18784325 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttgaagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccagatttgagtggtctca 18784423  T
Q  278 gcaccataacagagtgg 294  Q
      ||||||| |||||||    
T  18784424 ataccataatagagtgg 18784440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 298
Target Start/End: Original strand, 28434399 - 28434456
Alignment:
Q  241 gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28434399 gttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtaac 28434456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 298
Target Start/End: Original strand, 33301018 - 33301062
Alignment:
Q  254 taacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33301018 taacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaac 33301062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3094414 - 3094299
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3094414 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 3094317  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
     || |||||  |||||||    
T  3094316 acatcataattgagtggt 3094299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32626434 - 32626384
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtt 227  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32626434 gaaattgtggtaacaccatatttgagtgattgtagtaccatattgatagtt 32626384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12260246 - 12260205
Alignment:
Q  254 taacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12260246 taacaccatatttgagtggtctcagcacaataatagagtggt 12260205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8138191 - 8138153
Alignment:
Q  259 ccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaa 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8138191 ccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtaa 8138153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 40166454 - 40166322
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| | ||  ||||||| |||||||||||| |  ||    
T  40166454 ataatataagtcccttcggaataaa-agtactattaagatcatagtccct-tttgaaataataatgttccgtctgaattaagaatgatcttaacag--ta 40166359  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat 181  Q
    |||||| | | |||||||||||   || ||||||||||||    
T  40166358 tataaatattctttcaatattt---taattgaggagaaat 40166322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 110
Target Start/End: Original strand, 39200410 - 39200458
Alignment:
Q  61 aataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  39200410 aataaagagtactattaagatcattgtccct-tttggaataataatgtcc 39200458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16833753 - 16833697
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| |||||||    
T  16833753 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtttcaacaccaaaatagaatggtaac 16833697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Original strand, 23192644 - 23192700
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23192644 ttagaatggtggtaacattatattcgagtggtctcaacaccataatagagtggtaac 23192700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36424106 - 36423850
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36424106 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgttccgtcggaattaataatgatcttaagggtata 36424007  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36424006 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 36423907  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36423906 ttagaatggtgttaataccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 36423850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 37248431 - 37248685
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||    
T  37248431 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtata 37248530  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37248531 tataaaaagtatttcaatattttt-tatttgagaagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 37248629  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaa 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37248630 ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaa 37248685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26667741 - 26667485
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26667741 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 26667642  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  26667641 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtggtaccattttggtagtttgtagaacttaaag 26667542  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26667541 ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataac 26667485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26939338 - 26939082
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26939338 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 26939239  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  26939238 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtggtaccattttggtagtttgtagaacttaaag 26939139  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26939138 ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataac 26939082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 29167600 - 29167855
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  29167600 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 29167699  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29167700 tatcaaaagtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatagtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 29167798  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29167799 ttagaatggtgttaacaccatatttgagcggtctcagcaccataacagagtggtaac 29167855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 42 - 277
Target Start/End: Original strand, 37549779 - 37550014
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  37549779 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 37549878  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37549879 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtaccatattgatagtttagagaacttaaag 37549978  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37549979 ttagaatgatattaacaccatatttgagtggtctca 37550014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36429178 - 36428922
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  36429178 ataatatatgtcccttcagaataaagagtatttttaagatcatagtacctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 36429079  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36429078 tataaaaagtattttaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagttgtcgtattaccatattgatagtttggagaacttaaag 36428979  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36428978 ttagaatggtgttaacatcatatttgagtggtctcaacactataacagagtggtaac 36428922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 277
Target Start/End: Original strand, 37652577 - 37652812
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  37652577 ataatatatgtcccttcagaataaagagcacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaataatgatcttaacggtata 37652676  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37652677 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtaccatattgatagtttagagaacttaaag 37652776  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37652777 ttagaatgatattaacaccatatttgagtggtctca 37652812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12103480 - 12103238
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12103480 ttcagaatatagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatatcctgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 12103381  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  12103380 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttaagtagtcgcagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggca 12103281  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12103280 acaccatatttgagtggtctcaataccataacagagtggtaac 12103238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7452209 - 7451970
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7452209 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcaaaattaagaatgatcttaacagtatatataaaaagtattt 7452110  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  7452109 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccgtatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaaagttagaatggtggca 7452010  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7452009 acaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggt 7451970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 61 - 298
Target Start/End: Original strand, 35679521 - 35679758
Alignment:
Q  61 aataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaata 160  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35679521 aataaatagtactattaaaatcatagtccctttttggaataataatgtcgcgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaata 35679620  T
Q  161 tttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacacc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  35679621 tttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggtaacacc 35679720  T
Q  261 atatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  35679721 atatttgagtggtctgaacaccataacagagtggtaac 35679758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 40148364 - 40148108
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||| |||||||||||    
T  40148364 ataatatatgtcccttcagaataaaaagtacttttaagatcattgtccctatttggaataacaatgtctcgtcggaattgagaatgatgttaacggtata 40148265  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  40148264 tgtaaaaaatatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 40148165  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40148164 ttagaatgggggcaacaccatatttaagtggtctcaacaccataacagagtggtaac 40148108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 124 - 298
Target Start/End: Original strand, 10759529 - 10759703
Alignment:
Q  124 aatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10759529 aatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatacttttcaatttgaggagaaaaggtggtatcaccgtatttgagtgctcgtagtgccatattgat 10759628  T
Q  224 agtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10759629 gttttggagaaattaaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaac 10759703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 207
Target Start/End: Original strand, 9726382 - 9726546
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9726382 ataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaaaggtata 9726481  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtc 207  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9726482 ta-aaaaattatttcaatatttttttatttgaggagaaatggtggaatcaccatatttgagtggtc 9726546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 178 - 296
Target Start/End: Original strand, 20180825 - 20180943
Alignment:
Q  178 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  20180825 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatattttggagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctca 20180924  T
Q  278 gcaccataacagagtggta 296  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  20180925 gcaccataacagaatggta 20180943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 16116011 - 16116127
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcag 278  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |     
T  16116011 aatggtggtatcatcatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtttgaagaacttaaaggtagaatggtgataacatcatatttgagtggtcttaa 16116110  T
Q  279 caccataacagagtggt 295  Q
    |||||||| ||||||||    
T  16116111 caccataatagagtggt 16116127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 182 - 295
Target Start/End: Original strand, 15414647 - 15414761
Alignment:
Q  182 ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagca 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||  | ||    
T  15414647 ggtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatattttgaagaacttaaatgttagaatggtgataacaccatattttagtggtcataaca 15414746  T
Q  281 ccataacagagtggt 295  Q
    |||||||||||||||    
T  15414747 ccataacagagtggt 15414761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 290
Target Start/End: Original strand, 34707299 - 34707412
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |     
T  34707299 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggatttagtatcatattgatagttttgagaacttaaagttagaatagtgataacaccatatttgagtgatttt 34707398  T
Q  277 agcaccataacaga 290  Q
    ||||||||||||||    
T  34707399 agcaccataacaga 34707412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 298
Target Start/End: Original strand, 6155181 - 6155301
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaactta--aagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||  || ||| |||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  6155181 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttagaaaattaaaatgttggtaacaccatatttgagtggtctc 6155279  T
Q  277 agcaccataacagagtggtaac 298  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  6155280 aacaccataacagagtggtaac 6155301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 251
Target Start/End: Original strand, 6513544 - 6513761
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||   |||||| ||||||||||| ||||||    
T  6513544 ataatataagtcccttcggaataaagagtgctattaagatcatagtccct-tttggaatat-aatgtcccgtcataattaagaatgatcttaaaggtata 6513641  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtt 227  Q
    ||  || | | |||||||||||||||| ||||||||||||              |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  6513642 ta--aatattctttcaatatttttctaattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatc--catatttgagtggtcgtagtgccatattgatactt 6513737  T
Q  228 tggagaacttaaagttagaatggt 251  Q
    ||||||| | ||||||||||||||    
T  6513738 tggagaaatgaaagttagaatggt 6513761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3666237 - 3666131
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3666237 aatggttgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttagatgttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 3666139  T
Q  278 gcaccata 285  Q
    ||| ||||    
T  3666138 gcatcata 3666131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 294
Target Start/End: Original strand, 12044907 - 12045022
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  12044907 aatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaaaggtggtaacaccatatttgattggtctca 12045005  T
Q  278 gcaccataacagagtgg 294  Q
     |||||||| |||||||    
T  12045006 acaccataatagagtgg 12045022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7086693 - 7086595
Alignment:
Q  176 agaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtc 274  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7086693 agaaatggtggtagcatcatatttgagtgattgtaataccatattgata-tttggagatgttaaaggttagaatggtgataacaccatatttgagtggtc 7086595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 12102637 - 12102712
Alignment:
Q  224 agtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc-agcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  12102637 agtttggagaacttaaagttagaatggtggtaacaccatatttaagtggtctcaaaaaccataacagagtggtaac 12102712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 32461316 - 32461433
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||| ||| |||||||||| || ||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32461316 aatggtcgtaacaccatattttagcggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 32461414  T
Q  277 agcaccataacagagtggt 295  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  32461415 aacaccataatagagtggt 32461433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Original strand, 15414496 - 15414597
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||| ||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  || ||||| || |||||||||||| |||||    
T  15414496 ataatttatgtcccttcaaaataaagagtacttgtaagatcatagttcctttttggaataataatgtctcgtcggaatcaagaatgatcttaacagtata 15414595  T
Q  142 ta 143  Q
    ||    
T  15414596 ta 15414597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 135
Target Start/End: Original strand, 16115875 - 16115955
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtcc-ctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  16115875 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccattttttgaaataataatgtcctgtcagaattaagaatgatcttaac 16115955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 557021 - 556906
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  557021 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 556924  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
     ||||||||  |||||||    
T  556923 acaccataattgagtggt 556906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 561793 - 561678
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  561793 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 561696  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
     ||||||||  |||||||    
T  561695 acaccataattgagtggt 561678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 298
Target Start/End: Original strand, 12501736 - 12501781
Alignment:
Q  253 ttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12501736 ttaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaac 12501781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 296
Target Start/End: Original strand, 13301299 - 13301368
Alignment:
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggta 296  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  13301299 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggta 13301368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41996986 - 41996871
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41996986 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 41996889  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
     ||||||||  |||||||    
T  41996888 acaccataattgagtggt 41996871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 42001755 - 42001640
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42001755 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 42001658  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
     ||||||||  |||||||    
T  42001657 acaccataattgagtggt 42001640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4872191 - 4872135
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4872191 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtaac 4872135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31731821 - 31731750
Alignment:
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  31731821 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaataccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaac 31731750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 298
Target Start/End: Original strand, 6514444 - 6514482
Alignment:
Q  260 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6514444 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 6514482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 298
Target Start/End: Original strand, 9726529 - 9726570
Alignment:
Q  257 caccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9726529 caccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaac 9726570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 36937280 - 36937395
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36937280 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 36937377  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
     || |||||  |||||||    
T  36937378 acatcataattgagtggt 36937395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 36942034 - 36942149
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36942034 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 36942131  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
     || |||||  |||||||    
T  36942132 acatcataattgagtggt 36942149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 286
Target Start/End: Original strand, 1429827 - 1429871
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataa 286  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1429827 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataa 1429871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39518678 - 39518623
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39518678 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccat-atagagtggtaac 39518623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39523317 - 39523262
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39523317 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccat-atagagtggtaac 39523262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 246
Target Start/End: Original strand, 23977359 - 23977425
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttaga 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  23977359 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaagtaccatattgata-tttggagaagttaaaattaga 23977425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 298
Target Start/End: Original strand, 11981118 - 11981162
Alignment:
Q  254 taacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  11981118 taacaccatatttgagtggtctcatcaccacaatagagtggtaac 11981162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 298
Target Start/End: Original strand, 21323810 - 21323854
Alignment:
Q  254 taacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  21323810 taacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaac 21323854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Original strand, 12041772 - 12041814
Alignment:
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  12041772 acaccatatttgagtagtcttagcaccataatagagtggtaac 12041814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9911430 - 9911370
Alignment:
Q  226 tttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccata 285  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9911430 tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacatcatatttgagtggtcttagcaccata 9911370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18344891 - 18344635
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18344891 ataatatatgtcccttcagaataaatagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 18344792  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18344791 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatctgagaggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 18344692  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18344691 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcgccataacagagtggtaac 18344635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Original strand, 1934634 - 1934875
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1934634 ttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 1934733  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1934734 caatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatatgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatga 1934832  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1934833 acaccatatttgagtggtctcagaaccttaacagagtggtaac 1934875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 19892100 - 19892348
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19892100 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaat------gtctagtcggaattaagaatgatcttaacggtata 19892193  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  19892194 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtacc--attgatagtttggagaatttaaag 19892291  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19892292 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtcttagcaccataacagagtggtaac 19892348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 25496952 - 25497207
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||| |||||||||||    
T  25496952 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtacttatttggaataacaatgtcacgtcggaattaagaatgattttaacggtata 25497051  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  25497052 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgaggggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 25497151  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaa 297  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25497152 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaa 25497207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 25477924 - 25478180
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25477924 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtacttatttgaaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 25478023  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  25478024 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 25478123  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25478124 ttagaatggtggtaacatcatatttgagtagtctcaacaccataacagagtggtaac 25478180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Original strand, 9180368 - 9180607
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9180368 ttcaggataaagagtacttttaagatcatagttcctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 9180467  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  9180468 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgctatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggca 9180567  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9180568 acaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggt 9180607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 47 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28603764 - 28603516
Alignment:
Q  47 atatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataa 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  28603764 atatgtcgcttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtatata--a 28603667  T
Q  147 aaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttaga 246  Q
    | | ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28603666 atattatttct-tatttttctaattgaggagaaatggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtaccatattaatagtttggagaacttaaagttaga 28603568  T
Q  247 atggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28603567 atggtgttaacaccatatttaagtggtctcatcaccataacagagtggtaac 28603516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 42 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31327218 - 31326987
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31327218 ataatatatgtcccttcgaaataaaaagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaatggtata 31327119  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  31327118 tataaaaagtatttcaatatgtttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 31327019  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggt 273  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  31327018 ttagaatggtgacaacaccatatttgagtggt 31326987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12797393 - 12797141
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12797393 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcataatccctgtttggaataacaatgtcccgtcagaattaaaaatgatcttaacgatata 12797294  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||      
T  12797293 tataaaaagtgtttcaatatttttctattcgaggagaaatgat-gtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaata 12797195  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    ||||||||||   || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12797194 ttagaatggtggcaataccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggt 12797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 17968590 - 17968751
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17968590 ataatatatgtcccttcaaaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgttggaattaagaatgatcttcacggtata 17968689  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17968690 tataaaaagtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtg 17968751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 187
Target Start/End: Original strand, 9185059 - 9185190
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9185059 ttcaggataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 9185158  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9185159 caatatttttctatttgaggagaaatggtggt 9185190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Original strand, 40847360 - 40847481
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  40847360 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtatcatcttgatagtttggagaacttaaagttagaatggacgtaacatcatatttgagtggtctc 40847459  T
Q  277 agcaccataacagagtggtaac 298  Q
    | |||||| ||| |||||||||    
T  40847460 aacaccattacaaagtggtaac 40847481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 115 - 298
Target Start/End: Original strand, 17544986 - 17545181
Alignment:
Q  115 ggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttg 200  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||  || | | |||||||||||||||||||||||||||||              ||| |||||| ||||||||    
T  17544986 ggaattaagaatgatcttaacagtatata--aatattctttcaatatttttctatttgaggagaaattaaaaagtcgaaaaggtagtatcatcatatttg 17545083  T
Q  201 agtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17545084 agtgttcgtaataccatattgatagtttagagaacttaaagttagaatggtggtaacaccatattttagtggtctcagcaccataacaaagtggtaac 17545181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 295
Target Start/End: Original strand, 9189573 - 9189686
Alignment:
Q  182 ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcac 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9189573 ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacac 9189672  T
Q  282 cataacagagtggt 295  Q
    ||||||||||||||    
T  9189673 cataacagagtggt 9189686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19538711 - 19538595
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |    
T  19538711 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagtaaaaaattagaatggtagtaacaccataatagagtggtctta 19538613  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  19538612 gcaccataatagagtggt 19538595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28855330 - 28855224
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaactt-aaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||    
T  28855330 aatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaagtaccatattgata-ttttgagaagttcaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggttgca 28855232  T
Q  278 gcaccata 285  Q
    ||||||||    
T  28855231 gcaccata 28855224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29678036 - 29677980
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29678036 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaac 29677980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 295
Target Start/End: Original strand, 10160495 - 10160609
Alignment:
Q  181 tggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagc 279  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10160495 tggtcgtaacaccatatttgagtagttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaataccatatttgagtggtctcaac 10160593  T
Q  280 accataacagagtggt 295  Q
    |||| || ||||||||    
T  10160594 accaaaatagagtggt 10160609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35602238 - 35602133
Alignment:
Q  190 caccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataaca 288  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||| |||||  |||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  35602238 caccatatttgagtggttgaaataccatattggta-tttggagaagttaaaaattagaattttggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataata 35602140  T
Q  289 gagtggt 295  Q
    |||||||    
T  35602139 gagtggt 35602133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 251
Target Start/End: Original strand, 19578180 - 19578251
Alignment:
Q  181 tggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggt 251  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19578180 tggttgtatcaccatatttgaatggtcgtagcaccgtattgataatttagagaacttaaatgttagaatggt 19578251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 17453348 - 17453466
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttg-gagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||| |||  ||||  |||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  17453348 aatggtcgtatcaccatatttgagtggttgaaatattatattgatatttttagagatgttaaaaattagaatgatgataacaccatatttgagtggtctc 17453447  T
Q  277 agcaccataacagagtggt 295  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  17453448 aacaccataatagagtggt 17453466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30629181 - 30629074
Alignment:
Q  180 atggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcag 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| || ||| ||||  ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||     
T  30629181 atggtggtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattggta-ttttgagatgttaaatgttacaatggtggtaacaccatatttgagtggtcacaa 30629083  T
Q  279 caccataac 287  Q
     ||||||||    
T  30629082 taccataac 30629074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30651197 - 30651142
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  30651197 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccat-atagagtggtaac 30651142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Original strand, 6297703 - 6297774
Alignment:
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  6297703 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcaacaacataatagaatggtaac 6297774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 134
Target Start/End: Original strand, 40847236 - 40847310
Alignment:
Q  59 agaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaa 134  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| || | |||||| |||||||||||    
T  40847236 agaataaagagtgcttttaatatcatagtccct-tttggaacaataatgtcccgtcgtaattaagaatgatcttaa 40847310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 298
Target Start/End: Original strand, 42926361 - 42926398
Alignment:
Q  261 atatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42926361 atatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaac 42926398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 276
Target Start/End: Original strand, 19094256 - 19094353
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggaga-acttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||| | |||||||| | | ||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||    
T  19094256 aatggtggtagcaccatatttgagtgattgaaataccatattgaca-tttggagatattaaaagttagaatggtggtaacatcatatttaaatggtctc 19094353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30658501 - 30658459
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattg 221  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30658501 aatggtcgtaacaccatatttgagtggtcatagtaccatattg 30658459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 295
Target Start/End: Original strand, 7737689 - 7737730
Alignment:
Q  254 taacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7737689 taacaccatgtttgagtggtctcaacaccataatagagtggt 7737730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30619192 - 30619143
Alignment:
Q  180 atggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  30619192 atggtggtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgatattttg 30619143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30643453 - 30643408
Alignment:
Q  241 gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataa 286  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30643453 gttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcaacaccataa 30643408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 35602254 - 35602222
Alignment:
Q  241 gttagaatggtattaacaccatatttgagtggt 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35602254 gttagaatggttttaacaccatatttgagtggt 35602222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 17964186 - 17964441
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17964186 ataatatatgtccattcaaaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcgcgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 17964285  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17964286 tataaaaagtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 17964384  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17964385 ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 17964441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Original strand, 6407502 - 6407743
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6407502 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 6407601  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6407602 caatattttt-tatttgaggagaaatgatggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccgtattgatagtttggaaaacttaaagttagaatggtatta 6407700  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6407701 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 6407743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 25314083 - 25314339
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccc--tatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggta 139  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  25314083 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggta 25314182  T
Q  140 tatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaa 239  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25314183 ta--taaaaagtatttcaacatttttctatttgaggagaaatagtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaa 25314280  T
Q  240 agttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25314281 agttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaac 25314339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 26201577 - 26201833
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccc--tatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggta 139  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  26201577 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggta 26201676  T
Q  140 tatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaa 239  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26201677 ta--taaaaagtatttcaacatttttctatttgaggagaaatagtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaa 26201774  T
Q  240 agttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26201775 agttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaac 26201833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 295
Target Start/End: Original strand, 11559847 - 11560100
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||     
T  11559847 ataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccatcggaattaagaatgatcttaacagtatt 11559946  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||    
T  11559947 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatctaagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaactaaag 11560046  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11560047 ttagaatggtgacaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggt 11560100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 295
Target Start/End: Original strand, 11534337 - 11534590
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||| ||||     
T  11534337 ataatatatgtcccttaggaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccatcgaaattaagaatgatcttaacagtatt 11534436  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||  |||||||||  |||||    
T  11534437 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatataagtggtcatagtgccatattgatgttttggagaaactaaag 11534536  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11534537 ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggt 11534590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12689441 - 12689184
Alignment:
Q  41 aataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtat 140  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||   |||||||||||||||||    
T  12689441 aataatatatgtctcttcagaataaatagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgttctccctttatttggaatgatcttaacggtat 12689342  T
Q  141 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||||  ||||||||| |||||    
T  12689341 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtaccatcatatttgagtggtcatagtgtcatattgatgttttggagaaattaaa 12689242  T
Q  241 gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12689241 gttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaac 12689184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Original strand, 16835799 - 16836039
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagag--tacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtat 153  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  16835799 ttcagaataaagagagtacttttaaggtcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatataaaaa-tat 16835897  T
Q  154 ttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtat 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||      
T  16835898 ttcaatatttttctatttaaggagaaattgtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattaatgttttggagaagttaaagttagaatggtgg 16835997  T
Q  254 taacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16835998 caacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagtgtggt 16836039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 82 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11428436 - 11428222
Alignment:
Q  82 catagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11428436 catagtccctatttggaataacaatgttccgtcagaattaagaatgatcttaacggtatata--aaaattatttcaatatttttctatttgaggagaaat 11428339  T
Q  182 ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcac 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  11428338 ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaatgaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacac 11428239  T
Q  282 cataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||    
T  11428238 cataacagagtggtaac 11428222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 295
Target Start/End: Original strand, 11570375 - 11570628
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||||||||| ||||     
T  11570375 ataatatatgtcccttcggattaaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtccc-tcagaattaagaatgatcttaacagtatt 11570473  T
Q  142 tataaaaa-gtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa 240  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||  ||||||||| |||||    
T  11570474 tataaaaaagtatgtcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtaatgacatattgatgttttggagaaattaaa 11570573  T
Q  241 gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11570574 gttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtcttaacaccataacagagtggt 11570628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 298
Target Start/End: Original strand, 12405987 - 12406235
Alignment:
Q  61 aataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaata 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || | |||||| ||||| |||||| |||||||  || | | ||||||||    
T  12405987 aataaagagtatttttaagatcatagtccct-tttggaacaataatgtcccgtcgaaattaagaatgagcttaacagtatata--aatattctttcaata 12406083  T
Q  161 tttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttaga 246  Q
    |||||||| ||||||||||||              ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12406084 tttttctaattgaggagaaattaaaatgtcaaaatggtagtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaaattaaagttaaa 12406183  T
Q  247 atggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    || ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12406184 atagtggtaacatcatatttgagtggtatcagcaccataacagagtggtaac 12406235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 298
Target Start/End: Original strand, 4156983 - 4157251
Alignment:
Q  41 aataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtat 140  Q
    ||||||||| |||  ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||    
T  4156983 aataatataagtcccttcggaataaagagtattattaagatcataatccctttttagaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaatgggat 4157082  T
Q  141 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga-----------gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttg 229  Q
    ||||||| | | ||||||||||||  |    ||| |           ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||    
T  4157083 atataaatattctttcaatattttaattgaagagaaattaaaaagtggaaatggtgatatcaccatatttgagtggtggtagtatcatattgatgttttg 4157182  T
Q  230 gagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4157183 gagaaattaaagtttgaatggtggtgacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagcggtaac 4157251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Original strand, 33687277 - 33687430
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | |           |    
T  33687277 ataatatatgttccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaaaggt-----------a 33687365  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggt 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33687366 tataaaaattatttcaatatttttctacttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggt 33687430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5856341 - 5856220
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  5856341 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtaatgccatattgatactttggaaaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctt 5856242  T
Q  277 agcaccataacagagtggtaac 298  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  5856241 aacaccataatagagtggtaac 5856220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Original strand, 19995164 - 19995285
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||| ||||||    
T  19995164 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatattttggagaacttaaagttagaatgatggtaacaccgtagttgaggggtctc 19995263  T
Q  277 agcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |  ||||||||| |||||||||    
T  19995264 ataaccataacaaagtggtaac 19995285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 187 - 298
Target Start/End: Original strand, 29892032 - 29892143
Alignment:
Q  187 tatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataa 286  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  29892032 tatcactatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaaattaaatttagaatggtggtaacaccatatttgagtgctcttagtaccataa 29892131  T
Q  287 cagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||    
T  29892132 cagagtggtaac 29892143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 278
Target Start/End: Original strand, 22694956 - 22695185
Alignment:
Q  60 gaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| || | |||||| |||||||||||| ||||| |  || | | |||||||    
T  22694956 gaataaagagtacttttaagatcatagtccct-tttgaaacaataatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacagtataga--aatattctttcaat 22695052  T
Q  160 atttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttag 245  Q
    ||||||||| || |||||||||              ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22695053 atttttctaattaaggagaaattaaaaagtcgaattggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtatcatgttgatagtttggagaacttaaagttag 22695152  T
Q  246 aatggtattaacaccatatttgagtggtctcag 278  Q
    ||||||  | ||||||||||  |||||| ||||    
T  22695153 aatggtggtgacaccatattaaagtggtttcag 22695185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 298
Target Start/End: Original strand, 2699742 - 2699989
Alignment:
Q  60 gaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaat 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||| | | |||||||    
T  2699742 gaataaagagtactattaagatcatagtcccttttcgaaataataatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaacg--atatataaatattctttcaat 2699839  T
Q  160 atttttctatttgaggaga--------------aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttag 245  Q
    |||||   | |||||||||              ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| || || ||||||||||    
T  2699840 atttt---aattgaggagatattaaaaagtggaaatggcgatatcaccatatttgaatggtcgtagtgtcatattgatattttagaaaaattaaagttag 2699936  T
Q  246 aatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2699937 aatggtggcaacaccgtatttgagtggtctcagcaccataacatagtggtaac 2699989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 177 - 297
Target Start/End: Original strand, 11613527 - 11613646
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||     
T  11613527 gaaatggtggtatcaccataattgagtggtcgtagg-ctatattgatattttggagaactcaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagaggtctt 11613625  T
Q  277 agcaccataacagagtggtaa 297  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  11613626 agcaccataatagagtggtaa 11613646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17913910 - 17913810
Alignment:
Q  191 accatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacaga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |       ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17913910 accatatttgagtggtcgtagtatcatagt-------tggagaacttaaagttagaatggtaataacactatatttaagtggtctcaacaccataacaga 17913818  T
Q  291 gtggtaac 298  Q
    ||||||||    
T  17913817 gtggtaac 17913810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8748108 - 8747993
Alignment:
Q  180 atggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaa-cttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcag 278  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||     
T  8748108 atggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagatgctaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgaatggtctcaa 8748010  T
Q  279 caccataacagagtggt 295  Q
    ||||||||  |||||||    
T  8748009 caccataattgagtggt 8747993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 298
Target Start/End: Original strand, 6112724 - 6112842
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| || | | ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  6112724 aatggtcgtagcactatatttgaatgcttgaagtaccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtgataacaccatatttgagtggtctta 6112822  T
Q  278 gcaccataacagagtggtaac 298  Q
     || ||||| |||||||||||    
T  6112823 aca-cataatagagtggtaac 6112842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22609841 - 22609794
Alignment:
Q  239 aagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataa 286  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22609841 aagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataa 22609794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 295
Target Start/End: Original strand, 33687430 - 33687482
Alignment:
Q  243 tagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33687430 tagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcggcaccataacagagtggt 33687482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 2863229 - 2863345
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| | | |  |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||    
T  2863229 aatggtgataacaccatatttgagtggttgaaatttcatattgata-tttggagatgttaaaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtcaca 2863327  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
      ||||||  ||||||||    
T  2863328 ataccatagtagagtggt 2863345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14509241 - 14509197
Alignment:
Q  254 taacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  14509241 taacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtgataac 14509197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 134
Target Start/End: Original strand, 19995025 - 19995115
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaa 134  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||  |||  ||||||| |||||||||||    
T  19995025 ataatgtatgtcccttcagaataaagagtac-tttaggatcatagtccct-tttggaacaataatgttttgtacgaattaagaatgatcttaa 19995115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 15951181 - 15951437
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15951181 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgttccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 15951280  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15951281 tataaaaagtatttcaatatttttctatttaaggagaaacagtggtatcactatatttgagtggtcgtagtaccaaattgatagtttggagaacttaaag 15951380  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951381 ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 15951437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 46 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36684044 - 36683792
Alignment:
Q  46 tatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatata 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36684044 tatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcataattaagaatgatcttaacggtatatata 36683945  T
Q  146 aaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  36683944 aaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatcttttggagaaattaaagttag 36683845  T
Q  246 aatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||   || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36683844 aatggtggcaagaccatatttgagtggtctcaacaccataacatagtggtaac 36683792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 44925550 - 44925806
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||| ||||| |||||    
T  44925550 ataatatatgtcccttcagaataaatagtacttttaagatcatagtccctatttggattaacaatgtcccgtcggaaataagaatgattttaacagtata 44925649  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  44925650 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 44925749  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44925750 ttagaatggtggtaaaaccatatttgagtggtctcgacaccataacagagtggtaac 44925806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 57 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33417001 - 33416767
Alignment:
Q  57 tcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaa-tgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33417001 tcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaaatgtcccgtcgaaattaagaatgattttaacggtatatataaaaagtattt 33416902  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  33416901 caatatttttctatttaaggataaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggta 33416802  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacaga 290  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33416801 acatcatatttgagtggtctcaacaccataacaga 33416767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 56 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1807901 - 1807685
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1807901 ttcagaataaagattacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtaaaaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 1807802  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||   |    
T  1807801 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtcgttgt-gtgccatattgatgttttggataaattaaagttagaatggtggca 1807703  T
Q  256 acaccatatttgagtggt 273  Q
    |||||||| | |||||||    
T  1807702 acaccataatagagtggt 1807685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 285
Target Start/End: Original strand, 18876018 - 18876258
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18876018 ataatataagtcccttcggaataaagagtaatattaagatcatagtccct-tttggaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacgctata 18876116  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||  || | | ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  18876117 ta--aatattctttcaatttttttctatttgagcagaaattgtggtatcgccatatttgagtggttgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 18876214  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccata 285  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18876215 ttagaatggtggcaacaacatatttgagtggtctcaacaccata 18876258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 23548245 - 23548512
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||| ||||||| |||  |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||    
T  23548245 ataatgtatgtcgcttcgtaataaagaatacttttaagattatagtccct-tttggaacaataatgtcttgtcggaattaagaatgatcttaacagttta 23548343  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaa--------------tggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtt 227  Q
    ||  || | | |||||||| |||||||||||||||||||              ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||| |     
T  23548344 ta--aatattctttcaatagttttctatttgaggagaaattaaaaagtcgaaatggtggtatcatcatatttgagtggtcatagtgcgatattgatatta 23548441  T
Q  228 tggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23548442 tggagaacttaaagttcgaatggtggtaacaccatatttgagtgatctcaacaccataacagagtggtaac 23548512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 38181873 - 38182138
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  38181873 ataatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccttttttggaataataatgtcccgtcggaattaaaaatgatcttaacggtata 38181972  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtt 227  Q
    ||  || | | ||||| |||||    | ||||||||||||              ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  38181973 ta--aatattctttcattattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaatggtgagatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactt 38182067  T
Q  228 tggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38182068 tggagaaattaaagtttgaatagtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaac 38182138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Original strand, 28559427 - 28559547
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28559427 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttggagaa-ttaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 28559525  T
Q  277 agcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  28559526 agcaccataagagagtggtaac 28559547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 298
Target Start/End: Original strand, 1910604 - 1910851
Alignment:
Q  61 aataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaata 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||  || | | ||||||||    
T  1910604 aataaagagtactattaagatcatagtcccttttttgaataataatgtcccgtcggaattaagaatgaccttaacggtatata--aatattctttcaata 1910701  T
Q  161 tttttct---------atttga--ggagaaatggtggta-tcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaat 248  Q
    ||||  |         |||| |  |  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  1910702 ttttaatcgaggagaaatttaaaagtggaaatggtggtaataaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatactttggagaaattaaagtcagaat 1910801  T
Q  249 ggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1910802 ggtggtaacatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 1910851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Original strand, 28564582 - 28564702
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28564582 gaaatagtggtatcagcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaa-ttaaagttaaaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 28564680  T
Q  277 agcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  28564681 agcaccataagagagtggtaac 28564702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Original strand, 28572205 - 28572325
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28572205 gaaatagtggtatcagcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaa-ttaaagttaaaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 28572303  T
Q  277 agcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  28572304 agcaccataagagagtggtaac 28572325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19167112 - 19166847
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19167112 ataatataagtcccttcggaataaagagtactattaagatcatagtccctttttgaaataataatgttctgccggaaataagaatgatcttaacggtata 19167013  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtt 227  Q
    ||  || | | |||||||| |||   | ||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  19167012 ta--aatattctttcaatacttt---aattgaggagaaattaaaaagaagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtaatgccatattg-tagtt 19166919  T
Q  228 t-ggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    | |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19166918 ttggagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatatgagtggtctcaacaccataatagagtggtaac 19166847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2965964 - 2965843
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  2965964 gaaatggtggtatcaccatatttgagtgggcgtagtaccatatcgatagattagagaacttaacgttaaaatggtggtaacatcatatttgagtagtctc 2965865  T
Q  277 agcaccataacagagtggtaac 298  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  2965864 aacaccataacagagtggtaac 2965843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17020672 - 17020563
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  17020672 gaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcatagtgccatattgatactttgaagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatgtttgagtggtctc 17020573  T
Q  277 agcaccataa 286  Q
    ||| ||||||    
T  17020572 agcgccataa 17020563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17551109 - 17551000
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  17551109 gaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcatagtgccatattgatactttgaagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatgtttgagtggtctc 17551010  T
Q  277 agcaccataa 286  Q
    ||| ||||||    
T  17551009 agcgccataa 17551000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 283
Target Start/End: Original strand, 24673097 - 24673202
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| |    
T  24673097 aatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtaccatattgttattttgaagaacttaaaggttggaatggtgataacatcatatttgagtggtctta 24673196  T
Q  278 gcacca 283  Q
    ||||||    
T  24673197 gcacca 24673202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26779564 - 26779317
Alignment:
Q  61 aataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaata 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  || |||||||| |||||||||||  || ||||  || | | ||||||||    
T  26779564 aataaaaagtacttttaagatcatagtccct-tttggaaaaataatgtctcgtcggaattaagaatgatcttaaaagtttata--aatattctttcaata 26779468  T
Q  161 tttttctatttgaggagaaatg----------------gtggtatcaccatatttgagtggtc--gtagtaccatattgatagtttgg-agaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||| ||||                 |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||| | |||| ||||||    
T  26779467 tttttctatttgaggaaaaattaaaaaatcaaaatggtgtggtatcaccatatttgagtggtcccgtagtgccatattaatatttttgcagaagttaaag 26779368  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtg 293  Q
    ||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26779367 ttaaaatggtgt-agcaccatatttgagtggtctcagcaacataacagagtg 26779317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 293
Target Start/End: Original strand, 22714777 - 22714885
Alignment:
Q  186 gtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccat 284  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| || ||| ||||||||    
T  22714777 gtatcatcatatttgagtgatcgtaataccatattgatatattgaagaagttaaatgttagaatggtcataacatcatatttgaatgatcttagcaccat 22714876  T
Q  285 aacagagtg 293  Q
    || ||||||    
T  22714877 aaaagagtg 22714885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17020802 - 17020715
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatata 143  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| | |   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17020802 ttcaaaataaagagtactattaagatcattgtccctttttggaataataatgttccgccagaattaagaatgatcttaacggtatata 17020715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17026204 - 17026149
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaa 297  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17026204 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaa 17026149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17551239 - 17551152
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatata 143  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| | |   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17551239 ttcaaaataaagagtactattaagatcattgtccctttttggaataataatgttccgccagaattaagaatgatcttaacggtatata 17551152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17556696 - 17556641
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaa 297  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17556696 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaa 17556641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Original strand, 25367797 - 25367868
Alignment:
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  25367797 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaac 25367868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 43302456 - 43302575
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttga---gtggtc 274  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||   ||||||    
T  43302456 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtggtc 43302554  T
Q  275 tcagcaccataacagagtggt 295  Q
    ||| |||||||| ||||||||    
T  43302555 tcaacaccataatagagtggt 43302575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24090876 - 24090835
Alignment:
Q  257 caccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24090876 caccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 24090835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Original strand, 34818487 - 34818587
Alignment:
Q  191 accatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacaga 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |       ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  34818487 accatatttgagtggtcatagtaccatagt-------tggagaagttaaagttagaatggtggtagcaccatatttgagtggtcacaacaccataataga 34818579  T
Q  291 gtggtaac 298  Q
     |||||||    
T  34818580 atggtaac 34818587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17793797 - 17793697
Alignment:
Q  178 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| |||| || |||||| ||||| ||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||    
T  17793797 aaatggtggtataaccatatttgaatggttgcagtaccatatcgatatttaggagaagttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagaggtctc 17793698  T
Q  277 a 277  Q
    |    
T  17793697 a 17793697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 295
Target Start/End: Original strand, 31449633 - 31449750
Alignment:
Q  178 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtct 275  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31449633 aaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtct 31449730  T
Q  276 cagcaccataacagagtggt 295  Q
    || ||||||||  |||||||    
T  31449731 caacaccataattgagtggt 31449750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Original strand, 8331174 - 8331245
Alignment:
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||    
T  8331174 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcttaccaccataatagaatggtaac 8331245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 4238110 - 4238225
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4238110 aatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 4238207  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
     || |||||  |||||||    
T  4238208 acatcataattgagtggt 4238225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 4242849 - 4242964
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4242849 aatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 4242946  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
     || |||||  |||||||    
T  4242947 acatcataattgagtggt 4242964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14035764 - 14035669
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtc 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  14035764 aatggtggtagcaccatatttgagcggttgaaataccatattgata-tttggagatgttaaatgttagaatggtggtgacatcatatttgagtggtc 14035669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Original strand, 40125712 - 40125767
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40125712 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccat-atagagtggtaac 40125767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 133
Target Start/End: Original strand, 22714641 - 22714712
Alignment:
Q  62 ataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatctta 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||  | | |||||| ||||||||||    
T  22714641 ataaagagtacttttaagatcatactccctttttggaataataatatcccatcgaaattaagaatgatctta 22714712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37771989 - 37771918
Alignment:
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  37771989 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaatatcatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaac 37771918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 134
Target Start/End: Original strand, 28564461 - 28564527
Alignment:
Q  68 agtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaa 134  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||||||||    
T  28564461 agtactattaagatcatagttcctttttggaataataatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaa 28564527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 15875447 - 15875563
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaactt-aaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || | | ||||||||||| | |||| |||  || ||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  15875447 aatggtggtggcaccatatttgagtagttgaaataccatattgaca-tttgaagatgttaaaagttagagtggtggtaacaccatatttgaatggtctca 15875545  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
    | ||||||| ||| ||||    
T  15875546 gtaccataatagaatggt 15875563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27415836 - 27415788
Alignment:
Q  176 agaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgata 224  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27415836 agaaatagtggtagcaccatatttgagtggttgtagtatcatattgata 27415788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2966101 - 2966022
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaac 135  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| || || ||||||| || | |||||| |||||| |||||    
T  2966101 ttcagaataaaaagtatttttaagatcatagtccttttttgaaacaataatgtcccgtcgaaattaagaatgattttaac 2966022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17793926 - 17793852
Alignment:
Q  59 agaataaagagtacttttaagatcatagtccctattt-ggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatctt 132  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| |  ||| ||| |||||||||    
T  17793926 agaataaaaagtacttttaagatcatagtccatttttaggaataataatgtcctttcagaactaagaatgatctt 17793852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24090889 - 24090859
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24090889 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtc 24090859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5884301 - 5884256
Alignment:
Q  176 agaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattg 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  5884301 agaaatggtggtaacaccatatttgagtggatgtagtaccgtattg 5884256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18260299 - 18260199
Alignment:
Q  48 tatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctattt--ggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatata 145  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||| | |||   |||||| |||||||  | |||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  18260299 tatgtcctttcggaataaaaaatacttttaagatcatagtccattttttatgaataataatgtcccttcggaattaagaatgatctcaatagtatatata 18260200  T
Q  146 a 146  Q
    |    
T  18260199 a 18260199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 134
Target Start/End: Original strand, 24672953 - 24673042
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaa 134  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||| |||||||||  ||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  24672953 ataatatatgtcccttcagaataaagagtatttttaagacc--agt-cctttttggaatagtaatgtccagtcggaattaagaatgatgttaa 24673042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8694181 - 8693924
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8694181 ataatatatgtccctttagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaatagcaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 8694082  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtg--gtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaa 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8694081 tataaaaagtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtgtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaa 8693983  T
Q  240 agttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8693982 agttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagaaccataacagagtggtaac 8693924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Original strand, 37264205 - 37264446
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37264205 ttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 37264304  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37264305 caatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtgtta 37264403  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37264404 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 37264446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 5927845 - 5928101
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  5927845 ataatatatgtcccttcaaaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtata 5927944  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||     
T  5927945 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtggtaccattttgatagtttgaaaaacttaaaa 5928044  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5928045 ttagaacggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 5928101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19107077 - 19106821
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19107077 ataatatatgtctcttcggaataaagagtacttttaagatcatagcccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaaaaatgatcttaacggtata 19106978  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  19106977 tataaaaaatatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 19106878  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19106877 ttagaatggtggcaacaccatatttgagtgttctcaacaccataacagagtggtaac 19106821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31269480 - 31269247
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31269480 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacgatatatataaaaagtattt 31269381  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  31269380 caatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtatcatattgatagtttggagaacttaaagttagaat------- 31269289  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31269288 -caccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 31269247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Original strand, 5271063 - 5271302
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5271063 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatataaaaagtattt 5271162  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  5271163 caatatttttctatttgtggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaaagttagaatggtggca 5271262  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5271263 acaccatatttgagtggtctgaacaccataacagagtggt 5271302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19102446 - 19102190
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  19102446 ataatatatgtccattcgaaataaagagtacttttaagatcattgtccctatttggaataacaatgtcctgtcgaaattaagaatgatcttaacggtata 19102347  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  19102346 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaacggtggtatcaccatatttgagtggtcgtatggccatattgatgttttggagaaattaaag 19102247  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19102246 ttagaatggtggcaacatcatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaac 19102190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Original strand, 31729031 - 31729270
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  31729031 ttcagaataaaaagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttatcagtatatataaaaagtatat 31729130  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  31729131 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaaagttagaatggttgca 31729230  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31729231 acaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggt 31729270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 61 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13059857 - 13059622
Alignment:
Q  61 aataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaata 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  13059857 aataaagagtacttttaagatcatagtccctatttagaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata--aaaattatttcaata 13059760  T
Q  161 tttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacacc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||    
T  13059759 tttttctatttgaggagaaatggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttagaatggtgacaacacc 13059660  T
Q  261 atatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13059659 atatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaac 13059622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31273969 - 31273737
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31273969 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacgatatatataaaaagtattt 31273870  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatg--gtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtat 253  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  31273869 caatattttt-tatttgaggagaaatggtgtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaat----- 31273776  T
Q  254 taacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31273775 ---caccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 31273737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Original strand, 37259505 - 37259759
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacgg-------------tatat 142  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||             |||||    
T  37259505 ttcagaataaagaatatttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggatgatcttaacggtatat 37259604  T
Q  143 ataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37259605 ataaaaagtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagt 37259703  T
Q  243 tagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37259704 tagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 37259759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 51698371 - 51698132
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51698371 ttcagaataatgagtacttttaagatcgtagtccctatttggaataacaatgtcccgccggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 51698272  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||  ||    
T  51698271 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtgtcatattgatgttttggagaaattaaagttaggatggtggta 51698172  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  51698171 aaaccatatttgagtggtctcaacaccctaacagagtggt 51698132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31766339 - 31766153
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31766339 ataatatatgtcccttcagaataaaaagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 31766240  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttgg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31766239 tataaaaagtatttcaatatttt--tatttgaggaaaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttgg 31766153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 115 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 47244644 - 47244461
Alignment:
Q  115 ggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtac 214  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |      
T  47244644 ggaattaagaatgatcttaacgatatatataaaaagtattttaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtaatgt 47244545  T
Q  215 catattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47244544 catattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaac 47244461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 169 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31766152 - 31766023
Alignment:
Q  169 tttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttga 268  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31766152 tttgaggaaaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttga 31766053  T
Q  269 gtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31766052 gtggtctcagcaccataatagagtggtaac 31766023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16421488 - 16421242
Alignment:
Q  60 gaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaat 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  || | | |||| ||    
T  16421488 gaataaagagtactattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata--aatattctttcgat 16421391  T
Q  160 atttttctatttgaggagaaat-------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttaga 246  Q
    |||||   | ||||||||||||             ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16421390 atttt---aattgaggagaaattaaaagtggaaatggtcgtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaga 16421294  T
Q  247 atggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16421293 atggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataac 16421242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 19540809 - 19541043
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||| |||||||||  ||    
T  19540809 ataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgctccgttggatttaagaatggtcttaacgg--ta 19540906  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||                   || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19540907 tataaatattattt-aatatttttctaattgaggagaaatg-------------------gtagtcgtaataccatattgatagtttggagaacttaaag 19540986  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19540987 ttagaatagtgttaacaccatatttgagtggtctcaacaccatagcagagtggtaac 19541043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6943248 - 6942987
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6943248 ataatatatgtccattcggaataaatagtatttttaagatcatagtccct-tttggaataataatgtcgcgtcggaattaagaatgatcttaatggtata 6943150  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtt 227  Q
    ||  || | | |||||||||||||||| || || ||||||              |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6943149 ta--aatattctttcaatatttttctaattaagaagaaattaaaaagtcaaaatggtgatatcaccatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtt 6943052  T
Q  228 tggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagt 292  Q
    | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6943051 ttgagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtagtctcagcaccataacagagt 6942987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 12823519 - 12823783
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||    
T  12823519 ataatataagtcctttcggaataaagagtattattaagatcatagaccct-tttggaataataatgttccgtcggaattaagaatgatcttaacagtata 12823617  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga-----------gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttgg 230  Q
    ||  || | | ||||||||||||  |   |||| |           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  12823618 ta--aatattctttcaatattttaattgatgagaaatttaaaagttgaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttgg 12823715  T
Q  231 agaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12823716 agaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 12823783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Original strand, 32081893 - 32082014
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32081893 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 32081992  T
Q  277 agcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  32081993 agcaccataatagagcggtaac 32082014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 178 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15134486 - 15134371
Alignment:
Q  178 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  15134486 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcctagtggcatattgatattttggagaacttaaatgttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctt 15134387  T
Q  277 agcaccataacagagt 292  Q
    | |||||||| |||||    
T  15134386 aacaccataatagagt 15134371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 290
Target Start/End: Original strand, 13065578 - 13065690
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  13065578 gaaattgtgttatcaccatatttgagtggtcgtagtgttatattgatattttg-agaacttaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtagtatc 13065676  T
Q  277 agcaccataacaga 290  Q
    ||||| ||||||||    
T  13065677 agcactataacaga 13065690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 47574984 - 47574868
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  47574984 aatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 47574886  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
     |||||||| ||||||||    
T  47574885 acaccataatagagtggt 47574868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 31298157 - 31298273
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaactt-aaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  31298157 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaagtaccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaaaaccatatttgagtggtctca 31298255  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
     |||||||  ||||||||    
T  31298256 acaccatagtagagtggt 31298273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 13521756 - 13521873
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  13521756 aatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaacatatttgagtggtctc 13521854  T
Q  277 agcaccataacagagtggt 295  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  13521855 aacaccataatagagtggt 13521873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 40408535 - 40408414
Alignment:
Q  178 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  || |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||    
T  40408535 aaatggtggtatcatcgtatttgaattatcatagggtcatattgatattttggagaacttaaagttagaatggtggtggcaccatatttgagtggtccca 40408436  T
Q  278 gcaccat-aacagagtggtaac 298  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  40408435 gcaccataaacagagtgctaac 40408414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 55252130 - 55252029
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  55252130 ataatataagtcccttcggaataaagaatactattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcccgtcagaattaagaatgattttaacggtata 55252031  T
Q  142 ta 143  Q
    ||    
T  55252030 ta 55252029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 277
Target Start/End: Original strand, 39217184 - 39217272
Alignment:
Q  190 caccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagtt-agaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  39217184 caccatatttgaatggtcgtagtaccatattgatattttggagaagttaaaattcagaatgatcgaaacaccatatttgagtggtctca 39217272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4551305 - 4551233
Alignment:
Q  178 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  4551305 aaatggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtgccacattgatattttggacaacttaaaggttagaatg 4551233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 55251976 - 55251932
Alignment:
Q  254 taacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55251976 taacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 55251932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Original strand, 7902923 - 7902994
Alignment:
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  7902923 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaac 7902994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34560704 - 34560633
Alignment:
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  34560704 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaac 34560633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 277
Target Start/End: Original strand, 52690891 - 52690990
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||||    
T  52690891 aatggtggtagcatcgtatttgagtggtcgtagtaccatatcgatattttggaaaagttaaatgttagaatgatgataacacaataattgagtggtctca 52690990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39319893 - 39319784
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcag 278  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |       ||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  39319893 aatggtagtaacaccatatttgagtggtcatagtaccataat-------tggagaagttaaaattaaaatggtggtaacaccatatttgagtgttctcag 39319801  T
Q  279 caccataacagagtggt 295  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  39319800 caccataatagaatggt 39319784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41817109 - 41816992
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcag 278  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| |||||  | ||||| |  ||||| ||||||| | ||||||||     
T  41817109 aatggttgtagcaccatatttgagtggttgaagtaccatattgata-cttggagaagttaaaaattgaatgatggtaacatcatattttaatggtctcaa 41817011  T
Q  279 caccataacagagtggtaa 297  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  41817010 caccataatagagtggtaa 41816992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23093434 - 23093317
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||   ||||||| |    
T  23093434 aatggtggtatcaccattttttagcggtcgcagtgtcatattgatattttagagaacttaaaggttagaatgatgataacactatattctggtggtctta 23093335  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  23093334 gcaccataatagagtggt 23093317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 32081755 - 32081835
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaa 123  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  32081755 ataatataagtcccttcggaataaagagtactattaagatcatagtccct-tttggaataataatgtcccgtcggaattaaa 32081835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Original strand, 8030302 - 8030358
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8030302 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtaac 8030358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 286
Target Start/End: Original strand, 3997874 - 3997933
Alignment:
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataa 286  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3997874 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataa 3997933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 42758514 - 42758630
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| | | | ||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  42758514 aatggtggtagcgccatatttgagtgattgaaataccatattgaca-tttggagatgttaaaagttagaatggtggtaacaccatatttaaatggtctca 42758612  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
    | ||||||| ||| ||||    
T  42758613 gtaccataatagaatggt 42758630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Original strand, 48276475 - 48276531
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  48276475 ttagaatggtggtaacaccatattcgagtggtctcaacaccataatagagtggtaac 48276531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 297
Target Start/End: Original strand, 33463182 - 33463237
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaa 297  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  33463182 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagttgtaa 33463237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2820120 - 2820045
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagttt--ggagaacttaaa-gttagaatggt 251  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  2820120 aatggtggtaaacccatatttgagtggttgtagtaccatatagatattttgcggagaacttaaatgttagaatggt 2820045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19906519 - 19906463
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  19906519 ttagaatggtgatagcaccatatttgagtgatctcggcaccataatagagtggtaac 19906463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16954632 - 16954593
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccata 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16954632 aatggtggtagcaccatatttgagtggtcatagtaccata 16954593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12878495 - 12878454
Alignment:
Q  254 taacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  12878495 taacaccatatttgagtgttctcaacaccataactgagtggt 12878454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39319898 - 39319865
Alignment:
Q  241 gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtc 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39319898 gttagaatggtagtaacaccatatttgagtggtc 39319865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 41 - 298
Target Start/End: Original strand, 42626216 - 42626473
Alignment:
Q  41 aataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtat 140  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  42626216 aataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatattccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtat 42626315  T
Q  141 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  42626316 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtgccatattaatgttttggagaaattaaa 42626415  T
Q  241 gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42626416 gttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaac 42626473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26341675 - 26341412
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26341675 ataatatatgtcccttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 26341576  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatat-ttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26341575 tataaaaagtatttcaatattttttttatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcggagtaccatattgatagtttggagaacttaaa 26341476  T
Q  241 gttagaatggtattaacacc------atatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26341475 gttagaatgatattaacaccatattgatatttgagtggtctcagcatcataacagagtggtaac 26341412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 47 - 298
Target Start/End: Original strand, 44422766 - 44423019
Alignment:
Q  47 atatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataa 146  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44422766 atatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggactaacaatgtcctgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataa 44422865  T
Q  147 aa--agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagtta 244  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  44422866 aaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccacattgatgttttggagaaattaaagtta 44422965  T
Q  245 gaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||| ||   |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  44422966 gaattgtgacaacaccatatttgattggtttcaacaccataacagagtggtaac 44423019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8268760 - 8268507
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8268760 ataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtctcgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 8268661  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||  || | |||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8268660 ta--aatattatt-ctatatttttctaattgaggagatatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtaccatatagatagtttggagaacttaaag 8268564  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8268563 ttagaatggtgttaacaacatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaac 8268507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 60 - 298
Target Start/End: Original strand, 13313879 - 13314119
Alignment:
Q  60 gaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  13313879 gaataaagagtacttttaagatcatagaccctatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtatataaaaaaattattttaat 13313978  T
Q  160 atttttctatttgaggagaaatg--gtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaac 257  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||    
T  13313979 atttttctatttgaggagaaatggtgtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaatagtggtaac 13314078  T
Q  258 accatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13314079 acaatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaac 13314119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4930676 - 4930446
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4930676 ttcaggataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 4930577  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtatta 255  Q
                |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  4930576 ------------atttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtgccatattaatgttttggagaaattaaagttagaatggtgaca 4930489  T
Q  256 acaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4930488 gcaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaac 4930446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 89 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12799840 - 12799623
Alignment:
Q  89 cctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggta 188  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12799840 cctatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaatggtatatataaaaagtatttcaatgtttttctatttgaggagaaatggtggta 12799741  T
Q  189 tcaccatatttgagtggtcgtagtacc--------atattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagca 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||        ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  12799740 tcaccatatttgagtggtcgtagtgccatagtgctatattgatattttggagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaaca 12799641  T
Q  281 ccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||| |||||||||    
T  12799640 ccataacaaagtggtaac 12799623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27238576 - 27238455
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27238576 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaaattacaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 27238477  T
Q  277 agcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  27238476 agcaccataacaaagtggtaac 27238455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 178 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3045888 - 3045768
Alignment:
Q  178 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3045888 aaatggtagtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttagaaaacttaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 3045789  T
Q  278 gcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3045788 gcaccataacagagtggtaac 3045768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Original strand, 10387997 - 10388249
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||   | |||||| | ||||||||||||||||||||  || | | |||    
T  10387997 ttcagaataaaaagtacttttaagaatatagtccct-tttggaacaataatgtctcatcggaattgagaatgatcttaacggtatata--aatattcttt 10388093  T
Q  156 caatatttttctatttgaggagaaa--------------tggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    ||||||||||||| |||||||||||              |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10388094 caatatttttctaattgaggagaaattaaaaagtcgaaatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtgccatattgatattttggagaaattaaag 10388193  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||| | | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10388194 ttaaagttgtggtaacacca-atttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaac 10388249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30258434 - 30258313
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30258434 gaaatggtggtattatcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttaaagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 30258335  T
Q  277 agcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  30258334 agcaccataacatagtggtaac 30258313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 277
Target Start/End: Original strand, 3356857 - 3356957
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  3356857 gaaatggtggtatcaccatatttgattggtcgtagtaccgtattgatagtttggagaacttacagttagaattgtgataacaccatatttgagtggtctc 3356956  T
Q  277 a 277  Q
    |    
T  3356957 a 3356957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21671528 - 21671421
Alignment:
Q  178 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||||    
T  21671528 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttggaaaaattaaagttataatggtggtaacaccatatttgagttatctca 21671429  T
Q  278 gcaccata 285  Q
     |||||||    
T  21671428 acaccata 21671421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 194 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15642495 - 15642393
Alignment:
Q  194 atatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||    
T  15642495 atatttgagtggtcgtagtaccatcttgatattttggagaacttaaaggttagaatggtgataataccatatctgaatggtcttagcaccataagagagt 15642396  T
Q  293 ggt 295  Q
    |||    
T  15642395 ggt 15642393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 298
Target Start/End: Original strand, 13142683 - 13142783
Alignment:
Q  198 ttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaa 297  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13142683 ttgagtgatcgtagttccatattgatattttgtagaacttgaagaaagaatggtggtaacaccatatttaagtggtctcagcaccataacaaagtggtaa 13142782  T
Q  298 c 298  Q
    |    
T  13142783 c 13142783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 298
Target Start/End: Original strand, 44510440 - 44510559
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44510440 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 44510538  T
Q  278 gcaccataacagagtggtaac 298  Q
     || ||||||||| |||||||    
T  44510539 acaacataacagaatggtaac 44510559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19640624 - 19640510
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  19640624 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaagtatcatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatattttagtggtctca 19640526  T
Q  278 gcaccataacagagtg 293  Q
    ||||||||| ||||||    
T  19640525 gcaccataatagagtg 19640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 9650731 - 9650848
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  9650731 aatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctc 9650829  T
Q  277 agcaccataacagagtggt 295  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  9650830 aacaccataatagagtggt 9650848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3880264 - 3880208
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3880264 ttagaatggtgataacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaac 3880208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3025733 - 3025666
Alignment:
Q  205 gtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtgg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||    
T  3025733 gtcgtagtaccatattgatagttttgagaacttaaagttagaatgacggtaacaccatattttagtgg 3025666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23866394 - 23866279
Alignment:
Q  180 atggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaactt--aaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  23866394 atggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatattt-agtggtctca 23866297  T
Q  278 gcaccataacagagtggt 295  Q
     ||| |||| ||||||||    
T  23866296 acacaataatagagtggt 23866279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27256520 - 27256450
Alignment:
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaa 297  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  27256520 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaa 27256450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8076358 - 8076255
Alignment:
Q  193 catatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacaga 290  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  8076358 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaacggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccgtaataga 8076260  T
Q  291 gtggt 295  Q
    |||||    
T  8076259 gtggt 8076255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30258567 - 30258466
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    |||||||| |||  |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || | |||||| |||||||||||| |||||    
T  30258567 ataatataagtcccttcaaaatcaagggtactattaagatcatagtccctttttgaaataataatgtcccgtcgaaattaataatgatcttaactgtata 30258468  T
Q  142 ta 143  Q
    ||    
T  30258467 ta 30258466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 298
Target Start/End: Original strand, 3357470 - 3357513
Alignment:
Q  255 aacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3357470 aacactatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 3357513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21671646 - 21671573
Alignment:
Q  60 gaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| | || |||||||| |||||||||||    
T  21671646 gaataaagagtacttttaagatcatggtccct-tttgaaataataatgttccgtcggaattaagaatgatcttaa 21671573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15642558 - 15642506
Alignment:
Q  189 tcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15642558 tcaccatatttgagtggttgtagtactatattaatattttggagaacttaaag 15642506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23319169 - 23319115
Alignment:
Q  184 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaactta 238  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  23319169 tggtatcactatgtttgagtggtcgtagtaccatattgacatttaggagaactta 23319115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23319243 - 23319181
Alignment:
Q  178 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||| |||||||| ||||||    
T  23319243 aaatggtggtatcaccatatttgagcggttgtagtacaataacgatattttggagatcttaaa 23319181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15973085 - 15973037
Alignment:
Q  176 agaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgata 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  15973085 agaaatggtggtaacaccatatttgagtgattgtagtaccatgttgata 15973037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Original strand, 40865185 - 40865241
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||    
T  40865185 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcttaacaccataatagaatggtaac 40865241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27238690 - 27238586
Alignment:
Q  75 ttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgag 174  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||| ||| |   || |||| ||| ||||||||||| ||||||||  || | | |||||||||||||||| |||||    
T  27238690 ttaagaccatagtccctttttgaaataataatatttcgtcggaagtaagaatgatcttaaaggtatata--aatattctttcaatatttttctaattgag 27238593  T
Q  175 gagaaat 181  Q
    |||||||    
T  27238592 gagaaat 27238586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 26286975 - 26287027
Alignment:
Q  245 gaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  26286975 gaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca-cacgataatagagtggtaac 26287027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2628970 - 2628926
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgat 223  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2628970 aatggtggcagcaccgtatttgagtggttgtagtaccatattgat 2628926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3284978 - 3284942
Alignment:
Q  261 atatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaa 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3284978 atatttgattggtctcagcaccataacagagtagtaa 3284942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 42 - 295
Target Start/End: Original strand, 443572 - 443825
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  443572 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaaaatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgttggaattaagaatgatcttaacggtaca 443671  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  443672 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 443771  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    ||||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  443772 ttagaatggtggaaacaccatattttagtggtctcaacaccataatagagtggt 443825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4342 - 4287
Alignment:
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4342 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccat-atagagtggtaac 4287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 150765 - 150729
Alignment:
Q  238 aaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtc 274  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  150765 aaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtc 150729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7573 - 7317
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7573 ataatatatgtctcttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaacggtata 7474  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  7473 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatgttttggagaaattaaag 7374  T
Q  242 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||   ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7373 ttagaatggtggcaacacaatatttaagtggtatcaacaccataacagagtggtaac 7317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25921 - 25657
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25921 ataatataagtcccttcggaataaagagtgctattaagatcatagtccctttttggaataataatgtctcgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 25822  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtt 227  Q
    ||  || | | ||||||||||||   | ||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  25821 ta--aatattctttcaatatttt---aattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatactt 25727  T
Q  228 tggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaa 297  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25726 tggagaaattaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagaaccataacagagtggtaa 25657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29497 - 29372
Alignment:
Q  177 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttgg----agaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtgg 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29497 gaaatggtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtgcaatattgatattttggttagagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtgg 29398  T
Q  273 tctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  29397 tctcagaaccataacagagtggtaac 29372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 29640 - 29521
Alignment:
Q  42 ataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggtata 141  Q
    |||||||| |||  ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || | |||||| |||||||||||| |  ||    
T  29640 ataatataagtcccttcggaatgaagagt-ctattaagatcatagtccctttttggaataataatgtctcgtcgaaattaagaatgatcttaacag--ta 29544  T
Q  142 tataaaaagtatttcaatatttt 164  Q
    |||||| | | ||||||||||||    
T  29543 tataaatattctttcaatatttt 29521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5766 - 5508
Alignment:
Q  40 gaataatatatgtcgtttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggta 139  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||| |||    
T  5766 gaataatttatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccat-tttggaataaaaatgtctcattggaattaagaatgatcttaacagta 5668  T
Q  140 tatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatag 225  Q
    ||||  || | | |||||||||||| | ||||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||     
T  5667 tata--aatattctttcaatatttt-cgatttgaggagaaattaaaaaatcgaagtggtgttatcaccatatttgagtggtcatagtaccataaagataa 5571  T
Q  226 tttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataaca 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5570 tttggagaacttaaagtaagaatagtggtaacaccatatttgagtggtatcagcaccataaca 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Original strand, 148034 - 148288
Alignment:
Q  56 ttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaacggta-tatataaaaagtatt 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||  |   |||||| ||||||||||   ||| |||||||| | | ||    
T  148034 ttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctttttgaaa-aataatgtcccatcaaaattaagaatgatctta---gtagtatataaatattctt 148129  T
Q  155 tcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaactt-aa 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |              |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  148130 taaatatttttctatttgaggagaatttaaaaagtcgaaaaggtggtttcaccatattagagtggttgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa 148229  T
Q  240 agttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||    
T  148230 agttagaatggtggtaacactatatttgagtggtctcaacatcataatagagtgataac 148288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 298
Target Start/End: Original strand, 9650 - 9769
Alignment:
Q  179 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9650 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 9747  T
Q  277 agcaccataacagagtggtaac 298  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  9748 aacaccataacagagtggtaac 9769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 295
Target Start/End: Original strand, 146192 - 146309
Alignment:
Q  178 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctc 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  146192 aaatggtggtagcaccatatttgagtggttgtactaccttattgaca-tttggagatgttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgaatggtctc 146290  T
Q  277 agcaccataacagagtggt 295  Q
    || ||||||| ||| ||||    
T  146291 agtaccataatagaatggt 146309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 83357 - 83274
Alignment:
Q  212 taccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggt 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  83357 taccatattgata-tttggagatgttaaaaattagaatggtagtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggt 83274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 46062 - 45991
Alignment:
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  46062 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaac 45991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42262 - 42183
Alignment:
Q  200 gagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcag 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  42262 gagtggtcgtagtacaatattgatattttggagaagttaaaggttagaatggtgagaacaccatacttgagtggtctcag 42183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Original strand, 152725 - 152796
Alignment:
Q  227 ttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  152725 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaac 152796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4259 - 4186
Alignment:
Q  226 tttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaac 298  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4259 tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagtaccataatagagtggtaac 4186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3080 - 3002
Alignment:
Q  200 gagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctca 277  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||   |||||| || |||||||||||||    
T  3080 gagtggtcgtagtacaatattgatattttggagaagttaaaggttagaatggtgagaacaccgtacttgagtggtctca 3002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 13670 - 13601
Alignment:
Q  66 agagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcctgttggaattaaaaatgatcttaac 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||  | || ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  13670 agagtatttttaagatcatagtccctttttgataaaataatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaac 13601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 286
Target Start/End: Original strand, 47692 - 47733
Alignment:
Q  245 gaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataa 286  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47692 gaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataa 47733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University