View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1111_high_121 (Length: 299)

Name: NF1111_high_121
Description: NF1111
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1111_high_121
NF1111_high_121
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (8-172)||(13133219-13133383)
chr7 (1-172)||(15096347-15096518)
chr7 (1-152)||(13133049-13133200)
chr7 (8-171)||(15139348-15139512)
chr7 (8-155)||(14219692-14219839)
chr7 (8-172)||(19557987-19558151)
chr7 (8-134)||(1489925-1490051)
chr7 (1-155)||(16077540-16077694)
chr7 (8-174)||(22000922-22001089)
chr7 (50-152)||(48809211-48809313)
chr7 (1-171)||(8135784-8135954)
chr7 (63-139)||(14929021-14929097)
chr7 (63-139)||(15352487-15352563)
chr7 (60-134)||(14258676-14258750)
chr7 (60-134)||(16460586-16460660)
chr7 (60-134)||(16579984-16580058)
chr7 (60-134)||(16585605-16585679)
chr7 (60-134)||(20487767-20487841)
chr7 (60-134)||(32301506-32301580)
chr7 (18-159)||(11053866-11054008)
chr7 (45-157)||(4070988-4071100)
chr7 (11-48)||(14219835-14219872)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (1-172)||(11192156-11192327)
chr3 (8-172)||(11562651-11562815)
chr3 (9-157)||(11562843-11562994)
chr3 (7-134)||(19569023-19569150)
chr3 (1-146)||(6155852-6155998)
chr3 (1-134)||(11192346-11192479)
chr3 (8-134)||(17046434-17046560)
chr3 (8-134)||(17691459-17691585)
chr3 (8-134)||(54876137-54876263)
chr3 (1-125)||(14441433-14441557)
chr3 (8-134)||(17685497-17685623)
chr3 (1-152)||(17258907-17259058)
chr3 (28-134)||(6155998-6156104)
chr3 (13-134)||(9511819-9511940)
chr3 (13-134)||(9519794-9519915)
chr3 (45-157)||(13179404-13179517)
chr3 (63-139)||(13519570-13519646)
chr3 (60-134)||(14671148-14671222)
chr3 (60-134)||(14682647-14682721)
chr3 (63-139)||(42353362-42353438)
chr3 (60-134)||(12470126-12470200)
chr3 (60-134)||(18700127-18700201)
chr3 (64-134)||(43889453-43889523)
chr3 (15-157)||(20417311-20417454)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (8-172)||(36727987-36728151)
chr8 (14-172)||(31723461-31723619)
chr8 (1-156)||(31723287-31723442)
chr8 (1-174)||(22318615-22318788)
chr8 (8-134)||(5760805-5760931)
chr8 (1-152)||(45471140-45471291)
chr8 (8-152)||(20024965-20025108)
chr8 (7-172)||(36727816-36727962)
chr8 (15-157)||(17907645-17907788)
chr8 (60-134)||(21346053-21346127)
chr8 (63-139)||(6102441-6102517)
chr8 (15-138)||(20084327-20084448)
chr8 (60-134)||(23914248-23914322)
chr8 (15-105)||(23947433-23947523)
[»] scaffold1186 (2 HSPs)
scaffold1186 (1-172)||(786-957)
scaffold1186 (1-134)||(976-1109)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-172)||(187311-187482)
scaffold0005 (1-134)||(187159-187292)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (1-172)||(14629901-14630072)
chr4 (11-171)||(9638046-9638206)
chr4 (13-172)||(16026750-16026909)
chr4 (8-124)||(16026620-16026736)
chr4 (8-134)||(53631127-53631253)
chr4 (1-134)||(14630091-14630224)
chr4 (15-139)||(3485151-3485274)
chr4 (12-134)||(13036431-13036552)
chr4 (77-139)||(19734587-19734649)
chr4 (15-105)||(2584939-2585030)
chr4 (15-157)||(21061759-21061902)
chr4 (75-134)||(33243950-33244009)
chr4 (17-104)||(20899489-20899577)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (8-172)||(25141312-25141476)
chr2 (8-172)||(25141122-25141286)
chr2 (1-172)||(22259191-22259362)
chr2 (2-172)||(3538959-3539130)
chr2 (15-172)||(44071724-44071881)
chr2 (18-172)||(27851814-27851968)
chr2 (15-159)||(27860517-27860661)
chr2 (60-134)||(9784906-9784980)
chr2 (113-157)||(10897216-10897260)
chr2 (75-134)||(23069104-23069163)
chr2 (1-42)||(10897388-10897429)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (1-172)||(23491977-23492148)
chr6 (1-172)||(23497575-23497746)
chr6 (1-134)||(19655883-19656016)
chr6 (7-134)||(23491825-23491952)
chr6 (7-134)||(23497423-23497550)
chr6 (38-160)||(23500883-23501005)
chr6 (1-172)||(6083450-6083619)
chr6 (15-172)||(22212168-22212327)
chr6 (60-134)||(15705265-15705339)
chr6 (8-134)||(28947617-28947742)
chr6 (60-134)||(19773363-19773437)
chr6 (15-172)||(31735584-31735742)
chr6 (63-139)||(23655665-23655741)
chr6 (63-134)||(22806160-22806231)
chr6 (90-139)||(23655732-23655781)
chr6 (17-104)||(19444011-19444099)
[»] scaffold0241 (4 HSPs)
scaffold0241 (11-172)||(1620-1781)
scaffold0241 (11-172)||(4773-4934)
scaffold0241 (8-124)||(4960-5076)
scaffold0241 (1-124)||(1800-1923)
[»] chr5 (9 HSPs)
chr5 (1-172)||(20565629-20565800)
chr5 (2-172)||(21618702-21618872)
chr5 (8-124)||(20565826-20565942)
chr5 (32-172)||(29914524-29914664)
chr5 (15-139)||(32608053-32608176)
chr5 (75-139)||(36509505-36509569)
chr5 (45-157)||(20469802-20469915)
chr5 (90-139)||(32608013-32608062)
chr5 (90-139)||(36509465-36509514)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (11-172)||(7572-7733)
scaffold0529 (9-122)||(7761-7874)
[»] scaffold1695 (1 HSPs)
scaffold1695 (8-172)||(588-752)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (1-134)||(15240-15373)
scaffold0061 (1-134)||(24298-24431)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (15-172)||(20686-20843)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (8-161)||(136290-136443)
[»] scaffold0520 (1 HSPs)
scaffold0520 (8-171)||(122-285)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (12-134)||(1121-1243)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (9-134)||(3692-3817)
scaffold0439 (63-139)||(11447-11523)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (13-161)||(3761-3909)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (8-174)||(3907-4074)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (8-156)||(16830-16978)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (15-158)||(66244-66387)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (8-134)||(168709-168835)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (18-172)||(13302023-13302177)
chr1 (2-134)||(21239949-21240082)
chr1 (15-139)||(14238301-14238424)
chr1 (15-139)||(38887816-38887939)
chr1 (15-139)||(7052744-7052867)
chr1 (63-139)||(51082503-51082579)
chr1 (44-135)||(51323583-51323674)
chr1 (90-139)||(38887776-38887825)
chr1 (17-105)||(52983380-52983469)
chr1 (15-105)||(18275148-18275239)
chr1 (88-145)||(7321491-7321548)
chr1 (90-134)||(20588033-20588077)
chr1 (90-134)||(20592571-20592615)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-126)||(34494-34619)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (8-125)||(25788-25905)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (9-128)||(78296-78414)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (45-157)||(127471-127584)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (15-139)||(33590-33713)
scaffold0077 (36-171)||(14327-14462)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (60-134)||(5980-6054)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (12-134)||(39376-39497)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (15-139)||(15198-15321)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (63-139)||(22345-22421)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (63-139)||(29445-29521)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (60-134)||(6837-6911)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (60-134)||(20976-21050)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (63-128)||(29897-29962)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (50-139)||(146008-146096)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (15-139)||(7215-7338)
scaffold0546 (63-139)||(11082-11158)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (63-139)||(666-742)
scaffold0109 (15-139)||(5969-6092)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (60-134)||(21392-21466)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (110-159)||(4202-4251)
scaffold0628 (110-159)||(8762-8811)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (75-127)||(507-559)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (75-139)||(10618-10682)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (45-149)||(109428-109532)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (75-134)||(3609-3668)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (51-105)||(2661-2716)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (15-105)||(34119-34210)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (60-134)||(13319-13393)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (60-134)||(120234-120308)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (88-145)||(388-445)
[»] scaffold0645 (1 HSPs)
scaffold0645 (8-48)||(4-44)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13133383 - 13133219
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  13133383 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 13133284  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13133283 tctcaaattattcagcaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 13133219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15096518 - 15096347
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15096518 atgacagcaacaataacaacttgcaacataacaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 15096419  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||||  | ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15096418 atatgtatctcaaattatccaacaacaacattcatattaattcaaactcactgaaagacaatacaattataa 15096347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 13133200 - 13133049
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||    
T  13133200 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttatataccatacaatattcacataat 13133101  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcact 152  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13133100 atatgtatctcaaattattcaacaacgatattcatattaattcagactcact 13133049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 171
Target Start/End: Original strand, 15139348 - 15139512
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||      
T  15139348 caacaataacaacttgcaacataacaacattaacactaacaacttgattgatataaacaacaatatttctatatcatacaatgttcacataatatatgta 15139447  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaata-ttcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattata 171  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15139448 tctcaaattatccaacaacaatatttcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattata 15139512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14219839 - 14219692
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  14219839 caacaataacaacttgcaacataacaacaccaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatacttctatatcatacaatattcacataatatatgta 14219740  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaa 155  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14219739 tctcaaattatccaacaacaacattcatattaattcagactcactgaa 14219692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19558151 - 19557987
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  19558151 caacaataacaacttgcaacataacaacatcaataacaacaacttgaatgatatgaacaactatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 19558052  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||  |||| | ||||||||    
T  19558051 tctcaaattatccaacaacaacattcatattaatttagactcacggaacaacaatataattataa 19557987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1490051 - 1489925
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  1490051 caacaataacaacttgcatcataacaatattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 1489952  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1489951 tatcaaattatccaacaaagatattca 1489925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 16077540 - 16077694
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||  | || | |||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  16077540 atgacagcagcaataacaacttgcaacatggcgacttcaacaacagcaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 16077639  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaa 155  Q
    | |||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  16077640 acatgtatttcaaattatccaacaacaacattcatattaattcaaactcactgaa 16077694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22001089 - 22000922
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | | ||||  ||||||||||||||||||      
T  22001089 caactataacaacttgcaacttaacatcgttaacaacaaaaacttgaatgatatgaacaacaatatttccacaacatataatattcacataatatatgta 22000990  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcat-ataaattcagactcactgaaagacaacacaattataagc 174  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22000989 ttccaaattatccaacaacagtattcataataattacagactcactgtaaggcaacacaattataagc 22000922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 48809313 - 48809211
Alignment:
Q  50 cttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactc 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  48809313 cttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacatcatatatgtgtctcaaattacccaacatcaatattcatattaattcagactc 48809214  T
Q  150 act 152  Q
    |||    
T  48809213 act 48809211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 8135954 - 8135784
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| | || ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||  | || | ||| | || | ||||||||    
T  8135954 atgacagcaactataacaacttgcaacttaacatcgttgacaacaacaacttgaataatatgaataacaataaatatacaacatgcaatctccacataat 8135855  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattata 171  Q
    |  ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  8135854 aggtgtatttcaatttatccaacaacaatattcatattaattcatactcactgtaagacaatacaattata 8135784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14929097 - 14929021
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14929097 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattcacataa 14929021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15352563 - 15352487
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15352563 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattcacataa 15352487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 14258676 - 14258750
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  14258676 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 14258750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16460660 - 16460586
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  16460660 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 16460586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 16579984 - 16580058
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  16579984 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 16580058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16585679 - 16585605
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  16585679 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 16585605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 20487767 - 20487841
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  20487767 atgaacaacattatgtctatatcttacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 20487841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 32301506 - 32301580
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  32301506 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaatatattca 32301580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Original strand, 11053866 - 11054008
Alignment:
Q  18 aacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaatt 116  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||    |||||||    
T  11053866 aacttgcaatatagcaacattaataataacaacttgaatgatataaacaacaatattttctatatcatacattttccacataatatatgtagctcaaatt 11053965  T
Q  117 attcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagac 159  Q
    |  |||||||| || |||||| | || ||| |||||| |||||    
T  11053966 aaccaacaacattagtcatattagtttagattcactggaagac 11054008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Original strand, 4070988 - 4071100
Alignment:
Q  45 aacagcttgaatgata-tgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattc 143  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || | | |||||||||||  | ||||||||  |||||||| || |||| | |||||    
T  4070988 aacaacttgaatgataatgaacatcaatatctctat-tcatacaatttcctcataatatatgtatctcaaattaaccaacaacattaatcattttaattc 4071086  T
Q  144 agactcactgaaag 157  Q
    |||||| |||||||    
T  4071087 agactctctgaaag 4071100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 14219872 - 14219835
Alignment:
Q  11 caataacaacttgcatcataacaacattaacagcaaca 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14219872 caataacaacttgcatcataacaacatgaacaacaaca 14219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 11192156 - 11192327
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11192156 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaataatatttctatatcatacaatattcacataat 11192255  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11192256 atatgtatctcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaataaaattataa 11192327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 11562651 - 11562815
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  11562651 caacaataaaaccttgcatcataacaacattaacaacaacaatttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 11562750  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11562751 tctctaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 11562815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 157
Target Start/End: Original strand, 11562843 - 11562994
Alignment:
Q  9 aacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagc---ttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11562843 aacaataacaacttgcatcataacaacattaacaacaacaacaacttgaatgatatgaataacaatatttctatatcattcaatattcacataatatatg 11562942  T
Q  106 actttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaag 157  Q
      | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11562943 tatctcaaattagtcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaag 11562994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19569150 - 19569023
Alignment:
Q  7 gcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  19569150 gcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaataacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgt 19569051  T
Q  107 ctttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
     | ||||||||||||||||  |||||||    
T  19569050 atctcaaattattcaacaaagatattca 19569023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 6155852 - 6155998
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacag-caacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataa 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  6155852 atgacagcaacaataacaacttgcaacttaacaacattaacaatcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataa 6155951  T
Q  100 tatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcaga 146  Q
     |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6155952 catatgtatctcaaattattcaacaacaatattcatattaattcaga 6155998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 11192346 - 11192479
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11192346 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 11192445  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    | |||  | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  11192446 aaatgtatctcaaattatccaacaaagatattca 11192479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Original strand, 17046434 - 17046560
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  17046434 caacaataacaacttgcatcataacaatattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 17046533  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  17046534 tctcaaattatccaacaaagatattca 17046560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17691585 - 17691459
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  17691585 caacaataacaacttgcatcataacaatattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 17691486  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  17691485 tatcaaattatccaacaaagatattca 17691459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 54876263 - 54876137
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  54876263 caacaataacaacttgcatcataacaatattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 54876164  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  54876163 tctcaaattatccaacaaagatattca 54876137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 14441433 - 14441557
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14441433 atgacagcaataataacaacttgcatcataacaatattaacagcaacaacttgaatgacatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 14441532  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaa 125  Q
    |||||  | ||||||||| ||||||    
T  14441533 atatgtatctcaaattatccaacaa 14441557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17685623 - 17685497
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  17685623 caacaataacaacttggatcataacaatattaacaacaacaacttgaatgctatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 17685524  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||||    
T  17685523 tttctaattatccaacaaagatattca 17685497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 17259058 - 17258907
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||| |||||| |||||| | |||| |||||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17259058 atgacagcagcaataaaaacttgtagcatagcaacattaatcacaataacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 17258959  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcact 152  Q
    | |||  | | |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17258958 acatgtatcttaaattatctaacatcaatattcatattaattcagactcact 17258907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Original strand, 6155998 - 6156104
Alignment:
Q  28 ataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||      
T  6155998 ataacaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaacatttctatatcatacaatattcacataacatatgtatctcaaattattcaacaaag 6156097  T
Q  128 atattca 134  Q
    |||||||    
T  6156098 atattca 6156104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9511940 - 9511819
Alignment:
Q  13 ataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttca 112  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  9511940 ataacaacttgcaacttaacatcgttaacaacatcaacttgaatgatatgaacaacaatatttctacaacataccatattcacataatatatgtatttca 9511841  T
Q  113 aattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||| ||||||  |||||||    
T  9511840 aattatccaacaaagatattca 9511819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9519915 - 9519794
Alignment:
Q  13 ataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttca 112  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  9519915 ataacaacttgcaacttaacatcgttaacaacatcaacttgaatgatatgaacaacaatatttctacaacataccatattcacataatatatgtatttca 9519816  T
Q  113 aattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||| ||||||  |||||||    
T  9519815 aattatccaacaaagatattca 9519794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Original strand, 13179404 - 13179517
Alignment:
Q  45 aacagcttgaatgatatgaacaacaatatgt-ctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattc 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||    ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||     
T  13179404 aacaacttgaatgatatgaacaacaatattttctatatcatacatttttcacataatatatgtagctcaaattaaccaacaacaataatcatattaattt 13179503  T
Q  144 agactcactgaaag 157  Q
    ||||||||||||||    
T  13179504 agactcactgaaag 13179517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Original strand, 13519570 - 13519646
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13519570 aacaacattatttctatatcatacgatattcacataatatatgtacctcaaattattcaacaacaacattcatataa 13519646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 14671148 - 14671222
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  14671148 atgaacaacattatgtctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 14671222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 14682647 - 14682721
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  14682647 atgaacaacattatgtctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 14682721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 42353438 - 42353362
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42353438 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattcacataa 42353362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 12470126 - 12470200
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  12470126 atgaacaacattatatctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 12470200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18700201 - 18700127
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  18700201 atgaacaacattacttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 18700127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 43889523 - 43889453
Alignment:
Q  64 acaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  43889523 acaacattatttctaaatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 43889453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Original strand, 20417311 - 20417454
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatat-gtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaa 113  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||  | | |||||||||||||    ||||    
T  20417311 aacaacttgcaacatatcaatattaataataacaacttgaatgatataaacaacaatatcttttatatcatacattttccacataatatatgtagctcaa 20417410  T
Q  114 attattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaag 157  Q
    ||||  |||||||| || |||||| | || ||| ||||||||||    
T  20417411 attaaccaacaacattaatcatattagtttagattcactgaaag 20417454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 36728151 - 36727987
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  36728151 caacaatagcaacttgcatcataacaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 36728052  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36728051 tctcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactaaaagacaatacaattataa 36727987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31723619 - 31723461
Alignment:
Q  14 taacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||    
T  31723619 taacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcagataatatatgtatctcaa 31723520  T
Q  114 attattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31723519 attattcaacaacaatattcatattaattcatactcactgaaagacaatacaattataa 31723461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31723442 - 31723287
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31723442 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 31723343  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaa 156  Q
    |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31723342 atatgtatctcaaattatttaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaa 31723287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22318788 - 22318615
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||    
T  22318788 atgacagcaacaatatcaacttgcaacataacaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatatccacgtaat 22318689  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataagc 174  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22318688 atatgtatctcaaattatccaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataagc 22318615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Original strand, 5760805 - 5760931
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  5760805 caacaataacaacttgcatcataacaatattaaccacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 5760904  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  5760905 tctcaaattatccaacaaagatattca 5760931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 45471291 - 45471140
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  45471291 atgacagcaacaataacaactcgcaatatagcaacattaatcacaataacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 45471192  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcact 152  Q
    |||||  | ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45471191 atatgtatctcaaattatccaacatcaatatttatattaattcagactcact 45471140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20025108 - 20024965
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||   ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||      
T  20025108 caacaataacaacttgcaacatagcaacattaatcacattaacttgaatgatatgaacaacaatatttctata-catacaatattcacataatatatgta 20025010  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcact 152  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20025009 tctcaaattatccaacatcaatattcatattaattcagactcact 20024965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 36727962 - 36727816
Alignment:
Q  7 gcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||     
T  36727962 gcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaata-------------------tcacataatatatgt 36727882  T
Q  107 ctttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  36727881 atctcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagactatacatttataa 36727816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17907788 - 17907645
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaa 113  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |  | || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||||     
T  17907788 aacaacttgcaacatagcaacattaataatatcaacttgaatgatatgaacaacaatattttctatatcatactttttccacataatatatgtatttcac 17907689  T
Q  114 attattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaag 157  Q
    ||||  |||||||| || |||| | |||| ||| ||||||||||    
T  17907688 attaaccaacaacattaatcattttaatttagattcactgaaag 17907645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21346127 - 21346053
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  21346127 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 21346053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 6102517 - 6102441
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  6102517 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaataacaacattcacataa 6102441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20084448 - 20084327
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  |||  ||||| || ||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    |||||    
T  20084448 aacaacttgaatcataacaacattaataataaccacttga-tggtat-aacaacattatttttatatcatacaatattcacataatatatgtacctcaaa 20084351  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatata 138  Q
    ||||||||||| || |||||||||    
T  20084350 ttattcaacaagaacattcatata 20084327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 23914248 - 23914322
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  23914248 atgaacaacattatttctatatcatacaacattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 23914322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Original strand, 23947433 - 23947523
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatatg 105  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  23947433 aacaacttgcaacatagcaacattaataataacaacttgaatgatataaacaataatattttctatatcatac-atttccacataatatatg 23947523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 786 - 957
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  786 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacaggaacaacttgaatgatataaacaataatatttctatatcatacaatattcacataat 885  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  886 atatgtatctcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacatttataa 957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 976 - 1109
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  | |||||||||||    
T  976 atgacagcaacaataacaacttgcaacataacaacatcaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctacaacatataacattcacataat 1075  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  1076 atatgtatttcaaattatccaacaaagatattca 1109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 187482 - 187311
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  187482 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacaggaacaacttgaatgatataaacaataatatttctatatcatacaatattcacataat 187383  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  187382 atatgtatctcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacatttataa 187311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 187292 - 187159
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  | |||||||||||    
T  187292 atgacagcaacaataacaacttgcaacataacaacatcaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctacaacatataacattcacataat 187193  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  187192 atatgtatttcaaattatccaacaaagatattca 187159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 14629901 - 14630072
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14629901 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacaggaacaacttgaatgatataaacaataatatttctatatcatacaatattcacataat 14630000  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14630001 atatgtatctcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacatttataa 14630072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 9638046 - 9638206
Alignment:
Q  11 caataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgacttt 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |    
T  9638046 caataacaatttgcatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatct 9638145  T
Q  111 caaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattata 171  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9638146 caaattattcaacaacaacattcatattaattcagactcattgaaagacaatacaattata 9638206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16026909 - 16026750
Alignment:
Q  13 ataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||    
T  16026909 ataacaacttgcatcataacaacattaacaatagcaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcacacaatattcacataatatatgtatctca 16026810  T
Q  113 aattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16026809 aattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaaggcaatacaattataa 16026750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16026736 - 16026620
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  16026736 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaatttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 16026637  T
Q  108 tttcaaattattcaaca 124  Q
    | |||||||||||||||    
T  16026636 tctcaaattattcaaca 16026620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 53631253 - 53631127
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  53631253 caacaataacaacttgcatcataacaatattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 53631154  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  53631153 tctcaaattatccaacaaagatattca 53631127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 14630091 - 14630224
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  | |||||||||||    
T  14630091 atgacagcaacaataacaacttgcaacataacaacatcaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctacaacatataacattcacataat 14630190  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  14630191 atatgtatttcaaattatccaacaaagatattca 14630224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Original strand, 3485151 - 3485274
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  3485151 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaa 3485249  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  3485250 ttattcaacaacaacattcacataa 3485274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13036552 - 13036431
Alignment:
Q  12 aataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttc 111  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||||||||||||||  |||     
T  13036552 aataacaactt-caacataacaacatcaaaaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctacaacattcaacattcacataatatatgtatttt 13036454  T
Q  112 aaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||||||  |||||||    
T  13036453 aaattatccaacaaagatattca 13036431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 139
Target Start/End: Original strand, 19734587 - 19734649
Alignment:
Q  77 tatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19734587 tatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattcacataa 19734649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 2585030 - 2584939
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatatg 105  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |  |||| || ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  2585030 aacaacttgcaacataacaacgttaataataacaactcgaatgatataaacaacaatattttctatatcatacattttccacataatatatg 2584939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Original strand, 21061759 - 21061902
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaa 113  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||  | | ||||||||| |||   || ||    
T  21061759 aacaacttgcaacatagcaacattaataacaacaacttgaatgatataaacatcaatattttctatatcaaacattttccacataataaatgtaattgaa 21061858  T
Q  114 attattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaag 157  Q
    | ||  |||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  21061859 aataaccaacaacattgatcatttaaattcagactctctgaaag 21061902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33244009 - 33243950
Alignment:
Q  75 tctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  33244009 tctatatcataccttattcacacaatatatgtatctcaaattattcaacaaaaatattca 33243950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 20899577 - 20899489
Alignment:
Q  17 caacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatat 104  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  20899577 caacttgcaacataacaatattaataacaacaacttgaatgatataaacaacgacattttctatatcatacattttccacataatatat 20899489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 25141312 - 25141476
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||      
T  25141312 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcataaaatattcacataatatatgta 25141411  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25141412 tctcaaattattcaacaacaataattatattaattcagactcagtgaaagacaatacaattataa 25141476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 25141122 - 25141286
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||      
T  25141122 caacaataacaacttgtatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaataatatttctatatcatataatattcacataatatatgta 25141221  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25141222 tctcaaattattcaacaacaatattcatgttaatttagactcactgaaagacaatacaattataa 25141286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 22259191 - 22259362
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22259191 atgacagcaataataacaacttgcaacataacaacatttacaacaacaacttgaataatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 22259290  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||||  | |||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22259291 atatgcatctcaaattatctagcaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 22259362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 172
Target Start/End: Original strand, 3538959 - 3539130
Alignment:
Q  2 tgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataata 101  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3538959 tgacagcaacaacaacaacttgcaacataacaacatcaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataata 3539058  T
Q  102 tatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagac-tcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    ||||  | ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||    
T  3539059 tatgtatctcaaattatccaacaacaacattcatattaattcagacttcactgaacaacaatataattataa 3539130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Original strand, 44071724 - 44071881
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||  | |||||    
T  44071724 aacaacttgcaacataacaacactaataataacaacttgaacgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatttccacataatatatgtatctcaaa 44071823  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44071824 ttatccaacaacaataatcatgttaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 44071881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 27851814 - 27851968
Alignment:
Q  18 aacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaatta 117  Q
    |||||||| |||||||||| | | |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||  ||||||||||    
T  27851814 aacttgcaacataacaacactgataataacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatttccacataatatatgtatttcaaatta 27851913  T
Q  118 ttcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
      ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  27851914 accaacaactataatcttattaattcagactcactgaaagactatacatttataa 27851968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 159
Target Start/End: Original strand, 27860517 - 27860661
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||   | ||||     
T  27860517 aacaacttgcaacataacaacactgataataacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatttccacataatatatctatctcaat 27860616  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagac 159  Q
    |||  |||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27860617 ttaaccaacaacattaatcatattaattcagactcacttaaagac 27860661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 9784906 - 9784980
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  9784906 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 9784980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10897260 - 10897216
Alignment:
Q  113 aattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaag 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10897260 aattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaag 10897216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23069163 - 23069104
Alignment:
Q  75 tctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  23069163 tctatatcataaaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 23069104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 10897429 - 10897388
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaaca 42  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  10897429 atgacagcaacaataacaacttgcaacttaacaacattaaca 10897388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23492148 - 23491977
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | | | |||||||||| |||||||||||||    
T  23492148 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaaaagcaacaacttgaatgatatgaacaacactctttttatatcatacaatattcacataat 23492049  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23492048 atatgtatctcaaattattcaacaacaaaattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 23491977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23497746 - 23497575
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | | | |||||||||| |||||||||||||    
T  23497746 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaaaagcaacaacttgaatgatatgaacaacactctttttatatcatacaatattcacataat 23497647  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23497646 atatgtatctcaaattattcaacaacaacattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 23497575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19656016 - 19655883
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19656016 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaatattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 19655917  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||  | || |||||| ||||||  |||||||    
T  19655916 atatgtatctcgaattatccaacaaagatattca 19655883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23491952 - 23491825
Alignment:
Q  7 gcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatga 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  23491952 gcaacaataacaactttcatcataacaacattaacatcaacaacttgaatgatatgaaaaataatatttctatatcatacaatattcacataatatatgt 23491853  T
Q  107 ctttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
     | ||||||||||||||||  |||||||    
T  23491852 atctcaaattattcaacaaagatattca 23491825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23497550 - 23497423
Alignment:
Q  7 gcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatga 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  23497550 gcaacaataacaactttcatcataacaacattaacatcaacaacttgaatgatatgaaaaataatatttctatatcatacaatattcacataatatatgt 23497451  T
Q  107 ctttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
     | ||||||||||||||||  |||||||    
T  23497450 atctcaaattattcaacaaagatattca 23497423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 160
Target Start/End: Original strand, 23500883 - 23501005
Alignment:
Q  38 taacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatat 137  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23500883 taacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatataagtatctcaaattatccaacaacaatattcatat 23500982  T
Q  138 aaattcagactcactgaaagaca 160  Q
     |||||||  |||||||||||||    
T  23500983 taattcaggatcactgaaagaca 23501005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 6083619 - 6083450
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | || |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |  ||| | ||||| |||||||||||||    
T  6083619 atgacagcaacaataacatcttgcaacttagcaactttaacaacaacaatttgaatgatatgaacaacaattt--ctacaacatacaatattcacataat 6083522  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||||  |||||| |||| |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  6083521 atatgcatttcaatttatccaacaacattattcagattaattcagactcattgaaagataatacaattataa 6083450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22212327 - 22212168
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgt-ctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaa 113  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |  |||| |||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||    
T  22212327 aacaacttgcaacacaacaacatcaataataacaacttgaatgatataaacaaaattattttctatatcatacaattttcacataatatatgtatctcaa 22212228  T
Q  114 attattcaacaacaatattcata-taaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    ||||  |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  22212227 attaaccaacaacattattcatattactttcagactcactgtaagacaatgcaattataa 22212168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15705339 - 15705265
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15705339 atgaacaacaatatttttatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaaaatattca 15705265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Original strand, 28947617 - 28947742
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| | | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||      
T  28947617 caactataacaacttgcaacttaatatcgttagcaacaacaacttga-tgatatgaacaacaatatttctacagcatacaacattcacataatatatgta 28947715  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28947716 tttcaaattatccaacaaaaatattca 28947742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19773437 - 19773363
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  19773437 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 19773363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31735742 - 31735584
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgt-ctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaa 113  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||| |  ||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||  | | |||||||||||||  ||||||    
T  31735742 aacaacttgtaacatagcaacattaataataacaatttgaatgatataaacaacaatattttctatatcaaacattttccacataatatatgtatttcaa 31735643  T
Q  114 attattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    ||||  |||||||| || |||| | |||||||||||||||||  |||| | ||||||||    
T  31735642 attaaccaacaacattaatcattttaattcagactcactgaaccacaatataattataa 31735584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Original strand, 23655665 - 23655741
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23655665 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtacctcaaaatattcaacaacaacattcatataa 23655741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Original strand, 22806160 - 22806231
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||  |||||||    
T  22806160 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatcttaaattattcaacaaagatattca 22806231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 139
Target Start/End: Original strand, 23655732 - 23655781
Alignment:
Q  90 attcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23655732 attcatataatatatgtattttaaattattcaacaacaacattcatataa 23655781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 19444099 - 19444011
Alignment:
Q  17 caacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatat 104  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  19444099 caacttgcaacatagcaatattaataacaacaacttgaatgatataaacaacgatattttctatatcatacattttccacataatatat 19444011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 1620 - 1781
Alignment:
Q  11 caataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgacttt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  | |    
T  1620 caataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaatttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacatagtatatgtatct 1719  T
Q  111 caaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1720 caaattattcaacaacaacattcatattaattcagactcactaaaagacaatacaattataa 1781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 4773 - 4934
Alignment:
Q  11 caataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgacttt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||  | |    
T  4773 caataataacttgcatcataacaacattaacaacaacaatttaaatgatataaacaacaatatttatatattatacaatattcacataatatatgtatct 4872  T
Q  111 caaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4873 caaattaatcaacaacaacattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 4934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 4960 - 5076
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  4960 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacaacaataacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 5059  T
Q  108 tttcaaattattcaaca 124  Q
    | |||||||||||||||    
T  5060 tctcaaattattcaaca 5076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 1800 - 1923
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  1800 atgactgcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacaacaataacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacacaat 1899  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaaca 124  Q
    |||||  | |||||||||||||||    
T  1900 atatgtatctcaaattattcaaca 1923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 9)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 20565629 - 20565800
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20565629 atgacagcatcaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaatttcaatgatatgatcaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 20565728  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20565729 atatgtatctcaaattattcaacaacaacattcatattaattcagactcattgaaagacaatacaattataa 20565800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21618872 - 21618702
Alignment:
Q  2 tgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataata 101  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21618872 tgacagcaacaatagcaacttgtaacataacaacatcaacaacaataacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataata 21618773  T
Q  102 tatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||   | ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  21618772 tatttatctcaaattatccaacaagaatattcataataattcagactcactgaacaacaacataattataa 21618702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 20565826 - 20565942
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||      
T  20565826 caacaataacaacttgcaacataacaacataaacaacaacaactcgaatgatatgaacaacaatatttctacaacatacaacattcacataatatatgta 20565925  T
Q  108 tttcaaattattcaaca 124  Q
    ||||||||||| |||||    
T  20565926 tttcaaattatccaaca 20565942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 172
Target Start/End: Original strand, 29914524 - 29914664
Alignment:
Q  32 caacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatat 131  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||  | |||||| || ||| ||||| ||    
T  29914524 caacattaaccacaacaacttgaatgatatgaacgactatatttctatattatacaatattcgcataatatatgtatctcaaatcatccaaaaacaacat 29914623  T
Q  132 tcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||| | ||||||||    
T  29914624 tcatattaattcagactcactgaacaacaatataattataa 29914664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 32608176 - 32608053
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | | |||    
T  32608176 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatgatat-aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctaaaa 32608078  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  32608077 ttattcaacaacaacattcatataa 32608053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 36509569 - 36509505
Alignment:
Q  75 tctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36509569 tctatatcatacgatattcacataatatatgtacctcaaattattcaacaacaacattcatataa 36509505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20469915 - 20469802
Alignment:
Q  45 aacagcttgaatgata-tgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattc 143  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| || | |||||||||||||  | ||||||||  |||||||| || |||| | |||||    
T  20469915 aacaacttgaatgataatgaacatcaatatctctatatcatacaatttccacataatatatgtatctcaaattaaccaacaacattaatcattttaattc 20469816  T
Q  144 agactcactgaaag 157  Q
    |||||| |||||||    
T  20469815 agactctctgaaag 20469802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 32608062 - 32608013
Alignment:
Q  90 attcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32608062 attcatataatatatgtatttcaaattattcaacaacaacattcatataa 32608013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 36509514 - 36509465
Alignment:
Q  90 attcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36509514 attcatataatatatgtatttcaaattattcaacaacaacattcatataa 36509465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 7572 - 7733
Alignment:
Q  11 caataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgacttt 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |    
T  7572 caataacaacttccatcataacaacattaacaacaacaatttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatct 7671  T
Q  111 caaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7672 cgaattattcaacaacaacattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 7733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 7761 - 7874
Alignment:
Q  9 aacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgact 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  7761 aacaataacaacttgcatcataacaacattaacaacaataacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcaaataatatatgtat 7860  T
Q  109 ttcaaattattcaa 122  Q
     |||||||||||||    
T  7861 atcaaattattcaa 7874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1695 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1695
Description:

Target: scaffold1695; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 588 - 752
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  588 caacaataacaacttgtaacataacaacatcaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 687  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  688 tctcaaattatccaacaacaacattcataataattcagactcactgaacaacaacataataataa 752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15373 - 15240
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15373 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaatattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 15274  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||  | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  15273 atatgtatctcaaattatccaacaaagatattca 15240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24431 - 24298
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24431 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaatattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 24332  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||  | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  24331 atatgtatctcaaattatccaacaaagatattca 24298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 20843 - 20686
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  | |||||    
T  20843 aacaacttgcaacataacaacattgacaacaataacttgaatgatatgaacgacaatatttctatatcatacaattttcacataatatatgtatctcaaa 20744  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
    |||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20743 ttatccaactacaataatcatattaattcagactcactgaaagacaatgcaattataa 20686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 136443 - 136290
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||      
T  136443 caacaatgacaacttgcaacataataacattaataacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaattttcacataatatatgta 136344  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaa 161  Q
    | ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  136343 tctcaaattatccaactacaataatcatattaattcagactcactgaaaaacaa 136290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 285 - 122
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||| || | ||||||||| |||      
T  285 caacaataacaacttgcaacttaacaacattaacaacaacaacttgaataatatgaacaacaatatttctacaacatacaatttccacataatagatgta 186  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattata 171  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  185 tttaaatttatccaacaacaatattcatattaattcagactcactgtaagacaatacaattata 122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1243 - 1121
Alignment:
Q  12 aataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||    
T  1243 aataacaacttgcatcataacaatattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctc 1144  T
Q  112 aaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||||||  |||||||    
T  1143 aaattatccaacaaagatattca 1121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 3692 - 3817
Alignment:
Q  9 aacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgact 108  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  3692 aacaataacaagttgcttcataacaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgtat 3791  T
Q  109 ttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||    
T  3792 ttcaaattatccaacaaagatattca 3817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11523
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11447 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtacctcaaattattcaacaacaacattcatataa 11523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3909 - 3761
Alignment:
Q  13 ataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttca 112  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||  | |||    
T  3909 ataataacttgcaacataacaacattaacaacaacaacctgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatatattattcacataatatatgtatctca 3810  T
Q  113 aattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaa 161  Q
    |||||| |||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3809 aattatccaacaacattcttcatattaattcagattcactgaaagacaa 3761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 3907 - 4074
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||      
T  3907 caactataacaacttgcaacttaacattgttaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatctctacaacatacaatattcacataatatatgta 4006  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcata-taaattcagactcactgaaagacaacacaattataagc 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4007 tttcaaattatccaacaacaatattcatattactttctgactcactgcaaggcaacacaattataagc 4074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Original strand, 16830 - 16978
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| || || |||||||||||||||      
T  16830 caacaataacaatttgcaacataacaacattaataacaacaacttaaatgatatgaacaagaatatttctatatcaaacaattttcacataatatatgta 16929  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaa 156  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  16930 tctcaaattatccaacaacaataatcatattaattccgactcactgaaa 16978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 66244 - 66387
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||  | |||||    
T  66244 aacaacttgcaacataacaacattaataataacaactttaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatttccacatcatatatgtatctcaaa 66343  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaaga 158  Q
    |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  66344 ttaaccaacaacaataatcatattaattcagactcactgaaaga 66387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Original strand, 168709 - 168835
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||      
T  168709 caacaataacaaattgcaacataacaacattaacaacaacaacttgaataatatgaacaacaatatttcaatatcatacaatattaacataatatatgta 168808  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  168809 tttcaaattatccaacaaagatattca 168835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 13302023 - 13302177
Alignment:
Q  18 aacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaatta 117  Q
    |||||||| |||||||||| | | |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||   | ||||||||    
T  13302023 aacttgcaacataacaacactgataataacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatttccacataatatatagatctcaaatta 13302122  T
Q  118 ttcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagacaacacaattataa 172  Q
      ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  13302123 aacaacaacaacaatcatattaattcagactcactgaaagactatacatttataa 13302177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21240082 - 21239949
Alignment:
Q  2 tgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaac-aatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| | |||||||||||    
T  21240082 tgacagcaacacaaacaacttgcaacataacaacatcaacaataacaacttgaatgatatgaacaacaaatatttctacaacatacaacattcacataat 21239983  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21239982 atatgtatttcaaattatccaacaaaaatattca 21239949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14238424 - 14238301
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  14238424 aacaacttgaatcataacaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaa 14238326  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14238325 ttattcaacaacaacattcacataa 14238301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38887939 - 38887816
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||    
T  38887939 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtacctcaaa 38887841  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  38887840 ttattcaacaacaacattcatataa 38887816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7052867 - 7052744
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  | |||||    
T  7052867 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttctatatcatacaatattcacctaatatatgtatctcaaa 7052769  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  7052768 ttattcaacaacaacattcacataa 7052744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Original strand, 51082503 - 51082579
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  51082503 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattcacataa 51082579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 135
Target Start/End: Original strand, 51323583 - 51323674
Alignment:
Q  44 caacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcat 135  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| | |||||   ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  51323583 caacaacttaaatgatatgaacatcaatatttctacaacatacatcattcacataatatatgtatttcaaattatccaacaaagatattcat 51323674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38887825 - 38887776
Alignment:
Q  90 attcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38887825 attcatataatatatgtatttcaaattattcaacaacaacattcatataa 38887776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Original strand, 52983380 - 52983469
Alignment:
Q  17 caacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatatg 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  52983380 caacttgcaacataacaacattaataataacaacttgaatgatataaacaacgatattttctatatcatacattttccacataatatatg 52983469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Original strand, 18275148 - 18275239
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatatg 105  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| |  |||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  18275148 aacaacttgcaacatagcaacgttaataataacaacttgaatgatataaacaacaatattttctatatcatacattttccacataatatatg 18275239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7321548 - 7321491
Alignment:
Q  88 atattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcag 145  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  7321548 atattcacataatatatgtatttcaatttatctaacgacaatattcatattaattcag 7321491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 134
Target Start/End: Original strand, 20588033 - 20588077
Alignment:
Q  90 attcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||    
T  20588033 attcacataatatatgtctttcaaattatccaacaaagatattca 20588077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 134
Target Start/End: Original strand, 20592571 - 20592615
Alignment:
Q  90 attcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||    
T  20592571 attcacataatatatgtctttcaaattatccaacaaagatattca 20592615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 34494 - 34619
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||| || || || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  34494 atgacagcaacaataaaaaatttcaacatagcaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaataacaatatttctatatcataaaatattcacataat 34593  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaac 126  Q
    | |||  | ||||||||| |||||||    
T  34594 acatgtatctcaaattatccaacaac 34619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 125
Target Start/End: Original strand, 25788 - 25905
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||      
T  25788 caactataacaacttgcaacttaatatcgttaacaacaacagcttgaatgatatgaacaacaatatttctacaacatacaacattcacataatatatgta 25887  T
Q  108 tttcaaattattcaacaa 125  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  25888 tttcaaattatccaacaa 25905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 78296 - 78414
Alignment:
Q  9 aacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgact 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  |    
T  78296 aacaataacaacttgaatcataacaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttctataccatacaatattcacataatatatgtat 78394  T
Q  109 ttcaaattattcaacaacaa 128  Q
     |||||||||||||||||||    
T  78395 ctcaaattattcaacaacaa 78414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 127584 - 127471
Alignment:
Q  45 aacagcttgaatgatatgaacaacaatatgt-ctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattc 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||    ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||     
T  127584 aacaacttgaatgatatgaacaacaatattttctatatcatacatttttcacataatatatgtagctcaaattaaccaacaacaataatcatattaattt 127485  T
Q  144 agactcactgaaag 157  Q
    ||||||||||||||    
T  127484 agactcactgaaag 127471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Original strand, 33590 - 33713
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  33590 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaa 33688  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33689 ttattcaacaacaacattcacataa 33713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 171
Target Start/End: Original strand, 14327 - 14462
Alignment:
Q  36 attaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcat 135  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||| || || ||| |  |||||||||||||| ||   | ||||||||  ||||||||   |||||    
T  14327 attaacaacaacaacttgagtgatgtgaaccacaatatttcaatgtcacataatattcacataatacatacatctcaaattacccaacaacatacttcat 14426  T
Q  136 ataaattcagactcactgaaagacaacacaattata 171  Q
    || |||||||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  14427 attaattcagattcattgtaagacaatacaattata 14462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6054 - 5980
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  6054 atgaacaacattatgtctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 5980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 39376 - 39497
Alignment:
Q  12 aataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttc 111  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | ||| | | ||||| ||||||||||  ||||    
T  39376 aataacaactt-caacataacaacatcaacaacaacaacttgaatgatatgaacatcaatatttctacaacattcaacattcatataatatatgtatttc 39474  T
Q  112 aaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||||||  |||||||    
T  39475 aaattatccaacaaagatattca 39497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15321 - 15198
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||| ||| || |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  15321 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatggtataaa-aacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaa 15223  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15222 ttattcaacaacaacattcacataa 15198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Original strand, 22345 - 22421
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22345 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattcacataa 22421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Original strand, 29445 - 29521
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29445 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattcacataa 29521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 6837 - 6911
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  6837 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 6911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 20976 - 21050
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  20976 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 21050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 128
Target Start/End: Original strand, 29897 - 29962
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaa 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  29897 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaa 29962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 139
Target Start/End: Original strand, 146008 - 146096
Alignment:
Q  50 cttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  146008 cttggatgatat-aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattaatcaacaacaacattcacataa 146096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Original strand, 7215 - 7338
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||    
T  7215 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttccatatcatacaatattcacataatttatgtatctcaaa 7313  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  7314 ttattcaacaacaacattcacataa 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Original strand, 11082 - 11158
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11082 aacaacattatttctatgtcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattcacataa 11158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 742 - 666
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  742 aacaacattatttctatgtcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattcacataa 666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 6092 - 5969
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||    
T  6092 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttccatatcatacaatattcacataatttatgtatctcaaa 5994  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5993 ttattcaacaacaacattcacataa 5969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 21392 - 21466
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  21392 atgaacaacattatttctatatcataaaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 21466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4251 - 4202
Alignment:
Q  110 tcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagac 159  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4251 tcaaattatccaacaacaatcttcatattaattcagactcactgaaagac 4202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8811 - 8762
Alignment:
Q  110 tcaaattattcaacaacaatattcatataaattcagactcactgaaagac 159  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8811 tcaaattatccaacaacaatcttcatattaattcagactcactgaaagac 8762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 127
Target Start/End: Original strand, 507 - 559
Alignment:
Q  75 tctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaaca 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  507 tctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaca 559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10682 - 10618
Alignment:
Q  75 tctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  10682 tctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaataacaacattcacataa 10618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Original strand, 109428 - 109532
Alignment:
Q  45 aacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattca 144  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| || | |||||||||||||  | ||||||||  |||||||| || |||| | ||||||    
T  109428 aacaacttgaatgatatgaacattaatatctctacatcatacaatttccacataatatatgtatctcaaattaaccaacaacattaatcattttaattca 109527  T
Q  145 gactc 149  Q
    |||||    
T  109528 gactc 109532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 134
Target Start/End: Original strand, 3609 - 3668
Alignment:
Q  75 tctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  3609 tctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 3668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 2716 - 2661
Alignment:
Q  51 ttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatatg 105  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  2716 ttgaatgatatgaacaacaatattttctatatcatacaatttccacataatatatg 2661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 34210 - 34119
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatat-gtctatatcatacgatattcacataatatatg 105  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  34210 aacaactagcaacatagcaacattaataataacaacttgaatgatataaacaacaatatcttctatatcatacattttccacataatatatg 34119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13393 - 13319
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  13393 atgaacaacattatttctatatcatacaatcatcaaataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 13319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 120234 - 120308
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  120234 atgaacaacattatttctatatcataaaataatcaaataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 120308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 388 - 445
Alignment:
Q  88 atattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatataaattcag 145  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  388 atattcacataatataagtatttcaaattatccaacaaagatattcatattaattcag 445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0645 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0645
Description:

Target: scaffold0645; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 44 - 4
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaaca 48  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44 caacaataaaaccttgcatcataacaacattaacaacaaca 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University