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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1111_low_163 (Length: 299)

Name: NF1111_low_163
Description: NF1111
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1111_low_163
NF1111_low_163
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (8-172)||(13133219-13133383)
chr7 (1-172)||(15096347-15096518)
chr7 (1-152)||(13133049-13133200)
chr7 (8-171)||(15139348-15139512)
chr7 (8-172)||(14219675-14219839)
chr7 (8-172)||(19557987-19558151)
chr7 (8-134)||(1489925-1490051)
chr7 (1-172)||(16077540-16077711)
chr7 (8-174)||(22000922-22001089)
chr7 (50-152)||(48809211-48809313)
chr7 (1-171)||(8135784-8135954)
chr7 (63-134)||(14929026-14929097)
chr7 (63-134)||(15352492-15352563)
chr7 (60-134)||(14258676-14258750)
chr7 (60-134)||(16460586-16460660)
chr7 (60-134)||(16579984-16580058)
chr7 (60-134)||(16585605-16585679)
chr7 (60-134)||(20487767-20487841)
chr7 (60-134)||(32301506-32301580)
chr7 (18-164)||(11053866-11054013)
chr7 (45-157)||(4070988-4071100)
chr7 (11-48)||(14219835-14219872)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (1-172)||(11192156-11192327)
chr3 (8-172)||(11562651-11562815)
chr3 (9-172)||(11562843-11563009)
chr3 (1-146)||(6155852-6155998)
chr3 (7-134)||(19569023-19569150)
chr3 (1-134)||(11192346-11192479)
chr3 (8-134)||(17046434-17046560)
chr3 (8-134)||(17691459-17691585)
chr3 (8-134)||(54876137-54876263)
chr3 (1-125)||(14441433-14441557)
chr3 (8-134)||(17685497-17685623)
chr3 (1-152)||(17258907-17259058)
chr3 (28-134)||(6155998-6156104)
chr3 (13-134)||(9511819-9511940)
chr3 (13-134)||(9519794-9519915)
chr3 (45-157)||(13179404-13179517)
chr3 (63-137)||(13519570-13519644)
chr3 (60-134)||(14671148-14671222)
chr3 (60-134)||(14682647-14682721)
chr3 (63-134)||(42353367-42353438)
chr3 (60-134)||(12470126-12470200)
chr3 (60-134)||(18700127-18700201)
chr3 (15-172)||(20417311-20417469)
chr3 (64-134)||(43889453-43889523)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (8-172)||(36727987-36728151)
chr8 (14-172)||(31723461-31723619)
chr8 (1-172)||(31723271-31723442)
chr8 (1-174)||(22318615-22318788)
chr8 (7-172)||(36727816-36727962)
chr8 (1-152)||(45471140-45471291)
chr8 (8-134)||(5760805-5760931)
chr8 (8-152)||(20024965-20025108)
chr8 (15-157)||(17907645-17907788)
chr8 (60-134)||(21346053-21346127)
chr8 (63-134)||(6102446-6102517)
chr8 (15-137)||(20084328-20084448)
chr8 (60-134)||(23914248-23914322)
chr8 (15-172)||(23947433-23947589)
chr8 (15-157)||(23888957-23889100)
chr8 (110-172)||(9489-9551)
chr8 (15-172)||(22244636-22244793)
[»] scaffold1186 (2 HSPs)
scaffold1186 (1-172)||(786-957)
scaffold1186 (1-134)||(976-1109)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-172)||(187311-187482)
scaffold0005 (1-134)||(187159-187292)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (1-172)||(14629901-14630072)
chr4 (11-171)||(9638046-9638206)
chr4 (13-172)||(16026750-16026909)
chr4 (8-124)||(16026620-16026736)
chr4 (8-134)||(53631127-53631253)
chr4 (1-134)||(14630091-14630224)
chr4 (15-134)||(3485151-3485269)
chr4 (12-134)||(13036431-13036552)
chr4 (77-134)||(19734587-19734644)
chr4 (15-105)||(2584939-2585030)
chr4 (75-134)||(33243950-33244009)
chr4 (15-73)||(21061759-21061817)
chr4 (17-104)||(20899489-20899577)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (8-172)||(25141312-25141476)
chr2 (8-172)||(25141122-25141286)
chr2 (1-172)||(22259191-22259362)
chr2 (2-172)||(3538959-3539130)
chr2 (15-172)||(44071724-44071881)
chr2 (18-172)||(27851814-27851968)
chr2 (15-165)||(27860517-27860667)
chr2 (113-172)||(10897201-10897260)
chr2 (60-134)||(9784906-9784980)
chr2 (45-157)||(18391006-18391119)
chr2 (75-134)||(23069104-23069163)
chr2 (1-42)||(10897388-10897429)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (1-172)||(23491977-23492148)
chr6 (1-172)||(23497575-23497746)
chr6 (1-134)||(19655883-19656016)
chr6 (7-134)||(23491825-23491952)
chr6 (7-134)||(23497423-23497550)
chr6 (38-160)||(23500883-23501005)
chr6 (1-172)||(6083450-6083619)
chr6 (15-172)||(22212168-22212327)
chr6 (15-172)||(31735584-31735742)
chr6 (60-134)||(15705265-15705339)
chr6 (8-134)||(28947617-28947742)
chr6 (60-134)||(19773363-19773437)
chr6 (63-137)||(23655665-23655739)
chr6 (63-134)||(22806160-22806231)
chr6 (17-104)||(19444011-19444099)
[»] scaffold0241 (4 HSPs)
scaffold0241 (11-172)||(1620-1781)
scaffold0241 (11-172)||(4773-4934)
scaffold0241 (8-124)||(4960-5076)
scaffold0241 (1-124)||(1800-1923)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (1-172)||(20565629-20565800)
chr5 (2-172)||(21618702-21618872)
chr5 (8-124)||(20565826-20565942)
chr5 (32-172)||(29914524-29914664)
chr5 (15-137)||(32608055-32608176)
chr5 (45-172)||(20469787-20469915)
chr5 (15-171)||(21406347-21406502)
chr5 (75-137)||(36509507-36509569)
chr5 (90-137)||(32608015-32608062)
chr5 (90-137)||(36509467-36509514)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (11-172)||(7572-7733)
scaffold0529 (9-122)||(7761-7874)
[»] scaffold1695 (1 HSPs)
scaffold1695 (8-155)||(588-735)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (15-172)||(20686-20843)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (8-172)||(136279-136443)
[»] scaffold0520 (1 HSPs)
scaffold0520 (8-171)||(122-285)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (1-134)||(15240-15373)
scaffold0061 (1-134)||(24298-24431)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (13-165)||(3757-3909)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (12-134)||(1121-1243)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (9-134)||(3692-3817)
scaffold0439 (63-137)||(11447-11521)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (8-156)||(16830-16978)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (8-174)||(3907-4074)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (15-158)||(66244-66387)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (8-134)||(168709-168835)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (18-172)||(13302023-13302177)
chr1 (2-134)||(21239949-21240082)
chr1 (15-134)||(14238306-14238424)
chr1 (15-137)||(38887818-38887939)
chr1 (15-134)||(7052749-7052867)
chr1 (63-134)||(51082503-51082574)
chr1 (44-135)||(51323583-51323674)
chr1 (88-145)||(7321491-7321548)
chr1 (17-105)||(52983380-52983469)
chr1 (15-105)||(18275148-18275239)
chr1 (90-137)||(38887778-38887825)
chr1 (90-134)||(20588033-20588077)
chr1 (90-134)||(20592571-20592615)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-126)||(34494-34619)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (8-125)||(25788-25905)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (45-157)||(127471-127584)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (9-128)||(78296-78414)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (15-134)||(33590-33708)
scaffold0077 (36-171)||(14327-14462)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (60-134)||(5980-6054)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (12-134)||(39376-39497)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (110-172)||(4191-4251)
scaffold0628 (110-172)||(8751-8811)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (15-134)||(15203-15321)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (63-134)||(22345-22416)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (63-134)||(29445-29516)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (60-134)||(6837-6911)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (60-134)||(20976-21050)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (63-128)||(29897-29962)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (50-134)||(146008-146091)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (45-149)||(109428-109532)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (15-134)||(7215-7333)
scaffold0546 (63-134)||(11082-11153)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (63-134)||(671-742)
scaffold0109 (15-134)||(5974-6092)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (60-134)||(21392-21466)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (75-127)||(507-559)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (75-134)||(3609-3668)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (75-134)||(10623-10682)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (88-145)||(388-445)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (51-157)||(2608-2716)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (82-145)||(19013-19076)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (15-105)||(34119-34210)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (60-134)||(13319-13393)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (60-134)||(120234-120308)
[»] scaffold0645 (1 HSPs)
scaffold0645 (8-48)||(4-44)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13133383 - 13133219
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  13133383 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 13133284  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13133283 tctcaaattattcagcaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 13133219  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15096518 - 15096347
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15096518 atgacagcaacaataacaacttgcaacataacaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 15096419  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||||  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15096418 atatgtatctcaaattatccaacaacaacattcatattaattcaaactcactgaaagacaatacaattataa 15096347  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 13133200 - 13133049
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||    
T  13133200 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttatataccatacaatattcacataat 13133101  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcact 152  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13133100 atatgtatctcaaattattcaacaacgatattcatattaattcagactcact 13133049  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 171
Target Start/End: Original strand, 15139348 - 15139512
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||      
T  15139348 caacaataacaacttgcaacataacaacattaacactaacaacttgattgatataaacaacaatatttctatatcatacaatgttcacataatatatgta 15139447  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaata-ttcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattata 171  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15139448 tctcaaattatccaacaacaatatttcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattata 15139512  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14219839 - 14219675
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  14219839 caacaataacaacttgcaacataacaacaccaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatacttctatatcatacaatattcacataatatatgta 14219740  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||    
T  14219739 tctcaaattatccaacaacaacattcatattaattcagactcactgaacaacaatatatttataa 14219675  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19558151 - 19557987
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  19558151 caacaataacaacttgcaacataacaacatcaataacaacaacttgaatgatatgaacaactatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 19558052  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  19558051 tctcaaattatccaacaacaacattcatattaatttagactcacggaacaacaatataattataa 19557987  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1490051 - 1489925
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  1490051 caacaataacaacttgcatcataacaatattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 1489952  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1489951 tatcaaattatccaacaaagatattca 1489925  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 16077540 - 16077711
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||  | || | |||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  16077540 atgacagcagcaataacaacttgcaacatggcgacttcaacaacagcaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 16077639  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    | |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||    
T  16077640 acatgtatttcaaattatccaacaacaacattcatattaattcaaactcactgaacaacaatatgattataa 16077711  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22001089 - 22000922
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | | ||||  ||||||||||||||||||      
T  22001089 caactataacaacttgcaacttaacatcgttaacaacaaaaacttgaatgatatgaacaacaatatttccacaacatataatattcacataatatatgta 22000990  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatattaatt-cagactcactgaaagacaatacaattataagc 174  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  22000989 ttccaaattatccaacaacagtattcataataattacagactcactgtaaggcaacacaattataagc 22000922  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 48809313 - 48809211
Alignment:
Q  50 cttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactc 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48809313 cttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacatcatatatgtgtctcaaattacccaacatcaatattcatattaattcagactc 48809214  T
Q  150 act 152  Q
    |||    
T  48809213 act 48809211  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 8135954 - 8135784
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| | || ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||  | || | ||| | || | ||||||||    
T  8135954 atgacagcaactataacaacttgcaacttaacatcgttgacaacaacaacttgaataatatgaataacaataaatatacaacatgcaatctccacataat 8135855  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattata 171  Q
    |  ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8135854 aggtgtatttcaatttatccaacaacaatattcatattaattcatactcactgtaagacaatacaattata 8135784  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14929097 - 14929026
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  14929097 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattca 14929026  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15352563 - 15352492
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  15352563 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattca 15352492  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 14258676 - 14258750
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  14258676 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 14258750  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16460660 - 16460586
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  16460660 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 16460586  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 16579984 - 16580058
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  16579984 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 16580058  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16585679 - 16585605
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  16585679 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 16585605  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 20487767 - 20487841
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  20487767 atgaacaacattatgtctatatcttacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 20487841  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 32301506 - 32301580
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  32301506 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaatatattca 32301580  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Original strand, 11053866 - 11054013
Alignment:
Q  18 aacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaatt 116  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||    |||||||    
T  11053866 aacttgcaatatagcaacattaataataacaacttgaatgatataaacaacaatattttctatatcatacattttccacataatatatgtagctcaaatt 11053965  T
Q  117 attcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatac 164  Q
    |  |||||||| || |||||||| || ||| |||||| ||||| ||||    
T  11053966 aaccaacaacattagtcatattagtttagattcactggaagactatac 11054013  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Original strand, 4070988 - 4071100
Alignment:
Q  45 aacagcttgaatgata-tgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattc 143  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || | | |||||||||||  | ||||||||  |||||||| || |||| |||||||    
T  4070988 aacaacttgaatgataatgaacatcaatatctctat-tcatacaatttcctcataatatatgtatctcaaattaaccaacaacattaatcattttaattc 4071086  T
Q  144 agactcactgaaag 157  Q
    |||||| |||||||    
T  4071087 agactctctgaaag 4071100  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 14219872 - 14219835
Alignment:
Q  11 caataacaacttgcatcataacaacattaacagcaaca 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14219872 caataacaacttgcatcataacaacatgaacaacaaca 14219835  T

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Target: chr3 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 11192156 - 11192327
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11192156 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaataatatttctatatcatacaatattcacataat 11192255  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11192256 atatgtatctcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaataaaattataa 11192327  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 11562651 - 11562815
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  11562651 caacaataaaaccttgcatcataacaacattaacaacaacaatttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 11562750  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11562751 tctctaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 11562815  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Original strand, 11562843 - 11563009
Alignment:
Q  9 aacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagc---ttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11562843 aacaataacaacttgcatcataacaacattaacaacaacaacaacttgaatgatatgaataacaatatttctatatcattcaatattcacataatatatg 11562942  T
Q  106 actttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
      | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  11562943 tatctcaaattagtcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagctaataccattataa 11563009  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 6155852 - 6155998
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacag-caacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataa 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  6155852 atgacagcaacaataacaacttgcaacttaacaacattaacaatcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataa 6155951  T
Q  100 tatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcaga 146  Q
     |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6155952 catatgtatctcaaattattcaacaacaatattcatattaattcaga 6155998  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19569150 - 19569023
Alignment:
Q  7 gcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  19569150 gcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaataacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgt 19569051  T
Q  107 ctttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
     | ||||||||||||||||  |||||||    
T  19569050 atctcaaattattcaacaaagatattca 19569023  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 11192346 - 11192479
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11192346 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 11192445  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    | |||  | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  11192446 aaatgtatctcaaattatccaacaaagatattca 11192479  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Original strand, 17046434 - 17046560
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  17046434 caacaataacaacttgcatcataacaatattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 17046533  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  17046534 tctcaaattatccaacaaagatattca 17046560  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17691585 - 17691459
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  17691585 caacaataacaacttgcatcataacaatattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 17691486  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  17691485 tatcaaattatccaacaaagatattca 17691459  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 54876263 - 54876137
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  54876263 caacaataacaacttgcatcataacaatattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 54876164  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  54876163 tctcaaattatccaacaaagatattca 54876137  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 14441433 - 14441557
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14441433 atgacagcaataataacaacttgcatcataacaatattaacagcaacaacttgaatgacatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 14441532  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaa 125  Q
    |||||  | ||||||||| ||||||    
T  14441533 atatgtatctcaaattatccaacaa 14441557  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17685623 - 17685497
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  17685623 caacaataacaacttggatcataacaatattaacaacaacaacttgaatgctatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 17685524  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||||    
T  17685523 tttctaattatccaacaaagatattca 17685497  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 17259058 - 17258907
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||| |||||| |||||| | |||| |||||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17259058 atgacagcagcaataaaaacttgtagcatagcaacattaatcacaataacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 17258959  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcact 152  Q
    | |||  | | |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17258958 acatgtatcttaaattatctaacatcaatattcatattaattcagactcact 17258907  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Original strand, 6155998 - 6156104
Alignment:
Q  28 ataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||      
T  6155998 ataacaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaacatttctatatcatacaatattcacataacatatgtatctcaaattattcaacaaag 6156097  T
Q  128 atattca 134  Q
    |||||||    
T  6156098 atattca 6156104  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9511940 - 9511819
Alignment:
Q  13 ataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttca 112  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  9511940 ataacaacttgcaacttaacatcgttaacaacatcaacttgaatgatatgaacaacaatatttctacaacataccatattcacataatatatgtatttca 9511841  T
Q  113 aattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||| ||||||  |||||||    
T  9511840 aattatccaacaaagatattca 9511819  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9519915 - 9519794
Alignment:
Q  13 ataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttca 112  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  9519915 ataacaacttgcaacttaacatcgttaacaacatcaacttgaatgatatgaacaacaatatttctacaacataccatattcacataatatatgtatttca 9519816  T
Q  113 aattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||| ||||||  |||||||    
T  9519815 aattatccaacaaagatattca 9519794  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Original strand, 13179404 - 13179517
Alignment:
Q  45 aacagcttgaatgatatgaacaacaatatgt-ctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattc 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||     
T  13179404 aacaacttgaatgatatgaacaacaatattttctatatcatacatttttcacataatatatgtagctcaaattaaccaacaacaataatcatattaattt 13179503  T
Q  144 agactcactgaaag 157  Q
    ||||||||||||||    
T  13179504 agactcactgaaag 13179517  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 13519570 - 13519644
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatat 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13519570 aacaacattatttctatatcatacgatattcacataatatatgtacctcaaattattcaacaacaacattcatat 13519644  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 14671148 - 14671222
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  14671148 atgaacaacattatgtctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 14671222  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 14682647 - 14682721
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  14682647 atgaacaacattatgtctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 14682721  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 42353438 - 42353367
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  42353438 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattca 42353367  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 12470126 - 12470200
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  12470126 atgaacaacattatatctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 12470200  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18700201 - 18700127
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  18700201 atgaacaacattacttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 18700127  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Original strand, 20417311 - 20417469
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatat-gtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaa 113  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||  | | |||||||||||||    ||||    
T  20417311 aacaacttgcaacatatcaatattaataataacaacttgaatgatataaacaacaatatcttttatatcatacattttccacataatatatgtagctcaa 20417410  T
Q  114 attattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    ||||  |||||||| || |||||||| || ||| |||||||||| | ||||| ||||||    
T  20417411 attaaccaacaacattaatcatattagtttagattcactgaaaggctatacatttataa 20417469  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 43889523 - 43889453
Alignment:
Q  64 acaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  43889523 acaacattatttctaaatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 43889453  T

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Target: chr8 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 36728151 - 36727987
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  36728151 caacaatagcaacttgcatcataacaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 36728052  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36728051 tctcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactaaaagacaatacaattataa 36727987  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31723619 - 31723461
Alignment:
Q  14 taacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||    
T  31723619 taacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcagataatatatgtatctcaa 31723520  T
Q  114 attattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31723519 attattcaacaacaatattcatattaattcatactcactgaaagacaatacaattataa 31723461  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31723442 - 31723271
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31723442 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 31723343  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  31723342 atatgtatctcaaattatttaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaatactatacatttataa 31723271  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22318788 - 22318615
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||    
T  22318788 atgacagcaacaatatcaacttgcaacataacaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatatccacgtaat 22318689  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataagc 174  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22318688 atatgtatctcaaattatccaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataagc 22318615  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 36727962 - 36727816
Alignment:
Q  7 gcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||     
T  36727962 gcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaata-------------------tcacataatatatgt 36727882  T
Q  107 ctttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36727881 atctcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagactatacatttataa 36727816  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 45471291 - 45471140
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  45471291 atgacagcaacaataacaactcgcaatatagcaacattaatcacaataacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 45471192  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcact 152  Q
    |||||  | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45471191 atatgtatctcaaattatccaacatcaatatttatattaattcagactcact 45471140  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Original strand, 5760805 - 5760931
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  5760805 caacaataacaacttgcatcataacaatattaaccacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 5760904  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  5760905 tctcaaattatccaacaaagatattca 5760931  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20025108 - 20024965
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||   ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||      
T  20025108 caacaataacaacttgcaacatagcaacattaatcacattaacttgaatgatatgaacaacaatatttctata-catacaatattcacataatatatgta 20025010  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcact 152  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20025009 tctcaaattatccaacatcaatattcatattaattcagactcact 20024965  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17907788 - 17907645
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaa 113  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |  | || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||||     
T  17907788 aacaacttgcaacatagcaacattaataatatcaacttgaatgatatgaacaacaatattttctatatcatactttttccacataatatatgtatttcac 17907689  T
Q  114 attattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaag 157  Q
    ||||  |||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||    
T  17907688 attaaccaacaacattaatcattttaatttagattcactgaaag 17907645  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21346127 - 21346053
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  21346127 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 21346053  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6102517 - 6102446
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  6102517 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaataacaacattca 6102446  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20084448 - 20084328
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  |||  ||||| || ||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    |||||    
T  20084448 aacaacttgaatcataacaacattaataataaccacttga-tggtat-aacaacattatttttatatcatacaatattcacataatatatgtacctcaaa 20084351  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatat 137  Q
    ||||||||||| || ||||||||    
T  20084350 ttattcaacaagaacattcatat 20084328  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 23914248 - 23914322
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  23914248 atgaacaacattatttctatatcatacaacattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 23914322  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Original strand, 23947433 - 23947589
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaa 113  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| || | |||||||||||||    || |    
T  23947433 aacaacttgcaacatagcaacattaataataacaacttgaatgatataaacaataatattttctatatcatac-atttccacataatatatgtagctc-a 23947530  T
Q  114 attattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    ||||  ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  23947531 attaaccaaaaacattaatcattttaattcagactcactgaaccacaatataattataa 23947589  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Original strand, 23888957 - 23889100
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatat-gtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaa 113  Q
    ||||||||||| || | | ||||||| |  |||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||  | | |||||||||||||    ||||    
T  23888957 aacaacttgcaacacagctacattaataataacaacttgaacgatataaacaacaatatcttctatatcatacattttccacataatatatgtagctcaa 23889056  T
Q  114 attattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaag 157  Q
    ||||  |||||||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  23889057 attaaccaacaacattaatcatattagtttagattcactgaaag 23889100  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 172
Target Start/End: Original strand, 9489 - 9551
Alignment:
Q  110 tcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||  |||||| | ||||||    
T  9489 tcaaattattcaacaacattatccatactgattcagactcactgaactacaatatagttataa 9551  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Original strand, 22244636 - 22244793
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgt-ctatatcatacgatattca-cataatatatg-actttc 111  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||| || |||| ||||||||||| |  ||     
T  22244636 aacaacttgcaacatagaaacattaataataacaacttgaaagatataaacaataatattttctatatcatac-attttcaacataatatatgtagctt- 22244733  T
Q  112 aaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
     |||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  22244734 -aattaaccaacaacattaatcattttaattcagactcactgaaccacaatataattataa 22244793  T

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Target: scaffold1186 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 786 - 957
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  786 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacaggaacaacttgaatgatataaacaataatatttctatatcatacaatattcacataat 885  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  886 atatgtatctcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacatttataa 957  T

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Target: scaffold1186; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 976 - 1109
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  | |||||||||||    
T  976 atgacagcaacaataacaacttgcaacataacaacatcaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctacaacatataacattcacataat 1075  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  1076 atatgtatttcaaattatccaacaaagatattca 1109  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 187482 - 187311
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  187482 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacaggaacaacttgaatgatataaacaataatatttctatatcatacaatattcacataat 187383  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  187382 atatgtatctcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacatttataa 187311  T

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Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 187292 - 187159
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  | |||||||||||    
T  187292 atgacagcaacaataacaacttgcaacataacaacatcaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctacaacatataacattcacataat 187193  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  187192 atatgtatttcaaattatccaacaaagatattca 187159  T

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Target: chr4 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 14629901 - 14630072
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14629901 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacaggaacaacttgaatgatataaacaataatatttctatatcatacaatattcacataat 14630000  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14630001 atatgtatctcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacatttataa 14630072  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 9638046 - 9638206
Alignment:
Q  11 caataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgacttt 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |    
T  9638046 caataacaatttgcatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatct 9638145  T
Q  111 caaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattata 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9638146 caaattattcaacaacaacattcatattaattcagactcattgaaagacaatacaattata 9638206  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16026909 - 16026750
Alignment:
Q  13 ataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||    
T  16026909 ataacaacttgcatcataacaacattaacaatagcaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcacacaatattcacataatatatgtatctca 16026810  T
Q  113 aattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16026809 aattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaaggcaatacaattataa 16026750  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16026736 - 16026620
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  16026736 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaatttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 16026637  T
Q  108 tttcaaattattcaaca 124  Q
    | |||||||||||||||    
T  16026636 tctcaaattattcaaca 16026620  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 53631253 - 53631127
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  53631253 caacaataacaacttgcatcataacaatattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 53631154  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  53631153 tctcaaattatccaacaaagatattca 53631127  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 14630091 - 14630224
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  | |||||||||||    
T  14630091 atgacagcaacaataacaacttgcaacataacaacatcaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctacaacatataacattcacataat 14630190  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  14630191 atatgtatttcaaattatccaacaaagatattca 14630224  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Original strand, 3485151 - 3485269
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  3485151 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaa 3485249  T
Q  115 ttattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  3485250 ttattcaacaacaacattca 3485269  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13036552 - 13036431
Alignment:
Q  12 aataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttc 111  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||||||||||||||  |||     
T  13036552 aataacaactt-caacataacaacatcaaaaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctacaacattcaacattcacataatatatgtatttt 13036454  T
Q  112 aaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||||||  |||||||    
T  13036453 aaattatccaacaaagatattca 13036431  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 134
Target Start/End: Original strand, 19734587 - 19734644
Alignment:
Q  77 tatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  19734587 tatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattca 19734644  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 2585030 - 2584939
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatatg 105  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |  |||| || ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  2585030 aacaacttgcaacataacaacgttaataataacaactcgaatgatataaacaacaatattttctatatcatacattttccacataatatatg 2584939  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33244009 - 33243950
Alignment:
Q  75 tctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  33244009 tctatatcataccttattcacacaatatatgtatctcaaattattcaacaaaaatattca 33243950  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 73
Target Start/End: Original strand, 21061759 - 21061817
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatat 73  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  21061759 aacaacttgcaacatagcaacattaataacaacaacttgaatgatataaacatcaatat 21061817  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 20899577 - 20899489
Alignment:
Q  17 caacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatat 104  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  20899577 caacttgcaacataacaatattaataacaacaacttgaatgatataaacaacgacattttctatatcatacattttccacataatatat 20899489  T

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Target: chr2 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 25141312 - 25141476
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||      
T  25141312 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcataaaatattcacataatatatgta 25141411  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25141412 tctcaaattattcaacaacaataattatattaattcagactcagtgaaagacaatacaattataa 25141476  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 25141122 - 25141286
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||      
T  25141122 caacaataacaacttgtatcataacaacattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaataatatttctatatcatataatattcacataatatatgta 25141221  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25141222 tctcaaattattcaacaacaatattcatgttaatttagactcactgaaagacaatacaattataa 25141286  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 22259191 - 22259362
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22259191 atgacagcaataataacaacttgcaacataacaacatttacaacaacaacttgaataatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 22259290  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||||  | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22259291 atatgcatctcaaattatctagcaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 22259362  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 172
Target Start/End: Original strand, 3538959 - 3539130
Alignment:
Q  2 tgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataata 101  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3538959 tgacagcaacaacaacaacttgcaacataacaacatcaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataata 3539058  T
Q  102 tatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagac-tcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    ||||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  3539059 tatgtatctcaaattatccaacaacaacattcatattaattcagacttcactgaacaacaatataattataa 3539130  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Original strand, 44071724 - 44071881
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||  | |||||    
T  44071724 aacaacttgcaacataacaacactaataataacaacttgaacgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatttccacataatatatgtatctcaaa 44071823  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44071824 ttatccaacaacaataatcatgttaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 44071881  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 27851814 - 27851968
Alignment:
Q  18 aacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaatta 117  Q
    |||||||| |||||||||| | | |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||  ||||||||||    
T  27851814 aacttgcaacataacaacactgataataacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatttccacataatatatgtatttcaaatta 27851913  T
Q  118 ttcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
      ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27851914 accaacaactataatcttattaattcagactcactgaaagactatacatttataa 27851968  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 165
Target Start/End: Original strand, 27860517 - 27860667
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||   | ||||     
T  27860517 aacaacttgcaacataacaacactgataataacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatttccacataatatatctatctcaat 27860616  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaataca 165  Q
    |||  |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27860617 ttaaccaacaacattaatcatattaattcagactcacttaaagactataca 27860667  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10897260 - 10897201
Alignment:
Q  113 aattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  10897260 aattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagctaatataattataa 10897201  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 9784906 - 9784980
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  9784906 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 9784980  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18391119 - 18391006
Alignment:
Q  45 aacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtct-atatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattc 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||   | | |||||||||||||    ||||||||  |||||| |||| |||||||||||     
T  18391119 aacaacttgaatgatatgaacaacaatatttccgatatcatatattttccacataatatatgtagctcaaattaaccaacaaaaataatcatattaattt 18391020  T
Q  144 agactcactgaaag 157  Q
    ||||||||||||||    
T  18391019 agactcactgaaag 18391006  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23069163 - 23069104
Alignment:
Q  75 tctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  23069163 tctatatcataaaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 23069104  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 10897429 - 10897388
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaaca 42  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  10897429 atgacagcaacaataacaacttgcaacttaacaacattaaca 10897388  T

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Target: chr6 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23492148 - 23491977
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | | | |||||||||| |||||||||||||    
T  23492148 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaaaagcaacaacttgaatgatatgaacaacactctttttatatcatacaatattcacataat 23492049  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492048 atatgtatctcaaattattcaacaacaaaattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 23491977  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23497746 - 23497575
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | | | |||||||||| |||||||||||||    
T  23497746 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaacattaaaagcaacaacttgaatgatatgaacaacactctttttatatcatacaatattcacataat 23497647  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23497646 atatgtatctcaaattattcaacaacaacattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 23497575  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19656016 - 19655883
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19656016 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaatattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 19655917  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||  | || |||||| ||||||  |||||||    
T  19655916 atatgtatctcgaattatccaacaaagatattca 19655883  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23491952 - 23491825
Alignment:
Q  7 gcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatga 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  23491952 gcaacaataacaactttcatcataacaacattaacatcaacaacttgaatgatatgaaaaataatatttctatatcatacaatattcacataatatatgt 23491853  T
Q  107 ctttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
     | ||||||||||||||||  |||||||    
T  23491852 atctcaaattattcaacaaagatattca 23491825  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23497550 - 23497423
Alignment:
Q  7 gcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatga 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  23497550 gcaacaataacaactttcatcataacaacattaacatcaacaacttgaatgatatgaaaaataatatttctatatcatacaatattcacataatatatgt 23497451  T
Q  107 ctttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
     | ||||||||||||||||  |||||||    
T  23497450 atctcaaattattcaacaaagatattca 23497423  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 160
Target Start/End: Original strand, 23500883 - 23501005
Alignment:
Q  38 taacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatat 137  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23500883 taacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatataagtatctcaaattatccaacaacaatattcatat 23500982  T
Q  138 taattcagactcactgaaagaca 160  Q
    ||||||||  |||||||||||||    
T  23500983 taattcaggatcactgaaagaca 23501005  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 6083619 - 6083450
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | || |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |  ||| | ||||| |||||||||||||    
T  6083619 atgacagcaacaataacatcttgcaacttagcaactttaacaacaacaatttgaatgatatgaacaacaattt--ctacaacatacaatattcacataat 6083522  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||||  |||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6083521 atatgcatttcaatttatccaacaacattattcagattaattcagactcattgaaagataatacaattataa 6083450  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22212327 - 22212168
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgt-ctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaa 113  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |  |||| |||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||    
T  22212327 aacaacttgcaacacaacaacatcaataataacaacttgaatgatataaacaaaattattttctatatcatacaattttcacataatatatgtatctcaa 22212228  T
Q  114 attattcaacaacaatattcatatta-attcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22212227 attaaccaacaacattattcatattactttcagactcactgtaagacaatgcaattataa 22212168  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31735742 - 31735584
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgt-ctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaa 113  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||| |  ||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||  | | |||||||||||||  ||||||    
T  31735742 aacaacttgtaacatagcaacattaataataacaatttgaatgatataaacaacaatattttctatatcaaacattttccacataatatatgtatttcaa 31735643  T
Q  114 attattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    ||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  31735642 attaaccaacaacattaatcattttaattcagactcactgaaccacaatataattataa 31735584  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15705339 - 15705265
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15705339 atgaacaacaatatttttatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaaaatattca 15705265  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Original strand, 28947617 - 28947742
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| | | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||      
T  28947617 caactataacaacttgcaacttaatatcgttagcaacaacaacttga-tgatatgaacaacaatatttctacagcatacaacattcacataatatatgta 28947715  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28947716 tttcaaattatccaacaaaaatattca 28947742  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19773437 - 19773363
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  19773437 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 19773363  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 23655665 - 23655739
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatat 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23655665 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtacctcaaaatattcaacaacaacattcatat 23655739  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Original strand, 22806160 - 22806231
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||  |||||||    
T  22806160 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatcttaaattattcaacaaagatattca 22806231  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 19444099 - 19444011
Alignment:
Q  17 caacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatat 104  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  19444099 caacttgcaacatagcaatattaataacaacaacttgaatgatataaacaacgatattttctatatcatacattttccacataatatat 19444011  T

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Target: scaffold0241 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 1620 - 1781
Alignment:
Q  11 caataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgacttt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  | |    
T  1620 caataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaatttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacatagtatatgtatct 1719  T
Q  111 caaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1720 caaattattcaacaacaacattcatattaattcagactcactaaaagacaatacaattataa 1781  T

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Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 4773 - 4934
Alignment:
Q  11 caataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgacttt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||  | |    
T  4773 caataataacttgcatcataacaacattaacaacaacaatttaaatgatataaacaacaatatttatatattatacaatattcacataatatatgtatct 4872  T
Q  111 caaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4873 caaattaatcaacaacaacattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 4934  T

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Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 4960 - 5076
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  4960 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacaacaataacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 5059  T
Q  108 tttcaaattattcaaca 124  Q
    | |||||||||||||||    
T  5060 tctcaaattattcaaca 5076  T

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Target: scaffold0241; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 1800 - 1923
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  1800 atgactgcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacaacaataacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacacaat 1899  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaaca 124  Q
    |||||  | |||||||||||||||    
T  1900 atatgtatctcaaattattcaaca 1923  T

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Target: chr5 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 20565629 - 20565800
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20565629 atgacagcatcaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacaatttcaatgatatgatcaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 20565728  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20565729 atatgtatctcaaattattcaacaacaacattcatattaattcagactcattgaaagacaatacaattataa 20565800  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21618872 - 21618702
Alignment:
Q  2 tgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataata 101  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21618872 tgacagcaacaatagcaacttgtaacataacaacatcaacaacaataacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataata 21618773  T
Q  102 tatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||   | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||    
T  21618772 tatttatctcaaattatccaacaagaatattcataataattcagactcactgaacaacaacataattataa 21618702  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 20565826 - 20565942
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||      
T  20565826 caacaataacaacttgcaacataacaacataaacaacaacaactcgaatgatatgaacaacaatatttctacaacatacaacattcacataatatatgta 20565925  T
Q  108 tttcaaattattcaaca 124  Q
    ||||||||||| |||||    
T  20565926 tttcaaattatccaaca 20565942  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 172
Target Start/End: Original strand, 29914524 - 29914664
Alignment:
Q  32 caacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatat 131  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||  | |||||| || ||| ||||| ||    
T  29914524 caacattaaccacaacaacttgaatgatatgaacgactatatttctatattatacaatattcgcataatatatgtatctcaaatcatccaaaaacaacat 29914623  T
Q  132 tcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  29914624 tcatattaattcagactcactgaacaacaatataattataa 29914664  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 32608176 - 32608055
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | | |||    
T  32608176 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatgatat-aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctaaaa 32608078  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatat 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  32608077 ttattcaacaacaacattcatat 32608055  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 20469915 - 20469787
Alignment:
Q  45 aacagcttgaatgata-tgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattc 143  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| || | |||||||||||||  | ||||||||  |||||||| || |||| |||||||    
T  20469915 aacaacttgaatgataatgaacatcaatatctctatatcatacaatttccacataatatatgtatctcaaattaaccaacaacattaatcattttaattc 20469816  T
Q  144 agactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||||| ||||||| | ||||| ||||||    
T  20469815 agactctctgaaaggctatacatttataa 20469787  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21406502 - 21406347
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| | |||||||||| |||||||| ||||||||   | |||||    
T  21406502 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttgtatatcatacaatattcacgtaatatatacatctcaaa 21406404  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattata 171  Q
    |||  ||||||||   |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  21406403 ttacccaacaacatacttcatattaattcagattcattgtaagacaatacaattata 21406347  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36509569 - 36509507
Alignment:
Q  75 tctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36509569 tctatatcatacgatattcacataatatatgtacctcaaattattcaacaacaacattcatat 36509507  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 32608062 - 32608015
Alignment:
Q  90 attcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatat 137  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32608062 attcatataatatatgtatttcaaattattcaacaacaacattcatat 32608015  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36509514 - 36509467
Alignment:
Q  90 attcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatat 137  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36509514 attcatataatatatgtatttcaaattattcaacaacaacattcatat 36509467  T

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Target: scaffold0529 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 7572 - 7733
Alignment:
Q  11 caataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgacttt 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |    
T  7572 caataacaacttccatcataacaacattaacaacaacaatttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatct 7671  T
Q  111 caaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7672 cgaattattcaacaacaacattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 7733  T

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Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 7761 - 7874
Alignment:
Q  9 aacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgact 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  7761 aacaataacaacttgcatcataacaacattaacaacaataacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcaaataatatatgtat 7860  T
Q  109 ttcaaattattcaa 122  Q
     |||||||||||||    
T  7861 atcaaattattcaa 7874  T

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Target: scaffold1695 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1695
Description:

Target: scaffold1695; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 588 - 735
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  588 caacaataacaacttgtaacataacaacatcaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgta 687  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaa 155  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  688 tctcaaattatccaacaacaacattcataataattcagactcactgaa 735  T

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Target: scaffold0251 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 20843 - 20686
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  | |||||    
T  20843 aacaacttgcaacataacaacattgacaacaataacttgaatgatatgaacgacaatatttctatatcatacaattttcacataatatatgtatctcaaa 20744  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20743 ttatccaactacaataatcatattaattcagactcactgaaagacaatgcaattataa 20686  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 136443 - 136279
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||      
T  136443 caacaatgacaacttgcaacataataacattaataacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaattttcacataatatatgta 136344  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  136343 tctcaaattatccaactacaataatcatattaattcagactcactgaaaaacaatgtaattataa 136279  T

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Target: scaffold0520 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 285 - 122
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||| || | ||||||||| |||      
T  285 caacaataacaacttgcaacttaacaacattaacaacaacaacttgaataatatgaacaacaatatttctacaacatacaatttccacataatagatgta 186  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattata 171  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  185 tttaaatttatccaacaacaatattcatattaattcagactcactgtaagacaatacaattata 122  T

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Target: scaffold0061 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15373 - 15240
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15373 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaatattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 15274  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||  | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  15273 atatgtatctcaaattatccaacaaagatattca 15240  T

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Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24431 - 24298
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24431 atgacagcaacaataacaacttgcatcataacaatattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataat 24332  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||  | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  24331 atatgtatctcaaattatccaacaaagatattca 24298  T

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Target: scaffold0028 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3909 - 3757
Alignment:
Q  13 ataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttca 112  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||  | |||    
T  3909 ataataacttgcaacataacaacattaacaacaacaacctgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatatattattcacataatatatgtatctca 3810  T
Q  113 aattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaataca 165  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3809 aattatccaacaacattcttcatattaattcagattcactgaaagacaataca 3757  T

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Target: scaffold1283 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1243 - 1121
Alignment:
Q  12 aataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||    
T  1243 aataacaacttgcatcataacaatattaacagcaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctc 1144  T
Q  112 aaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||||||  |||||||    
T  1143 aaattatccaacaaagatattca 1121  T

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Target: scaffold0439 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 3692 - 3817
Alignment:
Q  9 aacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgact 108  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  3692 aacaataacaagttgcttcataacaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatattcacataatatatgtat 3791  T
Q  109 ttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||    
T  3792 ttcaaattatccaacaaagatattca 3817  T

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Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11521
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatat 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11447 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtacctcaaattattcaacaacaacattcatat 11521  T

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Target: scaffold0371 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Original strand, 16830 - 16978
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| || || |||||||||||||||      
T  16830 caacaataacaatttgcaacataacaacattaataacaacaacttaaatgatatgaacaagaatatttctatatcaaacaattttcacataatatatgta 16929  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaa 156  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16930 tctcaaattatccaacaacaataatcatattaattccgactcactgaaa 16978  T

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Target: scaffold0859 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 3907 - 4074
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||      
T  3907 caactataacaacttgcaacttaacattgttaacaacaacaacttgaatgatatgaacaacaatatctctacaacatacaatattcacataatatatgta 4006  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattcatatta-attcagactcactgaaagacaatacaattataagc 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  4007 tttcaaattatccaacaacaatattcatattactttctgactcactgcaaggcaacacaattataagc 4074  T

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Target: scaffold0056 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 66244 - 66387
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||  | |||||    
T  66244 aacaacttgcaacataacaacattaataataacaactttaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatttccacatcatatatgtatctcaaa 66343  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaaga 158  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  66344 ttaaccaacaacaataatcatattaattcagactcactgaaaga 66387  T

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Target: scaffold0021 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Original strand, 168709 - 168835
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||      
T  168709 caacaataacaaattgcaacataacaacattaacaacaacaacttgaataatatgaacaacaatatttcaatatcatacaatattaacataatatatgta 168808  T
Q  108 tttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  168809 tttcaaattatccaacaaagatattca 168835  T

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Target: chr1 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 13302023 - 13302177
Alignment:
Q  18 aacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaatta 117  Q
    |||||||| |||||||||| | | |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||   | ||||||||    
T  13302023 aacttgcaacataacaacactgataataacaacttgaatgatatgaacaacaatatttctatatcatacaatttccacataatatatagatctcaaatta 13302122  T
Q  118 ttcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
      ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13302123 aacaacaacaacaatcatattaattcagactcactgaaagactatacatttataa 13302177  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21240082 - 21239949
Alignment:
Q  2 tgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaac-aatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| | |||||||||||    
T  21240082 tgacagcaacacaaacaacttgcaacataacaacatcaacaataacaacttgaatgatatgaacaacaaatatttctacaacatacaacattcacataat 21239983  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21239982 atatgtatttcaaattatccaacaaaaatattca 21239949  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14238424 - 14238306
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  14238424 aacaacttgaatcataacaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaa 14238326  T
Q  115 ttattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  14238325 ttattcaacaacaacattca 14238306  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38887939 - 38887818
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||    
T  38887939 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtacctcaaa 38887841  T
Q  115 ttattcaacaacaatattcatat 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  38887840 ttattcaacaacaacattcatat 38887818  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7052867 - 7052749
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  | |||||    
T  7052867 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttctatatcatacaatattcacctaatatatgtatctcaaa 7052769  T
Q  115 ttattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  7052768 ttattcaacaacaacattca 7052749  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Original strand, 51082503 - 51082574
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  51082503 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattca 51082574  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 135
Target Start/End: Original strand, 51323583 - 51323674
Alignment:
Q  44 caacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcat 135  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| | |||||   ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  51323583 caacaacttaaatgatatgaacatcaatatttctacaacatacatcattcacataatatatgtatttcaaattatccaacaaagatattcat 51323674  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7321548 - 7321491
Alignment:
Q  88 atattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcag 145  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  7321548 atattcacataatatatgtatttcaatttatctaacgacaatattcatattaattcag 7321491  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Original strand, 52983380 - 52983469
Alignment:
Q  17 caacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatatg 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  52983380 caacttgcaacataacaacattaataataacaacttgaatgatataaacaacgatattttctatatcatacattttccacataatatatg 52983469  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Original strand, 18275148 - 18275239
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatatg 105  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| |  |||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  18275148 aacaacttgcaacatagcaacgttaataataacaacttgaatgatataaacaacaatattttctatatcatacattttccacataatatatg 18275239  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38887825 - 38887778
Alignment:
Q  90 attcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatat 137  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38887825 attcatataatatatgtatttcaaattattcaacaacaacattcatat 38887778  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 134
Target Start/End: Original strand, 20588033 - 20588077
Alignment:
Q  90 attcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||    
T  20588033 attcacataatatatgtctttcaaattatccaacaaagatattca 20588077  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 134
Target Start/End: Original strand, 20592571 - 20592615
Alignment:
Q  90 attcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||    
T  20592571 attcacataatatatgtctttcaaattatccaacaaagatattca 20592615  T

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Target: scaffold0113 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 34494 - 34619
Alignment:
Q  1 atgacggcaacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataat 100  Q
    ||||| |||||||||| || || || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  34494 atgacagcaacaataaaaaatttcaacatagcaacattaacaacaacaacttgaatgatatgaataacaatatttctatatcataaaatattcacataat 34593  T
Q  101 atatgactttcaaattattcaacaac 126  Q
    | |||  | ||||||||| |||||||    
T  34594 acatgtatctcaaattatccaacaac 34619  T

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Target: scaffold0017 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 125
Target Start/End: Original strand, 25788 - 25905
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgac 107  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||      
T  25788 caactataacaacttgcaacttaatatcgttaacaacaacagcttgaatgatatgaacaacaatatttctacaacatacaacattcacataatatatgta 25887  T
Q  108 tttcaaattattcaacaa 125  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  25888 tttcaaattatccaacaa 25905  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 127584 - 127471
Alignment:
Q  45 aacagcttgaatgatatgaacaacaatatgt-ctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattc 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||     
T  127584 aacaacttgaatgatatgaacaacaatattttctatatcatacatttttcacataatatatgtagctcaaattaaccaacaacaataatcatattaattt 127485  T
Q  144 agactcactgaaag 157  Q
    ||||||||||||||    
T  127484 agactcactgaaag 127471  T

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Target: scaffold0047 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 78296 - 78414
Alignment:
Q  9 aacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgact 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  |    
T  78296 aacaataacaacttgaatcataacaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttctataccatacaatattcacataatatatgtat 78394  T
Q  109 ttcaaattattcaacaacaa 128  Q
     |||||||||||||||||||    
T  78395 ctcaaattattcaacaacaa 78414  T

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Target: scaffold0077 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Original strand, 33590 - 33708
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  33590 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaa 33688  T
Q  115 ttattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  33689 ttattcaacaacaacattca 33708  T

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Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 171
Target Start/End: Original strand, 14327 - 14462
Alignment:
Q  36 attaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcat 135  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||| || || ||| |  |||||||||||||| ||   | ||||||||  ||||||||   |||||    
T  14327 attaacaacaacaacttgagtgatgtgaaccacaatatttcaatgtcacataatattcacataatacatacatctcaaattacccaacaacatacttcat 14426  T
Q  136 attaattcagactcactgaaagacaatacaattata 171  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  14427 attaattcagattcattgtaagacaatacaattata 14462  T

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Target: scaffold0575 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6054 - 5980
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  6054 atgaacaacattatgtctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 5980  T

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Target: scaffold0098 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 39376 - 39497
Alignment:
Q  12 aataacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttc 111  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | ||| | | ||||| ||||||||||  ||||    
T  39376 aataacaactt-caacataacaacatcaacaacaacaacttgaatgatatgaacatcaatatttctacaacattcaacattcatataatatatgtatttc 39474  T
Q  112 aaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||||||  |||||||    
T  39475 aaattatccaacaaagatattca 39497  T

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Target: scaffold0628 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4251 - 4191
Alignment:
Q  110 tcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4251 tcaaattatccaacaacaatcttcatattaattcagactcactgaaagac--tacaattataa 4191  T

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Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8811 - 8751
Alignment:
Q  110 tcaaattattcaacaacaatattcatattaattcagactcactgaaagacaatacaattataa 172  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8811 tcaaattatccaacaacaatcttcatattaattcagactcactgaaagac--tacaattataa 8751  T

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Target: scaffold0207 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15321 - 15203
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||| ||| || |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  15321 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatggtataaa-aacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaa 15223  T
Q  115 ttattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  15222 ttattcaacaacaacattca 15203  T

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Target: scaffold0146 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Original strand, 22345 - 22416
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  22345 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattca 22416  T

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Target: scaffold0019 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Original strand, 29445 - 29516
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  29445 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattca 29516  T

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Target: scaffold0292 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 6837 - 6911
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  6837 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 6911  T

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Target: scaffold0018 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 20976 - 21050
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  20976 atgaacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 21050  T

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Target: scaffold0205 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 128
Target Start/End: Original strand, 29897 - 29962
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaa 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  29897 aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaa 29962  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 134
Target Start/End: Original strand, 146008 - 146091
Alignment:
Q  50 cttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||    
T  146008 cttggatgatat-aacaacattatttctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattaatcaacaacaacattca 146091  T

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Target: scaffold0004 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Original strand, 109428 - 109532
Alignment:
Q  45 aacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattca 144  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| || | |||||||||||||  | ||||||||  |||||||| || |||| ||||||||    
T  109428 aacaacttgaatgatatgaacattaatatctctacatcatacaatttccacataatatatgtatctcaaattaaccaacaacattaatcattttaattca 109527  T
Q  145 gactc 149  Q
    |||||    
T  109528 gactc 109532  T

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Target: scaffold0546 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Original strand, 7215 - 7333
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||    
T  7215 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttccatatcatacaatattcacataatttatgtatctcaaa 7313  T
Q  115 ttattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  7314 ttattcaacaacaacattca 7333  T

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Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Original strand, 11082 - 11153
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  11082 aacaacattatttctatgtcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattca 11153  T

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Target: scaffold0109 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 742 - 671
Alignment:
Q  63 aacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  742 aacaacattatttctatgtcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaacaacattca 671  T

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Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6092 - 5974
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||  |||| ||| ||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||    
T  6092 aacaacttgaatcatagcaacattaataataaccacttggatggtat-aacaacattatttccatatcatacaatattcacataatttatgtatctcaaa 5994  T
Q  115 ttattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  5993 ttattcaacaacaacattca 5974  T

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Target: scaffold0096 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 21392 - 21466
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  21392 atgaacaacattatttctatatcataaaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 21466  T

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Target: scaffold1633 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 127
Target Start/End: Original strand, 507 - 559
Alignment:
Q  75 tctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaaca 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  507 tctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaca 559  T

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Target: scaffold0232 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 134
Target Start/End: Original strand, 3609 - 3668
Alignment:
Q  75 tctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  3609 tctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 3668  T

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Target: scaffold0039 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10682 - 10623
Alignment:
Q  75 tctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  10682 tctatatcatacaatattcacataatatatgtatctcaaattattcaataacaacattca 10623  T

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Target: scaffold1276 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 388 - 445
Alignment:
Q  88 atattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcag 145  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  388 atattcacataatataagtatttcaaattatccaacaaagatattcatattaattcag 445  T

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Target: scaffold0445 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2716 - 2608
Alignment:
Q  51 ttgaatgatatgaacaacaata-tgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttc-aaattattcaacaacaatattcatattaattcagact 148  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||||||  | || ||||||  ||||| || || | || ||||||||||||    
T  2716 ttgaatgatatgaacaacaatattttctatatcatacaatttccacataatatatgtatctcaaaattaaccaacatcattaatgattttaattcagact 2617  T
Q  149 cactgaaag 157  Q
    | |||||||    
T  2616 ctctgaaag 2608  T

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Target: scaffold0285 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Original strand, 19013 - 19076
Alignment:
Q  82 catacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattcatattaattcag 145  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |  |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  19013 catacaatatccacataatatacgcatttcaatttatccaaccacaatattcatattaattcag 19076  T

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Target: scaffold0181 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 34210 - 34119
Alignment:
Q  15 aacaacttgcatcataacaacattaacagcaacagcttgaatgatatgaacaacaatat-gtctatatcatacgatattcacataatatatg 105  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  34210 aacaactagcaacatagcaacattaataataacaacttgaatgatataaacaacaatatcttctatatcatacattttccacataatatatg 34119  T

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Target: scaffold0452 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13393 - 13319
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  13393 atgaacaacattatttctatatcatacaatcatcaaataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 13319  T

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Target: scaffold0034 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 120234 - 120308
Alignment:
Q  60 atgaacaacaatatgtctatatcatacgatattcacataatatatgactttcaaattattcaacaacaatattca 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||    
T  120234 atgaacaacattatttctatatcataaaataatcaaataatatatgtatctcaaattattcaacaaagatattca 120308  T

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Target: scaffold0645 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0645
Description:

Target: scaffold0645; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 44 - 4
Alignment:
Q  8 caacaataacaacttgcatcataacaacattaacagcaaca 48  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44 caacaataaaaccttgcatcataacaacattaacaacaaca 4  T

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