View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1111_low_202 (Length: 272)

Name: NF1111_low_202
Description: NF1111
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1111_low_202
NF1111_low_202
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (37-199)||(4071433-4071596)
chr2 (37-199)||(20850270-20850434)
chr2 (37-199)||(21604845-21605009)
chr2 (37-177)||(44091000-44091140)
chr2 (37-177)||(2385833-2385973)
chr2 (37-177)||(24426752-24426892)
chr2 (37-186)||(27729589-27729739)
chr2 (37-174)||(1067177-1067315)
chr2 (37-159)||(4077501-4077623)
chr2 (37-174)||(24481513-24481651)
chr2 (58-177)||(71425-71544)
chr2 (37-174)||(30196428-30196566)
chr2 (37-199)||(34131-34295)
chr2 (37-175)||(31828693-31828832)
chr2 (37-175)||(31834045-31834184)
chr2 (37-175)||(36984478-36984617)
chr2 (37-174)||(1061794-1061932)
chr2 (37-177)||(27037325-27037466)
chr2 (37-174)||(11360157-11360291)
chr2 (37-185)||(35243937-35244086)
chr2 (37-152)||(22013048-22013164)
chr2 (37-179)||(28292800-28292943)
chr2 (37-181)||(11466152-11466296)
chr2 (82-177)||(27272376-27272472)
chr2 (82-136)||(17592492-17592547)
chr2 (82-174)||(14563956-14564045)
chr2 (82-136)||(36800680-36800735)
chr2 (82-136)||(45028632-45028687)
chr2 (82-136)||(13101133-13101188)
chr2 (82-136)||(15643249-15643304)
chr2 (82-136)||(25590161-25590216)
chr2 (82-136)||(32911442-32911497)
chr2 (81-127)||(9241492-9241538)
chr2 (81-127)||(22810042-22810088)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (37-199)||(14882232-14882395)
chr5 (37-199)||(14888909-14889072)
chr5 (37-199)||(22248157-22248321)
chr5 (45-199)||(24008089-24008244)
chr5 (37-199)||(24800300-24800463)
chr5 (37-186)||(43029070-43029220)
chr5 (37-177)||(1111618-1111758)
chr5 (37-177)||(14614890-14615030)
chr5 (37-186)||(40010902-40011052)
chr5 (37-183)||(24794950-24795096)
chr5 (37-186)||(30781094-30781244)
chr5 (37-177)||(5582217-5582357)
chr5 (37-199)||(11995166-11995330)
chr5 (37-177)||(18894935-18895075)
chr5 (37-195)||(37539878-37540038)
chr5 (37-195)||(37547422-37547582)
chr5 (37-177)||(5454518-5454658)
chr5 (37-177)||(15461501-15461641)
chr5 (37-174)||(38013763-38013901)
chr5 (37-199)||(17938799-17938964)
chr5 (37-186)||(10686174-10686323)
chr5 (37-175)||(7507956-7508095)
chr5 (37-177)||(25853005-25853147)
chr5 (39-177)||(25846375-25846515)
chr5 (37-187)||(19508192-19508343)
chr5 (37-177)||(20340569-20340710)
chr5 (37-177)||(20347173-20347314)
chr5 (37-183)||(597303-597451)
chr5 (37-182)||(29746527-29746673)
chr5 (37-177)||(22501008-22501147)
chr5 (37-177)||(22507589-22507728)
chr5 (37-187)||(18566619-18566768)
chr5 (37-183)||(19800272-19800420)
chr5 (82-173)||(16774986-16775078)
chr5 (46-136)||(41877985-41878075)
chr5 (82-174)||(37566161-37566254)
chr5 (82-136)||(5341700-5341755)
chr5 (46-136)||(18941195-18941284)
chr5 (82-136)||(19362721-19362776)
chr5 (46-136)||(20990389-20990479)
chr5 (82-136)||(23076272-23076327)
chr5 (82-136)||(23081720-23081775)
chr5 (82-136)||(23544842-23544897)
chr5 (46-136)||(28259854-28259944)
chr5 (46-136)||(41877815-41877905)
chr5 (82-136)||(19801866-19801921)
chr5 (82-135)||(22379604-22379658)
chr5 (56-127)||(23112708-23112777)
chr5 (56-127)||(34829167-34829236)
chr5 (46-136)||(7773629-7773719)
chr5 (84-136)||(24057724-24057777)
chr5 (82-127)||(25419943-25419988)
chr5 (82-136)||(26650524-26650579)
chr5 (82-136)||(26922109-26922164)
chr5 (82-136)||(39608854-39608909)
chr5 (81-126)||(20937754-20937799)
chr5 (81-126)||(22312801-22312846)
chr5 (66-127)||(10035266-10035325)
chr5 (84-127)||(23444167-23444211)
[»] chr7 (53 HSPs)
chr7 (37-199)||(49150665-49150828)
chr7 (37-199)||(49157355-49157518)
chr7 (37-177)||(8197151-8197291)
chr7 (37-177)||(1317846-1317986)
chr7 (37-177)||(26089902-26090042)
chr7 (37-177)||(40684714-40684854)
chr7 (37-177)||(48987872-48988012)
chr7 (37-185)||(30602804-30602953)
chr7 (37-199)||(42058629-42058794)
chr7 (37-177)||(749923-750063)
chr7 (37-177)||(5187194-5187335)
chr7 (37-177)||(11339851-11339991)
chr7 (37-177)||(11899261-11899401)
chr7 (37-177)||(26113707-26113847)
chr7 (37-177)||(32627477-32627617)
chr7 (37-178)||(11879147-11879288)
chr7 (37-185)||(17726275-17726424)
chr7 (37-185)||(18437109-18437258)
chr7 (37-185)||(33404733-33404882)
chr7 (39-174)||(40922876-40923012)
chr7 (37-156)||(11299626-11299745)
chr7 (37-156)||(11307990-11308109)
chr7 (37-177)||(26120320-26120460)
chr7 (39-177)||(642632-642770)
chr7 (37-177)||(20019622-20019763)
chr7 (37-175)||(2281166-2281305)
chr7 (37-162)||(2026191-2026316)
chr7 (37-166)||(2438964-2439093)
chr7 (37-177)||(13963953-13964094)
chr7 (37-177)||(37285289-37285430)
chr7 (37-183)||(49158822-49158970)
chr7 (37-187)||(13453743-13453892)
chr7 (37-187)||(21757373-21757522)
chr7 (37-156)||(17468226-17468344)
chr7 (37-156)||(17584870-17584988)
chr7 (37-156)||(37379971-37380089)
chr7 (37-181)||(46174405-46174549)
chr7 (37-100)||(8213299-8213362)
chr7 (37-136)||(2388551-2388649)
chr7 (46-136)||(46649858-46649948)
chr7 (82-136)||(15838736-15838791)
chr7 (82-136)||(16843865-16843920)
chr7 (82-136)||(12461640-12461695)
chr7 (82-136)||(19439434-19439489)
chr7 (82-136)||(23521124-23521179)
chr7 (82-136)||(30271776-30271831)
chr7 (82-136)||(13019830-13019885)
chr7 (68-127)||(16073934-16073993)
chr7 (81-127)||(18607025-18607071)
chr7 (81-126)||(14281617-14281662)
chr7 (84-136)||(32771662-32771715)
chr7 (81-126)||(35962709-35962754)
chr7 (56-127)||(15166912-15166983)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (37-199)||(34133877-34134040)
chr6 (37-199)||(15332028-15332192)
chr6 (37-199)||(17309753-17309917)
chr6 (37-177)||(16223588-16223728)
chr6 (37-177)||(25463920-25464060)
chr6 (47-199)||(22406712-22406864)
chr6 (37-177)||(1070697-1070837)
chr6 (37-177)||(25315575-25315715)
chr6 (37-177)||(26203069-26203209)
chr6 (37-177)||(29159148-29159288)
chr6 (37-177)||(24362647-24362787)
chr6 (37-177)||(24369266-24369406)
chr6 (37-177)||(30799367-30799507)
chr6 (58-177)||(19096717-19096836)
chr6 (37-181)||(8069619-8069764)
chr6 (37-187)||(4106776-4106923)
chr6 (37-181)||(94420-94564)
chr6 (46-173)||(27767447-27767574)
chr6 (46-177)||(10470666-10470797)
chr6 (82-127)||(14582927-14582972)
chr6 (56-127)||(19300639-19300708)
chr6 (82-136)||(10464185-10464240)
chr6 (82-136)||(12447172-12447227)
chr6 (46-136)||(13128242-13128332)
chr6 (82-136)||(17207714-17207769)
chr6 (82-136)||(23021325-23021380)
chr6 (82-136)||(29925817-29925872)
chr6 (75-127)||(14133011-14133064)
chr6 (82-137)||(13940556-13940612)
chr6 (81-127)||(8768145-8768191)
chr6 (81-126)||(19726765-19726810)
chr6 (82-129)||(17027156-17027204)
chr6 (84-127)||(18786230-18786274)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (37-199)||(38907927-38908090)
chr1 (37-199)||(37682165-37682329)
chr1 (37-199)||(39189554-39189717)
chr1 (37-199)||(37675472-37675636)
chr1 (37-177)||(6740597-6740737)
chr1 (37-177)||(31535196-31535336)
chr1 (37-177)||(31563913-31564053)
chr1 (37-177)||(48427932-48428072)
chr1 (37-185)||(18026639-18026788)
chr1 (39-186)||(18418205-18418354)
chr1 (37-177)||(20277148-20277288)
chr1 (37-177)||(28556398-28556538)
chr1 (37-174)||(39094400-39094538)
chr1 (58-186)||(36211937-36212066)
chr1 (58-185)||(20396760-20396888)
chr1 (45-199)||(20570828-20570984)
chr1 (37-143)||(22185534-22185640)
chr1 (45-185)||(20292767-20292909)
chr1 (45-185)||(20299401-20299538)
chr1 (37-187)||(20076836-20076987)
chr1 (38-177)||(42626280-42626418)
chr1 (37-179)||(4231267-4231410)
chr1 (37-160)||(21963084-21963208)
chr1 (94-177)||(17149454-17149537)
chr1 (37-93)||(3652679-3652735)
chr1 (46-136)||(21920884-21920974)
chr1 (46-136)||(29602229-29602319)
chr1 (56-127)||(19961273-19961342)
chr1 (82-136)||(36615058-36615113)
chr1 (82-136)||(49328155-49328210)
chr1 (37-98)||(17146336-17146397)
chr1 (46-136)||(29596794-29596884)
chr1 (82-125)||(43088514-43088557)
chr1 (82-136)||(47484229-47484284)
chr1 (81-127)||(20242693-20242739)
chr1 (81-126)||(23066673-23066718)
chr1 (83-127)||(20824329-20824373)
chr1 (84-127)||(21698261-21698305)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (37-199)||(36800328-36800492)
chr8 (37-186)||(16887198-16887348)
chr8 (37-199)||(214023-214187)
chr8 (37-199)||(238067-238231)
chr8 (37-199)||(727646-727810)
chr8 (37-199)||(800147-800311)
chr8 (37-199)||(851540-851704)
chr8 (37-199)||(27909470-27909634)
chr8 (37-199)||(27955889-27956053)
chr8 (37-185)||(23224648-23224797)
chr8 (37-177)||(9205260-9205400)
chr8 (37-186)||(14736720-14736871)
chr8 (37-177)||(28980805-28980947)
chr8 (37-177)||(28986025-28986167)
chr8 (37-199)||(4520619-4520784)
chr8 (37-199)||(23117290-23117454)
chr8 (37-156)||(14563622-14563741)
chr8 (37-157)||(14765668-14765788)
chr8 (37-177)||(35541129-35541269)
chr8 (37-187)||(10956585-10956735)
chr8 (37-187)||(3697724-3697875)
chr8 (37-177)||(3224592-3224733)
chr8 (82-187)||(10948503-10948608)
chr8 (37-181)||(14746424-14746570)
chr8 (37-177)||(26485929-26486070)
chr8 (37-187)||(40144195-40144344)
chr8 (37-177)||(27345797-27345936)
chr8 (37-177)||(6588151-6588290)
chr8 (37-187)||(16266769-16266920)
chr8 (117-199)||(807925-808008)
chr8 (46-177)||(27873842-27873973)
chr8 (46-177)||(27948630-27948761)
chr8 (46-177)||(27889972-27890103)
chr8 (82-174)||(11392519-11392612)
chr8 (45-179)||(25701476-25701610)
chr8 (46-136)||(14416525-14416615)
chr8 (82-136)||(29299030-29299085)
chr8 (82-136)||(29305576-29305631)
chr8 (46-136)||(29328284-29328374)
chr8 (81-127)||(22063558-22063604)
chr8 (81-127)||(22176030-22176076)
chr8 (66-127)||(39363631-39363692)
chr8 (84-136)||(20006386-20006439)
chr8 (56-127)||(8728980-8729051)
chr8 (111-177)||(27902275-27902342)
chr8 (45-136)||(43687487-43687577)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (37-199)||(26395713-26395877)
chr4 (37-186)||(52500579-52500729)
chr4 (37-199)||(11937186-11937350)
chr4 (37-177)||(21396845-21396985)
chr4 (37-186)||(391194-391344)
chr4 (37-177)||(3266533-3266673)
chr4 (37-177)||(49240758-49240898)
chr4 (37-177)||(49749472-49749612)
chr4 (37-186)||(3259895-3260045)
chr4 (37-177)||(39266151-39266291)
chr4 (37-162)||(23435911-23436036)
chr4 (37-174)||(29448592-29448730)
chr4 (37-174)||(29455276-29455414)
chr4 (37-177)||(29382678-29382818)
chr4 (37-187)||(11202333-11202484)
chr4 (58-177)||(50082269-50082388)
chr4 (37-177)||(7359276-7359416)
chr4 (37-177)||(1583938-1584078)
chr4 (37-187)||(45959644-45959795)
chr4 (45-162)||(5938961-5939079)
chr4 (37-183)||(45142455-45142603)
chr4 (37-127)||(34772196-34772286)
chr4 (46-187)||(20895032-20895173)
chr4 (82-187)||(42955925-42956031)
chr4 (46-177)||(31665098-31665229)
chr4 (82-187)||(20889448-20889554)
chr4 (46-174)||(2972649-2972777)
chr4 (82-174)||(19128259-19128352)
chr4 (37-136)||(47872376-47872475)
chr4 (82-179)||(36037636-36037734)
chr4 (37-127)||(54844912-54845001)
chr4 (82-136)||(49548538-49548593)
chr4 (82-185)||(21881665-21881770)
chr4 (82-136)||(899666-899721)
chr4 (82-136)||(30396269-30396324)
chr4 (82-136)||(33097166-33097221)
chr4 (46-136)||(35462566-35462656)
chr4 (46-136)||(49548323-49548413)
chr4 (83-136)||(41404662-41404716)
chr4 (37-82)||(391154-391199)
chr4 (56-127)||(14910723-14910792)
chr4 (46-136)||(33221408-33221498)
chr4 (82-136)||(42220504-42220559)
chr4 (82-136)||(46044825-46044880)
chr4 (59-127)||(27905352-27905418)
chr4 (37-93)||(7356283-7356339)
chr4 (56-127)||(14485649-14485717)
chr4 (81-127)||(18212297-18212343)
chr4 (81-127)||(26077682-26077728)
chr4 (81-126)||(17000139-17000184)
chr4 (67-127)||(30237898-30237958)
chr4 (84-127)||(10972873-10972917)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (37-199)||(10382001-10382165)
chr3 (37-199)||(10410654-10410818)
chr3 (37-199)||(29493615-29493778)
chr3 (37-186)||(21151394-21151544)
chr3 (37-177)||(28758961-28759101)
chr3 (37-177)||(50142716-50142856)
chr3 (37-186)||(2498980-2499131)
chr3 (37-177)||(43724011-43724151)
chr3 (37-177)||(47121209-47121349)
chr3 (37-177)||(47128577-47128717)
chr3 (37-174)||(50655937-50656075)
chr3 (37-174)||(53571183-53571321)
chr3 (37-177)||(54833134-54833274)
chr3 (37-175)||(3782700-3782839)
chr3 (37-177)||(10767818-10767958)
chr3 (37-187)||(9771852-9772003)
chr3 (37-147)||(45611728-45611838)
chr3 (37-187)||(12271331-12271482)
chr3 (69-186)||(6927477-6927596)
chr3 (39-199)||(14845090-14845253)
chr3 (45-178)||(38743004-38743138)
chr3 (37-187)||(48774554-48774705)
chr3 (46-177)||(16331541-16331672)
chr3 (46-177)||(16833305-16833436)
chr3 (46-177)||(54091684-54091815)
chr3 (46-136)||(3802581-3802671)
chr3 (46-136)||(15374724-15374814)
chr3 (82-179)||(29545108-29545206)
chr3 (46-136)||(54520130-54520220)
chr3 (82-136)||(8373914-8373969)
chr3 (46-136)||(9691396-9691486)
chr3 (82-136)||(11956585-11956640)
chr3 (46-136)||(20187825-20187915)
chr3 (46-136)||(20377229-20377319)
chr3 (82-136)||(30596848-30596903)
chr3 (46-136)||(54520345-54520435)
chr3 (82-127)||(19344151-19344196)
chr3 (46-136)||(3802743-3802833)
chr3 (82-136)||(32388006-32388061)
chr3 (82-127)||(18961077-18961122)
chr3 (82-127)||(49163272-49163317)
chr3 (56-127)||(13313907-13313976)
chr3 (125-177)||(16414230-16414281)
chr3 (82-136)||(12725113-12725168)
chr3 (82-136)||(29551042-29551097)
chr3 (82-136)||(46071099-46071154)
chr3 (56-127)||(13324819-13324888)
chr3 (56-127)||(38312118-38312187)
chr3 (81-127)||(23173921-23173967)
chr3 (67-127)||(12274375-12274435)
chr3 (75-127)||(17512698-17512751)
chr3 (56-127)||(20249105-20249175)
chr3 (56-127)||(13303231-13303300)
chr3 (84-127)||(15934960-15935004)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (37-199)||(13486-13650)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (37-186)||(18349-18499)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (37-185)||(12158-12307)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (37-177)||(18463-18603)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (37-177)||(104367-104507)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (39-174)||(50083-50219)
[»] scaffold0279 (1 HSPs)
scaffold0279 (37-187)||(5651-5802)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (37-187)||(31720-31871)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (45-187)||(4569-4710)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (37-187)||(512465-512614)
scaffold0001 (82-136)||(179126-179181)
scaffold0001 (84-127)||(488350-488394)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (37-182)||(19688-19832)
scaffold0103 (37-182)||(23752-23897)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (37-187)||(947-1098)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (45-173)||(25128-25255)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (37-136)||(972-1072)
[»] scaffold0214 (1 HSPs)
scaffold0214 (37-187)||(15128-15278)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (101-175)||(22027-22101)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (82-177)||(19337-19433)
scaffold0113 (82-177)||(15239-15335)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (46-174)||(12948-13076)
scaffold0310 (46-107)||(7801-7861)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (37-136)||(15182-15281)
[»] scaffold1427 (2 HSPs)
scaffold1427 (46-136)||(712-802)
scaffold1427 (56-127)||(976-1045)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (46-179)||(65241-65374)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (46-136)||(2102-2192)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (46-136)||(9842-9932)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (82-136)||(184-239)
scaffold0076 (81-127)||(51672-51718)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (82-136)||(74112-74167)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (82-136)||(137199-137254)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (82-177)||(24770-24867)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (56-127)||(11912-11981)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (56-127)||(24472-24541)
scaffold0261 (84-127)||(10626-10670)
scaffold0261 (84-127)||(18805-18849)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (82-136)||(20102-20157)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (82-136)||(30955-31010)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (46-193)||(101586-101734)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (82-136)||(247142-247197)
scaffold0009 (82-136)||(253656-253711)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (82-136)||(41353-41408)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (56-127)||(72367-72436)
scaffold0034 (81-127)||(10076-10122)
scaffold0034 (56-127)||(17372-17440)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (81-127)||(139-185)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (90-127)||(5377-5415)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (81-127)||(7409-7455)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (81-127)||(36789-36835)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (81-127)||(41588-41634)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (81-127)||(20489-20535)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (81-126)||(14469-14514)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (81-126)||(42090-42135)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (81-122)||(50948-50989)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (81-126)||(17637-17682)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (84-127)||(6293-6337)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (84-127)||(4091-4135)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (82-129)||(19439-19487)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (84-127)||(55912-55956)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (84-127)||(38723-38767)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4071596 - 4071433
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4071596 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 4071497  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaacatacaatgcat 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4071496 aatgcaactccaagtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaacatacaatgcat 4071433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 20850270 - 20850434
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20850270 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 20850369  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20850370 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 20850434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 21604845 - 21605009
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21604845 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21604944  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21604945 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 21605009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44091140 - 44091000
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44091140 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 44091041  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44091040 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 44091000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2385973 - 2385833
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2385973 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2385874  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2385873 atgcaactccatatgactccacttaaacaacatgtatgatt 2385833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24426892 - 24426752
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24426892 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24426793  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24426792 atgcaactccatatgactccacttaaacaacatgtatgatt 24426752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Original strand, 27729589 - 27729739
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27729589 gctgttgagcaactagtactctagggccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttatgtatatctacatacaactgaccatgca 27729688  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataattaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27729689 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 27729739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 1067177 - 1067315
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1067177 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1067276  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  1067277 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 1067315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 4077501 - 4077623
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4077501 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 4077600  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccact 159  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4077601 atgcaactccatgtgactccact 4077623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24481651 - 24481513
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24481651 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24481552  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  24481551 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 24481513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 71544 - 71425
Alignment:
Q  58 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71544 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 71445  T
Q  158 cttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  71444 cttaaacaacatgtatgatt 71425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30196566 - 30196428
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30196566 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30196467  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  30196466 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 30196428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 34131 - 34295
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34131 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 34230  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34231 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattaatagttaaaacatacaatgcat 34295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 31828693 - 31828832
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31828693 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 31828792  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  31828793 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatga 31828832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 31834045 - 31834184
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31834045 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 31834144  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  31834145 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatga 31834184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 36984617 - 36984478
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36984617 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 36984518  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  36984517 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatga 36984478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 1061794 - 1061932
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1061794 gctgttgagcaactactactccaggaccgaagccctcatcgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1061893  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  1061894 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 1061932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 27037325 - 27037466
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27037325 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27037424  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27037425 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgatt 27037466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11360291 - 11360157
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11360291 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttat----atgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaactgaccatgca 11360196  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  11360195 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 11360157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35244086 - 35243937
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35244086 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 35243987  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatta 185  Q
    |    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35243986 atacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatggttaataatta 35243937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22013164 - 22013048
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22013164 gctgttgagcaactaatactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggaactacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22013065  T
Q  137 atgc-aactccatgtga 152  Q
    |||| ||||||||||||    
T  22013064 atgcaaactccatgtga 22013048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Original strand, 28292800 - 28292943
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28292800 gctgttgagcaactagtactccaggacaaaagacatcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccttgc 28292899  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaa 179  Q
    |    |||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||    
T  28292900 atacaaactccatatgactccacttttacaacatgtatgtttaa 28292943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 181
Target Start/End: Original strand, 11466152 - 11466296
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11466152 gctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 11466250  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaata 181  Q
     || || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11466251 -atacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatggttaata 11466296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 177
Target Start/End: Original strand, 27272376 - 27272472
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27272376 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaacaacatatatgatt 27272472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17592547 - 17592492
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17592547 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 17592492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Original strand, 14563956 - 14564045
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||     ||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  14563956 tttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccataca----tactccatatgactccacttatacaacatgtatg 14564045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 36800680 - 36800735
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36800680 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 36800735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 45028632 - 45028687
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45028632 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 45028687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13101188 - 13101133
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13101188 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 13101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15643304 - 15643249
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15643304 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 15643249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25590216 - 25590161
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25590216 tttatgcatatgaaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 25590161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32911497 - 32911442
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32911497 tttatgcatatgctatgcacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 32911442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 9241492 - 9241538
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9241492 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 9241538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 22810042 - 22810088
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22810042 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22810088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14882395 - 14882232
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14882395 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 14882296  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14882295 aatgcaactccatgtgactccacttaactaacatgtatgattaacaattaaacatacaatgcat 14882232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14889072 - 14888909
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14889072 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 14888973  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14888972 aatgcaactccatgtgactccacttaactaacatgtatgattaacaattaaacatacaatgcat 14888909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22248321 - 22248157
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22248321 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22248222  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22248221 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 22248157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 199
Target Start/End: Original strand, 24008089 - 24008244
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24008089 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacatgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 24008188  T
Q  145 ccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24008189 ccatgtgactccacttaaacgacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 24008244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24800463 - 24800300
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24800463 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24800364  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24800363 atgcaactccatgtgactccacttaatcgacaagtatgattaataattaaaacatacaatgcat 24800300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Original strand, 43029070 - 43029220
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43029070 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 43029169  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataattaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43029170 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 43029220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1111758 - 1111618
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1111758 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1111659  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1111658 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 1111618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14615030 - 14614890
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14615030 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14614931  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14614930 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 14614890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 40011052 - 40010902
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40011052 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 40010953  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataattaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  40010952 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 40010902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24795096 - 24794950
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795096 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24794997  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  24794996 atgcaactccatgtgactccacttaatcgacaagtatgattaataat 24794950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Original strand, 30781094 - 30781244
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30781094 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30781193  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataattaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||    
T  30781194 atgcaactccatgtgactccactttaacaatatgtatgattcaataattaa 30781244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5582357 - 5582217
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5582357 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 5582258  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  5582257 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 5582217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 11995166 - 11995330
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995166 gctgttgagcaactagtactctaggaccgaagccctcaccgcagttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11995265  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11995266 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgatcaataattaaaacatacaatgcat 11995330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18895075 - 18894935
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18895075 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 18894976  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  18894975 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 18894935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37540038 - 37539878
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37540038 gctgttgagtaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37539939  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactt-aaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaat 195  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37539938 atgcaactccatgtgactccaattaaaacaacatgtatgattaatatttaaaacatacaat 37539878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37547582 - 37547422
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37547582 gctgttgagtaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37547483  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactt-aaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaat 195  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37547482 atgcaactccatgtgactccaattaaaacaacatgtatgattaatatttaaaacatacaat 37547422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 5454518 - 5454658
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5454518 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 5454617  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  5454618 atgcaactccatgtgacttcactataataatatgtatgatt 5454658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 15461501 - 15461641
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461501 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaacggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 15461600  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  15461601 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 15461641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 38013763 - 38013901
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38013763 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 38013862  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  38013863 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 38013901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17938964 - 17938799
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17938964 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 17938865  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactta-aataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  17938864 aatgcaactccatgtgactccaattattacaacatgtatgatcaatagttaaaacatacaatgcat 17938799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Original strand, 10686174 - 10686323
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10686174 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccataca 10686273  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataattaa 186  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  10686274 atgcaacttcatgtgattccactt-aacaacatgtatgattcaataattaa 10686323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7508095 - 7507956
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508095 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 7507996  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  7507995 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatga 7507956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 25853005 - 25853147
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25853005 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 25853104  T
Q  137 atgcaactc--catgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||   || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  25853105 atgcaactcaatatatgactccactttaacaacatgtatgatt 25853147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 177
Target Start/End: Original strand, 25846375 - 25846515
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25846375 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 25846474  T
Q  139 gcaactc--catgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||   || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  25846475 gcaactcaatatatgactccactttaacaacatgtatgatt 25846515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 19508192 - 19508343
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19508192 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatagacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 19508291  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19508292 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattaatagttaaa 19508343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 20340569 - 20340710
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340569 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 20340668  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  20340669 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtgtgatt 20340710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 20347173 - 20347314
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20347173 gctgttgagcaactagtactccaggacatgaatcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 20347272  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  20347273 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtgtgatt 20347314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Original strand, 597303 - 597451
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  597303 gctgttgagcaactagtactcctggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 597402  T
Q  137 atgc-aactccatgt-gactccacttaaataacatgtatgattaataat 183  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  597403 atgcaaactccatataaactccactttaacaacatgtatggttaataat 597451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29746673 - 29746527
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29746673 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 29746574  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataa 182  Q
    |    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  29746573 atacaaactccatatgacttcacttaaacaacatgtatggttaataa 29746527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 22501008 - 22501147
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22501008 gctgttgagcaactagtgctccaagacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22501106  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
        ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22501107 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatatatgatt 22501147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 22507589 - 22507728
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22507589 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtatatatctacatacaactgaccatgca 22507687  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
        ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22507688 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatctatgatt 22507728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 18566619 - 18566768
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18566619 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaattgaccatgca 18566717  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
        |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||    
T  18566718 tacaaactccttgtgactccacttaaacaacgtgtatggttaatagttaaa 18566768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19800420 - 19800272
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19800420 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcagtggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 19800321  T
Q  136 aatgcaactccatgt-gactccacttaaataacatgtatgattaataat 183  Q
    |    |||||||| |  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19800320 atacaaactccatataaactccacttaaacaacatgtatggttaataat 19800272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16775078 - 16774986
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtat 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16775078 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaataacatgtat 16774986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41878075 - 41877985
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41878075 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 41877985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Original strand, 37566161 - 37566254
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  37566161 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccaattatacaacatgtatg 37566254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5341755 - 5341700
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5341755 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 5341700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18941284 - 18941195
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18941284 caactagtgctccaggacatgagccctc-ccgctgttt-atgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 18941195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 19362721 - 19362776
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19362721 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 19362776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 20990389 - 20990479
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20990389 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 20990479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23076327 - 23076272
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23076327 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23076272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23081775 - 23081720
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23081775 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23081720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23544897 - 23544842
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23544897 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23544842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 28259944 - 28259854
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28259944 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 28259854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41877905 - 41877815
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41877905 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 41877815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19801921 - 19801866
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19801921 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 19801866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 135
Target Start/End: Original strand, 22379604 - 22379658
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22379604 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 22379658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23112777 - 23112708
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23112777 tccaggaccgaggccatcaccgct--tttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatacaact 23112708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 34829167 - 34829236
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34829167 tccaggaccgaggtcctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 34829236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7773719 - 7773629
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7773719 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgaaatggacccactcgtgtatttctacatacaactagaccatgca 7773629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 24057724 - 24057777
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24057724 tatgcatatgctatggacccacttgtgtatatcaacatacaacttgaccatgca 24057777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 25419943 - 25419988
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25419943 tttatgcatatgttatggacccacttgtgtatatctacatacaact 25419988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 26650524 - 26650579
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26650524 tttatgcatatgctatggactcactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 26650579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 26922109 - 26922164
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26922109 tttatgcatatgctatggactcactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 26922164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39608909 - 39608854
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39608909 tttatgcatatgttatggactcacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 39608854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 20937754 - 20937799
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20937754 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 20937799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22312846 - 22312801
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22312846 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 22312801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 127
Target Start/End: Original strand, 10035266 - 10035325
Alignment:
Q  66 aagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||||   |||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10035266 aagccctcaccgct---ttatgtttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10035325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23444211 - 23444167
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23444211 tatgcttatgcaatggactctacttgtgtatatctacataaaact 23444167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 49150665 - 49150828
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49150665 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 49150764  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaacatacaatgcat 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49150765 aatgcaactccatgtgaccccacttaactaacatgtatgattaacaattaaacatacaatgcat 49150828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 49157355 - 49157518
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157355 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 49157454  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaacatacaatgcat 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49157455 aatgcaactccatgtgaccccacttaactaacatgtatgattaacaattaaacatacaatgcat 49157518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8197291 - 8197151
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8197291 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 8197192  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8197191 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 8197151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 1317846 - 1317986
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1317846 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1317945  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1317946 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 1317986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26090042 - 26089902
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090042 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26089943  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26089942 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 26089902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40684854 - 40684714
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40684854 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 40684755  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40684754 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 40684714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 48988012 - 48987872
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48988012 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 48987913  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  48987912 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 48987872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30602953 - 30602804
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30602953 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30602854  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataatta 185  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30602853 atgcaactctatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaataatta 30602804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 42058629 - 42058794
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42058629 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 42058728  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42058729 aatgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 42058794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 749923 - 750063
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  749923 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 750022  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  750023 atgcaactccatgtgactcaactttaacaacatgtatgatt 750063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5187335 - 5187194
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5187335 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgcgtatatctacatacaactgaccatgc 5187236  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5187235 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 5187194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 11339851 - 11339991
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11339851 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11339950  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11339951 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgatt 11339991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11899401 - 11899261
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11899401 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11899302  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  11899301 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgatt 11899261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26113847 - 26113707
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113847 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26113748  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  26113747 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 26113707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 32627477 - 32627617
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32627477 gctgttgagcaactagtactccagaaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 32627576  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  32627577 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 32627617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 178
Target Start/End: Original strand, 11879147 - 11879288
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11879147 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttcatgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatacaactgaccatgca 11879246  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  11879247 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatta 11879288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17726424 - 17726275
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17726424 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17726325  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataatta 185  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||| ||||||||    
T  17726324 atgcaactccatatgattccactttaacaatatgtatgattcaataatta 17726275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18437258 - 18437109
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18437258 gctgttgagcaactagtactccaggactgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 18437159  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataatta 185  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||    
T  18437158 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgattcaataatta 18437109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 33404733 - 33404882
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33404733 gctgttgagcaactagtactctaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 33404832  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataatta 185  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||    
T  33404833 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgattcaataatta 33404882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40923012 - 40922876
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40923012 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 40922913  T
Q  139 gcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  40922912 gcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 40922876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11299745 - 11299626
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11299745 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11299646  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11299645 atgcaactccatgtgactcc 11299626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11308109 - 11307990
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11308109 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11308010  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11308009 atgcaactccatgtgactcc 11307990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26120460 - 26120320
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26120460 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtggatatctacatacaactgaccatgca 26120361  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  26120360 atgcaacaacatgtgactccactataataatatgtatgatt 26120320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 177
Target Start/End: Original strand, 642632 - 642770
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  642632 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaaatgaccatgcaat 642731  T
Q  139 gcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||    
T  642732 gcaactcaatatgactccactttaacaatatgtatgatt 642770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20019763 - 20019622
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20019763 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 20019664  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20019663 atacaaactccatgtgactccacttaaaaaacatgtatgatt 20019622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 2281166 - 2281305
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281166 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctatttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 2281265  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  2281266 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatga 2281305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2026316 - 2026191
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2026316 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagctctcaccgttgttttatgcatatggaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2026217  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2026216 atgcaactccatgtgactccaattaa 2026191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 2438964 - 2439093
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2438964 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaactgaccatgca 2439063  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataa 166  Q
    |||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  2439064 atgcaactcattatgactccactttaataa 2439093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13964094 - 13963953
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964094 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 13963995  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13963994 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgatt 13963953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 37285289 - 37285430
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37285289 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37285388  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  37285389 atgcaaacttcatgtgacaccacttaaacaacatgtgtgatt 37285430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Original strand, 49158822 - 49158970
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49158822 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 49158921  T
Q  137 atgc-aactccatgt-gactccacttaaataacatgtatgattaataat 183  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  49158922 atgcaaactccatataaactccactttaacaacatgtatggttaataat 49158970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13453892 - 13453743
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13453892 gctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 13453794  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
        |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13453793 tacaaacttcatgtgactccacttaaataacatgtatggttaatagttaaa 13453743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 21757373 - 21757522
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21757373 gctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21757471  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  21757472 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatggttaatagttaaa 21757522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17468344 - 17468226
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17468344 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17468246  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
        ||||||||||||||||    
T  17468245 tacaaactccatgtgactcc 17468226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 17584870 - 17584988
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17584870 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17584968  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
        ||||||||||||||||    
T  17584969 tacaaactccatgtgactcc 17584988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 37379971 - 37380089
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37379971 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37380069  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
        ||||||||||||||||    
T  37380070 tacaaactccatgtgactcc 37380089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 181
Target Start/End: Original strand, 46174405 - 46174549
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46174405 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcccctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacatgaccatgc 46174503  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaata 181  Q
     || || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  46174504 -atacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatggttaata 46174549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 8213362 - 8213299
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8213362 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgga 8213299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 2388649 - 2388551
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2388649 gctgttgagcaactagtgctccagaacatgagtcctctctgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2388551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 46649858 - 46649948
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46649858 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 46649948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 15838736 - 15838791
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15838736 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 15838791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16843920 - 16843865
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16843920 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 16843865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 12461640 - 12461695
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12461640 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 12461695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 19439434 - 19439489
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19439434 tttatgcatattctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 19439489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 23521124 - 23521179
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23521124 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23521179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30271831 - 30271776
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30271831 tttatgcatatgctgtggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 30271776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 13019830 - 13019885
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13019830 tttatgcatatgttatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 13019885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16073993 - 16073934
Alignment:
Q  68 gccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16073993 gccctcaccgct-ttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 16073934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 18607025 - 18607071
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18607025 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18607071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14281662 - 14281617
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14281662 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 14281617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 32771662 - 32771715
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  32771662 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaacttacaatgca 32771715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 35962754 - 35962709
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35962754 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 35962709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 15166912 - 15166983
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15166912 tccaggaccgaagtcctcatcgtt-ttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 15166983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 34134040 - 34133877
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34134040 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 34133941  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataattaaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  34133940 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatacttaaacatacaatgcat 34133877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15332192 - 15332028
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15332192 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 15332093  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15332092 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 15332028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 17309753 - 17309917
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17309753 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17309852  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17309853 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 17309917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16223728 - 16223588
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16223728 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 16223629  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16223628 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 16223588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 25463920 - 25464060
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25463920 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 25464019  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25464020 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 25464060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 199
Target Start/End: Original strand, 22406712 - 22406864
Alignment:
Q  47 aactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22406712 aactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctact-gtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactc 22406810  T
Q  146 catgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaacatacaatgcat 199  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22406811 catatgactccacttaactaacatgtatgattaacaattaaacatacaatgcat 22406864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 1070697 - 1070837
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1070697 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1070796  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1070797 atgcaactaaatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 1070837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25315715 - 25315575
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25315715 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 25315616  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  25315615 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 25315575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26203209 - 26203069
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26203209 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26203110  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  26203109 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 26203069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 29159148 - 29159288
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29159148 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 29159247  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29159248 atgcaactccatatgattccacttaaacaacatgtatgatt 29159288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 24362647 - 24362787
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24362647 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24362746  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24362747 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgatt 24362787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 24369266 - 24369406
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24369266 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24369365  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24369366 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgatt 24369406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30799507 - 30799367
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30799507 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30799408  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    
T  30799407 atgcaactccatgcgactccactataataatatgtatgatt 30799367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19096836 - 19096717
Alignment:
Q  58 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19096836 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactcca 19096737  T
Q  158 cttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  19096736 cttaaacaacatgtatgatt 19096717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8069764 - 8069619
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8069764 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 8069665  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaata 181  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8069664 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatggttaata 8069619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 4106776 - 4106923
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4106776 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagccctctccgctgttttatgcatatgccatggacc----tgtgtatgtctacatacaactgaccatgca 4106871  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4106872 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattaatatttaaa 4106923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 94564 - 94420
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  94564 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 94466  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaata 181  Q
     || || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  94465 -atacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatggttaata 94420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 173
Target Start/End: Original strand, 27767447 - 27767574
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  27767447 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 27767544  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtat 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27767545 tccatatgactccacttatataacatgtat 27767574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10470797 - 10470666
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  10470797 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 10470700  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  10470699 tccatatgactccacttatacaacatgtatgatt 10470666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 14582927 - 14582972
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14582927 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 14582972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19300708 - 19300639
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19300708 tccaagaccgaagccctcaccgct--tttatgcttatgcaattgacccacttatgtatatctacatacaact 19300639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10464240 - 10464185
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10464240 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 10464185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12447227 - 12447172
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12447227 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 12447172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13128332 - 13128242
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13128332 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atggatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 13128242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17207769 - 17207714
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17207769 tttatgcatatgcaatggaccaactagtgtatatctacatacaacttgaccatgca 17207714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23021380 - 23021325
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23021380 tttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23021325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 29925817 - 29925872
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29925817 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 29925872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14133064 - 14133011
Alignment:
Q  75 ccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14133064 ccgctgttttatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 14133011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 13940556 - 13940612
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaa 137  Q
    ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13940556 tttatgcatatgttatggacccaattgtgtatatctacatacaacatgaccatgcaa 13940612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8768191 - 8768145
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8768191 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 8768145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 19726765 - 19726810
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19726765 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 19726810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17027204 - 17027156
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactga 129  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17027204 tttatgcttatgcaatgaactccacttgtgtatatctacatacaactga 17027156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Original strand, 18786230 - 18786274
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18786230 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18786274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38908090 - 38907927
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38908090 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 38907991  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38907990 atgcaacttcatgtgactccacttaaacgacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 38907927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 37682165 - 37682329
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682165 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 37682264  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37682265 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 37682329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39189717 - 39189554
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39189717 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 39189618  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39189617 atgcaactccatgtgactccacttaatcgacaagtatgattaataattaaaacatacaatgcat 39189554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 37675472 - 37675636
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37675472 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccttcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 37675571  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37675572 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 37675636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 6740597 - 6740737
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740597 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 6740696  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6740697 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 6740737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31535336 - 31535196
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31535336 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 31535237  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31535236 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 31535196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31564053 - 31563913
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564053 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 31563954  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31563953 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 31563913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 48427932 - 48428072
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427932 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 48428031  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  48428032 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 48428072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18026788 - 18026639
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18026788 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 18026689  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataatta 185  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||    
T  18026688 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgattcaataatta 18026639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 186
Target Start/End: Original strand, 18418205 - 18418354
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18418205 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaac 18418304  T
Q  139 gcaactccatgtgactccactt-aaataacatgtatgatt-aataattaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18418305 gcaactccatgtgactccacttaaaacaacatgtatgattcaataattaa 18418354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20277288 - 20277148
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20277288 gctgttgagcaactagtactccaggaccaaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 20277189  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  20277188 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 20277148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28556538 - 28556398
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28556538 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28556439  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    
T  28556438 atgcaactccatgcgactccactataataatatgtatgatt 28556398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 39094400 - 39094538
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39094400 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 39094499  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  39094500 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 39094538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36212066 - 36211937
Alignment:
Q  58 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36212066 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 36211967  T
Q  158 cttaaataacatgtatgatt-aataattaa 186  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36211966 cttaaacaacatgtatgattcaataattaa 36211937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20396888 - 20396760
Alignment:
Q  58 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20396888 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 20396789  T
Q  158 cttaaataacatgtatgatt-aataatta 185  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20396788 cttaaacaacatgtatgattcaataatta 20396760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 199
Target Start/End: Original strand, 20570828 - 20570984
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aac 143  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20570828 gcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaac 20570927  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20570928 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattaatagttaaaacatacaatgcat 20570984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22185640 - 22185534
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22185640 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22185541  T
Q  137 atgcaac 143  Q
    |||||||    
T  22185540 atgcaac 22185534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 185
Target Start/End: Original strand, 20292767 - 20292909
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aac 143  Q
    |||||||||||||||||||   || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20292767 gcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaac 20292866  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataatta 185  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20292867 tccatgtaacaccacttaaacaacatgtatgattcaataatta 20292909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 185
Target Start/End: Original strand, 20299401 - 20299538
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    |||||||||||||||||||   || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  20299401 gcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatg----t 20299496  T
Q  145 ccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataatta 185  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20299497 ccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataatta 20299538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20076987 - 20076836
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20076987 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctctgctgttttatgcatatgcaatggacttacttgtgtatatctacatacaacatgaccatgc 20076888  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
     || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20076887 -atacatactccatatgactccacttaaataacatgtatggttaataaataaa 20076836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 177
Target Start/End: Original strand, 42626280 - 42626418
Alignment:
Q  38 ctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaa 137  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42626280 ctgttgagcaactagtgctccaggacatgggtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcat 42626378  T
Q  138 tgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
       ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42626379 acaaactccatgtgactccacttaaacaacatctatgatt 42626418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Original strand, 4231267 - 4231410
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4231267 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 4231366  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaa 179  Q
    |    |||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||    
T  4231367 atacaaactccatatgactccacttctacaacatgtatgcttaa 4231410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 160
Target Start/End: Original strand, 21963084 - 21963208
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21963084 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 21963183  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactt 160  Q
    |    |||||||| |||||||||||    
T  21963184 atacaaactccatatgactccactt 21963208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 17149454 - 17149537
Alignment:
Q  94 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  17149454 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccactt-aacaacatgtatgatt 17149537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 3652735 - 3652679
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatg 93  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3652735 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcatatg 3652679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 21920884 - 21920974
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21920884 caactagtactccaggacataagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatgaaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 21920974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29602319 - 29602229
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29602319 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 29602229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 19961273 - 19961342
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19961273 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 19961342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 36615058 - 36615113
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36615058 tttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 36615113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 49328155 - 49328210
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49328155 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 49328210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 98
Target Start/End: Original strand, 17146336 - 17146397
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17146336 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 17146397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29596884 - 29596794
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29596884 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgtaatggacccactcgtgtatttctacatacaactagaccatgca 29596794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 43088514 - 43088557
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43088514 tttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaa 43088557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 47484229 - 47484284
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47484229 tttatgcatatgctatagacccactagtgtatatctacatacaacttgaccatgca 47484284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 20242693 - 20242739
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20242693 ttttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatacaact 20242739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23066718 - 23066673
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23066718 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 23066673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20824373 - 20824329
Alignment:
Q  83 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20824373 ttatgcttatgcaactaacctacttgtgtatatctacatacaact 20824329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Original strand, 21698261 - 21698305
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21698261 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 21698305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36800492 - 36800328
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36800492 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 36800393  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36800392 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 36800328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16887348 - 16887198
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16887348 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 16887249  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataattaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16887248 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 16887198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 214023 - 214187
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214023 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 214122  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  214123 aatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 214187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 238231 - 238067
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238231 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 238132  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  238131 aatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 238067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 727646 - 727810
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  727646 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 727745  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  727746 aatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 727810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 800147 - 800311
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  800147 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 800246  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  800247 aatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 800311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 851540 - 851704
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851540 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 851639  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  851640 aatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 851704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27909634 - 27909470
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27909634 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27909535  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27909534 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgatcaataattaaaacatacaatgcat 27909470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27956053 - 27955889
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27956053 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27955954  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27955953 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgatcaataattaaaacatacaatgcat 27955889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23224797 - 23224648
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23224797 gctgttgagcaactagtactccaggaacgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 23224698  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataatta 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23224697 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatta 23224648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9205400 - 9205260
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9205400 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 9205301  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9205300 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 9205260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14736871 - 14736720
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14736871 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctattttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14736772  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactt-aaataacatgtatgatt-aataattaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14736771 atgcaactccatgtgactccacttaaaacaacatgtatgattcaataattaa 14736720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 28980805 - 28980947
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28980805 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28980904  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaat--aacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  28980905 atgcaactccatgtgactccaattaaatacaacatgtatgatt 28980947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 28986025 - 28986167
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986025 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28986124  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaat--aacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  28986125 atgcaactccatgtgactccaattaaatacaacatgtatgatt 28986167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4520784 - 4520619
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4520784 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 4520685  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  4520684 aatgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgatcaatagttaaaacatacaatgcat 4520619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 23117290 - 23117454
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117290 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 23117389  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23117390 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattaatagttaaaacatacaatgcat 23117454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 14563622 - 14563741
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14563622 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14563721  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14563722 atgcaactccatgtgactcc 14563741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Original strand, 14765668 - 14765788
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14765668 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14765767  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcca 157  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14765768 atgcaactccatgtgactcca 14765788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 35541129 - 35541269
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35541129 gctgttgagcaactcgtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 35541228  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  35541229 atgcaactcaatatgactcccctttaataatatgtatgatt 35541269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10956735 - 10956585
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |   || |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956735 gctgttgagcaactagtactccagggcatgagtcctctccgttgttttatgcatatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 10956636  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10956635 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattaatagttaaa 10956585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 3697724 - 3697875
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3697724 gctgttgagcaactagtactccagtacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 3697823  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  3697824 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatttatagttaaa 3697875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3224733 - 3224592
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3224733 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 3224634  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  3224633 atgcaaactccatgtgacaccacttgaacaacatgtatgatt 3224592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10948608 - 10948503
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaata 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10948608 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattaata 10948509  T
Q  182 attaaa 187  Q
     |||||    
T  10948508 gttaaa 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14746570 - 14746424
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746570 gctgttgagcaactagtgctccaggacttgagtcctctccgctgtttttatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 14746471  T
Q  136 aatgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaata 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14746470 aatgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattaata 14746424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26486070 - 26485929
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26486070 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaattgaccatgca 26485971  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26485970 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgatt 26485929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40144344 - 40144195
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40144344 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 40144246  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  40144245 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatggttaatagttaaa 40144195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 27345797 - 27345936
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27345797 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27345895  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27345896 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 27345936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 6588151 - 6588290
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6588151 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 6588249  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
        ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6588250 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatctatgatt 6588290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16266920 - 16266769
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgt--atatctacatacaactgaccatg 134  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16266920 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatatctacatacaactgaccatg 16266822  T
Q  135 caatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  16266821 catacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtacggttaatagttaaa 16266769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 808008 - 807925
Alignment:
Q  117 tacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  808008 tacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 807925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Original strand, 27873842 - 27873973
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  27873842 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 27873939  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  27873940 tccatatgactccacttatacaacatgtatgatt 27873973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Original strand, 27948630 - 27948761
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  27948630 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 27948727  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  27948728 tccatatgactccacttatacaacatgtatgatt 27948761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Original strand, 27889972 - 27890103
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatac-aactgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || || ||    
T  27889972 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaaattgaccatgc-atacatac 27890069  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  27890070 tccatatgactccacttatacaacatgtatgatt 27890103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11392612 - 11392519
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  11392612 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttatacaacatgtatg 11392519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25701610 - 25701476
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-a 142  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |    
T  25701610 gcaactagtgctccaggacatgagtcctttccgctgttt-atgcttatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgatcatgca-tacata 25701513  T
Q  143 ctccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaa 179  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  25701512 ctccatatgactccacttatacaacatgtatggttaa 25701476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14416615 - 14416525
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14416615 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 14416525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29299085 - 29299030
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29299085 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 29299030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29305631 - 29305576
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29305631 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 29305576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 29328284 - 29328374
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29328284 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 29328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22063604 - 22063558
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22063604 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22063558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22176076 - 22176030
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22176076 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22176030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 127
Target Start/End: Original strand, 39363631 - 39363692
Alignment:
Q  66 aagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39363631 aagccctcac-gcttttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 39363692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 20006386 - 20006439
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20006386 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaacttacaatgca 20006439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8729051 - 8728980
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8729051 tccaggaccgaagtcctcatcgtt-ttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 8728980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 177
Target Start/End: Original strand, 27902275 - 27902342
Alignment:
Q  111 tatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  27902275 tatatctacatacaacttgaccatgca-tacatactccatatgactccacttatacaacatgtatgatt 27902342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 136
Target Start/End: Original strand, 43687487 - 43687577
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43687487 gcaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt-atgcatatgtaatggactcccttatgtatatctacatacaacttgaccatgca 43687577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 26395713 - 26395877
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26395713 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26395812  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26395813 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 26395877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Original strand, 52500579 - 52500729
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52500579 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 52500678  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataattaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  52500679 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 52500729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 11937186 - 11937350
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11937186 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccttcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 11937285  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11937286 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 11937350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 21396845 - 21396985
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396845 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21396944  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21396945 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 21396985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Original strand, 391194 - 391344
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  391194 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 391293  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataattaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  391294 atgcaactccatgtgactccactttaataatatgtatgattcaataattaa 391344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3266673 - 3266533
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3266673 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 3266574  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3266573 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 3266533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 49240898 - 49240758
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49240898 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 49240799  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49240798 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 49240758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 49749612 - 49749472
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49749612 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 49749513  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49749512 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 49749472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3260045 - 3259895
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3260045 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatataactgaccatgca 3259946  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataattaa 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  3259945 atgcaacttcatgtgactccactttaacaacatgtatgattcaataattaa 3259895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39266291 - 39266151
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39266291 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 39266192  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||    
T  39266191 atgcaactccatgtgactccaccataataatatgtatgatt 39266151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23436036 - 23435911
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23436036 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 23435937  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23435936 atgcaactccatgtgactccaattaa 23435911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29448730 - 29448592
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29448730 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgga 29448631  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  29448630 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 29448592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29455414 - 29455276
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29455414 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 29455315  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatg 174  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  29455314 atgcaactccatatgactccaattaatacaacatgtatg 29455276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29382818 - 29382678
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29382818 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcacatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 29382719  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29382718 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgatt 29382678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11202484 - 11202333
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11202484 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacagctgaccatgca 11202385  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11202384 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattaatagttaaa 11202333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 177
Target Start/End: Original strand, 50082269 - 50082388
Alignment:
Q  58 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50082269 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgccacggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactcca 50082368  T
Q  158 cttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||| ||||| ||||||||||    
T  50082369 ctttaataatatgtatgatt 50082388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 7359276 - 7359416
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7359276 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 7359375  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  7359376 atgcaaactccatgtgacaccactt-aacaacatgtatgatt 7359416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 1583938 - 1584078
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1583938 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1584037  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  1584038 atgcaaactccatgtgacaccactt-aacaacatgtatgatt 1584078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45959795 - 45959644
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45959795 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 45959696  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
    |    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  45959695 atacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatggttaataaataaa 45959644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 162
Target Start/End: Original strand, 5938961 - 5939079
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aac 143  Q
    ||||||||||||||| |||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5938961 gcaactagtactccaagacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaac 5939060  T
Q  144 tccatgtgactccacttaa 162  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  5939061 tccatgtgacaccacttaa 5939079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 45142603 - 45142455
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45142603 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 45142504  T
Q  136 aatgcaactccatgt-gactccacttaaataacatgtatgattaataat 183  Q
    |    |||||||| |  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45142503 atacaaactccatataaactccacttaaacaacatgtatggttaataat 45142455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 127
Target Start/End: Original strand, 34772196 - 34772286
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772196 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 34772286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 187
Target Start/End: Original strand, 20895032 - 20895173
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  20895032 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 20895129  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||| ||||    
T  20895130 tccatatgactccacttttacaacatgtatggttaataaataaa 20895173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42956031 - 42955925
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaa 179  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42956031 tttatgcatatgcaacggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatggttaa 42955933  T
Q  180 taattaaa 187  Q
    ||| ||||    
T  42955932 taaataaa 42955925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Original strand, 31665098 - 31665229
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||    
T  31665098 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaacttgaccatgc-atacatac 31665195  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31665196 tccatatgactccatttaaacaacatgtatgatt 31665229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 187
Target Start/End: Original strand, 20889448 - 20889554
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||    
T  20889448 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttttacaacatgtatggttaa 20889546  T
Q  180 taattaaa 187  Q
    ||| ||||    
T  20889547 taaataaa 20889554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2972777 - 2972649
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  2972777 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 2972680  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatg 174  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  2972679 tccatatgactccaattatacaacatgtatg 2972649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19128352 - 19128259
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  19128352 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttatacaacatgtatg 19128259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 47872475 - 47872376
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47872475 gctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 47872377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 179
Target Start/End: Original strand, 36037636 - 36037734
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||    
T  36037636 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttttacaacatgtatggttaa 36037734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 54845001 - 54844912
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54845001 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatacaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 54844912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 49548593 - 49548538
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49548593 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 49548538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 185
Target Start/End: Original strand, 21881665 - 21881770
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-a 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  || ||| |||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  21881665 tttatgcatatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc-atacatccttcatatgactccacttatacaacatgtatgattca 21881763  T
Q  179 ataatta 185  Q
    |||||||    
T  21881764 ataatta 21881770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 899666 - 899721
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  899666 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 899721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 30396269 - 30396324
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30396269 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 30396324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 33097166 - 33097221
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33097166 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 33097221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 35462656 - 35462566
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35462656 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 35462566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 49548413 - 49548323
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49548413 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 49548323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41404716 - 41404662
Alignment:
Q  83 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41404716 ttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 41404662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 82
Target Start/End: Original strand, 391154 - 391199
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtt 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  391154 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtt 391199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 14910723 - 14910792
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14910723 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14910792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 33221408 - 33221498
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33221408 caactagtgctccaggacacgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctatatacaactagaccatgca 33221498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 42220504 - 42220559
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42220504 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 42220559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 46044880 - 46044825
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46044880 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 46044825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 127
Target Start/End: Original strand, 27905352 - 27905418
Alignment:
Q  59 aggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27905352 aggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttattcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 27905418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 93
Target Start/End: Original strand, 7356283 - 7356339
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatg 93  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||    
T  7356283 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatg 7356339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 14485649 - 14485717
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14485649 tccagggccgaagccctc-ccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14485717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 18212297 - 18212343
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18212297 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18212343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 26077728 - 26077682
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26077728 ttttatgcttatgtaattgacccacttgtgtatatctacatacaact 26077682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17000184 - 17000139
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17000184 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 17000139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 127
Target Start/End: Original strand, 30237898 - 30237958
Alignment:
Q  67 agccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30237898 agccctcaccgct-ttatatgcttatgaaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 30237958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10972917 - 10972873
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10972917 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10972873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 10382001 - 10382165
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10382001 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 10382100  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10382101 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 10382165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 10410654 - 10410818
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10410654 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 10410753  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10410754 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 10410818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 29493615 - 29493778
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29493615 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 29493714  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||||    
T  29493715 aatgcaactccatgtgactccacttaaatgacatgtgtgattaaaactcaaacatacaatgcat 29493778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21151544 - 21151394
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21151544 gctgttgagcaactattactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21151445  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataattaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21151444 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 21151394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 28758961 - 28759101
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28758961 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28759060  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28759061 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 28759101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 50142856 - 50142716
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50142856 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 50142757  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  50142756 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgatt 50142716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2499131 - 2498980
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2499131 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2499032  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactt-aaataacatgtatgatt-aataattaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2499031 atgcaactccatgtgactccacttaaaacaacatgtatgattcaataattaa 2498980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 43724151 - 43724011
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43724151 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 43724052  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43724051 atgcaactccatgagactcaacttaaacaacatgtatgatt 43724011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 47121209 - 47121349
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47121209 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatccacatacaactgaccatgca 47121308  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47121309 atgcaactccatgtgactcgacttaaacaacatgtatgatt 47121349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 47128577 - 47128717
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47128577 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatccacatacaactgaccatgca 47128676  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47128677 atgcaactccatgtgactcgacttaaacaacatgtatgatt 47128717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 50656075 - 50655937
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50656075 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 50655976  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  50655975 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 50655937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 53571321 - 53571183
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53571321 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgca 53571222  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  53571221 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 53571183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 54833274 - 54833134
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833274 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcacatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 54833175  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  54833174 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgatt 54833134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3782839 - 3782700
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3782839 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 3782740  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  3782739 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatga 3782700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 10767818 - 10767958
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10767818 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 10767917  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  10767918 atgcaactcaatatgactccactttattaatatgtatgatt 10767958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9772003 - 9771852
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9772003 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 9771904  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  9771903 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgataaatagttaaa 9771852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 147
Target Start/End: Original strand, 45611728 - 45611838
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45611728 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 45611827  T
Q  137 atgcaactcca 147  Q
    |||||||||||    
T  45611828 atgcaactcca 45611838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12271482 - 12271331
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12271482 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 12271383  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  12271382 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcatagttaaa 12271331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 69 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 6927596 - 6927477
Alignment:
Q  69 ccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt-aaataac 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6927596 ccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaaacaac 6927497  T
Q  168 atgtatgatt-aataattaa 186  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  6927496 atgtatgattcaataattaa 6927477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14845253 - 14845090
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14845253 tgttgagcaactagtgctccagaaccgaagccctcactgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaa 14845154  T
Q  138 tgcaactccatgtgac-tccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    |||||||||||| ||| || | | | | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14845153 tgcaactccatgagacttctattgatacaacatgtatgattaatagttaaaacatacaatgcat 14845090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Original strand, 38743004 - 38743138
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aac 143  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38743004 gcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacgtacaactgaccatgcaatgcaaac 38743103  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatgatta 178  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38743104 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatta 38743138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 48774705 - 48774554
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48774705 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 48774606  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
    |    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  48774605 atacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatggttaataaataaa 48774554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16331672 - 16331541
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  16331672 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 16331575  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  16331574 tccatatgactccacttaatcaacatgtatgatt 16331541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Original strand, 16833305 - 16833436
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  16833305 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 16833402  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  16833403 tccatatgactccacttatacaacatgtatgatt 16833436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 54091815 - 54091684
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  54091815 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 54091718  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  54091717 tccatatgactccacttatacaacatgtatgatt 54091684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 3802581 - 3802671
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3802581 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 3802671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 15374724 - 15374814
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15374724 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacatgaccatgca 15374814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29545206 - 29545108
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||    
T  29545206 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttttacaacatgtatggttaa 29545108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 54520130 - 54520220
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54520130 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 54520220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8373969 - 8373914
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8373969 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 8373914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9691486 - 9691396
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9691486 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 9691396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11956640 - 11956585
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11956640 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 11956585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 20187825 - 20187915
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20187825 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 20187915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20377319 - 20377229
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20377319 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 20377229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30596903 - 30596848
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30596903 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 30596848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 54520345 - 54520435
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54520345 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 54520435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19344196 - 19344151
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19344196 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 19344151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 3802743 - 3802833
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3802743 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggactcactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 3802833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32388061 - 32388006
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32388061 tttatgcatatgttatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 32388006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 18961077 - 18961122
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18961077 tttatgcatatgcaatggactcacttgtgtatatctacatacaact 18961122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 49163272 - 49163317
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49163272 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaact 49163317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13313976 - 13313907
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13313976 tccagggcagaagccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 13313907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16414281 - 16414230
Alignment:
Q  125 actgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16414281 actgaccatgcaatgca-ctccatgtgactccacttaaacatcatgtatgatt 16414230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12725168 - 12725113
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12725168 tttatgcatatgaaatggacccactagtgtatatctacatacaacttgaccatgca 12725113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 29551042 - 29551097
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29551042 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatttacatacaacatgaccatgca 29551097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 46071154 - 46071099
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  46071154 tttatgcatatgcaatggacccactcgtatatatctacatacaactagaccatgca 46071099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13324888 - 13324819
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||  ||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13324888 tccagggcagaagccctcaccgct--tttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 13324819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 38312187 - 38312118
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38312187 tccaggaccgaggtcctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatttacatacaact 38312118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 23173921 - 23173967
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23173921 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 23173967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 127
Target Start/End: Original strand, 12274375 - 12274435
Alignment:
Q  67 agccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12274375 agccctccccgct-ttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 12274435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 127
Target Start/End: Original strand, 17512698 - 17512751
Alignment:
Q  75 ccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17512698 ccgcttttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 17512751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20249175 - 20249105
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| ||||| || |  ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20249175 tccaggaccgaagtcctcatcgtt--tttatgcttatgcaattgactccacttgtgtatatctacatacaact 20249105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13303300 - 13303231
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||  ||||||  |||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13303300 tccagggcagaagccctcaccgct--tttatgtttatgcaactgacccacttgtatatatctacatacaact 13303231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15935004 - 15934960
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15935004 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 15934960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 13486 - 13650
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13486 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatccaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 13585  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataatt-aaacatacaatgcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13586 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatgattaataattaaaacatacaatgcat 13650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18499 - 18349
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18499 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcc 18400  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataattaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18399 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 18349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12307 - 12158
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12307 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 12208  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataatta 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12207 atgcaactctatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatta 12158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18603 - 18463
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18603 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccttgca 18504  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  18503 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 18463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 104367 - 104507
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104367 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 104466  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  104467 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgatt 104507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 174
Target Start/End: Original strand, 50083 - 50219
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50083 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 50182  T
Q  139 gcaactccatgtgactccacttaa-ataacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  50183 gcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 50219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0279
Description:

Target: scaffold0279; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5802 - 5651
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5802 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 5703  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5702 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattaatagttaaa 5651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 31720 - 31871
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31720 gctgttgagcaactagtactccaggacaaaagacctcaccgctgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttaaccatgc 31819  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
    |    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  31820 atacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatggttaataaataaa 31871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4710 - 4569
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  4710 gcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaact 4612  T
Q  145 ccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4611 ccttgtgactccacttaaataacatgtatgattaatagttaaa 4569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 512614 - 512465
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  512614 gctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 512516  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
        |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  512515 tacaaactccttgtgactccacttaaacaacatgtatggttaatagttaaa 512465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 179126 - 179181
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  179126 tttatgcatatgcaatggacccacttttgtatatctacatacaacttgaccatgca 179181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 488394 - 488350
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  488394 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 488350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 19688 - 19832
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-attcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 19786  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataa 182  Q
        |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19787 tacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatggttaataa 19832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23752
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23897 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-attcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 23799  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataa 182  Q
     || || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23798 -atacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatggttaataa 23752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1098 - 947
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1098 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttctatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 999  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
    |    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  998 atacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatggttaataaataaa 947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 173
Target Start/End: Original strand, 25128 - 25255
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25128 gcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgtaatggatcaacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc-atacaact 25226  T
Q  145 ccatgtgactccacttaaataacatgtat 173  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25227 ccatgtgactccacataaacaacatgtat 25255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Original strand, 972 - 1072
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  972 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 1071  T
Q  136 a 136  Q
    |    
T  1072 a 1072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15278 - 15128
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15278 gctgttgagtaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctatttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 15180  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaataattaaa 187  Q
     || || || |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  15179 -atacatacaccatatgactccacttaaacaacatgtatggttaataaataaa 15128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22101 - 22027
Alignment:
Q  101 cctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaataacatgtatga 175  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  22101 cctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatga 22027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 177
Target Start/End: Original strand, 19337 - 19433
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19337 tttatgcatatgaaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatgtgactccatttaaacaacatgtatgatt 19433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 177
Target Start/End: Original strand, 15239 - 15335
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15239 tttacgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgatcatgca-tacatactccatgtgactccatttaaacaacatgtatgatt 15335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 174
Target Start/End: Original strand, 12948 - 13076
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatac-aactgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || || ||    
T  12948 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaaattgaccatgc-atacatac 13045  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatg 174  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  13046 tccatatgactccacttatacaacatgtatg 13076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 107
Target Start/End: Original strand, 7801 - 7861
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctactt 107  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7801 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctactt 7861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Original strand, 15182 - 15281
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15182 gctgttgagcaactagtgctccaggaaatgagtcctccccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 15280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 712 - 802
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  712 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 976 - 1045
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  976 tccaggaccgaggcactcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 65374 - 65241
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  65374 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatgaaactacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 65277  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatgattaa 179  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||    
T  65276 tccatatgactccacttttacaacatgtatggttaa 65241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 2102 - 2192
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2102 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 2192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 9842 - 9932
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9842 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 184 - 239
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  184 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 51718 - 51672
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51718 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 51672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 74167 - 74112
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  74167 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 74112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 137199 - 137254
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  137199 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 137254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 177
Target Start/End: Original strand, 24770 - 24867
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactcca-cttaaataacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  24770 tttatgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatagaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccattttaaacaacatgtatgatt 24867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11981 - 11912
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11981 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 11912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24541 - 24472
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24541 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 24472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10670 - 10626
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10670 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18849 - 18805
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18849 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20157 - 20102
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20157 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 20102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 30955 - 31010
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30955 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 31010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 101734 - 101586
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||  |    
T  101734 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtg-atatctacatacaacatgaccatgc-atacatcc 101638  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataatta-aacataca 193  Q
    | ||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  101637 ttcatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataattacaacataca 101586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 247142 - 247197
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  247142 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 247197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 253656 - 253711
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  253656 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 253711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 41353 - 41408
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41353 tttatgcatatgatatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 41408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 72367 - 72436
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  72367 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgaaactaacccacttgtgtatatctacatacaact 72436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10122 - 10076
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10122 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 10076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17440 - 17372
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17440 tccagggccgaagccctc-ccgct--tttatgcttatgtaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 17372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 185 - 139
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  185 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5415 - 5377
Alignment:
Q  90 tatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5415 tatgcaatggactctacttgtgtatatctacatacaact 5377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 7409 - 7455
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7409 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 7455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 36835 - 36789
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36835 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 36789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 41634 - 41588
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41634 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 41588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20535 - 20489
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20535 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 20489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14514 - 14469
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14514 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 14469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 42090 - 42135
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42090 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 42135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 50989 - 50948
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 122  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50989 ttttatgcttatgcaactgacctacttgtgtatatctacata 50948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 17637 - 17682
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17637 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 17682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Original strand, 6293 - 6337
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6293 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 6337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4135 - 4091
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4135 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 4091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 129
Target Start/End: Original strand, 19439 - 19487
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactga 129  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19439 tttatgcttatgcaatgaactccacttgtgtatatctacatacaactga 19487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 55956 - 55912
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  55956 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 55912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 38767 - 38723
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggacct-acttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38767 tatgcttatgcaatggacttcacttgtgtatatctacatacaact 38723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University