View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1111_low_7 (Length: 628)

Name: NF1111_low_7
Description: NF1111
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1111_low_7
NF1111_low_7
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (30-623)||(9989561-9990154)
chr3 (30-623)||(7652625-7653219)
chr3 (30-623)||(52307488-52308082)
chr3 (30-617)||(10385479-10386067)
chr3 (30-624)||(27849953-27850547)
chr3 (30-623)||(36468839-36469432)
chr3 (30-624)||(4742404-4742997)
chr3 (30-591)||(20837259-20837820)
chr3 (30-571)||(22097832-22098373)
chr3 (30-623)||(48167594-48168190)
chr3 (43-623)||(37022867-37023449)
chr3 (82-623)||(20962661-20963200)
chr3 (30-555)||(45527812-45528338)
chr3 (172-617)||(8625931-8626376)
chr3 (30-617)||(33248154-33248742)
chr3 (30-480)||(37471233-37471683)
chr3 (30-490)||(1232027-1232487)
chr3 (30-487)||(3588565-3589023)
chr3 (259-624)||(22098375-22098740)
chr3 (30-490)||(23194088-23194545)
chr3 (30-409)||(49434261-49434642)
chr3 (33-490)||(2357329-2357787)
chr3 (124-390)||(23411748-23412003)
chr3 (30-318)||(26335272-26335562)
chr3 (30-177)||(8615668-8615816)
chr3 (424-612)||(11260201-11260389)
chr3 (204-496)||(27104326-27104624)
chr3 (386-496)||(23394091-23394201)
chr3 (508-617)||(23382948-23383057)
chr3 (533-617)||(23396965-23397048)
chr3 (362-506)||(24899449-24899594)
chr3 (362-506)||(24905915-24906060)
chr3 (30-90)||(23385561-23385622)
chr3 (33-97)||(4311171-4311235)
chr3 (33-97)||(6036739-6036803)
chr3 (33-97)||(10940989-10941053)
chr3 (33-97)||(24179547-24179611)
chr3 (33-97)||(27501652-27501716)
chr3 (33-97)||(32746843-32746907)
chr3 (33-97)||(41353998-41354062)
chr3 (33-97)||(43932050-43932114)
chr3 (33-97)||(43995550-43995614)
chr3 (33-75)||(24705305-24705347)
chr3 (352-416)||(17404747-17404811)
chr3 (33-97)||(23068937-23069001)
chr3 (33-74)||(25692476-25692518)
chr3 (33-74)||(4591291-4591332)
chr3 (33-74)||(4644147-4644188)
chr3 (349-392)||(4675111-4675155)
chr3 (33-97)||(47441274-47441338)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (30-617)||(11766920-11767507)
chr5 (30-623)||(9404589-9405183)
chr5 (30-623)||(11722679-11723273)
chr5 (30-623)||(16904012-16904606)
chr5 (30-623)||(33434768-33435361)
chr5 (30-623)||(34456462-34457054)
chr5 (30-623)||(7315369-7315963)
chr5 (30-623)||(30606479-30607073)
chr5 (30-623)||(24835900-24836481)
chr5 (30-623)||(27166501-27167094)
chr5 (46-623)||(14344642-14345219)
chr5 (30-601)||(6270055-6270627)
chr5 (30-624)||(34869146-34869742)
chr5 (30-490)||(37251440-37251901)
chr5 (117-487)||(32226911-32227281)
chr5 (30-311)||(31846145-31846426)
chr5 (338-623)||(31846426-31846705)
chr5 (30-241)||(7315130-7315342)
chr5 (150-365)||(519315-519530)
chr5 (30-441)||(39655621-39656034)
chr5 (33-97)||(2958332-2958396)
chr5 (33-97)||(2966801-2966865)
chr5 (33-97)||(25894334-25894398)
chr5 (33-97)||(40958302-40958366)
chr5 (33-97)||(42151292-42151356)
chr5 (33-97)||(4974036-4974100)
chr5 (33-97)||(5876691-5876755)
chr5 (33-69)||(12505450-12505486)
chr5 (33-97)||(22360437-22360501)
chr5 (34-97)||(22314303-22314366)
chr5 (514-617)||(42800956-42801058)
chr5 (33-95)||(29414354-29414416)
chr5 (33-74)||(3412975-3413016)
chr5 (33-74)||(9843845-9843886)
chr5 (33-74)||(19853213-19853254)
chr5 (32-97)||(42747558-42747623)
chr5 (33-97)||(2439274-2439338)
chr5 (349-392)||(40821326-40821370)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (30-617)||(28925552-28926140)
chr8 (30-623)||(9067570-9068164)
chr8 (30-623)||(3298967-3299560)
chr8 (30-623)||(8742686-8743280)
chr8 (30-623)||(11308390-11308984)
chr8 (30-617)||(28370258-28370846)
chr8 (30-623)||(41576734-41577328)
chr8 (30-623)||(27348191-27348785)
chr8 (30-623)||(34006176-34006768)
chr8 (30-478)||(13510129-13510577)
chr8 (30-478)||(13599659-13600107)
chr8 (30-623)||(16958716-16959310)
chr8 (30-490)||(22242778-22243240)
chr8 (30-490)||(4861487-4861947)
chr8 (30-508)||(12538323-12538807)
chr8 (30-344)||(22180767-22181081)
chr8 (54-490)||(22222210-22222648)
chr8 (30-490)||(22233385-22233847)
chr8 (54-490)||(22228552-22228990)
chr8 (85-490)||(17993087-17993492)
chr8 (76-624)||(13848729-13849278)
chr8 (369-623)||(22181081-22181335)
chr8 (114-412)||(36736820-36737117)
chr8 (88-392)||(21692669-21692974)
chr8 (30-183)||(16580250-16580404)
chr8 (237-490)||(22227043-22227297)
chr8 (550-617)||(16583062-16583129)
chr8 (352-506)||(1607757-1607912)
chr8 (30-87)||(24040881-24040937)
chr8 (33-97)||(11357878-11357942)
chr8 (33-97)||(36425415-36425479)
chr8 (33-97)||(45068101-45068165)
chr8 (33-97)||(1238687-1238751)
chr8 (33-97)||(15012861-15012925)
chr8 (33-97)||(16710353-16710417)
chr8 (32-74)||(29336746-29336788)
chr8 (33-74)||(7933611-7933652)
chr8 (33-74)||(24219957-24219998)
chr8 (33-97)||(26250277-26250340)
chr8 (33-97)||(36021484-36021548)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (30-617)||(3539212-3539800)
chr6 (30-617)||(9932214-9932802)
chr6 (30-617)||(26514837-26515425)
chr6 (41-624)||(16698086-16698669)
chr6 (30-624)||(21595930-21596524)
chr6 (30-623)||(32806166-32806759)
chr6 (30-623)||(24160657-24161252)
chr6 (30-576)||(24879030-24879577)
chr6 (30-602)||(5988426-5988999)
chr6 (30-490)||(25977114-25977575)
chr6 (30-490)||(13181892-13182353)
chr6 (28-490)||(14270835-14271298)
chr6 (30-459)||(34913854-34914283)
chr6 (30-431)||(13173419-13173820)
chr6 (30-390)||(34006667-34007028)
chr6 (30-557)||(1454961-1455483)
chr6 (30-557)||(1466653-1467175)
chr6 (30-556)||(21631347-21631876)
chr6 (394-623)||(8667461-8667690)
chr6 (405-617)||(5670686-5670898)
chr6 (30-506)||(15642582-15643060)
chr6 (422-623)||(25055960-25056161)
chr6 (30-490)||(9517982-9518440)
chr6 (441-556)||(34007032-34007147)
chr6 (476-624)||(6778167-6778315)
chr6 (375-593)||(26604831-26605050)
chr6 (28-183)||(32821963-32822119)
chr6 (30-276)||(26604505-26604752)
chr6 (33-97)||(4019920-4019984)
chr6 (33-97)||(4026346-4026410)
chr6 (33-97)||(7062201-7062265)
chr6 (33-97)||(7069387-7069451)
chr6 (33-97)||(9864445-9864509)
chr6 (33-97)||(13671502-13671566)
chr6 (33-97)||(21262259-21262323)
chr6 (33-97)||(27670567-27670631)
chr6 (33-97)||(34649273-34649337)
chr6 (33-97)||(34655724-34655788)
chr6 (33-97)||(34711242-34711306)
chr6 (33-74)||(11016584-11016625)
chr6 (33-97)||(31128976-31129040)
chr6 (33-97)||(31548368-31548432)
chr6 (30-68)||(6868011-6868049)
chr6 (33-74)||(10081247-10081288)
chr6 (33-69)||(1167164-1167200)
chr6 (349-392)||(24908606-24908650)
chr6 (33-97)||(29907332-29907396)
[»] chr7 (53 HSPs)
chr7 (30-623)||(10345709-10346302)
chr7 (30-617)||(31157685-31158273)
chr7 (30-623)||(8107291-8107885)
chr7 (30-624)||(2631561-2632156)
chr7 (30-623)||(23795259-23795852)
chr7 (30-617)||(22321210-22321797)
chr7 (30-623)||(2796966-2797559)
chr7 (30-623)||(6172681-6173274)
chr7 (32-623)||(12089862-12090455)
chr7 (30-623)||(31878765-31879357)
chr7 (30-624)||(45500113-45500707)
chr7 (30-617)||(12191008-12191594)
chr7 (30-617)||(12184031-12184612)
chr7 (30-596)||(31663942-31664491)
chr7 (30-623)||(3544281-3544876)
chr7 (30-602)||(24482911-24483483)
chr7 (30-490)||(22909283-22909743)
chr7 (30-623)||(2477824-2478419)
chr7 (30-487)||(1274753-1275212)
chr7 (187-624)||(31882433-31882870)
chr7 (30-352)||(19471864-19472186)
chr7 (222-619)||(1954285-1954681)
chr7 (292-624)||(22825036-22825368)
chr7 (161-434)||(22820401-22820674)
chr7 (288-595)||(4704809-4705116)
chr7 (30-470)||(29032349-29032780)
chr7 (402-623)||(19471637-19471860)
chr7 (30-174)||(22818577-22818721)
chr7 (30-187)||(1954122-1954270)
chr7 (33-97)||(1948318-1948382)
chr7 (33-97)||(6020549-6020613)
chr7 (33-97)||(8185077-8185141)
chr7 (33-97)||(8192637-8192701)
chr7 (33-97)||(15915110-15915174)
chr7 (33-97)||(15949631-15949695)
chr7 (33-97)||(19090281-19090345)
chr7 (33-97)||(21642991-21643055)
chr7 (33-97)||(22853891-22853955)
chr7 (33-97)||(23612862-23612926)
chr7 (33-97)||(26602385-26602449)
chr7 (33-97)||(36876018-36876082)
chr7 (33-97)||(48346781-48346845)
chr7 (33-97)||(48353165-48353229)
chr7 (33-97)||(8142130-8142194)
chr7 (33-97)||(9642601-9642665)
chr7 (33-97)||(33850328-33850392)
chr7 (33-97)||(39433380-39433444)
chr7 (33-97)||(3923778-3923842)
chr7 (363-415)||(8138948-8138999)
chr7 (33-97)||(10830810-10830874)
chr7 (33-97)||(11024602-11024666)
chr7 (281-373)||(27954283-27954375)
chr7 (33-97)||(45434059-45434122)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (30-623)||(4838539-4839133)
chr4 (30-623)||(22047846-22048440)
chr4 (30-623)||(5272966-5273559)
chr4 (30-617)||(323603-324191)
chr4 (30-623)||(35416099-35416692)
chr4 (30-615)||(52618668-52619253)
chr4 (30-623)||(40994950-40995546)
chr4 (30-617)||(42532295-42532884)
chr4 (30-623)||(21677071-21677664)
chr4 (30-624)||(26069893-26070487)
chr4 (30-623)||(26373034-26373626)
chr4 (30-623)||(1188130-1188723)
chr4 (30-623)||(55326941-55327530)
chr4 (30-624)||(19247231-19247824)
chr4 (30-599)||(46691464-46692033)
chr4 (30-623)||(30217789-30218387)
chr4 (228-623)||(21668307-21668703)
chr4 (30-597)||(20948911-20949480)
chr4 (49-556)||(53895561-53896070)
chr4 (322-623)||(33239375-33239675)
chr4 (30-490)||(33110235-33110699)
chr4 (375-617)||(44428799-44429042)
chr4 (269-623)||(42271781-42272135)
chr4 (88-390)||(9417069-9417372)
chr4 (366-446)||(19730985-19731065)
chr4 (564-623)||(19730923-19730982)
chr4 (367-453)||(6640465-6640551)
chr4 (33-97)||(7780799-7780863)
chr4 (33-97)||(13594581-13594645)
chr4 (33-97)||(17457328-17457392)
chr4 (33-97)||(27590778-27590842)
chr4 (33-97)||(30211221-30211285)
chr4 (33-97)||(30238702-30238766)
chr4 (33-97)||(37356034-37356098)
chr4 (33-97)||(37368000-37368064)
chr4 (33-97)||(8104354-8104418)
chr4 (204-275)||(8895205-8895277)
chr4 (33-97)||(36754476-36754540)
chr4 (33-97)||(55462457-55462521)
chr4 (533-601)||(24576852-24576924)
chr4 (344-377)||(5660545-5660578)
chr4 (33-69)||(5660234-5660270)
chr4 (33-97)||(49359000-49359063)
[»] chr1 (49 HSPs)
chr1 (30-623)||(12167619-12168213)
chr1 (30-623)||(38121335-38121929)
chr1 (30-623)||(33491601-33492195)
chr1 (30-623)||(39000584-39001178)
chr1 (30-617)||(431750-432337)
chr1 (30-623)||(9667099-9667692)
chr1 (46-613)||(49249245-49249812)
chr1 (30-623)||(40999507-41000100)
chr1 (30-624)||(16832185-16832779)
chr1 (30-623)||(11738201-11738794)
chr1 (30-624)||(13217450-13218042)
chr1 (57-623)||(16130706-16131260)
chr1 (30-433)||(44504861-44505265)
chr1 (30-556)||(8995731-8996258)
chr1 (46-490)||(36083938-36084383)
chr1 (50-490)||(15161612-15162052)
chr1 (328-623)||(20225765-20226060)
chr1 (30-475)||(9268801-9269247)
chr1 (363-490)||(3365761-3365889)
chr1 (352-453)||(13830756-13830857)
chr1 (33-275)||(6244363-6244606)
chr1 (352-453)||(39456759-39456860)
chr1 (33-97)||(1175079-1175143)
chr1 (33-97)||(4600002-4600066)
chr1 (33-97)||(9869578-9869642)
chr1 (33-97)||(26621943-26622007)
chr1 (33-97)||(31072791-31072855)
chr1 (33-97)||(41305205-41305269)
chr1 (33-97)||(43687102-43687166)
chr1 (33-97)||(45023008-45023072)
chr1 (33-97)||(44241830-44241892)
chr1 (33-74)||(45619829-45619870)
chr1 (33-97)||(1115667-1115731)
chr1 (33-97)||(6239128-6239192)
chr1 (57-105)||(16130156-16130203)
chr1 (33-97)||(23762021-23762085)
chr1 (33-97)||(35085479-35085543)
chr1 (33-97)||(39053023-39053087)
chr1 (33-97)||(39059395-39059459)
chr1 (43-92)||(13830465-13830515)
chr1 (33-74)||(2824505-2824546)
chr1 (33-74)||(5357432-5357473)
chr1 (33-86)||(29002209-29002262)
chr1 (33-74)||(38672462-38672503)
chr1 (33-97)||(11912947-11913011)
chr1 (32-68)||(13249218-13249254)
chr1 (33-69)||(28996510-28996546)
chr1 (33-97)||(32798197-32798261)
chr1 (33-97)||(44916811-44916875)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (30-617)||(8907-9495)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (30-617)||(29223879-29224467)
chr2 (30-617)||(29337178-29337766)
chr2 (30-623)||(13229745-13230338)
chr2 (30-623)||(36039665-36040259)
chr2 (30-623)||(27257550-27258143)
chr2 (30-624)||(23924434-23925028)
chr2 (50-623)||(42700377-42700949)
chr2 (30-602)||(32523094-32523668)
chr2 (30-624)||(36667290-36667865)
chr2 (30-623)||(43991690-43992271)
chr2 (30-623)||(28457280-28457873)
chr2 (30-623)||(14700807-14701403)
chr2 (30-490)||(41977760-41978221)
chr2 (30-459)||(21160131-21160560)
chr2 (116-623)||(36556965-36557473)
chr2 (30-556)||(9786574-9787102)
chr2 (294-623)||(8679198-8679527)
chr2 (30-624)||(24662529-24663127)
chr2 (88-392)||(31758500-31758805)
chr2 (107-288)||(40200181-40200363)
chr2 (531-623)||(28006751-28006843)
chr2 (33-97)||(15853023-15853087)
chr2 (33-97)||(21331679-21331743)
chr2 (33-97)||(21341611-21341675)
chr2 (33-97)||(29485368-29485432)
chr2 (33-97)||(36781869-36781933)
chr2 (33-97)||(42931057-42931121)
chr2 (33-97)||(43268332-43268396)
chr2 (33-97)||(45012456-45012520)
chr2 (344-414)||(11909946-11910016)
chr2 (33-74)||(37439219-37439260)
chr2 (33-97)||(2021133-2021197)
chr2 (33-97)||(21067642-21067706)
chr2 (33-97)||(34834497-34834561)
chr2 (33-97)||(34840941-34841005)
chr2 (33-75)||(17863978-17864020)
chr2 (30-82)||(36557465-36557518)
chr2 (33-74)||(36842284-36842325)
chr2 (30-74)||(11651904-11651948)
chr2 (41-97)||(16817023-16817079)
chr2 (41-97)||(16856180-16856236)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (30-623)||(28302-28896)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (30-623)||(15377-15970)
scaffold0298 (30-623)||(11607-12200)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (30-617)||(11896-12477)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (30-617)||(12358-12947)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (30-617)||(25059-25647)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (30-624)||(115970-116564)
scaffold0019 (208-623)||(168811-169226)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (30-624)||(6897-7490)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (30-586)||(75892-76448)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (30-463)||(546-980)
[»] scaffold0059 (3 HSPs)
scaffold0059 (30-489)||(16009-16469)
scaffold0059 (517-624)||(14625-14732)
scaffold0059 (522-624)||(15870-15972)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (43-490)||(14362-14810)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (150-490)||(34858-35196)
scaffold0160 (30-96)||(35212-35279)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (436-623)||(350009-350196)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (266-490)||(4881-5107)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (508-623)||(175245-175360)
[»] scaffold0447 (4 HSPs)
scaffold0447 (30-143)||(7228-7341)
scaffold0447 (30-143)||(11842-11955)
scaffold0447 (172-252)||(7340-7420)
scaffold0447 (172-252)||(11954-12034)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (30-143)||(9837-9950)
scaffold0383 (172-252)||(9949-10029)
[»] scaffold0060 (2 HSPs)
scaffold0060 (352-586)||(6003-6238)
scaffold0060 (33-97)||(15644-15708)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (363-490)||(7255-7382)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (363-490)||(7265-7392)
[»] scaffold0152 (1 HSPs)
scaffold0152 (363-490)||(24876-25003)
[»] scaffold0457 (2 HSPs)
scaffold0457 (522-592)||(393-463)
scaffold0457 (386-463)||(258-334)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (352-453)||(6857-6958)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (522-586)||(45670-45733)
scaffold0045 (386-474)||(45781-45868)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (33-97)||(2949-3013)
[»] scaffold0510 (1 HSPs)
scaffold0510 (33-97)||(8566-8630)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (33-69)||(11818-11854)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (33-97)||(3118-3182)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 578; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 9989561 - 9990154
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9989561 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 9989660  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9989661 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 9989760  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9989761 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 9989860  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9989861 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 9989960  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9989961 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 9990060  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9990061 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 9990154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 7653219 - 7652625
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7653219 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgttttcattgttttattgagattcaaaatgata 7653120  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7653119 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 7653020  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7653019 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 7652920  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7652919 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 7652820  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7652819 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaattagttttacac 7652720  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7652719 aaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 7652625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 535; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 52308082 - 52307488
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52308082 attatgtaatcttttgatcttttaatacatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtttttattgttttattgagattcaaaatgata 52307983  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52307982 tggacacatacttttgaatctataaatagaataataatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 52307883  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52307882 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgttgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgtgaaatcgatgtttaaac 52307783  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52307782 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 52307683  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52307682 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 52307583  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  52307582 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggacacgatcctattatact 52307488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 10386067 - 10385479
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10386067 attatgtaatcctttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttgtattgttttattgagattcaaaatgata 10385968  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10385967 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagga 10385868  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10385867 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 10385768  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10385767 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 10385668  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  10385667 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgctttactttcatgttgattaggaaaatagttttacac 10385568  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10385567 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 10385479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 27850547 - 27849953
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27850547 attatgtaattttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 27850448  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27850447 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcgtaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 27850348  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27850347 ttaatgcttttggctaatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaactatccaatcaactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaaccgatgtttaaacg 27850248  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27850247 atcccttagaaataatgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 27850148  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27850147 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagctctatctcttctcactttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacaca 27850048  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  27850047 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactctctgtggacacgatcctattatactc 27849953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 36469432 - 36468839
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc-ttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36469432 attatgtaatctttagatcttttaatacatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcattttattgttt-attgagattcaaaatgata 36469334  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36469333 tggacacatacttttgaatctagacatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagga 36469234  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36469233 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcggttaaaatatctaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 36469134  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36469133 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 36469034  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36469033 attgcagctgttacgcttggttgatatttctaaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacac 36468934  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  36468933 aaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaagtgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatact 36468839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 4742997 - 4742404
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4742997 attatgtaatcttttgatcatt-aatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttt-attgagattcaaaatgatat 4742900  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4742899 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttaataatcacttttaatctagaac 4742800  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4742799 ttaatgcttttgggtaatttaatcggtttggaaattgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 4742700  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag-tttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4742699 atcccttagaaataacgatatcatttggtcacgaatgatattttcgagtgattgtgataatatcgttttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 4742600  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4742599 attgcagctattacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtagattaggaaaatagttttacac 4742500  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  4742499 aaaaaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactc 4742404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 591
Target Start/End: Original strand, 20837259 - 20837820
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20837259 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattattgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 20837358  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20837359 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatattaatatttgataatcacttttaatctaggac 20837458  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20837459 ttaatgcttttgggtaaattaatcggttgggaaatcatcgattaaattatccaatcgacttcgtgatcgtttgaatgtttgggaaatcgacgtttaaacg 20837558  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20837559 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 20837658  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20837659 ttgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccacaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 20837758  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatac 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20837759 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtaaaaatgcttatgaaatac 20837820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 571
Target Start/End: Original strand, 22097832 - 22098373
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22097832 attatgtaatattttgatcatttaatatatggttctagccatttattcaatattgttgttattcttacttttattgttttattgagattcaaaatgatat 22097931  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22097932 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 22098031  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22098032 ttaatgcttttggttaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 22098131  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22098132 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatataatttaaaaagttagaatccgttaatcgatcgagaga 22098231  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22098232 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctttgaccgcaagcggaataaccctatctcttctcattttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacaca 22098331  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattg 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22098332 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattg 22098373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 48168190 - 48167594
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  48168190 attatgtaatcttttgatcatttaatatattgttttagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgacat 48168091  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48168090 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 48167991  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48167990 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgaatttgtgagcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 48167891  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  48167890 atcccttagaaataacgatatcatttgaacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaaactagaattcgttaatcgatcgagaga 48167791  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||    
T  48167790 ttgcagccgttacacttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccgtatctcttcttgttttacttttttgtcaaataggaaaatagttttacgca 48167691  T
Q  530 aacaaacaat---ttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  48167690 aacaaacaatttattatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtcgaaacgatcctattatact 48167594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 43 - 623
Target Start/End: Original strand, 37022867 - 37023449
Alignment:
Q  43 ttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttt 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37022867 ttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgatatggacacatatttt 37022966  T
Q  143 tgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga--acttaatgctttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||    
T  37022967 tgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttgatatttgataatcacttttaatctatatgatttaatgctttt 37023066  T
Q  241 gggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaa 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37023067 gggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgataaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttggaaaaacgatgtttaaacgatcccttagaa 37023166  T
Q  341 ataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgtt 440  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37023167 ataacgatatcatttggacacggatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagttaggatccgttaatcgatcgagagattgcagctgtt 37023266  T
Q  441 acgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatt 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37023267 acgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcattttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacgcaaacaaacaatt 37023366  T
Q  541 tatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  37023367 tatacccaaacacttaacatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgtaactccctgtggactcgatcatattatact 37023449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 82 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 20963200 - 20962661
Alignment:
Q  82 ttgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20963200 ttgttgttattattgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatgaacatatacttttgaatctagaaatagaataacaatatatcttaaggtatc 20963101  T
Q  182 actctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactaccc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20963100 actctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggactcaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcatcgattaaactatcc 20963001  T
Q  282 aatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgat 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20963000 aatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgttgaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgat 20962901  T
Q  382 tgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagcccta 481  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20962900 tgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagttgttacgcttggttgatgtctccgaccgcaagcgaaatagcccta 20962801  T
Q  482 tctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgct 581  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20962800 tctcttctcgttttgcttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacact--atgtgataaatattgtgaaaatgct 20962703  T
Q  582 tatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||    
T  20962702 tatgaaatacgcaactccctacagaaacgatcctattatact 20962661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 555
Target Start/End: Original strand, 45527812 - 45528338
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc-ttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45527812 attatgtaatcttttgatcatttaatacatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcattttaatgttttattgagattcaaaatgata 45527911  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45527912 tggacacatacttttgaatctagaaataaaataaaaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagga 45528011  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45528012 cttgatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgattgtttaaatgtttgggaaatcgatgtgtaaac 45528111  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45528112 gatcccttagaaataacgacaacatttggacacgaatgacattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 45528211  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  45528212 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcattttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacac 45528311  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacactt 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  45528312 aaacaaacaatttatacccaaacactt 45528338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 172 - 617
Target Start/End: Original strand, 8625931 - 8626376
Alignment:
Q  172 ttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgat 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8625931 ttaatttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcgattgggaaatcgtcgat 8626030  T
Q  272 taaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatatt 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8626031 taaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatatt 8626130  T
Q  372 gtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgg 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8626131 gtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcga 8626230  T
Q  472 aatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattg 571  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8626231 aatagccctatctcttctcattttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattg 8626330  T
Q  572 tgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8626331 tgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctat 8626376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Original strand, 33248154 - 33248742
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagc-aatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33248154 attatgtaatctttcgatattttaatatatgattctagctaatttattcaatattgttgttat-cttatgtttaatgctttattgagattcaaaatgata 33248252  T
Q  129 tggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 227  Q
    | |||  ||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  33248253 ttgaccaatatttttgggtctaagaactagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataatcactttttatctcga 33248352  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||  ||||||    
T  33248353 acttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcaactttgtgattgtttaaatgtatgagaaatcgacatttaaa 33248452  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  33248453 caatctcttagaaataacgatatcatttggacgcgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaattcgttatttgatcgaga 33248552  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttaca 527  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  33248553 gattgcatctgttacgcttggttgatatctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttctcattttacttttatgtcgaataggaaaatagttttaca 33248652  T
Q  528 caaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33248653 caaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctat 33248742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 37471683 - 37471233
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37471683 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 37471584  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37471583 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 37471484  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37471483 ttaattcttttggataatttaatcagttgagaaatcgtcgattaaattatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 37471384  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37471383 atcccttaaaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 37471284  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccct 480  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37471283 ttgcagttgttacgtttgcttgatgtcgctgaccgcaagcagaatagccct 37471233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 1232487 - 1232027
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1232487 attatgtaatttcttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattctttcatttaatgttttattgagatttaaaatgatat 1232388  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1232387 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatatatcttaagttatcactatagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 1232288  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1232287 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactattcaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 1232188  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1232187 atcccttagaaataacgatatcctttggacacgaatgatattgccgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttaattgatcgagaga 1232088  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || | | |||||||||||    
T  1232087 ttgcagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagcgatatggtcatatctcttctc 1232027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 487
Target Start/End: Original strand, 3588565 - 3589023
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3588565 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattattttattgagattcaaaatgata 3588664  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  3588665 tggacacatacttttgaatctagagatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataatcacttataatctagga 3588764  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3588765 cttaatgcttttgggtcatttagtcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgattgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaac 3588864  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3588865 aatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaattgatcgagag 3588964  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctctt 487  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | | ||||||||    
T  3588965 attacagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagcgaaatggtcttatctctt 3589023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 259 - 624
Target Start/End: Original strand, 22098375 - 22098740
Alignment:
Q  259 ggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttgga 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22098375 ggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttgga 22098474  T
Q  359 cacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctc 458  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22098475 cacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatataatttaaaaagttagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctt 22098574  T
Q  459 tgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaac 558  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22098575 tgaccgcaagcggaataaccctatctcttctcattttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaac 22098674  T
Q  559 gtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22098675 gtgacaaatattgtgaaaatgtttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctattatactc 22098740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 30 - 490
Target Start/End: Original strand, 23194088 - 23194545
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23194088 attacgtaatcttttgatcatttaatatatggttctatctatttattcaatattgt---tattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaataatat 23194184  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  23194185 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataaacacttttaatctaggac 23194284  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||  || ||||||  |||||||||||| |  ||| ||      
T  23194285 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttaggaaatcgtcgattaaacgatccgatcgactttgcaattgtttaatagtttgggaaatcaacttttgaata 23194384  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
     ||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23194385 gtccattagaaatcacgacatcatttggacacgaatgatgttgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttatttgatcgagaga 23194484  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  23194485 ttgcagctgttacgcttggttgatatctctgaccccaagcgaaatggtcatatctcttctc 23194545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 30 - 409
Target Start/End: Original strand, 49434261 - 49434642
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  49434261 attatgtaaactcttcatcttttaatatatagttctaacttatttatttaatattgttgttattcttgtgtttaatgttttattgagatttaaaatgata 49434360  T
Q  129 tggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 227  Q
    | |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49434361 ttgacaaatacttttgggtctaagaaatagaataacaatctatcttaagtttacattctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 49434460  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  49434461 acttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgattatttaaatgtttgagaaatcgacatttaaa 49434560  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaa 409  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  49434561 caatcccttaaaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaa 49434642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 33 - 490
Target Start/End: Original strand, 2357329 - 2357787
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatgg 131  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  2357329 atgtaaactcttgatcttctaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttattgagattcaaaatgatattg 2357428  T
Q  132 acacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaact 230  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2357429 acaaatacttttgaatctaagaaatagaataataatctatattaagttatcactctagaca--gatgttaatatttgataatcacttttaatctagaact 2357526  T
Q  231 taatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacga 330  Q
    |||||||||||| | | ||||| | |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||| ||       
T  2357527 taatgcttttggatcaattaattgattgggaaatcatcgattaaatgaaccaatcgactttgtgattgtttaatagtttgggaaatcgacttttgaatag 2357626  T
Q  331 tcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagat 430  Q
    | | |||||||| || | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||    
T  2357627 ttcattagaaatcacgacatcatttggacacaaatgatgttgttgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagttagaatccgttatttgatcgtgagat 2357726  T
Q  431 tgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||    
T  2357727 tgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatggccacatctcttctc 2357787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 23411748 - 23412003
Alignment:
Q  124 tgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||    
T  23411748 tgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacgatctatcttaagttatcactctagacat-----------tttgataatcacttttaatc 23411836  T
Q  224 tagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtt 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23411837 tagaacttaattcttttgggtaatttattcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtt 23411936  T
Q  324 taaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 390  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23411937 taaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 23412003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 318
Target Start/End: Original strand, 26335272 - 26335562
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26335272 attatgtaaactcttgatcttttaatatatgattttagcttatttattcaatattgttgttattcttgtatttattgctttattgagattcaaaacgata 26335371  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaa-tagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 227  Q
    | |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26335372 ttgacaaatacttttggatctaaaaaatagaataacaatctatcttaagttataactctagatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 26335471  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcg 318  Q
    | ||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26335472 atttaatgcttatgggtcgtttaataggtttggaaatcgtcaattaaatgatccaatcgactttgtgatagtttaaatgtttggggaatcg 26335562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Original strand, 8615668 - 8615816
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615668 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 8615767  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615768 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagt 8615816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 11260389 - 11260201
Alignment:
Q  424 gagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttt 523  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11260389 gagagattgcagctgttacacttggttagtgtctccgaccgcaagcgaaataaccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttt 11260290  T
Q  524 tacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgat 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  11260289 tacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaagtccctgcggaaacgat 11260201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 204 - 496
Target Start/End: Original strand, 27104326 - 27104624
Alignment:
Q  204 tttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaa----tcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||    | | ||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  27104326 tttgataatcacttttaatctataacttaatgcttttggatcaattaacatatagattgagaaatcgtcgattaaatgatccaatcgactttgtgatcgt 27104425  T
Q  300 ttaaat-gtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagttta 398  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27104426 ttaaatagtttgggaaatcgacatttaaatgatcccttcgaaataacgatatgatttggacatgaatgatgttgttgagtgattgtgataatatcgttta 27104525  T
Q  399 aagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgtttta 496  Q
    || ||||||||| ||||| | || |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |  ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  27104526 aatagctagaattcgttatttgaacgagaggttgtagctgttacgcttagttgagtgtctctgaccccaaacaaaatagtcctatatctactcgtttta 27104624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 386 - 496
Target Start/End: Original strand, 23394091 - 23394201
Alignment:
Q  386 ataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctc 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23394091 ataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaataaccctatctc 23394190  T
Q  486 ttctcgtttta 496  Q
    |||||||||||    
T  23394191 ttctcgtttta 23394201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 508 - 617
Target Start/End: Original strand, 23382948 - 23383057
Alignment:
Q  508 attaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggac 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23382948 attaggaaaatagttttacacaaacaaacaattaatacccaaacacttaacgtcacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggac 23383047  T
Q  608 acgatcctat 617  Q
    ||||||||||    
T  23383048 acgatcctat 23383057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 533 - 617
Target Start/End: Original strand, 23396965 - 23397048
Alignment:
Q  533 aaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23396965 aaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatg-aatacgcaactccctgtggatacgatcctat 23397048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 362 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 24899594 - 24899449
Alignment:
Q  362 gaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctg 460  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||||||| || | ||| ||    
T  24899594 gaatgatattgtcaagtgattgtgataatatcgtttaaaaattcagaatccgttatttgatcgtgaaattgcagttgttacgcttggtcgagtatctatg 24899495  T
Q  461 accgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtc 506  Q
    ||| |||||| ||| ||| ||||||||||   ||| ||||||||||    
T  24899494 accccaagcgaaatggccatatctcttctatattttcttttatgtc 24899449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 362 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 24906060 - 24905915
Alignment:
Q  362 gaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctg 460  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||||||| || | ||| ||    
T  24906060 gaatgatattgtcaagtgattgtgataatatcgtttaaaaattcagaatccgttatttgatcgtgaaattgcagttgttacgcttggtcgagtatctatg 24905961  T
Q  461 accgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtc 506  Q
    ||| |||||| ||| ||| ||||||||||   ||| ||||||||||    
T  24905960 accccaagcgaaatggccatatctcttctatattttcttttatgtc 24905915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 90
Target Start/End: Original strand, 23385561 - 23385622
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagc-aatttattcaatattgttgtta 90  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23385561 attatgtaattttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgtta 23385622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 4311171 - 4311235
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  4311171 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 4311235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 6036803 - 6036739
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  6036803 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 6036739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 10940989 - 10941053
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  10940989 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 10941053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24179611 - 24179547
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  24179611 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 24179547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 27501652 - 27501716
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  27501652 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 27501716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 32746907 - 32746843
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  32746907 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 32746843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 41353998 - 41354062
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  41353998 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 41354062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 43932114 - 43932050
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  43932114 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 43932050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 43995614 - 43995550
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  43995614 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 43995550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24705347 - 24705305
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttat 75  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24705347 atgtaatcttttgatctttgaatatatgattctagcaatttat 24705305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 17404811 - 17404747
Alignment:
Q  352 atttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgtta 416  Q
    |||| |||| |||| || |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  17404811 atttagacatgaataatgttgttgagtgattgtgataatatcgattaaaaagctagaatccgtta 17404747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 23069001 - 23068937
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | |  |||||| ||||||||||||    
T  23069001 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgatgttattcttgc 23068937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25692518 - 25692476
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatctttt-aatatatggttctagcaattta 74  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25692518 atgtaatcttttgatcttttgaatatatgattctagcaattta 25692476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 4591332 - 4591291
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4591332 atgtaatcttttaatcttgtaatatatgattctagcaattta 4591291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 4644147 - 4644188
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4644147 atgtaaacttttgatctttcaatatatgattctagcaattta 4644188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 349 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4675155 - 4675111
Alignment:
Q  349 atcatttggacacgaatgatattgtcgagtgat-tgtgataatat 392  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  4675155 atcatttggacacgaatgatgttgtcgagcgatatgtgataatat 4675111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 47441338 - 47441274
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  47441338 atgtaatttgttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 47441274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 560; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Original strand, 11766920 - 11767507
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11766920 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattattttattgagattcaaaatgatat 11767019  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11767020 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 11767119  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11767120 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgattttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 11767219  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11767220 accccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 11767319  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11767320 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 11767419  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11767420 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 11767507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 9404589 - 9405183
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9404589 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtttttattgttttattgagattcaaaatgata 9404688  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9404689 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 9404788  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9404789 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 9404888  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9404889 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 9404988  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9404989 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 9405088  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9405089 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 9405183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 11723273 - 11722679
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11723273 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 11723174  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11723173 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 11723074  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11723073 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgattgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 11722974  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11722973 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 11722874  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11722873 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctaaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 11722774  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11722773 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 11722679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 16904606 - 16904012
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16904606 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 16904507  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16904506 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 16904407  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16904406 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaat 16904307  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16904306 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagttttaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 16904207  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16904206 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 16904107  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16904106 aaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 16904012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 33434768 - 33435361
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33434768 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 33434867  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33434868 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 33434967  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33434968 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgacgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 33435067  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33435068 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 33435167  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33435168 ttgcagcagttacgcttgattgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttatcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacaca 33435267  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  33435268 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactctttgtggacacgatcctattatact 33435361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 540; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 34456462 - 34457054
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34456462 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtttttattgttttattgagattcaaaatgata 34456561  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34456562 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactc--gacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 34456659  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34456660 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 34456759  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34456760 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 34456859  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34456860 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcagaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 34456959  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34456960 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 34457054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 7315369 - 7315963
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7315369 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtttttattgttttattgagattcaaaatgata 7315468  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7315469 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 7315568  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7315569 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaac 7315668  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  7315669 gatctcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagttagaatccgttaatcgatcgagag 7315768  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7315769 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 7315868  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7315869 aaataaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 7315963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 531; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 30607073 - 30606479
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30607073 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtttttattgttttattgagattcaaaatgata 30606974  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30606973 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataataatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 30606874  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30606873 cttaatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatatttaaac 30606774  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30606773 gatctcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 30606674  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30606673 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 30606574  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30606573 aaacaaacaatttataccctaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 30606479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 24835900 - 24836481
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24835900 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 24835999  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24836000 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaa-------------acatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 24836086  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24836087 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaat 24836186  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24836187 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 24836286  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24836287 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctggttttacttttatgtcaattaggaaaatagttttacac 24836386  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  24836387 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctttggacacgatcctattatact 24836481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 27167094 - 27166501
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27167094 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 27166995  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27166994 ggacatatatttttgaatctagaaatagaataacaatttatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 27166895  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27166894 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 27166795  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27166794 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctacaattcgttaatcgatcgagaga 27166695  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27166694 ttgcaacttttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacaca 27166595  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  27166594 aacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatact 27166501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 623
Target Start/End: Original strand, 14344642 - 14345219
Alignment:
Q  46 atcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttg 144  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14344642 atcttttaatatatggttctaacttatttattcaatattgttgttattcttgtttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttg 14344741  T
Q  145 aatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14344742 aatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggt 14344841  T
Q  245 aatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14344842 aatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataa 14344941  T
Q  345 caatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgc 444  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14344942 agatatcatttgaacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccattaatcgatcgagagattgcagctgttacgc 14345041  T
Q  445 ttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttata 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14345042 ttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagctctatcttttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatag-tttacacagacaaacaatttata 14345140  T
Q  545 cccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14345141 cccaaacacttaacgtgacaaacattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 14345219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 601
Target Start/End: Original strand, 6270055 - 6270627
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6270055 attatgtaatattttgatcatttaatatatatttctagctatttattcaatattgttgttattcttgtctttattgttttattgagactcaaaatgatat 6270154  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6270155 ggacatgtacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 6270254  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttggg-aaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6270255 ttaatgctttttggtaatttaatcggttggggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaat 6270354  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6270355 gatctcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcaatcaagag 6270454  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  6270455 attgcagctgttacgcatggttgatgtctctgacagcaagcgaaatgaccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacat 6270554  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccct 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6270555 aaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgcaatacgcaactccct 6270627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 34869742 - 34869146
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| ||||||||||    
T  34869742 attatgtaatctttcgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatataatgttctattgagatttaaaatgatat 34869643  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869642 ggacacgtacttttgaatctagaaataaaataacaatctttcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 34869543  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869542 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcctcgattaaattatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 34869443  T
Q  330 atccc-ttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagttt-aaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  34869442 atccctttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaaagctagaatccgttaattaatcgaga 34869343  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttaca 527  Q
    | |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  34869342 ggttgcagttgttacacttggttgatgtctctgacccccagcgaaatagccctatctcttctcgctttacttttatgttgaataggaagatagttttaca 34869243  T
Q  528 caaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||| ||||||    
T  34869242 caaacaaacaatttatacctaaacacttaatatgataaatattatgaaaatacttatgaaatacgcaatttcctacggaaacgatcctattatactc 34869146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 37251901 - 37251440
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37251901 attatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgaaattcaaaatgatat 37251802  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37251801 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 37251702  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37251701 ttaatgcttttgggtaatttaatcgtttgggaaatcgtcgattaagctatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 37251602  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  37251601 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatctgttatttgatcgtgaga 37251502  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||    
T  37251501 ttgtagttgttacgcttggttgagtgtctctgacctcaagcgaaatgaccctatctcttctc 37251440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 117 - 487
Target Start/End: Original strand, 32226911 - 32227281
Alignment:
Q  117 ttcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcact 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  32226911 ttcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctgtcttaagttatcactctagacatgaatgtcaatatttgataatcact 32227010  T
Q  217 tttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaat 316  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32227011 tttaatctaggacttagtgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaat 32227110  T
Q  317 cgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgtta 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  32227111 cgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcatttaaaaagcaagaatccgtta 32227210  T
Q  417 atcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctctt 487  Q
    || |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | | ||||||||    
T  32227211 attgatcaagagattgaagttgttacgcttggttgatatctctaaccccaagcgaaatggtcatatctctt 32227281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 30 - 311
Target Start/End: Original strand, 31846145 - 31846426
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31846145 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 31846244  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31846245 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 31846344  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31846345 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgg 31846426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 338 - 623
Target Start/End: Original strand, 31846426 - 31846705
Alignment:
Q  338 gaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagct 437  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31846426 gaaataacgatattatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagct 31846525  T
Q  438 gttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaaca 537  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31846526 g--acgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctccttttacttttatgttgattagg-aaatagttttacataaacaaaca 31846622  T
Q  538 atttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31846623 atttatacccaaacacct---gtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctatggacacgatcctattatact 31846705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 30 - 241
Target Start/End: Original strand, 7315130 - 7315342
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7315130 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtttttattgttttattgagattcaaaatgata 7315229  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7315230 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcatttttaatctagaa 7315329  T
Q  229 cttaatgcttttg 241  Q
    |||||||||||||    
T  7315330 cttaatgcttttg 7315342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 150 - 365
Target Start/End: Original strand, 519315 - 519530
Alignment:
Q  150 agaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaattt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  519315 agaaatagaataacaatctatcttaagttttcattctaaatatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgttt 519414  T
Q  250 aatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaata 349  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  519415 aataggttgggaaattgtcgattaaacgatcaaatcaactttgtgattgtttaaatgtttgggaaatcgacaattaaacgatcccttagagataacgata 519514  T
Q  350 tcatttggacacgaat 365  Q
    ||||||||||||||||    
T  519515 tcatttggacacgaat 519530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 39656034 - 39655621
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttatt-gagattcaaaatgat 127  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||| ||||  | |||||| ||||||  ||||| |    
T  39656034 attatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatcttcttattattcttgcatttaaagctttatttgagatttgaaatgtt 39655935  T
Q  128 atggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacat-ggatgttaatatttgataatcacttt-taatcta 225  Q
    || |||| ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  39655934 attgacaaatacttttgaatctagggttaaaataataatctatct-aagttttaattctagacataggat-ttaatctttgataatcactttgtaatcaa 39655837  T
Q  226 gaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgttta 325  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||| ||| | || || |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||  |||     
T  39655836 gaacttaatggttttgggtcgtttaatagattgggaaatcgtcgattgaacgatccgattgactttctgattgtttaatagtttgggaaatcgacttttg 39655737  T
Q  326 aacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcga 425  Q
    ||   ||| |||||||| || | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||| ||||  | ||||      
T  39655736 aatagtccattagaaatcacgacatcatttggacacaaatgatgttgttgagtgattgtgataataccgtttaaaaagttagaattcgttgtttgatcat 39655637  T
Q  426 gagattgcagctgtta 441  Q
    |||||||||| |||||    
T  39655636 gagattgcagttgtta 39655621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 2958396 - 2958332
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  2958396 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 2958332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 2966865 - 2966801
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  2966865 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 2966801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 25894334 - 25894398
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  25894334 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 25894398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 40958302 - 40958366
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  40958302 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 40958366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 42151356 - 42151292
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  42151356 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 42151292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 4974100 - 4974036
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  4974100 atgtaatcttttgatctacaaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 4974036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5876755 - 5876691
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  5876755 atgtaaacttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 5876691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Original strand, 12505450 - 12505486
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca 69  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12505450 atgtaatcttttgatctattaatatatggttctagca 12505486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22360501 - 22360437
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  22360501 atgtaatcttttgatctataaatatatggttatagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 22360437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22314366 - 22314303
Alignment:
Q  34 tgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  22314366 tgtaatcttttgatctataaatatatggttatagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 22314303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 514 - 617
Target Start/End: Original strand, 42800956 - 42801058
Alignment:
Q  514 aaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatc 613  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||  |||  ||||||||| || |  ||||||||| || ||| ||||||    
T  42800956 aaaatagttttaaacaaacaaact-tttatacccaaacacttaatataataaatgatgttgaaatgcttaagatacgcgcaactccatgcggaaacgatc 42801054  T
Q  614 ctat 617  Q
    ||||    
T  42801055 ctat 42801058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 95
Target Start/End: Original strand, 29414354 - 29414416
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattctt 95  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || || |||  |||||| ||||||||||    
T  29414354 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctaacatttgatttgatattgatgttattctt 29414416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 3412975 - 3413016
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3412975 atgtaaacttttgatctttcaatatatgattctagcaattta 3413016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 9843886 - 9843845
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9843886 atgtaatcttttaatcttgtaatatatgattctagcaattta 9843845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 19853213 - 19853254
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  19853213 atgtaatcttttgatcttgtaatatattattctagcaattta 19853254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 42747623 - 42747558
Alignment:
Q  32 tatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||  ||||||   ||||||||||    
T  42747623 tatgtaatcttttgatctttgaatatatgattctagctctttatttgatattgagattattcttgc 42747558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 2439338 - 2439274
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||| || || |||  |||||| ||||||||||||    
T  2439338 atgtaatcttttaatctataaatatatggttctaacatttgatttgatattgatgttattcttgc 2439274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 349 - 392
Target Start/End: Original strand, 40821326 - 40821370
Alignment:
Q  349 atcatttggacacgaatgatattgtcgagtgat-tgtgataatat 392  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  40821326 atcatttggacacgaatgatgttgtcgagcgatatgtgataatat 40821370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 557; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 28926140 - 28925552
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28926140 attatgtaatcttttgatattttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaaagata 28926041  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28926040 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 28925941  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28925940 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 28925841  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28925840 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 28925741  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28925740 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 28925641  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28925640 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgggaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 28925552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 9068164 - 9067570
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9068164 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 9068065  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9068064 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 9067965  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9067964 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 9067865  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9067864 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 9067765  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9067764 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 9067665  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9067664 aaacaaacaatttatacccaaacacttaaagtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 9067570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 3298967 - 3299560
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3298967 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 3299066  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3299067 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 3299166  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3299167 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaatg 3299266  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3299267 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 3299366  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3299367 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgttgattaggaaaatagttttacaca 3299466  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3299467 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtaacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 3299560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 8743280 - 8742686
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743280 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtttttattgttttattgagattcaaaatgata 8743181  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743180 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 8743081  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743080 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 8742981  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8742980 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 8742881  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8742880 attgcaactgttacccttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 8742781  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8742780 aaacaaacaatttatacccaaacatttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 8742686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 535; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 11308984 - 11308390
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11308984 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttactgttttattgagattcaaaatgata 11308885  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11308884 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 11308785  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11308784 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactgcccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 11308685  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  11308684 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgaaag 11308585  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11308584 attgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaataattttacac 11308485  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11308484 aaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 11308390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Original strand, 28370258 - 28370846
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28370258 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 28370357  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28370358 tggacacatacttttgaatctagaaataaaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 28370457  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28370458 cttaatgcttttgggtaaattaatcggttgggaaatcgtcgattaaattatccaatcgacttcgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 28370557  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28370558 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 28370657  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28370658 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 28370757  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28370758 aaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctatggacacgatcctat 28370846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 41577328 - 41576734
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41577328 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtttttattgttttattgagattcaaaatgata 41577229  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41577228 tggacacgtacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctaaacatggatcttaatatttgataatcacttttaatctagaa 41577129  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41577128 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 41577029  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41577028 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 41576929  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41576928 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgacagcaagcggaatagccatatctcttctcgatttacttttatgtaaattaggaaaatagttttacac 41576829  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41576828 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 41576734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 27348191 - 27348785
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27348191 attatgtaatcttttgatattttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 27348290  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27348291 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatccatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagga 27348390  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27348391 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcaactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 27348490  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27348491 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatggtttaaaaagctagaatccgttaattgatcaagag 27348590  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27348591 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 27348690  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  27348691 aaacaaacaatttataccccaacacttaacgtgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaattccctgtggacacgattctattatact 27348785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 34006768 - 34006176
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34006768 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttt-attgagattcaaaatgatat 34006670  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34006669 ggacacataattttgaatctataaatagaataacaatctatcttaagttatcactctatacattgatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 34006570  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34006569 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgtttaaattatcttatctactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaaag 34006470  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  34006469 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagaga 34006370  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34006369 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctctttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacaca 34006270  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  34006269 aacaaataatttatactcaaacacttaatgtgacaaatattgtaaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctgtggacacgatcctattatact 34006176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 478
Target Start/End: Original strand, 13510129 - 13510577
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13510129 attatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 13510228  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13510229 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatatatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 13510328  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13510329 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacg 13510428  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  13510429 atcccttagaattaccgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaaggtagaatccgttaattgatcgagaga 13510528  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagcc 478  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | |||||||    
T  13510529 ttgcagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagtgaaatagcc 13510577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 478
Target Start/End: Original strand, 13599659 - 13600107
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13599659 attatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 13599758  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13599759 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatatatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 13599858  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13599859 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacg 13599958  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  13599959 atcccttagaattaccgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaaggtagaatccgttaattgatcgagaga 13600058  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagcc 478  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | |||||||    
T  13600059 ttgcagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagtgaaatagcc 13600107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 16958716 - 16959310
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16958716 attatttaatttcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcactattgttgttattcttgtatttaatgttttattgagattcaaaatgata 16958815  T
Q  129 tggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 227  Q
    | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16958816 ttgacaaatacttttggatctaagaaatagaataacaatctattttaagttatcactttagacatagattttaatatttgataatcacttttaatctaga 16958915  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||    
T  16958916 acttaatgtttttgggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactctgtgattgtttaaatgtttgagaaattgacatttaaa 16959015  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||| |  |||||||    
T  16959016 cgat-ccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatgttgtcgagtgattgtgataatatcatttataaagc-agaatccgttatttaatcgaga 16959113  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattag-gaaaatagttttac 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  16959114 gattgcagctgttacgcttggttgatatctttaaccccaagcgaaatagccctatctcgtctcgttttacttttatgtcgaatagttaaaatagttttac 16959213  T
Q  527 acaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  16959214 acaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatact 16959310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22243240 - 22242778
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||    
T  22243240 attatgtaatttcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattattgttattcttgaattaaatgttttattgagattcaaaatgata 22243141  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22243140 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagga 22243041  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22243040 cttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattgaactatccaatcgactttgtaatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaaa 22242941  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||||| |||    
T  22242940 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagccagaatccgttatttgatcgcgag 22242841  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||| ||   ||||||||||||||    
T  22242840 attgcagttgttatgcttggttgagtgtctctgacccgaagcgaaaggaccctatctcttctc 22242778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 4861947 - 4861487
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4861947 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 4861848  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4861847 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatttatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 4861748  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||  ||| ||      
T  4861747 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaatgatccgatcgactttgcgattgtttaatagtttgggaaatcgacttttgaata 4861648  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
     ||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4861647 gtccattagaaatcacgacatcatttggacacgaatgatgttgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttatttgatcgagaga 4861548  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  4861547 ttgcagctgttacgcttggttggtatctctgaccccaagcgaaatggtcatatctcttctc 4861487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 30 - 508
Target Start/End: Original strand, 12538323 - 12538807
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaa------ 123  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||          
T  12538323 attatgtaattttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgattttattattttattgagatttaaaattaaaa 12538422  T
Q  124 tgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12538423 tgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatttatcttaagttatcactctagatatggatgttaatatttgataatcacttttaatc 12538522  T
Q  224 tagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtt 323  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  12538523 taggacttaatgtttttgggtcatttaatcgattagaaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgattgtttaaatgtttgggaaatcgacatt 12538622  T
Q  324 taaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatc 423  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | ||||    
T  12538623 taaacaattccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccattatttgatc 12538722  T
Q  424 gagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcta 508  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  || ||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  12538723 gtgagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatgaccttatcttttctctattta-ttttatgtcta 12538807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 30 - 344
Target Start/End: Original strand, 22180767 - 22181081
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22180767 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 22180866  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22180867 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 22180966  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22180967 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgagaaatcgatgtttaaacg 22181066  T
Q  330 atcccttagaaataa 344  Q
    |||||||||||||||    
T  22181067 atcccttagaaataa 22181081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 54 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22222648 - 22222210
Alignment:
Q  54 atatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatcta-ga 152  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||    
T  22222648 atatatgattctagctatttattcaatattgttgttattcttgtgtttaatgttttattgagattcaaaatgatattgacaaatacttttggatttaaga 22222549  T
Q  153 aatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22222548 aatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaat 22222449  T
Q  253 cggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatca 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22222448 cggttgggaaatcgtcgattaaacgatccagtcgactttgtgattgttttaatgttcgggaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatca 22222349  T
Q  353 tttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  22222348 tttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttatttgatcgtgaaattgcagttgttacgcttggttga 22222249  T
Q  453 -tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
     | ||||||||| |||| | | | |||||||||||||||    
T  22222248 gtatctctgaccccaagtgaattggccctatctcttctc 22222210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 30 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22233847 - 22233385
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22233847 attatgtaaactcttgatcttttaatatatgattctagctgtttattcaatattgttgttattcttgtgtttaatgttttattgagattcaaaatgatat 22233748  T
Q  130 ggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
     |||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22233747 tgacaaatacttttggatttaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 22233648  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||||    
T  22233647 cttaatgtttttgggtcatttaatctgttgggaaatcgtcgattaaacgatccagtcgactttgtgattgttttaatgtttggaaaatcgacatttaaac 22233548  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||     
T  22233547 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtggagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttatttgatcgtgaa 22233448  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| | | | | |||||||||||||    
T  22233447 attgcagttgttacgcttggttgagtatctctgaccccaagtgaattggtcctatctcttctc 22233385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 54 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22228990 - 22228552
Alignment:
Q  54 atatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatcta-ga 152  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||    
T  22228990 atatatgattctagctatttattcaatattgttgttattcttgtgtttaatgttttattgagattcaaaatgatattgacaaatacttttggatttaaga 22228891  T
Q  153 aatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22228890 aatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataatcatttttaaactagaacttaatgcttttgggtcatttaat 22228791  T
Q  253 cggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatca 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22228790 cggttgggaaatcgtcgattaaacgatccagtcgactttgtgattgttttaatgttcgggaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatca 22228691  T
Q  353 tttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  22228690 tttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttatttgatcgtgaaattgcagttgttacgcttggttga 22228591  T
Q  453 -tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
     | ||||||||| |||| | | | |||||||||||||||    
T  22228590 gtatctctgaccccaagtgaattggccctatctcttctc 22228552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 85 - 490
Target Start/End: Original strand, 17993087 - 17993492
Alignment:
Q  85 ttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcact 184  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993087 ttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcact 17993186  T
Q  185 ctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaat 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||    
T  17993187 ctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcgcttggaaaatcgtcgattaaacgatccgat 17993286  T
Q  285 cgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgt 384  Q
    |||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||  ||| ||   ||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17993287 cgactttgcgattgtttaatagtttgggaaatcgacttttgaatagtccattagaaatcacgacatcatttggacacgaatgatgttgtcaagtgattgt 17993386  T
Q  385 gataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatct 484  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||    
T  17993387 gataatatcgtttaaaaagctagaattcgttatttgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctgaccccaagcgaaatggtcctatct 17993486  T
Q  485 cttctc 490  Q
    ||||||    
T  17993487 cttctc 17993492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 76 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 13849278 - 13848729
Alignment:
Q  76 tcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaa 175  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||  | ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  13849278 tcaatattgttattattcttgtatttaaagctttattgagatttgaaatgatattgacaaatacttttgaatctaggagtagaataacaatctatct-aa 13849180  T
Q  176 gttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaa 275  Q
    ||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  13849179 gttttcattctatacatagatgttaatctttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttagatcaattaatagattgggaaatcatcgattaaa 13849080  T
Q  276 ctacccaatcgactttgtgatcgtttaaat-gtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtc 374  Q
      | |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||     
T  13849079 tgatccaatcgattttgtgatcatttaaatagtttggaaaatcgacatttaaacaatcccttagaaataacgctatcatttgaacatgaatggtattgtt 13848980  T
Q  375 gagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaa 473  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  13848979 gagtgattgtgataatatcacttaaaaagctagaatccgttatttgatcgagaggttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaa 13848880  T
Q  474 tagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattag-gaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgt 572  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  |||    
T  13848879 tagccctatctctactcgatttacttttatgtcaaatagttaaaatagttttacacaaacaaac-ttttatacccaaacacttaatatgataaatgatgt 13848781  T
Q  573 gaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
      || |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  13848780 tgaattgcttaagatatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactc 13848729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 369 - 623
Target Start/End: Original strand, 22181081 - 22181335
Alignment:
Q  369 attgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaag 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  22181081 attgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagttgttacgattcgttgatgtctctgactgcaag 22181180  T
Q  469 cggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaata 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22181181 cggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaata 22181280  T
Q  569 ttgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22181281 ttgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 22181335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 114 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 36737117 - 36736820
Alignment:
Q  114 agattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatc 213  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  36737117 agattcaaaatgatattgacaaatacttttgaatctaggaatagaataataatctatct-aagttttcactctagacatagattttaatctttgataatc 36737019  T
Q  214 acttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttggga 313  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36737018 actattaatctagaacttgaagcttttgagtcatttaatagattgggaaatcatcgattaaatgatgcaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgtga 36736919  T
Q  314 aatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatcc 412  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  36736918 aatcgatatttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaatgctagaatcc 36736820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 88 - 392
Target Start/End: Original strand, 21692669 - 21692974
Alignment:
Q  88 ttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactct 186  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| || ||| |||    
T  21692669 ttattcttgtgtttaatgctttattgagattcaaaatgatattgacaaatgcttttggatccaagaaatagaataacaatctattttaaattttcattct 21692768  T
Q  187 agacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcg 286  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||  | |||||||| | |||||||    
T  21692769 agacatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatttttgattaaacgatccaatcg 21692868  T
Q  287 actttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtga 386  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21692869 actttgtgattgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataatgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattatga 21692968  T
Q  387 taatat 392  Q
    ||||||    
T  21692969 taatat 21692974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 183
Target Start/End: Original strand, 16580250 - 16580404
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16580250 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 16580349  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcac 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16580350 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcac 16580404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 237 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22227297 - 22227043
Alignment:
Q  237 ttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatccctt 336  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  22227297 ttttgggtcatttaatctgttgggaaatcgtcgattaaacgatccagtcgactttgtgattgttttaatgtttggaaaatcgacatttaaacgatccctt 22227198  T
Q  337 agaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagc 436  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| | ||||| || |||||||     
T  22227197 agaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtggagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttatttgatcgtgaaattgcagt 22227098  T
Q  437 tgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| | | | | |||||||||||||    
T  22227097 tgttacgcttggttgagtatctctgaccccaagtgaattggtcctatctcttctc 22227043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 550 - 617
Target Start/End: Original strand, 16583062 - 16583129
Alignment:
Q  550 acacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16583062 acacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccatgtggacacgatcctat 16583129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 506
Target Start/End: Original strand, 1607757 - 1607912
Alignment:
Q  352 atttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttg 451  Q
    |||| |||| |||| || |||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1607757 atttagacaggaataatgttgttgagtaattgtgataatatcgtttaaaaagttagattccgttatttggtcaagagattgcagttgttacgcttggttg 1607856  T
Q  452 atgtct-ctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtc 506  Q
    ||   | || ||| |||||| |||  ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  1607857 attaattctaaccccaagcgaaatgaccctatctcttctctatttatttttatgtc 1607912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 87
Target Start/End: Original strand, 24040881 - 24040937
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttg 87  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24040881 attatgtaatcttttgatattt-aatatatggttttagctatttattcaatattgttg 24040937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 11357878 - 11357942
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  11357878 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 11357942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 36425415 - 36425479
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  36425415 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 36425479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 45068101 - 45068165
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  45068101 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 45068165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1238751 - 1238687
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||   ||||| ||||||||||||    
T  1238751 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgttattgatgttattcttgc 1238687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15012925 - 15012861
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||    
T  15012925 atgtaatcttttgatatagaaatatatggttctagcatttgatttaatattgatgttattcttgc 15012861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 16710353 - 16710417
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  16710353 atgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 16710417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 74
Target Start/End: Original strand, 29336746 - 29336788
Alignment:
Q  32 tatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  29336746 tatgtaatcttttgatcttcaaatatatggttctagcatttta 29336788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 7933611 - 7933652
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7933611 atgtaatcttttaatcttgtaatatatgattctagcaattta 7933652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 24219957 - 24219998
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24219957 atgtaaacttttgatctttcaatatatgattctagcaattta 24219998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 26250277 - 26250340
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  26250277 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctaac-attgatttgatattgatgttattcttgc 26250340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 36021484 - 36021548
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  36021484 atgtaatcctttgatttataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 36021548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 557; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Original strand, 3539212 - 3539800
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3539212 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 3539311  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3539312 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 3539411  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3539412 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 3539511  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3539512 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 3539611  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3539612 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagtggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 3539711  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3539712 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggacacgatcctat 3539800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 9932802 - 9932214
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9932802 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 9932703  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9932702 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 9932603  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9932602 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 9932503  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9932502 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaataagctagaatccattaatcgatcgagag 9932403  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9932402 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttcttgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 9932303  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9932302 aaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 9932214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 26515425 - 26514837
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26515425 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 26515326  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26515325 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 26515226  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26515225 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 26515126  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26515125 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 26515026  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26515025 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcagaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 26514926  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26514925 aaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggacaagatcctat 26514837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 624
Target Start/End: Original strand, 16698086 - 16698669
Alignment:
Q  41 ttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatact 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16698086 ttttgatcatttaatatatggttctaactatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgaaattcaaaatgatatggacacatact 16698185  T
Q  141 tttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgctttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16698186 tttgaatctagaaatagaataacaacctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgctttt 16698285  T
Q  241 gggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaa 340  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16698286 gggtaatttaatcggtttggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttggaaaatcgatttttaagcgatcccttagaa 16698385  T
Q  341 ataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgtt 440  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16698386 ataacgttatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaaggtagaatccattaatcgatcgagagattacagctgtt 16698485  T
Q  441 acgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatt 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16698486 acgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcattttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatt 16698585  T
Q  541 tatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  16698586 tatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcttgtggacacaatcctattatactc 16698669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 21596524 - 21595930
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21596524 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 21596425  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21596424 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaaactatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagacc 21596325  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21596324 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaaatatccaatcgactttttgatcgtttaaatgtttgagaaatcgatgtttaaacg 21596225  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    | | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21596224 acctcttagcaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgattgagaga 21596125  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21596124 ttgcagctgttacgtttggttgatgtatctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgatttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacaca 21596025  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21596024 aacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatgcgcacctccctgcggaaacgatcctattatactc 21595930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 32806759 - 32806166
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32806759 attatgtaatcttttgataatttaatatatggttatagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattggtttattgagattcaaaatgatat 32806660  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32806659 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataaaaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttaataatcacttttaatctagaac 32806560  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32806559 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgacgttgtgatcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacg 32806460  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32806459 acctcttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagcgattgtgataatattgtttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagaga 32806360  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32806359 ttgcagctgttacgcttgattgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacaca 32806260  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32806259 aacaaacaaattatacccaaacacttaatatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggaaacgatcctatcatact 32806166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 24161252 - 24160657
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24161252 attatgtaatattttgatcatttaatatatggttctagttatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 24161153  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24161152 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataataatctatcttaagttatcactctcgacatggatgttaatatttgataatcacttttaatcaaggac 24161053  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24161052 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttggggaatcgatgtttaaacg 24160953  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24160952 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccattaatcgatcgagaga 24160853  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattag--gaaaatagttttaca 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||    
T  24160852 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctttgatcgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaatagttaaaaatagttttaca 24160753  T
Q  528 caaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  24160752 caaacaaataatttatacccaaccacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccatgcggaaacgatcctattatact 24160657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 576
Target Start/End: Original strand, 24879030 - 24879577
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24879030 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggctatagcttatttattcaatattgttgttattcttgtgtttaatgttttattgagatacaaaatgata 24879129  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879130 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactttagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 24879229  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879230 cttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaattatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 24879329  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24879330 gatcccttagaaataacgatatcatttggacaagaatgatattgtcgagcgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgattgagag 24879429  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  24879430 attgcagctattacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacaa 24879529  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaa 576  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||    
T  24879530 aaacaaacaatttatacccaaatacttaaaatgataaatattatgaaa 24879577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 5988999 - 5988426
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5988999 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtgtttaatgctttattgagattcaaaatgata 5988900  T
Q  129 tggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 227  Q
    | |||| |||||||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5988899 ttgacaaatacttttgggtctaagaactaga-taacaatctatcttaagttttcattctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatttaga 5988801  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  5988800 acttaatgcttttgggtcatttaatcggtagggaaatcgtcaattaaacgatccaatcgacgttgtgaatatttaaatgtttgggaaatcgacatttaaa 5988701  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  5988700 caatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtaataatatcgtttaaaaagctagaatccgttatttgatcgaga 5988601  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttaca 527  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  5988600 gattgcagttgttgcgcttggttgatgtctctgaccccaagtgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcggatagaaaaatagttttaca 5988501  T
Q  528 caaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctg 602  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5988500 caaacaaacattttatacccaaacagttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctg 5988426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 490
Target Start/End: Original strand, 25977114 - 25977575
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaa-tttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25977114 attatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttgtttattcaatattgttgttatttttgtatttaatgatttattgagattcaaaatgata 25977213  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25977214 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagga 25977313  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25977314 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactaaccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 25977413  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25977414 gatcccttagaaataacgatatcatttggaaacgaatgatattgtcgagagattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 25977513  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttg-atgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  25977514 attgcagctgttacgcttggttgaatgtc-ctgaccccaagtgaaatagccctatctcttctc 25977575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 13182353 - 13181892
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13182353 attatgtaatcttttgatcatttaatatatgattctagctatttattcaatattgttgttattcttgtttttaatgttttattgagattcaaaatgatat 13182254  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13182253 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagtac 13182154  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13182153 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttggaaaatcgtcgattgaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 13182054  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  13182053 atcctttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatattgtttaaaaagctagaatccgttatttgatcgtgaga 13181954  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||  || |||||||||||    
T  13181953 ttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgatcccaagcgaaatgaccttatctcttctc 13181892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 490
Target Start/End: Original strand, 14270835 - 14271298
Alignment:
Q  28 caattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatga 126  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14270835 caattatgtaatttcttgattttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtgtttaatgttttattgagattcaaaatga 14270934  T
Q  127 tatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14270935 tatggacacatacttttgaatctagaaatagaatagcaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctag 14271034  T
Q  227 aacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaa 326  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14271035 gacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaattgatgtttaa 14271134  T
Q  327 acgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgag 426  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||    
T  14271135 acgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttaattgatagag 14271234  T
Q  427 agattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||| | | |||||||||||    
T  14271235 agattgcagctgttacgcttggttgatatctctaacccgaagcgaaatggtcatatctcttctc 14271298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 459
Target Start/End: Original strand, 34913854 - 34914283
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34913854 attatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctatctatttattcaatattgctgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 34913953  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34913954 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 34914053  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34914054 ttaatgtttttgggtaatttaatcagttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaatg 34914153  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34914154 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttaattgatcgagaga 34914253  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctct 459  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34914254 ttgcagctgttacgcttggttgatatctct 34914283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13173820 - 13173419
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13173820 attatgtaatcttttgatcatttaatatatgattctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 13173721  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13173720 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatgaatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 13173621  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13173620 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcttcgattgaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaaca 13173521  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  13173520 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttattggatcgtgaga 13173421  T
Q  430 tt 431  Q
    ||    
T  13173420 tt 13173419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 390
Target Start/End: Original strand, 34006667 - 34007028
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34006667 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtttttattgttttattgagattcaaaatgata 34006766  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34006767 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 34006866  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34006867 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 34006966  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 390  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34006967 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtggtaat 34007028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 30 - 557
Target Start/End: Original strand, 1454961 - 1455483
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaa-tttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||     
T  1454961 attatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttgtttattcaatattgttgttattcttgtatttgatgttttattgagattcaaaatgatg 1455060  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    | |||| |||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1455061 ttgacaaatacttttgaatc-----atagaattacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagga 1455155  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1455156 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgttgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaattgatgtttaaac 1455255  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  1455256 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgttgaaaaagctagaatctattaattgatcgagag 1455355  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | | |||||||||||  |||  ||||||||| | || |   |||| |||||||    
T  1455356 attgcagctgttatgcttggttgatctctctaaccccaagcgaaatggtcttatctcttctctattttattttatgtcaaata-gtttataggtttacac 1455454  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaa 557  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||||||||    
T  1455455 aaacaaacattttaaatccatacacttaa 1455483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 30 - 557
Target Start/End: Original strand, 1466653 - 1467175
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaa-tttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||     
T  1466653 attatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttgtttattcaatattgttgttattcttgtatttgatgttttattgagattcaaaatgatg 1466752  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    | |||| |||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1466753 ttgacaaatacttttgaatc-----atagaattacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagga 1466847  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1466848 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgttgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaattgatgtttaaac 1466947  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  1466948 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgttgaaaaagctagaatctattaattgatcgagag 1467047  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | | |||||||||||  |||  ||||||||| | || |   |||| |||||||    
T  1467048 attgcagctgttatgcttggttgatctctctaaccccaagcgaaatggtcttatctcttctctattttattttatgtcaaata-gtttataggtttacac 1467146  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaa 557  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||||||||    
T  1467147 aaacaaacattttaaatccatacacttaa 1467175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 30 - 556
Target Start/End: Original strand, 21631347 - 21631876
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21631347 attacgtaaactcttgatcttttaatacatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtatttaatgctttattgagattcaaaatgata 21631446  T
Q  129 tggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 227  Q
    | || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21631447 ttgaaaaatgcttttgaatctaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatctttgataatcacttataatctaga 21631546  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| || |||  |||||||| |||||  ||||||    
T  21631547 acttaatgtttttgggtcgtttaatagattgagaaatcgtcgattaaacgatctaatcgactttgtgattgtgtaatagtttgggatatcgaattttaaa 21631646  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
       |||||| ||||| || | |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||    
T  21631647 tagtcccttggaaatcacgacacaatttggacacgaatgatgatgttgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagttagaatccgttatttgatcgaga 21631746  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattag-gaaaatagtttta 525  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||   | |||| ||||    
T  21631747 ggttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcggaatgaccctatctcttctctattta-ttttatgtcaaatagtttatataggttta 21631845  T
Q  526 cacaaacaaacaatttatacccaaacactta 556  Q
    |||||||||||| |||| | ||| |||||||    
T  21631846 cacaaacaaacattttaaatccatacactta 21631876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 394 - 623
Target Start/End: Original strand, 8667461 - 8667690
Alignment:
Q  394 gtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgtt 493  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8667461 gtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgtt 8667560  T
Q  494 ttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgc 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  8667561 ttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttataccctaacacttaacttgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatatgc 8667660  T
Q  594 aactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8667661 aactccctgtggacacgatcctattatact 8667690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 405 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 5670898 - 5670686
Alignment:
Q  405 tagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatg 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5670898 tagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatg 5670799  T
Q  505 tctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtg 604  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5670798 tcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaaaacgcaactccctgtg 5670699  T
Q  605 gacacgatcctat 617  Q
    |||||||||||||    
T  5670698 gacacgatcctat 5670686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 506
Target Start/End: Original strand, 15642582 - 15643060
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattga-gattcaaaatgat 127  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  | |||||| | ||||  ||||| |    
T  15642582 attatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattgaatattgttattattcttgcctttaaagctttatttaagatttgaaatgtt 15642681  T
Q  128 atggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttt-taatctag 226  Q
    || |||| ||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||| |   ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||    
T  15642682 attgacaaatacttttggatctaggattagaataataatctatct-atgttttcattctagacatagtatttaatctttcataatcactttgtaatcaag 15642780  T
Q  227 aacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaat-gtttgggaaatcgatgttta 325  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||  ||||    
T  15642781 aacttaatgcttttggatcgtttaataggttaggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgattatttaaatagtttggaaaatcgactttta 15642880  T
Q  326 aacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcga 425  Q
    ||  |||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||   ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  15642881 aataatccattagaaatcacgacatcatttggacaagaatga---tgttgagtgattgtaataatatcgtttaaagaggtaaaatccgttatttgatcga 15642977  T
Q  426 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgc-aagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtc 506  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15642978 aagattgcagttgttatgcttggttgattgtctctgaccccaaagcgaaatttccctatctcgtctcgatttacttttatgtc 15643060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 422 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 25056161 - 25055960
Alignment:
Q  422 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25056161 tcgagagattgcagctgttacgcttgactgatgtctctgacagcaagcgaaataaccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 25056062  T
Q  522 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgata 621  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||    
T  25056061 tttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcttattata 25055962  T
Q  622 ct 623  Q
    ||    
T  25055961 ct 25055960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 9518440 - 9517982
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttatt-gagattcaaaatgat 127  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||| |||||||||| ||||  | |||||| ||||||  ||||| |    
T  9518440 attatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagtttatttattcataattgttattattcttgcatttaaagctttatttgagatttgaaatgtt 9518341  T
Q  128 atggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacat-ggatgttaatatttgataatcacttt-taatcta 225  Q
    || |||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||     |||| | | ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  9518340 attgacaaatacttttgaatctagggttagaataataatcta-----agtttttattctagacataggat-ttaatctttgataatcactttgtaattaa 9518247  T
Q  226 gaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgttta 325  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||     
T  9518246 gaacttaatacttttgggtcgtttaatagattgagaaatcgtcgattaaacgatccgatcgactttgtgattgtttaatagtttgggaaatcgacttttg 9518147  T
Q  326 aacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcga 425  Q
    |    ||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| |||| | ||| |     
T  9518146 agtagtccattagaaatcacgacatcatttggacacgaatgatgttgtttagtgattatgctaatatcgtttaaaaagctagaatctgttatttgattgt 9518047  T
Q  426 gagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  9518046 gagattgcagttgttacacttggttgagtgtgtctgacc-caagcgaaatggccctatctcttctc 9517982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 441 - 556
Target Start/End: Original strand, 34007032 - 34007147
Alignment:
Q  441 acgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatt 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34007032 acgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgttgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatt 34007131  T
Q  541 tatacccaaacactta 556  Q
    ||||||||||||||||    
T  34007132 tatacccaaacactta 34007147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 476 - 624
Target Start/End: Original strand, 6778167 - 6778315
Alignment:
Q  476 gccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaa 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  6778167 gccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaatacttaaagtgataaacattgtgaa 6778266  T
Q  576 aatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
     |||||||||||||| |||||||||||  || |||||| ||| ||||||    
T  6778267 tatgcttatgaaatatgcaactccctgcagaaacgatcatattatactc 6778315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 375 - 593
Target Start/End: Original strand, 26604831 - 26605050
Alignment:
Q  375 gagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaa 473  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||    
T  26604831 gagtgattgtgataatattgtttaaaaagctagaatccgttatttgctcgtgagattgcagctgttacgcttggttgattatctctaaccccaagcgaaa 26604930  T
Q  474 tagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattag-gaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgt 572  Q
    | ||||| |||| ||||  |||| ||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  26604931 tggccctctctcgtctccatttatttttatgtcaaatagttaaaatagttttaaacaaacaaac-ttttatacccaaacacttaagatgataaatatcgt 26605029  T
Q  573 gaaaatgcttatgaaatacgc 593  Q
     ||||||||||| | ||||||    
T  26605030 taaaatgcttatcagatacgc 26605050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Original strand, 32821963 - 32822119
Alignment:
Q  28 caattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatga 126  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32821963 caattatgtaatctttagat-ttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtatttactgttttattgagattcaaaatga 32822061  T
Q  127 tatggacacatacttttgaatct-agaaatagaataacaatctatcttaagttatcac 183  Q
    ||| |||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32822062 tattgacaaatacttttgggtctaagaactagaataacaatatatcataagttatcac 32822119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 26604505 - 26604752
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgtttta-ttgagattcaaaatgat 127  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| || |||||  ||||| |    
T  26604505 attatgtaatcttt-gatcatttaatataagattctagcttatttattcaatattgttattattcttgtttttaatgctttatttaagatttgaaatgtt 26604603  T
Q  128 atggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttt-taatctag 226  Q
    || || | ||||||||| || |||   |||||||| ||||||||  ||||| | | ||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||| ||||| ||    
T  26604604 attgaaaaatacttttggatgtagggttagaataataatctatc-aaagtttttattctagacatagagtttaagttttgataatcactttgtaatcaag 26604702  T
Q  227 aacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaac 276  Q
    ||||||||||| || | |  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26604703 aacttaatgctatttgatcgtttaatagattgggaaatcgtcgattaaac 26604752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 4019920 - 4019984
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  4019920 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 4019984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 4026346 - 4026410
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  4026346 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 4026410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 7062201 - 7062265
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  7062201 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 7062265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 7069387 - 7069451
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  7069387 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 7069451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 9864445 - 9864509
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  9864445 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 9864509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 13671502 - 13671566
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  13671502 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 13671566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 21262259 - 21262323
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  21262259 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 21262323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 27670631 - 27670567
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  27670631 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttaatttgatattgatgttattcttgc 27670567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 34649337 - 34649273
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  34649337 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 34649273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 34655788 - 34655724
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  34655788 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 34655724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 34711242 - 34711306
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  34711242 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 34711306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11016625 - 11016584
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11016625 atgtaatcttttgatctttcaatatatgattctagcaattta 11016584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 31128976 - 31129040
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  31128976 atgtaatcttttgatttataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 31129040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 31548432 - 31548368
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  31548432 atgtaatcttttgatttataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 31548368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 6868049 - 6868011
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagc 68  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6868049 attatgtaatcttttgataatttaatatatggttctagc 6868011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 10081247 - 10081288
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10081247 atgtaatcttttaatcttgtaatatatgattctagcaattta 10081288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Original strand, 1167164 - 1167200
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca 69  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1167164 atgtaatcttttgatctttaaatgtatggttctagca 1167200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 349 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24908650 - 24908606
Alignment:
Q  349 atcatttggacacgaatgatattgtcgagtgat-tgtgataatat 392  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  24908650 atcatttggacacgaatgatgttgtcgagcgatatgtgataatat 24908606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 29907396 - 29907332
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||  | |||| ||||||||||||    
T  29907396 atgtaatcttttgatctataaatatatgattctagcatttgatttgaaattgatgttattcttgc 29907332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 555; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 10346302 - 10345709
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10346302 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 10346203  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10346202 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 10346103  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10346102 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 10346003  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10346002 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 10345903  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10345902 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcaattaggaaaatag-tttacac 10345804  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10345803 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 10345709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 31158273 - 31157685
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31158273 attatgtaaccttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 31158174  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31158173 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagga 31158074  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31158073 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 31157974  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31157973 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 31157874  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31157873 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgctttacttttatgttgattaggaaaatagttttacac 31157774  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31157773 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 31157685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 8107885 - 8107291
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8107885 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgttttcattgttttattgagattcaaaatgata 8107786  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8107785 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 8107686  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8107685 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 8107586  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8107585 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 8107486  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  8107485 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaattagttttacac 8107386  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8107385 aaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 8107291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 624
Target Start/End: Original strand, 2631561 - 2632156
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2631561 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattattgttattcttgttttcattgttttattgagattcaaaatgata 2631660  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2631661 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 2631760  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2631761 cttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 2631860  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2631861 gatcccttagaaataacgatattatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 2631960  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2631961 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgtttaggaaaatagttttacac 2632060  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2632061 aaacaaataatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatactc 2632156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 23795259 - 23795852
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23795259 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaaaattgttgttattcttgtttttattgttttattgagattcaaaatgata 23795358  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23795359 tggacatatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagga 23795458  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23795459 cttaatgcttttgggtaatttagtcgattgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 23795558  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23795559 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 23795658  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23795659 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcaattaggaaaatag-tttacac 23795757  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23795758 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 23795852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 517; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 22321797 - 22321210
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321797 attatgtaatcttttgatcctttaatatatggttctagcttatttattca-tattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 22321699  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321698 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatatatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 22321599  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22321598 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattagactacccaattgactttttgatcgtttaaaagtttgggaaatcgatgtttaaac 22321499  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22321498 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagag 22321399  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22321398 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 22321299  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22321298 aaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctat 22321210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 2797559 - 2796966
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2797559 attatgtaattttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagatttaaaatgatat 2797460  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2797459 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 2797360  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2797359 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtggtcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 2797260  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2797259 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagaga 2797160  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2797159 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaataaccctatctcttctcgttttacttttatgtcaaataggaaaatagttttacaca 2797060  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  2797059 aacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttttgaaatacgcaactccatgcggaaacgatcctattatact 2796966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 6172681 - 6173274
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6172681 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgctgttattcttgcgtttattgttttattgagattcaaaatgatat 6172780  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  6172781 ggacacatactttttaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcagttttaatctaggac 6172880  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6172881 ttaatgcttttaggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 6172980  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6172981 atcccttaaaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgttgagtgattatgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 6173080  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6173081 ttgcagctcttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacgtttatgtcaattaggaaaatagttttacaca 6173180  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6173181 aacaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 6173274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 12090455 - 12089862
Alignment:
Q  32 tatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatatt-gttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatg 130  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12090455 tatgtaatattttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatatttgttgttattattgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatg 12090356  T
Q  131 gacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaact 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12090355 gacacatacttttgaatctagaactagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaact 12090256  T
Q  231 taatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacga 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12090255 taatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcctttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacaa 12090156  T
Q  331 tcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgata-ttgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  12090155 cctcttagaaataacgatatcatttggacatgaatgatatttgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatacgataatcgatcgagaga 12090056  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  12090055 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagtttcacaca 12089956  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  12089955 aacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatgcgcaactccctgcggaaacgatcctattatact 12089862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 31878765 - 31879357
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31878765 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcagttaatgttttattgagattcaaaatgatat 31878864  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31878865 ggacacatacttttgaatctagaaatataataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttagtatttgataatcacttttaatctagaac 31878964  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31878965 ttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaatctatccaatcgattttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 31879064  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagttt-aaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31879065 atcccttagaaataacgatatcatttggaaacaaatgatattgtc--gtgattgtgataatatcgtttaaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 31879162  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31879163 attgaagctgttacgcttggttgatgtctctgactgtaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacac 31879262  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  31879263 aaacaaacaatttatactcaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatact 31879357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 45500707 - 45500113
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  45500707 attatgtaatattttgaccatttaatatatggttatagttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagatttgaaatgatat 45500608  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45500607 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatgtatcttaagttatcactctagacatgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 45500508  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45500507 ttaatgtttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtggtcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaaca 45500408  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45500407 atcccttagaaataacgatatcatttagacatgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccattaatcgatcgagaga 45500308  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  45500307 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagctttacaca 45500208  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||    
T  45500207 aacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgagaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtagaaacgatcatattatactc 45500113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Original strand, 12191008 - 12191594
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12191008 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctggatatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaa-tgatat 12191106  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  12191107 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaaaatttgataatcacttttaatctaggac 12191206  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12191207 ttaatgcttttgggtaatttaatcgttttgtaattcttctatttaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 12191306  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12191307 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgattgatattgtcgagtgattgtgataatatcatttaaaaatctagaattcgttaatcgatcgagaga 12191406  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12191407 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttatttttatgtcgaataggaaaatagttttacaca 12191506  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  12191507 aacaaacaatttataccctaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgtggattcgatcctat 12191594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Original strand, 12184031 - 12184612
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12184031 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttgttcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaa-tgatat 12184129  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  12184130 ggatacatacttttgaatctagagatagaataacaatctatcttgagttatcactctatacatggatgttaaaatttgataatcacttttaatctacgac 12184229  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12184230 ttaatgcttttgggtaatttaatcagttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 12184329  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  12184330 atcccttagaaataac-----gatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatttgttaatcgatcgagaga 12184424  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12184425 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttattttcatgtcgaataggaaaatagttttacaca 12184524  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  12184525 aacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaactccctgtggattcgatcctat 12184612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 31664491 - 31663942
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31664491 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 31664392  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31664391 ggacacatacttttgaatctagaactagaataacaatctatcttaagttatcaatctagacatggatgttagtatttgataatcacttttaatctagaac 31664292  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||                 ||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31664291 ttaatgcttttggg-----------------aaatcgtcgattaaactattcaatcgacttttttattgtttaaatgtttggagaatcgatgtttaaacg 31664209  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    | | |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31664208 acctcttaaaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcaaatgattgtgttaatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 31664109  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  31664108 ttgcaggtgttacgcttggttgatgtttctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagtttcacaca 31664009  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaac 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31664008 aacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatgcgcaac 31663942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 3544876 - 3544281
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3544876 attatgtaattacttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtatttaatgttttattgagattcaaaatgata 3544777  T
Q  129 tggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 227  Q
    | |||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3544776 ttgacaaatacttttggatttaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 3544677  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  3544676 acttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgattgtttaaatgtttgagaaatcgacatttaaa 3544577  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| | ||||||||    
T  3544576 caatctcttagaaataacaatatcatttggacaaaaatgctattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctataattcgttatttgatcgaga 3544477  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttaca 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||| |||||||      
T  3544476 gattgcagctgttacgcttggttgatatctctgaacccaagcgaaatagccctatctcttctcattttacttttatgtcgaatagataaacagttttatt 3544377  T
Q  528 caaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||||    
T  3544376 caaacaaacactttatacccaaacatttaatgcgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacaattctattatact 3544281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 602
Target Start/End: Original strand, 24482911 - 24483483
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24482911 attatgtaatcttttgatcttttaaaatatggttctagtttatttattcaatattgttgttattcttgtgtttaatgttttattgagattcaaaatgata 24483010  T
Q  129 tggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 227  Q
    | ||||  ||||||||  |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24483011 ttgacaattacttttgggtctaagaactagaataataatttatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataatcatttttaatctaga 24483110  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24483111 -cttaatgcttttgggtcatttaatcggttgagaa-tcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgattgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaa 24483208  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24483209 caatccattagaaataacgatatcatttggacccgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgttaaaaaagctagaattcgttaatcgatcgaga 24483308  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttaca 527  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  24483309 gattgcagttgttacgcttggttgatatctctgaccccaagcgaaatagccatatatcttctcgttttacttttatgtcgaataagaaaatagttttaca 24483408  T
Q  528 caaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctg 602  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24483409 taaacaaacaatttatacccaaacacttgatgtgataaatattatgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctg 24483483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 490
Target Start/End: Original strand, 22909283 - 22909743
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22909283 attatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatatattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 22909382  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22909383 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 22909482  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22909483 ttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaattatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacg 22909582  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |    
T  22909583 atcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttatttgatcgagaaa 22909682  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  22909683 ttgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaatagccatatctcttctc 22909743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 2477824 - 2478419
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  2477824 attatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttctatttaaggctttattgagattcaaaatgata 2477923  T
Q  129 tggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 227  Q
    | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2477924 ttgacaaatacttttggatctaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacataaatgttaatatttgataatcacttttcatctaga 2478023  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||    
T  2478024 acttaatgcttttgggtcgtttaataggttaggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgattgtttaaatgtttggaaaatcaacatttaaa 2478123  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  2478124 cgatcccttaaaaataacgatatcatttggacatgaatgatgttgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttatttgatcgaga 2478223  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttaca 527  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || ||| | ||| |||||||||||||     
T  2478224 aattgcagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagcgaaatagctctatctcttctctttttacttctaggtcgaatagaaaaatagttttact 2478323  T
Q  528 caaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  2478324 caaacaaacaatttatacccaagcacttaatgtgaaaaatattgtggaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatact 2478419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 487
Target Start/End: Original strand, 1274753 - 1275212
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1274753 attatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 1274852  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1274853 agacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 1274952  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1274953 ttaatgcttttgggtaatttaatcgattgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 1275052  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaat-ccgttaatcgatcgagag 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||| | ||||| |||    
T  1275053 atcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaatgctagaatcccgttatttgatcgtgag 1275152  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctctt 487  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  1275153 attgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatggccctatctctt 1275212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 187 - 624
Target Start/End: Original strand, 31882433 - 31882870
Alignment:
Q  187 agacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  31882433 agacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatacttttgggtgatttaatcggttgggaaatcattgattaaactatccaatcg 31882532  T
Q  287 actttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtga 386  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882533 aatttgtgattgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttggaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtga 31882632  T
Q  387 taatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctct 486  Q
    |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31882633 taatatcgtttaaaaagttagaattcgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctct 31882732  T
Q  487 tctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatga 586  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31882733 tctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagtttcacataaacaaacaatttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatga 31882832  T
Q  587 aatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  31882833 aatacgcaactccttgcggaaacgatcctattatactc 31882870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 30 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19472186 - 19471864
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19472186 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 19472087  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19472086 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 19471987  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19471986 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 19471887  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatca 352  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  19471886 atcccttagaaataacgatatca 19471864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 222 - 619
Target Start/End: Original strand, 1954285 - 1954681
Alignment:
Q  222 tctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  1954285 tctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttaggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgatcgtataaatgtttagaaaatcgatg 1954384  T
Q  322 tttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcga 421  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1954385 tttaaatgatcccatagaaataacgatatcatttggacactaatgat-ttgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcga 1954483  T
Q  422 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1954484 tcgagagattgcagctgttacgcttggtagatgtctctgaccgcaagcgaaatatccctatctcttctccttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 1954583  T
Q  522 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatga 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||    
T  1954584 tttacacaaacaaacaatttatacccaagcacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaactccctgcggaaacgatcttatga 1954681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 292 - 624
Target Start/End: Original strand, 22825036 - 22825368
Alignment:
Q  292 gtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataata 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22825036 gtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataata 22825135  T
Q  392 tagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcg 491  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22825136 tagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcatctgttacgcttggttgatgtctttgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcg 22825235  T
Q  492 ttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatac 591  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22825236 tttgacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattatgaaaatgcttatgaaatac 22825335  T
Q  592 gcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
     |||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  22825336 acaactctctatggacacgatcctattatactc 22825368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 161 - 434
Target Start/End: Original strand, 22820401 - 22820674
Alignment:
Q  161 aacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttggg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22820401 aacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcaattttaatctaggacttaatgcttttgggtaaattaatcggttggg 22820500  T
Q  261 aaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggaca 360  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22820501 aaatcgtcgattaaattatccaatcgacttcgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggaca 22820600  T
Q  361 cgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgca 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22820601 cgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgca 22820674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 288 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 4705116 - 4704809
Alignment:
Q  288 ctttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgat 387  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  4705116 ctttgtgatcgtttaaatgttttgaaaatcgatatttaaacgatcccttagaactaacgatatcatttggacacatatggtattgttgagtgattgtgat 4705017  T
Q  388 aatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctctt 487  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  4705016 aatatcgtttaaaaagttagaatccgttatttgatcgagagattgcagctattacgcttggttgatgtctttgaccccaagcgaaatagtcctatctctt 4704917  T
Q  488 ctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaa 587  Q
    ||| |||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4704916 ctcattttacttttctatcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaagcacttaatgtgataaatactgtgaaaatacttatgaa 4704817  T
Q  588 atacgcaa 595  Q
    ||| ||||    
T  4704816 atatgcaa 4704809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 29032780 - 29032349
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  29032780 attatgtaaacttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtatttaatgctttattgaaattcaaaatgata 29032681  T
Q  129 tggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 227  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |            |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29032680 ttgacaaatacttttgaatctaagaaatagaataaaaatatatcttaagttatcacttt------------taatatttgataatcacttttaatctaga 29032593  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| | ||| |||||| |||||||||  | || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||| ||    
T  29032592 acttaatgcttttggatcaattaattgattgagaaatcatcgattaaatgatccgatcgactttgtgattgtttaatagtttgggaaatcgacttttgaa 29032493  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
       ||| |||||||| || | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | | ||||| ||    
T  29032492 tagtccattagaaatcacgacatcatttggacacggatgatgttgttgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgtaatttgatcgtga 29032393  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcg 470  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29032392 gaatgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcg 29032349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 402 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 19471860 - 19471637
Alignment:
Q  402 agctagaatccgttaatcgatcgagagattg--cagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttactt 499  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19471860 agctagaatccgttaatcaatcgagagagagagcagctattacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacct 19471761  T
Q  500 ttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactcc 599  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19471760 ttatgtcgattaggaaaatagttttacacgaacaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactcc 19471661  T
Q  600 ctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  19471660 ctgtggacacgatcctattatact 19471637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Original strand, 22818577 - 22818721
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22818577 attatgtaatcttttgataatttaatgtatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 22818676  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatctta 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22818677 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatctta 22818721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 1954122 - 1954270
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  1954122 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatatt---------cttgcttttattgctttattgagatttgaaatgatat 1954212  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactcta 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1954213 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactcta 1954270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 1948318 - 1948382
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  1948318 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 1948382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 6020549 - 6020613
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  6020549 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 6020613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 8185077 - 8185141
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  8185077 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 8185141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 8192637 - 8192701
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  8192637 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 8192701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15915174 - 15915110
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  15915174 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 15915110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15949695 - 15949631
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  15949695 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 15949631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 19090345 - 19090281
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  19090345 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 19090281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 21643055 - 21642991
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  21643055 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 21642991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 22853891 - 22853955
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  22853891 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 22853955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 23612926 - 23612862
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  23612926 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 23612862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26602449 - 26602385
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  26602449 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 26602385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 36876082 - 36876018
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  36876082 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 36876018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 48346781 - 48346845
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  48346781 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 48346845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 48353165 - 48353229
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  48353165 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 48353229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 8142130 - 8142194
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  8142130 atgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 8142194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 9642601 - 9642665
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  9642601 atgtaatcttttgatctataattatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 9642665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 33850328 - 33850392
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  33850328 atgtaatcttttgatctagaaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 33850392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 39433444 - 39433380
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  39433444 atgtaatcttttgatctataaatatctggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 39433380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 3923778 - 3923842
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || | |  |||||| ||||||||||||    
T  3923778 atgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgatgttattcttgc 3923842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 363 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 8138999 - 8138948
Alignment:
Q  363 aatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgtt 415  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  8138999 aatgatgttgttgagtgattgtgataatatcgattaaa-agctagaatccgtt 8138948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 10830810 - 10830874
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||    |||||| ||||||||||||    
T  10830810 atgtaatcttttaatcttgtaatatattattctagcaatttacatgatattgatgttattcttgc 10830874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 11024602 - 11024666
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||    |||||| ||||||||||||    
T  11024602 atgtaatcttttaatcttgtaatatattattctagcaatttacatgatattgatgttattcttgc 11024666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 281 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27954375 - 27954283
Alignment:
Q  281 caatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgt 373  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||  ||||||||||| ||  |||||| ||| | |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||    
T  27954375 caatcgactattggattgtttaatagtttgggaaattgacatttaaatgattcattagaaatcacgacatcatttggacacgaatgatgttgt 27954283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 45434122 - 45434059
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  45434122 atgtaatattttgatctataaa-atatggttctagcaattgatttgatattgatgttattcttgc 45434059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 555; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 4839133 - 4838539
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4839133 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 4839034  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4839033 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 4838934  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4838933 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 4838834  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4838833 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagag 4838734  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4838733 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctaaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 4838634  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4838633 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 4838539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 22047846 - 22048440
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22047846 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttatttttgtttttattgttttattgagattcagaatgata 22047945  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047946 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 22048045  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22048046 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 22048145  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22048146 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 22048245  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22048246 attgcaactgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 22048345  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22048346 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 22048440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 535; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 5273559 - 5272966
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273559 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaaaattgttgttattcttgtttttattgttttattgagattcaaaatgata 5273460  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273459 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 5273360  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5273359 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaac 5273260  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  5273259 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcggtcgagag 5273160  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5273159 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatag-tttacac 5273061  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5273060 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 5272966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Original strand, 323603 - 324191
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  323603 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 323702  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  323703 cggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcacgctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctataa 323802  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  323803 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcaacgttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaac 323902  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  323903 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 324002  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  324003 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggtaaatagttttacac 324102  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  324103 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 324191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 35416692 - 35416099
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35416692 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagcaatttattcaatattattgatattcttgcttttattgttttattgagattcaaaaagatat 35416593  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35416592 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 35416493  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35416492 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgagaaatcgtcaattaaactatccaatcgactttatgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 35416393  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  35416392 acctcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaacaagctagaatttgttaatcgatcaagaga 35416293  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  35416292 ttgcagctgttacgcttggctgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacaga 35416193  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  35416192 aacaaataatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatact 35416099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 615
Target Start/End: Original strand, 52618668 - 52619253
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  52618668 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgatttattgagattcaaaatgatat 52618767  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52618768 ggacacaaacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 52618867  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52618868 ttaatgcttttgggtaatttaatcgatcgggaaatcgtcaattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 52618967  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  52618968 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagattaaaaagatagaatccgttaatcgatcgagaga 52619067  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52619068 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaatagccccatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacaca 52619167  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcct 615  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  52619168 aacaaacaatttataaacaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccgtgcggaaacgatcct 52619253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 40995546 - 40994950
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaata---tatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatga 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40995546 attatgtaatcttttgatcatttaataatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgtcttattgagatttaaaatga 40995447  T
Q  127 tatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40995446 tatggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctag 40995347  T
Q  227 aacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaa 326  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40995346 aacttaatgcttttgagtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaatgaaccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgagaaatcgatgtttaa 40995247  T
Q  327 acgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgag 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40995246 acgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatattttttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgag 40995147  T
Q  427 agattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttac 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40995146 agattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcatgcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcaaataggaaaatagttttac 40995047  T
Q  527 acaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||    
T  40995046 acaaacaaacactttatacccaaacacttaatgtgacaagtattgtgaaaatgcatatgaaatacgcaactccctgtagaaacgatcttattatact 40994950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 42532884 - 42532295
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatgg-ttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42532884 attatgtaatcttttgatcatttaatatatgggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattaagattcaaaatgata 42532785  T
Q  129 tggacacatactttt-gaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42532784 tggacacatactttttgaatctagaactagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagg 42532685  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42532684 acttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 42532585  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  42532584 caatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaatgcttgaatcctttaatcgatcgaga 42532485  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttaca 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42532484 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctttgatcgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttaca 42532385  T
Q  528 caaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42532384 caaacaaacaatttatacccaaacagttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttacgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctat 42532295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 21677664 - 21677071
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  21677664 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgtttgattgagatttaaaatgata 21677565  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21677564 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctataa 21677465  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677464 cttaatgcttttaggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 21677365  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21677364 gatcccttagaaataacgatatcatttggacatgaatgatattgtcgagt-attgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 21677266  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  21677265 attgcagctattacacttggttgatgtctctgaccccaagcgaaataacactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataagaaaatagttttacac 21677166  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  21677165 aaacaaacactttatacctaaacactttatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatact 21677071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 624
Target Start/End: Original strand, 26069893 - 26070487
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26069893 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 26069992  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26069993 ggacacagacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatgtatgttaatatttgataatcacttttagtctagaac 26070092  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26070093 ttaatgcttttgggtaatttaatcgattgggaaatcgtcgattaaactatctaatcgactttgtggtcgtttaaatgtttgagaaatcgatgttttaacg 26070192  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26070193 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 26070292  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  26070293 ttgcagctgttatgcttggttgatgtctctgacccgaagtgaaattgccctatctcttctcattttacttttatgtcgaacaggaaaatagttttacaca 26070392  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  26070393 aacaaacaatttgttcccaaacaattaatgtggcaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactc 26070487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 26373626 - 26373034
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  26373626 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttat-gttttattgagatttgaaatgatat 26373528  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26373527 ggacacatacttttgaatctataaatagaataacaatctaccttaagttatcactctagacatgaatgttaatatttgataatcacttttaatctataac 26373428  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  26373427 ttaatgcttttgggtcatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgatcgtttaaacgtttgggaaatcaatgtttaaaca 26373328  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26373327 atcccttagaaataacaatataatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgatagtatcgtttaaaaagctagaattcgttaatcgatcaagaga 26373228  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26373227 ttgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacaca 26373128  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  26373127 aacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccttgcggaaacgatcctatcatact 26373034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 1188130 - 1188723
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1188130 attatgtaatcttttgatcatttaatatatgattctagttatttatttaatattgttgttattattgaatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 1188229  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1188230 ggacacatacttttgaatctagaaatagaatagcaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 1188329  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1188330 ttgatgcttttgggtgatttaatcggttgggaaatcgtcgaataaactatccaatcgactttgtgattgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaaca 1188429  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  1188430 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgtatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgctaatcgatcgagaga 1188529  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  1188530 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagtgaaataaccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagtttcacaca 1188629  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  1188630 aacaaacaatttatacccacacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacggaaacgatcctattatact 1188723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 55326941 - 55327530
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  55326941 attatgcaatcttttgatcatttaatatatggttctagcttatttattcaaaattgttgttattcttgtgtttaatgctttattgagattcaaaatgata 55327040  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55327041 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactttagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagag 55327140  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55327141 cttaatgtttttgggtaatttaatcgg----gaaatcgtcggttaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 55327236  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  55327237 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatat-gtctaaaaagctggaatccgttaatcgatcgagag 55327335  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55327336 attgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaatagccctgtctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacac 55327435  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||    
T  55327436 aaacaatcaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcatattatact 55327530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 19247824 - 19247231
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19247824 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagcttcaaaatgatat 19247725  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19247724 agacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 19247625  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19247624 ttaatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcaactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 19247525  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  19247524 atcccttagaaataacgatatcatttggatacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagttagaatctgttaatctatcgagaga 19247425  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattagg-aaaatagttttacac 528  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  19247424 ttgcagttgttatgcttggttgatgtctctaaccgtaagcgaaatagctctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaaatagttttacac 19247325  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||    
T  19247324 aaacaaacaatttatactcaaacacttaatgggataaacattgtgaaaatac--atgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcttattatactc 19247231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 46692033 - 46691464
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  46692033 attatgtaatcttttgataatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagatttgaaatgatat 46691934  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46691933 ggacacatacttttaaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatccctctaaacattgatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 46691834  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46691833 ttaatgcttttaggtcaattaatcggttgggaaatcatcgattaaacgatccaatcaactttgtgatcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacg 46691734  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46691733 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 46691634  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46691633 ttgtagctgttacgcttgattgatgtctctgagcgcaagcgaaatagtcctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacaca 46691534  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactcc 599  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46691533 accaaacaatttatactcaaacacttaatgtgataaacattatgaaaatacttatgaaatacgcaactcc 46691464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 30218387 - 30217789
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca----atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatg 125  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||||||    
T  30218387 attatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttattatttattcaatattgttgctattcttgtatttaatgctttattgagattcaaaatg 30218288  T
Q  126 atatggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatct 224  Q
    |||| |||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30218287 atattgacaaatactttttgttctaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatct 30218188  T
Q  225 agaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgttt 324  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  30218187 aaaacttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatcatcgattaaag-atccaatcgactttgtgatagtttaaatgtttgggaaatcgacattt 30218089  T
Q  325 aaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcg 424  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||    
T  30218088 agacgatccattagaaataacgatatcatttggacaggaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagttagaattcgttatttgatcg 30217989  T
Q  425 agagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattag-gaaaatagttt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||  ||||||||||    
T  30217988 agagattgcagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagcgagctagccctatctcgtctcgttttacttttacgtcgaatagttaaaatagttt 30217889  T
Q  524 tacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||| |||||    
T  30217888 tacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactctctgcgaaaacgatcttattatact 30217789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 228 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 21668703 - 21668307
Alignment:
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21668703 acttaatgcttttaggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 21668604  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagttt-aaagagctagaatccgttaatcgatcgag 426  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21668603 cgatcccttagaaataacgatatcatttggtcacgaatgatattttcgagtgattgtgataatatcgttttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgag 21668504  T
Q  427 agattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttac 526  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  21668503 agattgcagctattactcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaataacactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataagaaaatagttttac 21668404  T
Q  527 acaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  21668403 acaaacaaacactttatacctaaacactttatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatact 21668307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 30 - 597
Target Start/End: Original strand, 20948911 - 20949480
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||  ||||||||    
T  20948911 attatgtaaactcttgatattttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtatttatagctttattgagatttgaaatgata 20949010  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    | |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20949011 ttgacaaatacttttggatctaggaatagaataacaatctatct-aagttttcattccagacatagatgttaatctttgataatcacttttaatctagaa 20949109  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaat-gtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
     |||||| |||||| | | ||||| | |||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  20949110 tttaatgtttttggatcaattaatagattggaaaatcatcgattaaatgatccaatcgactttgtggtcgtttaaatagtttgggaaatcgacatttaaa 20949209  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||    
T  20949210 cgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatgtcgtttaaaaagctagaatccgttatttaatcgaga 20949309  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattag-gaaaatagtttta 525  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  20949310 ggttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaagtagccttatctctactcgatttacttttatgtcgaatagttaaaatagtttta 20949409  T
Q  526 cacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaact 597  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  |||  ||||||||| || ||||||||||    
T  20949410 cacaaacaaac-ttttatacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaaatgcttaagatatacgcaact 20949480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 49 - 556
Target Start/End: Original strand, 53895561 - 53896070
Alignment:
Q  49 ttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |    
T  53895561 ttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtgtttaatgctttattgagattcaaaatgatattgacaaatacttttgggt 53895660  T
Q  148 cta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaa 246  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||      
T  53895661 ctaagaaatagaataacaatctatcttaagttttcattctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaccttaatgtttttgggtcg 53895760  T
Q  247 tttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataaca 346  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||   ||| |||||||| ||     
T  53895761 tttaataggttgggaaatcgtctattaaacgatccaatcgactttgtgattgtttaatagtttgggaaatcgacttttaaatagtccattagaaatcacg 53895860  T
Q  347 atatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgctt 446  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  53895861 acatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaatctagaatctgttatttgatcgtgagattgcagttgttaggctt 53895960  T
Q  447 ggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatac 545  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | || ||| |||| | |||||||||||||| |||| |     
T  53895961 ggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttctctatttatttttatgtcaagta-gaatataggtatacacaaacaaacattttaaat 53896059  T
Q  546 ccaaacactta 556  Q
    ||| |||||||    
T  53896060 ccatacactta 53896070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 322 - 623
Target Start/End: Original strand, 33239375 - 33239675
Alignment:
Q  322 tttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcga 421  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33239375 tttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcga 33239474  T
Q  422 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33239475 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtttctgaccgcaagcggaatagccctaactcttctcattttacttttatgtctattaggaaaatagt 33239574  T
Q  522 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgata 621  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33239575 tttacacaaac-aacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 33239673  T
Q  622 ct 623  Q
    ||    
T  33239674 ct 33239675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 30 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 33110699 - 33110235
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||  ||||||||    
T  33110699 attatgtaaacttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtatttaaagctttattgagatttgaaatgata 33110600  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    | |||| |||||||||||||||| || |  |||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33110599 ttgacaaatacttttgaatctaggaaaaacataagagtctatcttaagttatcattctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatctataa 33110500  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||    
T  33110499 cttaatgttcaggggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgattgtttaaatgtttgggagatcgacatttgaac 33110400  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
     ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || | ||||| |||    
T  33110399 aatcccttagaaatcacgacaacatttggacacgaatgatgttgttgagtgattgtgataatattgtttaaaaagctagaatccaatatttgatcgtgag 33110300  T
Q  429 a--ttgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    |  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  33110299 attttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatagtcatatctcttctc 33110235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 375 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 44429042 - 44428799
Alignment:
Q  375 gagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaat 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  44429042 gagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagtggtat 44428943  T
Q  475 agccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtga 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44428942 agccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtga 44428843  T
Q  575 aaatgcttatgaaatacgcaac-tccctgtggacacgatcctat 617  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44428842 aaatgcttatgaaatacgcaacttccctgtggacacgatcctat 44428799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 269 - 623
Target Start/End: Original strand, 42271781 - 42272135
Alignment:
Q  269 gattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgat 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42271781 gattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacggccttttagaaataatgatatcatttggacacgaatgat 42271880  T
Q  369 attgtcgagtgattgtgataatatagttt-aaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaa 467  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||    
T  42271881 attgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaaagttagaatccgttaattgatcgagaggttgcagctgttacgcttgattgatgcctctgaccctaa 42271980  T
Q  468 gcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaat 567  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42271981 gcgaaata-tcctatctcttctcgttttactttattgttgaataggaaaatagttttacacaaataaacactttatacccaaacacttaaagtgataaat 42272079  T
Q  568 attgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  42272080 attgtgaacatacttatgaaatatgcaactccatgcggaaacgatcctattatact 42272135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 88 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9417372 - 9417069
Alignment:
Q  88 ttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactct 186  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  9417372 ttattcttgtgtttaatgctttattgagattcaaaatgatattgacaaatacttttggatctaagaaatagaataacaatctatcgtaagttttcattct 9417273  T
Q  187 agacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcg 286  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  9417272 agacatagatgttaatattttacaatcacttttaatctagaatttaatgcttttggtttgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaatgatccaatcg 9417173  T
Q  287 actttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtga 386  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9417172 actttgtgattgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacgatcccctagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtga 9417073  T
Q  387 taat 390  Q
    ||||    
T  9417072 taat 9417069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 366 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 19731065 - 19730985
Alignment:
Q  366 gatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgctt 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19731065 gatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgctt 19730985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 564 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 19730982 - 19730923
Alignment:
Q  564 aaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19730982 aaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 19730923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 367 - 453
Target Start/End: Original strand, 6640465 - 6640551
Alignment:
Q  367 atattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgat 453  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6640465 atattgttgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttatttgatcacgagattgcagttgttacgcttggttgat 6640551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 7780863 - 7780799
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  7780863 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 7780799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 13594645 - 13594581
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  13594645 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 13594581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 17457392 - 17457328
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  17457392 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 17457328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 27590842 - 27590778
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  27590842 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 27590778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 30211221 - 30211285
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  30211221 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 30211285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 30238766 - 30238702
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  30238766 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 30238702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 37356034 - 37356098
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  37356034 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 37356098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 37368000 - 37368064
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  37368000 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 37368064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8104418 - 8104354
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||  ||||||||||||    
T  8104418 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattaatgttattcttgc 8104354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 275
Target Start/End: Original strand, 8895205 - 8895277
Alignment:
Q  204 tttgataatcacttttaa-tctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaa 275  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  8895205 tttgataatcactttgaaatcaagaacttaatgcttttggatcgtttaataggttgagaaatcatcgattaaa 8895277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 36754476 - 36754540
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  36754476 atgtattcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 36754540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 55462457 - 55462521
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||  ||||||||||||    
T  55462457 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattaatgttattcttgc 55462521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 533 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 24576924 - 24576852
Alignment:
Q  533 aaacaatttataccc-aaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgc---ttatgaaatacgcaactccct 601  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||    
T  24576924 aaacaatttataccccaaacatttaatgtgataaacattgtgaaaatactaattatgaaatacgcaattccct 24576852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Original strand, 5660545 - 5660578
Alignment:
Q  344 acaatatcatttggacacgaatgatattgtcgag 377  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5660545 acaatattatttggacacgaatgatattgtcgag 5660578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Original strand, 5660234 - 5660270
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca 69  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5660234 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagca 5660270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 49359000 - 49359063
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||  |||||| | ||||||||||    
T  49359000 atgtaatcttttgatcttt-aatatatgattctagcatttgatttgatattgatattattcttgc 49359063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 547; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 547; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 12168213 - 12167619
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12168213 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaataata 12168114  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12168113 ttgacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 12168014  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12168013 cttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 12167914  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12167913 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 12167814  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12167813 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 12167714  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12167713 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgtttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 12167619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 547; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 38121929 - 38121335
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38121929 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 38121830  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38121829 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 38121730  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38121729 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 38121630  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38121629 gatcccttagaaataatgatatcatttgtacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 38121530  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38121529 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagtttcacac 38121430  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  38121429 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcttattatact 38121335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 33492195 - 33491601
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33492195 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgttttcattgttttattgagattcaaaatgata 33492096  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33492095 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 33491996  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491995 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 33491896  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  33491895 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagttagaatccgttaatcgatcgagag 33491796  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33491795 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 33491696  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33491695 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtagacacgatcctattatact 33491601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 535; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 39001178 - 39000584
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39001178 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 39001079  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39001078 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgtcaatatttgataatcacttttaatctagaa 39000979  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39000978 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgattgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 39000879  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  39000878 gatcgcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgtaaatcgatcgaaag 39000779  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39000778 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagtcctatctcttcttgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 39000679  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39000678 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 39000584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 432337 - 431750
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  432337 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 432238  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  432237 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 432138  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  432137 ttaatgcttttgggtgaattaatcggttgggaaatcgtcgattaaattatccaatcgacttcgtgattgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 432038  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  432037 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagaga 431938  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  431937 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcaattaggaaaataattttacaca 431838  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  431837 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 431750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 9667692 - 9667099
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9667692 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 9667593  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9667592 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 9667493  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9667492 ttaatgcttttgggtaaattaatcggttggtaaatcgtcgattaaattatccaatcgacttcgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaagg 9667393  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9667392 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaattgatcgagaga 9667293  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9667292 ttgaagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacaca 9667193  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9667192 aacaaacaatttatacccaaacacttaacatgacaaatattgcgaaaatgcttatgaactacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 9667099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 613
Target Start/End: Original strand, 49249245 - 49249812
Alignment:
Q  46 atcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49249245 atcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaattatatggacacatacttttg 49249344  T
Q  145 aatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  49249345 aatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagaaatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgagt 49249444  T
Q  245 aatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49249445 aatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataa 49249544  T
Q  345 caatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgc 444  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49249545 cgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacac 49249644  T
Q  445 ttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttata 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49249645 ttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgctttacatttatgtcaattaggaaaatag-tttacacaaacaaacaatttata 49249743  T
Q  545 cccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatc 613  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  49249744 tccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctatggacacgatc 49249812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 41000100 - 40999507
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  41000100 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattcttttattgagatttgaaatgatat 41000001  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41000000 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 40999901  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40999900 ttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaaaaggctttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 40999801  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  40999800 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaaa 40999701  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  40999700 ttgcaactgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcaaaataaccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagtttaacaca 40999601  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  40999600 aacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaattacgcaactccctgcggaaacgatcctattatact 40999507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 16832779 - 16832185
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||    
T  16832779 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgctattcttgcatttaatatgttatttagattcaaaatgatat 16832680  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16832679 ggacacatatttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatgaatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 16832580  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16832579 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttaggaaatcgtcgattaaattatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 16832480  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16832479 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgcttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 16832380  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16832379 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctccgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacaca 16832280  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  16832279 aacaaacaatttatacccaaacacttaatatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactc 16832185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 11738794 - 11738201
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11738794 attatgcaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttactgagattcaaaatgatat 11738695  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11738694 ggacacataattttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 11738595  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11738594 ttaatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgactaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatttttgggaaatcaatgtttaaacg 11738495  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11738494 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagaga 11738395  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  11738394 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcaaatagaaaaatagttttacaca 11738295  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  11738294 aacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaattattgtgaaaatgcttatgaaatacgaaactccctgcggaaatgatcctattatact 11738201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 13218042 - 13217450
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13218042 attatgtaatcttttgataatttaatatacggttctagctatttattcaatattgttgttatt---gcctttaatgttttattaagattcaaaatgatat 13217946  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13217945 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatttatcttaagttatcactctagacatgaatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 13217846  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgacttt-gtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13217845 ttaatacttttggataatttaattagctgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgacttttgggatcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaac 13217746  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13217745 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgattgatattgtcgagtgattgtgataatatcatttaaaaagctaaaatccgttaatcgatcgagag 13217646  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13217645 attgcagctgttacgtttggttgagctctgtgaccgcaagcgaaatggccctatctcttttcgttttacatttatgtcgaataggaaaatagttttacac 13217546  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  13217545 aaacatacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactc 13217450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 57 - 623
Target Start/End: Original strand, 16130706 - 16131260
Alignment:
Q  57 tatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaata 156  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16130706 tatgattctagccatttattcaatattgttgttattcttgctttt--------attgagatttgaaatgatatggacacatacttttgaatctagaaata 16130797  T
Q  157 gaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggt 256  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16130798 aaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtcatttaatcggt 16130897  T
Q  257 tgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttg 356  Q
    | || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16130898 tagggaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgatcgtttaaatatttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttg 16130997  T
Q  357 gacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtc 456  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16130998 gacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctataatcc----atcaatcgagatattgcagctgttacgcttggttgatgtc 16131093  T
Q  457 tctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacactta 556  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16131094 tccgaccgcaagcgaaataaccctatcccttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacactta 16131193  T
Q  557 acgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  16131194 atatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccgtgcggaaacgatcctattatact 16131260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 44505265 - 44504861
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatgg-ttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44505265 attatgtaatcttttgattatttaatatatgggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 44505166  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44505165 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaaattatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 44505066  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44505065 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 44504966  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    || | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44504965 gacctcttagaaataacgacatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagag 44504866  T
Q  429 attgc 433  Q
    |||||    
T  44504865 attgc 44504861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 8996258 - 8995731
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8996258 attatgtaaactcttgatcttttaatatatgattctagctatttattcaatattgttgttattattgcatttaatgttttattgagatttaaaatgatat 8996159  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  8996158 ggacacatccttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgctaatatttgataatcacttttaatctaaaaa 8996059  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8996058 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaagctatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacg 8995959  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  8995958 atcccttagaaataacgatatcattttgacacgaatgatattattgagtgattgtgataatgtagtttaaaaagctagaatccgttatttgatcgtgaga 8995859  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattag-gaaaatagttttaca 527  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||   | |||| ||||||    
T  8995858 ttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatggccctatctcttctctattta-ttttatgtcaaatagtttatataggtttaca 8995760  T
Q  528 caaacaaacaatttatacccaaacactta 556  Q
    |||||||||| |||| | ||| |||||||    
T  8995759 caaacaaacattttaaatccatacactta 8995731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 46 - 490
Target Start/End: Original strand, 36083938 - 36084383
Alignment:
Q  46 atcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36083938 atcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgtgtttaatgttttattgagattcaaaatgatattgacaaatacttttg 36084037  T
Q  145 aatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggg 243  Q
      |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36084038 ggtctaagaaatataataacaatctatcttaagttttcattctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcatttggg 36084137  T
Q  244 taatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaata 343  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  36084138 tcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgattatataaatgtttgggaaatcgacatttaaacaatcccttagaaata 36084237  T
Q  344 acaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacg 443  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  36084238 acgatatcatttggacacgaatgatattgtcaagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatatgttaattgatcgtgagattgcagttgttacg 36084337  T
Q  444 cttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    | ||||||| || ||||||| |||||| |||| || ||||| |||||    
T  36084338 cgtggttga-gtgtctgaccccaagcgaaataaccatatcttttctc 36084383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 50 - 490
Target Start/End: Original strand, 15161612 - 15162052
Alignment:
Q  50 tttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttatt-gagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatc 148  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||| |||||  ||| ||||||||| |||    
T  15161612 tttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgctttatttgagattgaaaaggatattaacaaatacttttggatc 15161711  T
Q  149 tagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatt 248  Q
     || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15161712 caggattagaataataatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatatagaacttaatgcttttgggtcatt 15161811  T
Q  249 taatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaat 348  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15161812 taatcggttgggaaatagtcgattaaacggttcaatcgactttgtgattgtttaaatgtttgggaaattgacatttaaatgatcccttagaaataacgat 15161911  T
Q  349 atcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttgg 448  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15161912 atcatttggacatgaatgatattgtcgagt-attgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttatttgatcgagcgattgcagctgttacgcttag 15162010  T
Q  449 ttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||||    
T  15162011 ttgatatctctaaccccaagcgaaatagccatacctcttctc 15162052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 328 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 20226060 - 20225765
Alignment:
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20226060 cgatcgcttataaataacgatatcatttggacacggatgagattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgaga 20225961  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttaca 527  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  20225960 gattgtagctgttacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaatatccccatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttata 20225861  T
Q  528 caaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||    
T  20225860 caaacaaacaatttatacccaaacacttaatatgataaatattgtaaaaatgcttatgaaatacgcaactctctgcggaaacgatcctattatact 20225765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 475
Target Start/End: Original strand, 9268801 - 9269247
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttatt-gagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||  | |||||| ||||||  ||||  ||    
T  9268801 attatgtaaactcttgatcttttaatatatgtttctagctatttattcaatattgttattattcttgcatctaaagctttatttgagatttgaaatttta 9268900  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaa-tctaga 227  Q
    | |||| ||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||| || || || |||    
T  9268901 ttgacaaatacttttggatctaggatcagaataataatctatct-aagtgttcattctagacatagaatttaatctttgataatcaccttgaaatcaaga 9268999  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
     |||||||||||| |||  |||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||  |||||| |||| ||  ||||||    
T  9269000 gcttaatgcttttaggtcgtttaattgattgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcggcttt-tgattgtttaatagtttggaaaattgacttttaaa 9269098  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
       ||| |||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||| ||    
T  9269099 tagtccattagaaatcacgacatcatttagacacgaatgatgttgtcgagtgattttgataatatcgtttaaaaagttagaatccgttatttgatcgtga 9269198  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaata 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||    
T  9269199 gattgcagttgttacgcttggttgagtatctctgaccccaagcgaaata 9269247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 363 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 3365889 - 3365761
Alignment:
Q  363 aatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctga 461  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3365889 aatgatgttgtcgagaaattgtgataatatcgttttaaaagctagaatccgttatttgatcgagaggttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctga 3365790  T
Q  462 ccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    || |||||| |||  ||||||||||||||    
T  3365789 ccccaagcgaaatgaccctatctcttctc 3365761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 352 - 453
Target Start/End: Original strand, 13830756 - 13830857
Alignment:
Q  352 atttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttg 451  Q
    |||| |||| |||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | || ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13830756 atttagacatgaataatgttgttgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttatttggtcaagagattgcagttgttacgtttggttg 13830855  T
Q  452 at 453  Q
    ||    
T  13830856 at 13830857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 275
Target Start/End: Original strand, 6244363 - 6244606
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattt-attcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatgg 131  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| | |||||||  |||| |||||  || |||||| ||||| ||| |    
T  6244363 atgtaaactcttgatcatttaatatatggttccagctcttttattcaatattgttatcattcttgtgtttaatgtttattttagattcgaaatgttattg 6244462  T
Q  132 acacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttt-taatctagaact 230  Q
    | |  |||||||||||||||   || ||||| ||||||| | ||||| | | ||||||||| ||  |||   |||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  6244463 aaaggtacttttgaatctagggttaaaataataatctat-taaagtttttattctagacatagagtttagattttggtaatcactttaaaatcaagaact 6244561  T
Q  231 taatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaa 275  Q
    ||||| | |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||    
T  6244562 taatgttattgggtcatttaatagattgagaaatcatcgattaaa 6244606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 453
Target Start/End: Original strand, 39456759 - 39456860
Alignment:
Q  352 atttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttg 451  Q
    |||| |||| |||| || |||| |||||||||||||||||| |||| || | |||||||| |||| | ||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  39456759 atttagacatgaataatgttgttgagtgattgtgataatatcgtttgaaaatctagaatctgttatttgatcatgaggttgcagttgttacgcttggttg 39456858  T
Q  452 at 453  Q
    ||    
T  39456859 at 39456860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1175143 - 1175079
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  1175143 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 1175079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 4600066 - 4600002
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  4600066 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 4600002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 9869642 - 9869578
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  9869642 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 9869578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26622007 - 26621943
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  26622007 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 26621943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 31072855 - 31072791
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  31072855 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 31072791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 41305205 - 41305269
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  41305205 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 41305269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 43687166 - 43687102
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  43687166 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 43687102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 45023072 - 45023008
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  45023072 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 45023008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 44241892 - 44241830
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||    
T  44241892 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagca--ttatttgatattgatgttattcttgc 44241830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 45619829 - 45619870
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  45619829 atgtaatcttttgatcttgtaatatatgattctagcaattta 45619870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 1115667 - 1115731
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  1115667 atgtaatcttttgatctagaaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 1115731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 6239192 - 6239128
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  6239192 atgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 6239128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 105
Target Start/End: Original strand, 16130156 - 16130203
Alignment:
Q  57 tatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattg 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16130156 tatgattctagccatttattcaatattgttgttattcttg-ttttattg 16130203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 23762021 - 23762085
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  23762021 atgtaatcttttaatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 23762085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 35085543 - 35085479
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  35085543 atgtaatcttttgatctataaatatatggttatagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 35085479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 39053023 - 39053087
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  39053023 atgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 39053087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 39059395 - 39059459
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  39059395 atgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 39059459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 92
Target Start/End: Original strand, 13830465 - 13830515
Alignment:
Q  43 ttgatcttttaatatatggttctagc-aatttattcaatattgttgttatt 92  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  13830465 ttgatcatttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttattatt 13830515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 2824505 - 2824546
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2824505 atgtaatcttttaatcttgtaatatatgattctagcaattta 2824546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 5357432 - 5357473
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5357432 atgtaatcctttgatcttgtaatatatgattctagcaattta 5357473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 29002262 - 29002209
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgtt 86  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  29002262 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgtt 29002209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 38672462 - 38672503
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38672462 atgtaatcttttaatcttataatatatgattctagcaattta 38672503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 11912947 - 11913011
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  11912947 atgtaatcttttgatttataaatatatgattctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 11913011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 13249254 - 13249218
Alignment:
Q  32 tatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagc 68  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13249254 tatgtaatcttttgttcttttaatatatgattctagc 13249218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 28996546 - 28996510
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca 69  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28996546 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagca 28996510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 32798261 - 32798197
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  32798261 atgtaatcttttgatgtagaaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 32798197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 44916875 - 44916811
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || || |||  |||||| ||||||||||||    
T  44916875 atgtaatattttgatctataaatatatggttctaacatttgatttgatattgatgttattcttgc 44916811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 545; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Original strand, 8907 - 9495
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8907 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 9006  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9007 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagga 9106  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9107 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtctaaat 9206  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9207 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaattgatcgagag 9306  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9307 attgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 9406  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9407 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 9495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 541; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Original strand, 29223879 - 29224467
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29223879 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 29223978  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29223979 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactttagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 29224078  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29224079 cttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 29224178  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29224179 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccattaatcgatcgagag 29224278  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29224279 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 29224378  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29224379 aaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 29224467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Original strand, 29337178 - 29337766
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29337178 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 29337277  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29337278 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactttagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 29337377  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29337378 cttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 29337477  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29337478 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccattaatcgatcgagag 29337577  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29337578 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 29337677  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29337678 aaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 29337766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 13230338 - 13229745
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13230338 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagatttgaaatgatat 13230239  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13230238 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 13230139  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13230138 ttaatgcttttagttcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacg 13230039  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13230038 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 13229939  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13229938 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgttgattaggaaaatagttttacaca 13229839  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  13229838 aacaaacaatttatactcaaacacttaatgtgacaaatattataaaaatgcttataaaatacgcaactccatgtggaaacgatcatattatact 13229745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 36040259 - 36039665
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgtttt-attgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36040259 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattttttttattgagattcaaaatgata 36040160  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36040159 tggacacatacttttgaatctataaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagga 36040060  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36040059 cttgatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatcctatcgactttttgattgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 36039960  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36039959 gatcccttataaataacgatatcatttggacatgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatcctttaatcgatcgagag 36039860  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36039859 attgtatttgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcattttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 36039760  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  36039759 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcatatgaaatacgcaactccttgtgaacacgatcctattatact 36039665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 27257550 - 27258143
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27257550 attatgtaatcttttgatcttttaatatatagttctagctatttattcaatattgttgttattcttaaatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 27257649  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27257650 ggacacatacttttaaatctagaaatagaataacaatctatcttaaattatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 27257749  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27257750 ttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 27257849  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27257850 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 27257949  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27257950 ttgcagctgttacgattggttgatgtctctaaccccaagtgaaattgccctatctcttctcgttttacttttatgtcaaataggaaaatagttttacaca 27258049  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||| |||||    
T  27258050 aacaaacactttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttcctgcggaaacaatcatattatact 27258143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 23925028 - 23924434
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23925028 attatgtaatcttttgataatttaatatatggttatagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 23924929  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       
T  23924928 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataataatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatttttgataatcacttttaatctaggtt 23924829  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23924828 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcaattaaattatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 23924729  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23924728 atcccttaaaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagcaagaatccgttaatcgatcgagaga 23924629  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  23924628 ttgcagctgttacgtttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatggccctatctcttattgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacaga 23924529  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  23924528 aacgaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctacggaaacgatcctattatactc 23924434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 42700949 - 42700377
Alignment:
Q  50 tttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatct 149  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42700949 tttaatatatggttctagctatttgtttaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatgaacacatacttttgaatct 42700850  T
Q  150 agaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaattt 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42700849 agaaatagaataacaatctatattaagttatcactctagacatggaagttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgctttttggtaattt 42700750  T
Q  250 aatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaata 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42700749 aatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgata 42700650  T
Q  350 tcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  42700649 tcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcatttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga-tgtagttgttacgcttggt 42700551  T
Q  450 tgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaa 549  Q
    ||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42700550 tgatgtctccgactgcaagccaaatagccatatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatactcaa 42700451  T
Q  550 acacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  42700450 acacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgcggaaacgatcctattatact 42700377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 602
Target Start/End: Original strand, 32523094 - 32523668
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32523094 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttatagcgatttattcaatagtgttgttattcttacttttattgttttattgagatttgaaatgatat 32523193  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32523194 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatccatcttaagttatcactctaaacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaaaac 32523293  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32523294 ttaatgcttttgggtcatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgatcgtttaaatatttgggaaatcgatgtttcaacg 32523393  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  32523394 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatatgttaatcgatcgagaga 32523493  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtc--tattaggaaaatagttttaca 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  32523494 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttatcgttttaattttatgtcataagtaggaaaatagttttaca 32523593  T
Q  528 caaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctg 602  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32523594 caaacaaacactttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgtttatgaaatatgcaactccctg 32523668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 36667865 - 36667290
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36667865 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagatttaaaatgatat 36667766  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36667765 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctaggcatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 36667666  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||         
T  36667665 ttaatgcttttgggtaatttaatccgttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgttt----- 36667571  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||             ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36667570 -tcccttagaaataacgatatcatttggaca-------------cgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 36667485  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  36667484 tttcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaattgccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacaca 36667385  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  36667384 aacaaacaatttatattcaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactc 36667290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 43991690 - 43992271
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43991690 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggtgctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 43991789  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaa-tagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43991790 ggacacatacttttgaatctagaaaatagaataacaatctatcttaagttatcactgtagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagga 43991889  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||           |    
T  43991890 cgtaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgataaaactatctaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaat-----------c 43991978  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||    
T  43991979 gatcccttagaaataacgatatcatttggacactaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatatgttaattgatcgagag 43992078  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  43992079 attgcagatgttacgcttgattgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttac-tttatgtcgattaggaaaatagttttgcgc 43992177  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  43992178 aaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccatgtgga-acgatcctattatact 43992271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 28457873 - 28457280
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||    
T  28457873 attatgtaatttcttgatcttttaatatatagttctagcttatttatttaatattgttgttattcttg--tgtaatgctttattgagattcaaaatgata 28457776  T
Q  129 tggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 227  Q
    | |||| |||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28457775 ttgacaaatacttttgggtttaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataattacatttaatctaga 28457676  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  28457675 atttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaatgatccaatcaactttgtgattgtttaaatgtttgggaaatagacatttaaa 28457576  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||||||||    
T  28457575 caatctcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgttttaaaagctagaatccgttatttgatcgaga 28457476  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttaca 527  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  28457475 gattgcagctattacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttctcattttacttttatgtcaaatagaaaaatagttttaca 28457376  T
Q  528 caaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||    
T  28457375 caaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcatattatact 28457280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Original strand, 14700807 - 14701403
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14700807 attatgtaaacttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttgttcttgtatttaatgctttattgagattcaaaatgata 14700906  T
Q  129 tggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 227  Q
    | || | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14700907 ttgagaaatacttttggatctaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 14701006  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
    |||||||  |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  14701007 acttaatatttttaggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgattgtttaaatgtttggaaaatcgacatttaaa 14701106  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  14701107 cgatcccttagaaataacgatatcttttagacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtctaaaaagctagaatccgtttattgatcgaga 14701206  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattag-gaaaatagttttac 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  14701207 gattgcagctgttacgcttggttgatatttctaaccccaagcgaaatagctctatcttgtctcgttttacttttatgtcgaatagttaaaatagttttac 14701306  T
Q  527 acaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  14701307 acaaacaaacaatttatactcaaacactcaatgtgataaatattatgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatccaattatact 14701403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 490
Target Start/End: Original strand, 41977760 - 41978221
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41977760 attatgtaaacttttgatattttaatatacgattttagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagatttaaaatgatat 41977859  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41977860 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatttatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 41977959  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41977960 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgagaaatcgtcgattaagctatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacg 41978059  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||    
T  41978060 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatatagtttaaaaagttagaatccgttatttgatcgtgaga 41978159  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41978160 ttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttctc 41978221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 459
Target Start/End: Original strand, 21160131 - 21160560
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21160131 attatgtaatttcttgatcattcaatatatgattctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaataatat 21160230  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21160231 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatatatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 21160330  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21160331 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactattcaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 21160430  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  21160431 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgccgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagttagaatctgttaattgatcgagaga 21160530  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctct 459  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21160531 ttgcagctgttacgcttggttgatatctct 21160560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 36557473 - 36556965
Alignment:
Q  116 attcaaaatgatatggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatca 214  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36557473 attcaatatgatattgacaaatacttttgaatctaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgttaatatttgataatca 36557374  T
Q  215 cttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  36557373 cttttaatctagaacttaatgcttttgggtcattcaaacggctgggaaatcgtcgattatacaatgcaatcgactttgtgattgtgtaaatgtttggaaa 36557274  T
Q  315 atcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgt 414  Q
    || ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  36557273 attgacatttaaacgatcccttataaataacgatatcatttggacacgaatgatattatcaagtgattgtgataatatcgtttaaaaggctagaatccgt 36557174  T
Q  415 taatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattagga 514  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |    
T  36557173 tatttgatcgagagattgcaactgttacgctttgttgatatctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataaaa 36557074  T
Q  515 aaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcc 614  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||     
T  36557073 caatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaactccctgcggaaacgatca 36556974  T
Q  615 tatgatact 623  Q
    ||| |||||    
T  36556973 tattatact 36556965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 30 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 9787102 - 9786574
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  9787102 attatgtaaacttttgatcatttaatatatggttatagcttatttattcaatattgttgttattcttgtatttaatgctttattgagattcaatatgata 9787003  T
Q  129 tggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 227  Q
    |  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |      
T  9787002 ttaacaaatacttttggatctaagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatagatgtcaatatttgataatcacttttaatccaag 9786903  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9786902 acttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgattcaatcgactttgtgattgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaa 9786803  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |    
T  9786802 caattccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgccgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttatttgatcgata 9786703  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttaca 527  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  9786702 gattgcagttgttacgcttggttgatgtctttgaccccaagcgaaataattctatctcttatcgttttacttttatgtcgaatagaaaaatagttttaca 9786603  T
Q  528 caaacaaacaatttatacccaaacactta 556  Q
    |||| ||||| |||| | ||| |||||||    
T  9786602 caaataaacattttaaatccatacactta 9786574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 294 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 8679527 - 8679198
Alignment:
Q  294 gatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatata 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8679527 gatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatc 8679428  T
Q  394 gtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgtt 493  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  8679427 gtttaaaaagatagaatctattaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctccgaccgcaagctagataaccctatctcttctcgtt 8679328  T
Q  494 ttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgc 593  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  8679327 ttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaattattc 8679228  T
Q  594 aactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8679227 aactccctgtggaaacgatcctattatact 8679198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 24663127 - 24662529
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattga-gattcaaaatgat 127  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | |||||| | ||||  ||||| |    
T  24663127 attacgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttattattcttgcatttaaagctttatttaagatttgaaatgtt 24663028  T
Q  128 atggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacat-ggatgttaatatttgataatcacttt-taatcta 225  Q
    || |||| ||||||||| |||||  | || ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  24663027 attgacaaatacttttggatctaagattaaaataataatctatct-aagttttcattctagacataggat-ttaatctttgataatcactttgtaatcaa 24662930  T
Q  226 gaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaat-gtttgggaaatcgatgttt 324  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||    
T  24662929 gaacttaatgctttttggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaatgatccaatcaacattgtgattatttaaatagtttgggaaatcgactttt 24662830  T
Q  325 aaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcg 424  Q
    |||  |||| |||||||| || | || ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | | |||    
T  24662829 aaataatccattagaaatcacgacattatttggacacgaatgatgttattgaatgattgtgataatatcgtttaaagagttagaatccgttatttggtcg 24662730  T
Q  425 agagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattag-gaaaatagtt 522  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | | | || | |||||||||||||| || || ||||||||| |||| | |||  |||||||||    
T  24662729 agagattgcagttgttacgcttggttgattatctctaatccctagtgaaatagccctatctcgtcccgatttacttttttgtcgaatagttaaaatagtt 24662630  T
Q  523 ttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatac 622  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||  |||  ||||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||| ||||    
T  24662629 ttacacaaacaaac-ttttatacccaaacacctaatatgataaatgatgttgaaatgcttaagatatacgcaactccctgcagaaacgatcctattatac 24662531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 88 - 392
Target Start/End: Original strand, 31758500 - 31758805
Alignment:
Q  88 ttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactct 186  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  31758500 ttattcttgtgtttaatgctttattgagattcaaaatgatattgaccaatgcttttggatctaagaaatagaataacaagctatcttaagttttcattcc 31758599  T
Q  187 agacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcg 286  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  31758600 agacataaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatcgttgattaaacgatccaatcg 31758699  T
Q  287 actttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtga 386  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31758700 actttgtgattgtttaaatgtttggtaaatcgacatttaaacgatcccttaaaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtga 31758799  T
Q  387 taatat 392  Q
    ||||||    
T  31758800 taatat 31758805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 40200181 - 40200363
Alignment:
Q  107 tttattgagattcaaaatgatatggacacatacttttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||    
T  40200181 tttattgagattcaaaatgatattgacaaatacttttggatctaagaaatagaataacaatctatcttaagttttcattccagacatagatgttaatatt 40200280  T
Q  206 tgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  40200281 tgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgac 40200363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 531 - 623
Target Start/End: Original strand, 28006751 - 28006843
Alignment:
Q  531 acaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||| |||||    
T  28006751 acaaacaatttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaacttcctacggaaacgatcctattatact 28006843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15853087 - 15853023
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  15853087 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 15853023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 21331679 - 21331743
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  21331679 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 21331743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 21341611 - 21341675
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  21341611 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 21341675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 29485432 - 29485368
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  29485432 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 29485368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 36781869 - 36781933
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  36781869 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 36781933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 42931057 - 42931121
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  42931057 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 42931121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 43268396 - 43268332
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  43268396 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 43268332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 45012520 - 45012456
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  45012520 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 45012456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 414
Target Start/End: Original strand, 11909946 - 11910016
Alignment:
Q  344 acaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgat-tgtgataatatagtttaaagagctagaatccgt 414  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11909946 acaatattatttggacacgaataatattgtcgactgatacgtgataatatagattaaa-agctagaatccgt 11910016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 37439219 - 37439260
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37439219 atgtaatcttttgatctttgaatatatgattctagcaattta 37439260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 2021133 - 2021197
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  2021133 atgtaatcttttgatctataaatatatggttatagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 2021197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 21067642 - 21067706
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  21067642 atgtaatattttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 21067706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 34834497 - 34834561
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  34834497 atgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 34834561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 34840941 - 34841005
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  34840941 atgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 34841005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 17864020 - 17863978
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttat 75  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17864020 atgtaatcttttgttctttaaatatatgattctagcaatttat 17863978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 36557518 - 36557465
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagc-aatttattcaatat 82  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  36557518 attatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctaacttatttattcaatat 36557465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 36842325 - 36842284
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  36842325 atgtaatcttttgatcttgtattatatgattctagcaattta 36842284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 11651904 - 11651948
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaattta 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  11651904 attatgtaatcttttgatcatctaatatatgattctagctattta 11651948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 97
Target Start/End: Original strand, 16817023 - 16817079
Alignment:
Q  41 ttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  16817023 ttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 16817079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 97
Target Start/End: Original strand, 16856180 - 16856236
Alignment:
Q  41 ttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  16856180 ttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 16856236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 539; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 28896 - 28302
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28896 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 28797  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28796 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 28697  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28696 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttggaaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaac 28597  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28596 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagag 28497  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28496 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagggggatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacac 28397  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28396 aaacaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 28302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 522; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 522; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 15970 - 15377
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15970 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggtactagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 15871  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  15870 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagaaatggatgttaatatttgataattacttttaatctaggac 15771  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15770 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcaactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 15671  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15670 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 15571  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15570 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttactattatgtcgattaggaaaatagttttacata 15471  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15470 aacaaacaatttatacccaaacaattaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 15377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 518; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 12200 - 11607
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12200 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggtactagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 12101  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12100 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagaaatggatgttaatatttgataattacttttaatctaggac 12001  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12000 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatctactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 11901  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11900 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgacgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 11801  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  11800 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttactattatgtcgattaggaaaatagttttacata 11701  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11700 aacaaacaatttatacccaaacaattaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 11607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 509; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 509; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 12477 - 11896
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  12477 attatgtaatcttttgatattttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattg--------agattcaaaatgata 12386  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12385 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 12286  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12285 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 12186  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12185 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcaagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagag 12086  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12085 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcaattaggaaaatagttttacac 11986  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaac-tccctgtggacacgatcctat 617  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11985 aaacaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaacttccctgtggacacgatcctat 11896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 506; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Original strand, 12358 - 12947
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgtt-attcttgctttta-ttgttttattgagattcaaaatgat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12358 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggtactagctatttattcaatattgttgtttattcttgcatttaattgttttattgagattcaaaatgat 12457  T
Q  128 atggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  12458 atggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagaaatggatgttaatatttgataattacttttaatctagg 12557  T
Q  228 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12558 acttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcaactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 12657  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12658 cgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgacgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgaga 12757  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttaca 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12758 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaataattttaca 12857  T
Q  528 caaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12858 caaacaaacaatttatacccaaacaattaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 12947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 505; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 505; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 25647 - 25059
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25647 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 25548  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25547 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagta 25448  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25447 cttaatgcttttgggtaaattaatcggtttggaaatcgtcgattaaattatccaatcgacttcgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 25348  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25347 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagag 25248  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  25247 attgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgctttacttttatgttgatttggaaaatagttttacac 25148  T
Q  529 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25147 aaacaaacaatttatacccaaacacttaacgcggcaaatattgtgaaaatgcctatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctat 25059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 483; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 116564 - 115970
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  116564 attatgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctattaattcaatattgttgttattcttgaatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 116465  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  116464 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 116365  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  116364 ttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaaca 116265  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  116264 atcccttaaaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatattgtttaaaaagttagaatccgttaattgatcgagaga 116165  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  116164 ttgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttcaagttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacaca 116065  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  116064 aacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaactccctgcggaaacgatcctattatactc 115970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 208 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 169226 - 168811
Alignment:
Q  208 ataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgt 307  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  169226 ataatcactttaaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttttgatcgtttaaatgt 169127  T
Q  308 ttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctag 407  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  169126 ttggaaaatcgatgtttaaatgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaacgatattatcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctag 169027  T
Q  408 aatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtct 507  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  169026 aatccgttaatcgatcgagagattacagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtca 168927  T
Q  508 attaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggac 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168926 attaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggac 168827  T
Q  608 acgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||| |||||    
T  168826 acgatcctattatact 168811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 475; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 624
Target Start/End: Original strand, 6897 - 7490
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6897 attatgtaatattttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttcttgagattcaaaatgatat 6996  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6997 gaacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatatattttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggac 7096  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7097 ttaatgcttttgggtaaattaattggttggaaaatcgtcgattaagttatccaatcgactttgtgatcttttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 7196  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7197 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatgttgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga 7296  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  7297 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctttgactgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttgcata 7396  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatactc 624  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  7397 aacaaacaatttatatccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactcccggtggacac-atcctattatactc 7490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 465; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 76448 - 75892
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  76448 attatgtaatcttttgatcatttaatgtatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgatat 76349  T
Q  130 ggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaac 229  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  76348 gaacacatacttttgaatctagaaataaaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctacgac 76249  T
Q  230 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  76248 ttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactattcaatcgactttgtgatcgtttaaatcattgggaaatcgttgtttaaacg 76149  T
Q  330 atcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagaga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  76148 atcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtctagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagaga 76049  T
Q  430 ttgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacaca 529  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  76048 ttgtagttgttacgtttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacaca 75949  T
Q  530 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatga 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75948 aacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatga 75892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 30 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 980 - 546
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  980 attatgtaaactcttgatcttttaatatatggtg-tagcttatttattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaataata 882  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  881 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 782  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaac 328  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  781 cttaatgattttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgattgttttaatgtttgggaaatcgacatttaaac 682  T
Q  329 gatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagag 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||    
T  681 gatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatattttttaaaaagctagaatccattatttgatcgtgag 582  T
Q  429 attgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgacc 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  581 attgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgacc 546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 30 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 16469 - 16009
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgata 128  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||  | ||||||||||||  ||||||||    
T  16469 attatgtaaacccttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatggttgttattcttgtatttaaggctttattgagatttgaaatgata 16370  T
Q  129 tggacacatacttttgaatctagaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaa 228  Q
    |  ||  ||||||||| |||||| |||   |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16369 ttaactaatacttttggatctaggaattatataacaatctatct-aagttttcattctagacatagatgttaatctttgataatcatttttaatctagaa 16271  T
Q  229 cttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaat-gtttgggaaatcgatgtttaaa 327  Q
    |||||||||||||| |   ||||| | |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  16270 cttaatgcttttggatcgattaatagattgggaaatcatcgattaaacgatccaatcgactttgtgatcgtttaaatagtttgggaaatcgacatttaaa 16171  T
Q  328 cgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgaga 427  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| | ||||||||    
T  16170 cgatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgttgagtgattgtgataat-tcgtttaaaaaggtagaatccgttatttgatcgaga 16072  T
Q  428 gattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttct 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16071 gattgcagctgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttct 16009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 517 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 14732 - 14625
Alignment:
Q  517 atagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatccta 616  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||  ||||||||  |||  ||||||||| || ||| ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  14732 atagatttagacaaacaaatattttaaacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaaatgcttaagatatatgcaactctctgcggaaacgatccta 14633  T
Q  617 tgatactc 624  Q
    | ||||||    
T  14632 ttatactc 14625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 522 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 15972 - 15870
Alignment:
Q  522 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgata 621  Q
    |||||||||||| | | |||| ||||||||||||||  ||||||||  |||  ||||| ||| || |||||||||| |||| | | |||||||||| |||    
T  15972 tttacacaaacataaattttaaacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaaatgtttaagatatacgcaacttcctgcgaaaacgatcctattata 15873  T
Q  622 ctc 624  Q
    |||    
T  15872 ctc 15870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 43 - 490
Target Start/End: Original strand, 14362 - 14810
Alignment:
Q  43 ttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatatggacacatactt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14362 ttgatcttttaatatatggttctagtttatttattcaatatagttgttattcttgtgtttaatgctttattgagattcaaaatgatattgacaaatactt 14461  T
Q  142 ttgaatcta-gaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgctttt 240  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  14462 ttggatataagaaatagaataacaatctatcttaagttttcattctagacatagatgttaatatttgataatcactttaaatcaagagcttaatgctttt 14561  T
Q  241 gggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaa 340  Q
    || |  |||||| | |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||| | ||| ||| ||    
T  14562 ggatcgtttaatagattggaaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgattgtttaatagtttgggaaatcgacttttaaatggtccattataa 14661  T
Q  341 ataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgtt 440  Q
    || || | |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14662 atcacgacatcatttggacacgaatgatgttgtcgag-aattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaattgatcgagagattgcagctgtt 14760  T
Q  441 acgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||    
T  14761 acgcttggttgatatctctaacctcaagcgaaatggtcctatctcttctc 14810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 150 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 35196 - 34858
Alignment:
Q  150 agaaatagaataacaatctatcttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaa-tctagaacttaatgcttttgggtaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  35196 agaaatagaataacaatctaccttaagttatcactctata----gatgttaatatttgataatcacttttaaatctagaacttaatgctttttggtcatt 35101  T
Q  249 taatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaat 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||  ||||||   ||| |||||||| ||||     
T  35100 taatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccgatcgactttgtgattatttaatagtttgggaaatcgacttttaaatagtccattagaaatcacaac 35001  T
Q  349 atcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttgg 448  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  35000 atcatttggacacgaatgatgttgtttagtgattgtgataatattgtttaaaaagctagaatccgttatttgatcgtgagattgcagttgttacgcttgg 34901  T
Q  449 ttga-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  34900 ttgagtgtctctgaccccaagcgaaatggtcatatctcttctc 34858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 35279 - 35212
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca-atttattcaatattgttgttattcttg 96  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  35279 attatgtaatttcttgattttttaatatatggttatagcttatttattcaatattgttgttattcttg 35212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 436 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 350196 - 350009
Alignment:
Q  436 ctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaa 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  350196 ctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaa 350097  T
Q  536 caatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctatgatact 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  350096 caatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatact 350009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 266 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 5107 - 4881
Alignment:
Q  266 gtcgattaaactacccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaat 365  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5107 gtcgattaaactatccaatcaactttgtgaacgtttaaatgttaaggaaatcgatgtttaaatgacctcttagaaataacgatatcatttggacacgaat 5008  T
Q  366 gatattgtcgagtgattgtgataatatagttt-aaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgacc 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5007 gatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaaagctagaatccgttatttgatcgtgagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgacc 4908  T
Q  464 gcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||    
T  4907 ccaagcgaaatggccctatctcttctc 4881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 508 - 623
Target Start/End: Original strand, 175245 - 175360
Alignment:
Q  508 attaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggac 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  175245 attaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggac 175344  T
Q  608 acgatcctatgatact 623  Q
    |||||||||| |||||    
T  175345 acgatcctattatact 175360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 7228 - 7341
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  7228 attatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatctattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgttat 7327  T
Q  130 ggacacatactttt 143  Q
    ||||||||||||||    
T  7328 ggacacatactttt 7341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 11842 - 11955
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  11842 attatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatctattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgttat 11941  T
Q  130 ggacacatactttt 143  Q
    ||||||||||||||    
T  11942 ggacacatactttt 11955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 252
Target Start/End: Original strand, 7340 - 7420
Alignment:
Q  172 ttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  7340 ttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttgagtaacttaat 7420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 252
Target Start/End: Original strand, 11954 - 12034
Alignment:
Q  172 ttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  11954 ttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttgagtaacttaat 12034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 9837 - 9950
Alignment:
Q  30 attatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcttttattgttttattgagattcaaaatgatat 129  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  9837 attatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatctattcaatattgttgttattcttgcatttaatgttttattgagattcaaaatgttat 9936  T
Q  130 ggacacatactttt 143  Q
    ||||||||||||||    
T  9937 ggacacatactttt 9950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 252
Target Start/End: Original strand, 9949 - 10029
Alignment:
Q  172 ttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  9949 ttaagttatcactctagacatggatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttgagtaacttaat 10029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 352 - 586
Target Start/End: Original strand, 6003 - 6238
Alignment:
Q  352 atttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttg 451  Q
    |||| |||| |||| ||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||  || |||||||||||||||    
T  6003 attttgacatgaataatattgttgattgattatggtaatatcgtttaaagagctagaattcgttatttgatcgtgagattatagttgttacgcttggttg 6102  T
Q  452 a-tgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtctattag-gaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaa 549  Q
    | | ||||| ||| |||||| ||| |||||||||| ||||| |||| ||||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6103 attatctctaaccccaagcgaaatggccctatctcgtctcgatttatttttaagtcgaatagttaaaatagttttacacaaacaaac-ttttatacccaa 6201  T
Q  550 acacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatga 586  Q
    | ||||||  |||||||||||||  ||||||||||||    
T  6202 atacttaagatgataaatattgtttaaatgcttatga 6238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15708 - 15644
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  15708 atgtattcttttgatctataaatatatggttttagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 15644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 363 - 490
Target Start/End: Original strand, 7255 - 7382
Alignment:
Q  363 aatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgac 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  7255 aatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttaattgatcgagagattgcagctgttacgcttgattgatatctctaac 7354  T
Q  463 cgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    | |||||| ||| | | |||||||||||    
T  7355 cccaagcgaaatggtcatatctcttctc 7382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 363 - 490
Target Start/End: Original strand, 7265 - 7392
Alignment:
Q  363 aatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgac 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  7265 aatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttaattgatcgagagattgcagctgttacgcttgattgatatctctaac 7364  T
Q  463 cgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    | |||||| ||| | | |||||||||||    
T  7365 cccaagcgaaatggtcatatctcttctc 7392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0152 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0152
Description:

Target: scaffold0152; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 363 - 490
Target Start/End: Original strand, 24876 - 25003
Alignment:
Q  363 aatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgac 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  24876 aatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaaactgttaattgatcgagagattgcagctgttacgcttgattgatatctctaac 24975  T
Q  463 cgcaagcggaatagccctatctcttctc 490  Q
    | |||||| ||| | | |||||||||||    
T  24976 cccaagcgaaatggtcatatctcttctc 25003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 522 - 592
Target Start/End: Original strand, 393 - 463
Alignment:
Q  522 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacg 592  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  393 tttatacaaacaaacattttaaacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgagatacg 463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 463
Target Start/End: Original strand, 258 - 334
Alignment:
Q  386 ataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgacc 463  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  258 ataatattgtttaaaaagctagaatatgttatttgatcgaga--ttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgacc 334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 6958 - 6857
Alignment:
Q  352 atttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttg 451  Q
    |||| |||| |||| || |||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||  |||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  6958 atttagacatgaataatgttgttgagtgattgtgataatgtcgtttgaagatctagaatatgttatttgatcatgagattgcagttgttacgcttggttg 6859  T
Q  452 at 453  Q
    ||    
T  6858 at 6857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 522 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 45733 - 45670
Alignment:
Q  522 tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatga 586  Q
    |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45733 tttatacaaacaaacatttta-agccaaacacttaatgtgataaatattgcgaaaatgcttatga 45670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 386 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 45868 - 45781
Alignment:
Q  386 ataatatagtttaaagagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcggaat 474  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| |||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  45868 ataatatcgtttaaaaaactagaatctgttatttgatcgaga--ttgcatttgttacgcttggttgagtgtctctgacctcaagcgaaat 45781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 2949 - 3013
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||| ||||||||    
T  2949 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgtcattcttgc 3013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 8566 - 8630
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  8566 atgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 8630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Original strand, 11818 - 11854
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagca 69  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11818 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagca 11854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 3182 - 3118
Alignment:
Q  33 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 97  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  3182 atgtaatcttttgatctaaaaatatatggttctagtatttgatttgatattgatgttattcttgc 3118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University