View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1111_low_85 (Length: 370)

Name: NF1111_low_85
Description: NF1111
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1111_low_85
NF1111_low_85
[»] chr3 (78 HSPs)
chr3 (37-370)||(2498797-2499131)
chr3 (37-370)||(21151211-21151544)
chr3 (69-309)||(6927355-6927596)
chr3 (37-367)||(10767818-10768149)
chr3 (37-370)||(3782507-3782839)
chr3 (37-370)||(43723818-43724151)
chr3 (37-370)||(47121209-47121542)
chr3 (37-370)||(47128577-47128910)
chr3 (37-370)||(28758961-28759294)
chr3 (37-370)||(50142523-50142856)
chr3 (37-370)||(45611728-45612051)
chr3 (37-338)||(54832975-54833274)
chr3 (37-370)||(29493615-29493951)
chr3 (37-370)||(53570987-53571321)
chr3 (37-187)||(10382001-10382151)
chr3 (37-187)||(10410654-10410804)
chr3 (37-183)||(50655928-50656075)
chr3 (37-370)||(9771674-9772003)
chr3 (37-179)||(12271339-12271482)
chr3 (37-370)||(48774372-48774705)
chr3 (46-370)||(16331348-16331672)
chr3 (125-370)||(16414037-16414281)
chr3 (45-177)||(38743004-38743137)
chr3 (39-154)||(14845137-14845253)
chr3 (46-367)||(54091493-54091815)
chr3 (46-367)||(16833305-16833625)
chr3 (46-313)||(3802743-3803011)
chr3 (46-367)||(20376999-20377319)
chr3 (82-370)||(29551042-29551330)
chr3 (46-313)||(54520345-54520613)
chr3 (46-370)||(15374724-15375039)
chr3 (82-286)||(29545000-29545206)
chr3 (244-367)||(12724891-12725013)
chr3 (309-370)||(50655741-50655802)
chr3 (82-367)||(11956354-11956640)
chr3 (46-136)||(3802581-3802671)
chr3 (46-136)||(54520130-54520220)
chr3 (244-366)||(30596618-30596739)
chr3 (82-181)||(19344097-19344196)
chr3 (248-367)||(46070868-46070986)
chr3 (261-370)||(27029444-27029552)
chr3 (46-183)||(9691348-9691486)
chr3 (82-136)||(8373914-8373969)
chr3 (46-136)||(20187825-20187915)
chr3 (82-136)||(30596848-30596903)
chr3 (261-313)||(27031668-27031720)
chr3 (331-370)||(14844918-14844957)
chr3 (82-136)||(32388006-32388061)
chr3 (82-186)||(46071048-46071154)
chr3 (272-366)||(32387777-32387870)
chr3 (82-127)||(18961077-18961122)
chr3 (82-127)||(49163272-49163317)
chr3 (244-300)||(9691240-9691296)
chr3 (330-370)||(10382296-10382336)
chr3 (330-370)||(10410949-10410989)
chr3 (56-127)||(13313907-13313976)
chr3 (323-367)||(13940393-13940437)
chr3 (323-367)||(13946882-13946926)
chr3 (82-136)||(12725113-12725168)
chr3 (324-367)||(13203297-13203340)
chr3 (331-367)||(11963908-11963944)
chr3 (323-367)||(12200608-12200652)
chr3 (56-127)||(13324819-13324888)
chr3 (318-366)||(14288764-14288812)
chr3 (318-366)||(15011642-15011690)
chr3 (56-127)||(38312118-38312187)
chr3 (324-366)||(12419808-12419850)
chr3 (333-367)||(14652473-14652507)
chr3 (81-127)||(23173921-23173967)
chr3 (67-127)||(12274375-12274435)
chr3 (75-127)||(17512698-17512751)
chr3 (333-366)||(18756683-18756716)
chr3 (56-127)||(20249105-20249175)
chr3 (56-127)||(13303231-13303300)
chr3 (323-363)||(13909937-13909977)
chr3 (323-367)||(14570209-14570253)
chr3 (84-127)||(15934960-15935004)
chr3 (334-366)||(49163525-49163557)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (37-370)||(18165-18499)
[»] chr5 (89 HSPs)
chr5 (37-370)||(10686174-10686506)
chr5 (37-370)||(40010719-40011052)
chr5 (37-370)||(43029070-43029403)
chr5 (37-370)||(1111425-1111758)
chr5 (37-370)||(5582024-5582357)
chr5 (37-370)||(30781094-30781429)
chr5 (37-370)||(14614697-14615030)
chr5 (37-370)||(5454518-5454851)
chr5 (37-370)||(15461501-15461834)
chr5 (37-370)||(18894743-18895075)
chr5 (37-370)||(7507762-7508095)
chr5 (37-370)||(20340569-20340899)
chr5 (37-370)||(20347173-20347503)
chr5 (39-370)||(25846375-25846698)
chr5 (37-370)||(14882060-14882395)
chr5 (37-370)||(14888737-14889072)
chr5 (37-187)||(22248171-22248321)
chr5 (45-187)||(24008089-24008230)
chr5 (37-187)||(24800314-24800463)
chr5 (37-177)||(24794956-24795096)
chr5 (37-183)||(38013763-38013910)
chr5 (37-177)||(37539897-37540038)
chr5 (37-177)||(37547441-37547582)
chr5 (37-187)||(11995166-11995316)
chr5 (37-180)||(25853005-25853150)
chr5 (37-176)||(17938823-17938964)
chr5 (37-370)||(597303-597637)
chr5 (37-370)||(19508192-19508528)
chr5 (37-370)||(19800087-19800420)
chr5 (37-370)||(29746340-29746673)
chr5 (82-363)||(16774796-16775078)
chr5 (37-183)||(22501008-22501153)
chr5 (37-183)||(22507589-22507734)
chr5 (37-174)||(18566619-18566755)
chr5 (82-367)||(26650524-26650809)
chr5 (82-367)||(26922109-26922394)
chr5 (82-183)||(37566161-37566263)
chr5 (46-370)||(7773394-7773719)
chr5 (245-370)||(25853154-25853279)
chr5 (309-370)||(38014036-38014097)
chr5 (46-369)||(28259623-28259944)
chr5 (46-136)||(41877985-41878075)
chr5 (46-183)||(20990389-20990527)
chr5 (46-183)||(41877767-41877905)
chr5 (82-136)||(5341700-5341755)
chr5 (46-136)||(18941195-18941284)
chr5 (82-136)||(19362721-19362776)
chr5 (82-136)||(23076272-23076327)
chr5 (82-136)||(23081720-23081775)
chr5 (82-136)||(23544842-23544897)
chr5 (244-370)||(20990588-20990712)
chr5 (272-366)||(24057908-24058001)
chr5 (273-366)||(39608625-39608718)
chr5 (330-370)||(24008374-24008414)
chr5 (331-370)||(11995463-11995502)
chr5 (82-136)||(19801866-19801921)
chr5 (331-370)||(22247985-22248024)
chr5 (82-183)||(22379604-22379707)
chr5 (331-370)||(24800128-24800167)
chr5 (331-370)||(37539703-37539742)
chr5 (331-370)||(37547247-37547286)
chr5 (272-366)||(25420134-25420227)
chr5 (330-370)||(18566912-18566952)
chr5 (56-127)||(23112708-23112777)
chr5 (56-127)||(34829167-34829236)
chr5 (261-313)||(41876469-41876521)
chr5 (324-367)||(17271001-17271044)
chr5 (331-370)||(17938628-17938667)
chr5 (324-367)||(22175426-22175469)
chr5 (329-367)||(9775884-9775922)
chr5 (272-366)||(18940966-18941059)
chr5 (245-370)||(33536333-33536456)
chr5 (84-136)||(24057724-24057777)
chr5 (82-127)||(25419943-25419988)
chr5 (318-366)||(21495272-21495320)
chr5 (330-370)||(22501299-22501339)
chr5 (244-300)||(37566324-37566380)
chr5 (324-367)||(758028-758071)
chr5 (324-367)||(20938003-20938046)
chr5 (324-367)||(22508899-22508942)
chr5 (82-136)||(39608854-39608909)
chr5 (329-367)||(17264519-17264557)
chr5 (333-366)||(17022502-17022535)
chr5 (81-126)||(20937754-20937799)
chr5 (81-126)||(22312801-22312846)
chr5 (66-127)||(10035266-10035325)
chr5 (330-370)||(22507880-22507920)
chr5 (84-127)||(23444167-23444211)
chr5 (306-366)||(27635596-27635655)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (58-370)||(36211753-36212066)
chr1 (37-370)||(18026455-18026788)
chr1 (58-370)||(20396576-20396888)
chr1 (39-368)||(18418205-18418536)
chr1 (37-370)||(28556206-28556538)
chr1 (37-370)||(6740597-6740930)
chr1 (37-370)||(48427932-48428265)
chr1 (37-370)||(20276956-20277288)
chr1 (37-370)||(31535003-31535336)
chr1 (37-370)||(31563720-31564053)
chr1 (45-370)||(20299401-20299722)
chr1 (45-370)||(20292767-20293093)
chr1 (37-370)||(39094400-39094734)
chr1 (37-187)||(38907941-38908090)
chr1 (37-187)||(37682165-37682315)
chr1 (37-187)||(39189568-39189717)
chr1 (37-187)||(37675472-37675622)
chr1 (37-370)||(20076652-20076987)
chr1 (37-370)||(4231267-4231602)
chr1 (94-370)||(17149454-17149729)
chr1 (37-143)||(22185534-22185640)
chr1 (45-177)||(20570828-20570961)
chr1 (38-183)||(42626280-42626424)
chr1 (213-370)||(19046004-19046160)
chr1 (46-370)||(21920884-21921209)
chr1 (37-170)||(21963084-21963218)
chr1 (46-370)||(29601994-29602319)
chr1 (37-93)||(3652679-3652735)
chr1 (46-186)||(29596743-29596884)
chr1 (56-127)||(19961273-19961342)
chr1 (82-136)||(36615058-36615113)
chr1 (331-370)||(38907756-38907795)
chr1 (331-370)||(39189382-39189421)
chr1 (82-136)||(49328155-49328210)
chr1 (37-98)||(17146336-17146397)
chr1 (330-370)||(37682448-37682488)
chr1 (324-367)||(27280601-27280644)
chr1 (82-125)||(43088514-43088557)
chr1 (316-370)||(20571102-20571156)
chr1 (272-366)||(49328346-49328439)
chr1 (333-370)||(3706485-3706522)
chr1 (329-370)||(21963377-21963418)
chr1 (333-370)||(42626573-42626610)
chr1 (330-370)||(37675755-37675795)
chr1 (331-370)||(36917489-36917528)
chr1 (82-136)||(47484229-47484284)
chr1 (323-366)||(47484471-47484514)
chr1 (81-127)||(20242693-20242739)
chr1 (324-366)||(20824085-20824127)
chr1 (324-366)||(20837894-20837936)
chr1 (324-366)||(21734131-21734173)
chr1 (324-366)||(24079967-24080009)
chr1 (333-370)||(954788-954825)
chr1 (330-367)||(22434687-22434724)
chr1 (81-126)||(23066673-23066718)
chr1 (333-366)||(25092005-25092038)
chr1 (83-127)||(20824329-20824373)
chr1 (84-127)||(21698261-21698305)
[»] chr4 (74 HSPs)
chr4 (37-370)||(52500579-52500912)
chr4 (37-370)||(3259712-3260045)
chr4 (37-370)||(21396845-21397178)
chr4 (37-370)||(391194-391528)
chr4 (37-370)||(29382486-29382818)
chr4 (37-370)||(3266340-3266673)
chr4 (37-370)||(49240565-49240898)
chr4 (37-370)||(49749279-49749612)
chr4 (37-370)||(39265957-39266291)
chr4 (58-370)||(50082269-50082581)
chr4 (37-370)||(23435701-23436036)
chr4 (37-274)||(1583938-1584176)
chr4 (37-187)||(26395713-26395863)
chr4 (37-370)||(29448396-29448730)
chr4 (37-370)||(29455080-29455414)
chr4 (37-187)||(11937186-11937336)
chr4 (37-370)||(7359276-7359609)
chr4 (37-370)||(45142269-45142603)
chr4 (37-177)||(11202343-11202484)
chr4 (45-196)||(5938961-5939112)
chr4 (46-370)||(31665098-31665422)
chr4 (37-174)||(45959657-45959795)
chr4 (82-370)||(21881665-21881954)
chr4 (46-370)||(2972454-2972777)
chr4 (82-370)||(19128064-19128352)
chr4 (46-313)||(49548145-49548413)
chr4 (37-370)||(34772196-34772531)
chr4 (46-174)||(20895032-20895160)
chr4 (82-174)||(42955938-42956031)
chr4 (37-370)||(47872152-47872475)
chr4 (82-184)||(36037636-36037739)
chr4 (82-174)||(20889448-20889541)
chr4 (37-127)||(54844912-54845001)
chr4 (82-183)||(33097166-33097268)
chr4 (46-370)||(33221408-33221732)
chr4 (323-370)||(44657488-44657535)
chr4 (323-370)||(44663417-44663464)
chr4 (82-136)||(49548538-49548593)
chr4 (245-370)||(54825896-54826020)
chr4 (82-136)||(899666-899721)
chr4 (82-136)||(30396269-30396324)
chr4 (46-136)||(35462566-35462656)
chr4 (83-136)||(41404662-41404716)
chr4 (37-82)||(391154-391199)
chr4 (273-366)||(899858-899951)
chr4 (56-127)||(14910723-14910792)
chr4 (331-370)||(26396010-26396049)
chr4 (82-366)||(42220504-42220788)
chr4 (324-367)||(43284618-43284661)
chr4 (82-136)||(46044825-46044880)
chr4 (142-185)||(54826080-54826123)
chr4 (330-370)||(45959463-45959503)
chr4 (274-366)||(46044595-46044687)
chr4 (324-367)||(635488-635531)
chr4 (331-370)||(20889689-20889728)
chr4 (324-367)||(20940669-20940712)
chr4 (59-127)||(27905352-27905418)
chr4 (333-370)||(42955744-42955781)
chr4 (330-370)||(1584230-1584270)
chr4 (330-370)||(5939246-5939286)
chr4 (37-93)||(7356283-7356339)
chr4 (330-370)||(11937469-11937509)
chr4 (56-127)||(14485649-14485717)
chr4 (324-367)||(11170983-11171026)
chr4 (323-370)||(16999889-16999936)
chr4 (331-370)||(20895316-20895355)
chr4 (81-127)||(18212297-18212343)
chr4 (324-370)||(23122008-23122054)
chr4 (81-127)||(26077682-26077728)
chr4 (324-366)||(37881811-37881853)
chr4 (324-366)||(49051362-49051404)
chr4 (81-126)||(17000139-17000184)
chr4 (67-127)||(30237898-30237958)
chr4 (84-127)||(10972873-10972917)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (37-370)||(44090807-44091140)
chr2 (37-370)||(27729589-27729922)
chr2 (37-370)||(24426560-24426892)
chr2 (37-370)||(4077501-4077834)
chr2 (37-370)||(27037325-27037658)
chr2 (58-370)||(71232-71544)
chr2 (37-370)||(2385641-2385973)
chr2 (37-370)||(31828693-31829026)
chr2 (37-370)||(31834045-31834378)
chr2 (37-370)||(36984285-36984617)
chr2 (37-370)||(4071260-4071596)
chr2 (37-370)||(30196232-30196566)
chr2 (37-370)||(1067177-1067510)
chr2 (37-370)||(28292800-28293135)
chr2 (37-187)||(20850270-20850420)
chr2 (37-187)||(21604845-21604995)
chr2 (37-183)||(24481504-24481651)
chr2 (37-370)||(1061794-1062127)
chr2 (37-370)||(11359962-11360291)
chr2 (37-177)||(34131-34272)
chr2 (37-174)||(35243948-35244086)
chr2 (37-152)||(22013048-22013164)
chr2 (37-370)||(11466152-11466485)
chr2 (82-185)||(27272376-27272480)
chr2 (82-370)||(14563956-14564241)
chr2 (82-370)||(17592258-17592547)
chr2 (82-370)||(15643015-15643304)
chr2 (309-370)||(24481317-24481378)
chr2 (173-255)||(22012968-22013050)
chr2 (82-183)||(13101085-13101188)
chr2 (82-136)||(36800680-36800735)
chr2 (82-136)||(45028632-45028687)
chr2 (330-370)||(21605140-21605180)
chr2 (82-136)||(25590161-25590216)
chr2 (330-370)||(34426-34466)
chr2 (324-367)||(27295729-27295772)
chr2 (82-136)||(32911442-32911497)
chr2 (329-367)||(10685349-10685387)
chr2 (330-370)||(20850565-20850605)
chr2 (318-366)||(21123594-21123642)
chr2 (331-370)||(27272525-27272564)
chr2 (81-127)||(9241492-9241538)
chr2 (81-127)||(22810042-22810088)
chr2 (318-364)||(24669548-24669594)
chr2 (333-366)||(25365644-25365677)
chr2 (323-367)||(12572717-12572761)
chr2 (323-367)||(12579199-12579243)
[»] chr8 (78 HSPs)
chr8 (37-370)||(16887014-16887348)
chr8 (37-370)||(14736537-14736871)
chr8 (37-370)||(23224464-23224797)
chr8 (37-370)||(9205067-9205400)
chr8 (37-370)||(35541129-35541462)
chr8 (37-370)||(3224400-3224733)
chr8 (37-370)||(28980805-28981140)
chr8 (37-370)||(28986025-28986360)
chr8 (37-370)||(26485737-26486070)
chr8 (37-370)||(14765668-14766002)
chr8 (37-187)||(27909484-27909634)
chr8 (37-187)||(27955903-27956053)
chr8 (37-187)||(36800342-36800492)
chr8 (37-187)||(214023-214173)
chr8 (37-187)||(238081-238231)
chr8 (37-187)||(727646-727796)
chr8 (37-187)||(800147-800297)
chr8 (37-187)||(851540-851690)
chr8 (37-370)||(10956401-10956735)
chr8 (37-176)||(4520643-4520784)
chr8 (37-156)||(14563622-14563741)
chr8 (82-370)||(10948319-10948608)
chr8 (37-177)||(23117290-23117431)
chr8 (37-177)||(3697724-3697865)
chr8 (37-177)||(14746428-14746570)
chr8 (37-183)||(27345797-27345942)
chr8 (37-183)||(6588151-6588296)
chr8 (37-174)||(40144208-40144344)
chr8 (37-172)||(16266784-16266920)
chr8 (82-370)||(11392323-11392612)
chr8 (46-185)||(27873842-27873981)
chr8 (46-185)||(27948630-27948769)
chr8 (46-185)||(27889972-27890111)
chr8 (117-187)||(807939-808008)
chr8 (45-183)||(25701472-25701610)
chr8 (46-367)||(29328284-29328605)
chr8 (46-183)||(14416477-14416615)
chr8 (82-183)||(29298983-29299085)
chr8 (82-183)||(29305529-29305631)
chr8 (245-370)||(19296808-19296932)
chr8 (244-370)||(43687677-43687801)
chr8 (111-185)||(27902275-27902350)
chr8 (331-370)||(214320-214359)
chr8 (331-370)||(237895-237934)
chr8 (331-370)||(727943-727982)
chr8 (331-370)||(800444-800483)
chr8 (331-370)||(807753-807792)
chr8 (331-370)||(851837-851876)
chr8 (142-185)||(19296705-19296748)
chr8 (331-370)||(27909310-27909349)
chr8 (331-370)||(27955729-27955768)
chr8 (244-370)||(14416292-14416416)
chr8 (330-370)||(6588442-6588482)
chr8 (330-370)||(12303566-12303606)
chr8 (330-370)||(14746235-14746275)
chr8 (330-370)||(23117573-23117613)
chr8 (324-367)||(22056126-22056169)
chr8 (261-370)||(25701331-25701440)
chr8 (330-370)||(16266585-16266625)
chr8 (330-370)||(27346087-27346127)
chr8 (244-367)||(27890170-27890293)
chr8 (244-367)||(27902409-27902532)
chr8 (244-367)||(27948828-27948951)
chr8 (330-370)||(40144011-40144051)
chr8 (331-370)||(4520447-4520486)
chr8 (324-367)||(22050608-22050651)
chr8 (323-366)||(31412231-31412274)
chr8 (323-366)||(31418413-31418456)
chr8 (81-127)||(22063558-22063604)
chr8 (81-127)||(22176030-22176076)
chr8 (244-282)||(27896503-27896541)
chr8 (241-367)||(29305345-29305470)
chr8 (66-127)||(39363631-39363692)
chr8 (84-136)||(20006386-20006439)
chr8 (56-127)||(8728980-8729051)
chr8 (331-367)||(9272908-9272944)
chr8 (318-366)||(20011837-20011885)
chr8 (323-367)||(36799781-36799825)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (37-370)||(11973-12307)
[»] chr7 (82 HSPs)
chr7 (37-370)||(30602619-30602953)
chr7 (37-370)||(18436925-18437258)
chr7 (37-370)||(33404733-33405066)
chr7 (37-370)||(11899068-11899401)
chr7 (37-370)||(8196958-8197291)
chr7 (37-370)||(1317846-1318179)
chr7 (37-370)||(11879147-11879480)
chr7 (37-370)||(17726098-17726424)
chr7 (37-370)||(26089709-26090042)
chr7 (37-370)||(26120127-26120460)
chr7 (37-370)||(37285289-37285621)
chr7 (37-370)||(11339851-11340184)
chr7 (37-370)||(48987679-48988012)
chr7 (37-370)||(2438964-2439297)
chr7 (37-370)||(26113514-26113847)
chr7 (37-370)||(749923-750256)
chr7 (37-370)||(40684521-40684854)
chr7 (37-370)||(5187001-5187335)
chr7 (39-370)||(642632-642962)
chr7 (37-370)||(32627477-32627816)
chr7 (37-370)||(2281166-2281498)
chr7 (37-370)||(13963761-13964094)
chr7 (37-370)||(2025981-2026316)
chr7 (37-370)||(49150665-49151000)
chr7 (37-370)||(49157355-49157690)
chr7 (39-183)||(40922867-40923012)
chr7 (37-187)||(42058629-42058780)
chr7 (37-156)||(11299626-11299745)
chr7 (37-156)||(11307990-11308109)
chr7 (37-183)||(20019616-20019763)
chr7 (37-370)||(49158822-49159156)
chr7 (37-174)||(21757373-21757509)
chr7 (37-370)||(46174405-46174738)
chr7 (37-174)||(13453756-13453892)
chr7 (37-195)||(17468184-17468344)
chr7 (37-195)||(17584870-17585030)
chr7 (82-370)||(30271543-30271831)
chr7 (37-195)||(37379971-37380131)
chr7 (82-367)||(23521124-23521410)
chr7 (37-100)||(8213299-8213362)
chr7 (37-136)||(2388551-2388649)
chr7 (309-370)||(40922680-40922741)
chr7 (46-136)||(46649858-46649948)
chr7 (82-286)||(12461640-12461846)
chr7 (82-183)||(16843817-16843920)
chr7 (244-367)||(12454348-12454470)
chr7 (82-136)||(15838736-15838791)
chr7 (82-136)||(19439434-19439489)
chr7 (331-370)||(42058927-42058966)
chr7 (244-301)||(23518029-23518086)
chr7 (330-370)||(2388337-2388377)
chr7 (330-370)||(13453559-13453599)
chr7 (330-370)||(20019431-20019471)
chr7 (330-370)||(21757666-21757706)
chr7 (82-136)||(13019830-13019885)
chr7 (329-367)||(23665549-23665587)
chr7 (329-367)||(29796147-29796185)
chr7 (329-367)||(29799966-29800004)
chr7 (330-367)||(23201225-23201262)
chr7 (330-367)||(23507352-23507389)
chr7 (68-127)||(16073934-16073993)
chr7 (318-366)||(19152250-19152298)
chr7 (318-366)||(20751649-20751697)
chr7 (306-366)||(26289488-26289547)
chr7 (324-367)||(15722941-15722984)
chr7 (324-367)||(19600254-19600297)
chr7 (329-367)||(14128622-14128660)
chr7 (329-367)||(14135468-14135506)
chr7 (329-367)||(14432440-14432478)
chr7 (81-127)||(18607025-18607071)
chr7 (324-366)||(19145974-19146016)
chr7 (324-366)||(20745373-20745415)
chr7 (81-126)||(14281617-14281662)
chr7 (333-366)||(19439685-19439718)
chr7 (333-366)||(23442610-23442643)
chr7 (84-136)||(32771662-32771715)
chr7 (81-126)||(35962709-35962754)
chr7 (323-367)||(806724-806768)
chr7 (318-358)||(14253705-14253745)
chr7 (56-127)||(15166912-15166983)
chr7 (323-363)||(18958151-18958191)
chr7 (322-366)||(45185847-45185891)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (37-370)||(104367-104700)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (37-369)||(30799176-30799507)
chr6 (37-370)||(24369266-24369599)
chr6 (37-370)||(25315382-25315715)
chr6 (37-370)||(26202876-26203209)
chr6 (37-370)||(16223395-16223728)
chr6 (37-370)||(24362647-24362979)
chr6 (37-370)||(25463920-25464253)
chr6 (37-370)||(29159148-29159481)
chr6 (37-370)||(34133705-34134040)
chr6 (58-370)||(19096524-19096836)
chr6 (37-196)||(1070697-1070856)
chr6 (37-187)||(15332042-15332192)
chr6 (37-187)||(17309753-17309903)
chr6 (47-177)||(22406712-22406842)
chr6 (37-174)||(8069626-8069764)
chr6 (46-370)||(27767447-27767771)
chr6 (37-177)||(4106776-4106913)
chr6 (46-367)||(10470475-10470797)
chr6 (37-370)||(94231-94564)
chr6 (46-370)||(13128009-13128332)
chr6 (82-370)||(29925817-29926106)
chr6 (244-370)||(10463958-10464085)
chr6 (82-186)||(14582927-14583033)
chr6 (82-183)||(17207666-17207769)
chr6 (56-127)||(19300639-19300708)
chr6 (323-370)||(8069430-8069477)
chr6 (82-136)||(10464185-10464240)
chr6 (82-136)||(12447172-12447227)
chr6 (331-370)||(15331856-15331895)
chr6 (331-370)||(17310038-17310077)
chr6 (82-136)||(23021325-23021380)
chr6 (75-127)||(14133011-14133064)
chr6 (324-367)||(33681928-33681971)
chr6 (82-137)||(13940556-13940612)
chr6 (324-367)||(21724483-21724526)
chr6 (324-367)||(27562264-27562307)
chr6 (333-367)||(1593179-1593213)
chr6 (81-127)||(8768145-8768191)
chr6 (329-367)||(28289929-28289967)
chr6 (333-366)||(13940806-13940839)
chr6 (81-126)||(19726765-19726810)
chr6 (333-366)||(21470207-21470240)
chr6 (333-366)||(21476708-21476741)
chr6 (324-364)||(8760153-8760193)
chr6 (82-129)||(17027156-17027204)
chr6 (84-127)||(18786230-18786274)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (37-370)||(18271-18603)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (101-370)||(21833-22101)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (37-187)||(13486-13636)
scaffold0443 (330-370)||(13781-13821)
[»] scaffold0041 (2 HSPs)
scaffold0041 (39-183)||(50083-50228)
scaffold0041 (309-370)||(50354-50415)
[»] scaffold0279 (1 HSPs)
scaffold0279 (37-177)||(5661-5802)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (37-370)||(767-1098)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (37-370)||(972-1307)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (37-174)||(31720-31858)
scaffold0088 (311-370)||(31925-31984)
[»] scaffold0103 (4 HSPs)
scaffold0103 (37-174)||(19688-19824)
scaffold0103 (37-174)||(23760-23897)
scaffold0103 (330-370)||(19979-20019)
scaffold0103 (330-370)||(23565-23605)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (37-174)||(512478-512614)
scaffold0001 (82-136)||(179126-179181)
scaffold0001 (322-370)||(449387-449435)
scaffold0001 (84-127)||(488350-488394)
scaffold0001 (330-370)||(512281-512321)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (45-177)||(4579-4710)
scaffold0188 (330-370)||(4385-4425)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (45-370)||(25128-25453)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (46-370)||(9842-10166)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (82-370)||(19337-19625)
scaffold0113 (82-370)||(15239-15527)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (46-370)||(65050-65374)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (46-313)||(101468-101734)
[»] scaffold0214 (2 HSPs)
scaffold0214 (37-174)||(15141-15278)
scaffold0214 (323-370)||(14945-14992)
[»] scaffold0310 (3 HSPs)
scaffold0310 (46-174)||(12948-13076)
scaffold0310 (251-367)||(16368-16483)
scaffold0310 (46-107)||(7801-7861)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (37-136)||(15182-15281)
scaffold0266 (318-366)||(23401-23449)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (82-370)||(24770-25059)
[»] scaffold1427 (2 HSPs)
scaffold1427 (46-136)||(712-802)
scaffold1427 (56-127)||(976-1045)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (46-183)||(2102-2240)
scaffold0363 (244-370)||(2292-2416)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (82-358)||(19880-20157)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (82-136)||(184-239)
scaffold0076 (81-127)||(51672-51718)
scaffold0076 (333-366)||(435-468)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (82-136)||(74112-74167)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (82-136)||(137199-137254)
scaffold0019 (333-366)||(137451-137484)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (82-367)||(30955-31232)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (56-127)||(11912-11981)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (56-127)||(24472-24541)
scaffold0261 (84-127)||(10626-10670)
scaffold0261 (84-127)||(18805-18849)
[»] scaffold0009 (4 HSPs)
scaffold0009 (82-136)||(247142-247197)
scaffold0009 (82-136)||(253656-253711)
scaffold0009 (272-366)||(247334-247428)
scaffold0009 (272-366)||(253848-253942)
[»] scaffold0652 (1 HSPs)
scaffold0652 (312-370)||(1623-1681)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (244-370)||(161241-161366)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (82-136)||(41353-41408)
[»] scaffold1336 (1 HSPs)
scaffold1336 (318-366)||(477-525)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (318-366)||(4875-4923)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (318-366)||(8953-9001)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (318-366)||(6503-6551)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (318-366)||(26703-26751)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (318-366)||(21249-21297)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (56-127)||(72367-72436)
scaffold0034 (81-127)||(10076-10122)
scaffold0034 (56-127)||(17372-17440)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (318-366)||(143068-143116)
scaffold0026 (318-366)||(35970-36018)
scaffold0026 (84-127)||(38723-38767)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (324-367)||(14222-14265)
scaffold0239 (81-126)||(14469-14514)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (323-366)||(23525-23568)
scaffold0077 (323-363)||(17895-17935)
[»] scaffold0071 (2 HSPs)
scaffold0071 (324-367)||(50695-50738)
scaffold0071 (81-122)||(50948-50989)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (324-367)||(14418-14461)
scaffold0063 (329-367)||(24624-24662)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (324-367)||(265507-265550)
scaffold0005 (333-367)||(259090-259124)
[»] scaffold1726 (1 HSPs)
scaffold1726 (324-366)||(673-715)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (81-127)||(139-185)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (90-127)||(5377-5415)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (81-127)||(7409-7455)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (324-366)||(9078-9120)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (324-366)||(25845-25887)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (81-127)||(36789-36835)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (81-127)||(41588-41634)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (81-127)||(20489-20535)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (324-366)||(35191-35233)
[»] scaffold2016 (1 HSPs)
scaffold2016 (333-366)||(586-619)
[»] scaffold0669 (1 HSPs)
scaffold0669 (333-366)||(1441-1474)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (333-366)||(901-934)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (333-366)||(2646-2679)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (81-126)||(42090-42135)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (333-366)||(27500-27533)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (81-126)||(17637-17682)
[»] scaffold1290 (1 HSPs)
scaffold1290 (322-366)||(992-1036)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (84-127)||(6293-6337)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (84-127)||(4091-4135)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (82-129)||(19439-19487)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (330-370)||(7537-7577)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (84-127)||(55912-55956)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (318-366)||(42658-42706)
scaffold0049 (318-366)||(53353-53401)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (318-366)||(3507-3555)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 78)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2499131 - 2498797
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2499131 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2499032  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaa-caacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2499031 atgcaactccatgtgactccacttaaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 2498932  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2498931 accaaaacaatgcatagttaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 2498832  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2498831 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 2498797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21151544 - 21151211
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21151544 gctgttgagcaactattactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21151445  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21151444 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtgttcatcaatccagcaatccaatcaa 21151345  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||  || | |||| |||  | | ||||||||||| ||||||||| |||    
T  21151344 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaaatacaacaacaccaaccactactaatcatgcaagca-agtcaacactcagaaactgtgcaactc 21151246  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21151245 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 21151211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6927596 - 6927355
Alignment:
Q  69 ccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa-caac 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6927596 ccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaaacaac 6927497  T
Q  168 atgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6927496 atgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgtataattaaatgtaactatg 6927397  T
Q  268 cccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  6927396 cccaaaacaacaacatcaatcatcaccattcgtacaataaca 6927355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 367
Target Start/End: Original strand, 10767818 - 10768149
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10767818 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 10767917  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  || ||||||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||  |||||| | | |||||||    
T  10767918 atgcaactcaatatgactccactttattaatatgtatgattcaacaattgacatacatttcaaccatcatcagtaatcatttatccagtagttcaatcaa 10768017  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||  || |||||  | |  | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  10768018 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaacatcaaccactactattcaagctagcaaaaacaacattcaggaactgtgcagctc 10768117  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10768118 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 10768149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3782839 - 3782507
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3782839 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 3782740  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||||| || |||||| | | ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||    
T  3782739 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatca-atcatcatcagtattcggtaatgcagcactccaatca 3782641  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |  |||||  |||  |   |||||| |||||||||| |||||||    
T  3782640 accaaaacaatgcatgattatatatacccatgctc-aaacaacaacatcaaccattattattcaagcaagtaatttcaacaatcaggaactgagcagctc 3782542  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3782541 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 3782507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43724151 - 43723818
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43724151 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 43724052  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  43724051 atgcaactccatgagactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcaccagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 43723952  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  ||||| || |  || | | |||||| |||||||||| | |||||    
T  43723951 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccatcca-agcacgaaattcaacattcaggaactgagtagctc 43723853  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43723852 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 43723818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 47121209 - 47121542
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47121209 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatccacatacaactgaccatgca 47121308  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  47121309 atgcaactccatgtgactcgacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 47121408  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | ||||||  ||||||||| | |||||    
T  47121409 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacatacaggaactgagtagctc 47121507  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47121508 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 47121542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 47128577 - 47128910
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47128577 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatccacatacaactgaccatgca 47128676  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  47128677 atgcaactccatgtgactcgacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 47128776  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | ||||||  ||||||||| | |||||    
T  47128777 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacatacaggaactgagtagctc 47128875  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47128876 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 47128910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 28758961 - 28759294
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28758961 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28759060  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||   |||||||||| | |||||||||||| |||| || |||    
T  28759061 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagaaatcaaaacaa 28759160  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||| ||| |  || | | ||||||  ||||||||| | |||||    
T  28759161 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaatacaacaacattaaggtactaccaatca-agcacgaaattcaacatacaggaactgagtagctc 28759259  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28759260 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 28759294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 50142856 - 50142523
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50142856 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 50142757  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||   |||||||||| | |||||||||||| |||| || |||    
T  50142756 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagaaatcaaaacaa 50142657  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||| ||| |  || | | ||||||  ||||||||| | |||||    
T  50142656 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaatacaacaacattaaggtactaccaatca-agcacgaaattcaacatacaggaactgagtagctc 50142558  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50142557 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 50142523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 45611728 - 45612051
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45611728 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 45611827  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||          ||||||||  || || |||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45611828 atgca----------actccactataataatatgtatgattcaataaatagcatacatttcaaccatcatcagtattcatcaatccaacaatccaatcaa 45611917  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||  || | |||| |||  | | ||||||||||| ||||||||| |||    
T  45611918 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaaatacaacaacaccaaccactactaatcatgcaagca-agtcaacactcagaaactgtgcaactc 45612016  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45612017 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 45612051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 54833274 - 54832975
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833274 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcacatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 54833175  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||  |||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||| | | |||||||    
T  54833174 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagttcaatcaa 54833075  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcg 336  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  || |||||  |   | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54833074 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaacaacaacatcaaccactactattcaagc--tagcaaacaacactcaggaactgtgcagctcg 54832977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 29493615 - 29493951
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29493615 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 29493714  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatt---tacatcatcatcagtattcatc-aatccagcaatcca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||     |||||||| |   | ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||    
T  29493715 aatgcaactccatgtgactccacttaaatgacatgtgtgattaaaactcaaacatacaatgcattcatcatcatcaatcatcatcaaatccagcaattca 29493814  T
Q  232 atcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtg 329  Q
    ||||| | |||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||  ||||||||||||   |  |||| |||| | || | |||||||| |||||||||| |    
T  29493815 atcaatc-aaacaatgcacaatt--atatatctatgctcaaatccaacaacatcaaggtactaccactcatgc-acgaaaatcaacattcaggaactgag 29493910  T
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29493911 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 29493951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 53571321 - 53570987
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53571321 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgca 53571222  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa-catacatttacatcatcatcagtatt--catcaatccagcaatccaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||   |||   |||||| | |  || ||| |||||||| | |    
T  53571221 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatggtttaataaataatcatacat---catagccatcagcaataacaacaa-ccagcaattc-a 53571127  T
Q  233 tcaa-ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatc-aaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtg 329  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||  || | ||||||||  | | | | |||||||||||||||    
T  53571126 tcaatccataacaatgcacaattaaatataactatgctcaaatccaacaacctcaaaccactactaatcatacaagca-agttagcactcaggaactgtg 53571028  T
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53571027 caactcgcctcgcgagctcatctgctcgccatggcgagttc 53570987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 10382001 - 10382151
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10382001 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 10382100  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10382101 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatgatt-aataattaa 10382151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 10410654 - 10410804
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10410654 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 10410753  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10410754 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatgatt-aataattaa 10410804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 50656075 - 50655928
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50656075 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 50655976  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  50655975 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatggtttaataa 50655928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9772003 - 9771674
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9772003 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 9771904  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt--aacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaat 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||   || ||| |   ||  |||||  |||  || |||     
T  9771903 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga-taaatagttaaaacatacatttcagtcctcaac---atcaatcaa--cagagattcaac 9771810  T
Q  234 caaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcag 332  Q
    || ||| ||  ||||| |||||||||||| |||| |  ||||||| ||| |||| ||| ||||||||| |||  | || |||||||||||| |||||||     
T  9771809 catccagaaatatgcacaattaaatataattatg-cttaaacaaccacactcaatcataaccattcatgcaagca-aaacaacactcaggagctgtgcaa 9771712  T
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9771711 ctcgcctcgcgagcacatctactcgcgatggcgagttc 9771674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12271482 - 12271339
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12271482 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 12271383  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattca 179  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12271382 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattca 12271339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 48774705 - 48774372
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48774705 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 48774606  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaat 233  Q
    |    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||||||| |   |||||| ||  |  |||||||  ||  |||||||    
T  48774605 atacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatggtt-aataaataaagcatacatctcagtcatcagcaaca-acatcaat-tagagatccaat 48774509  T
Q  234 caa-ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcag 332  Q
    ||| ||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| | ||| ||  ||||  ||| | || | | ||||||||||||||||||||||    
T  48774508 caatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaattacaataccaagcactaccacccatgc-acgaaattcaacactcaggaactgtgcag 48774410  T
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48774409 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 48774372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16331672 - 16331348
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  16331672 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 16331575  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataa--ttaacatacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaa 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| |||||| ||  |  |||||||  ||  || |||  | |||     
T  16331574 tccatatgactccacttaatcaacatgtatgattcaataattttagcataca-tcacagtcatcagcaaca-acatcaat-tagagattcaacaatccag 16331478  T
Q  241 aacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctc 340  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||  | | ||||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  16331477 aataatgcacaatcaaatataactatgctcaaaacaacaacatcaatcacgaccattcatgcaagcaaattcaacactcaaaaactgggtagctcgcctc 16331378  T
Q  341 gcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16331377 gcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 16331348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 125 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16414281 - 16414037
Alignment:
Q  125 actgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccag 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||   ||||||| |||| ||||||||  ||    
T  16414281 actgaccatgcaatgca-ctccatgtgactccacttaaacatcatgtatgattcaataatttgcatgcatttcattcatcatgagtaatcatcaattaag 16414183  T
Q  225 caatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaac-atcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcagga 323  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||  ||  |||| || | |||  ||||| ||| ||  || |||||||||||||||    
T  16414182 caaaccaatcaaccacaataatgcataattacatgaaactatgctcagcacctcaacaataagccactaccatccatgcatgaa-aatcaacactcagga 16414084  T
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16414083 actgtgcagctcgcctcgcgaacacatctgctcgccatggcgagttc 16414037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Original strand, 38743004 - 38743137
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aac 143  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38743004 gcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacgtacaactgaccatgcaatgcaaac 38743103  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38743104 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 38743137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14845253 - 14845137
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14845253 tgttgagcaactagtgctccagaaccgaagccctcactgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaa 14845154  T
Q  138 tgcaactccatgtgact 154  Q
    |||||||||||| ||||    
T  14845153 tgcaactccatgagact 14845137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 54091815 - 54091493
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  54091815 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 54091718  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataa--ttaacatacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaa 240  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||| ||  |  |||||||  ||  ||||||  | |||     
T  54091717 tccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataattttagcataca-ttacagtcatcagcaaca-acatcaat-tagagatccaacaatccag 54091621  T
Q  241 aacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcct 339  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||   || || |  | | |||||||    
T  54091620 aataatgcacaattaaatataactatgctcaaaacaacaacaacaattcatcaccattcacacaacaacaatcagcatgtagcaaattaggaactcgcct 54091521  T
Q  340 cgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54091520 cgcgagcacatctgctcgctatggcgag 54091493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 367
Target Start/End: Original strand, 16833305 - 16833625
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  16833305 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 16833402  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataa--ttaacatacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaa 240  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||| |||||| ||  |  |||||||  ||  ||| ||  | |||     
T  16833403 tccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataattttagcataca-atacagtcatcagcaaca-acatcaat-tagagatctaacaatccag 16833499  T
Q  241 aacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctc 340  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||||||||||||||  || | | |  | | ||||||||    
T  16833500 aataatgcacaattaagtataactatgctcaaaacaacaacaacaatcatcaccatacacacaacaacaatcaacatgca-gcatttaggaactcgcctc 16833598  T
Q  341 gcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16833599 gcgagcacatctgctcgctatggcgag 16833625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 313
Target Start/End: Original strand, 3802743 - 3803011
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaa-c 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |    
T  3802743 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggactcactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca-tacattc 3802840  T
Q  144 tccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatc-atcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaacca 239  Q
    ||||| |||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||  |||||||  ||| | |||| ||  || || ||| |||||||| |||  | |||    
T  3802841 tccatatgactccaatttatacaacatgtatggttcaataaataaatcatacatc-acagccatcaacaacat-caacaa-ccagcaattcaacaatcca 3802937  T
Q  240 aaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatca 313  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3802938 aaataatgcataattaaatataactatgctcaagacaacaacatcaatcatcaccattcatacaacaacaatca 3803011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20377319 - 20376999
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaa-c 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |    
T  20377319 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca-tacattc 20377222  T
Q  144 tccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatc-atcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaacca 239  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| | |||| ||  |  |||||| | |  | |||||  | |||    
T  20377221 tccatatgactccaaataatacaacatgtatgattcaataattatagcatacatt-acagccatcagcaacaa-catcaaacaatga-tccaacaatcca 20377125  T
Q  240 aaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcct 339  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  || ||| |  | | |||||||    
T  20377124 gaataatgcataattaaatataactatgctcaaa-caacaacatcaatcatcaccattcatacaataacaatcagcatgca-gaatttagtaactcgcct 20377027  T
Q  340 cgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20377026 cgcgagcacatctgctcgctatggcgag 20376999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 370
Target Start/End: Original strand, 29551042 - 29551330
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaac-tccatgtgactcca-cttaaacaacatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | || | | ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29551042 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatttacatacaacatgaccatgca-tacatccttcatatgactccaacttatacaacatgtatgattc 29551140  T
Q  179 aataatta--acatacatttacatc-atcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaac 275  Q
    ||||||||  ||||||||| ||| | |||| ||  |  |||||| | |  | |||||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29551141 aataattacaacatacatt-acagccatcagcaacaa-catcaaacaatga-tccaacaatccagaataatgcataattaaatataactatgctcaaaac 29551237  T
Q  276 aacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||  ||||  | | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29551238 aacaacatccatcatcaccattcatacaataacaatcagcatgca--aacttagtaactcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttc 29551330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 313
Target Start/End: Original strand, 54520345 - 54520613
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaa-c 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |    
T  54520345 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca-tacattc 54520442  T
Q  144 tccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatc-atcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaacca 239  Q
    ||||| |||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||  |||||||  ||| | |||| ||  |  || ||| |||||||| |||  | |||    
T  54520443 tccatatgactccaatttatacaacatgtatggttcaataaataaatcatacatc-acagccatcagcaacaa-caacaa-ccagcaattcaacaatcca 54520539  T
Q  240 aaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatca 313  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  54520540 gaataatgcacaattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaatcatcacaattcatacaacaacaatca 54520613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 370
Target Start/End: Original strand, 15374724 - 15375039
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  |    
T  15374724 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacatgaccatgc-atacattc 15374821  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaa 241  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||  |||||||||  | ||||| ||  | ||| ||| ||||||||        ||  |    
T  15374822 ttcatatgactccacttatacaacatgtatggtttaataaataaagcatacatttcaaccatca-caaca-tcaacaa-ccagcaat--------ccgga 15374910  T
Q  242 acaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcg 341  Q
    | |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||  ||  | ||||| ||| ||  ||||| | |||||||||||    
T  15374911 ataatgcacaattacataaaactatgctcaaaacaacaacatcaatcacaaacattcatgtaagtaaaatcagcacacaaaaactgggtagctcgcctcg 15375010  T
Q  342 cgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15375011 cgagcacatctgctcgctatggcgagttc 15375039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29545206 - 29545000
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||  |||||||||||| || |    
T  29545206 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttttacaacatgtatggttaa 29545108  T
Q  180 ataattaa-catacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaa 277  Q
    ||||| || |||||| | |||  ||||| ||  ||||  |||| ||||||||||| ||  || || ||||||||||| |||||||||||||  || ||||    
T  29545107 ataataaatcataca-tcacagccatcaacaacattcgacaattcagcaatccaaccattcagaataatgcataatttaatataactatgcttaagacaa 29545009  T
Q  278 caacatcaa 286  Q
    |||| ||||    
T  29545008 caacctcaa 29545000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12725013 - 12724891
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcg 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  | ||||| ||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  12725013 aatgcacaattaaatataactatgctcaaaacaacaacatcaatcactaccattcatataagtaaaatcagcacaca-aaactgggaagctcgcctcgcg 12724915  T
Q  344 agcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  12724914 agcacatctgctcgctatggcgag 12724891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 50655802 - 50655741
Alignment:
Q  309 aatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50655802 aatcaacactcaggaactgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 50655741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11956640 - 11956354
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  || ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  11956640 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacattcttcatatgactccaatttatacaacatgtatgattc 11956542  T
Q  179 aataat--taacatacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaac 275  Q
    ||||||  || |||||| |||||  ||||| ||  | |||||||  |||   | |||  | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11956541 aataattatagcataca-ttacagccatcagcaaca-tcatcaa-acagtggttcaacaatccagaacaatgcacaattaaacataactatgcccaaaac 11956445  T
Q  276 aacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    | ||||||||| ||  |||||||||| ||  | ||||| ||| ||  ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11956444 atcaacatcaatcactaccattcatataaataaaatcagcacaca-aaactgggtaggtcgcctcgcgagcacatatgctcgctatggcgag 11956354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 3802581 - 3802671
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3802581 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 3802671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 54520130 - 54520220
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54520130 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 54520220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30596739 - 30596618
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcg 343  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||  ||||||| ||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  30596739 aatgcacaattaaacataactatgctcaaaacatcaacatcaatcactaccattcatataaatacaatcagcacacaa-aactgggtagctcgcctcgcg 30596641  T
Q  344 agcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  30596640 agcacatctgctcgctatggcga 30596618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19344196 - 19344097
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||  |||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19344196 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccataca-tacatttccatacgactccaattacacaacatgtatgattcaa 19344098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 46070986 - 46070868
Alignment:
Q  248 cataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagca 347  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||  |||||||| |||| |  | ||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||    
T  46070986 cataattaaatataactatgctcaaa-caacaacaccaagcactaccattcacacaatagaattcaacactcaaaaactgggtagctcgcctcacgagca 46070888  T
Q  348 catctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  46070887 catctgctcgctatggcgag 46070868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27029552 - 27029444
Alignment:
Q  261 aactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcca 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |  | || |  | | || ||||||||||||||||||||||| |    
T  27029552 aactatgctcaaaacaacaacatcaatcatcaccattcatacaacaacaatcagca-tgcgaaatttagtaacttgcctcgcgagcacatctgctcgcta 27029454  T
Q  361 tggcgagttc 370  Q
    ||||||||||    
T  27029453 tggcgagttc 27029444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9691486 - 9691348
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |    
T  9691486 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc-atacattc 9691389  T
Q  144 tccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  9691388 tccatatgactccaaattatacaacatgtatggttcaataa 9691348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8373969 - 8373914
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8373969 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 8373914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 20187825 - 20187915
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20187825 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 20187915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30596903 - 30596848
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30596903 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 30596848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27031720 - 27031668
Alignment:
Q  261 aactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatca 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27031720 aactatgctcaaaacaacaacatcaatcatcaccattcatacaacaacaatca 27031668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14844957 - 14844918
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14844957 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 14844918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32388061 - 32388006
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32388061 tttatgcatatgttatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 32388006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 46071154 - 46071048
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||  || ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  46071154 tttatgcatatgcaatggacccactcgtatatatctacatacaactagaccatgc-atacattcttcatatgactccaatttatacaacatgtatgattc 46071056  T
Q  179 aataatta 186  Q
    ||||||||    
T  46071055 aataatta 46071048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 32387870 - 32387777
Alignment:
Q  272 aaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||  ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32387870 aaacaacaacatcaatcatcaccattcaaacaagcacaatcaacatacaa-aactgggtaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 32387777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 18961077 - 18961122
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18961077 tttatgcatatgcaatggactcacttgtgtatatctacatacaact 18961122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 49163272 - 49163317
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49163272 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaact 49163317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 244 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9691296 - 9691240
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||    
T  9691296 aatgcataattaaatataactatgctcaaaacaacaacaccaagcactaccattcat 9691240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 10382296 - 10382336
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10382296 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccacggcgagttc 10382336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 10410949 - 10410989
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10410949 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccacggcgagttc 10410989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13313976 - 13313907
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13313976 tccagggcagaagccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 13313907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 367
Target Start/End: Original strand, 13940393 - 13940437
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13940393 aactgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 13940437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 367
Target Start/End: Original strand, 13946882 - 13946926
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13946882 aactgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 13946926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12725168 - 12725113
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12725168 tttatgcatatgaaatggacccactagtgtatatctacatacaacttgaccatgca 12725113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13203340 - 13203297
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13203340 actgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 13203297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11963944 - 11963908
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11963944 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 11963908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 367
Target Start/End: Original strand, 12200608 - 12200652
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12200608 aactgggcatctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 12200652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13324888 - 13324819
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||  ||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13324888 tccagggcagaagccctcaccgct--tttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 13324819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14288812 - 14288764
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14288812 tcaggaactaggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 14288764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15011690 - 15011642
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15011690 tcaggtactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 15011642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 38312187 - 38312118
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38312187 tccaggaccgaggtcctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatttacatacaact 38312118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 366
Target Start/End: Original strand, 12419808 - 12419850
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12419808 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 12419850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14652507 - 14652473
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14652507 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 14652473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 23173921 - 23173967
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23173921 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 23173967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 127
Target Start/End: Original strand, 12274375 - 12274435
Alignment:
Q  67 agccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12274375 agccctccccgct-ttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 12274435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 127
Target Start/End: Original strand, 17512698 - 17512751
Alignment:
Q  75 ccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17512698 ccgcttttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 17512751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18756716 - 18756683
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18756716 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 18756683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20249175 - 20249105
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| ||||| || |  ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20249175 tccaggaccgaagtcctcatcgtt--tttatgcttatgcaattgactccacttgtgtatatctacatacaact 20249105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13303300 - 13303231
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||  ||||||  |||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13303300 tccagggcagaagccctcaccgct--tttatgtttatgcaactgacccacttgtatatatctacatacaact 13303231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 363
Target Start/End: Original strand, 13909937 - 13909977
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatgg 363  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13909937 aactgggcagctcgcctcgcaagcacatctgctcgctatgg 13909977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 367
Target Start/End: Original strand, 14570209 - 14570253
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14570209 aactgggcaactcgcttcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 14570253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15935004 - 15934960
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15935004 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 15934960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 366
Target Start/End: Original strand, 49163525 - 49163557
Alignment:
Q  334 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49163525 tcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 49163557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18499 - 18165
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18499 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcc 18400  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18399 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 18300  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcagg-aactgtgcagctc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18299 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaatcatcaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaaactgtgcagctc 18200  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18199 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 18165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 89)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 10686174 - 10686506
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10686174 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccataca 10686273  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686274 atgcaacttcatgtgattccacttaa-caacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 10686372  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686373 ccaaaacaatgcataattaaatataactatacccaaaacaacaacatcaatcatcaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcg 10686472  T
Q  337 cctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686473 cctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 10686506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40011052 - 40010719
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40011052 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 40010953  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40010952 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 40010853  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgccca-aaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||| |||| || | ||||||||| ||||||  || | |||| |||  | | ||||||||||| ||||||||| |||    
T  40010852 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcagatacaacaacaccaaccactactaatcatgcaagca-agtcaacactcagaaactgtgcaactc 40010754  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40010753 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 40010719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 43029070 - 43029403
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43029070 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 43029169  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43029170 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaattcagcaatccaatcaa 43029269  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgccca-aaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||  | | ||||||||| ||||||  || | |||| |||  | | ||||||||||| ||||||||| |||    
T  43029270 ccaaaacaatgtataattatatacaaccatgcttagatacaacaacaccaaccactactaatcatgcaagca-agtcaacactcagaaactgtgcaactc 43029368  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43029369 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 43029403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1111758 - 1111425
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1111758 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1111659  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  1111658 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtactcatcaattcagcaatcaaatcaa 1111559  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  ||||||||| | || | |||||||| |||||||||| | |||||    
T  1111558 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattcatgc-acgaaaatcaacattcaggaactgagtagctc 1111460  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1111459 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 1111425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5582357 - 5582024
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5582357 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 5582258  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5582257 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatttcaaccatcatcagtattcatcaatccaacaatccaatcaa 5582158  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||  || | |||| |||  | | ||||||||||| ||||||||| |||    
T  5582157 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaaatacaacaacaccaaccactactaatcatgcaagca-agtcaacactcagaaactgtgcaactc 5582059  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5582058 gcctcgcgagcgcatctgctcgccatggcgagttc 5582024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 30781094 - 30781429
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30781094 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30781193  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||    
T  30781194 atgcaactccatgtgactccactttaacaatatgtatgattcaataattaacatacatttcaaccatcatcaataatcatcaatccaacaattcaatcaa 30781293  T
Q  237 -ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatc-aaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagc 333  Q
     |||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||  || | |||| |||  | | ||||||||||||||||||||| |    
T  30781294 cccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaatccaacaacatcaaaccactactaatcatgcaagca-agtcaacactcaggaactgtgcaac 30781392  T
Q  334 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30781393 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggctagttc 30781429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14615030 - 14614697
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14615030 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14614931  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  14614930 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcactactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 14614831  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  ||||||||| | || | |||||||| |||| ||||| | |||||    
T  14614830 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattcatgc-acgaaaatcaacattcagaaactgagtagctc 14614732  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14614731 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 14614697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 5454518 - 5454851
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5454518 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 5454617  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||    
T  5454618 atgcaactccatgtgacttcactataataatatgtatgattcaataaataacatacattca-accatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 5454716  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||  | |  | || | |||||||||||||||||||||    
T  5454717 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacattcaaccaccactattcaagctagca-aaaccacactcaggaactgtgcagct 5454815  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5454816 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 5454851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 15461501 - 15461834
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461501 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaacggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 15461600  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||    
T  15461601 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 15461700  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  || | |||| |||  | | | ||||||||| ||| ||||| |||    
T  15461701 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacgacatcaaccactactaatcatgcaagca-agttaacactcagaaacagtgcaactc 15461799  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461800 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 15461834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18895075 - 18894743
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18895075 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 18894976  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||    
T  18894975 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattca-accatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 18894877  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||  ||  | | ||||||||||| ||| ||||| |||    
T  18894876 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacgacatcaaccactactaatcatgtaagca-agtcaacactcagaaacagtgcaactc 18894778  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18894777 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 18894743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7508095 - 7507762
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508095 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 7507996  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||||| || |||||| | | | ||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||    
T  7507995 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatca-accatcatcagtattcggtaatgcagcactccaatca 7507897  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||  |||  |   |||||| |||||||||| |||||||    
T  7507896 accaaaacaatgcatgattatatatacccatgctcaaaacaacaacatcaaccattattattcaagcaagcaatttcaacaatcaggaactgagcagctc 7507797  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7507796 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggtgagttc 7507762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 20340569 - 20340899
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340569 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 20340668  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||   |||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  20340669 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtgtgattcaataaataacatccatttcagtcatcat---taatcatcaatccagcaatccaatca 20340765  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
     || ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||  || || ||||||||||||| |||||| ||    
T  20340766 tcccaaataatgcataattacatataaccatgctcaaaaactacaacatcaaacactaccatccataca--aataaacaacactcaggaattgtgcaact 20340863  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20340864 cgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttc 20340899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 20347173 - 20347503
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20347173 gctgttgagcaactagtactccaggacatgaatcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 20347272  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||   |||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  20347273 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtgtgattcaataaataacatccatttcagtcatcat---taatcatcaatccagcaatccaatca 20347369  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
     || ||| ||| |||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||  | ||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  20347370 tcccaaataattcataattacatataaccatgctcaaaaactacaacatcaaacactatcatccataca--aacaaacatcactcaggaactgtgcaact 20347467  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20347468 cgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttc 20347503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 39 - 370
Target Start/End: Original strand, 25846375 - 25846698
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25846375 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 25846474  T
Q  139 gcaactc--catgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||| | | |||||||    
T  25846475 gcaactcaatatatgactccactttaacaacatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagttcaatcaa 25846574  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcg 336  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||         ||||||  || |||||  | |  | || ||||| |||||||||||||||||||    
T  25846575 cccaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaa---------caaccactactattcaagctagca-aaacaacattcaggaactgtgcagctcg 25846664  T
Q  337 cctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25846665 cctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttc 25846698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14882395 - 14882060
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14882395 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 14882296  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt-aacatacatt---tacatcatcatcagtattcatcaa-tccagcaatcc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||| |   | ||||||||||| |   |||||| ||||||||| |    
T  14882295 aatgcaactccatgtgactccacttaactaacatgtatgatt-aacaattaaacatacaatgcattcatcatcatcaatcagcatcaagtccagcaattc 14882197  T
Q  231 aatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatca-accatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgt 328  Q
    |||||| | ||| | ||||| |||  ||||||||||||  |||  |||||||||||    |  |||| |||| ||  |  || ||||||||||||||||     
T  14882196 aatcaatc-aaatagtgcatgatt--atataactatgcttaaatccaacaacatcatgatactaccactcatgcacga--aaacaacactcaggaactga 14882102  T
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14882101 gtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 14882060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14889072 - 14888737
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14889072 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 14888973  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt-aacatacatt---tacatcatcatcagtattcatcaa-tccagcaatcc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||| |   | ||||||||||| |   |||||| ||||||||| |    
T  14888972 aatgcaactccatgtgactccacttaactaacatgtatgatt-aacaattaaacatacaatgcattcatcatcatcaatcagcatcaagtccagcaattc 14888874  T
Q  231 aatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatca-accatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgt 328  Q
    |||||| | ||| | ||||| |||  ||||||||||||  |||  |||||||||||    |  |||| |||| ||  |  || ||||||||||||||||     
T  14888873 aatcaatc-aaatagtgcatgatt--atataactatgcttaaatccaacaacatcatgatactaccactcatgcacga--aaacaacactcaggaactga 14888779  T
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14888778 gtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 14888737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22248321 - 22248171
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22248321 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22248222  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22248221 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgatt-aataattaa 22248171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 187
Target Start/End: Original strand, 24008089 - 24008230
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24008089 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacatgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 24008188  T
Q  145 ccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24008189 ccatgtgactccacttaaacgacatgtatgatt-aataattaa 24008230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24800463 - 24800314
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24800463 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24800364  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  24800363 atgcaactccatgtgactccacttaatcgacaagtatgatt-aataattaa 24800314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24795096 - 24794956
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795096 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24794997  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  24794996 atgcaactccatgtgactccacttaatcgacaagtatgatt 24794956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Original strand, 38013763 - 38013910
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38013763 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 38013862  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  38013863 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatggtttaataa 38013910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37540038 - 37539897
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37540038 gctgttgagtaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37539939  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactt-aaacaacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37539938 atgcaactccatgtgactccaattaaaacaacatgtatgatt 37539897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37547582 - 37547441
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37547582 gctgttgagtaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37547483  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactt-aaacaacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37547482 atgcaactccatgtgactccaattaaaacaacatgtatgatt 37547441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 11995166 - 11995316
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995166 gctgttgagcaactagtactctaggaccgaagccctcaccgcagttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11995265  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11995266 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatga-tcaataattaa 11995316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 180
Target Start/End: Original strand, 25853005 - 25853150
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25853005 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 25853104  T
Q  137 atgcaactc--catgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaa 180  Q
    |||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25853105 atgcaactcaatatatgactccactttaacaacatgtatgattcaa 25853150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17938964 - 17938823
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17938964 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 17938865  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactta-aacaacatgtatgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  17938864 aatgcaactccatgtgactccaattattacaacatgtatgat 17938823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 597303 - 597637
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  597303 gctgttgagcaactagtactcctggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 597402  T
Q  137 atgc-aactccatgt-gactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattc-atcaatccagcaatccaat 233  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||| |  |||||||||||| || |||||| |||||||| |||    
T  597403 atgcaaactccatataaactccactttaacaacatgtatggtt-aataataagcatacattca-gtcatcatcagtaatcaatcaattcagcaatcaaat 597500  T
Q  234 caaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatca-accatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcag 332  Q
    || ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| | | ||  ||||||||| |||  | || ||||||     ||| | | ||    
T  597501 catccagaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattagatcactaccattcatgcaagca-aaacaacacattaaaacagggtag 597599  T
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  597600 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 597637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 19508192 - 19508528
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19508192 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatagacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 19508291  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt--aacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatc--cagcaatcca 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||   || ||| ||  | ||| |||||  |||  || ||    
T  19508292 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt-aatagttaaaacatacatttcattcctcaacatcaatcaacaatcaacagagattca 19508390  T
Q  232 atcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgc 330  Q
      || ||| ||  ||||| |||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||| ||| |||| |||| |||  | || || ||||||||||||||||    
T  19508391 tccatccagaattatgcacaattaaatataattatg-cttaaacaacaacactcaatcataaccactcatgcaagca-aaacagcactcaggaactgtgc 19508488  T
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19508489 aactcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttc 19508528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19800420 - 19800087
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19800420 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcagtggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 19800321  T
Q  136 aatgcaactccatgt-gactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatc 234  Q
    |    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  19800320 atacaaactccatataaactccacttaaacaacatgtatggtt-aataataagcatacatttcagtcatcatcagtaatcaacaattcagcaatccaatc 19800222  T
Q  235 aaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagc 333  Q
    | ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||| | || ||  ||||||||| ||| || ||||| ||| ||  ||  | | |||    
T  19800221 atccagaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaatcactaccattcatgcaagaa-aatcagcacaca-aaatagggtagc 19800124  T
Q  334 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19800123 tcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 19800087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29746673 - 29746340
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29746673 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 29746574  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt--aacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaat 233  Q
    |    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |  | ||||||| |   |||||| ||  |  |||||||  ||  |||||||    
T  29746573 atacaaactccatatgacttcacttaaacaacatgtatggtt-aataaatagagcatacatctcagtcatcagcaaca-acatcaat-tagagatccaat 29746477  T
Q  234 caa-ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcag 332  Q
    ||| ||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| | ||| ||  ||||  ||| | || | | ||||||||||||||||||||||    
T  29746476 caatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaattacaataccaagcactaccacccatgc-acgaaattcaacactcaggaactgtgcag 29746378  T
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29746377 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 29746340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16775078 - 16774796
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16775078 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaataacatgtataattca 16774980  T
Q  180 ataa--ttaacatacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaaca 276  Q
    || |  ||| |||||| ||||| |||||| ||  | ||| |||| ||||||||||| || ||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  16774979 atgattttagcataca-ttacagtcatcagcaaca-tcaacaat-cagcaatccaaccatccagaataatgcacaatttaatataactatgctcaaaaca 16774883  T
Q  277 acaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatgg 363  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| |||  | | ||| || |||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16774882 acaacatcaatcactaccattcatgcaagcaaattcagcattcaaaaactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatgg 16774796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Original strand, 22501008 - 22501153
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22501008 gctgttgagcaactagtgctccaagacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22501106  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataa 183  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22501107 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatatatgattcaataa 22501153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Original strand, 22507589 - 22507734
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22507589 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtatatatctacatacaactgaccatgca 22507687  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataa 183  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22507688 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatctatgattcaataa 22507734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 18566619 - 18566755
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18566619 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaattgaccatgca 18566717  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
        |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18566718 tacaaactccttgtgactccacttaaacaacgtgtatg 18566755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 367
Target Start/End: Original strand, 26650524 - 26650809
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaa-ctccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  || ||| |||||||| || | ||||||||||||||||    
T  26650524 tttatgcatatgctatggactcactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca-tacattcttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattc 26650622  T
Q  179 aataattaa--catacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaaca 276  Q
    ||||| |||  |||||||| | | ||||| ||  || || ||| ||||||||||||  | ||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  26650623 aataaataaaacatacattca-accatcaacaacat-caacaa-ccagcaatccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaaca 26650719  T
Q  277 acaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| ||    ||||| ||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26650720 acaacatcaatcactaccattcatataagtgaaatcagcacaca-aaactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 26650809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 367
Target Start/End: Original strand, 26922109 - 26922394
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaa-ctccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  || ||| |||||||| || | ||||||||||||||||    
T  26922109 tttatgcatatgctatggactcactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca-tacattcttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattc 26922207  T
Q  179 aataattaa--catacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaaca 276  Q
    ||||| |||  |||||||| | | ||||| ||  || || ||| ||||||||||||  | ||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  26922208 aataaataaaacatacattca-accatcaacaacat-caacaa-ccagcaatccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaaca 26922304  T
Q  277 acaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| ||    ||||| ||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26922305 acaacatcaatcactaccattcatataagtgaaatcagcacaca-aaactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 26922394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Original strand, 37566161 - 37566263
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  37566161 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccaattatacaacatgtatggttca 37566259  T
Q  180 ataa 183  Q
    ||||    
T  37566260 ataa 37566263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7773719 - 7773394
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaa-c 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||  |    
T  7773719 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgaaatggacccactcgtgtatttctacatacaactagaccatgca-tacattc 7773622  T
Q  144 tccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatc-atcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaacca 239  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| | |||| ||  |  |||||| | |  | |||||  | |||    
T  7773621 tccatatgactccaaataatacaacatgtatgattcaataattatagcatacatt-acagccatcagcaacaa-catcaaacaatga-tccaacaatcca 7773525  T
Q  240 aaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcct 339  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  | |||||||| ||  | | ||| ||||||  ||||| | ||||| |||    
T  7773524 gaataatgcataattaaatataactatgctcaaaacaacaacatcaatgactatcattcatataaataaattcagcactcaaaaactgggtagctcacct 7773425  T
Q  340 cgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7773424 cgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 7773394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 370
Target Start/End: Original strand, 25853154 - 25853279
Alignment:
Q  245 atgcataattaaatataactatgcccaaaa-caacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcg 343  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  || |||||  | |  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25853154 atgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaacatcaaccactactattcaagctagcaaaa-caacattcaggaactgtgcagctcgcctcgcg 25853252  T
Q  344 agcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25853253 agcacaactgctcgccatggcgagttc 25853279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Original strand, 38014036 - 38014097
Alignment:
Q  309 aatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38014036 aatcaacactcaggaactgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 38014097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28259944 - 28259623
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaact 144  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||       
T  28259944 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca-tacattc 28259847  T
Q  145 ccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa--catacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaa 241  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||  |||||| | ||| |||||| ||  | ||| ||| |||||||| |||  | ||| |    
T  28259846 ccatatgactccaattatacaacatgtatgtttcaataaataaatcataca-tcacagtcatcagcaaca-tcaacaa-ccagcaattcaacaacccaga 28259750  T
Q  242 acaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcg 341  Q
    | |||||| |||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||  |   | | ||| ||||||  ||||| | ||||||||||     
T  28259749 ataatgcacaatttaatacaattatgctcaaaacaacaacatcaatcactaccattcatgtaggtaaattcagcactca-aaactgggtagctcgcctca 28259651  T
Q  342 cgagcacatctgctcgccatggcgagtt 369  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28259650 cgagcacatctactcgctatggcgagtt 28259623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41878075 - 41877985
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41878075 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 41877985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Original strand, 20990389 - 20990527
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |    
T  20990389 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc-atacattc 20990486  T
Q  144 tccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  20990487 tccatatgactccaaattatacaacatgtatggttcaataa 20990527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41877905 - 41877767
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |    
T  41877905 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc-atacattc 41877808  T
Q  144 tccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  41877807 tccatatgactccaatttatacaacatgtatggttcaataa 41877767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5341755 - 5341700
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5341755 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 5341700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18941284 - 18941195
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18941284 caactagtgctccaggacatgagccctc-ccgctgttt-atgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 18941195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 19362721 - 19362776
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19362721 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 19362776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23076327 - 23076272
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23076327 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23076272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23081775 - 23081720
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23081775 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23081720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23544897 - 23544842
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23544897 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23544842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 370
Target Start/End: Original strand, 20990588 - 20990712
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||  |||||||||  |   | | ||| ||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  20990588 aatgcataattaaatataactatgctcaaa-caacaacaccaagcactaccattcatgtacgta-attcagcactcaaaaactgggtagctcgcctcgcg 20990685  T
Q  344 agcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20990686 agcacatctgctcgctatggcgagttc 20990712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 366
Target Start/End: Original strand, 24057908 - 24058001
Alignment:
Q  272 aaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||  ||  ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24057908 aaacaacaacatcaatcatcaccattcatacaagcacaatcaacataca-aaactgggcaactcgcctcgcgagcacatttgctcgctatggcga 24058001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 273 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 39608718 - 39608625
Alignment:
Q  273 aacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||| ||  ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39608718 aacaacaacatcaatcatcaccattcatataagtacaatcagcatacaaaaactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 39608625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 24008374 - 24008414
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24008374 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 24008414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Original strand, 11995463 - 11995502
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995463 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 11995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19801921 - 19801866
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19801921 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 19801866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22248024 - 22247985
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22248024 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 22247985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Original strand, 22379604 - 22379707
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattca 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |     || ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  22379604 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgctaacattcttcatatgactccaatttatacaacatgtatgattca 22379703  T
Q  180 ataa 183  Q
    ||||    
T  22379704 ataa 22379707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24800167 - 24800128
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24800167 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 24800128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37539742 - 37539703
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37539742 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 37539703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37547286 - 37547247
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37547286 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 37547247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 366
Target Start/End: Original strand, 25420134 - 25420227
Alignment:
Q  272 aaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||  ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25420134 aaacaacaacatcaatcatcaccattcaaacaagcacaatcagcatacaa-aactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 25420227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 18566912 - 18566952
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18566912 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 18566952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23112777 - 23112708
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23112777 tccaggaccgaggccatcaccgct--tttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatacaact 23112708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 34829167 - 34829236
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34829167 tccaggaccgaggtcctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 34829236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 261 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41876521 - 41876469
Alignment:
Q  261 aactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatca 313  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41876521 aactatgctcaagacaacaacatcaatcatcaccattcatacaacaacaatca 41876469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17271044 - 17271001
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17271044 actgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 17271001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17938667 - 17938628
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17938667 agctcgcctcgcgagcacatcagctcgccatggcgagttc 17938628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Original strand, 22175426 - 22175469
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22175426 actgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 22175469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Original strand, 9775884 - 9775922
Alignment:
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9775884 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 9775922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18941059 - 18940966
Alignment:
Q  272 aaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| |   ||  ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18941059 aaacaacaacatcaatcatcaccattcatataataacaatcagcgtacaa-aactgggtaactcgcctcgcgagcacatctgctcgcgatggcga 18940966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 370
Target Start/End: Original strand, 33536333 - 33536456
Alignment:
Q  245 atgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||  ||||||||| |||  | || |||||||||  || ||  ||||||||||||||    
T  33536333 atgcataattaaatataactatgcttaaa-caacaacactcaatcactaccattcatgcaagcaaaa-caacactcaacaa-tgcacagctcgcctcgcg 33536429  T
Q  344 agcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33536430 agcacatctgctcgctatgacgagttc 33536456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 24057724 - 24057777
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24057724 tatgcatatgctatggacccacttgtgtatatcaacatacaacttgaccatgca 24057777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 25419943 - 25419988
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25419943 tttatgcatatgttatggacccacttgtgtatatctacatacaact 25419988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Original strand, 21495272 - 21495320
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21495272 tcaggtactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 21495320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 22501299 - 22501339
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22501299 cagctcgcctcgtgagcacatctgctcgctatggcgagttc 22501339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 300
Target Start/End: Original strand, 37566324 - 37566380
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcat 300  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  37566324 aatgcacaatttaatataactatgctcaaaacaacaacatcaatcactaccattcat 37566380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 758071 - 758028
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  758071 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 758028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Original strand, 20938003 - 20938046
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20938003 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 20938046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22508942 - 22508899
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22508942 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 22508899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39608909 - 39608854
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39608909 tttatgcatatgttatggactcacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 39608854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17264557 - 17264519
Alignment:
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17264557 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatgtcgag 17264519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17022535 - 17022502
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17022535 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 17022502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 20937754 - 20937799
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20937754 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 20937799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22312846 - 22312801
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22312846 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 22312801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 127
Target Start/End: Original strand, 10035266 - 10035325
Alignment:
Q  66 aagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||||   |||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10035266 aagccctcaccgct---ttatgtttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10035325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 22507880 - 22507920
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22507880 cagctcgccttgcgagcacatctgctcgttatggcgagttc 22507920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23444211 - 23444167
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23444211 tatgcttatgcaatggactctacttgtgtatatctacataaaact 23444167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27635655 - 27635596
Alignment:
Q  306 aacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  27635655 aacaatcaacattcaa-aactgtgcaactcgcctcgcgaacatatctgctcgctatggcga 27635596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 58 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36212066 - 36211753
Alignment:
Q  58 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36212066 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 36211967  T
Q  158 cttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaa 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36211966 cttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatctagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaa 36211867  T
Q  258 tataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcagg-aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36211866 tataactatgcccaaaacaacaacatcaatcatcaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctc 36211767  T
Q  357 gccatggcgagttc 370  Q
    ||||||| ||||||    
T  36211766 gccatggtgagttc 36211753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18026788 - 18026455
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18026788 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 18026689  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  18026688 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaatccagtaattcaatcaa 18026589  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||  || |||||  | |  | || ||||||||||||||||||||||||    
T  18026588 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaacatcaaccactactattcaagctagca-aaacaacactcaggaactgtgcagctc 18026490  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18026489 acctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttc 18026455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 58 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20396888 - 20396576
Alignment:
Q  58 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20396888 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 20396789  T
Q  158 cttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  20396788 cttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacatttcaatcatcatcagtaatcatcaattcaacaatccaatcaaccaaaataatgcaaaattaca 20396689  T
Q  258 tataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctc 356  Q
    |  |||||||| ||| ||| ||||| | |||||  ||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20396688 tgaaactatgctcaacacatcaacattaaaccactaccattcatgc-acaaaattcaacactcaagaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgttc 20396590  T
Q  357 gccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||    
T  20396589 gccatggcgagttc 20396576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 39 - 368
Target Start/End: Original strand, 18418205 - 18418536
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18418205 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaac 18418304  T
Q  139 gcaactccatgtgactccactt-aaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaac 237  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  18418305 gcaactccatgtgactccacttaaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaaatcaaacaac 18418404  T
Q  238 caaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatc-aaccatgaccattcatacaacaacaa-tcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
    ||| | |||||||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||| |||||  |  |||||  ||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  18418405 caacataatgcataattataaataaccatgctcaaaaacaacaacatcaaaccactattattcaagca--aacaattcaacactcaggaattgtgcagtt 18418502  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagt 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18418503 cgcctcgcgagcacatcttctcgccatggcgagt 18418536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28556538 - 28556206
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28556538 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28556439  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||  | | |||||||| || |||||||||||||||| ||||| |    
T  28556438 atgcaactccatgcgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatgca-accatcatcaataatcatcaatccagcaattcaatcga 28556340  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||   || |||||  | |  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28556339 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaatacaacaacatcaacctccactattcaagctagcaaaat-aacactcaggaactgtgcagctc 28556241  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28556240 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 28556206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 6740597 - 6740930
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740597 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 6740696  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  6740697 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 6740796  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | |||||| |||||||||| | |||||    
T  6740797 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacattcaggaactgagtagctc 6740895  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740896 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 6740930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 48427932 - 48428265
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427932 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 48428031  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  48428032 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 48428131  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | |||||| |||||||||| | |||||    
T  48428132 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacattcaggaactgagtagctc 48428230  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428231 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 48428265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20277288 - 20276956
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20277288 gctgttgagcaactagtactccaggaccaaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 20277189  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  20277188 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattca-accatcatcaataatcatcaatccagcaattcaaacaa 20277090  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  || | |||| |||  | | |||||||||||||  |||||| ||    
T  20277089 ccaaaataatgcataactatatataaccatgcccaaatacaacaacattcaaccaccacta-tcatgcaagca-agtcaacactcaggagttgtgcaact 20276992  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20276991 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 20276956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31535336 - 31535003
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31535336 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 31535237  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  31535236 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 31535137  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | |||||| |||||||||| | |||||    
T  31535136 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacattcaggaactgagtagctc 31535038  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31535037 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 31535003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31564053 - 31563720
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564053 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 31563954  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  31563953 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 31563854  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | |||||| |||||||||| | |||||    
T  31563853 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacattcaggaactgagtagctc 31563755  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31563754 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 31563720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 20299401 - 20299722
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    |||||||||||||||||||   || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  20299401 gcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatg----t 20299496  T
Q  145 ccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaaca 244  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  20299497 ccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaattcagcaatccaatcatccaaaata 20299596  T
Q  245 atgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcg 343  Q
    ||||||||||| ||  |||||||| ||| ||  ||||| | || ||  ||||||||| |||  | || || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20299597 atgcataattacatgaaactatgctcaacacttcaacattaaatcactaccattcatgcaagca-aaacagcactcaggaactgtgcaactcgcctcgcg 20299695  T
Q  344 agcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20299696 agcacatctactcgctatggcgagttc 20299722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 20292767 - 20293093
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aac 143  Q
    |||||||||||||||||||   || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20292767 gcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaac 20292866  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaac 243  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||| || |||| |||||| ||||||     
T  20292867 tccatgtaacaccacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacattttagtcatcatcagtaatcatcaattcaacaattcaatcatccaaaat 20292966  T
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgc 342  Q
    |||||||||||| ||  || ||||| |||  |  ||||| | || ||  ||||||||| |||  | || || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20292967 aatgcataattacatgaaattatgctcaacgcttcaacattaaatcactaccattcatgcaagca-aaacagcactcaggaactgtgcaactcgcctcgc 20293065  T
Q  343 gagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20293066 gagcacatctactcgctatggcgagttc 20293093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 39094400 - 39094734
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39094400 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 39094499  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa-catacatttacatcatcatcagtatt--catcaatccagcaatccaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||   |||   |||||||| |  || ||| |||||||| | |    
T  39094500 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatggtttaataaataatcatacat---catagccatcagtaataacaacaa-ccagcaattc-a 39094594  T
Q  233 tcaa-ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatc-aaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtg 329  Q
    |||| ||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||  || | ||||||||  | | | | |||||||||||||||    
T  39094595 tcaatccataataatgcacaattaaatataactatgctcaaatccaacaacctcaaaccactactaatcatacaagca-agttagcactcaggaactgtg 39094693  T
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39094694 caactcgcctcgcgagctcatctgctcgccatggcgagttc 39094734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38908090 - 38907941
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38908090 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 38907991  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  38907990 atgcaacttcatgtgactccacttaaacgacatgtatgatt-aataattaa 38907941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 37682165 - 37682315
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682165 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 37682264  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  37682265 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatgatt-aataattaa 37682315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39189717 - 39189568
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39189717 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 39189618  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  39189617 atgcaactccatgtgactccacttaatcgacaagtatgatt-aataattaa 39189568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 37675472 - 37675622
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37675472 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccttcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 37675571  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  37675572 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatgatt-aataattaa 37675622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20076987 - 20076652
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20076987 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctctgctgttttatgcatatgcaatggacttacttgtgtatatctacatacaacatgaccatgc 20076888  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatcatcatcagt---attcatcaatccagcaatc 229  Q
     || || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||  ||||||||| ||  | |||||||   |||||||||| ||||||||    
T  20076887 -atacatactccatatgactccacttaaataacatgtatggtt-aataaataaagcatacatttcca--accatcagtaacattcatcaatgcagcaatc 20076792  T
Q  230 caatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgt 328  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||| ||  ||||  ||||||   | | ||||||||||||||||||    
T  20076791 caatcatccagaacaatgcacaattaaatataactatgcttaaaaacaac-acaccaagcacaaccagccatacatgga-attcaacactcaggaactgt 20076694  T
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20076693 gcagctcgcctcgcgatcacatctgctcgctatggcgagttc 20076652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 4231267 - 4231602
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4231267 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 4231366  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa-catacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatc 234  Q
    |    |||||||| |||||||||||  |||||||||||| || |||||  || |||||||    | |||||  |  ||||| |||| |||||||||||||    
T  4231367 atacaaactccatatgactccacttctacaacatgtatgcttaaataaccaatcatacatcacaaccatcagtaacattcaacaattcagcaatccaatc 4231466  T
Q  235 aaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagc 333  Q
    | ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||| | || |   ||||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||    
T  4231467 acccagaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaatctctaccattcatgc-acgaaattcaacactcaggaactgtgcagc 4231565  T
Q  334 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4231566 tcaccttgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 4231602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 370
Target Start/End: Original strand, 17149454 - 17149729
Alignment:
Q  94 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatac 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | || |||||    
T  17149454 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccactt-aacaacatgtatgattcaatcaatagcatac 17149552  T
Q  193 atttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaacca-aaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccat 290  Q
    ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||  ||||||| |||| |||    
T  17149553 atttcagtcatcatcagtaatcatcaatccagcaatccagtcatccagaaataatgcacaattaagtataaccatgctcaaa--aacaacactcaatcat 17149650  T
Q  291 -gaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
      ||||||||| |||  | || || |||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17149651 ctaccattcatgcaagca-aaacagcactc-taaactgcacagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 17149729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22185640 - 22185534
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22185640 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22185541  T
Q  137 atgcaac 143  Q
    |||||||    
T  22185540 atgcaac 22185534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Original strand, 20570828 - 20570961
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aac 143  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20570828 gcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaac 20570927  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20570928 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 20570961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 183
Target Start/End: Original strand, 42626280 - 42626424
Alignment:
Q  38 ctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaa 137  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42626280 ctgttgagcaactagtgctccaggacatgggtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcat 42626378  T
Q  138 tgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataa 183  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42626379 acaaactccatgtgactccacttaaacaacatctatgattcaataa 42626424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19046160 - 19046004
Alignment:
Q  213 tcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaa-caacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||||||| ||  ||||| |||||||  ||||     
T  19046160 tcatcaatccagcaatccaatcatcccaaataatgcataattacatataaccatgctcaaaaactacaacatcaaacactaccatccatacaa--acaaa 19046063  T
Q  312 caacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19046062 caacactcaagaactgtgcaactcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttc 19046004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 370
Target Start/End: Original strand, 21920884 - 21921209
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaa-c 143  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |    
T  21920884 caactagtactccaggacataagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatgaaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca-tacattc 21920981  T
Q  144 tccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaa 240  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||     ||||| ||  |  |||||| | |  | |||||  | | |     
T  21920982 tccatatgactccaaataatacaacatgtatgattcaataattatagcatacattatagccatcagcaacaa-catcaaacaatga-tccaacaatctag 21921079  T
Q  241 aacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctc 340  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |  | ||| ||||||  ||||| | ||||||||||    
T  21921080 aataatgcataattaaatataactatgctcaaaacaacaacatcaatcactaccattcacacaatagaattcagcactcaaaaactgggtagctcgcctc 21921179  T
Q  341 gcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  21921180 gcgagcacttctgctcgctatgacgagttc 21921209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 170
Target Start/End: Original strand, 21963084 - 21963218
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21963084 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 21963183  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatg 170  Q
    |    |||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  21963184 atacaaactccatatgactccacttctacaacatg 21963218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29602319 - 29601994
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaa-c 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |    
T  29602319 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca-tacattc 29602222  T
Q  144 tccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatc-atcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaacca 239  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| | |||| ||  |  |||||| | |  | |||||  | |||    
T  29602221 tccatatgactccaaataatacaacacgtatgattcaataattatagcatacatt-acagccatcagcaacaa-catcaaacaatga-tccaacaatcca 29602125  T
Q  240 aaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcct 339  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |  | ||| |||| |  ||||| | |||||||||    
T  29602124 gaataatgcataattaaatataactatgctcaaaacaacaacatcaatcactaccattcacacaatagaattcagcactaaaaaactgggtagctcgcct 29602025  T
Q  340 cgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  29602024 cgcgagcacttctgctcgctatggcgagttc 29601994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 3652735 - 3652679
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatg 93  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3652735 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcatatg 3652679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29596884 - 29596743
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||  |    
T  29596884 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgtaatggacccactcgtgtatttctacatacaactagaccatgc-atacattc 29596787  T
Q  144 tccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataatta 186  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29596786 tccatatgactccaaataatacaacatgtatgattcaataatta 29596743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 19961273 - 19961342
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19961273 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 19961342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 36615058 - 36615113
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36615058 tttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 36615113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 38907795 - 38907756
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38907795 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 38907756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 39189421 - 39189382
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39189421 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 39189382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 49328155 - 49328210
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49328155 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 49328210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 98
Target Start/End: Original strand, 17146336 - 17146397
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17146336 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 17146397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 37682448 - 37682488
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37682448 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccacggcgagttc 37682488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Original strand, 27280601 - 27280644
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27280601 actgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 27280644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 43088514 - 43088557
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43088514 tttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaa 43088557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 370
Target Start/End: Original strand, 20571102 - 20571156
Alignment:
Q  316 actcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  20571102 actcaggaactgtggaactcgcctcgcgggcacatctactcgctatggcgagttc 20571156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 366
Target Start/End: Original strand, 49328346 - 49328439
Alignment:
Q  272 aaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||  ||  ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49328346 aaacaacaacatcaatcatcaccattcaaacaagcacaatcagcatacaa-aactgggtaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 49328439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3706522 - 3706485
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3706522 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 3706485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 370
Target Start/End: Original strand, 21963377 - 21963418
Alignment:
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21963377 gcagctcgcctcgcgagcgcatctgctcgctatggcgagttc 21963418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 370
Target Start/End: Original strand, 42626573 - 42626610
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42626573 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 42626610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 37675755 - 37675795
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37675755 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccacagcgagttc 37675795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Original strand, 36917489 - 36917528
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36917489 agctcgcctcacgagcacatctgctcgctatggcgagttc 36917528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 47484229 - 47484284
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47484229 tttatgcatatgctatagacccactagtgtatatctacatacaacttgaccatgca 47484284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 323 - 366
Target Start/End: Original strand, 47484471 - 47484514
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47484471 aactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 47484514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 20242693 - 20242739
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20242693 ttttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatacaact 20242739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20824127 - 20824085
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20824127 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 20824085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20837936 - 20837894
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20837936 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 20837894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21734173 - 21734131
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21734173 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 21734131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 366
Target Start/End: Original strand, 24079967 - 24080009
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24079967 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 24080009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 954825 - 954788
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  954825 ctcgcctcgcgagcacacctgctcgctatggcgagttc 954788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22434724 - 22434687
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22434724 cagctcgcctcgcgagcacttctgctcgctatggcgag 22434687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23066718 - 23066673
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23066718 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 23066673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25092038 - 25092005
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25092038 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 25092005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20824373 - 20824329
Alignment:
Q  83 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20824373 ttatgcttatgcaactaacctacttgtgtatatctacatacaact 20824329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Original strand, 21698261 - 21698305
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21698261 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 21698305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 74)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 52500579 - 52500912
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52500579 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 52500678  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52500679 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacattaaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 52500778  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||  || | |||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  52500779 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaaatacaacaacaccaaccactactaatcatgcaagca-agtcaacactcaggaactgtgcagctc 52500877  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52500878 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 52500912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3260045 - 3259712
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3260045 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatataactgaccatgca 3259946  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  3259945 atgcaacttcatgtgactccactttaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttcaatcatcattagtaatcatcaatccaacaatcaaatcaa 3259846  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatc-aaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||  || |||||| | |  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  3259845 ccaaaacaatgcataattacatataaccttgctcaaaacaacaacatcaaaccactactattcatgctagca-agtcaacactcaggaactgtgcagctc 3259747  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3259746 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 3259712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 21396845 - 21397178
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396845 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21396944  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21396945 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcgataattagcatacatttcaatcatcatcagtaatcatcaattcagcaatccaatcaa 21397044  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||| |   ||||| | || ||  ||||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  21397045 ccaaaataatgcataattacatgaaactatgctcaacatttcaacattaaatcactaccattcatgc-acgaaattcaacactcaggaactgtgcagctc 21397143  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21397144 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 21397178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 391194 - 391528
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  391194 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 391293  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacattt-acatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  391294 atgcaactccatgtgactccactttaataatatgtatgattcaataattaacatacatttaaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 391393  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||  || | |||| |||  | | ||||||||||| ||||||||| ||    
T  391394 accaaaataatgtgtaattatatacaaccatgctcaaatacaacaacaccaaccactactaatcatgcaagca-agtcaacactcagaaactgtgcaact 391492  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  391493 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 391528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29382818 - 29382486
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29382818 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcacatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 29382719  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||  |||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  29382718 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagcagttcaatcaa 29382619  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcg 336  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  || |||||  | |  | || ||||| |||||||||||||||||||    
T  29382618 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaacaacaacatcaaccactactattcaagctagca-aaacaacattcaggaactgtgcagctcg 29382520  T
Q  337 cctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29382519 cctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttc 29382486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3266673 - 3266340
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3266673 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 3266574  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  3266573 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 3266474  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | |||||| |||||||||| | |||||    
T  3266473 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacattcaggaactgagtagctc 3266375  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3266374 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 3266340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 49240898 - 49240565
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49240898 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 49240799  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||   |||||||||| | |||||||||||| |||| || |||    
T  49240798 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagaaatcaaaacaa 49240699  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | |||||| |||||||||| | |||||    
T  49240698 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaatacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacattcaggaactgagtagctc 49240600  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49240599 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 49240565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 49749612 - 49749279
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49749612 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 49749513  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||   |||||||||| | |||||||||||| |||| || |||    
T  49749512 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagaaatcaaaacaa 49749413  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | |||||| |||||||||| | |||||    
T  49749412 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaatacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacattcaggaactgagtagctc 49749314  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49749313 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 49749279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 39266291 - 39265957
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39266291 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 39266192  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||   || || |||||||||||| ||| ||||||||||| | | |||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||    
T  39266191 atgcaactccatgtgactccaccataataatatgtatgattcactaaataacatacattca-accatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 39266093  T
Q  237 cc-aaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagc 333  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||  | |    || |||| |||||||||||||||||    
T  39266092 ccaaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacattcaaccaccactattcaagcta-gttaaacaactctcaggaactgtgcagc 39265994  T
Q  334 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39265993 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 39265957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 58 - 370
Target Start/End: Original strand, 50082269 - 50082581
Alignment:
Q  58 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50082269 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgccacggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactcca 50082368  T
Q  158 cttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaa 257  Q
    ||| || || ||||||||||||| ||||  |||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||| | | ||||||||| ||| |||||||||||  |    
T  50082369 ctttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagttcaatcaaccgaaataatgcataattgca 50082468  T
Q  258 tataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctc 356  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||  || |||||  | |  | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50082469 tataaccatgctcaaaaacaacaacatcaaccactactattcaagctagca-aaacaacattcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctc 50082567  T
Q  357 gccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||    
T  50082568 gccatggcgagttc 50082581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23436036 - 23435701
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23436036 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 23435937  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatcatcatcagtatt--catcaatccagcaatcca 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||  |||||||   |||   |||||| | |  || ||| |||||||| |     
T  23435936 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtgtggttcaataaataaatcatacat---catagccatcagcaataacaacaa-ccagcaattc- 23435842  T
Q  232 atcaa-ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatc-aaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgt 328  Q
    ||||| | | || |||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||  || | ||||||||  | | | | ||||||||||||||    
T  23435841 atcaatctataataatgcacaattaaatataactatgctcaaatccaacaacctcaaaccactactaatcatacaagca-agttagcactcaggaactgt 23435743  T
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23435742 gcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 23435701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Original strand, 1583938 - 1584176
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1583938 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1584037  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  1584038 atgcaaactccatgtgacaccactt-aacaacatgtatgattcaatcaatagcatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaatccagcaatccattca 1584136  T
Q  236 acca-aaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaa 274  Q
     ||| ||| |||||| |||||| |||||| |||| |||||    
T  1584137 tccagaaataatgcacaattaagtataaccatgctcaaaa 1584176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 26395713 - 26395863
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26395713 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26395812  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26395813 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgatt-aataattaa 26395863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29448730 - 29448396
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29448730 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgga 29448631  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa-catacatttacatcatcatcagtatt--catcaatccagcaatccaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||   |||   |||||| | |  || ||| |||||||| | |    
T  29448630 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatggtttaataaataatcatacat---catagccatcagcaataacaacaa-ccagcaattc-a 29448536  T
Q  233 tcaa-ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatc-aaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtg 329  Q
    |||| ||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||||  ||||||| || |||||  || | |||||||   | | | | |||||||||||||||    
T  29448535 tcaatccataataatgcacaattaaataaaactatgctcaaatccaacaacctcaaaccactactaatcatacaggca-agttagcactcaggaactgtg 29448437  T
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29448436 caactcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 29448396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29455414 - 29455080
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29455414 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 29455315  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa-catacatttacatcatcatcagtatt--catcaatccagcaatccaa 232  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||   |||   |||||| | |  || ||| |||||||| | |    
T  29455314 atgcaactccatatgactccaattaatacaacatgtatggtttaataaataatcatacat---catagccatcagcaataacaacaa-ccagcaattc-a 29455220  T
Q  233 tcaa-ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatc-aaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtg 329  Q
    |||| ||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||||  ||||||| || |||||  || | |||||||   | | | | |||||||||||||||    
T  29455219 tcaatccataataatgcacaattaaataaaactatgctcaaatccaacaacctcaaaccactactaatcatacaggca-agttagcactcaggaactgtg 29455121  T
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29455120 caactcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 29455080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 11937186 - 11937336
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11937186 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccttcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 11937285  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11937286 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatgatt-aataattaa 11937336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 7359276 - 7359609
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7359276 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 7359375  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatc--cagcaatccaat 233  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||||||  |  | ||| ||| |   ||  || |||     
T  7359376 atgcaaactccatgtgacaccactt-aacaacatgtatgattcaatagttagcatacatttcagtcatcaataacaatcaacaaccaatagagattcaac 7359474  T
Q  234 caaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcag 332  Q
    || ||| ||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||  | || |||||||||  || ||  |||    
T  7359475 catccagaattatgcataattaaatataactatg-cttaaacaacaacactcaatcactaccattcatgcaagca-aaacaacactcaataa-tgcacag 7359571  T
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7359572 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 7359609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 45142603 - 45142269
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45142603 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 45142504  T
Q  136 aatgcaactccatgt-gactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatc 234  Q
    |    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  45142503 atacaaactccatataaactccacttaaacaacatgtatggtt-aataataagcatacatttcagtcatcatcagtaatcaacaattcagcaatccaatc 45142405  T
Q  235 aaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagc 333  Q
    | ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||| | || ||  ||||||||| |||  | ||||| ||| ||  ||| | | |||    
T  45142404 atccagaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaatcactaccattcatgcaagca-aatcagcacacaaaaacagggtagc 45142306  T
Q  334 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  45142305 tcgcctcgcgagcacatctgcttgctatggtgagttc 45142269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11202484 - 11202343
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11202484 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacagctgaccatgca 11202385  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11202384 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 11202343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Original strand, 5938961 - 5939112
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aac 143  Q
    ||||||||||||||| |||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5938961 gcaactagtactccaagacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaac 5939060  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacattt 196  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5939061 tccatgtgacaccactt-aacagcatgtatgattcaatagttagcatacattt 5939112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 370
Target Start/End: Original strand, 31665098 - 31665422
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||    
T  31665098 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaacttgaccatgc-atacatac 31665195  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataa--ttaacatacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaa 240  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| |||||| ||  |  |||||||  ||  ||||||  | |||     
T  31665196 tccatatgactccatttaaacaacatgtatgattcaataattttagcataca-tcacagtcatcagcaaca-acatcaat-tagagatccaacaatccag 31665292  T
Q  241 aacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctc 340  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||  | | ||| || |||  ||||| | ||||||||||    
T  31665293 aataatgcacaattaaatataactatgctcaaaacaacaacatcaatcactaccattcatgcaagcaaattcagcattcaaaaactgggtagctcgcctc 31665392  T
Q  341 gcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31665393 gcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 31665422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45959795 - 45959657
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45959795 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 45959696  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    |    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45959695 atacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 45959657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 370
Target Start/End: Original strand, 21881665 - 21881954
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaac-tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || | | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21881665 tttatgcatatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca-tacatccttcatatgactccacttatacaacatgtatgattca 21881763  T
Q  180 ataattaa--catacatttacatc-atcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaaca 276  Q
    |||||||   |||||||| ||| | |||| ||  |  |||||| |||   |||||   | ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21881764 ataattatagcatacatt-acagccatcagcaacaa-catcaa-ccaatgatccagcaatccagaataatgcataattaaatataactatgttcaaaaca 21881860  T
Q  277 acaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||  | ||||| ||||||  || || | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21881861 acaacatccatcatcaccattcatacaattaaaatcagcactcaaaaattgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggtgagttc 21881954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2972777 - 2972454
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  2972777 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 2972680  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatcatcatcagtattcatca--atccagcaatccaatcaacca 239  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||   |||    |||||| |  |||||  | |||| ||||||| ||| ||    
T  2972679 tccatatgactccaattatacaacatgtatggttcaataaataaatcataca---acacagccatcagca-acatcaacaaccagaaatccaa-caatca 2972585  T
Q  240 a-aacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcc 338  Q
    | || |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||  | | ||| ||||||  ||||| | ||||||||    
T  2972584 agaataatgcacaatttaatataactatgctcaaaacaacaacatcaatcactaccattcatgcaagcaaattcagcactca-aaactgggtagctcgcc 2972486  T
Q  339 tcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2972485 tcgcgaacacatctgctcgctatggcgagttc 2972454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19128352 - 19128064
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19128352 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttatacaacatgtatggttca 19128254  T
Q  180 ataattaa--catacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaaca 276  Q
    |||| |||  |||||| | |||  ||||| ||  | ||| |||  |||||||||||  | ||| || |||||| |||| |||| |||||||| |||||||    
T  19128253 ataagtaaatcataca-tcacagccatcagcaaca-tcaacaa-gcagcaatccaacaatccagaataatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 19128157  T
Q  277 acaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||| ||  ||||| ||| |||  |   ||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19128156 acaacatcaatcactaccatacatgcaagcaatttcagcactca-aaactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 19128064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 49548413 - 49548145
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaa-c 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |    
T  49548413 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca-tacattc 49548316  T
Q  144 tccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatc-atcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaacca 239  Q
    ||||| |||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||  |||||||  ||| | |||| ||  |  || ||| |||||||| |||  | |||    
T  49548315 tccatatgactccaatttatacaacatgtatggttcaataaataaatcatacatc-acagccatcagcaacaa-caacaa-ccagcaattcaacaatcca 49548219  T
Q  240 aaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatca 313  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  49548218 gaataatgcacaattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaatcatcaccattcatacaacaacaatca 49548145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 34772196 - 34772531
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34772196 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgactatgc 34772295  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa-catacatttacatcatcatcagt---attc-atcaatccagcaatc 229  Q
     || || ||||||| |||||||| ||  |||||||||||| || |||||  || |||||||   ||| | |||||||   |||| | || | ||||||||    
T  34772296 -atacatactccatatgactcca-ttttacaacatgtatgtttaaataacaaatcatacat---cataaccatcagtaacattcaaacatttcagcaatc 34772390  T
Q  230 caatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgt 328  Q
    |||||| ||| || | |||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||| | || ||  ||||||||| |||  | || || ||| ||  ||| |     
T  34772391 caatcatccagaatagtgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaatcactaccattcatgcaatca-aaacagcacgcaacaacagg 34772489  T
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34772490 gtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 34772531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 174
Target Start/End: Original strand, 20895032 - 20895160
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  20895032 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 20895129  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  20895130 tccatatgactccacttttacaacatgtatg 20895160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 42956031 - 42955938
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42956031 tttatgcatatgcaacggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 42955938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 47872475 - 47872152
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47872475 gctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 47872377  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaat 233  Q
    |       | |||   ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||||||   |||||| ||| | ||| ||| |||| || |||      
T  47872376 a-------tacat---actccacttaaacaacatgtatggtt-aataaataaagcatacatttcagtcatcaacagcaatcaacaa-ccagtaacccagc 47872289  T
Q  234 caaccaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcag 332  Q
     | | | || ||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||  |||||||||   ||   | ||||||| ||||||| || |||    
T  47872288 aatctagaataatgcataattatttataaatatgctcgaaaacaacaacaccaagcactaccattcat-gtacgcaattcaacacccaggaacagtacag 47872190  T
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47872189 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 47872152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 184
Target Start/End: Original strand, 36037636 - 36037739
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||  |||||||||||| || |    
T  36037636 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttttacaacatgtatggttaa 36037734  T
Q  180 ataat 184  Q
    |||||    
T  36037735 ataat 36037739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Original strand, 20889448 - 20889541
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  20889448 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttttacaacatgtatg 20889541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 54845001 - 54844912
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54845001 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatacaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 54844912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Original strand, 33097166 - 33097268
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattca 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  | ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  33097166 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacattttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattca 33097264  T
Q  180 ataa 183  Q
    ||||    
T  33097265 ataa 33097268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 370
Target Start/End: Original strand, 33221408 - 33221732
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||       
T  33221408 caactagtgctccaggacacgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctatatacaactagaccatgc-atacatta 33221505  T
Q  144 tccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattcaataattaa--catacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaacca 239  Q
    ||||| ||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||| || |||  ||||| |   | ||| ||| |||| |||||||  | | |    
T  33221506 tccatatgactccaaattatacaacatgtatggttcaataaataaatcatac-ttcacagccatcaaccaca-tcaacaa-ccagtaatccaacaatcta 33221602  T
Q  240 aaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcct 339  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||   ||   | ||| ||||||  ||||| | |||||||||    
T  33221603 gaataatgcataattaaatataactatgctcaaaacaacaacaccaagcactaccattcat-gtacgtgattcagcactcaaaaactgggtagctcgcct 33221701  T
Q  340 cgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33221702 cgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 33221732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 323 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44657535 - 44657488
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44657535 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 44657488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 323 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44663464 - 44663417
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44663464 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 44663417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 49548593 - 49548538
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49548593 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 49548538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 54826020 - 54825896
Alignment:
Q  245 atgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcg 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||| || ||||| ||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  54826020 atgcacaattaaatataactatgcttaaaacaacaacactcaatcactaccattcatgcaagaa-aatcagcacacaa-aactgggtagctcgcctcgcg 54825923  T
Q  344 agcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  54825922 agcacatctgctcgctatggcgagttc 54825896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 899666 - 899721
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  899666 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 899721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 30396269 - 30396324
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30396269 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 30396324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 35462656 - 35462566
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35462656 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 35462566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41404716 - 41404662
Alignment:
Q  83 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41404716 ttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 41404662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 82
Target Start/End: Original strand, 391154 - 391199
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtt 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  391154 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtt 391199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 273 - 366
Target Start/End: Original strand, 899858 - 899951
Alignment:
Q  273 aacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||  ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  899858 aacatcaacatcaatcatcaccattcatataataacaatcagcatacaaaaactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 899951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 14910723 - 14910792
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14910723 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14910792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Original strand, 26396010 - 26396049
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26396010 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 26396049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 366
Target Start/End: Original strand, 42220504 - 42220788
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaa-ctccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  || ||| |||||| | || | ||||||||||||||||    
T  42220504 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca-tacattcttcatatgactctaatttatacaacatgtatgattc 42220602  T
Q  179 aataattaa--catacatttacatc-atcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaac 275  Q
    ||||| ||   |||||||| ||| | |||| || ||| |||||| | ||  ||||||  | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |    
T  42220603 aataaatatagcatacatt-acagccatcagcaatat-catcaaac-agtgatccaacaatccagaacaatgcacaattaaacataactatgctcaaa-c 42220698  T
Q  276 aacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    | ||||||| | ||| |||||| | ||||  ||||||| ||  ||  ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42220699 atcaacatctatcatcaccatttaaacaagcacaatcagcatacaa-aactgggtaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 42220788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43284661 - 43284618
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43284661 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 43284618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 46044880 - 46044825
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46044880 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 46044825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 54826123 - 54826080
Alignment:
Q  142 actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54826123 actccatatgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt 54826080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 45959503 - 45959463
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45959503 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 45959463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 46044687 - 46044595
Alignment:
Q  274 acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||| ||  ||  ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  46044687 acaacaacatcaatcatcaccattcatataagtacaatcagcatacaaaaactgggcaactcgcctcgcgagcacatttgctcgctatggcga 46044595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 635531 - 635488
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  635531 actgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 635488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Original strand, 20889689 - 20889728
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20889689 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgcgatggcgagttc 20889728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Original strand, 20940669 - 20940712
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20940669 actgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 20940712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 127
Target Start/End: Original strand, 27905352 - 27905418
Alignment:
Q  59 aggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27905352 aggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttattcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 27905418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 42955781 - 42955744
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42955781 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 42955744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 1584230 - 1584270
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1584230 cagctcgcctcgcgagcccatctgctcgctatggcgagttc 1584270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 5939246 - 5939286
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5939246 cagctcgccttgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 5939286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 93
Target Start/End: Original strand, 7356283 - 7356339
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatg 93  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||    
T  7356283 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatg 7356339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 11937469 - 11937509
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11937469 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccacagcgagttc 11937509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 14485649 - 14485717
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14485649 tccagggccgaagccctc-ccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14485717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11171026 - 11170983
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11171026 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 11170983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 323 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16999936 - 16999889
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16999936 aactgggcaactcgcctcgcgagcacacctgctcgctatggcgagttc 16999889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Original strand, 20895316 - 20895355
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20895316 agctcgcctcgcgagcacaactgctcgctatggcgagttc 20895355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 18212297 - 18212343
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18212297 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18212343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 370
Target Start/End: Original strand, 23122008 - 23122054
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23122008 actgggcaactcgcctcgcgagcacatatgctcgcgatggcgagttc 23122054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 26077728 - 26077682
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26077728 ttttatgcttatgtaattgacccacttgtgtatatctacatacaact 26077682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 366
Target Start/End: Original strand, 37881811 - 37881853
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37881811 actgggcagctcgcctcgcaagcacatctgctcgctatggcga 37881853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 366
Target Start/End: Original strand, 49051362 - 49051404
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49051362 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 49051404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17000184 - 17000139
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17000184 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 17000139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 127
Target Start/End: Original strand, 30237898 - 30237958
Alignment:
Q  67 agccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30237898 agccctcaccgct-ttatatgcttatgaaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 30237958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10972917 - 10972873
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10972917 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10972873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44091140 - 44090807
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44091140 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 44091041  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44091040 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcactaattaacatacatttaaatcatcatcagtaatcatcaatccagcaatccaatcaa 44090941  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||  || | |||| |||  | | ||||||||||| ||||||||| |||    
T  44090940 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaaatacaacaacaccaaccactactaatcatgcaagca-agtcaacactcagaaactgtgcaactc 44090842  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44090841 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 44090807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 27729589 - 27729922
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27729589 gctgttgagcaactagtactctagggccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttatgtatatctacatacaactgaccatgca 27729688  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27729689 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcttcatcagtgttcatcaatccagcaatccaatcaa 27729788  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||| |||||||  || ||| |||| |||| ||||||||| ||||||  || | |||| |||  | | ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  27729789 ccaaaataatgtataattatgtacaaccatgctcaaatacaacaacaccaaccactactaatcatgcaagca-agtcaacgctcagaaactgtgcaactc 27729887  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27729888 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 27729922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24426892 - 24426560
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24426892 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24426793  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24426792 atgcaactccatatgactccacttaaacaacatgtatgattcgataattagcatacatttcaatcatcatcagtaatcatcaattcagcaatccaatcaa 24426693  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||  |||||||| | | |   |||||| ||  ||  |||||||||  |  || | |||||||||||||||||||||||||    
T  24426692 ccaaaataatgcataattacatgaaactatgctc-acatttcaacattaattcactaccattcatgtatgaa-attcaacactcaggaactgtgcagctc 24426595  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24426594 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 24426560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 4077501 - 4077834
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4077501 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 4077600  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || | |||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4077601 atgcaactccatgtgactccactataataatacgtatgagtcaataaataacatacatttcaaccatcatcagtattcatcaatccaacaatccaatcaa 4077700  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||  || | |||| |||  | | ||||||||||| ||||||||| |||    
T  4077701 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaaatacaacaacaccaaccactactaatcatgcaagca-agtcaacactcagaaactgtgcaactc 4077799  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4077800 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 4077834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 27037325 - 27037658
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27037325 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27037424  T
Q  137 atgcaa-ctccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27037425 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataaataacatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaatccagcaatccaatca 27037524  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
     || ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  27037525 tcccaaataatgcataattacatataaccatgctcaaaaactacaacatcaaacactaccatccataca--aacaaacagcactcaggaactgtgcaact 27037622  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27037623 cgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttc 27037658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 58 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 71544 - 71232
Alignment:
Q  58 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71544 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 71445  T
Q  158 cttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaa 257  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |    
T  71444 cttaaacaacatgtatgattcactactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaaccacaataatgcataattaca 71345  T
Q  258 tataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctc 356  Q
    |  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  ||||||||| | || | |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  71344 tgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattcatgc-acgaaaatcaacattcaggaactgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctc 71246  T
Q  357 gccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||    
T  71245 gccatggcgagttc 71232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2385973 - 2385641
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2385973 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2385874  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| |    
T  2385873 atgcaactccatatgactccacttaaacaacatgtatgattcga-aattagcatacatttcaatcatcatcaataatcattaattcagcaatccaatcca 2385775  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
     ||||| |||||||||||| ||  |||||||  ||| |   ||||| | || ||  ||||||||| | || | | |||||||||||||||||  ||||||    
T  2385774 tcaaaataatgcataattacatgaaactatgatcaacatttcaacattaaatcactaccattcatgc-acgaaattcaacactcaggaactgctcagctc 2385676  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2385675 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 2385641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 31828693 - 31829026
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31828693 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 31828792  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||||| || |||||| | | | ||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||    
T  31828793 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatca-accatcatcagtattcggtaatgcagcactccaatca 31828891  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||  |||  |   |||||| |||||||||| |||||||    
T  31828892 accaaaacaatgcatgattatatatacccatgctcaaaacaacaacatcaaccattattattcaagcaagcaatttcaacaatcaggaactgagcagctc 31828991  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31828992 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 31829026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 31834045 - 31834378
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31834045 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 31834144  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||||| || |||||| | | | ||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||    
T  31834145 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatca-accatcatcagtattcggtaatgcagcactccaatca 31834243  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||  |||  |   |||||| |||||||||| |||||||    
T  31834244 accaaaacaatgcatgattatatatacccatgctcaaaacaacaacatcaaccattattattcaagcaagcaatttcaacaatcaggaactgagcagctc 31834343  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31834344 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 31834378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36984617 - 36984285
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36984617 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 36984518  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||||| || |||||| | | | ||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||    
T  36984517 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatca-accatcatcagtattcggtaatgcagcactccaatca 36984419  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |  |||||  |||  |   |||||| ||||| || | | |||||    
T  36984418 accaaaacaatgcatgattatatatacccatgctc-aaacaacaacatcaaccattattattcaagcaagcaatttcaacaatcagggacagagtagctc 36984320  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36984319 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 36984285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4071596 - 4071260
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4071596 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 4071497  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa-catacatt---tacatcatcatcagtattcatcaa-tccagcaatcc 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |   | ||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |    
T  4071496 aatgcaactccaagtgactccacttaaataacatgtatgatt-aataattaaacatacaatgcattcatcatcatcaatcatcatcaaatccagcaattc 4071398  T
Q  231 aatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatca-accatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgt 328  Q
    |||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||    |  |||| |||| | || | |||||||  ||||||||||     
T  4071397 aatcaatc-aaataatgcataatt--atataactatgctcaaatccaacaacatcagggtactaccactcatgc-acgaaaatcaactttcaggaactga 4071302  T
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4071301 gtagctcgcctcgcgagcacgtctgctcgccatggcgagttc 4071260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 30196566 - 30196232
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30196566 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30196467  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa-catacatttacatcatcatcagtatt--catcaatccagcaatccaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||   |||   |||||| | |  || ||| |||||||| | |    
T  30196466 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatggtttaataaataatcatacat---catagccatcagcaataacaacaa-ccagcaattc-a 30196372  T
Q  233 tcaa-ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatc-aaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtg 329  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||  || | ||||||||  | | | | |||||||||||||||    
T  30196371 tcaatccataacaatgcacaattaaatataactatgctcaaatccaacaacctcaaaccactactaatcatacaagca-agttagcactcaggaactgtg 30196273  T
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30196272 caactcgcctcgcgagctcatctgctcgccatggcgagttc 30196232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 1067177 - 1067510
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1067177 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1067276  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa-catacatttacatcatcatcagtatt--catcaatccagcaatccaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||   |||   |||||| | |  || ||| |||||||| | |    
T  1067277 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatggtttaataaataatcatacat---catagccatcagcaataacaacaa-ccagcaattc-a 1067371  T
Q  233 tcaa-ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgc 330  Q
    |||| ||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||||  ||||||  |||||||  || | |||||||   | | | | ||||||||||||||||    
T  1067372 tcaatccataataatgcacaattaaataaaactatgctcaaatccaacaatctcaaccactacaaatcatacaggca-agttagcactcaggaactgtgc 1067470  T
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1067471 aactcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 1067510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 28292800 - 28293135
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28292800 gctgttgagcaactagtactccaggacaaaagacatcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccttgc 28292899  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa-catacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatc 234  Q
    |    |||||||| |||||||||||  |||||||||||| || |||||  || |||||||    | |||||  |  ||||| |||| |||||||||||||    
T  28292900 atacaaactccatatgactccacttttacaacatgtatgtttaaataacaaatcatacatcacaaccatcagtaacattcaacaattcagcaatccaatc 28292999  T
Q  235 aaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagc 333  Q
    | ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||| | || ||  ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28293000 acccagaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaatcactaccattcatgc-acaaaattcaacactcaggaactgtgcagc 28293098  T
Q  334 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28293099 tcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 28293135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 20850270 - 20850420
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20850270 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 20850369  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20850370 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatgatt-aataattaa 20850420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 21604845 - 21604995
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21604845 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21604944  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21604945 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgatt-aataattaa 21604995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24481651 - 24481504
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24481651 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24481552  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  24481551 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatggtttaataa 24481504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 1061794 - 1062127
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1061794 gctgttgagcaactactactccaggaccgaagccctcatcgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1061893  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa-catacatttacatcatcatcagtatt--catcaatccagcaatccaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||   |||   |||||| | |  || ||| |||||||| | |    
T  1061894 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatggtttaataaataatcatacat---catagccatcagcaataacaacaa-ccagcaattc-a 1061988  T
Q  233 tcaa-ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgc 330  Q
    |||| ||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||||  ||| ||  |||||||  || | |||||||   | | | | ||||||||||||||||    
T  1061989 tcaatccataataatgcacaattaaataaaactatgctcaaatccaataatctcaaccactacaaatcatacaggca-agttagcactcaggaactgtgc 1062087  T
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1062088 aactcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 1062127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11360291 - 11359962
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11360291 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttat----atgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaactgaccatgca 11360196  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa-catacatttacatcatcatcagtatt--catcaatccagcaatccaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||   |||   |||||| | |  || ||| |||||||| | |    
T  11360195 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatggtttaataaataatcatacat---catagccatcagcaataacaacaa-ccagcaattc-a 11360101  T
Q  233 tcaa-ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgc 330  Q
    |||| ||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||  || | ||||||||  | | | | ||||||||||||||||    
T  11360100 tcaatccataataatgcacaattaaatataactatgctcaaatccaacaacctaaaccactactaatcatacaagca-agttagcactcaggaactgtgc 11360002  T
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11360001 aactcgcctcgcgagcgcatctgctcgccatggcgagttc 11359962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 34131 - 34272
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34131 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 34230  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34231 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 34272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35244086 - 35243948
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35244086 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 35243987  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    |    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35243986 atacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 35243948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22013164 - 22013048
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22013164 gctgttgagcaactaatactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggaactacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22013065  T
Q  137 atgc-aactccatgtga 152  Q
    |||| ||||||||||||    
T  22013064 atgcaaactccatgtga 22013048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 11466152 - 11466485
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11466152 gctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 11466250  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaa 232  Q
     || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||  |||||||||   |||||| ||| | ||| ||| |||  ||||||     
T  11466251 -atacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatggtt-aatagataaagcatacatttcagtcatcaacagcaatcaacaa-ccaataatccag 11466347  T
Q  233 tcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgca 331  Q
      | ||| || |||||||||| |  ||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||  |||||||||   ||   | ||| ||||||  |||||||||    
T  11466348 caatccagaataatgcataatcatttataaatatgctcgaaaacaacaacaccaagcactaccattcat-gtacgcaattcagcactcaaaaactgtgca 11466446  T
Q  332 gctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11466447 gctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 11466485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 185
Target Start/End: Original strand, 27272376 - 27272480
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27272376 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaacaacatatatgattca 27272474  T
Q  180 ataatt 185  Q
    ||||||    
T  27272475 ataatt 27272480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 370
Target Start/End: Original strand, 14563956 - 14564241
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaa 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14563956 tttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatacat----actccatatgactccacttatacaacatgtatggttcaa 14564051  T
Q  181 taattaa--catacatttacatc-atcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaa 277  Q
    ||| |||  |||||||  ||| | |||| ||  || || ||| | ||||||||||  | | | || |||||| |||| |||| |||||||| | ||||||    
T  14564052 taaataaatcatacatc-acagccatcagcaacat-caacaagc-agcaatccaacaatctagaataatgcacaatttaatacaactatgctctaaacaa 14564148  T
Q  278 caacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| |||  |   ||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14564149 caacatcaatcactaccattcatgcaagcaatttcagcactcaaaaactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 14564241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17592547 - 17592258
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtat-gattc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||| || ||||||||||| | |||    
T  17592547 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccac-tatacaacatgtatggtttc 17592450  T
Q  179 aataattaa--catacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaac 275  Q
    |||||||||  |||||| | |||  ||||| ||  | ||| |||  ||||| |||||  | ||| || |||||| |||| |||| |||| ||| ||||||    
T  17592449 aataattaaatcataca-tcacagccatcagcaaca-tcaacaa-acagcagtccaacaatccagaataatgcacaatttaatacaactctgctcaaaac 17592353  T
Q  276 aacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||| |||  |   ||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17592352 aacaacatcaatcactaccattcatgcaagcaatctcagcactcaaaaactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 17592258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15643304 - 15643015
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaa-ctccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  || ||| |||||||| || | ||||||||||||||||    
T  15643304 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca-tacattcttcatatgactccaatttatacaacatgtatgattc 15643206  T
Q  179 aataattaa--catacatttacatc-atcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaac 275  Q
    ||||| ||   |||||||| ||| | |||| || ||| | |||| | ||  ||||||  | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  15643205 aataaatatagcatacatt-acagccatcagcaatat-cttcaaac-agtgatccaacaatccagaacaatgcacaattaaacataactatgctcaaaac 15643109  T
Q  276 aacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    | ||||||||| ||  |||||||||| ||  ||||||| ||| ||  ||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15643108 atcaacatcaatcactaccattcatataaatacaatcagcacacaa-aactaggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 15643015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24481378 - 24481317
Alignment:
Q  309 aatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24481378 aatcaacactcaggaactgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 24481317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22013050 - 22012968
Alignment:
Q  173 tgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataatta 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22013050 tgattcaataattagcatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaattcagcaatccaatcatccaaaataatgcataatta 22012968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13101188 - 13101085
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  13101188 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc-atacattctccatatgactccaacttatacaacatgtatggttc 13101090  T
Q  179 aataa 183  Q
    |||||    
T  13101089 aataa 13101085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 36800680 - 36800735
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36800680 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 36800735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 45028632 - 45028687
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45028632 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 45028687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 21605140 - 21605180
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21605140 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 21605180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25590216 - 25590161
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25590216 tttatgcatatgaaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 25590161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 34426 - 34466
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34426 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 34466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27295772 - 27295729
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27295772 actgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 27295729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32911497 - 32911442
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32911497 tttatgcatatgctatgcacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 32911442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10685387 - 10685349
Alignment:
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10685387 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 10685349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 20850565 - 20850605
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20850565 cagctcgcctcgcgagcacatttgctcgccacggcgagttc 20850605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21123642 - 21123594
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21123642 tcaggtactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 21123594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Original strand, 27272525 - 27272564
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27272525 agctcgccttgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 27272564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 9241492 - 9241538
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9241492 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 9241538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 22810042 - 22810088
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22810042 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22810088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24669594 - 24669548
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggc 364  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24669594 tcaggtactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggc 24669548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25365677 - 25365644
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25365677 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 25365644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 367
Target Start/End: Original strand, 12572717 - 12572761
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  12572717 aactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 12572761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 367
Target Start/End: Original strand, 12579199 - 12579243
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  12579199 aactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 12579243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 78)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16887348 - 16887014
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16887348 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 16887249  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacat-ttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16887248 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatctaaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 16887149  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||  || | |||| |||  | | ||||||||||| ||||||||| ||    
T  16887148 accaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaaatacaacaacaccaaccactactaatcatgcaagca-agtcaacactcagaaactgtgcaact 16887050  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16887049 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 16887014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14736871 - 14736537
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14736871 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctattttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14736772  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactt-aaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  14736771 atgcaactccatgtgactccacttaaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcaatattcatcaatccagcaattcaaaca 14736672  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatc-aaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
    ||||| | |||||||||||| ||  |||||||| ||| ||| ||||||| |||||  || | |||| |||  | | ||||||||||||| ||||||| ||    
T  14736671 accaacataatgcataattacatgaaactatgctcaacacatcaacatcaaaccactactaatcatgcaagca-agtcaacactcaggagctgtgcaact 14736573  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14736572 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 14736537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23224797 - 23224464
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23224797 gctgttgagcaactagtactccaggaacgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 23224698  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||    
T  23224697 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacatttcaatcatcatcagtaattatcaactcagcaatccaatcaa 23224598  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||| ||| ||||| | || ||  ||||||||  | || | | || |||||||||||||||| | |||    
T  23224597 ccaaaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacatcaacattaaatcactaccattcaggc-acgaaattccacactcaggaactgtgaaactc 23224499  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23224498 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 23224464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9205400 - 9205067
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9205400 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 9205301  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  9205300 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 9205201  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | |||||| |||||||||| | |||||    
T  9205200 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacattcaggaactgagtagctc 9205102  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9205101 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 9205067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 35541129 - 35541462
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35541129 gctgttgagcaactcgtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 35541228  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||  |||||||||  | |||||||||||  ||| ||||||| | | |||||||    
T  35541229 atgcaactcaatatgactcccctttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaaccattaatccagtagttcaatcaa 35541328  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||  || |||||  | |  | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  35541329 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaacatcaaccactactattcaagctagca-aaacaacattcaggaactgtgcagctc 35541427  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35541428 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 35541462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3224733 - 3224400
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3224733 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 3224634  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3224633 atgcaaactccatgtgacaccacttgaacaacatgtatgattcaataaatagcatacatttcagtcatcaacagtaatcatcaatccagcaatccaatca 3224534  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
     || ||| ||| |||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||  || || ||||||||||||| |||||| ||    
T  3224533 tcccaaataatacataattacatataaccatgctcaaaaactacaacatcaaacactaccatccataca--aaaaaacaacactcaggaaatgtgcaact 3224436  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3224435 cgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttc 3224400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 28980805 - 28981140
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28980805 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28980904  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa--acaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  28980905 atgcaactccatgtgactccaattaaatacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtactcatcaattcagcaatcaaatc 28981004  T
Q  235 aaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagc 333  Q
    || || || |||| ||||||| |   ||| || | |||| ||||||||| ||||||  || | |||  | |  | || | |||||| ||||||| |||||    
T  28981005 aatcacaataatgtataattatacgcaaccatactcaaatacaacaacaccaaccactactaatcaagctagca-aaactacactctggaactgggcagc 28981103  T
Q  334 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28981104 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccgtggcgagttc 28981140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 28986025 - 28986360
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986025 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28986124  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa--acaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  28986125 atgcaactccatgtgactccaattaaatacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtactcatcaattcagcaatcaaatc 28986224  T
Q  235 aaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagc 333  Q
    || || || |||| ||||||| |   ||| || | |||| ||||||||| ||||||  || | | |  | |  | || | |||||| ||||||| |||||    
T  28986225 aatcacaataatgtataattatacgcaaccatactcaaatacaacaacaccaaccactactaattaagctagca-aaactacactctggaactgggcagc 28986323  T
Q  334 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28986324 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccgtggcgagttc 28986360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26486070 - 26485737
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26486070 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaattgaccatgca 26485971  T
Q  137 atgcaa-ctccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26485970 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataaataacatacacttcagtcatcatcagtaatcatcaatccaacaatccaatca 26485871  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
     || ||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||  |  ||||||||| |||  | || |  ||| |   |||||  |||||    
T  26485870 tcccaaataatgcataattacatataaccatgctcaaaaacaacaacaccaagtactaccattcatgcaagga-aaactgcac-cctaaactgcacagct 26485773  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26485772 cgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 26485737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 14765668 - 14766002
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14765668 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14765767  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattcaataattaa-catacatttacatcatcatcagtatt--catcaatccagcaatccaa 232  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||   |||  ||||||| | |  || ||| |||||||| | |    
T  14765768 atgcaactccatgtgactccaatttatacaacatgtatggtttaataaataatcatacat---catagtcatcagcaataacaacaa-ccagcaattc-a 14765862  T
Q  233 tcaa-ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatc-aaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtg 329  Q
    |||| ||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||||| || |||||  || | ||||||||  | | | | |||||||||| ||||    
T  14765863 tcaatccataataatgcacaattaaatgtaactatgctcaaatccaacaacctcaaaccactactaatcatacaagca-agttagcactcaggaattgtg 14765961  T
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14765962 caactcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 14766002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27909634 - 27909484
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27909634 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27909535  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27909534 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatga-tcaataattaa 27909484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27956053 - 27955903
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27956053 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27955954  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27955953 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatga-tcaataattaa 27955903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36800492 - 36800342
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36800492 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 36800393  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36800392 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgatt-aataattaa 36800342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 214023 - 214173
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214023 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 214122  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  214123 aatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatgatt-aataattaa 214173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 238231 - 238081
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238231 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 238132  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  238131 aatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatgatt-aataattaa 238081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 727646 - 727796
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  727646 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 727745  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  727746 aatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatgatt-aataattaa 727796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 800147 - 800297
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  800147 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 800246  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  800247 aatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatgatt-aataattaa 800297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 851540 - 851690
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851540 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 851639  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  851640 aatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatgatt-aataattaa 851690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10956735 - 10956401
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |   || |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956735 gctgttgagcaactagtactccagggcatgagtcctctccgttgttttatgcatatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 10956636  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt--aacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatc--cagcaatccaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||   || ||| ||  | ||| |||||  |||  || |||    
T  10956635 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt-aatagttaaaacatacatttcattcctcaacatcaatcaacaatcaacagagattcaa 10956537  T
Q  233 tcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgca 331  Q
     || ||| ||  ||||| |||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||  | ||| || |||||||||||||||||    
T  10956536 ccatccagaaatatgcacaattaaatataattatg-cttaaacaacaacactcaatcattaccattcatgca--agcaaacagcactcaggaactgtgca 10956440  T
Q  332 gctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10956439 actcgcctcgcgagcacaactactcgccatggcgagttc 10956401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4520784 - 4520643
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4520784 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 4520685  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4520684 aatgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgat 4520643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 14563622 - 14563741
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14563622 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14563721  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14563722 atgcaactccatgtgactcc 14563741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 82 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10948608 - 10948319
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaat 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10948608 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt-aat 10948510  T
Q  182 aatt--aacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatc--cagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaa 277  Q
    | ||  |||||||||||   || ||| ||  | ||| |||||  |||  || ||| || ||| ||  ||||| |||||||||||| |||| |  ||||||    
T  10948509 agttaaaacatacatttcattcctcaacatcaatcaacaatcaacagagattcaaccatccagaaatatgcacaattaaatataattatg-cttaaacaa 10948411  T
Q  278 caaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10948410 caacactcaatcattaccattcatgca--agcaaacagcactcaggaactgtgcaactcgcctcgcgagcacaactactcgccatggcgagttc 10948319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 23117290 - 23117431
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117290 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 23117389  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117390 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 23117431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 3697724 - 3697865
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3697724 gctgttgagcaactagtactccagtacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 3697823  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3697824 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 3697865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14746570 - 14746428
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746570 gctgttgagcaactagtgctccaggacttgagtcctctccgctgtttttatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 14746471  T
Q  136 aatgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746470 aatgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 14746428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Original strand, 27345797 - 27345942
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27345797 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27345895  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataa 183  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27345896 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataa 27345942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Original strand, 6588151 - 6588296
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6588151 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 6588249  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataa 183  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6588250 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatctatgattcaataa 6588296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40144344 - 40144208
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40144344 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 40144246  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40144245 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 40144208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16266920 - 16266784
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgt--atatctacatacaactgaccatg 134  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16266920 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatatctacatacaactgaccatg 16266822  T
Q  135 caatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgta 172  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16266821 catacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgta 16266784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11392612 - 11392323
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11392612 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttatacaacatgtatggttca 11392514  T
Q  180 ataattaa--catacatttacatcatcatcagtattcatcaa--tccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaac 275  Q
    |||| |||  |||||| | ||| |  |||||| |  ||||||    ||||| |||||  | ||| || |||||| |||| |||| |||||||| ||||||    
T  11392513 ataaataaatcataca-tcacagc--catcagca-acatcaacgagcagcattccaacaatccagaataatgcacaatttaatacaactatgctcaaaac 11392418  T
Q  276 aacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||| | ||  ||||||||| |||  |   ||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11392417 aacaacatctatcactaccattcatgcaagcaatttcagcactcaaaaactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 11392323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 185
Target Start/End: Original strand, 27873842 - 27873981
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  27873842 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 27873939  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt 185  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27873940 tccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataatt 27873981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 185
Target Start/End: Original strand, 27948630 - 27948769
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  27948630 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 27948727  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt 185  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27948728 tccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataatt 27948769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 185
Target Start/End: Original strand, 27889972 - 27890111
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatac-aactgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || || ||    
T  27889972 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaaattgaccatgc-atacatac 27890069  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt 185  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27890070 tccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataatt 27890111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 808008 - 807939
Alignment:
Q  117 tacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  808008 tacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatgatt-aataattaa 807939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25701610 - 25701472
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-a 142  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |    
T  25701610 gcaactagtgctccaggacatgagtcctttccgctgttt-atgcttatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgatcatgca-tacata 25701513  T
Q  143 ctccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataa 183  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  25701512 ctccatatgactccacttatacaacatgtatggttaaataa 25701472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 367
Target Start/End: Original strand, 29328284 - 29328605
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |    
T  29328284 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc-atacattc 29328381  T
Q  144 tccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattcaataattaa--catacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaacca 239  Q
    ||||| ||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||  |||||| | ||| |||||| ||  | |||||||   ||  ||||||  | |||    
T  29328382 tccatatgactccaatttatacaacatgtatggttcaataaataaatcataca-tcacagtcatcagcaaca-tcatcaa-atagagatccaacaatcca 29328478  T
Q  240 aaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcct 339  Q
     || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||| | || |||||||||| ||  || | | |  | | |||||||    
T  29328479 gaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaacaacaacaacaatcatcaccatttacacgacaacaatcagcatgca-gcatttaggaactcgcct 29328577  T
Q  340 cgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29328578 cgcgagcacatctgctcgctatggcgag 29328605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14416615 - 14416477
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |    
T  14416615 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc-atacattc 14416518  T
Q  144 tccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  14416517 tccatatgactccaaattatacaacatgtatggttcaataa 14416477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29299085 - 29298983
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattca 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  | ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  29299085 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacattttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattca 29298987  T
Q  180 ataa 183  Q
    ||||    
T  29298986 ataa 29298983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29305631 - 29305529
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattca 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  | ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  29305631 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacattttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattca 29305533  T
Q  180 ataa 183  Q
    ||||    
T  29305532 ataa 29305529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 370
Target Start/End: Original strand, 19296808 - 19296932
Alignment:
Q  245 atgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcg 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||| || ||||| ||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  19296808 atgcacaattaaatataactatgcttaaaacaacaacactcaatcactaccattcatgcaagaa-aatcagcacacaa-aactgggtagctcgcctcgcg 19296905  T
Q  344 agcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19296906 agcacatctgctcgctatggcgagttc 19296932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 370
Target Start/End: Original strand, 43687677 - 43687801
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcg 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||  | ||||| ||| ||  || || | |||||||||||||    
T  43687677 aatgcacaattaaatataactatgctcaaa-caacaacatcaatcactaccattcatataagtaaaatcagcacacaa-aattgggtagctcgcctcgcg 43687774  T
Q  344 agcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  43687775 agcacatctgctcgctatggcgagttc 43687801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 185
Target Start/End: Original strand, 27902275 - 27902350
Alignment:
Q  111 tatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27902275 tatatctacatacaacttgaccatgca-tacatactccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataatt 27902350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Original strand, 214320 - 214359
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214320 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 214359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 237934 - 237895
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  237934 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 237895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Original strand, 727943 - 727982
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  727943 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 727982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Original strand, 800444 - 800483
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  800444 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 800483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 807792 - 807753
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  807792 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 807753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Original strand, 851837 - 851876
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851837 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 851876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 185
Target Start/End: Original strand, 19296705 - 19296748
Alignment:
Q  142 actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19296705 actccatatgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt 19296748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27909349 - 27909310
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27909349 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 27909310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27955768 - 27955729
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27955768 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 27955729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14416416 - 14416292
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||  |||||||||  |   | | ||| |||| |  ||||| | |||||||||||||    
T  14416416 aatgcataattaaatataactatgctcaaa-caacaacaccaagcactaccattcatgtacgta-attcagcactaaaaaactgggtagctcgcctcgcg 14416319  T
Q  344 agcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14416318 agcacatctgctcgctatggcgagttc 14416292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 6588442 - 6588482
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6588442 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 6588482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 12303566 - 12303606
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12303566 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 12303606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14746275 - 14746235
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14746275 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 14746235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 23117573 - 23117613
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23117573 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 23117613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Original strand, 22056126 - 22056169
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22056126 actgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 22056169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25701440 - 25701331
Alignment:
Q  261 aactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcca 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||  ||||  | | ||| ||||||  ||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  25701440 aactatgcacaaaacaacaacatcactcactaccattcgcacaatcaaattcagcactcaaaaactgggtagctcgcctcgtgagctcatctgctcgcta 25701341  T
Q  361 tggcgagttc 370  Q
    ||||||||||    
T  25701340 tggcgagttc 25701331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16266625 - 16266585
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16266625 cagctcacctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 16266585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 27346087 - 27346127
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27346087 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgtgttc 27346127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 367
Target Start/End: Original strand, 27890170 - 27890293
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgc 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||| |  ||||||||||||| ||  || | | |  | | ||||||| ||    
T  27890170 aatgcacaattaaatataactatgctcaaaacaacaacaacaattcatcaccatacgcacaacaacaatcagcatgca-gcatttaggaactcgccttgc 27890268  T
Q  343 gagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  27890269 gagcacatctgctcgctatggcgag 27890293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 367
Target Start/End: Original strand, 27902409 - 27902532
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgc 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||| |  ||||||||||||| ||  || | | |  | | ||||||| ||    
T  27902409 aatgcacaattaaatataactatgctcaaaacaacaacaacaattcatcaccatacgcacaacaacaatcagcatgca-gcatttaggaactcgccttgc 27902507  T
Q  343 gagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  27902508 gagcacatctgctcgctatggcgag 27902532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 367
Target Start/End: Original strand, 27948828 - 27948951
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgc 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||| |  ||||||||||||| ||  || | | |  | | ||||||| ||    
T  27948828 aatgcacaattaaatataactatgctcaaaacaacaacaacaattcatcaccatacgcacaacaacaatcagcatgca-gcatttaggaactcgccttgc 27948926  T
Q  343 gagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  27948927 gagcacatctgctcgctatggcgag 27948951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40144051 - 40144011
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40144051 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcactatggcgagttc 40144011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4520486 - 4520447
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4520486 agctcgcctcgcgagcacatcagctcgccatggtgagttc 4520447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Original strand, 22050608 - 22050651
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22050608 actgggcagctcgcctcgtgagcacatctgctcgctatggcgag 22050651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 323 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31412274 - 31412231
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31412274 aactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 31412231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 323 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31418456 - 31418413
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31418456 aactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 31418413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22063604 - 22063558
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22063604 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22063558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22176076 - 22176030
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22176076 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22176030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 282
Target Start/End: Original strand, 27896503 - 27896541
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27896503 aatgcacaattaaatataactatgctcaaaacaacaaca 27896541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29305470 - 29305345
Alignment:
Q  241 aacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctc 340  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| || ||||| ||| ||  |||||||||| ||  | ||||| ||| ||  ||  | | ||||||||||    
T  29305470 aacaatgcacaattaaacataactatgctcaaagcaccaacaccaatcactaccattcatagaaataaaatcagcacacaaaaatag-gtagctcgcctc 29305372  T
Q  341 gcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29305371 gcgagcacatcttctcgctatggcgag 29305345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 127
Target Start/End: Original strand, 39363631 - 39363692
Alignment:
Q  66 aagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39363631 aagccctcac-gcttttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 39363692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 20006386 - 20006439
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20006386 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaacttacaatgca 20006439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8729051 - 8728980
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8729051 tccaggaccgaagtcctcatcgtt-ttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 8728980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 331 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9272944 - 9272908
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9272944 agctcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgag 9272908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20011885 - 20011837
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  20011885 tcaggaactgggcaactcgcctcccgagcacatctgcttgctatggcga 20011837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 367
Target Start/End: Original strand, 36799781 - 36799825
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  36799781 aactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 36799825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12307 - 11973
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12307 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 12208  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12207 atgcaactctatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacaattcaaccatcatcagtattcatcaacccagcaatccaatcaa 12108  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgccc-aaaacaacaacatc-aaccatgaccattcatacaacaacaa-tcaacactcaggaactgtgcagc 333  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||  |  |||||  ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12107 ccaaaacaatgcatagttatatataaccatgcccaaaaacaacaacatcaaaccactattattcaagca--aacaattcaacactcagaaactgtgcagc 12010  T
Q  334 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12009 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 11973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 82)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 30602953 - 30602619
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30602953 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30602854  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30602853 atgcaactctatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtattcattaatgcagcaatccaatcaa 30602754  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatc-aaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| |||||  |  |||||  |||  | | ||||||||||||||||||||||||    
T  30602753 ccaaaacaatgcataattatatataaccatgctaaaaaacaacaacatcaaaccactattattcaagcaagca-attcaacactcaggaactgtgcagct 30602655  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30602654 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 30602619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18437258 - 18436925
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18437258 gctgttgagcaactagtactccaggactgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 18437159  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  18437158 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaatccagtaattcaatcaa 18437059  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||  || |||||  | |  | || ||||||||||||||||||||||||    
T  18437058 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaacatcaaccactactattcaagctagca-aaacaacactcaggaactgtgcagctc 18436960  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18436959 gcctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttc 18436925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 33404733 - 33405066
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33404733 gctgttgagcaactagtactctaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 33404832  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  33404833 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaatccagtaattcaatcaa 33404932  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||  || |||||  | |  | || ||||||||||||||||||||||||    
T  33404933 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaacatcaaccactactattcaagctagca-aaacaacactcaggaactgtgcagctc 33405031  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33405032 gcctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttc 33405066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11899401 - 11899068
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11899401 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11899302  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga-ttcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  11899301 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgatttcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaatccagtaattcaatca 11899202  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |  || |||||  |   | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11899201 accaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaacatcaacaactactattcaagc--tagcaaacaacactcaggaactgtgcagct 11899104  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11899103 cgcctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttc 11899068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8197291 - 8196958
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8197291 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 8197192  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  8197191 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtactcatcaattcagcaatcaaatcaa 8197092  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  ||||||||| | || | |||||||| |||||||||| | |||||    
T  8197091 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattcatgc-acgaaaatcaacattcaggaactgagtagctc 8196993  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8196992 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 8196958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 1317846 - 1318179
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1317846 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1317945  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  1317946 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 1318045  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | |||||||| |||||||||| | |||||    
T  1318046 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaaatcaacattcaggaactgagtagctc 1318144  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1318145 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 1318179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 11879147 - 11879480
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11879147 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttcatgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatacaactgaccatgca 11879246  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||  |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11879247 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattatataagtaacatacatttcaaccatcatcagtattcatcaatccaacaatccaatcaa 11879346  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| ||||  |||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||  || |||||| |||  | | ||||||||||| ||||||||| |||    
T  11879347 ccaaaataatgtgtaattatatacaaccatgctcaaatacaacaacaccaaccactactattcatgcaagca-agtcaacactcagaaactgtgcaactc 11879445  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11879446 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 11879480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17726424 - 17726098
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17726424 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17726325  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||    
T  17726324 atgcaactccatatgattccactttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaattcagtaattcaatcaa 17726225  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcg 336  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||     |||| ||||||  || | |||  |   | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17726224 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaa-----aacaacaaccactactactcaagc--tagcaaacaacactcaggaactgtgcagctcg 17726132  T
Q  337 cctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17726131 cctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttc 17726098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26090042 - 26089709
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090042 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26089943  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  26089942 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 26089843  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | |||||| |||||||||| | |||||    
T  26089842 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacattcaggaactgagtagctc 26089744  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26089743 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 26089709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26120460 - 26120127
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26120460 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtggatatctacatacaactgaccatgca 26120361  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| || ||||| |||||||| | ||| |||    
T  26120360 atgcaacaacatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattca-accatcatcaataatcatcgatccagcagttcaaacaa 26120262  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacat-caaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  || |||||  | |  | || | |||||||||||||||||||||    
T  26120261 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacatacaaccaccactattcaagctagca-aaaccacactcaggaactgtgcagct 26120163  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120162 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 26120127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 37285289 - 37285621
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37285289 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37285388  T
Q  137 atgcaa-ctccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37285389 atgcaaacttcatgtgacaccacttaaacaacatgtgtgattcaataaataacatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaatccagcaatccaatca 37285488  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
     || ||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  37285489 tcccaaataatgcataattacatataaccatgctaaaaactacaacatcaaacactaccatccataca--aacaaacagcactcaggaactgtgcaactc 37285586  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  37285587 gcctcgcgagcacatctactcgctatgtcgagttc 37285621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 11339851 - 11340184
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11339851 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11339950  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||  |||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||| | | |||||||    
T  11339951 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagttcaatcaa 11340050  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| ||  || |||||    |  | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  11340051 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaacatcaaacactactattcaagttagca-aaacaacattcaggaactgtgcagctc 11340149  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11340150 gcctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttc 11340184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 48988012 - 48987679
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48988012 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 48987913  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  48987912 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 48987813  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | |||||| |||||||||| | |||||    
T  48987812 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacattcaggaactgagtagctc 48987714  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48987713 gcctcgcgagcacatctactcgccatggcgagttc 48987679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 2438964 - 2439297
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2438964 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaactgaccatgca 2439063  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaa-catgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    |||||||||  | ||||||||||| || ||  |||||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  2439064 atgcaactcattatgactccactttaataattatgtatgattcaatgattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaatccagtaaatcaatca 2439163  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
    ||||||  |||||||||||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||  || |||||  |   | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2439164 accaaagtaatgcataattatatgtaaccatgctcaaaaacaacaacatcaaccactactattcaagc--tagcaaacaacactcaggaactgtgcagct 2439261  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2439262 cgcctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttc 2439297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26113847 - 26113514
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113847 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26113748  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| || ||||| |||||||| | ||| |||    
T  26113747 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattca-accatcatcaataatcatcgatccagcagttcaaacaa 26113649  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  || ||| |  | |  | || | ||||||||||||| |||||||    
T  26113648 ccaatataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacattcaaccaccactattaaagctagca-aaaccacactcaggaactatgcagct 26113550  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113549 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 26113514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 749923 - 750256
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  749923 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 750022  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  750023 atgcaactccatgtgactcaactttaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 750122  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | |||||| |||||||||| | |||||    
T  750123 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacattcaggaactgagtagctc 750221  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  750222 gcctcgcgagcacatctactcgccatggcgagttc 750256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40684854 - 40684521
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40684854 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 40684755  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||    
T  40684754 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaacacaa 40684655  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | |||||| |||||||||| | |||||    
T  40684654 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacattcaggaactgagtagctc 40684556  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40684555 gcctcgcgagcacatctgctcaccatggcgagttc 40684521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5187335 - 5187001
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5187335 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgcgtatatctacatacaactgaccatgc 5187236  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| || ||    
T  5187235 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaaca 5187136  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
    |||| || |||||||||| | ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | ||||||  ||||||||| | ||||    
T  5187135 accacaataatgcataatcacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacatacaggaactgagtagct 5187037  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5187036 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 5187001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 370
Target Start/End: Original strand, 642632 - 642962
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  642632 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaaatgaccatgcaat 642731  T
Q  139 gcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaacc 238  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | |  |||||||||| || | ||||||| | | |||||||||    
T  642732 gcaactcaatatgactccactttaacaatatgtatgattcaacaattgacatacattca-actatcatcagtaatcgttaatccagtagttcaatcaacc 642830  T
Q  239 aaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgc 337  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||  || |||||  | |  | || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  642831 aaaataatgcataattatatataaccatgctaaaaaacaacaacatcaaccactactattcaagctagca-aaacaacattcaggaactgtgcagctcgc 642929  T
Q  338 ctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  642930 ttcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttc 642962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 32627477 - 32627816
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32627477 gctgttgagcaactagtactccagaaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 32627576  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||    
T  32627577 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattca-accatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 32627675  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacact------caggaactgtg 329  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  || | |||| |||  | | ||||||||      ||| ||| |||    
T  32627676 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcctaaatacaacgacatcaaccactactaatcatgcaagca-agtcaacactcagaaacagaaacagtg 32627774  T
Q  330 cagctcg-cctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32627775 caactcgccctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 32627816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 2281166 - 2281498
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281166 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctatttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 2281265  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||||| || |||||| | | | ||||||||||||||   |||   ||| ||||||||    
T  2281266 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatca-accatcatcagtattcggtaatgtggcactccaatca 2281364  T
Q  236 accaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |  |||||  |||  |   |||||| |||||||||| |||||||    
T  2281365 accaaaacaatgcatgattatatatacccatgctc-aaacaacaacatcaaccattattattcaagcaagcaatttcaacaatcaggaactgagcagctc 2281463  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281464 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 2281498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13964094 - 13963761
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964094 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 13963995  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 235  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13963994 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataaataacatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaatccaacaatccaatca 13963895  T
Q  236 acca-aaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccat-gaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcag 332  Q
     ||| ||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||  ||||||| |||| |||  || |||||| |||  | ||||| |||||   |||||  |||    
T  13963894 tccagaaataatgcacaattaagtataaccatgctcaaa--aacaacactcaatcatctactattcatgcaagca-aatcagcactc-taaactgcacag 13963799  T
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13963798 ctcgcctcgcgagcacatctgcttgctatggcgagttc 13963761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2026316 - 2025981
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2026316 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagctctcaccgttgttttatgcatatggaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2026217  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatcatcatcagtatt--catcaatccagcaatcca 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||  |||||||   |||  ||||||| | |  || ||| |||||||| |     
T  2026216 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtgtggttcaataaataaatcatacat---catagtcatcagcaataacaacaa-ccagcaattc- 2026122  T
Q  232 atcaa-ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatc-aaccatgaccattcatacaacaacaa-tcaacactcaggaactg 327  Q
    ||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||  || | |||||||  ||||| | | |||||||||||||    
T  2026121 atcaatccataataatgcacaattaaatataactatgctcaaatccaacaacctcaaaccactactaatcataca--aacaagttagcactcaggaactg 2026024  T
Q  328 tgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2026023 tgcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 2025981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 49150665 - 49151000
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49150665 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 49150764  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt-aacatacatt---tacatcatcatcagtattcatcaa-tccagcaatcc 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||| |   | ||||||||||| |   |||||| ||||||||| |    
T  49150765 aatgcaactccatgtgaccccacttaactaacatgtatgatt-aacaattaaacatacaatgcattcatcatcatcaatcagcatcaagtccagcaattc 49150863  T
Q  231 aatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacat-caaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgt 328  Q
    |||||| | ||| | |||||||||  ||||||||||||  |||  ||||||||| |    |  |||| |||| ||  |  || ||||||||||||||||     
T  49150864 aatcaatc-aaatagtgcataatt--atataactatgcttaaatccaacaacatcctgatactaccactcatgcacga--aaacaacactcaggaactga 49150958  T
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49150959 gtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 49151000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 49157355 - 49157690
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157355 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 49157454  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt-aacatacatt---tacatcatcatcagtattcatcaa-tccagcaatcc 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||| |   | ||||||||||| |   |||||| ||||||||| |    
T  49157455 aatgcaactccatgtgaccccacttaactaacatgtatgatt-aacaattaaacatacaatgcattcatcatcatcaatcagcatcaagtccagcaattc 49157553  T
Q  231 aatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacat-caaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgt 328  Q
    |||||| | ||| | |||||||||  ||||||||||||  |||  ||||||||| |    |  |||| |||| ||  |  || ||||||||||||||||     
T  49157554 aatcaatc-aaatagtgcataatt--atataactatgcttaaatccaacaacatcctgatactaccactcatgcacga--aaacaacactcaggaactga 49157648  T
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157649 gtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 49157690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40923012 - 40922867
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40923012 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 40922913  T
Q  139 gcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  40922912 gcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatggtttaataa 40922867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 42058629 - 42058780
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42058629 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 42058728  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42058729 aatgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgatt-aataattaa 42058780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11299745 - 11299626
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11299745 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11299646  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11299645 atgcaactccatgtgactcc 11299626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11308109 - 11307990
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11308109 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11308010  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11308009 atgcaactccatgtgactcc 11307990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20019763 - 20019616
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20019763 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 20019664  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataa 183  Q
    |    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20019663 atacaaactccatgtgactccacttaaaaaacatgtatgattcaataa 20019616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 49158822 - 49159156
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49158822 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 49158921  T
Q  137 atgc-aactccatgt-gactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattc-atcaatccagcaatccaat 233  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||| |  |||||||||| | || |||||| |||||||| |||    
T  49158922 atgcaaactccatataaactccactttaacaacatgtatggtt-aataataagcatacattca-gtcatcatcagcaatcaatcaattcagcaatcaaat 49159019  T
Q  234 caaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcag 332  Q
    || ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||| | || ||  ||||||||| |||  | || ||||||     ||| | | ||    
T  49159020 catccagaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaatcactaccattcatgcaagca-aaacaacacattaaaacagggtag 49159118  T
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49159119 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 49159156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 21757373 - 21757509
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21757373 gctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21757471  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21757472 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 21757509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 46174405 - 46174738
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46174405 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcccctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacatgaccatgc 46174503  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaa 232  Q
     || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||  |||||||||   |||||| ||| | ||| ||| |||  ||||||     
T  46174504 -atacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatggtt-aatagataaagcatacatttcagtcatcaacagaaatcaacaa-ccaataatccag 46174600  T
Q  233 tcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgca 331  Q
      | ||| || ||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||  |||||||||   ||   | ||| ||||||  |||||||||    
T  46174601 caatccagaataatgcataattatttataaatatgctcgaaaacaacaacaccaagcactaccattcat-gtacgcaattcagcactcaaaaactgtgca 46174699  T
Q  332 gctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46174700 gctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 46174738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13453892 - 13453756
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13453892 gctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 13453794  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
        |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13453793 tacaaacttcatgtgactccacttaaataacatgtatg 13453756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17468344 - 17468184
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17468344 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17468246  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc--acttaaacaacatgtatgattcaataatta-acatacatt 195  Q
        ||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  17468245 tacaaactccatgtgactccgaatttattcaacatgtatgatttaataaatatacatacatt 17468184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 195
Target Start/End: Original strand, 17584870 - 17585030
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17584870 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17584968  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc--acttaaacaacatgtatgattcaataatta-acatacatt 195  Q
        ||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  17584969 tacaaactccatgtgactccgaatttattcaacatgtatgatttaataaatatacatacatt 17585030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 30271831 - 30271543
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaa-ctccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattc 178  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  || ||| |||||||| || | ||||||||||||||||    
T  30271831 tttatgcatatgctgtggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca-tacattcttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattc 30271733  T
Q  179 aataatta--acatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaaca 276  Q
    ||||| ||  ||||||||| | | ||||| ||  || || ||| |||||||||||   | |||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||    
T  30271732 aataaatataacatacattca-agcatcaacaacat-caacaa-ccagcaatccagcaatccaaaataattcacaattaaatataactatgctc-aaaca 30271637  T
Q  277 acaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| ||  | ||||| ||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30271636 acaacatcaatcactaccattcatataagtaaaatcagcacacaaaaactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 30271543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 195
Target Start/End: Original strand, 37379971 - 37380131
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37379971 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37380069  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc--acttaaacaacatgtatgattcaataatta-acatacatt 195  Q
        ||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  37380070 tacaaactccatgtgactccgaatttattcaacatgtatgatttaataaatatacatacatt 37380131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 367
Target Start/End: Original strand, 23521124 - 23521410
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||||| ||||||| | ||| |||||||||||| |||    
T  23521124 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacattctccatatgactccaatttatacaacatgtatggttc 23521222  T
Q  179 aataa--ttaacatacatttacat-catcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaac 275  Q
    |||||   || |||||| |||||| ||||| ||| | |||||||  |||  ||||||  | ||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23521223 aataaatatagcataca-ttacatccatcagcagca-tcatcaa-acagtgatccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaac 23521319  T
Q  276 aacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| ||  | ||||| ||| ||  || || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23521320 aacaacatcaatcactaccattcatataagtaaaatcagcacaca-aaattgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 23521410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 8213362 - 8213299
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8213362 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgga 8213299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 2388649 - 2388551
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2388649 gctgttgagcaactagtgctccagaacatgagtcctctctgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2388551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40922741 - 40922680
Alignment:
Q  309 aatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40922741 aatcaacactcaggaactgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 40922680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 46649858 - 46649948
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46649858 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 46649948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 286
Target Start/End: Original strand, 12461640 - 12461846
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||| | ||| |||||||||||| |||    
T  12461640 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc-atacattctccatatgactccaatttatacaacatgtatggttc 12461738  T
Q  179 aataattaa--catacatttacatcatcatcagtattcatcaat--ccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaa 274  Q
    ||||| |||  |||||| ||||| |  |||||| |  |||||||  |||||||| ||   | ||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12461739 aataaataaatcataca-ttacagc--catcagca-acatcaataaccagcaattcagcaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaa 12461834  T
Q  275 caacaacatcaa 286  Q
    ||||||||||||    
T  12461835 caacaacatcaa 12461846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16843920 - 16843817
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  || ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  16843920 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacattcttcatatgactccaatttatacaacatgtatgattc 16843822  T
Q  179 aataa 183  Q
    |||||    
T  16843821 aataa 16843817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 367
Target Start/End: Original strand, 12454348 - 12454470
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcg 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| ||  | | ||| ||| ||  ||| | | |||||||||||||    
T  12454348 aatgcacaattaaatataactatgctcaaaacaacaacatcaatcgctaccattcatataagtaaagtcagcacaca-aaaccgggtagctcgcctcgcg 12454446  T
Q  344 agcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  12454447 agcacatctgctcgctatggcgag 12454470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 15838736 - 15838791
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15838736 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 15838791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 19439434 - 19439489
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19439434 tttatgcatattctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 19439489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Original strand, 42058927 - 42058966
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42058927 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 42058966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Original strand, 23518029 - 23518086
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcata 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  23518029 aatgcacaattaaatataactatgctcaaaacaacaacatcaatcactaccattcata 23518086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2388377 - 2388337
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2388377 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 2388337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13453599 - 13453559
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13453599 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 13453559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20019471 - 20019431
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20019471 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 20019431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 21757666 - 21757706
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21757666 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 21757706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 13019830 - 13019885
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13019830 tttatgcatatgttatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 13019885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23665587 - 23665549
Alignment:
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23665587 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 23665549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Original strand, 29796147 - 29796185
Alignment:
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29796147 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 29796185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Original strand, 29799966 - 29800004
Alignment:
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29799966 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 29800004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23201262 - 23201225
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23201262 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 23201225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23507389 - 23507352
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23507389 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 23507352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16073993 - 16073934
Alignment:
Q  68 gccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16073993 gccctcaccgct-ttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 16073934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Original strand, 19152250 - 19152298
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19152250 tcaggtactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 19152298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Original strand, 20751649 - 20751697
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20751649 tcaggtactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 20751697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 26289547 - 26289488
Alignment:
Q  306 aacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26289547 aacaatcaacattcaa-aactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 26289488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15722984 - 15722941
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15722984 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 15722941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Original strand, 19600254 - 19600297
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19600254 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 19600297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Original strand, 14128622 - 14128660
Alignment:
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14128622 gcagctcgcctcgcgagcatatctgctcgctatggcgag 14128660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Original strand, 14135468 - 14135506
Alignment:
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14135468 gcagctcgcctcgcgagcatatctgctcgctatggcgag 14135506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Original strand, 14432440 - 14432478
Alignment:
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14432440 gcagctcgcctcgcgagcatatctgctcgctatggcgag 14432478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 18607025 - 18607071
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18607025 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18607071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 366
Target Start/End: Original strand, 19145974 - 19146016
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19145974 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 19146016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 366
Target Start/End: Original strand, 20745373 - 20745415
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20745373 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 20745415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14281662 - 14281617
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14281662 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 14281617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Original strand, 19439685 - 19439718
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19439685 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 19439718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Original strand, 23442610 - 23442643
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23442610 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 23442643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 32771662 - 32771715
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  32771662 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaacttacaatgca 32771715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 35962754 - 35962709
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35962754 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 35962709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 806768 - 806724
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  806768 aactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 806724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14253745 - 14253705
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgc 358  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14253745 tcaggtactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgc 14253705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 15166912 - 15166983
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15166912 tccaggaccgaagtcctcatcgtt-ttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 15166983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18958191 - 18958151
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatgg 363  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18958191 aactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatgg 18958151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 366
Target Start/End: Original strand, 45185847 - 45185891
Alignment:
Q  322 gaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45185847 gaactgggcaactcgcctcgcgagctcatctgctcgctatggcga 45185891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 104367 - 104700
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104367 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 104466  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||  |||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||    
T  104467 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtaattcaatcaa 104566  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||  || |||||  | |  | || ||||||||||||||||||||||||    
T  104567 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaacatcaaccactactattcaagctagca-aaacaacactcaggaactgtgcagctc 104665  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104666 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 104700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 37 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30799507 - 30799176
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30799507 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30799408  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| || |||||||||||||||| ||||| |    
T  30799407 atgcaactccatgcgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattca-accatcatcaataatcatcaatccagcaattcaatcga 30799309  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||  || |||||  | |  | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  30799308 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaacatcaaccactactattcaagctagca-aaacaacattcaggaactgtgcagctc 30799210  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagtt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30799209 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagtt 30799176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 24369266 - 24369599
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24369266 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24369365  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||    
T  24369366 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagtccaatcaa 24369465  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||  || |||||  | |  | || || || ||||||||| ||||||||    
T  24369466 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaaacaacaacatcaaccactactattcaagctagca-aaacatcattcaggaactatgcagctc 24369564  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24369565 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 24369599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25315715 - 25315382
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25315715 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 25315616  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| || ||||| ||||||||||  || |||    
T  25315615 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattca-accatcatcaataatcatcgatccagcaattaaaacaa 25315517  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||  | |  | || | |||||||||||||||||||||    
T  25315516 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacattcaaccaccactattcaagctagca-aaaccacactcaggaactgtgcagct 25315418  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25315417 cgcctcgcgtgcacatctgctcgccatggcgagttc 25315382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26203209 - 26202876
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26203209 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26203110  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| || ||||| ||||||||||  || |||    
T  26203109 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattca-accatcatcaataatcatcgatccagcaattaaaacaa 26203011  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagct 334  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||  | |  | || | |||||||||||||||||||||    
T  26203010 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacattcaaccaccactattcaagctagca-aaaccacactcaggaactgtgcagct 26202912  T
Q  335 cgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26202911 cgcctcgcgtgcacatctgctcgccatggcgagttc 26202876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16223728 - 16223395
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16223728 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 16223629  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  16223628 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 16223529  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | |||||| |||||||||| | |||||    
T  16223528 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacattcaggaactgagtagctc 16223430  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16223429 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 16223395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 24362647 - 24362979
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24362647 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24362746  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||    
T  24362747 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagtccaatcaa 24362846  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcg 336  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |   | |||||||||||||||||||  || |||||  | |  | || || || ||||||||| |||||||||    
T  24362847 ccaaaataatgcataattatatataaccagctcaaaaacaacaacatcaaccactactattcaagctagca-aaacatcattcaggaactatgcagctcg 24362945  T
Q  337 cctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24362946 cctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 24362979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 25463920 - 25464253
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25463920 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 25464019  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  25464020 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 25464119  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||   |  |||||||| |  || | | |||||| |||||||||| | |||||    
T  25464120 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggtactaccattca-agcacgaaattcaacattcaggaactgagtagctc 25464218  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25464219 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 25464253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 29159148 - 29159481
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29159148 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 29159247  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  29159248 atgcaactccatatgattccacttaaacaacatgtatgattcgataattagcatacacttcaatcatcatcagaaatcatcaattcagcaatccaatcaa 29159347  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||  ||| |||| ||| |   || || | || ||  ||||||||| | || | | |||||||||||||| ||  ||||||    
T  29159348 ccaaaataatgcataattacatgaaaccatgctcaacatttcagcattaaatcactaccattcatgc-acgaaattcaacactcaggaattgcacagctc 29159446  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29159447 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 29159481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 34134040 - 34133705
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34134040 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 34133941  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt-aacatacatt---tacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaa 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |   | ||||||||| | |  |||||||||||||||| |||    
T  34133940 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatacttaaacatacaatgcattcatcatcattaatcatcatcaatccagcaattcaa 34133841  T
Q  233 tcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaa-caacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgca 331  Q
    |||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  || |  ||  | |  | || |||||||| ||||| | | |    
T  34133840 tcaatcacaacaatgcataatt--atataactatgctcaaaaccaacaacaccaaccactactaaccaagctagca-aaacaacactctggaacagggta 34133744  T
Q  332 gctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34133743 gctcgcctcgcgagcacatctgctcgccacggcgagttc 34133705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 58 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19096836 - 19096524
Alignment:
Q  58 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19096836 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactcca 19096737  T
Q  158 cttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19096736 cttaaacaacatgtatgattcgataattagcatacacttcaatcatcatcagaaatcatcaattcagcaatccaatcaaccaaaataatgcataattaca 19096637  T
Q  258 tataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctc 356  Q
    |  ||| |||| ||| |   || || | || ||  ||||||||| | || | | |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19096636 tgaaaccatgctcaacatttcatcattaaatcactaccattcatgc-acgaaattcaacactcaggaactgcacagctcacctcgcgagcacatccgctc 19096538  T
Q  357 gccatggcgagttc 370  Q
    || |||||||||||    
T  19096537 gctatggcgagttc 19096524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 196
Target Start/End: Original strand, 1070697 - 1070856
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1070697 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1070796  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacattt 196  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1070797 atgcaactaaatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaatatttagcatacattt 1070856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15332192 - 15332042
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15332192 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 15332093  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15332092 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgatt-aataattaa 15332042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 17309753 - 17309903
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17309753 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17309852  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17309853 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatgatt-aataattaa 17309903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 177
Target Start/End: Original strand, 22406712 - 22406842
Alignment:
Q  47 aactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22406712 aactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctact-gtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactc 22406810  T
Q  146 catgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 177  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  22406811 catatgactccacttaactaacatgtatgatt 22406842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8069764 - 8069626
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8069764 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 8069665  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8069664 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 8069626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 370
Target Start/End: Original strand, 27767447 - 27767771
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  27767447 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 27767544  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataa--ttaacatacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaa 240  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||  |||||| |  ||| |||||| ||||| |||||| ||  | ||| |||| |||||||||||  | |||     
T  27767545 tccatatgactccacttatataacatgtatttttcaattattttatcataca-ttacagtcatcagcaaca-tcaacaat-cagcaatccaactatccag 27767641  T
Q  241 aacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctc 340  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||  | | ||||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  27767642 aataatgcacaatttaatataactatgctcaaaacaacaacatcaatcactaccattcatgcaagcaaattcaacactcaaaaactgggtagctcgcctc 27767741  T
Q  341 gcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  27767742 gcgggcacatttgctcgctatggcgagttc 27767771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 4106776 - 4106913
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4106776 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagccctctccgctgttttatgcatatgccatggacc----tgtgtatgtctacatacaactgaccatgca 4106871  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4106872 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 4106913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10470797 - 10470475
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  10470797 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 10470700  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataa--ttaacatacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaa 240  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||| ||  |  |||||||  ||  ||||||  | |||     
T  10470699 tccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataattttagcataca-ttacagtcatcagcaaca-acatcaat-tagagatccaacaatccag 10470603  T
Q  241 aacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaa-ccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcct 339  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||| || ||||||||||||| ||  ||| || |  | | |||||||    
T  10470602 aataatgcacaattaaatataactatgctcaaaacaacaacaacaattcatcaccatacacacaacaacaatcagcatgcagcaaattaggaactcgcct 10470503  T
Q  340 cgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10470502 cgcgagcacatctgctcgctatggcgag 10470475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 94564 - 94231
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  94564 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 94466  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaa 232  Q
     || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||  |||||||||   |||||| ||| | ||| ||| |||  ||||||     
T  94465 -atacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatggtt-aatagataaagcatacatttcagtcatcaacagcaatcaacaa-ccaataatccag 94369  T
Q  233 tcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgc-ccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgca 331  Q
      | ||| || ||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||| |||  |  |||||||||   ||   | ||| ||||||  |||||||||    
T  94368 caatccataataatgcataattatttataaatatgctcgaaaacaacaacaccaagtactaccattcat-gtacgcaattcagcactcaaaaactgtgca 94270  T
Q  332 gctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  94269 gctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 94231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13128332 - 13128009
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |    
T  13128332 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atggatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc-atacattc 13128235  T
Q  144 tccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattcaataat--taacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaa 240  Q
    | ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||    ||||| ||  |  ||||||  ||    |||||  | |||     
T  13128234 ttcatatgactccaacttatacatcatgtatgattcaataattatagcatacatttcagccatcagcaaca-acatcaa-acaatggtccaacaatccag 13128137  T
Q  241 aacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctc 340  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||    
T  13128136 aataatgcataattaaatat-actatgctcaaaacaacaacatcaatcatcaccattcatacaataacaatcagcactca-aaactgggtagctcgcctc 13128039  T
Q  341 gcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13128038 gcgagcacttctgctcgctatggcgagttc 13128009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 370
Target Start/End: Original strand, 29925817 - 29926106
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaa-ctccatgtgactccactt--aaacaacatgtatgatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  || ||| |||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  29925817 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca-tacattcttcatatgactccaatttgacacaacatgtatgatt 29925915  T
Q  178 caataatta--acatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaac 275  Q
    |||||| ||  ||||||||| | | ||||| ||  || |||||| | ||  ||||||  | ||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29925916 caataaatataacatacattca-accatcagcaacat-catcaaac-agtgatccaacaatccagaataatacataattaaatataactatgctcaaaac 29926012  T
Q  276 aacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||| ||  ||  || || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29926013 aacaacatcaatcatcaccattcacataataacaatcagcatgca-aaaatgagtaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 29926106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10464085 - 10463958
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgccc-aaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgc 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||  | | ||| ||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  10464085 aatgcacaattaaatataactatgccccaaaacaacaacaccaatcactaccattcatataaataaattcagcactcaaaaactgggtagctcgcctcgc 10463986  T
Q  343 gagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10463985 gagcatatctgctcgctatggcgagttc 10463958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Original strand, 14582927 - 14583033
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||  || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14582927 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaactagatcatgc-atacattcttcatatgactccaacttatacaacatgtatgattc 14583025  T
Q  179 aataatta 186  Q
    ||||||||    
T  14583026 aataatta 14583033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17207769 - 17207666
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  || ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  17207769 tttatgcatatgcaatggaccaactagtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacattcttcatatgactccaatttatacaacatgtatgattc 17207671  T
Q  179 aataa 183  Q
    |||||    
T  17207670 aataa 17207666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19300708 - 19300639
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19300708 tccaagaccgaagccctcaccgct--tttatgcttatgcaattgacccacttatgtatatctacatacaact 19300639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8069477 - 8069430
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8069477 aactgtgcagcttgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 8069430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10464240 - 10464185
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10464240 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 10464185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12447227 - 12447172
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12447227 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 12447172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15331895 - 15331856
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15331895 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 15331856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Original strand, 17310038 - 17310077
Alignment:
Q  331 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17310038 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 17310077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23021380 - 23021325
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23021380 tttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23021325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14133064 - 14133011
Alignment:
Q  75 ccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14133064 ccgctgttttatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 14133011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33681971 - 33681928
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33681971 actgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 33681928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 13940556 - 13940612
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaa 137  Q
    ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13940556 tttatgcatatgttatggacccaattgtgtatatctacatacaacatgaccatgcaa 13940612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21724526 - 21724483
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21724526 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 21724483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27562307 - 27562264
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27562307 actgggcagctcgcctcgcgagctcatctgctcgctatggcgag 27562264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 367
Target Start/End: Original strand, 1593179 - 1593213
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1593179 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 1593213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8768191 - 8768145
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8768191 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 8768145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28289967 - 28289929
Alignment:
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28289967 gcagctcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgag 28289929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Original strand, 13940806 - 13940839
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13940806 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 13940839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 19726765 - 19726810
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19726765 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 19726810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Original strand, 21470207 - 21470240
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21470207 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 21470240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Original strand, 21476708 - 21476741
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21476708 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 21476741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8760193 - 8760153
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggc 364  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8760193 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggc 8760153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17027204 - 17027156
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactga 129  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17027204 tttatgcttatgcaatgaactccacttgtgtatatctacatacaactga 17027156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Original strand, 18786230 - 18786274
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18786230 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18786274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18603 - 18271
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18603 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccttgca 18504  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||    
T  18503 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattca-accatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 18405  T
Q  237 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaa-acaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctc 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  || | |||| |||  | | ||||||||||| ||||||||| |||    
T  18404 ccaaaataatgcataattatatataaccatgcccaaatacaacaacaccaaccactactaatcatgcaagca-agtcaacactcagaaactgtgcaactc 18306  T
Q  336 gcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18305 gcctcgcgagcacatctgctcgccatgccgagttc 18271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 101 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22101 - 21833
Alignment:
Q  101 cctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacat 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||||| || |||||| | | |     
T  22101 cctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatca-ac 22003  T
Q  201 catcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcat 300  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||     
T  22002 catcatcagtattcggtaatgcagcactccaatcaaccaaaacaatgcatgattatatatacccatgctcaaaacaacaacatcaaccattattattcaa 21903  T
Q  301 acaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
     |||  |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21902 gcaagcaatttcaacaatcaggaactgagcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggtgagttc 21833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 13486 - 13636
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13486 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatccaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 13585  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13586 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatgatt-aataattaa 13636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 13781 - 13821
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13781 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccacggcgagttc 13821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 183
Target Start/End: Original strand, 50083 - 50228
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50083 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 50182  T
Q  139 gcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  50183 gcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatggtttaataa 50228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Original strand, 50354 - 50415
Alignment:
Q  309 aatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50354 aatcaacactcaggaactgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 50415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0279
Description:

Target: scaffold0279; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5802 - 5661
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5802 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 5703  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5702 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 5661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1098 - 767
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1098 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttctatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 999  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaat 233  Q
    |    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||||||   |||||| ||  | ||| || | ||||||| |||     
T  998 atacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatggtt-aataaataaagcatacatttcagtcatcagcaaca-tcaacagt-cagcaattcaa- 903  T
Q  234 caaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagc 333  Q
    || ||| || | || | |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |  |||||||||   |||  | |||||||||||||||||||||||    
T  902 catccagaatattgtacaatttaatataactatgcttaaaacaacaacatcaataactaccattcat-gtacacaattcaacactcaggaactgtgcagc 804  T
Q  334 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  803 tcgcctcgcgagcacatctgctcactatggcgagttc 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 972 - 1307
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  972 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 1071  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa-catacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatc 234  Q
    |    ||||||||  ||||||||||  ||||| |||||| ||   |||  || |||||||    | |||||  |  ||||| |||| |||||||| ||||    
T  1072 atacaaactccataggactccacttttacaacttgtatgtttatttaacaaatcatacatcacaaccatcaataacattcaacaattcagcaatctaatc 1171  T
Q  235 aaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagc 333  Q
    | ||| || ||||||||| || ||  |||||||| ||| ||||||||| | || ||  ||||||||| | || | | |||||||||||||||||  ||||    
T  1172 atccagaataatgcataaatacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaatcactaccattcatgc-acgaaattcaacactcaggaactgatcagc 1270  T
Q  334 tcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1271 tcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 1307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 31720 - 31858
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31720 gctgttgagcaactagtactccaggacaaaagacctcaccgctgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttaaccatgc 31819  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    |    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31820 atacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 31858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Original strand, 31925 - 31984
Alignment:
Q  311 tcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31925 tcaacactccagaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 31984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 19688 - 19824
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-attcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 19786  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19787 tacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 19824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23760
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23897 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-attcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 23799  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
     || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23798 -atacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 23760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 19979 - 20019
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19979 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 20019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23605 - 23565
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23605 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 23565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 512614 - 512478
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  512614 gctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 512516  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  512515 tacaaactccttgtgactccacttaaacaacatgtatg 512478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 179126 - 179181
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  179126 tttatgcatatgcaatggacccacttttgtatatctacatacaacttgaccatgca 179181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 449435 - 449387
Alignment:
Q  322 gaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  449435 gaactgggcaactcgcctcgcgagtacatctactcgctatggcgagttc 449387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 488394 - 488350
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  488394 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 488350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 512321 - 512281
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  512321 cagctctcctcgcgagcacatctgcttgctatggcgagttc 512281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4710 - 4579
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  4710 gcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaact 4612  T
Q  145 ccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 177  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4611 ccttgtgactccacttaaataacatgtatgatt 4579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4425 - 4385
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4425 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 4385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 25128 - 25453
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  25128 gcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgtaatggatcaacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca-tacaact 25226  T
Q  145 ccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatt--aacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatcca--gcaatccaatcaaccaa 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  ||  |||||||||||   || ||| ||  | ||| ||| | |  |  |||||| || |||     
T  25227 ccatgtgactccacataaacaacatgtat-atttaattgttcaaacatacatttcagtcctcaacaacaatcaacaaccaatagagatccaaccatccag 25325  T
Q  241 aacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacat-caaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcct 339  Q
    ||  ||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| || || || ||||||  |||||  ||||||||||    
T  25326 aaatatgcacagttaaatataactatgcttaaa-caacaacattcaatcattaccattcatgcaagaaaaa-cagcactcaa-aactgcacagctcgcct 25422  T
Q  340 cgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25423 cgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 25453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 370
Target Start/End: Original strand, 9842 - 10166
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaa-c 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |    
T  9842 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca-tacattc 9939  T
Q  144 tccatgtgactcca-cttaaacaacatgtatgattcaataattaa--catacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaa 240  Q
    | ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | | ||||| ||  || || ||| |||||||| |||  | |||     
T  9940 ttcatatgactccaacttatacaacatgtatgattcaataaataaaacatacattca-accatcaacaacat-caacaa-ccagcaattcaacaatccag 10036  T
Q  241 aacaatgcataattaaatataactatgccc-aaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcct 339  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||  | | ||| ||||||  ||||| | |||||||||    
T  10037 aataatgcacaattaaatataactatgccccaaaacaacaacaccaatcactaccattcatataagtaaattcagcactcaa-aactgggtagctcgcct 10135  T
Q  340 cgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10136 cgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 10166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 370
Target Start/End: Original strand, 19337 - 19625
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattca 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19337 tttatgcatatgaaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatgtgactccatttaaacaacatgtatgattca 19435  T
Q  180 ataa--ttaacatacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaaca 276  Q
    ||||  |||||||||| | ||| |||||| ||  |  |||||||  ||  |||||| || ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  19436 ataactttaacataca-tcacagtcatcagcaaca-acatcaat-tagagatccaaccatccagaaatatgcacaattaaatataactatgcttaaaaca 19532  T
Q  277 acaaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||| |||| ||  ||||||||| |||  | || || ||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19533 acaacattcaatcactaccattcatgcaagca-aaacagcacaca-aaactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcgatggcgagttc 19625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 370
Target Start/End: Original strand, 15239 - 15527
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattca 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15239 tttacgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgatcatgca-tacatactccatgtgactccatttaaacaacatgtatgattca 15337  T
Q  180 ataa--ttaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaa 277  Q
    ||||  |||||||||||     |||||| ||  |  |||||||  ||  |||||| || ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  15338 ataactttaacatacatcagagtcatcagcaaca-acatcaat-tagagatccaaccatccagaaatatgcacaattaaatataactatgcttaaaacaa 15435  T
Q  278 caaca-tcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||| |||  | || || ||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15436 caacattcaatcactaccattcatgcaagca-aaacagcacaca-aaactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgcccgcgatggcgagttc 15527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 65374 - 65050
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  65374 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatgaaactacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatac 65277  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaa-catacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaa 241  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||| || |||||| || |||||| | |||  ||||| ||  ||  | |||| ||||||||||| ||  || |    
T  65276 tccatatgactccacttttacaacatgtatggttaaataataaatcataca-tcacagccatcagcaacatctaacaattcagcaatccaaccattcaga 65178  T
Q  242 acaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcg 341  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||| ||  ||||||||| |||  | | ||| || |||  ||||| | |||||||||||    
T  65177 ataatgcataatttaatataactatgcttaaaaaaaccacatcaatcactaccattcatgcaagca-attcagcattcaaaaactgggtagctcgcctcg 65079  T
Q  342 cgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  65078 cgagcacatctgctcgctatggcgagttc 65050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 101734 - 101468
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaac- 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | || |     
T  101734 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtg-atatctacatacaacatgaccatgca-tacatcc 101638  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataatta--acatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaa 241  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||   | ||||| |   |  |||||| | |  | |||||  | ||| |    
T  101637 ttcatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataattacaacatacattacaaccatcaaccacaa-catcaaacaatga-tccaacaatccaga 101540  T
Q  242 acaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatca 313  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  101539 ataatgcataattaaatataactatgttcaaaacaacaacatcaatcatcaccattcatacaataacaatca 101468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15278 - 15141
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15278 gctgttgagtaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctatttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 15180  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
     || || || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15179 -atacatacaccatatgactccacttaaacaacatgtatg 15141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14992 - 14945
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14992 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcaagttc 14945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 174
Target Start/End: Original strand, 12948 - 13076
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatac-aactgaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || || ||    
T  12948 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaaattgaccatgc-atacatac 13045  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13046 tccatatgactccacttatacaacatgtatg 13076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 367
Target Start/End: Original strand, 16368 - 16483
Alignment:
Q  251 aattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacat 350  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||  || | | |  | | ||||||||||||||||||    
T  16368 aattaagtataactatgctcaaaacaacaaaaacaatcatcaccatacacacaacaacaatcagcatgca-gcatttaggaactcgcctcgcgagcacat 16466  T
Q  351 ctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||| | ||||||||    
T  16467 ctgctcactatggcgag 16483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 107
Target Start/End: Original strand, 7801 - 7861
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctactt 107  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7801 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctactt 7861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Original strand, 15182 - 15281
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15182 gctgttgagcaactagtgctccaggaaatgagtcctccccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 15280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Original strand, 23401 - 23449
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23401 tcaggtactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcactatggcga 23449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 370
Target Start/End: Original strand, 24770 - 25059
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactccactt-aaacaacatgtatgattc 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24770 tttatgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatagaacttgaccatgca-tacatactccatatgactccattttaaacaacatgtatgattc 24868  T
Q  179 aataa--ttaacatacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaac 275  Q
    |||||  ||| |||||||  ||| |||||| ||  |  |||||||  ||  |||||| || ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  24869 aataactttagcatacata-acagtcatcagcaacaa-catcaatt-agagatccaaccatccagaaatatgcacaattaaatataactatgcttaaaac 24965  T
Q  276 aacaacat-caaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||| ||| ||  ||||||||| |||  | || || ||| ||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24966 aacaacattcaatcactaccattcatgcaagcaaaa-cagcacacaa-agctgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttc 25059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 712 - 802
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  712 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 976 - 1045
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  976 tccaggaccgaggcactcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Original strand, 2102 - 2240
Alignment:
Q  46 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-ac 143  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |    
T  2102 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc-atacattc 2199  T
Q  144 tccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattcaataa 183  Q
    ||||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  2200 tccatatgactccaaattatacaacatgtatggttcaataa 2240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 370
Target Start/End: Original strand, 2292 - 2416
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||  |||||||||  |   | | ||| |||| |  ||||| | |||||||||||||    
T  2292 aatgcataattaaatataactatgctcaaa-caacaacaccaagcactaccattcatgtacgta-attcagcactaaaaaactgggtagctcgcctcgcg 2389  T
Q  344 agcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2390 agcacatctgctcgctatggcgagttc 2416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20157 - 19880
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  || ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  20157 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacattcttcatatgactccaatttatacaacatgtatgattc 20059  T
Q  179 aataa--ttaacatacatttaca-tcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaac 275  Q
    |||||   || |||||| |||||  ||||| ||  | |||||||  |||  ||||||  | ||| || |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  20058 aataaatatagcataca-ttacagccatcagcaaca-tcatcaa-acagtgatccaacaatccagaataatgcacaattaaacataaccatgctcaaaac 19962  T
Q  276 aacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgc 358  Q
    | ||||||||| ||  |||||||||| ||  ||||||| ||| ||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19961 atcaacatcaatcactaccattcatataaatacaatcagcacaca-aaactaagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgc 19880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 184 - 239
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  184 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 51718 - 51672
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51718 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 51672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Original strand, 435 - 468
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  435 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 74167 - 74112
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  74167 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 74112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 137199 - 137254
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  137199 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 137254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Original strand, 137451 - 137484
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  137451 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 137484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 367
Target Start/End: Original strand, 30955 - 31232
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatgattc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  || ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  30955 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacattcttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattc 31053  T
Q  179 aataa--ttaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaaca 276  Q
    | |||   ||||||||||||  | ||||| ||  | ||| ||| ||||||||        ||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  31054 agtaaatataacatacatttcaaccatcaacaaca-tcaacaa-ccagcaat--------ccagaataatgcacaattaaatacaactatgctcaaaaca 31143  T
Q  277 acaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| ||  | ||||| ||| ||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31144 acaacatcaatcactaccattcatataagtaaaatcagcacaca-aaactgggtagctcg-ctcgcgagcacatctgctcgatatggcgag 31232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11981 - 11912
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11981 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 11912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24541 - 24472
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24541 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 24472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10670 - 10626
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10670 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18849 - 18805
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18849 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 247142 - 247197
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  247142 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 247197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 253656 - 253711
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  253656 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 253711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 366
Target Start/End: Original strand, 247334 - 247428
Alignment:
Q  272 aaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||  ||  ||||  | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  247334 aaacatcaacatcaatcatcaccattcatataataacaatcagcatacaaaaactaggtaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 247428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 366
Target Start/End: Original strand, 253848 - 253942
Alignment:
Q  272 aaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||  ||  ||||  | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  253848 aaacatcaacatcaatcatcaccattcatataataacaatcagcatacaaaaactaggtaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 253942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0652 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0652
Description:

Target: scaffold0652; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 1623 - 1681
Alignment:
Q  312 caacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1623 caacactctggaacagggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccacggcgagttc 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 161366 - 161241
Alignment:
Q  244 aatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaacatcaaccatgaccattcatacaacaacaatcaacactcaggaactgtgcagctcgcctcgcg 343  Q
    |||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||| | |||  | | ||| ||||||  ||||  | |||||||||||||    
T  161366 aatgcacaatttaatacaactatgctcaatacaacaacatcaatcactaccattcgtgcaagca-attcagcactcaaaaactaggtagctcgcctcgcg 161268  T
Q  344 agcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  161267 agcacatctgctcgcgatggcgagttc 161241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 41353 - 41408
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41353 tttatgcatatgatatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 41408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1336 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1336
Description:

Target: scaffold1336; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 525 - 477
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  525 tcaggtactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Original strand, 4875 - 4923
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4875 tcaggtactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 4923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9001 - 8953
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9001 tcaggtactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 8953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6551 - 6503
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6551 tcaggtactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 6503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Original strand, 26703 - 26751
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26703 tcaggtactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 26751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Original strand, 21249 - 21297
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21249 tcaggtactgagcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 21297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 72367 - 72436
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  72367 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgaaactaacccacttgtgtatatctacatacaact 72436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10122 - 10076
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10122 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 10076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17440 - 17372
Alignment:
Q  56 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17440 tccagggccgaagccctc-ccgct--tttatgcttatgtaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 17372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Original strand, 143068 - 143116
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  143068 tcaggtactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 143116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Original strand, 35970 - 36018
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35970 tcaggtactgggcaactcacctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 36018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 38767 - 38723
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggacct-acttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38767 tatgcttatgcaatggacttcacttgtgtatatctacatacaact 38723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14265 - 14222
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14265 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 14222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14514 - 14469
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14514 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 14469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 323 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23568 - 23525
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23568 aactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 23525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17935 - 17895
Alignment:
Q  323 aactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatgg 363  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17935 aactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatgg 17895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 50738 - 50695
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50738 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 50695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 50989 - 50948
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 122  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50989 ttttatgcttatgcaactgacctacttgtgtatatctacata 50948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Original strand, 14418 - 14461
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14418 actgggcagctcacctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 14461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Original strand, 24624 - 24662
Alignment:
Q  329 gcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24624 gcagctcacctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 24662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Original strand, 265507 - 265550
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  265507 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 265550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 367
Target Start/End: Original strand, 259090 - 259124
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  259090 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 259124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1726
Description:

Target: scaffold1726; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 366
Target Start/End: Original strand, 673 - 715
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  673 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 185 - 139
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  185 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5415 - 5377
Alignment:
Q  90 tatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5415 tatgcaatggactctacttgtgtatatctacatacaact 5377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 7409 - 7455
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7409 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 7455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 366
Target Start/End: Original strand, 9078 - 9120
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9078 actgagcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 9120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 366
Target Start/End: Original strand, 25845 - 25887
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25845 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 25887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 36835 - 36789
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36835 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 36789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 41634 - 41588
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41634 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 41588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20535 - 20489
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20535 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 20489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 366
Target Start/End: Original strand, 35191 - 35233
Alignment:
Q  324 actgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35191 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 35233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2016 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2016
Description:

Target: scaffold2016; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 586
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  619 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0669 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0669
Description:

Target: scaffold0669; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1474 - 1441
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1474 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 1441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Original strand, 901 - 934
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  901 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2679 - 2646
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2679 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 2646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 42090 - 42135
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42090 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 42135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27533 - 27500
Alignment:
Q  333 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27533 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 27500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 17637 - 17682
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17637 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 17682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1290 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1290
Description:

Target: scaffold1290; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1036 - 992
Alignment:
Q  322 gaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1036 gaactgggcaactcgcctcgcgagctcatctgctcgctatggcga 992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Original strand, 6293 - 6337
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6293 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 6337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4135 - 4091
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4135 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 4091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 129
Target Start/End: Original strand, 19439 - 19487
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactga 129  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19439 tttatgcttatgcaatgaactccacttgtgtatatctacatacaactga 19487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 7537 - 7577
Alignment:
Q  330 cagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttc 370  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7537 cagctcgccttgtgagcacatctgctcgctatggcgagttc 7577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 55956 - 55912
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  55956 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 55912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 42706 - 42658
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  42706 tcaggtactgggcaactcgccttgcgagcacatctgctcgctatggcga 42658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 53401 - 53353
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  53401 tcaggtactgggcaactcgccttgcgagcacatctgctcgctatggcga 53353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3555 - 3507
Alignment:
Q  318 tcaggaactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcga 366  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3555 tcaggtactgggcaactcgcctcgcgagctcatctgctcgctatggcga 3507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University