View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11126_high_9 (Length: 441)

Name: NF11126_high_9
Description: NF11126
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11126_high_9
NF11126_high_9
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (222-431)||(2481396-2481605)
chr4 (20-222)||(27581260-27581462)
chr4 (221-431)||(45424522-45424732)
chr4 (218-431)||(54189537-54189750)
chr4 (223-431)||(19913618-19913826)
chr4 (223-431)||(38055154-38055362)
chr4 (223-429)||(23776449-23776655)
chr4 (222-431)||(15241016-15241225)
chr4 (222-431)||(28032700-28032909)
chr4 (222-431)||(37464717-37464926)
chr4 (222-431)||(53717452-53717661)
chr4 (225-431)||(1756752-1756958)
chr4 (222-431)||(27488636-27488845)
chr4 (227-431)||(16700782-16700986)
chr4 (222-422)||(50055098-50055298)
chr4 (221-431)||(44784905-44785115)
chr4 (221-431)||(50353796-50354006)
chr4 (222-431)||(6611348-6611557)
chr4 (223-431)||(6688615-6688817)
chr4 (222-431)||(15669179-15669388)
chr4 (221-430)||(20877042-20877251)
chr4 (235-431)||(33703850-33704046)
chr4 (224-431)||(11639566-11639773)
chr4 (224-431)||(40428708-40428915)
chr4 (221-431)||(14987787-14987997)
chr4 (225-431)||(54412627-54412833)
chr4 (226-431)||(1617084-1617289)
chr4 (226-431)||(31969681-31969886)
chr4 (226-431)||(35490761-35490966)
chr4 (221-432)||(8932165-8932376)
chr4 (217-428)||(43289951-43290162)
chr4 (222-429)||(48909842-48910049)
chr4 (218-430)||(37968746-37968958)
chr4 (224-431)||(47632032-47632240)
chr4 (227-431)||(53875658-53875862)
chr4 (221-428)||(23704200-23704407)
chr4 (221-428)||(30423556-30423762)
chr4 (226-428)||(52139203-52139405)
chr4 (226-431)||(8591080-8591285)
chr4 (222-431)||(44379175-44379384)
chr4 (222-431)||(27536092-27536297)
chr4 (221-430)||(53353050-53353267)
chr4 (227-431)||(19164961-19165164)
chr4 (222-431)||(55344813-55345022)
chr4 (227-431)||(30171581-30171785)
chr4 (230-431)||(27583620-27583821)
chr4 (230-431)||(40680026-40680227)
chr4 (235-431)||(38071314-38071504)
chr4 (229-397)||(28360433-28360602)
chr4 (225-422)||(44375844-44376041)
chr4 (222-428)||(16703821-16704023)
chr4 (222-375)||(50053439-50053592)
chr4 (303-431)||(23269034-23269162)
chr4 (344-431)||(53408137-53408225)
chr4 (221-311)||(23265865-23265955)
chr4 (221-375)||(44548185-44548340)
chr4 (368-431)||(23261874-23261937)
chr4 (328-431)||(9595890-9595982)
chr4 (292-374)||(51780763-51780845)
chr4 (382-431)||(50055301-50055350)
chr4 (365-431)||(48748197-48748263)
chr4 (222-279)||(9595975-9596031)
chr4 (233-375)||(17493340-17493482)
chr4 (397-431)||(55344681-55344715)
chr4 (314-370)||(55344724-55344780)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (222-431)||(22174976-22175185)
chr3 (222-431)||(50528922-50529131)
chr3 (222-430)||(15520629-15520837)
chr3 (224-430)||(20699144-20699350)
chr3 (221-431)||(20842334-20842544)
chr3 (229-431)||(44609319-44609521)
chr3 (222-431)||(37698129-37698338)
chr3 (221-430)||(42307892-42308101)
chr3 (223-431)||(25999382-25999590)
chr3 (221-431)||(15520128-15520338)
chr3 (229-431)||(21581042-21581244)
chr3 (223-431)||(25494271-25494479)
chr3 (221-431)||(8042599-8042809)
chr3 (225-431)||(38856089-38856295)
chr3 (222-431)||(35226440-35226649)
chr3 (222-431)||(38933939-38934147)
chr3 (222-430)||(46452149-46452357)
chr3 (222-431)||(29445481-29445690)
chr3 (221-426)||(32244112-32244317)
chr3 (221-431)||(12117644-12117854)
chr3 (222-431)||(54534314-54534521)
chr3 (222-431)||(54870160-54870369)
chr3 (223-431)||(2895179-2895391)
chr3 (222-430)||(24835686-24835894)
chr3 (221-431)||(32359251-32359461)
chr3 (233-431)||(42104957-42105155)
chr3 (223-430)||(26122808-26123015)
chr3 (222-431)||(53028218-53028419)
chr3 (222-431)||(34700334-34700543)
chr3 (250-430)||(44688782-44688961)
chr3 (229-431)||(48924989-48925189)
chr3 (262-431)||(16354379-16354548)
chr3 (224-377)||(35643212-35643365)
chr3 (229-363)||(50529827-50529961)
chr3 (252-428)||(12915930-12916105)
chr3 (221-357)||(49128041-49128177)
chr3 (343-430)||(24366143-24366230)
chr3 (350-431)||(13696914-13696995)
chr3 (221-279)||(24366084-24366142)
chr3 (383-431)||(50528868-50528916)
chr3 (226-256)||(40240485-40240515)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (223-431)||(52696788-52696996)
chr1 (222-431)||(25897370-25897579)
chr1 (222-431)||(26580270-26580479)
chr1 (222-431)||(39260346-39260555)
chr1 (222-431)||(52753147-52753356)
chr1 (227-431)||(8120870-8121074)
chr1 (223-431)||(42370795-42371003)
chr1 (222-428)||(1170447-1170653)
chr1 (221-431)||(20089466-20089676)
chr1 (225-431)||(26663257-26663463)
chr1 (222-431)||(29288145-29288352)
chr1 (222-431)||(1168499-1168708)
chr1 (221-430)||(16052091-16052300)
chr1 (229-430)||(29078519-29078720)
chr1 (222-431)||(33510480-33510689)
chr1 (226-430)||(46760966-46761170)
chr1 (223-431)||(970524-970734)
chr1 (225-431)||(5215384-5215590)
chr1 (229-431)||(38829072-38829274)
chr1 (222-431)||(1940747-1940956)
chr1 (223-431)||(12682817-12683025)
chr1 (222-431)||(17591687-17591893)
chr1 (221-431)||(32671574-32671784)
chr1 (222-431)||(41928495-41928704)
chr1 (226-430)||(8079710-8079914)
chr1 (223-431)||(40092488-40092696)
chr1 (221-431)||(43905649-43905859)
chr1 (226-431)||(19715161-19715366)
chr1 (221-431)||(46409430-46409642)
chr1 (221-431)||(7145202-7145412)
chr1 (222-431)||(2347652-2347862)
chr1 (242-431)||(17587505-17587694)
chr1 (223-431)||(15203109-15203317)
chr1 (223-431)||(51359217-51359424)
chr1 (221-431)||(13996723-13996933)
chr1 (228-428)||(15717787-15717986)
chr1 (223-431)||(23498457-23498665)
chr1 (226-428)||(2473722-2473924)
chr1 (221-431)||(49146167-49146377)
chr1 (222-431)||(15554152-15554353)
chr1 (225-426)||(6765458-6765659)
chr1 (260-431)||(40149497-40149668)
chr1 (224-392)||(29695673-29695842)
chr1 (221-430)||(38171827-38172023)
chr1 (222-355)||(52086263-52086396)
chr1 (240-374)||(23322897-23323031)
chr1 (221-297)||(5675100-5675176)
chr1 (222-375)||(5217840-5217992)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (221-431)||(15655908-15656118)
chr7 (221-431)||(43067963-43068173)
chr7 (223-431)||(33359080-33359288)
chr7 (220-431)||(30181014-30181225)
chr7 (218-431)||(12101168-12101381)
chr7 (222-431)||(24792322-24792531)
chr7 (224-431)||(20346487-20346694)
chr7 (227-431)||(42673467-42673667)
chr7 (221-431)||(42964986-42965196)
chr7 (221-429)||(3511319-3511527)
chr7 (221-431)||(42204150-42204361)
chr7 (228-431)||(1803029-1803232)
chr7 (221-431)||(5280856-5281066)
chr7 (225-431)||(7164184-7164390)
chr7 (223-431)||(22649684-22649892)
chr7 (221-431)||(4347269-4347478)
chr7 (222-431)||(33846519-33846723)
chr7 (221-430)||(36890821-36891029)
chr7 (227-431)||(4477311-4477515)
chr7 (221-431)||(933281-933491)
chr7 (221-431)||(6394747-6394957)
chr7 (226-431)||(9452591-9452796)
chr7 (223-431)||(12097580-12097788)
chr7 (223-431)||(25748485-25748693)
chr7 (230-429)||(43156718-43156917)
chr7 (222-431)||(32041539-32041748)
chr7 (228-431)||(38866547-38866750)
chr7 (224-431)||(8630665-8630872)
chr7 (225-431)||(17753600-17753806)
chr7 (225-431)||(46134294-46134500)
chr7 (226-431)||(46891329-46891535)
chr7 (260-429)||(48865665-48865837)
chr7 (221-431)||(16894497-16894697)
chr7 (221-431)||(43021570-43021776)
chr7 (221-370)||(19828266-19828415)
chr7 (221-319)||(37704976-37705074)
chr7 (221-427)||(43405016-43405223)
chr7 (221-375)||(37005857-37006011)
chr7 (223-368)||(36849590-36849735)
chr7 (221-375)||(15655458-15655612)
chr7 (230-359)||(20163824-20163953)
chr7 (223-375)||(30075277-30075426)
chr7 (241-312)||(27691435-27691506)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (221-431)||(9008057-9008267)
chr5 (221-431)||(16069351-16069561)
chr5 (222-431)||(27679169-27679378)
chr5 (222-428)||(1579035-1579241)
chr5 (222-428)||(1605574-1605780)
chr5 (221-431)||(33491196-33491406)
chr5 (221-431)||(24105671-24105881)
chr5 (228-431)||(16737447-16737650)
chr5 (229-431)||(3386486-3386688)
chr5 (221-427)||(27420856-27421062)
chr5 (221-431)||(31883142-31883352)
chr5 (221-431)||(35782644-35782854)
chr5 (222-431)||(8374339-8374547)
chr5 (222-431)||(33991139-33991348)
chr5 (230-428)||(1165604-1165802)
chr5 (221-431)||(3921579-3921789)
chr5 (221-431)||(4120935-4121145)
chr5 (221-431)||(19358524-19358734)
chr5 (223-430)||(5202972-5203179)
chr5 (221-431)||(20992146-20992356)
chr5 (222-431)||(38598450-38598659)
chr5 (223-428)||(31410476-31410681)
chr5 (260-431)||(26602942-26603113)
chr5 (268-431)||(27025001-27025164)
chr5 (221-358)||(20992354-20992495)
chr5 (231-364)||(33284642-33284775)
chr5 (373-431)||(35420424-35420482)
chr5 (235-359)||(31638157-31638281)
chr5 (393-424)||(27024822-27024853)
chr5 (223-255)||(26603108-26603140)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (222-431)||(24113166-24113375)
chr8 (223-431)||(14422702-14422910)
chr8 (221-431)||(18594534-18594744)
chr8 (228-429)||(2042526-2042727)
chr8 (222-431)||(39206584-39206793)
chr8 (223-431)||(29938060-29938268)
chr8 (226-431)||(13110406-13110611)
chr8 (227-431)||(144397-144601)
chr8 (221-431)||(6144273-6144483)
chr8 (222-431)||(22260630-22260839)
chr8 (223-431)||(35118031-35118239)
chr8 (222-431)||(10836755-10836964)
chr8 (222-430)||(39218775-39218983)
chr8 (223-431)||(33278399-33278607)
chr8 (224-431)||(34842365-34842572)
chr8 (220-431)||(36491153-36491364)
chr8 (221-430)||(4035844-4036053)
chr8 (229-431)||(34679457-34679659)
chr8 (222-431)||(7774762-7774971)
chr8 (227-430)||(41575516-41575719)
chr8 (225-431)||(7791412-7791618)
chr8 (221-431)||(34998896-34999106)
chr8 (223-427)||(38167159-38167363)
chr8 (230-430)||(44804945-44805145)
chr8 (222-431)||(7811993-7812202)
chr8 (223-431)||(5320563-5320771)
chr8 (226-431)||(8021721-8021918)
chr8 (222-428)||(33287040-33287234)
chr8 (221-377)||(40117906-40118062)
chr8 (228-431)||(42571598-42571798)
chr8 (226-428)||(28639280-28639484)
chr8 (221-363)||(26783801-26783943)
chr8 (227-430)||(66180-66384)
chr8 (303-428)||(9807339-9807464)
chr8 (221-375)||(2322068-2322222)
chr8 (226-311)||(9806875-9806960)
chr8 (229-352)||(5005171-5005294)
chr8 (226-375)||(39220258-39220407)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (221-431)||(3347523-3347733)
chr6 (222-424)||(16307015-16307217)
chr6 (223-431)||(26946876-26947084)
chr6 (221-431)||(18613535-18613745)
chr6 (222-431)||(2837543-2837752)
chr6 (222-431)||(6086599-6086808)
chr6 (223-431)||(30691850-30692058)
chr6 (222-431)||(21893453-21893662)
chr6 (223-431)||(26704339-26704547)
chr6 (226-431)||(17261073-17261278)
chr6 (223-431)||(9459562-9459770)
chr6 (227-431)||(34887292-34887496)
chr6 (223-431)||(20726790-20726994)
chr6 (222-431)||(11167238-11167447)
chr6 (225-431)||(3955769-3955972)
chr6 (226-431)||(28199508-28199714)
chr6 (234-431)||(1153603-1153800)
chr6 (222-430)||(35198282-35198489)
chr6 (228-426)||(30698934-30699132)
chr6 (222-387)||(52834-52999)
chr6 (294-431)||(33464399-33464536)
chr6 (321-431)||(53005-53115)
chr6 (220-302)||(33463697-33463779)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (223-426)||(22956-23159)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (221-431)||(33906047-33906257)
chr2 (223-431)||(31517215-31517423)
chr2 (222-431)||(18806884-18807093)
chr2 (223-431)||(3873244-3873452)
chr2 (222-431)||(2178769-2178978)
chr2 (221-431)||(26323186-26323396)
chr2 (222-431)||(5733395-5733604)
chr2 (222-430)||(39635448-39635656)
chr2 (226-431)||(28329839-28330042)
chr2 (226-431)||(4016039-4016244)
chr2 (222-431)||(42937715-42937925)
chr2 (222-431)||(4232142-4232351)
chr2 (222-431)||(6174828-6175037)
chr2 (221-411)||(1108275-1108464)
chr2 (226-431)||(850997-851202)
chr2 (227-431)||(1482903-1483106)
chr2 (221-431)||(30270679-30270889)
chr2 (239-428)||(19383938-19384127)
chr2 (221-426)||(19901143-19901347)
chr2 (225-429)||(30420181-30420373)
chr2 (230-423)||(16066302-16066495)
chr2 (222-431)||(16588776-16588985)
chr2 (227-427)||(429817-430017)
chr2 (224-431)||(44947549-44947749)
chr2 (222-375)||(42446625-42446778)
chr2 (262-368)||(22101210-22101316)
chr2 (227-375)||(3585291-3585439)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (222-431)||(36701-36910)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (221-431)||(10233-10443)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (226-430)||(145246-145450)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (224-431)||(3708-3915)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (222-431)||(6-215)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (226-431)||(6-212)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (225-431)||(295-501)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 2481605 - 2481396
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2481605 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatc 2481506  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481505 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagccaaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 2481406  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  2481405 attctctctg 2481396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27581462 - 27581260
Alignment:
Q  20 tatgagacattgaaacgagaagtaagagtaacaaaatagtcaatggaacatggaataacaatatttcccattgggtgttcaaaaccaaactcttcctcag 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27581462 tatgagacattgaaacgagaagtaagagtaacaaaatagtcaatggaacatggaataacaatatttcccattggatgttcaaaaccaaactcttcctcag 27581363  T
Q  120 cacaacacaacaaggcctgaaacataggttgcttcaagtacgatattgggaccacaaaccgcctcatatattcatcatctttatcatccacgtacaccac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27581362 cacaacacaacaaggcctgaaacataggttgcttcaagtacgatattgggaccacaaaccgcctcatatattcatcatccttatcatccacgtacaccac 27581263  T
Q  220 aaa 222  Q
    |||    
T  27581262 aaa 27581260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 45424732 - 45424522
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||     
T  45424732 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 45424633  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424632 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 45424533  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||| ||||    
T  45424532 gattctttctg 45424522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 218 - 431
Target Start/End: Original strand, 54189537 - 54189750
Alignment:
Q  218 acaaaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagct 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  54189537 acaaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 54189636  T
Q  318 taccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 417  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189637 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 54189736  T
Q  418 ttcgattctctctg 431  Q
    ||||||||||||||    
T  54189737 ttcgattctctctg 54189750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19913826 - 19913618
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  19913826 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttatca 19913727  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913726 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 19913627  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  19913626 ttctctctg 19913618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 38055154 - 38055362
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||    
T  38055154 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 38055253  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38055254 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcga 38055353  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  38055354 ttctctctg 38055362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 223 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23776655 - 23776449
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  23776655 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 23776556  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23776555 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggatcttatgaatttatgtaaccttcttcga 23776456  T
Q  423 ttctctc 429  Q
    |||||||    
T  23776455 ttctctc 23776449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15241225 - 15241016
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  15241225 aggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatc 15241126  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15241125 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 15241026  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  15241025 attctctctg 15241016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28032909 - 28032700
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  28032909 aggccctgtttagattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 28032810  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28032809 atagtatcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 28032710  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||| ||||||    
T  28032709 attatctctg 28032700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 37464717 - 37464926
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  37464717 aggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatc 37464816  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464817 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttaccctccggtttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcg 37464916  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  37464917 attctctctg 37464926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 53717661 - 53717452
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  53717661 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 53717562  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717561 atagtttcataagctgcttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 53717462  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  53717461 attctctctg 53717452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 225 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1756958 - 1756752
Alignment:
Q  225 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccata 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||    
T  1756958 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 1756859  T
Q  325 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1756858 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgatt 1756759  T
Q  425 ctctctg 431  Q
    |||||||    
T  1756758 ctctctg 1756752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27488845 - 27488636
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  27488845 aggccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 27488746  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488745 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcg 27488646  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  27488645 attctctctg 27488636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 227 - 431
Target Start/End: Original strand, 16700782 - 16700986
Alignment:
Q  227 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagt 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16700782 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 16700881  T
Q  327 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16700882 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattct 16700981  T
Q  427 ctctg 431  Q
    |||||    
T  16700982 ctctg 16700986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 222 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 50055298 - 50055098
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||| |    
T  50055298 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatc 50055199  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055198 atggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 50055099  T
Q  422 a 422  Q
    |    
T  50055098 a 50055098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44785115 - 44784905
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||     
T  44785115 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttat 44785016  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44785015 catagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaactttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttc 44784916  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  44784915 gattctctctg 44784905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 50353796 - 50354006
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  50353796 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 50353895  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50353896 gatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 50353995  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||| ||||||    
T  50353996 gattatctctg 50354006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6611557 - 6611348
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  6611557 aggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 6611458  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6611457 atagtttcataagctgtttatgtcatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcg 6611358  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  6611357 attctctctg 6611348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6688817 - 6688615
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  6688817 ggccccgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 6688718  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    |||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688717 tagtttc------tgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 6688624  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  6688623 ttctctctg 6688615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 15669179 - 15669388
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  15669179 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 15669278  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15669279 atagtttcataagctgcttatgtcatactttaataagcctaaattttcagcttaccgtccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcc 15669378  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  15669379 attctctctg 15669388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 221 - 430
Target Start/End: Original strand, 20877042 - 20877251
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||     
T  20877042 aaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 20877141  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  20877142 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttacgtaacctcctta 20877241  T
Q  421 gattctctct 430  Q
    ||||||||||    
T  20877242 gattctctct 20877251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 235 - 431
Target Start/End: Original strand, 33703850 - 33704046
Alignment:
Q  235 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  33703850 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataag 33703949  T
Q  335 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703950 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33704046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 224 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 11639773 - 11639566
Alignment:
Q  224 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccat 323  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  11639773 gccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 11639674  T
Q  324 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  11639673 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgat 11639574  T
Q  424 tctctctg 431  Q
    ||||||||    
T  11639573 tctctctg 11639566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 224 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 40428915 - 40428708
Alignment:
Q  224 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccat 323  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  40428915 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 40428816  T
Q  324 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 423  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428815 agtttcataagctgcttataccatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 40428716  T
Q  424 tctctctg 431  Q
    ||||||||    
T  40428715 tctctctg 40428708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 14987787 - 14987997
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  14987787 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 14987886  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987887 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcttgcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttc 14987986  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||| ||||    
T  14987987 gattctttctg 14987997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 225 - 431
Target Start/End: Original strand, 54412627 - 54412833
Alignment:
Q  225 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccata 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  54412627 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 54412726  T
Q  325 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 424  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54412727 gtttcataagctgcttatgtcatattctaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctccttcgatt 54412826  T
Q  425 ctctctg 431  Q
    |||||||    
T  54412827 ctctctg 54412833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 1617084 - 1617289
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||    
T  1617084 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatag 1617183  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1617184 tttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 1617283  T
Q  426 tctctg 431  Q
    ||||||    
T  1617284 tctctg 1617289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 31969681 - 31969886
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  31969681 cccgtttgaattgatttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 31969780  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969781 tttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 31969880  T
Q  426 tctctg 431  Q
    ||||||    
T  31969881 tctctg 31969886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 35490966 - 35490761
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||    
T  35490966 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 35490867  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35490866 tttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccaccttcgattc 35490767  T
Q  426 tctctg 431  Q
    ||||||    
T  35490766 tctctg 35490761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 221 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8932376 - 8932165
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||     
T  8932376 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttaa 8932277  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8932276 cgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctccttc 8932177  T
Q  421 gattctctctgc 432  Q
    ||||||||||||    
T  8932176 gattctctctgc 8932165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 43290162 - 43289951
Alignment:
Q  217 cacaaaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagc 316  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  43290162 cacataggctccgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagc 43290063  T
Q  317 ttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 416  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43290062 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctc 43289963  T
Q  417 cttcgattctct 428  Q
    ||||||||||||    
T  43289962 cttcgattctct 43289951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 222 - 429
Target Start/End: Original strand, 48909842 - 48910049
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |    
T  48909842 aggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatc 48909941  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48909942 atagtttcataagctgcttatgccatattttaacaaacctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcg 48910041  T
Q  422 attctctc 429  Q
    ||||||||    
T  48910042 attctctc 48910049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 218 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 37968958 - 37968746
Alignment:
Q  218 acaaaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagct 317  Q
    ||||| ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37968958 acaaatgccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 37968859  T
Q  318 taccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 417  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37968858 tatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 37968759  T
Q  418 ttcgattctctct 430  Q
    |||||||||||||    
T  37968758 ttcgattctctct 37968746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 224 - 431
Target Start/End: Original strand, 47632032 - 47632240
Alignment:
Q  224 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaa-ggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||    
T  47632032 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctca 47632131  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47632132 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcaa 47632231  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  47632232 ttctctctg 47632240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 227 - 431
Target Start/End: Original strand, 53875658 - 53875862
Alignment:
Q  227 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagt 326  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  53875658 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 53875757  T
Q  327 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 426  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53875758 tttataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattct 53875857  T
Q  427 ctctg 431  Q
    |||||    
T  53875858 ctctg 53875862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 221 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23704407 - 23704200
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||     
T  23704407 aaggccctgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 23704308  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  23704307 catagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattt 23704208  T
Q  421 gattctct 428  Q
    ||||||||    
T  23704207 gattctct 23704200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 221 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30423762 - 30423556
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  30423762 aaggtcccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 30423663  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30423662 catagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcataaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagctta-gaatttatgtaacctccttc 30423564  T
Q  421 gattctct 428  Q
    ||||||||    
T  30423563 gattctct 30423556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 52139203 - 52139405
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |   ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  52139203 cccgtttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 52139302  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139303 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 52139402  T
Q  426 tct 428  Q
    |||    
T  52139403 tct 52139405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8591285 - 8591080
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  8591285 cccgtttgacttggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8591186  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8591185 tttcataagctgcttatgccatatgttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcggttc 8591086  T
Q  426 tctctg 431  Q
    ||||||    
T  8591085 tctctg 8591080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44379384 - 44379175
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |    
T  44379384 aggccctgtttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 44379285  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44379284 atagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcg 44379185  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  44379184 attctctctg 44379175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27536297 - 27536092
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |    
T  27536297 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatacgggctta----ctcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 27536202  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536201 atagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 27536102  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  27536101 attctctctg 27536092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 221 - 430
Target Start/End: Original strand, 53353050 - 53353267
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagctta----tgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagc 316  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    | ||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  53353050 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 53353149  T
Q  317 ttaccatagtttcataagctgcttatgccatatttta----ataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 412  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53353150 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaatatataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttatgtaa 53353249  T
Q  413 cctccttcgattctctct 430  Q
    ||||||||||||||||||    
T  53353250 cctccttcgattctctct 53353267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 227 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19165164 - 19164961
Alignment:
Q  227 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaa-ggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  19165164 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 19165065  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19165064 tttcataagctgcttatgccata-tttaataagcctaaattttcagcttaccct-cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgtttt 19164967  T
Q  426 tctctg 431  Q
    ||||||    
T  19164966 tctctg 19164961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 55345022 - 55344813
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  55345022 aggccccgtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 55344923  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||| || ||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55344922 atatttgcatgagttgtttataccatattttaataagccaaaattttcagcttaccatccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttg 55344823  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  55344822 attctctctg 55344813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 227 - 431
Target Start/End: Original strand, 30171581 - 30171785
Alignment:
Q  227 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagt 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  30171581 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagt 30171680  T
Q  327 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 426  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30171681 ttcataagctgcttataccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccttccggtttaacaaggagcttatgaatttatttaacctccttcgattct 30171780  T
Q  427 ctctg 431  Q
    |||||    
T  30171781 ctctg 30171785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 230 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27583821 - 27583620
Alignment:
Q  230 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttc 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| | |||| ||||||| |    
T  27583821 tttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgc 27583722  T
Q  330 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 429  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27583721 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctctc 27583622  T
Q  430 tg 431  Q
    ||    
T  27583621 tg 27583620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 40680227 - 40680026
Alignment:
Q  230 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttc 329  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  40680227 tttggattgacttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 40680128  T
Q  330 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 429  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40680127 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctc 40680028  T
Q  430 tg 431  Q
    ||    
T  40680027 tg 40680026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 235 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 38071504 - 38071314
Alignment:
Q  235 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataag 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  38071504 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 38071405  T
Q  335 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  38071404 ctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagtttac---ggggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa---ccttcgattctctctg 38071314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 229 - 397
Target Start/End: Original strand, 28360433 - 28360602
Alignment:
Q  229 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagttt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  28360433 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 28360532  T
Q  329 cataagctgcttatgcca-tattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagct 397  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28360533 tataagctgcttatgccattatttttataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 28360602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 225 - 422
Target Start/End: Original strand, 44375844 - 44376041
Alignment:
Q  225 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccata 324  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||  | |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||    
T  44375844 ccccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatctattccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcata 44375943  T
Q  325 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44375944 gtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaaaaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcga 44376041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 222 - 428
Target Start/End: Original strand, 16703821 - 16704023
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||| ||||||||||||||||    |||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||| ||||| || ||| |    
T  16703821 aggcctcgtttggattgactta----gagcttatgtgaacttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatc 16703916  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  16703917 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttatcctccggcttaacaaggagcctataaatttatgtaacccccttcg 16704016  T
Q  422 attctct 428  Q
    |||||||    
T  16704017 attctct 16704023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 222 - 375
Target Start/End: Original strand, 50053439 - 50053592
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||| |    
T  50053439 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatagcttatc 50053538  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50053539 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcatctta 50053592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 303 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269034
Alignment:
Q  303 taaacaaaaacagcttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatga 402  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 23269063  T
Q  403 atttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23269062 atttatgtaatctccttcgattctctctg 23269034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 344 - 431
Target Start/End: Original strand, 53408137 - 53408225
Alignment:
Q  344 ccatattttaataagcctaaattttcagcttacc-ttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53408137 ccatattttattaagcctaaattttcagcttacccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 53408225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23265955 - 23265865
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaa 311  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23265955 aaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 221 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44548340 - 44548185
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgac-ttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagctta 319  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||    
T  44548340 aaggccccgtttgaattggccttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatctta 44548241  T
Q  320 ccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 375  Q
     || | ||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  44548240 tcacaattttataagttgtttatgccctattttattaagcccaaattttaagctta 44548185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 368 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23261937 - 23261874
Alignment:
Q  368 tcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23261937 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 23261874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 328 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9595982 - 9595890
Alignment:
Q  328 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 427  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595982 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaactctc-----------cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 9595894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 292 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 51780845 - 51780763
Alignment:
Q  292 gtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 374  Q
    |||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51780845 gtttggataaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcccaaattttaagctt 51780763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 382 - 431
Target Start/End: Original strand, 50055301 - 50055350
Alignment:
Q  382 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055301 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 50055350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 431
Target Start/End: Original strand, 48748197 - 48748263
Alignment:
Q  365 ttttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48748197 ttttcagcataccctccgtcttaataaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctctctg 48748263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9596031 - 9595975
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagc 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9596031 aggccccgtttggattggcttattt-gagtttatgtgggcttatctactctcataagc 9595975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 375
Target Start/End: Original strand, 17493340 - 17493482
Alignment:
Q  233 ggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcata 332  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||  | |||||||||  |||||| ||||| | || ||||| |||||| || ||||| | ||||   || ||| |||    
T  17493340 ggattgacttattttgaatttatatgaacatatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatcttattctaattttata 17493439  T
Q  333 agctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 375  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  17493440 agctgcttataccatgttttaataagctcaaattttgagctta 17493482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 55344715 - 55344681
Alignment:
Q  397 ttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344715 ttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 55344681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 55344780 - 55344724
Alignment:
Q  314 agcttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 370  Q
    |||||| |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55344780 agcttatcatattttcatgagttgtttatgccatattttaataagccaaaattttca 55344724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22175185 - 22174976
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22175185 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 22175086  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175085 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 22174986  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  22174985 attctctctg 22174976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 50528922 - 50529131
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  50528922 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 50529021  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50529022 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcg 50529121  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  50529122 attctctctg 50529131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 222 - 430
Target Start/End: Original strand, 15520629 - 15520837
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15520629 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatc 15520728  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15520729 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttttgtaacctccttcg 15520828  T
Q  422 attctctct 430  Q
    |||||||||    
T  15520829 attctctct 15520837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 224 - 430
Target Start/End: Original strand, 20699144 - 20699350
Alignment:
Q  224 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccat 323  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20699144 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcat 20699243  T
Q  324 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20699244 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttaggaatttttgtaacctccttcgat 20699343  T
Q  424 tctctct 430  Q
    |||||||    
T  20699344 tctctct 20699350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20842544 - 20842334
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  20842544 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttat 20842445  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842444 catagtttcataagctgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 20842345  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  20842344 gattctctctg 20842334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 229 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44609521 - 44609319
Alignment:
Q  229 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagttt 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  44609521 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 44609422  T
Q  329 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44609421 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctctttcgattctct 44609322  T
Q  429 ctg 431  Q
    |||    
T  44609321 ctg 44609319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 37698338 - 37698129
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  37698338 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 37698239  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698238 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 37698139  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  37698138 attctctctg 37698129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 221 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 42308101 - 42307892
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  42308101 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 42308002  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42308001 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttc 42307902  T
Q  421 gattctctct 430  Q
    ||||||||||    
T  42307901 gattctctct 42307892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 25999382 - 25999590
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  25999382 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 25999481  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25999482 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcga 25999581  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  25999582 ttctctctg 25999590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15520338 - 15520128
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||     
T  15520338 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttat 15520239  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15520238 catcgtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattc 15520139  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  15520138 gattctctctg 15520128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 229 - 431
Target Start/End: Original strand, 21581042 - 21581244
Alignment:
Q  229 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagttt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  21581042 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagttt 21581141  T
Q  329 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21581142 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattctct 21581241  T
Q  429 ctg 431  Q
    |||    
T  21581242 ctg 21581244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25494479 - 25494271
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  25494479 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 25494380  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25494379 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcga 25494280  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  25494279 ttctctctg 25494271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 8042599 - 8042809
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||     
T  8042599 aaggccccgtttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttat 8042698  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042699 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 8042798  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  8042799 gattctctctg 8042809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 225 - 431
Target Start/End: Original strand, 38856089 - 38856295
Alignment:
Q  225 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccata 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  38856089 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 38856188  T
Q  325 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38856189 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgatt 38856288  T
Q  425 ctctctg 431  Q
     ||||||    
T  38856289 atctctg 38856295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 35226440 - 35226649
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  35226440 aggccctgtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagcttatc 35226539  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226540 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcctaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 35226639  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  35226640 attctctctg 35226649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 38933939 - 38934147
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  38933939 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 38934037  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934038 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagtctaaatttccagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 38934137  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  38934138 attctctctg 38934147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 222 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 46452357 - 46452149
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |    
T  46452357 aggccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 46452258  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46452257 atagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctcaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 46452158  T
Q  422 attctctct 430  Q
    |||||||||    
T  46452157 attctctct 46452149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 29445481 - 29445690
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  29445481 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 29445580  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29445581 atagtttcataagctgtttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcc 29445680  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||| ||||    
T  29445681 attctatctg 29445690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 221 - 426
Target Start/End: Original strand, 32244112 - 32244317
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||     
T  32244112 aaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 32244211  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244212 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 32244311  T
Q  421 gattct 426  Q
    ||||||    
T  32244312 gattct 32244317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12117854 - 12117644
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||     
T  12117854 aaggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttat 12117755  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12117754 catagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattc 12117655  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  12117654 gattctctctg 12117644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 54534521 - 54534314
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  54534521 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 54534422  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54534421 atggttt-ataagctgcttatgccata-ttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 54534324  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  54534323 attctctctg 54534314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 54870369 - 54870160
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  54870369 aggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 54870270  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870269 atcgtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 54870170  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||| ||||    
T  54870169 attctttctg 54870160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 2895179 - 2895391
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||    
T  2895179 ggccccatttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatca 2895278  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagct----tatgaatttatgtaacctcct 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||    
T  2895279 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatatatgaatttatataacctcct 2895378  T
Q  419 tcgattctctctg 431  Q
    |||||||||||||    
T  2895379 tcgattctctctg 2895391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 222 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 24835894 - 24835686
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||      
T  24835894 aggccccgtttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatt 24835795  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24835794 atagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaactccttcg 24835695  T
Q  422 attctctct 430  Q
    ||| |||||    
T  24835694 attatctct 24835686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 32359251 - 32359461
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||||| || |||     
T  32359251 aaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttat 32359350  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359351 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttc 32359450  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  32359451 gattctctctg 32359461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 233 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 42105155 - 42104957
Alignment:
Q  233 ggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcata 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  42105155 ggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatcatagtttcata 42105056  T
Q  333 agctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42105055 agctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcatgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattccctctg 42104957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 223 - 430
Target Start/End: Original strand, 26122808 - 26123015
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||    
T  26122808 ggcccagtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatca 26122907  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  26122908 tagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagtagcttatgaatttacgtaacattcttcga 26123007  T
Q  423 ttctctct 430  Q
    ||||||||    
T  26123008 ttctctct 26123015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 53028218 - 53028419
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||        ||||||| ||||| |||||| |    
T  53028218 aggccctgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttagaggt--------aaataaataaaaatagcttatc 53028309  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53028310 atattttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 53028409  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  53028410 attctctctg 53028419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 34700334 - 34700543
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |    
T  34700334 aggccccgtttagattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatc 34700433  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  34700434 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaagaagcttatgaatttatataacctcctttg 34700533  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||| ||||||    
T  34700534 attatctctg 34700543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 250 - 430
Target Start/End: Original strand, 44688782 - 44688961
Alignment:
Q  250 gcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataagctgcttatgccatat 349  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44688782 gcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgc-atat 44688880  T
Q  350 tttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 430  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44688881 tttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctctct 44688961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 229 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 48925189 - 48924989
Alignment:
Q  229 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagttt 328  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||||  ||||||| ||||| || ||  ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  48925189 gtttggattggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 48925092  T
Q  329 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 428  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48925091 cataagctgtttatgtcatattttaataagtctaaatttttagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 48924992  T
Q  429 ctg 431  Q
    |||    
T  48924991 ctg 48924989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 262 - 431
Target Start/End: Original strand, 16354379 - 16354548
Alignment:
Q  262 ttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcct 361  Q
    |||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16354379 ttatctacactcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgccatgttttaataagcct 16354478  T
Q  362 aaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16354479 aaattttcagcttatcctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctgcgattatctctg 16354548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 224 - 377
Target Start/End: Original strand, 35643212 - 35643365
Alignment:
Q  224 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  35643212 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 35643311  T
Q  324 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacc 377  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35643312 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttgagcttacc 35643365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 229 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 50529961 - 50529827
Alignment:
Q  229 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagttt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  50529961 gtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 50529862  T
Q  329 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50529861 cataagctgcttatgccatattttaatgagcctaa 50529827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 12915930 - 12916105
Alignment:
Q  252 ttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataagctgcttatgccatattt 351  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  12915930 ttatgtgggcttatttactc-cataaatctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatgtcatattt 12916028  T
Q  352 taataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 428  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12916029 aaataagcttaagttttcagcttaccctccggtttaagaaagagtttatgaatttatgtaacccccttcgattctct 12916105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 357
Target Start/End: Original strand, 49128041 - 49128177
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | ||||     
T  49128041 aaggccccgtttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataacttat 49128140  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataa 357  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49128141 cgtaatttcataagctgcttatgctatattttaataa 49128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Original strand, 24366143 - 24366230
Alignment:
Q  343 gccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 430  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24366143 gccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttagattctctct 24366230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 350 - 431
Target Start/End: Original strand, 13696914 - 13696995
Alignment:
Q  350 tttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13696914 tttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttgtgtaacctcctttgattctctctg 13696995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 279
Target Start/End: Original strand, 24366084 - 24366142
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagc 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24366084 aaggccccttttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagc 24366142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 383 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 50528916 - 50528868
Alignment:
Q  383 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  50528916 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctatctg 50528868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 256
Target Start/End: Original strand, 40240485 - 40240515
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40240485 cccgtttggattgacttattttgagcttatg 40240515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 52696788 - 52696996
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52696788 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatca 52696887  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696888 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 52696987  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    || ||||||    
T  52696988 ttatctctg 52696996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 25897370 - 25897579
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  25897370 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 25897469  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897470 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 25897569  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  25897570 attctctctg 25897579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26580479 - 26580270
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |    
T  26580479 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagcttatc 26580380  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580379 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 26580280  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||| ||||||    
T  26580279 attatctctg 26580270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 39260555 - 39260346
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  39260555 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 39260456  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260455 atagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 39260356  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  39260355 attctctctg 39260346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 52753356 - 52753147
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  52753356 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 52753257  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753256 atagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 52753157  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  52753156 attctctctg 52753147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 227 - 431
Target Start/End: Original strand, 8120870 - 8121074
Alignment:
Q  227 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagt 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  8120870 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagt 8120969  T
Q  327 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8120970 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagtttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 8121069  T
Q  427 ctctg 431  Q
    |||||    
T  8121070 ctctg 8121074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 42371003 - 42370795
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||    
T  42371003 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaacttatca 42370904  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42370903 tagtttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 42370804  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  42370803 ttctctctg 42370795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 222 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1170653 - 1170447
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1170653 aggccccgtttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 1170554  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1170553 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcg 1170454  T
Q  422 attctct 428  Q
    |||||||    
T  1170453 attctct 1170447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 20089466 - 20089676
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  20089466 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttat 20089565  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089566 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 20089665  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  20089666 gattctctctg 20089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 225 - 431
Target Start/End: Original strand, 26663257 - 26663463
Alignment:
Q  225 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccata 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  26663257 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 26663356  T
Q  325 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 424  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663357 gtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 26663456  T
Q  425 ctctctg 431  Q
    |||||||    
T  26663457 ctctctg 26663463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 29288145 - 29288352
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |    
T  29288145 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 29288244  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29288245 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaa--tatgtaacctccttcg 29288342  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  29288343 attctctctg 29288352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 1168499 - 1168708
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  1168499 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 1168598  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  1168599 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttg 1168698  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  1168699 attctctctg 1168708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 221 - 430
Target Start/End: Original strand, 16052091 - 16052300
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  16052091 aaggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 16052190  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052191 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 16052290  T
Q  421 gattctctct 430  Q
    ||||||||||    
T  16052291 gattctctct 16052300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 229 - 430
Target Start/End: Original strand, 29078519 - 29078720
Alignment:
Q  229 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagttt 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  29078519 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 29078618  T
Q  329 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078619 cataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 29078718  T
Q  429 ct 430  Q
    ||    
T  29078719 ct 29078720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 33510480 - 33510689
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||| |    
T  33510480 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatc 33510579  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510580 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 33510679  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  33510680 attctctctg 33510689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Original strand, 46760966 - 46761170
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  46760966 cccgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 46761065  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46761066 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacttccttcgattc 46761165  T
Q  426 tctct 430  Q
    |||||    
T  46761166 tctct 46761170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 970734 - 970524
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  970734 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 970635  T
Q  323 ta--gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  970634 tatagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttc 970535  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  970534 gattctctctg 970524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 225 - 431
Target Start/End: Original strand, 5215384 - 5215590
Alignment:
Q  225 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccata 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  5215384 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcata 5215483  T
Q  325 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 424  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215484 gtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaacttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 5215583  T
Q  425 ctctctg 431  Q
     ||||||    
T  5215584 atctctg 5215590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 229 - 431
Target Start/End: Original strand, 38829072 - 38829274
Alignment:
Q  229 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagttt 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  38829072 gtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 38829171  T
Q  329 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 428  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38829172 cataagctgcttgtgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcgattctct 38829271  T
Q  429 ctg 431  Q
    |||    
T  38829272 ctg 38829274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1940956 - 1940747
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  1940956 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 1940857  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1940856 atagtttcataagttgtttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttca 1940757  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  1940756 attctctctg 1940747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 12682817 - 12683025
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  12682817 ggccctgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 12682916  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12682917 tagtttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatctttagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcga 12683016  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  12683017 ttctctctg 12683025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 17591687 - 17591893
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17591687 aggccccgtttggattggcttatt--gagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 17591783  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591784 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttccagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 17591883  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  17591884 attctctctg 17591893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 32671574 - 32671784
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  32671574 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 32671673  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32671674 catagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttc 32671773  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  32671774 gattctctctg 32671784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 41928704 - 41928495
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |    
T  41928704 aggccccgtttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 41928605  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41928604 atagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcg 41928505  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  41928504 attctctctg 41928495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 8079914 - 8079710
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  8079914 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8079815  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8079814 tttcataagctacttatgccatattttaataagcctaagttttcagcttaccctctggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttgattc 8079715  T
Q  426 tctct 430  Q
    |||||    
T  8079714 tctct 8079710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 40092488 - 40092696
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||    
T  40092488 ggccctgtttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatca 40092587  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  40092588 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctttttcga 40092687  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    || ||||||    
T  40092688 ttttctctg 40092696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 43905649 - 43905859
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  43905649 aaggctccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 43905748  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43905749 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttacgtaacctccttc 43905848  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||| ||||||    
T  43905849 gattgtctctg 43905859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19715366 - 19715161
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |    
T  19715366 cccgtttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattg 19715267  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19715266 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 19715167  T
Q  426 tctctg 431  Q
    ||||||    
T  19715166 tctctg 19715161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 46409430 - 46409642
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  46409430 aaggctccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 46409529  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggc--ttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46409530 catagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttacccttcgacaattaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 46409629  T
Q  419 tcgattctctctg 431  Q
    |||||||||||||    
T  46409630 tcgattctctctg 46409642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 7145202 - 7145412
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttatttt-gagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagctta 319  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  7145202 aaggtcccgtttggattgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgtt-gggtaaataaacaaaaatagttta 7145300  T
Q  320 ccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 419  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145301 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 7145400  T
Q  420 cgattctctctg 431  Q
    ||||||||||||    
T  7145401 cgattctctctg 7145412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 2347652 - 2347862
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |    
T  2347652 aggccccgtttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 2347751  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccata-ttttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2347752 atagtttcataagctgcttatgtcatatttttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttc 2347851  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  2347852 gattctctctg 2347862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 242 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587505
Alignment:
Q  242 tattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataagctgctta 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctta 17587595  T
Q  342 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17587594 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctttctg 17587505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203317
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  15203109 ggccccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagcttatca 15203208  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15203209 tagtttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagccaaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcga 15203308  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  15203309 ttctctctg 15203317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 51359424 - 51359217
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||| |||||| ||    
T  51359424 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatca 51359326  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51359325 tagtttcataaggtgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcga 51359226  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  51359225 ttctctctg 51359217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13996933 - 13996723
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  13996933 aaggccctgtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttat 13996834  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13996833 aatggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcattc 13996734  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  13996733 gattctctctg 13996723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 15717787 - 15717986
Alignment:
Q  228 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  15717787 cgtttggattgacttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctttc-atagtt 15717885  T
Q  328 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 427  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15717886 tcataagctgcttatgccataatttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgattttatgtaacctccttcaattctc 15717985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 23498457 - 23498665
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | | ||    
T  23498457 ggccctgtttgaattggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttcatca 23498556  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23498557 tagtttcataagttgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcga 23498656  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  23498657 ttctctctg 23498665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 2473722 - 2473924
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||    
T  2473722 cccgtttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 2473821  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2473822 tttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctcctacttaacaaggagcttatgaatttatgttacctccttcgagtc 2473921  T
Q  426 tct 428  Q
    |||    
T  2473922 tct 2473924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 49146167 - 49146377
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  49146167 aaggctccgtttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttat 49146266  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  49146267 catagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcatcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacgtcattc 49146366  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  49146367 gattctctctg 49146377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15554353 - 15554152
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |       
T  15554353 aggccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcat--- 15554257  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
         ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15554256 -----ttcataaactgctgatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 15554162  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  15554161 attctctctg 15554152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 225 - 426
Target Start/End: Original strand, 6765458 - 6765659
Alignment:
Q  225 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccata 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||    
T  6765458 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 6765557  T
Q  325 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 424  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6765558 ttttcatgagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctccttcgatt 6765657  T
Q  425 ct 426  Q
    ||    
T  6765658 ct 6765659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 260 - 431
Target Start/End: Original strand, 40149497 - 40149668
Alignment:
Q  260 gcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 359  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40149497 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttatgtcatattttaataagc 40149596  T
Q  360 ctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40149597 ctaaattttcagtttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 40149668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 224 - 392
Target Start/End: Original strand, 29695673 - 29695842
Alignment:
Q  224 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataa-gcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||| ||    
T  29695673 gccctgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatca 29695772  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaag 392  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29695773 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaag 29695842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 430
Target Start/End: Original strand, 38171827 - 38172023
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||     
T  38171827 aaggctccgtttgcattgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtttat 38171926  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38171927 catagtttcataagctgcttatg-------------tgcctaaattttcagcttatcctccggcttaagaatgagcttatgaatttatgtaacctccttc 38172013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 222 - 355
Target Start/End: Original strand, 52086263 - 52086396
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| | |||| |    
T  52086263 aggccctgtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttatc 52086362  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaat 355  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52086363 ataatttcataagctgcttatgccataatttaat 52086396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23323031 - 23322897
Alignment:
Q  240 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataagctgct 339  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||  ||||| || ||||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  23323031 cttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgct 23322932  T
Q  340 tatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 374  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  23322931 tatgtcatactttaataagcgcaaattttaagctt 23322897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 5675100 - 5675176
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgg 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||  ||| |||||||    
T  5675100 aaggccccgtttggattggcttattttaagcttatgttagcttatctactaacataagctttttgaaagatgtttgg 5675176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 222 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5217992 - 5217840
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||  |||  ||    ||||||||||| || ||||| ||||||      
T  5217992 aggcctcgtttggattggcttattttaagcttatgagagcttatctactaacataagctctttcaaatacatttgggtaaat-aataaaaatagcttata 5217894  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 375  Q
      | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  5217893 ccaatttcataagccgcttataccatatttttataagccataattttgagctta 5217840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 15655908 - 15656118
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15655908 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttat 15656007  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15656008 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttc 15656107  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  15656108 gattctctctg 15656118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 43068173 - 43067963
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  43068173 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 43068074  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068073 catagtttcataagcttcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 43067974  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  43067973 gattctctctg 43067963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33359288 - 33359080
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  33359288 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 33359189  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359188 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 33359089  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  33359088 ttctctctg 33359080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 220 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 30181225 - 30181014
Alignment:
Q  220 aaaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagctta 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30181225 aaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 30181126  T
Q  320 ccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 419  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30181125 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaaccccctt 30181026  T
Q  420 cgattctctctg 431  Q
    ||||||||||||    
T  30181025 cgattctctctg 30181014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 218 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12101381 - 12101168
Alignment:
Q  218 acaaaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagct 317  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12101381 acaaaggccccatttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 12101282  T
Q  318 taccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 417  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101281 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctatggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 12101182  T
Q  418 ttcgattctctctg 431  Q
    ||||||||||||||    
T  12101181 ttcgattctctctg 12101168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24792531 - 24792322
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  24792531 aggccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 24792432  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792431 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 24792332  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  24792331 attctctctg 24792322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 224 - 431
Target Start/End: Original strand, 20346487 - 20346694
Alignment:
Q  224 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccat 323  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||    
T  20346487 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcat 20346586  T
Q  324 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20346587 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgaaacctccttcgat 20346686  T
Q  424 tctctctg 431  Q
    ||||||||    
T  20346687 tctctctg 20346694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 227 - 431
Target Start/End: Original strand, 42673467 - 42673667
Alignment:
Q  227 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagt 326  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||    
T  42673467 ccgtttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa----aacagcttatcatagt 42673562  T
Q  327 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673563 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 42673662  T
Q  427 ctctg 431  Q
    |||||    
T  42673663 ctctg 42673667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 42965196 - 42964986
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  42965196 aaggccccttttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 42965097  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965096 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 42964997  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  42964996 gattctctctg 42964986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 221 - 429
Target Start/End: Original strand, 3511319 - 3511527
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||     
T  3511319 aaggtcccgtttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagcttat 3511418  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511419 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 3511518  T
Q  421 gattctctc 429  Q
    |||||||||    
T  3511519 gattctctc 3511527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 42204150 - 42204361
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaa-ggtgtttgggtaaataaacaaaaacagctta 319  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  42204150 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagctta 42204249  T
Q  320 ccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 419  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42204250 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcctt 42204349  T
Q  420 cgattctctctg 431  Q
    ||||||||||||    
T  42204350 cgattctctctg 42204361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 228 - 431
Target Start/End: Original strand, 1803029 - 1803232
Alignment:
Q  228 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  1803029 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 1803128  T
Q  328 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 427  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803129 tcataagctgcttatacgatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 1803228  T
Q  428 tctg 431  Q
    ||||    
T  1803229 tctg 1803232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 5280856 - 5281066
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||     
T  5280856 aaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 5280955  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5280956 catagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 5281055  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  5281056 gattctctctg 5281066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 225 - 431
Target Start/End: Original strand, 7164184 - 7164390
Alignment:
Q  225 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccata 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  7164184 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 7164283  T
Q  325 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7164284 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgatt 7164383  T
Q  425 ctctctg 431  Q
    || ||||    
T  7164384 ctatctg 7164390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22649892 - 22649684
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  22649892 ggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 22649793  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22649792 taatttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcga 22649693  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    || ||||||    
T  22649692 ttttctctg 22649684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 4347269 - 4347478
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4347269 aaggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttac 4347368  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4347369 catagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctcgagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc-ccttc 4347467  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
     ||||||||||    
T  4347468 tattctctctg 4347478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33846723 - 33846519
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  33846723 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 33846624  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846623 atagtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta-----gggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 33846529  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  33846528 attctctctg 33846519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 221 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 36891029 - 36890821
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  36891029 aaggccccgtttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 36890931  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36890930 catagtttcataagttgcttatgccatatttcaataagcctaagttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 36890831  T
Q  421 gattctctct 430  Q
    ||||||||||    
T  36890830 gattctctct 36890821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 227 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4477515 - 4477311
Alignment:
Q  227 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagt 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||    
T  4477515 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggt 4477416  T
Q  327 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4477415 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 4477316  T
Q  427 ctctg 431  Q
    |||||    
T  4477315 ctctg 4477311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 933281 - 933491
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||     
T  933281 aaggccctgtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 933380  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933381 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 933480  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    || ||||||||    
T  933481 gaatctctctg 933491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 6394747 - 6394957
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||     
T  6394747 aaggccccgtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttat 6394846  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6394847 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 6394946  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  6394947 gattctctctg 6394957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 9452591 - 9452796
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||| |||||    
T  9452591 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatag 9452690  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452691 tttcataagctgtctatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 9452790  T
Q  426 tctctg 431  Q
    ||||||    
T  9452791 tctctg 9452796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12097788 - 12097580
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  12097788 ggccccatttggattggcttaagttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 12097689  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097688 tagtttcataagctacttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 12097589  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  12097588 ttctctctg 12097580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 25748485 - 25748693
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||| |  | |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  25748485 ggccccgtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 25748584  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748585 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 25748684  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    || ||||||    
T  25748685 ttatctctg 25748693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 429
Target Start/End: Original strand, 43156718 - 43156917
Alignment:
Q  230 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttc 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  43156718 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 43156817  T
Q  330 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 429  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156818 ataagctgtttatggcaaatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagaacttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 43156917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 32041539 - 32041748
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  32041539 aggccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 32041638  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  32041639 atagtttcataagctgcttatgtcatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttataaatttatgtaaccttattcg 32041738  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  32041739 attctctctg 32041748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 228 - 431
Target Start/End: Original strand, 38866547 - 38866750
Alignment:
Q  228 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtt 327  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  38866547 cgtttggatcgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 38866646  T
Q  328 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 427  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38866647 tcataagctgtttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatc 38866746  T
Q  428 tctg 431  Q
    ||||    
T  38866747 tctg 38866750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 224 - 431
Target Start/End: Original strand, 8630665 - 8630872
Alignment:
Q  224 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccat 323  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||    
T  8630665 gccccgtttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcat 8630764  T
Q  324 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8630765 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaatccccttcgat 8630864  T
Q  424 tctctctg 431  Q
    ||||||||    
T  8630865 tctctctg 8630872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 225 - 431
Target Start/End: Original strand, 17753600 - 17753806
Alignment:
Q  225 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccata 324  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  17753600 ccccgtttggattagcttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaacata 17753699  T
Q  325 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17753700 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttacccttcaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgatt 17753799  T
Q  425 ctctctg 431  Q
    |||||||    
T  17753800 ctctctg 17753806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 225 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 46134500 - 46134294
Alignment:
Q  225 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccata 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||  |||    
T  46134500 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattata 46134401  T
Q  325 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 424  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  46134400 gtttcataagctgtttacgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttattaatttatgtaacctcattcgatt 46134301  T
Q  425 ctctctg 431  Q
    |||||||    
T  46134300 ctctctg 46134294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 46891535 - 46891329
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaa-ggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccata 324  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||    
T  46891535 cccgtttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcata 46891436  T
Q  325 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 424  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46891435 gttttataagctgcttatgtcatattttaattagcctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcgatt 46891336  T
Q  425 ctctctg 431  Q
     ||||||    
T  46891335 gtctctg 46891329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 260 - 429
Target Start/End: Original strand, 48865665 - 48865837
Alignment:
Q  260 gcttatctactcgcataagcctttttg---aaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 356  Q
    |||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865665 gcttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 48865764  T
Q  357 agcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 429  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865765 agcctaaattttcagcttaacatcaggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 48865837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16894697 - 16894497
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| || |||     
T  16894697 aaggccccgtttggattggcttattttgagc----------ttatctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagtttat 16894608  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16894607 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcaacttaacagggagcttatgaatttatgtaacatccttc 16894508  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||| ||||    
T  16894507 gattctttctg 16894497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 43021776 - 43021570
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||   ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | ||||     
T  43021776 aaggccccatttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataacttat 43021677  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||    |  | |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43021676 tatagtttcataagctgcttatggcatatt----tcggtctaaattttcagcttactctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 43021581  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  43021580 gattctctctg 43021570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 221 - 370
Target Start/End: Original strand, 19828266 - 19828415
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  19828266 aaggccccgtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagcttat 19828365  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 370  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19828366 catagtttcataaattgcttatgccatattttaataagccaaaattttca 19828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 319
Target Start/End: Original strand, 37704976 - 37705074
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagctta 319  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  37704976 aaggccccgtttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 37705074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 221 - 427
Target Start/End: Original strand, 43405016 - 43405223
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||||     
T  43405016 aaggccccgtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttat 43405115  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttat-gaatttatgtaacctcctt 419  Q
    | || ||||||||| || || | | ||||||||||||||| || |||| |||||| |    |||||| || ||||||||| ||||| | |  ||||||||    
T  43405116 cgtaatttcataagttgtttctactatattttaataagcccaattttttagcttaacacaaggcttatcacggagcttatggaattcaagggacctcctt 43405215  T
Q  420 cgattctc 427  Q
    ||||||||    
T  43405216 cgattctc 43405223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37006011 - 37005857
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||   |||||  ||||| |||| |||||||||||| |  ||||| ||||||     
T  37006011 aaggctccgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagcttat 37005912  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 375  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  37005911 cgtaatttcataagctgcttatgctatattttaataaggctaattttttagctta 37005857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 36849735 - 36849590
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||  |||| |  ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||    
T  36849735 ggccccgtttggattgacttattcgaagcttatgtgggtttgtctactaacatatgtttttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttatca 36849636  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 368  Q
     | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  36849635 caatttcataaactgtttatgtcatattttaataagctcaaatttt 36849590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15655612 - 15655458
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||| |||| ||||||  |||||| |||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  15655612 aaggccgcgtttggattggcttattctaaacttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaaactatttggataaatcaataaaaatagcttac 15655513  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 375  Q
    || | ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  15655512 cacaattttataaactgcttataccaaattttaataagctcaaattttgagctta 15655458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 359
Target Start/End: Original strand, 20163824 - 20163953
Alignment:
Q  230 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttc 329  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||   ||||| ||||| |||| | |||||||| ||| ||  |||| |||||| || ||||||    
T  20163824 tttggattgacttattttgggcttatatgagcttatttaccaacataatcctttgtgaatgcgtttgggtgaattaattaaaatagcttatcacagtttc 20163923  T
Q  330 ataagctgcttatgccatattttaataagc 359  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  20163924 ataagctgcttatagcatattttaacaagc 20163953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30075426 - 30075277
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||| |||   |   |||||||||||| || ||||| ||||||  |    
T  30075426 ggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgagtttatctactaacataagccctttcagatacgtttgggtaaat-aataaaaatagctta-ta 30075329  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 375  Q
    || |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  30075328 ta-tttcataaaccgcttataccatattttaataagccataattttgagctta 30075277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27691506 - 27691435
Alignment:
Q  241 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaa 312  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  27691506 ttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaa 27691435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9008267 - 9008057
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  9008267 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 9008168  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9008167 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttc 9008068  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  9008067 gattctctctg 9008057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 16069351 - 16069561
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||     
T  16069351 aaggtcccgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttat 16069450  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069451 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 16069550  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  16069551 gattctctctg 16069561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27679378 - 27679169
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  27679378 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 27679279  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27679278 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcg 27679179  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  27679178 attctctctg 27679169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 222 - 428
Target Start/End: Original strand, 1579035 - 1579241
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |    
T  1579035 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 1579134  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579135 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 1579234  T
Q  422 attctct 428  Q
    |||||||    
T  1579235 attctct 1579241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 222 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1605780 - 1605574
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |    
T  1605780 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 1605681  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605680 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 1605581  T
Q  422 attctct 428  Q
    |||||||    
T  1605580 attctct 1605574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33491406 - 33491196
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  33491406 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 33491307  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491306 catagtttcataagctgcttttgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 33491207  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  33491206 gattctctctg 33491196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24105881 - 24105671
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  24105881 aaggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 24105782  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105781 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattatcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 24105682  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  24105681 gattctctctg 24105671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 228 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16737650 - 16737447
Alignment:
Q  228 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtt 327  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  16737650 cgtttgaattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 16737551  T
Q  328 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737550 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 16737451  T
Q  428 tctg 431  Q
    ||||    
T  16737450 tctg 16737447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 229 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3386688 - 3386486
Alignment:
Q  229 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagttt 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  3386688 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 3386589  T
Q  329 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3386588 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcctatgaatttatgtaacctccttcgattatct 3386489  T
Q  429 ctg 431  Q
    |||    
T  3386488 ctg 3386486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 221 - 427
Target Start/End: Original strand, 27420856 - 27421062
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || |||     
T  27420856 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttat 27420955  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27420956 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattc 27421055  T
Q  421 gattctc 427  Q
    |||||||    
T  27421056 gattctc 27421062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 31883142 - 31883352
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||     
T  31883142 aaggctccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 31883241  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883242 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 31883341  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  31883342 gattctctctg 31883352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 35782854 - 35782644
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  35782854 aaggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 35782755  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccg-gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35782754 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcctaccctccgtgctta-caaggagcttatgaatttatgtaacctcatt 35782656  T
Q  420 cgattctctctg 431  Q
    ||||||||||||    
T  35782655 cgattctctctg 35782644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8374547 - 8374339
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |    
T  8374547 aggccccgtttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 8374448  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8374447 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatg-atttatgtaacctccttcg 8374349  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  8374348 attctctctg 8374339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 33991139 - 33991348
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  33991139 aggccccgtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 33991238  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33991239 atagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcg 33991338  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  33991339 attctctctg 33991348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 230 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1165802 - 1165604
Alignment:
Q  230 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  1165802 tttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 1165703  T
Q  330 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 428  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165702 ataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1165604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 3921579 - 3921789
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  3921579 aaggtcccgtttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttat 3921678  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921679 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaaaaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 3921778  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  3921779 gattctctctg 3921789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 4120935 - 4121145
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||| |  |||     
T  4120935 aaggccccgtttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttat 4121034  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4121035 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttt 4121134  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  4121135 gattctctctg 4121145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 19358524 - 19358734
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  19358524 aaggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 19358623  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19358624 catagtttcataagctgcttatgccatattttagtaagcctaaattttcagcttaccctccaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttc 19358723  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  19358724 gattctctctg 19358734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 223 - 430
Target Start/End: Original strand, 5202972 - 5203179
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  5202972 ggccccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 5203071  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5203072 tagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtcaccttcttcga 5203171  T
Q  423 ttctctct 430  Q
    ||||||||    
T  5203172 ttctctct 5203179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20992356 - 20992146
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||     
T  20992356 aaggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatat 20992257  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20992256 catagtttcataagctgattatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttc 20992157  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  20992156 gattctctctg 20992146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 38598659 - 38598450
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| |||||| |    
T  38598659 aggcccggtttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatc 38598560  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38598559 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcg 38598460  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  38598459 attctctctg 38598450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 223 - 428
Target Start/End: Original strand, 31410476 - 31410681
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||    
T  31410476 ggccgcgtttggattgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatca 31410575  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31410576 tagttttataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtgacctccttcga 31410675  T
Q  423 ttctct 428  Q
    ||||||    
T  31410676 ttctct 31410681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 260 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26603113 - 26602942
Alignment:
Q  260 gcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 359  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26603113 gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagc 26603014  T
Q  360 ctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
     ||| ||||||| ||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26603013 ataatttttcagtttactctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctctctg 26602942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 268 - 431
Target Start/End: Original strand, 27025001 - 27025164
Alignment:
Q  268 actcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattt 367  Q
    |||| |||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27025001 actcccataagactttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccattttttaataagcctaaattt 27025100  T
Q  368 tcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025101 tcagcttaccctccggcttaacaaggagtttataaatttatgtaacctccttcgattctctctg 27025164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20992495 - 20992354
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgt----gggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagc 316  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20992495 aaggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 20992396  T
Q  317 ttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataag 358  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992395 atatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataag 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33284775 - 33284642
Alignment:
Q  231 ttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttca 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||||| |    
T  33284775 ttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttta 33284676  T
Q  331 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaa 364  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33284675 taaactgcttataccatatttcaataagcctaaa 33284642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 373 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 35420482 - 35420424
Alignment:
Q  373 ttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35420482 ttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 35420424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 359
Target Start/End: Original strand, 31638157 - 31638281
Alignment:
Q  235 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataag 334  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||  ||||||||||| | || |||||||| |||||  | ||||| | |||| || | ||| |||||    
T  31638157 attgacttattttatgtttatgtgagcttacctactaacataagcctttgtaaaagtgtttggataaatcgataaaaataacttatcacaattttataag 31638256  T
Q  335 ctgcttatgccatattttaataagc 359  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  31638257 cttcttatgtcatattttaataagc 31638281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 424
Target Start/End: Original strand, 27024822 - 27024853
Alignment:
Q  393 gagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024822 gagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 27024853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26603140 - 26603108
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttat 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26603140 ggccccgtttggattggcttattttgagcttat 26603108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24113375 - 24113166
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  24113375 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatc 24113276  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113275 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 24113176  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  24113175 attctctctg 24113166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 14422702 - 14422910
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  14422702 ggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 14422801  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422802 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 14422901  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  14422902 ttctctctg 14422910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 18594534 - 18594744
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  18594534 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 18594633  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594634 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 18594733  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  18594734 gattctctctg 18594744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 228 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 2042727 - 2042526
Alignment:
Q  228 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtt 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2042727 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtt 2042628  T
Q  328 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 427  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042627 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 2042528  T
Q  428 tc 429  Q
    ||    
T  2042527 tc 2042526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 39206584 - 39206793
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  39206584 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 39206683  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206684 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 39206783  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  39206784 attctctctg 39206793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 29938060 - 29938268
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||    
T  29938060 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatca 29938159  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938160 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 29938259  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  29938260 ttctctctg 29938268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 13110406 - 13110611
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  13110406 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 13110505  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13110506 tttaataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcgattc 13110605  T
Q  426 tctctg 431  Q
    ||||||    
T  13110606 tctctg 13110611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 227 - 431
Target Start/End: Original strand, 144397 - 144601
Alignment:
Q  227 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||    
T  144397 ccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtttatcatagt 144496  T
Q  327 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144497 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 144596  T
Q  427 ctctg 431  Q
    |||||    
T  144597 ctctg 144601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6144483 - 6144273
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  6144483 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 6144384  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144383 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 6144284  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  6144283 gattctctctg 6144273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22260839 - 22260630
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  22260839 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatc 22260740  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260739 ctagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 22260640  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  22260639 attctctctg 22260630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 35118239 - 35118031
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  35118239 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 35118140  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35118139 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcga 35118040  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  35118039 ttctctctg 35118031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 10836964 - 10836755
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |    
T  10836964 aggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 10836865  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10836864 atagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcg 10836765  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||| ||||||    
T  10836764 attatctctg 10836755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 222 - 430
Target Start/End: Original strand, 39218775 - 39218983
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||| |    
T  39218775 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatc 39218874  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39218875 atagcttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctgatgaatttatgtgacctccttcg 39218974  T
Q  422 attctctct 430  Q
    |||||||||    
T  39218975 attctctct 39218983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 33278399 - 33278607
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||    
T  33278399 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatca 33278498  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278499 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 33278598  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  33278599 ttctctctg 33278607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 224 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34842572 - 34842365
Alignment:
Q  224 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccat 323  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||    
T  34842572 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 34842473  T
Q  324 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34842472 agtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaatttccagcttacccaccgtcttaacaaggagcttattaatttatgtgacctccttcgat 34842373  T
Q  424 tctctctg 431  Q
    ||||||||    
T  34842372 tctctctg 34842365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 220 - 431
Target Start/End: Original strand, 36491153 - 36491364
Alignment:
Q  220 aaaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagctta 319  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36491153 aaaggccccatttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagctta 36491252  T
Q  320 ccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 419  Q
     |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  36491253 tcatagtttcataacttgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcttt 36491352  T
Q  420 cgattctctctg 431  Q
    ||||||||||||    
T  36491353 cgattctctctg 36491364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 221 - 430
Target Start/End: Original strand, 4035844 - 4036053
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||     
T  4035844 aaggccccgtttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttat 4035943  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4035944 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 4036043  T
Q  421 gattctctct 430  Q
    ||||||||||    
T  4036044 gattctctct 4036053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 229 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34679659 - 34679457
Alignment:
Q  229 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagttt 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  34679659 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagttt 34679560  T
Q  329 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 428  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34679559 cataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattcttt 34679460  T
Q  429 ctg 431  Q
    |||    
T  34679459 ctg 34679457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 7774762 - 7774971
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |    
T  7774762 aggcctcgtttagattggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatc 7774861  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7774862 atagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 7774961  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  7774962 attctctctg 7774971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 227 - 430
Target Start/End: Original strand, 41575516 - 41575719
Alignment:
Q  227 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagt 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||||    
T  41575516 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatagt 41575615  T
Q  327 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41575616 ttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattct 41575715  T
Q  427 ctct 430  Q
    ||||    
T  41575716 ctct 41575719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 225 - 431
Target Start/End: Original strand, 7791412 - 7791618
Alignment:
Q  225 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccata 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||    
T  7791412 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 7791511  T
Q  325 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 424  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7791512 gtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 7791611  T
Q  425 ctctctg 431  Q
    |||||||    
T  7791612 ctctctg 7791618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34999106 - 34998896
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  34999106 aaggtcccgtatggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 34999007  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  34999006 cttagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttgccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatttaatctccttc 34998907  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  34998906 gattctctctg 34998896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 223 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 38167363 - 38167159
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||    
T  38167363 ggccctgtttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagtttatca 38167264  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167263 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcga 38167164  T
Q  423 ttctc 427  Q
    |||||    
T  38167163 ttctc 38167159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 230 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 44805145 - 44804945
Alignment:
Q  230 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttc 329  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  44805145 tttgaattggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 44805046  T
Q  330 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805045 ataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 44804946  T
Q  430 t 430  Q
    |    
T  44804945 t 44804945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 7811993 - 7812202
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |    
T  7811993 aggccccgttttgattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatc 7812092  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7812093 atagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcg 7812192  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  7812193 attctctctg 7812202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 5320563 - 5320771
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |  ||| ||    
T  5320563 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatca 5320662  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5320663 tagtttcataagttgcttatgtcatgtttcaataagcctaaattttcaacttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 5320762  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  5320763 ttctctctg 5320771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 8021721 - 8021918
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  8021721 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 8021820  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  8021821 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttca--------tccggcttaacaaggagcttatgagtttatataacctacttcgattc 8021912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 222 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33287234 - 33287040
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||| |    
T  33287234 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatc 33287135  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287134 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc------------tagcttatgaatttatgtaacctccttcg 33287047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 221 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40118062 - 40117906
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  40118062 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 40117963  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40117962 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagcttacc 40117906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 228 - 431
Target Start/End: Original strand, 42571598 - 42571798
Alignment:
Q  228 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtt 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  42571598 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagtt 42571696  T
Q  328 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 427  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42571697 tcataagctgcttatgtcatatttcaat--gcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaaggaacttatgaatttatgcaacctctttcgattctc 42571794  T
Q  428 tctg 431  Q
    ||||    
T  42571795 tctg 42571798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 28639280 - 28639484
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcata----agcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||    ||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||| |    
T  28639280 cccgtttgaattggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaatagtttatc 28639379  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28639380 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacatagagcttatga--ttatgtaacctccttcg 28639477  T
Q  422 attctct 428  Q
    |||||||    
T  28639478 attctct 28639484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 221 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26783943 - 26783801
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||     
T  26783943 aaggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttat 26783844  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26783843 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 26783801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 227 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 66384 - 66180
Alignment:
Q  227 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagt 326  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| || |||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||    
T  66384 ccgtttagattggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataacttataatagt 66285  T
Q  327 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta-ccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  66284 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagtttaaattttcagcttaccctttcggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctccttcgattc 66185  T
Q  426 tctct 430  Q
    |||||    
T  66184 tctct 66180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 303 - 428
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807464
Alignment:
Q  303 taaacaaaaacagcttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatga 402  Q
    |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatga 9807438  T
Q  403 atttatgtaacctccttcgattctct 428  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9807439 atttatgaaacctccttcgtttctct 9807464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2322222 - 2322068
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||  |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  2322222 aaggccccgtttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagcttat 2322123  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 375  Q
    || | |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2322122 cacaatttcataagctgcttatatcatattttgataagcctaaattttaagctta 2322068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 311
Target Start/End: Original strand, 9806875 - 9806960
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  9806875 cccgtttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 229 - 352
Target Start/End: Original strand, 5005171 - 5005294
Alignment:
Q  229 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagttt 328  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||||   || | |    
T  5005171 gtttggattggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatgctactct 5005270  T
Q  329 cataagctgcttatgccatatttt 352  Q
    ||||| |||||||||| |||||||    
T  5005271 cataaactgcttatgctatatttt 5005294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 375
Target Start/End: Original strand, 39220258 - 39220407
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||| | |||||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||    |     
T  39220258 cccgtttgaattgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttattccaa 39220357  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 375  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  39220358 tttcataagctgctcatactatattttaataagctcaaattttgagctta 39220407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3347733 - 3347523
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  3347733 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttat 3347634  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347633 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 3347534  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  3347533 gattctctctg 3347523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 222 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 16307217 - 16307015
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  16307217 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatc 16307118  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16307117 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcg 16307018  T
Q  422 att 424  Q
    |||    
T  16307017 att 16307015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26947084 - 26946876
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  26947084 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 26946985  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946984 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 26946885  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  26946884 ttctctctg 26946876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 18613535 - 18613745
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  18613535 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttat 18613634  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613635 catagttccataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 18613734  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  18613735 gattctctctg 18613745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 2837543 - 2837752
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  2837543 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 2837642  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837643 atagtttcatgagctgctcatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 2837742  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  2837743 attctctctg 2837752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6086808 - 6086599
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  6086808 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 6086709  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086708 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 6086609  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  6086608 attctctctg 6086599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 30691850 - 30692058
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  30691850 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 30691949  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691950 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 30692049  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  30692050 ttctctctg 30692058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 21893453 - 21893662
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  21893453 aggccccgtttggatcgatttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatc 21893552  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893553 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 21893652  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  21893653 attctctctg 21893662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26704547 - 26704339
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  26704547 ggccccgtttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 26704448  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704447 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 26704348  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  26704347 ttctctctg 26704339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17261278 - 17261073
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||     
T  17261278 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatat 17261179  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17261178 tttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctccttcgattc 17261079  T
Q  426 tctctg 431  Q
    ||||||    
T  17261078 tctctg 17261073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 9459562 - 9459770
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  9459562 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatca 9459661  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459662 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtatcctccttcga 9459761  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  9459762 ttctctctg 9459770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 227 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34887496 - 34887292
Alignment:
Q  227 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  34887496 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 34887397  T
Q  327 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 426  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34887396 ttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctaatgaatttatgtgacctccttcgattct 34887297  T
Q  427 ctctg 431  Q
    |||||    
T  34887296 ctctg 34887292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Original strand, 20726790 - 20726994
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    |||| ||    
T  20726790 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaaaataa----cttatca 20726885  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726886 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 20726985  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  20726986 ttctctctg 20726994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 11167238 - 11167447
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  11167238 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 11167337  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167338 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccaccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 11167437  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  11167438 attctctctg 11167447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 225 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3955972 - 3955769
Alignment:
Q  225 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccata 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  3955972 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 3955873  T
Q  325 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 424  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  3955872 gtttcataaactgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa---ccttcgatt 3955776  T
Q  425 ctctctg 431  Q
    |||||||    
T  3955775 ctctctg 3955769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28199714 - 28199508
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatc---tactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  28199714 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactc-cataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 28199616  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199615 tagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 28199517  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  28199516 ttctctctg 28199508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 234 - 431
Target Start/End: Original strand, 1153603 - 1153800
Alignment:
Q  234 gattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataa 333  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||| |||||||||||||    
T  1153603 gattggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttcataa 1153702  T
Q  334 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1153703 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggtgcttatgtatttatgtaacctccttcgtttctctctg 1153800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 222 - 430
Target Start/End: Original strand, 35198282 - 35198489
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  35198282 aggccccgtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataagc-tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 35198380  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||    
T  35198381 atagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttactctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtgatctcattcg 35198480  T
Q  422 attctctct 430  Q
    |||||||||    
T  35198481 attctctct 35198489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 228 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 30699132 - 30698934
Alignment:
Q  228 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtt 327  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| || |   ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  30699132 cgtttggattgacttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30699033  T
Q  328 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 426  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699032 ttattagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 30698934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 222 - 387
Target Start/End: Original strand, 52834 - 52999
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  52834 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 52933  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggctta 387  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  52934 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggctta 52999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Original strand, 33464399 - 33464536
Alignment:
Q  294 ttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaagg 393  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33464399 ttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagg 33464498  T
Q  394 agcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464499 agcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 321 - 431
Target Start/End: Original strand, 53005 - 53115
Alignment:
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53005 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 53104  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  53105 gattctctctg 53115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 302
Target Start/End: Original strand, 33463697 - 33463779
Alignment:
Q  220 aaaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaa 302  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33463697 aaaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 223 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 23159 - 22956
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  23159 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 23060  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23059 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 22960  T
Q  423 ttct 426  Q
    ||||    
T  22959 ttct 22956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33906257 - 33906047
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  33906257 aaggccctgtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 33906158  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906157 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 33906058  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||| ||||||    
T  33906057 gattatctctg 33906047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31517423 - 31517215
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  31517423 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 31517324  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517323 tagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 31517224  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  31517223 ttctctctg 31517215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18807093 - 18806884
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  18807093 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 18806994  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806993 atagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 18806894  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  18806893 attctctctg 18806884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 223 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3873452 - 3873244
Alignment:
Q  223 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||    
T  3873452 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatca 3873353  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3873352 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatataacctcattcga 3873253  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  3873252 ttctctctg 3873244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 2178978 - 2178769
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  2178978 aggccccgtttggattgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 2178879  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178878 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 2178779  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  2178778 attctctctg 2178769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26323396 - 26323186
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  26323396 aaggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttat 26323297  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26323296 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattc 26323197  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  26323196 gattctctctg 26323186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 5733395 - 5733604
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |    
T  5733395 aggccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatc 5733494  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5733495 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcg 5733594  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  5733595 attctctctg 5733604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 222 - 430
Target Start/End: Original strand, 39635448 - 39635656
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||| |    
T  39635448 aggccccgtttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatc 39635547  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39635548 atagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaacgagcttatcaatttatgtaacctccttcg 39635647  T
Q  422 attctctct 430  Q
    |||||||||    
T  39635648 attctctct 39635656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28330042 - 28329839
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  28330042 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 28329943  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329942 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacc--ctagcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctccttcgattc 28329845  T
Q  426 tctctg 431  Q
    | ||||    
T  28329844 tttctg 28329839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 4016039 - 4016244
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | | || |||||    
T  4016039 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatag 4016138  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016139 tttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 4016238  T
Q  426 tctctg 431  Q
    ||||||    
T  4016239 tctctg 4016244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 42937715 - 42937925
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |    
T  42937715 aggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 42937814  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaat-aagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937815 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataaagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 42937914  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  42937915 gattctctctg 42937925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4232351 - 4232142
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  4232351 aggccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 4232252  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4232251 atagtttcataagctgcttatgccatattttcacaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcattcg 4232152  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||| ||||||    
T  4232151 attatctctg 4232142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6175037 - 6174828
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |    
T  6175037 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatc 6174938  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6174937 atagtttcataagctgcttatgtcatatttcattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctccttcg 6174838  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  6174837 attctctctg 6174828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 221 - 411
Target Start/End: Original strand, 1108275 - 1108464
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||     
T  1108275 aaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 1108373  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgta 411  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108374 catagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgta 1108464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 850997 - 851202
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||     
T  850997 cccgtttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataa 851096  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851097 ttttataagctgcttatgccatattttaataagcttaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 851196  T
Q  426 tctctg 431  Q
    ||||||    
T  851197 tctctg 851202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 227 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1483106 - 1482903
Alignment:
Q  227 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagt 326  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||  || ||    
T  1483106 ccgttttgattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactc-cataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgt 1483008  T
Q  327 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1483007 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttacccttcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattct 1482908  T
Q  427 ctctg 431  Q
    |||||    
T  1482907 ctctg 1482903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 30270889 - 30270679
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||| || |||     
T  30270889 aaggccccgtttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtttat 30270790  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30270789 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttc 30270690  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||| ||||||    
T  30270689 gattatctctg 30270679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 239 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19384127 - 19383938
Alignment:
Q  239 acttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataagctgc 338  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||     
T  19384127 acttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgt 19384028  T
Q  339 ttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19384027 ttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 19383938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 221 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19901347 - 19901143
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||||     
T  19901347 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataat-aaaaatagcttat 19901249  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19901248 catagtttcataaactgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcccacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttc 19901149  T
Q  421 gattct 426  Q
    ||||||    
T  19901148 gattct 19901143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 225 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 30420373 - 30420181
Alignment:
Q  225 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccata 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  30420373 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 30420274  T
Q  325 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30420273 ggttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcag------------cttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgatt 30420186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16066495 - 16066302
Alignment:
Q  230 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttc 329  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  16066495 tttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 16066396  T
Q  330 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066395 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgatttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 16066302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16588985 - 16588776
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||  ||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  16588985 aggctccgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 16588886  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16588885 atagtttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaattaatgtaacctccgtcg 16588786  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||| ||||||    
T  16588785 attatctctg 16588776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 227 - 427
Target Start/End: Original strand, 429817 - 430017
Alignment:
Q  227 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagt 326  Q
    ||||||| |||  ||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |    
T  429817 ccgtttgaattcccttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataat 429916  T
Q  327 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 426  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  429917 ttcataagttgcttatgcgatattttaataagcctaaattttcaacttacaattcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattct 430016  T
Q  427 c 427  Q
    |    
T  430017 c 430017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 224 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44947749 - 44947549
Alignment:
Q  224 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccat 323  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||| |||    
T  44947749 gccccatttgtattggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatcat 44947650  T
Q  324 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  44947649 agtttcataagctgcttatgccatattt-------gctaaattttcagtttaccctccggcttaacaagaagtttatgaatttatgtaacctccttcgat 44947557  T
Q  424 tctctctg 431  Q
    ||||||||    
T  44947556 tctctctg 44947549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 222 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42446778 - 42446625
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |    
T  42446778 aggccccgtttggattggcttattcggagtttatgcgaacttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatc 42446679  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 375  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  42446678 acaatttcataagctgcttatgccatattttaataagatcaaattttaagctta 42446625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22101316 - 22101210
Alignment:
Q  262 ttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcct 361  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||  ||||| || ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22101316 ttatctactaacataagcctttttaaaggtatttgtataaatcaataaaaacaacttatcacaatttcataagctgcttatgtcatattttaataagccc 22101217  T
Q  362 aaatttt 368  Q
    |||||||    
T  22101216 aaatttt 22101210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 3585291 - 3585439
Alignment:
Q  227 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatagt 326  Q
    |||||||||| | ||||||   |||||||||||  ||||| |||  ||||| |||| || || |||||| ||||||| || |||||||  ||| || | |    
T  3585291 ccgtttggatcggcttattcaaagcttatgtggatttatccactaacataaaccttattaaatgtgttttggtaaattaataaaaacaatttatcacaat 3585390  T
Q  327 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  3585391 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattatgagctta 3585439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Original strand, 36701 - 36910
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  36701 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 36800  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36801 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 36900  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  36901 attctctctg 36910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 221 - 431
Target Start/End: Original strand, 10233 - 10443
Alignment:
Q  221 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttac 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||     
T  10233 aaggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 10332  T
Q  321 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 420  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10333 catagtttcataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 10432  T
Q  421 gattctctctg 431  Q
    |||||||||||    
T  10433 gattctctctg 10443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145246
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccatag 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  145450 cccgtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 145351  T
Q  326 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  145350 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattc 145251  T
Q  426 tctct 430  Q
    |||||    
T  145250 tctct 145246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 224 - 431
Target Start/End: Original strand, 3708 - 3915
Alignment:
Q  224 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccat 323  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  3708 gccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 3807  T
Q  324 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  3808 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgat 3907  T
Q  424 tctctctg 431  Q
    ||||||||    
T  3908 tctctctg 3915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 222 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 215 - 6
Alignment:
Q  222 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacc 321  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  215 aggccccgtttgtattggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 116  T
Q  322 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  115 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataatcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 16  T
Q  422 attctctctg 431  Q
    ||||||||||    
T  15 attctctctg 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 6
Alignment:
Q  226 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatc---tactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttacca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  212 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactc-cataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 114  T
Q  323 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 422  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113 tagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 15  T
Q  423 ttctctctg 431  Q
    |||||||||    
T  14 ttctctctg 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 225 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 501 - 295
Alignment:
Q  225 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttaccata 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||    
T  501 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 402  T
Q  325 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 424  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  401 gtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 302  T
Q  425 ctctctg 431  Q
    |||||||    
T  301 ctctctg 295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University