View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11133_low_9 (Length: 562)

Name: NF11133_low_9
Description: NF11133
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11133_low_9
NF11133_low_9
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (18-547)||(15019675-15020204)
chr2 (18-547)||(31969100-31969629)
chr2 (18-547)||(15013183-15013709)
chr2 (18-527)||(14528701-14529216)
chr2 (18-527)||(14542927-14543442)
chr2 (18-547)||(15003732-15004260)
chr2 (18-517)||(14512251-14512756)
chr2 (18-547)||(14533935-14534461)
chr2 (18-537)||(15007773-15008292)
chr2 (18-528)||(14520091-14520598)
chr2 (18-547)||(14547074-14547603)
chr2 (51-527)||(14552317-14552793)
chr2 (54-525)||(14567359-14567830)
chr2 (51-529)||(14850206-14850684)
chr2 (51-533)||(15023743-15024225)
chr2 (285-527)||(14525113-14525355)
chr2 (270-528)||(14847502-14847755)
chr2 (467-527)||(14495102-14495162)
chr2 (469-512)||(14485650-14485693)
chr2 (459-507)||(14168641-14168689)
chr2 (467-515)||(14480917-14480965)
chr2 (467-526)||(14502589-14502648)
chr2 (467-527)||(14475717-14475777)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (467-530)||(49553785-49553848)
chr4 (46-120)||(17357027-17357101)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 547
Target Start/End: Original strand, 15019675 - 15020204
Alignment:
Q  18 actttcatcacaaccccacaaaaggttattgcctaagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||  ||| | ||| ||  ||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  15019675 actttcatcacaaccccacaaaatgttattgccaaagtttcaattctttctatctgatgcttcttattcctctgatattattccattgttaactgcacac 15019774  T
Q  118 ccttacattttacaaagtagcttggagagacgaataatccctccttttgaattgttaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgtttgcttaa 217  Q
    |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15019775 cctagaattttacaaggtagcttggagagacgaataatccctttttttgaattattaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgtttgcttaa 15019874  T
Q  218 ttcgatattgggctgcattttctactaatccctatcaccttattgtgcctaatatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccattgctag 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15019875 ttcgatattggactgcattttctactaatccccatgaccgtattgtgtctaatatcaatttgatggttgattttggattttctgattctaccattgctag 15019974  T
Q  318 attgcttcgaacaaggccatctatatttggttcaaatgatatgatgaagtcattggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacggctttt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15019975 attgcttcgaacaaggccatctatatttggttcaaatgatatgattaagttattggaggaaattaagggtttagggtttaaaccttcaacgaccgctttt 15020074  T
Q  418 gggactgctttgatgaccaagatattgatgagtaacatgctttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattc 517  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15020075 gggactgctttgatgaccaagcaattgttgggtaacatactttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattc 15020174  T
Q  518 gagcatttaggagtcatcctggtttgatgt 547  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15020175 gagtatttaggagtcagcctggtttgatgt 15020204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 547
Target Start/End: Original strand, 31969100 - 31969629
Alignment:
Q  18 actttcatcacaaccccacaaaaggttattgcctaagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31969100 actttcatcacaaccccacaaaaggttattgcctaagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactgcaaac 31969199  T
Q  118 ccttacattttacaaagtagcttggagagacgaataatccctccttttgaattgttaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgtttgcttaa 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  31969200 cctcacattttacaaagtagcttggacaaacgaataatccctctttttcaattgttaaataggttttcgaaaaccaacaaggatactattgtttacttaa 31969299  T
Q  218 ttcgatattgggctgcattttctactaatccctatcaccttattgtgcctaatatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccattgctag 317  Q
    ||||| |||      | |||  |  | |||||  | ||||| | | | |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  31969300 ttcgacattcaaggtcgtttattgtttatccccttaaccttctagaggctaatatcaatttgatggttgattttggagtttatgattctgccattgctag 31969399  T
Q  318 attgcttcgaacaaggccatctatatttggttcaaatgatatgatgaagtcattggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacggctttt 417  Q
    |||||||||||| |||  |||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||    
T  31969400 attgcttcgaactaggaaatctatatcttgttcaaatgatttgattaagtcattggaggacgttaagggtttagggtttgacccttcaacgatcgcattt 31969499  T
Q  418 gggactgctttgatgaccaagatattgatgagtaacatgctttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattc 517  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969500 gggactgctttggtgaccaagcaatgtatgagtaacatactttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattc 31969599  T
Q  518 gagcatttaggagtcatcctggtttgatgt 547  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  31969600 gagtatttaggagtcagcctagtttgatgt 31969629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 547
Target Start/End: Original strand, 15013183 - 15013709
Alignment:
Q  18 actttcatcacaaccccacaaaaggttattgcctaagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15013183 actttcatcacaaccccacaaaaggttattgcctaagtttcaattttttatatccaacggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactgcaaac 15013282  T
Q  118 ccttacattttacaaagtagcttggagagacgaataatccctccttttgaattgttaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgtttgcttaa 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  15013283 cctcacattttacaaagtagcttggacaaacggataatccctctttttcaattattaaataggtttttgaaaaccaacaaggatactattgtttacttaa 15013382  T
Q  218 ttcgatattgggctgcattttctactaatccctatcaccttattgtgcctaatatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccattgctag 317  Q
    ||| | |||      | |||   |||   |||  ||||||| | | | |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15013383 ttctaaattcaaggtcgtttataact---ccccttcaccttctagaggctaatatcaatttgatggttgattttggagtttgtgattctgccattgctag 15013479  T
Q  318 attgcttcgaacaaggccatctatatttggttcaaatgatatgatgaagtcattggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacggctttt 417  Q
    |||||||||||| |||  |||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  15013480 attgcttcgaactaggaaatctatatattgttcaaatgatttgattaagtcattggaggacgttaagggtttagggtttgacccttcaacggccgctttt 15013579  T
Q  418 gggactgctttgatgaccaagatattg-atgagtaacatgctttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttatt 516  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15013580 gggactgctttggtgaccaag-cattgtatgagtaacatactttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttatt 15013678  T
Q  517 cgagcatttaggagtcatcctggtttgatgt 547  Q
    |||| ||||||| |||| ||| |||||||||    
T  15013679 cgagtatttaggtgtcagcctagtttgatgt 15013709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 527
Target Start/End: Original strand, 14528701 - 14529216
Alignment:
Q  18 actttcatcacaaccccacaaaaggttattgcctaagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14528701 actttcatcacaaccccacaaaaggtttttgccaaagtttcaattttttctatccaatgctgcttcttcctctgatattgttccattgttaactacaaac 14528800  T
Q  118 ccttacattttacaaagtagc------ttggagagacgaataatccctccttttgaattgttaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgttt 211  Q
    |||   ||||||| |||||||      ||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14528801 cctagaattttacgaagtagcctggacttggagaaacaaataatccctctttttgaattattaagtaggttcttgaaaaccaacaaggatatcattcttt 14528900  T
Q  212 gcttaattcgatattgggctgcattttctactaatccctatcaccttattgtgcctaatatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccat 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |   ||    
T  14528901 gcttaattcgatattggactgcatttgctactaatccctatcaccttattgtgtctaatatcaatttgatgtctgattttggagtttctgataatgttat 14529000  T
Q  312 tgctagattgcttcgaacaaggccatctatatttggttcaaatgatatgatgaagtcattggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacg 411  Q
    || ||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||     
T  14529001 tggtagtttgcttcagtcaaggccgtctatatttggttcaaaggatttgattaagtcattggaggaagttaaggatttagggtttcatccttcaatgact 14529100  T
Q  412 gcttttgggactgctttgatgaccaagatattgatgagtaacatgctttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatg 511  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |  ||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  14529101 aattttgggactgctttgatggccaagaaatgtatgagtaaaaaactttgggatgagaaaattgatacctttaagaaatggggttggtctgatgaggcta 14529200  T
Q  512 ttattcgagcatttag 527  Q
    ||||||||||||||||    
T  14529201 ttattcgagcatttag 14529216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 527
Target Start/End: Original strand, 14542927 - 14543442
Alignment:
Q  18 actttcatcacaaccccacaaaaggttattgcctaagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14542927 actttcatcacaaccccacaaaaggtttttgccaaagtttcaattttttctatccaatgctgcttcttcctctgatattgttccattgttaactacaaac 14543026  T
Q  118 ccttacattttacaaagtagc------ttggagagacgaataatccctccttttgaattgttaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgttt 211  Q
    |||   ||||||| |||||||      ||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14543027 cctagaattttacgaagtagcctggacttggagaaacaaataatccctctttttgaattattaagtaggttcttgaaaaccaacaaggatatcattcttt 14543126  T
Q  212 gcttaattcgatattgggctgcattttctactaatccctatcaccttattgtgcctaatatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccat 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |   ||    
T  14543127 gcttaattcgatattggactgcatttgctactaatccctatcaccttattgtgtctaatatcaatttgatgtctgattttggagtttctgataatgttat 14543226  T
Q  312 tgctagattgcttcgaacaaggccatctatatttggttcaaatgatatgatgaagtcattggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacg 411  Q
    || ||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||     
T  14543227 tggtagtttgcttcagtcaaggccgtctatatttggttcaaaggatttgattaagtcattggaggaagttaaggatttagggtttcatccttcaatgact 14543326  T
Q  412 gcttttgggactgctttgatgaccaagatattgatgagtaacatgctttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatg 511  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |  ||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  14543327 aattttgggactgctttgatggccaagaaatgtatgagtaaaaaactttgggatgagaaaattgatacctttaagaaatggggttggtctgatgaggcta 14543426  T
Q  512 ttattcgagcatttag 527  Q
    ||||||||||||||||    
T  14543427 ttattcgagcatttag 14543442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 15004260 - 15003732
Alignment:
Q  18 actttcatcacaaccccacaaaaggttattgcctaagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaac 117  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15004260 actttcatcgcaaccccacaaaggtttattgtcaaagtttcaattttttctatccaaaggtgcttcttcctctgatattgtttcattgttaacttcaaac 15004161  T
Q  118 ccttacattttacaaagtagcttggagagacgaataatccctccttttgaattgttaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgtttgcttaa 217  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15004160 cctcgaattttacaaagtagcttggagaatcgaataatccctctttttgaattgttaaataggttttcgaaa-ccaacaaggataccattgttggcttaa 15004062  T
Q  218 ttcgatattgggctgcattttctactaatccctatcaccttattgtgcctaatatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccattgctag 317  Q
    |||||||||      | ||| ||  | ||||||||||| || | | | |||||||||||||||||   |||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  15004061 ttcgatattcaagatcgtttactttttatccctatcactttctagaggctaatatcaatttgatggtggattttgatgtttctgattctaccattgctag 15003962  T
Q  318 attgcttcgaacaaggccatctatatttggttcaaatgatatgatgaagtcattggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacggctttt 417  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  15003961 attgcttcaaaaaaggccatctatatttggttcaaaggatttgattatgtcattggaggaagttaagtgtttagggtttgacgcttcaacgaccactttt 15003862  T
Q  418 gggactgctttgatgaccaagatattgatgagtaacatgctttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattc 517  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15003861 gggactgctttgatgaccaagcaatgtatgagtaaaatactttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattc 15003762  T
Q  518 gagcatttaggagtcatcctggtttgatgt 547  Q
    ||| ||||||| |||| ||| |||||||||    
T  15003761 gagtatttaggtgtcagcctagtttgatgt 15003732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 517
Target Start/End: Original strand, 14512251 - 14512756
Alignment:
Q  18 actttcatcacaaccccacaaaaggttattgcctaagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14512251 actttcatcacaaccccacaaaaggtttttgccaaagtttcaattttttctatccaatgctgcttcttcctctgatattgttccattgttaactacaaac 14512350  T
Q  118 ccttacattttacaaagtagcttgga------gagacgaataatccctccttttgaattgttaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgttt 211  Q
    |||   ||||||| ||||||||||||      || || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14512351 cctagaattttacgaagtagcttggacttggagaaacaaataatccctctttttgaattattaagtaggttcttgaaaaccaacaaggatatcattcttt 14512450  T
Q  212 gcttaattcgatattgggctgcattttctactaatccctatcaccttattgtgcctaatatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccat 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |   ||    
T  14512451 gcttaattcgatattggactgcatttgctactaatccctatcaccttattgtgtctaatatcaatttgatgtctgattttggagtttctgataatgttat 14512550  T
Q  312 tgctagattgcttcgaacaaggccatctatatttggttcaaatgatatgatgaagtcattggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacg 411  Q
    || ||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||     
T  14512551 tggtagtttgcttcagtcaaggccgtctatatttggttcaaaggatttgattaagtcattagaggaagttaaggatttagggtttcatccttcattgact 14512650  T
Q  412 gcttttgggactgctttgatgaccaagatattgatgagtaacatgctttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatg 511  Q
     ||||| || ||||||||||  |||||| |   |||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  14512651 acttttagggctgctttgatagccaagaaaggtatgactaaaaaactttgggataagaaagttgatgtctttaagaaacggggttggtctggtgaagctg 14512750  T
Q  512 ttattc 517  Q
    ||||||    
T  14512751 ttattc 14512756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 547
Target Start/End: Original strand, 14533935 - 14534461
Alignment:
Q  18 actttcatcacaaccccacaaaaggttattgcctaagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14533935 actttcatcacaaccccacaaaaggttattgccaaagtttcaattttttctatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaac 14534034  T
Q  118 ccttacattttacaaagtagcttggagagacgaataatccctccttttgaattgttaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgtttgcttaa 217  Q
    |||   ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  14534035 cctcgaattttacgaagtagcttggagaaacaaataatccctctttttcaattattaagtaggtgcttaaaaaccaacagggatgccattatttgcttaa 14534134  T
Q  218 ttcgatattgggctgcattttctactaatccctatcaccttattgtgcctaatatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccattgctag 317  Q
    |   | ||||| || ||||| ||| | ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  14534135 taaaacattggactacatttactatttat---tatcaccttattgtggctaatatcaatttgatgactgattttggaattcctcattctgtcattgctag 14534231  T
Q  318 attgcttcgaacaaggccatctatatttggttcaaatgatatgatgaagtcattggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacggctttt 417  Q
    |||| ||||| | || |||| | || || ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||    
T  14534232 attgattcgatctagaccatttttaatttgttcaaaggatttgattaattcattggaggaaattaagggtttagggtttgatccttcaacgactactttt 14534331  T
Q  418 gggactgctttgatgaccaagatattgatgagtaacatgctttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattc 517  Q
    |||  ||||||| |  |||| |  |  | |||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14534332 gggtatgctttgttagccaataactgtacgagtaaaaaactttgggatgagaaagttgatgtcttgaagaaatggggttggtctgatgaagatgttatcc 14534431  T
Q  518 gagcatttaggagtcatcctggtttgatgt 547  Q
    | ||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  14534432 gggcatttaggtgtcatcctgatatgatgt 14534461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 537
Target Start/End: Original strand, 15007773 - 15008292
Alignment:
Q  18 actttcatcacaaccccacaaaaggttattgcctaagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15007773 actttcatcacaaccccacaaaatgttattgccaaagtttgaatattttctatccaaaggtgcttcttcagctgatattgtttcattgttaactgcaaac 15007872  T
Q  118 ccttacattttacaaagtagcttggagagacgaataatccctccttttgaattgttaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgtttgcttaa 217  Q
    |||   ||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15007873 cctacaattttacgaagtagcttgggcaaacgaataatccctctttttgaattgttaagtaggttctttaaaaccaacaaggatatcattgtttgcttac 15007972  T
Q  218 ttcgatattgggctgcattttctactaatccctatcaccttattgtgcctaatatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccattgctag 317  Q
    ||||| |||      | |||  || ||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  15007973 ttcgacattcaatgtcgtttattattagcccatatcaccttattgtggctaatatcaatttgataactggttttggagtttctgattctaccattgctaa 15008072  T
Q  318 attgcttcgaacaaggccatctatatttggttcaaatgatatgatgaagtcattggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacggctttt 417  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||  |||||    
T  15008073 attgcttcagaaaaggccatctatatttggttcaactgatttgattaagtcattagaggaagttaagcgtttagggtttcatccttcaacaactactttt 15008172  T
Q  418 gggactgctttgatgaccaagatattgatgagtaacatgctttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattc 517  Q
    |||||||||||||   |||||| |    | ||||| |  ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15008173 gggactgctttgacagccaagaaaggtttaagtaaaaaactttgggatgagaaagttgatgcctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattc 15008272  T
Q  518 gagcatttaggagtcatcct 537  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  15008273 gagcatttaggagttatcct 15008292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 528
Target Start/End: Original strand, 14520091 - 14520598
Alignment:
Q  18 actttcatcacaaccccacaaaaggttattgcctaagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||  ||||||||| |||   |||||||| ||||     
T  14520091 actttcatcacaaccccacaaaatggtattgccaaagtttcaatttttactctccaaaggtgcttcttcctctgatattattcgcctgttaactgcaaat 14520190  T
Q  118 ccttacattttacaaagtagcttggagagacgaataatccctccttttgaattgttaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgtttgcttaa 217  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14520191 cctaaaattttacaaagtagtttggagaaacgaataatccctctttttcaattgttaaataggttttcgaaaaccaacaaggataccattgtttgcttaa 14520290  T
Q  218 ttcgatattgggctgcattttctactaatccctatcaccttattgtgcctaatatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccattgctag 317  Q
    ||||| |||      | |||  || | ||||||||||  || | | | |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14520291 ttcgaaattcactatcgtttattatttatccctatcatgttctagaggctaatatcaatttgatgattgaatttggagtttctgattctaacattgctag 14520390  T
Q  318 attgcttcgaacaaggccatctatatttggttcaaatgatatgatgaagtcattggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacggctttt 417  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||  |||||    
T  14520391 attgcttcaaacaaggtcatctatatttggttcaactgatttgattaagtcattagaggaagttaagtgtttagggtttcatccttcaaagactactttt 14520490  T
Q  418 gggactgctttgatgaccaagatattgatgagtaacatgctttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattc 517  Q
    ||| ||||||||||  |||||| ||     ||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |    
T  14520491 ggggctgctttgatagccaagaaat---gtagtaaaaaactttgggatgagaaagttgatgtctttaagaaatggggctggtctgatgaagttgtcatcc 14520587  T
Q  518 gagcatttagg 528  Q
    ||| |||||||    
T  14520588 gagtatttagg 14520598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 547
Target Start/End: Original strand, 14547074 - 14547603
Alignment:
Q  18 actttcatcacaaccccacaaaaggttattgcctaagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaac 117  Q
    |||||||| |||||||||||| |   | ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||   ||||    
T  14547074 actttcattacaaccccacaatataattttgcccaagtttgaattttttctatccaaaggtgctacttcatctgatattgtttcattcataacagaaaac 14547173  T
Q  118 ccttacattttacaaagtagcttggagagacgaataatccctccttttgaattgttaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgtttgcttaa 217  Q
    |||   ||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  14547174 cctcgaattttgcgaagtagcttggagaaacgaattatccctctttttcaattgttaagtagcttcttgaaaaccaacaaggatgtcattctttgcttac 14547273  T
Q  218 ttcgatattgggctgcattttctactaatccctatcaccttattgtgcctaatatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccattgctag 317  Q
    ||||| ||| | ||    || ||  |||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  14547274 ttcgacattcgacttatgttacttttaattcctatcaccttgttgccgctaatatcaatttgatgactgattttggagtttctgattctgtcattgctag 14547373  T
Q  318 attgcttcgaacaaggccatctatatttggttcaaatgatatgatgaagtcattggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacggctttt 417  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| |  |||||    
T  14547374 cttgcttcaaaaaaggccatctatatttggttcgactgatttgattaagtcattggaggaagttaagtgtttagggtttgatccttcaacggctactttt 14547473  T
Q  418 gggactgctttgatgaccaagatattgatgagtaacatgctttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattc 517  Q
    ||| |||||||| |  |||||| ||  |||||||| |  |  |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||    
T  14547474 ggggctgctttgttcgccaagaaatgtatgagtaaaacacgatgggatgagaaagtcgccgtctttaagaaatggggttggtctgatgaaactttttttc 14547573  T
Q  518 gagcatttaggagtcatcctggtttgatgt 547  Q
     ||||||||||   |||||| |||||||||    
T  14547574 aagcatttaggttgcatcctagtttgatgt 14547603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 51 - 527
Target Start/End: Original strand, 14552317 - 14552793
Alignment:
Q  51 taagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaacccttacattttacaaagtagcttggagagacga 150  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| | ||||    
T  14552317 taagtttgaatattttctatccaaaggtgcttcttcatctcatattatttcattgttaacttcaaaccctcaaattttacaaagtagcctggacaaacga 14552416  T
Q  151 ataatccctccttttgaattgttaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgtttgcttaattcgatattgggctgcattttctactaatccct 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |       || ||| | |||||     
T  14552417 ataatccctctttttgaattgttaagaatgttctttaaaactaacaaggatacaattgtttgcttaattcgacattcgaaatgggttgctagttatcccc 14552516  T
Q  251 atcaccttattgtgcctaatatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccattgctagattgcttcgaacaaggccatctatatttggttc 350  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| ||  || |||||  ||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||| ||||    
T  14552517 atcaccttattgtggctaatattaatctgatgtctgattttggcgtgtctcattctgtcattgctagattgcttcaaattaaaccatctatattttgttc 14552616  T
Q  351 aaatgatatgatgaagtcattggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacggcttttgggactgctttgatgaccaagatattgatgagt 450  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||  |||  ||  |||||||| ||||||||||  |||||| |   ||||||    
T  14552617 aaaggatttgattaagtcattggaggaagttaaaggtttagggtttcatcccccaatcactacttttggggctgctttgatagccaagaaaggtatgagt 14552716  T
Q  451 aacatgctttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattcgagcatttag 527  Q
    || |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14552717 aaaaaactttgggatgagaaagttgatgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattcgagcatttag 14552793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 54 - 525
Target Start/End: Original strand, 14567359 - 14567830
Alignment:
Q  54 gtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaacccttacattttacaaagtagcttggagagacgaata 153  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||   ||||| || | ||| ||||||| |||||||    
T  14567359 gtttcacttttttctatccaaaggtgcttcttcctctgagattgtttcattgttaacttcaaaccctataattttgcatattagtttggagaaacgaata 14567458  T
Q  154 atccctccttttgaattgttaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgtttgcttaattcgatattgggctgcattttctactaatccctatc 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||   ||||||||||||  ||| ||||||    
T  14567459 atccctctttttgaattgttaagtaagttcttgaaaaccaacaaagatatcattatttgcttaattcggcattcaactgcattttctatgaattcctatc 14567558  T
Q  254 accttattgtgcctaatatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccattgctagattgcttcgaacaaggccatctatatttggttcaaa 353  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||    
T  14567559 accttattatggataatgtcaatttgatgtctgattttggagtttctgataatgtcattgctagtttgcttcagtcaaggccatctatagttggttcaaa 14567658  T
Q  354 tgatatgatgaagtcattggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacggcttttgggactgctttgatgaccaagatattgatgagtaac 453  Q
     ||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||  |  ||||||||  |||||||    |||||| ||  ||||| ||     
T  14567659 ggaattgattaagtcattggaggaagttaagagtttagggtttgatccttcaacagcttcttttggggttgctttggcagccaagaaatgtatgagaaaa 14567758  T
Q  454 atgctttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattcgagcattt 525  Q
    |  | ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14567759 aaacgttgggatgagaaagttgatgcctttaagaaatggggttggtctgatgaagctgttattcaagcattt 14567830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 51 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 14850684 - 14850206
Alignment:
Q  51 taagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaacccttacattttacaaagtagcttggagagacga 150  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||  |||||| || | ||||    
T  14850684 taagtttgaatattttctatccaaaggtgcttcttcctctcatattatttcattgttaacttcaaaccctcaaattttacaatatagcttagacaaacga 14850585  T
Q  151 ataatccctccttttgaattgttaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgtttgcttaattcgatattgggctgcattttctactaatccct 250  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| | ||||||||||||| ||   |||||||| |||  |||||||    
T  14850584 ataatccctctttttgaattattaagtaggttcttgaaatccagcaaggataccattctctgcttaattcgatgttccactgcatttactataaatccct 14850485  T
Q  251 atcaccttattgtgcctaatatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccattgctagattgcttcgaacaaggccatctatatttggttc 350  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||  ||||||   || |||||||| ||||||||||    
T  14850484 atcgcattattgtggctaatatcaatttgatgactgattttggagtttctgataatgtcattgctagtatgcttcagtcatggccatctgtatttggttc 14850385  T
Q  351 aaatgatatgatgaagtcattggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacggcttttgggactgctttgatgaccaagatattgatgagt 450  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| ||    |||||| | ||||||     | |||| |    |||||    
T  14850384 aaaggatttgattaagtcattggaggaagttaagtgtttagggtttgatccttcaaagaatagttttggaattgctttagcagcaaagaaaggtttgagt 14850285  T
Q  451 aacatgctttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattcgagcatttagga 529  Q
    || |  ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14850284 aaaaaactttgggatgagaaagttgatgcctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattcgagtatttagga 14850206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 51 - 533
Target Start/End: Original strand, 15023743 - 15024225
Alignment:
Q  51 taagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaacccttacattttacaaagtagcttggagagacga 150  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||| ||||  |||    
T  15023743 taagtttgaattttttctatccaaaggtgcttcttcatctcatattgtttcattgttaactacataccctcaaattttacaaactagctttgagaatcga 15023842  T
Q  151 ataatccctccttttgaattgttaagtaggtacttgaaaaccaacaaggatatcattgtttgcttaattcgatattgggctgcattttctactaatccct 250  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||  |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | ||| |       || ||| | |||||     
T  15023843 ataatccctctttttaaattgctaacaaggttctttaaaactaacaaggatactattgtttgcttaattcaacattcgaaatgggttactagtcatcccc 15023942  T
Q  251 atcaccttattgtgcctaatatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccattgctagattgcttcgaacaaggccatctatatttggttc 350  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  15023943 atcaccttattgtggctagtatcaatctgatttctgattttggagtttctgattctgtcattgctagattgcttcaaaataagccatctatatttggttc 15024042  T
Q  351 aaatgatatgatgaagtcattggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacggcttttgggactgctttgatgaccaagatattgatgagt 450  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||  |  ||||||||  ||||||| |  |||||| |   ||||||    
T  15024043 aaaggatttgattaagtcattggaggaagttaagagtttagggtttgatccttcaacagcttcttttggggttgctttggtagccaagaaaggtatgagt 15024142  T
Q  451 aacatgctttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattcgagcatttaggagtca 533  Q
    || |  ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||||||||    
T  15024143 aaaaaactttgggatgagaaagttgacacctttaagaaatggggttggtctgatgaaaatattgttgaagcatttaggagtca 15024225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 285 - 527
Target Start/End: Original strand, 14525113 - 14525355
Alignment:
Q  285 tgattttggagttcctgattctaccattgctagattgcttcgaacaaggccatctatatttggttcaaatgatatgatgaagtcattggaggaaattaag 384  Q
    ||||| |||||||  ||||||  | |||||||||||||||   ||||| ||| ||||| |||| |||| |||| | || |   | ||||||||| |||||    
T  14525113 tgattatggagtttgtgattccgctattgctagattgcttttgacaagaccagctatacttggatcaattgatttcattagtactttggaggaagttaag 14525212  T
Q  385 ggtttagggtttaacccttcaacgacggcttttgggactgctttgatgaccaagatattgatgagtaacatgctttgggataagaaagttgacgtcttta 484  Q
    |||||||||||| ||| ||||||  |  |||||||| | |||||| |  | |||| ||  |||||||| |  ||||||||| |||||||||| || ||||    
T  14525213 ggtttagggtttcacctttcaacttcaacttttggggcagctttggttgcaaagaaatgtatgagtaaaacactttgggatgagaaagttgatgttttta 14525312  T
Q  485 agaaatggggttggtctgatgaagatgttattcgagcatttag 527  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14525313 agaaatggggttggactgatgaagatgttattcgagcatttag 14525355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 270 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 14847755 - 14847502
Alignment:
Q  270 tatcaatttgatgactgattttggagttcctgattctaccattgctagattgcttcgaacaaggccatctatatttggttcaaatgatatgatgaagtca 369  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||  || || | |||| ||||||    
T  14847755 tatcaattttaggactgattttggagtttgcgattctaccattgatagattgcttcaaaaaaggtcatctatatttggtcaaactggtttgattaagtca 14847656  T
Q  370 ttggaggaaattaagggtttagggtttaacccttcaacgacggcttttgggactgctttgatgaccaagatattgatgagtaacatgctttgggataaga 469  Q
     ||||||   |||| |||||||| ||| | ||||||| |||  |||| ||| || | |||||  |||||| ||  | |||||| |  | ||||||| ||     
T  14847655 -tggagg---ttaacggtttaggttttgatccttcaatgactactttcggggcttccttgatagccaagaaatgtaggagtaaaacacgttgggatgag- 14847561  T
Q  470 aagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattcgagcatttagg 528  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||    
T  14847560 aagttgatgtctttgagaaacggggttggtctgatgaagctatttttcaagcatttagg 14847502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 467 - 527
Target Start/End: Original strand, 14495102 - 14495162
Alignment:
Q  467 agaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattcgagcatttag 527  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  14495102 agaaagttgatgccttgaagaaatggggttggtcggatgaagatgttcttcaagcatttag 14495162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 469 - 512
Target Start/End: Original strand, 14485650 - 14485693
Alignment:
Q  469 aaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgt 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14485650 aaagttgatgtctttaagaaatggggatggtctgatgaagatgt 14485693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 459 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 14168689 - 14168641
Alignment:
Q  459 ttgggataagaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaa 507  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14168689 ttgggatgcgaaagttgttgtctttaagaaatggggttggtctgatgaa 14168641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 467 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 14480965 - 14480917
Alignment:
Q  467 agaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttat 515  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14480965 agaaagttgatgcctttaagaagtggggttggtctgatgaagatattat 14480917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 467 - 526
Target Start/End: Original strand, 14502589 - 14502648
Alignment:
Q  467 agaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattcgagcattta 526  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||    
T  14502589 agaaagttgatgcctttaagaagtggggttggtcggatgaagatgttcttgaagcattta 14502648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 467 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 14475777 - 14475717
Alignment:
Q  467 agaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattcgagcatttag 527  Q
    ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||    
T  14475777 agaaagtcgatgcctttaagaagtggggttggtctgctgaagatgttctacaagcatttag 14475717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 467 - 530
Target Start/End: Original strand, 49553785 - 49553848
Alignment:
Q  467 agaaagttgacgtctttaagaaatggggttggtctgatgaagatgttattcgagcatttaggag 530  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||    
T  49553785 agaaagttgaaatttttaagaaatggggttggtctgatgaagacattcttcaagcatttaggag 49553848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 17357101 - 17357027
Alignment:
Q  46 ttgcctaagtttcaattttttatatccaatggtgcttctttatctgatattgttccattgttaactacaaaccct 120  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  17357101 ttgccaaagtttgaattttttctatccaaaggtgctacttcatctgatattgtttcattcgtaactgcaaaccct 17357027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University