View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11137_high_18 (Length: 438)

Name: NF11137_high_18
Description: NF11137
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11137_high_18
NF11137_high_18
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (6-423)||(26883885-26884302)
chr6 (21-285)||(27611065-27611329)
chr6 (21-279)||(27698557-27698815)
chr6 (30-285)||(27229092-27229347)
chr6 (21-283)||(27724908-27725170)
chr6 (21-283)||(26802304-26802566)
chr6 (21-283)||(27718442-27718704)
chr6 (21-285)||(27593083-27593347)
chr6 (21-285)||(27678806-27679070)
chr6 (21-285)||(31284148-31284412)
chr6 (21-285)||(26622836-26623100)
chr6 (21-285)||(26728814-26729078)
chr6 (21-283)||(26655851-26656113)
chr6 (21-283)||(26761822-26762084)
chr6 (21-285)||(26646339-26646603)
chr6 (21-285)||(26752307-26752571)
chr6 (21-283)||(28786140-28786402)
chr6 (21-283)||(28792261-28792523)
chr6 (21-285)||(27677677-27677941)
chr6 (21-285)||(28780999-28781263)
chr6 (21-251)||(25579613-25579843)
chr6 (21-283)||(27604768-27605030)
chr6 (24-285)||(26861476-26861737)
chr6 (21-285)||(27706465-27706729)
chr6 (21-263)||(27531260-27531502)
chr6 (21-251)||(26142759-26142989)
chr6 (21-285)||(27338128-27338392)
chr6 (21-285)||(27398868-27399132)
chr6 (21-251)||(25481636-25481866)
chr6 (24-251)||(25538434-25538661)
chr6 (21-251)||(26055820-26056050)
chr6 (21-251)||(26075790-26076020)
chr6 (21-302)||(26823683-26823964)
chr6 (21-251)||(26048739-26048969)
chr6 (21-251)||(26069908-26070138)
chr6 (21-280)||(28234429-28234688)
chr6 (21-247)||(28242702-28242928)
chr6 (21-283)||(28325343-28325605)
chr6 (21-268)||(28226827-28227074)
chr6 (21-271)||(28139415-28139665)
chr6 (21-131)||(28149952-28150061)
chr6 (21-283)||(28185228-28185490)
chr6 (21-283)||(28180976-28181238)
chr6 (21-283)||(28297776-28298038)
chr6 (21-283)||(28514035-28514297)
chr6 (21-129)||(26341997-26342105)
chr6 (21-103)||(27427669-27427751)
chr6 (21-226)||(27665180-27665385)
chr6 (27-130)||(25506978-25507081)
chr6 (24-250)||(26949556-26949782)
chr6 (21-130)||(2184303-2184412)
chr6 (21-130)||(26937109-26937218)
chr6 (21-63)||(26975134-26975176)
chr6 (21-213)||(26848592-26848784)
chr6 (27-215)||(29825957-29826145)
chr6 (24-63)||(2184980-2185019)
chr6 (21-64)||(27214498-27214541)
chr6 (21-64)||(27234687-27234730)
chr6 (21-63)||(25071741-25071783)
chr6 (21-226)||(28098432-28098637)
chr6 (98-130)||(28491660-28491692)
chr6 (98-130)||(29804070-29804102)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (21-283)||(3484-3747)
scaffold0349 (21-279)||(14419-14676)
scaffold0349 (218-283)||(8061-8126)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (21-302)||(28127729-28128011)
chr1 (21-285)||(28164412-28164676)
chr1 (21-285)||(268407-268671)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (21-283)||(4734-4996)
scaffold0277 (21-285)||(13695-13959)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (21-283)||(18724135-18724397)
chr4 (21-281)||(18679617-18679877)
chr4 (21-283)||(18731554-18731816)
chr4 (25-283)||(18655531-18655789)
chr4 (21-283)||(18699450-18699712)
chr4 (21-103)||(17989103-17989185)
chr4 (21-103)||(18073804-18073886)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (21-285)||(7385-7649)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (60-285)||(19-244)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (21-285)||(29273833-29274097)
chr8 (114-268)||(31903728-31903882)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (21-280)||(34590-34849)
scaffold0038 (21-247)||(42864-43090)
scaffold0038 (21-283)||(116658-116920)
scaffold0038 (21-268)||(27325-27572)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (21-283)||(58345-58607)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (21-103)||(59612-59694)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (21-130)||(3279703-3279812)
chr2 (21-63)||(17993747-17993789)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26884302 - 26883885
Alignment:
Q  6 gtagcagagaatgacatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatgg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884302 gtagcagtgaatgacatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatgg 26884203  T
Q  106 ccttgatgagtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884202 ccttgatgagtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttcc 26884103  T
Q  206 agtgaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaaggtgattgcattgccatggat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884102 agtgaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaaggtgattgcattgccatggat 26884003  T
Q  306 aattgtaggttactgtcgtttgtggagtaaatgagggaaactgatcatatcatatacaaataaaaatggcaagtttgaaaccaatcattcctttttggaa 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884002 aattgtaggttactgtcgtttgtggagtaaatgagggaaactgatcatatcatatacaaataaaaatggcaagtttgaaaccaatcattcctttttggaa 26883903  T
Q  406 taatttaaccaactcttt 423  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26883902 taatttaaccaactcttt 26883885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 27611065 - 27611329
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27611065 atgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatg 27611164  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||    
T  27611165 gtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcg 27611264  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27611265 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaagaag 27611329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 279
Target Start/End: Original strand, 27698557 - 27698815
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27698557 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttgagagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatg 27698656  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||    
T  27698657 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccg 27698756  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 279  Q
    ||||||| | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698757 agtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 27698815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27229347 - 27229092
Alignment:
Q  30 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgattt 129  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27229347 agttcgttcaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgattt 27229248  T
Q  130 cgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccgagtgtcact 229  Q
    ||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| | |||||||||| |    
T  27229247 cgtctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgagtgtcagt 27229148  T
Q  230 tcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27229147 gcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccaaaggaaaatgaagaggaag 27229092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 27724908 - 27725170
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27724908 atgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatg 27725007  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||    
T  27725008 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccg 27725107  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||||| | || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27725108 agtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 27725170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26802566 - 26802304
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802566 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 26802467  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||    
T  26802466 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccg 26802367  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26802366 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagagga 26802304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 27718442 - 27718704
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27718442 atgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatg 27718541  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||  | |||    
T  27718542 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaactgtgccg 27718641  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27718642 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagagga 27718704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 27593083 - 27593347
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  27593083 atgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 27593182  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27593183 gtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccg 27593282  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||| |||||    
T  27593283 agtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtaatcataggaaattgaagtggaag 27593347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27679070 - 27678806
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  27679070 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 27678971  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27678970 gtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattcccggtgaaaccgtaccg 27678871  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||| |||||    
T  27678870 agtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaag 27678806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31284412 - 31284148
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| |  || |||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  31284412 atgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatagttggcagaaaacacggggataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatg 31284313  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||    |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31284312 gtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccataccg 31284213  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  31284212 agtgtcacttcccctgaaactaaggaatacttggtatttgaatacataggaaattgaagaggaag 31284148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26623100 - 26622836
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| || || |||   |||||||    
T  26623100 atgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatg 26623001  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    || ||||||||   |||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26623000 gtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccg 26622901  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||    
T  26622900 agtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagaggaag 26622836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26729078 - 26728814
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| || || |||   |||||||    
T  26729078 atgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatg 26728979  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    || ||||||||   |||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26728978 gtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccg 26728879  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||    
T  26728878 agtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagaggaag 26728814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26656113 - 26655851
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26656113 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatg 26656014  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||  |||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || || ||||| | |||    
T  26656013 gtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccg 26655914  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
     |||||| | || || ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  26655913 ggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagagga 26655851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26762084 - 26761822
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26762084 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatg 26761985  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||  |||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || || ||||| | |||    
T  26761984 gtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccg 26761885  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
     |||||| | || || ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  26761884 ggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagagga 26761822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26646603 - 26646339
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26646603 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 26646504  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||    
T  26646503 gtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacg 26646404  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  26646403 agtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaattaaagaggaag 26646339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26752571 - 26752307
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26752571 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 26752472  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||    
T  26752471 gtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacg 26752372  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  26752371 agtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaattaaagaggaag 26752307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28786402 - 28786140
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||   || |  || |||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28786402 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatg 28786303  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||    
T  28786302 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcg 28786203  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786202 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 28786140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28792523 - 28792261
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||   || |  || |||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28792523 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatg 28792424  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||    
T  28792423 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcg 28792324  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28792323 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 28792261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 27677677 - 27677941
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  27677677 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacagcaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 27677776  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||    |||||| |||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27677777 gtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccg 27677876  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||| |||||    
T  27677877 agtgtcacttcctctgaaattgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaag 27677941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28781263 - 28780999
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28781263 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatg 28781164  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||    
T  28781163 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcg 28781064  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28781063 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaag 28780999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25579843 - 25579613
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25579843 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatg 25579744  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||| |  ||||||||| |||||||| || || |||   |  ||    
T  25579743 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaagtgttgcg 25579644  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacact 251  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25579643 agtgtcactgcctctgaaactgaggaacact 25579613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 27604768 - 27605030
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||| ||    
T  27604768 atgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaagaggcatatttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctg 27604867  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||    
T  27604868 gtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcg 27604967  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27604968 agtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaaatgaagagga 27605030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26861737 - 26861476
Alignment:
Q  24 tggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtg 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||  |     
T  26861737 tggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaacacaggaatgaaaattctagactcttcaatggcattgtcgagtgatcttt 26861638  T
Q  124 tgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccgagt 223  Q
    |||||||    |||||| |||| | |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  26861637 tgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattaccggtaaaaccataccgagt 26861538  T
Q  224 gtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  26861537 gtcacttcctctgaaactgaggaatacctggtatttgaatccataggaaatggaagaggaag 26861476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 27706465 - 27706729
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  27706465 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 27706564  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||    | |||| |||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27706565 gtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaaaagccttgtagagattgcctgtgaaaccgtaccg 27706664  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||| |||||    
T  27706665 agtgtcacctcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaag 27706729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 27531260 - 27531502
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  | |||||||    
T  27531260 atgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttttcagaaaatacgggaataaaaatcctagatttttcaatggcattttttagtgatg 27531359  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||    
T  27531360 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcg 27531459  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaat 263  Q
    ||||||    || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27531460 agtgtccgcgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 27531502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26142989 - 26142759
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26142989 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatg 26142890  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||||||||| |||||||| || || ||    |  ||    
T  26142889 gtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttgttgcg 26142790  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacact 251  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26142789 agtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26142759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 27338128 - 27338392
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  27338128 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatg 27338227  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||| ||||   |||||||  |||||  || |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||| ||  |    
T  27338228 gtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaag 27338327  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||| |  | || |||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||| |||||||||||    
T  27338328 agtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaag 27338392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 27398868 - 27399132
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  27398868 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatg 27398967  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||| ||||   |||||||  |||||  || |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||| ||  |    
T  27398968 gtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaag 27399067  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||| |  | || |||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||| |||||||||||    
T  27399068 agtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaag 27399132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25481866 - 25481636
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25481866 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatg 25481767  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||||||||| |||||||| || || |||   |  ||    
T  25481766 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcg 25481667  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacact 251  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  25481666 agtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 25481636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25538661 - 25538434
Alignment:
Q  24 tggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  25538661 tggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaattctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtg 25538562  T
Q  124 tgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccgagt 223  Q
    |||||||   |||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||    |||||||||| |  ||||||||| |||||||| || || ||    |  |||||    
T  25538561 tgatttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttgttgcgagt 25538462  T
Q  224 gtcacttcctctgaaactgaggaacact 251  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||    
T  25538461 gtcactgcccctgaaactgaggaacact 25538434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26056050 - 26055820
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  26056050 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatg 26055951  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
     |||||||||   ||||||| |||||| ||| ||||||||||| || |  |||||||||| |  ||||||||| |||||||| || || |||   |  ||    
T  26055950 atgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcg 26055851  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacact 251  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  26055850 agtgtcactgcccctgaaaatgaggaacact 26055820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26076020 - 26075790
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  26076020 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatg 26075921  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
     |||||||||   ||||||| |||||| ||| ||||||||||| || |  |||||||||| |  ||||||||| |||||||| || || |||   |  ||    
T  26075920 atgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcg 26075821  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacact 251  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  26075820 agtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 26075790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26823964 - 26823683
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||     
T  26823964 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggcagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattattgagtgatt 26823865  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||  |||||     |||||| |||| | |  ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||  |||||||    
T  26823864 gttcgattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaaaggtgtggattcccttgtctgtaagagccttgtagagattgccggtaaattcataccg 26823765  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaaggtgattgcattgccatg 302  Q
    |||||||   ||||| |||||||| |||||||||||  ||||  |||| |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  26823764 agtgtcagcgcctctaaaactgagaaacacttggtatttgaaatcatatgaaactgaagaggaagttgactgcatagccatg 26823683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26048969 - 26048739
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||   |    
T  26048969 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggccttgacaagtttgg 26048870  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||    |||||||||| | | |||||||| |||||||| || || |||   |  ||    
T  26048869 gtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcg 26048770  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacact 251  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26048769 agtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26048739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26070138 - 26069908
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||   |    
T  26070138 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggccttgacaagtttgg 26070039  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||    |||||||||| | | |||||||| |||||||| || || |||   |  ||    
T  26070038 gtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcg 26069939  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacact 251  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26069938 agtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26069908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28234688 - 28234429
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  28234688 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 28234589  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    |||| |||||   ||||| | |||| |   | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  | ||||||||| | || |||||||| ||    
T  28234588 gtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccatagcg 28234489  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaaga 280  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  || |||||||||||||| || |||||    
T  28234488 agtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggagaaagaaga 28234429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28242928 - 28242702
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  28242928 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 28242829  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    |||| |||| |   |||| |||||| |   | ||||||||||||||| | |||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28242828 gtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacg 28242729  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaa 247  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28242728 agtgtcactacctctaaaactaaggaa 28242702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28325605 - 28325343
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  28325605 atgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgacg 28325506  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    |||| ||||||   |||| | |||| |  || ||||||||||||||  | |||| |||  ||  |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28325505 gtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacg 28325406  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28325405 agtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 28325343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28227074 - 28226827
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  28227074 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgaccttgaaaagtgatg 28226975  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
     ||| |||||    |||| | |||| |   ||||||||| ||| ||||| |||||||| |||  |||| |  |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28226974 atgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagtaaaaccataacg 28226875  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccata 268  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||| |  || |||||||||||    
T  28226874 agtgtcaatacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccata 28226827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28139665 - 28139415
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |  || || ||||| ||||||||||||||||| || | |||||| |    
T  28139665 atgtggacaagttcgtccaagcaaaacgaagaagaggcatagttgatggaaaacacagggatgaaaatcctagattcttcaatggcttttacgagtgacg 28139566  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    |||  ||||||   |||| | |||| |   |||||||||| || |||||||||||   || |  |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  28139565 gtgatatttcgtcacctccttgaagctccctatcatcaataaaagtgtggattccacagtcacgaagagctttgtagagatttccagtgaaaccgaaacg 28139466  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatagga 271  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || || | ||| ||||| ||||||||    
T  28139465 agtgtcactgcctctgaagctgagaaagacatcgtatgtgaagccatagga 28139415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 28150061 - 28149952
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| || |||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||    
T  28150061 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgatagagaagattggaatgaaaatcctggactcttcaatggccttga-gagtgatg 28149963  T
Q  121 gtgtgatttcg 131  Q
    |||||||||||    
T  28149962 gtgtgatttcg 28149952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28185490 - 28185228
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  28185490 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 28185391  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
     ||| |||||    |||| | |||| |   | ||||| ||||||||  |||||||||||| |  ||||||  | | |||||||||||| |||| ||| ||    
T  28185390 atgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaacgataacg 28185291  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||||| |  || |||||||||||||| || ||||||||    
T  28185290 agtgtcactacctctaaagctaaggaacacgtcataggtgaatccataggagaaggaagagga 28185228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28181238 - 28180976
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  28181238 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 28181139  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
     ||| |||||    |||| | |||| |   | ||||| ||||||||  |||||||||||| |  ||||||  | | |||||||||||| |||||||| ||    
T  28181138 atgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaaccataacg 28181039  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||||||  ||||| || || |||||| | |  || |||||||||||||| || ||||||||    
T  28181038 agtgtcaccacctctaaagctaaggaacgcgtcataggtgaatccataggagaaggaagagga 28180976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 28297776 - 28298038
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||||  |||||||||  |||||  |||||||    
T  28297776 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgcttgaaaagtgatg 28297875  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    |||| ||||||   |||| |  ||| |   | ||||||||||||||| | ||||||||  ||  |||| | |||| |||||||||| | ||||  || ||    
T  28297876 gtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcctacaaagatctttgtggagatttccaataaaactgtagcg 28297975  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||| || ||||||||    
T  28297976 tgtgtcactacctctaaaacttaggaaaacgtcatgagtgaatccataggagaaggaagagga 28298038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28514297 - 28514035
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||||  |||||||||  |||||  |||||||    
T  28514297 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgcttgaaaagtgatg 28514198  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    |||| ||||||   |||| |  ||| |   | ||||||||||||||| | ||||||||  ||  |||| | |||| |||||||||| | ||||  || ||    
T  28514197 gtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcctacaaagatctttgtggagatttccaataaaactgtagcg 28514098  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||| || ||||||||    
T  28514097 tgtgtcactacctctaaaacttaggaaaacgtcatgagtgaatccataggagaaggaagagga 28514035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 26341997 - 26342105
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||  ||||||     
T  26341997 atgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactcttcaatggctttgacaagtgatt 26342096  T
Q  121 gtgtgattt 129  Q
    |||||||||    
T  26342097 gtgtgattt 26342105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 103
Target Start/End: Original strand, 27427669 - 27427751
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaat 103  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  27427669 atgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 27427751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 27665180 - 27665385
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||   |||   ||| || ||||||||||||  |||   |||||| |    
T  27665180 atgtggacaagttcatctaaacaaaatgaagaagtagcatagttcttagagaatataataatggcaatcctcgattcttcaatgctcttccggagtgaag 27665279  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    |||||||||||   ||  ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| || || ||||||||| | ||    
T  27665280 gtgtgatttcgtcaccagttggaagctccttgtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagaggttaccggtgaaaccaaatcg 27665379  T
Q  221 agtgtc 226  Q
    ||||||    
T  27665380 agtgtc 27665385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Original strand, 25506978 - 25507081
Alignment:
Q  27 acaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtga 126  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||    
T  25506978 acaagttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtgtga 25507077  T
Q  127 tttc 130  Q
    ||||    
T  25507078 tttc 25507081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26949782 - 26949556
Alignment:
Q  24 tggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtg 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |   ||||||| |    |||   |||||| |||||||||||   ||||| |||||| ||||    
T  26949782 tggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatattccttagaaaagacgataatggcaattctcgattcttcaattctcttgaggagtgaaggtg 26949683  T
Q  124 tgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccgagt 223  Q
    ||||||||   ||| |  |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||| || |||||||| || ||||||||  | |||||    
T  26949682 tgatttcgtcacctttctgaagctccttatcatcaatgaaggttcggattcccttgtcagagagagctttatagagattaccggtgaaaccgaatcgagt 26949583  T
Q  224 gtcacttcctctgaaactgaggaacac 250  Q
    |||  | ||||||||||| | ||||||    
T  26949582 gtcggtacctctgaaactaatgaacac 26949556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 2184412 - 2184303
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || || |  || || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||    
T  2184412 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagttctttgagaaaacagggatgaaaattctggactcttcaatggctttcataagtgatg 2184313  T
Q  121 gtgtgatttc 130  Q
     ||| |||||    
T  2184312 ctgttatttc 2184303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26937218 - 26937109
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||  || ||   ||| |  || |||||||| |||||||  |||||||    
T  26937218 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaatacaggtatggcaatcccggaatcttcaattgccttgacaagtgatg 26937119  T
Q  121 gtgtgatttc 130  Q
    ||||||||||    
T  26937118 gtgtgatttc 26937109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26975176 - 26975134
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26975176 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 26975134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26848784 - 26848592
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||   ||| ||||   ||||  |||| || || |||||||||  ||||| ||| || |    
T  26848784 atgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagttctcagagaatacaagaatggaaatcctcgagtcttcaatgttcttgaggagcgaag 26848685  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaac 213  Q
    ||||||| ||    || ||  ||||||  || ||||||||||||||  ||||||| |||| || |||||| || |||||||| ||||||||||    
T  26848684 gtgtgatctcatcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggttcggattccattgtcagaaagagctttatagagattaccagtgaaac 26848592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29826145 - 29825957
Alignment:
Q  27 acaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtga 126  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||||    || |||||||||| ||| ||||| |  ||||| |||||||    
T  29826145 acaagttcatctaagcaaaacgaagaagaagcataattggtagagaaaataggaatggctatcctagattcttgaattgccttcacaagtgagggtgtga 29826046  T
Q  127 tttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaacca 215  Q
    |||||   |||||| |||| |  || ||||||||||||||| | |||  ||||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  29826045 tttcgtcccctctttgaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaattttcttgtcagttagagctttgtagagattgccggtaaaacca 29825957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 2185019 - 2184980
Alignment:
Q  24 tggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2185019 tggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 2184980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 27214541 - 27214498
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagtt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27214541 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27214498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Original strand, 27234687 - 27234730
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagtt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27234687 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27234730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 25071783 - 25071741
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 63  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25071783 atgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 25071741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 28098432 - 28098637
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| || |  ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||  || |||     
T  28098432 atgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagaccggaattaaaatcctggactcttcgatggccttgacaagggatt 28098531  T
Q  121 gtgtgatt-tcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccatacc 219  Q
    |||||||| |  |  | || || |||||  ||||  |||||||||||| ||| |||   || |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28098532 gtgtgattctatcaccttcatg-aagatctttatggtcaatgaaggtgcggactcctccgtcacaaagagctttgtagagatttccagtaaaaccatacc 28098630  T
Q  220 gagtgtc 226  Q
    |||||||    
T  28098631 gagtgtc 28098637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 130
Target Start/End: Original strand, 28491660 - 28491692
Alignment:
Q  98 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttc 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28491660 ttcaatggctttgatgagtgatggtgtgatttc 28491692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 130
Target Start/End: Original strand, 29804070 - 29804102
Alignment:
Q  98 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttc 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29804070 ttcaatggctttgatgagtgatggtgtgatttc 29804102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 3484 - 3747
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatag-ttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3484 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgat 3583  T
Q  120 ggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccatacc 219  Q
    |||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||    
T  3584 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgcc 3683  T
Q  220 gagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    |||||||| | || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3684 gagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 3747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 279
Target Start/End: Original strand, 14419 - 14676
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14419 atgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatg 14517  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||    
T  14518 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccg 14617  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 279  Q
    ||||||| | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14618 agtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 14676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 283
Target Start/End: Original strand, 8061 - 8126
Alignment:
Q  218 ccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    |||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8061 ccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagagga 8126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 302
Target Start/End: Original strand, 28127729 - 28128011
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |    
T  28127729 atgtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaaatacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctttaaaagtgacg 28127828  T
Q  121 gtgtgatttcgct-tcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccatacc 219  Q
    |||||||||   | ||||||   ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||  ||||||||||| |  |    
T  28127829 gtgtgatttttttctcctctctcaagattacaatcatcaatgaatgtgtggattcccttgtcataaagggccttgtagagatggccagtgaaaccgtcac 28127928  T
Q  220 gagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaaggtgattgcattgccatg 302  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28127929 gagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaattgaagaggaatgtgattgcatagccatg 28128011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 28164412 - 28164676
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  28164412 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagataacacaggaataaaaattcaagatttttcaatggccttgatgaatgacg 28164511  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||   ||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||    ||| ||||| |||||||  ||||||||||| |  ||    
T  28164512 gtgtgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaattcccttgtcgtcaagggccttatagagatggccagtgaaaccgtcacg 28164611  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28164612 agtgtcactgcccctaaaactgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaattgaagaggaag 28164676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 268407 - 268671
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  268407 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatg 268506  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    || |||||||    |||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | ||||| |  ||    
T  268507 gtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccctcacg 268606  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||||  ||||||||  ||||||| || ||||| |  |||||||| || | |||||||||||    
T  268607 agtgtcaccgcctctgaagttgaggaagacctggtaggcaaatccatatgagattgaagaggaag 268671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 4734 - 4996
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  | ||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  4734 atgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatagaagatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgcggagggatg 4833  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||    
T  4834 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcg 4933  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4934 agtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 13695 - 13959
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  || |||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13695 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatg 13794  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||    
T  13795 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcg 13894  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13895 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaag 13959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 18724135 - 18724397
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  18724135 atgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatg 18724234  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    || |||||||    |||||| | || | |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||    
T  18724235 gtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacg 18724334  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18724335 agtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagagga 18724397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 281
Target Start/End: Original strand, 18679617 - 18679877
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  18679617 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatg 18679716  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    || |||||||    |||||| | || | |   ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||    
T  18679717 gtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacg 18679816  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagag 281  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18679817 agtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagag 18679877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 18731554 - 18731816
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  18731554 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatg 18731653  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    || |||||||    |||||| | || | |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  ||||| ||||| |  ||    
T  18731654 gtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctctgtagagatggccagtaaaaccgtcacg 18731753  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18731754 agtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagagga 18731816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Original strand, 18655531 - 18655789
Alignment:
Q  25 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||| || ||||| |||| |||||| |||  |||||||||| |    
T  18655531 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaagatcctagactcttgaatggcattgtcgagtgatggttt 18655630  T
Q  125 gatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccgagtg 224  Q
    ||||||    || ||| | || | |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||    
T  18655631 gatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatgcccagtaaaaccgttacgagtg 18655730  T
Q  225 tcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18655731 tcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagagga 18655789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 18699450 - 18699712
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  18699450 atgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatg 18699549  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    || |||||||    || ||| | || | |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  ||    
T  18699550 gtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatggccagtaaaaccgtcacg 18699649  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18699650 agtgtcagtgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagagga 18699712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 103
Target Start/End: Original strand, 17989103 - 17989185
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaat 103  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  17989103 atgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 17989185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 18073886 - 18073804
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaat 103  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  18073886 atgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 18073804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7649 - 7385
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  || |||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7649 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatg 7550  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||    
T  7549 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcg 7450  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7449 agtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaag 7385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 285
Target Start/End: Original strand, 19 - 244
Alignment:
Q  60 tagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaa 159  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  19 tagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaa 118  T
Q  160 tgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagt 259  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||||||||| | || || ||||| |||||||||||||||||    
T  119 tgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagt 218  T
Q  260 gaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||    
T  219 gaatgcatatgaaaatgaagaggaag 244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 29273833 - 29274097
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||    
T  29273833 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagactcttcaatgacattgtcgagtgatg 29273932  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
     | |||||||    |||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| | ||||| |  ||    
T  29273933 atttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagtcttgtagagatggccaataaaaccgtcacg 29274032  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 285  Q
    ||||||||  ||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  29274033 agtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaag 29274097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31903882 - 31903728
Alignment:
Q  114 agtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaac 213  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |||| |  | ||| ||||| ||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  31903882 agtgatggtgtgatttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataaagagctttgtagagatttccagtaaaac 31903783  T
Q  214 cataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccata 268  Q
    |||| ||||||||    ||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  31903782 catagcgagtgtctaagcctctaaagctgaggaacacatcgtaggtgaatccata 31903728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34849 - 34590
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  34849 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 34750  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    |||| |||||   ||||| | |||| |   | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  | ||||||||| | || |||||||| ||    
T  34749 gtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccatagcg 34650  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaaga 280  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  || |||||||||||||| || |||||    
T  34649 agtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggagaaagaaga 34590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43090 - 42864
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  43090 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 42991  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    |||| |||| |   |||| |||||| |   | ||||||||||||||| | |||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  42990 gtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacg 42891  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaa 247  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  42890 agtgtcactacctctaaaactaaggaa 42864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 116920 - 116658
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  116920 atgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgacg 116821  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    |||| ||||||   |||| | |||| |  || ||||||||||||||  | |||| |||  ||  |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  116820 gtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacg 116721  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  116720 agtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 116658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27572 - 27325
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  27572 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgaccttgaaaagtgatg 27473  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
     ||| |||||    |||| | |||| |   ||||||||| ||| ||||| |||||||| |||  |||| |  |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  27472 atgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagtaaaaccataacg 27373  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccata 268  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||| |  || |||||||||||    
T  27372 agtgtcaatacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccata 27325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 58345 - 58607
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||  |||||||    
T  58345 atgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggccttgaaaagtgatg 58444  T
Q  121 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 220  Q
    |||| ||||||   |||| | |||| |   | ||||| ||||||||  |||||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  58445 gtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagtaaaaccatagcg 58544  T
Q  221 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 283  Q
    ||||||||  ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||    
T  58545 agtgtcacaacctctaaagctaaggaacacgtgataggtgaatccataggagaaggaagagga 58607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 59694 - 59612
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaat 103  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  59694 atgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 59612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 3279812 - 3279703
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| || |  |||||||||||  | || ||||| ||||||||||  ||||||     
T  3279812 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggccttgacaagtgatt 3279713  T
Q  121 gtgtgatttc 130  Q
    ||||||||||    
T  3279712 gtgtgatttc 3279703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 63
Target Start/End: Original strand, 17993747 - 17993789
Alignment:
Q  21 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 63  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17993747 atgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 17993789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University