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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11137_low_3 (Length: 814)

Name: NF11137_low_3
Description: NF11137
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11137_low_3
NF11137_low_3
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (18-799)||(54013680-54014456)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 734; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 734; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 54014456 - 54013680
Alignment:
Q  18 caatttaactttttaagccttatcacatggattatgtttttggaaactgtctatttatacagccatagaggaagaccagttgcatatttattccggttca 117  Q
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T  54014456 caatttaactttttaagccttatcacatggattatgtttttggaaactgtctatttataaagccataaaggaagaccagttacatatttattccggttca 54014357  T
Q  118 tgaaccatgatacctccatgtgtttactatttactttatccacacgatcaattaatcagagtaaacatttttacacacgcatctaattaaattacacaat 217  Q
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T  54014356 tgaaccatgatacctccatgtgtttactatttactttatccacacgatcaattaatcagagtaaacatttttacacacgcatctaattaaattacacaat 54014257  T
Q  218 gatatcgttttcttaaatttattgttaaaatatgtacataaatatctatctgattatatggttagatgtgattgaatacacgtgtaattttttgaccgac 317  Q
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T  54014256 gatatcgttttcttaaatttattgttaaaatatgttcataaatatctatatgattatatggttagatgtgattgaatacacgtgtaattttttgaccgac 54014157  T
Q  318 cctatattagaataggacctatcctatattggaacctattctatactccttccaaactacatgtaaatattgtattggtgattaagcatgactttgtatt 417  Q
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T  54014156 cctatattagaataggaccgatcctatattggaacctattctatactccttccaaactacatgtaaatattgtattggtgattaagcatgactttgtatt 54014057  T
Q  418 ggtgcagctggaaatgcaacatttttggaacatctaattttgatggcagtgattggaatacctatctttggggcttcaatgatgggatatggatccggaa 517  Q
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T  54014056 ggtgcagctggaaatgcaacatttttggaacatctaattttgatggcagtgattggaatacctatctttggggcttcaatgatgggatatggatccggaa 54013957  T
Q  518 gtttggtatacggctatgttttgatttttgattttctaagatgcttgggtcattgcaacgttgaaataatcccacacaaattgttcaaggcatttccatt 617  Q
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T  54013956 gtttggtatacggctatgttttgatttttgattttctaagatgcttgggtcattgcaacgttgaaataatcccacacaaattgttcaaggcatttccatt 54013857  T
Q  618 tcttagatatgtgatatacacaccaacgtaagtttattaaaatttacatttacatttgtccaaaatttagattacagttaatgcacccttgaggttgagt 717  Q
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T  54013856 tcttagatatgtgatacacacaccaacgtaagtttattaaaatttacatttacatttgtccaaaatttagattacagttaatgcacccttgaggttgagt 54013757  T
Q  718 aacaaaacaaagtacgaatctctcttacttacactcattacttgttcaattgtcagacacataaaatagccccctcattcat 799  Q
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T  54013756 aa-----caaagtacgaatctctcttacttacactcattacttgttcaattgtcagacacataaaatagccccctcattcat 54013680  T

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