View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11141_low_6 (Length: 242)

Name: NF11141_low_6
Description: NF11141
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11141_low_6
NF11141_low_6
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (16-232)||(30391-30607)
[»] chr3 (91 HSPs)
chr3 (48-232)||(28194751-28194935)
chr3 (105-232)||(23371407-23371533)
chr3 (105-232)||(51300621-51300747)
chr3 (108-232)||(14763664-14763787)
chr3 (105-232)||(324294-324420)
chr3 (105-232)||(14179430-14179556)
chr3 (105-232)||(14670982-14671108)
chr3 (105-232)||(14682481-14682607)
chr3 (105-232)||(43889561-43889687)
chr3 (105-232)||(52989657-52989783)
chr3 (105-232)||(9577684-9577808)
chr3 (105-220)||(10834039-10834152)
chr3 (105-232)||(12339765-12339891)
chr3 (105-232)||(14966228-14966354)
chr3 (105-232)||(16796545-16796671)
chr3 (110-234)||(37427772-37427895)
chr3 (105-232)||(12469960-12470086)
chr3 (105-232)||(54876322-54876448)
chr3 (105-226)||(16643237-16643357)
chr3 (105-221)||(10542367-10542482)
chr3 (105-232)||(5223363-5223489)
chr3 (110-232)||(18700247-18700368)
chr3 (105-232)||(21837484-21837609)
chr3 (114-232)||(15465134-15465251)
chr3 (105-206)||(50242985-50243085)
chr3 (106-232)||(15246078-15246204)
chr3 (106-232)||(15265199-15265325)
chr3 (105-232)||(17691644-17691769)
chr3 (105-206)||(43550377-43550477)
chr3 (108-204)||(44494893-44494988)
chr3 (105-213)||(32402894-32403002)
chr3 (106-208)||(316202-316304)
chr3 (106-188)||(15207040-15207122)
chr3 (104-211)||(23318649-23318754)
chr3 (105-170)||(9533416-9533481)
chr3 (94-223)||(34852578-34852708)
chr3 (110-223)||(8928369-8928481)
chr3 (125-214)||(13919408-13919495)
chr3 (152-232)||(3264997-3265076)
chr3 (152-232)||(36527803-36527882)
chr3 (110-217)||(14568899-14569007)
chr3 (105-161)||(17248221-17248276)
chr3 (105-161)||(24340657-24340713)
chr3 (105-161)||(37642199-37642255)
chr3 (181-232)||(4588864-4588915)
chr3 (181-232)||(11854700-11854751)
chr3 (165-232)||(11914011-11914077)
chr3 (105-212)||(12378003-12378108)
chr3 (105-159)||(37251102-37251156)
chr3 (147-209)||(38311759-38311820)
chr3 (181-234)||(15617339-15617392)
chr3 (108-161)||(29172565-29172618)
chr3 (181-234)||(30065911-30065964)
chr3 (110-162)||(2051138-2051190)
chr3 (105-161)||(8899221-8899276)
chr3 (110-162)||(52523666-52523718)
chr3 (105-161)||(53070633-53070688)
chr3 (181-232)||(4107488-4107539)
chr3 (181-232)||(4111340-4111391)
chr3 (181-232)||(7109665-7109716)
chr3 (181-232)||(7113600-7113651)
chr3 (181-232)||(11070035-11070086)
chr3 (181-232)||(11165620-11165671)
chr3 (181-232)||(15964936-15964987)
chr3 (181-232)||(15968860-15968911)
chr3 (181-232)||(15972784-15972835)
chr3 (181-232)||(22321631-22321682)
chr3 (181-232)||(22336686-22336737)
chr3 (181-232)||(27409735-27409786)
chr3 (181-232)||(28949691-28949742)
chr3 (181-232)||(37439727-37439778)
chr3 (181-232)||(55022834-55022885)
chr3 (181-219)||(19775745-19775783)
chr3 (147-209)||(20248741-20248803)
chr3 (108-161)||(7781330-7781382)
chr3 (108-161)||(9707590-9707642)
chr3 (108-161)||(10247706-10247758)
chr3 (108-161)||(13151773-13151825)
chr3 (108-161)||(13154238-13154290)
chr3 (108-161)||(16282794-16282846)
chr3 (108-161)||(16454264-16454316)
chr3 (108-161)||(17463305-17463357)
chr3 (108-161)||(34159453-34159505)
chr3 (108-161)||(38961874-38961926)
chr3 (108-161)||(41124014-41124066)
chr3 (108-161)||(45606890-45606942)
chr3 (108-161)||(55476618-55476670)
chr3 (105-149)||(12119704-12119747)
chr3 (105-161)||(17672753-17672808)
chr3 (113-161)||(22147467-22147515)
chr3 (105-161)||(50242949-50243004)
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (105-237)||(17438151-17438283)
chr8 (105-232)||(5083088-5083215)
chr8 (105-231)||(17086088-17086213)
chr8 (106-232)||(37515765-37515890)
chr8 (105-232)||(18833622-18833748)
chr8 (105-232)||(23659467-23659593)
chr8 (105-228)||(23667872-23667995)
chr8 (105-232)||(20502036-20502162)
chr8 (105-219)||(25363137-25363250)
chr8 (105-232)||(17460987-17461113)
chr8 (105-232)||(19808297-19808423)
chr8 (109-232)||(22963351-22963474)
chr8 (105-219)||(22237954-22238067)
chr8 (105-232)||(14397797-14397923)
chr8 (105-232)||(22253100-22253226)
chr8 (105-232)||(23943928-23944054)
chr8 (105-195)||(25484174-25484263)
chr8 (105-217)||(16799561-16799673)
chr8 (105-208)||(22995927-22996029)
chr8 (104-206)||(28397635-28397736)
chr8 (105-171)||(27941589-27941655)
chr8 (146-232)||(23914097-23914183)
chr8 (105-214)||(35026797-35026903)
chr8 (105-207)||(37116434-37116535)
chr8 (113-222)||(14103167-14103275)
chr8 (105-218)||(19154820-19154932)
chr8 (105-176)||(21346167-21346239)
chr8 (156-232)||(23409855-23409930)
chr8 (105-162)||(2418808-2418865)
chr8 (114-218)||(20533352-20533455)
chr8 (105-207)||(17439440-17439541)
chr8 (105-214)||(22419349-22419455)
chr8 (105-161)||(13508019-13508075)
chr8 (105-161)||(13597551-13597607)
chr8 (105-207)||(17266927-17267028)
chr8 (105-207)||(22364748-22364848)
chr8 (147-209)||(44476753-44476814)
chr8 (147-209)||(44480015-44480076)
chr8 (105-162)||(20498692-20498749)
chr8 (113-229)||(13665189-13665304)
chr8 (113-229)||(13724464-13724579)
chr8 (105-161)||(41598315-41598370)
chr8 (181-232)||(18862736-18862787)
chr8 (181-232)||(19278374-19278425)
chr8 (181-232)||(21410914-21410965)
chr8 (181-232)||(21805406-21805457)
chr8 (181-232)||(21828105-21828156)
chr8 (181-232)||(21972676-21972727)
chr8 (181-232)||(21976761-21976812)
chr8 (105-148)||(22525659-22525702)
chr8 (181-232)||(43251777-43251828)
chr8 (181-230)||(1327017-1327066)
chr8 (108-161)||(1484529-1484581)
chr8 (108-161)||(4483407-4483459)
chr8 (108-161)||(5853275-5853327)
chr8 (108-161)||(14409427-14409479)
chr8 (108-161)||(15203214-15203266)
chr8 (108-161)||(19896395-19896447)
chr8 (108-161)||(20046178-20046230)
chr8 (108-161)||(20403354-20403406)
chr8 (108-161)||(22001880-22001932)
chr8 (105-162)||(24353150-24353207)
chr8 (108-161)||(24486027-24486079)
chr8 (108-161)||(32810058-32810110)
chr8 (105-161)||(25484255-25484310)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (105-232)||(142641-142768)
scaffold0020 (123-232)||(169702-169810)
[»] chr7 (95 HSPs)
chr7 (105-232)||(20619440-20619567)
chr7 (105-232)||(130751-130878)
chr7 (105-232)||(11525498-11525625)
chr7 (105-232)||(11661332-11661458)
chr7 (105-232)||(14566228-14566354)
chr7 (105-232)||(18872386-18872512)
chr7 (108-232)||(16008604-16008727)
chr7 (16-149)||(16495541-16495673)
chr7 (108-232)||(42462009-42462132)
chr7 (105-232)||(18607513-18607639)
chr7 (105-232)||(38519432-38519558)
chr7 (106-232)||(9033281-9033407)
chr7 (105-232)||(10501358-10501484)
chr7 (105-232)||(46580610-46580736)
chr7 (105-228)||(11768853-11768977)
chr7 (105-232)||(14422010-14422137)
chr7 (105-232)||(14258510-14258636)
chr7 (105-232)||(14273574-14273700)
chr7 (105-232)||(16460700-16460826)
chr7 (105-232)||(16998652-16998778)
chr7 (105-232)||(32301347-32301473)
chr7 (105-230)||(16996284-16996407)
chr7 (105-232)||(14157039-14157165)
chr7 (105-232)||(16579818-16579944)
chr7 (105-232)||(16585719-16585845)
chr7 (105-232)||(20487601-20487727)
chr7 (105-232)||(1858766-1858892)
chr7 (105-232)||(25927186-25927309)
chr7 (105-232)||(17060358-17060485)
chr7 (105-206)||(13647492-13647592)
chr7 (105-232)||(9177600-9177726)
chr7 (105-232)||(13918460-13918586)
chr7 (106-179)||(9725595-9725668)
chr7 (105-208)||(14929155-14929257)
chr7 (105-208)||(15352621-15352723)
chr7 (94-223)||(16109435-16109565)
chr7 (105-223)||(17017402-17017519)
chr7 (105-162)||(1867929-1867986)
chr7 (105-162)||(15008433-15008490)
chr7 (125-223)||(837311-837408)
chr7 (125-223)||(1202491-1202588)
chr7 (146-237)||(15720050-15720140)
chr7 (105-171)||(147704-147770)
chr7 (105-162)||(20220124-20220181)
chr7 (125-232)||(833315-833421)
chr7 (125-232)||(1198495-1198601)
chr7 (105-169)||(2529988-2530052)
chr7 (165-232)||(8940309-8940375)
chr7 (105-208)||(48991266-48991366)
chr7 (138-218)||(18203887-18203965)
chr7 (181-232)||(18279367-18279418)
chr7 (181-232)||(18283330-18283381)
chr7 (147-209)||(10896687-10896748)
chr7 (147-209)||(15167285-15167346)
chr7 (105-162)||(2280053-2280110)
chr7 (110-222)||(38828298-38828409)
chr7 (105-161)||(13647456-13647511)
chr7 (105-161)||(15081929-15081984)
chr7 (105-161)||(17061895-17061950)
chr7 (105-161)||(19486678-19486734)
chr7 (181-232)||(33071-33122)
chr7 (181-232)||(70856-70907)
chr7 (181-232)||(74965-75016)
chr7 (181-232)||(8468777-8468828)
chr7 (181-232)||(12704750-12704801)
chr7 (181-232)||(12714828-12714879)
chr7 (181-232)||(12718632-12718683)
chr7 (181-232)||(12723543-12723594)
chr7 (181-232)||(14270036-14270087)
chr7 (181-232)||(16907292-16907343)
chr7 (181-232)||(39722230-39722281)
chr7 (181-232)||(45170097-45170148)
chr7 (190-232)||(15113003-15113045)
chr7 (181-223)||(26292368-26292410)
chr7 (108-161)||(456448-456500)
chr7 (108-161)||(11393270-11393322)
chr7 (108-161)||(11972623-11972675)
chr7 (108-161)||(14949105-14949157)
chr7 (108-161)||(15376696-15376748)
chr7 (114-223)||(16091827-16091934)
chr7 (108-161)||(16232647-16232699)
chr7 (108-161)||(18430839-18430891)
chr7 (108-161)||(20385106-20385158)
chr7 (108-161)||(21189578-21189630)
chr7 (108-161)||(24702365-24702417)
chr7 (108-161)||(24704812-24704864)
chr7 (108-161)||(27216987-27217039)
chr7 (108-161)||(32125618-32125670)
chr7 (165-218)||(38898189-38898241)
chr7 (108-161)||(41523044-41523096)
chr7 (108-161)||(41525506-41525558)
chr7 (110-162)||(12255730-12255782)
chr7 (105-149)||(12756651-12756694)
chr7 (192-232)||(15116540-15116580)
chr7 (105-161)||(44116636-44116691)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (105-232)||(998-1125)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (105-232)||(3016-3143)
[»] chr2 (73 HSPs)
chr2 (105-232)||(19201909-19202036)
chr2 (105-232)||(9241986-9242112)
chr2 (105-232)||(19662355-19662481)
chr2 (108-223)||(21237821-21237936)
chr2 (108-232)||(30643984-30644107)
chr2 (105-232)||(21073427-21073553)
chr2 (105-232)||(34137000-34137126)
chr2 (108-232)||(6261081-6261205)
chr2 (105-232)||(27472479-27472605)
chr2 (105-232)||(21081671-21081797)
chr2 (105-232)||(23069218-23069344)
chr2 (105-232)||(34874147-34874273)
chr2 (105-219)||(18358668-18358781)
chr2 (114-232)||(31345176-31345293)
chr2 (105-232)||(9784741-9784866)
chr2 (105-206)||(22173728-22173828)
chr2 (113-221)||(26392453-26392559)
chr2 (120-218)||(23287438-23287534)
chr2 (109-228)||(18546883-18547002)
chr2 (94-223)||(22703167-22703297)
chr2 (104-208)||(43947305-43947408)
chr2 (105-162)||(20520127-20520184)
chr2 (105-170)||(23791396-23791461)
chr2 (165-232)||(23707283-23707349)
chr2 (165-232)||(24671055-24671121)
chr2 (165-232)||(24918170-24918236)
chr2 (111-223)||(13101577-13101689)
chr2 (105-162)||(24529508-24529564)
chr2 (105-169)||(23207400-23207464)
chr2 (165-232)||(24681474-24681540)
chr2 (105-159)||(22413070-22413124)
chr2 (105-162)||(25109018-25109075)
chr2 (105-161)||(22173809-22173864)
chr2 (105-161)||(23708553-23708609)
chr2 (105-161)||(24642836-24642891)
chr2 (113-153)||(24834804-24834844)
chr2 (105-161)||(32039478-32039533)
chr2 (181-232)||(1283353-1283404)
chr2 (181-232)||(12901603-12901654)
chr2 (110-161)||(19671960-19672010)
chr2 (181-232)||(24628570-24628621)
chr2 (181-232)||(27379524-27379575)
chr2 (181-232)||(27383570-27383621)
chr2 (181-232)||(27601760-27601811)
chr2 (181-232)||(30345082-30345133)
chr2 (181-232)||(41531095-41531146)
chr2 (147-209)||(6482838-6482899)
chr2 (147-209)||(6486305-6486366)
chr2 (181-223)||(24649330-24649372)
chr2 (105-162)||(7667-7724)
chr2 (108-161)||(571524-571576)
chr2 (108-161)||(6726122-6726174)
chr2 (108-161)||(18809070-18809122)
chr2 (108-161)||(21155043-21155095)
chr2 (108-161)||(22105540-22105592)
chr2 (105-162)||(23004879-23004936)
chr2 (108-161)||(23130989-23131041)
chr2 (108-161)||(23133456-23133508)
chr2 (108-161)||(23709515-23709567)
chr2 (108-161)||(23711996-23712048)
chr2 (108-161)||(24367901-24367953)
chr2 (105-162)||(24697540-24697597)
chr2 (108-161)||(24898178-24898230)
chr2 (108-161)||(24900661-24900713)
chr2 (108-161)||(24903138-24903190)
chr2 (108-161)||(24905615-24905667)
chr2 (108-161)||(24908090-24908142)
chr2 (108-161)||(26505506-26505558)
chr2 (108-161)||(26507984-26508036)
chr2 (108-161)||(28577226-28577278)
chr2 (108-161)||(34402505-34402557)
chr2 (108-161)||(39682440-39682492)
chr2 (113-153)||(26903443-26903483)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (105-232)||(7491-7616)
scaffold0111 (105-232)||(14610-14735)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (105-232)||(2605-2732)
scaffold0507 (105-162)||(7993-8050)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (105-232)||(15041896-15042023)
chr4 (105-232)||(15112401-15112528)
chr4 (105-232)||(18212792-18212918)
chr4 (105-232)||(24047234-24047360)
chr4 (105-228)||(14852810-14852933)
chr4 (109-228)||(32306934-32307052)
chr4 (106-232)||(13591862-13591987)
chr4 (105-232)||(10056698-10056824)
chr4 (105-217)||(16043087-16043198)
chr4 (105-232)||(17048069-17048195)
chr4 (105-231)||(26050410-26050534)
chr4 (110-226)||(40906980-40907094)
chr4 (105-206)||(51463767-51463867)
chr4 (104-208)||(15791857-15791961)
chr4 (105-218)||(17333352-17333466)
chr4 (109-229)||(40907134-40907253)
chr4 (105-206)||(23803164-23803264)
chr4 (108-189)||(26789440-26789521)
chr4 (106-208)||(14825551-14825653)
chr4 (105-195)||(630603-630692)
chr4 (94-223)||(4831457-4831587)
chr4 (94-223)||(4834752-4834882)
chr4 (105-206)||(12611106-12611203)
chr4 (110-223)||(14047708-14047820)
chr4 (110-223)||(30146455-30146567)
chr4 (144-231)||(26045268-26045353)
chr4 (105-162)||(53082086-53082143)
chr4 (165-232)||(14185039-14185105)
chr4 (165-232)||(14746578-14746644)
chr4 (100-162)||(13780-13842)
chr4 (105-162)||(46640390-46640447)
chr4 (105-162)||(52243128-52243185)
chr4 (105-161)||(18215254-18215309)
chr4 (113-229)||(27995975-27996090)
chr4 (105-161)||(51463848-51463903)
chr4 (181-232)||(4561425-4561476)
chr4 (181-232)||(5757029-5757080)
chr4 (181-232)||(9556494-9556545)
chr4 (181-232)||(10712820-10712871)
chr4 (181-232)||(10926590-10926641)
chr4 (181-232)||(12487675-12487726)
chr4 (181-232)||(14757513-14757564)
chr4 (181-232)||(14954258-14954309)
chr4 (181-232)||(15497045-15497096)
chr4 (181-232)||(25689834-25689885)
chr4 (181-232)||(27533990-27534041)
chr4 (181-223)||(33742351-33742393)
chr4 (108-161)||(1837492-1837544)
chr4 (108-161)||(7641175-7641227)
chr4 (108-161)||(15118335-15118387)
chr4 (108-161)||(15355307-15355359)
chr4 (105-162)||(43198487-43198544)
chr4 (108-161)||(44615415-44615467)
chr4 (108-161)||(52312637-52312689)
chr4 (105-161)||(12611070-12611125)
chr4 (113-153)||(15365208-15365248)
chr4 (105-161)||(15367821-15367876)
chr4 (105-161)||(15371333-15371388)
chr4 (105-161)||(15373614-15373669)
chr4 (105-161)||(15402834-15402889)
chr4 (113-229)||(19738310-19738425)
chr4 (105-161)||(44102341-44102396)
chr4 (105-161)||(44928858-44928914)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (117-232)||(7435-7550)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (105-232)||(1954-2080)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (105-232)||(110713-110839)
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (105-232)||(23838234-23838360)
chr6 (108-232)||(4476884-4477007)
chr6 (105-232)||(18453242-18453368)
chr6 (105-232)||(14979322-14979448)
chr6 (105-232)||(15817456-15817582)
chr6 (105-232)||(19773477-19773603)
chr6 (105-232)||(28103833-28103959)
chr6 (105-218)||(33443122-33443231)
chr6 (105-232)||(20136730-20136855)
chr6 (105-232)||(22196014-22196139)
chr6 (105-232)||(23414944-23415070)
chr6 (109-219)||(15705382-15705491)
chr6 (105-232)||(22805992-22806117)
chr6 (105-219)||(25619657-25619770)
chr6 (105-206)||(20556793-20556893)
chr6 (105-206)||(25754972-25755072)
chr6 (105-232)||(16493206-16493332)
chr6 (104-218)||(18177605-18177719)
chr6 (104-218)||(18199349-18199463)
chr6 (104-218)||(18204152-18204266)
chr6 (105-232)||(27556702-27556828)
chr6 (105-218)||(23076806-23076918)
chr6 (107-211)||(18896252-18896354)
chr6 (120-231)||(20182854-20182962)
chr6 (120-231)||(22153029-22153137)
chr6 (105-229)||(23539032-23539155)
chr6 (104-211)||(19362507-19362612)
chr6 (105-179)||(23528041-23528115)
chr6 (105-218)||(23538884-23538996)
chr6 (105-218)||(35008224-35008336)
chr6 (105-217)||(20224018-20224129)
chr6 (105-217)||(22118002-22118113)
chr6 (105-169)||(25752838-25752902)
chr6 (111-225)||(29416845-29416958)
chr6 (105-161)||(8227445-8227501)
chr6 (105-173)||(18706423-18706491)
chr6 (105-161)||(19847929-19847984)
chr6 (104-159)||(17105864-17105919)
chr6 (110-223)||(25738450-25738561)
chr6 (105-162)||(18696616-18696673)
chr6 (113-153)||(15896074-15896114)
chr6 (105-161)||(18456846-18456901)
chr6 (105-161)||(20556874-20556929)
chr6 (181-232)||(11566826-11566877)
chr6 (181-232)||(14472235-14472286)
chr6 (181-232)||(16760259-16760310)
chr6 (181-232)||(18917357-18917408)
chr6 (181-232)||(18955854-18955905)
chr6 (181-232)||(19870554-19870605)
chr6 (181-232)||(22862910-22862961)
chr6 (181-232)||(22949072-22949123)
chr6 (181-232)||(22953028-22953079)
chr6 (181-232)||(23395032-23395083)
chr6 (181-232)||(23871516-23871567)
chr6 (181-232)||(23875472-23875523)
chr6 (181-232)||(23989884-23989935)
chr6 (181-223)||(8243834-8243876)
chr6 (181-223)||(12618935-12618977)
chr6 (105-159)||(22782356-22782409)
chr6 (181-219)||(31477901-31477939)
chr6 (108-161)||(2291163-2291215)
chr6 (108-161)||(8055156-8055208)
chr6 (108-161)||(12742444-12742496)
chr6 (108-161)||(18334575-18334627)
chr6 (108-161)||(19005173-19005225)
chr6 (108-161)||(19858902-19858954)
chr6 (108-161)||(24422674-24422726)
chr6 (105-162)||(25644451-25644508)
chr6 (108-161)||(26924623-26924675)
chr6 (108-161)||(33861921-33861973)
chr6 (108-161)||(33864405-33864457)
chr6 (113-153)||(19656075-19656115)
chr6 (105-161)||(25754936-25754991)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (105-232)||(37598817-37598943)
chr5 (105-232)||(42960602-42960728)
chr5 (16-149)||(36314690-36314822)
chr5 (105-232)||(28370956-28371082)
chr5 (105-232)||(23469863-23469988)
chr5 (105-228)||(25574404-25574525)
chr5 (105-228)||(25575597-25575718)
chr5 (105-228)||(25576790-25576911)
chr5 (105-232)||(6765888-6766014)
chr5 (122-232)||(22107386-22107495)
chr5 (105-219)||(30138863-30138976)
chr5 (105-221)||(26732768-26732882)
chr5 (105-221)||(26740581-26740695)
chr5 (105-232)||(21328150-21328276)
chr5 (105-232)||(21809516-21809642)
chr5 (147-232)||(22336627-22336711)
chr5 (147-232)||(22340165-22340249)
chr5 (105-185)||(33895590-33895670)
chr5 (105-232)||(21731396-21731522)
chr5 (111-232)||(10816462-10816582)
chr5 (104-232)||(15796479-15796608)
chr5 (111-223)||(23538497-23538608)
chr5 (108-159)||(38145441-38145492)
chr5 (113-218)||(27988869-27988978)
chr5 (105-152)||(20572025-20572072)
chr5 (105-161)||(2154593-2154648)
chr5 (105-161)||(20901988-20902043)
chr5 (105-161)||(40725984-40726040)
chr5 (165-232)||(18356256-18356322)
chr5 (147-209)||(22750264-22750325)
chr5 (105-162)||(22178154-22178211)
chr5 (105-159)||(25743852-25743908)
chr5 (181-232)||(10753328-10753379)
chr5 (181-232)||(15236871-15236922)
chr5 (181-232)||(15236926-15236977)
chr5 (181-232)||(19472811-19472862)
chr5 (181-232)||(20295811-20295862)
chr5 (181-232)||(20910926-20910977)
chr5 (147-209)||(19511516-19511577)
chr5 (108-161)||(264751-264803)
chr5 (108-161)||(20909139-20909191)
chr5 (105-162)||(22144179-22144236)
chr5 (108-161)||(29330061-29330113)
chr5 (108-161)||(29346107-29346159)
chr5 (108-161)||(29348580-29348632)
chr5 (108-161)||(29351053-29351105)
chr5 (105-158)||(29448137-29448190)
chr5 (108-161)||(32027520-32027572)
chr5 (108-161)||(39363511-39363563)
chr5 (108-161)||(42245348-42245400)
chr5 (105-161)||(36154763-36154818)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (105-232)||(635917-636043)
chr1 (105-232)||(22124345-22124471)
chr1 (16-149)||(14295401-14295533)
chr1 (16-149)||(51130703-51130835)
chr1 (109-232)||(20958168-20958290)
chr1 (105-232)||(21043216-21043342)
chr1 (105-232)||(52940812-52940937)
chr1 (105-232)||(13881316-13881442)
chr1 (105-232)||(20437927-20438054)
chr1 (105-232)||(28312574-28312700)
chr1 (105-232)||(27653157-27653283)
chr1 (105-232)||(48603512-48603638)
chr1 (105-232)||(14800589-14800720)
chr1 (105-232)||(14809463-14809594)
chr1 (104-179)||(47190713-47190788)
chr1 (105-222)||(21533808-21533923)
chr1 (105-232)||(41781524-41781649)
chr1 (105-195)||(45574741-45574830)
chr1 (105-222)||(48520581-48520697)
chr1 (147-232)||(16372057-16372141)
chr1 (105-195)||(22130765-22130853)
chr1 (110-223)||(32649780-32649892)
chr1 (130-234)||(16381239-16381346)
chr1 (105-162)||(41049970-41050027)
chr1 (120-179)||(20329121-20329181)
chr1 (121-176)||(11945571-11945626)
chr1 (110-223)||(29534617-29534729)
chr1 (110-222)||(2332914-2333025)
chr1 (105-160)||(16368221-16368276)
chr1 (112-207)||(50686698-50686792)
chr1 (105-159)||(35261015-35261069)
chr1 (105-207)||(50614050-50614151)
chr1 (105-207)||(50621878-50621979)
chr1 (105-162)||(16758780-16758837)
chr1 (105-162)||(21896190-21896247)
chr1 (105-161)||(433137-433193)
chr1 (181-232)||(1010687-1010738)
chr1 (181-232)||(1925220-1925271)
chr1 (181-232)||(20228900-20228951)
chr1 (181-232)||(20924234-20924285)
chr1 (181-232)||(21407319-21407370)
chr1 (181-232)||(23819389-23819440)
chr1 (107-162)||(26065068-26065123)
chr1 (181-232)||(43543188-43543239)
chr1 (181-232)||(51326852-51326903)
chr1 (190-232)||(12271614-12271656)
chr1 (105-159)||(13212841-13212894)
chr1 (105-159)||(21347091-21347144)
chr1 (108-161)||(13988993-13989045)
chr1 (108-161)||(21475070-21475122)
chr1 (105-162)||(21861504-21861561)
chr1 (108-161)||(21923274-21923326)
chr1 (108-161)||(29776815-29776867)
chr1 (108-161)||(31612440-31612492)
chr1 (105-149)||(21477659-21477703)
chr1 (105-161)||(45574822-45574877)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (16-149)||(919-1051)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (105-232)||(36240-36366)
scaffold0107 (105-237)||(10019-10150)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (105-228)||(55619-55742)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (108-232)||(477-600)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (105-232)||(6094-6220)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (105-232)||(18102-18228)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (105-232)||(21226-21352)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (105-232)||(105140-105266)
scaffold0023 (108-161)||(94538-94590)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (105-232)||(132976-133102)
scaffold0019 (105-217)||(29285-29387)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (105-232)||(126015-126141)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (105-232)||(707-833)
scaffold0010 (104-162)||(60648-60706)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (106-232)||(696-821)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (110-232)||(10223-10344)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (106-232)||(221143-221267)
scaffold0012 (105-162)||(225536-225593)
scaffold0012 (181-232)||(189468-189519)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (105-222)||(17572-17688)
scaffold0293 (105-232)||(20145-20271)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (105-232)||(3927-4054)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (105-232)||(8091-8217)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (105-228)||(29358-29481)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (105-232)||(24532-24658)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (105-232)||(20810-20936)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (105-232)||(912-1038)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (105-232)||(9656-9781)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (105-232)||(219-345)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (113-232)||(15802-15920)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (105-230)||(75763-75887)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (105-229)||(1809-1932)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (105-232)||(39312-39438)
[»] scaffold1419 (2 HSPs)
scaffold1419 (105-214)||(101-209)
scaffold1419 (105-145)||(1-41)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (105-232)||(17633-17759)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (105-232)||(31183-31309)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (105-219)||(6684-6797)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (106-223)||(19582-19698)
scaffold0106 (165-232)||(15233-15299)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (107-232)||(120068-120192)
[»] scaffold1439 (2 HSPs)
scaffold1439 (105-206)||(269-369)
scaffold1439 (105-161)||(233-288)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (105-210)||(67342-67446)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (105-218)||(206459-206570)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (135-231)||(15030-15125)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (113-229)||(11209-11323)
scaffold0040 (113-229)||(22309-22423)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (105-195)||(124-213)
[»] scaffold0394 (2 HSPs)
scaffold0394 (113-206)||(12221-12313)
scaffold0394 (105-161)||(12185-12240)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (109-208)||(1785-1884)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (108-232)||(3265-3388)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (125-232)||(7894-8000)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (113-232)||(10533-10651)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (108-211)||(57898-57999)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (106-208)||(22361-22463)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (106-208)||(14056-14158)
scaffold0005 (105-162)||(267790-267847)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (105-228)||(332380-332501)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (105-171)||(2427-2493)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (105-223)||(4631-4748)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (113-211)||(16861-16957)
scaffold0046 (108-176)||(26016-26084)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (94-223)||(146254-146384)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (105-206)||(82235-82339)
scaffold0037 (181-232)||(80426-80477)
scaffold0037 (105-161)||(82199-82254)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (116-211)||(6116-6210)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (113-217)||(29747-29851)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (94-223)||(48396-48526)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (123-232)||(85605-85713)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (105-176)||(2361-2432)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (105-207)||(97092-97193)
scaffold0006 (105-207)||(106370-106471)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (105-174)||(3712-3781)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (113-222)||(604-712)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (105-207)||(128904-129005)
scaffold0022 (165-232)||(53833-53899)
scaffold0022 (105-160)||(78453-78508)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (105-181)||(13433-13507)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (105-162)||(6217-6274)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (105-162)||(666-723)
scaffold0123 (105-154)||(6330-6378)
scaffold0123 (107-162)||(25236-25290)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (105-161)||(11595-11651)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (105-161)||(17961-18017)
scaffold0247 (105-159)||(2108-2161)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (105-161)||(38190-38246)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (165-232)||(1287-1353)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (105-207)||(16034-16136)
scaffold0357 (105-162)||(13259-13316)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (165-232)||(3317-3383)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (181-232)||(58810-58861)
scaffold0028 (108-161)||(134338-134390)
scaffold0028 (108-161)||(136807-136859)
scaffold0028 (108-161)||(139276-139328)
scaffold0028 (108-161)||(141745-141797)
scaffold0028 (108-161)||(144214-144266)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (104-162)||(135-193)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (165-219)||(632-685)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (165-231)||(4264-4329)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (165-219)||(15070-15123)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (107-161)||(9877-9930)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (100-162)||(53478-53540)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (105-162)||(38447-38504)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (109-162)||(18176-18229)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (105-161)||(30059-30114)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (105-161)||(1260-1315)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (105-161)||(79264-79319)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (113-153)||(446631-446671)
scaffold0001 (105-159)||(85559-85612)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (181-232)||(414-465)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (181-232)||(3966-4017)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (181-232)||(359-410)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (181-232)||(5192-5243)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (181-232)||(12386-12437)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (165-232)||(6897-6963)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (181-232)||(11592-11643)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (181-232)||(32751-32802)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (181-232)||(36033-36084)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (181-232)||(36177-36228)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (181-232)||(207593-207644)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (166-232)||(6937-7002)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (105-159)||(164570-164623)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (105-162)||(1732-1789)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (108-161)||(20874-20926)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (108-161)||(14074-14126)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (108-161)||(37948-38000)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (108-161)||(158433-158485)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (105-153)||(14547-14595)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (105-149)||(27683-27727)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (105-161)||(16911-16966)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (105-149)||(19819-19863)


Alignment Details
Target: scaffold0013 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30607 - 30391
Alignment:
Q  16 gaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacatgcatgatagttatgttgaaaattattttatgatgttacgtgattttgttaatgatttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30607 gaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttatgtgattttgttcatgatttgatg 30508  T
Q  116 ttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30507 ttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgttgattgattattatttgacattgttatgtcttgagatg 30408  T
Q  216 tttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  30407 tttatgtgatgcctatg 30391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 91)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28194935 - 28194751
Alignment:
Q  48 tttacatgcatgatagttatgttgaaaattattttatgatgttacgtgattttgttaatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcat 147  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194935 tttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgtttttgttcatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcat 28194836  T
Q  148 tatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28194835 tatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtctatg 28194751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 23371407 - 23371533
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  23371407 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttat 23371505  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23371506 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 23371533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 51300747 - 51300621
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  51300747 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttat 51300649  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51300648 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 51300621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 232
Target Start/End: Original strand, 14763664 - 14763787
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatc 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14763664 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatc 14763762  T
Q  208 ttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  14763763 ttgagatgtttatgtgctgcctatg 14763787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 324420 - 324294
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  324420 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 324322  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  324321 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 324294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14179556 - 14179430
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  14179556 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 14179458  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14179457 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 14179430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14671108 - 14670982
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||    
T  14671108 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgttat 14671010  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14671009 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 14670982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14682607 - 14682481
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||    
T  14682607 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatcttgttat 14682509  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14682508 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 14682481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 43889561 - 43889687
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  43889561 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 43889659  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43889660 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 43889687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 52989657 - 52989783
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  52989657 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 52989755  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  52989756 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 52989783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9577808 - 9577684
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||| ||||||||    
T  9577808 atgatttgatgttgttagtaatgtgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggtgttg-ttgattatcatttgatattgttat 9577710  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||    
T  9577709 atcttgaga--tttatgtgttgcctatg 9577684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 220
Target Start/End: Original strand, 10834039 - 10834152
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  10834039 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatt-gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 10834136  T
Q  205 atcttgagatgtttat 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  10834137 atcttgagatgtttat 10834152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12339891 - 12339765
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  12339891 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 12339793  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  12339792 atcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 12339765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14966354 - 14966228
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  14966354 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaattgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 14966256  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14966255 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 14966228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16796671 - 16796545
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  16796671 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 16796573  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  16796572 atcttgaaatgtttacgtgctgcctatg 16796545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37427895 - 37427772
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  37427895 ttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttga-tgattatcatttgatactgttatatctt 37427797  T
Q  210 gagatgtttatgtgatgcctatgct 234  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37427796 gagatgtttatgtgctgcctgtgct 37427772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12470086 - 12469960
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  12470086 atgatgtgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 12469988  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  12469987 atcttgagatgttcacgtgctgcctatg 12469960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 54876322 - 54876448
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  54876322 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 54876420  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||    
T  54876421 atcttgagatgtttacgtgctgtctatg 54876448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16643357 - 16643237
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  16643357 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataggatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 16643259  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatg 226  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  16643258 atctcaagatgtttatgtgatg 16643237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 221
Target Start/End: Original strand, 10542367 - 10542482
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||    
T  10542367 atgatttgatgtcgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgttat 10542465  T
Q  205 atcttgagatgtttatg 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  10542466 atcttgagatgtttatg 10542482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5223489 - 5223363
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  5223489 atgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 5223391  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  5223390 atcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 5223363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 232
Target Start/End: Original strand, 18700247 - 18700368
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    ||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  18700247 ttgatgttgatggtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttaattatcatttgatattgttatatctt 18700345  T
Q  210 gagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||| ||| ||||||||    
T  18700346 gagatgtttacgtgctgcctatg 18700368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21837609 - 21837484
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  21837609 atgatttaatgatgatagtaatgtaataaatttgtatatgcatt-tgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 21837512  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21837511 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 21837484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15465251 - 15465134
Alignment:
Q  114 tgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgaga 213  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15465251 tgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgcttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgaga 15465153  T
Q  214 tgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||| |||  |||||||    
T  15465152 tgtttacgtgtcgcctatg 15465134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 50243085 - 50242985
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  50243085 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttgatgttgttat 50242987  T
Q  205 at 206  Q
    ||    
T  50242986 at 50242985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15246204 - 15246078
Alignment:
Q  106 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  15246204 tgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcctttgatattgttat 15246106  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
     ||| || |||||  |||| ||||||||    
T  15246105 gtctggatatgttattgtgctgcctatg 15246078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15265325 - 15265199
Alignment:
Q  106 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  15265325 tgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcctttgatattgttat 15265227  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
     ||| || |||||  |||| ||||||||    
T  15265226 gtctggatatgttattgtgctgcctatg 15265199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 17691644 - 17691769
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||  || ||||    
T  17691644 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgataatcatttgatgttattat 17691742  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  17691743 atc-tgagatgtttacgtgctgcctatg 17691769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Original strand, 43550377 - 43550477
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  43550377 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-ttgattatgatttgatgttgttat 43550475  T
Q  205 at 206  Q
    ||    
T  43550476 at 43550477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44494988 - 44494893
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||    
T  44494988 atttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattattat 44494893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 213
Target Start/End: Original strand, 32402894 - 32403002
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgttt-aagttgatgattgattattatttgacattgtta 203  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  32402894 atgatttgttgttgcgagtaatgtgatatagttttatatgcattatgtgaattatctaagatgtttaaagttgct-attgattattatttgatattgtta 32402992  T
Q  204 tatcttgaga 213  Q
    ||||||||||    
T  32402993 tatcttgaga 32403002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 316304 - 316202
Alignment:
Q  106 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatg-tttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||    
T  316304 tgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatg-ttgattattcttggatattgttat 316206  T
Q  205 atct 208  Q
    ||||    
T  316205 atct 316202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15207122 - 15207040
Alignment:
Q  106 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataaaatgtttaagttgatgattgattat 188  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15207122 tgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatg-ttgattat 15207040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 211
Target Start/End: Original strand, 23318649 - 23318754
Alignment:
Q  104 aatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||| | | |||| |||||||    
T  23318649 aatgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagttgttcaagttgttg-ttgattgtca-ttgatattgtta 23318746  T
Q  204 tatcttga 211  Q
    ||||||||    
T  23318747 tatcttga 23318754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9533481 - 9533416
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9533481 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 9533416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Original strand, 34852578 - 34852708
Alignment:
Q  94 tgattttgttaatgat--ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataaaatgtttaagttgatgattgattatta 190  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||| |    
T  34852578 tgatgttgttaatgatgattgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatca 34852675  T
Q  191 tttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  34852676 tttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 34852708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 8928369 - 8928481
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatct 208  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8928369 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 8928466  T
Q  209 tgagatgtttatgtg 223  Q
    |||||||| ||||||    
T  8928467 tgagatgtctatgtg 8928481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13919495 - 13919408
Alignment:
Q  125 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagat 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  13919495 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaag-tgttg-ttgattattatgtgataatgttatatcttgagat 13919408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 232
Target Start/End: Original strand, 3264997 - 3265076
Alignment:
Q  152 tgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3264997 tgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcatgagatgtttatgtgttgcctatg 3265076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36527882 - 36527803
Alignment:
Q  152 tgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  36527882 tgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatatttatgtgttgcctatg 36527803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 217
Target Start/End: Original strand, 14568899 - 14569007
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatat--ttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatc 207  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| | | | |||| |||||||||||    
T  14568899 ttgatgttgttgttaatgtgatatataattgtatatgcgttatgtgaattatatatgatgtttaggttgatg-ttgactgtcacttgatattgttatatc 14568997  T
Q  208 ttgagatgtt 217  Q
     |||| ||||    
T  14568998 atgagctgtt 14569007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 17248221 - 17248276
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17248221 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 17248276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 24340657 - 24340713
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24340657 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24340713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 37642199 - 37642255
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  37642199 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 37642255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 4588864 - 4588915
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4588864 ttgattatcatttgaaattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatg 4588915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11854751 - 11854700
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  11854751 ttgattattatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 11854700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Original strand, 11914011 - 11914077
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  11914011 atgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctggctatg 11914077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12378108 - 12378003
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||   |||||| ||||||||    
T  12378108 atgatttaatgttgatagtaatttaatatatt-gtatatgtattatttgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgatttgcatttgatattgttat 12378011  T
Q  205 atcttgag 212  Q
    ||| ||||    
T  12378010 atcatgag 12378003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 159
Target Start/End: Original strand, 37251102 - 37251156
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  37251102 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 37251156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Original strand, 38311759 - 38311820
Alignment:
Q  147 ttatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  38311759 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 38311820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15617392 - 15617339
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatgct 234  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  15617392 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgct 15617339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 29172565 - 29172618
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29172565 atttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29172618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30065964 - 30065911
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatgct 234  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  30065964 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgct 30065911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 162
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051190
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 2051190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8899276 - 8899221
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8899276 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8899221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 162
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523718
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 52523718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 53070633 - 53070688
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  53070633 atgatttgatgttgttag-attgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 53070688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 4107488 - 4107539
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  4107488 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 4107539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 4111340 - 4111391
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  4111340 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 4111391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7109716 - 7109665
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  7109716 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 7109665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7113651 - 7113600
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  7113651 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 7113600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11070086 - 11070035
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  11070086 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 11070035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 11165620 - 11165671
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  11165620 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 11165671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15964987 - 15964936
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  15964987 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 15964936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15968911 - 15968860
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  15968911 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 15968860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15972835 - 15972784
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  15972835 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 15972784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22321682 - 22321631
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  22321682 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 22321631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22336737 - 22336686
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  22336737 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 22336686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 27409735 - 27409786
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  27409735 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 27409786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28949742 - 28949691
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  28949742 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 28949691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 37439727 - 37439778
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  37439727 ttgattattatttgatatggttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 37439778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 55022885 - 55022834
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  55022885 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 55022834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19775783 - 19775745
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 219  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19775783 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 19775745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Original strand, 20248741 - 20248803
Alignment:
Q  147 ttatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||| | |||||||||||    
T  20248741 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattatcatttgatactgttatatctt 20248803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 7781330 - 7781382
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7781330 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 7781382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 9707590 - 9707642
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  9707590 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 9707642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 10247706 - 10247758
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  10247706 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 10247758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 13151773 - 13151825
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13151773 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13151825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 13154238 - 13154290
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13154238 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13154290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 16282794 - 16282846
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16282794 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16282846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 16454264 - 16454316
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16454264 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16454316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17463357 - 17463305
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17463357 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 17463305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 34159505 - 34159453
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  34159505 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 34159453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 38961874 - 38961926
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  38961874 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 38961926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 41124066 - 41124014
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  41124066 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 41124014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 45606890 - 45606942
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  45606890 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 45606942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 55476670 - 55476618
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  55476670 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 55476618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 149
Target Start/End: Original strand, 12119704 - 12119747
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 149  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  12119704 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcatta 12119747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17672808 - 17672753
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  17672808 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattatatatgcattatttgaattatat 17672753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 161
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147515
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22147515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 50243004 - 50242949
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  50243004 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 50242949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Original strand, 17438151 - 17438283
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17438151 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 17438250  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatgcttct 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17438251 atcttgagatgtttatgtgttgcctatgtttct 17438283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 5083088 - 5083215
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5083088 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatccttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 5083187  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5083188 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 5083215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Original strand, 17086088 - 17086213
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  17086088 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttgatg-ttgattattatttggtattgttat 17086186  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctat 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17086187 atcttgagatgtttatgtgctgcctat 17086213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37515890 - 37515765
Alignment:
Q  106 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttata 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  37515890 tgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttata 37515792  T
Q  206 tcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37515791 tcttgatatgtttatgtgctgcctatg 37515765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18833748 - 18833622
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatg-tttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  18833748 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatgtgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatg-ttgtttattatttgatattgtta 18833650  T
Q  204 tatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18833649 tatc-tgagatgtttatgtgctgcctatg 18833622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23659593 - 23659467
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  23659593 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 23659495  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23659494 atctcaagatgtttatgtgatgcctatg 23659467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23667995 - 23667872
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||    
T  23667995 atgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgtttaagttgatgttaaaatattatttgatattgttat 23667896  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcc 228  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||    
T  23667895 atcttgagatggttatgtgctgcc 23667872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 20502036 - 20502162
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| |||| |||||| ||||||||    
T  20502036 atgatttgatgttgttagtaatatgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgttg-ttggttatcatttgatattgttat 20502134  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20502135 atcttgagatatttatgtgctgcctatg 20502162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Original strand, 25363137 - 25363250
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  25363137 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 25363235  T
Q  205 atcttgagatgttta 219  Q
    |||||||||||||||    
T  25363236 atcttgagatgttta 25363250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 17460987 - 17461113
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  17460987 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 17461085  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  17461086 atctctagatgtttatgtgtttcctatg 17461113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 19808297 - 19808423
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  19808297 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 19808395  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||    
T  19808396 atcttgagatgtttacgtgctgtctatg 19808423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 232
Target Start/End: Original strand, 22963351 - 22963474
Alignment:
Q  109 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatct 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  22963351 tttgatgttgttggtaatgtgatataattgtatatgcattgtgtgaattataaaatatgttaaagttgatgttgaattattatttgatattgttatatct 22963450  T
Q  209 tgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||  ||||||||    
T  22963451 tgagatgtttatgtactgcctatg 22963474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Original strand, 22237954 - 22238067
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  22237954 atgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 22238052  T
Q  205 atcttgagatgttta 219  Q
    |||||||||||||||    
T  22238053 atcttgagatgttta 22238067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 14397797 - 14397923
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| | |||| ||||||||    
T  14397797 atgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgctg-ttgattatcaattgatattgttat 14397895  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  14397896 atcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 14397923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 22253100 - 22253226
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  22253100 atgatttgatgttcttagtaatgtgataaagttatatatgcattatgtggatcacataagatgtttaagttgatg-ttaattatcatttgatattgttat 22253198  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  22253199 atcttgagatgtatatgtgctacctatg 22253226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 23943928 - 23944054
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| | |||| ||| ||||    
T  23943928 atgatttgatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatattattat 23944026  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||| || ||||| ||||| ||| ||||    
T  23944027 atctggatatgttaatgtgctgcatatg 23944054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 195
Target Start/End: Original strand, 25484174 - 25484263
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttga 195  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25484174 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttga 25484263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16799673 - 16799561
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatg-tttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 203  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  16799673 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaaatatataagatgttttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 16799575  T
Q  204 tatcttgagatgtt 217  Q
    ||||| || |||||    
T  16799574 tatctggatatgtt 16799561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22996029 - 22995927
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  22996029 atgatttgatgttaaaaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 22995931  T
Q  205 atct 208  Q
    ||||    
T  22995930 atct 22995927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28397736 - 28397635
Alignment:
Q  104 aatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatg-tttaagttgatgattgattattatttgacattgtt 202  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  28397736 aatgatttaatgttgttaataatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatg-ttgattattcttggatattgtt 28397639  T
Q  203 atat 206  Q
    ||||    
T  28397638 atat 28397635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 171
Target Start/End: Original strand, 27941589 - 27941655
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgttta 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  27941589 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatatgagatgttta 27941655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23914183 - 23914097
Alignment:
Q  146 attatgtgaatta-tataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23914183 attatgtgaattaatataagatgtttaagttgttgct-gattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 23914097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 214
Target Start/End: Original strand, 35026797 - 35026903
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||| |   |||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  35026797 atgatttgatgttgttaataatgtgatatgattttatatgcattatgtgaattatatatgatgtttta--agatg-ttgattatcgtttgatattgttat 35026893  T
Q  205 atcttgagat 214  Q
    ||||||||||    
T  35026894 atcttgagat 35026903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37116535 - 37116434
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| || || || ||||||   |||||| ||||||||    
T  37116535 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattgttat 37116437  T
Q  205 atc 207  Q
    |||    
T  37116436 atc 37116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Original strand, 14103167 - 14103275
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgag 212  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||    
T  14103167 atgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttaag 14103265  T
Q  213 atgtttatgt 222  Q
     |||| ||||    
T  14103266 ttgttaatgt 14103275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Original strand, 19154820 - 19154932
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || |||||||  | |||| ||| ||||    
T  19154820 atgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattagcacttgatattattat 19154918  T
Q  205 atcttgagatgttt 218  Q
    |||| || ||||||    
T  19154919 atctggatatgttt 19154932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 176
Target Start/End: Original strand, 21346167 - 21346239
Alignment:
Q  105 atgatttgat-gttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttg 176  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21346167 atgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttg 21346239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23409930 - 23409855
Alignment:
Q  156 ttatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23409930 ttatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 23409855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 2418808 - 2418865
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2418808 atgatttgatgttgttaacaatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatata 2418865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 218
Target Start/End: Original strand, 20533352 - 20533455
Alignment:
Q  114 tgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgaga 213  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| || | |||| ||| |||||||| || |    
T  20533352 tgttgatagtaatgtaatataattgtatatgcattttgtgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgatcatcacttgatattattatatctggata 20533450  T
Q  214 tgttt 218  Q
    |||||    
T  20533451 tgttt 20533455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Original strand, 17439440 - 17439541
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| || || || ||||||   |||||| ||||||||    
T  17439440 atgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattgttat 17439538  T
Q  205 atc 207  Q
    |||    
T  17439539 atc 17439541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 214
Target Start/End: Original strand, 22419349 - 22419455
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |   |||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  22419349 atgatttaatgttgtcaataatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatttatgatgtttta--agatg-ttgattatcgtttgaaattgttat 22419445  T
Q  205 atcttgagat 214  Q
    ||||||||||    
T  22419446 atcttgagat 22419455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 13508019 - 13508075
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13508019 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13508075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 13597551 - 13597607
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13597551 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13597607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Original strand, 17266927 - 17267028
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||  |||||| || || || ||||||   |||||| ||||||||    
T  17266927 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattgttat 17267025  T
Q  205 atc 207  Q
    |||    
T  17267026 atc 17267028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22364848 - 22364748
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||  |||||| || || || |||||| || ||||| ||||||||    
T  22364848 atgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttg-ttgatt-ttctttgatattgttat 22364751  T
Q  205 atc 207  Q
    |||    
T  22364750 atc 22364748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44476814 - 44476753
Alignment:
Q  147 ttatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  44476814 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 44476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44480076 - 44480015
Alignment:
Q  147 ttatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  44480076 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 44480015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20498749 - 20498692
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  20498749 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 20498692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 229
Target Start/End: Original strand, 13665189 - 13665304
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgag 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | ||| ||  ||||| |||||| | |||| |||||  ||||| ||||||| |  ||||    
T  13665189 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgcggaatatgtatgatgttgaagttg-ttattgtttattcattgacgttgttatgttatgag 13665287  T
Q  213 atgtttatgtgatgcct 229  Q
     |||||||||| |||||    
T  13665288 ttgtttatgtgctgcct 13665304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 229
Target Start/End: Original strand, 13724464 - 13724579
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgag 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | ||| ||  ||||| |||||| | |||| |||||  ||||| ||||||| |  ||||    
T  13724464 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgcggaatatgtatgatgttgaagttg-ttattgtttattcattgacgttgttatgttatgag 13724562  T
Q  213 atgtttatgtgatgcct 229  Q
     |||||||||| |||||    
T  13724563 ttgtttatgtgctgcct 13724579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 41598370 - 41598315
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  41598370 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 41598315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 18862736 - 18862787
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  18862736 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 18862787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 19278374 - 19278425
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  19278374 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 19278425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21410965 - 21410914
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  21410965 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 21410914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21805457 - 21805406
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  21805457 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 21805406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 21828105 - 21828156
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  21828105 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 21828156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 21972676 - 21972727
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  21972676 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 21972727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 21976761 - 21976812
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  21976761 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 21976812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22525702 - 22525659
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatt 148  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22525702 atgatttaatgttgttggtaatgtcatatatttgtatatgcatt 22525659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43251828 - 43251777
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  43251828 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 43251777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Original strand, 1327017 - 1327066
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgccta 230  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  1327017 ttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgccta 1327066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1484581 - 1484529
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1484581 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 1484529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4483459 - 4483407
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  4483459 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 4483407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 5853275 - 5853327
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  5853275 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 5853327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 14409427 - 14409479
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14409427 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 14409479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 15203214 - 15203266
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15203214 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 15203266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19896447 - 19896395
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19896447 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 19896395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 20046178 - 20046230
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20046178 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20046230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20403406 - 20403354
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20403406 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20403354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22001932 - 22001880
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22001932 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22001880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24353207 - 24353150
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||  |||||| ||||    
T  24353207 atgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtata 24353150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 24486027 - 24486079
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24486027 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24486079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 32810110 - 32810058
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32810110 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32810058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 25484255 - 25484310
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  25484255 atgatttgatgttatta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 25484310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 142768 - 142641
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142768 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 142669  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  142668 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 142641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 232
Target Start/End: Original strand, 169702 - 169810
Alignment:
Q  123 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  169702 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 169800  T
Q  223 gatgcctatg 232  Q
    | ||||||||    
T  169801 gctgcctatg 169810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 95)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20619567 - 20619440
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20619567 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 20619468  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20619467 atcttgagatgtttatgtgttgcctatg 20619440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 130751 - 130878
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  130751 atgatttgatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataaggtgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttat 130850  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  130851 atcttgagatgtttctgtgctgcctatg 130878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 11525498 - 11525625
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11525498 atgatatgatgttattagtaatttgatatattggtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttat 11525597  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11525598 atcctgagatgtttatgtgctgcctatg 11525625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11661458 - 11661332
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  11661458 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 11661360  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11661359 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 11661332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14566354 - 14566228
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  14566354 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttat 14566256  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14566255 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 14566228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18872512 - 18872386
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  18872512 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttat 18872414  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18872413 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 18872386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16008727 - 16008604
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatc 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16008727 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatc 16008629  T
Q  208 ttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  16008628 ttgagatgtttatgtgttgcctatg 16008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16495673 - 16495541
Alignment:
Q  16 gaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacatgcatgatagttatgttgaaaattattttatgatgttacgtgattttgttaatgatttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  16495673 gaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgattttgttcataatttgatg 16495574  T
Q  116 ttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 149  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16495573 ttgtta-taatgttatataattgtatatacatta 16495541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42462132 - 42462009
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  42462132 atttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatattcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatc 42462034  T
Q  208 ttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  42462033 ttgagatgtttatgtgttgcctatg 42462009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18607639 - 18607513
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||    
T  18607639 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatatttttat 18607541  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||    
T  18607540 atattgagatgtttatgtgctgcctatg 18607513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38519558 - 38519432
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  38519558 atgatttgatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattgtataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 38519460  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38519459 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 38519432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 232
Target Start/End: Original strand, 9033281 - 9033407
Alignment:
Q  106 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttata 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  9033281 tgatttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgcattattatttgatattgttata 9033380  T
Q  206 tcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||    
T  9033381 tcctgagatatttatgtgttgcctatg 9033407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 10501358 - 10501484
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  10501358 atgatttgattttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 10501456  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10501457 atcttgagatgtttatgtgttgcctatg 10501484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 46580610 - 46580736
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  46580610 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 46580708  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  46580709 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 46580736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 11768853 - 11768977
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattg--attattatttgacattgtt 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||||    
T  11768853 atgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgaaaatattatttgatattgtt 11768951  T
Q  203 atatcttgagatgtttatgtgatgcc 228  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11768952 atatcttgagatgattatgtgctgcc 11768977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14422137 - 14422010
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatg-tttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14422137 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggatcatataagatgttttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 14422039  T
Q  204 tatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14422038 tatcttgaggtgtttatgtgctgcctatg 14422010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14258636 - 14258510
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  14258636 atgatttgatattgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 14258538  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14258537 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 14258510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14273700 - 14273574
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  14273700 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 14273602  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14273601 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 14273574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 16460700 - 16460826
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||    
T  16460700 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgttat 16460798  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16460799 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 16460826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16998778 - 16998652
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  16998778 atgatttaatgttgataataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 16998680  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16998679 atcttgagatgtttaagtgctgcctatg 16998652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32301473 - 32301347
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  32301473 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatctttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 32301375  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  32301374 atcttgagatgtttacgtgttgcctatg 32301347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16996407 - 16996284
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || || |||||| | |||||| ||||||||    
T  16996407 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaa-atgttg-ttgattttcatttgatattgttat 16996310  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgccta 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16996309 atcttgagatgtttatgtgctgccta 16996284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 14157039 - 14157165
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  14157039 atgatttgatatcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 14157137  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||    
T  14157138 atcttgagatgtttatgtgttgtctatg 14157165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16579944 - 16579818
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||  |||||||    
T  16579944 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg-tttttgattatcatttgatgttgttat 16579846  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16579845 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 16579818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 16585719 - 16585845
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||  |||||||    
T  16585719 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg-tttttgattatcatttgatgttgttat 16585817  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16585818 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 16585845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20487727 - 20487601
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||    
T  20487727 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgttat 20487629  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20487628 gtcttgagatatttatgtgctgcctatg 20487601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 1858766 - 1858892
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  1858766 atgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 1858864  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  1858865 atcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 1858892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 25927186 - 25927309
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||| |||||| ||||||||    
T  25927186 atgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttg----ttgattatcatttgatattgttat 25927281  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  25927282 atcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 25927309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 17060358 - 17060485
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatg-tttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 203  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||    
T  17060358 atgatttaatgttgatagtaatgtcaaatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgaag-ttgattatcgtttgatattgtta 17060456  T
Q  204 tatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  17060457 tattttgagatgtttatgtgctgcatatg 17060485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13647592 - 13647492
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  13647592 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-ttgattatgatttgatgttgttat 13647494  T
Q  205 at 206  Q
    ||    
T  13647493 at 13647492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 9177600 - 9177726
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||    
T  9177600 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattattat 9177698  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    || | || ||||| ||||| ||| ||||    
T  9177699 atttggatatgttaatgtgctgcatatg 9177726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 13918460 - 13918586
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| || || ||||| |||||| || |||||    
T  13918460 atgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttaattatcatttgatatcgttat 13918558  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  13918559 atcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 13918586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Original strand, 9725595 - 9725668
Alignment:
Q  106 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatg 179  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9725595 tgatttaatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatg 9725668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 14929155 - 14929257
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |    
T  14929155 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttgt 14929253  T
Q  205 atct 208  Q
    ||||    
T  14929254 atct 14929257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 15352621 - 15352723
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |    
T  15352621 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttgt 15352719  T
Q  205 atct 208  Q
    ||||    
T  15352720 atct 15352723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Original strand, 16109435 - 16109565
Alignment:
Q  94 tgattttgttaatgat--ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataaaatgtttaagttgatgattgattatta 190  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||| |    
T  16109435 tgatattgttaatgatgattgatgttgttaatgatgtggtatatttgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatca 16109532  T
Q  191 tttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16109533 tttgatattgctatatcttgagatgtctatgtg 16109565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 223
Target Start/End: Original strand, 17017402 - 17017519
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| | ||||  || ||||    
T  17017402 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatatgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatgttattat 17017500  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtg 223  Q
    |||| || ||||| |||||    
T  17017501 atctggatatgttaatgtg 17017519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 1867929 - 1867986
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1867929 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatata 1867986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 15008433 - 15008490
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15008433 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatata 15008490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Original strand, 837311 - 837408
Alignment:
Q  125 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  837311 atgtgttatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 837408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Original strand, 1202491 - 1202588
Alignment:
Q  125 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1202491 atgtgttatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 1202588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15720140 - 15720050
Alignment:
Q  146 attatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatgcttct 237  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  15720140 attaagtgaattagataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcatatgtttct 15720050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 147770 - 147704
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgttta 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||    
T  147770 atgatttgatgttgtgagtaatgagatatatttgtataagcattatgtggattatatgagatgttta 147704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 20220124 - 20220181
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  20220124 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatata 20220181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 232
Target Start/End: Original strand, 833315 - 833421
Alignment:
Q  125 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  833315 atgtggtatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 833412  T
Q  224 atgcctatg 232  Q
     | ||||||    
T  833413 ctacctatg 833421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 232
Target Start/End: Original strand, 1198495 - 1198601
Alignment:
Q  125 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1198495 atgtggtatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 1198592  T
Q  224 atgcctatg 232  Q
     | ||||||    
T  1198593 ctacctatg 1198601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Original strand, 2529988 - 2530052
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtt 169  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2529988 atgatttaatgttgatagtgatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtt 2530052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8940375 - 8940309
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8940375 atgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 8940309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48991366 - 48991266
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| | |||| ||| ||||    
T  48991366 atgatttaatgttgatagtaat-tgatatatt-gtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatattattat 48991270  T
Q  205 atct 208  Q
    ||||    
T  48991269 atct 48991266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18203965 - 18203887
Alignment:
Q  138 gtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttt 218  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  ||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18203965 gtatatgcattgtgtggattatatatgatgattaagt-gttg-ttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 18203887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18279418 - 18279367
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18279418 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatg 18279367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18283381 - 18283330
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18283381 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatg 18283330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Original strand, 10896687 - 10896748
Alignment:
Q  147 ttatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  10896687 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 10896748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15167346 - 15167285
Alignment:
Q  147 ttatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  15167346 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 15167285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 2280053 - 2280110
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  2280053 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatata 2280110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38828409 - 38828298
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatct 208  Q
    |||||||||||| | | ||| || ||||| | |||||||||||| | |||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  38828409 ttgatgttgttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattattatatct 38828312  T
Q  209 tgagatgtttatgt 222  Q
    |||||||| |||||    
T  38828311 tgagatgtctatgt 38828298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13647511 - 13647456
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13647511 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13647456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 15081929 - 15081984
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15081929 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 15081984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 17061895 - 17061950
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17061895 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 17061950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 19486678 - 19486734
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  19486678 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatat 19486734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33122 - 33071
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  33122 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 33071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 70856 - 70907
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  70856 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 70907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 74965 - 75016
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  74965 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 75016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8468828 - 8468777
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  8468828 ttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcctatg 8468777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 12704750 - 12704801
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12704750 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12704801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12714879 - 12714828
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12714879 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12714828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12718683 - 12718632
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12718683 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12718632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12723594 - 12723543
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12723594 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12723543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 14270036 - 14270087
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  14270036 ttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcctatg 14270087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 16907292 - 16907343
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  16907292 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 16907343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39722281 - 39722230
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  39722281 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 39722230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 45170097 - 45170148
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  45170097 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 45170148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15113045 - 15113003
Alignment:
Q  190 atttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15113045 atttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttgcctatg 15113003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26292410 - 26292368
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26292410 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtg 26292368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 456500 - 456448
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  456500 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 456448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 11393270 - 11393322
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11393270 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 11393322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11972675 - 11972623
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11972675 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 11972623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 14949105 - 14949157
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14949105 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 14949157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 15376696 - 15376748
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15376696 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 15376748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16091934 - 16091827
Alignment:
Q  114 tgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgaga 213  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||| ||||| || || |||||||| |||||| ||| |||||| | || |    
T  16091934 tgttgttaataatgttacatatttgtatacgcattatgtggattatatatgatgattaag-tgttg-ttgattatcatttgatattattatatttggata 16091837  T
Q  214 tgtttatgtg 223  Q
    |||| |||||    
T  16091836 tgttaatgtg 16091827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16232699 - 16232647
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16232699 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16232647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18430891 - 18430839
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18430891 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18430839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 20385106 - 20385158
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20385106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20385158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 21189578 - 21189630
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21189578 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 21189630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24702417 - 24702365
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24702417 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24702365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24704864 - 24704812
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24704864 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24704812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27217039 - 27216987
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  27217039 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 27216987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 32125670 - 32125618
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32125670 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32125618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Original strand, 38898189 - 38898241
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttt 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  38898189 atgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatctagagatgttt 38898241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 41523096 - 41523044
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  41523096 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 41523044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 41525558 - 41525506
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  41525558 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 41525506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 162
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255782
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatata 12255782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 149
Target Start/End: Original strand, 12756651 - 12756694
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 149  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  12756651 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcatta 12756694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15116580 - 15116540
Alignment:
Q  192 ttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15116580 ttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatg 15116540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44116691 - 44116636
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  44116691 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatat 44116636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1125 - 998
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1125 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattcttat 1026  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1025 atcttgagatgtttatgtgttgcctatg 998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3143 - 3016
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3143 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 3044  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3043 atcttgagatgtttatgtgctacctatg 3016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 73)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 19201909 - 19202036
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19201909 atgatttgaagttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 19202008  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19202009 atcttgagatgtttatgtgttgcctatg 19202036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9242112 - 9241986
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  9242112 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 9242014  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9242013 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 9241986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 19662355 - 19662481
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  19662355 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttat 19662453  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19662454 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 19662481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21237936 - 21237821
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  21237936 atttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgatgaattattatttgatattgttatatc 21237837  T
Q  208 ttgagatgtttatgtg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  21237836 ttgagatgtttatgtg 21237821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 232
Target Start/End: Original strand, 30643984 - 30644107
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatc 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  30643984 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagtagat-attgattatcatttgatattgttatatc 30644082  T
Q  208 ttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    
T  30644083 ttgagacgtttatgtgctgcctatg 30644107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 21073427 - 21073553
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  21073427 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattcattatgtggattatataagatatttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 21073525  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21073526 atcttgagatgtttatgtgctgcatatg 21073553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34137126 - 34137000
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  34137126 atgatgtgatgttactagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 34137028  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  34137027 ctcttgagatgtttatgtgttgcctatg 34137000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 108 - 232
Target Start/End: Original strand, 6261081 - 6261205
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatat-gcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatat 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  6261081 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatat 6261179  T
Q  207 cttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6261180 cttgagacgtttatgtgctgcctatg 6261205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27472605 - 27472479
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  27472605 atgatttaatgttgatagtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 27472507  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||    
T  27472506 atcttgagatgtttacgtgctgtctatg 27472479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 21081671 - 21081797
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||    
T  21081671 atgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgtttttat 21081769  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  21081770 atctttagatgtttacgtgctgcctatg 21081797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 23069218 - 23069344
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  23069218 atgatttgatgttgatggcaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 23069316  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  23069317 atcttgagatgtttacgtgctacctatg 23069344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 34874147 - 34874273
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  34874147 atgatttaatgttgaaagtattgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 34874245  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  34874246 atcttgagatgtttaagtgccgcctatg 34874273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Original strand, 18358668 - 18358781
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  18358668 atgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcaatatgtgaattatataagatgcttaagttgatg-ttgattattatttgatgttgttat 18358766  T
Q  205 atcttgagatgttta 219  Q
    |||||||||||||||    
T  18358767 atcttgagatgttta 18358781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31345293 - 31345176
Alignment:
Q  114 tgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgaga 213  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31345293 tgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgaga 31345195  T
Q  214 tgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||| |||  |||||||    
T  31345194 tgtttacgtgtcgcctatg 31345176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9784866 - 9784741
Alignment:
Q  105 atgatttgat-gttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 203  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||| ||| ||  ||||||    
T  9784866 atgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttg-ttgattatcattggatgttgtta 9784770  T
Q  204 tatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9784769 tatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 9784741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Original strand, 22173728 - 22173828
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  22173728 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattaagtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttgatgttgttat 22173826  T
Q  205 at 206  Q
    ||    
T  22173827 at 22173828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26392559 - 26392453
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgag 212  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26392559 atgttgatagaaaggtgatatatttgtatatgcattatgtggattagataagatgtttaagt--attgttgattattatttgatattgttatatcctgag 26392462  T
Q  213 atgtttatg 221  Q
    |||||||||    
T  26392461 atgtttatg 26392453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23287534 - 23287438
Alignment:
Q  120 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23287534 tagtaatgtgatatatttgtatatgcaatatgtggattatatatgatgattaag-tgttg-ttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 23287438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 18546883 - 18547002
Alignment:
Q  109 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||    
T  18546883 tttgatgttgttagtaatgtgatacatttgtatatgcattatgtaaattaatgtaagatgtctaagttgatg-ttgattatcctttgatattgttatgtc 18546981  T
Q  208 ttgagatgtttatgtgatgcc 228  Q
    | || |||||  |||||||||    
T  18546982 tggatatgttattgtgatgcc 18547002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22703297 - 22703167
Alignment:
Q  94 tgattttgttaatgat--ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataaaatgtttaagttgatgattgattatta 190  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |    
T  22703297 tgatgttgttaatgatgattgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaaattg-tg-ttgattatca 22703200  T
Q  191 tttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22703199 tttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 22703167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Original strand, 43947305 - 43947408
Alignment:
Q  104 aatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtt-taagttgatgattgattattatttgacattgtt 202  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  43947305 aatgatttaatgttgttaataatgtgatata-ttgtatatgcactatgtgaattatatgagatgttgtaagttgatg-ttgattattcttggatattgtt 43947402  T
Q  203 atatct 208  Q
    ||||||    
T  43947403 atatct 43947408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 20520127 - 20520184
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20520127 atgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatata 20520184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23791461 - 23791396
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgttt 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  23791461 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatataatgttt 23791396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Original strand, 23707283 - 23707349
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23707283 atgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 23707349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24671121 - 24671055
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  24671121 atgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtactgcctatg 24671055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24918236 - 24918170
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24918236 atgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 24918170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 223
Target Start/End: Original strand, 13101577 - 13101689
Alignment:
Q  111 tgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttga-cattgttatatct 208  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  13101577 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgataatttttatatct 13101674  T
Q  209 tgagatgtttatgtg 223  Q
    |||||||| ||||||    
T  13101675 tgagatgtctatgtg 13101689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 24529508 - 24529564
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24529508 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatata 24529564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23207464 - 23207400
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtt 169  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| || ||||||    
T  23207464 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttataatgtt 23207400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24681540 - 24681474
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24681540 atgtttaagttgatg-ttgatcatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 24681474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 159
Target Start/End: Original strand, 22413070 - 22413124
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  22413070 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 22413124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25109075 - 25109018
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  25109075 atgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 25109018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 22173809 - 22173864
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22173809 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22173864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 23708553 - 23708609
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23708553 atgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23708609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 24642836 - 24642891
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24642836 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24642891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 153
Target Start/End: Original strand, 24834804 - 24834844
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 153  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24834804 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtg 24834844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 32039478 - 32039533
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32039478 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32039533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1283404 - 1283353
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  1283404 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 1283353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 12901603 - 12901654
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12901603 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12901654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671960
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19672010 ttgatgttgtta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 19671960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 24628570 - 24628621
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  24628570 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 24628621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 27379524 - 27379575
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  27379524 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 27379575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 27383570 - 27383621
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  27383570 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 27383621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27601811 - 27601760
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  27601811 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 27601760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 30345082 - 30345133
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  30345082 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 30345133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 41531095 - 41531146
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  41531095 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 41531146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6482899 - 6482838
Alignment:
Q  147 ttatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||    
T  6482899 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttaattaccatttgatattgttatatctt 6482838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6486366 - 6486305
Alignment:
Q  147 ttatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||    
T  6486366 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttaattaccatttgatattgttatatctt 6486305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24649372 - 24649330
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24649372 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtg 24649330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 7667 - 7724
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  7667 atgatttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 7724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 571576 - 571524
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  571576 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 571524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 6726174 - 6726122
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  6726174 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 6726122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18809122 - 18809070
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18809122 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18809070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 21155043 - 21155095
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21155043 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 21155095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22105592 - 22105540
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22105592 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22105540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23004936 - 23004879
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23004936 atgatttaacgttgttaatgatgttaaatatttgtatatgcattatgtggattatata 23004879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23131041 - 23130989
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23131041 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23130989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23133508 - 23133456
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23133508 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23133456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 23709515 - 23709567
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23709515 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23709567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 23711996 - 23712048
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23711996 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23712048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24367953 - 24367901
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24367953 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24367901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 24697540 - 24697597
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||    
T  24697540 atgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtata 24697597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 24898178 - 24898230
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24898178 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24898230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 24900661 - 24900713
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24900661 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24900713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 24903138 - 24903190
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24903138 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24903190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 24905615 - 24905667
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24905615 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24905667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 24908090 - 24908142
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24908090 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24908142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26505558 - 26505506
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  26505558 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 26505506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26508036 - 26507984
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  26508036 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 26507984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28577278 - 28577226
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28577278 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 28577226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 34402505 - 34402557
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  34402505 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 34402557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 39682492 - 39682440
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  39682492 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 39682440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26903483 - 26903443
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 153  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  26903483 atgttgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtg 26903443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7616 - 7491
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7616 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 7517  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  7516 atctt--gatgtttatgtgctgcctatg 7491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14735 - 14610
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14735 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 14636  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  14635 atctt--gatgtttatgtgctgcctatg 14610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 2605 - 2732
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  2605 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacatggatat 2704  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||    
T  2705 atcttgagatgtttatgtgctgactatg 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 7993 - 8050
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||    
T  7993 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatata 8050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 15041896 - 15042023
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15041896 atgatttgatgttcttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattgatat 15041995  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  15041996 atcttaagatgtttatgtgctgcatatg 15042023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15112528 - 15112401
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15112528 atgatttgatgtttttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattgatat 15112429  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  15112428 atcttaagatgtttatgtgctgcatatg 15112401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18212918 - 18212792
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  18212918 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 18212820  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18212819 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 18212792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 24047234 - 24047360
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  24047234 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 24047332  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24047333 atcttaagatgtttatgtgctgcctatg 24047360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 14852810 - 14852933
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||    
T  14852810 atgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 14852909  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  14852910 atcttgagatgtttatgtgctgcc 14852933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 32306934 - 32307052
Alignment:
Q  109 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatct 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  32306934 tttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattattatttaatattgttatatct 32307032  T
Q  209 tgagatgtttatgtgatgcc 228  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  32307033 tgagatgtttatgtgctgcc 32307052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 232
Target Start/End: Original strand, 13591862 - 13591987
Alignment:
Q  106 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttata 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  13591862 tgatttaatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttata 13591960  T
Q  206 tcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||    
T  13591961 ttttgagatgtttatgtgctgcctatg 13591987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10056824 - 10056698
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  10056824 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 10056726  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10056725 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 10056698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16043198 - 16043087
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  16043198 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 16043100  T
Q  205 atcttgagatgtt 217  Q
    |||||||||||||    
T  16043099 atcttgagatgtt 16043087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 17048069 - 17048195
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  17048069 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtacatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 17048167  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17048168 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 17048195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Original strand, 26050410 - 26050534
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||| | |||||| ||||||||    
T  26050410 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttg-ttgattttcatttgatattgttat 26050507  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctat 231  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||    
T  26050508 atcttgagatgtttttgtgctgcctat 26050534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40907094 - 40906980
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  40907094 ttgatgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcatgatgtggattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatctt 40906997  T
Q  210 gagatgtttatgtgatg 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  40906996 gagatgtttatgtgatg 40906980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Original strand, 51463767 - 51463867
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  51463767 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttgatgttgttat 51463865  T
Q  205 at 206  Q
    ||    
T  51463866 at 51463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15791961 - 15791857
Alignment:
Q  104 aatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||  ||||| |||||||    
T  15791961 aatgatttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatacaagatgtttaagttgatgttgaattatcctttgatattgtta 15791862  T
Q  204 tatct 208  Q
    |||||    
T  15791861 tatct 15791857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17333466 - 17333352
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaa--gttgatgattgattattatttgacattgtt 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  17333466 atgatttaatgttgttagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgattaagtgttgttgatt-attattatttgatattgtt 17333368  T
Q  203 atatcttgagatgttt 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  17333367 atatcttgagatgttt 17333352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40907253 - 40907134
Alignment:
Q  109 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatct 208  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  40907253 tttgatgttgttaatgatgtgaaatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatg-ttgattatcatttgatatttttatatct 40907155  T
Q  209 tgagatgtttatgtgatgcct 229  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  40907154 tgagatgtttatgtgttgcct 40907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Original strand, 23803164 - 23803264
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |  |||||||    
T  23803164 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgattttatgttgttat 23803262  T
Q  205 at 206  Q
    ||    
T  23803263 at 23803264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26789521 - 26789440
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataaaatgtttaagttgatgattgattatt 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26789521 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatg-ttgattatt 26789440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14825653 - 14825551
Alignment:
Q  106 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatg-tttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||    
T  14825653 tgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatg-ttgattattcttggatattgttat 14825555  T
Q  205 atct 208  Q
    ||||    
T  14825554 atct 14825551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 195
Target Start/End: Original strand, 630603 - 630692
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttga 195  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  630603 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttaaagttgatg-ttgattatgatttga 630692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Original strand, 4831457 - 4831587
Alignment:
Q  94 tgattttgttaatgat--ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataaaatgtttaagttgatgattgattatta 190  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||| |    
T  4831457 tgatgttgttaatgatgattgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatca 4831554  T
Q  191 tttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4831555 tttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 4831587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Original strand, 4834752 - 4834882
Alignment:
Q  94 tgattttgttaatgat--ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataaaatgtttaagttgatgattgattatta 190  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||| |    
T  4834752 tgatgttgttaatgatgattgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatca 4834849  T
Q  191 tttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4834850 tttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 4834882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12611203 - 12611106
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  12611203 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatt---tgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttgatgttgttat 12611108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14047820 - 14047708
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatct 208  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  14047820 ttgatattgttaatgatgtggtatattcgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 14047723  T
Q  209 tgagatgtttatgtg 223  Q
    |||||||| ||||||    
T  14047722 tgagatgtctatgtg 14047708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30146567 - 30146455
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatct 208  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||| | |||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30146567 ttgatattgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattaagtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 30146470  T
Q  209 tgagatgtttatgtg 223  Q
    |||||||| ||||||    
T  30146469 tgagatgtctatgtg 30146455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Original strand, 26045268 - 26045353
Alignment:
Q  144 gcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctat 231  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| | || |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26045268 gcattatgtggattatataagatgtttaagt-gttg-ttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttttgtgctgcctat 26045353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 53082086 - 53082143
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  53082086 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 53082143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14185105 - 14185039
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14185105 atgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgatgttatatcttgagacgtttatgtgttgcctatg 14185039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Original strand, 14746578 - 14746644
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  14746578 atgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctacctatg 14746644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 162
Target Start/End: Original strand, 13780 - 13842
Alignment:
Q  100 tgttaatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  13780 tgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 13842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 46640390 - 46640447
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  46640390 atgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 46640447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 52243128 - 52243185
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||    
T  52243128 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatata 52243185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 18215254 - 18215309
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18215254 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18215309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27996090 - 27995975
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgag 212  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||| | |||| |||||  ||||| |||||||    ||||    
T  27996090 atgttgttagtaatgtgatacaattatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg-ttattgtttatttattgacgttgttatgctgtgag 27995992  T
Q  213 atgtttatgtgatgcct 229  Q
     ||||||||||||||||    
T  27995991 ctgtttatgtgatgcct 27995975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 51463848 - 51463903
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  51463848 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattatttgaattatat 51463903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 4561425 - 4561476
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  4561425 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 4561476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 5757029 - 5757080
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  5757029 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 5757080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9556545 - 9556494
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  9556545 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 9556494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10712871 - 10712820
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  10712871 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 10712820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10926641 - 10926590
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  10926641 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 10926590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12487726 - 12487675
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  12487726 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 12487675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 14757513 - 14757564
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  14757513 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 14757564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 14954258 - 14954309
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  14954258 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 14954309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 15497045 - 15497096
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  15497045 ttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatg 15497096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25689885 - 25689834
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  25689885 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 25689834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27534041 - 27533990
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  27534041 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 27533990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33742393 - 33742351
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33742393 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtg 33742351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 1837492 - 1837544
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||    
T  1837492 atttgatgttgtta-taatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatat 1837544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 7641175 - 7641227
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7641175 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 7641227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 15118335 - 15118387
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15118335 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 15118387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 15355307 - 15355359
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15355307 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 15355359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 43198487 - 43198544
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  43198487 atgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 43198544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44615467 - 44615415
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44615467 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 44615415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 52312689 - 52312637
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  52312689 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 52312637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12611125 - 12611070
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  12611125 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 12611070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15365248 - 15365208
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 153  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  15365248 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgaattatgtg 15365208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15367876 - 15367821
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  15367876 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15367821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15371388 - 15371333
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  15371388 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15371333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15373669 - 15373614
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  15373669 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15373614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15402889 - 15402834
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  15402889 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15402834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19738425 - 19738310
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgag 212  Q
    |||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||| | |||| |||||  || || ||||||| |  ||||    
T  19738425 atgttgatagtaatgttatatagttatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg-ttattgtttattcattaacgttgttatgttgtgag 19738327  T
Q  213 atgtttatgtgatgcct 229  Q
    ||||||||||| |||||    
T  19738326 atgtttatgtgctgcct 19738310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44102396 - 44102341
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44102396 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 44102341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 44928858 - 44928914
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44928858 atgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 44928914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 117 - 232
Target Start/End: Original strand, 7435 - 7550
Alignment:
Q  117 tgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7435 tgttagtaatgtgatatatttgtgtatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgatatatcttgagatgt 7534  T
Q  217 ttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||| ||||||||    
T  7535 ttatgtgctgcctatg 7550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2080 - 1954
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  2080 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 1982  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1981 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 1954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 110839 - 110713
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  110839 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttat 110741  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  110740 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 110713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23838360 - 23838234
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  23838360 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 23838262  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23838261 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 23838234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4477007 - 4476884
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatc 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4477007 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatc 4476909  T
Q  208 ttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  4476908 ttgagatgtttatgtgctgcctatg 4476884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18453368 - 18453242
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  18453368 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgattttgttat 18453270  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18453269 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 18453242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 14979322 - 14979448
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  14979322 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 14979420  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  14979421 atctcaagatgtttaagtgatgcctatg 14979448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 15817456 - 15817582
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  15817456 atgatttgatgttgttagtaatgtggtatatttgaatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttaattatcatttgatattgttat 15817554  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  15817555 atcttgagatgtttacgtgctgcatatg 15817582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 19773477 - 19773603
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||    
T  19773477 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg-ttcttgattatcatttgatattgttat 19773575  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  19773576 atcttgagatgtttacgtgctgcatatg 19773603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 28103833 - 28103959
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  28103833 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatataagttgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 28103931  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28103932 accttgagatgtttacgtgctgcctatg 28103959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33443231 - 33443122
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||    
T  33443231 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttg----ttgattattatttgatattgttat 33443136  T
Q  205 atcttgagatgttt 218  Q
    ||||||||||||||    
T  33443135 atcttgagatgttt 33443122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20136855 - 20136730
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  20136855 atgatttgatgttgttagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 20136758  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  20136757 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 20136730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 22196014 - 22196139
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  22196014 atgatttgatgttgttagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 22196111  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22196112 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 22196139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23415070 - 23414944
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  23415070 atgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 23414972  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  23414971 atcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 23414944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 219
Target Start/End: Original strand, 15705382 - 15705491
Alignment:
Q  109 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatct 208  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15705382 tttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtttatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttatatct 15705480  T
Q  209 tgagatgttta 219  Q
    |||||||||||    
T  15705481 tgagatgttta 15705491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22806117 - 22805992
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  22806117 atgatttaatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-agttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 22806020  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  22806019 atcttgtgatgtttacgtgctgcctatg 22805992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Original strand, 25619657 - 25619770
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  25619657 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatttttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 25619755  T
Q  205 atcttgagatgttta 219  Q
    ||||  |||||||||    
T  25619756 atctcaagatgttta 25619770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Original strand, 20556793 - 20556893
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  20556793 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttgatgttgttat 20556891  T
Q  205 at 206  Q
    ||    
T  20556892 at 20556893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25755072 - 25754972
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  25755072 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattttataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttgatgttgttat 25754974  T
Q  205 at 206  Q
    ||    
T  25754973 at 25754972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16493332 - 16493206
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |  | |||||||||   ||||| |    
T  16493332 atgaattgaggttgttagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttct 16493234  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16493233 atcttgagatgtttatgttctgcctatg 16493206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 218
Target Start/End: Original strand, 18177605 - 18177719
Alignment:
Q  104 aatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaag-ttgatgattgattattatttgacattgtt 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  18177605 aatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatg-ttgattatcatttgatattgtt 18177703  T
Q  203 atatcttgagatgttt 218  Q
    ||||| |||| |||||    
T  18177704 atatcatgagttgttt 18177719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 218
Target Start/End: Original strand, 18199349 - 18199463
Alignment:
Q  104 aatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaag-ttgatgattgattattatttgacattgtt 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  18199349 aatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatg-ttgattatcatttgatattgtt 18199447  T
Q  203 atatcttgagatgttt 218  Q
    ||||| |||| |||||    
T  18199448 atatcatgagttgttt 18199463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18204266 - 18204152
Alignment:
Q  104 aatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaag-ttgatgattgattattatttgacattgtt 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  18204266 aatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatg-ttgattatcatttgatattgtt 18204168  T
Q  203 atatcttgagatgttt 218  Q
    ||||| |||| |||||    
T  18204167 atatcatgagttgttt 18204152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27556828 - 27556702
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||| || ||||||  |||||||    
T  27556828 atgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgatcatcatttgatgttgttat 27556730  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    || |||||||||||| |||  |||||||    
T  27556729 atattgagatgtttacgtgtcgcctatg 27556702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23076918 - 23076806
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| || |||||||| | |||| ||| ||||    
T  23076918 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatattattat 23076820  T
Q  205 atcttgagatgttt 218  Q
    |||| || ||||||    
T  23076819 atctggatatgttt 23076806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 211
Target Start/End: Original strand, 18896252 - 18896354
Alignment:
Q  107 gatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatat 206  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| | | |||| ||||||||||    
T  18896252 gatttaatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattgtca-ttgatattgttatat 18896349  T
Q  207 cttga 211  Q
    |||||    
T  18896350 cttga 18896354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20182962 - 20182854
Alignment:
Q  120 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20182962 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttg-ttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 20182866  T
Q  220 tgtgatgcctat 231  Q
    |||| |||||||    
T  20182865 tgtgctgcctat 20182854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 231
Target Start/End: Original strand, 22153029 - 22153137
Alignment:
Q  120 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22153029 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttg-ttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22153125  T
Q  220 tgtgatgcctat 231  Q
    |||| |||||||    
T  22153126 tgtgctgcctat 22153137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23539155 - 23539032
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||  || ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  23539155 atgatttaatgttaataataaggtgatatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatg-ttaattatcatttgatattgttat 23539057  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcct 229  Q
    |||||||||||| |||||| |||||    
T  23539056 atcttgagatgtatatgtgctgcct 23539032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19362612 - 19362507
Alignment:
Q  104 aatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||| | | |||| |||||||    
T  19362612 aatgatttaatgttgttagtaatgtgatataattttatatgcattatgtgaattatttaagatgttcaagttgttg-ttgattgtca-ttgatattgtta 19362515  T
Q  204 tatcttga 211  Q
    ||||||||    
T  19362514 tatcttga 19362507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Original strand, 23528041 - 23528115
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatg 179  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  23528041 atgatttgatgttgatagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagtcgatg 23528115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23538996 - 23538884
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  23538996 atgaattgatgttgttgttaatgtgatatagttgtatatgcgttatgtgaatgatatatgatgtttaggttgatg-ttgattgtcatttgatattgttat 23538898  T
Q  205 atcttgagatgttt 218  Q
    ||| |||| |||||    
T  23538897 atcatgagctgttt 23538884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35008336 - 35008224
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||| | |||| ||| ||||    
T  35008336 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttg-tttttgattatcacttgatattattat 35008238  T
Q  205 atcttgagatgttt 218  Q
    |||| || ||||||    
T  35008237 atctggatatgttt 35008224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20224129 - 20224018
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| | |||| ||| ||||    
T  20224129 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatattattat 20224031  T
Q  205 atcttgagatgtt 217  Q
    |||| || |||||    
T  20224030 atctggatatgtt 20224018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22118113 - 22118002
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| | |||| ||| ||||    
T  22118113 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatattattat 22118015  T
Q  205 atcttgagatgtt 217  Q
    |||| || |||||    
T  22118014 atctggatatgtt 22118002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25752902 - 25752838
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtt 169  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25752902 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 25752838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 225
Target Start/End: Original strand, 29416845 - 29416958
Alignment:
Q  111 tgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  29416845 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttaattatcatttgatattgttatatctt 29416942  T
Q  210 gagatgtttatgtgat 225  Q
    ||||||| ||||||||    
T  29416943 gagatgtctatgtgat 29416958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 8227445 - 8227501
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8227445 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8227501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18706491 - 18706423
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaag 173  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  18706491 atgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaag 18706423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 19847929 - 19847984
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19847929 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 19847984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17105919 - 17105864
Alignment:
Q  104 aatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 159  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17105919 aatgaattgatgttgttaataacgtgatatagttgtatatgaattatgtgaattat 17105864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25738561 - 25738450
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    |||||||||||| |  | || |||||||| | |||||||||||| |||||  |  |||||||||||||   |||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  25738561 ttgatgttgttaatgctatggtatatttgcaaatgcattatgtggattatgaatgatgtttaagttgag--ttgattattaattgatattgtcatatctt 25738464  T
Q  210 gagatgtttatgtg 223  Q
    ||||||| ||||||    
T  25738463 gagatgtctatgtg 25738450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18696673 - 18696616
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  18696673 atgatttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 18696616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15896114 - 15896074
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 153  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15896114 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtg 15896074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18456901 - 18456846
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18456901 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18456846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 20556874 - 20556929
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20556874 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20556929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11566877 - 11566826
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  11566877 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 11566826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14472286 - 14472235
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  14472286 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 14472235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16760310 - 16760259
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  16760310 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 16760259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 18917357 - 18917408
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  18917357 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 18917408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 18955854 - 18955905
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  18955854 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 18955905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19870605 - 19870554
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  19870605 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 19870554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22862961 - 22862910
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  22862961 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 22862910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22949123 - 22949072
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  22949123 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 22949072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22953079 - 22953028
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  22953079 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 22953028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23395083 - 23395032
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  23395083 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 23395032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23871567 - 23871516
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  23871567 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 23871516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23875523 - 23875472
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  23875523 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 23875472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23989935 - 23989884
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  23989935 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 23989884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8243876 - 8243834
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8243876 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtg 8243834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 223
Target Start/End: Original strand, 12618935 - 12618977
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12618935 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtg 12618977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22782409 - 22782356
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 159  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  22782409 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 22782356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 219
Target Start/End: Original strand, 31477901 - 31477939
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 219  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31477901 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 31477939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 2291163 - 2291215
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  2291163 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 2291215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8055208 - 8055156
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8055208 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8055156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12742496 - 12742444
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12742496 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 12742444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 18334575 - 18334627
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18334575 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18334627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19005225 - 19005173
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19005225 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 19005173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 19858902 - 19858954
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19858902 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 19858954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24422726 - 24422674
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24422726 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24422674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25644508 - 25644451
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  25644508 atgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatata 25644451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 26924623 - 26924675
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  26924623 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 26924675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33861973 - 33861921
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  33861973 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 33861921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33864457 - 33864405
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  33864457 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 33864405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 153
Target Start/End: Original strand, 19656075 - 19656115
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 153  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  19656075 atgttgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtg 19656115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25754991 - 25754936
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  25754991 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 25754936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 37598817 - 37598943
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  37598817 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttat 37598915  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37598916 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 37598943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42960728 - 42960602
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  42960728 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttat 42960630  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42960629 atcttgagatgtttatgtgttgcctatg 42960602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 36314822 - 36314690
Alignment:
Q  16 gaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacatgcatgatagttatgttgaaaattattttatgatgttacgtgattttgttaatgatttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  36314822 gaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgattttgttcataatttgatg 36314723  T
Q  116 ttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 149  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  36314722 ttgtta-taatgttatataattgtatatacatta 36314690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 28370956 - 28371082
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  28370956 atgatctgatgttgttagtaatgagatatatttgcatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttat 28371054  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28371055 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 28371082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23469988 - 23469863
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | || |||    
T  23469988 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgata-tggtat 23469891  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23469890 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 23469863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 25574404 - 25574525
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||    
T  25574404 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatta-ttgaaatagttat 25574501  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  25574502 atcttgagatgtttatgtgctgcc 25574525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 25575597 - 25575718
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||    
T  25575597 atgatttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatta-ttgaaatagttat 25575694  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  25575695 atcttgagatgtttatgtgctgcc 25575718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 25576790 - 25576911
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  25576790 atgattttatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcatgatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatta-ttgatattgttat 25576887  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  25576888 atcttgagatgtttatgtgctgcc 25576911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6766014 - 6765888
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  6766014 atgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatg-ttgattattatttgatgttgttat 6765916  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  6765915 atcttgagatgtttaagtgccgcctatg 6765888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 22107386 - 22107495
Alignment:
Q  122 gtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatg 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  22107386 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttagg 22107484  T
Q  222 tgatgcctatg 232  Q
    || ||||||||    
T  22107485 tgctgcctatg 22107495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Original strand, 30138863 - 30138976
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||    
T  30138863 atgatttaatgttcgtagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgttat 30138961  T
Q  205 atcttgagatgttta 219  Q
    |||||||||||||||    
T  30138962 atcttgagatgttta 30138976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 221
Target Start/End: Original strand, 26732768 - 26732882
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||   |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  26732768 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaagt--gtcgttgattattatttgatattgttat 26732865  T
Q  205 atcttgagatgtttatg 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  26732866 atcctgagatgtttatg 26732882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 221
Target Start/End: Original strand, 26740581 - 26740695
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  26740581 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaag-tgttg-ttgattattatttgatattgttat 26740678  T
Q  205 atcttgagatgtttatg 221  Q
    ||| | |||||||||||    
T  26740679 atccttagatgtttatg 26740695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 21328150 - 21328276
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||    
T  21328150 atgatttgatgttataaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgctat 21328248  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||  | |||||| |||| ||||||||    
T  21328249 atctgaatatgtttttgtgctgcctatg 21328276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 21809516 - 21809642
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |  | |||||||||   ||||| |    
T  21809516 atgaattgaggttgttagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttct 21809614  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21809615 atcttgagatgtttatgttctgcctatg 21809642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22336711 - 22336627
Alignment:
Q  147 ttatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22336711 ttatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 22336627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22340249 - 22340165
Alignment:
Q  147 ttatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22340249 ttatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 22340165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 185
Target Start/End: Original strand, 33895590 - 33895670
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgat 185  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  33895590 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgtttgat 33895670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 21731396 - 21731522
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |  | |||||||||   ||||| |    
T  21731396 atgaattgaggttgttagtaatgagatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttct 21731494  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21731495 atcttgagatgtttatgttctgcctatg 21731522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10816582 - 10816462
Alignment:
Q  111 tgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10816582 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggagttatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatctt 10816485  T
Q  210 gagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||| |||||| | ||||||    
T  10816484 gagatgtctatgtgctacctatg 10816462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15796608 - 15796479
Alignment:
Q  104 aatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaag-ttgatgattgattattatttgacattgtt 202  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||| |    
T  15796608 aatgatttgatgttgctaataatgtgatataattgtatatacagtatgcgaattataagagatgtttaagattgatg-ttgattatcatttgatattgct 15796510  T
Q  203 atatcttgagatg-tttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  15796509 atatcatgagctgttttatgtgctgcctatg 15796479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23538608 - 23538497
Alignment:
Q  111 tgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23538608 tgatgttgttaacgatgtggtatatttgaaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatgatttgatattgttatatctt 23538511  T
Q  210 gagatgtttatgtg 223  Q
    ||||||| ||||||    
T  23538510 gagatgtctatgtg 23538497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 38145441 - 38145492
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38145441 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattat 38145492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Original strand, 27988869 - 27988978
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatata--tttgtatatgcatt-atgtgaattatataaaatgtttaa--gttgatgattgattattatttgacattgttatatc 207  Q
    |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  27988869 atgttgttaagaatgtgatataaatttgtatatgcattgatgtgaattatacaagatgtttaaatgttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatc 27988967  T
Q  208 ttgagatgttt 218  Q
     |||| |||||    
T  27988968 atgagctgttt 27988978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20572072 - 20572025
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgt 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20572072 atgatttgatgttgttagtaatgtaatatagttgtatatgcattatgt 20572025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 2154593 - 2154648
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2154593 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 2154648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 20901988 - 20902043
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20901988 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 20902043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40726040 - 40725984
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  40726040 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 40725984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18356322 - 18356256
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  18356322 atgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 18356256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22750325 - 22750264
Alignment:
Q  147 ttatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  22750325 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 22750264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 22178154 - 22178211
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  22178154 atgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 22178211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25743908 - 25743852
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtga--tatatttgtatatgcattatgtgaattat 159  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25743908 atgatttggtgttgttattaatgtgacatatatttatatatgcattatgtgaattat 25743852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10753379 - 10753328
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  10753379 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacatgttgcctatg 10753328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 15236871 - 15236922
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  15236871 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 15236922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 15236926 - 15236977
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  15236926 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 15236977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 19472811 - 19472862
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  19472811 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 19472862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20295862 - 20295811
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  20295862 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 20295811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 20910926 - 20910977
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  20910926 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 20910977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19511577 - 19511516
Alignment:
Q  147 ttatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| || ||||||||||    
T  19511577 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatatcgttatatctt 19511516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 264751 - 264803
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  264751 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 264803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20909191 - 20909139
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20909191 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20909139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22144236 - 22144179
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  22144236 atgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 22144179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29330113 - 29330061
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29330113 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29330061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29346159 - 29346107
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29346159 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29346107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29348632 - 29348580
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29348632 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29348580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29351105 - 29351053
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29351105 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29351053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 29448190 - 29448137
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatta 158  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  29448190 atgatttgatgttgataataaggtgatgtatttgtatatgcattacatgaatta 29448137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 32027572 - 32027520
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32027572 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32027520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 39363563 - 39363511
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  39363563 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 39363511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 42245348 - 42245400
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  42245348 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 42245400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 36154763 - 36154818
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  36154763 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 36154818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 635917 - 636043
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  635917 atgatttgatgttgttagcaatgtgat-tatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgatgattgaatattatttgacattgttat 636015  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  636016 atcttgaaatatttatgtgctgcctatg 636043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22124471 - 22124345
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  22124471 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 22124373  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22124372 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 22124345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 149
Target Start/End: Original strand, 14295401 - 14295533
Alignment:
Q  16 gaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacatgcatgatagttatgttgaaaattattttatgatgttacgtgattttgttaatgatttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  14295401 gaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgattttgttcataatttgatg 14295500  T
Q  116 ttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 149  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14295501 ttgtta-taatgttatataattgtatatacatta 14295533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 51130835 - 51130703
Alignment:
Q  16 gaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacatgcatgatagttatgttgaaaattattttatgatgttacgtgattttgttaatgatttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  51130835 gaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgattttgttcataatttgatg 51130736  T
Q  116 ttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 149  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  51130735 ttgtta-taatgttatataattgtatatacatta 51130703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20958290 - 20958168
Alignment:
Q  109 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  20958290 tttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtcatatct 20958192  T
Q  209 tgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  20958191 tgagatgtttatgtgctgcctatg 20958168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 21043216 - 21043342
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||    
T  21043216 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-ttttattatcatttgatattgttat 21043314  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21043315 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 21043342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 52940812 - 52940937
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  52940812 atgatttgatgttgttagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattattatttggtattgttat 52940910  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  52940911 atcttgagatg-ttatgtgctgcctatg 52940937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 13881316 - 13881442
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  13881316 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 13881414  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13881415 atctcaagatgtttatgtgatgcctatg 13881442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 20437927 - 20438054
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatg-tttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  20437927 atgatttgatgctgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 20438025  T
Q  204 tatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20438026 tatcttgaggtgtttatgtgctgcctatg 20438054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28312700 - 28312574
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  28312700 atgatttgatgtttttagtaatgagatatatttgtatatacattatgtggattttataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 28312602  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||    
T  28312601 atcttgagatgtttatgtgctgtctatg 28312574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 27653157 - 27653283
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  27653157 atgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgagaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 27653255  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27653256 atcttgagatgtttaagtgctgcctatg 27653283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48603638 - 48603512
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||     
T  48603638 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatacattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttag 48603540  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  48603539 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 48603512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14800720 - 14800589
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgtta-gtaatgtgatatat----ttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacatt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  14800720 atgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattattatttgatatt 14800622  T
Q  200 gttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  14800621 gttatatcttgatatgtttatgtgctgcatatg 14800589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14809594 - 14809463
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgtta-gtaatgtgatatat----ttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacatt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  14809594 atgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattattatttgatatt 14809496  T
Q  200 gttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  14809495 gttatatcttgatatgtttatgtgctgcatatg 14809463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47190788 - 47190713
Alignment:
Q  104 aatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  47190788 aatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtaaattatataagatgtttaagttgatg 47190713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 222
Target Start/End: Original strand, 21533808 - 21533923
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  21533808 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttg-ttgattattatttgatattgttat 21533905  T
Q  205 atcttgagatgtttatgt 222  Q
    ||| | ||| ||||||||    
T  21533906 atcctaagaagtttatgt 21533923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 41781524 - 41781649
Alignment:
Q  105 atgatttgat-gttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 203  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||| ||||||  ||||||    
T  41781524 atgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttg-ttgattatcatttgatgttgtta 41781620  T
Q  204 tatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41781621 tatcttgaaatgtttatgtgctgcctatg 41781649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 195
Target Start/End: Original strand, 45574741 - 45574830
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttga 195  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  45574741 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-ttgattatgatttga 45574830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 48520697 - 48520581
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatg-tttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 203  Q
    |||| |||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  48520697 atgaattgatgttataaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatg-ttgtttattatttgatattgtta 48520599  T
Q  204 tatcttgagatgtttatgt 222  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  48520598 tatc-tgagatgttcatgt 48520581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16372141 - 16372057
Alignment:
Q  147 ttatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16372141 ttatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 16372057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 195
Target Start/End: Original strand, 22130765 - 22130853
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttga 195  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  22130765 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg--tgattatgatttga 22130853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32649892 - 32649780
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatct 208  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32649892 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 32649795  T
Q  209 tgagatgtttatgtg 223  Q
    |||||||| ||||||    
T  32649794 tgagatgtctatgtg 32649780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16381346 - 16381239
Alignment:
Q  130 atatatttgtatatgcatt-atgtgaattatataaaatgtttaa--gttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatg-tttatgtgat 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  16381346 atatatttgtatatgcattgatgtgaattatacaatatgtttaaatgttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgat 16381248  T
Q  226 gcctatgct 234  Q
    | |||||||    
T  16381247 gtctatgct 16381239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 41049970 - 41050027
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41049970 atgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatata 41050027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20329181 - 20329121
Alignment:
Q  120 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatg-tttaagttgatg 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20329181 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgttttaagttgatg 20329121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11945626 - 11945571
Alignment:
Q  121 agtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttg 176  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11945626 agtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagttg 11945571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29534729 - 29534617
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatct 208  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||  | |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| || |||||||||    
T  29534729 ttgatgttgttaatgatgtggtatattttcaaatgcattatgtggaattttatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatatcgttatatct 29534632  T
Q  209 tgagatgtttatgtg 223  Q
    |||||||| ||||||    
T  29534631 tgagatgtctatgtg 29534617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 222
Target Start/End: Original strand, 2332914 - 2333025
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatct 208  Q
    |||||||||||| | | ||| || ||||| | |||||||||||| | |||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2332914 ttgatgttgttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 2333011  T
Q  209 tgagatgtttatgt 222  Q
    |||||||| |||||    
T  2333012 tgagatgtctatgt 2333025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Original strand, 16368221 - 16368276
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattata 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  16368221 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 16368276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 50686792 - 50686698
Alignment:
Q  112 gatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatc 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||  |||||| || || || ||||||   ||||||||||||||||||    
T  50686792 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgacattgttatatc 50686698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 159
Target Start/End: Original strand, 35261015 - 35261069
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  35261015 atgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattat 35261069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Original strand, 50614050 - 50614151
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| || |||||| || || || ||||||   |||||| ||||||||    
T  50614050 atgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattgttat 50614148  T
Q  205 atc 207  Q
    |||    
T  50614149 atc 50614151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Original strand, 50621878 - 50621979
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| || |||||| || || || ||||||   |||||| ||||||||    
T  50621878 atgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattgttat 50621976  T
Q  205 atc 207  Q
    |||    
T  50621977 atc 50621979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16758837 - 16758780
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16758837 atgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 16758780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 21896190 - 21896247
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  21896190 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatata 21896247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 433193 - 433137
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  433193 atgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 433137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1010738 - 1010687
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  1010738 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 1010687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 1925220 - 1925271
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  1925220 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 1925271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 20228900 - 20228951
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  20228900 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 20228951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 20924234 - 20924285
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  20924234 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 20924285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21407370 - 21407319
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  21407370 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 21407319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 23819389 - 23819440
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  23819389 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 23819440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26065123 - 26065068
Alignment:
Q  107 gatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26065123 gatttgatgtcattaataatgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatata 26065068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43543239 - 43543188
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  43543239 ttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatg 43543188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 51326903 - 51326852
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  51326903 ttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgtctatg 51326852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12271656 - 12271614
Alignment:
Q  190 atttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12271656 atttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatg 12271614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 159
Target Start/End: Original strand, 13212841 - 13212894
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 159  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  13212841 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 13212894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21347144 - 21347091
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 159  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  21347144 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 21347091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13989045 - 13988993
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13989045 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13988993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 21475070 - 21475122
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21475070 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 21475122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 21861504 - 21861561
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  21861504 atgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 21861561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 21923274 - 21923326
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21923274 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 21923326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29776867 - 29776815
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29776867 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29776815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31612492 - 31612440
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  31612492 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 31612440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21477703 - 21477659
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 149  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21477703 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatacgcatta 21477659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 45574822 - 45574877
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  45574822 atgatttgatgttctta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 45574877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 149
Target Start/End: Original strand, 919 - 1051
Alignment:
Q  16 gaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacatgcatgatagttatgttgaaaattattttatgatgttacgtgattttgttaatgatttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  919 gaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgattttgttcataatttgatg 1018  T
Q  116 ttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 149  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  1019 ttgtta-taatgttatataattgtatatacatta 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36366 - 36240
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||    
T  36366 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg-tcgttgattatcatttgatattgttat 36268  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36267 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 36240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Original strand, 10019 - 10150
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  10019 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagatgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 10117  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatgcttct 237  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  10118 atcttgagatgtttacgtgctgcctatgtttct 10150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 55619 - 55742
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||    
T  55619 atgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 55718  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  55719 atcttgagatgtttatgtgctgcc 55742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 600 - 477
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||||    
T  600 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatg-ttaattatcatttgatattgttatatc 502  T
Q  208 ttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||    
T  501 ttgagatgtttacgtgctccctatg 477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 6094 - 6220
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||    
T  6094 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgttat 6192  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6193 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 18102 - 18228
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  18102 atgatttgatattgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-tttattatcatttgatattgttat 18200  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18201 atcttgagatatttatgtgctgcctatg 18228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21352 - 21226
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  21352 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 21254  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21253 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 21226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 105266 - 105140
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  105266 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattttttgaattatataagatgtttaatttgatg-ttaattatcatttgatattgttat 105168  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  105167 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 105140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 94590 - 94538
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  94590 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 94538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 133102 - 132976
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  133102 atgatttgatgttgttagtaataagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 133004  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  133003 atcttgaaatgtttatgtgctgcatatg 132976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29387 - 29285
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||         |||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  29387 atgatttactgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaagta---------tttaagatgatg-ttgattatcatttgatattgttat 29298  T
Q  205 atcttgagatgtt 217  Q
    ||||||| |||||    
T  29297 atcttgatatgtt 29285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 126141 - 126015
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  126141 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 126043  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  126042 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 126015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 833 - 707
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |   ||| ||    
T  833 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattattatttcatgatgtgat 735  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  734 atcttgagatgtttatgtgttgcctatg 707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 162
Target Start/End: Original strand, 60648 - 60706
Alignment:
Q  104 aatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  60648 aatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatata 60706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 232
Target Start/End: Original strand, 696 - 821
Alignment:
Q  106 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttata 205  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||||| |||||||||    
T  696 tgatctgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcttttgatattgttata 794  T
Q  206 tcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||    
T  795 tcttgagatgtttatatgctgcctatg 821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10344 - 10223
Alignment:
Q  110 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10344 ttgatgttgttagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatga-tgattattatttgatattgttacatctt 10246  T
Q  210 gagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
T  10245 gagatgtttatgtgctgcttatg 10223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 232
Target Start/End: Original strand, 221143 - 221267
Alignment:
Q  106 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttata 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  221143 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataaga-ctttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttata 221240  T
Q  206 tcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  221241 tcttgagatgtttatgtgctgcctatg 221267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 225593 - 225536
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  225593 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 225536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 189468 - 189519
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  189468 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 189519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17688 - 17572
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  17688 atgatttgaagttgttggtaatgtgatatagttgtatatgccttatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 17590  T
Q  205 atcttgagatgtttatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17589 atcttgagatgtttatgt 17572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 20145 - 20271
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||     
T  20145 atgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcactatgtgaattatatataatgtttaagttgttg-ttgattagcatttgatattgttaa 20243  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  20244 atcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 20271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4054 - 3927
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatg-tttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||  | |||||    
T  4054 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatg-ttgattatcatttggtaatgtta 3956  T
Q  204 tatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3955 tatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 3927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8217 - 8091
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  8217 atgatttgatgtcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 8119  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8118 atcttgagatgtttatgtgttgcatatg 8091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 29358 - 29481
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||    
T  29358 atgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgcatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttat 29457  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcc 228  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||    
T  29458 atcttgagaagtttatgtgctgcc 29481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 24532 - 24658
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  24532 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 24630  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  24631 atcttgaaatgtttaagtgttgcctatg 24658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20936 - 20810
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  20936 atgatttgatgttaatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 20838  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  20837 atcttgagatgtttacgtgctgcctatg 20810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1038 - 912
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  1038 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttatatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 940  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||    
T  939 atcttgagatgtttatgtgctgtctatg 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 9656 - 9781
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  9656 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattgtatggattatataagatgtttaag-tgatg-ttgattatcatttgatattgttat 9753  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9754 atcttgagatgtctatgtgctgcctatg 9781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 345 - 219
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  345 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatttgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 247  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  246 atcttgatatgtttacgtgttgcctatg 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15920 - 15802
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgag 212  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  15920 atgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgag 15822  T
Q  213 atgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||| ||| | ||||||    
T  15821 atgtttacgtgttacctatg 15802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 230
Target Start/End: Original strand, 75763 - 75887
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  75763 atgatttgatgttgttagtaatgtgataaaattgtatttgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 75861  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgccta 230  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  75862 atcttgagatgtttacgtgctgccta 75887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Original strand, 1809 - 1932
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||||    
T  1809 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgatgttat 1907  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcct 229  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    
T  1908 atcttgagatgtttacgtgctgcct 1932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39438 - 39312
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  39438 atgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 39340  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  39339 atcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 39312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 209 - 101
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  209 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgatga-tgtttatcatttgatattgttat 111  T
Q  205 atcttgagat 214  Q
    ||||||||||    
T  110 atcttgagat 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 1
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgc 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17759 - 17633
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  17759 atgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgaattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 17661  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  17660 atcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 17633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31309 - 31183
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||||    
T  31309 atgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-tttattatcatttgatattgttat 31211  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  31210 atcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 31183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6797 - 6684
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  6797 atgatttgaggttgatggtaatgtaatatatttgtatatgtagtatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 6699  T
Q  205 atcttgagatgttta 219  Q
    |||||||||||||||    
T  6698 atcttgagatgttta 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Original strand, 19582 - 19698
Alignment:
Q  106 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat-aaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19582 tgatttgatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagattttttaagttgatg-ttgattattgtttgacattgttat 19680  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtg 223  Q
    || ||||||||||| ||||    
T  19681 at-ttgagatgtttctgtg 19698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Original strand, 15233 - 15299
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15233 atgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 15299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 120192 - 120068
Alignment:
Q  107 gatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatat 206  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  120192 gatttgatgttgatgataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaactatatcagatgtttaagtt-attgttgattatcatttgatattgttatat 120094  T
Q  207 cttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  120093 cttgagatgtttacgtgttgcctatg 120068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 369 - 269
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  369 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagctgatg-ttgattatgatttgatgttgttat 271  T
Q  205 at 206  Q
    ||    
T  270 at 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 233
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  288 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 67446 - 67342
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  67446 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattgtataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 67348  T
Q  205 atcttg 210  Q
    ||||||    
T  67347 atcttg 67342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Original strand, 206459 - 206570
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  206459 atgatttaatattgttagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatacaagatgattaag-tgttg-ttgattattatttgatattgttat 206556  T
Q  205 atcttgagatgttt 218  Q
    ||||||||||||||    
T  206557 atcttgagatgttt 206570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15125
Alignment:
Q  135 tttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15030 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctat 15125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11323 - 11209
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgag 212  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  11323 atgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatttggattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatcctgag 11226  T
Q  213 atgtttatgtgatgcct 229  Q
    ||||||||||| |||||    
T  11225 atgtttatgtgctgcct 11209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22423 - 22309
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgag 212  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  22423 atgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatatggattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatcctgag 22326  T
Q  213 atgtttatgtgatgcct 229  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22325 atgtttatgtgctgcct 22309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 213 - 124
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttga 195  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  213 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-ttgattatgatttga 124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12313 - 12221
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatat 206  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||    
T  12313 atgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgatg-ttgattatgatttgatgttgttatat 12221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12240 - 12185
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12240 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 12185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1884 - 1785
Alignment:
Q  109 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatc 207  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  1884 tttgatgttgttaatgatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattattataaggagtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatc 1786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 232
Target Start/End: Original strand, 3265 - 3388
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatc 207  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| |  |||||||||     
T  3265 atttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatg-ttgattatcatttaatgttgttatata 3363  T
Q  208 ttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
     | |||| |||| ||| ||||||||    
T  3364 ataagatatttaagtgctgcctatg 3388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8000 - 7894
Alignment:
Q  125 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatg-tttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8000 atgtaatatatttgtgtatggattatgtgaattatataagatgttttaagttgatg-ttgcttattatttgatattgttatatc-tgagatgtttatgtg 7903  T
Q  224 atgcctatg 232  Q
     ||||||||    
T  7902 ttgcctatg 7894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10651 - 10533
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgag 212  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| |||| |||    
T  10651 atgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttacatctagag 10553  T
Q  213 atgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  10552 atgtttatgtgttgcctatg 10533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 57999 - 57898
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatc 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||| | | |||| |||||||||||    
T  57999 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatttaaaatgttcaagttgttg-ttgattgtca-ttgatattgttatatc 57902  T
Q  208 ttga 211  Q
    ||||    
T  57901 ttga 57898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22463 - 22361
Alignment:
Q  106 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatg-tttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||    
T  22463 tgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatg-ttgattattcttggatattgttat 22365  T
Q  205 atct 208  Q
    ||||    
T  22364 atct 22361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 208
Target Start/End: Original strand, 14056 - 14158
Alignment:
Q  106 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatg-tttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||    
T  14056 tgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatg-ttgattattcttggatattgttat 14154  T
Q  205 atct 208  Q
    ||||    
T  14155 atct 14158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 267847 - 267790
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  267847 atgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 267790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 332501 - 332380
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  | ||||| |||| |||| |||    
T  332501 atgattttatgttgaaagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattataaattatgtttaagttgatgttgaaatatta-ttgatattg-tat 332404  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtgatgcc 228  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  332403 atcttgagatgttgatgtgctgcc 332380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 171
Target Start/End: Original strand, 2427 - 2493
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgttta 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2427 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttta 2493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 223
Target Start/End: Original strand, 4631 - 4748
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| || ||| ||| ||||    
T  4631 atgatttaatgatgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttgaaatgtttaagttgttga-tgattatcatatgatattattat 4729  T
Q  205 atcttgagatgtttatgtg 223  Q
    |||| || ||||| |||||    
T  4730 atctggatatgttaatgtg 4748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 16861 - 16957
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttga 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| | | |||| |||||||||||||||    
T  16861 atgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgttg-ttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 16957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 176
Target Start/End: Original strand, 26016 - 26084
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26016 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttg 26084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 146384 - 146254
Alignment:
Q  94 tgattttgttaatgat--ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataaaatgtttaagttgatgattgattatta 190  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||| |    
T  146384 tgatgttgttaatgatgattgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatca 146287  T
Q  191 tttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  146286 tttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 146254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 82339 - 82235
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcat----tatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattg 200  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||    
T  82339 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttgatgttg 82241  T
Q  201 ttatat 206  Q
    ||||||    
T  82240 ttatat 82235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 80426 - 80477
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  80426 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatg 80477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 82254 - 82199
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  82254 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 82199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6210 - 6116
Alignment:
Q  116 ttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttga 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||    
T  6210 ttgttaataatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgagga-tgtttatcatttgatattgttatatcttga 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29851 - 29747
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatattt-gtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttga 211  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  29851 atgttgatagtaatgtaatatattttgtatgtgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatctgga 29753  T
Q  212 gatgtt 217  Q
     |||||    
T  29752 tatgtt 29747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 48526 - 48396
Alignment:
Q  94 tgattttgttaatgat--ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataaaatgtttaagttgatgattgattatta 190  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||| |    
T  48526 tgatgttgttaatgatgattgatattgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatca 48429  T
Q  191 tttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  48428 tttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 48396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 85713 - 85605
Alignment:
Q  123 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgt 222  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||    
T  85713 taatgtgatataatcgtatacgcattacatgaattatatatgatgcttaagttgatg-ttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagt 85615  T
Q  223 gatgcctatg 232  Q
    | ||||||||    
T  85614 gctgcctatg 85605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 176
Target Start/End: Original strand, 2361 - 2432
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttg 176  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2361 atgatttaatgttgatagtaatttaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttg 2432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 97193 - 97092
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| || || || ||||||   |||||| ||||||||    
T  97193 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattgttat 97095  T
Q  205 atc 207  Q
    |||    
T  97094 atc 97092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 106471 - 106370
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| || || || ||||||   |||||| ||||||||    
T  106471 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattgttat 106373  T
Q  205 atc 207  Q
    |||    
T  106372 atc 106370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3781 - 3712
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagt 174  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3781 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgtattatgtggattatataagatgtttaagt 3712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Original strand, 604 - 712
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgag 212  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||    
T  604 atgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttaag 702  T
Q  213 atgtttatgt 222  Q
     |||| ||||    
T  703 ttgttaatgt 712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Original strand, 128904 - 129005
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||| || || || ||||||   |||||| ||||||||    
T  128904 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattgttat 129002  T
Q  205 atc 207  Q
    |||    
T  129003 atc 129005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Original strand, 53833 - 53899
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  53833 atgtttaagtagatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 53899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 78508 - 78453
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattata 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  78508 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 78453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Original strand, 13433 - 13507
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgat 181  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13433 atgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtat--gcattatctgaattatataagatgtttaagttgttgat 13507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 6217 - 6274
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  6217 atgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 6274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 723 - 666
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  723 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6378 - 6330
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtga 154  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6378 atgatttggtgttgttaataatgtgatata-ttgtatatgcattatgtga 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25290 - 25236
Alignment:
Q  107 gatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  25290 gatttgatgttgtaa-taatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatata 25236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11651 - 11595
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11651 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 11595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 17961 - 18017
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17961 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 159
Target Start/End: Original strand, 2108 - 2161
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 159  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  2108 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 2161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 38190 - 38246
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  38190 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 38246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Original strand, 1287 - 1353
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  1287 atgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctggctatg 1353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Original strand, 16034 - 16136
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataa-aatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 203  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || || || ||||||   |||||| |||||||    
T  16034 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttg-ttgatttacatttgatattgtta 16132  T
Q  204 tatc 207  Q
    ||||    
T  16133 tatc 16136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13316 - 13259
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  13316 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 13259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3383 - 3317
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3383 atgtttcagttgatg-ttgattgtcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgttgcctatg 3317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 58810 - 58861
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  58810 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatg 58861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 134390 - 134338
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  134390 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 134338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 136859 - 136807
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  136859 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 136807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 139328 - 139276
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  139328 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 139276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 141797 - 141745
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  141797 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 141745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 144266 - 144214
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  144266 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 144214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 193 - 135
Alignment:
Q  104 aatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  193 aatgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatata 135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 685 - 632
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  685 atgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 231
Target Start/End: Original strand, 4264 - 4329
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctat 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  4264 atgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttgcctat 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15123 - 15070
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15123 atgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 15070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 9930 - 9877
Alignment:
Q  107 gatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9930 gatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 9877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 162
Target Start/End: Original strand, 53478 - 53540
Alignment:
Q  100 tgttaatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  53478 tgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 53540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 38504 - 38447
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  38504 atgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatata 38447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 162
Target Start/End: Original strand, 18176 - 18229
Alignment:
Q  109 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  18176 tttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 18229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 30114 - 30059
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30114 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatat 30059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 1260 - 1315
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1260 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 79264 - 79319
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  79264 atgatttgatgttgtta-tattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatat 79319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 446671 - 446631
Alignment:
Q  113 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 153  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  446671 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtg 446631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 159
Target Start/End: Original strand, 85559 - 85612
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 159  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  85559 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 85612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 465 - 414
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  465 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 3966 - 4017
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  3966 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 4017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 410 - 359
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  410 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 5192 - 5243
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  5192 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 5243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12437 - 12386
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12437 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Original strand, 6897 - 6963
Alignment:
Q  165 atgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||| |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6897 atgtttaagttgatg-ttgagtatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 6963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 11592 - 11643
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  11592 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 32751 - 32802
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  32751 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 32802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 36033 - 36084
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  36033 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 36084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 36177 - 36228
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  36177 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 36228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 207593 - 207644
Alignment:
Q  181 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  207593 ttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgtcgcctatg 207644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Original strand, 6937 - 7002
Alignment:
Q  166 tgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 232  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  6937 tgtttaagttgatg-ttgattatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgactatg 7002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 159
Target Start/End: Original strand, 164570 - 164623
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 159  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  164570 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 164623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 1732 - 1789
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 162  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||||    
T  1732 atgatttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatata 1789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20926 - 20874
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20926 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14126 - 14074
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14126 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 14074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38000 - 37948
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  38000 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 37948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158485
Alignment:
Q  108 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  158433 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 158485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 153
Target Start/End: Original strand, 14547 - 14595
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 153  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14547 atgatttaaagttgttggtaatgtgatataattatatatgcattatgtg 14595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 149
Target Start/End: Original strand, 27683 - 27727
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 149  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27683 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcatta 27727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16966 - 16911
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 161  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16966 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 149
Target Start/End: Original strand, 19819 - 19863
Alignment:
Q  105 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 149  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  19819 atgatttgatgttattaataatgtgatataaatgtatatgcatta 19863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University