View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11149_high_4 (Length: 710)

Name: NF11149_high_4
Description: NF11149
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11149_high_4
NF11149_high_4
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (152-695)||(1274538-1275081)
chr7 (152-655)||(22909108-22909611)
chr7 (152-645)||(2797231-2797725)
chr7 (152-645)||(10345973-10346467)
chr7 (152-645)||(31157944-31158438)
chr7 (152-645)||(12190843-12191335)
chr7 (162-645)||(12183866-12184348)
chr7 (152-645)||(31878601-31879093)
chr7 (152-645)||(12090128-12090622)
chr7 (152-645)||(8107556-8108050)
chr7 (158-570)||(19471864-19472275)
chr7 (152-645)||(2631396-2631890)
chr7 (152-645)||(3544546-3545042)
chr7 (152-645)||(6172527-6173009)
chr7 (152-645)||(22321469-22321962)
chr7 (152-645)||(23795094-23795588)
chr7 (155-645)||(45500382-45500872)
chr7 (152-645)||(2477658-2478154)
chr7 (152-645)||(24482744-24483239)
chr7 (152-645)||(31664180-31664656)
chr7 (152-663)||(29032462-29032965)
chr7 (336-645)||(22818412-22818721)
chr7 (152-348)||(22820402-22820598)
chr7 (323-645)||(1953957-1954270)
chr7 (508-695)||(19063464-19063651)
chr7 (152-323)||(31882433-31882604)
chr7 (18-151)||(11541840-11541973)
chr7 (18-147)||(2652852-2652981)
chr7 (18-151)||(11534921-11535055)
chr7 (18-151)||(12752073-12752206)
chr7 (18-151)||(29329002-29329135)
chr7 (18-151)||(15153681-15153815)
chr7 (152-288)||(1954285-1954421)
chr7 (28-149)||(12739764-12739886)
chr7 (27-151)||(11557075-11557199)
chr7 (33-152)||(18562267-18562386)
chr7 (20-148)||(9979044-9979174)
chr7 (20-149)||(18256679-18256809)
chr7 (506-645)||(19472285-19472425)
chr7 (152-218)||(22825036-22825102)
chr7 (152-222)||(4705046-4705116)
chr7 (52-88)||(7748212-7748248)
chr7 (586-645)||(33160182-33160242)
chr7 (54-88)||(30918034-30918068)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (152-655)||(13509954-13510457)
chr8 (152-655)||(13599484-13599987)
chr8 (152-662)||(22242911-22243423)
chr8 (166-645)||(22180601-22181081)
chr8 (152-645)||(3298802-3299295)
chr8 (152-645)||(9067835-9068329)
chr8 (152-645)||(8742951-8743445)
chr8 (152-645)||(28925811-28926305)
chr8 (152-645)||(11308655-11309149)
chr8 (152-646)||(22233518-22234013)
chr8 (152-645)||(27348026-27348520)
chr8 (152-645)||(28370093-28370587)
chr8 (152-645)||(41576999-41577493)
chr8 (152-646)||(22222343-22222829)
chr8 (152-661)||(4861619-4862130)
chr8 (152-646)||(22228685-22229171)
chr8 (152-645)||(12538157-12538657)
chr8 (152-645)||(16958550-16959045)
chr8 (152-645)||(34006441-34006922)
chr8 (327-645)||(16580085-16580404)
chr8 (152-425)||(17993087-17993360)
chr8 (152-422)||(21692669-21692940)
chr8 (152-396)||(36736874-36737117)
chr8 (154-434)||(13848998-13849278)
chr8 (292-646)||(1607284-1607639)
chr8 (455-661)||(17992876-17993085)
chr8 (18-151)||(15327437-15327569)
chr8 (18-151)||(15507806-15507938)
chr8 (423-619)||(24040743-24040937)
chr8 (18-149)||(21941881-21942012)
chr8 (18-151)||(6095360-6095492)
chr8 (18-131)||(28549248-28549361)
chr8 (152-273)||(22227176-22227297)
chr8 (18-131)||(22172699-22172814)
chr8 (18-133)||(24644162-24644280)
chr8 (34-151)||(29230589-29230706)
chr8 (55-151)||(27660698-27660795)
chr8 (18-145)||(24795853-24795980)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (155-652)||(8995933-8996430)
chr1 (152-645)||(11738466-11738959)
chr1 (154-645)||(38121602-38122094)
chr1 (152-645)||(9667364-9667857)
chr1 (152-645)||(16832451-16832944)
chr1 (152-645)||(40999772-41000265)
chr1 (152-645)||(44504936-44505432)
chr1 (152-645)||(39000849-39001343)
chr1 (152-645)||(432009-432502)
chr1 (152-645)||(12167884-12168378)
chr1 (152-645)||(33491866-33492360)
chr1 (152-645)||(49249072-49249558)
chr1 (152-645)||(13217716-13218207)
chr1 (152-536)||(36083868-36084252)
chr1 (152-453)||(16130706-16130999)
chr1 (152-460)||(15161612-15161921)
chr1 (155-626)||(9268655-9269126)
chr1 (18-148)||(18531376-18531506)
chr1 (18-152)||(27130256-27130390)
chr1 (18-151)||(18253244-18253377)
chr1 (452-659)||(15161087-15161296)
chr1 (456-645)||(16129659-16129848)
chr1 (18-151)||(27309412-27309546)
chr1 (418-645)||(13830288-13830515)
chr1 (456-605)||(16130254-16130402)
chr1 (18-131)||(16357911-16358026)
chr1 (359-645)||(6244201-6244482)
chr1 (398-645)||(39454103-39454354)
chr1 (47-152)||(21169282-21169388)
chr1 (52-151)||(9075751-9075852)
chr1 (586-658)||(36080205-36080279)
chr1 (57-130)||(22640728-22640800)
chr1 (53-88)||(25662281-25662316)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (152-655)||(11872-12373)
scaffold0298 (152-655)||(15642-16143)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (152-661)||(14270654-14271166)
chr6 (152-655)||(25976940-25977443)
chr6 (152-645)||(24160924-24161417)
chr6 (152-645)||(3539047-3539541)
chr6 (152-645)||(34006502-34006996)
chr6 (152-645)||(26515096-26515590)
chr6 (152-646)||(13173492-13173978)
chr6 (152-646)||(1454795-1455285)
chr6 (152-646)||(1466487-1466977)
chr6 (152-645)||(9932473-9932967)
chr6 (152-646)||(13182025-13182511)
chr6 (152-645)||(21596196-21596693)
chr6 (152-645)||(24878865-24879359)
chr6 (152-645)||(32806431-32806924)
chr6 (152-531)||(34913803-34914182)
chr6 (152-645)||(5988670-5989164)
chr6 (152-464)||(16698091-16698403)
chr6 (191-645)||(21631180-21631638)
chr6 (152-605)||(15642457-15642913)
chr6 (327-635)||(32821812-32822119)
chr6 (191-605)||(9518153-9518565)
chr6 (18-151)||(11652912-11653045)
chr6 (18-151)||(17690300-17690433)
chr6 (18-151)||(27380087-27380220)
chr6 (18-151)||(27470470-27470603)
chr6 (536-684)||(34913410-34913558)
chr6 (229-645)||(26604339-26604757)
chr6 (18-151)||(29310104-29310237)
chr6 (18-151)||(29317063-29317196)
chr6 (18-151)||(27278581-27278714)
chr6 (18-151)||(27297873-27298006)
chr6 (18-151)||(27303472-27303605)
chr6 (472-645)||(14479560-14479733)
chr6 (441-526)||(6868010-6868095)
chr6 (564-645)||(26510392-26510474)
chr6 (64-139)||(28755127-28755202)
chr6 (54-151)||(16393339-16393436)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (152-655)||(12185-12688)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (152-653)||(37251573-37252073)
chr5 (152-645)||(27166766-27167259)
chr5 (152-645)||(34869413-34869908)
chr5 (152-645)||(11766755-11767248)
chr5 (152-645)||(9404424-9404918)
chr5 (152-645)||(11722944-11723438)
chr5 (152-645)||(16904277-16904771)
chr5 (152-645)||(33434603-33435096)
chr5 (152-645)||(34456297-34456789)
chr5 (152-645)||(30606744-30607238)
chr5 (154-645)||(14344469-14344953)
chr5 (152-645)||(6269890-6270384)
chr5 (199-645)||(31845980-31846426)
chr5 (152-645)||(24835735-24836216)
chr5 (152-491)||(7315358-7315698)
chr5 (269-645)||(7314965-7315342)
chr5 (152-393)||(32226911-32227152)
chr5 (152-645)||(39655704-39656199)
chr5 (152-360)||(519315-519523)
chr5 (18-151)||(24694320-24694453)
chr5 (18-151)||(24701089-24701222)
chr5 (18-131)||(18565335-18565450)
chr5 (564-652)||(32226826-32226914)
chr5 (18-121)||(19713396-19713500)
chr5 (18-151)||(28718819-28718951)
chr5 (55-151)||(39539783-39539879)
chr5 (41-147)||(938385-938489)
chr5 (53-148)||(17297856-17297951)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (152-605)||(21160006-21160459)
chr2 (152-645)||(36667543-36668031)
chr2 (152-645)||(23924700-23925193)
chr2 (152-645)||(27257385-27257878)
chr2 (152-645)||(29223715-29224208)
chr2 (152-645)||(29337014-29337507)
chr2 (152-645)||(36039930-36040424)
chr2 (152-645)||(13230010-13230503)
chr2 (152-645)||(32522929-32523422)
chr2 (152-643)||(43991533-43992008)
chr2 (152-530)||(41977710-41978088)
chr2 (152-605)||(9786772-9787227)
chr2 (159-641)||(14700645-14701130)
chr2 (152-645)||(28457545-28458039)
chr2 (152-460)||(42700641-42700949)
chr2 (152-645)||(24662796-24663293)
chr2 (152-431)||(31758491-31758771)
chr2 (152-394)||(36557230-36557473)
chr2 (430-645)||(36557467-36557684)
chr2 (222-411)||(40200173-40200363)
chr2 (452-645)||(42702175-42702368)
chr2 (472-645)||(5784513-5784686)
chr2 (18-138)||(22790704-22790826)
chr2 (18-151)||(18621050-18621184)
chr2 (152-216)||(8679463-8679527)
chr2 (32-151)||(41664996-41665115)
chr2 (586-658)||(492724-492798)
chr2 (580-645)||(8687769-8687835)
chr2 (58-139)||(27353600-27353686)
chr2 (436-491)||(11651893-11651948)
chr2 (18-84)||(12299005-12299072)
chr2 (21-80)||(44856150-44856211)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (152-645)||(116236-116729)
scaffold0019 (152-302)||(169076-169226)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (151-645)||(19247495-19247989)
chr4 (152-645)||(4838804-4839298)
chr4 (152-645)||(26069725-26070221)
chr4 (152-645)||(21677335-21677829)
chr4 (152-645)||(42532554-42533049)
chr4 (152-645)||(1187965-1188458)
chr4 (152-645)||(22047681-22048175)
chr4 (152-645)||(40995215-40995711)
chr4 (152-645)||(52618514-52618996)
chr4 (152-645)||(323438-323932)
chr4 (152-643)||(46691705-46692196)
chr4 (152-645)||(5273230-5273713)
chr4 (152-645)||(55326774-55327266)
chr4 (152-645)||(30218055-30218553)
chr4 (152-645)||(26373299-26373791)
chr4 (152-645)||(35416364-35416845)
chr4 (152-662)||(33110370-33110884)
chr4 (152-625)||(53895400-53895872)
chr4 (152-645)||(20948745-20949240)
chr4 (152-431)||(9417101-9417381)
chr4 (153-282)||(21668574-21668703)
chr4 (18-151)||(55613922-55614055)
chr4 (18-151)||(18263426-18263560)
chr4 (18-148)||(20579275-20579405)
chr4 (18-151)||(869835-869968)
chr4 (18-151)||(10620168-10620301)
chr4 (18-149)||(18270287-18270419)
chr4 (18-151)||(28392002-28392135)
chr4 (18-151)||(8859406-8859540)
chr4 (18-151)||(5715187-5715319)
chr4 (18-136)||(19919381-19919499)
chr4 (18-151)||(26964785-26964916)
chr4 (18-151)||(26971679-26971810)
chr4 (18-151)||(10825189-10825320)
chr4 (18-136)||(19925610-19925728)
chr4 (18-151)||(5708551-5708685)
chr4 (444-645)||(6639977-6640178)
chr4 (18-151)||(47387788-47387922)
chr4 (18-151)||(35224766-35224903)
chr4 (18-136)||(5667043-5667162)
chr4 (490-645)||(44432060-44432215)
chr4 (18-151)||(10676422-10676557)
chr4 (18-151)||(10890062-10890197)
chr4 (152-241)||(42271781-42271870)
chr4 (29-151)||(4425468-4425590)
chr4 (54-148)||(49066009-49066103)
chr4 (35-79)||(10627327-10627372)
chr4 (152-188)||(33239375-33239411)
chr4 (112-151)||(10627274-10627313)
chr4 (18-47)||(27031787-27031816)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (152-662)||(1232159-1232676)
chr3 (152-645)||(22097667-22098160)
chr3 (154-645)||(48167864-48168355)
chr3 (152-645)||(9989396-9989889)
chr3 (152-645)||(10385738-10386232)
chr3 (152-645)||(45527647-45528141)
chr3 (152-645)||(7652890-7653384)
chr3 (152-645)||(20837094-20837587)
chr3 (152-645)||(27850219-27850711)
chr3 (152-645)||(36469104-36469596)
chr3 (152-645)||(37471355-37471848)
chr3 (153-619)||(4742672-4743135)
chr3 (152-645)||(3588400-3588894)
chr3 (152-645)||(52307753-52308247)
chr3 (152-661)||(23193905-23194413)
chr3 (152-645)||(33247988-33248483)
chr3 (152-464)||(37022870-37023184)
chr3 (152-645)||(49434097-49434591)
chr3 (191-663)||(2357141-2357615)
chr3 (192-641)||(26335121-26335562)
chr3 (152-428)||(20962924-20963200)
chr3 (333-645)||(8615503-8615816)
chr3 (152-386)||(23411748-23411971)
chr3 (152-338)||(8625931-8626117)
chr3 (18-153)||(18534851-18534986)
chr3 (18-152)||(13258759-13258893)
chr3 (18-151)||(8491598-8491731)
chr3 (18-151)||(13212514-13212647)
chr3 (18-151)||(15599744-15599877)
chr3 (18-151)||(15606289-15606422)
chr3 (18-151)||(16481318-16481451)
chr3 (18-150)||(10578193-10578325)
chr3 (19-153)||(18538210-18538344)
chr3 (18-151)||(13691896-13692029)
chr3 (18-151)||(6111314-6111446)
chr3 (18-149)||(10571427-10571559)
chr3 (18-151)||(13518023-13518156)
chr3 (18-153)||(17780023-17780156)
chr3 (18-153)||(19081324-19081457)
chr3 (152-251)||(22098375-22098474)
chr3 (420-645)||(23385396-23385622)
chr3 (472-645)||(27030672-27030845)
chr3 (18-152)||(32055273-32055408)
chr3 (53-152)||(12564395-12564494)
chr3 (18-148)||(1646358-1646489)
chr3 (18-151)||(15341077-15341212)
chr3 (18-151)||(15356444-15356579)
chr3 (18-131)||(23014221-23014336)
chr3 (152-306)||(27104326-27104485)
chr3 (18-152)||(16201433-16201567)
chr3 (542-645)||(20963711-20963815)
chr3 (38-85)||(17196702-17196749)
chr3 (57-146)||(6288184-6288272)
chr3 (402-464)||(17405038-17405101)
chr3 (53-147)||(47699511-47699605)
chr3 (87-152)||(25801443-25801509)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (152-645)||(8742-9236)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (152-645)||(76120-76613)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (152-645)||(28567-29061)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (152-645)||(25318-25812)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (152-645)||(652-1145)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (152-645)||(6732-7225)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (152-494)||(12156-12491)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (152-654)||(14176-14679)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (152-645)||(16140-16635)
[»] scaffold0447 (4 HSPs)
scaffold0447 (367-521)||(7191-7341)
scaffold0447 (367-521)||(11805-11955)
scaffold0447 (258-338)||(7340-7420)
scaffold0447 (258-338)||(11954-12034)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (367-521)||(9800-9950)
scaffold0383 (258-338)||(9949-10029)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (18-148)||(26427-26557)
[»] scaffold1199 (1 HSPs)
scaffold1199 (18-151)||(339-472)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (18-151)||(3931-4064)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (18-151)||(10071-10205)
scaffold0234 (18-151)||(1178-1312)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (414-658)||(35212-35458)
scaffold0160 (152-360)||(34991-35196)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (18-151)||(19527-19660)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (18-151)||(8322-8455)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (28-151)||(29046-29169)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (18-151)||(4454-4587)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (18-138)||(5069-5189)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (18-125)||(12811-12918)
scaffold0390 (18-106)||(5814-5902)
[»] scaffold1494 (1 HSPs)
scaffold1494 (472-645)||(1564-1737)
[»] scaffold1832 (1 HSPs)
scaffold1832 (515-663)||(1-154)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (18-151)||(7497-7632)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (18-151)||(6742-6877)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (398-645)||(9364-9615)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (18-151)||(107107-107240)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (152-244)||(5015-5107)
[»] scaffold1303 (1 HSPs)
scaffold1303 (18-100)||(892-974)
[»] scaffold0502 (1 HSPs)
scaffold0502 (19-131)||(261-373)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (18-151)||(229242-229380)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (18-151)||(87925-88059)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 464; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 1275081 - 1274538
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1275081 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 1274982  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1274981 caatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 1274882  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1274881 tctatttctagattcaaaagtatgtgtctatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 1274782  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1274781 tatattaaatgatcaagagtttacataataacttgtttgaatacctcaaaacccagaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcatagg 1274682  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctctagaaat 651  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1274681 atgaagaagagataaagattcaatgccgagatccatgatgtctcaacaaatcttgagttaaatctactcataacaccttactttgtgtttctctagaaat 1274582  T
Q  652 gccatctctctatttctccaaaaatatgtgatattgctctctgc 695  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1274581 gccatctctctatctctccaaaaatatgtgatattgctctctgc 1274538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 22909611 - 22909108
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22909611 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggataatttaatcgacgatttcc 22909512  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22909511 caaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 22909412  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22909411 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatatatagctagaacca 22909312  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22909311 tatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 22909212  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctctagaaat 651  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22909211 atgaagaaaagatgaagattcaatgactagatccatgatgtctcaacaaatcttagattgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctagaaat 22909112  T
Q  652 gcca 655  Q
    ||||    
T  22909111 gcca 22909108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 2797231 - 2797725
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2797231 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgaccacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 2797330  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2797331 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 2797430  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2797431 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 2797530  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2797531 tatattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 2797630  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  2797631 atgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 2797725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 10345973 - 10346467
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10345973 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 10346072  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10346073 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 10346172  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10346173 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 10346272  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10346273 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 10346371  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10346372 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 10346467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 31157944 - 31158438
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31157944 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 31158043  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31158044 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 31158143  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31158144 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 31158243  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31158244 atatattaaaagatcaaaaggttacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 31158342  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31158343 gatgaagaaagggtgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 31158438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 12191335 - 12190843
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || |    
T  12191335 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttaaatagaagaattac 12191236  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12191235 aaaacgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaattttaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 12191136  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  12191135 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatca-tttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatatccagaacca 12191037  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12191036 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtaaatacatatgtctatgatagctttgcaaagg 12190938  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12190937 atgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 12190843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 162 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 12184348 - 12183866
Alignment:
Q  162 atcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcccaaccgatta 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12184348 atcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaactgatta 12184249  T
Q  262 aattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcattctatttcta 361  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  12184248 aattacccaaaagcattaagtcgtagattaaaagtgattatcaaattttaacatccatgtatagagtgataactcaagatagattgttattctatctcta 12184149  T
Q  362 gattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaaccatatattaaat 461  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12184148 gattcaaaagtatgtatccatatca-tttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaacaaatagctagaaccatatattaaat 12184050  T
Q  462 gatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaaga 561  Q
    ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12184049 gatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaaaagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaa 12183951  T
Q  562 gatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12183950 gatgaagattccatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 12183866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 31879093 - 31878601
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31879093 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaaatcgattggatagattaatcgacgatttcc 31878994  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31878993 caaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatactaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 31878894  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31878893 tatatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaactgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 31878794  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  31878793 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctttgatagttttgcaaagg 31878695  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31878694 atgaa-aaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 31878601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 12090128 - 12090622
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12090128 tccaaatgatatcgttatttctaagaggttgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaaggatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 12090227  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12090228 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 12090327  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac-aacattgaataaatagctagaacc 450  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12090328 tctagttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaataataacaacaaatattgaataaatagctagaacc 12090427  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||||||| || |  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12090428 atatattaaatgatcaaaatattacatattagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagattagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 12090526  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12090527 gatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatttactcctaactaccttgctttgtgtttctct 12090622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 8107556 - 8108050
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  8107556 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 8107655  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8107656 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 8107755  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8107756 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 8107855  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8107856 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ttacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 8107954  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8107955 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 8108050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 158 - 570
Target Start/End: Original strand, 19471864 - 19472275
Alignment:
Q  158 tgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcccaaccg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19471864 tgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccg 19471963  T
Q  258 attaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcattctatt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19471964 attaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatt 19472063  T
Q  358 tctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaaccatatatt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19472064 tctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatatt 19472163  T
Q  458 aaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaag 557  Q
    ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19472164 aaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgaag 19472262  T
Q  558 aagagatgaagat 570  Q
    ||  |||||||||    
T  19472263 aaaggatgaagat 19472275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 2631890 - 2631396
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  2631890 tccaaataatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 2631791  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2631790 caaccgattaaattatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 2631691  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  2631690 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaataatattgaataaataagctagaacc 2631591  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2631590 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtttatgatagctttgcaaag 2631492  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2631491 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 2631396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 3544546 - 3545042
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3544546 tccaaatgatattgttatttctaagagattgtttaaatgtcgatttctcaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcc 3544645  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3544646 caaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 3544745  T
Q  352 tctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaac 449  Q
    |||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3544746 tctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaac 3544845  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
    ||||||||||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  3544846 catatattaaaagatcaagtaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaa 3544945  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||||||    
T  3544946 ggatggagaagagatgaagatttaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaactacctttctttttgtttctct 3545042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 6173009 - 6172527
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6173009 tccaaatgatatcgttatttttaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 6172910  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6172909 caaccgattaaattacctaaaagcattaagtcctagattaaaactgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 6172810  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6172809 tctatttctagattaaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaacgcaagaataacagcaatattgaataaatagctagaacca 6172710  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  6172709 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaag- 6172612  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
              ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6172611 ----------gatgaagattccatgacaggatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 6172527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 22321469 - 22321962
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  22321469 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacttttaaacgatcaaaaagtcaattgggtagtctaatcgacgatttcc 22321568  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22321569 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatatattgttat 22321668  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  22321669 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaata-tgaataaataagctagaacc 22321767  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22321768 atatattaaaggatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 22321866  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| | |||||||||| |||||||    
T  22321867 gatgaagaaaggatgaagattcaatgaaaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaacttgctttgtatttctct 22321962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 23795588 - 23795094
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  23795588 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 23795489  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23795488 caatcgactaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 23795389  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  23795388 tctatttctagattcaaaagtatatgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaattttgaataaataagctagaacc 23795289  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23795288 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatggagctacatatgtctataatagctttgcaaag 23795190  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  23795189 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgagtttctct 23795094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 155 - 645
Target Start/End: Original strand, 45500382 - 45500872
Alignment:
Q  155 aaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcccaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  45500382 aaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgaccacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcccaa 45500481  T
Q  255 ccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcattct 354  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45500482 ccgattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagatacattgttattct 45500581  T
Q  355 atttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaaccatat 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  45500582 atttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataactataaccatat 45500681  T
Q  455 attaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatg 554  Q
    |||||||| | || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  45500682 attaaatggtcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctgtgatagctttgcaaatgatg 45500780  T
Q  555 aagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  45500781 aagaagaaatgaagattcaatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcataactaccttgctttgtgtttctct 45500872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 2478154 - 2477658
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2478154 tccaaatgatatcgttatttttaagggatcgtttaaatgttgattttccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcc 2478055  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
     |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2478054 taacctattaaacgacccaaaagcattaagttctagatgaaaagtgattatcaaatattaacatttatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 2477955  T
Q  352 tctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaac 449  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2477954 tctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagccttaaatagaagaataacaacaatattgaataaataagctagaac 2477855  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  2477854 catatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatggagctacatatgtctatgatagctttgcaaa 2477755  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2477754 ggatgaggaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 2477658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 24483239 - 24482744
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |     
T  24483239 tccaaatgatatcgttatttctaatggattgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatt-ct 24483141  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  24483140 caaccgattaaatgacccaaaagcattaagtc-tagattaaaaatgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagataaattattat 24483042  T
Q  352 tctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatag-ctagaac 449  Q
    |||| |||| |||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  24483041 tctagttcttagacccaaaagtaattgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataaactagaac 24482942  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctc-aaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcat 548  Q
    ||||| ||||| ||| || || ||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  24482941 catattttaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctctaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaa 24482842  T
Q  549 aggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  24482841 aggatgaagaagagatgaagattcaatgtctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggtttgatctactcataactcccttgctttgtgtttctct 24482744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 31664180 - 31664656
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||| || | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31664180 tccaaatgatatcgttatttttaagaggtcgtttaaacatcgattctccaaacatttaaacaataaaaaagtcgattgaatagtttaatcgacgatttcc 31664279  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||                 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  31664280 ca-----------------aaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatactaacatccatgtctagattgataacttaagatagattgttat 31664362  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31664363 tctagttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 31664462  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  31664463 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcctgttcgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctagatatgtttatgatagctttgtaaagg 31664561  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    || ||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31664562 attaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 31664656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 152 - 663
Target Start/End: Original strand, 29032462 - 29032965
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||   || |||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||  || |||||| ||||||     
T  29032462 tccaaatgatgtcgtgatttctaatggactattcaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcacaaagtcgatcggatcatttaatcgatgatttct 29032561  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||| | ||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |            |||||||||||||||| ||| | ||    
T  29032562 caatcaattaattgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaaaa------------gtgataacttaagatatatttttat 29032649  T
Q  352 tctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaata-gctagaac 449  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  29032650 tctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatttcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaac 29032749  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| |    
T  29032750 catatattaaaagatcaaaagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaaggttagatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaa 29032849  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctc--tag 647  Q
     ||||||  | |||||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||||||   | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||    
T  29032850 tgatgaaagaaagatgaagattccatgtctagactcatgatgtctcaacaaatcttgaatagaatctactcctaacaccttactttgtgtttctctatag 29032949  T
Q  648 aaatgccatctctcta 663  Q
    ||||||||||||||||    
T  29032950 aaatgccatctctcta 29032965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 336 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 22818721 - 22818412
Alignment:
Q  336 taagatagattgtcattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaa 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22818721 taagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 22818622  T
Q  436 taaatagctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctat 535  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  22818621 taaatagctagaaccatacattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagaatggatgtagctacatatgtctat 22818523  T
Q  536 gatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctt 634  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||| |    
T  22818522 gatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgcct 22818423  T
Q  635 tgtgtttctct 645  Q
    ||| |||||||    
T  22818422 tgtatttctct 22818412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 152 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22820598 - 22820402
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22820598 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacgaagtcgattggataatttaatcgacgatttcc 22820499  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgt 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22820498 caaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaattgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgt 22820402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 323 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 1954270 - 1953957
Alignment:
Q  323 tagagtgataacttaagatagattgtcattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| |||||||||     
T  1954270 tagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaagcaataaaagcaagaata- 1954172  T
Q  423 caacaacattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacc 522  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| || |    
T  1954171 --------ttgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaacc-acaatagtagatatagc 1954081  T
Q  523 tacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactctt 622  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| |    
T  1954080 tacatatgtctatgatagcttttcaaaggatgaagaagaattgaagattcaatgacaagatccatgatgtcttaacaaatcttggcttgaatctactcct 1953981  T
Q  623 aac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  1953980 aactacattgctttgtgtttctct 1953957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 508 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 19063651 - 19063464
Alignment:
Q  508 aagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttag 607  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19063651 aagggtagatataactacatatgtctatgatagctttacatagaatgaagaagagatgaagattcaatgcttagatccatgatgtctcaacaaattttag 19063552  T
Q  608 gttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctctagaaatgccatctctctatttctccaaaaatatgtgatattgctctctgc 695  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19063551 gttgaatctactcctaacaccttactttgtgtttctctagaaataccatctctctatctctccaaaaatatgtgatattgctctctgc 19063464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31882604 - 31882433
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  31882604 tccaaatgatattgttatttccaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaattcgattggatagtttaatcaatgatttcc 31882505  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtct 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882504 caaccgattaaatcacccaaaagtattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtct 31882433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11541973 - 11541840
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11541973 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgtaaagaggatt 11541874  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11541873 aaaattttgaaaaaaccctcttaaaatcccttca 11541840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2652981 - 2652852
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2652981 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgtaaagaggatt 2652882  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatccc 147  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2652881 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatccc 2652852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11535055 - 11534921
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11535055 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttatgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgtaaagaggatt 11534956  T
Q  118 aaaattttga-aaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  11534955 aaaattttgaaaaaacccctcttaaaatcccttca 11534921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 12752073 - 12752206
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12752073 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctttttgatttttgattaatgatttaattaagatccgtttcaatgggatttcttccgtaaagaggatt 12752172  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  12752173 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatccattca 12752206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 29329002 - 29329135
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  29329002 gtaaacacatgaatcttaaaatgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttctgcaaagaggatt 29329101  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  29329102 aaaattttgaaaatcccctcttaaaatcccttca 29329135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 15153681 - 15153815
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatctt-aaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15153681 gtaaacacatgaatctttaaagtgtttaaatttctgtttgatttgtgagtaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggat 15153780  T
Q  117 taaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15153781 taaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 15153815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1954421 - 1954285
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1954421 tccaaatgatatcgttatttctatgggatcatttaaacatcgattttctaaacatttatacgatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcc 1954322  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctaga 288  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1954321 taaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctaga 1954285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Original strand, 12739764 - 12739886
Alignment:
Q  28 gaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttg- 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |     
T  12739764 gaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaataggatttcttccgcaaagagaattaaaatttcga 12739863  T
Q  127 aaaaatccctcttgaaatccctt 149  Q
    ||||| ||||||| |||||||||    
T  12739864 aaaaacccctcttaaaatccctt 12739886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11557199 - 11557075
Alignment:
Q  27 tgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||     
T  11557199 tgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgagatttcttccgcaaagacggttaaaatttta 11557100  T
Q  127 aaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||    
T  11557099 aaaaccccctcttaaaatcccttca 11557075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 152
Target Start/End: Original strand, 18562267 - 18562386
Alignment:
Q  33 ttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttgaaaaat 132  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||     
T  18562267 ttaaagtgtttaagtatgtgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgagatttcttcctcaaagagtattaaaattttgaaaaac 18562366  T
Q  133 ccctcttgaaatcccttcat 152  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  18562367 ccctcttaaaatcccttcat 18562386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 148
Target Start/End: Original strand, 9979044 - 9979174
Alignment:
Q  20 aaacacatgaatc-ttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgttt-ctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9979044 aaacacatgaatccttaaattatttaagtatgtgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgttttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 9979143  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatccct 148  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  9979144 aaaattttcaaaaacccctcttaaaatccct 9979174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18256809 - 18256679
Alignment:
Q  20 aaacacatgaatct-taaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatta 118  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  18256809 aaacacatgaatccctaaattgtttaagtatgtgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttgttccgctaagaggatta 18256710  T
Q  119 aaattttgaaaaatccctcttgaaatccctt 149  Q
    || |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18256709 aatttttgaaaaacccctctttaaatccctt 18256679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 506 - 645
Target Start/End: Original strand, 19472285 - 19472425
Alignment:
Q  506 acaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatctt 605  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19472285 acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgcagaaaggatgaagattccaagacaagatccatgatgtctcaacaaatctt 19472384  T
Q  606 aggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
     | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19472385 ggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 19472425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22825102 - 22825036
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcac 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22825102 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcac 22825036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 4705046 - 4705116
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaag 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4705046 tccaaatgatatcgttagttctaagggatcgtttaaatatcgattttcaaaacatttaaacgatcacaaag 4705116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 88
Target Start/End: Original strand, 7748212 - 7748248
Alignment:
Q  52 atttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtt 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7748212 atttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtt 7748248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 33160242 - 33160182
Alignment:
Q  586 atgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33160242 atgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 33160182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 88
Target Start/End: Original strand, 30918034 - 30918068
Alignment:
Q  54 ttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtt 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30918034 ttgatttgtgattaatgatttaatcatgatccgtt 30918068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 13510457 - 13509954
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13510457 tccaaatgatatcggtaattctaagggatcgtttaaacattgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 13510358  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13510357 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatatattgttat 13510258  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13510257 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 13510158  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13510157 tatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 13510058  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctctagaaat 651  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13510057 atgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatctacttctaacatcttgctttgtgtttctctagaaat 13509958  T
Q  652 gcca 655  Q
    ||||    
T  13509957 gcca 13509954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 13599987 - 13599484
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13599987 tccaaatgatatcggtaattctaagggatcgtttaaacattgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 13599888  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13599887 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatatattgttat 13599788  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13599787 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 13599688  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13599687 tatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 13599588  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctctagaaat 651  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13599587 atgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatctacttctaacatcttgctttgtgtttctctagaaat 13599488  T
Q  652 gcca 655  Q
    ||||    
T  13599487 gcca 13599484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 662
Target Start/End: Original strand, 22242911 - 22243423
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22242911 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcttttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgattacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 22243010  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22243011 caaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 22243110  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  22243111 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacatttaattcaagaataacaataatattgaataaataagctagaacc 22243210  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22243211 atatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaaggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 22243310  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctctagaa 649  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22243311 gatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctacttctaactaccttgttttgtgtttctctagaa 22243410  T
Q  650 atgccatctctct 662  Q
    ||| |||||||||    
T  22243411 atgtcatctctct 22243423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 22181081 - 22180601
Alignment:
Q  166 ttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcccaaccgattaaatt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22181081 ttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttctcaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatt 22180982  T
Q  266 acccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcattctatttctagatt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22180981 acccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagatt 22180882  T
Q  366 caaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatg 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22180881 caaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatc 22180782  T
Q  466 aagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatg 565  Q
    || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  22180781 aaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaggatg 22180682  T
Q  566 aagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  22180681 aagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttttgtttctct 22180601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 3299295 - 3298802
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3299295 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 3299196  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3299195 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 3299096  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3299095 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaacca 3298996  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3298995 tatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaatgg 3298897  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3298896 atgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 3298802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 9067835 - 9068329
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  9067835 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 9067934  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9067935 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 9068034  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9068035 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 9068134  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9068135 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 9068233  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9068234 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 9068329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 8742951 - 8743445
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  8742951 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 8743050  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8743051 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 8743150  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8743151 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 8743250  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8743251 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 8743349  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8743350 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 8743445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 28925811 - 28926305
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28925811 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 28925910  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28925911 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 28926010  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28926011 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatctttttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 28926110  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    ||||||||||  || || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28926111 atatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 28926209  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28926210 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 28926305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 11308655 - 11309149
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||    
T  11308655 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggcagtttaatcgacgatttcc 11308754  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11308755 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 11308854  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11308855 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacagtaaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 11308954  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11308955 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 11309053  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | || |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11309054 gatgaagaaagggtggagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 11309149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 646
Target Start/End: Original strand, 22233518 - 22234013
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  22233518 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgattttccaaacattaaaacaatcacaaagtcgactggatcgtttaatcgacgatttcc 22233617  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22233618 caacagattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 22233717  T
Q  352 tctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacc 450  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  22233718 tctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaacagctagaatc 22233817  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22233818 atatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 22233917  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctcta 646  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22233918 gatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctcta 22234013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 27348520 - 27348026
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27348520 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagttgattgggtagtttaatcgacgatttcc 27348421  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27348420 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatggattgttat 27348321  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27348320 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 27348221  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    ||||||||||  || || || ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27348220 atatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaga-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaag 27348122  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27348121 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 27348026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 28370587 - 28370093
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28370587 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacgaagtcgattggataatttaatcgacgatttcc 28370488  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28370487 caaccgattaatttacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 28370388  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28370387 tttatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 28370288  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28370287 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtaaatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 28370189  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28370188 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 28370093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 41576999 - 41577493
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  41576999 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 41577098  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41577099 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaagatccatgtttagagtgataacttaagatagattgttat 41577198  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41577199 tctatttctagattcaaaagtacgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 41577298  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41577299 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctc-aaagctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 41577397  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  41577398 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 41577493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 646
Target Start/End: Original strand, 22222343 - 22222829
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  22222343 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccgaacattaaaacaatcacaaagtcgactggatcgtttaatcgacgatttcc 22222442  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22222443 caaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 22222542  T
Q  352 tctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacc 450  Q
    |||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22222543 tctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaatagctagaatc 22222642  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    ||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22222643 atatat-----------aagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 22222731  T
Q  551 gatgaag--aagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctcta 646  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22222732 gatgaagaaaagagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctcta 22222829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 152 - 661
Target Start/End: Original strand, 4861619 - 4862130
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||   || |||  ||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  4861619 tccaaatgatgtcgtgatttctaatggactattcaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcgcaaagtcgatcggatcatttaatcgacgatttcc 4861718  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4861719 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagataaattgttat 4861818  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4861819 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 4861918  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4861919 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 4862017  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtt--tctctaga 648  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||||| | |||||||  |||||| |    
T  4862018 atgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcttaactaccttaccttgtgtttctctctaaa 4862117  T
Q  649 aatgccatctctc 661  Q
    |||||||||||||    
T  4862118 aatgccatctctc 4862130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 152 - 646
Target Start/End: Original strand, 22228685 - 22229171
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  22228685 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccgaacattaaaacaatcacaaagtcgactggatcgtttaatcgacgatttcc 22228784  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22228785 caaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagtttaaaaatgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 22228884  T
Q  352 tctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacc 450  Q
    |||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22228885 tctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaatagctagaatc 22228984  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    ||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22228985 atatat-----------aagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 22229073  T
Q  551 gatgaag--aagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctcta 646  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22229074 gatgaagaaaagagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctcta 22229171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 12538657 - 12538157
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  12538657 tccaaatgatatcgttatttctaaggaattgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgattttc 12538558  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
     || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12538557 taatcgattaaatgacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatatctagagtgataacttaagataaattgttat 12538458  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatca------ttttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagcta 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12538457 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaattttaaatctcaataaaataataaaatcaagaataacaacaatattgaataaatagcta 12538358  T
Q  446 gaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttg 545  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12538357 gaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctaagatagctttg 12538258  T
Q  546 cataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctc 644  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| || || |||| |||||| ||||||||||||    
T  12538257 caaatgatgaagaagagatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcatagcttgaatctaatcctaactaccttgatttgtgtttctc 12538158  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  12538157 t 12538157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 16959045 - 16958550
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16959045 tccaaatgatatcgttatttctaagg-atcgtttaaatgtcaatttctcaaacatttaaacaatcacagagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcc 16958947  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16958946 caacctattaaacgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaaaatctatgtctaaagtgataacttaaaatagattgttat 16958847  T
Q  352 tctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaata-gctagaac 449  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  16958846 tctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaatacaagaataacaacaatagtgaataaataagctagaac 16958747  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16958746 catatattaaaagatcaagaaattaaataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaa 16958647  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16958646 ggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgctttgtgtttctct 16958550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 34006441 - 34006922
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| || || |||||||||||    
T  34006441 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcttttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtagataagataatttaaacgacgatttcc 34006540  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34006541 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatcaatgtatagagtgataacttaagatagattgttat 34006640  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34006641 tctatttatagattcaaaattatgtgtccatatcattttgaatctcaat-aaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 34006739  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  34006740 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag- 34006837  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
              ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  34006838 ----------gatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggctttaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 34006922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 327 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 16580404 - 16580085
Alignment:
Q  327 gtgataacttaagatagattgtcattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac 426  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16580404 gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac 16580305  T
Q  427 aacattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctac 525  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  16580304 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctac 16580206  T
Q  526 atatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac 625  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||    
T  16580205 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 16580106  T
Q  626 -accttgctttgtgtttctct 645  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  16580105 taccttgctttgtgtttctct 16580085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 152 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17993360 - 17993087
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||   || |||  ||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| |    
T  17993360 tccaaatgatgtcgtgatttctaatggactattcaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcgcaaagtcgatcggatcgtttaatcgacgattttc 17993261  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17993260 caagcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 17993161  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993160 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa 17993087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21692940 - 21692669
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |  ||||||    
T  21692940 tccaaatgatatcattatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgtttaatcaaaaatttcc 21692841  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||    
T  21692840 caacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaatttaaaatagattgttat 21692741  T
Q  352 tctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataa 422  Q
    |||||||| | ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  21692740 tctatttcttggatccaaaagcatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataa 21692669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 152 - 396
Target Start/End: Original strand, 36736874 - 36737117
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| |||||||    
T  36736874 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatatcgatttcacaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgcatcatttaatcgatgatttcc 36736973  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||| | ||||||| || ||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||    
T  36736974 caatctattaaatgactcaaaagcttcaagttctagattaatagtgattatcaaagattaaaatctatgtctagagtgaaaactt-agatagattattat 36737072  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatct 396  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36737073 tctattcctagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatct 36737117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 154 - 434
Target Start/End: Original strand, 13848998 - 13849278
Alignment:
Q  154 caaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaac-atttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttccc 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  13848998 caaatgatagcgttatttctaagggattgtttaaatgtcgattttccaaactatttaaatgatcacaaaatcgattggatcatttaatcgatgatttccc 13849097  T
Q  253 aaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcatt 352  Q
    || | ||||| | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||    
T  13849098 aatctattaattgatctaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaagattaacatctatgtatagaatgaaaactt-agatagattgttatt 13849196  T
Q  353 ctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattga 434  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  13849197 ctactcctagattcaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctttaaatacaagaataataacaatattga 13849278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 292 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1607639 - 1607284
Alignment:
Q  292 aaagtgattatcaaatattaacatcc-atgtctagagtgataacttaagatagattgtcattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttt 390  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||| | | |||||| |||||||| | ||||||  ||||||| ||||| ||| | || ||| |||||     
T  1607639 aaagtgattatcaaagattaa-atcctatatctagaataaaaactta-gatagattattattctaactctagatccaaaattatttttcaataacatttc 1607542  T
Q  391 gaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtt 488  Q
     ||||| || |||| |||||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |  || || ||||||||| | |||||    
T  1607541 aaatcttaaataaagcattaagtacaagaataataacaatatttaataaataaggtagaaccatatattaaataaataa-agattacataatagtttgtt 1607443  T
Q  489 tgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatg 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||  ||||  |||    
T  1607442 tgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgcctatgaaagctttgcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgctaagattcatg 1607343  T
Q  589 atgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaaca-ccttgctttgtgtttctcta 646  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1607342 atgtctcaacaaatcttaggaagaatatactcttaacacccttgctttgtgtttctcta 1607284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 455 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 17993085 - 17992876
Alignment:
Q  455 attaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatg 554  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17993085 attaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 17992986  T
Q  555 aagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtt--tctctagaaat 651  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  |||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||    
T  17992985 aagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttggattgaatctactcttaactaccttgccttgtgtttctctctagaaat 17992886  T
Q  652 gccatctctc 661  Q
    ||||||||||    
T  17992885 gccatctctc 17992876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 15327437 - 15327569
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15327437 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaatatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 15327536  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  15327537 aaaattttgaaaaacctctctt-aaatcccttca 15327569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 15507806 - 15507938
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15507806 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaatatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 15507905  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  15507906 aaaattttgaaaaacctctctt-aaatcccttca 15507938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 423 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 24040937 - 24040743
Alignment:
Q  423 caacaacattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacc 522  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| || |    
T  24040937 caacaatattgaataaatagctaaaaccatatattaaat-atcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-ataagagtagatatagc 24040840  T
Q  523 tacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatact 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  24040839 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctact 24040743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 149
Target Start/End: Original strand, 21941881 - 21942012
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  21941881 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgagattttttccgcatagaggatt 21941980  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatccctt 149  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21941981 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatccctt 21942012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 6095360 - 6095492
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6095360 gtaaacacatgaatcttaaagtatttaaatttctatttgattagtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 6095459  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6095460 aaaattttgaaaaa-ccctcttaaaatcccttca 6095492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Original strand, 28549248 - 28549361
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28549248 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgagatttcttccgcaaagaggatt 28549347  T
Q  118 aaaattttgaaaaa 131  Q
    |||||| |||||||    
T  28549348 aaaattgtgaaaaa 28549361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 273
Target Start/End: Original strand, 22227176 - 22227297
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  22227176 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgattttccaaacattaaaacaatcacaaagtcgactggatcgtttaatcgacgatttcc 22227275  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaa 273  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  22227276 caacagattaaatgacccaaaa 22227297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Original strand, 22172699 - 22172814
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat- 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||     
T  22172699 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttatgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttgttccgctaagcggatt 22172798  T
Q  117 -taaaattttgaaaaa 131  Q
     |||||||||||||||    
T  22172799 ataaaattttgaaaaa 22172814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 24644162 - 24644280
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccg-tttctatgggatttcttccgtaaagaggat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||  ||||||||    
T  24644162 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgttttcaatggaatttgttccgctaagaggat 24644261  T
Q  117 --taaaattttgaaaaatc 133  Q
      ||||||||| |||||||    
T  24644262 tataaaattttaaaaaatc 24644280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 151
Target Start/End: Original strand, 29230589 - 29230706
Alignment:
Q  34 taaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttgaaaaatc 133  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||| |    
T  29230589 taaaatgtttaagtttgtgtttgatttgtgattgatgatttaatcaagatctgtttcaatgagatttattccgctaagatgattaaaattttaaaaaaac 29230688  T
Q  134 cctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29230689 cctcttgaaatcccttca 29230706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27660795 - 27660698
Alignment:
Q  55 tgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgttt-ctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||    
T  27660795 tgatttgtgataaatgatttaatcaagattcattttcaatgggatttcttccgctaagaggattaaaattttgaaaaacctctcttaaaatcctttca 27660698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24795980 - 24795853
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaa-gtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccg-tttctatgggatttcttccgtaaagagga 115  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||  |||| |||||  |||||||    
T  24795980 gtaaacacatgaatcc--aagtgtttaaagtttgtgtttgatttgtgattaatgatttaatgaaaatccgttttcaatgaaatttgttccgctaagagga 24795883  T
Q  116 ttaaaattttgaaaaatccctcttgaaatc 145  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  24795882 ttaaaattttgaataacccctcttaaaatc 24795853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 155 - 652
Target Start/End: Original strand, 8995933 - 8996430
Alignment:
Q  155 aaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcccaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8995933 aaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacattgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatcgacgatttcccaa 8996032  T
Q  255 ccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcattct 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8996033 ccgattaaattacccaaaagcattaatttttagattaaaagtgattatcaaatattagcatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattct 8996132  T
Q  355 atttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaaccatat 454  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8996133 atttctagattcaaaaggatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaataataacaacaatattgaataaatagctagaatcatat 8996232  T
Q  455 attaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatg 554  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8996233 attaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacatcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 8996332  T
Q  555 aagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctctagaaatg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8996333 aagaagagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcgcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctagaaatg 8996430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 11738466 - 11738959
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11738466 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacattgatttcccaaaaatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttagtcgacgatttcc 11738565  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11738566 caaccgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 11738665  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11738666 tctatttctagattcaaaattatgtgtccatatcattttgaatctcagtaaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 11738765  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11738766 tatattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 11738864  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11738865 atgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtgtcaacaaatcttggcttgaatttactcctaactaccttgctttgtgtttctct 11738959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 154 - 645
Target Start/End: Original strand, 38121602 - 38122094
Alignment:
Q  154 caaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttccca 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38121602 caaatgatatcattatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttccca 38121701  T
Q  254 accgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38121702 accgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattc 38121801  T
Q  354 tatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaaccat 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38121802 tatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccat 38121901  T
Q  453 atattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagga 552  Q
    |||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38121902 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 38122000  T
Q  553 tgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  38122001 tgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 38122094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 9667364 - 9667857
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  9667364 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcctttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacgaagtcgattggataatttaatcgacgatttac 9667463  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9667464 caaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 9667563  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9667564 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaacca 9667663  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9667664 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagaatgtatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 9667762  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||||    
T  9667763 atgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgccttgtatttctct 9667857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 16832451 - 16832944
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16832451 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggataatttaatcgacgatttcc 16832550  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16832551 taaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 16832650  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16832651 tctatttctagattcaaaaatatgtgtccatatcattttgaatctaaataacatattaaatgcaagaatagcaacaatattgaataaatagctagaacca 16832750  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16832751 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatatagctacatatatctatgatagctttgcaaagg 16832849  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||  |||   ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  16832850 atgaagaaaagatgaagatttcatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttactttgtgtttctct 16832944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 40999772 - 41000265
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||    
T  40999772 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagccttttggatcgtttaatcgacgatttcc 40999871  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40999872 caaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 40999971  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40999972 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaagaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 41000071  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  41000072 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagatttgcaaagg 41000170  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  41000171 atgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 41000265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 44504936 - 44505432
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44504936 tccaaatgatgtcgttatttctaagaggtcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 44505035  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  44505036 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataatttaagatagattgttat 44505135  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaa-cc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  44505136 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccc 44505235  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttg-tttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  44505236 atatattaaataatcaaaagattacataatagcttgttttgaatacctcaaaaaccacaagtttagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaa 44505335  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44505336 ggatgaagaaaagatgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaattttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 44505432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 39000849 - 39001343
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39000849 tccaaatgatatcgttatttctaagcgatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 39000948  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39000949 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattgacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 39001048  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39001049 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 39001148  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39001149 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaataccttaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 39001247  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39001248 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 39001343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 432009 - 432502
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  432009 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacaatcacgaagtcgattggataatttaatcgacgatttcc 432108  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  432109 caaccgattaattcacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 432208  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  432209 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaacca 432308  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  432309 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagaatggatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 432407  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||| | |||| | ||||| |||| ||||||| |||| |||||||    
T  432408 atgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgagtctactcctaactaccttgccttgtatttctct 432502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 12167884 - 12168378
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  12167884 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 12167983  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12167984 caaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 12168083  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12168084 tctatttctagattcaaaagtatgtgtcaatattattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 12168183  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12168184 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 12168282  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  12168283 gatgaagaaatggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacacctaactaccttgctttgtgtttctct 12168378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 33491866 - 33492360
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  33491866 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 33491965  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33491966 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 33492065  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33492066 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 33492165  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33492166 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcagaa-ctacaagagtagatgtggctacatatgtctatgatagctttgcaaag 33492264  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33492265 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 33492360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 49249558 - 49249072
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  49249558 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 49249459  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49249458 caaccgattaaattactcaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatttctagagtgataacttaagatagattgttat 49249359  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  49249358 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatataattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 49249259  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    ||||||||||        || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49249258 atatattaaa--------agattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 49249168  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  49249167 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttactttgtgtttctct 49249072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 13217716 - 13218207
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaa-gtcgattggatagttcaatcgacgatttc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13217716 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcccaaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttc 13217815  T
Q  251 ccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtca 350  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13217816 ccagctaattaaattatccaaaagtattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagataaattgtta 13217915  T
Q  351 ttctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13217916 ttctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatcttaataaaacattaaaggc---aataacaacaatattgaataaatagctagaacc 13218012  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
     |||||||||| || || || |||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13218013 gtatattaaattatcaaaagattacataatatcttgtttgaatgcctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 13218111  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaa-caccttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13218112 gatgaagaaaagatgaagattccatgacaagttccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaaccaccttgctttgtgtttctct 13218207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 152 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 36084252 - 36083868
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36084252 tccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaatgtcgatttcccaaacatttatataatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcc 36084153  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  36084152 caaccgattaaatgacccaaatgcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaacttaagatagattgttat 36084053  T
Q  352 tctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaac 449  Q
    | |||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36084052 tatatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaac 36083953  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatg 536  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  36083952 catatattaaaagat-aagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggtagatgtaactacatatgtctatg 36083868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 152 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16130999 - 16130706
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  16130999 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaatatttaaacgatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgattccc 16130900  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16130899 taaccgattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 16130800  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  16130799 tttatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaa--------gcaagaataacaacaatattgaataaatggctagaatca 16130708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 152 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 15161921 - 15161612
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||    
T  15161921 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaatgtcaatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattgaaccgtttaatcgactatttcc 15161822  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  15161821 caaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctatattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattattat 15161722  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacc 450  Q
    |||| | || ||| ||||||||| |||  ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15161721 tctaatcctggatccaaaagtatttgttaatatccttttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacc 15161622  T
Q  451 atatattaaa 460  Q
    ||||||||||    
T  15161621 atatattaaa 15161612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 155 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 9269126 - 9268655
Alignment:
Q  155 aaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcccaa 254  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||   ||||||  || |||| ||||||  |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9269126 aaatgatgtcgtgatttctaatggactatttaaaagtcaattttccaaactattaaacaatca-aaagccgattggatcgtttaatcgacgatttcccaa 9269028  T
Q  255 ccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaag-tgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcattc 353  Q
     | ||||||  ||| ||||||||||||  || ||||  ||| ||||||||||| |||||  || ||||||||| |||  ||||| |||||||| | ||||    
T  9269027 tcaattaaacgacctaaaagcattaagctcttgatttcaaggtgattatcaaagattaaattctatgtctagaatgaacactta-gatagattattattc 9268929  T
Q  354 tatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaaccat 452  Q
    |  | |||||| ||||||||| |||| |||  ||||  |||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  9268928 tgatcctagatccaaaagtatttgtcaataaaatttcaaatctcaaataaagctttagatgcaagaataataacaatattgaataaatagctagaaacat 9268829  T
Q  453 atattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagga 552  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  || || ||| ||||    
T  9268828 atattaaaagatcaagagtttacataatagcttggttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctttgcaagtttggcaaagga 9268729  T
Q  553 tgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaaca 626  Q
    | ||  | |||||||||||  ||| |||||   |||||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||    
T  9268728 taaaagaaagatgaagatttcatgtctagactcatgatgtctcaataaatattaggaagaatctactcttaaca 9268655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18531506 - 18531376
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  18531506 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcattgggatttcttccgcaaagaggatt 18531407  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatccct 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18531406 aaaattttgaaaaatccctcttaaaatccct 18531376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27130390 - 27130256
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27130390 gtaatcacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 27130291  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttcat 152  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  27130290 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcctttcat 27130256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 18253244 - 18253377
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  18253244 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaataatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttctgcaaagaggatt 18253343  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18253344 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 18253377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 452 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 15161296 - 15161087
Alignment:
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15161296 tatattaaaaaatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccataagagtagatgtaactacatatgtctatgatagctttgcagagg 15161197  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgttt--ctctagaa 649  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||  ||||  |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  15161196 atgaagaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgggaagaatctactcctaatatcttgctttgtgtttctctctagaa 15161097  T
Q  650 atgccatctc 659  Q
    ||||||||||    
T  15161096 atgccatctc 15161087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 456 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 16129848 - 16129659
Alignment:
Q  456 ttaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatga 555  Q
    ||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  16129848 ttaaatgatcaaaagattacataatagattgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatga 16129750  T
Q  556 agaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  16129749 agaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactatcttgctttgtgtttctct 16129659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27309546 - 27309412
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27309546 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaatatttgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 27309447  T
Q  118 aaaattttgaaaaa-tccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  27309446 aaaattttgaaaaaccccctcttaaaatcccttca 27309412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 418 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 13830515 - 13830288
Alignment:
Q  418 aataacaacaacattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtaga 516  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  13830515 aataataacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaatgatcaag-taatacataatagcttgtttgaatacctaaaaacccacaagggtaaa 13830417  T
Q  517 tgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatat 616  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  | | |||||||||  ||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||  |||| |    
T  13830416 tgtagctacatatgtctatgaaaactttgcaaaggatgaaagaaaaatgaagatttcatgctaagattcatgacgtctcaacaaatcttaggaagaatct 13830317  T
Q  617 actcttaacaccttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  13830316 actcctaacacccttccttgtgtttctct 13830288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 456 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 16130402 - 16130254
Alignment:
Q  456 ttaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatga 555  Q
    ||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  16130402 ttaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaatc-acaagagtagatatagctacatatgtctatgataactttgcaaatgatga 16130304  T
Q  556 agaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatctt 605  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16130303 agaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatctt 16130254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16358026 - 16357911
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat- 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||     
T  16358026 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaaatttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgagatttgttccgctaagaggatt 16357927  T
Q  117 -taaaattttgaaaaa 131  Q
     |||||||||||||||    
T  16357926 ataaaattttgaaaaa 16357911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 359 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 6244482 - 6244201
Alignment:
Q  359 ctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaaccatatatt 457  Q
    |||||||||||||||  | || ||| ||||| |||||| ||  ||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  6244482 ctagattcaaaagtacctttcaataacatttcgaatctaaaataaacattaaacacaagaatgataacaatattgaataaaagagctggaaccatatatt 6244383  T
Q  458 aaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggat-gaa 556  Q
    ||||||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |  ||  |||||||||| | ||| |||    
T  6244382 aaatgatcaagagtttacat-------tgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctatatgttttcatagtagctttgcaaaagatggaa 6244290  T
Q  557 gaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaaca-ccttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||| ||||||||||| ||| | | ||  ||||| |||| |||||||||  |  |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6244289 gaag-gatgaagattccatgacaatattcatgatatctctacaaatctttagaagaatctactcctaacacccttgctttgtgtttctct 6244201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 398 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 39454354 - 39454103
Alignment:
Q  398 aataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatgaagagtttaca---taatggcttgtttgaat 493  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| || || |||||   |||| ||||||||||||    
T  39454354 aataaagcattaaactcaagaataataacaatattgaataaataagctagaaccttaaattaaatgatcaa-agattacaaattaatagcttgtttgaat 39454256  T
Q  494 acctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatg-aagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgt 592  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| |||||||||||| || |  ||||  ||||| |    
T  39454255 accttaaaaaccacaagcgtagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatggaagaa-agatgaagattccatactaagattcatgatat 39454157  T
Q  593 ctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaaca-ccttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||| ||||||| ||||  |||| ||||  |||||  |||| |||||||||||||    
T  39454156 ctctacaaatcctaggaagaatctacttctaacatgcttgatttgtgtttctct 39454103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 21169388 - 21169282
Alignment:
Q  47 tttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttgaaaa-atccctcttgaaatc 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||    
T  21169388 tttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccttttcaatgggatttcttccgcaaagaggatcaaaattttgaaaacccccctcttaaaatc 21169289  T
Q  146 ccttcat 152  Q
    |||||||    
T  21169288 ccttcat 21169282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9075852 - 9075751
Alignment:
Q  52 atttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat--taaaattttgaaaaatccctcttgaaatccctt 149  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9075852 atttgatttgtgattaattctttaatcaagacccgtttcaatgagatttgttccgctaagaggattataaaattttgaaaaacccctctttaaatccctt 9075753  T
Q  150 ca 151  Q
    ||    
T  9075752 ca 9075751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 36080279 - 36080205
Alignment:
Q  586 atgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgttt--ctctagaaatgccatct 658  Q
    ||||||||||||||| |||| | | |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36080279 atgatgtctcaacaagtcttggatagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctctagaaatgccatct 36080205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22640800 - 22640728
Alignment:
Q  57 atttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttgaaaa 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  22640800 atttatgattaatgatttaatcaagatccattttaatgggatttgttccgctaaga-gattaaaattttgaaaa 22640728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 88
Target Start/End: Original strand, 25662281 - 25662316
Alignment:
Q  53 tttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtt 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25662281 tttgatttgtgattaatgatttaatcaatatccgtt 25662316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 655
Target Start/End: Original strand, 11872 - 12373
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11872 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtagattggatagtttaatcgacgatttcc 11971  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11972 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctagagtgataacttaagatagattgttat 12071  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12072 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagtacca 12171  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  12172 tatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagct--atatgtctatgatagctttgcaaagg 12269  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctctagaaat 651  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12270 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctagaaat 12369  T
Q  652 gcca 655  Q
    ||||    
T  12370 gcca 12373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 655
Target Start/End: Original strand, 15642 - 16143
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15642 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagttgattggatagtttaatcgacgatttcc 15741  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15742 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctagagtgataacttaagatagattgttat 15841  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15842 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagtacca 15941  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  15942 tatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagct--atatgtctatgatagctttgcaaagg 16039  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctctagaaat 651  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16040 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctagaaat 16139  T
Q  652 gcca 655  Q
    ||||    
T  16140 gcca 16143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 14271166 - 14270654
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14271166 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcaatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 14271067  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14271066 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgctat 14270967  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14270966 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 14270867  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    ||||||||||  || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |     
T  14270866 atatattaaaaaatcaagaaattacataattgcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtatatatagctacatatgtctatgatagttttgcaaaa 14270767  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtt--tctctaga 648  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14270766 gatgaagaaaagatgaagattcactgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctctaga 14270667  T
Q  649 aatgccatctctc 661  Q
    |||| ||||||||    
T  14270666 aatgtcatctctc 14270654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 25977443 - 25976940
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25977443 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggttagtttaatcgacgatttcc 25977344  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25977343 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 25977244  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaa-tagctagaacc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  25977243 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaatcattaaatacaaaaataacaacaatattgaataaacaagctagaacc 25977144  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  25977143 atatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgca-aa 25977045  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctctagaaa 650  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  | ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25977044 gatgaagaaaagatgaagattccataacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctagaaa 25976945  T
Q  651 tgcca 655  Q
    |||||    
T  25976944 tgcca 25976940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 24160924 - 24161417
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24160924 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattccccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 24161023  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  24161024 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtccttgattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtcgagagtgataacttaagatagattattat 24161123  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24161124 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataactagaacca 24161223  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  24161224 tatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgccaaga 24161322  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24161323 atgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatctttgcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 24161417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 3539541 - 3539047
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3539541 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 3539442  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3539441 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 3539342  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3539341 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 3539242  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3539241 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 3539143  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3539142 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 3539047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 34006996 - 34006502
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  34006996 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 34006897  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34006896 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 34006797  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34006796 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 34006697  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34006696 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 34006598  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  34006597 gatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggtttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 34006502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 26515096 - 26515590
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  26515096 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 26515195  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26515196 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 26515295  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26515296 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 26515395  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26515396 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 26515494  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26515495 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 26515590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 646
Target Start/End: Original strand, 13173492 - 13173978
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13173492 tccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgaagatttcc 13173591  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13173592 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 13173691  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  13173692 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaatca 13173791  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||    
T  13173792 tatattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaagggtagatg--------tatgtctatgatagctttgcaaagg 13173883  T
Q  552 atgaag--aagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctcta 646  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||  ||   ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  13173884 atgaagaaaagagatgaagattccatgcc--gactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttactttgtgtttttcta 13173978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1455285 - 1454795
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1455285 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcaatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcaacgatttcc 1455186  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1455185 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtaat 1455086  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaa-tagctagaacc 450  Q
    |||||     ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  1455085 tctat-----gattcaaaagtatttgtcaacatcattttgaatctcaataaaacatcaaatacaagaataacaacaatattgaataaacaagctagaacc 1454991  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||| ||    
T  1454990 atatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagttacatatgtctatgcaagcttggcaaag 1454891  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctcta 646  Q
    ||||||  | |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1454890 gatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctcta 1454795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1466977 - 1466487
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1466977 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcaatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcaacgatttcc 1466878  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1466877 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtaat 1466778  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaa-tagctagaacc 450  Q
    |||||     ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  1466777 tctat-----gattcaaaagtatttgtcaacatcattttgaatctcaataaaacatcaaatacaagaataacaacaatattgaataaacaagctagaacc 1466683  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||| ||    
T  1466682 atatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagttacatatgtctatgcaagcttggcaaag 1466583  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctcta 646  Q
    ||||||  | |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1466582 gatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctcta 1466487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 9932473 - 9932967
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  9932473 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 9932572  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9932573 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 9932672  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9932673 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 9932772  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9932773 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtatatgatagctttgcaaag 9932871  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  9932872 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgccttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 9932967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 646
Target Start/End: Original strand, 13182025 - 13182511
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13182025 tccaaatgatatcgttatttctaaaggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgattttc 13182124  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13182125 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtactagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 13182224  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  13182225 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaaaacaagaataacaacaatattgaataaatagctagaatca 13182324  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||    
T  13182325 tatattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaagggtagatg--------tatgtctatgatagctttgcaaagg 13182416  T
Q  552 atgaag--aagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctcta 646  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||  ||   ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  13182417 atgaagaaaagagatgaagattccatgcc--gactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttactttgtgtttttcta 13182511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 21596196 - 21596693
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21596196 tccaaatgatatcgttattgctaagaggtcgtttaaacatcgatttctcaaacatttaaacgatcaaaaagtcgattggatattttaatcgacgatttcc 21596295  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  21596296 caaccgattaaattacccaaaagcattaaggtctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagtttgttat 21596395  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21596396 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 21596495  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21596496 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagtttagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 21596594  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgc----ctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||    | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  21596595 atgaagaaaagatgaagattccatgcatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccatgctttgtgtttctct 21596693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 24879359 - 24878865
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24879359 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggataatttaatcgacgatttcc 24879260  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24879259 caaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttat 24879160  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||    
T  24879159 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgtatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataagctatagcc 24879060  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24879059 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtatatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 24878961  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  24878960 gatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 24878865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 32806431 - 32806924
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32806431 tccaaatgatatcgttatttctaagaggtcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaacgtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 32806530  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  32806531 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattattaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagatttttat 32806630  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32806631 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaccaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctataacca 32806730  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    |||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32806731 tatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtaggtgtagatacatatgtctatgatagctttgcaaagg 32806829  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32806830 atgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 32806924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 34914182 - 34913803
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34914182 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 34914083  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34914082 caactgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 34913983  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34913982 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacagcaatattgaataaatagatagaacca 34913883  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgt 531  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34913882 tatattaaatgatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgt 34913803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 5988670 - 5989164
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  5988670 tccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaatattcacaacgtcgattggatcgtttaattgacgatttcc 5988769  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |     
T  5988770 ctaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctaaattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaacttaagatagattgtta- 5988868  T
Q  352 tctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaac 449  Q
    |||| ||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5988869 tctagttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaac 5988968  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
    ||||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5988969 catatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtaaatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaa 5989068  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
     |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5989069 tgatgaa-aaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 5989164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 152 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 16698403 - 16698091
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16698403 tccaaatgataacgttatttctaagggatcgcttaaaaatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 16698304  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16698303 aaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagataggttgttat 16698204  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16698203 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatttcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagttagaacca 16698104  T
Q  452 tatattaaatgat 464  Q
    |||||||||||||    
T  16698103 tatattaaatgat 16698091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 191 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 21631638 - 21631180
Alignment:
Q  191 tcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatt 290  Q
    ||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||| |||||||| |||||||    
T  21631638 tcgatatcccaaactattacacaatcacaaagtcgattagatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgacccaaaaacattaagttctagatt 21631539  T
Q  291 aaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattt 389  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | || |||||||||    
T  21631538 ataagtgattatcaaagattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttagattcaaaagcatttttcaatatcattt 21631439  T
Q  390 tgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtt 488  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  21631438 tgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatgtattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtt 21631339  T
Q  489 tgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaag--aagagatgaagattcaatgcctagatcta 586  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  21631338 tgaatacctc-aaatccacaagagtagatgtaactacatatgtctatgatagctttacaaaggatgaagaaaagagatgaagattctatgtctagatcca 21631240  T
Q  587 tgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21631239 tgatgtctcaacaaatcttgtgttaaatctactcttaactaccttgctttatgtttctct 21631180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 152 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 15642913 - 15642457
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaac-atttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttc 250  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||  ||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15642913 tccaaatgatgtcgtgatttctaatggattatttaaaagtcgattttccaaactatttaaataatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttc 15642814  T
Q  251 ccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtc 349  Q
    | |||| ||||||  | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| |||||   | ||||||||| ||| ||| || |||||||| |     
T  15642813 ctaacctattaaacgatccaaaagcattaagttcttgattacaaagtgattatgaaagattaaatactatgtctagaatgaaaacata-gatagattatt 15642715  T
Q  350 attctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaata-gctaga 447  Q
    |||||| | |||||| ||||||||| |||| ||| |||||  ||||| || |||| | ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  15642714 attctaatcctagatccaaaagtatttgtcaataacatttcaaatcttaaataaagctttaaaggcaagaataataacaatattcaataaataagctaga 15642615  T
Q  448 accatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgca 547  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||| |||    
T  15642614 accatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttatttgaatacctcaaaacccacaagggtagatttagctacatatgtctatgcaagcttagca 15642515  T
Q  548 taggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatctt 605  Q
     ||||||||  | |||||||||||  ||||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  15642514 aaggatgaaagaaagatgaagatttcatgctaagattcatgatgtctcaacaaatctt 15642457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 327 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 32822119 - 32821812
Alignment:
Q  327 gtgataacttaagatagattgtcattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa 425  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32822119 gtgataacttatgatatattgttattctagttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacagtaaatacaagaataacaa 32822020  T
Q  426 caacattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtaccta 524  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  32822019 caatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa-atctaaagattacataattgcttatttgaatacctcaaaacccacaag--tagatgtagcta 32821923  T
Q  525 catatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaa 624  Q
    ||| ||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||    
T  32821922 catttgtctatgatagcttttaaaaggatggagaagagatgaagattcaatgcatagatccatgatttatcaacaaatcttgggttgaatctattcctaa 32821823  T
Q  625 caccttgcttt 635  Q
     ||||||||||    
T  32821822 taccttgcttt 32821812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 191 - 605
Target Start/End: Original strand, 9518153 - 9518565
Alignment:
Q  191 tcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatt 290  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||| ||||||| ||  |||    
T  9518153 tcgatttcccaaactattaaacaatcacaaagtcgatcggatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgacccaaaagtattaagttcttaatt 9518252  T
Q  291 a-aaagtgattatcaaatattaacatcc-atgtctagagtgataacttaagatagattgtcattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatt 388  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | | ||||||     |||| | ||||||   |||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  9518253 acaaagtgattatcaaagattaa-atcctatgtctagaataaaaactta-----gattattattctaaccctagattcaaaagtatttgtcaataacatt 9518346  T
Q  389 ttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatag-ctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttg 486  Q
    |  |||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9518347 tcaaatctcaaataaagctttaaatgcaagaataataacaattatgaataaataaactagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttg 9518446  T
Q  487 tttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatcta 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||| ||||||||  | |||||||||||  ||||  | ||  |    
T  9518447 tttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgcaaacttggcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgctaaaattca 9518546  T
Q  587 tgatgtctcaacaaatctt 605  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9518547 tgatgtctcaacaaatctt 9518565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 11652912 - 11653045
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11652912 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagattcgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 11653011  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11653012 aaaattttgaaaaaaccctcttaaaatcccttca 11653045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 17690433 - 17690300
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17690433 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 17690334  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17690333 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 17690300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27380220 - 27380087
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27380220 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 27380121  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27380120 aaatttttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 27380087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27470603 - 27470470
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27470603 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 27470504  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27470503 aaatttttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 27470470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 536 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 34913558 - 34913410
Alignment:
Q  536 gatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgcttt 635  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34913558 gatagctttgcataggatgatgaagagatgaagattcaatgcctaaatccataatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgcttt 34913459  T
Q  636 gtgtttctctagaaatgccatctctctatttctccaaaaatatgtgata 684  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34913458 gtgtttctctagaaatgtcatctctctatctctccaaaaatatgtgata 34913410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 229 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 26604757 - 26604339
Alignment:
Q  229 ggatagttcaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagag 327  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||  | | || |||||||||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  || |||||||||     
T  26604757 ggatcgtttaatcgacgatttcccaatctattaaacgatcaaatagcattaagttcttgattacaaagtgattatcaaaacttaaactctatgtctagaa 26604658  T
Q  328 tgataacttaagatagattgtcattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatc-tcaataaaacattaaatgcaagaataacaac 426  Q
    | | |||||  |||||||| | ||||||   ||| || ||||||||| | || ||| |||||  |||| | |||||| |||||||  ||||||||| |||    
T  26604657 taaaaactt-tgatagattattattctaaccctacatccaaaagtatttttcaataacatttcaaatcttaaataaagcattaaaaacaagaataataac 26604559  T
Q  427 aacattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctac 525  Q
    || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  26604558 aatattgaataaataagctagaatcttatattaaatgatcaa-agattacataatagcttttttgaatacctcaatacccacaaggatagatgtagctac 26604460  T
Q  526 atatgtctatgatagctttgcataggat-gaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaa 624  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||  |||    
T  26604459 atatgtctatgaaagctttgcaaaagatggaagaa-agatgaagattccatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgggaagaatctacttctaa 26604361  T
Q  625 ca-ccttgctttgtgtttctct 645  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  26604360 cacccttgctttgtgtttctct 26604339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 29310104 - 29310237
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29310104 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcattgggatttcttccgcaaagaggatt 29310203  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29310204 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 29310237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 29317063 - 29317196
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29317063 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcattgggatttcttccgcaaagaggatt 29317162  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29317163 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 29317196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 27278581 - 27278714
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27278581 gtaaacacgtgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 27278680  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27278681 aatattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 27278714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 27297873 - 27298006
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27297873 gtaaacacgtgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 27297972  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27297973 aatattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 27298006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 27303472 - 27303605
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27303472 gtaaacacgtgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 27303571  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27303572 aatattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 27303605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 472 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 14479733 - 14479560
Alignment:
Q  472 ttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagatt 571  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14479733 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatatagctacatatgtctatgatagatttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt 14479635  T
Q  572 caatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    | ||| | ||||  |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14479634 ccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 14479560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 441 - 526
Target Start/End: Original strand, 6868010 - 6868095
Alignment:
Q  441 agctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctaca 526  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6868010 agctagaaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaataccttaaaacccacaagggtagatgtagctaca 6868095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 564 - 645
Target Start/End: Original strand, 26510392 - 26510474
Alignment:
Q  564 tgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26510392 tgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 26510474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 28755202 - 28755127
Alignment:
Q  64 attaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttgaaaaatccctctt 139  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28755202 attagtgatttaatcaagatctgtttcagtggaatttgttccgccaagatgattaaaattttgaaaaatccctctt 28755127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16393436 - 16393339
Alignment:
Q  54 ttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccg-tttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| | |||  ||||||| |||| ||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  16393436 ttgatttgtgattaatgatttaataaagatccgttttcaatgagatttgtaccgctaagagga-taaatttttgaaaaactcctctcaaaatcccttca 16393339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 12688 - 12185
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12688 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagttgattggatagtttaatcgacgatttcc 12589  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12588 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctagagtgataacttaagatagattgttat 12489  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaac-attaaatgcaagaat-aacaacaacattgaataaatagctagaac 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12488 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaattaaatgcaagaataaacaacaatattgaataaatagctagtac 12389  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
    ||||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| |    
T  12388 catatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagct--atatgtctatgatagctttgcaaa 12291  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctctagaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12290 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctagaa 12191  T
Q  650 atgcca 655  Q
    ||||||    
T  12190 atgcca 12185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 653
Target Start/End: Original strand, 37251573 - 37252073
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37251573 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatcgacgatttcc 37251672  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37251673 caaacgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 37251772  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37251773 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatttcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 37251872  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  37251873 tatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatatctatgatagctttgcaaagg 37251972  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctctagaaat 651  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  37251973 atgaagaaaagatgaagattccat-ccttgactcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctacacctaacaccttgttttgtgtctctctaaaaat 37252071  T
Q  652 gc 653  Q
    ||    
T  37252072 gc 37252073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 27166766 - 27167259
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  27166766 tccaaatgatattgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttct 27166865  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27166866 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagataaattgttat 27166965  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27166966 tctatttctagattcaaaaatatatgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 27167065  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27167066 tatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 27167164  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27167165 atgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtcccaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 27167259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 34869413 - 34869908
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaa-gggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  34869413 tccaaatgatatcgttatttctaaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggataatttaatcgaggatttc 34869512  T
Q  251 ccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtca 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  34869513 ccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagaaagattgtta 34869612  T
Q  351 ttctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacc 450  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34869613 ttttatttctagattcaaaagtacgtgtccatatcattttaaatctcaatagaacattatatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacc 34869712  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34869713 atatattaaatgatcgaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 34869812  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  34869813 aatgaataagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 34869908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 11767248 - 11766755
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11767248 tccaaatgatatcgttatttctaaggggtcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaaatcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 11767149  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11767148 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 11767049  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11767048 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaataataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaacca 11766949  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11766948 tatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 11766850  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11766849 atgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 11766755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 9404918 - 9404424
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  9404918 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 9404819  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9404818 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 9404719  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9404718 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 9404619  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9404618 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 9404520  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9404519 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 9404424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 11722944 - 11723438
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  11722944 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 11723043  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11723044 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 11723143  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11723144 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 11723243  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11723244 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 11723342  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11723343 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 11723438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 16904277 - 16904771
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16904277 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 16904376  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16904377 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 16904476  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaata-gctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16904477 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataggctagaacc 16904576  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16904577 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 16904675  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  16904676 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacccctaactaccttgctttgtgtttctct 16904771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 33435096 - 33434603
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  33435096 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgtcgatttcc 33434997  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33434996 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 33434897  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33434896 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaacca 33434797  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33434796 tatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgagtacctcaaaa-ctacaagaggagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 33434698  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33434697 atgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 33434603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 34456789 - 34456297
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  34456789 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 34456690  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  34456689 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtc--gagtgataacttaagatagattgttat 34456592  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34456591 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 34456492  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34456491 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 34456393  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  34456392 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 34456297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 30606744 - 30607238
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  30606744 tccaaatgatatcgttatttctaagagatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 30606843  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  30606844 caaccgattaaattacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattattat 30606943  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30606944 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 30607043  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30607044 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 30607142  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  30607143 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatattggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 30607238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 154 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 14344953 - 14344469
Alignment:
Q  154 caaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttccca 253  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14344953 caaatgatatctttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttccca 14344854  T
Q  254 accgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14344853 accgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattc 14344754  T
Q  354 tatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaaccat 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  14344753 tatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagttagaaccat 14344654  T
Q  453 atattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagga 552  Q
    ||||||||        || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14344653 atattaaa--------agattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 14344563  T
Q  553 tgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  14344562 tgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgagtttctct 14344469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 6270384 - 6269890
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6270384 tccaaatgatatcgttatttctaagagatcatttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 6270285  T
Q  252 c-aaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtca 350  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6270284 ccaaccgattaaattaccaaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtta 6270185  T
Q  351 ttctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  6270184 ttctatttctagattcaaaagtacatgtccatatcattttgagtctcaataaaacaataaagacaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaat 6270085  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6270084 atatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 6269986  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||| | ||||||||||  || | ||||| ||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||    
T  6269985 gatgaagaaaatatgaagattccttgacaagatccatgttgtcacaacaaatcttggcttgaatctactcataactacatttctttgtgtttctct 6269890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 199 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 31846426 - 31845980
Alignment:
Q  199 ccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31846426 ccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtga 31846327  T
Q  299 ttatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctca 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31846326 ttatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctca 31846227  T
Q  399 ataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctc 498  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31846226 ataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctc 31846127  T
Q  499 aaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaac 598  Q
    |||| | |||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  31846126 aaaa-ctacaagattaaatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaac 31846028  T
Q  599 aaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31846027 aaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 31845980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 24836216 - 24835735
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24836216 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 24836117  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||| ||    
T  24836116 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgt-------------ttaagatagattgttat 24836030  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24836029 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 24835930  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24835929 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 24835831  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  24835830 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcctgacttgaatctactcctaactaccttgatttgtgtttctct 24835735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 152 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 7315698 - 7315358
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  7315698 tccaaatgatatcgttatttctaagagatcgtttaaacattgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 7315599  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7315598 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 7315499  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7315498 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 7315399  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttga 491  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  7315398 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 7315358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 269 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 7315342 - 7314965
Alignment:
Q  269 caaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcattctatttctagattcaa 368  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7315342 caaaagcattaagttctagattaaaaatgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaa 7315243  T
Q  369 aagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatgaa 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7315242 aagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaa 7315143  T
Q  468 gagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaa 567  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||    
T  7315142 aagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaa 7315044  T
Q  568 gattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  7315043 gattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 7314965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 152 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 32227152 - 32226911
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32227152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 32227053  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  32227052 caaccgattaaattacccaaaagcactaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattgacattcatgtctagagtgataacttaagacagattgttat 32226953  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaa 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32226952 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaa 32226911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 39655704 - 39656199
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||   || |||  ||||||||||||||  |||||| |||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  39655704 tccaaatgatgtcgtgatttctaatggactattcaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcagaaagtcaatcggatcgttcaatcgacgatttcc 39655803  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatcc-atgtctagagtgataacttaagatagattgtc 349  Q
    ||| | ||||||  |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | | |||||| |||||||| |     
T  39655804 caatctattaaacgacccaaaaccattaagttcttgattacaaagtgattatcaaagattaa-atcctatgtctagaattaaaactta-gatagattatt 39655901  T
Q  350 attctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaata-gctaga 447  Q
    ||| ||   |||||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||| |||| | |||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||    
T  39655902 attttaaccctagattcaaaagtatttgtcaataacatttcaaatctcaaataaagctttaaatgcaagaataataagaagattgaataaataagctaga 39656001  T
Q  448 accatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgca 547  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||  ||    
T  39656002 accatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctttgcaagcttgaca 39656101  T
Q  548 taggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctct 645  Q
     ||||||||  | |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  39656102 aaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttttgtagaatctactcctaacaccttacgttgtgtttctct 39656199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 152 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 519523 - 519315
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||    
T  519523 tccaaatgatatcgttatctctaagggatcgtttaattgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagttgatttgatcgtttaatcgacaatttcc 519424  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  519423 caacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatttagaatgaaaacttaagatagattgttat 519324  T
Q  352 tctatttct 360  Q
    |||||||||    
T  519323 tctatttct 519315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24694453 - 24694320
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24694453 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgtaaagaggatt 24694354  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||| |||||    
T  24694353 aaaatcatgaaaaacacctctttaaatctcttca 24694320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24701222 - 24701089
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24701222 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgtaaagaggatt 24701123  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||| |||||    
T  24701122 aaaatcatgaaaaacacctctttaaatctcttca 24701089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18565450 - 18565335
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat- 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||     
T  18565450 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttattccgctaagaggatt 18565351  T
Q  117 -taaaattttgaaaaa 131  Q
     |||||||||||||||    
T  18565350 ataaaattttgaaaaa 18565335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 564 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 32226914 - 32226826
Alignment:
Q  564 tgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctctagaaatg 652  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32226914 tgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaattttaggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctagaaatg 32226826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 19713500 - 19713396
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatc-ttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat 116  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  19713500 gtaaacacatgaatccttaaattgtttaagtatgtgtttgatttgtgattaataatttaatcaagatccgtttcaatgagatttcttccgcaaagaggat 19713401  T
Q  117 taaaa 121  Q
    |||||    
T  19713400 taaaa 19713396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28718951 - 28718819
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatc-ttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat 116  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |  ||||| ||    
T  28718951 gtaaacacatgaacccttaaagcgtttaagtttggttttgatttgtgattaatgatttaatcaagattcgtttcaacgggatttgttctgccaagagtat 28718852  T
Q  117 taaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28718851 t-aaattttgaaaaa-ccctctttaaatcccttca 28718819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 151
Target Start/End: Original strand, 39539783 - 39539879
Alignment:
Q  55 tgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaatttt-gaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  39539783 tgatttgtgattaattatttaatcaagatccgtttc-atgagatttgttccattaagcggattaaaattttcgataaacccctcttgaaatcccttca 39539879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 938489 - 938385
Alignment:
Q  41 tttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttgaaaaatccctcttg 140  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||| |||     
T  938489 tttaagtatgtatttgatttgtgattaatgattta-tcaa-attcgtttcaatgagatttcttccgctaagaaaattaaaattttgaaaaacccccctta 938392  T
Q  141 aaatccc 147  Q
    |||||||    
T  938391 aaatccc 938385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17297951 - 17297856
Alignment:
Q  53 tttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttgaaaaatccctc--ttgaaatccct 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||  |||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17297951 tttgatttgtgattaatgatttaatcaatatccgttcatttga-atttattccgccaagagg-ttaaaattttgaaaaatacctctattgaaatccct 17297856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 21160459 - 21160006
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21160459 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgaatagtttaatcgacgatttcc 21160360  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21160359 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatatattgttat 21160260  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21160259 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaatca 21160160  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  21160159 tatattgaatgatcaagaaattacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaag 21160060  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatctt 605  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21160059 atgaagaagagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatctt 21160006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 36667543 - 36668031
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36667543 tccaaatgatatcgttatttctaaggga------aaacatcgatttcctaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 36667636  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36667637 caacggattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgcctagagtgataacttaagatagattgttat 36667736  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36667737 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 36667836  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36667837 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 36667936  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | || | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  36667937 atgaagaagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttaagtctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 36668031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 23924700 - 23925193
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  23924700 tccaaatgatatcgttatttttaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggataatttaattgacgatttcc 23924799  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23924800 caaccgattaaattacccaaaagcattaaaacctagattaaaagtgattatcaaaaattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattattat 23924899  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23924900 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctataacca 23924999  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    |||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23925000 tatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-caacaagagtagatgtagatacatatgtctatgatagctttgcaaagg 23925098  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23925099 atgaagaaaagatgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaatcttcgcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 23925193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 27257878 - 27257385
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27257878 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 27257779  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27257778 caaccgattaaattatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataatttaagatagattgttat 27257679  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27257678 tctatttctagatttaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatttaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacta 27257579  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27257578 tatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 27257480  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||| ||| | |||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  27257479 atgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttaaatctcctccaaactaccttgttttgtgtttctct 27257385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 29224208 - 29223715
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29224208 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 29224109  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  29224108 caaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttat 29224009  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29224008 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 29223909  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29223908 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaa--ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 29223811  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29223810 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 29223715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 29337507 - 29337014
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29337507 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 29337408  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  29337407 caaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttat 29337308  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29337307 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 29337208  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29337207 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaa--ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 29337110  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29337109 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 29337014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 36039930 - 36040424
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36039930 tccaaatgatatcgttatttataagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacaatcaaaaagtcgataggatagtttaatcgacgatttcc 36040029  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36040030 caaccgattaaattacccaaaaacatcaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 36040129  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaat-aaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacc 450  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36040130 tctatttatagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaaaaaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacc 36040229  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36040230 atatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 36040328  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  36040329 gatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 36040424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 13230010 - 13230503
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13230010 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcc 13230109  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13230110 caaccgattaaatgaactaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 13230209  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13230210 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 13230309  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13230310 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcagaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgtaaagg 13230408  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13230409 atgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcataactaccttgctttgtgtttctct 13230503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 32523422 - 32522929
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  32523422 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgttgaaacatcgatttcccaaatatttaaacgatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttct 32523323  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  32523322 caaccgattaaatgacccaaaagcattaagttttagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtttagagtgataacttaagatggattgttat 32523223  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  32523222 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagtaagaataacaacactattgaataaatcgctataacca 32523123  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  32523122 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagggtagaaatagctacatatgtccatgatagctttgcaaagg 32523024  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    | |||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32523023 acgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaataaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 32522929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 152 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 43992008 - 43991533
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  43992008 tccaaatgatatcgttatttctaaggg-----------atcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattagatagttttatcgacgatttcc 43991920  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  43991919 caaccgattaaattacccaaaagcattacgtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctacagtgataacttaagatagattgttat 43991820  T
Q  352 tcta-tttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacc 450  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  43991819 tctattttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagcacc 43991720  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43991719 atatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 43991621  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttct 643  Q
    |||||||||      ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  43991620 gatgaagaa------aagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgccttgtgtttct 43991533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 152 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 41978088 - 41977710
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  41978088 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacattgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatcgacgatttct 41977989  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  41977988 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagataaattgttat 41977889  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |     
T  41977888 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctaaaatcg 41977789  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatg 530  Q
    |||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  41977788 tatattaaaatatcaaaagtttacataatggcttgtttgaataccttaaaacccacaatggtagatgtagctatatatg 41977710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 152 - 605
Target Start/End: Original strand, 9786772 - 9787227
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  9786772 tccaaatgatatcgttatttctaaggaattgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattgaatcgtttaatcgacgatttcc 9786871  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9786872 caaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 9786971  T
Q  352 tctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaac 449  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  9786972 tctatttcttagatccaaaagtatttgttaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataac 9787071  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  9787072 catatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaatggtagatatacttacatatgtctatgatagctttgcaaa 9787171  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatctt 605  Q
    |||||||||| | |||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  9787172 ggatgaagaaaatatgaagatttcatgcctagattcatgatatctcaacaaatctt 9787227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 159 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 14701130 - 14700645
Alignment:
Q  159 gatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcccaaccga 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  14701130 gatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgattttccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcccaaccta 14701031  T
Q  259 ttaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcattctattt 358  Q
    |||||  ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14701030 ttaaacgacctaaaaatattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctattt 14700931  T
Q  359 c-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaaccatatat 456  Q
    | ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14700930 cttagatccaaaagtatttctcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatacaagaacaacaacaatattgaataaataagctagaaccatatat 14700831  T
Q  457 taaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaa 556  Q
    |||| ||| || |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14700830 taaaagatcaaaagtttacataatagttagtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtaactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 14700731  T
Q  557 gaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgttt 641  Q
    ||| | |||||| |||  ||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14700730 gaaaatatgaagtttccttgcctagactcaagatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgctttgtgttt 14700645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 28457545 - 28458039
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||    
T  28457545 tccaaatgatatcgttatttctaagagattgtttaaatgtctatttcccaaacatttaaacaatcacaaagttgattggatcatttaatcgacgatttcc 28457644  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28457645 caaccgattaaatgacccaaaagcattaaattctagattaaatgtaattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 28457744  T
Q  352 tctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaac 449  Q
    |||||||| || |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  28457745 tctatttcttaaacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaca--caagaataacaacaatattaaataaataagctagaac 28457842  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
     |||||||||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28457843 tatatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagcattgcaaa 28457942  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28457943 ggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcttaacaaatcttgagttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 28458039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 152 - 460
Target Start/End: Original strand, 42700641 - 42700949
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42700641 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 42700740  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  42700741 caaccgattaaattaccaaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacttccatgtctagagtgataacttaatatagattgttat 42700840  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  42700841 tctatttctagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattaaacaaatagctagaacca 42700940  T
Q  452 tatattaaa 460  Q
    |||||||||    
T  42700941 tatattaaa 42700949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 24662796 - 24663293
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaac-atttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttc 250  Q
    ||||||| || |||| |||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||||  || |||||||||||||    
T  24662796 tccaaataatgtcgtgatttctaatggattatttaaaagtcgatttcccaaactatttaaataatcacaatgttgattggatcatttaatcgacgatttc 24662895  T
Q  251 ccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatcc-atgtctagagtgataacttaagatagattgt 348  Q
    |||||| ||||||  ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| |    
T  24662896 ccaacctattaaacgaccaaaaagcattaagttcttgattacaaagtgattatcaaagattaa-atcctatgtctagaatgaaaactta-gatagattat 24662993  T
Q  349 cattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaata-gctag 446  Q
     ||| || |  ||||| ||||||||| |||| ||| |||||  ||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  24662994 tattttaatcttagatccaaaagtatttgtcaataacatttcaaatcttaaataaagctttaaatgcaagaataataacaatattgaataaataagctag 24663093  T
Q  447 aaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgc 546  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||    
T  24663094 aaccatatattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaatacctcaaaactcacaagcgtagatgtagctacatatgtctatgcaagcttcgc 24663193  T
Q  547 ataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    | ||||||||  | |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |  ||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24663194 aaaggatgaaagaaagatgaagattcaatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttggtatgaaactactcctaacaaccttgctttgtgtttctct 24663293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31758771 - 31758491
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  31758771 tccaaatgatatcgttatttttaagggatcgtttaaatgtcgatttaccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgtttaatcaacgatttcc 31758672  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||| |||| ||    
T  31758671 caacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatttatgtctggaatgaaaacttaagatagcttgttat 31758572  T
Q  352 tctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacat 431  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||    
T  31758571 tctatttcttagatccaaaagcattggtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataaaatcaacat 31758491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 394
Target Start/End: Original strand, 36557230 - 36557473
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| || |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  36557230 tccaaatgatatcgttatttataagggatcgtttaaatgtcaattttccaaacatttacacaatcacaaagtcgattgcattgtataatcgacgatttcc 36557329  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    || ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36557330 cagccgtttgaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 36557429  T
Q  352 tctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaat 394  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  36557430 tctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcatattgaat 36557473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 430 - 645
Target Start/End: Original strand, 36557467 - 36557684
Alignment:
Q  430 attgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacata 528  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36557467 attgaataaataagttagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtacctacata 36557566  T
Q  529 tgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-ac 627  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  36557567 tgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattaaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaactac 36557666  T
Q  628 cttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||| |||||||||||    
T  36557667 cttgctatgtgtttctct 36557684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 222 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40200363 - 40200173
Alignment:
Q  222 gtcgattggatagttcaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgt 321  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40200363 gtcgattggatcgtttaatcgacgatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgt 40200264  T
Q  322 ctagagtgataacttaagatagattgtcattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaa 411  Q
    || || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40200263 ctggaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaa 40200173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 452 - 645
Target Start/End: Original strand, 42702175 - 42702368
Alignment:
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42702175 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttatttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 42702273  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    | |||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  42702274 aggaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 42702368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 645
Target Start/End: Original strand, 5784513 - 5784686
Alignment:
Q  472 ttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagatt 571  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||    
T  5784513 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaact-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt 5784611  T
Q  572 caatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    | ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  5784612 ccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaacttccttgctttgtgtttctct 5784686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22790826 - 22790704
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat- 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  22790826 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttttgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatcaatttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 22790727  T
Q  117 -taaaattttgaaaaatccctct 138  Q
     ||||||||||||||| ||||||    
T  22790726 ataaaattttgaaaaacccctct 22790704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 18621050 - 18621184
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaat-cttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat 116  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
T  18621050 gtaaacacatgaattcttaaattgtttaactatgtgtttgatttgtgattaatcatttaatcaagatccgtttcaatgagatttattccgcaaagaggat 18621149  T
Q  117 taaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  18621150 taaaattttgaaaaacccttcttaaaatcccttca 18621184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Original strand, 8679463 - 8679527
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8679463 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatc 8679527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 41664996 - 41665115
Alignment:
Q  32 cttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttgaaaaa 131  Q
    |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||| || ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  41664996 cttaaattgtttaagtatgtgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccattttaatgatatttgttacgctaagaggattaaaattttaaaaaa 41665095  T
Q  132 tccctcttgaaatcccttca 151  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  41665096 gccctctttaaatcccttca 41665115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 492798 - 492724
Alignment:
Q  586 atgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgttt--ctctagaaatgccatct 658  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  492798 atgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgatttgtgtttctctctagaaatgccatct 492724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 580 - 645
Target Start/End: Original strand, 8687769 - 8687835
Alignment:
Q  580 agatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8687769 agatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 8687835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 139
Target Start/End: Original strand, 27353600 - 27353686
Alignment:
Q  58 tttgtgattaatgatttaatcaagatc-----cgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttgaaaaatccctctt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |||||| |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27353600 tttgtgattaatgatttaatcaagatctgtttcgtttcaatggaatttgttccgctaagagaattaaaattttgaaaaacccctctt 27353686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 11651948 - 11651893
Alignment:
Q  436 taaatagctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttga 491  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  11651948 taaatagctagaatcatatattagatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 11651893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 84
Target Start/End: Original strand, 12299005 - 12299072
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatc-ttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatc 84  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12299005 gtaaacacatgaatgattaaagtgtttaagtatgtattatatttatgattaatgatataatcaagatc 12299072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 44856211 - 44856150
Alignment:
Q  21 aacacatgaatcttaaa--gtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaa 80  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  44856211 aacacatgaatctttaactgtgtttaggtttccatttgaattgtgattaatggtttaatcaa 44856150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 116236 - 116729
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  116236 tccaaatgatatcgttatttttaagggattgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 116335  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  116336 caaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 116435  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  116436 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaattaatagctagaacca 116535  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  116536 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 116634  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  116635 atgaagaaaagatgaggattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 116729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 302
Target Start/End: Original strand, 169076 - 169226
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  169076 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcaaaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 169175  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  169176 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatttaaagtgattat 169226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 151 - 645
Target Start/End: Original strand, 19247495 - 19247989
Alignment:
Q  151 atccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19247495 atccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagttgattggatagtttaatcgacgatttc 19247594  T
Q  251 ccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtca 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19247595 ccaaccgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtta 19247694  T
Q  351 ttctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19247695 ttctatttctagattcaaaagtatgtgtctatatcattttgaagctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacc 19247794  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19247795 atatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 19247893  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||| || | |||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  19247894 gatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatattggtttgaatctactcccaactaccttgctttgtgtttctct 19247989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 4838804 - 4839298
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  4838804 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 4838903  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4838904 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 4839003  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4839004 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 4839103  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4839104 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 4839202  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4839203 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 4839298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 26070221 - 26069725
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26070221 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgttaaaacatcgatttctcaaacatttaaacgaccacaaagtcgattagatagtttaatcgacgatttcc 26070122  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26070121 caatcgattaaattacccaaaagcattaagttctagactaaaagtgattatcaaatattaacatacatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 26070022  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26070021 tctatttctagattcaaaagtctgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 26069922  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtag--atgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26069921 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaa 26069822  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  26069821 ggatgaagaagagttgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacttctaactaccttgctttgtgtttctct 26069725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 21677335 - 21677829
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21677335 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 21677434  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21677435 caaccgattaaattacctaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 21677534  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21677535 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaatcaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 21677634  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21677635 atatattaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 21677733  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| || || |||| || |||||||||||||||||    
T  21677734 gatgaagaaaagatgaagattttatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctattcctaactactttgctttgtgtttctct 21677829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 42532554 - 42533049
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42532554 tccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 42532653  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42532654 caaccaattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 42532753  T
Q  352 tctatttctagattc-aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaa-c 449  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  42532754 tctagttctagattcaaaaagtatgtgtccatatcattttgaatcttaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacc 42532853  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  42532854 catatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaa 42532952  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaa-caccttgctttgtgtttctct 645  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42532953 tgatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgacgtctcaacaaatctaggcttgaatctactcctaaccaccttgctttgtgtttctct 42533049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 1188458 - 1187965
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1188458 tccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatagtttattcgacgatttcc 1188359  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  1188358 caaccgattaaatcacccaaaagcatcaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgctat 1188259  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||    
T  1188258 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaataataacaacaatattaaataaataactagaatca 1188159  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  1188158 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgcctatgatagctttgcaaagg 1188060  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1188059 atgaagaaaagatgaagatttcatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttgacttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 1187965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 22048175 - 22047681
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  22048175 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 22048076  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22048075 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 22047976  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22047975 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattctgaatctcaataaaacaataaaaacaaaaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 22047876  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22047875 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 22047777  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22047776 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccataatgtctcaacaaatcttggcttgaatcttctcctaactaccttgctttgtgtttctct 22047681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 40995215 - 40995711
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  40995215 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttctcaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggttcatttaatcgacgatttcc 40995314  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40995315 caaccgattaaatgactcaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 40995414  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40995415 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 40995514  T
Q  452 ta---tattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcat 548  Q
    ||   ||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  40995515 tatattattaaatgatcaaaagattacataatagcttttttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaa 40995613  T
Q  549 aggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  40995614 aggatgaagaagagatgaagattcaatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgatttgtgtttctct 40995711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 52618996 - 52618514
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  52618996 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaattgacgatttcc 52618897  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52618896 cgatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 52618797  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52618796 tctatttctagattcaaaagtttgtgtccatatcattttgaatctcaataaatcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 52618697  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  52618696 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaatagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag- 52618599  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
              ||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  52618598 ----------gatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 52618514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 323932 - 323438
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  323932 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacattgatttcccaaacatttaaacgatcacaacgttgattgggtagtttaatcgacgatttcc 323833  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  323832 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagcgtgataacttaagatagattgttat 323733  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  323732 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccgtatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 323633  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  323632 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacatcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtttatgatagctttgcaaag 323534  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  323533 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactatcttgctttgtgtttctct 323438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 643
Target Start/End: Original strand, 46691705 - 46692196
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||    
T  46691705 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagttgattggatcgtttaatcgatgatttcc 46691804  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  46691805 caaccgattaattgacctaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatcaatgtttagagggataacttaagatagattgttat 46691904  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46691905 tctatttctagatttaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 46692004  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    |||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46692005 tatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagg 46692103  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttct 643  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  46692104 atgaggaagaaatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttct 46692196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 5273230 - 5273713
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  5273230 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 5273329  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5273330 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 5273429  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  5273430 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaattttgaataaataagctagaacc 5273529  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5273530 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 5273628  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||           || ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5273629 gatgaagaa-----------tccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 5273713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 55327266 - 55326774
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  55327266 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaaccgacgatttcc 55327167  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  55327166 c----gattaaattacccaaaaacattaagctctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttat 55327071  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  55327070 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaacaattttgaataaataagctagaacc 55326971  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||||||| || || || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |    
T  55326970 atatattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgcttgaatacctcaaaa-ccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttggaatg 55326872  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaata--tactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  55326871 gatgaagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatatctactcctaactatcttgctatgtgtttctct 55326774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 30218055 - 30218553
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||    
T  30218055 tccaaatgatatcgttatttctaatggatcgtctaaatgtcgatttcccaaacatttaaactatcacaaagtcgattggatcttt-aatcgatgatttcc 30218153  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30218154 caacctattaaacgacccaaaagcattaagttttagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 30218253  T
Q  352 tctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaata----gctag 446  Q
    ||||||||| |||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    |||||    
T  30218254 tctatttcttagaacaaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatacaagaatagcaacaatattgaataaataataagctag 30218353  T
Q  447 aaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgc 546  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30218354 aaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgc 30218453  T
Q  547 ataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
      ||||||||||| |||||||||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30218454 taaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgacgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgctttgtgtttctct 30218553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 26373299 - 26373791
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  26373299 tccaaattatattgttatttctaagggattgtttaaacattgatttcccaaacgtttaaacgatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttct 26373398  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  26373399 caaccgattaaatgacccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaaggtagattgttat 26373498  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26373499 tctatttatagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaaca-taaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 26373597  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |  ||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  26373598 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacatgaggtgatatagctatatatgtctatgatagctttgcaaagg 26373696  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    || ||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26373697 ataaagaagaaatgaagattcaatgataagatccatgatatctcaacaaatattggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 26373791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 35416364 - 35416845
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  35416364 tccaaatgatatcgttatttctaagaggtcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcataaagtcgattggatagtttaattgacgatttct 35416463  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35416464 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 35416563  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  35416564 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatctttttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaatatcaataatattgaataaattgctagaacca 35416663  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||         
T  35416664 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttg-ttgaatacatcaaaa-ccacaagagtagatgtaactacatatgtctatgatagttgtgc----- 35416756  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
          || |||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| | ||| ||||||||||||||    
T  35416757 ------aaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactatctttctttgtgtttctct 35416845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 152 - 662
Target Start/End: Original strand, 33110370 - 33110884
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33110370 tccaaatgttgtcgtgatttctaagggattgttcaaatgtcgatctcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 33110469  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||    
T  33110470 caaccgattaaattacccctgaacattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgataacttaagatagactcttat 33110569  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
      | || |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33110570 gtttttcctagattcaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctttaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 33110669  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  33110670 atatattaaaagatcaaaagtttacataatggcttgtgtgaatacctcaaaacccacaagggtatatataactacatatgtctacgatagctttgcaaag 33110769  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtt--tctctag 647  Q
    |||||| || ||||||||||   ||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||    
T  33110770 gatgaaaaaaagatgaagatgtcatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgccttgtgtttctctctag 33110869  T
Q  648 aaatgccatctctct 662  Q
    ||||| |||||||||    
T  33110870 aaatgtcatctctct 33110884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 152 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 53895872 - 53895400
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||   ||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  53895872 tccaaatgatgtcgtgatttctaatggactatttaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcacaaagtcgattggatcgtttaatagacgatttcc 53895773  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||| ||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  53895772 caacctattaaacgacccaaaaacattaaggtctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaacttaagatagattgttat 53895673  T
Q  352 tctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaata-gctagaac 449  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  53895672 tctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaac 53895573  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  53895572 catatattaaa--at-aagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccagaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaa 53895476  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac 625  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  53895475 ggatgaagaagagatgaagactccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctacttttaac 53895400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 20949240 - 20948745
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaac-atttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||| |||||     
T  20949240 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccaaactatttaaacgaccacaaagtcgattggatcatttaatcgatgatttt 20949141  T
Q  251 ccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtca 350  Q
    |||| | ||||| | | |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||| |||||| |||||||||| |    
T  20949140 ccaatctattaattgatccaaaaacattaaattctagattaaaagtgattatcaaagattaacatctatgtctggaatgaaaactta-gatagattgtta 20949042  T
Q  351 ttctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaata-gctagaac 449  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20949041 ttctattcctagatccaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctataaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaac 20948942  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||  || |    
T  20948941 catatattaaaatatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggatagatgtagctacatatatttatgatagcttgacaaa 20948842  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20948841 ggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcgacaaatcttgggttgaatctacttttaactaccttgctttgtgtttctct 20948745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Original strand, 9417101 - 9417381
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  9417101 tccaaatgatatcgttatttctaggggatcgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcatttaatcgacgatttcc 9417200  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||| ||||||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||    
T  9417201 caacctattaaacaaaccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattgtaaaatattaacatctatgtctagaatgaaaacttacgatagattgttat 9417300  T
Q  352 tctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacat 431  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||    
T  9417301 tctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataaaatcaacat 9417381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 282
Target Start/End: Original strand, 21668574 - 21668703
Alignment:
Q  153 ccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttccc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21668574 ccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttccc 21668673  T
Q  253 aaccgattaaattacccaaaagcattaagt 282  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21668674 aaccgattaaattacctaaaagcattaagt 21668703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 55613922 - 55614055
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55613922 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttttatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgtaaagaggatt 55614021  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  55614022 taaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 55614055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 18263426 - 18263560
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18263426 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 18263525  T
Q  118 aaaattttg-aaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  18263526 aaaattttgaaaaaacccctcttaaaatcccttca 18263560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20579405 - 20579275
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20579405 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 20579306  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatccct 148  Q
    ||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20579305 aaatttttgaaaaacccctcttaaaatccct 20579275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 869835 - 869968
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||    
T  869835 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaataggatttcttccgcaaagagaatt 869934  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  869935 aaatttttgaaaaatccctcttaaaatcccttca 869968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10620301 - 10620168
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10620301 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatctgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 10620202  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10620201 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 10620168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 149
Target Start/End: Original strand, 18270287 - 18270419
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18270287 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 18270386  T
Q  118 aaaattttg-aaaaatccctcttgaaatccctt 149  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  18270387 aaaattttgaaaaaacccctcttaaaatccctt 18270419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28392135 - 28392002
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28392135 gtaaacatatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgagatttcttccgcaaagaggatt 28392036  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28392035 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 28392002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 8859406 - 8859540
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  8859406 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttctttcggaaagaggatt 8859505  T
Q  118 aaaattttgaaaaa-tccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  8859506 aaaattttgaaaaaccccctcttaaaatcccttca 8859540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 5715187 - 5715319
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5715187 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgagatttcttccgcaaagaggatt 5715286  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  5715287 aaaattttg-aaaacccctcttaaaatcccttca 5715319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19919499 - 19919381
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  19919499 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcattgggatttcttccgcaaagaggatt 19919400  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccct 136  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  19919399 aaatttttgaaaaatccct 19919381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 26964785 - 26964916
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  26964785 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatcggtttcaatgggatttcttccg--cagaggatt 26964882  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26964883 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 26964916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 26971679 - 26971810
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  26971679 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatcggtttcaatgggatttcttccg--cagaggatt 26971776  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26971777 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 26971810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10825320 - 10825189
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10825320 gtaaacacatgaat--taaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatctgtttcaatgggatttattccgcaaagaggatt 10825223  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10825222 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 10825189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19925728 - 19925610
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||    
T  19925728 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgttttattgggatttcttccgcaaagaggatt 19925629  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccct 136  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  19925628 aaatttttgaaaaatccct 19925610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 5708551 - 5708685
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaa--agagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||    
T  5708551 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccacaaagagagga 5708650  T
Q  116 ttaaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  5708651 ttaaaattttg-aaaacccctcttaaaatcccttca 5708685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 444 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 6640178 - 6639977
Alignment:
Q  444 tagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctt 543  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6640178 tagaaccttatattaaatgatcaa-agattccataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgaaagctt 6640080  T
Q  544 tgcataggat-gaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaaca-ccttgctttgtgttt 641  Q
    || | | ||| |||||| |||||||||||  ||||  ||||  | ||||||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6640079 tggaaaagatagaagaa-agatgaagattacatgctaagattcaagatgtctcaacaaattttgggaagaatctactcctaacacccttgctttgtgttt 6639981  T
Q  642 ctct 645  Q
    ||||    
T  6639980 ctct 6639977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 47387922 - 47387788
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaat-cttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat 116  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||| | | | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  47387922 gtaaacacatgaattcttaaattgcttaaatatgtgttagatgtgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgagatttcttccgcaaagaggat 47387823  T
Q  117 taaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47387822 taaaattttgaaaaacccctcttgaaatcccttca 47387788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 35224766 - 35224903
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttc-----tatgggatttcttccgtaaaga 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||||| ||||||  |||    
T  35224766 gtaaacacatgaat-ttaaagtgtttaagtttgtgtttgatttgtgattgatgatttaatcaagatccgtttcattttaatgggatttattccgttgaga 35224864  T
Q  113 ggattaaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35224865 ggattaaaattttgaaaaccccctcttgaaatcccttca 35224903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5667162 - 5667043
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatc-ttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat 116  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||| ||    
T  5667162 gtaaacacatgaatccttaaattgtttaagtatgtgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaataagatttcttccgcagagagcat 5667063  T
Q  117 taaaattttgaaaaatccct 136  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5667062 taaaattttgaaaaatccct 5667043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 490 - 645
Target Start/End: Original strand, 44432060 - 44432215
Alignment:
Q  490 gaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatga 589  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| ||||    
T  44432060 gaatacctcaaaact-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaagggtgaagattccatggcaagatccatga 44432158  T
Q  590 tgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| ||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  44432159 tgtctcaagaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgagtttctct 44432215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10676557 - 10676422
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaaga-tccg-tttctatgggatttcttccgtaaagagga 115  Q
    ||||||||||||||    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  10676557 gtaaacacatgaattcgtaagtgtttaagtttgtgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagattccgttttcaatgggatttgttccgctaagagga 10676458  T
Q  116 ttaaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10676457 ttaaaaatttgaaaaaaccctctttaaatcccttca 10676422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10890197 - 10890062
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaaga-tccg-tttctatgggatttcttccgtaaagagga 115  Q
    ||||||||||||||    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  10890197 gtaaacacatgaattcgtaagtgtttaagtttgtgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagattccgttttcaatgggatttgttccgctaagagga 10890098  T
Q  116 ttaaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10890097 ttaaaaatttgaaaaaaccctctttaaatcccttca 10890062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42271870 - 42271781
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatc 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42271870 tccaaatgatatcattatttctaaaaggccgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatc 42271781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 4425590 - 4425468
Alignment:
Q  29 aatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatta-aaattttga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||   ||||||||| ||| |||||    
T  4425590 aatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatctgtttcaatgagatttgttccgcttagaggattataaaatttga 4425491  T
Q  128 aaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||| | ||||| |||||||||||    
T  4425490 aaaacctctctt-aaatcccttca 4425468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 148
Target Start/End: Original strand, 49066009 - 49066103
Alignment:
Q  54 ttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaa-ttttgaaaaatccctcttgaaatccct 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||    
T  49066009 ttgatttgtgattaatgatttaatcaagattcgttt-gacgagatttcttccattaagagtattaaaatttttgaagaacccctgttgaaatccct 49066103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 10627372 - 10627327
Alignment:
Q  35 aaagtgtttaagttt-ctatttgatttgtgattaatgatttaatca 79  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10627372 aaagtgtttaagttttctgtttgatttgtgattaatgatttaatca 10627327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33239411 - 33239375
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33239411 tccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaa 33239375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10627313 - 10627274
Alignment:
Q  112 aggattaaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10627313 aggattaaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 10627274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 47
Target Start/End: Original strand, 27031787 - 27031816
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagt 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031787 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagt 27031816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 662
Target Start/End: Original strand, 1232159 - 1232676
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1232159 tccaaaggatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgaatagtttaatcgacgatttcc 1232258  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1232259 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctatagtgataacttaagatatattgttat 1232358  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1232359 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgaaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 1232458  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  1232459 tatattaaatgatcaagaaattacataatggtttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctataatagctttgcaaagg 1232558  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacacc-----ttgctttgtgtt--tctc 644  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||     |||| ||||| |||||||     ||||||||||||  ||||    
T  1232559 atgaagaagagataaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctactcctaacaccttattttgctttgtgtttctctc 1232658  T
Q  645 tagaaatgccatctctct 662  Q
    |||||||| |||||||||    
T  1232659 tagaaatgtcatctctct 1232676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 22098160 - 22097667
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22098160 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 22098061  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22098060 caaccgattaaattaaccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 22097961  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22097960 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagtaagaataacaacaatattgaataaatggctagaacca 22097861  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22097860 tatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 22097762  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  22097761 atgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttactttgtgtttctct 22097667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 154 - 645
Target Start/End: Original strand, 48167864 - 48168355
Alignment:
Q  154 caaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttccca 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48167864 caaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgctcacaaattcgattggatagtttaatcgacgatttccca 48167963  T
Q  254 accgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48167964 accgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattc 48168063  T
Q  354 tatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaaccata 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  48168064 tatttctagattcaaaagtatgtgtccatgtcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctaaaacaata 48168163  T
Q  454 tattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggat 553  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48168164 tattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcataggat 48168262  T
Q  554 gaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||   ||||| |||||| |||   |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  48168263 gaagtgaagatgcagattccatgataagatccctgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgcttcgtgtttctct 48168355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 9989889 - 9989396
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9989889 tccaaatgatattgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 9989790  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9989789 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 9989690  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9989689 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaacca 9989590  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9989589 tatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 9989491  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
     |||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9989490 ttgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 9989396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 10385738 - 10386232
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10385738 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 10385837  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10385838 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 10385937  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10385938 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatacaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 10386037  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10386038 atatattaaaagatcaaaggattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 10386136  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10386137 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggctcgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 10386232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 45528141 - 45527647
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45528141 tccaaatgttgtcgttatttctaagggatcgtttacacatcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 45528042  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  45528041 caaccgattaaattacccaaaaacatcaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagatttttat 45527942  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacatt-aaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacc 450  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45527941 tttatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacc 45527842  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  45527841 atgtattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctagatatgtctatgatagctttgcaaag 45527743  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  45527742 gatgatgaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 45527647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 7652890 - 7653384
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  7652890 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcc 7652989  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7652990 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 7653089  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7653090 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 7653189  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  7653190 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctaagatagctttgcaaag 7653288  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  7653289 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 7653384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 20837587 - 20837094
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  20837587 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacgtcgatttcccaaacattcaaacgatcacgaagtcgattggataatttaatcgatgatttcc 20837488  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20837487 caaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaatatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 20837388  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20837387 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaataatattgaataaatagctagaacca 20837288  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20837287 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagaatggatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 20837189  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||||    
T  20837188 atgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgccttgtatttctct 20837094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 27850219 - 27850711
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  27850219 tccaaatgatatcattatttctaagggatcgtttaaacatcggtttcccaaacatttaaacgatcacaaagttgattggatagtttaatcgacgatttct 27850318  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27850319 caaccgattaaattagccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttacgatagattgttat 27850418  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27850419 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 27850518  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27850519 tatattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttaaatacctcaaaa-ccacaagattggatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 27850617  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  27850618 atgaagaaatgatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc-ttgtgtttctct 27850711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 36469104 - 36469596
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || || |||||||||||    
T  36469104 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttagatattttaaccgacgatttcc 36469203  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36469204 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 36469303  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36469304 tctatgtctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaacaataaaatgcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaacca 36469403  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    | ||||||| |||  | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36469404 tgtattaaaagatctaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagttgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 36469502  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  36469503 atgaagaaaagatgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc-ttgtgtttctct 36469596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 37471355 - 37471848
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  37471355 tccaaatgatatcgttatttttaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggataatttaatcgacgatttct 37471454  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37471455 caactgattaaattatccaaaagaattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 37471554  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37471555 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 37471654  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37471655 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacatcaaaa-ccacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 37471753  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||  |||||||||||| || | |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  37471754 atgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgtcgtctcaacaaattttggcttgaatctactcctaactactttgctttgtgtttctct 37471848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 153 - 619
Target Start/End: Original strand, 4742672 - 4743135
Alignment:
Q  153 ccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttccc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  4742672 ccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacaatttcca 4742771  T
Q  253 aaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcatt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4742772 aaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattattaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttatt 4742871  T
Q  353 ctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaaccat 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4742872 ctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaat-aaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccat 4742970  T
Q  453 atattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagga 552  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4742971 atatt-aatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaacga 4743068  T
Q  553 tgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatact 619  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  4743069 tgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatctctcaacaaatcttggcttgaatctact 4743135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 3588894 - 3588400
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3588894 tccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcc 3588795  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3588794 caaccgactaaatgacccaaaagcattaagtcctagattataagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 3588695  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3588694 tctatctctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaataataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 3588595  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3588594 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 3588496  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3588495 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 3588400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 52307753 - 52308247
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||    
T  52307753 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcacaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcaacgatttcc 52307852  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  52307853 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattattat 52307952  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52307953 tctatttatagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 52308052  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    || ||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  52308053 atgtattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctaagatagctttgcaaag 52308151  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||||| || | | |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  52308152 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctaaacaaatattggctagaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 52308247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 152 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 23194413 - 23193905
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||   || |||  | ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  23194413 tccaaatgatgtcgtgatttctaatggactattcaaaagttgatttcccaaactattaaacaattgcaaagtcgatcggatcgtttaatcgacgatttcc 23194314  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23194313 taaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgtttatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 23194214  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23194213 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaata---acaatattgaataaatagatagaacca 23194117  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  23194116 tatattaaatgatcaaaagattacgtaatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctctgatag-tttgcaaagg 23194018  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtt--tctctaga 648  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |    
T  23194017 atgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgccttgtgtttctctctaaa 23193918  T
Q  649 aatgccatctctc 661  Q
    |||||||||||||    
T  23193917 aatgccatctctc 23193905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 33248483 - 33247988
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33248483 tccaaatgatatcgttatttctaagagattgtttaaatgtcgatttctcatacatttaaacaatcacaaagttgattggatcgtttaatcgacgatttcc 33248384  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33248383 caaccgattaaatgacccaaaagcattaagttcgagataaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 33248284  T
Q  352 tctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaa-tagctagaac 449  Q
    |||| ||| ||||  ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  33248283 tctagttcttagacccaaaaatattggtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacataag-ataacaacaatattgaataaattagctagaat 33248185  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
    |||||||||||  ||  | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  33248184 catatattaaaatatcgaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgcagctacatatgtctatgatagctttgcaaa 33248085  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33248084 ggatgaaaaagagatgaagattcaatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 33247988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 152 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 37023184 - 37022870
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  37023184 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgtttttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttttatcgacgatttcc 37023085  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtccta--gattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtc 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37023084 caaccgattaaattacccaaaagcattaaatcatatagattaaaagtgattatcaaatatcaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtt 37022985  T
Q  350 attctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaac 449  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37022984 attctatttctagattcaaaaatatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaac 37022885  T
Q  450 catatattaaatgat 464  Q
    |||||||||||||||    
T  37022884 catatattaaatgat 37022870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 49434591 - 49434097
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  49434591 tccaaatgatatcgttatttttaagggattgtttaaatgtcgatttctcaaacatttaaataatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcc 49434492  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||    
T  49434491 caaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgtaaacttaagatagattgttat 49434392  T
Q  352 tctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaac 449  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||    
T  49434391 tctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttaaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattaaataaataagttagaac 49434292  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||  ||||| ||| |    
T  49434291 tatatattaaaagatgaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacgcacaa-gataaatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaa 49434193  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||  | |||| ||||||  || |||| |   || || |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49434192 ggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcataatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctct 49434097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 191 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 2357615 - 2357141
Alignment:
Q  191 tcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatt 290  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| | ||||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  2357615 tcgatttcccaaactattaaacaatcacaaagtcgattggttcatttaatcgatgatttcccaatcaattaattgatccaaaagcattaagttctagatt 2357516  T
Q  291 aaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2357515 aaaagtgattatcaaatattaacatc--tgtctagagtgataacttaatatagattattattctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcattt 2357418  T
Q  390 tgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtt 488  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  2357417 tgaatctcaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattagaagatcaagagtttacatcatggtttgtt 2357318  T
Q  489 tgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatg 588  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||  | |||||||||||  |||||||||   |||    
T  2357317 tgaatacctcaaaacccacaatgttagatgtagctacatatgtctatacaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctagactcatg 2357218  T
Q  589 atgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctc--tagaaatgccatctctcta 663  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  2357217 atgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacatcttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctctcta 2357141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 192 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 26335562 - 26335121
Alignment:
Q  192 cgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatta 291  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  26335562 cgattccccaaacatttaaactatcacaaagtcgattggatcatttaattgacgatttccaaacctattaaacgacccataagcattaaattctagatta 26335463  T
Q  292 aaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcattcta-tttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  26335462 aaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagttataacttaagatagattgttattctattttttagatccaaaagtatttgtcaatatcgtttt 26335363  T
Q  391 gaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgttt 489  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  26335362 gaatctcaataaagcaataaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctaaaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgttt 26335263  T
Q  490 gaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatga 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||  |||||||||   ||||    
T  26335262 gaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagatttcatgcctagactcatga 26335174  T
Q  590 tgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgttt 641  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26335173 tgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgctttgtgttt 26335121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 152 - 428
Target Start/End: Original strand, 20962924 - 20963200
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20962924 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttcaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgatgatttcc 20963023  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  20963024 caaccgattaaattacccaaaagcattgagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataccttaagatatattgttat 20963123  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaa 428  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  20963124 tctatttctagattcaaaagtatatgttcatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaataataacaacaa 20963200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 333 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 8615816 - 8615503
Alignment:
Q  333 acttaagatagattgtcattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacatt 432  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  8615816 acttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 8615717  T
Q  433 gaataaat-agctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgt 531  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8615716 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgt 8615618  T
Q  532 ctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-acctt 630  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||    
T  8615617 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 8615518  T
Q  631 gctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||||||||    
T  8615517 gctttgtgtttctct 8615503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 152 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23411971 - 23411748
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23411971 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 23411872  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23411871 caaccgaataaattacccaaaagaattaagttctagattaaaagtgattatcaaa-----------atgtctagagtgataacttaagatagatcgttat 23411783  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23411782 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatca 23411748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 152 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8626117 - 8625931
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8626117 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 8626018  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8626017 caatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataaattaa 8625931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Original strand, 18534851 - 18534986
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18534851 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgagatttcttctgtaaagaggatt 18534950  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttcatc 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18534951 aaaattttgaaaaatccctcttaaaatcccttcatc 18534986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Original strand, 13258759 - 13258893
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13258759 gtaaacacatgaatcttaaaatgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgtaaagaggatt 13258858  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttcat 152  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13258859 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttcat 13258893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 8491598 - 8491731
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8491598 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 8491697  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8491698 aaatttttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 8491731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 13212514 - 13212647
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13212514 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgtaaagaggatt 13212613  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  13212614 aaaattttgaaaaactcctcttaaaatcccttca 13212647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15599877 - 15599744
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15599877 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 15599778  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15599777 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 15599744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15606422 - 15606289
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15606422 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 15606323  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15606322 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 15606289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16481451 - 16481318
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16481451 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttttatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgtaaagaggatt 16481352  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16481351 taaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 16481318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10578325 - 10578193
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10578325 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 10578226  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttc 150  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10578225 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttc 10578193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 18538210 - 18538344
Alignment:
Q  19 taaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatta 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18538210 taaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttaatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgagatttcttctgtaaagaggatta 18538309  T
Q  119 aaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttcatc 153  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18538310 aaattttgaaaaatctctcttaaaatcccttcatc 18538344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 13691896 - 13692029
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13691896 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtatgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 13691995  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13691996 aaaattttgaaaaacccctcttcaaatcccttca 13692029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 6111314 - 6111446
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6111314 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaacatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 6111413  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6111414 aaaattttgaaaaa-ccctcttaaaatcccttca 6111446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10571559 - 10571427
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaa-gtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10571559 gtaaacacatgaatcttaaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggat 10571460  T
Q  117 taaaattttgaaaaatccctcttgaaatccctt 149  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10571459 taaaattttgaaaaacccctcttaaaatccctt 10571427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 13518023 - 13518156
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  13518023 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgattgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttctgcaaagaggaat 13518122  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13518123 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 13518156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 17780156 - 17780023
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17780156 gtaaacacatgaatctttaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttc-atgggatttcttccgcaaagaggatt 17780058  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttcatc 153  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  17780057 aaaattttg-aaaacccctcttaaaatcccttcatc 17780023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19081457 - 19081324
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19081457 gtaaacacatgaatctttaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttc-atgggatttcttccgcaaagaggatt 19081359  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttcatc 153  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  19081358 aaaattttg-aaaacccctcttaaaatcccttcatc 19081324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22098474 - 22098375
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22098474 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 22098375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 420 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 23385622 - 23385396
Alignment:
Q  420 taacaacaacattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatg 518  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||    
T  23385622 taacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacctaaaaact-acaagaatagatg 23385524  T
Q  519 tacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatac 618  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  23385523 tagctaaatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgtagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctac 23385424  T
Q  619 tcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||    
T  23385423 tcctaactaccttgctttttgtttctct 23385396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 472 - 645
Target Start/End: Original strand, 27030672 - 27030845
Alignment:
Q  472 ttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagatt 571  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||    
T  27030672 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaact-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt 27030770  T
Q  572 caatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    | ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27030771 ccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 27030845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 32055408 - 32055273
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat- 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||     
T  32055408 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttcaatttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatggaatttcttccgcaaagaggatt 32055309  T
Q  117 -taaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttcat 152  Q
     ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  32055308 ataaaattttgaaaaacctctctt-aaatcccttcat 32055273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 152
Target Start/End: Original strand, 12564395 - 12564494
Alignment:
Q  53 tttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttcat 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12564395 tttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttcat 12564494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1646489 - 1646358
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat- 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||     
T  1646489 gtaaacacattaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttgttccgctaagaggatt 1646390  T
Q  117 -taaaattttgaaaaatccctcttgaaatccct 148  Q
     ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  1646389 ataaaattttgaaaaacctctctt-aaatccct 1646358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15341212 - 15341077
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat- 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||     
T  15341212 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgattgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttgttccgcttagaggatt 15341113  T
Q  117 -taaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
     |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||    
T  15341112 ataaaatttggaaaaacctctcttaaaatcccttca 15341077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15356579 - 15356444
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat- 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||   |||||||     
T  15356579 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgattgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgagatttgttccgcttagaggatt 15356480  T
Q  117 -taaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
     |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||    
T  15356479 ataaaatttggaaaaacctctcttaaaatcccttca 15356444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23014336 - 23014221
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat- 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || |||||  ||||||||     
T  23014336 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatatgtttcaatgggaattgttccgctaagaggatt 23014237  T
Q  117 -taaaattttgaaaaa 131  Q
     |||||||||||||||    
T  23014236 ataaaattttgaaaaa 23014221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27104485 - 27104326
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaac-atttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttc 250  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  27104485 tccaaatcatatcgttatttcgaagggatcatttaaatgtcgatttcccaaactatttaaacgatcacaaagtcgattggatcatttaatcgacgatttc 27104386  T
Q  251 ccaaccga----ttaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaa 306  Q
     ||| | |    |||| | | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27104385 tcaatctatatgttaattgatccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaa 27104326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Original strand, 16201433 - 16201567
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||  |||||||||    
T  16201433 gtaaacacattactcttaaaatgtttaagtttttgtttgatttgtgagtaatgatttaatcaagattcgttttcatgggatttctttcgctaagaggatt 16201532  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttcat 152  Q
    |||||||||||||| |  |||| || |||||||||    
T  16201533 aaaattttgaaaaacctttcttaaattcccttcat 16201567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 542 - 645
Target Start/End: Original strand, 20963711 - 20963815
Alignment:
Q  542 tttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtt 640  Q
    |||||| | ||||||||  |||||||||||| | | | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  20963711 tttgcaaatgatgaagagaagatgaagattccacgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtt 20963810  T
Q  641 tctct 645  Q
    |||||    
T  20963811 tctct 20963815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 17196749 - 17196702
Alignment:
Q  38 gtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatcc 85  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17196749 gtgtttaagtttttgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatcc 17196702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 6288272 - 6288184
Alignment:
Q  57 atttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttgaaaaatccctcttgaaatcc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  6288272 atttgtgattaatgatttaatcaagatccg-ttcatcgagatttattctactaagaggattaaaattttgaaaaaccccttttaaaatcc 6288184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 464
Target Start/End: Original strand, 17405038 - 17405101
Alignment:
Q  402 aaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgat 464  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  17405038 aaacattaaacacaagaataataacaatattgaataaaagatctagaaccatatattaaatgat 17405101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 47699605 - 47699511
Alignment:
Q  53 tttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttgaaaa-atccctcttgaaatccc 147  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||| ||||   |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  47699605 tttgatttatgattaatgacttaatcaagacccgtctat-tggaatttattcctctaagaggattaaaatttggaaaatacccctcttgaaatccc 47699511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 152
Target Start/End: Original strand, 25801443 - 25801509
Alignment:
Q  87 tttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttg-aaaaatccctcttgaaatcccttcat 152  Q
    |||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25801443 tttcaatgggatttgttccactaagaggattaaaattttgaaaaaacccctctttaaatcccttcat 25801509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 9236 - 8742
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9236 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttagacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 9137  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9136 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 9037  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9036 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 8937  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8936 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 8838  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  8837 gatgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgccttgtgtttctct 8742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 76120 - 76613
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  76120 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacaacgatttcccaatgatttaaacgatcacaaagtcgattgaatagtttaatcgacgatttcc 76219  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  76220 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcgtagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 76319  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  76320 tttatttctagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 76419  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    || |||||||||| || || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  76420 tacattaaatgatcaaaagattacataataacttgtttgaatacctcaaaa-tcacaagagtagatgtatctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 76518  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  76519 atgaagaattgttgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 76613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 28567 - 29061
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |    
T  28567 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgattttc 28666  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28667 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 28766  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28767 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 28866  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28867 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 28965  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28966 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 29061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 25318 - 25812
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25318 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacgaagtcgattggataatttaatcgacgatttcc 25417  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25418 aaaccgattaatttacccaaaagcattaagtactagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 25517  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25518 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 25617  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  25618 atatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatatctatgatagctttgcaaag 25716  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25717 gatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 25812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 652 - 1145
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  652 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccaaacattaaaacaatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcc 751  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  752 caaccgattaaatgacccaaaatcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 851  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||    
T  852 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataagcta-cacc 950  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatag 550  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  951 atatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaaaggtagatgtagctacatatgtctgtgataactttgcaaag 1050  T
Q  551 gatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctct 645  Q
    || |||||||| ||||| |||| |||||||||   |||||||||||||||||||| | | |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1051 gacgaagaagatatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttggatagaatctactcctaacaccttactttgtgtttctct 1145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 7225 - 6732
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |    
T  7225 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaaagatcacaaagtcgattggataacttaatcgacgattttc 7126  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  7125 caaccaattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaaaatatattgttat 7026  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaacca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7025 tctatttctagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaagaaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacca 6926  T
Q  452 tatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcatagg 551  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6925 tatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagaatggatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 6827  T
Q  552 atgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||||    
T  6826 atgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgccttgtatttctct 6732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 152 - 494
Target Start/End: Original strand, 12156 - 12491
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12156 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcc 12255  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12256 caaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttat 12355  T
Q  352 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaat-agctagaacc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12356 tctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaa--------gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaacc 12447  T
Q  451 atatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaata 494  Q
    ||||||||||  || || || ||||||||| |||||||||||||    
T  12448 atatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 12491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 152 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 14679 - 14176
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  14679 tccaaatgatgtcgtgatttataatggaccatttaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgattttc 14580  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtcat 351  Q
    ||| | ||||||  | ||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  14579 caatctattaaacgatccaaaagcattaagctcttgatttaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaacttaagatagattgttat 14480  T
Q  352 tctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatag-ctagaac 449  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  14479 tctatttcttatatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaactatattgaataaataaactagaac 14380  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14379 catatattaaaagatcaagagtttac-taatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtatatgatagctttgcaaa 14281  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctctagaa 649  Q
    ||||||| || |||||||||||| || |||| |   ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14280 ggatgaaaaaaagatgaagattccatccctaaactcatgatgtctcaacaaatcttgagttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtctctctagaa 14181  T
Q  650 atgcc 654  Q
    |||||    
T  14180 atgcc 14176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 152 - 645
Target Start/End: Original strand, 16140 - 16635
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaac-atttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  16140 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccaaactatttaaacgatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgatgatttc 16239  T
Q  251 ccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtca 350  Q
    |||| | |||||   | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| |    
T  16240 ccaatctattaatcgatccaaaagcattaagttctagattaaaaatgattatcaaagattaacatctatgtctagaatgaaaactta-gatagattgtta 16338  T
Q  351 ttctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaata-gctagaac 449  Q
    |   ||| |||||| |||||||||  ||  |||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  16339 tataattcctagatccaaaagtattagttaatatcatttcaaatctcaataaagccttaaatacaagaataacaaccatattgaataaataagctagaac 16438  T
Q  450 catatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcata 549  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| ||| |    
T  16439 catatattaaaagatcaagggtttacataatagcttatttaaatacctcaaaacccacaagggtatatgtagatacatatgtctaagatagcttggcaaa 16538  T
Q  550 ggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16539 ggatgaagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcttaactaccttactttgtgtttctct 16635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 367 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 7341 - 7191
Alignment:
Q  367 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatga 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7341 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatca 7242  T
Q  467 agagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtac 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  7241 agagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaa----acaagggtagatgtac 7191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 367 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 11955 - 11805
Alignment:
Q  367 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatga 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  11955 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatca 11856  T
Q  467 agagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtac 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  11855 agagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaa----acaagggtagatgtac 11805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7420 - 7340
Alignment:
Q  258 attaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 338  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7420 attaagttactcaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 7340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12034 - 11954
Alignment:
Q  258 attaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 338  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12034 attaagttactcaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 11954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 367 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 9950 - 9800
Alignment:
Q  367 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatga 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9950 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatca 9851  T
Q  467 agagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtac 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  9850 agagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaa----acaagggtagatgtac 9800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10029 - 9949
Alignment:
Q  258 attaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 338  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10029 attaagttactcaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 9949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 115; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 26427 - 26557
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26427 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgtaaagaggatt 26526  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatccct 148  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  26527 aaaattttgaaaaacccctcttaaaacccct 26557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1199 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1199
Description:

Target: scaffold1199; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 339 - 472
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  339 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttcagaaaagaggatt 438  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  439 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 3931 - 4064
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3931 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgtaaagaggatt 4030  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  4031 aaaattttgaaaaactcctcttaaaatcccttca 4064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10205 - 10071
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10205 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 10106  T
Q  118 aaaattttga-aaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  10105 aaaattttgaaaaaacccctcttaaaatcccttca 10071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 1312 - 1178
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1312 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctaattgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 1213  T
Q  118 aaaattttga-aaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  1212 aaaattttgaaaaaacccctcttaaaatcccttca 1178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 414 - 658
Target Start/End: Original strand, 35212 - 35458
Alignment:
Q  414 caagaataacaacaacattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatgaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  35212 caagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaaaaatcaagaaattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaatgg 35311  T
Q  513 tagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttga 612  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  | | |||||||||  || || |||   || ||||||||||||||||| ||| ||    
T  35312 tggatgtacctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaaaatgaagatttcataccgagactcataatgtctcaacaaatcttgggtaga 35411  T
Q  613 atatactcttaacaccttgctttgtgtttct-ctagaaatgccatct 658  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35412 atctactcctaacaccttgctttgtgtttctcctagaaatgccatct 35458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 360
Target Start/End: Original strand, 34991 - 35196
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcc 251  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||   ||||||  ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  34991 tccaaatgatgttgtgatttctaatggactatttaaaagtcgatttcccaaactattaaataatcacaaagtcgatcggatcgtttaatcgacgatttcc 35090  T
Q  252 caaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctaga-ttaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtca 350  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  35091 caaccgattaaatgaccaaaaagcattaagttctagatttaaaagtgattatcaaatattaacatc----tatagagtgataacttaaggtagattgtta 35186  T
Q  351 ttctatttct 360  Q
    ||||||||||    
T  35187 ttctatttct 35196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 19527 - 19660
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19527 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 19626  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  19627 aaatttttgaaaaactcctcttaaaatcccttca 19660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 8322 - 8455
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8322 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgtttaatgatttaatcaagattcgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggatt 8421  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8422 aaaattttgaaaaacccctcttaaaatcccttca 8455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 29169 - 29046
Alignment:
Q  28 gaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggattaaaattttga 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29169 gaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttcttccgcaaagaggattaaaattttga 29070  T
Q  128 aaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  29069 aaaacccctcttaaaatcccttca 29046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 4454 - 4587
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  4454 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgggatttattctataaagaggatt 4553  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  4554 aaaattttgaaaaacccctctcaaaatcccttca 4587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5189 - 5069
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  5189 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcattgggatttcttccgcaaagaggatt 5090  T
Q  118 aaaattttgaaaaatccctct 138  Q
    |||||||| ||||| ||||||    
T  5089 aaaattttaaaaaacccctct 5069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12918 - 12811
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12918 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgttttaatgggatttcttccgcaaagaggatt 12819  T
Q  118 aaaatttt 125  Q
    ||||||||    
T  12818 aaaatttt 12811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5902 - 5814
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5902 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctgtttgatttgtgattaataatttaatcaagatccgttttaatgggatttcttccg 5814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1494 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1494
Description:

Target: scaffold1494; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 1737 - 1564
Alignment:
Q  472 ttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagatt 571  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||    
T  1737 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaact-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt 1639  T
Q  572 caatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 645  Q
    | |||   ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1638 ccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 1564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1832 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1832
Description:

Target: scaffold1832; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 515 - 663
Target Start/End: Original strand, 1 - 154
Alignment:
Q  515 gatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaat 614  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagaggaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgtgttgaat 100  T
Q  615 atactcttaac-accttgctttgtgtt----tctctagaaatgccatctctcta 663  Q
     |||||  ||| |||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||    
T  101 ctactcccaactaccttgctttgtctttctctctctagaaatgccctctctcta 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7632 - 7497
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat- 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||   |||||||     
T  7632 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctttttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttcaatgtgatttgttccgcttagaggatt 7533  T
Q  117 -taaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
     |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||    
T  7532 ataaaatttggaaaaacctctcttaaaatcccttca 7497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 6742 - 6877
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatc-ttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat 116  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6742 gtaaacacatgaatcctttaattgtttaagtatgtgtttgattggtgattaatgatttaatcaagatccatttcaatgggatttcttccgcaaagaggat 6841  T
Q  117 taaaattttgaaaaatccctct-tgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  6842 taaaattttgaaaaacccctctattaaatcccttca 6877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 398 - 645
Target Start/End: Original strand, 9364 - 9615
Alignment:
Q  398 aataaaacattaaatgcaagaataacaacaacattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatgaagagtttaca---taatggcttgtttgaat 493  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| || || |||||   |||| ||||||||||||    
T  9364 aataaagcattaaactcaagaataataacaatattgaataaataagctagaaccttaaattaaatgatcaa-agattacaaattaatagcttgtttgaat 9462  T
Q  494 acctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcataggat-gaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgt 592  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||| || |  ||||  ||||| |    
T  9463 accttaaaaaccacaagcgtagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatggaagaa-agatgaagattccatactaagattcatgatat 9561  T
Q  593 ctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaaca-ccttgctttgtgtttctct 645  Q
    ||| ||||||| ||||  |||| ||||  |||||  |||| |||||||||||||    
T  9562 ctctacaaatcctaggaagaatctacttctaacatgcttgatttgtgtttctct 9615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 107240 - 107107
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatc-ttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat 116  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||  |||| |||    
T  107240 gtaaacacatgaatccttaaattgtttaagtatgtgtttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgttttaatgggatttgtttcgctaaga-gat 107142  T
Q  117 taaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  107141 taaatttttgaaaaacctctctttaaatcccttca 107107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 61; Significance: 8e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 244
Target Start/End: Original strand, 5015 - 5107
Alignment:
Q  152 tccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttcaatcgac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5015 tccaaatgatatcgttatttctaagaggtcatttaaacatcgatttccttaacatttaaacgttcacaaagttgattggatagtttaatcgac 5107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1303 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1303
Description:

Target: scaffold1303; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 974 - 892
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggattt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  974 gtaaacacatgaatcttgaagtgtttaagtttttgtttgatttgtgattaatgatttaagcaagatccatttcaatgggattt 892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0502 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0502
Description:

Target: scaffold0502; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Original strand, 261 - 373
Alignment:
Q  19 taaacacatgaatcttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggatta 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |   |||||||||    
T  261 taaacacatgaattttaaagtgtttaagaacatttttgatttttgattaatgatttaatcaagatccgattcaatgggatttattctgctgagaggatta 360  T
Q  119 aaattttgaaaaa 131  Q
    |||||||||||||    
T  361 aaattttgaaaaa 373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 229380 - 229242
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatc-ttaaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgat---ttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagag 113  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  229380 gtaaacacatgaatccttaaattgtttaagtatgtgtttgatttgtgattaataataatttaatcaagattcgtttcaatgaaatttcttccgcaaagag 229281  T
Q  114 gattaaaattttgaaaaatccctct-tgaaatcccttca 151  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||    
T  229280 gattaaaatttggaaaaaaccctctattaaatcccttca 229242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 87925 - 88059
Alignment:
Q  18 gtaaacacatgaatctt-aaagtgtttaagtttctatttgatttgtgattaatgatttaatcaagatccgtttctatgggatttcttccgtaaagaggat 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||| || | | ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||    
T  87925 gtaaactcatgaatctttaaattgtttatgtatgtgtttgattagtgataaataatttaatcaagatccgtttcaatgaaatttcttccgcatagaggat 88024  T
Q  117 taaaattttgaaaaatccctcttgaaatcccttca 151  Q
    ||||  || |||||| ||||||| |||||||||||    
T  88025 taaagattggaaaaacccctcttaaaatcccttca 88059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University