View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11150_high_5 (Length: 508)

Name: NF11150_high_5
Description: NF11150
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11150_high_5
NF11150_high_5
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (14-445)||(55163832-55164256)
chr3 (14-248)||(1017044-1017277)
chr3 (18-249)||(1687655-1687885)
chr3 (18-249)||(35346378-35346608)
chr3 (14-249)||(22851996-22852229)
chr3 (14-249)||(53925886-53926120)
chr3 (14-256)||(21564496-21564737)
chr3 (14-219)||(20813378-20813582)
chr3 (14-243)||(20759984-20760212)
chr3 (14-263)||(51562162-51562410)
chr3 (14-250)||(29677476-29677711)
chr3 (14-190)||(33151696-33151872)
chr3 (14-249)||(21656518-21656752)
chr3 (19-249)||(21890175-21890404)
chr3 (14-250)||(19268521-19268761)
chr3 (14-249)||(31122662-31122896)
chr3 (14-249)||(41250886-41251120)
chr3 (14-220)||(38446476-38446681)
chr3 (19-189)||(42016878-42017048)
chr3 (14-220)||(42107035-42107240)
chr3 (18-227)||(50287570-50287778)
chr3 (14-246)||(27070649-27070880)
chr3 (14-190)||(47329140-47329316)
chr3 (14-248)||(53196014-53196246)
chr3 (14-249)||(1448642-1448873)
chr3 (18-251)||(10618386-10618617)
chr3 (14-190)||(20086279-20086455)
chr3 (14-230)||(35608057-35608272)
chr3 (14-250)||(37247956-37248191)
chr3 (14-190)||(52821014-52821190)
chr3 (14-249)||(26455582-26455815)
chr3 (14-160)||(36314967-36315113)
chr3 (14-151)||(19664541-19664678)
chr3 (18-249)||(32650727-32650957)
chr3 (14-189)||(48651248-48651423)
chr3 (18-227)||(40922094-40922302)
chr3 (14-236)||(44798268-44798488)
chr3 (14-147)||(12748391-12748524)
chr3 (18-134)||(51475267-51475383)
chr3 (16-166)||(3697148-3697298)
chr3 (16-220)||(20913690-20913893)
chr3 (16-220)||(20921808-20922011)
chr3 (14-227)||(45380189-45380401)
chr3 (16-134)||(50977866-50977984)
chr3 (16-134)||(51080998-51081116)
chr3 (14-166)||(39069726-39069878)
chr3 (14-134)||(50364908-50365028)
chr3 (14-176)||(33473218-33473380)
chr3 (29-190)||(38923963-38924124)
chr3 (14-114)||(28699685-28699785)
chr3 (16-134)||(34019462-34019580)
chr3 (14-83)||(44152700-44152769)
chr3 (14-78)||(47473230-47473294)
chr3 (45-120)||(42641213-42641288)
chr3 (143-261)||(1016879-1016996)
chr3 (169-249)||(50287384-50287463)
chr3 (137-249)||(51475431-51475541)
chr3 (137-256)||(1687491-1687609)
chr3 (143-249)||(28699532-28699637)
chr3 (195-249)||(33151905-33151959)
chr3 (116-249)||(44152775-44152907)
chr3 (137-249)||(21564343-21564454)
chr3 (135-227)||(47473099-47473190)
chr3 (143-190)||(3697051-3697098)
chr3 (195-254)||(28193243-28193302)
chr3 (202-249)||(50364814-50364861)
chr3 (135-248)||(39069574-39069687)
chr3 (137-190)||(33473422-33473475)
chr3 (164-249)||(36315211-36315295)
[»] chr1 (81 HSPs)
chr1 (14-251)||(7651662-7651898)
chr1 (16-250)||(25988177-25988410)
chr1 (14-249)||(19315640-19315874)
chr1 (14-254)||(28425265-28425504)
chr1 (14-248)||(12143072-12143303)
chr1 (14-251)||(23767320-23767555)
chr1 (14-249)||(46825531-46825765)
chr1 (14-245)||(50689943-50690173)
chr1 (14-249)||(7552923-7553157)
chr1 (16-220)||(49814302-49814505)
chr1 (14-249)||(19274559-19274792)
chr1 (14-249)||(46051450-46051684)
chr1 (14-227)||(38473555-38473767)
chr1 (14-249)||(36157584-36157818)
chr1 (14-249)||(24204378-24204612)
chr1 (14-249)||(26549388-26549622)
chr1 (14-249)||(48802238-48802472)
chr1 (18-227)||(45350646-45350852)
chr1 (18-220)||(49094647-49094848)
chr1 (18-249)||(9878691-9878921)
chr1 (18-249)||(26069896-26070126)
chr1 (14-249)||(33325727-33325961)
chr1 (14-249)||(33674017-33674251)
chr1 (14-249)||(43396675-43396909)
chr1 (14-255)||(7608668-7608907)
chr1 (14-227)||(46095004-46095216)
chr1 (14-230)||(23228119-23228335)
chr1 (14-166)||(41106016-41106168)
chr1 (18-249)||(37216900-37217130)
chr1 (14-227)||(16705870-16706082)
chr1 (16-249)||(36781079-36781311)
chr1 (14-190)||(18892329-18892505)
chr1 (19-248)||(5400876-5401103)
chr1 (18-249)||(45670393-45670623)
chr1 (18-249)||(9962755-9962985)
chr1 (14-245)||(52146993-52147223)
chr1 (14-176)||(50533383-50533545)
chr1 (18-251)||(18781994-18782226)
chr1 (18-251)||(21965069-21965301)
chr1 (336-491)||(26156627-26156778)
chr1 (336-491)||(26169925-26170076)
chr1 (14-227)||(40721342-40721555)
chr1 (18-176)||(48669375-48669533)
chr1 (18-190)||(8141452-8141623)
chr1 (18-150)||(41982240-41982372)
chr1 (14-249)||(18917524-18917758)
chr1 (14-227)||(6711440-6711652)
chr1 (18-134)||(48319067-48319183)
chr1 (14-189)||(17983864-17984039)
chr1 (14-189)||(52067617-52067792)
chr1 (14-250)||(12964646-12964867)
chr1 (19-191)||(33714325-33714495)
chr1 (14-166)||(52349913-52350065)
chr1 (18-249)||(25800648-25800875)
chr1 (18-135)||(9974846-9974963)
chr1 (14-134)||(33194672-33194792)
chr1 (18-160)||(34971084-34971226)
chr1 (19-248)||(21929526-21929758)
chr1 (54-247)||(44978677-44978868)
chr1 (18-134)||(16506809-16506925)
chr1 (14-134)||(30281631-30281751)
chr1 (14-71)||(50099220-50099277)
chr1 (14-62)||(44979281-44979329)
chr1 (14-58)||(32373650-32373694)
chr1 (143-250)||(22351031-22351137)
chr1 (143-250)||(52146839-52146945)
chr1 (169-251)||(19274375-19274456)
chr1 (195-245)||(52349864-52349914)
chr1 (198-251)||(25800459-25800512)
chr1 (169-250)||(41105833-41105913)
chr1 (137-190)||(49814205-49814258)
chr1 (143-255)||(16505138-16505249)
chr1 (142-245)||(12142916-12143018)
chr1 (143-249)||(16508118-16508222)
chr1 (16-58)||(17989864-17989906)
chr1 (137-190)||(9974747-9974800)
chr1 (137-250)||(46825346-46825458)
chr1 (202-251)||(50533199-50533248)
chr1 (138-190)||(12964551-12964603)
chr1 (202-250)||(18782365-18782413)
chr1 (168-252)||(37216711-37216794)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (14-249)||(47219145-47219379)
chr7 (14-251)||(1469398-1469634)
chr7 (14-249)||(44544409-44544643)
chr7 (14-249)||(47294198-47294432)
chr7 (14-249)||(47271981-47272215)
chr7 (14-249)||(48628805-48629039)
chr7 (14-190)||(8162677-8162853)
chr7 (14-236)||(38427483-38427704)
chr7 (19-247)||(7336065-7336291)
chr7 (14-249)||(11476463-11476697)
chr7 (14-249)||(30876259-30876493)
chr7 (14-249)||(31684041-31684275)
chr7 (14-249)||(35600029-35600263)
chr7 (38-248)||(221299-221508)
chr7 (14-176)||(47281103-47281265)
chr7 (18-249)||(37393904-37394135)
chr7 (14-249)||(45723398-45723632)
chr7 (27-249)||(2960547-2960768)
chr7 (14-250)||(30798275-30798509)
chr7 (14-190)||(23842305-23842481)
chr7 (14-249)||(42979245-42979479)
chr7 (18-160)||(33884323-33884465)
chr7 (14-248)||(40851274-40851507)
chr7 (14-235)||(43752697-43752917)
chr7 (14-249)||(41139315-41139553)
chr7 (14-249)||(41113377-41113612)
chr7 (14-249)||(47119991-47120227)
chr7 (14-227)||(47579016-47579228)
chr7 (14-166)||(27364328-27364480)
chr7 (18-229)||(11050188-11050398)
chr7 (14-176)||(43968238-43968400)
chr7 (18-176)||(44800389-44800547)
chr7 (14-189)||(30971908-30972082)
chr7 (14-134)||(3797544-3797664)
chr7 (18-150)||(4923220-4923352)
chr7 (14-149)||(29248342-29248477)
chr7 (18-176)||(18353148-18353306)
chr7 (14-134)||(27774108-27774228)
chr7 (18-134)||(37354284-37354400)
chr7 (14-107)||(40520918-40521011)
chr7 (102-231)||(42888937-42889065)
chr7 (137-250)||(23842151-23842263)
chr7 (14-74)||(39034062-39034122)
chr7 (137-256)||(42888715-42888833)
chr7 (137-250)||(47294474-47294586)
chr7 (99-249)||(5106127-5106275)
chr7 (137-250)||(40851129-40851241)
chr7 (137-249)||(31684317-31684428)
chr7 (161-249)||(39033879-39033966)
chr7 (137-249)||(47119838-47119949)
chr7 (14-57)||(43025112-43025155)
chr7 (198-249)||(47271800-47271851)
chr7 (195-249)||(1469762-1469816)
chr7 (156-250)||(25801472-25801565)
chr7 (143-249)||(27772983-27773088)
chr7 (169-247)||(29739521-29739598)
chr7 (135-249)||(30972122-30972234)
chr7 (195-249)||(43968528-43968582)
chr7 (195-245)||(45233468-45233518)
chr7 (14-63)||(29739781-29739829)
chr7 (195-251)||(34378512-34378569)
chr7 (137-250)||(45233641-45233753)
chr7 (195-228)||(48628644-48628677)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (14-236)||(3875908-3876129)
chr8 (18-250)||(37933646-37933877)
chr8 (14-249)||(2533272-2533508)
chr8 (14-247)||(9056247-9056479)
chr8 (14-256)||(22683888-22684129)
chr8 (14-249)||(36399976-36400211)
chr8 (14-249)||(513308-513541)
chr8 (16-251)||(35884335-35884569)
chr8 (18-249)||(38107103-38107333)
chr8 (14-249)||(35443311-35443545)
chr8 (19-249)||(15847117-15847346)
chr8 (18-249)||(259982-260211)
chr8 (18-249)||(655710-655939)
chr8 (18-249)||(841445-841674)
chr8 (14-249)||(43806440-43806674)
chr8 (14-247)||(12010549-12010784)
chr8 (14-249)||(33651841-33652075)
chr8 (18-248)||(440844-441073)
chr8 (14-176)||(1293486-1293648)
chr8 (29-249)||(41536434-41536653)
chr8 (14-249)||(13797089-13797322)
chr8 (14-249)||(23972201-23972437)
chr8 (14-167)||(39513327-39513480)
chr8 (14-166)||(28707435-28707587)
chr8 (14-134)||(7434886-7435006)
chr8 (14-249)||(28496262-28496495)
chr8 (18-176)||(38208756-38208914)
chr8 (14-248)||(42988135-42988367)
chr8 (14-249)||(24430478-24430712)
chr8 (18-189)||(36218747-36218917)
chr8 (14-134)||(23935233-23935353)
chr8 (14-190)||(38633675-38633851)
chr8 (18-159)||(40301889-40302030)
chr8 (16-134)||(6016207-6016325)
chr8 (18-245)||(4649154-4649380)
chr8 (14-134)||(29485287-29485406)
chr8 (90-176)||(24193109-24193195)
chr8 (14-92)||(24193356-24193433)
chr8 (137-250)||(22684171-22684283)
chr8 (20-79)||(8137180-8137239)
chr8 (138-249)||(6016052-6016162)
chr8 (164-257)||(43806772-43806867)
chr8 (137-210)||(2533158-2533230)
chr8 (169-250)||(35443128-35443207)
chr8 (169-249)||(15846956-15847035)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (14-248)||(55517094-55517326)
chr4 (14-249)||(28264643-28264877)
chr4 (14-249)||(31591076-31591309)
chr4 (19-249)||(49118616-49118845)
chr4 (14-249)||(33807688-33807921)
chr4 (14-249)||(4544893-4545126)
chr4 (14-245)||(12196469-12196699)
chr4 (16-251)||(24458536-24458770)
chr4 (14-249)||(42273802-42274036)
chr4 (14-252)||(31973591-31973828)
chr4 (19-236)||(44490324-44490540)
chr4 (14-250)||(19496008-19496243)
chr4 (14-249)||(15985010-15985243)
chr4 (15-249)||(33173927-33174160)
chr4 (18-246)||(23134916-23135143)
chr4 (14-255)||(40988633-40988869)
chr4 (14-249)||(5227390-5227624)
chr4 (14-250)||(11795059-11795295)
chr4 (16-249)||(26017425-26017657)
chr4 (14-227)||(48707662-48707874)
chr4 (14-250)||(28812193-28812427)
chr4 (18-257)||(23553069-23553306)
chr4 (18-249)||(48551671-48551901)
chr4 (16-190)||(2055280-2055454)
chr4 (16-255)||(8881912-8882152)
chr4 (14-247)||(28159862-28160094)
chr4 (14-249)||(9339031-9339267)
chr4 (18-249)||(25730244-25730475)
chr4 (17-245)||(48149502-48149729)
chr4 (14-249)||(17847004-17847236)
chr4 (16-250)||(50276044-50276274)
chr4 (18-175)||(32317957-32318114)
chr4 (14-227)||(35930040-35930251)
chr4 (14-250)||(39995072-39995308)
chr4 (14-249)||(22298517-22298752)
chr4 (14-190)||(32118714-32118890)
chr4 (14-250)||(50542259-50542495)
chr4 (18-248)||(30466910-30467140)
chr4 (14-248)||(10588580-10588813)
chr4 (16-190)||(37381848-37382022)
chr4 (14-190)||(30141073-30141249)
chr4 (14-189)||(33693299-33693474)
chr4 (46-227)||(31208776-31208956)
chr4 (14-134)||(24623148-24623268)
chr4 (14-166)||(39700045-39700197)
chr4 (18-149)||(25734229-25734360)
chr4 (14-166)||(17993006-17993158)
chr4 (14-166)||(51371036-51371188)
chr4 (14-165)||(14564796-14564947)
chr4 (14-134)||(19168816-19168936)
chr4 (14-134)||(42549643-42549762)
chr4 (14-95)||(56555200-56555281)
chr4 (74-190)||(20534225-20534341)
chr4 (137-254)||(28264485-28264601)
chr4 (137-249)||(26017270-26017381)
chr4 (195-245)||(17992957-17993007)
chr4 (171-249)||(31590896-31590972)
chr4 (169-250)||(31208565-31208645)
chr4 (137-249)||(23135189-23135300)
chr4 (195-249)||(12196296-12196350)
chr4 (137-190)||(48149404-48149457)
chr4 (143-248)||(49118459-49118563)
chr4 (178-250)||(9339379-9339450)
chr4 (169-249)||(17847368-17847447)
chr4 (198-250)||(25734495-25734547)
chr4 (143-227)||(48707922-48708005)
chr4 (138-190)||(51371262-51371314)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (14-250)||(41282342-41282577)
chr5 (14-251)||(35342180-35342416)
chr5 (18-249)||(14717609-14717840)
chr5 (14-249)||(16095867-16096100)
chr5 (14-249)||(19659408-19659642)
chr5 (14-249)||(38964021-38964254)
chr5 (14-220)||(6739891-6740096)
chr5 (14-249)||(6251972-6252206)
chr5 (14-249)||(11000635-11000869)
chr5 (14-249)||(43166177-43166410)
chr5 (14-227)||(8689572-8689783)
chr5 (16-190)||(39001990-39002164)
chr5 (14-227)||(31710282-31710494)
chr5 (14-251)||(39824556-39824791)
chr5 (14-190)||(30863253-30863428)
chr5 (14-160)||(40074950-40075096)
chr5 (6-190)||(23128877-23129062)
chr5 (14-190)||(27457162-27457338)
chr5 (14-249)||(8215900-8216134)
chr5 (14-245)||(20079170-20079399)
chr5 (14-228)||(26593208-26593421)
chr5 (18-249)||(6600043-6600273)
chr5 (14-249)||(28078312-28078546)
chr5 (14-248)||(3351910-3352143)
chr5 (14-220)||(4015810-4016015)
chr5 (14-172)||(11692130-11692288)
chr5 (14-236)||(33760390-33760611)
chr5 (18-247)||(11935450-11935677)
chr5 (14-207)||(30297697-30297890)
chr5 (14-190)||(42993518-42993694)
chr5 (22-249)||(1052541-1052767)
chr5 (18-189)||(14952328-14952499)
chr5 (18-249)||(20408537-20408767)
chr5 (14-227)||(30208331-30208543)
chr5 (18-236)||(19398113-19398330)
chr5 (14-134)||(16752116-16752236)
chr5 (18-249)||(27116006-27116236)
chr5 (14-114)||(6331377-6331477)
chr5 (14-134)||(26035367-26035487)
chr5 (14-189)||(8694866-8695041)
chr5 (22-134)||(444962-445074)
chr5 (14-166)||(27509978-27510123)
chr5 (169-250)||(43166504-43166584)
chr5 (158-249)||(8215718-8215808)
chr5 (111-249)||(6332873-6333010)
chr5 (143-249)||(38964302-38964406)
chr5 (138-255)||(30863094-30863210)
chr5 (195-249)||(33760739-33760793)
chr5 (169-249)||(30297993-30298072)
chr5 (137-190)||(20517063-20517116)
chr5 (137-190)||(40074855-40074908)
chr5 (169-254)||(41282155-41282239)
chr5 (169-249)||(4016117-4016196)
chr5 (169-249)||(19661875-19661954)
chr5 (169-249)||(27116338-27116417)
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (14-249)||(1915251-1915484)
chr6 (14-249)||(6503718-6503952)
chr6 (14-250)||(2707459-2707694)
chr6 (14-251)||(9382519-9382755)
chr6 (18-249)||(30379021-30379251)
chr6 (14-250)||(3408189-3408425)
chr6 (14-250)||(29050272-29050508)
chr6 (18-250)||(17943040-17943271)
chr6 (14-249)||(8178156-8178390)
chr6 (18-189)||(17428238-17428409)
chr6 (14-249)||(12626636-12626870)
chr6 (18-249)||(26392916-26393146)
chr6 (18-249)||(16193314-16193544)
chr6 (18-256)||(1077241-1077478)
chr6 (16-190)||(2390267-2390441)
chr6 (14-227)||(10256237-10256449)
chr6 (14-249)||(3258714-3258948)
chr6 (25-249)||(2598007-2598229)
chr6 (14-249)||(26230840-26231073)
chr6 (14-212)||(11133873-11134072)
chr6 (18-190)||(26196286-26196458)
chr6 (14-134)||(26936607-26936727)
chr6 (14-249)||(6785008-6785239)
chr6 (18-253)||(25820452-25820686)
chr6 (29-135)||(35223919-35224025)
chr6 (68-249)||(31375971-31376153)
chr6 (38-220)||(10931084-10931264)
chr6 (97-189)||(12612937-12613029)
chr6 (76-190)||(12612813-12612927)
chr6 (195-249)||(35224160-35224214)
chr6 (169-250)||(1915587-1915667)
chr6 (137-250)||(2707305-2707417)
chr6 (195-249)||(26393278-26393332)
chr6 (169-249)||(1077052-1077131)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (18-249)||(37838301-37838531)
chr2 (14-255)||(771877-772116)
chr2 (14-249)||(2456010-2456244)
chr2 (14-251)||(9276574-9276810)
chr2 (14-248)||(7378963-7379195)
chr2 (14-249)||(27328584-27328818)
chr2 (14-253)||(41500405-41500643)
chr2 (14-251)||(40854609-40854845)
chr2 (14-250)||(12759656-12759890)
chr2 (18-190)||(25087761-25087933)
chr2 (14-249)||(36211046-36211281)
chr2 (14-250)||(36444134-36444369)
chr2 (14-249)||(28650333-28650567)
chr2 (14-256)||(33106869-33107110)
chr2 (14-251)||(8899682-8899917)
chr2 (14-190)||(16246158-16246334)
chr2 (14-249)||(2094318-2094551)
chr2 (14-249)||(11949333-11949567)
chr2 (14-236)||(19180422-19180642)
chr2 (14-227)||(921022-921234)
chr2 (14-249)||(37732100-37732334)
chr2 (14-249)||(42629962-42630196)
chr2 (14-176)||(33865246-33865408)
chr2 (17-258)||(2056929-2057168)
chr2 (16-249)||(2314882-2315114)
chr2 (14-247)||(43249321-43249553)
chr2 (14-189)||(1106525-1106700)
chr2 (14-190)||(34253142-34253318)
chr2 (14-254)||(3430527-3430765)
chr2 (14-190)||(17134229-17134404)
chr2 (16-190)||(7297199-7297373)
chr2 (14-166)||(29737748-29737900)
chr2 (14-190)||(38751048-38751224)
chr2 (18-249)||(17484457-17484687)
chr2 (14-134)||(8396572-8396692)
chr2 (63-248)||(14630663-14630846)
chr2 (15-220)||(45124120-45124324)
chr2 (18-130)||(37654112-37654224)
chr2 (14-227)||(41177964-41178160)
chr2 (15-227)||(9331757-9331968)
chr2 (14-134)||(19916008-19916128)
chr2 (65-249)||(23671719-23671901)
chr2 (116-227)||(28216893-28217003)
chr2 (14-70)||(23672958-23673014)
chr2 (169-249)||(23673117-23673196)
chr2 (169-260)||(7297476-7297566)
chr2 (195-248)||(9276393-9276446)
chr2 (195-248)||(9331584-9331637)
chr2 (168-249)||(28650671-28650751)
chr2 (178-249)||(33107222-33107292)
chr2 (195-249)||(920840-920894)
chr2 (195-249)||(31214086-31214140)
chr2 (153-190)||(3358157-3358194)
chr2 (137-190)||(3430807-3430860)
chr2 (137-190)||(11949612-11949665)
chr2 (195-248)||(33865536-33865589)
chr2 (164-249)||(41500732-41500816)
chr2 (137-249)||(772158-772268)
chr2 (198-250)||(2315246-2315298)
chr2 (169-245)||(8899504-8899579)
chr2 (169-249)||(12759993-12760072)
chr2 (170-250)||(41178264-41178343)
chr2 (137-249)||(42629803-42629914)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (14-247)||(218885-219118)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (18-250)||(4934-5164)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (18-257)||(5190-5427)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (14-166)||(114-266)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (19-190)||(47967-48138)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (14-134)||(1994-2114)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (18-166)||(11362-11510)
scaffold0122 (195-249)||(11183-11237)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (14-165)||(252428-252579)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (18-176)||(13099-13257)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (18-176)||(59587-59745)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (74-248)||(3280-3452)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (74-191)||(1877-1994)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (14-67)||(289-342)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (74-166)||(599-691)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (74-166)||(1902-1994)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (14-64)||(19781-19831)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (143-250)||(5729-5835)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (169-250)||(101245-101325)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 55164256 - 55163832
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55164256 agagcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 55164157  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||  | ||||||| |||||||||||    
T  55164156 agcaactatgctatctacaatatgacttatttgaaacaattcaaaaattaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacggctttgggaaaa 55164058  T
Q  214 atgaaaagcttaaaa-gacttttacatacatttgaccattaattaattagtatttgtttgtagatcatatattaattatgttatatatgttttattttgt 312  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55164057 atgaaaaacttaaaaggacatttagatgcatttgaccattaattaattagtatttgtttgtagatcatatattaattatgttatatatgttttattttgt 55163958  T
Q  313 tggtttgtaaatgtgcattattgattattgacttgattgtatattccaaactacaccatgttctgttatgttcgttatacatgctttattcttcctcctg 412  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55163957 tggtttgtaaatgtgc-------attattgacttaattgtatattccaaactacaccatgttctgttatgttcgttatacatgctttattcttcctcctg 55163865  T
Q  413 ttgcctcaaattgattctcataccccttgttat 445  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55163864 ttgcctcaaattgattctcattccccttgttat 55163832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 1017044 - 1017277
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1017044 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1017143  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  1017144 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtatgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 1017242  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  1017243 atgaaaaacttaaaagacctttagatgcatttgac 1017277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 1687655 - 1687885
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1687655 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 1687754  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||    
T  1687755 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgaaacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaatga 1687853  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  1687854 aaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 1687885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35346608 - 35346378
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35346608 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 35346509  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||    
T  35346508 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttaggaaaaatga 35346410  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| ||| |||| || | |||||||    
T  35346409 aaaacttaaaggacctttagatgcgtttgacc 35346378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 22851996 - 22852229
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22851996 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaacagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 22852095  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | || ||||| |||||  |||||||| ||||| |||||||  | ||||||||||||  |||||    
T  22852096 accaactatgctatctacaataggacttatttgaaagatttcaaaaactaaaaggacttgtttagaactgttgaaactta-aaggacgactttaagaaaa 22852194  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||    
T  22852195 atgaaaaactt-aaagacctttagatgcatttgacc 22852229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 53926120 - 53925886
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  53926120 agagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 53926021  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||  || ||||||||||||    
T  53926020 accaactatactatctacaatatgacttatttgaaatgattcaaaaactaaaatgacttgtttggaacttttgaaactta-aataaccactttgggaaaa 53925922  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  53925921 atgaaaaacttaaatgacctttagatacatttgacc 53925886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Original strand, 21564496 - 21564737
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  21564496 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 21564595  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  21564596 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 21564694  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaatt 256  Q
    | ||||| |||||| ||  |||| || ||||||||| ||||||    
T  21564695 acgaaaaacttaaaggatctttagatgcatttgacctttaatt 21564737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20813582 - 20813378
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20813582 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 20813483  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  20813482 accaattatgctatctacattatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 20813384  T
Q  214 atgaaa 219  Q
    ||||||    
T  20813383 atgaaa 20813378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20760212 - 20759984
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20760212 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 20760113  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  20760112 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 20760014  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacat 243  Q
    ||||||| ||| || ||| |||| ||||||    
T  20760013 atgaaaaacttcaaggacctttatatacat 20759984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 51562162 - 51562410
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  51562162 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 51562261  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||| ||   ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  51562262 accaactatgttatctacattagaacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgcttgagacttttgaaactca-aaggaccactttaggaaaa 51562360  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaattaattagt 263  Q
    | ||||| ||||||  ||||||| || ||||||||| |||| | ||||||    
T  51562361 acgaaaaacttaaagaacttttagatgcatttgacctttaagttattagt 51562410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 29677476 - 29677711
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29677476 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaaatgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29677575  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    |  ||||||| ||||||| ||| ||| | |||||||| ||| ||||| ||||   |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  29677576 acaaactatgatatctacgataggacctgtttgaaacgattgaaaaactaaacggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 29677674  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  29677675 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 29677711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 33151696 - 33151872
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  33151696 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaatt 33151795  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  33151796 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 33151872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 21656518 - 21656752
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21656518 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaaggtgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 21656617  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||    
T  21656618 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaa 21656716  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  21656717 acgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 21656752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 249
Target Start/End: Original strand, 21890175 - 21890404
Alignment:
Q  19 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21890175 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 21890274  T
Q  119 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaa 218  Q
     ||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||  | |||||| | ||||  ||||| |||    
T  21890275 atatgttatctataataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaactta-aaggaccattttgaaaaaaacgaa 21890373  T
Q  219 aagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    || |||||| |||||||| || |||||||||    
T  21890374 aaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 21890404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 19268521 - 19268761
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19268521 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 19268620  T
Q  114 aacaacta------tgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttg 207  Q
    | ||||||      ||||||||||| || ||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||    
T  19268621 accaactatgttattgttatctacattaggacttgtttaaaacgattcaaaaactaaaataacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttg 19268719  T
Q  208 ggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||| |||| || ||||||||||    
T  19268720 ggaaaaacgaaaaactt-aaagacctttagatgcatttgacca 19268761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 31122662 - 31122896
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31122662 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtcttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31122761  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||  ||||||||||||    
T  31122762 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggatcactttgggaaaa 31122860  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | |||||  ||||| ||| |||| || |||||||||    
T  31122861 acgaaaaagttaaaggacctttagatgcatttgacc 31122896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 41250886 - 41251120
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  41250886 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 41250985  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||| ||| | || ||||||||  | |||||| ||||||| | ||    
T  41250986 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttatttgggacctttgaaactta-aaggaccactttggaagaa 41251084  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    || |||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  41251085 ataaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 41251120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 38446476 - 38446681
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38446476 agagcattatctactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38446575  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||| ||||    
T  38446576 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagcacttctttggaacttttaaaactta-aaggaccactttggaaaaa 38446674  T
Q  214 atgaaaa 220  Q
    | |||||    
T  38446675 acgaaaa 38446681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Original strand, 42016878 - 42017048
Alignment:
Q  19 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 118  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  42016878 attatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 42016977  T
Q  119 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  || |||||  |||||||||||    
T  42016978 ctatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacctgtttgaaacttttgaaa 42017048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42107240 - 42107035
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42107240 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtgtcaaagatgagttcaaggaagtaatt 42107141  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||||||| |||||| ||||    
T  42107140 accaactatactatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgtgacttttgaaactta-aaggacggctttggaaaaa 42107042  T
Q  214 atgaaaa 220  Q
    |||||||    
T  42107041 atgaaaa 42107035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Original strand, 50287570 - 50287778
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| || |||||||||| ||    
T  50287570 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagtttaatgaagcaattacca 50287669  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||| |   |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||    
T  50287670 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtatgagacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaatga 50287768  T
Q  218 aaagcttaaa 227  Q
    ||| ||||||    
T  50287769 aaaacttaaa 50287778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27070880 - 27070649
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| | | | || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27070880 agagcattatccaccatttataatgtctgaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 27070781  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  27070780 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaa 27070682  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttg 246  Q
    |||||||  ||||| ||| |||| || ||||||    
T  27070681 atgaaaaatttaaaggacctttatatgcatttg 27070649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 47329316 - 47329140
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47329316 agagcattatccaccatttgccatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47329217  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||  ||||||||   |||||||||||    
T  47329216 accaactatgctatctacgatatgacttgttggaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 47329140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 53196014 - 53196246
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  53196014 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaataatt 53196113  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || |||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||    
T  53196114 accaactatgttatctacaataagacttctttgaaacga-ttcaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttcggaaaa 53196211  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| || ||||||||    
T  53196212 acgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgac 53196246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1448873 - 1448642
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1448873 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaatt 1448774  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||   |||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||  | |||||  |||||| |||||    
T  1448773 accaactatggta---acaataggacttctttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttggtacttttgaaactta-aaggatcactttgagaaaa 1448678  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  1448677 acgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 1448642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10618617 - 10618386
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  10618617 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 10618518  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||| | || ||  |||||||| |||| ||    
T  10618517 attatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacttttgaaacata-aaagatcactttggg-aaaacga 10618420  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  10618419 aaaacttaaaggacctttagatgcatttgaccat 10618386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20086455 - 20086279
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20086455 agagcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 20086356  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | ||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||    
T  20086355 accaagtatgctatctataataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaac 20086279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35608272 - 35608057
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  35608272 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttaggagtccgatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaatt 35608173  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   | |||||||||  | || ||||||||| || |||    
T  35608172 accaattatgctatctacaataggacttatttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgacatttttgaaactta-aatgacgactttaggcaaa 35608074  T
Q  214 atgaaaagcttaaaaga 230  Q
    ||||||| |||||||||    
T  35608073 atgaaaaacttaaaaga 35608057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 37247956 - 37248191
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37247956 agagcattattcatcatttgtcatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 37248055  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  37248056 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagtacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttagaaaaa 37248154  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    | ||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||    
T  37248155 acgaaaaacttaaaagacatttagatgtatttgacca 37248191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 52821190 - 52821014
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  52821190 agagcattatccatcatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagttttactaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 52821091  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  52821090 accaactatgttatctacaacaggacttgtttaaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttggaacttttgaaac 52821014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 26455582 - 26455815
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26455582 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 26455681  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||| ||   |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||    
T  26455682 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttggttgagacttttgaaactta-aaggaccactttaggaaaa 26455780  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |  |||| ||||||| || |||| || |||||||||    
T  26455781 accaaaaacttaaaa-acctttagatgcatttgacc 26455815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36315113 - 36314967
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36315113 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaatt 36315014  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaa 160  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  36315013 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaa 36314967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Original strand, 19664541 - 19664678
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19664541 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttatgagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 19664640  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaaca 151  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19664641 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaaca 19664678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32650957 - 32650727
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32650957 cattatccaccatttgccatgcctagaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 32650858  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| |||||| ||||  |||| |||||||  ||| ||||| |||||  | ||||||  ||||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| ||    
T  32650857 actatgctatctataatagaacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaagaattgtttgaaacttttgaaactta-aaggaccactttagaaaaaacga 32650759  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  32650758 aaaacttaaatgacatttagatccatttgacc 32650727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 48651248 - 48651423
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48651248 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagacgattaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaatt 48651347  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 189  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   ||||||||||    
T  48651348 accaactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttgaaa 48651423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40922302 - 40922094
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  40922302 cattatccaccattttccatgcctaaaaaaattactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattacca 40922203  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | || ||| ||||| ||||||||||    
T  40922202 actatgctatctacaatacgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaagaccactttaggaaaaatga 40922104  T
Q  218 aaagcttaaa 227  Q
    ||| ||||||    
T  40922103 aaaacttaaa 40922094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 44798268 - 44798488
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44798268 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaa-atgagtaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 44798366  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||| |   | |||||||||  | ||| || ||||||||||||    
T  44798367 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtatgagaattttgaaactta-aagcaccactttgggaaaa 44798465  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    || |||| |||||| ||| ||||    
T  44798466 ataaaaaacttaaaggaccttta 44798488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Original strand, 12748391 - 12748524
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12748391 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12748490  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttga 147  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  12748491 accaactatgctatctacaataggacttgtttga 12748524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 51475383 - 51475267
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51475383 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 51475284  T
Q  118 actatgttatctacaat 134  Q
    |||||| ||||||||||    
T  51475283 actatgctatctacaat 51475267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Original strand, 3697148 - 3697298
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||     
T  3697148 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgaattcaatgaagcaattac 3697247  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 166  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| |||||    
T  3697248 caactatactatctacaataggacttgtttgaaaggattcaaaaactaaaa 3697298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20913893 - 20913690
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    |||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  20913893 agcattattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattat 20913794  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaat 215  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | || ||| |||||||||||||     
T  20913793 caactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagatttgtttgagacttttgaaactta-aatgaccactttgggaaaaac 20913695  T
Q  216 gaaaa 220  Q
    |||||    
T  20913694 gaaaa 20913690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20922011 - 20921808
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    |||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  20922011 agcattattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattat 20921912  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaat 215  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | || ||| |||||||||||||     
T  20921911 caactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagatttgtttgagacttttgaaactta-aatgaccactttgggaaaaac 20921813  T
Q  216 gaaaa 220  Q
    |||||    
T  20921812 gaaaa 20921808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45380401 - 45380189
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||    
T  45380401 agagcattatccaccatttaccatgcataaaaagatgactaattttaagt-ggtgttatgagccagatttggtaccaaagatgagtttaaagaagcaatt 45380303  T
Q  114 aac-aactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaa 212  Q
    | | ||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||  |||||||||||    
T  45380302 atcaaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaactta-aaggatcactttgggaaa 45380204  T
Q  213 aatgaaaagcttaaa 227  Q
    || ||||| ||||||    
T  45380203 aacgaaaaacttaaa 45380189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 134
Target Start/End: Original strand, 50977866 - 50977984
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  50977866 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactac 50977965  T
Q  116 caactatgttatctacaat 134  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  50977966 caactatgctatctacaat 50977984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 134
Target Start/End: Original strand, 51080998 - 51081116
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  51080998 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactac 51081097  T
Q  116 caactatgttatctacaat 134  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  51081098 caactatgctatctacaat 51081116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 39069726 - 39069878
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  39069726 agagcattatccaccatttgccatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttggtaccaaagataagttaaaggaaacaatt 39069825  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 166  Q
    | |||||||| |||  |||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  39069826 atcaactatgctattaacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 39069878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 50365028 - 50364908
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50365028 agagcattacccaccatttgccatgcctaaaaagattactgattttaagtgagtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 50364929  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  50364928 accaactatgttatctacaat 50364908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33473380 - 33473218
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| ||||||| |  |||||||| |||||    
T  33473380 agagcattatccaccatttatcatgactaaaaagatgactaattttaagtgcgtgttagaaaccagatttggtaccaaagataaaatcaaggaaacaatt 33473281  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 176  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  33473280 accaactatgttatctacaataaaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 33473218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38924124 - 38923963
Alignment:
Q  29 atttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatc 128  Q
    |||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  38924124 atttgtcatgcttaaagagatgattaattttaagtggatgttaggagtccaatttggtaccaaagataagttcaacgaagcaattaccaactattttatc 38924025  T
Q  129 tacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  38924024 tacgataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 38923963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 28699685 - 28699785
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28699685 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtgccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28699784  T
Q  114 a 114  Q
    |    
T  28699785 a 28699785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 134
Target Start/End: Original strand, 34019462 - 34019580
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||   |||||||||| |||||||||     
T  34019462 agcattatccaccatttgacatgcctaaaaatatggctgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaacagtgagttcaagtaagcaattat 34019561  T
Q  116 caactatgttatctacaat 134  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  34019562 caactatgctatctacaat 34019580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 44152700 - 44152769
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 83  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44152700 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagattt 44152769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 47473230 - 47473294
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 78  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  47473230 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtggatgttaggagcca 47473294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 42641288 - 42641213
Alignment:
Q  45 aagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaact 120  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42641288 aagatgattgattttaagtgggtgttaggaggcagacttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaact 42641213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1016996 - 1016879
Alignment:
Q  143 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 242  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||    
T  1016996 tttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgca 1016898  T
Q  243 tttgaccattaattaatta 261  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  1016897 tttgacctttatttaatta 1016879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 50287463 - 50287384
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  50287463 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 50287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 51475431 - 51475541
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  51475431 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaactt-aaagaccttta 51475528  T
Q  237 catacatttgacc 249  Q
     || |||||||||    
T  51475529 gatgcatttgacc 51475541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1687609 - 1687491
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | |||||| | |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  1687609 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgggacttttgaaactta-aatgacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 1687511  T
Q  237 catacatttgaccattaatt 256  Q
     || ||||||||| ||||||    
T  1687510 gatgcatttgacccttaatt 1687491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28699637 - 28699532
Alignment:
Q  143 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 242  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||| |    
T  28699637 tttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaatgacctttagatata 28699539  T
Q  243 tttgacc 249  Q
    |||||||    
T  28699538 tttgacc 28699532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Original strand, 33151905 - 33151959
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  33151905 aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 33151959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 249
Target Start/End: Original strand, 44152775 - 44152907
Alignment:
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaat 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   | ||||||||   | ||| ||  |||||| ||||||    
T  44152775 caactatgttatctataatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagatttttgaaattta-aagaacagctttggaaaaaat 44152873  T
Q  216 gaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  44152874 gaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 44152907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21564454 - 21564343
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||| || |||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  21564454 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgggacttttgaaactta-aagaaccacttcgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 21564356  T
Q  237 catacatttgacc 249  Q
     || |||||||||    
T  21564355 gatgcatttgacc 21564343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47473190 - 47473099
Alignment:
Q  135 atgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 227  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  47473190 atgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttttggacttttgaaactta-aaggaccacttagggaaaaacgaaaaacttaaa 47473099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3697098 - 3697051
Alignment:
Q  143 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3697098 tttgaaacaattcaaaaactaaaagaacttgtttggaacttttgaaac 3697051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28193302 - 28193243
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaa 254  Q
    |||||| | |||| |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  28193302 aaggactattttgagaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagatacatttgaccattaa 28193243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 50364861 - 50364814
Alignment:
Q  202 actttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||    
T  50364861 actttgggaaaaatgaaaaacttaaaagacctttagattcatttgacc 50364814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39069687 - 39069574
Alignment:
Q  135 atgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatg-aaaagcttaaaagactt 233  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |    
T  39069687 atgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaacgaaaaaacttaaaagacct 39069589  T
Q  234 ttacatacatttgac 248  Q
    ||| || ||||||||    
T  39069588 ttagatgcatttgac 39069574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Original strand, 33473422 - 33473475
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  33473422 gacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 33473475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 249
Target Start/End: Original strand, 36315211 - 36315295
Alignment:
Q  164 aaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  36315211 aaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 36315295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 81)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 7651662 - 7651898
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7651662 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 7651761  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  7651762 atcaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 7651860  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  7651861 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgaccat 7651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25988410 - 25988177
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  25988410 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaattac 25988311  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaat 215  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||    
T  25988310 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaactta-aaggacgattttggaaaaaat 25988212  T
Q  216 gaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25988211 gaaaaacttaaaagacctttacatacatttgacca 25988177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 19315640 - 19315874
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19315640 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19315739  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||    
T  19315740 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaa 19315838  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  19315839 atgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 19315874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28425504 - 28425265
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28425504 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28425405  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  28425404 accaactatgctatctgcaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaa 28425306  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaa 254  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||| ||||    
T  28425305 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacctttaa 28425265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 12143072 - 12143303
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12143072 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12143171  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  12143172 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaa--acttaaagacgactttggaaaaa 12143269  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  12143270 atgaaaaactt-aaagacctttagatgcatttgac 12143303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23767555 - 23767320
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23767555 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 23767456  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||    
T  23767455 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagga-ttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttaggaaaa 23767358  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    ||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  23767357 atgaaaaacttaaaggatctttagatacatttgaccat 23767320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 46825531 - 46825765
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46825531 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 46825630  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  46825631 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgagtttgggaaaa 46825729  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| ||  ||||||||    
T  46825730 aggaaaaacttaaaggacctttagatgtatttgacc 46825765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 50689943 - 50690173
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  50689943 agagcattatccatcatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50690042  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  50690043 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 50690141  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacattt 245  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||||    
T  50690142 atgaaaaacttaaaagacctttagatgcattt 50690173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7553157 - 7552923
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7553157 agagcattatccaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7553058  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||  | || ||| | ||||| ||||    
T  7553057 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaactta-aaagaccattttggaaaaa 7552959  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| | | |||| || |||||||||    
T  7552958 atgaaaaacttaaaggccctttaaatgcatttgacc 7552923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Original strand, 49814302 - 49814505
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  49814302 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 49814401  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaat 215  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  || ||||  |||||||||||||     
T  49814402 caactatgctatctagaatatgacttatttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaacttat-aggatcactttgggaaaaac 49814500  T
Q  216 gaaaa 220  Q
    |||||    
T  49814501 gaaaa 49814505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 19274559 - 19274792
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19274559 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 19274658  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | | |||||||||| | | ||    
T  19274659 accagctatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-acggacgacttt-gaagaa 19274756  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  19274757 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 19274792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 46051450 - 46051684
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46051450 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 46051549  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  46051550 accaactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 46051648  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  46051649 acgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 46051684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38473767 - 38473555
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38473767 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38473668  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||| || ||||||||||||    
T  38473667 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aagtaccactttgggaaaa 38473569  T
Q  214 atgaaaagcttaaa 227  Q
    | ||||| ||||||    
T  38473568 acgaaaaacttaaa 38473555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36157818 - 36157584
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36157818 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36157719  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
      ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  36157718 -ccaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 36157621  T
Q  214 atgaaaagcttaaaa-gacttttacatacatttgacc 249  Q
    | |||||  |||||| ||| |||| ||||||| ||||    
T  36157620 acgaaaaatttaaaaggacatttagatacattcgacc 36157584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24204612 - 24204378
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24204612 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactcattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaatt 24204513  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  24204512 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgactcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aagaacgactttgggaaaa 24204414  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  24204413 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 24204378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 26549388 - 26549622
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26549388 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 26549487  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||  |||||    
T  26549488 accaactatgctatctacaataggacttgtttaaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttaagaaaa 26549586  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||  ||||||  || |||| ||| ||||||||    
T  26549587 atgaaacacttaaagtacctttagatatatttgacc 26549622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48802472 - 48802238
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  48802472 agagcattatccaccatttatcatgcctacaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 48802373  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  48802372 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaa 48802274  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  48802273 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 48802238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45350852 - 45350646
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  45350852 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagatcaaggaagcaattacca 45350753  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||    
T  45350752 actatgttatctacaatagg--ttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgaaaaaaatga 45350656  T
Q  218 aaagcttaaa 227  Q
    ||| ||||||    
T  45350655 aaaacttaaa 45350646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 49094848 - 49094647
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49094848 cattatccaccatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 49094749  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||  ||||| ||||||||||    
T  49094748 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggatcactttaggaaaaatga 49094650  T
Q  218 aaa 220  Q
    |||    
T  49094649 aaa 49094647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9878921 - 9878691
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9878921 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaacccgatatggtactaaagatgagttcaaggaagcaattacca 9878822  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||  | || ||| ||||||||||||| ||    
T  9878821 actattttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttatttgggacttttgaaactta-aatgaccactttgggaaaaacga 9878723  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| |||  ||| || |||||||||    
T  9878722 aaaacttaaaggacagttagatgcatttgacc 9878691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 26069896 - 26070126
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  26069896 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccggatttgataccaaaaatgagttcaaggaaacaattacca 26069995  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | || |||   |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||    
T  26069996 actatgatatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttctttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaatga 26070094  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  26070095 aaaatttaaaggacctttaaatacatttgacc 26070126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 33325727 - 33325961
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  33325727 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtcttagaagccagatttgataccaaagatgagtttaaggaagcaatt 33325826  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||    
T  33325827 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaa 33325925  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| || |||| ||||    
T  33325926 acgaaaaacttaaaggacctttagatgcattcgacc 33325961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 33674017 - 33674251
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33674017 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaagatgagttcaaggaagcaatt 33674116  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||| || |||||  |||||    
T  33674117 accagctatgctatctacaataggacttgtttgacacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aagaaccactttaagaaaa 33674215  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33674216 atgaaaaatttaaaagacctttaaatacatttgacc 33674251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 43396675 - 43396909
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43396675 agagcattatccatcatttgctatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43396774  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  43396775 atcaactctgctatctacagtaggatttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaa 43396873  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  43396874 atgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 43396909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7608907 - 7608668
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||    
T  7608907 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacaaaagatgagttcaaagaagcaatt 7608808  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | | |||||||  |  ||| ||| ||||||  ||||    
T  7608807 atcaactatgctatctataataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggatttttgaa--atttaaagaccactttgaaaaaa 7608710  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaat 255  Q
    | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7608709 acgaaaaacttaaaagacttttagatacatttgacctttaat 7608668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 46095216 - 46095004
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  46095216 agagcattatccaccatttgtcatgtttaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagacagatttgatatcaaagatgagttcaaggaaacaatt 46095117  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||  ||||    
T  46095116 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaatttttgaaactta-aaggacgactttgaaaaaa 46095018  T
Q  214 atgaaaagcttaaa 227  Q
    ||||||| ||||||    
T  46095017 atgaaaaacttaaa 46095004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23228335 - 23228119
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23228335 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 23228236  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||  | |||||||||||  | |||||  |||||| |||||    
T  23228235 accaactatgctatctacaatagtacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttagggacttttgaaacttaaaaggatcactttgagaaaa 23228136  T
Q  214 atgaaaagcttaaaaga 230  Q
    ||||||| |||||||||    
T  23228135 atgaaaaacttaaaaga 23228119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 41106016 - 41106168
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41106016 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41106115  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 166  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  41106116 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 41106168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 37216900 - 37217130
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37216900 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagctagagttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattacca 37216999  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | ||||||||| | || ||||||||    
T  37217000 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgacctaggaaaaaatga 37217098  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  37217099 aaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 37217130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 16705870 - 16706082
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16705870 agagcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggcgccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16705969  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||  || |||||||||  | |||||| ||||| ||||||    
T  16705970 accaactatgttatctaaaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgaaatttttgaaactta-aaggaccactttaggaaaa 16706068  T
Q  214 atgaaaagcttaaa 227  Q
    | ||||| ||||||    
T  16706069 acgaaaaacttaaa 16706082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36781311 - 36781079
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  36781311 agcattatccaccatttgccatgcccaaaaagacgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 36781212  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaat 215  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| |||||   |||||     
T  36781211 caactatgatatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttcaaaaaaac 36781113  T
Q  216 gaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||| |||||||||| |||| || |||||||||    
T  36781112 gaaaaacttaaaagacctttagatgcatttgacc 36781079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 18892329 - 18892505
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18892329 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaggatgactaattttcagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 18892428  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  18892429 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttttttggaacttttgaaac 18892505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Original strand, 5400876 - 5401103
Alignment:
Q  19 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 118  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5400876 attatccaccatttg-catgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagaaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 5400974  T
Q  119 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaa 218  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||| |||    
T  5400975 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaaagattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaaacgaa 5401073  T
Q  219 aagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    || |||||| |||||||| || ||||||||    
T  5401074 aaacttaaaggacttttagatgcatttgac 5401103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45670623 - 45670393
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaac- 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  45670623 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 45670525  T
Q  117 aactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatg 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||| |    
T  45670524 aactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttgggacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaaacg 45670426  T
Q  217 aaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||| |||||| ||  |||| || |||||||||    
T  45670425 aaaaacttaaaggatctttagatgcatttgacc 45670393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 9962755 - 9962985
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9962755 cattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaactagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 9962854  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| |||   |||||||||||  | |||||| |||||| |||||| ||    
T  9962855 actatgctatctacaacagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttctttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgagaaaaacga 9962953  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  9962954 aaaacttaaaggacctttaaatgcatttgacc 9962985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 52146993 - 52147223
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  52146993 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 52147092  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    |  ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||   | ||||||||   | |||||| ||||||||||||    
T  52147093 acaaactatgctatatacaacatgacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagatttttgaaattta-aaggaccactttgggaaaa 52147191  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacattt 245  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| || |||||    
T  52147192 acgaaaaacttaaaggacctttagatgcattt 52147223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 50533383 - 50533545
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  50533383 agagcattatccaaaatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50533482  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 176  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  50533483 accaactatgttatctataataggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgttt 50533545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18782226 - 18781994
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  18782226 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctatgaaccagattttgtaccaaagatgagttcaaataagcaattatca 18782127  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||  ||||| ||    
T  18782126 actatgctatctagaatatgacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaacata-aagaaccactttgaaaaaaacga 18782028  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  18782027 aaaacttaaaggacctttagatgcatttgaccat 18781994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 21965069 - 21965301
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| ||    
T  21965069 cattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtaaggagtcagatttggtaccaaagatgagtttaatgaagcaattacca 21965168  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||  ||||||||||||| ||    
T  21965169 attatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggatcactttgggaaaaacga 21965267  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    ||| |||||| ||| |||| ||  ||||||||||    
T  21965268 aaaacttaaaggacctttagatgtatttgaccat 21965301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 336 - 491
Target Start/End: Original strand, 26156627 - 26156778
Alignment:
Q  336 attattgacttgattgtatattccaaactacaccatgttctgttatgttcgttatacatgctttattcttcctcctgttgcctcaaattgattctcatac 435  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26156627 attatggacttgattgtaaattccaaactataccatgttctgttctgttggttatacatgctttattcttcctcctattgcctcaaattgattctcattc 26156726  T
Q  436 cccttgttattagatagatatatacactcgttgtcaagaatttctacactatcaat 491  Q
    |||||||||| ||||||    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26156727 cccttgttatgagatag----atacactcattgtcaagagtttttacactatcaat 26156778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 336 - 491
Target Start/End: Original strand, 26169925 - 26170076
Alignment:
Q  336 attattgacttgattgtatattccaaactacaccatgttctgttatgttcgttatacatgctttattcttcctcctgttgcctcaaattgattctcatac 435  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26169925 attatggacttgattgtaaattccaaactataccatgttctgttctgttggttatacatgctttattcttcctcctattgcctcaaattgattctcattc 26170024  T
Q  436 cccttgttattagatagatatatacactcgttgtcaagaatttctacactatcaat 491  Q
    |||||||||| ||||||    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26170025 cccttgttatgagatag----atacactcattgtcaagagtttttacactatcaat 26170076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 40721342 - 40721555
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagt-gggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40721342 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataattaattttaggttgggtattaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaagaaagcaat 40721441  T
Q  113 taacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaa 212  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||  |||||||||||    
T  40721442 tatcaactatgctatctacaataggacttgttggaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggatcactttgggaaa 40721540  T
Q  213 aatgaaaagcttaaa 227  Q
    || ||||| ||||||    
T  40721541 aacgaaaaacttaaa 40721555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48669533 - 48669375
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  48669533 cattatccattatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatcacca 48669434  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 176  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  48669433 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgttt 48669375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8141623 - 8141452
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||  |    
T  8141623 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacaagtcagatttggtactaaagatgagttcaaagaagcaattacaa 8141524  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8141523 attatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa-aacttgtttggaacttttgaaac 8141452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 41982372 - 41982240
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  41982372 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaatatgactaattttaaatgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaattatca 41982273  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaac 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41982272 actatgttatctacaatatgacttgtttgaaac 41982240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 18917524 - 18917758
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  18917524 agagaattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaatt 18917623  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    |  || |||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||| ||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  18917624 attaaatatgctatctacaatatgatttgtttgaaacgattaaaaaactaaaaggacttgtttgagacttatgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 18917722  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| ||||||  || |||| || |||||||||    
T  18917723 acgaaaaacttaaagaacctttaaatgcatttgacc 18917758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 6711440 - 6711652
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||  || |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6711440 agagcattatccaccatttaccatgtgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6711539  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||  | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| | ||||  ||||    
T  6711540 accaactataatgtctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaataaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccattttgaaaaaa 6711638  T
Q  214 atgaaaagcttaaa 227  Q
    ||||||| ||||||    
T  6711639 atgaaaaacttaaa 6711652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 48319183 - 48319067
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48319183 cattatccaccatttgtaatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 48319084  T
Q  118 actatgttatctacaat 134  Q
    |||||| ||| ||||||    
T  48319083 actatgctatatacaat 48319067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17984039 - 17983864
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17984039 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 17983940  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 189  Q
    |  ||||||||||| |||| || |||||  ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||   ||||||||||    
T  17983939 acaaactatgttatttacattaggacttggttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttaagacttttgaaa 17983864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 52067792 - 52067617
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  52067792 agagcattatccaccatttgtcatccctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaacgatgagttcaaggaagcaatt 52067693  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 189  Q
    |  || ||||  |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   ||||||||||    
T  52067692 acaaattatgccatctacaacatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaa 52067617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 12964646 - 12964867
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12964646 agagcattatacaacatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12964745  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||              |||| ||||| |||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||  | || | | ||||||||||||    
T  12964746 acca--------------aataggacttgtttgaatcgattcaaaaactaaaagaacttgtttgggacttttgaaactta-aatggccactttgggaaaa 12964830  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  12964831 atgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacca 12964867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33714495 - 33714325
Alignment:
Q  19 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  33714495 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatgt-aagtgg-tgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaaacaattatcaa 33714398  T
Q  119 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaaca 191  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||| || ||  |||||||| | || |||||||||    
T  33714397 ctatgttatctacaataggatttgtttgaaacgattcaaaaactagaaagacttgtttgggacatttgaaaca 33714325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 52350065 - 52349913
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  52350065 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaatt 52349966  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 166  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  52349965 accaactatgctatttacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 52349913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 25800648 - 25800875
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaa----gatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| ||| ||||    |||||||||||||||||||||    
T  25800648 cattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta------agatttggtaccaaattaagatgagttcaaggaagcaatt 25800741  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| || ||||    
T  25800742 accaac-atgttatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgacttcggaaaaa 25800839  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  25800840 aagaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 25800875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 135
Target Start/End: Original strand, 9974846 - 9974963
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9974846 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccatatttagtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattacca 9974945  T
Q  118 actatgttatctacaata 135  Q
    |||||| |||||||||||    
T  9974946 actatgctatctacaata 9974963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33194792 - 33194672
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  33194792 agagcattaaccaccattcgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaact 33194693  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  33194692 accaactatgctatctacaat 33194672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Original strand, 34971084 - 34971226
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||| |||||||||| ||| |||||| ||    
T  34971084 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagtcagatttgataccaaatatgagttcaaagaaacaattacca 34971183  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaa 160  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||    
T  34971184 actatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaa 34971226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Original strand, 21929526 - 21929758
Alignment:
Q  19 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaag-------atgagttcaaggaagcaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||       ||||||||||||||||||    
T  21929526 attatccaccatttgccat--ctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgaaagatgagttcaaggaagcaa 21929623  T
Q  112 ttaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaa 211  Q
    ||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||| | ||    
T  21929624 ttaccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttagaaa 21929722  T
Q  212 aaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    ||| ||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  21929723 aaacgaaaaactt-aaagacctttagatgcatttgac 21929758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44978868 - 44978677
Alignment:
Q  54 aattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaat 153  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||| |||||||| ||    
T  44978868 aattttaagtgg-tattaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattatcaattatgctatctacattctgacttgtttgaaacgat 44978770  T
Q  154 ttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttga 247  Q
    | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||    
T  44978769 tcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttaaatgcatttga 44978677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16506925 - 16506809
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  16506925 cattatccaccatttgccatgcttaaaaagatggctgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaattacca 16506826  T
Q  118 actatgttatctacaat 134  Q
    |||||| ||||||||||    
T  16506825 actatgctatctacaat 16506809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 30281631 - 30281751
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30281631 agagcattatccaccattttacatgcctaaaaagataactggtattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 30281730  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  30281731 accaactatgctatctacaat 30281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Original strand, 50099220 - 50099277
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50099220 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgtta 50099277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 44979329 - 44979281
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaag 62  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44979329 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 44979281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 32373694 - 32373650
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32373694 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 32373650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22351137 - 22351031
Alignment:
Q  143 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 242  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| || ||    
T  22351137 tttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaactaaaaacttaaaggacctttagatgca 22351039  T
Q  243 tttgacca 250  Q
    ||||||||    
T  22351038 tttgacca 22351031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 52146945 - 52146839
Alignment:
Q  143 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 242  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||    
T  52146945 tttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacatttagatgca 52146847  T
Q  243 tttgacca 250  Q
    ||||||||    
T  52146846 tttgacca 52146839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19274456 - 19274375
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  19274456 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgaccat 19274375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 52349914 - 52349864
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacattt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  52349914 aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaagacctttagatatattt 52349864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25800512 - 25800459
Alignment:
Q  198 gacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  25800512 gacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatacatttgaccat 25800459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41105913 - 41105833
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  41105913 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 41105833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 49814258 - 49814205
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49814258 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaataacttgtttggaacttttgaaac 49814205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16505249 - 16505138
Alignment:
Q  143 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 242  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  || |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||  |||| || ||    
T  16505249 tttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaacttat-aggacgacttcgggaaaaactaaaaacttaaaggatctttagatgca 16505151  T
Q  243 tttgaccattaat 255  Q
    |||||||| ||||    
T  16505150 tttgaccaataat 16505138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12143018 - 12142916
Alignment:
Q  142 atttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatac 241  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |    
T  12143018 atttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aagaacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgc 12142920  T
Q  242 attt 245  Q
    ||||    
T  12142919 attt 12142916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 249
Target Start/End: Original strand, 16508118 - 16508222
Alignment:
Q  143 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 242  Q
    |||||||||||| |||| | ||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| || ||    
T  16508118 tttgaaacaattcaaaact-aaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaactaaaaacttaaaggacctttagatgca 16508215  T
Q  243 tttgacc 249  Q
    |||||||    
T  16508216 tttgacc 16508222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 17989906 - 17989864
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattt 58  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17989906 agcattattcactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 17989864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9974800 - 9974747
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  9974800 gacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaac 9974747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 46825458 - 46825346
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||    ||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  46825458 gacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagtcttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 46825360  T
Q  237 catacatttgacca 250  Q
     || ||||| ||||    
T  46825359 gatgcatttaacca 46825346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 50533248 - 50533199
Alignment:
Q  202 actttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  50533248 actttggaaaaaatgaaaaacttaaaggacctttaaatacatttgaccat 50533199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12964603 - 12964551
Alignment:
Q  138 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  12964603 acttgtttgaaacaattcaaaaattaaaagaacttgtttgagacttttgaaac 12964551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 250
Target Start/End: Original strand, 18782365 - 18782413
Alignment:
Q  202 actttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  18782365 actttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacca 18782413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37216794 - 37216711
Alignment:
Q  168 aacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccatt 252  Q
    ||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||  |||| || ||||||||||||    
T  37216794 aacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggaactttagatgcatttgaccatt 37216711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 47219145 - 47219379
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47219145 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47219244  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||  ||||    
T  47219245 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgaaaaaa 47219343  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  47219344 atgaaaaacttaaaggacctttaaatgcatttgacc 47219379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1469634 - 1469398
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1469634 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaacaaagatgagttcaaggaagcaatt 1469535  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   || ||||||||  | |||||| ||||| ||||||    
T  1469534 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacctttgaaactta-aaggaccactttaggaaaa 1469436  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1469435 atgaaaaacttaaaagacctttagatacatttgaccat 1469398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 44544409 - 44544643
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44544409 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 44544508  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||  | |||||||||||||||||||    
T  44544509 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgtttgggactttagaaactta-aaggacgactttgggaaaa 44544607  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  44544608 atgaaaaacttaaaggatctttagatacatttgacc 44544643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47294432 - 47294198
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47294432 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47294333  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  47294332 accaacgatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 47294234  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  47294233 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 47294198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 47271981 - 47272215
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47271981 agagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47272080  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | |||||||  | |||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  47272081 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgttttagaattttgaaactta-aatgacgactttgggaaaa 47272179  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  47272180 atgaaaaacttaaaggacatttagatgcatttgacc 47272215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 48628805 - 48629039
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  48628805 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtgcaaaaaatgagttcaaggaagcaatt 48628904  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  48628905 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 48629003  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  48629004 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 48629039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8162853 - 8162677
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  8162853 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataacaaagatgagttcaaggaagcaatt 8162754  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||    
T  8162753 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaataacttgtttgagacttttgaaac 8162677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38427704 - 38427483
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  38427704 agagcattatccgccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38427605  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | || |||||||||| |||||    
T  38427604 accaactatgctatctataataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaagacgactttgagaaaa 38427506  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||    
T  38427505 atgaaaaacttaaaggaccttta 38427483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 7336065 - 7336291
Alignment:
Q  19 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 118  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  7336065 attattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaatgatgagttcaaggaagcaattatcaa 7336164  T
Q  119 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaa 218  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||  |||||||||    
T  7336165 ctatgctatctacaata-gaactgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttggaatttttgaaactta-aaggacgactttgaaaaaaatgaa 7336262  T
Q  219 aagcttaaaagacttttacatacatttga 247  Q
    || |||||| ||| |||| || |||||||    
T  7336263 aaacttaaaggacctttagatgcatttga 7336291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11476697 - 11476463
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11476697 agagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 11476598  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  11476597 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 11476499  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |  |||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  11476498 acaaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 11476463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 30876259 - 30876493
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  30876259 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcccaatttggtaccaaaaatgagttcaatgaagcaatt 30876358  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  30876359 accaactatgctatctacaatagcacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 30876457  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  30876458 acgaaaaacttaaaggacctttaaatgcatttgacc 30876493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31684275 - 31684041
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31684275 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31684176  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||  ||    
T  31684175 accaactattctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggggaa 31684077  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  31684076 acgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 31684041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35600263 - 35600029
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35600263 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35600164  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| |||   |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||    
T  35600163 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaa 35600065  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| ||  ||||||||    
T  35600064 atgaaaaacttaaaggacctttaaatgtatttgacc 35600029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 248
Target Start/End: Original strand, 221299 - 221508
Alignment:
Q  38 gcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatg 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  221299 gcctaaaaagaagactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaatagg 221398  T
Q  138 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttac 237  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| |||||  | |||||| |||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||     
T  221399 acttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttggaacttttgaaactta-aaggacgactttcgaaaaaatgaaaaacttaaaagacttttag 221497  T
Q  238 atacatttgac 248  Q
    || ||||||||    
T  221498 atgcatttgac 221508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47281265 - 47281103
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47281265 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47281166  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 176  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  47281165 accaactatggtatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 47281103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37394135 - 37393904
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  37394135 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactacca 37394036  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatg- 216  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| |     
T  37394035 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacga 37393937  T
Q  217 aaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  37393936 aaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 37393904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45723632 - 45723398
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||    
T  45723632 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaatt 45723533  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    |  || |||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||| |||||||||| ||||    
T  45723532 actaattatgctatctacaatatgatttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttgaaactta-aagaacgactttggaaaaa 45723434  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  45723433 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 45723398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2960768 - 2960547
Alignment:
Q  27 ccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgtta 126  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  2960768 ccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgcta 2960669  T
Q  127 tctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaa 226  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||| |||||| ||| | |||||    
T  2960668 tctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgagaaaaacgaacaacttaa 2960570  T
Q  227 aagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||| |||| || |||||||||    
T  2960569 aggacctttagatgcatttgacc 2960547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30798509 - 30798275
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30798509 agagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 30798410  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||| || || |||||  |||||||| | |||||||||  || ||| ||| ||||| ||||||    
T  30798409 accaactatgctatctacaataggatttgtttgaaacgattcaacaactaaaaggacttgtttgggacttttgaa--acttaaagaccactttaggaaaa 30798312  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    | ||||| || ||||||| |||| || ||||||||||    
T  30798311 acgaaaaactcaaaagacctttatatgcatttgacca 30798275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 23842305 - 23842481
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23842305 agagcattatccaccatctgccatgcctaaaaagatgactaatttgaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 23842404  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  23842405 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 23842481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 42979479 - 42979245
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  42979479 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttgatatcaaagatgagttcaacgaagcaatt 42979380  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||| |||||  |||||||| ||| |||||||||  | |||||  ||||| | ||||    
T  42979379 accaactatgttatctacagtaggacttgtttgaaacgattcacaaactaaaaggacttgtttagaa-ttttgaaacttaaaaggaacacttttgaaaaa 42979281  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  42979280 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 42979245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Original strand, 33884323 - 33884465
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33884323 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 33884422  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaa 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33884423 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatttaaaaa 33884465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 40851274 - 40851507
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  40851274 agagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaatt 40851373  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||  || |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||  |||||  ||||||||  || |||||||||  | ||||||||||||   ||||    
T  40851374 accaactattctacctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaagctaaaaggacttgtttgaaatttttgaaactta-aaggacgactttaaaaaaa 40851472  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||    
T  40851473 atgaaaaacttaaaggacatttagatgcatttgac 40851507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43752917 - 43752697
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43752917 agagcattatccaccatttgtcctgcctcaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43752818  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| | |||   ||||    
T  43752817 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccattttaaaaaaa 43752719  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagactttt 235  Q
    ||||||| |||||| |||||||    
T  43752718 atgaaaaacttaaaggactttt 43752697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41139553 - 41139315
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41139553 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41139454  T
Q  114 aacaac----tatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttggg 209  Q
    | ||||    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | |||  |||||||| | |||||||||||  | ||| || |||||||     
T  41139453 accaactatatatgctatttacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaact-aaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aagtacaactttgga 41139356  T
Q  210 aaaaatgaaaagcttaaaa-gacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  41139355 aaaaatgaaaaacttaaaaggacctttagatacatttgacc 41139315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 41113377 - 41113612
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  41113377 agagcattattcatcatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 41113476  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||| |||||||  |||    
T  41113477 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttggagaaa 41113575  T
Q  214 atg-aaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||| ||||||  || |||| ||||||||||||    
T  41113576 atgaaaaaacttaaataacctttagatacatttgacc 41113612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 47119991 - 47120227
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  47119991 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaatatgagttcaagaaagcaatt 47120090  T
Q  114 aacaac--tatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaa 211  Q
    | ||||  |||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||  ||||||| ||    
T  47120091 accaactatatgctctctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggatcactttggaaa 47120189  T
Q  212 aaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  47120190 aaatgaaaaacttaaaggacatttagatgcatttgacc 47120227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47579228 - 47579016
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagc-aat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  47579228 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatggttaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaaat 47579129  T
Q  113 taacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaa 212  Q
    || ||| |||| |||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||  | |||||| |||||| ||||    
T  47579128 taccaattatgctatctataataggacttgtctgaaacaattcaaaaactaaaatgacttg-tttggacttttgaaactta-aaggaccactttgagaaa 47579031  T
Q  213 aatgaaaagcttaaa 227  Q
    |||||||| ||||||    
T  47579030 aatgaaaaacttaaa 47579016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27364480 - 27364328
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27364480 agagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaatt 27364381  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 166  Q
    | |||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||| |||||    
T  27364380 accaactatgttatctacaataggatctgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 27364328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11050398 - 11050188
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11050398 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggaggcagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaattacca 11050299  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    | |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | |||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||    
T  11050298 aatatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactgaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacga 11050200  T
Q  218 aaagcttaaaag 229  Q
    ||| || |||||    
T  11050199 aaaactcaaaag 11050188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43968400 - 43968238
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43968400 agagcattatccaccatttgtcatgcctataaagatgactaattttaagtgggtattatgagccaaatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 43968301  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 176  Q
    | |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  43968300 accaactacgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 43968238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44800547 - 44800389
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  44800547 cattatccaccatatatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccatatttggtaccaaagatgagttcaatgaaacaattacca 44800448  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 176  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  44800447 actatgttatctacaacaggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaagaacttgttt 44800389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30972082 - 30971908
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||    
T  30972082 agagcattatccacaatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgggtttaaggaagtaatt 30971983  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 189  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  30971982 accaactatgccatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaacgacttg-tttgaaattttgaaa 30971908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3797664 - 3797544
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3797664 agagcattatccaccatttaacatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3797565  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  3797564 atcaactatgctatctacaat 3797544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 150
Target Start/End: Original strand, 4923220 - 4923352
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4923220 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattacca 4923319  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaac 150  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  4923320 actatgctatccacaataggacttgtttgaaac 4923352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 149
Target Start/End: Original strand, 29248342 - 29248477
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||    
T  29248342 agagaattatccacaatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttgatgccaaagatgagttcaaggaatcaatt 29248441  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaa 149  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  29248442 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaa 29248477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 18353148 - 18353306
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  18353148 cattatccaccatttatcatgtctaaaaagatgactaattttaattaggtgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaagaaaacaattacca 18353247  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 176  Q
    |||||| |||||||  || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  18353248 actatgctatctaccttaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 18353306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 27774108 - 27774228
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  27774108 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctgattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaatt 27774207  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  27774208 accaactatgctatctacaat 27774228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37354400 - 37354284
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  37354400 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccaaatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 37354301  T
Q  118 actatgttatctacaat 134  Q
    |||||| ||||||||||    
T  37354300 actatgctatctacaat 37354284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 107
Target Start/End: Original strand, 40520918 - 40521011
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40520918 agagcattatccaccatttgccatggctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaa 40521011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 42888937 - 42889065
Alignment:
Q  102 aaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacg 201  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||  ||||||||||||  | |||||||    
T  42888937 aaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttatttgaaacttttgaaactta-aaggacg 42889035  T
Q  202 actttgggaaaaatgaaaagcttaaaagac 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42889036 actttgggaaaaatgaaaaacttaaaagac 42889065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23842263 - 23842151
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  23842263 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgttttgaacttttgaaactta-aaggaccactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggactttta 23842165  T
Q  237 catacatttgacca 250  Q
     || ||||||||||    
T  23842164 gatgcatttgacca 23842151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 39034062 - 39034122
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 74  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39034062 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggcgttagga 39034122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 42888833 - 42888715
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  42888833 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaatgaccttta 42888735  T
Q  237 catacatttgaccattaatt 256  Q
     || ||||||||||| ||||    
T  42888734 gatgcatttgaccataaatt 42888715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 250
Target Start/End: Original strand, 47294474 - 47294586
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  47294474 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggaccttta 47294572  T
Q  237 catacatttgacca 250  Q
     || ||||||||||    
T  47294573 gatgcatttgacca 47294586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 5106127 - 5106275
Alignment:
Q  99 ttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataagg 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | ||||    
T  5106127 ttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataaga-atgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgagacttttgaaactta-aagg 5106224  T
Q  199 acgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||  || |||| || |||||||||    
T  5106225 acgattttggaaaaaatgaaaaacttaaataacctttagatgcatttgacc 5106275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40851241 - 40851129
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  40851241 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 40851143  T
Q  237 catacatttgacca 250  Q
     || ||||||||||    
T  40851142 gatgcatttgacca 40851129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 31684317 - 31684428
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  31684317 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaaatgcaaaacttaaaggaccttta 31684415  T
Q  237 catacatttgacc 249  Q
     || |||||||||    
T  31684416 gatgcatttgacc 31684428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39033966 - 39033879
Alignment:
Q  161 ttaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  39033966 ttaaaagaacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 39033879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47119949 - 47119838
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  47119949 gacttatttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 47119851  T
Q  237 catacatttgacc 249  Q
     || |||||||||    
T  47119850 gatgcatttgacc 47119838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 57
Target Start/End: Original strand, 43025112 - 43025155
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaatt 57  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43025112 agagcaatatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaatt 43025155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47271851 - 47271800
Alignment:
Q  198 gacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  47271851 gacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacatttagatgcatttgacc 47271800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Original strand, 1469762 - 1469816
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  1469762 aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacatttagatgcatttgacc 1469816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25801565 - 25801472
Alignment:
Q  156 aaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  25801565 aaaaactaaaaggacttgtttaggacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 25801472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27773088 - 27772983
Alignment:
Q  143 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 242  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| || ||    
T  27773088 tttgaaacgattcaaaaactaaaaggactagtttggaacttttgaaattta-aaggacgactttgggaaaaactaaaaacttaaaggacctttagatgca 27772990  T
Q  243 tttgacc 249  Q
    |||||||    
T  27772989 tttgacc 27772983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29739598 - 29739521
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttga 247  Q
    |||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||    
T  29739598 acttgtttggaacttttgaaactta-aaggactactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttga 29739521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 249
Target Start/End: Original strand, 30972122 - 30972234
Alignment:
Q  135 atgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttt 234  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| | |||||| | |||||||||||  | || ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| ||    
T  30972122 atgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgatttgtttgggacttttgaaactta-aaagacgactttgggaaaatcgaaaaactt-aaagacctt 30972219  T
Q  235 tacatacatttgacc 249  Q
    || || |||||||||    
T  30972220 tagatgcatttgacc 30972234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Original strand, 43968528 - 43968582
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  43968528 aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 43968582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45233518 - 45233468
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacattt 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||    
T  45233518 aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagatacattt 45233468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 29739781 - 29739829
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagt 63  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||    
T  29739781 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaa-gatgactaattttaagt 29739829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34378569 - 34378512
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa-gacttttacatacatttgaccat 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  34378569 aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaaggacctttaaatgcatttgaccat 34378512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 250
Target Start/End: Original strand, 45233641 - 45233753
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  45233641 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgaaaaaaatgaaaaatttaaaggaccttta 45233739  T
Q  237 catacatttgacca 250  Q
     || ||||||||||    
T  45233740 gatgcatttgacca 45233753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48628677 - 48628644
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48628677 aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaa 48628644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 3875908 - 3876129
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3875908 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3876007  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  3876008 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 3876106  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||    
T  3876107 atgaaaaacttaaaggaccttta 3876129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 37933646 - 37933877
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37933646 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 37933745  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  37933746 actatgctatctacgataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatga 37933844  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||| |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  37933845 aaaacttaaaggacttttagatgcatttgacca 37933877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 2533272 - 2533508
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2533272 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2533371  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac-acataaggacgactttgggaaa 212  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||   | ||||| |||||| | |||    
T  2533372 accaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaacttaaaaaggatgacttttgaaaa 2533471  T
Q  213 aatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||| |||||| || ||||| || |||||||||    
T  2533472 aatgaaaaacttaaatgagttttagatgcatttgacc 2533508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9056479 - 9056247
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9056479 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 9056380  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataag-gacgactttgggaaa 212  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||  ||||||||||  || |||| ||||||||||| |||    
T  9056379 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaatgatttgtttgaaacttttgaa--acttaagagacgactttggaaaa 9056282  T
Q  213 aatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttga 247  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||    
T  9056281 aatgaaaaacttaaaggacctttagatacatttga 9056247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22684129 - 22683888
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22684129 agagcattattcaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 22684030  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  22684029 accaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 22683931  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaatt 256  Q
    ||||||| |||||| ||  |||| || ||||||||| ||||||    
T  22683930 atgaaaaacttaaaggagctttagatgcatttgacctttaatt 22683888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36400211 - 36399976
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36400211 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36400112  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  36400111 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 36400013  T
Q  214 atgaaaagcttaaaa-gacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||    
T  36400012 acgaaaaacttaaaaggacctttagatgcatttgacc 36399976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 513308 - 513541
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  513308 agagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 513406  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||| ||||   |||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  513407 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggactagtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaa 513505  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  513506 atgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 513541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35884569 - 35884335
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  35884569 agcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 35884470  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || |||||||| | ||||||| ||| | ||||||||    
T  35884469 caactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaactc-taaggaccactctaggaaaaat 35884371  T
Q  216 gaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  35884370 gaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgaccat 35884335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 38107103 - 38107333
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38107103 cattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 38107202  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  38107203 actatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttttttgggacttttgaaactta-aaggacgacttcgggaaaaatga 38107301  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  38107302 aaaacttaaaggacatttagatgcatttgacc 38107333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 35443311 - 35443545
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35443311 agagcattatccactatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35443410  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||  ||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  35443411 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaacaaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 35443509  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  35443510 atgaaaatcttaaaggacctttagatgcatttgacc 35443545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 249
Target Start/End: Original strand, 15847117 - 15847346
Alignment:
Q  19 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 118  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15847117 attatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 15847216  T
Q  119 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaa 218  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| || ||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||    
T  15847217 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttggagcttttgaaactta-aaggaccactttaggaaaaatgaa 15847315  T
Q  219 aagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    || ||||||| || || | || |||||||||    
T  15847316 aaacttaaaaaaccttaagatgcatttgacc 15847346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 259982 - 260211
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  259982 cattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 260080  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   | |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  260081 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagaattttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatga 260179  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  260180 aaaacttaaaggacatttagatgcatttgacc 260211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 655939 - 655710
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  655939 cattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 655841  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   | |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  655840 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagaattttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatga 655742  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  655741 aaaacttaaaggacatttagatgcatttgacc 655710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 841674 - 841445
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  841674 cattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 841576  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   | |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  841575 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagaattttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatga 841477  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  841476 aaaacttaaaggacatttagatgcatttgacc 841445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43806674 - 43806440
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43806674 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43806575  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| |||||  |||||    
T  43806574 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgcgacttttgaaactta-aaggaccactttaagaaaa 43806476  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||| ||| |||  || |||||||||    
T  43806475 acgaaaaacttaaaggacctttgaatgcatttgacc 43806440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 12010549 - 12010784
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  12010549 agagcattatccaccatttgccatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggcaacaatt 12010648  T
Q  114 aacaactatgttat---ctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttggga 210  Q
    | |||||||| |||   |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||||||    
T  12010649 accaactatgctatctactacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttggga 12010747  T
Q  211 aaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttga 247  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||    
T  12010748 aaaatgaaaaacttaaaggacatttagatgcatttga 12010784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 33651841 - 33652075
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33651841 agagcattatccaccgtttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatgaaagatgagttcaaggaaacaatt 33651940  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    |  ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | || ||| ||||| ||||||    
T  33651941 acaaactatgctatctacgataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaactta-aaagaccactttaggaaaa 33652039  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  33652040 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 33652075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 248
Target Start/End: Original strand, 440844 - 441073
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||| |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  440844 cattatccaccgtttgccatgtctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaattacca 440943  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||    
T  440944 actatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacaactttaggaaaaatga 441042  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    ||| |||||| ||| |||| |||||||||||    
T  441043 aaaacttaaaggacctttagatacatttgac 441073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 1293486 - 1293648
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  1293486 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1293585  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 176  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  1293586 accaactatgttatctacaacatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 1293648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41536653 - 41536434
Alignment:
Q  29 atttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatc 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41536653 atttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaattaccaactatgctatc 41536554  T
Q  129 tacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa 228  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | || ||||||||||  ||||||||||| ||||||     
T  41536553 tacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaagacgactttgaaaaaaatgaaaaacttaaag 41536455  T
Q  229 gacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||| || |||||||||    
T  41536454 gacctttagatgcatttgacc 41536434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 13797089 - 13797322
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  || |||| |||||||||| |||||||||    
T  13797089 agagcatcgtccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttatgtggatgttaggagccagatttgataccaaa-atgagttcaaagaagcaatt 13797187  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  13797188 accaactatgctatatacaataggatttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 13797286  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||||||||    
T  13797287 atgaaaaacttaaaagacctttagatgcatttgacc 13797322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23972437 - 23972201
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccattt-gtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 112  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23972437 agagtattatccaacattttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgataggagtcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 23972338  T
Q  113 taacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttggg-aa 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||  | |||||| |||||||| ||    
T  23972337 taccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaactta-aaggaccactttgggaaa 23972239  T
Q  212 aaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||| |||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  23972238 aaataaaaaacttaaaggacctttatatgcatttgacc 23972201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39513480 - 39513327
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39513480 agagtattatccaccatatgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 39513381  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaat 167  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39513380 accaactatgttatctacattaggacttatttgaaacaatttaaaaactaaaat 39513327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 28707587 - 28707435
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28707587 agagcattatccaccatttgtcatgccttaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 28707488  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 166  Q
    | ||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||| ||||| |||||    
T  28707487 accaattatgatatctacaataggatttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 28707435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 7434886 - 7435006
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7434886 agagcattatccaccatttgtcaagcctataaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7434985  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  7434986 accaactatgttatctacaat 7435006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28496495 - 28496262
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28496495 agagtattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattagaa-ctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28496397  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||  | || ||| |||||   ||||    
T  28496396 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaactta-aatgaccactttataaaaa 28496298  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||  ||||| |||||||| || |||||||||    
T  28496297 atgaaaaatttaaaggacttttagatgcatttgacc 28496262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 38208756 - 38208914
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaag-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaac 116  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  38208756 cattatccaccatttgccatgtctaaaatggatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtagcaaagatgagttcaaagaagcaattacc 38208855  T
Q  117 aactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
T  38208856 aactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa-aacttgttt 38208914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42988367 - 42988135
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| || |||| || |||||||||    
T  42988367 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaatataagttaaatgaagcaatt 42988268  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||| ||||  | || ||||||||||| ||||    
T  42988267 atcaactatattatctacaataggactt-tttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgagacttttaaaactta-aatgacgactttggaaaaa 42988170  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  42988169 atgaaaaacttgaaagacctttaaatacatttgac 42988135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24430712 - 24430478
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||  || |||||    
T  24430712 agagcattatccaccttttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagtagtgagatttggtaccaaagatgagttcaataaaacaatt 24430613  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||  | || ||| ||||||  ||||    
T  24430612 atcaactatactatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttttggatttttgaaactta-aaagaccactttgaaaaaa 24430514  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  24430513 acgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 24430478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 36218917 - 36218747
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36218917 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgctagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaa-gaagcaattatca 36218819  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 189  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36218818 actatattatctacatcatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttagaacttttgaaa 36218747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 23935233 - 23935353
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23935233 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 23935332  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  23935333 atcaactatgctatctacaat 23935353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38633851 - 38633675
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38633851 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38633752  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  || |||||   |||||||||||    
T  38633751 accaactatgctatctacattagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacctgtttgagacttttgaaac 38633675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40302030 - 40301889
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  40302030 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgagtgttaggagctagatttggtaccaaagataaattcaatgaagcaattacca 40301931  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaa 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  40301930 actatgctatctacaatatgacttttttgaaacgattcaaaa 40301889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 134
Target Start/End: Original strand, 6016207 - 6016325
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  6016207 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccaaattgagtatcaaagatgagtttaaagaagcaattac 6016306  T
Q  116 caactatgttatctacaat 134  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  6016307 caactatgctatctacaat 6016325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 245
Target Start/End: Original strand, 4649154 - 4649380
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  4649154 cattatccaccatttgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtggatgttggaagtcagatttggtaccaaagacgagttcaaggaaacaattacca 4649253  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    | |||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | || |||  |||||||||||||||    
T  4649254 attatgctatctacaattggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aatgaccgctttgggaaaaatga 4649352  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacattt 245  Q
    ||| ||| || ||| |||| || |||||    
T  4649353 aaaacttgaaggacctttagatgcattt 4649380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 29485287 - 29485406
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29485287 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaa-atgactgattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29485385  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  29485386 accaactatgttatctacaat 29485406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24193195 - 24193109
Alignment:
Q  90 aaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  24193195 aaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattaaaaaactaaaaggacttgttt 24193109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 24193433 - 24193356
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaa 92  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24193433 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggagccagatttggtaccaaa 24193356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 250
Target Start/End: Original strand, 22684171 - 22684283
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  22684171 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 22684269  T
Q  237 catacatttgacca 250  Q
     || ||||||||||    
T  22684270 gatgcatttgacca 22684283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 79
Target Start/End: Original strand, 8137180 - 8137239
Alignment:
Q  20 ttatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccag 79  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8137180 ttatccaccatttgctatgcctaaaaaaatgactaattttaagtaggtgttaggagccag 8137239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6016162 - 6016052
Alignment:
Q  138 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttac 237  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  6016162 acttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgtgacttttgaaactta-aaggatcacttttggaaaaatgaaaaacttaaaggacttttaa 6016064  T
Q  238 atacatttgacc 249  Q
    || |||||||||    
T  6016063 atgcatttgacc 6016052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 257
Target Start/End: Original strand, 43806772 - 43806867
Alignment:
Q  164 aaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa-gacttttacatacatttgacc-attaatta 257  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||    
T  43806772 aaatgacttgtttgggacttttgaaacttaaaaggactactttgggaaaaatggaaaacttaaaaggacatttagatgcatttgacctattaatta 43806867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2533230 - 2533158
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttggga 210  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  2533230 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttaggacttttgaaactta-aaggacgactttggga 2533158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35443207 - 35443128
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  35443207 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaactt-aaagacctttagatacatttgacca 35443128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15847035 - 15846956
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  15847035 acttgtttggaacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaacaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 15846956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 55517326 - 55517094
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55517326 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 55517227  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  55517226 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 55517128  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  55517127 atgaaaaactt-aaagacctttagatgcatttgac 55517094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 28264643 - 28264877
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28264643 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28264742  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  28264743 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 28264841  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  28264842 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 28264877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 31591076 - 31591309
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31591076 agagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31591174  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  31591175 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgactcgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 31591273  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  31591274 atgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 31591309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 249
Target Start/End: Original strand, 49118616 - 49118845
Alignment:
Q  19 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  49118616 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 49118715  T
Q  119 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaa 218  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  49118716 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaa 49118814  T
Q  219 aagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    || |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  49118815 aaacttaaacgacatttagatacatttgacc 49118845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33807921 - 33807688
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33807921 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 33807822  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  33807821 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaa--acttaaagacgactttgggaaaa 33807724  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  33807723 atgaaaaacttaaatgacctttagatgcatttgacc 33807688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4545126 - 4544893
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4545126 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaatt 4545027  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  4545026 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacctttgaaactta-aaggactactttagaaaaa 4544928  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||    
T  4544927 atgaaaaactt-aaagacctttagatgcatttgacc 4544893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 12196469 - 12196699
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12196469 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 12196568  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||| |  | |||||||||||||||||||    
T  12196569 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaagctta-aaggacgactttgggaaaa 12196667  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacattt 245  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||    
T  12196668 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcattt 12196699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24458770 - 24458536
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  24458770 agcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 24458671  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || |||||||| | ||||||| ||| | ||||||||    
T  24458670 caactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaactc-taaggaccactctaggaaaaat 24458572  T
Q  216 gaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  24458571 gaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgaccat 24458536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 42273802 - 42274036
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42273802 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 42273901  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   | |||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  42273902 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagatttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaa 42274000  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||  || |||||||||    
T  42274001 atgaaaaacttaaaggaccttttgatgcatttgacc 42274036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Original strand, 31973591 - 31973828
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31973591 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31973690  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||  | |||||  ||||||||||||    
T  31973691 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaactta-aaggatcactttgggaaaa 31973789  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccatt 252  Q
    | |||||  ||||| ||| |||| || ||||||||||||    
T  31973790 acgaaaaatttaaaggacatttagatgcatttgaccatt 31973828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Original strand, 44490324 - 44490540
Alignment:
Q  19 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  44490324 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaactttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 44490423  T
Q  119 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaa 218  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  44490424 ctatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaa 44490522  T
Q  219 aagcttaaaagactttta 236  Q
    || |||||| ||| ||||    
T  44490523 aaacttaaaggacattta 44490540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19496243 - 19496008
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19496243 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggcgccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19496144  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||| | || |||||||   | |||||  ||||||||||||    
T  19496143 accaactatggtatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaattta-aaggatcactttgggaaaa 19496045  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||||||| |||||||||  |||| || ||||||||||    
T  19496044 atgaaaaacttaaaagaactttagatgcatttgacca 19496008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 15985010 - 15985243
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15985010 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagattactgattttaagtaggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 15985109  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||    
T  15985110 accaactatgttatctagaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaa 15985208  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15985209 acgaaaaacttaaaa-acttttagatacatttgacc 15985243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33174160 - 33173927
Alignment:
Q  15 gagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33174160 gagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatta 33174061  T
Q  115 acaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaa 214  Q
     ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | || ||||||||||| |||||    
T  33174060 ccaactatgaaatctacaataagacttgtttgaaacgatttgaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aatgacgactttggaaaaaa 33173962  T
Q  215 tgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  33173961 tgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 33173927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23135143 - 23134916
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23135143 cattagccaccatttggcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 23135044  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||  ||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  23135043 actatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgaaacttttgaaactta-aaggatgactttgggaaaaatga 23134945  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttg 246  Q
    ||| |||| | ||| |||| || ||||||    
T  23134944 aaaacttacaggacctttagatgcatttg 23134916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Original strand, 40988633 - 40988869
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  40988633 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 40988732  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||    ||||||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||    
T  40988733 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt----aattaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttaggaaaa 40988827  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaat 255  Q
    |  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  40988828 acaaaaaacttaaaggacttttagatacatttgaccaataat 40988869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 5227390 - 5227624
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5227390 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatactaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 5227489  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | ||| || ||||||| ||||    
T  5227490 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aagaaccactttggaaaaa 5227588  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  5227589 acgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 5227624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11795295 - 11795059
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11795295 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 11795196  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||    
T  11795195 accaactatgctatctagaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaa 11795097  T
Q  214 atg-aaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    | | |||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  11795096 acgaaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 11795059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Original strand, 26017425 - 26017657
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  26017425 agcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 26017524  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaat 215  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| || ||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||    
T  26017525 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactacaaggacttgtttgtgacttttgaaactta-aaggacaactttggaaaaaat 26017623  T
Q  216 gaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||| || ||| ||| |||| || |||||||||    
T  26017624 gaaaaactcaaaggacctttagatgcatttgacc 26017657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48707874 - 48707662
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48707874 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 48707775  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||  ||||| |||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  ||||    
T  48707774 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaaagattcaaaatctaaaagaacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgaaaaaa 48707676  T
Q  214 atgaaaagcttaaa 227  Q
    ||||||| ||||||    
T  48707675 atgaaaaacttaaa 48707662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28812427 - 28812193
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28812427 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtaccaaagatgacttcaaggaagcaatt 28812329  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||  ||||||||||||    
T  28812328 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggatcactttgggaaaa 28812230  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  28812229 acgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 28812193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 23553069 - 23553306
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23553069 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 23553167  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    | |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||| ||    
T  23553168 attatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgtgacttttaaaactta-aaggaccactttagaaaaaacga 23553266  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaatta 257  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||||| ||||    
T  23553267 aaaacttaaaggacctttagatgcatttgaccatttatta 23553306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48551901 - 48551671
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  48551901 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagattttgtaccaaagatgagttcaagaaagcaattacca 48551802  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||| ||    
T  48551801 accatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaaacga 48551703  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  48551702 aaaacttaaaggacatttagatgcatttgacc 48551671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 2055280 - 2055454
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  2055280 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaactttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattat 2055379  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  2055380 caactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaacaaaaacgacttgtttggaacttttaaaac 2055454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8882152 - 8881912
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||     
T  8882152 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaagaagcaattat 8882053  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgg--gaaaa 213  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||| |   ||||    
T  8882052 caactatgctatctagaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttagaaaaaaa 8881954  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaat 255  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||| |||||    
T  8881953 atgaaaaacttaaaggacctttaaatgcatttgacctttaat 8881912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28160094 - 28159862
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  28160094 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaatt 28159995  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||   | |||||||||  | |||||| |||||  |||||    
T  28159994 accaactatggtatctacaataagacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagatttttgaaactta-aaggaccactttaagaaaa 28159896  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttga 247  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| || |||||||    
T  28159895 acgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttga 28159862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9339267 - 9339031
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaa---gatgagttcaaggaagca 110  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  9339267 agagcattattcaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgatgagttcaaggaagca 9339168  T
Q  111 attaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttggga 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  |    
T  9339167 attaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggaattgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgaaa 9339069  T
Q  211 aaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||    
T  9339068 aaaatgaaaaactt-aaagacctttagatgcatttgacc 9339031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 25730244 - 25730475
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25730244 cattatccactatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcggatttagtgccaaagatgagttcaaggaatcaattacca 25730343  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  25730344 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatga 25730442  T
Q  218 aaagcttaaaa-gacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  25730443 aaaacttaaaaggacatttagatacatttgacc 25730475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Original strand, 48149502 - 48149729
Alignment:
Q  17 gcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaac 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  48149502 gcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgtcaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 48149601  T
Q  117 aactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatg 216  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||| || ||||||| ||||| |    
T  48149602 aactatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aagaaccactttggaaaaaacg 48149700  T
Q  217 aaaagcttaaaagacttttacatacattt 245  Q
    |||| |||||| ||| |||| || |||||    
T  48149701 aaaaacttaaaggacctttagatgcattt 48149729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17847236 - 17847004
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847236 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaa-gatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 17847138  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| || ||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| |||||||| |||    
T  17847137 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactataaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttggg-aaa 17847040  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  17847039 acgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 17847004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 50276274 - 50276044
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  50276274 agcattatccaccgtttgccatgcctaaaaaga---ctaattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 50276178  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaat 215  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||    
T  50276177 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-caggaccactttgggaaaaat 50276079  T
Q  216 gaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  50276078 gaaaaacttaaaggacatttagatgcatttgacca 50276044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 175
Target Start/End: Original strand, 32317957 - 32318114
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  32317957 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagacagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 32318056  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgtt 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||    
T  32318057 actatgttatctacaataggacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtt 32318114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 35930040 - 35930251
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  35930040 agagcattatccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcatggaagcaatt 35930138  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  | |||||| |||| ||||||||  | |||||| ||||||  ||||    
T  35930139 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttggaacctttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaa 35930237  T
Q  214 atgaaaagcttaaa 227  Q
    ||||||| ||||||    
T  35930238 atgaaaaacttaaa 35930251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 39995308 - 39995072
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  39995308 agaggattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 39995209  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||| ||||  | |||||| ||||||||||||    
T  39995208 accaactatgttatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttaaaactta-aaggaccactttgggaaaa 39995110  T
Q  214 atg-aaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    | | |||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  39995109 acgaaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 39995072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 22298517 - 22298752
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaa-agatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22298517 agagcattatccaccatttgctatgcctaaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagtttaaggaaacaat 22298616  T
Q  113 taacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaa 212  Q
    || ||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  22298617 taccaattatgctatctacaatagggcttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaa 22298715  T
Q  213 aatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    || ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  22298716 aacgaaaaacttaaaggacatttagatgcatttgacc 22298752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 32118714 - 32118890
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32118714 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagggggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 32118813  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||| |||||  | |||||| | |||||||||||    
T  32118814 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggatttgtttgggacttttgaaac 32118890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 50542495 - 50542259
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  50542495 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50542396  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| || || ||| |||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||    
T  50542395 accaactatgctatctacaataagatttgtttaaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaa 50542297  T
Q  214 atgaaaagcttaaaa-gacttttacatacatttgacca 250  Q
    | ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  50542296 acgaaaaacttaaaaggacctttagatacatttgacca 50542259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30467140 - 30466910
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30467140 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaaatgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaattacca 30467041  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgacttt-gggaaaaatg 216  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||| |  ||||| |    
T  30467040 actatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttagaaaaaaacg 30466942  T
Q  217 aaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    |||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  30466941 aaaaacttaaaagacctttagatgcatttgac 30466910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 10588580 - 10588813
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10588580 agagcattatctgccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 10588679  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||  | |||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||    
T  10588680 accaactatgctatctacaatacgacttgtttgaaacgatccaaaaattaaaaggatttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgacaaaa 10588778  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    | |||||  ||||| ||| |||| || ||||||||    
T  10588779 acgaaaaatttaaaggacctttagatgcatttgac 10588813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 37381848 - 37382022
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||||||     
T  37381848 agcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatggtaccaaaaatgagtttaaggaagcaattac 37381947  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||  ||||||||   |||||||||||    
T  37381948 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaatgatttaaaaacaaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 37382022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30141249 - 30141073
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  30141249 agagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 30141150  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  30141149 accaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttagaatttttgaaac 30141073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33693474 - 33693299
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33693474 agagcattatctatcatttgccatgtctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33693375  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 189  Q
    | |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  33693374 accaactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttatttggaacttttgaaa 33693299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 227
Target Start/End: Original strand, 31208776 - 31208956
Alignment:
Q  46 agatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttattt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  31208776 agatgactaattttaagtgggtgttgggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgttt 31208875  T
Q  146 gaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 227  Q
    ||||| ||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||||  | || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  31208876 gaaacgattcaaaaactaaaaggagttgttttggacttttgaaactta-aatgacgaatttaggaaaaatgaaaaacttaaa 31208956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 24623148 - 24623268
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24623148 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaataactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 24623247  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  24623248 accaactatgctatctacaat 24623268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 39700045 - 39700197
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  39700045 agagcattattcacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaagagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 39700144  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 166  Q
    | ||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||    
T  39700145 accaattatgttatctataataagacttgtttgaaacgattcaataattaaaa 39700197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25734360 - 25734229
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  25734360 cattatccaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacgaaagatgagttcaattaagcaattacca 25734261  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaa 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25734260 actatgttatctacaataggacttgtttgaaa 25734229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17993158 - 17993006
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  17993158 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaatt 17993059  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 166  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  17993058 accaactatgctatttacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 17993006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 51371188 - 51371036
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  51371188 agagcattattcaccatttgccatgtctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaatt 51371089  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 166  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  51371088 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaa 51371036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 165
Target Start/End: Original strand, 14564796 - 14564947
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  14564796 agagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaatt 14564895  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaa 165  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  14564896 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaa 14564947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19168936 - 19168816
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  19168936 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgagtcaaatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19168837  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  19168836 accaactatgctatctacaat 19168816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 42549762 - 42549643
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  42549762 agagcattttccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgattgattttaagtgggtgttaggagccaaatttagtaccaaagataagttcaatgaagcaatt 42549664  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  42549663 accaactatgttatctacaat 42549643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 56555281 - 56555200
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagat 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  56555281 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtcaggagccagatttggtaccaaagat 56555200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 190
Target Start/End: Original strand, 20534225 - 20534341
Alignment:
Q  74 agccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttg 173  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||    
T  20534225 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttg 20534324  T
Q  174 ttttgaacttttgaaac 190  Q
    |||   |||||||||||    
T  20534325 tttgagacttttgaaac 20534341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28264601 - 28264485
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  28264601 gacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aagaacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 28264503  T
Q  237 catacatttgaccattaa 254  Q
     || ||||||||| ||||    
T  28264502 gatgcatttgacctttaa 28264485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26017381 - 26017270
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  26017381 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 26017283  T
Q  237 catacatttgacc 249  Q
     || |||||||||    
T  26017282 gatgcatttgacc 26017270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17993007 - 17992957
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacattt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  17993007 aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaagacctttagatatattt 17992957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31590972 - 31590896
Alignment:
Q  171 ttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||    
T  31590972 ttgtttggaacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaa-acctttaaatacatttgacc 31590896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31208645 - 31208565
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  31208645 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 31208565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 23135189 - 23135300
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||    
T  23135189 gacttatttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagactttttaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggccattta 23135287  T
Q  237 catacatttgacc 249  Q
     || |||||||||    
T  23135288 gatgcatttgacc 23135300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12196350 - 12196296
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  12196350 aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttaaatgcatttgacc 12196296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 48149457 - 48149404
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  48149457 gacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaagaacttgtttgggacttttgaaac 48149404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 49118563 - 49118459
Alignment:
Q  143 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 242  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||    
T  49118563 tttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgca 49118465  T
Q  243 tttgac 248  Q
    ||||||    
T  49118464 tttgac 49118459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 250
Target Start/End: Original strand, 9339379 - 9339450
Alignment:
Q  178 gaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  9339379 gaacttttgaaactta-aaggacgattttggaaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 9339450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Original strand, 17847368 - 17847447
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  17847368 acttgtttgggacttttgaaaccta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 17847447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 250
Target Start/End: Original strand, 25734495 - 25734547
Alignment:
Q  198 gacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  25734495 gacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 25734547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 227
Target Start/End: Original strand, 48707922 - 48708005
Alignment:
Q  143 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 227  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  48707922 tttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaacgaaaaacttaaa 48708005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 190
Target Start/End: Original strand, 51371262 - 51371314
Alignment:
Q  138 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  51371262 acttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttggaacttttgaaac 51371314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 41282342 - 41282577
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41282342 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41282441  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  41282442 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgatttaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 41282540  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  41282541 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 41282577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 35342180 - 35342416
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  35342180 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35342279  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| |||  ||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  35342280 atcaactatgctatctacaatgagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttgaaacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 35342378  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  35342379 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgaccat 35342416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 14717609 - 14717840
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14717609 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 14717708  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaac-ttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatg 216  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    |||||| ||||||  |||||||    
T  14717709 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttggaactttttgaaac-ttgaaggaccactttgaaaaaaatg 14717807  T
Q  217 aaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  14717808 aaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 14717840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16096100 - 16095867
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16096100 agagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggta-ccaagatgagttcaaggaagcaatt 16096002  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||    |||||| | |||||||||||  | |||||||||||| ||||||    
T  16096001 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaagggtttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgacttttggaaaa 16095903  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  16095902 atgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 16095867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19659642 - 19659408
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  19659642 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaaaagcaatt 19659543  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  19659542 accaactatgctatctacaataggacttatttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 19659444  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    || |||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  19659443 ataaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 19659408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38964254 - 38964021
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38964254 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38964156  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||  ||| ||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  38964155 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcagaaactaaaaagactcgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 38964057  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  38964056 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 38964021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6740096 - 6739891
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6740096 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6739997  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  6739996 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 6739898  T
Q  214 atgaaaa 220  Q
    | |||||    
T  6739897 acgaaaa 6739891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 6251972 - 6252206
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6251972 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 6252071  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  6252072 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 6252170  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  6252171 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 6252206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11000869 - 11000635
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11000869 agagcattatccaccacttgccaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 11000770  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  11000769 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 11000671  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||| ||| || | || |||||||||    
T  11000670 acgaaaaacttaaaggaccttaagatgcatttgacc 11000635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43166410 - 43166177
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43166410 agagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 43166311  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  43166310 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaagacgactttgggaaaa 43166212  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  43166211 atgaaaaactt-aaagacctttagatacatttgacc 43166177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 8689572 - 8689783
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8689572 agagcattatccactatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaatcaatt 8689671  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||  || ||| ||| ||||||||||||    
T  8689672 accaactatgttatctacattatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaa--acttaaagaccactttgggaaaa 8689769  T
Q  214 atgaaaagcttaaa 227  Q
    | ||||| ||||||    
T  8689770 acgaaaaacttaaa 8689783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39002164 - 39001990
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  39002164 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 39002065  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  | || ||| |||||||||||||    
T  39002064 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggatttatttggaacttttgaaac 39001990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 31710282 - 31710494
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31710282 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31710381  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  31710382 accaactatgttatctacattatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 31710480  T
Q  214 atgaaaagcttaaa 227  Q
    |  |||| ||||||    
T  31710481 actaaaaacttaaa 31710494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 39824556 - 39824791
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  39824556 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaatt 39824655  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||  | || ||| ||||||||||||    
T  39824656 accaactatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaactta-aatgaccactttgggaaaa 39824754  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    | ||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||    
T  39824755 acgaaaaactt-aaagacatttagatgcatttgaccat 39824791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 30863253 - 30863428
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30863253 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 30863352  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  30863353 accaactatgctatctacattatgacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaatgacttg-tttggacttttgaaac 30863428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 40074950 - 40075096
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  40074950 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 40075049  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaa 160  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  40075050 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaa 40075096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23129062 - 23128877
Alignment:
Q  6 agcagcagagagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23129062 agcagcaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaagg 23128963  T
Q  106 aagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttga-acttttgaaac 190  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23128962 aagcaattaccaattatgctatctacgatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgttttgagacttttgaaac 23128877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27457338 - 27457162
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27457338 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaatttaaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 27457239  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  27457238 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 27457162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 8215900 - 8216134
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8215900 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 8215999  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||| | | |||||| ||||  | |||||||||||||  ||||    
T  8216000 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtatgggacttttaaaactta-aaggacgactttgaaaaaa 8216098  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||  ||||| ||| |||| || |||||||||    
T  8216099 atgaaaaatttaaaggacctttaaatgcatttgacc 8216134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20079399 - 20079170
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20079399 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 20079300  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||| |||||   ||||    
T  20079299 accaactatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttaaaaaaa 20079201  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacattt 245  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  20079200 atgaaaaactt-aaagacttttaaatacattt 20079170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26593421 - 26593208
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26593421 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaagaagcaatt 26593322  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||| ||||| |||| ||||    
T  26593321 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aagaacgacgttggaaaaa 26593223  T
Q  214 atgaaaagcttaaaa 228  Q
    ||||||| |||||||    
T  26593222 atgaaaaacttaaaa 26593208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6600273 - 6600043
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6600273 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 6600174  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||| ||    
T  6600173 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttcggaaaaacga 6600075  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| ||||||  || |||| || |||||||||    
T  6600074 aaaacttaaagaacgtttagatgcatttgacc 6600043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28078546 - 28078312
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078546 agagcattatctaccatttgtcatgcctaattagtttactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 28078447  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||    
T  28078446 accaactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaa 28078348  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |  |||| |||||||||| |||| || |||||||||    
T  28078347 acaaaaaacttaaaagacctttagatgcatttgacc 28078312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3352143 - 3351910
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3352143 agagcattatccaccctttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 3352044  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||  ||||  |||||||    |||||||||||  | || ||| |||||| |||||    
T  3352043 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaacaaaaaggacttgttcgagacttttgaaactta-aatgaccactttgagaaaa 3351945  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||    
T  3351944 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgac 3351910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4016015 - 4015810
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4016015 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaatatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 4015916  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | || ||||||||||  ||||    
T  4015915 accaactatgttatctacaataggacttgcttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaagacgactttgaaaaaa 4015817  T
Q  214 atgaaaa 220  Q
    |||||||    
T  4015816 atgaaaa 4015810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 11692288 - 11692130
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692288 agagcattatccaccatttgtgatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 11692189  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataactt 172  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  11692188 accaactatgctatctgcaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaactt 11692130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33760611 - 33760390
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  33760611 agagcattatccaccatttgtcatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaatt 33760512  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||| |  |||||||| | |||||||||||  | || ||||| ||| ||||||    
T  33760511 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaagaggacttgtttgggacttttgaaactta-aatgacgattttaggaaaa 33760413  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||    
T  33760412 atgaaaaacttaaaggaccttta 33760390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 247
Target Start/End: Original strand, 11935450 - 11935677
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  11935450 cattatccactatttgttatgcctaaaaagatggctaattttaagtgagtgttaggagccacatttggt-tcaaagatgagatcaaggaaacaattacca 11935548  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  11935549 actatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatga 11935647  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttga 247  Q
    ||| |||||| ||| |||| ||||||||||    
T  11935648 aaaacttaaaggacctttagatacatttga 11935677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30297890 - 30297697
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30297890 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctaggagccagatttggtaccaaagatgagttgaaggaagcaatt 30297791  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttg 207  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||    
T  30297790 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaacttaaaaggaccactttg 30297697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 42993518 - 42993694
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42993518 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 42993617  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  42993618 accaactatgctatctacaataggaattgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttctttggaacttttgaaac 42993694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Original strand, 1052541 - 1052767
Alignment:
Q  22 atccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaacta 121  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1052541 atccaccatttgccatgcttaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggatgagttcaaggaagcaattaccaacta 1052640  T
Q  122 tgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaag 221  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | || ||| |||||| ||||||||||||     
T  1052641 tgctatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aatgaccactttgagaaaaatgaaaaa 1052739  T
Q  222 cttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  1052740 cttagaggacctttaaatacatttgacc 1052767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 14952328 - 14952499
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14952328 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 14952427  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 189  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   ||||||||||    
T  14952428 actatgttatctacaacaagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaa 14952499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 20408537 - 20408767
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  20408537 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagctagatttggtaccaaatatgagttcaatgaagcaattacca 20408636  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| | ||||||||||| ||    
T  20408637 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccattttgggaaaaacga 20408735  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  20408736 aaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 20408767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30208543 - 30208331
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30208543 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtaggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 30208444  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | || ||||| ||| | ||||    
T  30208443 accaactatgttatctacaatagaacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggatttgtttgagacttttgaaactta-aaagacgatttttgaaaaa 30208345  T
Q  214 atgaaaagcttaaa 227  Q
    ||||||| ||||||    
T  30208344 atgaaaaacttaaa 30208331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19398330 - 19398113
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  19398330 cattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaggctagatttggtaccaaagatgagttcaaagaaacaattacca 19398231  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||||  ||| ||||| ||||| || ||||||   |||||||||||  | |||||  ||||||| ||||||||    
T  19398230 actatgctatctacaatagaacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaagaatttgtttgagacttttgaaactta-aaggatcactttggaaaaaatga 19398132  T
Q  218 aaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  19398131 aaaacttaaaagaccttta 19398113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 16752116 - 16752236
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16752116 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggatccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16752215  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  16752216 accaactatgttatctacaat 16752236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27116236 - 27116006
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27116236 cattatccacgatttgtaatgcctaaaaagatgactaatttgaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattacca 27116137  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||  ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | || ||| ||||| | ||||| ||    
T  27116136 actatgctatctacaataggacttgtttaaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaagaccactttagaaaaaacga 27116038  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| ||||||  || |||| ||||||||||||    
T  27116037 aaaacttaaagaacctttagatacatttgacc 27116006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 6331377 - 6331477
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6331377 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6331476  T
Q  114 a 114  Q
    |    
T  6331477 a 6331477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26035487 - 26035367
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26035487 agagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtattaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 26035388  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  26035387 accaactatggtatctacaat 26035367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 8694866 - 8695041
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||  ||||    
T  8694866 agagcattatccaccatttatcatgcctaagaacatgactaattttaagtgagtattatgagccagatttggtactaaagatgagttcaatgaaataatt 8694965  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 189  Q
    | ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||   ||||||||||    
T  8694966 atcaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaa 8695041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 134
Target Start/End: Original strand, 444962 - 445074
Alignment:
Q  22 atccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaacta 121  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  444962 atccaccatttgccacgcctaaaaagacgactgattttaagtgggttttaggagtcatatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaacta 445061  T
Q  122 tgttatctacaat 134  Q
    || ||||||||||    
T  445062 tgctatctacaat 445074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 27509978 - 27510123
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||        ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27509978 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ccttttag------tttttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 27510070  T
Q  114 aacaactatg-ttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 166  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  27510071 accaactatgcttat-tacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 27510123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 250
Target Start/End: Original strand, 43166504 - 43166584
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    |||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43166504 acttgtttggaacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaagacctttagatacatttgacca 43166584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8215808 - 8215718
Alignment:
Q  158 aaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||| ||| || |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  8215808 aaatttaaagaaattgtttggaacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 8215718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 249
Target Start/End: Original strand, 6332873 - 6333010
Alignment:
Q  111 attaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttggga 210  Q
    |||| |||||||  |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  6332873 attaccaactattctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacttttaaaactta-aaggacgactttgaaa 6332971  T
Q  211 aaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  6332972 aaaatgaaaaacttaaaggacatttagatgcatttgacc 6333010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 249
Target Start/End: Original strand, 38964302 - 38964406
Alignment:
Q  143 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 242  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| | |||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| |||||    
T  38964302 tttgaaacgattcaaaaactaaaatgatttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaa-acctttaaataca 38964399  T
Q  243 tttgacc 249  Q
    |||||||    
T  38964400 tttgacc 38964406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30863210 - 30863094
Alignment:
Q  138 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttac 237  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||     
T  30863210 acttgtttgaaacgattcaaaaactaaaacgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaagacctttag 30863112  T
Q  238 atacatttgaccattaat 255  Q
    || |||||||||| ||||    
T  30863111 atgcatttgaccaataat 30863094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Original strand, 33760739 - 33760793
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  33760739 aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 33760793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Original strand, 30297993 - 30298072
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  30297993 acttgtttggaacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaaacgaaaaacttaaatgacttttagatgcatttgacc 30298072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20517116 - 20517063
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  20517116 gacttatttgaaacaattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaac 20517063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 40074908 - 40074855
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  40074908 gacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaagaacttgtttgggacttttgaaac 40074855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41282239 - 41282155
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaa 254  Q
    |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| || ||||||||| ||||    
T  41282239 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacaaaaaacttaaaggacgtttagatgcatttgacctttaa 41282155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Original strand, 4016117 - 4016196
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  4016117 acttgtttggtacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaataacttaaaggacctttagatgcatttgacc 4016196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Original strand, 19661875 - 19661954
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  19661875 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacaactttgggaaaaacgaaaaacttaaacgacctttagatgcatttgacc 19661954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Original strand, 27116338 - 27116417
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  27116338 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacaaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 27116417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1915484 - 1915251
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1915484 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 1915385  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||  | |||||||||||||||||||    
T  1915384 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaactattcaaaaactaaaaggacttgtttgggactttggaaactta-aaggacgactttgggaaaa 1915286  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  1915285 atgaaaaacttaaaggaccttta-atgcatttgacc 1915251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 6503718 - 6503952
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6503718 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgggttcaaggaagcaatt 6503817  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  6503818 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaa 6503916  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| ||| || ||| |||| || |||||||||    
T  6503917 atgaaaaacttgaaggacctttaaatgcatttgacc 6503952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 2707459 - 2707694
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2707459 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaatt 2707558  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  2707559 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 2707657  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  2707658 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 2707694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 9382519 - 9382755
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9382519 agagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 9382618  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  9382619 accaactatgttatctacatcaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 9382717  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    |  |||| |||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  9382718 acaaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgaccat 9382755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 30379021 - 30379251
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30379021 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 30379120  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | || ||| ||||||||||||| ||    
T  30379121 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aatgaccactttgggaaaaacga 30379219  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  30379220 aaaacttaaaggacctttagatacatttgacc 30379251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 3408189 - 3408425
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3408189 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 3408288  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||  | |||||| |||| | |||||    
T  3408289 accaactatactatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccacttcgagaaaa 3408387  T
Q  214 atgaaaagcttaaaa-gacttttacatacatttgacca 250  Q
    |  |||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  3408388 acaaaaaacttaaaaggacctttaaatgcatttgacca 3408425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 29050272 - 29050508
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29050272 agagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29050371  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  29050372 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 29050470  T
Q  214 atgaaaagcttaaaa-gacttttacatacatttgacca 250  Q
    | ||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  29050471 acgaaaaacttaaaaggacctttagatgcatttgacca 29050508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 17943040 - 17943271
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  17943040 cattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattacca 17943139  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    | |||| |||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||||||||||  |    
T  17943140 attatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacaa 17943238  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  17943239 aaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 17943271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8178390 - 8178156
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8178390 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 8178291  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||| ||||  | ||||||||||||| |||||    
T  8178290 accaactatgctatctacaataggacatgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttaaaactta-aaggacgactttgagaaaa 8178192  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||  || |||||||||    
T  8178191 atgaaaaacttaaaggacctttggatgcatttgacc 8178156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17428409 - 17428238
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17428409 cattattcaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 17428310  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  17428309 actatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaa 17428238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 12626636 - 12626870
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12626636 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaatt 12626735  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||  ||    
T  12626736 accaactattctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggggaa 12626834  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  12626835 acgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 12626870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26393146 - 26392916
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26393146 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 26393047  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| |||||||||||  | || |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   || ||||||||  |  ||||| |||||| |||||||||    
T  26393046 actatgctatctacaatagaagttttttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacctttgaaactta-gaggaccactttgtgaaaaatga 26392948  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  26392947 aaaacttaaaggacctttagatacatttgacc 26392916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 16193314 - 16193544
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16193314 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 16193413  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    ||||| |||||| || ||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| | |||||||||||  |    
T  16193414 actattttatctgcattagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccattttgggaaaaacaa 16193512  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  16193513 aaaacttaaaggacttttagatgtatttgacc 16193544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 1077241 - 1077478
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1077241 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 1077340  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | || ||| ||||| ||||||| ||    
T  1077341 actatgctatctacaacatgacttatttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aatgaccactttaggaaaaacga 1077439  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaatt 256  Q
    ||| |||||| ||| |||| |  ||||||||| ||||||    
T  1077440 aaaacttaaaggacctttagacgcatttgacctttaatt 1077478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 2390267 - 2390441
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  2390267 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagctatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 2390366  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | |||||| | |||||||||||    
T  2390367 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgggacttttgaaac 2390441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 10256237 - 10256449
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10256237 agagcattatccaccatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 10256336  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||| |||||  |||||    
T  10256337 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaacgaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttaagaaaa 10256435  T
Q  214 atgaaaagcttaaa 227  Q
    | ||||| ||||||    
T  10256436 acgaaaaacttaaa 10256449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3258948 - 3258714
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3258948 agagcgttatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3258850  T
Q  114 aac-aactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaa 212  Q
    | | ||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||| |||    
T  3258849 accaaactatggtatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaa 3258751  T
Q  213 aatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    || ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  3258750 aacgaaaaacttaaaggacctttatatgcatttgacc 3258714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2598229 - 2598007
Alignment:
Q  25 caccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgt 124  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||     
T  2598229 caccatttgccatgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaataaagcaattaccaactatga 2598130  T
Q  125 tatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagctt 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   || |||  || || ||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  2598129 tatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagaccttt--aaaacttaaagaccactttgggaaaaatgaaaaactt 2598032  T
Q  225 aaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| ||| |||| || |||||||||    
T  2598031 aaaggacctttagatgcatttgacc 2598007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26231073 - 26230840
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |    
T  26231073 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaact 26230974  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||   ||||||  || || ||| ||| | ||||  ||||    
T  26230973 accaactatgttatttacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgatttgtttgagactttt--aaaacttaaagaccattttgaaaaaa 26230876  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  26230875 acgaaaaacttaaacgacttttagatgcatttgacc 26230840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 212
Target Start/End: Original strand, 11133873 - 11134072
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttc-aaggaagcaat 112  Q
    ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11133873 agagcattatccatcatttgttatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaggaagcaat 11133972  T
Q  113 taacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaa 212  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  11133973 taccatctatgctatctacgataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttaggacttttgaaacttaaaaggaccactttgggaaa 11134072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26196458 - 26196286
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaac- 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |     
T  26196458 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgt-tgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcacggaagcaattacca 26196360  T
Q  117 aactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||| ||||| |||||| | ||||||   |||||||||||    
T  26196359 aactatgttatctacaataggacttggttgaaccgattcaaaaactaaaatgatttgtttgagacttttgaaac 26196286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 26936607 - 26936727
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26936607 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccggatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 26936706  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  26936707 atcaactatgctatctacaat 26936727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6785239 - 6785008
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||  ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||       
T  6785239 agagcattatacaaaatttgacatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagca--- 6785143  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||| | |||||| ||||||  ||||    
T  6785142 accaattatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttgaaacata-aaggaccactttgaaaaaa 6785044  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| ||||||  || |||| || |||||||||    
T  6785043 acgaaaaacttaaagaacctttagatgcatttgacc 6785008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25820686 - 25820452
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||  ||||| || | ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  25820686 cattatccataatttgacatgactaaaattatgactaattttaaatgggtgttatgagttagatttggtaccaaacatgagttcaatgaagcaattacca 25820587  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||    
T  25820586 actatgctatctacgataggaattgtttgaaacgattaaaaaattaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgagtttaggaaaaatga 25820488  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgaccatta 253  Q
     || |||||| ||  |||| || |||||||||||||    
T  25820487 taaacttaaacgatctttagatgcatttgaccatta 25820452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 35224025 - 35223919
Alignment:
Q  29 atttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatc 128  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  35224025 atttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatc 35223926  T
Q  129 tacaata 135  Q
    |||||||    
T  35223925 tacaata 35223919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Original strand, 31375971 - 31376153
Alignment:
Q  68 gttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaat 167  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||     
T  31375971 gttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattaacaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaag 31376070  T
Q  168 aacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatg-aaaagcttaaaa-gacttttacatacatttgacc 249  Q
     ||||||||   |||||||||||  | |||||  |||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||| || |||||||||    
T  31376071 gacttgtttgagacttttgaaactta-aaggatcactttgagaaaaacgaaaaaacttaaaaggacttttagatgcatttgacc 31376153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10931264 - 10931084
Alignment:
Q  38 gcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||| || |    
T  10931264 gcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaatt-acaactatgctatccacattagg 10931166  T
Q  138 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaa 220  Q
    |||| ||||| || ||| ||||| |||||  | |||||| |||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||| |||||    
T  10931165 acttgtttgatacgattcaaaaactaaaagtatttgtttggaacttttgaaactta-aaggaccactttaggaaaaacgaaaa 10931084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12613029 - 12612937
Alignment:
Q  97 agttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||||    
T  12613029 agttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaa 12612937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12612927 - 12612813
Alignment:
Q  76 ccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgtt 175  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| || ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||    
T  12612927 ccagatttggtagcaaagatgagttcaatgaagcaagtactaactttgctatctacaataggacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtt 12612828  T
Q  176 ttgaacttttgaaac 190  Q
    |   |||||||||||    
T  12612827 tgagacttttgaaac 12612813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Original strand, 35224160 - 35224214
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  35224160 aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 35224214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 250
Target Start/End: Original strand, 1915587 - 1915667
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    |||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  1915587 acttgtttggaacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaacgaaaaatttaaaggacttttagatgcatttgacca 1915667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2707417 - 2707305
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||| |||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  2707417 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttggaactta-aaggacgactttggaaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 2707319  T
Q  237 catacatttgacca 250  Q
     || ||||||||||    
T  2707318 tatgcatttgacca 2707305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Original strand, 26393278 - 26393332
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  26393278 aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 26393332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1077131 - 1077052
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1077131 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaaatgaaaaatttaaaagacatttagatacatttgacc 1077052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 37838301 - 37838531
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  37838301 cattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattacca 37838400  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||    
T  37838401 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttaggaaaaatga 37838499  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  37838500 aaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 37838531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 772116 - 771877
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  772116 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 772017  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  772016 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaa-gattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 771919  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaat 255  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||| ||||    
T  771918 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgaccaataat 771877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 2456010 - 2456244
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2456010 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2456109  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||||||||| |||||||||    
T  2456110 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgacattgggaaaa 2456208  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  2456209 atgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 2456244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 9276574 - 9276810
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9276574 agagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 9276673  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||| ||||||    
T  9276674 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttaggaaaa 9276772  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  9276773 atgaaaaacttaaatgacctttagatgcatttgaccat 9276810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 7378963 - 7379195
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7378963 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagaggactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7379062  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||  || ||| ||| ||||||| ||||    
T  7379063 accaactattctatctacattatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgggacttttgaa--acttaaagacaactttggaaaaa 7379160  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    | ||||| |||||||||  |||| || ||||||||    
T  7379161 acgaaaaacttaaaagatctttagatgcatttgac 7379195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 27328584 - 27328818
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27328584 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 27328683  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||    
T  27328684 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaa 27328782  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  27328783 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 27328818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41500643 - 41500405
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41500643 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41500544  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| || ||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  41500543 accaactatgctatgtacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactagaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 41500445  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccatta 253  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||||||    
T  41500444 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgaccatta 41500405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 40854609 - 40854845
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  40854609 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 40854708  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||  ||||  ||| |||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  40854709 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaacaaaaaggactagtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 40854807  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || ||| |||||||    
T  40854808 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatctgaccat 40854845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12759890 - 12759656
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  12759890 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta-gaggcaaatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaatt 12759792  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  12759791 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 12759693  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  12759692 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 12759656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25087933 - 25087761
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  25087933 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccagagatgagttcaaggaagcaattatca 25087834  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||  ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  25087833 actatgttatatacaataagacttgtttgaaacaattcaaaaacaaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 25087761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 36211046 - 36211281
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36211046 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 36211145  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt-tgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaa 212  Q
    |  |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||  | |||||| ||||||| |||    
T  36211146 acaaactatgttatctagaataggacttgtttgaaacaatttaaaaattaaaaggacttgtttgagaccttttgaaactta-aaggaccactttggaaaa 36211244  T
Q  213 aatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    || ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  36211245 aacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 36211281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36444369 - 36444134
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36444369 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtaggtgttatgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36444270  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  36444269 accaactatgctatctactataggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaa 36444171  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||||||| |||||||||  |||| || ||||||||||    
T  36444170 atgaaaaacttaaaagatctttagatgcatttgacca 36444134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28650567 - 28650333
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28650567 agagcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaatt 28650468  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | |||||||||||| || |||    
T  28650467 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttagggaaa 28650369  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  28650368 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 28650333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33107110 - 33106869
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33107110 agagcattatttaccatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33107011  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  33107010 accaactatgatatctacaataggactcgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 33106912  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaatt 256  Q
    ||||||| |||||| || ||||| || ||||||| | ||||||    
T  33106911 atgaaaaacttaaaggagttttagatgcatttgatctttaatt 33106869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 8899682 - 8899917
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8899682 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcatggaagcaatt 8899781  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  ||||    
T  8899782 accaactatgctatctacaatatgactt-gttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgaaaaaa 8899879  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 251  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  8899880 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgaccat 8899917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16246334 - 16246158
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16246334 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16246235  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  16246234 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 16246158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2094551 - 2094318
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2094551 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccaaatttagtatcaaagattagttcaaggaagcaatt 2094452  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||    
T  2094451 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacga-tttggaaaaa 2094354  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  2094353 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 2094318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11949567 - 11949333
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11949567 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 11949468  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   || ||||||||  | || ||| ||||||| ||||    
T  11949467 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacatttgaaactta-aatgaccactttggaaaaa 11949369  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  11949368 atgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 11949333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 19180422 - 19180642
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19180422 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag-agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19180520  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    |  ||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||   |||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  19180521 actaactatactatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaatggacttgtttggaacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaa 19180619  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||    
T  19180620 atgaaaaacttaaaggaccttta 19180642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 921022 - 921234
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  921022 agagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 921121  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| |||   |||||||||||  | || ||||||||||  ||||    
T  921122 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttaagacttttgaaactta-aaagacgactttgaaaaaa 921220  T
Q  214 atgaaaagcttaaa 227  Q
    ||||||| ||||||    
T  921221 atgaaaaacttaaa 921234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37732334 - 37732100
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  37732334 agagcattatccaccatttgtcatacataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaaaatgagttcaagaaagcaatt 37732235  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  37732234 accaactatgttatttacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaagacgactttgggaaaa 37732136  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  37732135 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 37732100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 42629962 - 42630196
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  42629962 agagcatcatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 42630061  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | ||| |||| ||||||  ||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  42630062 atcaattatgctatctatgataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaa 42630160  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    | ||||| |||||||||| |||| || |||||||||    
T  42630161 acgaaaaacttaaaagacctttagatgcatttgacc 42630196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33865408 - 33865246
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33865408 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33865309  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 176  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| || ||| ||||||||    
T  33865308 accaactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactagaatgacttgttt 33865246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 2056929 - 2057168
Alignment:
Q  17 gcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaac 116  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  2056929 gcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctggatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 2057028  T
Q  117 aactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatg 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||| | | |||||||||||  | || ||| |||||||| ||||||    
T  2057029 aactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtctgggacttttgaaactta-aaagaccactttggg-aaaatg 2057126  T
Q  217 aaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaattaa 258  Q
    |||| |||||| ||| |||| || |||||||||  |||||||    
T  2057127 aaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacctataattaa 2057168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2315114 - 2314882
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  2315114 agcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattac 2315015  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaat 215  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||| ||| | || ||||||||  | |||||| ||||||| | ||||    
T  2315014 caactatgctatctacaataagacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttatttgggacctttgaaactta-aaggaccactttggaagaaat 2314916  T
Q  216 gaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
     |||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  2314915 aaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 2314882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43249553 - 43249321
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  43249553 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgtattcaaggaaacaatt 43249454  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||  | ||  || ||||||||||||    
T  43249453 accaactatgctatcatcaataggacttgttcgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaactta-aattaccactttgggaaaa 43249355  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttga 247  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || |||||||    
T  43249354 atgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttga 43249321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1106700 - 1106525
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1106700 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1106601  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 189  Q
    | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||||  ||||||||  |||||||||||    
T  1106600 accaattatgctatctacaataggacttatttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtttgcaacttttgaaa 1106525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 34253142 - 34253318
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  34253142 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaatt 34253241  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||    
T  34253242 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacctttgaaac 34253318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3430765 - 3430527
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3430765 agagcattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 3430666  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||   ||| ||||| ||  |  |||||||| | |||||||||  || ||| ||| ||||| ||||||    
T  3430665 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaacttattcaaaaactagtaggacttgtttgggacttttgaa--acttaaagaccactttaggaaaa 3430568  T
Q  214 atgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaa 254  Q
    | ||||| ||||||  || |||| || ||||||||| ||||    
T  3430567 acgaaaaacttaaagaacctttagatgcatttgacctttaa 3430527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 17134229 - 17134404
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17134229 agagcattatccatcatttgccattcctaaaaagatgactacttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 17134328  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  17134329 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt-aaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 17134404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7297373 - 7297199
Alignment:
Q  16 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||     
T  7297373 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaagaagacaattac 7297274  T
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  7297273 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaatctaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 7297199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 29737748 - 29737900
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29737748 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatcttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29737847  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 166  Q
    | |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  29737848 atcaactatgctatcgacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaa 29737900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 38751048 - 38751224
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  38751048 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtggatgttaggagccacatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38751147  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    | |||||||  |||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  38751148 accaactatactatctacattaggacttgtttgaaacgattaaaaaactaaaaggacttgtttaggacttttgaaac 38751224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17484687 - 17484457
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17484687 cattatccaccattttccatgcttaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattacca 17484588  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||| |||||| ||    
T  17484587 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgagaaaaacga 17484489  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| ||||||  || |||| || |||||||||    
T  17484488 aaaacttaaagaacctttagatgcatttgacc 17484457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8396692 - 8396572
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8396692 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggttttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 8396593  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  8396592 atcaactatgctatctacaat 8396572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 248
Target Start/End: Original strand, 14630663 - 14630846
Alignment:
Q  63 tgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaatt 162  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |    
T  14630663 tgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaact 14630762  T
Q  163 aaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    ||||  |||||||| | || ||| ||||  | |||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14630763 aaaaggacttgtttgggacctttaaaactta-aaggatcacttt-ggaaaaatgaaaaacttaaaggacttttacatgcatttgac 14630846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 220
Target Start/End: Original strand, 45124120 - 45124324
Alignment:
Q  15 gagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||    
T  45124120 gagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaagagtctgatttgataccaaagatgagtttaaggaaacaatta 45124219  T
Q  115 acaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaa 214  Q
     |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||  |||||    
T  45124220 ccaactatgctatctacaataagatttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaatttgtttgagacttttgaaactta-aaggactactttgaaaaaaa 45124318  T
Q  215 tgaaaa 220  Q
    ||||||    
T  45124319 tgaaaa 45124324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 37654112 - 37654224
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37654112 cattattcatcatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 37654211  T
Q  118 actatgttatcta 130  Q
    |||||||||||||    
T  37654212 actatgttatcta 37654224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41178160 - 41177964
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  41178160 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat- 41178062  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaa 213  Q
                   ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| | |||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  41178061 ---------------tacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgatttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaa 41177978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 9331757 - 9331968
Alignment:
Q  15 gagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |  ||  |||||||||||    
T  9331757 gagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaatcttaggtgggtgttaggagccaaatttggtacctaagataatatctgggaagcaatta 9331856  T
Q  115 acaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaa 214  Q
     |||| ||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||| |||||||    
T  9331857 ccaacaatactatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttaggaaaaa 9331955  T
Q  215 tgaaaagcttaaa 227  Q
    |||||| ||||||    
T  9331956 tgaaaaacttaaa 9331968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19916128 - 19916008
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19916128 agagcattatccacaatttgtcaagcctaaaaagatgattgatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaatt 19916029  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  19916028 accaactatgctatctacaat 19916008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23671901 - 23671719
Alignment:
Q  65 ggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaa 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||  |||    
T  23671901 ggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaccatgttatctataataagacttgtttgaaacgattcaaaatctaa 23671802  T
Q  165 aataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||| | |||||  | |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  23671801 aatgatttgttgag-acttttgaaactta-aatgacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 23671719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28217003 - 28216893
Alignment:
Q  116 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||| || |||||||||||||     
T  28217003 caactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aagaaccactttgggaaaaac 28216905  T
Q  216 gaaaagcttaaa 227  Q
    ||||| ||||||    
T  28216904 gaaaaacttaaa 28216893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 23673014 - 23672958
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 70  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23673014 agagcattttccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 23672958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Original strand, 23673117 - 23673196
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  23673117 acttgtttggaatttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 23673196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 260
Target Start/End: Original strand, 7297476 - 7297566
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaattaatt 260  Q
    |||||||| | |||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  7297476 acttgtttgggacttttgaaacttaaaag-acgactttggaaaaaacgaaaaacttataagacttttagataaatttgacctttaattaatt 7297566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9276446 - 9276393
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||    
T  9276446 aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacatttatatgcatttgac 9276393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9331637 - 9331584
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||    
T  9331637 aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacatttatatgcatttgac 9331584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 249
Target Start/End: Original strand, 28650671 - 28650751
Alignment:
Q  168 aacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  28650671 aacttgtttggaacttttgaaactta-aaggacaactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttaaatgcatttgacc 28650751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 249
Target Start/End: Original strand, 33107222 - 33107292
Alignment:
Q  178 gaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  33107222 gaacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttaaatgcatttgacc 33107292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 920894 - 920840
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  920894 aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 920840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Original strand, 31214086 - 31214140
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || |||||||||    
T  31214086 aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaagacctttagatgcatttgacc 31214140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 190
Target Start/End: Original strand, 3358157 - 3358194
Alignment:
Q  153 tttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3358157 tttaaaaattaaaatgacttgtttggaacttttgaaac 3358194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Original strand, 3430807 - 3430860
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3430807 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttggaacttttgaaac 3430860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Original strand, 11949612 - 11949665
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  11949612 gacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgttttggacttttgaaac 11949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 248
Target Start/End: Original strand, 33865536 - 33865589
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  33865536 aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaagacctttagatgcatttgac 33865589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 249
Target Start/End: Original strand, 41500732 - 41500816
Alignment:
Q  164 aaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  41500732 aaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaatgacctttagatgcatttgacc 41500816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 772158 - 772268
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  772158 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaactt-aaagacattta 772255  T
Q  237 catacatttgacc 249  Q
     || |||||||||    
T  772256 gatgcatttgacc 772268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 250
Target Start/End: Original strand, 2315246 - 2315298
Alignment:
Q  198 gacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  2315246 gacgactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatacatttgacca 2315298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8899579 - 8899504
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacattt 245  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||    
T  8899579 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgattttgggaaaaatgaaaaacttaaagaacctttagatacattt 8899504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Original strand, 12759993 - 12760072
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||||| | |||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  12759993 acttgtttgggacttttgaaacttaaaag-acgactttggaaaaaacgaaaaacttaaatgacctttagatacatttgacc 12760072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 250
Target Start/End: Original strand, 41178264 - 41178343
Alignment:
Q  170 cttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  41178264 cttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 41178343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 42629914 - 42629803
Alignment:
Q  137 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||  ||||    
T  42629914 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggatcttta 42629816  T
Q  237 catacatttgacc 249  Q
     || |||||||||    
T  42629815 gatgcatttgacc 42629803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 218885 - 219118
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtggg-tgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  218885 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 218984  T
Q  113 taacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaa 212  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||  |||||||| | |||||||||||  | || ||| |||||  ||||    
T  218985 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcgaaaattaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaagaccactttaagaaa 219083  T
Q  213 aatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttga 247  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| || |||||||    
T  219084 aatgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttga 219118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5164 - 4934
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || |||||| ||    
T  5164 cattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagagggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaattacca 5065  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| || |||| ||    
T  5064 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttttggacttttgaaactta-aaggaccacttt-ggtaaaacga 4967  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    ||| |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  4966 aaaacttaaaggacttttagatgcatttgacca 4934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 5190 - 5427
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5190 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 5288  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatga 217  Q
    | |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||| ||    
T  5289 attatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgtgacttttaaaactta-aaggaccactttagaaaaaacga 5387  T
Q  218 aaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaatta 257  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||||| ||||    
T  5388 aaaacttaaaggacctttagatgcatttgaccatttatta 5427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 114 - 266
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  114 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 213  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 166  Q
    | | |||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  214 accgactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Original strand, 47967 - 48138
Alignment:
Q  19 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  47967 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaaggtgagttcaaggaagcaattaccaa 48066  T
Q  119 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 190  Q
    |||||| || ||||||  ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  48067 ctatgtgatatacaatcggacttgtttaaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttttggacttttgaaac 48138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 2114 - 1994
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2114 agagcattatccaccatttgtcatgcctaataagatgactgattttaagtaggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2015  T
Q  114 aacaactatgttatctacaat 134  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  2014 accaactatgctatctacaat 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 11362 - 11510
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||||||| ||    
T  11362 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccatagataagtttaaggaagcaattacca 11461  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 166  Q
    |||||| || |||||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  11462 actatgctacctacaataggtcttatttaaaacgatttaaaaactaaaa 11510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11237 - 11183
Alignment:
Q  195 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 249  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  11237 aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaagacttttagatgcatttgacc 11183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 252579 - 252428
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  252579 agagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaatt 252480  T
Q  114 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaa 165  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  252479 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaa 252428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 13099 - 13257
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13099 cattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatca 13198  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 176  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  13199 attatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 13257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 59745 - 59587
Alignment:
Q  18 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 117  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  59745 cattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatca 59646  T
Q  118 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 176  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  59645 attatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 59587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3452 - 3280
Alignment:
Q  74 agccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttg 173  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||    
T  3452 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcaacattaggacttatttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttg 3353  T
Q  174 ttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 248  Q
     |||| | |||||||||  | |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||  || |||| || ||||||||    
T  3352 -tttggatttttgaaactta-aaggatcactttggaaaaaatgaaaaacttaaagcacctttagatgcatttgac 3280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 191
Target Start/End: Original strand, 1877 - 1994
Alignment:
Q  74 agccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttg 173  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||    
T  1877 agccagatttggtaccaaagatgaggtcaaggaagcaattatcaactatgctatcaacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaacgacttg 1976  T
Q  174 ttttgaacttttgaaaca 191  Q
    |||   ||||||||||||    
T  1977 tttgagacttttgaaaca 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 342 - 289
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggt 67  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  342 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggt 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 166
Target Start/End: Original strand, 599 - 691
Alignment:
Q  74 agccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 166  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  599 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1994 - 1902
Alignment:
Q  74 agccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 166  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  1994 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Original strand, 19781 - 19831
Alignment:
Q  14 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtg 64  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19781 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtg 19831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 250
Target Start/End: Original strand, 5729 - 5835
Alignment:
Q  143 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 242  Q
    |||||||||| | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| || ||    
T  5729 tttgaaacaaatcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaactaaaaacttaaaggacctttagatgca 5827  T
Q  243 tttgacca 250  Q
    ||||||||    
T  5828 tttgacca 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 250
Target Start/End: Original strand, 101245 - 101325
Alignment:
Q  169 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 250  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  101245 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaacgaaaaacttaaatgacctttagatgcatttgacca 101325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University