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Alignment Overview

Query: NF11156_low_1 (Length: 575)

Name: NF11156_low_1
Description: NF11156
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11156_low_1
NF11156_low_1
[»] chr4 (70 HSPs)
chr4 (188-558)||(42053107-42053476)
chr4 (188-558)||(52180617-52180986)
chr4 (188-558)||(29148856-29149224)
chr4 (188-558)||(32655362-32655730)
chr4 (188-558)||(3387052-3387424)
chr4 (192-558)||(12185685-12186043)
chr4 (192-558)||(12187677-12188036)
chr4 (191-558)||(54978986-54979347)
chr4 (208-558)||(52595467-52595815)
chr4 (185-558)||(14576691-14577057)
chr4 (188-555)||(42755243-42755608)
chr4 (184-558)||(2224797-2225171)
chr4 (214-558)||(25938293-25938635)
chr4 (269-558)||(2721078-2721361)
chr4 (188-558)||(21075732-21076096)
chr4 (262-558)||(41003295-41003593)
chr4 (387-558)||(23147504-23147675)
chr4 (208-558)||(38000519-38000866)
chr4 (387-558)||(652350-652521)
chr4 (387-558)||(54932585-54932756)
chr4 (208-558)||(21245761-21246109)
chr4 (387-558)||(8066057-8066228)
chr4 (387-523)||(4757229-4757365)
chr4 (388-558)||(3094817-3094985)
chr4 (90-188)||(51767500-51767598)
chr4 (188-553)||(34459476-34459839)
chr4 (387-553)||(2073471-2073637)
chr4 (208-553)||(22313201-22313543)
chr4 (387-553)||(1730896-1731062)
chr4 (214-532)||(33983065-33983381)
chr4 (265-364)||(26340264-26340363)
chr4 (188-364)||(1758013-1758188)
chr4 (297-371)||(39804280-39804354)
chr4 (220-347)||(23147348-23147474)
chr4 (274-370)||(22829725-22829821)
chr4 (260-367)||(11034669-11034776)
chr4 (262-364)||(8805959-8806061)
chr4 (263-364)||(28234206-28234306)
chr4 (263-359)||(52802303-52802399)
chr4 (263-359)||(53140587-53140683)
chr4 (190-326)||(3097987-3098123)
chr4 (260-370)||(652218-652328)
chr4 (265-359)||(45097540-45097634)
chr4 (274-370)||(22306830-22306926)
chr4 (390-496)||(56445062-56445169)
chr4 (190-342)||(2073667-2073818)
chr4 (391-505)||(28928516-28928630)
chr4 (274-370)||(31786401-31786497)
chr4 (307-359)||(33733397-33733449)
chr4 (294-364)||(56445196-56445266)
chr4 (317-370)||(3094994-3095047)
chr4 (294-359)||(22247867-22247932)
chr4 (471-538)||(1757890-1757957)
chr4 (470-553)||(7250439-7250522)
chr4 (418-505)||(44292890-44292977)
chr4 (471-538)||(46030388-46030455)
chr4 (390-476)||(22829841-22829927)
chr4 (262-356)||(46080693-46080787)
chr4 (418-548)||(27586433-27586565)
chr4 (188-325)||(8065867-8066002)
chr4 (390-478)||(52013888-52013977)
chr4 (329-367)||(7262054-7262092)
chr4 (260-346)||(27586635-27586721)
chr4 (284-370)||(31713662-31713748)
chr4 (263-365)||(51806963-51807065)
chr4 (294-347)||(21297323-21297376)
chr4 (387-499)||(52802162-52802275)
chr4 (387-499)||(53140711-53140824)
chr4 (390-474)||(23349317-23349401)
chr4 (294-354)||(41780664-41780724)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (188-558)||(16567466-16567834)
chr7 (188-558)||(16597828-16598196)
chr7 (188-558)||(46181112-46181480)
chr7 (188-558)||(5023036-5023405)
chr7 (192-558)||(27398483-27398856)
chr7 (187-558)||(31454796-31455167)
chr7 (188-558)||(19804937-19805294)
chr7 (188-558)||(10066104-10066474)
chr7 (387-558)||(39414661-39414832)
chr7 (388-558)||(35092584-35092754)
chr7 (387-558)||(3363060-3363222)
chr7 (188-553)||(43224223-43224580)
chr7 (387-532)||(9477742-9477887)
chr7 (387-503)||(46783161-46783277)
chr7 (387-554)||(3551384-3551551)
chr7 (388-533)||(33067353-33067498)
chr7 (192-347)||(39414481-39414635)
chr7 (294-553)||(43702268-43702524)
chr7 (387-553)||(42284601-42284767)
chr7 (264-370)||(1876077-1876183)
chr7 (263-364)||(33978798-33978899)
chr7 (294-367)||(36072609-36072682)
chr7 (263-359)||(17172264-17172360)
chr7 (265-356)||(34152405-34152496)
chr7 (265-356)||(34174628-34174719)
chr7 (262-365)||(36074163-36074266)
chr7 (297-367)||(38469956-38470026)
chr7 (262-347)||(9223614-9223699)
chr7 (391-556)||(38398282-38398446)
chr7 (391-556)||(38400824-38400988)
chr7 (265-366)||(48558722-48558823)
chr7 (294-370)||(11244028-11244104)
chr7 (262-364)||(26299125-26299227)
chr7 (265-359)||(40789576-40789670)
chr7 (188-370)||(3362854-3363036)
chr7 (188-347)||(33067525-33067683)
chr7 (294-370)||(5924104-5924180)
chr7 (294-370)||(40342350-40342426)
chr7 (275-367)||(45112179-45112271)
chr7 (188-252)||(46782987-46783051)
chr7 (307-366)||(28067309-28067368)
chr7 (276-347)||(46783062-46783133)
chr7 (311-370)||(30738668-30738727)
chr7 (264-346)||(9355220-9355302)
chr7 (188-250)||(43702555-43702617)
chr7 (188-347)||(9477558-9477716)
chr7 (308-359)||(3809419-3809470)
chr7 (209-252)||(35092864-35092907)
chr7 (316-366)||(30391574-30391624)
chr7 (390-476)||(40342244-40342330)
chr7 (189-246)||(11211336-11211393)
chr7 (387-499)||(17172123-17172236)
chr7 (294-347)||(35092782-35092835)
chr7 (307-359)||(20443407-20443459)
chr7 (188-252)||(21916241-21916305)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (188-558)||(33867392-33867761)
chr2 (188-558)||(25424643-25425011)
chr2 (188-558)||(32422588-32422956)
chr2 (188-558)||(38620281-38620649)
chr2 (294-558)||(13142419-13142682)
chr2 (188-558)||(4480951-4481315)
chr2 (189-558)||(31440483-31440850)
chr2 (188-558)||(23231626-23231993)
chr2 (187-558)||(9205066-9205432)
chr2 (387-558)||(44070263-44070434)
chr2 (294-558)||(30241423-30241686)
chr2 (188-533)||(667843-668186)
chr2 (267-558)||(4592040-4592331)
chr2 (207-445)||(3329099-3329336)
chr2 (188-347)||(44070462-44070621)
chr2 (307-558)||(29155323-29155578)
chr2 (481-558)||(17961301-17961378)
chr2 (481-558)||(3329344-3329421)
chr2 (387-553)||(15150079-15150245)
chr2 (264-364)||(35048587-35048687)
chr2 (263-356)||(8027500-8027593)
chr2 (263-356)||(15161950-15162043)
chr2 (387-558)||(20937131-20937301)
chr2 (263-359)||(4289603-4289699)
chr2 (260-370)||(29546130-29546240)
chr2 (455-558)||(38958541-38958644)
chr2 (387-499)||(10391549-10391662)
chr2 (273-366)||(2656771-2656864)
chr2 (260-321)||(42968992-42969053)
chr2 (188-252)||(30241331-30241394)
chr2 (265-365)||(41935564-41935664)
chr2 (307-370)||(18974710-18974773)
chr2 (263-370)||(15234273-15234380)
chr2 (275-370)||(17154181-17154275)
chr2 (388-499)||(4289728-4289840)
chr2 (266-346)||(11788590-11788669)
chr2 (396-499)||(39767036-39767139)
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (188-558)||(24987258-24987626)
chr3 (188-558)||(44792489-44792862)
chr3 (208-558)||(41923877-41924226)
chr3 (188-558)||(50480921-50481283)
chr3 (188-558)||(49359850-49360211)
chr3 (188-558)||(39352354-39352716)
chr3 (260-558)||(6408533-6408831)
chr3 (187-555)||(19618572-19618938)
chr3 (208-554)||(13735490-13735827)
chr3 (188-553)||(5040910-5041273)
chr3 (188-553)||(25467374-25467741)
chr3 (387-556)||(22844983-22845152)
chr3 (387-553)||(39952597-39952763)
chr3 (190-532)||(40563829-40564173)
chr3 (187-370)||(23299559-23299741)
chr3 (266-526)||(19873058-19873314)
chr3 (275-507)||(48080036-48080267)
chr3 (387-553)||(23298184-23298350)
chr3 (388-533)||(12905701-12905846)
chr3 (263-359)||(45079255-45079351)
chr3 (294-525)||(50508756-50508986)
chr3 (265-364)||(38694858-38694957)
chr3 (294-359)||(42096792-42096857)
chr3 (294-370)||(35688295-35688371)
chr3 (269-364)||(10085305-10085400)
chr3 (269-364)||(10192225-10192320)
chr3 (387-553)||(11671822-11671981)
chr3 (398-507)||(49193559-49193669)
chr3 (264-364)||(32995197-32995297)
chr3 (387-548)||(2150542-2150701)
chr3 (187-359)||(30248104-30248274)
chr3 (294-370)||(8340134-8340210)
chr3 (263-347)||(27346543-27346627)
chr3 (387-499)||(41410167-41410279)
chr3 (182-250)||(48079956-48080024)
chr3 (260-364)||(49374752-49374856)
chr3 (188-247)||(11671723-11671782)
chr3 (269-356)||(35732204-35732291)
chr3 (263-366)||(48583692-48583794)
chr3 (266-364)||(5908196-5908294)
chr3 (276-370)||(19454760-19454854)
chr3 (262-347)||(43657229-43657314)
chr3 (387-499)||(45079114-45079227)
chr3 (188-370)||(12905503-12905684)
chr3 (307-370)||(7940337-7940400)
chr3 (387-445)||(33558754-33558812)
chr3 (390-476)||(35688392-35688478)
chr3 (388-499)||(30247963-30248075)
chr3 (396-491)||(49374888-49374984)
chr3 (335-370)||(11671771-11671806)
chr3 (425-476)||(19454911-19454962)
chr3 (265-356)||(41410310-41410401)
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (188-558)||(14645209-14645577)
chr5 (188-557)||(14088162-14088528)
chr5 (188-558)||(41616477-41616845)
chr5 (266-558)||(1060918-1061214)
chr5 (387-558)||(15719038-15719212)
chr5 (191-555)||(4572164-4572526)
chr5 (191-553)||(14087560-14087919)
chr5 (188-548)||(29455684-29456042)
chr5 (188-553)||(7977924-7978288)
chr5 (187-347)||(15719238-15719397)
chr5 (187-553)||(22632098-22632459)
chr5 (189-553)||(31149546-31149909)
chr5 (206-538)||(41983159-41983489)
chr5 (388-532)||(18595452-18595596)
chr5 (387-553)||(6224697-6224863)
chr5 (265-359)||(4901985-4902079)
chr5 (188-347)||(6224889-6225047)
chr5 (262-359)||(19254532-19254629)
chr5 (260-367)||(15674016-15674122)
chr5 (307-370)||(19549361-19549424)
chr5 (264-367)||(33347112-33347215)
chr5 (294-364)||(35853520-35853590)
chr5 (266-367)||(35935276-35935377)
chr5 (189-359)||(38309669-38309839)
chr5 (264-364)||(30774775-30774875)
chr5 (263-359)||(41692512-41692608)
chr5 (276-359)||(639406-639489)
chr5 (294-364)||(32302387-32302457)
chr5 (272-370)||(36470484-36470582)
chr5 (294-366)||(16186766-16186838)
chr5 (263-359)||(34718828-34718924)
chr5 (262-352)||(10937387-10937477)
chr5 (390-496)||(3049675-3049782)
chr5 (294-359)||(6277857-6277924)
chr5 (471-538)||(36470367-36470434)
chr5 (387-504)||(6311073-6311190)
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[»] chr1 (65 HSPs)
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[»] chr6 (28 HSPs)
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[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (189-558)||(24789406-24789774)
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chr8 (390-474)||(222078-222162)
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[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (185-558)||(240318-240684)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
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[»] scaffold0164 (4 HSPs)
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[»] scaffold0242 (2 HSPs)
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[»] scaffold0938 (1 HSPs)
scaffold0938 (307-366)||(472-531)
[»] scaffold0062 (2 HSPs)
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[»] scaffold0230 (2 HSPs)
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[»] scaffold0160 (2 HSPs)
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[»] scaffold0249 (1 HSPs)
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[»] scaffold0024 (1 HSPs)
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[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (308-363)||(14390-14445)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 70)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 42053476 - 42053107
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |||     
T  42053476 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tatccgtacccgtgcccgtaccctcgtg 42053378  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |    
T  42053377 ggcaacaactttagtccccttccccataccctgtgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaaac 42053278  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42053277 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatatt 42053178  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42053177 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 42053107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 52180986 - 52180617
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |||     
T  52180986 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgtccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tatccgtacccgtgcccgtaccctcgtg 52180888  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |    
T  52180887 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaggtacccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaaac 52180788  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52180787 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatatt 52180688  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52180687 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgatattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 52180617  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 29149224 - 29148856
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       || ||||||| |||||||||||| |||     
T  29149224 tagggatggcaatgggtacccaatggatagggtactacaatgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tatccgtaccagtgcccgtaccctcgtg 29149126  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |    
T  29149125 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaa-c 29149027  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29149026 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatatt 29148927  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29148926 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 29148856  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 32655730 - 32655362
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |||     
T  32655730 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgtccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tatccgtacccgtgcccgtaccctcgtg 32655632  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |    
T  32655631 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaggtacccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaaac 32655532  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32655531 atcacaaatgaaataaaactacgatccca-ttttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatatt 32655433  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32655432 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgatattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 32655362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 3387424 - 3387052
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||     
T  3387424 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtaccctcgtg 3387326  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                |    
T  3387325 ggcaacaactttagtcctcttccccataccctatgggtacttaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaactatg-aaaagacaaaaaaaac 3387227  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaa----ttttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaa 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3387226 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaaattttttttttaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaa 3387127  T
Q  484 tattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3387126 tattcctaaaaaattatacaccgacatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 3387052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 192 - 558
Target Start/End: Original strand, 12185685 - 12186043
Alignment:
Q  192 gatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggca 291  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12185685 gatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacagtgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtaccctcgtgggca 12185783  T
Q  292 caaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatca 391  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||                 ||||    
T  12185784 acaactttagtccccttccccataccctatgggtacctcagtgcccatacccgcatccattacccgcactttaactatgaaaaaaaaaa-------atca 12185876  T
Q  392 caaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattccta 491  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  12185877 caaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatatcccta 12185976  T
Q  492 aaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12185977 aaaaattatacaccggcataatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 12186043  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 192 - 558
Target Start/End: Original strand, 12187677 - 12188036
Alignment:
Q  192 gatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggca 291  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12187677 gatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacagtgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtaccctcgtgggca 12187775  T
Q  292 caaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatca 391  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||                 ||||    
T  12187776 acaactttagtccccttccccataccctatgggtacctcagtgcccatacccgcatccattacccgcactttaactatgaaaaaaaaaat------atca 12187869  T
Q  392 caaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattccta 491  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  12187870 caaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatatcccta 12187969  T
Q  492 aaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12187970 aaaaattatacaccggcataatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 12188036  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 191 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 54979347 - 54978986
Alignment:
Q  191 ggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnn-tacccgtacccgtgcccgtacccccgtagg 289  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||        |||||||||||||||||       ||| |     
T  54979347 ggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccgtccccatacccgtatttataaaaaaaatacccgtacccgtgccct------cgtgga 54979254  T
Q  290 cacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncat 389  Q
     |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |||    
T  54979253 taacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaagtacacatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaa-cat 54979155  T
Q  390 cacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcc 489  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54979154 cacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatattcc 54979055  T
Q  490 taaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54979054 taaaaaattatacatcggcatgatgtagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 54978986  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 208 - 558
Target Start/End: Original strand, 52595467 - 52595815
Alignment:
Q  208 caatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccat 307  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||      
T  52595467 caatgggtacggtactacaatgtccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tatccgtatccgtgcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtcccca 52595565  T
Q  308 tccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaact 407  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||                |||||||| | ||||||||||    
T  52595566 tcatcataccctatgggtacttaagtgtccatacccgcacccattacccgcactttaactatg-aaaaaacaaaaaaaacatcacaagtaaaataaaact 52595664  T
Q  408 acgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccgg 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52595665 acaatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatctgaaatattcctaaaaaattatacaccgg 52595764  T
Q  508 catgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52595765 catgatgaagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 52595815  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 185 - 558
Target Start/End: Original strand, 14576691 - 14577057
Alignment:
Q  185 atatagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtaccccc 284  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |    
T  14576691 atatagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtattacagtgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtaccctc 14576789  T
Q  285 gtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnn 384  Q
    || ||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||                  
T  14576790 gtgggcaacaattttagtccccttccccatatcctatgggtacctcagtgcccatacccgcatccattatccgcactttaactatgaaaaaaaaaat--- 14576886  T
Q  385 nncatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaat 484  Q
       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  14576887 ---atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacattcaaaat 14576983  T
Q  485 attcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14576984 atccctaaaaaattatacaccggcataatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 14577057  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 188 - 555
Target Start/End: Original strand, 42755243 - 42755608
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||| |||     
T  42755243 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacactgcccgtccccataccctcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtaccctcgtg 42755341  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    || |  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||                |    
T  42755342 ggtaacaactttagtccccttccccataccctatggatacctaagtgcacatacccgcacccattacccgcactttaactatg-aaaaaacaaaaaaaac 42755440  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||     
T  42755441 atcacaaatcaaataaaactacgatcccaagtttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaataaaaaacatccaaaatatc 42755540  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttag 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42755541 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaaatttag 42755608  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 184 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 2225171 - 2224797
Alignment:
Q  184 aatatagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnn-tacccgtacccgtgcccgtaccc 282  Q
    |||||||||||| |||| | |||  |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||        ||||||||||||||||||||||     
T  2225171 aatatagggatgacaatgggtacttaatgggtagggtactacagtgcccgtccacatacccgtatttataaaaaaaatacccgtacccgtgcccgtacct 2225072  T
Q  283 ccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnn 382  Q
     ||| ||||  || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||                
T  2225071 tcgtgggcaacaattttagtccccttctccatacccgatgggtacctaagtgctcatacccgcacccattacccgcactttaactatgaaaaaacaaaaa 2224972  T
Q  383 nnnncatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaa 482  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2224971 aaat-atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaattgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaa 2224873  T
Q  483 atattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2224872 atatccctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattatattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 2224797  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 214 - 558
Target Start/End: Original strand, 25938293 - 25938635
Alignment:
Q  214 gtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattcccca 313  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||       || ||||| ||||||| ||| || ||| | ||  |||||||||||| ||| |||    
T  25938293 gtagggtactacaatgtccgttcccatacccgtatttataaaaaa-tatccgtatccgtgcctgtatcctcgtggacaacaactttagtccccttctcca 25938391  T
Q  314 taccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaactacgatc 413  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||                 ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25938392 taccatgtgggtacttaagtacccatacccgcacccattaccagcactttaactata-aaaaaacaaaaaaaacatcacaaatgaaataaaattacgatc 25938490  T
Q  414 tcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgat 513  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25938491 ccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgcggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatatttctaaaaaattatacaccggcatgat 25938590  T
Q  514 ggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25938591 ggagttgttattgtattaagtagttttttggtttaagtttaggtt 25938635  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 269 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 2721361 - 2721078
Alignment:
Q  269 ccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaacta 368  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2721361 ccgtgcccataccctcgtgggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacctcagtgcccatacccgcatccattacccgcactttaacta 2721262  T
Q  369 tggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat 468  Q
    ||                 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2721261 tgaaaaaaaaaat------atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaat 2721168  T
Q  469 agaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2721167 agaaaacatccaaaatatccctaaaaaattatacaccggcataatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 2721078  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Original strand, 21075732 - 21076096
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||| |||     
T  21075732 tagggatggcaatgggtacccaatggatagggtactacagtgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacttgtacccgtgcccgtaccctcgtg 21075830  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||                     
T  21075831 ggcaacatttttagtccccttccccataccctatgggtacctaagtgcccatacccgcatccattacccgcactttaactatgaaaaaaaaaaaat---- 21075926  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||     
T  21075927 atcacaaaagaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagataacatccaaaatatc 21076026  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||    
T  21076027 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcaattg-ttggtttaaatttgggtt 21076096  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 262 - 558
Target Start/End: Original strand, 41003295 - 41003593
Alignment:
Q  262 cccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaat 361  Q
    |||||||||||| | ||||||  || ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  41003295 cccgtacccgtgtctgtacccttgtgggcaacaactttaatccccttccccatatcctatgggtacctaagtgctcatacccgcacccattacccgcact 41003394  T
Q  362 ttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn--catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatt 459  Q
    |||||||||                  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41003395 ttaactatgaaaaaacaaaaaaaaaaacatcacaaatgaaataaaactacgatccgaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatt 41003494  T
Q  460 tagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41003495 tagtcaaatagaaaacatccaaaatatccctaaaaaattatacaacggcatgatggagttgttattgtattaaatagttgtttggtttaagtttaggtt 41003593  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 387 - 558
Target Start/End: Original strand, 23147504 - 23147675
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23147504 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccttggtatttagtcaattagaaaacatccgaaatat 23147603  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23147604 tcctaaaaaattatacaccggcatgatgaagttgttattatattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 23147675  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 208 - 558
Target Start/End: Original strand, 38000519 - 38000866
Alignment:
Q  208 caatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccat 307  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||      |||| ||| ||||  |||||||||| | |    
T  38000519 caatgggtagggtactacagtgtccgtctccatacccgcatttataaaaaaatactcgtacccgt------acccacgtgggcaacaactttagtctcct 38000612  T
Q  308 tccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn---catcacaaatgaaataaa 404  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | | | ||||||||||                   ||||||||||||||||||    
T  38000613 tccccataccttatgggtacctaagtgcccatacccgcatccattatctgaactttaactatgaaaaaacaaaaaaaaaaaacatcacaaatgaaataaa 38000712  T
Q  405 actacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacac 504  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  38000713 actacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtgtttagtcaaatagaaaacatccaaaatatccctaaaaaatcatacac 38000812  T
Q  505 cggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38000813 cggcatgatggagttgttattgtattaaacagttgtttggtttaagtttaggtt 38000866  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 387 - 558
Target Start/End: Original strand, 652350 - 652521
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  652350 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtgatatttagtaaaatagaaaacatccaaaatat 652449  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  652450 acctaaaaaattatacaccgacatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 652521  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 387 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 54932756 - 54932585
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||    
T  54932756 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataacatgaatcgtggtattttatcaaatagaaaacatccaaaatat 54932657  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54932656 ccctaaaaaattatacaccggcatgatgaagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 54932585  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 208 - 558
Target Start/End: Original strand, 21245761 - 21246109
Alignment:
Q  208 caatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccat 307  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || ||||||| ||||||||       | | ||||||||||| ||||  | ||| ||||  |||| ||||||| |    
T  21245761 caatgggtagggtactacagtgtccatccccatacctgcatttataaaaaaattctcgtacccgtgcacgtattctcgtgggcaacaactgtagtcccct 21245860  T
Q  308 tccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaact 407  Q
    || ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| || || ||||||||||                |||||||||||||||||||||    
T  21245861 tctccataccctatgggtatctaagtgcccatatccgcatccattatccacactttaactatg--aaaggacaaaaaaacatcacaaatgaaataaaact 21245958  T
Q  408 acgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccgg 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||    
T  21245959 acgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatacgaatcgtagtatttagtcaaatagaaaacattcaaaatatctctaaaaaattatacaccgg 21246058  T
Q  508 catgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21246059 catgatgaagttgttattgtatcaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 21246109  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 387 - 558
Target Start/End: Original strand, 8066057 - 8066228
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  8066057 catcacaaatgaaataaaactacgattccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatat 8066156  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8066157 ccctagaaaattatacaccatcatgatggagttgtaattgtattaagcagttgtttggtgtaagtttaggtt 8066228  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 387 - 523
Target Start/End: Original strand, 4757229 - 4757365
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4757229 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatat 4757328  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgtta 523  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757329 ccctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgtta 4757365  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 388 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 3094985 - 3094817
Alignment:
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||   || ||     
T  3094985 atcataaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattgactcataaaataatataaatcgtagtatttagtcaaatagaaaacatc--caaaatc 3094888  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3094887 cctaaaaaattatacactggcgtgatggagttgttattgtattaaggagttgtttggtttaagtttaggtt 3094817  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 51767598 - 51767500
Alignment:
Q  90 cccccactcttcctagcaaaataacaaccttcaagagataactttaatatcaccaacaacaacatctaccctcagagtcttttaaggtaactttaatat 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51767598 cccccactcttcctagcaaaataacaaccttcaagagataactttaatatcaccaacaacaacatctaccctcagagtcttctaaggtaactttaatat 51767500  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 188 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 34459839 - 34459476
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| |       || | ||| |||||||||||||| |||     
T  34459839 tagggatggcaatgggtacccaataggtagggtactataatgcccatcctcatacccgcattt-ttaaaaattatctgtatccgtgcccgtaccctcgtg 34459741  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
     |||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||                |    
T  34459740 tgcaacaactttagtgtcattcctcataccctatgggtatctaagtgcacatacttgcactcattacccgcactttaactatg-aaaagacaataaaaac 34459642  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||||     
T  34459641 atcacaattgaaataaaactatggtcaaaatattttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtagtatttagtccaattaaaaacatcaaaaatatc 34459542  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
     |||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  34459541 tctaaaatattgtacaccagcaggatggagttgttattatattaagctgttttttggtttaggttt 34459476  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 2073637 - 2073471
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||    
T  2073637 catcacaattgagataaaactatggtctaaatcttttaaaattaactcataaaataatacgaatcgtagtatttagtcaaattaaaaacatctaaaatat 2073538  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
      |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  2073537 ctctaaaaaattgtacaccggtagaatggagttgttattgtattaaatagttttttggtttaggttt 2073471  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 208 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 22313543 - 22313201
Alignment:
Q  208 caatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccat 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |       |||| |||||||||||||||||| | | || |  |||||||||  | |    
T  22313543 caatgggtagggtactacaatgcccatccccatatccgcattt-taaaaaattacctgtacccgtgcccgtaccctcatgggaaacaactttagtgtcct 22313445  T
Q  308 tccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaact 407  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||                |||||||| |||||||||| |    
T  22313444 tccccatatcctatgggtatctaagtgtccatacccgcactcattatccgcactttaactatg-aaaaaacaataaaaacatcacaattgaaataaaatt 22313346  T
Q  408 acgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccgg 507  Q
    | ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||  ||| ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  22313345 atgatcaaaatcttttaaaattaactaataaaataatatgaatcgtagtatttagtcaaattcaaaaattca-aaatatctctaaaaaattgtacaccgg 22313247  T
Q  508 catgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||    
T  22313246 cagaatggagttgttactgtatcaagtagtttattggtttatgttt 22313201  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1731062 - 1730896
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||  ||||||    
T  1731062 catcacaattgaaataaaactatagtctaaatcttttaaaattaattcataaaataatatgaattgtagtatttagtcaaattaaaaacatccaaaatat 1730963  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
      |||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  1730962 ctctaaaaaactgtacaccagcaggatgaagttgttattgtattaagtaattttttggtttaggttt 1730896  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 214 - 532
Target Start/End: Original strand, 33983065 - 33983381
Alignment:
Q  214 gtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattcccca 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |       |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||||||| || || || |    
T  33983065 gtagggtactacaatgcccatctctatatctgcattt-ttaaaaattacctgtacccgtgtccgtaccctcgtgggcaataactttagtgccctttccta 33983163  T
Q  314 taccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaactacgatc 413  Q
    || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                |||||||| |||||||||| || ||||    
T  33983164 tatcctatgggtatctaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaactatg-aaaaaataatgaaaacatcacaattgaaataaaattatgatc 33983262  T
Q  414 tcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgat 513  Q
      ||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||| |||||  |||| ||    
T  33983263 aaaatcttttaaaatgaactaataaaataatacgaatcgtagtatttagtcaaattaaaaacatccaaaatatctctaaaaaattgtacactcgcataat 33983362  T
Q  514 ggagttgttattgtattaa 532  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  33983363 agagttgttactgtattaa 33983381  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26340363 - 26340264
Alignment:
Q  265 gtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattta 364  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26340363 gtacccgtgcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccatatcctatgggcacttaagtacccatacccgcacccattacccgcacttta 26340264  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 188 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1758188 - 1758013
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    |||||||| |||| | || |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |       | ||| ||||||||||||||||  |||     
T  1758188 tagggatgacaatgggtatccaatgggtagggtactatagtgcccatctccatacccacatttgtaagaaa-tgcccatacccgtgcccgtaccttcgtg 1758090  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattta 364  Q
    ||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1758089 ggcaacaactttagggcccttccccataccctatgggtacctaagtgcccatacccgcacccattacccgcacttta 1758013  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 297 - 371
Target Start/End: Original strand, 39804280 - 39804354
Alignment:
Q  297 tttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatgg 371  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39804280 tttagtgcccttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcactttagctatgg 39804354  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 347
Target Start/End: Original strand, 23147348 - 23147474
Alignment:
Q  220 tactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccct 319  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  23147348 tactacaatgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tatccgtacccgtgcccgtaccttcgtgggcaagaactttagtctcattccccataccct 23147446  T
Q  320 atgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||    
T  23147447 ataggtacttaagtgtccatacccgcac 23147474  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 370
Target Start/End: Original strand, 22829725 - 22829821
Alignment:
Q  274 cccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||||| ||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22829725 cccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggcacctaagtgcccatacccgcacccattacccgcattttaactatg 22829821  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 367
Target Start/End: Original strand, 11034669 - 11034776
Alignment:
Q  260 tacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11034669 tacccgtacccggacccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggcacctaagtgcccatacccgcacccattatccgca 11034768  T
Q  360 atttaact 367  Q
     |||||||    
T  11034769 gtttaact 11034776  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8806061 - 8805959
Alignment:
Q  262 cccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaat 361  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| || |  ||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  8806061 cccgtacccgtacccgtaccctcgtgggtaacaactttagtgcccttcctcataacctatgggcacttaagtgcccatacccgcacccattacccgcact 8805962  T
Q  362 tta 364  Q
    |||    
T  8805961 tta 8805959  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 28234306 - 28234206
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatt 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28234306 ccgtacccgtgcccgtaccctcgtggacaacaactttagtgcccttcccaataccctatgggcactt-agtgcccatacccgcacccattacccgcactt 28234208  T
Q  363 ta 364  Q
    ||    
T  28234207 ta 28234206  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 52802399 - 52802303
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  52802399 ccgtacccgagcccgtaccctcgtgggcaacaactttaatgcccttccccataccctatgggcacttaagtgctcatacccccacccattacccgca 52802303  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 359
Target Start/End: Original strand, 53140587 - 53140683
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  53140587 ccgtacccgagcccgtaccctcgtgggcaacaactttaatgcccttccccataccctatgggcacttaagtgctcatacccccacccattacccgca 53140683  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3098123 - 3097987
Alignment:
Q  190 gggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtagg 289  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||       ||  ||||||||||| |||| |  ||||||    
T  3098123 gggatggcaatgggtacctaatggatagggtactacaatgcccgtccccatactcgcatttataaaaaaatattcgtacccgtgctcgtatcttcgtagg 3098024  T
Q  290 cacaaactttagtcccattccccataccctatgggta 326  Q
    ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3098023 caacaactttagtcctcttccccataccctatgggta 3097987  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 370
Target Start/End: Original strand, 652218 - 652328
Alignment:
Q  260 tacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||    
T  652218 tacccgtacccgtgcccgtaccttcgtgggcaacaacaatagtccccttctccataccctatgggtacctaagtgcccttacccgcactcattacccaca 652317  T
Q  360 atttaactatg 370  Q
     ||||| ||||    
T  652318 ctttaattatg 652328  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 359
Target Start/End: Original strand, 45097540 - 45097634
Alignment:
Q  265 gtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  45097540 gtacccgagcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccttctccataccctatgggcacctaagtgcctatacccgcacccattacccgca 45097634  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22306926 - 22306830
Alignment:
Q  274 cccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||||| ||| ||||  ||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22306926 cccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccttcctcataccttatgggcacttaggtgcccatacccgcaccaattacccgcattttaactatg 22306830  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 56445169 - 56445062
Alignment:
Q  390 cacaaatgaaataaaactacgatctcaatttttt-aaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattc 488  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||  |||||| |    
T  56445169 cacaattgaaataaaactatgatccaaatttttttaaaatcaactcacaaaataatatgaatcgtagtatttagccaaataaaaaacatccaaaatatac 56445070  T
Q  489 ctaaaaaa 496  Q
    || |||||    
T  56445069 ctgaaaaa 56445062  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2073818 - 2073667
Alignment:
Q  190 gggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtagg 289  Q
    ||||||||||| | || ||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||       ||||||||  |||||  ||| || ||| ||    
T  2073818 gggatggcaatggttatccaatgaatagggtactacaatgctcatctccatacccgcatttat-aaaaattacccgtattcgtgcttgtatcctcgtggg 2073720  T
Q  290 cacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacc 342  Q
    ||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  2073719 caacaactttagtgcccttccccataccctatgggtacgtaagtgcccgtacc 2073667  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 391 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 28928630 - 28928516
Alignment:
Q  391 acaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcct 490  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||  || ||| |||||||||||| |  ||||||||  ||||||  ||    
T  28928630 acaattgaaataaaactatggtctaaatcttttaaaattatctcataaaataatacaaatcgtagtatttagtcaatttaaaaacatccaaaatatctct 28928531  T
Q  491 aaaaaattatacacc 505  Q
    |||||||| ||||||    
T  28928530 aaaaaattgtacacc 28928516  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 370
Target Start/End: Original strand, 31786401 - 31786497
Alignment:
Q  274 cccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||  | || ||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31786401 cccgtacccttgtgggcaaaaactttagtgtcctttcccataccctatgggcacctaagtgtctatacccgcacccattacccgcattttaactatg 31786497  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 307 - 359
Target Start/End: Original strand, 33733397 - 33733449
Alignment:
Q  307 ttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33733397 ttccccataccctatgggcacttaagtgcccatacctgcacccattacccgca 33733449  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 294 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 56445266 - 56445196
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattta 364  Q
    |||||||||  | ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  56445266 aactttagtgtccttccccataccttatgggcacttaagtgcccatactcgcacccattacccgcacttta 56445196  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3095047 - 3094994
Alignment:
Q  317 cctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3095047 cctatgagtacctaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaactatg 3094994  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 359
Target Start/End: Original strand, 22247867 - 22247932
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  22247867 aactttagtgcccttccccataccctataggcacttaagtgctcatacccgcacccattatccgca 22247932  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 471 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 1757957 - 1757890
Alignment:
Q  471 aaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagtt 538  Q
    ||||||||  |||||| |||||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1757957 aaaacatctaaaatatccctaaacaattgtacatcggcaagatgaagttgttattgtattaagtagtt 1757890  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 7250522 - 7250439
Alignment:
Q  470 gaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
    |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||    
T  7250522 gaaaacatccaaaatatctctaaaaaattgtacaccagcatgatggagttattattgtattaaacatatttttggtttaagttt 7250439  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 418 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 44292977 - 44292890
Alignment:
Q  418 ttttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacacc 505  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||| |||||| |||| |||  |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  44292977 ttttttaaaatcaacttataaaataatatgaattgtagtatttagccaaataaaaaatatccaaaatatccctaagaaattgtacacc 44292890  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 471 - 538
Target Start/End: Original strand, 46030388 - 46030455
Alignment:
Q  471 aaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagtt 538  Q
    ||||||||  |||||| |||||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  46030388 aaaacatctaaaatatccctaaacaattgtacatcggcaagatgaagttgttattgtattaagtagtt 46030455  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 476
Target Start/End: Original strand, 22829841 - 22829927
Alignment:
Q  390 cacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaaca 476  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  ||   ||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  22829841 cacaattgaaataaaactatgatccaaaaaatttcaaatcaactcataaaataatatgaatcgtagtatttagccaaataaaaaaca 22829927  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Original strand, 46080693 - 46080787
Alignment:
Q  262 cccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattaccc 356  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||| ||||  |||||||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  46080693 cccgtacctgtgtccgtagcctcgtgggcaacaactttagtgtcattctccataccctatgagcacttaagtgtccatacccgcactcattaccc 46080787  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 418 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 27586565 - 27586433
Alignment:
Q  418 ttttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaa-tagaaaacatcagaaatattcctaaaaaa-ttatacaccggcatgatgg 515  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||||| || |||||||   |||||| ||||||||| || |||  ||| | ||||     
T  27586565 ttttgtaaaattaactcataagatagtatgaatcttagtatttagtcaaaataaaaaacattcaaaatatccctaaaaaaattgtacgtcggtaggatga 27586466  T
Q  516 agttgttattgtattaagtagttgtttggttta 548  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27586465 aactgttattgtattaagtagttttttcgttta 27586433  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 325
Target Start/End: Original strand, 8065867 - 8066002
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||       ||| ||||||||||||||||||| ||      
T  8065867 tagggatggcaatgggtatccaatgggtagggtactacagtgcccatccccatatctgcatttat-aaaaaatactcgtacccgtgcccgtacccacgcg 8065965  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggt 325  Q
    | ||  |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  8065966 gacaacaactttagtccc-tttcccataccttatgggt 8066002  T

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Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 478
Target Start/End: Original strand, 52013888 - 52013977
Alignment:
Q  390 cacaaatgaaataaaactacgatctcaatttt--ttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatc 478  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||| ||||||||    
T  52013888 cacaattgaaataaaactatgatc-caattttttttaaaatcaactcacaaaataatatgaatcgtagtacttagctaaataaaaaacatc 52013977  T

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Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Original strand, 7262054 - 7262092
Alignment:
Q  329 taagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaact 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7262054 taagtgcccatacccgcacccattacccgcagtttaact 7262092  T

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Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27586721 - 27586635
Alignment:
Q  260 tacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgca 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| || |  ||||||| | || ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  27586721 tacccttacccgtgcccgtaccttcgtggggaacaactttactgccgttctccataccctatgggtacctaaatgcccatacccgca 27586635  T

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Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31713748 - 31713662
Alignment:
Q  284 cgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||||  |||||||||  | ||| |||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  31713748 cgtaggcaataactttagtgtccttctccatactctatgggcacctaagtgtccatacccgcacctattacccgcattttaattatg 31713662  T

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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 51807065 - 51806963
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatt 362  Q
    |||| |||| |||||||||| ||| || |  || |||||| ||  ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||    
T  51807065 ccgtgcccgagcccgtaccctcgtgggtaataattttagtgcccctccccataccctatggtaacctaagtgcccatacctgtacccattacccgcactt 51806966  T
Q  363 taa 365  Q
    |||    
T  51806965 taa 51806963  T

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Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21297376 - 21297323
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  21297376 aactttagtgcccttccctataccctatggatacttaagtgtccatacccgcac 21297323  T

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Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 52802275 - 52802162
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaata 485  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| ||||||||||| |||  || |||||||| ||||| | ||||||||  |||||    
T  52802275 catcacaattgaaataaaactatgatccaaaattatttaaatcaactaataaaataatacgaattgtagtatttagccaaataaaaaaacatccaaaata 52802176  T
Q  486 ttcctaaaaaatta 499  Q
    | ||| ||||||||    
T  52802175 tccctcaaaaatta 52802162  T

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Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 499
Target Start/End: Original strand, 53140711 - 53140824
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaata 485  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| ||||||||||| |||  || |||||||| ||||| | ||||||||  |||||    
T  53140711 catcacaattgaaataaaactatgatccaaaattatttaaatcaactaataaaataatacgaattgtagtatttagccaaataaaaaaacatccaaaata 53140810  T
Q  486 ttcctaaaaaatta 499  Q
    | ||| ||||||||    
T  53140811 tccctcaaaaatta 53140824  T

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Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 23349401 - 23349317
Alignment:
Q  390 cacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaa 474  Q
    ||||| ||||||||||||| |||   ||  |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  23349401 cacaattgaaataaaactatgattcaaaaattttcaaatcaactcataaaatagtatgaatcgtagtatttagccaaataaaaaa 23349317  T

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Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 294 - 354
Target Start/End: Original strand, 41780664 - 41780724
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattac 354  Q
    ||||||||| || ||||| ||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41780664 aactttagtgcccttccctatatcttatgggcacttaagtgtccatacccgcacccattac 41780724  T

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Target: chr7 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Original strand, 16567466 - 16567834
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |||     
T  16567466 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tatccgtacccgtgcccgtaccctcgtg 16567564  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |    
T  16567565 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaa-c 16567663  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16567664 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatatt 16567763  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16567764 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 16567834  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 16598196 - 16597828
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |||     
T  16598196 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tatccgtacccgtgcccgtaccctcgtg 16598098  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |    
T  16598097 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaa-c 16597999  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16597998 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatatt 16597899  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16597898 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 16597828  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Original strand, 46181112 - 46181480
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |||     
T  46181112 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tatccgtacccgtgcccgtaccctcgtg 46181210  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |    
T  46181211 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaa-c 46181309  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46181310 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatatt 46181409  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46181410 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 46181480  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 5023405 - 5023036
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| || ||| ||     
T  5023405 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacagtgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtactcgtgcccttatccc-gtg 5023308  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn- 386  Q
    ||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||                     
T  5023307 ggcaacaactttagtctccttccc-ataccctatgggtacctaagtgcccatacccgcacccattgcccgtactttaactatgaaaaaacaaaaaaaaaa 5023209  T
Q  387 -catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaata 485  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5023208 acatcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaata 5023109  T
Q  486 ttcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5023108 tccctaaaaaattatacaccggcatgatggggttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 5023036  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 192 - 558
Target Start/End: Original strand, 27398483 - 27398856
Alignment:
Q  192 gatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggca 291  Q
    ||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||       ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27398483 gatggcaatgggtgcccaatggatagggtactacaatgcccgtccccatacccgtatttataaaaaa-tacccatacccgtgcccgtaccctcgtgggca 27398581  T
Q  292 caaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn----c 387  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||                    |    
T  27398582 acaactttagtccccttccccataccctatggatacttaagtgcccatacccgcacccattacccacactttaactatgaaaaaacaaaaacaaaaaaac 27398681  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaatttttta----aaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaa 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27398682 atcacaaatgaaataagactacgatcccaatttttttttttaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttaatcaaatagaaaacatccgaaa 27398781  T
Q  484 tattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27398782 tattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 27398856  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 187 - 558
Target Start/End: Original strand, 31454796 - 31455167
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    |||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||       ||| ||||| | ||||||||  | |||    
T  31454796 atagggatggcaatgggtatccaatgagtagggtactacaatgtccgtccccatatccgcatttataaaaaa-tactcgtactcatgcccgtattctcgt 31454894  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn 386  Q
     ||||  |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||                    
T  31454895 gggcaacaactttagtctcctttcccatacccaatgggtacttaagtgtccatacccacacccattacccgcactttaactatgaaaaaacaaaaaaaaa 31454994  T
Q  387 -catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaata 485  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31454995 acatcacaaatgaaataaaactacgatctcaatttttcaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagttaaatagaaaacatccgaaata 31455094  T
Q  486 ttcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31455095 ttcctaaaaaattatacaccggcatgatgaagttgttattgtattaagcaattgtttggtttaagtttaggtt 31455167  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Original strand, 19804937 - 19805294
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||     
T  19804937 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacagtgcccgtcctcatacccgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtaccctcgtg 19805035  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    || |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||                     
T  19805036 ggtaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacctaagtgctcatacccgcacccattacccgcactttaactatgaaaaaacaaaaaaaat- 19805134  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||              
T  19805135 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacat---------- 19805224  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19805225 -ccaaaaagttatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 19805294  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 10066474 - 10066104
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    |||||||| |||| |  |||||||| ||| ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||       |||| ||||||||| |||||||| |||     
T  10066474 tagggatgacaatgggcacccaatgggtatggtactacagtgcgcgtccctatacccgcatttataaaaaa-tacctgtacccgtgtccgtaccctcgtg 10066376  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn- 386  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                     
T  10066375 ggcaacaactttagtccccttccccataccctataggtacctaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaactatgaaaaaacaaaaaaaaaa 10066276  T
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10066275 catcacaaatgaaataaaactacaatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtgttatttagtcaaatagaaaacatccaaaatat 10066176  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10066175 ccctaaaaaattatacacgaacatgatggagttgttattgtattaagcagttgtatggtttaagtttaggtt 10066104  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 387 - 558
Target Start/End: Original strand, 39414661 - 39414832
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39414661 catcgcaaatgaaataaaactacaatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatat 39414760  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39414761 ttctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 39414832  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 388 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 35092754 - 35092584
Alignment:
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||     
T  35092754 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaataaaaaacatccaaaatatc 35092655  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35092654 cctaaaaaattatacatcgacatgatggagttgttattgtaataagcagttgtttggtttaagtttaggtt 35092584  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 387 - 558
Target Start/End: Original strand, 3363060 - 3363222
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  3363060 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatat 3363159  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     | ||||         || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3363160 ccttaaa---------actggcatgatggagttgttagtgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 3363222  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 553
Target Start/End: Original strand, 43224223 - 43224580
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |             |||||||| | |||||| |||     
T  43224223 tagggatggcaatgagtacccaatgggaagggtactacaatgcccatccccatacccgcatttttaaaaat-------tacccgtgtctgtaccctcgtg 43224315  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||                |    
T  43224316 gacaacaactttagtgcccttccccataccctatgggtatctaagtgcccatacctgcacccattacccgcactttaactatg-aaaaaacaataaaaac 43224414  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||     
T  43224415 atcacaattgaaataaaattatgatcaaaatcttttaaaattaactaataaaataataagaatcgtagtatttagtcaaattaaaaacatccaaaatatc 43224514  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
     |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  43224515 tctaaaaaattgtacaccggcagaatggagttgttactgtattaagcagtttattggtttaggttt 43224580  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 387 - 532
Target Start/End: Original strand, 9477742 - 9477887
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||    
T  9477742 catcacaattgaaataaaactatggtctaaaacttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtagtatttagtcaaattaaaaacatctaaaatat 9477841  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaa 532  Q
      |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9477842 ctctaaaaaattgtacaccggcaggatggagttgttattgtattaa 9477887  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 387 - 503
Target Start/End: Original strand, 46783161 - 46783277
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  46783161 catcaaaaataaaataaaactatgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatataaaacatccaaaatat 46783260  T
Q  487 tcctaaaaaattataca 503  Q
     ||||||||||||||||    
T  46783261 ccctaaaaaattataca 46783277  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 387 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 3551551 - 3551384
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||| ||||||||| |||||||   ||||||    
T  3551551 catcacaattgaaatagaactatggtccaaattttttaaaattaacttataaaataatatgaattgcagtattaagtcaaataaaaaacatttaaaatat 3551452  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttta 554  Q
     ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3551451 ccctaaaaaattgtacaccgacagaatggagttgttattgtattaagtagttttttggtttaggttta 3551384  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 388 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 33067498 - 33067353
Alignment:
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||     
T  33067498 atcacaattgaaataaaactatggtctacatcttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtagtatttagtcaaattaaaaacatccaaaatatc 33067399  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaag 533  Q
     || ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33067398 tcttaaaaattgtacaccggcaagatggagtttttattgtattaag 33067353  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 347
Target Start/End: Original strand, 39414481 - 39414635
Alignment:
Q  192 gatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggca 291  Q
    ||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  39414481 gatggcaatgggtacccaatggatagggtactacaatgcccgttcccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtaccttcgtgggca 39414579  T
Q  292 caaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
      |||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39414580 acaactatggtccccttccccataccctatgggtatttaagtacccatacccgcac 39414635  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 43702524 - 43702268
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcaca 393  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||                |||||||    
T  43702524 aactttagtgctcttccccataccctatgggtacctaagtgcccatacccgcatccattacccgcactttaactatg-aaaagacaataaaaacatcaca 43702426  T
Q  394 aatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaa 493  Q
    | ||||||||||||| | ||| ||| | ||||||||||||||  |||||||| ||| | |  |||||||||||||  ||||||||  ||||||  |||||    
T  43702425 attgaaataaaactatggtctaaatctattaaaattaactca--aaataatacgaatcataatatttagtcaaattaaaaacatccaaaatatctctaaa 43702328  T
Q  494 aaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
    ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||    
T  43702327 aaattgtacacctgcaggatagagttgttattgtattaaacagtttttttgtttaggttt 43702268  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Original strand, 42284601 - 42284767
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||    
T  42284601 catcacaattgaaataaaactatgaacaaaatattttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtagtatttagtcaaattaaaaacattcaaaatat 42284700  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
       ||||| ||| |||||   || |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  42284701 ctttaaaatattgtacactaacaggatgtaattgttattgtattaagtagttttttgatttaggttt 42284767  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 264 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1876183 - 1876077
Alignment:
Q  264 cgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattt 363  Q
    ||||||||  ||||||||  ||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1876183 cgtacccggacccgtaccatcgtgggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggcacctaagtgcccatacccgcacccattacccgcatttt 1876084  T
Q  364 aactatg 370  Q
    |||||||    
T  1876083 aactatg 1876077  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 364
Target Start/End: Original strand, 33978798 - 33978899
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatt 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||  | ||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33978798 ccgtacccgtgcccgtaccctcgtgggcaacacctttagtgcccttccccataccgtatgggcacataagtgcccatacccgcacccattatccgcactt 33978897  T
Q  363 ta 364  Q
    ||    
T  33978898 ta 33978899  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 367
Target Start/End: Original strand, 36072609 - 36072682
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaact 367  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36072609 aactttagtgcccttccccataccctatgggcacctaagtgcccatacccgcaccaattacccgcaatttaact 36072682  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17172360 - 17172264
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  17172360 ccgtacccgagcccgtaccctcgtgggcaacaactttaatgcccttccccataccctatgggcacttaagtgctcatacccccacccattacccgca 17172264  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34152496 - 34152405
Alignment:
Q  265 gtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattaccc 356  Q
    ||||||||| | |||||| ||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34152496 gtacccgtgtctgtaccctcgtgggcaataactttagtgcccttccccataccctatggacacttaagtgcccatacccgcacccattaccc 34152405  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 356
Target Start/End: Original strand, 34174628 - 34174719
Alignment:
Q  265 gtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattaccc 356  Q
    ||||||||| | |||||| ||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34174628 gtacccgtgtctgtaccctcgtgggcaataactttagtgcccttccccataccctatggacacttaagtgcccatacccgcacccattaccc 34174719  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 262 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36074266 - 36074163
Alignment:
Q  262 cccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaat 361  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| || |  ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  36074266 cccgtactcgtgcccgtaccttcgtgggtaacaactttagtgcccttccccataccctatgggcacctaagtgcccatacccgtacccattacccgcact 36074167  T
Q  362 ttaa 365  Q
    ||||    
T  36074166 ttaa 36074163  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38470026 - 38469956
Alignment:
Q  297 tttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaact 367  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38470026 tttagtacccttccccatacccaatgggcacttaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaact 38469956  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 347
Target Start/End: Original strand, 9223614 - 9223699
Alignment:
Q  262 cccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  9223614 cccgtacctgtgcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtatcattccccataccctatgggcacttaagtgtccatacccgcac 9223699  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 391 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 38398446 - 38398282
Alignment:
Q  391 acaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcct 490  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || |||||| |||| ||||||||||||| || ||||| |  ||||| | |||||| ||||||||  |||||| | |    
T  38398446 acaattgaaataaaactatgatc-catttttttcaaataaactcataaaatattaggaaccataatatttggccaaataaaaaacatccaaaatatactt 38398348  T
Q  491 aaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttagg 556  Q
     ||||||| |||||| ||| || ||||  |||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  38398347 caaaaattgtacaccagcaagagggagcggttactttattaagtagtttttaggtttaagtttagg 38398282  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 391 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 38400988 - 38400824
Alignment:
Q  391 acaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcct 490  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || |||||| |||| ||||||||||||| || ||||| |  ||||| | |||||| ||||||||  |||||| | |    
T  38400988 acaattgaaataaaactatgatc-catttttttcaaataaactcataaaatattaggaaccataatatttggccaaataaaaaacatccaaaatatactt 38400890  T
Q  491 aaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttagg 556  Q
     ||||||| |||||| ||| || ||||  |||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  38400889 caaaaattgtacaccagcaagagggagcggttactttattaagtagtttttaggtttaagtttagg 38400824  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 48558823 - 48558722
Alignment:
Q  265 gtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattta 364  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  48558823 gtacctgtgcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccataccctatggccacttaagtgtccatatccgcatccattacccgcacttta 48558724  T
Q  365 ac 366  Q
    ||    
T  48558723 ac 48558722  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 370
Target Start/End: Original strand, 11244028 - 11244104
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  11244028 aactttagtgcccttccccatatcctatgggtacctaagtacccatacccgcacccattatcaacattttaactatg 11244104  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 364
Target Start/End: Original strand, 26299125 - 26299227
Alignment:
Q  262 cccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaat 361  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | ||  |||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| |    
T  26299125 cccgtactcgtgcccgtaccctcgtggacaacaactttggtgcccttccccataccctatgggcacttaagtgtccatacccgcaccaattatccgcact 26299224  T
Q  362 tta 364  Q
    |||    
T  26299225 tta 26299227  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 40789670 - 40789576
Alignment:
Q  265 gtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    |||||||  ||||||||| ||| | ||  ||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40789670 gtacccgaacccgtaccctcgtggacaacaactttagtgccctttcccataccctatgggcacttaagtgcccatacccgcactcattacccgca 40789576  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 370
Target Start/End: Original strand, 3362854 - 3363036
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||       |||||||| |  |||  |||||| |||     
T  3362854 tagggttggcaatggttacccaatggataaggtactacagtgtccgtctccatacccgtatttataaaaaaatacccgtatctatgctggtaccctcgtg 3362953  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    | ||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||  | | |  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3362954 gacaacaactttagtccccttccccatatcatatgggtatctcaatgtccatacccgcatccattacccgcactttaactatg 3363036  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33067683 - 33067525
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |       |||||||| || ||||| ||||| |||     
T  33067683 tagggatggcaatgggtaccaaatggatagggtactacaatgcctatcttcatacccacatttgtaaaaat-tacccgtatccatgcccataccctcgtg 33067585  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    ||||  |||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33067584 ggcaacaactttagtgtccttccccatactctatgggtacctaagtgcccatacccgcac 33067525  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5924180 - 5924104
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5924180 aactttagtgcccttccccataccctgtgggcacctaagtgtccatacctgcacccattacccgcactttaactatg 5924104  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40342426 - 40342350
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  40342426 aactttagtgcccttccccataccctataggcacctaagtgcccatacccccatccattacccgcattttaactatg 40342350  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 367
Target Start/End: Original strand, 45112179 - 45112271
Alignment:
Q  275 ccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaact 367  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45112179 ccgtaccctcgtgggcaataactttagtgcccttctccataccctatgggcacctaagtgctcatacccgcacccattacccgtagtttaact 45112271  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Original strand, 46782987 - 46783051
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttat 252  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  46782987 tagggatggcaatgggtacccaatggttagggtactacagtgcccgtccccatacccgcatttat 46783051  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28067368 - 28067309
Alignment:
Q  307 ttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaac 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  28067368 ttcctcataccctatgggtacttaagtgcccatacctgcacccattacctgcactttaac 28067309  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 347
Target Start/End: Original strand, 46783062 - 46783133
Alignment:
Q  276 cgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    ||||||| ||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  46783062 cgtaccctcgtgggcaacaactttagtccccttctccataccctatgggtacctaagtgcccatacccgcac 46783133  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 30738727 - 30738668
Alignment:
Q  311 ccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30738727 ccatacgctatgggtacctaagtgcccatacccacacccattacctgcactttaactatg 30738668  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9355302 - 9355220
Alignment:
Q  264 cgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgca 346  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  9355302 cgtacacgtgcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgtccttcctcataccctatgggcacttaagtgctcatacccgca 9355220  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43702617 - 43702555
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcattt 250  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  43702617 tagggatggcaatgggtacccaataggtagggtactacaatgcccatccccatacccacattt 43702555  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 347
Target Start/End: Original strand, 9477558 - 9477716
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    |||||||| |||| | ||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |       || ||||||  ||| |||||||| |||     
T  9477558 tagggatgacaatgggtacccaatcggtagggtactacaatgctcatccccataccctcatttgtaaaaat-tatccgtacttgtgtccgtaccctcgtg 9477656  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    ||||  ||||||| | || || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9477657 ggcaacaactttaatgccctttcccatgccctatgggtacctaagtgcccatacccgcac 9477716  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3809470 - 3809419
Alignment:
Q  308 tccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  3809470 tccccatacccgatgggtatttaagtgcccgtacccgaacccattacccgca 3809419  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 35092907 - 35092864
Alignment:
Q  209 aatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttat 252  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35092907 aatgggtagggtactacagtgcccgtccccatacccgcatttat 35092864  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 366
Target Start/End: Original strand, 30391574 - 30391624
Alignment:
Q  316 ccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaac 366  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  30391574 ccctatgggcacttaagtgcccatacccgcatccattatccgcactttaac 30391624  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 40342330 - 40342244
Alignment:
Q  390 cacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaaca 476  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  ||   ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  40342330 cacaattgaaataaaactatgatccaaaaaatttcaaatcaactaataaaataatatgaatcgtagtatttagccaaataaaaaaca 40342244  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11211393 - 11211336
Alignment:
Q  189 agggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgc 246  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  11211393 agggatggcaatggacccccaatgggtagggtactataatgcctgtccccatacccgc 11211336  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 17172236 - 17172123
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaata 485  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| ||||||||||| |||  || |||||||| ||||| | ||||||||  |||||    
T  17172236 catcacaattgaaataaaactatgatccaaaattatttaaatcaactaataaaataatacgaattgtagtatttagccaaataaaaaaacatccaaaata 17172137  T
Q  486 ttcctaaaaaatta 499  Q
    | ||| ||||||||    
T  17172136 tccctcaaaaatta 17172123  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35092835 - 35092782
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  35092835 aactttagtccccttccccatatcatatgggtacctaagtgtccatacccgcac 35092782  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 359
Target Start/End: Original strand, 20443407 - 20443459
Alignment:
Q  307 ttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  20443407 ttccccatacccgatgggtatctaagtgcccgtacccgaacccattacccgca 20443459  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Original strand, 21916241 - 21916305
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttat 252  Q
    ||||||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||    
T  21916241 tagggatggcaatggatatcctatgggtagggtacaacaattcccttccccatatccgcatttat 21916305  T

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Target: chr2 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 33867761 - 33867392
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |||     
T  33867761 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgtccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tatccgtacccgtgcccgtaccctcgtg 33867663  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |    
T  33867662 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaggtacccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaaac 33867563  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33867562 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatatt 33867463  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33867462 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 33867392  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Original strand, 25424643 - 25425011
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |||     
T  25424643 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgtccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tatccgtacccgtgcccgtaccctcgtg 25424741  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |    
T  25424742 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaggtacccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaaac 25424841  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25424842 atcacaaatgaaataaaactacgatccca-ttttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatatt 25424940  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25424941 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgatattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 25425011  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 32422956 - 32422588
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||  ||||||||||||||||||| |||     
T  32422956 tagggatggcaatgggtacccaatggatacggtactacaatgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tattcgtacccgtgcccgtaccctcgtg 32422858  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |    
T  32422857 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaa-c 32422759  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32422758 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatatt 32422659  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32422658 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttgatttaagtttaggtt 32422588  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Original strand, 38620281 - 38620649
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||       ||||||||||||||||| ||||| | |     
T  38620281 tagggatggcaatgggtactcaatgggtagggtactacaatgcccatccccatacctgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccataccctcatg 38620379  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |    
T  38620380 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaagtatccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaa-c 38620478  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  38620479 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaatatccgaaatatt 38620578  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38620579 cctaaaaaattatacaccggcatgatgaagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 38620649  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 294 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 13142682 - 13142419
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcaca 393  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||               |||||||    
T  13142682 aactttagtccccttccccataccctatgagtacttaagtacccatacccgcatccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaa-catcaca 13142584  T
Q  394 aatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaa 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13142583 aatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatattcctaaa 13142484  T
Q  494 aaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13142483 aaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 13142419  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Original strand, 4480951 - 4481315
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||             ||||||| ||||||||| |||     
T  4480951 tagggatggcaatgggtacccaatgggtaaggtactacaatgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-------tacccgtacccgtaccctcgtg 4481043  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||                    
T  4481044 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaagtgtccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaaaa 4481143  T
Q  388 -atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4481144 tatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataacatgaaccgtgatatttagtcaaatagaaaacatccgaaatat 4481243  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  4481244 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcaagtgtttggtttaagtttaggtt 4481315  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 189 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 31440850 - 31440483
Alignment:
Q  189 agggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtag 288  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  31440850 agggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccgtcccaatacccgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtaccctcgtgg 31440752  T
Q  289 gcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnca 388  Q
    |||  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                ||    
T  31440751 gcaataactttagtccccttctccataccctatgtgtacctaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaactatg-aaaaaacaaaaaaaaca 31440653  T
Q  389 tcacaaatgaaataaaactacgatctcaatttttta----aaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaat 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31440652 tcacaaatgaaataaaactacgatcctaatttttttttttaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaat 31440553  T
Q  485 attcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||    
T  31440552 attcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcag----ttggtttaagtttaggtt 31440483  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Original strand, 23231626 - 23231993
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||             ||||||| ||||||||| |||     
T  23231626 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccgtccccatacccaaatttataaaaaa-------tacccgtacccgtaccctcgtg 23231718  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn- 386  Q
    ||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                     
T  23231719 ggcaacaactgtagtccccttccccataccctatgggtacttaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaactatgaaaaaataaaaaaaaaa 23231818  T
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaatttttta---aaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaa 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23231819 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttttttaaattaactcataaaataataagaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaa 23231918  T
Q  484 tattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23231919 tattcctaaaaaattatacaccggcatgttggagttgttattgtaataagtagttgtttggtttaagtttaggtt 23231993  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 187 - 558
Target Start/End: Original strand, 9205066 - 9205432
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    |||||||||||||| | | ||||||  |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||       |||  ||||||||| ||||| || |||    
T  9205066 atagggatggcaatgggtgcccaataggtagggtactgcagtgcccgtctccataaccgcatttataaaaaa-tacttgtacccgtgtccgtatcctcgt 9205164  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn 386  Q
     || |  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||                    
T  9205165 gggtaataactttggtccccttccccataccctatgagtacctaagtgcccatacccgcatccattatccgcattttaactatg----aaaaaaaaaaaa 9205260  T
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9205261 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttcaaactaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatat 9205360  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9205361 ccctaaaaaattatacaccaacatgatggagttgttattgtattaagaaattgtttggtttaagtttaggtt 9205432  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 387 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 44070434 - 44070263
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  44070434 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatataaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatat 44070335  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44070334 ccctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttgttgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 44070263  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 294 - 558
Target Start/End: Original strand, 30241423 - 30241686
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcaca 393  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||                |||||||    
T  30241423 aactttagtctccttctccataccctatgggtacctaagtgcccatactcgcacccattacccgcactttaactatg-aaaaaacaaaaagaacatcaca 30241521  T
Q  394 aatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaa 493  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  30241522 aataaaataaaattacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtagtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatatccctaaa 30241621  T
Q  494 aaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30241622 caattatacacaggcacgatggaattgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 30241686  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 188 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 668186 - 667843
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |       ||| |||||||||||||||| || |||     
T  668186 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccatcctcatacccacatttgtaaaaat-tactcgtacccgtgcccgtatcctcgtg 668088  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||                     
T  668087 ggcaacaactttagtgcccttccccatatcctatgggtacctaagtgcccatacccgcacccattatccgcactttaactatgaaaagacaataaaaat- 667989  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||  ||||||     
T  667988 atcacaattgaaataaaactatggtctacatcttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtagtatttaatcaaattaaaaacatccaaaatatc 667889  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaag 533  Q
     || ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  667888 tcttaaaaattgtacaccggcaagatggagtttttattgtattaag 667843  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 267 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 4592331 - 4592040
Alignment:
Q  267 acccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaac 366  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||| || |||| | |||| ||||||||| |||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  4592331 acccgtgctcgtaccctcgtcggcaacaactttagtgcccttcctcgtaccttatgggtacctaagtgtccatgctcgcacccattacccgcactttaac 4592232  T
Q  367 tatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaa 466  Q
    ||| |                ||||||| ||||||||||||  | ||  |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||    
T  4592231 tat-gaaaagaaaataaaaatatcacaattgaaataaaactgaggtccaaattgtttaaaattaactcataaaatagtacgaatcgtactatttagtcaa 4592133  T
Q  467 atagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgat-ggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||| ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4592132 ataaaaaacatccaaaatatccctaaaaaattgtacaccggcatgatgggagttgttattgtattaagtagttttttggtttaagtttaggtt 4592040  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 207 - 445
Target Start/End: Original strand, 3329099 - 3329336
Alignment:
Q  207 ccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtccca 306  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||     
T  3329099 ccaatgggtagggtactacagtgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtacccatgcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtccct 3329197  T
Q  307 ttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaac 406  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| || ||||||||||                ||| ||||||||||||||||    
T  3329198 ttccccatactctatgggtacctaagtgtctatacccgcacccattacccacactttaactatgaaaaaaaaaaaaaaaacattacaaatgaaataaaac 3329297  T
Q  407 tacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataata 445  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3329298 tatgatcccaattttttaaaattaactcataaaataata 3329336  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 188 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44070621 - 44070462
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||     
T  44070621 tagggatggcaatgggtactcaatgggtagggtactacagtgcccgtcttcatatccgcatttataaaaaaatacccgtacccgtgcccgtaccctcgtg 44070522  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    ||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44070521 ggcaacaactttagtcccctttcccataccctatgggtacctaagtgcccatacccgcac 44070462  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 307 - 558
Target Start/End: Original strand, 29155323 - 29155578
Alignment:
Q  307 ttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaac 406  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||                |||||||| |||||||||||    
T  29155323 ttccccataccctatgggtacccaagtgcccgtacccgcacccattacccgcactttaactatg-aaaagacattaaaaacatcacaattgaaataaaac 29155421  T
Q  407 tacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaac-----cgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattata 501  Q
    || | ||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||      ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| ||    
T  29155422 tatggtccaattttttttaaattaactcataaaatagtatgaattcgatcgtagtatttagtcaaataaaaaacatccaaaatatccctaaaaaatttta 29155521  T
Q  502 caccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  29155522 cacaggcaggatggagccgttattgtagtaagtagttttttggtttaggtttaggtt 29155578  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 481 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 17961378 - 17961301
Alignment:
Q  481 aaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17961378 aaatatccctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 17961301  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 481 - 558
Target Start/End: Original strand, 3329344 - 3329421
Alignment:
Q  481 aaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3329344 aaatatccctaaaaaattatgcaccggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 3329421  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 15150245 - 15150079
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| |||||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||  |||||||   ||||||    
T  15150245 catcacaattgaaataaaattatggtctaaatcttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtaaaatttagtcaaattaaaaacattcaaaatat 15150146  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
      ||| |||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||    
T  15150145 ctctacaaaattgtacaccgacaggatgaagttgttattgtattaagcagatttttggtttaggttt 15150079  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 264 - 364
Target Start/End: Original strand, 35048587 - 35048687
Alignment:
Q  264 cgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattt 363  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35048587 cgtacccgtgcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccatatcctatgggcacttaagtgcccatacccgcacccattacccgcacttt 35048686  T
Q  364 a 364  Q
    |    
T  35048687 a 35048687  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8027593 - 8027500
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattaccc 356  Q
    |||||||||||||||||| | ||| | ||  ||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8027593 ccgtacccgtgcccgtacactcgtggacaacaactttagtgccctttcccataccctatgggcacttaagtacccatacccgcacccattaccc 8027500  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 356
Target Start/End: Original strand, 15161950 - 15162043
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattaccc 356  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| ||||  ||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15161950 ccgtacccgtgcctgttccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccctataccctatgggcacttaagtgcccatacccgcacccattaccc 15162043  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 387 - 558
Target Start/End: Original strand, 20937131 - 20937301
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||  | ||||||||||||||||||  || || |   ||  || ||||||||| ||||| ||||||||  ||| |     
T  20937131 catcacaattgaaataaaactaccgtccaatttttttaaaattaactca--aagtagttccaatagtagtatttagtgaaataaaaaacatccaaaaaaa 20937228  T
Q  487 tcct-aaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||| |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20937229 tccttaaaaaagtgtacaacggcacgatggagttgttattgtattaagtagtattttggtttaagtttaggtt 20937301  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 359
Target Start/End: Original strand, 4289603 - 4289699
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  4289603 ccgtacccgagcccgtaccctcgtgggcaacaactttaatgcccttccccataccctatgggcacttaagtgctcatacccccacccattacccgca 4289699  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29546240 - 29546130
Alignment:
Q  260 tacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||| ||||  ||||| | | || |||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29546240 tacccgtacccggacccgtatcctcgtgggcaacaacttcattgcccttccccataccctatgggcacctaagtgtccatacccgcacccattacccgca 29546141  T
Q  360 atttaactatg 370  Q
     ||||||||||    
T  29546140 ttttaactatg 29546130  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 455 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 38958644 - 38958541
Alignment:
Q  455 gtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttta 554  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| || |||||| |  |||||    
T  38958644 gtatttagtcaaataaaaaacatccaaaatatccttaaaaaactatacaccggcatgatgaggctcttattgtattaagtaattttttggtcttggttta 38958545  T
Q  555 ggtt 558  Q
    ||||    
T  38958544 ggtt 38958541  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 10391662 - 10391549
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaata 485  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  10391662 catcacaattgaaataaaactaggatccaaaattatttaaatcaactaataaaataatatgaatcgtagtatttagtcaaataaaaaaacatccaaaata 10391563  T
Q  486 ttcctaaaaaatta 499  Q
    | ||| ||||||||    
T  10391562 tccctcaaaaatta 10391549  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 366
Target Start/End: Original strand, 2656771 - 2656864
Alignment:
Q  273 gcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaac 366  Q
    |||| ||||| ||| ||||  |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||    
T  2656771 gcccataccctcgtgggcaacaactttagtgtccttccccataccctatgggtacttaagtgtccatacccacacacattacctgcactttaac 2656864  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 321
Target Start/End: Original strand, 42968992 - 42969053
Alignment:
Q  260 tacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctat 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  42968992 tacccgtacccgtgcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccataccctat 42969053  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Original strand, 30241331 - 30241394
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttat 252  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30241331 tagggatggcaatgggtatccaatgagtagggtactacagtgcccgtc-ccatacccgcatttat 30241394  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 41935664 - 41935564
Alignment:
Q  265 gtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattta 364  Q
    ||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||  | |||| ||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||    
T  41935664 gtacccgggtccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgtccttcctcataccctatgggcacctaagtgctcatacccgcacccattacccacagttta 41935565  T
Q  365 a 365  Q
    |    
T  41935564 a 41935564  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 370
Target Start/End: Original strand, 18974710 - 18974773
Alignment:
Q  307 ttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  18974710 ttccccataccctatgggcacttaggtgcccatatccgcacccattatccgcattttaattatg 18974773  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 15234273 - 15234380
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatt 362  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||||  ||||||||| || | || ||||||||||||| ||  |||| | ||| |||||||||| |||||||| ||    
T  15234273 ccgtacccgagcccgtactctcgtgggcaacaactttagtaccctacctcataccctatgggcacaaaagtgctcattcccgcacccaatacccgcactt 15234372  T
Q  363 taactatg 370  Q
    || |||||    
T  15234373 tatctatg 15234380  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17154275 - 17154181
Alignment:
Q  275 ccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||  | ||||||||||||||| ||||| | | | |||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  17154275 ccgtaccctcgtaggcaacaactttagtgtccttccccataccctat-ggtaccttaatgcccatacccgcaccaattatctgcattttaactatg 17154181  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 388 - 499
Target Start/End: Original strand, 4289728 - 4289840
Alignment:
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| ||||||||||| |||  || |||||||| ||||| | ||||||||  ||||||    
T  4289728 atcacaattgaaataaaactatgatccaaaattatttaaatcaactaataaaataatacgaattgtagtatttagccaaataaaaaaacatccaaaatat 4289827  T
Q  487 tcctaaaaaatta 499  Q
     ||| ||||||||    
T  4289828 ccctcaaaaatta 4289840  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 346
Target Start/End: Original strand, 11788590 - 11788669
Alignment:
Q  266 tacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgca 346  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  || |||||| || ||||| | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  11788590 tacccgtgcccgtaccctcgtgggcaacaattttagtgcccttccc-agaccctatgggcccttaagtgcccatacccgca 11788669  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 396 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 39767139 - 39767036
Alignment:
Q  396 tgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaatattcctaaaa 494  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||  || ||| |||||||| ||||| | ||||||||  ||||||||||  ||    
T  39767139 tgaaataaaactatgatc-caatttttttaaagcaactcataaaatagtagaaatcgtagtatttagccaaataaaaaaacatccaaaatattcctcgaa 39767041  T
Q  495 aatta 499  Q
    |||||    
T  39767040 aatta 39767036  T

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Target: chr3 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 24987626 - 24987258
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||| |||     
T  24987626 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtgcccgtgcccgtaccctcgtg 24987528  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||               |    
T  24987527 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcatccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaa-c 24987429  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24987428 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttggtcaaatagaaaacatccgaaatatt 24987329  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24987328 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagtagtttggtttaagtttaggtt 24987258  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 44792862 - 44792489
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||| |||     
T  44792862 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtatccgtgcccgtaccctcgtg 44792764  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn- 386  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||                    
T  44792763 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaaaa 44792664  T
Q  387 ---catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaa 483  Q
       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44792663 aaacatcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatctgaaa 44792564  T
Q  484 tattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44792563 tatgcctaaaaaattatacaccagcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttgttttaagtttaggtt 44792489  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 208 - 558
Target Start/End: Original strand, 41923877 - 41924226
Alignment:
Q  208 caatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccat 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||       |||||||| |||||  ||||||| ||| ||||  |||||||||||| |    
T  41923877 caatgggtagggtactacaatgcccgttcttatacccgcatttataaaaaa-tacccgtatccgtgttcgtaccctcgtgggcaacaactttagtcccct 41923975  T
Q  308 tccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaact 407  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||               |||||||||||||||||||||    
T  41923976 tccccatactctatgggtacttaagtgtctatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaaacatcacaaatgaaataaaact 41924075  T
Q  408 acgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccgg 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41924076 acgatctcaattttttaaaattaactcataaaataacataaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatattcctaaaaaattatacaccgg 41924175  T
Q  508 catgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41924176 catgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 41924226  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 50481283 - 50480921
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||     
T  50481283 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacagtgcccgtccccatccccgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtaccctcgtg 50481185  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||                     
T  50481184 ggcaacaactttagtccccttccccatagcctatgggtacctcagtgcccatacccgcattcattacccgcactttaactatgaaaaaaaaat------- 50481092  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  50481091 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatatc 50480992  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50480991 cctaaaaaattatacaccggcataatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 50480921  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Original strand, 49359850 - 49360211
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||       |||||||| ||||| |||||||| |||     
T  49359850 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacactgcctgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtatccgtgtccgtaccctcgtg 49359948  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                     
T  49359949 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacctcagtacccatacccgcacccattacccgcactttaactatgaaaaaaaat-------- 49360040  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||     
T  49360041 atcataaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataacatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacattcaaaatatc 49360140  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49360141 tctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 49360211  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Original strand, 39352354 - 39352716
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    |||||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||       |||     
T  39352354 tagggatgacaatgggtacctaatgggtagggtactacagtgcccgtccccatacccgcatttataaaaaaatacccgtacccgtgccct------cgtg 39352447  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||                     
T  39352448 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgagtacctaagtgcccatacccacacccattacccgcactttaactatgaaaaaaaaaaaaaaa-- 39352545  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||     
T  39352546 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaatatctaaaatatc 39352645  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39352646 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 39352716  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 260 - 558
Target Start/End: Original strand, 6408533 - 6408831
Alignment:
Q  260 tacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6408533 tacccgtacccgtgcccctaccctcgtgggcaacaactttagtcctcttccccgtaccctatgggtacctaagtgcccatacccgcacccattacccgca 6408632  T
Q  360 atttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatt 459  Q
     ||||||||||                ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  6408633 ctttaactatgaaaaaacaaaaaaaaacatcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactaataaaataatatgaatcgtgatatt 6408732  T
Q  460 tagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  6408733 tagtcaaatagaaaacatccaaaatatccctaaaaaattatacaccggcatgatggagttattattgtattaagcagttgtttgatttaaatttaggtt 6408831  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 187 - 555
Target Start/End: Original strand, 19618572 - 19618938
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    |||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||| ||||||| |||    
T  19618572 atagggatggcaatgggtatccaatgggcagggtactacattgtccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tatccgtacccgtgctcgtaccctcgt 19618670  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn 386  Q
     ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                    
T  19618671 gggcaacaactttagttcccttccccataccctatggatacctaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaactatg-ataaaacaaaaaaaa 19618769  T
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19618770 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcttgatatttagtcaaatagaaaacatccaaaatat 19618869  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttag 555  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  19618870 ccctaaaaaattatacaccgacatgatggagttgttattgtattaagcaattgtttgatttaaatttag 19618938  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 208 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 13735827 - 13735490
Alignment:
Q  208 caatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccat 307  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||| || ||| ||||  ||||||| |||| |    
T  13735827 caatgggtagggtactacagtgcccgtccccatacccgcatttataaaaaaatacccttacccgtgcccgtatcctcgtgggcaacaactttaatcccct 13735728  T
Q  308 tccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaact 407  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||                 ||  || |||||||||||||    
T  13735727 tccccataccctatgggtacctcagtgccgatacccgcacccattactcgcactttaactatgaaaaaaaa---------atatcatatgaaataaaact 13735637  T
Q  408 acgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccgg 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13735636 acgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagttaaatagaaaacatccaaaatattcctaaaaaattatacaccgg 13735537  T
Q  508 catgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttta 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13735536 catgacggagttgttattgtattaaacagttgtttggtttaagttta 13735490  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 188 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 5041273 - 5040910
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |       ||||||||| |||| |||||||| |||     
T  5041273 tagggatggcaatggatacccaatgggtagggtactacaatgcccatccccatacccgcattt-ttaaaaattacccgtactcgtgtccgtaccctcgtg 5041175  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||                |    
T  5041174 ggcaacaactttagtgtcattccccataccctataggtatctaagtgcccatacctgcacccattatccgcactttaactatg-aaaagataataaaaac 5041076  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||  |||||||   ||||||     
T  5041075 atcacaattgaaataaaactatggtcaaaatattttaaaattaacttataaaataatatgaattgtgatatttagtccaattaaaaacattcaaaatata 5040976  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
     |||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||    
T  5040975 tctaaaatattgtacaccagcaagatagagttgttattgtattaagcaggtttttggtttaggttt 5040910  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 188 - 553
Target Start/End: Original strand, 25467374 - 25467741
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |       |||||| |||||||||| ||||| |||     
T  25467374 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccatccccatatccgcattt-ttaaaaattacccgcacccgtgcccataccctcgtg 25467472  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg---gnnnnnnnnnnnnn 384  Q
    ||||  ||||||||| || ||||||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     |                 
T  25467473 ggcaacaactttagtgcccttccccatatcttatgggtatctaagtgctcatacccgcacccattacccgcaatttaactaactatgaaaaaacaataaa 25467572  T
Q  385 nncatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaat 484  Q
      |||||||| |||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||  ||||||||  ||||    
T  25467573 aacatcacaattgaaataaaattatgatcaaaatcttttaaaattaactaataaaataatacgaatcgtagtatttagtaaaattaaaaacatccaaaat 25467672  T
Q  485 attcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||| ||||    
T  25467673 atctctaaaaaattgtacaccggcagaatggagttgttactgttttaagcagtttattggtttaggttt 25467741  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 387 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22845152 - 22844983
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||  ||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  22845152 catcacatttgaaataaaactatggtccaaatttttttaaattaactcataaaataatacgaattgtagtatttagtcaaataaaaaacatccaaaatat 22845053  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttagg 556  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  22845052 ccctaaaaaattgtacaccggcaggatggagctgttactgtattaagtagtttttttgtttaggtttagg 22844983  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Original strand, 39952597 - 39952763
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||  |||||||   ||||||    
T  39952597 catcacaattgaaataaaactatggtctaaatcttttaaaattaactcataaaataatataaattgtagtatttaatcaaattaaaaacattcaaaatat 39952696  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
      |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  39952697 ctctaaaaaattgtacaccgacatgatggagttgttattgtattaagcagttttttggtttaggttt 39952763  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 190 - 532
Target Start/End: Original strand, 40563829 - 40564173
Alignment:
Q  190 gggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtagg 289  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |       ||||||||  |||||||||| | |||| ||    
T  40563829 gggatggcaataggtacccaatgtgtagggtactacaatacccatccccatacccgcatttgtaaaaat-tacccgtattcgtgcccgtatctccgtggg 40563927  T
Q  290 cacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccatta----cccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnn 385  Q
    ||  ||||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||| ||||||||    |||||| |||||| |||                   
T  40563928 caacaactttagtgcccttccccataccctatgagtatctaagtgcccataaccgtacccattaattacccgcactttaacaatg-aaaagaaaataaaa 40564026  T
Q  386 ncatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaata 485  Q
     |||||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||||||  ||||||||  |||||    
T  40564027 acatcacaattgaaataaaactatggtctaaatattttaaaattaactcatcaaataatacgaatcgtagcatttagtcaaattaaaaacatccaaaata 40564126  T
Q  486 ttcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaa 532  Q
    |  || ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40564127 tctcttaaaaattgtacaccggcagaatggagttgttattgtattaa 40564173  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23299741 - 23299559
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    ||||| ||| |||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |       || ||||||||||||||||||||  ||    
T  23299741 ataggaatgtcaatgggtaccaaatgggtagggtactacaatgcccatccccatacccgcattt-ttaaaaattatccgtacccgtgcccgtacccttgt 23299643  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
     ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23299642 gggcaacaactttagtgtcattccccataccctatgggtatctaagtgcccatacccgcacccattacccgcattttaactatg 23299559  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 266 - 526
Target Start/End: Original strand, 19873058 - 19873314
Alignment:
Q  266 tacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaa 365  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||||| ||  |||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19873058 tacctgtgcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccctccccatactttatgggtacctaagtgcccatacccgcacccattacctgcactttaa 19873157  T
Q  366 ctatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtca 465  Q
    |||||                |||||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  19873158 ctatg-aaaagacaataaaaacatcacaattgaaataaaactatggtctaaatcttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtagtatatagtca 19873256  T
Q  466 aatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattg 526  Q
    |||  ||||||||  |||   | |||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  19873257 aattaaaaacatccaaaa---ttctaaaaaattgtacaccggcgggatggagttgtaattg 19873314  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 507
Target Start/End: Original strand, 48080036 - 48080267
Alignment:
Q  275 ccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnn 374  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||        
T  48080036 ccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccatatcctatgggtacctaagtgtccatacccgcactcattacccgcactttaactatgaaaa 48080135  T
Q  375 nnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaa 474  Q
                 ||||||| ||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||    
T  48080136 gacaataaaaat-atcacaattgaaataaaactatggtctacatcttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtagtatttagtcaaattaaaaa 48080234  T
Q  475 catcagaaatattcctaaaaaattatacaccgg 507  Q
    ||||  ||||||  || ||||||| ||||||||    
T  48080235 catccaaaatatctcttaaaaattgtacaccgg 48080267  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 23298350 - 23298184
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||  | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||  ||||||||  ||||||    
T  23298350 catcacaattgaaataaaactatggtcaaattattttaaaattaactcataaaataatacgaatcgtagtatttagtccaattaaaaacatccaaaatat 23298251  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
      |||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  23298250 ctctaaaatattgtacaccagcaggatgtagttgttattgtattaagctgttttttggtttaggttt 23298184  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 388 - 533
Target Start/End: Original strand, 12905701 - 12905846
Alignment:
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||   ||||||     
T  12905701 atcacaattgaaataaaactatggtctacatcttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtattatttagtcaaattaaaaacattcaaaatatc 12905800  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaag 533  Q
     || ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12905801 tcttaaaaattgtacactagcaagatggagttgttattgtattaag 12905846  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45079351 - 45079255
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45079351 ccgtacccgagcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggcacttaagtgcccatacccgcacccattacccgca 45079255  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 50508986 - 50508756
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcaca 393  Q
    ||||||||| || || | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||                |||||||    
T  50508986 aactttagtgccctttctcataccctatgggaacttaagtgcccatacctgcacccactacccgcactttaactatg-aaaagacaataaaaacatcaca 50508888  T
Q  394 aatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaa 493  Q
    | |||||||||| || | ||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||  ||||||||  ||||||  || ||    
T  50508887 attgaaataaaattatggtctaaatctttttaaattaacgcataaaataatatgaattgtagtatttaatcaaatgaaaaacatccaaaatatctcttaa 50508788  T
Q  494 aaattatacaccggcatgatggagttgttatt 525  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  50508787 aaattgtacaccggcaggattgagttgttatt 50508756  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 38694957 - 38694858
Alignment:
Q  265 gtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattta 364  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38694957 gtacccgtgtccgtaccctcgtgggcaaaaactttagtgcccttccccataccctatggacacttaagtgtccatacccgcactcattacccgcacttta 38694858  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42096857 - 42096792
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42096857 aactttagtgcccttccccataccctatgggcacttaagtgcccatacccgcacccattacccgca 42096792  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 370
Target Start/End: Original strand, 35688295 - 35688371
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35688295 aactttagtgcccttccccatatcctatgggcacctaagtgcccatacccgcacccattacccgcattttaactatg 35688371  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 269 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10085400 - 10085305
Alignment:
Q  269 ccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattta 364  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  10085400 ccgtgcccataccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggtacttaagtgctcataccctcacctattacccgcacttta 10085305  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 269 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10192320 - 10192225
Alignment:
Q  269 ccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattta 364  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  10192320 ccgtgcccataccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggtacttaagtgctcataccctcacctattacccgcacttta 10192225  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Original strand, 11671822 - 11671981
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||  |||||||   ||||||    
T  11671822 catcacaattgaaataaaactatggtca-aatattttaaaattaactcataaaataatacgaatcatagtatttagtcaaattaaaaacattcaaaatat 11671920  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
       ||||| ||| ||      || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11671921 ctttaaaatattgta------caggatggagttgttattgtattaagtagttttttggtttaggttt 11671981  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 398 - 507
Target Start/End: Original strand, 49193559 - 49193669
Alignment:
Q  398 aaataaaactacgatctcaat-tttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaa 496  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||  || ||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||    
T  49193559 aaataaaactatgatctaaatctttttaaaatcaacacgtaaaataatacgaattgttgtatttagtcaaataaagaacatctaaaatattcctaaaaaa 49193658  T
Q  497 ttatacaccgg 507  Q
    ||||| |||||    
T  49193659 ttatagaccgg 49193669  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 364
Target Start/End: Original strand, 32995197 - 32995297
Alignment:
Q  264 cgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattt 363  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | ||  |||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  32995197 cgtactcgtgcccgtaccctcgtggacaacaactttagtgtccttccacataccctatgggcacttaagtgctcatacccgcacccattacccgcacttt 32995296  T
Q  364 a 364  Q
    |    
T  32995297 a 32995297  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 2150701 - 2150542
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||| |||||| | |||||  ||||||||  ||||||    
T  2150701 catcacaattgaaataaaactatggtctaaatattttcaaatcaactcataaaatagtacgaatcgtagtatttggccaaat--aaaacatccaaaatat 2150604  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggttta 548  Q
    |||||||| ||  |||||| | | ||  |||| |||| |||||||||||||| || ||||||    
T  2150603 tcctaaaatatggtacaccagtaggagcgagtggttactgtattaagtagtttttaggttta 2150542  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30248274 - 30248104
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| | | ||| || |||||||| ||||| |       | |||||||||  | |||||||| |||    
T  30248274 atagggatggcaatgggtacccaatggatagggtactatagtacccatccccataccctcatttgtaaaaaa-tgcccgtacccaagtccgtaccctcgt 30248176  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30248175 gggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggcaattaagtgcccata-ccgcacccattacccgca 30248104  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 370
Target Start/End: Original strand, 8340134 - 8340210
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8340134 aactttaatgcccttccccatacccaatgggcacctaagtgcccatacccgcacctattacccgcattttaactatg 8340210  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 347
Target Start/End: Original strand, 27346543 - 27346627
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||||  ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27346543 ccgtacccgagcccgtaccctcgagggcaacaactttagtgcctttccccatatcctatgggtaattaagtgcccatacccgcac 27346627  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 387 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 41410279 - 41410167
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||||    
T  41410279 catcacaattgaaataaaactatgatccaaaattatttaaatcaactaataaaatagtatgaatcgtagtatttagccaaataaaaaacatccaaaatat 41410180  T
Q  487 tcctaaaaaatta 499  Q
     ||| ||||||||    
T  41410179 ccctcaaaaatta 41410167  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 250
Target Start/End: Original strand, 48079956 - 48080024
Alignment:
Q  182 ttaatatagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcattt 250  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  48079956 ttaaaatagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccatccccatacccacattt 48080024  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 364
Target Start/End: Original strand, 49374752 - 49374856
Alignment:
Q  260 tacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| | ||  || ||||||  | || ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  49374752 tacccgtatccgtgcccgtatcctcgtggacaacaattttagtgtcctttcccataccctatgggcacttaagtgctcatacccgcacccattacccgca 49374851  T
Q  360 attta 364  Q
     ||||    
T  49374852 cttta 49374856  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Original strand, 11671723 - 11671782
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgca 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11671723 tagggatggcaatggatacccaatggatagggtactacaatgcccatccccatacccgca 11671782  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 356
Target Start/End: Original strand, 35732204 - 35732291
Alignment:
Q  269 ccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattaccc 356  Q
    |||||||||||||| ||| ||||  || ||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  35732204 ccgtgcccgtaccctcgtgggcaacaattttagtgtccttccccagaccctatgggcacttaagtgcccatacccgcactcattaccc 35732291  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 366
Target Start/End: Original strand, 48583692 - 48583794
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatt 362  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||| || || |||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||||||||| ||    
T  48583692 ccgtacccgagcccgtaccctcgtgggcaacaacttt-gtgcccttccccataccctatgggcacttaagtgcacatacctgcagtcattacccgcactt 48583790  T
Q  363 taac 366  Q
    ||||    
T  48583791 taac 48583794  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 364
Target Start/End: Original strand, 5908196 - 5908294
Alignment:
Q  266 tacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattta 364  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||||| || || || |||||||||| | |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  5908196 tacctgtgcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgccctttcctataccctatgagcacttaagtgcccatacccacaccaattacccgcacttta 5908294  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 276 - 370
Target Start/End: Original strand, 19454760 - 19454854
Alignment:
Q  276 cgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||    
T  19454760 cgtaccctcgtgggcaacaactttagtacccttccccatactctatgggcacttaagtgtccatatctgcacccattacccacattttaactatg 19454854  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 347
Target Start/End: Original strand, 43657229 - 43657314
Alignment:
Q  262 cccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| ||||  ||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  43657229 cccgtactcgtgcctgtaccctcgtgggcaacaactttattgcccttccccataccctataggcacttaagtgcccatacccgcac 43657314  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 45079227 - 45079114
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaata 485  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||  |||||    
T  45079227 catcacaattgaaataaaactatgatccaaaattatttaaatcaactaataaaataatatgaatcgtagtatttagccaaataaaaaaacatccaaaata 45079128  T
Q  486 ttcctaaaaaatta 499  Q
    | ||| ||||||||    
T  45079127 tccctcaaaaatta 45079114  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 370
Target Start/End: Original strand, 12905503 - 12905684
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | |||| |||  ||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| |       ||| |||||||||||||||||   |||     
T  12905503 tagggatggcaatgggtaccgaataggtatggtactacaatgtccatccccatacccacatttgtaaaaat-tactcgtacccgtgcccgtacagtcgtg 12905601  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||  |||||||||  | ||||||| || |||||||||| |||||  | |||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12905602 ggcaataactttagtgtccttccccaaactctatgggtacctaagtgtctatactcgcacccattactcgcactttaactatg 12905684  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 370
Target Start/End: Original strand, 7940337 - 7940400
Alignment:
Q  307 ttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  7940337 ttccccataccctatgaatacctaagtgcccatacccgcatccattacccgcactttagctatg 7940400  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 33558812 - 33558754
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataata 445  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33558812 catcacaattgaaataaaactatgattaaaatattttaaaattaactcataaaataata 33558754  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 476
Target Start/End: Original strand, 35688392 - 35688478
Alignment:
Q  390 cacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaaca 476  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  ||   ||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  35688392 cacaattgaaataaaactatgatccaaaaaatttcaaatcaactcataaaataatatgaatcgtagtatttagccaaataaaaaaca 35688478  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 30248075 - 30247963
Alignment:
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| |||||||| || ||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||  ||||||    
T  30248075 atcacaattgaaataaaactatgatccaaaattatttaaatcaactaataaaatagtacgaatcgtagtatttagccaaataaaaaaacatccaaaatat 30247976  T
Q  487 tcctaaaaaatta 499  Q
     ||||||||||||    
T  30247975 ccctaaaaaatta 30247963  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 491
Target Start/End: Original strand, 49374888 - 49374984
Alignment:
Q  396 tgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaatattccta 491  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||| |  |||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  49374888 tgaaataaaactatgatccaaatttttttaaatcaacttacgaaataatatgaatcgtaatatttagccaaataagaaaacatccaaaatattccta 49374984  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 370
Target Start/End: Original strand, 11671771 - 11671806
Alignment:
Q  335 cccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11671771 cccatacccgcacccattacccgcactttaactatg 11671806  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 476
Target Start/End: Original strand, 19454911 - 19454962
Alignment:
Q  425 aaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaaca 476  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  19454911 aaatcaactcataaaataatatgaatcgtagtatttagccaaataaaaaaca 19454962  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41410401 - 41410310
Alignment:
Q  265 gtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattaccc 356  Q
    ||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||| || ||||| | |||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41410401 gtacccgagtccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccctacaccctatgagcacctaagtgcccatacccgcacgcattaccc 41410310  T

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Target: chr5 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Original strand, 14645209 - 14645577
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||     
T  14645209 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccgtc-ccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtaccctcgtg 14645306  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |    
T  14645307 ggcaacaactttagtcccctcccccataccctatgggtacttaagtgtccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaaac 14645406  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14645407 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataacatgaaccgtgatatttagtcaaatagaaaacatccgaaatatt 14645506  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14645507 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 14645577  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 188 - 557
Target Start/End: Original strand, 14088162 - 14088528
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14088162 tagggatgacaatgggtacccaatgggtagggtactacagtgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtaccctcgta 14088260  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||                |    
T  14088261 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgg-tacctaagtgcccatacccgtacccattacccgcactttaactatg-aaaaaacaaaaaaaac 14088358  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  14088359 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaattcataaaataatatgaattgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatatc 14088458  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggt 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14088459 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggt 14088528  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Original strand, 41616477 - 41616845
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    |||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||| |||     
T  41616477 tagggatgacaatgggtacccaataggtagggtactacaatgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtatccgtgcccgtaccctcgtg 41616575  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn- 386  Q
    ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                     
T  41616576 ggcaacaactttagtccccttctccataccctatgggtacttaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaactatgaaaaacaataaaaaaaa 41616675  T
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaatttttta--aaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41616676 catcacaaatgaaataaaactacgatcccattttttttttaaattaactcattaaataatacgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaat 41616775  T
Q  485 attcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||    
T  41616776 attcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcag----ttggtttaagtttaggtt 41616845  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 266 - 558
Target Start/End: Original strand, 1060918 - 1061214
Alignment:
Q  266 tacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaa 365  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1060918 tacccgtgcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtccccttccccatatcctatgggtacctaattgcccatacccgcacccattacacgcactttaa 1061017  T
Q  366 ctatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtca 465  Q
    |||||                ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1061018 ctatgaaaaaacaaaaaaaaacatcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtca 1061117  T
Q  466 aatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacacc----ggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1061118 aatagaaaacattcaaaatatccctaaaaaattatacaccaacaggcatgatagagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 1061214  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 387 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 15719212 - 15719038
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaatt---ttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaa 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15719212 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaattattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaa 15719113  T
Q  484 tattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719112 tattcctaaaaaattatacaccggcatgatgaagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 15719038  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 555
Target Start/End: Original strand, 4572164 - 4572526
Alignment:
Q  191 ggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggc 290  Q
    |||| ||||| | ||||||||  ||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||       || ||||||||||| ||||| || ||| |||    
T  4572164 ggatagcaatggctacccaataggtagggtacaacagtgcccgtccccatacctgcatttataaaaaaatatccgtacccgtgtccgtatcctcgtgggc 4572263  T
Q  291 acaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatc 390  Q
    |  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||                ||||    
T  4572264 aacaactgtagtccccttccccatacc-tatgggtatctaagtgctcatactcgcatccattatccgcactttaactatg-aaaagacaaaaaaaacatc 4572361  T
Q  391 acaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcct 490  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  4572362 acaaatgaaataaaactacgatcccaaatttttaaaattaactcataaaaaaatacgaatcgtagtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatatccct 4572461  T
Q  491 aaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttag 555  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  4572462 aaaatattatacacctgcatgatggagttattattgtatcaaacagttgtttgatttaagtttag 4572526  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 553
Target Start/End: Original strand, 14087560 - 14087919
Alignment:
Q  191 ggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggc 290  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |       || |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14087560 ggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccatccccatacccgcattt-ttaaaaattatccgtacccgtgcccgtaccctcgtgggc 14087658  T
Q  291 acaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatc 390  Q
    |  ||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||                ||||    
T  14087659 aacaactttagtgcctttccccataccctatgggtatctaagtgcccatacccgcacc-attatccgcactttaactatg-aaaaaacaataaaaacatc 14087756  T
Q  391 acaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcct 490  Q
    |||| |||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||||  ||||||  ||    
T  14087757 acaattgaaataaaattatgatcaaaatcttttaaaattaactaataaaataatacgaatcgtaatatttagtcaaattaaaaacatccaaaatatctct 14087856  T
Q  491 aaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  14087857 aaaaaattgtacaccggtagaatggagttgttactgtattaagcagtttattggtttaggttt 14087919  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 188 - 548
Target Start/End: Original strand, 29455684 - 29456042
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||||| |       |||||||||||||| |||||||| |||     
T  29455684 tagggatggcaatgggcatccaatgggtagggtactataatgtccatccccatacccgcattt-ttaaaaattacccgtacccgtgtccgtaccctcgtg 29455782  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||                |    
T  29455783 ggcaacaactttagtgcccttccccataccttatgggtatctaagtgcccatacccgcacccattacccacactttaactatg-aaaagataataaaaac 29455881  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||| |||  |||||||   ||||||     
T  29455882 atcacaattgaaataaaactatggtcaaaatattttaaaattaacttataaaataatatgaattgtagtatttagtccaattaaaaacatttaaaatatc 29455981  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggttta 548  Q
     |||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29455982 tctaaaatattgtacaccagcaggatggagttgttattgtattaagcagttttttggttta 29456042  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 188 - 553
Target Start/End: Original strand, 7977924 - 7978288
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| |       |||||||||||||| |||||||| |||     
T  7977924 tagggatggcaatggttacccaatgggtagggtactacaatgcccatcctcatacctgcattt-ttaaaaattacccgtacccgtgtccgtaccctcgtg 7978022  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |               |    
T  7978023 ggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggtatctaagtgctcatacccgcacccattacccgcactttaactat-gaaaaaacaataaaaac 7978121  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat- 486  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||| | |||||||||||||   | ||||||||||||||  |||||||   ||||||     
T  7978122 atcacaattgaaataaaattatgatcaaaatcttttaaaattaactaaaaaaataatatgaataatagtatttagtcaaattaaaaacattcaaaatatc 7978221  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
    ||  ||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  7978222 tctaaaaaaattgcacaccggcagaatggagttgttactgtattaagcagtttattggtttaagttt 7978288  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15719397 - 15719238
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15719397 atagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccgtccccataaccgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtaccctcgt 15719299  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
     ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15719298 gggcaacaactttagtccccttcctcataccctatgggtacttaagtgcccatacccgcac 15719238  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 187 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 22632459 - 22632098
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |       |||| ||| |||||||||||||  |||    
T  22632459 atagggatggcaatag-tacccaatgggtagggtactacaatgcccatccccatactcgcatttgtaaaaat-tacctgtatccgtgcccgtaccttcgt 22632362  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn 386  Q
    |  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||                    
T  22632361 atacaacaactttagtgccattccccataccttatgggtacctaagtgatcatacctgcactcattacccgcactttaactatg-aaaagacaataaaaa 22632263  T
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| |||||||||| |  | ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  22632262 catcacaattgaaataaaatt--ggtctaaatcttttaaaattaacccataaaataatacgaatcatagtatttagtcaaattaaaaacatcaaaaatat 22632165  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
      ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||    
T  22632164 ctctaaaaagttgtacaccagcaggatggagttgttattgtattaaacagttcttttgtttaggttt 22632098  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 31149909 - 31149546
Alignment:
Q  189 agggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtag 288  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |       || |||||| |||| | |||||| ||| |    
T  31149909 agggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacactgcccatccccatacccgcattt-ttaaaaattatccgtactcgtgtctgtaccctcgtgg 31149811  T
Q  289 gcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtaccc-atacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    |||   ||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||                |    
T  31149810 gcaacgactttagtgtccttccccataccctatgggtatctaagtgccttatacccgcacccattatccgcactttaactatg-aaaagacaataaaaac 31149712  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||||  |||||      
T  31149711 atcacaattgaaataaaactatggtcaaaatctcttaaaattaactcataaaataatacgaatcgtaatatttagtcaaattaaaaacatccaaaatagc 31149612  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
     |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  31149611 actaaaaaattatacaccaataggatggagttgttattgtattaagcagttttttggtttaggttt 31149546  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 206 - 538
Target Start/End: Original strand, 41983159 - 41983489
Alignment:
Q  206 cccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtccc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |       ||||||||   |||| ||||||| ||| ||||  |||||||||  |    
T  41983159 cccaatgggtagggtactacaatgcccatcctcataccctcatttgtaaaaat-tacccgtatatgtgctcgtaccctcgtgggcaacaactttagtgtc 41983257  T
Q  306 attccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaa 405  Q
    ||| || || | |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||                |||||||| ||||||||||    
T  41983258 atttcctatgctctatgggtacctaagtgctcatacctgcacccattacccgcactttaactatg-aaaagacaataaaaacatcacaattgaaataaaa 41983356  T
Q  406 ctacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacacc 505  Q
    ||| | ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||| |||||     
T  41983357 ctatggtctaaatcttttaaaattaaaccataaaataatatgaatcgtagtatttagtcaaattaaaaacatccaaaatatctctaaaaaattgtacaca 41983456  T
Q  506 ggcatgatggagttgttattgtattaagtagtt 538  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41983457 ggcaggatggggttgttattgtattaagcagtt 41983489  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 388 - 532
Target Start/End: Original strand, 18595452 - 18595596
Alignment:
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||| |||||||||| || | |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||     
T  18595452 atcacaattgaaataaaattatggtctacatcttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtagtatttagtcaaattaaaaacatccaaaatatc 18595551  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaa 532  Q
     || ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18595552 tcttaaaaattgtacaccgccaagatggagttgttattgtattaa 18595596  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 6224863 - 6224697
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||| |||  ||||||||  ||||||    
T  6224863 catcacaattgaaataaaactatggtcaaaatattttaaaattaactcataaaataatacgaattgtagtatttagtccaattaaaaacatccaaaatat 6224764  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
      |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  6224763 ctctaaaatattgtacaccagcaggatggagttgttattgtattaagctgttttttggtttaggttt 6224697  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4902079 - 4901985
Alignment:
Q  265 gtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||| |||||||| ||| || |  ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4902079 gtacccgtgtccgtaccctcgtgggtaacaactttagtgcccttccccataccctatgggcacctaagtgcccatacccgcacccattacccgca 4901985  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6225047 - 6224889
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    |||||||| |||| | || | |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |       ||| ||||||||||||||||||| | |     
T  6225047 tagggatgacaatgggtatctaatgggtagggtactacaatgcccatccccatacccgcattt-ttaaaaattactcgtacccgtgcccgtaccctcatg 6224949  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||    
T  6224948 ggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggtatccaagtgcccatacccgcac 6224889  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19254629 - 19254532
Alignment:
Q  262 cccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    |||||||||  |||||||||| ||| | ||  ||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19254629 cccgtacccaagcccgtaccctcgtggacaacaactttagtgcccttccccataccctatgagcacttaagtgcccatacccgcacccattacccgca 19254532  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15674122 - 15674016
Alignment:
Q  260 tacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||| || || ||||| |||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  15674122 tacccgtacccgggcccgtaccctcgtgggcaacaactttcgtgcccttccc-ataccctatgggcacctaagtgtccatacccgcacccattatccgca 15674024  T
Q  360 atttaact 367  Q
    ||||||||    
T  15674023 atttaact 15674016  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 307 - 370
Target Start/End: Original strand, 19549361 - 19549424
Alignment:
Q  307 ttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19549361 ttccccataccccatgggtacctaagtacccatacccacacccattacccgcactttaactatg 19549424  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33347215 - 33347112
Alignment:
Q  264 cgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattt 363  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||| || || |||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| | |||||||    
T  33347215 cgtacccgggcccgtaccctcgtgggcaacaactttcgtgcccttccccataccctatgggcacctaagtgtccatacccgcacccattatctgcaattt 33347116  T
Q  364 aact 367  Q
    ||||    
T  33347115 aact 33347112  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 364
Target Start/End: Original strand, 35853520 - 35853590
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattta 364  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35853520 aactttagtgtccttccccataccctatgggcacttaagtgcccatacccgcacccattacccgcacttta 35853590  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 367
Target Start/End: Original strand, 35935276 - 35935377
Alignment:
Q  266 tacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaa 365  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||||| || ||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35935276 tacccgggcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccttctccataccctacgggcacctaagtgcccatacccgcacccattacccacagtttaa 35935375  T
Q  366 ct 367  Q
    ||    
T  35935376 ct 35935377  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 359
Target Start/End: Original strand, 38309669 - 38309839
Alignment:
Q  189 agggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtag 288  Q
    ||||||||| || |||||||||||  |||||||||| | | ||| ||||||||||| |||||||       | ||||||| || |||||||||| | | |    
T  38309669 agggatggccatggatacccaatggatagggtactatagtacccatctccataccctcatttataaaaaaatgcccgtactcgagcccgtaccctcatgg 38309768  T
Q  289 gcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    |||  || |||||| || || ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  38309769 gcaacaattttagtaccctttcccataccctatgggcacttaagtgctcatacccgcacacattatccgca 38309839  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 364
Target Start/End: Original strand, 30774775 - 30774875
Alignment:
Q  264 cgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattt 363  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||    
T  30774775 cgtactcgtgtccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccataccctataggcacttaagtgcctatacccgcacccactacccgcacttt 30774874  T
Q  364 a 364  Q
    |    
T  30774875 a 30774875  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41692608 - 41692512
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| ||||  ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  41692608 ccgtacccgaacccgtaccctcgtgggcaacaactttaatgcccttccccataccctatgggcacttaagtgctcatacccccacccattacccgca 41692512  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 639489 - 639406
Alignment:
Q  276 cgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||| ||| ||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  639489 cgtaccctcgtgggcaacaactttagtgtctttccccataccctatgggtacttaagtgcccatacccgcatcaattacccgca 639406  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 364
Target Start/End: Original strand, 32302387 - 32302457
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattta 364  Q
    |||||||||  | ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32302387 aactttagtgtccttccccataccttatgggcacttaagtgcccatacccgcacccattacccgcacttta 32302457  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36470582 - 36470484
Alignment:
Q  272 tgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    |||||||||||  || ||||  ||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  36470582 tgcccgtacccttgtgggcaacaactttagtgcccttccccatactctatgggtacctaagtgtccatacccgcacccattaccagcactttagctatg 36470484  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 366
Target Start/End: Original strand, 16186766 - 16186838
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaac 366  Q
    ||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16186766 aactttagttcctttccacatactttatgggtacttaagtgcccatacacgcacccattacccgcactttaac 16186838  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34718924 - 34718828
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    |||| |||| |||||||||| ||| | ||  ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  34718924 ccgtccccgagcccgtaccctcgtggacaacaactttaatgcccttccccataccctatgggcacttaagtgctcatacccccacccattacccgca 34718828  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 352
Target Start/End: Original strand, 10937387 - 10937477
Alignment:
Q  262 cccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccatt 352  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||| || |  ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  10937387 cccgtacccgagcccataccctcgtgggtaacaactttagtgcccttccccataccctatgggcacctaagtgcccatacccgtacccatt 10937477  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 3049782 - 3049675
Alignment:
Q  390 cacaaatgaaataaaactacgatctcaa--ttttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||||  ||||||     
T  3049782 cacaattgaaataaaactatgat-tcaaatttttttaaaatcaactcacaaaataatatgaatcgtaatatttagacaaataaaaaacatccaaaatata 3049684  T
Q  488 cctaaaaaa 496  Q
    ||| |||||    
T  3049683 cctgaaaaa 3049675  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6277924 - 6277857
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccata--cccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  6277924 aactttagtgctcttccccataccctatgggcacttaagtgcccatacccccgcacccattacccgca 6277857  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 471 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 36470434 - 36470367
Alignment:
Q  471 aaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagtt 538  Q
    ||||||||  |||||| |||||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36470434 aaaacatctaaaatatccctaaacaattgtacatcggcaagatgaagttgttattgtattaagtagtt 36470367  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 504
Target Start/End: Original strand, 6311073 - 6311190
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||| | |||||| |||| ||||||||||||| || |||  || |||||||| |||||| |||  |||  ||||||    
T  6311073 catcacaattgaaataaaaatatgatctaattttttttaaatcaactcataaaatagtacgaattgtagtatttagccaaataaaaattatccaaaatat 6311172  T
Q  487 tcctaaaaaattatacac 504  Q
     ||| ||||||| |||||    
T  6311173 cccttaaaaattgtacac 6311190  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 19254504 - 19254417
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaa 474  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  19254504 catcacaattgaaataaaactatgatccaaaattatttaaatcaactaataaaatagtatgaatcgtagtatttagccaaataaaaaa 19254417  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24489185 - 24489106
Alignment:
Q  291 acaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||| | || | | | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24489185 acaaactttagtacctttcctcataccctatgcgcaccttaatgcctatacccgcacccattacccacactttaactatg 24489106  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 419 - 477
Target Start/End: Original strand, 36323144 - 36323202
Alignment:
Q  419 tttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacat 477  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  36323144 tttttcaaatcaactcatcaaataatatgaatcgtagtatttagccaaataaaaaacat 36323202  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 34718800 - 34718687
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaata 485  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| ||||||||||| |||  || |||||||| ||||| | ||||||||  |||||    
T  34718800 catcacaattgaaataaaactatgatccaaaattatttaaatcaactaataaaataatacgaattgtagtatttagccaaataaaaaaacatccaaaata 34718701  T
Q  486 ttcctaaaaaatta 499  Q
    | ||| ||||||||    
T  34718700 tccctcaaaaatta 34718687  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 41692484 - 41692371
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaata 485  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| ||||||||||| |||  || |||||||| ||||| | ||||||||  |||||    
T  41692484 catcacaattgaaataaaactatgatccaaaattatttaaatcaactaataaaataatacgaattgtagtatttagccaaataaaaaaacatccaaaata 41692385  T
Q  486 ttcctaaaaaatta 499  Q
    | ||| ||||||||    
T  41692384 tccctcaaaaatta 41692371  T

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Target: chr1 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 185 - 558
Target Start/End: Original strand, 9222132 - 9222503
Alignment:
Q  185 atatagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtaccccc 284  Q
    |||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        || |||||||||||  ||||||| |    
T  9222132 atatagggatggcaatgggtatccaatgggtagggtactacaatgcccgtccccatacccgcattta-caaaaaatatccgtacccgtgttcgtaccctc 9222230  T
Q  285 gtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnn 384  Q
    || ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||                 
T  9222231 gtgggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccacacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaa 9222330  T
Q  385 nncatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaat 484  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9222331 a-catcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaat 9222429  T
Q  485 attcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9222430 attcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 9222503  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Original strand, 13312625 - 13312995
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||| |||     
T  13312625 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtatccgtgcccgtaccctcgtg 13312723  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn- 386  Q
     |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||                    
T  13312724 agcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaaaa 13312823  T
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13312824 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatat 13312923  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13312924 gcctaaaaaattatacaccagcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttgttttaagtttaggtt 13312995  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 25815542 - 25815172
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||| ||||| |||     
T  25815542 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tatccgtacccgtgcccataccctcgtg 25815444  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn- 386  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||                    
T  25815443 ggcaacaactttggtccccttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaaaa 25815344  T
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25815343 catcgcaaataaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatat 25815244  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25815243 ttctaaaaaattatacaccagcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 25815172  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 188 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 42069333 - 42068977
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||     
T  42069333 tagggatggcaatgggtgcccaatgggtagggtactacagtgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtaccctcgtg 42069235  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                     
T  42069234 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtatctaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaactatgaaaaaaaa--------- 42069144  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||     
T  42069143 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttaatcaaatagaaaacatccaaaatatc 42069044  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttta 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42069043 cctaaaaaattatacaccggcatgatgaagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagttta 42068977  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 29054821 - 29054452
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||       |||  |||||||||  ||||  | |||     
T  29054821 tagggatggcaatgggtacccaatggatagggtactgcattgcccatctccatacctgcatttataaaaaa-tacatgtacccgtgttcgtattctcgtg 29054723  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||                |    
T  29054722 ggcaacaactttggtccccttccccataccctatgggtacctaagtgtccatacccgcacccattacccgcactttaactatgaaaaaataaataaaaac 29054623  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  29054622 atcacaaatgaaataaaactacgatgtcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatatc 29054523  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29054522 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 29054452  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 35978724 - 35978356
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||       |||||||||||||| ||||||| |        
T  35978724 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacagtgcccgtccccatacccacatttataaaaaa-tacccgtacccgtgtccgtacctcaag- 35978627  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||                 |    
T  35978626 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacctaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaaatataaaaaaacaaaaaaacac 35978527  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  35978526 atcacaaatgatataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaatagtatgaatcgtggtatttagtcaagtagaaaacatccaaaatatc 35978427  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  35978426 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttgatttaagtttaggtt 35978356  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 187 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 48964590 - 48964215
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||       ||||||| ||| |||||||| || |||    
T  48964590 atagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacagtgcctgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtgcccttgcccgtatcctcgt 48964492  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn 386  Q
     ||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                    
T  48964491 gggcaacaactttagtccccttccccatactctatgggtacctcagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaactatgaaaaataaaaaaaata 48964392  T
Q  387 -----catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcaga 481  Q
         |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  48964391 aaaaacatcacaaatgagataaaactacaatcccaatttttaaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaa 48964292  T
Q  482 aatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48964291 aatatccctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 48964215  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 44328140 - 44327779
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||       |||| ||||||||      |||| |||     
T  44328140 tagggatgacaatgggtacccaatgggtagagtactacagtgaccgtccccatacccgtatttataaaaaaatacctgtacccgt------accctcgtg 44328047  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
     |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||                |    
T  44328046 agcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacctaagtgtccatacccgcacccattacccgcactttaactatg-aaaaaacaaaaaaaac 44327948  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||     
T  44327947 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactca--aaataatatgaatcgtggtatttagtcaaataaaaaacatccaaaatatc 44327850  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44327849 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaaacagttgtttggtttaagtttaggtt 44327779  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 388 - 558
Target Start/End: Original strand, 27783587 - 27783757
Alignment:
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  27783587 atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatatc 27783686  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27783687 cctaaaaaattatacaccggcataatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 27783757  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 387 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 43634524 - 43634353
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  43634524 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtaaaatagaaaacatccaaaatat 43634425  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43634424 ccccaaaaaattatacagcggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 43634353  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 388 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 33794415 - 33794245
Alignment:
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  33794415 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaaatttttaaaattaattcataaaataatatgaattgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatatc 33794316  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33794315 cctaaaaaattatagaccgacatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 33794245  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 192 - 538
Target Start/End: Original strand, 424465 - 424811
Alignment:
Q  192 gatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnn-tacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggc 290  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  424465 gatggcaatgggtacccaatggatagggtactacaatgcccttccccatgtccgcatttataaaaaaaatacccgtacccgtgcccgtaccctcgtgggc 424564  T
Q  291 acaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatc 390  Q
    |  |||||||| ||| ||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||                ||||    
T  424565 aacaactttagcccccttcccaatatcctgcgggtacttaagtgcccatacctgcacccattacccacactttaactatg-aaaagacaataaaaacatc 424663  T
Q  391 acaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcct 490  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  424664 acaaatgaaataaaactacggtcccaatttttaaaaattaactcataaaataatacgaatcgtagtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatatccct 424763  T
Q  491 aaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagtt 538  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  424764 aaaaaattatacactggcctgatggagttgttattgtattaagaagtt 424811  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 387 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 12560634 - 12560466
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  12560634 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaatatccaaaatat 12560535  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttag 555  Q
     | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12560534 ccttaaaaaattatacaccaacatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttag 12560466  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 188 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 19996891 - 19996528
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    |||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |       ||| |||||| |||||||||||| |||     
T  19996891 tagggatgacaatgggtgcccaatgggtagggtactacaatgcccatccccatatccgcatttgtaaaaat-tactcgtacctgtgcccgtaccctcgtg 19996793  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||                |    
T  19996792 ggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggtatctaagtgttcatacccgcacccattacccgcactttgactatg-aaaagacaataaaaac 19996694  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||     
T  19996693 atcacaattgaaataaaactatgatctaaatcttttaaaattaactcataaaataatacaaatcgtagtatttagtcaaattaaaaacatccaaaatatc 19996594  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
     |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  19996593 tctaaaaaattgtacaccagcaggatgaagttgttattgtattaagcagttttttggtttaggttt 19996528  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 188 - 553
Target Start/End: Original strand, 2978311 - 2978672
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |       |||||||||||||| | ||||||  ||     
T  2978311 tagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccatccccatacccgcattt-ttaaaaattacccgtacccgtgtctgtacccttgtg 2978409  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||                |    
T  2978410 ggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggtatctaagtgcccatacccgcacacattacccccactttaactatg-aaaagacaataaaaac 2978508  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||     
T  2978509 atcacaattgaaataaaact--ggtcaaaatattttaaaattaacttataaaataatacgaatcgtagtatttagtcaaattaaaaacatacaaaatatc 2978606  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
     |||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  2978607 tctaaaatattgtacaccaacatgatggagttgttattgtattaagcagtttttttgtttaggttt 2978672  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 187 - 553
Target Start/End: Original strand, 28220859 - 28221222
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |       |||||||| |||||||||||||| |||    
T  28220859 atagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccatccccatacccgcattt-ttaaaaattacccgtatccgtgcccgtaccctcgt 28220957  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn 386  Q
     ||||  ||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |                   
T  28220958 gggcaacaactttagtgccctttcccataccctatgggtatctaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaactat-gaaaaaacaatgaaaa 28221056  T
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| |||||| ||| || ||||  ||| ||||||||| |||| || |||||||| |||  || ||||||| ||||||  ||||||||  ||||||    
T  28221057 catcacaattgaaat-aaattatgatcaaaatcttttaaaatgaactaatgaaataatacgaattgtagtatttaatcaaattaaaaacatccaaaatat 28221155  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
      |||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  28221156 ctctaaaaaattgtacattggcagaatggagttgttactgtattaagcagtttattggtttaggttt 28221222  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 188 - 548
Target Start/End: Original strand, 19506275 - 19506634
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||| || || ||||||||| |||| |       ||||||||| |||| |||||||| |||     
T  19506275 tagggatggcaatgggtatccaatgggtagggtactataatgtccatccccatacccgaattt-ttaaaaattacccgtactcgtgtccgtaccctcgtg 19506373  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |               |    
T  19506374 ggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggtatctaagtgcccatacccgcacccattacccacactttaactat-gaaaagataataaaaac 19506472  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcat-aaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||  || |||||||||| |||  |||||||   ||||||    
T  19506473 atcacaattgaaataaaactatggtcaaaatattttaaaattaacttataaaaataatatgaattgtagtatttagtccaattaaaaacatttaaaatat 19506572  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggttta 548  Q
      |||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19506573 ctctaaaatattgtacaccagcaggatggagttgttattgtattaagcagttttttggttta 19506634  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 274 - 558
Target Start/End: Original strand, 610687 - 610970
Alignment:
Q  274 cccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnn 373  Q
    ||||||||| ||| ||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||       
T  610687 cccgtaccctcgtgggcaacaactttagttctcttccccataccctatgggtacttaagtgcacatacccgcacccattacccgcactttaactatg-aa 610785  T
Q  374 nnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaa 473  Q
                 |||||||| |||||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||| ||||||||||||||| |||    
T  610786 aagacaataaaaacatcacaattgaaataaaattatggtccaaattttttaaaattaactcataaaagagtacaaatcgtagtatttagtcaaataaaaa 610885  T
Q  474 acatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggag-ttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||  |||||| |||||   ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  610886 acatccaaaatatccctaaccgattgtacaccgacatgatggagtttgttattgtataaagtagtt-ttttgtttaggtttaggtt 610970  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 387 - 533
Target Start/End: Original strand, 38491517 - 38491663
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| ||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  ||||||||  ||||||    
T  38491517 catcacaattgaaataaaactatggtataaatcttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtagtatttagtaaaattaaaaacatccaaaatat 38491616  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaag 533  Q
      |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38491617 ctctaaaaaattatacaccgacaggatggagttgttattgtattaag 38491663  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 553
Target Start/End: Original strand, 25059064 - 25059356
Alignment:
Q  260 tacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    |||||||||| ||| ||||| || ||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25059064 tacccgtacctgtgtccgtatcctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggtatctaagtgcccatacccgcacccattacccgca 25059163  T
Q  360 atttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatt 459  Q
     ||||||||| |               ||| |||| ||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  25059164 ctttaactat-gaaaagacattaaaaacattacaattgaaataaaactatggtcaaaatattttaaaattaactcataaaataatacgaatcgtagtatt 25059262  T
Q  460 tagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
    |||||||||  |||||||   ||||||   ||||| ||| |||||   |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  25059263 tagtcaaattaaaaacattcaaaatatctttaaaatattgtacactaactggatggagttgttattgtattaagtaattttttggtttatgttt 25059356  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 387 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 13797090 - 13796939
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| |||||||||| || | ||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  13797090 catcacaattgaaataaaattatggtccaatttttttaaaattaactcataaaatagtatgaattgtagtatttagtcaaataaaaaacatccaaaatat 13796991  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagtt 538  Q
     ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13796990 ccctaaaaaattgtacgccggcaagatggagttgttattgtattaaatagtt 13796939  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 2975461 - 2975114
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  ||| ||||||||||| || | | ||||||||||||| |       |||||||||||||| | |||||| |||    
T  2975461 atagggatgacaatgggtacccaatggatagagtactacaatgtccattttcatacccgcattt-ttaaaaattacccgtacccgtgtctgtaccctcgt 2975363  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn 386  Q
     ||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |                   
T  2975362 gggcaacaactttagtgcccttcgccataccctatgggtatctaagtacccatacccgcacacattacccccactttaactat-gaaaagacaataaaaa 2975264  T
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| ||||||||||||  | ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||  |||||||   ||||||    
T  2975263 catcacaattgaaataaaact--ggtcaaaatattttaaaattaacttataaaataatacgaatcgtagtatttagtctaattaaaaacatacaaaatat 2975166  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagtt 538  Q
      |||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2975165 ctctaaaatattgtacaccaacatgatggagttgttattgtattaagcagtt 2975114  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 388 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 32835528 - 32835383
Alignment:
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||     
T  32835528 atcacaattgaaataaaactatggtttacatcttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaattaaaaacatccaaaatatc 32835429  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaag 533  Q
     || ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32835428 tcttaaaaattgtaccccggcaagatggagttgttattgtattaag 32835383  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 553
Target Start/End: Original strand, 945392 - 945735
Alignment:
Q  208 caatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccat 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |       ||||||||| | |||||||| || ||| ||||  ||||||||| || |    
T  945392 caatgggtagggtactacaatgcccatccccatacccgtattt-ttaaaaattacccgtacacatgcccgtatcctcgtgggcaacaactttagtgccct 945490  T
Q  308 tccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaact 407  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||                 |||||||| ||||||||||||    
T  945491 tccccatatcctatgggtatctaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaattata-aaaagacaataaaaacatcacaattgaaataaaact 945589  T
Q  408 acgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccgg 507  Q
    | | ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||   ||||| ||| |||||       
T  945590 atggtcaaaatattttaaaactaactcataaaataatacaaatcgtagtatttagtcaaattaaaaacattcaaaatatctttaaaatattgtacactaa 945689  T
Q  508 catgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  945690 caggatggagttgttattgtattaagtagtttttttgtttaggttt 945735  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 553
Target Start/End: Original strand, 7842460 - 7842818
Alignment:
Q  189 agggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtag 288  Q
    |||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||| | |       ||| ||||| |||||||||||| | ||      
T  7842460 agggatggcaatgggtacccaatggatagggtactacaatgcccatccccatacccgcatctgtaaaaat-tacacgtactcgtgcccgtacctc-gtgt 7842557  T
Q  289 gcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnca 388  Q
    |||   |||||||| || ||| |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||                ||    
T  7842558 gcaactactttagtgcccttctccatactctatgggtatctaagtgcccatacccgcactcattacccgcactttaactatg-aaaagacaataaaaaca 7842656  T
Q  389 tcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattc 488  Q
    |||||  ||||||||||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||      
T  7842657 tcacacttgaaataaaactatggtctaaatctcttaaaattaactcataaaataatacaaatcgtagtatttagtcaaattaaaaacatccaaaatatct 7842756  T
Q  489 ctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
    |||||||||| |||||   || |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||    
T  7842757 ctaaaaaattgtacac---caagatgaagttgttattgtattaaacagttttttggtttaggttt 7842818  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 264 - 364
Target Start/End: Original strand, 47662242 - 47662342
Alignment:
Q  264 cgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattt 363  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47662242 cgtacccgtgcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggcacttaagtgcccatacccgcacccattacccgcacttt 47662341  T
Q  364 a 364  Q
    |    
T  47662342 a 47662342  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 387 - 554
Target Start/End: Original strand, 35659638 - 35659806
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaatttttt--aaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatc-agaaa 483  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| || ||||| || |||||||  |||||||||| ||  |||| ||| | |||    
T  35659638 catcacaattgaaataaaactatgatc-caattttttttaaaattaacttattaaatagtacgaaccgtaatatttagtcacatt-aaaatatccaaaaa 35659735  T
Q  484 tattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttta 554  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35659736 tattcctaaaaaattgtacaccgacatgatggagctgatattgtattaagtagttttttggtttaggttta 35659806  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31646515 - 31646333
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    |||||||||||||| | |||||||   ||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||| |       ||||||||||||  ||||||||| |||    
T  31646515 atagggatggcaatgggtacccaacaggtagggtactatagtacccatctccatacccgcgtttgtaaaaaa-tacccgtacccggacccgtaccctcgt 31646417  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31646416 gggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggcacctaagtgcccatacccgcacccgttacccgcattttaactatg 31646333  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 208 - 347
Target Start/End: Original strand, 27783426 - 27783565
Alignment:
Q  208 caatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccat 307  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||| |    
T  27783426 caatgggtaggatactacactgcccgtccccatccccgcatttataaaaaaatacccgtacccgtgcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtcccct 27783525  T
Q  308 tccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    ||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  27783526 tccccatagtctatgggtacctcagtgcccatacccgcac 27783565  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 364
Target Start/End: Original strand, 39026706 - 39026808
Alignment:
Q  262 cccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaat 361  Q
    |||||||||| | |||||| | ||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  39026706 cccgtacccgagtccgtactctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggcacttaagtgcccatacccgcacccattacccgcact 39026805  T
Q  362 tta 364  Q
    |||    
T  39026806 tta 39026808  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 387 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 21260766 - 21260605
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| ||||| |||| || ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  |||| |||  ||||||    
T  21260766 catcacaattgaaacaaaattatgatcaaaatcttttaaaattaactaataaaataatacgaatcgtagtatttagtcaaattaaaaatatccaaaatat 21260667  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggttta 548  Q
      |||||||||| |||| |||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||  ||||||||    
T  21260666 ctctaaaaaattgtacatcggcagaatggagtttttactgtattaagcagtttattggttta 21260605  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43634827 - 43634674
Alignment:
Q  215 tagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccat 314  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  43634827 tagggtattacaatgtccgtctccatacccgcatttataaaaaa-tacccgcacctgtgcctgtaccctcgtgggcaacaactttagtccccttccc-at 43634730  T
Q  315 accctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||||||    
T  43634729 accctatgggtacctaagtgtccatatccgcactcatcacccgcacttttactatg 43634674  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4893434 - 4893338
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  4893434 ccgtacccgagcccgtaccctcgtgggcaacaactttaatgcccttccccataccctatgggcacttaagtgctcatacccccacccattacccgca 4893338  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 359
Target Start/End: Original strand, 29185053 - 29185149
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  29185053 ccgtacccgagcccgtaccctcgtgggcaacaactttaatgcccttccccataccctatgggcacttaagtgctcatacccccacccattacccgca 29185149  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33363036 - 33362941
Alignment:
Q  264 cgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  33363036 cgtacccgagcccgtaccctcgtgggcaacaactttaatgcccttccccataccctatgggcacttaagtgctcatacccccacccattacccgca 33362941  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33794532 - 33794437
Alignment:
Q  274 cccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactat 369  Q
    ||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  33794532 cccgtaccttcgtaggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacctaagtgctcatatccgcacccattactcgcactttaattat 33794437  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 367
Target Start/End: Original strand, 48796500 - 48796607
Alignment:
Q  260 tacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||  ||||||||| || ||||| ||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48796500 tacccgtatccgggcccataccctcgtgggcaataactttagtgcccttccctataccctttgggcacctaagtgcccatacccgcacccattacccgca 48796599  T
Q  360 atttaact 367  Q
     |||||||    
T  48796600 gtttaact 48796607  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 359
Target Start/End: Original strand, 20414933 - 20415030
Alignment:
Q  262 cccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||| ||||  ||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20414933 cccgtatccgagcccgtaccctcgtgggcaacaactttactgcccttccccgtaccctatgggcacttaagtggccatacccgcacccattacccgca 20415030  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29426444 - 29426351
Alignment:
Q  274 cccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaact 367  Q
    ||||||||| ||| ||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29426444 cccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccataccatatgggcacctaagtgcccatacccgcacccattacccacagtttaact 29426351  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35949711 - 35949638
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaact 367  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35949711 aactttagtgtcattccccataccctgtgggcacctaagtgcccatacccgcacccattacccgcagtttaact 35949638  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22580282 - 22580101
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    |||||||| |||| | || || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| |       |||||||||||| | ||||| ||||||     
T  22580282 tagggatgacaatgggtatcctatgggtagggtactacaatgcccgtcccaatacccgtgtttgtaaaaaa-tacccgtacccgagtccgtatccccgtg 22580184  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    | ||  || |||||| || || |||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22580183 gacaataattttagtgccttttcccatatcctatgggtaccttagtgcccatacccgcaccaattatccgcaatttaactatg 22580101  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 38491393 - 38491469
Alignment:
Q  271 gtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  38491393 gtgcccgtaccctcgtaggcaacaactttagtacccttccccataccctatgggtatctaagtgcccatacccgcac 38491469  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 387 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 29512231 - 29512140
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatc 478  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||    
T  29512231 catcacaattgaaataaaactatggtccaatttttttaaaattaactcataaaatagtatgaattgtagtatttaatcaaataaaaaacatc 29512140  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 469
Target Start/End: Original strand, 236456 - 236538
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaata 469  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  236456 catcacaattgaaatagaactatggtccaaattttttaaaattaattcataaaataatatgaattgtagtatttagtcaaata 236538  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 35739150 - 35739052
Alignment:
Q  266 tacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattta 364  Q
    |||||||||||||||||  || ||||  || |||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  35739150 tacccgtgcccgtacccttgtgggcaacaattttagtgcccttccccagaccctatgggcacttaagtgcccatatccgcacccatcacccgcacttta 35739052  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 364
Target Start/End: Original strand, 48514399 - 48514499
Alignment:
Q  264 cgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattt 363  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | ||  ||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  48514399 cgtacccgtgtccgtaccctcgtggacaacaactttagtgctctttcccataccctatgggcacttaagtgcccataaccgtacccattacccgcatttt 48514498  T
Q  364 a 364  Q
    |    
T  48514499 a 48514499  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 548
Target Start/End: Original strand, 236707 - 236773
Alignment:
Q  482 aatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggttta 548  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  236707 aatatccctaaaaaattatacaccgacaggatgaagctgttattgtattaagtaattttttggttta 236773  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 370
Target Start/End: Original strand, 973506 - 973582
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  973506 aactttagtgtcatttcccataccctatgggtacctaagtgcacatatccgcacccattatccgcactttaattatg 973582  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 9472961 - 9473021
Alignment:
Q  310 cccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9472961 cccataccttatgggtatctaagtactcatacccgcacccattactcgcactttaactatg 9473021  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 367
Target Start/End: Original strand, 48985140 - 48985200
Alignment:
Q  307 ttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaact 367  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48985140 ttcctcataccctatgggcacttaagtgtccatacctgcacccattacccgcattttaact 48985200  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 366
Target Start/End: Original strand, 50099823 - 50099882
Alignment:
Q  307 ttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaac 366  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  50099823 ttccccacaccttatgggcacttaagtgcccatacccgcacccattacctgcactttaac 50099882  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21260946 - 21260888
Alignment:
Q  192 gatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcattt 250  Q
    ||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21260946 gatggcaatgggtacctaatgggtagggtactacaatgcccatccccatacccgcattt 21260888  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 370
Target Start/End: Original strand, 48662636 - 48662730
Alignment:
Q  276 cgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||||||| || ||| |||||| ||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  48662636 cgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcctttctccatactctatgggcacctaagtgttcatacccgcacccattacccgcattttaattatg 48662730  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 481 - 538
Target Start/End: Original strand, 2433395 - 2433452
Alignment:
Q  481 aaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagtt 538  Q
    |||||| |||||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2433395 aaatatccctaaacaattgtacatcggcaagatgaagttgttattgtattaagtagtt 2433452  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 294 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30623109 - 30623048
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacc 355  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  30623109 aactttagttcccttccccataccctatgagtagctaagtgtccatacccgcacccattacc 30623048  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 297 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32835618 - 32835545
Alignment:
Q  297 tttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    |||||| || |||| |||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32835618 tttagtgcccttcctcatactttatgggtacctaagtgctcatacccgcactcattacccgcactttaactatg 32835545  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40094620 - 40094568
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgca 346  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  40094620 aactttagtgcccttccccataccctatgggcacctaagtgcccatacccgca 40094568  T

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Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 356
Target Start/End: Original strand, 2433258 - 2433321
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccc-tatgggtacttaagtacccatacccgcacccattaccc 356  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2433258 aactttagtgtccttccccatacccctatgggtacctaagtgcccataccctcacccattaccc 2433321  T

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Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4052476 - 4052405
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaa 365  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||| || |||||    
T  4052476 aactttagtgtcattccccatatcctatgggtacctaagtgctcatacccgtactcattacccacattttaa 4052405  T

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Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 365
Target Start/End: Original strand, 30489663 - 30489734
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaa 365  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||  || ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30489663 aactttagtgcccttccccatatcctatggacacctaagtgcctatacccgtacccattacccgcactttaa 30489734  T

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Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 4893310 - 4893197
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaata 485  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| ||||||||||| |||  || |||||||| ||||| | ||||||||  |||||    
T  4893310 catcacaattgaaataaaactatgatccaaaattatttaaatcaactaataaaataatacgaattgtagtatttagccaaataaaaaaacatccaaaata 4893211  T
Q  486 ttcctaaaaaatta 499  Q
    | ||| ||||||||    
T  4893210 tccctcaaaaatta 4893197  T

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Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28192592 - 28192547
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccat 339  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28192592 aactttagtgcccttccccataccctatgggcacttaagtgcccat 28192547  T

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Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 499
Target Start/End: Original strand, 29185177 - 29185290
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaata 485  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| ||||||||||| |||  || |||||||| ||||| | ||||||||  |||||    
T  29185177 catcacaattgaaataaaactatgatccaaaattatttaaatcaactaataaaataatacgaattgtagtatttagccaaataaaaaaacatccaaaata 29185276  T
Q  486 ttcctaaaaaatta 499  Q
    | ||| ||||||||    
T  29185277 tccctcaaaaatta 29185290  T

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Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Original strand, 25058993 - 25059037
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgccc 232  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25058993 tagggatgacaatgggtacccaatgtgtagggtactacaatgccc 25059037  T

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Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 474
Target Start/End: Original strand, 39026834 - 39026918
Alignment:
Q  390 cacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaa 474  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||  ||||||  |||||| ||||    
T  39026834 cacacatgaaataaaactatgatccaaatttttttaaatcaacttacaaaataatatgaatcgtaatatttaaccaaataaaaaa 39026918  T

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Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 187 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 13534404 - 13534029
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||       |||| ||||||||| |||||||| |||    
T  13534404 atagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactacaatgcccatccccatacccgcatttataaaaaaatacctgtacccgtgtccgtaccctcgt 13534305  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn 386  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||                   
T  13534304 gggcaacaactttagtcccattccccataccatatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaaa 13534205  T
Q  387 ----catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaa 482  Q
        |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13534204 aaaacatcacaaatgaaataaaactaagatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatccgaa 13534105  T
Q  483 atattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13534104 atattcctaaaaaattgtacatcggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 13534029  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 187 - 558
Target Start/End: Original strand, 33331499 - 33331868
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||  ||    
T  33331499 atagggatggcaatgggtacccaatggatagggtactacaatgtccgtctccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtacccttgt 33331597  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn 386  Q
     ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||                   
T  33331598 gggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaattactcatacccgcactcattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaa- 33331696  T
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33331697 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaactatggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatat 33331796  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33331797 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 33331868  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 187 - 558
Target Start/End: Original strand, 33328487 - 33328856
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       || | ||||||||||||||||||  ||    
T  33328487 atagggatggcaatgggtacccaatggatagggtactacaatgtccgtctccatacccgcatttataaaaaa-tatctgtacccgtgcccgtacccttgt 33328585  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn 386  Q
     ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||                   
T  33328586 gggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacttaagtaaccatacccgcactcattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaa- 33328684  T
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33328685 catcacaaatgaaataaaactacgatcctaattttttaaaattaactcataaaataatatgaactatggtatttagtcaaatagaaaacatccgaaatat 33328784  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33328785 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 33328856  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 187 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 20691800 - 20691430
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||       || ||||||||||| |||||||| |||    
T  20691800 atagggatggcaatgggcacccaatgggtagggtactacagtgcccgtccctctatccgcatttataaaaaa-tatccgtacccgtgtccgtaccctcgt 20691702  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn 386  Q
     ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                    
T  20691701 gggcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacctaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaactatgaaaaaacaaaaaaaaa 20691602  T
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20691601 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaatttttcaaaattaactcataaaataatatgaatcgttatatttagtcaaatagaaaacatccaaaatat 20691502  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20691501 ccctaaaaaattatacacgaacatgatggagttgttattgtattaagcagttgtatggtttaagtttaggtt 20691430  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 188 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 1329772 - 1329402
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||       ||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  1329772 tagggatggcaatgggtatccaatgggcagggtactacagtgtccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tactcgtacccgtgcccttaccctcgtg 1329674  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||                     
T  1329673 ggcaacaactttagtccccttccccataccctatggatacctaagtgcccatacccacacccattacccgcactttaactatgaaaaaacaaaacaacaa 1329574  T
Q  388 a-tcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    | | |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1329573 aattacaaattaaataaaactacgatcccagttttttaaaattaactcataaaataatatgaattgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatat 1329474  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1329473 ccctaaaaaattatacaccgacatgatggagttgttattgtattaaacagttgtttggtttaagtttaggtt 1329402  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 188 - 555
Target Start/End: Original strand, 31070696 - 31071059
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||| |||     
T  31070696 tagggatggcaatgggtacccaatgagtagggtactacagtgcccgt-tccatacccgcatttataaaaaaatacccgtacacgtgcccgtaccctcgtg 31070794  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
      ||  |||||||||||| || || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                |    
T  31070795 aacaacaactttagtcccctttccaatcccctatgggtacctaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaactatg--aaaaaacaaaaaaac 31070892  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaatttttt-aaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31070893 atcataaatgaaataaaaccacgatcctaatttttttaaaattaactca--aaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatat 31070990  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttag 555  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31070991 ctctaaaaaattatacactggcatgatggagttgttattttattaagcagttgtttggtttaagtttag 31071059  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 387 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 31783997 - 31783825
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31783997 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatat 31783898  T
Q  487 tcct-aaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31783897 ccctaaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 31783825  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 387 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 31511655 - 31511485
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31511655 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttgaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatat 31511556  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||||||    
T  31511555 ccctaaaaaattatacaccgacatgatggagttgttattgtattaagaaagtg-ttggtttaaatttaggtt 31511485  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 387 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 29641476 - 29641330
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  29641476 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaataaaaaacatccaaaatat 29641377  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaag 533  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29641376 ccctaaaaaattatacaccgtcatgatggagttgttattgtattaag 29641330  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 274 - 553
Target Start/End: Original strand, 6938029 - 6938304
Alignment:
Q  274 cccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnn 373  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||       
T  6938029 cccgtacccccgtgggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggtacctaagtgcccatacccgcaccca---cccgcactttaactatg-aa 6938124  T
Q  374 nnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaa 473  Q
                 |||||||| ||||| ||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||  |||    
T  6938125 aagacaataaaaacatcacaattgaaacaaaactatgacataaatattttaaaattaactcataaaataatacgaatcgtagtatttagtaaaattaaaa 6938224  T
Q  474 acatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
    |||||  |||||   |||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  6938225 acatccaaaatacctctaaaaaattgtacaccggtaggatgtagttgttattgtattaagcagttttttggtttaggttt 6938304  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 370
Target Start/End: Original strand, 6337132 - 6337314
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |       || || ||||||||| ||||||| |||    
T  6337132 atagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtactatagtgcccatccccatacccacatttgtaagaaa-tatccatacccgtgctcgtaccctcgt 6337230  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
     ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| |||||    
T  6337231 gggcaacaactttagtgccattccccataccctatgggtacctaagtgcccatacccgcacctattacccacactttagctatg 6337314  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31784183 - 31784025
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    |||||||| |||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  31784183 tagggatgtcaatgggtactcgatgggtagggtactacaatgcccgtcctcatacccgcatttataaaaaa-tacacgtacacgtgcccgtaccctcgta 31784085  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
     |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  31784084 cgcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacctaagtgctcatacccgcac 31784025  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 387 - 523
Target Start/End: Original strand, 7807852 - 7807988
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||    
T  7807852 catcacaattgaaataaaattatgatcaaaatcttttaaaattaactaataaaataatacgaatcgtagtatttagtcaaattaaaaacatccaaaatat 7807951  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgtta 523  Q
      |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  7807952 ctctaaaaaattgtacaccggcagaatggagttgtta 7807988  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9062283 - 9062181
Alignment:
Q  262 cccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaat 361  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | ||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  9062283 cccgtacccgtgtccgtaccctcgtggacaacaactttagtgcccttccccataccctatgggcacttaagtgcccatacccgcacccattacccgcact 9062184  T
Q  362 tta 364  Q
    |||    
T  9062183 tta 9062181  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24447261 - 24447165
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  24447261 ccgtacccgagcccgtaccctcgtgggcaacaactttaatgcccttccccataccctatgggcacttaagtgctcatacccccacccattacccgca 24447165  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 387 - 548
Target Start/End: Original strand, 12429520 - 12429681
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    |||||||| |||||||||| || | ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||  || ||| |||||||||||||   ||||||||  ||||||    
T  12429520 catcacaattgaaataaaattatggtctaaatcttttaaaattaacccgtaaaataatacaaatcgtagtatttagtcaaactaaaaacatccaaaatat 12429619  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggttta 548  Q
       ||||||||| || ||  |||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  12429620 ctttaaaaaattgtaaactagcatgataaagttgttattgtattaaagagttttttggttta 12429681  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 370
Target Start/End: Original strand, 28769883 - 28769959
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28769883 aactttagtgtcattccccatatcctatgggtacctaagtgtccatacccgcacccattacccgcactttagctatg 28769959  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1221850 - 1221754
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||| ||||||||||  || | ||  ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  1221850 ccgtacccgagcccgtacccttgtggacaacaactttaatgcccttccccataccctatgggcacttaagtgctcatacccccacccattacccgca 1221754  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29641646 - 29641505
Alignment:
Q  205 acccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcc 304  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||       ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||     
T  29641646 acccaatgggtagggtactacagcgtccgtccccatatccgcatttataaaaaa-tacccatacccgtgcccgtaccctcgtggacaacaactttagtcg 29641548  T
Q  305 cattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    |  |||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  29641547 ccatccccataccatatgggcacctaagtgcccatacccgcac 29641505  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 250
Target Start/End: Original strand, 6937957 - 6938018
Alignment:
Q  189 agggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcattt 250  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6937957 agggatggcaatgggtaccctatgggtagggtactacaatgcccatccccatacccgcattt 6938018  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6338062 - 6337970
Alignment:
Q  273 gcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaa 365  Q
    |||| ||||| ||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6338062 gcccataccctcgtgggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggcacctaagagctcatacccgcaccaattacccgcagtttaa 6337970  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 471 - 538
Target Start/End: Original strand, 28770009 - 28770076
Alignment:
Q  471 aaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagtt 538  Q
    ||||||||  |||||| |||||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28770009 aaaacatctaaaatatccctaaacaattgtacatcggcaagatgaagttgttattgtattaagtagtt 28770076  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6799563 - 6799478
Alignment:
Q  262 cccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||  | ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  6799563 cccgtacccgtacccgtaccctcgtgggcaacatctttagtgcccttccccataccttatgggcacttaaatgtccatacccgcac 6799478  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 250
Target Start/End: Original strand, 12429325 - 12429385
Alignment:
Q  190 gggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcattt 250  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  12429325 gggatggcaatgggtacccaatgagtaggggactacaatgcccatctccaaacccgtattt 12429385  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31511822 - 31511683
Alignment:
Q  208 caatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccat 307  Q
    ||||| |||||||||||||  | | ||| ||||| ||||||||||       ||||| ||| |||||||||| || ||| | ||  |||||||||| |      
T  31511822 caatgggtagggtactacagcgtctgtccccatatccgcatttataaaaaaatacccatactcgtgcccgtatcctcgtggacaacaactttagtcgcca 31511723  T
Q  308 tccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  31511722 tccccataccccatgggcacctaagtgcccatacccgcac 31511683  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 24447137 - 24447024
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaata 485  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| ||||||||||| |||  || |||||||| ||||| | ||||||||  |||||    
T  24447137 catcacaattgaaataaaactatgatccaaaattatttaaatcaactaataaaataatacgaattgtagtatttagccaaataaaaaaacatccaaaata 24447038  T
Q  486 ttcctaaaaaatta 499  Q
    | ||| ||||||||    
T  24447037 tccctcaaaaatta 24447024  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 388 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 1221725 - 1221613
Alignment:
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| ||||||||||| |||  || |||||||| ||||| | ||||||||  ||||||    
T  1221725 atcacaattgaaataaaactatgatccaaaattatttaaatcaactaataaaataatacgaattgtagtatttagccaaataaaaaaacatccaaaatat 1221626  T
Q  487 tcctaaaaaatta 499  Q
     ||| ||||||||    
T  1221625 ccctcaaaaatta 1221613  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 294 - 370
Target Start/End: Original strand, 10499172 - 10499248
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||| | || ||||||||| |||||||| || ||||| | |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10499172 aactttactgcccttccccatatcctatgggcacctaagttctcatatcagcacccattacacgcactttaactatg 10499248  T

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Target: chr8 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 189 - 558
Target Start/End: Original strand, 24789406 - 24789774
Alignment:
Q  189 agggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtag 288  Q
    |||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  24789406 agggatggcaatgggtaccaaatgggtagggtactacaatgcccgtcctcatacccgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtaccttcgtgg 24789504  T
Q  289 gcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnca 388  Q
    |||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||               ||    
T  24789505 gcaacaactttagtccccttcctcataccctatgggtacttaagtgtccatacccgcacccattacccgcactttaactatggaaaaacaaaaaaaaaca 24789604  T
Q  389 tcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24789605 tcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataacatgaaccgtgatatttagtcaaatagaaaacatccgaaatattc 24789704  T
Q  489 ctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24789705 ctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttgatttaagtttaggtt 24789774  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 204 - 555
Target Start/End: Original strand, 1376094 - 1376446
Alignment:
Q  204 tacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtc 303  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||       ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||    
T  1376094 tacccaatgggtaggatactacagtgccggtccctatacctgcatttataaaaaa-tactcgtacccgtgcccgtaccttcgtgggcaacaactttagtc 1376192  T
Q  304 ccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnn--catcacaaatgaaat 401  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                  |||||||||||||||    
T  1376193 ccattccttataccctatgggtacctaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaactatgaaaaaacaaaaaaaaaaacatcacaaatgaaat 1376292  T
Q  402 aaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattata 501  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  1376293 aaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatatccctaaaaaattata 1376392  T
Q  502 caccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttag 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1376393 caccggcatgatggagttgttattgtattaagcagttgtttgatttaagtttag 1376446  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 189 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 3617079 - 3616717
Alignment:
Q  189 agggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtag 288  Q
    |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  3617079 agggatggcaatgggtgcccaatgggtagggtactatagtgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tactcgtacccgtgcccgtaccctcgtgg 3616981  T
Q  289 gcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnca 388  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||                ||    
T  3616980 gcaacaactttagtccccttccccataccctatgggtacctaagtacccatactcgcacctattacccgcactttaactatg-aaaaaacaaaaaaaaca 3616882  T
Q  389 tcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattc 488  Q
    ||||||||     ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  3616881 tcacaaat-----aaaactatgatcccaattatttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatatct 3616787  T
Q  489 ctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3616786 ctaaaaaattatacaccggcatgatggagctgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 3616717  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 188 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 19643729 - 19643366
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||| |       ||||||||||||||||||||||  |||     
T  19643729 tagggatggtaatgggtacccaatgggtagggtactataatgctcatctccatacctgcatttgtaaaaat-tacccgtacccgtgcccgtaccttcgtg 19643631  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  ||||||||| || |||| |||||||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||                |    
T  19643630 ggcaacaactttagtgcccttcctcataccctatgggtatctaggtgcccatacccgcgcccattacccgcactttaactatg-aaaagacaataaaaac 19643532  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||  |||||||||||||  ||||||||  ||||||     
T  19643531 atcacaattgaaaaaaaactatggtctaaatcttttaaaattaactcataaaataatacaaattgtattatttagtcaaattaaaaacatccaaaatatc 19643432  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
     |||||||||| |||| | ||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  19643431 tctaaaaaattgtacatcagcaggatgaagttgttattgtattaagcagttttttggtttaggttt 19643366  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 208 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 2621156 - 2620813
Alignment:
Q  208 caatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccat 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |       ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||  ||||||||| ||||    
T  2621156 caatgggtagggtactacaatgcccattcccatacccgcattt-ttaaaaattacccgtactcgtgtccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgccat 2621058  T
Q  308 tccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcacaaatgaaataaaact 407  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |               |||||||| |||||||||||     
T  2621057 tccccataccctatgggtatctaagtgcccatacctgcacccattacccgcactttaactat-gaaaagataataaaaacatcacaattgaaataaaaca 2620959  T
Q  408 acgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccgg 507  Q
    | | ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| | |  |||||||   ||||||  |||||| ||| ||||||      
T  2620958 atggtcaaaatattttaaaattaacttataaaataatatgaattgtgatatttagtccatttaaaaacattcaaaatatctctaaaatattgtacaccaa 2620859  T
Q  508 catgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  2620858 caagatagagttgttattgtattaagcagttttttggtttaggttt 2620813  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 188 - 553
Target Start/End: Original strand, 6109515 - 6109878
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||       |||  ||| |||||  |||| |  |||     
T  6109515 tagggatggcaatgggtacctaatgcatagggtactacaatgtccatccccatacctgcatttattaaaat-tacttgtatccgtgttcgtatcttcgtg 6109613  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnnc 387  Q
    ||||  ||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||                     
T  6109614 ggcaacaactttagtgccttttccaataccctatgggtacctaagtgctcatacccgcacccattacccgcactttaactatgaaaagacaataaaaat- 6109712  T
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatatt 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||     
T  6109713 atcacaattgaaataaaactatggtctaaatcttttaaaattaacttataaaataatacggatcgtagtatttagtcaaattaaaaacatttaaaatatc 6109812  T
Q  488 cctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
     | |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  6109813 tccaaaaaattgtacaccggcaggataaagttgttattgtattaagcagttctttggtttaggttt 6109878  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2472496 - 2472316
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |       || || || |||||||||||||| |||     
T  2472496 tagggatggcaatgggtatccaatgggtagggtactacaatgcccatctccatacccgcatttgtaaaaat-tatccatatccgtgcccgtaccctcgtg 2472398  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactat 369  Q
    | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| | |||||||||    
T  2472397 gacaacaactttagtgccattccccataccctatgggtacataagtgcccatacccgcatccataacccgtactttaactat 2472316  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 418 - 554
Target Start/End: Original strand, 30801368 - 30801504
Alignment:
Q  418 ttttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggag 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||| || |||| ||  || |||    
T  30801368 ttttttaaaattaactcataaaataatatgaattgcagtattaagtcaaataaaaaacatttaaaatatccctaaaaaattgtataccgacagaatagag 30801467  T
Q  518 ttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttta 554  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30801468 ttgttattgtattaagtagttttttggtttaggttta 30801504  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 416 - 554
Target Start/End: Original strand, 7057723 - 7057865
Alignment:
Q  416 aattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatg---- 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| | |||||   |||||| ||||||||||| |||||||||| |        
T  7057723 aattttttaaaattaactcataaaatagtatgaattgtagtatttagtcaaataaataacatttaaaatatccctaaaaaattgtacaccggcaagatgc 7057822  T
Q  512 atggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttta 554  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||    
T  7057823 atggagatgttattctattaagtagttttttgatttaggttta 7057865  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 188 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24891634 - 24891452
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaa-tgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |       ||| ||||||||||| ||||||  |||    
T  24891634 tagggatggcaatgggtacctaatgggtagggtactacaaatgcccatccccatacccgcatttgtaaaaat-tactcgtacccgtgctcgtaccgtcgt 24891536  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
     | ||  ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24891535 ggacaacaactttagtaccctttcccataccctatgggtacctaagtgcctgtacccgcacccattacccgcactttaactatg 24891452  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 359
Target Start/End: Original strand, 7580024 - 7580120
Alignment:
Q  263 ccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7580024 ccgtacccgtgcccgtaccctcgtgggtaacaactttagtgcccttccccataccctatgggcacctaagtgcccatacccgcacccattacccgca 7580120  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 26561338 - 26561080
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatcaca 393  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||                |||||||    
T  26561338 aactttagtgcccttccccatgccctatgagtacctaagtgcccatacccacacccattacacgcactttaactatg-aaaagacaataaaaacatcaca 26561240  T
Q  394 aatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaa 493  Q
    | ||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||    
T  26561239 attgatataaaactatggtc-caattttttaaa-ttaactcataaaatagtacaaatcgtaatatttagtcaaataaaaatcatccaaaatatccctaaa 26561142  T
Q  494 aaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttag 555  Q
    ||||| |||| || || ||||||| ||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||    
T  26561141 aaattgtacatcgacaggatggagctgttattgtgttaagtacttttttgatttaggtttag 26561080  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 370
Target Start/End: Original strand, 221873 - 222057
Alignment:
Q  186 tatagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccg 285  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| || | |  || ||||||||||||| ||| |       || |||||||||  ||||||||| ||    
T  221873 tatagggatggtaatgggtacccaatgggtagggtattatagtatccatctccatacccgcgtttgtaaaaaaatatccgtacccgaacccgtaccctcg 221972  T
Q  286 taggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    | ||||  |||||||||  | |||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  221973 tgggcaacaactttagtgtccttccccataccctatgggcacctaagtgctcatacccgcacccattacccgcattttaactatg 222057  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 370
Target Start/End: Original strand, 691028 - 691212
Alignment:
Q  186 tatagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccg 285  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| || | |  || ||||||||||||| ||| |       || |||||||||  ||||||||| ||    
T  691028 tatagggatggtaatgggtacccaatgggtagggtattatagtatccatctccatacccgcgtttgtaaaaaaatatccgtacccgaacccgtaccctcg 691127  T
Q  286 taggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    | ||||  |||||||||  | |||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  691128 tgggcaacaactttagtgtccttccccataccctatgggcacctaagtgctcatacccgcacccattacccgcattttaactatg 691212  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 370
Target Start/End: Original strand, 735496 - 735680
Alignment:
Q  186 tatagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccg 285  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| || | |  || ||||||||||||| ||| |       || |||||||||  ||||||||| ||    
T  735496 tatagggatggtaatgggtacccaatgggtagggtattatagtatccatctccatacccgcgtttgtaaaaaaatatccgtacccgaacccgtaccctcg 735595  T
Q  286 taggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    | ||||  |||||||||  | |||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  735596 tgggcaacaactttagtgtccttccccataccctatgggcacctaagtgctcatacccgcacccattacccgcattttaactatg 735680  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 370
Target Start/End: Original strand, 859392 - 859576
Alignment:
Q  186 tatagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccg 285  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| || | |  || ||||||||||||| ||| |       || |||||||||  ||||||||| ||    
T  859392 tatagggatggtaatgggtacccaatgggtagggtattatagtatccatctccatacccgcgtttgtaaaaaaatatccgtacccgaacccgtaccctcg 859491  T
Q  286 taggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    | ||||  |||||||||  | |||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  859492 tgggcaacaactttagtgtccttccccataccctatgggcacctaagtgctcatacccgcacccattacccgcattttaactatg 859576  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 25419401 - 25419512
Alignment:
Q  442 aatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtt 541  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||   ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  25419401 aatatgaatcgtagtatttagtcaaattaaaaacatccaaaatatctttaaaaaactgtacaccggcaggatggagttgttattgtattaaacagttttt 25419500  T
Q  542 tggtttaagttt 553  Q
    ||||||| ||||    
T  25419501 tggtttaggttt 25419512  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 370
Target Start/End: Original strand, 25500110 - 25500220
Alignment:
Q  260 tacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||||| |||||||||||   ||| | ||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  25500110 tacccgtactcgtgcccgtactgtcgtggacaacaactttagtacccttccccataccttatgggtacctaagtgcccatacccgcacccattacctgca 25500209  T
Q  360 atttaactatg 370  Q
     ||||| ||||    
T  25500210 ctttaaatatg 25500220  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 366
Target Start/End: Original strand, 1667161 - 1667326
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||       ||    |||||||||||       |||     
T  1667161 tagggatggcaatgggtaccaaatgggtagggtactacaatgcccatccccatacccgcatttat-------taaaattacccgtgccct------cgtg 1667247  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaac 366  Q
    ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  1667248 ggcaacaactttagtgcccttccccataccctatgggtacctaagtgcccatacccgcacccattaacctcactttaac 1667326  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 370
Target Start/End: Original strand, 25419265 - 25419341
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  25419265 aactttagtaccctttcccataccctatgggtacttaagtgcccatacacgctcccattacctgcactttaactatg 25419341  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 367
Target Start/End: Original strand, 38020047 - 38020119
Alignment:
Q  295 actttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaact 367  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38020047 actttagtgcccttccccataccctatgggcacctaagtgtccatacccgcacccattacccgcagtttaact 38020119  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37226988 - 37226836
Alignment:
Q  188 tagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgta 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||| || |||||||||||||| |       | |||||||||| ||| |||||| | |     
T  37226988 tagggatggcaatggatacccaatgggtagggtactacagtacccttccccatacccgcatttgt-aaaaaatgcccgtacccgagcctgtaccctcctg 37226890  T
Q  288 ggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatac 341  Q
    || |  |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  37226889 ggtaacaactttagtgtcattccccataccctatgggcacctaagtgcccatac 37226836  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24891379 - 24891287
Alignment:
Q  455 gtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggttta 548  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  ||||||   |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24891379 gtatttagtcaaattaaaaacatccaaaatatctttaaaaactt-tacaccggcaggatggagttgttattgtattaagcagttttttggttta 24891287  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 491 - 553
Target Start/End: Original strand, 1667360 - 1667422
Alignment:
Q  491 aaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttt 553  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  1667360 aaaaaaatgtacaccggcaggatggagttgttattgtattaagcagttttttggtttaggttt 1667422  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 387 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 2472299 - 2472237
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaa 449  Q
    |||||||| | ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2472299 catcacaattaaaataaaactacggtataaatcttttaaaattaactcataaaataatatgaa 2472237  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 370
Target Start/End: Original strand, 7057616 - 7057679
Alignment:
Q  307 ttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  7057616 ttccccataccctatgggtacctaagtgcacatactcgtacccattactcgcactttaactatg 7057679  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 347
Target Start/End: Original strand, 38551558 - 38551629
Alignment:
Q  276 cgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38551558 cgtaccctcgtgggcaacaactttagcgcccttccccataccctatgggcacttaagtgcccatacccgcac 38551629  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 474
Target Start/End: Original strand, 222078 - 222162
Alignment:
Q  390 cacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaa 474  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  ||   ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  222078 cacaattgaaataaaactatgatccaaaaaatttcaaatcaacttataaaataatatgaatcgtagtatttagccaaataaaaaa 222162  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 474
Target Start/End: Original strand, 691233 - 691317
Alignment:
Q  390 cacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaa 474  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  ||   ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  691233 cacaattgaaataaaactatgatccaaaaaatttcaaatcaacttataaaataatatgaatcgtagtatttagccaaataaaaaa 691317  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 474
Target Start/End: Original strand, 735701 - 735785
Alignment:
Q  390 cacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaa 474  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  ||   ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  735701 cacaattgaaataaaactatgatccaaaaaatttcaaatcaacttataaaataatatgaatcgtagtatttagccaaataaaaaa 735785  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 474
Target Start/End: Original strand, 859596 - 859680
Alignment:
Q  390 cacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaa 474  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  ||   ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  859596 cacaattgaaataaaactatgatccaaaaaatttcaaatcaacttataaaataatatgaatcgtagtatttagccaaataaaaaa 859680  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 185 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 240684 - 240318
Alignment:
Q  185 atatagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtaccccc 284  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |    
T  240684 atatagggatggcaatgggtacccaatgggtagggtattacagtgcccgtccccatacccgcatttataaaaaa-tacccgtacccgtgcccgtaccctc 240586  T
Q  285 gtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnn 384  Q
    || ||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||                  
T  240585 gtgggcaacaattttagtccccttccccatatcctatgggtacctcagtgcccatacccgcatccattatccgcactttaactatgaaaaaaaaaat--- 240489  T
Q  385 nncatcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaat 484  Q
       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  240488 ---atcacaaatgaaataaaactacgatcccaattttttaaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacattcaaaat 240392  T
Q  485 attcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttaggtt 558  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  240391 atccctaaaaaattatacaccggcataatggagttgttattgtattaagcagttgtttggtttaagtttaggtt 240318  T

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Target: scaffold0312 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 192 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 6084 - 5722
Alignment:
Q  192 gatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnn-tacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggc 290  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6084 gatggcaatgggtacccaatggatagggtactacaatgcccttccccatgtccgcatttataaaaaaaatacccgtacccgtgcccgtaccctcgtgggc 5985  T
Q  291 acaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatggnnnnnnnnnnnnnnncatc 390  Q
    |  |||||||| ||| ||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||                ||||    
T  5984 aacaactttagcccccttcccaatatcctgcgggtacttaagtgcccatacctgcacccattacccacactttaactatg-aaaagacaataaaaacatc 5886  T
Q  391 acaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatattcct 490  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  5885 acaaatgaaataaaactacggtcccaatttttaaaaattaactcataaaataatacgaatcgtagtatttagtcaaatagaaaacatccaaaatatccct 5786  T
Q  491 aaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagttta 554  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  5785 aaaaaattatacactggcctgatggagttgttattgtattaagaagtttttttgtttgagttta 5722  T

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Target: scaffold0164 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 4)
Name: scaffold0164
Description:

Target: scaffold0164; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 387 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 7130 - 6962
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  7130 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaatttttttaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatacaaaatat 7031  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttag 555  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7030 ccctaaaatattatacaccggaatgatgaagttgttattgtattaaacagttgtttggtttaagtttag 6962  T

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Target: scaffold0164; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 387 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 15011 - 14843
Alignment:
Q  387 catcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  15011 catcacaaatgaaataaaactacgatcccaatttttttaaattaactcataaaataatatgaatcgtggtatttagtcaaatagaaaacatacaaaatat 14912  T
Q  487 tcctaaaaaattatacaccggcatgatggagttgttattgtattaagtagttgtttggtttaagtttag 555  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14911 ccctaaaatattatacaccggaatgatgaagttgttattgtattaaacagttgtttggtttaagtttag 14843  T

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Target: scaffold0164; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7234 - 7158
Alignment:
Q  266 tacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacc 342  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  7234 tacccgtgcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtccccttcctcataccctaagggtacctaagtgcccatacc 7158  T

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Target: scaffold0164; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15115 - 15039
Alignment:
Q  266 tacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacc 342  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  15115 tacccgtgcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtccccttcctcataccctaagggtacctaagtgcccatacc 15039  T

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Target: scaffold0242 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13216 - 13129
Alignment:
Q  260 tacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13216 tacctgtacccgagcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcctttccccataccctatgggtacttaagtgcccatacccgcac 13129  T

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Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22051 - 21964
Alignment:
Q  260 tacccgtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcac 347  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22051 tacctgtacccgagcccgtaccctcgtgggcaacaactttagtgcctttccccataccctatgggtacttaagtgcccatacccgcac 21964  T

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Target: scaffold0938 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0938
Description:

Target: scaffold0938; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 307 - 366
Target Start/End: Original strand, 472 - 531
Alignment:
Q  307 ttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaac 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  472 ttccacataccctatgggtacttaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaac 531  T

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Target: scaffold0062 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 307 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23980 - 23921
Alignment:
Q  307 ttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaac 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23980 ttccacataccctatgggtacttaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaac 23921  T

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Target: scaffold0062; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 307 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34148 - 34089
Alignment:
Q  307 ttccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaac 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34148 ttccacataccctatgggtacttaagtgcccatacccgcacccattacccgcactttaac 34089  T

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Target: scaffold0230 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 359
Target Start/End: Original strand, 26604 - 26698
Alignment:
Q  265 gtacccgtgcccgtacccccgtaggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgca 359  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  26604 gtacccgagcccgtaccctcgtgggcaacaactttaatgcccttccccataccctatgggcacttaagtgctcatacccccacccattacccgca 26698  T

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Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 499
Target Start/End: Original strand, 26727 - 26839
Alignment:
Q  388 atcacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaat-agaaaacatcagaaatat 486  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  || || || |||| |||| |||||||||||||||  || |||||||| ||||| | ||||||||  ||||||    
T  26727 atcacaattgaaataaaactatgatccaaaattatttaaatcaactaataaaataatatgaattgtagtatttagccaaataaaaaaacatccaaaatat 26826  T
Q  487 tcctaaaaaatta 499  Q
     ||| ||||||||    
T  26827 ccctcaaaaatta 26839  T

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Target: scaffold0160 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26342 - 26160
Alignment:
Q  187 atagggatggcaatagatacccaatgcgtagggtactacaatgcccgtctccatacccgcatttatnnnnnnntacccgtacccgtgcccgtacccccgt 286  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| | | ||| || |||||||||| ||| |       |||||||| |||  ||||||||| |||    
T  26342 atagggatggcaatgggtacccaatggatagggtactatagtacccatccccatacccgcgtttgtaaaaaa-tacccgtatccgaacccgtaccctcgt 26244  T
Q  287 aggcacaaactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaactatg 370  Q
     ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  || ||||| | |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26243 gggcaacaactttagtgcccttcctcataccctatggtcacctaagtgctcataaccgcactcattacccgcattttaactatg 26160  T

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Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26139 - 26053
Alignment:
Q  390 cacaaatgaaataaaactacgatctcaattttttaaaattaactcataaaataatatgaaccgtggtatttagtcaaatagaaaaca 476  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  ||   ||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  26139 cacaattgaaataaaactatgatccaaaaaatttcaaatcaactcataaaataatatgaatcgtagtatttagccaaataaaaaaca 26053  T

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Target: scaffold0249 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 366
Target Start/End: Original strand, 20033 - 20103
Alignment:
Q  296 ctttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaatttaac 366  Q
    ||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20033 ctttagtgcccttccccatatcttatggatacttaagtgtccatacccgcacccattacccgcattttaac 20103  T

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Target: scaffold0024 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 294 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 110115 - 110045
Alignment:
Q  294 aactttagtcccattccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattta 364  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  110115 aactttagtgcccttccccatatcctatgggtacttaagtgctcataccctcacctattacccgcacttta 110045  T

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Target: scaffold0163 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 363
Target Start/End: Original strand, 14390 - 14445
Alignment:
Q  308 tccccataccctatgggtacttaagtacccatacccgcacccattacccgcaattt 363  Q
    |||| ||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14390 tccctataccttatgggtatctaagtacccgtatccgcacccattacccgcaattt 14445  T

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