View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11167_low_17 (Length: 249)

Name: NF11167_low_17
Description: NF11167
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11167_low_17
NF11167_low_17
[»] chr5 (169 HSPs)
chr5 (4-249)||(7951607-7951852)
chr5 (1-243)||(41383915-41384157)
chr5 (5-249)||(3497547-3497791)
chr5 (1-249)||(9828439-9828687)
chr5 (1-249)||(40004152-40004400)
chr5 (5-249)||(16127305-16127549)
chr5 (1-244)||(186149-186392)
chr5 (1-249)||(13660907-13661153)
chr5 (1-249)||(32147339-32147585)
chr5 (3-249)||(23286226-23286465)
chr5 (1-249)||(1265995-1266244)
chr5 (1-249)||(17674400-17674649)
chr5 (1-249)||(31888939-31889188)
chr5 (1-249)||(16152997-16153246)
chr5 (1-249)||(28041093-28041342)
chr5 (1-228)||(17592544-17592771)
chr5 (1-249)||(15190557-15190806)
chr5 (1-249)||(22527738-22527987)
chr5 (1-249)||(34662250-34662499)
chr5 (3-244)||(40738461-40738702)
chr5 (1-249)||(6672970-6673219)
chr5 (3-249)||(7940498-7940743)
chr5 (1-249)||(3686496-3686745)
chr5 (1-249)||(10734263-10734512)
chr5 (1-249)||(13862737-13862986)
chr5 (3-249)||(22581480-22581726)
chr5 (1-246)||(25600802-25601048)
chr5 (1-249)||(41641141-41641394)
chr5 (1-249)||(42561093-42561340)
chr5 (1-249)||(15521684-15521933)
chr5 (17-249)||(26605374-26605614)
chr5 (3-249)||(33639337-33639583)
chr5 (19-244)||(14789604-14789829)
chr5 (5-249)||(23285081-23285328)
chr5 (27-249)||(4984884-4985107)
chr5 (3-249)||(20186547-20186794)
chr5 (17-249)||(31158186-31158415)
chr5 (1-249)||(14913695-14913942)
chr5 (1-249)||(16440977-16441224)
chr5 (17-249)||(14570649-14570879)
chr5 (9-245)||(14649235-14649472)
chr5 (17-249)||(32478184-32478417)
chr5 (1-249)||(9020741-9020988)
chr5 (3-242)||(31507365-31507605)
chr5 (3-249)||(4752962-4753209)
chr5 (3-249)||(40643140-40643387)
chr5 (4-249)||(9064953-9065199)
chr5 (3-248)||(9268037-9268283)
chr5 (3-249)||(20987959-20988204)
chr5 (25-245)||(28140686-28140907)
chr5 (3-247)||(34332266-34332511)
chr5 (3-249)||(40951787-40952034)
chr5 (7-249)||(43060159-43060402)
chr5 (3-249)||(20142005-20142250)
chr5 (3-249)||(32964178-32964423)
chr5 (5-245)||(14619299-14619540)
chr5 (3-249)||(4194728-4194971)
chr5 (8-249)||(27873094-27873336)
chr5 (17-249)||(5528020-5528252)
chr5 (3-249)||(7734880-7735128)
chr5 (3-249)||(8283856-8284099)
chr5 (7-249)||(38161529-38161771)
chr5 (50-249)||(14571333-14571530)
chr5 (3-249)||(22657814-22658061)
chr5 (34-249)||(10511246-10511462)
chr5 (1-249)||(18615804-18616057)
chr5 (3-249)||(4976033-4976281)
chr5 (3-249)||(12743870-12744117)
chr5 (3-245)||(21239149-21239391)
chr5 (4-245)||(39984819-39985063)
chr5 (3-249)||(35039043-35039289)
chr5 (3-249)||(39121434-39121681)
chr5 (3-249)||(13759193-13759438)
chr5 (4-249)||(38371719-38371964)
chr5 (25-249)||(3160293-3160518)
chr5 (5-249)||(34889024-34889269)
chr5 (42-249)||(24307924-24308132)
chr5 (42-249)||(24365191-24365399)
chr5 (3-249)||(3028059-3028308)
chr5 (3-249)||(9264019-9264266)
chr5 (3-249)||(23092384-23092631)
chr5 (3-249)||(35547307-35547554)
chr5 (3-225)||(39758957-39759180)
chr5 (3-249)||(19571674-19571929)
chr5 (81-249)||(24170179-24170348)
chr5 (3-214)||(14435883-14436095)
chr5 (34-249)||(23285852-23286067)
chr5 (3-249)||(41418356-41418601)
chr5 (3-248)||(20517892-20518134)
chr5 (44-249)||(32617561-32617767)
chr5 (3-210)||(8144464-8144672)
chr5 (88-249)||(20987793-20987955)
chr5 (3-248)||(21749977-21750223)
chr5 (9-225)||(15774813-15775030)
chr5 (88-249)||(12806692-12806854)
chr5 (5-249)||(8949861-8950105)
chr5 (5-249)||(31642233-31642477)
chr5 (3-249)||(17714610-17714861)
chr5 (3-245)||(18251066-18251312)
chr5 (66-249)||(16284998-16285181)
chr5 (3-204)||(37034238-37034438)
chr5 (6-249)||(4902853-4903071)
chr5 (8-246)||(25837057-25837295)
chr5 (3-249)||(31657730-31657976)
chr5 (45-249)||(12098607-12098811)
chr5 (88-249)||(39971060-39971221)
chr5 (65-249)||(24857602-24857785)
chr5 (34-249)||(11780809-11781016)
chr5 (3-249)||(41686860-41687104)
chr5 (17-249)||(8100152-8100384)
chr5 (43-248)||(13703594-13703797)
chr5 (17-142)||(13958610-13958735)
chr5 (81-249)||(28414507-28414675)
chr5 (113-249)||(39180507-39180643)
chr5 (45-216)||(9438877-9439051)
chr5 (88-246)||(6328633-6328791)
chr5 (15-249)||(16926499-16926732)
chr5 (126-248)||(26894742-26894863)
chr5 (88-249)||(11432356-11432523)
chr5 (66-249)||(21069683-21069866)
chr5 (3-245)||(37700143-37700386)
chr5 (3-249)||(23259883-23260129)
chr5 (65-249)||(13235988-13236169)
chr5 (3-249)||(15559579-15559829)
chr5 (34-159)||(15674913-15675037)
chr5 (148-249)||(26674494-26674595)
chr5 (148-249)||(26946100-26946201)
chr5 (3-178)||(30182958-30183133)
chr5 (65-246)||(27833993-27834174)
chr5 (27-245)||(26076158-26076375)
chr5 (1-111)||(26889596-26889706)
chr5 (65-217)||(3628980-3629132)
chr5 (155-244)||(13735701-13735789)
chr5 (65-249)||(5283094-5283277)
chr5 (66-249)||(35784728-35784908)
chr5 (5-246)||(39692401-39692640)
chr5 (17-108)||(39181907-39181998)
chr5 (3-137)||(42030344-42030478)
chr5 (3-246)||(1303322-1303563)
chr5 (33-135)||(2328397-2328498)
chr5 (88-249)||(16636828-16636992)
chr5 (5-245)||(13335338-13335578)
chr5 (174-249)||(30182129-30182204)
chr5 (3-142)||(7001455-7001594)
chr5 (7-84)||(20988254-20988331)
chr5 (5-168)||(9727498-9727661)
chr5 (77-244)||(16099279-16099448)
chr5 (34-108)||(11937193-11937267)
chr5 (3-168)||(8356284-8356449)
chr5 (40-113)||(10561248-10561321)
chr5 (3-84)||(12807134-12807215)
chr5 (127-224)||(20187151-20187248)
chr5 (34-112)||(35684732-35684811)
chr5 (77-245)||(37206169-37206338)
chr5 (12-136)||(41470804-41470928)
chr5 (42-142)||(9264715-9264814)
chr5 (44-84)||(7717710-7717750)
chr5 (155-230)||(7956578-7956653)
chr5 (155-245)||(10116630-10116721)
chr5 (45-107)||(37330994-37331056)
chr5 (1-31)||(41384176-41384206)
chr5 (33-93)||(8421136-8421199)
chr5 (148-217)||(21591815-21591884)
chr5 (148-217)||(21595932-21596001)
chr5 (155-245)||(30117163-30117255)
chr5 (34-111)||(35495046-35495123)
chr5 (3-31)||(14649193-14649221)
chr5 (3-31)||(22657773-22657801)
chr5 (3-31)||(40643099-40643127)
[»] chr3 (236 HSPs)
chr3 (1-249)||(33868494-33868742)
chr3 (1-249)||(16434980-16435228)
chr3 (1-249)||(50647687-50647935)
chr3 (1-249)||(4024098-4024345)
chr3 (1-249)||(14428656-14428903)
chr3 (1-249)||(17591288-17591536)
chr3 (1-249)||(52058988-52059236)
chr3 (1-249)||(9779982-9780230)
chr3 (1-249)||(37728759-37729007)
chr3 (1-249)||(36099011-36099258)
chr3 (1-249)||(44543828-44544076)
chr3 (1-249)||(20862242-20862491)
chr3 (1-245)||(36005553-36005798)
chr3 (1-249)||(51283805-51284054)
chr3 (5-249)||(10044887-10045130)
chr3 (3-249)||(39952317-39952563)
chr3 (1-244)||(26806118-26806366)
chr3 (1-245)||(53271642-53271885)
chr3 (1-249)||(9499239-9499488)
chr3 (1-249)||(22103671-22103920)
chr3 (17-249)||(36317415-36317646)
chr3 (1-249)||(43868149-43868398)
chr3 (1-249)||(26306357-26306598)
chr3 (1-249)||(7051462-7051711)
chr3 (1-249)||(45745824-45746073)
chr3 (1-249)||(46703073-46703322)
chr3 (1-249)||(7181396-7181645)
chr3 (1-249)||(23700527-23700776)
chr3 (1-249)||(23718982-23719231)
chr3 (1-249)||(23737438-23737687)
chr3 (1-249)||(52673233-52673482)
chr3 (1-249)||(7251024-7251273)
chr3 (1-249)||(46878181-46878430)
chr3 (3-249)||(54107399-54107646)
chr3 (3-249)||(20621430-20621675)
chr3 (1-249)||(21756532-21756781)
chr3 (1-249)||(26221334-26221583)
chr3 (17-249)||(32467471-32467704)
chr3 (1-249)||(45048764-45049013)
chr3 (1-249)||(54782659-54782908)
chr3 (60-244)||(22832411-22832595)
chr3 (6-249)||(45252819-45253063)
chr3 (17-248)||(41824155-41824386)
chr3 (3-249)||(10015535-10015780)
chr3 (1-245)||(20656052-20656297)
chr3 (1-249)||(30040759-30041008)
chr3 (4-249)||(31186804-31187048)
chr3 (1-249)||(31531153-31531402)
chr3 (17-249)||(43701224-43701457)
chr3 (5-249)||(25148505-25148746)
chr3 (1-249)||(49126938-49127189)
chr3 (1-249)||(32962847-32963095)
chr3 (5-249)||(53361601-53361846)
chr3 (1-243)||(54604332-54604573)
chr3 (3-249)||(50433133-50433380)
chr3 (8-249)||(1450288-1450530)
chr3 (3-249)||(19897582-19897827)
chr3 (4-249)||(49383389-49383635)
chr3 (17-249)||(25148880-25149113)
chr3 (17-245)||(25916450-25916681)
chr3 (17-249)||(32569043-32569275)
chr3 (3-249)||(10656737-10656984)
chr3 (4-249)||(26593510-26593756)
chr3 (3-249)||(45513381-45513626)
chr3 (17-249)||(1641858-1642090)
chr3 (1-249)||(35867825-35868074)
chr3 (34-249)||(35165738-35165953)
chr3 (7-249)||(46862114-46862357)
chr3 (3-249)||(47066980-47067227)
chr3 (4-249)||(6784509-6784754)
chr3 (3-249)||(8321971-8322216)
chr3 (4-249)||(17753280-17753526)
chr3 (4-249)||(19054600-19054846)
chr3 (3-249)||(28673040-28673285)
chr3 (3-249)||(8546950-8547197)
chr3 (3-249)||(42801526-42801773)
chr3 (3-249)||(46845236-46845483)
chr3 (3-249)||(50517266-50517513)
chr3 (3-249)||(15996519-15996764)
chr3 (3-249)||(36600189-36600435)
chr3 (27-249)||(1572377-1572598)
chr3 (1-245)||(43978210-43978453)
chr3 (7-246)||(12050143-12050381)
chr3 (3-249)||(12906156-12906403)
chr3 (3-249)||(21459028-21459275)
chr3 (1-249)||(26058592-26058833)
chr3 (3-249)||(33212442-33212689)
chr3 (25-249)||(48887712-48887937)
chr3 (3-244)||(52044540-52044780)
chr3 (1-249)||(35711321-35711568)
chr3 (5-224)||(40919025-40919245)
chr3 (1-249)||(46049730-46049977)
chr3 (3-249)||(20877679-20877922)
chr3 (3-249)||(53686741-53686988)
chr3 (7-249)||(48909918-48910159)
chr3 (3-249)||(4759093-4759342)
chr3 (49-249)||(46861666-46861867)
chr3 (5-246)||(50726532-50726772)
chr3 (5-246)||(50786076-50786316)
chr3 (5-249)||(53164209-53164454)
chr3 (3-249)||(13809553-13809800)
chr3 (1-244)||(32978533-32978774)
chr3 (3-249)||(43686547-43686794)
chr3 (17-248)||(22527381-22527611)
chr3 (3-249)||(1084698-1084945)
chr3 (3-249)||(42390648-42390895)
chr3 (7-249)||(27688032-27688272)
chr3 (40-248)||(45323870-45324077)
chr3 (7-243)||(25130702-25130934)
chr3 (42-249)||(43158521-43158727)
chr3 (88-249)||(12683011-12683173)
chr3 (3-249)||(17698778-17699023)
chr3 (8-249)||(51489413-51489654)
chr3 (7-249)||(23776245-23776486)
chr3 (3-249)||(14758884-14759127)
chr3 (7-246)||(52291177-52291415)
chr3 (3-249)||(48213798-48214043)
chr3 (25-249)||(54849409-54849634)
chr3 (14-248)||(31533414-31533643)
chr3 (12-249)||(2993305-2993541)
chr3 (3-249)||(38071241-38071489)
chr3 (3-247)||(44561441-44561685)
chr3 (3-249)||(50730371-50730619)
chr3 (3-249)||(50782235-50782483)
chr3 (46-249)||(10220978-10221180)
chr3 (3-245)||(29383064-29383307)
chr3 (3-245)||(1111393-1111635)
chr3 (3-249)||(47008247-47008493)
chr3 (34-246)||(43557228-43557441)
chr3 (3-242)||(41992284-41992509)
chr3 (3-249)||(35572202-35572446)
chr3 (26-244)||(28810889-28811107)
chr3 (88-249)||(7886892-7887053)
chr3 (3-249)||(24087082-24087326)
chr3 (58-249)||(33361500-33361684)
chr3 (3-245)||(27646051-27646293)
chr3 (12-249)||(41392633-41392871)
chr3 (5-229)||(46879084-46879309)
chr3 (66-244)||(49383640-49383819)
chr3 (3-245)||(29719456-29719698)
chr3 (65-249)||(48904070-48904254)
chr3 (3-183)||(37144230-37144413)
chr3 (3-249)||(12918583-12918829)
chr3 (3-249)||(48902454-48902699)
chr3 (1-137)||(20848990-20849127)
chr3 (65-249)||(17589683-17589867)
chr3 (3-229)||(33976549-33976772)
chr3 (65-245)||(34021802-34021982)
chr3 (94-249)||(30819924-30820079)
chr3 (1-111)||(12675165-12675275)
chr3 (75-249)||(43408544-43408720)
chr3 (3-245)||(45404425-45404666)
chr3 (88-249)||(15095244-15095405)
chr3 (88-224)||(44542303-44542440)
chr3 (25-245)||(16776652-16776874)
chr3 (6-183)||(19350123-19350302)
chr3 (118-249)||(49543723-49543854)
chr3 (3-249)||(32968971-32969216)
chr3 (3-249)||(42526370-42526616)
chr3 (46-218)||(52177876-52178050)
chr3 (148-244)||(20848612-20848708)
chr3 (126-242)||(46557751-46557867)
chr3 (3-180)||(54866388-54866565)
chr3 (34-174)||(23308059-23308200)
chr3 (88-245)||(42755391-42755548)
chr3 (65-249)||(8379723-8379907)
chr3 (3-178)||(25879256-25879431)
chr3 (4-240)||(49543925-49544161)
chr3 (3-249)||(38340996-38341240)
chr3 (1-79)||(7462843-7462921)
chr3 (155-249)||(9582289-9582383)
chr3 (3-224)||(33290417-33290636)
chr3 (3-168)||(41750932-41751097)
chr3 (3-249)||(31541073-31541314)
chr3 (110-241)||(18658311-18658442)
chr3 (3-245)||(54927835-54928078)
chr3 (25-244)||(34265491-34265716)
chr3 (65-245)||(42044061-42044239)
chr3 (90-249)||(48655072-48655231)
chr3 (3-124)||(18658173-18658295)
chr3 (95-249)||(34811360-34811514)
chr3 (88-249)||(4564280-4564444)
chr3 (148-249)||(39625684-39625785)
chr3 (88-249)||(40215059-40215220)
chr3 (65-229)||(28875059-28875222)
chr3 (186-249)||(7462925-7462988)
chr3 (26-109)||(9582396-9582479)
chr3 (34-184)||(35938472-35938623)
chr3 (34-136)||(39625232-39625335)
chr3 (65-230)||(24813651-24813814)
chr3 (34-218)||(55287338-55287517)
chr3 (46-136)||(21497599-21497689)
chr3 (172-246)||(41751383-41751457)
chr3 (172-249)||(7886455-7886532)
chr3 (3-249)||(36584756-36584997)
chr3 (117-249)||(52693547-52693679)
chr3 (173-249)||(54690581-54690657)
chr3 (148-247)||(40047979-40048078)
chr3 (3-72)||(43408197-43408266)
chr3 (34-142)||(8503277-8503385)
chr3 (188-244)||(20919133-20919189)
chr3 (188-244)||(20928095-20928151)
chr3 (88-214)||(4836523-4836647)
chr3 (88-246)||(2764233-2764390)
chr3 (88-137)||(22494490-22494539)
chr3 (34-137)||(16776522-16776626)
chr3 (65-137)||(29447602-29447674)
chr3 (3-67)||(33360890-33360954)
chr3 (4-84)||(46557660-46557740)
chr3 (69-171)||(13702666-13702769)
chr3 (66-184)||(23650639-23650758)
chr3 (110-181)||(27067501-27067572)
chr3 (194-249)||(1330943-1330998)
chr3 (1-31)||(7051724-7051754)
chr3 (45-79)||(9018089-9018123)
chr3 (1-31)||(10044845-10044875)
chr3 (194-244)||(16869513-16869563)
chr3 (69-111)||(20084697-20084739)
chr3 (199-245)||(29454725-29454771)
chr3 (1-31)||(32963109-32963139)
chr3 (1-31)||(32978484-32978514)
chr3 (1-31)||(33868451-33868481)
chr3 (195-245)||(36730057-36730107)
chr3 (4-62)||(49543866-49543924)
chr3 (4-77)||(2801221-2801294)
chr3 (3-104)||(18657613-18657713)
chr3 (157-246)||(21777975-21778064)
chr3 (3-31)||(21458987-21459015)
chr3 (3-31)||(24813607-24813635)
chr3 (3-31)||(27646310-27646338)
chr3 (3-31)||(28673298-28673326)
chr3 (3-31)||(33212402-33212430)
chr3 (3-31)||(34811320-34811348)
chr3 (3-31)||(50517526-50517554)
chr3 (3-31)||(53164168-53164196)
chr3 (115-174)||(54690378-54690435)
[»] chr2 (184 HSPs)
chr2 (1-249)||(23789015-23789263)
chr2 (1-249)||(39833742-39833990)
chr2 (1-249)||(1359837-1360085)
chr2 (1-249)||(2438271-2438519)
chr2 (3-249)||(16805536-16805782)
chr2 (3-249)||(16844818-16845064)
chr2 (1-249)||(8841400-8841648)
chr2 (1-249)||(16108218-16108466)
chr2 (1-249)||(16456615-16456863)
chr2 (5-249)||(17408041-17408285)
chr2 (1-249)||(22897437-22897685)
chr2 (1-249)||(29239336-29239584)
chr2 (1-249)||(7491890-7492138)
chr2 (1-246)||(11201732-11201977)
chr2 (25-249)||(9697908-9698132)
chr2 (1-249)||(27560252-27560500)
chr2 (1-249)||(34883590-34883839)
chr2 (3-248)||(19630933-19631179)
chr2 (3-248)||(19827834-19828080)
chr2 (1-249)||(25624778-25625024)
chr2 (8-249)||(7116050-7116290)
chr2 (1-249)||(32120990-32121239)
chr2 (1-249)||(13197387-13197636)
chr2 (1-249)||(20727600-20727849)
chr2 (1-249)||(4711773-4712021)
chr2 (1-249)||(8716634-8716883)
chr2 (1-249)||(15404450-15404698)
chr2 (5-249)||(34062411-34062656)
chr2 (1-249)||(36130770-36131019)
chr2 (1-241)||(45474369-45474610)
chr2 (3-249)||(15571232-15571478)
chr2 (1-245)||(1943624-1943869)
chr2 (3-249)||(12889954-12890199)
chr2 (20-245)||(20252260-20252486)
chr2 (4-249)||(37229486-37229732)
chr2 (17-249)||(41450562-41450795)
chr2 (5-249)||(12360502-12360745)
chr2 (3-249)||(40607748-40607995)
chr2 (3-249)||(22182669-22182914)
chr2 (17-249)||(8990250-8990483)
chr2 (1-249)||(16669672-16669921)
chr2 (1-249)||(15227893-15228140)
chr2 (3-214)||(1422168-1422378)
chr2 (1-249)||(40680773-40681022)
chr2 (38-249)||(5664684-5664896)
chr2 (5-249)||(40788836-40789079)
chr2 (1-249)||(42629418-42629660)
chr2 (1-244)||(36020992-36021235)
chr2 (3-249)||(24345463-24345710)
chr2 (3-249)||(8912620-8912865)
chr2 (3-249)||(23465181-23465426)
chr2 (3-245)||(11865031-11865275)
chr2 (3-247)||(23083541-23083790)
chr2 (3-249)||(1143002-1143249)
chr2 (3-245)||(2200029-2200272)
chr2 (17-249)||(45151794-45152029)
chr2 (34-249)||(28840684-28840899)
chr2 (3-249)||(2060363-2060609)
chr2 (26-249)||(9040874-9041097)
chr2 (3-249)||(31751115-31751365)
chr2 (3-249)||(1748386-1748633)
chr2 (3-249)||(19318799-19319046)
chr2 (3-249)||(26322037-26322284)
chr2 (1-249)||(34113577-34113820)
chr2 (3-249)||(41003989-41004234)
chr2 (5-249)||(24973846-24974091)
chr2 (3-243)||(19034465-19034703)
chr2 (3-249)||(19353237-19353484)
chr2 (98-249)||(10757816-10757969)
chr2 (7-249)||(38214526-38214767)
chr2 (7-248)||(17665571-17665811)
chr2 (8-248)||(7531650-7531889)
chr2 (3-249)||(38121255-38121502)
chr2 (42-228)||(41967987-41968174)
chr2 (3-249)||(45628625-45628872)
chr2 (3-248)||(40680409-40680652)
chr2 (3-249)||(7418539-7418787)
chr2 (3-249)||(18375238-18375485)
chr2 (9-249)||(20643528-20643767)
chr2 (3-249)||(11851932-11852177)
chr2 (11-245)||(25523551-25523784)
chr2 (3-247)||(13336501-13336744)
chr2 (17-249)||(29830514-29830747)
chr2 (3-245)||(41834456-41834700)
chr2 (3-249)||(34944163-34944403)
chr2 (5-249)||(10399208-10399453)
chr2 (49-249)||(15435667-15435867)
chr2 (7-246)||(5255583-5255822)
chr2 (3-249)||(11385914-11386159)
chr2 (3-212)||(30779745-30779955)
chr2 (25-249)||(1859594-1859818)
chr2 (13-245)||(7933471-7933703)
chr2 (34-229)||(15353239-15353430)
chr2 (34-249)||(6007618-6007834)
chr2 (54-249)||(18374498-18374693)
chr2 (8-244)||(43701021-43701246)
chr2 (3-184)||(44436229-44436411)
chr2 (34-249)||(7666324-7666540)
chr2 (4-249)||(32712531-32712775)
chr2 (3-241)||(40173147-40173380)
chr2 (17-244)||(16808975-16809201)
chr2 (17-244)||(16848256-16848482)
chr2 (45-249)||(5070355-5070557)
chr2 (62-246)||(8782515-8782700)
chr2 (3-246)||(30466153-30466418)
chr2 (4-216)||(3670223-3670448)
chr2 (110-249)||(12873035-12873174)
chr2 (3-249)||(18970474-18970720)
chr2 (3-249)||(36750629-36750875)
chr2 (88-247)||(13215649-13215808)
chr2 (3-249)||(32511065-32511293)
chr2 (3-249)||(30857984-30858230)
chr2 (3-249)||(31633592-31633838)
chr2 (75-249)||(44573702-44573874)
chr2 (4-249)||(34431947-34432191)
chr2 (43-218)||(3060405-3060581)
chr2 (34-220)||(7461261-7461448)
chr2 (34-249)||(15917855-15918070)
chr2 (3-249)||(6028388-6028634)
chr2 (3-249)||(9701116-9701362)
chr2 (45-229)||(18223686-18223872)
chr2 (65-249)||(2788145-2788328)
chr2 (34-244)||(8030794-8030992)
chr2 (65-249)||(30830150-30830333)
chr2 (3-249)||(12619853-12620102)
chr2 (88-249)||(3095345-3095506)
chr2 (13-245)||(12296182-12296416)
chr2 (8-245)||(29830817-29831053)
chr2 (3-249)||(41422558-41422804)
chr2 (3-249)||(41494367-41494613)
chr2 (8-244)||(44017791-44018030)
chr2 (3-249)||(43700663-43700913)
chr2 (3-249)||(8295367-8295601)
chr2 (65-246)||(28566200-28566381)
chr2 (3-249)||(40544370-40544618)
chr2 (13-223)||(18294065-18294273)
chr2 (131-249)||(26334717-26334836)
chr2 (70-248)||(40348217-40348388)
chr2 (11-248)||(11944391-11944628)
chr2 (4-243)||(11083431-11083671)
chr2 (189-249)||(24300282-24300342)
chr2 (3-230)||(13598582-13598809)
chr2 (65-245)||(4408584-4408765)
chr2 (126-215)||(7446945-7447034)
chr2 (16-168)||(8867712-8867860)
chr2 (69-245)||(12969561-12969738)
chr2 (44-244)||(22302572-22302774)
chr2 (46-246)||(6650939-6651144)
chr2 (65-214)||(21838698-21838846)
chr2 (81-246)||(27725513-27725681)
chr2 (66-249)||(44417445-44417631)
chr2 (186-249)||(44436749-44436812)
chr2 (155-245)||(4897640-4897730)
chr2 (155-245)||(4945034-4945124)
chr2 (69-242)||(26273366-26273540)
chr2 (65-217)||(3904524-3904677)
chr2 (139-229)||(7457305-7457395)
chr2 (44-121)||(16636408-16636486)
chr2 (148-245)||(15079298-15079394)
chr2 (3-96)||(26334629-26334722)
chr2 (88-245)||(12873559-12873712)
chr2 (25-136)||(4897420-4897530)
chr2 (25-136)||(4944814-4944924)
chr2 (34-224)||(14493590-14493779)
chr2 (69-244)||(11121034-11121211)
chr2 (12-182)||(8056070-8056240)
chr2 (189-232)||(16636493-16636536)
chr2 (88-183)||(40544651-40544746)
chr2 (3-69)||(15435589-15435655)
chr2 (64-122)||(16807067-16807126)
chr2 (64-122)||(16846348-16846407)
chr2 (1-31)||(15228153-15228183)
chr2 (1-31)||(16805795-16805825)
chr2 (1-31)||(16845076-16845106)
chr2 (1-31)||(22897394-22897424)
chr2 (155-233)||(25888339-25888417)
chr2 (1-31)||(32120947-32120977)
chr2 (3-56)||(13214973-13215026)
chr2 (1-29)||(1359794-1359822)
chr2 (3-31)||(6027623-6027651)
chr2 (1-41)||(10757777-10757817)
chr2 (3-31)||(11852189-11852217)
chr2 (3-31)||(30466110-30466138)
chr2 (3-31)||(41968206-41968234)
[»] chr1 (219 HSPs)
chr1 (5-249)||(15810979-15811223)
chr1 (1-249)||(44646317-44646565)
chr1 (1-246)||(39750124-39750369)
chr1 (1-249)||(30289605-30289853)
chr1 (1-249)||(23542025-23542273)
chr1 (1-248)||(1047995-1048242)
chr1 (3-249)||(45039458-45039704)
chr1 (1-249)||(39362937-39363185)
chr1 (1-249)||(39497479-39497727)
chr1 (1-249)||(44649675-44649923)
chr1 (1-249)||(1039124-1039372)
chr1 (1-249)||(1046030-1046278)
chr1 (1-249)||(37951692-37951940)
chr1 (1-244)||(9202248-9202491)
chr1 (5-248)||(47068835-47069078)
chr1 (5-249)||(35984409-35984653)
chr1 (1-249)||(7784037-7784288)
chr1 (1-249)||(42872076-42872325)
chr1 (17-249)||(18237138-18237370)
chr1 (1-249)||(52430916-52431165)
chr1 (5-249)||(45794390-45794635)
chr1 (1-249)||(11741443-11741692)
chr1 (1-249)||(36694900-36695149)
chr1 (1-249)||(36711001-36711250)
chr1 (1-244)||(50246672-50246916)
chr1 (4-249)||(46075613-46075858)
chr1 (1-249)||(11906970-11907219)
chr1 (17-249)||(16575850-16576083)
chr1 (1-249)||(30290311-30290560)
chr1 (1-249)||(49907067-49907316)
chr1 (17-249)||(10383800-10384034)
chr1 (3-249)||(34931125-34931370)
chr1 (1-246)||(47300635-47300881)
chr1 (1-249)||(16456682-16456931)
chr1 (1-249)||(943381-943628)
chr1 (3-249)||(6089781-6090026)
chr1 (1-245)||(50008225-50008470)
chr1 (1-249)||(52602037-52602284)
chr1 (7-249)||(9413075-9413316)
chr1 (4-229)||(14089997-14090223)
chr1 (25-249)||(2280000-2280224)
chr1 (3-249)||(47263501-47263750)
chr1 (3-241)||(5765735-5765973)
chr1 (3-249)||(22567115-22567361)
chr1 (3-245)||(31635875-31636117)
chr1 (1-249)||(4102458-4102705)
chr1 (3-249)||(23530591-23530838)
chr1 (3-249)||(27037315-27037562)
chr1 (1-249)||(45335931-45336180)
chr1 (1-249)||(41855217-41855464)
chr1 (27-249)||(15616179-15616404)
chr1 (8-249)||(15892313-15892555)
chr1 (3-249)||(40614651-40614896)
chr1 (1-249)||(32169697-32169945)
chr1 (17-244)||(8104048-8104275)
chr1 (3-246)||(9700495-9700738)
chr1 (3-249)||(9715406-9715653)
chr1 (3-249)||(24855327-24855574)
chr1 (3-249)||(27530348-27530593)
chr1 (3-249)||(28052235-28052482)
chr1 (3-249)||(28888167-28888414)
chr1 (3-249)||(38261386-38261633)
chr1 (11-249)||(42275912-42276151)
chr1 (3-240)||(229152-229388)
chr1 (3-249)||(21630850-21631098)
chr1 (41-249)||(31238765-31238972)
chr1 (3-249)||(45285556-45285801)
chr1 (3-245)||(9378846-9379090)
chr1 (3-249)||(15100402-15100655)
chr1 (3-249)||(28885847-28886094)
chr1 (1-220)||(36880365-36880582)
chr1 (52-243)||(46506207-46506398)
chr1 (3-249)||(48067639-48067886)
chr1 (3-248)||(27575381-27575627)
chr1 (3-249)||(41317640-41317885)
chr1 (17-248)||(4592625-4592857)
chr1 (25-249)||(8923436-8923659)
chr1 (34-249)||(25509254-25509468)
chr1 (3-249)||(38613521-38613768)
chr1 (3-249)||(8472095-8472339)
chr1 (3-243)||(51422170-51422414)
chr1 (8-243)||(14347174-14347410)
chr1 (37-249)||(47429166-47429378)
chr1 (34-246)||(10433369-10433583)
chr1 (3-249)||(7763496-7763740)
chr1 (17-246)||(31465714-31465944)
chr1 (4-249)||(36674043-36674289)
chr1 (3-249)||(37584999-37585244)
chr1 (55-244)||(39324576-39324766)
chr1 (8-249)||(15111627-15111873)
chr1 (3-249)||(12814531-12814778)
chr1 (5-249)||(26549838-26550079)
chr1 (3-249)||(15763361-15763608)
chr1 (48-245)||(50008024-50008221)
chr1 (25-249)||(1767630-1767853)
chr1 (3-246)||(13343822-13344066)
chr1 (17-249)||(48022952-48023184)
chr1 (3-249)||(7212303-7212550)
chr1 (3-170)||(13698736-13698903)
chr1 (15-224)||(37589012-37589221)
chr1 (3-249)||(48853864-48854109)
chr1 (3-246)||(27974900-27975144)
chr1 (3-249)||(2489146-2489391)
chr1 (1-216)||(14171610-14171824)
chr1 (3-245)||(31086667-31086910)
chr1 (3-249)||(38530896-38531141)
chr1 (11-248)||(19792616-19792852)
chr1 (88-249)||(43456451-43456612)
chr1 (4-244)||(25271242-25271480)
chr1 (34-245)||(32149086-32149298)
chr1 (54-249)||(50937824-50938020)
chr1 (59-245)||(15289984-15290171)
chr1 (5-232)||(43395419-43395645)
chr1 (7-249)||(45038111-45038353)
chr1 (3-214)||(896797-897008)
chr1 (3-249)||(3549078-3549322)
chr1 (34-249)||(32153569-32153785)
chr1 (45-240)||(43668188-43668384)
chr1 (45-203)||(31154351-31154509)
chr1 (3-206)||(25228285-25228489)
chr1 (34-247)||(47296342-47296556)
chr1 (3-183)||(25283918-25284099)
chr1 (62-245)||(39873488-39873672)
chr1 (3-189)||(47754431-47754618)
chr1 (33-215)||(51810956-51811139)
chr1 (7-247)||(3934653-3934894)
chr1 (44-249)||(26544550-26544754)
chr1 (148-249)||(39867546-39867647)
chr1 (110-249)||(11352916-11353055)
chr1 (3-246)||(27479647-27479890)
chr1 (3-246)||(39425575-39425818)
chr1 (3-245)||(17483783-17484024)
chr1 (44-249)||(34503282-34503488)
chr1 (3-249)||(37850182-37850428)
chr1 (65-249)||(2636993-2637177)
chr1 (65-249)||(49549047-49549231)
chr1 (3-245)||(35693112-35693357)
chr1 (3-178)||(44529419-44529593)
chr1 (3-249)||(52428934-52429179)
chr1 (7-249)||(27530805-27531034)
chr1 (65-245)||(4389659-4389839)
chr1 (5-249)||(38174922-38175163)
chr1 (3-249)||(29437599-29437845)
chr1 (7-249)||(39626985-39627227)
chr1 (3-249)||(51467218-51467463)
chr1 (66-249)||(21290167-21290350)
chr1 (1-249)||(38920285-38920528)
chr1 (7-249)||(30996790-30997032)
chr1 (4-249)||(43789700-43789949)
chr1 (46-248)||(48363802-48364004)
chr1 (173-249)||(5858301-5858377)
chr1 (65-249)||(15302551-15302735)
chr1 (89-249)||(23893528-23893687)
chr1 (9-243)||(27669894-27670127)
chr1 (34-241)||(1427253-1427460)
chr1 (3-184)||(1837317-1837505)
chr1 (148-249)||(51561768-51561869)
chr1 (65-229)||(35945274-35945438)
chr1 (158-249)||(32908286-32908377)
chr1 (88-249)||(4279958-4280117)
chr1 (8-167)||(44454575-44454736)
chr1 (17-217)||(1197925-1198128)
chr1 (5-245)||(9424817-9425055)
chr1 (69-245)||(26768435-26768611)
chr1 (3-111)||(32906710-32906819)
chr1 (164-249)||(44455529-44455614)
chr1 (3-249)||(46271097-46271341)
chr1 (11-171)||(18114224-18114385)
chr1 (59-227)||(31338946-31339115)
chr1 (3-136)||(51561075-51561207)
chr1 (54-246)||(18172377-18172557)
chr1 (66-244)||(4371574-4371750)
chr1 (27-245)||(9411148-9411367)
chr1 (3-121)||(26544387-26544506)
chr1 (63-246)||(33163201-33163387)
chr1 (88-249)||(41619998-41620157)
chr1 (88-249)||(5854423-5854583)
chr1 (3-136)||(26547662-26547797)
chr1 (148-248)||(19349254-19349354)
chr1 (88-245)||(50074460-50074618)
chr1 (26-107)||(8946410-8946491)
chr1 (120-245)||(39647654-39647779)
chr1 (34-241)||(33336855-33337060)
chr1 (110-244)||(8905463-8905596)
chr1 (148-246)||(38505848-38505945)
chr1 (3-171)||(22940566-22940733)
chr1 (80-176)||(25968416-25968512)
chr1 (13-184)||(30761008-30761180)
chr1 (88-183)||(1867285-1867380)
chr1 (7-168)||(45810116-45810278)
chr1 (35-108)||(9413560-9413633)
chr1 (3-108)||(27255473-27255578)
chr1 (195-248)||(47754065-47754118)
chr1 (34-230)||(15624668-15624868)
chr1 (26-84)||(43453337-43453395)
chr1 (63-135)||(19349642-19349714)
chr1 (65-137)||(38509070-38509142)
chr1 (150-249)||(15907109-15907208)
chr1 (34-119)||(2606690-2606776)
chr1 (52-137)||(15330968-15331054)
chr1 (152-245)||(3262965-3263058)
chr1 (197-246)||(25227356-25227405)
chr1 (8-89)||(25967790-25967871)
chr1 (196-249)||(44530546-44530599)
chr1 (156-244)||(43589318-43589405)
chr1 (65-108)||(52001530-52001573)
chr1 (164-226)||(35160218-35160280)
chr1 (212-249)||(897154-897191)
chr1 (3-56)||(5854051-5854104)
chr1 (66-111)||(10332370-10332415)
chr1 (9-97)||(11351452-11351541)
chr1 (200-237)||(22940767-22940804)
chr1 (3-31)||(3934611-3934639)
chr1 (88-160)||(22177575-22177646)
chr1 (3-31)||(22567071-22567099)
chr1 (164-212)||(37000735-37000783)
chr1 (201-249)||(45809870-45809918)
chr1 (8-108)||(46084054-46084154)
chr1 (25-69)||(49893428-49893472)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-249)||(47686-47934)
[»] chr8 (186 HSPs)
chr8 (1-249)||(13153974-13154222)
chr8 (1-249)||(11798651-11798899)
chr8 (1-249)||(17856520-17856768)
chr8 (6-249)||(12255141-12255384)
chr8 (6-249)||(12260684-12260927)
chr8 (1-249)||(44250862-44251112)
chr8 (5-249)||(4631300-4631544)
chr8 (1-249)||(28864250-28864498)
chr8 (1-249)||(29279242-29279490)
chr8 (1-249)||(40741311-40741558)
chr8 (6-249)||(44502665-44502912)
chr8 (1-249)||(43653946-43654194)
chr8 (3-249)||(29321039-29321285)
chr8 (1-249)||(50837-51086)
chr8 (1-245)||(26990570-26990815)
chr8 (1-249)||(34490563-34490812)
chr8 (3-249)||(8948095-8948342)
chr8 (3-249)||(2151985-2152231)
chr8 (1-249)||(8251675-8251924)
chr8 (1-249)||(28191917-28192166)
chr8 (1-249)||(18455766-18456015)
chr8 (1-249)||(38878767-38879016)
chr8 (1-244)||(35504322-35504566)
chr8 (5-249)||(18754190-18754436)
chr8 (1-246)||(41014553-41014799)
chr8 (1-249)||(8951170-8951419)
chr8 (1-249)||(32675499-32675748)
chr8 (1-249)||(1774388-1774637)
chr8 (1-249)||(4076218-4076467)
chr8 (1-249)||(29598270-29598519)
chr8 (1-241)||(38183308-38183549)
chr8 (1-249)||(42598458-42598706)
chr8 (60-244)||(5593470-5593654)
chr8 (3-249)||(23687910-23688155)
chr8 (17-249)||(36245671-36245904)
chr8 (3-249)||(5162350-5162597)
chr8 (3-249)||(18111721-18111966)
chr8 (3-249)||(23487110-23487355)
chr8 (3-249)||(32522589-32522834)
chr8 (5-249)||(33745643-33745887)
chr8 (17-249)||(36176861-36177094)
chr8 (5-249)||(13568656-13568895)
chr8 (3-249)||(40784936-40785183)
chr8 (5-249)||(14699498-14699743)
chr8 (1-249)||(34568536-34568785)
chr8 (1-244)||(9035283-9035525)
chr8 (1-231)||(16125452-16125683)
chr8 (3-249)||(45425081-45425325)
chr8 (1-249)||(28579685-28579931)
chr8 (3-249)||(5783891-5784139)
chr8 (4-247)||(16999045-16999289)
chr8 (1-249)||(26016615-26016862)
chr8 (1-249)||(39029224-39029470)
chr8 (1-249)||(2944016-2944263)
chr8 (1-246)||(36661668-36661914)
chr8 (34-230)||(16117226-16117423)
chr8 (3-249)||(11482864-11483111)
chr8 (3-249)||(24992561-24992808)
chr8 (3-249)||(39406605-39406852)
chr8 (3-249)||(14548433-14548679)
chr8 (3-249)||(33865288-33865532)
chr8 (3-249)||(44580621-44580870)
chr8 (8-249)||(14583882-14584122)
chr8 (17-249)||(42218105-42218335)
chr8 (3-249)||(5774094-5774342)
chr8 (34-244)||(257313-257524)
chr8 (34-244)||(658396-658607)
chr8 (34-244)||(844132-844343)
chr8 (3-249)||(38967189-38967436)
chr8 (3-249)||(8797033-8797288)
chr8 (8-249)||(25058088-25058328)
chr8 (75-249)||(29806039-29806214)
chr8 (3-245)||(44747098-44747340)
chr8 (3-243)||(7682782-7683022)
chr8 (34-249)||(8072904-8073120)
chr8 (18-238)||(21652241-21652466)
chr8 (3-244)||(40855846-40856089)
chr8 (3-249)||(7683308-7683554)
chr8 (5-243)||(8566255-8566491)
chr8 (4-249)||(26980722-26980967)
chr8 (5-244)||(42985262-42985501)
chr8 (1-249)||(32474975-32475218)
chr8 (3-249)||(44888726-44888973)
chr8 (44-249)||(16448538-16448744)
chr8 (3-249)||(33980510-33980754)
chr8 (103-249)||(40529352-40529497)
chr8 (5-246)||(44021055-44021297)
chr8 (34-246)||(45283565-45283778)
chr8 (34-248)||(5268016-5268230)
chr8 (3-249)||(38780886-38781132)
chr8 (2-249)||(7758672-7758900)
chr8 (3-246)||(4778640-4778882)
chr8 (3-229)||(12825013-12825239)
chr8 (4-249)||(18641122-18641368)
chr8 (34-247)||(21136903-21137117)
chr8 (25-249)||(35143288-35143511)
chr8 (54-245)||(44748258-44748450)
chr8 (7-185)||(44056818-44056994)
chr8 (3-229)||(45260289-45260515)
chr8 (3-229)||(31886737-31886962)
chr8 (3-249)||(11293699-11293945)
chr8 (17-177)||(28740973-28741133)
chr8 (3-177)||(29738104-29738276)
chr8 (65-244)||(39463036-39463215)
chr8 (44-249)||(41615952-41616162)
chr8 (3-249)||(36786514-36786759)
chr8 (5-249)||(17336464-17336707)
chr8 (94-249)||(5951164-5951318)
chr8 (3-249)||(23995623-23995868)
chr8 (3-249)||(44165214-44165460)
chr8 (7-245)||(23497778-23498018)
chr8 (1-143)||(42885321-42885465)
chr8 (42-195)||(35202938-35203089)
chr8 (4-249)||(35179646-35179891)
chr8 (65-249)||(5109927-5110111)
chr8 (1-105)||(40530336-40530440)
chr8 (158-249)||(42885100-42885191)
chr8 (3-248)||(23894653-23894896)
chr8 (3-249)||(36941315-36941560)
chr8 (34-242)||(11113829-11114043)
chr8 (88-249)||(26625839-26626000)
chr8 (3-249)||(43292743-43292987)
chr8 (43-227)||(25056682-25056868)
chr8 (163-249)||(28965550-28965636)
chr8 (27-231)||(31089699-31089894)
chr8 (7-183)||(110182-110361)
chr8 (65-248)||(12802657-12802838)
chr8 (3-166)||(30140211-30140375)
chr8 (7-245)||(24260702-24260941)
chr8 (4-111)||(28965651-28965758)
chr8 (88-249)||(5244457-5244618)
chr8 (121-249)||(44580916-44581044)
chr8 (11-111)||(14625712-14625812)
chr8 (149-249)||(17851339-17851439)
chr8 (69-245)||(30512817-30512991)
chr8 (12-242)||(39970021-39970252)
chr8 (93-249)||(41898330-41898487)
chr8 (129-229)||(25635979-25636079)
chr8 (66-249)||(26502525-26502709)
chr8 (91-230)||(42220522-42220653)
chr8 (86-229)||(39970553-39970698)
chr8 (148-249)||(19176182-19176283)
chr8 (40-152)||(39112543-39112655)
chr8 (149-246)||(9615975-9616071)
chr8 (34-199)||(35203098-35203254)
chr8 (3-183)||(23424921-23425101)
chr8 (27-111)||(44580522-44580606)
chr8 (7-86)||(25635897-25635975)
chr8 (88-183)||(36409708-36409803)
chr8 (93-183)||(45145356-45145446)
chr8 (8-228)||(2767701-2767918)
chr8 (3-111)||(16894065-16894173)
chr8 (7-105)||(37296185-37296276)
chr8 (6-136)||(19700757-19700887)
chr8 (88-249)||(13141506-13141664)
chr8 (3-137)||(19176849-19176982)
chr8 (155-249)||(37023180-37023274)
chr8 (3-84)||(17851254-17851335)
chr8 (149-245)||(24355214-24355310)
chr8 (45-137)||(42747366-42747459)
chr8 (3-245)||(31618997-31619235)
chr8 (4-146)||(41388490-41388634)
chr8 (7-97)||(5952482-5952572)
chr8 (123-249)||(13401786-13401911)
chr8 (45-98)||(24358906-24358958)
chr8 (195-248)||(36408462-36408515)
chr8 (189-244)||(13335827-13335882)
chr8 (3-181)||(29073738-29073912)
chr8 (152-229)||(2786183-2786260)
chr8 (110-179)||(28929349-28929418)
chr8 (7-56)||(45145767-45145816)
chr8 (81-120)||(5449607-5449646)
chr8 (45-108)||(13401722-13401784)
chr8 (74-108)||(19715658-19715692)
chr8 (7-162)||(31846246-31846394)
chr8 (1-31)||(40529310-40529340)
chr8 (69-136)||(42486219-42486288)
chr8 (1-31)||(44502623-44502653)
chr8 (200-249)||(43986654-43986703)
chr8 (46-137)||(6988966-6989058)
chr8 (1-29)||(12255099-12255127)
chr8 (1-29)||(12260642-12260670)
chr8 (3-31)||(14699457-14699485)
chr8 (139-224)||(39112875-39112961)
chr8 (8-56)||(39463508-39463556)
chr8 (3-31)||(41898500-41898528)
[»] chr7 (188 HSPs)
chr7 (1-249)||(21295197-21295445)
chr7 (1-249)||(29176995-29177243)
chr7 (1-247)||(28060766-28061011)
chr7 (3-249)||(9036674-9036920)
chr7 (3-249)||(38858344-38858590)
chr7 (1-249)||(38428194-38428441)
chr7 (4-249)||(41002900-41003145)
chr7 (7-249)||(34012267-34012509)
chr7 (1-249)||(1275475-1275724)
chr7 (1-249)||(25247433-25247682)
chr7 (1-249)||(39871355-39871604)
chr7 (1-249)||(8290949-8291198)
chr7 (1-249)||(31458043-31458292)
chr7 (1-249)||(34978819-34979068)
chr7 (1-249)||(41025838-41026087)
chr7 (5-249)||(8612321-8612566)
chr7 (1-249)||(17491561-17491810)
chr7 (1-249)||(17561404-17561653)
chr7 (17-249)||(32872133-32872366)
chr7 (1-249)||(33858609-33858857)
chr7 (1-249)||(44547472-44547721)
chr7 (1-248)||(36697873-36698121)
chr7 (3-249)||(40300276-40300523)
chr7 (3-249)||(9299143-9299393)
chr7 (3-249)||(9303692-9303942)
chr7 (1-249)||(29642886-29643134)
chr7 (1-245)||(48521076-48521321)
chr7 (1-248)||(7703563-7703810)
chr7 (1-249)||(31200104-31200355)
chr7 (3-249)||(27529274-27529519)
chr7 (1-249)||(6387371-6387620)
chr7 (3-244)||(12930371-12930611)
chr7 (1-249)||(26255141-26255390)
chr7 (1-249)||(32814479-32814728)
chr7 (17-249)||(36646395-36646628)
chr7 (1-249)||(41252104-41252352)
chr7 (1-248)||(2006522-2006770)
chr7 (27-249)||(29064225-29064448)
chr7 (3-249)||(29285781-29286028)
chr7 (3-249)||(44719173-44719415)
chr7 (5-249)||(35569400-35569643)
chr7 (1-246)||(23320700-23320950)
chr7 (1-249)||(39197764-39198013)
chr7 (3-249)||(34895903-34896150)
chr7 (17-249)||(7449315-7449547)
chr7 (17-249)||(31581724-31581957)
chr7 (17-248)||(36711057-36711288)
chr7 (27-249)||(47534672-47534894)
chr7 (3-249)||(5524742-5524989)
chr7 (1-249)||(32759604-32759851)
chr7 (5-249)||(43279751-43279993)
chr7 (1-249)||(45907291-45907538)
chr7 (2-249)||(42298171-42298417)
chr7 (1-249)||(18112906-18113158)
chr7 (7-249)||(7400174-7400420)
chr7 (5-249)||(28016292-28016537)
chr7 (3-249)||(2289760-2290007)
chr7 (3-249)||(47323273-47323520)
chr7 (8-245)||(10475751-10475989)
chr7 (3-249)||(11647580-11647825)
chr7 (1-214)||(17326952-17327166)
chr7 (1-154)||(20074988-20075141)
chr7 (3-249)||(9140277-9140524)
chr7 (3-249)||(26736526-26736779)
chr7 (3-249)||(1574765-1575010)
chr7 (3-249)||(6799290-6799535)
chr7 (34-246)||(41803245-41803460)
chr7 (3-249)||(7607378-7607625)
chr7 (3-249)||(30895606-30895853)
chr7 (3-245)||(41444252-41444495)
chr7 (3-249)||(43081298-43081544)
chr7 (17-249)||(18751746-18751975)
chr7 (3-249)||(4856852-4857102)
chr7 (34-249)||(9998333-9998549)
chr7 (34-249)||(25950876-25951094)
chr7 (3-244)||(21119609-21119851)
chr7 (5-246)||(19920612-19920851)
chr7 (5-249)||(21870082-21870327)
chr7 (3-246)||(23919781-23920023)
chr7 (3-244)||(27881832-27882074)
chr7 (34-249)||(787979-788195)
chr7 (6-249)||(37913121-37913365)
chr7 (34-249)||(43093183-43093399)
chr7 (3-249)||(46266120-46266365)
chr7 (42-249)||(48008980-48009190)
chr7 (8-249)||(7400471-7400712)
chr7 (4-245)||(23364064-23364306)
chr7 (3-249)||(29629763-29630007)
chr7 (4-217)||(12130126-12130338)
chr7 (3-231)||(26842828-26843064)
chr7 (3-249)||(27813546-27813792)
chr7 (42-249)||(38361197-38361402)
chr7 (34-249)||(47657441-47657655)
chr7 (11-248)||(38736499-38736735)
chr7 (3-218)||(23109144-23109360)
chr7 (7-239)||(10538879-10539116)
chr7 (3-249)||(49044865-49045111)
chr7 (3-249)||(19619080-19619326)
chr7 (17-249)||(22991504-22991735)
chr7 (4-246)||(30737757-30738001)
chr7 (59-249)||(43440910-43441101)
chr7 (34-249)||(45777994-45778213)
chr7 (127-249)||(17317487-17317609)
chr7 (6-199)||(20950787-20950978)
chr7 (1-249)||(44510087-44510334)
chr7 (34-249)||(3024630-3024843)
chr7 (3-249)||(9682648-9682893)
chr7 (3-245)||(42887825-42888067)
chr7 (3-238)||(17878121-17878346)
chr7 (3-249)||(19845412-19845660)
chr7 (34-229)||(44780168-44780362)
chr7 (5-243)||(31802869-31803105)
chr7 (7-201)||(16957729-16957923)
chr7 (34-209)||(24299979-24300155)
chr7 (117-249)||(26299361-26299493)
chr7 (126-249)||(10071242-10071365)
chr7 (3-249)||(30534751-30534995)
chr7 (148-248)||(31769222-31769322)
chr7 (3-249)||(32699451-32699695)
chr7 (36-225)||(49110804-49110994)
chr7 (88-249)||(19292884-19293045)
chr7 (27-248)||(24504731-24504952)
chr7 (88-249)||(32964225-32964386)
chr7 (113-249)||(9233431-9233567)
chr7 (90-244)||(46414835-46414991)
chr7 (10-249)||(23801935-23802173)
chr7 (49-244)||(41787302-41787495)
chr7 (148-248)||(12616273-12616373)
chr7 (3-249)||(35888358-35888602)
chr7 (3-245)||(40120999-40121245)
chr7 (88-229)||(3796060-3796202)
chr7 (42-244)||(19497292-19497498)
chr7 (3-172)||(21135371-21135540)
chr7 (7-179)||(21870840-21871013)
chr7 (86-246)||(3881369-3881529)
chr7 (93-248)||(45722054-45722209)
chr7 (54-223)||(2470871-2471041)
chr7 (3-249)||(8781957-8782204)
chr7 (89-249)||(43934637-43934795)
chr7 (27-246)||(2345312-2345531)
chr7 (62-245)||(24210955-24211135)
chr7 (3-133)||(33381363-33381494)
chr7 (26-248)||(3775870-3776098)
chr7 (88-249)||(37915189-37915349)
chr7 (3-166)||(27325913-27326076)
chr7 (34-162)||(32118000-32118127)
chr7 (66-230)||(46415103-46415266)
chr7 (3-241)||(46148485-46148723)
chr7 (17-109)||(10071825-10071917)
chr7 (178-249)||(33381494-33381565)
chr7 (5-248)||(12631560-12631807)
chr7 (88-214)||(33683014-33683140)
chr7 (3-249)||(33682760-33683003)
chr7 (197-249)||(20074935-20074987)
chr7 (48-120)||(34900769-34900841)
chr7 (65-168)||(47648985-47649088)
chr7 (3-232)||(34693463-34693693)
chr7 (8-168)||(21587534-21587695)
chr7 (17-155)||(43008251-43008387)
chr7 (148-245)||(43008144-43008240)
chr7 (77-245)||(20182099-20182265)
chr7 (161-249)||(32643658-32643746)
chr7 (65-131)||(6910622-6910688)
chr7 (3-184)||(28017054-28017235)
chr7 (7-120)||(30866122-30866235)
chr7 (121-217)||(3478814-3478910)
chr7 (204-249)||(12129723-12129768)
chr7 (34-111)||(12616186-12616263)
chr7 (34-245)||(18312239-18312449)
chr7 (143-249)||(4700528-4700635)
chr7 (195-244)||(23256804-23256853)
chr7 (120-205)||(32811293-32811378)
chr7 (74-183)||(33342249-33342357)
chr7 (3-115)||(32643549-32643661)
chr7 (194-249)||(24282077-24282132)
chr7 (1-31)||(29177256-29177286)
chr7 (62-104)||(34037502-34037544)
chr7 (156-245)||(30866416-30866505)
chr7 (69-137)||(31137214-31137283)
chr7 (3-31)||(7400134-7400162)
chr7 (3-31)||(17317446-17317474)
chr7 (3-31)||(19292844-19292872)
chr7 (3-31)||(19845673-19845701)
chr7 (3-31)||(21119562-21119590)
chr7 (205-249)||(21135323-21135367)
chr7 (3-31)||(22991748-22991776)
chr7 (3-31)||(27529234-27529262)
chr7 (3-31)||(42888084-42888112)
[»] chr4 (241 HSPs)
chr4 (1-249)||(55632002-55632250)
chr4 (1-249)||(4035871-4036119)
chr4 (1-249)||(29014067-29014315)
chr4 (1-245)||(53629842-53630086)
chr4 (1-246)||(4549632-4549877)
chr4 (1-246)||(39144453-39144698)
chr4 (8-249)||(52870690-52870931)
chr4 (1-249)||(20747216-20747464)
chr4 (1-249)||(5743402-5743650)
chr4 (1-249)||(25708423-25708670)
chr4 (1-249)||(2615686-2615936)
chr4 (4-249)||(1859190-1859434)
chr4 (3-249)||(4416011-4416257)
chr4 (1-249)||(20391180-20391429)
chr4 (1-249)||(53276928-53277177)
chr4 (3-249)||(35675664-35675911)
chr4 (5-249)||(32032737-32032982)
chr4 (5-242)||(30771575-30771813)
chr4 (1-249)||(5375300-5375548)
chr4 (1-249)||(9327982-9328231)
chr4 (1-249)||(20285763-20286012)
chr4 (1-249)||(34272961-34273210)
chr4 (1-249)||(36391900-36392149)
chr4 (1-249)||(43387735-43387984)
chr4 (1-249)||(47806906-47807155)
chr4 (1-246)||(50533932-50534178)
chr4 (1-249)||(6753571-6753820)
chr4 (1-249)||(10588120-10588369)
chr4 (7-245)||(26866610-26866850)
chr4 (4-244)||(29427540-29427781)
chr4 (1-249)||(33413564-33413813)
chr4 (6-249)||(49228465-49228709)
chr4 (1-249)||(54676593-54676843)
chr4 (1-249)||(24754124-24754373)
chr4 (17-249)||(37352589-37352822)
chr4 (1-249)||(44294835-44295084)
chr4 (1-249)||(47298980-47299229)
chr4 (1-249)||(51536213-51536462)
chr4 (3-246)||(6083333-6083576)
chr4 (3-249)||(50424598-50424845)
chr4 (1-249)||(1028564-1028813)
chr4 (45-246)||(4094759-4094960)
chr4 (1-249)||(15241525-15241774)
chr4 (1-249)||(47228470-47228719)
chr4 (1-249)||(52978028-52978277)
chr4 (7-249)||(30049832-30050075)
chr4 (1-248)||(422671-422918)
chr4 (3-231)||(52966159-52966387)
chr4 (3-249)||(625713-625958)
chr4 (7-249)||(34948401-34948642)
chr4 (17-248)||(4455108-4455341)
chr4 (1-249)||(17609764-17610012)
chr4 (5-249)||(30745546-30745790)
chr4 (17-229)||(37364583-37364796)
chr4 (1-249)||(45742548-45742797)
chr4 (11-249)||(36129842-36130081)
chr4 (3-249)||(36990960-36991207)
chr4 (3-249)||(55562870-55563117)
chr4 (44-249)||(37357488-37357694)
chr4 (3-249)||(17339124-17339371)
chr4 (3-249)||(39184319-39184563)
chr4 (1-249)||(8343953-8344200)
chr4 (4-249)||(13620601-13620845)
chr4 (3-249)||(31937122-31937369)
chr4 (3-249)||(37776480-37776725)
chr4 (60-249)||(50352110-50352300)
chr4 (5-249)||(375470-375715)
chr4 (17-249)||(17678277-17678510)
chr4 (4-249)||(48030359-48030603)
chr4 (13-241)||(52850208-52850437)
chr4 (1-249)||(26625746-26625993)
chr4 (34-249)||(37173879-37174095)
chr4 (3-246)||(38027181-38027425)
chr4 (1-249)||(45096909-45097156)
chr4 (5-249)||(29519911-29520155)
chr4 (5-249)||(20454930-20455173)
chr4 (3-249)||(20767960-20768207)
chr4 (3-244)||(34963435-34963676)
chr4 (3-249)||(36900856-36901100)
chr4 (3-249)||(47683135-47683381)
chr4 (4-245)||(56432568-56432811)
chr4 (3-249)||(14793769-14794014)
chr4 (3-229)||(20180662-20180888)
chr4 (3-247)||(25123988-25124234)
chr4 (3-249)||(25474862-25475107)
chr4 (3-248)||(29460449-29460695)
chr4 (21-249)||(19281853-19282072)
chr4 (34-249)||(37842221-37842435)
chr4 (3-249)||(6462435-6462681)
chr4 (3-249)||(39114633-39114880)
chr4 (3-246)||(46950041-46950283)
chr4 (3-249)||(55014711-55014957)
chr4 (9-249)||(51717849-51718089)
chr4 (13-249)||(18706398-18706633)
chr4 (3-218)||(20761569-20761785)
chr4 (3-249)||(28298114-28298362)
chr4 (5-247)||(49373441-49373682)
chr4 (3-249)||(20788977-20789224)
chr4 (3-249)||(33988541-33988783)
chr4 (3-248)||(39670771-39671018)
chr4 (7-249)||(48241398-48241641)
chr4 (3-249)||(50450969-50451216)
chr4 (3-245)||(50602842-50603084)
chr4 (43-249)||(51335839-51336046)
chr4 (3-204)||(30523769-30523969)
chr4 (3-249)||(45921477-45921721)
chr4 (3-249)||(51329526-51329757)
chr4 (3-249)||(13389656-13389900)
chr4 (3-249)||(23777548-23777792)
chr4 (34-249)||(47311336-47311551)
chr4 (3-240)||(1173616-1173855)
chr4 (59-249)||(9808398-9808589)
chr4 (13-224)||(18882422-18882636)
chr4 (3-245)||(37518055-37518296)
chr4 (3-245)||(37522271-37522512)
chr4 (3-244)||(40809607-40809849)
chr4 (88-249)||(41191457-41191619)
chr4 (9-245)||(41620564-41620799)
chr4 (3-194)||(54535926-54536118)
chr4 (5-246)||(37639634-37639875)
chr4 (45-249)||(39184037-39184240)
chr4 (6-203)||(45850471-45850669)
chr4 (4-249)||(49793137-49793381)
chr4 (7-244)||(55876431-55876667)
chr4 (9-249)||(18003989-18004228)
chr4 (34-249)||(38899820-38900034)
chr4 (3-249)||(54877760-54878003)
chr4 (7-249)||(16545732-16545974)
chr4 (3-249)||(28501132-28501377)
chr4 (7-247)||(6656494-6656733)
chr4 (1-171)||(33501671-33501842)
chr4 (3-249)||(13549026-13549271)
chr4 (77-245)||(38405643-38405806)
chr4 (5-246)||(53564103-53564344)
chr4 (3-249)||(54623847-54624093)
chr4 (3-244)||(15500356-15500598)
chr4 (3-249)||(18872763-18873009)
chr4 (7-244)||(49329541-49329775)
chr4 (43-218)||(18018735-18018911)
chr4 (3-246)||(32898983-32899207)
chr4 (3-169)||(41191280-41191447)
chr4 (3-249)||(23390093-23390339)
chr4 (127-249)||(49490036-49490158)
chr4 (96-249)||(20286096-20286249)
chr4 (17-249)||(36211304-36211536)
chr4 (90-245)||(48149017-48149173)
chr4 (13-249)||(30868554-30868791)
chr4 (25-247)||(41333817-41334039)
chr4 (5-249)||(13498233-13498477)
chr4 (34-249)||(28495430-28495646)
chr4 (3-249)||(6629221-6629464)
chr4 (66-249)||(48801427-48801610)
chr4 (17-183)||(3168194-3168358)
chr4 (27-249)||(29508851-29509073)
chr4 (88-249)||(52181016-52181175)
chr4 (3-243)||(26889646-26889884)
chr4 (3-231)||(47109565-47109793)
chr4 (148-249)||(42528481-42528582)
chr4 (59-244)||(31071749-31071932)
chr4 (65-249)||(35909687-35909872)
chr4 (110-241)||(5734530-5734661)
chr4 (3-178)||(23623753-23623928)
chr4 (65-244)||(32684648-32684825)
chr4 (65-168)||(55968949-55969053)
chr4 (166-249)||(468413-468496)
chr4 (3-249)||(17467937-17468180)
chr4 (4-249)||(20783234-20783477)
chr4 (1-137)||(6807504-6807641)
chr4 (9-136)||(5840046-5840171)
chr4 (3-111)||(49489885-49489993)
chr4 (46-148)||(36031177-36031280)
chr4 (3-124)||(5734392-5734514)
chr4 (3-238)||(21265275-21265511)
chr4 (148-249)||(36040851-36040953)
chr4 (65-246)||(30010659-30010838)
chr4 (3-246)||(37779960-37780201)
chr4 (121-213)||(53906099-53906191)
chr4 (75-245)||(8418162-8418333)
chr4 (65-168)||(42598519-42598621)
chr4 (175-249)||(23621504-23621578)
chr4 (44-181)||(46480805-46480943)
chr4 (97-224)||(51787603-51787732)
chr4 (3-111)||(39879922-39880030)
chr4 (7-121)||(4143561-4143676)
chr4 (5-108)||(55777081-55777183)
chr4 (65-222)||(3085518-3085672)
chr4 (148-249)||(39797480-39797581)
chr4 (173-249)||(46481303-46481380)
chr4 (81-249)||(6595556-6595724)
chr4 (65-244)||(13138777-13138956)
chr4 (3-111)||(53910317-53910425)
chr4 (127-249)||(18879545-18879665)
chr4 (88-207)||(19596271-19596390)
chr4 (5-108)||(55841261-55841363)
chr4 (68-181)||(706659-706773)
chr4 (68-181)||(729844-729958)
chr4 (164-249)||(11469142-11469227)
chr4 (164-249)||(11522234-11522319)
chr4 (3-82)||(38319726-38319805)
chr4 (155-249)||(24073023-24073117)
chr4 (88-214)||(49613990-49614115)
chr4 (1-67)||(50352484-50352550)
chr4 (46-176)||(2405965-2406093)
chr4 (3-123)||(24072227-24072347)
chr4 (5-136)||(50621486-50621618)
chr4 (3-213)||(7776689-7776902)
chr4 (69-245)||(10497416-10497593)
chr4 (7-67)||(55969070-55969130)
chr4 (202-249)||(2738832-2738879)
chr4 (189-244)||(38319656-38319711)
chr4 (44-130)||(27009626-27009715)
chr4 (155-244)||(38613458-38613547)
chr4 (75-246)||(26169770-26169941)
chr4 (69-184)||(26186510-26186626)
chr4 (148-240)||(50622483-50622575)
chr4 (170-240)||(55967928-55967998)
chr4 (65-122)||(2507662-2507719)
chr4 (20-69)||(42596088-42596137)
chr4 (157-248)||(7205194-7205284)
chr4 (164-223)||(7326074-7326133)
chr4 (194-249)||(15496177-15496232)
chr4 (74-245)||(22130323-22130498)
chr4 (1-31)||(6753528-6753558)
chr4 (1-31)||(17610024-17610054)
chr4 (1-31)||(24754081-24754111)
chr4 (65-111)||(54158710-54158756)
chr4 (3-104)||(5733832-5733932)
chr4 (204-249)||(7698378-7698423)
chr4 (1-30)||(39144407-39144436)
chr4 (3-31)||(3085450-3085478)
chr4 (3-31)||(13620858-13620886)
chr4 (194-246)||(19839887-19839939)
chr4 (3-31)||(20286025-20286053)
chr4 (17-77)||(20286251-20286311)
chr4 (3-31)||(26889903-26889931)
chr4 (3-31)||(28298375-28298403)
chr4 (3-31)||(36901114-36901142)
chr4 (3-31)||(39114891-39114919)
chr4 (3-31)||(47683094-47683122)
chr4 (36-96)||(51788017-51788077)
chr4 (3-31)||(54623806-54623834)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (1-249)||(65381-65629)
[»] chr6 (121 HSPs)
chr6 (6-249)||(8743233-8743476)
chr6 (1-249)||(9388532-9388782)
chr6 (1-248)||(23397882-23398129)
chr6 (1-249)||(1779787-1780035)
chr6 (1-249)||(34741512-34741760)
chr6 (5-248)||(344911-345158)
chr6 (1-246)||(6417924-6418165)
chr6 (5-244)||(15287190-15287428)
chr6 (1-249)||(34301574-34301823)
chr6 (1-249)||(11847617-11847866)
chr6 (1-248)||(25197199-25197447)
chr6 (3-249)||(6147429-6147676)
chr6 (1-246)||(25024248-25024494)
chr6 (3-249)||(20449925-20450172)
chr6 (1-249)||(287156-287405)
chr6 (4-249)||(345492-345737)
chr6 (1-249)||(30248693-30248942)
chr6 (1-245)||(33487881-33488126)
chr6 (7-249)||(34915291-34915534)
chr6 (3-249)||(31149992-31150237)
chr6 (1-249)||(12105806-12106055)
chr6 (1-249)||(13647871-13648120)
chr6 (8-245)||(18105921-18106158)
chr6 (3-249)||(9341884-9342131)
chr6 (3-249)||(31487115-31487362)
chr6 (3-249)||(13866641-13866886)
chr6 (17-244)||(8175712-8175934)
chr6 (1-249)||(10195736-10195985)
chr6 (26-244)||(3177232-3177448)
chr6 (3-249)||(15498675-15498920)
chr6 (7-249)||(2090705-2090948)
chr6 (3-249)||(402367-402612)
chr6 (3-249)||(8670181-8670426)
chr6 (1-246)||(17175207-17175453)
chr6 (1-249)||(1729845-1730093)
chr6 (17-249)||(22852090-22852322)
chr6 (1-249)||(925677-925924)
chr6 (20-246)||(5457461-5457688)
chr6 (3-249)||(25045387-25045634)
chr6 (1-249)||(230849-231097)
chr6 (3-249)||(7772222-7772469)
chr6 (2-249)||(19097546-19097792)
chr6 (5-244)||(15966907-15967148)
chr6 (1-249)||(1147011-1147258)
chr6 (1-249)||(12143825-12144072)
chr6 (8-249)||(19418873-19419115)
chr6 (3-247)||(16122302-16122546)
chr6 (3-249)||(17227272-17227519)
chr6 (3-249)||(16272712-16272957)
chr6 (3-249)||(31091491-31091736)
chr6 (1-249)||(34126187-34126434)
chr6 (3-245)||(13010864-13011107)
chr6 (3-245)||(23604512-23604755)
chr6 (88-249)||(11656174-11656337)
chr6 (3-245)||(15355300-15355541)
chr6 (17-249)||(15126510-15126742)
chr6 (34-246)||(23578201-23578414)
chr6 (3-248)||(32615035-32615279)
chr6 (3-249)||(6418397-6418643)
chr6 (4-244)||(33773628-33773871)
chr6 (25-249)||(390369-390592)
chr6 (3-207)||(20373123-20373326)
chr6 (59-249)||(5576180-5576367)
chr6 (7-249)||(13690480-13690723)
chr6 (3-249)||(4175288-4175534)
chr6 (88-249)||(9660506-9660668)
chr6 (34-245)||(31711625-31711835)
chr6 (3-249)||(22998790-22999036)
chr6 (3-249)||(23789368-23789614)
chr6 (1-112)||(29036258-29036369)
chr6 (25-229)||(235825-236027)
chr6 (1-249)||(9038688-9038934)
chr6 (35-245)||(13901689-13901899)
chr6 (3-249)||(8217466-8217710)
chr6 (6-249)||(13321076-13321317)
chr6 (65-244)||(27581437-27581616)
chr6 (27-249)||(11161897-11162121)
chr6 (75-215)||(17952175-17952316)
chr6 (162-249)||(29036171-29036258)
chr6 (88-249)||(22710312-22710471)
chr6 (3-249)||(28980600-28980847)
chr6 (27-131)||(5186264-5186368)
chr6 (74-240)||(9299245-9299411)
chr6 (81-248)||(14629950-14630115)
chr6 (88-249)||(11200640-11200801)
chr6 (65-249)||(28236010-28236192)
chr6 (66-241)||(4823026-4823198)
chr6 (169-249)||(11104618-11104698)
chr6 (4-84)||(11655814-11655894)
chr6 (34-241)||(23282580-23282789)
chr6 (3-249)||(33012410-33012656)
chr6 (88-249)||(23923538-23923698)
chr6 (116-249)||(29293657-29293790)
chr6 (87-239)||(493509-493661)
chr6 (65-249)||(27310480-27310662)
chr6 (69-243)||(8646015-8646190)
chr6 (17-160)||(26211032-26211178)
chr6 (3-89)||(9660138-9660224)
chr6 (34-249)||(13446001-13446213)
chr6 (121-249)||(11840417-11840544)
chr6 (3-121)||(17992163-17992281)
chr6 (45-137)||(2746330-2746423)
chr6 (95-183)||(8595644-8595732)
chr6 (3-136)||(11104710-11104846)
chr6 (95-241)||(7847150-7847292)
chr6 (148-244)||(8637165-8637261)
chr6 (3-75)||(13208842-13208914)
chr6 (67-134)||(2364478-2364545)
chr6 (34-92)||(225920-225977)
chr6 (69-171)||(6840082-6840183)
chr6 (65-124)||(8345401-8345460)
chr6 (3-72)||(17950490-17950556)
chr6 (77-216)||(32982442-32982580)
chr6 (1-31)||(1730105-1730135)
chr6 (195-245)||(2365030-2365080)
chr6 (65-229)||(11211495-11211654)
chr6 (1-31)||(25197155-25197185)
chr6 (69-168)||(2665541-2665641)
chr6 (3-31)||(9341843-9341871)
chr6 (157-229)||(11278463-11278535)
chr6 (196-244)||(13209989-13210037)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (1-249)||(12110-12358)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (12-249)||(117892-118128)
scaffold0019 (3-31)||(117851-117879)
[»] scaffold0649 (1 HSPs)
scaffold0649 (1-249)||(4040-4289)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (1-249)||(61595-61844)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (1-249)||(31429-31678)
[»] scaffold0368 (1 HSPs)
scaffold0368 (1-249)||(8264-8512)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-249)||(51424-51673)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (3-249)||(6356-6601)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (1-249)||(6882-7131)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (3-249)||(18542-18788)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (17-249)||(258880-259113)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-245)||(24374-24617)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (3-249)||(164260-164505)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (3-249)||(5196-5441)
[»] scaffold0549 (1 HSPs)
scaffold0549 (3-249)||(9929-10174)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (3-249)||(3483-3730)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (1-218)||(9496-9714)
[»] scaffold0308 (2 HSPs)
scaffold0308 (17-249)||(14107-14339)
scaffold0308 (40-249)||(5067-5277)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (5-249)||(19705-19951)
[»] scaffold0907 (1 HSPs)
scaffold0907 (3-248)||(4321-4565)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (1-249)||(3528-3774)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (3-245)||(9171-9413)
scaffold0250 (3-31)||(9430-9458)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (3-224)||(34176-34395)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (3-249)||(45717-45962)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (1-249)||(355045-355292)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (3-249)||(4409-4654)
[»] scaffold0883 (1 HSPs)
scaffold0883 (34-249)||(1766-1982)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (34-249)||(45559-45775)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (3-246)||(48704-48946)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (3-249)||(93831-94078)
scaffold0039 (3-245)||(103808-104049)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (26-246)||(156169-156391)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (6-249)||(4808-5049)
scaffold0443 (186-249)||(4726-4789)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (3-245)||(290-531)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (3-249)||(17510-17756)
[»] scaffold0086 (2 HSPs)
scaffold0086 (34-243)||(32939-33148)
scaffold0086 (66-111)||(22074-22119)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (27-146)||(13094-13213)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (113-249)||(1302-1438)
[»] scaffold0280 (4 HSPs)
scaffold0280 (88-223)||(8410-8545)
scaffold0280 (3-137)||(13308-13443)
scaffold0280 (34-84)||(8082-8132)
scaffold0280 (210-249)||(13447-13486)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (3-249)||(246502-246747)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (123-248)||(9531-9656)
scaffold0311 (3-119)||(9030-9144)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (3-249)||(24265-24500)
[»] scaffold0172 (2 HSPs)
scaffold0172 (34-168)||(18481-18616)
scaffold0172 (175-224)||(18142-18191)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (3-180)||(40611-40789)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (65-249)||(36172-36354)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (3-245)||(11407-11646)
[»] scaffold2116 (1 HSPs)
scaffold2116 (198-249)||(1-52)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (1-55)||(3-57)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (3-125)||(11-133)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (69-224)||(47226-47382)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (43-95)||(17502-17554)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (69-168)||(56051-56151)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (27-134)||(531-640)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (66-184)||(616-733)
scaffold0407 (66-184)||(7080-7197)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (40-171)||(1916-2050)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (40-245)||(5457-5662)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 169)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7951852 - 7951607
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7951852 ctccctccctaattataagatcattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatt 7951753  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7951752 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 7951653  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7951652 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 7951607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 41383915 - 41384157
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41383915 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 41384014  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41384015 attttgtccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 41384114  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384115 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 41384157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 3497547 - 3497791
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3497547 tccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatat 3497646  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3497647 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 3497746  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3497747 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 3497791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9828687 - 9828439
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9828687 tccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 9828588  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9828587 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 9828488  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9828487 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 9828439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 40004152 - 40004400
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40004152 tccctccgtccctaaatataagatccttttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 40004251  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40004252 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaag 40004351  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40004352 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 40004400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16127549 - 16127305
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16127549 tccgtccctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 16127450  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16127449 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaat 16127350  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16127349 aattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 16127305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 186392 - 186149
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  186392 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaatttgtttgtaatcactattgtttttaca 186293  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  186292 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 186193  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  186192 aaataattaatgtagttggaaatgacaaaatggtcttataaaaa 186149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13661153 - 13660907
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13661153 tccctccgtccctaattataagacctttttattaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 13661054  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  13661053 attttatccttaagagagag--ttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatatatgtaaag 13660956  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13660955 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 13660907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32147585 - 32147339
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32147585 tccctccgtctctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagc--atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttttaca 32147488  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32147487 attttatccttaagagtgagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 32147388  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32147387 aaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 32147339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 23286226 - 23286465
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23286226 cctccgttcctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 23286325  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23286326 tttatccttaagagagagagttagtttatattttccatatgcta-------ctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaa 23286418  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23286419 ataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaagggac 23286465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1266244 - 1265995
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1266244 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 1266145  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1266144 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 1266045  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1266044 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 1265995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 17674400 - 17674649
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17674400 tccctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 17674499  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17674500 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 17674599  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17674600 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 17674649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31889188 - 31888939
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31889188 tccctccgttcctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 31889089  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31889088 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 31888989  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31888988 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 31888939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 16152997 - 16153246
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16152997 tccctccgtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 16153096  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16153097 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaa 16153196  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16153197 gaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 16153246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 28041093 - 28041342
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28041093 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattacagttgtttgtaatcactattgtttttaca 28041192  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28041193 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 28041292  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28041293 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 28041342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 17592544 - 17592771
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||  ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17592544 tccctccgtttctaattataggacacttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 17592643  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17592644 attttatctttaagagagagaattagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaag 17592743  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592744 aaataattaatgtagttggaaataacaa 17592771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 15190557 - 15190806
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  15190557 tccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttataatcactattgtttttaca 15190656  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    |||||||| || |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15190657 attttatcatttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 15190756  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15190757 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 15190806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22527987 - 22527738
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22527987 tccctccgtccctatatataagacctttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 22527888  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| || | |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22527887 attttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 22527788  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22527787 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 22527738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34662499 - 34662250
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34662499 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaaataagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 34662400  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34662399 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaa 34662300  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34662299 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 34662250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40738702 - 40738461
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||  |||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40738702 cctccgtctttaattataggatatttttgctaaaattacgggaattaaaaaagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 40738603  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40738602 tttatccttatgagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctcattgaagaaaaagatgtataataaatagaggtatgtatgtaaagaa 40738503  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40738502 ataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaa 40738461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 6672970 - 6673219
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6672970 tccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 6673069  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6673070 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 6673169  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6673170 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 6673219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7940743 - 7940498
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  7940743 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 7940644  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7940643 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaa 7940545  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940544 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 7940498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 3686496 - 3686745
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3686496 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 3686595  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| | |  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3686596 attttatcctttaagaaataaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 3686695  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3686696 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaatggac 3686745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 10734263 - 10734512
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10734263 tccctccgtctctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaaacactattgtttttaca 10734362  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10734363 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 10734462  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10734463 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 10734512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 13862737 - 13862986
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13862737 tccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 13862836  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13862837 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgacagaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 13862936  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13862937 gaattaattaatgtagttggaaataacaaaggagttttataaaaagggac 13862986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 22581480 - 22581726
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  22581480 cctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaataaagtggatatttatattacagttgtttgtaagtactattgtttttacagt 22581579  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22581580 tttatccttaagagagagagttcgtttatgttttccatatgttatttattgctgattcaaaaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaa 22581679  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  22581680 ataattaatgtagttgaaaatagcaaagaaatcttataaaaagggac 22581726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 25600802 - 25601048
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25600802 tccctctgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 25600901  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||  || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25600902 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 25601001  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25601002 gaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaagg 25601048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41641394 - 41641141
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41641394 tccctccgtccctgtatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttaca 41641295  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41641294 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 41641195  T
Q  200 gaaa----taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41641194 gaaataattaattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 41641141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 42561093 - 42561340
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||   |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42561093 tccctccgtccctatatataac--ccttttgccaaaattacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 42561190  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42561191 attttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 42561290  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42561291 gaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 42561340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 15521684 - 15521933
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15521684 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 15521783  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15521784 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaggaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 15521883  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15521884 taaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaaaggac 15521933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 26605374 - 26605614
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26605374 tataagacccttttactaaaattacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagag 26605473  T
Q  117 --------agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataatt 208  Q
            ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26605474 agagagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattcaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataatt 26605573  T
Q  209 aatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26605574 aatgtagttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 26605614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33639583 - 33639337
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| ||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33639583 cctccatccctatatacaagatccttttgccaaaatcacgggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaat 33639484  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||    
T  33639483 tttatccttaagagataaagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtagaaaa 33639384  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||| |||||    
T  33639383 ataattaatgtagttgaaaatagtaaatgagtcttataaaacgggac 33639337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14789829 - 14789604
Alignment:
Q  19 taagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagag 118  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14789829 taagacccttctgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatcattatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagag 14789730  T
Q  119 agagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 218  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14789729 agggttaatttatgttttctatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtaattg 14789630  T
Q  219 gaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
     ||||| || || |||||||||||||    
T  14789629 aaaatagcagagaggtcttataaaaa 14789604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23285328 - 23285081
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23285328 tccgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 23285229  T
Q  105 tatccttaa---gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| |   ||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23285228 tatcctttaagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 23285129  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285128 aataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 23285081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Original strand, 4984884 - 4985107
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagtta 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||    
T  4984884 ttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattatagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggtta 4984983  T
Q  126 gtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 225  Q
    |||||||||||| | ||| || |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4984984 gtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatctataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 4985083  T
Q  226 caaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  4985084 caaaagggtcttataaaaagggac 4985107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20186794 - 20186547
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  20186794 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 20186695  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  20186694 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaataggggtatgtatgtaaaga 20186595  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  20186594 aataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggac 20186547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 31158186 - 31158415
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    |||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31158186 tataagactcttttgttaaaattacgggaattaagaaagtg-atatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttataattttatccttaagag 31158284  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31158285 agag--ttggtttatgttttccatatgctatttattgcttattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtaat 31158382  T
Q  217 tggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    || |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  31158383 tgaaaatagaaaagtggtcttataaaaagggac 31158415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14913942 - 14913695
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  14913942 tccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 14913843  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||| || |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14913842 attttatccttta-agagatagatgatttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaag 14913744  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14913743 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 14913695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16441224 - 16440977
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  16441224 tccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 16441125  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16441124 attttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaaaatgtataattaatagaggcatgtatgtaaag 16441026  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16441025 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaagagggac 16440977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 14570649 - 14570879
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14570649 tataagaccattttgttaaaatcacgggaattaagaaggtggatatttgtattaaagttgtttataatcacaattattttaacaattttatccttaagag 14570748  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14570749 --agagttagtttatgttttccatatgctattcattgttgattgaagaaaaatatgtataataagtaggggcatatatgtaaagaaataattaatgtaat 14570846  T
Q  217 tggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14570847 tgaaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 14570879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14649472 - 14649235
Alignment:
Q  9 tccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc 108  Q
    |||||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  14649472 tccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatc 14649373  T
Q  109 ctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataat 207  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14649372 ctttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 14649273  T
Q  208 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14649272 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 14649235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32478417 - 32478184
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  32478417 tataagaatcttttaccaaaatcacgggaattaatataatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaa 32478318  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32478317 aagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 32478218  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32478217 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 32478184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9020988 - 9020741
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  9020988 tccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 9020889  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9020888 attttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaag 9020790  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9020789 aaataattaatgtagatggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggac 9020741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 31507365 - 31507605
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31507365 cctccatctctaattataaggtccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatcactattgtttttacaat 31507464  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31507465 tttatcctttaatagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 31507564  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31507565 aataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaa 31507605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 4752962 - 4753209
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4752962 cctccgtccctatatataagacccttttatcaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 4753061  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  4753062 tttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaa 4753161  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||||||    
T  4753162 aataattaatgtagttgaaattaacaaaaatgtcttataaaaagggac 4753209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40643387 - 40643140
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  40643387 cctccgtccctaattatcagggccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 40643288  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40643287 tttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 40643188  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  40643187 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaaggac 40643140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9065199 - 9064953
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9065199 ctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 9065100  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9065099 ttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaa 9065000  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9064999 ataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 9064953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Original strand, 9268037 - 9268283
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  9268037 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 9268136  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| || | | || ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9268137 tttatcctttaaaaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 9268236  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9268237 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 9268283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 20987959 - 20988204
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  20987959 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaatagcgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 20988058  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20988059 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 20988157  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  20988158 ataattaatgtagttggaaatagcaaaaaggtcttataaaaagggac 20988204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 28140686 - 28140907
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 124  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28140686 ccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagtgtt 28140785  T
Q  125 agtttatgttttccatatgctacttatt-gctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 223  Q
     |||||||||||| | ||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28140786 ggtttatgttttcaacatgttatttatccgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 28140885  T
Q  224 aacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  28140886 agcaaaggggtcttataaaaag 28140907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34332511 - 34332266
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  34332511 cctccgtccctaattataagaccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 34332412  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    | ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  34332411 tatattcttgaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaaaa 34332312  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34332311 aataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaggg 34332266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 40951787 - 40952034
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||     
T  40951787 cctccgttcctaattatacgatccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaa 40951886  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40951887 tttatccttcaagagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaaga 40951986  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  40951987 aataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaaaggac 40952034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 43060159 - 43060402
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43060159 cgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 43060258  T
Q  107 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    ||||| || |||||| | | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43060259 tcctttaaaagagagggatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 43060358  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  43060359 attaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggac 43060402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 20142005 - 20142250
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  20142005 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 20142104  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  20142105 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaaagaa 20142203  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20142204 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 20142250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32964423 - 32964178
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  32964423 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 32964324  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||| | | |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  32964323 tttatccttta-agagagtgatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgcataattaatagggacatgtatgtaaagaa 32964225  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32964224 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggac 32964178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14619540 - 14619299
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14619540 tccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 14619441  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||| || |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14619440 tatcttttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 14619341  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14619340 taattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 14619299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4194971 - 4194728
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  4194971 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaa--tgtttgtaattactattatttttacaat 4194874  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4194873 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacattttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 4194775  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||    
T  4194774 ataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttacaaaaagggac 4194728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 27873094 - 27873336
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    ||||||||||||| | || |||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27873094 gtccctaattatagggtcattttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 27873193  T
Q  108 cctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  27873194 cctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgcatgtaaagaaataa 27873293  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  27873294 ttaatgtagttggaaataggaaaagggtcttataaaaagggac 27873336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5528252 - 5528020
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    |||||||  ||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5528252 tataagactcttttgtcaaaatcacgg-aattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactactgtttttacaattttatcctttaaga 5528154  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||| ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5528153 aagaaggttaatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 5528054  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5528053 ttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaaggac 5528020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7735128 - 7734880
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaa-tcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  7735128 cctccgtccctaattatatggcccttttgaaaaaagtaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaa 7735029  T
Q  102 ttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||| || | | || ||| | |||| ||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7735028 ttttatcctttaaaaaatagggttgggttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 7734929  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7734928 aaataattaatgtagttgaaaataaaaaaggggtcttataaaaagggac 7734880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 8283856 - 8284099
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||||||    || | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  8283856 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaa----gataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 8283951  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| | || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8283952 tttatcctttaagaaagagggttagcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaaga 8284051  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8284052 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 8284099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 38161529 - 38161771
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||    
T  38161529 cgtccctatatataagactcttttgccaaaattacgggaatcaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgcaatcaccgttgattttacaatttta 38161628  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38161629 tcctttagagatagagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtatagtaagtaggggcatgtatgtaaagaaataa 38161728  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  38161729 ttaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaaaggac 38161771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14571530 - 14571333
Alignment:
Q  50 agaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctactt 149  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| || |     
T  14571530 agaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcacaattgtttttacaattttatccttaagagagag--ttagtttatgttttgcatatgttattc 14571433  T
Q  150 attgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  14571432 attgttgattgaagaaaaatatgtataataagtaggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttatgaaaagggac 14571333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22658061 - 22657814
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||| |  | |||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  22658061 cctccgtctctaattataagatctttttgaaaaaattaaagaaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 22657962  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22657961 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 22657862  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  22657861 aataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggac 22657814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 10511246 - 10511462
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||    
T  10511246 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatg 10511345  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |     
T  10511346 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataggaaatga 10511445  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||    
T  10511446 gtcttataaaaagggac 10511462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 18615804 - 18616057
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||  |||||||    
T  18615804 tccctctgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattaattttaca 18615903  T
Q  101 attttatcctt-aagagagaga----gttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatg 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||    
T  18615904 attttatcctttaagagagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatatggacatgtatg 18616003  T
Q  196 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18616004 taaagaaataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 18616057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 4976033 - 4976281
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||    
T  4976033 cctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaat 4976132  T
Q  103 tttatccttaa---gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4976133 tttatcctttaagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaa 4976231  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||||    
T  4976232 gaaataattaatgtagctggaaatagcaaagagatcttataaaaggggac 4976281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12744117 - 12743870
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  12744117 cctctgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 12744018  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  12744017 tttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatagggacatgtatgtaaaga 12743918  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  12743917 aataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaaaagggac 12743870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21239391 - 21239149
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  21239391 cctccgtctctaattataggc-ccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgcattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaat 21239293  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21239292 tttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttgtttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgtaaaga 21239193  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21239192 agtaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 21239149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39985063 - 39984819
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  39985063 ctccgtccctaattataaggaccttttgaaaaaataacgagaattaagatagcggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 39984964  T
Q  104 ttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaat--agtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  39984963 ttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagagaggtatgtatgtaaag 39984864  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  39984863 aaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaag 39984819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35039289 - 35039043
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||   ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||     
T  35039289 cctccgtcgctaattataaggcccttttaa-aaaataacgcgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaa 35039191  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  35039190 tttatcattcaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataaggacatatatgtaaaga 35039091  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  35039090 aataattaatgtagttggaaatagcaaaaatatcttataaaaagggac 35039043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 39121434 - 39121681
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||   |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  39121434 cctccgtccctaattataaggctcttttaaaaaaatagcgggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaat 39121533  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | ||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39121534 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgatttaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 39121633  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  39121634 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 39121681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 13759193 - 13759438
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||||  ||||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |    
T  13759193 cctccgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatggtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagt 13759292  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  13759293 tttatccttta-agagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaaaa 13759391  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  13759392 ataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaagggac 13759438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 38371719 - 38371964
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  ||||| | || ||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||    
T  38371719 ctccgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataatggaaattaagattgtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattaatattatttttacaatt 38371818  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||| ||| | | |||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38371819 ttattcttta-atagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 38371917  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataac-aaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  38371918 taattaatgtagttggaaataacaaaaaggatcttataaaaagggac 38371964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Original strand, 3160293 - 3160518
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagt 123  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||    
T  3160293 ccttttgccaaaatcacgagaatcaagatagtgaatatttgtgttaaagttttttgtaaacactattgtttttacaaatttatcctttaagagagatggt 3160392  T
Q  124 tagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 223  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  3160393 tagtttatgttttcaacatactatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaaaaattaatgtaattgaaaat 3160492  T
Q  224 aacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||    
T  3160493 agcaaaggaatcttataaaaagggac 3160518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 34889024 - 34889269
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||| ||||||||   || |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34889024 tccgtccttaattatagagtctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttttattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 34889123  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| | ||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34889124 tatcctttaaaagagagagttgatttatgtattcaacatgttatttattgctggttgaaaaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaa 34889223  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  34889224 taattaatgtagttggaaataggaaagatgtcttataaaaagggac 34889269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 249
Target Start/End: Original strand, 24307924 - 24308132
Alignment:
Q  42 gggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccat 140  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||| |     
T  24307924 gggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaac 24308023  T
Q  141 atgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata 240  Q
    ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24308024 atgttatttattacttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttata 24308123  T
Q  241 aaaagggac 249  Q
    |||||||||    
T  24308124 aaaagggac 24308132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24365399 - 24365191
Alignment:
Q  42 gggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccat 140  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||| |     
T  24365399 gggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaac 24365300  T
Q  141 atgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata 240  Q
    ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24365299 atgttatttattacttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttata 24365200  T
Q  241 aaaagggac 249  Q
    |||||||||    
T  24365199 aaaagggac 24365191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3028308 - 3028059
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  3028308 cctccgtcccttattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatttttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 3028209  T
Q  103 tttatccttaa---gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||| ||| |   ||||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3028208 tttattctttaagagagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataattaataggggcatgtatgtaaa 3028109  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  3028108 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 3028059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9264266 - 9264019
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||  |||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  9264266 cctccgtctttaattataaggtctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 9264167  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  9264166 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatataaaga 9264067  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| |||||    
T  9264066 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaacgggac 9264019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 23092384 - 23092631
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||  ||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||| |||||||    
T  23092384 cctccgtccctaatcatatgacctttttgaaaaaataacgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttgttacaat 23092483  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||||| | | || |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  23092484 tttatcctttaagagacataattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagttgtataaaaaataggggcatgcatgtaaaga 23092583  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  23092584 aataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtattataaaaagggac 23092631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35547554 - 35547307
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||| | |||| ||||||||||    
T  35547554 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaagtaacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttgtaattactattatttttacaat 35547455  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||| | |||||||||| | ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35547454 tttatcctttaagaatgagggttggcttatgttttcaacattttatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaaga 35547355  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  35547354 aataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagggac 35547307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39759180 - 39758957
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||     
T  39759180 cctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatgtttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaa 39759081  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39759080 tttatccttcaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaaga 39758981  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39758980 aataattaatgtagttggaaataa 39758957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 19571674 - 19571929
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaa--------agtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtt 94  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||        |||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||    
T  19571674 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaatttaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgtt 19571773  T
Q  95 tttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgta 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  19571774 tttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtg 19571873  T
Q  194 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  19571874 tgtaaagaaataattaatatagttggaaatagtaaatgggtcttataaaaagggac 19571929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 81 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24170348 - 24170179
Alignment:
Q  81 taatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 180  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24170348 taatcactactgtttttacaattttatcttaaagagagagaattagtttatgttttctatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 24170249  T
Q  181 atagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa-ggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  24170248 ataggagcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagatcttataaaaagggac 24170179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14436095 - 14435883
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  14436095 cctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 14435996  T
Q  103 tttatc-cttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||  |||||||||||| || |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |    
T  14435995 tttatcttttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtattataaataatgacatgcatgtaaaaa 14435896  T
Q  202 aataattaatgta 214  Q
    |||||||||||||    
T  14435895 aataattaatgta 14435883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 23285852 - 23286067
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagaga-gttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | |||||||    
T  23285852 aaaataacgggaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagatgattgtttatg 23285950  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||      
T  23285951 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagat 23286050  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| ||||||    
T  23286051 gtcttataaatagggac 23286067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41418601 - 41418356
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||    
T  41418601 cctccgtccctaattatgaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaat 41418502  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| |||||| |||| |||   |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||||||||    
T  41418501 tttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaatattctatttattgttgattgaagaaaatgatgtataataaata--tgtatgtatgtaaaga 41418404  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  41418403 aataattaatgtatttagaaatagaaaaagggtcttataaaaagggac 41418356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20518134 - 20517892
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||    
T  20518134 cctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataat 20518035  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| ||||||||  || |||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  20518034 tttatcctttagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaagaatgtataataaatgggggcatatatgtaaagaa 20517937  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| || || ||||||||||||    
T  20517936 ataattaatgtagttgaaaatagcaaatggatc-tataaaaaggga 20517892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Original strand, 32617561 - 32617767
Alignment:
Q  44 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatat 142  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| |||   |||||||||| | ||    
T  32617561 gaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttgtcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacat 32617660  T
Q  143 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 242  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  32617661 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtatattaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaa 32617760  T
Q  243 aagggac 249  Q
    |||||||    
T  32617761 aagggac 32617767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Original strand, 8144464 - 8144672
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  8144464 cctccgtccctaattataaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 8144563  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| |||||| |||  ||| | |||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8144564 tttatcctttaagaaagatggttggcttatgtttttaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataattaggggcatgtatgtaaaga 8144663  T
Q  202 aataattaa 210  Q
    |||||||||    
T  8144664 aataattaa 8144672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20987955 - 20987793
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20987955 tattgtttttacaattttatcctttaagaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 20987856  T
Q  187 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20987855 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 20987793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21750223 - 21749977
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||    
T  21750223 cctccgtccttaattataagatccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataat 21750124  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21750123 tttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 21750024  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||| |||||||||| |||||  ||| |  ||| |||||||||||    
T  21750023 aataatcaatgtagttgaaaatagaaaatgaatctcataaaaaggga 21749977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 15774813 - 15775030
Alignment:
Q  9 tccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc 108  Q
    |||||||||||||  |||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15774813 tccctaattataatgtccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatc 15774912  T
Q  109 c-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataat 207  Q
    | |||||| |||| |||   |||||||||| | || ||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  15774913 ctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgttgattaaagaaaaagatgtacaataaataggggcatatatgtaaaaaaataat 15775012  T
Q  208 taatgtagttggaaataa 225  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  15775013 taatgtagtcggaaataa 15775030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12806854 - 12806692
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  12806854 tattgtttttacaattttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaataggg 12806755  T
Q  187 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  12806754 gcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaaaagggac 12806692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8950105 - 8949861
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||    
T  8950105 tccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattt 8950006  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||  || | ||  ||||||||||    
T  8950005 tatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaat 8949906  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8949905 aattagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagggac 8949861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31642477 - 31642233
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| ||| |  |||| | |||||||||||||||||    
T  31642477 tccgtccctaaatatacgagccttttgcaaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgataataattactattgtttttacaattt 31642378  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||  || | ||  ||||||||||    
T  31642377 tatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaat 31642278  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31642277 aattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 31642233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17714861 - 17714610
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| | || | ||||||||| |||||    
T  17714861 cctccgtccctaattatagaacctttttgaaaaaattatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttctgattactattgttttgacaat 17714762  T
Q  103 tttatcctt-aagagagaga-gttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaa---gatgtataataaatagtggcatgtatgta 197  Q
    |||||  || |||||||||| | | |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17714761 tttattttttaagagagagatgatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 17714662  T
Q  198 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||| |||||||    
T  17714661 aagaaataattaatgtagttgaaaatagtaaatgagtcttataagaagggac 17714610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18251312 - 18251066
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| | || |  ||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  18251312 cctccgtccctaaatatatgatccttttgtcaaaatcacgagaattaaaaaagttggtagtaatattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 18251213  T
Q  103 tttatccttaag----agagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaa 198  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||||| | || |||||  || || |  ||||    
T  18251212 tttatccttaagagaaagagagagttagtttatgttttcaatatagtatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaagaaataagggtatcttggtaa 18251113  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18251112 aaaaataattaatttaattggaaataccaaaggggtcttttaaaaag 18251066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 249
Target Start/End: Original strand, 16284998 - 16285181
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaa 165  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| | ||  || |||||| | |||||||||    
T  16284998 tattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagattgaattaatttatgttttcaacataatatttattgtttattgaagaa 16285097  T
Q  166 aaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16285098 aaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 16285181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37034438 - 37034238
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  37034438 cctccgtccctaattataaggaccttttgaaaaaataaccgaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtgtgtaaac--tattgtttttacaat 37034341  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||| ||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  37034340 tttatcctttaagaaagagggttggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatttaaaga 37034241  T
Q  202 aat 204  Q
    |||    
T  37034240 aat 37034238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4903071 - 4902853
Alignment:
Q  6 ccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttt 105  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  4903071 ccgtccctatatataagacccttttgttaaaattacgggaattaaggaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagtttt 4902972  T
Q  106 atccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||                 || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |        ||||| |||||    
T  4902971 atccttaggagagagagttagt-----------------tatttattgttgattcaagaaaaagatgtataataaataggg--------gtaaaaaaata 4902897  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4902896 attaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 4902853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25837295 - 25837057
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    |||||||| |||| || |||||| | ||||| |||   ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||||    
T  25837295 gtccctaaatataggagccttttaccaaaattacgaagattaagaaagttgtttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat 25837196  T
Q  108 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataat 207  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||    
T  25837195 ccttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataat 25837096  T
Q  208 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25837095 taatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaagg 25837057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31657976 - 31657730
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||  |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  31657976 cctccgtccctaaatatatgagtcttttgtcaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 31657877  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| ||||||||||||||  || | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  31657876 tttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaagtgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 31657777  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  31657776 ataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggac 31657730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12098811 - 12098607
Alignment:
Q  45 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatg 143  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||  | ||     
T  12098811 aattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgta-tcacaattgtttttacaattttatcctttaagagagatagctagtttatatttttaacatt 12098713  T
Q  144 ctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| |  || |||||||    
T  12098712 ctatttattgctcattgaagaaaaagatgtttaataaagaggggtatgtaagtaaaaaaataattaatgtagttgaaaaagacaaaagaatcctataaaa 12098613  T
Q  244 agggac 249  Q
    ||||||    
T  12098612 agggac 12098607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39971221 - 39971060
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||  ||    
T  39971221 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaagatgcaaaataattaaggg 39971122  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39971121 tatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaagggac 39971060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24857785 - 24857602
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||    
T  24857785 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 24857686  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| || | ||||||||  || | ||  |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  24857685 aaaag-tgcaaaataaataagggtacgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacatcaaaggggtcttataaaaagggac 24857602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11781016 - 11780809
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||     
T  11781016 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttggcttata 11780917  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |        | |||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||    
T  11780916 ttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaacaggg--------gaaaagaaataattaatgtagttgaaaat-agaaaagg 11780826  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||    
T  11780825 gtcttataaaaagggac 11780809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 41686860 - 41687104
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||||||| |||| || ||||||||  |||| ||||  ||||||||| | | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  41686860 cctctgtccctaaatataggagccttttgcccaaattacggagattaagaaaattggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 41686959  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  41686960 tttatccttaagag--agagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaa 41687057  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  41687058 ataattaatgtacttggaaataccaaaggagtcttataaaaagggac 41687104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 8100152 - 8100384
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc-cttaaga 115  Q
    ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  8100152 tataagaccattttgccaaaattacgggaattaagaaagttgatatttgtattaaatttgtttgtaatccctattggttttacaattttatcatttagga 8100251  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     | ||| |||| |||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||   | ||||| |||||||| |||||||||| |    
T  8100252 taaagaattag-ttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaaaaaaaaaatgtatgataaataagagtatgtaagtaaagaagtaattaatgttg 8100350  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||  |||  | ||||||||||||||||    
T  8100351 ttggaaatagaaaattgatcttataaaaagggac 8100384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 248
Target Start/End: Original strand, 13703594 - 13703797
Alignment:
Q  43 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 142  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||  || | | |||||||| |||||| ||||| | ||    
T  13703594 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtatttacaattttattttttaaa-agagagttggtttat-ttttcaacat 13703691  T
Q  143 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 242  Q
    | || |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| |  ||||||||     
T  13703692 gttatttattgttgtttgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttaaaaatagcaaaagaatcttataac 13703791  T
Q  243 aaggga 248  Q
    ||||||    
T  13703792 aaggga 13703797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 142
Target Start/End: Original strand, 13958610 - 13958735
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13958610 tataagaccattttgataaaatcatgagaattaaaaaagtgaatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaaaag 13958709  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatat 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13958710 agagagttagtttatattttccatat 13958735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 249
Target Start/End: Original strand, 28414507 - 28414675
Alignment:
Q  81 taatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 180  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  28414507 taattattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 28414606  T
Q  181 atagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||  || ||||  |||||||||| |||||| || || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  28414607 ataagggtatgttggtaaagaaatgattaatttacttcgaaataccaaagtggtcttataaaaatggac 28414675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39180643 - 39180507
Alignment:
Q  113 agagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatg 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  39180643 agagagagagttaatttatgttttcaacatgttatttattgatgatttaagaaaaagatgtataataattagggacatgtatgtaaagaaataattaatg 39180544  T
Q  213 tagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||   || ||||||||||||||    
T  39180543 tagttggaaataacaaaaatgttttataaaaagggac 39180507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 216
Target Start/End: Original strand, 9438877 - 9439051
Alignment:
Q  45 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc--ttaagagagagagttagtttatgttttccatat 142  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  9438877 aattaagaaagttgatatttttattaaatttgtttgtaattattattgtttttacaatttttttcttttaagagagagaattagtttgtgttttcaacat 9438976  T
Q  143 gctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9438977 gctatttattgctgatcaaagaaaaaaagtgtataataaatagggatatgtaggtaaaaaaataattaatgtagt 9439051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 246
Target Start/End: Original strand, 6328633 - 6328791
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  ||    
T  6328633 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaggg 6328732  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
     ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  6328733 tatgttggtaaagaaataattaatatatttggaaatatcaaagagatcttataaaaagg 6328791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16926732 - 16926499
Alignment:
Q  15 attataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaag 114  Q
    ||||||||| |||||||| |||||   ||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16926732 attataagacccttttgcaaaaattgtggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaag 16926633  T
Q  115 agagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 214  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||  || | ||  ||||||||||||||| ||||    
T  16926632 aga-agagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgta 16926534  T
Q  215 gttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16926533 cttggaaatatcaaaggggtcttataaagagggac 16926499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 248
Target Start/End: Original strand, 26894742 - 26894863
Alignment:
Q  126 gtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 225  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26894742 gtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaat-attaatgtagttggaaatag 26894840  T
Q  226 caaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  26894841 caaatgggtcttataaaaaggga 26894863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11432523 - 11432356
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagag------ttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaa 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  11432523 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcagaataaa 11432424  T
Q  182 tagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11432423 taagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaagggac 11432356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21069866 - 21069683
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaa 165  Q
    ||||||| |||| | |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||    
T  21069866 tattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatccttaagagaggtagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaa 21069767  T
Q  166 aaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| ||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  21069766 aaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaatggtcttataaaaagggac 21069683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37700386 - 37700143
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| ||||||||| |   ||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||   |  || |||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37700386 cctccgtctctaattatatggcacttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgaaggtgataataaatttgtttgtaatcaccattgtttttacaat 37700287  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||| |  ||||  |||||||    
T  37700286 tttatcctttaagagagaaaattagtatatgttttcaatatagtatttaatgctgattgaagaaaatgatataaaataaatagggatatgttggtaaaga 37700187  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    | ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  37700186 attaattaatgtactcggaaatatcaaaggagtcttataaaaag 37700143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 23259883 - 23260129
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |  ||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  23259883 cctccgtccctaaatatagaagtcttttgccaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaat 23259982  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| | ||  || |||||| || ||||||||||||||| | ||||||||   | || |  ||||||||    
T  23259983 tttatccttaagagaaagtgttaatttatgttttcaacataatatttattgttggttgaagaaaaagatgcaaaataaataagagtatattagtaaagaa 23260082  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||    
T  23260083 ataattaatgtacttggaaataccaaaggaatcttataaaaaaggac 23260129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13236169 - 13235988
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||    
T  13236169 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatccttaagagagag--taaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 13236072  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13236071 aaaa-atgcaaaataaataatggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttagaaacatcaaaggggtcttataaaaagggac 13235988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15559829 - 15559579
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||  | |||| | |||||||||||||||    
T  15559829 cctccgtccctaaatataagagccttttgtaaaaattacggagattaagaaagttggttctagtattaaatttgcatataattactattgtttttacaat 15559730  T
Q  103 tttatccttaagagagagag----ttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaa 198  Q
    ||||| ||||||||||||||    ||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  || ||||   |||    
T  15559729 tttattcttaagagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataactaagggtatgttgataa 15559630  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  15559629 agaaataattaatgtacttgaaaataccaaagaggtcttataaaaaaggac 15559579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15675037 - 15674913
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |    
T  15675037 aaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttttacaattttatctttta-agagagagttagtttatat 15674939  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgatt 159  Q
    |||| | ||| || ||||||||||||    
T  15674938 tttcaacatgttatttattgctgatt 15674913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Original strand, 26674494 - 26674595
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  26674494 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtctgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaggg 26674593  T
Q  248 ac 249  Q
    ||    
T  26674594 ac 26674595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Original strand, 26946100 - 26946201
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  26946100 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtctgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaggg 26946199  T
Q  248 ac 249  Q
    ||    
T  26946200 ac 26946201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30183133 - 30182958
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| ||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  30183133 cctccgtctctaattataagactcttctgaaaaaataacgggaattaagatagatgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 30183034  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataat 178  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30183033 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaa-atgtataat 30182958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27834174 - 27833993
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| ||||||||||    
T  27834174 gtattaaatttgtatataattatcattgtttttacaattttatcattaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 27834075  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||| | |||||||    | ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  27834074 aaaagatgaaaaataaatgagagtatgttggtaaagaaataattaatgcatttggaaataccaaaatgatcttataaaaagg 27833993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Original strand, 26076158 - 26076375
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta-tccttaagagagagagtta 125  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  26076158 ttttgataaaatcacga-aattaagaaaattgatatctgtattaaatttgtttctaattattattatttttacaattttattctttaagaaagagagtta 26076256  T
Q  126 gtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga--aataattaatgtagttggaaat 223  Q
    |||| ||||||| | ||  || |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |  || |||| | |||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  26076257 gtttgtgttttcaacatattatttattgctgattgaggaaaaag--gtataataaacaagggtatgtctctaaaaaataataattaatttagttggaaat 26076354  T
Q  224 aacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  26076355 agcaaagggg-cttataaaaag 26076375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 26889596 - 26889706
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  26889596 tccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 26889695  T
Q  101 attttatcctt 111  Q
    |||||||||||    
T  26889696 attttatcctt 26889706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3629132 - 3628980
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||    
T  3629132 gtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatgttatccttta-agctagagttagtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaaga 3629034  T
Q  165 aaaaga-tgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 217  Q
    |||| | | |||||||||||  ||  || | |||||||||||||||||||||||    
T  3629033 aaaaaattatataataaataagggtgtgcaagtaaagaaataattaatgtagtt 3628980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13735789 - 13735701
Alignment:
Q  155 tgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  13735789 tgattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 13735701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5283277 - 5283094
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| | ||  || |||||| ||||||||||    
T  5283277 gtattaaatttgtatgtaattactattgtttttacaattttatccttaagaaagatagttaatctatgttttcaacatagtatttattgttgattgaaga 5283178  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| | |||||| |  || | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||||    
T  5283177 aaaagatgcaaaataaaaaagggta-gttggtaaagaaataattaatgtatttggaaatacaaaaaaagtcttataaaaagggac 5283094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 249
Target Start/End: Original strand, 35784728 - 35784908
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaa 165  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||| ||    
T  35784728 tattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctta--agagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa-aa 35784824  T
Q  166 aaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||  || | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||    
T  35784825 aaaactgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaacatcaaagaagtcttataaaaagggac 35784908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Original strand, 39692401 - 39692640
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||| ||||| |||| || ||||||   ||||| |||| |||||||||||| | || |  ||||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||||    
T  39692401 tccgttcctaaatataggaaccttttatcaaaattacggaaattaagaaagttggtagtaatattaaatttgtatataattattgttgtttttacaattt 39692500  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||||    
T  39692501 tattcttaagag--agagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaat 39692598  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||| ||||| ||  ||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  39692599 aattgatgtacttaaaaatatcaaatgagtcatataaaaagg 39692640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 39181998 - 39181907
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc 108  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39181998 tataagatcattttgtcaaaatcatgggaactaagaaagtcgatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatc 39181907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Original strand, 42030344 - 42030478
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  42030344 cctccgtccctagttataagg-ccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 42030442  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttc 137  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  42030443 tttatcctttaagaaggagagttagcttatgttttc 42030478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Original strand, 1303322 - 1303563
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||||  ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| |  | | |||| | |||| ||||||||||    
T  1303322 cctccgtccctaaatataagagttttttgtcaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaattaatatataattactattatttttacaat 1303421  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |   || |||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  1303422 tttatccttaagagagag--ttagtttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaaaacgatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaa 1303519  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||||  || |||||||||||    
T  1303520 ataattaatgtacttgaaaatactaaagaagttttataaaaagg 1303563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 135
Target Start/End: Original strand, 2328397 - 2328498
Alignment:
Q  33 taaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatg 132  Q
    |||||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  2328397 taaaatcacatgaatttagaaaatggatatttgcattaaagttgttagtaatcactattgattttacaattttatccttta-agagagagttaatttatg 2328495  T
Q  133 ttt 135  Q
    |||    
T  2328496 ttt 2328498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 16636828 - 16636992
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaatt---ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 184  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||  ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||     
T  16636828 tattgtttttacaattattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatgtattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataa 16636927  T
Q  185 tggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
      | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||  |||  | ||||||||||||||||    
T  16636928 gagtatgttggtaatgaaataattaatgtacgtggaaatactaaaatgatcttataaaaagggac 16636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13335578 - 13335338
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||  || ||||||| |||| | |  || |||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  13335578 tccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgaaaaataagaaaatggaaagtgataataaatttgtttgtaattaatattgcttttacaattt 13335479  T
Q  105 tatccttaa-gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| | ||||||   ||| | |||| |||  | ||  || ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||  ||||| ||     
T  13335478 tatcctttacgagagatgattattgtatgctttgaacatagtatttaatgctgattgaagaaaaagatataaaataaatagcggtatgttggtaaa-aat 13335380  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13335379 taattaatatacttggaaataccaaatgggtcttataaaaag 13335338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30182204 - 30182129
Alignment:
Q  174 ataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  30182204 ataataaatagggccatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagggac 30182129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 7001594 - 7001455
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||  |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  7001594 cctccgtccctgaatataagagtcttttgtcaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 7001495  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 142  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  7001494 tttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatat 7001455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 20988331 - 20988254
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaat 84  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20988331 cgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaat 20988254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9727661 - 9727498
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaa-ttaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||| |||| ||||| ||| |||||  |||||||||  || |||||||||| |||||  |||||||| || ||| |||||| |||| |||||| ||||    
T  9727661 tccgtcactaaatataatatctttttgtcaaaatcacgaaaaattaagaaagttgatatcagtattaaaattatttctaatcactattatttttataatt 9727562  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaa 168  Q
     |||| || | ||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||| |||||||| |||||    
T  9727561 atatctttta-agagagagttagtttatgtttttaacatgctatttattgttgattgaaaaaaaa 9727498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16099448 - 16099279
Alignment:
Q  77 tttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttat---tgctgattgaagaaaaagatgt 173  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| | ||  || ||||   |||| |||||||||||  || |    
T  16099448 tttgtaattgttattgtttttacaattttatccttta-agagagggttagtgtatgttttcaacatagtatttatcaatgctaattgaagaaaataatat 16099350  T
Q  174 ataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    | ||||||||| ||  |||  |||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  16099349 aaaataaataggggtgtgttggtaaagaattaattaatctacttggagatatcaaagggatcttataaaaa 16099279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 11937193 - 11937267
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc 108  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11937193 aaaatcaaggaaattaagaaagttgatatttgtattaaatttatttataatcacaattgtttttacaattttatc 11937267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 168
Target Start/End: Original strand, 8356284 - 8356449
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || | ||||   ||||| || |||||||||||||| |||| |  ||||||| || | | |||| | | |||||||||||||    
T  8356284 cctccgtccctaaatataggagcattttatcaaaattactggaattaagaaagttgatagtaatattaaatttatatataattactgttgtttttacaat 8356383  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaa 168  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||| |||||    
T  8356384 tttatacttaaaagatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaaaaaa 8356449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 10561321 - 10561248
Alignment:
Q  40 acgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaa 113  Q
    |||| |||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10561321 acggaaattaagaaaattgatatttctaataaatttgtttgtaattattattgtttttataattttatccttaa 10561248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 12807215 - 12807134
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaat 84  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12807215 cctccgtccctaattatagagtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaat 12807134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20187248 - 20187151
Alignment:
Q  127 tttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 224  Q
    ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20187248 tttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcataataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaata 20187151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Original strand, 35684732 - 35684811
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattg-tttttacaattttatcctta 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  35684732 aaaatcacggggattaagaaagttgacatttgtataaaaattgtttgtaatcacaactgctttttacaattttatcctta 35684811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37206338 - 37206169
Alignment:
Q  77 tttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtat 175  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || | ||   |||||| ||||||||| | ||  || ||| ||||||||||||||||| || ||     
T  37206338 tttgtaattactattatttttacaattttatcctttaaaaaagcaggttagtgtatgttttcaacataatatttaatgctgattgaagaaaaatatataa 37206239  T
Q  176 aataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||| || || |||| |||||||||  ||||||||||  || ||||| ||||  | ||||||||||||    
T  37206238 aataaacaggggtatgtttgtaaagaatcaattaatgtacatgaaaatatcaaaaagttcttataaaaag 37206169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41470928 - 41470804
Alignment:
Q  12 ctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt 111  Q
    |||| ||| |||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||| |  ||||||| |||| | |||| | ||||||||||| ||||||||| ||    
T  41470928 ctaaatatgagattcttttaccaaaatcatggggattaagaaagttgatagtaatattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatcttt 41470829  T
Q  112 aagagagagagttagtttatgtttt 136  Q
    ||||||||   ||||||||| ||||    
T  41470828 aagagagatgattagtttatatttt 41470804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 142
Target Start/End: Original strand, 9264715 - 9264814
Alignment:
Q  42 gggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaa-tcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccat 140  Q
    ||||| |||||||||  ||| | |||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  9264715 gggaactaagaaagtcaatagtagtattaaatttgtatataaattattattgtttttacaattttattttta--agagagagttagtttatgttttcaat 9264812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 7717750 - 7717710
Alignment:
Q  44 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaat 84  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7717750 gaattaagaaagttgatatttatattaaagttgtttgtaat 7717710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 230
Target Start/End: Original strand, 7956578 - 7956653
Alignment:
Q  155 tgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 230  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||   |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  7956578 tgattgaagaaaaagatatacaataaataggggtatggtggtaaagaattaattaatatatttggaaatagcaaag 7956653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10116721 - 10116630
Alignment:
Q  155 tgattgaagaaaaa-gatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||   |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  10116721 tgattgaagaaaaaagatataaaataaataatggtatgatggtaaagaattaattaatgtatttggaaataccaaaagaatcttataaaaag 10116630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 107
Target Start/End: Original strand, 37330994 - 37331056
Alignment:
Q  45 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  37330994 aattaagaaaattgatatttgtcttaaatttgtttgtaattactgatgtttttacaattttat 37331056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 41384206 - 41384176
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384206 tccctccgtccctaattataagatccttttg 41384176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 93
Target Start/End: Original strand, 8421136 - 8421199
Alignment:
Q  33 taaaatcacgggaattaagaaagtgg---atatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgt 93  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8421136 taaaatcacggaaattaagatagttgttgatatttgtattaaagttgtttgtaaacactattgt 8421199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 217
Target Start/End: Original strand, 21591815 - 21591884
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 217  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  21591815 ttattgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaatatgggtatgttggtaaaaaaataattaatatagtt 21591884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 217
Target Start/End: Original strand, 21595932 - 21596001
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 217  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  21595932 ttattgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaatatgggtatgttggtaaaaaaataattaatatagtt 21596001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30117255 - 30117163
Alignment:
Q  155 tgattgaagaaaaagatgtataa--taaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  30117255 tgatcgaagaaaaagatatataaaataaatagaggtttgttggtaaagaattaattaatgtacttacaaatatcaaaggagtcttataaaaag 30117163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 111
Target Start/End: Original strand, 35495046 - 35495123
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt 111  Q
    ||||| || |||||||||||| | |||| | ||| |||| || |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  35495046 aaaataacaggaattaagaaaattgataatggtaataaatttatttgtaattactattgattttacaattttatcctt 35495123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 14649193 - 14649221
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14649193 cctccgtccctaattataagatccttttg 14649221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 22657773 - 22657801
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22657773 cctccgtccctaattataagatccttttg 22657801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 40643099 - 40643127
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40643099 cctccgtccctaattataagatccttttg 40643127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 236)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33868742 - 33868494
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33868742 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 33868643  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33868642 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 33868543  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33868542 aaataattaatgtagttggaaataactaaggggtcttataaaaagggac 33868494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 16434980 - 16435228
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16434980 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaaaaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 16435079  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16435080 attttatccttaagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 16435179  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16435180 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 16435228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 50647687 - 50647935
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50647687 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 50647786  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  50647787 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaa 50647886  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50647887 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 50647935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4024345 - 4024098
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4024345 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaat-aagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 4024247  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4024246 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 4024147  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4024146 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 4024098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14428903 - 14428656
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14428903 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 14428804  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14428803 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag-ggcatgtatgtaaag 14428705  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14428704 aaataattaatgtagttggaaataagaaaggggtcttataaaaagggac 14428656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 17591288 - 17591536
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17591288 tccctccatccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 17591387  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17591388 attttatctttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 17591487  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591488 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 17591536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 52058988 - 52059236
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52058988 tccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 52059087  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52059088 attttatccttaagagagagagtttgtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 52059187  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52059188 aagtaattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 52059236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 9779982 - 9780230
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9779982 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattattattgtttttaca 9780081  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9780082 atattatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 9780181  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9780182 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 9780230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37729007 - 37728759
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37729007 tccctctgtccttaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtatttaca 37728908  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37728907 attttatctttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 37728808  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37728807 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 37728759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36099258 - 36099011
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36099258 tccctctgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggataattgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 36099159  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36099158 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 36099059  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36099058 aaataattaatgtaattggaaataacaaa-gggtcttataaaaagggac 36099011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44544076 - 44543828
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44544076 tcccttcgtcccttattataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 44543977  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44543976 attttatccttaagagagagagttcgtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 44543877  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44543876 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 44543828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20862491 - 20862242
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20862491 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttttaca 20862392  T
Q  101 attttatccttaagagag--agagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaa 198  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20862391 attttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgcta-ttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaa 20862293  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20862292 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 20862242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36005798 - 36005553
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36005798 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 36005699  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36005698 attttatcttttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 36005599  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36005598 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 36005553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 51283805 - 51284054
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51283805 tccctctgtccctaattataagacccttttgctaaaatcatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 51283904  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataat-aaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  51283905 attttatccttaagagagagagttagtttacgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaaataggggcatgtatgtaaa 51284004  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  51284005 gaaataattaatgtagttggaaataacaaatggattttataaaaagggac 51284054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10045130 - 10044887
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10045130 tccgtccctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgcattaaagctgtttgtaatcactattgtttttacaattt 10045031  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10045030 tatcctgaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 10044931  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10044930 aattaatgtagttggaaataacaaa-gggtcttataaaaagggac 10044887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39952563 - 39952317
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  39952563 cctccgtccctaattataagatccttttgttaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaat 39952464  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39952463 attatccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaa 39952364  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39952363 ataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 39952317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 26806118 - 26806366
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg-----ctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgttt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26806118 tccctccgtccctaattataagacccttttgctttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgttt 26806217  T
Q  96 ttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26806218 ttacaattttatccttaagagagaaggttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatg 26806317  T
Q  196 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26806318 taaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 26806366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 53271885 - 53271642
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  53271885 tccctccgtccctaattataagacttttttgctaaaattatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcac-attgtttttaca 53271787  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53271786 attttatccttaagagagggagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 53271687  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53271686 aaataattaatgtaattggaaataacaaagggatcttataaaaag 53271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 9499239 - 9499488
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9499239 tccctctgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 9499338  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9499339 attttatcctttaagagagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 9499438  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9499439 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 9499488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 22103671 - 22103920
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22103671 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 22103770  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22103771 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaa 22103870  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22103871 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 22103920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 36317415 - 36317646
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36317415 tataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaa-gtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagag 36317513  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36317514 agagagttagtttatgttttccttatgctatttattactgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtgaagaaataattaatgtagt 36317613  T
Q  217 tggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  36317614 tggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 36317646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43868398 - 43868149
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43868398 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 43868299  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43868298 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 43868199  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43868198 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 43868149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 26306357 - 26306598
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26306357 tccctctgtccttaattataagacccttttgctaaaatcacg-------agaaagcggatatttgtattaaagttgtttgcaatcactattgtttttaca 26306449  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26306450 attttatccttaagcgagagagttaatttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 26306549  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26306550 aaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaaggac 26306598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 7051462 - 7051711
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7051462 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgggtatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 7051561  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7051562 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 7051661  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7051662 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 7051711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45746073 - 45745824
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45746073 tccctccgtccttatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 45745974  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45745973 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 45745874  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45745873 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 45745824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 46703322 - 46703073
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46703322 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 46703223  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  46703222 attttatcctttaagaaaaaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaagcatgtatgtaaa 46703123  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46703122 gaaataattaatgtagttagaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 46703073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7181645 - 7181396
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7181645 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagataggggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 7181546  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7181545 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaa 7181446  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7181445 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 7181396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 23700527 - 23700776
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| ||||  || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23700527 tccctccgttcctatatacaagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 23700626  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23700627 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 23700726  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23700727 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 23700776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 23718982 - 23719231
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| ||||  || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23718982 tccctccgttcctatatacaagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 23719081  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23719082 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 23719181  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23719182 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 23719231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 23737438 - 23737687
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| ||||  || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23737438 tccctccgttcctatatacaagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 23737537  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23737538 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 23737637  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23737638 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 23737687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 52673482 - 52673233
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52673482 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 52673383  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52673382 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 52673283  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52673282 gaaataattaatgtaggtggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 52673233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 7251024 - 7251273
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7251024 tccctccgtccctatatataagacccttttgttaaaatcattggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 7251123  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7251124 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 7251223  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7251224 gaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggac 7251273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 46878181 - 46878430
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46878181 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagataaaggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 46878280  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46878281 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 46878380  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46878381 gaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggac 46878430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 54107646 - 54107399
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54107646 cctctgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 54107547  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  54107546 tttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaga 54107447  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54107446 aataattaatgtagttgaaaataataaaggggtcttataaaaagggac 54107399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 20621430 - 20621675
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  20621430 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 20621529  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20621530 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 20621628  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20621629 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 20621675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21756781 - 21756532
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21756781 tccctccgtccctatatataagacccttttgcgaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 21756682  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21756681 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaa 21756582  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21756581 gaaataattaatgtagttggaaataataaagaggtcttataaaaagggac 21756532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26221583 - 26221334
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26221583 tccctctgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttaca 26221484  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26221483 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagagaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaa 26221384  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26221383 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 26221334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32467704 - 32467471
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaa-ga 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  32467704 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttacga 32467605  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32467604 aagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 32467505  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32467504 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 32467471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 45048764 - 45049013
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  45048764 tccctccgtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttaca 45048863  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45048864 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa 45048963  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45048964 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 45049013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 54782659 - 54782908
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54782659 tccctctgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 54782758  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  54782759 attttatcctttaagaaaaaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa 54782858  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54782859 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 54782908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 60 - 244
Target Start/End: Original strand, 22832411 - 22832595
Alignment:
Q  60 tatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgatt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22832411 tatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgatt 22832510  T
Q  160 gaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22832511 gaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 22832595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45253063 - 45252819
Alignment:
Q  6 ccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttt 105  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45253063 ccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttt 45252964  T
Q  106 atcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45252963 atcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaat 45252864  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45252863 aattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 45252819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41824386 - 41824155
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41824386 tataagacccttttgctaaaattacggaaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagag 41824287  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41824286 agagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattcaagaaaaaagtgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 41824187  T
Q  217 tggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  41824186 tggaaatagaaaagatgtcttataaaaaggga 41824155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 10015535 - 10015780
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  10015535 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 10015634  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |  || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10015635 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacgtgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 10015733  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10015734 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 10015780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 20656052 - 20656297
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  20656052 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaataactattgcttttaca 20656151  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20656152 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaagatgtataataaattggggcatgtatgtaaa 20656251  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20656252 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 20656297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 30040759 - 30041008
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30040759 tccctccgtctctatatacaagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 30040858  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30040859 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 30040958  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30040959 taaataattaatgtagttgaaaataacaaaatggtcttataaaaagggac 30041008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31187048 - 31186804
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31187048 ctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaatt 31186949  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||||||| | ||||| |||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31186948 ttatccttta-agagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaa 31186850  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31186849 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 31186804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 31531153 - 31531402
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31531153 tccctccgtccctatatataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 31531252  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31531253 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaa 31531352  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  31531353 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaaatgtcttataaaaagggac 31531402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43701457 - 43701224
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43701457 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 43701358  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43701357 aagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtag 43701258  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43701257 ttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 43701224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25148746 - 25148505
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25148746 tccgtccctagatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 25148647  T
Q  105 tatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||    
T  25148646 tatcctttaagaaagaaaattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc----atgtaaagaaa 25148551  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25148550 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 25148505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 49126938 - 49127189
Alignment:
Q  1 tccctccgtcccta-at-tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgttttta 98  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49126938 tccctccgtccctatatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 49127037  T
Q  99 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgta 197  Q
    ||||||||||||| || | |||   ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49127038 caattttatcctttaaaaaagaagattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 49127137  T
Q  198 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49127138 aagaaataattattgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 49127189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 32962847 - 32963095
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  32962847 tccctccgtccttatatataagacccttttgccaaaatcacaggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt-aca 32962945  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32962946 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaa 32963045  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32963046 gaaataattaatgtagttgcaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 32963095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 53361601 - 53361846
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  53361601 tccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 53361700  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  53361701 tatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaa 53361800  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  53361801 taattaatgtagttagaaataacaaaagagtcttataaaaagggac 53361846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 54604332 - 54604573
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54604332 tccctccgtcccta--tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 54604429  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  54604430 attttatcctttaagaatgaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatggatgtaaa 54604529  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54604530 gaattaattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaa 54604573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 50433133 - 50433380
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  50433133 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 50433232  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50433233 tttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 50433332  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  50433333 aataattaatgtagttggaaatagaataggggtcttataaaaagggac 50433380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1450530 - 1450288
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  1450530 gtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttag 1450431  T
Q  108 cctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    |||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1450430 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 1450331  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1450330 ttaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 1450288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 19897582 - 19897827
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  19897582 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 19897681  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19897682 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 19897780  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  19897781 ataattaaagtagttggaaatagtaaaggagtcttataaaaagggac 19897827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49383635 - 49383389
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||   ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  49383635 ctccgtcccttattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 49383536  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49383535 ttatcctttaagaaagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 49383436  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49383435 ataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 49383389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 25148880 - 25149113
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25148880 tataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgcaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 25148979  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25148980 aagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatatag 25149079  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25149080 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 25149113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25916681 - 25916450
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25916681 tataagatccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttcagag 25916582  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatg---tatgtaaagaaataattaatgt 213  Q
    ||||| ||| ||||| ||| ||||||  || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  25916581 agagaattaatttatatttcccatatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaattgaggcatgcaatatgtaaagaaataattaatgt 25916482  T
Q  214 agttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  25916481 agttagaaatagcaaatgggtcttataaaaag 25916450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32569275 - 32569043
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  32569275 tataagacccttttgtcaaaatcacggga-ttaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattatttttacaattttatcatttaaga 32569177  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||||||||||||||| | ||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  32569176 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgtcgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaa 32569077  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32569076 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 32569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10656984 - 10656737
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  10656984 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 10656885  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10656884 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 10656785  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10656784 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 10656737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 26593510 - 26593756
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26593510 ctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagataatagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatt 26593609  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26593610 ttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaagaa 26593709  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26593710 ataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttataaaaagggac 26593756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 45513381 - 45513626
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||  ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  45513381 cctccgtccttaattataggacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactatcgtttttacaat 45513480  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45513481 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 45513579  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45513580 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 45513626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 1641858 - 1642090
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  1641858 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttta-ag 1641956  T
Q  117 agaga-gttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
    | | | |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1641957 aaaaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 1642056  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1642057 ttgaaaataacaaagaagtcttataaaaagggac 1642090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 35867825 - 35868074
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  35867825 tccctccgtccttatatataagatccttttgccaaaattacgggaattaagatagggcatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttata 35867924  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  35867925 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtgtgtatgtaaa 35868024  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35868025 aaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 35868074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 35165738 - 35165953
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||    
T  35165738 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtagtcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 35165837  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35165838 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa-gg 35165936  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||    
T  35165937 gtcttataaaaagggac 35165953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 46862114 - 46862357
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  46862114 cgtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattattactgtttttacaatttta 46862213  T
Q  107 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    ||||| ||||  ||| |||   |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46862214 tcctttaagaaggagggttgacttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 46862313  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46862314 attaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaagggac 46862357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47067227 - 47066980
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||     
T  47067227 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaa 47067128  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47067127 tttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaatgatgaataataaataagggcatgtatgtaaaga 47067028  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  47067027 aataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggac 47066980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6784754 - 6784509
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6784754 ctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 6784655  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||| |||| |||||||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6784654 ttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaa 6784555  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  6784554 ataattaatgtagttgaaaat-agaaaagggtcttataaaaagggac 6784509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8322216 - 8321971
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |    
T  8322216 cctccgtccttaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagt 8322117  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8322116 tttatccttta-agagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 8322018  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8322017 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 8321971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 17753280 - 17753526
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17753280 ctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 17753379  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||| |||||| |  ||| |||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17753380 ttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 17753479  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17753480 ataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 17753526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 19054600 - 19054846
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19054600 ctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 19054699  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||| |||||| |  ||| |||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19054700 ttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 19054799  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19054800 ataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 19054846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 28673040 - 28673285
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||    
T  28673040 cctccgtccctaattataaaacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactgttgtttttacaat 28673139  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28673140 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctggttgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 28673238  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  28673239 ataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttataaaaagggac 28673285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8547197 - 8546950
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  8547197 cctccgtccctaagtataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgcgtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttgacaat 8547098  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  8547097 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacctgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtatagtaaatagggacatgtatgtaaaga 8546998  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8546997 aataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 8546950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 42801526 - 42801773
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||    
T  42801526 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataat 42801625  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42801626 tttatcctttaagaaagagggttagcttatattttcaatattctatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 42801725  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||||||||||||    
T  42801726 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagttttataaaaagggac 42801773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 46845236 - 46845483
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  46845236 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 46845335  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| |||   |||||||||| | ||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46845336 tttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 46845435  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  46845436 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 46845483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 50517266 - 50517513
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  50517266 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaat 50517365  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  50517366 tttatcctttaagggggagggttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaaga 50517465  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  50517466 aataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtattataaaaagggac 50517513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 15996519 - 15996764
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  15996519 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 15996618  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  15996619 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaaagaa 15996717  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15996718 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 15996764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36600435 - 36600189
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  |  |||||||||||| |    
T  36600435 cctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaatttggaaaatggatatttatattaaagtcgtttgtaagtaccattgtttttacagt 36600336  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  36600335 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccttatgctatttattgccgattcaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatataaagaa 36600236  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||    
T  36600235 gtaattaatgtagttgaaaatagcaaataggtgttataaaaaaggac 36600189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1572598 - 1572377
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttag 126  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  1572598 ttttgttaaaatcacggaaattaagaaaattgatatttatattaaagttgtttgtaatcgttattgtttttacaattttatccttaagag--agagttaa 1572501  T
Q  127 tttatgttttccatatgctacttattgctgatt-gaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 225  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1572500 tttatgttttccatatgttatttattgttgattggaaaaaaaaaatgtataatgaatatgggcatgtatctaaagaaataattaatgtagttggaaataa 1572401  T
Q  226 caaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  1572400 caaaggggtcttataaaaaaggac 1572377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43978453 - 43978210
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  43978453 tccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 43978354  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  43978353 attttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaag 43978255  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  43978254 aaataattaatgtagttggaaatagcaaataagtcttataaaaag 43978210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 12050143 - 12050381
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||| || | |||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12050143 cgtccctaattataggacctttttgaaaaaattacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 12050242  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    |||||  |||||||| || |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12050243 tccttt-gagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataa 12050341  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12050342 ttaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagg 12050381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 12906156 - 12906403
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||    
T  12906156 cctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgtttttacaat 12906255  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12906256 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 12906355  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||    
T  12906356 aataattaatgtagttggaaatggaaaaggggtcttataagaagggac 12906403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21459275 - 21459028
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  21459275 cctccttccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttgacaat 21459176  T
Q  103 tttatccttaa-gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| | || | |||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21459175 tttatcctttacgatatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 21459076  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21459075 aataattaatgtagttggaaataacaaaggtgtcctataaaaagggac 21459028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26058833 - 26058592
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26058833 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgagaattaagatattggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 26058734  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | |||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||||    
T  26058733 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg----ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg----gtatataaa 26058642  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26058641 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 26058592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33212689 - 33212442
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  33212689 cctccgtccctaattataagatccttttaaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 33212590  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  33212589 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 33212490  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||   ||||||||||||||||    
T  33212489 aataattaatgtagatggaaatagaaaagaaatcttataaaaagggac 33212442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Original strand, 48887712 - 48887937
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagt 123  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48887712 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaagtattattgtttttacaattttatcctttaagagagagagt 48887811  T
Q  124 tagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 223  Q
    | |||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48887812 tggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 48887911  T
Q  224 aacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    | |||||  |||||||||||||||||    
T  48887912 agcaaagcagtcttataaaaagggac 48887937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 52044780 - 52044540
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  52044780 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaat 52044681  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  52044680 tttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatatatgtaaagaa 52044582  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  52044581 ataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaa 52044540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35711568 - 35711321
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||   ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  35711568 tccctccgttcctaattataggacccttttaaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 35711469  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||  ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  35711468 attttatccttta-agagagaattcatttgtgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaag 35711370  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35711369 aaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggac 35711321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40919245 - 40919025
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40919245 tccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 40919146  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||| |||| ||||  |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  40919145 tatcctttaagaaagagggttatcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaaaaaa 40919046  T
Q  204 taattaatgtagttggaaata 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40919045 taattaatgtagttggaaata 40919025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 46049730 - 46049977
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| ||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  46049730 tccctctgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 46049829  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  46049830 attttatccttta-agagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatacatgtaaag 46049928  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  46049929 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaaggac 46049977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20877922 - 20877679
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  20877922 cctccgtcgctatatataaga-ccttttgttaaaattgcagaaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattacttttacaat 20877824  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  20877823 tttattcttaagagagag--ttagtttacgttttccatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaagaa 20877726  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  20877725 ataattaatgtagttgaaaatagcaaaaagatcttataaaaagggac 20877679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 53686741 - 53686988
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||  ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  53686741 cctctgtccctaattataaaacccttttgaaaaaacaacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 53686840  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53686841 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggcatgtatgtaaaga 53686940  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  53686941 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 53686988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48910159 - 48909918
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  48910159 cgtccctaattataggattcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 48910060  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    |  || | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48910059 ttattta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataa 48909961  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  48909960 ttaatgtagttggaaataacaagtaggtcttataaaaagggac 48909918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 4759093 - 4759342
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaa-tcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  4759093 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaaataacgcgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaa 4759192  T
Q  102 ttttatcctt-aagagagagagttagt-ttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    |||||||||| |||| |||| ||| |  |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4759193 ttttatcctttaagaaagagggtttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 4759292  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  4759293 aaaataattaatgtagttggaaatagaaaaaggatcttataaaaagggac 4759342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 46861867 - 46861666
Alignment:
Q  49 aagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctac 147  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||     
T  46861867 aagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttattatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttat 46861768  T
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46861767 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 46861668  T
Q  248 ac 249  Q
    ||    
T  46861667 ac 46861666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Original strand, 50726532 - 50726772
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  50726532 tccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 50726631  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||| | ||||||| || |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50726632 tatccttta-agagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaat 50726730  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  50726731 aattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 50726772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 50786316 - 50786076
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  50786316 tccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 50786217  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||| | ||||||| || |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50786216 tatccttta-agagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaat 50786118  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  50786117 aattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 50786076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 53164454 - 53164209
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  ||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  53164454 tccgtccctaattataatgtccttttgaaaaaataatgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 53164355  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||| |||  ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53164354 tatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggcatgtatgtaaagaaa 53164255  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  53164254 taattaatgtagttggaaatagaaaagaagtcttataaaaagggac 53164209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 13809553 - 13809800
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  13809553 cctccatccttaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaat 13809652  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||| ||| |||||||||  || |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  13809653 tttattcttcaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaaaa 13809752  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  13809753 aataattaatgtagttggaaatagcaaaatgatcttataaaaagggac 13809800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32978774 - 32978533
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  32978774 tccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 32978675  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||| ||||| || |||||| ||||| || ||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32978674 attttatccttta-agagagaattgatttatgttttcaatatgatatttattgttgattaaaaaaaattatatataataaataggggcatgcatgtaaag 32978576  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32978575 aaataattaatgtagttggaaataacaaa-gggtcttataaaaa 32978533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43686794 - 43686547
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  43686794 cctccgtccctaattataaggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 43686695  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  43686694 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaata 43686595  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  43686594 aataattaatgtagttggaaatagaaaaaaggtcttataaaaagggac 43686547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Original strand, 22527381 - 22527611
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22527381 tataagacccttttgttaaaatttcgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgttaggaatcactattg-ttttacaattttatccttaagag 22527479  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata-gtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22527480 aaagtgttagtttatg-tttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggagccatgtatgtaaagaaataattaatgtag 22527578  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||| ||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  22527579 ttgaaaatagcaaatgaatcttataaaaaggga 22527611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 1084698 - 1084945
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||| | |||||||||||||||    
T  1084698 cctccgtccctaactatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttttattaaatatctttgtaattactattgtttttacaat 1084797  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1084798 tttaccctttaagagagagagatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 1084897  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  1084898 aataattaatgtagttgaaaatagtaaaaggatcttataaaaagggac 1084945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 42390648 - 42390895
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||    
T  42390648 cctccgtccctaattataggatcattttgaaaaaataacgagaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttgcaat 42390747  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||  | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  42390748 tttatcatttaagagagagagttagtttatgttttcaacatgtaatttattgcaaattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaata 42390847  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  42390848 aataattaatgcagttggagataacaaagatgtcttataaaaagggac 42390895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27688272 - 27688032
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27688272 cgtcgctaattatatggtccttttgaaaaaataacgggaattaagacagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 27688173  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    ||||| | |||||| ||| |||||||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  27688172 tccttta-agagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattactaattgaagaaaaatatgtataat-aataagggcatgtatgtaaagaaataa 27688075  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  27688074 ttaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 27688032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 248
Target Start/End: Original strand, 45323870 - 45324077
Alignment:
Q  40 acgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttcca 139  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| |    
T  45323870 acggaaattaagatagaagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaa 45323968  T
Q  140 tatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat 239  Q
     ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45323969 catattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat 45324068  T
Q  240 aaaaaggga 248  Q
    |||||||||    
T  45324069 aaaaaggga 45324077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25130934 - 25130702
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25130934 cgtccctatatataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttta 25130835  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgt---ataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||         |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  25130834 tc-------tcgagagttgatttatgtttttcatatgctatttattgctgattaaataaaaagatgtataataataaataggggcatgtatgtaaataaa 25130742  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  25130741 taattaatgtaattggaaataacaaagaagacttataaaa 25130702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 249
Target Start/End: Original strand, 43158521 - 43158727
Alignment:
Q  42 gggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccata 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||| | |    
T  43158521 gggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agagagaaatggtttatgttttcaaca 43158619  T
Q  142 tgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 241  Q
    || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43158620 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataa 43158719  T
Q  242 aaagggac 249  Q
    ||||||||    
T  43158720 aaagggac 43158727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 12683011 - 12683173
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12683011 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 12683110  T
Q  187 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12683111 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 12683173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 17698778 - 17699023
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| ||| |||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  17698778 cctccatccttaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 17698877  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | | | || |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||    
T  17698878 tttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacacgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtttaattaataggggcgtgtatgtaaaaaa 17698976  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  17698977 ataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaaaggac 17699023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 51489654 - 51489413
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    ||||||||||||| |  |||||||  ||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  51489654 gtccctaattataggg-ccttttgaaaaaataatgggaattaagataggggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 51489556  T
Q  108 cctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  51489555 cctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgatggaagaaaaagatgtataataaataaatgcatgtatgtaaagaaataa 51489456  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  51489455 ttaatgtagttgaaaatagcaaacaagtcttataaaaagggac 51489413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 23776245 - 23776486
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23776245 cgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 23776344  T
Q  107 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    | ||| || |||||| ||| | |||||||||| |  |  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  23776345 ttctttaatagagagggttggattatgttttcaacgt--tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaaca 23776442  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23776443 attaatgtagttgtaaataacaaaggagtcttataacaagggac 23776486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14759127 - 14758884
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  14759127 cctccgttcataattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 14759028  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||   ||||||||||    
T  14759027 tttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataattaatagaggca--aatgtaaagaa 14758931  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14758930 ataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggac 14758884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 52291177 - 52291415
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  52291177 cgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataaagggaattaagatagtggatttttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 52291276  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    | ||| | |||||||| || ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  52291277 ttcttta-agagagagataatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataa 52291375  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  52291376 ttaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagg 52291415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48214043 - 48213798
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||     
T  48214043 cctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaag 48213944  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||  | |||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  48213943 tttatccttta-agagagaaatggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataattaatatgggcatatatgtaaagaa 48213845  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  48213844 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcctataaaaaaggac 48213798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 54849634 - 54849409
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc-cttaagagagagagt 123  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||    
T  54849634 ccttttgccaaaattattggaattaagaaagtggatatttacattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcatttaagagagatggt 54849535  T
Q  124 tagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 222  Q
    || ||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  54849534 tactttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaatatgtataataaat-ggggcatgtatgtaaagaaatagttaatgtacttgaaaa 54849436  T
Q  223 taacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||    
T  54849435 taacaaatggatcttataaaaagggac 54849409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31533643 - 31533414
Alignment:
Q  14 aattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgta-atcattattgtttttacaattttatcctta 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| |||      ||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31533643 aattataagactcttttgctaaaactacggaaattaagaaaatgg------gtaataaagttgtttttatatcactattatttttacaattttatcctta 31533550  T
Q  113 agagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatg 212  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  31533549 ggagagaaagttagtttatgttttctatatgctatttattgcagattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaata 31533450  T
Q  213 tagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||| |||||| |||  || |||||||||||||||    
T  31533449 tagttagaaatagcaattggatcttataaaaaggga 31533414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2993541 - 2993305
Alignment:
Q  12 ctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt 111  Q
    ||||||||| | |||||||   ||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2993541 ctaattatatggtccttttaaaaaaataacgggaactaaggtagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctt 2993442  T
Q  112 aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaat 211  Q
     | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2993441 ta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 2993343  T
Q  212 gtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2993342 gtaattgaaaataacaaatgagtcttataaaaagggac 2993305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38071489 - 38071241
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatcctttt-gctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||    
T  38071489 cctccgttcctaattataggatccttttagaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaa 38071390  T
Q  102 ttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||| || |||||||||  || ||||||| |||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  38071389 ttttatcttttaagagagaggattggtttatgctttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaag 38071290  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  38071289 aaataattaatatagttagaaatagcaaatgagtcttataaaaaaggac 38071241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Original strand, 44561441 - 44561685
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| ||||  | |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  44561441 cctccgtccctaaatatagaagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 44561540  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  44561541 tttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 44561640  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44561641 ataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaggg 44561685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 50730619 - 50730371
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaa-tcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||  |||| | | |  |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||    
T  50730619 cctccgttcttaattataagatccttttgaaaaaaataatgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataa 50730520  T
Q  102 ttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||| |||||||| || | |||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  50730519 ttttatcctttaagagagatagatggtttatgttttcaacatgttatttgttgctgatcgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgtatgtaaag 50730420  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  50730419 aaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaagggac 50730371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 50782235 - 50782483
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaa-tcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||  |||| | | |  |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||    
T  50782235 cctccgttcttaattataagatccttttgaaaaaaataatgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataa 50782334  T
Q  102 ttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||| |||||||| || | |||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  50782335 ttttatcctttaagagagatagatggtttatgttttcaacatgttatttgttgctgatcgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgtatgtaaag 50782434  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  50782435 aaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaagggac 50782483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10221180 - 10220978
Alignment:
Q  46 attaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgct 145  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| | ||| |    
T  10221180 attaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagaattggtttatgttttcaacatgat 10221082  T
Q  146 acttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  10221081 atttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaag 10220982  T
Q  246 ggac 249  Q
    ||||    
T  10220981 ggac 10220978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29383307 - 29383064
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || | |||||  ||||| ||||||||||||||| | |||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29383307 cctccgtccctaaatataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgataatagtaataaatttgtttgtaattattattgtttttacaat 29383208  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||  |||||||    
T  29383207 tttatccttgaagagagagagttagtttatgttttcaatatagtatttaatattgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttggtaaaga 29383108  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    | ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  29383107 attaattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaag 29383064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 1111393 - 1111635
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |  | | |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  1111393 cctccgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagcattaaatttgtatgtaattactattgtttttacaat 1111492  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || || |  ||||||||    
T  1111493 tttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatcttggtaaagaa 1111592  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1111593 ataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaag 1111635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 47008247 - 47008493
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  47008247 cctccgtccctaaatataggacccttttgccaaaattacggagattaaaaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 47008346  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  47008347 tttatccttaagggagagagttaatttatgttttcaacataatatttattcttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaa 47008446  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47008447 ataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaagggac 47008493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 43557228 - 43557441
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||  || ||||||||  ||| |||||||    
T  43557228 aaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttattatttaagagagaaggttggtttatg 43557327  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  43557328 ttttcaacatgttatttattggtaattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaatgattaatgtagttgaaaatagcaaatgg 43557427  T
Q  233 gtcttataaaaagg 246  Q
     |||||||||||||    
T  43557428 atcttataaaaagg 43557441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 41992284 - 41992509
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  41992284 cctccgtccctaattataaggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 41992383  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||               |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  41992384 tttatcctg--------------gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatatatgtaaagaa 41992469  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  41992470 ataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaa 41992509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 35572202 - 35572446
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||| |||||||||    
T  35572202 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataaagggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttataattactattgattttacaat 35572301  T
Q  103 tttatccttaa---gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||| | |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||    
T  35572302 tttatcctttaagggagagagagttggtttatgttttcaacatgtcatttactgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag-----gttatgtaaa 35572396  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  35572397 gaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 35572446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 28810889 - 28811107
Alignment:
Q  26 cttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtta 125  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28810889 cttttgctaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtta 28810988  T
Q  126 gtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 225  Q
     ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  28810989 atttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaatac 28811088  T
Q  226 caaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  28811089 caaaggagtcttataaaaa 28811107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 7886892 - 7887053
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  7886892 tattatttttacaattttattcttaagagaaagagttgacttatgtttttcatatgctatttattgctcattgaagaaaaagatgtataataaatagaga 7886991  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  7886992 catgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaaggac 7887053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 24087082 - 24087326
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  24087082 cctccgtccctaattataagactcctttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 24087181  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| |||||| |||  ||| |  ||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  24087182 tttatcctttaagaaagaaggttggcctatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaatatgt---ataaataggggcatgtatgtaaaga 24087278  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  24087279 aataattaatatagttgaaaatagaaaacgggtcttataaaacgggac 24087326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 249
Target Start/End: Original strand, 33361500 - 33361684
Alignment:
Q  58 gatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctg 156  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | ||| || |||||||||    
T  33361500 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctg 33361599  T
Q  157 attgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |        |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  33361600 attgaagaaaaagatgtataataagtaggg--------gtaaagaaataattaatgtagttggaaaaagcaaagaggtcttataaaaagggac 33361684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 27646051 - 27646293
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |  | | |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  27646051 cctccgtccctaattataggagctttttgcaaaaattacggagattaaaaaagttggttgtagcattaaatttgtatgtaattactattgtttttacaat 27646150  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || || |  ||||||||    
T  27646151 tttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatcttagtaaagaa 27646250  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  27646251 ataattaatgtacttgaaaataccaaaagggtcttataaaaag 27646293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 249
Target Start/End: Original strand, 41392633 - 41392871
Alignment:
Q  12 ctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-t 110  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||  | |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |    
T  41392633 ctaattataagagccttttgataaaatcatgagaattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtttgtaattactattgtttttacaattatatcctt 41392732  T
Q  111 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaa 210  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| |||   | ||||||  || ||||   |||||||||||||||    
T  41392733 taagagatagagttggtttatattttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaatatgggaagtaaataagggtatgttgataaagaaataattaa 41392832  T
Q  211 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  41392833 tgtagttggaaataacaaaagggtcttacaaaaagggac 41392871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46879309 - 46879084
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||| |||| ||| | |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  46879309 tccgtccctatttatcagaccattttggcaaaatcacgggacttaagaaagttgatatttgtattaaattcgtttgtaattactattgtttttacaa-tt 46879211  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaa--gatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||  |||| | ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||   |||||| ||||| |  || ||||||||||||||    
T  46879210 tatttttaaaaaagatagttagtgtatgttttcaatatgctatttattgcttattgaaaaaaaaataatgtatcataaacatgggtatgtatgtaaagaa 46879111  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  46879110 ataattaatgtagttggaaatagcaaa 46879084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 244
Target Start/End: Original strand, 49383640 - 49383819
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||  | ||| || |||||||||||||||||    
T  49383640 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaatagagagggttggtttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaaga 49383739  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  49383740 aaaaaatatataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaaaaggtcttataaaaa 49383819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 29719456 - 29719698
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  29719456 cctccgtccttaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 29719555  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | || ||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |  || ||||  ||||||||    
T  29719556 tttatccttaagagagagagttaatttatgttttgaacatactatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaagaagggtatgttggtaaagaa 29719655  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  29719656 ataattaatgtacttggaaataccaaatgggttttataaaaag 29719698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Original strand, 48904070 - 48904254
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| ||||||||||    
T  48904070 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 48904169  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| ||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  48904170 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggac 48904254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Original strand, 37144230 - 37144413
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatcc-ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagt-tgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||||    
T  37144230 cctccgtccctaattataagaacccttttgaaaaattaacgggaattaagatagtggatatttttattaaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 37144329  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 183  Q
    |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37144330 attttatcttttaagagagagagttgatttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 37144413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 12918583 - 12918829
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  12918583 cctccgtccctaaatatatgagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 12918682  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  12918683 tttatccttaagagagatagttaatttatattttcaatataatatttattgttaattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 12918782  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  12918783 ataattaatgtacttgaaaataccaaaaggatcttataaaaagggac 12918829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 48902454 - 48902699
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || | |||||| |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||  | |||||||||||||||    
T  48902454 cctccgtccctaaatataggagcattttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataactactattgtttttacaat 48902553  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||| ||    
T  48902554 tttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataaaggtatgttggtaaaaaa 48902652  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  48902653 ataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggac 48902699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20849127 - 20848990
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20849127 tccctccatccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaggatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 20849028  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttc 137  Q
    ||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  20849027 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttc 20848990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Original strand, 17589683 - 17589867
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||    
T  17589683 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 17589782  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| ||| | ||||||||  ||  |||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  17589783 aaaaaatgcaaaataaataagggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaagggac 17589867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33976772 - 33976549
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||||   ||||| || | |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| | | ||||| ||||| |||    
T  33976772 cctccatcccgaattataggacccttttaaaaaaataacagaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgcttttataat 33976673  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||    ||||  | |  ||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33976672 tttatccttt---gagatggatgatttatgttttcaacatgttatttatggctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaa 33976576  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33976575 ataattaatgtagttggaaataacaaa 33976549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 34021802 - 34021982
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| ||||||||||    
T  34021802 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 34021901  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  34021902 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattgatgtacttgaaaataccaaaggagtcttataaaaag 34021982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30820079 - 30819924
Alignment:
Q  94 ttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgta 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||  || |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||     
T  30820079 ttttacaattttatccttaagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgtt 30819980  T
Q  194 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30819979 agtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 30819924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 12675165 - 12675275
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12675165 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttaca 12675264  T
Q  101 attttatcctt 111  Q
    |||||||||||    
T  12675265 attttatcctt 12675275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 249
Target Start/End: Original strand, 43408544 - 43408720
Alignment:
Q  75 tgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgta 174  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||     ||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43408544 tgtttataattagtattgtttttacaattttatctttaagagaaagacga--tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgta 43408641  T
Q  175 taataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaat----gtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43408642 taattaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtacgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 43408720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45404666 - 45404425
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  |||  |||||||||||   |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  45404666 cctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagtttgttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 45404567  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  || |||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  45404566 tttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 45404468  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  45404467 ataattaatgtacttggaaacaccaaatgggtcttataaaaag 45404425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15095405 - 15095244
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  ||    
T  15095405 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaggg 15095306  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     |  |  ||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15095305 tagtttggtaaacaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaagggac 15095244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 224
Target Start/End: Original strand, 44542303 - 44542440
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  44542303 tattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataaga 44542402  T
Q  187 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44542403 acatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 44542440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 16776652 - 16776874
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt--aagagagagag 122  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||| |  | | | ||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| |    
T  16776652 ccttttggaaaaataacgggaattaagaaaattaaaagtggtaataaatttgtttgtaattactattgtttttacaaatttgtccttttaagagagaggg 16776751  T
Q  123 ttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 222  Q
    ||||| ||||||||| || |  || ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| || || |  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16776752 ttagtgtatgttttcaatgtagtatttaatgctgattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatattggtaaagaattaattaatgtacttggaaa 16776851  T
Q  223 taacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  16776852 tagcaaaggggtcttataaaaag 16776874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Original strand, 19350123 - 19350302
Alignment:
Q  6 ccgtccctaattataagatcctttt-gctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||| || ||||||    ||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  19350123 ccgtccctaattataggacccttttaaaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttataaatt 19350222  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 183  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19350223 tatccttcaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaata 19350302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49543854 - 49543723
Alignment:
Q  118 gagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 217  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| || |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49543854 gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaaaaaaaagatgtatgataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 49543755  T
Q  218 ggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  49543754 ggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggac 49543723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 32968971 - 32969216
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  32968971 cctccgtccctaaatataggagtcttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 32969070  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  ||  |||   |||||||    
T  32969071 tttatccttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtctgttgttaaagaa 32969169  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  32969170 ataattaatgtacttggaaacaccaaagggatcttataaaaagggac 32969216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 42526370 - 42526616
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||||| |||  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  42526370 cctccgtccttaaatataagagccttttgtcaaaattacagagattaagaaagttgattatagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 42526469  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||| || || | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  42526470 tttatccttaagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaagaggtgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaa 42526569  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  42526570 ataattaatgtacttgaaaatactaaagaggtcttgtaaaaagggac 42526616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 52178050 - 52177876
Alignment:
Q  46 attaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttc-catatg 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||   || ||||||||||   |||       
T  52178050 attaagatagtggatatttgtattaaatatctttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagattggtttatgtttcaacattct 52177951  T
Q  144 ctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52177950 ctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 52177876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20848708 - 20848612
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20848708 ttattgttgattgatgaaaaagatgtataataaatcggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaa 20848612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 242
Target Start/End: Original strand, 46557751 - 46557867
Alignment:
Q  126 gtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 225  Q
    |||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46557751 gtttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 46557850  T
Q  226 caaaggggtcttataaa 242  Q
     |||||| |||||||||    
T  46557851 aaaagggatcttataaa 46557867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 54866565 - 54866388
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||||| |||| |||||| ||||||   |||||||||| | |||||||||||||||    
T  54866565 cctccgtccctaattataagatccttttga-aaaataatggaaattaagatagtgaatatttatattaattatgtttgtaattactattgtttttacaat 54866467  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 180  Q
    |||||| || || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54866466 tttatcttttaataaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 54866388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23308200 - 23308059
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23308200 aaaataacgggaattaagacagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagagagagggttagtttatg 23308101  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgta 174  Q
    ||||| | ||| || |||||||||||| || |||||||||||    
T  23308100 ttttcaacatgttatttattgctgattaaaaaaaaagatgta 23308059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42755548 - 42755391
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  ||    
T  42755548 tattgtttttataattttatccttaaaagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataaagg 42755449  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  42755448 tatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaataccaaaaaggtcttataaaaag 42755391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8379907 - 8379723
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||  || | |||| ||||||||||    
T  8379907 gtattaaatttgtatataattactactgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatattgattgttgattgaaga 8379808  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| ||  | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  8379807 aaaaaattcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaatgggtcttataaaaaaggac 8379723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25879431 - 25879256
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  25879431 cctccgtccctaattatg-gacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgcattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaat 25879333  T
Q  103 tttatc-cttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataat 178  Q
    ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25879332 tttatcttttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataat 25879256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 49543925 - 49544161
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | |||| |  || |||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  49543925 ctccgtccctaattatagggccctttagaaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttttacaatt 49544024  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  || ||| || |||||||||||||| ||  | ||||||||| || |||   || || ||     
T  49544025 ttatccttaagagagagagttaatttatgtttttaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaatatacaaaataaataggggtatgatggtgaaaaat 49544124  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata 240  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  49544125 taattaatgcacttgaaaataacaaaggggtcttata 49544161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38341240 - 38340996
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| | ||||| || |  ||||||||||| | |  |  |||||||  ||| | |||| | |||||||||||||||    
T  38341240 cctccgtccctaaatatacgagccttttacaaaaattacagagattaagaaagttggttgtaatattaaatctgtatataattactattgtttttacaat 38341141  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  || |||| |||||||||    
T  38341140 tttatccttaagagagag--ttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgtttgtaaagaa 38341043  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     |||||||| || || ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  38341042 ttaattaatatacttcgaaatactaaagaggtcttgtaaaaagggac 38340996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 7462843 - 7462921
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgttt 79  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7462843 tccctccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgttt 7462921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9582383 - 9582289
Alignment:
Q  155 tgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9582383 tgattgaagaaaaagatgtaaaataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatatagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggac 9582289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33290636 - 33290417
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |  |||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||| |||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  33290636 cctccgtctctaattatatgaacctttagtcaaaatcacggaaattaagaaagttgataatagtattaaatttgtttataattactattatttttacaat 33290537  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    | ||| ||||||||  ||||||| |||||||| || | ||  || |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| || |||   ||||||||    
T  33290536 tgtattcttaagag--agagttaatttatgttctcaacataatatttattattgattgaagaaaaagatgaaaaataaataggggtatggtggtaaagaa 33290439  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaata 224  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  33290438 ataattaatgtaattgaaaata 33290417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 168
Target Start/End: Original strand, 41750932 - 41751097
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  41750932 cctccgtccttaattatatgatccttttga-aaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 41751030  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaa 168  Q
    ||||||| || ||||||| |||| |||||||||||| | ||| || ||| || |||||||| |||||    
T  41751031 tttatcctttgagagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttaatgttgattgaaaaaaaa 41751097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31541314 - 31541073
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| || | || |||||||| |||||   ||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  31541314 cctccgtccctaaatacaggagccttttgccaaaattgtggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 31541215  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| |    |||||  || ||||  |||||||     
T  31541214 tttatccttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgca----aaataagggtatgttggtaaagat 31541120  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  31541119 ataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggac 31541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Original strand, 18658311 - 18658442
Alignment:
Q  110 ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgt-aaagaaataatt 208  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  18658311 ttaagagatagagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaaaaaataatt 18658410  T
Q  209 aatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 241  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18658411 aatgtagttggaaatagcaaa-gggtcttataa 18658442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 54927835 - 54928078
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||  |||||| |||| | |  | |||||||| |||| |||||| | ||||||||||| |||    
T  54927835 cctccgtccctaattataggagctttttgcaaaaattacggagattaagcaagttggttgtagtattaaatttgtatgtaattactattgtttttataat 54927934  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||   | ||||  ||||| |    
T  54927935 tttatcatttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaaagtatgttggtaaaaa 54928034  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| | || ||||||||||    
T  54928035 aataattaatgtacttggaaatactaaaagagtattataaaaag 54928078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Original strand, 34265491 - 34265716
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagag---- 120  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | || | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||        
T  34265491 ccttttgtcaaaattacgggaattaagaaagtcggtagtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattcttaagagagagatga 34265590  T
Q  121 --agttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 218  Q
      | ||||||||||||||| | ||  || ||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  34265591 ataattagtttatgttttcaacatagtatttattgtcgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaaggtatgttagtaaagaaataattaatgtaattg 34265690  T
Q  219 gaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
     ||||| ||||| | ||||| |||||    
T  34265691 aaaatatcaaagagatcttaaaaaaa 34265716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 42044061 - 42044239
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||    
T  42044061 gtattaaatttgtgtataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 42044160  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||  ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||| | ||||  | ||||||||||||    
T  42044161 aaa--atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatatacttggaaacaccaaaaagatcttataaaaag 42044239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 249
Target Start/End: Original strand, 48655072 - 48655231
Alignment:
Q  90 ttgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggca 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  || |    
T  48655072 ttgtttttacaattttatacttaagatggagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggta 48655171  T
Q  190 tgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| |   ||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  48655172 tgttggtaaagaaataataaatgtactcaaaaataccaaagggatcttataaaacgggac 48655231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Original strand, 18658173 - 18658295
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  18658173 cctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 18658272  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagtt 124  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  18658273 tttatcctttaagagatagagtt 18658295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34811514 - 34811360
Alignment:
Q  95 tttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||   | ||||      
T  34811514 tttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaagaatgcaaaataaataagagtatgttg 34811415  T
Q  195 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  34811414 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataccaaaaggatcttataaaaagggac 34811360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4564444 - 4564280
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaa-gaaaaagatgtataataaatagtg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |   || |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||  |    
T  4564444 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacacaatatttattgttgattgaataaaaaagatgcaaaataaataagg 4564345  T
Q  187 g--catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |   ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  4564344 gtatatgttagtaaagaaataatcaatgtacttggaaatactaaagaggtcttataaaaagggac 4564280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Original strand, 39625684 - 39625785
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||    
T  39625684 ttattgctaattgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagttttataaaaaggg 39625783  T
Q  248 ac 249  Q
    ||    
T  39625784 ac 39625785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 40215059 - 40215220
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||   ||    
T  40215059 tattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaatcaggg 40215158  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  40215159 tatgttggtaaagaaacaattaatgtacttgaaaataccaaaagaatcttataaaatgggac 40215220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 229
Target Start/End: Original strand, 28875059 - 28875222
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||  || |||||| ||||||||||    
T  28875059 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-ttaagagagagagttaatttatatttttaatataatatttattgttgattgaaga 28875157  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    |||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28875158 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaatatcaaa 28875222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 249
Target Start/End: Original strand, 7462925 - 7462988
Alignment:
Q  186 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7462925 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 7462988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 9582479 - 9582396
Alignment:
Q  26 cttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc 109  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9582479 cttttgccaaaatcgcgggaattaagaaagtggatatttgtatcaaagttgtttggaattactattgtttttacaattttatcc 9582396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35938623 - 35938472
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| |||| |||||||||| | || | ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  35938623 aaaataacggaaattaagaaaattgaaagttgtaataaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaagagagatagttagtgtatg 35938524  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 184  Q
    ||||| | ||| || ||| || |||| |||||||||||| || |||||||||    
T  35938523 ttttcaacatgataattaatgttgatcgaagaaaaagatataaaataaatag 35938472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 136
Target Start/End: Original strand, 39625232 - 39625335
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  39625232 aaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagtttgtttatt 39625331  T
Q  133 tttt 136  Q
    ||||    
T  39625332 tttt 39625335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24813814 - 24813651
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||    
T  24813814 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagaaag--taaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 24813717  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 230  Q
    |||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  24813716 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaatatttaatgtacttggaaatatcaaag 24813651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 55287517 - 55287338
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||   |||||| | || |||||  ||||||||||||||||||| |    || |||||||||||||    
T  55287517 aaaatcatgggaattaagaaagttgatttttgcattat--ttgtttttgattattatgatttttacaattttatcctttat---gatagttagtttatgt 55287423  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 218  Q
    |||| | ||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  55287422 tttcaacatgttatttattgttgattgaagtaaaagatgtattataaacaggggtatgttcgtaaaaaaataattaatgtagttg 55287338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 21497599 - 21497689
Alignment:
Q  46 attaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgtttt 136  Q
    ||||||||||| |||  | |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21497599 attaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgtttt 21497689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 41751383 - 41751457
Alignment:
Q  172 gtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  41751383 gtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaacgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagg 41751457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7886532 - 7886455
Alignment:
Q  172 gtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  7886532 gtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggaatcttataaaaatggac 7886455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36584997 - 36584756
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || | |||||  |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | ||||||||||| |||    
T  36584997 cctccgtccctaaatataggagctttttgtcaaaattgcggagattaagaaagtcggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttataat 36584898  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||| ||||  || |||||| ||||||||||||   ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  36584897 tttatccttaagag--agagtaaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaa---atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 36584803  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||   |||||||||||||||||    
T  36584802 ataattaatgtacttggaaacaccaaataagtcttataaaaagggac 36584756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 249
Target Start/End: Original strand, 52693547 - 52693679
Alignment:
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||   ||||||||||||||||||| |    
T  52693547 agagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttgttaaagaaataattaatgtact 52693646  T
Q  217 tggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  52693647 tggaaataccaaaatggtcttataaaaagggac 52693679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 249
Target Start/End: Original strand, 54690581 - 54690657
Alignment:
Q  173 tataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  54690581 tataataaatagaggcatgcatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaaaggac 54690657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40048078 - 40047979
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   | ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||    
T  40048078 ttattgctgattgaagaaaaatatgtaaaataaataagtgtatgttagtaaataaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttgtaaaaaggg 40047979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Original strand, 43408197 - 43408266
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaa 72  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  43408197 cctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaa 43408266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 142
Target Start/End: Original strand, 8503277 - 8503385
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| |  || |||| ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  8503277 aaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttttacaattttatccttaagagagatatttaatttatgt 8503376  T
Q  134 tttccatat 142  Q
    |||| ||||    
T  8503377 tttcaatat 8503385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20919189 - 20919133
Alignment:
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20919189 catgtatgtaaagaagtaattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaa 20919133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20928151 - 20928095
Alignment:
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20928151 catgtatgtaaagaagtaattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaa 20928095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 214
Target Start/End: Original strand, 4836523 - 4836647
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  ||    
T  4836523 tattgtttttacgattttatcctta--agagagagttaatttatgttttcaacataatatttatttttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaagg 4836620  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgta 214  Q
     ||||   |||| ||||||||||||||    
T  4836621 tatgttactaaataaataattaatgta 4836647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 246
Target Start/End: Original strand, 2764233 - 2764390
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  ||    
T  2764233 tattgtttttaca-tttgatacttaaaaaagaaagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaggg 2764331  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
     |||   ||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||  || ||||||||||    
T  2764332 tatgctggtaaagaaacaattaatgcaattgaaaataccaaaggaatcatataaaaagg 2764390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 137
Target Start/End: Original strand, 22494490 - 22494539
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttc 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22494490 tattatttttacaattttatccttaagagagagagttgatttatgttttc 22494539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 137
Target Start/End: Original strand, 16776522 - 16776626
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  | | | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | |||||| ||||    
T  16776522 aaaataacgggaattaagaaaattaaaagtggtaataaatttgtttgtaattattattgtttttacaaatttgtcctttaagagagggggttagtgtatg 16776621  T
Q  133 ttttc 137  Q
    |||||    
T  16776622 ttttc 16776626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 29447602 - 29447674
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttc 137  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29447602 gtattaaatttgtatataattactattatttgtacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttc 29447674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Original strand, 33360890 - 33360954
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgta 67  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33360890 cctccgtccttaattataagacccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgta 33360954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 84
Target Start/End: Original strand, 46557660 - 46557740
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaat 84  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||| | | ||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  46557660 ctccgtccctaattacaagattcttttggaaaaataacgggaattaaaataatggatatatgtattaaatatgtttgtaat 46557740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 171
Target Start/End: Original strand, 13702666 - 13702769
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaa 167  Q
    |||| |||||||||||   |||| |||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| | ||  || ||| ||||||||||||||||    
T  13702666 taaatttgtttgtaattgctattcttttaacaattttatcctttaagagagggggttagtgtatgttttcaacatagtatttaatgctgattgaagaaaa 13702765  T
Q  168 agat 171  Q
    ||||    
T  13702766 agat 13702769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 184
Target Start/End: Original strand, 23650639 - 23650758
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||||||||||| | ||  ||||||||  | |||| |||    
T  23650639 tattaaatttgtttgtaattagtaatgtttttacaattttatcctttatgaaaaaaagttagtttatgttttcaacataatacttattattaattggaga 23650738  T
Q  165 aaaagatgtataataaatag 184  Q
    |||| | ||| |||||||||    
T  23650739 aaaataagtaaaataaatag 23650758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27067572 - 27067501
Alignment:
Q  110 ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaa 181  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| |  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27067572 ttaagagagagagtttgtttatgttttcaacatgctatttatggtagattgaataaaaaaatgtataataaa 27067501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 249
Target Start/End: Original strand, 1330943 - 1330998
Alignment:
Q  194 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1330943 tgtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaagggac 1330998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 7051754 - 7051724
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7051754 tccctccgtccctaattataagatccttttg 7051724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 79
Target Start/End: Original strand, 9018089 - 9018123
Alignment:
Q  45 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgttt 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9018089 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgttt 9018123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 10044845 - 10044875
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10044845 tccctccgtccctaattataagatccttttg 10044875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 244
Target Start/End: Original strand, 16869513 - 16869563
Alignment:
Q  194 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  16869513 tgtaaagaaataattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaa 16869563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 111
Target Start/End: Original strand, 20084697 - 20084739
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt 111  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20084697 taaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttatcctt 20084739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Original strand, 29454725 - 29454771
Alignment:
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  29454725 agaaataattaatgtacttggaaataccaaaggagacttataaaaag 29454771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 32963139 - 32963109
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32963139 tccctccgtccctaattataagatccttttg 32963109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 32978484 - 32978514
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32978484 tccctccgtccctaattataagatccttttg 32978514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 33868451 - 33868481
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33868451 tccctccgtccctaattataagatccttttg 33868481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36730107 - 36730057
Alignment:
Q  195 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36730107 gtaaagaattaattaatatacttggaaatatcaaaggggccttataaaaag 36730057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 49543924 - 49543866
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatat 62  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  49543924 ctccgtccctaattataggccccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatat 49543866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 77
Target Start/End: Original strand, 2801221 - 2801294
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgt 77  Q
    |||| ||||||| |||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  2801221 ctccatccctaaatataagagttttttgtcaaaatcacgggaattaagaaagttgataatagtattaaatttgt 2801294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 18657713 - 18657613
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||  ||||| | ||||||||||||| | || |   ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18657713 cctctgtccttaattataggacccttttga-aaaataatgggaattaagaaaattgaaaggggtaataaatttgtttgtaattattattgtttttacaat 18657615  T
Q  103 tt 104  Q
    ||    
T  18657614 tt 18657613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Original strand, 21777975 - 21778064
Alignment:
Q  157 attgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||| ||||||||||| |  |||| ||| || ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||| ||||||||    
T  21777975 attgtagaaaaagatgcaacataattagaggtatgttagtaaagaaataattaatgaagttgaaaattatcaaggggtcttgtaaaaagg 21778064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 21458987 - 21459015
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21458987 cctccgtccctaattataagatccttttg 21459015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 24813607 - 24813635
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813607 cctccgtccctaattataagatccttttg 24813635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 27646338 - 27646310
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27646338 cctccgtccctaattataagatccttttg 27646310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 28673326 - 28673298
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28673326 cctccgtccctaattataagatccttttg 28673298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 33212402 - 33212430
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33212402 cctccgtccctaattataagatccttttg 33212430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 34811320 - 34811348
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34811320 cctccgtccctaattataagatccttttg 34811348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 50517554 - 50517526
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50517554 cctccgtccctaattataagatccttttg 50517526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 53164168 - 53164196
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53164168 cctccgtccctaattataagatccttttg 53164196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 54690378 - 54690435
Alignment:
Q  115 agagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgta 174  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||  || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54690378 agagagagttggtttatgttttcaacat--tatttattggtgattgaagaaaaagatgta 54690435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 184)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23789263 - 23789015
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23789263 tccctccgtccctaattataagactattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 23789164  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23789163 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 23789064  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23789063 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 23789015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 39833742 - 39833990
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39833742 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 39833841  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39833842 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 39833941  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39833942 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 39833990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1360085 - 1359837
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1360085 tccctccgtccctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 1359986  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1359985 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 1359886  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1359885 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 1359837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2438519 - 2438271
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2438519 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttaca 2438420  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2438419 attttatccttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 2438320  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2438319 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 2438271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 16805536 - 16805782
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16805536 cctccgtccctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 16805635  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16805636 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 16805735  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805736 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 16805782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 16844818 - 16845064
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16844818 cctccgtccctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 16844917  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16844918 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 16845017  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16845018 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 16845064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 8841400 - 8841648
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8841400 tccctccgtccctaattataagactcttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 8841499  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8841500 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaag 8841599  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8841600 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 8841648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 16108218 - 16108466
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16108218 tccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 16108317  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16108318 attttatccttaagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaa 16108417  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108418 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 16108466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 16456615 - 16456863
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16456615 tccctccgtccctaattataagacccttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 16456714  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16456715 attttatccttaagacagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 16456814  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16456815 aaataattaatgtagttggaaatgacaaaagggtcttataaaaagggac 16456863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 17408041 - 17408285
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17408041 tccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 17408140  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17408141 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatactacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaat 17408240  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17408241 aattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 17408285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22897685 - 22897437
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22897685 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 22897586  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22897585 atattatccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 22897486  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22897485 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggttttataaaaagggac 22897437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 29239336 - 29239584
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  29239336 tccctccgtccctaattataagactcttttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgttataaagttgtttgtaatcactattgtttttaga 29239435  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29239436 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaag 29239535  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29239536 aaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 29239584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7492138 - 7491890
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7492138 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacaggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 7492039  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7492038 attttatccttaagagaaagagttagtttatgttttccatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 7491939  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7491938 aaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggac 7491890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11201977 - 11201732
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11201977 tccctctgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgcgaattaaaaaagcagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 11201878  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11201877 attttatccttaagagtgagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 11201778  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11201777 aaataattaatgtagttggaaataacaaaagtgtcttataaaaagg 11201732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Original strand, 9697908 - 9698132
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9697908 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaatcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 9698007  T
Q  125 agtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 224  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9698008 agtttatatttttcatatactacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 9698107  T
Q  225 acaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9698108 acaaaggggtcttataaaaagggac 9698132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27560500 - 27560252
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27560500 tccctccgttcctaattataagaccattttgttaaaatcatgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtatgtaatcactattgtttttaca 27560401  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27560400 attttatccttaagaaagagagttaatttatgtttttcatatgttacttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaataggagcatgtatgtaaag 27560301  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27560300 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 27560252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 34883590 - 34883839
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34883590 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 34883689  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34883690 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 34883789  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34883790 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 34883839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Original strand, 19630933 - 19631179
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaatt--ataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  19630933 cctccgtccctaattttataagacccttttactaaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttctaatcactattgtttttaca 19631032  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19631033 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaag 19631132  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19631133 aaataattaatgtagttggaaataac-aaggggtcttatataaaggga 19631179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Original strand, 19827834 - 19828080
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaatt--ataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  19827834 cctccgtccctaattttataagacccttttactaaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttctaatcactattgtttttaca 19827933  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19827934 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaag 19828033  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19828034 aaataattaatgtagttggaaataac-aaggggtcttatataaaggga 19828080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25625024 - 25624778
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25625024 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 25624925  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25624924 attttatccttta-agaaag-gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 25624827  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25624826 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 25624778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 7116050 - 7116290
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  7116050 gtccctatatataagatccttttgctaaaatcacgggaaataagaaagtg-atatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttat 7116148  T
Q  108 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7116149 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataat 7116248  T
Q  208 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  7116249 taatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaagggac 7116290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32121239 - 32120990
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32121239 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 32121140  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||  | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32121139 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 32121040  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32121039 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 32120990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 13197387 - 13197636
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13197387 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatctcgggaattaagatagtggatatttgtattaaacttgtttgtaatcactattgtttttaca 13197486  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13197487 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 13197586  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13197587 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaaggac 13197636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 20727600 - 20727849
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20727600 tccctccgttcctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 20727699  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    |||||||| || |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20727700 attttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaa 20727799  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20727800 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 20727849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4712021 - 4711773
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4712021 tccctccgtctctatatataagacccttttgctaaaatcatgggaattaagatactggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 4711922  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4711921 attttatctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaag 4711822  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4711821 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggccttataaaaagggac 4711773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 8716634 - 8716883
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8716634 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 8716733  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8716734 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 8716833  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8716834 gaattaattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 8716883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 15404450 - 15404698
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15404450 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 15404549  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15404550 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatt-tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa 15404648  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15404649 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 15404698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 34062411 - 34062656
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34062411 tccgtccctatatataagacctttttgctaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 34062510  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34062511 tatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 34062610  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34062611 taactaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 34062656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 36130770 - 36131019
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36130770 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 36130869  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  36130870 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa 36130969  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36130970 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaaggtcttataaaaagggac 36131019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45474610 - 45474369
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45474610 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 45474511  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45474510 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 45474411  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45474410 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataa 45474369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15571478 - 15571232
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |    
T  15571478 cctccttccctatatataagacccttttgctaaaatcacggaaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttatagt 15571379  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||    
T  15571378 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggaacatgtatctaaagaa 15571279  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  15571278 ataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaagggac 15571232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1943869 - 1943624
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||| | |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1943869 tccctccgtccctatatataaaacccttttgtcaaaatcacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 1943770  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1943769 attttatcctttaagaaagatggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa 1943670  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1943669 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 1943624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 12889954 - 12890199
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  12889954 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 12890053  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12890054 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 12890152  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12890153 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 12890199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20252486 - 20252260
Alignment:
Q  20 aagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagag 118  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  20252486 aagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaag 20252387  T
Q  119 agagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 218  Q
    |  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20252386 aaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattg 20252287  T
Q  219 gaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20252286 gaaataacaaaggggtcttataaaaag 20252260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37229732 - 37229486
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37229732 ctccgtccctatatataagactcttttgtcaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatt 37229633  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37229632 ttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatatataataaataggggcatgtatgtaaagaa 37229533  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37229532 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 37229486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41450795 - 41450562
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  41450795 tataagacccttttgccaaaatcacaggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaaga 41450696  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41450695 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtag 41450596  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41450595 ttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 41450562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12360745 - 12360502
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12360745 tccgtccctatatataagacccttttgttaaaattaagggaattaagaaagtggatatttgtattaaagctgtttgtaatcattattgtttttacaattt 12360646  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12360645 tatccttaagagacaaagttagtttctattttccatatattatttattgttgatttaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgtatgtaaagaaat 12360547  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  12360546 aattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggac 12360502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40607995 - 40607748
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  40607995 cctctgtctctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 40607896  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  40607895 tttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttaaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaaga 40607796  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40607795 aataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 40607748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 22182669 - 22182914
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  22182669 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 22182768  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||| || ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22182769 tttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 22182867  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22182868 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 22182914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8990483 - 8990250
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8990483 tataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatgttatcctttaaga 8990384  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  8990383 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtag 8990284  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8990283 ttggaaataacaaaagggttttataaaaagggac 8990250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16669921 - 16669672
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16669921 tccctccgtcccaatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttata 16669822  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  16669821 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatgggggtatgtatgtaaa 16669722  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16669721 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 16669672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 15227893 - 15228140
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  15227893 tccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 15227992  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||  |||||||| || |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15227993 attttatccttc-gagagagaattggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaag 15228091  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15228092 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 15228140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 1422168 - 1422378
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1422168 cctccgtccctatatataagacccttttgttaaaattacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaat 1422267  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1422268 tttatgcttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatag-ggcatgcatgtaaagaa 1422366  T
Q  203 ataattaatgta 214  Q
    ||||||||||||    
T  1422367 ataattaatgta 1422378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40681022 - 40680773
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||   |||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  40681022 tccctccgtccctatatataagacattttttccaaaatcacgggaattaagatggtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttaca 40680923  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40680922 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaa 40680823  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680822 gaaataattaatatagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 40680773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 38 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5664896 - 5664684
Alignment:
Q  38 tcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgtttt 136  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||    
T  5664896 tcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgtttt 5664797  T
Q  137 ccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtct 236  Q
      | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5664796 taacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaatgaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtct 5664697  T
Q  237 tataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||    
T  5664696 tataaaaagggac 5664684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 40788836 - 40789079
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  40788836 tccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttatattaaatatgtttataattactattgtttttacaattt 40788935  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40788936 tatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 40789034  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40789035 aattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 40789079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 42629660 - 42629418
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatcctttt-gctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttac 99  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42629660 tccctccgtccctatatataagacccttttcgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttac 42629561  T
Q  100 aattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    |||||||||||| |       ||||||||||||||||| | ||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  42629560 aattttatccttta-------agttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataatatataagggcatgtatgtaaa 42629468  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42629467 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 42629418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 36020992 - 36021235
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36020992 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 36021091  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |||||| | |  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36021092 attttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgttttcgacatgttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaa 36021190  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36021191 gaaataattaatatagttggaaataataaaggagtcttataaaaa 36021235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24345710 - 24345463
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  24345710 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaataactattgtttttacaat 24345611  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||||| |   ||||| |||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24345610 tttatcctttaagaaagagagctgacttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 24345511  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  24345510 aataattaatgtagttggaaatagaaaaagggtcttataaaaagggac 24345463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 8912620 - 8912865
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |    
T  8912620 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagt 8912719  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8912720 tttatccttta-agagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 8912818  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8912819 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 8912865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23465426 - 23465181
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  23465426 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 23465327  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||| || ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23465326 tttatccttta-agagagaattggttaatattttcaacatgatatttattgatgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 23465228  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23465227 ataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 23465181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 11865031 - 11865275
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  11865031 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 11865130  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11865131 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaag 11865230  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11865231 aaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 11865275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23083790 - 23083541
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| ||||||  |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083790 cctccatccctatatataggaccctttttctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattagagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 23083691  T
Q  103 ttta---tcctta--agagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgta 197  Q
    || |   ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  23083690 ttaatattccttaagagagagagagttggtttatgttttccatatcttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgta 23083591  T
Q  198 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    || |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23083590 aaaaaattattaatgtagttcgaaatagcaaatgggtcttataaaaaggg 23083541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 1143002 - 1143249
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  1143002 cctccgtccctaattataagatccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 1143101  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1143102 tttatcctttaagaaagatggttggtttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 1143201  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  1143202 aataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaagggac 1143249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2200272 - 2200029
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  2200272 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 2200173  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||| || ||||||||| ||| |||| ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||| |    
T  2200172 tttatcatttaagagagagtgttggtttctgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtacagtaaatagggtcatgtatgtaaata 2200073  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2200072 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 2200029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45152029 - 45151794
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcatta----ttgtttttacaattttatcctta 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    || ||||||||||||||||||||    
T  45152029 tataggatccttttgctaaaatcacatgaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactatagtttttttttacaattttatcctta 45151930  T
Q  113 agagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaat 211  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||    
T  45151929 --agagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaaagatatataataaataagggcatgtatgtaaaaatataattaat 45151832  T
Q  212 gtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  45151831 gtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 45151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28840899 - 28840684
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28840899 aaaataacgggaattaagat-gtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatg 28840801  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28840800 ttttcaacatgttatttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggg 28840701  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||    
T  28840700 gtcttataaaaagggac 28840684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2060609 - 2060363
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||    
T  2060609 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaat 2060510  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||    
T  2060509 tttatcctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagat-tataataaatatgggaatgtatgtaaaga 2060411  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  2060410 aataattaatgtagttggaaataacaaatgagtattataaaaagggac 2060363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 249
Target Start/End: Original strand, 9040874 - 9041097
Alignment:
Q  26 cttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtta 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9040874 cttttgctaaaatcacgagaattaagaaagtagatacttatattaaagttaattgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagatatagtta 9040973  T
Q  126 gtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 225  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||    
T  9040974 gtttatgtttttcatatgttatttattgctgattcaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaatcattaatatagttgaaaataa 9041073  T
Q  226 caaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| | |||||||||||| ||||    
T  9041074 caaacgagtcttataaaaaaggac 9041097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31751365 - 31751115
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  31751365 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 31751266  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaa---gatgtataataaatagtggcatgtatgtaa 198  Q
    ||||||||| |||| ||||  || |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  31751265 tttatcctttaagaaagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgcatgtaa 31751166  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31751165 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 31751115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 1748386 - 1748633
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||| |  ||| |||||||||     
T  1748386 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagattatggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattatttttacaaa 1748485  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||    
T  1748486 tttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggtatgtatgtaaaga 1748585  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  1748586 aataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttataaaaagggac 1748633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 19318799 - 19319046
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  19318799 cctctgtccctaattatagggtccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 19318898  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  19318899 tttatcctttaagagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacgtgtatgtaaaga 19318998  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  19318999 aataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 19319046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 26322037 - 26322284
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  26322037 cctccgtccttaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 26322136  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| | | | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26322137 tttatcctttaagaaagagggctggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggtgcatgtatgtaaaga 26322236  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  26322237 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 26322284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34113820 - 34113577
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||    | |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  34113820 tccctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaatttag----ttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 34113725  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||| | || |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  34113724 attttatccttta-agagataattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaag 34113626  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34113625 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 34113577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41004234 - 41003989
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||||| |||    
T  41004234 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtgattaatattgtttttataat 41004135  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  41004134 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattaatgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatccatgtaaagaa 41004036  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41004035 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 41003989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24974091 - 24973846
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  24974091 tccgtccctaattacaagactcttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattt 24973992  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||| | || ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24973991 tatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatagaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 24973892  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  24973891 taattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggac 24973846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19034703 - 19034465
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||   ||||||||    
T  19034703 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactatt---tttacaat 19034607  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||  ||||| ||||| | ||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19034606 tttgtcctttaagagagagtgttgatttatcttttcaacatgttatttattgttgaatgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 19034507  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19034506 aataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 19034465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19353484 - 19353237
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||   ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19353484 cctccgtccctaattataaggcctctttaaaaaaataaagggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaat 19353385  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||   |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19353384 tttatcctttaagaatgagtgttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 19353285  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19353284 aataattaatgtagttgaaaatagaaaagggatcttataaaaagggac 19353237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 249
Target Start/End: Original strand, 10757816 - 10757969
Alignment:
Q  98 acaattttatccttaagag--agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatg 195  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  10757816 acaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataagagcatgtatg 10757915  T
Q  196 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757916 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 10757969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38214767 - 38214526
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38214767 cgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 38214668  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    ||||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  38214667 tccttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaaagaaataa 38214569  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  38214568 ttaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggac 38214526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17665811 - 17665571
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17665811 cgtccctaattatatgtcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaatttta 17665712  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    || || | |||||||| |  | ||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17665711 tctttta-agagagagatgatatatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatgcatgtaaagaaataa 17665613  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17665612 ttaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaaggga 17665571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7531889 - 7531650
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7531889 gtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 7531790  T
Q  108 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataat 207  Q
    |||| | ||||||| ||  ||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  7531789 ccttta-agagagatttgttttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaatgaaataat 7531691  T
Q  208 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7531690 taatgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaaggga 7531650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 38121255 - 38121502
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||   ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  38121255 cctccgtccctaattataaagtccttttaaaaaaataacggaatttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 38121354  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  38121355 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 38121454  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  38121455 aataattaatgtagttggtaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 38121502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 228
Target Start/End: Original strand, 41967987 - 41968174
Alignment:
Q  42 gggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccat 140  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |     
T  41967987 gggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaac 41968086  T
Q  141 atgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaa 228  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41968087 atgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaa 41968174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 45628625 - 45628872
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  45628625 cctccgtccctaattataaagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 45628724  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||| |||| || | |||| ||| | |||| ||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45628725 tttaccctttaaaaaagagggttggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 45628824  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| |  ||||||||||||||||    
T  45628825 aataattaatgtagttgaaaatagaaaatgaatcttataaaaagggac 45628872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Original strand, 40680409 - 40680652
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| | ||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  40680409 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataatgggaattaaaatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 40680508  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  40680509 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaa 40680607  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  40680608 ataattaatataattggaaatagcaaa-gggtcttataaaaaggga 40680652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7418787 - 7418539
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||  ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  7418787 cctcagtccctaattataaagcccttttgaaaaaataacagaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 7418688  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7418687 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaatgatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 7418588  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-aaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||    
T  7418587 aataattaatgtagttggaaatagaaaaagggtcttttataaaagggac 7418539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18375485 - 18375238
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||     |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  18375485 cctccgtccctaattatggagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 18375386  T
Q  103 tttatcctt-aagagaga-gagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18375385 tttatcctttaagagagatgagtga-tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 18375287  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  18375286 aaataattaatatagttgtaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 18375238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20643767 - 20643528
Alignment:
Q  9 tccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc 108  Q
    |||||||||||| |  |||||||  ||||| || |||||||||| || | |||||||||||| |  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  20643767 tccctaattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagcgaatatttgtattatatatgtttgtaattagtattctttttacaattttatc 20643668  T
Q  109 cttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataatt 208  Q
     || | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20643667 tttta-agagagagatgttttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataatt 20643569  T
Q  209 aatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20643568 aatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 20643528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 11851932 - 11852177
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| ||||||||   | ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  11851932 cctccgtccttaattatagagttcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaat 11852031  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||    
T  11852032 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataattaataggggcatgcatgtaaataa 11852130  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11852131 ataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggac 11852177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25523784 - 25523551
Alignment:
Q  11 cctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcct 110  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  25523784 cctaattataggacccttttggaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttaatcct 25523685  T
Q  111 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaa 210  Q
    | | |||||| ||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  25523684 tta-agagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaaaatgtataataaattggagcatgtatgtaaagaaataattaa 25523586  T
Q  211 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  25523585 tgtagttggaaatagtaaatgggtcttataaaaag 25523551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Original strand, 13336501 - 13336744
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  13336501 cctccgtccctaattatagggttcttttgaaaaaataacgggaattaatatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 13336600  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||| || | | |||||||| |||||||||||  | ||| || |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  13336601 tttatcttttaaa-agagagttggtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaataaaatgatgtataataaataggggcatatatataaagaa 13336699  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13336700 ataattaatgtagttggaaataacaaaggaatcttataaaaaggg 13336744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 29830514 - 29830747
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||  || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  29830514 tataagacccttttgtcaaaatcacgaaaagtaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcatttagag 29830613  T
Q  117 agaga--gttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 214  Q
    |||||  |||||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  29830614 agagatagttagtttatgttttcaatttgctatttgatgcttatcgaagaaaaagatgtatagtaaataggggtatgtgtgtaaagaaataattaatgta 29830713  T
Q  215 gttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| | || | |||||||||||||||||    
T  29830714 gttggaaatagc-aatgagtcttataaaaagggac 29830747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41834700 - 41834456
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  41834700 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatactggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaat 41834601  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgta---aa 199  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||   ||    
T  41834600 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttctacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgattaataggggcatgcatgtatgtaa 41834502  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  41834501 aaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaag 41834456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 34944163 - 34944403
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  34944163 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaat 34944262  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  |||||||||||     | || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  34944263 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttc-----gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaaagaa 34944356  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||    
T  34944357 ataattaatgtagttggaaacagcaaaatgttcttataaaaagggac 34944403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 10399208 - 10399453
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | | || ||||||||||||    
T  10399208 tccgtccttaattataaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacttttatttttacaattt 10399307  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10399308 tatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattactcattgaagaaaaagatgtatagtaaataggggcatgtatgtaaagaaa 10399407  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| |||||    
T  10399408 taattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaacgggac 10399453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 15435667 - 15435867
Alignment:
Q  49 aagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctac 147  Q
    |||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |      
T  15435667 aagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattatatcatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgtttt 15435766  T
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15435767 ttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa-aaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaaggg 15435865  T
Q  248 ac 249  Q
    ||    
T  15435866 ac 15435867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5255822 - 5255583
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||||||||||    |||||  ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5255822 cgtccctaattataaggcttttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 5255723  T
Q  107 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    ||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5255722 tcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaata 5255623  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    | ||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||    
T  5255622 a-taatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagg 5255583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 11385914 - 11386159
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  11385914 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 11386013  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  11386014 tttatccttta-agtgagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattaaagaaaaaaatatataattaatagggacatatatgtaaagaa 11386112  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  11386113 ataattaatgtagttggaaatagcaaattagtcttataaaaagggac 11386159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 30779745 - 30779955
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||     
T  30779745 cctccgtccctaattataggatcattttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaa 30779844  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30779845 tttatctttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaaga 30779944  T
Q  202 aataattaatg 212  Q
    |||||||||||    
T  30779945 aataattaatg 30779955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1859818 - 1859594
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagt 123  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  1859818 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagaat 1859719  T
Q  124 tagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 223  Q
    | |||||| ||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1859718 tggtttatattttcaacatcttatttattgttgattgaagaaaaaaatgaataataaata-aggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttggaaat 1859620  T
Q  224 aacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    | |||| | |||||||||||||||||    
T  1859619 agcaaatgagtcttataaaaagggac 1859594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7933703 - 7933471
Alignment:
Q  13 taattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt- 111  Q
    |||||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  7933703 taattataggacccttttgaaaaaacaacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 7933604  T
Q  112 aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaat 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7933603 aagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaacatgtataataaatagaggcatgtatgtaaaacaataattaat 7933504  T
Q  212 gtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
      ||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  7933503 acagttggaaatagcaga-tggtcttataaaaag 7933471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 15353239 - 15353430
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   ||||||||| ||||| |    
T  15353239 aaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcgttta---agagagttaatttattt 15353335  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    |||| | || ||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15353336 tttcaacatactatttattgttgattgaag-aaaagatatataataaataggggcatgtttgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 15353430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6007834 - 6007618
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||    
T  6007834 aaaataacgggaattaagataatatatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttcaagagagagaaatggtttatg 6007735  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       
T  6007734 ttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttagaaataacaaaaat 6007635  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    || ||||||||||||||    
T  6007634 gttttataaaaagggac 6007618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 18374498 - 18374693
Alignment:
Q  54 agtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttatt 152  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||    
T  18374498 agtggacatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt-atcttttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttatt 18374596  T
Q  153 gctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  18374597 gctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggagtcttataaaaagggac 18374693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 43701246 - 43701021
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    |||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||            | | ||||||||||||||||||||    
T  43701246 gtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaa------------ttactattgtttttacaattttat 43701159  T
Q  108 cctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    |||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  43701158 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataa 43701059  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  43701058 ttaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 43701021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Original strand, 44436229 - 44436411
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  44436229 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaaacactattgtttttacaaa 44436328  T
Q  103 tttatc-cttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 184  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44436329 tttatcttttaagaaagagagttagtttatgttttcaagatactatatattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatag 44436411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7666540 - 7666324
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| |||| |||||||| | || |||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| || ||||    
T  7666540 aaaataacggaaattaagataatgaatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagtgaaggttggtatatg 7666441  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  7666440 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgc 7666341  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||    
T  7666340 gtcttataaaaagggac 7666324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 32712531 - 32712775
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||| ||||||||||    |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  32712531 ctccgttcctaattatatagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtagttagtattgattttacaatt 32712630  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||||||| | ||||| |  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  32712631 ttatccttta-agagataaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaatagggacatgtatgtaaagaaa 32712729  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32712730 taattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggac 32712775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 40173147 - 40173380
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  40173147 cctccgtcccttattatatgatccttttgaaaaaataacgggaattaagatcgtgaatatttatattaaatatgtttataattactattgtttttacaat 40173246  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||       |||||||    
T  40173247 tttatcctttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataagtagggg------ggtaaaga 40173340  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  40173341 aataattattgtagttggaaataacaaatgagtcttataa 40173380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 244
Target Start/End: Original strand, 16808975 - 16809201
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    |||||||  ||||| | ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||    
T  16808975 tataagactcttttaccaaaatcgtgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaaag 16809074  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||  | ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16809075 agagagttagtttatattttcaaaatgtaatttaatgccgattgaa-aaaaagatgtatattaaatagagacatgtatgtaaataaataattaatatagt 16809173  T
Q  217 tggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    || |||||  |||  | |||||||||||    
T  16809174 tgaaaataggaaaatgatcttataaaaa 16809201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 244
Target Start/End: Original strand, 16848256 - 16848482
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    |||||||  ||||| | ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||    
T  16848256 tataagactcttttaccaaaatcgtgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaaag 16848355  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||  | ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16848356 agagagttagtttatattttcaaaatgtaatttaatgccgattgaa-aaaaagatgtatattaaatagagacatgtatgtaaataaataattaatatagt 16848454  T
Q  217 tggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    || |||||  |||  | |||||||||||    
T  16848455 tgaaaataggaaaatgatcttataaaaa 16848482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5070557 - 5070355
Alignment:
Q  45 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatg 143  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||     
T  5070557 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaactactattgtttttataattttattctttaagagagatggttggtttatgttttcaacat- 5070459  T
Q  144 ctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  5070458 -tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatataggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgg-aataacaaaagggttttataaaa 5070361  T
Q  244 agggac 249  Q
    ||||||    
T  5070360 agggac 5070355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8782700 - 8782515
Alignment:
Q  62 tttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattg 160  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||| | ||| || |||||||||||||    
T  8782700 tttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattg 8782601  T
Q  161 aagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||    
T  8782600 aagaaaaagatgtataataaatatgttcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaaatagtcttataaaaagg 8782515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30466418 - 30466153
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||     
T  30466418 cctccgtccctaattacagtgtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaa 30466319  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgt---------------------ataataa 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||                     |||||||    
T  30466318 tttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgttgtacccaaaaaaaaaaatgaataataa 30466219  T
Q  181 atagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30466218 ataagggcatgtatgaaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 30466153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 3670223 - 3670448
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgt---------- 93  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  3670223 ctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtaatcactatt 3670322  T
Q  94 --ttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcat 190  Q
      |||||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3670323 gtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcat 3670422  T
Q  191 gtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  3670423 gtatgtaaagaattaattaatgtagt 3670448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12873174 - 12873035
Alignment:
Q  110 ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataatta 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12873174 ttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagacgtataatagatagtgatatgtatgtaaagaaataatta 12873075  T
Q  210 atgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12873074 atgtagttggaaataacaagggggtcttataaaaaaggac 12873035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 18970474 - 18970720
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  18970474 cctccgtccctaaatatatgagccttttgcaaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 18970573  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||  || | ||  ||||||||    
T  18970574 tttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaaaatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaa 18970673  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  18970674 ataattaatgtacttggaaatatcaaagggatcttatgaaaagggac 18970720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 36750629 - 36750875
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||||||| |  | |||||||| |||| |  ||| |  ||| ||||||||||    
T  36750629 cctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagtgggttgtagtattaaatttgtataaaattacaattttttttacaat 36750728  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  || ||||  ||||||||    
T  36750729 tttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataattaagggtatgttggtaaagaa 36750828  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36750829 ataattaatgtacttggaaatatcaaagaggtcttataaaaagggac 36750875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 88 - 247
Target Start/End: Original strand, 13215649 - 13215808
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  13215649 tattatttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataaggg 13215748  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13215749 tatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaagggtcttataaaaaggg 13215808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32511293 - 32511065
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| |||  |||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| ||    
T  32511293 cctccgtctctatatataagactcttttgttaaaataacggaaattaagaaagtgaaaatttgtattaaaattgtttgtaattactgttgtttttacgat 32511194  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||                  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  32511193 tttatcctta------------------tgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatacgaacatgtatgtaaagaa 32511112  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  32511111 ataattaatgtagttgaaaatagcaaataggtcttataaaaagggac 32511065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30858230 - 30857984
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  30858230 cctccgtccctaaatataggagtcttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 30858131  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  30858130 tttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 30858031  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  30858030 ataattaatgtacatggaaataccaaaagagtcttataaaaagggac 30857984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 31633592 - 31633838
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |  |  ||||||| ||||   |||| | |||||||||||||||    
T  31633592 cctccgtccctaaatataggagtcttttgccaaaattacggagattaagaaagttggttgtaatattaaatttgtacataattactattgtttttacaat 31633691  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  ||||| ||    
T  31633692 tttgtccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaataa 31633791  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31633792 ataattaatgtacttggaaatacaaaaggggtcttataaaaagggac 31633838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 249
Target Start/End: Original strand, 44573702 - 44573874
Alignment:
Q  75 tgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgta 174  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||  | | |||||||||||  | ||| || |||||| | ||||||||||||||||||    
T  44573702 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttta-agagatggatggtttatgtttta-acatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgta 44573799  T
Q  175 taataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44573800 taattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 44573874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 34431947 - 34432191
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||  |||  ||||||||||| |||  | |||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  34431947 ctccgtctctaaatataagagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaatt 34432046  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  |  || |  |||||||||    
T  34432047 ttatccttaagagagggagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataaggatatattggtaaagaaa 34432145  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34432146 taattaatgtacttggaaacatcaaaggggtcttataaaaagggac 34432191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 218
Target Start/End: Original strand, 3060405 - 3060581
Alignment:
Q  43 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccata 141  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||   |||||||||| | |    
T  3060405 ggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttgacttatgttttcaaca 3060504  T
Q  142 tgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 218  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3060505 ttctatttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 3060581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 7461261 - 7461448
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggat---atttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagttta 130  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||| ||||    
T  7461261 aaaatcatgggaattaagaaaattgatggtatttgtattaaagttgtttgaaatcactatcgtttttacaattttatcttttagag--agagttaattta 7461358  T
Q  131 tgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 220  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7461359 tgttttcaatatactatttattgttgattgaagaaaaatatatataataaatatgagcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgga 7461448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 15917855 - 15918070
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  |||||||||| | |||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||  |||| |    
T  15917855 aaaataacgggaattaagatagtgaatattagtattaaatatgtttgtaattactattatttt-acagttttaccctttaagagagagagttgatttacg 15917953  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||  | ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  15917954 ttttgaacatgttatttattactgattgaagaaaaaaatgtataataaataaggacaagtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatga 15918053  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||    
T  15918054 gtcttataaaaagggac 15918070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6028634 - 6028388
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||  | |||||||| |||| | |||  | ||||||||||| |||    
T  6028634 cctccgtccctaaatataagagtcttttgcaaaaattacggagattaagaaagttgattatagtattaaatttgtatataactactattgtttttataat 6028535  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||  || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||  |||||| |    
T  6028534 tttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttggtaaagga 6028435  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| | |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  6028434 atattaaatgtacttggaaataccaaataggtcttataaaaagggac 6028388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9701362 - 9701116
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  9701362 cctccgttcctaaatataagagccttttgtcaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 9701263  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||  || |||||| ||||||||||||||  || | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  9701262 tttatccttaagagatagaattaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaattgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 9701163  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9701162 ataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggac 9701116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 229
Target Start/End: Original strand, 18223686 - 18223872
Alignment:
Q  45 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc-cttaagagagagagttagtttatgttttccatatg 143  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  18223686 aattaagaaagttaatatttgtattaaagttgtttgtgatcactattgtttttacaattttatcatttaagagagttagttagtttatgttttcaaagtg 18223785  T
Q  144 ctacttattgctgattg-aagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
     || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  || || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18223786 atatttattgttgattgaaagaaaaagatgtataataaaaatgggtatataagtaaataaataattaatatagttggaaataacaaa 18223872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Original strand, 2788145 - 2788328
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||| ||||||| ||    
T  2788145 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgagga 2788244  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| ||||| ||||||||  || ||||  | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2788245 aaaa-atgtaaaataaataagggtatgttggcaaagaaataagtaatgtacttggaaataccaaagtggtcttataaaaagggac 2788328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 244
Target Start/End: Original strand, 8030794 - 8030992
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||| ||  ||||||||||   |||| |||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||    
T  8030794 aaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattgaatatgtttgtaatttctattatttttacaattttatcgttta-agagagagttggtttatgt 8030892  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 233  Q
    | |           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  8030893 tat-----------ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtga 8030981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Original strand, 30830150 - 30830333
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||    
T  30830150 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 30830249  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||    
T  30830250 aaaa-atgcagaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaagtcttataaaaagggac 30830333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12620102 - 12619853
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||  ||||| | || |||||||| ||||  |||||||||||||  | |||||||| | ||||||||| |||||    
T  12620102 cctccgtccctaattatatgacatttttgaaaaaataatggtaattaagatagtgactatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttcacaat 12620003  T
Q  103 tttatccttaa---gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||| ||||| |   ||||||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||||||   |||| ||| ||||    
T  12620002 tttgtcctttaagagagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaatatatataataaatatgagcatttatataaa 12619903  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  12619902 gaaataattaatgtacttggaaatagcaaaagagttttataaaaagggac 12619853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3095506 - 3095345
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  |     
T  3095506 tattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataattaagga 3095407  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3095406 tatgttggtaaagaaataattaatttacttagaaatatcaaagaggtcttataaaaagggac 3095345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Original strand, 12296182 - 12296416
Alignment:
Q  13 taattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctta 112  Q
    |||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || | |  || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  12296182 taattatatgacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgaaagtgataataaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttacccttt 12296281  T
Q  113 a---gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataatta 209  Q
    |   |||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||| || |||||||| |||||||| || ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||    
T  12296282 aagagagagagagttagtatatgttttcaatatagta-ttaatgttgattgaaaaaaaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaatta 12296380  T
Q  210 atgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  12296381 atgtacttggaaatatcaaagatgtcttataaaaag 12296416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29831053 - 29830817
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||||| | || ||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  29831053 gtccctatttataagattcttttaataaattcacgggagtcaataaaatttatatttgtattaaatttgtttgtaattattatt--ttttacaattttat 29830956  T
Q  108 cctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    | || |||||| |||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||  | ||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||    
T  29830955 catttaagagaaagagtttgtttatgttttcaacatgttatttattgttgacggtagaaaaa-atgtataataaataaaggtatgtaagtaaaaaaataa 29830857  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaa-aggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  29830856 ttaatgtagtttaaaataacaaggggggtcttataaaaag 29830817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41422804 - 41422558
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||  |  ||| | |||||||||||||||    
T  41422804 cctccgtccctaaatataggagccttttgttaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgaatacaattactattgtttttacaat 41422705  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  41422704 tttatccttaagagagagaatttatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 41422605  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  41422604 ataattaatgtacttgaaaataccaaaagagttttataaaaagggac 41422558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 41494367 - 41494613
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||  |||  |||||||||||   |  | |||||||| |||  | |||| | |||||||||||||||    
T  41494367 cctccgtccctaaatataggagtcttttgttaaaattgcggagattaagaaagttagttgtagtattaaatttgaatataattactattgtttttacaat 41494466  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  41494467 tttatccttaagagagagaattaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 41494566  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  41494567 ataattaatgtacttgaaaataccaaaagagttttataaaaagggac 41494613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 44018030 - 44017791
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    |||||||| ||||||| | |||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||  |||| |||||||||    
T  44018030 gtccctaaatataagacctttttgacaaaatcacaggaataaagaaagttgatatttgtatcaaagttatttgtaatcaaaattactttt-caattttat 44017932  T
Q  108 cctta---agagagagagttagttta-tgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||    ||||||||||  ||     ||||||| | |||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  44017931 cctttgagagagagagagagagagagctgttttcaagatgctatttattactaattgaagaagaatatgtataataaataggggtatgtaagtaaataaa 44017832  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  44017831 taattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 44017791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43700913 - 43700663
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||   ||||||||| | | |  | |||||||| ||||   | || | |||||||||||||||    
T  43700913 cctccgtccctaattataggagtcttttgcaaaaaacacgaagattaagaaaattggttgtagtattaaatttgtacatgattactattgtttttacaat 43700814  T
Q  103 tttatccttaagagagaga---gttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgt-aa 198  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||  || ||    
T  43700813 tttatccttaagagagagagaggttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaa 43700714  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    | ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43700713 aaaaaaaattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 43700663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8295601 - 8295367
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||  ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||  ||| |||||| | |||||||||||||||    
T  8295601 cctccgtccctaattataggacgtttttgaaaaaataacgggaattatgatagtggatatttgtatgaaatatgtatgtaattactattgtttttacaat 8295502  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| | |             ||||  |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  8295501 tttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaaca-------------tgatcaaagaaaaatatgtataataaatatgggtatgtatgtaaaga 8295415  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||||    
T  8295414 aataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttgtaaagagggac 8295367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28566381 - 28566200
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||  || |||||| ||||||||||    
T  28566381 gtattaaatttgtatataattagtattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcagcataatatttattgttgattgaaga 28566282  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||  | ||||||||   | ||||  ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  28566281 aaaagattcaaaataaataagagtatgttagtaaataaataattaatgtatttgaaaataccaaatgagtcttataaaaagg 28566200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40544618 - 40544370
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| | ||  ||||||||||| | |  |  ||||||| |||| | |||| | ||||||||||| |||    
T  40544618 cctccgtccctaattataggagtcttttgcaaaaatgatggagattaagaaagttggttgtaatattaaatttgtatataattactattgtttttataat 40544519  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattg--aagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||| |  || ||||||||| | ||||||||  || |||   ||||||    
T  40544518 tttatccttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgatcggaaaaaaaaagatgcaaaataaataagggtatgccggtaaag 40544419  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  40544418 aaataattaatgtacttggaaatatcaaatgagtcttataaaaagggac 40544370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18294273 - 18294065
Alignment:
Q  13 taattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctta 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||| | || |  ||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  18294273 taattataagatatttttgctaaaatcataagaattaagaaagttggtagtattattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattctta 18294174  T
Q  113 agagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatg 212  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||  |||   || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || || |  ||||||||||||||||||    
T  18294173 agagaaagagttgatttatgtttttaata--atatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaaggtatattcgtaaagaaataattaatg 18294076  T
Q  213 tagttggaaat 223  Q
    || ||||||||    
T  18294075 taattggaaat 18294065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 249
Target Start/End: Original strand, 26334717 - 26334836
Alignment:
Q  131 tgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 230  Q
    ||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||    
T  26334717 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaacgaagttagaaataaaaaag 26334816  T
Q  231 gggtctt-ataaaaagggac 249  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  26334817 gggtcttaataaaaagggac 26334836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 40348217 - 40348388
Alignment:
Q  70 aaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaag 169  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||| ||||||    
T  40348217 aaagttgattgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagaaagaa--ttagtttatgtttttcatatgttatttattattgattgaaaaaaaag 40348314  T
Q  170 atgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||||||||||||   | |||||| |||||||| ||||||| ||     |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  40348315 atgtataataaataaatgaatgtatataaagaaaaaattaatcta-----aaataataaaggaatcttataaaaaggga 40348388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Original strand, 11944391 - 11944628
Alignment:
Q  11 cctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcct 110  Q
    ||||| |||| || |||||||| ||||| |||   ||||||||| | |||  | |||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  11944391 cctaaatatacgagccttttgcaaaaattacgaagattaagaaaattgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatctt 11944490  T
Q  111 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaa 210  Q
    ||||||| ||| ||| || |||||||| | ||  || |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||  ||||||||||||| ||    
T  11944491 taagagaaagaattaattcatgttttcaacataatatttatcgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataaagatatgttggtaaagaaataataaa 11944590  T
Q  211 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    | || || |||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  11944591 tatacttagaaataccaaagggatcttataaaatggga 11944628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Original strand, 11083431 - 11083671
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||||||||||||| | || | ||   ||||| ||||||||||||||| | || | | ||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  11083431 ctccgtccctaattatagggtcatcttaacaaaattacgggaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttgtttgtaattgctattgtttttacaatt 11083530  T
Q  104 ttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||   ||  || ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||   ||||||||    
T  11083531 ttatcctttaagagagagggttaatgtatattttcagcatagtatttaatgctgattgaagaaaaagatataaaataaacagtggtgtgctggtaaagaa 11083630  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
     ||||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  11083631 ttaattaatgtacttgaaaatattaaagaggtcttataaaa 11083671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 249
Target Start/End: Original strand, 24300282 - 24300342
Alignment:
Q  189 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24300282 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 24300342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13598809 - 13598582
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | |||| |  || ||||  |||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  13598809 cctccgtccctaattatagggccctttagaaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatctgttggtaattactattggttttacaat 13598710  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  || ||| || |||||||||||||| ||  | ||||||||| || |||   || || ||    
T  13598709 tttattcttaagagatagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaatatccaaaataaataggggtatgatggtgaaaaa 13598610  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaag 230  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||    
T  13598609 ttaattaatgcacttggaaataacaaag 13598582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 4408584 - 4408765
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaag- 163  Q
    |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||  || |||||| |||||||||     
T  4408584 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaaga 4408683  T
Q  164 aaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||| ||| | ||||||||   | ||||   |||||||||||||||| || ||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  4408684 aaaaatatgcaaaataaataaaagtatgttgataaagaaataattaatctacttggaaataccaaagatatcttataaaaag 4408765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7447034 - 7446945
Alignment:
Q  126 gtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
    |||||||||||| | ||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7447034 gtttatgttttcaacatattatttattgcagattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataagtaatgtag 7446945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8867860 - 8867712
Alignment:
Q  16 ttataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaaga 115  Q
    |||||| | |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| | |    
T  8867860 ttataatacccttttgacaaaatcacgggaat-aagaaagttgatatttctattaaatttgtttgtaattactattatttttacgattttatccttta-a 8867763  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaa 168  Q
    |||||||  ||||||||||||| | |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  8867762 gagagag--agtttatgttttcaacatgctatttattgttaattgaagaaaaa 8867712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12969738 - 12969561
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaa 167  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||| ||||| ||    || ||| ||||||||||||||||    
T  12969738 taaatttgtgtgtaattactattgtttttataaatttgtcctttaagagagagagttggtgtatattttcaatgcagtatttaatgctgattgaagaaaa 12969639  T
Q  168 agatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    | || || ||||||||| || ||||  |||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12969638 aaatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatatatttgaaaataacaaaggggtcttataaaaag 12969561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 244
Target Start/End: Original strand, 22302572 - 22302774
Alignment:
Q  44 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccata-- 141  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||  |||      
T  22302572 gaattaagaaagttgataagagtattaaatttgtttgtaattattattatttttacaattttatccttta-agatagtgttagtttatgtttttgatata 22302670  T
Q  142 -tgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata 240  Q
     |  || |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||  |||||||||||||| ||| | ||| ||||| || | || |||||||    
T  22302671 ttattatttattgttaattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataatttatgaatttgaaaatatcacaaggatcttata 22302770  T
Q  241 aaaa 244  Q
    ||||    
T  22302771 aaaa 22302774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 246
Target Start/End: Original strand, 6650939 - 6651144
Alignment:
Q  46 attaagaaagtggatatttgtattaaagttgttt----gtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccat 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || |||    |||||  |||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  ||||||||| |     
T  6650939 attaagaaagttgatatttgtattaatttttttttgttgtaatttttattgtttttacaattttatcattcaaaagagagaattagagtatgttttcaac 6651038  T
Q  141 atgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata 240  Q
     || || |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||    
T  6651039 gtgttatttattgttgattgaggaaaaaaatgtataataaatagagatatatacgtaaaaaaataattaatgtaattgaaaatagcaaagagaccttata 6651138  T
Q  241 aaaagg 246  Q
    ||||||    
T  6651139 aaaagg 6651144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21838846 - 21838698
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||    
T  21838846 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatctttaagagagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 21838747  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 214  Q
    |||| ||| | ||||||||  || ||||   |||||||||||||||||||    
T  21838746 aaaa-atgcaaaataaataagggtatgttgataaagaaataattaatgta 21838698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 246
Target Start/End: Original strand, 27725513 - 27725681
Alignment:
Q  81 taatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttc--cat-atgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataa 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || ||||| |||||  ||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  27725513 taattattattgtttttacaatttcatctttaagaaagagagatactttatattttcaacatcataatacttattgttgattgaggaaaaagatgtaaaa 27725612  T
Q  178 taaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||  || |  |   ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27725613 taaataagggtagattgataaagaaataattaatgtacttaaaaatatcaaagaggtcttataaaaagg 27725681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44417631 - 44417445
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatca---ttattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattga 161  Q
    ||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   ||||||||| | ||  || ||| || ||| |||    
T  44417631 tattaaatttgtttgtaattactattattgtttttacaattttatcccttatgagaaagagttacactatgttttcaacatagtatttactgttgactga 44417532  T
Q  162 agaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| || |||||||||    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||    
T  44417531 agaaaaagatata-aataaataggaatatgttggtaaagaaataattaatgtagttgaaaataccaaagagatcttatgaaaagggac 44417445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 249
Target Start/End: Original strand, 44436749 - 44436812
Alignment:
Q  186 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  44436749 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 44436812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 4897640 - 4897730
Alignment:
Q  155 tgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4897640 tgattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttcgaaatatcaaagaggtcttataaaaag 4897730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 4945034 - 4945124
Alignment:
Q  155 tgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4945034 tgattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttcgaaatatcaaagaggtcttataaaaag 4945124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Original strand, 26273366 - 26273540
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaa 167  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||   | ||  || ||| || |||||||||||||    
T  26273366 taaagttgtttgtaattgctattgttattacaattttatcctttaagagagatgattagtgtatgtttctaacatcatatttaatgttgattgaagaaaa 26273465  T
Q  168 agatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 242  Q
    | || || ||||||||| |   |||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26273466 aaatataaaataaatagagatgtgttagtaaagaattaattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaa 26273540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3904677 - 3904524
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaag 163  Q
    |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||  ||||| ||||  | |   || ||||||||||||||||    
T  3904677 gtattaaatttgtttgcaattactattgtttttataattatatcatttaagagagagagttgatttatatttttaacaaagtatttattgctgattgaag 3904578  T
Q  164 aaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 217  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  3904577 aaaaatatgtaaaataaataatggtatgtcagtacataaataattaatgtagtt 3904524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 229
Target Start/End: Original strand, 7457305 - 7457395
Alignment:
Q  139 atatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7457305 atatgctatttattgttgaatgaagaaaaatacgtataataaatatgaacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggatatagcaaa 7457395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 121
Target Start/End: Original strand, 16636408 - 16636486
Alignment:
Q  44 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagaga 121  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16636408 gaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaga 16636486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15079394 - 15079298
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| || || | |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  15079394 ttattgttgattgaagaaaaa-atgtaaaataaataggggtatatttgtaaagaaaaaataaatgtagttggaaatgtcaaatgagtcttataaaaag 15079298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Original strand, 26334629 - 26334722
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttt 96  Q
    ||||||| |||||||||||   |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  26334629 cctccgtacctaattataaagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 26334722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12873712 - 12873559
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||  | ||  || |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  |     
T  12873712 tattgtttttacaaatttatccttaag----agagttagtttatgtttttaacataatatttattattgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaggt 12873617  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
     || |   |||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12873616 tatattgataaagaaataataaatgtaattgaaaatttcaaagaggtcttataaaaag 12873559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 136
Target Start/End: Original strand, 4897420 - 4897530
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 124  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||| | || | | ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  4897420 ccttttgaaaaaataatgggaattaagaaaattgaaaatagtaataaatttgtttgtaatcactattgtttttataattttgtccttta-agagagagtt 4897518  T
Q  125 agtttatgtttt 136  Q
    ||| ||||||||    
T  4897519 agtgtatgtttt 4897530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 136
Target Start/End: Original strand, 4944814 - 4944924
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 124  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||| | || | | ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  4944814 ccttttgaaaaaataatgggaattaagaaaattgaaaatagtaataaatttgtttgtaatcactattgtttttataattttgtccttta-agagagagtt 4944912  T
Q  125 agtttatgtttt 136  Q
    ||| ||||||||    
T  4944913 agtgtatgtttt 4944924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 224
Target Start/End: Original strand, 14493590 - 14493779
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || | | |||  ||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| || | |||| |||||||| ||| |    
T  14493590 aaaataacgggaattaagaaaattgaaagtggtaacaaatttgtttgtaattactattgttttcataattttatctttta-agagggagttagtgtatat 14493688  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 224  Q
    |||| ||||  || ||| |  ||||||||||||| | | || ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  14493689 tttcaatataatatttaattttgattgaagaaaaggttataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtatttgaaaata 14493779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11121211 - 11121034
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc-cttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaa 167  Q
    |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| || ||||||||| | ||   | ||| || |||||||| ||||    
T  11121211 taaatttgtttgtaattactactgtttttacaattttatcatttaagagggagagttggtgtatgttttcaacataacatttaatgttgattgaataaaa 11121112  T
Q  168 agatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgta-gttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||| ||||||||   | ||||  |||||||| ||| |||||||  |||||||||  |||  |||||||||||||    
T  11121111 agatgtaaaataaataagtgtatgttggtaaagaattaactaatgtattttggaaatactaaaatggtcttataaaaa 11121034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8056240 - 8056070
Alignment:
Q  12 ctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgttttt-acaattttatcct 110  Q
    ||||||||| | |||||||   ||||| ||| ||||||||||| | || | | ||| |||| || ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  8056240 ctaattatatggtccttttaaaaaaataacgagaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttatttgtaattgttattgtttttcacaattttatctt 8056141  T
Q  111 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaat 182  Q
    | | |||||| |||||| ||| ||||| | ||  || ||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  8056140 tta-agagagggttagtgtatattttcaacataatatttaatgctgattgaagaaaaagatataaaataaat 8056070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 232
Target Start/End: Original strand, 16636493 - 16636536
Alignment:
Q  189 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16636493 atgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 16636536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40544746 - 40544651
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||  | || ||||| ||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  40544746 tattgtttttccaattttatccttaatagagatggctaatttatcttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgaaaaataaata 40544651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Original strand, 15435589 - 15435655
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtatt 69  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15435589 cctctgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtatt 15435655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Original strand, 16807067 - 16807126
Alignment:
Q  64 tgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagag 122  Q
    |||| |||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16807067 tgtaataaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagag 16807126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Original strand, 16846348 - 16846407
Alignment:
Q  64 tgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagag 122  Q
    |||| |||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16846348 tgtaataaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagag 16846407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 15228183 - 15228153
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228183 tccctccgtccctaattataagatccttttg 15228153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 16805825 - 16805795
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805825 tccctccgtccctaattataagatccttttg 16805795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 16845106 - 16845076
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16845106 tccctccgtccctaattataagatccttttg 16845076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 22897394 - 22897424
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22897394 tccctccgtccctaattataagatccttttg 22897424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25888417 - 25888339
Alignment:
Q  155 tgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 233  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||   | ||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25888417 tgattgaagaaaaatgtgtaaaataaataagtgtatgttggtaaaaaaataattaatgtagttaaaaataacaaagggg 25888339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 32120947 - 32120977
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32120947 tccctccgtccctaattataagatccttttg 32120977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Original strand, 13214973 - 13215026
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagt 56  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  13214973 cctccgtccctaattataggaaccttttgcaaaaattacggagattaagaaagt 13215026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 1359794 - 1359822
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1359794 tccctccgtccctaattataagatccttt 1359822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 6027623 - 6027651
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027623 cctccgtccctaattataagatccttttg 6027651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 10757777 - 10757817
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcac 41  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10757777 tccccccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcac 10757817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 11852217 - 11852189
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11852217 cctccgtccctaattataagatccttttg 11852189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 30466110 - 30466138
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30466110 cctccgtccctaattataagatccttttg 30466138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 41968234 - 41968206
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41968234 cctccgtccctaattataagatccttttg 41968206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 219)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 15810979 - 15811223
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15810979 tccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 15811078  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15811079 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 15811178  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15811179 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 15811223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44646565 - 44646317
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44646565 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 44646466  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44646465 attttatccttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 44646366  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44646365 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 44646317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 39750124 - 39750369
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39750124 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 39750223  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39750224 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 39750323  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39750324 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 39750369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 30289605 - 30289853
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30289605 tccctccgtccctaattataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 30289704  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30289705 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 30289804  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30289805 aaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggac 30289853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23542273 - 23542025
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23542273 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaatttgtttgtaatcactattgtttttaca 23542174  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23542173 attttatccttaagagagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaag 23542074  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23542073 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 23542025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 1047995 - 1048242
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1047995 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 1048094  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1048095 attttatccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 1048194  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1048195 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttttaaaaaggga 1048242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45039704 - 45039458
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45039704 cctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatattagtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 45039605  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  45039604 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgtatgtaaagaa 45039505  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45039504 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 45039458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 39362937 - 39363185
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39362937 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 39363036  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  39363037 attttatccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaag 39363136  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39363137 aaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 39363185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39497727 - 39497479
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39497727 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 39497628  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  39497627 attttatccttaagagagatagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatgtaaag 39497528  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39497527 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 39497479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44649923 - 44649675
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44649923 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 44649824  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44649823 attttatccttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 44649724  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44649723 aaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 44649675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1039124 - 1039372
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1039124 tccctccgttcctaattataagaccattttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 1039223  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1039224 attttatccttaagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaag 1039323  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1039324 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 1039372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1046030 - 1046278
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1046030 tccctccgttcctaattataagaccattttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 1046129  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1046130 attttatccttaagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaag 1046229  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1046230 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 1046278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 37951692 - 37951940
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37951692 tccctccgtccctaattatatgacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttaca 37951791  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37951792 atattatccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 37951891  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37951892 aaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 37951940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 9202248 - 9202491
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9202248 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 9202347  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  9202348 attttatccttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaat 9202447  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9202448 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 9202491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47069078 - 47068835
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  47069078 tccgtccctaattataagacccttttgttaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattt 47068979  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47068978 tatccttaaaagagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 47068879  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47068878 aattaatgcagttagaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 47068835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 35984409 - 35984653
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35984409 tccgtccctaattataagacccttttgcttaaatcacgggaattaaaaaagcatatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 35984508  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35984509 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 35984608  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  35984609 aattaatgtagttaaaaataacaaagggattttataaaaagggac 35984653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7784288 - 7784037
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaa-gtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7784288 tccctccgtccctaattataagactcttttgttaaaattacgggaattaagaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttac 7784189  T
Q  100 aattttatccttaagagagagag--ttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7784188 aattttatccttaagagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagaggcatgtatgta 7784089  T
Q  198 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7784088 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataataagggac 7784037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 42872076 - 42872325
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42872076 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 42872175  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42872176 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 42872275  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42872276 gaaataattaatgtagttggaaataacaatggggtcttataaaaagggac 42872325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18237370 - 18237138
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18237370 tataagatcattttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattctatccttaagag 18237271  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18237270 agagagttagtttatattttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaagcatgtatgtaaagaaataagtaatgtagt 18237171  T
Q  217 tggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  18237170 tggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 18237138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 52430916 - 52431165
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  52430916 tccctccgtccctatatataagatccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttaca 52431015  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52431016 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 52431115  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52431116 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 52431165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45794635 - 45794390
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45794635 tccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 45794536  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45794535 tatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaagaaa 45794436  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45794435 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 45794390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11741692 - 11741443
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11741692 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 11741593  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11741592 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatcttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 11741493  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11741492 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 11741443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36695149 - 36694900
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  36695149 tccctctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 36695050  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36695049 attttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 36694950  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36694949 gaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 36694900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36711250 - 36711001
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  36711250 tccctctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 36711151  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36711150 attttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 36711051  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36711050 gaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 36711001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 50246672 - 50246916
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  50246672 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttaca 50246771  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50246772 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 50246871  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50246872 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaa 50246916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 46075613 - 46075858
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46075613 ctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatt 46075712  T
Q  104 ttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  46075713 ttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatt-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgcaaagaa 46075811  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46075812 ataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 46075858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 11906970 - 11907219
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11906970 tccctccgtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgagaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 11907069  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11907070 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 11907169  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11907170 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 11907219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 16575850 - 16576083
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16575850 tataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattcaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 16575949  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16575950 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataactaatgtag 16576049  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16576050 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 16576083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30290560 - 30290311
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30290560 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttaca 30290461  T
Q  101 attttatcctta-agagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    |||||||||||  ||| |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30290460 attttatccttttagaaagaatgttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 30290361  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30290360 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 30290311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49907316 - 49907067
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  49907316 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcgcgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttaaca 49907217  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49907216 attttatcctttaagaaagaaggttagtttattttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 49907117  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49907116 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 49907067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 10383800 - 10384034
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10383800 tataagactctttttctaaaatcacggaaattaagaaagtggatatttatattaaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagag 10383899  T
Q  117 --agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10383900 agagagagttagtttatgttttccatatgttatttattactaattgaagaaaaagatatataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgta 10383999  T
Q  215 gttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10384000 gttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 10384034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34931370 - 34931125
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  34931370 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 34931271  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34931270 tttatccttta-agagagagttggttcatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 34931172  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34931171 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 34931125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 47300635 - 47300881
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47300635 tccctctgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 47300734  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47300735 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 47300834  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  47300835 taaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtctcataaaaagg 47300881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16456931 - 16456682
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16456931 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 16456832  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  16456831 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggagcatgcatgtaaa 16456732  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16456731 gaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 16456682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 943381 - 943628
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  943381 tccctccgtcccta--tataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 943478  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  943479 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa 943578  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  943579 gaaataattaatgtagttggaaatgacaaaggagtcttataaaaaaggac 943628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6090026 - 6089781
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  6090026 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 6089927  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6089926 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 6089828  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6089827 ataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 6089781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 50008225 - 50008470
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  50008225 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttgca 50008324  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  50008325 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttaattattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaa 50008424  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50008425 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaag 50008470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 52602284 - 52602037
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  52602284 tccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 52602185  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52602184 attttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaag 52602086  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52602085 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 52602037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 9413075 - 9413316
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9413075 cgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 9413174  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9413175 tccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataa 9413273  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9413274 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 9413316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 14089997 - 14090223
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14089997 ctccgtctttaattataagatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 14090096  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14090097 ttatcctttaagagagagaggtaatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 14090196  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14090197 ataattaatgtagttggaaataacaaa 14090223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2280224 - 2280000
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagt 123  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||    
T  2280224 ccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttctattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgt 2280125  T
Q  124 tagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 223  Q
    |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2280124 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaat 2280025  T
Q  224 aacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  2280024 aacaaaggggtc-tataaaaagggac 2280000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47263750 - 47263501
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||  |||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47263750 cctccgtttctaattgtaggacccttttgctaaaatcacgagaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 47263651  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaag----atgtataataaatagtggcatgtatgtaa 198  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  47263650 tttatccttaagattgagagttagtttatgtttttcatatgtta-ttattgctgattgaagaaaaagatgtatgtataataaatagggacatgtatgtaa 47263552  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||| ||||    
T  47263551 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgaatcttataaaaaaggac 47263501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 5765735 - 5765973
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  5765735 cctccgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 5765834  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5765835 tttctccttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 5765934  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 241  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||    
T  5765935 ataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataa 5765973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22567361 - 22567115
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22567361 cctccgtccctatatataagacccttttgttaaaattacggaaattaagaaagtggatatttgtattatttttgtttgtaatcactattgtttttacaat 22567262  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| |||    
T  22567261 tttattattaagagagagagttaatttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtattataaatatggacatgtatgtaaggaa 22567162  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  22567161 ataattaatatagttggaaatagcaaaagagtcttgtaaaaagggac 22567115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 31635875 - 31636117
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31635875 cctcggtccctaattataagacttttttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaat 31635974  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttcc--atatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  31635975 tttatcctta--aaagagagttaatttatgttttccatatatgctatttatggctaattgaagaaaaagatgtagaataaataggggcatgtatgtaaag 31636072  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  31636073 aaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaag 31636117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 4102458 - 4102705
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  4102458 tccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 4102557  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  4102558 attttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataagggcatgtatgtaaag 4102656  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4102657 aaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 4102705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23530838 - 23530591
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  23530838 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 23530739  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||| ||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  23530738 tttatcctttaagaaagagggttggcttatcttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaa 23530639  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  23530638 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaaggac 23530591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27037562 - 27037315
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  27037562 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaataactattgtttttacaat 27037463  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||||| | | ||||| |||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27037462 tttatcctttaagaaagagagctggcttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 27037363  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  27037362 aataattaatgtagttgaaaatagaaaaagggtcttataaaaagggac 27037315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45336180 - 45335931
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  || |||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  45336180 tccctccgtccctatatacaagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttcttaca 45336081  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| || |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  45336080 attttatcctttaagaaagaaagttagtttatattttcaacatgttatttattgttaattgaaaaaaaaaatgtataataaatggaagcatgtatgtaaa 45335981  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45335980 gaaataattaatgtagtaggaaataacaaaggggtcttataaaaaaggac 45335931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 41855217 - 41855464
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||  ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  41855217 tccctccaaccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 41855316  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41855317 attttatccttta-agagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaag 41855415  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41855416 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 41855464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15616404 - 15616179
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagag--agagtt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  15616404 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggataattatattaaagttgtttgtaatcatcattgtttttacaattttatctttaagagagagagagtt 15616305  T
Q  125 agtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaa-gaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15616304 agtttatgttttccatatgctatttattgttgattaaaggaaaaatatgtataaaaaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 15616205  T
Q  224 aacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    | ||||  | ||||||||||| ||||    
T  15616204 agcaaattgatcttataaaaatggac 15616179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 15892313 - 15892555
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15892313 gtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 15892412  T
Q  108 cctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    |||| |||| |||| ||| |||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  15892413 cctttaagaaagagtgttggtttatgttttcaacattctatttattactgattgaaaaaaaagatgtataataaataggagcatatatgtaaagaaataa 15892512  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  15892513 ttaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagggac 15892555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 40614651 - 40614896
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  40614651 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 40614750  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  40614751 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggagcatgtatgtaaagaa 40614849  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40614850 ataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaatggac 40614896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 32169697 - 32169945
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32169697 tccctccgtccttatatataacacccttttgccaaaatcacatgaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 32169796  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||| ||| |||| |||  |||| ||||| ||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32169797 attttattctttaagaaagaaggtta-tttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaa 32169895  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32169896 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 32169945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 244
Target Start/End: Original strand, 8104048 - 8104275
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8104048 tataagacccttttgccaaaattatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 8104147  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8104148 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatgtag 8104247  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8104248 ttggaaataacaaa-cggtcttataaaaa 8104275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Original strand, 9700495 - 9700738
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  || |||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  9700495 cctccgtccctatatacaagacctttttgccaaaatcacaggaattaagaaagtgagtatttgtattaaagttatttgtaatcactattgattttacaat 9700594  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  9700595 tttatcctttagaaagagagatagtttatattttcaacatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatatatgtaaagaa 9700694  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9700695 ataattaatttaattggaaataacaaggaggtcttataaaaagg 9700738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9715653 - 9715406
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  9715653 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 9715554  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| |||   |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  9715553 tttatcctttaagaaagagggttgccttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaattggggcatgcatgtaaaga 9715454  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  9715453 aataattaatgtagttggaaatagaaaagggcgcttataaaaagggac 9715406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24855574 - 24855327
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  24855574 cctccgtccctaattataaggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 24855475  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24855474 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaga 24855375  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  24855374 aataattaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 24855327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 27530348 - 27530593
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||    
T  27530348 cctccgtccctaattataggg-ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgcttttacaat 27530446  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27530447 tttatcctttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 27530545  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27530546 aataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggac 27530593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28052482 - 28052235
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||    
T  28052482 cctccgtccctaattacaggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataat 28052383  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28052382 tttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattggagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 28052283  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28052282 aataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 28052235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 28888167 - 28888414
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  28888167 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 28888266  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||| ||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28888267 tttttcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaaga 28888366  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  28888367 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttacaaaaaaggac 28888414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38261633 - 38261386
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  ||||| |||| |||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  38261633 cctccgtccctaattataaggttcttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttctattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 38261534  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38261533 tttatcctttaagaaagagtgttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 38261434  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  38261433 aataattaatgtagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaagggac 38261386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Original strand, 42275912 - 42276151
Alignment:
Q  11 cctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcct 110  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42275912 cctaattataagactcttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 42276011  T
Q  111 t-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataatta 209  Q
    | |||| | || ||| | |||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42276012 ttaagaaatagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 42276111  T
Q  210 atgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42276112 atgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 42276151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 229152 - 229388
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  229152 cctctgtccttaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaat 229251  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  229252 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaaaa 229350  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata 240  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  229351 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 229388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 21630850 - 21631098
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||    | |||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||     
T  21630850 cctccgtccctaattatatagcctttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaa 21630949  T
Q  103 tttatcctt--aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  21630950 tttatccttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtagag 21631049  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21631050 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 21631098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31238972 - 31238765
Alignment:
Q  41 cgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccat 140  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |     
T  31238972 cgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaac 31238874  T
Q  141 atgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata 240  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31238873 atgttatttattactgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaaagtagttggaaatagcaaaggggtcttata 31238774  T
Q  241 aaaagggac 249  Q
    |||||||||    
T  31238773 aaaagggac 31238765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 45285556 - 45285801
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  45285556 cctccgtccctaattatagggtccttttg--aaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 45285653  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45285654 tttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaaga 45285753  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||   || ||||||||||||||    
T  45285754 aataattaatgtagttggaaataggaaataagttttataaaaagggac 45285801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 9378846 - 9379090
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  9378846 cctccatccctaattataagatc-ttttgaaaaaataacggaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 9378944  T
Q  103 tttatccttaa---gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |   ||||||||||  |||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  9378945 tttatcctttaagagagagagagtcggtttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataagtagggacatgtatgtaaa 9379044  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9379045 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 9379090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15100655 - 15100402
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  15100655 cctctgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 15100556  T
Q  103 tttatccttaa-------gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatg 195  Q
    ||||||||| |       ||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15100555 tttatcctttaagagagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatg 15100456  T
Q  196 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15100455 taaagaaataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 15100402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 28885847 - 28886094
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  28885847 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 28885946  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |    
T  28885947 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtttcataaataggggcatgtatgtaaata 28886046  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| ||||||||||    
T  28886047 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttacaaaaagggac 28886094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 36880365 - 36880582
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36880365 tccctccgtccctatatataagatccttttgtcaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtatttaca 36880464  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||| |  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36880465 attttatccttta-aga-aatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaag 36880562  T
Q  201 aaataattaatgtagttgga 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36880563 aaataattaatgtagttgga 36880582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 243
Target Start/End: Original strand, 46506207 - 46506398
Alignment:
Q  52 aaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttat 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||    
T  46506207 aaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagaaagagagttgatttatgttttccatatgatgtttat 46506306  T
Q  152 tgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  46506307 tgctcattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaagtaattaatatagttgaaaatagcaaaagggtcttataaaa 46506398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 48067639 - 48067886
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  48067639 cctccgtccctaattacaaaacccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 48067738  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48067739 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 48067838  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  48067839 aataattaatttagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 48067886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Original strand, 27575381 - 27575627
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| || ||| | |||||||||||||||    
T  27575381 cctccatccctaattataaggtctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgaaattactattgtttttacaat 27575480  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27575481 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 27575580  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  27575581 aataattaatgtagttggaaatagaaaaaggatcttataaaaaggga 27575627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41317885 - 41317640
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  41317885 cctccgtctctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 41317786  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  41317785 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaaagaa 41317687  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41317686 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 41317640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4592857 - 4592625
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcct-taaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4592857 tataagatccttttgctaaaatcacgagaattaagaaagtagatatttgcattaatattgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctataaga 4592758  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||||||||     
T  4592757 gatagagttagtttatgttttcaacatattatttattgctagttgaagaaaaagatgtataataaatatggacatgtatgtaaagtaatagttaatgtac 4592658  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4592657 ttgaaaatatcaaaggtgtcttataaaaaggga 4592625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Original strand, 8923436 - 8923659
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 124  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |    
T  8923436 ccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatccttta-agagagagat 8923534  T
Q  125 agtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 224  Q
      ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8923535 gttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 8923634  T
Q  225 acaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  8923635 gcaaagggatcttataaaaagggac 8923659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25509468 - 25509254
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |  |||||||    
T  25509468 aaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatccttta-agagagagatgttttatgt 25509370  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 233  Q
    |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25509369 tttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaagggg 25509270  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  25509269 tcttataaaaagggac 25509254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38613768 - 38613521
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  38613768 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaactaaaatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 38613669  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| | | | |||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38613668 tttatcctttaagaaagagggctggcttatgttttcaacattctatttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 38613569  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38613568 aataattaatgtagttagaaatataaaaggggtcttataaaaagggac 38613521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8472339 - 8472095
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |   |||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  8472339 cctccgtccctaattatagggctcttttaaaaaaataacggaaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 8472240  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |   |||||| |  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  8472239 tttatccttta---agagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaaatgtatagttaataggggcatgtatgtaaaga 8472143  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8472142 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 8472095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 243
Target Start/End: Original strand, 51422170 - 51422414
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatcctttt-gctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    ||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  51422170 cctccgtccctaattataaggtccttttaaaaaaaataacgcgaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaa 51422269  T
Q  102 ttttat-ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggc--atgtatgtaa 198  Q
    |||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  51422270 ttttatgctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgccgattgaaggaaaagatgtataataaataggggcatatgtatgtaa 51422369  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51422370 ataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 51422414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14347410 - 14347174
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    ||||||||||||||    ||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  14347410 gtccctaattataaagctcttttgagaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttat 14347311  T
Q  108 cctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    |||| ||||| ||| ||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14347310 cctttaagagggagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 14347211  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  14347210 ttaatgtagttgaaaatagcaaagaggttttataaaa 14347174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 249
Target Start/End: Original strand, 47429166 - 47429378
Alignment:
Q  37 atcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgtttt 136  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |    
T  47429166 atcacgagaactaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtagtcactattatttttacaattttattctttagagagagagttagtttatattct 47429265  T
Q  137 ccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtct 236  Q
    | ||||  || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  47429266 caatatattatttattgttgattaaagaaaaagatgtataataaatggggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatct 47429365  T
Q  237 tataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||    
T  47429366 tataaaaagggac 47429378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10433583 - 10433369
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagag--ttagtttat 131  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||    
T  10433583 aaaatcacatgaattaagaaagtagatatttgtattaaatttgtttctaatcactattgtttttacaattttattcttaagagagagagaattagtatat 10433484  T
Q  132 gttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagg 231  Q
     ||||| | ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  10433483 attttcaacatgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataaataatgtagttggcaataacaaatg 10433384  T
Q  232 ggtcttataaaaagg 246  Q
     ||||||||||||||    
T  10433383 agtcttataaaaagg 10433369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 7763496 - 7763740
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |    
T  7763496 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagt 7763595  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | |||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7763596 tttatccttta-agagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttaattgaagaaaaagat-tataattaataggggcatgtatgtaaagaa 7763693  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7763694 ataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggac 7763740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31465944 - 31465714
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31465944 tataagactcttttgccaaaatcactggaattaagaaagtgaatatttgcattaaacttatttgttatcactaatgtttttacaattttatcctttaaga 31465845  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||     
T  31465844 gagatagttagtttatgttttcaacatgttatttattgctaattaaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaaggaatagttaatgtac 31465745  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31465744 ttggaaataacaaagggatcttgtaaaaagg 31465714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 36674043 - 36674289
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||||  ||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36674043 ctccgtctctaattataggacctttttgaaaaaataacgcgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 36674142  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||    
T  36674143 ttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgcatgtaaaaaa 36674242  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  36674243 ataattaatgtagttaaaaatagcaaaaggatcttataaaaagggac 36674289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37585244 - 37584999
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| | |||||||| | ||||||||  ||||| || |||||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  37585244 cctccgttcttaattatagggtccttttgaaaaaataacaggaattaagataatagatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaat 37585145  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37585144 tttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 37585046  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  37585045 ataattaatgtatttggaatttacaaaggggtcttataaaaacggac 37584999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39324766 - 39324576
Alignment:
Q  55 gtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattg 153  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||    
T  39324766 gtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattg 39324667  T
Q  154 ctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39324666 ttgattgaagaaaaagatgaataatagataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaa 39324576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15111873 - 15111627
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    |||||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||  ||||||||||||||    
T  15111873 gtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattaattttacaattttat 15111774  T
Q  108 cctt-aagagagaga----gttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||    ||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  15111773 cctttaagagagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatatggacatgtatgtaaagaa 15111674  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15111673 ataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 15111627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 12814531 - 12814778
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatcctttt-gctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||    ||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  12814531 cctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaaataacgggaattaagatactggatattagtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaa 12814630  T
Q  102 ttttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12814631 ttttatcctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttactgttgattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgtatgtaaag 12814729  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  12814730 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaagtgtcttataaaaagggac 12814778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26550079 - 26549838
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||    
T  26550079 tccgtccttaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtatt-agtattgtttttacaattt 26549981  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||| | |||||||  | |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26549980 tatccttta-agagagaaattgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaat 26549882  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  26549881 aattaatatagttggaaatagcaaatgggtctta-aaaaagggac 26549838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15763608 - 15763361
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| | | ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||     
T  15763608 cctccgtccataattatagggttcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaaaaa 15763509  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||  || ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  15763508 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattactgactgaagaaaaaaatgtataataaatatgagcatgtatgtaaaaa 15763409  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  15763408 aataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggac 15763361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 50008221 - 50008024
Alignment:
Q  48 taagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgcta 146  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || |||| | |  |||||||||||||||| | ||| ||    
T  50008221 taagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttcataattttatcatttaagaaaaaaggttagtttatgttttcaacatgtta 50008122  T
Q  147 cttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50008121 tttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 50008024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Original strand, 1767630 - 1767853
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 124  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| || | |||||||  |    
T  1767630 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgcattatatatgtttgtaattagcattgtttttacaattttatcattta-agagagaaat 1767728  T
Q  125 agtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 224  Q
     |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1767729 ggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 1767828  T
Q  225 acaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  1767829 gcaaaggggtcttataaaaagggac 1767853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13344066 - 13343822
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  13344066 cctctgtccctaattataaggttattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 13343967  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  13343966 tttatcctttaagaaagagtgttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatagaagaaaaagatgtacaataaataggggcatgtacgtaaaga 13343867  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||   ||||||||||||||    
T  13343866 aataattaatgtagttagaaatagaaaataagtcttataaaaagg 13343822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48023184 - 48022952
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    |||||||| |||||  |||| | |||| |||||||||| || ||||||  ||||||||| |||||||| |  |||||||||| |||||||| |||||||     
T  48023184 tataagattcttttattaaatttacggaaattaagaaaatgaatatttacattaaagttatttgtaattacaattgtttttataattttattcttaagaa 48023085  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48023084 agtgagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgatttaagaaaaatatatataataaataggggcatgtatgcaaagaaataattaatgtagt 48022985  T
Q  217 tggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  48022984 tggaaataccaaaatgatcttataaaaagggac 48022952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 7212303 - 7212550
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||||||   |||||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7212303 cctccgttcctatatataaaatccttttatcaaaatcacggaaattaatatagtgaatatttgtataaaagttgtttgtaatcattattgtttttataat 7212402  T
Q  103 tttatccttaa-gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| | || |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  7212403 tttatcctttatgaaagatggttagtttatgttttcaacatgatatttattgttcattcaagaaaaatatgtataataaataaaggtatgtatgtaaaga 7212502  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  7212503 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggttttatagaaagggac 7212550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13698903 - 13698736
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13698903 cctccgtccctgtatataagacccttttgctaaaatcacgagaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 13698804  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga 170  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  13698803 tttattcttaagagagagagttggtttatgttttccttatactttttattgctgattgaaaaaaaaga 13698736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37589221 - 37589012
Alignment:
Q  15 attataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc-cttaa 113  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||    
T  37589221 attataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcttttaa 37589122  T
Q  114 gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 213  Q
    || |||| ||| |||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37589121 gaaagagggttggtttatgttttcaacattccatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag-ggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 37589023  T
Q  214 agttggaaata 224  Q
    |||||||||||    
T  37589022 agttggaaata 37589012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48854109 - 48853864
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  48854109 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaat 48854010  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||  | ||||| |||||| | ||  || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  48854009 tttatccttta-agagagaaatggtttacgttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 48853911  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  48853910 agaattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 48853864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Original strand, 27974900 - 27975144
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27974900 cctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaattgcaggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaat 27974999  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||  || ||||||||||||   ||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| |    
T  27975000 tttattttttaagagagagagtatatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatatgtgcatgtatgtaaata 27975099  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||||||    
T  27975100 aataattaatgcagttgaaaataacaaaagagttttataaaaagg 27975144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 2489146 - 2489391
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatcc-ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||  ||||| ||||||||||||| | || | ||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||    
T  2489146 cctccgtccctaattata-gagccattttgaaaaaataacgggaattaagataatgaacatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaa 2489244  T
Q  102 ttttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  2489245 ttttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgtaaaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaaga 2489343  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  2489344 aataattaatgtagttggaaataccaaaaagttcttataaaaagggac 2489391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14171824 - 14171610
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||    
T  14171824 tccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttaca 14171725  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | | ||||| || |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  14171724 attttatccttta-aaagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaaa 14171626  T
Q  201 aaataattaatgtagt 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  14171625 aaataattaatgtagt 14171610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 31086667 - 31086910
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  31086667 cctccgtccttaattataaagtccttttgaaaaaataatgggagttaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaat 31086766  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||   ||  ||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  31086767 tttatcctttaagagagatgattgatttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaagaggggcatatatgtaaaga 31086866  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||    
T  31086867 aataattaatgtagttggaaatagcaaaaggattttataaaaag 31086910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 38530896 - 38531141
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||    
T  38530896 cctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattaatattgtttttataat 38530995  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||| ||| |  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  38530996 tttatccttta-agagggagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggtatgcatgtaaagaa 38531094  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  38531095 ataattaatgtagttgaaaatagcaaagcgatcttataaaaagggac 38531141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Original strand, 19792616 - 19792852
Alignment:
Q  11 cctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcct 110  Q
    |||||||||| |  |||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19792616 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 19792715  T
Q  111 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaa 210  Q
    | | ||| | || | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19792716 tta-agataaagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaa 19792814  T
Q  211 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    | |||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  19792815 tatagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaaggga 19792852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 43456451 - 43456612
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43456451 tattgtttttacaattttatccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgcaattttttgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggg 43456550  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  43456551 caggtatgtaaataaataactaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaacgggac 43456612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25271480 - 25271242
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||  ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||    
T  25271480 ctccgtccctaattatatgatatttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaatt 25271381  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||  |||||||||||   | ||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25271380 ttatt-ttaagagagaggaatggtttatgttatcaacatgtta-ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 25271283  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||    
T  25271282 caattaatgtagttggaaatagcaaagagatcttaaaaaaa 25271242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 245
Target Start/End: Original strand, 32149086 - 32149298
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||    
T  32149086 aaaattacaggaattaagaaagtagatattttcattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaaaatagagagttagtttatg 32149185  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  || ||||||||||| ||    
T  32149186 ttttgaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtgaaataaatagaggcatgtatgtaaataaataataaatgtgcttagaaataacaaaagg 32149285  T
Q  233 gtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||    
T  32149286 gtcttataaaaag 32149298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 50938020 - 50937824
Alignment:
Q  54 agtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttatt 152  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || | | |||||    
T  50938020 agtggatatttgtattaaatatctttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattcaatttatt 50937921  T
Q  153 gctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  50937920 gctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaaaggac 50937824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15290171 - 15289984
Alignment:
Q  59 atatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctga 157  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  15290171 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatattatcctttaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctga 15290072  T
Q  158 ttgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  15290071 ttgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaag 15289984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 43395419 - 43395645
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |  ||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  43395419 tccgtccctaattatagaatcctttagagaaaataacggaaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 43395518  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  43395519 tatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaatagggatatgtatgtaaagaaat 43395617  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  43395618 aattaatgtagttggaaatagcaaaggg 43395645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 45038111 - 45038353
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||| |||||||||   |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  45038111 cgtccataattataatgcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 45038210  T
Q  107 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    || || |||| |||||||| | | |||||||| | || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45038211 tcatttaagaaagagagttggctaatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 45038309  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||| |||||| |||||  | |||||||||||| ||||||||    
T  45038310 attaatatagttgaaaatagaataggggtcttatagaaagggac 45038353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 896797 - 897008
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| | |  |||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  896797 cctccgtctctaattataaggtccttttga-aaaataaggaaaattaagataattgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 896895  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  896896 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagaggcatgcatgtaaaca 896995  T
Q  202 aataattaatgta 214  Q
    |||||||||||||    
T  896996 aataattaatgta 897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3549322 - 3549078
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| |||||||||   |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  3549322 cctccgtctctaattatagagtcctttcgaaaaaataacgggaattaagatagtgtatatttatattaaatatgtttgtaattagtatt-tttttacaat 3549224  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | ||||| |  |  ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  3549223 tttatccttta-agagataaatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatataaagaa 3549125  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3549124 ataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggac 3549078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 32153569 - 32153785
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  32153569 aaaatcacggaaattaagaaagtaggtatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagatggagagttagtttatg 32153668  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||  | ||| || |||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||  || ||||||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||| ||    
T  32153669 ttttgaacatgttatttattgttgattgaagaaaataatgtgaaataaataagggtatgtatgtaaataaataataaatctatttagaaataacaaaagg 32153768  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||    
T  32153769 gtcttataaaaagggac 32153785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 240
Target Start/End: Original strand, 43668188 - 43668384
Alignment:
Q  45 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |   ||  ||||||||||| | |||    
T  43668188 aattaagatagtggatatttgtattaaatttgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagagaaaagattgatttatgttttcaacatg 43668287  T
Q  144 ctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata 240  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  43668288 ttatttattgctgattgatgaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagcaaagaagtcttata 43668384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31154509 - 31154351
Alignment:
Q  45 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgc 144  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  31154509 aattaagaaaatggatatttatattaaagttgtttttaatcactattgtttttacaattttatccttaaaagagataattggtttatgtttttcatatgc 31154410  T
Q  145 tacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    || |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31154409 tatttattgttgattgaaggaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgcaaagaaa 31154351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25228489 - 25228285
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||| |||  | |||||  || || |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  25228489 cctccgtccttaattaaaaggccattttgaaaatataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 25228390  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| |||   |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25228389 tttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 25228290  T
Q  202 aataa 206  Q
    |||||    
T  25228289 aataa 25228285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Original strand, 47296342 - 47296556
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||    
T  47296342 aaaatcacgagaattaagataatcgatattggtattaaagatgtttgtaatcactattgttttcacaattttgtcctttagagagagg--tagtttatgt 47296439  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgatt---gaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 230  Q
    |||| | ||| || |||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47296440 tttcaacatgatatttattgttgattattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaacaaataattaatgtagttggaaatagcaaag 47296539  T
Q  231 gggtcttataaaaaggg 247  Q
       || |||||||||||    
T  47296540 atatcctataaaaaggg 47296556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25284099 - 25283918
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  25284099 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaat 25284000  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 183  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25283999 tttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaata 25283918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 39873488 - 39873672
Alignment:
Q  62 tttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattg 160  Q
    |||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||  | ||  || |||||||||||||    
T  39873488 tttgtattaaatatgtatgtaattattattgtttttccaattttatcctttaagagagagggttggtttatgtttttaacatattatttattgctgattg 39873587  T
Q  161 aagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  39873588 aagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatatgtcttataaaaag 39873672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 47754618 - 47754431
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||  |   | ||||||||||     
T  47754618 cctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaatttagtgaatatttatattaaagttgtttgtaaataccgtcgtttttacaaa 47754519  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggca 189  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47754518 tttatcctttaagatagagagtttgtttatgttttcaacatactatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca 47754431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 51811139 - 51810956
Alignment:
Q  33 taaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttat 131  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||   |  |||||    
T  51811139 taaaataacgggaattaagatggtggatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaggaatgatttat 51811040  T
Q  132 gttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
    |||||| | ||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51811039 gttttcaacatgttattgattgctgattgaagaaaaagatgtatagtaaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 51810956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3934894 - 3934653
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||  |||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3934894 cgtccctcgttataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgagtatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 3934795  T
Q  107 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    ||||| |||| |||  ||| | |||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| |||| |||||    
T  3934794 tcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggaacatgtatctaaacaaata 3934695  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  3934694 attaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttataaaaaggg 3934653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26544754 - 26544550
Alignment:
Q  44 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatg 143  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |  ||||||  |  ||||||||||| | |||    
T  26544754 gaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttat-gagagaaatgatttatgttttcaacatg 26544656  T
Q  144 ctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
     || |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  26544655 ttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataatttataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtaattgaaaatagaaaagaggtcttataaaa 26544556  T
Q  244 agggac 249  Q
    ||||||    
T  26544555 agggac 26544550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Original strand, 39867546 - 39867647
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39867546 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaaggg 39867645  T
Q  248 ac 249  Q
    ||    
T  39867646 ac 39867647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 249
Target Start/End: Original strand, 11352916 - 11353055
Alignment:
Q  110 ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataatta 209  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||    
T  11352916 ttaagagagggagttagtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaaataataatta 11353015  T
Q  210 atgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11353016 atgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 11353055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27479890 - 27479647
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||| ||||  ||||||||||| |||  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  27479890 cctccgtccctaaatataggagtcttttgtcaaaattacggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 27479791  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  ||||| ||    
T  27479790 tttatccttaagagggaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaaaaa 27479691  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27479690 ataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaagg 27479647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Original strand, 39425575 - 39425818
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||  ||| |||| |||| |||||| ||||| |||   ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  39425575 cctccgtcattaaatataggatctttttgcaaaaataacgcagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 39425674  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||  || ||||  |||| |||    
T  39425675 tttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaatgatgcaaaataaataagggtatgttggtaatgaa 39425774  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39425775 ataatttatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaagg 39425818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17484024 - 17483783
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||| | | |  | |||||||| |||| | |||| | ||||| |||||||||    
T  17484024 cctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaaattggttgtagtattaaatttgtatataattactattgattttacaat 17483925  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  17483924 tttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 17483826  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17483825 ataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaag 17483783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34503488 - 34503282
Alignment:
Q  44 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatat 142  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||  | |||||||| | ||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  34503488 gaattaagatggtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgcttttataattttatcttttaagagagagggttggtttatgttttcaacat 34503389  T
Q  143 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 242  Q
    | || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |  |||||||||    
T  34503388 gttatttattgctgattgaaaaaaaaaatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttgaaaatagcaaatgaatcttataaa 34503289  T
Q  243 aagggac 249  Q
    || ||||    
T  34503288 aaaggac 34503282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 37850182 - 37850428
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||| ||||    
T  37850182 cctccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtgtataattactattgtttttgcaat 37850281  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  || |||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||  || ||||  ||||| ||    
T  37850282 tttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttggtaaaaaa 37850381  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  37850382 ataattaatctatttggaaataccaaaagggtcttatgaaaaaggac 37850428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Original strand, 2636993 - 2637177
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| ||||||||||    
T  2636993 gtattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 2637092  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| ||| | ||||||||  || | ||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2637093 aaaaaatgcaaaataaataagggtacgttggtaaagaaataattaatgtacttagaaataccaaaggggtcttataaaaagggac 2637177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49549231 - 49549047
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||| |    
T  49549231 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaaa 49549132  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| ||| | ||||||||  ||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  49549131 aaaaaatgcaaaataaataagggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggac 49549047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35693357 - 35693112
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | |||| | ||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  35693357 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaatttgataatggtaataaatttgtttgtaaatactattgtttttacaat 35693258  T
Q  103 tttatcctt---aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    |||||||||    ||||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||| ||| || ||||  |||||    
T  35693257 tttatccttgaagagagagagagttattttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaaaaaaaagatgttgaataactaggggtatgttggtaaa 35693158  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
     || ||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35693157 aaattaattaatgtgcttgaaaatatcaaagggatcttataaaaag 35693112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 44529419 - 44529593
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  44529419 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 44529518  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataat 178  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44529519 tttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaaaaaaaagatgtataat 44529593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 52429179 - 52428934
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||  |||  ||||| ||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  52429179 cctccgtccctaaatataagagctttttgccaaaattgcggagattaataaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 52429080  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  52429079 tttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 52428981  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| | | |||||||||||||||    
T  52428980 ataattaatgtacttgaaaataccaaaagagccttataaaaagggac 52428934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27531034 - 27530805
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||            
T  27531034 cgtccctatatataatatcattttattaaaatcacgggaattaagaaagtagataattgtattaaagttatttgtaattactattgtttataa------- 27530942  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttcca-tatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
        ||| | ||||||||| |||||||||| |  |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27530941 ----taa-atagagagttaatttatgtttttctgtatgtta-ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgacatgtatgtaaagaaata 27530848  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||    
T  27530847 attaatgtagttggaaatagc-aatgagtcttataaaaagggac 27530805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4389839 - 4389659
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| ||    
T  4389839 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgagga 4389740  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||| | ||||||||   | | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  4389739 aaaagatgcaaaataaataagagtaggttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagagatcttataaaaag 4389659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38175163 - 38174922
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaa-gaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| | || |||||| || |||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38175163 tccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataatggaaattaaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattgttattgtttttacaatt 38175064  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||| |||    ||||| ||| |||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||    
T  38175063 ttattcttt---gagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaatgaaaagatgtataataaataagggcgtgtatgtaaa-aaa 38174968  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  38174967 taattaatgtagttaaaaatagcaaaatagtcttataaaaagggac 38174922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 29437599 - 29437845
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||| |   |  | |||||||| || | |  ||| | |||||||||||||||    
T  29437599 cctccgtccctaaatataggagccttttgctaaaattacggagattaagaaaatttgttgtagtattaaatttttataaaattactattgtttttacaat 29437698  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||  || |||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  29437699 tttatccttaatagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgaatgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 29437798  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29437799 ataattgatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 29437845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 39626985 - 39627227
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| || | | |||| | |||||||||||||||||||    
T  39626985 cgtccctaaatataggaaccttttgcaaaaattacggagattaagaaagtaggttgtagtattaaatttatatataattactattgtttttacaatttta 39627084  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||  || |  | |||||||||||||    
T  39627085 tccttaagagaaatagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataagggtagatttgtaaagaaataa 39627184  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||  ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39627185 ttagcgtacttgaaaatatcaaagaggtcttataaaaagggac 39627227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 51467218 - 51467463
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||   | ||||||||||||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | ||||||||||| |||    
T  51467218 cctccgtccctaaatatcttagccttttgctaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttataat 51467317  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  51467318 tttatccttaagagagagggttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 51467416  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  51467417 ataattaatatacttggaaataccaaaagggtgttataaaaagggac 51467463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21290350 - 21290167
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaa 165  Q
    ||||||| |||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| |||    
T  21290350 tattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatccttaagacaaagaattaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaa 21290251  T
Q  166 aaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||| | ||||||||  || | ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21290250 aaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 21290167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38920528 - 38920285
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| || | | |||| | |||||||||||||    
T  38920528 tccctccgtccctaaatataggagccttttgctaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttttatataattactattgtttttaca 38920429  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  || |||| | |||||||||||||  ||| | ||||||||  || ||||  ||||||    
T  38920428 attttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaagaaaa--atgcaaaataaataagggtatgttggtaaag 38920331  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| ||| ||| | ||||||||   |||||||||||||    
T  38920330 aaataattaatgtacttgaaaacaccaaagggg---tataaaaagggac 38920285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30997032 - 30996790
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||| |||| ||  ||||||| ||||| ||||  | ||||||||| |||  |  ||||||| |||| | |||| | ||||||||||| |||||||    
T  30997032 cgtccctaaatataggagtcttttgccaaaattacggagactaagaaagttgattgtaatattaaatttgtatataattactattgtttttataatttta 30996933  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| |||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |  ||||  ||||||||||||    
T  30996932 tccttaagagagaggattaatttacgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaggatatgttggtaaagaaataa 30996833  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  30996832 ttaatgtacttggaaataccaaatggatcttataaaaagggac 30996790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43789949 - 43789700
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||| | || | || ||||| |||| | |||  | |||||||||| ||| |    
T  43789949 ctccgtccctaaatataggacccttt-gccaaaatcacgggaattaagtaagttggtactagtgttaaatttgtatataagtactattgtttttccaaat 43789851  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctac-----ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||  |||     |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||    
T  43789850 ttatcctcaagagagagagttagtttatgttttcaacatagtacagtatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaa 43789751  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  43789750 tgaaataattaatgtaattggaactaccaaaggggtcttttaaaaagggac 43789700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 248
Target Start/End: Original strand, 48363802 - 48364004
Alignment:
Q  46 attaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgct 145  Q
    ||||||||||| | || | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||  |    
T  48363802 attaagaaagttggtagtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaataaatttatgttttcaatataat 48363901  T
Q  146 acttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||| |||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||| |||||||    
T  48363902 atttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttaaaaacaccaaaggggtcttttaaaaag 48364001  T
Q  246 gga 248  Q
    |||    
T  48364002 gga 48364004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 173 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5858377 - 5858301
Alignment:
Q  173 tataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5858377 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 5858301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Original strand, 15302551 - 15302735
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| ||||||||||    
T  15302551 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 15302650  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| ||  | ||||||||  |  ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  15302651 aaaaaatacaaaataaataaggatatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaatggtcttataaaaagggac 15302735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 249
Target Start/End: Original strand, 23893528 - 23893687
Alignment:
Q  89 attgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggc 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  ||     
T  23893528 attgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggt 23893627  T
Q  189 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  23893628 atgttagtaaagaaataattaatgcacttggaaat-acctagggatcttataaaaagggac 23893687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27670127 - 27669894
Alignment:
Q  9 tccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgttttt-acaattttat 107  Q
    ||||||| |||| || | |||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||| ||||||||||    
T  27670127 tccctaaatataggagctttttgcaaaaattacggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgttttttacaattttat 27670028  T
Q  108 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataat 207  Q
    |||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||||| | | ||||||  || ||||  |||||||||||||    
T  27670027 ccttaaaagagag--ttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaagtaaataaaggtatgttggtaaagaaataat 27669930  T
Q  208 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
    |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27669929 taatatacttggaaatatcaaagggatcttataaaa 27669894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1427460 - 1427253
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||| |  || |||| ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1427460 aaaataacggaaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgt 1427361  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 233  Q
    |||| ||||  || ||| || |||||||||||||| ||  | ||||||||| || |||   || || || ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1427360 tttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaatatacaaaataaataggggtatgatggtgaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaagggg 1427261  T
Q  234 tcttataa 241  Q
    ||||||||    
T  1427260 tcttataa 1427253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Original strand, 1837317 - 1837505
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||   ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||| | ||||| |||||||||    
T  1837317 cctccgtccctaattatatgactcttttataaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtcttaaatatgtttgtaattactattgcttttacaat 1837416  T
Q  103 tttatcctt-------aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 184  Q
     ||||||||        |||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1837417 attatccttcaagagagagagagagagtttgtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatag 1837505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Original strand, 51561768 - 51561869
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| ||    
T  51561768 ttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaataacaaatgtgtcttataaaaatgg 51561867  T
Q  248 ac 249  Q
    ||    
T  51561868 ac 51561869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35945438 - 35945274
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| | ||  || |||||| ||||||||||    
T  35945438 gtattaaatttgtatgtaattattattgtttttataattttatccttaagaaagaaaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 35945339  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    |||||||| | ||||||||  |  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35945338 aaaagatgcaaaataaataaagatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaa 35945274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 158 - 249
Target Start/End: Original strand, 32908286 - 32908377
Alignment:
Q  158 ttgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  32908286 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaggaataattaatgtagttggaaatagcaaataagtcttataaaaagggac 32908377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 4279958 - 4280117
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||  |     
T  4279958 tattgtttttacaattttatccttaagcgagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaa--atgtaaaataaataaggt 4280055  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     | ||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||    
T  4280056 taagttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaatggatcttataaaaagggac 4280117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 44454575 - 44454736
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaa-tcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  44454575 gtccctaattataggatccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgattttacaatttta 44454674  T
Q  107 tcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaa 167  Q
    ||| ||||||||||  | |  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||    
T  44454675 tcctttaagagagatggatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgatagaagaaaa 44454736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 217
Target Start/End: Original strand, 1197925 - 1198128
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    |||||||| ||||| | |||||   ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  1197925 tataagattcttttaccaaaattgtgggaattaaaaaagttgatgtttgtattaaagctgtttataattgctattgtttttaaaattttatcttttaaga 1198024  T
Q  116 g--agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 213  Q
    |  ||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| | | | ||| |||||||||||||||||||    
T  1198025 gggagagagttaatttatgtttttaacatgctatttattgttgattgaaaaaaaaaatgtatattaaataatagtacgtaggtaaagaaataattaatgt 1198124  T
Q  214 agtt 217  Q
    ||||    
T  1198125 agtt 1198128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9425055 - 9424817
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||| ||||||| | |||| |   | |||  |||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  9425055 tccgtccctaattataagatcattttaaaaaaataacgggaactaagaaaattgataat---aataagtttgtttataattaatattgtttttacaattt 9424959  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | ||  || ||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||  ||||| |||    
T  9424958 tatcttttaagagagagaattattttatgttttcaacataatatttaatgttgattgaagaaaaagatataaaataaatagaggtatgttggtaaaaaaa 9424859  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
     |||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||| |||||    
T  9424858 gaattaatgtatttgaaaataccaaagagatcttatgaaaag 9424817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26768611 - 26768435
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaa 167  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| | | ||  || ||| || |||||||||||||    
T  26768611 taaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttaacctttaagagagaaagttagtgtatgttt-caacatagtatttaatgttgattgaagaaaa 26768513  T
Q  168 agatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||| || ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  26768512 agatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttagaaatacaaaagggatcttataaaaag 26768435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Original strand, 32906710 - 32906819
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaa-tcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  32906710 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatttgtttgtaattactattgtttttacaa 32906809  T
Q  102 ttttatcctt 111  Q
    ||||||||||    
T  32906810 ttttatcctt 32906819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 249
Target Start/End: Original strand, 44455529 - 44455614
Alignment:
Q  164 aaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  44455529 aaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaagagatcttataaaaaaggac 44455614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 46271097 - 46271341
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  ||   ||||||||| | | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  46271097 cctccgtccctaagtataggagccttttgccaaaattgcgtagattaagaaatttggttatagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 46271196  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||  |||| ||||||||| ||| | ||||||||  |  ||||  ||||||||    
T  46271197 tttattcttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattattgatagaagaaaaa-atgcaaaataaata-agatatgttggtaaagaa 46271294  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  46271295 ataattaatgtacttggaaataccaaaatcatcttataaaaagggac 46271341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 18114224 - 18114385
Alignment:
Q  11 cctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc- 109  Q
    |||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||||||| || | | ||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||     
T  18114224 cctaattatagggcccttttggaaaaataacggaaattaagaaagttgaaaatggtaataaacttgtttgtaatttctattgtttttacaattttatcct 18114323  T
Q  110 ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagat 171  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  18114324 ttaagagagagggttaatatatgttttcaatataatatttaatgctgattgaagaaaaagat 18114385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 227
Target Start/End: Original strand, 31338946 - 31339115
Alignment:
Q  59 atatttgtattaaagttgtttgtaatc--attattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgct 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||| | |||||| || ||| |    
T  31338946 atatttgtattaaatttgtttgtaattgtattattgtttttacaatttcatcctttaaaagagagagtttgtttctgttttcaacatgctatttcttgtt 31339045  T
Q  156 gattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataaca 227  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||  ||  |  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31339046 gattaaagaaaaaaatttataataaataaagg--ttgaggtaaagaaataattaatgaagttgaaaataaca 31339115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 136
Target Start/End: Original strand, 51561075 - 51561207
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  51561075 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 51561174  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgtttt 136  Q
    ||||||||| | ||||| || | |||||||||||    
T  51561175 tttatccttta-agagaaagatggtttatgtttt 51561207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18172557 - 18172377
Alignment:
Q  54 agtggatatttgtattaaagt-tgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttatt 152  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||| | | |||||||||||||||||||||| | ||||   | |  ||||||||||  | ||| || ||||     
T  18172557 agtggatatttatattaaattatgtttgtaattactgttgtttttacaattttatccttta-agagttggatgatttatgtttttaacatgttatttata 18172459  T
Q  153 gctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18172458 gttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggg------------gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 18172377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 244
Target Start/End: Original strand, 4371574 - 4371750
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaa 165  Q
    ||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| | ||  ||||||||| ||||||| |||    
T  4371574 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctta--agagagagttaatttatattttcaacataatacttattgttgattgaggaa 4371671  T
Q  166 aaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||| | ||||||||  |  | ||  ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||    
T  4371672 aaagatgcaaaataaataaggataggttggtaaataaataattaatgtacttgaaaatatcaaagaagtcttataaaaa 4371750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Original strand, 9411148 - 9411367
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaa-tcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtta 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| | |||||||| |||  | ||| |  ||||| ||||||||||||||||  || |||| |||||||    
T  9411148 ttttgctaaaatcatgggaattaagaaaatcaatagtagtattaaatttgaatataaattgttattatttttacaattttatctctatgagaaagagtta 9411247  T
Q  126 gtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 225  Q
    |||||| ||||| ||||  |  |||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||  || || |  |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  9411248 gtttatattttcaatatagtgtttattgttgattgaagaaaaagctgcaaaataattaagggtatattggtaaagaaataattaatgtaattggaaatat 9411347  T
Q  226 caaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||| |  ||||||||||||    
T  9411348 caaatgaatcttataaaaag 9411367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 26544506 - 26544387
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  26544506 cctccgtctctaattataggacccttttgaaaacataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatatttgtaattattattgtttttacaat 26544407  T
Q  103 ttta-tccttaagagagaga 121  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  26544406 tttattctttaagagagaga 26544387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 246
Target Start/End: Original strand, 33163201 - 33163387
Alignment:
Q  63 ttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctact-------tattgct 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| | ||  || |       |||||||    
T  33163201 ttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttatacaattttatcttt----gagagagttagtttatgttttcaacataatatttaatatatattgct 33163296  T
Q  156 gattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||| || ||| ||||||    
T  33163297 gattcaagaaaaaaatgtataataaataagggtatgtaggtaaagaaataattaatctaattgaacatagcaaagggatcatatgaaaagg 33163387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 41619998 - 41620157
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| | |||||||||||||||| | ||||||||  ||    
T  41619998 tattgtttttacaattttatctttaagag--agagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaagaaaaagatgcaaaataaataaggg 41620095  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||  ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  41620096 tatgttggtaaaaaaataattaatgtacttagaaataccaaataaatcttataaaaagggac 41620157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 5854423 - 5854583
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | ||  || |||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||    
T  5854423 tattgtttttgcaattttatcctta-gagataaagttagtttatgttttcaacataatatttatggttgattgaagaaaaatatgcaaaataaatagggg 5854521  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     |||   |||| |||||||| ||| || ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  5854522 tatggtggtaacgaaataatcaatctaattggaaataccaaaagggtcttatataaagggac 5854583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26547797 - 26547662
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  26547797 cctccgtccctaattatagggcccttttga-aaaataacggaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 26547699  T
Q  103 tttatc-cttaag--agagagagttagtttatgtttt 136  Q
    ||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  26547698 tttatcatttaagaaagagagagttggtttatgtttt 26547662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19349354 - 19349254
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19349354 ttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaatgggtcttataaaaaggg 19349255  T
Q  248 a 248  Q
    |    
T  19349254 a 19349254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 50074618 - 50074460
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatcctta-agagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtg 186  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||| ||||| ||||| ||||  || ||| || |||| ||||||||  ||||| |||||||||      
T  50074618 tattgtttttataattttatcctttgagagagagtgttattttatattttcaatatagtatttaatgttgatcgaagaaaacaatgtaaaataaatagga 50074519  T
Q  187 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    | ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  50074518 gtatgttggtaaagaattaattaatgtacttggaaataccaaagaagtcttataaaaag 50074460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 107
Target Start/End: Original strand, 8946410 - 8946491
Alignment:
Q  26 cttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8946410 cttttgccaaaatgacggaaattaggaaagctgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacatttttat 8946491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 245
Target Start/End: Original strand, 39647654 - 39647779
Alignment:
Q  120 gagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgg 219  Q
    |||||| || |||||||| ||||| || | ||||| ||||||||||||| || | ||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39647654 gagttacttgatgttttctatatgttattcattgccgattgaagaaaaatatatgtaataaataggagtatgtatgtaaagaaatggttaatgtagttgg 39647753  T
Q  220 aaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||    
T  39647754 aaatagtaaatggatcttataaaaag 39647779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33337060 - 33336855
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | |||| |  || |||| ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  33337060 aaaataacgagaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttttacaattttatccttaagag--agagttaatttatgt 33336963  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 233  Q
    |||| ||||  || ||  || |||||||| ||||| ||  | ||||||||| || |||   || || || ||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  33336962 tttcaatataatatttgatgttgattgaaaaaaaatatacaaaataaataggggtatgatggtgaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaagagg 33336863  T
Q  234 tcttataa 241  Q
    ||||||||    
T  33336862 tcttataa 33336855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8905596 - 8905463
Alignment:
Q  110 ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataatta 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  || |   ||||||||||||||    
T  8905596 ttaagaaagagagttagtttatgtttttgacatgttatttattgctgat-gaagaaaaagatgtataataaatagggaaatatggataaagaaataatta 8905498  T
Q  210 atgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    || |||||  ||||| |||||   |||||||||||    
T  8905497 atatagtttaaaatagcaaagatatcttataaaaa 8905463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38505945 - 38505848
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  38505945 ttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagg 38505848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 171
Target Start/End: Original strand, 22940566 - 22940733
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||| |    
T  22940566 cctccgtctctaattataggacccttttgatcaaatcacaggaattaagaaagttgatagtagtatt-aatttgtttgtaattactattgcttttacagt 22940664  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagat 171  Q
    ||||| ||    ||||||  ||||||||||||| | | ||  || |||||  |||||||||||||||||    
T  22940665 tttattctcttcagagagtattagtttatgtttccaacataatatttattattgattgaagaaaaagat 22940733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 25968416 - 25968512
Alignment:
Q  80 gtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtata 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  25968416 gtaatcactattgtttttacaattttatttttaagagaaagaactagtttatgttttcaacgtgctatttattactagttgaagaaaaagatgtata 25968512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30761180 - 30761008
Alignment:
Q  13 taattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt- 111  Q
    |||||||| | |||||||   ||||| |||||| |||||||| | || | | ||| |||  |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||     
T  30761180 taattatagggtccttttaaaaaaataacgggagttaagaaaattgaaagtggtaataagtttgtttgtaattgctattgtttttacaattttattcttt 30761081  T
Q  112 aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 184  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| | ||||||||||||||| || || |||||||||    
T  30761080 aagagaaagagttagtgtatgttttcaacatggtatttaatactgattgaagaaaaaaatataaaataaatag 30761008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 183
Target Start/End: Original strand, 1867285 - 1867380
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  1867285 tattggttttacaattttatccttaagaaatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgatcgaagaaaaaaatgtaaaataaata 1867380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 45810278 - 45810116
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |  ||||||||||| |||  | |||||||| || | | |||| | |||| ||||||||||||||    
T  45810278 cgtccctaattataggagccttttgcaaaaattaccgagattaagaaagttgattgtagtattaaatttatatataattactattatttttacaatttta 45810179  T
Q  107 tcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaa 168  Q
    ||| ||||  |||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||| |||||    
T  45810178 tcctttaaaggagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaaaaaa 45810116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9413633 - 9413560
Alignment:
Q  35 aaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc 108  Q
    |||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  9413633 aaatcatgagaattatgaaaattgatatttgtattaaagttgtttgcaatcattatcatttttacaattttatc 9413560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27255578 - 27255473
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||  ||||| ||||||||||||||| | || | | ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27255578 cctctgtccctaattatatagtccttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgaaaatggtaataaatttgtttgcaatcactattgtttttacaat 27255479  T
Q  103 tttatc 108  Q
    ||||||    
T  27255478 tttatc 27255473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47754118 - 47754065
Alignment:
Q  195 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  47754118 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaggga 47754065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 230
Target Start/End: Original strand, 15624668 - 15624868
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| |||| |||||||||| | || | | ||| |||| ||||||||||| | |||| |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  15624668 aaaataacggaaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttgtttgtaattactattattttgataattttatcctttaagaaagagagttagtgtatg 15624767  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattg---aagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    || ||  |||  || ||| || ||||||   || |||||||| || ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  15624768 ttgtcattatagtatttaatgttgattgaaaaaaaaaaagatataaaataaatagaggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttgaaaataccaaa 15624867  T
Q  230 g 230  Q
    |    
T  15624868 g 15624868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 84
Target Start/End: Original strand, 43453337 - 43453395
Alignment:
Q  26 cttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaat 84  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  43453337 cttttgctaaaactacgggaattaagaaagtgtgtatttgtattaatgttgtttgtaat 43453395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19349714 - 19349642
Alignment:
Q  63 ttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttt 135  Q
    |||||||||| |||| | |||| | |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19349714 ttgtattaaatttgtatataattactattatgtttacaattttatacttaagagagagagtttgtttatgttt 19349642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38509142 - 38509070
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttc 137  Q
    |||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  38509142 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaatttcatccttaaaagagagagtaaatttatgttttc 38509070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15907208 - 15907109
Alignment:
Q  150 attgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||  |  | ||  ||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15907208 attgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataaggataagttggtaaagaaataattagtgtatttaaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 15907109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 119
Target Start/End: Original strand, 2606690 - 2606776
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga 119  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||  |  ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2606690 aaaattacgagaattaagaaagttgatggtaatattaaatttgtttgtaattagtattgtttttacgattttatcctttaagagaga 2606776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15331054 - 15330968
Alignment:
Q  52 aaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc-cttaagagagagagttagtttatgttttc 137  Q
    |||||| ||||||| |||||  |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15331054 aaagtgaatatttgcattaatcttgtttgttatcactgatgtttttacaattttatcatttaagagagatagttagtttatattttc 15330968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 245
Target Start/End: Original strand, 3262965 - 3263058
Alignment:
Q  152 tgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |  |  ||||  |||||||| ||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||    
T  3262965 tgctgattgaagaaaaagatataaaataaagaaggatatgttggtaaagaattaattaatgtatttagaaataccaaagaagtcttataaaaag 3263058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25227405 - 25227356
Alignment:
Q  197 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  25227405 aaagaaataattaatatagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagg 25227356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 89
Target Start/End: Original strand, 25967790 - 25967871
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcatta 89  Q
    |||||||||||||| ||| ||||   ||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  25967790 gtccctaattataacatctttttagcaaaatcacttaaattaagaaagttgatatttgtaataaagttatatgtaatcatta 25967871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 249
Target Start/End: Original strand, 44530546 - 44530599
Alignment:
Q  196 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||    
T  44530546 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatgatcttataaaaatggac 44530599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Original strand, 43589318 - 43589405
Alignment:
Q  156 gattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||    
T  43589318 gattgaagaaaaa-atataaaataaataggggtatgttagtaaagaattaattaatgtactgtgaaatatcaaagggttcttataaaaa 43589405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 52001573 - 52001530
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc 108  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  52001573 gtattaaatttgtttgtaattattattgtttttataattttatc 52001530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 35160218 - 35160280
Alignment:
Q  164 aaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac 226  Q
    ||||| ||||| ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35160218 aaaaatatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtagttgaaaataac 35160280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 249
Target Start/End: Original strand, 897154 - 897191
Alignment:
Q  212 gtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  897154 gtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 897191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Original strand, 5854051 - 5854104
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagt 56  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5854051 cctccgtccctaattatatcactcttttgccaaaatcacggaaattaagaaagt 5854104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 10332415 - 10332370
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt 111  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  10332415 tattaaatttatttgtaattattattatttttacaattttatcctt 10332370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 97
Target Start/End: Original strand, 11351452 - 11351541
Alignment:
Q  9 tccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggata-tttgtattaaagttgtttgtaatcattattgttttt 97  Q
    |||||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  11351452 tccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatattttatattaaatatgtttgtaattattattattttt 11351541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 237
Target Start/End: Original strand, 22940767 - 22940804
Alignment:
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtctt 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22940767 gaaataattaatgttgttggaaataccaaaggggtctt 22940804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 3934611 - 3934639
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3934611 cctccgtccctaattataagatccttttg 3934639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22177646 - 22177575
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattg 160  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||  || |||||| ||||||    
T  22177646 tattgtttttacaagtttatccttca-agagagaattagtttatgttctccttatagtatttattgttgattg 22177575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 22567071 - 22567099
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22567071 cctccgtccctaattataagatccttttg 22567099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #216
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37000783 - 37000735
Alignment:
Q  164 aaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatg 212  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  37000783 aaaaagatgtaaaataattaggggtatgtttgtaaagaaataattaatg 37000735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #217
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 249
Target Start/End: Original strand, 45809870 - 45809918
Alignment:
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45809870 aaataattaatgtacttataaataccaaagaggtcttataaaaagggac 45809918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #218
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 46084154 - 46084054
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    |||||||||||||||  | |||||  ||||| ||| ||||||||||| | || | |  || |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  46084154 gtccctaattataaggccgttttgaaaaaataacgagaattaagaaaattgaaagtgataataaatttgtttgtaattaatattgcttttacaattttat 46084055  T
Q  108 c 108  Q
    |    
T  46084054 c 46084054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #219
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 69
Target Start/End: Original strand, 49893428 - 49893472
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtatt 69  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  49893428 ccttttggtaaaataacaggaattaagaaagttgatatttgtatt 49893472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47934 - 47686
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47934 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 47835  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47834 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 47735  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47734 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 47686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 186)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13154222 - 13153974
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13154222 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 13154123  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13154122 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 13154023  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154022 aaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 13153974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11798899 - 11798651
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11798899 tccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcatgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 11798800  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11798799 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 11798700  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11798699 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 11798651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 17856520 - 17856768
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17856520 tccctccgtccttaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 17856619  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17856620 attttatccttaagagagatagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 17856719  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17856720 aaataattaatgtagttggaagtaacaaaggggtcttataaaaagggac 17856768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12255384 - 12255141
Alignment:
Q  6 ccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttt 105  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  12255384 ccgtccctaattataaaacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatatt 12255285  T
Q  106 atccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12255284 atccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 12255185  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12255184 attaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 12255141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12260927 - 12260684
Alignment:
Q  6 ccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttt 105  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  12260927 ccgtccctaattataaaacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatatt 12260828  T
Q  106 atccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12260827 atccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 12260728  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12260727 attaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 12260684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 44250862 - 44251112
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44250862 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattatttttaca 44250961  T
Q  101 attttatccttaagag--agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaa 198  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44250962 attttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaa 44251061  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44251062 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 44251112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 4631300 - 4631544
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4631300 tccgtccctaattataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 4631399  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4631400 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatataaagaaat 4631499  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4631500 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 4631544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 28864250 - 28864498
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28864250 tccctccatccctaattataagacccttttgttaaaatcagaggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 28864349  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28864350 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 28864449  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28864450 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 28864498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29279490 - 29279242
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  29279490 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaaattttttgtaatcactattgtttttaca 29279391  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29279390 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 29279291  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29279290 aaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 29279242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40741558 - 40741311
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40741558 tccctccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgg-aattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 40741460  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40741459 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 40741360  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40741359 aaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 40741311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44502912 - 44502665
Alignment:
Q  6 ccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttt 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44502912 ccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaatttt 44502813  T
Q  106 atccttaagagagagag----ttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  44502812 atccttaagagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaata 44502713  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44502712 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 44502665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 43653946 - 43654194
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43653946 tccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 43654045  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43654046 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgtagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 43654145  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  43654146 aaataattaatgtagttggaaataataaagatgtcttataaaaagggac 43654194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 29321039 - 29321285
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||   ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29321039 cctccgtcccttattataggattcttttagaaaaaatacgggttttaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 29321138  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  29321139 tttatccttaagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaataggggcatgtatgtaaagaa 29321238  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29321239 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 29321285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 50837 - 51086
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50837 tccctccgtccttatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 50936  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50937 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 51036  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51037 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 51086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 26990570 - 26990815
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttac- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||       
T  26990570 tccctccgtccctaattataagacctttttactaaaattacgggaattaagaaagcgaatatttgcattaaagttgtttgtaatcactattttttttttt 26990669  T
Q  100 aattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26990670 aattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 26990769  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26990770 gaaataattaatgtatttggaaataacaaacgcgtcttataaaaag 26990815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34490812 - 34490563
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34490812 tccctccgtccctatatataagacccttttgcaaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 34490713  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34490712 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 34490613  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34490612 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 34490563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 8948095 - 8948342
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8948095 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 8948194  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8948195 tttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 8948294  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8948295 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 8948342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 2151985 - 2152231
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  2151985 cctccgtccctatatataagactcttttgttaaaatcacgtgaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagt 2152084  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2152085 tttatcgttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 2152184  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  2152185 ataattaatgtagttggaaatagcaaataggtcttataaaaagggac 2152231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 8251675 - 8251924
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8251675 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 8251774  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8251775 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 8251874  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8251875 aaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 8251924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 28191917 - 28192166
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28191917 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttataca 28192016  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28192017 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 28192116  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28192117 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 28192166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18456015 - 18455766
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18456015 tccctccgtccctatatataagacccttttgaaaaaaacacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 18455916  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18455915 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaa 18455816  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18455815 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 18455766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38879016 - 38878767
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38879016 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 38878917  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  38878916 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaat 38878817  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38878816 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 38878767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 35504322 - 35504566
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35504322 tccctccgtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 35504421  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35504422 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 35504521  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35504522 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaa 35504566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18754436 - 18754190
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18754436 tccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 18754337  T
Q  105 tatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||| |||| | |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18754336 tatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 18754237  T
Q  204 taattaatgtag-ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18754236 taattaatgtagtttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 18754190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41014799 - 41014553
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41014799 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 41014700  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41014699 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatattttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 41014600  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41014599 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 41014553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 8951170 - 8951419
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  8951170 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgagaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttcca 8951269  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8951270 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 8951369  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8951370 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaagagtcttataaaaagggac 8951419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 32675499 - 32675748
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32675499 tccctctgtccctatatataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 32675598  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32675599 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 32675698  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32675699 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 32675748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1774637 - 1774388
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1774637 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatatgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 1774538  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1774537 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 1774438  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  1774437 gaaatcattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaaggac 1774388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4076467 - 4076218
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||   |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4076467 tccctccgtccctatatataagacatttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 4076368  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4076367 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 4076268  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4076267 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtattataaaaagggac 4076218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29598519 - 29598270
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29598519 tccctccgtccctatatataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 29598420  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29598419 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaa 29598320  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  29598319 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaatgtcttataaaaagggac 29598270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 38183308 - 38183549
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38183308 tccctccgtctctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 38183407  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38183408 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 38183507  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  38183508 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataa 38183549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 42598458 - 42598706
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42598458 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 42598557  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42598558 attttatcctttaagaaagaacgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaggaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 42598657  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  42598658 gaaataattaatgtagttggaaataacaaa-gggtctaataaaaagggac 42598706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 60 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5593654 - 5593470
Alignment:
Q  60 tatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgatt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5593654 tatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgatt 5593555  T
Q  160 gaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5593554 gaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 5593470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 23687910 - 23688155
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  23687910 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaat 23688009  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23688010 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 23688108  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23688109 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 23688155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 36245671 - 36245904
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36245671 tataagactcttttgctaaaaatacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttctaatcacaattgtttttacaattttctccttaagag 36245770  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgt-aaagaaataattaatgtag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36245771 agagagttagtttatgttttccatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaaataattaatgtag 36245870  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| ||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  36245871 ttgaaaatagcaaatggatcttataaaaagggac 36245904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5162597 - 5162350
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  5162597 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 5162498  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5162497 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 5162398  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5162397 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 5162350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 18111721 - 18111966
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  18111721 cctctgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 18111820  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18111821 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 18111919  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18111920 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 18111966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23487355 - 23487110
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  23487355 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 23487256  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  23487255 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaaa 23487157  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23487156 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 23487110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 32522589 - 32522834
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  32522589 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 32522688  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| | |||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32522689 tttatccttta-agagagagttggcttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 32522787  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32522788 ataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 32522834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 33745643 - 33745887
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33745643 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcaagggaaataagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 33745742  T
Q  105 tatccttaagagagagag-ttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||||||  |||| | || ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33745743 tatccttt-gagaaaaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 33745841  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33745842 taattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaagggac 33745887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 36176861 - 36177094
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36176861 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 36176960  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||| ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36176961 aagaaggttaatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatctatgtaaagaaataattaatgtag 36177060  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36177061 ttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 36177094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 13568656 - 13568895
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13568656 tccgtccttaattataagacacttttgttaaaattacgagaattaagaaagcagatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 13568755  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        
T  13568756 tatccttaagagaaagagtga-tttatgttttccatatgctatttattgttgatggaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag---- 13568850  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13568851 aattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 13568895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40785183 - 40784936
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||    
T  40785183 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaat 40785084  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40785083 tttatcctttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttacttaatgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 40784984  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  40784983 aataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 40784936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14699743 - 14699498
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14699743 tccgtccctatatataagacccttttgtcaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 14699644  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||| || |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  14699643 tatcgtttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgtatgtaaagaaa 14699544  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14699543 taattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 14699498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34568785 - 34568536
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34568785 tccctccgtctctatatataagacccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 34568686  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| || | |||  |||| ||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  34568685 attttatcctttaaaaaagaaggttattttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaacaagggcatgtatgtaaa 34568586  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  34568585 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataataagggac 34568536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 9035283 - 9035525
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  9035283 tccctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 9035382  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9035383 attttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaag 9035481  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9035482 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 9035525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16125452 - 16125683
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||   |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16125452 tccctccgtccctatatataagacccttttatcaaaaacacgggaattaagatagtcgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 16125551  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16125552 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaa 16125651  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16125652 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagg 16125683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45425325 - 45425081
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45425325 cctccgtccctatatataagaccattttgttaaaattgcggaaattaagaaagttgatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 45425226  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  45425225 tttatccttaagagagag--ttaatttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaa 45425128  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  45425127 ataattaatgtagttgaaaatagcaaaaaggtcttataaaaagggac 45425081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28579931 - 28579685
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28579931 tccctccgtcccta--tataagaccattttgccaaagttacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgttt-taatcactattgtttttaca 28579835  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28579834 attttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 28579735  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28579734 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaagggac 28579685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 5783891 - 5784139
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  5783891 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 5783990  T
Q  103 tttatcctt--aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5783991 tttatccttttaagagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaag 5784090  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  5784091 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaagggac 5784139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16999289 - 16999045
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16999289 ctccgttcctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaatt 16999190  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16999189 ttatcctttaagaaagaaggttagtttatcttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaa 16999090  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16999089 ataattaatatagttggaaataacaaaaggatcttataaaaaggg 16999045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26016862 - 26016615
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  26016862 tccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 26016763  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26016762 attttatccttta-agagagaattgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaag 26016664  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26016663 aaataattaatgtagttggaaatagcaaagcggtcttataaaaagggac 26016615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39029470 - 39029224
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  39029470 tccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 39029371  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39029370 attttatccttta-agagagaattagtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaag 39029272  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  39029271 aaat-attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggac 39029224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 2944016 - 2944263
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  2944016 tccctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 2944115  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2944116 attttatccttta-agagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatatataataaataggggcatgcatgtaaag 2944214  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2944215 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 2944263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 36661668 - 36661914
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||   |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36661668 tccctccgtccctatatataagactattttgtcaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 36661767  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| || | |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  36661768 attttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatataaa 36661867  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36661868 gaattaattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagg 36661914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 230
Target Start/End: Original strand, 16117226 - 16117423
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||    
T  16117226 aaaaacacgggaattaagatagtcgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 16117325  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 230  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16117326 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 16117423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 11482864 - 11483111
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  11482864 cctccgtccctaattataagacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 11482963  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11482964 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 11483063  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  11483064 aataattaatgtagttgaaaatagaaaagtggtcttataaaaagggac 11483111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24992808 - 24992561
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  24992808 cctccgtccctaattataaggttattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 24992709  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |    
T  24992708 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggagcatgaatgtaaaaa 24992609  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  24992608 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaacggac 24992561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39406852 - 39406605
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  39406852 cctccgtccctaattatagaacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 39406753  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | ||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39406752 tttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaaga 39406653  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39406652 aataattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 39406605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 14548433 - 14548679
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| ||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  14548433 cctccgttcctatatataagaccattttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgcatatttgtattaaagttgtttttaatcactattgtgtttacaat 14548532  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  14548533 tttatccttaaaagagatagtttatttatggtttccatatgctatttattgctgattgaagaccaatatgtataataaatagaggcatgtatgtacataa 14548632  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||    
T  14548633 ataattaatatagttgaaaatagcaaagagatcttataaaaaaggac 14548679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 33865288 - 33865532
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |    
T  33865288 cctccgtccctaattatagggtccttttga-aaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagt 33865386  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | ||||| || |  ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33865387 tttatccttta-agagatagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 33865485  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  33865486 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggac 33865532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 44580621 - 44580870
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  44580621 cctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 44580720  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga--tgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| ||||||||    | |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44580721 tttatcctttaagagagatgaatggtttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 44580820  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44580821 gaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 44580870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 14583882 - 14584122
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14583882 gtccctaattataggacccttttactaaaatcacagaaattaagaaagtgaatatttgtattaaaattatttgtaatcacaattgtttttacaattttat 14583981  T
Q  108 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataat 207  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| |||||| || |||||| | ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  14583982 ccttaagagagaaaatttgtttatgtttttcatatgttatttattggtaattgaag-aaaagatatataataaacaggggcatgtatataaagaaataat 14584080  T
Q  208 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  14584081 taatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggac 14584122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 42218105 - 42218335
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  42218105 tataagactcttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagatgtttgcaatcactattgtttttacaattttatcttttagag 42218204  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
      ||||||||||||||| ||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  42218205 --agagttagtttatgtcttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcttgtatgtaaaaaaataattaatgtagt 42218302  T
Q  217 tggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42218303 tgaaaataacaaagggatcttataaaaaaggac 42218335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5774342 - 5774094
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  5774342 cctccgtccctaattacaaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 5774243  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataat-aaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  5774242 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataatggaataggggcatgtatgtaaag 5774143  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5774142 aaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 5774094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 244
Target Start/End: Original strand, 257313 - 257524
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  257313 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttcttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatg 257412  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  257413 ttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 257512  T
Q  233 gtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||    
T  257513 gtcttataaaaa 257524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 658607 - 658396
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  658607 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttcttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatg 658508  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  658507 ttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 658408  T
Q  233 gtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||    
T  658407 gtcttataaaaa 658396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 844343 - 844132
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  844343 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttcttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatg 844244  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  844243 ttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 844144  T
Q  233 gtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||    
T  844143 gtcttataaaaa 844132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38967436 - 38967189
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  38967436 cctccgttcctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaat 38967337  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| | || ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  38967336 tttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaaga 38967237  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  38967236 aataattcatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagggac 38967189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 8797033 - 8797288
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaa---gtt-----gtttgtaatcattattgtt 94  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||     |||| |||| | |||||||    
T  8797033 cctccgttcctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttatatgtttataattactattgtt 8797132  T
Q  95 tttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgta 193  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8797133 tttacaattatatcctttaagagagagggttggtttattttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatcggcatgta 8797232  T
Q  194 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8797233 tgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 8797288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25058328 - 25058088
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    ||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25058328 gtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 25058229  T
Q  108 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataat 207  Q
    |||| | ||||| |||| |||||||||||| | ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25058228 ccttta-agagatagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattaaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataat 25058130  T
Q  208 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||    
T  25058129 taatgtagttggaaatagcaaagaggttttataaaaaaggac 25058088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 249
Target Start/End: Original strand, 29806039 - 29806214
Alignment:
Q  75 tgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgt 173  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  29806039 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgt 29806138  T
Q  174 ataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29806139 ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 29806214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44747340 - 44747098
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  44747340 cctccgtccttaattataaggtccttttaaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 44747241  T
Q  103 tttatc-cttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||  |||||| |||||||| | |||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44747240 tttatcttttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatag-ggcatgtatgtaaaga 44747142  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44747141 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 44747098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 243
Target Start/End: Original strand, 7682782 - 7683022
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||   ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  7682782 cctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 7682881  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | ||||| | || |||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7682882 tttatcctttaaagagataattggtttatgttttcaacatgttatttatcgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaa 7682981  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  7682982 ataattaatgtagtcgaaaatagcaaaggggtcttataaaa 7683022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 8072904 - 8073120
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  8072904 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagagttggtttatg 8073003  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  8073004 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaacag 8073103  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  8073104 atcttataaaaagggac 8073120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 21652241 - 21652466
Alignment:
Q  18 ataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagag 116  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  21652241 ataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatttttattgtttttaccattttatcctttaaaag 21652340  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtat----aataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatg 212  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21652341 agagggttagtttatgttttcaacataatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatg 21652440  T
Q  213 tagttggaaataacaaaggggtctta 238  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  21652441 tggttgggaataacaaaagggtctta 21652466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40856089 - 40855846
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40856089 cctccgtccctatatgtaagacctttttgctaaaatcacggtaattaagaaagtgaatatttatattaaaattgtttgtaattattattgtttttacaat 40855990  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatg-ctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgt-aaag 200  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     |||||||| |||     
T  40855989 tttatctttaagataaagagttagtttatgttttccatatgtttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataagaatatgtatgtaaaaa 40855890  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  40855889 aaataattaatgtagttagaaataacaaagaggtcttacaaaaa 40855846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 7683308 - 7683554
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| || | ||||   ||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  7683308 cctccgtccataattataggacctttttaaaaaaataacgagaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 7683407  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||||||||||| | ||| ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7683408 tttatcctttaaagagagaattggtttatgttttcaacatgttatatatcgctgattgaaaaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaa 7683507  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  7683508 ataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 7683554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8566491 - 8566255
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||  ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8566491 tccgtccctaattataggc-cattttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattt 8566393  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  8566392 tatcctttat-gagagagttggtttatgttttcaacatgtcatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaagaaat 8566294  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  8566293 aattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaa 8566255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 26980722 - 26980967
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||| ||||||||  | | |||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26980722 ctccgtccttaattatagtacctttttgaaaaaatatcgggaattaagatagtggatattt-tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 26980820  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||| ||||||||   || |||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26980821 ttatcctttaagagagatgattggtttatgttttcaacatgttatttattggtgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 26980920  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26980921 ataattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaagggac 26980967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 244
Target Start/End: Original strand, 42985262 - 42985501
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42985262 tccgtccctaaatataacacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 42985361  T
Q  105 tatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  42985362 tatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataat-aatatagacatgtatgtaaagaaa 42985460  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  42985461 taattaatgtagttgaaaatagcaaaagagtcttataaaaa 42985501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 32474975 - 32475218
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||| || || | ||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  32474975 tccctccgtccctaattctaggacctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 32475074  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    ||||||||    
T  32475075 attttatccttta-agagagaattgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggc----atgtaaag 32475169  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32475170 aaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 32475218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44888973 - 44888726
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||   |||| ||||||||||    
T  44888973 cctccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattatttttacaat 44888874  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| | ||| || ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||| |||||    
T  44888873 tttatcctttaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgccgattgaagaaagagctgtgtaataaatagggtcatgtatgaaaaga 44888774  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  44888773 aataattaatgtagttgaaaatagcaaaggagtcttataaaaagggac 44888726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Original strand, 16448538 - 16448744
Alignment:
Q  44 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatat 142  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| ||||    
T  16448538 gaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaatat 16448637  T
Q  143 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 242  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16448638 tctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaa 16448737  T
Q  243 aagggac 249  Q
    |||||||    
T  16448738 aagggac 16448744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33980754 - 33980510
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||    
T  33980754 cctccgtccttgattatagggtccttttgaaaaaaa-acgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgtaattagtattgtttttacaat 33980656  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  33980655 tttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataagggcatgtatgtaaagaa 33980557  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  33980556 ataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 33980510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40529497 - 40529352
Alignment:
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40529497 tttatccttaaaagagagagttagtttatgttt-ccatatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 40529399  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40529398 ataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaaaggac 40529352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44021297 - 44021055
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  44021297 tccgtccctaattacaaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatacgtttataattactattgtttttacaattt 44021198  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44021197 tatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatctataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 44021098  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  44021097 taattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagg 44021055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 45283565 - 45283778
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| | || |||||| ||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||     
T  45283565 aaaataacgggaattaagacaatgaatatttatatcaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttata 45283664  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      
T  45283665 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaagataattaatgtagttggaaataacaaagat 45283764  T
Q  233 gtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||    
T  45283765 gtcttataaaaagg 45283778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5268230 - 5268016
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaa-gagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||    
T  5268230 aaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaaacattattatttt-acaaatttatcctttatgagagagaattaatttatg 5268132  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |     
T  5268131 ttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaagtagcaaaaga 5268032  T
Q  233 gtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||||| ||||||||    
T  5268031 gtcttatgaaaaggga 5268016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 38780886 - 38781132
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||| ||     
T  38780886 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttataa- 38780984  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  38780985 tttatcctttaagagagaggattgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaaga 38781084  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  38781085 aataattattgtggttggaaataggaaaggggtcttataaagagggac 38781132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 7758672 - 7758900
Alignment:
Q  2 ccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    |||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  7758672 ccctccgtacctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagataatggatagttgtattaaagttgtttgtaatcact-ttgtttttacga 7758770  T
Q  102 ttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7758771 ttttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttc-------------------attgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 7758851  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7758852 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 7758900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4778882 - 4778640
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||   ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |    
T  4778882 cctccgtccctaattatatgattattttaaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacagt 4778783  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  4778782 tttatccattaagagagagggttggtttat-ttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatatatgtaaaga 4778685  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||    
T  4778684 attaattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttatagaaagg 4778640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12825239 - 12825013
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||  ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  12825239 cctccgtccctaattatagagcccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaat 12825140  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12825139 tttatcctttaagagagatagttggtttatgttttcaacatgttgtttattgctgattgaagaaaaatatgtat-ataaataggggcatgtatgtaaaga 12825041  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12825040 aataattaatgtagttgaaaatagcaaa 12825013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 18641122 - 18641368
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||   ||||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  18641122 ctccgtcactaattataagacctttttaaaaaaataataggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataatt 18641221  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||| |||| |||| ||| | |||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  18641222 ttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttaaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggttatgtatgtaaagaa 18641321  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  18641322 ataattaatttagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaagggac 18641368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21137117 - 21136903
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc-cttaagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  21137117 aaaatcatgggaattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattatttttccaattttatcatttaagagatagagttaatttatg 21137018  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || |||||  | |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| |     
T  21137017 ttttcaacatgttatttattattcattgaagaaaaaaatgtataataaataggagtatgtaagtaaagaaatagttgatgtaattggaaatagcaaatga 21136918  T
Q  233 gtcttataaaaaggg 247  Q
    |||||||||||||||    
T  21136917 gtcttataaaaaggg 21136903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Original strand, 35143288 - 35143511
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 124  Q
    |||||||  ||||| || |||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  35143288 ccttttgaaaaaataaccggaattaagatagtatatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttgtccttta-agagagagtt 35143386  T
Q  125 agtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 224  Q
     |||||||||||| | ||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35143387 ggtttatgttttcaacatgttttttattggtgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaata 35143486  T
Q  225 acaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||   |||||||||||||||||    
T  35143487 acaaataagtcttataaaaagggac 35143511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 245
Target Start/End: Original strand, 44748258 - 44748450
Alignment:
Q  54 agtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttatt 152  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||    
T  44748258 agtggatatttatattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttatt 44748357  T
Q  153 gctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  44748358 gctgattgaagaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaag 44748450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 185
Target Start/End: Original strand, 44056818 - 44056994
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||  || | ||||| |||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44056818 cgtccctaattattggaccattttgttaaaatcacaagaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttta 44056917  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagt 185  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44056918 tcctta--agagagagttagtttatgtttttcatatgatatttattgttgatttaaaaaaaagatgtataataaatagt 44056994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45260515 - 45260289
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45260515 cctccgtccctaattatatgactcttttga-aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgttattgtttttacaat 45260417  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| |||||||| | |||| |||||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  | |||||||| ||| |    
T  45260416 tttatcctttaagagataaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgccgattgaagaaagagctgtataataaataaggtcatgtatggaaata 45260317  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45260316 aataattaatgtagttgaaaatagcaaa 45260289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31886962 - 31886737
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| ||||||||  | ||||||   ||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  31886962 cctccgtccttaattatagaacccttttaaaaaaataacgggaattaagataataaatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaat 31886863  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  31886862 tttatccttta-agagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaatagaggcatgtatgtaaaaaa 31886764  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31886763 ataattaatgtagttgaaaataacaaa 31886737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11293945 - 11293699
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| |||| |||| ||  ||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  11293945 cctccgtctctaaatataggagtcttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 11293846  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||  ||||||||    
T  11293845 tttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataagtaagggtatgttggtaaagaa 11293746  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  11293745 ataattaatgtacttggaaataccgaaggagtcttataaaaagggac 11293699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28741133 - 28740973
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28741133 tataagacccttttgttaaaattatgggaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttacaattattattgtttttacaattttatccttaagag 28741034  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataa 177  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28741033 cgagagttaatttatattttctatatattatttattgctcattgaaaaaaaagatgtataa 28740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 29738104 - 29738276
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||    
T  29738104 cctccgtccctatatgtaagacccttttgctaaaattacaggaattaagaaattggatatttgtattaaagttgatggtaatcactattatttttacaat 29738203  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataa 177  Q
    ||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29738204 tttgttctta--agagagagttgatttatgttttccatatgttatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataa 29738276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39463215 - 39463036
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| | ||  || |||||| ||||||||||    
T  39463215 gtattaaatttgtttgtaattactattgcttttacaattttatccttaagaaagagactaggtttatgttttcaacatagtatttattgttgattgaaga 39463116  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39463115 aaaagatgtaaaataaataggggtatgttggtaaggaaataattaacgtagttggaaatgacaaaggggtcttataaaaa 39463036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41616162 - 41615952
Alignment:
Q  44 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagaga-----gagttagtttatgttttc 137  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||     || ||| |||||||||||    
T  41616162 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgcaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagatgtttgattta-tttatgttttc 41616064  T
Q  138 catatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtctt 237  Q
     | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||   | ||    
T  41616063 aacatgttatttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaacaggggcatgtatgtaaagatataattaatgtagttgaaaataacaaagaaatttt 41615964  T
Q  238 ataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||    
T  41615963 ataaaaagggac 41615952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36786759 - 36786514
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||  |||| |||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  36786759 cctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattacggagattatgaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 36786660  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  36786659 tttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaa 36786560  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| || |||| |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  36786559 ataattaatctacttgg-aatatcaaatgagtcttataaaaagggac 36786514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17336707 - 17336464
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||  ||||||||| | | |  | |||||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||    
T  17336707 tccgtccctaattataggaacattttgcaaaaattacggagattaagaaaattggttgtagtattaaatttgtatgtaattactattgtttt-acaattt 17336609  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  ||||||||||    
T  17336608 tatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaat 17336509  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  17336508 aattaatgtacttgaaaatacaaaaaaggtcttataaaaagggac 17336464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5951318 - 5951164
Alignment:
Q  94 ttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgta 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  || |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5951318 ttttacaattttatccttta-agaggtagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgta 5951220  T
Q  194 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5951219 tgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 5951164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23995868 - 23995623
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||   ||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | | |||||||||||||    
T  23995868 cctccgtccctaaatataagagccttttaccaaaattgtggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactgttgtttttacaat 23995769  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  23995768 tttatccttgagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 23995670  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23995669 ataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggac 23995623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 44165214 - 44165460
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||   ||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  44165214 cctccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattgtggagattaagaaagttggttatagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 44165313  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||  || | ||  ||||||||    
T  44165314 tttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaa 44165413  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  44165414 ataattagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaatggac 44165460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23498018 - 23497778
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  ||| ||||||| | |  | |||||||| |||| || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23498018 cgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacggagattgagaaagttggttgtagtattaaatttgtatgcaattattattgtttttccaatttta 23497919  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattg--aagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||  || ||||  ||||||||||    
T  23497918 tccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaat 23497819  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  23497818 aattaatgtacttataaataccaaaagggtcttataaaaag 23497778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42885465 - 42885321
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42885465 tccctccgtcgctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 42885366  T
Q  101 attttatc--cttaagagagagagttagtttatgttttccatatg 143  Q
    ||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||| |||||    
T  42885365 attttatcttcttaagaaagaacgttagtttatgttttcaatatg 42885321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35203089 - 35202938
Alignment:
Q  42 gggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccata 141  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| | |    
T  35203089 gggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctt--tagagagagttggtttatgttttcaaca 35202992  T
Q  142 tgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatg 195  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  35202991 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatctataataaataggagcatgtatg 35202938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35179891 - 35179646
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||| ||||| |||| || |||||||| ||||| || |  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  35179891 ctccgtgcctaaatataggagccttttgccaaaattactgagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaatt 35179792  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||  || |||||  ||||||||||||||| || | ||||||||  || ||||  |||||||||    
T  35179791 ttatccttaagaaagagaattaatttatgttttcaacataatatttattattgattgaagaaaaaggtgcaaaataaataaaggtatgttggtaaagaaa 35179692  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  35179691 taattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaaaggac 35179646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5110111 - 5109927
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||  || |||| | |||||||| |    
T  5110111 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttatagttgattgaaaa 5110012  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  5110011 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgggtcttataaaaagggac 5109927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 40530440 - 40530336
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  40530440 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcacggttgtttttaca 40530341  T
Q  101 atttt 105  Q
    |||||    
T  40530340 atttt 40530336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 158 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 42885191 - 42885100
Alignment:
Q  158 ttgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42885191 ttgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 42885100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Original strand, 23894653 - 23894896
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||   ||||| |||||| ||||  ||||||||||| | |  | || ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  23894653 cctccgtccctaaatataggaattttttgttaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtgttaaatttgtatataattattattgtttttacaat 23894752  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |  ||||  ||||||||    
T  23894753 tttatcctta--agagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaggatatgttagtaaagaa 23894850  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  23894851 ataattaatgtatttggaaatactaaatggatcttataaaaaggga 23894896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36941560 - 36941315
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||  |||||  |||  ||||||||||| |||  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  36941560 cctccgtccctaaatataggagtcttttgtcaaaattgcggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 36941461  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  36941460 tttatccttaagagagagagtagatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 36941362  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  36941361 ataattaatgtacttgaaaataccaaatagatcttataaaaagggac 36941315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11114043 - 11113829
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagag--agagagttagttta 130  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  11114043 aaaatcacgtgaattaaaaaagttcatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttactattttatcctttaagagatagagagttgtttta 11113944  T
Q  131 tgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa---taattaatgtagttggaaataaca 227  Q
    ||||||  | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||||   |||||||| | ||| |||||| ||    
T  11113943 tgtttttaacatgatatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagatgtatgtagataaagaaatagtaattaatatggttagaaatagca 11113844  T
Q  228 aaggggtcttataaa 242  Q
    || | ||||||||||    
T  11113843 aaagagtcttataaa 11113829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26626000 - 26625839
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||   |    
T  26626000 tattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataagag 26625901  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     | ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26625900 taggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagggac 26625839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 43292743 - 43292987
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| | |  |  ||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  43292743 cctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattacggagattaagatagttggttgtaatattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 43292842  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||   | ||||  ||||||||    
T  43292843 tttatcctta--agagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagagtatgttagtaaagaa 43292940  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  43292941 ataatgaatgtacttggaaatatcaaagagatcttataaaaagggac 43292987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Original strand, 25056682 - 25056868
Alignment:
Q  43 ggaattaagaaagtggatattt---gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttcc 138  Q
    |||||||||||| | |||||||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||     
T  25056682 ggaattaagaaaattgatatttatagtattaaatttgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagtttgtttatgttttca 25056781  T
Q  139 atatgctacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata-gtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataaca 227  Q
    | || ||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||| | || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25056782 acatacta-ttat---tgattgaagaaaaaaaatgtataataaatagggggtatataggtaaagaaataattaatgtagttggaaataaca 25056868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28965636 - 28965550
Alignment:
Q  163 gaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28965636 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 28965550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 231
Target Start/End: Original strand, 31089699 - 31089894
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttag 126  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31089699 ttttgccaaaataacgggaattatgaaagttgatatttgtattaaagttgtct---------attgtttttacaattttatccttta-agagagagttag 31089788  T
Q  127 tttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa-ataattaatgtagttggaaataa 225  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||| ||||| ||  ||||||||||||||  ||||||    
T  31089789 tttatgttttcaacatgctatttattactgattgaagaaaaatatgtataataaataagagtatgtaggtaaaaaatttaattaatgtagttaaaaataa 31089888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 110361 - 110182
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||  ||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  110361 cgtccctaattataggacccttttgaaaaaataatgggaattaagatcgtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatctta 110262  T
Q  107 tcc-ttaagagagaga--gttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 183  Q
    ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||  | ||| || |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  110261 tcctttaagagagagagggttggtttatgtttttaacatgttatttattggtgattgaaaaaaaatatgtataataaata 110182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12802838 - 12802657
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| ||||||||||    
T  12802838 gtattaaatttgtatttaattactattgtttttacaattttatccttaagag--agagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 12802741  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||| ||| | ||||||||  || || |   ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12802740 aaaaaatgcaaaataaataagggtatattaataaagaaataattaatgtacttggaaataccataggggtcttataaaaaggga 12802657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30140375 - 30140211
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  30140375 cctccgtccctaattatagggtttttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 30140276  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaa 166  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||    
T  30140275 tttatcctttaagaaagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaa 30140211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 24260702 - 24260941
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |  | | | ||| |||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  24260702 cgtccctaattatatgattcttttgagaaaataacgggaattaagaaaattaaaaatggtaataaatttgtttgtaattactattgcttttacaattcta 24260801  T
Q  107 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    ||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | ||  || ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||  ||||| || ||    
T  24260802 tcctttaaaagagagaattagtgtatgttttcaagatagtatttaatactgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttggtaaaaaatta 24260901  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24260902 attaatgcacttggaaatatcaaagggatcttataaaaag 24260941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 28965758 - 28965651
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28965758 ctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 28965659  T
Q  104 ttatcctt 111  Q
    ||||||||    
T  28965658 ttatcctt 28965651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 5244457 - 5244618
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |   || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  ||    
T  5244457 tattgtttttagaattttatccttaagagagagagttcatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataaggg 5244556  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  5244557 tatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggac 5244618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 249
Target Start/End: Original strand, 44580916 - 44581044
Alignment:
Q  121 agttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 220  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  44580916 agttaatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaatagttaatgtacttgaa 44581015  T
Q  221 aataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  44581016 aataacaaagaggcattataaaaagggac 44581044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 14625812 - 14625712
Alignment:
Q  11 cctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcct 110  Q
    ||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14625812 cctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcct 14625713  T
Q  111 t 111  Q
    |    
T  14625712 t 14625712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 249
Target Start/End: Original strand, 17851339 - 17851439
Alignment:
Q  149 tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||| |||    
T  17851339 tattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatatagttggaaatagtaaaagagtcttataaaaaagga 17851438  T
Q  249 c 249  Q
    |    
T  17851439 c 17851439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30512991 - 30512817
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaa 168  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| | ||  || ||| || | ||||||||||||    
T  30512991 taaatttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt---agagagagctagtttgtgttttcaacatagtatttaatgttcattgaagaaaaa 30512895  T
Q  169 gatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa-taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||| || ||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30512894 gatataaaataaataggggtatgttggtaaaaaaattaattaatgtacttgaaaataccaaaggggtcttataaaaag 30512817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39970252 - 39970021
Alignment:
Q  12 ctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt 111  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||| | | ||||||||||| | || ||  ||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||    
T  39970252 ctaactataagacccttttgaaaaaataaggagaattaagaaaattgaaatgagtaataaatttgtttgtaattgtcattgtttttacaattgtatcctt 39970153  T
Q  112 -aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaa 210  Q
     || |||||| |||||| ||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  ||  |||  |||||||| |||||||    
T  39970152 taaaagagagggttagtgtatgttttcaatataatatttactgctgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtgtgttggtaaagaattaattaa 39970053  T
Q  211 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 242  Q
    |||| |||||||||  |||| | |||||||||    
T  39970052 tgtatttggaaatatgaaagagttcttataaa 39970021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 249
Target Start/End: Original strand, 41898330 - 41898487
Alignment:
Q  93 tttttacaattttatccttaagagagagagttagtt--tatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||    
T  41898330 tttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtat 41898428  T
Q  191 gtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  41898429 gttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaaaggac 41898487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 229
Target Start/End: Original strand, 25635979 - 25636079
Alignment:
Q  129 tatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaa 228  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25635979 tatgttttccacatgctatttattgctgattgaaaataaacatgtataataaatagagacatgtatgtacagaaataattaatatagttgaaaataacaa 25636078  T
Q  229 a 229  Q
    |    
T  25636079 a 25636079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26502709 - 26502525
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagag----ttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattga 161  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||| ||||| |  |  || ||||||   |||||    
T  26502709 tattaaatttgtatataatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagttaatttatattttcaacgtaatatttattg---attga 26502613  T
Q  162 agaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || ||||  ||||| ||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26502612 agaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacatagaaatacaaaaggggtcttataaaaagggac 26502525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42220653 - 42220522
Alignment:
Q  91 tgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  | ||    
T  42220653 tgtttttacaattttatccttaagagagag------tttatattttccatat-ctatttattgttg-ttgaagaaaaatatgtataataaatagaagtat 42220562  T
Q  191 gtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  42220561 gtatataaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaag 42220522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Original strand, 39970553 - 39970698
Alignment:
Q  86 attattgtttttacaattttatccttaa--gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 183  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||| | ||  || |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  39970553 attattgtttttacaatttaatacttaaaagagagagagtttgtttatgttttcaacatagtatttattgttgatggaagaaaaatatgtaaaataaata 39970652  T
Q  184 gtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
      |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  39970653 agggcatgttggtaaagaaataattaatgtaattgaaaataccaaa 39970698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19176283 - 19176182
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19176283 ttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaaggg 19176184  T
Q  248 ac 249  Q
    ||    
T  19176183 ac 19176182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 152
Target Start/End: Original strand, 39112543 - 39112655
Alignment:
Q  40 acgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcct-taagagagagagttagtttatgttttcc 138  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||     
T  39112543 acgggaatgaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcatctaagagaga-aattagtttatgtattca 39112641  T
Q  139 atatgctacttatt 152  Q
    | |||||| |||||    
T  39112642 acatgctatttatt 39112655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 246
Target Start/End: Original strand, 9615975 - 9616071
Alignment:
Q  149 tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  9615975 tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtagttaaagaaataattaacgtagtttgaaat-agaaatgagtcttataaaaagg 9616071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 35203254 - 35203098
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||         ||||| |||  |||||||    
T  35203254 aaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataatttta---------gagagggttgatttatgt 35203164  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    |||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  35203163 tttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatacggacatgtatgtaaa 35203098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23425101 - 23424921
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||||||| |||| || | |||||  ||||| ||||  ||||||||||| | |  |||||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  23425101 cctctgtccctaaatataggagcattttgtcaaaattacggagattaagaaagttggttgttgtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 23425002  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 183  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| | ||  || |||| | |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23425001 tttatccttaaaagagataattaatttatgttttcaagataatatttatggttgattgaagaaaaagatgcaaaataaata 23424921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 111
Target Start/End: Original strand, 44580522 - 44580606
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  44580522 ttttgctaaaatcacgagaattaagaaagttaatatttgcattaaacttgtttgttatcactaatgtttttacaattttatcctt 44580606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Original strand, 25635897 - 25635975
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatca 86  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25635897 cgtccctatatataagacccttttgttaaaat-acggaaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatca 25635975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 36409803 - 36409708
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  36409803 tattgtttttacaattttattcttaagagagagaattaatttatgtttttaatatgatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaata 36409708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 45145446 - 45145356
Alignment:
Q  93 tttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 183  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  45145446 tttttacaattttattcttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgtacaataaata 45145356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2767918 - 2767701
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    ||||| || ||||||| | |||||  |||||  ||||| | |||||| | |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2767918 gtcccaaaatataagaacattttgacaaaattccgggagtaaagaaaattgatatttgtattaaagatctttgtaatcactattgtttttacaatattat 2767819  T
Q  108 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataat 207  Q
      || | ||||| | ||| ||||||||||| | ||| || |||||  |||||||||||||| |   ||||||||||  || |||||  | ||||||| ||    
T  2767818 tattta-agagataattattttatgttttcaacatgttatttatttttgattgaagaaaaaaa--cataataaatatgggtatgtagctcaagaaatgat 2767722  T
Q  208 taatgtagttggaaataacaa 228  Q
    |||| |||||| |||||||||    
T  2767721 taatttagttgaaaataacaa 2767701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16894173 - 16894065
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| | | ||||||||||| | || | | ||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16894173 cctccgtccttaattataaaatccttttgaaaaaataatgagaattaagaaaattgaaaatggtaataaaattgtttgtaattactattgtttttacaat 16894074  T
Q  103 tttatcctt 111  Q
    |||||||||    
T  16894073 tttatcctt 16894065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 37296276 - 37296185
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttt 105  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  37296276 cgtccctatatataagatcattttgtcaaaatcacgagaattaagaaagttgatatttgtattaaagtt-------atcattattgtttttacaatttt 37296185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 136
Target Start/End: Original strand, 19700757 - 19700887
Alignment:
Q  6 ccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttt 105  Q
    ||||||||||||||| | || |||||  ||||| ||||||||||||||| | || | | ||| || | ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19700757 ccgtccctaattatagggtctttttgg-aaaataacgggaattaagaaaattgaaagtggtaatatatttgtttgtaattattactgtttttacaatttt 19700855  T
Q  106 atcc-ttaagagagagagttagtttatgtttt 136  Q
    |||| |||||||| || |||||| ||||||||    
T  19700856 atcctttaagagaaagggttagtgtatgtttt 19700887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13141664 - 13141506
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| | ||  || |||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||  |     
T  13141664 tattgtttttacaattttatctttaagagagaga--taatttatgttttcaacataatatttatttttgattgaa-aaaaagatgcaaaataaataagga 13141568  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||   ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  13141567 tatgttgataaagaaataattaatggacttaaaaatatcaaaaaggtcttataaaaagggac 13141506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19176982 - 19176849
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| ||||||||  |  ||||||| ||||| || |  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| |||||| | || ||||||||||||    
T  19176982 cctccgtccttaattatagaagtcttttgcaaaaattacagagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatgtaattaatactgtttttacaat 19176883  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttc 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19176882 tttatccttaagagagaga-ttaatttatgttttc 19176849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 249
Target Start/End: Original strand, 37023180 - 37023274
Alignment:
Q  155 tgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  37023180 tgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatatacttgaaaatatcaaagaggttttataaaaagggac 37023274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 84
Target Start/End: Original strand, 17851254 - 17851335
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaat 84  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17851254 cctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaat 17851335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24355310 - 24355214
Alignment:
Q  149 tattgctgattgaagaaaaa-gatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24355310 tattgttgatttaagaaaaacgatgtataataaatag-ggattgtaggtaaataaataattaacgtagttaaaaataacaaaggggtattataaaaag 24355214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 42747459 - 42747366
Alignment:
Q  45 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta-tccttaagagagagagttagtttatgttttc 137  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  42747459 aattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattttttttacaattttattctttaagagagagggttggtttatattttc 42747366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 31618997 - 31619235
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||| | || | | ||| |||| |||| | ||||   |||| ||||||||||    
T  31618997 cctccgtccttaattataggatccatttgaaaaaataacgagaattaagaaaattgaaaatggtaataaatttgtctataattgctattttttttacaat 31619096  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    || ||| ||    |||||||||||| || |||||| | ||  || ||| || |||||||||||||| || || ||||||||| ||  |||  ||||||||    
T  31619097 ttaatcattt---gagagagttagtgtacgttttcaacatattatttaatgttgattgaagaaaaa-atataaaataaataggggtgtgttggtaaagaa 31619192  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
     || |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  31619193 ttagttaatgtacttggaaataccaaaaaggtcttataaaaag 31619235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 41388490 - 41388634
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaa-gtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| |||| ||| ||||  |||||  ||||||||  ||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||||||||    
T  41388490 ctccgtcgctaaatatgagattgttttggaaaaatcacaagaattaacaaaagttgatatttgtattaaaattgtttgtgatgactattatttttacaat 41388589  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgcta 146  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||||| | ||||||    
T  41388590 tttatcctttaagagatatagctaatttatgttttcaacatgcta 41388634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5952572 - 5952482
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgttttt 97  Q
    |||||||||||||| |  | |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||    
T  5952572 cgtccctaattatatggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgatttt 5952482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 249
Target Start/End: Original strand, 13401786 - 13401911
Alignment:
Q  123 ttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 222  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || || | ||| || ||| |||| ||||| ||||    
T  13401786 ttagtttatattttcaacatgctatttattgct-attgaagaaaaagatgtataataaatagggttatatagggaaaaaagtaactaatatagttagaaa 13401884  T
Q  223 taacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    || || || | ||||||||||| ||||    
T  13401885 tagcacagagatcttataaaaaaggac 13401911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24358958 - 24358906
Alignment:
Q  45 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgttttta 98  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24358958 aattaagaaaattgatatttgtattaa-gttgtttgtaatcattattgttttta 24358906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36408515 - 36408462
Alignment:
Q  195 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36408515 gtaaagaaataattaatgtactagaaaatatcaaaggggtcttataaaaaggga 36408462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 13335827 - 13335882
Alignment:
Q  189 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  13335827 atgtaggtaaagaaataattaatgcagttgaaaataacaaaagagtcttataaaaa 13335882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29073912 - 29073738
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||| | | |  | |||||||| |||| | |||| | ||||| ||||| ||     
T  29073912 cctccgtccctaaatatatgagccttttgcaaaaattacggagattaagaaaattggttgtagtattaaatttgtatataattactattg-ttttataa- 29073815  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaa 181  Q
    |||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  29073814 tttatcatta--agagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 29073738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2786260 - 2786183
Alignment:
Q  152 tgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |  ||||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2786260 tgctgattgaagaaaaagatagaaaataaatagagatatgttggtaaaaaattaattaatgtacttggaaataacaaa 2786183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 179
Target Start/End: Original strand, 28929349 - 28929418
Alignment:
Q  110 ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 179  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||| | |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  28929349 ttaaaagagagactttgtttatgttttcaacatgctatttattgtttattggagaaaaagatgtataata 28929418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 45145816 - 45145767
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagt 56  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  45145816 cgtccctaattataagagccttttgccaaaattacgagaattaagaaagt 45145767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 5449646 - 5449607
Alignment:
Q  81 taatcattattgtttttacaattttatccttaagagagag 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5449646 taattattattgtttttacaattttatctttaagagagag 5449607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Original strand, 13401722 - 13401784
Alignment:
Q  45 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  13401722 aattaagaaagttgatatttgtattgaaattg-ttgtaatcactattacttttacaattttatc 13401784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 108
Target Start/End: Original strand, 19715658 - 19715692
Alignment:
Q  74 ttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19715658 ttgtttgtaattattattgtttttacaattttatc 19715692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Original strand, 31846246 - 31846394
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||  |||||||  ||||| ||||||| || | |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||       ||||||||    
T  31846246 cgtccctatgtataagactcttttactaaaattacag-aatttagaaagttgatatttatattaaagttgtttgtaattactatt-------caatttta 31846337  T
Q  107 tcct-taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaa 162  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||  ||||| | ||| ||||||||||| ||||||    
T  31846338 tcctctaagagggatagttaatttaaattttcaacatgttacttattgctcattgaa 31846394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 40529310 - 40529340
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40529310 tccctccgtccctaattataagatccttttg 40529340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 42486288 - 42486219
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc--ttaagagagagagttagtttatgtttt 136  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  42486288 taaatttgtttgtaattactattgtttttacaattttatacttttaagagagataattagtttatatttt 42486219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 44502623 - 44502653
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44502623 tccctccgtccctaattataagatccttttg 44502653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 249
Target Start/End: Original strand, 43986654 - 43986703
Alignment:
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  43986654 gaaataattaatgtagtttgaaatttgaaaggggtcttatagaaagggac 43986703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 6989058 - 6988966
Alignment:
Q  46 attaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat-ccttaagagagagagttagtttatgttttc 137  Q
    ||||| ||||||||||  | ||||||| || ||| |||| ||||||||||| | |||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  6989058 attaaaaaagtggataagtatattaaatttatttataattattattgttttgaaaattttatactttaagaaacagagtcagtttatgttttc 6988966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 12255099 - 12255127
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12255099 tccctccgtccctaattataagatccttt 12255127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 12260642 - 12260670
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12260642 tccctccgtccctaattataagatccttt 12260670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 14699457 - 14699485
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14699457 cctccgtccctaattataagatccttttg 14699485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 39112875 - 39112961
Alignment:
Q  139 atatgctacttattgctgattgaagaaaa--agatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 224  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |   | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39112875 atatgctatttattgttgattgaaaaaaaaaagatgtataataaacataagtatatatgtaaagaaataa-taatgtagttgaaaata 39112961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 39463556 - 39463508
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagt 56  Q
    ||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  39463556 gtccctaattataggacccttttggccaaatcacgggaattaagaaagt 39463508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 41898528 - 41898500
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41898528 cctccgtccctaattataagatccttttg 41898500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 188)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21295445 - 21295197
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21295445 tccctccgtccctaattataagaactttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 21295346  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21295345 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 21295246  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21295245 aaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 21295197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 29176995 - 29177243
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29176995 tccctccgtctctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 29177094  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29177095 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaag 29177194  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29177195 aaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 29177243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28061011 - 28060766
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28061011 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 28060912  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28060911 attttatccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtaggtaaag 28060812  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28060811 aaataattaatgtagttggaaataacaaa-gggtcttataaaaaggg 28060766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 9036674 - 9036920
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9036674 cctccgttcctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 9036773  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9036774 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgtagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaacaa 9036873  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036874 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 9036920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38858590 - 38858344
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38858590 cctccgtcccttattataagacccttttgctaaaatcaagggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 38858491  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38858490 tttatccttaagagagagagttcgtttatgtttttcatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 38858391  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858390 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 38858344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38428441 - 38428194
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38428441 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 38428342  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  38428341 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgtaaag 38428242  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  38428241 aaataattaatgtagttagaaataacaaa-ggatcttgtaaaaagggac 38428194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 41002900 - 41003145
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||  ||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41002900 ctccgtctttaattataagaccaatttgctaaaattacaggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatt 41002999  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41003000 ttatccttaagagagagagatagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 41003099  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41003100 taattaatgtagttggaaataacaaatggatcttataaaaagggac 41003145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 34012267 - 34012509
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34012267 cgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattgtttttacaatttta 34012366  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34012367 tccttaaaagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataacaaataggggcttgtatgtaaagaaataa 34012466  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  34012467 ttaatgtacttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggac 34012509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1275475 - 1275724
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1275475 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 1275574  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1275575 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 1275674  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1275675 gaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 1275724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 25247433 - 25247682
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25247433 tccctccgtccttatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 25247532  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25247533 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 25247632  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25247633 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 25247682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 39871355 - 39871604
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39871355 tccctctgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 39871454  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39871455 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 39871554  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39871555 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 39871604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8291198 - 8290949
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8291198 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 8291099  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8291098 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 8290999  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8290998 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 8290949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31458292 - 31458043
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31458292 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatgtctgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 31458193  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31458192 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 31458093  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31458092 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 31458043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 34978819 - 34979068
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34978819 tccctccgttcctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 34978918  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34978919 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 34979018  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34979019 gaaataattaatttagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 34979068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 41025838 - 41026087
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41025838 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 41025937  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41025938 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 41026037  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41026038 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 41026087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 8612321 - 8612566
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8612321 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 8612420  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8612421 tatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtcaagaaa 8612520  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8612521 taattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 8612566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17491810 - 17491561
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17491810 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttaca 17491711  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17491710 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 17491611  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17491610 aaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 17491561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 17561404 - 17561653
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17561404 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttaca 17561503  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17561504 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 17561603  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17561604 aaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 17561653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 32872133 - 32872366
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32872133 tataagatccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 32872232  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32872233 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 32872332  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32872333 ttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 32872366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 33858609 - 33858857
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33858609 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 33858708  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33858709 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 33858808  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33858809 gaaataatcaatgtagttggaaataacaaa-gggtcttataaaaagggac 33858857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44547721 - 44547472
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44547721 tccctccgtccctatatataagacctttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 44547622  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44547621 attttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaa 44547522  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44547521 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatcttataaaaagggac 44547472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 36697873 - 36698121
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36697873 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaaacacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 36697972  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36697973 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 36698072  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36698073 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagtggtcttataaaaaggga 36698121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40300523 - 40300276
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40300523 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 40300424  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40300423 tttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 40300324  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40300323 aataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 40300276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9299393 - 9299143
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  9299393 cctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcatgggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagt 9299294  T
Q  103 tttatccttaagaga----gagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaa 198  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9299293 tttatccttaagagaaatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaa 9299194  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9299193 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggacttataaaaagggac 9299143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9303942 - 9303692
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  9303942 cctccgtccttatatataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagt 9303843  T
Q  103 tttatccttaagaga----gagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaa 198  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9303842 tttatccttaagagaaatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaa 9303743  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9303742 agaaataattaatgtagttgtaaatagcaaaggggacttataaaaagggac 9303692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 29642886 - 29643134
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29642886 tccctccgttcctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 29642985  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29642986 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 29643085  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29643086 gaaataattaatgtagttgaaaataac-aaggggtcttataaaaagggac 29643134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48521321 - 48521076
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  48521321 tccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgcattaaagttatttgtaatcactattgtttttaca 48521222  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48521221 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 48521122  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48521121 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaag 48521076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 7703563 - 7703810
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7703563 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 7703662  T
Q  101 attttatccttaag-agagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| || | |||  ||||||| |||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7703663 attttatcctttaggaaagaaggttagtt-atgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 7703761  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7703762 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 7703810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 31200104 - 31200355
Alignment:
Q  1 tccctccgtcccta-at-tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgttttta 98  Q
    |||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31200104 tccctccgtccctatatatataaggcccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 31200203  T
Q  99 caattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgta 197  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31200204 caattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgta 31200303  T
Q  198 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31200304 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 31200355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27529519 - 27529274
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  27529519 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 27529420  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27529419 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 27529321  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27529320 ataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 27529274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6387620 - 6387371
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6387620 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 6387521  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6387520 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacattttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 6387421  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6387420 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 6387371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12930611 - 12930371
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  12930611 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 12930512  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12930511 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 12930413  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12930412 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 12930371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26255390 - 26255141
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26255390 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactaatgtttttaca 26255291  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26255290 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagggcatgtatgtaaa 26255191  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26255190 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaatggtcttataaaaagggac 26255141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32814728 - 32814479
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32814728 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 32814629  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||| | ||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  32814628 attttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaatagggtcatgtatgtaaa 32814529  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32814528 gaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 32814479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 36646395 - 36646628
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36646395 tataagacctttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 36646494  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||||||||||||||  | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36646495 aagaaggttagtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 36646594  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36646595 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 36646628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 41252104 - 41252352
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41252104 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 41252203  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41252204 attttatcctttaagaataag-gttagtttatgttttcaagatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaa 41252302  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41252303 gaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 41252352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2006770 - 2006522
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2006770 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaaccacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttaca 2006671  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2006670 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 2006571  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  2006570 gaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagccttataaaaaggga 2006522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Original strand, 29064225 - 29064448
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagtta 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||    
T  29064225 ttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgaaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggtta 29064324  T
Q  126 gtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 225  Q
    |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29064325 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 29064424  T
Q  226 caaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29064425 caaaggggtcttataaaaagggac 29064448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 29285781 - 29286028
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  29285781 cctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttagaat 29285880  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29285881 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 29285980  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29285981 aataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 29286028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44719415 - 44719173
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44719415 cctccgtccataattataggatccttttgttaaaatcactggaatgaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataat 44719316  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  44719315 tttatccttaagagag----ttggtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatttacaataaatatgggcatgtatgtaaagaa 44719220  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  44719219 ataattaatgtagttggaaatagcaaagacgtcttataaaaagggac 44719173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 35569400 - 35569643
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35569400 tccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 35569499  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35569500 tatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 35569598  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  35569599 aattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggac 35569643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23320950 - 23320700
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23320950 tccctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 23320851  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattg----aagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatg 195  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||    || ||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  23320850 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaaaaagatgtataataaataaggacatgtatg 23320751  T
Q  196 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23320750 taaagaaataattgatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 23320700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39198013 - 39197764
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39198013 tccctccgtccttatatataagaccattttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 39197914  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39197913 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 39197814  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  39197813 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttataaaaagggac 39197764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34896150 - 34895903
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34896150 cctccgtccttaattataggacttttttgctaaaatcacgggaattaagaaaataaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaat 34896051  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaa-agatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||||| |||    
T  34896050 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgaagaaaattgatgtataataaataaggatatgtatgtacaga 34895951  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  34895950 aataattaatgtagttgaaaatagcaaagagatcttataaaaagggac 34895903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7449547 - 7449315
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  7449547 tataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatccttta-ag 7449449  T
Q  117 agaga-gttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
    | | | |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7449448 aaaaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 7449349  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7449348 ttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 7449315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31581957 - 31581724
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31581957 tataagacctttttgttaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttataattttatctttaagag 31581858  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31581857 agagagttagtttatattttccatacgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 31581758  T
Q  217 tggaaataac-aaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  31581757 tggaaatagcaaaaggggtcttataaaaaaggac 31581724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Original strand, 36711057 - 36711288
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36711057 tataagacccttttgctaaaatcacggtaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 36711156  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  || ||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36711157 aagaaggtcagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 36711255  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36711256 ttggaaataacaaaggagtcttataaaaaggga 36711288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Original strand, 47534672 - 47534894
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttag 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  47534672 ttttgctaaaatcacgagaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattgttgtttttacaattttatcctta--agagagagttat 47534769  T
Q  127 tttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa----taattaatgtagttggaaa 222  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||    
T  47534770 tttatgttttccatatgttatttattgctaattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaattaatgtagttgaaaa 47534868  T
Q  223 taacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    || |||| |||| ||||||||||||||    
T  47534869 tagcaaa-gggttttataaaaagggac 47534894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 5524742 - 5524989
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5524742 cctccgtccctatatataagatctttttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgcattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 5524841  T
Q  103 tttatcctta--agagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||| |||||    
T  5524842 tttatccttaagagagagagagttgatttatgttttccatatgc-atttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatgagggcatatatataaag 5524940  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  5524941 aaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 5524989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32759851 - 32759604
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  32759851 tccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatggtggatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 32759752  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  32759751 attttatccttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaag 32759653  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32759652 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 32759604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43279993 - 43279751
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  43279993 tccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 43279894  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||| | ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43279893 tatccttta-agagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatag-ggcatgtatgtaaagaaat 43279796  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  43279795 aattaatgtagtaggaaatagtaaaggggtcttataaaaagggac 43279751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45907538 - 45907291
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  45907538 tccctccgttcctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 45907439  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||     
T  45907438 attttatccttta-agagagaattgatttatgtttccaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatacatgtaaaa 45907340  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45907339 aaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggac 45907291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 42298171 - 42298417
Alignment:
Q  2 ccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||    
T  42298171 ccctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattatttttacaa 42298270  T
Q  102 ttttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||||||| | ||||||| || |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42298271 ttttatccttta-agagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaaga 42298369  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42298370 aataattaatatagttggaaatagcaaaggggtcttatgaaaagggac 42298417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 18112906 - 18113158
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaat---taagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgttttt 97  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| || |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18112906 tccctccatccctatatataagatccttttgtcaaaattacaggaatatttaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 18113005  T
Q  98 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgt 196  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18113006 acaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttaatgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 18113105  T
Q  197 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18113106 aaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggttttataaaaagggac 18113158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7400420 - 7400174
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||  ||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7400420 cgtccctatatataagaccattttgccaaaaacacgggaattaagatagtggatatttgcattaaagttgtttgtaatccttattgtttttacaatttta 7400321  T
Q  107 tccttaa----gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||| |    |||||| |||| |||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7400320 tcctttaattagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaa 7400221  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7400220 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggac 7400174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 28016292 - 28016537
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28016292 tccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 28016391  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28016392 tatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaaggtgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 28016491  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  28016492 taattaatgtagttggaaatataaaaggaatcttataaaaagggac 28016537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 2289760 - 2290007
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| | ||||||||    
T  2289760 cctccgtccgtaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatatttacaat 2289859  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2289860 tttatcttttaagagagagagttcgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 2289959  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  2289960 aataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttagaaaaagggac 2290007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 47323273 - 47323520
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  47323273 cctccgtccctaattatagggtctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaat 47323372  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47323373 tttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagggcatgtatgtaaaga 47323472  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| | | ||||||||||||||    
T  47323473 aataattaatgtagttgaaaataagaaagagattttataaaaagggac 47323520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10475989 - 10475751
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10475989 gtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 10475890  T
Q  108 cctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    |||| |||||||||  || |||||||||||| | |||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||    
T  10475889 cctttaagagagagtattggtttatgttttcaacatgtcatttattgctaattgaagaaaaagatgtataatatatagggtcatgtatgtaaataaataa 10475790  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10475789 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 10475751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 11647580 - 11647825
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| ||| |||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  11647580 cctccctccttaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 11647679  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  11647680 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataagggcatgtatgtaaagaa 11647778  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11647779 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 11647825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17327166 - 17326952
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17327166 tccctccgtccctatatataagaccattttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaggttgtttgtaatcactattgtttttaca 17327067  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||| ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17327066 attttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 17326967  T
Q  200 gaaataattaatgta 214  Q
    |||||||||||||||    
T  17326966 gaaataattaatgta 17326952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20075141 - 20074988
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20075141 tccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 20075042  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20075041 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgc 20074988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 9140277 - 9140524
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||  ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  9140277 cctctgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaat 9140376  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  9140377 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaagaggggcatgtatgtaaaaa 9140476  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  9140477 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 9140524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26736779 - 26736526
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  26736779 cctccatccctaattataagacccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 26736680  T
Q  103 tttatccttaa-------gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatg 195  Q
    | ||||||| |       ||||||||||| |||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26736679 tatatccttgaagagagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 26736580  T
Q  196 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26736579 taaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgagtcttataaaaagggac 26736526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1575010 - 1574765
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  1575010 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 1574911  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  1574910 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaataatatgtatatttaataggggcatgtatgtaaagaa 1574812  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1574811 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggac 1574765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 6799290 - 6799535
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  6799290 cctccgtcccaaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 6799389  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  6799390 tttatccttta-agagagagatagtttatgctttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatatatgtaaagaa 6799488  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  6799489 ataattaatgtagttggaaatagcaaagagatcttataaaaagggac 6799535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 41803245 - 41803460
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  41803245 aaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatg 41803344  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtata--ataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 230  Q
    ||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||    
T  41803345 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattatagttgaaaataataaag 41803444  T
Q  231 gggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||||    
T  41803445 gggtcttataaaaagg 41803460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 7607378 - 7607625
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||   ||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  7607378 cctccgtccctaattatagggtccttttaaaaaaataatgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 7607477  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7607478 tttatcatttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 7607577  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  7607578 aataattcatgcagttggaaatagcaaagaggtctcataaaaagggac 7607625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30895853 - 30895606
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||  ||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||     
T  30895853 cctccgtccctaattatagcgcccttttgaaaaaataacaggaattaagataatggatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaaa 30895754  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30895753 tttatccttcaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaaga 30895654  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30895653 aataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 30895606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41444495 - 41444252
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||     
T  41444495 cctccgtccctaattataagatccttttgaaaaaataacgggaattgagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaa 41444396  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||||||| |  || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41444395 tttattattcaagagagagtgttagtttatgttttcaacatgttatttattgctggtataataaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaaga 41444296  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41444295 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 41444252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43081544 - 43081298
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  43081544 cctccgtccctaattataagg-ctttttgaaaaaataacgggaattaagatggtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 43081446  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| | || ||| | |||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43081445 tttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 43081346  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  43081345 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 43081298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 18751746 - 18751975
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||    
T  18751746 tataagactcttttgctaaaatcacgtaaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtatttaatcactattatttttacaattttattctta--ag 18751843  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18751844 agatagttggtttatgttttccatatgctatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaa-aaataattaatgtagt 18751942  T
Q  217 tggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    || ||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  18751943 tgaaaatagcagagtggtcttataaaaatggac 18751975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4857102 - 4856852
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatc---acgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttac 99  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||  |||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||    
T  4857102 cctccgtccctaattataggaccattttggaaaaatattaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttac 4857003  T
Q  100 aattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4857002 aattttatcctttaagagagatggttggtttaggttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataggggaatgtatgtaa 4856903  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  4856902 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagacgtcttataaaaagggac 4856852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9998549 - 9998333
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |   | |||    
T  9998549 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagagagagggatgaataatg 9998450  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  9998449 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 9998350  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| |||||||||||    
T  9998349 gtcttgtaaaaagggac 9998333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25951094 - 25950876
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  25951094 aaaatcacagcaattaagatagtggatatttgtattaacgttatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgattagtttatg 25950995  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga--tgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 230  Q
    ||||| | ||| || |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25950994 ttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggatatagcaaag 25950895  T
Q  231 gggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25950894 gggtcttataaaaagggac 25950876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21119851 - 21119609
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  21119851 cctccgtccctaattacaggatccttttgaaaaaataaaggaaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 21119752  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||| || |||||||| | ||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21119751 tttatcatttaagagagataattagtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaacaatgtataataaataggggcatgcatgtaaaga 21119652  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21119651 aataattaatgtaattggaaataacaaacgagtcttataaaaa 21119609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19920851 - 19920612
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||| |||    
T  19920851 tccgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttaca-ttt 19920753  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||| | ||||||| ||  ||||||||||| | ||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19920752 tatccttta-agagagaattgatttatgttttcaacatgatatttattaatgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaat 19920654  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19920653 aattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 19920612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 21870082 - 21870327
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||| |||||||| |   ||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| ||    
T  21870082 tccgtccttaattatagggctcttttggaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaatt 21870181  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21870182 tatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaa 21870281  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  21870282 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttatagaaggggac 21870327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23920023 - 23919781
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  23920023 cctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 23919924  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||| || | ||||| || | |||||||||||| | ||  || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23919923 tttatctttta-agagaaagatggtttatgttttcaacatattatttattgttgatggaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 23919825  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23919824 ataattaatgtagttggaaataacaaaagagtcttataaaaagg 23919781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Original strand, 27881832 - 27882074
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||    
T  27881832 cctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgtttttacaat 27881931  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| |    
T  27881932 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatatataataaatagagacatgtatgtaaaaa 27882031  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  27882032 aataattaatgtagttagaaatataaaaggtgtcttataaaaa 27882074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 788195 - 787979
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaag-agagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||    
T  788195 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaggagagagggttgatttatg 788096  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |     
T  788095 ttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagaagtataataaataagggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttggaaatagcaaatga 787996  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||    
T  787995 gtcttataaaaagggac 787979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37913365 - 37913121
Alignment:
Q  6 ccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttt 105  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||  ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  37913365 ccgtccttaattataaggctcttttgaaaaaataacggtaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaatttt 37913266  T
Q  106 atcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    |||||| |||| |||| |||   |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  37913265 atcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaat 37913166  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  37913165 aattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagggac 37913121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 43093183 - 43093399
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  43093183 aaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattataattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttata 43093282  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |     
T  43093283 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataactaatgtagttggaaatagcaaatga 43093382  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    || ||||||||||||||    
T  43093383 gttttataaaaagggac 43093399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 46266120 - 46266365
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||||||  ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46266120 cctctgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagatgtttgcaatcactattgtttttacaat 46266219  T
Q  103 tttatccttaagaga--gagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    || |||||| | | |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||   |||||||||||| ||| ||||||||||     
T  46266220 ttaatcctttatatatagagagttagtttatgttttcaacatgatatttatagctgattgaagaagaag---tataataaataggggcttgtatgtaaaa 46266316  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46266317 aaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaagagggac 46266365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48009190 - 48008980
Alignment:
Q  42 gggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagag--agttagtttatgttttcc 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||| ||||     
T  48009190 gggaattaagatagtggatatttgtatttaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagtgagttgatttatgctttca 48009091  T
Q  139 atatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtctta 238  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  48009090 atatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtatttggaaataacaaagggttctta 48008991  T
Q  239 taaaaagggac 249  Q
    |||||| ||||    
T  48008990 taaaaaaggac 48008980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 7400471 - 7400712
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7400471 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacggga-ttaagaaagttgaaatttgtattgaagatgtttgtaatcactattgtttttacaagtttat 7400569  T
Q  108 cc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    || |||| ||| ||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |  |||||||||||    
T  7400570 cctttaaaagaaagaattaatttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgcaaataaagaaataa 7400669  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7400670 ttaatgcagttgaaaataacaaagaggtcttataaaaaaggac 7400712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23364306 - 23364064
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||| | | |||||||||||||| |    
T  23364306 ctccgtccctaattatagggccctttttaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttgtagttactattgtttttacaaat 23364207  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  23364206 ttatcctttaagagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgatcgaagaaaaagatgaataataaataagagcatgtatgtaaagaa 23364107  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  23364106 ataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttataaaaag 23364064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29630007 - 29629763
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| ||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  29630007 cctccgttcctatatataagaccattttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatgtttgtattaaagttgtttgtaatcacaattgtttttgcaat 29629908  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttt----tccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaa 198  Q
    ||||||||||  | ||||||||  |||||||||    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |    ||||||    
T  29629907 tttatcctta--aaagagagttgatttatgttttccatccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggac----atgtaa 29629814  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29629813 agaaataattattgtagttgaaaataacagagggatcttataaaaagggac 29629763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12130338 - 12130126
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| |||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||     
T  12130338 ctccgtccctaattatagggccctattgagaaaataacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatg 12130239  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12130238 --atcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 12130141  T
Q  203 ataattaatgtagtt 217  Q
    |||||||||| ||||    
T  12130140 ataattaatgcagtt 12130126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26843064 - 26842828
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  26843064 cctccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 26842965  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgt-------tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtat 194  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| ||||||||       |||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26842964 tttatcctttaagaaagagggttggtttatgttttcaagtttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtat 26842865  T
Q  195 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagg 231  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26842864 ggaaagaaataattaatgtagttgaaaataaaaaagg 26842828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27813792 - 27813546
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  |||  |||||||||||||||  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  27813792 cctccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattgcggagattaagaaagtggattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 27813693  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  || | ||  ||||||||    
T  27813692 tttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgtaaaataaataagggtaggttggtaaagaa 27813593  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27813592 ataattaatatacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 27813546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38361402 - 38361197
Alignment:
Q  42 gggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccata 141  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| | |    
T  38361402 gggaattaagacagtgaatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatt--gagagagagttggtttatgttttcaaca 38361305  T
Q  142 tgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 241  Q
    || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||  |||||||||    
T  38361304 tgttatttatagctgattgaagaaaaagatatataataaatattagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagctcgaaatagcaaagaagtcttataa 38361205  T
Q  242 aaagggac 249  Q
    ||||||||    
T  38361204 aaagggac 38361197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 47657441 - 47657655
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||| |||| | ||||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||  |||||||    
T  47657441 aaaattacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttataattactattgtttttacaattttatctttta-agacagaattgatttatgt 47657539  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 233  Q
    |||| | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  47657540 tttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtgg 47657639  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  47657640 tcttataaaaagggac 47657655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38736735 - 38736499
Alignment:
Q  11 cctaattataagatccttttgctaaaa-tcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc 109  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| | || |||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  38736735 cctaattataggatccttttgaaaaaaataacaggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattatcattgtttttacaattttattc 38736636  T
Q  110 ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataatta 209  Q
    || | |||||  |||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38736635 ttta-agagaaggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataatta 38736537  T
Q  210 atgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||||    
T  38736536 atgtagttgaaaat-agaaaagagtcttataaaaaggga 38736499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23109360 - 23109144
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||| |||||||||     
T  23109360 cctccgtccctaattataggaccctattgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattttttttacaaa 23109261  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  23109260 tttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataaggacatatatgtaaaga 23109161  T
Q  202 aataattaatgtagttg 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  23109160 aataattaatgtagttg 23109144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Original strand, 10538879 - 10539116
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||  ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10538879 cgtccctatatataagacccatttgtcaaaatcaccaaaattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaatttta 10538978  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaa------gaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||       ||||| ||||| ||||||||  || || || ||||||    
T  10538979 tccttta-atagagagttagtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgaaaaaaagaaaaaaaatgtaaaataaataagggtatttaggtaaag 10539077  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10539078 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat 10539116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 49044865 - 49045111
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||||||| |  | |||||||| |||| |  ||| | |||||||||||||||    
T  49044865 cctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagtgggttgtagtattaaatttgtatacaattactattgtttttacaat 49044964  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  || || |  ||||||||    
T  49044965 tttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataattaagggtatattggtaaagaa 49045064  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  49045065 ataattaatgtacttggaaatatcaaagaggtcttataaaaagggac 49045111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19619326 - 19619080
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatc-cttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||  ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||||||||    
T  19619326 cctccgtccctaattata-gagctcttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaaatactattgtttttacaa 19619228  T
Q  102 ttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| | | ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  19619227 ttttatcctttaagagagagggttggtttatatttgcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaaa 19619128  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||    
T  19619127 aaataattaatgtagttggaaattgcaaa-gggtcttaagaaaagggac 19619080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 22991504 - 22991735
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22991504 tataagacccttttactaaaattacgggaattaagaaagttggaattagtattaaatttgtttataattactattgtttttaca-ttttatcctaaagag 22991602  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  || |||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || |||    ||||||||||||||||||| |    
T  22991603 agagagttagtttatgttttcaacataatatttattgttgatcgaagaaaaagatgcaaaataaataggggtatggtgataaagaaataattaatgtaat 22991702  T
Q  217 tggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  22991703 tggaaatagcaaatggatcttataaaaagggac 22991735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 30737757 - 30738001
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||   ||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30737757 ctccgtccttaattataaggtcattttaaaaaaataacgggaactaagatagtagatatttgtattaaatacgtttgtaattactattgtttttacaatt 30737856  T
Q  104 ttatcctt------aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgta 197  Q
    ||||||||      || | |||| ||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||    
T  30737857 ttatcctttaagaaaaaaaagagggttggtttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg----gtatgta 30737952  T
Q  198 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  30737953 aagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagg 30738001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 249
Target Start/End: Original strand, 43440910 - 43441101
Alignment:
Q  59 atatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctga 157  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||    
T  43440910 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 43441009  T
Q  158 ttgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||||||    
T  43441010 ttgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtttgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagataatgagtcttataaaaagggac 43441101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 45777994 - 45778213
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  45777994 aaaatcacgaaaattaagaaagttgaaatttgtattaaagatgtttgtaatcactattatttttataattttatcttttaagagaaagaattagtttatg 45778093  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagt----ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaa 228  Q
    ||||| | |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||      || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45778094 ttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaat-atgtataataaataaataagggtatgcaagtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaa 45778192  T
Q  229 aggggtcttataaaaagggac 249  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  45778193 agaggtcttataaaaagggac 45778213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 127 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17317609 - 17317487
Alignment:
Q  127 tttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac 226  Q
    ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17317609 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac 17317510  T
Q  227 aaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17317509 aaaggggtcttataaaaagggac 17317487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 20950787 - 20950978
Alignment:
Q  6 ccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttt 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20950787 ccgtccctaattataggacccttttga-aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaatttt 20950885  T
Q  106 atccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    |||||| | ||||||| ||  ||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  20950886 atccttta-agagagaattgatttatgttttcaacatgttatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgcatgtaaa 20950978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 44510087 - 44510334
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||  |||  ||||||||||||| |  | |||||||| | || |  ||| | ||||| |||||||    
T  44510087 tccctccgtccctaaatatatgagacttttgccaaaattgcggagattaagaaagtgggttgtagtattaaattggtatacaattactattg-ttttaca 44510185  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  || ||||  ||||||    
T  44510186 attttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataagtaagggtatgttggtaaag 44510285  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44510286 aaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 44510334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3024843 - 3024630
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||  | |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |  |||||||    
T  3024843 aaaataacgggaattaagatagtgaatgtttgtattaaatatatttgtaattagtattgtttt-acaattttatccttta-agagagagatgatttatgt 3024746  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 233  Q
    |||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |    
T  3024745 tttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatatatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaagaag 3024646  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  3024645 tcttataaaaagggac 3024630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9682893 - 9682648
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||   ||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  9682893 cctccgtccctaaatataagagcattttgccaaaattgtggacattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 9682794  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  || |||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  9682793 tttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaagaaaaa-atgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 9682695  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9682694 ataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggac 9682648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 42887825 - 42888067
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || | |||||  ||||| || |  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  42887825 cctccgtccctaaatataggagcattttgtcaaaattacagagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 42887924  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  42887925 tttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaa 42888024  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  42888025 ataattaatgtacttggtaataccaaaggggtcttataaaaag 42888067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 238
Target Start/End: Original strand, 17878121 - 17878346
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||||||  || || |||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||    
T  17878121 cctccatccctaattatagggttcttttgaaaatataacgggaattaagatggtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataat 17878220  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17878221 tttatcctttaagagagagggttggtttatgttttca----------tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag-ggcatgtatgtaaaaa 17878309  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtctta 238  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17878310 tataattaatgtagttagaaataacaaagaggtctta 17878346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 19845412 - 19845660
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||| ||||  |||||||||||   |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  19845412 cctccgtccctaaatataggagtcttttgccaaaattacggagattaagaaagttagttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 19845511  T
Q  103 tttatccttaagag--agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  ||||||    
T  19845512 tttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaag 19845611  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19845612 aaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaaggac 19845660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 44780168 - 44780362
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||    
T  44780168 aaaataacgagaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagagagagggttgatttatg 44780267  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    ||||| | ||| || ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44780268 ttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaa--tctataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 44780362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 243
Target Start/End: Original strand, 31802869 - 31803105
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||  |||||| |||||  ||| | |||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  31802869 tccgtccctagttataggatctttttgccaaaatcacgaaaattaaaaaagttaataatagtattaaatttgtttataattactattgtttttacaattt 31802968  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||| || ||| | ||||||||||    
T  31802969 tatcctta--agagagagttagtttatgttttcaacataatatttattgtttattaaagaaaaagatgcaaaataaataggggtatggaggtaaagaaat 31803066  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||  |||||||||||    
T  31803067 aattaatataattggaaatagcaaagcagtcttataaaa 31803105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16957923 - 16957729
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||||||||    |||||||  ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16957923 cgtccctaattatagagcccttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaatttta 16957824  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    || || | |||||  |||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16957823 tcgtttaaagagatggttgatttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaaga 16957729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Original strand, 24299979 - 24300155
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||| |||||||    
T  24299979 aaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaaaagagagggttggtttatg 24300078  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataatta 209  Q
    ||||| | ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  24300079 ttttcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaatatgggtatgtatgtaaagaaataatta 24300155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 117 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26299493 - 26299361
Alignment:
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26299493 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagt 26299394  T
Q  217 tggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26299393 tagaaatagtaaaggggtcttataaaaagggac 26299361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 126 - 249
Target Start/End: Original strand, 10071242 - 10071365
Alignment:
Q  126 gtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 225  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  10071242 gtttatattttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaatag 10071341  T
Q  226 caaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||  ||||||||||||||||||    
T  10071342 caaataggtcttataaaaagggac 10071365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30534995 - 30534751
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| | |||||  | |  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  30534995 cctccgtccctaaatataggagcctttttccaaaattgcagagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 30534896  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  30534895 tttatccttaagagagag--ttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 30534798  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  30534797 ataattaatgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaagggac 30534751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 248
Target Start/End: Original strand, 31769222 - 31769322
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  31769222 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaaggg 31769321  T
Q  248 a 248  Q
    |    
T  31769322 a 31769322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 32699451 - 32699695
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||| |   |  | |||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||    
T  32699451 cctccgtccctaaatataggagtcttttgctaaaattacagagattaagaaaatatgttgtagtattaaatttgtataaaattattattgtttttacaat 32699550  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||  ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  32699551 tttatccttaagagagag--ttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 32699648  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32699649 ataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 32699695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 225
Target Start/End: Original strand, 49110804 - 49110994
Alignment:
Q  36 aatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc-cttaagagagagagttagtttatgtt 134  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||    
T  49110804 aatcacggaaattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcacttaagagagtgagctattttatgtt 49110903  T
Q  135 ttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga-aataattaatgtagttggaaataa 225  Q
    ||  | ||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  49110904 tttaacatgttatttattgccaattgaag-aaaagatgtataataaatagggatatgtaagtaaaaataataattaatgtagttgaaaataa 49110994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19293045 - 19292884
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  ||    
T  19293045 tattgtttttacaattttattcttaagagagatagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaggg 19292946  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19292945 tatgttagtaaagaaataattaatgtacttagaaatactaaaggggtcttataaaaagggac 19292884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24504952 - 24504731
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttag 126  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  24504952 ttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagcgagagagttaa 24504853  T
Q  127 tttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac 226  Q
    ||| | ||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24504852 tttctattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatacc 24504753  T
Q  227 aaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||| | ||||||||||||||||    
T  24504752 aaaagagtcttataaaaaggga 24504731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 32964225 - 32964386
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  ||    
T  32964225 tattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaggg 32964324  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  32964325 tatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaggactcttataaaaagggac 32964386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 249
Target Start/End: Original strand, 9233431 - 9233567
Alignment:
Q  113 agagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatg 212  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||    
T  9233431 agagtgagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatatacgtaaataaataattaatg 9233530  T
Q  213 tagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  9233531 tagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 9233567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 244
Target Start/End: Original strand, 46414835 - 46414991
Alignment:
Q  90 ttgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaa-agatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  46414835 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctattttttgctgattgaagaaaaaagatgtataataaataggag 46414934  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  46414935 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaa 46414991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 23801935 - 23802173
Alignment:
Q  10 ccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc 109  Q
    |||||| |||| || |||||||| |||||  |||| ||||| ||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23801935 ccctaaatatatgagccttttgccaaaattgcggggattaacaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc 23802034  T
Q  110 ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataatta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  ||  |||  |||||||||||||||    
T  23802035 ttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaatatgggtgtgttggtaaagaaataatta 23802133  T
Q  210 atgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||    
T  23802134 atgtacttggaaacaccaaaaggatcttataaaaagggac 23802173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41787495 - 41787302
Alignment:
Q  49 aagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctact 148  Q
    |||| |||| |||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |  ||| |||||||||||  | ||| || |    
T  41787495 aagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-agaaaaggttggtttatgttttaaacatgttatt 41787397  T
Q  149 tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  41787396 tattgccgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaa-aaataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaaa 41787302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 248
Target Start/End: Original strand, 12616273 - 12616373
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  12616273 ttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagggatcttataaaaaggg 12616372  T
Q  248 a 248  Q
    |    
T  12616373 a 12616373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35888602 - 35888358
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||  |||  |||||||||||   |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  35888602 cctccgtccctaaatataagagtcttttgttaaaattgcggagattaagaaagtttgttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 35888503  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  35888502 tttatccttaagagagag--ttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 35888405  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  35888404 ataattaatgttcttggaaataccaaaatgctcttataaaaagggac 35888358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 40120999 - 40121245
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||||| | |||| | ||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  40120999 cctccgtctctaattatagggcccttttggaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtggtaataaatttgtttgtaattactattgtatttacaat 40121098  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtat--aataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | ||  || ||| |   |||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||||  |||||    
T  40121099 tttatcctttaagagagagaaatagtttatgttttcaacatagtatttaatatcgattgaagaaaaagatatataaaataaataggggaatgtcggtaaa 40121198  T
Q  200 ga-aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
     | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40121199 aataataattaatgtacttggaaatactaaaggggtcttataaaaag 40121245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 229
Target Start/End: Original strand, 3796060 - 3796202
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||  | ||  || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  3796060 tattgtttttacaattttatcttttaaaagagagaattaatttatgtttttaacatattatttattgctgatggaagaaaaagatgtaaaataaatagag 3796159  T
Q  187 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3796160 gtatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaa 3796202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19497498 - 19497292
Alignment:
Q  42 gggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagag----ttagtttatgttttc 137  Q
    ||||||||||||| | | || | |||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||    
T  19497498 gggaattaagaaaattggtagtagtattaaatttgtttataattcctattgtttttacaattttatccttaagagagagagaaagtcagtttatgttttc 19497399  T
Q  138 catatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtctt 237  Q
     ||||  ||||||||| ||||| ||| |||||||| | || |||||| || || |  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||    
T  19497398 aatatagtacttattgttgatttaagtaaaagatgcaaaacaaataggggtatcttagtaaagaaataattaatgtaattgaaaatatcaaagggatctt 19497299  T
Q  238 ataaaaa 244  Q
    |||||||    
T  19497298 ataaaaa 19497292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21135540 - 21135371
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||  | |||| |||| |||  | |||||||| |||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  21135540 cctccgtccgtaattataagagccttttgcaaaaattacggagaataagcaagttgattgtagtattaaatttgtatgtaattaccattgtttttacaat 21135441  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatg 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| ||||||||||||||||||    
T  21135440 tttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatg 21135371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 21870840 - 21871013
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||| |  |||||||  ||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| ||||    
T  21870840 cgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaattta 21870939  T
Q  107 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 179  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21870940 tccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaagatgaataata 21871013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 246
Target Start/End: Original strand, 3881369 - 3881529
Alignment:
Q  86 attattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagt 185  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||      
T  3881369 attattgtttttaaaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaataaaaagatgtaaaataaataag 3881468  T
Q  186 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    || ||||  ||||| |||||||  ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3881469 ggtatgttggtaaaaaaataatctatgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaagg 3881529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 45722209 - 45722054
Alignment:
Q  93 tttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||  ||  |||    
T  45722209 tttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaaaaaagatgcaaaataaataagggtgtgt 45722110  T
Q  193 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
      |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  45722109 tagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagagatcttataaaaaggga 45722054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Original strand, 2470871 - 2471041
Alignment:
Q  54 agtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttatt 152  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||    
T  2470871 agtggatatttgtattaaatatatttataattactattgtttttataatattatcctttaagagtgagagttgatttctgttttcaacatgttacttatt 2470970  T
Q  153 gctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 223  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||  || || |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2470971 gctaattaaagaaaaagatgtataataaataaaggtatatatgaaaagaattaattaatgtagttggaaat 2471041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 8781957 - 8782204
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||||| | |  | ||||||   |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  8781957 cctccgtccctaaatatatgagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattat--ttgtatataattactattgtttttacaat 8782054  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagt----ttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||  |||    ||| |||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||    
T  8782055 tttatccttaagagagagagagagtaaatttaagttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataaaggtatgttggtaa 8782153  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8782154 agaaataattaatgtatttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggac 8782204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43934795 - 43934637
Alignment:
Q  89 attgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggc 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||  ||     
T  43934795 attgtttttacaattttatccttaagagagagggtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaa--atgcaaaataaataagggt 43934698  T
Q  189 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||    
T  43934697 atgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaagatgtcttataaaaagggac 43934637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 246
Target Start/End: Original strand, 2345312 - 2345531
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttag 126  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||     
T  2345312 ttttgccaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaattttatccttaagaaaaagaattaa 2345411  T
Q  127 tttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac 226  Q
    ||||||||||| | ||  || |||||  ||||||||||||||| || | ||||||||  || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  2345412 tttatgttttcaacataatatttattattgattgaagaaaaaggtgcaaaataaataagggtatgtttgtaaataaataattaatgtatttggaaatatc 2345511  T
Q  227 aaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||| | ||||| ||||||||    
T  2345512 aaatgagtcttttaaaaagg 2345531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 24210955 - 24211135
Alignment:
Q  62 tttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattga 161  Q
    |||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| |  || || |||||| ||||| |    
T  24210955 tttgtattgaagttgtt-gtgatcgctattgtttttacaattttatc-ttaaaaaagagagttagtttatattttcaacttg-tatttattgttgattaa 24211051  T
Q  162 agaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    | ||||||||||||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  24211052 aaaaaaagatgtataataaatcggggtatgtagataaagaaataattaatgtagtttaaaataacaaagagatcttataaaaag 24211135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Original strand, 33381363 - 33381494
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  33381363 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 33381462  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  33381463 tttatcctttaagagagatggttggtttatgt 33381494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3776098 - 3775870
Alignment:
Q  26 cttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtta 125  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||  | |||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3776098 cttttgcaaaaattacggagattaaaaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaatattatccttaagagagagagtta 3775999  T
Q  126 gtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata------attaatgtagttgg 219  Q
     ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||  || || |  |||||||||||      ||||||||| |||     
T  3775998 atttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatacaaaataaataagggtatattggtaaagaaataaattatattaatgtacttga 3775899  T
Q  220 aaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3775898 aaataccaaagaggtcttataaaaaggga 3775870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37915349 - 37915189
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  ||    
T  37915349 tattgtttttacaattttatccttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataaggg 37915251  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| | ||||||||||| |||||    
T  37915250 tatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaacatcaaatgagtcttataaaaggggac 37915189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 27325913 - 27326076
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||| |||    
T  27325913 cctccgtcactaattatagggcccttttgaaaaaataacgg-aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatttctattgtttttataat 27326011  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaa 166  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||    
T  27326012 tttatcctttaagatagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaa 27326076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 32118000 - 32118127
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  32118000 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttattacaattttatccttta-agagagagttggtttatgt 32118098  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaa 162  Q
    |||| | ||| || |||||| ||||||||    
T  32118099 tttcaacatgttatttattgttgattgaa 32118127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 230
Target Start/End: Original strand, 46415103 - 46415266
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaa 165  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||| |||||||| ||    
T  46415103 tattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttattcttaagggagagagttagtttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa-aa 46415201  T
Q  166 aaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 230  Q
    ||||||| | ||||||||  || |||   |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||    
T  46415202 aaagatgcaaaataaataagggtatgatggtaaagaaataattgaagtaattggaaataccaaag 46415266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 46148723 - 46148485
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||||| || |||    ||||| ||||||||||||||| | |||| |  || |||| |||||  |||| | ||||| |||||||||    
T  46148723 cctccgtccctaattataaggtcttttataaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttgataattactattggttttacaat 46148624  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatg-taaaga 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   | ||| || | |||||||||||| ||  | ||||||||| || ||| ||| | || |    
T  46148623 tttatccttaagagatagagttaatttatgttttcaatatagaatttaatgttaattgaagaaaaatatacaaaataaataggggtatg-atgatgaaaa 46148525  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 241  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  46148524 attaattaatgcacttggaaataacaaaggggtcttataa 46148485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 10071825 - 10071917
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc 109  Q
    ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10071825 tataagaccattttactaaaattacgggaattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgtaattattatggtttttacaattttatcc 10071917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 249
Target Start/End: Original strand, 33381494 - 33381565
Alignment:
Q  178 taaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33381494 taaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 33381565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 12631560 - 12631807
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||   | ||||| || ||||||||||||  ||| | |||||||| |||||| | || | ||||||| || |||| |    
T  12631560 tccgtccttaattataggacccttttatcacaatcatggaaattaagaaagttaataatagtattaaatttgtttatgattactattgttcttgcaatgt 12631659  T
Q  105 tatccttaagag----agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||    ||| ||||||||||| ||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  | |||   ||||||    
T  12631660 tatccttaagagagaaagatagttagtttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataggagtatggtggtaaag 12631759  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  12631760 aaatgattaatgtaattgaaaataccaaattggtcttataaaaaggga 12631807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 214
Target Start/End: Original strand, 33683014 - 33683140
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |  || |||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||  ||    
T  33683014 tattgcttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacctaatatttattgttgattgaagaaaatgatgcaaaataaataaggg 33683113  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgta 214  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||    
T  33683114 tatgttggtaaagaaataattaatgta 33683140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33683003 - 33682760
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| ||||| |||| || |||||||  |||||  |||  ||||||||||| | |  | || ||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  33683003 cctccgtacctaaatataggagccttttgtcaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagttttaaatttgtatataattactattgtttttacaat 33682904  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||  | | ||||||||||| ||||  |  |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  33682903 tttatccttaagagagag--taaatttatgttttcaatataatt-ttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 33682808  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataac-aaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  33682807 ataattaatgtacttgaaaaacaccaaaggggtcttataaaaagggac 33682760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20074987 - 20074935
Alignment:
Q  197 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20074987 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 20074935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 120
Target Start/End: Original strand, 34900769 - 34900841
Alignment:
Q  48 taagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagag 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34900769 taagtaagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatccttaaaagagag 34900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 168
Target Start/End: Original strand, 47648985 - 47649088
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| ||||||||||    
T  47648985 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattcttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 47649084  T
Q  165 aaaa 168  Q
    ||||    
T  47649085 aaaa 47649088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34693693 - 34693463
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||  ||||||||| |   |  | |||||||| |||| |  ||| | |||| ||||||||||    
T  34693693 cctccgtccctaaatatagaagccttttgctaaaattacggagattaagaaaatttgttgtagtattaaatttgtatacaattactattatttttacaat 34693594  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaa-gaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||  || |||||| ||||||||  ||||| ||| | ||||||||  || ||||  |||||||    
T  34693593 tttatccttaagagatagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaacaaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaga 34693494  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    || |||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  34693493 aaaaattaatgtacttgaaaatatcaaaggg 34693463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21587695 - 21587534
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta- 106  Q
    ||||||| |||| |||  ||||||  |||||||  | |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||     
T  21587695 gtccctatttattagactcttttggcaaaatcatagaaattaagaaaattgatatttatattaaatttgtttgcaattactattgtttttacaattttat 21587596  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaa 168  Q
    |  |||| ||||||| || |||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||    
T  21587595 tttttaaaagagagaatttgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 21587534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43008387 - 43008251
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | ||    
T  43008387 tataagatcattttgccaaaattgcaagaattaagaaagttgatatttgtattaaagatatttgtaatcactactgtttttacaa-tttatacttta-ag 43008290  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgct 155  Q
    ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||||||    
T  43008289 agaaagttagtttaagttttcaacatgataattattgct 43008251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43008240 - 43008144
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||| || || || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43008240 ttattgcttattaaagaaaaatttgtataataattaggggtatttaggtaaagaagtaattaatatagttg-aaataacaaaggggtcttataaaaag 43008144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 245
Target Start/End: Original strand, 20182099 - 20182265
Alignment:
Q  77 tttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtata 176  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| || || |    
T  20182099 tttgtaattactattgtttttacaatcttatccttac-agagagatttagtgtatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatataga 20182197  T
Q  177 ataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||  || || |  |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||    
T  20182198 ataaataagggtatat-ggtaaagaattcattaatgtatttggaaataataaaatggttttataaaaag 20182265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 249
Target Start/End: Original strand, 32643658 - 32643746
Alignment:
Q  161 aagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  32643658 aagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaatatgtcttataaaaagggac 32643746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 131
Target Start/End: Original strand, 6910622 - 6910688
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttat 131  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6910622 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttat 6910688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28017235 - 28017054
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||  ||||| |||  |||||||||| | || | | ||| |||| |||||||||||   ||||||||||| |||    
T  28017235 cctccgtccttaattataagg-ctttttggaaaaataacgtaaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttgtttgtaattgctattgtttttataat 28017137  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 184  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  || ||| || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  28017136 tttatccgttaagaaagagggttaatgtatgttttcaatataatatttaatgttgattgaagaaaaagatataaaataaatag 28017054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 30866122 - 30866235
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| |||| || ||||||| ||||||| | |||   || ||||  ||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  30866122 cgtccctaaatataatacccttttgccaaaaccaagggaattgagaaagttgctatcaataataaatatgtatataatcactattgtttttacaatttta 30866221  T
Q  107 tccttaagagagag 120  Q
    ||||||||||||||    
T  30866222 tccttaagagagag 30866235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 217
Target Start/End: Original strand, 3478814 - 3478910
Alignment:
Q  121 agttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 217  Q
    ||||||||||||||||  | ||  || |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3478814 agttagtttatgtttttaacatagtatttattgttgattgaataaaaagatataaaataaataggggtatgttagtaaagaaataattaatgtagtt 3478910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12129768 - 12129723
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12129768 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaagagggac 12129723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 111
Target Start/End: Original strand, 12616186 - 12616263
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt 111  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  12616186 aaaataacaggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactaatgtttttacaaatttatcctt 12616263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18312449 - 18312239
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaat---cattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagttta 130  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || ||| ||| |||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| || |   ||||| ||||| ||    
T  18312449 aaaataacgggaattaagaaaattgaaattagta-taaatttgtttgtaattactactattgtttttacaattttatcattta---agagatttagtgta 18312354  T
Q  131 tgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 230  Q
    ||||||| | |   || ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||    ||||  ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||     
T  18312353 tgttttcaacacaatatttaatgctaattgaagaaaaagatataaaataaatagaaatatgttggtaaaaaattaattaatgtatttgaaaatatcaaaa 18312254  T
Q  231 gggtcttataaaaag 245  Q
    |  ||||||||||||    
T  18312253 gtatcttataaaaag 18312239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 249
Target Start/End: Original strand, 4700528 - 4700635
Alignment:
Q  143 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgg--aaataacaaaggggtcttata 240  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||| |  ||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||    
T  4700528 gctatttattgttgattgaaaaaatatatgtatagtaaatagagttatacacgtaaagaaataattaatgtagttggataaataacaaagaggtgtt-ta 4700626  T
Q  241 aaaagggac 249  Q
    |||||||||    
T  4700627 aaaagggac 4700635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 244
Target Start/End: Original strand, 23256804 - 23256853
Alignment:
Q  195 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23256804 gtaaagaaataattaatgtactcggaaataccaaaagggtcttataaaaa 23256853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 205
Target Start/End: Original strand, 32811293 - 32811378
Alignment:
Q  120 gagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||  |||||||||||    
T  32811293 gagttggtttatgttttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaata 32811378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 33342357 - 33342249
Alignment:
Q  74 ttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgt 173  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||| ||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| ||||    
T  33342357 ttgtttataattactattgtttttacaattaaatcattta-agagagagttagtttatattttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaatatgt 33342259  T
Q  174 ataataaata 183  Q
      ||||||||    
T  33342258 gaaataaata 33342249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 115
Target Start/End: Original strand, 32643549 - 32643661
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||||||| |||| ||  ||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| || | | |||| | |||||||||||||||    
T  32643549 cctcagtccctaaatataggagtcttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttatatataattactattgtttttacaat 32643648  T
Q  103 tttatccttaaga 115  Q
    |||||||||||||    
T  32643649 tttatccttaaga 32643661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24282132 - 24282077
Alignment:
Q  194 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24282132 tgtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaagggac 24282077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 29177286 - 29177256
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29177286 tccctccgtccctaattataagatccttttg 29177256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 34037544 - 34037502
Alignment:
Q  62 tttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  34037544 tttgtattaaagttgtttgtaattactcttgtttttacaattt 34037502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 245
Target Start/End: Original strand, 30866416 - 30866505
Alignment:
Q  156 gattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||  |||  ||||||||||||||    
T  30866416 gattgaagaaaatgatgcaaaataaataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgttattgaaaatactaaaaaggtcttataaaaag 30866505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Original strand, 31137214 - 31137283
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttc 137  Q
    |||| |||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||    
T  31137214 taaatttgtttgtaattgttatttcttttacaattttatcctttaagagagagggttggtgtatgttttc 31137283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 7400134 - 7400162
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7400134 cctccgtccctaattataagatccttttg 7400162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 17317446 - 17317474
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17317446 cctccgtccctaattataagatccttttg 17317474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 19292844 - 19292872
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19292844 cctccgtccctaattataagatccttttg 19292872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 19845701 - 19845673
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19845701 cctccgtccctaattataagatccttttg 19845673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 21119562 - 21119590
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21119562 cctccgtccctaattataagatccttttg 21119590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21135367 - 21135323
Alignment:
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  21135367 aattaatgtacttggaaatactaaaagggtcttataaaaagggac 21135323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 22991776 - 22991748
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22991776 cctccgtccctaattataagatccttttg 22991748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 27529234 - 27529262
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27529234 cctccgtccctaattataagatccttttg 27529262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 42888112 - 42888084
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42888112 cctccgtccctaattataagatccttttg 42888084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 241)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 55632002 - 55632250
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55632002 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaaaaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 55632101  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55632102 attttatccttaagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 55632201  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55632202 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 55632250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4036119 - 4035871
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4036119 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 4036020  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4036019 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 4035920  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4035919 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 4035871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 29014067 - 29014315
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29014067 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 29014166  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29014167 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 29014266  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29014267 aaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggac 29014315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 53630086 - 53629842
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53630086 tccctccgtccctaaatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 53629987  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53629986 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 53629887  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53629886 aaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaag 53629842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 4549632 - 4549877
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4549632 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttaca 4549731  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4549732 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 4549831  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4549832 aaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaagg 4549877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39144698 - 39144453
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39144698 tccctccgtctctaattataagacctttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 39144599  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39144598 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccgtatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 39144499  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39144498 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagg 39144453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 52870931 - 52870690
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52870931 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 52870832  T
Q  108 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataat 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  52870831 ccttaagagagagaattagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtaggtaaagaaataat 52870732  T
Q  208 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52870731 taatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 52870690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20747464 - 20747216
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20747464 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaattatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 20747365  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20747364 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 20747265  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20747264 aaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaagggac 20747216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 5743402 - 5743650
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5743402 tccctccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtctgtaatcactattgtttttaca 5743501  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5743502 attttatccttaagaaagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 5743601  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5743602 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 5743650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 25708423 - 25708670
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25708423 tccctccgtccctaattataagacccttt-gctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 25708521  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25708522 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaac 25708621  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25708622 aaaaaatcaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 25708670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 2615686 - 2615936
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2615686 tccctccgtccctaattataaggcccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 2615785  T
Q  101 attttatccttaagag--agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaa 198  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2615786 attttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaa 2615885  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2615886 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaaaagggac 2615936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1859434 - 1859190
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1859434 ctccgttcctaattataagactcttttgctaaaatcacaggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatt 1859335  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1859334 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgatacttattgctg-ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 1859236  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1859235 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 1859190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4416257 - 4416011
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  4416257 cctccgtccctatatataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtattattgtttttacagt 4416158  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4416157 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 4416058  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4416057 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 4416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 20391180 - 20391429
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20391180 tccctccgtccttatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 20391279  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20391280 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 20391379  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20391380 gaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 20391429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 53276928 - 53277177
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53276928 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 53277027  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53277028 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 53277127  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53277128 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 53277177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 35675664 - 35675911
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35675664 cctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 35675763  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35675764 tttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 35675863  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35675864 aataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 35675911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 32032737 - 32032982
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32032737 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 32032836  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32032837 tatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 32032936  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32032937 taattaatgtagctggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 32032982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30771813 - 30771575
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30771813 tccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 30771714  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30771713 tatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 30771614  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30771613 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 30771575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 5375300 - 5375548
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5375300 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 5375399  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5375400 attttatccgttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca-gtatgtaaa 5375498  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5375499 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 5375548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 9327982 - 9328231
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9327982 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 9328081  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9328082 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 9328181  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9328182 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 9328231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 20285763 - 20286012
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20285763 tccctccgtccctaattataaagcccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttaca 20285862  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20285863 attttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 20285962  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20285963 gaaataattaatgtagttggaaataacaagagggtcttataaaaagggac 20286012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 34272961 - 34273210
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34272961 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaactaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 34273060  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34273061 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtatgataaataggggcatgtatgtaaa 34273160  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34273161 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 34273210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36392149 - 36391900
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36392149 tccctccgtccctatatataagacacttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 36392050  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    |||||||| || |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36392049 attttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 36391950  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36391949 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 36391900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 43387735 - 43387984
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43387735 tccctccgtccctatatataagacccttttatcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 43387834  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43387835 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 43387934  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43387935 gaaataattaatgtagttggaagtaacaaaggggtcttataaaaagggac 43387984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47807155 - 47806906
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47807155 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttaca 47807056  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47807055 attttatcctttaagaaagaagattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 47806956  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47806955 taaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 47806906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 50534178 - 50533932
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  50534178 tccctccatccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttaca 50534079  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  50534078 attttatcctttaagaaagaagtttagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaa 50533979  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50533978 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 50533932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6753820 - 6753571
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6753820 tccctccgtccctgtatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 6753721  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||  | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6753720 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 6753621  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6753620 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 6753571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10588369 - 10588120
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10588369 tccctccgtccttatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 10588270  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10588269 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 10588170  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10588169 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 10588120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 26866610 - 26866850
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  26866610 cgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagtttta 26866709  T
Q  107 tccttaagagagaga--gttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26866710 tccttaagagagagatagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgatacaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 26866809  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26866810 aattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaag 26866850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29427781 - 29427540
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29427781 ctccgtccctatatatatgacccttttgttaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatt 29427682  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  29427681 ttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtatattaaataggggcatgtatgtaaagaa 29427582  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29427581 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 29427540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33413813 - 33413564
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33413813 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 33413714  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    |||||||| || |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33413713 attttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 33413614  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33413613 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaaaggac 33413564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Original strand, 49228465 - 49228709
Alignment:
Q  6 ccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttt 105  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49228465 ccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttt 49228564  T
Q  106 atcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    |||||| |||| | |  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49228565 atcctttaagaaataaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaat 49228664  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49228665 aattaatgtagtttgaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 49228709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 54676843 - 54676593
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  54676843 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttaca 54676744  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |||| | |||  |||||||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54676743 attttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 54676644  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataac-aaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54676643 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaaggggtcttataaaaagggac 54676593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24754373 - 24754124
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24754373 tccctccgtccttatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttattaca 24754274  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24754273 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 24754174  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24754173 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 24754124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37352822 - 37352589
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcct-taaga 115  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37352822 tataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaaga 37352723  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352722 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 37352623  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37352622 ttggaaataacaaaaaggtcttataaaaagggac 37352589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44295084 - 44294835
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44295084 tcccttcgtccctatatataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 44294985  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44294984 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 44294885  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44294884 gaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaaaggac 44294835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 47298980 - 47299229
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47298980 tcccttcgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtaaatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 47299079  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47299080 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaa 47299179  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47299180 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 47299229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 51536462 - 51536213
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51536462 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacaggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 51536363  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51536362 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 51536263  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  51536262 aaaataattaatgtagttgaaaataataaagaggtcttataaaaagggac 51536213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6083576 - 6083333
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| ||  |||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  6083576 cctccgtccttatatataagactcttttgttaaaattacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagt 6083477  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  6083476 tttatctttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattcaagaaaaagatgtataataaatagagctatgtatgtaaagaa 6083377  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6083376 ataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 6083333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 50424598 - 50424845
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50424598 cctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtggatatgtgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 50424697  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50424698 tttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 50424797  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  50424798 aataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttataaaaagggac 50424845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1028813 - 1028564
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||    
T  1028813 tccctccgtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatttatttgtaatcactattatttttaca 1028714  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1028713 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 1028614  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1028613 gaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggac 1028564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 246
Target Start/End: Original strand, 4094759 - 4094960
Alignment:
Q  45 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgc 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4094759 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagggttagtttatgttttccatatgc 4094858  T
Q  145 tacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  4094859 tatttattgttgattgaagagaaagatgtataataaatagagatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaatggtcttataaaaa 4094958  T
Q  245 gg 246  Q
    ||    
T  4094959 gg 4094960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15241774 - 15241525
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15241774 tccctccgttcctatatataagaccattttgtcaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 15241675  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15241674 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 15241575  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15241574 gaattaattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 15241525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 47228470 - 47228719
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47228470 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 47228569  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47228570 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 47228669  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  47228670 gaattaattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaatggac 47228719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 52978277 - 52978028
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  52978277 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttaca 52978178  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  52978177 attttatcctttaagaaagaaggttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaggatgtataataaataggggtatgtatgtaaa 52978078  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52978077 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 52978028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 30049832 - 30050075
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30049832 cgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 30049931  T
Q  107 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30049932 tcctttaagagagagagttgctttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 30050031  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30050032 attattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 30050075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 422671 - 422918
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  422671 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 422770  T
Q  101 attttatccttaagagagaga-gttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  422771 attttatccttta-agaaaaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaa 422869  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  422870 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 422918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52966387 - 52966159
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  52966387 cctctgtccctatatataagatcattttgctaaaatcacgggaaataagaaagtggatatttgtattaaagttatttgtaatccctattatttttacaat 52966288  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  52966287 tttatccttaaaagaggaagttagtttatgttttacatatgatatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaa 52966188  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaagg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52966187 ataattaatgtagttggaaataacaaagg 52966159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 625713 - 625958
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  625713 cctccgtccctaattataggatctttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 625812  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  625813 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 625911  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  625912 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 625958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 34948401 - 34948642
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34948401 cgtccctatatataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattgtttttacaatttta 34948500  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    || || | ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34948501 tctttta-agagagagttgatttatgttttccgtatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataa 34948599  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  34948600 ttaatgtagttgaaaatagtaaagtgatcttataaaaagggac 34948642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4455341 - 4455108
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4455341 tataagacccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 4455242  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaa-gatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 214  Q
     |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4455241 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 4455142  T
Q  215 gttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4455141 gttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 4455108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 17609764 - 17610012
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17609764 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgcttgtaatcactattgtttttaca 17609863  T
Q  101 attttatccttaagagagaga-gttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||| ||| | ||| | | |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17609864 attttattcttta-agaaaaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 17609962  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17609963 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 17610012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 30745546 - 30745790
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30745546 tccgtccctatatataagaccctcttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcatt-ttgtttttacaattt 30745644  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||| | |  |||||||||||||||| |  || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30745645 tatcctttaagaaataatgttagtttatgttttcaacctgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaa 30745744  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30745745 taattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 30745790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37364796 - 37364583
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcct-taaga 115  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37364796 tataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaaga 37364697  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37364696 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 37364597  T
Q  216 ttggaaataacaaa 229  Q
    ||||||||||||||    
T  37364596 ttggaaataacaaa 37364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 45742548 - 45742797
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  45742548 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttaca 45742647  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  45742648 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatggaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaa 45742747  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45742748 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 45742797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Original strand, 36129842 - 36130081
Alignment:
Q  11 cctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcct 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  36129842 cctaattataggatccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgtaattactattgtttttacaattttatcct 36129941  T
Q  111 t-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataatta 209  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| | | ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36129942 ttaagagagagagttggtttatgtttccaacatgttatctattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 36130041  T
Q  210 atgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36130042 atgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 36130081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36991207 - 36990960
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  36991207 cctccgtccctaattataggacccttctgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 36991108  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||| || |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  36991107 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtatgataaataggggcatgtatgtaaaga 36991008  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36991007 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 36990960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 55562870 - 55563117
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  55562870 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 55562969  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  55562970 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaa 55563069  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  55563070 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 55563117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37357694 - 37357488
Alignment:
Q  44 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcct-taagagagagagttagtttatgttttccatat 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||| | ||    
T  37357694 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 37357595  T
Q  143 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 242  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  37357594 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaa 37357495  T
Q  243 aagggac 249  Q
    |||||||    
T  37357494 aagggac 37357488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17339371 - 17339124
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  17339371 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 17339272  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||| || |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17339271 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtatgataaataggggcatgtatgtaaaga 17339172  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17339171 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 17339124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39184563 - 39184319
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  39184563 cctccgtccttaattatatgacttttttgctaaaatcgcgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtgatcactattgtttttacaat 39184464  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  39184463 tttatccttaaaagagag--ttagtttatgttttccatatattatttattgctagttgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtaggtaaagaa 39184366  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  39184365 ataattaatgtagttgaaaatagcaaagagatcttataaaaagggac 39184319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8344200 - 8343953
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8344200 tccctccgtccttatatataagacccttttgtcaaaattacggtaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 8344101  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  8344100 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggca--tatgtaaa 8344003  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  8344002 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaagagttttataaaaagggac 8343953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 13620601 - 13620845
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13620601 ctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 13620700  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  13620701 ttatccttta-agagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaaaa 13620799  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13620800 taattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 13620845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31937369 - 31937122
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  31937369 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 31937270  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||| || |||| |||| ||||| |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31937269 tttatcatttaagaaagagtgttagattatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgtaaaga 31937170  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  31937169 aataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagggac 31937122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 37776480 - 37776725
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| | |||||||| ||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  37776480 cctccgttcttaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaat 37776579  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  37776580 tttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataattaataggagcatgtatgtaaagaa 37776678  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37776679 ataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 37776725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 60 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 50352300 - 50352110
Alignment:
Q  60 tatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 158  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||    
T  50352300 tatttgtaataaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgat 50352201  T
Q  159 tgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50352200 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 50352110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 375715 - 375470
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  375715 tccgtccataattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 375616  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||| |||| ||| | ||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  375615 tatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcagcattctatttattgctgattgaagaaaaaaatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 375516  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  375515 taattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggac 375470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 17678277 - 17678510
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17678277 tataagatcattttgctaaaattatggaaattaagaaagtggatatttatattaatgttgtttgaaatcactattatttttacaattttatccttaagag 17678376  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaa-gaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||     
T  17678377 agagtgttagtttatgttttccatattatatttattgctgattgaaggaaaaagatgtataataaatagggacatatatataaagaaataattaatgtaa 17678476  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  17678477 ttggaaatagcaaataagtcttataaaaagggac 17678510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48030603 - 48030359
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  48030603 ctccgtccttaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 48030504  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||||||| | ||||||| || |||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  48030503 ttatccttta-agagagaattggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaa 48030405  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48030404 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 48030359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 52850208 - 52850437
Alignment:
Q  13 taattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt- 111  Q
    |||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||     
T  52850208 taattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatccttt 52850307  T
Q  112 aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaat 211  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52850308 aagagagatagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 52850407  T
Q  212 gtagttggaaataacaaaggggtcttataa 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52850408 atagttggaaataacaaaggggtcttataa 52850437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 26625746 - 26625993
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |    
T  26625746 tccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttata 26625845  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26625846 attttatccttta-agagagaattgatttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaag 26625944  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26625945 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 26625993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37174095 - 37173879
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  37174095 aaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacagttttatcctttaagagagaggattggtttatg 37173996  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37173995 ttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 37173896  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||    
T  37173895 gtcttataaaaagggac 37173879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38027425 - 38027181
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||| | |||||||||||||||    
T  38027425 cctccatccctaattatatgacccttttggaaaaataactggaattaagatagtggatatttatattaaatatttttgtaattactattgtttttacaat 38027326  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| ||||  || |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38027325 tttatcctttaagaaagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 38027226  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38027225 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 38027181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 45096909 - 45097156
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  45096909 tccctccgttcctaattataggacccttttataaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 45097008  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  45097009 attttatccttta-agagagaattggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaatcatgtataataaataagggtatgcatgtaaag 45097107  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  45097108 aaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggac 45097156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 29519911 - 29520155
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29519911 tccgtccctaattataaaacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggataaa-gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 29520009  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||| ||| |||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29520010 tatcctttaagaaagaaagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 29520109  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29520110 taattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 29520155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 20454930 - 20455173
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20454930 tccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 20455029  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20455030 tatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaat 20455128  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20455129 aattaatgtagttggaaatggcaaaggggtcttataaaaagggac 20455173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 20767960 - 20768207
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  20767960 cctccgtccctaattataagtcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 20768059  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20768060 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 20768159  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  20768160 aataattaatgtagttgaaaatagaaaagagatcttataaaaagggac 20768207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34963676 - 34963435
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatcc-ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  34963676 cctccgtccttaattataggatcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgcaattattattggttttacaa 34963577  T
Q  102 ttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34963576 ttttatcctttaagagagagagtt-gtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataa-tagaggcatgtatgtaaag 34963479  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  34963478 aaataattaatgtagttggaaataacaaaatgatcttataaaaa 34963435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 36900856 - 36901100
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  36900856 cctccgtccctaattatagggccattttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 36900955  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36900956 tttatccttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 36901053  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||    
T  36901054 ataattaatgtagttggaaatagcaagggagtcttacaaaaagggac 36901100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47683381 - 47683135
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  47683381 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatattagtattaaatatgtttgcaattactattatttttacaat 47683282  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47683281 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaggtgtataat-aataggggcatgtatgtaaaga 47683183  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||    
T  47683182 aataattaatgtagttggaaatagcaaaaaagtcttataaaaatggac 47683135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 56432811 - 56432568
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  56432811 ctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 56432712  T
Q  104 ttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||| | ||| || |||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  56432711 ttatcctttaagagagagagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtattataaataagggcatgtatgtaaaga 56432612  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  56432611 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaag 56432568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 14793769 - 14794014
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||||   ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  14793769 cctccgttcctaattatagggcccttttcaaaaaacaacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 14793868  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14793869 tttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 14793967  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14793968 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaatggac 14794014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 20180662 - 20180888
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20180662 cctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgagaattaaaaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaattaatattgtttttacaat 20180761  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || || ||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20180762 tttatccttaagagagagagttagattatgcttttcacatactatttattgctgatcgaagaaaaaaaattataataaatagtggtatgtatgaaaagaa 20180861  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  20180862 ataattaatgtaattaaaaataacaaa 20180888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Original strand, 25123988 - 25124234
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaa-tcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  25123988 cctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaa 25124087  T
Q  102 ttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||| || | |||| |||   |||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25124088 ttttatcctttaataaagagggttgacttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaat 25124187  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25124188 aaataattaatgaagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg 25124234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25475107 - 25474862
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25475107 cctccgtccctgtatataagatccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttactttaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 25475008  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||    
T  25475007 tttatccttta-agagataattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagacgtataataaataggattatgtatgtaaagaa 25474909  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25474908 ataattaatgtacttgaaaataacaaaagagtcttataaaaagggac 25474862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Original strand, 29460449 - 29460695
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29460449 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattagatatgtttgtaattattattgtttttacaat 29460548  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  29460549 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 29460648  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| |  |||||||||||||||    
T  29460649 aataattaatgtagttgaaaatagaaaatgaatcttataaaaaggga 29460695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 19281853 - 19282072
Alignment:
Q  21 agatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19281853 agatccttttgccaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaga 19281952  T
Q  120 gagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgg 219  Q
      |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19281953 aggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaat---------tatgtaaagaaataattaatgtagttgg 19282042  T
Q  220 aaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19282043 aaataacaaaagggtcttataaaaagggac 19282072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37842435 - 37842221
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||    
T  37842435 aaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-agagagaattggtttatgt 37842337  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 233  Q
    |||  | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37842336 ttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggg 37842237  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  37842236 tcttataaaaagggac 37842221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 6462435 - 6462681
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  6462435 cctccgtccataattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaat 6462534  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6462535 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataat-aataggggcatgtatgtaaaga 6462633  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  6462634 aataattaatgtagttgaaaatagcaaaaaggtcttataataagggac 6462681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 39114633 - 39114880
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39114633 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtatttacaat 39114732  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||  ||| | |||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  39114733 tttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagagcatgtatgtaaaga 39114832  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  39114833 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 39114880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 46950283 - 46950041
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  ||| ||   ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| |||||    
T  46950283 cctccgtccctaattatagggccctcttaaaaaaataacggaaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttctaattagtattgttttcacaat 46950184  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  46950183 tttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaataa 46950085  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46950084 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 46950041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 55014711 - 55014957
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  55014711 cctccatctctaattataggatccttttgaaaaaataacgg-aattaaaataatgcatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaat 55014809  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||| || ||||||||  ||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55014810 tttatcttttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 55014909  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  55014910 aataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttataaaaatggac 55014957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Original strand, 51717849 - 51718089
Alignment:
Q  9 tccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc 108  Q
    |||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  51717849 tccctaattataggacctttttga-aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtatgtaattactattgtttttacaattttatc 51717947  T
Q  109 ctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataat 207  Q
    ||| || | |||||||| |||||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||    
T  51717948 ctttaaaaaagagagttggtttatgttttcaacctgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatatggacatgtatgtaaagaaataat 51718047  T
Q  208 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  51718048 taatgtagttgaaaatagcaaaggggtattataaaaagggac 51718089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Original strand, 18706398 - 18706633
Alignment:
Q  13 taattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctta 112  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||     
T  18706398 taattataagacccttttaaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttataattattattatatttacaattttatccttt 18706497  T
Q  113 agagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatg 212  Q
    | |||||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  18706498 a-agagagagatcgtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtgtgtatgtaaagaaataattaatg 18706596  T
Q  213 tagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  18706597 tagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggac 18706633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 20761569 - 20761785
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  20761569 cctccgtccctaattataagtcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 20761668  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20761669 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 20761768  T
Q  202 aataattaatgtagttg 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  20761769 aataattaatgtagttg 20761785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 28298114 - 28298362
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||   ||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  28298114 cctccgtccctaattataaggctcttttaaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaat 28298213  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaa-agatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28298214 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgtcgattgaaaaaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaag 28298313  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  28298314 aaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagggac 28298362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Original strand, 49373441 - 49373682
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  49373441 tccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatctgtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaattt 49373540  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||||| |  ||| ||||||||| || | ||| || |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49373541 tatcctttaagagatatggttggtttatgttatcaagatgttatttatagctgattgaagaaaaa--tgtacaataaataggggcatgtatgtaaagaaa 49373638  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49373639 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 49373682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20789224 - 20788977
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||  | |||||||  ||||| | || |||||||| | || ||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||     
T  20789224 cctccgttcctaattatagaacccttttgaaaaaataatggaaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattgtttttacaac 20789125  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||||||| | || |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  20789124 tttatcctttaagagagataattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgcatataaaga 20789025  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20789024 aataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 20788977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 33988541 - 33988783
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  33988541 cctccatccctaattataggc-ccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 33988639  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||    
T  33988640 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa--aa 33988736  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33988737 ataattaatatagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 33988783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39671018 - 39670771
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  39671018 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 39670919  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattg-aagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||  |||||    
T  39670918 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgtagataaag 39670819  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  39670818 aaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaaggga 39670771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 48241398 - 48241641
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||| |||||||| || |||||||  ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  48241398 cgtccttaattataggacccttttgaaaaaataacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 48241497  T
Q  107 tccttaa-gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    ||||| | ||||||| ||| |||||||||||| | ||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48241498 tcctttatgagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttactggtgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaata 48241597  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||||    
T  48241598 attaatatagttggaaatagcaaaaagatcttataagaagggac 48241641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 50450969 - 50451216
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  50450969 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatctgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 50451068  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||| |||   | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  50451069 tttatcctttaagagtgaggaatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatatatgtaaaga 50451168  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  50451169 aataattaatgtagttttaaatagtaaaggggtcttataaaaatggac 50451216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 50602842 - 50603084
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  50602842 cctccgtccctaattatataacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 50602941  T
Q  103 ttta-tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||| || |||||||||| |||| | |||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  50602942 tttattctttaagagagatagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaataagggcatgtatgtaaaga 50603040  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  50603041 aataattaatgtagttggaaatagcaaaaaagtcttataaaaag 50603084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 51336046 - 51335839
Alignment:
Q  43 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccata 141  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  51336046 ggaattaagataatagatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaatttatccttcaagagagggagttggtttatgttttcaaca 51335947  T
Q  142 tgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 241  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  51335946 tgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataa 51335847  T
Q  242 aaagggac 249  Q
    ||||||||    
T  51335846 aaagggac 51335839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 30523769 - 30523969
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  30523769 cctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 30523868  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  30523869 tttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaatatgggcatgtatgtaaagaa 30523967  T
Q  203 at 204  Q
    ||    
T  30523968 at 30523969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45921721 - 45921477
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||||||||||||||    |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||    
T  45921721 cctctgtccctaattataaggcttttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaat 45921622  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||   ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  45921621 tttatcctttaagagagagggttaatttatgttttc---atgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaata 45921525  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  45921524 aataattaatgtagttgcaaataggaaatgagtcttataaaaagggac 45921477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 51329526 - 51329757
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51329526 cctccgtccctatatataagaccattttgctaaaattatgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 51329625  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||               ||  ||||||||||||| ||    
T  51329626 tttatccttaagagagataattagtttatatttttcatatgttatttattgctgattgaagaaaa---------------aggcgcatgtatgtaaaaaa 51329710  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  51329711 ataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggac 51329757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 13389656 - 13389900
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| |  | |||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||    
T  13389656 cctccgtccttaattatatggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtagttagtattgtttttacaat 13389755  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13389756 tttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 13389853  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  13389854 ataattaatgtagttgaaaatagcaaaggagtcttataaaaaaggac 13389900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 23777548 - 23777792
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| ||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  23777548 cctctgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgttataaatatgtttgtaattagtatt-tttttacaat 23777646  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||  | |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  23777647 tttatccttta-agagagatatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatataaagaa 23777745  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23777746 ataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggac 23777792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47311551 - 47311336
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaag-agagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||    
T  47311551 aaaataacgggaattaagata-tggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaggaaagagggttggcttatg 47311453  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||       
T  47311452 ttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaaaa 47311353  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    || ||||||||||||||    
T  47311352 gtgttataaaaagggac 47311336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1173855 - 1173616
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatca-cgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||    
T  1173855 cctccgtctctaattataaggctcttttgaaaaaattaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaa 1173756  T
Q  102 ttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||| |||| |||| |||   |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1173755 ttttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaggatgtataataaataggggcatatatgtaaag 1173656  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata 240  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  1173655 aaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 1173616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 249
Target Start/End: Original strand, 9808398 - 9808589
Alignment:
Q  59 atatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctga 157  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  9808398 atatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctga 9808497  T
Q  158 ttgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9808498 ttgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 9808589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18882636 - 18882422
Alignment:
Q  13 taattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-tt 111  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  18882636 taattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 18882537  T
Q  112 aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggc--atgtatgtaaagaaataatta 209  Q
    |||| |||||||| | |||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||    
T  18882536 aagaaagagagttggcttatgttttcaacattatatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatatgtaaagaaataatta 18882437  T
Q  210 atgtagttggaaata 224  Q
    |||||||||||||||    
T  18882436 atgtagttggaaata 18882422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37518296 - 37518055
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| ||| |||||||||||| | |||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  37518296 cctctgtctctaattataagacctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgaaattaatattgtttttacaat 37518197  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||| ||| | ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  37518196 tttatccttta-agagagagatgatttatgtcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgaatgtaaagaa 37518098  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37518097 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 37518055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37522512 - 37522271
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| ||| |||||||||||| | |||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  37522512 cctctgtctctaattataagacctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgaaattaatattgtttttacaat 37522413  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||| ||| | ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  37522412 tttatccttta-agagagagatgatttatgtcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgaatgtaaagaa 37522314  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37522313 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 37522271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40809849 - 40809607
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  40809849 cctccgtccataattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 40809750  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| |    
T  40809749 tttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagttgtattataaatagggacatgtatgtaaata 40809650  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| |  |||||||||||    
T  40809649 aataattaatgtagttaaaaatagcaaaagaatcttataaaaa 40809607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 41191457 - 41191619
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41191457 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 41191556  T
Q  187 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41191557 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 41191619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41620799 - 41620564
Alignment:
Q  9 tccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc 108  Q
    ||||||||||||   || |||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  41620799 tccctaattatagagtcattttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaattttatc 41620700  T
Q  109 cttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataatt 208  Q
    ||| | ||||| |||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  41620699 cttta-agagatagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatgaagacatgtatgtaaagaaataatt 41620601  T
Q  209 aatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  41620600 aatgtagttggaaatagcaaaaatgtcttataaaaag 41620564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Original strand, 54535926 - 54536118
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  54535926 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 54536025  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtat 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  54536026 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtat 54536118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Original strand, 37639634 - 37639875
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||| |||||||||||  | |||||  ||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  37639634 tccgtctctaattataagtcctttttgaaaaaataacgagaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 37639733  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||| || || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37639734 tatcttttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgccgattgaacaaaaatatgtataataaatag-gacatgtatgtaaagaaa 37639832  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37639833 taattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 37639875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 249
Target Start/End: Original strand, 39184037 - 39184240
Alignment:
Q  45 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatg 143  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||     
T  39184037 aattaaaaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctttaagatagagaattagtttatgttttcaacata 39184136  T
Q  144 ctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
     || ||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||    
T  39184137 atatttactgtcgattgaagaaaaatatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaatagttaatgtagttggaaatagcaa--gggtcttatacaa 39184234  T
Q  244 agggac 249  Q
    ||||||    
T  39184235 agggac 39184240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 203
Target Start/End: Original strand, 45850471 - 45850669
Alignment:
Q  6 ccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttt 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45850471 ccgttcctaattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaatttt 45850570  T
Q  106 atcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||| |||||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45850571 atcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 45850669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49793381 - 49793137
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||| ||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||| |||| |  ||||||||||||| |    
T  49793381 ctccgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttctaattacaattgtttttacaaat 49793282  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  49793281 ttatccttca-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattcaagaaaaagatgaataataaataaggaaatgtatgtaaagaaa 49793183  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  49793182 taattaatgtagttggaaatagcaaaaaggttttataaaaagggac 49793137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 55876667 - 55876431
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||| |||||||| || ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55876667 cgtccttaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 55876568  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    ||||| | | ||||| || ||||||||||||   ||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  55876567 tcctttaaa-agagaattggtttatgttttcatcatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataagggcatgcatgtaaaaaaataa 55876469  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  55876468 ttaatgtagttggaaatagcaaaggaatcttataaaaa 55876431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18004228 - 18003989
Alignment:
Q  9 tccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc 108  Q
    |||||||||||| |  |||||||  ||||| || |||||||||| || | |||||||||||| |  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  18004228 tccctaattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagcgaatatttgtattatatatgtttgtaattagtattctttttacaattttatc 18004129  T
Q  109 cttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataatt 208  Q
     || | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18004128 tttta-agagagagatgttttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataatt 18004030  T
Q  209 aatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    || ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18004029 aaggtagttgaaaataacaaaaggatcttataaaaagggac 18003989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 38899820 - 38900034
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||| | | |||||||||||||||||||||| | |||||||| |  |||||||    
T  38899820 aaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatatttgtaattaatgttgtttttacaattttatccttta-agagagagatgatttatgt 38899918  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 233  Q
    |||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  38899919 tttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatatataattaataggggcatgtatataaaggaataattaatgtagttggaaatagcaaagtga 38900018  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  38900019 tcttataaaaagggac 38900034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 54877760 - 54878003
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  54877760 cctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagagagtgaatatttttattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 54877859  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||| || | |||||| |||  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54877860 tttatctttta-agagagtgttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaa--tgtataataaataagggcatgtatgtaaagaa 54877956  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  54877957 ataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 54878003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 16545732 - 16545974
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||   ||||| ||| ||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  16545732 cgtccttaattatatgatcattttaaaaaaataacgagaattaaaatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaatttta 16545831  T
Q  107 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    || || ||||||||  ||| |||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16545832 tcttttaagagagaaggttggtttatcttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaatag-ggcatgtatgtaaagaaata 16545930  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||| ||||    
T  16545931 attaatgtaattggaaatatcaaatgattcttataaaaaaggac 16545974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 28501132 - 28501377
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |  ||||||||||| | |  | | |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  28501132 cctccgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacagagattaagaaagttggttgtagcattaaatttgtatgtaattactattgtttttacaat 28501231  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || || |  ||||||||    
T  28501232 tttatccttaagagagcgagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaata-aggtatcttggtaaagaa 28501330  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28501331 ataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggac 28501377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Original strand, 6656494 - 6656733
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||    
T  6656494 cgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaatttta 6656593  T
Q  107 tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | ||| |   |||||||||||    
T  6656594 tc-ttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaggacatattgataaagaaataa 6656692  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6656693 ttaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaggg 6656733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 33501671 - 33501842
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33501671 tccctccgtccctatatataagaccattttgccaaaatcacaggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 33501770  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagat 171  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  33501771 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagat 33501842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13549271 - 13549026
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||   ||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  13549271 cctccgtccctaaatataagagcattttgccaaaattgtggacattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 13549172  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  || |||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  13549171 tttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaagaaaaa-atgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 13549073  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13549072 ataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggac 13549026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 245
Target Start/End: Original strand, 38405643 - 38405806
Alignment:
Q  77 tttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtat 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38405643 tttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattactgattgaagaaaaagatgtat 38405742  T
Q  176 aataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  38405743 aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa------tggaaataacaaatgagtcttataaaaag 38405806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Original strand, 53564103 - 53564344
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |  | ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||    
T  53564103 tccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaagttgtgtataattactattgtttttacaattt 53564202  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  || |||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||||    
T  53564203 tatccttaagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaat 53564302  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  53564303 aattaatctacttggaaatatcaaatgggtcatataaaaagg 53564344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 54624093 - 54623847
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||||  ||||  | || |||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  54624093 cctccgtccctaattatatggccattttgaaaaaaaaatggaaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 54623994  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat-gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| | ||||| || | |||||||||||| | || | || |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  54623993 tttatccttta-agagaaagatggtttatgttttcaacattgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataattaataggggcatgtatgtaaata 54623895  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  54623894 aataattaatgtaggtggaaatagcaagtgagtcttataaaaagggac 54623847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Original strand, 15500356 - 15500598
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| ||   |||||  ||||| ||||||||||||| | | ||||||  |||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  15500356 cctccgtccttaattataggacttttttgaaaaaataacgggaattaagatactagatattcatattaaatatgtttataattactattatttttacaat 15500455  T
Q  103 tttatccttaa-gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| | ||||||| | | |||||||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  15500456 tttatcctttatgagagaggggtggtttatgttttcaacatgttatttattactaattgaagaaaaagatgtataataaatcggagcatgtgtgtaaaga 15500555  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  15500556 aataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaa 15500598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18873009 - 18872763
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||| |   |  | |||||||| |||| |  ||| | |||||||||||||||    
T  18873009 cctccgtccctaaatataggagccttttgctaaaattacggagattaagaaaatttgttgtagtattaaatttgtataaaattactattgtttttacaat 18872910  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  || |||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  18872909 tttatccttaagagagagagttaatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatacaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 18872810  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18872809 ataattaatgtacctggaaatatcaaagggatcttataaaaagggac 18872763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 49329775 - 49329541
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    ||| || | |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  49329775 cgtccctaattataaagtccttttg----aataacagaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacttttgtttttacaatttta 49329680  T
Q  107 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    || || |||| || | |||   |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  49329679 tcatttaagaaagtgggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataaaggcatgtatgtaaaaaaata 49329580  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||    
T  49329579 attaatgtagttgaaaataaaaaatgagtcttataaaaa 49329541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18018911 - 18018735
Alignment:
Q  43 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccata 141  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||   |||||||||| | |    
T  18018911 ggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttgacttatgttttcaaca 18018812  T
Q  142 tgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 218  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18018811 ttctatttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 18018735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Original strand, 32898983 - 32899207
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  32898983 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 32899082  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||    
T  32899083 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagat--------------------tatgtaaaga 32899162  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32899163 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 32899207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 169
Target Start/End: Original strand, 41191280 - 41191447
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  41191280 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 41191379  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaag 169  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41191380 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaag 41191447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 23390093 - 23390339
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||| |   |  | |||||||| |||| |  ||| | |||||||||||||||    
T  23390093 cctccgtccctaaatataggagccttttgctaaaattacggagattaagaaaatttgttgtagtattaaatttgtataaaattactattgtttttacaat 23390192  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  23390193 tttatccttaagagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 23390292  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  23390293 ataattaatgtacttggaaatatcaaaggagatttataaaaagggac 23390339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 127 - 249
Target Start/End: Original strand, 49490036 - 49490158
Alignment:
Q  127 tttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac 226  Q
    ||||||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  49490036 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgtagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagg 49490135  T
Q  227 aaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  49490136 aaaggggtcttataaaaagggac 49490158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20286249 - 20286096
Alignment:
Q  96 ttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatg 195  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||    
T  20286249 ttacaattttatttttaagagagagagttgatttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatatatg 20286150  T
Q  196 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||| ||||    
T  20286149 taatgaaataattaatgtagttggaaatagtaaataagtcttataaaaaaggac 20286096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36211536 - 36211304
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc-cttaaga 115  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||    
T  36211536 tataagatcattttaccaaaatcacgggaattaagaaagttgatatttgtattaaaattatttgaaatcactgttgtttttacaattttatcttttaaga 36211437  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
      |||||||||||||||||||| | ||  || | |||| ||||| | |||||||||| |||| |||||   | || || ||||||||||||||| |||||    
T  36211436 tcgagagttagtttatgttttcaacatattattcattgttgattaatgaaaaagatgaataaaaaatatgagtatttaggtaaagaaataattattgtag 36211337  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  36211336 ttggaaatagcata-gagtcttataaaaagggac 36211304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 245
Target Start/End: Original strand, 48149017 - 48149173
Alignment:
Q  90 ttgtttttacaattttatcct-taagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggc 188  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||  |||||| | || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  48149017 ttgtttttataattttatcctctaaaatagagagttgatttatgctctcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataatatatagaggc 48149116  T
Q  189 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  48149117 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaagggtcttataaaaag 48149173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Original strand, 30868554 - 30868791
Alignment:
Q  13 taattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctta 112  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||| || |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  30868554 taattataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttgat-ttagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctta 30868652  T
Q  113 agagagagag--ttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaa 210  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||| | ||  || |||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||  || | ||  ||||||||||||||||    
T  30868653 agagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaaaaaaaagatgcaaaataaataagggtacgttagtaaagaaataattaa 30868752  T
Q  211 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  30868753 tgtacttgaaaataccaaaggagtcttataaaaagggac 30868791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 41333817 - 41334039
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 124  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41333817 ccttttgccaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatctttaagagagagagtt 41333916  T
Q  125 agtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 224  Q
    | ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||     
T  41333917 aatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaaaaaataattaatatacttggaaatg 41334016  T
Q  225 acaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
     ||||||| || |||||||||||    
T  41334017 ccaaagggatcctataaaaaggg 41334039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 13498233 - 13498477
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||  |  |||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||| ||||||||||    
T  13498233 tccgtccctaaatatatgagccttttgcaaaaattacggagaaaaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtatttacaattt 13498332  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  ||||||||||    
T  13498333 tatccttaaaaaagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaat 13498432  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  13498433 aattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaagggac 13498477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28495646 - 28495430
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    |||||||| || ||||||||||| | ||   |||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  28495646 aaaatcacaggtattaagaaagttggtaagagtattaaatttgtttgtaattactattgcttttacaattttatcctttaagagagagatttagtttata 28495547  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||  || |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||| || | ||    
T  28495546 ttttcaacataatatttattgttgattgaataaaaagatgtaaaataaataggggtatgttggtaaataaataattaatgaacttggaaataccagatgg 28495447  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  28495446 atcttataaaaagggac 28495430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 6629221 - 6629464
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||  |||  ||||||||||| | |  |  ||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  6629221 cctccgtccctaaatatatgatttttttgctaaaattgcggagattaagaaagttggttgtaatattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 6629320  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  6629321 tttatccttaagagagag--ttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 6629417  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  6629418 ataattaatgtacttggaaataccaaaagcgtcttataaaaagggac 6629464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 249
Target Start/End: Original strand, 48801427 - 48801610
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaa 165  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||    
T  48801427 tattaaatttgtatataattattatagtttttacaattttatccttaagagaaagagttagtttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaa 48801526  T
Q  166 aaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| ||||||||  || ||||  |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||  |  ||||||||||||||||    
T  48801527 aaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataactaatgtaattgaaaatatcaattgtatcttataaaaagggac 48801610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 183
Target Start/End: Original strand, 3168194 - 3168358
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||    
T  3168194 tataagatttttttggcaaaatcacgagaattaagaaagttgatatttatattaaaattgttcgtaatcactattgtttttacaattttatcattta-ag 3168292  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 183  Q
    ||||||||| ||||||||||| | || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3168293 agagagtta-tttatgttttcaacatactatttatcgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 3168358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29509073 - 29508851
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttag 126  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  29509073 ttttgccaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatatagttactattgtttttacaattttatccttaaaagagagagttaa 29508974  T
Q  127 tttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac 226  Q
    ||||||||||| ||||  || |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  ||  |||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  29508973 tttatgttttcaatataatatttattattgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtttgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaatatc 29508874  T
Q  227 aaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  29508873 aaaatggtcttataaaaagggac 29508851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 52181016 - 52181175
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||  ||    
T  52181016 tattgtttttacaattttatcctt--gagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataaggg 52181113  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  52181114 taggttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagggac 52181175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 243
Target Start/End: Original strand, 26889646 - 26889884
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||   ||||||||||| | |  | |||||||| || | |||||| | |||||||||||||||    
T  26889646 cctccgtccataattatacgagccttttgcaaaaattacgaagattaagaaagttggttgtagtattaaatttatatgtaattactattgtttttacaat 26889745  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||  | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || |||| |||||||||    
T  26889746 tttatccttaagagggag--ttaatttatgtttttaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgtttgtaaagaa 26889843  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||    
T  26889844 ataattaatgtacttgaaaataccaaatgtgtcttataaaa 26889884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 47109565 - 47109793
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||  |||| ||||||   |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  47109565 cctccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaggaaagttagttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 47109664  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  || | ||  ||||||||    
T  47109665 tttatccttaagagagagagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtaagttggtaaagaa 47109764  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaagg 231  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  47109765 ataattaatgtacttgaaaataccaaagg 47109793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Original strand, 42528481 - 42528582
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  42528481 ttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataattaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaaggg 42528580  T
Q  248 ac 249  Q
    ||    
T  42528581 ac 42528582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31071932 - 31071749
Alignment:
Q  59 atatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 158  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||   ||| || |||||| ||||    
T  31071932 atatttgtattaaa-ttgtttgtaatcactgttacttttataattttatccttt-gagagataattagtttttgttttcagcatgttatttattgttgat 31071835  T
Q  159 tgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  31071834 tgaagaaaaagatgtataataaataaggatatgtatgtaaaaaaataattaatgtagctgaaaatagcaatggggtcttatgaaaa 31071749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35909872 - 35909687
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| || |||||||    
T  35909872 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttggttgaaga 35909773  T
Q  165 aaaaga-tgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| | |  | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  35909772 aaaaaaatacaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatggacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggac 35909687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Original strand, 5734530 - 5734661
Alignment:
Q  110 ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgt-aaagaaataatt 208  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  5734530 ttaagagatagagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaaaaaataatt 5734629  T
Q  209 aatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 241  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5734630 aatgtagttggaaatagcaaa-gggtcttataa 5734661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23623928 - 23623753
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||    
T  23623928 cctccgtccctaattatatgactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg-ttttacaat 23623830  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataat 178  Q
    ||||||| |||||| ||| | || |||||| ||||  | ||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23623829 tttatcctttaagaaagataattggtttatatttttaacatgttatttattgctgattgaataaaaatatgtataat 23623753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32684825 - 32684648
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||| ||||  || |||||| ||||||||||    
T  32684825 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagaaagag--ttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 32684728  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||| ||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||    
T  32684727 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaccggtcttataaaaa 32684648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 55969053 - 55968949
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagag-agttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaag 163  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  55969053 gtattaaagttgtttgtaatcactattggttttacaattttatccttaagagggggaagttagtttatgttttccatgtgctatttattgttgattgaag 55968954  T
Q  164 aaaaa 168  Q
    |||||    
T  55968953 aaaaa 55968949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 249
Target Start/End: Original strand, 468413 - 468496
Alignment:
Q  166 aaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  468413 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttttaaaaagggac 468496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17468180 - 17467937
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || | |||| | ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| || | | |||| | |||||||||||||||    
T  17468180 cctccgtccctaaatataggagcatttttcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttatatataattactattgtttttacaat 17468081  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||  || |||||| | |||||| ||||||||  | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  17468080 tttatccttaagagagag--ttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaa-aaaaagattcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 17467984  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17467983 ataattaatgtacttgaaaataccaaagggatcttataaaaagggac 17467937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20783477 - 20783234
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |    |||||||| |||| | |||| | |||| |||||||||||    
T  20783477 ctccgtccctaaatataagaggcttttgccaaaattacggagattaagaaagttggttgcagtattaaatttgtatataattactattatttttacaatt 20783378  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||  || |||||| |  ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  20783377 ttatccttaagagagag--ttaatttatgttttcaacataatatttattgttttttgaagaaaaagatgcaaaataaataatggtatgtttgtaatgaaa 20783280  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| || ||| |||||  ||| |  ||||||||||||||||    
T  20783279 taattaatatacttgaaaatacgaaatgaatcttataaaaagggac 20783234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 6807641 - 6807504
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||    
T  6807641 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaaaatagtggatatttgtattaaaaatgtttataattactattgtttttaca 6807542  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttc 137  Q
    ||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  6807541 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttc 6807504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Original strand, 5840046 - 5840171
Alignment:
Q  9 tccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc 108  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5840046 tccctaattatatgatcctcttaccaaaatcacgggaataaagaaagttgataataatattaaatttgtttataattattattatttttacaattttatc 5840145  T
Q  109 cttaagagagagagttagtttatgtttt 136  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5840146 ctta--agagagagttagtttatgtttt 5840171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Original strand, 49489885 - 49489993
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  49489885 cctccgtccctaattataggacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 49489984  T
Q  103 tttatcctt 111  Q
    |||||||||    
T  49489985 tttatcctt 49489993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 148
Target Start/End: Original strand, 36031177 - 36031280
Alignment:
Q  46 attaagaaagtggatatttg-tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgc 144  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  |   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36031177 attaagaaagtgaatatttaatattaaagttgtttgtaagtaccgttgtttttacaagtttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgc 36031276  T
Q  145 tact 148  Q
    ||||    
T  36031277 tact 36031280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Original strand, 5734392 - 5734514
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  5734392 cctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 5734491  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagtt 124  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  5734492 tttatcctttaagagatagagtt 5734514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21265511 - 21265275
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||||| |||  |  ||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  21265511 cctccgtccttaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttgattgtaatattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 21265412  T
Q  103 tttatcctt--aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||  |||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||    
T  21265411 tttatccttaaaagagaaagagtaaatttatgttttcagtataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaag 21265313  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtctta 238  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||    
T  21265312 aaataattaatgtacttggaaacaccaaagaggtctta 21265275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Original strand, 36040851 - 36040953
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaa-agatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  36040851 ttattgctgattcaagaaaaaagatgtataataaataggggtatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggaatcttataaaaagg 36040950  T
Q  247 gac 249  Q
    |||    
T  36040951 gac 36040953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 246
Target Start/End: Original strand, 30010659 - 30010838
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| ||||||||||    
T  30010659 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttgagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 30010758  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||| ||| | ||||||||  |  ||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||  |||||||||||||||    
T  30010759 aaaa-atgcaaaataaataaggatatgttggtaaagaaataattaatatacttagaaataccaaa-aggtcttataaaaagg 30010838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Original strand, 37779960 - 37780201
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||  |||||||||||   |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  37779960 cctccgtccctaaatataggagccttttgctaaaattgcggagattaagaaagtttgttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 37780059  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgt-aaaga 201  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||   | ||||  || ||| |    
T  37780060 tttatcctta--agagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagagtatgttggtaaaaaa 37780156  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||||||||||||    
T  37780157 aataattaatgtatttggaaacaccaaagaagtcttataaaaagg 37780201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53906191 - 53906099
Alignment:
Q  121 agttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  53906191 agttagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaatgatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaatagttaatgt 53906099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Original strand, 8418162 - 8418333
Alignment:
Q  75 tgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgt 173  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| | || ||| ||| || |||||||||||||| || |    
T  8418162 tgttagtaattagtattgtttttacaattctatcctttaagagagtaagttagtttatattttcaacatactatttaatgttgattgaagaaaaaaatat 8418261  T
Q  174 ataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    | ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||||    
T  8418262 aaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttgaaaataccaaatggatcttataaaaag 8418333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 168
Target Start/End: Original strand, 42598519 - 42598621
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  42598519 gtattaaatttgtttgtagttactattgtttttacaattttatccttta-agagagagttagtttatggtttcaatatgctacttattgttgattgaaaa 42598617  T
Q  165 aaaa 168  Q
    ||||    
T  42598618 aaaa 42598621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23621578 - 23621504
Alignment:
Q  175 taataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23621578 taataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggac 23621504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 181
Target Start/End: Original strand, 46480805 - 46480943
Alignment:
Q  44 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatat 142  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| | ||    
T  46480805 gaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacat 46480904  T
Q  143 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaa 181  Q
    | || |||||| |||||| ||||||| || |||||||||    
T  46480905 gttatttattgttgattggagaaaaaaatatataataaa 46480943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51787732 - 51787603
Alignment:
Q  97 tacaattttatccttaagagagagagtta--gtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtat 194  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| | || ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||     
T  51787732 tacaattttatctttaagagaaagagttatagtttatgttttcaacatactatttatcgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggaatgtaa 51787633  T
Q  195 gtaaagaaataattaatgtagttggaaata 224  Q
     |||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  51787632 ataaaaaaataattaatatagttagaaata 51787603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 39880030 - 39879922
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  39880030 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatacttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaat 39879931  T
Q  103 tttatcctt 111  Q
    |||||||||    
T  39879930 tttatcctt 39879922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 4143676 - 4143561
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4143676 cgtccttaattataggatccttttgaaaaaataacgagaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaatttta 4143577  T
Q  107 tcc-ttaagagagaga 121  Q
    ||| ||||||||||||    
T  4143576 tcctttaagagagaga 4143561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 55777183 - 55777081
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  55777183 tccgtccctaattatagga-ccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 55777085  T
Q  105 tatc 108  Q
    ||||    
T  55777084 tatc 55777081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3085672 - 3085518
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||  ||||  || |||||| ||||||||||    
T  3085672 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt--gagagagagtaaatttatgtttttaatataatatttattgttgattgaaga 3085575  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 222  Q
    |||| ||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3085574 aaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaa 3085518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39797581 - 39797480
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39797581 ttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaaggg 39797482  T
Q  248 ac 249  Q
    ||    
T  39797481 ac 39797480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 249
Target Start/End: Original strand, 46481303 - 46481380
Alignment:
Q  173 tataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac-aaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46481303 tataataaataggggctttcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaggggtcttataaaaagggac 46481380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 249
Target Start/End: Original strand, 6595556 - 6595724
Alignment:
Q  81 taatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 180  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |   || |||| | |||| ||||||||||| | | ||| |    
T  6595556 taattattattgtttttataaatttatctttaagaaagagagttagtttatgttttcaacaatttatttatggttgatcgaagaaaaagaagcaaaatta 6595655  T
Q  181 atagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||  || ||||   |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6595656 ataagggtatgttgataaagaaaaaattaatgtaattgaaaataacaaagggatcttctaaaaagggac 6595724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13138956 - 13138777
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaa-gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaag 163  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || | |||| |||||| |||||| ||||  | ||  || |||| | | |||||||    
T  13138956 gtattaaatatgtttgtaattattattgttttttcaattatatcttttacgagatagagttggtttatatttta-acataatatttatcgttaattgaag 13138858  T
Q  164 aaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||| ||||| ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  13138857 aaaaatatgtaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgagtcttataaaaa 13138777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 53910425 - 53910317
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | |  ||||||||||||||||    
T  53910425 cctctgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgagaattaagaaagttgatatttgcattaaagttgtttcaagtttttattgtttttacaat 53910326  T
Q  103 tttatcctt 111  Q
    |||||||||    
T  53910325 tttatcctt 53910317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18879665 - 18879545
Alignment:
Q  127 tttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac 226  Q
    ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  18879665 tttatgttttcaacatgttatttattgatgatagaagaaagaaatgtataataaataagagtatgtaggtaaagaaataattaa--tagttggaaatagc 18879568  T
Q  227 aaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  18879567 aaaggggacttataaaaagggac 18879545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 207
Target Start/End: Original strand, 19596271 - 19596390
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  19596271 tattgcttttacaattttatccttaagagagatagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataatgg 19596370  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataat 207  Q
     ||||  ||||| |||||||    
T  19596371 tatgttagtaaataaataat 19596390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 55841363 - 55841261
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    |||||||||||||||| || ||||||   ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  55841363 tccgtccctaattatagga-ccttttaaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 55841265  T
Q  105 tatc 108  Q
    ||||    
T  55841264 tatc 55841261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 706773 - 706659
Alignment:
Q  68 ttaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaa 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||  | |||||| |||||  | ||| ||||||    
T  706773 ttaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagatagataattagtttatgtttttaacatgctatttattatttattaaagaaa 706674  T
Q  167 aagatgtataataaa 181  Q
    || ||||||||||||    
T  706673 aatatgtataataaa 706659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 181
Target Start/End: Original strand, 729844 - 729958
Alignment:
Q  68 ttaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaa 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||  | |||||| |||||  | ||| ||||||    
T  729844 ttaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagatagataattagtttatgtttttaacatgctatttattatttattaaagaaa 729943  T
Q  167 aagatgtataataaa 181  Q
    || ||||||||||||    
T  729944 aatatgtataataaa 729958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 249
Target Start/End: Original strand, 11469142 - 11469227
Alignment:
Q  164 aaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  11469142 aaaaatatgtataataaataggggtatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 11469227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11522319 - 11522234
Alignment:
Q  164 aaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  11522319 aaaaatatgtataataaataggggtatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 11522234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 38319805 - 38319726
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgta 82  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38319805 cctccgtcactaattataggacccttatgctaaaatcacatgaattaagaaagtgagtatttgtattaaagttgtttgta 38319726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 249
Target Start/End: Original strand, 24073023 - 24073117
Alignment:
Q  155 tgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24073023 tgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatataattggaaataccaaagggatcttataaaaagggac 24073117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 214
Target Start/End: Original strand, 49613990 - 49614115
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || |  || ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  49613990 tattgtttttacaattttatccttga-agagagagttattttatattttcaatgtagtatttaatgttgagtgaagaaaaagatgtagaataaatagggg 49614088  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgta 214  Q
     ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  49614089 tatgttggtaaagaattaatgaatgta 49614115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 50352550 - 50352484
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgta 67  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50352550 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgta 50352484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2406093 - 2405965
Alignment:
Q  46 attaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgc 144  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| | |||   || |    
T  2406093 attaagaaaattgatatttgtattatagttgtttgtaatc---actgtttttacaattttatcctttaagagataaagttattttatatcttcgtaatac 2405997  T
Q  145 tacttattgctgattgaagaaaaagatgtata 176  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2405996 tatttattgttgattgaaaaaaaagatgtata 2405965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 24072227 - 24072347
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||  ||||| ||||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | ||| |||||||||||    
T  24072227 cctccgtccctaaatatatgagccttttgaaaaaattacggagattaagaaagttggttgtggtattaaatttgtatataattactatggtttttacaat 24072326  T
Q  103 tttatccttaagagagagagt 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24072327 tttatccttaagagagagagt 24072347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Original strand, 50621486 - 50621618
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtt-tgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |  | |||||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||    
T  50621486 tccgtccctaaatataggaaccttttgccaaaattacggagattaataaagttggttgtagtattaaatttgtactataattattattgtttttacaatt 50621585  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgtttt 136  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  50621586 ttatccttaaaaaagagagttaatttatgtttt 50621618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 7776689 - 7776902
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||||||| |||| || |||||||| |||||  |||  ||||| ||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  7776689 cctcagtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaaaaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 7776788  T
Q  103 tttatccttaagag----agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaa 198  Q
    ||||||||||||||    ||||||| | ||||||||||| ||||  || ||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||   |||    
T  7776789 tttatccttaagagagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgtcgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttgctaa 7776887  T
Q  199 agaaataattaatgt 213  Q
    ||||||| |||||||    
T  7776888 agaaatatttaatgt 7776902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10497593 - 10497416
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaa 167  Q
    |||| |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||  | ||  || ||| || |||||||||||||    
T  10497593 taaatttgtttataattactattatttttacaattttatcctttaagagagaagactagtgtatgtttttaacatagtatttaatgttgattgaagaaaa 10497494  T
Q  168 agatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
     ||| || ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  | ||||||||||||    
T  10497493 ggatataaaataaataggggtatgttggtaaagaactaattaatgtatttggaaaaaccaaatagatcttataaaaag 10497416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 55969130 - 55969070
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgta 67  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  55969130 cgtccctatatataagatcattttgctaaaatcaccggaattaagaaagttgatatttgta 55969070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2738879 - 2738832
Alignment:
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2738879 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtattataaaaagggac 2738832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 38319711 - 38319656
Alignment:
Q  189 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  38319711 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagctcttataaaaa 38319656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 130
Target Start/End: Original strand, 27009626 - 27009715
Alignment:
Q  44 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagt-tgtttgtaatc-attattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagttta 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  27009626 gaattaagatagtggatatttatattaaaatatgtttgtaatttactattgtttttacaattttatcctttaagagagaaagttggttta 27009715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 38613547 - 38613458
Alignment:
Q  155 tgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  38613547 tgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaa 38613458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 246
Target Start/End: Original strand, 26169770 - 26169941
Alignment:
Q  75 tgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgt 173  Q
    ||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||| || | | ||||||||||||||||||| | ||| || |||||| || |||||||||| ||| |    
T  26169770 tgtttgttatcacaattatttttacagttttatcctttaaaaaaaagagttagtttatgttttcaacatgata-ttattgttgtttgaagaaaatgatat 26169868  T
Q  174 ataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||  |  ||| | ||||| |||||||||||   ||||||||||  |||| |||  ||||||||||    
T  26169869 ataataaatatggttatgaaggtaaataaataattaattgtgttggaaatagaaaagaggttctataaaaagg 26169941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 184
Target Start/End: Original strand, 26186510 - 26186626
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc-cttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaa 167  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| | | | || |||||| |||| ||||||||    
T  26186510 taaagttgtttgtaatcacaattatttttacagttttatcatttaagaaaaagagtaagtttatgttttcaacaagatatttattgttgatcgaagaaaa 26186609  T
Q  168 agatgtataataaatag 184  Q
      || ||||||||||||    
T  26186610 taatatataataaatag 26186626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 240
Target Start/End: Original strand, 50622483 - 50622575
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata 240  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || |  ||||||||||||||||| || || |||||| |||||  ||||||||    
T  50622483 ttattgttgattgaagaaaaggatgtaaaataaataatggtatcttggtaaagaaataattaatatatttagaaataccaaagatgtcttata 50622575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 55967998 - 55967928
Alignment:
Q  170 atgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata 240  Q
    |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||    
T  55967998 atgtataataaatagatacgtgtatataaagaaataattaatgtagttgaaaataataaatgagtcttata 55967928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 122
Target Start/End: Original strand, 2507662 - 2507719
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagag 122  Q
    |||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2507662 gtattaaatttgtatataattattattgattttacaattttatccttaagtgagagag 2507719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Original strand, 42596088 - 42596137
Alignment:
Q  20 aagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtatt 69  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42596088 aagatccttttaccaaaatcacgagaattaagaaagttgatatttgtatt 42596137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7205284 - 7205194
Alignment:
Q  157 attgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||| ||||||| |||||  |||||||| || || |  |||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  7205284 attgtagaaaaatatgtaatataaataggggtatattggtaaagaaataattaatgtacttg-aaatttgaaaggggtcttataaaaaggga 7205194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 7326074 - 7326133
Alignment:
Q  164 aaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 223  Q
    ||||| ||||||||||||||  |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7326074 aaaaatatgtataataaataaggatatgtaggtaaagaaatcattaatgtagttggaaat 7326133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15496232 - 15496177
Alignment:
Q  194 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15496232 tgtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaagggac 15496177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 245
Target Start/End: Original strand, 22130323 - 22130498
Alignment:
Q  74 ttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatg 172  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||  ||| | ||||||||| | ||  || ||| || |||||||||||||||||     
T  22130323 ttgtttgtaattataattgtttt-acaattttatctttgaagagagaggattattgtatgttttcaacatagtatttaatgttgattgaagaaaaagata 22130421  T
Q  173 tataataa----atagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    || |||||    |||| || ||||  ||||| || |||||||| || | |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  22130422 taaaataattaaataggggtatgttagtaaacaactaattaatatactaggaaatactaaagaggtcttataaaaag 22130498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 6753528 - 6753558
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6753528 tccctccgtccctaattataagatccttttg 6753558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 17610054 - 17610024
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17610054 tccctccgtccctaattataagatccttttg 17610024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 24754081 - 24754111
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24754081 tccctccgtccctaattataagatccttttg 24754111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 111
Target Start/End: Original strand, 54158710 - 54158756
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt 111  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  54158710 gtattaaatttgtttgtaattactattatttttacaattttatcctt 54158756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5733932 - 5733832
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||  ||||| | ||||||||||||| | || |   ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5733932 cctctgtccttaattataggacccttttga-aaaataatgggaattaagaaaattgaaaggggtaataaatttgtttgtaattattattgtttttacaat 5733834  T
Q  103 tt 104  Q
    ||    
T  5733833 tt 5733832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 7698378 - 7698423
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  7698378 taattaatgtacttggaaacatcaaaggggtcttataaaatgggac 7698423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 39144407 - 39144436
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatcctttt 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39144407 tccctccgtccctaattataagatcctttt 39144436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 3085450 - 3085478
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3085450 cctccgtccctaattataagatccttttg 3085478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #231
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 13620886 - 13620858
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620886 cctccgtccctaattataagatccttttg 13620858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #232
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 246
Target Start/End: Original strand, 19839887 - 19839939
Alignment:
Q  194 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19839887 tgtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaagg 19839939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 20286053 - 20286025
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20286053 cctccgtccctaattataagatccttttg 20286025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #234
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20286311 - 20286251
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgt 77  Q
    ||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  20286311 tataagacctttttgctaaaattatggaaattaagaaagtgcatatttgttttaaaattgt 20286251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #235
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 26889931 - 26889903
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26889931 cctccgtccctaattataagatccttttg 26889903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #236
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 28298403 - 28298375
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28298403 cctccgtccctaattataagatccttttg 28298375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #237
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 36901142 - 36901114
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36901142 cctccgtccctaattataagatccttttg 36901114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #238
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 39114919 - 39114891
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39114919 cctccgtccctaattataagatccttttg 39114891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #239
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 47683094 - 47683122
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47683094 cctccgtccctaattataagatccttttg 47683122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #240
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 51788077 - 51788017
Alignment:
Q  36 aatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttt 96  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||| ||||    
T  51788077 aatcacggaaattaagaaagttgatatttatattaatgttctttgaaatcactattttttt 51788017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #241
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 54623806 - 54623834
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54623806 cctccgtccctaattataagatccttttg 54623834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 65381 - 65629
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  65381 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 65480  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  65481 attttatccttaagagagagaattagtttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaag 65580  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  65581 aaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 65629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 121)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8743476 - 8743233
Alignment:
Q  6 ccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttt 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8743476 ccgtccctaattataagacccttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttt 8743377  T
Q  106 atccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8743376 atccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 8743277  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743276 attaatgtacttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 8743233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 9388532 - 9388782
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9388532 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 9388631  T
Q  101 attttatccttaagag--agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaa 198  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9388632 attttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaa 9388731  T
Q  199 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9388732 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 9388782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 23397882 - 23398129
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23397882 tccctccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 23397981  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23397982 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaag 23398081  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23398082 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 23398129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1779787 - 1780035
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1779787 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaattacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttaca 1779886  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1779887 atattatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 1779986  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1779987 aaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 1780035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34741760 - 34741512
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34741760 tccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtcaatatttgtattaaagttgtttttaatcactattgtttttaca 34741661  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34741660 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtaggtaaag 34741561  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34741560 aaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 34741512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 345158 - 344911
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatca----ttattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||    
T  345158 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacaggaattaagaaagcagatatttatattaaagttgtttgtaatcactacgtattgtttttaca 345059  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  345058 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaag 344959  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  344958 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 344911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6418165 - 6417924
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6418165 tccctccgtccctaattataagacctttttgttaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattggttttaca 6418066  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    ||||||||    
T  6418065 attttatccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatagaggc----atgtaaag 6417970  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6417969 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 6417924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15287428 - 15287190
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15287428 tccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatctctattgtttttacaattt 15287329  T
Q  105 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15287328 tatccttaatatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatatataataaatag-gacatgtatgtaaagaaat 15287230  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15287229 aattaatgtagttggaaataacaaatggatcttataaaaa 15287190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 34301574 - 34301823
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34301574 tccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 34301673  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34301674 attttatcctttaagaaagaaggttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 34301773  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34301774 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 34301823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11847866 - 11847617
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  11847866 tccctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 11847767  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  11847766 attttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaa 11847667  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11847666 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 11847617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25197447 - 25197199
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25197447 tccctcagtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 25197348  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25197347 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttaattattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaa 25197248  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25197247 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaaggga 25197199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6147676 - 6147429
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6147676 cctccgtccctatatataagaccattttgccaaaatcaagggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 6147577  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6147576 tttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 6147477  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6147476 aataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 6147429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 25024248 - 25024494
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25024248 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 25024347  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
     |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25024348 tttttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 25024447  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  25024448 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaaggatcttataaaaagg 25024494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 20449925 - 20450172
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  20449925 cctccgtccctaattaaaggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttgacaat 20450024  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20450025 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaaga 20450124  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20450125 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 20450172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 287156 - 287405
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  287156 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 287255  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  287256 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 287355  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  287356 gaaataactgatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 287405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 345492 - 345737
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  345492 ctccgtccttatatataagactcttttgctaaaatcatgggaattaaaaaattcgatatttatattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaatt 345591  T
Q  104 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  345592 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctggttgaagaaagagatgtataataaataggcgcatgtatgtaaagaaa 345691  T
Q  204 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    || |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||    
T  345692 tagttaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataagaagggac 345737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30248942 - 30248693
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30248942 tccctccgtcactatatataagacccttttgccaaaatcccgggaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 30248843  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30248842 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggtgcatgtatgtaaa 30248743  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30248742 gaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 30248693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33488126 - 33487881
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33488126 tccctccgtccctatatataagacctttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 33488027  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33488026 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaa 33487927  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33487926 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaag 33487881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 34915291 - 34915534
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34915291 cgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattgagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 34915390  T
Q  107 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34915391 tcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaata 34915490  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34915491 attaatgtagttggaaatagcaaaggggacttataaaaagggac 34915534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 31149992 - 31150237
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  31149992 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtttatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 31150091  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31150092 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 31150190  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31150191 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 31150237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 12105806 - 12106055
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||| |||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12105806 tccctccgtctctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattatttttaca 12105905  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12105906 attttattctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaa 12106005  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12106006 gaaataattaatttagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 12106055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 13647871 - 13648120
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  13647871 tccctccgtcccttattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 13647970  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13647971 attttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatttataataaataggggcatgtatgtaaa 13648070  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13648071 gaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggac 13648120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Original strand, 18105921 - 18106158
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18105921 gtccctatatataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaaattgtttgtaatcactgttgtttttacaattttat 18106020  T
Q  108 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataat 207  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | || |||||||||||||||    
T  18106021 ccttaagagagaaagttagttcatattttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatagggacgtgcatgtaaagaaataat 18106120  T
Q  208 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18106121 taatgtacttggaaataacaaaagggtcttataaaaag 18106158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9342131 - 9341884
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  9342131 cctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaat 9342032  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||  ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9342031 tttatcctttaagaaagaaggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 9341932  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  9341931 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaaggac 9341884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 31487115 - 31487362
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  31487115 cctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 31487214  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31487215 ttaatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 31487314  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  31487315 aataattaatgtagttggaaattgcaaaggggtcttataaaaaaggac 31487362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13866886 - 13866641
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  13866886 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 13866787  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |  || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13866786 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacttgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaa 13866688  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13866687 ataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggac 13866641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8175934 - 8175712
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    ||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8175934 tataagacccctttgctaaaattgcgggaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttcaaga 8175835  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||      ||||| |||    
T  8175834 gagagagttagtttatgttttccatatactatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaag------ttaatatag 8175741  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8175740 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 8175712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 10195736 - 10195985
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10195736 tccctccgtccttatatataagacccttttgtcaaaatcacgagaattaacatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 10195835  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10195836 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaaaatatataataaataatggcatgtatgtaaa 10195935  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10195936 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaagagggac 10195985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3177448 - 3177232
Alignment:
Q  26 cttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtta 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3177448 cttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgcattaaagttgtttgtaaccactattttttttacaattttatccttaagagagag--tta 3177351  T
Q  126 gtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 225  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  3177350 gttcatattttccatatgatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtacgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatag 3177251  T
Q  226 caaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  3177250 caaagggatcttataaaaa 3177232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15498920 - 15498675
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  15498920 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 15498821  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15498820 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 15498722  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  15498721 ataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaaagggac 15498675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2090948 - 2090705
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2090948 cgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 2090849  T
Q  107 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    ||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2090848 tcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaata 2090749  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  2090748 attaatgtagttggaaatagaaaagggatcttgtaaaaagggac 2090705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 402367 - 402612
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |    
T  402367 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagt 402466  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  402467 tttatccttta-agagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 402565  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  402566 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 402612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8670426 - 8670181
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  8670426 cctccgtccctaattatagtacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 8670327  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8670326 tttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 8670228  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8670227 ataattaatgcagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 8670181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 17175207 - 17175453
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17175207 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 17175306  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    |||||||| || |||| ||| |||| |||||||||||  | ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17175307 attttatcttttaagaaagaaagttggtttatgttttgaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaa 17175406  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17175407 gaaataattaatgttgttggaaataacaaatggatcttataaaaagg 17175453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1729845 - 1730093
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaa-tcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttac 99  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  1729845 tccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttac 1729944  T
Q  100 aattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    |||||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1729945 aattttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaa 1730043  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1730044 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggac 1730093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 22852090 - 22852322
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22852090 tataagacccttttgctaaaattatgggtattaagaaagtggatatttgt-ttaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagag 22852188  T
Q  117 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattg-aagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22852189 agagagttagtttatatttttcatatactatttattgctgattgaaaaaaaaaaatgtataacaaatagggacatgtatgtaaataaataattaatgtag 22852288  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  22852289 ttggaaatagcaaagagatcttataaaaagggac 22852322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 925677 - 925924
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  925677 tccctccgttcctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 925776  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  925777 attttatccttta-agagagaattgttttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaag 925875  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  925876 aaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggac 925924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5457688 - 5457461
Alignment:
Q  20 aagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagag 118  Q
    |||| |||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  5457688 aagacccttttgtcaaaatcatgagaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaag 5457589  T
Q  119 agagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 218  Q
    |  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5457588 aaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 5457489  T
Q  219 gaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  5457488 aaaataacaaaggggtcttataaaaagg 5457461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 25045387 - 25045634
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  25045387 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 25045486  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| |||   |||||||||| | ||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25045487 tttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 25045586  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25045587 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 25045634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 230849 - 231097
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  230849 tccctccgtccctatatttaagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 230948  T
Q  101 attttatc-cttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||  |||||| | |  |||||||||||||||| | ||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  230949 attttatcttttaagaaataaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgactgaagaaaaagatgtataataaatacgggcatgtaggtaaa 231048  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  231049 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaa-tggtcttataaaaagggac 231097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7772469 - 7772222
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  7772469 cctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgtgaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 7772370  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7772369 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 7772270  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  7772269 aataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaatggac 7772222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 19097546 - 19097792
Alignment:
Q  2 ccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||    
T  19097546 ccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaa 19097645  T
Q  102 ttttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||||||| | ||||||| || |||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  19097646 ttttatccttta-agagagaattggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatataaaga 19097744  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19097745 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggac 19097792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 244
Target Start/End: Original strand, 15966907 - 15967148
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaatt-aagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15966907 tccgtccctaattataagtttcttttgaaaaaataacgagaatttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 15967006  T
Q  104 ttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15967007 ttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaa 15967106  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15967107 ataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 15967148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1147011 - 1147258
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||| |||| |||||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  1147011 tccctctgtccttaattataggacccttttgaaaaaacaacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 1147110  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1147111 attttatccttta-agagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaag 1147209  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1147210 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggac 1147258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12144072 - 12143825
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||    
T  12144072 tccctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattgtttttaca 12143973  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12143972 attttatccttta-agagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattaaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaag 12143874  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12143873 aaataattaatatagttgaaaatagcaaaggggttttataaaaagggac 12143825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 19418873 - 19419115
Alignment:
Q  8 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 107  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19418873 gtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 19418972  T
Q  108 cctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataa 206  Q
    |||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19418973 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaagagatgtacaataaatagggacatgtatgtaaagaaataa 19419072  T
Q  207 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19419073 ttaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggac 19419115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16122546 - 16122302
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  16122546 cctccgtccctaattataagacccttttga-aaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaat 16122448  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16122447 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaaga 16122348  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  16122347 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaggg 16122302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 17227272 - 17227519
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  17227272 cctccgtctttaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattgaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 17227371  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||  ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17227372 tttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 17227471  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  17227472 aataattaatgtagttagaaatagaaaataggtcttataaaaagggac 17227519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 16272712 - 16272957
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  16272712 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaat 16272811  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | | | ||||||  ||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16272812 tttatccttta-acaaagagttgatttttgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 16272910  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16272911 ataattgatgtagttggaaatagcaaaggggtcttttaaaaagggac 16272957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31091736 - 31091491
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  31091736 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 31091637  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||    
T  31091636 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaaaaaa 31091538  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  31091537 ataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggac 31091491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34126434 - 34126187
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||| ||| |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  34126434 tccctccgtccttaaatataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 34126335  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||| || | ||||||| || |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  34126334 attttatctttta-agagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggtatgcatgtaaag 34126236  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||    
T  34126235 aaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagccttataaaaagggac 34126187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 13010864 - 13011107
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  13010864 cctccgtccctaattacaaagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatgactattgtttttacaat 13010963  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| |||   |||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13010964 tttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 13011063  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| | || ||||||||||    
T  13011064 aataattaacgtagttggaaatagaaaatgagttttataaaaag 13011107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23604755 - 23604512
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| | | ||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  23604755 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtgaatatttgtattagatatgtttgtaattactattgtttttacaat 23604656  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||||| || ||||||||||||| | |||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||    
T  23604655 tttatcttttaagagagagagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtgtaataaataagggcatatatgtaaaga 23604556  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23604555 aataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaag 23604512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 11656174 - 11656337
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatcctta--agagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||      
T  11656174 tattgtttttacaattttatccttatgagagagagagttggtttatgttttccatatgctatttattgtttattgaagaaaaagatgtataataaataaa 11656273  T
Q  186 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11656274 agcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 11656337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 15355300 - 15355541
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15355300 cctccgtccctaattataggg-ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgtttttacaat 15355398  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  |||||||||| | ||| || |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  15355399 tttatcctttaagagagagaattaaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaag- 15355497  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15355498 aataattaatgtagttgaaaatagcaatggggtcttataaaaag 15355541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15126742 - 15126510
Alignment:
Q  17 tataagatcc-ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaaga 115  Q
    |||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |    
T  15126742 tataagatcccttttgtcaaaattacgggaattaagaaagtg-atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttcatcctt--ta 15126646  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaag--aaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 213  Q
    |||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15126645 gagagaattggtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgtagaaaaaaaaatctataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatat 15126546  T
Q  214 agttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||    
T  15126545 agttgaaaatagcaaagaagtcttatcaaaagggac 15126510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 23578201 - 23578414
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  23578201 aaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttggtttatg 23578300  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||| || |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |     
T  23578301 ttttcaacatgttatttatttttgattaaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttgaaaataacaaatga 23578400  T
Q  233 gtcttataaaaagg 246  Q
     |||||||||||||    
T  23578401 atcttataaaaagg 23578414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32615279 - 32615035
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||||||  |||||||||| |||||||||| | |||| |  ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  32615279 cctccgtctctaattatatgactcttttgtcaaaatcacggaaattaagaaaattgataataatattaaatttgtttataattactattgtttttacaat 32615180  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| || |||  |||||||||    
T  32615179 tttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataggggtatggttgtaaagaa 32615081  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32615080 ataattaatgtaattggaaataacaaacgggacttataaaaaggga 32615035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 6418397 - 6418643
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |  |  ||||||| |||| |  ||| | |||||||||||||||    
T  6418397 cctccgtccctaaatataggagccttttgctaaaatcacggagattaagaaagttggttgtaatattaaatttgtataaaattactattgtttttacaat 6418496  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  6418497 tttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 6418596  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6418597 ataattaatgtacttgaaaatatcaaagaggtcttataaaaagggac 6418643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33773871 - 33773628
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatt 103  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  33773871 ctccgtctctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaatt 33773772  T
Q  104 ttatccttaa---gagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||| || |   |||||||||||  ||||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  33773771 ttatcatttaagagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtagag 33773672  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  33773671 aaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtattataaaaa 33773628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 390592 - 390369
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 124  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |    
T  390592 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatttttaagagagaga--t 390495  T
Q  125 agtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 223  Q
      ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  390494 gatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtataattaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaat 390395  T
Q  224 aacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    | |||||  |||||||||||||||||    
T  390394 agcaaagatgtcttataaaaagggac 390369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20373326 - 20373123
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  20373326 cctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 20373227  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||    
T  20373226 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgcatataaagaa 20373128  T
Q  203 ataat 207  Q
    |||||    
T  20373127 ataat 20373123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 249
Target Start/End: Original strand, 5576180 - 5576367
Alignment:
Q  59 atatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 158  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||    
T  5576180 atatttgtattgaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttta-agtgagagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgat 5576278  T
Q  159 tgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||  | |||||||||||| ||||    
T  5576279 tgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaatagcaa--gagtcttataaaaatggac 5576367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 13690480 - 13690723
Alignment:
Q  7 cgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta 106  Q
    |||||||||||||||| | |||||   ||||| |  |||||||||| | || |||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13690480 cgtccctaattataaggttcttttaaaaaaataagaggaattaagataatgaatatttatattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaatttta 13690579  T
Q  107 tcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    || || |||| |||| ||| | ||||||||||   ||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13690580 tcttttaagaaagagggttggcttatgttttcatcattatatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 13690679  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||    
T  13690680 attaatgtagttggaaatagaaaataagtcttataaaaagggac 13690723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4175534 - 4175288
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |  |  ||||||| |||| |  ||| | |||| ||||||||||    
T  4175534 cctccgtccctaaatataggagccttttgctaaaatcacggagattaagaaagttggttgtaatattaaatttgtataaaattactattatttttacaat 4175435  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||| ||    
T  4175434 tttatccttaagagagagagttaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaa 4175335  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4175334 ataattaatgtatttggaaatatcaaagaggtcttataaaaagggac 4175288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 9660506 - 9660668
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  9660506 tattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaaaatgtataataaataggg 9660605  T
Q  187 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  9660606 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaaggac 9660668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 245
Target Start/End: Original strand, 31711625 - 31711835
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    ||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||  | |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |  ||||| |    
T  31711625 aaaataacaggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattagtattgtatttacaattttattcttta-agagagagatgatttatat 31711723  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 233  Q
    |||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  31711724 tttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatatataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaaggga 31711823  T
Q  234 tcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||    
T  31711824 tcttataaaaag 31711835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 22998790 - 22999036
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  22998790 cctccctccctaaatataagagccttttgtcaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 22998889  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||| ||    
T  22998890 tttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataa 22998989  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  22998990 ataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggac 22999036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23789614 - 23789368
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  23789614 cctccctccctaaatataagagccttttgtcaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 23789515  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||| ||    
T  23789514 tttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataa 23789415  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  23789414 ataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggac 23789368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29036369 - 29036258
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29036369 tccctccgtccctatatataagatccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 29036270  T
Q  101 attttatcctta 112  Q
    ||||||||||||    
T  29036269 attttatcctta 29036258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 236027 - 235825
Alignment:
Q  25 ccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagt 123  Q
    |||||||  ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || |||||| | | |    
T  236027 ccttttgtcaaaatcacgtgagttaagaaagtttatatttgtattaaaattgttcgtaatcactattgtttttacaattttgtcatttaagagaaata-t 235929  T
Q  124 tagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 223  Q
    |||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  235928 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg--gaaaaaaatgtataataaataggggtatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 235831  T
Q  224 aacaaa 229  Q
    ||||||    
T  235830 aacaaa 235825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9038934 - 9038688
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| || | | |||| | ||||||||||| |    
T  9038934 tccctccgtccctaaatataggagtcttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttctatataattactattgtttttata 9038835  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||  || ||||  ||||||    
T  9038834 attttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaa--atgcaaaataaataagggtatgttggtaaag 9038737  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9038736 aaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggac 9038688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13901899 - 13901689
Alignment:
Q  35 aaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgt 133  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||||| |||| ||  || | ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13901899 aaatcacgggaattaaaaaagttggtattactattaaatttgtatgctat-actattgtttttacatttttatcctttaagagaaagagttagtttatgt 13901801  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 233  Q
    |||| | ||| || || ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  13901800 tttcgaaatgatatttcttgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaatatgggtatgttggtaaagaaataattaatataattggaaataccaaagggg 13901701  T
Q  234 tcttataaaaag 245  Q
    |||| |||||||    
T  13901700 tcttgtaaaaag 13901689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 8217466 - 8217710
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  8217466 cctccgtccctaaatatatgaaccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 8217565  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  |  ||||  ||||||||    
T  8217566 tttatcctta--agagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataaggatatgttggtaaagaa 8217663  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  8217664 ataattaatgtacttgaaaataccaaaagagtcttataaaaatggac 8217710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Original strand, 13321076 - 13321317
Alignment:
Q  6 ccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttt 105  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||    
T  13321076 ccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaatttt 13321175  T
Q  106 atccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaata 205  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||  || |||||| |  ||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||    
T  13321176 atccttaagagagatagtaaatttatgttttcaatataatatttattg-tttttgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaata 13321273  T
Q  206 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  13321274 attaatgtacttggaaacacgaaaggggtcttataaaaagggac 13321317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27581616 - 27581437
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |   || |||||| ||||||||||    
T  27581616 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaaga 27581517  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||| | ||||||||  |  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  27581516 aaaagatgcaaaataaataaagatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaagagatcttataaaaa 27581437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11162121 - 11161897
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagag--agagtt 124  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||| | |  | |||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11162121 ttttgcaaaaattacggaaattaagaaagttggttgtagtattaaatttctatgtaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagtt 11162022  T
Q  125 agtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 224  Q
    | ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || | ||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  11162021 aatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtacgttggtaaagaattaattaatgtacttgtaaata 11161922  T
Q  225 acaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     |||| |||||||||||||| ||||    
T  11161921 ccaaaagggtcttataaaaaaggac 11161897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 215
Target Start/End: Original strand, 17952175 - 17952316
Alignment:
Q  75 tgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgt 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17952175 tgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacaatctatttattgctgattgaagaaaaaaatgt 17952274  T
Q  174 ataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17952275 ataataaatagggacatgtatgtaaaaaaatatttaatgtag 17952316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29036258 - 29036171
Alignment:
Q  162 agaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29036258 agaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttataaaaagggac 29036171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22710471 - 22710312
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  ||    
T  22710471 tattgtttttacaattttatccttaagagagag--ttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataaggg 22710374  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     || |  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  22710373 tattttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagggtcttataaaaagggac 22710312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 28980600 - 28980847
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | |||||| |||||  |||  |||||||||||   |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  28980600 cctccatccctaaatataagagctttttgccaaaattgcggagattaagaaagttagttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 28980699  T
Q  103 tttatccttaagagagagag--ttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||   | ||||  ||||||    
T  28980700 tttatccttgagagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagagtatgttggtaaag 28980798  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28980799 aaataattaatttacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggac 28980847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 5186264 - 5186368
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttag 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  5186264 ttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtaaatatttctattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttagaaatttatccttaagagagagagtttg 5186363  T
Q  127 tttat 131  Q
    |||||    
T  5186364 tttat 5186368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 240
Target Start/End: Original strand, 9299245 - 9299411
Alignment:
Q  74 ttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatg 172  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||  | ||| || |||||| |||||||||||||| |||    
T  9299245 ttgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaacagagatagtttgtttatgttttaaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatg 9299344  T
Q  173 tataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata 240  Q
    |||||||||||  || |||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  9299345 tataataaataagggtatg-ctggaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttata 9299411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14630115 - 14629950
Alignment:
Q  81 taatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 180  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||  || |||||| ||||| |||||||||||| | |||||    
T  14630115 taattattattatttttacaattttatccttaagagagaa--ttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaagatgcaaaataa 14630018  T
Q  181 atagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||  || ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  14630017 ataagggtatgttagtaaagaaataattaatctacttgaaaataccaaagaggtattataaaaaggga 14629950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11200801 - 11200640
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  ||    
T  11200801 tattgattttacaattgtatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataaggg 11200702  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     ||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||  |||| ||||||||| ||||    
T  11200701 tatgttggtaaagaattaattaatgtacttgtaaataccaacagggttttataaaaaaggac 11200640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Original strand, 28236010 - 28236192
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||| |    
T  28236010 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagaaagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaca 28236109  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||  ||| | ||||||||  || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||    
T  28236110 aaa--atgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaagtcttataaaaagggac 28236192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4823198 - 4823026
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaa 165  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||    
T  4823198 tattaaatttgtatgtaattactattgtttttataattttatccttaagag--agagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaa 4823101  T
Q  166 aaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 241  Q
    ||| ||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||||||||    
T  4823100 aaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaataccttaagggtcttataa 4823026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11104698 - 11104618
Alignment:
Q  169 gatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  11104698 gatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtattataaaaagggac 11104618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 84
Target Start/End: Original strand, 11655814 - 11655894
Alignment:
Q  4 ctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaat 84  Q
    |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11655814 ctccgtccctatatataagacccctttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaat 11655894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 241
Target Start/End: Original strand, 23282580 - 23282789
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag--agagagttagtttat 131  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| |  || |||| ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  23282580 aaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattaccattggttttacaattttatccttaagagaaagagagttaatttat 23282679  T
Q  132 gttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagg 231  Q
    |||||| ||||  || ||| || |||||||||||||| |   | ||||||||| || |||   || || || ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23282680 gttttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaataaacaaaataaataggggtatgatggtgaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaagg 23282779  T
Q  232 ggtcttataa 241  Q
    ||||||||||    
T  23282780 ggtcttataa 23282789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 33012410 - 33012656
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| ||||||| |||| ||  | ||||||||||| |  |||||||||||||| | || |  ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  33012410 cctccatccctaaatataggagtcatttgctaaaattataggaattaagaaagttggtagtaatattaaatttgtttataattaatattgtttttacaat 33012509  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  |  ||||   |||||||    
T  33012510 tttgtctttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataaagttatgttgataaagaa 33012609  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    || ||||| | | ||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  33012610 atgattaaggcacttgaaaatatcaaatgagtcttataaaaaaggac 33012656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23923698 - 23923538
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||  ||||  || |||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||    
T  23923698 tattgtttttacaattttatccttaa-aggtagagttagtatatgtttttaatataatatttatggttgattgaagaaaaatatgcaaaataaatagggg 23923600  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
     |||   ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  23923599 tatggtggtaaagaaatatttaatgtaattgaaaataccaaaagagtcttataaaaagggac 23923538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 249
Target Start/End: Original strand, 29293657 - 29293790
Alignment:
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||  ||||| ||||||||||||||     
T  29293657 gagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgatgaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtac 29293756  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  29293757 ttggaaataccaaaagggtcttataaaaatggac 29293790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 493509 - 493661
Alignment:
Q  87 ttattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtg 186  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||| || |||||||||||||| ||  | |||||| || |    
T  493509 ttattgattttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttaatgttgattgaagaaaaatatacaaaataaacaggg 493608  T
Q  187 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat 239  Q
    | |||   || || || ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  493609 gtatgatggtgaaaaattaattaatgcacttggaagtaacaaaggggtcttat 493661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27310662 - 27310480
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| | |   || |||||| ||||||||||    
T  27310662 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttataattttatccttaagagagat--ttaatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaaga 27310565  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| | ||||||||  || ||||    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||    
T  27310564 aaaagatgcaaaataaataaaggtatgttgacaaagaaataattaatgtatttggaaataccaaaggaatcttataaaaaaggac 27310480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 243
Target Start/End: Original strand, 8646015 - 8646190
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaa 167  Q
    |||| ||||||| ||| | |||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||  |  ||| || |||||||||||||    
T  8646015 taaatttgtttgcaattactattgtttttacaaatttgttctttaagaaagagagttagtgtatgttttcaatataatgtttaatgttgattgaagaaaa 8646114  T
Q  168 agatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 243  Q
    |||| || ||||||||| || |||   ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  8646115 agatataaaataaataggggtatggtggtaaaaaattaattaatgtacttggaaatagcaaatgagtcttataaaa 8646190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26211178 - 26211032
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaaga 115  Q
    |||||||  ||||||  |||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||    
T  26211178 tataagactcttttggcaaaatcactggaattaagagagttggtatttgtactaaagttgtttataatcactaatatttttacaattttatcctttaaga 26211079  T
Q  116 g--agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattg 160  Q
    |  ||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||    
T  26211078 gaaagagatttagtttatgttttcaacatgttatttattactgattg 26211032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 89
Target Start/End: Original strand, 9660138 - 9660224
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcatta 89  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  9660138 cctccgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattatta 9660224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13446213 - 13446001
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatca----ttattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagttt 129  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||| |    |||||||||||| |||||||| | |      ||||||||||||    
T  13446213 aaaatcacggaaattaacaaagtcgatattagtattaaatttgtttataattactacttattgtttttataattttattcat------gagagttagttt 13446120  T
Q  130 atgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgta-taataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaa 228  Q
    |||||||| ||||  || |||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||| || |||  |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13446119 atgttttcaatatagtatttattattgattgaagaaaaagatacagaaataaataggggtatgcttgtaa--aaataattaatgtaattggaaatatcaa 13446022  T
Q  229 aggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |   |||||||||||||||||    
T  13446021 aatagtcttataaaaagggac 13446001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11840544 - 11840417
Alignment:
Q  121 agttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| |||||| |||||||||| ||    
T  11840544 agttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagtaaaagatgtattataaacaggggtatgttcgtaaaaaaataactaatgtagtt-ga 11840446  T
Q  221 aataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| | || | |||||||||||||||||    
T  11840445 aatagctaaagtgtcttataaaaagggac 11840417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 17992281 - 17992163
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  17992281 cctccgtcactaaatatatgagccttttgctaaaattgcggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 17992182  T
Q  103 tttatccttaagagagaga 121  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  17992181 tttattcttaagagagaga 17992163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 137
Target Start/End: Original strand, 2746330 - 2746423
Alignment:
Q  45 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttc 137  Q
    |||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2746330 aattaaaaaaattgatagttgtaataaatttgtttgtaattattattgtttttacaaatttatcctttaagagagagaattagcttatgttttc 2746423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8595732 - 8595644
Alignment:
Q  95 tttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 183  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||  || | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8595732 tttacatttttatcgttaagagagtgagttagtttatgttttcaacataatattgattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaata 8595644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11104846 - 11104710
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgt---attaaagttgtttgtaatcattattgtttttac 99  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||   ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||   ||||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  11104846 cctccgtccctaattatagggtcattttaa-aaaataacggaaattaagatagtagatatttgttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttac 11104748  T
Q  100 aattttatc-cttaagagagagagttagtttatgtttt 136  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  11104747 aattttatcatttaagagagagaattggtttatgtttt 11104710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 241
Target Start/End: Original strand, 7847150 - 7847292
Alignment:
Q  95 tttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |  ||| |  |||||||||||||| ||  | ||||||||| || |||       
T  7847150 tttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatatagtttttaatattgattgaagaaaaatatacaaaataaataggggtatgatg 7847249  T
Q  195 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 241  Q
    ||   |||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7847250 gt---gaaa-aattaatgcacttggaaataacaaaggggtattataa 7847292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 244
Target Start/End: Original strand, 8637165 - 8637261
Alignment:
Q  148 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8637165 ttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaatgattaatatacttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaa 8637261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 13208842 - 13208914
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagtt 75  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||| |||||    
T  13208842 cctccttccctaattataagatctttttggcaaaatcacgtgaattaaaaaagttaatatttgtatttaagtt 13208914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 134
Target Start/End: Original strand, 2364478 - 2364545
Alignment:
Q  67 attaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgtt 134  Q
    |||||| |||| | |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2364478 attaaatttgtatataattactattatttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgtt 2364545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 225977 - 225920
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattg 92  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  225977 aaaatcacgggaatgaagaaatttgatatttg-attaaagttgtttgtaatcactattg 225920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 171
Target Start/End: Original strand, 6840082 - 6840183
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaa 168  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| | ||||||||| | ||  || ||| |||||||||||||||||    
T  6840082 taaatttgtttgtaattgctattgtttttacaattttatcc-tataagagagtgttaatgtatgttttcaacatattatttaatgctgattgaagaaaaa 6840180  T
Q  169 gat 171  Q
    |||    
T  6840181 gat 6840183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 8345460 - 8345401
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 124  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8345460 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatctttaagagagagagtt 8345401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Original strand, 17950490 - 17950556
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaa 72  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17950490 cctccgtccctaatta---gacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaa 17950556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 216
Target Start/End: Original strand, 32982442 - 32982580
Alignment:
Q  77 tttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtata 176  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||| | ||| |  || || |||| | |||||||||||||| |||||||    
T  32982442 tttgtaatcacaattatttttacaattttatctttt-gagggagagtaagtttatatattcaacgtgttatttatcggtgattgaagaaaaatatgtata 32982540  T
Q  177 ataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 216  Q
    |||||||  |  ||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  32982541 ataaataaggatatgtaggtaattaaataattaatatagt 32982580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 1730135 - 1730105
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1730135 tccctccgtccctaattataagatccttttg 1730105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 245
Target Start/End: Original strand, 2365030 - 2365080
Alignment:
Q  195 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  2365030 gtaaagaaataattagtgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaag 2365080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 229
Target Start/End: Original strand, 11211495 - 11211654
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat-gctacttattgctgattgaag 163  Q
    |||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| | | || |||||||||||| | || ||      ||| | |||||||    
T  11211495 gtattaaatttgtatataattattattgtttatacaattttatctttaacagacataatttgtttatgttttcaagatagc------ttgttaattgaag 11211588  T
Q  164 aaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    ||||||||||| |||||||||  | ||||   ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||    
T  11211589 aaaaagatgtaaaataaatagaagtatgttgataaagaaattattaatgtaattagaaataccaaa 11211654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 25197155 - 25197185
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25197155 tccctccgtccctaattataagatccttttg 25197185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 168
Target Start/End: Original strand, 2665541 - 2665641
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttta-tccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaa 167  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||   |||||| ||||||||| ||||  || ||| ||||  ||||||||||    
T  2665541 taaatttgtttgtaatcgctattgtttttacacttttattctttaagagagtaggttagtgtatgttttcaatatagtatttaatgctcgttgaagaaaa 2665640  T
Q  168 a 168  Q
    |    
T  2665641 a 2665641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 9341843 - 9341871
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9341843 cctccgtccctaattataagatccttttg 9341871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 229
Target Start/End: Original strand, 11278463 - 11278535
Alignment:
Q  157 attgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||   ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||    
T  11278463 attgaagaaaaagatgtaaaataaatagaagtatgttgataaagaaattattaatgtaattagaaataccaaa 11278535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 244
Target Start/End: Original strand, 13209989 - 13210037
Alignment:
Q  196 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||||||    
T  13209989 taaagaaataattaatatagttgaaaataacaacgtagtcttataaaaa 13210037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12358 - 12110
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12358 tccctccgtccctaattataaaacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 12259  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12258 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaag 12159  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12158 aaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 12110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 118128 - 117892
Alignment:
Q  12 ctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt 111  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  118128 ctaattataagactcttttgttaaaatcacgg-aattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt 118030  T
Q  112 aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  118029 aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaat 117930  T
Q  212 gtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117929 gtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 117892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 117851 - 117879
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  117851 cctccgtccctaattataagatccttttg 117879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0649 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0649
Description:

Target: scaffold0649; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 4040 - 4289
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4040 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 4139  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4140 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtcaa 4239  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4240 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 4289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 61595 - 61844
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  61595 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 61694  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  61695 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaatatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 61794  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  61795 gaaataattaatgtagttggaaataacataggggtcttataaaaagggac 61844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 31429 - 31678
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31429 tccctccgttcctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 31528  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    |||||||| || |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31529 attttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaa 31628  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31629 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 31678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0368
Description:

Target: scaffold0368; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8512 - 8264
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8512 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtntttaca 8413  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8412 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatat-tataataaataggggcatgtatgtaaa 8314  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8313 gaaataattaatgtagttggaaataacaatggggtcttataaaaagggac 8264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 51424 - 51673
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  51424 tccctccgtccctatatataagacccttttgcgaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcaccattgtttttaca 51523  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  51524 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatataaa 51623  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51624 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 51673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 6356 - 6601
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  6356 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 6455  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6456 tttatccttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 6554  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6555 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 6601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 6882 - 7131
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6882 tccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 6981  T
Q  101 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6982 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 7081  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  7082 gaattaattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaatggac 7131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18788 - 18542
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18788 cctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaat 18689  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18688 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgtatgtaaaga 18590  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  18589 aataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggac 18542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 258880 - 259113
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aaga 115  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  258880 tataagacccttttgtcaaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 258979  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  258980 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 259079  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  259080 ttggaaataacaaagagatcttataaaaagggac 259113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 24374 - 24617
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24374 tccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 24473  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  24474 attttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc--gtatgtaaa 24571  T
Q  200 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24572 gaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaag 24617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 164505 - 164260
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  164505 cctccgtccctaattataggatcgttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 164406  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  164405 tttattcttta-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 164307  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  164306 ataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggac 164260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5441 - 5196
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5441 cctccgtccctaat-ataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaat 5343  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5342 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataa-taggggcatgtatgtaaaga 5244  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  5243 aataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggac 5196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 9929 - 10174
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9929 cctccgtccctaat-ataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaat 10027  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10028 tttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataa-taggggcatgtatgtaaaga 10126  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  10127 aataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggac 10174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3730 - 3483
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  3730 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 3631  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||  | ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  3630 tttatcctttaagaaagagggttggattatgtttttaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaatcggggcatgcatgtaaaga 3531  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3530 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 3483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 9496 - 9714
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9496 tccctccgttcctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 9595  T
Q  101 attttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaa 199  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9596 attttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 9695  T
Q  200 gaaataattaatgtagttg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9696 gaaataattaatgtagttg 9714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 14107 - 14339
Alignment:
Q  17 tataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc-cttaaga 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  14107 tataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaaga 14206  T
Q  116 gagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 215  Q
     |||  |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  14207 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgta- 14305  T
Q  216 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14306 taggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 14339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 249
Target Start/End: Original strand, 5067 - 5277
Alignment:
Q  40 acgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttcc 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||||||||     
T  5067 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaagctgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttca 5166  T
Q  139 atatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtctta 238  Q
    | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5167 acatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtctta 5266  T
Q  239 taaaaagggac 249  Q
    |||||||||||    
T  5267 taaaaagggac 5277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 19705 - 19951
Alignment:
Q  5 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19705 tccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagaggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 19804  T
Q  105 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaa 203  Q
    ||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19805 tatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattcaatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 19904  T
Q  204 taattaatgtagttggaaata-acaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  19905 taattaatgtagttggaaatagaaaaagggatcttataaaaagggac 19951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0907 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0907
Description:

Target: scaffold0907; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Original strand, 4321 - 4565
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |    
T  4321 cctccgtccctaattatagggtctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagt 4420  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4421 tttatccttta-agagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 4519  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4520 ataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 4565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 3528 - 3774
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||    
T  3528 tccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactactgtttttaca 3627  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3628 attttatccttta-agagagaattgatttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaag 3726  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3727 aaat-attaatatagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 3774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 9171 - 9413
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  9171 cctctgtccctaattataacacccttttga-aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 9269  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||||| |||| |||| |||   |||| ||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9270 tttatcctttaagaaagagggttgacttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 9369  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  9370 aataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaag 9413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 9458 - 9430
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9458 cctccgtccctaattataagatccttttg 9430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34395 - 34176
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34395 cctccgtccctatatataaaacccttttgataaaattacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaat 34296  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||||||||| ||||| | | |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34295 tttatccttaagggaaagag--agtttatgtttttcatatcccatttattaatgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaa 34198  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaata 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34197 ataattaatgtagttggaaata 34176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45962 - 45717
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||||   ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  45962 cctccgttcctaattatagggcccttttcaaaaaacaacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 45863  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45862 tttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 45764  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  45763 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaatggac 45717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 355045 - 355292
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttaca 100  Q
    |||||||||| ||||||||| || | |||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||||||    
T  355045 tccctccgtctctaattataggaccattttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgttattactattgtttttaca 355144  T
Q  101 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaag 200  Q
    ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  355145 attttatccttta-agagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaggaaaattatgtataataaataggggcaagtatgtaaag 355243  T
Q  201 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  355244 aaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 355292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 4409 - 4654
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  4409 cctccgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattaatattgtttttacaat 4508  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4509 tttatccttta-agagagagatggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaa 4607  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  4608 ataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaatggac 4654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0883 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0883
Description:

Target: scaffold0883; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1982 - 1766
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  1982 aaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatg 1883  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1882 ttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaaggg 1783  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||    
T  1782 gtcttataaaaagggac 1766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45775 - 45559
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  45775 aaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatg 45676  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 232  Q
    ||||| | ||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45675 ttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaaggg 45576  T
Q  233 gtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||    
T  45575 gtcttataaaaagggac 45559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48946 - 48704
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||||||||    
T  48946 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatagatatttgtattaaatatgtttgtgattaatattgtttttacaat 48847  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  48846 tttatccttta-agagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattaatgtttgaagaaaaagatgtataattaataggagcatctatgtaaagaa 48748  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48747 ataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 48704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 94078 - 93831
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  | |||||||||||||||    
T  94078 cctccatccctaattataaggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaactactattgtttttacaat 93979  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    |||| |||| |||| |||| ||| |||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  93978 tttaacctttaagaaagagggttggtttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaaga 93879  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  93878 aataattaatgtagttgaaaataaaaaaggagttctataaaaagggac 93831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 103808 - 104049
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||| |||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||| | |||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||    
T  103808 cctccatccctaattataggaccattttgccaaaattacgggaattaaaaaaattgataatagtattaaatttgtttataattgctattgtttttacaat 103907  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||| || |||||||||| | || |||  | ||  ||  ||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||| || |||   ||||||||    
T  103908 tttatccttaaaagggagagttagtgtttggttt-aacataatatatattgttgattaaggaaaaagatgcaaattaaataggggtatggtggtaaagaa 104006  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||| |||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  104007 atatttaatgtaattgaaaatatcaaaggtttcttataaaaag 104049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Original strand, 156169 - 156391
Alignment:
Q  26 cttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtta 125  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  156169 cttttactaaaattatgggaattaaaaaagtagatatttgtactaaagttttttgtaatcactattgtttttacaattttatcctgaagagagagaatta 156268  T
Q  126 gtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa--ataattaatgtagttggaaat 223  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  156269 gtttatatttttcatatgctatttattactgattgaagaaaaatatgtataatgaatagggtcatctatgtaaagaaatataattaatgtggttgaaaat 156368  T
Q  224 aacaaaggggtcttataaaaagg 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  156369 aacaaacgggtcttataaaaagg 156391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5049 - 4808
Alignment:
Q  6 ccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaatttt 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||     
T  5049 ccgtccctaattataggatccttttaaaaaaataacgagagttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaattt- 4951  T
Q  106 atcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaat 204  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| ||||| | | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4950 atcctttaagagagagggttggtttttgttt-caacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataa-taggggcatgtatgtaaagaaat 4853  T
Q  205 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4852 aattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggac 4808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4789 - 4726
Alignment:
Q  186 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4789 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 4726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 290 - 531
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  290 cctccgtccctaattataggg-ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgtttttacaat 388  T
Q  103 tttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaaga 201  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  |||||||||| | ||| || |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  389 tttatcctttaagagagagaattaaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaag- 487  T
Q  202 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  488 aataattaatgtagttgaaaatagcaatggggtcttataaaaag 531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17756 - 17510
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| ||| |||| || | |||||| |||||  |||  ||||||||||| |||  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  17756 cctccgtccttaaatataggagcattttgccaaaattgcggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 17657  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  17656 tttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 17557  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17556 ataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggac 17510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 243
Target Start/End: Original strand, 32939 - 33148
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 133  Q
    |||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  32939 aaaatcgcggaaattaagaaagttggtatttctattaaagttctttgtaatcagtattgtttttacaattttatcctcaaaagagatagttagtttatgt 33038  T
Q  134 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 233  Q
    |||| | |   || |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||   |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||    
T  33039 tttcaacaatatatttattgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaataggggtatggcagtaaagaaataattaatgcagttagaaataccaaaatgg 33138  T
Q  234 tcttataaaa 243  Q
    ||||||||||    
T  33139 tcttataaaa 33148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 22119 - 22074
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt 111  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  22119 tattaaatttgtttgtaattattattatgtttacaattttatcctt 22074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 146
Target Start/End: Original strand, 13094 - 13213
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttag 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||    
T  13094 ttttgctaaaatcacggaaattaagaaagtaaatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatctttaagagagaggataag 13193  T
Q  127 tttatgttttccatatgcta 146  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13194 tttatgttttccatatgcta 13213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 249
Target Start/End: Original strand, 1302 - 1438
Alignment:
Q  113 agagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatg 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  1302 agagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaatcggggcatgtatgtaaagaaataattaacg 1401  T
Q  213 tagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  1402 tagttggaaatagcaaaggagtctcataaaaagggac 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 223
Target Start/End: Original strand, 8410 - 8545
Alignment:
Q  88 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  8410 tattgtttttacaattttatccttttaagagagagttggtttatgttatcaacatgttacttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataaggg 8509  T
Q  188 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8510 catgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 8545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Original strand, 13308 - 13443
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatcc-ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaa 101  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  13308 cctccgtccctaattata-gagccattttgaaaaaataacgtgaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaa 13406  T
Q  102 ttttatc-cttaagagagagagttagtttatgttttc 137  Q
    |||||||  ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  13407 ttttatcatttaagagagaaggttggtttatgttttc 13443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 84
Target Start/End: Original strand, 8082 - 8132
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaat 84  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8082 aaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaat 8132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Original strand, 13447 - 13486
Alignment:
Q  210 atgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13447 atgtagttggaaataacaaaggggtcgtataaaacgggac 13486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 246747 - 246502
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  |||  |||||||||||   |  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  246747 cctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttagttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 246648  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| | | | ||||||||  || ||||  ||||||||    
T  246647 tttatccttaaaagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-aagcaaaataaataagggtatgttggtaaagaa 246549  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  246548 ataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggac 246502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 248
Target Start/End: Original strand, 9531 - 9656
Alignment:
Q  123 ttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9531 ttagtttatgttttccatatgctatttattgctgatataagaaaaatgtgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 9630  T
Q  223 taacaaaggggtcttataaaaaggga 248  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  9631 tagcaaagaagtcttataaaaaggga 9656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 119
Target Start/End: Original strand, 9030 - 9144
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  9030 cctccgtcccta--tataagacccttttactaaaatcatgggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagt 9127  T
Q  103 tttatccttaagagaga 119  Q
    |||||||||||||||||    
T  9128 tttatccttaagagaga 9144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24500 - 24265
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||| | ||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  24500 cctccgtccctaattataggatcttttaga-aaaataatgggaattaagttaatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 24402  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||||||| |     || ||| |||||||||||| | ||| ||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    ||    
T  24401 tttatccttta-----ag-gttggtttatgttttcaacatgttatatattggcgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgt----aa 24312  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  24311 ataaataatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaaaggac 24265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18616 - 18481
Alignment:
Q  34 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatg 132  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||    
T  18616 aaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagggggtttgtttatg 18517  T
Q  133 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaa 168  Q
    ||||| | ||| |  |||||||||||||||||||||    
T  18516 ttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaa 18481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18191 - 18142
Alignment:
Q  175 taataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 224  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18191 taataaatagtgacatctatataaaaaaataattaatgtagttgaaaata 18142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 180
Target Start/End: Original strand, 40611 - 40789
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||||||||||||| |    |||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||||||||    
T  40611 cctccgtccctaattatagggcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttttattaaatatgtttgtaattactcttatttttacaat 40710  T
Q  103 tttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 180  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40711 tttattctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataa 40789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Original strand, 36172 - 36354
Alignment:
Q  65 gtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaaga 164  Q
    |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||| |    
T  36172 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagaaagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaca 36271  T
Q  165 aaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    |||  ||| | ||||||||  || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||    
T  36272 aaa--atgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaagtcttataaaaagggac 36354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 11407 - 11646
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    |||||||| |||| |||| || | |||||  ||||| ||||  ||||||||||| |||  | |||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||    
T  11407 cctccgtctctaaatataggagcattttgtcaaaattacggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaat 11506  T
Q  103 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaa 202  Q
    ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| | ||  || |||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||| ||    
T  11507 tttatacttaagagag-ga-ttaatttatgttttcaacataatatttattgtt-attgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttagtaaataa 11603  T
Q  203 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11604 ataattaatgtacttaaaaataccaaaggggtcttataaaaag 11646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2116 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2116
Description:

Target: scaffold2116; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 249
Target Start/End: Original strand, 1 - 52
Alignment:
Q  198 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 52  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 57 - 3
Alignment:
Q  1 tccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaag 55  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57 tccctccgtccctaaatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaag 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 133 - 11
Alignment:
Q  3 cctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaat 102  Q
    ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||||| | |  | |||||||| |||| | |||| | |||| ||||||||||    
T  133 cctccgtccttaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattatttttacaat 34  T
Q  103 tttatccttaagagagagagtta 125  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33 tttatccttaagagagagagtta 11  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47382 - 47226
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaa 167  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||  || ||| ||||| ||||||||||    
T  47382 taaatttgtttgtaatcgctattgtttttacccttttattctttaagagagtgagttagtgtatgttttcaatatagtatttaatgctggttgaagaaaa 47283  T
Q  168 agatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 224  Q
    | ||  | |||||||||  | ||||  |||||||| |||| |||||| ||| |||||    
T  47282 aaataaaaaataaataggagtatgttggtaaagaattaataaatgtacttgaaaata 47226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 95
Target Start/End: Original strand, 17502 - 17554
Alignment:
Q  43 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgttt 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17502 ggaattaagaaaatggatatttgcattaaagttgtttgtaatcactattgttt 17554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 56151 - 56051
Alignment:
Q  69 taaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaa 167  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||  || ||| ||||| ||||||||||    
T  56151 taaatttgtttgtaatcgctattgtttttacacttttattctttaagagagtgggttagtgtatgttttcaatatagtatttaatgctggttgaagaaaa 56052  T
Q  168 a 168  Q
    |    
T  56051 a 56051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 531 - 640
Alignment:
Q  27 ttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagag--agagagtt 124  Q
    |||||| ||||| || | |||||||| ||| |||| | |||||||| || | | |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||    
T  531 ttttgccaaaattaccgaaattaagatagttgatagtagtattaaatttatatataattactattgtttttacaattttgtccttaagagaaagatagtt 630  T
Q  125 agtttatgtt 134  Q
    ||||||||||    
T  631 agtttatgtt 640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 733 - 616
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaa 165  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||  ||||  || |||||| |||| ||||||    
T  733 tattaaatttgtttgtagttactattgattttacaattttatcctatat-gagagagttagtttttgtttttaatatagtatttattgttgatcgaagaa 635  T
Q  166 aaagatgtataataaatag 184  Q
    ||  ||||| |||||||||    
T  634 aacaatgtaaaataaatag 616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7197 - 7080
Alignment:
Q  66 tattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaa 165  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||  ||||  || |||||| |||| ||||||    
T  7197 tattaaatttgtttgtagttactattgattttacaattttatcctatat-gagagagttagtttttgtttttaatatagtatttattgttgatcgaagaa 7099  T
Q  166 aaagatgtataataaatag 184  Q
    ||  ||||| |||||||||    
T  7098 aacaatgtaaaataaatag 7080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 171
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2050
Alignment:
Q  40 acgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaa---gagagagagttagtttatgtttt 136  Q
    ||||||||||||||| | || | | ||| |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||| ||| ||||    
T  1916 acgggaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttatttgtaattactattgtttttacaattttattctttaagagagagagagttagtgtatatttt 2015  T
Q  137 ccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagat 171  Q
      | ||  || ||| || |||||||||||||||||    
T  2016 taacatagtatttaatgttgattgaagaaaaagat 2050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 245
Target Start/End: Original strand, 5457 - 5662
Alignment:
Q  40 acgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttcc 138  Q
    ||||||||||||||| | ||   | ||| |||| || |||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| ||||      
T  5457 acgggaattaagaaaattgaacgtggtaataaatttatttgtaattactattgcttttacaatttcattctttaagagagagagttagtgtatattttta 5556  T
Q  139 atatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagtggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtctta 238  Q
    | ||  || ||| || |||| ||||||||||||  | ||||||||| || ||||  |||||||| |||||||  || ||||||||  |||| |  |||||    
T  5557 acatagtatttaatgttgatcgaagaaaaagat-aaaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaaattacttggaaatcccaaatgaatctta 5655  T
Q  239 taaaaag 245  Q
    |||||||    
T  5656 taaaaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University