View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11168_high_10 (Length: 551)

Name: NF11168_high_10
Description: NF11168
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11168_high_10
NF11168_high_10
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (253-534)||(9455860-9456141)
chr1 (256-534)||(42817266-42817544)
chr1 (256-534)||(47667751-47668029)
chr1 (256-534)||(20391516-20391794)
chr1 (256-534)||(22670534-22670812)
chr1 (256-534)||(20779922-20780200)
chr1 (256-534)||(19706716-19706994)
chr1 (256-534)||(28135000-28135278)
chr1 (256-534)||(43802642-43802920)
chr1 (255-534)||(22612233-22612517)
chr1 (256-534)||(35930329-35930607)
chr1 (256-458)||(22234827-22235029)
chr1 (50-255)||(22852363-22852570)
chr1 (50-255)||(19818139-19818346)
chr1 (256-534)||(8727412-8727692)
chr1 (22-255)||(16969763-16969986)
chr1 (32-207)||(23478402-23478578)
chr1 (387-534)||(633814-633959)
chr1 (256-484)||(26923675-26923900)
chr1 (32-254)||(21983016-21983236)
chr1 (50-255)||(17495396-17495591)
chr1 (256-534)||(21881653-21881931)
chr1 (38-256)||(19957068-19957279)
chr1 (71-198)||(22051578-22051705)
chr1 (32-198)||(21017749-21017916)
chr1 (32-235)||(16153654-16153856)
chr1 (363-525)||(29096580-29096739)
chr1 (256-294)||(14482299-14482337)
chr1 (493-533)||(16435837-16435877)
chr1 (308-386)||(16435649-16435728)
chr1 (172-254)||(18934788-18934870)
[»] scaffold0264 (2 HSPs)
scaffold0264 (256-534)||(3952-4230)
scaffold0264 (256-490)||(10851-11085)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (256-534)||(130501-130779)
scaffold0001 (293-475)||(138471-138653)
scaffold0001 (256-291)||(141112-141147)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (256-534)||(21969080-21969358)
chr8 (256-534)||(27007794-27008072)
chr8 (256-534)||(27014937-27015215)
chr8 (256-534)||(28498240-28498518)
chr8 (256-534)||(12561870-12562148)
chr8 (256-534)||(22130886-22131164)
chr8 (255-534)||(45534550-45534829)
chr8 (256-534)||(26240231-26240509)
chr8 (255-534)||(27880764-27881044)
chr8 (255-534)||(28020945-28021225)
chr8 (256-534)||(25610941-25611220)
chr8 (256-534)||(8371530-8371808)
chr8 (255-534)||(22659771-22660050)
chr8 (255-530)||(2963217-2963490)
chr8 (357-534)||(21916524-21916701)
chr8 (256-487)||(36970023-36970253)
chr8 (256-519)||(6430692-6430952)
chr8 (33-253)||(19236839-19237059)
chr8 (33-253)||(19310023-19310243)
chr8 (50-255)||(14992072-14992276)
chr8 (274-533)||(18835119-18835374)
chr8 (256-534)||(20539674-20539953)
chr8 (256-340)||(21914310-21914394)
chr8 (255-336)||(21862146-21862227)
chr8 (174-254)||(19303939-19304018)
chr8 (256-434)||(8782188-8782365)
chr8 (256-323)||(12642210-12642277)
chr8 (27-213)||(8365785-8365975)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (256-534)||(18399851-18400129)
chr7 (256-534)||(18406835-18407113)
chr7 (256-534)||(48808773-48809051)
chr7 (255-534)||(19858868-19859147)
chr7 (256-534)||(15729498-15729776)
chr7 (256-534)||(30253885-30254163)
chr7 (256-534)||(2204298-2204577)
chr7 (256-534)||(8464746-8465024)
chr7 (256-534)||(18139615-18139895)
chr7 (256-534)||(19230634-19230913)
chr7 (256-534)||(10669179-10669456)
chr7 (256-534)||(47167136-47167413)
chr7 (256-533)||(18259402-18259678)
chr7 (256-534)||(34128322-34128598)
chr7 (282-534)||(41681250-41681502)
chr7 (255-534)||(28130308-28130586)
chr7 (22-253)||(1376636-1376869)
chr7 (271-530)||(19393705-19393963)
chr7 (261-534)||(14585913-14586191)
chr7 (317-534)||(15999791-16000007)
chr7 (321-534)||(2935846-2936056)
chr7 (51-226)||(9986841-9987017)
chr7 (256-376)||(22994055-22994176)
chr7 (256-526)||(42150363-42150626)
chr7 (256-534)||(3587657-3587934)
chr7 (32-256)||(9132052-9132276)
chr7 (256-534)||(22968697-22968975)
chr7 (250-332)||(48813743-48813825)
chr7 (363-534)||(24443604-24443772)
chr7 (259-533)||(15170307-15170581)
chr7 (256-397)||(24443932-24444074)
chr7 (256-532)||(31190722-31191000)
chr7 (271-335)||(25846379-25846443)
chr7 (491-534)||(25845753-25845796)
chr7 (491-534)||(25846172-25846215)
chr7 (258-322)||(5983259-5983324)
chr7 (164-254)||(11352187-11352279)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (256-534)||(16788818-16789096)
chr6 (256-534)||(1586385-1586663)
chr6 (256-534)||(22860165-22860443)
chr6 (256-534)||(13995220-13995498)
chr6 (256-534)||(18020118-18020396)
chr6 (256-534)||(27508624-27508903)
chr6 (256-534)||(27528210-27528489)
chr6 (256-534)||(14074227-14074505)
chr6 (256-534)||(8612664-8612940)
chr6 (256-458)||(13947501-13947704)
chr6 (256-534)||(5758758-5759034)
chr6 (255-519)||(17120741-17121003)
chr6 (18-253)||(18565360-18565596)
chr6 (256-534)||(20736605-20736882)
chr6 (22-252)||(17582746-17582977)
chr6 (32-253)||(12475952-12476174)
chr6 (256-534)||(19218179-19218454)
chr6 (32-255)||(24001600-24001824)
chr6 (256-404)||(14996859-14997007)
chr6 (256-534)||(22560461-22560740)
chr6 (256-528)||(4073320-4073595)
chr6 (114-251)||(10747309-10747446)
chr6 (326-534)||(21994406-21994613)
chr6 (36-250)||(20403442-20403654)
chr6 (32-183)||(19957339-19957491)
chr6 (135-227)||(10747457-10747549)
chr6 (256-332)||(21993711-21993786)
chr6 (257-434)||(10359410-10359588)
chr6 (256-294)||(11248531-11248569)
chr6 (173-253)||(15935575-15935656)
chr6 (258-330)||(23846851-23846923)
chr6 (492-534)||(10359326-10359368)
chr6 (441-530)||(23846668-23846755)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (256-534)||(2676760-2677038)
chr4 (256-534)||(15461244-15461522)
chr4 (255-534)||(15814767-15815046)
chr4 (255-534)||(26531359-26531638)
chr4 (256-534)||(18111320-18111598)
chr4 (256-534)||(20243684-20243962)
chr4 (256-534)||(3369300-3369578)
chr4 (256-534)||(18162909-18163187)
chr4 (256-534)||(4676260-4676538)
chr4 (256-534)||(17300236-17300514)
chr4 (256-534)||(5870159-5870443)
chr4 (256-534)||(34975298-34975576)
chr4 (256-490)||(38816460-38816694)
chr4 (256-534)||(1941472-1941749)
chr4 (256-463)||(11484265-11484472)
chr4 (258-533)||(9487301-9487575)
chr4 (18-254)||(16835554-16835790)
chr4 (260-534)||(11420768-11421041)
chr4 (22-255)||(19584019-19584253)
chr4 (256-534)||(30040751-30041028)
chr4 (22-247)||(27919361-27919591)
chr4 (50-255)||(16586955-16587161)
chr4 (375-533)||(4545948-4546104)
chr4 (255-346)||(4545859-4545950)
chr4 (377-534)||(19365389-19365544)
chr4 (256-472)||(9537710-9537926)
chr4 (321-534)||(19362229-19362435)
chr4 (55-249)||(10492619-10492802)
chr4 (276-528)||(5528762-5529013)
chr4 (256-524)||(39422426-39422694)
chr4 (490-534)||(32636465-32636509)
chr4 (254-433)||(23056437-23056617)
chr4 (256-320)||(19361597-19361661)
chr4 (260-528)||(56515990-56516255)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (256-534)||(21033985-21034263)
chr3 (254-534)||(15846813-15847093)
chr3 (254-534)||(55426766-55427046)
chr3 (256-534)||(12299658-12299936)
chr3 (254-534)||(14890136-14890416)
chr3 (256-534)||(20147831-20148110)
chr3 (256-530)||(21398539-21398813)
chr3 (255-533)||(25979006-25979283)
chr3 (258-502)||(28087967-28088211)
chr3 (303-533)||(11787382-11787611)
chr3 (32-255)||(8943090-8943313)
chr3 (32-255)||(19455835-19456059)
chr3 (37-253)||(14281922-14282139)
chr3 (256-534)||(14146769-14147046)
chr3 (32-247)||(4847943-4848160)
chr3 (32-253)||(4854268-4854491)
chr3 (32-253)||(4876001-4876224)
chr3 (256-533)||(15526503-15526777)
chr3 (50-246)||(14636432-14636630)
chr3 (32-256)||(4830878-4831100)
chr3 (32-182)||(4872333-4872484)
chr3 (57-254)||(13606939-13607135)
chr3 (105-255)||(20246310-20246458)
chr3 (255-390)||(14225953-14226090)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (256-534)||(30174124-30174402)
chr2 (256-534)||(24250309-24250587)
chr2 (256-534)||(24229492-24229770)
chr2 (22-255)||(23662640-23662873)
chr2 (259-534)||(19616186-19616460)
chr2 (262-534)||(24763834-24764105)
chr2 (265-534)||(15342280-15342548)
chr2 (32-255)||(25906475-25906696)
chr2 (256-473)||(21626429-21626647)
chr2 (256-397)||(29800175-29800317)
chr2 (171-254)||(24374002-24374085)
chr2 (95-252)||(18595684-18595830)
chr2 (161-253)||(21071994-21072086)
chr2 (302-434)||(28719170-28719304)
chr2 (255-424)||(18852167-18852338)
chr2 (492-539)||(28719053-28719100)
chr2 (491-534)||(29800449-29800492)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (255-534)||(119476-119755)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (256-534)||(24933583-24933861)
chr5 (255-534)||(31645-31924)
chr5 (255-534)||(23545668-23545947)
chr5 (256-534)||(12789940-12790218)
chr5 (256-534)||(25805662-25805940)
chr5 (256-534)||(22940997-22941275)
chr5 (256-534)||(31096563-31096841)
chr5 (256-534)||(20940774-20941052)
chr5 (259-534)||(12765271-12765544)
chr5 (256-534)||(7865711-7865987)
chr5 (259-534)||(12704155-12704428)
chr5 (259-534)||(9812014-9812287)
chr5 (256-534)||(26244850-26245127)
chr5 (270-534)||(5097414-5097676)
chr5 (256-534)||(39535211-39535489)
chr5 (23-254)||(16739221-16739451)
chr5 (32-254)||(24129715-24129936)
chr5 (32-255)||(24670500-24670723)
chr5 (32-255)||(24707275-24707498)
chr5 (32-255)||(24740269-24740492)
chr5 (32-255)||(24753038-24753261)
chr5 (258-534)||(20100520-20100793)
chr5 (32-247)||(19126906-19127122)
chr5 (255-530)||(26129974-26130250)
chr5 (50-255)||(22441516-22441723)
chr5 (27-159)||(19765166-19765299)
chr5 (259-389)||(31652208-31652338)
chr5 (491-534)||(31267939-31267982)
chr5 (99-156)||(23987242-23987298)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (256-534)||(8052-8330)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (258-534)||(15100-15376)
[»] scaffold2089 (1 HSPs)
scaffold2089 (256-524)||(1-273)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (256-490)||(40015-40249)
[»] scaffold1121 (1 HSPs)
scaffold1121 (18-255)||(1557-1794)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (256-485)||(19160-19389)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (256-534)||(67651-67928)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (256-534)||(8847-9135)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (255-533)||(45226-45503)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (256-534)||(11807-12083)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (256-439)||(18786-18969)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (327-534)||(1-208)
[»] scaffold1948 (1 HSPs)
scaffold1948 (256-464)||(961-1169)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (256-445)||(76307-76496)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (255-534)||(40265-40543)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (255-409)||(9515-9669)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (271-534)||(13226-13489)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (35-254)||(63732-63952)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (256-534)||(53521-53790)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (256-389)||(33927-34060)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (19-255)||(86287-86528)
[»] scaffold1485 (1 HSPs)
scaffold1485 (32-253)||(496-719)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (32-254)||(13945-14173)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (22-254)||(41910-42148)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (32-255)||(41925-42150)
[»] scaffold0520 (1 HSPs)
scaffold0520 (22-254)||(7124-7358)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (256-376)||(13740-13861)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (315-468)||(26413-26567)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (50-253)||(20130-20336)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (99-254)||(1795-1948)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (256-534)||(8479-8756)
[»] scaffold0783 (1 HSPs)
scaffold0783 (255-313)||(6226-6284)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (58-235)||(6954-7136)
[»] scaffold1400 (1 HSPs)
scaffold1400 (256-305)||(1826-1875)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (191-255)||(12718-12782)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (53-234)||(96654-96837)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (447-534)||(83292-83377)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 253 - 534
Target Start/End: Original strand, 9455860 - 9456141
Alignment:
Q  253 tcgtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatat 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9455860 tcgtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatat 9455959  T
Q  353 ttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9455960 ttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 9456059  T
Q  453 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456060 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 9456141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 42817544 - 42817266
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817544 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 42817445  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817444 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 42817345  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817344 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 42817266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 47668029 - 47667751
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47668029 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 47667930  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47667929 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 47667830  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47667829 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 47667751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 20391794 - 20391516
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391794 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgagaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 20391695  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391694 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 20391595  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391594 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20391516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22670812 - 22670534
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670812 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 22670713  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670712 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 22670613  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670612 aatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22670534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 20780200 - 20779922
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20780200 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttatatttatcttatgtatcatgacttttattattgtataatatatggcactctttattatattta 20780101  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20780100 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 20780001  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20780000 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20779922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19706994 - 19706716
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19706994 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcactctttattatattta 19706895  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19706894 aacaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctta 19706795  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19706794 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19706716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 28135278 - 28135000
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135278 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 28135179  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  28135178 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatctttaagaacgctattatta 28135079  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28135078 aatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagacaattatgtatgtagactgatg 28135000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 43802920 - 43802642
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43802920 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacatatcttatgtatcatgacttttaatattgaataatatatgacactctttattatattta 43802821  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43802820 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaattatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctta 43802721  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43802720 aatgtattcgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 43802642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 255 - 534
Target Start/End: Original strand, 22612233 - 22612517
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaa-taatatatggcactctttattatatt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22612233 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaaataatatatggcactctttattatatt 22612332  T
Q  354 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22612333 tagataatgttaataaagtccttagaatagaaagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 22612432  T
Q  454 taaatgtatc----cgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||| |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22612433 taaatatatatattcgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22612517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 35930329 - 35930607
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35930329 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtataatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 35930428  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35930429 gataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatatattaagtgcgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctta 35930528  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35930529 aatgtatccgtagtcaaaactttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatatagactgatg 35930607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 256 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 22235029 - 22234827
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22235029 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 22234930  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22234929 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 22234830  T
Q  456 aat 458  Q
    |||    
T  22234829 aat 22234827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Original strand, 22852363 - 22852570
Alignment:
Q  50 aattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttag 148  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||    
T  22852363 aattgaagaattaaatagagtttgcaatcaattgatctaagcaaattatatgaaacctaattcaatgaattagattaattttcaataaaaaacaacttag 22852462  T
Q  149 atcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg-aagagagataacaccaatatttttata 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22852463 atcaacactagcaattatcctaacatttattcaattaatcacatgcaatagtcaaaagtaaagaggatagggaaagagagataacaccgatatttttata 22852562  T
Q  248 gtagttcg 255  Q
    ||||||||    
T  22852563 gtagttcg 22852570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Original strand, 19818139 - 19818346
Alignment:
Q  50 aattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttag 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | |||  |||| |||| ||||||    
T  19818139 aattgaagaattgaatagattttgcaatcaattgatctaagcaaattatgtgaaacctaactcaatgaattagattgattttcaatgataaactacttag 19818238  T
Q  149 atcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg-aagagagataacaccaatatttttata 247  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19818239 atcaacactagaaattaacctaacaattattcaattaatcacatgcaatagcataaagtaaagaggatagggaaagagagataacaccgatatttttata 19818338  T
Q  248 gtagttcg 255  Q
    ||||||||    
T  19818339 gtagttcg 19818346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 8727412 - 8727692
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtta-aacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattata-tt 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||  |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8727412 tgttggtgtaagccctagaggccaatggtttatgttataacttatattacatatcataacatttactattaaataatatatggcactctttatcatactt 8727511  T
Q  354 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 453  Q
       |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | || |||||| ||||||    
T  8727512 gttataatgttaataaagtccctagaataaat-tttcgtgtaattttatattaagtgtgactaaatcataagattactttaacataaagaacgttattct 8727610  T
Q  454 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat--aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
     |||| |||| ||||||||| |||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8727611 gaaatctatctgtagtcaaa-ctttaatatgaattgagataataataataaagcgtcgagactattatctatgtagactgatg 8727692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16969986 - 16969763
Alignment:
Q  22 ctattaattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattattaaaacctaattcaatgaattag 121  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  16969986 ctatcaattgaaaacacaatgtatatggaattgagtaattgaatagaatttgcactcaattgatctaagcaaattataaaaacctaattcaacaaattag 16969887  T
Q  122 attaacttttgat-gaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||            |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16969886 attaacttttgatggaaaaacaacttagatcaataaaag------------caattattcaattaatcacatgcaataatgaaaagtaaagaggataggg 16969799  T
Q  221 -aagagagataacaccaatatttttatagtagttcg 255  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16969798 aaagagagataacaccgatatttttatagtagttcg 16969763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23478578 - 23478402
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  23478578 aaaacacaatacatgtgaaattgaagaagtgaatagattttgcaatcaattgatctaggcaaattatctgaaacctaattcaatgaactagattattttt 23478479  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagt 207  Q
       |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23478478 cagtgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagttaaaagt 23478402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 387 - 534
Target Start/End: Original strand, 633814 - 633959
Alignment:
Q  387 gttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaa 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  633814 gttcgtgtaataatatattaagtgtaacttaatcatgagattaaattatcataaagaacattatttttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaa 633912  T
Q  487 taaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  633913 t-aaggataataacaaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 633959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 256 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 26923900 - 26923675
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||| || | || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  26923900 tgttggtgtaagtcccaaagtccattaggttatgttaaacttatcttatgtatca---cttttattattaaataatatatgacactctttattatatttg 26923804  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
     | | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| | || | || | |||||||    
T  26923803 tagtgatgttaataaagtttctagaatagatagttcgtgtaattgtatattgagtgtgacttaatcattagattacattaacataaataatgttattctt 26923704  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatg 484  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26923703 aaatgtatccgtagtc-aagctttaatatg 26923675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21983236 - 21983016
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaactttt 131  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21983236 aaaacacaatgcatatggaattgaagaattgaatagaaattgaactcaattgatctaaggtgattactaaaatctaattcaacgaattaggttaactttt 21983137  T
Q  132 gatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataa 231  Q
    || ||||||| ||||||||||| |  |||   ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  21983136 gacgaaaaacaacttagatcaatataagtttctatcctaacaattattcaattaa-cgtatgtaataatcgaaagtaaataggataggg-agatagataa 21983039  T
Q  232 caccaatatttttatagtagttc 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  21983038 caccgatatttttatagtagttc 21983016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Original strand, 17495396 - 17495591
Alignment:
Q  50 aattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttag 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||| || ||||||    
T  17495396 aattgaagaattgaatagattttgcaatcaattgatctaagcaaattatatgaaacctaattcaatgaatcagattaattttcagtgaaacacaacttag 17495495  T
Q  149 atcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggata-gggaagagagataacaccaatatttttata 247  Q
    |||||||||||            |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17495496 atcaacactag------------caattattcaattaatcacatgcaatggtaaaaagtaaagaggataggggaagaaagataacaccgatatttttata 17495583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21881931 - 21881653
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatat--ggcactctttattatatt 353  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  21881931 tgttggtgtaagctctataggtcaatagtttatcttaaacttttgctacgtatcatgacttttattattgaataatatatatggcatt-tttattatatt 21881833  T
Q  354 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 452  Q
    |    |||  | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||   ||||||||| | | ||||||||||||||||||||   || |||| || ||||    
T  21881832 tgttgtaagataaataaagtccagagaatagatagttcgtgtgatggaatattaagtgttaattaatcatgagattacattaatgtaaagaatgcaattc 21881733  T
Q  453 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  21881732 ttaaatgtatccgtagtc-aatctttaatataaat-taggataatgataaagtgtcaagactattatttatgtagaccgatg 21881653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 256
Target Start/End: Original strand, 19957068 - 19957279
Alignment:
Q  38 caatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttct-aagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatga 136  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||  ||| | | ||||| ||| || |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||    
T  19957068 caatgcatatggaattgaagaactgaatagaaattgaactgaattgatcttaaacaaattattaaaacctaattcgttgg------ttaacttttgatga 19957161  T
Q  137 aaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataacacca 236  Q
    ||| ||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19957162 aaacccacttagatcaatacaagctactatcctaacaattattcaattaa-catatgtaataatgaaaagtaaggaggataaggaagagagataacacca 19957260  T
Q  237 atatttttatagtagttcgt 256  Q
    ||| ||||| ||||||||||    
T  19957261 ata-ttttaaagtagttcgt 19957279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 198
Target Start/End: Original strand, 22051578 - 22051705
Alignment:
Q  71 ttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcct 169  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22051578 ttgcaatcaattgatctaagcaaattgtatgaaacctaattcaatgaattagattaattttcaatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcct 22051677  T
Q  170 aacaattattcaattaatcatatgcaata 198  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22051678 aacaattattcaatt-atcacatgcaata 22051705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21017916 - 21017749
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    |||||||||||||   | |||||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  21017916 aaaacacaatgcaagtgtaattgaagaattgattagacttagcaatcaattgatctaagcaaattgtgtaaaacctaattcaatgaattaggttaatttt 21017817  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaata 198  Q
      ||||||| | ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  21017816 caatgaaaagcaacttagatcaacactaacaattaacctatcaattattcaattaatcacaagcaata 21017749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16153856 - 16153654
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaactttt 131  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||   ||| || |||||| || |||  || || ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  16153856 aaaacacatggcatatgcaattgaagaattgaatagtaattgaaaccaattgatccaaggtaagtactaaaatctaattcaaagaattaaattaaatttt 16153757  T
Q  132 gatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataa 231  Q
     || |||||| ||||||||||| || |||   ||  |||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16153756 tatcaaaaacaacttagatcaatacaagtttctactctaacaattaatcaattaa-catatgcaacaattgaaagtaaagaggataaggaagagagataa 16153658  T
Q  232 cacc 235  Q
    ||||    
T  16153657 cacc 16153654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 363 - 525
Target Start/End: Original strand, 29096580 - 29096739
Alignment:
Q  363 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtat 462  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||   ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |  | |||||  |||||||||| ||||    
T  29096580 ttaataaagtccctagaatagatagttcatgtgatggaatattaagtgtgacttaatcgtaagattacattaacaaaaagaactttattcttaaaagtat 29096679  T
Q  463 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgt 525  Q
      |||||| ||||||| ||||  ||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29096680 atgtagtc-aagcttt-atatatatcga-gataataataaagcgtagagactattatgtatgt 29096739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 294
Target Start/End: Original strand, 14482299 - 14482337
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaa 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14482299 tgttagtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaa 14482337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 533
Target Start/End: Original strand, 16435837 - 16435877
Alignment:
Q  493 ataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 533  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16435837 ataataataaagcgtagagactaatatgtatgtagactgat 16435877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 386
Target Start/End: Original strand, 16435649 - 16435728
Alignment:
Q  308 tcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattata-tttagataatgttaataaagtccttagaatagata 386  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  | || ||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  16435649 tcatgacttttattattaaataaaatgagacattctttattatattttatataagattaataaagttcttagaatagata 16435728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 254
Target Start/End: Original strand, 18934788 - 18934870
Alignment:
Q  172 caattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagaga-taacaccaatatttttatagtagttc 254  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||  || |||| ||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18934788 caattaatcaattaa-catatacaactatcaaaattaaagaggataaggaaaagagaatgacaccaatatttttatagtagttc 18934870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 2)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4230 - 3952
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4230 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 4131  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4130 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 4031  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4030 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 3952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 256 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 11085 - 10851
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11085 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 10986  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10985 gataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 10886  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10885 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 10851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 130779 - 130501
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130779 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 130680  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130679 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 130580  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130579 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 130501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 293 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 138653 - 138471
Alignment:
Q  293 aacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  138653 aacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcactctttattatatttatataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgt 138554  T
Q  393 gtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagc 475  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  138553 gtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagc 138471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 141147 - 141112
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141147 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtt 141112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 21969080 - 21969358
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969080 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 21969179  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969180 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 21969279  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969280 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 21969358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27008072 - 27007794
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27008072 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 27007973  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007972 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 27007873  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007872 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 27007794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27015215 - 27014937
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015215 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 27015116  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015115 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 27015016  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015015 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 27014937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 28498240 - 28498518
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28498240 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 28498339  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28498340 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 28498439  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28498440 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 28498518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 12561870 - 12562148
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12561870 tgttggcgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 12561969  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12561970 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 12562069  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12562070 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12562148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22131164 - 22130886
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131164 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcgtgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 22131065  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131064 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 22130965  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130964 aatttatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22130886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 255 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 45534829 - 45534550
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45534829 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 45534730  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45534729 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaatgctattctt 45534630  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45534629 aaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 45534550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 26240231 - 26240509
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26240231 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 26240330  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26240331 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctta 26240430  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26240431 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaagataataataaagcgtcgagactattatgtatgaagactgatg 26240509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 255 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27881044 - 27880764
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27881044 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattt 27880945  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880944 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 27880845  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880844 aaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 27880764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 255 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 28021225 - 28020945
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021225 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattt 28021126  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021125 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 28021026  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021025 aaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 28020945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 25610941 - 25611220
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25610941 tgtttgtgtaagccctaggggcaaatagtttatgataaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactccttattatattta 25611040  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt- 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25611041 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttagagaacgctattctta 25611140  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611141 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 25611220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 8371808 - 8371530
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8371808 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatgtatgacactctttattatattta 8371709  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  8371708 gataatgttaataaagtccttagaatagataattcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaataacactattctta 8371609  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8371608 aatgtgtctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcatcgagactattatgtatgtagactgatg 8371530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 255 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22660050 - 22659771
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22660050 gtgttggtgtaagtccaaaaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 22659951  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22659950 atataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 22659851  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22659850 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcaagactattatgtatgtagactgatg 22659771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 255 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 2963490 - 2963217
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2963490 gtgttggtgtaagccctagatgccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactttttattatattt 2963391  T
Q  355 aga-taatgtt-aataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 452  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  2963390 atagtaatgtttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 2963291  T
Q  453 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 530  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2963290 ttaaatgtattcgt-gtcaaa-ctttaatataatt--aggataataataaagcgtagagactattatgtatgtagact 2963217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 357 - 534
Target Start/End: Original strand, 21916524 - 21916701
Alignment:
Q  357 ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916524 ataatgttaataaagtccttagaatagataattcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaa 21916623  T
Q  457 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916624 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 21916701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 256 - 487
Target Start/End: Original strand, 36970023 - 36970253
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36970023 tgttggtgtaagcccta-aggccaatagtttatgttaaatttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgatactctttattatattta 36970121  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||    
T  36970122 tagtaatgttaataaagtccctagaatagatagttcatgtaataatatattatgtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgttgttctt 36970221  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat 487  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36970222 aaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat 36970253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 256 - 519
Target Start/End: Original strand, 6430692 - 6430952
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttatt-attgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6430692 tgttggtgtaagctctagagaccaatagtttacgttaaatttatcttatgtatcataacttttatttattaaataatatatgacactctttattatattt 6430791  T
Q  355 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 453  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  6430792 atagtaatgttaataaagtccttataatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgactta---atgagattacattatcataaataacactattct 6430888  T
Q  454 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattat 519  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6430889 taaatgtattcgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattat 6430952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19237059 - 19236839
Alignment:
Q  33 aaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttct-aagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaactttt 131  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||  ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19237059 aaacacaatgcatatggaattgaagaatttaatagaaattgaactcaattgatcttaagcaaattattaaaacctaattcaacgaattaggttaactttt 19236960  T
Q  132 gatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataa 231  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19236959 gatgaaaaacaacttagatcaatacaagctactatcctaaaaattattcaattaa-catatgcaataatgaaaagtaaagaggatagggaagagagataa 19236861  T
Q  232 caccaatatttttatagtagtt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19236860 caccaatatttttatagtagtt 19236839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19310243 - 19310023
Alignment:
Q  33 aaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttct-aagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaactttt 131  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||  ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19310243 aaacacaatgcatatggaattgaagaatttaatagaaattgaactcaattgatcttaagcaaattattaaaacctaattcaacgaattaggttaactttt 19310144  T
Q  132 gatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataa 231  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19310143 gatgaaaaacaacttagatcaatacaagctactatcctaaaaattattcaattaa-catatgcaataatgaaaagtaaagaggatagggaagagagataa 19310045  T
Q  232 caccaatatttttatagtagtt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19310044 caccaatatttttatagtagtt 19310023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Original strand, 14992072 - 14992276
Alignment:
Q  50 aattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttag 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||     
T  14992072 aattgaagaattgaatagattttgcaatcaatttatctaagcaaattatatgaaacctaattcaatgaattagattaattttcaatgaaaaacaacttat 14992171  T
Q  149 atcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataacaccaatatttttatag 248  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  14992172 atcaacactagtaattattctataaattattcaattaatcacatgaaatagtaaaaaataaagaggatagggaagagagataacac--tgatttttatag 14992269  T
Q  249 tagttcg 255  Q
    |||||||    
T  14992270 tagttcg 14992276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 274 - 533
Target Start/End: Original strand, 18835119 - 18835374
Alignment:
Q  274 aggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttag-ataatgttaataaagt 372  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  18835119 aggcgaatagtttatgttaaacttattttatttatcatgacttttgttattaaataatatatgacaatttttgttatatttgttataatgttaataaagt 18835218  T
Q  373 ccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaa 472  Q
     ||||||||||||||||   | | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || | |||| ||||||||||| |||| ||||||      
T  18835219 tcttagaatagatagtt---gcagtagtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaaaaacgttattcttaaatatatctgtagtc-c 18835314  T
Q  473 agctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 533  Q
    |||||||||||| ||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18835315 agctttaatatggattga-aataataataaagcatcgagactattatgtatgtagactgat 18835374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 20539953 - 20539674
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattat-attt 354  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||     
T  20539953 tgttggtgtaagccattgagaccaatagtttatgttaaacttgtgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgacattctttattataattg 20539854  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
       |||  |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||   ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||||| |||||||    
T  20539853 ttgtaagattaataaagtccatagaatagatagttcat-taatggaatattaagtgtgacttaatcatgtgattacattaacataaagaacgttattctt 20539755  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat--aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||  ||  ||||| ||||||||||| | |||    |  ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  20539754 aaatacatttgtagt-aaagctttaatgtaaattgggataataataataaagcgcatagacgattatgtatgtagactgatg 20539674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 256 - 340
Target Start/End: Original strand, 21914310 - 21914394
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcac 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21914310 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcac 21914394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 255 - 336
Target Start/End: Original strand, 21862146 - 21862227
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21862146 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatg 21862227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19304018 - 19303939
Alignment:
Q  174 attattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataacaccaatatttttatagtagttc 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19304018 attattcaattaa-catatgcaataatgaaaagtaaagaggatagggaagagagataacaccgatatttttatagtagttc 19303939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 8782365 - 8782188
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattat-attt 354  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| || ||||| ||||| || |||||||||| |||     
T  8782365 tgttggtgtaagccctataggtcaatagtttatgttaaacttatattatgtatcattac-tttatt-tttaataaaatatgtcattctttattataattg 8782268  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacatta 434  Q
       |||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||   ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  8782267 ttgtaagattaataaagtccttaaaatagatagttaatgtgatggaatattaaatgtgacttaatcatgggattacatta 8782188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 323
Target Start/End: Original strand, 12642210 - 12642277
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattat 323  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||    
T  12642210 tgttggtgtaagccctagaagcctatagtttatgttaaacttacgttgtgtatcatgacttttattat 12642277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 213
Target Start/End: Original strand, 8365785 - 8365975
Alignment:
Q  27 aattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaa-ttattaaaacctaattcaa-tgaatt-agat 123  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||| || |||| ||||| || ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||| ||||    
T  8365785 aattgaaaacacaatacacatgaaattgaataattgaattgatatttcaattaattgatccaagtaaaattgttttaacctaaatcaaatgaatttagat 8365884  T
Q  124 taa-cttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagag 213  Q
    ||| |||||||  ||| || ||||| ||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  8365885 taatcttttgagaaaacacaacttatatcaacactagcaattctctaatcaattattcaattaatcaagtgcaatattgaaaagtaaagag 8365975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 18399851 - 18400129
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18399851 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18399950  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18399951 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 18400050  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18400051 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18400129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 18406835 - 18407113
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18406835 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18406934  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18406935 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 18407034  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407035 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18407113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 48809051 - 48808773
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48809051 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 48808952  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808951 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 48808852  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808851 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 48808773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 255 - 534
Target Start/End: Original strand, 19858868 - 19859147
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858868 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 19858967  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858968 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtttaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 19859067  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859068 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataacaaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19859147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 15729498 - 15729776
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15729498 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 15729597  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15729598 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacactattctta 15729697  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15729698 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15729776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 30253885 - 30254163
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30253885 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttataatattta 30253984  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30253985 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagatcgctattctta 30254084  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30254085 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 30254163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 2204298 - 2204577
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2204298 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatgacactctttattatattta 2204397  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204398 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 2204497  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204498 aatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 2204577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 8464746 - 8465024
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464746 tgttggtgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgaatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 8464845  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8464846 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctta 8464945  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8464946 aatgtatccgtagtcgaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgacgagactattatgtatgtagactgatg 8465024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18139895 - 18139615
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18139895 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacctttattattgaataatatatgacactctttattatattta 18139796  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18139795 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgttattctta 18139696  T
Q  456 a--atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18139695 aatatatatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18139615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 19230634 - 19230913
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19230634 tgttggtgtacgccctagaggccaatagttaatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 19230733  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19230734 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtaacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctt 19230833  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230834 aaatgtatccgtagtcaaaacattaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19230913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 10669456 - 10669179
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10669456 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 10669357  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  10669356 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatataataagtgtgacttaatcatcagattacattatcataaagaacgttattctt 10669257  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10669256 aaatgtatccgtagtc-aatcttt-atattaataaatgataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 10669179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 47167413 - 47167136
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  47167413 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatgtgacactctttattatattta 47167314  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  47167313 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgactttatcatgagattacattatcataaagaacgttattctt 47167214  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47167213 aaatgtatttgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 47167136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 256 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 18259678 - 18259402
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18259678 tgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18259579  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  18259578 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacattattctt 18259479  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 533  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18259478 aaatgtatccatagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaatcgtcgagagtattatgtatgttgactgat 18259402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 34128322 - 34128598
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34128322 tgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 34128421  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||    
T  34128422 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacattattttt 34128521  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34128522 aaatgtatccgtagt-taagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagattattatgtatgtagactgatg 34128598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 282 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 41681502 - 41681250
Alignment:
Q  282 agtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaat 381  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41681502 agtttatattaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatataacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttggaat 41681403  T
Q  382 agatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaat 481  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41681402 agatagtttatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattactttatcttatagaatgttattcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaat 41681303  T
Q  482 atgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41681302 atgaataaaggataataataaagctttgagactattatgtatgtagactgatg 41681250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 255 - 534
Target Start/End: Original strand, 28130308 - 28130586
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  28130308 gtgttggtgtaagccctatatgccaatagtttatgttgaacttatcttatgtatcataacttttattattgaatagtatgtgacactctttattatattt 28130407  T
Q  355 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 453  Q
    | | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  28130408 ataataatgttaatgaagtccttataatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaaaaacgctattct 28130507  T
Q  454 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28130508 taaatgtatctgtagtc-aagctttaatatgaat-aaggataataataaagcgtcgagactattatgcatgtagactgatg 28130586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1376869 - 1376636
Alignment:
Q  22 ctattaattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaatta 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1376869 ctatcaattgaaaacacaatgcatatgaaactgaagaattgaatagatgttgcaatcaattgatctaagcaaattaggtaaaacctaattcaatgaatta 1376770  T
Q  121 gattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggata-gg 219  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||  |||| ||    
T  1376769 gattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaactattcaattaatcacatgcaatagtaaaaagtaaaggtgataggg 1376670  T
Q  220 gaagagagataacaccaatatttttatagtagtt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1376669 gaagagagataacaccaatatttttattgtagtt 1376636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 271 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 19393963 - 19393705
Alignment:
Q  271 tagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataa 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |  | ||||||||||||    
T  19393963 tagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgatactctttattatatctgtagtaatgttaataa 19393864  T
Q  370 agtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagt 469  Q
    ||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19393863 agtctctataatagatagttcatgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaatgctattcttaaatgtatctgtagt 19393764  T
Q  470 caaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 530  Q
    | |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19393763 c-aagctttaatatgagt-tgggataattataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 19393705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 534
Target Start/End: Original strand, 14585913 - 14586191
Alignment:
Q  261 gtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttatta------ttgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||      || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14585913 gtgtaagccgtaaatgccaatagtttaagttaaatttatgttatgtatcatgacttttattactattattaaataatatatgtcactctttattatattt 14586012  T
Q  355 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 453  Q
        ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  14586013 gttgtaatgttaataaagtccctaaaatagatagttcgtataatggtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaatgaacgctattat 14586112  T
Q  454 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14586113 taaatgtatccttagtcaaa-ctttaatatgaat-tggaataataataaagcgtcgagacttttatgtatgcagactgatg 14586191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 317 - 534
Target Start/End: Original strand, 15999791 - 16000007
Alignment:
Q  317 ttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgact 415  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||| |||| | || |||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  15999791 ttattattaaataatatatgtcactctttattatatttgttgtaatgttaattaagtacctaaaatagatagttcgtataatggtatattaagtgtgact 15999890  T
Q  416 taatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagacta 515  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  15999891 taatcatgagattacattaccttaaagaacgctattattaaatgtatccttagtcaaa-ctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactt 15999988  T
Q  516 ttatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  15999989 ttatgtatgcagactgatg 16000007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 321 - 534
Target Start/End: Original strand, 2935846 - 2936056
Alignment:
Q  321 tattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaat 419  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  2935846 tattaaataatatatgtcactcttcattatatttgttgtaatgttaataaagtccctagaataaatagttcatgtaattatatattaagt--gacttaat 2935943  T
Q  420 catgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattat 519  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2935944 catgagattacattaacataaagaacgttattcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-tgcgataataataaagcatcgagactgttat 2936041  T
Q  520 gtatgtagactgatg 534  Q
     ||||||||||||||    
T  2936042 ttatgtagactgatg 2936056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 51 - 226
Target Start/End: Original strand, 9986841 - 9987017
Alignment:
Q  51 attgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttaga 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| | | |||||    
T  9986841 attgaagaattgaatagattttgctttcaattgatctaagcaaattatataaaacctaattcaatgaattagatttattttcaatgaaaagcaatttaga 9986940  T
Q  150 tcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagaga 226  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  9986941 tcaacactagcaattatcttaaaaattattcaattaatcgcatgcaatagtaaaaagtaaagaggatagggaagaga 9987017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 256 - 376
Target Start/End: Original strand, 22994055 - 22994176
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22994055 tgttggtgtaagccctagagaccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 22994154  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtcctt 376  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  22994155 tagtaatgttaataaagtcctt 22994176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 42150626 - 42150363
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatctt-atgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42150626 tgttggtataagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatctttatgtatcgtgacttttattattgaataatatatgacactctttgttatattt 42150527  T
Q  355 aga-----taatgttaataaagtcc--ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgc 447  Q
      |     |||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||             || |||||||||||||||||||||||| | || ||||||     
T  42150526 gtaggtagtaatgttaataaagcccctatagaatagatagttc-tgt-------------gtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacgt 42150441  T
Q  448 tattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagact--attatgtatgta 526  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42150440 tattc-taaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-tgggataataataaagcgtcgagactaaattatgtatgta 42150363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 3587657 - 3587934
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||     
T  3587657 tgttggtgtaagccctaaatgtcaatagtttatgtgaaacttatgctatgtatcatgacttttattattaaataacatatgcaattctttattataattg 3587756  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
       |||  |||||||||||| |||||||| |||||  ||| || | ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | || | |||| |||||||    
T  3587757 ttgtaagattaataaagtccatagaataggtagtttatgtgatgaaatattaactgtgacttaatcatgagattactttaacataaaaaacgttattctt 3587856  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||| |||  ||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3587857 aaatgaatctatagtc-aagctttaatataaat-tgggataataataaagcgtagagactattatgtatatagaccgatg 3587934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 256
Target Start/End: Original strand, 9132052 - 9132276
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaactttt 131  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |   |  |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9132052 aaaacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagaaatccaacccaattgatctaagctaagtactaaaacctaattcaatgaattaggtcaactttt 9132151  T
Q  132 gatgaaaaacca-cttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagata 230  Q
     |  ||||| || |||||||||| || |||   || ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  9132152 aacaaaaaaacaacttagatcaatacaagtttctaacctaaccgttattcaattaa-catatgcaataatcaaaaataaagaagataaggaagagagata 9132250  T
Q  231 acaccaatatttttatagtagttcgt 256  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9132251 acaccgatatttttatagtagttcgt 9132276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 22968697 - 22968975
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatat--ggcactctttattatatt 353  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  22968697 tgttggtgtaagctctataggtcaatagtttatcttaaacttttgctacgtatcatgacttttattattgaataatatatatggcatt-tttattatatt 22968795  T
Q  354 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 452  Q
    |    |||  | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||   ||||||||| | | ||||||||||||||||||||   || |||| || ||||    
T  22968796 tgttgtaagataaataaagtccagagaatagatagttcgtgtgatggaatattaagtgttaattaatcatgagattacattaatgtaaagaatgcaattc 22968895  T
Q  453 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  22968896 ttaaatgtatccgtagtc-aatctttaatataaat-taggataatgataaagtgtcaagactattatttatgtagaccgatg 22968975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 332
Target Start/End: Original strand, 48813743 - 48813825
Alignment:
Q  250 agttcgtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataata 332  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48813743 agttagtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataata 48813825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 363 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24443772 - 24443604
Alignment:
Q  363 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtat 462  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||    
T  24443772 ttaataaagtccctataatagatagttcgtgtaatggaatattaagtgtgacttaatcacgagattacattaacataaagaacgatattcttaaatgtat 24443673  T
Q  463 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||| | |||||||||||| |||   |||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24443672 ccgtag-ccaagctttaatataaat--gggatgataacaaagtgtaaagactattatgtatgtagactgatg 24443604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 15170581 - 15170307
Alignment:
Q  259 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga- 357  Q
    ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||  |||  |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||| ||        
T  15170581 tggtgtaagccttgaaggctaatagtttatgttaaatttattctatgtatcgtgagttttaatattaaataatatacgacattctttattataattgttg 15170482  T
Q  358 taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaa 457  Q
    |||  |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | || | |||| ||||||||||    
T  15170481 taaaattaataaagtccataaaatagat-gttcatgtaatggaatattaagtgggacttaatcatgagattacattaacataaaaaacgttattcttaaa 15170383  T
Q  458 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa---ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 533  Q
    | |||  |||||||| ||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15170382 tatatttgtagtcaa-gctttaatat--ataaattgggataataataaagcgtagagactattatatatgtagactgat 15170307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 24444074 - 24443932
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt- 354  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  24444074 tgttggtgtaagtcttagaggtcaatagcttatgttaaacttatgttatctatcatgatttttattattgaataatatattgcattctttattatatttg 24443975  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaat 397  Q
      ||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  24443974 ttataagattaataaaattcatagaatagatagttcgtgtaat 24443932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 31191000 - 31190722
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatg----tatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattata 351  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||    | |||| || |    | || |||||||||||||||| |||||||||    
T  31191000 tgttggtgtaagccttagaggccaataatttatgttaaacttatgctatgacattttcataacatactatgttaaataatatatggcactttttattata 31190901  T
Q  352 tttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctat 450  Q
    |||    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||| |  | |||||||| | || | |||  |||    
T  31190900 tttgttgtaatgttaataaagtccccaga-tagatagttcatgtaatggtatattaagtgtgacttaatcgtttgcttacattaacataaataacattat 31190802  T
Q  451 tcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactga 532  Q
    | |||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |||   |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||    
T  31190801 tattaaatatatccttagtcaa-gctttagtataaattg-ggataataataaagcaccgagactattacgtatgtaggctga 31190722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25846443 - 25846379
Alignment:
Q  271 tagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatat 335  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25846443 tagaggtcaatattttatgttaaatttatgctatgtatcatgacttttattattaaataaaatat 25846379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 25845796 - 25845753
Alignment:
Q  491 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25845796 ggataataataaatcgtagagactattatgcatgtagactgatg 25845753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 25846215 - 25846172
Alignment:
Q  491 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25846215 ggataataataaatcgtagagactattatgcatgtagactgatg 25846172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5983324 - 5983259
Alignment:
Q  258 ttggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgttaaacctatcttatgtatcatgacttttatta 322  Q
    |||||||||||||| || |||| || ||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  5983324 ttggtgtaagccctggatgccattaattttatgttaaacttatgatatgtatcatgacttttatta 5983259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 254
Target Start/End: Original strand, 11352187 - 11352279
Alignment:
Q  164 tatcctaacaattattcaatt-aatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagata-acaccaatatttttatagtagttc 254  Q
    |||||||  ||||| |||||| || ||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  11352187 tatcctatgaattaatcaattcaagcatatacaattatcaaaattaaagaggataaggaagagaaaacgacaccaatatttttatagtagttc 11352279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 16788818 - 16789096
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16788818 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 16788917  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16788918 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 16789017  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16789018 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 16789096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1586663 - 1586385
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1586663 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 1586564  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1586563 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacactattctta 1586464  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1586463 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 1586385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22860443 - 22860165
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860443 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 22860344  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860343 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 22860244  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860243 aatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22860165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 13995498 - 13995220
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13995498 tgttggtataagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 13995399  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13995398 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaatgctattctta 13995299  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995298 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 13995220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18020396 - 18020118
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18020396 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattca 18020297  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18020296 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattattttaaagaacgctattctta 18020197  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020196 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18020118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27508903 - 27508624
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattg-aataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27508903 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctattttatgtatcatgacttttattattgtaataatatatgacactctttattatattt 27508804  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27508803 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattctt 27508704  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27508703 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgtataaaggataataataaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatg 27508624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27528489 - 27528210
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattg-aataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27528489 tgttggtgtaagccctaaaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgtaataatatatgacactctttattatattt 27528390  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27528389 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgaaattacattatattatagaacgctattctt 27528290  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27528289 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatg 27528210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 14074227 - 14074505
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14074227 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaaaatatcttatgtatcatgactattattattgaataatatatggcactctttattatattta 14074326  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  14074327 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactagtctta 14074426  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14074427 aatgtatatgtagtcaaagctttaatatgaataaagtataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 14074505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 8612664 - 8612940
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  8612664 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattca 8612763  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  8612764 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 8612863  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8612864 aaatgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 8612940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 256 - 458
Target Start/End: Original strand, 13947501 - 13947704
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattg-aataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13947501 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgtaataatatatggcactctttattatattt 13947600  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13947601 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 13947700  T
Q  455 aaat 458  Q
    ||||    
T  13947701 aaat 13947704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 5759034 - 5758758
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5759034 tgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatgatgacttttattattgaataatatatgatactctttattatattta 5758935  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||    
T  5758934 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacaatattatt 5758835  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5758834 aaatgtatccgtagt-aaagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagaatattatgtatgtagactgatg 5758758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 255 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 17121003 - 17120741
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccc-tagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 353  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17121003 gtgttggtgtaagcccctagaggtcaatagtttatgttaaactcatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatg--actctttattatatt 17120906  T
Q  354 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 452  Q
    || | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| |||||    
T  17120905 tataataatgttaataaaatccctagaatagatagttcgtataataatatattaagtgtgacttagtcatgagattatattatcataaagaacgttattc 17120806  T
Q  453 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattat 519  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17120805 ttaaatgtatccattgtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattat 17120741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18565596 - 18565360
Alignment:
Q  18 caaactattaattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattatta-aaacctaattcaatga 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  18565596 caaactatcaattgaaaacacaatgcatatgaaattgaagaattgagtagatcttgaaatcaattgatctaagcaaattatttgaaacctaattcaataa 18565497  T
Q  117 attagattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggat 216  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  18565496 attatattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagaatttatcctaacagttattcaattaatcacatgcaatagtaaaaagtaaagaggat 18565397  T
Q  217 agggaagagagataacaccaatatttttatagtagtt 253  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18565396 agggaagagagataataccgatatttttatagtagtt 18565360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 20736882 - 20736605
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20736882 tgttggtgtatgccctagaggccaataggttatgttaatcttatgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgccactctttattatatttg 20736783  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
       ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||  |||||||    
T  20736782 ttgtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatggtatattaagtttgacttaatcatgagattacattaacataaagaacattattctt 20736683  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20736682 aaatgtatctgtagtc-aagctttaataagaa-ctgggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20736605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 252
Target Start/End: Original strand, 17582746 - 17582977
Alignment:
Q  22 ctattaattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaatta-ttaaaacctaattcaatgaatta 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17582746 ctatcaattgaaaacacaatgcatatgaaattgaagaattgaacagatgttgcaatcaattgatctaaacaaattagttaaaacataattcaatgaatta 17582845  T
Q  121 gattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg 220  Q
    ||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17582846 gattatcttttaatgaaaa-caacatagatcaacactagcaattaacctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtaaaaagtaaagaggataggg 17582944  T
Q  221 -aagagagataacaccaatatttttatagtagt 252  Q
     |||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17582945 aaagagagatgccaccgatatttttatagtagt 17582977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12476174 - 12475952
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  12476174 aaaacacaatacatgtgtaattgaagaattgaatagattttgcaatcaattgatctaagcaaattatatgaaatctaattcaatgaattagattaatttt 12476075  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagata 230  Q
      ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12476074 caatgaaaaacaacttagatcaactctaacaattatccaaacaattattcaattaatcacatgcaatagtaaacagtaaagaggatagggaagagagata 12475975  T
Q  231 acaccaatatttttatagtagtt 253  Q
    ||||| | |||||||||||||||    
T  12475974 acaccgacatttttatagtagtt 12475952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 19218179 - 19218454
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt- 354  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  19218179 tgttggtgtaacccctatagtccaatagtttatgttaaatttatgctatgtatcatgacttttattattaaataatatatggcattctttattatatttg 19218278  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
       |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||    
T  19218279 ttgtaagattaataaagtctctagaatagatagttcgtgtaatagaatattaagtgtgacttaatcatgtgattacattatcataaagaatgctattctt 19218378  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||| | ||| |||||| ||||||||||||  | |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19218379 aaa-gcatcagtagtc-aagctttaatat--aaaggggataataataaagtgtagagactattatgtatgtagactgatg 19218454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24001824 - 24001600
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattatta-aaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    |||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  24001824 aaaacacaatacatgtgaaattaaagagttgaatagattttgcaatcaattgatctaagcaaattatttgaaacctaattcaatcaattagattattttt 24001725  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagata 230  Q
      ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24001724 caatgaaaaataacttagatcaacactagcaattgtcttaacaattattcaattaatcacatgcaatagtaaaaagtaaagaggatagggaatagagata 24001625  T
Q  231 acaccaatatttttatagtagttcg 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  24001624 acaccgatatttttatagtagttcg 24001600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 256 - 404
Target Start/End: Original strand, 14996859 - 14997007
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14996859 tgttggtgtaagatctagaggccaatattttatgttaaacttatcttatgtattatgactttaattattgaataatatatgacactctttattatattta 14996958  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatat 404  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996959 tataattttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatat 14997007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22560740 - 22560461
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22560740 tgttggtgtaagccctagaagccgatagtttatgttaaaattatgcagtgtatcatgacttctattattaaataatatatgacactttttattatattta 22560641  T
Q  356 -gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacg--ctattc 452  Q
        ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |  |||| |   ||| |    
T  22560640 ttgcaatattaataaggtccttagaatagatagttcgtgtaatgggatattaagtgtgactcaatcatgagatgacattaacattaagaatgttttatcc 22560541  T
Q  453 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  22560540 ttaaatgtatccatagtc-aagctttaatataaat-tgggataataataaagcgcagagactattatgcatgtagaccgatg 22560461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 256 - 528
Target Start/End: Original strand, 4073320 - 4073595
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||     
T  4073320 tgttggtgtaagtcttagatgccaataatttatgttaaacttatgttatgtatcatgatttttatcattaaataaaatatggcattctttattacatttg 4073419  T
Q  356 gataatgt-----taataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctat 450  Q
      |  |||     ||||||||||| |||||| |||||||| | ||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    | |||||  |||    
T  4073420 tttgttgtaagattaataaagtccatagaattgatagttcatataatggaacattaagtgtgacttaatcatgagattacattaatggaaagaacattat 4073519  T
Q  451 tcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtaga 528  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  4073520 tcttaaaagtatccgtagtcaaa-ctttaatataaat-caggataataataaaacgtagagactattatgtttgtaga 4073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10747446 - 10747309
Alignment:
Q  114 tgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagag 213  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||| | ||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10747446 tgaattaggttaacttttaacgaaaaacaatttagatcaatacaagtttttatcctaacaattattctattaatcatatgcaataatcaaaagtaaagag 10747347  T
Q  214 gatagggaagagagataacaccaatatttttatagtag 251  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10747346 gatatggaagagagataacaccgatatttttatagtag 10747309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 326 - 534
Target Start/End: Original strand, 21994406 - 21994613
Alignment:
Q  326 aataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatga 424  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||    
T  21994406 aataatatatgatactctttattatacttgttgtaatattaataaagtcccaataatagatagttcgtgtaatggtatattaattgtgacttaatcatga 21994505  T
Q  425 gattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 524  Q
    ||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||   | ||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  21994506 gattacattaatataaagaacactattcttaaatgtatccatagtc-gagctttaatataaat-tggaataataataaagcgcaaagactattatatatg 21994603  T
Q  525 tagactgatg 534  Q
    ||||||||||    
T  21994604 tagactgatg 21994613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20403654 - 20403442
Alignment:
Q  36 cacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatg 135  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||   ||| ||||||||| ||||||| || ||  ||||   ||||||| |||||||||||| |||| ||     
T  20403654 cacaatgcatatgtaattgaagaatcgaatagtaattgaaatcaattgatctaagctaagtacaaaaattcaattcaaagaattagattaattttt-atc 20403556  T
Q  136 aaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataacacc 235  Q
     ||||| ||||||||||| || |||   |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20403555 gaaaacaacttagatcaatacaagtttctatcctaacaattaatcaattaa-cacatgcaacaatttaaagtaaagaggataagaaagagagataacacc 20403457  T
Q  236 aatatttttatagta 250  Q
     || |||||||||||    
T  20403456 gatctttttatagta 20403442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Original strand, 19957339 - 19957491
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaatta-ttaaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    |||||||||||||   | |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || | |||    
T  19957339 aaaacacaatgcaagtgtaattgaagaattgaatggactttgcaatcatttgatctaagcaaattatttaaaacctaactcaaagaattaggttcatttt 19957438  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaat 183  Q
      ||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  19957439 caatgaaaaacaacttatatcaatactagccattaacctatcaattattcaat 19957491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 227
Target Start/End: Original strand, 10747457 - 10747549
Alignment:
Q  135 gaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagag 227  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  10747457 gaaaaacaacttagatcaatacaagcttctatcttaacaattattcaattaatcatatgcaataatcgaaagtaaagatgatagggaagagag 10747549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Original strand, 21993711 - 21993786
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataata 332  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21993711 tgttggtgtaagccctatag-ccaataatttatgttaaacctatgatatgtatcatgacttttattattaaataata 21993786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10359588 - 10359410
Alignment:
Q  257 gttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattat-attta 355  Q
    |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||| || | ||||| || |||      
T  10359588 gttggtgtaagttttagaggtcaatagtttatgttaaacttatcgtatgtattatgatttttaatattaaataaaatatgacattatttatcataattgt 10359489  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacatta 434  Q
     ||||  |||||||||||  || |||| ||||||  ||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10359488 tataagattaataaagtctctataatatatagttgatgtgatggaatattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 10359410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 294
Target Start/End: Original strand, 11248531 - 11248569
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11248531 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaa 11248569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15935656 - 15935575
Alignment:
Q  173 aattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg-aagagagataacaccaatatttttatagtagtt 253  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||| || | |||||||||   ||||||||||||||||    
T  15935656 aattattcaattaatcacatgcaatatccaaaattaaagaggatagggaaacaaagataacactgttatttttatagtagtt 15935575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23846923 - 23846851
Alignment:
Q  258 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataa 330  Q
    ||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23846923 ttggtataagctatagaggtcaatagtttatattaaacttgtcatatgtatcatgacttttaatattaaataa 23846851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 10359368 - 10359326
Alignment:
Q  492 gataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  10359368 gataataataaagcgtagagactattatatatgtagagtgatg 10359326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 23846755 - 23846668
Alignment:
Q  441 agaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 530  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||    
T  23846755 agaacactattcttaaaagtatctgtagtcaaa-ctttaatataaattg-ggataataatatagtacagagactattatgtatgtagact 23846668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 2676760 - 2677038
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676760 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 2676859  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676860 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 2676959  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676960 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 2677038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 15461244 - 15461522
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461244 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 15461343  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461344 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 15461443  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461444 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15461522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 255 - 534
Target Start/End: Original strand, 15814767 - 15815046
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15814767 gtgttggtgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 15814866  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15814867 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 15814966  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15814967 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15815046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 255 - 534
Target Start/End: Original strand, 26531359 - 26531638
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531359 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatattaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 26531458  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531459 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 26531558  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531559 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 26531638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18111598 - 18111320
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111598 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttgaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18111499  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111498 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 18111399  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111398 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18111320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 20243684 - 20243962
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20243684 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 20243783  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20243784 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 20243883  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20243884 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20243962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3369578 - 3369300
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3369578 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 3369479  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3369478 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 3369379  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3369378 aatatatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaagataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 3369300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 18162909 - 18163187
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18162909 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattacattta 18163008  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18163009 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 18163108  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18163109 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18163187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4676538 - 4676260
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4676538 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttataatattta 4676439  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4676438 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 4676339  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4676338 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 4676260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 17300514 - 17300236
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300514 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcttgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 17300415  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300414 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgaaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 17300315  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300314 aatgtatccatagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 17300236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 5870159 - 5870443
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactcttta------tta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||      |||    
T  5870159 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacctttattattgaataatatatgacactctttatttttatta 5870258  T
Q  350 tatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgcta 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870259 tatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgcta 5870358  T
Q  450 ttcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5870359 ttcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcaagactattatgtatgtagactgatg 5870443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 34975298 - 34975576
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34975298 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgattaatatatgacactctttattatattta 34975397  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34975398 gataatgttaataaagtccttagaatagatggttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctta 34975497  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34975498 aatgtatttgtagtcaaagttttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 34975576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 256 - 490
Target Start/End: Original strand, 38816460 - 38816694
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38816460 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 38816559  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38816560 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 38816659  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 490  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38816660 aatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 38816694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 1941472 - 1941749
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1941472 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacttattttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 1941571  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  1941572 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacagtatcataaagaacgttattctt 1941671  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1941672 aaatgtattcgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatatagactgatg 1941749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 256 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 11484472 - 11484265
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11484472 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 11484373  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11484372 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 11484273  T
Q  456 aatgtatc 463  Q
    ||||||||    
T  11484272 aatgtatc 11484265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 258 - 533
Target Start/End: Original strand, 9487301 - 9487575
Alignment:
Q  258 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9487301 ttggtgtaagccctaggggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttata 9487400  T
Q  358 -taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaa 456  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||    
T  9487401 gtaatgttaataaagcccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattactttatcataaagaacgttattcttaa 9487500  T
Q  457 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 533  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9487501 atgtatccgtagtc-aagatttaatatgaat-taggataataataaagcgttgagactattatgtatgttgactgat 9487575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 254
Target Start/End: Original strand, 16835554 - 16835790
Alignment:
Q  18 caaactattaattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattattaaaacctaattcaatgaa 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  16835554 caaactatcaattgaaaacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatcttgcaattaattgatctaagcaaattattaaaatctaattcaacgaa 16835653  T
Q  118 ttagattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggata 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16835654 ttagattaacttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataatgaaaagtaaagaggatg 16835753  T
Q  218 gggaagagagataacaccaatatttttatagtagttc 254  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16835754 gggaagagaaataacactgatatttttatagtagttc 16835790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 260 - 534
Target Start/End: Original strand, 11420768 - 11421041
Alignment:
Q  260 ggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-t 358  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  11420768 ggtggaagccctagaggccaatggtttatgttaaacttatgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatggcactctttattatattttttgt 11420867  T
Q  359 aatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaat 458  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  11420868 aatgttaataaagtccctaaaatagatagttcgtgcaatgatatattaagtgtgatttaatcattagattacattaacataaagaacgctattcttaaat 11420967  T
Q  459 gtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11420968 gtatccgtagtcaaa-ctttaatatgaat-taggataataataaagcttcgagactattatgtatgtagactgatg 11421041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 255
Target Start/End: Original strand, 19584019 - 19584253
Alignment:
Q  22 ctattaattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaa-ttattaaaacctaattcaatgaatta 120  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19584019 ctatcaattaaaaacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagaacttgcactcaattgatctgagcaaaattattaaaacctaattcaacgaatta 19584118  T
Q  121 gattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg 220  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19584119 gattaacttttgatgaaaaaaaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataatgaaaagtaaagaggttaggg 19584218  T
Q  221 aagagagataacaccaatatttttatagtagttcg 255  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19584219 aagagagataacaccggtatttttatagtagttcg 19584253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 30041028 - 30040751
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||     
T  30041028 tgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatgttatgtatcatgacttttattatcaattaatatatgatactctttattatatttg 30040929  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
       ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  30040928 ttgtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatagtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacactattctt 30040829  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30040828 aaatgtatctatagtc-aagcgttaatatgaat-tgggataataataaagcatcgagactattatgtatatagactgatg 30040751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 247
Target Start/End: Original strand, 27919361 - 27919591
Alignment:
Q  22 ctattaattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaatta-ttaaaacctaattcaatgaatta 120  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27919361 ctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaatta 27919460  T
Q  121 gattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaa---taattaaaagtaaagaggata 217  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || | |||||| |||| || |    
T  27919461 gattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgaca 27919560  T
Q  218 ggg-aagagagataacaccaatatttttata 247  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27919561 gggaaagagagataacaccgatatttttata 27919591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16587161 - 16586955
Alignment:
Q  50 aattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattatta-aaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttag 148  Q
    ||||||| | |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||    
T  16587161 aattgaatatttgaataggttttgcaatcaattgatctaagaaaattataagaaacctaattcaatgaattagattaattttcaatgaaaaacaacttag 16587062  T
Q  149 atcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataacaccaatatttttatag 248  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16587061 atcaacactagcaattattctatcaactattcaattaatcacatgcaatagtaaaaagtaaagaggatattgaagagagataacaccgatatttttatag 16586962  T
Q  249 tagttcg 255  Q
    |||||||    
T  16586961 tagttcg 16586955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 4545948 - 4546104
Alignment:
Q  375 ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  4545948 ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttagtcatgagaatactttatcataaagaacgttattcttaaatgtatccgtagt-taag 4546046  T
Q  475 ctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 533  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4546047 ctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 4546104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Original strand, 4545859 - 4545950
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactcttta 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4545859 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactcttta 4545950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 377 - 534
Target Start/End: Original strand, 19365389 - 19365544
Alignment:
Q  377 agaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagct 476  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19365389 agaatagatagttcgtgtaatggaatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacgtaaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtc-aagct 19365487  T
Q  477 ttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||| |||   || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  19365488 ttaatataaat-tggggtaataataaagtgttgagactattatatacgtagactgatg 19365544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 472
Target Start/End: Original strand, 9537710 - 9537926
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattat-attt 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||     
T  9537710 tgttggtgtaagccccagaggccaatagtttatgttaaatttatgttatgtatcatgac-tttattattaaataatatatgtca-tttttattataattg 9537807  T
Q  355 agataatgttaataaagt-ccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 453  Q
       |||  |||||||||| || |||||||||||||||||| |||   |||| |||| |||||  || | ||| |||||||| | || |||||||||||||    
T  9537808 ttgtaagattaataaagtcccctagaatagatagttcgtgcaatggaatatcaagtgtgactctataaagagtttacattaacataaagaacgctattct 9537907  T
Q  454 taaatgtatccgtagtcaa 472  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  9537908 taaatgtatatgtagtcaa 9537926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 321 - 534
Target Start/End: Original strand, 19362229 - 19362435
Alignment:
Q  321 tattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaat 419  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||    |||  | |||||||| | ||||||||||||||| ||||||   ||||||||| ||| |||||    
T  19362229 tattaaataatatatgacattctttattatatttgttgtaagatcaataaagttcctagaatagatagttcatgtaatgtaatattaagtgtgagttaat 19362328  T
Q  420 catgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattat 519  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |       ||||||||| || | ||||||||||||    
T  19362329 catgagattacattaacgtaaggaacgcttttcttaaatgtatcagtagtc-aagctttaatataa-------ataataatacagtgccgagactattat 19362420  T
Q  520 gtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||| |||||    
T  19362421 gtatgtagattgatg 19362435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10492802 - 10492619
Alignment:
Q  55 aagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattatta-aaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaa 153  Q
    |||||| ||||||||  || ||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||| ||| |||||||    
T  10492802 aagaatagaatagattgtgaaatcatttgatctaagcaaatgatttgaaacctaattcaatgaattcgattatttttcaatgaaaaacaactaagatcaa 10492703  T
Q  154 cactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataacaccaatatttttatagt 249  Q
    ||||||            ||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10492702 cactag------------caattattcaattgatcacatgcaatggtaaaaagtaaagaggatagggaagagatataacaccgatatttttatagt 10492619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 5529013 - 5528762
Alignment:
Q  276 gccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattat-atttagataatgttaataaagtcc 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| || | |||||||| |||    |||  |||||||| |||    
T  5529013 gccaatagtttatgttaaacttatgttatgtatcatgacatttattattaaatataatatgacattttttattataattgttgtaagattaataaaatcc 5528914  T
Q  375 ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaag 474  Q
     ||||||||||||| | ||| ||   ||||| |||  |||||||||| |||||||||||| |  | |||||  |||||||||| || | | ||||| |||    
T  5528913 ctagaatagatagtgcatgtgatggaatattcagtgcgacttaatcacgagattacattaacacaaagaactatattcttaaaagtgttcatagtc-aag 5528815  T
Q  475 ctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtaga 528  Q
    |||||| || ||   | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  5528814 ctttaa-attaaatcatgataataataaagcgtatagactattatgtttgtaga 5528762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 39422694 - 39422426
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||| | |||||||| ||||| ||   ||||| ||||||||||||    
T  39422694 tgttggtgtaagtcgtagaggtcaatagttttatgttaaacttatgttacatatcatgattgttattattaaataaaatgacgcactatttattatattt 39422595  T
Q  355 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 453  Q
        |||  ||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||   | |||||    ||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||  ||||||    
T  39422594 gttgtaagattaataatgtccctaaaataaatagttcatgtaatggaaaattaaacgagacttaatcgtgagattacattaacatataagacattattct 39422495  T
Q  454 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 524  Q
    |||| ||||  |||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||  |||||||||| ||||    
T  39422494 taaaagtatttgtagacaaa-ctttaatatgaattaagg-tagtaataaagcgtatagactattatttatg 39422426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 490 - 534
Target Start/End: Original strand, 32636465 - 32636509
Alignment:
Q  490 aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32636465 aggataataataaagcgtggagactattatgtatgtagactgatg 32636509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23056617 - 23056437
Alignment:
Q  254 cgtgttggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatat 352  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||  ||  | |||||||||||||||||| || | ||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  23056617 cgtgttggtgtaagcgctataggtgaatagttttatgttaaactgatgat-tgtatcatgacttttattgttaattaaaataaggcattctttgttatat 23056519  T
Q  353 ttag-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacatt 433  Q
    ||   ||||  |||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| | | |||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  23056518 tttctataaaattaataaagtccctagaatatatagttcaagtaatgagacattaagtgagacttaatcgtaagattacatt 23056437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 19361597 - 19361661
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttat 320  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  19361597 tgttggtttaagccctataggccaattgtttatgttaaacttatgctatgtatcatgaattttat 19361661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 528
Target Start/End: Original strand, 56515990 - 56516255
Alignment:
Q  260 ggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagat 358  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||    | |  ||||||||||||||   |    
T  56515990 ggtgtcagccctagaggtcaatagttttaagttaaagttatattttgtatcattacttttattattaaataatga--gactttctttattatatttgttt 56516087  T
Q  359 aatg-ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaa 457  Q
     | | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | | ||||| | |||||||||  ||||| | ||||| | ||||||||  ||||||| ||    
T  56516088 taagattaataaagtccttagaatagatggttagagtaatgaaacattaattgtgacttaattgtgagacttcattaacatatagaacattattcttgaa 56516187  T
Q  458 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtaga 528  Q
     |||||  ||||| |||||||| | ||||| || |||| || |||| | | |||||||||||||| |||||    
T  56516188 -gtatctatagtc-aagctttattgtgaat-aacgatagtattaaaacatagagactattatgtaggtaga 56516255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 21033985 - 21034263
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21033985 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 21034084  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034085 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 21034184  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034185 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 21034263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 254 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15847093 - 15846813
Alignment:
Q  254 cgtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847093 cgtgttggtgtaagcgctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 15846994  T
Q  354 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 453  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15846993 tagataatgttaataaattccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattttcttaaagaacgctattct 15846894  T
Q  454 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15846893 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15846813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 254 - 534
Target Start/End: Original strand, 55426766 - 55427046
Alignment:
Q  254 cgtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55426766 cgtgttggtgtaagccctagagaccaatagtttatgttaaatctatcttatgtattatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 55426865  T
Q  354 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55426866 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtatgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 55426965  T
Q  454 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55426966 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 55427046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 12299658 - 12299936
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12299658 tgttgatgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcgctctttattatattta 12299757  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12299758 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 12299857  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12299858 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaatgataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12299936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 254 - 534
Target Start/End: Original strand, 14890136 - 14890416
Alignment:
Q  254 cgtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14890136 cgtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 14890235  T
Q  354 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 453  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890236 tatataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 14890335  T
Q  454 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14890336 taaatgtatccgtattcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagtgttgagactattatgtatgtagactgatg 14890416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 20148110 - 20147831
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20148110 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 20148011  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20148010 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtaacttaatcatgagattacattatcttatagaacactattctta 20147911  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147910 aatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20147831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 256 - 530
Target Start/End: Original strand, 21398539 - 21398813
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21398539 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 21398638  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21398639 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaattatatattaattgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctta 21398738  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21398739 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagtgtcgagactattatgtatgtagact 21398813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 255 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 25979283 - 25979006
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25979283 gtgttggtgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 25979184  T
Q  355 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 453  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  25979183 atagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattct 25979084  T
Q  454 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 533  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25979083 taaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 25979006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 258 - 502
Target Start/End: Original strand, 28087967 - 28088211
Alignment:
Q  258 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga 357  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28087967 ttggtgtaatccctaaaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgacactctttattatatttaga 28088066  T
Q  358 taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaa 457  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  28088067 taatattaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaa 28088166  T
Q  458 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 502  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28088167 tagatccgtagtcaaagctttaatatgaataaatgataataataa 28088211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 303 - 533
Target Start/End: Original strand, 11787382 - 11787611
Alignment:
Q  303 atgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataata 401  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11787382 atgtatcatgacttttcttattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataata 11787481  T
Q  402 tattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataata 501  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11787482 tattaaatgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgttattcttaaatgtatctgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataata 11787579  T
Q  502 aagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 533  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11787580 aagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 11787611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8943313 - 8943090
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaactttt 131  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8943313 aaaacacaaggcatatgaatttgaagaattgaatagaacttgcactcaattgatctaaccaaattattaaaacctaattcaacgaattagattaactttt 8943214  T
Q  132 gatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataa 231  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8943213 gatgaaaaacaacttatatcaacactagcaattatcctaacaattattcaactaatcatatgtaataatgaaaagtaaagaggatagggaagagagataa 8943114  T
Q  232 caccaatatttttatagtagttcg 255  Q
    | || ||||||| |||||||||||    
T  8943113 ccccgatattttgatagtagttcg 8943090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 19455835 - 19456059
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattatta-aaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    |||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||    
T  19455835 aaaacacaatacatgtgaaattgaggaattgaatagattttgcaatcaattgatctaagcaaattatttgaaacctaattcaatgaattagattactatt 19455934  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagata 230  Q
      ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19455935 caatgaaaaacaacttaaatcaacactaggaattatcctaacaattattcaattgatcatatgcaatagtaaaaagtaaagaggatagggaagagagata 19456034  T
Q  231 acaccaatatttttatagtagttcg 255  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  19456035 acactaatatttttatagtagttcg 19456059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14282139 - 14281922
Alignment:
Q  37 acaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaatta-ttaaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14282139 acaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttccaatcaattgatctaagaaaattagttaaaacttaattcaatgaattagattatcttttgatg 14282040  T
Q  136 aaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataacacc 235  Q
    |||||  | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14282039 aaaaataatttagatcagcactagcaattaacctaacaattattgaattaatcacatgcaatagtaaaaagtgaagaggatagggaagagagataacacc 14281940  T
Q  236 aatatttttatagtagtt 253  Q
     |||||||||||||||||    
T  14281939 gatatttttatagtagtt 14281922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 14146769 - 14147046
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt- 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14146769 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatggcactctttattatatttg 14146868  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
      ||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |  | || ||||||  |    
T  14146869 ttataagattaatacggtccatagaatagatagttcgtgtaatggaatattaagtgtgacttaatcatgaaactacattaacattaacaaagctatttct 14146968  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| || |||   |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14146969 aaatgtatctgtagtc-aagctttaacataaat-tgggataataataaagcacagagactattatatatgtagactgatg 14147046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4848160 - 4847943
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4848160 aaaacacaatacatgtgtaattgaagaattgaatagattttgcattcaattgatctaagcaaattatatgaaacctaattcaatgaattagattgatttt 4848061  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg-aagagagat 229  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4848060 caatgaaaaacaacttagatcaacactagaaattatcctaaaaattattcaattaatcacatgcaatatctaaaagtaaagaggatagggaaagagagat 4847961  T
Q  230 aacaccaatatttttata 247  Q
     ||||| |||||||||||    
T  4847960 cacaccgatatttttata 4847943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4854491 - 4854268
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4854491 aaaacacaatacatgtgtaattgaagaattgaatagatttttcaatcaattgatctaagcaaattatatgaaacctaattcaatgaattagattgatttt 4854392  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg-aagagagat 229  Q
      ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4854391 caatgaaaaataacttagatcaacactagcaattattctaaaaattattcaattaatcacatgcaatagctaaaagtaaagaggatagggaaagagagat 4854292  T
Q  230 aacaccaatatttttatagtagtt 253  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    
T  4854291 aacaccgatatttttataatagtt 4854268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4876224 - 4876001
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4876224 aaaacacaatacatgtgtaattgaagaattgaatagatttttcaatcaattgatctaagcaaattatatgaaacctaattcaatgaattagattgatttt 4876125  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg-aagagagat 229  Q
      ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4876124 caatgaaaaataacttagatcaacactagcaattattctaaaaattattcaattaatcacatgcaatagctaaaagtaaagaggatagggaaagagagat 4876025  T
Q  230 aacaccaatatttttatagtagtt 253  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    
T  4876024 aacaccgatatttttataatagtt 4876001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 256 - 533
Target Start/End: Original strand, 15526503 - 15526777
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt- 354  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  15526503 tgttggtgtaagccctataggccattaatttatgttaaacttaagctacgtatcatgacttttattattaaataatatatgacattctttattatatttg 15526602  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
      ||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  15526603 ttataagattaataaa-tccctagaatatatagttcgtgtaatggaatattaagggtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacactattctt 15526701  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 533  Q
    ||||| ||  |||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15526702 aaatgcatatgtagtc-aagctttaatataaatga--gataataataaagcgtagagactattatgtttgtagactgat 15526777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Original strand, 14636432 - 14636630
Alignment:
Q  50 aattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttag 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| | |||  ||||||||| ||||||    
T  14636432 aattgaagaattgaatagattttaaaatcaattgatctaagcaaattatatgaaacctaattcaacaaattagattgattttcaatgaaaaacaacttag 14636531  T
Q  149 atcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaa-gtaaagaggatagggaagagagataacaccaatatttttat 246  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||    
T  14636532 atcaatactagcaattatcctaacaattattcaattaataacatgcaatggttaaaatgtaaagaggataggaaaaagagataataccgatatttttat 14636630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 256
Target Start/End: Original strand, 4830878 - 4831100
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaactttt 131  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||   ||| || |||||| || |||| || || ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  4830878 aaaacacaatgcatatgcagttgaagaattgaatagtaattgaaaccaattgatccaagctaagtactaaaacctaattcaaagaattatattaattttt 4830977  T
Q  132 gatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataa 231  Q
     || |||||| ||||||||||| || |||   |  ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  4830978 -atcaaaaacaacttagatcaatacaagtttgtcccctaacaatttatcaattaa-catatgcaacaattaaaagtaaggtgggtaaggaagagagataa 4831075  T
Q  232 caccaatatttttatagtagttcgt 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  4831076 cacccatatttttatagtagttcgt 4831100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4872484 - 4872333
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    |||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | |||    
T  4872484 aaaacacaatacatgtgtaattgaagaattgaattgattttgcaatcaattgacctaagcaaattatatgaatcctaattcaatgaattagattgatttt 4872385  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaa 182  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4872384 caatgaaaaacaacttagatcaacactagaaattatcctaaaaattattcaa 4872333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 254
Target Start/End: Original strand, 13606939 - 13607135
Alignment:
Q  57 gaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacac 156  Q
    ||||||||||||  ||| |  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| |  ||    
T  13606939 gaattgaatagaaattgaacccaattgatcgaagctaattattaaaacctaattcaacgaattaggttaacttttaacgaaaaacaacttagattattac 13607038  T
Q  157 tagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataacaccaatatttttatagtagttc 254  Q
     |     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13607039 aaacttctatcctaacaattattgaattaa-catatgcaataatcaaaagtaaagatggtaaggaagagagataacaccgatatttttatggtagttc 13607135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20246458 - 20246310
Alignment:
Q  105 ctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaa 204  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||| |||    
T  20246458 ctaattcaaggaattagattaa-ttttgatcaaaagcaacttagatcaacacaagtttttatcctaacaattaatcaactag-catatgcaaaaatcaaa 20246361  T
Q  205 agtaaagaggatagggaagagagataacaccaatatttttatagtagttcg 255  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20246360 agtaaagaagataaggaaaagagatgacaccgatatttttatagtagttcg 20246310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 390
Target Start/End: Original strand, 14225953 - 14226090
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 353  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||  | |||||||||||    
T  14225953 gtgttggtgtaagctctagagaccaatatttttatgttaaatttatgttatgtatcatgacttttattattaaataagataacgcgttttttattatatt 14226052  T
Q  354 ta-gataatgttaataaagtccttagaatagatagttc 390  Q
     |   |||  |||||||||||| || ||||||||||||    
T  14226053 aactgtaagattaataaagtccctaaaatagatagttc 14226090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 30174124 - 30174402
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174124 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 30174223  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174224 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 30174323  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174324 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 30174402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24250587 - 24250309
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24250587 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataaaatatggcactctttattatattta 24250488  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250487 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgcgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 24250388  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250387 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 24250309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24229770 - 24229492
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24229770 tgttggtgtaagccctagaggccaatggtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 24229671  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||    
T  24229670 aataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattactttatcataaagaacattattctta 24229571  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24229570 aatgtgtccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 24229492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 255
Target Start/End: Original strand, 23662640 - 23662873
Alignment:
Q  22 ctattaattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattattaaaacctaattcaatgaattag 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  23662640 ctatcaattgaaaacacaatgcatatgaatttgaagaattgaatagaacttgcactcaattgatctaagcaaattatttaaacctaattcaacaaattag 23662739  T
Q  122 attaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggga 221  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||   |    
T  23662740 attaacttttgatgaaaaataaattagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgctataatgaaaagtatagaggataaaaa 23662839  T
Q  222 agagagataacaccaatatttttatagtagttcg 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23662840 agagagataacaccgatatttttatagtagttcg 23662873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 259 - 534
Target Start/End: Original strand, 19616186 - 19616460
Alignment:
Q  259 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactcttt-attatatttaga 357  Q
    |||||||||  |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||       
T  19616186 tggtgtaagttctagcggtcaatagtttatgttaaacttatattatgtatcatgatttttattattaaataatatatgacactcttttataatatttgtt 19616285  T
Q  358 -taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaa 456  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||||    
T  19616286 gtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcataagattacattaacataaagaacactattcttaa 19616385  T
Q  457 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19616386 atgtatttgtagtc-aagctttaatatgaat-tgggataataat-aagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19616460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 262 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24764105 - 24763834
Alignment:
Q  262 tgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt-agataa 360  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||   ||||    
T  24764105 tgtaagccctggaggccaatagtttatgttaaacttatgttatgtataatgacttttattattaaataatacatggaaatctttattatatttgttataa 24764006  T
Q  361 tgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgt 460  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | || | |||| ||||||||||||     
T  24764005 tgttaataaagtcccaagaatagatagttcatgtaatagtatattaagcgtgacttaatcatgagattatattaacataaaaaacgatattcttaaatgc 24763906  T
Q  461 atccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24763905 atctgtactc-aagctttaatatgaattga-gataataataaagcatcgagactattatttatgtagactgatg 24763834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 265 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15342548 - 15342280
Alignment:
Q  265 aagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatg-t 363  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||     ||| |    
T  15342548 aagccttagaggccaatagtttatgttaaacttatattatgtatcatgacttttattgttaaataatatatgacattcgttattataattcttgtatgat 15342449  T
Q  364 taataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatc 463  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||     
T  15342448 taataaagtccctaaaatagatggttcgtgtaatggaatattaagtgtgatttaatcatgagattacattaccataaagaacactattctttaatgtata 15342349  T
Q  464 cgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
     |||||| ||| |||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15342348 tgtagtc-aagatttaatataaat-tgggataataataaagcgtggagactattatgtatgtagattgatg 15342280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 25906475 - 25906696
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaactttt 131  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |  |||||| ||||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25906475 aaaacacaatgcatatggaattgaagaattgaatagaacttgaatccaattgatctaaactaagtactaaaacctaattcaatgaattaggttaattttt 25906574  T
Q  132 gatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataa 231  Q
     | ||||| | ||||||||||| || |||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25906575 aacgaaaa-caacttagatcaatacaagtttctatccgaacaattattcaattaa-catatgcaataatcgaaagtaaagaggataaggaagagagataa 25906672  T
Q  232 caccaatatttttatagtagttcg 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  25906673 caccgatatttttatagtagttcg 25906696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 256 - 473
Target Start/End: Original strand, 21626429 - 21626647
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt- 354  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||     
T  21626429 tgttggtgtaagtcctagatgtcaatagtttatgttaaacttatgatatgcatcatgacatttattattgaataaaataaggcattctttattatatttg 21626528  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
      ||||  |||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||   | |||||||  ||||||||||||| ||||||||| | || |||||  |||||||    
T  21626529 ttataagattaataaagtccctcgaatagatagttcatgtgatggaacattaagtaagacttaatcatgacattacattaacataaagaacaatattctt 21626628  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaa 473  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  21626629 aaaagtatccgaagtcaaa 21626647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 256 - 397
Target Start/End: Original strand, 29800175 - 29800317
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  29800175 tgttggtgtaagccctagaggacaatattttatgttaaacttatactacgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcattctttattataatta 29800274  T
Q  356 -gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaat 397  Q
       |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29800275 ttgtaagattaataaagtccctagaatagatagttcgtgtaat 29800317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24374085 - 24374002
Alignment:
Q  171 acaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataacaccaatatttttatagtagttc 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24374085 acaattattcaattaatcacatgcaatagtaaaaagtaaagaggatagggaagagagataacaccgatatttttatagtagttc 24374002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18595830 - 18595684
Alignment:
Q  95 ttattaaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgc 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||| ||||            ||||||||||||||||||| ||||    
T  18595830 ttattgaaacctaattcaatgaattagattatatttcaatgaaaaacaacttagatcaatacta------------acaattattcaattaatcagatgc 18595743  T
Q  195 aataattaaaagtaaagaggataggg-aagagagataacaccaatatttttatagtagt 252  Q
     ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18595742 tatagtaaaaagtaaagaggatagggaaagagagataacactgatatttttatagtagt 18595684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21072086 - 21071994
Alignment:
Q  161 aattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaa-gagagataacaccaatatttttatagtagtt 253  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21072086 aattatcctaccaattattcagttaatcacatgcac-aagtaaaagtaaaaaggatagggaaagagagataacactgatatttttatagtagtt 21071994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28719304 - 28719170
Alignment:
Q  302 tatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactcttt-attatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||| | || ||||| |||||| |||   |||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||      
T  28719304 tatgtatcatgacttttattattaaacaaaataagacattcttttattatacttattgtaaaattaataaagtccttagaatatatagttcatgtgatgg 28719205  T
Q  400 tatattaagtctgacttaatcatgagattacatta 434  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28719204 aacattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 28719170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18852338 - 18852167
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 353  Q
    ||||||||||||||| || |  |||||| ||| | ||||||| ||| || | ||||||||||||||||| | |||||||   |||| |||||||||||||    
T  18852338 gtgttggtgtaagccataaaaaccaataattttaagttaaacttatgttttctatcatgacttttattaataaataatacgaggcattctttattatatt 18852239  T
Q  354 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatga 424  Q
    |    |||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||||    
T  18852238 ttttgtaagattaataaagtccatataatagatagttcgagtaatgaaacgttaagtgtgacttaatcatga 18852167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 28719100 - 28719053
Alignment:
Q  492 gataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgtccat 539  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28719100 gataataataaaacgtagagactattatgtatgtagactgatgaccat 28719053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 534
Target Start/End: Original strand, 29800449 - 29800492
Alignment:
Q  491 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  29800449 ggataataataaagcggaaagactattatgtatgtagactgatg 29800492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 255 - 534
Target Start/End: Original strand, 119476 - 119755
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119476 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 119575  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119576 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 119675  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  119676 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtacgtagactgatg 119755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24933861 - 24933583
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933861 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 24933762  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933761 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 24933662  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933661 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 24933583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 255 - 534
Target Start/End: Original strand, 31645 - 31924
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31645 gtgttggtgtaagccttagaggccaatagtttatgttaaacctattttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 31744  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31745 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 31844  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31845 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 31924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 255 - 534
Target Start/End: Original strand, 23545668 - 23545947
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23545668 gtgttggtgtgagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgattaatatatggcactctttattatattt 23545767  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545768 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 23545867  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545868 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 23545947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 12790218 - 12789940
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12790218 tgttggtgtaagccctaaaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 12790119  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12790118 gataattttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 12790019  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12790018 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12789940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 25805940 - 25805662
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805940 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 25805841  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25805840 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctta 25805741  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805740 aatatatccgtagtcgaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 25805662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 22940997 - 22941275
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22940997 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 22941096  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22941097 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaatgttattctta 22941196  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941197 aatgtatccgtagtcaaagctttaatttgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22941275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 31096563 - 31096841
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31096563 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgactcttattattgaataatatatggcactctttattatattta 31096662  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31096663 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgggattacattatcttaaagaacgttattctta 31096762  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31096763 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 31096841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 20940774 - 20941052
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20940774 tgtttgtgtaagccctaaaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 20940873  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20940874 gataatgttaataatgtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaactgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgttattctta 20940973  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20940974 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20941052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 259 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 12765544 - 12765271
Alignment:
Q  259 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga- 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  12765544 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatag 12765445  T
Q  358 taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaa 457  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  12765444 taatgttaataaagtccttaaaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaa 12765345  T
Q  458 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12765344 tgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12765271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 7865987 - 7865711
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  7865987 tgttggtttaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattca 7865888  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  7865887 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 7865788  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7865787 aaatgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 7865711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 259 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 12704428 - 12704155
Alignment:
Q  259 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga- 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  12704428 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatag 12704329  T
Q  358 taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaa 457  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  12704328 taatgttaataaagtccttaaaatagatagttcgtgtaataatatattaattgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaa 12704229  T
Q  458 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12704228 tgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatg 12704155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 259 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 9812287 - 9812014
Alignment:
Q  259 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga- 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  9812287 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatag 9812188  T
Q  358 taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaa 457  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  9812187 taatgctaataaagtccttaaaatagatagttcgtgtaataatatattaattgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattattaaa 9812088  T
Q  458 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9812087 tgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatg 9812014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 26244850 - 26245127
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  26244850 tgttggtgtaagctctggaggccaatagtttatgttaaacttatcttatatatcatgacttttattattgaataatatatgatactcttttttatattta 26244949  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
     | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||    
T  26244950 tagtaatgttaataaagtccctcgaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaatgttattctt 26245049  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26245050 aaatgtatctgtaatc-aagctttaatatgaat-aaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 26245127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 270 - 534
Target Start/End: Original strand, 5097414 - 5097676
Alignment:
Q  270 ctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaata 368  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||    
T  5097414 ctagaggctaata-tttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcaatttttattatatttatagtaatgttaata 5097512  T
Q  369 aagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtag 468  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||  ||||    
T  5097513 aagtccctggaatagatagttcatgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacgttattcttaaatgtatttgtag 5097612  T
Q  469 tcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    || ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5097613 tc-aagttttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 5097676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 39535211 - 39535489
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttatt-attgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39535211 tgttggtgtatgccctagaggtcaatagtttatgttaaatttacgttatgtatcatgaattttttttattaaataatatatgacactctttattatattt 39535310  T
Q  355 ag-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 453  Q
       |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  39535311 gttataatgttaataaagtccctggaatagatagttcatataatggtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaccttaaagaacgatattct 39535410  T
Q  454 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39535411 taaatgtatccgtactcaaa-ctttaatatgaat-tgggataataataaagcgtcaagactattatgtatgtagactgatg 39535489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Original strand, 16739221 - 16739451
Alignment:
Q  23 tattaattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagc-aaattattaaaacctaattcaatgaattag 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16739221 tattaattgaaaacacaatgcatatgatataaaagaattgaatggaacttgcactcaattgatctaagctaaattattaaa-cctaattcaacgaattag 16739319  T
Q  122 attaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggga 221  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16739320 attaacttttgat-agaaacaacttagatcaacactaccaattatcgtaacaattattcaatttatcatatgcaataatgaaaagtaaagaggataggga 16739418  T
Q  222 agagagataacaccaatatttttatagtagttc 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16739419 agagagataacaccgatatttttatagtagttc 16739451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24129936 - 24129715
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaactttt 131  Q
    |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  24129936 aaaacacaatgcatatagaatttaagaattgaatagaaattgcactcaatttatgtaagcaaattattaaaacctaattcaacgaattacgttaactttt 24129837  T
Q  132 gatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataa 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  24129836 gatgaaaaacaacttagatcaacacaagcaattattctaacaattattcaattaa-catatgcaataatgaaaagtaaagaggatagggaagagagatag 24129738  T
Q  232 caccaatatttttatagtagttc 254  Q
    || | ||||||||||||||||||    
T  24129737 caacgatatttttatagtagttc 24129715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24670723 - 24670500
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttct-aagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| | | ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24670723 aaaacacaatgcatatggaattgaagaattgaatagaaattgaactgaattgatcttaagcaaattataaaaacctaattcaatgaattaggttaacttt 24670624  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagata 230  Q
    |||||| | || ||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24670623 tgatgatatacaacttagatcaatacaaactattatcctaacaattattcaattaa-catatgcaatattgaaaagtaaagaggatagggaagagagata 24670525  T
Q  231 acaccaatatttttatagtagttcg 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  24670524 acaccgatatttttatagtagttcg 24670500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24707498 - 24707275
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttct-aagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| | | ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24707498 aaaacacaatgcatatggaattgaagaattgaatagaaattgaactgaattgatcttaagcaaattataaaaacctaattcaatgaattaggttaacttt 24707399  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagata 230  Q
    |||||| | || ||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24707398 tgatgatatacaacttagatcaatacaaactattatcctaacaattattcaattaa-catatgcaatattgaaaagtaaagaggatagggaagagagata 24707300  T
Q  231 acaccaatatttttatagtagttcg 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  24707299 acaccgatatttttatagtagttcg 24707275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24740492 - 24740269
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttct-aagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| | | ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24740492 aaaacacaatgcatatggaattgaagaattgaatagaaattgaactgaattgatcttaagcaaattataaaaacctaattcaatgaattaggttaacttt 24740393  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagata 230  Q
    |||||| | || ||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24740392 tgatgatatacaacttagatcaatacaaactattatcctaacaattattcaattaa-catatgcaatattgaaaagtaaagaggatagggaagagagata 24740294  T
Q  231 acaccaatatttttatagtagttcg 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  24740293 acaccgatatttttatagtagttcg 24740269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24753261 - 24753038
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttct-aagcaaattattaaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| | | ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24753261 aaaacacaatgcatatggaattgaagaattgaatagaaattgaactgaattgatcttaagcaaattataaaaacctaattcaatgaattaggttaacttt 24753162  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagata 230  Q
    |||||| | || ||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24753161 tgatgatatacaacttagatcaatacaaactattatcctaacaattattcaattaa-catatgcaatattgaaaagtaaagaggatagggaagagagata 24753063  T
Q  231 acaccaatatttttatagtagttcg 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  24753062 acaccgatatttttatagtagttcg 24753038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 258 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 20100793 - 20100520
Alignment:
Q  258 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||       
T  20100793 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtcagacttatgttatgtatcatgacttttattattcaataatat--gacattctttattatatttgtt 20100696  T
Q  358 -taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaa 456  Q
     |||  |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || | |||| |||||||||    
T  20100695 gtaagattaataaagtccatagaatagatagttcatataatggaatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacgtaaataacgttattcttaa 20100596  T
Q  457 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20100595 atgtattcgtagttaaa-ctttaatataaat-tgggataataataaagcgtcacgactattatgtatgtagactgatg 20100520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Original strand, 19126906 - 19127122
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  19126906 aaaacacaatacatgtgtaattgaagaattgaatagattttgcaatcaattgatctaagcaaattatatgaaacttaattcaatgaattagattaatttt 19127005  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg-aagagagat 229  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19127006 taatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcccaacaattattcaattaatcacatgaaat-agtagaagtaaagaggatagggaaagagagat 19127104  T
Q  230 aacaccaatatttttata 247  Q
    |||||  |||||||||||    
T  19127105 aacactgatatttttata 19127122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 255 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 26130250 - 26129974
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttatt--ata- 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||     
T  26130250 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgataaacttatgttatgtaacatgacttttattattaaataatatatgacactctttatttaatac 26130151  T
Q  352 tttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctatt 451  Q
    ||    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||| | | ||||| ||| | |  |||||||| ||    
T  26130150 ttgttgtaatattaataaagtctctagaatagatagttcgtgtaatggaatatttagtgtgacttaatcctaatattactttaacattaagaacgctctt 26130051  T
Q  452 cttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 530  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  26130050 cttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatataaat-tgggataataataaagcgcagagaatattatgtatgtagact 26129974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Original strand, 22441516 - 22441723
Alignment:
Q  50 aattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttag 148  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || || || | ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  22441516 aattgaagaaatgaatagattttgcaatcaattgatctaatcatatcatatgaaacctaattcaacgaattagattgatttttaatgaaaaacaacttag 22441615  T
Q  149 atcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg-aagagagataacaccaatatttttata 247  Q
    ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22441616 atcattattagaaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagctaaaagtaaaaaggatagggaaagagagataacaccgatatttttata 22441715  T
Q  248 gtagttcg 255  Q
    ||||||||    
T  22441716 gtagttcg 22441723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19765299 - 19765166
Alignment:
Q  27 aattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattatta-aaacctaattcaatgaattagatta 125  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19765299 aattgaaaacacaatgcatgtgaaattgaagaattgaatagattttgaaataaattgacctaagcaaattatttgaaacctaattcaatgaattagatta 19765200  T
Q  126 acttttgatgaaaaaccacttagatcaacactag 159  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19765199 tcttttaatgaaaaacaacttagatcaacactag 19765166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 31652338 - 31652208
Alignment:
Q  259 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt-aga 357  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||        
T  31652338 tggtgtaagccttaaaggccaata-tttatgttaaacttacgctttgtatcatgacttttattattaaataaaataaagcattctttattatatttgttg 31652240  T
Q  358 taatgttaataaagtccttagaatagatagtt 389  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31652239 taagattaataaagtccctagaatagatagtt 31652208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 31267982 - 31267939
Alignment:
Q  491 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31267982 ggataacaataaagcgtggagactattatgtatgtagacggatg 31267939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Original strand, 23987242 - 23987298
Alignment:
Q  99 taaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacac 156  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||    
T  23987242 taaaacctaattcaaggaattagattaa-ttttaatcaaaaagaacttagatcaacac 23987298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 8052 - 8330
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8052 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 8151  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8152 tataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 8251  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8252 aatgtatccatagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 8330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 258 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15376 - 15100
Alignment:
Q  258 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga 15277  T
Q  358 taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaa 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15276 taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattcttaaa 15177  T
Q  458 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15176 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcatcgagactattatgtatgtagactgatg 15100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2089 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold2089
Description:

Target: scaffold2089; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 256 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 273 - 1
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  273 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttttgttaaacctatcttatgtatcatgacctttattattgaataatatatggcactctttattatattta 174  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  173 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgcgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 74  T
Q  456 a----atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 524  Q
    |    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73 aatatatatatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 256 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 40249 - 40015
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40249 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 40150  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40149 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgttattctta 40050  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40049 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 40015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1121 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold1121
Description:

Target: scaffold1121; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1794 - 1557
Alignment:
Q  18 caaactattaattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattattaaaacctaattcaatgaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1794 caaactattaattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatgaattgatctaagcaaattattaaaacctaattcaatgaa 1695  T
Q  118 ttagattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggata 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1694 ttagattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagcaattttcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggata 1595  T
Q  218 gggaagagagataacaccaatatttttatagtagttcg 255  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||    
T  1594 gggaagagagataacatcgatagttttatagtaattcg 1557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 256 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 19389 - 19160
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19389 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttataaaaaaaatatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 19290  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19289 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 19190  T
Q  456 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatga 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19189 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatga 19160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 67928 - 67651
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  67928 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacttattttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 67829  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  67828 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacagtatcataaagaacgttattctt 67729  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  67728 aaatgtattcgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatatagactgatg 67651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 8847 - 9135
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatg-acttttattatt-gaataatatatggcactctttattatatt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8847 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgtacttttattattagaataatatatggcactctttattatatt 8946  T
Q  354 tagataatgttaataaagt-ccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatag-aacgctatt 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8947 tagataatgttaataaagtaccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagtaacgctatt 9046  T
Q  452 ctt-aaatgtatccgtagtc-aaagc-tttaatatgaat-aaaggataat-aataaagcgt-cgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9047 cttaaaatgtatccgtagtcaaaagcttttaatatgaataaaaggataataaataaagcgtacgagactattatgtatgtagactgatg 9135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 255 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 45503 - 45226
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45503 gtgttggtgtaagcccaaaaggccaatagtttctgttaaacttatcttatgcatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 45404  T
Q  355 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 453  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  45403 atagtaatgttaataaagtccttacaatagatagttcttgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattct 45304  T
Q  454 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 533  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45303 taaatgtatccgtagtc-aagctttaatattaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 45226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 12083 - 11807
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  12083 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacattctttattgtattta 11984  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  11983 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 11884  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11883 aaatgtatctgtagtc-aatctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgaaactattatgtatgtagattgatg 11807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 256 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18969 - 18786
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18969 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18870  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatctta 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18869 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatctta 18786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 327 - 534
Target Start/End: Original strand, 1 - 208
Alignment:
Q  327 ataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgaga 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1 ataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaataatgaga 100  T
Q  427 ttacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgta 526  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  101 ttacattatcttatagaacgctgttcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataatggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtc 200  T
Q  527 gactgatg 534  Q
    ||||||||    
T  201 gactgatg 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1948 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold1948
Description:

Target: scaffold1948; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 256 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 961
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 1070  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 455  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1069 gataatgttaataaagtccttataatagatagtttttttaataatatattaagtgtgacttaatcatgtgattacattatcttaaagaacgttattctta 970  T
Q  456 aatgtatcc 464  Q
    |||||||||    
T  969 aatgtatcc 961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 256 - 445
Target Start/End: Original strand, 76307 - 76496
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  76307 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttaatattgaataaaatatgacactctttattatattta 76406  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaac 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  76407 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaac 76496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 255 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 40543 - 40265
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40543 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatgctatgtagcatgacttttattattaaataatatatgacactctttattatattt 40444  T
Q  355 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 453  Q
        |||| |||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||    
T  40443 tttgtaatattaataaagtctctggaatagataattcatgtaatggtatattaagtgtgacttaatcatgagaatacattaacgtaaagaacgctattct 40344  T
Q  454 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40343 taaatgtatccatagtc-aagctttaatataaattga-gataataataaagcgccgagactattatgtatgtagactgatg 40265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 255 - 409
Target Start/End: Original strand, 9515 - 9669
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9515 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattatggaataatatgtggcactctttataatattt 9614  T
Q  355 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9615 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagt 9669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 271 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 13489 - 13226
Alignment:
Q  271 tagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataa 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||| ||||||    
T  13489 tagaggccaatagtttatgttaaatttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggctctcttaattatatttgtagtaatgctaataa 13390  T
Q  370 agtccttagaatagatagttcgtgt-aataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtag 468  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | || | |||  ||||||||||||||||| |||    
T  13389 agtccctagaatagatagttcatgtaaatgatatattaagtgtgatttaatcatgagattacattaacataaaaaacagtattcttaaatgtatccatag 13290  T
Q  469 tcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    || |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13289 tc-aagctttaatattaat-tgggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagaccgatg 13226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 63952 - 63732
Alignment:
Q  35 acacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattatta-aaacctaattcaatgaattagattaacttttga 133  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  63952 acacaaagcatatgaaattgaagaattgaatagattttgcaatcaattgatctaagaaaattatttgaaacctaattcaatgaattagattatcttttga 63853  T
Q  134 tgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataaca 233  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||| ||||      
T  63852 tgaagaacaacttagatcaacactagcaattattctaacaattattcaattaatcatatgcaatagtaaaaggtaaaaaggatagagaagagaaataatt 63753  T
Q  234 ccaatatttttatagtagttc 254  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  63752 ccaatatttttatagtagttc 63732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 53521 - 53790
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  53521 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacttatcttatatatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattcgattca 53620  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 454  Q
     | ||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||        |||||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  53621 tagtaatgttaataaagtccctagagtaaatagttcatgtaatgatatattaagtgtg--------atgagattacattaacataaagaacactattctt 53712  T
Q  455 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  53713 aaatgtatccgtattc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagtgtcaagactattatgtatgtagattgatg 53790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 34060 - 33927
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34060 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatgtggcactctttattatattta 33961  T
Q  356 gataatgttaataaagtccttagaatagatagtt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33960 gataatgttaataaagtccttagaatagatagtt 33927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Original strand, 86287 - 86528
Alignment:
Q  19 aaactattaattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatc----aattgttctaagcaaattatta-aaacctaattcaa 113  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  86287 aaactatctattgaaaacaaaatgcatgtgaaattgaaaaattgaatagattttgcaatcgatcaattgatctaagcaacttatttgaaacctaattcaa 86386  T
Q  114 tgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagag 213  Q
    |||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  86387 tgaattagattatcttttatcgaaaaacaacttagatcaatactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtaaaaagtaaagag 86486  T
Q  214 gatagggaagagagataacaccaatatttttatagtagttcg 255  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  86487 gatagcgaagagagataacaccgatatttttatagtagttcg 86528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1485 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1485
Description:

Target: scaffold1485; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 253
Target Start/End: Original strand, 496 - 719
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  496 aaaacacaatacatgtgtaattgaagaattgaatagatttttcaatcaattgatctaagcaaattatatgaaacctaattcaatgaattagattgatttt 595  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg-aagagagat 229  Q
      ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  596 caatgaaaaataacttagatcaacactagcaattattctaaaaattattcaattaatcacatgcaatagctaaaagtaaagaggatagggaaagagagat 695  T
Q  230 aacaccaatatttttatagtagtt 253  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    
T  696 aacaccgatatttttataatagtt 719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14173 - 13945
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14173 aaaacacaatacatgtgtaattgaagaattgaatagattttgtaatcaattgatctaagcaaattgtataaaacctaattcaatgaattagattaatttt 14074  T
Q  131 tgatgaaaaa--ccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagg---gaagag 225  Q
      ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||    |||||    
T  14073 caatgaaaaaaacaacttagatcaacactagaaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtaaaaagtaaagaggatgggcaaaaagag 13974  T
Q  226 agataacaccaatatttttatagtagttc 254  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13973 agataacacccatatttttataatagttc 13945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 254
Target Start/End: Original strand, 41910 - 42148
Alignment:
Q  22 ctattaattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattatta-aaacctaattcaatgaatta 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41910 ctatcaattgcaaacacaatgcatgtgaaattgagaaattgaatagattttgcaatcaattgatctaagcaaattatttgaaacctaattcaatgaatta 42009  T
Q  121 gattaact-tttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaa----caattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagagga 215  Q
    | ||  || ||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    ||||| |||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  42010 ggttgtctctttaatgaaaaacaacttagatcaacactagcaactatcctaattaacaattgttcacttaatcacatgcaatagtaaaaagtaaagagga 42109  T
Q  216 tagggaagagagataacaccaatatttttatagtagttc 254  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42110 tatggaagagagataacactgatatttttatagtagttc 42148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 42150 - 41925
Alignment:
Q  32 aaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttt 130  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  42150 aaaacacaatacatgcgtaattgaagaattgaatagattttgcaatcaatagatctaagaaaagtatatgaaaccttattcaatgaattagattaatttt 42051  T
Q  131 tgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg-aagagagat 229  Q
      ||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  42050 caatgaaaaacaacatagatcaatactggcaattatcccaacaattattaaattaatcacatgcaatagtaaaaagtaaagaggaaagggaaagaaagat 41951  T
Q  230 aacaccaatatttttatagtagttcg 255  Q
    |||| | | |||||||||||||||||    
T  41950 aacaacgacatttttatagtagttcg 41925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7358 - 7124
Alignment:
Q  22 ctattaattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattatta-aaacctaattcaatgaatta 120  Q
    |||| ||||||||||||||  | |  ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||| | ||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  7358 ctatcaattgaaaacacaacacgtgtgaaattgaagaattgtatagatttttcaatcaattgatctatgaaaattatttgaaacataatttaatgaatta 7259  T
Q  121 gattaacttttga-tgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggatagg 219  Q
    ||||| ||||| | |||||||| | ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||    
T  7258 gattatcttttcaatgaaaaacaaattagatcaacactagcatttagcctaataattattcaattaatcacatgcaatagtaaaaagaaaagaggattgg 7159  T
Q  220 gaagagagataacaccaatatttttatagtagttc 254  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  7158 gaagagagataacactgatatttttattgtagttc 7124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 256 - 376
Target Start/End: Original strand, 13740 - 13861
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13740 tgttggtgtaagccctagagaccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 13839  T
Q  356 ga-taatgttaataaagtcctt 376  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  13840 tagtaatgttaataaagtcctt 13861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 315 - 468
Target Start/End: Original strand, 26413 - 26567
Alignment:
Q  315 ttttattattgaataatatatggcactctttattatatt--tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctg 412  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  26413 ttttattattaaataatatatggcactctttattatattcgttg-taatgttaataaagtccctagaatagatagttcgtgtaatcgtatattaagtgtg 26511  T
Q  413 acttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtag 468  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26512 acttaatcatgagattacattataataaagaacgttattcttaaatgtatcagtag 26567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 253
Target Start/End: Original strand, 20130 - 20336
Alignment:
Q  50 aattgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatga-aaaaccactta 147  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || | |||  |||||| | |||||||||| | |||  |||| ||||  |||||    
T  20130 aattgaaaaattgaatagattttgcaatcaattgatttaagcaaataatatgaaagataattcgacgaattagattgattttcaatgacaaaaaaactta 20229  T
Q  148 gatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg-aagagagataacaccaatatttttat 246  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20230 gatcaatactagcaattatcctaacaattattcaattaattacatgcaatagctaaaagtaaagagaatagggaaagagagataacaccaatatttttat 20329  T
Q  247 agtagtt 253  Q
    |||||||    
T  20330 agtagtt 20336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Original strand, 1795 - 1948
Alignment:
Q  99 taaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaata 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || |||| | |||||||||||||| |||   |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  1795 taaaacctaattcaaggaattagcttaa-ttttcatcaaaagcaacttagatcaacacaagtttctatcctaataattaatcaattag-catatgcaata 1892  T
Q  199 attaaaagtaaagaggatagggaagagagataacaccaatatttttatagtagttc 254  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1893 atcaaaagtaaagaggataaggaagagagataactccgatatttttatagtagttc 1948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8756
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 354  Q
    |||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||  || | ||||||| | ||||    
T  8479 tgttggtgtaaatcctagaggttaatagttttatgttaaaattattttatgtatcgtgatttttattattaaataaaatgaggtattctttatgaaattt 8578  T
Q  355 -agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtctgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 453  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||   | |||| ||  ||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||    
T  8579 gatataatattaataaagtccttagaatatatagttcaagtaatgg-acattatgtgagacttaatcatgagattacattaacataaagaacactattct 8677  T
Q  454 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    |||| ||||  |||||| ||| |||||||| |||  | |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  8678 taaaagtatttgtagtc-aagttttaatataaattga-gatagtaataaagcgtagagactaatatgtatgtagattgatg 8756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0783 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0783
Description:

Target: scaffold0783; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 255 - 313
Target Start/End: Original strand, 6226 - 6284
Alignment:
Q  255 gtgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatga 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6226 gtgttggtgtaagccctagaagccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatga 6284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7136 - 6954
Alignment:
Q  58 aattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacac 156  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | || |||  ||||||||| | |||||| || ||    
T  7136 aattgaatagaatttgcaatcaattgatctaagcaaattgtatgaaacctaactcaatgaattaggtcaattttcaatgaaaaacaaattagataaatac 7037  T
Q  157 tagtaattatcctaacaattatt---caattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg-aagagagataacacc 235  Q
    | | ||||| |||| ||||||||   |||||||||| | |||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  7036 tggcaattaacctatcaattattcaacaattaatcacaagcaatattgaaaagtaaaaaggatagggaaagagagagaacacc 6954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1400 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1400
Description:

Target: scaffold1400; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Original strand, 1826 - 1875
Alignment:
Q  256 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1826 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatg 1875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 255
Target Start/End: Original strand, 12718 - 12782
Alignment:
Q  191 atgcaataattaaaagtaaagaggatagggaagagagataacaccaatatttttatagtagttcg 255  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12718 atgcaacaattaaaagtaaagaggataagaaagagagataacactaatatttttatagtagttcg 12782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Original strand, 96654 - 96837
Alignment:
Q  53 tgaagaattgaatagatcttgcaatcaattgttctaagcaaattat-taaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttagatc 151  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| | ||||| | ||||| | || |||| || |||| |||| |||  ||||||||| | ||||||     
T  96654 tgaagaattgaaaagactttgcaatcaattgatctaggaaaattgtgtaaaagcgaactcaaagagttaggttaattttcaatgaaaaacaagttagatg 96753  T
Q  152 aacactagtaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaataattaaaagtaaagaggataggg-aagagagataacac 234  Q
    | |||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||   ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  96754 accacttgcaattaacctatcaattattcaattaatcacaagcaatatcaaaaagtaaaaaggatagggaaagagagagaacac 96837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 447 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 83377 - 83292
Alignment:
Q  447 ctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 534  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| |||  || |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  83377 ctattcttaaaagtatccgtagtcgaaa-tttaatataaattgag-ataataataaagtgtatagactattatgtatgtagactgatg 83292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University