View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11171A_low_25 (Length: 424)

Name: NF11171A_low_25
Description: NF11171A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11171A_low_25
NF11171A_low_25
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (20-394)||(4572109-4572485)
chr5 (20-333)||(14088171-14088485)
chr5 (20-334)||(29455692-29456008)
chr5 (29-334)||(1060857-1061157)
chr5 (20-334)||(14645217-14645533)
chr5 (20-333)||(41616486-41616805)
chr5 (29-334)||(14087565-14087871)
chr5 (40-334)||(7977932-7978228)
chr5 (29-334)||(31149594-31149902)
chr5 (20-334)||(15719082-15719388)
chr5 (35-334)||(41692371-41692674)
chr5 (20-333)||(6224736-6225038)
chr5 (35-334)||(34718687-34718990)
chr5 (30-324)||(41983159-41983455)
chr5 (35-333)||(19254391-19254693)
chr5 (40-327)||(22632157-22632444)
chr5 (29-215)||(18595382-18595569)
chr5 (46-331)||(38309679-38309970)
chr5 (44-334)||(4901862-4902147)
chr5 (35-334)||(6277716-6278021)
chr5 (155-333)||(15674006-15674184)
chr5 (155-334)||(33347102-33347282)
chr5 (40-322)||(30774719-30775006)
chr5 (158-334)||(36470480-36470656)
chr5 (43-278)||(639274-639512)
chr5 (48-144)||(3049685-3049782)
chr5 (30-147)||(6311073-6311190)
chr5 (44-332)||(19549253-19549546)
chr5 (180-327)||(10937329-10937477)
chr5 (43-334)||(16186669-16186964)
chr5 (52-247)||(35853510-35853709)
chr5 (51-147)||(25694596-25694692)
chr5 (155-253)||(35935288-35935387)
chr5 (57-135)||(36323124-36323202)
chr5 (60-333)||(32302305-32302567)
chr5 (46-146)||(30867-30967)
chr5 (48-143)||(42030960-42031055)
chr5 (60-147)||(5657649-5657736)
chr5 (67-204)||(16620250-16620389)
chr5 (155-194)||(24489099-24489138)
chr5 (48-121)||(10937472-10937546)
chr5 (167-311)||(15023353-15023498)
chr5 (219-334)||(30688-30803)
chr5 (260-333)||(30488521-30488594)
chr5 (236-324)||(6092746-6092834)
chr5 (33-101)||(25828322-25828390)
[»] chr1 (73 HSPs)
chr1 (20-334)||(42069017-42069325)
chr1 (20-334)||(13312633-13312951)
chr1 (20-334)||(35978400-35978716)
chr1 (20-333)||(44327823-44328131)
chr1 (20-334)||(9222143-9222459)
chr1 (20-334)||(25815216-25815534)
chr1 (20-334)||(48964259-48964581)
chr1 (30-340)||(424463-424777)
chr1 (20-333)||(19996567-19996882)
chr1 (20-334)||(29054496-29054813)
chr1 (20-334)||(2978319-2978633)
chr1 (20-334)||(19506283-19506600)
chr1 (20-333)||(2975138-2975451)
chr1 (30-271)||(25059064-25059307)
chr1 (31-334)||(28220868-28221172)
chr1 (42-334)||(610616-610904)
chr1 (30-322)||(945392-945686)
chr1 (29-334)||(7842467-7842773)
chr1 (24-299)||(27783449-27783709)
chr1 (35-334)||(4893197-4893500)
chr1 (35-334)||(29184987-29185290)
chr1 (35-334)||(33362800-33363103)
chr1 (20-253)||(33794289-33794528)
chr1 (20-147)||(12560507-12560634)
chr1 (60-334)||(31646230-31646506)
chr1 (20-147)||(43634397-43634524)
chr1 (52-334)||(39026641-39026927)
chr1 (31-334)||(21260650-21260942)
chr1 (46-296)||(20414906-20415160)
chr1 (47-262)||(32835429-32835646)
chr1 (40-147)||(13796983-13797090)
chr1 (29-147)||(38491517-38491635)
chr1 (60-333)||(48796438-48796715)
chr1 (58-334)||(48662558-48662837)
chr1 (56-209)||(29512140-29512294)
chr1 (56-296)||(973447-973691)
chr1 (156-311)||(47662198-47662354)
chr1 (40-147)||(236456-236563)
chr1 (226-333)||(12560670-12560776)
chr1 (158-334)||(2433161-2433339)
chr1 (155-333)||(8981596-8981765)
chr1 (60-334)||(35738942-35739219)
chr1 (158-302)||(43634670-43634814)
chr1 (44-296)||(9472886-9473142)
chr1 (58-333)||(22580002-22580273)
chr1 (156-253)||(29426342-29426440)
chr1 (46-333)||(2501474-2501763)
chr1 (29-147)||(3821175-3821293)
chr1 (48-146)||(46772403-46772501)
chr1 (185-322)||(38491331-38491469)
chr1 (234-334)||(32133399-32133500)
chr1 (186-334)||(40094568-40094717)
chr1 (158-249)||(30623029-30623121)
chr1 (30-146)||(31107549-31107665)
chr1 (46-110)||(32888378-32888442)
chr1 (156-311)||(48514355-48514511)
chr1 (63-321)||(4052300-4052560)
chr1 (60-147)||(16177002-16177089)
chr1 (157-334)||(30489566-30489744)
chr1 (46-296)||(50099751-50100004)
chr1 (20-147)||(35659638-35659766)
chr1 (29-146)||(45816529-45816645)
chr1 (44-146)||(14106384-14106487)
chr1 (60-253)||(35949530-35949727)
chr1 (180-334)||(14106220-14106372)
chr1 (52-138)||(32133568-32133655)
chr1 (60-138)||(7121100-7121178)
chr1 (229-334)||(34320849-34320954)
chr1 (52-138)||(28192415-28192502)
chr1 (61-147)||(40045006-40045091)
chr1 (48-96)||(48514573-48514622)
chr1 (262-298)||(33794525-33794561)
chr1 (80-144)||(40094471-40094535)
[»] chr4 (77 HSPs)
chr4 (24-334)||(12185689-12185995)
chr4 (24-334)||(12187681-12187988)
chr4 (20-334)||(42755251-42755567)
chr4 (20-322)||(21245761-21246065)
chr4 (24-334)||(14576702-14577009)
chr4 (20-334)||(52180661-52180978)
chr4 (20-334)||(21075740-21076053)
chr4 (20-334)||(42053151-42053468)
chr4 (20-334)||(29148900-29149216)
chr4 (20-334)||(3387096-3387416)
chr4 (20-334)||(32655406-32655722)
chr4 (20-333)||(2224841-2225158)
chr4 (24-334)||(2721126-2721433)
chr4 (20-269)||(41003295-41003549)
chr4 (19-334)||(54979029-54979342)
chr4 (20-322)||(38000519-38000822)
chr4 (20-294)||(652195-652477)
chr4 (20-322)||(52595467-52595771)
chr4 (20-334)||(8065875-8066184)
chr4 (30-287)||(33983094-33983353)
chr4 (20-334)||(34459515-34459831)
chr4 (20-332)||(25938277-25938591)
chr4 (35-334)||(53140521-53140824)
chr4 (20-147)||(4757229-4757356)
chr4 (35-333)||(29405770-29406072)
chr4 (20-333)||(54932629-54932927)
chr4 (35-334)||(52802162-52802466)
chr4 (29-322)||(22313249-22313543)
chr4 (35-334)||(45097472-45097776)
chr4 (20-322)||(23147336-23147631)
chr4 (155-334)||(11034606-11034786)
chr4 (35-253)||(22247851-22248074)
chr4 (30-217)||(3094871-3095049)
chr4 (58-334)||(22829660-22829927)
chr4 (29-253)||(28928516-28928742)
chr4 (40-241)||(1730955-1731158)
chr4 (35-334)||(46080628-46080932)
chr4 (29-147)||(2073519-2073637)
chr4 (52-334)||(28234087-28234372)
chr4 (48-250)||(56445072-56445279)
chr4 (158-333)||(1758003-1758179)
chr4 (40-333)||(27586488-27586783)
chr4 (43-296)||(8805831-8806088)
chr4 (60-332)||(39804183-39804457)
chr4 (60-331)||(51806854-51807127)
chr4 (48-144)||(52013888-52013985)
chr4 (35-334)||(33733288-33733589)
chr4 (29-116)||(44292890-44292977)
chr4 (47-144)||(23349303-23349401)
chr4 (58-333)||(31786331-31786604)
chr4 (60-334)||(7261933-7262199)
chr4 (168-266)||(26340264-26340363)
chr4 (47-144)||(41780748-41780846)
chr4 (157-333)||(9608881-9609056)
chr4 (47-144)||(27790960-27791059)
chr4 (29-104)||(47106518-47106593)
chr4 (156-253)||(22306824-22306922)
chr4 (48-147)||(24486663-24486764)
chr4 (74-144)||(31713571-31713641)
chr4 (214-334)||(3097996-3098117)
chr4 (44-278)||(50981860-50982092)
chr4 (271-339)||(26340384-26340452)
chr4 (158-333)||(29994231-29994407)
chr4 (214-334)||(46258055-46258175)
chr4 (48-138)||(14595409-14595500)
chr4 (60-138)||(26340154-26340232)
chr4 (197-293)||(2073674-2073771)
chr4 (167-311)||(31487200-31487345)
chr4 (51-195)||(8644146-8644291)
chr4 (48-147)||(9930538-9930638)
chr4 (58-144)||(22306724-22306808)
chr4 (60-147)||(44808561-44808648)
chr4 (93-147)||(39485090-39485144)
chr4 (55-144)||(7117853-7117942)
chr4 (213-322)||(52013730-52013839)
chr4 (272-332)||(4757063-4757123)
chr4 (185-292)||(7250558-7250666)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (24-334)||(240366-240673)
scaffold0005 (48-138)||(221878-221969)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (24-334)||(50480969-50481275)
chr3 (20-334)||(49359858-49360167)
chr3 (20-334)||(19618581-19618897)
chr3 (20-334)||(24987302-24987618)
chr3 (20-333)||(39352363-39352672)
chr3 (20-334)||(44792533-44792854)
chr3 (20-285)||(6408519-6408787)
chr3 (29-334)||(25467382-25467693)
chr3 (22-322)||(13735532-13735827)
chr3 (29-334)||(5040958-5041265)
chr3 (20-291)||(41923908-41924182)
chr3 (35-334)||(30247963-30248265)
chr3 (35-333)||(45079114-45079416)
chr3 (50-322)||(19873001-19873275)
chr3 (29-253)||(48080039-48080265)
chr3 (35-334)||(41410167-41410469)
chr3 (20-296)||(22845025-22845301)
chr3 (35-333)||(42096651-42096953)
chr3 (29-334)||(40563835-40564146)
chr3 (30-334)||(12905511-12905817)
chr3 (58-334)||(35688198-35688478)
chr3 (31-195)||(11671773-11671937)
chr3 (19-147)||(23298222-23298350)
chr3 (43-334)||(49374689-49374984)
chr3 (157-333)||(23299554-23299731)
chr3 (43-334)||(10085177-10085472)
chr3 (52-334)||(10192106-10192392)
chr3 (58-334)||(19454681-19454962)
chr3 (48-334)||(32995130-32995420)
chr3 (158-334)||(46819056-46819233)
chr3 (29-296)||(50508776-50509045)
chr3 (20-147)||(39952597-39952724)
chr3 (48-334)||(5908127-5908417)
chr3 (48-333)||(27064089-27064378)
chr3 (37-147)||(2150593-2150701)
chr3 (185-333)||(43657166-43657314)
chr3 (33-136)||(49193559-49193663)
chr3 (156-322)||(38694846-38695013)
chr3 (155-334)||(48583626-48583805)
chr3 (85-334)||(33558750-33558982)
chr3 (60-266)||(2012989-2013196)
chr3 (46-292)||(6083462-6083712)
chr3 (40-109)||(27346691-27346760)
chr3 (48-147)||(33118977-33119076)
chr3 (48-138)||(43657352-43657443)
chr3 (52-138)||(30964479-30964566)
chr3 (52-138)||(30980291-30980378)
chr3 (40-82)||(33333616-33333658)
chr3 (52-262)||(35732204-35732418)
chr3 (30-147)||(50622157-50622279)
chr3 (48-147)||(26787519-26787620)
chr3 (52-147)||(9162923-9163019)
chr3 (43-138)||(36679023-36679119)
chr3 (185-278)||(27346533-27346627)
chr3 (259-328)||(36692002-36692074)
chr3 (77-253)||(8340118-8340298)
chr3 (40-109)||(39144029-39144098)
chr3 (46-102)||(14418363-14418419)
chr3 (189-338)||(26795319-26795470)
chr3 (163-293)||(51055396-51055527)
chr3 (46-146)||(35203337-35203434)
chr3 (156-204)||(7940358-7940406)
chr3 (155-334)||(33099542-33099722)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (30-333)||(10066158-10066465)
chr7 (51-334)||(19804945-19805230)
chr7 (20-334)||(16567474-16567790)
chr7 (20-334)||(16597872-16598188)
chr7 (20-334)||(46181120-46181436)
chr7 (20-334)||(5023080-5023397)
chr7 (20-334)||(27398487-27398812)
chr7 (30-294)||(42284452-42284718)
chr7 (20-339)||(39414480-39414788)
chr7 (20-334)||(31454805-31455123)
chr7 (29-334)||(43224231-43224532)
chr7 (35-334)||(17172123-17172426)
chr7 (40-334)||(3362862-3363167)
chr7 (31-334)||(46782995-46783277)
chr7 (31-146)||(35092639-35092754)
chr7 (25-253)||(43702312-43702540)
chr7 (46-334)||(44300620-44300912)
chr7 (20-333)||(9477567-9477869)
chr7 (58-333)||(1875969-1876249)
chr7 (29-334)||(3551433-3551740)
chr7 (58-334)||(40342244-40342523)
chr7 (20-284)||(33067372-33067625)
chr7 (46-332)||(40789446-40789736)
chr7 (40-333)||(48558591-48558890)
chr7 (60-334)||(36074052-36074331)
chr7 (43-334)||(28067183-28067478)
chr7 (46-250)||(30391540-30391744)
chr7 (44-253)||(5923987-5924196)
chr7 (46-334)||(25309431-25309720)
chr7 (186-333)||(9355220-9355368)
chr7 (47-243)||(11244022-11244224)
chr7 (80-332)||(26299062-26299317)
chr7 (52-322)||(33978744-33979018)
chr7 (214-332)||(9223551-9223669)
chr7 (155-254)||(36072592-36072692)
chr7 (48-138)||(34152308-34152399)
chr7 (48-138)||(34174725-34174816)
chr7 (47-226)||(30738555-30738733)
chr7 (67-259)||(2959917-2960112)
chr7 (170-296)||(34152399-34152526)
chr7 (170-296)||(34174598-34174725)
chr7 (48-143)||(38398352-38398446)
chr7 (48-143)||(38400894-38400988)
chr7 (155-253)||(45112182-45112281)
chr7 (259-332)||(12499685-12499758)
chr7 (43-138)||(12499515-12499611)
chr7 (43-266)||(38469831-38470058)
chr7 (214-322)||(16560793-16560901)
chr7 (214-322)||(16604761-16604869)
chr7 (52-138)||(9223735-9223822)
chr7 (52-138)||(9355094-9355181)
chr7 (49-147)||(16278525-16278624)
chr7 (43-109)||(21153332-21153399)
chr7 (263-334)||(35092849-35092920)
chr7 (50-147)||(48644430-48644528)
chr7 (261-339)||(5924192-5924270)
chr7 (60-146)||(7376642-7376730)
chr7 (155-201)||(43218648-43218694)
chr7 (31-104)||(27039660-27039732)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (30-334)||(20691484-20691791)
chr6 (20-334)||(1329446-1329764)
chr6 (20-334)||(33331508-33331824)
chr6 (20-334)||(13534073-13534395)
chr6 (20-334)||(33328496-33328812)
chr6 (20-325)||(29641349-29641646)
chr6 (20-334)||(31070704-31071018)
chr6 (20-333)||(31783869-31784174)
chr6 (35-334)||(24447024-24447327)
chr6 (35-334)||(1221613-1221916)
chr6 (20-147)||(31511528-31511655)
chr6 (29-253)||(6938033-6938256)
chr6 (52-334)||(9062062-9062349)
chr6 (158-334)||(6337141-6337318)
chr6 (29-147)||(7807852-7807970)
chr6 (47-334)||(12429331-12429620)
chr6 (213-334)||(6799507-6799628)
chr6 (45-147)||(33960063-33960166)
chr6 (179-293)||(6337982-6338097)
chr6 (185-322)||(31511683-31511822)
chr6 (158-245)||(28769875-28769963)
chr6 (52-138)||(6799355-6799442)
chr6 (155-245)||(10499164-10499255)
chr6 (261-334)||(6937964-6938037)
chr6 (51-99)||(31555874-31555922)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (20-334)||(33867436-33867753)
chr2 (20-334)||(32422632-32422948)
chr2 (20-334)||(38620289-38620605)
chr2 (20-334)||(25424651-25424967)
chr2 (20-334)||(31440523-31440843)
chr2 (20-334)||(4480959-4481271)
chr2 (20-334)||(9205075-9205388)
chr2 (23-334)||(23231634-23231946)
chr2 (20-334)||(667862-668178)
chr2 (89-332)||(3329090-3329336)
chr2 (20-299)||(13142463-13142744)
chr2 (20-334)||(44070307-44070613)
chr2 (30-250)||(30241410-30241632)
chr2 (35-334)||(4289537-4289840)
chr2 (20-320)||(4592085-4592388)
chr2 (30-295)||(29155252-29155524)
chr2 (51-334)||(20936944-20937225)
chr2 (58-334)||(29546022-29546303)
chr2 (52-334)||(35048521-35048806)
chr2 (62-333)||(41935456-41935731)
chr2 (35-147)||(10391549-10391662)
chr2 (29-147)||(15150127-15150245)
chr2 (43-278)||(2656751-2656988)
chr2 (48-240)||(39767049-39767244)
chr2 (70-332)||(15234209-15234475)
chr2 (48-322)||(8027368-8027648)
chr2 (48-138)||(15162049-15162140)
chr2 (30-333)||(16711247-16711550)
chr2 (155-332)||(17154174-17154353)
chr2 (20-81)||(38958585-38958646)
chr2 (52-271)||(42968992-42969207)
chr2 (51-146)||(12757853-12757948)
chr2 (170-296)||(15161922-15162049)
chr2 (220-334)||(11788521-11788635)
chr2 (60-144)||(18974794-18974878)
chr2 (60-138)||(11788706-11788784)
chr2 (167-311)||(29221229-29221374)
chr2 (167-311)||(29334528-29334673)
chr2 (40-104)||(35005373-35005438)
chr2 (52-138)||(12345462-12345549)
chr2 (20-61)||(17961345-17961386)
chr2 (236-333)||(44928796-44928893)
chr2 (266-334)||(30241339-30241406)
chr2 (20-61)||(3329336-3329377)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (20-332)||(1376088-1376405)
chr8 (20-334)||(3616761-3617072)
chr8 (20-334)||(24789413-24789730)
chr8 (31-332)||(19643416-19643719)
chr8 (29-294)||(2620861-2621128)
chr8 (29-334)||(6109523-6109830)
chr8 (20-338)||(7057502-7057821)
chr8 (40-333)||(30801149-30801444)
chr8 (31-284)||(26561132-26561385)
chr8 (60-332)||(859404-859680)
chr8 (46-334)||(20216108-20216400)
chr8 (46-334)||(20235706-20235998)
chr8 (60-332)||(221885-222162)
chr8 (60-332)||(691040-691317)
chr8 (60-332)||(735508-735785)
chr8 (80-334)||(7579958-7580213)
chr8 (47-334)||(24891347-24891626)
chr8 (155-338)||(38019945-38020129)
chr8 (47-311)||(25500070-25500325)
chr8 (89-334)||(2472241-2472488)
chr8 (48-334)||(37226691-37226980)
chr8 (166-251)||(1667240-1667326)
chr8 (40-147)||(33212347-33212456)
chr8 (48-147)||(15542226-15542326)
chr8 (60-138)||(38551665-38551743)
chr8 (47-92)||(25419401-25419446)
chr8 (33-114)||(29528092-29528173)
chr8 (46-143)||(43511286-43511383)
chr8 (29-137)||(42987651-42987759)
chr8 (156-253)||(25419249-25419347)
chr8 (236-334)||(34776839-34776937)
chr8 (169-333)||(28970736-28970901)
chr8 (265-334)||(1667169-1667238)
chr8 (185-253)||(38551560-38551629)
chr8 (155-196)||(39221590-39221631)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (30-340)||(5772-6086)
[»] scaffold0164 (2 HSPs)
scaffold0164 (20-294)||(7003-7263)
scaffold0164 (20-294)||(14884-15144)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (35-333)||(26537-26839)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (58-334)||(26053-26333)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (44-338)||(250055-250354)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (52-333)||(109926-110210)
[»] scaffold0242 (4 HSPs)
scaffold0242 (185-334)||(13129-13279)
scaffold0242 (185-334)||(21964-22114)
scaffold0242 (43-143)||(12998-13098)
scaffold0242 (43-143)||(21833-21933)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (43-278)||(19990-20229)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (30-147)||(72497-72612)
[»] scaffold0938 (1 HSPs)
scaffold0938 (43-143)||(561-661)
[»] scaffold0062 (2 HSPs)
scaffold0062 (43-143)||(23791-23891)
scaffold0062 (43-143)||(33959-34059)
[»] scaffold0602 (1 HSPs)
scaffold0602 (51-195)||(5049-5194)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (56-96)||(8014-8054)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (179-265)||(14348-14435)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4572485 - 4572109
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  4572485 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttctatttgactaaatactacgattcgtatttttttatgagttaattttaaaaatttg 4572386  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctataggtat 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4572385 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgtcttttcatagttaaagtgcggataatggatgcgagtatgagcacttagatacccataggtat 4572286  T
Q  219 ggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||    
T  4572285 ggggaaggggactacagttgttgcccacgaggatacggacacgggtacggatatttttttataaatgcaggtatggggacgggcactgttgtaccctacc 4572186  T
Q  318 cattgggtacccattgctatctgataactatggaagtagtggataagtggaaagtgaagagttgaggatcatgtgga 394  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4572185 tattgggtagccattgctatccgataactacggaagtagtggataagtggaaagtgaagagttgaggatcatgtgga 4572109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14088485 - 14088171
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14088485 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacaattcatattattttatgaattaattttaaaaaattg 14088386  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-ta 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  14088385 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtacgggtatgggcacttaggtacc-atagggta 14088287  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||    
T  14088286 tggggaaggggactaaagttgttgcctacgagggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcgggtatggggacgggcactgtagtaccctacc 14088187  T
Q  318 cattgggtacccattg 333  Q
    ||||||||||||||||    
T  14088186 cattgggtacccattg 14088171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29456008 - 29455692
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  29456008 catcctgctggtgtacaatattttagagatattttaaatgtttttaattggactaaatactacaattcatattattttataagttaattttaaaatattt 29455909  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnng-tcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  29455908 tgaccatagttttatttcaattgtgatgtttttattatcttttcatagttaaagtgtgggtaatgggtgcgggtatgggcacttagatacccataaggta 29455809  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||  ||||    
T  29455808 tggggaagggcactaaagttgttgcccacgagggtacggacacgggtacgggtaatttttaaaaatgcgggtatggggatggacattatagtaccctacc 29455709  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    |||||| | ||||||||    
T  29455708 cattggatgcccattgc 29455692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1061157 - 1060857
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1061157 ggtgtataattttttagggatattttgaatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcgtag 1061058  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaag 225  Q
    |||||||||||||||||||         || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||| ||||||||||    
T  1061057 ttttatttcatttgtgatgtttttttttgttttttcatagttaaagtgcgtgtaatgggtgcgggtatgggcaattaggtacccataggatatggggaag 1060958  T
Q  226 gggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggt 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||      ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    ||||||||||    
T  1060957 gggactaaagttgttgcccacgagggt------acgggcacgggtattttttataaatgcgagtatgaggacggacactgtagtac--cccccattgggt 1060866  T
Q  326 acccattgc 334  Q
    |||||||||    
T  1060865 acccattgc 1060857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14645533 - 14645217
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14645533 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaatatcacggttcatgttattttatgagttaattttaaaaaattg 14645434  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtctttt--catagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-t 216  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||        | ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||| |    
T  14645433 agatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatggacacttaagtacccatagggt 14645334  T
Q  217 atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttac 316  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||  |||    
T  14645333 atgggggaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcgggtat-gggacgggcattgtagtaccctac 14645235  T
Q  317 ccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14645234 ccattgggtacccattgc 14645217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41616805 - 41616486
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaat-- 117  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||       
T  41616805 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacgattcgtattatttaatgagttaatttaaaaaaaaaa 41616706  T
Q  118 tgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn----gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||    
T  41616705 tgggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttattgt-ttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtacccata 41616607  T
Q  214 gg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtact 312  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||     
T  41616606 gggtatggagaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacggatacgggtattttttataaatgcgggtatggggacgggcattgtagtacc 41616507  T
Q  313 ttacccattgggtacccattg 333  Q
     |||| |||||||||||||||    
T  41616506 ctacctattgggtacccattg 41616486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14087871 - 14087565
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||     
T  14087871 ggtgtacaattttttagagatattttggatgtttttaatttgactaaatattacgattcgtattattttattagttaattttaaaagattttgatcataa 14087772  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaagg 226  Q
    |||||||||| ||||||||        || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  14087771 ttttatttcaattgtgatgtttttattgttttttcatagttaaagtgcggataatgg-tgcgggtatgggcacttagatacccatagggtatggggaaag 14087673  T
Q  227 ggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggta 326  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| || || | ||||||  |||||||||||||    
T  14087672 gcactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacggataatttttaaaaatgcgggtatggggatgggcattgtagtaccctacccattgggta 14087573  T
Q  327 cccattgc 334  Q
    ||||||||    
T  14087572 cccattgc 14087565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7978228 - 7977932
Alignment:
Q  40 ttttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcat 139  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||     
T  7978228 ttttagagatattttgaatgtttttaatttgactaaatactattattcatattatttttttagttaattttaaaagattttgatcataattttatttcaa 7978129  T
Q  140 ttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagtt 237  Q
    ||||||||        || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  7978128 ttgtgatgtttttattgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgagcacttagatacccatagggtatggggaagggcactaaagtt 7978029  T
Q  238 gttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || || | ||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  7978028 gttgcccacgagggtacggacacgggtacgggtaatttttaaaaatgcaggtatgaggatgggcattgtagtaccctacccattgggtaaccattgc 7977932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Original strand, 31149594 - 31149902
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||    
T  31149594 ggtgtataattttttagtgctattttggatgtttttaatttgactaaatattacgattcgtattattttatgagttaattttaagagattttgaccatag 31149693  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgag-cacttagatacctatagg-tatggggaag 225  Q
    |||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31149694 ttttatttcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgcggataatgggtgcgggtataaggcacttagatacccatagggtatggggaag 31149793  T
Q  226 gggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggt 325  Q
    |  |||| ||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| || |||||| |||||| |||||||||| || || | ||||||  ||||||||||||    
T  31149794 gacactaaagtcgttgcccacgagggtacagacacgagtacggataatttttaaaaatgcgggtatggggatgggcagtgtagtaccctacccattgggt 31149893  T
Q  326 acccattgc 334  Q
    |||||||||    
T  31149894 acccattgc 31149902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 15719082 - 15719388
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaa---aa 116  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  15719082 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaataa 15719181  T
Q  117 ttgggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-g 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||        |  ||||||||||||||             ||||||||||| |||||||  |||| ||| |    
T  15719182 ttgggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttggtttttcatagttaaa-------------gtgcgggtatgggcacttaagtacccatagg 15719268  T
Q  215 gtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtacttt 314  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||||  |    
T  15719269 gtatgaggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcggttatggggacgggcattgtagtaccct 15719368  T
Q  315 acccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15719369 acccattgggtacccattgc 15719388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Original strand, 41692371 - 41692674
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  41692371 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacaattcgtattattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 41692470  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggac 230  Q
    ||||| ||||||||         ||||||||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||| |     
T  41692471 tttcaattgtgatgttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgggggtatgagcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcat 41692570  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||||||||||||||| ||   |||||||||  |||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  41692571 taaagttgttgcccacgagggtacgggttcgggtacggacattttttacaaatgagggtatggggatggatactatagtaccctatccattgggtaccca 41692670  T
Q  331 ttgc 334  Q
    ||||    
T  41692671 ttgc 41692674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 333
Target Start/End: Original strand, 6224736 - 6225038
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  6224736 catcctgctggtgtacaatattttagagatattttggatgtttttaattggactaaatactacaattcgtattattttatgagttaattttaaaatattt 6224835  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||             ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||    
T  6224836 tgaccatagttttatttcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaa-------------gtgcgggtatgggcacttggatacccatagggta 6224922  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||| || || | ||||||  ||||    
T  6224923 tggggaagggcactaaagttgttgcccatgagggtacgggcacgggtacgagtaatttttaaaaatgcgggtatggggatgggcattgtagtaccctacc 6225022  T
Q  318 cattgggtacccattg 333  Q
    |||| | |||||||||    
T  6225023 cattagatacccattg 6225038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Original strand, 34718687 - 34718990
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  34718687 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacaattcgtattattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 34718786  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggac 230  Q
    ||||| ||||||||         ||||||||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||| |     
T  34718787 tttcaattgtgatgttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgggggtatgagcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcat 34718886  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||| ||||||||||| || | |||| ||||  |||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  34718887 taaagttgttgtccacgagggtacgggctcggggacggacattttttacaaatgagggtatggggatggatactatagtaccctatccattgggtaccca 34718986  T
Q  331 ttgc 334  Q
    ||||    
T  34718987 ttgc 34718990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41983455 - 41983159
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||  || ||||||    
T  41983455 gtgtacaattttttagagatattttggatgtttttaatttgactaaatactacgattcatattattttatggtttaattttaaaagatttagaccatagt 41983356  T
Q  130 tttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gtatggggaaggg 227  Q
    ||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | || || || |     
T  41983355 tttatttcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcaggtatgagcacttaggtacccatagagcataggaaatga 41983256  T
Q  228 gactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattggg 324  Q
     |||| |||||||||||||||||||| |  |||   |||||||| |||||| |||||  |||||| ||| || || | ||||||  |||||||||||    
T  41983255 cactaaagttgttgcccacgagggtacgagcacatatacgggtaatttttacaaatgagggtatgaggatgggcattgtagtaccctacccattggg 41983159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 19254391 - 19254693
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  19254391 taattttttagggatactttgtatgtttttttatttggctaaatactacgattcatactattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 19254490  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggac 230  Q
    ||||| ||||||||         ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| ||    
T  19254491 tttcaattgtgatgttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtgctcatagggtatggggaagggcac 19254590  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||| ||||||||||| || |  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  || ||||| ||||||||    
T  19254591 taaagttgttgtccacgagggtacgggcttgggtacgggcattttttacaaatgagggtatggggatggatactatagtaccctatccattaggtaccca 19254690  T
Q  331 ttg 333  Q
    |||    
T  19254691 ttg 19254693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 327
Target Start/End: Original strand, 22632157 - 22632444
Alignment:
Q  40 ttttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcat 139  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || |  | ||||||||||     
T  22632157 ttttagagatatttttgatgtttttaatttgactaaatactatgattcgtattattttatgggttaattttaaaagatttagacc--aattttatttcaa 22632254  T
Q  140 ttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtatggggaaggggactacagtt 237  Q
    ||||||||        |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| || |||| ||||    
T  22632255 ttgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgagtgcaggtatgatcacttaggtacccataaggtatggggaatggcactaaagtt 22632354  T
Q  238 gttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtac 327  Q
    ||||   |||| |||| || ||||| ||| |||| |||||| ||||||  ||||||||| || || | ||||||  ||||||||||||||    
T  22632355 gttgtatacgaaggtacgggcacggatacaggtaatttttacaaatgcgagtatggggatgggcattgtagtaccctacccattgggtac 22632444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18595569 - 18595382
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||     
T  18595569 ggtgtacaatttttaagagatattttggatgtttttaatttgactaaatactacgattcatattattttatgagttaattttaaaagatgtagaccataa 18595470  T
Q  129 ttttatttcatttgtgat-gnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg 215  Q
    |||||||||| |||||||         || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18595469 ttttatttcaattgtgatatttttattgtttttttatagttaaagtgcggataatgggtgcgggtataggcacttagatacctatagg 18595382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38309970 - 38309679
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgtttttt--atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgt 143  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||||||| ||||    
T  38309970 ggatattttggatgttttttttatttggctaaatattacgattcgtactattttattagttgatttaaataatttcggatcatagttttatttcaattgt 38309871  T
Q  144 gatg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgtt 240  Q
    ||||         ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | || ||| |||||||| ||||| |||| | |||||    
T  38309870 gatgttttttgttgtcttttcatagagaaagtgcggataatgtgtgcgggtatgagcacttaagtgcccatagggtatgggaaagggtactaaaattgtt 38309771  T
Q  241 gcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccat 331  Q
    ||||| ||||||| || | || ||||||| | |||||||||||||  ||||||| || ||  ||||||||||  || |||||||||| ||||    
T  38309770 gcccatgagggtacgggctcgagtacgggcatttttttataaatgagggtatggagatgggtactatagtaccctatccattgggtatccat 38309679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 334
Target Start/End: Original strand, 4901862 - 4902147
Alignment:
Q  44 agggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||| || ||||||||||||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| ||||    
T  4901862 agggatattttggatgttttttatttggct------tacgattcatactattttatgagttgatttgaaattttttggatcatatttttatttcaattgt 4901955  T
Q  144 gatgnnnnnnn---gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgt 239  Q
    ||||          |||||||||||||||   || || ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  4901956 gatgcttttttattgtcttttcatagtta---tgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtgcccatagggtatggggaagggcactaaagttgt 4902052  T
Q  240 tgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||| || |||||||||| |   ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  4902053 tacccacgagggtacggacacgggtacagacattttttacaaacgcgggtatggggatgagtactatagtaccctactcattgggtgcccattgc 4902147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Original strand, 6277716 - 6278021
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || | |||| || || || ||||||||||||||    
T  6277716 taattttttagggatattttgaatgtttttttatttggctaaatattacgattcgtactattttattagatgatttaaataattttggatcatagtttta 6277815  T
Q  134 tttcatttgtgatg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgc--gggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaagggg 228  Q
    ||||| |||| |||         ||||||||||||  |||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||  | || ||| |||||||||||| |     
T  6277816 tttcaattgtaatgttttatattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgcgggggtatgggcacttaagtgcccatagggtatggggaagagc 6277915  T
Q  229 actacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacc 328  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||| ||   |||||||| |||||  |||||||||| ||  ||||||||||  || |||||||||| |    
T  6277916 actaaagttgttgcccactcgggtacggactcgggtgcgaacattttttacaaatgagggtatggggatgggtactatagtaccctatccattgggtatc 6278015  T
Q  329 cattgc 334  Q
    ||||||    
T  6278016 cattgc 6278021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 333
Target Start/End: Original strand, 15674006 - 15674184
Alignment:
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  15674006 gtcttttcagagttaaattgcggataatgggtgcgggtatggacacttaggtgcccatagggtatggg-aagggcacgaaagttgttgcccacgagggta 15674104  T
Q  254 tggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
     || | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||  ||||||||||  | |||||||| |||||||||    
T  15674105 cgggcccgggtacgggtattttttacaaacgcgggtatggggatgggtactatagtaccctgcccattggatacccattg 15674184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 334
Target Start/End: Original strand, 33347102 - 33347282
Alignment:
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  33347102 gtcttttcagagttaaattgcagataatgggtgcgggtatggacacttaggtgcccatagggtatggggaagggcacgaaagttgttgcccacgagggta 33347201  T
Q  254 tggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
     || | ||||||||  ||||||||| ||| || | |||||||| ||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  33347202 cgggcccgggtacgaatattttttacaaacgcggatatggggatgggtactatagtaccctgcccattgggtacccattgc 33347282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30775006 - 30774719
Alignment:
Q  40 ttttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  30775006 ttttaggaataatttggatgtttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaaattggatcatagttttatttca 30774907  T
Q  139 tttgtgatgnnnnnnngtctttt--catagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacag 235  Q
      |||| ||        | ||||  ||| | ||||||| || || |||||||||||||  |||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  30774906 agtgtggtgatttttattatttttccatggctaaagtgcgggtagtgggtgcgggtataggcacttaagtgcctatagggtatggggaagggcactaaag 30774807  T
Q  236 ttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||||| ||| || | |||||||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  30774806 ttgttgcccacgagggtacggacacgagtacgagcatttttttacaaacgcggatatggggatggatactatagtaccctacccattg 30774719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 334
Target Start/End: Original strand, 36470480 - 36470656
Alignment:
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgg 256  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  36470480 ttttcatagctaaagtgctggtaatgggtgcgggtatggacacttaggtacccatagagtatggggaagggcactaaagttgttgcccacaagggtacgg 36470579  T
Q  257 acacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
     || | ||| |||| ||| ||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  36470580 gcatgagtatgggt-tttcttacaaatctgggtatggggatggacactatagtaccctatccattgggtacccattgc 36470656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 278
Target Start/End: Original strand, 639274 - 639512
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttg 142  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||| |||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| |||    
T  639274 tagggatatttttgatgttttttatttggctaaatactacgatttatactattttattagttgatttgaaattttttggatcataattttatttcaattg 639373  T
Q  143 tgatg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgt 239  Q
    || ||          ||||||||| ||||| ||| || |||| | |||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||| |  |||| ||||||    
T  639374 tggtgttttttattttcttttcatggttaatgtgcgggtaattgatgcgggtatgggcacttaagtacccatagggtatggggaaagacactaaagttgt 639473  T
Q  240 tgcccacgagggtatggacacgggtacgggtatttttta 278  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||| |||||||||||    
T  639474 tgcccacgagggtacgaactcggatacaggtatttttta 639512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 144
Target Start/End: Original strand, 3049685 - 3049782
Alignment:
Q  48 atattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaatttt-aaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  3049685 atattttggatgttttttatttgtctaaatattacgattcatattattttgtgagttgattttaaaaaaatttgaatcatagttttatttcaattgtg 3049782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 6311190 - 6311073
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |  ||||||| |    
T  6311190 gtgtacaatttttaagggatattttggataatttttatttggctaaatactacaattcgtactattttatgagttgatttaaaaaaaattagatcatatt 6311091  T
Q  130 tttatttcatttgtgatg 147  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  6311090 tttatttcaattgtgatg 6311073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19549546 - 19549253
Alignment:
Q  44 agggatattttggatgtt-ttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta-tttcattt 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||| || |||||||||| ||||| ||    
T  19549546 agggatattttggatgttattttatttagctaaatattatgattcgtactattttatgagttgatttgaaaattttgagaccatagttttattttcaatt 19549447  T
Q  142 gt--gatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtatggggaaggggactacagttg 238  Q
    ||   ||        |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||  |||||||||||||  || | |||||    
T  19549446 gtaatatattttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgtgggtatgggtacttaggtacccatggggtatggggaaggataccaaagttg 19549347  T
Q  239 ttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccatt 332  Q
    ||||||||| ||||| |  | ||| |||  | ||| |||| ||| |  |||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19549346 ttgcccacgtgggtacgagctcggatacatgcattctttacaaacgtgggtatggggaagggtactatagtaccctacccattgggtacccatt 19549253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10937477 - 10937329
Alignment:
Q  180 aatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtatttttta 278  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  10937477 aatgggtacgggtatgggcacttaggtgcccatagggtatggggaagggcactaaagttgttacccacgagggtatgggctcgggtacgggcatttttta 10937378  T
Q  279 taaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtac 327  Q
     |||  | |||||||||| ||  |||| |||||  ||| ||||||||||    
T  10937377 caaacacgggtatggggaagggtactacagtaccctactcattgggtac 10937329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16186964 - 16186669
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcattt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  || |||||||| |||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| ||    
T  16186964 tagggatattttggatgtttttttatttggttaaatactacgatttatactattttattagttgatttgaaattttttggatcataattttatttcaatt 16186865  T
Q  142 gtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gtatggggaaggggactacagttg 238  Q
     || ||         |||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||  ||||| |||| || |||| |||||    
T  16186864 atggtgttttttattgtcttttcacggttaaagtgcgggtaatgggtgcgtgtatgggcacttaagtacccataaagtatgtggaaaggaactaaagttg 16186765  T
Q  239 ttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||| ||||||||||  ||  || |||||||||||||||| ||| || | ||||| || | | ||||| ||||  | |||||||| ||||||||||    
T  16186764 ttgctcacgagggtacagattcgagtacgggtattttttacaaacgcggatatggagatgaatactattgtacccttcccattggatacccattgc 16186669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35853709 - 35853510
Alignment:
Q  52 tttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg--n 148  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||       
T  35853709 tttggatgtttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgattttaaaaaatttggatcatagttttatttcaagtgtggtgatt 35853610  T
Q  149 nnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacg 247  Q
           ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  | || ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  35853609 tttattatcttttcatggctaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtgcccatagggtatggggaaggacactaaagttgttgcccacg 35853510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Original strand, 25694596 - 25694692
Alignment:
Q  51 ttttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| || || ||  ||||| | |||||||||| ||||||||    
T  25694596 ttttggatgttttttatttggctaaatactacgattcgtactattttattagttgatttaaataattttagatcacaattttatttcaattgtgatg 25694692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35935387 - 35935288
Alignment:
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||  || ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  35935387 gtcttttcagagttaaactgtgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtgcccgtagggtatggagaagggcactaaagttgttgcccacgagggta 35935288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 36323202 - 36323124
Alignment:
Q  57 atgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatt 135  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  36323202 atgttttttatttggctaaatactacgattcatattatttgatgagttgatttgaaaaattttggaccatagttttatt 36323124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32302567 - 32302305
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg--nnnnnnngtc 157  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||          ||    
T  32302567 ttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttcaagtgtggtgatttttattatc 32302468  T
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgg 256  Q
    ||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  | || || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||            
T  32302467 tttccatggctaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtgcccataaggtatggggaaggacactaaagttgttgcccacga-------- 32302376  T
Q  257 acacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
          ||||||| |||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  32302375 ------gtacgggcattttttacaaacgcgggtatggggatggatactatagtaccctacccattgggtatccattg 32302305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 30967 - 30867
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtga 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| | | |||| |||||||| | ||||||    
T  30967 ggatgttttggatgttttttattttggtaaatactacgattcgtactcttttatgagttgatttgaaaaaatttgaaccataattttattttaattgtga 30868  T
Q  146 t 146  Q
    |    
T  30867 t 30867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42031055 - 42030960
Alignment:
Q  48 atattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgt 143  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  || |||||||||| ||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  42031055 atattttggatgtttttttatttaattaaatactacgatttctactattttatgaattgctttaaaaaaaat-ggatcatagttttatttcaattgt 42030960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 147
Target Start/End: Original strand, 5657649 - 5657736
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||  || |||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5657649 ttttttctttggttaaatactacgatttctactattttatgagttgctttaaaaaaaattggatcatagttttatttcaatagtgatg 5657736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 204
Target Start/End: Original strand, 16620250 - 16620389
Alignment:
Q  67 tttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcat 164  Q
    |||| |||||||| | |||||||| |||||||  |||| |||| |||   || ||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||    
T  16620250 tttggctaaatacgatgattcgtactattttactagttgatttaaaattttttggatcatagttttatttcaattgtgatgctttttattgtcttttcat 16620349  T
Q  165 agttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttag 204  Q
     | ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  16620350 tgctaaagtgtggataatgggtacaagtatgagcacttag 16620389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 194
Target Start/End: Original strand, 24489099 - 24489138
Alignment:
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24489099 gtcttttcatagttaaagtgtgggtaatgggtgcgggtat 24489138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 10937546 - 10937472
Alignment:
Q  48 atattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattggg 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||  ||| |||||| ||||    
T  10937546 atattttggatgtttttttatttgcctaaatactacgatttctactattttatgagttgctttaaaaaaaatggg 10937472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Original strand, 15023353 - 15023498
Alignment:
Q  167 ttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctataggt-atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggta 265  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||| | ||| |||||| || |||||  ||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||||   ||||||    
T  15023353 ttaaagtgcgggtaatgggcgcgagtacgggcatttagatgcccataggccatggggacgggcagtaaaattgttgcccacgagggtatgggttcgggta 15023452  T
Q  266 cgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtac 311  Q
    | |  |||||||| ||| || ||||||||||||| || ||||||||    
T  15023453 ctgacattttttacaaacgccggtatggggacgggcattatagtac 15023498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30803 - 30688
Alignment:
Q  219 ggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttaccc 318  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||| | | |||| |  ||| ||||  ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||||  |||||    
T  30803 ggggaaggacactaaagttgttgcccacaaagatatgaattcggatacgaatattttttacaaatgcaggtatagggaaggacattgtagtacggtaccc 30704  T
Q  319 attgggtacccattgc 334  Q
    ||  ||||||||||||    
T  30703 ataaggtacccattgc 30688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30488594 - 30488521
Alignment:
Q  260 cgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||| ||| ||||||||| | || ||||||| |||||||||    
T  30488594 cgggtacggatattttttataaataatggtatgaggatggatactatagtattctatccattggatacccattg 30488521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6092834 - 6092746
Alignment:
Q  236 ttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattggg 324  Q
    |||||||||||||||||||||   |  ||||||| |||||||| ||| || ||||| ||||||| || ||||||||  | |||||||||    
T  6092834 ttgttgcccacgagggtatgggttcaagtacgggcattttttacaaacgcgggtatcgggacgggcattatagtaccctgcccattggg 6092746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 101
Target Start/End: Original strand, 25828322 - 25828390
Alignment:
Q  33 tataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatga 101  Q
    |||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||   |||||||||| |||| || ||||||||||    
T  25828322 tataatttgttaaggatgttttggatgttttttattttgttaaatactacaattcatactattttatga 25828390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 42069017 - 42069325
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42069017 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgattaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 42069116  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tat 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  42069117 ggatcgtagttttatttcatttgtgattt-------ttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttagatacccatagggtat 42069209  T
Q  219 ggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttaccc 318  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||    
T  42069210 ggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcgggtatggggacgggcactgtagtaccctaccc 42069309  T
Q  319 attgggtacccattgc 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  42069310 attgggcacccattgc 42069325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13312951 - 13312633
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13312951 catcatgctggtgtataattttttaggcatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 13312852  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn---gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg- 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||          || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||     
T  13312851 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacttaagtacccataggg 13312752  T
Q  216 tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtacttta 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||  ||    
T  13312751 tatggggaaggggactaaagttgttgctcacgagggtacgggcacggatacgggtattttttataaatgcgggtatggggacgggcattgtagtacccta 13312652  T
Q  316 cccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13312651 cccattgggtacccattgc 13312633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 35978400 - 35978716
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35978400 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctacttgactaaataccacgattcatactattttatgagttaattttaaaaaattg 35978499  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-t 216  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||         || |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |    
T  35978500 agatcgtagttttatatcatttgtgatgtgtttttttgtttttttatatttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtacccatagggt 35978599  T
Q  217 atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttac 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  |||    
T  35978600 atggggaaggggactaaagttgttgcccttgagg-tacggacacgggtacgggtattttttataaatgtgggtatggggacgggcactgtagtaccctac 35978698  T
Q  317 ccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35978699 ccattgggtacccattgc 35978716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 333
Target Start/End: Original strand, 44327823 - 44328131
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44327823 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttttatttgactaaataccacgattcatattattt--tgagttaattttaaaaaattg 44327920  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||    
T  44327921 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatggacacttaggtacccatagggta 44328020  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttac 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||      |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  44328021 tggggaaggggactaaagttgttgctcacgagggt------acgggtacaggtatttttttataaatacgggtatggggacggtcactgtagtactctac 44328114  T
Q  317 ccattgggtacccattg 333  Q
    |||||||||||||||||    
T  44328115 ccattgggtacccattg 44328131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9222459 - 9222143
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9222459 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 9222360  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        || ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| | |||||  |||| ||| ||||    
T  9222359 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgtgggtatgggtacttaagtacccatagggta 9222260  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||||  ||||    
T  9222259 tggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgaacacgggtacggatattttttgtaaatgcgggtatggggacgggcattgtagtaccctacc 9222160  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    |||||| ||||||||||    
T  9222159 cattggatacccattgc 9222143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 25815216 - 25815534
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25815216 catcatgctggtgtataattttttagaaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 25815315  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn---gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg- 215  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||          || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||     
T  25815316 ggatcgtagttttattttatttgcgatgttttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacttaagtacccataggg 25815415  T
Q  216 tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtacttta 315  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||  ||    
T  25815416 tatggggaaggggaccaaagttgttgcccacgagggtatgggcacgggtacggatattttttataaatgcgggtatggggacgggcattgtagtacccta 25815515  T
Q  316 cccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25815516 cccattgggtacccattgc 25815534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 48964259 - 48964581
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48964259 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaatttttaaaaattg 48964358  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtctttt-------catagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat 212  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||        | ||||       ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||    
T  48964359 ggattgtagttttatctcatttgtgatgttttttattttttttatttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcactgaggtacccat 48964458  T
Q  213 ag-gtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtac 311  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||    
T  48964459 agagtatggggaaggggactaaagttgttgcccacgaggatacgggcaagggcacgggtattttttataaatgcgggtatggggacaggcactgtagtac 48964558  T
Q  312 tttacccattgggtacccattgc 334  Q
      |||||||||||||||||||||    
T  48964559 cctacccattgggtacccattgc 48964581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 424777 - 424463
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  424777 gtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaatttttaaaaattgggaccgtagt 424678  T
Q  130 tttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggg 227  Q
    ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  ||||   ||| ||| ||||||||    
T  424677 tttatttcatttgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgtgggtaatgggtgcaggtatgggcacttaagtacccgcaggatattgggaaggg 424578  T
Q  228 gactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta--ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggt 325  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||| || || | ||||||  || |||||||||    
T  424577 ggctaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacgggtattttttttataaatgcggacatggggaagggcattgtagtaccctatccattgggt 424478  T
Q  326 acccattgctatctg 340  Q
    ||||||||| |||||    
T  424477 acccattgccatctg 424463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 333
Target Start/End: Original strand, 19996567 - 19996882
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19996567 catcctgctggtgtacaattttttagagatattttggatgtttttaatttgactaaatactacgatttgtattattttatgagttaattttaaaagattt 19996666  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  19996667 agatcatagttttatttcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagtcaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgaacacttagatacccatagggta 19996766  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||| |||||| | |||||||| || || | ||||||  ||||    
T  19996767 tggggaagggcactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacaggtacgagtaatttttacaaatgcggatatggggatgggcattgtagtaccctacc 19996866  T
Q  318 cattgggtacccattg 333  Q
    ||||||| ||||||||    
T  19996867 cattgggcacccattg 19996882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 29054496 - 29054813
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29054496 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 29054595  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggt 216  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||          | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||    
T  29054596 acatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttatttattttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatggacacttaggtacccatagggt 29054695  T
Q  217 atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttac 316  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||  || | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || || |  |||||  ||     
T  29054696 atggggaaggggaccaaagttgttgcccacgagaatacgaacacgggtacatgtattttttataaatgcaggtatggagatgggcaatgcagtaccctat 29054795  T
Q  317 ccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29054796 ccattgggtacccattgc 29054813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2978633 - 2978319
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  2978633 catcatgttggtgtacaatattttagagatattttgtatgtttttaatttgactaaatactacgattcgtattattttataagttaattttaaaatattt 2978534  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-ta 217  Q
     || ||  ||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  2978533 tgacca--gttttatttcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgggggtaatgtgtgcgggtatgggcacttagatacccatagggta 2978436  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || || | ||||||  ||||    
T  2978435 tggggaagggcactaaagttgttgcccacaagggtacagacacgggtacgggtaatttttaaaaatgcgggtatggggatgggcattgtagtaccctacc 2978336  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||    
T  2978335 cattgggtacccattgc 2978319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19506600 - 19506283
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattatttt-atgagttaattttaaaaaatt 118  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  19506600 catcctgctggtgtacaatattttagagatattttaaatgtttttaattggactaaatactacaattcatattatttttataagttaattttaaaatatt 19506501  T
Q  119 gggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnng-tcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-t 216  Q
      || ||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  19506500 ttgaccatagttttatttcaattgtgatgtttttattatcttttcatagttaaagtgtgggtaatgggtgcgggtatgggcacttagatacccatagggt 19506401  T
Q  217 atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttac 316  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||  |||    
T  19506400 atggggaagggcactaaagttgttgcccacgagggtacggacacgagtacgggtaatttttaaaaattcgggtatggggatggacattatagtaccctac 19506301  T
Q  317 ccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  19506300 ccattggatacccattgc 19506283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 333
Target Start/End: Original strand, 2975138 - 2975451
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  2975138 catcatgttggtgtacaatattttagagatattttgtatgtttttaattagactaaatactacgattcgtattattttataagttaattttaaaatattt 2975237  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-ta 217  Q
     || ||  ||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||    
T  2975238 tgacca--gttttatttcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgggggtaatgtgtgcgggtatgggtacttagatacccatagggta 2975335  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||   | ||||| | ||||||| || |    
T  2975336 tggcgaagggcactaaagttgttgcccacgagggtacagacacgggtacgggtaatttttaaaaatgcgggtatgaaaatggacattgtagtactctatc 2975435  T
Q  318 cattgggtacccattg 333  Q
    ||||||||||||||||    
T  2975436 cattgggtacccattg 2975451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25059307 - 25059064
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||    
T  25059307 gtgtacaatattttaaagatattttgaatgtttttaatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaatattttgaccatagt 25059208  T
Q  130 tttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggg 227  Q
    ||||||||| |||| |||        |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25059207 tttatttcaattgtaatgtttttaatgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttagatacccatagggtatggggaaggg 25059108  T
Q  228 gactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta 271  Q
     |||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  25059107 cactaaagttgttgcccacgaggatacggacacaggtacgggta 25059064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28221172 - 28220868
Alignment:
Q  31 tgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtt 130  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| ||    
T  28221172 tgtacaattttttagagatattttggatgtttttaatttgattaaatactacaattcgtattatttcattagttcattttaaaagattttgatcataatt 28221073  T
Q  131 ttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaagggg 228  Q
    | |||||| ||||||||        || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||     
T  28221072 t-atttcaattgtgatgttttcattgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttagatacccatagggtatgggaaagggc 28220974  T
Q  229 actacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacc 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| || || | ||||||  |||||||||||||||    
T  28220973 actaaagttgttgcccacgagggtacgggcacggatacgggtaatttttaaaaatgcgggtatggggatgggcattgtagtaccctacccattgggtacc 28220874  T
Q  329 cattgc 334  Q
    ||||||    
T  28220873 cattgc 28220868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 610904 - 610616
Alignment:
Q  42 ttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcattt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||    
T  610904 ttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgatttgtactcttttatgagttaattttaaaaaatttggaccataattttatttcaatt 610805  T
Q  142 gtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgt 239  Q
    ||||||        |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||    
T  610804 gtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgtgcacttaagtacccatagggtatggggaagagaactaaagttgt 610705  T
Q  240 tgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||      ||||||| | |||||||| | |||||| | ||||||||  |||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  610704 tgcccacgagggt------acgggtatgagtatttttaacaaatgcggatatggggaaagacactgtagtaccctacccatagggtatccattgc 610616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 945686 - 945392
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  || ||||||    
T  945686 gtgtacaatattttaaagatattttgaatgtttttaatttgactaaatactacgatttgtattattttatgagttagttttaaaatattttgaccatagt 945587  T
Q  130 tttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggg 227  Q
    ||||||||| ||||||||        ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  945586 tttatttcaattgtgatgtttttattgtctttttataattaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttagatacccataggatatggggaaggg 945487  T
Q  228 gactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
     |||| ||||||||||||||||| || || || | ||||||||| |||||| |||| | |||||||||| || || | ||||||  |||||||||    
T  945486 cactaaagttgttgcccacgaggatacgggcatgtgtacgggtaatttttaaaaatacgggtatggggatgggcattgtagtaccctacccattg 945392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7842773 - 7842467
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||    
T  7842773 ggtgtacaattttttagagatattttggatgtttttaatttgactaaatactacgatttgtattattttatgagttaattttaagagatttagaccatag 7842674  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gtatggggaagg 226  Q
    ||||||||||  |||||||        |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  7842673 ttttatttcaagtgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgagtgcgggtatgggcacttagatacccatagagtatggagaagg 7842574  T
Q  227 ggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggta 326  Q
    | |||| ||| ||||| ||||| |||| || |||| ||||| ||| |||||| | |||| |||||||||| || || | ||||||  || ||||||||||    
T  7842573 gcactaaagtagttgcacacga-ggtacgggcacgagtacgtgtaatttttacagatgcgggtatggggatgggcattgtagtaccctatccattgggta 7842475  T
Q  327 cccattgc 334  Q
    ||||||||    
T  7842474 cccattgc 7842467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27783709 - 27783449
Alignment:
Q  24 atgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggat 123  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27783709 atgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattgggat 27783610  T
Q  124 catagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gtatgggg 222  Q
    | |||||||||||||||||||||         | ||||||||||| ||             ||||||||||| ||||| || |||| ||||  |||||||    
T  27783609 cgtagttttatttcatttgtgat----attttttttttcatagttgaa-------------gtgcgggtatgggcactgaggtacccatagactatgggg 27783527  T
Q  223 aaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacgg 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  27783526 aaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacgggtatttttttataaatgcggggatggggacgg 27783449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Original strand, 4893197 - 4893500
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  4893197 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacaattcgtattattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 4893296  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggac 230  Q
    ||||| ||||||||         ||||||||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||| |     
T  4893297 tttcaattgtgatgttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgggggtatgagcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcat 4893396  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  4893397 taaagttgttgcccacgagggtacgggctcgggtacggacattttttacaaatgagggtatggggatggatactatagtaccctatccattgggtaccca 4893496  T
Q  331 ttgc 334  Q
    ||||    
T  4893497 ttgc 4893500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29185290 - 29184987
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  29185290 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacaattcgtattattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 29185191  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggac 230  Q
    ||||| ||||||||         ||||||||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||| |     
T  29185190 tttcaattgtgatgttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgggggtatgagcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcat 29185091  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  29185090 taaagttgttgcccacgagggtacgggctcgggtacggacattttttacaaatgagggtatggggatggatactatagtaccctatccattgggtaccca 29184991  T
Q  331 ttgc 334  Q
    ||||    
T  29184990 ttgc 29184987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Original strand, 33362800 - 33363103
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  33362800 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacaattcgtattattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 33362899  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggac 230  Q
    |||   |||||||          ||||||||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||| |     
T  33362900 tttatattgtgatattttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgggggtatgagcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcat 33362999  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||||||||||||||| || | ||||||||   |||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  33363000 taaagttgttgcccacgagggtacgggctcgggtacgaacattttttacaaatgagggtatggggatggatactatagtaccctatccattgggtaccca 33363099  T
Q  331 ttgc 334  Q
    ||||    
T  33363100 ttgc 33363103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Original strand, 33794289 - 33794528
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  33794289 catcatgtcggtctataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacaattcatattattttatgaattaattttaaaaatttg 33794388  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtga-----tgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata- 213  Q
     |||| ||||||||||||||||||||     ||       || |||| ||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||     
T  33794389 agatcgtagttttatttcatttgtgattttttgtttttttgttttttaataattaaagtgcgagtaatgggtgcggatatgagcacttaggtacccatag 33794488  T
Q  214 ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  33794489 ggtatggggaaggggactaaagttgttgcctacgaaggta 33794528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 12560507 - 12560634
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12560507 catcatgttggtgtataattttttaaggatattttggatattttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 12560606  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12560607 ggatcgtagttttatttcatttgtgatg 12560634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 334
Target Start/End: Original strand, 31646230 - 31646506
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtga-tgnnnnnnngtct 158  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||   || ||||||||||||||||||| |||||  |        ||||    
T  31646230 ttttttatttggttaaatactatgattcatattattttatgagttgatttgaaattttttggatcatagttttatttcaattgtgggttttttgttgtct 31646329  T
Q  159 tttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgga 257  Q
    ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||     
T  31646330 tttcatagttaaaatgcgggtaacgggtgcgggtatgggcacttaggtgcccatagggtatggggaagggcactaaagttgttgcccacgagggtacggg 31646429  T
Q  258 cacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
      ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || ||  ||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  31646430 tccgggtacgggtattttttacaaacgcgggtatggagatgggtactatagtaccctacctgttgggtacccattgc 31646506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 43634397 - 43634524
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43634397 catcatgccgctgtataattttttggggatattttggatgttttctattttactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 43634496  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||    
T  43634497 agatcgtagttttatttcatttgtgatg 43634524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 39026927 - 39026641
Alignment:
Q  52 tttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnn 150  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||       
T  39026927 tttggatgtttttttatttggttaaatattacgattcatattattttgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttcatgtgtggtgatt 39026828  T
Q  151 nnnngt--cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacg 247  Q
         |  |||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  39026827 tttattatctttccatggctaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcactaaagttgttgcccacg 39026728  T
Q  248 agggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    || ||| |||| |||||||||| |||||||| ||| |  ||||||| || ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  39026727 agagtacggactcgggtacgggcattttttacaaacgtgggtatggcgatggatactatagtaccctatccattgggtacccattgc 39026641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Original strand, 21260650 - 21260942
Alignment:
Q  31 tgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtt 130  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| ||    
T  21260650 tgtacaattttttagagatattttggatatttttaatttgactaaatactacgattcgtattattttattagttaattttaaaagattttgatcataatt 21260749  T
Q  131 ttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gtatggggaagggg 228  Q
    || ||||| ||||||||        || ||||||||||||||||||             ||||||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||      
T  21260750 ttgtttcaattgtgatgtttttattgttttttcatagttaaagtgt-------------gggtatgtgcacatagatacccatagaatgtggggaaggac 21260836  T
Q  229 actacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacc 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | || |||||| |||||| |||||||||| || || | ||||||  |||||||| ||||||    
T  21260837 actaaagttgttgcccacgagggtatggacacggacactgataatttttaaaaatgcgggtatggggatgggcattgtagtaccctacccattaggtacc 21260936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20415160 - 20414906
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  20415160 ggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacgattcgtactattttattagttgatttaaataattttggatcatagttttatttcaattgtg 20415061  T
Q  145 atg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttg 241  Q
    |||         ||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||  ||||||  | || ||| |||| ||||||||| | || ||||||||    
T  20415060 atgttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatggccacttaagtgcccatagggtacggggaagggcagtaaagttgttg 20414961  T
Q  242 cccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatgggga 296  Q
    |||||||||||| || | ||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  20414960 cccacgagggtacgggctcggatacgggcattttttacaaatgagggtatgggga 20414906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 262
Target Start/End: Original strand, 32835429 - 32835646
Alignment:
Q  47 gatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    | ||||||||||||||| |||||||    
T  32835429 gatattttggatgtttttaatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaagatgtaaaccatagttttatttcaattgtgat 32835528  T
Q  147 -gnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtatggggaaggggactacagttgttgccc 244  Q
             |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||| |||| | || ||||||    
T  32835529 atttttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgagtgcgggtatgagcacttaggtacccataaagtatgaggaagggcactaaaattattgccc 32835628  T
Q  245 acgagggtatggacacgg 262  Q
    |  ||| || ||||||||    
T  32835629 aaaaggatacggacacgg 32835646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 147
Target Start/End: Original strand, 13796983 - 13797090
Alignment:
Q  40 ttttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcat 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||     
T  13796983 ttttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacaattcatactattttatgagttaattttaaaaaaattggaccataattttatttcaa 13797082  T
Q  140 ttgtgatg 147  Q
    ||||||||    
T  13797083 ttgtgatg 13797090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38491635 - 38491517
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   | |||||    
T  38491635 ggtgtataattttttagagatattttggatgtttttaattttactaaatactacgattcatattattttatgagttaattttaaaagatttataccatag 38491536  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatg 147  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  38491535 ttttatttcaattgtgatg 38491517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 48796715 - 48796438
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn---gt 156  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||| |||   |  ||||||||||| ||||||| ||||| ||          ||    
T  48796715 ttttttatttggttaaatactaccattcatactattttatgagttgatttgaaattttctggatcatagttgtatttcagttgtggtgcttttttattgt 48796616  T
Q  157 cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatg 255  Q
    ||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| | || | ||| ||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  48796615 cttttcagagttaaactgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtgcccaaagggtatagggaagggcactaaagttattgcccacgagggtatg 48796516  T
Q  256 gacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    | | ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| | ||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  48796515 ggcccggatacgggtattttttacaaacgcgggtatgggaatgggtactatagtaccctgcccattgggtacccattg 48796438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 48662837 - 48662558
Alignment:
Q  58 tgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtga---tgnnnnnnn 154  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||   || |||| ||| |||||||||| |||||    |            
T  48662837 tgtttttttttttgctaaatactacgattcatattattttatgagttgatttgaaattttttggataataattttatttcaattgtgggtttttattatt 48662738  T
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| |||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  48662737 gtcttttcataattaaaatgcgggtaatgggtgcgggtatgaacacttaggtgcccatagagtatggagaaaggcactaaagttgttgcccacgagggta 48662638  T
Q  254 tggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
      ||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  | ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48662637 -cgagtcgggtacggatattttttacaaacgcaggtatggaaatgggtactatagtaccctacccattgggtacccattgc 48662558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 29512140 - 29512294
Alignment:
Q  56 gatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnn 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||            
T  29512140 gatgttttttatttgattaaatactacaattcatactattttatgagttaattttaaaaaaattggaccatagttttatttcaattgtgatgtttttatt 29512239  T
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacc 209  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||| |||||||| ||||    
T  29512240 gtcttttcatagttaaagtgcgggtaatggatgcagatatgtgcacttaggtacc 29512294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 973691 - 973447
Alignment:
Q  56 gatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaat--tgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnn 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |   || ||||||||||||||| ||||||   | ||| | ||||||||||||| ||||||||          
T  973691 gatgttttttattttactaaatactactattggatctactttatgagttaatttaaaaaaaaaattggaccgtagttttatttcaattgtgatgttttta 973592  T
Q  154 n-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgaggg 251  Q
      ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| || |  |||| |||||||||||| | |      
T  973591 ttgtcttttcataattaaagtgcggataatgggtgcggatatgtgcacttaggtacccatagggtatgggaaatgacactaaagttgttgcccatgggaa 973492  T
Q  252 tatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatgggga 296  Q
    || |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  973491 tacggacacggttatgagtattttttacaaatgcaggtatgggga 973447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47662354 - 47662198
Alignment:
Q  156 tcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtat 254  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  47662354 tcttttcatggctaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcactaaagttgttgcccacgagggtac 47662255  T
Q  255 ggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtac 311  Q
    || |||||||||| | |||||||| ||| |  |||||||||| ||| ||||||||||    
T  47662254 gggcacgggtacgagcattttttacaaacgtgggtatggggatggatactatagtac 47662198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 236563 - 236456
Alignment:
Q  40 ttttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcat 139  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||     
T  236563 ttttagggatattttaaatattctttatttgactaaatactacaattcatattattttatgaattaattttaaaaaatttggaccatagttctatttcaa 236464  T
Q  140 ttgtgatg 147  Q
    ||||||||    
T  236463 ttgtgatg 236456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 333
Target Start/End: Original strand, 12560670 - 12560776
Alignment:
Q  226 gggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggt 325  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||||    
T  12560670 gggactaaagttgttgcccatgaggatacggacacgggtacgggtattttttataaatgcgggtatagggacgggcactatagtac-ctacctattgggt 12560768  T
Q  326 acccattg 333  Q
    ||||||||    
T  12560769 acccattg 12560776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2433339 - 2433161
Alignment:
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg--tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatg 255  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |    
T  2433339 ttttcatagcttaagtgtgggtaatgggtgagggtatgggcacttaggtacccataggggtatggggaaggacactaaagttgttgcccacgaaggtacg 2433240  T
Q  256 gacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
     |||||||||  ||||||| ||| |||||  | |||||||| || |||||||  ||  |||||||||||||| ||||||    
T  2433239 aacacgggtataggtatttcttacaaatgtggatatggggatgggcactataaaaccctacccattgggtactcattgc 2433161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 333
Target Start/End: Original strand, 8981596 - 8981765
Alignment:
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctataggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtat 254  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||         ||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  8981596 gtcttttcatagttaaagtgtaggtaatgggtgcgggtatgggcacatag---------ggtgtgggaaagggcactaaagttgttgcccacgagggtac 8981686  T
Q  255 ggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    || | || |||||| ||||||||| ||| || |||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  8981687 gggctcgagtacggatattttttacaaacgcgggtatgggaatggatactatagtaccctacccattggatacccattg 8981765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 334
Target Start/End: Original strand, 35738942 - 35739219
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngt--c 157  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||        |  |    
T  35738942 ttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttcaagtgtggtgatttttattatc 35739041  T
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgg 256  Q
    ||| ||| | ||||||| || | |||||||||| |||| |||||||  | || ||||| | |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||    
T  35739042 tttccatggctaaagtgcgggtgatgggtgcggatatgggcacttaagtgcccatagggtctggggaagggcactaaaattgttgcccacaagggtacgg 35739141  T
Q  257 acacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
     |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||| ||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||    
T  35739142 gcacgggtatgggcattttttacaaacgcgggtatgtggatggatactataataccctacccattgagtacccattgc 35739219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 302
Target Start/End: Original strand, 43634670 - 43634814
Alignment:
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgg 256  Q
    |||||||||| |||||| || | ||| |||||| ||||  ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  43634670 ttttcatagtaaaagtgcgggtgatgagtgcggatatggacacttaggtacccatagggtatggg-aaggggactaaagttgttgcccacgagggtacag 43634768  T
Q  257 acacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggaca 302  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43634769 gcacaggtgcgggtattttttataaatgcgggtatggagacggaca 43634814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9473142 - 9472886
Alignment:
Q  44 agggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttattt-catttg 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| || ||| |||||| |||| ||||   ||||| |||| |||||||| || |||    
T  9473142 agggatattttggattttttttatttagctaaatattatgattcgtactagtttctgagttgatttgaaaattctgggaccataattttattttcaattg 9473043  T
Q  143 tgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtatggggaaggggactacagttgt 239  Q
    ||||          |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||    |||| ||||||    
T  9473042 tgatatattttattgtcttttcatagttaaagtgcgagtaatgggtgcgggtatgagtacttagatacccataaggtatgggaaaatacactaaagttgt 9472943  T
Q  240 tgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatgggga 296  Q
    ||||||||||| || ||||   |||||||  |||||||| | |||| ||||||||||    
T  9472942 tgcccacgaggatacggacttaggtacggacattttttacatatgcgggtatgggga 9472886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 333
Target Start/End: Original strand, 22580002 - 22580273
Alignment:
Q  58 tgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtc 157  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||   || | | ||||||||||||||| |||||||         |     
T  22580002 tgttttttattttgttaaatactacgattcgtactatattatgagttgatttgaaattttttgaaccatagttttatttcaattgtgatatta-----ta 22580096  T
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgg 256  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| || |||| ||||| |||||| || || |||| | || ||| ||||| || || ||    
T  22580097 ttttcatagttaaattgcggataattggtgcgggtatgggcactaaggtacccataggatatgggaaaaggcactaaaattattgtccacggggatacgg 22580196  T
Q  257 acacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    || ||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||| || | ||||||  ||||||| || |||||||||    
T  22580197 actcgggtacgggtattttttacaaacacgggtattgggacgggcattgtagtaccctacccataggatacccattg 22580273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 253
Target Start/End: Original strand, 29426342 - 29426440
Alignment:
Q  156 tcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29426342 tcttttcagagttaaactgtgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtgcccatatggtatggggaagggcactaaagttgttgcccacgagggta 29426440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2501763 - 2501474
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtga 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||   || | | ||||||||||||| |  | |||    
T  2501763 ggatgttttggatgttttttattttgttaaatactacgattcgtactcttttatgagttgatttgaaattttttgaaccatagttttattttaactatga 2501664  T
Q  146 t-gnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtatggggaaggggactacagttgttgcc 243  Q
    |         |  |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || | || || ||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  2501663 tatttttattgatttttcagagttcaagtgtgggtaatgggtgcgggtatgggcgctaaggtgcccataagggatggggaaggacactaaagttgttgcc 2501564  T
Q  244 cacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    | |||| ||||||   |||||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||| || |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  2501563 cgcgagagtatgggatcgggtacgagtattttttacaaacgcgtgtatggggaagggcactgtagtaccctacccatagggtacccattg 2501474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 3821175 - 3821293
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||| || | |||   || |||||||||    
T  3821175 ggtgtacaattttgtagggatattttgaatgttttttatttggctaaatactacgattcgtacaattgtatgtgttgatctgaaattttttggatcatag 3821274  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatg 147  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  3821275 ttttatttcaattgtgatg 3821293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Original strand, 46772403 - 46772501
Alignment:
Q  48 atattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||| |||||| | | | ||||||||||||||| |||||||    
T  46772403 atattttgaatgttttttatttgactaaatactacgatttttactattttatgagttgttttaaaaaaaattgaaacatagttttatttcaattgtgat 46772501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 38491469 - 38491331
Alignment:
Q  185 gtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaat 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||  |||||  || |||||| ||||    
T  38491469 gtgcgggtatgggcacttagatacccatagggtatggggaagggtactaaagttgttgcctacgagggtacgggcacatgtacgattaatttttacaaat 38491370  T
Q  284 gcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
    || || ||| ||| ||||| | ||||||  |||||||||    
T  38491369 gcgggaatgaggatggacattgtagtaccctacccattg 38491331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32133500 - 32133399
Alignment:
Q  234 agttgttgcccacgagggtatggacac-gggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccatt 332  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | |||| | |||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32133500 agtttttgcccacgagggtacggacacagggtacgggcatttttcacaaatacgggtatggggatggttactatagtaccctacccattgggtacccatt 32133401  T
Q  333 gc 334  Q
    ||    
T  32133400 gc 32133399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 334
Target Start/End: Original strand, 40094568 - 40094717
Alignment:
Q  186 tgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatg 284  Q
    |||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |   || |||||  ||||||||| ||| |    
T  40094568 tgcgggtatgggcacttaggtgcccatagggtatggggaagggcactaaagttgttgcccacgaggatacaggtccgtgtacgaatattttttacaaacg 40094667  T
Q  285 caggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    | |||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||    
T  40094668 cgggtatggggatggatactatggtaccctacccattggatacccattgc 40094717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 249
Target Start/End: Original strand, 30623029 - 30623121
Alignment:
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgag 249  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||| |||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30623029 ttttcatagttaaagtataggtaatgggtgcgggtatggacacttagctactcatagggtatggggaagggaactaaagttgttgcccacgag 30623121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Original strand, 31107549 - 31107665
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||||||| || |||| ||| |||||||||| || |||| |||||||| ||| |||| |    
T  31107549 gtgtataattttttagggatattttgaatatgttttatctggctaaataataagatttgtactattttatgacttgatttgaaaaaatttggaccataat 31107648  T
Q  130 tttatttcatttgtgat 146  Q
    ||||||| | |||||||    
T  31107649 tttattttaattgtgat 31107665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 32888442 - 32888378
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaatttt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||    
T  32888442 ggatattttggatgttttttatttgcctaaatactacaattcgtactattttatgaattgatttt 32888378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48514511 - 48514355
Alignment:
Q  156 tcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtat 254  Q
    ||||||||| | |||| || || |||||||| ||| |||| |||||||  | || ||||| |||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||||     
T  48514511 tcttttcatggctaaaatgcgggtaatgggtacggttatgggcacttaagtgcccatagggtatgggaaagagcactaaagttgttgtccacgagggtac 48514412  T
Q  255 ggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtac 311  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||| | ||| ||||||||||    
T  48514411 ggacacgggtacgagcattttttacaaacgcgggtatgggaatggatactatagtac 48514355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 321
Target Start/End: Original strand, 4052300 - 4052560
Alignment:
Q  63 tttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn---gtctt 159  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  || ||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||          || ||    
T  4052300 tttatttggctaaatactaagatttctactattttacgagttggtttaaaaaaattgg-atcatagttttatttcaat-gtgatgtttttttattgtttt 4052397  T
Q  160 ttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggac 258  Q
    || ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |  |||| |||||||   ||||| |||| || |    
T  4052398 tttataattaaaatgtgggtaatgagtacgggtatgagcacttaggtacccataggatatggggaatgacactaaagttgttattcacgaaggtacgggc 4052497  T
Q  259 acgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccatt 321  Q
     |||||||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||    
T  4052498 tcgggtacggacattttttacaaacgcgggtatggggaaggatactattgtaccctacccatt 4052560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 147
Target Start/End: Original strand, 16177002 - 16177089
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16177002 ttttttatttggctaaatactacgatttctgctattttatgagttgatttaaaaaaaattggatcatagttttatttcaatggtgatg 16177089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30489744 - 30489566
Alignment:
Q  157 cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatg 255  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |    
T  30489744 ctttttataattaaagtgcgggtaatgggtacgggtataggcacttaggtgtccataggatatggggaagggcactaaagttgttatccacgagggtacg 30489645  T
Q  256 gacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    | | | |||||  | |||||||| ||| || |||||||||| |   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  30489644 ggctcaggtacatgcattttttacaaacgcgggtatggggaagagtactatagtaccctacccattggctacccattgc 30489566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 50100004 - 50099751
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |  |||||||||| || |||| ||    || | ||||||||||||||||| |||||    
T  50100004 ggatattttggatgtttttttatttacctaaatactacgattcatgctattttatgaattgatttgaatttttttg-atcatagttttatttcaattgtg 50099906  T
Q  145 atgnnnnnnngt--cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtatggggaaggggactacagttgttg 241  Q
     ||        |  |||||||  |||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||  | || || |||| |||||||| | |||| | |||||     
T  50099905 gtgttttttattatcttttcacggttaaagtgcaggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtgcccataaggtgtggggaagagcactaaaattgtta 50099806  T
Q  242 cccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatgggga 296  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||    
T  50099805 cccatgagggtacggactcgggtacgggcattttttacaaacgcgggtatgggga 50099751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 35659766 - 35659638
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatatttt-ggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaa-aaaat 117  Q
    |||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||  || |||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
T  35659766 catcatgtcggtgtacaattttttaggaatatttttggatatttta-atgtgactaaatattacggttcgtactatttaataagttaattttaaaaaaaa 35659668  T
Q  118 tgggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35659667 ttggatcatagttttatttcaattgtgatg 35659638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 45816645 - 45816529
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| | |||| ||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| |    
T  45816645 ggtgtacaatttcttagagatatcttggatattttttatttggttaaatattacgattcacattattttttgagttgatttaaaaaaatt-ggatcatgg 45816547  T
Q  129 ttttatttcatttgtgat 146  Q
    |||||||| | |||||||    
T  45816546 ttttatttaaattgtgat 45816529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14106487 - 14106384
Alignment:
Q  44 agggatattttggatgttt-tttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttg 142  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||| || |||| || || || ||||||| ||||||||||| |||    
T  14106487 agggatattttggatgtgtatttatttggctaaatactactattcctactattatatgaattgatttgaataattttggatcatggttttatttcaattg 14106388  T
Q  143 tgat 146  Q
    ||||    
T  14106387 tgat 14106384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 253
Target Start/End: Original strand, 35949530 - 35949727
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn---gt 156  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||| |||   |  ||||||||||| ||||||| ||||| ||          ||    
T  35949530 ttttttatttggttaaatactaccattcatactattttatgagttgatttgaaattttctggatcatagttgtatttcagttgtggtgcttttttattgt 35949629  T
Q  157 cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| | || | | ||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||||||    
T  35949630 cttttcagagttaaactgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtgcccacagggtatggggaatgacactaaagttgttgtccacgagggta 35949727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14106372 - 14106220
Alignment:
Q  180 aatgggtgcgggtatgagcacttagatacctataggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttat 279  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    | |||||||||  ||||||||     
T  14106372 aatgggtgcgggtatgggcacttaggtgcccg--ggtatgaggaagggtactaaagttgttgcccacgaggatacaagctcgggtacggacattttttac 14106275  T
Q  280 aaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    ||| |  ||||| |||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  14106274 aaacgtgggtatagggatggatactatagtaccctgcccattgggtaccaattgc 14106220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 32133655 - 32133568
Alignment:
Q  52 tttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32133655 tttggatgtttttttatttagttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttca 32133568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7121178 - 7121100
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7121178 ttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcacagttttatttca 7121100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34320954 - 34320849
Alignment:
Q  229 actacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacc 328  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||| | ||| |||    |||||||| ||| || |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34320954 actaaagttattacccacgagggtatgggctcggatacatacattttttacaaacgcgggtatggggaagggtactatagtactctacccattggatacc 34320855  T
Q  329 cattgc 334  Q
    ||||||    
T  34320854 cattgc 34320849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Original strand, 28192415 - 28192502
Alignment:
Q  52 tttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||| || ||||| ||||||||  | |||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  28192415 tttggatgtttttttatttggttaaatattatgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaaattggatcatagttttatttca 28192502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40045091 - 40045006
Alignment:
Q  61 tttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||| |  || |||||||||||| || ||||||||    
T  40045091 tttttatatggctaaattctacgattcatactattttatgagttgatttaaaaaaaat-tgaccatagttttattacaattgtgatg 40045006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 48514622 - 48514573
Alignment:
Q  48 atattttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattt 96  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  48514622 atattttggatgttttcttatttggctaaatattacgattcatattattt 48514573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 33794525 - 33794561
Alignment:
Q  262 ggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  33794525 ggtacgggtattttttataaatgcggatatggggacg 33794561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 144
Target Start/End: Original strand, 40094471 - 40094535
Alignment:
Q  80 tacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||   || ||||||||||||||||||| |||||    
T  40094471 tacgattcatattattttataagttgatttgaaattttttggatcatagttttatttcaattgtg 40094535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 77)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12185995 - 12185689
Alignment:
Q  24 atgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggat 123  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12185995 atgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattgggat 12185896  T
Q  124 catagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatgggg 222  Q
    | |||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||| |||||||    
T  12185895 cgtagttttatttcatttgtgattttt-----ttttttcatagttaaagtgcgggtaatggatgcgggtatgggcactgaggtacccatagggtatgggg 12185801  T
Q  223 aaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  12185800 aaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcgggtatggggacgggcactgtagtaccctacccattg 12185701  T
Q  323 ggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||    
T  12185700 ggtacccattgc 12185689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12187988 - 12187681
Alignment:
Q  24 atgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggat 123  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12187988 atgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattgggat 12187889  T
Q  124 catagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatgggg 222  Q
    | |||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||| |||||||    
T  12187888 cgtagttttatttcatttgtgatatttt----ttttttcatagttaaagtgcgggtaatggatgcgggtatgggcactgaggtacccatagggtatgggg 12187793  T
Q  223 aaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  12187792 aaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcgggtatggggacgggcactgtagtaccctacccattg 12187693  T
Q  323 ggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||    
T  12187692 ggtacccattgc 12187681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42755567 - 42755251
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42755567 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttttatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaacttg 42755468  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-ta 217  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||        || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||| ||    
T  42755467 ggatcgtagttttatttgatttgtgatgttttttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgtgcacttaggtatccatagggta 42755368  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||  ||||    
T  42755367 tggggaaggggactaaagttgttacccacgagggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgagggtatggggacgggcagtgtagtaccctacc 42755268  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||    
T  42755267 cattgggtacccattgc 42755251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21246065 - 21245761
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21246065 catcatgccggtgtataattttttagagatattttgaatgttttctatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 21245966  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtat 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  21245965 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttttgtcctttcatagttaaagtgtggataatggatgcggatatgggcacttagatacccatagggtat 21245866  T
Q  219 ggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  || |  |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||    
T  21245865 ggagaaggggactacagttgttgcccacgagaatacgtgcacgggtacgagaatttttttataaatgcaggtatggggatggacactgtagtaccctacc 21245766  T
Q  318 cattg 322  Q
    |||||    
T  21245765 cattg 21245761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14577009 - 14576702
Alignment:
Q  24 atgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggat 123  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14577009 atgccggtgtataattttttagggatattttgaatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattgggat 14576910  T
Q  124 catagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatgggg 222  Q
    | |||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||| |||||||    
T  14576909 cgtagttttatttcatttgtgatatttt----ttttttcatagttaaagtgcggataatggatgcgggtatgggcactgaggtacccataggatatgggg 14576814  T
Q  223 aaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||  |||||||||    
T  14576813 aaggggactaaaattgttgcccacgagggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcgggtatggggacgggcactgtaataccctacccattg 14576714  T
Q  323 ggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||    
T  14576713 ggtacccattgc 14576702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 52180661 - 52180978
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52180661 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 52180760  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtctttt--catagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-t 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        | ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | || ||  |||| ||||| |    
T  52180761 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacctaagtacccatagggt 52180860  T
Q  217 atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttac 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||  |||    
T  52180861 atggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacggatattttttataaatgcgggtatggggacggacattgtagtaccctac 52180960  T
Q  317 ccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||||||||    
T  52180961 ccattgggtacccattgc 52180978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21076053 - 21075740
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21076053 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgttatctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 21075954  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtat 218  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||         | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  21075953 ggatcgtagttttatttcttttgtgat--attttttttttttcatagttaaagtgcgggtaatggatgcgggtatgggcacttaggtacccatagggtat 21075856  T
Q  219 ggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttaccc 318  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  || ||    
T  21075855 ggggaaggggactaaaaatgttgcccacgagggtacgggcacgggtacaagtattttttataaatgcgggtatggggacgggcactgtagtaccctatcc 21075756  T
Q  319 attgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||||||    
T  21075755 attgggtacccattgc 21075740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 42053151 - 42053468
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42053151 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 42053250  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtctttt--catagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-t 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        | ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||  |||| | ||| |    
T  42053251 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacttaagtacccacagggt 42053350  T
Q  217 atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttac 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||  |||    
T  42053351 atggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacggatattttttataaatgcgggtatggggacgggcattgtagtaccctac 42053450  T
Q  317 ccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42053451 ccattgggtacccattgc 42053468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 29148900 - 29149216
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29148900 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 29148999  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||  |||| ||| ||||    
T  29149000 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacttaagtacccatagggta 29149099  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||  || |    
T  29149100 tggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcactggtacggatattttttataaatgcgggtatggggacgggcattgtagtaccctatc 29149199  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||    
T  29149200 cattgggtacccattgc 29149216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 3387096 - 3387416
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaa--- 116  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||       
T  3387096 catcatgtcggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaatttaaaaaaaaaa 3387195  T
Q  117 -ttgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag 214  Q
     ||| |||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||    
T  3387196 tttgagatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtacccatag 3387295  T
Q  215 g-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactt 313  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||      
T  3387296 ggtatggggaagaggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcgggtatggggacgggcattgtagtaccc 3387395  T
Q  314 tacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3387396 tacccattgggtacccattgc 3387416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 32655406 - 32655722
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32655406 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaat-g 32655504  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtctttt--catagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-t 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        | ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | || ||  |||| ||||| |    
T  32655505 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacctaagtacccatagggt 32655604  T
Q  217 atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttac 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||  |||    
T  32655605 atggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacggatattttttataaatgcgggtatggggacggacattgtagtaccctac 32655704  T
Q  317 ccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32655705 ccattgggtacccattgc 32655722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 333
Target Start/End: Original strand, 2224841 - 2225158
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2224841 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacaattcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 2224940  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgat-gnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggta 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||         || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||    
T  2224941 ggatcgtagttttatttcatttgtgatattttttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgagcacttaggtacccatcgggta 2225040  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta--ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtacttta 315  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||  ||    
T  2225041 tggagaaggggactaaaattgttgcccacgaaggtacgggcacgggtacgggtattttttttataaatacgggtatgtggacgggcactgtagtacccta 2225140  T
Q  316 cccattgggtacccattg 333  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  2225141 cccattaagtacccattg 2225158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 334
Target Start/End: Original strand, 2721126 - 2721433
Alignment:
Q  24 atgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggat 123  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2721126 atgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattgggat 2721225  T
Q  124 catagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatgggg 222  Q
    | |||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||    
T  2721226 cgtagttttatttcatttgtgat----attttttttttcatagttaaagtgcgggtaatggatgcgggtatgggcactgaggtacccatagggtatgggg 2721321  T
Q  223 aaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||||||| ||| || ||||||| || ||| ||| ||||||  || ||||||    
T  2721322 aaggggactaaagttgttgcccacgagggtatgggcacggatacagacattttttacaaacgcgggtatggagatggatactgtagtaccctatccattg 2721421  T
Q  323 ggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||    
T  2721422 ggtacccattgc 2721433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41003549 - 41003295
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41003549 catcatgccgttgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattc 41003450  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg----nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  41003449 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttttttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgagcacttaggtacccatagg 41003350  T
Q  216 -tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacggg 269  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  41003349 atatggggaaggggattaaagttgttgcccacaagggtacagacacgggtacggg 41003295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 334
Target Start/End: Original strand, 54979029 - 54979342
Alignment:
Q  19 acatcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaatt 118  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54979029 acatcatgccgatgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaatt 54979128  T
Q  119 gggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggt 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||        || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||  |||| ||| |||    
T  54979129 gggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgtgtacttaagtacccatagggt 54979228  T
Q  217 atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta--ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtacttt 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||      ||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||| || | ||||||  |    
T  54979229 atggggaaggggactaaagttgttatccacgaggg------cacgggtacgggtattttttttataaatacgggtatggggacgggcattgtagtaccct 54979322  T
Q  315 acccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  54979323 acccattgggtacccattgc 54979342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 38000822 - 38000519
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38000822 catcatgccggtgtatgattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaacaccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 38000723  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-----nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-a 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||            || ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||| |||| || |    
T  38000722 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttttttgttttttcatagttaaagttcagataatggatgcgggtatgggcacttaggtacccataa 38000623  T
Q  214 ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtact 312  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||      ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||     
T  38000622 ggtatggggaaggagactaaagttgttgcccacgtgggt------acgggtacgagtatttttttataaatgcgggtatggagacggacactgtagtacc 38000529  T
Q  313 ttacccattg 322  Q
     |||||||||    
T  38000528 ctacccattg 38000519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 652477 - 652195
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  652477 catcatgtcggtgtataattttttaggtatattttggatgttttctattttactaaatatcacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 652378  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-------nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||              || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||    
T  652377 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttgttttttttgttttttcataattaaagtgtgggtaatgagtgcgggtaagggcacttaggtacccat 652278  T
Q  213 a-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggg 294  Q
    | ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  652277 agggtatggagaaggggactattgttgttgcccacgaaggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcgggtatggg 652195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 52595771 - 52595467
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52595771 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcagatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 52595672  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-ta 217  Q
     |||  ||||||||||| | ||||||||        || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||| ||    
T  52595671 agattgtagttttattttacttgtgatgttttttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatggacacttaagtacccatagggta 52595572  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||  || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||  ||||    
T  52595571 tgatgatggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacggatacggatattttttataaatgcgggtatggggacggacattgtagtaccgtacc 52595472  T
Q  318 cattg 322  Q
    |||||    
T  52595471 cattg 52595467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8066184 - 8065875
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8066184 catcatgatggtgtataattttctagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 8066085  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggta 217  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||| ||||      ||| || |||||    
T  8066084 gaatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgttttttcatagttaaagttagagtaatggatgcgggtatgggcac------acccataaggta 8065991  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    | ||||| ||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||  ||||    
T  8065990 t-gggaaagggactaaagttgttgtccgcgtgggtacgggcacgggtacgagtattttttataaatgcagatatggggatgggcactgtagtaccctacc 8065892  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    |||||| ||||||||||    
T  8065891 cattggatacccattgc 8065875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33983353 - 33983094
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||| |    
T  33983353 gtgtacaattttttagagatattttggatgtttttaatttgactaaatactacgattcgtattattttattagttcattttaaaagattttgatcataat 33983254  T
Q  130 tttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggg 227  Q
    ||||||||| ||||||||         | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  33983253 tttatttcaattgtgatgttttcattattttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttagatacccataggatataggaaaggg 33983154  T
Q  228 gactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcag 287  Q
     |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  33983153 cactaaagttattgcccacgagggtacggacacgggtacaggtaatttttaaaaatgcag 33983094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 34459515 - 34459831
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  34459515 catcctgctggtgtacaatattttagagatatttttgatgtttttaattggactaaatactacgattcatattattttatgagttaattttaaaatattt 34459614  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  34459615 tgaccatagttttatttcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgagtgcaagtatgtgcacttagatacccatagggta 34459714  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    || |||| |  |||| ||||||||| |||||||||| || ||||| ||| | || |||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||  ||||    
T  34459715 tgaggaatgacactaaagttgttgcacacgagggtacgggcacggatacagataatttttaaaaatgcgggtatgaggatgggcattatagtaccctacc 34459814  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
     ||||||||||||||||    
T  34459815 tattgggtacccattgc 34459831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25938591 - 25938277
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25938591 catcatgccggtgtataattttttagaaatatttcggatgttttctatttgactaaataccgcggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 25938492  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||        || |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||  |||| | | ||||    
T  25938491 ggatcgtaattttatttcatttgtgatgttttttttgtttttttatagttaaagtgctggtaatgggtgcgggtatgggtacttaagtacccacatggta 25938392  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||  ||||    
T  25938391 tggagaaggggactaaagttgttgtccacgaggatacaggcacggatacggatattttttataaatacgggtatgggaacggacattgtagtaccctacc 25938292  T
Q  318 cattgggtacccatt 332  Q
     ||||| ||||||||    
T  25938291 aattggatacccatt 25938277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 53140824 - 53140521
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  53140824 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacaattcgtattattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 53140725  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggac 230  Q
    ||||| ||||||||         ||||||||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||| |     
T  53140724 tttcaattgtgatgttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgggggtatgagcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcat 53140625  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  53140624 taaagttgttgcccacgagggtacgggctcgggtacggacattttttacaaatgagggtatggggatggatactatagtaccctatccattgggtaccca 53140525  T
Q  331 ttgc 334  Q
    ||||    
T  53140524 ttgc 53140521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4757356 - 4757229
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757356 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 4757257  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4757256 ggatcgtagttttatttcatttgtgatg 4757229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 29405770 - 29406072
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  29405770 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggttaaatactacgattcgtactattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 29405869  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gtatggggaaggggac 230  Q
    ||||| |||||||          ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | || |||| ||||||||||||| ||    
T  29405870 tttcaattgtgatatttttttttgtcttttcatagagaaagtgcggataatgggtgcaggtatgggcacttaggtgcccatagagtatggggaagggcac 29405969  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||||||||||||||| |  | |||||||| | |||||||| |||||  |||||||||| ||  ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  29405970 taaagttgttgcccacgagggtacgagctcgggtacgagcattttttacaaatgagggtatggggatgggtactatagtaccctatccattgggtaccca 29406069  T
Q  331 ttg 333  Q
    |||    
T  29406070 ttg 29406072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 333
Target Start/End: Original strand, 54932629 - 54932927
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54932629 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgataaaataccacgattcatgttattttatgagttaattttaaaaaattg 54932728  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtat 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||             ||||||||||   ||| ||| || | || ||||||    
T  54932729 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttt---ttttttcatagttaaa-------------gtgcgggtattgacacctaggtatccataaggtat 54932812  T
Q  219 ggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttaccc 318  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||  |||||    
T  54932813 ggggaaggagactaaagttgttgcccacgaggatacgtgcacgggtatgagtattttttataaatgcggatatggggacgggcactgttgtaccctaccc 54932912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Original strand, 52802162 - 52802466
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  52802162 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacaattcgtattattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 52802261  T
Q  134 tttcatttgtgatg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggac 230  Q
    ||||| ||||||||         ||||||||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||  | || ||| |||||||||||||| |     
T  52802262 tttcaattgtgatgttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgggggtatgagcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcat 52802361  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccc 329  Q
    || |||||||||||||||||||| || | |||||||||  | ||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  |  |||||||||||||    
T  52802362 taaagttgttgcccacgagggtacgggctcgggtacggacatttttttacaaatgagggtatggggatggatactatagtaccctgtccattgggtaccc 52802461  T
Q  330 attgc 334  Q
    |||||    
T  52802462 attgc 52802466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 322
Target Start/End: Original strand, 22313249 - 22313543
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||     
T  22313249 ggtgtacaattttttagagatattttgaat-ttttgaatttgactaaatactacgattcatattattttattagttaattttaaaagattttgatcataa 22313347  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaagg 226  Q
    |||||||||| ||||||||        || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22313348 ttttatttcaattgtgatgtttttattgttttttcatagttaaagtgcggataatgagtgcgggtatggacacttagatacccataggatatggggaagg 22313447  T
Q  227 ggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
      |||| ||||||| |||| ||||||| || ||||||||| |||| |||||  |||||| | |||||||| || || | ||||||  |||||||||    
T  22313448 acactaaagttgtttcccatgagggtacgggcacgggtacaggtaattttttaaaatgcggatatggggatgggcattgtagtaccctacccattg 22313543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 45097776 - 45097472
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  45097776 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttgaccaaatactacaattcgtactattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 45097677  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn---gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaagggga 229  Q
    ||| | ||||||||          ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||  |||||||| | || ||||| ||||| |||||| |    
T  45097676 ttttaattgtgatgtttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgcgggtataggcacttaggtgcccatagggtatggagaagggca 45097577  T
Q  230 ctacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccc 329  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || | |||||||  | |||||||| |||||  |||||||||| ||  ||||||||||  || |||||||||||||    
T  45097576 ctaaagttgttgcccacgagggtacgggctcgggtaccagcattttttacaaatgagggtatggggatgggtactatagtaccctatccattgggtaccc 45097477  T
Q  330 attgc 334  Q
    |||||    
T  45097476 attgc 45097472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23147631 - 23147336
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23147631 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctaattgactaaataccaaggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 23147532  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-----nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata- 213  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||            || ||||||||||||||             |||||||||||  ||||||  ||||||||     
T  23147531 agatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttttttgttttttcatagttaaa-------------gtgcgggtatggacacttaagtacctatag 23147445  T
Q  214 ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactt 313  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||  |    
T  23147444 ggtatggggaatgagactaaagttcttgcccacgaaggtacgggcacgggtacggatattttttataaatgcgggtatggggacgggcattgtagtatct 23147345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 155 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11034786 - 11034606
Alignment:
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11034786 gtcttttcagagttaaactgcggataatgggtgcgggtatgggcacttaggtgcccatagggtatggggaagggcactaaagttgttgcccacgagggta 11034687  T
Q  254 tggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
     ||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  11034686 cgggtccgggtacgggtattttttacaaacgcaggtatggggatgggtactatagtaccctgcccattgggtacccattgc 11034606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22248074 - 22247851
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  22248074 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacaatttgtattattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 22247975  T
Q  134 tttcatttgtgatg---nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaagggga 229  Q
    ||||| ||||||||          ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| |    
T  22247974 tttcaattgtgatgtttttttattgtcttttcatagagaaagtgcggataatgggtgcgggtatgagcacttaagtgcctatagggtatggggaagggca 22247875  T
Q  230 ctacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||    
T  22247874 ctaaagttgttgcccacaagggta 22247851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 217
Target Start/End: Original strand, 3094871 - 3095049
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3094871 gtgtataattttttagggat--tttggatgttttctatttgactaaatactacgatttatattattttatgagtcaattttaaaaaattgggatcgtagt 3094968  T
Q  130 tttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctataggta 217  Q
    |||||||||||| ||||         | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||    
T  3094969 tttatttcatttatgat-------ttttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtactcataggta 3095049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22829927 - 22829660
Alignment:
Q  58 tgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtga--tgnnnnnnng 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||   || ||||||||||||||||||| |||||   |        |    
T  22829927 tgttttttatttggctaaatactacgattcatattattttatgagttgatttgaaattttttggatcatagttttatttcaattgtgggtttttttattg 22829828  T
Q  156 tcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtat 254  Q
    | |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||         
T  22829827 ttttttcatagttaaaatgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtgcccatagggtatggggaagggcactaaagttgttgcccacgag----- 22829733  T
Q  255 ggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
           ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22829732 -------ggtacgggtattttttacaaacgcgggtatggggatgggtactatagtaccctacccattgggtacccattgc 22829660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 253
Target Start/End: Original strand, 28928516 - 28928742
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||    
T  28928516 ggtgtacaattttttagagatattttggatgtttttaaattgactaaatactacgatttgtattattttatgagataattttaaaagatttagaccatag 28928615  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gtatggggaagg 226  Q
    |||||||||| |||| |||        |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  28928616 ttttatttcaattgtaatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgcggataataggtgtgaatatgagaatttagatacccatagcgcatggggaagg 28928715  T
Q  227 ggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
      || | ||||||||||||||| ||||    
T  28928716 acaccaaagttgttgcccacgaaggta 28928742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 241
Target Start/End: Original strand, 1730955 - 1731158
Alignment:
Q  40 ttttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcat 139  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||  ||||||||||||||     
T  1730955 ttttagagatattttggatgtttttaatttgactaaatactacaattcatattattttatgaattaattttaaaagatttagactatagttttatttcaa 1731054  T
Q  140 ttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gtatggggaaggggactacagtt 237  Q
    ||||||||        ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| | ||    
T  1731055 ttgtgatgtttttattgtcttttcataattaaagtgcggacaatggatgcaggtatgggcacttaggtacccatagagtatggggaagggtactaaattt 1731154  T
Q  238 gttg 241  Q
    ||||    
T  1731155 gttg 1731158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 46080932 - 46080628
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | || |||| || || ||   ||||||||||||    
T  46080932 taattttttagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactatgattcgtactattttatcaattgatttaaataattttatatcatagtttta 46080833  T
Q  134 tttcatttgtgatg---nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaagggga 229  Q
    ||||| ||||||||          ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||  | |  ||| ||||||| ||| |  |    
T  46080832 tttcaattgtgatgtttttttattgtcttttcatagagaaagtgtgggtaatgagtgcgggtatggacacttaagtgctcatagggtatggagaatgaca 46080733  T
Q  230 ctacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccc 329  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||  |  ||||||||||  || |||||||||||||    
T  46080732 ctaaagttgttgcccacgaggctacggacacaggtacgggcattttttacaaatgagggtatggggattggtactatagtaccctatccattgggtaccc 46080633  T
Q  330 attgc 334  Q
    |||||    
T  46080632 attgc 46080628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 2073519 - 2073637
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||    
T  2073519 ggtgtacaattttttagagatattttagatgtttttaatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaagatttagaccatag 2073618  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatg 147  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  2073619 ttttatctcaattgtgatg 2073637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 334
Target Start/End: Original strand, 28234087 - 28234372
Alignment:
Q  52 tttggatgtt-ttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnn 150  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||       
T  28234087 tttggatgttgttttatttggttaaatattacaattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttcaggtgtggtgatt 28234186  T
Q  151 nnnngt--cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacg 247  Q
         |  |||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  28234187 tttattatctttccatggctaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcactaag-tgcccatagggtattgggaagggcactaaagttgttgtccacg 28234285  T
Q  248 agggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||| || |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  28234286 agggtacgggcacgggtacggacattttttacaaatgcgggtatggggatggatactatagtaccctatccattgggtacccattgc 28234372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 250
Target Start/End: Original strand, 56445072 - 56445279
Alignment:
Q  48 atattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaatttt-aaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  56445072 atattttggatgttttttatttggctaaatactacgattcatattattttgtgagttgattttaaaaaaatttggatcatagttttatttcaattgtggt 56445171  T
Q  147 g---nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtatggggaaggggactacagttgttgc 242  Q
    |           ||||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||  | || || ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  56445172 gtttttttattatcttttcatggctaaagtgcgggtaatgggtgcgagtatgggcacttaagtgcccataaggtatggggaaggacactaaagttgttgc 56445271  T
Q  243 ccacgagg 250  Q
    ||||||||    
T  56445272 ccacgagg 56445279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 333
Target Start/End: Original strand, 1758003 - 1758179
Alignment:
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgg 256  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  1758003 ttttcataactaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtacccatagggtatggggaagggccctaaagttgttgcccacgaaggtacgg 1758102  T
Q  257 acacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
     |||||||| ||| |||| ||| |||||  ||||||| || || |||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  1758103 gcacgggtatgggcatttcttacaaatgtgggtatggagatgggcactatagtaccctacccattggatacccattg 1758179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 333
Target Start/End: Original strand, 27586488 - 27586783
Alignment:
Q  40 ttttagggatattttggatgttttttattt-gactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |  || |||||||||| || |    
T  27586488 ttttagggatattttgaatgttttttattttgactaaatactaagattcatactatcttatgagttaattttacaaaaatttgaccatagtttta-ttaa 27586586  T
Q  139 tttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagt 236  Q
     |||| |||        ||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| ||| |||| |||| ||| ||||||| ||| || | || |||    
T  27586587 attgtaatgtttttattgtcttttcataattaaagtgtgggtattgaatgcgggtatgggcatttaggtacccatagggtatggagaacggcagtaaagt 27586686  T
Q  237 tgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||| || || | ||||||  ||||||| || |||||||||    
T  27586687 tgttccccacgaaggtacgggcacgggtaagggtattttttacaaatgtaggtacagggaagggcattgtagtaccctacccataggttacccattg 27586783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 296
Target Start/End: Original strand, 8805831 - 8806088
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcattt 141  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  8805831 taggtataatttggatgtttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcctaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttcaagt 8805930  T
Q  142 gtgatgnnnnnnngt--cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctataggt-atggggaaggggactacagttg 238  Q
    ||| ||        |  |||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  | || |||||| ||| ||||||| |||| |||||    
T  8805931 gtggtgatttttattatctttccatggctaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtgcccataggttatgaggaagggcactaaagttg 8806030  T
Q  239 ttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatgggga 296  Q
    || |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||    
T  8806031 ttacccacgagggtacgggtacgggtacgggcattttttacaaacgcgggtatgggga 8806088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39804457 - 39804183
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngt--c 157  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||        |  |    
T  39804457 ttttttatttagttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttcaagtgtggtgatttttattatc 39804358  T
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgg 256  Q
    ||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||| |||| |     
T  39804357 tttccatagctaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacttaagtacccatagggtatggggaagggcactaaact-gttgcccacgaaggtacgt 39804259  T
Q  257 acacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccatt 332  Q
     ||||| |||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  39804258 gcacggatacgagcattttttacaaatgcgggtatggggatggatactatagtaccctacccattgtatacccatt 39804183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 331
Target Start/End: Original strand, 51806854 - 51807127
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg--nnnnnnngtc 157  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||         |||    
T  51806854 ttttttatttggctaaatactacgatttctactattttatgagttgcttttaaaaaaattggatcatagttttatttcaatggtgatgttttttattgtc 51806953  T
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgg 256  Q
    |||| ||| |||||||| || |||||||| | |||||| |||||||| |  | ||| |||||||||| ||| |||| | || || |||||||||||| ||    
T  51806954 tttttataattaaagtgcgggtaatgggtacaggtatgggcacttaggttaccatagggtatggggaggggcactaaaattattacccacgagggtacgg 51807053  T
Q  257 acacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccat 331  Q
     | |||| ||||  |||||||| |||||| |||||| ||| ||  | ||||||||  || |||||||||||||||    
T  51807054 gctcgggcacggaaattttttacaaatgcgggtatgaggaagggtattatagtacccta-ccattgggtacccat 51807127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 52013985 - 52013888
Alignment:
Q  48 atattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaa-aaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  52013985 atattttggatgttttttatttagctaagtactacgattcatattattttgtgagttgattttaaaaaaaattggatcatagttttatttcaattgtg 52013888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33733589 - 33733288
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || || || |||||||||||    
T  33733589 taatttttgaggaatattttggatgtttttttatttggataaatactacgattcgtattattttattagttgatttaaataattttgggtcatagtttta 33733490  T
Q  134 tttcatttgtgatg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggac 230  Q
     |||| ||||||||         ||||||||||||  |||||| || |||||||||| |||||| |||||||  | || ||| |||||||||||||  ||    
T  33733489 -ttcaattgtgatgttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgcaggtatgggcacttaagtgcccatagggtatggggaaggacac 33733391  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || | |||||  |||||| | || || | ||| |||||  |||||||| ||||| |  |||||||| ||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||    
T  33733390 ta-aattgttatccacgaagatacgggctcggatacggacattttttacaaatgaaaatatggggatgggtactatagtaccttatctattgggtactca 33733292  T
Q  331 ttgc 334  Q
    ||||    
T  33733291 ttgc 33733288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 116
Target Start/End: Original strand, 44292890 - 44292977
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaa 116  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  44292890 ggtgtacaatttcttagggatattttggatattttttatttggctaaatactacaattcatattattttataagttgattttaaaaaa 44292977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Original strand, 23349303 - 23349401
Alignment:
Q  47 gatattttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||  || | ||||||||||||||||| |||||    
T  23349303 gatattttggatgtttttttatttggctaaatactacgattcatactattttatgagttgatttgaaaatttttgaatcatagttttatttcaattgtg 23349401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31786604 - 31786331
Alignment:
Q  58 tgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg-----atgnnnnn 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |||   || ||||||||||||||||||| |||||      |          
T  31786604 tgttttttatttggctaaatactacgattcatattattt--tgagttgatttgaaattttttggatcatagttttatttcaattgtgggtttttttatta 31786507  T
Q  153 nngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgaggg 251  Q
       |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||   ||||||| | || ||| |||||||| ||||  |||| |||| |||||||| ||||    
T  31786506 ttatcttttcatagttaaaatgcgggtaatgggtgcgggtatagacacttaggtgcccatagggtatgggaaaggacactaaagtttttgcccacaaggg 31786407  T
Q  252 tatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    |      |||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||| | | ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  31786406 t------acgggtccgggtattttttacaaacgcgggtatgaggatgaatactatagtaccctacccattggatacccattg 31786331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7262199 - 7261933
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn--gtc 157  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||| |||   |  ||||||||||| ||||||| ||||| ||         |||    
T  7262199 ttttttatttggttaaatactaccattcatactattttatgagttgatttgaaattttctggatcatagttgtatttcagttgtggtgctttttattgtc 7262100  T
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctataggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgga 257  Q
    |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||         |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||     
T  7262099 ttttcagagttaaactgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttag---------ggtatgggaaagagcactaaagttgttgcccacgatggtagggc 7262009  T
Q  258 cacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||| || | ||| |||| ||  |||||||||| || | || ||||||||||||||    
T  7262008 c-cgagtacgggtattttttacaaacgcggatatagggatgggtactatagtaccttgctcactgggtacccattgc 7261933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 266
Target Start/End: Original strand, 26340264 - 26340363
Alignment:
Q  168 taaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtac 266  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| | |||||  | || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26340264 taaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacttaagtgcccataggatatggggaagggcactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtac 26340363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41780846 - 41780748
Alignment:
Q  47 gatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| |||   || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  41780846 gatattttggatgtttttttatttggctaaatactaagattcatactattttatgagttgatttgaaattttttggatcattgttttatttcaattgtg 41780748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9609056 - 9608881
Alignment:
Q  157 cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||| |||| || |||||| || || || |||| | |||||||||||||||||| |    
T  9609056 cttttcatagttaaagtgtgggtaatggatgcggatattagaacttaggtacccataaggtat-ggaaaaggcactaaaattgttgcccacgagggtacg 9608958  T
Q  256 gacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    | | | |||||||| |||||| ||||| |   ||||||||| ||  ||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  9608957 g-ctcaggtacgggcatttttaataaacgatagtatggggaagggtactgtagtaccctacccattgggtatccattg 9608881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Original strand, 27790960 - 27791059
Alignment:
Q  47 gatattttggatgtttttt--atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    |||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||  |||| ||| |||||||||| |||||    
T  27790960 gatattttggatgttttttttatttagttaaatactacgattcgtactattttatgagttgatatgaaaaaatctggattataattttatttcaattgtg 27791059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Original strand, 47106518 - 47106593
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagtt 104  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||  || |||||||||||||    
T  47106518 ggtgtacaattttttagggatattttagatgttttttatttggctaagcactacgatttatactattttatgagtt 47106593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 253
Target Start/End: Original strand, 22306824 - 22306922
Alignment:
Q  156 tcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    |||||||||||||||| || || |||| |||||||||||| |||| ||  | || ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22306824 tcttttcatagttaaaatgcgggtaattggtgcgggtatgggcacctaagtgcccataaggtatgaggaagggcactaaagttgttgcccacgagggta 22306922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24486764 - 24486663
Alignment:
Q  48 atattttggatgtttttt--atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtga 145  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||  || |||||||||||||  ||| |||||| |   ||||||||||||||||| ||||||    
T  24486764 atattttggatgttttttttatttggctaaatactatgatttctactattttatgagttgctttaaaaaaaattaaatcatagttttatttcaattgtga 24486665  T
Q  146 tg 147  Q
    ||    
T  24486664 tg 24486663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 144
Target Start/End: Original strand, 31713571 - 31713641
Alignment:
Q  74 aaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||   || ||||||||||||||||||| |||||    
T  31713571 aaatactacgattcatattattttatgagttgatttgaaattttttggatcatagttttatttcaattgtg 31713641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Original strand, 3097996 - 3098117
Alignment:
Q  214 ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtatttt-ttataaatgcaggtatggggacggacactatagtact 312  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | || |  ||||||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||||| || | ||||||     
T  3097996 ggtatggggaagaggactaaagttgttgcctacgaagatacgagcacgggtacgaatatttttttataaatgcgagtatggggacgggcattgtagtacc 3098095  T
Q  313 ttacccattgggtacccattgc 334  Q
     || ||||| ||||||||||||    
T  3098096 ctatccattaggtacccattgc 3098117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Original strand, 50981860 - 50982092
Alignment:
Q  44 agggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttattt-cattt 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| || |||||  | ||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| || ||    
T  50981860 agggatattttggatatttttttatttagctaaatattatgattcaaactattttatgagttgatttgaaaaatttgggaccatagttttattttcaatt 50981959  T
Q  142 gtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttg 238  Q
    |||||          ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||       |||||| | || ||||| |||||||||||  |||| || ||    
T  50981960 gtgatatatttgattgtctttttatagttaaagtgcaggtaatgggtgcggg-------acttaggtgcccatagggtatggggaaggacactaaagatg 50982052  T
Q  239 ttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtatttttta 278  Q
    ||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  50982053 ttgtccacgagggtacgaacttgggtacgggtatttttta 50982092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 26340384 - 26340452
Alignment:
Q  271 attttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgctatct 339  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26340384 attttttacaaacgcgggtatggggatggatactatagtaccctacccattgggtacccattgccatct 26340452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29994407 - 29994231
Alignment:
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgg 256  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |  || |||| |||| ||||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||| |     
T  29994407 ttttcatagttaaagtgcgggtaatggatgcaggtacggacatttaggtacccatagaatatggaaaagggcactaaagttgttgcccacgaaggtacga 29994308  T
Q  257 acacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
     ||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||| || || | ||||||  ||||||||| |||| |||||    
T  29994307 gcacggctacaggtaatttttacaaatgtgggtatggggatgggcattgtagtaccctacccattgagtactcattg 29994231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Original strand, 46258055 - 46258175
Alignment:
Q  214 ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactt 313  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||| | || |||||||  |||||| ||| | |||||| ||| |||||  |||||| ||| || |||||||||||      
T  46258055 ggtatgggaaagggcactaaagttgtttctcatgagggtacagacacgtgtatgagtatttcttacaaatgtgggtatgaggatgggcactatagtaccc 46258154  T
Q  314 tacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  46258155 tacccattggatacccattgc 46258175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14595500 - 14595409
Alignment:
Q  48 atattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||  |  |||||||||||||  ||| |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  14595500 atattttggatgtttttttatctggctaaatactacgatttctcctattttatgagttgctttaaaaaaaattagatcatagttttatttca 14595409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 138
Target Start/End: Original strand, 26340154 - 26340232
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26340154 ttttttatttggttaaatattacgattcacattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttca 26340232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 293
Target Start/End: Original strand, 2073674 - 2073771
Alignment:
Q  197 gcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatgg 293  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2073674 gcacttacgtacccatagggtatggggaagggcactaaagttgttgcccacgaggatacaagcacgaatacgggtaatttttataaatgcgggtatgg 2073771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31487345 - 31487200
Alignment:
Q  167 ttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctataggt-atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggta 265  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||| ||||| |||||| || |||||  ||||||| ||  | || | |||||||||||||||||||||   ||| ||    
T  31487345 ttaaagtgcgggtaatgggcgcgagtacgagcatttagatgcccatagggcatggggacggacagtaaaattgttgcccacgagggtatgggttcggata 31487246  T
Q  266 cgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtac 311  Q
    ||||||||||||| |||  | |||||| |||||| || ||||||||    
T  31487245 cgggtattttttacaaacacgggtatgaggacgggcattatagtac 31487200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 195
Target Start/End: Original strand, 8644146 - 8644291
Alignment:
Q  51 ttttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat-gnn 149  Q
    ||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  || | | |||  ||||| |||| |||||||        
T  8644146 ttttgaatgttttttattttgttcaatactacgattcgtactattttatgagttgatttgaaaatttttgaaccatgattttagttcaattgtgatattt 8644245  T
Q  150 nnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatg 195  Q
         ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8644246 ttattgtcttttcataattaaagtgtagataatggatgcgggtatg 8644291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 9930638 - 9930538
Alignment:
Q  48 atattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |  |||||||||||||  ||| |||||| |  |||||||||||||||||| | |||||    
T  9930638 atattttgaatgtttttttatttggctaaatactaagatttctgctattttatgagttgctttaaaaaaaattagatcatagttttatttcaatggtgat 9930539  T
Q  147 g 147  Q
    |    
T  9930538 g 9930538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Original strand, 22306724 - 22306808
Alignment:
Q  58 tgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| |||||    
T  22306724 tgttttttatttggctaaatactacgactc--attattttatgggttgatttgaaattttttggatcataattttatttcaattgtg 22306808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 44808648 - 44808561
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||  ||| ||||||   |||||||| |||||| | | ||||||||    
T  44808648 ttttttatttggctaaatactacgatttctactattttatgagttgctttaaaaaaaaatggatcataattttatataagttgtgatg 44808561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 147
Target Start/End: Original strand, 39485090 - 39485144
Alignment:
Q  93 attttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39485090 attttatgagttactttaaaaaaaattggattatagttttatttcaattgtgatg 39485144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 144
Target Start/End: Original strand, 7117853 - 7117942
Alignment:
Q  55 ggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    |||| |||| ||||||  |||||||| | ||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||    
T  7117853 ggatattttgtatttgggtaaatactgcaatttgtactattttatgagttgatttgaaaaaatttggaccataattttagttcaattgtg 7117942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 52013839 - 52013730
Alignment:
Q  213 aggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtact 312  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||||| |||| ||||||| |  |||||| || |||||||| ||| || | |||||||| ||  ||||||||||     
T  52013839 aggtatggggaaggacactgaagttgttgcctacgaaggtatgggcttgggtacaggcattttttacaaacgcggatatggggatgggtactatagtacc 52013740  T
Q  313 ttacccattg 322  Q
     |||||||||    
T  52013739 ctacccattg 52013730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4757123 - 4757063
Alignment:
Q  272 ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccatt 332  Q
    |||||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  4757123 ttttttataaatgcgggtatgagaatggacactgtagtaccctatccattgggtacccatt 4757063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Original strand, 7250558 - 7250666
Alignment:
Q  185 gtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaat 283  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||| | | ||||||| ||||| || || | ||| |||||| ||||    
T  7250558 gtgcaggtatgggcacttaggtacccatagaatatggggaagggcactaaagttgttgtcaatgagggtacggacatggatatgagtaatttttacaaat 7250657  T
Q  284 gcaggtatg 292  Q
    || ||||||    
T  7250658 gcgggtatg 7250666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 334
Target Start/End: Original strand, 240366 - 240673
Alignment:
Q  24 atgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggat 123  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  240366 atgccggtgtataattttttagggatattttgaatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattgggat 240465  T
Q  124 catagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatgggg 222  Q
    | |||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||| |||||||    
T  240466 cgtagttttatttcatttgtgatatttt----ttttttcatagttaaagtgcggataatggatgcgggtatgggcactgaggtacccataggatatgggg 240561  T
Q  223 aaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||  |||||||||    
T  240562 aaggggactaaaattgttgcccacgagggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcgggtatggggacgggcactgtaataccctacccattg 240661  T
Q  323 ggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||    
T  240662 ggtacccattgc 240673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Original strand, 221878 - 221969
Alignment:
Q  48 atattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||  |  |||||||||||||  ||| |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  221878 atattttggatgtttttttatctggctaaatactacgatttctcctattttatgagttgctttaaaaaaaattagatcatagttttatttca 221969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 334
Target Start/End: Original strand, 50480969 - 50481275
Alignment:
Q  24 atgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggat 123  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50480969 atgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattgggat 50481068  T
Q  124 catagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatgggg 222  Q
    | |||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||| || |||| ||||| |||||||    
T  50481069 cgtagttttatttcatttgtgatattt-----ttttttcatagttaaagtgcgggtaatgaatgcgggtatgggcactgaggtacccataggctatgggg 50481163  T
Q  223 aaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  50481164 aaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcggggatggggacgggcactgtagtaccctacccattg 50481263  T
Q  323 ggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||    
T  50481264 ggtacccattgc 50481275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 49360167 - 49359858
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49360167 catcatgccggtgtataattttttagagatattttgaatgttttctatttgactaaataccacgattcatgttattttatgagttaattttaaaaaattg 49360068  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tat 218  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||         | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||| |||    
T  49360067 ggatcgtagttttatttcatttatgatatt------ttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtactgaggtacccatagggtat 49359974  T
Q  219 ggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttaccc 318  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | ||||||  |||||    
T  49359973 ggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacggacacggatacgggtattttttataaatgcgggtatggggacaggcagtgtagtaccctaccc 49359874  T
Q  319 attgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||||||    
T  49359873 attgggtacccattgc 49359858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19618897 - 19618581
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618897 catcatgtcggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaatatcaagattcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 19618798  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||    
T  19618797 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgttttatcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtatccatagggta 19618698  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||  | ||    
T  19618697 tggggaagggaactaaagttgttgcccacgagggtacgagcacgggtacggatattttttataaatgcgggtatggggacggacaatgtagtaccctgcc 19618598  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    |||||| ||||||||||    
T  19618597 cattggatacccattgc 19618581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 24987302 - 24987618
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24987302 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgaccaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 24987401  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-ta 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        || ||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| | |||||  |||| ||||| ||    
T  24987402 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatggatgcgggtatgggtacttaagtacccatagggta 24987501  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||  ||||    
T  24987502 tggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggcacgggtattttttataaatgcgggtatggggacgggcattgtagtaccctacc 24987601  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||    
T  24987602 cattgggtacccattgc 24987618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 39352672 - 39352363
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39352672 catcatgccggtgtataattttttagggatattttagatattttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 39352573  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtat 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| |||  ||| |||||    
T  39352572 ggatcgtagttttatttcatttgtgattttttttttttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgtgggtatgggcacttaggtactcatagggtat 39352473  T
Q  219 ggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||    
T  39352472 ggggaaggggactaaagttgttgcccacgaggg------cacgggtacgggtatttttttataaatgcgggtatggggacgggcactgtagtaccctacc 39352379  T
Q  318 cattgggtacccattg 333  Q
    |||| |||||||||||    
T  39352378 cattaggtacccattg 39352363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 44792533 - 44792854
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44792533 catcatgctggtgtataattttttaggcatatttcagatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 44792632  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn------gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||             || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||  |||| |||    
T  44792633 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacttaagtacccata 44792732  T
Q  214 gg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtact 312  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||     
T  44792733 gggtatggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacggatacgggtattttttataaatgcgggtatggggacgggcattgtagtacc 44792832  T
Q  313 ttacccattgggtacccattgc 334  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  44792833 ctacccattgggtacccattgc 44792854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6408787 - 6408519
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6408787 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaatatcacgattcatattattttattagttaattttaaaaaattg 6408688  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggt 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||         || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||    
T  6408687 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtacccatagggt 6408588  T
Q  217 atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgc 285  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6408587 acggggaagaggactaaagttgttgcccacgagggtaggggcacgggtacgggtattttttataaatgc 6408519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25467693 - 25467382
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||     
T  25467693 ggtgtacaattttttagagatattttggatgtttttaattttactaaatactacgattcgtattattttattagttaattttaaaagattttgatcataa 25467594  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagtta----aagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatgggg 222  Q
    |||||||||| ||||||||        || ||||||||||||    || || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  25467593 ttttatttcaattgtgatgtttttattgttttttcatagttagttaaattgcgggtaatgggtgcgggtatgagcacttagatacccataagatatgggg 25467494  T
Q  223 aaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||| | |||||||| || || | ||||||  |||||||||    
T  25467493 aagggcactaaagttgttgcccacgagggtatgggcacgggtgcgggtaatttttaaaaatgcggatatggggatgggcattgtagtaccctacccattg 25467394  T
Q  323 ggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||    
T  25467393 ggtacccattgc 25467382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Original strand, 13735532 - 13735827
Alignment:
Q  22 tcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattggg 121  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13735532 tcatgccggtgtataattttttaggaatattttggatgttttctatttaactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattggg 13735631  T
Q  122 atcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatgg 220  Q
    ||| |||||||||||||| ||  ||         | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| || |||| ||| |||||||    
T  13735632 atcgtagttttatttcatatgatat-------ttttttttcatagttaaagtgcgagtaatgggtgcgggtatcggcactgaggtacccatagggtatgg 13735724  T
Q  221 ggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttaccca 319  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||    
T  13735725 ggaaggggattaaagttgttgcccacgaggatacgggcacgggtaagggtatttttttataaatgcgggtatggggacgggcactgtagtaccctaccca 13735824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Original strand, 5040958 - 5041265
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  || |||||    
T  5040958 ggtgtacaatattttagatatattttgaatgtttttaattggactaaatatcacaattcatattattttataagttaattttaaaatattttgaccatag 5041057  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatgnnnnnnng-tcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaagg 226  Q
    |||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  5041058 ttttatttcaattgtgatgtttttattatcttttcatagttaaagtgcggataatgggtgcaggtatgggcacttagatacctatagggtatggggaatg 5041157  T
Q  227 ggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggta 326  Q
      |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || || | ||||||  |||||||||||||    
T  5041158 acactaaagttgttgcccacgagggtacggacacgagtacgggtaatttttaaaaatgcgggtatggggatgggcattgtagtaccctacccattgggta 5041257  T
Q  327 cccattgc 334  Q
     |||||||    
T  5041258 tccattgc 5041265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41924182 - 41923908
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41924182 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggtttatgttattttatgagttaattttaaaaaattg 41924083  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gt 216  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||         || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||   ||||||  |||| |||| ||    
T  41924082 agatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatagacacttaagtacccatagagt 41923983  T
Q  217 atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtat 291  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  41923982 atggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgaacacggatacgggtattttttataaatgcgggtat 41923908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Original strand, 30247963 - 30248265
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  30247963 taattttttagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacgattcgtactattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 30248062  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggac 230  Q
    ||||| |||||||          ||||||||||||  |||||| || |||||||||||| |||| |||||||  | || ||||| |||||||||||| ||    
T  30248063 tttcaattgtgatattatttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgcgg-tatgggcacttaattgcccatagggtatggggaagggcac 30248161  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||  ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  30248162 taaagttgttgcccacgagggtacggacttgggtacgggcattttttacaaatgagggtatggggatgggtactatagtaccctatccattgggtaccca 30248261  T
Q  331 ttgc 334  Q
    ||||    
T  30248262 ttgc 30248265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 45079114 - 45079416
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  45079114 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacgattcatattattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 45079213  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggac 230  Q
    ||||| ||||||||         |||||||||| |  |||||| || ||||||||||||||||| |||||||  | || ||||| |||||||||||| ||    
T  45079214 tttcaattgtgatgttttttattgtcttttcatcgagaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcac 45079313  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||||||| |||||  |||||||||| ||  ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  45079314 taaagttgttgcccacgagggtacgggctcgggtacggacattttttacaaatgagggtatggggatgggtactatagtaccctatccattgggtaccca 45079413  T
Q  331 ttg 333  Q
    |||    
T  45079414 ttg 45079416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19873275 - 19873001
Alignment:
Q  50 attttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg-n 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||||||      
T  19873275 attttggatgtttttaatttgactatatactacgattcatattattttatgagttaattttaaaagatttagaccatagttttatttcaattgtgatgtt 19873176  T
Q  149 nnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtatggggaaggggactacagttgttgcccacg 247  Q
          ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||| || | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  19873175 tttattgtcttttcatagttaaagtgcaggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtacccataaagtatggggaggggcactaaagttgttgcccacg 19873076  T
Q  248 agggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
    |||||| || ||| ||||   ||| |||||| |||||| ||||||  || || || ||||||||  |||||||||    
T  19873075 agggtacgggcacaggtatatgtaatttttacaaatgcgggtatgaagatgggcattatagtaccctacccattg 19873001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 48080265 - 48080039
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   || |||||    
T  48080265 ggtgtacaatttttaagagatattttggatgtttttaatttgactaaatactacgattcatattattttatgagttaattttaaaagatgtagaccatag 48080166  T
Q  129 ttttatttcatttgtgat-gnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaagg 226  Q
    |||||||||| |||||||         |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  48080165 ttttatttcaattgtgatatttttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgagtgcgggtatggacacttaggtacccataggatatggggaagg 48080066  T
Q  227 ggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||    
T  48080065 gcactaaagttgttgcccacgagggta 48080039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Original strand, 41410167 - 41410469
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttat 134  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| || || || |||||||||||||||    
T  41410167 taatttttgagggatattttggatgttttttatttggctaaatactacgattcatactattttattagttgatttaaataattttggatcatagttttat 41410266  T
Q  135 ttcatttgtgatg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggact 231  Q
    |||| ||||||||         ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |  ||| ||| | |||||||| |||    
T  41410267 ttcaattgtgatgttttttattgtcttttcatagagaaagtgtgggtaatgcgtgcgggtatgggcacttaggtgctcatagggtgtagggaagggcact 41410366  T
Q  232 acagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccat 331  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||  |||||||||| ||  |||||||||   || |||||| ||||||||    
T  41410367 aaagttgttgcccacgagggtacggactcgggtacagacattttttacaaatgagggtatggggatgggtactatagtatcctatccattgagtacccat 41410466  T
Q  332 tgc 334  Q
    |||    
T  41410467 tgc 41410469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 296
Target Start/End: Original strand, 22845025 - 22845301
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22845025 catcctgccggtgtacaattttttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacaattcgtattattttatgagttaatttaaaaaaattt 22845124  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||        ||||||||||||||||| || || |||||| |||||| |||  ||||||| ||||  || |||     
T  22845125 ggaccatagttttatttcaaatgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaaatgcgg-taatggatgcgggcatggacacttaggtacccgtagggtg 22845223  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatgggga 296  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||| || |||| |||  ||| | |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  22845224 tggggaagggcactaaagctgttgcccacga-ggaatgggcacatgtatgagtattttttacaaatacgggtatgggga 22845301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 42096651 - 42096953
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || | |||| || || || ||||||||||||||    
T  42096651 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggctaaatattacgattcgtactattttattagatgatttaaataattttggatcatagtttta 42096750  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggac 230  Q
    ||||| ||||||||         ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||| |||||||  | || ||||| |||||||||||| ||    
T  42096751 tttcaattgtgatgttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcac 42096850  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||| |||||| |||| || | |||||| ||  |||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  42096851 taaagttgttgtccacgaaggtacgggctcgggtatggacattttttacaaatgagggtatggggacgggtactatagtactctatccatttggtatcca 42096950  T
Q  331 ttg 333  Q
    |||    
T  42096951 ttg 42096953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40564146 - 40563835
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||    
T  40564146 ggtgtacaatttttaagagatattttggatgtttttaatttgactaaatgctacgattcgtattatttgatgagttaattttaaaatatttagaccatag 40564047  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtgg----ataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatgggg 222  Q
    |||||||||| ||||||||         ||||||||| ||||||||| ||     |||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  40564046 ttttatttcaattgtgatgtttttattttcttttcattgttaaagtgcgggtaattaatgggtacggttatgggcacttagatactcatagggtatgggg 40563947  T
Q  223 aaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  | || || ||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||  | | ||||||  ||| |||||    
T  40563946 aagggcactaaagttgttgcccacggagatacgggcacgaatacgggtaatttttacaaatgcgggtatggggatgggtattgtagtaccctacacattg 40563847  T
Q  323 ggtacccattgc 334  Q
    |||||| |||||    
T  40563846 ggtacctattgc 40563835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12905817 - 12905511
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    ||||| ||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||    
T  12905817 gtgtacaatttttaagagatattttgaatgtttttaatttgactaaataatacgattcatattattttatgagttaattttaaaagatgtagaccatagt 12905718  T
Q  130 tttatttcatttgtgat-gnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gtatggggaaggg 227  Q
    ||||||||| |||||||         ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||   ||||||| |||| |||| || |||||||||     
T  12905717 tttatttcaattgtgatatttttgttgtcatttcatagttaaagtgcgagtaatgggtgcgagtatagacacttaggtacccatagagtttggggaagga 12905618  T
Q  228 gactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtac 327  Q
     |||| |||| ||||||||||  ||| || |||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||||| ||||| | ||||||  |||| ||| |||||    
T  12905617 cactaaagttattgcccacgactgtacgggcacgggtacgagtaatttttacaaatgtgggtatggggatggacattgtagtaccatacctattcggtac 12905518  T
Q  328 ccattgc 334  Q
    |||||||    
T  12905517 ccattgc 12905511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35688478 - 35688198
Alignment:
Q  58 tgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtga---tgnnnnnnn 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||   || ||||||||||||||||||| |||||    |            
T  35688478 tgttttttatttggctaaatactacgattcatattattttatgagttgatttgaaattttttggatcatagttttatttcaattgtgggttttttttatt 35688379  T
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  35688378 gtcttttcatagttaaaatgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtgcccataggatatggggaagggcactaaagttgttgcccacaagggta 35688279  T
Q  254 tggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
     |||  || || ||| ||||||||| ||| || |||||||| |  || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  35688278 cggatccgtgtgcggatattttttacaaacgcgggtatgggaatagatactatagtaccctacccattggatactcattgc 35688198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11671937 - 11671773
Alignment:
Q  31 tgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtt 130  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||    
T  11671937 tgtacaatattttaaagatattttgaatgtttttaatttgactaaatactatgattcgtattattttatgagttaattttaaaatatt-tgaccatagtt 11671839  T
Q  131 ttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatg 195  Q
    |||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11671838 ttatttcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatg 11671773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 23298222 - 23298350
Alignment:
Q  19 acatcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaatt 118  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  23298222 acatcctgctggtgtacaatattttagagatattttggatgtttttaattggactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaataat 23298321  T
Q  119 gggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
      || ||||||||||||||| ||||||||    
T  23298322 ttgaccatagttttatttcaattgtgatg 23298350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 49374984 - 49374689
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcattt 141  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||       
T  49374984 taggaatattttggatgttttcttatttggctaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttcaagc 49374885  T
Q  142 gtgatgnnnnnnngt--cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttg 238  Q
    ||| ||        |  |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||| ||||  |||| | |||    
T  49374884 gtggtgattttcattatcttttcatggctaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgagcacttaagtgcccatagggtatgggaaaggacactaaaattg 49374785  T
Q  239 ttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  49374784 ttgtccacgaggatacgggcacggatacgggtattttttacaaacacgggtatggggatggatactatagtatcctacccattgggtacccattgc 49374689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 333
Target Start/End: Original strand, 23299554 - 23299731
Alignment:
Q  157 cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatg 255  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||| |    
T  23299554 cttttcatagttaaaatgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttagatacccatagggtatggggaatgacactaaagttgttgcccacaagggtacg 23299653  T
Q  256 gacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    | ||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| || || | ||||||  |||||||| |||||||||||    
T  23299654 ggcacgggtacggataatttttaaaaatgcgggtatggggatgggcattgtagtaccctacccatttggtacccattg 23299731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 334
Target Start/End: Original strand, 10085177 - 10085472
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcattt 141  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  10085177 taggaataatttggatgtttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttgcatcatagttttatttcaagt 10085276  T
Q  142 gtgatgnnnnnnngt--cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttg 238  Q
    ||| ||        |  |||||||| | ||||||| || |||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  10085277 gtggtgatttttattatcttttcatggctaaagtgcgggtaataggtgagggtatgagcacttaagtacccatagggtatggggaagggcactaaagttg 10085376  T
Q  239 ttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||||||| ||| || ||||||| || ||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||||    
T  10085377 ttgcccacgagggtatgggcacggatacagacattttttacaaacgcgggtatggagatggatactgtagtaccctatccattgggtacccattgc 10085472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 334
Target Start/End: Original strand, 10192106 - 10192392
Alignment:
Q  52 tttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnn 150  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||  |||| ||       
T  10192106 tttggatgtttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttgcatcatagttttatttcaagtgtggtgatt 10192205  T
Q  151 nnnngt--cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacg 247  Q
         |  |||||||| | ||||||| || |||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10192206 tttattatcttttcatggctaaagtgcgggtaataggtgagggtatgagcacttaagtacccatagggtatggggaagggcactaaagttgttgcccacg 10192305  T
Q  248 agggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||| ||||| ||| |  |||||||| ||| || ||||||| || ||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||||    
T  10192306 agggtatgggcacggatacagacattttttacaaacgcgggtatggagatggatactgtagtaccctatccattgggtacccattgc 10192392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 58 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19454962 - 19454681
Alignment:
Q  58 tgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtga---tgnnnnnnn 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| |||||    |            
T  19454962 tgttttttatttggctaaatactacgattcatattattttatgagttgatttgaaattttttggatcataattttatttcaattgtgggttttttttatt 19454863  T
Q  155 gtctttt-catagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggt 252  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||  ||||||  | || |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19454862 gtctttttcatagttaaaatgtgggtaatgggtgcagatatggacacttaagtgcccatagagtatggggaagggtactaaagttgttgcccacgagggt 19454763  T
Q  253 atggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    | |    |||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  19454762 acgagtccgggtacgagcattttttacaaacgcaggcatggggatgggtactatagtaccctatccattgggtacccattgc 19454681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32995420 - 32995130
Alignment:
Q  48 atattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||  |||| |    
T  32995420 atattttgaatgtttttttatttgactaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaatttttggatcatagttttatttcaagtgtggt 32995321  T
Q  147 gnnnnnnngt--cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcc 243  Q
    |        |  |||| |||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||| ||||||  |||| |||||||| |    
T  32995320 gatttttattatctttccatgtctaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgagcacttaagtgcccatagggtatgtggaaggacactaaagttgttgtc 32995221  T
Q  244 cacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||| || |||| |||||   |||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  32995220 cacgagggtacgggcacgagtacgaacattttttacaaacgcaggtatggggatggatactatagtaccctacctattgggtacccattgc 32995130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 46819233 - 46819056
Alignment:
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgg 256  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  46819233 ttttcatagctaaagtgtgggtaataggtgagggtatgagcacttaggtacccacagggtatggagaagggcactaaagttgttacccacgagagtatgg 46819134  T
Q  257 acacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||||  | |||||||| || || ||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  46819133 acacgggtatgtgtatttcttacaaatgtggatatggggatgggcattatagtaccctatccattgggtacccattgc 46819056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 296
Target Start/End: Original strand, 50508776 - 50509045
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||  || ||||     
T  50508776 ggtgtacaatttttaagagatattttggatgtttttcatttgattaaatactacaattcatattattttatgcgttaatttaaaaagatttagaccataa 50508875  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaagg 226  Q
    |||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| |||||||  | || ||| |||||| | ||||    
T  50508876 ttttatttcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtagtgggtgcaggtatgggcacttaagttcccatagggtatgagaaagg 50508975  T
Q  227 ggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatgggga 296  Q
    | |||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||  |||| |||||| ||||   ||||||||||    
T  50508976 gcactaaagttgttgtccacgaggataggggcacggatagtggtaatttttacaaattggggtatgggga 50509045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39952724 - 39952597
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39952724 catcatgtcggtgtacaattttttagagatattttgaatgtttttaatttgattaaatactacaatttatattattttatgagttaattttaaaagattt 39952625  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||    
T  39952624 agaccatagttttatttcaattgtgatg 39952597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5908417 - 5908127
Alignment:
Q  48 atattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||| | |||||| ||||||||||||  |||| |    
T  5908417 atattttggatgtttttttatttggctaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaaattggatcacagttttatttcaagtgtggt 5908318  T
Q  147 gnnnnnnngt--cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcc 243  Q
             |  ||||| || | ||||||| || |||| |||| ||||||| |||||||  | |  ||||| ||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  5908317 aatttttattatctttttatggctaaagtgcgggtaattggtgtgggtatgggcacttaagtgctcatagggtataggaaagggcactaaagttgttgcc 5908218  T
Q  244 cacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||| |||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5908217 cacgagggtacgggcacaggtatgggcattttttacaaacgcgggtatggggatggatactatagtaccctacccattgggtacccattgc 5908127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27064378 - 27064089
Alignment:
Q  48 atattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||  |  |||||||||||||  ||| ||||||   ||||||||||||||||||| | |||||    
T  27064378 atattttggatgtttttttatttggataaatacttcgatttctgctattttatgagttgctttaaaaaaaaatggatcatagttttatttcaatggtgat 27064279  T
Q  147 gnnnnnnngt--cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcc 243  Q
    |        |  ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| | || ||||| |||| ||||  | |||| ||||||| ||    
T  27064278 gttttttattgcctttttataattaaagtgtgggtaatgggtacgggtgtgggcacttaggtgcccatagggtatgaggaaatgcactaaagttgttacc 27064179  T
Q  244 cacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    |||||| ||| || | |||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  27064178 cacgagtgtacgggctcgggcacgggcattttttacaaacgcgggtatggggaagggtactattgtaccctacccattgggtacccattg 27064089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 147
Target Start/End: Original strand, 2150593 - 2150701
Alignment:
Q  37 atattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttattt 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||  || |||||||||||||    
T  2150593 atattttaggaatattttggatgtttt--atttggccaaatactacgattcgtactattttatgagttgatttgaaaatatttagaccatagttttattt 2150690  T
Q  137 catttgtgatg 147  Q
    || ||||||||    
T  2150691 caattgtgatg 2150701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 43657314 - 43657166
Alignment:
Q  185 gtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaat 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||| |||     
T  43657314 gtgcgggtatgggcacttaagtgcctatagggtatggggaagggcaataaagttgttgcccacgagggtacaggcacgagtacgggcattttttacaaac 43657215  T
Q  284 gcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    |  |||||||||| ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  43657214 gtgggtatggggatggatactatagtac-ctagccattgggtacccattg 43657166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 49193663 - 49193559
Alignment:
Q  33 tataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaa-attgggatcatagttt 131  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||  |||||||||||    
T  49193663 tataattttttaggaatattttagatgttctttatttgactaaatacaacaattcgtattattttacgtgttgattttaaaaagatttagatcatagttt 49193564  T
Q  132 tattt 136  Q
    |||||    
T  49193563 tattt 49193559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 322
Target Start/End: Original strand, 38694846 - 38695013
Alignment:
Q  156 tcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtat 254  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||  |  | ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||     
T  38694846 tcttttcatggctaaagtgcgggtaatgagtgcgggtatggacacttaagtgtccatagggtatggggaagggcactaaagtttttgcccacgagggtac 38694945  T
Q  255 ggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
    |||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||| ||  ||||||||||  |||||||||    
T  38694946 ggacacgggtacaggcatttttcacaaatgcggatatggggatgggtactatagtaccctacccattg 38695013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 48583805 - 48583626
Alignment:
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||  ||| |||||| |||||||  | || ||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  48583805 gtcttttcatggttaaagtgcgggtaatgactgcaggtatgtgcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcacaa-agttgttgcccacgagggta 48583707  T
Q  254 tggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
     || | ||||||||| | ||||||| |||  | |||||||||| |   ||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  48583706 cgggctcgggtacggattttttttacaaactcgggtatggggatgagtactatagtactatgcccattaggtacccattgc 48583626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 334
Target Start/End: Original strand, 33558750 - 33558982
Alignment:
Q  85 ttcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||                
T  33558750 ttcgtattattttatgagttaattttaaaatattttaatcatagttttatttcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaa------------ 33558837  T
Q  184 ggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaa 282  Q
     ||||||||| |  |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||      ||| |||||||||  || |||||| |||    
T  33558838 -gtgcgggtacggacacttagatacccataggatatggggaagggcactaaagttgttgcccacga------ggatacgggtacgaataatttttaaaaa 33558930  T
Q  283 tgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||| ||| ||||| |  |||||  || |||||||||| |||||||    
T  33558931 tgcaggtatgaggatggacattgcagtaccctatccattgggtatccattgc 33558982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Original strand, 2012989 - 2013196
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg--atgnnnnnnngtc 157  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  || |||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||        |||    
T  2012989 ttttttatttggcttaatactacgatttctactattttatgagttgctttaaaaaaaattggatcatagttttatttcaattgtgatattttttattgtc 2013088  T
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgg 256  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||| || || ||||||  ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| ||    
T  2013089 tttttataattaaagtgtggataatgggtacatatatgggcacttagattcccataaggtat--ggaagggtactaaagttgttacccatgagggtacgg 2013186  T
Q  257 acacgggtac 266  Q
     | |||||||    
T  2013187 gctcgggtac 2013196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 292
Target Start/End: Original strand, 6083462 - 6083712
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| |  || || |||||||||||||||||||  ||||    
T  6083462 ggatattttggatatttttttatttggctaaatacttcgattcgtactattttatgacttgatttgattaattttggatcatagttttatttcaaatgtg 6083561  T
Q  145 atg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttg 241  Q
    |||         || | ||||||| ||||||| || |||| |||   | ||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || ||||  || ||||    
T  6083562 atgttttttatagtatcttcatagataaagtgcgggtaataggtatagatatgagcacttaggtacccatagggtatgggaaatggtactaaggtagttg 6083661  T
Q  242 cccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatg 292  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||    |||||||| |||||| ||||||    
T  6083662 cccacaagggtatggactcgggtaccaacattttttacaaatgcgggtatg 6083712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27346760 - 27346691
Alignment:
Q  40 ttttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||    
T  27346760 ttttagggatattttggatgttttttatttggctaaatactacgatttatactattttattagttgattt 27346691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33119076 - 33118977
Alignment:
Q  48 atattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||  || ||||||| |||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33119076 atattttggattttttttatttggctaaatattatgatttctactattttacgagttgctttaaaaaaaattggatcatagttttatttcaattgtgatg 33118977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 43657443 - 43657352
Alignment:
Q  48 atattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43657443 atattttggatgtttttttatttggctaaatactacaattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcaaagttttatttca 43657352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Original strand, 30964479 - 30964566
Alignment:
Q  52 tttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30964479 tttggatgtttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttca 30964566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Original strand, 30980291 - 30980378
Alignment:
Q  52 tttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30980291 tttggatgtttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttca 30980378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 33333658 - 33333616
Alignment:
Q  40 ttttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactac 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33333658 ttttagggatattttggatgttttttatttggctaaatactac 33333616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 35732418 - 35732204
Alignment:
Q  52 tttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg--n 148  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||| ||       
T  35732418 tttggatgtttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcttagttttatttcaagtgtggtgatt 35732319  T
Q  149 nnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacg 247  Q
           ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  | || ||| ||| |||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  35732318 tttattatctttccatggctaaagtgtgggtaatgagtgcgggtatgggcacttaagtgcccatagggtctggggaaggacactaaaattgttgcccacg 35732219  T
Q  248 agggtatggacacgg 262  Q
    |||||| || |||||    
T  35732218 agggtacgggcacgg 35732204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 147
Target Start/End: Original strand, 50622157 - 50622279
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaatttt-----aaaaaattgggatc 124  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||     ||||||    ||||    
T  50622157 gtgtacaattttttagggatattttgaatattttttatttggttaaatactacaattcgtactattttctgagtaagttttttttaaaaaaaactagatc 50622256  T
Q  125 atagttttatttcatttgtgatg 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  50622257 atagttttatttcaattgtgatg 50622279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 147
Target Start/End: Original strand, 26787519 - 26787620
Alignment:
Q  48 atattttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattt-taaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtga 145  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||| | ||||    
T  26787519 atattttggatgtttttttatttggttaaatactacgatttctgctattttatgagttgatttaaaaaaaaattggatcatagttttatttcaatggtga 26787618  T
Q  146 tg 147  Q
    ||    
T  26787619 tg 26787620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 147
Target Start/End: Original strand, 9162923 - 9163019
Alignment:
Q  52 tttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  || ||||||||||||   ||| |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9162923 tttggatgtttttttattcggctaaatactacgatttctactattttatgagtagctttaaaaaaaattggatcatagttttattttaattgtgatg 9163019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 138
Target Start/End: Original strand, 36679023 - 36679119
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36679023 taggaataatttggatgtttttttatttggttaaatattacaattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttca 36679119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27346627 - 27346533
Alignment:
Q  185 gtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtatttttta 278  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||| | |||||||    
T  27346627 gtgcgggtatgggcacttaattacccataggatatggggaaaggcactaaagttgttgccctcgagggtacgggctcgggtacggttttttttta 27346533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36692074 - 36692002
Alignment:
Q  259 acgggtacgggtat---tttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacc 328  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  36692074 acgggtacgggtatatttttttataaatgcgggcatggggaaggacactgtagtaccctacccattgggtacc 36692002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8340298 - 8340118
Alignment:
Q  77 tactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn---gtcttttcatagttaaagt 173  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||   || ||||||||||||||||||| ||||| ||          ||||||||||||||||| |    
T  8340298 tactacgattcatactattttatgagttgattcgaaattttttggatcatagttttatttcaattgtggtggttttttattgtcttttcatagttaaaat 8340199  T
Q  174 gtggataatgggtgcgggtatgagcacttagataccta-taggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    | || |||| |||||||||||| |||||||| | || | | |||||||||||||| | || |||||||   ||||||||||    
T  8340198 gcgggtaataggtgcgggtatgggcacttaggtgcccattgggtatggggaagggcattaaagttgtttttcacgagggta 8340118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 109
Target Start/End: Original strand, 39144029 - 39144098
Alignment:
Q  40 ttttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattt 109  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  39144029 ttttaaggatgttttggatgttgtttattttgttaaatactatgattcgtactattttatgagttgattt 39144098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 14418419 - 14418363
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgag 102  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14418419 ggatattttagatattttttattttattaaatactacgattcatactattttatgag 14418363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 338
Target Start/End: Original strand, 26795319 - 26795470
Alignment:
Q  189 gggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtatttttt-ataaatgca 286  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |||| | ||||| |||  ||||||| |||||||||||| || | ||||||| |  ||||||| | |||  |     
T  26795319 gggtatgagcacttaggtgcccatagggtatgagaaagggcactgaagttgttacccacgagggtacgggctcgggtactgacatttttttacaaacacg 26795418  T
Q  287 ggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgctatc 338  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  26795419 ggtatggggaagggtactatagtaccatacctattgagtacccattgctatc 26795470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 51055527 - 51055396
Alignment:
Q  163 atagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacg 261  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| | |  ||| |||||| |||| |  |||| ||||||||||||| ||| || |  | ||    
T  51055527 atagttaaagtgcggataatggatgcaggtatgtgcacttaggtgctcatagggtatgaggaatgccactaaagttgttgcccacaaggatacgagctcg 51055428  T
Q  262 ggtacgggtattttttataaatgcaggtatgg 293  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  51055427 ggtacatgtattttttacaaatgcaggcatgg 51055396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 35203434 - 35203337
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtga 145  Q
    |||| ||||| |||||||||||||   |||||||| |||||| ||||   ||| ||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||    
T  35203434 ggatgttttgcatgttttttattttgttaaatactgcgattcatatt---ttacgagttgatttgaaaaaatttgaaccatagttttatttcaattgtga 35203338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7940406 - 7940358
Alignment:
Q  156 tcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttag 204  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||    
T  7940406 tcttttcatagctaaagtgcgggtaatggatgcgggtatgggcacttag 7940358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33099722 - 33099542
Alignment:
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||| ||||||  ||| ||||| || |||| ||| |||| || |||||| | || |||||||| |||||| ||||    
T  33099722 gtcttttcatagttaaagtgagggtgatgagtgcggcaatgtgcactaaggtacccatagggtacggagaagggcattaaagttgttggccacgaaggta 33099623  T
Q  254 tggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
     || | | |||||| |||||| ||| ||| ||  |||||| || || |||| ||||||  ||| ||| ||| |||||||||    
T  33099622 cgggctcaggtacgagtatttattacaaacgcgagtatggagaagggcactgtagtaccctactcatagggcacccattgc 33099542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 333
Target Start/End: Original strand, 10066158 - 10066465
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  10066158 gtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataacacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattgggattgtagt 10066257  T
Q  130 tttatttcatttgtgatgnnnnnnn---gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaag 225  Q
    ||||||||||||||||||          || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10066258 tttatttcatttgtgatgttttttttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtacctatagggtatggggaag 10066357  T
Q  226 gggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggt 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||  ||||||||||||    
T  10066358 gggactaaagttgttgcccacgagggtacggacacgggtacaggtattttttataaatgcgggtatagggacgcgcactgtagtaccatacccattgggt 10066457  T
Q  326 acccattg 333  Q
     |||||||    
T  10066458 gcccattg 10066465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 51 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19805230 - 19804945
Alignment:
Q  51 ttttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnn 150  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        
T  19805230 ttttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcgtagttttatttcatttgtgatattt 19805131  T
Q  151 nnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacga 248  Q
         || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19805130 tttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgagcacttaggtacccatagggtatggggaaggggactaaagttgttacccacga 19805031  T
Q  249 gggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19805030 gggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcgggtatgaggacgggcactgtagtaccctacccattgggtacccattgc 19804945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16567790 - 16567474
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16567790 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 16567691  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-ta 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| ||    
T  16567690 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacttaagtacccatagggta 16567591  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||  ||||    
T  16567590 tggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacggatattttttataaatgcgggtatggggacgggcattgtagtaccctacc 16567491  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||    
T  16567490 cattgggtacccattgc 16567474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 16597872 - 16598188
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16597872 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 16597971  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-ta 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| ||    
T  16597972 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacttaagtacccatagggta 16598071  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||  ||||    
T  16598072 tggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacggatattttttataaatgcgggtatggggacgggcattgtagtaccctacc 16598171  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||    
T  16598172 cattgggtacccattgc 16598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 46181436 - 46181120
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46181436 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 46181337  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-ta 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| ||    
T  46181336 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacttaagtacccatagggta 46181237  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||  ||||    
T  46181236 tggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacggatattttttataaatgcgggtatggggacgggcattgtagtaccctacc 46181137  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||    
T  46181136 cattgggtacccattgc 46181120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 5023080 - 5023397
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5023080 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 5023179  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg----nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-g 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  5023180 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttttttttgttttttcatagttaaagtacgggcaatgggtgcgggtatgggcacttaggtacccatagg 5023279  T
Q  215 gtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtacttt 314  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  |    
T  5023280 gtat-gggaaggagactaaagttgttgcccacg-ggataagggcacgagtacgggtattttttataaatgcgggtatggggacgggcactgtagtaccct 5023377  T
Q  315 acccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5023378 acccattgggtacccattgc 5023397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27398812 - 27398487
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaa--- 116  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||       
T  27398812 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgattaaataccacgattcatattattttatgagttaatttaaaaaaaaaa 27398713  T
Q  117 -ttgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttt------tcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacc 209  Q
     |||||||| |||| |||||||||||||||||       || |||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  || |    
T  27398712 attgggatcgtagtcttatttcatttgtgatgtttttttgtttttgttttttcatagttaaagtgtgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtatc 27398613  T
Q  210 tatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatag 308  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | |||    
T  27398612 catagggtatggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtatgggtattttttataaatacgggtatggggacgggcattgtag 27398513  T
Q  309 tactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||  || |||||||| |||||||||    
T  27398512 taccctatccattgggcacccattgc 27398487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 42284718 - 42284452
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||    
T  42284718 gtgtacaatattttaaagatattttgaatgtttttaatttgactaaatactacgattcatattattttatgagttaattttaaaatattttgttcatagt 42284619  T
Q  130 tttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggg 227  Q
    ||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||| |    
T  42284618 tttatttcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgagtatgtgcatttagatacccatatgatatggggaagag 42284519  T
Q  228 gactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggg 294  Q
     |||| |||||||||||||||| ||| || |||| |||| | || |||||| |||| ||||||||||    
T  42284518 cactaaagttgttgcccacgagagtacgggcacgagtacagataatttttaaaaatacaggtatggg 42284452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 39414788 - 39414480
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39414788 catcatgccggtgtataattttttagaaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 39414689  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||        || ||||||||||||||             ||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||    
T  39414688 ggattgtagttttatttcatttgcgatgttttttttgttttttcatagttaaa-------------gtgcgggtatgggtacttaaatacccatagggta 39414602  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | ||||||  || |    
T  39414601 tggggaaggggaccatagttgttgcccacgaaggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcgggtatgggaacgggcattgtagtaccctatc 39414502  T
Q  318 cattgggtacccattgctatct 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  39414501 cattgggtacccattgccatct 39414480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31455123 - 31454805
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31455123 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttaactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttgaaaaattg 31455024  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg---nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagataccta-tagg 215  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||          || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  ||||||  |||| | | ||    
T  31455023 agatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgtgggtatggacacttaagtacccattggg 31454924  T
Q  216 tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtacttta 315  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  || || || | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||  ||    
T  31454923 tatgggaaaggagactaaagttgttgcccacgagaatacgggcatgagtacgagtattttttataaatgcggatatggggacggacattgtagtacccta 31454824  T
Q  316 cccattgggtacccattgc 334  Q
    | |||||| ||||||||||    
T  31454823 ctcattggatacccattgc 31454805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 43224532 - 43224231
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||     
T  43224532 ggtgtacaattttttagagatattttggatgtttttaatttgactaaatactacgattcttattattttattagttaattttaaaagattttgatcataa 43224433  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaagg 226  Q
    |||||||||| ||||||||        || ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  43224432 ttttatttcaattgtgatgtttttattgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcaggtatgggcacttagatacccatagggtatggggaagg 43224333  T
Q  227 ggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggta 326  Q
    | |||| |||||||| |||||||||||  |||      ||||||| |||||| |||||| |||||||||| || || | ||||||  | |||||||||||    
T  43224332 gcactaaagttgttgtccacgagggtacagac------acgggtaatttttaaaaatgcgggtatggggatgggcattgtagtacccttcccattgggta 43224239  T
Q  327 cccattgc 334  Q
    | ||||||    
T  43224238 ctcattgc 43224231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Original strand, 17172123 - 17172426
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  17172123 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacaattcgtattattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 17172222  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggac 230  Q
    ||||| ||||||||         ||||||||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||| |     
T  17172223 tttcaattgtgatgttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgggggtatgagcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcat 17172322  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  17172323 taaagttgttgcccacgagggtacgggctcgggtacggacattttttacaaatgagggtatggggatggatactatagtaccctatccattgggtaccca 17172422  T
Q  331 ttgc 334  Q
    ||||    
T  17172423 ttgc 17172426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3363167 - 3362862
Alignment:
Q  40 ttttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcat 139  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3363167 ttttaaggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcgtagttttatttcat 3363068  T
Q  140 ttgtgatgnnnnnnngt---------cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaagggga 229  Q
    ||||||||        |          ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  || | ||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  3363067 ttgtgatgttttttattttatttttatttttcatagttaaagtgcgggtaatggatgcgggtatggacattgagatacccatatgatatggggaagggga 3362968  T
Q  230 ctacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacc 328  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    ||  | |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||| |    
T  3362967 ctaaagttgttgtccacgagggtaccagcatagatacgggtatttttttataaatacgggtatggagacggacactgtagtaccttatccattgggtaac 3362868  T
Q  329 cattgc 334  Q
    ||||||    
T  3362867 cattgc 3362862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 46783277 - 46782995
Alignment:
Q  31 tgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtt 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46783277 tgtataattttttagggatattttggatgttttatatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtt 46783178  T
Q  131 ttatttcatttgtgatg---nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaagg 226  Q
    |||||| |||| |||||          || ||||||||||||||             ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| |||||    
T  46783177 ttattttatttttgatgttttttttttgttttttcatagttaaa-------------gtgcgggtatgggcacttaggtacccatagggtatggagaagg 46783091  T
Q  227 ggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggta 326  Q
    |||||| |||||||||||||||            ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||    
T  46783090 ggactaaagttgttgcccacga------------gggtacgtgtattttttataaatgcgggtatggggacgggcactgtagtaccctaaccattgggta 46783003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Original strand, 35092639 - 35092754
Alignment:
Q  31 tgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtt 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35092639 tgtataattttttagggatattttggatgttttttatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcgtagtt 35092738  T
Q  131 ttatttcatttgtgat 146  Q
    ||||||||||||||||    
T  35092739 ttatttcatttgtgat 35092754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 253
Target Start/End: Original strand, 43702312 - 43702540
Alignment:
Q  25 tgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatc 124  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||  || |    
T  43702312 tgcaggtgtacaattttttagagatattttggatgtttttaatttgactaaatattatgattcgtattattt--tgagttaattttaatagatttagacc 43702409  T
Q  125 atagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatgggg 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||    
T  43702410 atagttttatttcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatggatgcgggtatgggcacttaggtacccatagggtatgggg 43702509  T
Q  223 aaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||| | |||| ||||||| ||||||||||||    
T  43702510 aagagcactaaagttgttacccacgagggta 43702540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44300912 - 44300620
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  44300912 ggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacgattcgtactattttattagttgatttaaataattttggatcatagttttatttcaattgtg 44300813  T
Q  145 atg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtatggggaaggggactacagttgttg 241  Q
    |||         ||||||||||||  |||||| || ||| |||||| |||||| |||||||  | || || || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  44300812 atgttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaacgggtgcaggtatgggcacttaagtgcccataagatatggggaagggcactaaagttgttg 44300713  T
Q  242 cccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||| || | |||||||||  |||||||| |||||    |||||||| ||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  44300712 cccacgagggtacgggctcgggtacggacattttttacaaatgagcttatggggatgggtactatagtaccctatccattgggtacccattgc 44300620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9477869 - 9477567
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  9477869 catcctgccggtgtacaattttttagagatattttagatgtttttaatttgactaaatactacgattcatattattttatgagttaattttaaaagtttt 9477770  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||             ||||||||||| |||||||| |||| ||| || |    
T  9477769 agaccatagttttatttcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaa-------------gtgcgggtatgggcacttaggtacccatagggca 9477683  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    |||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| || |||||| |||||  |||||||||| |  || | ||||||  ||||    
T  9477682 tgggaaagggcattaaagttgttgcccacgagggtacggacacaagtacggataatttttacaaatgagggtatggggatgagcattgtagtaccctacc 9477583  T
Q  318 cattgggtacccattg 333  Q
     |||||||||||||||    
T  9477582 gattgggtacccattg 9477567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 333
Target Start/End: Original strand, 1875969 - 1876249
Alignment:
Q  58 tgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtga----tgnnnnnn 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| ||| |     |           
T  1875969 tgttttttatttggctaaatactacgattgatattattttatgagttgatttgaaattttttggatcataattttatttcaattgcgggtttttttttat 1876068  T
Q  154 ngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggt 252  Q
     ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  1876069 tgtcttttcatagttaaaatgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtgcccatagggtatggggaagggcactaaagttgttgcccacgatggt 1876168  T
Q  253 atggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    | ||   |||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||  || |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  1876169 acgggtccgggtacgagtattttttacaaacgcgggtatggggatgggtaccatagtacccttcccattgggtacccattg 1876249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Original strand, 3551433 - 3551740
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3551433 ggtgtacaattttttagggatattttaaatgttttttatttgacttaatactgcaattcatattattttataagttaattttaaaaaatttggaccatag 3551532  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaagg 226  Q
    || ||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  ||||||| |||  ||| ||||| |||| ||    
T  3551533 ttctatttcaattgtgatgttttcattgtcttttcatagttaaagtgtgggtaatggatacgggtatggacacttaggtactcatagggtatagggatgg 3551632  T
Q  227 ggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggta 326  Q
    | || |  ||||||| |||||| | ||  | || |||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||| ||  ||| ||||||  |||  || |||||    
T  3551633 gcaccaaggttgttgtccacgaagatacaggcatgggtacaggtattttttacaaatacgggtatgaggaagggtactgtagtaccctacttatagggta 3551732  T
Q  327 cccattgc 334  Q
    ||||||||    
T  3551733 cccattgc 3551740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 334
Target Start/End: Original strand, 40342244 - 40342523
Alignment:
Q  58 tgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtga--tgnnnnnnng 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||   || ||||||||||||||||||| |||||   |        |    
T  40342244 tgttttttatttggctaaatactacgattcatattattttattagttgatttgaaattttttggatcatagttttatttcaattgtgggtttttttattg 40342343  T
Q  156 tcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtat 254  Q
    |||||||||||||||| || || |||||| || ||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  40342344 tcttttcatagttaaaatgcgggtaatggatgggggtatgggcacttaggtgcctatagggtatggggaagggcactaaagttgttgcccacgagggaat 40342443  T
Q  255 ggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    ||   ||||| || |||||||||| ||| ||  ||||| | | ||  ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  40342444 gggttcgggtccgagtattttttacaaacgcgtgtatgagaatgggtactatagtaccctacccattggatactcattgc 40342523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Original strand, 33067372 - 33067625
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||| ||| |||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||      
T  33067372 catcttgccggtgtacaatttttaagagatattttggatgtttttaatttgactaaatactacgattcatattattttatgagttaattttaaaagatgt 33067471  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgat-gnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gta 217  Q
     || ||||||||||||||| |||||||         |||||||||| | ||||             ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||    
T  33067472 agaccatagttttatttcaattgtgatatttttattgtcttttcattgctaaa-------------gtgcgggtatgggcacttaggtacccatagagta 33067558  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatg 284  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||    
T  33067559 tggggaaggacactaaagttgttgcccacgagggtatgggcatggatacgggtaatttttacaaatg 33067625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 332
Target Start/End: Original strand, 40789446 - 40789736
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  40789446 ggatattttggatgtttttttatttgactaaatattacgatttgtactattttattagttgatttaaataattttggatcatagttttatttcaattgtg 40789545  T
Q  145 atg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttg 241  Q
    |||         || |||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||  | || ||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  40789546 atgttttttattgttttttcatagagaaagtgcgggtaatgagtgcgggtatgggcacttaagtgcccatagggtatgggaaagggcactaaagttgttg 40789645  T
Q  242 cccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccatt 332  Q
     ||||||||||| ||   ||||||| |  |||||||| |||||  |||||||||| ||  |||||| |||  || | ||||||||||||||    
T  40789646 tccacgagggtacgggttcgggtacagacattttttacaaatgagggtatggggatgggtactataataccctatctattgggtacccatt 40789736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 333
Target Start/End: Original strand, 48558591 - 48558890
Alignment:
Q  40 ttttagggatattttggatgttttt---tatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttattt 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||   || ||||||| |||||||||    
T  48558591 ttttagggatattttagatgtttttatttatttgattaaatactacgattcatactattttatgagttgatttgaaattttttggatcatggttttattt 48558690  T
Q  137 catttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactac 233  Q
    ||  |||| ||         |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||  ||||||  |  | ||||| |||||||||||| ||||     
T  48558691 caactgtgctgttttttattgtcttttcatggttaaagtgcgggtaatggatgcggatatggacacttaagtggccatagggtatggggaagggcactaa 48558790  T
Q  234 agttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||    |||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||  | |||||||| |||||||||    
T  48558791 agttgttgcccacgagggtacgggcacaggtactaacattttttacaaatgcgggtatggggatgggtactatagtaccgtgcccattggatacccattg 48558890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 334
Target Start/End: Original strand, 36074052 - 36074331
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaat--tgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn--g 155  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  || |||||||| ||||  ||| ||||||   | |||||||| |||||||||| ||||||||         |    
T  36074052 ttttttatttggcttaatactacgatttctactattttataagttgttttaaaaaaaaaattggatcataattttatttcaattgtgatgtttttaattg 36074151  T
Q  156 tcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtat 254  Q
    ||| || ||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||     
T  36074152 tctatttataattaaagtgcgggtaatgggtacgggtatgggcacttaggtgcccatagggtatggggaagggcactaaagttgttacccacgaaggtac 36074251  T
Q  255 ggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    || |||| ||||||| | |||||| ||| |||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  36074252 gggcacgagtacgggcaatttttacaaacgcaggtatagggatgaatactatagtaccctacccattggatacccattgc 36074331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 334
Target Start/End: Original strand, 28067183 - 28067478
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcattt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  || |||||||| |||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| ||    
T  28067183 tagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacaatttatactattttattagttgatttgaaattttttggatcataattttatttcaatt 28067282  T
Q  142 gtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttg 238  Q
    ||| ||         |||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| |||| |||| |  | || |||||    
T  28067283 gtggtgttttttattgtcttttcatggttaaagtgcaggtaatgggtgcaggtatgggcacttaagtacccatagggtatgaggaaagacattaaagttg 28067382  T
Q  239 ttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    ||| ||||||||||| |  | || |||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||  ||||| ||||  | |||||||||||||||||||    
T  28067383 ttgtccacgagggtacgagctcgagtacgggtattttttacaaacgcgggtatggggatgggtactattgtaccctgcccattgggtacccattgc 28067478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30391744 - 30391540
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtga 145  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||   || ||||||| ||||||||||| |||||     
T  30391744 ggatattttagatgtttttt--ttgactaaatactacgattcatactattttatgagttgatttgaaattttttggatcatggttttatttcaattgtgc 30391647  T
Q  146 tgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctataggtatggggaaggggactacagttgttgcc 243  Q
    ||         |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  | || ||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  30391646 tgttttttattgtcttttcatggttaaagtgcggataatggatgcgggtatgggcacttaagtgcccatagggaagggaaagggcactaaagttgttgcc 30391547  T
Q  244 cacgagg 250  Q
    |||||||    
T  30391546 cacgagg 30391540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 253
Target Start/End: Original strand, 5923987 - 5924196
Alignment:
Q  44 agggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaat--tgggatcatagttttatttcattt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||   | |||| |||||||||||||| ||    
T  5923987 agggatattttggatgttttttatttggct------tacgattcgtactattttatgagttgatttaaaaaaaaaattggattatagttttatttcaatt 5924080  T
Q  142 gtgatgnnnnnnn---gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagtt 237  Q
    ||||||          |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||| | || | | |||||||||||||| |||| ||||    
T  5924081 gtgatgcttttttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcaggtatggacacttaggtgcccacagggtatggggaagggcactaaagtt 5924180  T
Q  238 gttgcccacgagggta 253  Q
    ||| ||||||||||||    
T  5924181 gttacccacgagggta 5924196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 334
Target Start/End: Original strand, 25309431 - 25309720
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtga 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||| |||   |||  | ||||||||||||||  ||||||    
T  25309431 ggatattttggatgttttttattttgttaaatgctacgattcatacttttttatgagttgatttgaaatttttga-accatagttttatttccattgtga 25309529  T
Q  146 tgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gtatggggaaggggactacagttgttgcc 243  Q
    |         ||||| || ||||||||||| || || ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  25309530 tatttttattgtcttctcgtagttaaagtgcgggtagtgggtgcaggtatgaacactaagatacccatagagaatgtggaagggcactaaagttgttgcc 25309629  T
Q  244 cacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
     ||||||||| ||   ||| |||| |||||||||| ||| || ||||||| ||  | |||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25309630 tacgagggtacgggttcggatacgtgtattttttacaaacgcgggtatggagaatggcactgtagtaccttacccatagggtacccattgc 25309720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 333
Target Start/End: Original strand, 9355220 - 9355368
Alignment:
Q  186 tgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatg 284  Q
    ||||||||||||||||||  | || ||||| |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| ||| |    
T  9355220 tgcgggtatgagcacttaagtgcccatagggtatgaggaaggacactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgtgtacgagtattttttacaaacg 9355319  T
Q  285 caggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
      |||||| ||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9355320 tgggtatgaggatggatactatagtaccctacccattgggtacccattg 9355368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11244224 - 11244022
Alignment:
Q  47 gatattttggatgtttttt--atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttattt-catttgt 143  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  || |||| || ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||||||||||| || ||||    
T  11244224 gatattttggatgttttttttatttagctgaatattatgattcttactattttatgagttgatttgaaaattttgggaccatagttttattttcaattgt 11244125  T
Q  144 gatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgtt 240  Q
    |||          ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  11244124 gatatattttattgtcttttcatagttaaaatgttgataatgggtgcgggtatgggtacttaggtacccataggatatggggaagggcactaaagttgtt 11244025  T
Q  241 gcc 243  Q
    |||    
T  11244024 gcc 11244022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26299317 - 26299062
Alignment:
Q  80 tacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngt--cttttcatagttaaagtgtgg 177  Q
    |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||        |  ||||||||   ||||||| ||    
T  26299317 tacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttattacaaatgtgatgatttttattatcttttcatgactaaagtgcgg 26299218  T
Q  178 ataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttt 276  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||  | || ||||| |||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| ||||||    
T  26299217 ataattggtgcgggtatggacacttaagtgcccatagggtatggggaagggcaccaaagttgttgtccacgagggtacgggcacgagtacgggcattttt 26299118  T
Q  277 tataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccatt 332  Q
    || ||| ||  |||||| || ||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  26299117 tacaaacgcgagtatggagatggatactatagtaccctacccattgagtacccatt 26299062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33979018 - 33978744
Alignment:
Q  52 tttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnn 150  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||       
T  33979018 tttggatgtttttttatttggttaaacattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttcaagtgtggtgatt 33978919  T
Q  151 nnnngt--cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacg 247  Q
         |  ||||  || | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  | || ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  33978918 tttattatctttcaatggctaaagtgcggataatgggtgcgggtatgggcacttatgtgcccatacggtatggggaagggcactaaaggtgttgcccacg 33978819  T
Q  248 agggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
    |||||| || |||||||||||  |||||||  ||| || |||||||  |  || ||||||||||  |||||||||    
T  33978818 agggtacgggcacgggtacggacattttttgcaaacgcgggtatggaaatcgatactatagtaccctacccattg 33978744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9223669 - 9223551
Alignment:
Q  214 ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactt 313  Q
    ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||| |  |||||||||| ||| || |||||||      
T  9223669 ggtatggggaatgatactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacaggtacgggcattttttacaaacgtgggtatggggatggatacaatagtaccc 9223570  T
Q  314 tacccattgggtacccatt 332  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9223569 tacccattgggtacccatt 9223551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36072692 - 36072592
Alignment:
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  36072692 gtcttttcagagttaaattgcgggtaattggtgcgggtatgggcacttaggtgcccatagggtatggggaagggcactaaagttgttgcccacgagggta 36072593  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  36072592 t 36072592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Original strand, 34152308 - 34152399
Alignment:
Q  48 atattttggatgttt-tttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  34152308 atattttggatgtttctttatttggctaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttca 34152399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34174816 - 34174725
Alignment:
Q  48 atattttggatgttt-tttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  34174816 atattttggatgtttctttatttggctaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttca 34174725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 226
Target Start/End: Original strand, 30738555 - 30738733
Alignment:
Q  47 gatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || || ||||||||||| ||| ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  30738555 gatattttgaatgttttttatatgactaaatactacca-tcatactattttatgaggtaa-tttgaaaaactaggaccatag-tttatttcaattgtgat 30738651  T
Q  147 g-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag-gtatggggaagg 226  Q
    |        ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  30738652 gtttttattgtcttttcatagttaaagtgcaggtaatgggtgtgggtatgggcacttaggtacccatagcgtatggagaagg 30738733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2960112 - 2959917
Alignment:
Q  67 tttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg--nnnnnnngtcttttcat 164  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| ||||||||         ||| ||||||    
T  2960112 tttggctaaatactacaattcgtactattttatgagttgatttgaaattttttggatcataattttatttcaattgtgatgttttttattgtcatttcat 2960013  T
Q  165 agttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggaca 259  Q
    |||||||||| || |||| | || |||||||  ||||||| | || ||| || ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  2960012 agttaaagtgcgggtaatagatgtgggtatggacacttaggtgcccatacggaatggggaagggcactaaagttattgcccacgaggatacggaca 2959917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 296
Target Start/End: Original strand, 34152399 - 34152526
Alignment:
Q  170 aagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgg 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |  | ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  34152399 aagtgtgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtgtccatagggtatggggaagggcactaaagttattgcccacgagggtacagacacgggtacag 34152498  T
Q  269 gtattttttataaatgcaggtatgggga 296  Q
      |||||| | ||| || ||||||||||    
T  34152499 acatttttaacaaacgcgggtatgggga 34152526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 34174725 - 34174598
Alignment:
Q  170 aagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgg 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |  | ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  34174725 aagtgtgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtgtccatagggtatggggaagggcactaaagttattgcccacgagggtacagacacgggtacag 34174626  T
Q  269 gtattttttataaatgcaggtatgggga 296  Q
      |||||| | ||| || ||||||||||    
T  34174625 acatttttaacaaacgcgggtatgggga 34174598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 143
Target Start/End: Original strand, 38398352 - 38398446
Alignment:
Q  48 atattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||| || ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  38398352 atattttggatgttttttatttggccaaatattatggttcctaatattttatgagtttatttgaaaaaaat-ggatcatagttttatttcaattgt 38398446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 143
Target Start/End: Original strand, 38400894 - 38400988
Alignment:
Q  48 atattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||| || ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  38400894 atattttggatgttttttatttggccaaatattatggttcctaatattttatgagtttatttgaaaaaaat-ggatcatagttttatttcaattgt 38400988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 45112281 - 45112182
Alignment:
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  45112281 gtcttttcagagttaaactacgggtaatgggtgcgggtatgagcacttaggtgcccatagggtatggagaagggcactaaagttattgcccacgagggta 45112182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 332
Target Start/End: Original strand, 12499685 - 12499758
Alignment:
Q  259 acgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccatt 332  Q
    |||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12499685 acgggtacaggcattttttacaaacgcaggtatggggatggatactatagtactctaccaattgggtacccatt 12499758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 138
Target Start/End: Original strand, 12499515 - 12499611
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  12499515 taggaatattttggatgtttttttatttggctaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaaattggatcataattttatttca 12499611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Original strand, 38469831 - 38470058
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatg-ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcattt 141  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||| |||| |||   |  |||| |||||||||||| | ||    
T  38469831 taggaatattttggatgcttttttatttggctaaatattactatttgtactattttataagttgatttgaaattttatggattatagttttattttaatt 38469930  T
Q  142 gtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagataccta-taggtatggggaaggggactacagttg 238  Q
    ||| ||         || |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  | || | | |||||||||||||| |||| | |||    
T  38469931 gtggtgttttttattgtatttttacagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtgcccattgggtatggggaagggtactaaaattg 38470030  T
Q  239 ttgcccacgagggtatggacacgggtac 266  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||    
T  38470031 ttgcccacgaggatacggactcgggtac 38470058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16560901 - 16560793
Alignment:
Q  214 ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactt 313  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||  | ||| |||| |||||| ||||||| || |||  |||||||||      
T  16560901 ggtatggggaaggacactaaagttgttgtccgcgagggtacggacacgggtactagcattatttacaaatgcgggtatggagatggatgctatagtaccc 16560802  T
Q  314 tacccattg 322  Q
    |||||||||    
T  16560801 tacccattg 16560793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 322
Target Start/End: Original strand, 16604761 - 16604869
Alignment:
Q  214 ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactt 313  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||  | ||| |||| |||||| ||||||| || |||  |||||||||      
T  16604761 ggtatggggaaggacactaaagttgttgtccgcgagggtacggacacgggtactagcattatttacaaatgcgggtatggagatggatgctatagtaccc 16604860  T
Q  314 tacccattg 322  Q
    |||||||||    
T  16604861 tacccattg 16604869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 9223822 - 9223735
Alignment:
Q  52 tttggatg-ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  9223822 tttggatgattttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaaattggatcatagttttatttca 9223735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Original strand, 9355094 - 9355181
Alignment:
Q  52 tttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9355094 tttggatgtttttttatttggtaaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttca 9355181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16278624 - 16278525
Alignment:
Q  49 tattttggatgtt-ttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||   | |||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16278624 tattttggatgttgttttatttggccaaatactatgatttcaactattttatgagttgctttaaaaaaaattggatcatagttttatatcaattgtgatg 16278525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 21153399 - 21153332
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||||| ||||| ||||    
T  21153399 tagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacaattcatactattttacgagttgattt 21153332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 334
Target Start/End: Original strand, 35092849 - 35092920
Alignment:
Q  263 gtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  35092849 gtacgagtattttttataaatgcgggtatggggacgggcactgtagtaccctacccattaagcacccattgc 35092920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Original strand, 48644430 - 48644528
Alignment:
Q  50 attttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||| |||||| | |||||| | |||||||| | ||||||||    
T  48644430 attttggatgttttttcatttggttaaatactacaatttgtactattttatgagttgctttaaaaaaaattggatcacaattttatttgaattgtgatg 48644528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 339
Target Start/End: Original strand, 5924192 - 5924270
Alignment:
Q  261 gggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgctatct 339  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||||| ||  |||||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5924192 gggtacgggtattttttacaaacgcggatatggggatgggtactataataccctacctattgggtacccattgccatct 5924270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 7376730 - 7376642
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaa-tactacgattcgtattattttatgagttaattt--taaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||  || |||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7376730 ttttttatttagctaaagtactacgatttctagtattttatgagttgttttaataaaaaattgg-atcatagttttatttcaattgtgat 7376642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43218694 - 43218648
Alignment:
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcact 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||    
T  43218694 gtcttttcatagttaaagtgttgatgatgggtgcggatatgggcact 43218648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 104
Target Start/End: Original strand, 27039660 - 27039732
Alignment:
Q  31 tgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagtt 104  Q
    |||| |||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27039660 tgtacaatattttagagatctcttggatgatttt-atttggcgaaatactacaattcgtactattttatgagtt 27039732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 20691484 - 20691791
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20691484 gtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaatataacgattcatattattttatgagttaattttgaaaaattgggatcgtagt 20691583  T
Q  130 tttatttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaagg 226  Q
    ||||||||||||||||||         || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  20691584 tttatttcatttgtgatgtttttttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtacccatagggtatggggaagg 20691683  T
Q  227 ggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggta 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||     
T  20691684 ggactaaagttgttgcccacgagggtacggacacgggtacggatattttttataaatgcggatagagggacgggcactgtagtaccctacccattgggtg 20691783  T
Q  327 cccattgc 334  Q
    ||||||||    
T  20691784 cccattgc 20691791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 1329446 - 1329764
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1329446 catcatgtcggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacaattcatattattttatgagttaattttaaaaaactg 1329545  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgat---gnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg- 215  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||   |       || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| || | |||||     
T  1329546 ggatcgtagttttatttaatttgtaattttgttgttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgtgggtatgggcacttaggtatccataggg 1329645  T
Q  216 tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtacttta 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |     
T  1329646 tatggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtaagggcacgggtacgagtattttttataaatgcgggtatggggacggacactgtagtaccctg 1329745  T
Q  316 cccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  1329746 cccattggatacccattgc 1329764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33331824 - 33331508
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33331824 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccatagttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 33331725  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-ta 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        || ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | |||  |||| ||||| ||    
T  33331724 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgagtgcgggtatgagtaattaagtacccatagggta 33331625  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||  || |    
T  33331624 tggggaaggggactaaagttgttgcccacaagggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcgggtatggagacggacattgtagtaccctatc 33331525  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||    
T  33331524 cattgggtacccattgc 33331508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 13534073 - 13534395
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13534073 catcatgccgatgtacaattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 13534172  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn------gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||             || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||  |||| |||    
T  13534173 ggatcttagttttatttcatttgtgatgtttttttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacttaagtacccata 13534272  T
Q  214 -ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtac 311  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| || || | ||||||    
T  13534273 tggtatggggaatgggactaaagttgttgcccacgagggtacggacacgggtacaggtatttttttataaatgcgggtatggggatgggcattgtagtac 13534372  T
Q  312 tttacccattgggtacccattgc 334  Q
      |||||||||||||||||||||    
T  13534373 cctacccattgggtacccattgc 13534395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33328812 - 33328496
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33328812 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccatagttcatattattttatgagttaattttaaaaaatta 33328713  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||   |||||  |||| ||| ||||    
T  33328712 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgagtgcgggtatggttacttaagtacccatagggta 33328613  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||  || |    
T  33328612 tggggaaggggactaaagttgttgcccacaagggtacgggcacgggtacagatattttttataaatgcgggtatggagacggacattgtagtaccctatc 33328513  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||    
T  33328512 cattgggtacccattgc 33328496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 325
Target Start/End: Original strand, 29641349 - 29641646
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29641349 catcatgacggtgtataattttttagggatattttggatgttttttatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 29641448  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg----nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-g 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||             ||||||||||| |||||||| | || ||| |    
T  29641449 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttgttttttgttttttcatagttaaa-------------gtgcgggtatgggcacttaggtgcccatatg 29641535  T
Q  215 gtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtacttt 314  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||  |    
T  29641536 gtatggggatggcgactaaagttgttgtccacgagggtacgggcacgggtatgggtattttttataaatgcggatatggggacggacgctgtagtaccct 29641635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31071018 - 31070704
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaatttt-aaaaaatt 118  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  31071018 catcatgccagtgtataattttttagagatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattt--tgagttaattttaaaaaaatt 31070921  T
Q  119 gggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
     ||||| | |||||||||||||| |||||       || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |    
T  31070920 aggatcgtggttttatttcatttatgatgtttttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtacccatagggga 31070821  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttac 316  Q
    | || |||||||||| ||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||  |||    
T  31070820 ttggaaaggggactaaagttgttgttcacgagggtacgggcacgtgtacgggtatttttttataaatgcgggtat-ggaacgggcactgtagtaccctac 31070722  T
Q  317 ccattgggtacccattgc 334  Q
     |||||||||||||||||    
T  31070721 tcattgggtacccattgc 31070704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 333
Target Start/End: Original strand, 31783869 - 31784174
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatatttt-agggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaatt 118  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31783869 catcatgccggtgtataatttttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaatt 31783968  T
Q  119 gggatcatagttttatttcatttgtgatg---nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-g 214  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||          || ||||||||||||||             |||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  31783969 gagatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttttgttttttcatagttaaa-------------gtgcgggtatgagcacttaggtacccatagg 31784055  T
Q  215 gtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtacttt 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || | ||||||  |    
T  31784056 gtatggggaaggggactaaagttgttgcgtacgagggtacgggcacgtgtacgtgtattttttataaatgcgggtatgaggacgggcattgtagtaccct 31784155  T
Q  315 acccattgggtacccattg 333  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  31784156 acccatcgagtacccattg 31784174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Original strand, 24447024 - 24447327
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  24447024 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacaattcgtattattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 24447123  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggac 230  Q
    ||||| ||||||||         ||||||||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||| |     
T  24447124 tttcaattgtgatgttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgggggtatgagcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcat 24447223  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  24447224 taaagttgttgcccacgagggtacgggctcgggtacggacattttttacaaatgagggtatggggatggatactatagtaccctatccattgggtaccca 24447323  T
Q  331 ttgc 334  Q
    ||||    
T  24447324 ttgc 24447327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Original strand, 1221613 - 1221916
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  1221613 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacaattcgtattattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 1221712  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggac 230  Q
    ||||| |||||||          ||||||||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||| |     
T  1221713 tttcaattgtgatattttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgggggtatgagcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcat 1221812  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||| |||| |||||| || | |||||||||  |||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  1221813 taaagttgttgtccacaagggtacgggctcgggtacggacattttttacaaatgagggtatggggatggatactatagtaccctatccattgggtaccca 1221912  T
Q  331 ttgc 334  Q
    ||||    
T  1221913 ttgc 1221916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 31511528 - 31511655
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31511528 catcatgtcggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaatttcaaaaaattg 31511627  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31511628 ggatcgtagttttatttcatttgtgatg 31511655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6938256 - 6938033
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| |||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||    
T  6938256 ggtgtacaattttttagaggtattttggatgtttttaattttactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaatatttatgtcatag 6938157  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaagg 226  Q
    |||| ||||| ||||||||        |||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  6938156 ttttgtttcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgcgg---gtgggtgcgggtatgggcacttaggtacccatagggtatggggaagg 6938060  T
Q  227 ggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||    
T  6938059 gcactaaagttgttgcccacgggggta 6938033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 334
Target Start/End: Original strand, 9062062 - 9062349
Alignment:
Q  52 tttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnn 150  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||       
T  9062062 tttggatgtttttttatttggttaaatattacgattcatattattttgtaagttgatttaaaaaaatttggatcataattttatttcatgtgtggtgatt 9062161  T
Q  151 nnnngt--cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacg 247  Q
         |  |||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  | || ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  9062162 tttattatctttccatggctaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcactaaagttgttgtccacg 9062261  T
Q  248 agggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccatt-gggtacccattgc 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||    
T  9062262 agggtacggacacgggtacgggcattttttacaaacgcgggtatggggatggatactatagtaccctatccattggggtacccattgc 9062349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6337318 - 6337141
Alignment:
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgg 256  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |     
T  6337318 ttttcatagctaaagtgtgggtaataggtgcgggtatgggcacttaggtacccatagggtatggggaatggcactaaagttgttgcccacgagggtacga 6337219  T
Q  257 acacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
     |||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6337218 gcacgggtatggatatttcttacaaatgtgggtatggggatgggcactatagtaccctacccattgggtacccattgc 6337141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7807970 - 7807852
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||     
T  7807970 ggtgtacaattttttagagatattttggatgtttttaatttgactaaatactacgattcgtattattttattagttaattttaaaagattttgatcataa 7807871  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatg 147  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  7807870 ttttatttcaattgtgatg 7807852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12429620 - 12429331
Alignment:
Q  47 gatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||  || |||| |||||||||| |||||||    
T  12429620 gatattttggatgtttttagtttgactaaatactacgatttgtattattttacgggttaattttaaaagatttagaccataattttatttcaattgtgat 12429521  T
Q  147 g-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgccc 244  Q
    |        |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||  |||||||||| | ||||| ||||| ||| || |||| ||| |||||||    
T  12429520 gtttttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgagtgtgggtatggacacttagataaccataggatatggagaaaggcactaaagtagttgccc 12429421  T
Q  245 acgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||  |||| | |||||  || |||||| |||| | ||| ||| || || || | |||| |  ||| |||||||||||||||||    
T  12429420 acgagggtacagacatgagtacgaataatttttacaaatacgggtttggagatgggcattgtagtcccctactcattgggtacccattgc 12429331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 334
Target Start/End: Original strand, 6799507 - 6799628
Alignment:
Q  213 aggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtact 312  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||||     
T  6799507 aggtatggggaagggcactaaagatgttgcccacgagggtacgggtacgggtacgggcattttttacaaacgcgggtatggggatggatactatagtacc 6799606  T
Q  313 ttacccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6799607 ttacccattgggtacccattgc 6799628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Original strand, 33960063 - 33960166
Alignment:
Q  45 gggatattttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgt 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| || || || | ||||||||||||||||| ||||    
T  33960063 gggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacgattcgtactattttattagttgatttaaataattttgaatcatagttttatttcaattgt 33960162  T
Q  144 gatg 147  Q
    ||||    
T  33960163 gatg 33960166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 293
Target Start/End: Original strand, 6337982 - 6338097
Alignment:
Q  179 taatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtatttttt 277  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||    
T  6337982 taattggtgcgggtatgagctcttaggtgcccatagggtatggggaagggcactaaagttgttgcccacgagggtatgggcccgaatacgtgtatttttt 6338081  T
Q  278 ataaatgcaggtatgg 293  Q
    | ||| || |||||||    
T  6338082 acaaacgcgggtatgg 6338097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 322
Target Start/End: Original strand, 31511683 - 31511822
Alignment:
Q  185 gtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaa 282  Q
    ||||||||||| |||||||| | || || || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| |||||||||||    
T  31511683 gtgcgggtatgggcacttaggtgcccatggggtatggggatggcgactaaagttgttgtccacgaggatacgggcacgagtatgggtatttttttataaa 31511782  T
Q  283 tgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
    ||| | ||||||||| ||| || ||||||  |||||||||    
T  31511783 tgcggatatggggacagacgctgtagtaccctacccattg 31511822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28769963 - 28769875
Alignment:
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgccca 245  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||    
T  28769963 ttttcatagctaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatggacacttaggtacccataggatatggggaatgacactaaagttgttgccca 28769875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Original strand, 6799355 - 6799442
Alignment:
Q  52 tttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6799355 tttggatgtttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttagatcatagttttatttca 6799442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10499255 - 10499164
Alignment:
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgccca 245  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||| |||||| | || ||||| |||||||||||| | || ||||||||||||    
T  10499255 gtcttttcatagttaaagtgcgtgtaatgggtgctgatatgagaacttaggtgcccataggatatggggaagggcagtaaagttgttgccca 10499164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6938037 - 6937964
Alignment:
Q  261 gggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || || | ||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6938037 gggtacgggtaatttttacaaatgcgggtatggggatgggcattgtagtaccctacccatagggtacccattgc 6937964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 99
Target Start/End: Original strand, 31555874 - 31555922
Alignment:
Q  51 ttttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttat 99  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31555874 ttttagatgttttttattttgttaaatactacgattcgtactattttat 31555922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 33867436 - 33867753
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33867436 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 33867535  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtctttt--catagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-t 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        | ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | || ||  |||| ||||| |    
T  33867536 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacctaagtacccatagggt 33867635  T
Q  217 atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttac 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||  |||    
T  33867636 atggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacggatattttttataaatgcgggtatggggacggacattgtagtaccctac 33867735  T
Q  317 ccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33867736 ccattgggtacccattgc 33867753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 32422632 - 32422948
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32422632 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 32422731  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||  |||| ||| ||||    
T  32422732 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacttaagtacccatagggta 32422831  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||  || |    
T  32422832 tggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacgaatattttttataaatgcgggtatggggacgggcattgtagtaccgtatc 32422931  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||    
T  32422932 cattgggtacccattgc 32422948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38620605 - 38620289
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38620605 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatattttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 38620506  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-ta 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||   |||||  |||| ||||| ||    
T  38620505 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatggatacttaagtacccatagggta 38620406  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||  ||||    
T  38620405 tggggaaggggactaaagttgttgcccatgagggtatgggcacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggatgggcattgtagtaccctacc 38620306  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    ||||| |||||||||||    
T  38620305 cattgagtacccattgc 38620289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25424967 - 25424651
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25424967 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaat-g 25424869  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtctttt--catagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-t 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        | ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | || ||  |||| ||||| |    
T  25424868 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggtacctaagtacccatagggt 25424769  T
Q  217 atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttac 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||  |||    
T  25424768 atggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacggatattttttataaatgcgggtatggggacggacattgtagtaccctac 25424669  T
Q  317 ccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25424668 ccattgggtacccattgc 25424651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 31440523 - 31440843
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaa--- 116  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||       
T  31440523 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaatttaaaaaaaaaa 31440622  T
Q  117 -ttgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatag 214  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  31440623 attaggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtacacatag 31440722  T
Q  215 g-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactt 313  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||      
T  31440723 ggtatggagaaggggactaaagttattgcccacgagggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcgggtattgggacgggcattgtagtaccc 31440822  T
Q  314 tacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31440823 tacccattgggtacccattgc 31440843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4481271 - 4480959
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4481271 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaatatcacggttcatgttattttatgagttaattttaaaaaattg 4481172  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtga---tgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-gg 215  Q
     |||| ||||||||||||||||||||   |        || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||    
T  4481171 agatcgtagttttatttcatttgtgatattttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatggacacttaagtacccataggg 4481072  T
Q  216 tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtacttta 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| |||    
T  4481071 tatggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggt------acgggtacgggtattttttataaatgcgggtatggggacgggcattgtagtacctta 4480978  T
Q  316 cccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4480977 cccattgggtacccattgc 4480959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9205388 - 9205075
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9205388 catcatgttggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttagtttgaaaaaattg 9205289  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtat 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| |||  ||| |||||    
T  9205288 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttt--ttttttcatagttaaaatgcggataatggatgcgggtatgggcacttaggtactcatagggtat 9205191  T
Q  219 ggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttaccc 318  Q
    |||||||||||| | |||| || ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||  |||||  ||||     
T  9205190 ggggaaggggaccaaagttattacccacgaggatacggacacgggtacaagtattttttataaatgcggttatggagacgggcactgcagtaccctacct 9205091  T
Q  319 attgggtacccattgc 334  Q
    |||||| |||||||||    
T  9205090 attgggcacccattgc 9205075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23231946 - 23231634
Alignment:
Q  23 catgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattt---taaaaaattg 119  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  23231946 catgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacgattcttattattttatgagttaatttaaaaaaaaaattg 23231847  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg---nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-gg 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||    
T  23231846 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttttattttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtacccataggg 23231747  T
Q  216 tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtacttta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || | ||||||  ||    
T  23231746 tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggt------acgggtacgggtattttttataaatttgggtatggggacgggcattgtagtacccta 23231653  T
Q  316 cccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23231652 cccattgggtacccattgc 23231634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 667862 - 668178
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||| ||| |||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||      
T  667862 catcttgccggtgtacaatttttaagagatattttggatgtttttaatttgattaaatactacgattcatattattttatgagttaattttaaaagatgt 667961  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-ta 217  Q
     || ||||||||||||||| |||||||         |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  667962 agaccatagttttatttcaattgtgatatttttattgtcttttcatagttaaagtgcggataatgggtgcgggtatgggcacttaggtacccataggata 668061  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||| |||||  |||||| ||| || || | ||||||  ||||    
T  668062 tggggaagggcactaaagttgttgcccacgaggatacgggcacgggtacgagtaatttttacaaatgtgggtatgaggatgggcattgtagtaccctacc 668161  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||    
T  668162 cattgggtacccattgc 668178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 89 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3329336 - 3329090
Alignment:
Q  89 tattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtctttt--catagttaaagtgtggataatgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        | ||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  3329336 tattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtaatgttttttttttttttttcatagttaaagtgtgggtaatgggt 3329237  T
Q  187 gcgggtatgagcacttagatacctatag-gtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgc 285  Q
    ||||||||   ||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  3329236 gcgggtatagacacttaggtacccatagagtatggggaaagggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcatgggtacgggtattttttataaatgc 3329137  T
Q  286 aggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccatt 332  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  3329136 gggtatggggacgggcactgtagtaccctacccattggatacccatt 3329090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 299
Target Start/End: Original strand, 13142463 - 13142744
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13142463 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaataccacggttcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 13142562  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||        || ||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| | |||||  |||  ||| ||||    
T  13142563 agatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatggatgcgggtatgggtacttaagtactcatagggta 13142662  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacgg 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13142663 tggggaaggggactaaagttgttgcccaagagggtacggacacgactacaagtattttttataaatgcgggtatagggacgg 13142744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 44070307 - 44070613
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44070307 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacggtttatattattttatgagttaattttaaaaaattg 44070406  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg---nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-gg 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||          || ||| ||||||||||             ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||    
T  44070407 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgttttttttttgtttttccatagttaaa-------------gtgcgggtatgggcacttaggtacccataggg 44070493  T
Q  216 tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtacttt 314  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||  ||||| |||| ||||||  |    
T  44070494 tatgggaaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacgggtatttttttataaatgcggatatgaagacgggcactgtagtaccct 44070593  T
Q  315 acccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  44070594 acccattgagtacccattgc 44070613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30241632 - 30241410
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  30241632 gtgtataattgtttagggatattttggatgttttctatttgactaaatactacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcgtaat 30241533  T
Q  130 tttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggg 227  Q
    ||||||| ||||||||||        || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||| |||||     
T  30241532 tttattttatttgtgatgttctttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgagtatgggcacttaggtacccatagggtatggagaagga 30241433  T
Q  228 gactacagttgttgcccacgagg 250  Q
    ||||| |||||||||| ||||||    
T  30241432 gactaaagttgttgccgacgagg 30241410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4289840 - 4289537
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  4289840 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacaattcgtattattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 4289741  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggac 230  Q
    ||||| |||||||          ||||||||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||| |     
T  4289740 tttcaattgtgatattttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaatgggtgggggtatgagcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcat 4289641  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||||||| |||||  ||||||||||  || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  4289640 taaagttgttgcccacgagggtacgggctcgggtacggacattttttacaaatgagggtatggggatagatactatagtaccctatccattgggtaccca 4289541  T
Q  331 ttgc 334  Q
    ||||    
T  4289540 ttgc 4289537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 320
Target Start/End: Original strand, 4592085 - 4592388
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  4592085 catcatgccggtgtacaattttttagggatattttggatgttttttatttgactaaatagtacgattcgtactattttatgagttaattttaaacaattt 4592184  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgat-gnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggta 217  Q
    ||| |  |||||||||||| |||||||          ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||  ||||||| |||| || |||||    
T  4592185 ggacctcagttttatttcaattgtgatatttttattttcttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgagcatggacacttaggtacccataaggta 4592284  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttac 316  Q
     | ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||| || ||| ||||||| |||||| |||||| ||| || |||| ||||||  |||    
T  4592285 cgaggaagggcactaaagttgttgccgacgagggtacgagcacgggtgcgtgtatttttttacaaatgctggtatgaggaagggcactgtagtaccctac 4592384  T
Q  317 ccat 320  Q
    ||||    
T  4592385 ccat 4592388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29155524 - 29155252
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgat-----tcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatc 124  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || || |||||||||||||||||| |||||| | ||| |    
T  29155524 gtgtaaaattttttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgatcgaattcatactattttatgagttaatttaaaaaaaattggacc 29155425  T
Q  125 atagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatgggg 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| | |||| ||| |||||||||    
T  29155424 atagttttatttcaattgtgatgtttttaatgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtacgggcacttgggtacccatagggtatgggg 29155325  T
Q  223 aaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatgggg 295  Q
    ||| | | || |||||||| |||| | |||  ||||| ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||    
T  29155324 aagagtattaaagttgttgtccacaaaggtgcggacatgggtacgagtatattttacaaatgcgggtatgggg 29155252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 51 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20937225 - 20936944
Alignment:
Q  51 ttttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnn 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | || |||  ||||||||||||||||| | |||   ||||||||||||| ||||||||       
T  20937225 ttttggatgttttttatttcactaaatactactattggaactacttt--gagttaattttaaaaaaattggacggtagttttatttcaattgtgatgttt 20937128  T
Q  151 nnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctataggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgag 249  Q
         ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||    
T  20937127 ttattgtcttttcataattaaagtgtgggtaataagtgcgggtatggacacttaggtacccataggtatggggaaggacactaaagttgtt-cccacgag 20937029  T
Q  250 ggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| || |||| ||||||  ||||||| |||| ||||||||    
T  20937028 ggtacaaacacgggtacgggtattttttacaaatacgggtatgaggatgggcactgtagtaccctacccatagggtgcccattgc 20936944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 334
Target Start/End: Original strand, 29546022 - 29546303
Alignment:
Q  58 tgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn--- 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||   || ||||||||||||||||||| | ||| |               
T  29546022 tgttttttatttggctaaatactacgattcatattatgttatgagttgatttgaaactttttggatcatagttttatttcaatcgtggttttttttttat 29546121  T
Q  155 -gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggt 252  Q
     ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||| | || ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |    
T  29546122 tgtcttttcatagttaaaatgcgggtaatgggtgcgggtatggacacttaggtgcccatagggtatggggaagggcaatgaagttgttgcccacgaggat 29546221  T
Q  253 atggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    | ||   ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  29546222 acgggtccgggtacgggtattttttacaaacgtgggtatggggatgggtactatagtaccctatccattgggtacccattgc 29546303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35048806 - 35048521
Alignment:
Q  52 tttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnn 150  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||| ||       
T  35048806 tttggatgtttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcgtagttttatttcaagtgtggtgatt 35048707  T
Q  151 nnnngt--cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacg 247  Q
         |  |||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35048706 tttattatctttccatggctaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtgcccataggatatggggaagggcactaaagttgttgcccacg 35048607  T
Q  248 agggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||| || |||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||||  || |||||||||| |||||||    
T  35048606 agggtacgggcacgggtacgagcattttttacaaacgcgggtatggggatggatactatagtacccta-ccattgggtatccattgc 35048521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 333
Target Start/End: Original strand, 41935456 - 41935731
Alignment:
Q  62 ttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn---gtct 158  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||   |  |||| |||||| ||||||| ||||| ||          ||||    
T  41935456 ttttatttggttaaatagtacgattcatattattttatgagttgatttgaaattttctggattatagttgtatttcagttgtggtgcttttttattgtct 41935555  T
Q  159 tttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgga 257  Q
    ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41935556 tttcagaattaaactgtgggtaatgggtgcgggtatgagcacttaggtgcccatagggtatgaggaaggacactaaagttgttgcccacgagggtacgga 41935655  T
Q  258 cacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    | ||||||| | ||||||||| ||| || ||||||| || ||  ||||||||||  | |||||||| |||||||||    
T  41935656 cccgggtacagatattttttacaaacgcgggtatggagatgggtactatagtaccctgcccattggatacccattg 41935731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 147
Target Start/End: Original strand, 10391549 - 10391662
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| || || || ||||| ||||||||    
T  10391549 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttgactaaatactacgattcatattattttattagttgatttaaataattttggatcctagtttta 10391648  T
Q  134 tttcatttgtgatg 147  Q
    ||||| ||||||||    
T  10391649 tttcaattgtgatg 10391662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 15150127 - 15150245
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||     
T  15150127 ggtgtacaattttgtagagatattttgaatgtttttaatttgactaaattttacgattcatattattttatgagttaattttaaaagatttagaccataa 15150226  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatg 147  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  15150227 ttttatttcaattgtgatg 15150245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2656988 - 2656751
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttg 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| ||     
T  2656988 tagggatattttggat-ttttttatttggctaaatactacgattcatactattttattagttgatttgaaattttttggatcataattttatttcaatta 2656890  T
Q  143 tgatg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgt 239  Q
    || ||         ||||||| || |||||||||  | ||||| ||| |||||||  ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |||| ||||||    
T  2656889 tggtgttttttattgtcttttgatggttaaagtgcaggtaatgtgtgtgggtatggacacttaagtacccatagggtatggggaaggacactaaagttgt 2656790  T
Q  240 tgcccacgagggtatggacacgggtacgggtatttttta 278  Q
    ||||||||||||||||| | || ||| ||| ||||||||    
T  2656789 tgcccacgagggtatgggctcgagtatgggcatttttta 2656751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 240
Target Start/End: Original strand, 39767049 - 39767244
Alignment:
Q  48 atattttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg-- 144  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |      
T  39767049 atattttggatgtttttttatttggctaaatactacgatttctactattttatgagttgctttaaaaaaatt-ggatcatagttttatttcaattgcgat 39767147  T
Q  145 atgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgtt 240  Q
    ||        || |||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| | |||| |||||||    
T  39767148 attttttattgtatttttataattaaagtgtgggtaatgggtacaggtatgagcacttaggtgcctatagggtatgaggaagagtactaaagttgtt 39767244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15234475 - 15234209
Alignment:
Q  70 gactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngt---cttttcatag 166  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| |||| || || || ||||||||||||| ||||| ||||||||        |   ||||||||||    
T  15234475 gactaaatactacgatttgtacgattttaagagttgatttgaataattttggatcatagttttgtttcaattgtgatgattttttattttcttttcatag 15234376  T
Q  167 ttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggta 265  Q
     ||||||| || || |||||||||| ||||||||||   | || ||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||    
T  15234375 ataaagtgcgggtattgggtgcgggaatgagcacttttgtgcccatagggtatgaggtagggtactaaagttgttgcccacgagagtacgggctcgggta 15234276  T
Q  266 cgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccatt 332  Q
    |||  |||||||| ||| ||  |||||||   ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15234275 cggacattttttacaaacgcgagtatgggattgggtactatagtaccctacccattgggtacccatt 15234209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Original strand, 8027368 - 8027648
Alignment:
Q  48 atattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||  |||| |    
T  8027368 atattttggatgtttttttatttggctaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaattttggatcatacttttatttcaagtgtggt 8027467  T
Q  147 gnnnnnnngt--cttttcatagttaaagtgtgga-taatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgc 242  Q
    |        |  |||| ||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||| | |||||  | || ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||     
T  8027468 gatttttattatctttccatggctaaagtgcggggtaatgggtgcgggtatgggtacttaagtgcccatagggtatgggaaagggcactaaagttgttgt 8027567  T
Q  243 ccacgagggtatggacacgggtacgggtatttttta-taaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattg 322  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||  ||| || |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  8027568 ccacgagtgtacgggcacgggtacggacattttttacaaaacgcgggtatggggatggatactatagtacactacccattg 8027648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15162140 - 15162049
Alignment:
Q  48 atattttggatgttt-tttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15162140 atattttggatgtttctttatttggctaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttca 15162049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 333
Target Start/End: Original strand, 16711247 - 16711550
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||| |||||   ||||||| ||||| |||| ||||  |||||| ||||||    
T  16711247 gtgtacaattttttagggatattttggatgttttt-atttgggtgcatactacaattcgc--tattttacgagttgatttgaaaactttgggaccatagt 16711343  T
Q  130 tttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggg 227  Q
    ||||||||| || |||||        ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||  | |  ||| |||||| ||||||     
T  16711344 tttatttcaattatgatgtttttattgtcttttcatatttaaagagcggataatgggtacgggtatgggcacttaagtgctcatagggtatgaggaagga 16711443  T
Q  228 gactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggta 326  Q
     | || | |||||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||| ||| || |||| ||||| || |||| ||||||  |||||||  ||||    
T  16711444 cattaaaattgttgtccacgagggtatgggttcgggtacgagtatttttttacaaacgcgggtagggggaagggcactgtagtaccctacccataaggta 16711543  T
Q  327 cccattg 333  Q
     ||||||    
T  16711544 tccattg 16711550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 332
Target Start/End: Original strand, 17154174 - 17154353
Alignment:
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||| | || |||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  17154174 gtcttttcatagttaaaatgcagataattggtgcgggtatgggcattaaggtacc-atagggtatggggaaggacactaaagttgttgcctacgagggta 17154272  T
Q  254 tggacacgggtacgggta--ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccatt 332  Q
     |||| ||| |||  |||  ||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||||||  ||||||||||    
T  17154273 cggactcggatacaagtattttttttacaaacgcatgtatggggaagggcactatagtacccaacccatatggtacccatt 17154353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 38958585 - 38958646
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatacta 81  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38958585 catcatgccggtgtatagttttttaaggatattttggatgttttttatttgactaaatacta 38958646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42969207 - 42968992
Alignment:
Q  52 tttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnn 150  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||  | ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||       
T  42969207 tttggatgtttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagtttgatttaaaaaatttggatcatagttttatttcaagtgtgatgatt 42969108  T
Q  151 nnnngt--cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctataggtatggggaaggggactacagttgttgcccacga 248  Q
         |  |||| ||| | ||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||| |        |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42969107 tttattatctttccatcgctaaagtgcgggtaatggatgcggatatgggcacttatag-------ggtatggggaagggcactaaagttgttgcccacga 42969015  T
Q  249 gggtatggacacgggtacgggta 271  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  42969014 gggtacgggcacgggtacgggta 42968992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12757948 - 12757853
Alignment:
Q  51 ttttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||| |   | |||||||||||||||||||||||    
T  12757948 ttttggatgttttttattttgttaaatactacgattcttactattttatgagctgatttgaaaaaaatttaaccatagttttatttcatttgtgat 12757853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15162049 - 15161922
Alignment:
Q  170 aagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgg 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |  | |||||||||||    
T  15162049 aagtgtgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaagtgcccatagggtatagggaagggcactaaagttgttgcccacgagggaacaggcacgggtacgg 15161950  T
Q  269 gtattttttataaatgcaggtatgggga 296  Q
      |||||||| ||| || | ||||||||    
T  15161949 acattttttacaaacgcggatatgggga 15161922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11788635 - 11788521
Alignment:
Q  220 gggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttaccca 319  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||| || |||||||| | | | |||||| ||| || |||||||||| ||| |||||| |||  ||||||    
T  11788635 gggaagggcactaaaattgttgcccacgagggtacgggcacgggtatgcgcactttttacaaacgcgggtatggggatggatactataataccctaccca 11788536  T
Q  320 ttgggtacccattgc 334  Q
    ||| |||||||||||    
T  11788535 ttgagtacccattgc 11788521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18974878 - 18974794
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||   || ||||||||||||||||||| |||||    
T  18974878 ttttttatttagctaaatactatgattcatattattttatgagttgatttgaaattttttggatcatagttttatttcaattgtg 18974794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11788784 - 11788706
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  11788784 ttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttca 11788706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Original strand, 29221229 - 29221374
Alignment:
Q  167 ttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctataggt-atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggta 265  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||| | ||| |||||| || |||||  ||||||| ||| | || | |||||||||||| ||||||||   ||||||    
T  29221229 ttaaagtgcgggtaatgggcgcgagtacgggcatttagatgcccatagggcatggggacgggcagtaaaattgttgcccacgggggtatgggttcgggta 29221328  T
Q  266 cgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtac 311  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| |||| || ||||||||    
T  29221329 cgggcattttttacaaatgcgggtatgggaacgggcattatagtac 29221374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Original strand, 29334528 - 29334673
Alignment:
Q  167 ttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctataggt-atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggta 265  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||| | ||| |||||| || |||||  ||||||| ||| | || | |||||||||||| ||||||||   ||||||    
T  29334528 ttaaagtgcgggtaatgggcgcgagtacgggcatttagatgcccatagggcatggggacgggcagtaaaattgttgcccacgggggtatgggttcgggta 29334627  T
Q  266 cgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtac 311  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| |||| || ||||||||    
T  29334628 cgggcattttttacaaatgcgggtatgggaacgggcattatagtac 29334673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 104
Target Start/End: Original strand, 35005373 - 35005438
Alignment:
Q  40 ttttagggatattttggatg-ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  35005373 ttttagggatattttggatgtttttttatattgctaaatactacgatccgtactattttatgagtt 35005438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Original strand, 12345462 - 12345549
Alignment:
Q  52 tttggatgtttt-ttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12345462 tttggatgtttttttatttggtaaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttca 12345549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Original strand, 17961345 - 17961386
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgtt 61  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17961345 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgtt 17961386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 333
Target Start/End: Original strand, 44928796 - 44928893
Alignment:
Q  236 ttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||| ||| || |||| ||||| ||||| ||||||||  | || |||||| ||||||||    
T  44928796 ttgttgcccacgagggtatgggttcgggtacggacattttttacaaacgcgggtacggggaaggacattatagtaccctgcctattggggacccattg 44928893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30241406 - 30241339
Alignment:
Q  266 cgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  30241406 cgggtattttttataaatgcgggtat-gggacgggcactgtagtaccctactcattggatacccattgc 30241339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 3329377 - 3329336
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgtt 61  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3329377 catcatgccggtgcataattttttagggatattttggatgtt 3329336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1376405 - 1376088
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1376405 catcatgccggtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaaaaattg 1376306  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg----nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-g 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  1376305 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttttttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtacccatagg 1376206  T
Q  215 gtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtacttt 314  Q
    ||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||   |    
T  1376205 gtataaggaatgggactaaagttgttgcccacgaaggtacgggcacgggtacgagtattttttataaatgcaggtatagggaccggcactgtagtatcct 1376106  T
Q  315 acccattgggtacccatt 332  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1376105 acccattgggtacccatt 1376088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 3616761 - 3617072
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3616761 catcatgccggtgtataattttttagagatattttggatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaattttaaataattg 3616860  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-ta 217  Q
    |||||||||||||||||     ||||||        || ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||    
T  3616861 ggatcatagttttattt-----gtgatgttttttttgttttttcatagttaaagtgcgggtaataggtgcgagtatgggtacttaggtacccatagggta 3616955  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  3616956 tggggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacgagtattttttataaatgcgggtatggggacgggcactatagtaccctacc 3617055  T
Q  318 cattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||| |||||||||    
T  3617056 cattgggcacccattgc 3617072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24789730 - 24789413
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789730 catcatgccggtgtataattttttaggaatatttcggatgttttctatttgactaaatatcacggttcatgttattttatgagttaattttaaaaaattg 24789631  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtctttt--catagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-t 216  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||        | ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||| |    
T  24789630 agatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttttttgtttttccatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatggacacttaagtacccatagggt 24789531  T
Q  217 atggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttac 316  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | ||||||  |||    
T  24789530 atgaggaaggggactaaagttgttgcccacgaaggtacgggcacgggtacgggtattttttataaatgcgggtatgaggacgggcattgtagtaccctac 24789431  T
Q  317 ccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  24789430 ccatttggtacccattgc 24789413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 332
Target Start/End: Original strand, 19643416 - 19643719
Alignment:
Q  31 tgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtt 130  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||    
T  19643416 tgtacaattttttagagatattttggatgtttttaatttgactaaataatacaatttgtattattttatgagttaattttaaaagatttagaccatagtt 19643515  T
Q  131 ttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaagggg 228  Q
    || ||||| ||||||||        |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||||     
T  19643516 ttttttcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgggcgcgggtatgggcacctagatacccatagggtatgaggaagggc 19643615  T
Q  229 actacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacc 328  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||  |||||||||||||||    
T  19643616 actaaagttgttgcccacgaaggtacgggcacgggtacgggtaatttttacaaatgcaggtatggagatgagcattatagtaccctacccattgggtacc 19643715  T
Q  329 catt 332  Q
    ||||    
T  19643716 catt 19643719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 294
Target Start/End: Original strand, 2620861 - 2621128
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  || ||| |    
T  2620861 ggtgtacaatattttagagatattttgaatgtttttaaatggactaaatatcacaattcatattattttataagttaattttaaaatattttgaccattg 2620960  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatgnnnnnnng-tcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaagg 226  Q
    |||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  2620961 ttttatttcaattgtgatgtttttattatcttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcaggtatgggcacttagatacccatagggtatggggaatg 2621060  T
Q  227 ggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggg 294  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  2621061 gcactaaagttgttgcccacgagggtacggacacgagtacgggtaatttttaaaaatgcgggtatggg 2621128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6109830 - 6109523
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| |||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  || |||||    
T  6109830 ggtgtacaattttttggagatattttaaatgtttttaatttgactaaatactacgatccgtattattttataagttaattttaaaagatttagaccatag 6109731  T
Q  129 ttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaagg 226  Q
    |||||||||| |||||||         |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || || |    
T  6109730 ttttatttcaattgtgatatttttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatgagcacttaggtacccatagggtattggaaaag 6109631  T
Q  227 ggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggta 326  Q
    | |||| ||||||||||||||| | || | |||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||  |||| ||||    
T  6109630 gcactaaagttgttgcccacgaagatacgaacacggatacaagtaattttaataaatgcaggtatggggatggacattgtagtaccctatgcattaggta 6109531  T
Q  327 cccattgc 334  Q
    ||||||||    
T  6109530 cccattgc 6109523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7057821 - 7057502
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  7057821 catcttgccggtgtacaattttttagggatattttaaatgttatttatttgactaaatactacaattcatactattttatgagttaattttaaaaaattt 7057722  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggta 217  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||        || ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  7057721 gg-tcatagttctatttcaattatgatgttttcattgttttttcatagttaaagtgcgagtaatgggtacgagtatgtgcacttaggtacccatagggta 7057623  T
Q  218 tggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacc 317  Q
    |||||||||| || |  ||||||| |||||||| || || ||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||| | || || |||| ||||||  ||||    
T  7057622 tggggaagggcaccaaggttgttgtccacgaggatacgggcacgaatacaggtattttttacaaatgcagatatagagaagggcactgtagtaccctacc 7057523  T
Q  318 cattgggtacccattgctatc 338  Q
    ||| | |||||||||||||||    
T  7057522 catagagtacccattgctatc 7057502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30801444 - 30801149
Alignment:
Q  40 ttttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcat 139  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||     
T  30801444 ttttagggatattttaaatgttttttatttgacttaatactgcaattcatattattttatgagttaattttaaaaaaattggactatagttctatttcaa 30801345  T
Q  140 ttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagtt 237  Q
    ||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| ||||| |||| ||| || |  |||    
T  30801344 ttgtgatgttttcattgtcttttcatagttaaagtgtgg-taatgggtacgggtatggacacttaggtacccatagggtatagggatgggcaccaaggtt 30801246  T
Q  238 gttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||| | || |||||||||||  || | || ||||||||||||    
T  30801245 gttgccctcgagggtacggacacaggtacgggtatttttttacaaatacgggtatgggaaagggcactatagtaccctatctatagggtacccattg 30801149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 284
Target Start/End: Original strand, 26561132 - 26561385
Alignment:
Q  31 tgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtt 130  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  26561132 tgtacaattttttagggatattttggatgatttttatttgactaaatattacgatttgtactattttatgagttaa-tttaaaaaatt-ggaccatagtt 26561229  T
Q  131 ttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaagggg 228  Q
    |||| ||| ||||||||        |||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||| |||  ||| || |||||||||||     
T  26561230 ttatatcaattgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgcgtgtaatgggtgtgggtatgggcacttaggtactcatagggcatggggaagggc 26561329  T
Q  229 actacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatg 284  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||||| |||||    
T  26561330 actaaagttgttgcccacgagaatacggacaaatgtacgggtattttttacaaatg 26561385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 859680 - 859404
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn--gtc 157  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||   || ||||||||||||||||||| ||||| |          |||    
T  859680 ttttttatttggctaaatactacgattcatattattttataagttgatttgaaattttttggatcatagttttatttcaattgtggtttttttttttgtc 859581  T
Q  158 ttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatgg 256  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  859580 ttttcatagttaaaatgcgggtaatgggtgcgggtatgagcacttaggtgcccatagggtatggggaaggacactaaagttgttgcccacgagggtacgg 859481  T
Q  257 acacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccatt 332  Q
       ||||||||| || ||||||| ||| || ||||||| || ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  859480 gttcgggtacggatatttttttacaaacgcgggtatggagatggatactataataccctacccattgggtacccatt 859404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20216400 - 20216108
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  20216400 ggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacgattcgtactattttattagttgatttaaataattttggatcatagttttatttcaattgtg 20216301  T
Q  145 atg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtatggggaaggggactacagttgttg 241  Q
    |||         ||||||||||||  |||||| || ||| |||||| |||||| |||||||  | || || || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  20216300 atgttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaacgggtgcaggtatgggcacttaagtgcccataagatatggggaagggcactaaagttgttg 20216201  T
Q  242 cccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||| || | |||||||||  |||||||| |||||    |||||||| ||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  20216200 cccacgagggtacgggctcgggtacggacattttttacaaatgagcttatggggatgggtactatagtaccctatccattgggtacccattgc 20216108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20235998 - 20235706
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtg 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  20235998 ggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacgattcgtactattttattagttgatttaaataattttggatcatagttttatttcaattgtg 20235899  T
Q  145 atg--nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtatggggaaggggactacagttgttg 241  Q
    |||         ||||||||||||  |||||| || ||| |||||| |||||| |||||||  | || || || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  20235898 atgttttttattgtcttttcatagagaaagtgcgggtaacgggtgcaggtatgggcacttaagtgcccataagatatggggaagggcactaaagttgttg 20235799  T
Q  242 cccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||||||||||| || | |||||||||  |||||||| |||||    |||||||| ||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  20235798 cccacgagggtacgggctcgggtacggacattttttacaaatgagcttatggggatgggtactatagtaccctatccattgggtacccattgc 20235706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 222162 - 221885
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn---gt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||   || ||||||||||||||||||| ||||| |           ||    
T  222162 ttttttatttggctaaatactacgattcatattattttataagttgatttgaaattttttggatcatagttttatttcaattgtggttttttttttttgt 222063  T
Q  157 cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatg 255  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |    
T  222062 cttttcatagttaaaatgcgggtaatgggtgcgggtatgagcacttaggtgcccatagggtatggggaaggacactaaagttgttgcccacgagggtacg 221963  T
Q  256 gacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccatt 332  Q
    |   ||||||||| || ||||||| ||| || ||||||| || ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  221962 ggttcgggtacggatatttttttacaaacgcgggtatggagatggatactataataccctacccattgggtacccatt 221885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 691317 - 691040
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn---gt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||   || ||||||||||||||||||| ||||| |           ||    
T  691317 ttttttatttggctaaatactacgattcatattattttataagttgatttgaaattttttggatcatagttttatttcaattgtggttttttttttttgt 691218  T
Q  157 cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatg 255  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |    
T  691217 cttttcatagttaaaatgcgggtaatgggtgcgggtatgagcacttaggtgcccatagggtatggggaaggacactaaagttgttgcccacgagggtacg 691118  T
Q  256 gacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccatt 332  Q
    |   ||||||||| || ||||||| ||| || ||||||| || ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  691117 ggttcgggtacggatatttttttacaaacgcgggtatggagatggatactataataccctacccattgggtacccatt 691040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 735785 - 735508
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn---gt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||   || ||||||||||||||||||| ||||| |           ||    
T  735785 ttttttatttggctaaatactacgattcatattattttataagttgatttgaaattttttggatcatagttttatttcaattgtggttttttttttttgt 735686  T
Q  157 cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatg 255  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |    
T  735685 cttttcatagttaaaatgcgggtaatgggtgcgggtatgagcacttaggtgcccatagggtatggggaaggacactaaagttgttgcccacgagggtacg 735586  T
Q  256 gacacgggtacgggta-ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccatt 332  Q
    |   ||||||||| || ||||||| ||| || ||||||| || ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  735585 ggttcgggtacggatatttttttacaaacgcgggtatggagatggatactataataccctacccattgggtacccatt 735508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7580213 - 7579958
Alignment:
Q  80 tacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn---gtcttttcatagttaaagtgtg 176  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| ||||||||          |||||||||||||||   || |    
T  7580213 tacgattcgcactattttatgagttgatttgaaattttttggatcatatttttatttcaattgtgatgcttttttattgtcttttcatagtta---tgcg 7580117  T
Q  177 gataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtatttt 275  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||    
T  7580116 ggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtgcccatagggtatggggaagggcactaaagttgttacccacgagggtacgggcacgggtacggccatttt 7580017  T
Q  276 ttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    ||| |||  | |||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  7580016 ttacaaacacgggtatggggatgggtactatagtaccctacccattgggtgcccattgc 7579958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 334
Target Start/End: Original strand, 24891347 - 24891626
Alignment:
Q  47 gatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||           ||||||||||| |||   | ||||||||||||||| |||||||    
T  24891347 gatattttggatgtttttaatttgactaaatactaagattcatatt-----------taattttaaaagatttaaaccatagttttatttcaattgtgat 24891435  T
Q  147 gnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgccc 244  Q
             |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  24891436 atttttattgtcttttcatagttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtacaggcacttaggtacccatagggtatgggaaagggtactaaagttgttgtcc 24891535  T
Q  245 acgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggaca-ctatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    |||| |||| |  |||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||| || ||  | ||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  24891536 acgacggtacgagcacgggtacgagtaatttttacaaatgcgggtatggggatgggcatttgtagtaccctacccattaggtacccattgc 24891626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38020129 - 38019945
Alignment:
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||| | || ||||| |||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  38020129 gtcttttcagagttaaactgcgggtaatgggtgcgggtatggacacttaggtgcccatagggtatggggaagggcactaaagtagttgtccacgagggta 38020030  T
Q  254 tggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgctatc 338  Q
     || |  | ||||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||  ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||    
T  38020029 cgggcctgagtacgagtattttttacaaacgcgggtatggggatgggtactatagtaccctgcccattggatacccattgctatc 38019945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25500325 - 25500070
Alignment:
Q  47 gatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||           ||||||||||| |||   | ||||||||||||||| |||||||    
T  25500325 gatattttggatgtttttaatttgattaaatactacgattcatatt-----------taattttaaaagatttaaaccatagttttatttcaattgtgat 25500237  T
Q  147 gnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgccc 244  Q
    |        ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  25500236 gtttttattgtcttttcatatttaaagtgcaggtaatgggtgcgggtatgggcacttaggtacccataaggtatggggaagggtactaaagttgttgtcc 25500137  T
Q  245 acgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtac 311  Q
    ||||  ||| || |||| ||||||||| | |||| |||||| ||| | |||| || || ||||||||    
T  25500136 acgacagtacgggcacgagtacgggtaatatttacaaatgcgggtttcgggatgggcattatagtac 25500070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 334
Target Start/End: Original strand, 2472241 - 2472488
Alignment:
Q  89 tattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnn-gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||   | | ||||||||||| | ||||||||        ||||||| |||||||||||  || | |||| ||    
T  2472241 tattattttatgagttaattttaaaagatttataccgtagttttattttaattgtgatgtttttattgtcttttaatagttaaagtacgggttatggatg 2472340  T
Q  188 cgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgca 286  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || |||||| ||||||     
T  2472341 cgggtatgggcacttatgtacccatagggtatggggaatggcactaaagttgttgtccacgagggtacgggcacggatatggataatttttacaaatgcg 2472440  T
Q  287 ggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||| || || || | ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  2472441 ggtatggagatgggcattgtagtaccctacccattggatacccattgc 2472488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 334
Target Start/End: Original strand, 37226691 - 37226980
Alignment:
Q  48 atattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaat-tgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||  || |||||||||||||| ||| ||||||  | |||| |||||||||||||| | |||||    
T  37226691 atattttggatttttttt-tttggctaaatactatgatttctactattttatgagttattttaaaaaaaaattggataatagttttatttcaatcgtgat 37226789  T
Q  147 gnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcc 243  Q
    |         |||||||  || |||||||| ||||||| | | || ||||| |||||||| | || ||||| ||||||||| |  |||| ||||||| ||    
T  37226790 gttttttattgtctttttgtaattaaagtgcggataatagatacgagtatgggcacttaggtgcccatagggtatggggaatgacactaaagttgttacc 37226889  T
Q  244 cacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    || |||||||  | | |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||  ||| ||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  37226890 caggagggtacaggctcgggtacgggcattttttacaaatgcgggtatggggaagggtactgtagtaccctacccattgggtatccattgc 37226980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1667326 - 1667240
Alignment:
Q  166 gttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgaggg 251  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1667326 gttaaagtgaggttaatgggtgcgggtatgggcacttaggtacccatagggtatggggaagggcactaaagttgttgcccacgaggg 1667240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33212456 - 33212347
Alignment:
Q  40 ttttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactac--gattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttc 137  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||  ||| || | |||||| |  |||||| ||||||||||    
T  33212456 ttttagagacattttggatgttttttatttggctaaatactactacattcgtattattttatatgttgatatgaaaaaaattagatcatggttttatttc 33212357  T
Q  138 atttgtgatg 147  Q
    | ||||||||    
T  33212356 aattgtgatg 33212347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15542326 - 15542226
Alignment:
Q  48 atattttggatgttttt-tatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat 146  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||| | |||||||    
T  15542326 atattttggatgtttttatacttggctaaatactacaatttctactattttatgagttgcttttaaaaaaattggatcttagttttattttaattgtgat 15542227  T
Q  147 g 147  Q
    |    
T  15542226 g 15542226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 38551743 - 38551665
Alignment:
Q  60 ttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttca 138  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  38551743 ttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttggatcatagttttatttca 38551665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 25419446 - 25419401
Alignment:
Q  47 gatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtatt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25419446 gatattttggatgtttttaatttgactaaatactacgattcatatt 25419401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 114
Target Start/End: Original strand, 29528092 - 29528173
Alignment:
Q  33 tataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaa 114  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  29528092 tataatttttgaaggatgttttggatgttttttattttgttaaataatacgattcgtactattttatgagttgatttgaaaa 29528173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 43511383 - 43511286
Alignment:
Q  46 ggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgt 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||  | || ||||||||||||| |||| |||||||| | | |||| |||||||||| ||||    
T  43511383 ggatgttttggatgttttttattttgttaaatactacgaaccatactattttatgagttgatttgaaaaaatttgaaccataattttatttcaattgt 43511286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 137
Target Start/End: Original strand, 42987651 - 42987759
Alignment:
Q  29 ggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatag 128  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| |||||||| |||| |||| ||||  || | | |||||    
T  42987651 ggtgtacaattttttaaggatattttagatgttttttatttagctaaatattatgatccgtactattttattagttgatttaaaaacttttgaaccatag 42987750  T
Q  129 ttttatttc 137  Q
    |||||||||    
T  42987751 ttttatttc 42987759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25419347 - 25419249
Alignment:
Q  156 tcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  25419347 tcttttcatagttaaagtgcaggtaatgggagcgtgtatgggcacttaagtacccatagggtatgggaaagggtactaaagttgttgtccacgacggta 25419249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 334
Target Start/End: Original strand, 34776839 - 34776937
Alignment:
Q  236 ttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||| ||| || ||||| ||||||| || ||||||||  | |||||||||  ||||||||    
T  34776839 ttgttgcccacaagggtatgggttcgggtacgggcattttttacaaacgcgggtatcgggacgggcattatagtaccctgcccattgggagcccattgc 34776937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28970901 - 28970736
Alignment:
Q  169 aaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctat-aggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacg 267  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| ||| || | | || |||||||| ||||||||  | |||||| |    
T  28970901 aaagtgcgggtattgggtgcgggtatgggcacttagatatccataaggtatggggacgggcaccaaacttattgcccacaagggtatgagctcgggtatg 28970802  T
Q  268 ggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    || ||||| |  ||| ||| |||||| || || |||||| ||||  | |||| |||||||||||||    
T  28970801 gggattttcttaaaacgcatgtatggagatgggcactatggtaccctgcccaatgggtacccattg 28970736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1667238 - 1667169
Alignment:
Q  265 acgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| || || | ||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  1667238 acgggtaattttaataaatgcgggtatggggatgggcattgtagtaccctacccatttggtacccattgc 1667169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 38551629 - 38551560
Alignment:
Q  185 gtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||||||||||| |||||||  | || ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  38551629 gtgcgggtatgggcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcgctaaagttgttgcccacgagggta 38551560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 196
Target Start/End: Original strand, 39221590 - 39221631
Alignment:
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatga 196  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39221590 gtcttttcatggttaaagtgcgggtaatgggtgcgggtatga 39221631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 340
Target Start/End: Original strand, 5772 - 6086
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  5772 gtgtataattttttagggatattttggatgttttctatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaatttttaaaaattgggaccgtagt 5871  T
Q  130 tttatttcatttgtgatg-nnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggg 227  Q
    ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  ||||   ||| ||| ||||||||    
T  5872 tttatttcatttgtgatgtttttattgtcttttcatagttaaagtgtgggtaatgggtgcaggtatgggcacttaagtacccgcaggatattgggaaggg 5971  T
Q  228 gactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggta--ttttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggt 325  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||| || || | ||||||  || |||||||||    
T  5972 ggctaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtacgggtattttttttataaatgcggacatggggaagggcattgtagtaccctatccattgggt 6071  T
Q  326 acccattgctatctg 340  Q
    ||||||||| |||||    
T  6072 acccattgccatctg 6086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0164 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0164
Description:

Target: scaffold0164; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 294
Target Start/End: Original strand, 7003 - 7263
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7003 catcattccggtgtataatattttagggatattttgtatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaatttaaaaaaattg 7102  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtat 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||              ||| |||||| |||||||| ||||  || |||||    
T  7103 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttt--ttttttcatagttaaa-------------atgcaggtatgggcacttaggtacccttagggtat 7187  T
Q  219 ggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggg 294  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7188 gaggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtataggtattttttataaatgcgggtatggg 7263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0164; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 294
Target Start/End: Original strand, 14884 - 15144
Alignment:
Q  20 catcatgcaggtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattg 119  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14884 catcattccggtgtataatattttagggatattttgtatgttttctatttgactaaataccacgattcatattattttatgagttaatttaaaaaaattg 14983  T
Q  120 ggatcatagttttatttcatttgtgatgnnnnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtat 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||              ||| |||||| |||||||| ||||  || |||||    
T  14984 ggatcgtagttttatttcatttgtgatgtttttt--ttttttcatagttaaa-------------atgcaggtatgggcacttaggtacccttagggtat 15068  T
Q  219 ggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggg 294  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15069 gaggaaggggactaaagttgttgcccacgagggtacgggcacgggtataggtattttttataaatgcgggtatggg 15144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26839 - 26537
Alignment:
Q  35 taatattttagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagtttta 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  26839 taatttttgagggatattttggatgtttttttatttggctaaatactacaattcatattattttattagttgatttaaataattttggatcatagtttta 26740  T
Q  134 tttcatttgtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggac 230  Q
    ||||| |||||||          ||||| ||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||| |     
T  26739 tttcaattgtgatattttttattgtcttgtcatagagaaagtgcgggtaatgggtgggggtatgagcacttaagtgcccatagggtatggggaagggcat 26640  T
Q  231 tacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtaccca 330  Q
    || |||||||||||||||||||| || | ||||||| |  |||||||| |||||  | |||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  26639 taaagttgttgcccacgagggtacgggctcgggtacagacattttttacaaatgaggatatggggatggatactatagtaccctatccattgggtaccca 26540  T
Q  331 ttg 333  Q
    |||    
T  26539 ttg 26537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 334
Target Start/End: Original strand, 26053 - 26333
Alignment:
Q  58 tgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtga---tgnnnnnnn 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||   || ||||||||||||||||||| |||||    |            
T  26053 tgttttttatttggctaaatactacgattcatattattttatgagttgatttgaaattttttggatcatagttttatttcaattgtggcttttttttatt 26152  T
Q  155 gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggta 253  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26153 gtcttttcatagttaaaatgcgggtaatgagtgcggttatgagcacttaggtgaccatagggtatgaggaagggcactaaagttgttgcccacgagggta 26252  T
Q  254 tggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
     ||   ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  26253 cgggttcggatacgggtattttttacaaacgcgggtatggggatgggtactatagtaccctatccattgggtacccattgc 26333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 250354 - 250055
Alignment:
Q  44 agggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttattt-cattt 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||| |||||||| || ||    
T  250354 agggatattttggatgtttttttatttaactaaatattatgattcgtactattttatgagttgatttaaaaattttgggaccataattttattttcaatt 250255  T
Q  142 gtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttg 238  Q
    |||||          ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||  |||| | |||    
T  250254 gtgatatattttattgtcttttgatagttaaagtgcggataatgggtacatgtatgagtacttagacgcccataaggtatggggaaggacactaaaattg 250155  T
Q  239 ttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgctatc 338  Q
    ||||||||| | ||||||   |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| |   ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||    
T  250154 ttgcccacgcgagtatgggatcgggtacgagtattttttacaaacgcatgtatggggaagagtactatagtaccctacctattagatacccattgctatc 250055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 333
Target Start/End: Original strand, 109926 - 110210
Alignment:
Q  52 tttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgatgnnn 150  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||  |||| ||       
T  109926 tttggatgtttttttatttggttaaatattacgattcatattatttcgtaagttgatttaaaaaaatttgaatcatagttttatttcaagtgtggtgatt 110025  T
Q  151 nnnngt--cttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacg 247  Q
         |  |||||||| | ||||||| || |||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  110026 tttattatcttttcatggctaaagtgcgggtaataggtgagggtatgagcacttaagtacccataggatatggggaagggcactaaagttgttgcccacg 110125  T
Q  248 agggtatggacacgggtacgggtattttttataaatgcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattg 333  Q
    | | || || ||| | |||||| |||||||| ||| || ||||||| || ||| ||| ||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  110126 aagatacgggcacagatacgggcattttttacaaacgcgggtatggagatggatactgtagtac-ctacccattgggtacctattg 110210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 185 - 334
Target Start/End: Original strand, 13129 - 13279
Alignment:
Q  185 gtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaat 283  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||| | |||     
T  13129 gtgcgggtatgggcacttaagtacccatagggtatggggaaaggcactaaagttgttgcccacgagggtacgggctcgggtacaggtatttttcacaaac 13228  T
Q  284 gcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    || |||||||||| ||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  13229 gcgggtatggggatgggtactattgtaccttgcccattgggtacccattgc 13279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 185 - 334
Target Start/End: Original strand, 21964 - 22114
Alignment:
Q  185 gtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtattttttataaat 283  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||| | |||     
T  21964 gtgcgggtatgggcacttaagtacccatagggtatggggaaaggcactaaagttgttgcccacgagggtacgggctcgggtacaggtatttttcacaaac 22063  T
Q  284 gcaggtatggggacggacactatagtactttacccattgggtacccattgc 334  Q
    || |||||||||| ||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  22064 gcgggtatggggatgggtactattgtaccttgcccattgggtacccattgc 22114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 12998 - 13098
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||| |||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| |||    
T  12998 tagggatattttggatgttttttatttggctaaatactacgacttatactattttattagttgatttgaaattttttggatcataattttatttcaattg 13097  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  13098 t 13098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 21833 - 21933
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||| |||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| |||    
T  21833 tagggatattttggatgttttttatttggctaaatactacgacttatactattttattagttgatttgaaattttttggatcataattttatttcaattg 21932  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  21933 t 21933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20229 - 19990
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgtttttt-atttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcattt 141  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||| || |||||||| |||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| ||    
T  20229 tagggatattttagatgtttttttatttggttaaatactacaattcatactattttattagttgatttaaaattttttggatcataattttatttcaatt 20130  T
Q  142 gtgatgnnnnnnn--gtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatgagcacttagatacctatagg-tatggggaaggggactacagttg 238  Q
    |||| |         |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||  ||||||  || | ||| | |||||||||||| |||| || ||    
T  20129 gtgacgtttttaattgtcttttcatggttaaaatgcgggtaatgggtgcgggtatggacacttaagtatccataagatatggggaagggcactaaagatg 20030  T
Q  239 ttgcccacgagggtatggacacgggtacgggtatttttta 278  Q
    ||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||    
T  20029 ttgcccaagagggtacggattcgggtacaggtatttttta 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 147
Target Start/End: Original strand, 72497 - 72612
Alignment:
Q  30 gtgtataatattttagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagt 129  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||| |   |||||| |    
T  72497 gtgtacaattttttagggatattttgaataatttttatttggctaaatgctatgattcatactattttatgagttaatttaaaaaaaat--aatcataat 72594  T
Q  130 tttatttcatttgtgatg 147  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  72595 tttatttcaattgtgatg 72612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0938 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0938
Description:

Target: scaffold0938; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 661 - 561
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttg 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  || |||||||| |||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| |||    
T  661 taggaatattttggatgttttttagttggctaaatactacgatttatactattttattagttgatttgaaattttttggatcataattttatttcaattg 562  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  561 t 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 23791 - 23891
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttg 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  || |||||||| |||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| |||    
T  23791 taggaatattttggatgttttttagttggctaaatactacgatttatactattttattagttgatttgaaattttttggatcataattttatttcaattg 23890  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  23891 t 23891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 33959 - 34059
Alignment:
Q  43 tagggatattttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttg 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  || |||||||| |||| |||| |||   || |||||||| |||||||||| |||    
T  33959 taggaatattttggatgttttttagttggctaaatactacgatttatactattttattagttgatttgaaattttttggatcataattttatttcaattg 34058  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  34059 t 34059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0602 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0602
Description:

Target: scaffold0602; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5194 - 5049
Alignment:
Q  51 ttttggatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattttatgagttaattttaaaaaattgggatcatagttttatttcatttgtgat-gnn 149  Q
    ||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  || | | |||  ||||| |||| |||||||        
T  5194 ttttgaatgttttttattttgttcaatactacgattcgtactattttatgagttgatttgaaaatttttgaaccatgattttagttcaattgtgatattt 5095  T
Q  150 nnnnngtcttttcatagttaaagtgtggataatgggtgcgggtatg 195  Q
         ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  5094 ttattgtcttttcataattaaagtgtagataatggatgcgggtatg 5049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 8054 - 8014
Alignment:
Q  56 gatgttttttatttgactaaatactacgattcgtattattt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8054 gatgttttttatttgactaaatactacaattcgtactattt 8014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14435 - 14348
Alignment:
Q  179 taatgggtgcgggtatgagcacttagatacctata-ggtatggggaaggggactacagttgttgcccacgagggtatggacacgggta 265  Q
    |||||||||||| || | | ||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14435 taatgggtgcggatacgggtacttagatacccataaggtatagggacgggcactaaacttattgcccacgagggtatggactcgggta 14348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University