View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11179_high_5 (Length: 419)

Name: NF11179_high_5
Description: NF11179
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11179_high_5
NF11179_high_5
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (110-291)||(31438646-31438827)
chr2 (96-291)||(30486196-30486391)
chr2 (110-291)||(20552931-20553112)
chr2 (109-291)||(561523-561705)
chr2 (109-291)||(27856401-27856583)
chr2 (107-290)||(1859159-1859342)
chr2 (106-304)||(32360860-32361059)
chr2 (113-291)||(4381798-4381976)
chr2 (110-291)||(44587902-44588083)
chr2 (109-291)||(31390011-31390193)
chr2 (109-276)||(32860101-32860267)
chr2 (109-291)||(22068325-22068506)
chr2 (108-276)||(6580187-6580355)
chr2 (161-291)||(8969412-8969542)
chr2 (107-290)||(22887747-22887930)
chr2 (109-291)||(4022484-4022665)
chr2 (110-276)||(5093559-5093724)
chr2 (109-291)||(34442538-34442718)
chr2 (113-290)||(3668119-3668295)
chr2 (109-269)||(26387091-26387251)
chr2 (172-289)||(25782840-25782957)
chr2 (109-291)||(2898071-2898252)
chr2 (110-290)||(43637165-43637343)
chr2 (109-291)||(22567601-22567783)
chr2 (109-266)||(38590904-38591061)
chr2 (107-265)||(13574060-13574216)
chr2 (108-234)||(26891725-26891851)
chr2 (160-291)||(27584788-27584918)
chr2 (113-263)||(5881221-5881374)
chr2 (160-266)||(35851781-35851887)
chr2 (109-259)||(11021259-11021408)
chr2 (133-291)||(28600990-28601147)
chr2 (110-250)||(38296178-38296317)
chr2 (175-268)||(25772176-25772269)
chr2 (106-264)||(34123057-34123214)
chr2 (160-244)||(15079011-15079094)
chr2 (161-277)||(15146683-15146798)
chr2 (160-271)||(39531874-39531983)
chr2 (161-273)||(29102306-29102418)
chr2 (160-258)||(10820534-10820630)
chr2 (160-286)||(20431488-20431614)
chr2 (109-151)||(44854485-44854527)
chr2 (224-290)||(45262024-45262090)
chr2 (109-148)||(35851917-35851956)
chr2 (116-149)||(28277517-28277550)
chr2 (111-151)||(29771417-29771457)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (110-291)||(34606261-34606442)
chr7 (109-275)||(29993508-29993674)
chr7 (109-291)||(18485960-18486142)
chr7 (110-291)||(24438477-24438658)
chr7 (109-291)||(24798408-24798589)
chr7 (110-292)||(1736980-1737161)
chr7 (109-291)||(12218442-12218623)
chr7 (109-291)||(34333283-34333464)
chr7 (105-275)||(47839488-47839657)
chr7 (110-270)||(43594062-43594222)
chr7 (110-264)||(8754617-8754771)
chr7 (107-235)||(27456174-27456301)
chr7 (130-266)||(30810675-30810811)
chr7 (160-275)||(45045820-45045935)
chr7 (109-269)||(4628565-4628725)
chr7 (108-264)||(5239283-5239439)
chr7 (111-291)||(28587911-28588090)
chr7 (111-269)||(47656981-47657137)
chr7 (160-291)||(37674111-37674240)
chr7 (160-291)||(23363172-23363303)
chr7 (113-265)||(11686353-11686507)
chr7 (160-290)||(42044300-42044429)
chr7 (160-269)||(18117193-18117302)
chr7 (160-269)||(13064903-13065013)
chr7 (114-265)||(46716642-46716793)
chr7 (175-269)||(7689227-7689321)
chr7 (160-266)||(47083105-47083211)
chr7 (108-237)||(37631601-37631730)
chr7 (109-269)||(5729345-5729505)
chr7 (172-268)||(525103-525199)
chr7 (109-234)||(34546376-34546501)
chr7 (161-269)||(33636503-33636611)
chr7 (108-292)||(28262029-28262208)
chr7 (194-290)||(23357716-23357812)
chr7 (164-289)||(29835711-29835836)
chr7 (185-243)||(47118042-47118100)
chr7 (160-262)||(22739873-22739976)
chr7 (162-265)||(36437429-36437531)
chr7 (160-250)||(20116940-20117029)
chr7 (110-243)||(18469993-18470126)
chr7 (172-252)||(13556474-13556553)
chr7 (160-276)||(18220691-18220806)
chr7 (160-266)||(3021941-3022039)
chr7 (160-271)||(4087673-4087783)
chr7 (109-290)||(34556898-34557077)
chr7 (111-149)||(507258-507296)
chr7 (109-151)||(32805537-32805579)
chr7 (224-290)||(38128406-38128472)
chr7 (161-250)||(18220486-18220573)
chr7 (160-264)||(4100557-4100660)
chr7 (109-151)||(6097335-6097377)
chr7 (110-152)||(47118108-47118150)
chr7 (108-149)||(6221151-6221192)
chr7 (256-292)||(27456136-27456172)
chr7 (107-151)||(30924136-30924180)
chr7 (238-290)||(32805544-32805596)
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (110-289)||(24178470-24178649)
chr1 (110-291)||(5694321-5694502)
chr1 (108-291)||(29657769-29657952)
chr1 (109-291)||(51065753-51065935)
chr1 (109-290)||(15227738-15227919)
chr1 (107-291)||(19031820-19032004)
chr1 (109-292)||(42769994-42770177)
chr1 (113-291)||(12072067-12072245)
chr1 (109-291)||(18043161-18043343)
chr1 (110-291)||(38162850-38163031)
chr1 (110-291)||(3097659-3097837)
chr1 (110-289)||(3784720-3784899)
chr1 (108-269)||(13961210-13961370)
chr1 (110-291)||(30294386-30294567)
chr1 (105-265)||(48071478-48071637)
chr1 (161-291)||(50128177-50128307)
chr1 (101-291)||(9266733-9266923)
chr1 (110-291)||(17333289-17333467)
chr1 (112-271)||(36446350-36446508)
chr1 (109-291)||(47009992-47010174)
chr1 (117-274)||(6770344-6770501)
chr1 (160-291)||(8472919-8473050)
chr1 (109-268)||(30657607-30657760)
chr1 (112-291)||(38701942-38702117)
chr1 (109-269)||(29683194-29683355)
chr1 (109-291)||(41730304-41730489)
chr1 (161-291)||(45449249-45449379)
chr1 (109-291)||(14350284-14350464)
chr1 (107-269)||(45431276-45431437)
chr1 (105-234)||(29210408-29210537)
chr1 (113-266)||(48383141-48383294)
chr1 (109-269)||(35985648-35985807)
chr1 (161-290)||(52431632-52431761)
chr1 (109-269)||(51368812-51368972)
chr1 (172-269)||(12306979-12307076)
chr1 (161-290)||(47532677-47532805)
chr1 (112-265)||(23473495-23473648)
chr1 (137-270)||(43286749-43286882)
chr1 (110-258)||(38335170-38335317)
chr1 (160-264)||(37315300-37315403)
chr1 (172-264)||(30217824-30217916)
chr1 (205-288)||(19010695-19010778)
chr1 (109-290)||(28725911-28726093)
chr1 (110-268)||(39081803-39081958)
chr1 (160-250)||(3838824-3838913)
chr1 (161-292)||(15282523-15282649)
chr1 (109-212)||(39912363-39912466)
chr1 (160-272)||(35700676-35700786)
chr1 (160-272)||(52749652-52749764)
chr1 (160-258)||(37503264-37503361)
chr1 (160-217)||(26228243-26228300)
chr1 (110-266)||(52702175-52702332)
chr1 (161-218)||(39497358-39497415)
chr1 (189-239)||(14881036-14881086)
chr1 (242-291)||(29210526-29210575)
chr1 (110-290)||(38595758-38595939)
chr1 (172-206)||(19011057-19011091)
chr1 (111-184)||(19011108-19011180)
chr1 (161-244)||(16590268-16590349)
chr1 (176-211)||(28481906-28481941)
chr1 (224-290)||(10679629-10679695)
chr1 (224-290)||(30664173-30664239)
chr1 (108-145)||(10679508-10679545)
chr1 (242-291)||(21112686-21112735)
chr1 (105-149)||(19940683-19940727)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (109-291)||(27988505-27988686)
chr8 (109-291)||(28045807-28045988)
chr8 (110-291)||(30675578-30675758)
chr8 (110-291)||(34228682-34228863)
chr8 (109-276)||(33357149-33357316)
chr8 (109-291)||(168465-168647)
chr8 (109-291)||(11112638-11112820)
chr8 (112-291)||(20831558-20831737)
chr8 (110-290)||(29235235-29235415)
chr8 (110-289)||(2805267-2805446)
chr8 (108-287)||(12203853-12204031)
chr8 (108-287)||(12448281-12448459)
chr8 (109-291)||(4537749-4537931)
chr8 (113-275)||(29444161-29444323)
chr8 (111-291)||(16888549-16888728)
chr8 (110-299)||(16394057-16394247)
chr8 (111-289)||(21595848-21596025)
chr8 (138-291)||(9537829-9537982)
chr8 (105-305)||(43119212-43119412)
chr8 (109-291)||(9063057-9063238)
chr8 (109-290)||(4648194-4648374)
chr8 (161-288)||(7304526-7304653)
chr8 (160-291)||(28626818-28626948)
chr8 (106-274)||(36730441-36730608)
chr8 (113-291)||(13643015-13643192)
chr8 (113-291)||(13743440-13743617)
chr8 (130-295)||(9253903-9254067)
chr8 (110-275)||(37373206-37373370)
chr8 (160-291)||(3930238-3930369)
chr8 (109-265)||(16785086-16785241)
chr8 (124-289)||(42034988-42035153)
chr8 (160-291)||(16890485-16890616)
chr8 (173-291)||(39406905-39407021)
chr8 (160-269)||(32113958-32114068)
chr8 (182-291)||(24843285-24843393)
chr8 (160-257)||(42433583-42433679)
chr8 (161-253)||(10870403-10870495)
chr8 (161-259)||(40831328-40831426)
chr8 (104-215)||(9278206-9278317)
chr8 (160-218)||(34192825-34192883)
chr8 (161-249)||(22451835-22451922)
chr8 (172-250)||(22956767-22956845)
chr8 (175-243)||(17467668-17467736)
chr8 (164-242)||(30933376-30933453)
chr8 (110-269)||(39751498-39751658)
chr8 (182-250)||(36057897-36057967)
chr8 (161-215)||(10618069-10618123)
chr8 (110-187)||(12652630-12652707)
chr8 (111-290)||(43714194-43714373)
chr8 (224-287)||(40268036-40268099)
chr8 (237-291)||(10618125-10618179)
chr8 (203-269)||(14191037-14191103)
chr8 (228-290)||(29566819-29566881)
chr8 (110-151)||(29566700-29566741)
chr8 (259-287)||(36696508-36696536)
chr8 (227-287)||(39206303-39206363)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (109-291)||(29591188-29591370)
chr4 (110-291)||(54897308-54897489)
chr4 (110-275)||(32217045-32217209)
chr4 (109-268)||(789558-789717)
chr4 (109-290)||(43944506-43944686)
chr4 (160-291)||(36395149-36395280)
chr4 (113-269)||(50619089-50619245)
chr4 (108-291)||(4268827-4269010)
chr4 (109-291)||(12356243-12356425)
chr4 (109-291)||(16536047-16536229)
chr4 (94-264)||(19503137-19503306)
chr4 (110-291)||(54655882-54656062)
chr4 (110-273)||(32202504-32202666)
chr4 (109-291)||(6164093-6164274)
chr4 (108-290)||(18067885-18068067)
chr4 (109-287)||(47231881-47232059)
chr4 (108-291)||(4089140-4089323)
chr4 (108-283)||(42898757-42898934)
chr4 (109-291)||(43202389-43202570)
chr4 (109-256)||(15186242-15186389)
chr4 (109-291)||(7768937-7769119)
chr4 (109-291)||(33108678-33108859)
chr4 (175-291)||(16820917-16821033)
chr4 (110-291)||(28755621-28755799)
chr4 (160-292)||(30387138-30387270)
chr4 (109-291)||(5091617-5091797)
chr4 (110-287)||(3783507-3783687)
chr4 (110-268)||(24679671-24679827)
chr4 (160-291)||(30154168-30154299)
chr4 (160-263)||(39843957-39844060)
chr4 (133-291)||(54945785-54945941)
chr4 (160-264)||(4220245-4220348)
chr4 (160-291)||(50603277-50603409)
chr4 (160-271)||(46148989-46149100)
chr4 (108-288)||(55882682-55882860)
chr4 (109-234)||(46688267-46688397)
chr4 (109-265)||(52533816-52533972)
chr4 (110-234)||(54054548-54054672)
chr4 (160-266)||(37987985-37988091)
chr4 (160-266)||(53268770-53268875)
chr4 (161-290)||(41265510-41265637)
chr4 (160-269)||(53655905-53656014)
chr4 (172-291)||(31680470-31680587)
chr4 (164-252)||(49915213-49915301)
chr4 (174-275)||(39877268-39877371)
chr4 (189-291)||(53003961-53004063)
chr4 (162-269)||(31517217-31517325)
chr4 (108-234)||(42815108-42815234)
chr4 (185-273)||(8133782-8133869)
chr4 (160-290)||(17344666-17344794)
chr4 (108-206)||(50167589-50167685)
chr4 (224-290)||(28119912-28119978)
chr4 (161-272)||(52697103-52697213)
chr4 (240-291)||(54054659-54054710)
chr4 (109-149)||(12701917-12701957)
chr4 (160-270)||(9964771-9964879)
chr4 (224-287)||(28120058-28120121)
chr4 (224-290)||(37402765-37402830)
chr4 (242-287)||(9012139-9012184)
chr4 (195-268)||(1432576-1432650)
chr4 (108-148)||(49446556-49446596)
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (108-289)||(49893329-49893510)
chr3 (107-291)||(272217-272401)
chr3 (110-291)||(48725271-48725452)
chr3 (109-291)||(52520680-52520862)
chr3 (109-290)||(18014671-18014852)
chr3 (110-291)||(39074419-39074599)
chr3 (109-291)||(46352633-46352815)
chr3 (107-295)||(41304002-41304188)
chr3 (109-289)||(858588-858768)
chr3 (108-288)||(41553948-41554127)
chr3 (111-291)||(42964254-42964434)
chr3 (110-291)||(4168183-4168364)
chr3 (110-291)||(43786871-43787052)
chr3 (110-291)||(10617289-10617469)
chr3 (110-269)||(28139309-28139468)
chr3 (109-276)||(40362600-40362767)
chr3 (110-272)||(20923992-20924154)
chr3 (167-291)||(6842676-6842800)
chr3 (130-291)||(7468431-7468590)
chr3 (110-291)||(52246582-52246763)
chr3 (162-290)||(33140937-33141065)
chr3 (130-275)||(53489845-53489990)
chr3 (160-295)||(42548145-42548279)
chr3 (130-290)||(49529274-49529435)
chr3 (113-287)||(50359195-50359368)
chr3 (104-268)||(13159891-13160055)
chr3 (160-269)||(2505399-2505508)
chr3 (161-268)||(50298973-50299080)
chr3 (136-291)||(43269744-43269899)
chr3 (109-291)||(11308216-11308397)
chr3 (160-264)||(41993652-41993755)
chr3 (160-263)||(29241687-29241790)
chr3 (161-291)||(2938045-2938175)
chr3 (175-277)||(38852282-38852384)
chr3 (110-258)||(2119431-2119577)
chr3 (134-266)||(22248910-22249042)
chr3 (160-287)||(24488416-24488543)
chr3 (116-268)||(50395591-50395742)
chr3 (161-268)||(31514842-31514948)
chr3 (185-290)||(52552549-52552652)
chr3 (160-290)||(21010047-21010173)
chr3 (160-234)||(2362882-2362955)
chr3 (160-268)||(25743860-25743967)
chr3 (172-209)||(6842605-6842642)
chr3 (175-266)||(53054869-53054959)
chr3 (110-152)||(2362801-2362843)
chr3 (167-205)||(6842636-6842674)
chr3 (186-268)||(17752762-17752842)
chr3 (186-268)||(19054082-19054162)
chr3 (110-189)||(23925280-23925359)
chr3 (246-291)||(2362948-2362993)
chr3 (109-195)||(52718167-52718252)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (109-291)||(1391183-1391364)
chr6 (109-291)||(32929513-32929695)
chr6 (110-291)||(392096-392277)
chr6 (112-296)||(2350654-2350838)
chr6 (113-292)||(32985197-32985376)
chr6 (109-291)||(4215694-4215876)
chr6 (109-291)||(23402137-23402319)
chr6 (110-291)||(12145122-12145303)
chr6 (109-291)||(18276617-18276801)
chr6 (109-291)||(3515765-3515947)
chr6 (108-265)||(29451146-29451302)
chr6 (109-264)||(7851191-7851346)
chr6 (108-290)||(27433490-27433672)
chr6 (132-290)||(26467130-26467288)
chr6 (110-276)||(35043890-35044055)
chr6 (110-291)||(2580952-2581133)
chr6 (109-291)||(3026014-3026194)
chr6 (109-291)||(12525718-12525900)
chr6 (160-291)||(25165418-25165549)
chr6 (130-296)||(11115098-11115261)
chr6 (110-291)||(21878358-21878533)
chr6 (109-234)||(20897947-20898072)
chr6 (160-265)||(961059-961164)
chr6 (136-290)||(1840253-1840407)
chr6 (114-291)||(34851854-34852030)
chr6 (130-265)||(23629607-23629742)
chr6 (109-227)||(34396596-34396714)
chr6 (162-274)||(28225272-28225384)
chr6 (110-291)||(29978233-29978412)
chr6 (160-265)||(5323450-5323555)
chr6 (112-252)||(9660988-9661128)
chr6 (134-269)||(13416986-13417124)
chr6 (107-243)||(31280318-31280454)
chr6 (134-234)||(34477612-34477712)
chr6 (108-209)||(13529453-13529554)
chr6 (109-290)||(34706719-34706901)
chr6 (220-276)||(22417303-22417359)
chr6 (178-269)||(24227415-24227506)
chr6 (196-263)||(28564322-28564388)
chr6 (224-290)||(34712131-34712197)
chr6 (160-201)||(10431786-10431827)
chr6 (110-151)||(34712271-34712312)
chr6 (109-149)||(29716728-29716768)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (110-291)||(34650838-34651018)
chr5 (109-291)||(8787338-8787520)
chr5 (109-291)||(13661807-13661989)
chr5 (110-291)||(11957972-11958153)
chr5 (109-291)||(35132521-35132702)
chr5 (110-291)||(35504246-35504426)
chr5 (109-291)||(10054358-10054539)
chr5 (110-291)||(21547399-21547579)
chr5 (160-269)||(11846122-11846231)
chr5 (160-296)||(20175277-20175412)
chr5 (110-290)||(6283562-6283742)
chr5 (160-269)||(12506346-12506455)
chr5 (138-275)||(31909659-31909791)
chr5 (160-263)||(9721640-9721743)
chr5 (106-268)||(10955947-10956109)
chr5 (160-266)||(40564434-40564540)
chr5 (110-234)||(10069969-10070092)
chr5 (109-242)||(13470150-13470283)
chr5 (172-288)||(4268624-4268739)
chr5 (131-234)||(19647720-19647823)
chr5 (160-269)||(40057357-40057466)
chr5 (109-217)||(4837257-4837364)
chr5 (137-258)||(39066973-39067095)
chr5 (111-219)||(2619634-2619742)
chr5 (109-259)||(39069380-39069527)
chr5 (104-295)||(14214050-14214242)
chr5 (160-270)||(19436864-19436972)
chr5 (160-290)||(31467770-31467900)
chr5 (110-151)||(40608681-40608722)
chr5 (247-291)||(10070086-10070130)
chr5 (224-268)||(30889458-30889502)
chr5 (160-207)||(6284845-6284892)
chr5 (109-151)||(21945006-21945048)
chr5 (176-258)||(22973751-22973832)
chr5 (238-275)||(10955972-10956009)
chr5 (238-290)||(40608664-40608716)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (160-305)||(40969-41114)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (109-290)||(22960-23141)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (110-275)||(14896-15061)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (109-268)||(68318-68477)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (113-291)||(116207-116385)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (111-291)||(6115-6295)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (108-290)||(53691-53873)
[»] scaffold0524 (1 HSPs)
scaffold0524 (110-269)||(825-984)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (172-291)||(10772-10891)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (175-291)||(233918-234034)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (160-291)||(19590-19721)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (104-268)||(146933-147097)
[»] scaffold1152 (1 HSPs)
scaffold1152 (105-305)||(673-873)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (161-288)||(69277-69403)
scaffold0050 (160-271)||(33707-33817)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (110-269)||(50548-50707)
scaffold0045 (137-218)||(53424-53505)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (161-273)||(17494-17605)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (113-265)||(95616-95767)
[»] scaffold1266 (1 HSPs)
scaffold1266 (108-291)||(291-473)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (162-274)||(25770-25882)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (107-234)||(11032-11157)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (134-234)||(7959-8059)
[»] scaffold0549 (1 HSPs)
scaffold0549 (134-234)||(7312-7412)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (161-207)||(5090-5136)
[»] scaffold1128 (1 HSPs)
scaffold1128 (160-201)||(1421-1462)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 31438646 - 31438827
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31438646 gggaaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 31438745  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31438746 aagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagcag 31438827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 291
Target Start/End: Original strand, 30486196 - 30486391
Alignment:
Q  96 aatgaaattaattagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgta 195  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30486196 aatgaaataaataagggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgta 30486295  T
Q  196 attaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  30486296 attaaactataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcag 30486391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 20552931 - 20553112
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||       ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20552931 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 20553030  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  20553031 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcag 20553112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 561705 - 561523
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  561705 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 561606  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||||||||    
T  561605 aaagtcaaaatcagtttccttttataataataattctcttttatggtatgcttaatcagtaccccggaggcaccggttagcag 561523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27856583 - 27856401
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  |||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27856583 agggaaatgttaaccggtgcccccggggcactggttaagagtatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 27856484  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||    
T  27856483 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcatcggttagcag 27856401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 107 - 290
Target Start/End: Original strand, 1859159 - 1859342
Alignment:
Q  107 ttagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||       |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1859159 ttagggaaatgctaactggtgcccccggggtaatggttaaggatataaaaaaagaaattgtatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttata 1859258  T
Q  207 ataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  1859259 ataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccctaggaacaccggttagca 1859342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 32361059 - 32360860
Alignment:
Q  106 attagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |        |||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||    
T  32361059 attagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaataatataattaattgat 32360960  T
Q  206 aataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca-gacccaattaatta 304  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32360959 aataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggacccaattaatta 32360860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 291
Target Start/End: Original strand, 4381798 - 4381976
Alignment:
Q  113 aaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4381798 aaatgctaaccggtgcccccggtgcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatg 4381897  T
Q  213 tcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  4381898 tcaaaaacagtttccttttatggtaataattccattttatggtatgcttaaccagtgccccgggagcactggttagcag 4381976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 44587902 - 44588083
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||       ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44587902 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcaccggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataata 44588001  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||   ||||||||||||    
T  44588002 aagtaaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacaagtgccccgggggtaccggttagcag 44588083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 31390011 - 31390193
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31390011 agggaaatgctaactggtgcctccggggcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataat 31390110  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||  ||||| |||||||    
T  31390111 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgctccgggggcaccgattagcag 31390193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 109 - 276
Target Start/End: Original strand, 32860101 - 32860267
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||||||       ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32860101 agggaaatgttaaccggtgccccgggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtatttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 32860200  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggg 276  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32860201 aaagtcaaaaacagtttccttttatg-taataattctcttttatggtatgcttaaccagtgtcccggg 32860267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22068506 - 22068325
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||       | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22068506 agggaaatgctaacaagtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaagggaattatatagtagtta-tgcattgaaattgtataattaattgataat 22068408  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||    
T  22068407 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccgattagcag 22068325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 276
Target Start/End: Original strand, 6580187 - 6580355
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||       |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6580187 tagggaaatgctaaccagtgccccgggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa 6580286  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggg 276  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6580287 taatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggg 6580355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 161 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8969542 - 8969412
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8969542 aaattatatagtagttaatgcattgaaatagtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatggtaataatttccttttatagtatgct 8969443  T
Q  261 taaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||| |||| ||| ||  |||||||||||||    
T  8969442 taactagtgcccctggggcaccggttagcag 8969412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 290
Target Start/End: Original strand, 22887747 - 22887930
Alignment:
Q  107 ttagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 206  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22887747 ttagggaaatgctaaccgatgcctccggggcagtggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttata 22887846  T
Q  207 ataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||    
T  22887847 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccgattagca 22887930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4022665 - 4022484
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||| ||||       ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4022665 agggaaatgctaactggtgcccacgggatactgattaagaatatgaaaaaagaaatta-atagtagttaatgtattgaaattctgtaattaatttataat 4022567  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4022566 aaagtcagaaacagtttccttttatgataataatttccttttatgatatgtttaaccagtgtcccgggggcaccggttagcag 4022484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5093724 - 5093559
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    |||||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||       ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5093724 gggaaatgctaactggtt-tctcggagcactagttaaggatatgaaaaaggaaattaaatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataata 5093626  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggg 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  5093625 aagtcaaaagcaatttccttttatgataataatttccttttatggtatgtttaactagtgccccggg 5093559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34442718 - 34442538
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||        | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34442718 agggaaatgctaaccggtgc-cccggggcacatgttaaggatatgaaaaagaagattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 34442620  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||    
T  34442619 aaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtg-cccgggggcatcggttagcag 34442538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 113 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3668295 - 3668119
Alignment:
Q  113 aaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3668295 aaatgctaaccggtgcccccgga-cactggttaagggtatggaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatg 3668197  T
Q  213 tcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  3668196 tcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatagtatgtttaaccagtgccccgagggcaccggttagca 3668119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26387251 - 26387091
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  | ||| |||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26387251 agggaaatgctaactggtgcctccgaagtacttgttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 26387152  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26387151 aaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtg 26387091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 172 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25782957 - 25782840
Alignment:
Q  172 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtc 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25782957 tagttaatgcattgaaattgtgtaattattttataataaagtcaaaaacaattttcttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgtc 25782858  T
Q  272 ccgggaacaccggttagc 289  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  25782857 ccggggacatcggttagc 25782840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 2898071 - 2898252
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2898071 agggaaatgttaaccggtg-tcccggaacactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 2898169  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  2898170 aaagtcaaaaacagttttcttctatcataataattctcttttatggtatgtttaatcagtgtcccggaggcaccggttagcag 2898252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 290
Target Start/End: Original strand, 43637165 - 43637343
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43637165 gggaaatgctaaccggtgc-cccgagacactggttaaggatatgaataaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 43637263  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||  |||||  ||||||||||||    
T  43637264 aagtcaaaaacaatttctttttatggtaataatttccttttacagtatgtttaacccgtgctccggg-gcaccggttagca 43637343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 22567601 - 22567783
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||||| ||| ||   | ||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22567601 agggaaatgctaactgatgcccctaagacactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 22567700  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||||  | |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||  || ||  |||||||||||||    
T  22567701 aaagtcaaaaataatttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaacccgtgctccaggggcaccggttagcag 22567783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38591061 - 38590904
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||||       ||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38591061 agggaaatgctaaccggtgtccctggggcactggttaagaatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgtattaaaattgtgtaattaattgataat 38590962  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaacca 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38590961 aaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacca 38590904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13574216 - 13574060
Alignment:
Q  107 ttagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 206  Q
    |||| ||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||       |||| ||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13574216 ttagagaaatgctaacaggtgc--cctgggtactggttaaggatatgaaaaaggaaaatatataaaaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttata 13574119  T
Q  207 ataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaacc 265  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13574118 ataaagtcaaaaacagtttctttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaacc 13574060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26891851 - 26891725
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26891851 tagggaaatgctaaccggtgcccccgggacactgattaaggatataaaaaaggaaattatatattagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 26891752  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatg 234  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||    
T  26891751 taaagtcaaaaatagtttccttttatg 26891725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 291
Target Start/End: Original strand, 27584788 - 27584918
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||| |    
T  27584788 gaaattatatagtagttaaagcattgaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaagcagtttccttttatggtaataattctcattcatggtatac 27584887  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  27584888 ttaaccagtg-cccggaagcagcggttagcag 27584918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 263
Target Start/End: Original strand, 5881221 - 5881374
Alignment:
Q  113 aaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgc----attgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5881221 aaatgctaaccggtg-tcccggagcacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 5881319  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaa 263  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5881320 aaagtcaaaaagagtttccttttatgataataattatcttttatggtatgcttaa 5881374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35851887 - 35851781
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  35851887 gaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcattttatggtaataattctcttttatggtatgc 35851788  T
Q  260 ttaacca 266  Q
    |||||||    
T  35851787 ttaacca 35851781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11021408 - 11021259
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| |||||| |||| |||||       ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11021408 agggaaatgttaactggtgc-ctcggagcactgattaaagatatgaaaaaagaaattatatggtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatatataat 11021310  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  11021309 aaagtcaaaaacagttttcttttgtggtaataattcccttttatggtatgc 11021259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 291
Target Start/End: Original strand, 28600990 - 28601147
Alignment:
Q  133 ggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttcctttta 232  Q
    ||||||||||||||||||||       | ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  28600990 ggggcactggttaaggatatgaaaaagggaattataaagtagtta-tgcattgaaattgtataattaattgataataaagttaaaaacagtttcttttta 28601088  T
Q  233 tgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||    
T  28601089 tggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcactgggagcaccggttagcag 28601147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 250
Target Start/End: Original strand, 38296178 - 38296317
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| |||||        |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38296178 gggaaatgctaaccggtg-tcttggggcactggttaaagatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatacattgaaattgtgtaattaatttataata 38296276  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttcctttt 250  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  38296277 aagtcaaaaacagtttctttttatggtaataattttctttt 38296317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 268
Target Start/End: Original strand, 25772176 - 25772269
Alignment:
Q  175 ttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagt 268  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  25772176 ttaatgcaatgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttccctttatgataataattcccttttatggtatacttaatcagt 25772269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34123214 - 34123057
Alignment:
Q  106 attagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttat 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| || |||        ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34123214 attagggaaatgctaaccggtgcctccggggtactggttgagcatactaaaaaagaaattatataatagttaatgctttgaatttgtgtaattaatttat 34123115  T
Q  206 aataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaac 264  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  34123114 aa-aaagtcaaaaacagtttccttttatggtcataattttcttttttaatatgcttaac 34123057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15079094 - 15079011
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataattt 244  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15079094 gaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacaatttccttttatgataataattt 15079011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 277
Target Start/End: Original strand, 15146683 - 15146798
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  15146683 aaattatataatagttaatacattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcaaaaataatttccttttatgataataattttcctttttggtatgtt 15146781  T
Q  261 taaccagtgtcccggga 277  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  15146782 taaccagtatccaggga 15146798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 271
Target Start/End: Original strand, 39531874 - 39531983
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| |||| |||| |||||  | |||||    
T  39531874 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-agagtcaaaaccagttttcttttatggtaat-attttctttttcgatatgc 39531971  T
Q  260 ttaaccagtgtc 271  Q
    ||||||||||||    
T  39531972 ttaaccagtgtc 39531983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29102418 - 29102306
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||  |||||||| |||| |    
T  29102418 aaattatatagcggttaatacattgaaattttataattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatagtaataattatcttttatgatatgtt 29102319  T
Q  261 taaccagtgtccc 273  Q
    |||||| ||||||    
T  29102318 taaccaatgtccc 29102306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 258
Target Start/End: Original strand, 10820534 - 10820630
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatg 258  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  10820534 gaaattataaaatagttaatacattgagattgt-taattaatttataa-aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattttcttttttggtatg 10820630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 286
Target Start/End: Original strand, 20431488 - 20431614
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaat-tgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatg 258  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||    || |||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  20431488 gaaattatattgtagttattgcattgaaaactgtgtaattaatactaaaaaaagtcaaaagt-gttatcttttatgataataatttccttttttggcata 20431586  T
Q  259 cttaaccagtgtcccgggaacaccggtt 286  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  20431587 cttaaccagtgccccggagacaccggtt 20431614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 44854527 - 44854485
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggata 151  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44854527 agggaaatgctaaccggtactcccggggcactggttaaggata 44854485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 290
Target Start/End: Original strand, 45262024 - 45262090
Alignment:
Q  224 ttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  45262024 ttccttttatggtaataatttcttttttttgtatgcttaacctttgtcccgggggcaccggttagca 45262090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 35851956 - 35851917
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaagg 148  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35851956 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagg 35851917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 149
Target Start/End: Original strand, 28277517 - 28277550
Alignment:
Q  116 tgctaactggtgctcccggggcactggttaagga 149  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28277517 tgctaactggtgcccccggggcactggttaagga 28277550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 151
Target Start/End: Original strand, 29771417 - 29771457
Alignment:
Q  111 ggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggata 151  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29771417 ggaaatgctaaccgatgcccccggggcactggttaaggata 29771457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 34606261 - 34606442
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34606261 gggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgaaattaatttataata 34606360  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  34606361 aagtcaaaagcagtttccttttatggtaataattaccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggagcaccggttagcag 34606442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 109 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29993674 - 29993508
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29993674 agggaaatgctaacgggtgcccccggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 29993575  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgg 275  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29993574 aaagtcaaaatcaatttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgg 29993508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 18485960 - 18486142
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18485960 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatattgaaaaggaaattatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 18486059  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  18486060 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataatttcattttatggtatgcttaacccgtgccccgaagacaccggttagcag 18486142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 24438477 - 24438658
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||       |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24438477 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactagttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataata 24438576  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  24438577 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcag 24438658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24798589 - 24798408
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24798589 agggaaatgctaaccggtgcccccggg-cacttgttgaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 24798491  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||    
T  24798490 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatagtatgcttaaccagtgccccgggggcaccagttagcag 24798408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 292
Target Start/End: Original strand, 1736980 - 1737161
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1736980 gggaaatgctaaccggtgcttctggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataata 1737079  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcaga 292  Q
    |||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  1737080 aagttaaaaacattttccatttatgataataa-ttcattttatggtatgcttaaccagtgccccggaagcaccggttagcaga 1737161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12218623 - 12218442
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12218623 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggataagtatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 12218524  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||| | ||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12218523 aaaataaaaaatagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccccggg-acaccggttagcag 12218442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 34333283 - 34333464
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34333283 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 34333382  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  34333383 aatgtcaaaa-cagtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggcaccggttagcag 34333464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 47839488 - 47839657
Alignment:
Q  105 aattagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaattta 204  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||       ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47839488 aattagggaaatgctaaccggtg-tcccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaatttatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaattta 47839586  T
Q  205 taataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgg 275  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  47839587 taataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgaataaccagtgccccgg 47839657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 43594222 - 43594062
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43594222 gggaaatgctaaccggtgtccccggaacactggttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 43594123  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgt 270  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43594122 aagtcaaaaacagtttcctcttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgt 43594062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8754771 - 8754617
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8754771 gggaaatgctaaccggtgccctgggagcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 8754672  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaac 264  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8754671 aagtcaaaaacagttttgttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaac 8754617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27456301 - 27456174
Alignment:
Q  107 ttagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27456301 ttagggaaatgctaactggtgcccccggg-cactggttaaggatatggaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 27456203  T
Q  207 ataaagtcaaaagcagtttccttttatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27456202 ataaagtcaaaagcagtttccttttatga 27456174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 266
Target Start/End: Original strand, 30810675 - 30810811
Alignment:
Q  130 cccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttcctt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  30810675 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttctt 30810774  T
Q  230 ttatgataataatttccttttatggtatgcttaacca 266  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30810775 ttatggtaataattttcttttatggtatgtttaacca 30810811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 275
Target Start/End: Original strand, 45045820 - 45045935
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45045820 gaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgc 45045919  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgg 275  Q
    |||||||||| |||||    
T  45045920 ttaaccagtgccccgg 45045935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 269
Target Start/End: Original strand, 4628565 - 4628725
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||       ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4628565 agggaaatgctaaccgatgcccctggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtttaattaatttataat 4628664  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    ||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4628665 aaagtcagaaacagtttacttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtg 4628725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 264
Target Start/End: Original strand, 5239283 - 5239439
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| | |||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5239283 tagggaaatgctaaccggtgcctccggagcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 5239382  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaac 264  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5239383 taatgtcaaaaacagtttctttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaac 5239439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 111 - 291
Target Start/End: Original strand, 28587911 - 28588090
Alignment:
Q  111 ggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 210  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||       ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28587911 ggaaatgctaaccggtgcccccgga-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagtcaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataa 28588009  T
Q  211 agtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  28588010 agtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaaccaataccccgggaacatcggttagcag 28588090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 269
Target Start/End: Original strand, 47656981 - 47657137
Alignment:
Q  111 ggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 210  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||        |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47656981 ggaaatgctaaccggtgcttcgggggcactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 47657080  T
Q  211 agtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  47657081 agttaaaagcagttt--ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcagtg 47657137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37674240 - 37674111
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||  |||||||||||||    
T  37674240 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgatataattttttttttatggtatgc 37674141  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  37674140 ttaaccagtgtccgggg--caccggttagcag 37674111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23363303 - 23363172
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||     
T  23363303 gaaattgtatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaatatttctcttttatggtatgt 23363204  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  23363203 ttaaccagtgccccgaaaacaccgattagcag 23363172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11686507 - 11686353
Alignment:
Q  113 aaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11686507 aaatgctaactggtgcttccgggatactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 11686408  T
Q  213 tcaaaagcag--tttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaacc 265  Q
    |||||| |||  |||  ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  11686407 tcaaaaacagtttttttttttatggtaataattctcttttatgatatgcttaacc 11686353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 42044429 - 42044300
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  42044429 gaaattatatagtagttaatagattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgt 42044330  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  42044329 ttaaccagtgccccggg-gcaccggttagca 42044300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Original strand, 18117193 - 18117302
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  18117193 gaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttttttttatagtaataatttcattttatggtatgc 18117292  T
Q  260 ttaaccagtg 269  Q
    ||||||||||    
T  18117293 ttaaccagtg 18117302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13065013 - 13064903
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaag-cagtttccttttatgataataatttccttttatggtatg 258  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13065013 gaaattatataatatttaatgtattgaatttgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatg 13064914  T
Q  259 cttaaccagtg 269  Q
    |||||||||||    
T  13064913 cttaaccagtg 13064903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 265
Target Start/End: Original strand, 46716642 - 46716793
Alignment:
Q  114 aatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagt 213  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||       ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46716642 aatgctaactggtgccctcggagcattggttaaagatataaaaaaggaaattatataatacttaatgcactgaaattatgtaattaatttataataaagt 46716741  T
Q  214 caaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaacc 265  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46716742 caaaaatattttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaacc 46716793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 175 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7689321 - 7689227
Alignment:
Q  175 ttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  7689321 ttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatacttaaccagtg 7689227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 266
Target Start/End: Original strand, 47083105 - 47083211
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||     
T  47083105 gaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaattgataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatgatatgt 47083204  T
Q  260 ttaacca 266  Q
    |||||||    
T  47083205 ttaacca 47083211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37631730 - 37631601
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||       ||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37631730 tagggaaatgttaaccggtgcttccggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatataataattaatgcattaaaattatgtaattaatttataa 37631631  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgata 237  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37631630 taaaatcaaaaacagtttccttttatgata 37631601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 269
Target Start/End: Original strand, 5729345 - 5729505
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  5729345 agggaaatgttaaccggtgttcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgtattgaaataatgtaattaattgataat 5729444  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    ||||||||||  | ||| |||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  5729445 aaagtcaaaaataattttcttttatagtaataattctcttttatggcatgcttaaccagtg 5729505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 525199 - 525103
Alignment:
Q  172 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagt 268  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  525199 tagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatgatatgtttaaccagt 525103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34546501 - 34546376
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34546501 agggaaatgctaaccgatgcccccgaggtaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttatagt 34546402  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatg 234  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||    
T  34546401 aaagtcaaaaacagtttacttttatg 34546376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 269
Target Start/End: Original strand, 33636503 - 33636611
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  33636503 aaattatataataattaattcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtaaaaaatagtttatttttatggtaataattctattttatggtatgct 33636602  T
Q  261 taaccagtg 269  Q
    |||||||||    
T  33636603 taaccagtg 33636611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 292
Target Start/End: Original strand, 28262029 - 28262208
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||| |||||     ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28262029 taggaaaatgctaaccggtgcctccgggtcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagtt-----attgaaattatgtaattaattgataa 28262123  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcaga 292  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||| || || || | ||||||| ||||||    
T  28262124 taaaatcaaaaacagtttccttttatagtaataattcttttttatggtatgcttaaccaatgccctggaagcaccggtcagcaga 28262208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23357812 - 23357716
Alignment:
Q  194 taattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  23357812 taattaatttataaaaaagtcaaaaacagtttccatttatgataataattctcttctatgatatgcttaaccagtgccccggagacaccgattagca 23357716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29835836 - 29835711
Alignment:
Q  164 ttatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcag-tttccttttatgataataatttccttttatggtatgctta 262  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||  ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  29835836 ttatatactagttaatgtattaaaattgcgtaattaatttgtaataaagttaaaaacagttttttttttatggtaataattctattttatggtatgctta 29835737  T
Q  263 accagtgtcccgggaacaccggttagc 289  Q
    | | ||| | |||||||||||||||||    
T  29835736 a-ctgtgcctcgggaacaccggttagc 29835711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47118100 - 47118042
Alignment:
Q  185 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47118100 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaagagcagtttccttttatggtaataatt 47118042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 262
Target Start/End: Original strand, 22739873 - 22739976
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttat-aataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatg 258  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| |||||| |||||||| |||||||||  |||| | |||||    
T  22739873 gaaagtatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataaaaaaaattaaaaacagttttcttttatggtaataattttatttttttgtatg 22739972  T
Q  259 ctta 262  Q
    ||||    
T  22739973 ctta 22739976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 265
Target Start/End: Original strand, 36437429 - 36437531
Alignment:
Q  162 aattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgctt 261  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||| |||    
T  36437429 aattatatagtaggtaattcattgaaattgtttaattaatttataa-aaagtcaaaaatagttttcttttatgataataacttctttttttagtatcctt 36437527  T
Q  262 aacc 265  Q
    ||||    
T  36437528 aacc 36437531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 250
Target Start/End: Original strand, 20116940 - 20117029
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttcctttt 250  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20116940 gaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtagtaaatttttaa-aaggccaaaaacagttttcttttatgataataatttcctttt 20117029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18470126 - 18469993
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccgggg-cactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||        |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  18470126 gggaaatgctaaccggtgcccccgggggcaccggttaagcatactaaaaaggaaattatatagcagttaatacattgaaattgtgtaattaatttatga- 18470028  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatt 243  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  18470027 aaagtcaaaaacagttacattttatggtaataatt 18469993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 252
Target Start/End: Original strand, 13556474 - 13556553
Alignment:
Q  172 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttat 252  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || | || ||||||| |||||||||||||||||    
T  13556474 tagtcaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaataacaatatctttttatggtaataatttccttttat 13556553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18220806 - 18220691
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||| || | |||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |    
T  18220806 gaaattatatagtaattaatgtatagaaattgtgtaattaatttataa-aatggcaaaaatagttttcttttatggtaataaattccttttttggtatcc 18220708  T
Q  260 ttaaccagtgtcccggg 276  Q
    |||| | ||| ||||||    
T  18220707 ttaatcggtgccccggg 18220691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 266
Target Start/End: Original strand, 3021941 - 3022039
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||        |||||||| |||||||||||| || |||||||     
T  3021941 gaaattatatactagttaatacattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcataa-------acttttatggtaataatttcctcttttggtatga 3022032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 271
Target Start/End: Original strand, 4087673 - 4087783
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataat-aatttccttttatggtatg 258  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |   |||||| |||||| |||||||| |||| || |||||||| |||||||    
T  4087673 gaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtgtgattaatttataa-agtttcaaaaacagttt-cttttatggtaataaaattccttttttggtatg 4087770  T
Q  259 cttaaccagtgtc 271  Q
     ||||| ||||||    
T  4087771 tttaactagtgtc 4087783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34557077 - 34556898
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggat-atnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattg-aaattgtgtaattaatttata 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||       ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||    
T  34557077 agggaaatgctaactggtgc-cccggggcattggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccata 34556979  T
Q  207 ataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    |  ||||||| |  | ||| |||||| | ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||    
T  34556978 aataagtcaacaaaacttt-cttttagggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgcccgggg--caccggttagca 34556898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 149
Target Start/End: Original strand, 507258 - 507296
Alignment:
Q  111 ggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaagga 149  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  507258 ggaaatgttaactggtgctcccggggcactggttaagga 507296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 151
Target Start/End: Original strand, 32805537 - 32805579
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggata 151  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32805537 agggaaatgctaaccggtgttcccggggcactggttaaggata 32805579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 290
Target Start/End: Original strand, 38128406 - 38128472
Alignment:
Q  224 ttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  38128406 ttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagca 38128472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18220573 - 18220486
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttcctttt 250  Q
    |||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  18220573 aaattatatagtaattaatgtattaaaattgtgtaattaatttataa-attgtcaaaaacaattt-cttttataataataaattcctttt 18220486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4100660 - 4100557
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||   |||||||||||||||   |||||| ||||||    
T  4100660 gaaattatatagtaattaatgtattaaaattatgttattaatttataatcaaatcaaaaacagttt-tatttatgataataattcatttttatagtatgc 4100562  T
Q  260 ttaac 264  Q
     ||||    
T  4100561 ctaac 4100557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 151
Target Start/End: Original strand, 6097335 - 6097377
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggata 151  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6097335 agggaaatgctaaccgatgcccccggggcactggttaaggata 6097377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 47118150 - 47118108
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatat 152  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  47118150 gggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaagatat 47118108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 6221192 - 6221151
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaagga 149  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6221192 tagggaaatgttaactagtgctctcggggcactggttaagga 6221151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27456172 - 27456136
Alignment:
Q  256 atgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcaga 292  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27456172 atgcttaaccagtatcccggggacaccggttagcaga 27456136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 30924180 - 30924136
Alignment:
Q  107 ttagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggata 151  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30924180 ttaggaaaatgctaaccggtgcccccggggcacgggttaaggata 30924136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 32805596 - 32805544
Alignment:
Q  238 ataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||||||| ||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32805596 ataatttccctttttattatccttaaccagtgccccgggaacaccggttagca 32805544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 110 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24178649 - 24178470
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24178649 gggaaatgctaaccgatgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatctataata 24178550  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  24178549 aagtcaaaagcagtttccttttatggtaataatttcattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagc 24178470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 5694321 - 5694502
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5694321 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatataaaaagggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 5694420  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  5694421 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccggttagcag 5694502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 291
Target Start/End: Original strand, 29657769 - 29657952
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29657769 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaattgataa 29657868  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  29657869 taaagtcaaaaacagtttccttttttggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccctgggggcaccggttagcag 29657952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 51065935 - 51065753
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51065935 agggaaatgctaaccggtgtccccgggacactggttaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 51065836  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  51065835 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcag 51065753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 109 - 290
Target Start/End: Original strand, 15227738 - 15227919
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||       ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15227738 agggaaatgctaaccggtaccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 15227837  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  15227838 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagca 15227919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19032004 - 19031820
Alignment:
Q  107 ttagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||       ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19032004 ttagggaaatgctaaccggtgctccgggggcattagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaaaacattgaaattgtgtaattaatttata 19031905  T
Q  207 ataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||    
T  19031904 ataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatgatatgcttaacccgtaccccggagacaccggttagcag 19031820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 109 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42770177 - 42769994
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42770177 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 42770078  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcaga 292  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  42770077 aatatcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaga 42769994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12072245 - 12072067
Alignment:
Q  113 aaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||       |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12072245 aaatgctaaccggtgcccccggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatgtagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 12072146  T
Q  213 tcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  12072145 tcaaaaacagttttcttttatggtaataattcctttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcag 12072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 18043161 - 18043343
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18043161 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 18043260  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  18043261 aatgtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcag 18043343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 38162850 - 38163031
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    |||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38162850 gggaaatgttaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 38162949  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  38162950 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagcag 38163031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 3097659 - 3097837
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3097659 gggaaatgctaattggtgcccccggagtcctggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataata 3097758  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||    
T  3097759 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagt---acggggacaccggttagcag 3097837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3784899 - 3784720
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||| ||  ||||| ||| | |||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3784899 gggaaatgcaaatcggtgcccccagtgcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 3784800  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagc 289  Q
    ||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  3784799 aagtcaaaaacaattttcttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaacccgtgtcccgggggcaccggttagc 3784720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 269
Target Start/End: Original strand, 13961210 - 13961370
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13961210 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcacgggttaaggatataaaaaaa-aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 13961308  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13961309 taaagtcaaaaacagtttcattttatggtaataattttcttttatggtatgcttaaccagtg 13961370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30294567 - 30294386
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||| ||| |||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30294567 gggaaatgctaatcggtgtccccggagcattggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 30294468  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||    
T  30294467 atgtcaaaaacagtttctttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacctgtgctccggggacaccggttagcag 30294386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 265
Target Start/End: Original strand, 48071478 - 48071637
Alignment:
Q  105 aattagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaattta 204  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48071478 aattagggaaatgctaaccgatgctcc-ggggtactggttaaggatatgtaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattta 48071576  T
Q  205 taataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaacc 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  48071577 taataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattatcttttatagtatgcttaacc 48071637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 161 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 50128307 - 50128177
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  50128307 aaattacatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaagcagtttcattttatggtaataattctcttttatggtatgct 50128208  T
Q  261 taaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  50128207 taaccagtgtcccagaaacaccggttagcag 50128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 101 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9266923 - 9266733
Alignment:
Q  101 aattaattagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaa 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||       ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9266923 aattaataagggaaatgttaaccggtgtccccgcggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtatttaatgcattgaaattgtgtaattaa 9266824  T
Q  201 tttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||  || | | |||||||||||||    
T  9266823 ttcataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcgcttttatggtatacttaaccagtgctccagaagcaccggttagcag 9266733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 17333467 - 17333289
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17333467 gggaaatgctaaccggtgcccccggg-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattcataata 17333369  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| || |||||   |||||||||||||    
T  17333368 aagtcaaaaacagtttccttttatgataatacttcccttttatggta--cttaaccaatgccccggaggcaccggttagcag 17333289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36446508 - 36446350
Alignment:
Q  112 gaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaa 211  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36446508 gaaatgttaactggtgcccccgaggcactggttaagaatataaaaag-gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaa 36446410  T
Q  212 gtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtc 271  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36446409 gtcaaaaacagtttccttttatagtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtgtc 36446350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 47009992 - 47010174
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47009992 agggaaatgctaatcggtgcatccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 47010091  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||    
T  47010092 aaattcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgctccaggggcaccggttagcag 47010174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 117 - 274
Target Start/End: Original strand, 6770344 - 6770501
Alignment:
Q  117 gctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaa 216  Q
    |||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6770344 gctaaccggtgcctccggggcactaattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaa 6770443  T
Q  217 aagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccg 274  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6770444 aaacagtttcattttatgataataattcccttttatgatatgcttaaccagtatcccg 6770501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8473050 - 8472919
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| |    
T  8473050 gaaattatataatagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttataataataattctcttttatggtatac 8472951  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  8472950 ttaaccagtgtcccgaggataccggttagcag 8472919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Original strand, 30657607 - 30657760
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30657607 agggaaatgctaaccggtgctcccggggcactagttaagcatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataat 30657706  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagt 268  Q
    |||||||||| |||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30657707 aaagtcaaaaacag------tttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagt 30657760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 112 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38702117 - 38701942
Alignment:
Q  112 gaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||       |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  38702117 gaaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataat 38702018  T
Q  212 gtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||    
T  38702017 gtcaaaaacagttttcttttatggtaataat----tcttatggtatgcttaaccagtgccccgagggcaccggttagcag 38701942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 269
Target Start/End: Original strand, 29683194 - 29683355
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnng-aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||       | |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29683194 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaagatataaaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatcgtataattaatttataa 29683293  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29683294 taaagtcaaaaacagtttcattttatagtaataattcacttttatggtatgcttaaccagtg 29683355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 41730304 - 41730489
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagt---taatgcattgaaattgtgtaattaatttat 205  Q
    ||||||||  |||| ||||| || ||||||| ||||||| ||||       ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41730304 agggaaatcttaaccggtgccccaggggcacgggttaagaatatgaaaaaagaaattatatagtagtaattaatgcattgaaattgtttaattaatttat 41730403  T
Q  206 aataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | | ||| |||||||||    
T  41730404 aataaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacaagtgccccagaagcactggttagcag 41730489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 45449379 - 45449249
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  45449379 aaattatatagtagttaatgcattaaaatagtgtaattaaattataataaagtcaaaagcagtttccttttatggtaataattgccttttatggtatgtt 45449280  T
Q  261 taaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| ||| ||  || ||||||||||    
T  45449279 taaccagtgccccaggggcatcggttagcag 45449249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14350464 - 14350284
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||       ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14350464 agggaaatgctaaccggtgcccccggagcaccggttaagggtatgaaaaaggaaattatattgtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataat 14350365  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || ||||||| || |||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  14350364 aatgtcaaaaacaatttccttttatggtaataa-ttcccttaatggtatgcttaaccagtgccccggg-gcaccggttagcag 14350284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 269
Target Start/End: Original strand, 45431276 - 45431437
Alignment:
Q  107 ttagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 206  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45431276 ttagggaaatgctaaccggtgcccccagggc-ctgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttata 45431374  T
Q  207 ataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  45431375 ataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattctcttttatgatatacttaaccagtg 45431437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 234
Target Start/End: Original strand, 29210408 - 29210537
Alignment:
Q  105 aattagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaattta 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29210408 aattagggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattta 29210507  T
Q  205 taataaagtcaaaagcagtttccttttatg 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29210508 taataatgtcaaaaacagtttccttttatg 29210537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 48383294 - 48383141
Alignment:
Q  113 aaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||   |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  48383294 aaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatatgaaagttaatgtattgaaataatgtaattaattgataataaag 48383195  T
Q  213 tcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaacca 266  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48383194 tcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacca 48383141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 35985807 - 35985648
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35985807 agggaaatgttaaccggtgc-cccggatcactgtttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 35985709  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  35985708 aaagtgaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatagtatacttaaccagtg 35985648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 290
Target Start/End: Original strand, 52431632 - 52431761
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttcc-ttttatggtatgc 259  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  52431632 aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcaaaagcaattttcttttatggtaataatttcctttttttggtatgc 52431730  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  52431731 ttaaccagtgccccagggacaccggttagca 52431761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 51368972 - 51368812
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||| |||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51368972 agggaaatgctaaccggtacctccagggtactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtagttaatttataat 51368873  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    || |||||||  |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  51368872 aatgtcaaaaatagtttccttttatagtaataattccattttatggtatgcttaaccagtg 51368812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 172 - 269
Target Start/End: Original strand, 12306979 - 12307076
Alignment:
Q  172 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12306979 tagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagattccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 12307076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 47532805 - 47532677
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  47532805 aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatg-ataataaagtcaaaaataatttccttttataataataattcccttttatggtatgct 47532707  T
Q  261 taaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    |||||| || ||||   |||||||||||||    
T  47532706 taaccaatgccccgaagacaccggttagca 47532677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23473648 - 23473495
Alignment:
Q  112 gaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaa 211  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||       || ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23473648 gaaatgctaactgatgcccctggggcattggttaaggatatgaaaaaggagattatatagcagttaatgtattgaaattgtataattaatttataataaa 23473549  T
Q  212 gtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaacc 265  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  23473548 gtttaaagcagtttccttttatggtaataatttctttttataatatgcttaacc 23473495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Original strand, 43286749 - 43286882
Alignment:
Q  137 cactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgat 236  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |    
T  43286749 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgttttgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttccttttatagt 43286848  T
Q  237 aataatttccttttatggtatgcttaaccagtgt 270  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43286849 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgt 43286882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 258
Target Start/End: Original strand, 38335170 - 38335317
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||| |||||       ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38335170 gggaaatgctaaccggtg-tcttgggacactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgtaattgtgtaattaatttataata 38335268  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatg 258  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38335269 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcacttttatggtatg 38335317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37315403 - 37315300
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  37315403 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa-aaagtcaaagacagttttcttttatgctaataatttctttttttggtatgc 37315305  T
Q  260 ttaac 264  Q
    |||||    
T  37315304 ttaac 37315300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 172 - 264
Target Start/End: Original strand, 30217824 - 30217916
Alignment:
Q  172 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaac 264  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30217824 tagttaatgcatttaaattatttaattaatttataataaagtcaaaaatagttttcttttatggtaataatttctttttatggtatgcttaac 30217916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19010778 - 19010695
Alignment:
Q  205 taataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttag 288  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19010778 taataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgattaaccagtgccccaggaacaccggttag 19010695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28726093 - 28725911
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggata-tnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaatttata 206  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |       ||||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  28726093 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggataataaaaaaggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccata 28725994  T
Q  207 ataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    |  ||||||| |  | || ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28725993 aataagtcaacaaaactt-ccttttatggtaagaatttccttttttcgtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagca 28725911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 268
Target Start/End: Original strand, 39081803 - 39081958
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  39081803 gggaaatgctaaccggtgttcc--gggcactggttaagcatactaaaaatgaaattatatactagttaatgtattgaaattttataattaatttataa-a 39081899  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagt 268  Q
    |  | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||    
T  39081900 atattaaaagcagtttcattttatgataataattttcttttttaatatgcttaatcagt 39081958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3838913 - 3838824
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttcctttt 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||    
T  3838913 gaaattatataatagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcaaaagcaatttttttttatggcaataatttcctttt 3838824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15282649 - 15282523
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |       ||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  15282649 aaattatatagtagttaatatattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaaa----taatttatgataataattccctattattgtatgct 15282554  T
Q  261 taaccagtgtcccgggaacaccggttagcaga 292  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  15282553 taa-cagtgccctggaaacaccggttagcaga 15282523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39912466 - 39912363
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||| |||| || || | |||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  39912466 agggaaatgttaaccggcgcactcggggcactgattaaggatataaaaagggaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtgattaatttataaa 39912367  T
Q  209 aaag 212  Q
    ||||    
T  39912366 aaag 39912363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35700786 - 35700676
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  ||  |||||||||||||| |||||||| || ||| |    
T  35700786 gaaattatacagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaaaaaatt-tttttatgataataacttccttttttgatatcc 35700689  T
Q  260 ttaaccagtgtcc 272  Q
    |||||||||||||    
T  35700688 ttaaccagtgtcc 35700676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 272
Target Start/End: Original strand, 52749652 - 52749764
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||| |||| || |||  ||||||| |||||||| | ||||||||||||     
T  52749652 gaaattatataatagttaatgtattgaaattgtatactaaatttacaataaagttaaaaacaatttttttttatggtaataattcctttttatggtatgt 52749751  T
Q  260 ttaaccagtgtcc 272  Q
    |||||| ||||||    
T  52749752 ttaaccggtgtcc 52749764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 258
Target Start/End: Original strand, 37503264 - 37503361
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatg 258  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||    
T  37503264 gaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-aaaatcaaaaatattttccttttatggtaacaattgtcttttttggtatg 37503361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 217
Target Start/End: Original strand, 26228243 - 26228300
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaa 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26228243 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaaatcaaa 26228300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 52702332 - 52702175
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggat-atnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattg-aaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||    
T  52702332 gggaaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataa 52702233  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaacca 266  Q
      |||||||||  |  ||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  52702232 ataagtcaaaa-aaacttcattttatggtaataatttcctttttttgtatgcttaacca 52702175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 39497358 - 39497415
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaa 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  39497358 aaattatatagtagttaatgcattaaaattatataattaatttataataaagtcaaaa 39497415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14881086 - 14881036
Alignment:
Q  189 ttgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataat 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14881086 ttgtataattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 14881036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 291
Target Start/End: Original strand, 29210526 - 29210575
Alignment:
Q  242 tttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  29210526 tttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcag 29210575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38595939 - 38595758
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggat-atnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattg-aaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||    
T  38595939 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataa 38595840  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
      ||||||| |  |  ||||||||||| ||| ||||| ||||| | | |||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  38595839 ataagtcaaca-aaacttccttttatggtaagaattttctttttttgcatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagca 38595758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19011091 - 19011057
Alignment:
Q  172 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19011091 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 19011057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19011180 - 19011108
Alignment:
Q  111 ggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcatt 184  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||    
T  19011180 ggaaatgctaaccggtg-tcccggggcacgggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcatt 19011108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16590349 - 16590268
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataattt 244  Q
    ||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||| || || ||| ||||||||||||||||||    
T  16590349 aaattatataacaattaatgtatt-aaattgtgtaattaatttataa-aatgtcagaaacaattttcttttatgataataattt 16590268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 211
Target Start/End: Original strand, 28481906 - 28481941
Alignment:
Q  176 taatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaa 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28481906 taatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaa 28481941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 290
Target Start/End: Original strand, 10679629 - 10679695
Alignment:
Q  224 ttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  10679629 ttccttttatggtaaaaatttcttttttttgtatgcttaacaggtgtcccgggggcaccggttagca 10679695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30664239 - 30664173
Alignment:
Q  224 ttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  30664239 ttccttttatggtaagaatttcttttttttgtatgcttaaccagtgccccgtgggcaccggttagca 30664173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 145
Target Start/End: Original strand, 10679508 - 10679545
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggtta 145  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10679508 tagggaaatgttaaccggtgctcccggggcactggtta 10679545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21112735 - 21112686
Alignment:
Q  242 tttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||    
T  21112735 tttccttttatggtatgcttaactagtgccccgagggcaccggttagcag 21112686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19940727 - 19940683
Alignment:
Q  105 aattagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaagga 149  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19940727 aattaggaaaatgttaaccggtgcccccggggcactggttaagga 19940683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27988686 - 27988505
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27988686 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 27988587  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  27988586 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtg-cccgggggcaccggttagcag 27988505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28045988 - 28045807
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28045988 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 28045889  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  28045888 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtg-cccgggggcaccggttagcag 28045807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30675758 - 30675578
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30675758 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 30675659  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30675658 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagcag 30675578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 34228682 - 34228863
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||       ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34228682 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 34228781  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  34228782 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcag 34228863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 109 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33357316 - 33357149
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33357316 agggaaatgctaactggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 33357217  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggg 276  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33357216 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaactagtgccccggg 33357149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 168465 - 168647
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168465 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 168564  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  168565 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccattttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcag 168647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 11112638 - 11112820
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11112638 agggaaatgctaactggtgcatccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 11112737  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| || |||  ||| |||||||||    
T  11112738 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcacttttatggtatgcttaacctgtgccctgggggcactggttagcag 11112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 112 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20831737 - 20831558
Alignment:
Q  112 gaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20831737 gaaatgctaaccggtgcccccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtataattaatttataataaa 20831638  T
Q  212 gtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg-tcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20831637 gtcaaaagcagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgctcccggga-caccggttagcag 20831558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 110 - 290
Target Start/End: Original strand, 29235235 - 29235415
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||| || ||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29235235 gggaaatgctaaccggtgttcccggagcattgattaaggatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattaaatttgtgtaattaatttataata 29235334  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    || ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29235335 aaatcaaaaataggttccttttatgataataatttccttttataggatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 29235415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 110 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2805446 - 2805267
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    |||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2805446 gggaaatgttaaccagtgcccccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaacctataata 2805347  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||    
T  2805346 aagtcaaaagcagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagc 2805267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 108 - 287
Target Start/End: Original strand, 12203853 - 12204031
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12203853 tagggaaatgctaaccggtgcccccgggt-accggttaagggtatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 12203951  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggtta 287  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12203952 taatgtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgctgaaccagtgtcccggggacatcggtta 12204031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 108 - 287
Target Start/End: Original strand, 12448281 - 12448459
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12448281 tagggaaatgctaaccggtgcccccgggt-accggttaagggtatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 12448379  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggtta 287  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12448380 taatgtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgctgaaccagtgtcccggggacatcggtta 12448459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4537931 - 4537749
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4537931 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatataaaataggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaattgataat 4537832  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |   |||||||||||||    
T  4537831 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacctgtgccccagaggcaccggttagcag 4537749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29444323 - 29444161
Alignment:
Q  113 aaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 212  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29444323 aaatgttaaccggtgctcccggggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaacgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 29444224  T
Q  213 tcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgg 275  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29444223 tcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtgtcccgg 29444161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 111 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16888728 - 16888549
Alignment:
Q  111 ggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 210  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16888728 ggaaatgctaaccggtgcccccggg-cacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 16888630  T
Q  211 agtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  16888629 agtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttgtggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcag 16888549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16394247 - 16394057
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |        |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  16394247 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataata 16394148  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca-gacccaatt 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16394147 aagtcaaaaacagtttccttttatgctaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggacccaatt 16394057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Original strand, 21595848 - 21596025
Alignment:
Q  111 ggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 210  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||       |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21595848 ggaaatgctaaccggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaattatataggagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 21595946  T
Q  211 agtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagc 289  Q
     ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  21595947 tgtcaaaaacagtttccttttatggtattaattcccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggagacactggttagc 21596025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9537982 - 9537829
Alignment:
Q  138 actggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgata 237  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||    
T  9537982 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaattcaaaaggagtttctttttatagta 9537883  T
Q  238 ataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9537882 ataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggagacaccggttagcag 9537829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 305
Target Start/End: Original strand, 43119212 - 43119412
Alignment:
Q  105 aattagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaattta 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43119212 aattagggaaatgctaaccggtgccctcggggcactgattaaagatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaattta 43119311  T
Q  205 taataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca-gacccaattaatt 303  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  43119312 taataaagtcaaaaacagttttcttttatggtgataattctcttttatggtatgcttaaccaatggcccggg-gcaccggttagcaggacccaattaatt 43119410  T
Q  304 aa 305  Q
    ||    
T  43119411 aa 43119412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9063238 - 9063057
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9063238 agggaaatgctaaccggtg-tcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatcgtgcaattaatttataat 9063140  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  9063139 aaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttgtgatatgcttaaccagtgccccggaagcaccggttagcag 9063057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 290
Target Start/End: Original strand, 4648194 - 4648374
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4648194 agggaaatgctaaccggtg-tcccggggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataat 4648292  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    || ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  4648293 aatgtcaaaaacagtttcttttgatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagtatcttgggagcaccggttagca 4648374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7304653 - 7304526
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  7304653 aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgaaaataattctcttttatggtatgct 7304554  T
Q  261 taaccagtgtcccgggaacaccggttag 288  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||||    
T  7304553 taaccagtgctccgggggcaccggttag 7304526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 291
Target Start/End: Original strand, 28626818 - 28626948
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28626818 gaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtgattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttatgataataattcccttttatggtatgc 28626917  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  28626918 ttaatcagtgt-ccgggagcaccggttagcag 28626948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 274
Target Start/End: Original strand, 36730441 - 36730608
Alignment:
Q  106 attagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttat 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36730441 attaggggaatgctaactggtgc-cccaggacactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttat 36730539  T
Q  206 aataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccg 274  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  36730540 aataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatagtatgcttaacctgtgccccg 36730608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 291
Target Start/End: Original strand, 13643015 - 13643192
Alignment:
Q  113 aaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13643015 aaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatacgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaag 13643114  T
Q  213 tcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||  |  ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||    
T  13643115 tcaaaa-aaaattccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccctaggagcaccggttagcag 13643192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 291
Target Start/End: Original strand, 13743440 - 13743617
Alignment:
Q  113 aaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13743440 aaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatacgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaag 13743539  T
Q  213 tcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||  |  ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||    
T  13743540 tcaaaa-aaaattccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccctaggagcaccggttagcag 13743617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9254067 - 9253903
Alignment:
Q  130 cccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttcctt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9254067 cccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattttatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatg-ataataaagtcaaaaacagtttcctt 9253969  T
Q  230 ttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcagaccc 295  Q
    ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  9253968 ttatagtaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgtcccaggggcaccggttagcagaccc 9253903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 275
Target Start/End: Original strand, 37373206 - 37373370
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37373206 gggaaatgctaaccggtgcccccgga-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 37373304  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgg 275  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37373305 aagtcgaaaacagttttcttttatggtaataattccctttcatggtatgcttaacccgtgtcccgg 37373370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3930369 - 3930238
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3930369 gaaattatatagtagttaatgcattgaagttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttttgataataatttccttttatgatatgc 3930270  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||| ||| || || |||||||    
T  3930269 ttaaccagtgccccaggagcatcgattagcag 3930238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Original strand, 16785086 - 16785241
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||       |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16785086 agggaaatgctaaccggtgctccaggg-cactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagcagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 16785184  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaacc 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  16785185 aaagtcaaaaacagtttccttttataataataattctcttttatggtatgattaacc 16785241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 124 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 42035153 - 42034988
Alignment:
Q  124 ggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagt 223  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  42035153 ggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaat 42035054  T
Q  224 ttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagc 289  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||||||    
T  42035053 tttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacacgtgccccagagacaccggttagc 42034988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16890616 - 16890485
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  16890616 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgc 16890517  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||| ||| | | ||  |||||||||||||    
T  16890516 ttaaccggtgcctccggggcaccggttagcag 16890485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 173 - 291
Target Start/End: Original strand, 39406905 - 39407021
Alignment:
Q  173 agttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcc 272  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  39406905 agttaatgcgttaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaactagtgccc 39407004  T
Q  273 cgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  39407005 cggg--caccggttagcag 39407021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Original strand, 32113958 - 32114068
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagttt-ccttttatgataataatttccttttatggtatg 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32113958 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtttaattaatttataataaagtaaaaaacagtttcccttttatgataataattcccttttatagtatg 32114057  T
Q  259 cttaaccagtg 269  Q
     ||||||||||    
T  32114058 tttaaccagtg 32114068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24843393 - 24843285
Alignment:
Q  182 attgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacac 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||| |  ||||| |||    
T  24843393 attgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatcagtttccttttatgacaataattctcttttatggtatgcttaatcagtat-tcgggagcac 24843295  T
Q  282 cggttagcag 291  Q
    ||||||||||    
T  24843294 cggttagcag 24843285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 42433679 - 42433583
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtat 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42433679 gaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataatttccttttttggtat 42433583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Original strand, 10870403 - 10870495
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatg 253  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10870403 aaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatg 10870495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 40831328 - 40831426
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  40831328 aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattttcttttatagtatgc 40831426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 215
Target Start/End: Original strand, 9278206 - 9278317
Alignment:
Q  104 taattagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaattt 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9278206 taataagggaaatgctaactggtgcctcagggacactcgttaaagatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattt 9278305  T
Q  204 ataataaagtca 215  Q
    ||||||||||||    
T  9278306 ataataaagtca 9278317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 218
Target Start/End: Original strand, 34192825 - 34192883
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34192825 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaa 34192883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 249
Target Start/End: Original strand, 22451835 - 22451922
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttt 249  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22451835 aaattatatagcagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaatagcttccttttatggtaataatttccttt 22451922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 250
Target Start/End: Original strand, 22956767 - 22956845
Alignment:
Q  172 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttcctttt 250  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  22956767 tagttaatacattaaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaaaaattccctttt 22956845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 243
Target Start/End: Original strand, 17467668 - 17467736
Alignment:
Q  175 ttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  17467668 ttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaaatcaaaaacaatttccttttactataataatt 17467736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30933453 - 30933376
Alignment:
Q  164 ttatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataat 242  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||| |||||||||    
T  30933453 ttatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagttaaaaacatttttcttttacgataataat 30933376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 39751658 - 39751498
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggat-atnnnnnnngaaattatatactagttaatgcatt-gaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||        |||||||||| || ||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  39751658 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggataataaaaaggaaaattatatattatttattgcattaaaaattgtttaattaatctataa 39751559  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
      ||||||| |  |  ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  39751558 ataagtcaaca-aaacttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtg 39751498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36057967 - 36057897
Alignment:
Q  182 attgaaattgtgtaattaatttataataa--agtcaaaagcagtttccttttatgataataatttcctttt 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36057967 attgaaattgtataattaatttataaaaagtagtcaaaaaaagttttcttttatgataataatttcctttt 36057897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 215
Target Start/End: Original strand, 10618069 - 10618123
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtca 215  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10618069 aaattatatagtagttaatgcaattaaattgtgtaattaattgataataaagtca 10618123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 187
Target Start/End: Original strand, 12652630 - 12652707
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaa 187  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12652630 gggaaatgctaaccggtgcccctggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaa 12652707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43714373 - 43714194
Alignment:
Q  111 ggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggata-tnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |       ||||||||||  || ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||     
T  43714373 ggaaacgctaaccggtgcccccggggcactggtta-ggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatctataaa 43714275  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
     ||||||| |  | || ||||||||| ||| |||||  |||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  43714274 taagtcaacaaaactt-ccttttatggtaaaaatttattttttttgtatgcttaaccagtgcccccgggacaccggttagca 43714194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 287
Target Start/End: Original strand, 40268036 - 40268099
Alignment:
Q  224 ttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggtta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||| ||| |||| ||||    
T  40268036 ttccttttatgataataatttcctttttttgtatgtttaacccgtgccccaggagcaccagtta 40268099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Original strand, 10618125 - 10618179
Alignment:
Q  237 aataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||    
T  10618125 aataattaccttttatggtatgcttaacccgtgtctccggggcaccggttagcag 10618179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14191103 - 14191037
Alignment:
Q  203 tataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||    
T  14191103 tataataaaatcaaaaacagttttattttatgataataattctcttttatagtatttttaaccagtg 14191037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 290
Target Start/End: Original strand, 29566819 - 29566881
Alignment:
Q  228 ttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||    
T  29566819 ttttatgataagaatttcctttttttgtatgcttaaccactgccccgagagcaccgattagca 29566881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Original strand, 29566700 - 29566741
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggata 151  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29566700 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcacgggttaaggata 29566741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 259 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36696536 - 36696508
Alignment:
Q  259 cttaaccagtgtcccgggaacaccggtta 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36696536 cttaaccagtgtcccgggaacaccggtta 36696508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 287
Target Start/End: Original strand, 39206303 - 39206363
Alignment:
Q  227 cttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggtta 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| ||  |||||||||    
T  39206303 cttttatgataaaaatttcctttttttgtatgcttaaccggtgcccccggggcaccggtta 39206363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 29591188 - 29591370
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29591188 agggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaagaatatgaataaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtacttaatttataat 29591287  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||    
T  29591288 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattaccttttatggtatgcttaactagtgccccgggggcaccggttagcag 29591370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 54897308 - 54897489
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54897308 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgagaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 54897407  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  54897408 aagtcaaaaacaatttccttttatggtaataatttccttttatggtatgtttaaccagtgtcccggaggcaccggttagcag 54897489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 275
Target Start/End: Original strand, 32217045 - 32217209
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32217045 gggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 32217144  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgg 275  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32217145 aagtcaaaaacagttt-tttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacctgtgccccgg 32217209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 789717 - 789558
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  789717 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcacgggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 789618  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagt 268  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  789617 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagt 789558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 290
Target Start/End: Original strand, 43944506 - 43944686
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43944506 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 43944605  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  43944606 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttgtatggtatgcttaaccagtg-cccgagggcaccggttagca 43944686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 160 - 291
Target Start/End: Original strand, 36395149 - 36395280
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36395149 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatgataataattcccttttatggtatgc 36395248  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| || |||  |||| ||||||||    
T  36395249 ttaaccagtgccctgggggcaccagttagcag 36395280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 269
Target Start/End: Original strand, 50619089 - 50619245
Alignment:
Q  113 aaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50619089 aaatgctaactggtgctcccggggcactgattaagaatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtacttaatttataataaag 50619188  T
Q  213 tcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50619189 taaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtg 50619245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4269010 - 4268827
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||       |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4269010 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa 4268911  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||    
T  4268910 taatgtcaaaaacagtttctttttatggtaataattcccttttatggtatgattaaccagtgccccgagggcaccggttagcag 4268827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 12356243 - 12356425
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |  |||||||||||||||       ||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  12356243 agggaaatgctaaccggtgcccctgagatactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattatataattaatttataat 12356342  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  12356343 aaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgttccgggggcaccggttagcag 12356425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 16536047 - 16536229
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| |||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16536047 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcacggattaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 16536146  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  16536147 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtattcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcag 16536229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19503306 - 19503137
Alignment:
Q  94 tcaatgaaattaattagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtg 193  Q
    ||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19503306 tcaatgaaaattataatggaaatgctaaccggtgctcccgggt-actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatactagttaatacattgaaattgtg 19503208  T
Q  194 taattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaac 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19503207 taattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttattgtaataattcccttttatggtatgcttaac 19503137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 54656062 - 54655882
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54656062 gggaaatgttaactggtgttccgggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataata 54655963  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  54655962 aagtcaaaaacaattttcttttaggataataattctctcttatgatatgcttaaccagtgtcccggg-gcaccggttagcag 54655882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32202666 - 32202504
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32202666 gggaaatgttaaccggtgtccccggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 32202567  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtccc 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  32202566 aagtcaaaaacagtttccttttatgataataa-ttccttttatgatatgcttaatcaatgtccc 32202504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 6164093 - 6164274
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6164093 agggaaatgataaccggtgctcttggggcactggttaaggatatcaaaaga-aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 6164191  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  6164192 aaagcaaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtaccccgaggacaccggttagcag 6164274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18068067 - 18067885
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18068067 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatca 18067968  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||  ||||||||||||    
T  18067967 taatgtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagca 18067885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47232059 - 47231881
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  47232059 agggaaatgctaaccggtgcccccggagcactggttaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataat 47231960  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggtta 287  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||| | |||||||||    
T  47231959 aaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaaccaataccccggaagcaccggtta 47231881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 291
Target Start/End: Original strand, 4089140 - 4089323
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||| |||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4089140 tagggaaatgctaaccggtgcccctggggcactgattaagggtatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 4089239  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| ||  |||| ||||||||    
T  4089240 taatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccccaggggcaccagttagcag 4089323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42898934 - 42898757
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    |||||||||| |||  |||||| || |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42898934 tagggaaatgttaatcggtgcttccagggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 42898835  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttcctttta--tgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccg 283  Q
    |||||||||||  |||||| |||||  || ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42898834 taaagtcaaaaatagtttctttttatgtggtaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgtcccggggacaccg 42898757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 43202570 - 43202389
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||       ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43202570 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactagttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattaaaattgtgtaattaatttataat 43202471  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  43202470 aatgtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtaagcttaaccagtg-cccgggggcaccggttagcag 43202389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Original strand, 15186242 - 15186389
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15186242 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatccattgaaattgtgtaattaatttataat 15186341  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggta 256  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  15186342 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccattttatggta 15186389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 7768937 - 7769119
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7768937 agggaaatgctaatcggtacccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 7769036  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || || |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  7769037 aatgttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggcatacttaacccgtgccccgggggcaccggttagcag 7769119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33108859 - 33108678
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| ||||       ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  33108859 agggaaatgttaaccggtgcctccggggcactggttaag-atatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaatagtataattaattgataat 33108761  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||    
T  33108760 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcag 33108678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 175 - 291
Target Start/End: Original strand, 16820917 - 16821033
Alignment:
Q  175 ttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccg 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16820917 ttaatgcattgaaattctgtaattaacttataataaagtcatacgcagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccg 16821016  T
Q  275 ggaacaccggttagcag 291  Q
    ||  |||||||||||||    
T  16821017 ggggcaccggttagcag 16821033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 28755621 - 28755799
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28755621 gggaaatgctaaccggtg-tcccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 28755719  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||    
T  28755720 aagttagaaacagtttccttttatgataat-acttccttttatagtatgcttaacccatgccccgag-acaccggttagcag 28755799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30387270 - 30387138
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||    
T  30387270 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatgatatgc 30387171  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcaga 292  Q
    |||| || |  || || ||||||||||||||||    
T  30387170 ttaatcaataccctggaaacaccggttagcaga 30387138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5091797 - 5091617
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||        |||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5091797 agggaaatactaaccggtactcccggggcactggttaagaatatgaaaaataaaattatataataattaatatattaaaattgtgtaattaatttataat 5091698  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5091697 aaagtcataaacagtttccttttatagtaataattcccttttat-gtatgcttaaccagtgt-ccgggagcaccggttagcag 5091617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3783687 - 3783507
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||  ||||       ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  3783687 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcaccggttaaacatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtttaattaattgataata 3783588  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgctta---accagtgtcccgggaacaccggtta 287  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || |||| ||||||| |||||||||    
T  3783587 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaagtactagtgccccgggagcaccggtta 3783507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24679827 - 24679671
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24679827 gggaaatgctaaccggtg-tctcggggcactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataata 24679729  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagt 268  Q
    |||| |||| || ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  24679728 aagttaaaaacaatttcc-tttatggtaataattctcttttatggtatgcttaatcagt 24679671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30154299 - 30154168
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||    
T  30154299 gaaattatatagtagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataataaaatcaaaaacaatttccttatatgataataattctcttttatggtgtgc 30154200  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  30154199 ttaaccagtgccccgaaaacatcggttagcag 30154168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 263
Target Start/End: Original strand, 39843957 - 39844060
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  39843957 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttagggtatgc 39844056  T
Q  260 ttaa 263  Q
    ||||    
T  39844057 ttaa 39844060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 54945941 - 54945785
Alignment:
Q  133 ggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttcctttta 232  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  54945941 ggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagcagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttcgtttta 54945842  T
Q  233 tgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || | |||||| | ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  54945841 tggt-ataattcctttttatggtatacttaaccagtg-ctccggaacaccggttagcag 54945785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 264
Target Start/End: Original strand, 4220245 - 4220348
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4220245 gaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatg-taataattcccttttatggtatgc 4220343  T
Q  260 ttaac 264  Q
    |||||    
T  4220344 ttaac 4220348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 291
Target Start/End: Original strand, 50603277 - 50603409
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcag-tttccttttatgataataatttccttttatggtatg 258  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  50603277 gaaattgtataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttttttttatgataataattctcttttatggtatg 50603376  T
Q  259 cttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||    
T  50603377 cttaaccagtaccccgagaacaccagttagcag 50603409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 271
Target Start/End: Original strand, 46148989 - 46149100
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||     
T  46148989 gaaattatataataattaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttctttttatggtaataattctcttttatggtatgt 46149088  T
Q  260 ttaaccagtgtc 271  Q
    ||||||||||||    
T  46149089 ttaaccagtgtc 46149100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 288
Target Start/End: Original strand, 55882682 - 55882860
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||        |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55882682 tagggaaatgctaaccggtgtctccggggcactcgttaaggatatgaaaaaa-aaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 55882780  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttag 288  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||||||||    
T  55882781 taaagtcaaaaacagttttcttttatggtaa-aattcacttttatggtatacttaacccgtgcctcgggggcaccggttag 55882860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46688397 - 46688267
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaa-----ttatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaattt 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||        |||     ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46688397 agggaaatgctaactggtgcccccgaggcactggttaaggatatgaaaaattaaagaaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattt 46688298  T
Q  204 ataataaagtcaaaagcagtttccttttatg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46688297 ataataaagtcaaaagcagtttccttttatg 46688267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 52533972 - 52533816
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||| |||| |||||  || || ||||||||||| ||||       ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  52533972 agggaaatgttaaccggtgcctccaggacactggttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcactgaaattgaataattaattgataat 52533873  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaacc 265  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  52533872 aaagtcgaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacc 52533816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 234
Target Start/End: Original strand, 54054548 - 54054672
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  54054548 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcaccggttaaggatatgaaaaaagaaattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataata 54054647  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatg 234  Q
    ||||||||| || ||||||||||||    
T  54054648 aagtcaaaaacaatttccttttatg 54054672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 266
Target Start/End: Original strand, 37987985 - 37988091
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||    
T  37987985 gaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataatgttaaaaacagtttccttttattgtaataattctcttttatagtatgc 37988084  T
Q  260 ttaacca 266  Q
    |||||||    
T  37988085 ttaacca 37988091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 266
Target Start/End: Original strand, 53268770 - 53268875
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  53268770 gaaattatatattagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacaattttcttttataataataattttcttttttggtatgc 53268868  T
Q  260 ttaacca 266  Q
    |||||||    
T  53268869 ttaacca 53268875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 290
Target Start/End: Original strand, 41265510 - 41265637
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||||||| |    
T  41265510 aaattatatagtagttaatgcagtgaaattgtgtaattaatttataa-aaaatcaaaaacagttttcttttattgtaataattttcttttttggtatgtt 41265608  T
Q  261 taaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  41265609 taaccagtg-cccaggaacaccgtttagca 41265637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 53656014 - 53655905
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  53656014 gaaattatataatagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaataattttattttatggtaataatttcattttatggtatgc 53655915  T
Q  260 ttaaccagtg 269  Q
    |||| |||||    
T  53655914 ttaatcagtg 53655905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31680587 - 31680470
Alignment:
Q  172 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtc 271  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||| |||||| |||||    
T  31680587 tagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttatggtaataattcatttttatgatatgtttaacccgtgtc 31680488  T
Q  272 ccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||  ||||| ||||||||    
T  31680487 ccgg--acacctgttagcag 31680470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 252
Target Start/End: Original strand, 49915213 - 49915301
Alignment:
Q  164 ttatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttat 252  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49915213 ttatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtaaaaaacagtttccttttataataataatttccttttat 49915301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39877371 - 39877268
Alignment:
Q  174 gttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatgg--tatgcttaaccagtgtc 271  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  39877371 gttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttatagtaataattctcttttatggtatatgcttaaccagtgcc 39877272  T
Q  272 ccgg 275  Q
    ||||    
T  39877271 ccgg 39877268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 53004063 - 53003961
Alignment:
Q  189 ttgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttag 288  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  53004063 ttgtgtaattaatgtataataaagtcaaaaataatttccttttaaaataataattctcttttatgatatgcttaatcagtgtccccgggacaccggttag 53003964  T
Q  289 cag 291  Q
    |||    
T  53003963 cag 53003961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 269
Target Start/End: Original strand, 31517217 - 31517325
Alignment:
Q  162 aattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagt-ttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | | ||  ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||    
T  31517217 aattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaagtcaaaaataatgttttttttatggtaataattctcttatatggtatgct 31517316  T
Q  261 taaccagtg 269  Q
    |||||||||    
T  31517317 taaccagtg 31517325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 234
Target Start/End: Original strand, 42815108 - 42815234
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    |||| |||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||       ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42815108 taggaaaatgctaaccggtgctct-ggagtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatcatagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataa 42815206  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttc-cttttatg 234  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  42815207 taaagtcaaaaacagtttctcttttatg 42815234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Original strand, 8133782 - 8133869
Alignment:
Q  185 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtccc 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  8133782 gaaaatgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagttttcttttatggtaataattatcttttat-gtatgtttaaccattgtccc 8133869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17344794 - 17344666
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| | ||||  |||||| ||||||| |||||| || ||||| | |||| |    
T  17344794 gaaattatataatagttaatgcatttaaattatataattaaattataa-aaatttaaaaaaagtttctttttatggtaataactttcttttcttgtatcc 17344696  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  17344695 ttaaacagtgtcccggg-acaccagttagca 17344666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 206
Target Start/End: Original strand, 50167589 - 50167685
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 206  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||        ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50167589 tagggaaatgctaaccggtgttctcggggcactggttaaagatatgaaaaagaaaattatag--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 50167685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28119978 - 28119912
Alignment:
Q  224 ttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  28119978 ttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgccccggagacaccggttagca 28119912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 272
Target Start/End: Original strand, 52697103 - 52697213
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  | ||| | |||||  ||||||||  |||||||| |||| |    
T  52697103 aaattatatagtagttaatacattaaaattatataat-aatttataataaagtcaaaaataattttcctttattgtaataattctcttttatgatatgtt 52697201  T
Q  261 taaccagtgtcc 272  Q
    |||| |||||||    
T  52697202 taacgagtgtcc 52697213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 291
Target Start/End: Original strand, 54054659 - 54054710
Alignment:
Q  240 aatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  54054659 aatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttggcag 54054710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12701957 - 12701917
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaagga 149  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12701957 agggaaatgttaactggtgcccccggggcactggttaagga 12701917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 270
Target Start/End: Original strand, 9964771 - 9964879
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgt-gtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatg 258  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||| | |||||| ||  |||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||    
T  9964771 gaaattatatattaattattgcattgaaatttttgtaattgatcaataaaaaa-tcaaaat-agtttcctttt-tgataataattttctttttcggtatg 9964867  T
Q  259 cttaaccagtgt 270  Q
    ||||||||||||    
T  9964868 cttaaccagtgt 9964879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28120121 - 28120058
Alignment:
Q  224 ttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggtta 287  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  28120121 ttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaacctgtgccccgggggcaccggtta 28120058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37402830 - 37402765
Alignment:
Q  224 ttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  37402830 ttccttttatggtaagaatttccttttttg-tatgcttaaccagtgccccgagggcaccggttagca 37402765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 287
Target Start/End: Original strand, 9012139 - 9012184
Alignment:
Q  242 tttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggtta 287  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  9012139 tttccttttatggtgtgcttaatcagtgtctcggaaacaccggtta 9012184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1432650 - 1432576
Alignment:
Q  195 aattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataat--aatttccttttatggtatgcttaaccagt 268  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||  ||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  1432650 aattaatttataataaaataaaaaacagttt-cttttatgataataaaattctcttttataatatgcttaaccagt 1432576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 49446556 - 49446596
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaagg 148  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  49446556 tagggaaatgttaactggtgcccccggggcactagttaagg 49446596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 108 - 289
Target Start/End: Original strand, 49893329 - 49893510
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49893329 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatctataa 49893428  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagc 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  49893429 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcagtgccccgggggcaccggttagc 49893510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Original strand, 272217 - 272401
Alignment:
Q  107 ttagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 206  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272217 ttagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 272316  T
Q  207 ataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||||    
T  272317 ataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcggtgccccgggggcaccggttagcag 272401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 48725271 - 48725452
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||       ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48725271 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 48725370  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  48725371 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggaccacgggttagcag 48725452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 52520680 - 52520862
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52520680 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 52520779  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  52520780 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcag 52520862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 109 - 290
Target Start/End: Original strand, 18014671 - 18014852
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18014671 agggaaatgctaactggtgcccccggggcactgattaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaaactataat 18014770  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||    
T  18014771 aaagttaaaaacagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaatcagtgccccgggggcaccagttagca 18014852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 39074419 - 39074599
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39074419 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 39074518  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  39074519 atgtcaaaa-cagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcag 39074599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 46352633 - 46352815
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46352633 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 46352732  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||    
T  46352733 aaagtcagaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcag 46352815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 295
Target Start/End: Original strand, 41304002 - 41304188
Alignment:
Q  107 ttagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 206  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||       ||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  41304002 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggggcagtggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgt--aattaattgata 41304099  T
Q  207 ataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcagaccc 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  41304100 ataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccaatgccccggagacaccggttagcagaccc 41304188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 109 - 289
Target Start/End: Original strand, 858588 - 858768
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  858588 agggaaatgcaaaccggtgcccccagtgcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 858687  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagc 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  858688 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagc 858768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 108 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 41554127 - 41553948
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41554127 taggaaaatgctaactggtgc-cccggtgcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 41554029  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttag 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||    
T  41554028 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattattttttatggtatgcttaacaagtgccctgggaacaccgattag 41553948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 111 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 42964434 - 42964254
Alignment:
Q  111 ggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 210  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42964434 ggaaatgttaactggtgcttccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattttatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 42964335  T
Q  211 agtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  42964334 agtcaaaaacagttttcttttatagtaataattcacttttatgatatgcttaaccagtgtctcagggacaccggttagcag 42964254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 4168183 - 4168364
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4168183 gggaaatgctaaccggtgcctccggggaactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataata 4168282  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||    
T  4168283 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaacccgtaccccgggggcaccggttagcag 4168364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 43786871 - 43787052
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | |||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43786871 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 43786970  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  43786971 atatcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcag 43787052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10617469 - 10617289
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10617469 gggaaatgttaaccggtgcccccgga-cactgattaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataata 10617371  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  10617370 aagtcaaaaacaatttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagcag 10617289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 269
Target Start/End: Original strand, 28139309 - 28139468
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||       ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28139309 gggaaatgctaactggtgcccccaagacactggttaaggatatgaaaaaagaaattaaatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 28139408  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  28139409 aagtcaaaagcagattccttttatggtaataattcccttttatggtatacttaaacagtg 28139468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 40362767 - 40362600
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40362767 agggaaatgctaacccgtgcctccggggcactgattaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaattgataat 40362668  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggg 276  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40362667 aaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccggg 40362600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 272
Target Start/End: Original strand, 20923992 - 20924154
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||       ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20923992 gggaaatgctaaccggtgcttccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaattcattgaaattgtgtaattaatttataata 20924091  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcc 272  Q
    |  |||||| ||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20924092 atatcaaaaacagtttccttttaaggtaataattctcttttatggtatacttaaccagtgtcc 20924154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 167 - 291
Target Start/End: Original strand, 6842676 - 6842800
Alignment:
Q  167 tatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaacca 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6842676 tataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatggtatgcttaacca 6842775  T
Q  267 gtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||| ||||||  || ||||||||||    
T  6842776 gtgccccgggggcagcggttagcag 6842800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 291
Target Start/End: Original strand, 7468431 - 7468590
Alignment:
Q  130 cccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttcctt 229  Q
    |||||| ||||||||||||| ||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7468431 cccgggacactggttaaggaaatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaagcagttttctt 7468530  T
Q  230 ttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  7468531 ttatgataataa-tcccttttatggtatgcttaatcagtg-ccccggagcaccggttagcag 7468590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 52246582 - 52246763
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52246582 gggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagttgttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 52246681  T
Q  210 aagtcaaaagc-agtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| | | |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||| ||||||||    
T  52246682 aagtcaaaaacaattttttttttatagtaataatttccttttatggtatgcttaactagtg-cccgagagcaccagttagcag 52246763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 162 - 290
Target Start/End: Original strand, 33140937 - 33141065
Alignment:
Q  162 aattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgctt 261  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  33140937 aattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatggtaataattcccttttatgatatgctt 33141036  T
Q  262 aaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    || ||||  ||||| | ||||||||||||    
T  33141037 aatcagtaccccggaagcaccggttagca 33141065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 53489990 - 53489845
Alignment:
Q  130 cccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttcctt 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  53489990 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 53489891  T
Q  230 ttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgg 275  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || |||||    
T  53489890 ttatgataataattctattttatggtatgcttaaccaatgccccgg 53489845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 295
Target Start/End: Original strand, 42548145 - 42548279
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  42548145 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttcattttatggtaataattcccttttatggtatgc 42548244  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcagaccc 295  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  42548245 ttaaccagtgctccggg-acaccggttagcaaaccc 42548279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 49529435 - 49529274
Alignment:
Q  130 cccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagt---taatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttc 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||        |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  49529435 cccggggcactgattaaggatatgaaaaagaaaattatatactagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacattttc 49529336  T
Q  227 cttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||    
T  49529335 cttttatggtaataatttccttttatggtatgtttaaccagtg--ccgggggcaccggttagca 49529274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 50359368 - 50359195
Alignment:
Q  113 aaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 212  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||         |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  50359368 aaatgctaactggtgc-cccgtggcactggttaaggttaagaaaaaaaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgggtaattaatatataataaag 50359270  T
Q  213 tcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggtta 287  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  50359269 tcaaaaacagttttcttttgtggtaataattatcttctatggtatgcttaaccagtgtcccggaagcaccggtta 50359195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 13159891 - 13160055
Alignment:
Q  104 taattagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaattt 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||||||       ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  13159891 taataagggaaatgctaaccggtgctcctggggttctagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaattg 13159990  T
Q  204 ataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagt 268  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13159991 ataataaagtcaaaaacagttttctattacggtaataatttctttttatggtatgcttaatcagt 13160055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Original strand, 2505399 - 2505508
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  2505399 gaaattatatagtagttagtgcattgaaattgtgtaattaattcataataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgt 2505498  T
Q  260 ttaaccagtg 269  Q
    ||||||||||    
T  2505499 ttaaccagtg 2505508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 50299080 - 50298973
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||    
T  50299080 aaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttatgataataattcactcttatggtatact 50298981  T
Q  261 taaccagt 268  Q
    ||||||||    
T  50298980 taaccagt 50298973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 43269899 - 43269744
Alignment:
Q  136 gcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatga 235  Q
    |||||||||||||||||       ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||      
T  43269899 gcactggttaaggatatgaaaagggaaattacatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaaatcaaacacagtttccttttatag 43269800  T
Q  236 taataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||    
T  43269799 taataattatcctttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcag 43269744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 11308397 - 11308216
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  11308397 agggaaatgctaaccggtgtttccgggacactgattaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataat 11308298  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||| |||||||    
T  11308297 aaaatcaaaaatagtttccttttatggtaataa-ttccttttatggtatgcttaaccaatgccccaggggcaccgattagcag 11308216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41993755 - 41993652
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  41993755 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttccttttat-ataataattctcttttatggtatgc 41993657  T
Q  260 ttaac 264  Q
    |||||    
T  41993656 ttaac 41993652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 263
Target Start/End: Original strand, 29241687 - 29241790
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  29241687 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagattctttttatgataataattccgttttatagtatgc 29241786  T
Q  260 ttaa 263  Q
    ||||    
T  29241787 ttaa 29241790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 2938175 - 2938045
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  2938175 aaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtgattaatttataataaagtcaaaaacaatttcattttatggtaataattcacttttatggtatgct 2938076  T
Q  261 taaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||| |||  |||| |  |||||||||||||    
T  2938075 taacgagtaccccgagggcaccggttagcag 2938045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 175 - 277
Target Start/End: Original strand, 38852282 - 38852384
Alignment:
Q  175 ttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccg 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  38852282 ttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttattttatgataataattcacttttatggtatgtttaacccgtgccccg 38852381  T
Q  275 gga 277  Q
    |||    
T  38852382 gga 38852384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 258
Target Start/End: Original strand, 2119431 - 2119577
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    |||||||| |||| ||||  | || |||||||||||| |||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2119431 gggaaatgttaaccggtgtcctcgaggcactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgagtaattaatttataata 2119530  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatg 258  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2119531 aagtcaaaaacaatttccttttatg-taataa-ttccttttatggtatg 2119577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 266
Target Start/End: Original strand, 22248910 - 22249042
Alignment:
Q  134 gggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttat 233  Q
    ||||||| |||||||||||       ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22248910 gggcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttattgtattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttat 22249009  T
Q  234 gataataatttccttttatggtatgcttaacca 266  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22249010 ggtaataattcccttttatagtatgcttgacca 22249042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 287
Target Start/End: Original strand, 24488416 - 24488543
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||||    
T  24488416 gaaattatataatagttaatgcatggaaatagtgtaattaattgataataaaatcaaaaacagtttctttttatggtaataattctcttttatgatatgc 24488515  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggtta 287  Q
    | ||| ||||  |||||| |||||||||    
T  24488516 tgaactagtgctccgggagcaccggtta 24488543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 50395742 - 50395591
Alignment:
Q  116 tgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtca 215  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||        |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50395742 tgctaaccggtgcccccgggacactggttagggatatgaaaaagaaaattatacagtagttaatgcatagaaattgtgtaattaattgataataaagtca 50395643  T
Q  216 aaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagt 268  Q
    ||| || |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  50395642 aaa-caatttccttttatggtaataattctcttttatgatatgattaatcagt 50395591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 268
Target Start/End: Original strand, 31514842 - 31514948
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||    
T  31514842 aaattatatagtagttaatgtattaaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaaacaattt-tttttatagtaataatttccttttatagtatact 31514940  T
Q  261 taaccagt 268  Q
    ||||||||    
T  31514941 taaccagt 31514948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Original strand, 52552549 - 52552652
Alignment:
Q  185 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccgg 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| |||    
T  52552549 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtat-cttttatggtaataattctcttttatggtatatttaaccagtgt-ccggggacatcgg 52552646  T
Q  285 ttagca 290  Q
    ||||||    
T  52552647 ttagca 52552652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Original strand, 21010047 - 21010173
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||| |  ||| |    
T  21010047 gaaattatatagtagttaa--cattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcaaaaa-agtttctttttatggtaataacttccttttttaatatcc 21010142  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||| | | |||| ||||||||||||||||    
T  21010143 ttaacaaatatccctggaacaccggttagca 21010173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 234
Target Start/End: Original strand, 2362882 - 2362955
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatg 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  2362882 gaaattatata-tagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaaatcaaaaacagttttcttttatg 2362955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 268
Target Start/End: Original strand, 25743860 - 25743967
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatg 258  Q
    ||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  25743860 gaaattatatagtaattattgcattaaaaattgtgtaattaattcataa-aaagtcaaaatc-gtttcattttttagtaataatttccttttttggtatg 25743957  T
Q  259 cttaaccagt 268  Q
    ||||||||||    
T  25743958 cttaaccagt 25743967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 209
Target Start/End: Original strand, 6842605 - 6842642
Alignment:
Q  172 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6842605 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 6842642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 266
Target Start/End: Original strand, 53054869 - 53054959
Alignment:
Q  175 ttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaacca 266  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||  || ||| |||||  |||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  53054869 ttaatgcattgagattgtgtaatttatctataataaagccaaaaatag-ttcattttacaataataattctcttttatagtatgtttaacca 53054959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 152
Target Start/End: Original strand, 2362801 - 2362843
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatat 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2362801 gggaaatgctaaccggtgctcccggtgcaatggttaaggatat 2362843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 205
Target Start/End: Original strand, 6842636 - 6842674
Alignment:
Q  167 tatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttat 205  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6842636 tataatagttaattcattgaaattgtgtaattaatttat 6842674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 268
Target Start/End: Original strand, 17752762 - 17752842
Alignment:
Q  186 aaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagt 268  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  17752762 aaattgtgtaattaatttataa-aatgtcataat-agttttcttttacaataataattcccttttttggtatgcttaatcagt 17752842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 268
Target Start/End: Original strand, 19054082 - 19054162
Alignment:
Q  186 aaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagt 268  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  19054082 aaattgtgtaattaatttataa-aatgtcataat-agttttcttttacaataataattcccttttttggtatgcttaatcagt 19054162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 189
Target Start/End: Original strand, 23925280 - 23925359
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaat 189  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||       ||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  23925280 gggaaatgctaactggtacccccggggaactggttaagaatataaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattaaaat 23925359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 291
Target Start/End: Original strand, 2362948 - 2362993
Alignment:
Q  246 cttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  2362948 cttttatggtatgcttaatcagtgccccggaaacatcggttagcag 2362993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 195
Target Start/End: Original strand, 52718167 - 52718252
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgta 195  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  52718167 agggaaatactaatcggtgctcccgga-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattaaaattgtgta 52718252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1391364 - 1391183
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1391364 agggaaatgctaaccggtgctcc-ggggtactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataat 1391266  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1391265 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgttccaggaacaccggttagcag 1391183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32929695 - 32929513
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||       ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32929695 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcaatggttaagggtatgaaaaaggaaattatatattaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 32929596  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  32929595 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcag 32929513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 392096 - 392277
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  392096 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 392195  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  392196 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcag 392277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 112 - 296
Target Start/End: Original strand, 2350654 - 2350838
Alignment:
Q  112 gaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2350654 gaaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaa 2350753  T
Q  212 gtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcagaccca 296  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||    
T  2350754 gtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagtaccccggagacaccggttagcataccca 2350838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32985376 - 32985197
Alignment:
Q  113 aaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 212  Q
    |||||| ||| ||||| | ||||||| |||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32985376 aaatgcaaaccggtgccctcggggcattggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaag 32985277  T
Q  213 tcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcaga 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  32985276 tcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaga 32985197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 4215694 - 4215876
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  |||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215694 agggaaatgttaaccggtgcccccggggcactggttaagagtatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 4215793  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||    
T  4215794 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcatcggttagcag 4215876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 23402137 - 23402319
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23402137 agggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgaaattaatttataat 23402236  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||    
T  23402237 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattaccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcag 23402319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12145303 - 12145122
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12145303 gggaaatgctaaccggtgcccccagtgcacttgttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 12145204  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||    
T  12145203 aagtcaaaaacagtttccttttatgataataatttccttttatagtatgcttaaccagtgctccggaggcaccggttagcag 12145122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18276801 - 18276617
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18276801 agggaaatgttaactggtgc-ccctgggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaatttgtgtaattaatttataat 18276703  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatgg---tatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  18276702 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtattatgcttaaccagtgcccctggggcaccggttagcag 18276617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 3515765 - 3515947
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515765 agggaaatgctaaccggtgcccccagggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 3515864  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| ||  |||||||||||||    
T  3515865 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacctgtgccccaggggcaccggttagcag 3515947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29451302 - 29451146
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29451302 tagggaaatgctaactggtgcctccggg-caccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaaattataa 29451204  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaacc 265  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29451203 taaagtcaaacacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacc 29451146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7851346 - 7851191
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||        |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7851346 agggaaatgctaaccggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatgcattaaaattgtgtaattaatttataat 7851247  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaac 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7851246 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaac 7851191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 290
Target Start/End: Original strand, 27433490 - 27433672
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27433490 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatca 27433589  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||  ||||||||||||    
T  27433590 taatgtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagca 27433672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26467288 - 26467130
Alignment:
Q  132 cggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttcctttt 231  Q
    |||||||| ||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26467288 cggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttcctttt 26467189  T
Q  232 atgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  26467188 atggtaataattcccttttatggtatgtctaaccagtgccccggaggcaccggttagca 26467130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 35043890 - 35044055
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35043890 gggaaatgctaactggtgtccacgggacactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaattcattgaaattgtgta-ttaatttataata 35043988  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggg 276  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35043989 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccggg 35044055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 2580952 - 2581133
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |  | || ||||||||| |||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2580952 gggaaatgctaaccggtgcccttgaggtactggttaatgatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataata 2581051  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  2581052 aagtcaaaaataatttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaataccccgggagcaccggttagcag 2581133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3026194 - 3026014
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||       ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3026194 agggaaatgctaactggtgcccc--gggcactggttaagggtatgaaaaatgaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataat 3026097  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || ||||||| |||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||    
T  3026096 aatgtcaaaaacagttttcttttatcgtaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgtcccgagggcaccggttagcag 3026014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 12525718 - 12525900
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||       ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12525718 agggaaatgctaaccggtgcctccggggtactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaaatgtgtaattaatttataat 12525817  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || ||||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| || | ||||||||||||    
T  12525818 aatgtcaaacacagtttcattttatggtaataattcccttttatgatatgcttaactagtgccccagggataccggttagcag 12525900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25165549 - 25165418
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| | |||||    
T  25165549 gaaattatatagtagttaatatattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttacgatatgc 25165450  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||||||    
T  25165449 ttaaccaatgccctgggagcaccggttagcag 25165418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11115261 - 11115098
Alignment:
Q  130 cccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttcctt 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| |||    
T  11115261 cccgaggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataa--tcaaaaatagttttctt 11115164  T
Q  230 ttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcagaccca 296  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  11115163 ttatggtaataattcccttttatgatatgtttaaccagtgccccggg-acaccggttagtagaccca 11115098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21878533 - 21878358
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||||  || |||||| ||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21878533 gggaaatgctaaccggtgcctcccgggcacgggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatttaattaatttataata 21878434  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||      ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21878433 aagtcaaaaacagtttctttttatggtaataattccct------gtatgtttaaccagtgccccaggaacaccggttagcag 21878358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 234
Target Start/End: Original strand, 20897947 - 20898072
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20897947 agggaaatgctaaccggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 20898046  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatg 234  Q
    ||||||| || |||||||||||||||    
T  20898047 aaagtcagaaacagtttccttttatg 20898072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 265
Target Start/End: Original strand, 961059 - 961164
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  961059 gaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacaatttccttttatgataataattctcttttatggtatgc 961158  T
Q  260 ttaacc 265  Q
    ||||||    
T  961159 ttaacc 961164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1840407 - 1840253
Alignment:
Q  136 gcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatga 235  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||     
T  1840407 gcactggttaaggatataaaaaaagaaattatataataattaatgtattaaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttcctttcatgg 1840308  T
Q  236 taataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  1840307 taataattcccttttatgatatgtttaaccagtgccctagaaacaccggttagca 1840253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34852030 - 34851854
Alignment:
Q  114 aatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagt 213  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34852030 aatgctaaccggtgctcctgggacactg-ttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattgatttataataaagt 34851932  T
Q  214 caaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||  | |||||||||||  ||||||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||    
T  34851931 caaaaataatttccttttatagtaataattctcttttataatatgcttaaccagtgttccggtgacaccgattagcag 34851854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23629742 - 23629607
Alignment:
Q  130 cccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttcctt 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||        |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  23629742 cccggggcactgattaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattactttataataaagtcaaaaacaatttcctt 23629643  T
Q  230 ttatgataataatttccttttatggtatgcttaacc 265  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  23629642 ttatgacaataattttcttttatgttatacttaacc 23629607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34396714 - 34396596
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34396714 agggaaatgctaaccggtgcccccaggacacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 34396615  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttcc 227  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  34396614 aaagtcaaaaacagtttcc 34396596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 274
Target Start/End: Original strand, 28225272 - 28225384
Alignment:
Q  162 aattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgctt 261  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  28225272 aattatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatcctt 28225371  T
Q  262 aaccagtgtcccg 274  Q
    || ||||| ||||    
T  28225372 aaacagtgacccg 28225384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 29978233 - 29978412
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||  |||| |||||||||||       ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  29978233 gggaaatgctaaccggtgcctccgga-cactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtatttaatgtattgaaattatgtaatatatttataata 29978331  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  29978332 aagtcaaaaacagtttaattttatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagcg-ccctggaacaccggttagcag 29978412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 265
Target Start/End: Original strand, 5323450 - 5323555
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5323450 gaaattatatagtaattaaagcattaaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttatggtaataattcccttttatggtatgc 5323549  T
Q  260 ttaacc 265  Q
     |||||    
T  5323550 gtaacc 5323555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 252
Target Start/End: Original strand, 9660988 - 9661128
Alignment:
Q  112 gaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| | || |||||  |||||||||||       ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9660988 gaaatgctaaccggtgccctcgtggcaccagttaaggatatgaaaaaagaaattacataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttaaaataaa 9661087  T
Q  212 gtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttat 252  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  9661088 gttaaaagcagtttccttttatggtaataattccattttat 9661128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13417124 - 13416986
Alignment:
Q  134 gggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata---ataaagtcaaaagcagtttccttt 230  Q
    ||||||| |||||||||||       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||    
T  13417124 gggcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatattagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataataaagtcaaaaacagttttcttt 13417025  T
Q  231 tatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    |||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  13417024 tatggtaataattctcttttataatatgcttaaccagtg 13416986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 243
Target Start/End: Original strand, 31280318 - 31280454
Alignment:
Q  107 ttagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||   ||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31280318 ttagggaaatgctaaccggtgctcccgaggcactgattaagagaatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttata 31280417  T
Q  207 ataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatt 243  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||||    
T  31280418 ataatgtcaaaaacggtttccttttatagtaataatt 31280454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34477712 - 34477612
Alignment:
Q  134 gggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttat 233  Q
    |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34477712 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttat 34477613  T
Q  234 g 234  Q
    |    
T  34477612 g 34477612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 209
Target Start/End: Original strand, 13529453 - 13529554
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13529453 tagggaaatgctaacttgtgccttcggggcactggttaaggatgtgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 13529552  T
Q  208 ta 209  Q
    ||    
T  13529553 ta 13529554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 290
Target Start/End: Original strand, 34706719 - 34706901
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggata-tnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaatttata 206  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |       ||||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  34706719 agggaaatgctaaccggtgccccgggggcaccggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccata 34706818  T
Q  207 ataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    |  ||||||| |  | || ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  34706819 aataagtcaacaaaactt-ccttttatggtaagaatttccttttttcgtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagca 34706901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 276
Target Start/End: Original strand, 22417303 - 22417359
Alignment:
Q  220 cagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggg 276  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22417303 cagtttccttttatgctaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgccccggg 22417359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24227506 - 24227415
Alignment:
Q  178 atgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagca-gtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||| |||||    
T  24227506 atgcattgaatttatgtaattaatttataa-aaagtcaaaaaaaagttttcttttatgataataacttccttttttggtacccttaaacagtg 24227415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 263
Target Start/End: Original strand, 28564322 - 28564388
Alignment:
Q  196 attaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaa 263  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  28564322 attaatttataa-aatctcaaaaacagtttccttttatggtaataaattccttttttggtatccttaa 28564388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34712197 - 34712131
Alignment:
Q  224 ttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||    
T  34712197 ttccttttatggtaagaatttccattttttgtatgcttaactagtgccccgggggcaccggttagca 34712131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 201
Target Start/End: Original strand, 10431786 - 10431827
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaat 201  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10431786 gaaattatataatagttattacattgaaattgtgtaattaat 10431827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 34712312 - 34712271
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggata 151  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  34712312 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggata 34712271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 149
Target Start/End: Original strand, 29716728 - 29716768
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaagga 149  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29716728 agggaaatgttaactagtgcccccggggcactggttaagga 29716768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34651018 - 34650838
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34651018 gggaaatgctaaccggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 34650920  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  34650919 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcag 34650838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 8787338 - 8787520
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8787338 agggaaatgctaaccggtgtccccggggcattggttaagggtatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 8787437  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  8787438 aatatcaaaaacagtttccttttatgataataattccattttatggtatgcttaacctgtgccccgggggcaccggttagcag 8787520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 13661807 - 13661989
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13661807 agggaaatgctaaccggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 13661906  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||    
T  13661907 aaagtcagaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcag 13661989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 11958153 - 11957972
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||       ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11958153 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcacaggttaaagatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcaatgaaattgtgtaattaattgataata 11958054  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  11958053 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggcatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcag 11957972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Original strand, 35132521 - 35132702
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35132521 agggaaatgctaaccggtgcccccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataat 35132620  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||| |||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  35132621 aaagtcaaaaacagttttc-tttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcag 35132702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 35504426 - 35504246
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35504426 gggaaatgctaaccggtgcccccgggacactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 35504327  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  35504326 atgtcaaaaacagttcccttttatggcaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgt-ccgggggcaccggttagcag 35504246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10054539 - 10054358
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10054539 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 10054440  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||   ||||||||||||    
T  10054439 aatgtcaaaa-cagtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggtaccggttagcag 10054358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21547579 - 21547399
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||  ||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21547579 gggaaatgctaaccggtg-tccccgggcatcggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 21547481  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  21547480 aagtcaaaaacagtttcattttaagttaataattctcatttatggtatgcttaaccagtaccccggagacaccggttagcag 21547399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Original strand, 11846122 - 11846231
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||    
T  11846122 gaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagtagtttccttttatggtaataaatcccttttatagtatgc 11846221  T
Q  260 ttaaccagtg 269  Q
    ||||||||||    
T  11846222 ttaaccagtg 11846231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Original strand, 20175277 - 20175412
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  20175277 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatgataataattcccttttataatatgc 20175376  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcagaccca 296  Q
    ||||| |||| | | || ||||||||||||| |||||    
T  20175377 ttaactagtg-ctctgggacaccggttagcacaccca 20175412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 290
Target Start/End: Original strand, 6283562 - 6283742
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||        |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6283562 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcactagttaaagatatgaaaaagaaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 6283661  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||||||| || ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||    
T  6283662 aagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcatttttatggtatgcttaaccagtgccctaggggcaccggttagca 6283742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Original strand, 12506346 - 12506455
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||    
T  12506346 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatagtaataattctcttttatggaatgc 12506445  T
Q  260 ttaaccagtg 269  Q
    ||||||||||    
T  12506446 ttaaccagtg 12506455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 275
Target Start/End: Original strand, 31909659 - 31909791
Alignment:
Q  138 actggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgata 237  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     |||||    
T  31909659 actggttaaggatattaaaagggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattgatttataataaagtcaaaaacagtttcc-----tgata 31909753  T
Q  238 ataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgg 275  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31909754 ataattttcttttatggtatgcttaaccagtatcccgg 31909791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9721743 - 9721640
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  9721743 gaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtttaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcccttttatggtatgt 9721644  T
Q  260 ttaa 263  Q
    ||||    
T  9721643 ttaa 9721640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 10955947 - 10956109
Alignment:
Q  106 attagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnnga-aattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaattta 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||        |  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10955947 attagggaaatgctaactgttgcctccggggcactggttaagcataccataaaagggaattataaagtagttaatgcattgaaattgt-taattaattta 10956045  T
Q  205 taataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagt 268  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10956046 taacaaagtcaaaaacaatttccttttatggtaataatttccttttatgatatgcttaaccagt 10956109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40564540 - 40564434
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  40564540 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttttttttatggtaataattctcttttatggtatgc 40564441  T
Q  260 ttaacca 266  Q
    |||||||    
T  40564440 ttaacca 40564434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 234
Target Start/End: Original strand, 10069969 - 10070092
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10069969 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaa-tgataata 10070067  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatg 234  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||    
T  10070068 aagtcaaaaacagtttctttttatg 10070092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Original strand, 13470150 - 13470283
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||       ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13470150 agggaaatgctaaccggtgcctatggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaataatatagtagtcaatgcattgaaattgtataattaatttataat 13470249  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataat 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13470250 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 13470283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 288
Target Start/End: Original strand, 4268624 - 4268739
Alignment:
Q  172 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtc 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  4268624 tagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataaaaaa-taaaaaacagtttccttttatggtaataattttcttttttggtatgcttaacccgtgtc 4268722  T
Q  272 ccgggaacaccggttag 288  Q
    | |||  ||||||||||    
T  4268723 cagggggcaccggttag 4268739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19647823 - 19647720
Alignment:
Q  131 ccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  19647823 ccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaattgataataaagtcataaacagtttccttt 19647724  T
Q  231 tatg 234  Q
    ||||    
T  19647723 tatg 19647720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Original strand, 40057357 - 40057466
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||| | ||     
T  40057357 gaaattatatagtagttagtgcattgaaatagtataattaatttataataaaatcaaaagcagttttcttttatagtaatatttcccttttatgatgtgt 40057456  T
Q  260 ttaaccagtg 269  Q
    ||||||||||    
T  40057457 ttaaccagtg 40057466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 217
Target Start/End: Original strand, 4837257 - 4837364
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||       ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837257 agggaaatgttaaccggtgc-cccggggcaccggttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 4837355  T
Q  209 aaagtcaaa 217  Q
    |||||||||    
T  4837356 aaagtcaaa 4837364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 39067095 - 39066973
Alignment:
Q  137 cactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatact-agttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatga 235  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  39067095 cactggttaaggatatgaaaaaagaaattatataattagttaatatattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatatccttttatgg 39066996  T
Q  236 taataatttccttttatggtatg 258  Q
    ||||||||  |||||||| ||||    
T  39066995 taataattctcttttatgttatg 39066973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2619742 - 2619634
Alignment:
Q  111 ggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 210  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||        ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2619742 ggaaatgctaactggtgtctccgggacacttgttaaggatatgaaaaagaaaattatttagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataa 2619643  T
Q  211 agtcaaaag 219  Q
    ||| |||||    
T  2619642 agttaaaag 2619634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 259
Target Start/End: Original strand, 39069380 - 39069527
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||    
T  39069380 agggaaatgctaaccggtgcttccagggcactggttaagggtatgaaaag-gaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaatta---tataat 39069475  T
Q  209 aa-agtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||  || |||| || |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||    
T  39069476 aattgtgaaaaacaatttccttttatggtaataattctcttttatgatatgc 39069527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14214242 - 14214050
Alignment:
Q  104 taattagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggata-tnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaat 201  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |       ||||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  14214242 taataagggaaatgttaaccggtgctcccgaggcacaggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaat 14214143  T
Q  202 ttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcagaccc 295  Q
      ||||  ||||||| |  | || ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  14214142 ccataaataagtcaacaaaactt-ccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccggtgtcccgggggcaccggttagcataccc 14214050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19436972 - 19436864
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  |||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||     
T  19436972 gaaattatatagtggttaaagcattgaaattgtataattaatttat-ataaagttaaaaatagttt-tttttatggtaataattctcttttatggtatgt 19436875  T
Q  260 ttaaccagtgt 270  Q
    || ||||||||    
T  19436874 ttcaccagtgt 19436864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Original strand, 31467770 - 31467900
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatg 258  Q
    ||||||||||  || ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||| |  | || ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  31467770 gaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatctataaataagtcaacaaaactt-ccttttatggtaagaatttcctttttttgtatg 31467868  T
Q  259 cttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  31467869 cttaaccagtgccccagggacaccggttagca 31467900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 40608722 - 40608681
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggata 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40608722 gggaaatgctaaccggtgctcccgggacactggttaaggata 40608681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 291
Target Start/End: Original strand, 10070086 - 10070130
Alignment:
Q  247 ttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  10070086 ttttatggtatgcttaaccaatgtcccaggagcaccggttagcag 10070130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30889502 - 30889458
Alignment:
Q  224 ttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30889502 ttccttttatgataaaaatttcctttttttgtatgcttaaccagt 30889458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 207
Target Start/End: Original strand, 6284845 - 6284892
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6284845 gaaattatatagtaattaatgtattgaaattgtataattaatttataa 6284892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21945048 - 21945006
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggata 151  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  21945048 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggata 21945006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Original strand, 22973751 - 22973832
Alignment:
Q  176 taatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatg 258  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  22973751 taatgaattaaaattgtgtaattaatttatca-aaagtataaaagagtttccttttatgataataaatttcatttttggtatg 22973832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10956009 - 10955972
Alignment:
Q  238 ataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgg 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10956009 ataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgg 10955972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 290
Target Start/End: Original strand, 40608664 - 40608716
Alignment:
Q  238 ataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40608664 ataatttccctttttattatccttaaccagtgtcccgggagcaccggttagca 40608716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 305
Target Start/End: Original strand, 40969 - 41114
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40969 gaaattatataatagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataatgaagtcaaaaacagtttccttttatgataataatttccttttatgatatgc 41068  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcagacccaattaattaa 305  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||  || |||||||||    
T  41069 ttaaccagtgtcccggagacaccggttggcaggacccattaattaa 41114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 290
Target Start/End: Original strand, 22960 - 23141
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||       ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22960 agggaaatgctaaccggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatacattgaaattgtgtaattaatttataat 23059  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||    
T  23060 aaagtcaaaaacagtttccttttatgttaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccccaaggacaccggttagca 23141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 275
Target Start/End: Original strand, 14896 - 15061
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||       ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14896 gggaaatgctaaccggtgtccccggggcactggttaaagatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtagttaatttataata 14995  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgg 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14996 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgg 15061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 68477 - 68318
Alignment:
Q  109 agggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  68477 agggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaaataaattataat 68378  T
Q  209 aaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagt 268  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  68377 aaagttaaaatcagtttccttttaaggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagt 68318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 291
Target Start/End: Original strand, 116207 - 116385
Alignment:
Q  113 aaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  116207 aaatgctaaccggtgcccccggggcacaggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 116306  T
Q  213 tcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| || | ||||||||||||    
T  116307 tcagaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaacccgtgccccagggataccggttagcag 116385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6295 - 6115
Alignment:
Q  111 ggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 210  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||       |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6295 ggaaatgctaaccggtgcccctggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattggaattgtgtaattaaattataataa 6196  T
Q  211 agtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  6195 agtcaaaaacagtttccttttatggtaataatccccttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggcaccggttagcag 6115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 53873 - 53691
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  53873 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatca 53774  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca 290  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||  ||||||||||||    
T  53773 taatgtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagca 53691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0524 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0524
Description:

Target: scaffold0524; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 110 - 269
Target Start/End: Original strand, 825 - 984
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  825 gggaaatgctagccggtgcttccggagcactagttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 924  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    ||||||||| || |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  925 aagtcaaaatcaatttccttttatagtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 172 - 291
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10891
Alignment:
Q  172 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtc 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  10772 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatggtatgcttaaccagtgcc 10871  T
Q  272 ccgggaacaccggttagcag 291  Q
     ||||  || ||||||||||    
T  10872 tcgggggcagcggttagcag 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 175 - 291
Target Start/End: Original strand, 233918 - 234034
Alignment:
Q  175 ttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccg 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||    
T  233918 ttaattcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgaaaataatttccttttatggtatgtttaaccggtactccg 234017  T
Q  275 ggaacaccggttagcag 291  Q
    ||  |||||||||||||    
T  234018 ggggcaccggttagcag 234034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19721 - 19590
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||     
T  19721 gaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaatgaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttacgataatagttctcttttatgatatga 19622  T
Q  260 ttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19621 ttaatcagtgtcccggaaactccggttagcag 19590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 147097 - 146933
Alignment:
Q  104 taattagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaattt 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||||||       ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  147097 taataagggaaatgctaaccggtgctcctggggttctagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaattg 146998  T
Q  204 ataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagt 268  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  146997 ataataaagtcaaaaacagttttctattacggtaataatttctttttatggtatgcttaatcagt 146933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1152 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1152
Description:

Target: scaffold1152; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 305
Target Start/End: Original strand, 673 - 873
Alignment:
Q  105 aattagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaattta 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| | |||| |||||| |||||       ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  673 aattagggaaatgctaatcggtgcccccagagcacgggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatccattgaaattgtgtaattaattta 772  T
Q  205 taataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagca-gacccaattaatt 303  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| | |  ||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  773 taataaagtcaaaaactgttttcttttatggtgataattctcttttatggtatgcttaactaatagcccggg-gcaccggttagtaggacccaattaatt 871  T
Q  304 aa 305  Q
    ||    
T  872 aa 873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 288
Target Start/End: Original strand, 69277 - 69403
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  69277 aaattatatagtagttaatacattaaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttttttttaaggtaataattt-cttttatggtatgct 69375  T
Q  261 taaccagtgtcccgggaacaccggttag 288  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  69376 taaccagtgcctcgggagcaccggttag 69403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33817 - 33707
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgc 259  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||  ||||| |||||||| ||||||||| || || || |||||    
T  33817 gaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-aagataaaaaatagttttcttttatgctaataattttctcttttgatatgc 33719  T
Q  260 ttaaccagtgtc 271  Q
    ||||| ||||||    
T  33718 ttaactagtgtc 33707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 269
Target Start/End: Original strand, 50548 - 50707
Alignment:
Q  110 gggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 209  Q
    |||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| |||||       ||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  50548 gggaaatgttaaccggtgcctccggggcactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgttttgaaattgtataattaatttataata 50647  T
Q  210 aagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 269  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  50648 aagtcaaaatcaattttcttttatgataataattctcttttatagtatgtttaaccagtg 50707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 53505 - 53424
Alignment:
Q  137 cactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaa 218  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53505 cactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaa 53424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17605 - 17494
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgct 260  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  17605 aaattatatagtagctaatgcattgaaattgtg-aattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcctttttatggtatgtt 17507  T
Q  261 taaccagtgtccc 273  Q
    ||||| |||||||    
T  17506 taaccggtgtccc 17494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 95767 - 95616
Alignment:
Q  113 aaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 212  Q
    |||||||||| ||||| |||| || |||||||||| ||||       ||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  95767 aaatgctaaccggtgcccccgaggtactggttaagaatatgaaaaaggaaattatataataattaatgaattgaaattatgtaattaatttataataaag 95668  T
Q  213 tcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaacc 265  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  95667 tcaaaa-cagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacc 95616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1266 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1266
Description:

Target: scaffold1266; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 291
Target Start/End: Original strand, 291 - 473
Alignment:
Q  108 tagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  291 tagggaaatcctaaccggtgc-cccagggcactggttaagcatatgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaataaatttataa 389  T
Q  208 taaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcag 291  Q
    ||||||||||| |||||||||| || | ||||||||  |||||||| |||| |||| |||| ||| || ||| | |||||||||    
T  390 taaagtcaaaaacagtttccttctacggtaataattctcttttatgatatgattaatcagtatcctggaaactctggttagcag 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 274
Target Start/End: Original strand, 25770 - 25882
Alignment:
Q  162 aattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgctt 261  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  25770 aattatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatcctt 25869  T
Q  262 aaccagtgtcccg 274  Q
    || ||||| ||||    
T  25870 aaacagtgacccg 25882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11157 - 11032
Alignment:
Q  107 ttagggaaatgctaactggtgctcccggggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  11157 ttagggaaatgctaactggtgcccc--ggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatattagttaatgcattgaaattgtgtaattaaactata 11060  T
Q  207 ataaagtcaaaagcagtttccttttatg 234  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11059 ataaagtcaaaaacagtttcattttatg 11032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8059 - 7959
Alignment:
Q  134 gggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttat 233  Q
    |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8059 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttat 7960  T
Q  234 g 234  Q
    |    
T  7959 g 7959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 7312 - 7412
Alignment:
Q  134 gggcactggttaaggatatnnnnnnngaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttat 233  Q
    |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7312 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttat 7411  T
Q  234 g 234  Q
    |    
T  7412 g 7412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 207
Target Start/End: Original strand, 5090 - 5136
Alignment:
Q  161 aaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5090 aaattatatagtagttaatttattgaaattgtgtaattaatttataa 5136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1128 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1128
Description:

Target: scaffold1128; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 201
Target Start/End: Original strand, 1421 - 1462
Alignment:
Q  160 gaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaat 201  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1421 gaaattatataatagttattgcattgaaattgtgtaattaat 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University