View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11180A_low_95 (Length: 278)

Name: NF11180A_low_95
Description: NF11180A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11180A_low_95
NF11180A_low_95
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (8-278)||(9609646-9609916)
chr5 (8-278)||(30796942-30797212)
chr5 (8-278)||(29242252-29242522)
chr5 (8-278)||(27452614-27452883)
chr5 (19-278)||(1721707-1721966)
chr5 (19-193)||(39860689-39860863)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (8-278)||(3962438-3962708)
chr7 (8-278)||(25611507-25611777)
chr7 (8-278)||(23362014-23362284)
chr7 (8-278)||(30466393-30466663)
chr7 (19-276)||(24267868-24268125)
chr7 (8-278)||(4595174-4595444)
chr7 (8-278)||(42851690-42851960)
chr7 (8-274)||(40187083-40187349)
chr7 (8-278)||(9360467-9360737)
chr7 (20-223)||(5865969-5866172)
chr7 (11-138)||(27566295-27566422)
chr7 (177-278)||(14160358-14160459)
chr7 (19-167)||(33336229-33336377)
chr7 (227-278)||(28424023-28424074)
chr7 (19-241)||(35827303-35827525)
chr7 (145-241)||(2241556-2241652)
chr7 (177-225)||(21947086-21947134)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (8-276)||(186851-187119)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (8-278)||(26429336-26429606)
chr4 (8-278)||(35852884-35853154)
chr4 (8-278)||(9034623-9034893)
chr4 (8-277)||(33846033-33846302)
chr4 (8-278)||(791670-791940)
chr4 (16-278)||(48446379-48446641)
chr4 (8-266)||(17423978-17424236)
chr4 (8-278)||(26006229-26006499)
chr4 (8-278)||(54552331-54552600)
chr4 (8-278)||(22359384-22359653)
chr4 (42-278)||(12273939-12274175)
chr4 (122-278)||(2537123-2537279)
chr4 (124-278)||(52759271-52759425)
chr4 (57-278)||(8169468-8169689)
chr4 (189-278)||(25058448-25058537)
chr4 (134-197)||(23860120-23860183)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (8-278)||(32577762-32578032)
chr8 (8-278)||(5839490-5839760)
chr8 (124-278)||(25663346-25663500)
chr8 (23-239)||(36530876-36531092)
chr8 (8-131)||(32283056-32283179)
chr8 (177-224)||(32283002-32283049)
chr8 (235-271)||(14219947-14219983)
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (8-278)||(32957163-32957433)
chr6 (8-248)||(7607613-7607853)
chr6 (25-278)||(7597300-7597555)
chr6 (8-267)||(12523336-12523595)
chr6 (156-278)||(7435760-7435882)
chr6 (19-278)||(13405854-13406113)
chr6 (191-256)||(6192479-6192544)
chr6 (11-80)||(7435877-7435946)
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (8-278)||(55218790-55219060)
chr3 (8-278)||(51192016-51192286)
chr3 (11-278)||(21689467-21689734)
chr3 (36-278)||(8457650-8457892)
chr3 (8-278)||(43018499-43018769)
chr3 (124-278)||(13443959-13444113)
chr3 (73-278)||(51951726-51951931)
chr3 (145-278)||(39133522-39133653)
chr3 (103-230)||(39371317-39371444)
chr3 (35-220)||(26399928-26400113)
chr3 (94-268)||(23487868-23488042)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (8-278)||(2343-2613)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (8-278)||(23769919-23770189)
chr2 (8-278)||(10213543-10213813)
chr2 (52-278)||(24477620-24477846)
chr2 (8-276)||(23407895-23408161)
chr2 (8-276)||(38451838-38452106)
chr2 (103-278)||(45086129-45086304)
chr2 (55-276)||(40074174-40074394)
chr2 (205-278)||(22605840-22605913)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (8-278)||(27082-27352)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (11-274)||(216190-216453)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (8-278)||(25070949-25071219)
chr1 (35-278)||(48518813-48519056)
chr1 (19-200)||(19956269-19956450)
[»] scaffold0279 (1 HSPs)
scaffold0279 (134-278)||(6564-6708)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (148-278)||(5156-5286)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (8-278)||(58124-58395)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (8-86)||(1736-1814)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (58-200)||(20433-20574)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (174-276)||(148073-148175)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9609916 - 9609646
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9609916 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactccgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 9609817  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9609816 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgactccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 9609717  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9609716 ggcgtctctaattttagcgcagttattaatgattgtagacgtctgttagcttctgatttagtaacctctga 9609646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30797212 - 30796942
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30797212 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactccgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 30797113  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30797112 gttatcagcaatgcagtgggttcgtgatttgcaactaggtattgtggactttgagcttgactccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 30797013  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  30797012 ggcgtctctaattttagcgcagttattaatgattgtagacgtctattagcttatgatttagtaacctctga 30796942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29242522 - 29242252
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29242522 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgctttgttttagccaagactgaatggatgactccgcttcttgatgtcgatttggatgagactttgggttt 29242423  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  29242422 gttatcagcaatgcattgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagattgactccaaaactatggtagacagtctttatggtagtaaaagt 29242323  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29242322 ggcgtctctaattttagcgcagatattaatgattgtagacgtctgttagcttctgacttagtaacctctga 29242252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27452883 - 27452614
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  27452883 ttggtgtgtgcatttgagatgatgaaggtcgttatgttttggccaagactgaatggatgtctccgctccttgatgtgaatttgggtgagactttaggttt 27452784  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||| | ||| || || |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||| || ||||||||||| ||||  |||    
T  27452783 attatcatccatgtaccggattcgcgatcttcagctaggtattgtggacattgagcttgattccaaacctgtggtggatagtctttatggcagtagaagt 27452684  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||||||| || | || |||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27452683 ggcgtctctaattttagcgcaataatcaatgattgtagac-actgttagcttatgatttagtaacctctga 27452614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 278
Target Start/End: Original strand, 1721707 - 1721966
Alignment:
Q  19 attcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaa 118  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1721707 attcgagatgatgaaggttgttatgtgttagccaaaactgaatggatgactccaatccttgatgtggaattgggtgaggctttaggtttattatcagcaa 1721806  T
Q  119 tgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaa 218  Q
    || | ||  |||  |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||||  |   ||||||||| |||    
T  1721807 tgtattgaattcacgatctgcagctgtgtattgtggattttgagcttgattccaagactgtggtagatagtctttatggtaagaaatgtggcgtctttaa 1721906  T
Q  219 ttttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||||||| |||| || |||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||||||||||    
T  1721907 ttttagcgcagtgatcaatgattgtaaacgcctgttaacttatgatttagtaacctctga 1721966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Original strand, 39860689 - 39860863
Alignment:
Q  19 attcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaa 118  Q
    ||||| ||||| ||||||| || |||  |||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  39860689 attcgcgatgatgaaggtcattatgtgctagctaaaaccgaatggatgactccgcttcttgatgtggatttgggcaaggctttaggtttattatcagcaa 39860788  T
Q  119 tgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtcttt 193  Q
    || | ||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||    
T  39860789 tgtattgggtgcgtgatctgcagctgggtattatggattttgagcttgattccaatactgtggtagatagtcttt 39860863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3962708 - 3962438
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3962708 ttggtgtttgtattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactccgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 3962609  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3962608 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagctcgactccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtaatagt 3962509  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3962508 ggcgtctctaattttagcgcagttattaatgattgtagatgtctgttagcttctgatttagtaacctctga 3962438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25611777 - 25611507
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25611777 ttggtgtttgtattcgcgatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactccgctccttgatgtcgagttgggtgaggctttgggttt 25611678  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611677 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgactccaaaagtgtggtagacagtctttatggtagtactagt 25611578  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25611577 ggcgtctctaattttagcgcagttattaatgaatgtagacgtctgttagcttctgatttagtaacctctga 25611507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Original strand, 23362014 - 23362284
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23362014 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactccgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 23362113  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  23362114 gttatcaacaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagattgactccaaaactgtggtagacagtctttatggtaggaaaagt 23362213  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23362214 ggtgtctctaattttagcgcagttattaatgattgtagacgtctgttagcttctgatttagtaacctctga 23362284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Original strand, 30466393 - 30466663
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  30466393 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgctttgttttagccaagactgaatagatgactccgctccttgatgcgaatttgggtgaggctttgggttt 30466492  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  30466493 attatcagcaatgcactgggttcgcgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgactccaaaactgtggtagacagtctttatgatagtaaaagt 30466592  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  30466593 ggcgtctctaattttagcgcagttattaatgattgtagacgtctgttagcttctgatatagtaacctctga 30466663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24268125 - 24267868
Alignment:
Q  19 attcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaa 118  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||| || |||||  |||||||||    
T  24268125 attcgagatgatgaatgtcgttttgttttagccaaaattgaatggatgactccactcattgatgtggatttgagtgaggccttaggtttactatcagcaa 24268026  T
Q  119 tgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaa 218  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  24268025 tgtattgggttcatgatctgcaactaggtattgtggactttgtgcttgattccaaaattgtggtggatagtctttatggtggtaaaagtggcgtctctaa 24267926  T
Q  219 ttttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctct 276  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  24267925 ttttagcgcagtaattaatgattgtagacgcttgttagtttctgatttagtaacctct 24267868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4595444 - 4595174
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4595444 ttggtgtgtgcattcaagatgatgaagatcattatgttttggccaagactgaatggatgcctccgctccttgatgtggatttgggtgaggctttaggttt 4595345  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| || |   ||    
T  4595344 attatcaaccatgtactgagttcgcgatctgcaactaggtattttggactttaagcttgattccaaaattgtggtatatagtctttatggcagaaaatgt 4595245  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||| ||| || | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4595244 ggcgtctctaatttaagcgcaataatcaatgactgtagacgtctgttagcttctgatttagtaacctctga 4595174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Original strand, 42851690 - 42851960
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  42851690 ttggtgtgtgtattcgagatgatgaaggtcgttgtgttttagccaagactaaatgaatgtctttgctccttgatgtggatttaggtgaggctttaggttt 42851789  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||  |||    
T  42851790 attatcagtcatgtattgggttcgcgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgattccaaaaccgtggtagatagtctttatggtattaaaagt 42851889  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42851890 ggcgtatctaattttagtgcagtaatcaatgactgtagacgcgtgttagcttctgacttagtaacctctga 42851960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 274
Target Start/End: Original strand, 40187083 - 40187349
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| || ||    
T  40187083 ttggtgtgtgcatttgagatgatgaaggtcgttatgttttggccaagactaaatggatgtctccgctccttgatgtgaatttgggtgaggctttaggctt 40187182  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||    
T  40187183 attatcagccatttaatgggttcgcgatctgcagctaggtagtgtggactttgagcttgattccaaaattgtggtagatagtctttatggcaataaaagt 40187282  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacct 274  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  40187283 ggcgtctctaattttagcgcagtaatcaatgactgtagacgcttgttaacttctgatttagtaacct 40187349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Original strand, 9360467 - 9360737
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| || ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  9360467 ttggtgtgtacattcgagatgatgaaggtcgttatgtttcggccaaaacggaatggatgtctccgatccttgatgtggatttgggtgagactttaggttt 9360566  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||  |||    
T  9360567 attatcagccatgtattgggttcgcgatctccagttaggtattgtggactttgagcttgattccaaaaatgtgatagatagtctttatggcagtaaaagt 9360666  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9360667 ggcgtttctaattttagcgcagtaatcaatgactgtagacgcctgttagcttctgttttagtaacctctga 9360737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 223
Target Start/End: Original strand, 5865969 - 5866172
Alignment:
Q  20 ttcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaat 119  Q
    |||||||||| |||||||||| | | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| ||||| ||||||| | |    
T  5865969 ttcgagatgatgaaggtcgttatttgttagccaaaacagaatggatgactctgctccttgatatggaattggatgaggctttaggtttattatcagtagt 5866068  T
Q  120 gcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaat 219  Q
    | | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  5866069 gtattaggttcgcgatctgcagctaggtattgtggactttgagcttgattctaaaattgtggtagataatctttatggtagtaaatgtggcgtctctaat 5866168  T
Q  220 ttta 223  Q
    ||||    
T  5866169 ttta 5866172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27566422 - 27566295
Alignment:
Q  11 gtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgtt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||    
T  27566422 gtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgctttgttttagccaagactgaatggatgactccgctccttgatgtgaatttgggtaaggctttgggtttatt 27566323  T
Q  111 atcagcaatgcactgggttcgtgatctg 138  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27566322 atcaacaatgcactgggttcgcgatctg 27566295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 177 - 278
Target Start/End: Original strand, 14160358 - 14160459
Alignment:
Q  177 tgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctct 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14160358 tgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcgcaattattaatgattgtagacgtctgttagcttctgatttagtaacctct 14160457  T
Q  277 ga 278  Q
    ||    
T  14160458 ga 14160459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33336377 - 33336229
Alignment:
Q  19 attcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |   |||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||| |||||| |||    
T  33336377 attcgagatgatgaaggtcgttgtgtgttagctaaaaacaaatggatgactccgctccttgatgtggatttcgatgagactttaggtttattatcaacaa 33336278  T
Q  119 tgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttga 167  Q
    || | ||||| | |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  33336277 tgtattgggtgcatgatctgcagttgggtattgtggattttgagcttga 33336229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28424074 - 28424023
Alignment:
Q  227 cagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28424074 cagttattaatgattgtagacttctgttagcttctgatttagtaacctctga 28424023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Original strand, 35827303 - 35827525
Alignment:
Q  19 attcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaa 118  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||||| || || |||||| |||||   ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||     
T  35827303 attcgagatgataagggtcgttttgtgttagctaaaaccgaatggttgactgcactccttgatgtggatttgggggaggctttaggtttattatcaacac 35827402  T
Q  119 tgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaa 218  Q
       | ||| |  |||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||| |||| |  ||||| || |||||    
T  35827403 actattggatgtgtgatctatagttaggtattgtggattttgagcttgattccaaaattgtggtggatagtctctatagtagcaaaagtggtgtttctaa 35827502  T
Q  219 ttttagcacagttattaatgatt 241  Q
    || |||  |||| || |||||||    
T  35827503 ttatagtgcagtgatcaatgatt 35827525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 241
Target Start/End: Original strand, 2241556 - 2241652
Alignment:
Q  145 ggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttattaatgatt 241  Q
    |||||| ||||||||||| | ||  |||||| |||||| || ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  2241556 ggtattatggactttgagatcgatgccaaaactgtggtggatagtctctatggtagtaaatgtggcgtttctaattatagtgcagtgattaatgatt 2241652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21947134 - 21947086
Alignment:
Q  177 tgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagc 225  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||    
T  21947134 tgtggtagatagtctttatgatagtaaaagtgacgtctctaattttagc 21947086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 276
Target Start/End: Original strand, 186851 - 187119
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  186851 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggttgttttgttttagccaagactgaatggatgactccgctccttgatgtcgagttgggtgaggctttgggttt 186950  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  186951 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgactccaaaagtgtggtagacagtctttatggtagtactagt 187050  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctct 276  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  187051 ggcgtctctaattttagcgcaattattaatgattgtagacgtctgttagcttctgatttagtaacctct 187119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26429606 - 26429336
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26429606 ttggtgtttgcattcaagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactccgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 26429507  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26429506 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctccaactaggtattgtggactttgagcttgactccaaaattatggtaaacagtctttatggtagtactagt 26429407  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26429406 ggcgtctttaattttagcgcagttattaatgattgtagacgtctgttagcttctgatttagtaacctctga 26429336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Original strand, 35852884 - 35853154
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  35852884 ttggtgtttgcattcgagatgaaaaagatcgctttgttttagccaagactgaatggatgactccgctcattgatgtgaatttggttgagtctttgggttt 35852983  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  35852984 attatcagcaatgcactgtgttcgcgatctgcaactaggtattgtggactttgagtttgactccaaaactgtggtagacagtctttatggtagtaaaagt 35853083  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35853084 ggcatctctaattttagcgcagttattagtgattgtagacttctgttagcttctgatttaataacctctga 35853154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Original strand, 9034623 - 9034893
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  9034623 ttggtgtgtgcattcgagatgaggaaggtcgttatgttttggccaagactgaatggatgtctccgctctttgatgtggatttaggtgaggctttaggttt 9034722  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  9034723 attatcagccatgtattgggttcgcaatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgattccaaaattgtggtagatagtctttatggtagtaatatt 9034822  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9034823 ggcgtttctaattttagcgcagttattaatgattgtagatgtctgttagcttctgatttagtaacctctga 9034893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 33846033 - 33846302
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  33846033 ttggtgtgtgcattcaagatgatgaatgtcgttatgttttggccaagattgaatggatgtctccgctccttgatgtggatttgggtgaggctttaggctt 33846132  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  33846133 attatcagccatgtactgggttcgtgatctacaactaggtattgtggactttgagcttgattccaaaattttggtagatagtctttatggcagtaaaagt 33846232  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctg 277  Q
    ||| | |||||||||||| |||| || ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33846233 ggcatatctaattttagcgcagtaatcaatgactatagacgtttgttagcttctgatttggtaacctctg 33846302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Original strand, 791670 - 791940
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||| |||||| | | ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  791670 ttggtgtgtgtattcgagatgatgaatgtcgttatttgttagttaaaactgaatggatgactccgctccttgatgtggatttgagtgaggctttaggttt 791769  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  791770 attatcagcaatgtattgggttcgcgatctgcaactgagtattctggactttgagcttgattccaaaactgtggtagatagtctatatggtagtaattgt 791869  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    || ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  791870 ggtgtctctaattttagcgcagtgatcaatgattgtagacgtctgttagcttctaatttagcaacctctga 791940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 278
Target Start/End: Original strand, 48446379 - 48446641
Alignment:
Q  16 tgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcag 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||    
T  48446379 tgcattcgagatgatgaaggtcgttatgttttggccaagattgaatggatgtctcctctccttgatgtggattttggtgagactttaggtttattatcag 48446478  T
Q  116 caatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctc 215  Q
    | ||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  48446479 ccatgtattgggttcgcgacctgcaactaggtattgtggactttgaacttgatttcaaaactgtggtagatagtctttatggcagtaaaagtggcgtctc 48446578  T
Q  216 taattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||| |||| || |||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  48446579 taattttagcgcagtaatcaatgacggtagacgtctgttagcttcagatttagtaacctctga 48446641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17424236 - 17423978
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  17424236 ttggtgtgtgtattcaagatgaagaaggtcgatatgtgtcagccaaaactgaatggatgactccgctccttgatgtggagttgggtgaggctttaggttt 17424137  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     ||||| |||||| | |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  17424136 attatctgcaatgtattgggtttgcgatctacagctaggtattgtggactttgagcttgattccaaaactgtggtagatagtctctatggtagtaattgt 17424037  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgattt 266  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  17424036 ggcgtctctaattttagcgcagtgatcaatgactgtagacgcatgttagcttctgattt 17423978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26006499 - 26006229
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||| |||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  26006499 ttggtgtgtgcattcgagatgatgaaggttgttatgttttggacaagacttaatggatgtctctgattcttgatgtggatttgggtgagactttaggttt 26006400  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  26006399 attatcagctatgtactgggttcgtgatgtccagctaggtattgtggaatttgagcttgatttcaaaaatgtggtagatagtctttatggcagtaaaagt 26006300  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  26006299 ggcgtctctaattttatcacagtaatcaatgactgtagacccctgttagcttctgatgtagtaacttctga 26006229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Original strand, 54552331 - 54552600
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||    
T  54552331 ttggtgtgtgtattcgagatgatgaaggtcgttatgtgttagcgaagactgaatggataactccgctccttaatgtggatttgggtgaggctctaggttt 54552430  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | |    
T  54552431 attatcagctatgtactgggttcgtgatctgcagctgggtattatggactttgagcttgatttcaaaattgtcgtagatagtctttatggtagtaaaaat 54552530  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||| ||||| ||||||||  ||| || |||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  54552531 ggcatctct-attttagcgtagtaataaatgattgtatacgcctattaacttctgatttagtaacctctga 54552600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22359653 - 22359384
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| | | |||||||| |||| |||||    
T  22359653 ttggtgtgtgcattcgagatgataaagattgttatgttttggccaagaatgaatggatgtctc-gctcctttatgtgggtctgggtgagactttaggttt 22359555  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||| | |||||||||   ||||  |||    
T  22359554 attatcagccatgtactggattcgtgatttgtaactaggtattgtggactttgagtttgatttcaaaactgtggtatatagtctttataacagtaaaagt 22359455  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22359454 gacgtctctaattttagcacagtaatcaattattgtcgatgcctgttagcttctgatttagtaatctctga 22359384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 12273939 - 12274175
Alignment:
Q  42 tgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaa 141  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||| ||  ||| ||||||| || ||| | |||    
T  12273939 tgttttagccaagattgaatgaatgtctccgctccttgatgtggatttgagtgagactttaggtttattattagtgatgtactgggtccgcgatatacaa 12274038  T
Q  142 ctaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttattaatgatt 241  Q
     ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||| |||| || ||||| |    
T  12274039 ttaggtattgtgaactttgagcttgattccaaaactgtggctgatagtctttatggtagtaaaagtggcacctctaatttcagcgcagtaatcaatgact 12274138  T
Q  242 gtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12274139 gtagatgcttgttagcttctgatttagtaacctctga 12274175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 122 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2537279 - 2537123
Alignment:
Q  122 actgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattt 221  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  2537279 actgggttcgcgatctacatataggtattgtggactttgagcttgattccaaaactgtggtagatagtctttatggcagtaaaagtggcgtctctaattt 2537180  T
Q  222 tagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||  |||| || ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2537179 tagtgcagtaatcaatgactgtagacgcatgttagcttctgatttagtaacctctga 2537123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 52759425 - 52759271
Alignment:
Q  124 tgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaatttta 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  52759425 tgggttcgcgatctgcaactaggtattgtgaactttgagtttgattccaaaaccgtgatagatagtctttatggtattaaaactggcgtctctaatttta 52759326  T
Q  224 gcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    || |||| || ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  52759325 gcgcagtaatcaatgattgtagacgcatgttagcttatgatttagtaacctctga 52759271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8169689 - 8169468
Alignment:
Q  57 tgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggac 156  Q
    |||| |||||| || |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| | |||  | ||||||||||||||||| || | |||| |||||    
T  8169689 tgaaaggatgattccgctcattgatgtggatttgggtgaggccttaggtttattatctgtaatttattgggttcgtgatctgcagctggatattatggac 8169590  T
Q  157 tttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttag 256  Q
    |||||| ||||   ||||| |||||  || | ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||| || | ||||||||||||||| |  ||||||    
T  8169589 tttgagtttgatttcaaaactgtggcggataatctttatggtagtaaaagtggtgtcttttattttagcgcattaattaatgattgtagatgcatgttag 8169490  T
Q  257 cctctgatttagtaacctctga 278  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  8169489 cttctgatttagtaacctctga 8169468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25058537 - 25058448
Alignment:
Q  189 tctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||||||||||||||  |||  | | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25058537 tctttatggtagtaaaagtaacatatctaattttagcgcagtaattaatgattgtagacgtctgttagcttctgatttagtaacatctga 25058448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23860183 - 23860120
Alignment:
Q  134 atctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatgg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23860183 atctgcaactaggtattgtggactttgaacttgactccaaaactgtagtagacagtctttatgg 23860120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Original strand, 32577762 - 32578032
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32577762 ttggtgtttgtattcgcgatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactccgctccttgatgtcgagttgggtgaggctttgggttt 32577861  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32577862 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgactccaaaagtgtggtagacagtctttatggtagtactagt 32577961  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32577962 ggcgtctctaattttagtgcagttattaatgaatgtagacgtctgttagcttctgatttagtaacctctga 32578032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Original strand, 5839490 - 5839760
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  5839490 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgctttgttttagccaagacggaatggatgactccgctccttgatgtggatttgggtgaggctttggattt 5839589  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  5839590 attatcagcaatgtactgggtccgcgatctgcaactaggtattgtggacattgagcttaactccaaaactgtggtagacagtctttatggtagtaaaagt 5839689  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5839690 ggcgtctctaattttagcgcagttattaatgattgtagacgtctgttagcttctgatttagtaacctctga 5839760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 278
Target Start/End: Original strand, 25663346 - 25663500
Alignment:
Q  124 tgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaatttta 223  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25663346 tgggtttgttatcagcaactaggtattgtggactttgagcttgactctaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaatttta 25663445  T
Q  224 gcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25663446 gcgcagttattaatgattgtagacgtctgttagcttctgatttagtaacctctga 25663500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Original strand, 36530876 - 36531092
Alignment:
Q  23 gagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaatgca 122  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || || |||||| |||| |||||  ||||||  ||| |    
T  36530876 gagatgatgaaggttgttatgttttagccaagactgaatggatgtctccgctccttgatgtggacttaggtgagactttaggtttactatcagtcatgta 36530975  T
Q  123 ctgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaatttt 222  Q
     ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  36530976 ttgggttcatgatctggaactaggtattgtggactttgagcttgattccaaaactgtggtagatagtctttatggtagtaaaagtggtatctctaatttt 36531075  T
Q  223 agcacagttattaatga 239  Q
    |||||||| || |||||    
T  36531076 agcacagtaatcaatga 36531092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32283179 - 32283056
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||    
T  32283179 ttggtgtgtgcattcgagatgatgaagttcgttatgttttggccaagactgaatggatgtctctgctccttgatgtggatttgggtgaggctttaagctt 32283080  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcg 131  Q
     |||||||| ||| ||||||||||    
T  32283079 attatcagccatgtactgggttcg 32283056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32283049 - 32283002
Alignment:
Q  177 tgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttag 224  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  32283049 tgtggtagatagtctttatggcagtaaaagtggcgtctctaattttag 32283002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14219983 - 14219947
Alignment:
Q  235 aatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14219983 aatgattgtagacgtctgttagcttttgatttagtaa 14219947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Original strand, 32957163 - 32957433
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32957163 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactccgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgagttt 32957262  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  32957263 gttatcagcaatgcactgggttcatgatctgcaactaggtattgtggactttgagattgattccaaaactgtggtagacagtctttatggtagtaaaagt 32957362  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32957363 ggcgtctctaattttagcgcagttattaatgattgtagacgtctattagcttctgatttagtaacctctga 32957433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 7607613 - 7607853
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||| || ||    
T  7607613 ttggtgtgtgcattcgagatgatgaaggtcgttatgttttggccaagactgaatggatgtctccactccttgatgtatatttgggtgaggctttaggctt 7607712  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||    
T  7607713 attatcagccatgggctgggttcgtggtctgcagctaggtattgtggactttgagcttgatttcaaaattgtggtagatagtctttattgtagtaaaagt 7607812  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacg 248  Q
    ||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||    
T  7607813 ggcgtctctaattttagcgtagtaatcaatgactgtagacg 7607853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Original strand, 7597300 - 7597555
Alignment:
Q  25 gatgaagaaggtcgttttgttttagccaa--gactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaatgca 122  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| |    
T  7597300 gatgatgaaggtcgttatgttttggccaaaagactgaatggatgtctccgctccttgatgtggatttgggtgaggctttaggtttattatcaaccatgta 7597399  T
Q  123 ctgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaatttt 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||  |||    
T  7597400 ctgggtttgtgatctgcagctaggtattgtggactttgagtttgatttcaaaattgtggtagagagtctttatggcagtaaaagtggcgtctctagattt 7597499  T
Q  223 agcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||    
T  7597500 agcgcagtaatcaatgactgtagacgtatgttagttttttatttagtaacctctga 7597555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Original strand, 12523336 - 12523595
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||| |||||| | | ||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  12523336 ttggtgtgtgtattcgagatgatgaatgtcgttatttgttagctagaactgaatggatgactctgttccttgatgtgaatttgggtgaggctttaggttt 12523435  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  12523436 attatcagcaatgtattgggttcgcgatctgcagctgagtattatggactttgagcttgattccaaaactgtggtagatagtctatatggtagtaattgt 12523535  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgattta 267  Q
    || ||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||| |||||||| ||| |||||    
T  12523536 ggtgtctctaattttagcgcagtgatcaatgactatagacgcctgttagcttctaattta 12523595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7435882 - 7435760
Alignment:
Q  156 ctttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgtta 255  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  | | |||||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  7435882 ctttgagcttgattccaaaactgtggtagatagtctttatggcagtaaaattagcgtctctaattttagcgtagtaatcaatgactgtagacgcctgtta 7435783  T
Q  256 gcctctgatttagtaacctctga 278  Q
     | ||||||||||||||||||||    
T  7435782 acttctgatttagtaacctctga 7435760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 278
Target Start/End: Original strand, 13405854 - 13406113
Alignment:
Q  19 attcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaa 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||| |  || || ||||| ||||| || |||||| | || || |||||| ||     
T  13405854 attcgagatgatgaaggtcgttttgtgcttgccaaaactgaatggctgacacaacttctcgatgtggattttggggaggctctaggcttattatcaacac 13405953  T
Q  119 tgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaa 218  Q
    | || ||| |  ||||||||||  | |||| ||| || ||| ||||||||  ||||| |||||| || |||||||||||| |||  |||| | | |||||    
T  13405954 ttcaatggatgtgtgatctgcatttgggtaatgtagattttcagcttgacttcaaaactgtggttgatagtctttatggtggtaaaagtgccatttctaa 13406053  T
Q  219 ttttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    || ||| ||| |  | |||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13406054 ttatagtacaatgctcaatgatagtaaacgtatgttagcttctgatttagcaacctctga 13406113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Original strand, 6192479 - 6192544
Alignment:
Q  191 tttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttag 256  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  6192479 tttatggtagtaaaagtggcgtctctaattttagcgcagttaataatgattgtggacatctgttag 6192544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 7435946 - 7435877
Alignment:
Q  11 gtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttga 80  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  7435946 gtgtgtgcattcgagatgatgaaggtcgttatgtattggtcaagactgaatggatgtctccgctctttga 7435877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 55219060 - 55218790
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  55219060 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgctttgttttagccaagactgaatggatgactccgctccttgatgtggttttgggtgaggctttgagttt 55218961  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  55218960 attatcagcaatgtactgggtctgtgatctgcaactaggtattgtgaactttgagtttgactccaaaactgtggtagacagtctttatggtagtaaaagt 55218861  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55218860 ggcgtatctaattttagcgcatttattaatgattgtagacgtctgttagcttctgatttagtaacctctga 55218790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 51192286 - 51192016
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  51192286 ttggtgtgtgcattcgagatgatgaaggtcgttatgttttggccaagactgaatggatgtctccgctctttgatgtggatttgggtgaggctttaggctt 51192187  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  51192186 attatcagtcatgtactgggttcgcgatctgcagctaggtattgtggactttgagcttgattccaaaactgtggtagatagtctttatggcagtaaaagt 51192087  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  51192086 ggcgtctctaattttagtgtagtaatcaatgactgtagacgtctgttagcttatgatttagtaacctctga 51192016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Original strand, 21689467 - 21689734
Alignment:
Q  11 gtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgtt 110  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||    
T  21689467 gtgtgtgcattcgagatgatgaaggtcgatatgttttagccaagattgaatggatgactccgctccttgatgtggatttgggggaggctgtaggtttatt 21689566  T
Q  111 atcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggc 210  Q
    ||||  |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||| |    
T  21689567 atcaataatgcattgggttcgcgatctgcagctgggtattgtgaactttgagcttgatttcaaaactgtggtagatagtttttatggtagtaaaagtgac 21689666  T
Q  211 gtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||  ||||||| ||| || |||||||||||||    
T  21689667 gtctctaattttagcgcagtaatcaatgaatgtagacgcttgttagcttctaatctagtaacctctga 21689734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 278
Target Start/End: Original strand, 8457650 - 8457892
Alignment:
Q  36 tcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaatgcactgggttcgtgat 135  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||    
T  8457650 tcgttatgttttggccaagactaaatggatgtctcctctccttgatgtggagttgggtgaggctttaggtttattatcagccatgtactgggttcgcgat 8457749  T
Q  136 ctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttatta 235  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| || |||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||| |    
T  8457750 ctgcagctaggaattgtggactttgtgcttgattccaaaattatggtagatagcctttatggcagtaaaagtgacgtctctaatttcagcgcagttatca 8457849  T
Q  236 atgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8457850 atgattgtagacacctgttagcttttgatttagtaacctctga 8457892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43018769 - 43018499
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  43018769 ttggtgtgtgtattcgagatgatgaaggtcgttatgttttagctaagactgaatggatgtctccgctccttgatgtggatttaggtgagactttaggttt 43018670  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||| ||| | ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||  |||||||| ||||||||||||| ||  |||    
T  43018669 attatcagccatgtattggattcacgatctgcaactagatattgtggactttgagtttgatttcaaaaccgtggtagatagtctttatggtattaaaagt 43018570  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    | |||||||||||||||| |||| || || || | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43018569 gacgtctctaattttagcgcagtaatcaaagactatagacgcatgttagcttctgatttagtaacctctga 43018499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 124 - 278
Target Start/End: Original strand, 13443959 - 13444113
Alignment:
Q  124 tgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaatttta 223  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13443959 tgggttcgtgatctacaactgggtattgtggactttgagcttaattccaaaattgtggtggatagtccttatggtagtaaaagtggcgtctctaatttta 13444058  T
Q  224 gcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  13444059 gcgcagtaattaatgactgtagacgtctgttagcttctgatttagcaaccactga 13444113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 278
Target Start/End: Original strand, 51951726 - 51951931
Alignment:
Q  73 ctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacacca 172  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||| | | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  51951726 ctccttgatgtggatttaggtgaggctttaggtttattatcaaccatgtattaggttcgtgatctgtagctaggtattgtggactttgagcttgattcta 51951825  T
Q  173 aaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaac 272  Q
    ||| |||||| || ||||||||||  || |  ||||| |||||||||||| || |||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  51951826 aaagtgtggtggatagtctttatgacaggaaaagtggggtctctaatttttgcgcagtaatcaatgactgtagacgcctgttagcttctgatttagtaac 51951925  T
Q  273 ctctga 278  Q
    ||||||    
T  51951926 ctctga 51951931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 278
Target Start/End: Original strand, 39133522 - 39133653
Alignment:
Q  145 ggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgta 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  39133522 ggtattgtggactttgagtttgactccaaaactgtggtagataatctttatggtagtaaaagtgacgtctctaattttag--cggtaattaatgattgta 39133619  T
Q  245 gacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39133620 gacgtttgttagcttctgatttagtaacctctga 39133653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 230
Target Start/End: Original strand, 39371317 - 39371444
Alignment:
Q  103 ggtttgttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagta 202  Q
    ||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  39371317 ggtttattatcaaccatgtactgggttcgcgatctggagtcaggtattgtggactttgagattgattccaaaattgtgataaatagtctttatggcagta 39371416  T
Q  203 ctagtggcgtctctaattttagcacagt 230  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39371417 aaagtggcgtctctaattttagcgcagt 39371444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 220
Target Start/End: Original strand, 26399928 - 26400113
Alignment:
Q  35 gtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaatgcactgggttcgtga 134  Q
    |||||| ||| ||||| ||||  ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  | | ||   ||||    
T  26399928 gtcgttatgtgttagctaagatcgaatgaatgactcctctccttgatgtggatttgggtgagcctttaggtttattatcagcaatatatttggggtgtga 26400027  T
Q  135 tctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaatt 220  Q
    | ||||  | |||||| |||| |||||||||||  |||||  ||| || || | ||||||||||||||  |||| | |||||||||    
T  26400028 tttgcagttgggtattatggattttgagcttgattccaaacatgtagttgataatctttatggtagtaaaagtgacatctctaatt 26400113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 268
Target Start/End: Original strand, 23487868 - 23488042
Alignment:
Q  94 gaggctttgggtttgttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtcttt 193  Q
    |||||||| ||||| |||| | || || | ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||  |||||  |||||| |||||| || ||||| |    
T  23487868 gaggctttaggtttattataaacattgtattgggtgcgtgatctatagctaggtattgtggattttggccttgattccaaaaatgtggtggatagtctct 23487967  T
Q  194 atggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttag 268  Q
    ||||||| |  |||  |||  |||||| |||  ||||||| | ||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  23487968 atggtagaaaaagtaacgttactaattatagtgcagttataattgattgtagacgcatgttagcttgtgatttag 23488042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2613 - 2343
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2613 ttggtgtttgcattcgagacgatgaaggtcactttgttttagccaagactgaatggatgacttcgcttcttgatgtggatttgggtgaggctttgggttt 2514  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | |    
T  2513 attatcagcaatgtactcggttcgcgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgactccaaaactgtggtagacaatctttatggtagtaaaaat 2414  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2413 ggcgtctctaattttagcacggttattaatgattgtagacgtctgttagcttctgatttagtaacctctga 2343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23770189 - 23769919
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  23770189 ttggtgtgtgcattcgagatgatgaaggttgttatgttttggccaagactgaatgaatgtctccactccttgatgtagatttgggtgagactttaggttt 23770090  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  23770089 attatcagccatgtactgggttcgcgatctgcagctaggtattgtggactttgagcttgattccaaaactgtggtagatagtctttatggcagtaaaagt 23769990  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23769989 ggcgtctctaattttagcgcagtaatcaatgattgtagacgtctgttagcttcagaattagtaacctctga 23769919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Original strand, 10213543 - 10213813
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||||| ||| ||||||||||  | |||||    
T  10213543 ttggtgtgtgtatccgagatgatgaaggttgttttgttttagccaaaactgaatggatgacttatctcattgatgtggatctgggtgaggccctaggttt 10213642  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     ||||||||| || | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| || ||||||||||||||||  |||    
T  10213643 attatcagcactgtattgggtccgtgatctgcagctgggtattgtggactttgagcttgattccaaaactgtggtggatagtctttatggtagtaaaagt 10213742  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10213743 ggcgtatctaattttagcgcagtaactaatgattgtagacgcttgttagcttctgatttagtaacctctga 10213813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24477846 - 24477620
Alignment:
Q  52 aagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattg 151  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24477846 aagactgaatggatgtctccgctccttgatgtggatttaggtgaggctttaggtttattatcagccatgtattgggttcgcgatctgcaattaggtattg 24477747  T
Q  152 tggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtct 251  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |  |    
T  24477746 tggactttgagcttgattccaaaactgtggtagatagtctttatggtagtaaaagtggcgtctctaattttagcgcagtaatgaatgactgtagatgcat 24477647  T
Q  252 gttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24477646 gttagcttctgatttagtaacctctga 24477620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23408161 - 23407895
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  23408161 ttggtgtgtgtattcgagatgatgaaggtcgttttgttttagccaaaactgaatggatgactccgctcattgatgtggatttgggtgaggccttaggttt 23408062  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
      |||| |||||| | || ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||| || |||||||||| |||||  |||    
T  23408061 actatc-gcaatgtattgagttcgtgat-tgcagctgggtattgtggactttgagcttgattctaaaactgtggtggatagtctttatgatagtaaaagt 23407964  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctct 276  Q
    | |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23407963 gacgtctctaattttagtttagtaattaatgattgtagacgcatgttagcttctgatttagtaacctct 23407895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38452106 - 38451838
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  38452106 ttggtgtgtgcattcgagatgatgaaggtcgttatgttttggccaagactaaatggatgtctccactccttgatgtggatttaggtgagactttaggttt 38452007  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||| ||| |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| | || || |||||||||||||  |||    
T  38452006 attatcagccatgtactgggttcgcgatcttcggctaggtattgtggactttgagcttgattccaaaaccgtgatggatagcctttatggtagtaaaagt 38451907  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctct 276  Q
    |||||||||||||||||| || | || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38451906 ggcgtctctaattttagcgcaataatcaatgactgtagacgcctgttagcttctgatttattaacctct 38451838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 103 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 45086304 - 45086129
Alignment:
Q  103 ggtttgttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagta 202  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||||| |    
T  45086304 ggtttattatcagcaatgtattgggttcgcgatctgcagttgggtattgtgaactttgagcttgattccaagaatgtggtagatagtctttatggtagca 45086205  T
Q  203 ctagtggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
       |||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45086204 aatgtggcgtctctaattttagcgccgtgatcaatgattgtaaacgactgttagcttatgatttagtaacctctga 45086129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 40074394 - 40074174
Alignment:
Q  55 actgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtgg 154  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  40074394 actgaatggatgactccactcattgaagtggatttgggcgaggctttaggtttattatcagcaatgtattgggtgcgtgatctacaattgggtattgtgg 40074295  T
Q  155 actttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgtt 254  Q
    | |||||| ||    |||||| |||||| || ||||||||||||||||  || ||||| ||||||| |||  ||| ||| ||||  |||| |||||||||    
T  40074294 attttgagttttgttccaaaactgtggtggatagtctttatggtagtaaaagcggcgtttctaattatagtgcag-tatcaatggctgtaaacgtctgtt 40074196  T
Q  255 agcctctgatttagtaacctct 276  Q
     || |||||||||| |||||||    
T  40074195 tgcttctgatttagcaacctct 40074174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 278
Target Start/End: Original strand, 22605840 - 22605913
Alignment:
Q  205 agtggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22605840 agtggcgtctctaatttttgcgtagttattaatgattgtagtcgtctgttagcttctgatttagtaacctctga 22605913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27352 - 27082
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27352 ttggtgtgtgcattcgagataatgaatgtcgttatgttttggccaagactggatggatgtttccactccttgatgtggatttgggtgaggctttaggttt 27253  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||  | |    
T  27252 attatcagccatgtattgggttcgcgatctgcagctaggtattgtggactttgagcttgattccaaaactatggtagatagtctttatggcagtataaat 27153  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    || ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  27152 ggtgtctctaattttagtgcagtaatcaatgattgtagacgcctgttatcttctgatttcgtaacctctga 27082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 216190 - 216453
Alignment:
Q  11 gtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgtt 110  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||  ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  216190 gtgtgtgcattcaagatgattaaggatgttatgttttggccaagactcaatggatgtctccgctccttgatgtggatttgggtgaggctttaggtttatt 216289  T
Q  111 atcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggc 210  Q
    ||| || ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||    
T  216290 atctgccatgtactgggttcgcgatctacagctaggtattgtggactttgagcttgattctaaaattgtggtagatagtctttatggcagtaaaaatggc 216389  T
Q  211 gtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacct 274  Q
     ||| |||||||||| || | || ||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  216390 atctttaattttagcgcaataatcaatgactgtagacgcatgttagattctgatttagtaacct 216453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25071219 - 25070949
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||| |||||| | | ||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25071219 ttggtgtgtgtattcgagatgatgaatgtcgttatttgttagctaaaattgaatggatgactccgctccttgatgtggatttgggtgaggctttaggttt 25071120  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagt 207  Q
     |||||||||||| | || ||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||  | ||    
T  25071119 attatcagcaatgtattgcgttcacgatctgcagctgagtattgtggactttgagtttgattccaaaattgtggtagatggtctatatggtagttattgt 25071020  T
Q  208 ggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    || ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  25071019 ggtgtctctaattttagcgcagtgatcaatgactgtagacgcatgttagcttctaatttagcaacctctga 25070949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 278
Target Start/End: Original strand, 48518813 - 48519056
Alignment:
Q  35 gtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaatgcactgggttcgtga 134  Q
    |||||| |||||| ||||||| | |||||||| ||  |||  ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||  ||| |||||||||| ||    
T  48518813 gtcgttatgttttggccaagatttaatggatgtcttcgctttttgatgtggattttggtgaggttttaggtttattatcagtcatgtactgggttcgcga 48518912  T
Q  135 tctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttatt 234  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| | |||||  || ||||  |||| ||||||| |||||||| || | ||     
T  48518913 tctgcagttaggtattgtggactttgaacttgattccaaaatcgtggtagatattctttgcggcagtaaaagtgacgtctctgattttagcgcaataatc 48519012  T
Q  235 aatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  48519013 aatgactatagacgtctgttagcttctgatttagtaatctctga 48519056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Original strand, 19956269 - 19956450
Alignment:
Q  19 attcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaa 118  Q
    |||||| |||| |||||||||| | | ||||| ||  | ||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19956269 attcgaaatgatgaaggtcgttatctattagctaaatccgaatggatgactctgtttcttgatgtgaatttgagtgaggctttaggtttattatcagcaa 19956368  T
Q  119 tgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtag 200  Q
    || | ||||| |||||||||    | ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19956369 tgtattgggtgcgtgatctgattttgggtattgtggattttgagcttgattccaaaattgtggtggatagtctttatggtag 19956450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0279
Description:

Target: scaffold0279; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 278
Target Start/End: Original strand, 6564 - 6708
Alignment:
Q  134 atctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6564 atctgcaactaggtattgtggactttgagtttgactccaaaactgtggtagacagcctttatggtagtaaaaatggcgtctctaattttagcgcagttat 6663  T
Q  234 taatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6664 taatgattgtaaacgtctattagcttctgatttagtaacctctga 6708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 278
Target Start/End: Original strand, 5156 - 5286
Alignment:
Q  148 attgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagac 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5156 attgtggactttgagcttgactccaaaactgtggtagacagtctttatggtagtaaaagtagcgtctctaattttaacgcagttattaatgattgtagac 5255  T
Q  248 gtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5256 gcctgttagcttttgatttagtaacctctga 5286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Original strand, 58124 - 58395
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggttt 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||| ||||||| |||| |||||    
T  58124 ttggtgtgtgcattcgagatgataaaggtcattatgttttagccaagactgaatggatgtctccgctcgttgatatggattcgggtgagcctttaggttt 58223  T
Q  108 gttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggactttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtagt-actag 206  Q
     ||||| || ||| |||||||||| ||| || | |||||||   ||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |     
T  58224 attatctgccatgtactgggttcgcgatttgtagctaggtacgttggactttgatattgattccaaaattgtggtagatagtctttatggcagtaaaaaa 58323  T
Q  207 tggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacctctga 278  Q
    | | |||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  58324 tcgtgtctctaattttagcgtagtaataaatgactgtagacgcctattagcttctgatttaataacctctga 58395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1814 - 1736
Alignment:
Q  8 ttggtgtttgcattcgagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactctgctccttgatgtcga 86  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1814 ttggtttttgtattctagatgaagaaggtcgttttgttttagccaagactgaatggatgactccgctccttgatgtcga 1736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 200
Target Start/End: Original strand, 20433 - 20574
Alignment:
Q  58 gaatggatgactctgctccttgatgtcgatttgggtgaggctttgggtttgttatcagcaatgcactgggttcgtgatctgcaactaggtattgtggact 157  Q
    |||||| |||||| | |||||||||| || |||  ||||||||| ||||| |||| | || || | ||||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  20433 gaatggttgactccggtccttgatgtggacttga-tgaggctttaggtttattataaacattgtattgggtgcgtgatctatagctaggtattgtggatt 20531  T
Q  158 ttgagcttgacaccaaaattgtggtagacagtctttatggtag 200  Q
    |||| |||||  |||||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  20532 ttgaccttgattccaaaactgtggtggatagtctctatggtag 20574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 148175 - 148073
Alignment:
Q  174 aattgtggtagacagtctttatggtagtactagtggcgtctctaattttagcacagttattaatgattgtagacgtctgttagcctctgatttagtaacc 273  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| |  |||| |||  |||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  148175 aattgtggtggatagtctctatggtaggaaaagtgacgttactaattatagtgcagtgattaatgatcgtagacgtctgataatttctgatttagtaacc 148076  T
Q  274 tct 276  Q
    |||    
T  148075 tct 148073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University