View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11207_low_13 (Length: 494)

Name: NF11207_low_13
Description: NF11207
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11207_low_13
NF11207_low_13
[»] chr7 (4 HSPs)
chr7 (1-485)||(20707189-20707675)
chr7 (1-485)||(20875233-20875719)
chr7 (119-433)||(41594420-41594734)
chr7 (1-103)||(41595380-41595482)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (119-433)||(43523027-43523341)
chr2 (127-333)||(5086489-5086695)
chr2 (1-103)||(43523986-43524088)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (121-433)||(22511700-22512012)
chr3 (1-103)||(22510960-22511062)
[»] chr5 (5 HSPs)
chr5 (119-433)||(23123110-23123424)
chr5 (119-433)||(14007281-14007585)
chr5 (1-103)||(23122357-23122459)
chr5 (11-103)||(14008231-14008323)
chr5 (127-195)||(7348331-7348399)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (1-103)||(50413725-50413827)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (267-418)||(12869189-12869340)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 20707675 - 20707189
Alignment:
Q  1 ccttgaccgtgaaggttagacacgtcaatgttatgtcgagaaaggacatcatacactggttccgtaagacttaaagatgtagtgtttgtaacatatctga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20707675 ccttgatcgtgaaggttagacacttcaatgttatgtcaagaaagtacatcatacactggttccgtaagacttaaagatgtagtgtttgtaacatatctga 20707576  T
Q  101 tatnnnnnnntgcagcaccctttgaaggtgaatattctagccatgaaagaaatttgctaaaccaagtgtcttgaaaccgtcttggatgtttctctccacc 200  Q
    |||       ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20707575 tattaaaaaatgcagcatccgttgaaggtaaatattctagccatgaaagaaatatgctaaaccaagtgtcttgaaaccgtcttggatgtttctctccacc 20707476  T
Q  201 agacaaaggatattcttctatatataattaatatgaaccccaattcaaataagctcttcgtattttatcaacttgatttggtggatatgtccatatttgg 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20707475 agacaaaagatattcttctatacatatttaatatgaaccccaattcgaataagctcttcgtattttat-aacatgatttagtggatatgtccatatttgg 20707377  T
Q  301 gaacgctttccaggatcacgttctaaagtattcacaaaataagcttggttatgcacttcttcaattcctagaacttgaacaagttgatgtgtaggag--- 397  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  20707376 gaacgctttccaggatcacgttttaaagtattcacaaaataagcttggttatgcacttcttcaattcctagaacttgaacaagttgatgtgtaagagtta 20707277  T
Q  398 ttatctcttcttcaattcttggtacttcaacaggttaagcgccatctgttatcttttgctacttcttcaaataaaacgggttctctgc 485  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20707276 ttatctcttcttgaattcttggtacttcaacaggttatgcgccatctgttatcttttccttcttcttcaaataaaatgggttctctgc 20707189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 20875719 - 20875233
Alignment:
Q  1 ccttgaccgtgaaggttagacacgtcaatgttatgtcgagaaaggacatcatacactggttccgtaagacttaaagatgtagtgtttgtaacatatctga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20875719 ccttgatcgtgaaggttagacacttcaatgttatgtcaagaaagtacatcatacactggttccgtaagacttaaagatgtagtgtttgtaacatatctga 20875620  T
Q  101 tatnnnnnnntgcagcaccctttgaaggtgaatattctagccatgaaagaaatttgctaaaccaagtgtcttgaaaccgtcttggatgtttctctccacc 200  Q
    |||       ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20875619 tattaaaaaatgcagcatccgttgaaggtaaatattctagccatgaaagaaatatgctaaaccaagtgtcttgaaaccgtcttggatgtttctctccacc 20875520  T
Q  201 agacaaaggatattcttctatatataattaatatgaaccccaattcaaataagctcttcgtattttatcaacttgatttggtggatatgtccatatttgg 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20875519 agacaaaagatattcttctatacatatttaatatgaaccccaattcgaataagctcttcgtattttat-aacatgatttagtggatatgtccatatttgg 20875421  T
Q  301 gaacgctttccaggatcacgttctaaagtattcacaaaataagcttggttatgcacttcttcaattcctagaacttgaacaagttgatgtgtaggag--- 397  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  20875420 gaacgctttccaggatcacgttttaaagtattcacaaaataagcttggttatgcacttcttcaattcctagaacttgaacaagttgatgtgtaagagtta 20875321  T
Q  398 ttatctcttcttcaattcttggtacttcaacaggttaagcgccatctgttatcttttgctacttcttcaaataaaacgggttctctgc 485  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20875320 ttatctcttcttgaattcttggtacttcaacaggttatgcgccatctgttatcttttccttcttcttcaaataaaatgggttctctgc 20875233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 119 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 41594734 - 41594420
Alignment:
Q  119 cctttgaaggtgaatattctagccatgaaagaaatttgctaaaccaagtgtcttgaaaccgtcttggatgtttctctccaccagacaaaggatattcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||  |||||||||||||||||||||    
T  41594734 cctttgaaggtgaatattctagccatgaatgaaataagctaaaccaagtgtctttaaaccgtcttggatgatctcctgtaccagacaaaggatattcttc 41594635  T
Q  219 tatatataattaatatgaaccccaattcaaataagctcttcgtattttatcaacttgatttggtggatatgtccatatttgggaacgctttccaggatca 318  Q
    || ||  | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41594634 taaatggatttgatatggaccccaattcagataagctcttcgtatttcatccacatgatttgctggaaatgtccatattggggaacgctttccaggatca 41594535  T
Q  319 cgttctaaagtattcacaaaataagcttggttatgcacttcttcaattcctagaacttgaacaagttgatgtgtaggagttatctcttcttcaattcttg 418  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | |   |||||||| ||||||||||| | |||| | |||| |||||    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  41594534 cgttctaaagaattcaaaaaatcacccgcgttatgcaattcttcaattctttgaacatcaacaggttgagtcatatgagttatgtcttcttcaattcttg 41594435  T
Q  419 gtacttcaacaggtt 433  Q
    | |||| || |||||    
T  41594434 gaactttaataggtt 41594420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 41595482 - 41595380
Alignment:
Q  1 ccttgaccgtgaaggttagacacgtcaatgttatgtcgagaaaggacatcatacactggttccgtaagacttaaagatgtagtgtttgtaacatatctga 100  Q
    ||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||||||||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| |    
T  41595482 ccttgaccacgaaggttagaaacatcaaggttatgtcgagaaagtatatcacacactgcttccttaagacttaaagatgtagtgctggtaacacatctca 41595383  T
Q  101 tat 103  Q
    |||    
T  41595382 tat 41595380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 119 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 43523341 - 43523027
Alignment:
Q  119 cctttgaaggtgaatattctagccatgaaagaaatttgctaaaccaagtgtcttgaaaccgtcttggatgtttctctccaccagacaaaggatattcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||| |   ||  |||||||||||||||||||||    
T  43523341 cctttgaaggtgaatattctagccatgaatgaaataagttaaaccaagtatctttaaaccgtcttggatgatctcctgtaccagacaaaggatattcttc 43523242  T
Q  219 tatatataattaatatgaaccccaattcaaataagctcttcgtattttatcaacttgatttggtggatatgtccatatttgggaacgctttccaggatca 318  Q
    || ||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43523241 taaatggatttgatatggaccccaattcaaataagctcttcgtatttcatccacatgatttgctggaaatgtccatattggggaacgctttccaggatca 43523142  T
Q  319 cgttctaaagtattcacaaaataagcttggttatgcacttcttcaattcctagaacttgaacaagttgatgtgtaggagttatctcttcttcaattcttg 418  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | |   |||||||| ||||||||||| | |||| | |||| |||||    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  43523141 cgttctaaagaattcaaaaaatcacccgcgttatgcaattcttcaattctttgaacatcaacaggttgagtcatatgagttatgtcttcttcaattcttg 43523042  T
Q  419 gtacttcaacaggtt 433  Q
    | |||| || |||||    
T  43523041 gaactttaataggtt 43523027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5086695 - 5086489
Alignment:
Q  127 ggtgaatattctagccatgaaagaaatttgctaaaccaagtgtcttgaaaccgtcttggatgtttctctccaccagacaaaggatattcttctatatata 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||||| | |||||  |       
T  5086695 ggtgaatattctagccatgaaggaaacaagctgaaccaagtgtcttgaaaccgccttggatgtttctgctcaccagacaagggatagttttctaatttcg 5086596  T
Q  227 attaatatgaaccccaattcaaataagctcttcgtattttatcaacttgatttggtggatatgtccatatttgggaacgctttccaggatcacgttctaa 326  Q
     || ||| | |||||| || | ||| ||||||||||||  |||   |||||| |||||||||  ||| ||| |   ||||||| ||||||||||||||||    
T  5086595 tttgataaggaccccattttagatacgctcttcgtattgcatccttttgattcggtggatattgccaaattggaatacgcttttcaggatcacgttctaa 5086496  T
Q  327 agtattc 333  Q
    || ||||    
T  5086495 agaattc 5086489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 43524088 - 43523986
Alignment:
Q  1 ccttgaccgtgaaggttagacacgtcaatgttatgtcgagaaaggacatcatacactggttccgtaagacttaaagatgtagtgtttgtaacatatctga 100  Q
    ||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||||||||| | |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| |    
T  43524088 ccttgaccacgaaggttagaaacatcaaggttatgtcgagaaagtatatcacacaccgcttccttaagacttaaagatgtagtgctggtaacacatctca 43523989  T
Q  101 tat 103  Q
    |||    
T  43523988 tat 43523986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 121 - 433
Target Start/End: Original strand, 22511700 - 22512012
Alignment:
Q  121 tttgaaggtgaatattctagccatgaaagaaatttgctaaaccaagtgtcttgaaaccgtcttggatgtttctctccaccagacaaaggatattcttcta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  22511700 tttgaaggtgaatattctagccatgaatgaaataagctaaaccaagtgtctttaaaccgtcttggatgatcccctttaccagacaaatgatattcttcta 22511799  T
Q  221 tatataattaatatgaaccccaattcaaataagctcttcgtattttatcaacttgatttggtggatatgtccatatttgggaacgctttccaggatcacg 320  Q
     ||  | || ||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22511800 aatggatttgatatagaccccaatttagataagctcttcatatttcatccacatgatttgctggaaatgtccatattggggaacgctttccaggatcacg 22511899  T
Q  321 ttctaaagtattcacaaaataagcttggttatgcacttcttcaattcctagaacttgaacaagttgatgtgtaggagttatctcttcttcaattcttggt 420  Q
    |||||||| ||||| ||||| | |   |||||||| ||||||||||| | | || | |||| |||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  22511900 ttctaaagaattcaaaaaatcacccgcgttatgcaattcttcaattctttgtacatcaacaggttgagttgtatgagttatgtcttcttcaattcttgga 22511999  T
Q  421 acttcaacaggtt 433  Q
    || ||||||||||    
T  22512000 acatcaacaggtt 22512012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 22510960 - 22511062
Alignment:
Q  1 ccttgaccgtgaaggttagacacgtcaatgttatgtcgagaaaggacatcatacactggttccgtaagacttaaagatgtagtgtttgtaacatatctga 100  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| |    
T  22510960 ccttgaccatgaaggttagaaacatcaaggttatgtcgagaaagtatatcacacaccgcttccttaagacttaaagatgtagtgctagtaacacatctca 22511059  T
Q  101 tat 103  Q
    |||    
T  22511060 tat 22511062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 119 - 433
Target Start/End: Original strand, 23123110 - 23123424
Alignment:
Q  119 cctttgaaggtgaatattctagccatgaaagaaatttgctaaaccaagtgtcttgaaaccgtcttggatgtttctctccaccagacaaaggatattcttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||  ||||||| |||||||||||||    
T  23123110 cctttgaaggtgaatattctagccatgaataaaacaagctaaaccaagtgtctttaaaccgtcttggatgatcccctttaccagacgaaggatattcttc 23123209  T
Q  219 tatatataattaatatgaaccccaattcaaataagctcttcgtattttatcaacttgatttggtggatatgtccatatttgggaacgctttccaggatca 318  Q
    || ||  | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  23123210 taaatggatttgatatggaccccaattcagataagctcttcgtatttcatccacatgatttgctggaaatgtccatattggggaacgcttttcaagatca 23123309  T
Q  319 cgttctaaagtattcacaaaataagcttggttatgcacttcttcaattcctagaacttgaacaagttgatgtgtaggagttatctcttcttcaattcttg 418  Q
    |||||||||  ||||| ||||| | |   |||||||| ||||||||||  | |||| | |||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23123310 cgttctaaataattcaaaaaatcacccgcgttatgcaattcttcaattttttgaacatcaacatgttgagttgtatgagttatgtcttcttcaattcttg 23123409  T
Q  419 gtacttcaacaggtt 433  Q
    | || ||||||||||    
T  23123410 gaacatcaacaggtt 23123424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 119 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 14007585 - 14007281
Alignment:
Q  119 cctttgaaggtgaatattctagccatgaaagaaatttgctaaaccaagtgtcttgaaaccgtcttggatgtttctctccaccagacaaaggatattcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||  ||||||||||||||||||||     
T  14007585 cctttgaaggtgaatattctagccatgaatgaaataagctaaaccaagtgtctttaaaccgtcttggatgatctcctgtaccagacaaaggatattctt- 14007487  T
Q  219 tatatataattaatatgaaccccaattcaaataagctcttcgtattttatcaacttgatttggtggatatgtccatatttgggaacgctttccaggatca 318  Q
             || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14007486 ---------ttgatatggaccccaatttagataagctcttcgtatttcatccacatgatttgctggaaatgtccatattggggaacgctttccaggatca 14007396  T
Q  319 cgttctaaagtattcacaaaataagcttggttatgcacttcttcaattcctagaacttgaacaagttgatgtgtaggagttatctcttcttcaattcttg 418  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | |   |||||||| ||||||||||| | |||| | |||| |||||    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  14007395 cgttctaaagaattcaaaaaatcacccgcgttatgcaattcttcaattctttgaacatcaacaggttgagtcatatgagttatgtcttcttcaattcttg 14007296  T
Q  419 gtacttcaacaggtt 433  Q
    | |||| || |||||    
T  14007295 gaactttaataggtt 14007281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 23122357 - 23122459
Alignment:
Q  1 ccttgaccgtgaaggttagacacgtcaatgttatgtcgagaaaggacatcatacactggttccgtaagacttaaagatgtagtgtttgtaacatatctga 100  Q
    ||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||||||||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| |    
T  23122357 ccttgaccacgaaggttagaaacatcaaggttatgtcgagaaagtatatcacacactgcttccttaagacttaaagatgtagtgctagtaacacatctca 23122456  T
Q  101 tat 103  Q
    |||    
T  23122457 tat 23122459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 14008323 - 14008231
Alignment:
Q  11 gaaggttagacacgtcaatgttatgtcgagaaaggacatcatacactggttccgtaagacttaaagatgtagtgtttgtaacatatctgatat 103  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||| | |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  14008323 gaaggttagaaacatcaaggttatgtcgagaaagtatatcacacaccgcttccttaagacttaaagatgtagtgctggtaacacatctcatat 14008231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7348399 - 7348331
Alignment:
Q  127 ggtgaatattctagccatgaaagaaatttgctaaaccaagtgtcttgaaaccgtcttggatgtttctct 195  Q
    |||||||||||||||||  || ||||  ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||    
T  7348399 ggtgaatattctagccacaaaggaaacatgccaaaccaagtgtgttgaaaccaccttggatgattctct 7348331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 50413827 - 50413725
Alignment:
Q  1 ccttgaccgtgaaggttagacacgtcaatgttatgtcgagaaaggacatcatacactggttccgtaagacttaaagatgtagtgtttgtaacatatctga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50413827 ccttgaccgcgaaggttagacacatcaaggttacgtcgagaaagcatatcacacactgcttccttaagagttaaagatgtagtgtttgtaacatatctca 50413728  T
Q  101 tat 103  Q
    |||    
T  50413727 tat 50413725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 267 - 418
Target Start/End: Original strand, 12869189 - 12869340
Alignment:
Q  267 atcaacttgatttggtggatatgtccatatttgggaacgctttccaggatcacgttctaaagtattcacaaaataagcttggttatgcacttcttcaatt 366  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |   |||||||| ||||||||||    
T  12869189 atcaacatgatttgctggaaatgtccgtattggggaacgctttccaggatcacgttctaaagaattcaaaaaatcacccgcgttatgcaattcttcaatt 12869288  T
Q  367 cctagaacttgaacaagttgatgtgtaggagttatctcttcttcaattcttg 418  Q
    | | |||| | |||| |||||    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  12869289 ctttgaacatcaacaggttgagtcatatgagttatgtcttcttcaattcttg 12869340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University