View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11221_low_1 (Length: 801)

Name: NF11221_low_1
Description: NF11221
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11221_low_1
NF11221_low_1
[»] chr3 (102 HSPs)
chr3 (215-532)||(16184669-16184986)
chr3 (213-533)||(53815722-53816041)
chr3 (213-533)||(2775375-2775695)
chr3 (213-533)||(7486464-7486784)
chr3 (213-532)||(43809473-43809792)
chr3 (213-533)||(2778618-2778938)
chr3 (213-533)||(45896274-45896594)
chr3 (213-533)||(54723635-54723955)
chr3 (213-532)||(50461530-50461849)
chr3 (213-532)||(52199807-52200125)
chr3 (213-533)||(6434759-6435078)
chr3 (213-533)||(29343855-29344175)
chr3 (213-533)||(43926729-43927048)
chr3 (213-533)||(2873458-2873777)
chr3 (213-533)||(24125393-24125712)
chr3 (213-533)||(24128670-24128989)
chr3 (213-532)||(3840410-3840729)
chr3 (213-534)||(49742899-49743220)
chr3 (214-533)||(8461468-8461786)
chr3 (213-530)||(23298599-23298916)
chr3 (213-533)||(11190420-11190740)
chr3 (215-532)||(27091790-27092106)
chr3 (213-533)||(538720-539040)
chr3 (213-533)||(20728628-20728947)
chr3 (213-533)||(32287304-32287624)
chr3 (213-532)||(11784659-11784978)
chr3 (213-533)||(25584581-25584890)
chr3 (215-533)||(47051391-47051709)
chr3 (213-530)||(15195286-15195602)
chr3 (219-533)||(10881380-10881693)
chr3 (223-533)||(10884761-10885070)
chr3 (213-533)||(9392628-9392947)
chr3 (213-525)||(10106588-10106899)
chr3 (213-533)||(12561215-12561534)
chr3 (213-533)||(30690630-30690949)
chr3 (213-532)||(35412409-35412722)
chr3 (213-533)||(28008052-28008370)
chr3 (213-533)||(16243767-16244086)
chr3 (224-532)||(17040004-17040311)
chr3 (213-533)||(22416815-22417134)
chr3 (213-533)||(48064016-48064335)
chr3 (215-533)||(47054821-47055139)
chr3 (213-533)||(17141302-17141621)
chr3 (213-533)||(54719865-54720184)
chr3 (254-532)||(18644750-18645028)
chr3 (213-534)||(25442839-25443160)
chr3 (213-532)||(55034838-55035160)
chr3 (213-530)||(19301489-19301805)
chr3 (213-530)||(19304673-19304989)
chr3 (213-533)||(34983834-34984153)
chr3 (213-478)||(32367165-32367429)
chr3 (266-526)||(31549118-31549378)
chr3 (240-533)||(46884862-46885153)
chr3 (213-531)||(41976909-41977212)
chr3 (280-532)||(35751401-35751653)
chr3 (213-533)||(17531637-17531950)
chr3 (213-533)||(17528742-17529057)
chr3 (213-529)||(3292943-3293261)
chr3 (213-448)||(28265774-28266005)
chr3 (213-420)||(52988299-52988505)
chr3 (213-530)||(22993680-22993999)
chr3 (213-530)||(30219989-30220309)
chr3 (315-532)||(54461010-54461227)
chr3 (213-479)||(18542445-18542711)
chr3 (341-532)||(18641754-18641945)
chr3 (272-530)||(17545808-17546068)
chr3 (213-529)||(22783486-22783812)
chr3 (213-529)||(22787850-22788176)
chr3 (331-532)||(55031978-55032183)
chr3 (401-533)||(52309596-52309728)
chr3 (619-789)||(41078357-41078523)
chr3 (416-533)||(28266013-28266130)
chr3 (266-466)||(282240-282439)
chr3 (213-307)||(31857710-31857804)
chr3 (213-316)||(52309754-52309858)
chr3 (253-382)||(27308717-27308845)
chr3 (433-533)||(52990813-52990913)
chr3 (210-276)||(17544506-17544572)
chr3 (467-533)||(37408828-37408894)
chr3 (293-379)||(27308157-27308243)
chr3 (103-175)||(30158472-30158544)
chr3 (482-533)||(6922682-6922733)
chr3 (474-533)||(10902094-10902153)
chr3 (104-198)||(10884575-10884669)
chr3 (103-175)||(36037396-36037468)
chr3 (103-174)||(17532041-17532112)
chr3 (104-202)||(9392453-9392551)
chr3 (214-255)||(6922641-6922682)
chr3 (472-517)||(25486290-25486335)
chr3 (444-504)||(31857847-31857910)
chr3 (124-173)||(55032259-55032308)
chr3 (104-175)||(2280049-2280120)
chr3 (107-173)||(9154434-9154500)
chr3 (105-150)||(44508425-44508470)
chr3 (150-210)||(6435149-6435209)
chr3 (118-210)||(8461859-8461950)
chr3 (106-170)||(26551211-26551275)
chr3 (290-382)||(27298594-27298686)
chr3 (150-210)||(28265643-28265703)
chr3 (104-175)||(10107004-10107075)
chr3 (213-251)||(22360339-22360377)
chr3 (124-173)||(55035268-55035317)
[»] chr2 (69 HSPs)
chr2 (213-533)||(9185419-9185739)
chr2 (213-533)||(31585935-31586255)
chr2 (213-532)||(31427537-31427856)
chr2 (213-533)||(5105517-5105837)
chr2 (213-533)||(5666309-5666628)
chr2 (213-533)||(9188647-9188967)
chr2 (213-533)||(45493151-45493470)
chr2 (213-533)||(45500893-45501212)
chr2 (213-534)||(42368705-42369025)
chr2 (176-533)||(9966364-9966723)
chr2 (213-533)||(11347890-11348210)
chr2 (213-533)||(24234886-24235206)
chr2 (213-533)||(25959683-25960003)
chr2 (213-532)||(25820842-25821160)
chr2 (213-533)||(30274763-30275083)
chr2 (216-526)||(25138933-25139243)
chr2 (213-533)||(27266579-27266899)
chr2 (213-533)||(37279671-37279991)
chr2 (213-532)||(38015309-38015628)
chr2 (217-533)||(8888431-8888746)
chr2 (213-533)||(24238158-24238478)
chr2 (213-533)||(40781263-40781582)
chr2 (213-533)||(43207885-43208204)
chr2 (213-530)||(45456952-45457269)
chr2 (213-533)||(26365724-26366044)
chr2 (213-532)||(16178918-16179236)
chr2 (213-532)||(33310457-33310776)
chr2 (240-533)||(22020885-22021178)
chr2 (213-530)||(36808440-36808756)
chr2 (213-533)||(13971889-13972208)
chr2 (213-524)||(45453665-45453975)
chr2 (213-534)||(22630632-22630952)
chr2 (213-533)||(1386417-1386736)
chr2 (213-533)||(43723492-43723810)
chr2 (213-532)||(37937215-37937533)
chr2 (213-533)||(6826563-6826881)
chr2 (213-533)||(25870575-25870894)
chr2 (213-533)||(3875077-3875397)
chr2 (213-533)||(40259134-40259453)
chr2 (213-533)||(12219586-12219906)
chr2 (213-533)||(16790752-16791073)
chr2 (213-533)||(25873966-25874291)
chr2 (302-533)||(29440375-29440605)
chr2 (213-528)||(17876897-17877211)
chr2 (232-530)||(17874585-17874877)
chr2 (213-526)||(30926338-30926645)
chr2 (384-532)||(10600876-10601024)
chr2 (213-327)||(17876211-17876325)
chr2 (213-466)||(35521423-35521679)
chr2 (213-330)||(10600737-10600854)
chr2 (346-487)||(34682624-34682764)
chr2 (213-274)||(29440314-29440375)
chr2 (103-210)||(26365545-26365653)
chr2 (104-210)||(38005566-38005674)
chr2 (104-171)||(29435365-29435432)
chr2 (104-173)||(4577466-4577535)
chr2 (104-210)||(25873788-25873895)
chr2 (104-174)||(10600578-10600648)
chr2 (290-342)||(11187953-11188005)
chr2 (104-176)||(15704403-15704475)
chr2 (123-210)||(29440156-29440243)
chr2 (104-163)||(15719670-15719729)
chr2 (107-173)||(1503866-1503931)
chr2 (105-173)||(38325984-38326053)
chr2 (105-173)||(38326706-38326775)
chr2 (107-173)||(1507070-1507135)
chr2 (176-210)||(6826458-6826492)
chr2 (176-210)||(24234781-24234815)
chr2 (104-174)||(25870421-25870491)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (213-534)||(5738077-5738398)
chr6 (213-534)||(3596774-3597095)
chr6 (213-533)||(2379040-2379360)
chr6 (213-534)||(1125728-1126049)
chr6 (215-533)||(9953776-9954093)
chr6 (213-533)||(20185555-20185874)
chr6 (213-533)||(22150117-22150436)
chr6 (213-533)||(11402067-11402387)
chr6 (213-533)||(26942429-26942748)
chr6 (213-533)||(30655254-30655574)
chr6 (213-533)||(9839388-9839708)
chr6 (213-533)||(10289783-10290102)
chr6 (213-530)||(22561160-22561477)
chr6 (213-532)||(11125692-11126009)
chr6 (232-533)||(23384746-23385048)
chr6 (240-529)||(6513093-6513382)
chr6 (240-533)||(13005026-13005319)
chr6 (240-533)||(14281514-14281807)
chr6 (213-533)||(24399990-24400309)
chr6 (213-527)||(28230405-28230718)
chr6 (213-533)||(19475813-19476132)
chr6 (213-533)||(24410110-24410428)
chr6 (240-520)||(28111773-28112051)
chr6 (268-533)||(17106604-17106868)
chr6 (213-527)||(2846112-2846428)
chr6 (213-533)||(13946829-13947148)
chr6 (213-533)||(18856019-18856338)
chr6 (240-533)||(28107781-28108075)
chr6 (213-533)||(4512283-4512606)
chr6 (213-530)||(11247572-11247889)
chr6 (213-457)||(12988195-12988439)
chr6 (213-530)||(13021249-13021568)
chr6 (293-533)||(7128190-7128429)
chr6 (240-493)||(5259774-5260024)
chr6 (213-420)||(24371084-24371292)
chr6 (276-505)||(23007934-23008163)
chr6 (276-505)||(23780201-23780430)
chr6 (606-793)||(12839136-12839330)
chr6 (213-487)||(28848652-28848926)
chr6 (607-719)||(25993943-25994055)
chr6 (213-444)||(31072115-31072332)
chr6 (318-533)||(26896253-26896467)
chr6 (213-448)||(11192657-11192893)
chr6 (607-719)||(25552777-25552889)
chr6 (419-533)||(23842792-23842906)
chr6 (627-791)||(6428597-6428766)
chr6 (617-789)||(31387537-31387704)
chr6 (22-200)||(2371897-2372072)
chr6 (420-532)||(32109685-32109797)
chr6 (213-367)||(2372136-2372286)
chr6 (417-534)||(23847783-23847899)
chr6 (438-533)||(2372293-2372383)
chr6 (213-324)||(26898071-26898182)
chr6 (213-312)||(11188130-11188229)
chr6 (213-296)||(23388327-23388410)
chr6 (722-793)||(25991763-25991834)
chr6 (104-208)||(5738471-5738575)
chr6 (213-287)||(28665503-28665577)
chr6 (104-210)||(1126112-1126220)
chr6 (103-210)||(23388484-23388591)
chr6 (426-476)||(23667721-23667771)
chr6 (104-171)||(11410379-11410446)
chr6 (459-533)||(24155360-24155434)
chr6 (104-175)||(28848474-28848545)
chr6 (103-210)||(9953599-9953703)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (213-533)||(3782-4102)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (213-533)||(292832-293151)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (213-533)||(23224904-23225224)
chr7 (213-533)||(45287068-45287387)
chr7 (213-532)||(2441278-2441597)
chr7 (213-532)||(48645270-48645588)
chr7 (215-533)||(37415422-37415741)
chr7 (213-533)||(8276781-8277101)
chr7 (213-532)||(6603254-6603573)
chr7 (213-528)||(13449780-13450094)
chr7 (213-526)||(9864732-9865045)
chr7 (213-529)||(13842436-13842751)
chr7 (213-533)||(9132759-9133078)
chr7 (213-532)||(16165544-16165863)
chr7 (213-533)||(17730610-17730929)
chr7 (213-533)||(20594059-20594378)
chr7 (223-533)||(26557305-26557614)
chr7 (213-533)||(4546665-4546984)
chr7 (213-533)||(3067976-3068295)
chr7 (213-533)||(4596008-4596327)
chr7 (213-533)||(14683443-14683762)
chr7 (215-533)||(10468942-10469259)
chr7 (213-533)||(20080717-20081036)
chr7 (213-533)||(26136127-26136446)
chr7 (213-533)||(26144507-26144826)
chr7 (213-534)||(37166145-37166465)
chr7 (215-406)||(37423083-37423273)
chr7 (290-533)||(9271464-9271699)
chr7 (344-533)||(45290479-45290667)
chr7 (217-425)||(11398132-11398340)
chr7 (213-530)||(5242152-5242471)
chr7 (213-452)||(10345010-10345248)
chr7 (213-530)||(7227323-7227641)
chr7 (213-487)||(18562577-18562852)
chr7 (376-533)||(11919864-11920021)
chr7 (213-529)||(13809519-13809831)
chr7 (354-533)||(4542734-4542912)
chr7 (213-466)||(5796347-5796600)
chr7 (213-368)||(22611770-22611925)
chr7 (215-388)||(4695322-4695494)
chr7 (403-533)||(35961076-35961206)
chr7 (428-529)||(4695491-4695592)
chr7 (93-210)||(26557107-26557225)
chr7 (452-532)||(11398049-11398129)
chr7 (213-274)||(45290671-45290732)
chr7 (93-163)||(8276610-8276680)
chr7 (213-288)||(9273363-9273438)
chr7 (104-175)||(11825791-11825862)
chr7 (104-175)||(8397471-8397541)
chr7 (213-431)||(24917991-24918208)
chr7 (104-209)||(10431936-10432041)
chr7 (104-206)||(4542610-4542713)
chr7 (213-367)||(2090402-2090555)
chr7 (467-532)||(22611710-22611775)
chr7 (489-533)||(10345266-10345310)
chr7 (104-206)||(4546489-4546590)
chr7 (172-210)||(13450165-13450203)
chr7 (176-210)||(13809902-13809936)
chr7 (176-213)||(17730505-17730542)
chr7 (107-175)||(22256875-22256944)
[»] chr4 (89 HSPs)
chr4 (213-532)||(56195335-56195654)
chr4 (213-532)||(44808950-44809269)
chr4 (213-533)||(34017775-34018095)
chr4 (213-533)||(39501456-39501776)
chr4 (213-533)||(40903077-40903397)
chr4 (213-532)||(34319912-34320231)
chr4 (213-531)||(24150480-24150798)
chr4 (213-532)||(15812131-15812451)
chr4 (213-533)||(27014071-27014391)
chr4 (213-526)||(29324633-29324946)
chr4 (213-533)||(48415523-48415843)
chr4 (213-531)||(19820536-19820853)
chr4 (213-533)||(48637313-48637633)
chr4 (213-533)||(52006525-52006844)
chr4 (213-532)||(5681236-5681554)
chr4 (213-532)||(56198661-56198980)
chr4 (213-532)||(12238071-12238392)
chr4 (213-534)||(27677048-27677368)
chr4 (213-533)||(44164591-44164910)
chr4 (217-533)||(52530929-52531245)
chr4 (213-529)||(15164000-15164317)
chr4 (213-533)||(24044135-24044454)
chr4 (213-532)||(15431887-15432205)
chr4 (213-530)||(15405078-15405398)
chr4 (213-533)||(5672692-5673023)
chr4 (213-532)||(46955473-46955792)
chr4 (213-533)||(40794810-40795130)
chr4 (213-532)||(3718932-3719250)
chr4 (213-533)||(40616802-40617136)
chr4 (213-533)||(5670374-5670705)
chr4 (213-533)||(38283483-38283802)
chr4 (215-533)||(18673076-18673393)
chr4 (215-533)||(37103210-37103526)
chr4 (280-533)||(18911374-18911626)
chr4 (213-533)||(11195484-11195803)
chr4 (213-532)||(33926775-33927099)
chr4 (222-533)||(3797802-3798112)
chr4 (213-533)||(15429850-15430169)
chr4 (213-525)||(49270494-49270799)
chr4 (213-533)||(12782713-12783032)
chr4 (213-532)||(40493362-40493681)
chr4 (213-533)||(53009552-53009871)
chr4 (240-533)||(19859516-19859808)
chr4 (213-530)||(33408314-33408631)
chr4 (213-533)||(15436464-15436783)
chr4 (213-532)||(21419597-21419915)
chr4 (216-533)||(30392380-30392696)
chr4 (213-532)||(29544869-29545187)
chr4 (213-532)||(25961866-25962185)
chr4 (240-533)||(19864511-19864799)
chr4 (213-483)||(35509773-35510042)
chr4 (213-530)||(8877497-8877815)
chr4 (213-515)||(8874772-8875075)
chr4 (240-530)||(53094342-53094633)
chr4 (222-471)||(15446792-15447040)
chr4 (215-530)||(37739754-37740074)
chr4 (213-408)||(19827298-19827492)
chr4 (606-793)||(5023930-5024110)
chr4 (215-478)||(22172422-22172685)
chr4 (224-411)||(27679341-27679527)
chr4 (606-793)||(1933640-1933821)
chr4 (388-532)||(5706374-5706519)
chr4 (266-466)||(33493756-33493956)
chr4 (228-411)||(48014168-48014351)
chr4 (627-793)||(26093804-26093975)
chr4 (617-739)||(22735702-22735826)
chr4 (442-530)||(39498346-39498434)
chr4 (266-488)||(5677447-5677660)
chr4 (462-533)||(15445359-15445430)
chr4 (104-210)||(27013894-27014000)
chr4 (213-274)||(15438501-15438562)
chr4 (104-210)||(12237903-12238009)
chr4 (109-201)||(5670198-5670290)
chr4 (457-529)||(35510043-35510115)
chr4 (104-206)||(37103603-37103706)
chr4 (479-533)||(19827489-19827543)
chr4 (215-323)||(8448745-8448854)
chr4 (109-201)||(5672517-5672609)
chr4 (104-208)||(5681060-5681163)
chr4 (290-329)||(24410206-24410245)
chr4 (105-175)||(18859391-18859461)
chr4 (104-210)||(19859905-19860013)
chr4 (118-173)||(11703020-11703075)
chr4 (335-429)||(8448654-8448748)
chr4 (104-150)||(40617139-40617185)
chr4 (111-151)||(7642770-7642810)
chr4 (104-155)||(19864926-19864977)
chr4 (118-173)||(33400754-33400808)
chr4 (104-173)||(10385579-10385648)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (215-533)||(41876758-41877076)
chr5 (213-534)||(26752694-26753015)
chr5 (213-533)||(20055583-20055902)
chr5 (215-533)||(18952504-18952821)
chr5 (213-533)||(42062730-42063050)
chr5 (213-532)||(22936932-22937251)
chr5 (213-532)||(14016133-14016452)
chr5 (213-533)||(7270825-7271144)
chr5 (213-533)||(17664361-17664679)
chr5 (213-532)||(7624911-7625230)
chr5 (213-530)||(34831572-34831889)
chr5 (213-533)||(26895598-26895917)
chr5 (213-533)||(41306521-41306840)
chr5 (215-533)||(43491566-43491884)
chr5 (213-532)||(40583058-40583376)
chr5 (213-533)||(33551930-33552249)
chr5 (213-533)||(4099511-4099830)
chr5 (213-533)||(34132977-34133296)
chr5 (213-533)||(34143208-34143527)
chr5 (213-533)||(12058486-12058805)
chr5 (213-533)||(12087767-12088086)
chr5 (213-532)||(14375790-14376121)
chr5 (213-533)||(21335692-21336011)
chr5 (213-533)||(26907449-26907768)
chr5 (217-533)||(31863513-31863843)
chr5 (213-533)||(17748249-17748568)
chr5 (213-532)||(39192137-39192457)
chr5 (213-533)||(21332674-21332995)
chr5 (224-533)||(26292611-26292919)
chr5 (213-530)||(21914930-21915249)
chr5 (213-458)||(2837112-2837357)
chr5 (213-526)||(28787330-28787636)
chr5 (213-530)||(18239492-18239809)
chr5 (213-533)||(11959172-11959483)
chr5 (606-791)||(22378451-22378636)
chr5 (217-394)||(32837831-32838007)
chr5 (606-794)||(17524550-17524731)
chr5 (213-411)||(30066151-30066348)
chr5 (334-532)||(22131159-22131357)
chr5 (22-207)||(32837570-32837755)
chr5 (213-363)||(23043973-23044123)
chr5 (379-526)||(37215019-37215166)
chr5 (213-338)||(22130073-22130198)
chr5 (266-487)||(18765681-18765903)
chr5 (93-210)||(21333066-21333183)
chr5 (93-210)||(21336082-21336199)
chr5 (444-533)||(30066348-30066437)
chr5 (426-533)||(23044163-23044270)
chr5 (295-487)||(31575306-31575499)
chr5 (104-206)||(22937326-22937428)
chr5 (290-411)||(563375-563496)
chr5 (104-207)||(28441522-28441625)
chr5 (104-175)||(26547705-26547776)
chr5 (104-175)||(26551264-26551335)
chr5 (105-173)||(3194814-3194883)
chr5 (118-210)||(14376194-14376286)
chr5 (105-173)||(34653187-34653256)
chr5 (124-208)||(43491408-43491492)
chr5 (104-146)||(2452953-2452995)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (213-533)||(14421550-14421871)
chr8 (213-532)||(18824389-18824708)
chr8 (213-533)||(10663705-10664024)
chr8 (213-532)||(18825882-18826201)
chr8 (213-532)||(36710631-36710950)
chr8 (213-533)||(16953582-16953902)
chr8 (213-533)||(18721275-18721595)
chr8 (213-533)||(25591473-25591792)
chr8 (213-530)||(43681867-43682184)
chr8 (213-533)||(12582814-12583133)
chr8 (213-529)||(25594655-25594971)
chr8 (213-533)||(5980307-5980626)
chr8 (213-532)||(22173918-22174237)
chr8 (213-532)||(17930787-17931105)
chr8 (213-532)||(21279764-21280082)
chr8 (213-533)||(13196663-13196982)
chr8 (213-533)||(10498208-10498527)
chr8 (213-532)||(23643625-23643944)
chr8 (240-533)||(45155263-45155556)
chr8 (215-529)||(12516450-12516765)
chr8 (226-533)||(31284493-31284799)
chr8 (240-533)||(38248393-38248685)
chr8 (215-530)||(8911455-8911771)
chr8 (213-532)||(5538768-5539087)
chr8 (248-533)||(25230921-25231206)
chr8 (222-524)||(2560367-2560669)
chr8 (224-534)||(33419473-33419782)
chr8 (213-533)||(23619358-23619677)
chr8 (215-533)||(44027087-44027404)
chr8 (225-485)||(4868075-4868330)
chr8 (213-529)||(5613715-5614041)
chr8 (376-533)||(33883344-33883501)
chr8 (213-530)||(30784735-30785042)
chr8 (48-210)||(45155654-45155817)
chr8 (673-789)||(45469511-45469632)
chr8 (462-533)||(20887589-20887660)
chr8 (450-532)||(14589616-14589698)
chr8 (103-210)||(25595042-25595149)
chr8 (104-175)||(5963868-5963939)
chr8 (103-210)||(18721666-18721773)
chr8 (103-210)||(25591863-25591965)
chr8 (104-171)||(452767-452834)
chr8 (103-213)||(23613168-23613278)
chr8 (123-210)||(10663546-10663634)
chr8 (104-210)||(14421372-14421479)
chr8 (104-176)||(18696359-18696431)
chr8 (213-253)||(23613346-23613386)
chr8 (470-533)||(5584390-5584462)
chr8 (97-155)||(31984603-31984661)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (213-533)||(62326-62645)
scaffold0035 (230-533)||(63686-63987)
scaffold0035 (104-206)||(62148-62250)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (213-533)||(2794038-2794357)
chr1 (213-533)||(45941226-45941546)
chr1 (213-532)||(6070948-6071267)
chr1 (213-533)||(28110867-28111186)
chr1 (213-532)||(37183858-37184177)
chr1 (213-533)||(20398663-20398983)
chr1 (213-532)||(31204648-31204967)
chr1 (213-532)||(45960739-45961058)
chr1 (213-530)||(49498494-49498811)
chr1 (213-533)||(21107285-21107604)
chr1 (213-530)||(23021920-23022237)
chr1 (213-533)||(1950449-1950768)
chr1 (213-532)||(29643216-29643534)
chr1 (213-519)||(49853086-49853391)
chr1 (213-533)||(41058296-41058615)
chr1 (213-533)||(3796820-3797139)
chr1 (213-533)||(673064-673386)
chr1 (213-533)||(905679-906002)
chr1 (223-533)||(21018461-21018770)
chr1 (213-525)||(2405320-2405631)
chr1 (240-530)||(34732357-34732647)
chr1 (304-532)||(27354939-27355165)
chr1 (276-526)||(27355687-27355939)
chr1 (374-533)||(21111152-21111311)
chr1 (240-479)||(21434523-21434763)
chr1 (213-529)||(7635455-7635773)
chr1 (215-487)||(27331817-27332082)
chr1 (213-381)||(11668171-11668339)
chr1 (442-533)||(21114492-21114583)
chr1 (376-526)||(11667001-11667152)
chr1 (346-530)||(13430954-13431140)
chr1 (348-466)||(16055629-16055747)
chr1 (351-489)||(42022587-42022720)
chr1 (348-526)||(16060968-16061148)
chr1 (348-466)||(16056864-16056982)
chr1 (371-487)||(34065202-34065318)
chr1 (266-342)||(34066626-34066702)
chr1 (104-199)||(1950850-1950945)
chr1 (473-532)||(27536526-27536585)
chr1 (104-175)||(37641479-37641550)
chr1 (104-171)||(49715985-49716052)
chr1 (104-171)||(49719468-49719535)
chr1 (213-259)||(42022485-42022531)
chr1 (123-210)||(2793880-2793967)
chr1 (435-487)||(30938601-30938654)
chr1 (263-316)||(37891150-37891203)
[»] scaffold0381 (2 HSPs)
scaffold0381 (213-533)||(5392-5712)
scaffold0381 (104-208)||(5786-5890)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (213-533)||(19204-19524)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (213-530)||(89578-89895)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (213-533)||(197956-198275)
[»] scaffold0962 (2 HSPs)
scaffold0962 (213-532)||(3277-3596)
scaffold0962 (137-210)||(3666-3739)
[»] scaffold0520 (3 HSPs)
scaffold0520 (213-534)||(8212-8532)
scaffold0520 (299-526)||(1549-1775)
scaffold0520 (213-319)||(4187-4293)
[»] scaffold0757 (1 HSPs)
scaffold0757 (215-529)||(5163-5476)
[»] scaffold0270 (1 HSPs)
scaffold0270 (224-532)||(58-366)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (213-533)||(58675-58996)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (215-533)||(57583-57901)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (213-532)||(10218-10536)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (213-532)||(67520-67838)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (276-533)||(2-259)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (213-527)||(30903-31216)
[»] scaffold1755 (1 HSPs)
scaffold1755 (290-533)||(7-249)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (213-533)||(29174-29493)
scaffold0084 (213-533)||(19104-19408)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (213-533)||(2999-3325)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (213-533)||(2067-2386)
[»] scaffold1208 (2 HSPs)
scaffold1208 (309-533)||(89-313)
scaffold1208 (213-287)||(17-91)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (213-529)||(118443-118759)
scaffold0002 (450-529)||(99233-99312)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (216-487)||(19168-19431)
[»] scaffold1785 (2 HSPs)
scaffold1785 (230-518)||(1076-1362)
scaffold1785 (499-533)||(1-35)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (604-793)||(188105-188296)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (299-533)||(248413-248646)
[»] scaffold1063 (1 HSPs)
scaffold1063 (297-532)||(2385-2628)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (300-533)||(27005-27237)
scaffold0080 (103-210)||(26819-26926)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (338-533)||(241434-241628)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (256-420)||(14091-14254)
[»] scaffold2073 (1 HSPs)
scaffold2073 (387-533)||(861-1007)
[»] scaffold1809 (1 HSPs)
scaffold1809 (339-533)||(1-193)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (266-517)||(48411-48664)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (213-479)||(9746-10014)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (438-533)||(7706-7801)
[»] scaffold0048 (2 HSPs)
scaffold0048 (426-533)||(15433-15540)
scaffold0048 (213-246)||(24630-24663)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (104-173)||(2095-2164)
[»] scaffold0062 (2 HSPs)
scaffold0062 (104-176)||(53315-53387)
scaffold0062 (104-163)||(68227-68286)
[»] scaffold0214 (3 HSPs)
scaffold0214 (104-173)||(13222-13291)
scaffold0214 (104-173)||(19672-19741)
scaffold0214 (104-173)||(27238-27307)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (213-249)||(1555-1591)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (97-155)||(226961-227019)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (487-532)||(14314-14359)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 102)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 215 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 16184986 - 16184669
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16184986 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaa 16184887  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16184886 taaacatggttagtctaggaatggataatcttttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 16184787  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagta 514  Q
     ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16184786 gctgtagtttaagaaaaaggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagta 16184687  T
Q  515 taccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16184686 taccaattaggggaacat 16184669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 53815722 - 53816041
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  53815722 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttct 53815821  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53815822 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 53815920  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  53815921 gggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 53816020  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  53816021 tataccaattaggggaacata 53816041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 2775375 - 2775695
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  2775375 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttct 2775474  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2775475 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 2775574  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2775575 gggctgtagtttgagaagagggtcctaattcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 2775674  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2775675 tataccaattaggggaacata 2775695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 7486464 - 7486784
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  7486464 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 7486563  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7486564 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 7486663  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7486664 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 7486763  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7486764 tataccaattaggggaacata 7486784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 43809473 - 43809792
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43809473 tcttgatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgtgaacgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttct 43809572  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  43809573 aataaacatggttagtctaggaatgaataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattag 43809672  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  43809673 ggggtgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagagtaggtgcag 43809772  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43809773 tataccaattaggggaacat 43809792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 2778618 - 2778938
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  2778618 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 2778717  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2778718 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 2778817  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2778818 gggctgtagtttgagaagagggtcctaattcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 2778917  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2778918 tataccaattaggggaacata 2778938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 45896274 - 45896594
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||    
T  45896274 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgagttgttct 45896373  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45896374 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 45896473  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45896474 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 45896573  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45896574 tataccaattaggggaacata 45896594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 54723635 - 54723955
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54723635 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 54723734  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  54723735 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttaatgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaaatag 54723834  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  54723835 gggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 54723934  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  54723935 tataccaattatgggaacata 54723955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 50461849 - 50461530
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50461849 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 50461750  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  50461749 aataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaatgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattag 50461650  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  50461649 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcag 50461550  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  50461549 tataccaattaggggaacat 50461530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 52199807 - 52200125
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52199807 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 52199906  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52199907 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 52200005  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  52200006 gggctgtagtttgagaagagggtcctaattcaagggattgattaggactattttgttaattatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 52200105  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52200106 tataccaattaggggaacat 52200125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 6435078 - 6434759
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6435078 tcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttct 6434979  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6434978 aataaacatggttagtctaggaatgaataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 6434880  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  6434879 gggctgtagtttgagaagagggttctatctcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataaaaataggtgcag 6434780  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6434779 tataccaattaggggaacata 6434759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 29344175 - 29343855
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||    
T  29344175 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagttagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattattct 29344076  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29344075 aataatcatggttagtctaggaatgaataatcttttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 29343976  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  29343975 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcaa 29343876  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29343875 tataccaattaggggaacata 29343855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 43926729 - 43927048
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  43926729 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 43926828  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43926829 aataaacaaggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 43926927  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43926928 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcatggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 43927027  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43927028 tataccaattaggggaacata 43927048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 2873458 - 2873777
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  2873458 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 2873557  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2873558 aataaacagggttagtctaagaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 2873656  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2873657 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattcataagaataggtgcag 2873756  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2873757 tataccaattaggggaacata 2873777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 24125393 - 24125712
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  24125393 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 24125492  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24125493 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 24125591  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24125592 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 24125691  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  24125692 tataccaattagggaaacata 24125712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 24128670 - 24128989
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  24128670 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 24128769  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24128770 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 24128868  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24128869 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 24128968  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  24128969 tataccaattagggaaacata 24128989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 3840410 - 3840729
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||    
T  3840410 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattattct 3840509  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  3840510 aataatcatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccatctaaggaattag 3840609  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3840610 gggttgtagtttgagaagagggtactaactcaagggattgattaggactgttttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaataggtgtag 3840709  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  3840710 tatatcaattaggggaacat 3840729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 213 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 49743220 - 49742899
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  49743220 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttct 49743121  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49743120 aataaacagggttagtttaggaatggataatcgtctgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 49743021  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||     
T  49743020 gggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcgttcataagaataggtgcaa 49742921  T
Q  513 tataccaattaggggaacataa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49742920 tataccaattaggggaacataa 49742899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 214 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 8461786 - 8461468
Alignment:
Q  214 cttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttcta 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8461786 cttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttcta 8461687  T
Q  314 ataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatg 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8461686 ataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgtt-tttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagg 8461588  T
Q  414 gactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagt 513  Q
    | |||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||||||| |||||||    
T  8461587 ggctgtagtttgagaagaggatactaaatcaagggattgattaggactattttgttaactatcatggaactatagaatcattcacaagaataggtgcagt 8461488  T
Q  514 ataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  8461487 ataccaattagggaaacata 8461468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 23298916 - 23298599
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23298916 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacataattgaattgttct 23298817  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||     
T  23298816 aataaacatcgttagtctaggaatggataatcgtttgttggtgatattaggttaatgttcttaaaaccttgaaagattcttagaccacctaagaaattag 23298717  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  23298716 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaactagaaagtcattcataagaataggtgcag 23298617  T
Q  513 tataccaattaggggaac 530  Q
     |||||||||| ||||||    
T  23298616 cataccaattaagggaac 23298599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 11190420 - 11190740
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11190420 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 11190519  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  11190520 aataaacatggttagtcgaggaatggataatcacttgttagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaagaattattagaccacctaaggaattag 11190619  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||     
T  11190620 gggttgtaggttgagaagagggttctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaacaagaaaatcattcataagaataggtgcaa 11190719  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11190720 tataccaattaggggaacata 11190740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 215 - 532
Target Start/End: Original strand, 27091790 - 27092106
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  27091790 ttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaataactactgaccatagctttcgacttagacctaattaacttgttctaa 27091889  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  27091890 taaacatggttagtctaggaatggataatcgtttattagtgataaaaggttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccgcctaagaaattaggg 27091989  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagta 514  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27091990 gatgtagtttgagaaga-ggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaataagaataggtgcagta 27092088  T
Q  515 taccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  27092089 taccaattaggagaacat 27092106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 538720 - 539040
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||      
T  538720 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaattactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttta 538819  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  538820 aataaacaggtttagtctagcaatggatattcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaacattcaaagattattagaccacctaaggaattag 538919  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  538920 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaataggtgtag 539019  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  539020 tataccaattagggaaacata 539040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 20728947 - 20728628
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  20728947 tcttaatgctttttatatccttatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 20728848  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20728847 aataaacagggttagtctaggaatggataatcttttgttagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 20728749  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
     | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20728748 aggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattagggctattttgttaaatatcatcgaactagaaaatcattcataagaatatgtgcag 20728649  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20728648 tataccaattaggggaacata 20728628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 32287624 - 32287304
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||||||||||||||  |||    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32287624 tcttaatgttttttatatattgacaccatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactaaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttct 32287525  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32287524 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttattagtgatattaggttaacatacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 32287425  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  32287424 ggattatagtttgagaagagggccctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcag 32287325  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32287324 tataccaattaggggaacata 32287304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 11784659 - 11784978
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11784659 tcttaatgctttttatatcctgatcacatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccttagctttcgacttagacctaattgaattgttct 11784758  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  11784759 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattagattaacgtgcttaaaaccttcaacgattattagaccacctaaggaattag 11784858  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  |||| |  || |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  11784859 gggttgtaatccgataagagggtcctaactcaagggatttattagggctattttgttaactatcgtggaactagtgaatcattcataagaatatgtgcag 11784958  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11784959 tataccaattaggggaacat 11784978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 25584581 - 25584890
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  25584581 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtga-----------tactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 25584669  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  25584670 aataaacagggttagtccaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattag 25584769  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25584770 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 25584869  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25584870 tataccaattaggggaacata 25584890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 215 - 533
Target Start/End: Original strand, 47051391 - 47051709
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47051391 ttaatgttttttatatcctggtcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaa 47051490  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  47051491 taaacatggttagtctaggaaaggataaccgtttgttactgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctatggaattaggg 47051590  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagta 514  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  47051591 gctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagagctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagta 47051690  T
Q  515 taccaattaggggaacata 533  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  47051691 taccagttaggggaacata 47051709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 15195602 - 15195286
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15195602 tcttattgctttttatatcctgattaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgtgct 15195503  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  15195502 aataaacatggttagtctaggaatggataatcttttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattag 15195404  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
     |  ||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15195403 aggttgtagtcctagaagagggtcctatctcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagtgaatcatttataagaatatgtgcag 15195304  T
Q  513 tataccaattaggggaac 530  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15195303 tataccaattaggggaac 15195286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 219 - 533
Target Start/End: Original strand, 10881380 - 10881693
Alignment:
Q  219 tgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10881380 tgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttatacttagacagaattgaattgttctaataaa 10881479  T
Q  319 catggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactg 418  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  10881480 cagggttaatctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacttaaggaattaggggctg 10881578  T
Q  419 tagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtatacc 518  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10881579 tagtttgagaagagggtcttaagtcaaaggattgattagaactattttgttaactattgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtatacc 10881678  T
Q  519 aattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||    
T  10881679 aattaggggaacata 10881693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 223 - 533
Target Start/End: Original strand, 10884761 - 10885070
Alignment:
Q  223 ttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatg 322  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  10884761 ttttatatcccgatcatatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagg 10884860  T
Q  323 gttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagt 422  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10884861 gttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtg-tttaaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagt 10884959  T
Q  423 ttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaatt 522  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10884960 ttgagaagagggttctaagtcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaatt 10885059  T
Q  523 aggggaacata 533  Q
    |||||||||||    
T  10885060 aggggaacata 10885070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 9392628 - 9392947
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  9392628 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgatcctagctttcgacttagatctaattgatttgttct 9392727  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9392728 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattagtttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacttaaggaattag 9392826  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||    
T  9392827 gggctagagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactattgtggaactagaaaatcattcataagtataggtgtag 9392926  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9392927 tataccaattaggggaacata 9392947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 213 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 10106899 - 10106588
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  10106899 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataagcatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacataattgaattgttct 10106800  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  10106799 aataaacagggttagtctaggaatggataatcatttgttagtgatattaggttaacgtgctt-acaccttcaaatattattagaccacctaaggaattag 10106701  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10106700 gggctgtagtttgagaagagggttctaagtcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 10106601  T
Q  513 tataccaattagg 525  Q
    |||||||||||||    
T  10106600 tataccaattagg 10106588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 12561534 - 12561215
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12561534 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 12561435  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  12561434 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 12561336  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || || | ||||||| ||||||    
T  12561335 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagggactctttcacaagaataggtgcag 12561236  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  12561235 tatatcaattaggggaacata 12561215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 30690630 - 30690949
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |    
T  30690630 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttat 30690729  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30690730 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 30690828  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30690829 gggttgtaatttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagaattattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 30690928  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  30690929 tataccaattagggaaacata 30690949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 35412409 - 35412722
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35412409 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttct 35412508  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||      |||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||     
T  35412509 aataaacatggttagtct------ggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctaacctaaggaattag 35412602  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35412603 ggactgtaatctgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 35412702  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  35412703 tataccaattagaggaacat 35412722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 28008370 - 28008052
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28008370 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacaaataactactaaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttct 28008271  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  | || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28008270 aataaatatggttagtctaggaatggataatcgtttattagtgataatagat--acgtacttacaacattcaaagattattagaccacctaaggaattag 28008173  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  28008172 gggctgtagtttgagaagagggtcataactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagagaataattcataagaataggtgcag 28008073  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  28008072 tatacaaatttggggaacata 28008052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 16243767 - 16244086
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  16243767 tcttaatgatttttatatcctgatcaaccgtaaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 16243866  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16243867 aataaatagggttagtctaggaatagataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaacacctaaggaattag 16243965  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16243966 gggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 16244065  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16244066 tataccaattaggggaacata 16244086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 224 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 17040311 - 17040004
Alignment:
Q  224 tttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatgg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17040311 tttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatgg 17040212  T
Q  324 ttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtt 423  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  17040211 ttagtctaggaatggataattgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaagattattagatcatctaaggaattaggggctgtagtt 17040113  T
Q  424 tgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaatta 523  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  17040112 tgagaagagggtcctaacttaagggattgattaggactattttgttaactatcatgaaactaaagaatcattcataagaataagtgttgtataccaatta 17040013  T
Q  524 ggggaacat 532  Q
     ||||||||    
T  17040012 agggaacat 17040004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 22417134 - 22416815
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22417134 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacataatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttct 22417035  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  22417034 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 22416936  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  | || || | ||||||| ||||||    
T  22416935 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaacgagtgactctttcacaagaataagtgcag 22416836  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22416835 tataccaattaggggaacata 22416815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 48064335 - 48064016
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  48064335 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagatctaattgaattgttct 48064236  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  48064235 aataaacatggttagtctatgaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattag 48064137  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||| | |||||||  |||||    
T  48064136 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaatagatgcag 48064037  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48064036 tataccaattaggggaacata 48064016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 215 - 533
Target Start/End: Original strand, 47054821 - 47055139
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47054821 ttaatgttttttatatcctggtcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaa 47054920  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  47054921 taaacatggttagtctaggaaaggataaccgtttgttactgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctatggaattaggg 47055020  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagta 514  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  47055021 gctttagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagagctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagta 47055120  T
Q  515 taccaattaggggaacata 533  Q
    ||| | ||| |||||||||    
T  47055121 tactagttatgggaacata 47055139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 17141302 - 17141621
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17141302 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttct 17141401  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||      
T  17141402 aataaacatggttagtctaggaatggatgatcctttattagtgatattaggttaacg-tgattaaacctttaacggttattagaccacctaagaaatttg 17141500  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||     
T  17141501 gggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagcgaatcattcataagaataggtgcaa 17141600  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17141601 tataccaattaggggaacata 17141621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 54719865 - 54720184
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54719865 tcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 54719964  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  54719965 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattag 54720063  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||| |||||     
T  54720064 gggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtagaactagtgaatcattcacaagaataggtgcaa 54720163  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||| || ||||||    
T  54720164 tataccaattatggaaacata 54720184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 254 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 18645028 - 18644750
Alignment:
Q  254 tagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattag 353  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  18645028 tagtgagaacgaatgactactgaccttagctttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggacaatcgtttgttag 18644929  T
Q  354 tgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattga 453  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18644928 tgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagtgtcctaactcaagggattga 18644829  T
Q  454 ttaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18644828 ttaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacat 18644750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 213 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 25443160 - 25442839
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25443160 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 25443061  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagatta-ttagaccacctaaggaatta 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||||    
T  25443060 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattagcttaacgtgc-ttaaacattcgacggttatttagaccacctaaggaatta 25442962  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgca 511  Q
     || |||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||| | ||||||| |||||    
T  25442961 ggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataggtgca 25442862  T
Q  512 gtataccaattaggggaacataa 534  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  25442861 atataccaattaggggaacataa 25442839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 55035160 - 55034838
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  55035160 tcttaatgctttttatatc-tgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 55035062  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  55035061 aataaacatgattagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattactaaaccacctaaggaattag 55034962  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataa----gaatatgt 508  Q
    ||  ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    ||||| ||    
T  55034961 gggatgtagtttgagaagaggattctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaatgaataggt 55034862  T
Q  509 gcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  55034861 gcagtataccaattaggggaacat 55034838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 19301805 - 19301489
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  19301805 tcttaatgctttttaaatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactacagaccctagctttcaacttagacataattgaattgttct 19301706  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  19301705 aataaacatggttagtctaggaatggataatcttttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaagattattaaaccacctaagaaattag 19301607  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19301606 gggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggatttattagaactattttgttaactatcgtagaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 19301507  T
Q  513 tataccaattaggggaac 530  Q
    | || ||| || ||||||    
T  19301506 tgtagcaaatacgggaac 19301489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 19304989 - 19304673
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||    
T  19304989 tcttaatgctttttaaatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactattgaccctagctttcaacttagacataaatgaattgttct 19304890  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19304889 aatgaacatggttagtataggaatggataatcatttgttaatgatgttaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 19304791  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19304790 gggttgtagtttgagaagagggtcgtaactcaggggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 19304691  T
Q  513 tataccaattaggggaac 530  Q
    | ||||||  ||||||||    
T  19304690 tgtaccaagcaggggaac 19304673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 34984153 - 34983834
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34984153 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactaccgactctaactttcaacttagacctaattgaattgttct 34984054  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  34984053 aataaacatggttagtctaagaatggataatcatttattagtgatattaggttaaagtgc-ttaaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattag 34983955  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||| |||| |    
T  34983954 gggctgtaaccctagaagatggtcctaactcaagggattgattatgactcttttgttaactatcgtagaactagtgaatcattcacaagaataggtgcgg 34983855  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  34983854 tataccaatcaggggaacata 34983834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 213 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 32367429 - 32367165
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32367429 tcttaatgctttttgtatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 32367330  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  32367329 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 32367231  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgt 478  Q
    || |||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32367230 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgt 32367165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 266 - 526
Target Start/End: Original strand, 31549118 - 31549378
Alignment:
Q  266 atgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggtt 365  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31549118 atgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagaaatggataatcgtttattagtgataataggtt 31549217  T
Q  366 aatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattt 465  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31549218 aacattcataaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattagggtctgtagttttagaagagggtcctaagtcaagggattgattatgactattt 31549317  T
Q  466 tgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31549318 tgttaactatcgtggaactagaaaattattcataagaataggtgcagtataccaattaggg 31549378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 240 - 533
Target Start/End: Original strand, 46884862 - 46885153
Alignment:
Q  240 atataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  46884862 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttggtctagaaatgga 46884961  T
Q  340 taatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtccta 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||     |||||| ||||| |    
T  46884962 taatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaacacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtccca 46885060  T
Q  440 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46885061 actcaagggattgattaggactattttgctaactatcgt-gaactagaaaagcattcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 46885153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 213 - 531
Target Start/End: Original strand, 41976909 - 41977212
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  41976909 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaataactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 41977008  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41977009 aataaacatgattagtctatgaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 41977107  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||              |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41977108 gggttgtagtttgagaag--------------agggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataagtgcag 41977193  T
Q  513 tataccaattaggggaaca 531  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  41977194 tataccaattaggagaaca 41977212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 280 - 532
Target Start/End: Original strand, 35751401 - 35751653
Alignment:
Q  280 tagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaac 379  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||| |||     
T  35751401 tagctttcaacttagacctaattgagttgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgttaatgatattaggttaacgtgcttaaaat 35751500  T
Q  380 cttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35751501 cttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgta 35751600  T
Q  480 gaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35751601 gaactagaaaatcattaatacgaaaaggtgcagtatacaaattaggggaacat 35751653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 17531950 - 17531637
Alignment:
Q  213 tcttaatg-ttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttc 311  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||         
T  17531950 tcttaatgcttttttatatc-tgatcaaatataaacataatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaat----- 17531857  T
Q  312 taataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17531856 taataaacatggttagtctaggaatggataat-ctttattagtgatattaggttaacg-tgtttaaaccttcaacggttattagaccacctaaggaatta 17531759  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgca 511  Q
     ||  ||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||| | ||||||| |||||    
T  17531758 ggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataggtgca 17531659  T
Q  512 gtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  17531658 gtataccaattagaggaacata 17531637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 17529057 - 17528742
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17529057 tcttaatactttttatattttgatcaaatataaacatgatttagtgataacgaatgactattgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 17528958  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||     
T  17528957 aataaacatggttagtctagga----ataatcctttattagtgatattaggttaatgtgc-ttaaaccttcaacggttattaaaccacctaaggaattag 17528863  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
     |  ||||     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  | ||||| | ||||||||||||||    
T  17528862 tggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttattaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaatatgtgcag 17528763  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  17528762 tatatcaattaggggaacata 17528742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 213 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 3293261 - 3292943
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  3293261 tcttaatgctttttatatcctagtcaaatataaacatgatttcgtgagaacgaatgactactaaccctagccttcaacttagacctaattgaattgttca 3293162  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatccttta-ttagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  | |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3293161 aataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttatttttttatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaatta 3293062  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgc 510  Q
     ||  |||| |  ||||||  |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||| |||| ||||    
T  3293061 ggggttgtaatcggagaagtgggtcttaagtcaagggattgattagggctattttgttaaccatcgtgaaactatagaatcattcataagaaataggtgc 3292962  T
Q  511 agtataccaattaggggaa 529  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3292961 aatataccaattaggggaa 3292943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 213 - 448
Target Start/End: Original strand, 28265774 - 28266005
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28265774 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaat---tactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttct 28265870  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28265871 aataaacatgattagtctaggaatggataatcttttattagtgatactaggttaacgttc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 28265969  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaaggg 448  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  28265970 gggctgtagtttgagaagagggttctatctcaaggg 28266005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 213 - 420
Target Start/End: Original strand, 52988299 - 52988505
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  52988299 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttct 52988398  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  52988399 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaactttcaacggttattagaccacctaaggaattag 52988497  T
Q  413 ggactgta 420  Q
    | ||||||    
T  52988498 gaactgta 52988505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 22993999 - 22993680
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  22993999 tcttaatgttttttatatacttatcagatataaacatgaattcgtgagagtgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttca 22993900  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  22993899 aataaacatggtaagtttaggaatggataatcgtttatttgtgatactaggttaacgttctaaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattag 22993800  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactatttt-gttaactatcgtggaactagaaaatcatttata-agaatatgtgc 510  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||  ||||||| ||  ||| |||   |||| ||||    
T  22993799 ggactgtaatttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattagggatattttagttaaccatcgtaaaactagagaagtattcatagtaaataggtgc 22993700  T
Q  511 agtataccaattaggggaac 530  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  22993699 agtgtaccaattaggggaac 22993680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 30220309 - 30219989
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||     
T  30220309 tcttaatgctctttatatccttatcaaatataaagatgatttggtgagagtgaatgactactgaccatagctttcaacttaaacctaattgaattgttca 30220210  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggtta---atgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaat 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||   ||   ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30220209 aataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttatttgtgatattaagttaactatcaacttaaaagcttcaaagaatattagaccacctaaggaat 30220110  T
Q  410 tatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtg 509  Q
    || ||  |  | | |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  30220109 taggggttacaatctatgaagagggtcctaagtcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtgaaactagagaatcattcataagaataggtg 30220010  T
Q  510 cagtataccaattaggggaac 530  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  30220009 cagttgaccaattaggggaac 30219989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 315 - 532
Target Start/End: Original strand, 54461010 - 54461227
Alignment:
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||    
T  54461010 taaacatggttagtctaggaatgtataatcctttactagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattaggg 54461109  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagta 514  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  54461110 actgtaatatgagaagagggtcctaactcaagggatgaattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagta 54461209  T
Q  515 taccaattaggggaacat 532  Q
    |||| ||| |||||||||    
T  54461210 tacccatttggggaacat 54461227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 213 - 479
Target Start/End: Original strand, 18542445 - 18542711
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||| | ||||||| | |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  18542445 tcttaatgatttttatatactgatcacatataa-catgaatttgtgagaatgaatgactaatgaccataactttcaacttagacctaattgaattgttca 18542543  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||     
T  18542544 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaagaaattag 18542643  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactatttt-gttaactatcgtg 479  Q
    |||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18542644 ggactgtaatctgagaagaaggtcttaagtcaagggattgattaggactattttagttaaccatcgtg 18542711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 341 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 18641945 - 18641754
Alignment:
Q  341 aatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaa 440  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||    
T  18641945 aatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagtgtcctaa 18641846  T
Q  441 ctcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18641845 ctcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacat 18641754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 272 - 530
Target Start/End: Original strand, 17545808 - 17546068
Alignment:
Q  272 actaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgtt 371  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||     
T  17545808 actaaccatagttttcaacttagacctaattgaattattcaaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttatttatgatactaggttaacgtg 17545907  T
Q  372 ctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactatttt-gtta 470  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17545908 cttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagggattgtaatctgagaagagggtcataagtcaagggattgattagggctattttagtta 17546007  T
Q  471 actatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgcagtataccaattaggggaac 530  Q
    || |||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17546008 accatcgtgaaactagagaatcattcataagaaataggtgcagtataccaattaggggaac 17546068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 213 - 529
Target Start/End: Original strand, 22783486 - 22783812
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||| | |||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  22783486 tcttaatgctttttatacccttatcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactgctgaccacaactttcaacttagacttaattgaattgttca 22783585  T
Q  313 aa-------taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagat-tattagaccacctaa 404  Q
    ||       |||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||    
T  22783586 aaattcaaataaacatggttattctaggtatgcataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaaaaaatattataccacctaa 22783685  T
Q  405 ggaattatggactgtag--tttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataaga 502  Q
    ||||||| || || ||   | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  22783686 ggaattaggggctatataatctgagaagagggtcctaagtcaagggatttattaggactattatgttaactatcgtgaaactagagaatcattcataaga 22783785  T
Q  503 atatgtgcagtataccaattaggggaa 529  Q
    |||||||  || | |||||||||||||    
T  22783786 atatgtgatgtgtgccaattaggggaa 22783812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 213 - 529
Target Start/End: Original strand, 22787850 - 22788176
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||| | |||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  22787850 tcttaatgctttttatacccttatcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactgctgaccacaactttcaacttagacttaattgaattgttca 22787949  T
Q  313 aa-------taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagat-tattagaccacctaa 404  Q
    ||       |||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||    
T  22787950 aaattcaaataaacatggttattctaggtatgcataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaaaaaatattataccacctaa 22788049  T
Q  405 ggaattatggactgtag--tttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataaga 502  Q
    ||||||| || || ||   | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  22788050 ggaattaggggctatataatctgagaagagggtcctaagtcaagggatttattaggactattatgttaactatcgtgaaactagagaatcattcataaga 22788149  T
Q  503 atatgtgcagtataccaattaggggaa 529  Q
    |||||||  || | |||||||||||||    
T  22788150 atatgtgatgtgtgccaattaggggaa 22788176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 331 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 55032183 - 55031978
Alignment:
Q  331 aggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaag 430  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| || | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  55032183 aggaatggataatcgtttgtcagtgatattaggttaacgtgcataaaagcttcaaagattactagaccacctaaggaatcaggggatgtagtttgagaag 55032084  T
Q  431 atggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataa----gaatatgtgcagtataccaattaggg 526  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  55032083 agggttctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaatgaataggtgcagtataccaattaggg 55031984  T
Q  527 gaacat 532  Q
    ||||||    
T  55031983 gaacat 55031978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 401 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 52309728 - 52309596
Alignment:
Q  401 ctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataa 500  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52309728 ctaaggaattaggggttgtagtttgagaagatggtcctagctcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataa 52309629  T
Q  501 gaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  52309628 gaataggtgcaatataccaattaggggaacata 52309596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 619 - 789
Target Start/End: Original strand, 41078357 - 41078523
Alignment:
Q  619 tgttattcagttttttgtctcagcaatgcag---aaacagggagcactcaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttag-ttttttggt 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41078357 tgttattcagttttttgtctcagcagtgcagcagaaacagggagcacccaaggact--ttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttagtttttttggt 41078454  T
Q  715 gttgtaacttgctgctgctgttagaactttgtatttctttactttgctaatgttggtagttcttataccttccta 789  Q
    | |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41078455 gatgtaacttgctgctgctgttagaac------tttctttactttgatagagttggtagttcttataccttccta 41078523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 416 - 533
Target Start/End: Original strand, 28266013 - 28266130
Alignment:
Q  416 ctgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtat 515  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  28266013 ctgtagtttgagaagagggttctatctcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataaaaataggtgcagtat 28266112  T
Q  516 accaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28266113 accaattaggggaacata 28266130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 266 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 282439 - 282240
Alignment:
Q  266 atgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggtt 365  Q
    ||||||||| ||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||     
T  282439 atgactactgaccctaacttttgacttagacctaattgaattgttcgaataaacatggttagtctaggaatggataattgtttattggtgatattatgtc 282340  T
Q  366 aatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattt 465  Q
    || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||   | |||| | |||||||| ||| |||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  282339 aacgttcttaaaaccttcgaagaatattagatcacctaaggaattagtaattgtaatctgagaagagggttctaagtcaa-tgattgattagaactattt 282241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 307
Target Start/End: Original strand, 31857710 - 31857804
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaatt 307  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31857710 tcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaagatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaatt 31857804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52309858 - 52309754
Alignment:
Q  213 tcttaatg-ttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttc 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52309858 tcttaatgcttttttatttcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgacaatagttttctacttagacctaattgaattgttc 52309759  T
Q  312 taata 316  Q
     ||||    
T  52309758 aaata 52309754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27308845 - 27308717
Alignment:
Q  253 ttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttatta 352  Q
    ||||| ||| || ||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||     
T  27308845 ttagtaagatcgaatgaccactgaccctagcttacgacttagacctaattgagttgttcaaataaacatggt-agtctaggaatagataatcgcttattt 27308747  T
Q  353 gtgatattaggttaatgttctttaaacctt 382  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27308746 gtgatattaggttaacgttcttaaaacctt 27308717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 433 - 533
Target Start/End: Original strand, 52990813 - 52990913
Alignment:
Q  433 ggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  52990813 ggtcctaactcaatggattgattacgactattttgttaattatcgtaaaactagagactcattcacaagaataggtgcggtataccaattaggggaacat 52990912  T
Q  533 a 533  Q
    |    
T  52990913 a 52990913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 210 - 276
Target Start/End: Original strand, 17544506 - 17544572
Alignment:
Q  210 tgatcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||    
T  17544506 tgatcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgaattcgtgagaatgaatgactactaa 17544572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 467 - 533
Target Start/End: Original strand, 37408828 - 37408894
Alignment:
Q  467 gttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37408828 gttaactatcgtggaactagtgaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 37408894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 293 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27308243 - 27308157
Alignment:
Q  293 agacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  27308243 agacctaattgaattgttcaaataaacaaggttaatcaaggaatagataatcgtttatttgtgttattaggttaacgttcttaaaac 27308157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 30158544 - 30158472
Alignment:
Q  103 acaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttc 175  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  30158544 acaacgatggaactctatcggtttattttctttattatgttgtttattcgtttgatcatgtctagctaatttc 30158472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 533
Target Start/End: Original strand, 6922682 - 6922733
Alignment:
Q  482 actagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6922682 actagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 6922733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 474 - 533
Target Start/End: Original strand, 10902094 - 10902153
Alignment:
Q  474 atcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10902094 atcgtggaactagaaaatcattcataagaatcggtgcaatataccaattaggggaacata 10902153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 198
Target Start/End: Original strand, 10884575 - 10884669
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgatt 198  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| ||| |||||||    ||||| |||||||||||||    
T  10884575 caacgacggaactttattggtttattttctttactatgttgtttaattctttgattatgtttagttaatttcctttgattaggtctgagatgatt 10884669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 36037468 - 36037396
Alignment:
Q  103 acaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttc 175  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||    
T  36037468 acaacgtcgaaactctatcgatttattttctttattatgttgtttattcattgaatcatgtgtagctaatttc 36037396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17532112 - 17532041
Alignment:
Q  103 acaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaattt 174  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  17532112 acaacgacggaactctttcgctttattttctttactatgttgcttattgctttaatcatgtctagctaattt 17532041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Original strand, 9392453 - 9392551
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgt 202  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||  || ||| ||||||| |||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  9392453 caacgacggaattctatcggtttattttcttctttatgttgtttgcttatttgatcatgtctagctagtttcttttgattaggtctgagatgattctgt 9392551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Original strand, 6922641 - 6922682
Alignment:
Q  214 cttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgattta 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6922641 cttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgattta 6922682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 472 - 517
Target Start/End: Original strand, 25486290 - 25486335
Alignment:
Q  472 ctatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtatac 517  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25486290 ctatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtatac 25486335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 504
Target Start/End: Original strand, 31857847 - 31857910
Alignment:
Q  444 aagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaact---agaaaatcatttataagaat 504  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  31857847 aaggaattgattagaactattttgttaactatcgtggaactagaagaaaatcattgataagaat 31857910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 55032308 - 55032259
Alignment:
Q  124 tttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  55032308 tttattttctttactatgttgtttattccttttatcatgtctagctaatt 55032259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 2280120 - 2280049
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttc 175  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||    
T  2280120 caacgacggaattctatcggtttattttctttacaatgttgtttgtttctttattcatgtctagctaatttc 2280049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 9154434 - 9154500
Alignment:
Q  107 cgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  9154434 cgacggaactttatctgtttattttttttactatgttgtttatgtatttaatcatgtctagctaatt 9154500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 150
Target Start/End: Original strand, 44508425 - 44508470
Alignment:
Q  105 aacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatt 150  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44508425 aacgacggaattctatcgatttattttctttactatgttgtttatt 44508470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6435209 - 6435149
Alignment:
Q  150 ttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtgtaaccct 210  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6435209 ttcttttatcatgtctagctaaattcttttgattaggtctgagatgaatctgtgtaaccct 6435149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8461950 - 8461859
Alignment:
Q  118 tatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtgtaaccct 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| ||||||| |||||| ||| |   ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  8461950 tatcgatttattttcttt-ttatgttatttgcttatttgatcatgtctagctagtttattttgattaggtctgagatgattttgtgtaaccct 8461859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 170
Target Start/End: Original strand, 26551211 - 26551275
Alignment:
Q  106 acgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagcta 170  Q
    ||||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26551211 acgacggaacactttcaatttaatttctttactatgttgtttatttctttcatcatgtctagcta 26551275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27298686 - 27298594
Alignment:
Q  290 cttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaacctt 382  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| || |||| ||||||| | ||   ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  27298686 cttagacataattgaattgttcaaataaatacggttagtttatgaatagataatcatatacctgtgatattatgttaacgttcttaaaacctt 27298594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 210
Target Start/End: Original strand, 28265643 - 28265703
Alignment:
Q  150 ttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtgtaaccct 210  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28265643 ttcttttatcatgtctagctaaattcttttgattaggtctgagatgaatctgtgtaaccct 28265703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10107075 - 10107004
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttc 175  Q
    |||||||||||   ||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  10107075 caacgacggaatcctattggtttattttctttactatgttgtttaattctttgattatgtctagctaatttc 10107004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 251
Target Start/End: Original strand, 22360339 - 22360377
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatga 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22360339 tcttaatgttttttatatactgatcatatataaacatga 22360377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 55035317 - 55035268
Alignment:
Q  124 tttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  55035317 tttattttctttactacgctgtttattccttttatcatgtctagctaatt 55035268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 257; Significance: 1e-142; HSPs: 69)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 9185739 - 9185419
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  9185739 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 9185640  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9185639 aataatcatggttagtctaggaatgaataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 9185540  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9185539 agactgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatatgtgcag 9185440  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9185439 tataccaattaggggaacata 9185419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 31586255 - 31585935
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  31586255 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataatcatgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 31586156  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31586155 aataatcatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 31586056  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  31586055 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatagatgcag 31585956  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31585955 tataccaattaggggaacata 31585935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 31427856 - 31427537
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31427856 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 31427757  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  31427756 aataaacatggttaatctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacttaaggaattag 31427657  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  31427656 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattaatacgaataggtgcag 31427557  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31427556 tataccaattaggggaacat 31427537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 5105517 - 5105837
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  5105517 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacataatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 5105616  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5105617 aataatcatggttagtataggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 5105716  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  5105717 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcatatgaataggtgcag 5105816  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5105817 tataccaattaggggaacata 5105837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 5666309 - 5666628
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5666309 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaatagttct 5666408  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5666409 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 5666507  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5666508 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcttggaactagaaaatcattcataagaatatgtgcag 5666607  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5666608 tataccaattaggggaacata 5666628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 9188967 - 9188647
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  9188967 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagatttctacttagacagaattgaattgttct 9188868  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9188867 aataatcatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagtaattag 9188768  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9188767 gggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttgactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 9188668  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9188667 tataccaattaggggaacata 9188647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 45493470 - 45493151
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  45493470 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttct 45493371  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45493370 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgttc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 45493272  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  45493271 gggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtagaactagagaatcattcataagaataggtgcag 45493172  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  45493171 tataccaattagggaaacata 45493151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 45501212 - 45500893
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  45501212 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttct 45501113  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45501112 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgttc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 45501014  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  45501013 gggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtagaactagagaatcattcataagaataggtgcag 45500914  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  45500913 tataccaattagggaaacata 45500893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 213 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 42369025 - 42368705
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  42369025 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 42368926  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42368925 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 42368827  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42368826 gggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 42368727  T
Q  513 tataccaattaggggaacataa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42368726 tataccaattaggggaacataa 42368705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 176 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 9966723 - 9966364
Alignment:
Q  176 tagagattaagtctgagatgattctgtgtaaccctgatct--taatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactac 273  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9966723 tagagattaggtctgagatgattctttgtaaccctaatctcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactac 9966624  T
Q  274 taaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttct 373  Q
    | |||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||     
T  9966623 tgaccatagcttcctacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcatttatttgtgatgttaagttaacgttca 9966524  T
Q  374 ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaact 473  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9966523 taaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaagggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggtttgattatgactattttgttaact 9966424  T
Q  474 atcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9966423 atcgtgaaactagaaaataattcataagaataggtgcaatataccaattaggggaacata 9966364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 11348210 - 11347890
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  11348210 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 11348111  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  11348110 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattag 11348011  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  11348010 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatagatgcag 11347911  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11347910 tataccaattaggggaacata 11347890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 24234886 - 24235206
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||  |||||||  |||||||||||| |    
T  24234886 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatatctttctacttagacagaattgaattgttat 24234985  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24234986 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 24235085  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  24235086 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactaggaaatcattcataagaataggtgcag 24235185  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24235186 tataccaattaggggaacata 24235206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 25960003 - 25959683
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  25960003 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 25959904  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  25959903 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaacctttaaagattattagaccacctaaggaattag 25959804  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25959803 gggttgtagtctgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 25959704  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25959703 tataccaattaggggaacata 25959683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 25821160 - 25820842
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  25821160 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcaacttatacctaattgaattgttct 25821061  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25821060 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatactaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 25820962  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25820961 gggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 25820862  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  25820861 tatatcaattaggggaacat 25820842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 30275083 - 30274763
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  30275083 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 30274984  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30274983 aataatcatggttagtctaggaatggataatcctttatcagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 30274884  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30274883 gggctgtagtttgagaagagggtcttaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 30274784  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  30274783 tataccaattaggagaacata 30274763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 216 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 25139243 - 25138933
Alignment:
Q  216 taatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaat 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  25139243 taatgctttttatatcctgatcaaatgtaaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctcat 25139144  T
Q  316 aaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgga 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  25139143 aatcatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggg 25139044  T
Q  416 ctgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtat 515  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  25139043 ttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaacttgaaaatcgttcataagaataggtgcagtat 25138944  T
Q  516 accaattaggg 526  Q
    |||||||||||    
T  25138943 accaattaggg 25138933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 27266579 - 27266899
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27266579 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccatagatttcgacttagacctaattgaattgttct 27266678  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27266679 aataaacatggttagtctaagaatggataatcgtttattagtgataataggttaacgtacttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaattag 27266778  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||     
T  27266779 gggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaaggaatttattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaagtcattcataagaatagctgcat 27266878  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27266879 tataccaattaggggaacata 27266899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 37279991 - 37279671
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  37279991 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 37279892  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  37279891 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacattcttaaaaccttcaaagattattagaccacgtaaggaattag 37279792  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  37279791 gggctgtagtttgagaagaggatcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 37279692  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37279691 tataccaattaggggaacata 37279671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 38015309 - 38015628
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38015309 tcttaatgctttttatatcatgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgactttgacctaattgaattgttct 38015408  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  38015409 aataaacatggttagtctaggaatggataatcatttgttagtgatattaggttaaggtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattag 38015508  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||    
T  38015509 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggttcag 38015608  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  38015609 tatatcaattaggggaacat 38015628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 217 - 533
Target Start/End: Original strand, 8888431 - 8888746
Alignment:
Q  217 aatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaata 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  8888431 aatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaata 8888530  T
Q  317 aacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggac 416  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8888531 aacagggttagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggc 8888629  T
Q  417 tgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtata 516  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8888630 tgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagaactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtata 8888729  T
Q  517 ccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||    
T  8888730 ccaattaggggaacata 8888746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 24238158 - 24238478
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  24238158 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatggctactgaccatatctttctacttagacagaattgaattgttct 24238257  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24238258 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaatcttcaaagattattagaccacctaaggaattag 24238357  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  24238358 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggtatattttgttaactatcgtggaactaggaaatcattcataagaataggtgcag 24238457  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24238458 tataccaattaggggaacata 24238478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 40781263 - 40781582
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  40781263 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccacagctttctacttagacagaattgaattgttct 40781362  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  40781363 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtaatattaggtcaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattag 40781461  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40781462 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 40781561  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40781562 tataccaattaggggaacata 40781582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 43208204 - 43207885
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  43208204 tcttaatactttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttct 43208105  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  43208104 aataaacagggttagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttacaaccttcaaagactattagaccacctaaggaattag 43208005  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  43208004 gggctgtagtttgagaagagggtcct-actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatagatgcag 43207906  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43207905 tataccaattaggggaacata 43207885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Original strand, 45456952 - 45457269
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45456952 tcttaatgctttttatatcctgattaaatataaacatgatttagttagaacgaatgactactgaccctagttttcgacttagacctaattgaattgttct 45457051  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  45457052 aataaacatggttagtctatgaatggataatctttttttagtgatattaggttaacgttctttaaaccttctattattattagaccacctaaggaattag 45457151  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  45457152 gggctgtagtttgagaagagggtcttaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcag 45457251  T
Q  513 tataccaattaggggaac 530  Q
    |||| |||||||||||||    
T  45457252 tataacaattaggggaac 45457269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 26365724 - 26366044
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  26365724 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaattactactgaccctaactttcgacttatacctaattgaatttttct 26365823  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26365824 aataaacatggttagtttaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 26365923  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||     
T  26365924 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtacac 26366023  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26366024 tataccaattaggggaacata 26366044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 16178918 - 16179236
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16178918 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactttcgacttagacctaattgaattgttct 16179017  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16179018 aataaacatggttagtctaggaatggataatccattattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 16179116  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  |||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  16179117 gggatgtaatcctagaagagggtcctaactcaagggattgattagagctattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaatatatgcag 16179216  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16179217 tataccaattaggggaacat 16179236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 33310457 - 33310776
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33310457 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttggacttagacctaattgaattgttct 33310556  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  33310557 aataaacatagttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacttgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattag 33310656  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||    
T  33310657 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactaccgtggaactagaaaattattaatatgaatagttgcag 33310756  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33310757 tataccaattaggggaacat 33310776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 240 - 533
Target Start/End: Original strand, 22020885 - 22021178
Alignment:
Q  240 atataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22020885 atataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 22020984  T
Q  340 taatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtccta 439  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||| |||    
T  22020985 taatcgtttattagtgatattaggttaacgtacttaaaacctttaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggttcta 22021084  T
Q  440 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22021085 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggtaacata 22021178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 36808756 - 36808440
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36808756 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtaagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttct 36808657  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  36808656 aataaacagggttagtctaggaatgtataatcgtttattagtaatattaggttaacgtgc-ttaaactttcaaagattattagaccacctaaagaattag 36808558  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36808557 ggtctgtagtttaagaagagggtcttaactcaagggattgattagaactattttgttaactattgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 36808458  T
Q  513 tataccaattaggggaac 530  Q
    | ||||||||||||||||    
T  36808457 tgtaccaattaggggaac 36808440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 13972208 - 13971889
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  13972208 tcttaatgttttttatatcatgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattggatttttct 13972109  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13972108 aaaaaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 13972010  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  | || ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13972009 gggttttattttgagaagagtgtcctaagttaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 13971910  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13971909 tataccaattaggggaacata 13971889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 213 - 524
Target Start/End: Original strand, 45453665 - 45453975
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45453665 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa-catgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 45453763  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  45453764 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattag 45453863  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||     
T  45453864 gggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagtgctattttgttaactatcatggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcat 45453963  T
Q  513 tataccaattag 524  Q
    ||||||||||||    
T  45453964 tataccaattag 45453975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 213 - 534
Target Start/End: Original strand, 22630632 - 22630952
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22630632 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 22630731  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  22630732 aataaacattgttagtctaagaatggataatattttattattgatattaggttaacatgc-ttaaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattag 22630830  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  22630831 gggctgtaaccctagaaaatggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagggaatcattcataagaataggtgcag 22630930  T
Q  513 tataccaattaggggaacataa 534  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  22630931 tataccaattaagggaacataa 22630952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 1386736 - 1386417
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1386736 tcttaatgctttttatatcatgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 1386637  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1386636 aataaacatggttagtctagaaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 1386538  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||| | ||||||| ||||||    
T  1386537 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataagtgcag 1386438  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1386437 tataccaattaggggaacata 1386417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 43723492 - 43723810
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||    
T  43723492 tcttaatgctttttatatc-tgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaactgttct 43723590  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43723591 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttagcgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 43723689  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  43723690 ggactatagtttgagacgagggtcctaagttaaaggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcaa 43723789  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43723790 tataccaattaggggaacata 43723810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 37937533 - 37937215
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  37937533 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacataattgaattattct 37937434  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  37937433 aataaacatggttagtttaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaacgattattagaccacctaaggaattgg 37937335  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||| |||| |    
T  37937334 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtagaactagtgaatcattcacaagaataggtgcgg 37937235  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37937234 tataccaattaggggaacat 37937215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 6826563 - 6826881
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||    
T  6826563 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgaaaatgaatgactactgaccatagctttctacttagaaagaattgaattgttct 6826662  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  6826663 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaaattattagaccacctaaggaattag 6826761  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  6826762 gggctgtagtttgagaagagaatcctaagtcaagggtttgattaggactattttgttaac-atcgtggaactagaaaatcattcataaaaataggtgcag 6826860  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  6826861 tataccaattaggggagcata 6826881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 25870575 - 25870894
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||    
T  25870575 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagacttgaattgttct 25870674  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25870675 aataaacagggttagtctaggaatggataattgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 25870773  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||    
T  25870774 gggatgtagtttgagaagacggtcctaactcaagggattgattaaaactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcacaagaataggtgtag 25870873  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
     ||||||||||||| ||||||    
T  25870874 cataccaattagggaaacata 25870894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 3875077 - 3875397
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3875077 tcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaattactaccgaccctagctttcgacttagacctaattgaatttttct 3875176  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  3875177 aataaacatggttagtataggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacg-tgattaaaccttcaatggttattagaccacctaaggaattag 3875275  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttat-aagaatatgtgca 511  Q
    || |||||     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||||||||    
T  3875276 gggctgtaaccctagaagagtgtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagtgaattattaataaagaatatgtgca 3875375  T
Q  512 gtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3875376 gtataccaattaggggaacata 3875397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 40259453 - 40259134
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40259453 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagttttcgacttagacctaattgaattgttct 40259354  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  40259353 aataaacatggttagtttaggaatggataatcatttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaacgattattataccacctaaggaattag 40259255  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    |  |||||     | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||| | ||||||| ||||||    
T  40259254 gcgctgtaaccctataagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataggtgcag 40259155  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40259154 tataccaattaggggaacata 40259134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 12219586 - 12219906
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatga-ctactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttc 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12219586 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatcatttagtgagaacgaatgaactactgaccctagctttcgacttaaacctaattgaattgttc 12219685  T
Q  312 taataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12219686 taataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacataaggaatta 12219784  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgca 511  Q
     |   | ||     |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  12219785 agagatataaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgctaactatcgtggaactagaaaaacattcacaagaataggtgca 12219884  T
Q  512 gtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12219885 gtataccaattaggggaacata 12219906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 16791073 - 16790752
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16791073 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttaatgagaacgaatgactactgaccatagctttcggcttagacctaattgaattgttct 16790974  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggtta--atgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16790973 aataaacatggttagtctaggaatggataatcatttgttagtgatattaggttaacacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaatt 16790875  T
Q  411 atggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgc 510  Q
    | || ||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  | || || | || |||| ||||    
T  16790874 aggggctgtagccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaagactagtgactctttcacaataataggtgc 16790775  T
Q  511 agtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16790774 agtataccaattaggggaacata 16790752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 25873966 - 25874291
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||  |||||||  | ||||||||||||    
T  25873966 tcttaatgttttttatattctgatcaaatataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacagacttgaattgttct 25874065  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaa---- 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  25874066 aataaacagggttagtctaggaatggataattgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 25874164  T
Q  409 --ttatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatat 506  Q
      ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  25874165 ggttaggggatgtagtttgagaagacggtcctaactcaagggattgattaaaactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaatag 25874264  T
Q  507 gtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25874265 gtgtagtataccaattagggaaacata 25874291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 302 - 533
Target Start/End: Original strand, 29440375 - 29440605
Alignment:
Q  302 tgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29440375 tgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactagcttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacc 29440473  T
Q  402 taaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag 501  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29440474 taaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataag 29440573  T
Q  502 aatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  29440574 aataggtgcagtataccaattagggaaacata 29440605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 213 - 528
Target Start/End: Original strand, 17876897 - 17877211
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17876897 tcttaattctttttatatcctggtcaaatataaacatgatttagtgagaacgaattactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 17876996  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| || |||||||||| ||||| | |||||| |||||     
T  17876997 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggataacgtgc-ttatacgttcaaagattgttagagcccctaagtaattaa 17877095  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  |||| |    |||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||     
T  17877096 gggttgtaatcctcgaagaaagtcctaactcaagggattgattttggctattttgttaactatcatggaactagagaatcattaataagaataggtgcaa 17877195  T
Q  513 tataccaattagggga 528  Q
    |||| |||||||||||    
T  17877196 tatatcaattagggga 17877211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 232 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 17874877 - 17874585
Alignment:
Q  232 ctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtcta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17874877 ctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacttaattgaattgttctaatacacatggttagtcta 17874778  T
Q  332 ggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaa-agattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaag 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||     |||||    
T  17874777 ggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgt------aaccttcaacaga-tattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaag 17874685  T
Q  431 atggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaac 530  Q
    | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17874684 agggtcctaacttaagggattgactaagactattttgttaatcatcgtagaactagtgaatcattcacaagaataggtgcagtgtaccaattaggggaac 17874585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 213 - 526
Target Start/End: Original strand, 30926338 - 30926645
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  30926338 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgattttgtgagaatgaatgactgctaaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttca 30926437  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacc----taaggaa 408  Q
    ||||||||||||           ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||    |||||||    
T  30926438 aataaacatggt-----------tggataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcataaaaccttcaaagagtattagaccacctaattaaggaa 30926526  T
Q  409 ttatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttata-agaatatg 507  Q
    ||| ||  |||  | |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  || | |||| |    
T  30926527 ttaggggttgtcatctgagaagagggtcctaagtcaatggattgattaggactattttgctaaccatcgtgaaactagaaaatcattcgtagaaaatagg 30926626  T
Q  508 tgcagtataccaattaggg 526  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  30926627 tgcagtatatcaattaggg 30926645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 384 - 532
Target Start/End: Original strand, 10600876 - 10601024
Alignment:
Q  384 aaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaac 483  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10600876 aaagattactagaccacctaaggaattaagggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattaggattattttgttaactatcgtggaac 10600975  T
Q  484 tagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    |||| ||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10600976 tagagaatcattcataaaaataggtgcagtatatcaattaggggaacat 10601024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17876325 - 17876211
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17876325 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacttaattgaattgttct 17876226  T
Q  313 aataaacatggttag 327  Q
    |||| ||||||||||    
T  17876225 aatacacatggttag 17876211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 213 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 35521679 - 35521423
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | | ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||     
T  35521679 tcttaatgtattttatatactgataatatataa-catgaattcgtgagaatgaaagactactgatcctagctttcaacttagacctaattgatttgttca 35521581  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaat----ggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaa 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||  |||||| ||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  35521580 aataaacatggttagtctaggaatatatggataattgtttatttgtgatataaggttagcgctcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaagaaa 35521481  T
Q  409 ttatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactatttt 466  Q
    ||| ||| |||| | |||||||| |||||||| |||| |  |||||||| ||||||||    
T  35521480 ttagggattgtaatctgagaagagggtcctaagtcaatgagttgattagaactatttt 35521423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 213 - 330
Target Start/End: Original strand, 10600737 - 10600854
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  10600737 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 10600836  T
Q  313 aataaacatggttagtct 330  Q
    |||||||||| |||||||    
T  10600837 aataaacatgattagtct 10600854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 346 - 487
Target Start/End: Original strand, 34682624 - 34682764
Alignment:
Q  346 tttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaa 445  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||| ||||    
T  34682624 tttatttgtgatatcaggttaacgttcttaaaacc--caaagaatattagatcaccttaggaattagggactgtaatctgagaagagagtcctaagtcaa 34682721  T
Q  446 gggattgattaggactatttt-gttaactatcgtggaactaga 487  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  34682722 gggattgattagggctattttggttaaccatcgtgaaactaga 34682764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 274
Target Start/End: Original strand, 29440314 - 29440375
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactact 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29440314 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactact 29440375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 210
Target Start/End: Original strand, 26365545 - 26365653
Alignment:
Q  103 acaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaa-tttctagagattaagtctgagatgattctg 201  Q
    ||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||     
T  26365545 acaacgatgaaactctatcggtttattttttttattatgttgtttattccttttatcatgtctagctaattttcttttgattaagtctgagatgattctt 26365644  T
Q  202 tgtaaccct 210  Q
    | |||||||    
T  26365645 tctaaccct 26365653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38005674 - 38005566
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaattt--ctagagattaagtctgagatgattctg 201  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  |||| ||||||||||   ||||||| | ||||||||| |||||     
T  38005674 caacgacggaactctatcggtttattttctttactatgttgtttattcctttaactatgtctagctaattttcttagagatgaggtctgagatcattctt 38005575  T
Q  202 tgtaaccct 210  Q
    |||||||||    
T  38005574 tgtaaccct 38005566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Original strand, 29435365 - 29435432
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaa 171  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  29435365 caacgacggaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatttatttgatcatgtctagctaa 29435432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 173
Target Start/End: Original strand, 4577466 - 4577535
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  4577466 caacgacgaagctctatcgatttattttctttactatgttgtttatttctttaattatgtctagctaatt 4577535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Original strand, 25873788 - 25873895
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaattt-ctagagattaagtctgagatgattctgt 202  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||| ||| || |||| |||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||| |    
T  25873788 caacgactgaactttatcggtttaatttcttctttatgttgtttgtttatttgattatgtctagctaatttcctagatgttaggtctgaggtgattcttt 25873887  T
Q  203 gtaaccct 210  Q
    ||||||||    
T  25873888 gtaaccct 25873895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 174
Target Start/End: Original strand, 10600578 - 10600648
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaattt 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  10600578 caacgacggaactttatcggtttattttctttactatattgtttgttattttaatcatgtctagctaattt 10600648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 11187953 - 11188005
Alignment:
Q  290 cttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataa 342  Q
    |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11187953 cttatacctaattgaattgtttaattaaacatggttagtctaggaatggataa 11188005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15704475 - 15704403
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttct 176  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||    
T  15704475 caacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatttatttgatcatgtctagttaaattct 15704403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Original strand, 29440156 - 29440243
Alignment:
Q  123 atttattttcttta-ttatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtgtaaccct 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29440156 atttattttctttacttatgttgtttatt-ctttgatcatgtctagctaaattcctttgattaggtctgagatgaatctgtgtaaccct 29440243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15719729 - 15719670
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgt 163  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  15719729 caacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatttatttgatcatgt 15719670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1503931 - 1503866
Alignment:
Q  107 cgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  1503931 cgacgaaactctatcgatttattttctt-actatgttgtttatttatttaatcatgtctagctaatt 1503866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 173
Target Start/End: Original strand, 38325984 - 38326053
Alignment:
Q  105 aacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatt-tcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  38325984 aacgacggaattctatcgatttattttctttactacgttgtttattctttttaatcatgtctagctaatt 38326053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 38326775 - 38326706
Alignment:
Q  105 aacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatt-tcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  38326775 aacgacggaattctatcgatttattttctttactacgttgtttattctttttaatcatgtctagctaatt 38326706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1507135 - 1507070
Alignment:
Q  107 cgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  1507135 cgacgaaactctatcggtttattttctt-actatgttgtttatttatttaatcatgtctagctaatt 1507070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 6826458 - 6826492
Alignment:
Q  176 tagagattaagtctgagatgattctgtgtaaccct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6826458 tagagattaagtctgagatgattctttgtaaccct 6826492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 24234781 - 24234815
Alignment:
Q  176 tagagattaagtctgagatgattctgtgtaaccct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24234781 tagagattaagtctgagatgattctttgtaaccct 24234815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 174
Target Start/End: Original strand, 25870421 - 25870491
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaattt 174  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||| ||| || |||| ||||||||||    
T  25870421 caacgaccgaactttatcggtttaatttcttctttatgttgtttgtttatttgattatgtctagctaattt 25870491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 213 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 5738398 - 5738077
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  5738398 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttct 5738299  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5738298 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 5738199  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5738198 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 5738099  T
Q  513 tataccaattaggggaacataa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5738098 tataccaattaggggaacataa 5738077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 213 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3597095 - 3596774
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  3597095 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaataaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 3596996  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3596995 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaatgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 3596896  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3596895 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 3596796  T
Q  513 tataccaattaggggaacataa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3596795 tataccaattaggggaacataa 3596774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 2379040 - 2379360
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  2379040 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttct 2379139  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2379140 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattac 2379239  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
     | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2379240 aggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 2379339  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2379340 tataccaattaggggaacata 2379360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 213 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1126049 - 1125728
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  1126049 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaaggaataactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttct 1125950  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1125949 aataatcatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 1125850  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  1125849 gggctgtagtttgagaagagggtcttaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtccag 1125750  T
Q  513 tataccaattaggggaacataa 534  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  1125749 tataccaattaggagaacataa 1125728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 215 - 533
Target Start/End: Original strand, 9953776 - 9954093
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  9953776 ttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaa 9953875  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9953876 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 9953974  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagta 514  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  9953975 gttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaattagaaaattattcataagaataggtgcagta 9954074  T
Q  515 taccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9954075 taccaattaggggaacata 9954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 20185555 - 20185874
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  20185555 tcttaatgatttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 20185654  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20185655 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttattagtgatattaggttaacattctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 20185753  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20185754 gggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 20185853  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20185854 tataccaattaggggaacata 20185874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 22150436 - 22150117
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  22150436 tcttaatgatttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 22150337  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22150336 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttattagtgatattaggttaacattctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 22150238  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22150237 gggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 22150138  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22150137 tataccaattaggggaacata 22150117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 11402067 - 11402387
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11402067 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttct 11402166  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  11402167 aataaacagggttaatctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaacacctaaggaattag 11402266  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  11402267 gggatatagtataagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaaacattcataagaataggtgcag 11402366  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  11402367 tataccaattagggaaacata 11402387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 26942748 - 26942429
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |    
T  26942748 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgtttt 26942649  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  26942648 gataaacaaggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagtttattagaccacctaaggaattag 26942550  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  26942549 gggctgtaatttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataggaataggtgcag 26942450  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26942449 tataccaattaggggaacata 26942429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 30655254 - 30655574
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  30655254 tcttaatgctttttatatcccgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttct 30655353  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30655354 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 30655453  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  30655454 gggctgtagtttgagaagagggtcctaattcaagggattgattaggactattttgttaactattatggaactagagaatcattcataagaataagtgcag 30655553  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30655554 tataccaattaggggaacata 30655574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 9839708 - 9839388
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  9839708 tcttaatgttttttatatccttatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgactatagctttctacttagacctaattgaattgttca 9839609  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9839608 aataaatatggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcgtaaaactttcgaagattattagaccacctaaggaattag 9839509  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9839508 ggactgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattagggctactttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 9839409  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9839408 tataccaattaggggaacata 9839388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 10289783 - 10290102
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  10289783 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttct 10289882  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10289883 aataaacaaggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaatgtgc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 10289981  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||| |||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  10289982 gggctgtaatttgagaagaaggtcctaagttaaaggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactaaaaaataattcataagaataagtgcag 10290081  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  10290082 tataccaattcggggaacata 10290102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 22561477 - 22561160
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||     
T  22561477 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactaacaatagctttctacttagacctaattgatttgttca 22561378  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  22561377 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttatttctgatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagattatgagatcacctaaggaattag 22561278  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22561277 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttgactatcgtgaaaccagaaaatcattcataagaataggtgcag 22561178  T
Q  513 tataccaattaggggaac 530  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22561177 tataccaattaggggaac 22561160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 11126009 - 11125692
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11126009 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgaaaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgtttt 11125910  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  11125909 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttactgatatttggttaacgtgc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaaatat 11125811  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||    
T  11125810 gggctttagtttgtgaagagggtcctaactcaagggactgatcaggactattttgttaactatcgtggaactag-agatcattcataagaataggtgcag 11125712  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11125711 tataccaattaggggaacat 11125692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 232 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 23385048 - 23384746
Alignment:
Q  232 ctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtcta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23385048 ctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtcta 23384949  T
Q  332 ggaatggata--atcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaa 429  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23384948 ggaatggatataatcgtttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaacaactaaggaattaggggctgtagtttgagaa 23384850  T
Q  430 gatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaa 529  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23384849 gagggtcctaaatcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaaacattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaa 23384750  T
Q  530 cata 533  Q
    ||||    
T  23384749 cata 23384746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 240 - 529
Target Start/End: Original strand, 6513093 - 6513382
Alignment:
Q  240 atataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 339  Q
    |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6513093 atataaacatgatttcatgagaatgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctacgaatgaa 6513192  T
Q  340 taatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtccta 439  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||    
T  6513193 taatcgtttattagtgatattaggttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggatgtagtttgagaagagagtccta 6513292  T
Q  440 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaa 529  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  6513293 actcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtatatcaattaggggaa 6513382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 240 - 533
Target Start/End: Original strand, 13005026 - 13005319
Alignment:
Q  240 atataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  13005026 atataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactggccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaataga 13005125  T
Q  340 taatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtccta 439  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||    
T  13005126 taatcgtttattagtgatattaggttaacgtacttaaaaaattcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcata 13005225  T
Q  440 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13005226 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgaagtataccaattaggggaacata 13005319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 240 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 14281807 - 14281514
Alignment:
Q  240 atataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 339  Q
    ||||||||||||||| || |||| | ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14281807 atataaacatgatttcgttagaatgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattcaattgttctaataaacatggttagtctaggaattga 14281708  T
Q  340 taatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtccta 439  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  14281707 taatcgtttattagtgatattaggttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtccta 14281608  T
Q  440 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14281607 acttaagggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaacaagagaatcattcataagaataggtgcagtatcccaattaggggaacata 14281514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 24399990 - 24400309
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24399990 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 24400089  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||     
T  24400090 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcgacggttattagaccacctgaggaattag 24400188  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||   | || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || | ||||||| ||||||    
T  24400189 gggttgtaaccttaggagagggtcctcacttaagggattgattaggactaatttgttaactatcgtagaactagtgaatcgttcacaagaataggtgcag 24400288  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  24400289 tataccaattagggaaacata 24400309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 213 - 527
Target Start/End: Original strand, 28230405 - 28230718
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28230405 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgatttgttct 28230504  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  28230505 aataaacatggttagtctaggaatgaataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 28230603  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  | || || | ||||||| ||||||    
T  28230604 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcag 28230703  T
Q  513 tataccaattagggg 527  Q
    |||||||||||||||    
T  28230704 tataccaattagggg 28230718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 19475813 - 19476132
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19475813 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagttttcgacttagacctaattgaattgttct 19475912  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  19475913 aataaacatggttagcctaggaatggataatcctttattagtgatagtaggttaacg-tgttaaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 19476011  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| | ||||||| ||||||    
T  19476012 gggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggactgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagagactcattcacaagaataggtgcag 19476111  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19476112 tataccaattaggggaacata 19476132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 24410110 - 24410428
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24410110 tcttaatgctttttatatc-tgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 24410208  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| | | | |||||||||||||||||||||||     
T  24410209 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaacctccgacggttattagaccacctaaggaattag 24410307  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||   | || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||| || | ||||||| ||||||    
T  24410308 gggctgtaaccttaggagagggtcctgactcaagggattgattaggacttatttgttaactatcgtagaactagtgaatcgttcacaagaataggtgcag 24410407  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  24410408 tataccaattagggaaacata 24410428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 240 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28112051 - 28111773
Alignment:
Q  240 atataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 339  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28112051 atataaacatgatttagtgagattgaatgactactaaccatagctt-cgacttagaccaaattgaattgatctaataaacatggttagtctaggaatgaa 28111953  T
Q  340 taatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtccta 439  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  28111952 gaatcgtttattagtgatattaggttaacgtactt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggatgtagtttgagaagagggtccta 28111854  T
Q  440 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaa 520  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28111853 actcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtagaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaa 28111773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 268 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 17106868 - 17106604
Alignment:
Q  268 gactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaa 367  Q
    ||||||| |||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17106868 gactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgttttttagtgatattaggttaa 17106769  T
Q  368 tgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttg 467  Q
     || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17106768 cgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggactattttg 17106670  T
Q  468 ttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17106669 ttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatatgtgcaatataccaattaggggaacata 17106604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 213 - 527
Target Start/End: Original strand, 2846112 - 2846428
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  2846112 tcttaatgttttttatatcatgataaaatataaacatgatttcgtgataatgaatgactactgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttca 2846211  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttcttt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2846212 aataaacatggttagtctaggaatggataatcttttatttgtgatattaagttaacgttctttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaatta 2846311  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgc 510  Q
     || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||| |||| ||||    
T  2846312 ggggctgtagtttgagaagagggtcctatgtcaagggattgattatggctattttgttaaccatcgtgaaactagagaatcattcgtaagaaataggtgc 2846411  T
Q  511 agtataccaattagggg 527  Q
    |||||||||||||||||    
T  2846412 agtataccaattagggg 2846428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 13946829 - 13947148
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13946829 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacaaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttct 13946928  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  13946929 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattagattaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattaaaccacctaaggaattag 13947027  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||      ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||| | ||||||| ||||||    
T  13947028 gggttgtaaccctcgaagagggtcataactcaagggattaattaggactattttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataggtgcag 13947127  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13947128 tataccaattaggggaacata 13947148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 18856338 - 18856019
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18856338 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 18856239  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||     
T  18856238 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttagcagaccacctaagaaattag 18856140  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    |   ||||     |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||  | || || | ||||||| ||||||    
T  18856139 gagttgtaaccctagaagaggttcctaactcaagggattgattaggactatattgttaactatcgcaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcag 18856040  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18856039 tataccaattaggggaacata 18856019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 240 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 28108075 - 28107781
Alignment:
Q  240 atataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  28108075 atataaacatgatttagagagaatgaatgactaatgatcatagcttt-gacttagacctaattgaattgttctaataaacacggttagtcatggaatgga 28107977  T
Q  340 taatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaaga---ttattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtc 436  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||   |||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  28107976 taatcgattattagtcatattaggttaacgtactt-aaaccttcaaagaatattattagaccacgtaagaaattaggggttgtagtttgagaagagggtc 28107878  T
Q  437 ctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  28107877 ctaactcaagggattgattaggactattttgttaactattgtggaactagaaaatcattcataagaatagctgtagtataccaattaggggaacata 28107781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 4512283 - 4512606
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  4512283 tcttaatactttttatctcgtgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagactgaattgaattgttct 4512382  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||     
T  4512383 aataaacatggttagtctaggaatgaataatcatttattagtgatattaggttaacatgc-ttaaaccttcaaaagttagtagaccacctaaggaattag 4512481  T
Q  413 ggact----gtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgt 508  Q
    || ||    |||     |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||| ||    
T  4512482 gggctacaagtaaccctagaagagggtccgaactcaatggattgattatgactattttgttaattatcgtggaactaatgaatcattcataagaataggt 4512581  T
Q  509 gcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4512582 gcagtataccaattaggggaacata 4512606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Original strand, 11247572 - 11247889
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  11247572 tcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgattacgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacataattgaattgttca 11247671  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  11247672 aataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaatta- 11247770  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgca 511  Q
    || ||||| | ||| ||||  || |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| || ||||||| |||||||  |||| |||| ||| |    
T  11247771 gggctgtaatctgataagagagttctaagtcaagggattgattaaggatattttgttaaccatcatgaaactagagaatcattcgtaagaaataagtgta 11247870  T
Q  512 gtataccaattaggggaac 530  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  11247871 gtatacaaattaggggaac 11247889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 213 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 12988439 - 12988195
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  12988439 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccataactttcaacttagacataattgaattgttca 12988340  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||     
T  12988339 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaggttagcgttcttcaaatcttctaagaatattagatcacctaaggaattag 12988240  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattag 457  Q
    |||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12988239 ggactgtaatatgcgaagagggtcctaagtcaagggattgattag 12988195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 13021568 - 13021249
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  13021568 tcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatgatttcgtaagaatgaatgactactgatcataactttcaacttagacctaattgaattgttca 13021469  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| ||| |||||| |||     
T  13021468 aataaacatcgttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaggttaatgttcttcaaatcttctaagaatattagatcacttaaggagttag 13021369  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactatttt-gttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgc 510  Q
    ||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||  ||||||| ||  ||| || || |||| ||||    
T  13021368 ggactataatctgagaagagggtcctaagtcaagggattgattagggctattttagttaatcatcgtaaaactagagaaatattcatgagaaataggtgc 13021269  T
Q  511 agtataccaattaggggaac 530  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  13021268 agtgtaccaattaggggaac 13021249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 293 - 533
Target Start/End: Original strand, 7128190 - 7128429
Alignment:
Q  293 agacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattat 392  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||  ||||    
T  7128190 agacctaactgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaatgttat 7128288  T
Q  393 tagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatc 492  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||    
T  7128289 tagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagtgactc 7128388  T
Q  493 atttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
     || | || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7128389 tttcacaataatatgtgcattataccaattaggggaacata 7128429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 240 - 493
Target Start/End: Original strand, 5259774 - 5260024
Alignment:
Q  240 atataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 339  Q
    ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  5259774 atataaacatgattctgtaagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatggg 5259873  T
Q  340 taatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtccta 439  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||   ||| ||| |||||| |||||||    
T  5259874 taatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtattagaccacctaagaaaataggg---gtattttaagaagagggtccta 5259970  T
Q  440 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatca 493  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  5259971 agtcaagggattgattagggctattttgttaaccatcgtgaaactagagaatca 5260024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 213 - 420
Target Start/End: Original strand, 24371084 - 24371292
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaatt-gttc 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  24371084 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatataatgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaatttgttc 24371183  T
Q  312 taataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  24371184 aaataaaccgggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgataataggttaatgttcttaaaaccttcaaataatattagatcacctaaggaatta 24371283  T
Q  412 tggactgta 420  Q
     ||||||||    
T  24371284 gggactgta 24371292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 276 - 505
Target Start/End: Original strand, 23007934 - 23008163
Alignment:
Q  276 accatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttcttt 375  Q
    |||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||     
T  23007934 accataactttcaacttagacctaactgaactgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatatcaggttaacgttctta 23008033  T
Q  376 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactat 475  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23008034 aaacctttaaagaatattagaccacctaaggaattagaggctgtaatctgataagagggtcctaagtcaagggattgattagggctattttgttaactat 23008133  T
Q  476 cgtggaactagaaaatcatttataagaata 505  Q
    |||| ||||| | ||||||| | |||||||    
T  23008134 cgtgaaactaaagaatcattcacaagaata 23008163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 276 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 23780430 - 23780201
Alignment:
Q  276 accatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttcttt 375  Q
    |||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||     
T  23780430 accataactttcaacttagacctaactgaactgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatatcaggttaacgttctta 23780331  T
Q  376 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactat 475  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23780330 aaacctttaaagaatattagaccacctaaggaattagaggctgtaatctgataagagggtcctaagtcaagggattgattagggctattttgttaactat 23780231  T
Q  476 cgtggaactagaaaatcatttataagaata 505  Q
    |||| ||||| | ||||||| | |||||||    
T  23780230 cgtgaaactaaagaatcattcacaagaata 23780201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 606 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 12839330 - 12839136
Alignment:
Q  606 ctttagcttcctatgttattcagttttttgtctcagcaatgcagaaacagggagcactcaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttag 705  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12839330 ctttagcttcccatgttattcagttttttgtatcagcagtgcagaaacagggagcacccaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgttttag 12839231  T
Q  706 ttttttggtgttgtaa-------cttgctgctgctgttagaactttgtatttctttactttgctaatgttggtagttcttataccttcctatgct 793  Q
    | |||||||| |||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  12839230 tcttttggtgctgtaacatgctgcttgttgctgctgttagaactttgtatttctttactttgctagagttggtaaatcttataccttcctatgct 12839136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 213 - 487
Target Start/End: Original strand, 28848652 - 28848926
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| || ||||||| | |||||| || | ||||||||||  || |||||||||||||||||||     
T  28848652 tcttaatgttttttatatactgatcatatataacc-tgaattcgtgagaatgaatgactgctgaacatagctttcaactcagacctaattgaattgttca 28848750  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||     
T  28848751 aataaacaaggttagtctaggaatagataatcgtttatttgtgataataggttaacgttctcaaaaccttcaaagaatatcagatcacctaaggaattag 28848850  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactatttt-gttaactatcgtggaactaga 487  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||  |||||||    
T  28848851 ggactgtaatttgagaagagggccctaagtcaagggatttatcaggactattttagttaaccatcgtaaaactaga 28848926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 607 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 25994055 - 25993943
Alignment:
Q  607 tttagcttcctatgttattcagttttttgtctcagcaatgcagaaacagggagcactcaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttagt 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25994055 tttagcttcctatgttattcagttttttgtctcagcagtgcagaaacagggagcacccaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttagt 25993956  T
Q  707 tttttggtgttgt 719  Q
    |||||||||||||    
T  25993955 tttttggtgttgt 25993943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 444
Target Start/End: Original strand, 31072115 - 31072332
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31072115 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 31072214  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||              ||||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||||     
T  31072215 aataaacatggctggtctaggaatggataatcgttt--------------gttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaaaaattag 31072300  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactca 444  Q
    || ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  31072301 gggctgtagtttgagaagagagccctaactca 31072332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 318 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 26896467 - 26896253
Alignment:
Q  318 acatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggact 417  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||    
T  26896467 acatggttactctacgaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaaaggttatgagaccacctaagaaattaggggct 26896369  T
Q  418 gtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtatac 517  Q
    |||     |||||| ||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  26896368 gtaaccctagaagagggtctaaactcaatggattgattatggctattttgttaattattgtggaactagtgaatcattcacaagaataggtgcagtatac 26896269  T
Q  518 caattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||    
T  26896268 caattaggggaacata 26896253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 11192893 - 11192657
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgt-cttagacctaattgaattgttc 311  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    |||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||    
T  11192893 tcttaatgctttctatatgctaatcaaatataaacatgatttcgtgagaa----tgactactgaccataggtttcacacttagacctaattgaaatgttc 11192798  T
Q  312 taataaacatggtta----gtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaagga 407  Q
     |||||||| |||||    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11192797 aaataaacagggttaattagtctaggattggataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaagga 11192698  T
Q  408 attatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaaggg 448  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||    
T  11192697 attagggactgtagtctgagaagagagtcttaagtcaaggg 11192657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 607 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 25552889 - 25552777
Alignment:
Q  607 tttagcttcctatgttattcagttttttgtctcagcaatgcagaaacagggagcactcaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttagt 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25552889 tttagcttcctatgttattcagttttttgtcttagcagtgcagaaacagggagcacccaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgtctttttgctttagt 25552790  T
Q  707 tttttggtgttgt 719  Q
    |||||||||||||    
T  25552789 tttttggtgttgt 25552777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 419 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 23842906 - 23842792
Alignment:
Q  419 tagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtatacc 518  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  23842906 tagtttgagaagagggtcctaactcaaaggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcatttataagaataagtgcaatataac 23842807  T
Q  519 aattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||    
T  23842806 aattaggggaacata 23842792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 627 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 6428766 - 6428597
Alignment:
Q  627 agttttttgtctcagcaatgcagaaacagggagcactcaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttagtt-ttttggtgttgtaacttg 725  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6428766 agttttttgtctcagcagtgcagaaatagggtgcacccaacaaatgtttgtgtgtgcttcccttcttattttgctttagtttttttggtgatgtaacttg 6428667  T
Q  726 ctgctgctgttagaactt----tgtatttctttactttgctaatgttggtagttcttataccttcctatg 791  Q
     |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6428666 atgctactgttagaactttgtatgtatttctttactttgctagagttggtagttcttgtaccttcctatg 6428597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 617 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 31387704 - 31387537
Alignment:
Q  617 tatgttattcagttttttgtctcagcaatgcag---aaacagggagcactcaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttagtt-ttttg 712  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31387704 tatgttattcagttttt-gtctcagcagtgcagcagaaacagggagcacccaaggact--ttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttagtttttttg 31387608  T
Q  713 gtgttgtaacttgctgctgctgttagaactttgtatttctttactttgctaatgttggtagttcttataccttccta 789  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31387607 gtgatgtaacttgctgctgctgttagaac------tttctttactttgatagagttggtagttcttataccttccta 31387537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Original strand, 2371897 - 2372072
Alignment:
Q  22 acgttttcggcagagaggaaggaagcatatgggaaaagaacatcaatcgtagtgattgagaagtaaatgaagagcaagcccacaacgacggaactttatc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||   |||||| ||||| ||||    
T  2371897 acgttttcggcagagaggaaggaagcatatggaaaaagaacatcaaccgtagtgattgtgaagtaactgaagagtaagccggtaacgacagaactctatc 2371996  T
Q  122 gatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattct 200  Q
    | |||||||| |||| |||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||  || || |||||||||    
T  2371997 ggtttattttttttactatgctgtttatttctttt---atgtctagctaatttccagagatttggtatgggatgattct 2372072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 420 - 532
Target Start/End: Original strand, 32109685 - 32109797
Alignment:
Q  420 agtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtatacca 519  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| |    
T  32109685 agtttgagaagagggtcataactcaagggattgattagaactattttgttaattatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagcatacaa 32109784  T
Q  520 attaggggaacat 532  Q
    |||||||||||||    
T  32109785 attaggggaacat 32109797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 213 - 367
Target Start/End: Original strand, 2372136 - 2372286
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||||||||||||||  |||    |||||||| |||||| |||||||  |||||||||| ||    ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2372136 tcttaatgttttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgtgagaattgatgactactgac----gctttcaacttagacctaattgaattgttct 2372231  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaa 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2372232 aataaacatggttagtctatgaatgaataatcgtttattagtgatattaggttaa 2372286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 417 - 534
Target Start/End: Original strand, 23847783 - 23847899
Alignment:
Q  417 tgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtata 516  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  23847783 tgtagtttgagaagagagacctaactcaagagattgattaagactattttgttaactattgtggaactagaaaatcattcat-agaataggtgcagtata 23847881  T
Q  517 ccaattaggggaacataa 534  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  23847882 ccaattaggggaatataa 23847899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 438 - 533
Target Start/End: Original strand, 2372293 - 2372383
Alignment:
Q  438 taactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2372293 taactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaact-----atcattcataagaatatgtgcagtataccaactaggggaacata 2372383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 213 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26898182 - 26898071
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  26898182 tcttaatgcttgttatatcctgatcaaatttaaacatgatttagtgacaacgaatgactactgaccctagctttcgaattagacctaattaagttgttct 26898083  T
Q  313 aataaacatggt 324  Q
    ||||||||||||    
T  26898082 aataaacatggt 26898071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11188229 - 11188130
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||    
T  11188229 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttaaacagaattgaattgttct 11188130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23388410 - 23388327
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagac 296  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  23388410 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagac 23388327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 722 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 25991834 - 25991763
Alignment:
Q  722 cttgctgctgctgttagaactttgtatttctttactttgctaatgttggtagttcttataccttcctatgct 793  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25991834 cttgctgctgttgttagaactttgtatttctttactttgctagagttggtagttcttataccttcttatgct 25991763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5738575 - 5738471
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtg 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||    
T  5738575 caacgacggaactctatcggtttattttctttactatgttgtttattattttaatcatgtctagctaatttcctttgattaggtctgagatgattctttg 5738476  T
Q  204 taacc 208  Q
    |||||    
T  5738475 taacc 5738471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28665577 - 28665503
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttc 287  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  28665577 tcttaatattttttatatcatgatcaaataaaaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagttttc 28665503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1126220 - 1126112
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaattt--ctagagattaagtctgagatgattctg 201  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||    
T  1126220 caacgacggaactctatcggtttattgtttttactatgttgtttattccttttactatgtctagctaattttcttagagagtaggtctgagatgattctg 1126121  T
Q  202 tgtaaccct 210  Q
    |||||||||    
T  1126120 tgtaaccct 1126112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23388591 - 23388484
Alignment:
Q  103 acaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgt 202  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||||| |||||||||||    ||||| ||| |||||||||||||    
T  23388591 acaacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatgtatttaaccatgtctagctaatttcctttgattaggtccgagatgattctgt 23388492  T
Q  203 gtaaccct 210  Q
    ||||||||    
T  23388491 gtaaccct 23388484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 426 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 23667771 - 23667721
Alignment:
Q  426 agaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatc 476  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23667771 agaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatc 23667721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Original strand, 11410379 - 11410446
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaa 171  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  11410379 caacgacggaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatttatttgatcatgtctagctaa 11410446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 459 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 24155434 - 24155360
Alignment:
Q  459 actattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||  | ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24155434 actactttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 24155360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 175
Target Start/End: Original strand, 28848474 - 28848545
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttc 175  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||    
T  28848474 caacgatggaactccatcgatttattttctttactatgttgtttatgtatttgatcatgtctagttaatttc 28848545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 210
Target Start/End: Original strand, 9953599 - 9953703
Alignment:
Q  103 acaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgt 202  Q
    ||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||||||    ||||| ||||||   ||||||||    
T  9953599 acaacgacgaaactctatcggcttattttttttattatgttgtttatgtatttaaccatgtctagctaatttcctttgattaggtctga---gattctgt 9953695  T
Q  203 gtaaccct 210  Q
    ||||||||    
T  9953696 gtaaccct 9953703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 4102 - 3782
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  4102 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttct 4003  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4002 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaatgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 3903  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3902 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 3803  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  3802 tataccaattagggtaacata 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 292832 - 293151
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  292832 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgacgatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 292931  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  292932 aataaacatggttagtataggaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 293030  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  293031 gggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcag 293130  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  293131 tataccaattaggggaacata 293151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 23225224 - 23224904
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  23225224 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 23225125  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23225124 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 23225025  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23225024 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatatgtgcag 23224925  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23224924 tataccaattaggggaacata 23224904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 45287387 - 45287068
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  45287387 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttct 45287288  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45287287 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 45287189  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45287188 gggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 45287089  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  45287088 tataccaattagggaaacata 45287068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 2441597 - 2441278
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2441597 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaaagactactgaccctagctttcgacttagacataattgaattgttct 2441498  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  2441497 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattaaaccacctaaggaattag 2441398  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  2441397 ggactgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtagaattagaaaatcattaatacgaataggtgcag 2441298  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  2441297 tataccaattaggagaacat 2441278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 48645270 - 48645588
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  48645270 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgataacgaatgactactgaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttct 48645369  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48645370 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttactgatattaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 48645468  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  48645469 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaaccatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 48645568  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48645569 tataccaattaggggaacat 48645588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 215 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 37415741 - 37415422
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37415741 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttctaa 37415642  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaa--ggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  37415641 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgttc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggggaattag 37415543  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  37415542 gggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagagattgattaggactattttgttaactatcatggaactagagaatcattcataagaataggtgcag 37415443  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37415442 tataccaattaggggaacata 37415422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 8276781 - 8277101
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  8276781 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 8276880  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8276881 aataaacagggttagtctaggaattgataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 8276980  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  8276981 gggctatagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcat 8277080  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8277081 tataccaattaggggaacata 8277101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 6603254 - 6603573
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6603254 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactattgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 6603353  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||     
T  6603354 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaagaaattag 6603453  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  6603454 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcag 6603553  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6603554 tataccaattaggggaacat 6603573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 213 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 13450094 - 13449780
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13450094 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccc-agctttcgacttagacctaattgaattgttct 13449996  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13449995 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaa 13449896  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  13449895 gggctttagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagagctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcag 13449796  T
Q  513 tataccaattagggga 528  Q
    ||||||||||||||||    
T  13449795 tataccaattagggga 13449780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 213 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 9865045 - 9864732
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9865045 tcttattgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 9864946  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  9864945 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaagttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattat 9864846  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||    
T  9864845 gggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgtag 9864746  T
Q  513 tataccaattaggg 526  Q
    ||||||||||||||    
T  9864745 tataccaattaggg 9864732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 529
Target Start/End: Original strand, 13842436 - 13842751
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13842436 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctctcgacttagacctaattgaattgttct 13842535  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13842536 aataaacatggttagtctaggaatagataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 13842634  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  13842635 gggctgtagtttgaggagagggtcctaattcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattaatacgaataggtgcag 13842734  T
Q  513 tataccaattaggggaa 529  Q
    ||||||||||| |||||    
T  13842735 tataccaattacgggaa 13842751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 9133078 - 9132759
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9133078 tcttaatgctttctatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaatggaattgttct 9132979  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  9132978 aataaacatggttagtctaggaatggataatcatttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 9132880  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  9132879 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagtgaatcattcataagaatatgtgcag 9132780  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9132779 tataccaattaggggaacata 9132759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 16165544 - 16165863
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16165544 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattattct 16165643  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16165644 aataaacatggttaatctaggaatgggtaatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 16165743  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||  |||| ||||||    
T  16165744 gggctgtaatctgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgttgaattagagaatcattaatacaaataggtgcag 16165843  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16165844 tataccaattaggggaacat 16165863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 17730610 - 17730929
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  17730610 tcttaatgatttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgaaaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 17730709  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17730710 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttaatgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 17730808  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || || ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17730809 gggctatagtttgagaagagggtcctaagttaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 17730908  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  17730909 tataccaattagggaaacata 17730929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 20594059 - 20594378
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  20594059 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacataattgaattgttct 20594158  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20594159 aataaacagggttagtgtaagaatggataatcgttttttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 20594257  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20594258 gggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaatacgtgcag 20594357  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20594358 tataccaattaggggaacata 20594378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 223 - 533
Target Start/End: Original strand, 26557305 - 26557614
Alignment:
Q  223 ttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatg 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  26557305 ttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagg 26557404  T
Q  323 gttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagt 422  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26557405 gttagtttaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactgtagt 26557503  T
Q  423 ttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaatt 522  Q
    ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26557504 ttgagaagagggttctatgtcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaatt 26557603  T
Q  523 aggggaacata 533  Q
    |||| ||||||    
T  26557604 agggaaacata 26557614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 4546665 - 4546984
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  4546665 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccattgctttctacttagacaaaattgaattgttct 4546764  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4546765 aataaacagggttagtctaggaatggataattgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 4546863  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4546864 gggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggattattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 4546963  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  4546964 tatatcaattagggaaacata 4546984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 3068295 - 3067976
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3068295 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataatcatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 3068196  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  3068195 aatatacatggttagtctaggaatggataatcttttattagtgatattaggttaatgtgc-ttaaaccttcaacgattattagaccacctaaggaattag 3068097  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||| | ||||||| ||||||    
T  3068096 gggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcatagaactagtgagtcattcacaagaataggtgcag 3067997  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  3067996 tataacaattaggggaacata 3067976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 4596327 - 4596008
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  4596327 tcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactattgaccatagttttctacttagacaaaattgaattgttct 4596228  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4596227 aataaacagggttagtctaggaatgaataattgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccaactaaggaattag 4596129  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  4596128 gggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaagggattgattatgactatttttttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatatgtgaag 4596029  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4596028 tataccaattaggggaacata 4596008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 14683762 - 14683443
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14683762 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactagtgaccataacttttgacttagacctaattgaattgttct 14683663  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||     
T  14683662 aataaacatggttagtctaggaatgcataatcatttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaataactattagaccacctatggaattag 14683564  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||    
T  14683563 gggctgtaatcctagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagtgaatcattcataagaatagatgcag 14683464  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14683463 tataccaattaggggaacata 14683443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 215 - 533
Target Start/End: Original strand, 10468942 - 10469259
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10468942 ttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttcgtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaa 10469041  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  10469042 taaacatggttagtctaggaatagataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 10469140  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagta 514  Q
      ||||     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||     
T  10469141 gttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactatttttttaactatcatggaactagaaaagaattcacaagaataggtgcagtg 10469240  T
Q  515 taccaattaggggaacata 533  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  10469241 tactaattaggggaacata 10469259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 20081036 - 20080717
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20081036 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatggctactgaccctagctttcgacttagacctaattgagttgttct 20080937  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||     
T  20080936 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcagcgattattagaccacctaagaaattag 20080838  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || || ||     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| | ||||||| ||||||    
T  20080837 ggtctataaccctagaagggggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgttgaactagtgactcattcagaagaataggtgcag 20080738  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20080737 tataccaattaggggaacata 20080717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 26136446 - 26136127
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26136446 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacgtaattgaattgttct 26136347  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  26136346 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 26136248  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || || ||     |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || || | ||||||| ||||||    
T  26136247 gggctttaaccctagaagagggtcctaactgaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcag 26136148  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26136147 tataccaattaggggaacata 26136127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 26144826 - 26144507
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26144826 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacgtaattgaattgttct 26144727  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  26144726 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttactagaccacctaaggaattag 26144628  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || || ||     |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || || | ||||||| ||||||    
T  26144627 gggctttaaccctagaagagggtcctaactgaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcag 26144528  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26144527 tataccaattaggggaacata 26144507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 213 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 37166465 - 37166145
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37166465 tcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 37166366  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  37166365 aataaacatggttagtctaggaatggataatcatttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaacattcaaaggttattagaccacctaaggaattag 37166267  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | ||||| | ||||||| ||||||    
T  37166266 gggttgtaaccctagaagagagtcctaactcaagggattgattaggactactttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataggtgcag 37166167  T
Q  513 tataccaattaggggaacataa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37166166 tataccaattaggggaacataa 37166145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 215 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37423273 - 37423083
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37423273 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttctaa 37423174  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37423173 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgttc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaagg 37423083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 290 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 9271699 - 9271464
Alignment:
Q  290 cttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagat 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  9271699 cttagacctaattgaattgttctaataaacaa-------ctaggaatggataatcgtttgttagtgatatttggttaacgtgctt-aaaccttcaaagat 9271608  T
Q  390 tattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaa 489  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9271607 tattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggacctaactcaagggattgattaggagtattttcttaactatcgtggaactagaaa 9271508  T
Q  490 atcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9271507 atcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 9271464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 344 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 45290667 - 45290479
Alignment:
Q  344 cctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactc 443  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  45290667 cctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaactc 45290569  T
Q  444 aagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45290568 aagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 45290479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 217 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11398340 - 11398132
Alignment:
Q  217 aatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaata 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11398340 aatgttttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaata 11398241  T
Q  317 aacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggac 416  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  11398240 aacatggttagtctaagagtggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggt 11398141  T
Q  417 tgtagtttg 425  Q
    |||||||||    
T  11398140 tgtagtttg 11398132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 5242471 - 5242152
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| || | |||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  5242471 tcttaatgctttttatatcctgatagaatataaacatgatttcgtgataatgaatgactgctgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttca 5242372  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttcttt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5242371 aataaacatggttagtccaagaatggatactcatttatttgtgatattaagttaacgttctttaaaatcttcaaagaatattagaccacctaaggaatta 5242272  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgc 510  Q
     || ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||| || ||| ||||||| |||||||  |||| |||| ||||    
T  5242271 ggggctgtagtctgagaatagggtcctaagtcaagggattggttatggatattttgttaaccatagtgaaactagagaatcattcgtaagaaataggtgc 5242172  T
Q  511 agtataccaattaggggaac 530  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  5242171 agtataccaattaagggaac 5242152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 213 - 452
Target Start/End: Original strand, 10345010 - 10345248
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10345010 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgactgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 10345109  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||     
T  10345110 aataaacatggttagtctaagaatggataatcctttattagtgatattaagttaacgtgc-ttaaaccttcaacggttattagaccatctaaggaattag 10345208  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattg 452  Q
    ||  ||||     | |||| ||||||||||||||||||||    
T  10345209 gggttgtaaccctataagagggtcctaactcaagggattg 10345248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Original strand, 7227323 - 7227641
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||     
T  7227323 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacattatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgagttgttca 7227422  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||     
T  7227423 aataaacatggctagcctagcaatggataatcgtttatttgagatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagaatattagatcatataaggaattag 7227522  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgca 511  Q
     | ||||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||| |||| |||||    
T  7227523 aggctgtaattggagaatagggtcctaagtcaagggattgattatggttattttgttaaccatcgtgaaactagagaatcattcgtaagaaataggtgca 7227622  T
Q  512 gtataccaattaggggaac 530  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  7227623 gtataccaatcaggggaac 7227641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 213 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18562852 - 18562577
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  18562852 tcttaatgctttttatatccttataaaatataaacatgttttattgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttca 18562753  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||||||  ||||||||||||||     
T  18562752 attaaacagggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcgaataatattagctcacctaaggaattag 18562653  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactatttt-gttaactatcgtggaactaga 487  Q
    |||||||| | ||||||||  ||||||| |||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  18562652 ggactgtaatatgagaagagagtcctaagtcaaaggattaatcagggctattttagttaactatcgtaaaactaga 18562577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 376 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 11920021 - 11919864
Alignment:
Q  376 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactat 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11920021 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttacctat 11919922  T
Q  476 cgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11919921 cgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgtagtataccaattaggggaacata 11919864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 213 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 13809831 - 13809519
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| |  |||||||||||  || |||||||     |||||||     
T  13809831 tcttaatgctttttatattatgatcaaatataaacatgatttcatgagaatgaatgactattggccatagctttcaactcagaccta-----attgttca 13809737  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||     
T  13809736 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtattaggccacataaggaattag 13809637  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataa-gaatatgtgca 511  Q
     |  |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||  |||| |||||    
T  13809636 aggttgtaatatgagaagagggtcctaagtcaagggattgatcagggctattttgttaaccatcgtgaaactagagaatcattcgtaataaataggtgca 13809537  T
Q  512 gtataccaattaggggaa 529  Q
    |||||||||||| |||||    
T  13809536 gtataccaattaagggaa 13809519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 354 - 533
Target Start/End: Original strand, 4542734 - 4542912
Alignment:
Q  354 tgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattga 453  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  4542734 tgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccaactaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaggtcaagggattga 4542832  T
Q  454 ttaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4542833 ttagaattattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 4542912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 213 - 466
Target Start/End: Original strand, 5796347 - 5796600
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  || || ||||||||||||  ||||||||||||||| || |||     
T  5796347 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgattttgtgagaatgaatacctgctgaccatagctttcaacttagacctaattgagtttttca 5796446  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  5796447 aataaaaagggttagtctatgaatgaataatcgtttatttgtgatataatgttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattag 5796546  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactatttt 466  Q
     || |||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  5796547 agattgtaatatgataagagggtcctaagtcaagggattgattagagctatttt 5796600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 213 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22611925 - 22611770
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  22611925 tcttaatgctttttatattttgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttacacctaattgaattattct 22611826  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaat 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22611825 aataaacatggttagtctaggaatgaataatcctttattagtgatattaggttaat 22611770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 215 - 388
Target Start/End: Original strand, 4695322 - 4695494
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||    
T  4695322 ttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacacatttgaattgttctaa 4695421  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaaga 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  4695422 taaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaga 4695494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 403 - 533
Target Start/End: Original strand, 35961076 - 35961206
Alignment:
Q  403 aaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataaga 502  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35961076 aaggaattaggggctatagtttgagaagagggtcctaaatcaagggattgattaggactattttgttgactatcgtggaactagaaaatcattcataaga 35961175  T
Q  503 atatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  35961176 ataggtgcagtataccaattagaggaacata 35961206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 428 - 529
Target Start/End: Original strand, 4695491 - 4695592
Alignment:
Q  428 aagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattagggg 527  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4695491 aagagggtcctaagtcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattgataagaataggtgcagtataccaattagggg 4695590  T
Q  528 aa 529  Q
    ||    
T  4695591 aa 4695592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 210
Target Start/End: Original strand, 26557107 - 26557225
Alignment:
Q  93 gagcaagcccacaacgacggaactttatcgatttattttcttt-attatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctga 191  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26557107 gagcaagccggcaacgacggaactctatcagtttatttttttttattatgttgtttatttcttttatcatgtctagctaatttccagagattaagtctga 26557206  T
Q  192 gatgattctgtgtaaccct 210  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26557207 gatgattctgtgtaaccct 26557225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 452 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 11398129 - 11398049
Alignment:
Q  452 gattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11398129 gattaggactattttgctaactatcgtagaactagaaaatcattaatacgaataggtacagtataccaattaggggaacat 11398049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 45290732 - 45290671
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactact 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45290732 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactact 45290671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 163
Target Start/End: Original strand, 8276610 - 8276680
Alignment:
Q  93 gagcaagcccacaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgt 163  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8276610 gagcaagccggcaacgacggaactctatcagtttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgt 8276680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9273438 - 9273363
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcg 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||| |||||    
T  9273438 tcttaatattttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactgttgaccataggtttcg 9273363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11825862 - 11825791
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttc 175  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  11825862 caacgacggaactctatcggtttattttctttattatgttgtttattcgtttgatcatgtctagctaatttc 11825791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 175
Target Start/End: Original strand, 8397471 - 8397541
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttc 175  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  8397471 caacgacggaactcta-cggtttattttctttattatgttgtttattcctttgatcatgtctagctaatttc 8397541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 431
Target Start/End: Original strand, 24917991 - 24918208
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| || ||| ||||| || || || | | ||||||||| |||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||     
T  24917991 tcttaatgctttttatatactaatcatatgtaa-catgaattcgtaagtatgaatgactactgaccaaagctttcaacttagacataattggattgttca 24918089  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    | |||||| || | ||||| |||||||||||| |||| | || ||||||||||||   | |  |||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||     
T  24918090 attaaacagggcttgtctatgaatggataatcgtttaattgtaatattaggttaacactttgaaaactttcagggaatattagaccacataaggaattag 24918189  T
Q  413 ggactgtagtttgagaaga 431  Q
    ||| |||| | ||||||||    
T  24918190 ggagtgtaatctgagaaga 24918208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 209
Target Start/End: Original strand, 10431936 - 10432041
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtg 203  Q
    ||||||||||||| ||  | ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||    ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  10431936 caacgacggaactctaatggtttattttctttactaggttgtttatttctttattcatgtctagctaatttccttggattaggtccgagatgactctgtg 10432035  T
Q  204 taaccc 209  Q
    ||||||    
T  10432036 taaccc 10432041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Original strand, 4542610 - 4542713
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaa-tttctagagattaagtctgagatgattctgt 202  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||| ||| || |||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  4542610 caacgactgaactttatcggtttaatttcttctttatgttgtttttttatttgattatgtctagttaattttctagaggttaggtctgagatgattcttt 4542709  T
Q  203 gtaa 206  Q
    ||||    
T  4542710 gtaa 4542713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 367
Target Start/End: Original strand, 2090402 - 2090555
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||| | | ||| ||||  || ||| |||||  |||| | ||||||| |||||||     
T  2090402 tcttaattttttttatatactgatcatatataa-catgaatttgtgagtatgaatgcctaccgacaataactttcaacttaaatctaattggattgttca 2090500  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaa 367  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||| ||| |||| | |||||| ||||||||    
T  2090501 aataaacaggggtagtctaggaatagatgatcgtttaattgtgatactaggttaa 2090555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 467 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 22611775 - 22611710
Alignment:
Q  467 gttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  22611775 gttaattatcgtggaactagtgaatcattcataagaatagatgcagtatatcaattaggggaacat 22611710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 533
Target Start/End: Original strand, 10345266 - 10345310
Alignment:
Q  489 aatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10345266 aatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 10345310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Original strand, 4546489 - 4546590
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtg 203  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||| ||| || |||| |||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||    
T  4546489 caacgactgaactttatcggtttaatttcttctttatgttgtttttttatttgattatgtctagcaaattt-tctagattaggtctgagatgattctttg 4546587  T
Q  204 taa 206  Q
    |||    
T  4546588 taa 4546590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13450203 - 13450165
Alignment:
Q  172 tttctagagattaagtctgagatgattctgtgtaaccct 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13450203 tttctagagattaggtctgagatgattctttgtaaccct 13450165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13809936 - 13809902
Alignment:
Q  176 tagagattaagtctgagatgattctgtgtaaccct 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13809936 tagagattaggtctgagatgattctgtgtaaccct 13809902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 213
Target Start/End: Original strand, 17730505 - 17730542
Alignment:
Q  176 tagagattaagtctgagatgattctgtgtaaccctgat 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17730505 tagagattaggtctgagatgattctttgtaaccctgat 17730542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 175
Target Start/End: Original strand, 22256875 - 22256944
Alignment:
Q  107 cgacggaactttatcgatttattttctttattatgttg-tttatttcttttatcatgtatagctaatttc 175  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  22256875 cgacgaaactctatcggtttattttctttattatgttgttttttttatttaatcatgtctagttaatttc 22256944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 252; Significance: 1e-139; HSPs: 89)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 56195335 - 56195654
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  56195335 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 56195434  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  56195435 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 56195534  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  56195535 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcag 56195634  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  56195635 tataccaattaggggaacat 56195654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 44809269 - 44808950
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44809269 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 44809170  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44809169 aataaacatggttagtctaggaatggatgatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 44809070  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||     
T  44809069 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcaa 44808970  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  44808969 tataccaattaggagaacat 44808950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 34018095 - 34017775
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  34018095 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 34017996  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34017995 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 34017896  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34017895 gggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaaccagaaaatcattcataagaataggtgcag 34017796  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34017795 tataccaattaggggaacata 34017775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 39501456 - 39501776
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  39501456 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 39501555  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39501556 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 39501655  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  39501656 gggctgtagtttgataagagggtcctaactcaaaggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 39501755  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39501756 tataccaattaggggaacata 39501776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 40903397 - 40903077
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  40903397 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 40903298  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40903297 aataatcatggttagtctaggaattgataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaa 40903198  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40903197 gggctgtagtttgagaagagagtcctaagtcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 40903098  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40903097 tataccaattaggggaacata 40903077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 34320231 - 34319912
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34320231 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 34320132  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34320131 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaattag 34320032  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  34320031 gggctttagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattaatacgaataggtgcag 34319932  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  34319931 tataccaattaagggaacat 34319912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 213 - 531
Target Start/End: Original strand, 24150480 - 24150798
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  24150480 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 24150579  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24150580 aataaacagggttagtccaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 24150679  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24150680 gggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 24150779  T
Q  513 tataccaattaggggaaca 531  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24150780 tataccaattaggggaaca 24150798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 15812451 - 15812131
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15812451 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 15812352  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15812351 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgttttttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 15812252  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattga-ttaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgca 511  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  15812251 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagagattgatttaggactattttgttaactattgtagaactagaaaatcattaatacgaataggtgca 15812152  T
Q  512 gtataccaattaggggaacat 532  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15812151 gtataccaattaggggaacat 15812131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 27014071 - 27014391
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  27014071 tcttaatgttttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 27014170  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  27014171 aataatcatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggctaacgttcttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaatcag 27014270  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27014271 gggctgtagtttgagaagagggtcttaactcaaaggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 27014370  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27014371 tataccaattaggggaacata 27014391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 213 - 526
Target Start/End: Original strand, 29324633 - 29324946
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29324633 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 29324732  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  29324733 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattag 29324832  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||     
T  29324833 gggctgtagtttgagaaaatggtcataactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatatgaataggtgcaa 29324932  T
Q  513 tataccaattaggg 526  Q
    ||||||||||||||    
T  29324933 tataccaattaggg 29324946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 48415843 - 48415523
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  48415843 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaatttttct 48415744  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48415743 aataataatggttagtctaggaatggataatcatttattattgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 48415644  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    |  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  48415643 gagctgtagtttgagaagagagtcctgactcaagggattgattaggactattttgttaactatcatggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 48415544  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48415543 tataccaattaggggaacata 48415523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 213 - 531
Target Start/End: Original strand, 19820536 - 19820853
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  19820536 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgactatagctttctacttagacagaattgaattgttct 19820635  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19820636 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaagatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 19820734  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19820735 gggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 19820834  T
Q  513 tataccaattaggggaaca 531  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19820835 tataccaattaggggaaca 19820853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 48637313 - 48637633
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  48637313 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttct 48637412  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaaga-ttattagaccacctaaggaatta 411  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48637413 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaagatttattagaccacctaaggaatta 48637511  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgca 511  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  48637512 ggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattcataagcataggtgca 48637611  T
Q  512 gtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  48637612 gtataccaattagggaaacata 48637633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 52006844 - 52006525
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  52006844 tcttaatgttttttatatcttgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttct 52006745  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52006744 aataaacaggtttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttgacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 52006646  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  52006645 gggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 52006546  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  52006545 tataccaattaggggaacata 52006525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 5681236 - 5681554
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5681236 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagccataacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 5681335  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5681336 aataagcatggttagtgtaggaatggataatcgtttgttagtgatactaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 5681434  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||    
T  5681435 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatagtttcag 5681534  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  5681535 tataccaattaagggaacat 5681554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 56198661 - 56198980
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  56198661 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 56198760  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  56198761 aataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatcag 56198860  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||  |||| ||||||    
T  56198861 gggttgtagttagagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcttagaactagaaaatgattaatacaaataggtgcag 56198960  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  56198961 tataccaattaggggaacat 56198980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 12238071 - 12238392
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatc--ctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgtt 310  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12238071 tcttaatgctttttatatctcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgtt 12238170  T
Q  311 ctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  12238171 ctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgtttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaatt 12238270  T
Q  411 atggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgc 510  Q
    |  ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12238271 agagactgtaatctgagaagagggttctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgc 12238370  T
Q  511 agtataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12238371 agtataccaattaggggaacat 12238392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 213 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27677368 - 27677048
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||| |||| ||||    
T  27677368 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattaaattattct 27677269  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27677268 aataaacaaggttagtctaggaatggataatcgtttgttagcgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 27677170  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27677169 gggctgtagtttgagaagagggttctaagtcaagggattgattaggactattttgttaactatggtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 27677070  T
Q  513 tataccaattaggggaacataa 534  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  27677069 tataccaattagaggaacataa 27677048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 44164591 - 44164910
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  44164591 tcttaatgttttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgactatagctttctacttagacaaaattgaattgttct 44164690  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44164691 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacctgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 44164789  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  44164790 ggattgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactataaaatcattcataagaatatgtgtag 44164889  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44164890 tataccaattaggggaacata 44164910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 217 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 52531245 - 52530929
Alignment:
Q  217 aatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaata 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||    
T  52531245 aatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactattgaccatagctttttacttagacagaattgaattgttctaata 52531146  T
Q  317 aacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggac 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  52531145 aacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacactcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggga 52531046  T
Q  417 tgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtata 516  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  52531045 tgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattcataagaataggtgcagtata 52530946  T
Q  517 ccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||    
T  52530945 ccaattaggggaacata 52530929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 213 - 529
Target Start/End: Original strand, 15164000 - 15164317
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15164000 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataatcatgatttagtgagaacgaatgactactgaccttagctttcgacttagacctaattgaattgttct 15164099  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaa-tggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15164100 aataaacatggttagtctaggaaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaatctgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 15164199  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgca 511  Q
     ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||    
T  15164200 ggggttgtagtttaagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcatggaactagataatcattcataagaataggggca 15164299  T
Q  512 gtataccaattaggggaa 529  Q
     |||||||||||| ||||    
T  15164300 atataccaattagaggaa 15164317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 24044454 - 24044135
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  24044454 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaattactacttaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 24044355  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  24044354 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtg-tttaaacctttaaagattattagaccacctaagaaattag 24044256  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  24044255 gggctgtagtttgagaagagtgtcctaagtcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgtag 24044156  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24044155 tataccaattaggggaacata 24044135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 15431887 - 15432205
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  15431887 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgatcatagctttctacttagacagaattgaattgttct 15431986  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15431987 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattagattaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 15432085  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  15432086 gggatgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagaactattttgttaactatcgtggtactagagaatcattcataagaataggtgcag 15432185  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15432186 tataccaattaggggaacat 15432205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 15405398 - 15405078
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15405398 tcttaatgctttttatatcgtgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagaccgaattgaattgttct 15405299  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaat---ggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaat 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  15405298 aataaacatggttagtctaggaataatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaat 15405199  T
Q  410 tatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtg 509  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  15405198 taggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaatggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacaaataggtg 15405099  T
Q  510 cagtataccaattaggggaac 530  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  15405098 cagtatatcaattaggggaac 15405078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 5672692 - 5673023
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaaca-----------tgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaat 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||  |||||||  |||    
T  5672692 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacaagatttagtgatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagttttctacttagacagaat 5672791  T
Q  302 tgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacc 401  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5672792 tgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacc 5672891  T
Q  402 taaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag 501  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  5672892 taaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaagcattcacaag 5672991  T
Q  502 aatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5672992 aatatgtgcagtataccaattaggggaacata 5673023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 46955792 - 46955473
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46955792 tcttaatgctttttatattatgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgatttagacctaattgaattgttct 46955693  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  46955692 aataaacatggttaatctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtttttaaaacattcaaagattattagtccacctaaggaattag 46955593  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||  |||| ||||||    
T  46955592 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagagctattttgttaactatcgttgaattagagaatcattaatacaaataggtgcag 46955493  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  46955492 tataccaattaggggaacat 46955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 40794810 - 40795130
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||  |||| ||  ||||||||||||||    
T  40794810 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttaaacagaattgaattgttct 40794909  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40794910 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 40795009  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  40795010 gggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaaggaattgatcaggactattctgttaactatcgtgtaactagaaaatcattcataagaataggtgtag 40795109  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  40795110 tataccaattagggaaacata 40795130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 3718932 - 3719250
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  3718932 tcttaatactttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgattactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttct 3719031  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3719032 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtg-tttaaatcttcaaagattattagaccacctaaggaattag 3719130  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  3719131 gggttgtagtttgagaagagggtcctaagccaagggattgattaggactattttgttaactattgtggaactagcaaatcattcataagaataggtgcag 3719230  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  3719231 tataccaattagggaaacat 3719250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 40617136 - 40616802
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggat--------------gactactaaccatagctttcgtcttagacct 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||              ||||||| ||||||||||||  ||||||       
T  40617136 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaattagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagagag 40617037  T
Q  299 aattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagacc 398  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40617036 aattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgattttaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagacc 40616937  T
Q  399 acctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttat 498  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  40616936 acctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaagcattcat 40616837  T
Q  499 aagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40616836 aagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 40616802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 5670374 - 5670705
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtga-----------gaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaat 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||           ||| | ||||||||| ||||||| ||||  |||||||  |||    
T  5670374 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacaagatttagtgatgatttagaaagaatgaatgactactgaccatagttttctacttagacagaat 5670473  T
Q  302 tgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacc 401  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5670474 taaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacc 5670573  T
Q  402 taaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag 501  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  5670574 taaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaagcattcacaag 5670673  T
Q  502 aatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5670674 aatatgtgcagtataccaattaggggaacata 5670705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 38283802 - 38283483
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  || | |    |||||||||||||    
T  38283802 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacctgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctactgatagaatattgaattgttct 38283703  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38283702 aataaacagggttagtctaggaatggataatcctttgttagtgatattaggttaacgtgcta-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 38283604  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  38283603 gggctgtagtttgagaagagagtcctaactcaagggattgattatgactattttgtttactatcatggaactagaaaatcattcataagaatagatgcag 38283504  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38283503 tataccaattaggggaacata 38283483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 215 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 18673393 - 18673076
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18673393 ttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacgtaattgaattgttctaa 18673294  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18673293 taaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 18673195  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagta 514  Q
     || ||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || || | ||||||| ||||||||    
T  18673194 gctttaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcagta 18673095  T
Q  515 taccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18673094 taccaattaggggaacata 18673076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 215 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 37103526 - 37103210
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  37103526 ttaatgctttatatatcctggtcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaa 37103427  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  37103426 taaaca-ggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaagattattagaccaccaaaggaattaggg 37103329  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagta 514  Q
     |||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37103328 gctgtagtttgagaagagggttctaagtcaaaggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagta 37103229  T
Q  515 taccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  37103228 taccaattagggaaacata 37103210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 280 - 533
Target Start/End: Original strand, 18911374 - 18911626
Alignment:
Q  280 tagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaac 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||    
T  18911374 tagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgataataggttaacgtgctt-aaac 18911472  T
Q  380 cttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911473 cttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtg 18911572  T
Q  480 gaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18911573 gaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 18911626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 11195484 - 11195803
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11195484 tcttaatgctttttatatcatgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctacttgaattgttct 11195583  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  11195584 aataaacatggttagtttaggaatgaataatcatttattagtgataataggttaacgtgc-ctaaaccttcaaaggttattagaccacctaagaaattag 11195682  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || || ||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  11195683 gggctttaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactgttttgttaactatcgtggaactagtgaatcattcataagaatatgtgcag 11195782  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11195783 tataccaattaggggaacata 11195803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 33926775 - 33927099
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgga-----tgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaatt 307  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  33926775 tcttgatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgacttgactactgaccctagctttcgacttagatctaattgaact 33926874  T
Q  308 gttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaagga 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||    
T  33926875 gttctaataaacatgattagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaacctttgagaattattagaccacctgagga 33926974  T
Q  408 attatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatg 507  Q
    |||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  33926975 attaggggctgtagttttagaagagggtcctaactcaagggattgattatggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaatagg 33927074  T
Q  508 tgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33927075 tgcagtataccaattaggggaacat 33927099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 222 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 3798112 - 3797802
Alignment:
Q  222 tttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacat 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  3798112 tttttatatcctgatcacatataaacatgatttaatgagaatgaatgactactgaccatagctttctatttagacagaattgaattgttctaataaacag 3798013  T
Q  322 ggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtag 421  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  3798012 ggttaatctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtag 3797914  T
Q  422 tttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaat 521  Q
    | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3797913 tgtgagaagagggtcttaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagtgaatcattaataagaataggtgcagtataccaat 3797814  T
Q  522 taggggaacata 533  Q
    ||||||||||||    
T  3797813 taggggaacata 3797802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 15430169 - 15429850
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||| |||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  15430169 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttaatgaaaatgaacgactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttct 15430070  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  15430069 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgttttttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagataattagaccacctaaggaattag 15429971  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || | |||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  15429970 gggcagtagtttgagaagtgggtcccaagtcaagggatggattaagactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgtag 15429871  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15429870 tataccaattaggggaacata 15429850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 213 - 525
Target Start/End: Original strand, 49270494 - 49270799
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49270494 tcttaatgctttttatattct---caaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgatcatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 49270590  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
     ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||   |||||||||||||||| |||||||     
T  49270591 cataaacatggttagtatatgaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacattcttaaaaccttca---attattagaccacctagggaattag 49270687  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  49270688 ggactgtagtttgagaagagggtcctaactcaa-ggattgattaggactattttgttaactatcgttgaactagataatcattcataagaatatgtgcag 49270786  T
Q  513 tataccaattagg 525  Q
    |||||||||||||    
T  49270787 tataccaattagg 49270799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 12782713 - 12783032
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  12782713 tcttaatactttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtaaaaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacggaattgaattgttct 12782812  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12782813 aataaacagggttagtctatgaatggataatcgtttgttagggatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 12782911  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12782912 gggttgtagtttgagaaaagggtcctaagtcaagggattgattaggactattttgttaactctaatgaaactagaaaatcatttataagaataggtgcag 12783011  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  12783012 tataccaattagaggaacata 12783032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 40493681 - 40493362
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40493681 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 40493582  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  40493581 aataaacatggttagtctaggaatgtataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattag 40493483  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaac-tcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgca 511  Q
    ||  ||||     |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||| |||      
T  40493482 gggttgtaaccctagaagagggtcgtaacttcaagggattgattaggactatttttttaactatcgtagaactagtgaatcattcacaagaataggtgtg 40493383  T
Q  512 gtataccaattaggggaacat 532  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40493382 gtataccaattaggggaacat 40493362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 53009871 - 53009552
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53009871 tcttaatactttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 53009772  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||     
T  53009771 aataaacatggttagtctaggaatttataaccatttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaacggttattagaccacctaagaaattag 53009673  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||    
T  53009672 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagagattaattaggactattttgttaactatcgtggaactagtgaatcattcacaagaataggtgcag 53009573  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  53009572 tatactaattaggggaacata 53009552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 240 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 19859808 - 19859516
Alignment:
Q  240 atataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||  |||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859808 atataaacatgatttagtgagaatgaataactactgaccatagctttctacttaaacttaattaagttgttttaataaacatggttagtctaggaatgga 19859709  T
Q  340 taatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtccta 439  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  19859708 taatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtccta 19859610  T
Q  440 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19859609 actcaagggattgattaagactattttattaattatcgtggaactagaaaataattcataagaatatgtgcagtataccaattaggggatcata 19859516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 33408631 - 33408314
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||     
T  33408631 tcttaatgctttttatatcctgatcagatataaacatgatttagtgagaatgaatgattactgaccatagctgtctacttagacctaattgagttgttca 33408532  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33408531 aataaacattgttagtctaggaatagataatcagttatttgtgatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 33408432  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  33408431 gggttatagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattagggctattttattaaccatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 33408332  T
Q  513 tataccaattaggggaac 530  Q
    |||||| |||||||||||    
T  33408331 tataccgattaggggaac 33408314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 15436783 - 15436464
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||| |||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  15436783 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttaatgaaaatgaacgactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttct 15436684  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  15436683 aataaacagggttagtctaggaatgtataatcgttttttattgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagataattagaccacctaaggaattag 15436585  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || | |||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  15436584 gggcagtagtttgagaagtgggtcccaagtcaagggatggattaagactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgtag 15436485  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15436484 tataccaattaggggaacata 15436464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 21419597 - 21419915
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21419597 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgagcgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 21419696  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  21419697 aataagcatggttagtctaggaatggataatcttttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattag 21419795  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    |   ||||     |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||| |||  |    
T  21419796 gtgatgtaaccctagaagagggttctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtagaactagtgaatcattcacaagaataggtgtgg 21419895  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21419896 tataccaattaggggaacat 21419915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 216 - 533
Target Start/End: Original strand, 30392380 - 30392696
Alignment:
Q  216 taatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaat 315  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  30392380 taatgctttttatatcttaatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagcttttgaattagacctaattgaattgttctaat 30392479  T
Q  316 aaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgga 415  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  30392480 aaacatggttagtctaggaatgaataatactttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaagattattagaccaccttaggaattagggg 30392578  T
Q  416 ctgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtat 515  Q
     ||||     |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||| |||    
T  30392579 ttgtaaccctagaagagggtcctaattcaagggattgattaggattattttgttaactatcgtggaactagcgaatcattcataaaaataggtgcaatat 30392678  T
Q  516 accaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30392679 accaattaggggaacata 30392696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 29545187 - 29544869
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || |||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  29545187 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactggccctaacttttgacttacacctaattgaattgttct 29545088  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  29545087 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagacctcctaaggaattag 29544989  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||     | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || |||| |||||     
T  29544988 gggttgtaaccctataagagagtcataactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagttaatcattcacaataataggtgcaa 29544889  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  29544888 tataccaattagaggaacat 29544869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 25961866 - 25962185
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25961866 tcttaaagctttttatatcctgatcaaatataaaaatgatttaatgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 25961965  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagatta-ttagaccacctaaggaatta 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||||    
T  25961966 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattagcttaacgtgc-ttaaacattcgacggttatttagaccacctaaggaatta 25962064  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgca 511  Q
     || |||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||| ||||     
T  25962065 ggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggaatattttgttaactatcgtagaactagtgaatcattcacaagaataggtgcg 25962164  T
Q  512 gtataccaattaggggaacat 532  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  25962165 gtataccaattaggagaacat 25962185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 240 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 19864799 - 19864511
Alignment:
Q  240 atataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||  |||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864799 atataaacatgatttagtgagaatgaataactactgaccatagctttctacttaaacttaattaagttgttttaataaacatggttagtctaggaatgga 19864700  T
Q  340 taatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtccta 439  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  19864699 taatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccatctaagaaattaggggctgtagtttgagaagagggtccta 19864601  T
Q  440 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19864600 actcaagggattgattaggactattttgttaactat----gaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggatcata 19864511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 213 - 483
Target Start/End: Original strand, 35509773 - 35510042
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35509773 tcttaatgctttttatatcctgattaaatataaacatgatttagtaagaacgaatgactactgaccctagctttcgaattagacctaattgaattgttct 35509872  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||     
T  35509873 aataaacatcgttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaacctttaatggttattagaccacctaaggaattag 35509971  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaac 483  Q
    || |||||     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35509972 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaac 35510042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 8877815 - 8877497
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||     
T  8877815 tcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgggaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagatttaattgaattgttca 8877716  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  8877715 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaagttaacattcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaagaaattag 8877616  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgca 511  Q
    ||  |||  |  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||| |||| |||||    
T  8877615 gggttgtgatcggagaagagagtcctaagtcaagggattgattagggctattttgttaaccatcgtgaaactagagagtcattcataagaaataggtgca 8877516  T
Q  512 gtataccaattaggggaac 530  Q
    |||||| || |||||||||    
T  8877515 gtatactaaataggggaac 8877497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 213 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8875075 - 8874772
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  8875075 tcttaatgctttttatcacttgatcaaatataaacataatttagtgagaatgaatgactaccgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttca 8874976  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  8874975 aataaacatggttagtctaggaatggatagtcgtttatttgttatattaagttaatgttcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattag 8874876  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgca 511  Q
    || ||||| |  ||||||| ||| |||| ||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| ||||| |||| |||||    
T  8874875 gggctgtaatcggagaagagggttctaagtcaatcgattgattatggctattttgttaaccatcttgaaactagagaatcattcataagaaataggtgca 8874776  T
Q  512 gtat 515  Q
    ||||    
T  8874775 gtat 8874772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 240 - 530
Target Start/End: Original strand, 53094342 - 53094633
Alignment:
Q  240 atataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  53094342 atataaacatgatttcgtgagaacgaattactactgaccatagttttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatgga 53094441  T
Q  340 taatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtccta 439  Q
    ||||| ||||||  |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||| | |||||||| |||||||    
T  53094442 taatcgtttatttctgatattaagttaacgttcataaaacattcaaagagtattagaccacctaaggagttaggggttgtactatgagaagagggtccta 53094541  T
Q  440 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgcagtataccaattaggggaac 530  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53094542 agtcaagggattgattaggcctattttgttaatcatcgtgaaactagagaatcattcgtaagaaataggtgcagtataccaattaggggaac 53094633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 222 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 15447040 - 15446792
Alignment:
Q  222 tttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacat 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  15447040 tttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaattactactgaccataactttctacttagactgaattgaattgttctaataaacag 15446941  T
Q  322 ggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtag 421  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  15446940 ggttagtctatgaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttctaagattattggaccacctaaggaattaggggctgtag 15446842  T
Q  422 tttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaa 471  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  15446841 tttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattataactatttggttaa 15446792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 215 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 37740074 - 37739754
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||    
T  37740074 ttaatgctttttatattctaatcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactaaccatagctttcaacttagacctaatcgaatttttcaaa 37739975  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtga---tattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    |||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37739974 taaactgggttaatctatgaatggataatcgtttatttgtgatattattaggttaatgtttgtaaaaccttcaaagattattagatcacctaaggaatta 37739875  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactatttt-gttaactatcgtggaactagaaaatcatttataaga-atatgtg 509  Q
     |||| ||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||| ||  ||| |||||| ||| |||    
T  37739874 gggacagtaatctgataagagggtcctaagtcaagggattgattagggctattttagctaaccatcgtgaaactagagaaatattcataagacataggtg 37739775  T
Q  510 cagtataccaattaggggaac 530  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  37739774 cagtgtaccaattagaggaac 37739754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 213 - 408
Target Start/End: Original strand, 19827298 - 19827492
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||    
T  19827298 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatacaaacatgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttctacttagactgaatggaattgttct 19827397  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaa 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19827398 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaa 19827492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 606 - 793
Target Start/End: Original strand, 5023930 - 5024110
Alignment:
Q  606 ctttagcttcctatgttattcagttttttgtctcagcaatgcagaaacagggagcactcaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttag 705  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5023930 ctttagcttcatatgttattcggttttttgtctcagcagtgcagaaacagggagcacctaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttag 5024029  T
Q  706 ttttttggtgttgtaacttgctgctgctgttagaactttgtatttctttactttgctaatgttggtagttcttataccttcctatgct 793  Q
    |||||||||| ||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5024030 ttttttggtgatgta-------gctgctgttaaaactttgtatttctttactttgctagagttggtagttcttataccttcctatgct 5024110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22172685 - 22172422
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||| | |||| |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||    
T  22172685 ttaatgatttttatatactgatcacatataa-catgaattcgtgagaatgaatgattactgaccatagctttcaacttagaccttattgaattgttcaaa 22172587  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||    
T  22172586 taaacagggttagtctatgaatggataatcgtttatttgcgatattaggttaacgttcttaaaaccttcgaagaatattagttcacctaaggaattaggg 22172487  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactatttt-gttaactatcgt 478  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  22172486 actgtaatctgagaagagggtcctaagtcaagggattgattatggctattttagttaactatcgt 22172422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 224 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27679527 - 27679341
Alignment:
Q  224 tttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatgg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  27679527 tttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaacatagctttctacttatacagaattgaattgttctaataaacaagg 27679428  T
Q  324 ttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679427 ttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 27679341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 606 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 1933821 - 1933640
Alignment:
Q  606 ctttagcttcctatgttattcagttttttgtctcagcaatgcagaaacagggagcactcaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttag 705  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1933821 ctttagcttcctatgttattcggttttttgtctcagcagtgcagaaatagggagcacccaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttag 1933722  T
Q  706 tt-ttttggtgttgtaacttgctgctgctgttagaactttgtatttctttactttgctaatgttggtagttcttataccttcctatgct 793  Q
    || |||||||| ||||       |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1933721 tttttttggtgatgta-------gctgttgttataactttgtatttctttactttgctagagttggtagttcttataccttcctatgct 1933640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 388 - 532
Target Start/End: Original strand, 5706374 - 5706519
Alignment:
Q  388 attattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggact-attttgttaactatcgtggaactag 486  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5706374 attattagctcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagtgtcctaactcaagggattgattaggacttattttgttaactatcgtggaactag 5706473  T
Q  487 aaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5706474 aaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacat 5706519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 33493956 - 33493756
Alignment:
Q  266 atgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggtt 365  Q
    ||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || |||    
T  33493956 atgactactgaccatagcttacaatttagacctaattgaattgttcaaataaacagagttagtctaggaatagataatcgtttatttgtgataatatgtt 33493857  T
Q  366 aatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattt 465  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||| | |||||||||||    
T  33493856 aacgttctttaaacattcaaagaatattagatcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagatggtcctaagttaaggaattaaataggactattt 33493757  T
Q  466 t 466  Q
    |    
T  33493756 t 33493756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 228 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 48014351 - 48014168
Alignment:
Q  228 tatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttag 327  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||| | || |||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  48014351 tatcctgatcaaatataaatatgaattcgtgagaatgaataactactgaccataactttcaactttgacctaattgaattgttcaaataaacagggttag 48014252  T
Q  328 tctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  48014251 tttaggaatggataatcgtttatttgtgacattaggttaacgttcttaaaaccttcaaataatattagatcacctaaggaatta 48014168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 627 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 26093975 - 26093804
Alignment:
Q  627 agttttttgtctcagcaatgcagaaacagggagcactcaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttagtt-ttttggtgttgtaacttg 725  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26093975 agttttttgtcttagcagtgcagaaacagggtgcacccaacgaatgtttgtgtttgcttcccttgttattttgctttagtttttttggtgatgtaacttg 26093876  T
Q  726 ctgctgctgttagaactttgta----tttctttactttgctaatgttggtagttcttataccttcctatgct 793  Q
    ||||| ||||||||| ||||||    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26093875 ctgctactgttagaattttgtatgtgtttctttactttgctagagttggtggttcttataccttcctatgct 26093804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 617 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 22735826 - 22735702
Alignment:
Q  617 tatgttattcagttttttgtctcagcaatgcag---aaacagggagcactcaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttagtt-ttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22735826 tatgttattcagttttttgtctcagcagtgcagcagaaacagggagcacccaaggact--ttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttagtttttttg 22735729  T
Q  713 gtgttgtaacttgctgctgctgttaga 739  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22735728 gtgatgtaacttgctgctgctgttaga 22735702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 442 - 530
Target Start/End: Original strand, 39498346 - 39498434
Alignment:
Q  442 tcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaac 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39498346 tcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaac 39498434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 266 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 5677660 - 5677447
Alignment:
Q  266 atgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggtt 365  Q
    |||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||      |||||||    ||| | |||| ||||||  |||||    
T  5677660 atgactactaaccataacttacaacttagacttaattgaattgttcaaataaacaaggt------aggaatg----atcgtatatttgtgatacaaggtt 5677571  T
Q  366 aatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattt 465  Q
    || || ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5677570 aacgtccttaaaaccttcaaagaatattagatcacttaaggaattagggactgtaatctgagaagatggtcctaagtcaagggattgattaggactattt 5677471  T
Q  466 t-gttaactatcgtggaactagaa 488  Q
    | |||| | |||||| ||||||||    
T  5677470 tagttagccatcgtgaaactagaa 5677447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 462 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 15445430 - 15445359
Alignment:
Q  462 attttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15445430 attttgttaactatcgtggaagtagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 15445359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Original strand, 27013894 - 27014000
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtg 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    ||||| ||||||||||||  ||||    
T  27013894 caacgacggaactctatcgatttattttctttactatgttgtttattattttaatcatgtctagctaatttcctttgattaggtctgagatgatcttgtg 27013993  T
Q  204 taaccct 210  Q
    |||||||    
T  27013994 taaccct 27014000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 274
Target Start/End: Original strand, 15438501 - 15438562
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactact 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15438501 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactact 15438562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Original strand, 12237903 - 12238009
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtg 203  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||     ||| ||||||||||||||| ||    
T  12237903 caacgacggaattttatcggtttattttctttattatgttgtttattatttcaatcatgtttagctaatttctttttgttaggtctgagatgattctttg 12238002  T
Q  204 taaccct 210  Q
    |||||||    
T  12238003 taaccct 12238009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 201
Target Start/End: Original strand, 5670198 - 5670290
Alignment:
Q  109 acggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctg 201  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    ||||| ||||||||||||||||    
T  5670198 acggaactctatcggtttattttctttgctatgttgtttatttctttaatcatgtctagctaatttcctttgattaggtctgagatgattctg 5670290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 457 - 529
Target Start/End: Original strand, 35510043 - 35510115
Alignment:
Q  457 ggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaa 529  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35510043 ggactattttgttaactaacgtggaactagtgaatcattcataagaataggtgtagtataccaattaggggaa 35510115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37103706 - 37103603
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaa-tttctagagattaagtctgagatgattctgt 202  Q
    ||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| |    
T  37103706 caacggcgaaactctatcggtttattttctttattatgttgtttattctttttatcatgtctagctaattttcttttgattaaatctgagatgattcttt 37103607  T
Q  203 gtaa 206  Q
    ||||    
T  37103606 gtaa 37103603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 479 - 533
Target Start/End: Original strand, 19827489 - 19827543
Alignment:
Q  479 ggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19827489 ggaactagaaaatcattcataagaatatgtgcattataccaattaggggaacata 19827543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8448854 - 8448745
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacct-aattgaattgttcta 313  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||   ||||||||||  ||||||||| |||||||||| || |    
T  8448854 ttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatcatttcgtaagaatgaatgactactggtcatagctttctacttagacctaaattgaattgctcaa 8448755  T
Q  314 ataaacatgg 323  Q
    ||||||||||    
T  8448754 ataaacatgg 8448745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 201
Target Start/End: Original strand, 5672517 - 5672609
Alignment:
Q  109 acggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctg 201  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     ||||| ||||||||||||||||    
T  5672517 acggaactctatcggtttattttctttgctatgttgtttatttctttaatcatgtctagctaattttctttgattaggtctgagatgattctg 5672609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Original strand, 5681060 - 5681163
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtg 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| || |||| ||||  || ||| ||||||||||||||| ||    
T  5681060 caacgacggaactctatcggtttattttctttactatattgtttatttctttattcatgtctaactaa-ttctttaggttaggtctgagatgattctttg 5681158  T
Q  204 taacc 208  Q
    |||||    
T  5681159 taacc 5681163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24410245 - 24410206
Alignment:
Q  290 cttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24410245 cttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtc 24410206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 175
Target Start/End: Original strand, 18859391 - 18859461
Alignment:
Q  105 aacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttc 175  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  18859391 aacgacggaactctatcaatttattgtctttagtatgttgtttattcgtttgatcatgtttagctaatttc 18859461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19860013 - 19859905
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaa-tttct-agagattaagtctgagatgattctg 201  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||| | |||| |  |||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||     
T  19860013 caacgacggaacttcatcggtttattttctttactatattgtttagtcctttaactatgtctagctaattttctaagagattaggtttgagatgtttctt 19859914  T
Q  202 tgtaaccct 210  Q
    |||||||||    
T  19859913 tgtaaccct 19859905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11703075 - 11703020
Alignment:
Q  118 tatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  11703075 tatcggtttattttctttactatgttgtttatttatttaatcatgtctagctaatt 11703020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8448748 - 8448654
Alignment:
Q  335 atggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaa 429  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||| |||  | | ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||| |||||    
T  8448748 atggataatcctttgtttgtgatattagcttaacgtttgtaatacctttaaagattattagatcacctatgaaattaggggctgtagttggagaa 8448654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 40617185 - 40617139
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatt 150  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40617185 caacgacggaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatt 40617139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7642810 - 7642770
Alignment:
Q  111 ggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttattt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7642810 ggaactttatcgatttattttttttactatgttgtttattt 7642770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19864977 - 19864926
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttt 155  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  19864977 caacgacggaactctatcggtttattttctttactatcttgtttattccttt 19864926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 33400808 - 33400754
Alignment:
Q  118 tatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||    
T  33400808 tatcgatttattttctttactatgttgttta-ttctttaatcatgtctatctaatt 33400754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 173
Target Start/End: Original strand, 10385579 - 10385648
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||    
T  10385579 caacgacggaactctatgaatttattttttttactatgttgtttgtttctttattcatgtctagttaatt 10385648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 215 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 41877076 - 41876758
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  41877076 ttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaaagaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaa 41876977  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41876976 taaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 41876877  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagta 514  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  41876876 gctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaattattcataagaataggtgcagta 41876777  T
Q  515 taccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41876776 taccaattaggggaacata 41876758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 213 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 26753015 - 26752694
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  26753015 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaattactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 26752916  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26752915 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 26752816  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  26752815 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaaaaggtgcag 26752716  T
Q  513 tataccaattaggggaacataa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26752715 tataccaattaggggaacataa 26752694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 20055583 - 20055902
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20055583 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaaagaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttct 20055682  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20055683 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 20055781  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20055782 gggttgtagtttgagaagacggtcctaactcacgggattgattaggattattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 20055881  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20055882 tataccaattaggggaacata 20055902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 215 - 533
Target Start/End: Original strand, 18952504 - 18952821
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18952504 ttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactaatgaccatagctttcgacttagatctaattgaattgttctaa 18952603  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18952604 taaacatggttagtttaggaatggataattgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 18952702  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagta 514  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18952703 gctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaatatgtgcagta 18952802  T
Q  515 taccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18952803 taccaattaggggaacata 18952821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 42062730 - 42063050
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42062730 tcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 42062829  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||     
T  42062830 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagttcacctaaggaattag 42062929  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42062930 ggactgtaatatgagaagagggtcctaactcaagagattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 42063029  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  42063030 tataccaattagggaaacata 42063050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 22937251 - 22936932
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22937251 tcttaatgcattttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 22937152  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||     
T  22937151 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattag 22937052  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22937051 ggactgtaatctgagaagagggtcctaactaaagggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 22936952  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22936951 tataccaattaggggaacat 22936932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 14016452 - 14016133
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14016452 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 14016353  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||     
T  14016352 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaaagtgctttaaaccttcgagaattattaaaccacctaagaaattag 14016253  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||     
T  14016252 gggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactaccgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcac 14016153  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14016152 tataccaattaggggaacat 14016133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 7270825 - 7271144
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7270825 tcttaatgctttttatatcctggtcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttct 7270924  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  7270925 aacaaacatggttagtctatgaatggataatcgtttgttagtgatattgggctaacgtg-tttaaaccttcaaagattatcagaccacctaaggaattag 7271023  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7271024 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagaactattttgttaactatcatggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 7271123  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7271124 tataccaattaggggaacata 7271144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 17664361 - 17664679
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17664361 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagatctaattgaattgttct 17664460  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17664461 aataaacatggttagtctaggaatcgataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 17664559  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  |||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || |||||| ||||||    
T  17664560 gggttgtaatcttagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagtgaatcatacat-agaataggtgcag 17664658  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17664659 tataccaattaggggaacata 17664679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 7624911 - 7625230
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7624911 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacaaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 7625010  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  7625011 aataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattag 7625110  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
     | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||    
T  7625111 aggctgtagtttgagaagagagtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacaaataggtgtag 7625210  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7625211 tataccaattaggggaacat 7625230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Original strand, 34831572 - 34831889
Alignment:
Q  213 tcttaatg-ttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttc 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  34831572 tcttaatgcttttttatttcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttc 34831671  T
Q  312 taataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34831672 taataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 34831770  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgca 511  Q
     ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  34831771 ggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaattattcataagaataggtgca 34831870  T
Q  512 gtataccaattaggggaac 530  Q
     ||||||||||||||||||    
T  34831871 ttataccaattaggggaac 34831889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 26895917 - 26895598
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26895917 tcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgattgactactgaccatagctttcgacttagacataattgaattgttct 26895818  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26895817 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 26895719  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
     | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||     
T  26895718 aggctgtagtttgagaagagagtcttaactcaagggattgattaggactattttgttaattatcgttgaactaaaaaatcattcataagaataggtgcaa 26895619  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  26895618 cataccaattaggggaacata 26895598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 41306840 - 41306521
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  41306840 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttaataagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 41306741  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41306740 aataaacagggttagtctaggtatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 41306642  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  41306641 gggctgtagtttgaaaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataaaaataggtgcag 41306542  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41306541 tataccaattaggggaacata 41306521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 215 - 533
Target Start/End: Original strand, 43491566 - 43491884
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43491566 ttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaa 43491665  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  43491666 taaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcataaaatcttcaaagattattaaaccacctaaggaattaggg 43491765  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagta 514  Q
      | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  43491766 ggtctagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattagaactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataaaaatagatgcaata 43491865  T
Q  515 taccaattaggggaacata 533  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  43491866 taccgattaggggaacata 43491884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 40583058 - 40583376
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  40583058 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattaaattgttct 40583157  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  40583158 aataaagatggttagtctaggaatagataatcgtttcttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattag 40583256  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  40583257 gggttgtagtttaagaagagggtcataactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaattatagaatcattcataagaataggtgcag 40583356  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  40583357 tataccaattaggagaacat 40583376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 33551930 - 33552249
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaa-tataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttc 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33551930 tcttaatgctttttatatcctgatcaaaatataaacatgatttagtgataatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttc 33552029  T
Q  312 taataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33552030 taacaaatatggtcagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaaagattat-agaccacttaaggaatta 33552127  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgca 511  Q
     ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33552128 ggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattcataagaataggtgca 33552227  T
Q  512 gtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33552228 gtataccaattaggggaacata 33552249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 4099830 - 4099511
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  4099830 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttatacataattgaattgttct 4099731  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  4099730 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaatcttcaaatattattagaccacctaaagaattag 4099632  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4099631 gggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaagggattgattatgactattttgctaactatcgtgcaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 4099532  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4099531 tataccaattaggggaacata 4099511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 34133296 - 34132977
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34133296 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttct 34133197  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  34133196 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 34133098  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || || | ||||||| ||||||    
T  34133097 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcag 34132998  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34132997 tataccaattaggggaacata 34132977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 34143527 - 34143208
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34143527 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttct 34143428  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  34143427 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 34143329  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || || | ||||||| ||||||    
T  34143328 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcag 34143229  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34143228 tataccaattaggggaacata 34143208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 12058805 - 12058486
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12058805 tcttaatgctttttatatcctggtcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttaaacctaattgaattgttct 12058706  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  12058705 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 12058607  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || || | ||||||| ||||||    
T  12058606 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagggactctttcacaagaataggtgcag 12058507  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12058506 tataccaattaggggaacata 12058486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 12087767 - 12088086
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12087767 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttct 12087866  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  12087867 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 12087965  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || || | ||||||| ||||||    
T  12087966 gggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcag 12088065  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12088066 tataccaattaggggaacata 12088086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 14376121 - 14375790
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14376121 tcttaatgcttgttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 14376022  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14376021 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgctagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 14375923  T
Q  413 ggactgtagtttgagaag-------------atggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttata 499  Q
    || |||||||||||| ||             | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  14375922 ggtctgtagtttgagtagagggtcctaactcaaggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcatggaactagaaaatcattcata 14375823  T
Q  500 agaatatgtgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14375822 aaaataggtgcagtataccaattaggggaacat 14375790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 21336011 - 21335692
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  21336011 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgactataactttctacttagacataattgaattgttct 21335912  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  21335911 aataaacagggttagtctataaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagatcacctaaggaattag 21335813  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  21335812 gggctgtagtttgagaagacggttctaagtcaaaggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcag 21335713  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  21335712 tatacaaattaggggaacata 21335692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 26907768 - 26907449
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26907768 tcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacttaattgaattgttct 26907669  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  26907668 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattggtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattac 26907570  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
     |  ||||     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||| ||||||    
T  26907569 aggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtagaactaatgaatcattcataagaataggtgcag 26907470  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26907469 tataccaattaggggaacata 26907449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 217 - 533
Target Start/End: Original strand, 31863513 - 31863843
Alignment:
Q  217 aatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaata 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||    
T  31863513 aatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattattctaata 31863612  T
Q  317 aacatggttagtctaggaatggataatcctttattag--------------tgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacct 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||              |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31863613 aacatggttagtctaggaatggataatcatttgttagtgatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacct 31863712  T
Q  403 aaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataaga 502  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31863713 aaggaattaggggctatagtttgagaagaggatcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataaga 31863812  T
Q  503 atatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31863813 ataggtgcagtatatcaattaggggaacata 31863843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 17748249 - 17748568
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17748249 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagaactaattgaattgttct 17748348  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| | | |||||||| ||| |||| |||||     
T  17748349 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcgacggttattagatcacttaagaaattag 17748447  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||| | || |||| |||| |    
T  17748448 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgttaaactagggactcattcacaaaaataggtgcgg 17748547  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17748548 tataccaattaggggaacata 17748568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 39192137 - 39192457
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  39192137 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttaatgagaacaaatgactattgaccatagctttcgacctagatctaattgaattgttct 39192236  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  39192237 aataaacatggttagtctaggaatagataatcgtttgttagtgatattaggttaatgtgc-ttaaaccttgaaagattattataccacctaaggaattag 39192335  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaact--agaaaatcatttataagaatatgtgc 510  Q
    ||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  39192336 gggttgtagtttaagaagagggtcttaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtgcaactagagagaatcattcataagaatacgtgc 39192435  T
Q  511 agtataccaattaggggaacat 532  Q
    | |||| |||||||||||||||    
T  39192436 attatatcaattaggggaacat 39192457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 21332995 - 21332674
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaaca--tgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgtt 310  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  21332995 tcttaatgctttttatatcatgatcaaatataaaaagatgatttagtgagaataaatgactactgactatagctttctacttagacataattgaattgtt 21332896  T
Q  311 ctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatt 410  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21332895 ctaataaacagggttagtctatgaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagatcatctaaggaatt 21332797  T
Q  411 atggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgc 510  Q
    | || |||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  21332796 aggggctgtagtttgagaagagggttctaagtcaatgaattgattaggactattttattaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgc 21332697  T
Q  511 agtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21332696 agtataccaattaggggaacata 21332674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 224 - 533
Target Start/End: Original strand, 26292611 - 26292919
Alignment:
Q  224 tttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatgg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292611 tttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatgg 26292710  T
Q  324 ttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtt 423  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||       
T  26292711 ttagtctaggaatgtataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaacc 26292809  T
Q  424 tgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaatta 523  Q
      | |||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26292810 ctataagagggtcgtaactcaagggattggttcggactatttggttaactatcatggaactagcgaatcattgataagaataggtgcagtataccaatta 26292909  T
Q  524 ggggaacata 533  Q
    | ||| ||||    
T  26292910 gaggagcata 26292919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Original strand, 21914930 - 21915249
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  21914930 tcttaatgatttttatagcctgatcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttca 21915029  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  21915030 aataaacagggttagtctaggaatgaataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttcttcaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattag 21915129  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactatttt-gttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgc 510  Q
    |||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || |||| ||  ||| ||||| |||| |||     
T  21915130 ggactgtaatctgagaagagggtcataagtcaagggattgattagggctattttagttaaccatcgtgaaattagagaaatattcataagaaataggtgt 21915229  T
Q  511 agtataccaattaggggaac 530  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  21915230 agtgtaccaattaggggaac 21915249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 213 - 458
Target Start/End: Original strand, 2837112 - 2837357
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2837112 tcttaatgctttttatatcccgatcaaatataaacatgatttagtcagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttct 2837211  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2837212 aataaacatggttagtttatgaatggataatcgtttattagtgataataggttaacgttcataaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 2837311  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattagg 458  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2837312 gggttgtagtttgagaagagggtcctaaatcaagggattgattagg 2837357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 213 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28787636 - 28787330
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaac-atgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttc 311  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  28787636 tcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaactatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagttttctacttggacataattgaattgttc 28787537  T
Q  312 taataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | |||||||        ||||||||||| |||||||||||    
T  28787536 taataaacaaggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-ttaaacc--------ttattagaccagctaaggaatta 28787446  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattg--attaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtg 509  Q
    |||  ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| |||    
T  28787445 tgggttgtagtttgagaagagggt-ctaagtcaagggattgaaattaagactattttgttaactattgtggaattagaaaatcattcatcagaataggtg 28787347  T
Q  510 cagtataccaattaggg 526  Q
    |||||||||||||||||    
T  28787346 cagtataccaattaggg 28787330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 18239809 - 18239492
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||     
T  18239809 tcttcatgctttttatatcct-atcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttgaacttagacctaattgaattgttca 18239711  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  18239710 aataaacaaggctagtctaggaatggataatcgtttatatgtaatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtattagaccacctaagaaattag 18239611  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgca 511  Q
    ||  | || | ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||   ||| |||| |||||    
T  18239610 gggttttactctgacaagggggtcctaagtcaagggattgattagggctattttgttaattatcgtgaaactagagaatcattcgaaagaaataggtgca 18239511  T
Q  512 gtataccaattaggggaac 530  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  18239510 gtacaccaattaggggaac 18239492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 11959483 - 11959172
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacc-taattgaattgttc 311  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11959483 tcttaatgctttttatatc-tgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccatagcgttcgacttagaccttaattgaattgttc 11959385  T
Q  312 taataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  11959384 taataaacatggttagtcta--aa--gataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaacggttattacaccacctaaggaatta 11959290  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgca 511  Q
     || |||||     |||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||    |||||||||| | |||||||  | ||||| | ||||||| ||||     
T  11959289 ggggctgtaaccctagaagagggttctaactcaaaggattgattataacta----gttaactatcatagaactagggactcattcacaagaataggtgcg 11959194  T
Q  512 gtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11959193 gtataccaattaggggaacata 11959172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 606 - 791
Target Start/End: Original strand, 22378451 - 22378636
Alignment:
Q  606 ctttagcttcctatgttattcagttttttgtctcagcaatgcagaaacagggagcactcaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttag 705  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22378451 ctttagcttcctatgttattcagttttttgtctcagcagtgcagaaatagggcgaaccaaaggactgtttgtgtgtgcttcccttcttattttgcattag 22378550  T
Q  706 ttttttggtgttgtaacttgctgctgctgttagaactttgtatttctttactttgctaatgttggtagttcttataccttcctatg 791  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22378551 ttttttggtgctctaacttgctgctgctgttagaactttgtatttctttactttgctagagttggtagttcttataccttcctatg 22378636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 217 - 394
Target Start/End: Original strand, 32837831 - 32838007
Alignment:
Q  217 aatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaata 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32837831 aatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgattt-gtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaata 32837929  T
Q  317 aacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattatta 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  32837930 aacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattatta 32838007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 606 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 17524731 - 17524550
Alignment:
Q  606 ctttagcttcctatgttattcagttttttgtctcagcaatgcagaaacagggagcactcaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttag 705  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17524731 ctttagcttcctatgttattcagttttttgtctcagcagtgcagaaacacggagtacccaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttag 17524632  T
Q  706 ttttttggtgttgtaacttgctgctgctgttagaactttgtatttctttactttgctaatgttggtagttcttataccttcctatgcta 794  Q
    |||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17524631 ttttttggtgttgta-------gctgctgttaaaactttgtatttatttactttgctagagttggtagttcttataccttcctatgcta 17524550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 213 - 411
Target Start/End: Original strand, 30066151 - 30066348
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  30066151 tcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatgatttaatgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaaatgaattgttct 30066250  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066251 aacaaacatggttagtctaggagtggataatcgtttgttagagatattaggttaacgttc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 30066348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 334 - 532
Target Start/End: Original strand, 22131159 - 22131357
Alignment:
Q  334 aatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatg 433  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |    
T  22131159 aatggataatcgtttattagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaggattattaaaccacctaaggaattaggtgttgtagtttgagaagagg 22131258  T
Q  434 gtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22131259 gtcctaactcaagagattgattaggaatattttgttaactatcgtagaactagagaatcattcatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacat 22131357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 207
Target Start/End: Original strand, 32837570 - 32837755
Alignment:
Q  22 acgttttcggcagagaggaaggaagcatatgggaaaagaacatcaatcgtagtgattgagaagtaaatgaagagcaagcccacaacgacggaactttatc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| | |  |    
T  32837570 acgttttcggcagagaggaaggaagcatatgggaaaagaacatcaaccgtagtgattgagaagtaattgaagagcaagccggcaactacggaattctgac 32837669  T
Q  122 gatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtgtaac 207  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32837670 ggtttattttctttactatgttgtttatttcttttatcatgtctagctaattttcagagattaagtctaagatgattctgtgtaac 32837755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 213 - 363
Target Start/End: Original strand, 23043973 - 23044123
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23043973 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactggccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 23044072  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattagg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23044073 aataaacatggttagtctaggaatgaataatcctttattagtgatattagg 23044123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 379 - 526
Target Start/End: Original strand, 37215019 - 37215166
Alignment:
Q  379 ccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37215019 ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgt 37215118  T
Q  479 ggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggg 526  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37215119 ggaactagaaaatcattcataagaataggtgcaatataccaattaggg 37215166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 338
Target Start/End: Original strand, 22130073 - 22130198
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22130073 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgattttgtgagattgaatgactacggaccctagcgttcgacttagacctaattgaattgttct 22130172  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatgg 338  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  22130173 aataaacatggttagtttaggaatgg 22130198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 266 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18765903 - 18765681
Alignment:
Q  266 atgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggtt 365  Q
    ||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||    
T  18765903 atgactactaatcctagcttacgacttagacctatttgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaataaataatcatttatttgtgatattaggtt 18765804  T
Q  366 aatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattt 465  Q
    || | |||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||| |   ||||   | | |||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18765803 aacgctcttaaaaccttcgaagaatgttagaccacttaaggaattaggagttgtaagctaacaagagggatctaactcaagggattgattataactattt 18765704  T
Q  466 t-gttaactatcgtggaactaga 487  Q
    | |||||| |||||  |||||||    
T  18765703 tagttaaccatcgtaaaactaga 18765681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21333183 - 21333066
Alignment:
Q  93 gagcaagcccacaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgag 192  Q
    |||||||||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21333183 gagcaagccggcagcgacggaactctatcggtttattttctttactatgttgtttattccttttattatgtctagctaattttcagagattaagtctgag 21333084  T
Q  193 atgattctgtgtaaccct 210  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21333083 atgattctgtgtaaccct 21333066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21336199 - 21336082
Alignment:
Q  93 gagcaagcccacaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgag 192  Q
    |||||||||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21336199 gagcaagccggcagcgacggaactctatcggtttattttctttactatgttgtttattccttttattatgtctagctaattttcagagattaagtctgag 21336100  T
Q  193 atgattctgtgtaaccct 210  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21336099 atgattctgtgtaaccct 21336082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 444 - 533
Target Start/End: Original strand, 30066348 - 30066437
Alignment:
Q  444 aagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30066348 aagggattgattagcactattttgttaactatcgcggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 30066437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 426 - 533
Target Start/End: Original strand, 23044163 - 23044270
Alignment:
Q  426 agaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattagg 525  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23044163 agaagagggtcctaactcaaggcattgattaagattattttgttaactatcgtgaaactactgaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagg 23044262  T
Q  526 ggaacata 533  Q
    ||||||||    
T  23044263 ggaacata 23044270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 295 - 487
Target Start/End: Original strand, 31575306 - 31575499
Alignment:
Q  295 acctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattatta 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||||||  | ||||||||| |||||    
T  31575306 acctaattgaattgttcaaataaacagggttattctgagaatggatattcgtttatttgtgatattaggttaactttcttttta-cttcaaagaatatta 31575404  T
Q  395 gaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactc-aagggattgattaggactatttt-gttaactatcgtggaactaga 487  Q
    ||  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  |||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  31575405 gattacctagggaattagagactgtaatttgagaagagagtcccaagtcaaagggattgattagagctattttagttaaccatcgtgaaactaga 31575499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22937428 - 22937326
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtg 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||    
T  22937428 caacgacggaactctatcggtttattttctttactatgttgtttattattttaatcatgtctagctaatttctcttgattaggtctgagatgattttgtg 22937329  T
Q  204 taa 206  Q
    |||    
T  22937328 taa 22937326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 290 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 563496 - 563375
Alignment:
Q  290 cttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagat 389  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||| ||||||| | |  |||||||  ||||     
T  563496 cttagacctaattgaattgttcaactaaacaaggttagtctaggaatgaataatcgtttaattgtgatattatgttaatgctttgaaaacctttgaagaa 563397  T
Q  390 tattagaccacctaaggaatta 411  Q
    ||||||| ||||||| ||||||    
T  563396 tattagatcacctaaagaatta 563375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28441625 - 28441522
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtg 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||     
T  28441625 caacgacggaactctatcggtttattttctttactacgttgtttatttctttattcatgtctagctaatttccttggattaggtctgagatgactctgta 28441526  T
Q  204 taac 207  Q
    ||||    
T  28441525 taac 28441522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 175
Target Start/End: Original strand, 26547705 - 26547776
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttc 175  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  26547705 caacgacggaactctatcggtttattgtttttattatgttgtttattcgtttgatcatgtctagctaatttc 26547776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 175
Target Start/End: Original strand, 26551264 - 26551335
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttc 175  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  26551264 caacgacggaactctatcggtttattgtttttattatgttgtttattcgtttgatcatgtctagctaatttc 26551335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 173
Target Start/End: Original strand, 3194814 - 3194883
Alignment:
Q  105 aacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatt-tcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  3194814 aacgacggaattctatcggtttattttctttactatgttgtttattctttttaatcatgtatagctaatt 3194883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14376286 - 14376194
Alignment:
Q  118 tatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagatta-agtctgagatgattctgtgtaaccct 210  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||   |||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  14376286 tatcggtttattttctttactatgttgtttattccttttatcatgcctagctaa-ttctcttgattagggtctgagatgattctttgtaaccct 14376194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 34653256 - 34653187
Alignment:
Q  105 aacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatt-tcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  34653256 aacgacggaattctatcggtttattttctttactatgttgtttattctttttaatcatgtctagctaatt 34653187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 208
Target Start/End: Original strand, 43491408 - 43491492
Alignment:
Q  124 tttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtgtaacc 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||||| |||||||||||    |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  43491408 tttattttctttactatgttgtttatgtatttaaccatgtctagctaatttccttggattagatctgaaatgattctgtgtaacc 43491492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 146
Target Start/End: Original strand, 2452953 - 2452995
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtt 146  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2452953 caacgacggaactctatggatttattttctttactatgttgtt 2452995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 14421550 - 14421871
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14421550 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaagatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttct 14421649  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  14421650 aataaacatggttagtctatgaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattatcagaccacctaaggaattag 14421749  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattta-taagaatatgtgca 511  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||    
T  14421750 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactaaaaaatcattcagtaagaataggtgca 14421849  T
Q  512 gtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  14421850 gtatatcaattaggggaacata 14421871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 18824708 - 18824389
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18824708 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 18824609  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  18824608 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattag 18824509  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||    
T  18824508 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaagatcattaatacgaataggtgcag 18824409  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18824408 tataccaattaggggaacat 18824389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 10663705 - 10664024
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  10663705 tcttaatgatttttatatcatgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttct 10663804  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10663805 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggttaatgttc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaa 10663903  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||    
T  10663904 gggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcatagaactagagaatcattcataagaataggtgtag 10664003  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  10664004 tataccaattagggaaacata 10664024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 18826201 - 18825882
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18826201 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 18826102  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  18826101 aataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattag 18826002  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||    
T  18826001 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaagatcattaatacgaataggtgcag 18825902  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18825901 tataccaattaggggaacat 18825882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 36710950 - 36710631
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36710950 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataagcatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttggacctaattgaattgttct 36710851  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  36710850 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattag 36710751  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  36710750 gggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcag 36710651  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36710650 tataccaattaggggaacat 36710631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 16953582 - 16953902
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  16953582 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaatgaatgactacttaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 16953681  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||     
T  16953682 tataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttaatgatattaggttaatgtgctttaaaccttcgagaattattagaccgcctaaggaattag 16953781  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16953782 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 16953881  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16953882 tataccaattaggggaacata 16953902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 18721595 - 18721275
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||    
T  18721595 tcttaatgctttttatatactgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattattct 18721496  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  18721495 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccaactaagaaattag 18721396  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18721395 gggctgtagtatgagaagagagtcataactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 18721296  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18721295 tataccaattaggggaacata 18721275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 25591792 - 25591473
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||   |||||||  ||||||||||||||    
T  25591792 tcttaatgttttttatattatgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttta-cttagacaaaattgaattgttct 25591694  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  25591693 aataatcatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccatctaaggaattag 25591594  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  25591593 gggctgtagtttgagaagagagtcttaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataaaaataggtgcag 25591494  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25591493 tataccaattaggggaacata 25591473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 43682184 - 43681867
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43682184 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccctagctttcgacttagacctaattgaaatgttct 43682085  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||     
T  43682084 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacatgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctacggaattag 43681985  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  43681984 ggactgtaatatgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactattgtggaactagaaaatcattcataagaataagtgtag 43681885  T
Q  513 tataccaattaggggaac 530  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43681884 tataccaattaggggaac 43681867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 12582814 - 12583133
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  12582814 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 12582913  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12582914 aataaacagggttagtctaggaatagataattgtttgttagtgatattaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattacaccacctaaggaattag 12583012  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12583013 gggttgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggactattttgtcaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 12583112  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12583113 tataccaattaggggaacata 12583133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 213 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 25594971 - 25594655
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||    
T  25594971 tcttaatgctttttatattctgatcaagtataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgatttgttct 25594872  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25594871 aataatcatggttagtctaggaatggataatcctttattactgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccatctaaggaattat 25594772  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25594771 gggctgtagtttgagaagagagtcttaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 25594672  T
Q  513 tataccaattaggggaa 529  Q
    ||||| |||||||||||    
T  25594671 tatactaattaggggaa 25594655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 5980626 - 5980307
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5980626 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgacttgttct 5980527  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  5980526 aataaacaagtttagtctagatatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattac 5980428  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||    
T  5980427 ggactgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactattgtggaactagaaaatcatccataagaataggtgtag 5980328  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  5980327 tataccaattaagggaacata 5980307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 22174237 - 22173918
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22174237 tcttaatgctttttatatgctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattaaattgttct 22174138  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22174137 aataaacatggttaatctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 22174038  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||| |||  |||| ||| ||    
T  22174037 gggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactaacgttgaattagagaataattaatacaaataggtgtag 22173938  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22173937 tataccaattaggggaacat 22173918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 17930787 - 17931105
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17930787 tcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 17930886  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| || | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17930887 agtaaacatggttagtataggaatggataatcgtttgttagtgatataagatcaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 17930985  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||     
T  17930986 gggctgtagtttgagaagagggtcgtaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcaa 17931085  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  17931086 tataccaattacggaaacat 17931105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 21280082 - 21279764
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21280082 tcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactctcgacttagacctaattgaattgttct 21279983  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21279982 aataaacatggttggtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 21279884  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  21279883 gggctgtagtttaagaagagagtcttaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcatgtaactagagaatcattcataagaataggtgcag 21279784  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21279783 tataccaattaggggaacat 21279764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 13196663 - 13196982
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13196663 tcttaatactttttatatcctgatcaaataaaaacatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccataactttcgacttaaacctaattgaattgttct 13196762  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  13196763 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgc-tcaaaccttcaaagattattagactacctaagaaattag 13196861  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13196862 gggttgtagttcgagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcttggaactagaaaatcattcataagaataagtgcag 13196961  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  13196962 tataccaattaagagaacata 13196982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 10498527 - 10498208
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10498527 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatataatttagtgagaacgaacgactactgatcatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 10498428  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  10498427 aataaacatggttagtcttggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtac-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 10498329  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||| | ||||||| ||||||    
T  10498328 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataggtgcag 10498229  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10498228 tataccaattaggggaacata 10498208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 23643625 - 23643944
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23643625 tcttaatgctgtttatatcctgataaaaaataaacatgacttagtgagaacgaatgactactgaccctagcttttgacttagacctaattgaattgttct 23643724  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23643725 aataaacatgtttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaacctttaaagattattagaccacctaaggaattag 23643824  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
     | ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||||||    
T  23643825 aggctgtaatctgagaagagggtcataactcaagagattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcatacaaagaagtgcag 23643924  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23643925 tataccaattaggggaacat 23643944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 240 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 45155556 - 45155263
Alignment:
Q  240 atataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 339  Q
    ||||||||||||||| |||  || | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45155556 atataaacatgatttcgtggaaatgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctattaaacatggttagtctaggaatgga 45155457  T
Q  340 taatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtccta 439  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| ||    
T  45155456 taatcgtttattagtgatattaggttaacgtacttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttttagtttgagaagagggtctta 45155357  T
Q  440 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  45155356 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgcgaaactagagaatcattcataagaataggtgcaatataccaattaggggaacata 45155263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 215 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 12516765 - 12516450
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  12516765 ttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacataatttagtgagaacgaatggctactgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaa 12516666  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||    
T  12516665 taaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattatgttaaagtgcataaaaccttcaaagaatattagatcaactaaggaattaggg 12516566  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatt-tataagaatatgtgcagt 513  Q
    | |||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||    
T  12516565 attgtaatctaagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaaccattccaaaagaataggtgcagt 12516466  T
Q  514 ataccaattaggggaa 529  Q
    ||||||||||||||||    
T  12516465 ataccaattaggggaa 12516450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 226 - 533
Target Start/End: Original strand, 31284493 - 31284799
Alignment:
Q  226 tatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggtt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31284493 tatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagccttcgacttagacctaattgaattgttgtaataaacatggtt 31284592  T
Q  326 agtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  ||||         
T  31284593 agtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggggatgtaaccct 31284691  T
Q  426 agaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattagg 525  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31284692 agaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcatagaactagggactcattcacaagaataggtgcggtataccaattagg 31284791  T
Q  526 ggaacata 533  Q
    ||||||||    
T  31284792 ggaacata 31284799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 240 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 38248685 - 38248393
Alignment:
Q  240 atataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||    
T  38248685 atataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagcttacgacttagacctaattgaattgttctaataaacatagatagtctaggtttgga 38248586  T
Q  340 taatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtccta 439  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||    
T  38248585 taatcgtttattagtgatattaggttaacgtacta-aaactttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaatgtccta 38248487  T
Q  440 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38248486 actcaagagattgattaggactattttgttagctatcgtggaactagagaatcattcataagaatatgtgcaatataccaattaggggaacata 38248393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 215 - 530
Target Start/End: Original strand, 8911455 - 8911771
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8911455 ttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaa 8911554  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta-tg 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  8911555 taaacatggttagtctaggaatgcataatcctttattagtgatattatgttaacgtgcttaaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 8911654  T
Q  414 gactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagt 513  Q
    |  |||||    |||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| | ||||||| |||||||    
T  8911655 ggttgtagccctagaagagggtctaaactcgagggatttattaggactattttgttaactatcatagaactagtgaatcattcacaagaataggtgcagt 8911754  T
Q  514 ataccaattaggggaac 530  Q
    |||||||||||||||||    
T  8911755 ataccaattaggggaac 8911771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 5539087 - 5538768
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  5539087 tcttaatgctttttatatactgatcaaatataaaaatgattaagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttct 5538988  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| | || |||||||| |||||||     
T  5538987 aataaacatgattagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaatgtgcataaaaccttcaaagatcactaaaccacctacggaattag 5538888  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  5538887 gggttgtagtttgagaagagggttctaactcaaaggattgattaggactattttgttaactatcgtgcaactagagaatcattcataagaataggtgcag 5538788  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  5538787 tataccaatttggggaacat 5538768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 248 - 533
Target Start/End: Original strand, 25230921 - 25231206
Alignment:
Q  248 atgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctt 347  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  25230921 atgatttcgtgagaatgaatgactactgaccgtaactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagcttaggaatggataatcgtt 25231020  T
Q  348 tattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagg 447  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  | || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25231021 tattagtgatattaggttaacatacttaaaaccttcaaatattattagaacacccaaggaattagaggctttagtttgagaagagggtcctaactcaagg 25231120  T
Q  448 gattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25231121 gattgattaagactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 25231206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 222 - 524
Target Start/End: Original strand, 2560367 - 2560669
Alignment:
Q  222 tttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacat 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  2560367 tttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgataacgaatgactactgaccatggttttcgacttagacctaactgaattgttctaatacagat 2560466  T
Q  322 ggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtag 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  2560467 ggttagtctaggaatggataatcctttattaatgatattagtttaacgtgcttaaagccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg-gtgtaa 2560565  T
Q  422 tttgagaagatggtcct-aactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaa 520  Q
    | ||||||||  ||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2560566 tctgagaagagagtcttaaactcaagtgattgattatggctattttgttaactatcgtggaactagataatcattcataagaataggtgcagtataccaa 2560665  T
Q  521 ttag 524  Q
    ||||    
T  2560666 ttag 2560669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 224 - 534
Target Start/End: Original strand, 33419473 - 33419782
Alignment:
Q  224 tttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatgg 323  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33419473 tttatatcatgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccctagctttcgacttagaccgaattgaattgttctaataaacatgg 33419572  T
Q  324 ttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtt 423  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||||       
T  33419573 ttagtctaggaatgtataatcctttattagtgatattagataaacatgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacataaggaattaggggttgtaacc 33419671  T
Q  424 tgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaatta 523  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33419672 ctagaagagggtcctaactcaagggattgattatgaatattttgttaactatcgtggaactagtgaatcattcataagaataggtgcagtatacaaatta 33419771  T
Q  524 ggggaacataa 534  Q
    |||||||||||    
T  33419772 ggggaacataa 33419782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 23619677 - 23619358
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23619677 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacataattgaattgttct 23619578  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23619577 aataaacatggttagtctaggaatggataatcatttattagtgaaattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 23619479  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||  |     |||||| ||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  | || || | ||||||| ||||||    
T  23619478 gggcttcaaccctagaagagggttctaactcaatgaattgattagaactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcag 23619379  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23619378 tataccaattaggggaacata 23619358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 215 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 44027404 - 44027087
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||| | ||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||    
T  44027404 ttaatgttttttatatcatgatcaaatataaatatgatttactgagaacgaatgattactgatcatagtttttgacttagacttaattgaatttttctaa 44027305  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    |||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44027304 taaacatgattaggttaggaatgaataatcatttattagtgacattaggttaacg-tgtttaaaccttcaacgattattagaccacctaaggaattaggg 44027206  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagta 514  Q
      ||||     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||    
T  44027205 gttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtagaactagttaatcattcacaagaatatgtgcatta 44027106  T
Q  515 taccaattaggggaacata 533  Q
    || ||||||||||||||||    
T  44027105 tatcaattaggggaacata 44027087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 225 - 485
Target Start/End: Original strand, 4868075 - 4868330
Alignment:
Q  225 ttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggt 324  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||| | |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||     |    
T  4868075 ttatatcctgatcaaatataaagatgaattcgtgagaatgaatgactattgaccataactttcaacttaggcctaattgaattgttcaaataaa-----t 4868169  T
Q  325 tagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagttt 424  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |      
T  4868170 tagtctaggaatggataattttttatttgtgatattaggtgaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattatgaactgtaatcc 4868269  T
Q  425 gagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaacta 485  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||    
T  4868270 gagaagagggtcctaagtcaagggattgattagggctatttagttaaccatcgtgaaacta 4868330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 213 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 5614041 - 5613715
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||| | |||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  5614041 tcttaatgctttttatacccttatcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactgctgaccacaactttcaacttagacttaattgaattgttca 5613942  T
Q  313 aa-------taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagat-tattagaccacctaa 404  Q
    ||       |||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||    
T  5613941 aaattcaaataaacatggttattctaggtatgcataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaaaaaatattataccacctaa 5613842  T
Q  405 ggaattatggactgtag--tttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataaga 502  Q
    ||||||| || || ||   | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  5613841 ggaattaggggctatataatctgagaagagggtcctaagtcaagggatttattaggactattatgttaactatcgtgaaactagagaatcattcataaga 5613742  T
Q  503 atatgtgcagtataccaattaggggaa 529  Q
    |||||||  || | |||||||||||||    
T  5613741 atatgtgatgtgtgccaattaggggaa 5613715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 376 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 33883501 - 33883344
Alignment:
Q  376 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactat 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33883501 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattatgactattttgttaactat 33883402  T
Q  476 cgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33883401 cgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacata 33883344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Original strand, 30784735 - 30785042
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  30784735 tcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatgaattcgtgagaatgaatgactattgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttca 30784834  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||           | ||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||   ||| | ||||||||||||||     
T  30784835 aataaacatgaataatctaggaatgga-----------ttgtgatattaggttaacgttcgtaaaaccttcagagaactttaaatcacctaaggaattag 30784923  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgca 511  Q
     ||||||| |  ||||||| |||||||  || | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| |||| || ||    
T  30784924 agactgtaatccgagaagagggtcctacgtccatggattgattagggttattttgttaactatcgtgaaactagagaatcattcgtaagaaataggtaca 30785023  T
Q  512 gtataccaattaggggaac 530  Q
     ||||||||||||||||||    
T  30785024 atataccaattaggggaac 30785042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 45155817 - 45155654
Alignment:
Q  48 atatgggaaaagaacatcaatcgtagtgattgagaagtaaatgaagagcaagcccacaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgttt 147  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  45155817 atatgggaaaagaacatgaacagtagcgattgagaagtaattgaggagcaagccggcaacgacggaactctatatgtttattttctttactatgttgttt 45155718  T
Q  148 atttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctg-tgtaaccct 210  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  45155717 atttctttaatcatgtctagctaatttttagagattaggtctgagatgattctgatgtaaccct 45155654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 673 - 789
Target Start/End: Original strand, 45469511 - 45469632
Alignment:
Q  673 tttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttag-ttttttggtgttgtaacttgctgctgctgttagaactt----tgtatttctttactttgctaatgt 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||||||  ||    
T  45469511 tttgtgtgtgcttcccttgttattttgctttagtttttttggcgatgtaacttgctgctgctgttagaagtttgtatgtatttccttactttgctagagt 45469610  T
Q  768 tggtagttcttataccttccta 789  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45469611 tggtagttcttataccttccta 45469632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 462 - 533
Target Start/End: Original strand, 20887589 - 20887660
Alignment:
Q  462 attttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20887589 attttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 20887660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 450 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 14589698 - 14589616
Alignment:
Q  450 ttgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14589698 ttgattagggctattttgttaacgatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacat 14589616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25595149 - 25595042
Alignment:
Q  103 acaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgt 202  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||    
T  25595149 acaacgacgaaactctatcggtttattttttttactatgttgtttatgtatttaatcatgtctagctaatttccattgattaggtctgagattattctgt 25595050  T
Q  203 gtaaccct 210  Q
    ||||||||    
T  25595049 gtaaccct 25595042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 175
Target Start/End: Original strand, 5963868 - 5963939
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttc 175  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  5963868 caacgacggaactctatcggtttattttctttattatgttgtttattcgtttgatcatgtctagctaatttc 5963939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18721773 - 18721666
Alignment:
Q  103 acaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgt 202  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||||| |||||||||||    ||||| ||||||||||||||| |    
T  18721773 acaacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatgtatttaaccatgtctagctaatttcctttgattaggtctgagatgattctat 18721674  T
Q  203 gtaaccct 210  Q
    ||||||||    
T  18721673 gtaaccct 18721666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25591965 - 25591863
Alignment:
Q  103 acaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgt 202  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||      ||||||||||||| |||||||    
T  25591965 acaacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatgtatttaatcatgtctagctaatttc-----cttaagtctgagattattctgt 25591871  T
Q  203 gtaaccct 210  Q
    ||||||||    
T  25591870 gtaaccct 25591863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Original strand, 452767 - 452834
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaa 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  452767 caacgacagaactctatcgatttattttctttattatgttgtttattaatttgatcatgtctagctaa 452834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 23613168 - 23613278
Alignment:
Q  103 acaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgt 202  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||| | ||||| |||||||||||    ||||| ||||||||||||| | |    
T  23613168 acaacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttatttatgtatttaaccatgtctagctaatttcctttgattaggtctgagatgattttat 23613267  T
Q  203 gtaaccctgat 213  Q
    |||||||||||    
T  23613268 gtaaccctgat 23613278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Original strand, 10663546 - 10663634
Alignment:
Q  123 atttattttctttatt-atgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtgtaaccct 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  10663546 atttattttctttatttatgttgtttattcctttgatcatgtctagctaaattcctttgattaggtctgagatgaatctgtgtaaccct 10663634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Original strand, 14421372 - 14421479
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgttt-atttcttttatcatgtatagctaattt-ctagagattaagtctgagatgattctg 201  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||| || | ||| | ||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||    
T  14421372 caacgacggaattctatcggtttattttctttactatgtttttttatgtatttaaccatgtttagctaatttacttg-gattaggtctgagatgattctg 14421470  T
Q  202 tgtaaccct 210  Q
    |||||||||    
T  14421471 tgtaaccct 14421479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18696431 - 18696359
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttct 176  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||    
T  18696431 caacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatttatttgatcatgtctagttaaattct 18696359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Original strand, 23613346 - 23613386
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23613346 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatt 23613386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 5584462 - 5584390
Alignment:
Q  470 aactatcgtggaactagaaaatcatttataa---------gaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5584462 aactatcgtggaactagaaaatcattcataagaattttatgaataggtgcagtataccaattaggggaacata 5584390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Original strand, 31984603 - 31984661
Alignment:
Q  97 aagcccacaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttt 155  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31984603 aagccgacaacgacgaagctctatcggtttattttctttactatgttgtttattccttt 31984661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 62326 - 62645
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  62326 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 62425  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  62426 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 62524  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  62525 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 62624  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  62625 tataccaattaggggaacata 62645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 230 - 533
Target Start/End: Original strand, 63686 - 63987
Alignment:
Q  230 tcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  63686 tcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcga-ttagacctaattgtattgttttaataaacatggttagtc 63784  T
Q  330 taggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaa 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || || ||     | ||    
T  63785 taggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcgaaggttattataccacctaaggaattaggggctataaccctataa 63883  T
Q  430 gatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaa 529  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  63884 gagggtcctaactcaagggattgattcagactattttgttaactattgtggaactagaaaagcattcacaagaataggtgcagtataccgattaggggaa 63983  T
Q  530 cata 533  Q
    ||||    
T  63984 cata 63987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Original strand, 62148 - 62250
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtg 203  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||    
T  62148 caacgacggaactctatcgggttattttctttaccatgttgtttattattttaatcatgtctagctaatttcctttgattaggtctgagatgattctttg 62247  T
Q  204 taa 206  Q
    |||    
T  62248 taa 62250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 2794038 - 2794357
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2794038 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttct 2794137  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2794138 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactagcttaacgttc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 2794236  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  2794237 gggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcag 2794336  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  2794337 tataccaattagggaaacata 2794357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 45941226 - 45941546
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  45941226 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 45941325  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45941326 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 45941425  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45941426 gggctgtagtttgagaaaagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 45941525  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45941526 tataccaattaggggaacata 45941546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 6071267 - 6070948
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6071267 tcttaatgccttttatatactgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 6071168  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  6071167 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattag 6071068  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||     
T  6071067 gggatgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaaatagaaaatcattaatacgaataggtgcaa 6070968  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6070967 tataccaattaggggaacat 6070948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 28110867 - 28111186
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  28110867 tcttaatgtttt-tatatcctgatcaaatataaacatgatttaatgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 28110965  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28110966 aataaatagggttagtataggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaatgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 28111065  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28111066 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactgttttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 28111165  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28111166 tataccaattaggggaacata 28111186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 37184177 - 37183858
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37184177 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgatcctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 37184078  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  37184077 aataaacatagttagtctaggaatggataaccgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattag 37183978  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  37183977 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcag 37183878  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37183877 tataccaattaggggaacat 37183858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 20398663 - 20398983
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  20398663 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatcactactgaccatagctttctactttgacagaattgaattgttct 20398762  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20398763 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 20398862  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20398863 gggttgtagtctgagaagagggttctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 20398962  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20398963 tataccaattaggggaacata 20398983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 31204648 - 31204967
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31204648 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 31204747  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  31204748 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgttttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattag 31204847  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  31204848 gggatgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggatattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattaatacgaataggtgcag 31204947  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31204948 tataccaattaggggaacat 31204967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 45961058 - 45960739
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45961058 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 45960959  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  45960958 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattag 45960859  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| |||||     
T  45960858 gggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagagctattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattaatacaaataggtgcat 45960759  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45960758 tataccaattaggggaacat 45960739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 49498811 - 49498494
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtctta-gacctaattgaattgttc 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||    
T  49498811 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgataatgaatgactactgaccatagctttctacttaagacagaattgaattgttc 49498712  T
Q  312 taataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49498711 taataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 49498613  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgca 511  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  49498612 ggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactataaaatcattcataagaataggtgca 49498513  T
Q  512 gtataccaattaggggaac 530  Q
    |||||||||||||||||||    
T  49498512 gtataccaattaggggaac 49498494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 21107604 - 21107285
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  21107604 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccattgctttctacttagacaaaattgaattgttct 21107505  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  21107504 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccatctaaggaattag 21107406  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21107405 gggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 21107306  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  21107305 tataccaattaggtgaacata 21107285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 23022237 - 23021920
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  23022237 tcttaatactttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 23022138  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  23022137 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattatttgatcacctaaggaattag 23022038  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  23022037 gggctgtggtctaagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaatatcattcataagaataggtgcag 23021938  T
Q  513 tataccaattaggggaac 530  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23021937 tataccaattaggggaac 23021920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 1950768 - 1950449
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  1950768 tcttaatgctttttatatcctgatcatatataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgtattgttct 1950669  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  1950668 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattag 1950570  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1950569 gggctgtagtttgagaagagggttctaagtcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 1950470  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1950469 tataccaattaggggaacata 1950449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 29643534 - 29643216
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29643534 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgtgaacgaatgactactgaccctaactttcgacttagacctaattgaattgttct 29643435  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  29643434 aataaacatggttaatctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacatgc-ttaaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattag 29643336  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
     |  |||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29643335 aggttgtaatcctagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 29643236  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  29643235 tatactagttaggggaacat 29643216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 213 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 49853391 - 49853086
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  49853391 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 49853292  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49853291 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttattgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 49853193  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  49853192 gggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagtgattgattaggactattttgttaactgtcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcaa 49853093  T
Q  513 tatacca 519  Q
    |||||||    
T  49853092 tatacca 49853086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 41058615 - 41058296
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  41058615 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 41058516  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  41058515 aataaatagggttagtctaggaatggataattgtttgttagtgataataggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagactacctaaggaattag 41058417  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41058416 gggctgtagtttgagaagagggtcctaaatcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 41058317  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  41058316 cataccaattagaggaacata 41058296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 3797139 - 3796820
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3797139 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 3797040  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  3797039 aataaacatggttagtttaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 3796941  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  | || ||   ||||||| ||||||    
T  3796940 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcgcaagaataggtgcag 3796841  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3796840 tataccaattaggggaacata 3796820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 673386 - 673064
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  673386 tcttaatgctttttatatcctgataaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactattgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttct 673287  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  673286 aataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttattagtgatattatgttaacgtacttaaacccttcaaagattattagaccacctaaaaaattag 673187  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggacta--ttttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgc 510  Q
    ||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  673186 gggttgtagtttgagaagagggtattaactcaagggattgattgagactatttttttttaactatcgtggaactagaaaatcatttacaagaataggtgc 673087  T
Q  511 agtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  673086 agtataccaattagggaaacata 673064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 906002 - 905679
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  906002 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttct 905903  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtg----atattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaa 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  905902 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatatatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaa 905804  T
Q  409 ttatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgt 508  Q
    ||| ||  ||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  905803 ttaggggttgtaaccatagaagagggtcctaactcaagggattgattaaaactattttgttaactatcgtggaactagtgaatcattcataagaataagt 905704  T
Q  509 gcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  905703 gcagtataccaattagggaaacata 905679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 223 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 21018770 - 21018461
Alignment:
Q  223 ttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatg 322  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  21018770 ttttttatcttgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttttaataaacagg 21018671  T
Q  323 gttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagt 422  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  21018670 gttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagt 21018572  T
Q  423 ttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaatt 522  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  21018571 ttgagaagagggtcataagtcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactaaaaaaccattcataagaataggttcagtatacaaatt 21018472  T
Q  523 aggggaacata 533  Q
    |||||||||||    
T  21018471 aggggaacata 21018461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 213 - 525
Target Start/End: Original strand, 2405320 - 2405631
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2405320 tcttaatgattttcatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccataacgttcgacttagacctaattgaattgttct 2405419  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttc-aaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2405420 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcgacaga-tattagaccacctaaggaatta 2405517  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgca 511  Q
     ||  ||||     || ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||| |||||    
T  2405518 agggatgtaaccctaggagagggtcctaactcaattgattgattaggactattttgttaactatcgtagaactagggaatcattcacaagaataggtgca 2405617  T
Q  512 gtataccaattagg 525  Q
    ||||||||||||||    
T  2405618 gtataccaattagg 2405631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 240 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 34732647 - 34732357
Alignment:
Q  240 atataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 339  Q
    |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  34732647 atataaacatgatttcctgagaatgaatgactactgaccataactttcaacttaaacctaattgaattgttcaaataaacatagttagtctaggaatgaa 34732548  T
Q  340 taatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtccta 439  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||  |||| |||||||||| |||||||    
T  34732547 taatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtattagaccacctaacaaattaggggatgtactttgagaagagggtccta 34732448  T
Q  440 actcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgcagtataccaattaggggaac 530  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34732447 agtcaagggattga-tagggctattttgttaaccatcgtgaaactagagaatcattcgtaagaaataattgcagtataccaattaggggaac 34732357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 304 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 27355165 - 27354939
Alignment:
Q  304 aattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccaccta 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27355165 aattgttctaataaacatggttagtgtaggaatagataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtg-tttaaaccttcgaagattaatagaccaccta 27355067  T
Q  404 aggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaa 503  Q
    |||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27355066 aggaattagggt-tgtagtttaagaagagggtcctaactcaagggattggttatgactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaa 27354968  T
Q  504 tatgtgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27354967 taggtgcaatataccaattaggagaacat 27354939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 276 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 27355939 - 27355687
Alignment:
Q  276 accatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttcttt 375  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  27355939 accatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttctta 27355840  T
Q  376 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactatttt-gttaacta 474  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  27355839 aaaccttcaaaaaatattagatcacctaatgaattagggactgtaatatgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggcctattttagttaacca 27355740  T
Q  475 tcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgcagtataccaattaggg 526  Q
    ||||| ||||||| ||  ||| ||| | |||| ||||||| ||||||||||||    
T  27355739 tcgtgaaactagagaaatattcataggaaataggtgcagtgtaccaattaggg 27355687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 374 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 21111311 - 21111152
Alignment:
Q  374 ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaact 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21111311 ttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagttaagggattgattaagactattttgttaact 21111212  T
Q  474 atcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21111211 atcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggagaacata 21111152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 240 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21434763 - 21434523
Alignment:
Q  240 atataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 339  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  21434763 atataaacatgttttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttatacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatgaa 21434664  T
Q  340 taatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtccta 439  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||| ||    
T  21434663 taatcgtttatttgttatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaataatattagatcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagtgtctta 21434564  T
Q  440 actcaagggattgattaggactatttt-gttaactatcgtg 479  Q
    | |||| |||||||||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  21434563 agtcaatggattgattatggctattttagttaactgtcgtg 21434523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 213 - 529
Target Start/End: Original strand, 7635455 - 7635773
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||| | ||||||| | | |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||     
T  7635455 tcttagtgctttttatatgctgatcacatatatacatgaattcgtgagaatgaatgactattgatcataactttcaacttagacctgattgaattgttca 7635554  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| || |||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7635555 aataaacagggtcagtctaggaatagataatcgtttatttgtaataagaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattat 7635654  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactatttt-gttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaa-tatgtgc 510  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||  |||||| ||||||| ||  ||| ||| ||| || ||||    
T  7635655 ggactgtaatctgagaagagggtcctaagtcaaggtattgattagggttattttagttaatcatcgtgaaactagagaaatattcataggaagtaggtgc 7635754  T
Q  511 agtataccaattaggggaa 529  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  7635755 agtgtaccaattatgggaa 7635773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 215 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 27332082 - 27331817
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||| | ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  27332082 ttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcatgagaatgaatgactactgaccataactttcaacttagacctaattgaattgttcaaa 27331983  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaa-tggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatg 413  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||        
T  27331982 taaacatggttagtctaggaattgaataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttgttaaaaccttcaaaaaatattagatcacctaatgaat---- 27331887  T
Q  414 gactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactatttt-gttaactatcgtggaactaga 487  Q
         |||  |||||||| | |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  27331886 -----taggctgagaagaggttcctaagtcaagggatttattagggctattttagttaaccatcgtgaaactaga 27331817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 213 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 11668339 - 11668171
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||     
T  11668339 tcttaatgctttttatatcccgatcaaatataaacatgattttgtgagaattaatgactactgaccatagctttcaacttagaccgaattgaatttttca 11668240  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaacct 381  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  11668239 aataaatatggttactctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaacct 11668171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 442 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 21114583 - 21114492
Alignment:
Q  442 tcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21114583 tcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggagaacata 21114492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 376 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 11667152 - 11667001
Alignment:
Q  376 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactat 475  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  11667152 aaaccttcaaataatattagaccacctaaggaattaggggctgtaatctgagaagaggatcctaagtcaagggattgattagggctattttgttaaccat 11667053  T
Q  476 cgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgcagtataccaattaggg 526  Q
     ||| || |||| | |||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11667052 tgtgaaattagagattcattcgtaagaaataggtgcagtataccaattaggg 11667001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 13431140 - 13430954
Alignment:
Q  346 tttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaa 445  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||  ||||||| ||||    
T  13431140 tttatttgtgatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagagactgtaatatgagaagagagtcctaagtcaa 13431041  T
Q  446 gggattgattaggactattt-tgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaa-tatgtgcagtataccaattaggggaac 530  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||  ||||||| ||  ||| || |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  13431040 gggattgattagggctatttaagttaaccatcgtaaaactagagaaatattcatgagaactaagtgcagtgtaccaattaggggaac 13430954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 348 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16055747 - 16055629
Alignment:
Q  348 tattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagg 447  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||  |||| | |||||||| |||||||| ||||||    
T  16055747 tatttgtgatattaggttaacattcttcaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggatttaggggttgtaatctgagaagagggtcctaagtcaagg 16055648  T
Q  448 gattgattaggactatttt 466  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  16055647 gattgattagggctatttt 16055629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 351 - 489
Target Start/End: Original strand, 42022587 - 42022720
Alignment:
Q  351 tagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggat 450  Q
    ||||||||||||| ||| ||  || ||||||||||| ||||||||| ||||||     ||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42022587 tagtgatattaggataacgtaattaaaaccttcaaaaattattagatcaccta-----ttaggggttatagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 42022681  T
Q  451 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaa 489  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42022682 tgattaaaactattttgttaactatagtggaactagaaa 42022720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 348 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16061148 - 16060968
Alignment:
Q  348 tattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagg 447  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||| ||| |||| | ||||||||   |||||| |||| |    
T  16061148 tatttgtgatattaggttaatgttcttcaaacctataaagtatattagatcacctaaggaattagggattgtaatatgagaagagaatcctaagtcaatg 16061049  T
Q  448 gattgattaggactatttt-gttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgcagtataccaattaggg 526  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  |||||  ||||||| ||  ||| || || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  16061048 gattgattagggctattttagttaatcatcgtaaaactagagaaatattcatgagaaataggtgcagtgtaccaattaggg 16060968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16056982 - 16056864
Alignment:
Q  348 tattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagg 447  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||  ||| | |||||||| |||||||| ||||||    
T  16056982 tatttgtgatattaggttaacgttattcaaacctttaaagtatattagatcacctaaggaattagggatcgtaatctgagaagagggtcctaagtcaagg 16056883  T
Q  448 gattgattaggactatttt 466  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  16056882 gattgattagagctatttt 16056864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 371 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 34065318 - 34065202
Alignment:
Q  371 tctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgtta 470  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  ||||||| | ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  34065318 tcttaaaaccttcaaagattattagatcaccaaaggtattagagactgtaatatgagaggagggtcctaagttaagagattgattagggctatttggtta 34065219  T
Q  471 actatcgtggaactaga 487  Q
    || |||||| |||||||    
T  34065218 accatcgtgaaactaga 34065202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34066702 - 34066626
Alignment:
Q  266 atgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataa 342  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34066702 atgactactaaccatagcttacaacttatacctaatttgattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataa 34066626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1950945 - 1950850
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattc 199  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||    ||||| ||||||||||||||    
T  1950945 caacgacggaactctattggtttattttctttactatgttgtttaattctttgattatgtctagctaatttcctttgattaggtctgagatgattc 1950850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 473 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 27536585 - 27536526
Alignment:
Q  473 tatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27536585 tatcctggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacat 27536526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 175
Target Start/End: Original strand, 37641479 - 37641550
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttc 175  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  37641479 caacgacagaactctatcggtttattttctttattatgttgtttattcgtttgatcatgtctagctaatttc 37641550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Original strand, 49715985 - 49716052
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaa 171  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  49715985 caacgacggaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatttatttgatcatgtctagctaa 49716052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Original strand, 49719468 - 49719535
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaa 171  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  49719468 caacgacggaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatttatttgatcatgtctagctaa 49719535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Original strand, 42022485 - 42022531
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtga 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42022485 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtga 42022531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Original strand, 2793880 - 2793967
Alignment:
Q  123 atttattttcttta-ttatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtgtaaccct 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2793880 atttattttctttacttatgttgtttatt-ctttgatcatgtctagctaaattcctttgattaggtctgagatgaatctgtgtaaccct 2793967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 30938654 - 30938601
Alignment:
Q  435 tcctaactcaagggattgattaggactatttt-gttaactatcgtggaactaga 487  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  30938654 tcctaagtcaagggattgattatgactattttagttaaccatcgtgaaactaga 30938601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37891203 - 37891150
Alignment:
Q  263 cggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaata 316  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37891203 cggatgactactgaccctagcttacgacttagacttaattgaattgttcaaata 37891150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 5712 - 5392
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  5712 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 5613  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  5612 aataatcatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggctaacgttcttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaatcag 5513  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5512 gggctgtagtttgagaagagggtcttaactcaaaggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcag 5413  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5412 tataccaattaggggaacata 5392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5890 - 5786
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtg 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||    
T  5890 caacgacggaactctatcgatttattttctttactatgttgtttattattttaatcatgtctagctaatttcctttgattaggtctgagatgattctttg 5791  T
Q  204 taacc 208  Q
    |||||    
T  5790 taacc 5786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 19204 - 19524
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  19204 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 19303  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  19304 aataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagtttattagaccacctaaggaattag 19403  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  19404 gggctgtagtttgagaagagagttctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcag 19503  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  19504 tataccaattagaggaacata 19524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 213 - 530
Target Start/End: Original strand, 89578 - 89895
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  89578 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaacttttgacttagacctaattgaattgtttt 89677  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  89678 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaagttaacgtgcttcaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattag 89777  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  89778 gggctgtagtttgagaagagagtcctaactcaagggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaatatgtgcag 89877  T
Q  513 tataccaattaggggaac 530  Q
    ||||||||||||||||||    
T  89878 tataccaattaggggaac 89895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 197956 - 198275
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  197956 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 198055  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  198056 aataaacaggaatagtctaggaatggataatcatttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 198154  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
     | || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  198155 aggctatagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaattattcataagaataggtgcag 198254  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  198255 tataccaattaggggaacata 198275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3277
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3596 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 3497  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||     
T  3496 aataaacatggttaacctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggtaaacatgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattag 3397  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    |||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  3396 ggactgtaatatgagaagagggttctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcat 3297  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  3296 tataccaattatgggaacat 3277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3739 - 3666
Alignment:
Q  137 ttatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgtgtaaccct 210  Q
    |||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3739 ttatgttgtttgcttatttgatcatgtctagctaatttcttttgattaggtctgagatgattttgtgtaaccct 3666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 3)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 213 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 8532 - 8212
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  8532 tcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 8433  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8432 aataaacttggttagtctaggaatggataatcgtttgtttgtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 8334  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  8333 gggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggatcgattaggactattttgttaactatcgtggaaatagaaaatcattcataagaataggtgtag 8234  T
Q  513 tataccaattaggggaacataa 534  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  8233 tataccaattagggaaacataa 8212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 299 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1775 - 1549
Alignment:
Q  299 aattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagacc 398  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||    
T  1775 aattgaattattctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaacttttaaagattattagacc 1677  T
Q  399 acctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttat 498  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||    
T  1676 acctaaggaattaggggttgtagtttgagaagacggtcctaagtcaagggattgattatgactattttgttaactattgtgtaactagacaatcattcat 1577  T
Q  499 aagaatatgtgcagtataccaattaggg 526  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1576 aagaataggtgcagtttaccaattaggg 1549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4293 - 4187
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  4293 tcttaaagctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttct 4194  T
Q  313 aataaac 319  Q
    |||||||    
T  4193 aataaac 4187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0757 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0757
Description:

Target: scaffold0757; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 215 - 529
Target Start/End: Original strand, 5163 - 5476
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  5163 ttaatgctttttatatccttatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattaaattgttctaa 5262  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5263 taaatagggttagtctaggaatggatgatcgtttgttagtgatattaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 5361  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagta 514  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  5362 gctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactaaaaaatcattcataagaataggtgcacta 5461  T
Q  515 taccaattaggggaa 529  Q
    || ||||||||||||    
T  5462 tatcaattaggggaa 5476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 205; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 224 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 366 - 58
Alignment:
Q  224 tttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatgg 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  366 tttatatcctgatcaaatataaacatgaattagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagatataattgaattgttctgataaacatgg 267  T
Q  324 ttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtt 423  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  266 ttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttctaaaaaccttgaaagattattagaccgcctaagaaattaggggctgtagtt 167  T
Q  424 tgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaatta 523  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  166 tgagaagagggtcctaactcaagggatttattagggctattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaatta 67  T
Q  524 ggggaacat 532  Q
     ||||||||    
T  66 agggaacat 58  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 58996 - 58675
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgtt-- 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||      
T  58996 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccctaactttcgacttagacctaattgaattttttt 58897  T
Q  311 ctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  58896 ctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagactgcataaggaatt 58798  T
Q  411 atggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgc 510  Q
    | || |||||     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  58797 aggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaagcattcacaagaataggtgc 58698  T
Q  511 agtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  58697 agtatacaaattaggggaacata 58675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 215 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 57901 - 57583
Alignment:
Q  215 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  57901 ttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaa 57802  T
Q  315 taaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg 414  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||    
T  57801 taaaaatggttagtctagaaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagagtattagaccacctaagcaatcaggg 57702  T
Q  415 actgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagta 514  Q
      ||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||| ||    
T  57701 gatgtagtttgagaagagggccctaactcaatggatagattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcgttcataagaataggtgcaata 57602  T
Q  515 taccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  57601 taccaattatgtgaacata 57583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Original strand, 10218 - 10536
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10218 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacaggatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 10317  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||| || |||||| |||||     
T  10318 aataaacatggttagtcaaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaacggttattagtccgcctaagaaattag 10416  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||| ||||||    
T  10417 gggttgtaaccctagaagatggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtagaactagtgaatcattcacaagaataggtgcag 10516  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10517 tataccaattaggggaacat 10536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 213 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 67838 - 67520
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  67838 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttct 67739  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||||  | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  67738 aataaacatggttagtctaggaatatataatcgtttgttagtgatattaagttaacatgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattag 67640  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    |   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||| ||||||    
T  67639 gagttgtagtttaagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggtactagagaatcaatcataacaataggtgcag 67540  T
Q  513 tataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  67539 tataccaattaggggaacat 67520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 276 - 533
Target Start/End: Original strand, 2 - 259
Alignment:
Q  276 accatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttcttt 375  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  2 accatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttctta 101  T
Q  376 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactat 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  102 aaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactat 201  T
Q  476 cgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  202 cgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 213 - 527
Target Start/End: Original strand, 30903 - 31216
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30903 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgatttgttct 31002  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  31003 aataaacatggttagtctaggaatgtataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattag 31101  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || |||||     |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  | || || | ||||||| ||||||    
T  31102 gggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcag 31201  T
Q  513 tataccaattagggg 527  Q
    |||||||||||||||    
T  31202 tataccaattagggg 31216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1755 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold1755
Description:

Target: scaffold1755; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 290 - 533
Target Start/End: Original strand, 7 - 249
Alignment:
Q  290 cttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  7 cttagacctaattgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatggataatcctttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagat 105  T
Q  390 tattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaa 489  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  106 tattagaccacctaagcaattagggactgaagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactatgttgttaactatcgtggaactagaaa 205  T
Q  490 atcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  206 atcattcataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 29174 - 29493
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29174 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaaagactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttct 29273  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||     
T  29274 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcaaaagttattagaccacgtgaggaattag 29372  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||| | ||||||| ||||||    
T  29373 gggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataggtgcag 29472  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  29473 tataaaaattaggggaacata 29493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Original strand, 19104 - 19408
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19104 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttatacctaattgaattgttct 19203  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||| |||               | |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  19204 aataaacatgctta---------------aacctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccatctaaggaattag 19287  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    ||  ||||  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||| | ||||||| ||||||    
T  19288 gggttgtaactctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagggagtcattcacaagaataggtgcag 19387  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||| ||| |||||||    
T  19388 tataccaatgaggtgaacata 19408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 182; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 3325 - 2999
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaacca-------tagctttcgtcttagacctaattgaa 305  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |       ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3325 tcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaa 3226  T
Q  306 ttgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3225 ttgttctaataaacatggttagtctacgaatggataatcctttattagtgatattaggttaacatgc-ttaaaccttcaacgattattagaccacctaag 3127  T
Q  406 gaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaata 505  Q
    |||||| ||  ||||     |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| | |||||||    
T  3126 gaattaggggttgtaacactagaagagggtcctaactcaatggattgattaggactattttggtaactatcgtagaactagtgaatcattcacaagaata 3027  T
Q  506 tgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  3026 ggtgcagtataccaattaggggaacata 2999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 213 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 2386 - 2067
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2386 tcttaatgctttttgcatcctgatcaaatataaatatgatttattgagaacgaattactactggccctagatttcgacttagacctaattgaattgttct 2287  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  2286 aataaacatggttaatctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcgaagattattagaccacctaagaaattac 2188  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
    || ||||| |   ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||     
T  2187 gggctgtaatcctagaagagagtcccaactcaagggattgattagggctattttgttaagtatcgtggaattagaaaatcattcataagaataggtgcaa 2088  T
Q  513 tataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  2087 tataccaattcggagaacata 2067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 165; Significance: 8e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 309 - 533
Target Start/End: Original strand, 89 - 313
Alignment:
Q  309 ttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaa 408  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  89 ttctactaatcatggttagtctaggaatgaataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaa 188  T
Q  409 ttatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgt 508  Q
    ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  189 ttaggggctgtagtttgagaagagagtcttaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtaaaactagaaaatcattcataagaataggt 288  T
Q  509 gcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  289 gcagtataccaattaggggaacata 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 287
Target Start/End: Original strand, 17 - 91
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttc 287  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  17 tcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttc 91  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 165; Significance: 8e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 213 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 118759 - 118443
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  118759 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgaattcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttca 118660  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    | ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  118659 aataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaggttaacgcatgtaaaaccttcaaagaatattagatcatctaaggaattat 118560  T
Q  413 ggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcag 512  Q
     |||||||    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  118559 agactgtaacccgcgaagagggtcctaagtcaagggattgattagtgctattttgttaactatcctgaaactagcgaatcattcataagaataggtgcag 118460  T
Q  513 tataccaattaggggaa 529  Q
    |  |||||||| |||||    
T  118459 tggaccaattaagggaa 118443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 99312 - 99233
Alignment:
Q  450 ttgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaa 529  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  99312 ttgattatggctattttgttaactatcgtgaaactagagaatcattcataagaataggtgcagtgaaccaattagaggaa 99233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 162; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 216 - 487
Target Start/End: Original strand, 19168 - 19431
Alignment:
Q  216 taatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaat 315  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||      
T  19168 taatgcttgttatatcttgatcaaatataa-catgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgactgagacctaattgaattgttcta-- 19264  T
Q  316 aaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatgga 415  Q
         |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  19265 -----tggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattattagatcacctaaggaattagggg 19359  T
Q  416 ctgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactaga 487  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19360 ctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagaactattttgttaactatcgtggaactaga 19431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold1785
Description:

Target: scaffold1785; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 230 - 518
Target Start/End: Original strand, 1076 - 1362
Alignment:
Q  230 tcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1076 tcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcga-ttagacctaattgtattgttttaataaacatggttagtc 1174  T
Q  330 taggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaa 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || || ||     | ||    
T  1175 taggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgc-ttaaaccttcgaaggttattataccacctaaggaattaggggctataaccctataa 1273  T
Q  430 gatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtatacc 518  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  1274 gagggtcctaactcaagggattgattcagactattttgttaactattgtggaactagaaaagcattcacaagaataggtgcagtatacc 1362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 499 - 533
Target Start/End: Original strand, 1 - 35
Alignment:
Q  499 aagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 604 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 188296 - 188105
Alignment:
Q  604 aactttagcttcctatgttattcagtttttt-gtctcagcaatgcagaaacagggagcactcaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188296 aactttagcttcctatgttattcagtttttttgtctcagcagtgcagaaacagggagcacccaaggactgtttgtgtgtgcttcccttgttattttgctt 188197  T
Q  703 tagtttttt-ggtgttgtaacttgctgctgctgttagaactttgtatttctttactttgctaatgttggtagttcttataccttcctatgct 793  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  188196 tagtttttttggtgctgtaacttgctgctgctgttagaactttgtatttctttactttgctagagttggtagttcttataccttcctatgct 188105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 299 - 533
Target Start/End: Original strand, 248413 - 248646
Alignment:
Q  299 aattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagacc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||    
T  248413 aattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgatt-aaaccttcaaagattattagacc 248511  T
Q  399 acctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttat 498  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  248512 acctaaggaattaggggttgtagtttgtgaagagggtcctaagtcaagggattgattatgactattttgttaactgtcgtggaactagaaaatcactcat 248611  T
Q  499 aagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  248612 aagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 248646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1063 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1063
Description:

Target: scaffold1063; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 297 - 532
Target Start/End: Original strand, 2385 - 2628
Alignment:
Q  297 ctaattgaattgttctaataaacatggtta--gtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattatta 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| |||||    
T  2385 ctaactgaattgttctaataaacatggttatagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgcttaaaacgttcaaagaatatta 2484  T
Q  395 gaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcat 494  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485 gctcacctaaggaattagggactgtagtatgagaagagggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcat 2584  T
Q  495 t------tataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    |       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2585 tcataagaataagaataggtgcagtataccaattaggggaacat 2628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 150; Significance: 7e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 300 - 533
Target Start/End: Original strand, 27005 - 27237
Alignment:
Q  300 attgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagacca 399  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27005 attgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatggataatcgtttgttcgtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattacacca 27103  T
Q  400 cctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttata 499  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  27104 cctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaatggattgattaggactattttgttaactatcatggaactagagaatcattcata 27203  T
Q  500 agaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27204 agaatagatgcagtataccaattaggggaacata 27237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 210
Target Start/End: Original strand, 26819 - 26926
Alignment:
Q  103 acaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttctagagattaagtctgagatgattctgt 202  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||    ||||| |||||||||||||||||    
T  26819 acaacgacgaaactctatcggtttatttcttttaatatgttgtttatctctttgatcatgtctaggtaatttcatttgattaggtctgagatgattctgt 26918  T
Q  203 gtaaccct 210  Q
    ||||||||    
T  26919 gtaaccct 26926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 136; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 338 - 533
Target Start/End: Original strand, 241434 - 241628
Alignment:
Q  338 gataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcc 437  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||    
T  241434 gataatcatttgttagtgatactaggttaatgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggcctgcagtttgagaagagggtcc 241532  T
Q  438 taactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  241533 taactcaagggattgattacgactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataaaaataggtgcagtataccaattaggggaacata 241628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 113; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 256 - 420
Target Start/End: Original strand, 14091 - 14254
Alignment:
Q  256 gtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtg 355  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14091 gtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtg 14190  T
Q  356 atattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgta 420  Q
    |||||||||||| || | |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  14191 atattaggttaacgtgc-ttaaaccttcgacggttattagatcacctaaggaattaggggctgta 14254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2073 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold2073
Description:

Target: scaffold2073; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 387 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 1007 - 861
Alignment:
Q  387 gattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactag 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1007 gattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgaaaagagggtcctaacccaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactag 908  T
Q  487 aaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  907 ataatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacata 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1809 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1809
Description:

Target: scaffold1809; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 339 - 533
Target Start/End: Original strand, 1 - 193
Alignment:
Q  339 ataatcctttattagtgatattaggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcct 438  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| | ||||||    
T  1 ataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaactttcaaagattatttgaccacctaagaaattaggggttgtagtttgagaatagggtcct 99  T
Q  439 aactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  100 aagtcaagggactgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaaca-gtgtagtataccaattaggggaacata 193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 266 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 48664 - 48411
Alignment:
Q  266 atgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggtt 365  Q
    ||||||||| ||| |||||| |  ||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  48664 atgactactgaccctagcttacaactttgacctaattgaattgttcaagtaaacaaggttagcctaggaatggataatcgtttatttgtgatattatgtt 48565  T
Q  366 aatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattatggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattt 465  Q
    ||  ||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  48564 aacattcataaaaccttcaaagaatattggatcacctaaggaattagggaccgtaatctgagaagagggtcctacgtcaagggattgattatgactattt 48465  T
Q  466 t-gttaactatcgtggaactagaaaatcatttataag-aatatgtgcagtatac 517  Q
    | ||| || |||||| ||||||| ||  ||||||| | |||| |||||||||||    
T  48464 tagttgaccatcgtgaaactagagaaatatttataggaaataggtgcagtatac 48411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 93; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 213 - 479
Target Start/End: Original strand, 9746 - 10014
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacggatgactactaaccatagctttcgtcttagacctaattgaattgttct 312  Q
    |||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||||| || ||||||| | |||| || | |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||     
T  9746 tcttaatgctttttatatattgatcacataaaaacatgaattcgtgagaatgaatgattattgaccataactttcaacttagacctaattgaattgatcg 9845  T
Q  313 aataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatatt-aggttaatgttctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 411  Q
    ||||||||  |||||||||||||| | ||||  |||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||    
T  9846 aataaacagagttagtctaggaattggtaattgtttatttgtgatattaaggttaactttcttaaaaccttcaaataatattataacacataaggaatta 9945  T
Q  412 tggactgtagtttgagaagatggtcctaactcaagggattgattaggactatttt-gttaactatcgtg 479  Q
     ||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  9946 gggactctaatctgagaagagggtcctaagtcaagggattgattagggctattttggttaaccatcgtg 10014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 438 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 7801 - 7706
Alignment:
Q  438 taactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacata 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7801 taactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcaatataccaattaggggaacata 7706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 426 - 533
Target Start/End: Original strand, 15433 - 15540
Alignment:
Q  426 agaagatggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattagg 525  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15433 agaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagcgactcattcacaagaataggtgcagtatcccaattagg 15532  T
Q  526 ggaacata 533  Q
    ||||||||    
T  15533 ggaacata 15540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 246
Target Start/End: Original strand, 24630 - 24663
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaa 246  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24630 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 24663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 173
Target Start/End: Original strand, 2095 - 2164
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| |||||||||    
T  2095 caacgacggaactctatcggtttattttctttattatgttgtttgtttctttattgatgtctagctaatt 2164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 53387 - 53315
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatttct 176  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||    
T  53387 caacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatttatttgatcatgtctagttaaattct 53315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 68286 - 68227
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgt 163  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  68286 caacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatttatttgatcatgt 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 173
Target Start/End: Original strand, 13222 - 13291
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    |||||||| | || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| |||||||||    
T  13222 caacgacgaagctctatcggtttattttctttactatgttgtttatttttttaattatgtctagctaatt 13291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 173
Target Start/End: Original strand, 19672 - 19741
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    |||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||    
T  19672 caacgacgaagctctatcggtttattttctttactatgttgtttaattctttaattatgtctagctaatt 19741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 173
Target Start/End: Original strand, 27238 - 27307
Alignment:
Q  104 caacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttttatcatgtatagctaatt 173  Q
    |||||||| | || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| |||||||||    
T  27238 caacgacgaagctctatcggtttattttctttactatgttgtttatttttttaattatgtctagctaatt 27307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 249
Target Start/End: Original strand, 1555 - 1591
Alignment:
Q  213 tcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacat 249  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1555 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Original strand, 226961 - 227019
Alignment:
Q  97 aagcccacaacgacggaactttatcgatttattttctttattatgttgtttatttcttt 155  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  226961 aagccgacaacgacgaagctctatcggtttattttctttactatgttgtttattccttt 227019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 487 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 14359 - 14314
Alignment:
Q  487 aaaatcatttataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacat 532  Q
    ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14359 aaaatcattaatacaaataggtgcagtataccaattaggggaacat 14314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University