View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11229_low_2 (Length: 507)

Name: NF11229_low_2
Description: NF11229
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11229_low_2
NF11229_low_2
[»] chr3 (97 HSPs)
chr3 (195-384)||(54244520-54244709)
chr3 (8-181)||(12127562-12127735)
chr3 (8-182)||(1375995-1376170)
chr3 (8-182)||(13349155-13349329)
chr3 (16-182)||(53581579-53581745)
chr3 (8-182)||(50801594-50801768)
chr3 (8-182)||(50874112-50874286)
chr3 (8-180)||(8814800-8814972)
chr3 (8-182)||(31039555-31039729)
chr3 (14-182)||(27317659-27317828)
chr3 (15-182)||(3800216-3800384)
chr3 (8-182)||(53467349-53467523)
chr3 (14-182)||(27360017-27360183)
chr3 (8-171)||(33837807-33837971)
chr3 (8-165)||(17605510-17605667)
chr3 (14-174)||(3269398-3269558)
chr3 (16-182)||(50913006-50913172)
chr3 (8-182)||(32203173-32203343)
chr3 (8-182)||(36823975-36824149)
chr3 (8-142)||(22894545-22894678)
chr3 (14-182)||(48765214-48765385)
chr3 (8-127)||(8815063-8815182)
chr3 (8-181)||(29239592-29239764)
chr3 (43-182)||(26103649-26103787)
chr3 (17-182)||(6748652-6748819)
chr3 (17-182)||(47461719-47461887)
chr3 (17-182)||(7848552-7848719)
chr3 (17-182)||(6114806-6114974)
chr3 (17-182)||(12896662-12896830)
chr3 (17-162)||(51952247-51952395)
chr3 (16-76)||(54244747-54244807)
chr3 (17-182)||(11460175-11460342)
chr3 (17-182)||(7521383-7521551)
chr3 (17-182)||(21727670-21727838)
chr3 (17-182)||(45059534-45059702)
chr3 (17-160)||(994724-994868)
chr3 (17-140)||(8815399-8815523)
chr3 (21-182)||(37504566-37504729)
chr3 (17-141)||(995030-995155)
chr3 (17-182)||(6109166-6109334)
chr3 (17-182)||(26152199-26152367)
chr3 (17-182)||(27728216-27728386)
chr3 (17-136)||(52654387-52654507)
chr3 (17-182)||(38798003-38798172)
chr3 (37-182)||(26158254-26158402)
chr3 (52-141)||(29950609-29950698)
chr3 (52-141)||(29999763-29999852)
chr3 (52-117)||(30033084-30033149)
chr3 (56-160)||(53581601-53581705)
chr3 (17-80)||(4043765-4043828)
chr3 (17-80)||(30347776-30347839)
chr3 (17-127)||(26152512-26152624)
chr3 (53-162)||(2868201-2868312)
chr3 (56-160)||(8814820-8814924)
chr3 (57-160)||(12127584-12127687)
chr3 (56-156)||(27360038-27360137)
chr3 (17-80)||(3269235-3269298)
chr3 (17-80)||(17226204-17226267)
chr3 (56-160)||(32203195-32203299)
chr3 (17-78)||(51148014-51148075)
chr3 (76-160)||(34277547-34277630)
chr3 (14-57)||(30685186-30685229)
chr3 (24-62)||(30033150-30033188)
chr3 (56-160)||(33837855-33837960)
chr3 (56-160)||(13349177-13349281)
chr3 (56-93)||(50801616-50801653)
chr3 (56-93)||(50874227-50874264)
chr3 (56-93)||(53467464-53467501)
chr3 (454-491)||(54244413-54244450)
chr3 (17-160)||(17065774-17065918)
chr3 (56-159)||(31039604-31039707)
chr3 (17-67)||(3800185-3800235)
chr3 (105-182)||(4043653-4043731)
chr3 (17-67)||(13349124-13349174)
chr3 (144-182)||(22894883-22894921)
chr3 (17-67)||(22894902-22894952)
chr3 (17-67)||(31039710-31039760)
chr3 (59-101)||(48765318-48765360)
chr3 (17-51)||(53467504-53467538)
chr3 (56-93)||(17605515-17605552)
chr3 (18-50)||(4043639-4043671)
chr3 (18-50)||(6109316-6109348)
chr3 (18-50)||(6114792-6114824)
chr3 (18-50)||(6748801-6748833)
chr3 (18-50)||(7521369-7521401)
chr3 (18-50)||(7848538-7848570)
chr3 (18-50)||(8815343-8815375)
chr3 (18-50)||(11460161-11460193)
chr3 (18-50)||(12896648-12896680)
chr3 (18-50)||(17226326-17226358)
chr3 (19-67)||(17604921-17604969)
chr3 (18-50)||(21408634-21408666)
chr3 (18-50)||(21727656-21727688)
chr3 (18-50)||(26152349-26152381)
chr3 (18-50)||(26158384-26158416)
chr3 (18-50)||(27728202-27728234)
chr3 (18-50)||(47461705-47461737)
[»] chr8 (96 HSPs)
chr8 (8-182)||(27545753-27545927)
chr8 (8-182)||(26042970-26043144)
chr8 (8-182)||(2823631-2823805)
chr8 (8-182)||(10616284-10616458)
chr8 (8-182)||(34102993-34103167)
chr8 (8-172)||(32069015-32069179)
chr8 (8-182)||(1201662-1201836)
chr8 (16-182)||(3369713-3369878)
chr8 (16-182)||(13269263-13269430)
chr8 (16-182)||(30207168-30207334)
chr8 (14-173)||(36899736-36899897)
chr8 (16-182)||(10776976-10777140)
chr8 (14-182)||(13468330-13468499)
chr8 (16-182)||(30633094-30633260)
chr8 (14-182)||(25123377-25123545)
chr8 (14-182)||(35550621-35550789)
chr8 (16-182)||(9483949-9484116)
chr8 (8-182)||(184099-184274)
chr8 (16-182)||(5946816-5946982)
chr8 (8-182)||(8258351-8258525)
chr8 (23-182)||(13290504-13290663)
chr8 (16-182)||(32486956-32487123)
chr8 (8-156)||(26630022-26630171)
chr8 (14-179)||(45299620-45299784)
chr8 (14-171)||(23544832-23544990)
chr8 (16-182)||(25127870-25128038)
chr8 (16-176)||(9413809-9413969)
chr8 (38-182)||(29125739-29125883)
chr8 (8-182)||(26867952-26868127)
chr8 (8-131)||(39922355-39922478)
chr8 (16-137)||(17691216-17691337)
chr8 (16-172)||(35067000-35067159)
chr8 (23-182)||(39934430-39934590)
chr8 (8-126)||(25123652-25123770)
chr8 (17-182)||(1783003-1783170)
chr8 (14-103)||(7089938-7090028)
chr8 (8-90)||(42556675-42556757)
chr8 (94-182)||(1281913-1282001)
chr8 (17-160)||(19971483-19971627)
chr8 (17-182)||(9483650-9483817)
chr8 (17-160)||(31071555-31071698)
chr8 (17-142)||(14826361-14826487)
chr8 (17-160)||(21021186-21021330)
chr8 (17-182)||(21442129-21442296)
chr8 (17-159)||(30577869-30578013)
chr8 (23-103)||(23053923-23054003)
chr8 (56-160)||(45299639-45299743)
chr8 (74-182)||(44874163-44874271)
chr8 (60-178)||(17883984-17884102)
chr8 (14-84)||(34969926-34969996)
chr8 (17-182)||(41942860-41943024)
chr8 (19-139)||(5642590-5642706)
chr8 (19-139)||(5644531-5644647)
chr8 (56-160)||(10616332-10616436)
chr8 (56-160)||(27545801-27545905)
chr8 (17-80)||(4018669-4018732)
chr8 (129-182)||(23161348-23161401)
chr8 (56-160)||(32069063-32069167)
chr8 (56-160)||(36899780-36899884)
chr8 (111-175)||(42556758-42556822)
chr8 (17-80)||(3154203-3154266)
chr8 (17-80)||(14819308-14819371)
chr8 (17-92)||(18804323-18804398)
chr8 (56-160)||(13468352-13468457)
chr8 (60-160)||(1201710-1201810)
chr8 (56-160)||(13269285-13269390)
chr8 (14-67)||(23053848-23053901)
chr8 (17-80)||(1775529-1775592)
chr8 (17-67)||(2823600-2823650)
chr8 (96-162)||(21442400-21442466)
chr8 (17-75)||(25280997-25281055)
chr8 (17-141)||(30400544-30400665)
chr8 (56-160)||(26042992-26043096)
chr8 (14-67)||(29377880-29377933)
chr8 (16-67)||(7977246-7977297)
chr8 (59-160)||(23544846-23544948)
chr8 (129-160)||(42556723-42556754)
chr8 (17-67)||(184255-184305)
chr8 (56-160)||(1783042-1783147)
chr8 (76-182)||(21352262-21352368)
chr8 (17-67)||(26042939-26042989)
chr8 (17-67)||(27545908-27545958)
chr8 (17-67)||(29125708-29125758)
chr8 (17-67)||(35550590-35550640)
chr8 (123-160)||(184147-184184)
chr8 (17-50)||(1201817-1201850)
chr8 (56-93)||(1281935-1281972)
chr8 (56-160)||(9483971-9484076)
chr8 (123-160)||(17691256-17691293)
chr8 (123-160)||(26630070-26630107)
chr8 (18-67)||(42556484-42556533)
chr8 (18-50)||(3154122-3154154)
chr8 (18-50)||(9483799-9483831)
chr8 (18-50)||(14826306-14826338)
chr8 (18-50)||(21442278-21442310)
chr8 (8-40)||(29126156-29126188)
[»] chr7 (90 HSPs)
chr7 (8-182)||(938926-939100)
chr7 (8-182)||(28912113-28912287)
chr7 (8-182)||(38367847-38368021)
chr7 (8-182)||(25818515-25818690)
chr7 (20-182)||(41407373-41407535)
chr7 (14-182)||(18352312-18352481)
chr7 (8-182)||(9401647-9401821)
chr7 (8-182)||(11766152-11766326)
chr7 (16-182)||(454135-454301)
chr7 (14-182)||(19069427-19069595)
chr7 (8-182)||(15957205-15957379)
chr7 (8-182)||(2509312-2509485)
chr7 (7-182)||(2936671-2936847)
chr7 (8-182)||(2362783-2362955)
chr7 (8-182)||(23740069-23740244)
chr7 (8-174)||(38796814-38796981)
chr7 (8-182)||(2633883-2634055)
chr7 (8-182)||(6559388-6559559)
chr7 (8-182)||(6736504-6736676)
chr7 (18-182)||(27168254-27168418)
chr7 (14-182)||(41037389-41037558)
chr7 (56-160)||(27168292-27168396)
chr7 (17-182)||(11327627-11327795)
chr7 (17-182)||(12080730-12080897)
chr7 (17-182)||(28605473-28605639)
chr7 (17-182)||(38876166-38876334)
chr7 (17-160)||(20516974-20517119)
chr7 (17-182)||(45225424-45225592)
chr7 (17-162)||(37138934-37139081)
chr7 (17-182)||(15230096-15230263)
chr7 (17-182)||(32852888-32853055)
chr7 (17-182)||(48454543-48454711)
chr7 (17-182)||(27811973-27812140)
chr7 (17-160)||(24720315-24720459)
chr7 (17-182)||(14718993-14719160)
chr7 (25-182)||(14777958-14778117)
chr7 (17-162)||(14770127-14770273)
chr7 (17-162)||(15220578-15220724)
chr7 (17-182)||(18123080-18123248)
chr7 (56-160)||(11766174-11766278)
chr7 (17-133)||(18829775-18829896)
chr7 (17-182)||(26380074-26380242)
chr7 (23-111)||(3512507-3512595)
chr7 (17-182)||(4655076-4655248)
chr7 (18-182)||(7437798-7437965)
chr7 (17-160)||(22479260-22479404)
chr7 (56-160)||(25818537-25818642)
chr7 (39-143)||(32577614-32577719)
chr7 (56-160)||(28912135-28912239)
chr7 (17-160)||(8047972-8048112)
chr7 (17-80)||(27597168-27597231)
chr7 (96-182)||(45225291-45225378)
chr7 (56-160)||(18352354-18352459)
chr7 (56-160)||(938948-939052)
chr7 (56-160)||(19069449-19069553)
chr7 (17-182)||(34986556-34986724)
chr7 (56-160)||(41407395-41407499)
chr7 (44-182)||(43711943-43712084)
chr7 (124-179)||(3512711-3512766)
chr7 (17-72)||(32577713-32577768)
chr7 (17-80)||(33889892-33889955)
chr7 (57-158)||(9401697-9401798)
chr7 (56-93)||(2936693-2936730)
chr7 (139-182)||(7835347-7835390)
chr7 (17-80)||(18199708-18199771)
chr7 (17-67)||(938895-938945)
chr7 (21-67)||(2362752-2362798)
chr7 (17-67)||(2936640-2936690)
chr7 (17-67)||(6559357-6559407)
chr7 (34-76)||(17317398-17317440)
chr7 (17-67)||(27168399-27168449)
chr7 (123-161)||(38367894-38367932)
chr7 (17-67)||(38368002-38368052)
chr7 (53-156)||(48193211-48193316)
chr7 (56-93)||(454157-454194)
chr7 (123-160)||(3512540-3512577)
chr7 (114-182)||(9401606-9401675)
chr7 (18-51)||(11327612-11327645)
chr7 (56-160)||(28605496-28605600)
chr7 (56-101)||(37139034-37139079)
chr7 (60-93)||(38796930-38796963)
chr7 (123-182)||(1325336-1325396)
chr7 (18-50)||(18199585-18199617)
chr7 (18-50)||(20516937-20516969)
chr7 (18-50)||(24720278-24720310)
chr7 (18-50)||(27597037-27597069)
chr7 (18-50)||(27811959-27811991)
chr7 (17-49)||(28912100-28912132)
chr7 (18-50)||(45225277-45225309)
chr7 (18-50)||(45225410-45225442)
[»] chr5 (91 HSPs)
chr5 (8-182)||(14369782-14369956)
chr5 (15-182)||(25912042-25912209)
chr5 (8-182)||(4083753-4083927)
chr5 (8-182)||(4737947-4738121)
chr5 (9-182)||(31752131-31752304)
chr5 (8-177)||(7944308-7944476)
chr5 (8-173)||(17232909-17233074)
chr5 (14-182)||(22701743-22701910)
chr5 (16-182)||(2695097-2695262)
chr5 (8-182)||(6436438-6436612)
chr5 (14-182)||(33696068-33696236)
chr5 (16-182)||(6260992-6261158)
chr5 (16-182)||(17421709-17421875)
chr5 (17-182)||(2528782-2528949)
chr5 (39-182)||(31240268-31240411)
chr5 (14-182)||(39038534-39038703)
chr5 (8-174)||(9124725-9124893)
chr5 (8-182)||(28747777-28747952)
chr5 (8-182)||(39548835-39549007)
chr5 (8-157)||(857928-858079)
chr5 (8-182)||(12910015-12910189)
chr5 (22-178)||(10951074-10951230)
chr5 (16-178)||(22800641-22800804)
chr5 (14-182)||(3038902-3039057)
chr5 (8-101)||(32736356-32736449)
chr5 (16-182)||(13711032-13711200)
chr5 (16-182)||(33832731-33832899)
chr5 (55-182)||(8410658-8410785)
chr5 (14-182)||(17233273-17233439)
chr5 (17-182)||(1951434-1951601)
chr5 (17-182)||(30687915-30688083)
chr5 (17-162)||(11448772-11448919)
chr5 (17-141)||(26905956-26906080)
chr5 (20-182)||(15808989-15809154)
chr5 (8-89)||(11351811-11351892)
chr5 (14-178)||(38952207-38952372)
chr5 (17-160)||(3960639-3960783)
chr5 (17-182)||(17605059-17605226)
chr5 (17-142)||(4736851-4736977)
chr5 (17-147)||(37249356-37249488)
chr5 (17-162)||(29302105-29302252)
chr5 (17-127)||(37468608-37468719)
chr5 (14-174)||(10471017-10471175)
chr5 (8-137)||(15294098-15294227)
chr5 (34-142)||(17209894-17210003)
chr5 (17-182)||(33282274-33282441)
chr5 (17-182)||(1921478-1921646)
chr5 (56-160)||(25912083-25912187)
chr5 (56-160)||(31240285-31240389)
chr5 (8-76)||(17210137-17210204)
chr5 (24-182)||(33026246-33026406)
chr5 (21-162)||(30667586-30667725)
chr5 (56-156)||(6261036-6261136)
chr5 (56-160)||(14369804-14369908)
chr5 (35-142)||(37282238-37282346)
chr5 (17-80)||(17559225-17559288)
chr5 (19-84)||(7014621-7014686)
chr5 (56-160)||(17232957-17233061)
chr5 (56-160)||(31752153-31752257)
chr5 (89-142)||(40234162-40234215)
chr5 (17-80)||(1807514-1807577)
chr5 (17-76)||(22282213-22282272)
chr5 (44-138)||(38661242-38661337)
chr5 (17-99)||(4151067-4151148)
chr5 (56-160)||(4737969-4738073)
chr5 (56-93)||(17421731-17421768)
chr5 (56-93)||(39548948-39548985)
chr5 (60-158)||(4083779-4083877)
chr5 (53-157)||(33833090-33833196)
chr5 (14-68)||(3189723-3189777)
chr5 (17-67)||(4737916-4737966)
chr5 (17-67)||(12910170-12910220)
chr5 (17-67)||(14369751-14369801)
chr5 (18-67)||(1921447-1921496)
chr5 (123-160)||(2695137-2695174)
chr5 (17-50)||(2695243-2695276)
chr5 (56-93)||(3038924-3038961)
chr5 (56-160)||(6436460-6436564)
chr5 (56-93)||(7944325-7944362)
chr5 (8-105)||(8318059-8318155)
chr5 (25-74)||(13676280-13676329)
chr5 (111-160)||(30486151-30486200)
chr5 (123-160)||(32736364-32736401)
chr5 (17-50)||(33696054-33696087)
chr5 (18-50)||(1951583-1951615)
chr5 (18-50)||(26905902-26905934)
chr5 (18-50)||(30486114-30486146)
chr5 (18-50)||(30688065-30688097)
chr5 (80-164)||(31752485-31752569)
chr5 (18-50)||(33833204-33833236)
chr5 (150-182)||(40234209-40234241)
[»] chr1 (114 HSPs)
chr1 (14-182)||(36389456-36389624)
chr1 (8-182)||(16005594-16005769)
chr1 (8-182)||(26842989-26843163)
chr1 (8-182)||(28454735-28454909)
chr1 (16-182)||(13157556-13157725)
chr1 (14-182)||(6192421-6192591)
chr1 (14-182)||(34515126-34515296)
chr1 (25-174)||(4158116-4158265)
chr1 (8-182)||(16073429-16073605)
chr1 (15-179)||(50559248-50559412)
chr1 (14-174)||(51431884-51432045)
chr1 (8-182)||(8643026-8643197)
chr1 (8-179)||(24770622-24770792)
chr1 (8-181)||(3273363-3273537)
chr1 (44-182)||(13264561-13264699)
chr1 (16-182)||(42199883-42200049)
chr1 (16-182)||(42208751-42208917)
chr1 (8-182)||(10764627-10764803)
chr1 (14-182)||(32156013-32156181)
chr1 (8-178)||(158405-158576)
chr1 (64-182)||(463360-463478)
chr1 (16-182)||(5491601-5491767)
chr1 (8-182)||(14387246-14387419)
chr1 (16-182)||(23413667-23413831)
chr1 (14-182)||(34306437-34306609)
chr1 (16-179)||(41146283-41146446)
chr1 (16-182)||(45818811-45818977)
chr1 (8-176)||(28764540-28764708)
chr1 (8-121)||(28704441-28704554)
chr1 (14-141)||(33676084-33676212)
chr1 (8-142)||(13157272-13157408)
chr1 (86-182)||(27787870-27787966)
chr1 (70-160)||(32151919-32152009)
chr1 (73-182)||(3979434-3979543)
chr1 (8-93)||(20201691-20201776)
chr1 (17-160)||(13385776-13385921)
chr1 (14-182)||(39424264-39424434)
chr1 (17-182)||(14494367-14494535)
chr1 (17-141)||(47130976-47131101)
chr1 (52-160)||(32144027-32144135)
chr1 (17-182)||(12864311-12864477)
chr1 (14-182)||(16960278-16960448)
chr1 (17-182)||(27348129-27348292)
chr1 (21-182)||(27389506-27389672)
chr1 (8-79)||(10558203-10558274)
chr1 (17-182)||(20411195-20411363)
chr1 (17-160)||(1805030-1805174)
chr1 (16-182)||(32994184-32994336)
chr1 (111-182)||(47130803-47130874)
chr1 (17-144)||(50797663-50797790)
chr1 (14-103)||(10368082-10368171)
chr1 (8-69)||(463009-463070)
chr1 (8-121)||(24190822-24190935)
chr1 (17-182)||(27255650-27255818)
chr1 (17-182)||(36817648-36817816)
chr1 (17-160)||(20201739-20201884)
chr1 (56-160)||(13264583-13264687)
chr1 (8-80)||(3977963-3978035)
chr1 (56-160)||(13157596-13157703)
chr1 (60-136)||(32151842-32151918)
chr1 (17-160)||(51465064-51465207)
chr1 (17-182)||(43236152-43236328)
chr1 (17-182)||(52772244-52772412)
chr1 (52-182)||(28182163-28182293)
chr1 (20-117)||(3099571-3099668)
chr1 (56-160)||(28454757-28454861)
chr1 (17-182)||(32374558-32374726)
chr1 (56-160)||(36389498-36389602)
chr1 (134-182)||(33675851-33675899)
chr1 (57-160)||(4158147-4158250)
chr1 (8-67)||(32379581-32379640)
chr1 (56-160)||(16005616-16005721)
chr1 (56-160)||(51431898-51432003)
chr1 (56-152)||(463360-463456)
chr1 (56-160)||(8643048-8643152)
chr1 (17-78)||(28646760-28646821)
chr1 (17-80)||(28094541-28094604)
chr1 (53-182)||(32716425-32716556)
chr1 (17-71)||(5491748-5491802)
chr1 (55-93)||(32151972-32152010)
chr1 (35-178)||(9005142-9005282)
chr1 (56-93)||(26843104-26843141)
chr1 (56-93)||(27787907-27787944)
chr1 (114-182)||(28454881-28454950)
chr1 (114-182)||(28704526-28704595)
chr1 (96-182)||(14387479-14387566)
chr1 (95-142)||(32144129-32144176)
chr1 (17-67)||(463459-463509)
chr1 (17-80)||(12010599-12010664)
chr1 (17-67)||(13157706-13157756)
chr1 (17-67)||(23413636-23413686)
chr1 (17-67)||(27787947-27787997)
chr1 (95-141)||(32152003-32152049)
chr1 (17-67)||(34515277-34515327)
chr1 (56-93)||(5491708-5491745)
chr1 (17-50)||(6192572-6192605)
chr1 (106-182)||(13943351-13943428)
chr1 (114-182)||(16005741-16005810)
chr1 (56-93)||(16073546-16073583)
chr1 (17-70)||(16073586-16073639)
chr1 (88-125)||(32144177-32144214)
chr1 (18-67)||(32374527-32374576)
chr1 (17-50)||(34306590-34306623)
chr1 (56-93)||(34515237-34515274)
chr1 (18-50)||(12010527-12010559)
chr1 (18-50)||(12864297-12864329)
chr1 (18-50)||(13385739-13385771)
chr1 (18-50)||(13943410-13943442)
chr1 (18-50)||(14387548-14387580)
chr1 (18-50)||(16960430-16960462)
chr1 (18-50)||(20411345-20411377)
chr1 (18-50)||(27255800-27255832)
chr1 (18-50)||(32716411-32716443)
chr1 (18-50)||(39424416-39424448)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (8-182)||(34082557-34082731)
chr2 (8-165)||(33739537-33739694)
chr2 (8-182)||(11675142-11675317)
chr2 (8-182)||(16513104-16513275)
chr2 (8-182)||(42850006-42850180)
chr2 (14-182)||(1576649-1576817)
chr2 (18-182)||(16075073-16075237)
chr2 (14-182)||(18370228-18370396)
chr2 (16-182)||(1750219-1750384)
chr2 (8-182)||(37169547-37169720)
chr2 (14-182)||(23387157-23387325)
chr2 (16-182)||(768574-768741)
chr2 (8-182)||(8386687-8386864)
chr2 (8-182)||(13002052-13002226)
chr2 (8-182)||(29512105-29512281)
chr2 (8-182)||(23664738-23664913)
chr2 (16-180)||(41527927-41528092)
chr2 (17-127)||(23387065-23387176)
chr2 (17-162)||(44542897-44543043)
chr2 (17-182)||(6332288-6332455)
chr2 (17-182)||(7682017-7682183)
chr2 (17-182)||(9689387-9689555)
chr2 (17-182)||(39906281-39906449)
chr2 (14-94)||(29511962-29512042)
chr2 (17-160)||(33173549-33173692)
chr2 (17-157)||(22711045-22711186)
chr2 (17-182)||(20939722-20939889)
chr2 (39-174)||(29403983-29404118)
chr2 (12-156)||(9690165-9690310)
chr2 (17-160)||(2586431-2586575)
chr2 (17-160)||(4293216-4293360)
chr2 (17-160)||(30406473-30406617)
chr2 (8-84)||(32601381-32601457)
chr2 (17-162)||(38987007-38987154)
chr2 (14-103)||(45629733-45629819)
chr2 (52-117)||(20940000-20940065)
chr2 (8-101)||(39435142-39435235)
chr2 (17-162)||(39904702-39904849)
chr2 (64-182)||(17265317-17265435)
chr2 (17-162)||(44257506-44257654)
chr2 (56-160)||(18370270-18370374)
chr2 (17-182)||(22301990-22302157)
chr2 (17-121)||(3769654-3769759)
chr2 (56-160)||(33739585-33739689)
chr2 (17-80)||(1297602-1297665)
chr2 (8-150)||(44288805-44288944)
chr2 (17-91)||(19630764-19630840)
chr2 (17-91)||(19827665-19827741)
chr2 (56-160)||(34082605-34082709)
chr2 (14-109)||(41088785-41088880)
chr2 (24-62)||(20940066-20940104)
chr2 (144-182)||(29513919-29513957)
chr2 (14-64)||(43660810-43660860)
chr2 (17-70)||(11675298-11675351)
chr2 (56-101)||(13002074-13002119)
chr2 (56-93)||(16075095-16075132)
chr2 (17-160)||(15554034-15554178)
chr2 (17-67)||(16513073-16513123)
chr2 (17-67)||(34082712-34082762)
chr2 (56-101)||(29403997-29404042)
chr2 (18-50)||(3769467-3769499)
chr2 (18-50)||(7682165-7682197)
chr2 (18-50)||(22711194-22711226)
chr2 (76-140)||(24755176-24755240)
chr2 (18-50)||(39906431-39906463)
[»] chr4 (105 HSPs)
chr4 (8-182)||(26335773-26335947)
chr4 (8-182)||(49425765-49425939)
chr4 (14-182)||(9744143-9744311)
chr4 (8-178)||(11777501-11777671)
chr4 (14-182)||(15725211-15725379)
chr4 (8-180)||(46106708-46106880)
chr4 (16-182)||(16553457-16553623)
chr4 (8-179)||(45875794-45875965)
chr4 (16-182)||(33105944-33106110)
chr4 (16-182)||(52306800-52306966)
chr4 (14-182)||(40496153-40496322)
chr4 (14-182)||(6946677-6946840)
chr4 (8-172)||(23383931-23384092)
chr4 (8-182)||(38425657-38425831)
chr4 (8-182)||(6192960-6193135)
chr4 (8-182)||(29102017-29102192)
chr4 (14-182)||(4712689-4712858)
chr4 (17-182)||(14863005-14863164)
chr4 (8-174)||(20458837-20459004)
chr4 (14-156)||(142677-142819)
chr4 (14-182)||(14948155-14948322)
chr4 (24-182)||(4490697-4490856)
chr4 (56-182)||(6137552-6137678)
chr4 (8-182)||(36955389-36955562)
chr4 (17-182)||(26958588-26958754)
chr4 (17-182)||(52437437-52437605)
chr4 (14-121)||(102258-102366)
chr4 (8-182)||(54742480-54742658)
chr4 (17-182)||(42807911-42808079)
chr4 (17-162)||(10216252-10216398)
chr4 (8-142)||(43639071-43639208)
chr4 (71-182)||(49606051-49606162)
chr4 (17-162)||(13211886-13212032)
chr4 (73-182)||(33811077-33811186)
chr4 (14-180)||(40496480-40496640)
chr4 (17-182)||(48560048-48560215)
chr4 (17-162)||(5046641-5046787)
chr4 (17-182)||(6214033-6214201)
chr4 (17-182)||(12584286-12584454)
chr4 (17-182)||(13621148-13621315)
chr4 (17-157)||(49970671-49970811)
chr4 (59-182)||(6137530-6137653)
chr4 (17-162)||(17377564-17377711)
chr4 (16-80)||(38425572-38425636)
chr4 (17-182)||(3818794-3818963)
chr4 (17-162)||(13371282-13371428)
chr4 (17-162)||(13381483-13381629)
chr4 (17-160)||(21519804-21519949)
chr4 (14-182)||(41172460-41172630)
chr4 (17-182)||(7630107-7630275)
chr4 (17-182)||(14202870-14203038)
chr4 (16-84)||(13211553-13211621)
chr4 (17-182)||(5157048-5157215)
chr4 (18-147)||(51783970-51784101)
chr4 (17-160)||(34683048-34683193)
chr4 (17-141)||(30820489-30820614)
chr4 (17-160)||(30258127-30258271)
chr4 (17-182)||(17181000-17181170)
chr4 (17-182)||(50182225-50182390)
chr4 (17-162)||(17745219-17745363)
chr4 (17-160)||(578757-578904)
chr4 (56-160)||(6946699-6946803)
chr4 (56-160)||(9744185-9744289)
chr4 (56-160)||(26335795-26335899)
chr4 (123-182)||(43639009-43639068)
chr4 (55-160)||(49425813-49425918)
chr4 (56-160)||(14863027-14863130)
chr4 (56-160)||(45875813-45875917)
chr4 (14-127)||(53975202-53975315)
chr4 (56-99)||(4712711-4712754)
chr4 (96-182)||(13621395-13621482)
chr4 (17-80)||(47382306-47382369)
chr4 (8-47)||(49606163-49606202)
chr4 (59-156)||(15725236-15725333)
chr4 (17-67)||(52306769-52306819)
chr4 (63-160)||(52306829-52306926)
chr4 (106-182)||(10981392-10981469)
chr4 (59-160)||(11777549-11777650)
chr4 (56-93)||(52437546-52437583)
chr4 (106-162)||(45801878-45801934)
chr4 (17-67)||(6137659-6137709)
chr4 (17-67)||(26335742-26335792)
chr4 (17-67)||(26958557-26958607)
chr4 (56-160)||(26958610-26958715)
chr4 (56-160)||(40496195-40496300)
chr4 (119-177)||(50677979-50678037)
chr4 (17-67)||(52437586-52437636)
chr4 (56-93)||(6193076-6193113)
chr4 (56-93)||(43639031-43639068)
chr4 (56-93)||(46106728-46106765)
chr4 (56-93)||(49606073-49606110)
chr4 (56-101)||(54742502-54742547)
chr4 (18-50)||(578909-578941)
chr4 (18-50)||(5157034-5157066)
chr4 (17-72)||(6137493-6137549)
chr4 (18-50)||(7630093-7630125)
chr4 (18-50)||(12584436-12584468)
chr4 (18-50)||(14203020-14203052)
chr4 (18-50)||(17180986-17181018)
chr4 (18-50)||(18470293-18470325)
chr4 (18-50)||(30820639-30820671)
chr4 (18-50)||(34683198-34683230)
chr4 (18-50)||(42808061-42808093)
chr4 (18-50)||(48560034-48560066)
chr4 (18-50)||(50182211-50182243)
[»] scaffold0627 (3 HSPs)
scaffold0627 (8-182)||(4090-4263)
scaffold0627 (56-160)||(4112-4215)
scaffold0627 (17-67)||(4059-4109)
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (8-182)||(4898438-4898612)
chr6 (8-182)||(25061681-25061854)
chr6 (8-182)||(14488325-14488499)
chr6 (14-182)||(33730548-33730713)
chr6 (8-179)||(11742352-11742523)
chr6 (14-174)||(4838310-4838476)
chr6 (8-182)||(18102715-18102890)
chr6 (7-182)||(15718235-15718411)
chr6 (16-182)||(3437993-3438159)
chr6 (8-182)||(21969886-21970060)
chr6 (20-182)||(30525359-30525520)
chr6 (14-174)||(4898125-4898286)
chr6 (14-182)||(11100083-11100254)
chr6 (17-182)||(11100381-11100549)
chr6 (17-182)||(15962738-15962906)
chr6 (14-141)||(11009912-11010039)
chr6 (76-182)||(18154571-18154677)
chr6 (16-103)||(5703852-5703939)
chr6 (17-180)||(9406611-9406775)
chr6 (17-182)||(1369900-1370067)
chr6 (17-182)||(29646245-29646412)
chr6 (17-182)||(31132877-31133045)
chr6 (17-160)||(8171928-8172072)
chr6 (17-142)||(9955796-9955923)
chr6 (17-162)||(16599070-16599217)
chr6 (17-142)||(5187771-5187897)
chr6 (17-162)||(10777944-10778091)
chr6 (17-182)||(4184262-4184428)
chr6 (17-179)||(26211280-26211442)
chr6 (56-160)||(4898486-4898590)
chr6 (17-174)||(26667866-26668026)
chr6 (17-80)||(11210298-11210361)
chr6 (17-182)||(27828308-27828480)
chr6 (17-80)||(15881927-15881990)
chr6 (17-76)||(24022875-24022934)
chr6 (14-121)||(32889684-32889789)
chr6 (17-80)||(10196598-10196661)
chr6 (17-76)||(35002023-35002082)
chr6 (137-182)||(228020-228065)
chr6 (56-93)||(14488347-14488384)
chr6 (60-160)||(25061707-25061807)
chr6 (56-93)||(33730570-33730607)
chr6 (14-50)||(32194228-32194264)
chr6 (17-67)||(30525501-30525551)
chr6 (15-48)||(3881414-3881447)
chr6 (56-93)||(4838324-4838361)
chr6 (123-160)||(4838397-4838434)
chr6 (123-160)||(11742438-11742475)
chr6 (17-50)||(15962887-15962920)
chr6 (18-51)||(20755506-20755539)
chr6 (18-50)||(1370049-1370081)
chr6 (18-50)||(4184410-4184442)
chr6 (18-50)||(9955946-9955978)
chr6 (18-50)||(11100531-11100563)
chr6 (18-50)||(27828462-27828494)
chr6 (18-50)||(29646231-29646263)
chr6 (18-50)||(31133027-31133059)
[»] scaffold0015 (3 HSPs)
scaffold0015 (14-182)||(9730-9899)
scaffold0015 (56-160)||(9772-9877)
scaffold0015 (17-67)||(9880-9930)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (16-182)||(20619-20786)
scaffold0217 (56-160)||(20659-20764)
scaffold0217 (17-67)||(20767-20817)
[»] scaffold0418 (3 HSPs)
scaffold0418 (14-182)||(5713-5881)
scaffold0418 (14-121)||(5394-5502)
scaffold0418 (56-160)||(5735-5839)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (8-182)||(6569-6743)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (8-182)||(594-768)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (17-182)||(452367-452534)
scaffold0002 (16-50)||(452514-452548)
[»] scaffold1717 (1 HSPs)
scaffold1717 (14-81)||(1378-1444)
[»] scaffold1527 (1 HSPs)
scaffold1527 (14-81)||(1624-1690)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (17-160)||(57947-58092)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (17-160)||(26052-26197)
scaffold0074 (18-50)||(26202-26234)
[»] scaffold0119 (2 HSPs)
scaffold0119 (17-174)||(2767-2927)
scaffold0119 (17-174)||(14822-14982)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (24-147)||(22624-22747)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (17-76)||(82743-82802)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (17-142)||(65961-66086)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 97)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 195 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 54244709 - 54244520
Alignment:
Q  195 cattcactatgcaaataatagtcacccaaaattttctttgaatttttacatgcaattatttaaacagagaaactctattgacttttcttttgattcactc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54244709 cattcactatgcaaataatagtcacccaaaattttcattgaatttttaaatgcaattatttaaacagagaaactctattgacttttcttttgattcactc 54244610  T
Q  295 ttctaaactgatataattaacatgagaactcttccaatgtaataatgaaatacaatataataaacatgtcagattaatttaggtaaataa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54244609 ttctaaactgatataattaacatgagaactcttccaatgtaataatgaaatacaatataataaacatgtcagattaatttaggtaaataa 54244520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12127735 - 12127562
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  12127735 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 12127636  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagtta 181  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12127635 taggcattttctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcatgttataactaaaaagtagtta 12127562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 1375995 - 1376170
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  1375995 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 1376094  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1376095 ataggcatttgctaggatacatccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 1376170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13349329 - 13349155
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |    
T  13349329 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactccaa 13349230  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13349229 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggcgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 13349155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 53581745 - 53581579
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  53581745 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 53581646  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53581645 tgctaagatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 53581579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 50801768 - 50801594
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  50801768 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaacttctataaaataaatgagtgtatgttagcaactccta 50801669  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50801668 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 50801594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 50874112 - 50874286
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  50874112 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaacttctataaaataaatgagtgtatgttagcaactccta 50874211  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50874212 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 50874286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8814972 - 8814800
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  8814972 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacatcctaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttcta 8814873  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagtt 180  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8814872 taagcatttgctagaatacacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagttatgattaaaaagtagtt 8814800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 31039555 - 31039729
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  31039555 tagcaaagatataactaaaaatttgttcaatacaccttaaggtgaatgatgctaaaacacacattctaaaaaataagtgcgtgtatgttagcaactccta 31039654  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31039655 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 31039729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27317828 - 27317659
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaaca-caccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27317828 agatataactaaaaatttattaaatacaccttagagtgaatgttgctaaaaaaacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggc 27317729  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27317728 atttgctagaatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 27317659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3800384 - 3800216
Alignment:
Q  15 gatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  3800384 gatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaatacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttaacaacatctataagcat 3800285  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaagg-tgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3800284 tttctaggatacacccacttattttttagaaggttgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 3800216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 53467349 - 53467523
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||  |     
T  53467349 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaaacacacattctaaaatataagttggtgtatgttagcaactcatg 53467448  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53467449 taggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 53467523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27360183 - 27360017
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27360183 agatataactaaaaagttattaaatacaccttagagtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctat-agca 27360085  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27360084 tttgctagaatacatccacttattttttataaggtgtgttttagcaagttataact-aaaagtagttaa 27360017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 171
Target Start/End: Original strand, 33837807 - 33837971
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  33837807 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 33837906  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaa 171  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33837907 atagacatttgctaggatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaa 33837971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17605667 - 17605510
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  17605667 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtttttaaaacacatcttctaaaaaataagtgggggtatgttagcaactccta 17605568  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttat 165  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17605567 tatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtttgttttagcaagttat 17605510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3269558 - 3269398
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  3269558 agatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagttggtgtatgttaccaactcctatatgca 3269459  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaa 174  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||||||||| ||||| ||||||||    
T  3269458 tttgctaggatacacacacttattttttagaatgtctgttttagcatgttataactaaaaa 3269398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 50913006 - 50913172
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  50913006 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgataaaacacatattctaaaaaataaatgggtgtatgttagcaactcctacaggcatt 50913105  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  50913106 tgctagaatacacccacttaatttttagaaggtgtgttttagggagttataactaaaaagtagttaa 50913172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 32203343 - 32203173
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  32203343 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggt----gttgctaaaacatacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactctta 32203248  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32203247 taggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactagaaagtagttaa 32203173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36824149 - 36823975
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  36824149 tagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagtaactccaa 36824050  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||| |||||   |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  36824049 taggcatttgctagaatacaagaacttgttttttagaaggtgtgttttagcaagttataattaaaaagtagttaa 36823975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Original strand, 22894545 - 22894678
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  22894545 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacacat-ctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 22894643  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttatttttta 142  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22894644 taaacatttgctaggatacacccacttatttttta 22894678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 48765214 - 48765385
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgcta---aaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||      
T  48765214 agatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctactaaaacacactttctacaaaataagtgggtgtatgttaacaactcctatgg 48765313  T
Q  111 gcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
      ||||||||  ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48765314 atatttgctaaaatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagtaagttataactaaaaagtagttaa 48765385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8815182 - 8815063
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  8815182 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacatcctaaggtgaatgttgctaaaacacacgttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttcta 8815083  T
Q  108 taagcatttgctaggataca 127  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  8815082 taagcatttgctagaataca 8815063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 181
Target Start/End: Original strand, 29239592 - 29239764
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  |  |||||||||||||||||  ||    
T  29239592 tagcaaagatataactaaaaagctgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacactcattctaaaaaat--gtaggtgtatgttagcaactcgta 29239689  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagtta 181  Q
    || ||||||| ||  ||||| |||| || ||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29239690 taggcatttgttaaaatacacccacatatttttttagaatgtgtgttttaccaagttataactaaaaagtagtta 29239764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 182
Target Start/End: Original strand, 26103649 - 26103787
Alignment:
Q  43 cttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttatttttt 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||    
T  26103649 cttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttccaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatatgcatttgccaggacac--ccacttatttttt 26103746  T
Q  142 aaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26103747 agaaggtgtcttttagcaagttataactaaaaaatagttaa 26103787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 6748652 - 6748819
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| |  |||||| | |||||||||||    
T  6748652 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataagcatt 6748751  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  6748752 tgctagaatacacccacttcttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 6748819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 47461887 - 47461719
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  47461887 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctattaaaattaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 47461788  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  47461787 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 47461719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 7848719 - 7848552
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  7848719 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtacgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 7848620  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  7848619 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 7848552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6114974 - 6114806
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| |||||| |  |||||| | |||||  |||    
T  6114974 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacat 6114875  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  6114874 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaaaagtggttaa 6114806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12896830 - 12896662
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  12896830 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 12896731  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||  |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  12896730 ttgctaggatacacccacttaatttttggaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 12896662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 51952395 - 51952247
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa--aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  51952395 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 51952296  T
Q  115 ttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| || |||||||||||    
T  51952295 ttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaagt 51952247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 54244807 - 54244747
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54244807 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaa 54244747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11460342 - 11460175
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| | ||||    |||||| | ||||| |||||    
T  11460342 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgagtgtgctctagcaaatcctataggcatt 11460243  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| || || |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  11460242 tgctagaatgcacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 11460175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 7521551 - 7521383
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||  |||||| | ||||| ||||    
T  7521551 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtattctagcaaatcctataggcat 7521452  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||| || |  | |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  7521451 ttgttagaatacacccacttattttttagaaagaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 7521383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21727838 - 21727670
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa--taagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||   ||| |||||| |  |||||| | ||| | ||||    
T  21727838 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttataaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctacaggcat 21727739  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  21727738 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaaaagtggttaa 21727670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 45059534 - 45059702
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa--aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||| || ||||||| ||||||  |||||||| |||||| |  |||||| | |||||  |||    
T  45059534 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgttataacacacattctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacat 45059633  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  45059634 ttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 45059702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 994724 - 994868
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |  || ||| | ||||| |||||    
T  994724 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgctgctataacacaccttctaaaaaaacaattgggtgtgttctaccaaatcctataggcatt 994823  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  994824 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 994868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8815523 - 8815399
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||| | ||||| |||||    
T  8815523 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttttagcaaatcctataggcatt 8815424  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttt 140  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||    
T  8815423 tgctagaatacacctacttattttt 8815399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 37504729 - 37504566
Alignment:
Q  21 actaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgct 119  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| | |||||  |||||| |    
T  37504729 actaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgtt 37504630  T
Q  120 aggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||| || |||||| ||||  || |||||||||| |||||    
T  37504629 agaatacacccacttattttttagaaggagtattttagaaagtgaataactaaaaagtggttaa 37504566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Original strand, 995030 - 995155
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||  ||| |||| | |  |||||| | ||||| |||||    
T  995030 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctgtaacacaccttctaaaaaaacaagtgggtatgttctagcaaatcctataggcatt 995129  T
Q  116 tgctaggatacatccacttatttttt 141  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||    
T  995130 tgctagaatacaaccacttatttttt 995155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 6109166 - 6109334
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||| |  |||||| |  |||| ||||    
T  6109166 tataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcat 6109265  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||| || | || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  6109266 ttgctagaatacacccatttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 6109334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 26152199 - 26152367
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||| |  || ||| | ||||| ||||    
T  26152199 tataactaaaaagttaataaatataccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagcaggtgtgttctatcaaatcctataggcat 26152298  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| || |||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  26152299 ttggtaagatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 26152367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27728386 - 27728216
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacac--cttctaa--aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||| |||||| | ||||||| | ||||| ||    
T  27728386 tataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttttagcaaatcctataggc 27728287  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||  | |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  27728286 atttgcttagatacacccacttagtttttagaaggaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 27728216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 52654507 - 52654387
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  52654507 tataactaaaaagttaataaatacactttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgagtgtgttctagcaaattctataggcatt 52654408  T
Q  116 tgctaggatacatccacttat 136  Q
    |||||  ||||| ||||||||    
T  52654407 tgctaaaatacacccacttat 52654387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38798172 - 38798003
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataa---gcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||   | |||||| |  |||||| | ||||| |||    
T  38798172 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaagtgtatgttgcgataacacaccttctaaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 38798073  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||    
T  38798072 tttgctaaaatacatccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtggttaa 38798003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 26158254 - 26158402
Alignment:
Q  37 atacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccactt 134  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| | ||||    
T  26158254 atacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctactt 26158353  T
Q  135 attttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  26158354 attttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 26158402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 29950698 - 29950609
Alignment:
Q  52 aatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttatttttt 141  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  29950698 aatgttgctaaaacacttcttctaaaaaataagtgggtgtatgttaccaagtgatataggcatttgatagaatacacccacttatttttt 29950609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 29999852 - 29999763
Alignment:
Q  52 aatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttatttttt 141  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  29999852 aatgttgctaaaacacttcttctaaaaaataagtgggtgtatgttaccaagtgatataggcatttgatagaatacacccacttatttttt 29999763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 117
Target Start/End: Original strand, 30033084 - 30033149
Alignment:
Q  52 aatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30033084 aatgttgctaacacacaccttctaaaaaataagttggtgtatgttagcaactcctataggcatttg 30033149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 53581601 - 53581705
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  |||| || | ||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  53581601 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcttagcaaatgtctat-aggagttgctaacatacacccacttattttttagaatgtgtgttt 53581699  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  53581700 tagcaa 53581705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 4043828 - 4043765
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4043828 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 4043765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Original strand, 30347776 - 30347839
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30347776 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 30347839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Original strand, 26152512 - 26152624
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  26152512 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 26152611  T
Q  115 ttgctaggataca 127  Q
    ||||||| |||||    
T  26152612 ttgctagaataca 26152624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 162
Target Start/End: Original strand, 2868201 - 2868312
Alignment:
Q  53 atgttgctaaaacacaccttctaaaaaa--taagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgt 150  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||  |||| |||||| |  |||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||    
T  2868201 atgttgctataacacacattctaacaaaattaagtgggtgttttctagcaaatcatataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgagt 2868300  T
Q  151 gttttagcaagt 162  Q
    ||||||||||||    
T  2868301 gttttagcaagt 2868312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 8814820 - 8814924
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgtttt 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||| | ||   || | ||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  8814820 ttgctaaaacacaccttcaaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatgcttatagaagttgctaacatacacccacttattttttagaatgtgtgtttt 8814919  T
Q  156 agcaa 160  Q
    |||||    
T  8814920 agcaa 8814924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Original strand, 12127584 - 12127687
Alignment:
Q  57 tgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgtttt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || |  |||| || | ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12127584 tgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagaaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgtttt 12127682  T
Q  156 agcaa 160  Q
    |||||    
T  12127683 agcaa 12127687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 156
Target Start/End: Original strand, 27360038 - 27360137
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgtttt 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||||| | |||| || | ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27360038 ttgctaaaacacaccttataaaaaataagtggatgtattctagcaaatgctat-aggagttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgtttt 27360136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Original strand, 3269235 - 3269298
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3269235 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 3269298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Original strand, 17226204 - 17226267
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17226204 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaa 17226267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 32203195 - 32203299
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |  ||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  32203195 ttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatgcctataag-agttgctaacatacacccacttattttttagaatgtatgttt 32203293  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  32203294 tagcaa 32203299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 51148014 - 51148075
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaa 78  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51148014 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaa 51148075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 160
Target Start/End: Original strand, 34277547 - 34277630
Alignment:
Q  76 aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  34277547 aaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacgtttg-tagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 34277630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 30685229 - 30685186
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgtt 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30685229 agatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgtt 30685186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 30033188 - 30033150
Alignment:
Q  24 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaa 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30033188 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaa 30033150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33837960 - 33837855
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgtt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33837960 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgagtgtatcctagcaaatgtctat-aggagttgctaacatacacccacttatttttttagaaggtgtgtt 33837862  T
Q  154 ttagcaa 160  Q
    |||||||    
T  33837861 ttagcaa 33837855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 13349177 - 13349281
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  ||||  | | ||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  13349177 ttgctaaaacacgccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-tggagttgctaacatacacccacttatattttagaaggtgtgttt 13349275  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  13349276 tagcaa 13349281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 50801616 - 50801653
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50801616 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 50801653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 50874264 - 50874227
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50874264 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 50874227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 53467501 - 53467464
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53467501 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 53467464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 454 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 54244450 - 54244413
Alignment:
Q  454 acttagttgatgataaagttttcaaatgtggttgtttg 491  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54244450 acttagttgatgatcaagttttcaaatgtggttgtttg 54244413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17065918 - 17065774
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||| |||||  |||||||  ||||||||  |||||  || |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| | |||||  ||||    
T  17065918 tataactaagaagttaataaatacgtcttaaggtgtatgttattataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatt 17065819  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||| ||  | |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  17065818 tgctagaatgtacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 17065774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31039707 - 31039604
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  |||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  31039707 ttgctaaaacacatcttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacgcacttattttttagaatgtgtgttt 31039609  T
Q  155 tagca 159  Q
    |||||    
T  31039608 tagca 31039604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 3800235 - 3800185
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  3800235 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 3800185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4043731 - 4043653
Alignment:
Q  105 ctataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  4043731 ctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 4043653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 13349174 - 13349124
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  13349174 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtggagcttgctaaaacac 13349124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 182
Target Start/End: Original strand, 22894883 - 22894921
Alignment:
Q  144 aaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22894883 aaggtgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaa 22894921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 22894902 - 22894952
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  22894902 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 22894952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 31039710 - 31039760
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  31039710 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 31039760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 48765360 - 48765318
Alignment:
Q  59 ctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  48765360 ctaaaacacaccttctaaaaaataaatgggtgtattttagcaa 48765318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 51
Target Start/End: Original strand, 53467504 - 53467538
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggta 51  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53467504 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggta 53467538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 17605515 - 17605552
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17605515 ttgctaaaacaaaccttctaaaaaataagtgggtgtat 17605552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 4043671 - 4043639
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4043671 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 4043639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 6109316 - 6109348
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6109316 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 6109348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 6114824 - 6114792
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6114824 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 6114792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 6748801 - 6748833
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6748801 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 6748833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 7521401 - 7521369
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7521401 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 7521369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 7848570 - 7848538
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7848570 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 7848538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 8815375 - 8815343
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8815375 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 8815343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 11460193 - 11460161
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11460193 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 11460161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 12896680 - 12896648
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12896680 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 12896648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 17226326 - 17226358
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17226326 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 17226358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 17604969 - 17604921
Alignment:
Q  19 taactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  17604969 taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 17604921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 21408634 - 21408666
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21408634 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 21408666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 21727688 - 21727656
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21727688 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 21727656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 26152349 - 26152381
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26152349 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 26152381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 26158384 - 26158416
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26158384 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 26158416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 27728234 - 27728202
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27728234 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 27728202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 47461737 - 47461705
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47461737 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 47461705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 96)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 27545753 - 27545927
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  27545753 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactccta 27545852  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27545853 taagcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 27545927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26043144 - 26042970
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  26043144 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaatacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttaacaactccta 26043045  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26043044 taggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 26042970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2823805 - 2823631
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  2823805 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataattgggtgtatgttagcaactccta 2823706  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2823705 tagacatttgctaggatacatccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 2823631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 10616284 - 10616458
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  10616284 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatatacattaaggtgaatattgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 10616383  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10616384 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaaatagttaa 10616458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 34102993 - 34103167
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  34102993 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttcta 34103092  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  34103093 taggcttttgctatgatacatccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaaatagttaa 34103167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 32069015 - 32069179
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  32069015 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaataaaccttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 32069114  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaa 172  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32069115 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaa 32069179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 1201662 - 1201836
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  1201662 tagcaaagatataactaaaaagttgtaaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 1201761  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  1201762 taggcatttgctaggatacacccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaagtagttaa 1201836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 3369713 - 3369878
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3369713 atatagctaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 3369812  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3369813 tgctaggatacacccactta-tttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 3369878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13269430 - 13269263
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  13269430 atataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataaacat 13269331  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13269330 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 13269263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 30207168 - 30207334
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  30207168 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccatctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 30207267  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  30207268 tgctagaatacacccacttattttttaaagagtgtgttttagcaaattataattaaaaagtagttaa 30207334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 173
Target Start/End: Original strand, 36899736 - 36899897
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacac--cttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  36899736 agatataactaaaaagttgttaaatacacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactcctatacg 36899835  T
Q  112 catttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaa 173  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36899836 catttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaa 36899897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 10776976 - 10777140
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10776976 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataagcat 10777075  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10777076 ttgctaagatacatccacttatttttt---aggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 10777140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13468499 - 13468330
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13468499 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggc 13468400  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13468399 atttgctataatacacccacttattttttagaaggtgtgctttagcaagttataactaaaaagtagttaa 13468330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 30633260 - 30633094
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  30633260 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtttgttagcaacttctacatgcatt 30633161  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30633160 tgctagaatacacccatttaatttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 30633094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 25123377 - 25123545
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  |||||  ||    
T  25123377 agatataactaaaaaattgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataaatggttgtatgttagcaacgcctatagaca 25123476  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25123477 tttgctagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaa 25123545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35550789 - 35550621
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  35550789 agatataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacactttctaaaatataagtgggtgtatattagcaactcctataggca 35550690  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35550689 tttgctaggatacactcacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 35550621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 9484116 - 9483949
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9484116 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataagcat 9484017  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| || |||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9484016 ttgttaagatatacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaaatagttaa 9483949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 184099 - 184274
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||    
T  184099 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaacccata 184198  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  184199 tagacatttgctaggatacacccacttatttttttagaatgtgtgttttaataagttataactaaaaagtagttaa 184274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 5946982 - 5946816
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  5946982 atataactaaaaagttgttaaataaaccttaaggtgaatgttgttgaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatcggcat 5946883  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5946882 ttgctaggataca-ccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 5946816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8258525 - 8258351
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  8258525 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacattccttataaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 8258426  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  8258425 taggcatttgctagaatacacccacttattttttagaagaagtgttttagcaaattataaccaaaaagtagttaa 8258351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Original strand, 13290504 - 13290663
Alignment:
Q  23 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctagg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||  || | ||||||| |||     
T  13290504 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacagacattctaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcttacatgcatttgttaga 13290603  T
Q  123 atacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13290604 atacatccacttaatttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 13290663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 32487123 - 32486956
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32487123 atataactaaaaagttgttaaatacatcttaagataaatcttggtaaaacacacctttaaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 32487024  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32487023 ttgctaggatacacccacttattttttagaaagtgtattttagcaagttataactaaaaagtagttaa 32486956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Original strand, 26630022 - 26630171
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  26630022 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 26630121  T
Q  108 taagcattt-gctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgtttta 156  Q
    ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||    
T  26630122 tagacatttagctaggatacacccacttatttttttgaagatgtgtttta 26630171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45299784 - 45299620
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| |||    
T  45299784 agatataactaaaa-gttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgctagcaactcttataggca 45299686  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagt 179  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||    
T  45299685 tttgctaggatacacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaaattataattaaaaaatagt 45299620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23544990 - 23544832
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |    
T  23544990 agatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagac 23544891  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaa 171  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23544890 atttgttagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagttataactaa 23544832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 25127870 - 25128038
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa--taagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |  ||    
T  25127870 atataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacaaaccttctaaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctacagaca 25127969  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||| ||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25127970 tttgctagaatactctcacttaatttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 25128038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 9413809 - 9413969
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  9413809 atataactaaaaaattgttaaatacatcttaagatgaatgttgctaaaactcaccttctaacaaataagtggatgtatgttagcaactcctatagacatt 9413908  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagt 176  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  9413909 tgctagaatacatctacttattttttaaaaggtatgttttagcaagttataattaaaaagt 9413969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29125883 - 29125739
Alignment:
Q  38 tacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttatt 137  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29125883 tacaccttaaggtgaatgttactaaaacacaccttctaagaaataagtgggtgtatcttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacctatt 29125784  T
Q  138 ttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29125783 ttttggaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 29125739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26868127 - 26867952
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttc-taaaaaataagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| ||    
T  26868127 tagcaaagataaaactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgccaaaacacaccttcttaaaaattaagtgcgtgtatgttagcaactcct 26868028  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| |||||| |||  | ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26868027 ataggcatttactataacacacccacttattttctagaaggtgtgttttagcaagttatatctaaaaagtagttaa 26867952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 39922478 - 39922355
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  39922478 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacacctcaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgagtgtatgttagcaactccta 39922379  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatcca 131  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  39922378 taggcatttgctaggatacatcca 39922355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 137
Target Start/End: Original strand, 17691216 - 17691337
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  17691216 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttctatagacatt 17691315  T
Q  116 tgctaggatacatccacttatt 137  Q
    || ||  ||||| |||||||||    
T  17691316 tgttataatacacccacttatt 17691337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 35067000 - 35067159
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||| || || | |    
T  35067000 atataattaaaaagttgttaattacaccttaagataaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctttaggta 35067099  T
Q  114 tttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaa 172  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35067100 tttgctagaatacgcccacttatttttttagaaggtgtgctttagcaagttataactaaa 35067159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39934590 - 39934430
Alignment:
Q  23 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacac-cttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctag 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |  ||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  39934590 taaaaagttgttaaatataccttaatgtgaatgttgctaaaacactcatttaaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctacaggcatttgctag 39934491  T
Q  122 gatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
     ||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  39934490 aatacaccaacttattttttagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaggtagttaa 39934430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 126
Target Start/End: Original strand, 25123652 - 25123770
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  25123652 tagcatagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttaacaactctta 25123751  T
Q  108 taagcatttgctaggatac 126  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  25123752 taaacatttgctagaatac 25123770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 1783003 - 1783170
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  1783003 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 1783102  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  1783103 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtgttttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 1783170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 7090028 - 7089938
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttc-taaaaaataagcgggtgtatgttagcaact 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  7090028 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgtgtgtatgttaacaact 7089938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 90
Target Start/End: Original strand, 42556675 - 42556757
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtg 90  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42556675 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttttaaaaaataagtgggtg 42556757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 1282001 - 1281913
Alignment:
Q  94 gttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1282001 gttagcaacttctataggcatttggtagaatacatccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaatgtagttaa 1281913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19971627 - 19971483
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  || ||| | ||||| |||||    
T  19971627 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctaacaaatcctataggcatt 19971528  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  19971527 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 19971483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 9483650 - 9483817
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  9483650 tataactaaaaagttaataaatagacattaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 9483749  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  9483750 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 9483817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 31071555 - 31071698
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcattt 116  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||||    
T  31071555 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgtcgctataacacaccttctaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcattt 31071654  T
Q  117 gctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||    
T  31071655 gctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaa 31071698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 14826487 - 14826361
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||||| |  |||||| | |||||||||||    
T  14826487 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtaggtgtgttctagcaaatcctataagcatt 14826388  T
Q  116 tgctaggatacatccacttatttttta 142  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14826387 tgctagaatacacccacttatttttta 14826361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 21021186 - 21021330
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |  || ||| | ||||| |||||    
T  21021186 tataaataaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctaacaaatcctataggcatt 21021285  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  21021286 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 21021330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 21442129 - 21442296
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa--taagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  21442129 tataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 21442228  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  21442229 ttgctagaataca-ccacttgttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 21442296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 159
Target Start/End: Original strand, 30577869 - 30578013
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||| | |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  30577869 tataactgaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataggtgggtgtgttctagcaaattctataggcat 30577968  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagca 159  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || | || ||||||||    
T  30577969 ttgctaggatacacccgcttattttttagaatgagtattttagca 30578013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 23054003 - 23053923
Alignment:
Q  23 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  23054003 taaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacacgcattctaaaatataagtaggtgtatgttagcaact 23053923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 45299639 - 45299743
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactac-tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||| | | |||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45299639 ttgctaaaacacaccttcaaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctataag-agttgctagcatacacccacttattttttagaaggtgtgttt 45299737  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  45299738 tagcaa 45299743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44874271 - 44874163
Alignment:
Q  74 taaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaa 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |  || ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| | ||| |||| |||||||    
T  44874271 taaaaaataagtgggtgtatgttaacaactcctacagacaattgctagaatacacccacttattttttagaaagtgtgtttcaccaacttataactaaaa 44874172  T
Q  174 agtagttaa 182  Q
    |||||||||    
T  44874171 agtagttaa 44874163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 178
Target Start/End: Original strand, 17883984 - 17884102
Alignment:
Q  60 taaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagca 159  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| | | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||    
T  17883984 taaaatacaccttctaaaacataagtggatgtaagttagcaactcccacaagcatttgttaaaatacatccacttattttttagaatgagtgttttaaca 17884083  T
Q  160 agttatgactaaaaagtag 178  Q
     || || ||||||||||||    
T  17884084 cgtcataactaaaaagtag 17884102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 34969996 - 34969926
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataag 84  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  34969996 agatataaccaaaaagttattaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacattgtaaaaaataag 34969926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 41942860 - 41943024
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcattt 116  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || |  |||||| | ||||| ||| ||    
T  41942860 tataactaaaaagttaataaatacaccctaaggtgtatcttgctataacacaccttctaaaaaacaagtggg-gtgttctagcaaatcctataggca-tt 41942957  T
Q  117 gctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  ||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  41942958 gctagaatacacccacttattttttaggaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 41943024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5642706 - 5642590
Alignment:
Q  19 taactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaa-aataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttg 117  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||     |||||| | ||||| |||||||    
T  5642706 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaataacaagtgggtg-----tagcaaatcctataggcatttg 5642612  T
Q  118 ctaggatacatccacttatttt 139  Q
    |||| ||||| |||||| ||||    
T  5642611 ctagaatacacccacttttttt 5642590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5644647 - 5644531
Alignment:
Q  19 taactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaa-aataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttg 117  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||     |||||| | ||||| |||||||    
T  5644647 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaataacaagtgggtg-----tagcaaatcctataggcatttg 5644553  T
Q  118 ctaggatacatccacttatttt 139  Q
    |||| ||||| |||||| ||||    
T  5644552 ctagaatacacccacttttttt 5644531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10616436 - 10616332
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10616436 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttt 10616338  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  10616337 tagcaa 10616332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27545905 - 27545801
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgtttt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | ||   || | ||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27545905 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcttataggagttgctaacatacacccacttatattttagaaggtgtgtttt 27545806  T
Q  156 agcaa 160  Q
    |||||    
T  27545805 agcaa 27545801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 4018732 - 4018669
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4018732 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 4018669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23161401 - 23161348
Alignment:
Q  129 ccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23161401 ccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 23161348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 32069167 - 32069063
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  32069167 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttattttttagaaagtgtgttt 32069069  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  32069068 tagcaa 32069063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36899884 - 36899780
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactac-tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | | ||| || | ||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  36899884 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcgtat-aggagttgctaacatacacccacttatattttagaaggtgtgttt 36899786  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  36899785 tagcaa 36899780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 42556758 - 42556822
Alignment:
Q  111 gcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaag 175  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42556758 gcatttgctaggatacactcacttatttttttgaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaag 42556822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 3154266 - 3154203
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3154266 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaa 3154203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Original strand, 14819308 - 14819371
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14819308 tataactaaaaagttaataaacacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 14819371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 92
Target Start/End: Original strand, 18804323 - 18804398
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgta 92  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  18804323 tataattaaaaagttgataaatacaccttgaggtgtatgttgctataagacaccttctaaaaaataaatgggtgta 18804398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 13468352 - 13468457
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaa-aaggtgtgtt 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13468352 ttgctaaagcacaccttctaaaaaataagtgggtgtattatagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttattttttaagaaggtgtgtt 13468450  T
Q  154 ttagcaa 160  Q
    |||||||    
T  13468451 ttagcaa 13468457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1201810 - 1201710
Alignment:
Q  60 taaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactac-tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagc 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| | | |||| | | ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1201810 taaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagc 1201712  T
Q  159 aa 160  Q
    ||    
T  1201711 aa 1201710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 13269285 - 13269390
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaa-aaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |   || | ||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  13269285 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatgtttataggagttgctaacatacacccacttattttttaagaatgtgtgttt 13269384  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  13269385 tagcaa 13269390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23053901 - 23053848
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  23053901 agatataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtatagcttgctaaaacac 23053848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1775592 - 1775529
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1775592 tataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcttaaaaa 1775529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 2823650 - 2823600
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  2823650 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtatagcttgctaaaacac 2823600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21442466 - 21442400
Alignment:
Q  96 tagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  21442466 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 21442400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 75
Target Start/End: Original strand, 25280997 - 25281055
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta 75  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  25280997 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttcta 25281055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Original strand, 30400544 - 30400665
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcattt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||| |   || |||||| |||||  |||||| ||||||| || | ||| | ||||    
T  30400544 tataactaaaaagtagttaaatacaccttgatgtacatgttgctaaaata---ctcctaaaagataagtaggtgtaagttagcagctccaataggaattt 30400640  T
Q  117 gctaggatacatccacttatttttt 141  Q
    ||||| ||| |  ||||||||||||    
T  30400641 gctagaataaactcacttatttttt 30400665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 26042992 - 26043096
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  26042992 ttgctaaaacacaccttttaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgttaacatacacccacttattttttagaaggtgtattt 26043090  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  26043091 tagcaa 26043096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 29377933 - 29377880
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  29377933 agatataactgaaaagttgttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacac 29377880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 7977297 - 7977246
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  7977297 atataactaaaaagttattaaatatactttaaggtgaatgtggctaaaacac 7977246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 160
Target Start/End: Original strand, 23544846 - 23544948
Alignment:
Q  59 ctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaa-aaggtgtgtttta 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||| |  |||| || | ||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23544846 ctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtattctaacaaatgtctat-aggagttgctaacatacacccacttattttttaagaatgtgtgtttta 23544944  T
Q  157 gcaa 160  Q
    ||||    
T  23544945 gcaa 23544948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 42556754 - 42556723
Alignment:
Q  129 ccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42556754 ccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 42556723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 184255 - 184305
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  184255 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 184305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1783147 - 1783042
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccactt-attttttaaaaggtgtgtt 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || ||||||||| | ||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  1783147 ttgctaaaacactccttctaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatgcctat-aggatttgctagaacacacccacttgtttttttagaaggtgtgtt 1783049  T
Q  154 ttagcaa 160  Q
     ||||||    
T  1783048 atagcaa 1783042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21352368 - 21352262
Alignment:
Q  76 aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaag 175  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||||| || ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||| | || | ||||||     
T  21352368 aaaaaaaagtgggtatacgttagcaacttctgtaagcatatgctataatacacccacttattttttagaaggggtattttaacaaatgataattaaaaaa 21352269  T
Q  176 tagttaa 182  Q
    |||||||    
T  21352268 tagttaa 21352262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 26042989 - 26042939
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  26042989 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 26042939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 27545908 - 27545958
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  27545908 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagattgctaaaacac 27545958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 29125758 - 29125708
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  29125758 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 29125708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 35550640 - 35550590
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  35550640 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 35550590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 184184 - 184147
Alignment:
Q  123 atacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  184184 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 184147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Original strand, 1201817 - 1201850
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1201817 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggt 1201850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 1281935 - 1281972
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1281935 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtggatgtat 1281972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 9483971 - 9484076
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| | ||   || | ||||||  ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||    
T  9483971 ttgctaaaacacatcttctaaaaaataagtgggtatatcttaacaaatgcttataggagttgctaacatacacccacttatttttttagaaagtgtgttt 9484070  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  9484071 tagcaa 9484076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17691293 - 17691256
Alignment:
Q  123 atacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17691293 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 17691256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26630107 - 26630070
Alignment:
Q  123 atacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26630107 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 26630070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 42556484 - 42556533
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||||||    
T  42556484 ataactaaaaagtggttaaatacatcttaaggtgtatcttgctaaaacac 42556533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 3154154 - 3154122
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3154154 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 3154122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 9483799 - 9483831
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9483799 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 9483831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 14826338 - 14826306
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14826338 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 14826306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 21442278 - 21442310
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21442278 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 21442310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 29126188 - 29126156
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatac 40  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29126188 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatac 29126156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 90)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 939100 - 938926
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  939100 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaagtaagtgggtgtatgttagcaactccta 939001  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  939000 taggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 938926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 28912287 - 28912113
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  28912287 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 28912188  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28912187 tgggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 28912113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 38367847 - 38368021
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||    
T  38367847 tagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatcttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttgacaactccta 38367946  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38367947 taggcatttgctagaatacagccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 38368021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25818690 - 25818515
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  25818690 tagcaaagatataactaaaaagttgtttaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 25818591  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25818590 ataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagcagttaa 25818515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 41407535 - 41407373
Alignment:
Q  20 aactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgct 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41407535 aactaaaaagttgttatatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgct 41407436  T
Q  120 aggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41407435 agaatacacccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 41407373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 18352312 - 18352481
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18352312 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggc 18352411  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18352412 atttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 18352481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 9401647 - 9401821
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  9401647 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtagctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactccta 9401746  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  9401747 taggcatttgctagaatacacccacttattttttagatggtgtgttttagcatgttataattaaaaagtagttaa 9401821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11766326 - 11766152
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||    
T  11766326 tagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtggacgtatgttagcaactctta 11766227  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11766226 tatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 11766152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 454301 - 454135
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  454301 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 454202  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  454201 tgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtattttagcaagttttaactaaaaagtagttaa 454135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19069595 - 19069427
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||   |    
T  19069595 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtttatgttagcaactcctatagcta 19069496  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  19069495 tttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataattaaaaactagttaa 19069427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 15957205 - 15957379
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  15957205 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaacgttgctaaaacacaccttct-aaaaataagtgggtgtatgttaacaactccta 15957303  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15957304 tagacatttgctaggatacaccaacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 15957379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 2509312 - 2509485
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  2509312 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaagaataagtgggtgtatgttaacaactccta 2509411  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2509412 tatgcatttgctagaatacacccactta-tttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtggttaa 2509485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2936847 - 2936671
Alignment:
Q  7 gtagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa--taagcgggtgtatgttagcaacta 104  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||     
T  2936847 gtagcaaatatataactaaaatgttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaaaataagtgg-tgtatgttagcaactc 2936749  T
Q  105 ctataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2936748 ctattggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 2936671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2362955 - 2362783
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  2362955 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcct 2362856  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2362855 atagacatttgctaggatacacccacttatttttt---aggtgtgttttagcaagttatcactaaaaagtagttaa 2362783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23740244 - 23740069
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  23740244 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatattgttaaaacactccttctaaaaaataagtgtgtgtatgttagcaactccta 23740145  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttatt-ttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  23740144 taggcatttgttagaatacacctacttatttttttagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaagtggttaa 23740069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 38796814 - 38796981
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  38796814 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaagcattcattctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 38796913  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaa 174  Q
    |||  |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  38796914 atagacatttgctagaatacacccgcttattttttaaaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaa 38796981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 2633883 - 2634055
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta-aaaaataagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2633883 tagcatagatataacgaaaaagttgttaaatacaccttacgatgaatattgctaaaacacacattctagaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 2633982  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  2633983 ataggcatttgctagaatacacctacttatttttt---aggtgtgttttagcaagttataaccaaaaagtagttaa 2634055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6559559 - 6559388
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  6559559 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct---aaaaaataagtgggtgtatgttaacaactcata 6559463  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||  ||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6559462 taggcatttgctataatacacccgcttattttatagaatgtatgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 6559388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 6736504 - 6736676
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6736504 tagcaaagatataactaaaaaattgttaactacaccttaaggtgaatattgctaaaacactcct---aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 6736600  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  6736601 taggcatttgctagaatacacctacttatttttttagaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaagtagttaa 6736676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Original strand, 27168254 - 27168418
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcattt 116  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||| |  |||| || | ||    
T  27168254 ataattaaaaagttcttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctaccaaatgcctat-aggagtt 27168352  T
Q  117 gctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27168353 gctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 27168418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 41037558 - 41037389
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||| ||    
T  41037558 agatataacgaaaaatttgttatatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaataagtgagtgtaagttagcaactcctataggc 41037459  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41037458 atttgctaaaatacacccagttatatttaagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 41037389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27168396 - 27168292
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgtttt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27168396 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttggtaggatacacccacttattttttagaaggtgtgtttt 27168297  T
Q  156 agcaa 160  Q
    |||||    
T  27168296 agcaa 27168292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11327795 - 11327627
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  11327795 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 11327696  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  11327695 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 11327627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12080897 - 12080730
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  12080897 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 12080798  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  12080797 tgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 12080730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 28605639 - 28605473
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcattt 116  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| | ||||| | ||||    
T  28605639 tataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacataccttctaaaaaacaagtgggtgtgttttagcaaattctataggtattt 28605540  T
Q  117 gctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  28605539 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 28605473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 38876166 - 38876334
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa--taagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  38876166 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 38876265  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  38876266 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 38876334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20517119 - 20516974
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa--aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  20517119 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 20517020  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  20517019 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 20516974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 45225592 - 45225424
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  45225592 tataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaattctataggcat 45225493  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtt-atgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  45225492 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagttaataactaaaaagtggttaa 45225424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Original strand, 37138934 - 37139081
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |  || ||| | |||||  |||    
T  37138934 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaaataagtgggtgtgttctaacaaatcctatagacat 37139033  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  37139034 ttgctaaaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 37139081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15230263 - 15230096
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaa-aaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| ||| ||| |||||| |  |||||| | |||||  ||||    
T  15230263 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaacaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatt 15230164  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  15230163 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 15230096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 32853055 - 32852888
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| | |||||  ||||    
T  32853055 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcctatagacatt 32852956  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  32852955 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 32852888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 48454543 - 48454711
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaa--aaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||| ||| |||||| |  |||||| | |||||  |||    
T  48454543 tataactaaaaagataataaatacaccttaaggtatatgttgatataacacaccttctaaaataaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacat 48454642  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatg-actaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||| | | |||||||||| |||||    
T  48454643 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaagaactaaaaagtggttaa 48454711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27812140 - 27811973
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| | || || |||||    
T  27812140 tataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctgtaggcatt 27812041  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  27812040 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtagttaa 27811973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24720459 - 24720315
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | ||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| |||  |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  24720459 tataactaaaaagttaataaatacaccattaggtgtatgttgctataacgcaccttctaaaaaaataaatgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 24720360  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  24720359 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 24720315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 14718993 - 14719160
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||  ||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  14718993 tataactaaaattttaataaatacatcttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 14719092  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||    
T  14719093 tgctggaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtggttaa 14719160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14778117 - 14777958
Alignment:
Q  25 aaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaa-aaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctagga 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| ||| ||| |||||| |  |||||| | |||||  |||||||||| |    
T  14778117 aaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaacaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaa 14778018  T
Q  124 tacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  14778017 tacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 14777958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14770273 - 14770127
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| | |||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  14770273 tataactaaaaagttaataagtacaccttaaggtgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaacaagtgagtgtgttatagcaaatcctataggcatt 14770174  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||    
T  14770173 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttcgcaagt 14770127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15220724 - 15220578
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| | |||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  15220724 tataactaaaaagttaataagtacaccttaaggtgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaacaagtgagtgtgttatagcaaatcctataggcatt 15220625  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||    
T  15220624 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttcgcaagt 15220578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 18123080 - 18123248
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||   ||||  ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  18123080 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctgacaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 18123179  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||| ||||  || |||||||||| |||||    
T  18123180 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaa 18123248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 11766174 - 11766278
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactac-tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | | |||||| | ||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  11766174 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcatataag-agttgctaacatacgtccacttattttttagaatgtgtgttt 11766272  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  11766273 tagcaa 11766278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18829896 - 18829775
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-----taagcgggtgtatgttagcaactactataag 111  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||     |||| |||||  |  |||||| | |||||||    
T  18829896 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaaaaataagtgggtgcgttctagcaaattctataag 18829797  T
Q  112 catttgctaggatacatccact 133  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  18829796 catttgctagaacacatccact 18829775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 26380074 - 26380242
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  ||||| ||| |  ||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  26380074 tataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtatatgtttctataacacaccttctaacaaaaacaagtgaatgtgttctagcaaatcctataggcat 26380173  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| || | || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  26380174 ttgctaggatacacccgcttagtttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 26380242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 111
Target Start/End: Original strand, 3512507 - 3512595
Alignment:
Q  23 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataag 111  Q
    ||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||    
T  3512507 taaaaagttattaaatacatatgaaggtgaatgttgctaaaacataccttttaaaaaataagtgggtgtatgttagtaattcctataag 3512595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4655248 - 4655076
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaa----cacaccttctaaaaaat--aagcgggtgtatgttagcaactactataa 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||    ||||||||||| ||||   ||| |||||| |  |||||| | ||||||    
T  4655248 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataagtaacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataa 4655149  T
Q  111 gcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  4655148 gcatttgctaaaatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 4655076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Original strand, 7437798 - 7437965
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaata--agcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||| |  || |||||| |  ||| || | ||||| |||||    
T  7437798 ataactaaaaagttaataaatacacattaaggtgtatgttgctataacacaccttccaaaaaaaacaagtgggtgtgttatagtaaatcctataggcatt 7437897  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||| || | || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  7437898 tgctagaatacacccaattattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 7437965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22479404 - 22479260
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||| ||||||  ||| |||||| |  || ||| | |||||  ||||    
T  22479404 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataggacaccttcgaaaaaaacaagtgggtgtgttctatcaaatcctatatacatt 22479305  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  22479304 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 22479260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 25818537 - 25818642
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaa-aaggtgtgtt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25818537 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttattttttaagaaggtgtgtt 25818635  T
Q  154 ttagcaa 160  Q
    |||||||    
T  25818636 ttagcaa 25818642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32577719 - 32577614
Alignment:
Q  39 acaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttatt 137  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||| |||||| |  |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32577719 acaccttaaggtgtatgttgctataacacgccttccaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataagcatttgctagaatacacccacttatt 32577620  T
Q  138 ttttaa 143  Q
    ||||||    
T  32577619 ttttaa 32577614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 28912135 - 28912239
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgtttt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |    || | ||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  28912135 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcccataggagttgctaacatacacccacttattttttagaatgtgtgtttt 28912234  T
Q  156 agcaa 160  Q
    |||||    
T  28912235 agcaa 28912239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 8047972 - 8048112
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||||    |||| |  |||||| | ||| |  ||||    
T  8047972 tataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaaaaataa----gtgtgttatagcaaatcctacagacatt 8048067  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  8048068 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 8048112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 27597231 - 27597168
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27597231 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 27597168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 45225378 - 45225291
Alignment:
Q  96 tagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtt-atgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  45225378 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagttaataactaaaaagtggttaa 45225291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18352459 - 18352354
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaa-aaggtgtgtt 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18352459 ttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttattttttaagaaggtgtgtt 18352361  T
Q  154 ttagcaa 160  Q
    |||||||    
T  18352360 ttagcaa 18352354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 938948 - 939052
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  938948 ttgctaaaacacaccttttaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttactttttagaaggtgtgttt 939046  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  939047 tagcaa 939052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 19069449 - 19069553
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaacta-ctataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| || |||| || | ||||||  ||| | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  19069449 ttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatagctat-aggagttgctaacataaacccacttatattttagaaggtgtgttt 19069547  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  19069548 tagcaa 19069553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 34986724 - 34986556
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaa--aataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||| |||||  |||||| |  ||| |  |||||| |  |||| ||||    
T  34986724 tataattaaaaagataataaatacaccttaaggtgtatgttgatataacacaccttataaaataaataagtgaatgtgttctagcaaatcttataggcat 34986625  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatg-actaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| || | || ||||||||||| | | |||||||||| |||||    
T  34986624 ttgctagaatacacccacttattttttagaaagagtattttagcaagtgaagaactaaaaagtggttaa 34986556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 41407395 - 41407499
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  41407395 ttgctaaaacacactttctaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttatattttagaaggtgtgttt 41407493  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  41407494 tagcaa 41407499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 43712084 - 43711943
Alignment:
Q  44 ttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccactta-tttttt 141  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| |||||||  |||||||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  43712084 ttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatactatatacatttgctagaatatacccacttattttttt 43711985  T
Q  142 aaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    | |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  43711984 agaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 43711943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 179
Target Start/End: Original strand, 3512711 - 3512766
Alignment:
Q  124 tacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagt 179  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3512711 tacacccacttattttttagaagatgtgttttagtaagttataactaaaaagtagt 3512766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 32577768 - 32577713
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacacctt 72  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  32577768 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctt 32577713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 33889955 - 33889892
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33889955 tataactaaaaagttaataaatacacattaaggtgtatgttgctataacgcaccttctaaaaaa 33889892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9401798 - 9401697
Alignment:
Q  57 tgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgtttt 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9401798 tgctaaaacacaccatctaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttatattttagaaggtgtgtttt 9401700  T
Q  156 agc 158  Q
    |||    
T  9401699 agc 9401697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 2936693 - 2936730
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2936693 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 2936730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 182
Target Start/End: Original strand, 7835347 - 7835390
Alignment:
Q  139 tttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7835347 tttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaaatagttaa 7835390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 18199771 - 18199708
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  18199771 tataactacaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaacttctataaaa 18199708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 938945 - 938895
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  938945 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 938895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 2362798 - 2362752
Alignment:
Q  21 actaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  2362798 actaaaaagtagttaaatacaccttaaggtataacttgctaaaacac 2362752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 2936690 - 2936640
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  2936690 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacac 2936640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 6559407 - 6559357
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  6559407 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 6559357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 17317440 - 17317398
Alignment:
Q  34 taaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  17317440 taaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaa 17317398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 27168399 - 27168449
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  27168399 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 27168449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38367932 - 38367894
Alignment:
Q  123 atacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaag 161  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38367932 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaag 38367894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 38368002 - 38368052
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  38368002 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacac 38368052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 48193316 - 48193211
Alignment:
Q  53 atgttgctaaaacacaccttctaa--aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgt 150  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  48193316 atgttgctataacacatcttctaataaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagt 48193217  T
Q  151 gtttta 156  Q
     |||||    
T  48193216 atttta 48193211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 454157 - 454194
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  454157 ttgctaaaatacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 454194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3512577 - 3512540
Alignment:
Q  123 atacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3512577 atacacccacttattttttaaaaggtatgttttagcaa 3512540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 182
Target Start/End: Original strand, 9401606 - 9401675
Alignment:
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagc-aagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||    
T  9401606 tttgctaggatacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaa 9401675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 11327645 - 11327612
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggta 51  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11327645 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggta 11327612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 28605496 - 28605600
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaacta-ctataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |||||| || |||| || ||||||||  | ||| |||||| ||||||| ||||| ||||     
T  28605496 ttgctaaaatactccttctaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatacctat-agaatttgctaaaacacacccacttgttttttagaaggtatgtta 28605594  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  28605595 tagcaa 28605600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 37139079 - 37139034
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaa 101  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37139079 ttgctaaaatactccttctaaaaaataagtgggtgtattttagcaa 37139034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 38796963 - 38796930
Alignment:
Q  60 taaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38796963 taaaacacaccttttaaaaaataagcgggtgtat 38796930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 182
Target Start/End: Original strand, 1325336 - 1325396
Alignment:
Q  123 atacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  1325336 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtagttaa 1325396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 18199617 - 18199585
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18199617 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 18199585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 20516969 - 20516937
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20516969 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 20516937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 24720310 - 24720278
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24720310 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 24720278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 27597069 - 27597037
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27597069 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 27597037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 27811991 - 27811959
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27811991 ataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggt 27811959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 28912132 - 28912100
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagg 49  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28912132 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaagg 28912100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 45225309 - 45225277
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45225309 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 45225277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 45225442 - 45225410
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45225442 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 45225410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 91)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14369956 - 14369782
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  14369956 tagcaaagatataactaaaaagttgttaactacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 14369857  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14369856 taggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 14369782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Original strand, 25912042 - 25912209
Alignment:
Q  15 gatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25912042 gatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaaggttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 25912141  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25912142 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtaattaa 25912209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4083927 - 4083753
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  4083927 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtcgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtacgttagcaactccta 4083828  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4083827 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaa 4083753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4738121 - 4737947
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  4738121 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactcata 4738022  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4738021 tgggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 4737947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 31752304 - 31752131
Alignment:
Q  9 agcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactat 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  31752304 agcaaagatataactaaaaagttgttaaatacacattaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtaggtgtatgttagcaactcctat 31752205  T
Q  109 aagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31752204 aggcatttgctagaatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 31752131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7944476 - 7944308
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  7944476 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactccta 7944378  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagta 177  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7944377 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagta 7944308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 173
Target Start/End: Original strand, 17232909 - 17233074
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||    
T  17232909 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaagcacaccttctaaaaaataaatgaatgtatgttagcaactccta 17233008  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaa 173  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17233009 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaaattataactaaaa 17233074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 22701743 - 22701910
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  22701743 agatataactaaaaagttgtgaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtacgttagcaactcttataagca 22701842  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22701843 tttgctagaatacacccactta-tttttggaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 22701910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 2695097 - 2695262
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2695097 atataactaaaatgttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 2695196  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2695197 tgctaggata-acccacttacattttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 2695262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6436612 - 6436438
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  6436612 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacaaacattctaaaaaataagtggttgtatgttagcaactccta 6436513  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || |||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6436512 taggcatttgctaggattcacctacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttacaactaaaaagtagttaa 6436438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33696236 - 33696068
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  33696236 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttatggtgaatgtagctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactcctataggca 33696137  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33696136 tttgctagaatacacccacttattttttagaagttatgttttagcatgttataactaaaaagtagttaa 33696068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 6260992 - 6261158
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  6260992 atataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 6261091  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  6261092 tgctaggatatacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataattaaaaaatagttaa 6261158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17421875 - 17421709
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||    
T  17421875 atataactaaaaagttgtttaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaatactcattctaaaaaataagtgggtgtatgttagaaactcctatagacatt 17421776  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17421775 tgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 17421709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2528949 - 2528782
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  2528949 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 2528850  T
Q  116 tgctaggatacatccacttatt-ttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2528849 tgctagaatacatccacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagttataactgaaaagtagttaa 2528782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 182
Target Start/End: Original strand, 31240268 - 31240411
Alignment:
Q  39 acaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattt 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31240268 acaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactcttataggcatttgctaggatacacccacttattt 31240367  T
Q  139 tttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31240368 tttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 31240411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39038703 - 39038534
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  39038703 agatttaactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaaataagtgggtctatgttagcaactcctatatgc 39038604  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  39038603 atttgctaggatatacccacttattttttagaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaagtagttaa 39038534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9124893 - 9124725
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttc-taaaaaataagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  9124893 tagcaaagatataactaaaaatttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttaacaacttct 9124794  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaa 174  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9124793 ataggcatttgctagaatacatccacttatttttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaa 9124725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 28747952 - 28747777
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  28747952 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaagcactccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 28747853  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28747852 atagacatttgctagaatacacccacttaatttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaaatagttaa 28747777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 39548835 - 39549007
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  39548835 tagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgataaa-cacaccatcaaaaaaataagtgg-tgtatgttagcaacttcta 39548932  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39548933 tagccatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 39549007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 858079 - 857928
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  858079 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctagaaaataagtgggtgtctgttagcaactccta 857980  T
Q  108 taagca-tttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgttttag 157  Q
    || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  857979 tatgcattttgctagaatacacccacttacttttttaaaaggtgtgttttag 857928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 12910015 - 12910189
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||    
T  12910015 tagcaaagatataattaaaaaattgttaaatacatcttaaggtgaatgttgttaaaacacacattctaaaatataagtgagtgtatgttagcaactccta 12910114  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12910115 taggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtatgttttagcatgttataactaaaaagtagttaa 12910189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10951230 - 10951074
Alignment:
Q  22 ctaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctag 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||     
T  10951230 ctaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtttctaaaacacacattcgaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgatat 10951131  T
Q  122 gatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtag 178  Q
     ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10951130 aatacacctacttattttttataaggtgtgttttagcaagttatatctaaaaagtag 10951074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 178
Target Start/End: Original strand, 22800641 - 22800804
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| |  |||    
T  22800641 atataattaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctacaacactccttttaaaaaaagaagtgggtgtatgttagcaactcctacagacat 22800740  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtag 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  22800741 ttgctagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaagtag 22800804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3039057 - 3038902
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||            |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3039057 agatataactaaaaa-ttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttc------------gggtgtatgttagcaactcctataggca 3038971  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3038970 tttgttaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 3038902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 32736449 - 32736356
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32736449 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaa 32736356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 13711032 - 13711200
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13711032 atataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacattcattctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 13711131  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaa-aaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||   || | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  13711132 ttgctagaatacacccactttttttttttgaatgagtgttttagcaagttataatcaaaaagtagttaa 13711200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33832899 - 33832731
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33832899 atataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaacgtttctaaaacacaccttctaaaaaaataaatgagtgtatgttagcaactcctataggcat 33832800  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttatt-ttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| ||| |  || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33832799 ttgttagaacgcacccacttattgttttggaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtaattaa 33832731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 182
Target Start/End: Original strand, 8410658 - 8410785
Alignment:
Q  55 gttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  8410658 gttgctaaaacacacattctaaaatataagtgagtgtatcctagcaactcctataaacatttgctaggatacatcaacttattttttagaatgtgtgttt 8410757  T
Q  155 tagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8410758 tagcaagttataactaaaaagtagttaa 8410785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 17233273 - 17233439
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||| |||    
T  17233273 agatataactaaaaagttgttaaatatattttaaggtgaacgttgctaaaacaca--ttctaaaaaataaatgtgtgtatgttagcaactcctataggca 17233370  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||| | |||  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  17233371 tttgctagaacacactcacttattttttagaagttgtgttttaccaaattataattaaaaagtagttaa 17233439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 1951434 - 1951601
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaa-aaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||     
T  1951434 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaagaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcata 1951533  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  1951534 tgttagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 1951601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 30687915 - 30688083
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  30687915 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 30688014  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  30688015 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 30688083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11448919 - 11448772
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa--aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||  |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  11448919 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgttataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 11448820  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||    
T  11448819 ttgctaggatacatccacttagtttttagaaggagtattttagcaagt 11448772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26906080 - 26905956
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcattt 116  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||||    
T  26906080 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcattt 26905981  T
Q  117 gctaggatacatccacttatttttt 141  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26905980 gctagaatacagccacttatttttt 26905956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15809154 - 15808989
Alignment:
Q  20 aactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa--aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttg 117  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||||    
T  15809154 aacttaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttg 15809055  T
Q  118 ctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtt-atgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| || || |||||||||| |||||    
T  15809054 ctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaattaataactaaaaagtggttaa 15808989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 89
Target Start/End: Original strand, 11351811 - 11351892
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggt 89  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11351811 tagcaaagatataattaaaaagttattgaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggt 11351892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38952372 - 38952207
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||||||| | |||| |||||||||  ||||||| |||| ||||  | | || |    
T  38952372 agatataactaaaaagttgttaaatacactttaatatgaatgtggctaaaacactcgttctaaaaaaataaatgggtgtaagttaacaacgtccacaaac 38952273  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtag 178  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||| || || ||||||||||||    
T  38952272 atttgctaaaatacacccacttattttttataaggagtgttttggcatgtcataactaaaaagtag 38952207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 3960639 - 3960783
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||| | ||| | |||||    
T  3960639 tataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgctctagcaaatcctacatgcatt 3960738  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  3960739 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 3960783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17605226 - 17605059
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  17605226 tataactaaaaatttaataaatacatcttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 17605127  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||    
T  17605126 tgctggaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtaaataactaaaaagtggttaa 17605059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4736977 - 4736851
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  4736977 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaaaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcctataggcatt 4736878  T
Q  116 tgctaggatacatccacttatttttta 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4736877 tgctagaatacatccacttatttttta 4736851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 37249488 - 37249356
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  37249488 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 37249389  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaagg 147  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  37249388 ttgctagaatacacccatttattttttaaaagg 37249356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Original strand, 29302105 - 29302252
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa--taagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  29302105 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcat 29302204  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| |||| || ||||| |||||    
T  29302205 ttgctagaatacacccgcttattttttagaaggagtattttaacaagt 29302252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 37468719 - 37468608
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||    
T  37468719 tataactaaaaagttgataaatacaccttgagttgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaaatcctataggaatt 37468620  T
Q  116 tgctaggataca 127  Q
    |||||| |||||    
T  37468619 tgctagaataca 37468608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10471175 - 10471017
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||  ||| |||| ||||||| |||||||||| | | || ||    
T  10471175 agatatagctaaaaagttgttaaaaacaccttaaggtgaatattgctaaaacacttattct--aaagtaagtgggtgtaagttagcaactcccacaaaca 10471078  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaa 174  Q
    |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||   ||||||||||| || || ||||||||    
T  10471077 tttgctaaaatacacccacttatgttttagaattagtgttttagcatgtcataactaaaaa 10471017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15294227 - 15294098
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| | || | ||||||||| | ||||| |||| ||||| |||    
T  15294227 tagcaaagacataattaaaaagttgttaaatacactttaagatgaatgttgttaaaacactcattttgaaaaataagtgagtgtacgttaacaactgcta 15294128  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttatt 137  Q
    ||  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  15294127 tagacatttgttaggatacatctacttatt 15294098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 142
Target Start/End: Original strand, 17209894 - 17210003
Alignment:
Q  34 taaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccac 132  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |   ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  17209894 taaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttcaagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccac 17209993  T
Q  133 ttatttttta 142  Q
    ||||||||||    
T  17209994 ttatttttta 17210003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33282441 - 33282274
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||| |  |||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| | | ||| |||||    
T  33282441 tataactaaaaagttaataaatacactttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatccaataggcatt 33282342  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| || || |||||||||||||| || | || |||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  33282341 tgctagaatgcacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtagttaa 33282274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 1921646 - 1921478
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa--aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  || ||| || |||||| |||||||  |||||||| | |||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  1921646 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatattgttataacacatcttctaacaaaaataagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcat 1921547  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  1921546 ttgctcggatacacccacttagtttttaaaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 1921478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25912187 - 25912083
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25912187 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttt 25912089  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  25912088 tagcaa 25912083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31240389 - 31240285
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  ||||||| | ||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  31240389 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctataag-agttgctaacatacacccacttatattttagaaggtgtgttt 31240291  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  31240290 tagcaa 31240285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 17210204 - 17210137
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa 76  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  17210204 tagcaaagatataactaaaaagttgt-aaatacaccttaaggtgaatgttggtaaaacacacattctaa 17210137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33026406 - 33026246
Alignment:
Q  24 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctagg 122  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |   ||||| | ||||| |||||||||||     
T  33026406 aaaaagttaataaatacatcttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttcaagcaaatcctataggcatttgctaga 33026307  T
Q  123 atacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtt-atgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||| | |||||||||||| |||| || ||||||||| || || |||||||||| |||||    
T  33026306 atacaccgacttattttttagaaggagtattttagcaaattaataactaaaaagtggttaa 33026246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 30667586 - 30667725
Alignment:
Q  21 actaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgcta 120  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| |  |||||| | ||||| ||||||||||    
T  30667586 actaaaaagttaataaatacaccataagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaaagtgagtgtgttctagcaaattctataggcatttgcta 30667685  T
Q  121 ggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    | |||||  ||| ||||||||| || | || |||||||||||    
T  30667686 gaataca--cacatattttttagaatgagtattttagcaagt 30667725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6261136 - 6261036
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaacta-ctataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| |  ||||| | | ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6261136 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtatatcctagcaaatgtctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttaaaaggtgtgttt 6261038  T
Q  155 ta 156  Q
    ||    
T  6261037 ta 6261036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 14369804 - 14369908
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14369804 ttgctaaaacacaccttttaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttt 14369902  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  14369903 tagcaa 14369908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37282346 - 37282238
Alignment:
Q  35 aaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccact 133  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||||||||  |||||  ||||    
T  37282346 aaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaaaatacactcact 37282247  T
Q  134 tatttttta 142  Q
    |||||||||    
T  37282246 tatttttta 37282238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Original strand, 17559225 - 17559288
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17559225 tataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 17559288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 7014686 - 7014621
Alignment:
Q  19 taactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataag 84  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  7014686 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaacaaataag 7014621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17233061 - 17232957
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  |||||| || |||||||||| |||||||| ||    
T  17233061 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacattcatttattttttagaaggtgtgctt 17232963  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  17232962 tagcaa 17232957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 31752153 - 31752257
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  31752153 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataaatgggtgtattctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacctacttattttttagaaggtgtgttt 31752251  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  31752252 tagcaa 31752257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 142
Target Start/End: Original strand, 40234162 - 40234215
Alignment:
Q  89 tgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttatttttta 142  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  40234162 tgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttatgtttta 40234215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1807577 - 1807514
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  |||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1807577 tataactaaaaagttaataaatatatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 1807514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 76
Target Start/End: Original strand, 22282213 - 22282272
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa 76  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||    
T  22282213 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgctgctataacacaccttctaa 22282272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 38661337 - 38661242
Alignment:
Q  44 ttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattt 138  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  38661337 ttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattt 38661242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 4151148 - 4151067
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagc 99  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4151148 tataactaaaaaattaataaatacatcttgaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaaaa-aagtgggtgtatgttagc 4151067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 4737969 - 4738073
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |  | ||| | | ||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  4737969 ttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcccatatg-agttgctaacatacacccacttatattttagaaggtgtgttt 4738067  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  4738068 tagcaa 4738073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 17421731 - 17421768
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17421731 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 17421768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 39548985 - 39548948
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39548985 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 39548948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 158
Target Start/End: Original strand, 4083779 - 4083877
Alignment:
Q  60 taaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||   |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4083779 taaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacgtacacccacttatattttagaaggtgtgttttagc 4083877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 157
Target Start/End: Original strand, 33833090 - 33833196
Alignment:
Q  53 atgttgctaaaacacaccttctaa--aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgt 150  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||| |  || ||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||    
T  33833090 atgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctaacaaatcctatatacatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagt 33833189  T
Q  151 gttttag 157  Q
     ||||||    
T  33833190 attttag 33833196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 68
Target Start/End: Original strand, 3189723 - 3189777
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacaca 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||  ||||||||    
T  3189723 agatataactaaaaagttgttaaatacactttgaagtgaatgttgtaaaaacaca 3189777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 4737966 - 4737916
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  4737966 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 4737916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 12910170 - 12910220
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  12910170 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 12910220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 14369801 - 14369751
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  14369801 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 14369751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 1921496 - 1921447
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  1921496 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 1921447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2695174 - 2695137
Alignment:
Q  123 atacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2695174 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 2695137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Original strand, 2695243 - 2695276
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2695243 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggt 2695276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 3038924 - 3038961
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3038924 ttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtat 3038961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 6436460 - 6436564
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  6436460 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtaggtgaatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacaaccacttattttttagaatgtttgttt 6436558  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  6436559 tagcaa 6436564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 7944325 - 7944362
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7944325 ttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtat 7944362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8318155 - 8318059
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactac 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||  |||||| | |||||| | |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||    
T  8318155 tagcaaagatataactaaaaagtggttaaatata-ttttaggtgcatgttgttgaaacactcattctaaaaaataagtgggtgtaatttaacaactac 8318059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 13676280 - 13676329
Alignment:
Q  25 aaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct 74  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  13676280 aaaagttgctaaatacatcttaaggtacatgttgctaaattacaccttct 13676329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 30486200 - 30486151
Alignment:
Q  111 gcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | || |||||||||    
T  30486200 gcatttgctaggatacatccacttagtttttagaatgagtattttagcaa 30486151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 160
Target Start/End: Original strand, 32736364 - 32736401
Alignment:
Q  123 atacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32736364 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 32736401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 33696087 - 33696054
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33696087 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggt 33696054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 1951583 - 1951615
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1951583 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 1951615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 26905934 - 26905902
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26905934 ataactaaaaagttgttaaatacaccctaaggt 26905902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 30486146 - 30486114
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30486146 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 30486114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 30688065 - 30688097
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30688065 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 30688097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31752569 - 31752485
Alignment:
Q  80 ataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtta 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||| | ||| |||||| ||  ||  |||||||||||||||||    
T  31752569 ataagtgggtgtatgttagcaactcttataagcatttgttataatatacccatttatttctttcaatttgtgttttagcaagtta 31752485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 33833204 - 33833236
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33833204 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 33833236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 182
Target Start/End: Original strand, 40234209 - 40234241
Alignment:
Q  150 tgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40234209 tgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 40234241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 114)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 36389456 - 36389624
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  36389456 agatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggca 36389555  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36389556 tttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 36389624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16005769 - 16005594
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  16005769 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacacctcaagctgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 16005670  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16005669 ataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 16005594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 26842989 - 26843163
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  26842989 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacacacattctaataaataagtgggtgtgtgttagcaactccta 26843088  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26843089 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 26843163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 28454909 - 28454735
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  28454909 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaagctgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaaaagtgggtgtatgttagcaactccta 28454810  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  28454809 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaacagtagttaa 28454735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 13157556 - 13157725
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaac---tactataagc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||  |    
T  13157556 atataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactgatcctatagac 13157655  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13157656 atttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 13157725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 6192421 - 6192591
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagg--taaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |    
T  6192421 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggggtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaataagtgggtgtgtgttagcaactcctatatg 6192520  T
Q  112 catttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6192521 catttgctagaatacacccacttatattttagaaggtgtgtttcagcaagttataactaaaaagtagttaa 6192591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 34515126 - 34515296
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataag 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  34515126 agatataactaaaaagttgtaaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacgcatcttcttaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagg 34515225  T
Q  112 catttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34515226 catttgttagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 34515296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 4158116 - 4158265
Alignment:
Q  25 aaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  4158116 aaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcctataagcatttgttaggaa 4158215  T
Q  125 acatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaa 174  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4158216 acacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaggttataactaaaaa 4158265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 16073429 - 16073605
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa--taagcgggtgtatgttagcaactac 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |    
T  16073429 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaaaaaataagtgggtgtttgttagcaactcc 16073528  T
Q  106 tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || | ||||||| || |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16073529 tacaggcatttgttatgatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 16073605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Original strand, 50559248 - 50559412
Alignment:
Q  15 gatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  50559248 gatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataaatagatgtatgttagcaactcctataggcat 50559347  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagt 179  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50559348 ttgttaggatacgcccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagt 50559412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 51432045 - 51431884
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  |    
T  51432045 agatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggttaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttaggaactcctatagac 51431946  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaa 174  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  51431945 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaaattataactaaaaa 51431884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8643197 - 8643026
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  8643197 tagcaaagatataactaaaaagttgttaa---cactttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 8643101  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8643100 tacgcatttgctataatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataaccaaaaagtagttaa 8643026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 24770622 - 24770792
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  24770622 tagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacat-ttaaggggaatgttgctaaaataaaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaaccccta 24770720  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagt 179  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24770721 taggcatttgctaggatacacccacttattcttttgaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagt 24770792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3273537 - 3273363
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  3273537 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaagcactcattctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 3273438  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagtta 181  Q
    ||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  3273437 ataggcatttgttagaatgcacccacttattttttaaaaggtgtgttttagtaagttataactaaaaaatagtta 3273363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13264699 - 13264561
Alignment:
Q  44 ttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaa 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  13264699 ttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcatataggcatttgctaggatacacccacttattttttag 13264600  T
Q  144 aaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13264599 aaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 13264561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 42200049 - 42199883
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||  || | |||||    
T  42200049 atataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtaaatgttgctaaaacacatcttttaaaaaataagtaggtgtatgttagcaactcttacaggcatt 42199950  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| |||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42199949 tgctagaatacacacacttaatttttagaaggtgtattttagcaagttataactaaaaagtagttaa 42199883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 42208917 - 42208751
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||  || | |||||    
T  42208917 atataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtaaatgttgctaaaacacatcttttaaaaaataagtaggtgtatgttagcaactcttacaggcatt 42208818  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| |||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42208817 tgctagaatacacacacttaatttttagaaggtgtattttagcaagttataactaaaaagtagttaa 42208751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10764803 - 10764627
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttc-taaaaaataagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  10764803 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactctt 10764704  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||  ||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  || |||||||||| |||||    
T  10764703 atagacattttctagaatacacccactcattttttagaaggtgtgttatagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 10764627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 32156181 - 32156013
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||    
T  32156181 agatataactaaaaaattgttaaatgcaccttaagatgaatgttgctaaaacaccgtttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctgtatgca 32156082  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  32156081 tttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtgttttagcaagttataaataaaaagtagttaa 32156013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 158405 - 158576
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttc-taaaaaataagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||  || ||||||||||||||| ||    
T  158405 tagcaaagataaaactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaattaaatggatgtatgttagcaactcct 158504  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtag 178  Q
    ||| | ||||||||  || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  158505 ataggaatttgctataattcacccacttattttctagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtag 158576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 182
Target Start/End: Original strand, 463360 - 463478
Alignment:
Q  64 acacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtt 163  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  463360 acacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtt 463459  T
Q  164 atgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||    
T  463460 ataactaaaaagtagttaa 463478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 5491601 - 5491767
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  5491601 atataactaaaaagttgttaaatacatcttaaagtgattgttgctgaaacactacttctaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcctatagacatt 5491700  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    | |||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5491701 tactagaatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 5491767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 14387246 - 14387419
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| || |||    
T  14387246 tagcaaagatataactaaaaagttgttgaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaataaatgggtgcatgttagcagctccta 14387345  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||  ||||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  14387346 tagccatttactagaatacatccattta-tttttagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaaatagttaa 14387419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23413831 - 23413667
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  23413831 atataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaatacaagtgggtgtatgttagcaactcctatgaacatt 23413732  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| || |||| |||||||||| |||||    
T  23413731 tgctagaatacatccacttatttttt--taggtgtgctttaggaatttataactaaaaagtggttaa 23413667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 34306437 - 34306609
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||    
T  34306437 agatataattaaaaagttgctaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacactcattctaaaaaataagtgagtgtatgttagcaactcctataggca 34306536  T
Q  114 tttgctaggatacat----ccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||| |||||     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34306537 tttgctagaatacactcacccacttattttttagaagttgtgctttagcaagttataactaaaaagtagttaa 34306609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41146446 - 41146283
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| | |||  ||||    
T  41146446 atataactaaaaggttgctaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattctaagaaataagtgggcgtatgttaacaactccaatagacatt 41146347  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagt 179  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41146346 tgctaggatatacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagt 41146283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 45818977 - 45818811
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttc-taaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||  |||    
T  45818977 atataactaaaatgttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataag-tggtgtatgttagcaactcatatagacat 45818879  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||    
T  45818878 ttgctataatacacccacttattttttagaagttgtgctttagaaaattataactaaaaagaagttaa 45818811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 28764540 - 28764708
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | |    
T  28764540 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtaagttatcaactccca 28764639  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagt 176  Q
      |||||| | ||  |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  28764640 cgagcattggataaaatacatccacttattttttagaatgattgttttagcaagtcataactaaaaagt 28764708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 28704554 - 28704441
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||    
T  28704554 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattctaaaaaataaatgagtgtatattagcaactccta 28704455  T
Q  108 taagcatttgctag 121  Q
    ||||||||||||||    
T  28704454 taagcatttgctag 28704441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33676212 - 33676084
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||  |    
T  33676212 agatataattaataagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgctagcaactcctatagac 33676113  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttatttttt 141  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33676112 atttgttaggatacacccacttatttttt 33676084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Original strand, 13157272 - 13157408
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactac 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13157272 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacactaattctaaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcc 13157371  T
Q  106 tataagcatttgctaggatacatccacttatttttta 142  Q
    |||| ||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  13157372 tataggcatttgctataattcacccacttatttttta 13157408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 182
Target Start/End: Original strand, 27787870 - 27787966
Alignment:
Q  86 gggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27787870 gggtgtatgttagcaactcttataggaatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 27787966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 160
Target Start/End: Original strand, 32151919 - 32152009
Alignment:
Q  70 cttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32151919 cttctataaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 32152009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Original strand, 3979434 - 3979543
Alignment:
Q  73 ctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  3979434 ctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctataatacacccacttattttttagaaggtgtgctttaacaagttataactaaa 3979533  T
Q  173 aagtagttaa 182  Q
    ||||||||||    
T  3979534 aagtagttaa 3979543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Original strand, 20201691 - 20201776
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  20201691 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattataaaaaataagtgggtgtat 20201776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13385921 - 13385776
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa--aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  13385921 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 13385822  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||    
T  13385821 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaa 13385776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 39424264 - 39424434
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||| | ||||| ||    
T  39424264 agatataattaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggc 39424363  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  39424364 atttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 39424434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 14494367 - 14494535
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  14494367 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 14494466  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  14494467 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 14494535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 47131101 - 47130976
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  47131101 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 47131002  T
Q  116 tgctaggatacatccacttatttttt 141  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||    
T  47131001 tgctagaatacacccacttatttttt 47130976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 160
Target Start/End: Original strand, 32144027 - 32144135
Alignment:
Q  52 aatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtg 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  32144027 aatgttgctaaaacacatattctagaaaataagtgggtgtatgttagcaactcttatatgcatttgctgggatacacccacttattttttagaaggtgta 32144126  T
Q  152 ttttagcaa 160  Q
     ||||||||    
T  32144127 atttagcaa 32144135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12864477 - 12864311
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcattt 116  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||   |||||| ||| |||||| |  |||||| |  |||| ||||||    
T  12864477 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtttgttgctataacacacctaaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcattt 12864378  T
Q  117 gctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  12864377 gctagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 12864311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 16960278 - 16960448
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| |  |||||| |  |||| ||    
T  16960278 agatataactaaaaatttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcatataggc 16960377  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  16960378 atttgctagaatacactcacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 16960448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 27348129 - 27348292
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcattt 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||  ||| |||||||    
T  27348129 tataactaaaaagttgataaatacaccttaaggtgtat-ttgctataacacaccttataaaaaataaatgggtatgtgttagcaactcttat-agcattt 27348226  T
Q  117 gctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    | ||| ||||| | |||||||||||| |||  || ||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  27348227 gttagaatacaccaacttattttttagaagaagtattttagcaaatgataactaaaaaatagttaa 27348292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27389672 - 27389506
Alignment:
Q  21 actaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagca----actactataagcattt 116  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||    | | ||||| ||||||    
T  27389672 actaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcaatcctataggcattt 27389573  T
Q  117 gctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  27389572 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 27389506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 79
Target Start/End: Original strand, 10558203 - 10558274
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaa 79  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10558203 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacatcatctaaaaa 10558274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 20411195 - 20411363
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| |||||| |  |||||| | |||||  |||    
T  20411195 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagtcat 20411294  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || | |||||||||  || |||||||||| |||||    
T  20411295 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtatcttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 20411363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1805174 - 1805030
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  1805174 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttttaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 1805075  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||    
T  1805074 tgctagaatacacccacttatcttttagaaggagtattttagcaa 1805030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 32994184 - 32994336
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||              |||||||||||||||| |  |||   ||||    
T  32994184 atataactaaaaagttgttaagtacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct--------------gggtgtatgttagcaaatcatatggccatt 32994269  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| |||||  || |||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  32994270 tgctagaatacactcatttattttttagaatatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagttaa 32994336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 182
Target Start/End: Original strand, 47130803 - 47130874
Alignment:
Q  111 gcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47130803 gcatttgctaggatacacccacttattttttaaaatgtgcgttttagcaggttataactaaaaagtagttaa 47130874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Original strand, 50797663 - 50797790
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcattt 116  Q
    |||||||||||||||   |||||| |||| || |  |||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  50797663 tataactaaaaagttaacaaatactccttgagatgtatgttgttataacccaccttctaaaaaataagtgggtgtatgatagcaactcctataagcactt 50797762  T
Q  117 gctaggatacatccacttattttttaaa 144  Q
    | ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  50797763 gttagaatatacccacttattttttaaa 50797790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Original strand, 10368082 - 10368171
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaact 103  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||    
T  10368082 agatataactaaaat-ttgttaaatacaccttaagttgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtggatgtaagttagcaact 10368171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 463009 - 463070
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacac 69  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  463009 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttcctaaaacacac 463070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24190935 - 24190822
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| || |||    
T  24190935 tagcagagttataattaagaagttcataaatacaccttgaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaataagtaagtgtatattagcatcttcta 24190836  T
Q  108 taagcatttgctag 121  Q
    || |||||||||||    
T  24190835 tatgcatttgctag 24190822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 27255650 - 27255818
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||| |  |||||  ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  27255650 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttttagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 27255749  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||| ||||  || |||||||||| |||||    
T  27255750 ttgctagaatacaccctcttattttttaaaaggagtattttaggaagtaaataactaaaaagtggttaa 27255818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 36817648 - 36817816
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| | ||    
T  36817648 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctacaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggaat 36817747  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||| || | || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  36817748 ttgctagaatacacacacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 36817816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20201884 - 20201739
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| |||||| |  |||||| | |||||  |||    
T  20201884 tataactaaaaagttaataaatagaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacat 20201785  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20201784 ttgctataatacacccacttattttttataatgtgtgttttagcaa 20201739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 13264583 - 13264687
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  ||||| | | ||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13264583 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatatg-agttgctaacatacatccacttattttttagaaagtgtgttt 13264681  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  13264682 tagcaa 13264687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 3977963 - 3978035
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | |||||||| |||||    
T  3977963 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaccgcaccttcttaaaaa 3978035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13157703 - 13157596
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actata--agcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||||  | || ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13157703 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgtctataggatcagttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgt 13157604  T
Q  153 tttagcaa 160  Q
    ||||||||    
T  13157603 tttagcaa 13157596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 136
Target Start/End: Original strand, 32151842 - 32151918
Alignment:
Q  60 taaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttat 136  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  32151842 taaaacacatattctataaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatatgcatttgctaagatacacccacttat 32151918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 51465207 - 51465064
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| || ||| |  |||||| |  || | ||| |    
T  51465207 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtggatgtgttatagcaaatcttacaggcaat 51465108  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  51465107 tgctagaataca-ccacttattttttagaaggagtattttagcaa 51465064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 43236152 - 43236328
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtg-----ta---tgttagcaactact 106  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||     ||   |  |||||| | ||    
T  43236152 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtggatgcgttctaggcttctagcaaatcct 43236251  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  43236252 ataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagaagtattttagcaagtggataactaaaaagtggttaa 43236328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 52772244 - 52772412
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataa---gcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| || |||||| ||||||||||| ||   | |||||| |  |||||| |  |||| |||    
T  52772244 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttg-tataacacatcttctaaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggca 52772342  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  52772343 tttgctagaatacacccacttatttttcagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 52772412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 28182293 - 28182163
Alignment:
Q  52 aatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtg 151  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | | ||||||||||||  ||||| | |||||||||||  || | |||    
T  28182293 aatgttgtcaaaacactcattctaaaaaataagtgggcgtaagttagcaactcccacaagcatttgctaaaatacaccaacttatttttttgaaagagtg 28182194  T
Q  152 ttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  28182193 ttttaacatgtcataactaaaaagtagttaa 28182163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Original strand, 3099571 - 3099668
Alignment:
Q  20 aactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttg 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||   | ||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  3099571 aactaaaaagttgataaatacaccttaaaatgtatgttgctataacacacattctaaaaaataaatagatgtatgttaacaactcctataaacatttg 3099668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 28454757 - 28454861
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  28454757 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccactttttttttagaaggtgtgttt 28454855  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  28454856 tagcaa 28454861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 32374726 - 32374558
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |  |||||| | |||||  |||    
T  32374726 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcctatagacat 32374627  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| || |||||| ||||||| ||| || |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  32374626 ttgttacgatacacccacttagtttgtagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 32374558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36389602 - 36389498
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactac-tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| | | |||| | | ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  36389602 ttgctaaaacacaccttttaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttt 36389504  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  36389503 tagcaa 36389498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33675899 - 33675851
Alignment:
Q  134 tattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33675899 tattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 33675851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4158250 - 4158147
Alignment:
Q  57 tgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgtttta 156  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |  || ||| | ||   || | ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4158250 tgctaaaacacaccttttaaaaaataagtgggtgtttcctaacaaatgcttataggagttgctaacatacatccacttattttttagaaggtgtgtttta 4158151  T
Q  157 gcaa 160  Q
    ||||    
T  4158150 gcaa 4158147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 32379640 - 32379581
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  32379640 tagcaaagatgtaactaaaaagttgttaaatacatctcaaggtgaatgttgctaaaacac 32379581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 16005616 - 16005721
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgtt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16005616 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttatttttttagaaggtgtgtt 16005714  T
Q  154 ttagcaa 160  Q
    |||||||    
T  16005715 ttagcaa 16005721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 51431898 - 51432003
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaa-aaggtgtgtt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | || |||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  51431898 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatgtctat-aggagttcctaacatacacccacttattttttaagaaggtgtgtt 51431996  T
Q  154 ttagcaa 160  Q
    |||||||    
T  51431997 ttagcaa 51432003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 463456 - 463360
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  463456 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgt 463360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 8643048 - 8643152
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactac-tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| | | ||| || | ||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  8643048 ttgctaaaacacatcttctaaaaaataagtgggtgtattatagcaaatgcgtat-aggagttgctaacatacacccacttatttttttgaaggtgtgttt 8643146  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  8643147 tagcaa 8643152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 28646760 - 28646821
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaa 78  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28646760 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacgcaccttctaaaa 28646821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 28094604 - 28094541
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28094604 tataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaa 28094541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 32716556 - 32716425
Alignment:
Q  53 atgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtg 151  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| |  |||||| |  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||     
T  32716556 atgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttatttttaagaaggagta 32716457  T
Q  152 ttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||  || |||||||||| |||||    
T  32716456 ttttagtaagtgaataactaaaaagtggttaa 32716425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Original strand, 5491748 - 5491802
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacacct 71  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  5491748 tataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtatcttgctaaaacacacct 5491802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 32152010 - 32151972
Alignment:
Q  55 gttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32152010 gttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 32151972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Original strand, 9005142 - 9005282
Alignment:
Q  35 aaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccactt 134  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||   ||||||| |||| | ||||||| |||||||||| | | || |||||||||  ||||| | ||||    
T  9005142 aaatgcaccttgaggtgaatgttgttaaaacacttattctaaataatatgtgggtgtaagttagcaactcccacaatcatttgctaaaatacacctactt 9005241  T
Q  135 attttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtag 178  Q
    |||||||| ||   ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  9005242 attttttagaa---gtgttttagcatgtcataactaagaagtag 9005282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 26843141 - 26843104
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26843141 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 26843104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 27787944 - 27787907
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27787944 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 27787907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 28454950 - 28454881
Alignment:
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagc-aagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||    
T  28454950 tttgctaggatacatccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaa 28454881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 28704595 - 28704526
Alignment:
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagc-aagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||    
T  28704595 tttgctatgatacatccatttattctttagaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaa 28704526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 182
Target Start/End: Original strand, 14387479 - 14387566
Alignment:
Q  96 tagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||  || |||||||||| |||||    
T  14387479 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttggcaagtgaataactaaaaagtggttaa 14387566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 142
Target Start/End: Original strand, 32144129 - 32144176
Alignment:
Q  95 ttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttatttttta 142  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32144129 ttagcaactcctatagacatttgctaggatacacccacttatttttta 32144176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 463459 - 463509
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  463459 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 463509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12010664 - 12010599
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaag--gtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  12010664 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatatgttgttataacacaccttctaaaaaa 12010599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 13157706 - 13157756
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  13157706 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 13157756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23413686 - 23413636
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  23413686 tataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 23413636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 27787947 - 27787997
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  27787947 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 27787997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 141
Target Start/End: Original strand, 32152003 - 32152049
Alignment:
Q  95 ttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttatttttt 141  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32152003 ttagcaactcctatagacatttgctaggatacacccacttatttttt 32152049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 34515277 - 34515327
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  34515277 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 34515327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 5491745 - 5491708
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5491745 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgagtgtat 5491708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Original strand, 6192572 - 6192605
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6192572 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggt 6192605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 182
Target Start/End: Original strand, 13943351 - 13943428
Alignment:
Q  106 tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  13943351 tataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 13943428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16005810 - 16005741
Alignment:
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagc-aagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||    
T  16005810 tttgctaggatacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaa 16005741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 16073583 - 16073546
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16073583 ttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtat 16073546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Original strand, 16073586 - 16073639
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacacc 70  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||    
T  16073586 tataactaaaaagtagttaaatacacgttaaggtgtaacttgctaaaacacacc 16073639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 125
Target Start/End: Original strand, 32144177 - 32144214
Alignment:
Q  88 gtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggata 125  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  32144177 gtgtatgttagcaactcctatatgcatttgctaggata 32144214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 32374576 - 32374527
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  32374576 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacac 32374527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Original strand, 34306590 - 34306623
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34306590 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggt 34306623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 34515274 - 34515237
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34515274 ttgctaaaacacaccttttaaaaaataagtgggtgtat 34515237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 12010559 - 12010527
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12010559 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 12010527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 12864329 - 12864297
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12864329 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 12864297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 13385771 - 13385739
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13385771 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 13385739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 13943410 - 13943442
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13943410 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 13943442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 14387548 - 14387580
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14387548 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 14387580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 16960430 - 16960462
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16960430 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 16960462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 20411345 - 20411377
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20411345 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 20411377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 27255800 - 27255832
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27255800 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 27255832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 32716443 - 32716411
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32716443 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 32716411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 39424416 - 39424448
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39424416 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 39424448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 34082557 - 34082731
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  34082557 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 34082656  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34082657 taggcatttgctaggatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 34082731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 33739537 - 33739694
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  33739537 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 33739636  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttat 165  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33739637 taggcatttgctagaatacatccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttat 33739694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 11675142 - 11675317
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  11675142 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactccta 11675241  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11675242 taggcatttgctaggatacacccacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 11675317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16513275 - 16513104
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  16513275 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacgcaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 16513176  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16513175 taggcatttgctaggatacacccacttatttttt---aggtgtatgttagcaaattataactaaaaagtagttaa 16513104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 42850006 - 42850180
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||| | |||    
T  42850006 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacactccttctaaagaatagatgggtgtatgttagcaattccta 42850105  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42850106 taggcatttgctagaatacatccacttattttttaaaaagtgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaa 42850180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 1576649 - 1576817
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1576649 agatataactaaaaagttgttgaatacaccttaaggtgaatgttgataaaacacaccttctgaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataatca 1576748  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  1576749 tttgctaggatgcacccacttattttttagaatgtgtgttttaggaaattataactaaaaagtagttaa 1576817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16075237 - 16075073
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||     
T  16075237 ataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagttggtgtatgttagcaactcctgtaggcattta 16075138  T
Q  118 ctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16075137 ctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaaatagttaa 16075073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 18370228 - 18370396
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||  ||    
T  18370228 agatataactaaaaaattgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacgcaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagaaactcttatagtca 18370327  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18370328 tttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataattaaaaagtagttaa 18370396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 1750384 - 1750219
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  1750384 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttccaaaaaataag-tggtgtatgttagcaactcctacatgcatt 1750286  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1750285 tgctagaatacacccacttaatttttagaaggtgtgttttagtaagttataactaaaaagtagttaa 1750219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 37169547 - 37169720
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||    
T  37169547 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaaacactccttttaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaacccata 37169645  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37169646 taggcatttgctagaatacaccctcttattttttaaaaggtgcgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 37169720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23387325 - 23387157
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||    
T  23387325 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatcttgttaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagaca 23387226  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  23387225 tttgttaggatacacctacttattttttagaaggtgtatcttaacaagttataactaaaaagtagttaa 23387157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 768741 - 768574
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaac-acaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  768741 atataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaaatacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 768642  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  768641 ttgctacgatacaccaacttattttttagaaggtgcgttttaacaagttataactaaaaagtagttaa 768574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 8386687 - 8386864
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagc--gggtgtatgttagcaactac 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |   |||||||||||||||||| |    
T  8386687 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacactccttctaaaaaaagtggttgggtgtatgttagcaactcc 8386786  T
Q  106 tataagcatttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8386787 tatatgcatttgctagaatacacccacttatttttttacaagatatgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 8386864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13002226 - 13002052
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  13002226 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccctaaggtgaatgttgctaaaacactcctcgtaaacaataagtaggtgtatgttagcaactccta 13002127  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||  ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  13002126 taggcatttgctaaaatacaccctcttattttttagaaggagtgttttagcaagtgataactaaaaagtggttaa 13002052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29512281 - 29512105
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  29512281 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacattttatggtgaatgttgctaaaacacacattctagaaaataagtgggtatatgttagcaacttcta 29512182  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttatt--ttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||  ||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29512181 tagacatttactaggatacacccacttattttttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtggttaa 29512105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 23664738 - 23664913
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||    
T  23664738 tagcaaagatataattaaaaaattgttaaatacattttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaaataaatgagtgtatgttagcaactcct 23664837  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  23664838 ataggcatttgctagaatacacccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaagtagttaa 23664913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41528092 - 41527927
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||  ||||    
T  41528092 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatattgctaaaacactcattttaaaaaataagtgggtgtacgttagcaacttatatagacatt 41527993  T
Q  116 tgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagtt 180  Q
    |||||  ||||| ||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41527992 tgctataatacacccacttacttttttagaatgtgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 41527927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23387176 - 23387065
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatac-accttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23387176 tataactaaaaagtagttaaatacgaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 23387077  T
Q  116 tgctaggataca 127  Q
    ||||||||||||    
T  23387076 tgctaggataca 23387065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 44543043 - 44542897
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  44543043 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 44542944  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  44542943 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 44542897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 6332288 - 6332455
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| |  |||||| | |||||  ||||    
T  6332288 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatt 6332387  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  6332388 tgctagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtagttaa 6332455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 7682017 - 7682183
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  7682017 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaaaaagaagtgggtgtattttagcaaatcctataggcatt 7682116  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  7682117 tgctagaatacacccactt-ttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 7682183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 9689387 - 9689555
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| | ||||||  |||||| | ||||| ||||    
T  9689387 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgagtgtattctagcaaatcctataggcat 9689486  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  9689487 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaattactaaaaagtggttaa 9689555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 39906281 - 39906449
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  39906281 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 39906380  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  39906381 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 39906449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 29511962 - 29512042
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29511962 agatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctagaaaataagtgggtgtatg 29512042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33173692 - 33173549
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcattt 116  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||| | |||||  |||||    
T  33173692 tataactaaaaagttaataaataaaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttccaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacattt 33173593  T
Q  117 gctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  33173592 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 33173549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 22711045 - 22711186
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||| |  || ||| | ||||| |||||    
T  22711045 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctgtaacacaccttctaaaaaaataaatgggtgtgttataacaaatcctataggcatt 22711144  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttag 157  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  22711145 tgctagaatacatccacttattttttagaaggagtattttag 22711186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 20939722 - 20939889
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaa-aaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  20939722 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgcatgttgctataacacactttctaaataaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 20939821  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  20939822 tgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 20939889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29404118 - 29403983
Alignment:
Q  39 acaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattt 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||   | ||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  29404118 acaccttaaggtgaatgttgctaaaacactaattctagaaaataagtgggtgtaagttagcaactctcacaagcatttgctaaaatacacccacttattt 29404019  T
Q  139 tttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaa 174  Q
    |||| || | |||||||||||| | || ||||||||    
T  29404018 tttagaatgagtgttttagcaaatgataactaaaaa 29403983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Original strand, 9690165 - 9690310
Alignment:
Q  12 agagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttc-taaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||| |  |||||| |  ||||     
T  9690165 agagagataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcttaaaaaacaagtgagtgtgttctagcaaatcttatag 9690264  T
Q  111 gcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgtttta 156  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||    
T  9690265 gcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtatttta 9690310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2586575 - 2586431
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  2586575 tataactaaaaaactaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagttggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 2586476  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||    
T  2586475 tgctagaatacacctacttattttttagaaggagtattttagcaa 2586431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 4293216 - 4293360
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||| |  |||||| |  |||| | |||    
T  4293216 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaaaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaattatataggtatt 4293315  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  4293316 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 4293360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 30406473 - 30406617
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttc-taaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||| |    
T  30406473 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcttaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcact 30406572  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||| | || || |||||||||    
T  30406573 tgctacaatacacccacttattttttagatggagtattttagcaa 30406617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Original strand, 32601381 - 32601457
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataag 84  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32601381 tagcaaagatataacaaaaaagttgttaagtataccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataag 32601457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 38987154 - 38987007
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  38987154 tataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctacaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 38987055  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||| |||| || ||||| |||||    
T  38987054 ttgctagaatacatccacttacattttagaaggagtattttaacaagt 38987007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Original strand, 45629733 - 45629819
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||  ||||||||    
T  45629733 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacac---ctaaaaaataagtgggtatattctagcaact 45629819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 117
Target Start/End: Original strand, 20940000 - 20940065
Alignment:
Q  52 aatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20940000 aatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagttggtgtatgttagcaactcctataggcatttg 20940065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 39435235 - 39435142
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaa 101  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39435235 tagcaaagatataattaaagagttgttaaatacaatttaagatgaatgttgttaaaacacacattctaaaacataagcgggtgtatattagcaa 39435142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39904849 - 39904702
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  39904849 tataactaaaaagttaataaatacactttaagatgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 39904750  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||    
T  39904749 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagt 39904702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 182
Target Start/End: Original strand, 17265317 - 17265435
Alignment:
Q  64 acacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtt 163  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||  |||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| |     
T  17265317 acacacattctaaaaaataaatgggtgtacgttatgaactcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatg 17265416  T
Q  164 atgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  17265417 ataactaagaagtagttaa 17265435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 44257654 - 44257506
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa---taagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||    ||| |||||| |  || ||| |  |||| |||    
T  44257654 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaaaaaaaagcaagtgggtgtgttctaacaaatcttataggca 44257555  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||    
T  44257554 tttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagt 44257506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18370374 - 18370270
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||||| | || |||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  18370374 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgactataag-agtttctaacatacacccacttattttttagaaggtgcgttt 18370276  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  18370275 tagcaa 18370270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 22301990 - 22302157
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaata--agcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||||||||||| |  || |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  22301990 tataactaaaaagttaataaatacacct-aaggtgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 22302088  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||| || | || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  22302089 ttgctagaatacacccacttattgtttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 22302157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 3769759 - 3769654
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  3769759 tataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 3769660  T
Q  116 tgctag 121  Q
    ||||||    
T  3769659 tgctag 3769654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33739689 - 33739585
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactac-tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| | | |||| | | ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33739689 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtggatgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttt 33739591  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  33739590 tagcaa 33739585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Original strand, 1297602 - 1297665
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1297602 tataactaaaaagttaataaataaaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 1297665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 44288944 - 44288805
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| |||   |||||||||  |||| ||  ||| |||||  ||    
T  44288944 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacatcttaaggtgaatgttactaacacactcct--aaaaaaataaatgggtata-cttaacaactcata 44288848  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgt 150  Q
    || ||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  44288847 taggcatttgctaaaatactcccacttattttttagaaggtgt 44288805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 19630764 - 19630840
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgt 91  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  19630764 tataactaaaaaattaataaatacacattaaggtatatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgt 19630840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 19827665 - 19827741
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgt 91  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  19827665 tataactaaaaaattaataaatacacattaaggtatatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgt 19827741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 34082709 - 34082605
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  34082709 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataaatgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttattttttagaatgtgtgttt 34082611  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  34082610 tagcaa 34082605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 41088880 - 41088785
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactata 109  Q
    |||||||| || ||||||| |||||| ||||| | ||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||    
T  41088880 agatataattagaaagttgataaatataccttgacgtatacattgttataacacaccttctaaaaaataagtagatgtatgttagcaactcctata 41088785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 20940104 - 20940066
Alignment:
Q  24 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaa 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20940104 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaa 20940066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 182
Target Start/End: Original strand, 29513919 - 29513957
Alignment:
Q  144 aaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29513919 aaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 29513957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 43660860 - 43660810
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaa 64  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  43660860 agatataactaaaaagtggttaaatacaccttgaggtgcatgttgctaaaa 43660810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Original strand, 11675298 - 11675351
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacacc 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  11675298 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacacacc 11675351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 101
Target Start/End: Original strand, 13002074 - 13002119
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13002074 ttgctaaaacactccttctaaaaaataagagggtgtattttagcaa 13002119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 16075095 - 16075132
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16075095 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 16075132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 15554034 - 15554178
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||  |||||| |  |||||| | ||||   ||||    
T  15554034 tataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttcctataacacacattctaaaaaaacaaatgggtgtgttctagcaaatcctattgacatt 15554133  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| || | || |||||||||    
T  15554134 tgttagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaa 15554178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 16513123 - 16513073
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  16513123 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 16513073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 34082712 - 34082762
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  34082712 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 34082762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 101
Target Start/End: Original strand, 29403997 - 29404042
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaa 101  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29403997 ttgctaaaacactcattctaaaaaataagtgggtgtattttagcaa 29404042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 3769499 - 3769467
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3769499 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 3769467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 7682165 - 7682197
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7682165 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 7682197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 22711194 - 22711226
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22711194 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 22711226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 24755240 - 24755176
Alignment:
Q  76 aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttt 140  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  24755240 aaaaataagtgggtgtatattagcaagtcctataaatatttgctaaaatacacccacttattttt 24755176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 39906431 - 39906463
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39906431 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 39906463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 105)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26335947 - 26335773
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  26335947 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 26335848  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26335847 taggcatttgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 26335773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 49425765 - 49425939
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  49425765 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtacgttagcaacttcta 49425864  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  49425865 taggcatttgctaggatacacctacttattttttagaaggtgtgttttagcaacttataactaaaaagtagttaa 49425939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 9744143 - 9744311
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  9744143 agatataactaaaaagttgttagatacaccttaaggtgaatgttgctacaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatattagcaactcctataggca 9744242  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9744243 tttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataaataaaaagtagttaa 9744311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 11777501 - 11777671
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  11777501 tagcaaaggtataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacatattctaaaaaataattgggtgtatgttagcaactccta 11777600  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtag 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11777601 taagcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagttataactaaaaagtag 11777671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15725379 - 15725211
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||    
T  15725379 agatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaataagtgagtgtatgttagcaactcctataggca 15725280  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  15725279 tttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagttataactaaaaaatagttaa 15725211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 46106880 - 46106708
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | |    
T  46106880 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactccaa 46106781  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagtt 180  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46106780 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 46106708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16553623 - 16553457
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16553623 atataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatataagtaggtgtatgttagcaactcctataggcatt 16553524  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16553523 tgctagaatacatccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagttataactaaaaagtaattaa 16553457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45875965 - 45875794
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  45875965 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 45875866  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagt 179  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45875865 taggcatttgctaggatacacccacttatttttttgaatgtgtgttttagcaaattataactaaaaagtagt 45875794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33106110 - 33105944
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  33106110 atataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 33106011  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  33106010 tgctaggatacgcccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataatcaaaaaatagttaa 33105944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 52306966 - 52306800
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  52306966 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttataaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 52306867  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||    
T  52306866 tgctaggatacacctacttattttttagaaggtgtgttataacaacttataactaaaaagtagttaa 52306800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 40496153 - 40496322
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||  |    
T  40496153 agatataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtaagttagcaactcctatagac 40496252  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40496253 atttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 40496322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6946840 - 6946677
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6946840 agatataactaaaaagttgttaaatacat-----ggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggca 6946746  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6946745 tttgctaggatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 6946677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 23383931 - 23384092
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  23383931 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct---aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 23384027  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaa 172  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  23384028 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgcgttttaacaagttataactaaa 23384092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 38425657 - 38425831
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  38425657 tagcaaagatataactgaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 38425756  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||| | ||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38425757 taggcatttgctagaacacacccatttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 38425831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 6192960 - 6193135
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | || ||||||| | || |||||||||||||||||  ||    
T  6192960 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacactcattttaaaaaaatgagtgggtgtatgttagcaacacct 6193059  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6193060 ataagcatttgctagaatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataacaaaaaagtagttaa 6193135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29102192 - 29102017
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaag-ttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||| ||    
T  29102192 tagcaaagatataactaaaaaaattgttaaatacactttaaggtaaatgttgctaaatcacaccttctacaaaacaagtgagtgtatgttaacaactcct 29102093  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  29102092 ataaacatttgctaggatacacccacttattttttataagatgtgttttagcaagttataattaaaaagtagttaa 29102017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4712858 - 4712689
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  4712858 agatataactagaaatttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaatacaccttctaaaaaaataagtgggtgtaagttagcaactcctataggc 4712759  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4712758 attcgctaaaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 4712689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14863164 - 14863005
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcattt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14863164 tataactaaagagttgttaaatacac-----ggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcattt 14863070  T
Q  117 gctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14863069 gctaggatacacccacttattttttagaa-gtgtgttttagcaagttataattaaaaagtagttaa 14863005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 20458837 - 20459004
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  20458837 tagcaaagatatagttaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacactccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcct 20458936  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaa 174  Q
    ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20458937 ataggcatttgctagaatatacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaa 20459004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 142819 - 142677
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  142819 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaagacactttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggca 142720  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgtttta 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  142719 tttgctaggatacacccacttatttttttgaatgtgtgtttta 142677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14948322 - 14948155
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||  ||    
T  14948322 agatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacgcattctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcatttagaca 14948223  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  14948222 tttgttaggattcacccacttattttttaaaaggtgtgttttaataagttataact-aaaagtagttaa 14948155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4490856 - 4490697
Alignment:
Q  24 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctagg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||      
T  4490856 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaattaagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctata 4490757  T
Q  123 atacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4490756 atacacccacttatttcctaaaatatgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 4490697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 182
Target Start/End: Original strand, 6137552 - 6137678
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgtttt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6137552 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgtttt 6137651  T
Q  156 agcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  6137652 agtaagttataactaaaaagtagttaa 6137678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36955562 - 36955389
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||| || |||||||||||||||  ||    
T  36955562 tagcaaagatataactaaaaaattgttaaatatactttaaggtgaatgttgctaaaacacttatactaaaaaataagtgg-tgtatgttagcaactcata 36955464  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36955463 taggcatttgctagaatacactcacttattttttataatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 36955389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26958754 - 26958588
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| |  |||||| |  |||| |||||    
T  26958754 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcatt 26958655  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26958654 tgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaaattataactaaaaagtagttaa 26958588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 52437437 - 52437605
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataa---gcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||||||||| ||   | |||||| |  |||||||| |||||  ||    
T  52437437 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagttgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaaaaaagtgggtgtgttctagcaactcctatagaca 52437536  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  52437537 tttgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtggttaa 52437605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Original strand, 102258 - 102366
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttc-taaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  102258 agatataactaaaaagttgttaaatacacattaaggtgaatgttgttaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtttatgttagcaactcctataggc 102357  T
Q  113 atttgctag 121  Q
    |||||||||    
T  102358 atttgctag 102366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 54742658 - 54742480
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgg--gtgtatgttagcaact 103  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||  ||||| |||| |||||    
T  54742658 tagcaaagatataacgaaaaatttgttaaatacatcttaagatgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaaataagtgggtgtgtaagttaacaact 54742559  T
Q  104 actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
      |||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  54742558 cttataggcatttgctaaaatacacccacttatattttagaatgtgtgttttagcaagttataactagaaagtagttaa 54742480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 42807911 - 42808079
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  42807911 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 42808010  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  42808011 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 42808079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Original strand, 10216252 - 10216398
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  10216252 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 10216351  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  10216352 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 10216398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 43639208 - 43639071
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaag-ttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaacta 104  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||     
T  43639208 tagcaaagatataattaaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctagaaaaaataagtggatgtatgttagcaactc 43639109  T
Q  105 ctataagcatttgctaggatacatccacttatttttta 142  Q
    |||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  43639108 ctatagacatttgttagaatacacccacttatttttta 43639071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 49606162 - 49606051
Alignment:
Q  71 ttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgacta 170  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   ||    
T  49606162 ttctaaaaaataagttgatgtatgttagcagcttctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgcgttttagcaagttatagata 49606063  T
Q  171 aaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||    
T  49606062 aaaagtagttaa 49606051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13212032 - 13211886
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  13212032 tataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 13211933  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  13211932 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 13211886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33811186 - 33811077
Alignment:
Q  73 ctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaa 172  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  33811186 ctaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcctacaggcatttgctataatacacccacttaatttttagaaagtgtgttttagcaagttataactaaa 33811087  T
Q  173 aagtagttaa 182  Q
    ||||||||||    
T  33811086 aagtagttaa 33811077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 40496640 - 40496480
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||  |    
T  40496640 agatataagtataaagttgttaaatatacgttaaggtgaatgttggtaaaacaaaccttctaaaaaaataagcgggtggatgttagcaactcctatagac 40496541  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagtt 180  Q
    |||||||| |||      |||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  40496540 atttgcta-gat------acttatttgttaagagatgtgttttagcaggttataactaaaaaatagtt 40496480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 48560215 - 48560048
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  48560215 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgttttaacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 48560116  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtt-atgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| || || |||||||||| |||||    
T  48560115 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaatttaataactaaaaagtggttaa 48560048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Original strand, 5046641 - 5046787
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| |  |||||| | |||||  ||||    
T  5046641 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatt 5046740  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  5046741 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 5046787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6214201 - 6214033
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  6214201 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccctctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 6214102  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||  || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  6214101 ttgctaggatacacccacttagtttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 6214033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 12584286 - 12584454
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgtt--agcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |   | | |||||||  ||||| | ||||| ||||    
T  12584286 tataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtatgttctagcaaattctataggcat 12584385  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  12584386 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 12584454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13621315 - 13621148
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa--aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  13621315 tataactaaaaagttaataaatactccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 13621216  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  13621215 ttgctaggataca-ccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 13621148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 49970811 - 49970671
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||| ||| |||||| | ||||||| | ||||| |||||    
T  49970811 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctactaaaaaaacaagtgggtgtgt-ttagcaaatcctataggcatt 49970713  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttag 157  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  49970712 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttag 49970671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6137653 - 6137530
Alignment:
Q  59 ctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactac-tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttag 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | | |||| | | ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6137653 ctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttag 6137555  T
Q  158 caagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||    
T  6137554 caaggtataactaaaaagtagttaa 6137530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17377711 - 17377564
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| || |    
T  17377711 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggctt 17377612  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||    
T  17377611 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagt 17377564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Original strand, 38425572 - 38425636
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38425572 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 38425636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3818963 - 3818794
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa---taagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||   |||| |||||| |  |||||| | |||||| ||    
T  3818963 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacatcttctaaaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataaaca 3818864  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  3818863 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 3818794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13371428 - 13371282
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  13371428 tataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 13371329  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || |||||| ||||    
T  13371328 tgctagaatacaaccacttatgttttagaaggagtattttagtaagt 13371282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13381629 - 13381483
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  13381629 tataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 13381530  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || |||||| ||||    
T  13381529 tgctagaatacaaccacttatgttttagaaggagtattttagtaagt 13381483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21519949 - 21519804
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaata--agcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||| || | ||||| ||||    
T  21519949 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttttaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagtaaatcctataggcat 21519850  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||  || |||||||||    
T  21519849 ttgctagaatacacccacttattttttagaagaagtattttagcaa 21519804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 41172630 - 41172460
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa-aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| |  |||||| |  |||| ||    
T  41172630 agatataactaaaaagttaataaatacattttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataaatgggtgtgttctagcaaatcttataggc 41172531  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  41172530 atttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 41172460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 7630275 - 7630107
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  7630275 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatattgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 7630176  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  7630175 ttgctaggatacacccacttagattttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 7630107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 14202870 - 14203038
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa--taagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  14202870 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcat 14202969  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  14202970 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtggataactaaaaagtggttaa 14203038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 84
Target Start/End: Original strand, 13211553 - 13211621
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataag 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13211553 atataactaaaaagttgttaaatacacctttaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaagtaag 13211621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 5157215 - 5157048
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |  |||||| | ||||| || ||    
T  5157215 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaaatgggtgtgttctagcaaatcctataggcctt 5157116  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||| ||||  || |||||||||| |||||    
T  5157115 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaa 5157048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 51783970 - 51784101
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaa-aaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcattt 116  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||||    
T  51783970 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaataaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcattt 51784069  T
Q  117 gctaggatacatcc-acttattttttaaaagg 147  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| ||||    
T  51784070 gctagaatacaccctacttattttttagaagg 51784101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 34683048 - 34683193
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||| |  |||||| |  |||| ||||    
T  34683048 tataactaaaaagttaacaaatacagcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcat 34683147  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||    
T  34683148 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaa 34683193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Original strand, 30820489 - 30820614
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||   |||||||  |||||| | ||||| |||||    
T  30820489 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataaattggtgtattctagcaaatcctataggcatt 30820588  T
Q  116 tgctaggatacatccacttatttttt 141  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||    
T  30820589 tgctagaagacacccacttatttttt 30820614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 30258127 - 30258271
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||  ||| | |||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  30258127 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacgcattctaaaaaaacaagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcatt 30258226  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || | || |||||||||    
T  30258227 tgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaa 30258271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17181170 - 17181000
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa----aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||| || ||||||||||||||    |||| ||| |||||  |  |||||| | ||||| ||    
T  17181170 tataactaaaaagttaataaatacaacttaaggtgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaaaacaagtgggtgcgttctagcaaatcctataggc 17181071  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtt-atgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||| || || |||||||||| |||||    
T  17181070 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtatttttgcaatttaataactaaaaagtggttaa 17181000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 50182390 - 50182225
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| |  |||||| |  |||| |||||    
T  50182390 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagttgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaat--tataggcatt 50182293  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||| |||||  ||||||||||||| |||  || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  50182292 tgttagaatacactcacttattttttagaagcagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 50182225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17745363 - 17745219
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| || ||| |  |||||| | ||||| ||||     
T  17745363 tataactaaaaagttaataaatacaccttcaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtggatgtgttctagcaaatcctataggcat- 17745265  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  17745264 -gctagaatacacccacctattttttagaaggagtattttagcaagt 17745219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 578757 - 578904
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaa--acacaccttctaaaaaat--aagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||| ||||   ||  ||||||||  |||||| | ||||| ||    
T  578757 tataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgtatgttgctatataacacaccttctagaaaaagcaaatgggtgtattctagcaaatcctataggc 578856  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| || | || |||||||||    
T  578857 atttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaa 578904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 6946699 - 6946803
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6946699 ttgctaaaacacatcttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttt 6946797  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  6946798 tagcaa 6946803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9744289 - 9744185
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  9744289 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaatatacacccacttattttttagaaggtgtgttg 9744191  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  9744190 tagcaa 9744185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 26335795 - 26335899
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||| |  |||| || | ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26335795 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctaacaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttt 26335893  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  26335894 tagcaa 26335899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 43639068 - 43639009
Alignment:
Q  123 atacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43639068 atacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaagcagttaa 43639009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 49425918 - 49425813
Alignment:
Q  55 gttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgtt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |  |||| || | ||||||   |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  49425918 gttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtaggtgtatcctagcaaatgcctat-agaagttgctaacgtacacccacttattttttagaaggtgtgtt 49425820  T
Q  154 ttagcaa 160  Q
    |||||||    
T  49425819 ttagcaa 49425813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 14863027 - 14863130
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactac-tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| | | |||| | | ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14863027 ttgctaaaacacac-ttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttt 14863124  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  14863125 tagcaa 14863130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 45875813 - 45875917
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactac-tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||| | | |||| | | ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45875813 ttgctaaaacacacattcaaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttaaaatgtgtgttt 45875911  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  45875912 tagcaa 45875917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 53975202 - 53975315
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||  ||| |||||||||||   ||||  |||||||||| ||| |  ||    
T  53975202 agatataacttaaaagtggttaaatacatcttaaggtgtatgttgctaacacacttcttttaaaaaataagtatgtgtgagttagcaactcctacataca 53975301  T
Q  114 tttgctaggataca 127  Q
    |||||||| |||||    
T  53975302 tttgctagaataca 53975315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Original strand, 4712711 - 4712754
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4712711 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtattttagc 4712754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 182
Target Start/End: Original strand, 13621395 - 13621482
Alignment:
Q  96 tagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  13621395 tagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 13621482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 47382369 - 47382306
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||    
T  47382369 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtttgttgatataacacaccttctaaaaaa 47382306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 49606202 - 49606163
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaa 47  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49606202 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaa 49606163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 156
Target Start/End: Original strand, 15725236 - 15725333
Alignment:
Q  59 ctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgtttta 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15725236 ctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacactcacttattttttagaaggtgtgtttta 15725333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 52306819 - 52306769
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  52306819 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaggttgctaaaacac 52306769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 160
Target Start/End: Original strand, 52306829 - 52306926
Alignment:
Q  63 aacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaacta-ctataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |  ||||| | | ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52306829 aacacaccttctaaaaaataagtaggtgtatcctagcaaatgtctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttataaggtgtgttttagcaa 52306926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 182
Target Start/End: Original strand, 10981392 - 10981469
Alignment:
Q  106 tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  10981392 tataggcatttgctagaatacatccacttattttctagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 10981469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11777650 - 11777549
Alignment:
Q  59 ctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagc 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | ||   || | ||||||  ||||| ||| |||||||||| ||  |||||||||||    
T  11777650 ctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcttataggagttgctaacatacacccaattattttttagaatatgtgttttagc 11777551  T
Q  159 aa 160  Q
    ||    
T  11777550 aa 11777549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 52437583 - 52437546
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52437583 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 52437546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 45801934 - 45801878
Alignment:
Q  106 tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  45801934 tataggcatttgttagaatacatccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 45801878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 6137659 - 6137709
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  6137659 tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtatagcttgctaaaacac 6137709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 26335792 - 26335742
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  26335792 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 26335742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 26958607 - 26958557
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  26958607 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 26958557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 26958610 - 26958715
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccactt-attttttaaaaggtgtgtt 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |  ||||| | ||||||||| | ||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  26958610 ttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatgcctatatg-atttgctagaacacacccacttgtttttttagaaggtgtgtt 26958708  T
Q  154 ttagcaa 160  Q
     ||||||    
T  26958709 atagcaa 26958715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 40496300 - 40496195
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgtt 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||   |||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40496300 ttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatgtctat-aggagttgctaacttacacccacttatttttttagaaggtgtgtt 40496202  T
Q  154 ttagcaa 160  Q
    |||||||    
T  40496201 ttagcaa 40496195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 50678037 - 50677979
Alignment:
Q  119 taggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagta 177  Q
    ||||||||| |||||  |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50678037 taggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagta 50677979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 52437586 - 52437636
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  52437586 tataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagtttgctaaaacac 52437636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 6193113 - 6193076
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6193113 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgagtgtat 6193076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 43639031 - 43639068
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  43639031 ttgctaaaacacatcttctaaaaaataagtgggtgtat 43639068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 46106728 - 46106765
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  46106728 ttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtat 46106765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 49606073 - 49606110
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  49606073 ttgctaaaacgcaccttctaaaaaataagtgggtgtat 49606110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 101
Target Start/End: Original strand, 54742502 - 54742547
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaa 101  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  54742502 ttgctaaaacacacattctaaaatataagtgggtgtattttagcaa 54742547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 578909 - 578941
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  578909 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 578941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 5157066 - 5157034
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5157066 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 5157034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 6137549 - 6137493
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaat-gttgctaaaacacacctt 72  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  6137549 tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtatatctttgctaaaacacgcctt 6137493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 7630125 - 7630093
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7630125 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 7630093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 12584436 - 12584468
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12584436 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 12584468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 14203020 - 14203052
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14203020 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 14203052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 17181018 - 17180986
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17181018 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 17180986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 18470325 - 18470293
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18470325 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 18470293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 30820639 - 30820671
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30820639 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 30820671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 34683198 - 34683230
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34683198 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 34683230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 42808061 - 42808093
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42808061 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 42808093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 48560066 - 48560034
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48560066 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 48560034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 50182243 - 50182211
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50182243 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 50182211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4263 - 4090
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  4263 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtggatgtatgttagcaactccta 4164  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4163 taagcatttgcta-aatacacccacttattttttagaaggtgtgtttgagcaagttataactaaaaagtagttaa 4090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 4112 - 4215
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgtttt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||   || | ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4112 ttgctcaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat-ttagcaaatgcttataggagttgctaacatacatccacttattttttagaaggtgtgtttt 4210  T
Q  156 agcaa 160  Q
    |||||    
T  4211 agcaa 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 4109 - 4059
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  4109 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacac 4059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 4898438 - 4898612
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  4898438 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 4898537  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4898538 taggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtaattaa 4898612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25061854 - 25061681
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  25061854 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag-tgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 25061756  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25061755 taggcatttgctaggatacaccaacttatttgttagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaa 25061681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14488499 - 14488325
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||    
T  14488499 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacactcattctaaaaaataagtgagtgtatgttagcaactcata 14488400  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14488399 taggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 14488325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33730713 - 33730548
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    ||||||||||||| ||||| ||    
T  33730713 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagag----tatgttagcaactcctataggc 33730618  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33730617 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 33730548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11742523 - 11742352
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  11742523 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacattttaaggtgtattttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactccta 11742424  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagt 179  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  11742423 taggcatttgctaggatacacccatttaattttttaaaggtgtgttttagcaggttataactaaaaaatagt 11742352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4838476 - 4838310
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4838476 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggca 4838377  T
Q  114 tttgc------taggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaa 174  Q
    ||| |      ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4838376 tttactaggaataggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaa 4838310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18102890 - 18102715
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactact 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||    
T  18102890 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgttaaaacacaccttttaaaaaaataagttggtgtatgtcagcaacttct 18102791  T
Q  107 ataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18102790 ataggcatttgctatgatacacccacttattttttagaatgtgtattttagcaagttataactaaagagtagttaa 18102715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15718411 - 15718235
Alignment:
Q  7 gtagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactac 105  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |    
T  15718411 gtagcaaagatataacgaaaaatttgttaaatacattttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaattaagtgggtgtaagttagcaactcc 15718312  T
Q  106 tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  15718311 tataggcatttgttagaatacatccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaagtagttaa 15718235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 3437993 - 3438159
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||  |||| |||||    
T  3437993 atataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgctgctaaaatacaacttctaaaaaatatgtgggtgtatgttaccaactcttataggcatt 3438092  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  3438093 tgcaaggatatacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataattaaaaagtagttaa 3438159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 21969886 - 21970060
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  21969886 tagcaaagatataactaaaatgttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaatataatttctaaaaaataagtgggtgtatgttaccaactctta 21969985  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21969986 taaacatttgctagaatacatctacttattttttataaggtgtattttaacaagttataactaaaaagtagttaa 21970060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Original strand, 30525359 - 30525520
Alignment:
Q  20 aactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgct 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30525359 aactaaaaagttgttaa-tacaccttaaggtgaatcttgctaaaatacaccttctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgct 30525457  T
Q  120 aggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || |||||  ||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30525458 agaatacactcacttattttttagaaagtatgttttagcaaattataactaaaaagtagttaa 30525520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Original strand, 4898125 - 4898286
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4898125 agatataactaaaaagttgtccaatacatcttaagatgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaataagttggtgtatgttagcaactcctataggca 4898224  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttatttttta-aaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaa 174  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4898225 tttgctagaatacactcacttattttttattaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 4898286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11100254 - 11100083
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa--taagcgggtgtatgttagcaactactataag 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||| | || |||||||  | |  || ||||| ||||||||| ||||| |    
T  11100254 agatataactaaatagttgttacatacagcttaagatgaatgttgctaaaacactcattttaaaaaaagtgaatggttgtatattagcaactcctatatg 11100155  T
Q  112 catttgctaggatacatccacttattttttaa-aaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11100154 catttgctagaatgcacccacttatttttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 11100083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 11100381 - 11100549
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  11100381 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 11100480  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  11100481 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 11100549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 15962738 - 15962906
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa--taagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  15962738 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaattctataggcat 15962837  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||| || | || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  15962838 tttctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgtataactaaaaagtggttaa 15962906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Original strand, 11009912 - 11010039
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||    
T  11009912 agatataattaaaatattgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaagactcattctaaaaaataagtgggtctatgttaacaactcctatatgca 11010011  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttatttttt 141  Q
    |||||||| |||||  ||||| ||||||    
T  11010012 tttgctagaatacactcacttttttttt 11010039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18154677 - 18154571
Alignment:
Q  76 aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaag 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||| || |||||     
T  18154677 aaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgttaggatacacccacttattttatagacggtgtgttttagcaagttataacaaaaaaa 18154578  T
Q  176 tagttaa 182  Q
    |||||||    
T  18154577 tagttaa 18154571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Original strand, 5703852 - 5703939
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5703852 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtagatgttgctaaaa-actccttctaaaaaaataagtgggtgtaagttagcaact 5703939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9406775 - 9406611
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||| |  |||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  9406775 tataactaaaaagttgataaatacactttgaggtgcatgttgttgcaacacaccttctaaaaaaataaataggtgtatattagcaattcctatatgcatt 9406676  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagtt 180  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||| || | |||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  9406675 tgctagaatacacccacttattgtttacaatgagtgtttcagcaagtgaaaactaaaaagtagtt 9406611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 1369900 - 1370067
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||| |  || ||| | |||||  ||||    
T  1369900 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctaacaaatcctatagacatt 1369999  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  1370000 tgctagaatacatccatttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 1370067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29646412 - 29646245
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  29646412 tataactaaaaa-ttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 29646314  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  29646313 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 29646245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 31132877 - 31133045
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||| ||||   ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  31132877 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatattgctatagcacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 31132976  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  31132977 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 31133045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8172072 - 8171928
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||| |  |||||| |  |||| |||||    
T  8172072 tataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggcatt 8171973  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  8171972 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 8171928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 142
Target Start/End: Original strand, 9955796 - 9955923
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa--taagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  9955796 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtacgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 9955895  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttatttttta 142  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9955896 ttgctagaatacacccacttatttttta 9955923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Original strand, 16599070 - 16599217
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaata--agcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||  ||||| | ||||  | | ||||| ||||    
T  16599070 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagttggtgtgttttagtgaatcctataggcat 16599169  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  16599170 ttactagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 16599217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 142
Target Start/End: Original strand, 5187771 - 5187897
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| |  ||||||   ||| | |||||    
T  5187771 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaaacctacaggcatt 5187870  T
Q  116 tgctaggatacatccacttatttttta 142  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5187871 tgctagaatacacccacttatttttta 5187897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Original strand, 10777944 - 10778091
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||| |  || ||| | |||||  |||    
T  10777944 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctaacaaatcctatagacat 10778043  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt 162  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| |||| || |||||||||||    
T  10778044 ttgctaggatacacccacttggtttttagaaggagtattttagcaagt 10778091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 4184262 - 4184428
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaata--agcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||   |||| || ||| |||||||||||||| |  || |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  4184262 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtac--gttgttataacgcaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 4184359  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  4184360 ttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 4184428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 26211280 - 26211442
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcattt 116  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||   ||   ||||||||| |||| || |||||||||||||  |||||||||||||||| |  | || ||||||    
T  26211280 tatagctaaaaagttgataaatacacctcggggcgtatgttgctataacatacgttctaaaaaataaatgggtgtatgttagcaattcttgtaggcattt 26211379  T
Q  117 gctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagt 179  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||  || ||||||||| | || | |||||||||||    
T  26211380 gctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaaatgataattaaaaagtagt 26211442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4898590 - 4898486
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactac-tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| | | |||| | | ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4898590 ttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttaaaaggtgtgttt 4898492  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  4898491 tagcaa 4898486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Original strand, 26667866 - 26668026
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| |  |||||| || ||||||||||||  |||||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  26667866 tataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaattctataggcat 26667965  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaa 174  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||| |||| ||| ||||||||    
T  26667966 ttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 26668026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Original strand, 11210298 - 11210361
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11210298 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 11210361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 27828308 - 27828480
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaa----cacaccttctaaaaaat--aagcgggtgtatgttagcaactactataa 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||    ||||||||||| ||||   ||| |||||| |  |||||| | |||||     
T  27828308 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataagtaacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatag 27828407  T
Q  111 gcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  27828408 gcatttgttagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 27828480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Original strand, 15881927 - 15881990
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15881927 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaa 15881990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 24022934 - 24022875
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa 76  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  24022934 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaa 24022875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Original strand, 32889684 - 32889789
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| || |||| |||| ||||| ||| |||||    
T  32889684 agatataactaaa--gtggttaaatacaccttaaaatgcatgttgctataacactcattctaaaaactaagtggatgtaagttatcaactcctagaagca 32889781  T
Q  114 tttgctag 121  Q
    ||||||||    
T  32889782 tttgctag 32889789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 10196661 - 10196598
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 80  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  10196661 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctagaaaa 10196598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 35002082 - 35002023
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa 76  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||    
T  35002082 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaa 35002023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 182
Target Start/End: Original strand, 228020 - 228065
Alignment:
Q  137 tttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  228020 tttttagaaggtatgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 228065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 14488347 - 14488384
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14488347 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 14488384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 160
Target Start/End: Original strand, 25061707 - 25061807
Alignment:
Q  60 taaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactac-tataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagc 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||||| | | |||| | | ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25061707 taaaacacaccttctaacaaataagttggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagc 25061805  T
Q  159 aa 160  Q
    ||    
T  25061806 aa 25061807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 33730570 - 33730607
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33730570 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtat 33730607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 32194264 - 32194228
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32194264 agatataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggt 32194228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 30525501 - 30525551
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  30525501 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgcagcttgctaaaacac 30525551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 3881447 - 3881414
Alignment:
Q  15 gatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 48  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3881447 gatataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 3881414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 4838324 - 4838361
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtat 93  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4838324 ttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtat 4838361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 160
Target Start/End: Original strand, 4838397 - 4838434
Alignment:
Q  123 atacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4838397 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 4838434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 160
Target Start/End: Original strand, 11742438 - 11742475
Alignment:
Q  123 atacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11742438 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 11742475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Original strand, 15962887 - 15962920
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15962887 tataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 15962920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 51
Target Start/End: Original strand, 20755506 - 20755539
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggta 51  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20755506 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggta 20755539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 1370049 - 1370081
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1370049 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 1370081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 4184410 - 4184442
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4184410 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 4184442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 9955946 - 9955978
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9955946 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 9955978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 11100531 - 11100563
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11100531 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 11100563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 27828462 - 27828494
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27828462 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 27828494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 29646263 - 29646231
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29646263 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 29646231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 31133027 - 31133059
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31133027 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 31133059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 9730 - 9899
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  9730 agatataactaaaaagttgttaaatacacctcaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggcgtatgttagcaactcctataggc 9829  T
Q  113 atttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9830 atttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 9899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9877 - 9772
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgtt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9877 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacgcccacttatttttttagaaggtgtgtt 9779  T
Q  154 ttagcaa 160  Q
    |||||||    
T  9778 ttagcaa 9772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 9880 - 9930
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  9880 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 9930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 20619 - 20786
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20619 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 20718  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20719 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtatgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 20786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20764 - 20659
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccactta-ttttttaaaaggtgtgtt 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20764 ttgctaaaacataccttctaaaaaataagtgggtgtatcctagcaaatgcctat-aggagttgctaacatacacccacttatttttttagaaggtgtgtt 20666  T
Q  154 ttagcaa 160  Q
    |||||||    
T  20665 ttagcaa 20659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 20767 - 20817
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacac 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  20767 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtatcttgctaaaacac 20817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 5881 - 5713
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  ||    
T  5881 agatataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagtgggtgtaagttagcaactcctatagaca 5782  T
Q  114 tttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5781 tttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 5713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Original strand, 5394 - 5502
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagc 112  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |    
T  5394 agatataagtataaagttgttaaatatacgttaaggtgaatgttggtaaaacaaaccttctaaaaaaataagcgggtggatgttagcaactcctatagac 5493  T
Q  113 atttgctag 121  Q
    |||||||||    
T  5494 atttgctag 5502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5839
Alignment:
Q  56 ttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaact-actataagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttt 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||| || | ||||||   |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5735 ttgctaaaacacacattctaaaaaataagtgggtgtattctagcaaatgtctat-aggagttgctaacttacacccacttattttttagaaggtgtgttt 5833  T
Q  155 tagcaa 160  Q
    ||||||    
T  5834 tagcaa 5839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6743 - 6569
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||    
T  6743 tagcaaagatataactaaaaagttgttaaatatactttgaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataattgggtgtgtgttagcaactccta 6644  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6643 taggcatttgctaggatacatctatttattttttagaaggtgtattttagcaagttataactaaaaagtaattaa 6569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 594
Alignment:
Q  8 tagcagagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactacta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  768 tagcaaagatataactaaaaagttgttaattacaccttaagatgaatgcttctaaaacacacattctaaaatataagtgggtgtatgttagcaactccta 669  T
Q  108 taagcatttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  668 taggcattttctaggatacacccacttatttttcagaaggtatgttttagcaagctataactaaaaagtagttaa 594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 452367 - 452534
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatt 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| |  |||||| |  |||| |||||    
T  452367 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgcgtgtgttctagcaaatcgtataggcatt 452466  T
Q  116 tgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaagtagttaa 182  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  452467 tgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtatataactaaaaagtggttaa 452534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 50
Target Start/End: Original strand, 452514 - 452548
Alignment:
Q  16 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  452514 atataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 452548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1717 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1717
Description:

Target: scaffold1717; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 1378 - 1444
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1378 agatataactaaaaagttgttaaatacac-ttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaat 1444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1527 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1527
Description:

Target: scaffold1527; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 1624 - 1690
Alignment:
Q  14 agatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1624 agatataactaaaaagttgttaaatacac-ttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaat 1690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 58092 - 57947
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||  |||  ||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  58092 tataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagttggtgttttctagcaaatcctataggcat 57993  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  57992 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 57947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 26052 - 26197
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| |||||| |  |||||| |  |||| ||||    
T  26052 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggcat 26151  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa 160  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| || | || |||||||||    
T  26152 ttgctagaatacacccacttatattttagaatgagtattttagcaa 26197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 26202 - 26234
Alignment:
Q  18 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26202 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 26234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2927 - 2767
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa--aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| |  |||||| || ||||||||||||||  |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  2927 tataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaattctataggcat 2828  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaa 174  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||| |||| ||| ||||||||    
T  2827 ttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 2767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14982 - 14822
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa--aaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcat 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| |  |||||| || ||||||||||||||  |||| ||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  14982 tataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaattctataggcat 14883  T
Q  115 ttgctaggatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tatgactaaaaa 174  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||| |||| ||| ||||||||    
T  14882 ttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 14822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 147
Target Start/End: Original strand, 22624 - 22747
Alignment:
Q  24 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcatttgctagga 123  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||| |  |||| |  |||| ||| |    
T  22624 aaaaagttaataaatacaccttgaggtgtatgttgctataacacacttttgaaaaaacaagtgggtgtatgttagcaagttttatatgtgtttgttagaa 22723  T
Q  124 tacatccacttattttttaaaagg 147  Q
    |||| |||||||||||||| ||||    
T  22724 tacacccacttattttttagaagg 22747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 76
Target Start/End: Original strand, 82743 - 82802
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaa 76  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  82743 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaa 82802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 142
Target Start/End: Original strand, 65961 - 66086
Alignment:
Q  17 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataagcgggtgtatgttagcaactactataagcattt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| | | || ||||  ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||  |||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  65961 tataactaaaaagttgataaatgctctttgaggtgtatgttgctacaacacatcttttaaagaataagtaggtgtatgttaataactcctatatgcattt 66060  T
Q  117 gctaggatacatccacttatttttta 142  Q
    ||||| || ||  || ||||||||||    
T  66061 gctagaattcacacaattatttttta 66086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University