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Alignment Overview

Query: NF11252_high_15 (Length: 427)

Name: NF11252_high_15
Description: NF11252
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11252_high_15
NF11252_high_15
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (4-420)||(15518-15947)
[»] chr1 (45 HSPs)
chr1 (4-420)||(44469574-44470003)
chr1 (4-420)||(29352314-29352743)
chr1 (4-420)||(30909592-30910021)
chr1 (6-420)||(9710661-9711087)
chr1 (3-418)||(20353500-20353928)
chr1 (4-420)||(13633435-13633865)
chr1 (3-420)||(3993405-3993836)
chr1 (3-420)||(3944054-3944485)
chr1 (3-420)||(38771709-38772141)
chr1 (1-420)||(7966060-7966498)
chr1 (38-420)||(37018959-37019353)
chr1 (6-420)||(8459040-8459467)
chr1 (84-420)||(12643369-12643715)
chr1 (79-420)||(5081927-5082283)
chr1 (83-420)||(6558047-6558411)
chr1 (6-420)||(51666229-51666656)
chr1 (7-420)||(1655643-1656079)
chr1 (6-402)||(19495122-19495544)
chr1 (57-420)||(25039644-25040020)
chr1 (4-278)||(15051053-15051340)
chr1 (23-420)||(13177689-13178107)
chr1 (48-418)||(5141435-5141816)
chr1 (4-232)||(46886148-46886380)
chr1 (231-420)||(50113642-50113831)
chr1 (4-232)||(50113388-50113620)
chr1 (83-417)||(36072522-36072879)
chr1 (6-420)||(38690013-38690418)
chr1 (6-222)||(52805330-52805549)
chr1 (149-420)||(33168133-33168423)
chr1 (6-232)||(4518176-4518406)
chr1 (23-232)||(46979018-46979231)
chr1 (10-222)||(22527465-22527681)
chr1 (240-420)||(46978797-46978977)
chr1 (63-222)||(94537-94700)
chr1 (4-222)||(470840-471062)
chr1 (6-223)||(22345818-22346034)
chr1 (10-222)||(31780054-31780270)
chr1 (57-222)||(16281831-16281999)
chr1 (240-418)||(4517959-4518135)
chr1 (37-223)||(19521711-19521900)
chr1 (6-218)||(21144405-21144621)
chr1 (46-219)||(50617326-50617503)
chr1 (4-128)||(23359217-23359341)
chr1 (4-61)||(12643311-12643368)
chr1 (184-230)||(1179878-1179924)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (4-420)||(3407802-3408232)
chr4 (3-420)||(49563920-49564352)
chr4 (4-420)||(19069268-19069710)
chr4 (6-420)||(10422971-10423397)
chr4 (6-420)||(38460508-38460935)
chr4 (147-420)||(10374267-10374549)
chr4 (6-420)||(4774167-4774604)
chr4 (7-420)||(18578706-18579142)
chr4 (4-232)||(37394977-37395209)
chr4 (12-327)||(50904819-50905147)
chr4 (231-418)||(37394768-37394955)
chr4 (4-224)||(15995803-15996026)
chr4 (231-413)||(44050650-44050831)
chr4 (6-232)||(44050853-44051083)
chr4 (153-420)||(24415392-24415680)
chr4 (4-222)||(51492152-51492374)
chr4 (6-222)||(50278593-50278814)
chr4 (246-420)||(11506657-11506831)
chr4 (4-222)||(44674219-44674440)
chr4 (63-222)||(37016038-37016201)
chr4 (82-317)||(51642165-51642423)
chr4 (63-382)||(6186786-6187130)
chr4 (63-360)||(30043046-30043365)
chr4 (6-129)||(24414917-24415040)
chr4 (236-374)||(31598816-31598954)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (4-420)||(39538-39967)
chr8 (4-420)||(23924047-23924475)
chr8 (4-420)||(35962388-35962817)
chr8 (23-420)||(30301233-30301645)
chr8 (3-420)||(7344119-7344550)
chr8 (3-420)||(8419484-8419915)
chr8 (3-420)||(32375731-32376162)
chr8 (4-304)||(20548938-20549250)
chr8 (6-420)||(43679479-43679906)
chr8 (8-396)||(4867380-4867791)
chr8 (147-419)||(22588006-22588287)
chr8 (4-232)||(31959821-31960053)
chr8 (231-420)||(31959610-31959799)
chr8 (231-420)||(43376842-43377031)
chr8 (147-420)||(7171880-7172172)
chr8 (7-323)||(39751144-39751473)
chr8 (64-420)||(22661137-22661506)
chr8 (6-217)||(41743947-41744162)
chr8 (231-420)||(2124515-2124704)
chr8 (6-232)||(43377053-43377283)
chr8 (4-222)||(34366992-34367214)
chr8 (247-420)||(41744160-41744333)
chr8 (7-221)||(41238932-41239150)
chr8 (6-232)||(2124260-2124493)
chr8 (6-190)||(23578517-23578705)
chr8 (315-414)||(39751659-39751758)
chr8 (4-106)||(1116105-1116206)
chr8 (66-418)||(31280953-31281318)
chr8 (149-338)||(30972519-30972717)
chr8 (4-142)||(7172465-7172605)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (4-420)||(4889-5319)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (4-420)||(15069913-15070343)
chr7 (4-420)||(18109356-18109786)
chr7 (4-420)||(47742552-47742981)
chr7 (4-420)||(603860-604289)
chr7 (4-420)||(42503401-42503831)
chr7 (6-414)||(34622581-34623002)
chr7 (3-420)||(30790569-30791001)
chr7 (3-420)||(45767423-45767854)
chr7 (3-420)||(43619759-43620190)
chr7 (4-418)||(10705328-10705765)
chr7 (4-230)||(40928715-40928945)
chr7 (231-420)||(19044627-19044816)
chr7 (231-420)||(20709820-20710009)
chr7 (247-420)||(29592839-29593012)
chr7 (4-217)||(29592624-29592841)
chr7 (106-416)||(12111398-12111729)
chr7 (231-420)||(47064857-47065046)
chr7 (10-222)||(17838405-17838621)
chr7 (6-222)||(5537929-5538147)
chr7 (6-220)||(34742168-34742385)
chr7 (6-232)||(19044375-19044605)
chr7 (6-232)||(20710031-20710261)
chr7 (6-222)||(13323485-13323705)
chr7 (147-222)||(10522285-10522360)
chr7 (152-225)||(47065075-47065148)
chr7 (63-104)||(12111341-12111382)
chr7 (6-80)||(36186416-36186490)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (4-420)||(24753587-24754016)
chr2 (4-420)||(39798003-39798431)
chr2 (4-420)||(7267007-7267436)
chr2 (4-420)||(3795418-3795860)
chr2 (3-420)||(41564053-41564485)
chr2 (6-420)||(41181493-41181920)
chr2 (6-420)||(28342605-28343033)
chr2 (3-420)||(5351294-5351725)
chr2 (3-420)||(10620053-10620484)
chr2 (1-420)||(45479384-45479816)
chr2 (3-420)||(209064-209495)
chr2 (26-420)||(43943792-43944211)
chr2 (7-418)||(12905606-12906037)
chr2 (66-317)||(38950232-38950496)
chr2 (6-420)||(41004610-41005046)
chr2 (4-232)||(1096650-1096882)
chr2 (231-420)||(1096904-1097093)
chr2 (231-420)||(24601974-24602161)
chr2 (231-420)||(24611953-24612140)
chr2 (6-232)||(41052704-41052934)
chr2 (3-284)||(18000312-18000607)
chr2 (4-232)||(24601720-24601952)
chr2 (4-232)||(24612162-24612394)
chr2 (6-232)||(9659816-9660046)
chr2 (231-420)||(9659603-9659794)
chr2 (26-224)||(439592-439792)
chr2 (4-222)||(10825299-10825521)
chr2 (231-420)||(439373-439562)
chr2 (24-222)||(39950941-39951143)
chr2 (231-420)||(1150594-1150783)
chr2 (57-222)||(29398043-29398208)
chr2 (46-222)||(32952854-32953033)
chr2 (231-420)||(81813-82002)
chr2 (6-217)||(25184606-25184821)
chr2 (231-420)||(41052956-41053143)
chr2 (6-232)||(82024-82253)
chr2 (314-420)||(38949749-38949855)
chr2 (10-132)||(7189817-7189939)
chr2 (140-226)||(3206968-3207054)
chr2 (236-418)||(25613528-25613710)
chr2 (150-230)||(25613433-25613513)
chr2 (313-353)||(43668499-43668539)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (4-420)||(13563722-13564151)
chr5 (4-420)||(25890075-25890504)
chr5 (4-420)||(27863484-27863913)
chr5 (4-420)||(37814663-37815092)
chr5 (4-420)||(11029089-11029517)
chr5 (4-420)||(38855796-38856225)
chr5 (4-353)||(34079761-34080123)
chr5 (6-420)||(28882077-28882498)
chr5 (4-420)||(7017593-7018008)
chr5 (44-420)||(7796699-7797087)
chr5 (7-420)||(33994712-33995138)
chr5 (7-420)||(24053237-24053673)
chr5 (7-420)||(24050110-24050548)
chr5 (4-232)||(1039565-1039797)
chr5 (4-225)||(34122605-34122830)
chr5 (231-420)||(14280541-14280730)
chr5 (231-420)||(34122859-34123048)
chr5 (4-200)||(28388311-28388511)
chr5 (239-420)||(1039355-1039535)
chr5 (7-232)||(25877704-25877931)
chr5 (1-222)||(7762013-7762239)
chr5 (259-418)||(28387821-28387979)
chr5 (6-222)||(38407230-38407449)
chr5 (6-420)||(30352510-30352940)
chr5 (37-222)||(41799539-41799726)
chr5 (231-420)||(4196837-4197024)
chr5 (289-420)||(43179428-43179559)
chr5 (66-370)||(6267617-6267933)
chr5 (6-150)||(4196637-4196781)
chr5 (231-362)||(25877953-25878082)
chr5 (6-115)||(14280781-14280890)
chr5 (45-226)||(43179666-43179849)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (4-420)||(13743348-13743776)
chr3 (24-420)||(9426705-9427115)
chr3 (26-420)||(48246514-48246921)
chr3 (4-420)||(2857545-2857974)
chr3 (3-420)||(6744889-6745319)
chr3 (3-420)||(30943269-30943701)
chr3 (4-420)||(50957242-50957684)
chr3 (3-420)||(3952777-3953208)
chr3 (3-420)||(8156588-8157019)
chr3 (6-416)||(21951882-21952305)
chr3 (4-420)||(66954-67393)
chr3 (4-289)||(7841176-7841474)
chr3 (4-232)||(4002265-4002497)
chr3 (156-420)||(2743678-2743965)
chr3 (231-420)||(14402568-14402757)
chr3 (4-237)||(36812918-36813155)
chr3 (231-420)||(46989847-46990036)
chr3 (231-420)||(4002054-4002243)
chr3 (231-420)||(36813172-36813361)
chr3 (231-420)||(6489664-6489853)
chr3 (25-232)||(46989614-46989825)
chr3 (4-181)||(14402808-14402988)
chr3 (4-222)||(600314-600536)
chr3 (6-222)||(50213540-50213760)
chr3 (6-220)||(6489411-6489629)
chr3 (24-222)||(36134053-36134255)
chr3 (4-222)||(47070549-47070771)
chr3 (10-222)||(42166182-42166398)
chr3 (57-222)||(2271488-2271658)
chr3 (6-222)||(16646944-16647163)
chr3 (24-217)||(52387900-52388097)
chr3 (24-220)||(9473721-9473921)
chr3 (4-137)||(2743479-2743611)
chr3 (10-137)||(4004931-4005058)
chr3 (150-228)||(7314607-7314685)
chr3 (195-232)||(14402779-14402816)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (3-420)||(1608372-1608804)
chr6 (6-420)||(29286285-29286712)
chr6 (6-420)||(31150628-31151054)
chr6 (4-420)||(13382710-13383151)
chr6 (6-420)||(25140668-25141096)
chr6 (7-420)||(23958974-23959400)
chr6 (8-420)||(18609796-18610221)
chr6 (7-420)||(29667386-29667822)
chr6 (4-278)||(18351348-18351635)
chr6 (4-232)||(7537267-7537499)
chr6 (231-414)||(2051362-2051545)
chr6 (231-420)||(7537521-7537710)
chr6 (4-220)||(11840022-11840242)
chr6 (236-420)||(28362280-28362464)
chr6 (5-232)||(28362491-28362721)
chr6 (172-420)||(2259338-2259594)
chr6 (6-222)||(31771510-31771731)
chr6 (4-222)||(3502434-3502656)
chr6 (149-360)||(34230709-34230930)
chr6 (6-226)||(2051110-2051334)
chr6 (66-232)||(26702472-26702641)
chr6 (6-174)||(2258368-2258540)
chr6 (6-382)||(20448389-20448768)
chr6 (57-193)||(8304571-8304711)
chr6 (66-236)||(19129120-19129291)
chr6 (66-230)||(20439767-20439935)
chr6 (66-230)||(20436059-20436227)
chr6 (291-382)||(19129549-19129641)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (4-313)||(8280-8602)
[»] scaffold0201 (2 HSPs)
scaffold0201 (15-232)||(22493-22713)
scaffold0201 (231-420)||(22735-22924)
[»] scaffold0219 (3 HSPs)
scaffold0219 (4-232)||(19871-20104)
scaffold0219 (231-337)||(19743-19849)
scaffold0219 (335-420)||(19497-19582)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (269-420)||(10827-10978)
scaffold0169 (6-143)||(1537-1674)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (47-416)||(21774-22144)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (17-222)||(12497-12706)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (10-222)||(236006-236222)
[»] scaffold0794 (1 HSPs)
scaffold0794 (246-420)||(1314-1488)


Alignment Details
Target: scaffold0116 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 15947 - 15518
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15947 tgattatgcagacagtgagttctgcataattctaaacatttctaagccatttgttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 15848  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15847 aaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttagttaaaatt 15748  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15747 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 15648  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  15647 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtccccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 15548  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15547 gcttgccgttttccatacgtattcatctct 15518  T

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Target: chr1 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 45)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 44470003 - 44469574
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44470003 tgattatgcagacagtggattctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggtcagtttttacctgtaattgaaccagagcattttcaaaggca 44469904  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44469903 aaataattcatacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 44469804  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44469803 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 44469704  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  44469703 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 44469604  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44469603 gcttgccgttttccatgcgtattcatctct 44469574  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 29352314 - 29352743
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29352314 tgattatgcagacagtggattctacataattctaaacatttccaaaccattttttcggccaatttttacttgtaattaaaccagagcatttgcaaaggca 29352413  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29352414 aaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 29352513  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29352514 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaat 29352613  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29352614 tacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 29352713  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29352714 gcttgccgttttccatgcgtattcatctct 29352743  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 30910021 - 30909592
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30910021 tgattatgcagacagagggttctgcataattctgaacaattccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 30909922  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30909921 aaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaacataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacgtttggttaaaatt 30909822  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30909821 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaagtactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 30909722  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  30909721 tgcatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 30909622  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30909621 gcttgctgttttccatgcgtattcatctct 30909592  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Original strand, 9710661 - 9711087
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  9710661 attatgcagacagtgggttctgcataattctaaacatttccaagccattt-ttcggtcagtttttacctgtaattaaacaagagtatttccaaaggtaaa 9710759  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||     
T  9710760 ataattcatacaacattgaaactaggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaactgacatttggttcaaattac 9710859  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9710860 acaaacgtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 9710959  T
Q  293 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagc 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  9710960 catatggaaagaacatacatatataatatattatctttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 9711059  T
Q  393 ttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9711060 ttgccgtttttcatgcgtattcatctct 9711087  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 3 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 20353928 - 20353500
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20353928 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggt 20353829  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20353828 aatataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagacaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 20353729  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 289  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20353728 taaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattatacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaa 20353629  T
Q  290 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatat 389  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20353628 ttacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatat 20353529  T
Q  390 agcttgccgttttccatgtgtattcatct 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20353528 agcttgccgttttccatgcgtattcatct 20353500  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13633865 - 13633435
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||     
T  13633865 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctagacatttccaagccatttttccggccagtttttacctgtaattaaaccagacaatttccaaaggct 13633766  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  13633765 aaataattcatacaatattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatttaaccgacattttggttaacat 13633666  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13633665 taaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcaataaattaaatccctacttacattcaacgcaa 13633566  T
Q  290 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatat 389  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  13633565 ttacatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcatcgcgaataagcaaaggcatat 13633466  T
Q  390 agcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13633465 agcttgccgttttccatgcgtattcatctct 13633435  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 3993836 - 3993405
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  3993836 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggt 3993738  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3993737 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaa 3993638  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3993637 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 3993538  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  3993537 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 3993438  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3993437 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 3993405  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Original strand, 3944054 - 3944485
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  3944054 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggt 3944152  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3944153 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaa 3944252  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3944253 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 3944352  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  3944353 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 3944452  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3944453 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 3944485  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Original strand, 38771709 - 38772141
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  38771709 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggt 38771808  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38771809 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcctttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaa 38771908  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38771909 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 38772008  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || ||||    
T  38772009 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcaccgtcgtcgcggataagcaaaggcat 38772108  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38772109 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 38772141  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 420
Target Start/End: Original strand, 7966060 - 7966498
Alignment:
Q  1 aattgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7966060 aattgattatgcagacagtgagttctgcataattctaaagcacttccaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaa 7966158  T
Q  100 ggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatctttt-acaattgtccataattaaattaaaccgacatttggtta 194  Q
    ||||| |||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  7966159 ggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatctttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttc 7966258  T
Q  195 aaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattac------acatcattaaattaaatccctacttaca 279  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||         |||||||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7966259 aaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacatttacacatcattaaattaaatccctacttaca 7966358  T
Q  280 ttcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagc 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  7966359 ttcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatgtaatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataag- 7966457  T
Q  380 caatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7966458 caaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 7966498  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 38 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 37019353 - 37018959
Alignment:
Q  38 aacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataa 137  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37019353 aacatctccaagctattttttcggtcaaattttac-tgtaattaaaccagagtattttcaaaggtaaaataattcatacaacattgaaactcggatataa 37019255  T
Q  138 acaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacat 233  Q
    ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||     
T  37019254 acaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccaacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaatgttacaa 37019155  T
Q  234 agt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatt 324  Q
    |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37019154 agtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatt 37019055  T
Q  325 atcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  37019054 atcttccaccatattccgaaacataaatcctatgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctct 37018959  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Original strand, 8459040 - 8459467
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8459040 attatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttctaagccattt-ttcgaccagtttttacctgtaattaaaccatagcatttccaaaggcaa 8459138  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8459139 tataaatcatacaacattgaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 8459238  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 291  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||         |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8459239 cacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttaaaaagtgtccataattaaacaactcattacacatgattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 8459338  T
Q  292 gcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatag 391  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  8459339 acatatagaacgaacatacatgtataatatattatcttctaccatattttgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaagacatatag 8459438  T
Q  392 cttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8459439 cttgtcgttttccatgcgtattcatctct 8459467  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 84 - 420
Target Start/End: Original strand, 12643369 - 12643715
Alignment:
Q  84 ccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12643369 ccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaa 12643468  T
Q  180 accgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattca---tcaaaacatta------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatcc 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |   || | | ||||      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12643469 accgacatttggttaaaattaaacaaacgttt--aattaagtgtctata-attaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatcc 12643565  T
Q  271 ctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12643566 ctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcg 12643665  T
Q  371 cgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12643666 cgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 12643715  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 79 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 5082283 - 5081927
Alignment:
Q  79 ttaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcg--gacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataatt 172  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||  |||||||    |||||||||||||||||| |||||||    
T  5082283 ttaaaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactctcagacataataaagataagtacaatatcttttacaattgttcataatt 5082184  T
Q  173 aaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaat 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  5082183 aaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaagtactccttacacatcattaaat 5082084  T
Q  264 taaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgcc 363  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5082083 taaatccatatttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgcc 5081984  T
Q  364 gtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  5081983 gtcgtcgcgaataagcaaaggcatataccttgtcgttttccatgcgtattcatctct 5081927  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 83 - 420
Target Start/End: Original strand, 6558047 - 6558411
Alignment:
Q  83 accagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaatta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6558047 accagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatta 6558146  T
Q  179 aaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaa--------------acattacatagt---------taaacaactcattacacat 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||              |||||||| |||         ||||| |||||||||||||    
T  6558147 aaccgacatttggttaaaattaaacaaatgtttgaaattcatcaaattaaaccactcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacat 6558246  T
Q  256 cattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctg 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  6558247 cattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccg 6558346  T
Q  356 acgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6558347 acgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 6558411  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 51666656 - 51666229
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51666656 attatgcacacagtgggttctgcataattctaaagcattctcaagccattt-ttcggccaatttttacctgtaattaaaccaaagcatttccaaaggcaa 51666558  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51666557 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 51666458  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 291  Q
     | ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  51666457 cataaaagtttgaaattcatcaaaaagttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattatattaaatccctacttacattcatcacaatt 51666358  T
Q  292 gcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatag 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||   |||||||||| ||||||||    
T  51666357 gcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaattcgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatag 51666258  T
Q  392 cttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  51666257 cttgtcgtgttccatgtgtattcatctct 51666229  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 1656079 - 1655643
Alignment:
Q  7 ttatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| | || ||  | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  1656079 ttatgcagacagtgggttctgcataattgttaagcactttcaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaatttaatcagagcatttccaaaggcaat 1655981  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    |||| | |||||||||| ||| |  | ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||     
T  1655980 ataacttatacaacatttaaatttagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacggacatttggttcaaaatac 1655881  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaac----------tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattc 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||         ||||||||          |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1655880 acaaaagtttgaaattcatcaaatcgttacatagtatccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatcattacttacattc 1655781  T
Q  283 aacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1655780 aacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaa 1655681  T
Q  383 tgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1655680 gacatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 1655643  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 402
Target Start/End: Original strand, 19495122 - 19495544
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| | || ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19495122 attatgcagacagtgggttctgcataattgttaagcatttccaagctattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaa 19495220  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     ||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  19495221 tataattcatacaacatttaaactcagtcataaataagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaata 19495320  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaa--------acat----tacatagttaaacaac----------tcattacacatcattaaattaaatccctacttac 278  Q
     ||||| |||||||||||||||||        ||||    | |||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19495321 cacaaaagtttgaaattcatcaaacgcgtgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaagtcattacacatcattaaattaaatccctacttac 19495420  T
Q  279 attcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataag 378  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  19495421 attcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccaacgtcgctatcgtctcgaataag 19495520  T
Q  379 ccaatgcatatagcttgccgtttt 402  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  19495521 ccaaggcatatagcttgccgtttt 19495544  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 57 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 25040020 - 25039644
Alignment:
Q  57 ttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatc 152  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| |  ||||||||| |||||| | ||||||||||    ||| ||||||    
T  25040020 ttcggccagtttttacctgtaatttaaccagaacatttccaaagacaatataacttgtacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatc 25039921  T
Q  153 ttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||         |||||||    
T  25039920 ttttacaattgtccataattaaatcaaactgatatttggttcaaaatacacaaaagtttaaaattcatcaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaa 25039821  T
Q  244 ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccga 343  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25039820 cacattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgtatatggaacgaacatacacatataatatattatcttccaccatattccga 25039721  T
Q  344 aacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25039720 aacataaatccgacgtcgttatcgacgcgaataagccaaggcgtatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 25039644  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15051340 - 15051053
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15051340 tgattatgcagacagtgagttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 15051241  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15051240 aaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 15051141  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttac 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||         |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15051140 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttac 15051053  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13178107 - 13177689
Alignment:
Q  23 ttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacat 121  Q
    |||||||||||| |||| ||  |||||||||||| || |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||  |  |    
T  13178107 ttctgcataattataaagcacttccaagccatttttt-gaccagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatatta--t 13178011  T
Q  122 tgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaatt 217  Q
    | |||||| | ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  13178010 ttaaactcagtcataaacaagtaaaatataatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaatt 13177911  T
Q  218 catcaaaacattacatagt---------taaacaac----------tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatg 298  Q
    ||||||||| |||||||||         ||||||||          ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13177910 catcaaaacgttacatagtgtccatagttaaacaacacattacaactcattacacattattaaattaaatccctacttactttcaatgcaattgcatatg 13177811  T
Q  299 gaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccg 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  13177810 gaatgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgttgcgattaagccaagccatatagcttgccg 13177711  T
Q  399 ttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  13177710 ttttccatgcgtattcatctct 13177689  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 48 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 5141816 - 5141435
Alignment:
Q  48 agccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa 147  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||     
T  5141816 agccattt-ttcggtcagtttttacctgtaattaaagcagaacatttccaaaggcaatataactcatacaacatttatactcaggcataaacaagaaaat 5141718  T
Q  148 ---atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt-------- 236  Q
       |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||  |||||  | || ||||||||||||| ||||| ||| |||||            
T  5141717 tacatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacaaggggttcgaattactcgaatgtttgaaattcattaaaacgttaaatagtgtcaataa 5141618  T
Q  237 -taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccacca 335  Q
     |||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5141617 ttaaacaacacattatatatcgttaaattaaatctctactgacattctacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatca 5141518  T
Q  336 tattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatct 418  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5141517 tattccgaaacatacatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaacgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct 5141435  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 46886380 - 46886148
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46886380 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggctagtttttacctgtaattaaaccagagcctttccaaaggca 46886281  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46886280 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 46886181  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  46886180 acacaaacgtttgaaattcatcgaaacattaca 46886148  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Original strand, 50113642 - 50113831
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50113642 cataattaaacaactcattacacattattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 50113741  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50113742 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 50113831  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 50113388 - 50113620
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50113388 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaacattttcaatccattttttcggctagtttttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 50113487  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50113488 aaataattcatacaacgttgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 50113587  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50113588 acacaaacgtttgaaattcatcaaaacattaca 50113620  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 83 - 417
Target Start/End: Original strand, 36072522 - 36072879
Alignment:
Q  83 accagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaatta 178  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||| | |||||| | ||||||||||    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  36072522 accagaacatttccaaaggcaatataacttatacaacagttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatca 36072621  T
Q  179 aaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaa----------ctcattacacatcatt 259  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||         |||||||          ||||||||||||||||    
T  36072622 aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacattagatagtgtccatgattaaacaacatattacaactcattacacatcatt 36072721  T
Q  260 aaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgt 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36072722 aaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt 36072821  T
Q  360 cgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatc 417  Q
    |||  || ||   ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  36072822 cgctatcatcttcaattagccaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtattcatc 36072879  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Original strand, 38690013 - 38690418
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38690013 attatgcagacagtggtttctacataattctaaagcatttccaagccattt-ttcggccagtttttatctgtaattaaaccagaggatttccaaaggcaa 38690111  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 204  Q
     || | ||||| |                 |||  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| |||    
T  38690112 tatcagtcataaa-----------------taagaaaaatacaatatcttttacaattgtccatagttaaatcaaaccgacatttgattcaaattacaca 38690194  T
Q  205 aaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcat 295  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| |||         |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  38690195 aaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaacacattacacatcattatattaaatcc-tacttacattcatcacaattgcat 38690293  T
Q  296 atggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttg 395  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||  |||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  38690294 atggaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattttgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttg 38690393  T
Q  396 ccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  38690394 ccgttttccatgcgtattcatctct 38690418  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 52805549 - 52805330
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52805549 attatgcagacagtgggctctgcatgattctaaacatttccaagccattt-ttcggtcagcttttacctgtaattaaaccagagtatttccaaaggcaaa 52805451  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  52805450 ataattcatataacattgaaactctgacataaataagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaattac 52805351  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  52805350 acaaacgtttgaaattcatca 52805330  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 149 - 420
Target Start/End: Original strand, 33168133 - 33168423
Alignment:
Q  149 tatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taa 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || || |||||||| |||||||||| |||||||||         |||    
T  33168133 tatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttagttcaaagtacacgaaagtttgaaaatcatcaaaacgttacatagtgtccataattaa 33168232  T
Q  240 acaa----------ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatctt 329  Q
    ||||          ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33168233 acaacacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacactcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatttt 33168332  T
Q  330 ccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  33168333 ccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtctaaaataagtcaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtattcatctct 33168423  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4518406 - 4518176
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4518406 attatggagacagtaggttctgcataattctaaagcattttcaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccaaagcatttccaaaggcaa 4518308  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4518307 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 4518208  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  4518207 cacaaaagtttgaaattcatcagaacgttaca 4518176  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 46979231 - 46979018
Alignment:
Q  23 ttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacat 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  46979231 ttctgcataattctaaaacattttcaagctattt-ttcggtcagtttttacttgtaattaaatcagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacat 46979133  T
Q  122 tgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaatt 217  Q
    |||||||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  46979132 tgaaactcggtcataaacaagaaaaatagaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacagacatttgattcaaattacacaaaagtttgaaatt 46979033  T
Q  218 catcaaaacattaca 232  Q
    |||||||||||||||    
T  46979032 catcaaaacattaca 46979018  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22527681 - 22527465
Alignment:
Q  10 tgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaata 108  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22527681 tgcaggcagtgacctctgcatcattccaaaacatttccaagcctttt-ttcggctagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaaca 22527583  T
Q  109 attcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  22527582 attcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatgttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaca 22527483  T
Q  205 aaggtttgaaattcatca 222  Q
    || |||| ||||||||||    
T  22527482 aacgtttaaaattcatca 22527465  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 240 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 46978977 - 46978797
Alignment:
Q  240 acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatt 339  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46978977 acaattcattacacatcattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcattaggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatt 46978878  T
Q  340 ccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
     ||||||||||||| ||||||||  |||||   |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46978877 tcgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgttttccatgtgtattcatctct 46978797  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 94537 - 94700
Alignment:
Q  63 cagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttac 158  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  94537 cagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttac 94636  T
Q  159 aattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  94637 aattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 94700  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 471062 - 470840
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| |||| | | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  471062 tgattatgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaggtctttt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggc 470964  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  470963 aaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataagtacaatatcttttaccattgttcataatttaatcaaaccgacatttggttcaaat 470864  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    || ||||| |||||||||||||||    
T  470863 tatacaaacgtttgaaattcatca 470840  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22346034 - 22345818
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22346034 attatgcagacagtgggttctgcataattctaatgcatttccaagccattt-ttcgaccagtttttacctgtaattaagccagagcatttccaaaggcaa 22345936  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 204  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||  | | || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  22345935 tataaatcatacaacattgaaactcggaccaagaaaa-atacaatatcttttacaattgtccataagtaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaca 22345837  T
Q  205 aaggtttgaaattcatcaa 223  Q
    || ||||||||||||||||    
T  22345836 aacgtttgaaattcatcaa 22345818  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 222
Target Start/End: Original strand, 31780054 - 31780270
Alignment:
Q  10 tgcagacagtgacttctgcataattctaaac-atgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaata 108  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||||||||  || ||||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||| |    
T  31780054 tgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaatatttccaagc-attttttcggccaatttttacctgtaattaagccagagcatttcgaatggcaaaaca 31780152  T
Q  109 attcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||    
T  31780153 attcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattaggttcaaattacaca 31780252  T
Q  205 aaggtttgaaattcatca 222  Q
    || |||||||||||||||    
T  31780253 aacgtttgaaattcatca 31780270  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 222
Target Start/End: Original strand, 16281831 - 16281999
Alignment:
Q  57 ttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatc 152  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||| |||||     
T  16281831 ttcggtcagtttttac-tgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcggacataaacaagaaaaatacaatatt 16281929  T
Q  153 ttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16281930 ttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 16281999  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 240 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 4518135 - 4517959
Alignment:
Q  240 acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatt 339  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4518135 acaactcattacacatcattatat--aatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatatt 4518038  T
Q  340 ccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatct 418  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  | |||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4518037 ccgaaacataaatccgacgttgctatagtctttaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattcatct 4517959  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 223
Target Start/End: Original strand, 19521711 - 19521900
Alignment:
Q  37 aaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacata 136  Q
    |||||| |||||||||||| || || || ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19521711 aaacatttccaagccatttttt-ggtcactttttacctgcaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacagcattgaaactcggacata 19521809  T
Q  137 aacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaa 223  Q
    ||||||| |||    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19521810 aacaagaaaaatactatatcttttacaattgtctataattaaatcaaatcgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaa 19521900  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21144621 - 21144405
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||| |||||||||  |||| || |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21144621 attatgaagacagtgagctctgtatgattctaaaacatttccaagccattt-ttcggccagtttttatctgtaagtaaagcagagaatttcgaaaggcaa 21144523  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  21144522 aataattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtctataattaaatcaaatcgacatttggttcaaatta 21144423  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattc 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  21144422 cacaaacgtttgaaattc 21144405  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 219
Target Start/End: Original strand, 50617326 - 50617503
Alignment:
Q  46 caagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagata 145  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  50617326 caagccattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaagcacaacattttgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactctgacataaacaaaaaa 50617424  T
Q  146 a-----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattca 219  Q
    |     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  50617425 aaacacaatattttttacaattgtccatatttaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattca 50617503  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23359341 - 23359217
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23359341 tgattatacagacagcaagttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 23359242  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaact 128  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  23359241 aaataattcatacaagattgaaact 23359217  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 12643311 - 12643368
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcgg 61  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  12643311 tgattatgcagacagtttgttctgcataattctaaacattttcaagccattttttcgg 12643368  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Original strand, 1179878 - 1179924
Alignment:
Q  184 acatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta 230  Q
    |||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  1179878 acatttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacatta 1179924  T

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Target: chr4 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 3408232 - 3407802
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3408232 tgattatgtagacagtgggttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 3408133  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3408132 aaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaaaat 3408033  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3408032 taaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 3407933  T
Q  290 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatat 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3407932 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatat 3407833  T
Q  390 agcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407832 agcttgccgttttccatgtgtattcatctct 3407802  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Original strand, 49563920 - 49564352
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  49563920 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggt 49564019  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49564020 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatattttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaa 49564119  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49564120 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 49564219  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  49564220 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 49564319  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49564320 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 49564352  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 19069268 - 19069710
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19069268 tgattatgcagacagtgggt-ctgcataattgtaaacatttccaagccattttttcgaccagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 19069366  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19069367 aaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtaaaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 19069466  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaa--------------acattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 276  Q
    ||||||| |||||||||||||||||              |||||||| |||         ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19069467 aaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattgcacatcattaaattaaatccctactt 19069566  T
Q  277 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaata 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19069567 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatgtataatatattatcttccaccatattccgaaacataaacccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 19069666  T
Q  377 agccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19069667 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 19069710  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 10423397 - 10422971
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10423397 attatgcagacagtgggttttgcataaatctaaagcaattccaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaa 10423299  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa---atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  10423298 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacattaggttcaaattac 10423199  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca---------tagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||         || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10423198 acaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaatgtgtccataattaaacaactcattacatatcattagattaaatccctacttacattcaacgcaattg 10423099  T
Q  293 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagc 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  10423098 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgcaatcgccgcgaataagccaagacatatagc 10422999  T
Q  393 ttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  10422998 ttgtcgttttccatgtgtattcgtctct 10422971  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Original strand, 38460508 - 38460935
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38460508 attatgcagtcagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccattt-ttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaa 38460606  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  38460607 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatataatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttgattcaaatta 38460706  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 291  Q
     ||||| ||||||||||||||||||  |||         |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  38460707 cacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaatt 38460806  T
Q  292 gcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatag 391  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||   |||||||||| ||||||||    
T  38460807 gcatatgcaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccaacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatag 38460906  T
Q  392 cttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38460907 cttgccgttttccatgcgcattcatctct 38460935  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 147 - 420
Target Start/End: Original strand, 10374267 - 10374549
Alignment:
Q  147 aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca---------tagtt 237  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||         || ||    
T  10374267 aataccttttacagttgtccataattaaatgaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaggtgtccataatt 10374366  T
Q  238 aaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccata 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10374367 aaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccata 10374466  T
Q  338 ttccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    || |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10374467 tttcgaaacataaatctgatgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctct 10374549  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 4774604 - 4774167
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  4774604 attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttccaagccattt-ttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaagccaa 4774506  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| | |||||||||| |||||| | ||||| ||||    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||    
T  4774505 tataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaatcgacatttggttcaaaata 4774406  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaac----------tcattacacatcattaaattaaatccctacttacatt 281  Q
     ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||         ||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4774405 cacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatg 4774306  T
Q  282 caacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcca 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  4774305 caacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagcca 4774206  T
Q  382 atgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4774205 agccatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 4774167  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Original strand, 18578706 - 18579142
Alignment:
Q  7 ttatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  18578706 ttatgcagacagtggattctgcataattgttaagcatttccaagccattt-ttcggctagtttttacttgtaattcaaccagagtatttccaaaggcaat 18578804  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    |||| | |||||||||| ||||||   ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||     
T  18578805 ataacttatacaacatttaaactcactcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttgattcaaaatac 18578904  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaa----------ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattc 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||         |||||||          |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18578905 acaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatcacttcttacattc 18579004  T
Q  283 aacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaa 382  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||   ||| ||||||    
T  18579005 aacgcaattgcatatagaactaacatacatatataatatattatcttctaccatattccgaaacataaattcgacgtcgctatcgtcttcaattagccaa 18579104  T
Q  383 tgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18579105 ggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 18579142  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37395209 - 37394977
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37395209 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaacattttcaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggaa 37395110  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  37395109 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttgattcaaatt 37395010  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  37395009 acacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttaca 37394977  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 50905147 - 50904819
Alignment:
Q  12 cagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||     
T  50905147 cagacagtgagttctgcataattctaatgcatttccaagccattt-ttcggccaatttttacctgtaattaaaccagagcatttctaaatgcaatataaa 50905049  T
Q  111 tcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  50905048 tcatacaacattgaaactcgaacataaacaagaaaaatatgaaatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaa 50904949  T
Q  207 ggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatat 297  Q
     |||||||||||||||||||  ||         |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50904948 cgtttgaaattcatcaaaacgatacaaagtgttcataattaaacaattcatttcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatat 50904849  T
Q  298 ggaacgaacatacatatataatatattatc 327  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  50904848 ggaacaaacatacaaatataatatattatc 50904819  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 231 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 37394955 - 37394768
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37394955 cataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 37394856  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatct 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37394855 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatacaacttgccgttttccatgcgtattcatct 37394768  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 224
Target Start/End: Original strand, 15995803 - 15996026
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15995803 tgattatgcagacagtgggt-ctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 15995901  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15995902 aaataattcatacaagattgaaagtcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 15996001  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaa 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  15996002 aaacaaacgtttgaaattcatcaaa 15996026  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 231 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 44050831 - 44050650
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44050831 cataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttgcattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 44050732  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtatt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||    
T  44050731 caccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaa-acatatagcttgttgttttccatgcgtatt 44050650  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44051083 - 44050853
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44051083 attatgcaaacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccattt-ttcggccagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 44050985  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  44050984 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 44050885  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44050884 cacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttaca 44050853  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 153 - 420
Target Start/End: Original strand, 24415392 - 24415680
Alignment:
Q  153 ttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||         |||||||    
T  24415392 ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaa 24415491  T
Q  244 ----------ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccac 333  Q
              ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  24415492 cacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccat 24415591  T
Q  334 catattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgc--atatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||  |||||   |||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24415592 catattccgaaacataaatgcaacgtcgctatcgtcttcaataagtcaaggcatatatagcttgtcgttttccatgtgtattcatctct 24415680  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 51492152 - 51492374
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51492152 tgattatgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaagcctttt-ttcagccagattttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggc 51492250  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  51492251 aaaataattcatacaacattaaaactcgaacataaacaagataagtacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaat 51492350  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    || ||||| |||||||||||||||    
T  51492351 tacacaaacgtttgaaattcatca 51492374  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 50278814 - 50278593
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaac-atgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  || | |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  50278814 attatgcagacagtgagctctgcatgattctaaaatattttcaagccattttttcgatcagtttttacctgtaattaaaacagagcatttcgaaaggcaa 50278715  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  50278714 aataatctatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattattcataattaaatcaaaccgacatttggttgaaatta 50278615  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  50278614 cacaaacgtttgaaattcatca 50278593  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 11506831 - 11506657
Alignment:
Q  246 cattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaa 345  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  11506831 cattacacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcaaaa 11506732  T
Q  346 cataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||| ||||||||  | |||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11506731 cataaatccgacgtcgctattgtctttaataagtcaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 11506657  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 44674219 - 44674440
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| || || |||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  44674219 tgattatgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaagccttttttt-ggccagttttccc-tgtaattaaatcagagcatttcgaaaggc 44674316  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44674317 aaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataagtacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaat 44674416  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    || |||||  ||| ||||||||||    
T  44674417 tacacaaacatttaaaattcatca 44674440  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 37016038 - 37016201
Alignment:
Q  63 cagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttac 158  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  37016038 cagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacatcattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttac 37016137  T
Q  159 aattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||| || |||||| | ||| |||||||||||||||    
T  37016138 aattgtccataattaaatcaaactgacgtttgattcaaattacagaaacgtttgaaattcatca 37016201  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 317
Target Start/End: Original strand, 51642165 - 51642423
Alignment:
Q  82 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaatt 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||     
T  51642165 aaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcgatcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 51642264  T
Q  178 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaa----------acaactcattacacatcat 258  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||         |||| ||||          ||||||||||||| |||||    
T  51642265 aaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaattgtccataattaaacaacacattacaactcattacatatcat 51642364  T
Q  259 taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatata 317  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51642365 taagttaaatcccaacttacattcatcacaattacatatagaacgaacatacatatata 51642423  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 382
Target Start/End: Original strand, 6186786 - 6187130
Alignment:
Q  63 cagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacata--aacaagataaaa----tatctttt 156  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  | || ||||||||| | |||| | ||||  ||||||| |||     ||||||||    
T  6186786 cagtttttacctgtaattcaaccaaagcatttccgaaggcaatactagtcgtacaacatttatactcagtcatataaacaagaaaaatacattatctttt 6186885  T
Q  157 acaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactca 247  Q
    | | | ||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||| ||    
T  6186886 atagtagtcaataattaaatcaatccgacatttcgttaaaattacacgtatgtttgaaattcatcaaaacattaaagggtgtccataattaaacaacaca 6186985  T
Q  248 ttacac----------atcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccata 337  Q
    |||||           |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6186986 ttacaacatattacatatcattaaattaaatctctactgacattctacgcatttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccata 6187085  T
Q  338 ttccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaa 382  Q
    || | |||||||||||  | |||||  |||||| |||||||||||    
T  6187086 ttgctaaacataaatccaatgtcgctatcgtcgtgaataagccaa 6187130  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30043365 - 30043046
Alignment:
Q  63 cagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaaa----tatcttttac 158  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |  |||| ||||||||| | |||  | ||||||||||| |||     ||||||||||    
T  30043365 cagtttttacatgaaattcaaccagagcatttcaagaggcaatactattcgtacaacatttatactaagtcataaacaagaaaaatgtattatcttttac 30043266  T
Q  159 aattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta--------catagttaaacaactca--- 247  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| |   |||||||||| ||  | |||||||||| ||||||||||||        |||| ||||||||| ||       
T  30043265 aattatccataattaaatcaatccgacgtagagttaaaattacacggatgtttgaaatttatcaaaacattaaagagtgccataattaaacaacacacta 30043166  T
Q  248 -------ttacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattc 340  Q
           ||||| ||| |||||| ||||| ||  | |||||| | | | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30043165 caacacattacatatcgttaaatgaaatctctggtgacattctatgaagttgcaaatggaacgaaaatacaaatataatatattatcttccaccatattc 30043066  T
Q  341 cgaaacataaatctgacgtc 360  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  30043065 tgaaacataaatccgacgtc 30043046  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 129
Target Start/End: Original strand, 24414917 - 24415040
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  24414917 attatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccatttat-cggacagtttttacctgtaattaaaccagaacatttccaaagataa 24415015  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactc 129  Q
     |||| ||| | |||||| ||||||    
T  24415016 tataactcagaaaacatttaaactc 24415040  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 374
Target Start/End: Original strand, 31598816 - 31598954
Alignment:
Q  236 ttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccacca 335  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||| |||||  ||||  | |||||| || | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  31598816 ttaagcaactcattacataacattatatgaaatctctactgacattctacgcacatgcagttagaacgaccacaaatatataatatattattttcaacca 31598915  T
Q  336 tattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaa 374  Q
    |||  | |||||||||||| | ||||| |||||| ||||    
T  31598916 tatgtctaaacataaatcttatgtcgctgtcgtcacgaa 31598954  T

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Target: chr8 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 39538 - 39967
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
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T  39538 tgattatgcagacagtgagttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccaatttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 39637  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39638 aaataattcatacaagattgaacctcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 39737  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39738 aaacaaacatttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 39837  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||||    
T  39838 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacatcgccgtcgttgcgaataagcaaagacatata 39937  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
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T  39938 gcttgtcgttttccatgcgtattcatctct 39967  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 23924047 - 23924475
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
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T  23924047 tgattatgcagacaatggattatgcataattctaaacattttcaagccattt-ttcggtcagtttttacctgtaattaaactagagcatttccaaaggca 23924145  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23924146 aaataattcatacaagattgaaactcggacataaaaaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 23924245  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23924246 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaac 23924345  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23924346 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 23924445  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
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T  23924446 gcttgccgttttccatgcgtattcatctct 23924475  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 35962388 - 35962817
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
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T  35962388 tgattatgcaggcagtgggttctgcataattctaaacattttcaagccattttttcggccaatttttacgtgtaattataccagagtattacaaaaggca 35962487  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35962488 aaataattcatacaacattaaaactcggatataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgaaatttggttcaaatt 35962587  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||         ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35962588 acacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtgcataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaattcctacttacattcaacgcaat 35962687  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  35962688 tgcatatggaacgaacatacgtatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatata 35962787  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35962788 gcttgtcgttttccatgcgtattcatctct 35962817  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 420
Target Start/End: Original strand, 30301233 - 30301645
Alignment:
Q  23 ttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatac--aaca 120  Q
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T  30301233 ttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatga 30301332  T
Q  121 ttgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaat 216  Q
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T  30301333 ttgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaat 30301432  T
Q  217 tcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaaca 307  Q
    |||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30301433 tcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaaca 30301532  T
Q  308 tacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatg 407  Q
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T  30301533 tacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatg 30301632  T
Q  408 tgtattcatctct 420  Q
     ||||||||||||    
T  30301633 cgtattcatctct 30301645  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 7344550 - 7344119
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
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T  7344550 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggt 7344452  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344451 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaa 7344352  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7344351 attaaatagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 7344252  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  7344251 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 7344152  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7344151 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 7344119  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Original strand, 8419484 - 8419915
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
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T  8419484 ttgattatgcagacaataagttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttatctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggt 8419582  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419583 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaa 8419682  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8419683 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 8419782  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8419783 aattacatatggaacgaacgtacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 8419882  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8419883 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 8419915  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Original strand, 32375731 - 32376162
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
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T  32375731 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggt 32375829  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||| ||||||  ||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32375830 aatataattcatatgtatgattgaaactcgaacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaatcgacatttggttaaa 32375929  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32375930 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 32376029  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  32376030 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaataagcaaaggcat 32376129  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32376130 atagcttgccgtttcccatgcgtattcatctct 32376162  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20549250 - 20548938
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20549250 tgattatgcagacagcaagttctgcataattctaaacatttccaagccatca-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaagaca 20549152  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20549151 aaataattcatacaagattgaaactcggatataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgaaatttggttaaaatt 20549052  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20549051 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccttacttacattcaacgcaat 20548952  T
Q  291 tgcatatggaacga 304  Q
    ||||||||||||||    
T  20548951 tgcatatggaacga 20548938  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Original strand, 43679479 - 43679906
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    ||||| |||||||||  || |||||||||||||| ||| |||||  ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  43679479 attatacagacagtgggttttgcataattctaaagcatttccaaatcatttttt-ggctaatttttacatgtaattaaaccaaaatatttccaaaggcaa 43679577  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43679578 tataaatcatacaaaattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 43679677  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 291  Q
     ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||         |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  43679678 cacaaaagtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtgttcataattaaacaactcattacacatcattatattaaatccctgcttacattcatcacaatt 43679777  T
Q  292 gcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatag 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||   |||||| ||| |||||||     
T  43679778 gcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtctctatcgtctttaataagtcaaggcatataa 43679877  T
Q  392 cttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||    
T  43679878 cttgtcgttttccatgcgtgttcatctct 43679906  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 4867791 - 4867380
Alignment:
Q  8 tatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaa 106  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4867791 tatgcagacagtgggttttgcataattctaaagcatttccaagccatttttt-ggccagtttttacttgtaattaaactagagcatttccaaaggcaata 4867693  T
Q  107 taattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaa 202  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||| || |    
T  4867692 taactcatacaacatttaaactcagtcataaacaagaaaaatacaatatctttcaccattgtccataattaaatcaaaccaacatttgatttaaaataca 4867593  T
Q  203 caaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt-----taa--------------acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattca 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||     |||              ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4867592 caaaagtttgaaattcatcaaaacattacatagtctccataattaaacaacagattacaactcattacttatcattaaattaaatccctacttacattca 4867493  T
Q  284 acgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaat 383  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||   || || |||||||||||||    
T  4867492 acgcaattggatatggaacgaacatacgtatataatatattattttccaccataatccgaaacataaatccgacgtcgttatcatctcgaataagccaat 4867393  T
Q  384 gcatatagcttgc 396  Q
    ||| |||| ||||    
T  4867392 gcacataggttgc 4867380  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 147 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 22588287 - 22588006
Alignment:
Q  147 aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------t 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||         |    
T  22588287 aatatcttttacaattatccataattaaatcaaaccgacattaggttcaaattacacaaacgtttgaaattgatcaaaacgttacaaagtgtccataatt 22588188  T
Q  238 aaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccata 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22588187 aaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttccaccata 22588088  T
Q  338 ttccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctc 419  Q
    || | ||||||||||| ||||||||  |||||   ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22588087 tttcaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattagccaagacatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 22588006  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31960053 - 31959821
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31960053 tgattatgcagacagcaagttctgcataattctaaacatttgcaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 31959954  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31959953 aaataattcatataagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcatgattaaattaaacccacatttggttaaaatt 31959854  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31959853 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattaca 31959821  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 31959799 - 31959610
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31959799 cataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttc 31959700  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31959699 caccatattccaaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 31959610  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 43377031 - 43376842
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43377031 cataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 43376932  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43376931 caccatattccgaaacataaatctgacgtcactatcgtcgcgaataaaccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctct 43376842  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 147 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 7172172 - 7171880
Alignment:
Q  147 aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------t 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||         |    
T  7172172 aatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacccacattttgttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatgaaaacgttacatagtgtccataatt 7172073  T
Q  238 aaacaactcattaca----------catcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatc 327  Q
    ||||||| |||||||          ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7172072 aaacaacacattacaactcagtacacatcattaaattaaatctctacttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatt 7171973  T
Q  328 ttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7171972 ttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattcatctct 7171880  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 323
Target Start/End: Original strand, 39751144 - 39751473
Alignment:
Q  7 ttatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |||  ||| ||||||| |||| || || |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39751144 ttatgcagacagtggattctgcatatttataatgcatttccaagctatttttt-ggccagtttttaactataattaaaccagagcatttccaaagacaat 39751242  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||     
T  39751243 ataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccgtaattaaatcaaactgacatttggttcaaattac 39751342  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39751343 acaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgtaattg 39751442  T
Q  293 catatggaacgaacatacatatataatatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39751443 catatggaacgaacatacatatataatatat 39751473  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 22661506 - 22661137
Alignment:
Q  64 agtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaaa----tatcttttaca 159  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  || | |  ||||||||| | |||| | ||||||||||| |||     ||||||||||     
T  22661506 agtttttacctgtaattcaactagagcatttccaaaggcattattagttgtacaacatttatactcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttacg 22661407  T
Q  160 attgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcatta 250  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||         |||| ||||||||| |||||    
T  22661406 gttgtccataattaaatcaaaccgatatttcgttaaaattacacgaatgtttgagattcatcaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacatta 22661307  T
Q  251 cacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataa 350  Q
    || ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  22661306 catatcgttaaattaaatctctactgacattctgcgcagttgcatatggaacgaacatacatatataatatatcatcttccaccatattccgaaacatag 22661207  T
Q  351 atctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    | | ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22661206 acccgacgtcgctatcgtcgtgaataagccaaggcatatggcttgccgttttccatgcatattcatctct 22661137  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Original strand, 41743947 - 41744162
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41743947 attatgcagacagtgggttctgcataattttaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 41744046  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  41744047 ataatttatacaagattgaaactcgaacataaacaagataaatacaatattttttacaattgtccatgattaaattaaaccgacatttggttcaaattac 41744146  T
Q  202 acaaaggtttgaaatt 217  Q
    ||||| ||||||||||    
T  41744147 acaaacgtttgaaatt 41744162  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Original strand, 2124515 - 2124704
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2124515 cataattaaacaactcattacacatcattaaattaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaaaatacatatataatatattatcttc 2124614  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2124615 caccatattccgaaacataaatccaaagtcgctattgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctct 2124704  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43377283 - 43377053
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43377283 attatgcagacagtgggttctacataattctaaagcatttccaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 43377185  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||    
T  43377184 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatgaaaccgaaatttggttcaagtta 43377085  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  43377084 cacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttaca 43377053  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 34366992 - 34367214
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34366992 tgattatgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaagcctttt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggc 34367090  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  34367091 aaaacaattcatacagcattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaat 34367190  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    || ||||| |||||||||||||||    
T  34367191 tacacaaacgtttgaaattcatca 34367214  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 247 - 420
Target Start/End: Original strand, 41744160 - 41744333
Alignment:
Q  247 attacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaac 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41744160 attacacatcattaaattaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggagcgaatatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaat 41744259  T
Q  347 ataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41744260 ataaatccgacgtcgctatcgtcatgaataagccaaggcatataacttgtcgttttccatgcgtattcatctct 41744333  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 41238932 - 41239150
Alignment:
Q  7 ttatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    ||||||| ||||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  41238932 ttatgcaaacagtaagctctgcatgattctaaaacatgtccaagccattt-ttcagtcagttttaacctgtaattaaagcagagcatttcgaaatgcaaa 41239030  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||     
T  41239031 ataattcatacaacattgaatctcggacataaacaagacaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttgattcaaattac 41239130  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  41239131 acaaacgtttgaaattcatc 41239150  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 2124260 - 2124493
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaat---taaaccagagcatttccaaagg 101  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || ||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||    
T  2124260 attatgcagacagtgggttctgcataattctaatgcatttccaagccattt-ttcggccactttttacctggaatatttaaaccagagcatttccaaagg 2124358  T
Q  102 caaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaa 197  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  2124359 caatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccatagttaaatcaaaccgacatttggttcaaa 2124458  T
Q  198 ttaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  2124459 ttacacaaacatttgaaattcatcaaaacgttaca 2124493  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Original strand, 23578517 - 23578705
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23578517 attatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaaaccattt-ttcagccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 23578615  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttg 190  Q
     |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23578616 tataaattatacaacattgaaactctgtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttg 23578705  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 315 - 414
Target Start/End: Original strand, 39751659 - 39751758
Alignment:
Q  315 ataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattc 414  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39751659 ataatatattatcttctaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaagacatatagtttgccgttttccatgcgtattc 39751758  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 1116206 - 1116105
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1116206 tgattatgcagacagagggttctgcataattctaaacaattccaagccattttttcggccag-ttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 1116108  T
Q  104 aaa 106  Q
    |||    
T  1116107 aaa 1116105  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 418
Target Start/End: Original strand, 31280953 - 31281318
Alignment:
Q  66 tttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaaga----taaaatatcttttacaat 161  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||| | || ||||||| |||| | | |||| |||||||||||    || |  ||||||||||||    
T  31280953 tttttacctgtaattcaaccagagcatttccagagacaatacaactcatacaccatttataatcggtcataaacaagaacaatacataatcttttacaat 31281052  T
Q  162 tgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca--aaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcatta 250  Q
    || |  ||||||||| || | ||||||| |||||||||  |||  || |||||||||||||||||| |||| | |||         |||||||| |||||    
T  31281053 tgactgtaattaaatcaatctgacatttcgttaaaattttacacgaatgtttgaaattcatcaaaatattaaagagtgcttgaaattaaacaacacatta 31281152  T
Q  251 cacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataa 350  Q
    || ||||||| || | ||   ||   |||||| |||||  |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31281153 catatcattacataagatatttatcaacattctacgcacgtgcagatggaacgaacataaagatataatatattatcttcaaccatattctgaaacataa 31281252  T
Q  351 atctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatct 418  Q
    |||  ||||  |  ||||| ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||  ||| |||||||    
T  31281253 atcctacgt--ctatcgtcacgaataagccaatgcttataaatcgccgttttccacatgtcttcatct 31281318  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30972717 - 30972519
Alignment:
Q  149 tatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taa 239  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| ||  | |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||         |||    
T  30972717 tatcttttacggttgtcgataattaaatcaattcaacatttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacattacagagtatacataattaa 30972618  T
Q  240 acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatat 338  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||  |||   |||||| |||||  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30972617 acaacacattacacatcattacataaaatatctatcgacattctacgcatgtgcaaatggaacaaacacacatatataatatattatcttcaaccatat 30972519  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 7172605 - 7172465
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagttttt--acatgtaattaaaccagagcatttccaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||   | ||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7172605 tgattatgcagacagtggcttctgcataattctaaagcatttccaagccgttt-ttcaacctgtttttttacttgtaattaaaccagagcattttcaaag 7172507  T
Q  101 gcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag 142  Q
    |||| |||| | |||||||||| |||||  | ||||||||||    
T  7172506 gcaatataacttatacaacatttaaacttagtcataaacaag 7172465  T

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Target: scaffold0494 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 5319 - 4889
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5319 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctagacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggct 5220  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5219 aaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaaaat 5120  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 289  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5119 taaacaaacgtttgaaattcatgaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 5020  T
Q  290 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatat 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5019 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatat 4920  T
Q  390 agcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4919 agcttgccgttttccatgcgtattcatctct 4889  T

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Target: chr7 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 15070343 - 15069913
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  15070343 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctagacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaaataaaccagagcatttccaaaggct 15070244  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15070243 aaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaaaat 15070144  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070143 taaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 15070044  T
Q  290 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatat 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15070043 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatat 15069944  T
Q  390 agcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15069943 agcttgccgttttccatgcgtattcatctct 15069913  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 18109786 - 18109356
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18109786 tgataatgcagacagtgggttctgcataattctaaacatttccaaaccattttttcggccagtttttatctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 18109687  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18109686 aaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaaaat 18109587  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18109586 taaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 18109487  T
Q  290 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatat 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18109486 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatat 18109387  T
Q  390 agcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18109386 agcttgccgttttccatgcgtattcatctct 18109356  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 47742981 - 47742552
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47742981 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaacatttccaagccatttttttggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggca 47742882  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  47742881 aaataattcatacaacattgaaacatggacaaaaacaagataaatgcaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccaacatttggttcaaatt 47742782  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47742781 acacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 47742682  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  47742681 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaataagccaaggcatata 47742582  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47742581 gcttgtcgttttccatgcgtattcatctct 47742552  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 603860 - 604289
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  603860 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagaacatttccaaaggta 603959  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  603960 aaataattcatacaagattgaaactcgaacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaatcgacatttggttaaaatt 604059  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  604060 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 604159  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  604160 tacatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 604259  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  604260 gcttgccgttttccatgcgtattcatctct 604289  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 42503831 - 42503401
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  42503831 tgattatgcagacagtgagttctgcataattctagacatttccaagctattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatctccaaaggct 42503732  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaat 198  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42503731 aaataattcatgcaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttataattgttcatgattaaattaaaccaacattttggttaaaat 42503632  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42503631 taaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaa 42503532  T
Q  290 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatat 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  42503531 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatgt 42503432  T
Q  390 agcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42503431 agcttgccgttttccatgcgtattcatctct 42503401  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 6 - 414
Target Start/End: Original strand, 34622581 - 34623002
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622581 attatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccattt-ttcggtcagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 34622679  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34622680 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaataagaaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 34622779  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 291  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||         |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  34622780 cacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaacttctacttacattcaacgcaatt 34622879  T
Q  292 gcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatag 391  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  34622880 gcatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatag 34622979  T
Q  392 cttgccgttttccatgtgtattc 414  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  34622980 cttgccgttttccatgcgtattc 34623002  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 30791001 - 30790569
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  30791001 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccattttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggt 30790902  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790901 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatagaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaa 30790802  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30790801 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 30790702  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  30790701 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 30790602  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30790601 atagcttgctgttttccatgcgtattcatctct 30790569  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 45767854 - 45767423
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  45767854 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggt 45767756  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45767755 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaa 45767656  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45767655 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 45767556  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  45767555 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 45767456  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45767455 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 45767423  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Original strand, 43619759 - 43620190
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  43619759 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggt 43619857  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  |||||||||| |||||||  ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43619858 aatataattcatatgtatgattgaaactcagacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaa 43619957  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43619958 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 43620057  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  43620058 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 43620157  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43620158 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 43620190  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 418
Target Start/End: Original strand, 10705328 - 10705765
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  10705328 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcacttccaagtcattt-ttcggtcaatttttacatgtaatttaaccaaagcatttctaaaggc 10705426  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    || |||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  10705427 aatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaa 10705526  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaa----------ctcattacacatcattaaattaaatccctacttaca 279  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||         |||||||          |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10705527 tacacaaaagtttaaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaatacattacaactcattacacatcaataaattaaatctctacttaca 10705626  T
Q  280 ttcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagc 379  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||   ||| |||    
T  10705627 ttcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatcatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattagc 10705726  T
Q  380 caatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatct 418  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10705727 caaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatct 10705765  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40928945 - 40928715
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40928945 tgattatgcagacagtgagttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 40928846  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40928845 aaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 40928746  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40928745 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacatta 40928715  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Original strand, 19044627 - 19044816
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19044627 cataattaaacaaatcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 19044726  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  19044727 caccatatttcgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcatattcttctct 19044816  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 20710009 - 20709820
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20710009 cataattaaacaaatcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 20709910  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  20709909 caccatatttcgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcatattcttctct 20709820  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 247 - 420
Target Start/End: Original strand, 29592839 - 29593012
Alignment:
Q  247 attacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaac 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29592839 attacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatgtattatcttccaccatattccgaaac 29592938  T
Q  347 ataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29592939 ataaatctgacgtcgctatcgttgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcgtattcatctct 29593012  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 29592624 - 29592841
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29592624 tgattatgcagacagtggattctgcataattttaaacatttccaaaccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggaa 29592723  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29592724 aaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaatt 29592823  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaatt 217  Q
    | |||||  |||||||||    
T  29592824 acacaaacttttgaaatt 29592841  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 416
Target Start/End: Original strand, 12111398 - 12111729
Alignment:
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  12111398 ataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttataattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattac 12111497  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaa----------ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattc 282  Q
    || || |||| |||||||||||||| |||         |||| ||||||||          ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12111498 accaaagtttaaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacaatacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattc 12111597  T
Q  283 aacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaa 382  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||   ||||| ||||    
T  12111598 atcacaattgcatatggaacgaacatacatatata--atattattttccaccatattccgaaatataaatccgacgtcgctatcatctttaataaaccaa 12111695  T
Q  383 tgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcat 416  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12111696 ggcatatagcttgtcgttttccatgtgtattcat 12111729  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 47065046 - 47064857
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47065046 cataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttc 47064947  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  || ||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47064946 caccatatttcgaaacataaatttgacgtcgctatcatctttaataaaccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 47064857  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17838621 - 17838405
Alignment:
Q  10 tgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaata 108  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  17838621 tgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaagcctttt-ttcggccagtatttacttgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaaca 17838523  T
Q  109 attcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  17838522 attcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaca 17838423  T
Q  205 aaggtttgaaattcatca 222  Q
    || |||| ||||||||||    
T  17838422 aacgtttaaaattcatca 17838405  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 5537929 - 5538147
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  5537929 attatgtagacagtgagctctgcatgattctaaaacattttcaagccattt-ttcggtcagtttttac--gtaattaaagcagagcatttcgaaagggaa 5538025  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaaga----taaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5538026 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaataaaatatcttatacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 5538125  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  5538126 tacaaacgtttgaaattcatca 5538147  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34742385 - 34742168
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  34742385 attatgcagacagtgaactctgcatgattctaaaacatttccaagccattt-ttcggtcagtttttacctgtaattaaagtagagcatttcgaaaggcaa 34742287  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  34742286 aa-aattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaatcgacatttgattcaaatta 34742188  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcat 220  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  34742187 cacaaacgtttgaaattcat 34742168  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 19044375 - 19044605
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||| ||||  || |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19044375 attatgcagatagtgggttttgcataattctaatgcatttccaagccattt-ttcggctagtttttacctgtaattaaaccagagaatttccaaaggcaa 19044473  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| |||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19044474 tataaatcatacaacattgaaattgggtcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 19044573  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19044574 cacaaacgtttgaaattcatcaaaacattaca 19044605  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20710261 - 20710031
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||| ||||  || |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20710261 attatgcagatagtgggttttgcataattctaatgcatttccaagccattt-ttcggctagtttttacctgtaattaaaccagagaatttccaaaggcaa 20710163  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| |||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20710162 tataaatcatacaacattgaaattgggtcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 20710063  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20710062 cacaaacgtttgaaattcatcaaaacattaca 20710031  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13323705 - 13323485
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||| | |||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  13323705 attatgcagataatgagctcttcataattctaaaacatttccaagccattt-ttcgggcagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggtaa 13323607  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  13323606 aataattcatacaacgttgaaactgagacattaacaagaaaaatacaatattttttacaattttccataattaaattaaaccggcatttcgttcaaatta 13323507  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  13323506 cacaaacgtttgaaattcatca 13323485  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10522360 - 10522285
Alignment:
Q  147 aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  10522360 aatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatca 10522285  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47065148 - 47065075
Alignment:
Q  152 cttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  47065148 cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttgatttaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaa 47065075  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 104
Target Start/End: Original strand, 12111341 - 12111382
Alignment:
Q  63 cagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12111341 cagtttttacttgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaa 12111382  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 36186490 - 36186416
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaatt 80  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  36186490 attatacatacagtgagttctgcataattctaaagcattttcaagccattt-ttcggtcagtttttacctgtaatt 36186416  T

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Target: chr2 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 24754016 - 24753587
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24754016 tgattatgcagacagcaagttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 24753917  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24753916 aaataattcatacaagattgaaactgggacataaacaagataaatacaatatcttttacaatttttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 24753817  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24753816 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 24753717  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24753716 tgcatatggaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatacgatgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaagcatata 24753617  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24753616 gcttgccgttttccatacgtattcatctct 24753587  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 39798431 - 39798003
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||      
T  39798431 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctagacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagacaatttccaaaggtt 39798332  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  39798331 aaataattcatacaatattgaaactcggtcataatcaagataaatgcaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaacat 39798232  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt-------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39798231 taaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaatt 39798132  T
Q  292 gcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatag 391  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39798131 acatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatag 39798032  T
Q  392 cttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39798031 cttgccgttttccatgcgtattcatctct 39798003  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 7267436 - 7267007
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7267436 tgattatgcagacagtgggt-ctgcataattgtaaagcatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 7267338  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7267337 aaaataatttatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaacctacatttggttaaaat 7267238  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7267237 taaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaa 7267138  T
Q  290 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatat 389  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  7267137 ttacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggtatat 7267038  T
Q  390 agcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7267037 agcttgtcgttttccatgcgtattcatctct 7267007  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 3795418 - 3795860
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795418 tgattatgcagacagtgggt-ctgcataattctaaacatttccaagccatttttttggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 3795516  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795517 aaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 3795616  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaa--------------acattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 276  Q
    ||||||| |||||||||||||||||              |||||||| |||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795617 aaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 3795716  T
Q  277 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaata 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3795717 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcacgaata 3795816  T
Q  377 agccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3795817 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 3795860  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 41564485 - 41564053
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  41564485 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggt 41564386  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41564385 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaa 41564286  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41564285 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 41564186  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  41564185 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 41564086  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41564085 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 41564053  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Original strand, 41181493 - 41181920
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||  ||| |||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41181493 attatgcagacagtgggttatgcataattctaatgcatttccaagccattttttggg-cagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 41181591  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41181592 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataactaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 41181691  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 291  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41181692 cacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 41181791  T
Q  292 gcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatag 391  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41181792 acatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgtataagccaatgcatatag 41181891  T
Q  392 cttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41181892 cttgccgttttccatgcgtattcgtctct 41181920  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Original strand, 28342605 - 28343033
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaaca-tgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28342605 attatgcagacagtgggttctgcataattctaaagaatttccaaactattt-ttcggccagtttttatctgtaattaaaccagaacatttccaaaggcaa 28342703  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28342704 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 28342803  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 291  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||         ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342804 cacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgttcataattaaacaattcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 28342903  T
Q  292 gcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccg-aaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  28342904 gcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatata 28343003  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28343004 gcttgccgttttacatgtgtattcgtctct 28343033  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 5351725 - 5351294
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  5351725 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggt 5351627  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5351626 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaa 5351527  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5351526 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 5351427  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  5351426 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 5351327  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5351326 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 5351294  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Original strand, 10620053 - 10620484
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  10620053 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggt 10620151  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10620152 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaa 10620251  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10620252 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 10620351  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  10620352 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 10620451  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10620452 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 10620484  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 45479816 - 45479384
Alignment:
Q  1 aattgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45479816 aattgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcattttcaagctattt-ttcggccagtttttacttgtaatttaaccagagcatttccaaa 45479718  T
Q  100 ggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaa 195  Q
    ||||| |||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  45479717 ggcaatataactaatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttggttca 45479618  T
Q  196 aattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacg 286  Q
    || || | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||         |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45479617 aaatacaaaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacg 45479518  T
Q  287 caattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| |||    
T  45479517 caattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgccgatatcgtcgcgaataagccaaggca 45479418  T
Q  387 tatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45479417 tatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 45479384  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Original strand, 209064 - 209495
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  209064 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggt 209162  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209163 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaa 209262  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  209263 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgc 209362  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  209363 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 209462  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  209463 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 209495  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 26 - 420
Target Start/End: Original strand, 43943792 - 43944211
Alignment:
Q  26 tgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaata--attcatacaacatt 122  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  43943792 tgcataattctaaagcatttccaagccattt-ttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaatataaatcatacaacatt 43943890  T
Q  123 gaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattc 218  Q
     |||||||| ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  43943891 aaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaaaaaagtttgaaattc 43943990  T
Q  219 atcaaaacattacatagt---------taaacaac----------tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatgg 299  Q
    |||||||| ||||| |||         ||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43943991 atcaaaacgttacaaagtgtccatgcataaacaacacattacaattcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatgg 43944090  T
Q  300 aacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgt 399  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43944091 aacgaacatacatatatattatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcatcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgt 43944190  T
Q  400 tttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  43944191 tttccatgcgtattcatctct 43944211  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 418
Target Start/End: Original strand, 12905606 - 12906037
Alignment:
Q  7 ttatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  12905606 ttatgcagacagtgagttctgcataattctaaagcatttccaagccattt-ttcgaccagtttttac---taatttaaccagagcatttccaaaggcaat 12905701  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  12905702 ataactcatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatac 12905801  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaa----------ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattc 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||         |||||||          ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12905802 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtcaataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccgtacttacattc 12905901  T
Q  283 aacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaa 382  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12905902 aacgcaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaa 12906001  T
Q  383 tgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatct 418  Q
     ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  12906002 ggcatatagcttgttgttttccatgcgtattcatct 12906037  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 66 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38950496 - 38950232
Alignment:
Q  66 tttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaat 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||    
T  38950496 tttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaat 38950397  T
Q  162 tgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattaca 252  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         |||| |||||| ||||||||||    
T  38950396 tgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattaca 38950297  T
Q  253 catcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatata 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38950296 catcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattacatatggaacgaacatacatatata 38950232  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Original strand, 41004610 - 41005046
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  41004610 attatgcagacagtggattctgcataattctaaagcatttcaaagccattt--tcggtcagtttttacctgtaattaaaccgaagcatttccaaagacaa 41004707  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  41004708 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatataatatcttttacaattgtctataattaaatcaaaccaacatttggtttaaatta 41004807  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt-----taa--------------acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatt 281  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||     |||              ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  41004808 cacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattatattaaatcactacttacatt 41004907  T
Q  282 caacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcca 381  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||   |||||||||    
T  41004908 catcacaattgcatatggaatgaacatacatatataatatataatttttcaacatattctgaaacataaatctgacgtcccaatcgtctttaataagcca 41005007  T
Q  382 atgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
      |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41005008 gggcatgtagcttgtcgttttccatgcgtattcatctct 41005046  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 1096650 - 1096882
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096650 tgattatgaagacagtgggttatgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 1096749  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaaa----tatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1096750 aaataattcatacaacattaaaactcggacataaacaagataaatacagtatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaact 1096849  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1096850 acacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttaca 1096882  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Original strand, 1096904 - 1097093
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096904 cataattaaacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 1097003  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1097004 caccatattccgaaacataaattcgacgtcgctatcgtcgcaaataagcccaagcatataacttgccgttttccatgcgtattcgtctct 1097093  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Original strand, 24601974 - 24602161
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24601974 cataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacat--atatataatatattatcttc 24602071  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  24602072 caccatattccgaaaaataaatccgacgttgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatccgtattcgtctct 24602161  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 24612140 - 24611953
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24612140 cataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacat--atatataatatattatcttc 24612043  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  24612042 caccatattccgaaaaataaatccgacgttgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatccgtattcgtctct 24611953  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 41052704 - 41052934
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41052704 attatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagtatttccaaaggcaa 41052802  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41052803 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 41052902  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  41052903 cacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttaca 41052934  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 284
Target Start/End: Original strand, 18000312 - 18000607
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  18000312 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggt 18000410  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18000411 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaa 18000510  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaa 284  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||         |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18000511 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaa 18000607  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 24601720 - 24601952
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24601720 tgattatgcagacagtggattctacataattcaaaagcatttccaagccattt-ttcggtcagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 24601818  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24601819 aatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaat 24601918  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  24601919 tacacagacgtttgaaattcatcaaaacgttaca 24601952  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24612394 - 24612162
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24612394 tgattatgcagacagtggattctacataattcaaaagcatttccaagccattt-ttcggtcagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 24612296  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24612295 aatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaat 24612196  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  24612195 tacacagacgtttgaaattcatcaaaacgttaca 24612162  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9660046 - 9659816
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9660046 attatgcagacagtgggttatgcataattctaaaacatttccaagccattt-ttcggccagtttttacctttaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 9659948  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9659947 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaacgacatttggttaaaatta 9659848  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
     ||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  9659847 cacaaacgcttgaaattcatcaaaacgttaca 9659816  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 9659794 - 9659603
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatac--atatataatatattatct 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  9659794 cataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatacctacttacattcaacgcaattgcatattgaacgaacatacaaatataaaatatattatct 9659695  T
Q  329 tccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9659694 tccaccatattccgaaacataaactcgacgtcgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctct 9659603  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 439792 - 439592
Alignment:
Q  26 tgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattga 124  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  439792 tgcataattctaaagcatttccaagccattt-ttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagcgcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattga 439694  T
Q  125 aactcggacataaacaag--ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  439693 aactcggtcataaacaagaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 439594  T
Q  223 aa 224  Q
    ||    
T  439593 aa 439592  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 10825299 - 10825521
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10825299 tgattatgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaagc-attttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggc 10825397  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  10825398 aaaacaattcatacaacattgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacagacatttggttcaaat 10825497  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    || ||||| |||||||||||||||    
T  10825498 tacacaaacgtttgaaattcatca 10825521  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 439562 - 439373
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  439562 cataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctccttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattactttc 439463  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  439462 caccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccagggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 439373  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39951143 - 39950941
Alignment:
Q  24 tctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacatt 122  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  39951143 tctgcatcattctaaaacatttccaagcctttt-ttcgaccagtttttatctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacatt 39951045  T
Q  123 gaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||    
T  39951044 gaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattc 39950945  T
Q  219 atca 222  Q
    ||||    
T  39950944 atca 39950941  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 1150783 - 1150594
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1150783 cataattaaacaattcattacacatcattaaattaaatcactacttacattcaatgaaattgcatatggaacgaacatacatatataatatagtatcttc 1150684  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||| |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1150683 catcatattccaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcacaaataaaccaaggcgtatagtttgccgttttccatgcgtatttatctct 1150594  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 222
Target Start/End: Original strand, 29398043 - 29398208
Alignment:
Q  57 ttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaaatatctttt 156  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||| ||||    
T  29398043 ttcggccagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataagaaaaatacaatatttttt 29398142  T
Q  157 acaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29398143 acaattgtccataattaaattaaaccgacatttagttcaaattacacaaatgtttgaaattcatca 29398208  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 32952854 - 32953033
Alignment:
Q  46 caagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag--- 142  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||       
T  32952854 caagccattt-ttcggtcagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcagacatcaacaagaaa 32952952  T
Q  143 -ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  32952953 aatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 32953033  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 82002 - 81813
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  82002 cataattaaacaactcattacacatgattatattaaatgcatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttc 81903  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||   |||||   |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  81902 aaccatattccgaaacataaatccgacgtcgttatcgtctttaataagtcaagggatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 81813  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25184821 - 25184606
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||| | ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25184821 attatgtaaacagtgggttctgtataattctaaaacatttccaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagtattttcaaaggcaa 25184723  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  25184722 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgatatttggttcaaatta 25184623  T
Q  201 aacaaaggtttgaaatt 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  25184622 cacaaacgtttgaaatt 25184606  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Original strand, 41052956 - 41053143
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatat--ggaacgaacatacatatataa-tatattatc 327  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41052956 cataattaaacaattcattacacatcattaaatt-----cctacttacattcaatgcaattgcatatatggaacgaacacacatatataaatatattatc 41053050  T
Q  328 ttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||    
T  41053051 ttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttggcgttttcaatgcgtattcgtctct 41053143  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 82253 - 82024
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  82253 attatgcagacaatgagttctgcataattctaaagcattttcaaaccattt-ttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcatttctaaaggcag 82155  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| |||| ||||||  ||||| || ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  82154 tataaatcatccaacatcaaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccat-attaaatcaaaccgacatttgattcaaatta 82056  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  82055 cacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttaca 82024  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 314 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 38949855 - 38949749
Alignment:
Q  314 tataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtatt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38949855 tataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataacttgccgttttccatgcgtatt 38949756  T
Q  414 catctct 420  Q
    |||||||    
T  38949755 catctct 38949749  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7189939 - 7189817
Alignment:
Q  10 tgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaata 108  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  7189939 tgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaagcctttt-ttcggccaatttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcagaaca 7189841  T
Q  109 attcatacaacattgaaactcgga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7189840 attcatacaacattgaaactcgga 7189817  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 226
Target Start/End: Original strand, 3206968 - 3207054
Alignment:
Q  140 aagataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaac 226  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  3206968 aagatacattatcttttacaattgtctataattaaatcaaaccgacatttagttcaaagtatacaaaagtttgaaattcatcaaaac 3207054  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 418
Target Start/End: Original strand, 25613528 - 25613710
Alignment:
Q  236 ttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccacca 335  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| | |||||| | |||  |||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||  |  |    
T  25613528 ttaatcaacacattacatatcattacataaaatctctattgacattctatgcacatgcagatggaacgaacacaaagatataatatattatctttaatta 25613627  T
Q  336 tattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatct 418  Q
    |||||  |||||||||||  |||||||  ||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  25613628 tattcataaacataaatcctacgtcgctatcgtcacgaataagtcaaggcacatagctcgccgttttccacatgtcttcatct 25613710  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 230
Target Start/End: Original strand, 25613433 - 25613513
Alignment:
Q  150 atcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta 230  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || | | ||||| ||| |||||| |  || |||||||||||||||||| ||||    
T  25613433 atcttttacaattgaccaaaattaaatcaatcaggcattttgtttaaattacaagaatgtttgaaattcatcaaaatatta 25613513  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 353
Target Start/End: Original strand, 43668499 - 43668539
Alignment:
Q  313 atataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatc 353  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  43668499 atataatatattatcttcaaccatatgcctaaacataaatc 43668539  T

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Target: chr5 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 13563722 - 13564151
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13563722 tgattatgcagacagtgggttctgcataattataaacatttccaagccattttttcggctagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 13563821  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13563822 aaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 13563921  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13563922 aaacaaacgtttgaaattcattaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 13564021  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||| |||||||||| |||||||    
T  13564022 tgcatatggatcgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcatcgcaaataagccaaggcatata 13564121  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13564122 gcttgccgttttccatgcgtattcatctct 13564151  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 25890075 - 25890504
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25890075 tgattatgcagacaacaagttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 25890174  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25890175 aaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttatacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 25890274  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25890275 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgttcataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 25890374  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||     
T  25890375 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgacgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatc 25890474  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  25890475 gcttgctgttttccacgcgtattcatctct 25890504  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 27863484 - 27863913
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27863484 tgattatgcagatagtgggttctgcataattctaaacattttcaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagaacatttccaaaggca 27863583  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27863584 aaataattcacacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 27863683  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27863684 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 27863783  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  27863784 tgcaaatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccaaaacataaatccgacgtcgctgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 27863883  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27863884 gcttgccgtttttcatgcgtattcatctct 27863913  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 37814663 - 37815092
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37814663 tgataatgcagacagtgggttctgcatagttctaaacatttccaagccatttttccggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 37814762  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37814763 aaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 37814862  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||         |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37814863 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttactttcaacgcaat 37814962  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  37814963 tacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgtgaataagcaaaggcatata 37815062  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37815063 gcttgccgttttccatgcgtattcatctct 37815092  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 11029089 - 11029517
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||     
T  11029089 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctagacatttccaagccattttttcgaccagtttttacctgtaattaaaccagacaatttccaaaggct 11029188  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11029189 aaataattcatacaatattgaaactcggtcataatcaagataaatgcaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaacat 11029288  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt-------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||       ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11029289 taaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtccataattaaactactcatcacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 11029388  T
Q  292 gcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatag 391  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11029389 acatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatag 11029488  T
Q  392 cttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11029489 cttgccgttttccatgcgtattcatctct 11029517  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 38855796 - 38856225
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||     
T  38855796 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctagacatttccaagccattt-ttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagacaatttccaaaggct 38855894  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacattt-ggttaaaat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  38855895 aaataattcatacaatattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcgtaattaaattaaaccgacattttggttaacat 38855994  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38855995 taaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattcaatccctacttacattcaacgcaa 38856094  T
Q  290 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatat 389  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  38856095 ttacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatat 38856194  T
Q  390 agcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38856195 agcttgccgttttccatgcgtattcatctct 38856225  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 4 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 34080123 - 34079761
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34080123 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 34080024  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34080023 aaataattcatacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 34079924  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34079923 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccttacttacattcaacgcaat 34079824  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34079823 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatc 34079761  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Original strand, 28882077 - 28882498
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    ||||||||| ||||   |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28882077 attatgcagccagtaggttctacataattctaagcatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttacaaaggcaaa 28882176  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
          ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28882177 ------catacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttcgttaaaattaa 28882270  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28882271 acaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccccacttacattcaacgcaattg 28882370  T
Q  293 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagc 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28882371 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcaaataagcaaatgcatatagc 28882470  T
Q  393 ttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28882471 ttgccgttttccatgcgtattcatctct 28882498  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 7017593 - 7018008
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7017593 tgattatgcagacagtgggt-ctgcataattctaaacattttcaagccattttttcggccagtttttatctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 7017691  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7017692 aaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 7017791  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||         |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7017792 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 7017891  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7017892 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatat-------------tctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 7017978  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7017979 gcttgccattttccatgtgtattcatctct 7018008  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 44 - 420
Target Start/End: Original strand, 7796699 - 7797087
Alignment:
Q  44 tccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaaga 143  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7796699 tccaagctattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggttataaacaaga 7796797  T
Q  144 taaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt--- 236  Q
     |||    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||       
T  7796798 aaaatacaatatcttttataattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtc 7796897  T
Q  237 ------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7796898 cataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 7796997  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7796998 caccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctct 7797087  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 33995138 - 33994712
Alignment:
Q  7 ttatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  33995138 ttatgcagacagtgggttatgcataattgttaagcatttccaagccattt-ttcggccagtttttacatgtaatttaaccagaacatttccaaaggcaat 33995040  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    |||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  33995039 ataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatac 33994940  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 292  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||         |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33994939 aaaaaagtttgaaattcttcaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 33994840  T
Q  293 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagc 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||     
T  33994839 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattaagaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagt 33994740  T
Q  393 ttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33994739 ttgccgttgtccatgcgtattcatctct 33994712  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Original strand, 24053237 - 24053673
Alignment:
Q  7 ttatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  24053237 ttatgcagacagtgagttctgcataattgtcaagcattttcaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaatttaaccagagcattttcaaaggcaat 24053335  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    |||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||     
T  24053336 ataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattacatcaaaccgacatttggttcaaaatac 24053435  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaa----------ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattc 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||         |||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24053436 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacatattacaactcattacacatcattaaattatatccctaattacattc 24053535  T
Q  283 aacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaa 382  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||   |||  |||||    
T  24053536 aacgcaattgcatatagaaagaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattcgccaa 24053635  T
Q  383 tgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24053636 ggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctct 24053673  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Original strand, 24050110 - 24050548
Alignment:
Q  7 ttatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||     
T  24050110 ttatgcagatagtgagttctgcataattgttaagcatttccaagccattt-ttcggccagttttcacatgtaatttaaccagagcattaccaaaggaaat 24050208  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    |||| | |||||||||| ||| || | ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  24050209 ataacttatacaacatttaaattcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatac 24050308  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaa----------ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattc 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||         |||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24050309 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtatccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattatatccctacttacattc 24050408  T
Q  283 aacgcaattgcatatggaacgaacatacatatata--atatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcc 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||   |||  |||    
T  24050409 aacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattcgcc 24050508  T
Q  381 aatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24050509 aaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 24050548  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1039797 - 1039565
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1039797 tgattatgcagacagtgagttctgcataatcctaaatatttccaagccattttttgggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggca 1039698  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1039697 aaataattcatacaagattgaaactcggacataaacacgataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 1039598  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1039597 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattaca 1039565  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Original strand, 34122605 - 34122830
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34122605 tgattatgcagacagtggattctgcataattctaaatattttcaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggca 34122704  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34122705 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaatt 34122804  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaa 225  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||    
T  34122805 acacaaacgtttgaaattcatcaaaa 34122830  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 14280730 - 14280541
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14280730 cataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttc 14280631  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14280630 caccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 14280541  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Original strand, 34122859 - 34123048
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34122859 cataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcatacttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatatatatataatatattatcttc 34122958  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34122959 caccatattctgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttaccgttttccatgcgtattcatctct 34123048  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28388511 - 28388311
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28388511 tgattatgcagacagtgggttctgcataattttaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 28388412  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28388411 aaataattcatacaagattgaaattcggacataaacaaaataaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaatt 28388312  T
Q  200 a 200  Q
    |    
T  28388311 a 28388311  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 239 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 1039535 - 1039355
Alignment:
Q  239 aacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatat 338  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1039535 aacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaactgcatatggtacgaacatacatatataacatattattttccaccatat 1039436  T
Q  339 tccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1039435 tcc-aaacataaatccgatgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 1039355  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 232
Target Start/End: Original strand, 25877704 - 25877931
Alignment:
Q  7 ttatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  25877704 ttatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaagcaat 25877802  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||     
T  25877803 ataaatcatacaacattgaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaat--aaccgacatttggttcaaattac 25877900  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25877901 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaca 25877931  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7762239 - 7762013
Alignment:
Q  1 aattgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaa 99  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| | |||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||    
T  7762239 aattgattatgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacattttcaagcctttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccaaagcattttgaaa 7762140  T
Q  100 ggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaa----gataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaa 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  7762139 ggcaaaacaattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagatagatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttca 7762040  T
Q  196 aattaaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7762039 aattacacaaacgtttgaaattcatca 7762013  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 259 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 28387979 - 28387821
Alignment:
Q  259 taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacg 358  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28387979 taaattaaatccctacttacaatcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacg 28387880  T
Q  359 tcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatct 418  Q
    ||||  |||||| |||||| | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28387879 tcgctatcgtcgtgaataa-caaaggcatataacttgtcgttttccatgtgtattcatct 28387821  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 38407230 - 38407449
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  38407230 attatgtagacagtgagctctgcatgattctaaaacatttccaagccattt--tcggccagtttttacctgtaattaaagcagaacatttcgaaaggcaa 38407327  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  38407328 aataattcatacaacattgaaactcagacataaacaagaaaaatacaatatcttttagaattgtccataattaaatcaaaccggcatttggttcaaatta 38407427  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  38407428 cacaaacgtttgaaattcatca 38407449  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Original strand, 30352510 - 30352940
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| | || ||| | |||||||||| ||||  |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  30352510 attatgcagacagtgaattttgcataattgttaagcattttcaagccattt-ttcgatcagtttttatctgtaaataaatcagagcatttccaaatgcaa 30352608  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaac--aagataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaa 202  Q
     ||||  ||||||||||| |||||| | ||||||   || ||| ||||||||||     ||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||| || |    
T  30352609 tataagccatacaacatttaaactcagtcataaaagaaaaatacaatatctttt-----tgtccataattaaatcaaaccagcatttggttcaaaataca 30352703  T
Q  203 caaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaaca----------actcattacacatcattaaattaaatccctacttacattca 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||         ||||||          |||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  30352704 caaaagtttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaaacagcacattacaactcattacatatcaataaattaaatctttacttacattca 30352803  T
Q  284 acgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaat 383  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |||||   || |||||||     
T  30352804 atgcaattgcatatggaaaaaacatacatatataatatattattttccacaatattccgaaacataaatacgacgtcgctatcgtctttaacaagccaag 30352903  T
Q  384 gcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  30352904 gcatataacttgccgtttttcatgcatattcatctct 30352940  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41799726 - 41799539
Alignment:
Q  37 aaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacata 136  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41799726 aaacattttcaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaacttggacata 41799628  T
Q  137 aacaagataaaata----tcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    ||||||| ||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41799627 aacaaga-aaaatacaatttttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 41799539  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Original strand, 4196837 - 4197024
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  4196837 cataattaaacaactcattacatatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaa--tacatatataatatattattttc 4196934  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  4196935 gaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatgtagcttgtcgttttccatgcatattcatctct 4197024  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 289 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 43179559 - 43179428
Alignment:
Q  289 attgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcata 388  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  43179559 attgcagatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatcaaacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcata 43179460  T
Q  389 tagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  43179459 tagcttaccgttttccatgcgtgttcatctct 43179428  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 370
Target Start/End: Original strand, 6267617 - 6267933
Alignment:
Q  66 tttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaaa----tatcttttacaat 161  Q
    ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||| |  ||| | ||||||||||| |||     ||||||||||  |    
T  6267617 tttttacctataattcagccagagcatttccaaaggcaatactagtcgtacaacatttatcctcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttaccgt 6267716  T
Q  162 tgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattaca 252  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||  ||||||||  |  || ||||||||||||||| |||||||         |||| ||||||||| |||||||    
T  6267717 tatccataattaaatcaatccgacatttcattaaaattgcaagaatgtttgaaattcatcataacattaaagagtgtccataattaaacaacacattaca 6267816  T
Q  253 catcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaat 352  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6267817 tatcattaaattaaatctctactgacattctacgcagttgcagatggaacaaaaatacatatataatatattatcttccatcatattccg-aacataaat 6267915  T
Q  353 ctgacgtcgccgtcgtcg 370  Q
      ||||||||| ||||||    
T  6267916 tcgacgtcgccatcgtcg 6267933  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 150
Target Start/End: Original strand, 4196637 - 4196781
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4196637 attatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagctattt-ttcggtcaatttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 4196735  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaaata 150  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4196736 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaaata 4196781  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 231 - 362
Target Start/End: Original strand, 25877953 - 25878082
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  25877953 cataattaaacaactcattacacgtgattatattaaatccctacttaca--catcacaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattattttc 25878050  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25878051 caccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 25878082  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 14280890 - 14280781
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  14280890 attatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaatgtaat 14280791  T
Q  106 ataattcata 115  Q
    ||||||||||    
T  14280790 ataattcata 14280781  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43179849 - 43179666
Alignment:
Q  45 ccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagat 144  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  | || ||||||||| | |||||| || ||||||||     
T  43179849 ccaagccattt--tcggtcagtttttacctgtaattcaaccagagcattttcaaaggcaatactagtcgtacaacatttatactcggtcaaaaacaagaa 43179752  T
Q  145 aaaa----tatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaac 226  Q
    |||     ||||||||||| ||||||||||||||   || || |||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  43179751 aaatatattatcttttacacttgtccataattaatacaatccaacatttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaac 43179666  T

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Target: chr3 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 13743348 - 13743776
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13743348 tgattatgtagacagtgggttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaactagagcatttccaaaggca 13743447  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13743448 aaataattcatacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggtt-aaatt 13743546  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||         |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13743547 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaat 13743646  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13743647 tacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 13743746  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13743747 gcttgccgttttccatgcgtattcatctct 13743776  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 24 - 420
Target Start/End: Original strand, 9426705 - 9427115
Alignment:
Q  24 tctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacatt 122  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9426705 tctgcataattataaagcatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagatt 9426804  T
Q  123 gaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattc 218  Q
    |||||||||||||||  |||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9426805 gaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattc 9426904  T
Q  219 atcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacata 309  Q
    |||||||||||||| |||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9426905 atcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaacgaacata 9427004  T
Q  310 catatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |    
T  9427005 catatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagtttgccgttttccatgcg 9427104  T
Q  410 tattcatctct 420  Q
    |||||||||||    
T  9427105 tattcatctct 9427115  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 26 - 420
Target Start/End: Original strand, 48246514 - 48246921
Alignment:
Q  26 tgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaa 125  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48246514 tgcataattctaaacattttcaagccatttttccggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaaaataattcataaaacattgaa 48246613  T
Q  126 actcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatc 221  Q
    |||| ||||||| ||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  48246614 actcagacataagcaatataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattacacaaacttttgaaattcatc 48246713  T
Q  222 aaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacat 312  Q
    |||| |||||| |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  48246714 aaaaaattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcagttgcatatggaacaaacatacat 48246813  T
Q  313 atataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  48246814 atataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgtcgttttccatgcgtat 48246913  T
Q  413 tcatctct 420  Q
    ||||||||    
T  48246914 tcatctct 48246921  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 2857974 - 2857545
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2857974 tgattatgcagacagtgagt-ctgcataattgtaaagcatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 2857876  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2857875 aaaataattcatacaagattgaaacttggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 2857776  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2857775 taaacaaacgtttgaaattcatcttaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 2857676  T
Q  290 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatat 389  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2857675 ttacatatggaatgaacatacatatataatatattattttccaccattttccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatat 2857576  T
Q  390 agcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2857575 agcttgccgttttccatgcgtattcatctct 2857545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 6745319 - 6744889
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  6745319 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggt 6745220  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745219 aatataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 6745120  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 289  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6745119 taaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaa 6745020  T
Q  290 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatat 389  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  6745019 ttacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaagacatat 6744920  T
Q  390 agcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6744919 agcttgccgttttccatgcgtattcatctct 6744889  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Original strand, 30943269 - 30943701
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  30943269 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaagt 30943368  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943369 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaa 30943468  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30943469 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 30943568  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  30943569 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 30943668  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30943669 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 30943701  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 50957684 - 50957242
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50957684 tgattatgcagacagtgggt-ctgcataattttaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaatcagagcatttccaaaggca 50957586  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50957585 aaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaacagacatttggttaaaatt 50957486  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcat--------------caaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 276  Q
    ||||||| |||||||||||||              ||||||||| || |||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50957485 aaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattccaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 50957386  T
Q  277 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaata 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50957385 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacaaaaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 50957286  T
Q  377 agccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50957285 agcaaagacatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 50957242  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 3953208 - 3952777
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3953208 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggt 3953110  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3953109 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaa 3953010  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3953009 attaaatagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 3952910  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  3952909 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 3952810  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3952809 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 3952777  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Original strand, 8156588 - 8157019
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  8156588 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggt 8156686  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8156687 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaa 8156786  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8156787 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 8156886  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8156887 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 8156986  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8156987 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 8157019  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 416
Target Start/End: Original strand, 21951882 - 21952305
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||    ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21951882 attatgcagacagcaggttctgcagaattctaaaacaattccaagccattt-ttcggccagttttgacttgtaattaaaccagagcatttccaaatgcaa 21951980  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21951981 tataaatcatacaacattgaaactcgaacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttgattaaaatta 21952080  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 291  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21952081 cacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaatgtgtccatgattaaacaactcattacacgtcattaaattaaatccctagttacattcaatgcaatt 21952180  T
Q  292 gcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatag 391  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21952181 gcatatggaacgaacatacaaatataatatatcatcttccaccatattccgaaacctaaatccgacgtcgctatcatcgcgaataagccaaggcacatag 21952280  T
Q  392 cttgccgttttccatgtgtattcat 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  21952281 cttgccgttttccatgcgtattcat 21952305  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 66954 - 67393
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  66954 tgattatgcagacagtgggttctgcataattgttaagcatttccaagccattt-ttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcaatcccaaatgc 67052  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  67053 aatataattcatacaacatttaaactcacttataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaac 67152  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaa----------ctcattacacatcattaaattaaatccctacttaca 279  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||         |||||||          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  67153 tacacaaaagtttgaaattcatcaaaacggtacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaatgaaatccctacttaca 67252  T
Q  280 ttcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagc 379  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||   |||||||    
T  67253 ttcaacgcaatcacatatggaacgaacatacatatataatgtattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctattgtctttaataagc 67352  T
Q  380 caatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  67353 caagacatatagcttgccgtttttcatgcgtattcatctct 67393  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 289
Target Start/End: Original strand, 7841176 - 7841474
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841176 tgattatgcaaacagtgggttatgcataattctaaacatttccaagccattttttcgaccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 7841275  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaaa----tatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841276 aaataattcatacaacattgaaactcagacataaacaagataaatacagtatcttttacaattgtccataagtaaattaaaccgacatttggttaaaatt 7841375  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 289  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||| |||         |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841376 acacaaacgtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa 7841474  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4002497 - 4002265
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4002497 tgattatgcagacagcaagttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggcaagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 4002398  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4002397 aaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 4002298  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4002297 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattaca 4002265  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 156 - 420
Target Start/End: Original strand, 2743678 - 2743965
Alignment:
Q  156 tacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaa--------------acattacatagt----- 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||              |||||||| |||         
T  2743678 tacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattacaaagtgttca 2743777  T
Q  237 ----taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttcca 332  Q
        ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2743778 taattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacgtatataatatattatcttcca 2743877  T
Q  333 ccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2743878 ccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 2743965  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 14402757 - 14402568
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14402757 cataattaaacaactcattacacgtcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattattttc 14402658  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14402657 caccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 14402568  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Original strand, 36812918 - 36813155
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    ||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36812918 tgattgtgcagacagcaaattctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtagttaaaccagagcatttccaaaggca 36813017  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36813018 aaataatccatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttatacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 36813117  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagtt 237  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36813118 aaacaaacgtttgaaattcattaaaacattacaaagtt 36813155  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Original strand, 46989847 - 46990036
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46989847 cataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatgtggaacgaacatacatatataatatattatcttc 46989946  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46989947 caccatattccaaaacataaatccgacgtcgtcatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 46990036  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 4002243 - 4002054
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4002243 cataattaaataactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttc 4002144  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4002143 caccattttccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctct 4002054  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Original strand, 36813172 - 36813361
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36813172 cataattaaacaactcattacacatcattaaattatatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatattc 36813271  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  36813272 caccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagcttgccgttttccacacgtattcatctct 36813361  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Original strand, 6489664 - 6489853
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6489664 cataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 6489763  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6489764 caccatattccgaaatataaatccgacgacgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctct 6489853  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 46989614 - 46989825
Alignment:
Q  25 ctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattga 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||   |||    
T  46989614 ctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccaaagtattttcaaaggcaaaataattcatacaaatgtga 46989713  T
Q  125 aactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  46989714 aactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaacatttgaaattcat 46989813  T
Q  221 caaaacattaca 232  Q
    |||||| |||||    
T  46989814 caaaacgttaca 46989825  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14402988 - 14402808
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14402988 tgattatgca-acagtgagttctgcataattctaaacatttccaaaccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 14402890  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaac 181  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14402889 aaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaac 14402808  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 600536 - 600314
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    |||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  600536 tgatcatgcaggcagtgagctctgcatgattctaaaacatttccaagccattt-ttcggccaatttttacctgtaattaaaccagagcatttttaaaggc 600438  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  600437 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaat 600338  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    || ||||| |||||||||||||||    
T  600337 tacacaaacgtttgaaattcatca 600314  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 50213540 - 50213760
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||| || |||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  50213540 attatggagacagtgagctctgcatgattctaaaacatttctaagctattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaa 50213638  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  50213639 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatgcaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 50213738  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  50213739 cacaaacgtttgaaattcatca 50213760  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 220
Target Start/End: Original strand, 6489411 - 6489629
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6489411 attatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccattt-ttcggccagtttttaccgctaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 6489509  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaaa----tatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6489510 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacattatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 6489609  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcat 220  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  6489610 cacaaacgtttgaaattcat 6489629  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36134255 - 36134053
Alignment:
Q  24 tctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacatt 122  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36134255 tctgcatcattctaaaacatttccaagcttttt-ttcggccagtttttacctgtaattaaatcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacatt 36134157  T
Q  123 gaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||    
T  36134156 gaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattc 36134057  T
Q  219 atca 222  Q
    ||||    
T  36134056 atca 36134053  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 47070549 - 47070771
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47070549 tgattatgcagtcagtgagctctacatgattctaaaacatttccaagccattt-ttcggctagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggc 47070647  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  47070648 aaaacaattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagataaatacaatatcttttccaattgtccataattaaatcaaaccgacgtttggttcaaat 47070747  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    || ||||| |||||||||||||||    
T  47070748 tacacaaacgtttgaaattcatca 47070771  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 42166398 - 42166182
Alignment:
Q  10 tgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaata 108  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  42166398 tgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaagcctttt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttgaaaggcaaaaca 42166300  T
Q  109 attcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||     
T  42166299 attcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacact 42166200  T
Q  205 aaggtttgaaattcatca 222  Q
    || |||||||||| ||||    
T  42166199 aatgtttgaaatttatca 42166182  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 222
Target Start/End: Original strand, 2271488 - 2271658
Alignment:
Q  57 ttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa-----aatat 151  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     |||||    
T  2271488 ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaacttggacataaacaagataaaatacaatat 2271587  T
Q  152 cttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  2271588 cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattagacaaacgtttaaaattcatca 2271658  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16647163 - 16646944
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | ||| || ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16647163 attatgcaggcagtgagctctgcatgattctaaaacatttccaagccattt-tccggccaatttttatctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaa 16647065  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16647064 aacaattcatacaacattgaaactcagacataaa-aagataaatataatatcttttacgattgtccataattaaatcaaaccgacatttggtttaaatta 16646966  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  16646965 cacaaacgtttgaaattcatca 16646944  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 217
Target Start/End: Original strand, 52387900 - 52388097
Alignment:
Q  24 tctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacatt 122  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  52387900 tctgcatcattctaaaacatttccaagcctttt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaccaattcatacaacatt 52387998  T
Q  123 gaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaatt 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  52387999 gaaactcggacataaacaatataaatacaatatcttttacaattgaccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaacgtttgaaatt 52388097  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9473921 - 9473721
Alignment:
Q  24 tctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacatt 122  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9473921 tctgcatcattctaaaacatttccaagcctttt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagatcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacatt 9473823  T
Q  123 gaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattc 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  9473822 gaaactcggacataaacaatataaatacaatatctattacaattatccataattaaatcaaaccgacatttggttcaagttacacaaacgtttgaaattc 9473723  T
Q  219 at 220  Q
    ||    
T  9473722 at 9473721  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 137
Target Start/End: Original strand, 2743479 - 2743611
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2743479 tgattatgcagacagtgggt-ctgcataaatgtaaacatttcgaagccattttttcggccagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 2743577  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataa 137  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2743578 aaataattcatacaagattgaaactcggacataa 2743611  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 137
Target Start/End: Original strand, 4004931 - 4005058
Alignment:
Q  10 tgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaata 108  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  4004931 tgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaagc-attttttcggccagtttttacatgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaaca 4005029  T
Q  109 attcatacaacattgaaactcggacataa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4005030 attcatacaacattgaaactcggacataa 4005058  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 7314607 - 7314685
Alignment:
Q  150 atcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacat 228  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  7314607 atctttcacaattgaccaaaattaaatcaattcgacattttgttaaaattatacgaatgtttgaaattcaacaaaacat 7314685  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14402816 - 14402779
Alignment:
Q  195 aaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14402816 aaattaaacaaacgtttgaaattcatgaaaacattaca 14402779  T

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Target: chr6 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 420
Target Start/End: Original strand, 1608372 - 1608804
Alignment:
Q  3 ttgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  1608372 ttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaagt 1608471  T
Q  103 aaaataattcatac--aacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaa 196  Q
    || ||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608472 aatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaa 1608571  T
Q  197 attaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgc 287  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1608572 attaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgc 1608671  T
Q  288 aattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcat 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  1608672 aattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcat 1608771  T
Q  388 atagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1608772 atagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 1608804  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Original strand, 29286285 - 29286712
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29286285 attatgcagacagtaggttctgcataattctaaagcatttccaagccattt-ttcggccagtttttacttgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaa 29286383  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29286384 tataaatcatacaacgttgaaactcggtcttaaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 29286483  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 291  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29286484 cacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaacctctacttacattcaacgcaatt 29286583  T
Q  292 gcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatag 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29286584 gcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatag 29286683  T
Q  392 cttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29286684 tttgccgttttctatgtgtattcgtctct 29286712  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 31151054 - 31150628
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31151054 attatgcagactgtgggttctgcataattctaaatatttccaagccattt-ttcgcccagtttttacctataattaatccagagcatttccaaaggcaaa 31150956  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||     
T  31150955 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaaggtaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttccaattac 31150856  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31150855 acaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacatacattcaacgcaattg 31150756  T
Q  293 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagc 392  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31150755 catatcgatcaaacatacatatataatatattatcttccaccatattctaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagc 31150656  T
Q  393 ttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31150655 ttgccgttttccaagcgtattcatctct 31150628  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 420
Target Start/End: Original strand, 13382710 - 13383151
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13382710 tgattatgcagacagtgggt-ctgcataattgtaaacatttccaagccattt-ttcgaccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 13382807  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13382808 aaataattcatacaagtttgaaactcggacataataaagataactacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 13382907  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaa--------------acattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 276  Q
    ||||||| |||||||||||||||||              |||||||| |||         ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13382908 aaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattgcacatcattaaattaaatccctactt 13383007  T
Q  277 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaata 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13383008 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 13383107  T
Q  377 agccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13383108 agcaaaggcatataacttgacgttttccatgcgtattcatctct 13383151  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 25141096 - 25140668
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25141096 attatggagacagtgggttctgcataattctaaagcattttcaagccattt-ttcggccaagttttacctgtaattaaaccagaacatttccaaaggcaa 25140998  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25140997 tataaatcatacaatattgaaactcggccataaacaagaaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaatta 25140898  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 291  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25140897 aacaaacgtttgaaattcatcaacacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaatt 25140798  T
Q  292 gcatatggaacgaacataca-tatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatata 390  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||    
T  25140797 gcatatggaacgaacatacattatataatatattatctttcaccatattccgaaacataaatgcgacgtcgctatcgtcacgaataagccaaggcatata 25140698  T
Q  391 gcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25140697 gcttgccgttttccatgtgtattcgtctct 25140668  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Original strand, 23958974 - 23959400
Alignment:
Q  7 ttatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23958974 ttatgcagacagtggattctgcataattctaaagcatttccaagccattt-ttcgaccagattttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaat 23959072  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    |||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||    ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  23959073 ataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatattttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatac 23959172  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||         |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23959173 acaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 23959272  T
Q  293 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagc 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23959273 catatagaacgaacatacatatataatatattatcttacaccatattccgaaacataaatccaacgtcgctatcgtcgtgaataagccaaggcatatagc 23959372  T
Q  393 ttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23959373 ttgccgttttccatgcgtattcatctct 23959400  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 8 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 18610221 - 18609796
Alignment:
Q  8 tatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaa 106  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18610221 tatgcagatagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccattt-ttcggtcagtttttacatgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaata 18610123  T
Q  107 taattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaa 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| |    
T  18610122 taaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatctggttcgaattaca 18610023  T
Q  203 caaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||         |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18610022 caaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgc 18609923  T
Q  294 atatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagct 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||   |||||||||| ||||||| ||    
T  18609922 atatggaacgaacatacatatataatatataattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatataact 18609823  T
Q  394 tgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    || |||||||||||  |||| ||||||    
T  18609822 tgtcgttttccatgcatatttatctct 18609796  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 29667822 - 29667386
Alignment:
Q  7 ttatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  29667822 ttatgcagacagtgggttttgcataattccaaagcacttccaagccattt-ttcggccagtttttatctgtaatttaaccagagcattttcaaaggcaat 29667724  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    |||| | ||||||| || |||||| | ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  29667723 ataacttatacaacttttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatac 29667624  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaac----------tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattc 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||         ||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29667623 acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattc 29667524  T
Q  283 aacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||    
T  29667523 aacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattaacttccaccatattccgaaacataaatctgacatcgctatcgtcacgaataagccaa 29667424  T
Q  383 tgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29667423 ggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 29667386  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18351635 - 18351348
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18351635 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaacatttccgagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggca 18351536  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18351535 aaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 18351436  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttac 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||         |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18351435 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactacttattacacatcattaaattaaatccctacttac 18351348  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 7537267 - 7537499
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7537267 tgattatgcagacagtgaattctgcataattctaaagcatttccaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 7537365  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7537366 aatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttaaaat 7537465  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7537466 tacacaaacgtttgaaattcatctaaacattaca 7537499  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 231 - 414
Target Start/End: Original strand, 2051362 - 2051545
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2051362 cataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 2051461  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattc 414  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2051462 caccatatttcgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaataagccaagacatataacttgccgttttccatgcgtattc 2051545  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Original strand, 7537521 - 7537710
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7537521 cataattaaacaaatcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaaatgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 7537620  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  7537621 caccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgctgttttccatgcgtattcgtctct 7537710  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11840242 - 11840022
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11840242 tgattatgcaggcagtgagctctgcataattctaaaacatttccaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagaacatttccaaaggc 11840144  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  11840143 aaaataattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttgattcaaat 11840044  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcat 220  Q
    || ||||| |||||||||||||    
T  11840043 tacacaaacgtttgaaattcat 11840022  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 28362464 - 28362280
Alignment:
Q  236 ttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccacca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28362464 ttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacatacattctacacaattgcatatcgatcgaacatacatatataatatattatcttccacca 28362365  T
Q  336 tattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||  || |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  28362364 tattctgaaacataaattcgacgtcgctatcatcgcaaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcttattcatctct 28362280  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28362721 - 28362491
Alignment:
Q  5 gattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28362721 gattatgcaggcagtgtgttctgcataattctaaacatttccaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaa 28362623  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28362622 tataaatcatataacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacagttgtctaaaattaaattaaaccgacatttggttcaaatta 28362523  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
     ||||  | |||||||||| |||||| |||||    
T  28362522 cacaaccgattgaaattcaacaaaacgttaca 28362491  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 172 - 420
Target Start/End: Original strand, 2259338 - 2259594
Alignment:
Q  172 taaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt---------taaacaactcattacacatcattaaa 262  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||   ||||||||||||||||| |||||||||         |||||||| |||||||  | ||||||    
T  2259338 taaatgaaaccgacatttggttcaaaatgcacaaaatgttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaacttattaaa 2259437  T
Q  263 ttaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgc 362  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2259438 ttaaatccttacttacattcaacgta-ttgcatatggaacaaacatgcatatataatatattattttccaccatatttcgaaacataaatctgacgtcgc 2259536  T
Q  363 cgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
      |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  2259537 tttcgtctttaataagccaatgcatatagcttgtcgttttctatgcgtattcatctct 2259594  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31771731 - 31771510
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| | || ||||||| | ||||||||  ||| |||||| ||||||||    
T  31771731 attatgcagacaatgaactcttcatgattctaaaacatttccaagccattttttcagccattttttacctttaattaaagtagatcatttcgaaaggcaa 31771632  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31771631 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatattttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttcaaatta 31771532  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  31771531 cacaaacgtttgaaattcatca 31771510  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3502656 - 3502434
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    ||||||||||| || |||  ||||||| |||||||| ||| | |||| | ||| |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3502656 tgattatgcaggcaatgagctctgcatcattctaaaacatttacaagtctttt-ttcggctagtttttacctgtaattacaccagagcatttcaaaaggc 3502558  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3502557 aaaacaattcatacaacattgaaacttggccataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaat 3502458  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatca 222  Q
    || ||||| |||||||||||||||    
T  3502457 tacacaaacgtttgaaattcatca 3502434  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 149 - 360
Target Start/End: Original strand, 34230709 - 34230930
Alignment:
Q  149 tatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaagg-tttgaaattcatcaaaacatta---------catagtta 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |  || | ||||||||||||||||||||||         |||| |||    
T  34230709 tatcttttacaattgtctataattaaatcaaaccgacatttcgttaaaattacatgaatgctttgaaattcatcaaaacattaaagagtgtccataatta 34230808  T
Q  239 aacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatat 338  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34230809 aacaacacattacacatcgttaaattaaatctctactaacattctacacagttgcagatggaacgaacatacatatataatatattatcttctaccatat 34230908  T
Q  339 tccgaaacataaatctgacgtc 360  Q
    ||  ||||||||||| ||||||    
T  34230909 tctaaaacataaatcggacgtc 34230930  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 226
Target Start/End: Original strand, 2051110 - 2051334
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||  ||| | ||||| |||| ||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2051110 attatgcagacagtgggttatgcataattctaatgcattttcaagcaattt-ttcggccagtttttatctgtaattaaaacagagcatttccaaaggcaa 2051208  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaa----atatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  2051209 tataaatcatacaacattgaaactcgatcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaatta 2051308  T
Q  201 aacaaaggtttgaaattcatcaaaac 226  Q
     ||||| |||||||||||||||||||    
T  2051309 cacaaacgtttgaaattcatcaaaac 2051334  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26702641 - 26702472
Alignment:
Q  66 tttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaat 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    ||| |||||||||||||||    
T  26702641 tttttacatgtaattaaatcagagcatttccaaaggcagtataaatcatacaacatagaaattcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaat 26702542  T
Q  162 tgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26702541 tgtccataattaaa-taaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaca 26702472  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 2258368 - 2258540
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaaca-tgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | |||| ||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2258368 attatgcagacagtgaattctgcataattctaaagaattttcaagtcattt-ttcagtcagattttacttgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaa 2258466  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaa 174  Q
     |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2258467 tataactcatacaacatttaaactcagtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaa 2258540  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20448768 - 20448389
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||  |||| |  ||||||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||     
T  20448768 attatgcagacagtgacttctgcataattcaa-------ccaagccattt--tcggcctatttttatctgtaattcaaccagagcatttacagaggcaat 20448678  T
Q  106 ataattcatacaacattgaaactcggacataaacaaga----taaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaa 201  Q
    |||| ||||||| |||| | |||  | |||||||||||    || | ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||     
T  20448677 ataactcatacaccatttatacttagtcataaacaagaagaatacattatcttttacagttgtccataattaaatcaatccgacatttcgttaaaattag 20448578  T
Q  202 acaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattg 292  Q
    |  || ||||||||||||| |||||||||         |||| ||||||||| |||| || ||||||| || ||||  |||   |||||| || || |||    
T  20448577 aggaatgtttgaaattcataaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacatttcatatcattacataaaatatctatcgacattctacacatttg 20448478  T
Q  293 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaa 382  Q
    || ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||   |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  20448477 caaatgtaacaaacacacatatataatatattatctt-caacatatacctaaacataaatgaaacgtcgctatcgtcacgaataagccaa 20448389  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 193
Target Start/End: Original strand, 8304571 - 8304711
Alignment:
Q  57 ttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaaa----tatc 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||   |||| | ||||||||||| |||     ||||    
T  8304571 ttcggccagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaagccaatatacctcatacaacatttgcactcagtcataaacaagaaaaatacattatc 8304670  T
Q  153 ttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggtt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8304671 ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggtt 8304711  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 19129120 - 19129291
Alignment:
Q  66 tttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaaga-taaaatatcttttacaattgt 164  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||| | |||| | || ||| ||| |||| | |||| | ||||||||||| |  | ||||||||||| ||||    
T  19129120 tttttacctgtaattaaaccacaacatttccagatgcaataaaactcacacaccatttatactcagtcataaacaagaatgcattatcttttacagttgt 19129219  T
Q  165 ccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattacatagt 236  Q
    |||||||||||| || | ||||||| ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19129220 ccataattaaatcaatctgacatttcgttgaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacattaaatagt 19129291  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20439935 - 20439767
Alignment:
Q  66 tttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaaga----taaaatatcttttacaat 161  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| | || ||||||| |||| | |||  | |||||||||||    || | ||||||||||| |    
T  20439935 tttttacctgttattcaaccagagcatttccagaggcaatacaactcatacaccatttatacttagtcataaacaagaggaatacattatcttttacagt 20439836  T
Q  162 tgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta 230  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||    
T  20439835 tgtccataattaaatcaatccgacattttgttaaaattacaggaatgtttgaaattcatgaaaacatta 20439767  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20436227 - 20436059
Alignment:
Q  66 tttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaaga----taaaatatcttttacaat 161  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||  || | |||||||||| |||| | |||  | |||||||||||    || | ||||||||||| |    
T  20436227 tttttacctgttattcaaccagagcatttccagagaaaatacaattcatacaccatttatacttagtcataaacaagaggaatacattatcttttacagt 20436128  T
Q  162 tgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta 230  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||    
T  20436127 tgtccatgattaaatcaatccgacattttattaaaattacatgaatgtttgaaattcatgaaaacatta 20436059  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 382
Target Start/End: Original strand, 19129549 - 19129641
Alignment:
Q  291 tgcatatggaac-gaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaa 382  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||   |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19129549 tgcagatggaacagaacacacatatataatatattatattcaatcatatgcctaaacataaatgaaacgtcgcaatcgtcacgaataagccaa 19129641  T

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Target: scaffold0513 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 313
Target Start/End: Original strand, 8280 - 8602
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggca 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8280 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccaaagcatttccaaaggca 8379  T
Q  104 aaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaatt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8380 aaataattcatacaagattgaaactcgggcataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccaacatttggttaaaatt 8479  T
Q  200 aaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8480 aaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaat 8579  T
Q  291 tgcatatggaacgaacatacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8580 tgcatatggaacgaacatacata 8602  T

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Target: scaffold0201 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 22493 - 22713
Alignment:
Q  15 acagtgacttctgcataattctaaacatgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcat 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22493 acagtgagttctgcataattctaaacatttccaagccattttttcggccaatttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcat 22592  T
Q  115 acaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtt 210  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  22593 acaagattgaaactcggacataatcaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacg-t 22691  T
Q  211 tgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22692 tgaaattcatcaaaacattaca 22713  T

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Target: scaffold0201; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 231 - 420
Target Start/End: Original strand, 22735 - 22924
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22735 cataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcaaatggaacgaacatacatatataatataatattttc 22834  T
Q  331 caccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22835 caccatattctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcaaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 22924  T

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Target: scaffold0219 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20104 - 19871
Alignment:
Q  4 tgattatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20104 tgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagcttttttttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggc 20005  T
Q  103 aaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaag----ataaaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaat 198  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20004 aatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaat 19905  T
Q  199 taaacaaaggtttgaaattcatcaaaacattaca 232  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  19904 tacacaaacgtttaaaattcatcaaaacgttaca 19871  T

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Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 231 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19849 - 19743
Alignment:
Q  231 catagttaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 330  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19849 cataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgagcatacatatataatatattatcttc 19750  T
Q  331 caccata 337  Q
    |||||||    
T  19749 caccata 19743  T

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Target: scaffold0219; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 335 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 19582 - 19497
Alignment:
Q  335 atattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19582 atattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctct 19497  T

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Target: scaffold0169 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 269 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 10978 - 10827
Alignment:
Q  269 ccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgt 368  Q
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T  10978 ccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacaaatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatctgacgtcgctatcgt 10879  T
Q  369 cgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10878 cacgaataagccaaggcatatagcttgctgttttccatgcgtattcatctct 10827  T

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Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1674 - 1537
Alignment:
Q  6 attatgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 104  Q
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T  1674 attatgcagacagtgggttctgcataattctatagcatttccaagccattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaa 1576  T
Q  105 aataattcatacaacattgaaactcggacataaacaaga 143  Q
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T  1575 tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaaga 1537  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 416
Target Start/End: Original strand, 21774 - 22144
Alignment:
Q  47 aagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa 146  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |        |||     
T  21774 aagccattt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaagcaatataaatcatacaatattgaaactcgaaaa--------atac 21864  T
Q  147 aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggtttgaaattcatcaaaacatta---------catagtt 237  Q
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T  21865 aatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaaaaagtgtccataatt 21964  T
Q  238 aaacaa----------ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatc 327  Q
    ||||||          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||         |     
T  21965 aaacaacacattacaactcattacacatcattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatat---------tt 22055  T
Q  328 ttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcat 416  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  | |||   ||||||||||  |||||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  22056 ttccaccatattccaaaacataaattcgacgtcgctattgtctttaataagccaagacatataacttgtcattttccatgcgtattcat 22144  T

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Target: scaffold0199 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 12497 - 12706
Alignment:
Q  17 agtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcata 115  Q
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T  12497 agtgagttttgcatcattctaaaacatttccaagcctttt-ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaagcaaaacaattcata 12595  T
Q  116 caacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaaggttt 211  Q
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T  12596 caacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgtttaaattacacaaacgttt 12695  T
Q  212 gaaattcatca 222  Q
     ||||||||||    
T  12696 aaaattcatca 12706  T

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Target: scaffold0011 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 236222 - 236006
Alignment:
Q  10 tgcagacagtgacttctgcataattctaaa-catgtccaagccatttcttcggacagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaata 108  Q
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T  236222 tgcagacagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaaacctttt-ttcgaccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaaca 236124  T
Q  109 attcatacaacattgaaactcggacataaacaagataa----aatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaaca 204  Q
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T  236123 attcatacaatattgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaatcgacatttggttcaaattacaca 236024  T
Q  205 aaggtttgaaattcatca 222  Q
    || |||||||||||||||    
T  236023 aacgtttgaaattcatca 236006  T

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Target: scaffold0794 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0794
Description:

Target: scaffold0794; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 1488 - 1314
Alignment:
Q  246 cattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaa 345  Q
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T  1488 cattacacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcaaaa 1389  T
Q  346 cataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctct 420  Q
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T  1388 cataaatccgacgtcgctattgtctttaataagtcaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctct 1314  T

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