View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11253_high_1 (Length: 1384)

Name: NF11253_high_1
Description: NF11253
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11253_high_1
NF11253_high_1
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (706-1367)||(17520942-17521599)
chr5 (373-702)||(17520585-17520914)
chr5 (15-306)||(17520241-17520532)
chr5 (918-978)||(17621904-17621964)
chr5 (338-371)||(17520529-17520562)
chr5 (918-955)||(17570620-17570657)
[»] chr7 (10 HSPs)
chr7 (706-1367)||(14812581-14813238)
chr7 (706-1367)||(15259576-15260233)
chr7 (373-702)||(14813266-14813595)
chr7 (373-702)||(15260261-15260590)
chr7 (14-306)||(14813648-14813940)
chr7 (14-306)||(15260643-15260935)
chr7 (918-955)||(14749959-14749996)
chr7 (918-955)||(14757878-14757915)
chr7 (338-371)||(14813618-14813651)
chr7 (338-371)||(15260613-15260646)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 584; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 706 - 1367
Target Start/End: Original strand, 17520942 - 17521599
Alignment:
706 atttaggtgattcagtttatgagacattatttgagattcctttcattgaagtttcggctgagttttatagaggtgagttccaaaagttaagtgaatattg 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17520942 atttaggtgattcagtttatgagacattatttgagattcctttcatcgaagtttcggctgagttttatagaggtgagttccaaaagttaagtgaatattg 17521041  T
806 tgattgtggcgattatctatggaaagctgagaatcatttgattaaaggattgattagagtgaaccactacttggattccgtaagtcaaaagaagatttat 905  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
17521042 tgattgtggcgattatctatggaaagctgagaatcatttgattaaaggattgattagagtgaaccactacttggattccataagtcaaaagaagatttat 17521141  T
906 aatgcaatgtacaaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatccacataggaaattcttggttagtaattctctttcttgacaatagatatgaag 1005  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
17521142 aatgcaatgtacaaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatccggatagaaaattcttggttagtaactctctttcttaataatagatatgaag 17521241  T
1006 atttgagaaacttgtaccagattttctctacatatcctaatggactccttacaatacagaaagtagtgaatctctatgttagaaacacaggtgaaaagtt 1105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
17521242 atttgagaaacttgtaccagattttctctacatatcctaatggactctttacaatacagaaagtagcgaatctc--tgttagaaacacaggtgaaaagtt 17521339  T
1106 tgtaaaagatccaaaaaggttaaaggatcctatgatttttgttcaagaacttttggacatgaaagataagtatgatatagtatattaaacttggcattta 1205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
17521340 tgtaaaagatccaaaaaggttaaaggatcctatgatttttgttcaagaacttttggacatgaaagataaatatg--atagtatattaaacttggcattta 17521437  T
1206 atcatgatgaagaattccatggagtgctggactcatcatttgagtacattattaacttgaatcacaatttgccagagtttctttcgtcgttcttggatgt 1305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17521438 atcatgatgaagaattccatggagtgctggactcatcatttgagtacattattaacttgaatcacaatttgccagagtttctttcgtcgttcttggatgt 17521537  T
1306 caaattaaggaaaggtttcgaacgaagtagtgtggaaattattcttgacaaggtggtgatgt 1367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
17521538 caaattaaggaaaggtttcgaaggaaatagtgaggaaattattcttgacaaggtggtgatgt 17521599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 373 - 702
Target Start/End: Original strand, 17520585 - 17520914
Alignment:
373 atatgagattggttaccatcatgacatcacatgtgaaagaaatatcaaaatccattgaagaagcaacgcaaggagacttctttttggaagaactgaatag 472  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
17520585 atatgggattggttgccatcatgacatcacatgtgaaagaaatatcgaaatccattgaagatgcaacacaaggagacttctttttggaagaactgaatag 17520684  T
473 gaaatggaatgattacaaagatgcaatactaaatgtttgaaaagtactattgtatatggatagggtttatgttatacataacaataagactagaattcat 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17520685 gaaatggaatgattacaaagatgcaatactagatgttcgaaaagtactattgtatatggatagggtttatgttatacataacaataagactagaattcat 17520784  T
573 gatcttggaatgaacttgtggagagataatgttgttaactccacccagataattcaatctcaactgaagaagactctcgttgaattagttcatggagaat 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
17520785 gatcttggaatgaacttgtggagagataatgttgttaactccacccagatagttcaatctcaactgaagaagactctcgttaaattagttcatcgagaat 17520884  T
673 gcatcagtgaagttattaatagagacttga 702  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
17520885 gcatcggtgaagttattaatagagacttga 17520914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 17520241 - 17520532
Alignment:
15 attgtgttcattgtcttgctatttatcatttcttgattcttctgttattggtttctgttctaacagtaaatatgagatttaatatagaaaatagatgcgt 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||| | ||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
17520241 attgtgttcattgtcttgcgatttattatttctttaatcttctgttactagttgctgttctaaaaataaatatgagatttgatatagaaaatagatgcgt 17520340  T
115 agataataaggaataaattatgacatttgatgctnnnnnnnntataaatttcctttgcaacaccacaaaaatatgcattgtaaaacctgcaatgcctaca 214  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||| |||||||||||    
17520341 aaataatacggaataaattatgacatttgatgctaagaaaa-tataaatttcctttgcaacaccacac---tatgcattgtaacacctacaatgcctaca 17520436  T
215 attgcaatacat----tcgcatccacgaattaaaaccgtggaatatatgttattaatagatagtatttccaataatttgtgttttatttttcttct 306  Q
    ||| |||||| |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
17520437 attacaatacttccgcgcgcatccacgaattaaaaccgtggaatatatgttattaatagatagtatttccaataatttgtgttttgtttctcttct 17520532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 918 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 17621964 - 17621904
Alignment:
918 aaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatccacataggaaattcttggttagtaa 978  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||    
17621964 aaggagattattgaaaatgacatgcttagattaatccatatggaaaattctgggttagtaa 17621904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 371
Target Start/End: Original strand, 17520529 - 17520562
Alignment:
338 ttctctgatcagtcgaacacatgatatggtgatt 371  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
17520529 ttctctgatcagtctaacacatgatatggtgatt 17520562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 918 - 955
Target Start/End: Original strand, 17570620 - 17570657
Alignment:
918 aaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatcca 955  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
17570620 aaggagatgattgaaaatcacatgcttagattaatcca 17570657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 576; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 706 - 1367
Target Start/End: Complemental strand, 14813238 - 14812581
Alignment:
706 atttaggtgattcagtttatgagacattatttgagattcctttcattgaagtttcggctgagttttatagaggtgagttccaaaagttaagtgaatattg 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14813238 atttaggtgattcagtttatgagacattatttgagattcctttcatcgaagtttcggctgagttttatagaggtgagttccaaaagttaagtgaatattg 14813139  T
806 tgattgtggcgattatctatggaaagctgagaatcatttgattaaaggattgattagagtgaaccactacttggattccgtaagtcaaaagaagatttat 905  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
14813138 tgattgtggcgattatctacggaaagctgagaatcatttgattaaaggattgattagagtgaaccactacttggattccataagtcaaaagaagatttat 14813039  T
906 aatgcaatgtacaaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatccacataggaaattcttggttagtaattctctttcttgacaatagatatgaag 1005  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
14813038 aatgcaatgtacaaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatccggatagaaaattcttggttagtaactctctttcttaataatagatatgaag 14812939  T
1006 atttgagaaacttgtaccagattttctctacatatcctaatggactccttacaatacagaaagtagtgaatctctatgttagaaacacaggtgaaaagtt 1105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
14812938 atttgagaaacttgtaccagattttctctacatatcctaatggactctttacaatacagaaagtagcgaatctc--tgttagaaacacaggtgaaaagtt 14812841  T
1106 tgtaaaagatccaaaaaggttaaaggatcctatgatttttgttcaagaacttttggacatgaaagataagtatgatatagtatattaaacttggcattta 1205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
14812840 tgtaaaagatccaaaaaggttaaaggatcctatgatttttgttcaagaacttttggacatgaaagataaatatg--atagtatattaaacttggcattta 14812743  T
1206 atcatgatgaagaattccatggagtgctggactcatcatttgagtacattattaacttgaatcacaatttgccagagtttctttcgtcgttcttggatgt 1305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14812742 atcatgatgaagaattccatggagtgctggactcatcatttgagtacattattaacttgaatcacaatttgccagagtttctttcgtcgttcttggatgt 14812643  T
1306 caaattaaggaaaggtttcgaacgaagtagtgtggaaattattcttgacaaggtggtgatgt 1367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
14812642 caaattaaggaaaggtttcgaaggaaatagtgaggaaattattcttgacaaggtgatgatgt 14812581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 706 - 1367
Target Start/End: Complemental strand, 15260233 - 15259576
Alignment:
706 atttaggtgattcagtttatgagacattatttgagattcctttcattgaagtttcggctgagttttatagaggtgagttccaaaagttaagtgaatattg 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15260233 atttaggtgattcagtttatgagacattatttgagattcctttcatcgaagtttcggctgagttttatagaggtgagttccaaaagttaagtgaatattg 15260134  T
806 tgattgtggcgattatctatggaaagctgagaatcatttgattaaaggattgattagagtgaaccactacttggattccgtaagtcaaaagaagatttat 905  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
15260133 tgattgtggcgattatctacggaaagctgagaatcatttgattaaaggattgattagagtgaaccactacttggattccataagtcaaaagaagatttat 15260034  T
906 aatgcaatgtacaaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatccacataggaaattcttggttagtaattctctttcttgacaatagatatgaag 1005  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
15260033 aatgcaatgtacaaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatccggatagaaaattcttggttagtaactctctttcttaataatagatatgaag 15259934  T
1006 atttgagaaacttgtaccagattttctctacatatcctaatggactccttacaatacagaaagtagtgaatctctatgttagaaacacaggtgaaaagtt 1105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
15259933 atttgagaaacttgtaccagattttctctacatatcctaatggactctttacaatacagaaagtagcgaatctc--tgttagaaacacaggtgaaaagtt 15259836  T
1106 tgtaaaagatccaaaaaggttaaaggatcctatgatttttgttcaagaacttttggacatgaaagataagtatgatatagtatattaaacttggcattta 1205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
15259835 tgtaaaagatccaaaaaggttaaaggatcctatgatttttgttcaagaacttttggacatgaaagataaatatg--atagtatattaaacttggcattta 15259738  T
1206 atcatgatgaagaattccatggagtgctggactcatcatttgagtacattattaacttgaatcacaatttgccagagtttctttcgtcgttcttggatgt 1305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15259737 atcatgatgaagaattccatggagtgctggactcatcatttgagtacattattaacttgaatcacaatttgccagagtttctttcgtcgttcttggatgt 15259638  T
1306 caaattaaggaaaggtttcgaacgaagtagtgtggaaattattcttgacaaggtggtgatgt 1367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
15259637 caaattaaggaaaggtttcgaaggaaatagtgaggaaattattcttgacaaggtgatgatgt 15259576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 373 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 14813595 - 14813266
Alignment:
373 atatgagattggttaccatcatgacatcacatgtgaaagaaatatcaaaatccattgaagaagcaacgcaaggagacttctttttggaagaactgaatag 472  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
14813595 atatgggattggttgccatcatgacatcacatgtgaaagaaatatcaaaatccattgaagaagcaacacaaggagacttctttttggaagaactgaatag 14813496  T
473 gaaatggaatgattacaaagatgcaatactaaatgtttgaaaagtactattgtatatggatagggtttatgttatacataacaataagactagaattcat 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14813495 gaaatggaatgattacaaagatgcaatactaaatgttcgaaaagtactattgtatatggatagggtttatgttatacataacaataagactagaattcat 14813396  T
573 gatcttggaatgaacttgtggagagataatgttgttaactccacccagataattcaatctcaactgaagaagactctcgttgaattagttcatggagaat 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
14813395 gatcttggaatgaacttgtggagagataatgttgttaactccacccagatagttcaatctcaactgaagaagactctcgttaaattagttcatcgagaat 14813296  T
673 gcatcagtgaagttattaatagagacttga 702  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
14813295 gcatcggtgaagttattaatagagacttga 14813266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 373 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 15260590 - 15260261
Alignment:
373 atatgagattggttaccatcatgacatcacatgtgaaagaaatatcaaaatccattgaagaagcaacgcaaggagacttctttttggaagaactgaatag 472  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
15260590 atatgggattggttgccatcatgacatcacatgtgaaagaaatatcaaaatccattgaagaagcaacacaaggagacttctttttggaagaactgaatag 15260491  T
473 gaaatggaatgattacaaagatgcaatactaaatgtttgaaaagtactattgtatatggatagggtttatgttatacataacaataagactagaattcat 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15260490 gaaatggaatgattacaaagatgcaatactaaatgttcgaaaagtactattgtatatggatagggtttatgttatacataacaataagactagaattcat 15260391  T
573 gatcttggaatgaacttgtggagagataatgttgttaactccacccagataattcaatctcaactgaagaagactctcgttgaattagttcatggagaat 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
15260390 gatcttggaatgaacttgtggagagataatgttgttaactccacccagatagttcaatctcaactgaagaagactctcgttaaattagttcatcgagaat 15260291  T
673 gcatcagtgaagttattaatagagacttga 702  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
15260290 gcatcggtgaagttattaatagagacttga 15260261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14813940 - 14813648
Alignment:
14 gattgtgttcattgtcttgctatttatcatttcttgattcttctgttattggtttctgttctaacagtaaatatgagatttaatatagaaaatagatgcg 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||| | ||| | ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
14813940 gattgtgttcattgtcttgcgatttattatttctttaatcttctgttactagttgccgttctaaaaataaatatgagatttgatatagaaaatagatgcg 14813841  T
114 tagataataaggaataaattatgacatttgatgctnnnnnnnntataaatttcctttgcaacaccacaaaaatatgcattgtaaaacctgcaatgcctac 213  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||| ||||||||||    
14813840 taaataatacggaataaattatgacattttatgctaaaaaaa-tataaatttcctttgcaacaccacac---tatgcattgtaacacctacaatgcctac 14813745  T
214 aattgcaatacat----tcgcatccacgaattaaaaccgtggaatatatgttattaatagatagtatttccaataatttgtgttttatttttcttct 306  Q
    |||| |||||| |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
14813744 aattacaatacttccgcgcgcatccacgaattaaaaccgtggaatatatgttattaatcgatagtatttccaataatttgtgttttgtttctcttct 14813648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15260935 - 15260643
Alignment:
14 gattgtgttcattgtcttgctatttatcatttcttgattcttctgttattggtttctgttctaacagtaaatatgagatttaatatagaaaatagatgcg 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||| | ||| | ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
15260935 gattgtgttcattgtcttgcgatttattatttctttaatcttctgttactagttgccgttctaaaaataaatatgagatttgatatagaaaatagatgcg 15260836  T
114 tagataataaggaataaattatgacatttgatgctnnnnnnnntataaatttcctttgcaacaccacaaaaatatgcattgtaaaacctgcaatgcctac 213  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||| ||||||||||    
15260835 taaataatacggaataaattatgacattttatgctaaaaaaa-tataaatttcctttgcaacaccacac---tatgcattgtaacacctacaatgcctac 15260740  T
214 aattgcaatacat----tcgcatccacgaattaaaaccgtggaatatatgttattaatagatagtatttccaataatttgtgttttatttttcttct 306  Q
    |||| |||||| |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
15260739 aattacaatacttccgcgcgcatccacgaattaaaaccgtggaatatatgttattaatcgatagtatttccaataatttgtgttttgtttctcttct 15260643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 918 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 14749996 - 14749959
Alignment:
918 aaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatcca 955  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
14749996 aaggagactattgaaaatcacatgcttagattaatcca 14749959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 918 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 14757915 - 14757878
Alignment:
918 aaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatcca 955  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
14757915 aaggagatgattgaaaatcacatgcttagattaatcca 14757878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14813651 - 14813618
Alignment:
338 ttctctgatcagtcgaacacatgatatggtgatt 371  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
14813651 ttctctgatcagtctaacacatgatatggtgatt 14813618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15260646 - 15260613
Alignment:
338 ttctctgatcagtcgaacacatgatatggtgatt 371  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
15260646 ttctctgatcagtctaacacatgatatggtgatt 15260613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University