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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF11253_low_1 (Length: 1384)
Name: NF11253_low_1
Description: NF11253
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF11253_low_1 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 584; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 706 - 1367
Target Start/End: Original strand, 17520942 - 17521599
Alignment:
| Q |
706 |
atttaggtgattcagtttatgagacattatttgagattcctttcattgaagtttcggctgagttttatagaggtgagttccaaaagttaagtgaatattg |
805 |
Q |
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| T |
17520942 |
atttaggtgattcagtttatgagacattatttgagattcctttcatcgaagtttcggctgagttttatagaggtgagttccaaaagttaagtgaatattg |
17521041 |
T |
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| Q |
806 |
tgattgtggcgattatctatggaaagctgagaatcatttgattaaaggattgattagagtgaaccactacttggattccgtaagtcaaaagaagatttat |
905 |
Q |
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| T |
17521042 |
tgattgtggcgattatctatggaaagctgagaatcatttgattaaaggattgattagagtgaaccactacttggattccataagtcaaaagaagatttat |
17521141 |
T |
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| Q |
906 |
aatgcaatgtacaaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatccacataggaaattcttggttagtaattctctttcttgacaatagatatgaag |
1005 |
Q |
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| T |
17521142 |
aatgcaatgtacaaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatccggatagaaaattcttggttagtaactctctttcttaataatagatatgaag |
17521241 |
T |
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| Q |
1006 |
atttgagaaacttgtaccagattttctctacatatcctaatggactccttacaatacagaaagtagtgaatctctatgttagaaacacaggtgaaaagtt |
1105 |
Q |
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| T |
17521242 |
atttgagaaacttgtaccagattttctctacatatcctaatggactctttacaatacagaaagtagcgaatctc--tgttagaaacacaggtgaaaagtt |
17521339 |
T |
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| Q |
1106 |
tgtaaaagatccaaaaaggttaaaggatcctatgatttttgttcaagaacttttggacatgaaagataagtatgatatagtatattaaacttggcattta |
1205 |
Q |
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| T |
17521340 |
tgtaaaagatccaaaaaggttaaaggatcctatgatttttgttcaagaacttttggacatgaaagataaatatg--atagtatattaaacttggcattta |
17521437 |
T |
|
| Q |
1206 |
atcatgatgaagaattccatggagtgctggactcatcatttgagtacattattaacttgaatcacaatttgccagagtttctttcgtcgttcttggatgt |
1305 |
Q |
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| T |
17521438 |
atcatgatgaagaattccatggagtgctggactcatcatttgagtacattattaacttgaatcacaatttgccagagtttctttcgtcgttcttggatgt |
17521537 |
T |
|
| Q |
1306 |
caaattaaggaaaggtttcgaacgaagtagtgtggaaattattcttgacaaggtggtgatgt |
1367 |
Q |
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|
| T |
17521538 |
caaattaaggaaaggtttcgaaggaaatagtgaggaaattattcttgacaaggtggtgatgt |
17521599 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 373 - 702
Target Start/End: Original strand, 17520585 - 17520914
Alignment:
| Q |
373 |
atatgagattggttaccatcatgacatcacatgtgaaagaaatatcaaaatccattgaagaagcaacgcaaggagacttctttttggaagaactgaatag |
472 |
Q |
| |
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||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
17520585 |
atatgggattggttgccatcatgacatcacatgtgaaagaaatatcgaaatccattgaagatgcaacacaaggagacttctttttggaagaactgaatag |
17520684 |
T |
|
| Q |
473 |
gaaatggaatgattacaaagatgcaatactaaatgtttgaaaagtactattgtatatggatagggtttatgttatacataacaataagactagaattcat |
572 |
Q |
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||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17520685 |
gaaatggaatgattacaaagatgcaatactagatgttcgaaaagtactattgtatatggatagggtttatgttatacataacaataagactagaattcat |
17520784 |
T |
|
| Q |
573 |
gatcttggaatgaacttgtggagagataatgttgttaactccacccagataattcaatctcaactgaagaagactctcgttgaattagttcatggagaat |
672 |
Q |
| |
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|
|
| T |
17520785 |
gatcttggaatgaacttgtggagagataatgttgttaactccacccagatagttcaatctcaactgaagaagactctcgttaaattagttcatcgagaat |
17520884 |
T |
|
| Q |
673 |
gcatcagtgaagttattaatagagacttga |
702 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17520885 |
gcatcggtgaagttattaatagagacttga |
17520914 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 17520241 - 17520532
Alignment:
| Q |
15 |
attgtgttcattgtcttgctatttatcatttcttgattcttctgttattggtttctgttctaacagtaaatatgagatttaatatagaaaatagatgcgt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||| | ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17520241 |
attgtgttcattgtcttgcgatttattatttctttaatcttctgttactagttgctgttctaaaaataaatatgagatttgatatagaaaatagatgcgt |
17520340 |
T |
|
| Q |
115 |
agataataaggaataaattatgacatttgatgctnnnnnnnntataaatttcctttgcaacaccacaaaaatatgcattgtaaaacctgcaatgcctaca |
214 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17520341 |
aaataatacggaataaattatgacatttgatgctaagaaaa-tataaatttcctttgcaacaccacac---tatgcattgtaacacctacaatgcctaca |
17520436 |
T |
|
| Q |
215 |
attgcaatacat----tcgcatccacgaattaaaaccgtggaatatatgttattaatagatagtatttccaataatttgtgttttatttttcttct |
306 |
Q |
| |
|
||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
17520437 |
attacaatacttccgcgcgcatccacgaattaaaaccgtggaatatatgttattaatagatagtatttccaataatttgtgttttgtttctcttct |
17520532 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 918 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 17621964 - 17621904
Alignment:
| Q |
918 |
aaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatccacataggaaattcttggttagtaa |
978 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17621964 |
aaggagattattgaaaatgacatgcttagattaatccatatggaaaattctgggttagtaa |
17621904 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 371
Target Start/End: Original strand, 17520529 - 17520562
Alignment:
| Q |
338 |
ttctctgatcagtcgaacacatgatatggtgatt |
371 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17520529 |
ttctctgatcagtctaacacatgatatggtgatt |
17520562 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 918 - 955
Target Start/End: Original strand, 17570620 - 17570657
Alignment:
| Q |
918 |
aaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatcca |
955 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17570620 |
aaggagatgattgaaaatcacatgcttagattaatcca |
17570657 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 576; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 706 - 1367
Target Start/End: Complemental strand, 14813238 - 14812581
Alignment:
| Q |
706 |
atttaggtgattcagtttatgagacattatttgagattcctttcattgaagtttcggctgagttttatagaggtgagttccaaaagttaagtgaatattg |
805 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14813238 |
atttaggtgattcagtttatgagacattatttgagattcctttcatcgaagtttcggctgagttttatagaggtgagttccaaaagttaagtgaatattg |
14813139 |
T |
|
| Q |
806 |
tgattgtggcgattatctatggaaagctgagaatcatttgattaaaggattgattagagtgaaccactacttggattccgtaagtcaaaagaagatttat |
905 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14813138 |
tgattgtggcgattatctacggaaagctgagaatcatttgattaaaggattgattagagtgaaccactacttggattccataagtcaaaagaagatttat |
14813039 |
T |
|
| Q |
906 |
aatgcaatgtacaaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatccacataggaaattcttggttagtaattctctttcttgacaatagatatgaag |
1005 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
14813038 |
aatgcaatgtacaaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatccggatagaaaattcttggttagtaactctctttcttaataatagatatgaag |
14812939 |
T |
|
| Q |
1006 |
atttgagaaacttgtaccagattttctctacatatcctaatggactccttacaatacagaaagtagtgaatctctatgttagaaacacaggtgaaaagtt |
1105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14812938 |
atttgagaaacttgtaccagattttctctacatatcctaatggactctttacaatacagaaagtagcgaatctc--tgttagaaacacaggtgaaaagtt |
14812841 |
T |
|
| Q |
1106 |
tgtaaaagatccaaaaaggttaaaggatcctatgatttttgttcaagaacttttggacatgaaagataagtatgatatagtatattaaacttggcattta |
1205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14812840 |
tgtaaaagatccaaaaaggttaaaggatcctatgatttttgttcaagaacttttggacatgaaagataaatatg--atagtatattaaacttggcattta |
14812743 |
T |
|
| Q |
1206 |
atcatgatgaagaattccatggagtgctggactcatcatttgagtacattattaacttgaatcacaatttgccagagtttctttcgtcgttcttggatgt |
1305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14812742 |
atcatgatgaagaattccatggagtgctggactcatcatttgagtacattattaacttgaatcacaatttgccagagtttctttcgtcgttcttggatgt |
14812643 |
T |
|
| Q |
1306 |
caaattaaggaaaggtttcgaacgaagtagtgtggaaattattcttgacaaggtggtgatgt |
1367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14812642 |
caaattaaggaaaggtttcgaaggaaatagtgaggaaattattcttgacaaggtgatgatgt |
14812581 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 706 - 1367
Target Start/End: Complemental strand, 15260233 - 15259576
Alignment:
| Q |
706 |
atttaggtgattcagtttatgagacattatttgagattcctttcattgaagtttcggctgagttttatagaggtgagttccaaaagttaagtgaatattg |
805 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15260233 |
atttaggtgattcagtttatgagacattatttgagattcctttcatcgaagtttcggctgagttttatagaggtgagttccaaaagttaagtgaatattg |
15260134 |
T |
|
| Q |
806 |
tgattgtggcgattatctatggaaagctgagaatcatttgattaaaggattgattagagtgaaccactacttggattccgtaagtcaaaagaagatttat |
905 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15260133 |
tgattgtggcgattatctacggaaagctgagaatcatttgattaaaggattgattagagtgaaccactacttggattccataagtcaaaagaagatttat |
15260034 |
T |
|
| Q |
906 |
aatgcaatgtacaaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatccacataggaaattcttggttagtaattctctttcttgacaatagatatgaag |
1005 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
15260033 |
aatgcaatgtacaaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatccggatagaaaattcttggttagtaactctctttcttaataatagatatgaag |
15259934 |
T |
|
| Q |
1006 |
atttgagaaacttgtaccagattttctctacatatcctaatggactccttacaatacagaaagtagtgaatctctatgttagaaacacaggtgaaaagtt |
1105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15259933 |
atttgagaaacttgtaccagattttctctacatatcctaatggactctttacaatacagaaagtagcgaatctc--tgttagaaacacaggtgaaaagtt |
15259836 |
T |
|
| Q |
1106 |
tgtaaaagatccaaaaaggttaaaggatcctatgatttttgttcaagaacttttggacatgaaagataagtatgatatagtatattaaacttggcattta |
1205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15259835 |
tgtaaaagatccaaaaaggttaaaggatcctatgatttttgttcaagaacttttggacatgaaagataaatatg--atagtatattaaacttggcattta |
15259738 |
T |
|
| Q |
1206 |
atcatgatgaagaattccatggagtgctggactcatcatttgagtacattattaacttgaatcacaatttgccagagtttctttcgtcgttcttggatgt |
1305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15259737 |
atcatgatgaagaattccatggagtgctggactcatcatttgagtacattattaacttgaatcacaatttgccagagtttctttcgtcgttcttggatgt |
15259638 |
T |
|
| Q |
1306 |
caaattaaggaaaggtttcgaacgaagtagtgtggaaattattcttgacaaggtggtgatgt |
1367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15259637 |
caaattaaggaaaggtttcgaaggaaatagtgaggaaattattcttgacaaggtgatgatgt |
15259576 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 373 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 14813595 - 14813266
Alignment:
| Q |
373 |
atatgagattggttaccatcatgacatcacatgtgaaagaaatatcaaaatccattgaagaagcaacgcaaggagacttctttttggaagaactgaatag |
472 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14813595 |
atatgggattggttgccatcatgacatcacatgtgaaagaaatatcaaaatccattgaagaagcaacacaaggagacttctttttggaagaactgaatag |
14813496 |
T |
|
| Q |
473 |
gaaatggaatgattacaaagatgcaatactaaatgtttgaaaagtactattgtatatggatagggtttatgttatacataacaataagactagaattcat |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14813495 |
gaaatggaatgattacaaagatgcaatactaaatgttcgaaaagtactattgtatatggatagggtttatgttatacataacaataagactagaattcat |
14813396 |
T |
|
| Q |
573 |
gatcttggaatgaacttgtggagagataatgttgttaactccacccagataattcaatctcaactgaagaagactctcgttgaattagttcatggagaat |
672 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14813395 |
gatcttggaatgaacttgtggagagataatgttgttaactccacccagatagttcaatctcaactgaagaagactctcgttaaattagttcatcgagaat |
14813296 |
T |
|
| Q |
673 |
gcatcagtgaagttattaatagagacttga |
702 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14813295 |
gcatcggtgaagttattaatagagacttga |
14813266 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 373 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 15260590 - 15260261
Alignment:
| Q |
373 |
atatgagattggttaccatcatgacatcacatgtgaaagaaatatcaaaatccattgaagaagcaacgcaaggagacttctttttggaagaactgaatag |
472 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15260590 |
atatgggattggttgccatcatgacatcacatgtgaaagaaatatcaaaatccattgaagaagcaacacaaggagacttctttttggaagaactgaatag |
15260491 |
T |
|
| Q |
473 |
gaaatggaatgattacaaagatgcaatactaaatgtttgaaaagtactattgtatatggatagggtttatgttatacataacaataagactagaattcat |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15260490 |
gaaatggaatgattacaaagatgcaatactaaatgttcgaaaagtactattgtatatggatagggtttatgttatacataacaataagactagaattcat |
15260391 |
T |
|
| Q |
573 |
gatcttggaatgaacttgtggagagataatgttgttaactccacccagataattcaatctcaactgaagaagactctcgttgaattagttcatggagaat |
672 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15260390 |
gatcttggaatgaacttgtggagagataatgttgttaactccacccagatagttcaatctcaactgaagaagactctcgttaaattagttcatcgagaat |
15260291 |
T |
|
| Q |
673 |
gcatcagtgaagttattaatagagacttga |
702 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15260290 |
gcatcggtgaagttattaatagagacttga |
15260261 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14813940 - 14813648
Alignment:
| Q |
14 |
gattgtgttcattgtcttgctatttatcatttcttgattcttctgttattggtttctgttctaacagtaaatatgagatttaatatagaaaatagatgcg |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||| | ||| | ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14813940 |
gattgtgttcattgtcttgcgatttattatttctttaatcttctgttactagttgccgttctaaaaataaatatgagatttgatatagaaaatagatgcg |
14813841 |
T |
|
| Q |
114 |
tagataataaggaataaattatgacatttgatgctnnnnnnnntataaatttcctttgcaacaccacaaaaatatgcattgtaaaacctgcaatgcctac |
213 |
Q |
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| T |
14813840 |
taaataatacggaataaattatgacattttatgctaaaaaaa-tataaatttcctttgcaacaccacac---tatgcattgtaacacctacaatgcctac |
14813745 |
T |
|
| Q |
214 |
aattgcaatacat----tcgcatccacgaattaaaaccgtggaatatatgttattaatagatagtatttccaataatttgtgttttatttttcttct |
306 |
Q |
| |
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| T |
14813744 |
aattacaatacttccgcgcgcatccacgaattaaaaccgtggaatatatgttattaatcgatagtatttccaataatttgtgttttgtttctcttct |
14813648 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15260935 - 15260643
Alignment:
| Q |
14 |
gattgtgttcattgtcttgctatttatcatttcttgattcttctgttattggtttctgttctaacagtaaatatgagatttaatatagaaaatagatgcg |
113 |
Q |
| |
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| T |
15260935 |
gattgtgttcattgtcttgcgatttattatttctttaatcttctgttactagttgccgttctaaaaataaatatgagatttgatatagaaaatagatgcg |
15260836 |
T |
|
| Q |
114 |
tagataataaggaataaattatgacatttgatgctnnnnnnnntataaatttcctttgcaacaccacaaaaatatgcattgtaaaacctgcaatgcctac |
213 |
Q |
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|
| T |
15260835 |
taaataatacggaataaattatgacattttatgctaaaaaaa-tataaatttcctttgcaacaccacac---tatgcattgtaacacctacaatgcctac |
15260740 |
T |
|
| Q |
214 |
aattgcaatacat----tcgcatccacgaattaaaaccgtggaatatatgttattaatagatagtatttccaataatttgtgttttatttttcttct |
306 |
Q |
| |
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| T |
15260739 |
aattacaatacttccgcgcgcatccacgaattaaaaccgtggaatatatgttattaatcgatagtatttccaataatttgtgttttgtttctcttct |
15260643 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 918 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 14749996 - 14749959
Alignment:
| Q |
918 |
aaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatcca |
955 |
Q |
| |
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| T |
14749996 |
aaggagactattgaaaatcacatgcttagattaatcca |
14749959 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 918 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 14757915 - 14757878
Alignment:
| Q |
918 |
aaggagattattgaaaaccacatgcttagattaatcca |
955 |
Q |
| |
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| T |
14757915 |
aaggagatgattgaaaatcacatgcttagattaatcca |
14757878 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14813651 - 14813618
Alignment:
| Q |
338 |
ttctctgatcagtcgaacacatgatatggtgatt |
371 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
14813651 |
ttctctgatcagtctaacacatgatatggtgatt |
14813618 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15260646 - 15260613
Alignment:
| Q |
338 |
ttctctgatcagtcgaacacatgatatggtgatt |
371 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
15260646 |
ttctctgatcagtctaacacatgatatggtgatt |
15260613 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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